JP7398129B2 - 電流測定方法 - Google Patents
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Description
をさらに有する。
本発明の一実施形態に係る電極基板1と、電流測定装置9とについて、図1~図8を参照しつつ説明する。図1は、電極基板1の上面図である。図2~図4は、電極基板1の部分上面図である。図5および図6は、電流測定装置9を用いた電極基板1の押し曲げの様子を示した概略図である。図7および図8は、電極基板1の押し曲げの様子を示した概略部分断面図である。
次に、電極基板1および電流測定装置9を用いた生体高分子のトンネル電流測定処理の流れについて、図9を参照しつつ説明する。図9は、電解質を含む液体中に生体高分子が遊動する液体試料について、当該生体高分子のトンネル電流測定処理の流れを示したフローチャートである。本実施形態において、液体試料に含まれる生体高分子は、ヌクレオチドである。また、液体試料に含まれる電解質を含む液体は、水等の極性の大きな溶媒に溶質が溶解された、NaCl水溶液等の液体である。
次に、ステップS100の特徴量解析処理について、図12を参照しつつ説明する。図12は、特徴量解析処理の流れを示したフローチャートである。
次に、ステップS200のナノ電極34の校正処理について、図13を参照しつつ説明する。図13は、ナノ電極34の校正処理の流れを示したフローチャートである。
続いて、電極基板1を用いた生体高分子の電流測定処理を行うための、電極間距離dの設定処理について、図19~図21を参照しつつ説明する。図19は、ステップS300の電極間距離設定処理の流れを示したフローチャートである。図20は、スモールギャップモードにおける電極間距離調整工程の流れを示したフローチャートである。図21は、ラージギャップモードにおける電極間距離調整工程の流れを示したフローチャートである。
以上、本発明の一実施形態について説明したが、本発明は、上記の実施形態に限定されるものではない。
9 電流測定装置
34 ナノ電極
50 流路
90 制御部
93 押し上げ具
94 昇降機構
95 電源
96 電流計
942 ピエゾアクチュエータ
Claims (10)
- 一対の電極間を通過する生体高分子のトンネル電流を測定する電流測定方法であって、
a)電解質を含む液体中に前記電極を配置し、前記電極間に電圧を印加しつつ、前記電極の表面に形成される電気二重層を介して前記電極間を流れる電流を測定する工程と、
b)前記電極間の距離を固定したまま、電極間電圧をかけていない状態から所定の電圧印加を行いつつ、前記電極間を流れる電流を測定する工程と、
c)前記工程b)において測定した電流値について、前記電気二重層に起因する特徴量を算出する工程と、
を含む、電流測定方法。 - 請求項1に記載の電流測定方法であって、
前記工程b)および前記工程c)は、前記工程a)の前に行われ、
前記工程a)における測定タイミングは、前記特徴量に基づいて決定される、電流測定方法。 - 請求項1に記載の電流測定方法であって、
前記特徴量は、前記工程b)において測定した前記電流値の時定数である、電流測定方法。 - 請求項3に記載の電流測定方法であって、
前記工程c)において、複数の前記時定数を算出する、電流測定方法。 - 請求項3または4に記載の電流測定方法であって、
前記工程b)および前記工程c)は、前記工程a)の前に行われ、
前記工程a)における測定タイミングは、前記時定数に基づいて決定される、電流測定方法。 - 請求項4に記載の電流測定方法であって、
前記工程a)は、前記電極間に所定の電圧を印加しつつ、電極間距離を変更させるように操作を行って前記電極間の電流値を取得するキャリブレーション用電流測定工程であって、
前記工程a)は、
p1)前記時定数に基づいて算出された待機時間の間、待機する工程と、
p2)前記電極間距離の変更に用いられる操作量の値と、前記電極間の電流値とを取得する工程と、
p3)前記操作量を変更して前記電極間距離を変更する工程と、
を複数回繰り返す、電流測定方法。 - 請求項6に記載の電流測定方法であって、
d)前記工程a)における、複数の前記操作量と複数の前記電流値との関係を関数近似した近似関数を算出する工程
をさらに有する、電流測定方法。 - 請求項6に記載の電流測定方法であって、
前記工程p1)における前記待機時間は、前記時定数を定数倍して算出される、電流測定方法。 - 請求項4に記載の電流測定方法であって、
前記工程b)および前記工程c)の後であって、
e)前記電極間にトンネル電流が流れない電極間距離において、前記電極間に流れる基準電流の値を測定する工程と、
f)目標とする電極間距離に対応するトンネル電流の値と、前記e)で測定した前記基準電流の値とを加算して、目標合計電流値を算出する工程と、
をさらに含み、
前記工程e)および前記工程f)は、前記工程a)の前に行われ、
前記工程a)は、
q1)前記時定数に基づいて算出された待機時間の間、待機する工程と、
q2)前記電極間のベース電流を測定する工程と、
q3)前記ベース電流の値が、前記工程f)で算出した前記目標合計電流値に近づく方向に前記電極間距離を操作する工程と、
を複数回繰り返す、電流測定方法。 - 請求項4に記載の電流測定方法であって、
前記工程b)および前記工程c)の後であって、前記工程a)の前に、
g)前記電極間にトンネル電流が流れない電極間距離において、前記電極間に流れる基準電流の値を測定する工程と、
h)中間目標とする電極間距離に対応するトンネル電流の値と、前記工程g)で測定した前記基準電流の値とを加算して、中間目標合計電流値を算出する工程と、
をさらに含み、
前記工程a)は、
r1)前記時定数に基づいて算出された待機時間の間、待機する工程と、
r2)前記電極間のベース電流を測定する工程と、
r3)前記ベース電流の値が、前記工程h)で算出した前記中間目標合計電流値に近づく方向に前記電極間距離を操作する工程と、
を複数回繰り返し、
前記工程a)の後に、
i)中間目標とする電極間距離から最終目標とする電極間距離までの予め算出された操作量の操作を行うことにより、前記電極間距離を前記最終目標と一致させるように前記電極間距離を調整する工程
をさらに含む、電流測定方法。
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Non-Patent Citations (2)
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MORROW et al.,The time-dependent development of electric double-layers in pure water at metal electrodes: the effe,PROCEEDINGS OF THE ROYAL SOCIETY A,2011年08月10日,Vol.468/Iss.2137,PP.18-34 |
大城敬人,超高速単分子シーケンサーに向けた単分子電気分析法の開発,BUNSEKI KAGAKU,2017年,Vol.66/No.5,PP.351-362 |
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