WO2020184700A1 - Ｉｈｈ発現を調節するための核酸複合体 - Google Patents

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木澤　秀樹
鋼 高木
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Definitions

  • the present invention relates to a nucleic acid complex containing a heteroduplex oligonucleotide (HDO) for regulating the expression of the Indian hedgehog gene (hereinafter, IHH gene).
  • HDO heteroduplex oligonucleotide
  • IHH gene-specific inhibitors IHH gene-specific inhibitors.
  • the present invention also relates to a therapeutic agent for fibrosis, which comprises an inhibitor of a transcript of the IHH gene.
  • Hedgehog is a morphogenetic signaling pathway that controls the fate and tissue construction of progenitor cells during embryogenesis, and hedgehog reactivation occurs during liver injury in adults.
  • Hedgehog (Hh) is a signal transduction pathway that controls important cell fate decisions including proliferation, apoptosis, migration and differentiation, and the number of adult tissues including the liver regulates the wound healing response (non-patent literature). 1).
  • ECM extracellular matrix
  • HSC Hepatic Stem Cell
  • ECM contains a complex mixture of proteins that promote cell proliferation, migration and differentiation.
  • One ECM component having such a role is osteopontin (OPN: Osteopontin), a matrigergoline phosphoprotein also known as secretory phosphoprotein 1 (Non-Patent Document 2).
  • HSC Hepatic Stem Cell plays an important role in liver fibrosis.
  • the expression of the hedgehog signaling components of Ihh, Smo, Ptc, Gli2 and Gli3 in HSC was obtained by constructing a hedgehog siRNA vector targeting Ihh, Smo and Gli2 and transfecting them into HSC, respectively. Expression decreased. It has been found that HSC activation and collagen secretion can be regulated by hedgehog signaling (Non-Patent Document 3).
  • Nonalcoholic steatohepatitis is a major cause of liver disease worldwide.
  • the transcription factor TAZ (WWTR1) is significantly higher in human and murine NASH liver than in normal or fatty liver.
  • WWTR1 transcription factor 1
  • TAZ factor is significantly higher in human and murine NASH liver than in normal or fatty liver.
  • TAZ factor is significantly higher in human and murine NASH liver than in normal or fatty liver.
  • hepatocyte TAZ silencing in a mouse model of NASH prevented or reversed hepatitis, hepatocyte death and fibrosis, but not steatohepatitis. From these facts, it was found that the TAZ factor is a factor that contributes to an important process for the progression of steatosis and NASH (Non-Patent Document 4).
  • Non-Patent Documents 2 and 3 show that activation of hepatic stellate cells (HSC) plays an important role in NASH fibrosis. Although many factors for activating HSC have been proposed in NASH, research in this field is not yet complete and has not yet reached an FDA-approved therapeutic strategy (Non-Patent Document 5).
  • HSC hepatic stellate cells
  • the therapeutic agents for fibrosis include therapeutic agents consisting of antibiotics such as steroids, for example, pirfenidone and Nintedanib, which are therapeutic agents for idiopathic pulmonary fibrosis (IPF: (Idiopathic Pulmonary Fibrosis)).
  • Pirfenidone is an anti-fibrotic drug.
  • the main mechanism of action is suppression of transforming growth factor- ⁇ (TGF- ⁇ ) production.
  • TGF- ⁇ promotes fibrosis by controlling the phenomenon of "epithelial-mesenchymal transition" in which type 2 alveolar epithelial cells differentiate into fibroblasts and myofibroblasts.
  • Pirfenidone exerts an anti-fibrotic effect by blocking its pathway.
  • b-FGF basic-fibroblast growth factor
  • SDF-1 ⁇ stroma cell derived factor-1 ⁇
  • IFN- ⁇ interferon- ⁇
  • Nintedanib is an antifibrotic drug.
  • One of the small molecule tyrosine kinase inhibitors vascular endothelial cell growth factor receptor type 1-3 (VEGFR: vascular endothelial growth factor receptor), fibroblast growth factor receptor (FGFR: fibroblast growth factor receptor), platelets It acts on the derived growth factor receptor (PDGFR).
  • VEGFR vascular endothelial cell growth factor receptor type 1-3
  • FGFR fibroblast growth factor receptor
  • PDGFR derived growth factor receptor
  • therapeutic agents for fibrosis composed of these low molecular weight compounds, therapeutic agents having a new mechanism of action are required.
  • IHH gene inhibitors have not yet been used for the treatment of fibrosis and have not even been suggested.
  • IHH protein is a secretory protein belonging to the hedgehog family.
  • Intron 1 of the IHH gene has a binding region of the transcription factor TAZ, and the expression of the IHH gene is positively regulated by the transcription factor TAZ through this region (Patent Document 1, Non-Patent Document 4).
  • TAZ is an exacerbating factor of NASH fibrosis
  • the IHH gene may mediate the exacerbating effect.
  • the inventors have found that the IHH gene is secreted from hepatocytes, activates hepatocytes, and is a component in which the IHH gene is also secreted from activated stellate cells. Therefore, the IHH gene is used in the pathophysiology of fibrosis. It was thought that the pathological condition would progress further by enhancing the autokupffer and parakupffer action of the liver.
  • an inhibitor of the IHH gene which is one of the hedgehog families, is useful for elucidating the function of the IHH gene. Therefore, it can be expected to suppress or delay the progression of the pathological condition of fibrosis. Furthermore, the inhibitor of the IHH gene is useful not only for the liver but also for the treatment, prevention, improvement of inflammatory diseases and fibrotic diseases in tissues and organs such as kidney, lung and skin, or suppression or delay of its progression.
  • the present invention is a problem to be solved to provide an inhibitor of the IHH gene. It is an issue to be solved to provide a nucleic acid complex containing a hetero double-stranded nucleic acid (HDO) that regulates the expression of the IHH gene as an inhibitor of the IHH gene.
  • HDO hetero double-stranded nucleic acid
  • a nucleic acid complex for reducing the expression of mRNA and protein which are transcripts of the IHH gene that is, an inhibitor of the IHH gene and a method of inhibiting the expression of the IHH gene are disclosed as means for solving the problem. ..
  • IHH gene inhibitors are useful in treating, preventing, ameliorating or delaying the progression of fibrosis, fibrotic disease in patients in need.
  • a nucleic acid complex comprising an oligonucleotide consisting of 12 to 30 nucleotides and having a nucleic acid base sequence in which the oligonucleotide is complementary to an IHH gene transcript.
  • the nucleic acid complex of [1] wherein the oligonucleotide is a single-strand oligonucleotide.
  • the nucleic acid complex of [1] which is a hetero double-stranded nucleic acid composed of an antisense strand composed of the oligonucleotide and a nucleic acid strand complementary to the antisense strand.
  • nucleic acid complex according to any one of [1] to [3], wherein the oligonucleotide contains at least one modified nucleotide.
  • nucleic acid complex according to [5] wherein the oligonucleotide is a phosphorothioate oligonucleotide.
  • nucleic acid complex according to any one of [1] to [7], wherein the oligonucleotide contains a modified nucleobase.
  • nucleobase according to [8] wherein the modified nucleobase is 5-methylcytosine, 2'-MOE, BNA, LNA or AmNA.
  • the oligonucleotide is: Gap region consisting of multiple nucleic acids; 5'wing region consisting of multiple nucleic acids; 3'wing region consisting of multiple nucleic acids; The nucleic acid complex according to any one of [1] to [10], which comprises.
  • the nucleic acid base sequence of the oligonucleotide consists of a base sequence complementary to an oligonucleotide consisting of 12 to 30 consecutive nucleotides in the IHH gene sequence represented by SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 2 [1] to The nucleic acid complex of any of [11].
  • the nucleic acid base sequence of the oligonucleotide is SEQ ID NO: 4, 6, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, 30, 32, 34, 36, 38, 40, 42, 44, 46, 48, 50, 52, 54, 56, 58, 60, 62, 64, 66, 68, 70, 72, 74, 76, 78, 80, 82, 84, 86, 88,
  • the nucleic acid complex according to [12], which comprises the sequence of any of 90, 92, 94, 96, 98, 100, 102, 104, 106, 108, 110 and 112.
  • nucleic acid complex according to [13], wherein the nucleic acid base sequence of the oligonucleotide consists of the sequence of SEQ ID NO: 26.
  • the nucleobase sequence of the oligonucleotide is SEQ ID NO: 118, 120, 122, 124, 126, 128, 130, 132, 134, 136, 138, 140, 142, 144, 146, 148, 150, 152, It consists of any of the sequences 154, 156, 158, 160, 162, 164, 166, 168, 170, 172, 174, 176, 178, 180, 182, 184, 186 and 188, [1]-[11].
  • Nucleic acid complex of any of. [16] The nucleic acid complex according to [15], wherein the nucleic acid base sequence of the oligonucleotide consists of the sequence of SEQ ID NO: 160, 170 or 178. [17] A pharmaceutical composition comprising an IHH-specific inhibitor comprising any of the nucleic acid complexes of [1] to [16]. [18] A therapeutic agent for fibrosis comprising an IHH-specific inhibitor comprising the nucleic acid complex according to [1]. [19] A therapeutic agent for Nash containing an IHH-specific inhibitor comprising any of the nucleic acid complexes of [1] to [16].
  • a therapeutic agent for liver fibrosis which comprises an IHH-specific inhibitor comprising any of the nucleic acid complexes of [1] to [16].
  • a therapeutic agent for renal fibrosis which comprises an IHH-specific inhibitor comprising any of the nucleic acid complexes of [1] to [16].
  • a therapeutic agent for pancreatic fibrosis which comprises an IHH-specific inhibitor comprising any of the nucleic acid complexes of [1] to [16].
  • a therapeutic agent for pulmonary fibrosis which comprises an IHH-specific inhibitor comprising any of the nucleic acid complexes of [1] to [16].
  • a therapeutic agent for skin fibrosis which comprises an IHH-specific inhibitor comprising any of the nucleic acid complexes of [1] to [16].
  • a nucleic acid complex comprising 12 to 30 oligonucleotides and having a nucleic acid base sequence containing at least 8 consecutive nucleic acid bases of any of the nucleic acid base sequences of SEQ ID NOs: 1 to 50.
  • This specification includes the disclosure of Japanese Patent Application No. 2019-047703, which is the basis of the priority of the present application.
  • a nucleic acid complex comprising an oligonucleotide consisting of 12 to 30 nucleotides of the present invention and having a nucleic acid base sequence in which the oligonucleotide is complementary to the IHH gene transcript can inhibit the expression of the IHH gene.
  • C indicates the central vein
  • G indicates the Grisson capsule
  • ⁇ indicates the inflammatory cell collection
  • the arrow ( ⁇ ) indicates the lipid droplet.
  • It is a liver histology (Oil red O staining) of a NASH pathological model mouse 5 weeks after administration of Ren1-12-27.
  • e is the Normal Diet + Vehicle administration group
  • f is the Normal Diet + HDO administration group
  • g is the MCD Diet + Vehicle administration group
  • h is the MCD Diet + HDO administration group.
  • C indicates the central vein
  • G indicates the Grisson capsule
  • the arrow ( ⁇ ) indicates the lipid droplet.
  • A shows the expression-suppressing effect of IHH mRNA
  • B shows the expression-suppressing effect of Malat-1 mRNA (positive control). It is a figure which shows the IHH mRNA expression suppression effect by Ren-1-12-27 in the skin fibroblast (MDF) derived from a normal mouse.
  • MDF skin fibroblast
  • A shows the expression-suppressing effect of IHH mRNA
  • B shows the expression-suppressing effect of Malat-1 mRNA (positive control).
  • MRPTEC renal tubular epithelial cell
  • the present invention is a nucleic acid complex comprising an oligonucleotide consisting of 12 to 30 nucleotides and having a nucleic acid base sequence in which the oligonucleotide is complementary to a transcript of the IHH (Indian hedgehog) gene.
  • a nucleic acid having a nucleic acid sequence complementary to the transcript of the IHH gene acts as an antisense nucleic acid to the transcript of the IHH gene. That is, it acts as a specific inhibitor of the IHH gene, and has an activity of suppressing the expression of the target gene, the IHH gene, or the normal transcript level by an antisense effect.
  • the transcript of the IHH gene is an mRNA transcribed from the genomic DNA encoding the IHH gene, and includes unmodified mRNA, unspliced mRNA precursor, and the like.
  • the "transcript” can be any RNA synthesized by DNA-dependent RNA polymerase.
  • the oligonucleotide of the nucleic acid complex is a single-stranded oligonucleotide. That is, it is a single-strand antisense oligonucleotide (ASO: antisense oligonucleotide).
  • ASO antisense oligonucleotide
  • the nucleic acid complex is a heteroduplex oligonucleotide (HDO) composed of an antisense strand composed of an oligonucleotide and a sense strand which is a nucleic acid strand complementary to the antisense strand.
  • the antisense strand is annealing to the sense strand nucleic acid strand.
  • the antisense strand may be referred to as the first nucleic acid strand and the sense strand may be referred to as the second nucleic acid strand.
  • Such a nucleic acid complex is called a double-stranded nucleic acid complex.
  • the nucleic acid complex is a single-stranded oligonucleotide at the time of production, which comprises an antisense strand consisting of a DNA nucleotide or a DNA nucleotide analog, a linker moiety consisting of 3 to 10 nucleotides, and the above.
  • the structure may include a sense strand consisting of an RNA nucleotide or an RNA nucleotide analog complementary to the antisense strand.
  • the nucleic acid complex having this structure is called a single-strand heteroduplex oligonucleotide (ss-HDO), and has, for example, the structure of X-LY described in WO2017 / 131124A1.
  • oligonucleotide It is an oligonucleotide.
  • X is the antisense strand
  • Y is the complementary strand to the antisense strand
  • L consists of nucleotides that act as linkers.
  • this single-stranded oligonucleotide is used as a pharmaceutical composition, it is antisense in a solvent used for physiological saline, aqueous injection, non-aqueous injection, suspension injection, solid injection, etc., or in blood or plasma.
  • the strand and the complementary strand to the antisense strand anneal one molecule with the linker as a fulcrum to form a double chain structure.
  • Such a nucleic acid complex is one of the double-stranded nucleic acid complexes because it has a double-stranded structure by annealing one molecule when acting as a pharmaceutical composition.
  • HDO hetero double-stranded nucleic acid
  • active strand composed of DNA, which is the active body
  • sense strand Carrier strand
  • a pharmaceutical composition containing an IHH gene-specific inhibitor is highly stable in human blood and is efficiently delivered to a target tissue according to the performance of the ligand.
  • RNA strands are rapidly removed by RNase H after HDO is delivered intracellularly. There, a new double-stranded structure is formed between the freed DNA strand and the mRNA, and the mRNA is degraded by the action of intracellular RNase H, thereby exerting a knockdown effect.
  • the nucleic acid complex comprises 12-30 oligonucleotides having a nucleic acid sequence that is complementary to the transcript of the IHH gene.
  • the oligonucleotide which is the antisense strand of the nucleic acid complex of the present invention, targets mRNA, which is a transcript of the IHH gene.
  • the base sequence of the antisense strand is complementary to the partial sequence in the base sequence of the human IHH gene or the partial sequence in the base sequence of the mouse IHH gene, preferably complementary to the partial sequence in the base sequence of the human IHH gene. Is the target.
  • the nucleotide sequence of the human IHH gene is shown in SEQ ID NO: 1
  • the nucleotide sequence of the mouse IHH gene is shown in SEQ ID NO: 2.
  • the nucleic acid base sequence containing the oligonucleotide consisting of 12 to 30 nucleotides of the present invention and in which the oligonucleotide is complementary to the IHH transcript is a partial sequence in the base sequence of the human IHH gene or the mouse IHH gene. It is a sequence complementary to a partial sequence in the base sequence of.
  • the nucleic acid base sequence of the oligonucleotide is SEQ ID NO: 4, 6, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, 30, 32, 34, 36, 38, 40, 42, 44, 46, 48, 50, 52, 54, 56, 58, 60, 62, 64, 66, 68, 70, 72, 74, 76, 78, 80, 82, 84, It may consist of any of the sequences 86, 88, 90, 92, 94, 96, 98, 100, 102, 104, 106, 108, 110 and 112.
  • nucleobase sequence consisting of the sequences of SEQ ID NOs: 19, 24, 26, 28, 76, 78, 84 or 86 is preferable, and further, the nucleobase sequence consisting of the sequence of SEQ ID NO: 26 is preferable.
  • the sequence of the sense strand (SEQ ID NO: 25) with respect to the sequence of SEQ ID NO: 26 is the 598th to 611th base (14 base length) of the base sequence of SEQ ID NO: 1.
  • the starting site of the sequence is shifted to the 603rd and 596th bases of the base sequence of SEQ ID NO: 1
  • the sequence complementary to the sense strand having a base length of 13 to 20 is the nucleic acid base sequence of the oligonucleotide. It can also be.
  • the nucleic acid base sequence of the oligonucleotide is SEQ ID NO: 118, 120, 122, 124, 126, 128, 130, 132, 134, 136, 138, 140, 142, 144, 146, 148. It may consist of any of the sequences 150, 152, 154, 156, 158, 160, 162, 164, 166, 168, 170, 172, 174, 176, 178, 180, 182, 184, 186 and 188. .. Among these, a nucleobase sequence consisting of the sequence of SEQ ID NO: 160, 170 or 178 is preferable.
  • the DHO will be described in detail below.
  • the single-strand oligonucleotide can be prepared and used based on the description regarding the antisense strand described below.
  • the first nucleic acid chain is (I) Containing nucleotides and optionally nucleotide analogs, the total number of the nucleotides and optionally contained nucleotide analogs in the nucleic acid chain is 8-100. (Ii) Containing at least four contiguous nucleotides recognized by RNase H when hybridized to a transcript. (Iii) Containing at least one unnatural nucleotide, (Iv) Hybridizes to the transcript.
  • the second nucleic acid chain is (I) Contains RNA nucleotides, optionally nucleotide analogs, and optionally DNA nucleotides. (Ii) Contains DNA nucleotides and / or nucleotide analogs, or (Iii) Contains PNA nucleotides.
  • the "antisense effect” means that the target transcript (RNA sense strand) hybridizes with, for example, a DNA strand complementary to its partial sequence, or a strand usually designed to produce an antisense effect.
  • translational inhibition or splicing function conversion effects such as exon skipping that may occur by coating the transcript with a hybridization product, and / or the transcript that may occur by recognizing hybridized moieties. It means the suppression caused by the decomposition of.
  • complementarity here refers to the relationship in which so-called Watson-Crick base pairs (natural base pairs) and non-Watson-Crick base pairs (Hoogsteen base pairs, etc.) can be formed via hydrogen bonds. Means that. If a sufficient number of nucleobases in the antisense strand can hydrogen bond to the corresponding nucleobases in the target nucleic acid, the antisense strand and the target nucleobase are complementary to each other and thus produce the desired effect (eg, the IHH gene). Antisense inhibition of target nucleic acids such as).
  • a non-complementary nucleobase between the antisense strand and the IHH gene can be tolerated provided that the antisense strand can specifically hybridize to the target nucleic acid.
  • the antisense compound can hybridize to one or more segments of the tau nucleic acid so that the intervening or adjacent segments do not participate in hybridization events (eg, loop structures, mismatches or hairpin structures).
  • the antisense strand is complementary to the sequence of mRNA encoding the IHH gene.
  • Complementary means that the antisense strand is complementary to the extent that it can bind to the mRNA encoding the IHH gene, for example, 80% or more, 90% or more, or 95% or more, 96% or more, 97%. As mentioned above, it may be 98% or more, or 99% or more complementary. It may be 100% complementary. There may be about 0 to 4 mismatches.
  • the antisense strand or particular portion thereof provided herein is 80-100%, preferably 90-100%, relative to the tau nucleic acid, target region, target segment or particular portion thereof. %, More preferably 95-100%, or 100% complementary.
  • the ratio of antisense strand complementarity to the target nucleic acid can be determined using conventional methods.
  • 16 of the 20 nucleobases of the antisense strand are complementary to the target region, so the specifically hybridizing antisense strand represents 80% complementarity.
  • the remaining non-complementary nucleobases can collect or intersperse complementary nucleobases, and these non-complementary nucleobases need not be adjacent to each other or adjacent to the complementary nucleobases.
  • an antisense strand of 18 nucleobase length with four non-complementary nucleic acid bases next to two regions that are fully complementary to the target nucleic acid has 14 complementary to the target region. Therefore, it has 77.8% overall complementarity and is therefore within the scope of the present invention.
  • the ratio of the complementarity of the antisense strand to the region of the target nucleic acid can be determined by a BLAST program or the like known in the art.
  • the first nucleic acid strand is an antisense nucleic acid that is complementary to the target transcript, such as a transcript of the target gene, when the first nucleic acid strand hybridizes to the transcript.
  • a nucleic acid having a region containing at least four contiguous nucleotides.
  • nucleic acid may mean a monomer nucleotide, or may mean an oligonucleotide composed of a plurality of monomers.
  • nucleic acid chain is also used here to refer to oligonucleotides. Nucleic acid chains may be prepared in whole or in part by chemical synthesis methods such as the use of an automatic synthesizer, and are not limited to polymerase, ligase or restriction enzyme reactions, but are prepared by enzymatic treatment. You may.
  • the chain length of the first nucleic acid chain is not particularly limited, but is 12 to 30 bases, 12 to 25 bases, or 13 to 20 bases. In some cases, the strand length is usually selected according to other factors such as the strength of the antisense effect of the nucleic acid strand on the target, cost, synthesis yield and the like.
  • the chain length of the second nucleic acid chain may be the same as that of the first nucleic acid chain. In that case, it is 12 to 30 bases, 12 to 25 bases, or 13 to 20 bases. Further, it may be several bases to a dozen bases longer or shorter than the chain length of the first nucleic acid chain.
  • At least 4 contiguous nucleotides recognized by RNase H are usually regions containing 4 to 20 contiguous nucleotides, 5 to 16 contiguous nucleotides, or 6 to 12 A region containing contiguous nucleotides of bases.
  • a nucleotide recognized by RNase H which cleaves an RNA strand when hybridized to an RNA nucleotide, such as natural DNA, can be used in this region.
  • Suitable nucleotides such as modified DNA nucleotides and other bases, are known in the art. It is also known that nucleotides having a hydroxy group at the 2'position, such as RNA nucleotides, are unsuitable. Those skilled in the art can readily determine the suitability of nucleotides for use in this region containing "at least four contiguous nucleotides”.
  • the first nucleic acid strand comprises "nucleotides and optionally nucleotide analogs". This wording means that the first nucleic acid strand has a DNA nucleotide, an RNA nucleotide, and may optionally further have a nucleotide analog in the nucleic acid strand.
  • DNA nucleotide means a naturally occurring DNA nucleotide or a DNA nucleotide in which a subunit of a base, sugar or phosphate bond thereof is modified.
  • RNA nucleotide means a naturally occurring RNA nucleotide or an RNA nucleotide in which a subunit of its base, sugar or phosphate binding is modified. Modification of a subunit of a base, sugar or phosphate bond is the addition of one substituent or the substitution of one within the subunit, not the substitution of the entire subunit with a different chemical group. ..
  • DNA may be a modified nucleotide from the viewpoint of high resistance to DNA degrading enzymes and the like in a part or all of the region containing a nucleotide.
  • modifications include, for example, 5-methylation, 5-fluorolation, 5-bromolation, 5-iodolation, N4-methylation, 5-demethylation of thymidine, 5-fluorolation, 5-methylation of thytocin.
  • phosphorothioatetization methylphosphonateization, methylthiophosphonateization, chiral-methylphosphonateization, phospho Logithioate, phosphoromidate, 2'-O-methylation, 2'-methoxyethyl (MOE), 2'-aminopropyl (AP), 2'-fluoro, but in the body From the viewpoint of excellent kinetics, phosphorothioationation is preferable. Further, such modification may be applied to the same DNA in combination of a plurality of types. Further, as described later, RNA nucleotides may be modified in order to obtain the same effect.
  • the modified DNA may affect the antisense effect of the double-stranded nucleic acid disclosed here. Since these modes differ depending on the sequence of the target gene and the like, it cannot be said unconditionally, but those skilled in the art can determine them while taking into consideration the description of the literature on the antisense method described later.
  • the antisense effect of the modified double-stranded nucleic acid complex is measured, and the obtained measured value is not significantly lower than that of the unmodified double-stranded nucleic acid complex (for example,). If the measured value of the double-stranded nucleic acid complex after modification is 30% or more of the measured value of the double-stranded nucleic acid complex before modification), the modification can be evaluated.
  • the antisense effect can be measured, for example, in cells or the like in which a test nucleic acid compound is introduced into a cell or the like and suppressed by the antisense effect exerted by the test nucleic acid compound, as shown in Examples described later.
  • the expression level of the target gene (mRNA amount, cDNA amount, protein amount, etc.) can be determined by appropriately using known methods such as northern blotting, quantitative PCR, and Western blotting.
  • nucleotide analog means a nucleotide that does not exist in nature, and two or more substituents are added to the nucleotide, sugar, or phosphate-binding subunit of the nucleotide, or two in the subunit. It means that it has been substituted as described above, or that the entire subunit has been substituted with a different chemical group.
  • Examples of analogs with two or more substitutions include crosslinked nucleic acids.
  • a crosslinked nucleic acid is a nucleotide analog to which a crosslinked unit is added based on two substitutions in the sugar ring, typically a nucleotide analog in which a carbon at the 2'position and a carbon at the 4'position are bonded. Can be mentioned.
  • the first nucleic acid strand further comprises a nucleotide analog in view of increasing the affinity of the target gene for the transcript subsequence and / or resistance to the nucleolytic enzyme.
  • the "nucleotide analog” may be any nucleotide whose affinity for the partial sequence of the transcript of the target gene and / or resistance to the nucleolytic enzyme is increased by modification (crosslinking, substitution, etc.). 10-304889, International Publication 2005/021570, Japanese Patent Laid-Open No. 10-195098, Japanese Patent Laid-Open No. 2002-521310, International Publication No. 2007/143315, International Publication No. 2008/043753, International Publication No.
  • nucleic acids disclosed in / 029619 and International Publication No. 2008/049085 are disclosed as being suitably used for the antisense method. That is, the nucleic acids disclosed in the above literature: hexitol nucleic acid (HNA), cyclohexene nucleic acid (CeNA), peptide nucleic acid (PNA), glycol nucleic acid (GNA), treose nucleic acid (TNA), morpholinonucleic acid, tricyclo-DNA (tcDNA).
  • HNA hexitol nucleic acid
  • CeNA cyclohexene nucleic acid
  • PNA peptide nucleic acid
  • GAA glycol nucleic acid
  • TAA treose nucleic acid
  • morpholinonucleic acid tricyclo-DNA (tcDNA).
  • the BNA in one embodiment may be a ribonucleotide or deoxyribonucleotide in which the carbon at the 2'position and the carbon at the 4'position are crosslinked by two or more atoms.
  • crosslinked nucleic acids are known to those of skill in the art.
  • the carbon at the 2'position and the carbon at the 4'position are 4'-(CH 2 ) p -O-2' and 4'-(CH 2 ) p -S.
  • R 3 is a hydrogen atom, an alkyl group, an alkenyl group, a cycloalkyl group, an aryl group, respectively.
  • R 1 and R 2 of substituents at the 3'position carbon: OR 2 and substituents at the 5'position: OR 1 are typically hydrogen atoms, although It may be the same or different, and it may be the same or different.
  • a phosphate group protected by, or -P (R 4 ) R 5 (in the formula, R 4 and R 5 may be the same or different, a hydroxyl group, a hydroxyl group protected by a protective group for nucleic acid synthesis, A mercapto group, a mercapto group protected by a protective group for nucleic acid synthesis, an amino group, an alkoxy group having 1 to 5 carbon atoms, an alkylthio group having 1 to 5 carbon atoms, a cyanoalkoxy group having 1 to 6 carbon atoms, or a cyanoalkoxy group having 1 to 6 carbon atoms. It may be an amino group substituted with 1 to 5 alkyl groups).
  • Such BNA includes, for example, ⁇ -L-methyleneoxy (4'-CH 2 -O-), which is also called LNA (Locked Nucleic Acid (registered trademark), 2', 4'-BNA). 2') BNA or ⁇ -D-methyleneoxy (4'-CH 2 -O-2') BNA, ethyleneoxy (4'-(CH 2 ) 2 -O-2') BNA, ⁇ -D-Chio (4'-CH 2 -S-2') BNA, Aminooxy (4'-CH 2 -ON (R 3 ) -2') BNA, 2', 4'-BNA Also called NC Oxyamino (4'-CH 2 -N (R 3 ) -O-2') BNA, 2', 4'-BNA COC , 3'amino-2', 4'-BNA, 5'-methyl BNA, cEt Also called -BNA (4'-CH (CH 3 ) -O-2') BNA, also called
  • the base site may be modified.
  • Modifications of the base site include, for example, 5-methylation, 5-fluorolation, 5-bromolation, 5-iodolation, N4-methylation of cytosine, 5-demethylation of thymidine, 5-fluorolation, 5-. Includes bromination, 5-iodolation, N6-methylation of adenine, 8-bromolation, N2-methylation of guanine, and 8-bromolation.
  • the phosphodiester bond site may be modified.
  • Modifications of the phosphate diester bond site include, for example, phosphorothioation, methylphosphonate, methylthiophosphonate, chiral-methylphosphonate, phosphorodithioate, and phosphoramidate, which are excellent in pharmacokinetics. From the perspective of being present, phosphorothioation is used. Further, such modification of the base site and the modification of the phosphoric acid diester bond site may be applied to the same nucleic acid in combination of a plurality of types.
  • modified nucleotides and modified nucleotide analogs are not limited to those exemplified here.
  • a large number of modified nucleotides and modified nucleotide analogs are known in the art, for example, the description of U.S. Pat. No. 8299039 of Tachas et al., Especially the description in columns 17-22, as embodiments of the present application. It can also be used.
  • nucleotide analog is an LNA represented by the following formula (1).
  • Base is an aromatic heterocyclic group or an aromatic hydrocarbon ring group which may have a substituent, for example, a base moiety (purine base, pyrimidine base) of a natural nucleoside or a non-natural type.
  • a base moiety purine base, pyrimidine base
  • Modification Shows the base site of the nucleoside. An example of modification of the base site is as described above.
  • R 1 and R 2 may be the same or different, and may be the same or different, and may be the same or different, and may be the same or different, and may be the same or different. , Phosphate group, phosphate group protected by a protective group for nucleic acid synthesis, or -P (R 4 ) R 5 [Here, R 4 and R 5 may be the same or different, hydroxyl group, nucleic acid.
  • Hydroxyl group protected by a synthetic protective group mercapto group, mercapto group protected by a nucleic acid synthesis protective group, amino group, alkoxy group having 1 to 5 carbon atoms, alkylthio group having 1 to 5 carbon atoms, 1 to 5 carbon atoms
  • the cyanoalkoxy group of 6 or the amino group substituted with an alkyl group having 1 to 5 carbon atoms is shown. ] Is shown.
  • the compound represented by the chemical formula is a nucleoside
  • the "LNA" and the usual BNA in a certain embodiment also include a form (nucleotide) in which a phosphate group is bonded to the nucleoside. That is, BNA such as LNA is incorporated as a nucleotide into a nucleic acid chain containing a double-stranded nucleic acid complex.
  • the "wing region containing nucleotide analogs consisting of a plurality of nucleic acids” is 5'of the region consisting of a plurality of nucleic acids (hereinafter, also referred to as "DNA gap region”) containing at least four or more consecutive DNA nucleotides. It is located on the distal side and / or on the 3'end side.
  • a region containing a nucleotide analog located at the 5'end of the DNA gap region (hereinafter, also referred to as "5'wing region”) and a region containing a nucleotide analog located at the 3'end of the DNA gap region (hereinafter, ""
  • the 3'wing regions are independent of each other, and may contain at least one nucleotide analog listed in the literature on the antisense method, and other than the nucleotide analog, a natural type. Nucleic acid (DNA or RNA) may also be included.
  • the chain lengths of the 5'wing region and the 3'wing region are independently usually 1 to 10 bases, 1 to 7 bases, 1 to 5 bases, or 2 to 5 bases.
  • the type, number and position of nucleotide analog and natural nucleotides may affect the antisense effect exerted by the double-stranded nucleic acid complex in a certain embodiment. Therefore, the preferred embodiment may change depending on the arrangement or the like. Although it cannot be said unconditionally, a person skilled in the art can determine a preferable mode while taking into consideration the description of the literature relating to the antisense method. Further, the antisense effect of the modified double-stranded nucleic acid was measured in the same manner as in the region containing "at least four or more consecutive DNA nucleotides", and the obtained measured value was the double-stranded nucleic acid before modification. If it is not significantly lower than that of, the modification can be evaluated as a preferred embodiment.
  • the antisense strand of the IHH gene consisting of modified oligonucleotides against mRNA consists of a 5'wing site consisting of 1 to 10 bases, a gap region consisting of 8 to 25 bases, and 1 to 10 bases. It can consist of a 3'wing site consisting of the bases of.
  • the antisense strand can have a motif represented by 2-10-2, a motif represented by 3-10-3, and the like.
  • the first number of the motif represents the number of bases in the 5'wing region
  • the second number represents the number of bases in the gap region
  • the third number represents the number of bases in the 3'wing region. Represents the number of bases in.
  • the antisense method consisting only of RNA and LNA which has been tried in the past, suppressed translation by binding to the target mRNA, but the effect was generally insufficient.
  • the antisense method consisting only of DNA when it binds to the target gene, it has a double-stranded structure consisting of DNA and RNA. Although it was possible, the actual effect was still insufficient due to the weak binding to the target gene.
  • a DNA having a strand length of at least 4 bases or more is arranged in the center, and an LNA (or other BNA) having a strong binding ability to RNA (that is, a target transcript) is arranged at both ends.
  • LNA or other BNA
  • RNA that is, a target transcript
  • DNA having a strand length of 4 bases is not limited to DNA nucleotides, but includes at least four consecutive nucleotides recognized by RNase H when the first nucleic acid strand hybridizes to a transcript.
  • the first nucleic acid chain is also intended to be included.
  • At least four RNase Hs are recognized when the first nucleic acid strand hybridizes to the transcript, in view of the extremely high antisense effect produced by heteroduplex formation with the target transcript. It is desirable that the wing region containing the modified nucleic acid arranged on the 5'end side and the 3'end side of the region containing contiguous nucleotides optionally contains a nucleotide analog.
  • the nucleotide analog may be BNA, for example LNA.
  • the second nucleic acid strand in a certain embodiment is a nucleic acid complementary to the first nucleic acid strand described above.
  • the base sequence of the second nucleic acid chain and the base sequence of the first nucleic acid chain do not have to be completely complementary, and are at least 70% or more, preferably 80% or more, and more preferably 90% or more (for example, 90% or more). It suffices to have complementarity of 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or more).
  • the second nucleic acid strand is an oligobucreotide composed of at least one nucleic acid selected from the group consisting of RNA, DNA, PNA (peptide nucleic acid) and BNA (for example, LNA). More specifically, the second nucleic acid strand comprises (i) RNA nucleotides, optionally nucleotide analogs, optionally DNA nucleotides, (ii) DNA nucleotides and / or nucleotide analogs, or ( iii) Contains PNA nucleotides.
  • RNA nucleotides states that the second nucleic acid strand comprises RNA nucleotides and may further optionally contain nucleotide analogs, and further optionally DNA nucleotides. Means that it may contain.
  • DNA nucleotides and / or nucleotide analogs means that the second nucleic acid strand may contain either DNA nucleotides or nucleotide analogs, or may contain both DNA nucleotides and nucleotide analogs.
  • Constaining PNA nucleotides means that the second nucleic acid strand may be composed of PNA nucleotides.
  • the second nucleic acid strand contains RNA.
  • a functional molecule such as a peptide can be easily bound to the double-stranded nucleic acid complex in a certain embodiment, the second nucleic acid strand may be PNA.
  • RNA nucleotide means a naturally occurring RNA nucleotide or an RNA nucleotide in which a subunit of its base, sugar or phosphate bond is modified. Modification of a subunit of a base, sugar or phosphate bond is the addition of one substituent or the substitution of one within the subunit, not the substitution of the entire subunit with a different chemical group. ..
  • a part or all of the nucleic acid may be a modified nucleotide from the viewpoint of high resistance to a nucleic acid degrading enzyme such as an RNA degrading enzyme.
  • modifications include, for example, 5-methylation, 5-fluorolation, 5-bromolation, 5-iodolation, N4-methylation of cytosine, 5-demethylation of thymidine, 5-fluorolation, 5-.
  • RNA nucleotides in which the uracil base is replaced with a thymidine base, but phosphorothioatetization is used from the viewpoint of excellent pharmacokinetics.
  • modification may be applied to the same nucleic acid in combination of a plurality of types, and for example, as used in Examples described later, the same modification is provided in order to impart resistance to cleavage by an enzyme.
  • RNA may be phosphorothioated and 2'-O-methylated. However, if you expect or wish to cleave RNA nucleotides by RNase H, you can only perform either phosphorothioatetation or 2'-O-methylation.
  • the number and position of modifications may affect the antisense effect exerted by the double-stranded nucleic acid complex in a certain embodiment
  • the number and position of nucleotide analogs in the second nucleic acid strand may be a preferred embodiment. Exists. Since this preferred embodiment differs depending on the type, sequence, etc. of the nucleic acid to be modified, it cannot be said unconditionally, but like the first nucleic acid strand described above, the antisense effect of the modified double-stranded nucleic acid can be obtained. It can be identified by measuring.
  • RNaseH suppresses degradation by RNA-degrading enzymes such as RNaseA until the second nucleic acid strand is delivered into the nucleus of a specific cell, and the nucleic acid strand is produced by RNaseH in the specific cell.
  • the second nucleic acid strand is RNA, and the region containing the nucleotide analog of the first nucleic acid strand (that is, the 5'wing region and / or the region) from the viewpoint that the antisense effect is easily exerted by being decomposed.
  • the region complementary to the 3'wing region) is a modified nucleic acid or nucleotide analog, and the modified or analog has an effect of suppressing degradation by an enzyme such as RNA degrading enzyme.
  • the modification is 2'-O-methylation and / or phosphorothioatelation of RNA.
  • all of the regions complementary to the region containing the nucleotide analog of the first nucleic acid chain may be modified, and the region complementary to the region containing the modified nucleic acid of the first nucleic acid chain may be modified. Part of it may be modified. Further, the modified region may be longer or shorter than the region containing the modified nucleic acid of the first nucleic acid chain as long as the modified region is contained.
  • a functional portion may be bound to the second nucleic acid strand.
  • the bond between the second nucleic acid chain and the functional moiety may be a direct bond or an indirect bond via another substance, but in certain embodiments, a covalent bond, an ion. It is preferable that the second nucleic acid chain and the functional portion are directly bonded by a bond, a hydrogen bond, or the like, and a covalent bond is more preferable from the viewpoint of obtaining a more stable bond.
  • the structure of the "functional portion” is not particularly limited, and a desired function is imparted to the double-stranded nucleic acid complex and / or the nucleic acid strand that binds the "functional portion".
  • Desired functions include labeling function, purification function and delivery function to the target.
  • the portion that imparts the labeling function include compounds such as fluorescent protein and luciferase.
  • the portion that imparts the purification function include compounds such as biotin, avidin, His tag peptide, GST tag peptide, and FLAG tag peptide.
  • the second nucleic acid strand is used as a functional part. It is preferable that a molecule having an activity of delivering the double-stranded nucleic acid complex in a certain embodiment to the target site is bound.
  • Examples of the portion having the "delivery function to the target" include lipids from the viewpoint of being able to deliver the double-stranded nucleic acid complex in a certain embodiment with high specificity and efficiency to the liver and the like.
  • examples of such lipids include lipids such as cholesterol and fatty acids (for example, vitamin E (tocopherols and tocotrienols), vitamin A and vitamin D), fat-soluble vitamins such as vitamin K (for example, acylcarnitine), and acyl CoA.
  • examples of the "functional portion" in a certain embodiment include sugars (for example, glucose and sucrose).
  • examples of the "functional portion” in a certain embodiment include sugars (for example, glucose and sucrose).
  • a ligand or antibody of the receptor for example, a ligand or antibody of the receptor, And / or peptides or proteins such as fragments thereof are mentioned as "functional moieties" in certain embodiments.
  • the first nucleic acid chain, the second nucleic acid chain and the third nucleic acid chain can be prepared by appropriately selecting a method known to those skilled in the art.
  • a commercially available nucleic acid automatic synthesizer manufactured by Applied Biosystems
  • Nucleic acid can be prepared by synthesizing using (manufactured by Beckman, etc.) and then purifying the obtained oligonucleotide using a reverse phase column or the like. Then, the nucleic acids prepared in this manner are mixed in an appropriate buffer solution, denatured at about 90 to 98 ° C. for several minutes (for example, 5 minutes), and then about 30 to 70 ° C. Annealing over 1-8 hours can prepare the double-stranded nucleic acid complex in some embodiments. In addition, the double-stranded nucleic acid complex to which the functional moiety is bound can be prepared by synthesizing, purifying, and annealing as described above using a nucleic acid species to which the functional moiety is bound in advance. .. Many methods for binding functional moieties to nucleic acids are well known in the art.
  • the "second nucleic acid strand" targets the antisense nucleic acid at the target site without reducing the antisense effect. It is excellent in that it can be delivered efficiently. Therefore, the double-stranded nucleic acid in some embodiments is not limited to the above embodiment, and for example, an embodiment containing the following antisense nucleic acid can be provided instead of the above-mentioned first nucleic acid strand. ..
  • a double-stranded nucleic acid complex having an activity of suppressing the expression of a target gene by an antisense effect (i) an antisense nucleic acid complementary to a transcript of the target gene, and a nucleic acid containing no DNA.
  • the antisense nucleic acid has an RNase H independent antisense effect.
  • the "RNase H-independent antisense effect” is a splicing function such as translation inhibition and exon skipping by hybridizing a transcript (RNA sense strand) of a target gene with a nucleic acid strand complementary to its partial sequence. It means the activity of suppressing the expression of the target gene caused by the conversion effect.
  • DNA-free nucleic acid means an antisense nucleic acid that does not contain natural DNA and modified DNA, and examples thereof include nucleic acids consisting of PNA or morpholino nucleic acid. Further, in the "DNA-free nucleic acid", as with the first nucleic acid chain or the second nucleic acid chain, a part or all of the nucleic acid is a modified nucleotide from the viewpoint of high resistance to nucleic acid degrading enzyme. It may be configured. Examples of such modifications are as described above, and further, a plurality of types of modifications may be applied to the same nucleic acid in combination. In addition, a preferred embodiment regarding the number of modified nucleic acids and the position of modification can be specified by measuring the antisense effect of the modified double-stranded nucleic acid, as in the case of the first nucleic acid strand described above.
  • the base sequence of the "DNA-free nucleic acid” and the base sequence of the nucleic acid complementary to the nucleic acid or the base sequence of the transcript of the target gene need not be completely complementary, and are preferably at least 70% or more. May have complementarity of 80% or more, more preferably 90% or more (for example, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or more).
  • the chain length of the "DNA-free nucleic acid” is not particularly limited, but is usually 10 to 35 bases, preferably 12 to 25 bases, and more preferably 13 to 20 bases.
  • composition containing the double-stranded nucleic acid complex in some embodiments can be formulated by a known pharmaceutical method.
  • a known pharmaceutical method for example, capsules, tablets, pills, liquids, powders, granules, fine granules, film coatings, pellets, lozenges, sublinguals, chewing agents, buccal agents, pastes, syrups, suspending agents, As elixirs, emulsions, coatings, ointments, ointments, poultices, transdermal preparations, lotions, inhalants, aerosols, injections, suppositories, etc., enteral (oral, etc.) or non- It can be used transenterally.
  • lipoproteins such as chylomicrons and chylomicrons remnants are used in the double-stranded nucleic acid complex in some embodiments in which lipids are bound as functional portions during formulation. You may form a complex with.
  • a substance having an action of enhancing the permeability of the colonic mucosal epithelium for example, medium-chain fatty acid, long-chain unsaturated fatty acid or a derivative thereof (salt, ester)
  • it may be a complex (mixed micelle, emulsion) of a fatty acid ()) and a surfactant (nonionic surfactant, anionic surfactant).
  • the preferred administration form of the composition in some embodiments is not particularly limited, and is intrarectally (orally or the like) or non-enteric, more specifically, intravenous, intraarterial, or intraperitoneal administration. , Subcutaneous administration, intradermal administration, respiratory tract administration, rectal administration and intramuscular administration, and infusion administration.
  • compositions in some embodiments can be used for animals including humans, but are not particularly limited as non-human animals, and are intended for various livestock, poultry, pets, laboratory animals and the like. can do.
  • the dose or ingestion thereof depends on the age, weight, symptom, health condition, type of composition (medicine, food and drink, etc.) of the subject, and the like.
  • the effective intake of the composition according to an embodiment is preferably 0.001 mg / kg / day to 50 mg / kg / day in terms of nucleotides.
  • the present invention includes a therapeutic agent for fibrosis, which comprises an IHH gene-specific inhibitor or an inhibitor of a transcript of the IHH gene.
  • the expression of the COL1A1 gene, CTGF gene, and ADGRE1 is decreased, and the expression of the TGFB1 gene and CCL2 gene is increased.
  • Fibrosis in the liver includes fatty liver (fatty liver), alcoholic steatohepatitis (ASH), non-alcoholic steatohepatitis (ASH), non-alcoholic fatty liver disease (NAFLD), and non-alcoholic steatohepatitis (NAFLD).
  • Non-alcoholic steatohepatitis NASH
  • chronic hepatitis Chronic hepatitis
  • liver cirrhosis Liver cirrhosis
  • viral, autoimmune, biliary stagnation metabolic, congestive, drug-induced, infectious, etc.
  • the renal fibrosis means kidney fibrosis (Kidney fibrosis), renal systemic fibrosis (NSF), kidney fibroma (Kidney fibroma) and the like.
  • the fibrosis of the pancreas means cystic fibrosis (CF, cystic fibrosis) and the like.
  • Pulmonary fibrosis includes pulmonary fibrosis, interstitial pulmonary fibrosis, acute diffuse interstitial pulmonary fibrosis, and idiopathic pulmonary fibrosis. It means pulmonary fibrosis: IPF), etc.
  • Skin fibrosis includes skin fibrosis disease, scleroderma, systemic sclerroderma, localized scleroderma, and collagen disease. , Dermatofibroma, etc.
  • Example 1 Primary screening Obtained coding sequence information for each gene of human IHH and mouse IHH from the NCBI website (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/), and obtained human IHH and mouse IHH genes as shown in FIG. IHH gene coding sequence: NCBI Reference Sequence: NM_002181.3 (SEQ ID NO: 1), mouse IHH gene coding sequence: NCBI Reference Sequence: NM_010544.3 (SEQ ID NO: 2) based on the sequence (sense strand) of 55 of them. An antisense oligonucleotide (ASO) was designed. The sequence information is shown in Table 1.
  • mice IHH gene coding sequence In Table 1, the sequence in the human IHH gene coding sequence or the mouse IHH gene coding sequence is shown as a sense oligonucleotide, and the sequence complementary to the sequence is shown as an antisense oligonucleotide.
  • Mouse Hepa1-6 cell lines were seeded on a commercially available 24-well plate at 1 ⁇ 10 5 cells / ml / well and cultured in a CO 2 incubator for 24 hours. The next day, ASO (20 nM each) was transfected with Lipofectamine 2000 (Thermo Fisher Scientific) and cultured in a CO 2 incubator for 48 hours. Total RNA was extracted from each well of the 24-well plate after culturing using the RNeasy Mini Kit (QIAGEN).
  • the reverse transcription reaction and quantitative PCR used the Rotor Gene Probe RT-PCR Kit (QIAGEN), and the quantitative PCR device used the Rotor-Gene Q (QIAGEN).
  • the primers and probes for mouse IHH and mouse GAPDH used reagents designed by TaqMan Gene Expression Assays (Thermo Fisher Scientific), and the mRNA expression level was determined by measuring the Ct values of mouse IHH and mouse GAPDH, and then ⁇ Ct. Calculated by the relative quantitative method based on the method.
  • FIG. 3-1 shows the screening results of Ren-1-1 to -31
  • FIG. 3-2 shows the screening results of Ren-1-32 to -55.
  • PBS-1 to 8 are antisense nucleic acids used for negative control
  • APOB-1 to 2 are antisense nucleic acids used for positive control, and sequence information was obtained from the literature (Nat Communi. 2015 Aug 10; 6: 7969.).
  • FIGS. 3-1 and 3-2 a knockdown effect of 78% was confirmed in No. 12 (Ren-1-12) (FIGS. 3-1 and 3-2).
  • All the sequences listed in the Antisense column in the table contain phosphorothioate (PS) bonds between nucleotides.
  • the bases in bold are containing LNA modifications.
  • 3-8-3 in the Motif column consists of 3 LNA-modified nucleic acids-8 unmodified nucleic acids-3 LNA-modified nucleic acids (including PS modification between all nucleotides), for a total of 14 mer nucleic acid bases. Shows antisense nucleic acid.
  • Human / mouse in the Species specificity column indicates that it is an antisense nucleic acid that perfectly matches between human and mouse. Further, it is shown that mouse is an antisense nucleic acid that completely matches the mouse sequence but does not completely match the human sequence.
  • GC content was calculated based on the website (http://www.ngrl.co.jp/tools/0217oligocalc.htm).
  • the Tm value of the LNA-modified antisense nucleic acid was calculated based on the website (https://www.exiqon.com/ls/pages/exiqontmpredictiontool.aspx). Sequence information within the human and mouse coding regions was obtained from the NCBI website (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/).
  • Example 2 Calculation of IC50 value of IHH gene knockdown action of Ren-1-12 ASO
  • the IC50 value of IHH gene knockdown activity was obtained for Ren-1-12 which was hit in the screening of Example 1.
  • the experiment was basically performed in the same manner as in Example 1.
  • the IC50 value of knockdown action in Ren-1-12 was calculated to be 1.07 nM
  • the IC50 value of APOB ASO used as a control was calculated to be 2.52 nM (Fig. 4A, B).
  • the APOB sequence used this time is a sequence whose effectiveness has been confirmed in vivo in the literature information (Nat Commun. 2015 Aug 10; 6: 7969.).
  • Example 3 IHH gene knockdown effect of Toc-Ren-1-12 HDO in the liver To what extent the Ren-1-12 ASO hit in the screening of Example 1 exhibits a knockdown effect in the mouse liver was investigated. ..
  • HDO in which tocopherol (Toc) was added as a ligand to the sense strand was applied. Used (Table 2).
  • Toc-APOB HDO (Table 2) was used as a positive control.
  • the R Easy Mini Kit (QIAGEN) was used to extract Total RNA from mouse liver.
  • the reverse transcription reaction and quantitative PCR used the Rotor Gene Probe RT-PCR Kit (QIAGEN), and the quantitative PCR device used the Rotor-Gene Q (QIAGEN).
  • the primers and probes for mouse IHH and mouse 18S rRNA used reagents designed by TaqMan Gene Expression Assays (Thermo Fisher Scientific). The mRNA expression level was calculated by a relative quantification method based on the ⁇ Ct method after measuring each Ct value of mouse IHH and mouse 18S rRNA.
  • Toc-Ren-1-12 HDO When the IHH gene knockdown effect was examined 1, 3, and 7 days after a single iv administration of Toc-Ren-1-12 HDO and Toc-APOB HDO by the above method, Toc-Ren-1-12 was examined 7 days later. HDO showed almost the same knockdown effect as Toc-APOB HDO (Fig. 5). Since it has already been shown that Toc-APOB HDO can be used for efficacy evaluation in vivo (Nat Commun. 2015 Aug 10; 6: 7969.), Toc-Ren-1-12 HDO also has efficacy in vivo. It was shown to be a nucleic acid complex that could be fully used for evaluation.
  • Example 4 Secondary screening 36 new ASOs were designed based on Ren-1-12, which was a hit in the screening of Example 1.
  • the sequence of the sense chain of Ren-1-12 is the 598th to 611th bases (14 bases long) of the base sequence of SEQ ID NO: 1, whereas the start of the sequence is The site was shifted to the 603rd and 596th bases of the base sequence of SEQ ID NO: 1 and the base length was set to 13 to 20.
  • the results are shown in Table 3.
  • FIG. 6 shows the results of knockdown screening of the IHH gene for these 36 sequences (Ren-1-12-1 to -36) by the same method as in Example 1. From the results of the secondary screening, the three sequences Ren-1-12-22, 27, and 31 showed a particularly strong knockdown effect.
  • All the sequences listed in the Antisense column in the table contain phosphorothioate (PS) bonds between nucleotides.
  • the bases in bold are containing LNA modifications.
  • 3-8-3 in the Motif column consists of 3 LNA-modified nucleic acids-8 unmodified nucleic acids-3 LNA-modified nucleic acids (including PS modification between all nucleotides), for a total of 14 mer nucleic acid bases. Shows antisense nucleic acid.
  • Human / mouse in the Species specificity column indicates that it is an antisense nucleic acid that perfectly matches between human and mouse. Further, it is shown that mouse is an antisense nucleic acid that completely matches the mouse sequence but does not completely match the human sequence.
  • GC content was calculated based on the website (http://www.ngrl.co.jp/tools/0217oligocalc.htm).
  • the Tm value of the LNA-modified antisense nucleic acid was calculated based on the website (https://www.exiqon.com/ls/pages/exiqontmpredictiontool.aspx). Sequence information within the human and mouse coding regions was obtained from the NCBI website (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/).
  • Example 5 Comparison of IHH gene knockdown effect in liver when each HDO of Toc-Ren-1-12-22, -27, -31 was administered once iv to normal mice Selected in Example 4.
  • Toc-Ren-1-12-22, -27 in normal mice, in order to determine the sequence to be advanced to the drug efficacy evaluation in the NASH pathology model from the three sequences of Ren-1-12-22, -27, -31.
  • the knockdown effects of each of the -31 HDOs (Table 4) 3 days after a single iv administration at a dose of 10 nmol / kg were compared.
  • Ren-1-12-27 showed the strongest knockdown rate (48%) (Fig. 7). Based on the above results, we decided to use Ren-1-12-27 for drug efficacy evaluation in the NASH pathological model.
  • Example 6 Dose-dependent IHH gene knockdown effect in the liver when Toc-Ren-1-12-27 HDO was administered to normal mice in a single dose iv Toc showed the strongest knockdown effect in Example 5.
  • the IHH gene knockdown effect was investigated 3 days after a single iv administration of -Ren-1-12-27 HDO at 1, 3, 10, 30 nmol / kg.
  • Ren-1-12-27 showed a dose-dependent knockdown effect (55% inhibition at 3 nmol / kg, 57% inhibition at 10 nmol / kg, inhibition, 30 nmol). 72% suppression at / kg).
  • Example 7 Comparison of time-dependent changes in IHH gene knockdown action in the liver when Toc-Ren-1-12-27 HDO was administered to normal mice in a single dose. Comparison between Day 3 and Day 7 Toc-Ren in Example 5 The dose dependence of the knockdown effect of -1-12-27 HDO in the liver was evaluated 3 days after administration, and the knockdown effect of the IHH gene was further examined 7 days later. As a result, as shown in FIG. 9, it was shown that Ren-1-12-27 maintained a knockdown rate of about 60 to 70% from 3 days to 7 days after administration at a dose of 30 nmol / kg. .. Based on the above, when evaluating with the NASH pathological model, the dose of Ren-1-12-27 was set to 30 nmol / kg, and it was decided to administer once a week.
  • Example 8 Calculation of IC50 value of IHH gene knockdown effect by Ren-1 ASO in mouse Hepa 1-6 cells IC50 value was calculated for the top 19 ASOs showing strong knockdown effect found in Example 4. .. The results are shown in Table 5. In the secondary screening of Example 4, Ren-1-12-22, 27, 31 showed a particularly strong knockdown effect, but when the IC50 value was actually calculated, Ren-1-12-34 had the strongest IC50. The value is shown.
  • Example 9 Effect of Toc-Ren-1-12-27 HDO on IHH gene expression in NASH pathological model mice prepared with a methionine / choline deficient diet (MCD diet) 6-week-old female C57BL / 6J mice were produced by Charles Japan. I bought it from the river. The methionine / choline deficient diet (MCD diet) and control diet (normal diet) were purchased from Research Diet. First, C57BL / 6J mice were divided into the Vehicle (saline) -administered group (V group) and the Toc-Ren-1-12-27 HDO (30 nmol (0.3 mg) / kg) -administered group [I (IHH) group].
  • V group Vehicle (saline) -administered group
  • Toc-Ren-1-12-27 HDO 30 nmol (0.3 mg) / kg) -administered group [I (IHH) group.
  • mice used in this experiment were divided into the following four groups in total [(1) Vehicle-administered / Normal feed group (VN group), (2) Vehicle-administered / MCD feed group (VM group), (3) Toc- Ren-1-12-27 HDO (30 nmol (0.3 mg) / kg) administration / Normal feed group (IN group), (4) Toc-Ren-1-12-27 HDO (30 nmol (0.3 mg) / kg) ) Administration / MCD feed group (IM group)].
  • Feeding was started 1 week before the first administration (Day 0), and Vehicle and Toc-Ren-1-12-27 HDO were administered once a week from Day 0 for 5 weeks. Sampling was performed once a week, the body weight of the mice was measured, heparin blood was collected from the heart, liver tissue was collected, and then the liver weight was measured. Blood liver deviation enzyme (ALT) activity, blood triglyceride concentration, and blood cholesterol concentration were measured from serum samples.
  • ALT Blood liver deviation enzyme
  • the reverse transcription reaction was performed using PrimeScript (TM) RT Master Mix (TaKaRa Bio).
  • the quantitative PCR reaction was performed using Luna Universal qPCR Master Mix (NEB), and the quantitative PCR device used was StepOnePlus-01 (Thermo Fisher Scientific).
  • the TaqMan Gene Expression Assay reagent designed for each gene by Thermo Fisher Scientific was used.
  • the mRNA expression level was calculated by a relative quantification method based on the ⁇ Ct method after measuring each Ct value of each mouse gene and mouse 18S rRNA.
  • Statistical processing was performed using a three-factor analysis of variance (3-way ANOVA), and a significance level of less than 5% was considered significant.
  • Example 10 Effect of Toc-Ren-1-12-27 HDO on inflammatory marker gene (TNFA and CCL2) expression in NASH pathological model mice prepared with MCD diet Vehicle or in NASH pathological model mice prepared with MCD diet
  • TNFA and CCL2 inflammatory marker gene
  • Example 11 Effect of Toc-Ren-1-12-27 HDO on macrophage marker (ADGRE1) gene expression in NASH pathological model mice prepared with MCD diet Vehicle or Toc- As a result of investigating the effect on ADGRE1 gene expression in mice treated with Ren-1-12-27 HDO once a week for 5 weeks, as shown in FIG. 12, the expression of ADGRE1 tends to decrease as of Day 14. Indicated.
  • Example 12 Effect of Toc-Ren-1-12-27 HDO fibrosis marker (COL1A1, CTGF, TGFB1, TIMP, ACTA2) gene expression in NASH pathological model mice prepared with MCD feed. Investigate the effect on fibrosis marker (COL1A1, CTGF, TGFB1, TIMP, ACTA2) gene expression in mice treated with Vehicle or Toc-Ren-1-12-27 HDO once a week for 5 weeks in NASH pathological model mice. It was. As a result, as shown in FIG. 13-1A, the expression of the COL1A1 gene was significantly increased at the time of Day 7, and the expression of the COL1A1 gene was significantly decreased at the time of Day 35 (P ⁇ 0.05).
  • CTGF CTGF
  • TGFB1 TIMP and ACTA2 did not tend to decrease over the entire period.
  • Example 13 Effect of Toc-Ren-1-12-27 HDO on blood liver deviation enzyme (ALT) activity in NASH pathological model mice prepared with MCD feed Vehicle or in NASH pathological model mice prepared with MCD feed
  • ALT activity was significantly increased in the VM group (P ⁇ 0.0001).
  • Example 14 Effect of Toc-Ren-1-12-27 HDO on body weight and liver weight in NASH pathological model mice prepared with MCD diet Vehicle or Toc-Ren-1 in NASH pathological model mice prepared with MCD diet As a result of investigating the effect of -12-27 HDO on body weight and liver weight in mice administered once a week for 5 weeks, as shown in FIGS. 15A and 15B, body weight and liver in the VM group as compared with the VN group. Weight was significantly reduced (P ⁇ 0.0001). The effects of vehicle or Toc-Ren-1-12-27 HDO on body weight and liver weight of mice administered with vehicle or Toc-Ren-1-12-27 HDO once a week for 6 weeks to NASH pathological model mice prepared with MCD diet are shown in FIG. As described above, the body weight and liver weight were significantly reduced in the VM group as compared with the VN group (both P ⁇ 0.0001). At this time, no significant change was confirmed between the VM group and the IM group.
  • Example 15 Effect of Toc-Ren-1-12-27 HDO on blood triglyceride concentration and blood cholesterol concentration in NASH pathological model mice prepared with MCD diet Vehicle or in NASH pathological model mice prepared with MCD diet The effects of Toc-Ren-1-12-27 HDO on blood triglyceride concentration and blood cholesterol concentration in mice treated once a week for 5 weeks were investigated. As a result, as shown in FIGS. 16A and 16B, the blood triglyceride concentration and the blood cholesterol concentration were significantly reduced in the VM group as compared with the VN group (both P ⁇ 0.0001). At this time, no significant change in blood triglyceride concentration was confirmed between the VM group and the IM group, but the blood cholesterol concentration increased significantly (P ⁇ 0.05).
  • IHH mRNA expression was expressed by administering Toc-Ren-1-12-27 HDO (30 nmol (0.3 mg) / kg) once a week for 5 weeks to NASH pathological model mice prepared with MCD diet. It was shown that the expression of COL1A1 mRNA, which is a typical fibrosis marker, was significantly reduced (P ⁇ 0.05). Therefore, it was verified that Toc-Ren-1-12-27 HDO is a compound that can be a therapeutic agent for NASH.
  • Example 16 Third screening 37 ASOs (Ren-1-2, Ren-1-3, Ren-1-4, Ren-1-5, Ren-1) used in Examples 1 and 4 -6, Ren-1-7, Ren-1-9, Ren-1-11, Ren-1-12, Ren-1-12-13, Ren-1-12-27, Ren-1-14, Ren -1-15, Ren-1-16, Ren-1-17, Ren-1-18, Ren-1-19, Ren-1-23, Ren-1-24, Ren-1-25, Ren-1 -26, Ren-1-28, Ren-1-29, Ren-1-33, Ren-1-35, Ren-1-36, Ren-1-37, Ren-1-38, Ren-1-39 , Ren-1-40, Ren-1-41, Ren-1-43, Ren-1-44, Ren-1-48, Ren-1-47, Ren-1-49, Ren-1-50) and PBS as a negative control and antisense nucleic acid of APOB gene as a positive control were screened again at a nucleic acid concentration of 50 nM different from that of Examples 1 and 4.
  • the screening method was the same as in Example 1 and Example 4 except that the nucleic acid concentration of
  • Example 17 Knockdown activity of Ren-1-12-27, Ren-1-11, Ren-1-39, Ren-1-41 on IHH gene expression in normal mouse liver This experiment is newly performed in vitro schooling. Using four ASOs (Ren-1-12-27, Ren-1-11, Ren-1-39, Ren-1-41) that showed a strong knockdown effect on IHH gene expression, in The knockdown activity in vivo was examined. Twenty-five 6-week-old normal mice (c57BL / 6j) were divided into 5 groups (Vehicle, Ren-1-12-27, Ren-1-11, Ren-1-39, Ren-1-41) according to body weight. .. Knockdown activity was compared with positive control Ren-1-12-27 (17 mer) and negative control Vehicle administration group.
  • the dose of ASO was set to 30 nmol / 10 ml / kg and administered from the tail vein of mice (the administration day was set to Day 0).
  • the mice underwent intracardiac blood sampling under isoflurane anesthesia, the abdomen was opened, and the liver was removed.
  • Total mRNA was extracted from liver tissue, reverse transcription and qPCR were performed, and the expression of IHH mRNA was measured. The results are shown in FIG.
  • Ren-1-41-administered group Compared with the Vehicle-administered group, the IHH mRNA expression of any Ren-1 ASO-administered group was decreased. Ren-1-11 and Ren-1-39 showed the same level of knockdown activity as Ren-1-12-27 (20%). The IHH mRNA expression in the Ren-1-41-administered group was reduced by about half (53%) as compared with the Vehicle-administered group, and was significantly knocked down.
  • Example 18 Effect of Toc-Ren-1-12-27 on mouse NASH / liver fibrosis by MCD diet 6-week-old mice were divided into a Normal Diet group and an MCD (Methionine and Choline Deficient) Diet group, and MCD Diet A model of NASH / liver fibrosis was created.
  • MCD Methionine and Choline Deficient
  • FIG. 19 shows a HE-stained diagram of liver tissue 5 weeks after administration of Ren1-12-27.
  • the Vehicle-administered group as compared with the Normal Diet group (Fig. 19a), the collection of inflammatory cells showed more hepatic lipid droplets and balloon-like changes due to MCD Diet administration (Fig. 19c) (inside the black circle).
  • FIG. 20 shows an Oil red O staining diagram of liver tissue 5 weeks after administration of Ren1-12-27.
  • the Vehicle-administered group more fatty degeneration of hepatic tissue cells was observed in the MCD Diet administration (Fig. 20 g) than in the Normal Diet group (Fig. 20e) (stained in red by Oil red O staining).
  • Fig. 20 g MCD Diet administration
  • Fig. 20e Normal Diet group
  • many lipid droplet vacuoles were observed.
  • FIG. 21 shows a Sirius-stained diagram of liver tissue 5 weeks after administration of Ren-1-12-27.
  • liver fibrosis due to MCD Diet (Fig. 21k) was not observed compared to the Normal Diet group (Fig. 21i) because the observation period was short.
  • MCD Diet group no significant change was observed in the collagen staining of the Ren-1HDO administration group (Fig. 21l) as compared with the Vehicle administration group (Fig. 21k).
  • Table 6 shows the judgment results of NAFLD activity score * (NAS).
  • NAS NAFLD activity score *
  • Ren-1 HDO administration was found to have a therapeutic effect on fatty liver formation and infiltration of inflammatory cells by MCD Diet.
  • the fibrosis stage of each administration group was 0 to 1A, and no significant difference was observed.
  • NAFLD nonalcoholic fatty liver disease
  • NASH nonalcoholic steatohepatitis
  • NAS NAFLD activity score
  • Kleiner DE1 Brunt EM, Van Natta M, et al., Design and validation of a histological scoring system for nonalcoholic fatty liver disease. Hepatology. 2005 Jun; 41 (6): 1313-21.
  • Example 19 Effect of suppressing IHH mRNA expression by Ren-1-12-27 in normal mouse-derived pulmonary fibroblasts (MPF) Normal mouse pulmonary fibroblasts [Mouse pulmonary fibroblasts, MPF: Cat No. M3300-57] , Purchased from ScienCell Research Laboratories. An experiment to investigate the inhibitory effect of Ren-1-12-27 on IHH mRNA expression using MPF was carried out by the following method.
  • FIG. 22 shows the results of examining the effect of Ren-1-12-27ASO on suppressing IHH mRNA expression in MPF by this method.
  • Example 20 Effect of suppressing IHH mRNA expression by Ren-1-12-27 in normal mouse-derived skin fibroblasts (MDF) Normal mouse skin fibroblasts [Mouse dermal fibroblasts, MDF: Cat No. M2300-57] , Purchased from ScienCell Research Laboratories.
  • MDF normal mouse-derived skin fibroblasts
  • MDF normal mouse skin fibroblasts
  • the experiment for investigating the inhibitory effect of Ren-1-12-27 on IHH mRNA expression using MDF was carried out in the same manner as in Example 19 as follows. That is, 1 ⁇ 10 5 cells / well on a 24-well plate for adhering cell culture in which MDF previously cultured in a special medium (Fibroblast Medium-2, Cat. # 2331) was pre-coated with PLL.
  • FIG. 23 shows the results of investigating the effect of Ren-1-12-27ASO on suppressing IHH mRNA expression in MDF by such a method.
  • Example 21 Effect of suppressing IHH mRNA expression by Ren-1-12-27 on TGF-beta1-stimulated normal mouse-derived renal tubular epithelial cells
  • MRPTEC Cat No. M4100
  • An experiment to investigate the inhibitory effect of Ren-1-12-27 on IHH mRNA expression using MRPTEC was carried out by the following method. That is, 1 ⁇ 10 4 cells / well on a 24-well plate for adhering cell culture coated with MRPTEC previously cultured in a special medium (Epithelial Cell Medium-animal, Cat. # 4131 NZ).
  • FIG. 24 shows the results of investigating the inhibitory effect of Ren-1-12-27ASO on IHH mRNA expression in MRPTEC when stimulated with TGF-beta1 by the above method.
  • the nucleic acid complex of the present invention is useful as a therapeutic agent for fibrosis.

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Abstract

動物におけるIHH遺伝子のmRNA及びタンパク質の発現を低減させるための核酸複合体及び方法の提供。　IHH遺伝子のmRNA及びタンパク質の発現を低減させるための核酸複合体は、IHH遺伝子特異的な阻害剤として働くためIHH遺伝子の機能解明に有用である。また、IHH遺伝子特異的な阻害剤は、繊維症、線維化疾患の治療、予防、改善又はその進行の遅延に有用である。本発明の核酸複合体は、IHH遺伝子の発現を特異的に阻害するため、繊維症、線維化疾患の治療、予防、改善又はその進行の遅延を、必要とする患者において行うことに有用である。

Description

ＩＨＨ発現を調節するための核酸複合体
　本発明は、Indian hedgehog遺伝子(以下、IHH遺伝子）の発現を調節するためのヘテロ２重鎖核酸（Hetero duplex oligonucleotide, HDO）を含む核酸複合体に関する。また、本発明は、IHH遺伝子特異的な阻害剤に関する。また、本発明は、IHH遺伝子の転写産物の阻害剤を含む繊維症の治療薬に関する。
　ヘッジホッグは、胚発生中の前駆細胞の運命及び組織構築を制御する形態形成シグナル伝達経路であり、成人における肝臓損傷の間にヘッジホッグの再活性化が生じる。ヘッジホッグ（Hh）は、増殖、アポトーシス、移動及び分化を含む重要な細胞運命の決定を制御するシグナル伝達経路であり、肝臓を含む成体組織の数は創傷治癒応答、調節を行う（非特許文献１）。
　肝臓の線維化は、過剰な細胞外マトリックス（ECM: Extracellular matrix）沈着を特徴とする。これに関与する主要な細胞型の1つは、肝星状細胞（HSC：Hepatic Stem Cell）である。ECMは、細胞増殖、遊走及び分化を促進するタンパク質の複雑な混合物を含む。そのような役割を持つ1つのECM構成要素は、分泌型リンタンパク質1としても知られているマトリゲル糖リンタンパク質、オステオポンチン（OPN:Osteopontin）である（非特許文献２）。
　肝星状細胞（HSC：Hepatic Stem Cell）は、肝線維症において重要な役割を果たす。HSCにおけるIhh、Smo、Ptc、Gli2及びGli3のヘッジホッグシグナル伝達成分の発現は、Ihh、Smo及びGli2を標的とするヘッジホッグsiRNAベクターを構築し、それぞれHSCにトランスフェクトした結果、それぞれの標的遺伝子発現が減少した。HSC活性化及びコラーゲン分泌は、ヘッジホッグシグナリングによって調節され得ることが解った（非特許文献３）。
　非アルコール性脂肪肝炎（NASH：Nonalcoholic steatohepatitis)は、世界中の肝臓病の主要な原因である。しかしながら、良性脂肪症がどのようにNASHに進行するかの分子的根拠は不完全に理解されており、治療標的の同定は制限されている。転写調節因子TAZ（WWTR1）は、ヒト及びネズミのNASH肝臓において正常な肝臓若しくは脂肪肝よりも顕著に高い。さらに、脂肪細胞でTAZ因子の発現を促進した結果、繊維症を含むNASHの特徴が増加した。重要なこととして、NASHのマウスモデルにおける肝細胞のTAZのサイレンシングは、肝炎、肝細胞死及び線維症を防止又は逆転させたが、脂肪症は予防又は逆転しなかった。これらのことから、TAZ因子は、脂肪症、NASH進行への重要な過程に寄与する因子であることが判明した（非特許文献４）。
　しかしながら、これら肝臓病の病原性過程及びそれらの統合に対応する分子機構はまだほとんど解明されていません。非特許文献２、３は、肝星状細胞（HSC）の活性化がNASH線維症において重要な役割を果たすことを示している。NASHにおいて、HSCを活性化するための多くの要因が提案されているが、この分野の研究はまだ完全ではなく、FDA承認の治療戦略にも至っていない（非特許文献５）。
Tabas et al. WO2017/184586 (PCT/US2017/028109)
Alessia Omenetti et al., J Hepatol., 54(2): 366-373 (2011) James Pritchett et al., HEPATOLOGY, Vol. 56, No. 3, 1108-1116(2012) Tao Li et al., Int J Clin Exp Pathol, 8(11):14574-14579 (2015) Angulo P. et al. Semin Liver Dis. 35(2):132-45（2015） Wang X. et al., Cell Metabolism 24: 848-862 (2016)
　線維症の治療薬は、ステロイド等の抗生物質からなる治療薬、例えば特発性肺線維症（IPF：（Idiopathic Pulmonary Fibrosis）の治療薬であるピルフェニドン（Pirfenidone）、ニンテダニブ（Nintedanib）などがある。
　ピルフェニドンは抗線維化薬である。主要な作用機序は，transforming growth factor-β（TGF-β）の産生抑制である。TGF-βは、2型肺胞上皮細胞が線維芽細胞・筋線維芽細胞に分化する「上皮間葉転換」という事象を制御して線維化を促進する。ピルフェニドンはその経路を遮断することで、抗線維化効果を発揮する。その他、basic-fibroblast growth factor（b-FGF）、stroma cell derived factor-1α（SDF-1α）、interferon-γ（IFN-γ）など線維化や炎症に関連する因子を抑制するメカニズムが知られる。
　ニンテダニブは抗線維化薬である。小分子のチロシンキナーゼ阻害薬の一つで、血管内皮細胞増殖因子受容体１－３型（VEGFR：vascular endothelial growth factor receptor）、線維芽細胞増殖因子受容体（FGFR：fibroblast growth factor receptor）、血小板由来成長因子受容体（PDGFR：platelet derived growth factor receptor）に作用する。当初は固形がん治療薬として開発された薬剤であるが、線維芽細胞の増殖抑制作用・線維化予防効果を見出されたことから、IPFの治療薬として臨床応用された。
　これらの低分子化合物からなる線維化治療薬は存在するが、新たな作用機序を有する治療薬が求められている。
　従来はまだIHH遺伝子の阻害剤が、繊維症の治療に用いられることは無く、示唆すらされていない。
　IHHタンパク質はヘッジホッグファミリーに属する分泌タンパクである。IHH遺伝子のイントロン１に転写因子TAZの結合領域があり、この領域を介してIHH遺伝子の発現は転写因子TAZにより正に制御される（特許文献１、非特許文献４）。
　本発明者らは、TAZはNASH線維化の増悪因子であり、IHH遺伝子はその増悪作用を仲介するだろうと考えた。さらに発明者らは、IHH遺伝子は肝細胞から分泌され、肝星細胞を活性化すると共に、活性化星細胞からもIHH遺伝子が分泌される一成分であることから、線維化の病態ではIHH遺伝子のオートクラインやパラクライン作用が亢進することでさらに病態が進行するだろうと考えた。ヘッジホッグファミリーが肝臓の線維化に関連する病態進展に関与している可能性が示唆されていることから、ヘッジホッグファミリーの一つであるIHH遺伝子の阻害剤は、IHH遺伝子の機能解明に有用であり、線維化の病態の進行を抑制もしくは遅延させることが期待できる。さらに、IHH遺伝子の阻害剤は、肝臓に限らず、腎臓、肺、皮膚等の組織及び臓器における炎症性疾患や線維化疾患の治療、予防、改善又はその進行の抑制もしくは遅延に有用である。
　本発明は、IHH遺伝子の阻害剤を提供することを解決すべき課題とする。IHH遺伝子の阻害剤としてIHH遺伝子の発現を調節するヘテロ２重鎖核酸（HDO）を含む核酸複合体を提供することを解決すべき課題とする。
　発明者らは、動物における線維化に関連する遺伝子について研究を進めた結果、新たな遺伝子としてIHH遺伝子が線維化に関与していることを見出した。本発明では、IHH遺伝子の転写産物であるmRNA及びタンパク質の発現を低減させるための核酸複合体、すなわちIHH遺伝子の阻害剤及びIHH遺伝子の発現を阻害する方法が課題を解決する手段として開示される。
　そのようなIHH遺伝子の阻害剤は、繊維症、線維化疾患の治療、予防、改善又はその進行の遅延を、必要とする患者において行うことに有用である。
　すなわち、本発明は以下の通りである。
[１]　１２～３０のヌクレオチドからなるオリゴヌクレオチドを含み、当該オリゴヌクレオチドがIHH遺伝子転写産物に対して相補的である核酸塩基配列を有する核酸複合体。
[２]　前記オリゴヌクレオチドは一本鎖オリゴヌクレオチドである[１]の核酸複合体。
[３]　前記オリゴヌクレオチドからなるアンチセンス鎖と、前記アンチセンス鎖に相補的である核酸鎖からなるヘテロ２重鎖核酸である[１]の核酸複合体。
[４]　前記オリゴヌクレオチドが少なくとも１つの修飾ヌクレオチドを含む、[１]～[３]のいずれかの核酸複合体。
[５]　前記オリゴヌクレオチドが少なくとも１つのホスホロチオエートオリゴヌクレオチドを含む、[１]～[４]のいずれかの核酸複合体。
[６]　前記オリゴヌクレオチドが少なくとも１つのホスホジエステルオリゴヌクレオレオチドを含む、[１]～[５]の核酸複合体。
[７]　前記オリゴヌクレオチドがホスホロチオエートオリゴヌクレオチドである、[５]に記載の核酸複合体。
[８]　前記オリゴヌクレオチドが修飾核酸塩基を含む、[１]～[７]のいずれかの核酸複合体。
[９]　前記修飾核酸塩基が５－メチルシトシン、２’－MOE、BNA、LNA若しくはAmNAである、[８]に記載の核酸複合体。
[１０]　前記アンチセンス鎖に相補的である核酸鎖がRNAであることを特徴とする[３]～[９]のいずれかの核酸複合体。
[１１]　前記オリゴヌクレオチドが：
複数の核酸からなるギャップ領域；
複数の核酸からなる５’ウイング領域；
複数の核酸からなる３’ウイング領域；
を含むことを特徴とする[１]～[１０]のいずれかの核酸複合体。
[１２]　前記オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、配列番号１又は配列番号２に表すIHH遺伝子配列中の連続する１２～３０のヌクレオチドからなるオリゴヌクレオチドに相補的な塩基配列からなる、[１]～[１１]のいずれかの核酸複合体。
[１３]　前記オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、配列番号４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、５０、５２、５４、５６、５８、６０、６２、６４、６６、６８、７０、７２、７４、７６、７８、８０、８２、８４、８６、８８、９０、９２、９４、９６、９８、１００、１０２、１０４、１０６、１０８、１１０及び１１２の何れかの配列からなる、[１２]に記載の核酸複合体。
[１４]　前記オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、配列番号２６の配列からなる、[１３]に記載の核酸複合体。
[１５]　前記オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、配列番号１１８、１２０、１２２、１２４、１２６、１２８、１３０、１３２、１３４、１３６、１３８、１４０、１４２、１４４、１４６、１４８、１５０、１５２、１５４、１５６、１５８、１６０、１６２、１６４、１６６、１６８、１７０、１７２、１７４、１７６、１７８、１８０、１８２、１８４、１８６及び１８８の何れかの配列からなる、[１]～[１１]のいずれかの核酸複合体。
[１６]　前記オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、配列番号１６０、１７０又は１７８の配列からなる、[１５]に記載の核酸複合体。
[１７]　[１]～[１６]のいずれかの核酸複合体を含む、IHH特異的な阻害剤を含む医薬組成物。
[１８]　[１]に記載の核酸複合体を含む、IHH特異的な阻害剤を含む線維症の治療薬。
[１９]　[１]～[１６]のいずれかの核酸複合体を含む、IHH特異的な阻害剤を含むＮａｓｈの治療薬。
[２０]　[１]～[１６]のいずれかの核酸複合体を含む、IHH特異的な阻害剤を含む肝臓の線維症の治療薬。
[２１]　[１]～[１６]のいずれかの核酸複合体を含む、IHH特異的な阻害剤を含む腎臓の線維症の治療薬。
[２２]　[１]～[１６]のいずれかの核酸複合体を含む、IHH特異的な阻害剤を含む膵臓の線維症の治療薬。
[２３]　[１]～[１６]のいずれかの核酸複合体を含む、IHH特異的な阻害剤を含む肺の線維症の治療薬。
[２４]　[１]～[１６]のいずれかの核酸複合体を含む、IHH特異的な阻害剤を含む皮膚の線維症の治療薬。
[２５]　１２～３０のオリゴヌクレオチドを含み、配列番号１～５０の核酸塩基配列のいずれかの、少なくとも８の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する核酸複合体。
　本明細書は本願の優先権の基礎となる日本国特許出願番号2019-047703号の開示内容を包含する。
　本発明の１２～３０のヌクレオチドからなるオリゴヌクレオチドを含み、当該オリゴヌクレオチドがIHH遺伝子転写産物に対して相補的である核酸塩基配列を有する核酸複合体は、IHH遺伝子の発現を阻害することができ、線維症の治療に用いることができる。
HDOの構造を示す図である。 ヒトIHH遺伝子coding配列式を示す図である。 マウスIHH遺伝子coding配列式を示す図である。 ヒト及びマウスIHH遺伝子coding配列からの1次スクリーニングを示すグラフである（Ren-1-1～-31）。 ヒト及びマウスIHH遺伝子coding配列からの1次スクリーニングを示すグラフである（Ren-1-32～-55）。 Ren-1-12 ASOのノックダウン作用のIC50値の算出を示すグラフである。 マウスにおけるToc-Ren-1-12 HDO単回投与後のIHH遺伝子ノックダウン作用を示すグラフである。 Ren-1-12の周辺配列における２次スクリーニングを示すグラフである。 正常マウスにToc-Ren-1-12-22, -27, -31の各HDOを単回i.v.投与したときの肝臓におけるIHH遺伝子ノックダウン作用を示すグラフである。 正常マウスにToc-Ren-1-12-27 HDOを単回i.v.投与したときの肝臓におけるIHH遺伝子ノックダウン作用の用量依存性を示すグラフである。 正常マウスにToc-Ren-1-12-27 HDOを単回i.v.投与したときの肝臓におけるIHH遺伝子ノックダウン作用のDay3とDay7における経時変化を示すグラフである。 メチオニン・コリン欠乏飼料（MCD飼料）により作製したNASH病態モデルマウスにおけるToc-Ren-1-12-27 HDOのIHH遺伝子発現に及ぼす影響を示す図である。 MCD飼料により作製したNASH病態モデルマウスにおけるToc-Ren-1-12-27 HDOの炎症マーカー（A: TNFA及びB: CCL2）遺伝子発現に及ぼす影響を示す図である。 MCD飼料により作製したNASH病態モデルマウスにおけるToc-Ren-1-12-27 HDOのマクロファージマーカー（ADGRE1）遺伝子発現に及ぼす影響を示す図である。 MCD飼料により作製したNASH病態モデルマウスにおけるToc-Ren-1-12-27 HDOの線維化マーカー（A: COL1A1, B: CTGF）遺伝子発現に及ぼす影響を示す図である。 MCD飼料により作製したNASH病態モデルマウスにおけるToc-Ren-1-12-27 HDOの線維化マーカー（A: TGFB1, B: TIMP）遺伝子発現に及ぼす影響を示す図である。 MCD飼料により作製したNASH病態モデルマウスにおけるToc-Ren-1-12-27 HDOの線維化マーカー（ACTA2）遺伝子発現に及ぼす影響を示す図である。 MCD飼料により作製したNASH病態モデルマウスにおけるToc-Ren-1-12-27 HDOの血中肝臓逸脱酵素（ALT）活性に及ぼす影響を示す図である。 MCD飼料により作製したNASH病態モデルマウスにおけるToc-Ren-1-12-27 HDOの体重(A)及び肝重量(B)に及ぼす影響を示す図である。 MCD飼料により作製したNASH病態モデルマウスにおけるToc-Ren-1-12-27 HDOの血中トリグリセライド濃度(A)及び血中コレステロール濃度(B)に及ぼす影響を示す図である。 実施例１、実施例４で使用した３７本のASOの３次スクリーニングの結果を示す図である。 正常マウス肝臓のIHH　mRNA発現に対するRen1 ASOのノックダウン活性を示す図である。＊Vehicle投与群に比べ：p＜0.05 NASH病態モデルマウスに対するToc-Ren-1-12-27の影響を示すマウス肝臓組織図（hematoxylin and eosin染色）である。aはNormal Diet＋Vehicle投与群、bはNormal Diet＋HDO投与群、cはMCD Diet＋Vehicle投与群、dはMCD Diet＋HDO投与群の肝臓組織図を示す。図中、Cは中心静脈を示し、Gはグリソン鞘を示し、〇は炎症細胞集簇を示し、矢印（→）は脂肪滴を示す。 Ren1-12-27投与5週間後のNASH病態モデルマウスの肝臓組織図（Oil red O染色）である。eはNormal Diet＋Vehicle投与群、fはNormal Diet＋HDO投与群、gはMCD Diet＋Vehicle投与群、hはMCD Diet＋HDO投与群を示す。図中、Cは中心静脈を示し、Gは グリソン鞘を示し、矢印（←）は脂肪滴を示す。 Ren1-12-27投与5週間後のNASH病態モデルマウスの肝臓組織図（Sirius染色）である。iはNormal Diet＋Vehicle投与群、jはNormal Diet＋HDO投与群、kはMCD Diet＋Vehicle投与群、lはMCD Diet＋HDO投与群を示す。図中、Cは中心静脈を示し、Gはグリソン鞘を示し、矢印（↑）はコラーゲン線維を示す。 正常マウス由来肺線維芽細胞（MPF）におけるRen-1-12-27によるIHH　mRNA発現抑制効果を示す図である。AはIHH　mRNAの発現抑制効果を示し、BはMalat-1 mRNAの発現抑制効果（ポジティブコントロール）を示す。 正常マウス由来皮膚線維芽細胞（MDF）におけるRen-1-12-27によるIHH　mRNA発現抑制効果を示す図である。AはIHH　mRNAの発現抑制効果を示し、BはMalat-1 mRNAの発現抑制効果（ポジティブコントロール）を示す。 TGF-beta1刺激した正常マウス由来腎尿細管上皮細胞（MRPTEC）におけるRen-1-12-27によるIHH　mRNA発現抑制効果を示す図である。
　以下、本発明を詳細に説明する。
　本発明は、１２～３０のヌクレオチドからなるオリゴヌクレオチドを含み、当該オリゴヌクレオチドがIHH（Indian hedgehog）遺伝子の転写産物に対して相補的である核酸塩基配列を有する核酸複合体である。IHH遺伝子の転写産物に対して相補的である核酸塩基配列を有する核酸はIHH遺伝子の転写産物に対してアンチセンス核酸として作用する。すなわち、IHH遺伝子の特異的な阻害剤として作用し、標的遺伝子であるIHH遺伝子の発現、又は通常転写産物レベルをアンチセンス効果によって抑制する活性を有する。
　IHH遺伝子の転写産物とは、IHH遺伝子をコードするゲノムDNAから転写されたmRNAのことであり、塩基の修飾を受けていないmRNAや、スプライシングを受けていないmRNA前駆体等も含まれる。通常、「転写産物」は、DNA依存性RNAポリメラーゼによって合成される、いかなるRNAであってもよい。
　特定の実施形態において、核酸複合体のオリゴヌクレオチドは一本鎖オリゴヌクレオチドである。つまり、一本鎖アンチセンスオリゴヌクレオチド（ASO: antisense oligonucleotide）である。
　また、特定の実施形態において、核酸複合体は、オリゴヌクレオチドからなるアンチセンス鎖と、前記アンチセンス鎖に相補的である核酸鎖であるセンス鎖からなるヘテロ２重鎖核酸（HDO：Heteroduplex oligonucleotide）であり、アンチセンス鎖がセンス鎖核酸鎖にアニーリングしている。アンチセンス鎖を第１の核酸鎖と呼び、センス鎖を第２の核酸鎖と呼ぶことがある。このような核酸複合体を２重鎖核酸複合体という。
　また、特定の実施形態において、核酸複合体は、製造時は一本鎖のオリゴヌクレオチドであって、DNAヌクレオチド若しくはDNAヌクレオチドアナログからなるアンチセンス鎖と、３～１０ヌクレオチドからなるリンカー部分と、前記アンチセンス鎖に相補的であるRNAヌクレオチド若しくはRNAヌクレオチドアナログからなるセンス鎖を含む構造であってもよい。この構造の核酸複合体は一本鎖ヘテロ二本鎖(single stranded heteroduplex oligonucleotide：ss-HDO)と言われるものであり、例えば、WO2017/131124A1に記載されているX－L－Yの構造からなるオリゴヌクレオチドである。Xはアンチセンス鎖で、Yはアンチセンス鎖に対する相補鎖で、Lがリンカーの役割をするヌクレオチドからなる。この一本鎖オリゴヌクレオチドを医薬組成物として用いる際は、生理食塩水や水性注射剤、非水性注射剤、懸濁性注射剤、固形注射剤等に用いられる溶媒若しくは血液または血漿中でアンチセンス鎖と、アンチセンス鎖に対する相補鎖がリンカーを支点として一分子アニーリングして２重鎖構造をとる。このような核酸複合体は、医薬組成物として作用するときは一分子アニーリングして２重鎖構造をとるため、２重鎖核酸複合体の一つである。
　本発明のIHH遺伝子特異的な阻害剤を含む医薬組成物を実施するためのヘテロ２重鎖核酸（HDO）の基本的な形態は以下に述べるものである。すなわち、HDOは活性本体であるDNAで構成されるアンチセンス鎖（Active鎖）と、それと相補的な配列を有するRNAで主に構成されるセンス鎖（Carrier鎖）との2本鎖で構成される（図1）。さらにHDOはそのセンス鎖にリガンド構造を含むことを特徴とする。このような形態を持つことによりIHH遺伝子特異的な阻害剤を含む医薬組成物はヒトにおける血中での安定性が高く、リガンドの性能に応じた標的組織に効率よくデリバリーされる。HDOが細胞内に送達された後にはRNase Hにより速やかにRNA鎖が除かれる。そこでフリーになったDNA鎖とmRNAとの間で新たに2本鎖構造を形成し、細胞内RNase Hの作用によりmRNAが分解されることでノックダウン作用が発揮される。
　特定の実施形態において、核酸複合体は、１２～３０のオリゴヌクレオチドを含み、当該オリゴヌクレオチドがIHH遺伝子の転写産物に対して相補的である核酸塩基配列を有する。
　本発明の核酸複合体のアンチセンス鎖であるオリゴヌクレオチドは、IHH遺伝子の転写産物であるmRNAを標的とする。該アンチセンス鎖の塩基配列は、ヒトIHH遺伝子の塩基配列中の部分配列又はマウスIHH遺伝子の塩基配列中の部分配列に相補的であり、好ましくはヒトIHH遺伝子の塩基配列中の部分配列に相補的である。ヒトIHH遺伝子の遺伝子の塩基配列を配列番号１に、マウスIHH遺伝子の塩基配列を配列番号２に表す。すなわち、本発明の１２～３０のヌクレオチドからなるオリゴヌクレオチドを含み、当該オリゴヌクレオチドがIHH転写産物に対して相補的である核酸塩基配列は、ヒトIHH遺伝子の塩基配列中の部分配列又はマウスIHH遺伝子の塩基配列中の部分配列に相補的である配列である。
　具体的には、例えば、前記オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、配列番号４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、５０、５２、５４、５６、５８、６０、６２、６４、６６、６８、７０、７２、７４、７６、７８、８０、８２、８４、８６、８８、９０、９２、９４、９６、９８、１００、１０２、１０４、１０６、１０８、１１０及び１１２の何れかの配列からなっていてもよい。この中でも、配列番号１９、２４、２６、２８、７６、７８、８４又は８６の配列からなる核酸塩基配列が好ましく、さらに、配列番号２６の配列からなる核酸塩基配列が好ましい。
　配列番号２６の配列に対するセンス鎖の配列（配列番号２５）は、配列番号１の塩基配列の598番目の塩基から611番目の塩基（14塩基長）である。この配列に対して、配列のスタート部位を配列番号１の塩基配列の603番596番目の塩基にずらすと共に塩基長を１３から２０としたセンス鎖に相補的な配列を前記オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列とすることもできる。
　具体的には、例えば、前記オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、配列番号１１８、１２０、１２２、１２４、１２６、１２８、１３０、１３２、１３４、１３６、１３８、１４０、１４２、１４４、１４６、１４８、１５０、１５２、１５４、１５６、１５８、１６０、１６２、１６４、１６６、１６８、１７０、１７２、１７４、１７６、１７８、１８０、１８２、１８４、１８６及び１８８の何れかの配列からなっていてもよい。この中でも、配列番号１６０、１７０又は１７８の配列からなる核酸塩基配列が好ましい。
　以下、DHOについて詳述する。１本鎖オリゴヌクレオチドは、以下の記載のアンチセンス鎖に関する記載に基づいて作製し、使用することができる。
　第１の核酸鎖は、
（ｉ）ヌクレオチドと任意にヌクレオチドアナログとを含み、該核酸鎖における該ヌクレオチド及び任意に含まれる該ヌクレオチドアナログの総数は８～１００であり、
（ｉｉ）転写産物にハイブリダイズした際に、RNaseHによって認識される少なくとも４つの連続したヌクレオチドを含み、
（ｉｉｉ）少なくとも１つの非天然ヌクレオチドを含み、
（ｉｖ）前記転写産物にハイブリダイズする。
　第２の核酸鎖は、
（ｉ）RNAヌクレオチドと、任意にヌクレオチドアナログと、任意にDNAヌクレオチドとを含み、
（ｉｉ）DNAヌクレオチド及び／又はヌクレオチドアナログを含み、又は、
（ｉｉｉ）PNAヌクレオチドを含む。
　「アンチセンス効果」とは、標的転写産物（RNAセンス鎖）と、例えば、その部分配列に相補的なDNA鎖、又は通常アンチセンス効果が生じるように設計された鎖等とがハイブリダイズすることによって生じる、標的遺伝子の発現又は標的転写産物レベルの抑制を意味する。ある場合において、ハイブリダイゼーション産物により前記転写産物を被覆することによって生じ得る翻訳の阻害又はエキソンスキッピング等のスプライシング機能変換効果、及び/又は、ハイブリダイズした部分が認識されることにより生じ得る前記転写産物の分解によって生じる、前記抑制を意味する。
　「相補性」という文言は、ここでは水素結合を介して、いわゆるワトソン－クリック型塩基対（天然型塩基対）や非ワトソン－クリック型塩基対（フーグスティーン型塩基対等）を形成できる関係のことを意味する。アンチセンス鎖の十分な数の核酸塩基が、標的核酸の対応する核酸塩基と水素結合し得る場合、アンチセンス鎖及び標的核酸は互いに相補的であるので、所望の効果が生じる（例えば、IHH遺伝子などの標的核酸のアンチセンス阻害）。アンチセンス鎖とIHH遺伝子との間の非相補的核酸塩基は、アンチセンス鎖が標的核酸に特異的にハイブリダイズできるという条件で許容され得る。さらに、アンチセンス化合物はタウ核酸の１つ以上のセグメントに対してハイブリダイズでき、それにより介入する又は隣接するセグメントはハイブリダイゼーション事象（例えば、ループ構造、ミスマッチ又はヘアピン構造）に関与しない。当該アンチセンス鎖は、IHH遺伝子をコードするmRNAの配列に対して相補的である。相補的であるとは、アンチセンス鎖がIHH遺伝子をコードするmRNAに結合できる程度に相補的であればよく、例えば、８０％以上、９０％以上、又は９５％以上、９６％以上、９７％以上、９８％以上、若しくは９９％以上相補的であればよい。１００％相補的であってもよい。０～４個程度のミスマッチがあってもよい。
　特定の実施形態において、本明細書に提供されているアンチセンス鎖又はこの特定の部分は、タウ核酸、標的領域、標的セグメントもしくはこの特定の部分に対して８０～１００％、好ましくは９０～１００％、より好ましくは９５～１００％、若しくは１００％相補的である。標的核酸に対するアンチセンス鎖の相補性の割合は慣例の方法を使用して求められ得る。
　例えば、アンチセンス鎖の２０核酸塩基のうちの１６が標的領域に対して相補的であり、したがって特異的にハイブリダイズするアンチセンス鎖は８０％の相補性を表す。この例において、残りの非相補的核酸塩基には、相補的核酸塩基が集まり得る又は散在し得、これらの非相補的核酸塩基は互いに又は相補的核酸塩基に隣接している必要はない。例えば、標的核酸と完全な相補性の２つの領域の隣に４つの非相補的核酸塩基を有する１８核酸塩基長であるアンチセンス鎖は、標的核酸に対して１４が標的領域に対して相補的であるから７７．８％の全体の相補性を有するので、本発明の範囲内である。標的核酸の領域に対するアンチセンス鎖の相補性の割合は、当該技術分野において公知のＢＬＡＳＴプログラム等によって求めることができる。
　ある実施形態においては、第１の核酸鎖は、標的遺伝子の転写産物等の標的転写産物に相補的なアンチセンス核酸であって、第１の核酸鎖が前記転写産物にハイブリダイズした際に、少なくとも４つの連続したヌクレオチドを含む領域を有する核酸である。
　ここでは、「核酸」とはモノマーヌクレオチドを意味する場合もあり、複数のモノマーから構成されるオリゴヌクレオチドを意味する場合もある。「核酸鎖」という文言は、ここではオリゴヌクレオチドを称するためにも用いられる。核酸鎖は、その全部又は一部を、自動合成機の使用といった化学合成法によって調製してもよく、ポリメラ―ゼ、ライゲース又は制限酵素反応に限定されるわけではないが、酵素処理により調製してもよい。
　第１の核酸鎖の鎖長としては特に制限はないが、１２～３０塩基であり、１２～２５塩基であり、又は１３～２０塩基である。ある場合においては、通常、前記標的に対する核酸鎖によるアンチセンス効果の強さや、費用、合成収率等の他の要素に応じて、鎖長は選択される。
　第２の核酸鎖の鎖長は、第１の核酸鎖と同じであってもよい。その場合、１２～３０塩基であり、１２～２５塩基であり、又は１３～２０塩基である。また、第１の核酸鎖の鎖長に対して数塩基から十数塩基長くても短くてもよい。
　「RNaseHによって認識される少なくとも４つの連続したヌクレオチド」は、通常、４～２０塩基の連続したヌクレオチドを含む領域であり、５～１６塩基の連続したヌクレオチドを含む領域であり、又は、６～１２塩基の連続しヌクレオチドを含む領域である。また、この領域には、天然型DNAのような、RNAヌクレオチドにハイブリダイズした際に、RNA鎖を切断するRNaseHによって認識されるヌクレオチドを用いることができる。修飾されたDNAヌクレオチド及び他の塩基といった、好適なヌクレオチドは、この分野において知られている。また、RNAヌクレオチドのような、２’位にヒドロキシ基を有するヌクレオチドは、不適当であることも知られている。「少なくとも４つの連続したヌクレオチド」を含むこの領域への利用に関し、当業者であればヌクレオチドの適合性を容易に決定することができる。
　ある実施形態において、第１の核酸鎖は「ヌクレオチド及び任意にヌクレオチドアナログ」を含む。この文言は、第１の核酸鎖は、DNAヌクレオチド、RNAヌクレオチドを有し、また当該核酸鎖において任意にヌクレオチドアナログを更に有していてもよいということを意味する。
　ここで「DNAヌクレオチド」は、天然に存在するDNAヌクレオチド、又はその塩基、糖若しくはリン酸塩結合のサブユニットが修飾されているDNAヌクレオチドを意味する。同様に、「RNAヌクレオチド」は、天然に存在するRNAヌクレオチド、又はその塩基、糖若しくはリン酸塩結合のサブユニットが修飾されているRNAヌクレオチドを意味する。塩基、糖又はリン酸塩結合のサブユニットの修飾とは、１の置換基の付加、又は、サブユニット内における１の置換のことであり、サブユニット全体を異なる化学基に置換することではない。ヌクレオチドを含む領域の一部又は全部は、DNA分解酵素等に対する耐性が高いという観点から、DNAは修飾されたヌクレオチドであってもよい。このような修飾としては、例えば、シトシンの5-メチル化、5-フルオロ化、5-ブロモ化、5-ヨード化、N4-メチル化、チミジンの5-デメチル化、5-フルオロ化、5-ブロモ化、5-ヨード化、アデニンのN6-メチル化、8-ブロモ化、グアニンのN2-メチル化、8-ブロモ化、ホスホロチオエート化、メチルホスホネート化、メチルチオホスホネート化、キラル－メチルホスホネート化、ホスホロジチオエート化、ホスホロアミデート化、2’-O-メチル化、2’-メトキシエチル（MOE）化、2’-アミノプロピル（AP）化、2’-フルオロ化が挙げられるが、体内動態に優れているという観点から、ホスホロチオエート化が好ましい。さらに、かかる修飾は同一のDNAに対して、複数種組み合わせて施されていてもよい。また、後述の通り、同様の効果を奏するために、RNAヌクレオチドに修飾を施してもよい。
　ある場合において、修飾されたDNAの数や位置によっては、ここで開示する二重鎖核酸が奏するアンチセンス効果等に影響を与えることになるかもしれない。これらの態様は、標的遺伝子の配列等によっても異なるため、一概には言えないが、当業者であれば、後記のアンチセンス法に関する文献の記載を参酌しながら、決定することができる。また、修飾後の二重鎖核酸複合体が有するアンチセンス効果を測定し、得られた測定値が、修飾前の二重鎖核酸複合体のそれよりも有意に低下していなければ（例えば、修飾後の二重鎖核酸複合体の測定値が修飾前の二重鎖核酸複合体の測定値の３０％以上であれば）、当該修飾は評価することができる。アンチセンス効果の測定は、例えば、後述の実施例において示されているような、細胞等に被検核酸化合物を導入し、該被検核酸化合物が奏するアンチセンス効果によって抑制された該細胞等における標的遺伝子の発現量（mRNA量、cDNA量、タンパク質量等）を、ノザンブロッティング、定量的PCR、ウェスタンブロッティング等の公知の手法を適宜利用することによって行うことができる。
　ここで「ヌクレオチドアナログ」は天然には存在しないヌクレオチドを意味し、ヌクレオチドの塩基、糖若しくはリン酸塩結合のサブユニットにおいて、２以上の置換基が付加されており、若しくは、サブユニット内が２以上置換されており、又はサブユニット全体を異なる化学基に置換されていることを意味する。２以上の置換を伴うアナログの例としては、架橋化核酸が挙げられる。架橋化核酸は、糖環における２箇所の置換に基づいて架橋ユニットが付加されるヌクレオチドアナログであり、典型的には、２’位の炭素と４’位の炭素とが結合しているヌクレオチドアナログが挙げられる。ある実施形態における第１の核酸鎖においては、標的遺伝子の転写産物の部分配列に対する親和性及び/又は核酸分解酵素に対する耐性が増大させるという観点から、第１の核酸鎖はヌクレオチドアナログをさらに含む。「ヌクレオチドアナログ」としては、修飾（架橋、置換等）により、標的遺伝子の転写産物の部分配列に対する親和性及び/又は核酸分解酵素に対する耐性が増大されているヌクレオチドであればよく、例えば、特開平１０－３０４８８９号公報、国際公開第２００５／０２１５７０号、特開平１０－１９５０９８号公報、特表２００２－５２１３１０号公報、国際公開第２００７／１４３３１５号、国際公開第２００８／０４３７５３号、国際公開第２００８／０２９６１９号、国際公開第２００８／０４９０８５号（以下、これら文献を「アンチセンス法に関する文献」とも称する）において、アンチセンス法に好適に用いられるとして開示されている核酸が挙げられる。すなわち、前記文献に開示されている核酸：ヘキシトール核酸（HNA)、シクロヘキセン核酸（CeNA）、ペプチド核酸（PNA）、グリコール核酸（GNA）、トレオース核酸（TNA）、モルホリノ核酸、トリシクロ－DNA（tcDNA）、2’-O-メチル化核酸、2’-MOE（2’-O-メトキシエチル）化核酸、2’-AP（2’-O-アミノプロピル）化核酸、2’-フルオロ化核酸、2’F‐アラビノ核酸（2'-F-ANA）、BNA（架橋化核酸（Bridged Nucleic Acid）が挙げられる。
　ある実施態様におけるBNAとしては、２’位の炭素と４’位の炭素とが、２以上の原子によって架橋されているリボヌクレオチド又はデオキシリボヌクレオチドであればよい。架橋化核酸の例は当業者に知られている。このようなBNAの一のサブグループとしては、２’位の炭素と４’位の炭素とが、4’-(CH2)p-O-2’、4’-(CH2)p-S-2’、4’-(CH2)p-OCO-2’、4’-(CH2)n-N(R3)-O-(CH2)m-2’によって架橋されているＢＮＡを挙げられる（ここで、ｐ、ｍ及びｎは、各々１～４、０～２及び１～３の整数である。R3は、水素原子、アルキル基、アルケニル基、シクロアルキル基、アリール基、アラルキル基、アシル基、スルホニル基、及びユニット置換基（蛍光あるいは化学発光標識分子、核酸切断活性官能基、又は細胞内若しくは核内移行シグナルペプチド等）を示す）。さらに、ある実施態様におけるBNAにおいて、３’位の炭素における置換基：OR2及び５’位の炭素における置換基：OR1のR1及びR2は、典型的には水素原子であるが、同一又は異なっていてもよく、核酸合成の水酸基の保護基、アルキル基、アルケニル基、シクロアルキル基、アリール基、アラルキル基、アシル基、スルホニル基、シリル基、リン酸基、核酸合成の保護基で保護されたリン酸基、又は、-P(R4)R5（式中、R4及びR5は、同一又は異なっていてもよく、水酸基、核酸合成の保護基で保護された水酸基、メルカプト基、核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基、アミノ基、炭素数１～５のアルコキシ基、炭素数１～５のアルキルチオ基、炭素数１～６のシアノアルコキシ基、又は、炭素数１～５のアルキル基で置換されたアミノ基を示す）であってもよい。このようなBNAとしては、例えば、LNA（ロックド核酸（Locked Nucleic Acid（登録商標）、2’,4’-BNA）とも称される、α-L-メチレンオキシ（4’-CH2-O-2’）BNA又はβ-D-メチレンオキシ（4’-CH2-O-2’）BNA、ENAとも称されるエチレンオキシ（4’-(CH2)2-O-2’）BNA、β-D-チオ（4’-CH2-S-2’）BNA、アミノオキシ（4’-CH2-O-N(R3)-2’）BNA、2’,4’-BNANCとも称されるオキシアミノ（4’-CH2-N(R3)-O-2’)BNA、2’,4’-BNACOC、３’アミノ-2’，4’-BNA、5’-メチルBNA，cEt-BNAとも称される（4’-CH(CH3)-O-2’)BNA、cMOE-BNAとも称される（4’-CH(CH2OCH3)-O-2’)BNA、AmNAとも称されるアミドBNA（4’-C(O)-N(R)-2’)BNA（R=H,Me），当業者に知られた他のBNAが挙げられる。
　さらに、ある実施態様における修飾核酸においては、塩基部位が修飾されていてもよい。塩基部位の修飾としては、例えば、シトシンの5-メチル化、5-フルオロ化、5-ブロモ化、5-ヨード化、N4-メチル化、チミジンの5-デメチル化、5-フルオロ化、5-ブロモ化、5-ヨード化、アデニンのN6-メチル化、8-ブロモ化、グアニンのN2-メチル化、8-ブロモ化が挙げられる。さらにまた、ある実施態様における修飾核酸においては、リン酸ジエステル結合部位が修飾されていてもよい。リン酸ジエステル結合部位の修飾としては、例えば、ホスホロチオエート化、メチルホスホネート化、メチルチオホスホネート化、キラル－メチルホスホネート化、ホスホロジチオエート化、ホスホロアミデート化が挙げられるが、体内動態に優れているという観点から、ホスホロチオエート化が用いられる。また、このような塩基部位の修飾やリン酸ジエステル結合部位の修飾は同一の核酸に対して、複数種組み合わせて施されていてもよい。
　全体として、修飾されたヌクレオチド及び修飾されたヌクレオチドアナログは、ここで例示したものに限定されるわけではない。多数の修飾されたヌクレオチド及び修飾されたヌクレオチドアナログが当該分野では知られており、例えば、Ｔａｃｈａｓらの米国特許第８２９９０３９号明細書の記載、特に１７～２２欄の記載を、本願の実施態様として利用することもできる。
　当業者であれば、このような修飾核酸の中から、アンチセンス効果、標的遺伝子の転写産物の部分配列に対する親和性、核酸分解酵素に対する耐性等の観点を考慮し、適宜ヌクレオチドアナログを選択して利用することができるが、ある実施形態において、ヌクレオチドアナログは下記式（１）で表わされるＬＮＡである。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000001
　式（１）中、Baseは、置換基を有していてもよい芳香族複素環基若しくは芳香族炭化水素環基、例えば、天然型ヌクレオシドの塩基部位（プリン塩基、ピリミジン塩基）又は非天然型（修飾）ヌクレオシドの塩基部位を示す。なお、塩基部位の修飾の例は、前述の通りである。
　Ｒ１、Ｒ２は、同一又は異なっていてもよく、水素原子、核酸合成の水酸基の保護基、アルキル基、アルケニル基、シクロアルキル基、アリール基、アラルキル基、アシル基、スルホニル基、シリル基、リン酸基、核酸合成の保護基で保護されたリン酸基、又は、－Ｐ（Ｒ４）Ｒ５［ここで、Ｒ４及びＲ５は、同一又は異なっていてもよく、水酸基、核酸合成の保護基で保護された水酸基、メルカプト基、核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基、アミノ基、炭素数１～５のアルコキシ基、炭素数１～５のアルキルチオ基、炭素数１～６のシアノアルコキシ基、又は、炭素数１～５のアルキル基で置換されたアミノ基を示す。］を示す。
　なお、前記化学式において示されている化合物はヌクレオシドであるが、ある実施形態における「LNA」及び通常BNAには、当該ヌクレオシドにリン酸基が結合した形態（ヌクレオチド）も含まれる。すなわち、LNAといったBNAは、二重鎖核酸複合体を含む核酸鎖に、ヌクレオチドとして組み込まれる。
　ある実施態様における「複数の核酸からなるヌクレオチドアナログを含むウイング領域」は、前記少なくとも４つ以上の連続したDNAヌクレオチドを含む複数の核酸からなる領域（以下「DNAギャップ領域」とも称する）の５'末側及び／又は３'末側に配置されるものである。
　該DNAギャップ領域の５’末端に配置されたヌクレオチドアナログを含む領域（以下「５’ウイング領域」とも称する）、及び該DNAギャップ領域の３’末端に配置されたヌクレオチドアナログを含む領域（以下「３’ウイング領域」とも称する）は、それぞれ独立したものであり、前記アンチセンス法に関する文献に挙げられているヌクレオチドアナログを少なくとも１種含んでいればよく、さらに、かかるヌクレオチドアナログ以外に天然型の核酸（DNA又はRNA）も含まれていてもよい。また、５’ウイング領域及び３’ウイング領域の鎖長は独立的に、通常１～１０塩基であり、１～７塩基、１～５塩基、又は２～５塩基である。
　さらに、５’ウイング領域及び３’ウイング領域において、ヌクレオチドアナログ及び天然型のヌクレオチドの種類や数や位置については、ある実施形態における二重鎖核酸複合体が奏するアンチセンス効果等に影響を与える場合もあるため、好ましい態様は、配列等によっても変わり得る。一概には言えないが、当業者であれば、前記アンチセンス法に関する文献の記載を参酌しながら、好ましい態様を決定することができる。また、前記「少なくとも４つ以上の連続したDNAヌクレオチド」を含む領域同様に、修飾後の二重鎖核酸が有するアンチセンス効果を測定し、得られた測定値が、修飾前の二重鎖核酸のそれよりも有意に低下していなければ、当該修飾は好ましい態様であると評価することができる。
　修飾オリゴヌクレオチドからなるIHH遺伝子のmRNAに対するアンチセンス鎖は、１～１０個の塩基からなる５’ウイング領域(5’wing site)、８～２５個の塩基からなるギャップ領域、及び１～１０個の塩基からなる３’ウイング領域(3’wing site)からなり得る。アンチセンス鎖は、２－１０－２で表わされるモチーフ、３－１０－３で表されるモチーフ等を有することができる。ここで、モチーフの１番目の数字は、５’ウイング領域内の塩基の数を表し、２番目の数字は、ギャップ領域内の塩基の数を表し、３番目の数字は、３’ウイング領域内の塩基の数を表す。
　なお、従前から試みられているRNAやLNAのみからなるアンチセンス法は、標的となるmRNAと結合することで翻訳を抑制したが、その効果は概して不十分であった。一方DNAのみからなるアンチセンス法では、標的遺伝子と結合するとDNAとRNAからなる二本鎖構造となるため、RNaseHの標的となることでmRNAが切断されることにより強い標的遺伝子発現抑制効果が期待できたが、標的遺伝子との結合自体が弱いため実際の効果はやはり不十分だった。
　従って、第１の核酸鎖において、中央に少なくとも４塩基以上の鎖長のDNAが配置され、さらにRNA（すなわち、標的転写産物）と強い結合能力を持つLNA（又は他のBNA）が両端に配置されることによって、このような複合鎖は、RNaseHによる標的RNAの切断を促進することとなる。「鎖長が４塩基であるDNA」は、DNAヌクレオチドだけに制限されるわけではなく、第１の核酸鎖が転写産物にハイブリダイズした際に、RNaseHによって認識される少なくとも４つの連続したヌクレオチドを、第１の核酸鎖が含むことも意図するものである。ある実施形態において、標的転写産物とのヘテロ二重鎖形成により生じるアンチセンス効果が極めて高いという観点から、第１の核酸鎖が転写産物にハイブリダイズした際に、RNaseHによって認識される少なくとも４つの連続したヌクレオチドを含む領域の、５'末側及び３'末側に配置された修飾核酸を含むウイング領域は、任意にヌクレオチドアナログを含んでいることが望ましい。該ヌクレオチドアナログはBNAであってもよく、例えばLNAであってもよい。
　ある実施形態における第２の核酸鎖は、前述の第１の核酸鎖と相補的な核酸である。第２の核酸鎖の塩基配列と第１の核酸鎖の塩基配列とは、完全に相補的である必要はなく、少なくとも７０％以上、好ましくは８０％以上、さらに好ましくは９０％以上（例えば、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％以上）の相補性を有していればよい。
　第２の核酸鎖としては、RNA、DNA、PNA（ペプチド核酸）及びBNA（例えば、LNA）からなる群から選択される少なくとも１種の核酸からなるオリゴブクレオチドである。より具体的には、第２の核酸鎖は、（ｉ）RNAヌクレオチドと、任意にヌクレオチドアナログと、任意にDNAヌクレオチドとを含み、（ｉｉ）DNAヌクレオチド及び／又はヌクレオチドアナログを含み、又は、（ｉｉｉ）PNAヌクレオチドを含む。
　「RNAヌクレオチドと、任意にヌクレオチドアナログと、任意にDNAヌクレオチドとを含む」という文言は、第２の核酸鎖はRNAヌクレオチドを含み、さらに任意にヌクレオチドアナログを含んでもよく、さらにまた任意にDNAヌクレオチドを含んでもよいということを意味する。「DNAヌクレオチド及び／又はヌクレオチドアナログを含む」という文言は、第２の核酸鎖はDNAヌクレオチド及びヌクレオチドアナログのいずれかを含んでいてもよく、またDNAヌクレオチド及びヌクレオチドアナログを共に含んでいてもよいということを意味する。「PNAヌクレオチドを含む」とは第２の核酸鎖はPNAヌクレオチドから構成されてもよいということを意味する。
　しかしながら、ある実施形態における二重鎖核酸複合体が細胞内のＲＮａｓｅＨに認識され、第２の核酸鎖が分解されることにより、第１の核酸鎖のアンチセンス効果が発揮し易くなるという観点から、第２の核酸鎖はRNAを含む。また、ある実施形態における二重鎖核酸複合体にペプチド等の機能性分子を結合させ易いという観点からは、第２の核酸鎖はPNAであってもよい。
　ここで、「RNAヌクレオチド」は、天然に存在するRNAヌクレオチド、又はその塩基、糖若しくはリン酸塩結合のサブユニットが修飾されているRNAヌクレオチドを意味する。塩基、糖又はリン酸塩結合のサブユニットの修飾とは、１の置換基の付加、又は、サブユニット内における１の置換のことであり、サブユニット全体を異なる化学基に置換することではない。
　第２の核酸鎖において、核酸の一部又は全部は、RNA分解酵素等の核酸分解酵素に対する耐性が高いという観点から、修飾されたヌクレオチドであってもよい。このような修飾としては、例えば、シトシンの５－メチル化、５－フルオロ化、５－ブロモ化、５－ヨード化、Ｎ４－メチル化、チミジンの５－デメチル化、５－フルオロ化、５－ブロモ化、５－ヨード化、アデニンのＮ６－メチル化、８－ブロモ化、グアニンのＮ２－メチル化、８－ブロモ化、ホスホロチオエート化、メチルホスホネート化、メチルチオホスホネート化、キラル－メチルホスホネート化、ホスホロジチオエート化、ホスホロアミデート化、２’－Ｏ－メチル化、２’－メトキシエチル（MOE）化、２’－アミノプロピル（AP）化、２’－フルオロ化が挙げられる。また、ウラシル塩基をチミジン塩基に置換したRNAヌクレオチドの利用も考えられるが、薬物動態に優れているという観点から、ホスホロチオエート化が用いられる。また、かかる修飾は同一の核酸に対して、複数種組み合わせて施されていても良く、例えば、後述の実施例において用いられているように、酵素による切断に対する抵抗性を付与するため、同一のRNAに対して、ホスホロチオエ―ト化及び２’－Ｏ－メチル化を施してもよい。しかしながら、RNaseHによってRNAヌクレオチドが切断されることを期待し、又は望む場合には、ホスホロチオエ―ト化及び２’－Ｏ－メチル化のいずれかのみを施すことができる。
　修飾の数や位置は、ある実施形態における二重鎖核酸複合体が奏するアンチセンス効果等に影響を与える場合もあるため、第２の核酸鎖におけるヌクレオチドアナログの数及び修飾の位置には好ましい態様が存在する。この好ましい態様は、修飾対象となる核酸の種類、配列等によっても異なるため、一概には言えないが、前述の第１の核酸鎖同様に、修飾後の二重鎖核酸が有するアンチセンス効果を測定することにより特定することができる。このような好ましい態様として、第２の核酸鎖が特定の細胞の核内に送達されるまで、ＲＮａｓｅＡ等のRNA分解酵素による分解を抑制しつつも、特定の細胞内においてはＲＮａｓｅＨにより該核酸鎖が分解されることにより、アンチセンス効果を発揮し易いという観点から、第２の核酸鎖はRNAであって、第１の核酸鎖のヌクレオチドアナログを含む領域（すなわち、５’ウイング領域及び／又は３’ウイング領域）に対して相補的な領域は、修飾された核酸又はヌクレオチドアナログであり、前記修飾又はアナログがRNA分解酵素等の酵素による分解を抑制する効果を有するものである。ある実施態様においては、前記修飾はRNAに対する２’－Ｏ－メチル化及び／又はホスホロチオエ―ト化である。また、このような場合、第１の核酸鎖のヌクレオチドアナログを含む領域に相補的な領域の全てが修飾されていてもよく、第１の核酸鎖の修飾核酸を含む領域に相補的な領域の一部が修飾されていてもよい。さらに、修飾されている領域は、該一部を含む限り、第１の核酸鎖の修飾核酸を含む領域よりも長くなっていてもよく、短くなっていてもよい。
　ある実施形態における二重鎖核酸複合体において、第２の核酸鎖に機能性部分が結合していてもよい。第２の核酸鎖と機能性部分との結合は、直接的な結合であってもよく、他の物質を介した間接的な結合であってもよいが、ある実施形態において、共有結合、イオン結合、水素結合等で第２の核酸鎖と機能性部分とが直接的に結合していることが好ましく、より安定した結合が得られるという観点から、共有結合がより好ましい。
　ある実施形態において、「機能性部分」の構造上、特に制限はなく、それを結合する二重鎖核酸複合体及び/又は核酸鎖に所望の機能を付与する。所望の機能としては、標識機能、精製機能及び標的への送達機能が挙げられる。標識機能を付与する部分の例としては、蛍光タンパク質、ルシフェラーゼ等の化合物が挙げられる。精製機能を付与する部分の例としては、ビオチン、アビジン、Hisタグペプチド、GSTタグペプチド、FLAGタグペプチド等の化合物が挙げられる。
　また、第１の核酸鎖を特異性高く効率的に標的部位に送達し、かつ当該核酸によって標的遺伝子の発現を非常に効果的に抑制するという観点から、第２の核酸鎖に機能性部分として、ある実施形態における二重鎖核酸複合体を標的部位に送達させる活性を有する分子が結合していることが好ましい。
　「標的への送達機能」を有する部分として、例えば、肝臓等に特異性高く効率的にある実施形態における二重鎖核酸複合体を送達できるという観点から、脂質が挙げられる。このような脂質としては、コレステロール、脂肪酸等の脂質（例えば、ビタミンＥ（トコフェロール類、トコトリエノール類）、ビタミンＡ，ビタミンＤ）、ビタミンＫ等の脂溶性ビタミン（例えば、アシルカルニチン）、アシルＣｏＡ等の中間代謝物、糖脂質、グリセリド、並びにそれらの誘導体等を例示することができるが、これらの中では、より安全性が高いという観点から、ある実施形態において、コレステロール、ビタミンＥ（トコフェロール類、トコトリエノール類）を利用することが好ましい。また、脳に特異性高く効率的に本発明の二重鎖核酸を送達できるという観点から、ある実施形態における「機能性部分」としては、糖（例えば、グルコース、スクロース）が挙げられる。また、各臓器の細胞表面にある各種タンパク質に結合することにより、当該臓器に特異性高く効率的にある実施形態における二重鎖核酸複合体を送達できるという観点から、受容体のリガンドや抗体、及び／又はそれらの断片等のペプチド又はタンパク質が、ある実施形態における「機能性部分」として挙げられる。
　以上、いくつかの実施態様において、二重鎖核酸複合体の好適な典型例について説明したが、いくつかの実施態様における二重鎖核酸は上記典型例に限定されるものではない。また、いくつかの実施形態において、第１の核酸鎖、第２の核酸鎖及び第３の核酸鎖は、当業者であれば公知の方法を適宜選択することにより調製することができる。例えば、標的転写産物の塩基配列（又は、いくつかの場合においては標的遺伝子の塩基配列）の情報に基づいて、核酸の塩基配列を設計し、市販の核酸自動合成機（アプライドバイオシステムズ社製、べックマン社製等）を用いて合成し、次いで、得られるオリゴヌクレオチドを逆相カラム等を用いて精製することにより、核酸を調製することができる。そして、このようにして調製した核酸を適当な緩衝液中にて混合し、約９０～９８℃にて数分間（例えば、５分間）かけて変性させた後、約３０～７０℃にて約１～８時間かけてアニーリングさせることにより、いくつかの実施形態における二重鎖核酸複合体を調製することができる。また、機能性部分が結合している二重鎖核酸複合体は、予め機能性部分を結合させた核酸種を用いて、前記の通り、合成、精製及びアニーリングすることにより、調製することができる。機能性部分と核酸とを結合させるための多くの方法は、当該分野においてよく知られている。
　以上、本発明の二重鎖核酸の好適な実施態様について説明したが、いくつかの実施形態にかかる「第２の核酸鎖」は、アンチセンス効果を低下させることなく、アンチセンス核酸を標的部位に効率良く送達できるという点において優れている。従って、いくつかの実施形態における二重鎖核酸は上記実施態様に限定されるものではなく、例えば、前述の第１の核酸鎖の代わりに、下記アンチセンス核酸を含む態様も提供することができる。
　標的遺伝子の発現をアンチセンス効果によって抑制する活性を有する二重鎖核酸複合体であって、（ｉ）標的遺伝子の転写産物に相補的なアンチセンス核酸であって、DNAを含まない核酸と、（ｉｉ）（ｉ）の核酸に相補的な核酸とを含む二重鎖核酸複合体。
　すなわち、ある実施形態において、アンチセンス核酸はRNaseH非依存的アンチセンス効果を有する。「RNaseH非依存的アンチセンス効果」とは、標的遺伝子の転写産物（RNAセンス鎖）と、その部分配列に相補的な核酸鎖とがハイブリダイズすることによる翻訳の阻害やエキソンスキッピング等のスプライシング機能変換効果によって生じる標的遺伝子の発現を抑制する活性のことを意味する。
　「DNAを含まない核酸」は、天然型DNA及び修飾されたDNAを含まないアンチセンス核酸を意味し、例えば、PNA又はモルホリノ核酸からなる核酸が挙げられる。また、「DNAを含まない核酸」において、第１の核酸鎖又は第２の核酸鎖同様に、核酸の一部又は全部は、核酸分解酵素に対する耐性が高いという観点から、修飾されたヌクレオチドにて構成されていてもよい。このような修飾の例としては前述の通りであり、さらに、修飾は同一の核酸に対して複数種組み合わせて施されていてもよい。また、修飾された核酸の数や修飾の位置に関する好ましい態様は、前述の第１の核酸鎖同様に、修飾後の二重鎖核酸が有するアンチセンス効果を測定することにより特定することができる。
　「DNAを含まない核酸」の塩基配列と、該核酸に相補的な核酸の塩基配列又は標的遺伝子の転写産物の塩基配列とは、完全に相補的である必要はなく、少なくとも７０％以上、好ましくは８０％以上、さらに好ましくは９０％以上（例えば、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％以上）の相補性を有していればよい。
　「DNAを含まない核酸」の鎖長としては特に制限はないが、通常１０～３５塩基であり、好ましくは１２～２５塩基であり、より好ましくは１３～２０塩基である。
　いくつかの実施形態における二重鎖核酸複合体を含む組成物は、公知の製剤学的方法により製剤化することができる。例えば、カプセル剤、錠剤、丸剤、液剤、散剤、顆粒剤、細粒剤、フィルムコーティング剤、ペレット剤、トローチ剤、舌下剤、咀嚼剤、バッカル剤、ペースト剤、シロップ剤、懸濁剤、エリキシル剤、乳剤、塗布剤、軟膏剤、硬膏剤、パップ剤、経皮吸収型製剤、ローション剤、吸引剤、エアゾール剤、注射剤、坐剤等として、経腸管的（経口的等）又は非経腸管的に使用することができる。
　これら製剤化においては、薬理学上もしくは飲食品として許容される担体、具体的には、滅菌水や生理食塩水、植物油、溶剤、基剤、乳化剤、懸濁剤、界面活性剤、ｐＨ調節剤、安定剤、香味剤、芳香剤、賦形剤、ベヒクル、防腐剤、結合剤、希釈剤、等張化剤、無痛化剤、増量剤、崩壊剤、緩衝剤、コーティング剤、滑沢剤、着色剤、甘味剤、粘稠剤、矯味矯臭剤、溶解補助剤あるいはその他の添加剤等と適宜組み合わせることができる。
　製剤化等に際し、非特許文献１に示すように、機能性部分として脂質が結合している、いくつかの実施形態における二重鎖核酸複合体においては、カイロミクロンやカイロミクロンレムナント等のリポタンパク質との複合体を形成させてもよい。さらに、経腸投与の効率を高めるという観点から、前記リポタンパク質に加え、大腸粘膜上皮透過性亢進作用を有する物質（例えば、中鎖脂肪酸、長鎖不飽和脂肪酸又はそれらの誘導体（塩、エステル体又はエーテル体））及び界面活性剤（非イオン性界面活性剤、陰イオン性界面活性剤）との複合体（混合ミセル、エマルジョン）であってもよい。
　いくつかの実施形態における組成物の好ましい投与形態としては特に制限はなく、経腸管的（経口的等）又は非経腸管的、より具体的には、静脈内投与、動脈内投与、腹腔内投与、皮下投与、皮内投与、気道内投与、直腸投与及び筋肉内投与、輸液による投与が挙げられる。
　いくつかの実施形態における組成物は、ヒトを含む動物を対象として使用することができるが、ヒト以外の動物としては特に制限はなく、種々の家畜、家禽、ペット、実験用動物等を対象とすることができる。
　いくつかの実施形態における組成物を投与又は摂取する場合、その投与量又は摂取量は、対象の年齢、体重、症状、健康状態、組成物の種類（医薬品、飲食品など）等に応じて、適宜選択されるが、ある実施形態にかかる組成物の有効摂取量は、ヌクレオチド換算で０．００１ｍｇ／ｋｇ／日～５０ｍｇ／ｋｇ／日であることが好ましい。
　本発明は、IHH遺伝子特異的な阻害剤、又はIHH遺伝子の転写産物の阻害剤を含む繊維症の治療薬を包含する。
　また、本発明のIHH遺伝子特異的な阻害剤によりIHH遺伝子を阻害することにより、COL1A1遺伝子、CTGF遺伝子、ADGRE1発現が低下し、TGFB1遺伝子、CCL2遺伝子発現が上昇する。
　本発明のIHH遺伝子特異的な阻害剤を含む医薬組成物が治療薬としての用途を有する疾患は、主に肝臓、腎臓、膵臓、肺又は皮膚の線維症を含む炎症性の疾患である。肝臓における線維症は、脂肪肝（fatty liver）、アルコール性脂肪性肝疾患（alcoholic steatohepatitis：ASH）、非アルコール性脂肪性肝疾患（NAFLD：non-alcoholic fatty liver disease）、非アルコール性脂肪肝炎（non-alcoholic steatohepatitis：NASH）、慢性肝炎（Chronic hepatitis）、肝硬変症（Liver cirrhosis）の他、ウイルス性、自己免疫性、胆汁うっ滞性、代謝性、うっ血性、薬物性、感染性等の肝疾患等を含む。腎臓の線維症としては、腎臓線維症（Kidney fibrosis）、腎性全身性線維症（Nephrogenic Systemic Fibrosis：NSF）、腎臓線維腫(Kidney fibroma)等を意味する。膵臓の線維症としては、膵嚢胞線維症（cystic fibrosis：CF、システィック・ファイブローシス）等を意味する。
　肺の線維症とは、肺線維症（pulmonary fibrosis）、間質性線維症（Interstitial pulmonary fibrosis）、急性びまん性間質性肺線維症（Acute diffuse interstitial pulmonary fibrosis）、特発性肺線維症（Idiopathic pulmonary fibrosis: IPF）等を意味する。皮膚の線維症としては、皮膚線維化疾患（Skin fibrosis disease）、強皮症（Scleroderma）、全身性強皮症（Systemic scleroderma）、限局性強皮症（localized scleroderma）、膠原病(Collagen disease)、皮膚線維種（dermatofibroma）等を意味する。
　本発明を以下の実施例によって具体的に説明するが、本発明はこれらの実施例によって限定されるものではない。
[実施例１]　1次スクリーニング
　NCBIのウェブサイト（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/）よりヒトIHHとマウスIHHの各遺伝子におけるcoding配列情報を入手し、図２に示すヒトIHH遺伝子coding配列：NCBI Reference Sequence: NM_002181.3（配列番号１）、マウスIHH遺伝子coding配列：NCBI Reference Sequence: NM_010544.3（配列番号２）の配列（センス鎖）に基づいて中から55本のアンチセンスオリゴヌクレオチド（ASO）をデザインした。それらの配列情報を表１に示す。表１には、ヒトIHH遺伝子coding配列又はマウスIHH遺伝子coding配列中の配列をセンスオリゴヌクレオチドとして示し、その配列に相補的な配列をアンチセンスオリゴヌクレオチドとして示す。マウスHepa1-6細胞株を市販の24-well plateに1×105 cells/ml/wellずつ播種し、24時間CO2インキュベータ中で培養した。その翌日にLipofectamine 2000（Thermo Fisher Scientific）を用いてASO（各20 nM）のトランスフェクションを行い、CO2インキュベータ中にて48時間培養した。培養後の24-well plateの各ウェルよりRNeasy Mini Kit (QIAGEN)を用いてTotal RNAを抽出した。その後、逆転写反応と定量PCRはRotor Gene Probe RT-PCR Kit（QIAGEN）を用い、定量PCR装置はRotor-Gene Q（QIAGEN）を使用した。その際、マウスIHHとマウスGAPDHのプライマーとプローブはTaqMan Gene Expression Assays（Thermo Fisher Scientific）でデザインされた試薬を使用し、mRNA発現量はマウスIHHとマウスGAPDHの各Ct値を測定した後、ΔΔCt法に基づく相対定量法により算出した。
　上記の方法で55本のASO（Ren-1-1～-55）についてIHH遺伝子のノックダウンスクリーニングを行った。結果を図３－１及び３－２に示す。図３－１はRen-1-1～-31、図３－２はRen-1-32～-55までのスクリーニング結果を示す。PBS-1～8はネガティブコントロールでAPOB-1～2はポジティブコントロールに用いたアンチセンス核酸であり、配列情報は文献（Nat Commun. 2015 Aug 10;6:7969.）より入手した。図３－１及び３－２に示すように、No.12（Ren-1-12）で78％のノックダウン効果が確認された（図３－１，３－２）。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000002
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000003
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000004
　表中のAntisenseの欄に記載されている配列はすべてヌクレオチド間にホスホロチオエート（PS）結合を含む。それらのうち太字部分の塩基にはLNA修飾を含む。Motifの欄の例えば3-8-3は3個のLNA修飾核酸-8個の非修飾核酸-3個のLNA修飾核酸（すべてのヌクレオチド間にPS修飾含む）の計14mer核酸塩基で構成されるアンチセンス核酸を示す。Species specificityの欄のhuman/mouseとはヒトとマウスとで完全マッチするアンチセンス核酸であることを示す。また、mouseとはマウス配列とは完全マッチするが、ヒト配列とは完全マッチしないアンチセンス核酸であることを示す。GC contentはウェブサイト（http://www.ngrl.co.jp/tools/0217oligocalc.htm）に基づいて算出した。LNA修飾アンチセンス核酸のTm値はウェブサイト（https://www.exiqon.com/ls/pages/exiqontmpredictiontool.aspx）に基づいて算出した。ヒト及びマウスのcoding領域内の配列情報はNCBIのウェブサイト（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/）より入手した。
[実施例２]　Ren-1-12 ASOのIHH遺伝子ノックダウン作用のIC50値算出
　実施例１のスクリーニングでヒットしたRen-1-12についてIHH遺伝子ノックダウン活性のIC50値を求めた。実験は基本的に実施例1と同様の方法で行った。その結果、Ren-1-12におけるノックダウン作用のIC50値は1.07 nM、対照に用いたAPOB ASOのIC50値は2.52 nMと算出された（図４A, B）。今回用いたAPOBの配列は文献情報（Nat Commun. 2015 Aug 10;6:7969.）でもin vivoで有効性が確認済の配列である。本実験のin vitroノックダウン試験においてRen-1-12 ASOのIHH遺伝子ノックダウン活性は対照に用いたAPOB ASOよりも明らかに強かったことから、in vivoでも有効性が期待できる配列であることが示唆された。
[実施例３]　Toc-Ren-1-12 HDOの肝臓におけるIHH遺伝子ノックダウン作用
　実施例１のスクリーニングでヒットしたRen-1-12 ASOがマウス肝臓においてどの程度のノックダウン作用を示すか調べた。In vivo試験には、Ren-1-12 ASOより、該アンチセンス鎖に相補的なセンス鎖を含むヘテロ2本鎖構造をデザインした後、センス鎖にトコフェロール（Toc）をリガンドとして付与したHDOを用いた（表２）。ポジティブコントロールとしてToc-APOB HDO（表２）を使用した。マウス肝臓からのTotal RNAの抽出にはRNeasy Mini Kit (QIAGEN)を用いた。その後、逆転写反応と定量PCRはRotor Gene Probe RT-PCR Kit（QIAGEN）を用い、定量PCR装置はRotor-Gene Q（QIAGEN）を使用した。その際、マウスIHHとマウス18SrRNAのプライマーとプローブはTaqMan Gene Expression Assays（Thermo Fisher Scientific）でデザインされた試薬を使用した。mRNA発現量はマウスIHHとマウス18SrRNAの各Ct値を測定した後、ΔΔCt法に基づく相対定量法により算出した。以上の方法でToc-Ren-1-12 HDO及びToc-APOB HDOを単回i.v.投与した１、３、７日後のIHH遺伝子ノックダウン効果を調べたところ、7日後にToc-Ren-1-12 HDOはToc-APOB HDOとほぼ同等のノックダウン作用を示した（図５）。Toc-APOB HDOは既にin vivoでの薬効評価に使えることが示されている（Nat Commun. 2015 Aug 10;6:7969.）ことから、Toc-Ren-1-12 HDOもin vivoでの薬効評価に十分使える可能性のある核酸複合体であることが示された。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000005
[実施例４]　2次スクリーニング
　実施例１のスクリーニングでヒットしたRen-1-12を基に新たに36本のASOをデザインした。36本のASOの配列は、Ren-1-12のセンス鎖の配列が配列番号１の塩基配列の598番目の塩基から611番目の塩基（１４塩基長）であるのに対して、配列のスタート部位を配列番号１の塩基配列の603番596番目の塩基にずらすと共に塩基長を１３から２０とした。その結果を表３に示す。これらの36本（Ren-1-12-1～-36）の配列について実施例１と同様の方法でIHH遺伝子のノックダウンスクリーニングを行った結果を図６に示す。2次スクリーニングの結果から、Ren-1-12-22, 27, 31の3配列が特に強いノックダウン作用を示した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000006
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000007
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000008
　表中のAntisenseの欄に記載されている配列はすべてヌクレオチド間にホスホロチオエート（PS）結合を含む。それらのうち太字部分の塩基にはLNA修飾を含む。Motifの欄の例えば3-8-3は3個のLNA修飾核酸-8個の非修飾核酸-3個のLNA修飾核酸（すべてのヌクレオチド間にPS修飾含む）の計14mer核酸塩基で構成されるアンチセンス核酸を示す。Species specificityの欄のhuman/mouseとはヒトとマウスとで完全マッチするアンチセンス核酸であることを示す。また、mouseとはマウス配列とは完全マッチするが、ヒト配列とは完全マッチしないアンチセンス核酸であることを示す。GC contentはウェブサイト（http://www.ngrl.co.jp/tools/0217oligocalc.htm）に基づいて算出した。LNA修飾アンチセンス核酸のTm値はウェブサイト（https://www.exiqon.com/ls/pages/exiqontmpredictiontool.aspx）に基づいて算出した。ヒト及びマウスのcoding領域内の配列情報はNCBIのウェブサイト（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/）より入手した。
[実施例５]　正常マウスにToc-Ren-1-12-22, -27, -31の各HDOを単回i.v.投与したときの肝臓におけるIHH遺伝子ノックダウン作用の比較
　実施例４で選出されたRen-1-12-22, -27, -31の3配列の中からNASH病態モデルでの薬効評価に進める配列を決めるために、正常マウスにToc-Ren-1-12-22, -27, -31の各HDO（表４）を10 nmol/kgの用量で単回i.v.投与した3日後におけるノックダウン作用を比較した。その結果、Ren-1-12-27が最も強いノックダウン率（48%）を示した（図７）。以上の結果から、Ren-1-12-27をNASH病態モデルでの薬効評価に用いることとした。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000009
[実施例６]　正常マウスにToc-Ren-1-12-27 HDOを単回i.v.投与したときの肝臓におけるIHH遺伝子ノックダウン作用の用量依存性
　実施例５で最も強いノックダウン作用を示したToc-Ren-1-12-27 HDOの投与量を1, 3, 10, 30 nmol/kgで単回i.v.投与したときの3日後におけるIHH遺伝子ノックダウン作用を調べた。その結果、図８に示すようにRen-1-12-27 は用量依存的なノックダウン作用を示した（3 nmol/kgで55%,抑制、10 nmol/kgで57%,抑制、30 nmol/kgで72%抑制）。
[実施例７]　正常マウスにToc-Ren-1-12-27 HDOを単回i.v.投与したときの肝臓におけるIHH遺伝子ノックダウン作用の経時変化のDay3とDay7との比較
　実施例５でToc-Ren-1-12-27 HDOの肝臓におけるノックダウン作用の用量依存性を投与3日後で評価したが、さらに7日後におけるIHH遺伝子ノックダウン作用を調べた。その結果、図９に示すように、Ren-1-12-27 は30 nmol/kgの投与量で投与3日後から7日後にかけて60～70％程度のノックダウン率を維持することが示された。以上より、NASH病態モデルでの評価の際にはRen-1-12-27の投与量を30 nmol/kgとし、週1回の投与で行うこととした。
[実施例８]　マウスHepa 1-6細胞におけるRen-1 ASOによるIHH遺伝子ノックダウン作用のIC50値算出
　実施例４で見出した強いノックダウン作用を示すASOのうち上位19検体についてIC50値を算出した。結果を表５に示す。実施例４の2次スクリーニングではRen-1-12-22, 27, 31が特に強いノックダウン作用を示したが、実際にIC50値を算出したところ、Ren-1-12-34が最も強いIC50値を示した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000010
[実施例９]　メチオニン・コリン欠乏飼料（MCD飼料）により作製したNASH病態モデルマウスにおけるToc-Ren-1-12-27 HDOのIHH遺伝子発現に及ぼす影響
　6週齢雌性C57BL/6Jマウスを日本チャールズリバーから購入した。メチオニン・コリン欠乏飼料(MCD飼料)及びコントロール飼料（通常食）はリサーチダイエット社より購入した。まずC57BL/6JマウスをVehicle（生理食塩水）投与群（Ｖ群）とToc-Ren-1-12-27 HDO（30 nmol(0.3mg)/kg）投与群[Ｉ(IHH)群]とに分け、さらにそれぞれの群についてMCD飼料群（Ｍ群）とNormal飼料群（Ｎ群）とに分けた。すなわち、本実験に用いるマウスは以下の計4群に分けた[（１）Vehicle投与/Normal 飼料群（ＶＮ群）、（２）Vehicle投与/MCD飼料群（ＶＭ群）、（３）Toc-Ren-1-12-27 HDO（30 nmol(0.3mg)/kg）投与/Normal飼料群（ＩＮ群）、（４）Toc-Ren-1-12-27 HDO（30 nmol(0.3mg)/kg）投与/MCD飼料群（ＩＭ群）]。給餌は初回投与（Day 0）の1週間前から開始し、Vehicle及びToc-Ren-1-12-27 HDOの投与はDay 0より週1回、5週間実施した。サンプリングは週1回行い、マウスの体重を測定後、心臓よりヘパリン採血し、肝臓組織を採取した後、肝重量を測定した。血清サンプルより血中肝臓逸脱酵素（ALT）活性、血中トリグリセライド濃度及び血中コレステロール濃度を測定した。これらの測定には、トランスアミナーゼCII-テストワコー（富士フイルム和光純薬株式会社）、ラボアッセイ(TM)トリグリセライド（富士フイルム和光純薬株式会社）、ラボアッセイ(TM)コレステロール（富士フイルム和光純薬株式会社）を使用した。各種肝臓遺伝子発現（IHH, COL1A1, CTGF, ADGRE1, ACTA2, TGFB1, CCL2, TIMP1, TNF）は、以下の方法により測定した。マウス肝臓からのTotal RNAの抽出にはReliaPrep（商標） RNA Tissue Miniprep System (Promega)を用いた。逆転写反応はPrimeScript(TM) RT Master Mix　(TaKaRa Bio)を用いて行った。定量PCR反応はLuna Universal qPCR Master Mix（NEB）を用いて行い、定量PCR装置はStepOnePlus-01（Thermo Fisher Scientific）を使用した。各遺伝子毎のプライマーとプローブはThermo Fisher Scientific にて遺伝子毎にデザイン済のTaqMan Gene Expression Assay試薬を使用した。mRNA発現量はマウス各遺伝子とマウス18SrRNAの各Ct値を測定した後、ΔΔCt法に基づく相対定量法により算出した。統計処理は3要因の分散分析（3-way ANOVA）を用いて行い、危険率は5%未満を有意とした。
　MCD飼料により作製したNASH病態モデルマウスにVehicle又はToc-Ren-1-12-27 HDO を週1回、5週間投与したマウスでのIHH 遺伝子発現に及ぼす影響を調べた結果、図１０に示すように、Day0, 7, 14においてIHHの発現が顕著に上昇し、ＶＭ群と比較してＩＭ群においてIHHの発現が顕著に低下した。
[実施例１０]　MCD飼料により作製したNASH病態モデルマウスにおけるToc-Ren-1-12-27 HDOの炎症マーカー遺伝子（TNFA及びCCL2）発現に及ぼす影響
　MCD飼料により作製したNASH病態モデルマウスにVehicle又はToc-Ren-1-12-27 HDO を週1回、5週間投与したマウスでの炎症マーカー遺伝子（TNFA及びCCL2）発現に及ぼす影響を調べた結果、図１１A、Bに示すように、ＶＮ群と比較してＶＭ群においてTNFAとCCL2の発現が顕著に上昇し、Day14でＶＭ群と比較してＩＭ群においてTNFAとCCL2遺伝子の発現が顕著に低下した。
[実施例１１]　MCD飼料により作製したNASH病態モデルマウスにおけるToc-Ren-1-12-27 HDOのマクロファージマーカー（ADGRE1）遺伝子発現に及ぼす影響
　MCD飼料により作製したNASH病態モデルマウスにVehicle又はToc-Ren-1-12-27 HDO を週1回、5週間投与したマウスでのADGRE1遺伝子発現に及ぼす影響を調べた結果、図１２に示すように、Day14の時点でADGRE1の発現が低下する傾向を示した。
[実施例１２]　MCD飼料により作製したNASH病態モデルマウスにおけるToc-Ren-1-12-27 HDOの線維化マーカー（COL1A1, CTGF, TGFB1, TIMP, ACTA2）遺伝子発現に及ぼす影響
　MCD飼料により作製したNASH病態モデルマウスにVehicle又はToc-Ren-1-12-27 HDO を週1回、5週間投与したマウスでの線維化マーカー（COL1A1, CTGF, TGFB1, TIMP, ACTA2）遺伝子発現に及ぼす影響を調べた。その結果、図１３－１Aに示すように、Day7の時点でCOL1A1遺伝子の発現が顕著に上昇し、Day35の時点でCOL1A1遺伝子の発現が有意に低下した（P<0.05）。CTGFの発現は図１３－１Bに示すようにDay14とDay28で低下傾向は示したものの、有意ではなかった。TGFB1の発現は図１３－２Aに示すようにDay14とDay35で低下傾向は示したものの、有意ではなかった。TIMPとACTA2の発現については図１３－２B及び図１３－３に示すように全期間において低下傾向はみられなかった。
[実施例１３]　MCD飼料により作製したNASH病態モデルマウスにおけるToc-Ren-1-12-27 HDOの血中肝臓逸脱酵素（ALT）活性に及ぼす影響
　MCD飼料により作製したNASH病態モデルマウスにVehicle又はToc-Ren-1-12-27 HDO を週1回、5週間投与したマウスでの血中肝臓逸脱酵素（ALT）活性に及ぼす影響を調べた結果、図１４に示すように、ＶＮ群と比較してＶＭ群においてALT活性が有意に上昇した（P<0.0001）。
[実施例１４]　MCD飼料により作製したNASH病態モデルマウスにおけるToc-Ren-1-12-27 HDOの体重及び肝重量に及ぼす影響
　MCD飼料により作製したNASH病態モデルマウスにVehicle又はToc-Ren-1-12-27 HDO を週1回、5週間投与したマウスでの体重及び肝重量に及ぼす影響を調べた結果、図１５A、Bに示すように、ＶＮ群と比較してＶＭ群において体重と肝重量が有意に低下した（P<0.0001）。
　MCD飼料により作製したNASH病態モデルマウスにビークル又はToc-Ren-1-12-27 HDOを週1回、6週間投与したマウスでの体重及び肝重量に及ぼす影響を調べた結果、図１６に示すように、ＶＮ群と比較してＶＭ群において体重及び肝重量が有意に低下（いずれもP<0.0001）した。このときＶＭ群とＩＭ群との間に有意な変化は確認されなかった。
[実施例１５]　MCD飼料により作製したNASH病態モデルマウスにおけるToc-Ren-1-12-27 HDOの血中トリグリセライド濃度及び血中コレステロール濃度に及ぼす影響
　MCD飼料により作製したNASH病態モデルマウスにVehicle又はToc-Ren-1-12-27 HDO を週1回、5週間投与したマウスでの血中トリグリセライド濃度及び血中コレステロール濃度に及ぼす影響を調べた。その結果、図１６A、Bに示すように、ＶＮ群と比較してＶＭ群において血中トリグリセライド濃度及び血中コレステロール濃度が有意に低下した（いずれもP<0.0001）。このとき、ＶＭ群とＩＭ群との間に血中トリグリセライド濃度で有意な変化は確認されなかったが、血中コレステロール濃度は有意に上昇した（P＜0.05）。
　以上の結果より、MCD飼料により作製したNASH病態モデルマウスにToc-Ren-1-12-27 HDO（30 nmol(0.3mg)/kg）を週1回、5週間投与することによりIHH mRNAの発現が低下し、代表的な線維化マーカーであるCOL1A1 mRNAの発現が有意に低下することが示された（P<0.05）。
　したがって、Toc-Ren-1-12-27 HDOはNASH治療薬となりうる化合物であることが検証された。
[実施例１６]　３次スクリーニング
　実施例１、実施例４で使用した３７本のASO（Ren-1-2、Ren-1-3、Ren-1-4、Ren-1-5、Ren-1-6、Ren-1-7、Ren-1-9、Ren-1-11、Ren-1-12、Ren-1-12-13、Ren-1-12-27、Ren-1-14、Ren-1-15、Ren-1-16、Ren-1-17、Ren-1-18、Ren-1-19、Ren-1-23、Ren-1-24、Ren-1-25、Ren-1-26、Ren-1-28、Ren-1-29、Ren-1-33、Ren-1-35、Ren-1-36、Ren-1-37、Ren-1-38、Ren-1-39、Ren-1-40、Ren-1-41、Ren-1-43、Ren-1-44、Ren-1-48、Ren-1-47、Ren-1-49、Ren-1-50）及びネガティブコントロールとしてPBS、ポジティブコントロールとしてAPOB遺伝子のアンチセンス核酸について、実施例１、実施例４と異なる核酸濃度５０ｎMにて再度スクリーニングを実施した。スクリーニングの方法は、核酸濃度５０ｎMが異なる以外は、実施例１、実施例４と同様の方法で行った。結果を図１７に示す。50nMの濃度では、Ren-1-11とRen-1-41がIHHのmRNAの発現を阻害することが示された。
[実施例１７]　正常マウス肝臓のIHH遺伝子発現に対するRen-1-12-27、Ren-1-11、Ren-1-39、Ren-1-41のノックダウン活性
　本実験は新たにin vitroスクーリングにより、IHH遺伝子発現に対し、強いノックダウン作用を示した４つのASO（Ren-1-12-27、Ren-1-11、Ren-1-39、Ren-1-41）を用いて、in vivoでのノックダウン活性を調べた。
　25匹6週齢の正常マウス（c57BL/6j）を体重により5群（Vehicle、Ren-1-12-27、Ren-1-11、Ren-1-39、Ren-1-41）に分けた。ノックダウン活性はポジティブコントロールのRen-1-12-27（17 mer）とネガティブコントールのVehicle投与群と比較した。ASOの投与量は30 nmol/10ml/kgに設定し、マウスの尾静脈より投与を行った（投与日をDay 0とした）。投与三日後（Day 3）に、マウスはイソフルラン麻酔下にて心内採血を行い、開腹し、肝臓を摘出した。肝臓組織からトータルmRNAを抽出し、逆転写、qPCRし、IHH mRNAの発現を計測した。結果を図１８に示す。
　Vehicle投与群と比較して、いずれのRen-1 ASOを投与群のIHH　mRNA発現は低下した。Ren-1-11、Ren-1-39はRen-1-12-27と同程度（20%）のノックダウン活性を示した。Ren-1-41投与群のIHH　mRNA発現はVehicle投与群に比べ、半分程度（53%）低下し、有意にノックダウンされた。
[実施例１８]　MCD餌によるマウスNASH・肝線維化に対するToc-Ren-1-12-27の影響
　6週齢のマウスをNormal Diet群とMCD（Methionine and Choline Deficient）Diet群に分け、MCD DietによるNASH・肝線維化モデルを作成した。MCD投与1週間後、Toc-Ren1-12-27を30 nmol/kgの用量で週1回、5週間、iv投与を行った。
　図１９はRen1-12-27投与 5週間後の肝臓組織のHE染色図を示す。
Vehicle投与群では、Normal Diet群（図１９a）に比べ、炎症性細胞の集まりはMCD Diet投与(図１９c)により（黒丸内）、肝臓内脂肪滴、風船様変化が多く見られる。
　一方、HDO投与群では、Normal Diet群（図１９b）においても、炎症性細胞の集まりは観察された。MCD Diet投与により多く観察された炎症性細胞の集まり(図１９c)は、HDO投与により減少し、図１９dでは観察されなかった。また、肝臓内脂肪滴、風船様変化がHDO投与群では減少傾向を示した。
　図２０はRen1-12-27投与5週間後の肝臓組織のOil red O染色図を示す。Vehicle投与群では、Normal Diet群（図２０e）に比べ、肝組織細胞の脂肪変性はMCD Diet投与(図２０g)により多く見られる（Oil red O染色により赤色に染まっている）。また、脂肪滴空胞が多く観察された。
　一方、HDO投与群では、Normal Diet群（図２０f）に比べ、脂肪変性は多く観察された(図２０h)が、Vehicle投与群(図２０g)に比べ、Oil red O染色により赤く染まっている脂肪組織と脂肪滴の数は明らかに減少した。
　図２１はRen-1-12-27投与5週間後の肝臓組織のSirius染色図を示す。今回の試験では、観察期間が短いため、Normal Diet群（図２１i）に比べ、MCD Diet（図２１k）による肝臓線維化は観察されなかった。また、MCD Diet群において、Ren-1 HDO投与群（図２１l）のコラーゲン染色はVehicle投与群（図２１k）と比較して、顕著な変化は観察されなかった。
　表６はNAFLD activity score*(NAS)の判定結果を示す。Normal Diet群において、Vehicle投与群とRen-1 HDO投与群のNASは大きな差はなく、病理診断ではNAFLDであった。
　一方、MCD Diet投与群では、Vehicle投与群のNASは5であり、病理診断はNASHであった。これに対し、Ren-1 HDO投与群のNASは3に低下し、病理診断ではBorderline NASHであった。Ren-1 HDO投与はMCD Dietによる脂肪肝形成、炎症細胞の浸潤に治療効果が認められた。
　NAS判定においても、各投与群の線維化ステージは０～1Aであり、顕著な差は認められなかった。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000011
 NAFLD: nonalcoholic fatty liver disease; NASH: nonalcoholic steatohepatitis; NAS: NAFLD activity score; 
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[実施例１９]　正常マウス由来肺線維芽細胞（MPF）におけるRen-1-12-27によるIHH　mRNA発現抑制効果
　正常マウス肺線維芽細胞 [Mouse pulmonary fibroblasts, MPF: Cat No.M3300-57]は、ScienCell Research Laboratories社より購入した。MPFを用いたRen-1-12-27によるIHH　mRNA発現抑制効果を調べる実験は以下の方法で実施した。市販の接着細胞培養用24ウェルプレートに、滅菌水で700倍に希釈したPoly-L-Lysine (PLL)溶液（ScienCell Research Laboratories）を0.5 ml/wellずつ分注し、CO2インキュベータ中にて2時間インキュベートすることによりPLLコーティングを行った。次に、事前に専用培地（Fibroblast Medium, Cat. #2301）を用いて培養させたMPFをPLLコーティングした接着細胞培養用24ウェルプレートに1×105 cells/wellになるように播種した。その翌日にリポフェクトアミン2000（Thermo Fisher Scientific）を用いてRen-1-12-27ASOをトランスフェクションした。その際のASOの用量は0、0.3、1、3、10、30 (nM)を用い、ポジティブコントロールとしてのMalat-1ASOの用量は0、10 (nM)を用いた。次にトランスフェクションしてから2日後にSV96 Total RNA Isolation System(Promega)を用いてTotal RNAを精製し、Total RNAからのcDNA合成はPrimeScriptTMRT Master Mix（TAKARA BIO INC.）を用いて実施した。qPCR反応はStepOnePlus-01（Thermo Fisher Scientific）を用いて実施し、マウスRen-1とマウス18SrRNAのプライマー/プローブはTaqMan Gene Expression Assays（Thermo Fisher Scientific）でデザインされた試薬を使用し、mRNA発現量はマウスRen-1とマウス18SrRNAの各Ct値を測定した後、ΔΔCt法に基づく相対定量法により算出した。この方法でMPFにおけるRen-1-12-27ASOによるIHH　mRNA発現抑制効果を調べた結果を図２２に示す。
　本実験の結果から、MPFにRen-1-12-27ASOをトランスフェクションすることでIHH　mRNA発現が抑制されることがわかった（図２２A）。またポジティブコントロールとして用いたMalat-1 mRNAの発現もMalat-1ASOにより抑制された（図２２B）。
[実施例２０]　正常マウス由来皮膚線維芽細胞（MDF）におけるRen-1-12-27によるIHH　mRNA発現抑制効果
　正常マウス皮膚線維芽細胞 [Mouse dermal fibroblasts, MDF: Cat No.M2300-57]は、ScienCell Research Laboratories社より購入した。MDFを用いたRen-1-12-27によるIHH　mRNA発現抑制効果を調べる実験は実施例１９と同様の方法で以下の様に実施した。すなわち、あらかじめ専用培地（Fibroblast Medium-2, Cat. #2331）を用いて培養させておいたMDFを事前にPLLコーティングした接着細胞培養用24ウェルプレートに1×105 cells/wellになるように播種し、実施例２２と同様の方法でトランスフェクション、RNA抽出、cDNA合成、qPCRを行った。このような方法でMDFにおけるRen-1-12-27ASOによるIHH　mRNA発現抑制効果を調べた結果を図２３に示す。
　本実施例の結果から、MDFにRen-1-12-27 ASOをトランスフェクションすることでIHH　mRNA発現が抑制されることがわかった（図２３A）。またポジティブコントロールとして用いたMalat-1 mRNAの発現もMalat-1ASOにより抑制された（図２３B）。
[実施例２１]　TGF-beta1刺激した正常マウス由来腎尿細管上皮細胞（MRPTEC）でのRen-1-12-27によるIHH　mRNA発現抑制効果
　正常マウス由来腎尿細管上皮細胞 [Mouse renal proximal tubular epithelial cells, MRPTEC: Cat No.M4100]は、ScienCell Research Laboratories社より購入した。MRPTECを用いたRen-1-12-27によるIHH　mRNA発現抑制効果を調べる実験は以下の方法で実施した。すなわち、あらかじめ専用培地（Epithelial Cell Medium-animal, Cat. #4131 NZ）中にて培養させたMRPTECを事前にPLLコーティングした接着細胞培養用24ウェルプレートに1×104cells/wellになるように播種し、その翌日に実施例１９と同様の方法でトランスフェクションを行った。次にその翌日に1mlのPBSで2回細胞を洗浄した後、RPMI1640、0.2%FBS、ペニシリン/ストレプトマイシンを含む培地（0.5 ml）に交換した。さらにその翌日にRen-1-12-27無添加（ネガティブコントロール）のウェルを除くすべてのウェルにTGF-beta1(10 ng/ml)を添加し、さらに24時間培養した後、RNA抽出、cDNA合成、qPCRを行った。以上の方法でTGF-beta1刺激したときのMRPTECにおけるRen-1-12-27ASOによるIHH　mRNA発現抑制効果を調べた結果を図２４に示す。
　本実施例の結果から、TGF-beta1で刺激したMRPTECにおいてRen-1-12-27ASOをトランスフェクションすることでIHH　mRNA発現が著明に抑制されることがわかった（図２４）。
　本発明の核酸複合体は、線維症治療薬として有用である。
配列番号３～１９４　合成
　本明細書で引用した全ての刊行物、特許及び特許出願はそのまま引用により本明細書に組み入れられるものとする。

Claims (25)

  1. 　１２～３０のヌクレオチドからなるオリゴヌクレオチドを含み、当該オリゴヌクレオチドがIHH遺伝子転写産物に対して相補的である核酸塩基配列を有する核酸複合体。
  2. 　前記オリゴヌクレオチドは一本鎖オリゴヌクレオチドである請求項１に記載の核酸複合体。
  3. 　前記オリゴヌクレオチドからなるアンチセンス鎖と、前記アンチセンス鎖に相補的である核酸鎖からなるヘテロ２重鎖核酸である請求項１に記載の核酸複合体。
  4. 　前記オリゴヌクレオチドが少なくとも１つの修飾ヌクレオチドを含む、請求項１～３のいずれか１項に記載の核酸複合体。
  5. 　前記オリゴヌクレオチドが少なくとも１つのホスホロチオエートオリゴヌクレオチドを含む、請求項１～４のいずれか１項に記載の核酸複合体。
  6. 　前記オリゴヌクレオチドが少なくとも１つのホスホジエステルオリゴヌクレオレオチドを含む、請求項１～５のいずれか１項に記載の核酸複合体。
  7. 　前記オリゴヌクレオチドがホスホロチオエートオリゴヌクレオチドである、請求項５に記載の核酸複合体。
  8. 　前記オリゴヌクレオチドが修飾核酸塩基を含む、請求項１～７のいずれか１項に記載の核酸複合体。
  9. 　前記修飾核酸塩基が５－メチルシトシン、２’－MOE、BNA、LNA若しくはAmNAである、請求項８に記載の核酸複合体。
  10. 　前記アンチセンス鎖に相補的である核酸鎖がRNAであることを特徴とする請求項３～９のいずれか１項に記載の核酸複合体。
  11. 　前記オリゴヌクレオチドが：
    複数の核酸からなるギャップ領域；
    複数の核酸からなる５’ウイング領域；
    複数の核酸からなる３’ウイング領域；
    を含むことを特徴とする請求項１～１０のいずれか１項に記載の核酸複合体。
  12. 　前記オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、配列番号１又は配列番号２に表すIHH遺伝子配列中の連続する１２～３０のヌクレオチドからなるオリゴヌクレオチドに相補的な塩基配列からなる、請求項１～１１のいずれか１項に記載の核酸複合体。
  13. 　前記オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、配列番号４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、５０、５２、５４、５６、５８、６０、６２、６４、６６、６８、７０、７２、７４、７６、７８、８０、８２、８４、８６、８８、９０、９２、９４、９６、９８、１００、１０２、１０４、１０６、１０８、１１０及び１１２の何れかの配列からなる、請求項１２に記載の核酸複合体。
  14. 　前記オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、配列番号２６の配列からなる、請求項１３に記載の核酸複合体。
  15. 　前記オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、配列番号１１８、１２０、１２２、１２４、１２６、１２８、１３０、１３２、１３４、１３６、１３８、１４０、１４２、１４４、１４６、１４８、１５０、１５２、１５４、１５６、１５８、１６０、１６２、１６４、１６６、１６８、１７０、１７２、１７４、１７６、１７８、１８０、１８２、１８４、１８６及び１８８の何れかの配列からなる、請求項１～１１のいずれか１項に記載の核酸複合体。
  16. 　前記オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、配列番号１６０、１７０又は１７８の配列からなる、請求項１５に記載の核酸複合体。
  17. 　請求項１～１６のいずれか１項に記載の核酸複合体を含む、IHH特異的な阻害剤を含む医薬組成物。
  18. 　請求項１に記載の核酸複合体を含む、IHH特異的な阻害剤を含む線維症の治療薬。
  19. 　請求項１～１６のいずれか１項に記載の核酸複合体を含む、IHH特異的な阻害剤を含むＮａｓｈの治療薬。
  20. 　請求項１～１６のいずれか１項に記載の核酸複合体を含む、IHH特異的な阻害剤を含む肝臓の線維症の治療薬。
  21. 　請求項１～１６のいずれか１項に記載の核酸複合体を含む、IHH特異的な阻害剤を含む腎臓の線維症の治療薬。
  22. 　請求項１～１６のいずれか１項に記載の核酸複合体を含む、IHH特異的な阻害剤を含む膵臓の線維症の治療薬。
  23. 　請求項１～１６のいずれか１項に記載の核酸複合体を含む、IHH特異的な阻害剤を含む肺の線維症の治療薬。
  24. 　請求項１～１６のいずれか１項に記載の核酸複合体を含む、IHH特異的な阻害剤を含む皮膚の線維症の治療薬。
  25. 　１２～３０のオリゴヌクレオチドを含み、配列番号１～５０の核酸塩基配列のいずれかの、少なくとも８の連続した核酸塩基を含む、核酸塩基配列を有する核酸複合体。
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