WO2020004358A1 - 3',3'-cGAMPの水和物結晶 - Google Patents
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Abstract
Description
現在、販売されている3’,3’-cGAMPは凍結乾燥品、もしくはエタノール沈殿物である。市販品の一部には結晶性固体(“crystalline solid”)として販売されているものも存在するが、購入して分析した結果、いずれも不定形で、かつ押し潰した際には劈開せずに展延し、その際の外観は、例えば図1のようである。また、吸湿性が高く数分のうちに飴状化する。このため、市販の3’,3’-cGAMP結晶性固体は、いずれも結晶でないことが明らかとなった。
また、本発明の3’,3’-cGAMPの水和物結晶のうち、アルカリ金属塩結晶は、3’,3’-cGAMP水溶液をpH4~11となるよう調整後、有機溶媒を添加するという簡便な方法によって、遊離酸結晶も、3’,3’-cGAMP水溶液に酸を添加し、pH1~3まで低下させるという簡便な方法によって、いずれも調製可能である。
上記工程(3)で使用する酸としては、塩酸、硫酸、硝酸を例示することができるが、これらに限定されない。使用する塩基としては、水酸化ナトリウムなどを例示することができるが、これらに限定されない。酸及び塩基を急激に添加することによるアモルファス化や急激な結晶析出を防ぐため、添加はゆっくり行うことが好ましい。
上記工程(4)で使用する有機溶媒としては、メタノール、エタノール等の炭素数6以下のアルコール類、アセトン等のケトン類、ジオキサン等のエーテル類、アセトニトリル等のニトリル類、ジメチルホルムアミド等のアミド類等を例示することができるが、これらに限定されない。
さらに、(2)と(3)の工程は同時に行うこともできる。同様に、(4)(5)の工程は同時に行うこともできる。
上記工程(3)で使用する酸としては、塩酸、硫酸、硝酸などを例示することができるが、これらに限定されない。酸を急激に添加することによるアモルファス化や急激な結晶析出を防ぐため、添加はゆっくり行うことが好ましい。
さらに、(2)(3)の工程は同時に行うこともできる。もしくは、(3)(4)の工程を同時に行うこともできる。
公知の方法に従って、酵素的に3’,3’-cGAMPを合成し、精製を行った。精製して得られたOD260が6200、pH8.5の3’,3’-cGAMP溶液(10mL)を、インキュベーターにて30℃に加温し、撹拌しながらゆっくりとエタノール12mLを添加した。そこにpH8.5に調整した3’,3’-cGAMP溶液にエタノールを重層して得られた種結晶 20mgを加えて種結晶が溶けないことを確認した。
(機器分析)
(A)純度検定
実施例1より得られた3’,3’-cGAMPナトリウム塩結晶の純度を、高速液体クロマトグラフィー法で分析した結果、3’,3’-cGAMP純度は99.7%であった。なお、高速液体クロマトグラフィー法は以下の条件で行った。
(条件)
カラム:Hydrosphere C18(YMC社製)
溶出液:0.1mol/L TEA-P(pH6.0)+アセトニトリル5%
検出法:UV260nmによる検出
実施例1で調製した3’,3’-cGAMPナトリウム塩結晶の代表的な写真を図2に示す。図2に示すように、本発明の3’,3’-cGAMPナトリウム塩結晶は立方体結晶形を示した。
実施例1で調製した3’,3’-cGAMPナトリウム塩結晶について、乾燥直後の結晶の水分含量をカールフィッシャー法により測定した結果、水分含量は7.9%であった。すなわち、乾燥直後の本発明の3’,3’-cGAMPナトリウム塩結晶では、3’,3’-cGAMP1分子に対し3~4分子の水分子が結合又は付着していることが明らかとなった。また、水分含量を安定させるため、43%湿度で1日保管した結晶の水分含量を、同様に測定した結果、水分含量は18.1%であった。すなわち、43%湿度で1日保管した本発明の3’,3’-cGAMPナトリウム塩結晶では、3’,3’-cGAMP1分子に対し7~8分子の水分子が結合又は付着していることが明らかとなった。
本発明の3’,3’-cGAMPナトリウム塩結晶ついて、X線回折装置X’Pert PRO MPD(スペクトリス)を用い、下記の測定条件でX線回折スペクトルを測定した。
ターゲット:Cu
X線管電流:40mA
X線管電圧:45kV
走査範囲:2θ=4.0~40.0°
前処理:めのう製乳鉢を用いて粉砕
本発明3’,3’-cGAMPナトリウム塩結晶について、フーリエ変換赤外分光光度計Spectrum One(Perkin Elmer)を用いてATR(Attenuated Total Reflectance、減衰全反射)法によって赤外線吸収スペクトルを測定した。
熱重量測定/示差熱分析(TG/DTA)装置(昇温速度5℃/分)で分析したところ、本発明の3’,3’-cGAMPナトリウム塩結晶は、吸熱ピークを有しなかった(図5)。
実施例1で調製した3’,3’-cGAMPナトリウム塩結晶について、原子吸光光度法を用いてナトリウム含量を測定した。その結果6.2%w/wであり、2分子のナトリウムが含まれることが明らかとなった。
公知の方法に従って、酵素的に3’,3’-cGAMPを合成し、精製を行った。精製して得られたOD260が168の3’,3’-cGAMP溶液(360mL)を、インキュベーターにて60℃に加温し、撹拌しながら1mol/Lの塩酸溶液をゆっくり加え、pH1.5となるように調製した。
(機器分析)
(A)純度検定
実施例より得られた3’,3’-cGAMP結晶の純度を、高速液体クロマトグラフィー法で分析した結果、3’,3’-cGAMP純度は99.5%であった。なお、高速液体クロマトグラフィー法は以下の条件で行った。
(条件)
カラム:Hydrosphere C18(YMC社製)
溶出液:0.1mol/L TEA-P(pH6.0)+アセトニトリル5%
検出法:UV260nmによる検出
実施例2で調製した3’,3’-cGAMP遊離酸結晶の代表的な写真を図6に示す。図6に示すように、本発明の3’,3’-cGAMP遊離酸結晶は八面体結晶形を示した。
実施例2で調製した3’,3’-cGAMP遊離酸結晶について、水分含量を安定させるため、43%湿度で1日保管したのち、当該結晶の水分含量をカールフィッシャー法により測定した。その結果、水分含量は24.7%であった。すなわち、本発明の3’,3’-cGAMP遊離酸結晶では、3’,3’-cGAMP1分子に対し12~13分子の水分子が結合又は付着していることが明らかとなった。
本発明の3’,3’-cGAMP遊離酸結晶ついて、X線回折装置X’Pert PRO MPD(スペクトリス)を用い、下記の測定条件でX線回折スペクトルを測定した。
ターゲット:Cu
X線管電流:40mA
X線管電圧:45kV
走査範囲:2θ=4.0~40.0°
前処理:めのう製乳鉢を用いて粉砕
本発明3’,3’-cGAMP遊離酸結晶について、フーリエ変換赤外分光光度計Spectrum One(Perkin Elmer)を用いてATR(Attenuated Total Reflectance、減衰全反射)法によって赤外線吸収スペクトルを測定した。
熱重量測定/示差熱分析(TG/DTA)装置(昇温速度5℃/分)で分析したところ、本発明の3’,3’-cGAMP遊離酸結晶は、約260℃付近に特徴的な吸熱ピークを示した(図9)。
3’,3’-cGAMP遊離酸結晶500mgを10mLの水に懸濁した後、1mol/L NaOH溶液でpH8.5に調整することによって懸濁した3’,3’-cGAMP結晶を溶解した。
溶解した3’,3’-cGAMP溶液を適宜希釈した後、凍結乾燥を行うことにより3’,3’-cGAMPのナトリウム塩の凍結乾燥品を得た。
(機器分析)
(A)純度検定
参考例より得られた3’,3’-cGAMP凍結乾燥品の純度を、高速液体クロマトグラフィー法で分析した結果、3’,3’-cGAMP純度は99.7%であった。なお、高速液体クロマトグラフィー法は以下の条件で行った。
(条件)
カラム:Hydrosphere C18(YMC社製)
溶出液:0.1M TEA-P(pH6.0)+アセトニトリル5%
検出法:UV260nmによる検出
本発明の3’,3’-cGAMPナトリウム凍結乾燥品について、X線回折装置X’Pert PRO MPD(スペクトリス)を用い、下記の測定条件でX線回折スペクトルを測定した。
ターゲット:Cu
X線管電流:40mA
X線管電圧:45kV
走査範囲:2θ=4.0~40.0°
前処理:めのう製乳鉢を用いて粉砕
本発明3’,3’-cGAMPナトリウム凍結乾燥品について、フーリエ変換赤外分光光度計Spectrum One(Perkin Elmer)を用いてATR(Attenuated Total Reflectance、減衰全反射)法によって赤外線吸収スペクトルを測定した。
熱重量測定/示差熱分析(TG/DTA)装置(昇温速度5℃/分)で分析したところ、3’,3’-cGAMP凍結乾燥品は、吸熱ピークを示さなかった(図12)。
Claims (6)
- 3’,3’-Cyclic GMP-AMPの水和物結晶。
- カールフィッシャー法にて測定したときの水分が5~30%である、請求項1に記載の結晶。
- アルカリ金属塩結晶である、請求項1または2に記載の水和物結晶。
- 3’,3’-Cyclic GMP-AMP水溶液のpH4~11に調整し、有機溶媒を添加し、析出する結晶を取得する工程からなる、請求項1から3のいずれか1項に記載のアルカリ金属塩結晶の製造法。
- 遊離酸結晶である、請求項1または2に記載の水和物結晶。
- 3’,3’-Cyclic GMP-AMP水溶液に酸を添加し、pH1~3まで低下させ、析出する結晶を取得する工程からなる、請求項5記載の遊離酸結晶の製造法。
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Non-Patent Citations (8)
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ANONYMOUS: "Nucleosides, Nucleotides, Nucleic Acids and Related Reagents", TCI, vol. L3014, 2016, pages 1 - 13 , XP055766965 * |
DINSHAW J. PATEL ET AL., CELL, vol. 153, no. 5, 2013, pages 1094 - 1107 |
GAO, J. ET AL.: "Identification and characterization of phosphodiesterases that specifically degrade 3'3'-cyclic GMP-AMP", CELL, vol. 25, no. 5, May 2015 (2015-05-01), pages 539 - 550, XP055666700, ISSN: 1001-0602 * |
HYODO, M. ET AL.: "Synthesis of cyclic bis(3'-5') diguanylic acid (c-di-GMP) analogs", TETRAHEDRON, vol. 62, no. 13, 2006, pages 3089 - 3094, XP025001725, ISSN: 0040-4020, DOI: 10.1016/j.tet.2006.01.025 * |
JOHN J. MEKALANOS ET AL., CELL, vol. 149, 2012, pages 358 - 370 |
KELLENBERGER, C. A. ET AL.: "RNA-Based Fluorescent Biosensors for Live Cell Imaging of Second Messengers Cyclic di-GMP and Cyclic AMP-GMP", JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY, vol. 135, no. 13, 2013, pages 4906 - 4909, XP055449779, ISSN: 0002-7863, DOI: 10.1021/ja311960g * |
MING C. HAMMOND ET AL., PNAS, vol. 113, no. 7, 2016, pages 1790 - 1795 |
WANG, C. ET AL.: "Synthesis of All Possible Canonical (3'-5'-Linked) Cyclic Dinucleotides and Evaluation of Riboswitch Interactions and Immune- Stimulatory Effects", JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY, vol. 139, no. 45, 15 November 2017 (2017-11-15), pages 16154 - 16160, XP055666696, ISSN: 0002-7863 * |
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