도 1은 본 발명에 따른 다능성 특성을 갖는 사람 Physics 세포의 모식도이다.
도 2a는 사람 피부 섬유아세포에 대한 초음파 강도의 효과를 나타낸 것으로, a)는 초음파 강도별 HDF의 형태 변화 비교, b)는 초음파 강도별로 생성된 다세포 스페로이드의 수이다.
도 2b는 사람 피부 섬유아세포에 대한 초음파 강도의 효과를 나타낸 것으로, c)는 초음파 처리된 HDF의 살아있는/죽은 세포 분석 결과, d)는 상기 c)에서 살아있는 및 손상된 세포의 비율이다.
도 3a는 1 W/cm2의 고정된 강도 하에서 초음파 노출시간의 효과를 나타낸 것으로, a)는 초음파 노출시간 별 HDF의 형태 변화 비교, b)는 초음파 노출시간 별로 생성된 다세포 스페로이드의 수이다.
도 3b는 1 W/cm2의 고정된 강도 하에서 초음파 노출시간의 효과를 나타낸 것으로, c)는 초음파 처리된 HDF의 살아있는/죽은 세포 분석 결과, d)는 상기 c)에서 살아있는 및 손상된 세포의 비율이다.
도 4는 사람 ESC 배양배지에 대한 초음파 강도의 효과를 나타낸 것으로, 상단은 초음파 처리된 배지에서 자란 초음파-처리된 HDF의 형태 변화 비교, 하단은 상기에서 생성된 다세포 스페로이드의 수이다.
도 5는 5 W/cm2의 고정된 강도하에서 사람 ESC 배양배지의 초음파 노출시간의 효과를 나타낸 것으로, a)는 초음파 처리된 배지에서 자란 초음파-처리된 HDF의 형태 변화 비교, b)는 상기 a)에서 생성된 다세포 스페로이드의 수이다.
도 6은 다세포 스페로이드를 생성하기 위한 초음파 처리 조건 및 배양 조건의 효과를 나타낸 것으로, a)는 부유 배양, b)는 단층 배양이다.
도 7a는 부유 배양 조건하에서 초음파 자극 별(UC, UM, UCUM)로 생성된 다세포 스페로이드의 크기 분포를 나타낸 것으로, a)는 총 크기, b)는 50-100㎛ 크기의 스페로이드의 분포이다.
도 7b는 부유 배양 조건하에서 초음파 자극 별(UC, UM, UCUM)로 생성된 다세포 스페로이드의 크기 분포를 나타낸 것으로, c)는 100-200㎛, d)는 >200㎛ 크기의 스페로이드의 분포이다.
도 8a는 단층 배양 조건하에서 초음파 자극 별(UC, UM, UCUM)로 생성된 다세포 스페로이드의 크기 분포를 나타낸 것으로, a)는 총 크기, b)는 50-100㎛ 크기의 스페로이드의 분포이다.
도 8b는 단층 배양 조건하에서 초음파 자극 별(UC, UM, UCUM)로 생성된 다세포 스페로이드의 크기 분포를 나타낸 것으로, c)는 100-200㎛, d)는 >200㎛ 크기의 스페로이드의 분포이다.
도 9a는 부유 배양과 단층 배양 조건 간의 사람 Physics 세포의 다능성 마커 유전자, OCT3/4(a) 및 SOX2(b)의 발현 수준을 비교한 RT-PCR 분석 결과이다.
도 9b는 부유 배양과 단층 배양 조건 간의 사람 Physics 세포의 다능성 마커 유전자, NANOG(c) 및 TDGF1(d)의 발현 수준을 비교한 RT-PCR 분석 결과이다.
도 10a는 부유 배양 시 OCT3/4 발현 수준을 분석한 공초점 레이저 현미경 이미지이다.
도 10b는 단층 배양 시 OCT3/4 발현 수준을 분석한 공초점 레이저 현미경 이미지이다.
도 11은 배양 6일 동안 다능성 마커 유전자 발현의 RT-PCR 분석 결과이다.
도 12는 초음파 처리된 HDF 스페로이드에서 OCT3/4 발현 시기를 배양 시간 별로 확인한 RT-PCR 분석 결과이다.
도 13은 대표 미분화 마커의 발현을 ES 세포, HDF 및 사람 Physics 세포에서 확인한 결과이다.
도 14는 다세포 스페로이드의 다능성 상태를 특성규명하기 위한 알칼라인 포스파타아제 염색 결과이다.
도 15는 다능성 마커 발현의 면역세포화학 결과이다.
도 16a는 사람 ES(H9) 세포 표면 마커의 FACS 분석 결과이다.
도 16b는 사람 HDF 세포 표면 마커의 FACS 분석 결과이다.
도 16c는 사람 Physics 세포 표면 마커의 FACS 분석 결과이다.
도 17은 Feeder 세포와 physics 세포의 공동배양 시 다능성 마커의 유전자 발현 RT-PCR(a)로, 단백질 발현을 면역세포화학법(b)으로 분석한 결과이다.
도 18은 COT3/4 및 NANOG 프로모터의 메틸화 상태를 보여주는 바이설파이트 게놈 시퀀싱 결과이다.
도 19는 사람 Physics 세포의 증식능 검증 실험 결과로, a)는 증식마커인 Ki67의 발현을 나타낸 결과, b)는 H33342 와 PI를 이용하여 증가된 세포를 염색한 결과, c)는 배양 시간에 따른 스페로이드의 크기를 나타낸 것이다.
도 20은 사람 Physics 세포의 자기-재생능 검증 실험 결과이다.
도 21a는 사람 ES(H9) 세포로부터 3배엽 마커의 발현에 대한 면역세포화학 분석 결과이다.
도 21b는 사람 Physics 세포로부터 3배엽 마커의 발현에 대한 면역세포화학 분석 결과이다.
도 22은 사람 Physics 세포의 배양 15일 동안 OCT3/4 및 3배엽 마커의 발현 패턴에 대한 면역세포화학 분석 결과이다.
도 23은 초음파 자극 조건 별 사람 Physics 세포의 SEM 이미지를 나타낸 것이다.
도 24는 초음파 자극 조건 별로 초음파 처리 후 및 2시간 배양 후 형광 이미지로 본 사람 Physics 세포의 살아있는/사멸 세포 분석결과이다.
도 25는 다세포 스페로이드의 형성 후 사람 Physics 세포의 살아있는/사멸 세포 분석 결과이다.
도 26은 초음파 자극에 의한 세포내 Ca2
+ 농도의 변화이다.
도 27은 초음파 자극에 의한 H2O2의 발생을 분석한 결과이다.
도 28은 도 27에서 초음파 처리에 의한 세포 내 H2O2의 발생을 분석하기 위해 CM-H2DCFDA로 염색된 사람 Physics 세포의 형광 이미지이다.
도 29는 초음파 자극에 의한 세포내 ATP의 방출 분석 결과이다.
도 30은 사람 Physics 세포에서 P2X 및 P2Y 수용체의 발현 패턴을 나타낸 것이다.
도 31은 사람 Physics 세포의 더 높은 침투 능력을 Quantum dot 705를 이용하여 입증하는 공초점 현미경 이미지이다.
도 32는 사람 Physics 세포 배양 배지에서 엑소좀으로부터 다능성 마커 유전자 발현에 대한 RT-PCR 분석 결과이다.
도 33은 사람 Physics 세포에서 방출된 엑소좀 OCT4에 의한 HDF로의 전달 과정을 보여주는 면역세포화학 결과로, 노란색 화살표는 주변 HDF에서 OCT3/4 발현을 나타낸 것이다.
도 34는 인 비트로 분화유도된 사람 Physics 세포의 3 배엽 마커의 발현의 면역세포화학 결과이다.
도 35는 사람 Physics 세포의 인 비트로 분화를 확인하기 위한 신경 계통 유전자 발현의 RT-PCR 분석 결과이다.
도 36은 사람 Physics 세포의 인 비트로 분화를 확인하기 위한 심장 계통 유전자 발현의 RT-PCR 분석 결과이다.
도 37은 사람 Physics 세포의 인 비트로 분화를 확인하기 위한 신경 계통 마커 발현의 면역세포화학 결과이다.
도 38은 사람 Physics 세포의 인 비트로 분화를 확인하기 위한 심장 계통 마커 발현의 면역세포화학 결과이다.
도 39는 액티닌의 면역세포화학 이미지이다.
도 40은 본 발명의 사람 Physics 세포의 핵형 분석 결과이다.
도 41은 사람 Physics 세포의 마우스 정소 내 인 비보 분화를 확인하기 위한 조직면역형광염색 결과이다.
도 42는 사람 Physics 세포의 마우스 허벅지 내 인 비보 근육분화를 확인하기 위한 조직면역형광염색 결과이다.
도 43은 세포배양배지의 효과를 나타낸 것으로, a)는 ES 배지 및 HDF 배양 배지를 이용한 결과, b)는 ES 배지 및 HDF 배양 배지에서 사람 Physics 세포를 유도하고 ES 마커를 확인한 결과이다.
도 44는 다른 세포주에서 사람 Physics 세포를 유도한 결과를 도시한 것이다. a)는 세포 형태의 변화를 나타낸 결과이며, 각각 b와 c는 다른 세포주에서 사람 Physics 세포를 유도하고 b) ES 마커 및 c) 3배엽 마커를 확인한 결과이다.
도 45는 환자 피부 세포로부터 사람 Physics 세포를 유도한 결과를 도시한 것이다. a)는 세포 형태의 변화를 나타낸 결과이며, b)는 다른 세포주에서 사람 Physics 세포를 유도하고 ES 마커와 3배엽 마커를 확인한 결과이다.
도 46은 다른 에너지 제공원으로 열 처리하여 사람 Physics 세포를 유도하고 ES 마커 및 3배엽 마커를 확인한 결과이다.
도 47은 다른 에너지 제공원으로 레이저를 사용하여 사람 Physics 세포를 유도하고 ES 마커 및 3배엽 마커를 확인한 결과이다.
도 48는 마우스 배아 섬유아세포에서 마우스 Physics 세포를 유도하는 과정을 도시한 것이다.
도 49는 형질전환된 마우스 배아 섬유아세포(OG2 MEF 세포)에 초음파 처리 후 배양시간에 대한 세포의 형태 변화와 Oct4 발현을 확인한 결과로, A는 마우스 Physics 스페로이드에서 GFP 발현을 확인한 결과이고, B는 Tile scan 사진으로 넓은 범위를 여러 장의 사진을 찍어 합친 사진도이다.
도 50은 초음파로 형성된 스페로이드의 GFP 발현율 그래프와 플로우 사이토메트리를 이용하여 초음파 처리된 전체 세포 중 GFP 발현율을 분석한 결과이다.
도 51은 마우스 Physics 세포에서의 세포 표면 미분화 마커 (SSEA1)의 발현을 플로우 사이토메트리를 이용하여 분석한 결과이다.
도 52는 마우스 Physics 세포에서 다능성 마커 유전자의 RT-PCR 분석 결과를 나타낸 것이다.
도 53은 마우스 Physics 세포에서 다능성 단백질 마커를 면역세포화학법으로 분석한 결과이다.
도 54는 마우스 Physics 세포의 다능성 상태를 특성규명하기 위한 알칼라인 포스파타아제 염색 결과이다.
도 55는 마우스 Physics 세포로부터 3배엽 마커의 발현에 대한 RT-PCR 분석 결과이다.
도 56은 마우스 Physics 세포로부터 3배엽 마커의 발현에 대한 면역세포화학법으로 분석한 결과이다.
도 57은 마우스 Physics 세포의 핵형 분석 결과이다.
이하, 본 발명의 구성을 구체적으로 설명한다.
본 발명은 배양 배지와 분화된 세포를 혼합하고, 상기의 혼합물에 에너지를 제공하여 일정 시간 배양을 통해 스페로이드(spheroid)를 형성하는 것을 포함하고,
상기 스페로이드는 다능성(pluripotency) 특성을 가진 것인, 분화된 세포에서 다능성 세포로의 역분화 방법에 관한 것이다.
본 발명은 분화된 세포로의 역분화 유도인자, 화학물질 등의 역분화 유도 물질의 도입 없이 적절한 에너지 제공을 통해 분화된 세포로부터 다능성(pluripotency) 특성을 가지면서, 공지의 유도 만능 줄기세포에 비해 분화속성이 강한 새로운 타입의 다능성 세포를 유도할 수 있는 것을 특징으로 한다.
상기 다능성 세포는 외부 환경에 따라 분화 유도가 잘되며, 줄기세포의 속성 대비 분화속성이 강한 전구세포(progenitor cell)의 속성이 더 강하다는 점에서 공지의 유도 만능 줄기세포와 차별화된 특징을 갖는다. 즉, 유도 만능 줄기세포와 같은 배아줄기세포를 세포 치료제로 사용하는 경우, 어느 정도 분화 과정을 거치는 준비 단계가 요구되며, 암으로 변할 수 있는 위험 요소를 내포하고, 역분화 유도인자 도입을 위해 바이러스 벡터를 사용함에 따른 안전성 문제가 대두되나, 본 발명의 다능성 세포는 유전자 변이를 위한 역분화 유도인자 또는 화학물질 등의 역분화 유도 물질을 별도로 도입하지 않고 유도되므로 다른 종류의 세포와 공동 배양을 통한 배양이 필요 없어 세포 오염(다른 세포가 섞이는 문제점) 문제점이 없고 인 비보 실험에서 암세포와 유사한 테라토마를 형성하지 않아 암 발생의 문제점이 없어 안전성이 확보되어 있다. 다시 말해, 본 발명의 다능성 세포는 유도 과정이 단순하고 짧아 자가세포를 처리하여 이식 때까지 시간을 획기적으로 단축할 수 있는 장점을 가진다.
본 발명은 특이적으로, 배양 배지와 분화된 세포 둘 다에 에너지를 제공함으로써 우수한 수율로 스페로이드를 생성할 수 있다.
상기 에너지는 초음파, 레이저 또는 열 처리 중 어느 하나일 수 있다.
본 발명의 다능성 세포는 OCT3/4, SOX2, NANOG, c-MYC, KLF4, TDGF1, SSEA4, TRA-1-60, PAX6, Nestin, Brachyury, SMA, GATA4, 또는 AFP 중 어느 하나의 미분화 마커 또는 중배엽 및 내배엽으로 이루어진 3배엽 마커 유전자를 안정적으로 발현하는 것을 특징으로 한다.
상술한 바와 같이 분화된 세포로의 역분화 유도인자의 도입 없이 다능성 세포가 형성되는 점에 대해 본 발명자들은 엑소좀과의 연관성을 고려하였다. 즉, 초음파, 레이저, 또는 열 처리는 에너지에 의한 온도 상승, ROS(reactive oxygen species) 생성 유도, 초음파에 의해 생성되는 마이크로버블의 진동, 액체의 흐름 생성 유도 즉, 세포막을 따라 마이크로스트림 생성을 유도하여 이러한 효과로 인해 세포막에 미세한 손상을 가하고, 구멍 생성을 유도함으로써 외부 물질의 흡수가 증가하도록 하는데, 이는 세포 내 Ca2
+ 농도 변화 분석과 H2O2 생성 여부를 확인함으로써 입증된다. 즉, 세포 내 Ca2
+ 농도 변화 분석은 세포막에 손상이나 막의 유동성이 증가될 경우 순간적으로 세포 내(cytosol) Ca2
+ 농도가 증가함을 반영하여 세포막 유동성의 증가를 확인하는 것으로, 본 발명의 일 구체예에 따르면, 초음파 처리 직후 Ca2
+ 농도가 빠르게 증가하다가 점차 감소하여 초음파를 처리하지 않는 대조군의 수준으로 감소함을 통해 세포막의 손상이 유도된 후 회복됨을 알 수 있었다. 또한, 세포 내 H2O2 생성 여부를 확인한 실험 역시 이와 유사한 패턴으로 초기 초음파 처리 직후에는 H2O2 생성량이 증가하다 점차 대조군 수준으로 감소함을 통해 세포막의 손상이 유도된 후 회복됨을 알 수 있었다. 또한, ATP가 다양한 세포성 스트레스에 대한 반응 신호로 이용되어 초음파 처리 후 다능성 세포에서의 ATP 농도를 분석한 결과, 미처리 대조군에 비해 높은 수준으로 ATP를 방출하였다. 아울러, ATP 방출에 의한 이온향성 P2X 수용체와 대사성 P2Y 수용체의 발현 역시 다능성 세포에서 대조군 대비 활성화되었다.
한편, 엑소좀은 내부에 유전정보 물질(DNA, mRNA, microRNA, protein)을 포함하고 있는 것으로 알려져 있는데, 세포막 손상을 통해 세포막 밖으로 빠져 나온 엑소좀이 주변 다른 세포에 다시 들어가는 과정을 통해 엑소좀 내부에 존재하는 유전정보 물질이 전달될 수 있다. 따라서, 초음파 처리에 의한 자극으로 인해 세포 내 저발현되거나 발현이 억제된 상태로 유지되었던 미분화 마커들의 발현이 유도 내지 촉진됨과 동시에 세포막에 손상이 생김에 따라, 상기 발현이 유도 내지 촉진된 미분화 마커들을 포함하는 세포 내부에 존재하는 엑소좀이 외부로 배출되어 주변 세포에 전달되는데 주변 세포 역시 세포막이 부분적으로 손상된 상태이기 때문에 세포막 유동성이 증가되어 세포 내부로 엑소좀이 들어가는 효율이 정상 상태에 비해 더 높을 것으로 추정되며, 이러한 엑소좀 내부에 존재하는 상기 발현 유도 내지 촉진된 미분화 관련 유전정보가 전달되어 다능성 세포가 만들어지는 것으로 생각되었다. 본 발명의 일구체예에서 다능성 세포 유도 과정 중 배양 배지를 회수하고, 배지 내 엑소좀을 추출하여 엑소좀 내부에 다능성 세포 관련 미분화 마커가 존재하는지 확인한 결과, 알려진 미분화 마커들이 높은 발현 정도를 보이면서 확인되어 본 발명자들의 이러한 가설을 뒷받침하는 것으로 사료된다. 또한, 이러한 초음파, 레이저, 또는 열 처리에도 핵형 기형이 없이 정상인 것으로 나타났다.
이러한 가설은 세포막 손상에 의한 엑소좀 방출 유도를 통해 다능성 세포를 제조할 수 있음을 가능케 한다.
본 명세서에서, 용어 "다능성 세포"는 에너지, 엄격한 의미에서 초음파, 레이저, 또는 열 처리 후 다능성을 획득한 세포를 말한다. 본 명세서에서 상기 다능성은 배아줄기세포에서 발현되는 미분화 마커를 안정적으로 발현하는 상태를 의미한다. 아울러, 세 종류의 내배엽, 외배엽 및 중배엽의 3배엽 마커를 발현하는 상태를 의미한다. 상기 다능성 세포는 "Physics( p luripotent sp h ere y ielded by ultra s on ic s timulus) 세포", 또는 "Physics 스페로이드"와 혼용되어 사용될 수 있다. 본 발명의 분화된 세포에서 다능성 세포로의 역분화 방법을 도면 1을 참조하여 구체적으로 설명하면 다음과 같다.
우선, 세포 배양 배지와 분화된 세포를 혼합하고, 상기의 혼합물에 에너지를 제공한다.
분화된 세포의 혼합물에 에너지를 제공하기 전에 세포 배양 배지에 에너지를 제공하여 다능성 세포로의 역분화 효율을 높일 수 있다.
상기 에너지는 초음파, 레이저 또는 열처리 중 어느 하나일 수 있다.
상기 배양 배지에 대한 초음파 처리는 출력강도 1W/cm2
내지 20W/cm2의 초음파를 1 내지 20 분, 구체적으로, 출력강도 2W/cm2
내지 10W/cm2의 초음파를 5 내지 15 분, 더 구체적으로, 출력강도 3W/cm2
내지 7W/cm2의 초음파를 7 내지 13 분 동안 동안 동안 수행하는 것일 수 있다.
배양 배지에 대한 레이저 처리는 300 내지 900 nm 파장 대역의 펄스형 레이저 빔을 1초 내지 20초, 더 구체적으로, 상기 파장 대역의 펄스형 레이저 빔을 3초 내지 10초, 보다 구체적으로, 상기 파장 대역의 펄스형 레이저 빔을 4초 내지 6초 동안 조사하는 것일 수 있다. 상기 파장 대역은 예를 들어 400 nm, 808 nm, 880 nm의 파장을 사용할 수 있다.
배양 배지에 대한 열 처리는 40 내지 50 ℃의 온도 조건에서 5분 내지 20분 동안 수행할 수 있다.
상기 배양 배지로, 배아 줄기세포 배양 배지, 줄기세포 분화유도 배지 등을 사용할 수 있다.
상기 분화된 세포로, 포유류 유래의 섬유아세포; 자궁경부암세포(HeLa cell)를 포함하는 암세포; 또는 폐 상피세포(L132 cell)를 포함하는 기관 내 조직세포 등을 사용할 수 있다.
분화된 세포에 에너지를 제공할 경우, 일정 세기로 노출시키는 것이 좋고, 이 범위를 벗어날 경우 세포 생존율이 감소할 수 있다.
따라서, 배양 배지와 분화된 세포의 혼합물에 대한 초음파 처리는 출력강도 0.5W/cm2 내지 3W/cm2로 1 내지 5초 동안, 더 구체적으로, 출력강도 0.7W/cm2 내지 2W/cm2로 1 내지 5초 동안, 보다 구체적으로, 출력강도 0.8W/cm2 내지 1.5W/cm2로 1 내지 5초 동안 수행하는 것일 수 있다.
배양 배지와 분화된 세포의 혼합물에 대한 레이저 처리는 300 내지 900 nm 파장 대역의 펄스형 레이저 빔을 1초 내지 20초, 더 구체적으로, 상기 파장 대역의 펄스형 레이저 빔을 3초 내지 10초, 보다 구체적으로, 상기 파장 대역의 펄스형 레이저 빔을 4초 내지 6초 동안 조사하는 것일 수 있다. 상기 파장 대역은 예를 들어 400 nm, 808 nm, 880 nm의 파장을 사용할 수 있다.
배양 배지와 분화된 세포의 혼합물에 대한 열 처리는 40 내지 50 ℃의 온도 조건에서 1분 내지 10분 동안 노출한 후 0℃ 내지 4℃의 온도 조건에서 5 내지 10초간 노출하여 수행하는 것일 수 있다.
다음으로, 에너지가 제공된 혼합물을 일정 시간 동안 배양하여 다능성을 갖는 스페로이드(spheroid)를 형성시킨다.
에너지가 제공된 혼합물의 배양은 부유 배양(suspended culture) 또는 단층 배양(monolayer culture) 방식을 통해 미분화 마커를 안정적으로 발현하는 스페로이드가 형성되는 기간, 즉, 3일 내지 10일 동안 수행하는 것일 수 있다. 다만, 상기 배양 시간은 배양 방식, 세포 또는 배양 배지의 종류에 따라 다능성을 갖는 스페로이드 형성 여부가 달라 당업자 수준에서 적절히 조절될 수 있다.
본 발명의 일 구체예에 따르면, 부유 배양은 단층 배양에 비해 더 높은 스페로이드 형성 효율을 나타낸다. 또한, 부유 배양은 단층 배양에 비해 스페로이드의 수와 크기가 더 크며, 일정한 크기 분포를 나타낸다.
본 발명의 일구체예에 따르면, 초음파 또는 레이저 처리된 사람 피부 섬유아세포의 부유 배양 시 대략 3일째부터 미분화 마커의 발현이 증가하거나 안정화되어 이 시기부터 역분화가 시작되는 것으로 보인다. 또한, 열 처리된 사람 피부 섬유아세포의 부유 배양 시 대략 8일째부터 미분화 마커의 발현이 증가하거나 안정화되어 이 시기부터 역분화가 시작되는 것으로 보인다.
미분화 마커, 예컨대, OCT3/4, SOX2, NANOG, c-MYC, KLF4, TDGF1, SSEA4, TRA-1-60 등이 발현됨을 통해 스페로이드가 다능성을 가짐을 확인할 수 있다. 미분화 마커의 확인은 RT-PCR 또는 면역세포화학법을 통해 분석할 수 있으나, 이에 특별히 제한하는 것은 아니다.
또한, 본 발명의 다능성 세포는 3배엽 마커, 즉 외배엽(PAX6, Nestin), 중배엽(Brachyury, SMA), 내배엽(GATA4, AFP) 마커들을 높은 수준으로 발현하는 특징을 나타낸다.
또한, 본 발명의 다능성 세포는 증식 마커 단백질인 Ki-67를 발현하여 증식능을 가지는 특징이 있다.
또한, 상기의 역분화된 다능성 세포를 영양세포와 공배양할 경우 다능성 세포의 증식이 증가되고, 분화 유도 배지에서 배양 후 외배엽/내배엽/중배엽 및 신경세포/심근세포로 분화되는 것을 확인할 수 있다.
본 발명은 또한
세포 및 배양 배지를 수용할 수 있는 배양챔버; 및
상기 배양챔버의 일측에 배치되고, 상기 세포 및 배양 배지에 에너지를 제공할 수 있는 장치를 포함하고,
분화된 세포와 배양 배지를 혼합하고, 상기의 혼합물에 에너지를 제공하여 일정 시간 배양을 통해 스페로이드(spheroid)를 형성하며, 상기 스페로이드는 다능성(pluripotency) 특성을 가진 것인, 다능성 세포 유도 장치를 제공한다.
상기 배양챔버는 통상 세포 배양에 사용되는 배양기를 의미한다. 예컨대, 배양챔버는 온도 제어부와 이산화탄소 제어부가 구비되어 있고, 배양챔버 내 세포 배양 조건은 목적과 세포의 종류에 따라 당업자 수준에서 적절히 조절될 수 있다.
또한, 상기 배양챔버는 분화된 세포에서 다능성 세포로 역분화시킴에 있어서 부유 배양 또는 단층 배양 방식을 사용할 수 있어, 이러한 배양이 가능한 구조로 되어 있는 것이 좋다. 예컨대 부유 배양을 위한 교반기가 구비된 배양챔버일 수 있다.
상기 에너지를 제공할 수 있는 장치는 초음파를 조사할 수 있는 초음파 발생장치, 레이저를 조사할 수 있는 레이저 발생장치, 또는 온도조절장치를 포함할 수 있다.
상기 초음파 발생장치는 주파수가 10kHz 내지 100MHz인 초음파를 발생하는 공지의 초음파 장치라면 제한 없이 사용할 수 있다.
상기 레이저 발생장치는 300 내지 900 nm 파장 대역의 펄스형 레이저 빔을 발생하고, 1 내지 15W 출력으로, 펄스 지속 시간이 1ms 내지 900ms이고, 주파수가 1 내지 100Hz인 레이저 장치를 사용할 수 있으나, 이에 특별히 제한하는 것은 아니다.
온도조절장치는 -40℃ 내지 99.9℃ 범위의 온도 조절이 가능한 공지의 온도조절장치를 사용할 수 있으나, 이에 특별히 제한하는 것은 아니다.
본 발명의 다능성 세포 유도 장치는 배양 배지와 분화된 세포의 혼합물에 상기 초음파 발생장치, 레이저 발생장치, 또는 온도조절장치를 이용하여 초음파, 레이저, 또는 열 처리하고 일정 시간 배양을 통해 다능성을 갖는 스페로이드(spheroid)를 형성함으로써 분화된 세포에서 다능성 세포로 역분화 시킬 수 있다. 이때, 역분화 효율을 높이기 위해 배양 배지를 분화된 세포와 혼합하기 전에 배양 배지에 초음파, 레이저, 또는 열 처리를 미리 수행할 수 있다.
이하, 본 발명을 실시예에 의해 상세히 설명한다. 단, 하기 실시예는 본 발명을 예시하는 것일 뿐, 본 발명의 내용이 하기 실시예에 한정되는 것은 아니다.
<실시예 1> Physics 세포의 제조
도 1은 본 발명의 Physics( p luripotent sp h ere y ielded by ultra s on ic s timulus) 세포 형성 모식도로, 5W/cm2의 강도로 10분간 초음파 처리한 ES(embryonic stem) 배지에 사람 피부 섬유아세포(HDFa, Cat. No. C-013-5C, GIBCO(Invitrogen cell culture))(1×106)를 섞고, 세포를 포함하는 혼합물에 초음파를 5초간 1W/cm2의 강도로 처리하였다. 살아있는 세포를 선별한 후, 35 mm 세균용 페트리 접시에서 2×105의 HDF를 사람 ES 배양 배지에서 6일 동안 부유 배양하였다.
배양 1일째부터 스페로이드(spheroid)가 형성되고, 3일 이후부터 미분화 마커들이 발현된다.
<실험예 1> 스페로이드 형성의 최적 조건 실험
사람 피부 섬유아세포는 초음파 처리 시 스페로이드를 형성하므로 스페로이드 형성 효율을 높이기 위한 최적 조건 확립을 위해 초음파 처리 조건, 세포 배양 방식 등을 달리하여 실험하였다.
세포 배양 방식은 세포 배양 접시 표면이 코팅되지 않은 접시(세균용 페트리 접시)에서 배양하는 부유 배양(Suspended culture)과 세포 배양 접시 표면이 코팅되어 세포가 표면에 잘 붙는 접시(조직 배양 접시)에서 배양하는 단층 배양(Monolayer culture)을 사용하였다.
또한, 대조군으로 아무런 처리를 하지 않은 그룹(Null), 배지에 초음파를 처리한 그룹(UM: Ultrasound treated Media, 5W/cm2의 초음파 강도로 10분간 처리), 세포에 초음파를 처리한 그룹(UC: Ultrasound treated Cell, 1W/cm2의 초음파 강도로 5초간 처리) 및 세포와 배지에 초음파를 모두 처리한 그룹(UCUM: UM+UC)으로 나누고, 배양시간에 따른 세포 형태의 변화를 관찰하고, 스페로이드의 수를 측정하여 배양시간에 따른 스페로이드 수와 크기의 변화를 분석함으로써 스페로이드 형성 효율을 확인하였다. 실험 대상 세포는 사람 피부 섬유아세포이다.
우선, 초음파 강도 조건을 확립하기 위해, 초음파 강도(5초간 0, 0.5, 1, 3, 5, 10 W/cm2) 별로 HDF(1×106)에 직접적으로 노출시켰다. 살아있는 세포를 선별한 후, 35 mm 세균용 페트리 접시에서 2×105의 HDF를 사람 ES 배양 배지에서 6일 동안 배양하였다.
ES 배지 조성
시약명 |
용량 |
최종농도 |
비고 |
DMEM/F-12 |
500mL |
500mL |
|
Serum Replacement (KnockOut™ Serum Replacement) |
100mL |
20% |
|
NEAA (non-Essential Amino Acids) |
5mL |
1% |
|
P/S (Peniciline & Streptomycin) |
5mL |
1% |
|
β-Mercaptoethanol |
0.9mL |
0.1mM |
|
Glutamin (L-Glutamine, 200 mM Solution) |
2.5mL |
1mM |
|
basic human fibroblast growth factor 2 (FGF) (Recombinant Human FGF-Basic) |
2mg |
4ng/mL |
초음파 처리 후 첨가 |
도 2a의 (a)에 나타난 바와 같이, 0.5, 1 및 3 W/cm2의 초음파 강도에서, 초음파 처리된 대부분의 HDF는 자발적으로 응집되고, 다세포 스페로이드를 형성하였다. 대조군은 접시 표면에 부착되어 있으나, 5 및 10 W/cm2
강도의 초음파가 처리된 HDF는 스페로이드 형성 없이 세포 사멸이 증가되었다.
도 2a의 (b)는 도 2a의 (a)에서 초음파 강도 별로 생성된 다세포 스페로이드의 수를 나타낸 것이다.
1 W/cm2의 초음파 강도에서 살아있는/죽은 세포 분석 및 이미지 분석 결과, 도 2c 및 2d에 나타난 바와 같이, 25%의 세포가 부분적으로 손상을 받았고, 95% 이상의 세포 생존능이 유지되었다. 그러나, 1 W/cm2
보다 높은 초음파 강도에서, HDF는 심각하게 손상을 받아 세포 사멸에 이르렀다.
따라서, 1 W/cm2
의 고정된 초음파 강도 조건에서, 노출 시간(0, 1, 2, 5, 10, 20, 40초)을 달리하고, 35 mm 세균용 페트리 접시에서 사람 ES 세포배양배지에서 3일간 배양하였다.
도 3a 및 3b의 (a)-(d)에 나타난 바와 같이, 초음파에 5초 간 노출시킨 경우, 생성된 스페로이드의 수는 다른 노출 시간에 비해 가장 높았다. 그러나, 10초 이상 노출한 경우, 세포 사멸이 극적으로 증가하였는데, 이는 세포막 손상에서 기인한 것으로 보인다.
다음으로, ES 세포배양배지에 초음파 노출 강도(0, 1, 5, 10 W/cm2)를 달리하여 10분간 처리하였다. 35 mm 세균용 페트리 접시에서 초음파 노출된 2×105 HDF(1 W/cm2, 5초)를 이들 배지에서 3일간 배양하였다.
도 4에 나타난 바와 같이, 1W/cm2 보다 5 W/cm2
의 초음파 처리된 배양배지에서 약 2배의 스페로이드가 발생하였다.
노출시간(0, 5, 10, 20분)의 변화는 스페로이드 형성 효율에 대해 유의적인 효과를 보여주지는 않았다. 일반적으로, 짧은 노출시간이 일정한 크기 범위와 더 많은 수를 야기하였다(도 5).
다음으로, 배양 조건을 달리하였을 때 스페로이드 형성 효과를 조사하기 위해, ESC 배양배지에 초음파를 처리하고(5 W/cm2, 10분), HDF(1×106)에 초음파를 처리하였다(1 W/cm2, 5초). 살아있는 HDF(×105)를 선별한 후 세균용 페트리 접시에서 부유 배양하거나, 조직 배양 접시에서 단층 배양을 수행하였다.
도 6에 나타난 바와 같이, 부유 배양(suspended culture)된 초음파-처리된 HDF는 단층 배양된 것과 비교하여 더 높은 스페로이드 형성 효율을 보여주었다. 그리고 초음파의 자극을 세포와 배양배지 양쪽에 자극을 주었을 때 더 높은 스페로이드 형성 효율을 보여주었다
부유 배양 또는 단층 배양 하에서 초음파 자극별로 생성된 다세포성 스페로이드의 크기 분포를 보기 위해, 초음파 처리된 HDF 또는 비처리 HDF를 세균용 페트리 접시 또는 조직 배양 접시에서 초음파 처리 또는 비처리된 ES 배양배지에서 배양하였다.
도 7 및 도 8에 나타난 바와 같이, 두 배양 접시에서, HDF 및 배양배지 둘 다 초음파 처리될 때(UCUM) 더 높은 스페로이드 형성 효율이 관찰되었다.
또한, 부유 배양 조건은 더 높은 효율을 보여주며, 스페로이드는 수와 크기 면에서 크며(200㎛ 이상의 직경), 단층 배양(monolayer culture) 조건 보다 일정한 크기 분포를 나타냈다.
비처리된 ES 세포배양배지에서 자란 초음파 처리된 HDF(UC)는 스페로이드를 형성하였다. 그러나, UCUM 조건과 비교하여, 스페로이드의 수와 크기(200㎛까지)는 너무 낮다. 초음파 처리된 ES 세포배지에서 정상 HDF 배양(UM) 결과 크기가 작은(100㎛ 이하) 소량의 스페로이드가 형성되었다. 조직배양접시를 이용한 단층 배양의 UC 및 UM 조건은 스페로이드 형성 효율이 너무 낮았다. 대부분의 HDF는 배양접시 표면에 부착되어 있고, 스페로이드 수는 너무 작았다.
그리고 부유 배양 또는 단층 배양 하에서 초음파 자극별로 생성된 다세포성 스페로이드의 배양 시간별 대표적인 미분화 유전자의 발현을 분석하기 위해, 상기 실시예 1의 방법에 따라 대조군 및 초음파 처리된 그룹(Null, UM, UC, UCUM)의 세포를 배양시간(1, 2, 3, 4, 5 및 6일) 별로 회수하여 Dynabeads® mRNA direct kit(ambion)를 이용하여 mRNA를 추출하고, SuperScrip-Ⅱ(invtrogen) cDNA를 합성한 후 표 2 에 기재된 프라이머를 사용하여 PCR로 증폭하고 전기영동하여 분석하였다.
RT-PCR을 통해 분석한 결과 도 9에서 HDF 및 배양배지 둘 다 초음파 처리될 때(UCUM) 미분화 마커 유전자의 발현이 안정적으로 발현되었으며, 특히 부유 배양한 경우가 단층 배양세포에 비해 더 높게 나타났다.
배양 환경에 따른 미분화 속성의 스페로이드 형성 차이를 확인하고자 부유 배양 또는 단층 배양 하에서 미분화 마커인 OCT3/4 발현 수준을 비교하였다. 이를 위해, 초음파 처리 후 배양시간(0, 1, 2, 3, 4, 5 및 6일) 동안 배양된 세포를 4% 파라포름알데히드로 30분간 고정하고, 항체의 침투능력을 향상시키기 위해 0.1% TritonX100이 첨가된 PBS 버퍼에 40분간 노출시킨 후, 비 특이적인 단백질 반응을 막기 위해 5% non goat serum이 첨가된 PBS 버퍼로 30분간 실온에서 블록킹 과정을 수행하였다. 이후 세포를 세척한 후 각각의 1차 항체(OCT4; 1:200, abcam)를 넣고 4℃에서 오버나이트 동안 반응시키고, 0.03% Triton X100이 첨가된 PBS 버퍼로 3회 세척 후 2차 항체(IgG anti-rabbit conjugate alexa 488)를 D-PBS 버퍼로 각각 1:1000으로 희석하여 2시간 동안 실온에서 염색하였다. 염색된 세포는 0.03% TritonX100이 첨가된 PBS 버퍼를 사용하여 4회 세척한 후 슬라이드에 DAPI가 첨가된 마운팅 용액(mounting sol.)을 뿌려 커버 슬립으로 덮고 매니큐어로 모서리를 밀봉한 후 공초점 레이저 현미경으로 관찰하였다.
도 10에 나타난 바와 같이, 흥미롭게도, UCUM 조건에서 초음파 처리 1일 이후 즉시 OCT3/4 발현이 검출되었다. OCT3/4 발현은 점차 증가하고, 부유 배양 조건은 단층 배양 조건보다 더 높은 발현 수준을 보여주었다.
다음으로, 부유배양으로 UCUM 조건하에서 스페로이드 배양 6일 동안, 6가지의 미분화 마커 유전자인 OCT3/4, SOX2, NANOG, TDGF1, c-MYC 및 KLF4를 RT-PCR로 분석한 결과, 도 11에서와 같이 처리 후 1일에 OCT3/4와 NANOG유전자 발현이 증가 하였으며, 이후 다른 유전자의 발현도 배양시간이 지남에 따라 증가되는 것으로 나타났으며, 모든 마커 유전자의 발현이 2일에 관찰되었으나 안정적인 발현은 3일 이후에 관찰되었다. 최초의 OCT3/4 발현 시점은 초음파 처리 10시간 후 즉시 검출되었다(도 12).
Physics 세포의 미분화 능력을 확인하기 위해 4종의 무작위로 선별된 스페로이드에서의 RT-PCR 결과 OCT3/4, SOX2, NANOG, REX1, TDGF1, FOXD3, FGF4, UTF1, ESG1, LIN28a, KLF4, c-MYC를 포함하는 다능성 마커 유전자의 발현을 확인하였고, 사람 H9 ESC 및 정상 HDF와 비교하였다(도 13). 실험은 5일 배양된 physics 세포를 회수 하여 Dynabeads® mRNA direct kit(ambion)를 이용하여 mRNA를 추출하고, SuperScrip-Ⅱ(invtrogen) cDNA를 합성한 후 표 2에 기재된 프라이머를 사용하여 PCR로 증폭하고 전기영동하여 분석하였다.
유전자 명칭 |
프라이머 서열 (5'->3') |
OCT3/4 |
F |
GACAGGGGGAGGGGAGGAGCTAGG |
R |
CTTCCCTCCAACCAGTTGCCCCAAAC |
SOX-2 |
F |
GGGAAATGGGAGGGGTGCAAAAGAGG |
R |
TTGCGTGAGTGTGGATGGGATTGGTG |
NANOG |
F |
CAGCCCCGATTCTTCCACCAGTCCC |
R |
CGGAAGATTCCCAGTCGGGTTCACC |
c-Myc |
F |
AAACACAAACTTGAACAGCTAC |
R |
ATTTGAGGCAGTTTACATTATGG |
KLF4 |
F |
CCCACATGAAGCGACTTCCC |
R |
CAGGTCCAGGAGATCGTTGAA |
UTF1 |
F |
CCGTCGCTGAACACCGCCCTGCTG |
R |
CGCGCTGCCCAGAATGAAGCCCAC |
LIN28 |
F |
AGCGCAGATCAAAAGGAGACA |
R |
CCTCTCGAAAGTAGGTTGGCT |
REX1 |
F |
CAGATCCTAAACAGCTCGCAGAAT |
R |
GCGTACGCAAATTAAAGTCCAGA |
FGF4 |
F |
CTACAACGCCTACGAGTCCTACA |
R |
GTTGCACCAGAAAAGTCAGAGTTG |
FOXD3 |
F |
AAGCTGGTCGAGCAAACTCA |
R |
CTCCCATCCCCACGGTACTA |
ESG1 |
F |
ATATCCCGCCGTGGGTGAAAGTTC |
R |
ACTCAGCCATGGACTGGAGCATCC |
TDGF1 |
F |
CTGCTGCCTGAATGGGGGAACCTGC |
R |
GCCACGAGGTGCTCATCCATCACAAGG |
B-ACTN |
F |
CATGTACGTTGCTATCCAGGC |
R |
CTCCTTAATGTCACGCACGAT |
알칼라인 포스파타아제(AP) 염색 결과, 다세포 스페로이드의 다능성 상태의 특징을 나타내는 것으로 확인하였다. 부유 배양된 스페로이드는 단층 배양된 스페로이드보다 뚜렷한 붉은색을 나타내었다(도 14).
OCT3/4, SOX2, NANOG, SSEA-4 및 TRA-1-60의 발현은 H9 사람 ES 세포와 유사하였다(도 15). 또한, 다세포 스페로이드의 다능성 특성은 플로우 사이토메트리를 통해 확인하였다(도 16). SSEA4 및 TRA-60의 99.5% 이상이 스페로이드에서 발현되었고, 각 발현 수준은 H9 사람 ES 세포와 유사하였다.
또한, 스페로이드를 옮겨 마우스 배아 섬유아세포(MEF) 영양세포와 젤라틴-코팅된 조직배양 플레이트에서 공배양(coculture)하였을 때, 세포 스프레딩과 성장이 관찰되었다. 또한, 다능성 마커 유전자의 발현이 여전히 유지되었다(도 17).
또한, 미분화 마커의 발현을 추가로 확인하기 위해, DNA 메틸화 분석을 수행하였다. 유전자 발현이 시작되는 프로모터 부분이 메틸화가 되면 그 부분에서 유전자 발현이 되지 않는 것으로 알 수 있고, 탈메틸화된 경우 즉 DNA에서 메틸기가 떨어진 경우 그 부분의 유전자가 발현됨을 의미한다. 따라서, ES 세포의 주요 유전자인 미분화 줄기세포 주요 유전자인 OCT3/4와 NANOG 유전자 발현이 일어나고 있는지 두 유전자의 프로모터 부분의 메틸화 여부를 알아보았다.
이를 위해, Physics 스페로이드에서 DNA를 proteinase K와 페놀을 이용하여 추출한 후, EZ DNA 메틸화 키트(Zymo Reaserch)를 이용하여 Physics 스페로이드의 OCT3/4와 NANOG DNA 메틸화를 분석하였다. 분석에 이용한 DNA 증폭용 프라이머는 아래와 같다.
1) 사람 NANOG 증폭용 프라이머:
정방향 프라이머: 5'-TAGGAGTAGAGTGTAGAGGAGAATGAGTTA-3'
역방향 프라이머: 5'-ATCTATCCCTCCTCCCAAATAATC-3'
증폭 산물의 크기: 377 bp, Tm: 55, 산물에서 CpGs: 6
2) 사람 OCT4 증폭용 프라이머:
정방향 프라이머: 5'-TTTTTTTAAATTAGAAATTTTAATTATTTG-3'
역방향 프라이머: 5/-AATTACAAAAACCATACCTACAACC-3'
증폭 산물의 크기: 417bp, Tm: 55, 산물에서 CpGs: 4
바이설파이트 게놈 시퀀싱에 의해 평가되는 다능성-특이 OCT3/4 및 NANOG 유전자의 프로모터 영역에서 사이토신 구아닌 다이뉴클레오타이드(CpG)의 메틸화는 Physics 세포가 ES 세포와 유사하게 고도로 탈메틸화되나, 오리지널 HDF 세포에서 이 영역의 CpG 다이뉴클레오타이드는 낮은 탈메틸화가 보였다(도 18). 이들 결과는 OCT3/4와 NANOG 프로모터는 초음파 처리에 의해 활성화됨을 시사한다.
<실시예 2> Physics 세포의 증식능 및 다분화 능력
Physics 세포의 증식능은 증식 마커 단백질인 Ki-67 면역염색 방법 및 p스트(Hoechst 33342)와 프로피디움 아이오다이드(PI)을 이용한 시간 차 세포 핵 염색을 통해 평가하였다.
도 19에 나타난 바와 같이, 5일째에, Physics 세포에서 Ki-67의 발현이 검출되었다.
이에 더 확실한 증명을 위해 다음과 같은 방법을 통해 세포 증식을 확인하였다. 침투성이 좋아 살아있는 세포의 핵에 염색이 가능한 Hoechst 33342를 이용하여 5일째 배양된 Physics 세포를 염색하고 염색 시약을 완전히 제거 후 3일간 배양하고 나서, 총 8일간 배양된 Physics 세포를 4% paraformaldehyde로 고정 한 후 추가로 PI로 세포 핵을 염색하였다. 중복되지 않은 붉은색 신호는 5일 이후 세포분열에 의해 새롭게 형성된 Physics 세포를 의미한다. 또한, 동영상을 통해 단일 스페로이드를 5일간 배양하여 스페로이드 직경을 측정한 결과 크기의 증가를 통해 Physics 세포의 증식능을 입증한다.
Physics 세포의 자기-재생 능력을 평가하기 위해, Hoechst 33342로 염색된 Physics 세포를 추가로 5일간 배양하고 나서, 4% paraformaldehyde로 고정한 후 PI 및 OCT3/4로 다시 염색하였다. PI 신호는 Physics 세포 내 핵을 의미한다. Hoechst 33342와 거의 합병된 OCT3/4로 대비 염색된 핵은 Hoechst 33342가 5일 전에 Physics 세포를 염색하였음을 의미한다.
도 20에 나타난 바와 같이, 추가 배양의 5일 동안, 다능성 특성(OCT3/4)이 딸 Physics 세포로 전달되지 않았다. 이들 결과는 Physics 세포가 증식할 수 있으나 5일 이후 자기-재생을 하지 않음을 의미한다.
그리고 Physics 세포의 초기 배양 시기 동안, 각 배엽에서 특이 마커 유전자들의 발현을 발견하였다. 미분화된 및 분화된 마커 둘 다를 발현하는 Physics 세포의 독특한 유전자 발현 패턴은 사람 ESC에서 유래된 EB와 비교할 만 하였다(도 21). 왜냐하면 그들의 형태가 매우 유사하기 때문이다.
면역세포화학 분석 결과, Physics 세포와 EB는 내배엽(GATA4 및 AFP), 외배엽(PAX6 및 Nestin), 중배엽(Brachyury 및 SMA)의 마커들을 높게 발현하였다. OCT3/4 외에도, PAX6의 발현 역시 초음파 처리 후 1일쨰에 바로 검출되었다. 3배엽의 다른 유전자들의 발현은 Physics 세포의 생성 후 3일째에 시작되었다. 배양 15일 동안, 3배엽 마커들의 발현 수준은 점차 증가하였다. 그러나, OCT3/4 발현은 8일 이후 감소하였다(도 22).
<실시예 3> 초음파 자극에 의한 세포 변화
Physics 세포 발생 동안 HDF로의 초음파 자극의 효과를 평가하기 위해 초음파 조건별로 비교하였다. 초음파 처리 후 및 초음파 처리된 HDF의 2시간 배양 후 직접적으로 SEM 분석을 수행하였다.
도 23에 나타난 바와 같이, 몇몇 세포막 기공이 UC 및 UCUM 조건 둘 다에서 생겼다. 아마도 HDF가 초음파에 직접적으로 노출되었기 때문인 것으로 보인다. 그러나, UM 조건에서 HDF는 세포막을 통과하는 어떠한 기공 발생도 보여주지 않았다. 이는 배양배지에만 초음파를 처리하는 것은 세포막 손상에 충분하지 않기 때문이다. 특히, 세포배양의 2시간 후, 생성된 기공은 UC 및 UCUM 조건에서 둘 다 사라졌다. 이들 결과는 초음파 자극은 세포 사멸을 유도할 정도로 심각한 것은 아니나 세포막의 일시적인 투과를 유도하기에는 충분하며, 이후 초기 세포배양시기 동안 손상된 세포막이 회복됨을 시사한다.
손상된 세포막의 회복 과정은 또한 live/dead kit을 이용하여 세포막 손상이 없는 것은 (녹색형광)/죽거나 세포막손상이 있는 세포는(붉은색 형광) 분석에 의해 입증되었다. HDF 세포에 초음파 처리 직후와 2시간이 지난 후 형광시약으로 염색한 결과 2시간 이후 붉은색 형광의 비율이 줄어드는 것으로 보아 SEM 분석 결과와 마찬가지로 2시간 후 초음파로 인한 세포막 손상이 회복되는 것으로 나타났다(도 24).
또한, 시약을 초음파 자극을 받은 세포와 스페로이드 형성의 연관성을 확인하기 위해, 초음파 처리된 HDF에 live/dead kit 를 부가하고 녹색/붉은색 이중 염색된 HDF는 살아있는 세포 이미징 장치를 이용하여 24시간 동안 추적하였다.
도 25에 나타난 바와 같이, HDF는 단지 녹색 또는 붉은색/녹색 이중으로 염색된 다른 HDF와 응집하여 다세포 스페로이드를 형성하였다. 24시간 후 대부분의 약간 손상된 HDF는 안정한 Physics 세포를 형성하였다.
초음파-유도된 세포막 손상 및 일시적인 투과는 또한 각각 형광 염료 Fluo-4 염료 및 CM-H2DCFDA를 사용하여 증가된 세포내 Ca2
+ 농도 및 세포내 H2O2
생산에 의해 특징을 나타내었다. 초음파를 노출하자마자, Physics 세포의 Ca2
+ 농도가 갑자기 증가하고 나서, 150초에 감소하였다(도 26). Physics 세포에서 세포내 H2O2의 농도는 미처리 대조군 HDF와 비교하여 초음파 노출 60분 후 6배 더 높았다(도 27 및 도 28).
추가로, ATP가 다양한 세포성 스트레스에 대한 반응에서 신호로 이용되기 때문에 세포외로 방출된 ATP의 농도를 분석하였다.
도 29에 나타난 바와 같이, 초음파는 미처리 HDF 대비 Physics 세포에서 ATP의 22배 더 많은 방출을 자극하였다.
이온향성 P2X 수용체 및 대사성 P2Y 수용체는 ATP 방출에 의해 발현이 활성화되는 것으로 알려져있어 이들 수용체의 발현을 비교하였다.
Physics 세포에서 P2X4, P2X7, P2Y1, P2Y2 및 P2Y11의 더 높은 발현이 검출되었다(도 30).
Physics 세포의 향상된 세포 흡수는 추가로 Alexa-705 표지된 양자점(QD705)를 이용하여 확인하였다. QD705를 배양접시에 부가하고 24시간 후 공초점 현미경 이미지를 얻었다.
스페로이드 타입 내 Physics 세포 및 이웃하는 단일 Physics 세포와 응집하지 않은 단일 세포 타입 둘 다, QD705를 흡수하였다. 그러나, 정상 HDF는 QD705를 흡수하지 않았다(도 31). 이는 외부의 요소들의 세포 흡수가 초음파 자극에 의해 향상됨을 입증하는 것이다.
한편, 엑소좀 RNA는 Physics 세포 배양배지로부터 준비되며, RT-PCR 분석을 통해 Physics 세포의 발생 동안 세포배양 환경의 유전자 발현 패턴을 연구하였다. 일반적으로, 엑소좀은 몇몇 유전자 요소들, 예컨대, RNA, microRNA, DNA, 단백질을 포함한다. 또한, 엑소좀에서 유전자 요소들의 발현 프로파일은 세포 상태-의존적이다.
도 32에 나타난 바와 같이, 다능성 마커 유전자들의 높은 발현이 Physics 세포 배양 배지로부터 정제된 엑소좀에서 관찰되었다. 가장 두드러진 유전자 발현은 OCT3/4 및 NANOG 였다. 배양 시간이 진행됨에 따라, OCT3/4 발현은 두드러지게 증가하였다. NANOG 발현은 4일 후에 떨어졌다. c-MYC 발현은 부유 배양 조건에서 일정한 반면, 단층 배양 조건에서 2일 후에 감소하였다. 모든 다능성 마커 유전자들, 예컨대, REX1, TDGF1, FOXD3, UTF1, LIN28의 발현은 비록 그들의 발현 수준이 낮긴 하나 부유 배양 조건에서 검출되었다. 그러나, 이들 유전자들은 단층 배양 조건에서는 검출되지 않았다. 이들 결과는 초음파 처리된 HDF 중 유전자 요소들의 전달 가능성을 시사한다.
이 가설을 입증하기 위해, 초음파-미처리된 HDF를 Physics 세포와 공배양하였다. 이미징 분석을 위해, 리포펙타민에 의해 Cy5.5 붉은색 형광 염료를 HDF에 감염시켰다. Physics 세포는 별도로 생성되었고, 2일 유지 후, Physics 세포를 Cy5.5-감염된 HDF 배양접시에 부가하였다. 공배양 동안, 배양배지에 초음파를 처리하지는 않았다. 이는 UM 조건 역시 다능성 마커 유전자 발현을 유도할 수 있기 때문이다.
공초점 현미경 이미지는 Physics 세포와의 공배양 동안 Cy5.5-감염된 HDF로부터 OCT3/4 발현이 관찰되었다. OCT3/4 발현은 Cy5.5-감염된 HDF 단독 배양에서는 검출되지 않았다. 이들 결과는 Physics 세포의 다능성 특성이 이웃하는 정상 세포로 전달되고, 이후 정상 세포의 Physics 세포로의 리프로그래밍을 강하게 입증한다. 일반적으로, 세포에서 유전자 요소 전달에 엑소좀이 참여한다(도 33).
<실시예 4> Physics 세포의 인 비트로 분화
인 비트로 분화를 위해 5일 배양된 Physics 세포를 젤라틴이 코팅된 조직 배양 접시로 옮겼다. 옮긴 세포는 특이 분화 배지를 이용하여 신경 또는 심장 계통으로의 분화를 유도하였다. 상기 특이 분화 배지는 표 3와 같다. 분화 유도 후 8일된 세포에서 3 배엽 주요 단백질(GATA4, AFP, PAX6, Nestin, Brachyury, SMA)들이 발현되었다(도 34).
배지의 종류 |
성분 |
함량 |
배지1(외배엽/성상세포 분화유도배지) |
DMEMFBSN2 supplementGlutamax-I |
1%1%1% |
배지2(중배엽/심근세포 분화유도배지) |
DMEMFBS2-mercaptoethanolNon essential amino acidPenicillin/streptomycinAscorbic acid |
20%1%1%M100 μM |
배지3(내배엽/신경세포 분화유도배지) |
DMEMFBS2-mercaptoethanolNon essential amino acidPenicillin/streptomcin |
20%1%1% |
유전자 명칭 |
프라이머 서열 (5'->3') |
AFP |
F |
GAATGCTGCAAACTGACCACGCTGGAAC |
R |
TGGCATTCAAGAGGGTTTTCAGTCTGGA |
FOXA2 |
F |
TGGGAGCGGTGAAGATGGAAGGGCAC |
R |
TCATGCCAGCGCCCACGTACGACGAC |
Brachyury |
F |
GCCCTCTCCCTCCCCTCCACGCACAG |
R |
CGGCGCCGTTGCTCACAGACCACAGG |
MSX1 |
F |
CGAGAGGACCCCGTGGATGCAGAG |
R |
GGCGGCCATCTTCAGCTTCTCCAG |
ACTA2 (a-SMA) |
F |
CTATGAGGGCTATGCCTTGCC |
R |
GCTCAGCAGTAGTAACGAAGGA |
TnTc |
F |
ATGAGCGGGAGAAGGAGCGGCAGAAC |
R |
TCAATGGCCAGCACCTTCCTCCTCTC |
GATA4 |
F |
CGACACCCCAATCTCGATATG |
R |
GTTGCACAGATAGTGACCCGT |
NKX2.5 |
F |
CCAAGGACCCTAGAGCCGAA |
R |
ATAGGCGGGGTAGGCGTTAT |
Nestin |
F |
GAAACAGCCATAGAGGGCAAA |
R |
TGGTTTTCCAGAGTCTTCAGTGA |
PAX6 |
F |
ACCCATTATCCAGATGTGTTTGCCCGAG |
R |
ATGGTGAAGCTGGGCATAGGCGGCAG |
Map2 |
F |
CAGGTGGCGGACGTGTGAAAATTGAGAGTG |
R |
CACGCTGGATCTGCCTGGGGACTGTG |
GFAP |
F |
GGCCCGCCACTTGCAGGAGTACCAGG |
R |
CTTCTGCTCGGGCCCCTCATGAGACG |
Sox1 |
F |
TACAGCCCCATCTCCAACTC |
R |
GCTCCGACTTCACCAGAGAG |
Chat |
F |
GGAGGCGTGGAFCTCAGCGACACC |
R |
CGGGGAGCTCGCTGACGGAGTCTG |
Aadc |
F |
CGCCAGGATCCCCGCTTGAAATCTG |
R |
TCGGCCGCCAGCTCTTTGATGTGTTC |
Dat |
F |
ACAGAGGGGAGGTGCGCCAGTTCACG |
R |
ACGGGGTGGACCTCGCTGCACAGATC |
Th |
F |
CTGTGGCCTTTGAGGAGAAG |
R |
GGTGGATTTTGGCTTCAAAC |
Tuj1 |
F |
GAGCGGATCAGCGTCTACTACAA |
R |
GATACTCCTCACGCACCTTGCT |
Vglut1 |
F |
CGACGACAGCCTTTTGTGGT |
R |
GCCGAGACGTAGAAAACAGAG |
Vmat2 |
F |
CTTTGGAGTTGGTTTTGC |
R |
GAGTTGTGGTCCATGAG |
도 35 및 도 36에 나타난 바와 같이, 1-2주 분화 시기 동안, 유전자 17(SOX17, 내배엽), paired box 6(PAX6, 외배엽), Nestin(신경세포마커), microtubule-associated protein 2(MAP2, 외배엽), class III beta-tubulin(TuJ1, 신경세포마커), msh homeobox 1(MSX1, 중배엽), Brachyury(중배엽), myosin light chain 7(MYL7, 심근세포), NK2 homeobox 5(NKX2.5, 심근세포), 및 Troponin T type 2(TnnT2, 심근세포)를 포함하는 SRY-box의 발현이 RT-PCR에 의해 관찰되었다.
특히, OCT3/4의 발현이 분화 유도 후 유의하게 감소하였다.
신경 또는 심장세포로의 분화는 또한 면역세포화학에 의해 확인되었다.
도 37 내지 도 39에 나타난 바와 같이, 성상세포 배지에서 자란 Physics 세포에서 신경전구세포 마커(PAX6 및 Nestin)가 관찰되었다. 이들 분화된 Physics 세포는 성상세포 배지를 희돌기교세포 배지 또는 뉴런 배지로 바꾼 후 2주 동안 추가적인 분화가 유도되었을 때, 각각 희돌기교세포 마커(MAP2 및 O4) 또는 뉴런 마커(MAP2 및 Tuj1)의 발현이 관찰되었다. 분화 시기의 2주는 MHC, SMA, Actinin, NKX2.5 및 TnTc를 포함한 심장 마커를 검출하는데 충분하였다. 특히, 전형적인 분절된 액틴 패턴이 액티닌에서 검출되었다. 그러나, 같은 배양 조건 하에서 HDF는 어떠한 신경 또는 심장 마커들을 발현하지 않았다.
<실시예 5> 안정성 검사
초음파는 돌연변이, 유전자 변형, 암 발생 등의 바람직하지 않은 부작용을 유도하지 않았다. Physics 세포는 정상 핵형을 가지고 있었다(도 40),
<실시예 6> Physics 세포의 인 비보 분화능 평가
Physics 세포의 인 비보 분화 능력을 평가하기 위해 5일 배양된 Physics 세포를 4-5주된 면역결핍 마우스(NOD/SCID mouse)의 정소와 허벅지 근육에 1×106 세포를 주입하여 4주간 사육 후 정소와 근육을 회수하여 4% 파라포름알데히드로 고정 후 냉동절편(cryosection)하여 Human Nuclear antigen 염색을 통해 주입한 세포의 위치를 파악하고, 다양한 증식 및 분화관련 단백질 마커들(Ki67, CD44, SMA)을 염색하여 주입된 세포의 분화 유무를 확인하였다.
도 41에서 정소에 주입된 Physics 세포는 4주 후 정소내 혈관 내피세포에서 관찰되었으며, Ki67 염색을 통해 증식되고 있음을 확인하였고, 화살표에서 표시한 세포에서 보듯이 혈관 내피세포 마커인 CD44가 염색된 것을 확인하였다.
마우스 허벅지에 주입된 세포는 근육섬유층 외부인 라미나 층에서 발견되었으며, 근육 단백질 마커인 SMA 염색이 된 것을 확인하였다(도 42). 이와 같은 결과는 체내에 주입된 Physics 세포가 주변 세포와 환경에 맞추어 분화되었음을 시사하는 것이다.
<실시예 7> 세포 배양 배지의 효과
Physics 세포를 발생시키기 위해 사람 ES 세포배양배지를 사용하였다. ES 세포배양배지는 미분화 상태에서 ES 세포를 유지 및 번식하기 위한 제한 배지로서 개발되었다. 세포배양배지의 효과를 조사하기 위해, Physics 세포를 발생시키기 위해 정상 HDF 배양배지를 사용하였다.
도 43a 및 b에 나타난 바와 같이, ES 세포배양배지와 비교하여, 형태 및 스페로이드 형성 효율은 꽤 달랐다. 초음파 처리된 HDF 배지에서 씨딩한 후 1일째에, 다세포 스페로이드는 소량 형성되었다. 그러나, 2일 후, 대다수의 스페로이드는 접시 표면에 부착되어 있었다. 배양 4일째에 모든 스페로이드는 접시 표면에 부착되어 전형적인 섬유아세포 형태로 자랐다. 면역세포화학 결과 또한 두 종류의 다른 배양배지 조건 간의 다른 유전자 발현 패턴을 보여주었다. ES 세포배양배지를 이용하여 발생된 전형적인 Physics 세포는 OCT3/4, SOX2, NANOG, SSEA-4, 및 TRA-1-60의 높은 발현 수준을 보였다. DMEM 배지는 미분화 마커 유전자 및 3배엽 마커 유전자 발현을 유도하기 위한 어떠한 효과도 보이지 않았다. 이들 결과는 스페로이드 형성 및 특이 마커 유전자들의 발현이 세포배양배지의 성분과 밀접하게 연관되어 있음을 시사하는 것이다.
<실시예 8> 세포주의 효과
Physics 세포 발생 방법이 다른 세포주에 적용할 수 있는지 앞으로의 임상 적용에 적용할 수 있는지를 평가하기 위해, HeLa 세포, L132 사람 폐 상피세포 및 환자-유래 피부 섬유아세포 같은 다른 세포주를 이용하여 Physics 세포 발생을 조사하였다.
도 44a-c에 나타난 바와 같이, 2종의 세포주 또한 초음파의 직접적인 노출 후 세균용 페트리 접시에서 초음파 처리된 ES 세포배양배지에서 배양된 후 다세포 스페로이드를 형성하였다. 흥미롭게도 HDF로부터 생기는 Physics 세포와 비교하여, 2종의 세포주로부터 생긴 새로운 Physics 세포의 형태 및 크기 분포는 꽤 다르다. HeLa 세포 유래의 Physics 세포의 크기 분포는 상당히 일관성이 없고 크기는 너무 컸다. L132 세포 유래의 Physics 세포는 더 복잡하고 응집된 형태를 보였다. 각 스페로이드는 추가로 융합되고 판-같은 구조를 형성하였다.
도 44b 및 44c에 나타난 바와 같이, 2종의 다른 Physics 세포로부터 OCT3/4, SOX2, NANOG, SSEA4, 및 TRA-1-60를 포함하는 다능성 마커 및 GATA4, AFP, PAX6, Nestin, Brachyury, 및 SMA를 포함하는 3배엽 마커 유전자들의 발현은 면역세포화학에 의해 확인되었다.
그리고 환자 피부세포를 이용한 실험 결과에서도 Physics 세포와 같은 스페로이드를 형성하였고, 다능성 마커 및 3배엽 마커의 발현이 면역세포화학에 의해 확인되었다(도 45).
이들 결과는 Physics 세포 발생을 유도하는 초음파 자극이 다양한 세포주에 적용될 수 있음을 강하게 입증하며, 환자 세포를 이용한 자가 세포 치료의 가능성을 나타냈다.
<실시예 9> 다른 에너지원 제공의 효과
추가적인 외부 자극을 HDF 및 ES 세포배양배지에 가하여 Physics 세포의 발생 기작을 확인 및 평가하였다.
초음파 처리 대신 레이저 처리를 통해 Physics 세포가 형성되는지를 확인하였다. 이를 위해, 초음파 처리에 사용되었던 사람 피부 섬유아세포를 동일하게 사용하였고, 레이저 처리 조건은 Ocla 치료용 레이저(Ndlux)를 사용하여, 808nm의 레이저를 5초간 조사한 후 배양하였다.
열 처리를 위해, 피부 섬유아세포를 42℃로 2분간 노출시킨 후 아이스에서 약 5초간 정치하였다.
도 46 및 47에 나타난 바와 같이, HDF 및 ES 세포배양배지 둘 다에 레이저 또는 열 처리 후 다세포 스페로이드가 성공적으로 발생하였다. 레이저 처리된 HDF는 또한 레이저 유도 후 다세포 스페로이드를 즉시 형성하였다. 비록 스페로이드의 모양이 불규칙적이고 크기 분포가 균일하지는 않으나, 다능성 마커 및 3배엽 마커들의 높은 수준의 발현이 관찰되었다. 열처리 역시 스페로이드 형성을 유도하였다. 그러나, 효율은 초음파 및 레이저 처리보다 낮았다. 유지 8일 동안 열에 의해 유도된 다세포 스페로이드의 절반 이상이 접시 표면에 부착하였다. 더 낮은 스페로이드 형성 효율에도 불구하고, 다능성 마커 및 3배엽 마커의 높은 발현 수준이 관찰되었다. 이들 결과는 Physics 세포의 발생이 물리적 자극과 밀접하게 연관되어 있음을 강하게 입증하는 것이다.
<실시예 10> 마우스 Physics 세포의 제조
도 48에 도시된 과정에 따라 마우스 Physics 세포를 제조하였다. 이를 위해, 20KHz 초음파를 5W/cm2의 강도로 10분간 처리한 ES 배지에 OG2 마우스 MEF(Mouse Embryonic Fibroblast cell; 마우스 배아 섬유아세포)를 섞고, 그 세포에 직접적으로 초음파를 5초간 1W/cm2의 강도로 처리하여 배양하였다. 배양된 세포는 1, 3, 5, 8 및 10일 간격으로 형광현미경으로 세포의 형태 변화와 GFP 형광의 발현을 관찰하였다. 초음파 처리를 위한 배지 조성은 표 1과 같다.
상기 MEF 세포는 OCT4 프로모터가 삽입된 GFP 유전자를 형질전환 시킨 마우스의 13.5일된 배아의 섬유아세포로 일반적으로는 OCT4가 발현되지 않는 세포이나 만약 OCT4가 발현되면 GFP가 발현되어 녹색 형광이 보인다.
도 49A에서 대조군은 OG2 MEF 세포 사진도로 녹색 형광이 나타나지 않았다(OCT4 발현이 없음). 그러나 초음파를 처리한 OG2 MEF의 경우 배양 시간이 지날 수록 세포 구체의 크기가 증가하고, 녹색 형광의 강도가 강해지는 것을 알 수 있다. 이는 초음파 처리가 OCT4 발현을 유발한 것을 의미하며, OCT4는 미분화 줄기세포의 주요한 특징으로서, 이는 초음파 처리로 인해 OG2 MEF 세포가 줄기세포로 역분화됨을 알 수 있는 결과이다.
도 49B는 Tile scan 사진으로 넓은 범위를 여러 장의 사진을 찍어 합친 사진도로 초음파 처리 효과를 보여주는 결과이며, 많은 수의 MEF 세포가 초음파 처리로 인한 역분화로 OCT4-GFP를 발현하며, 도 50에서 생성된 스페로이드의 GFP 발현 효율을 분석한 결과 약 93% 정도의 OCT4-GFP 발현 효율을 나타났으며, 플로우 사이토메트리를 이용해 전체세포에서의 GFP 발현을 확인한 결과 약 85.3%의 세포에서 GFP가 발현되었으며, 세포표면 미분화 단백질 마커인 SSEA1의 발현을 분석한 결과에서도 약 75.5%의 발현이 나타났다(도 51). 이와 같은 결과는 초음파로 인한 역분화 효율이 상당히 높음을 시사한다.
다음으로, 하기 표 5에 나타난 프라이머 세트를 사용하여 대표적인 마우스 배아 줄기 세포(ESc)의 미분화 마커 유전자와 단백질 마커(OCT4, SOX2, NANOG, SSEA1)들의 발현을 RT-PCR과 세포면역화학법으로 확인하였다.
도 52 및 53에 나타난 바와 같이, 마우스 Physics 세포에서 미분화 마커들이 발현됨을 확인하였다.
또한, 알카라인 포스피테이트 염색을 통해서도 확인하였다(도 54).
마우스 ES 미분화 마커 발현 확인을 위한 RT-PCR용 프라이머
유전자 명칭 |
프라이머 서열(5'-3') |
Oct3/4 |
F |
CTGAGGGCCAGGCAGGAGCACGAG |
R |
CTGTAGGGAGGGCTTCGGGCACTT |
Sox2 |
F |
TAGAGCTAGACTCCGGGCGATGA |
R |
TTGCCTTAAACAAGACCACGAAA |
Nanog |
F |
CAGGTGTTTGAGGGTAGCTC |
R |
CGGTTCATCATGGTACAGTC |
c-Myc |
F |
TGACCTAACTCGAGGAGGAGCTGGAATC |
R |
AAGTTTGAGGCAGTTAAAATTATGGCTGAAGC |
Klf4 |
F |
GCGAACTCACACAGGCGAGAAACC |
R |
TCGCTTCCTCTTCCTCCGACACA |
Esg1 |
F |
GAAGTCTGGTTCCTTGGCAGGATG |
R |
ACTCGATACACTGGCCTAGC |
Rex1 |
F |
ACGAGTGGCAGTTTCTTCTTGGGA |
R |
TATGACTCACTTCCAGGGGGCACT |
Utf1 |
F |
GGATGTCCCGGTGACTACGTCTG |
R |
GGCGGATCTGGTTATCGAAGGGT |
TDGF1 |
F |
ATGGACGCAACTGTGAACATGATGTTCGCA |
R |
CTTTGAGGTCCTGGTCCATCACGTGACCAT |
Esrrb |
F |
GTGGCTGAGGGCATCAATG |
R |
AACCGAATGTCGTCCGAAGAC |
Sall4 |
F |
TGGCAGACGAGAAGTTCTTTC |
R |
TCCAACATTTATCCGAGCACAG |
LIN28a |
F |
GGCATCTGTAAGTGGTTCAACG |
R |
GCCAGTGACACGGATGGATT |
B-actin |
F |
CTGGCTGGCCGGGACCTGAC |
R |
ACCGCTCGTTGCCAATAGTGATGA |
마우스 분화 마커 발현 확인을 위한 RT-PCR용 프이머
유전자 명칭 |
프라이머 서열(5'-3') |
Tuj1 |
F |
ATCCACCTTCATTGGCAACAGCAC |
R |
ACTCGGACACCAGGTCATTCATGT |
Map2 |
F |
AGCCGCAACGCCAATGGATT |
R |
TTTGTTCCGAGGCTGGCGAT |
GATA4 |
F |
AACCAGAAAACGGAAGCCCAAG |
R |
TACGCGGTGATTATGTCCCCAT |
SOX7 |
F |
AACACGCTGCCTGAGAAAAACG |
R |
AATAGGCTGGAGATGGGGGACA |
Foxa2 |
F |
TACACACACGCCAAACCTCCCT |
R |
GCTTCCTTCAGTGCCAGTTGCT |
CER1 |
F |
AGGCAGAAGACAAGCCGGATCT |
R |
TCTTCATGGGCAATGGTCTGGT |
Brachyury |
F |
CCCGGTGCTGAAGGTAAATGTG |
R |
ATGAACTGGGTCTCGGGAAAGC |
FLT-1 |
F |
TACGAAAAGTCCGTGTCCTCGC |
R |
TTTCAGGTCCTCTCCTTCGGCT |
CAD11 |
F |
AAGACCCAGATGCTGCCAACAG |
R |
GCATGATTTCAGGGGGTAGGCT |
KDR |
F |
TTTCCTGGGACTGTGGCGAA |
R |
TGGACTCAATGGGCCTTCCA |
Nef1 |
F |
CGGAAGACGCCACTAACGAGAA |
R |
CTTCGGCGTTCTGCATGTTCTT |
Nestin |
F |
GGCATCCCTGAATTACCCAA |
R |
AGCTCATGGGCATCTGTCAA |
GATA6 |
F |
ACCTTATGGCGTAGAAATGCTGAGGGTG |
R |
CTGAATACTTGAGGTCACTGTTCTCGGG |
3배엽 마커를 확인한 결과, mPhysics는 내배엽(GATA6), 외배엽(Nestin), 중배엽(Brachyury)의 마커들을 높게 발현하였다. 3배엽의 다른 유전자들의 발현은 Physics 세포의 생성 후 3일째에 시작되었다. 배양 20일 동안, 3배엽 마커들의 발현 수준은 점차 증가하였다(도 55). 그리고, 도 56에서 면역염색을 통해 3배엽 단백질 마커들의 발현이 확인되었다.
마우스 세포에서도 초음파로 인해 형성된 mPhysics 세포는 정상 핵형을 가지고 있었다(도 57).