WO2010134519A1 - フロフラン型リグナン4位グルコース転移酵素、及びそれをコードするポリヌクレオチド - Google Patents
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- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
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- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P19/00—Preparation of compounds containing saccharide radicals
- C12P19/44—Preparation of O-glycosides, e.g. glucosides
- C12P19/46—Preparation of O-glycosides, e.g. glucosides having an oxygen atom of the saccharide radical bound to a cyclohexyl radical, e.g. kasugamycin
Definitions
- the present invention relates to forsythia-derived furofuran-type lignan 4-position glucose transferase, a polynucleotide encoding the enzyme, a vector containing the polynucleotide, a transformant obtained using the vector, and the like.
- Non-patent document 1 Umezawa, T. (2003) Phytochem. Rev. 2, 371-390
- useful biological activity among them Those that have are used as pharmaceuticals and health foods.
- the main furofuran-type lignans contained in the sesame family sesame are known for their antioxidative properties, lipid metabolism improvement and liver function protection, and are commercially available
- Non Patent Literature 2 Nakai, M. et al. al. (2003) J. Agri. Food Chem. 51, 1666-1670
- Non-Patent Document 3 Tsuruoka, T. et al. (2005) Biosci. Biotech. Biochem.
- Non-Patent Document 5 Ayres, DC and Loike, JD (1990) Lignans: Chemical Biological and Clinical Properties. CambridgeUniv. Press, Cambridge, UK).
- Non-patent Document 6 Heinonen, S. et al. (2001) J. Agric. Food Chem. 49, 3178-3186).
- Forsythia is a perennial woody plant that is strong and easy to grow, and is often used for garden trees because of its bright yellow flowers.
- forsythia leaves, berries and petals are known to have abundant accumulation of lignans with antioxidant and anti-inflammatory activities. In Asia (especially China and Japan), the leaves It is drunk as tea (Non-patent document 7: Guo, H. et al.
- Non-patent Document 11 Dinkova-Kostova, A. et al. (1996) J. Biol. Chem. 271, 29473-29482;
- Non-patent document 12 Nakatsubo, T. et al. (2008) J. Biol. Chem. 283, 15550-1557;
- Non-patent document 13 Min, T. et al. (2003) J. Biol. Chem. 278, 50714-50723;
- Non-Patent Document 14 Gang, D. et al. (1999) J. Biol. Chem.
- Any lignan contained in Forsythia is stably present as a glycoside, but only the sugar transfer activity to the 7-position of the lignan of the structural formula (VII) has been detected (Non-patent Document 17: Berim) , A. et al. (2008) Phytochemistry 69, 374-381), no other lignan glycosyltransferases have been identified.
- Non-patent Document 17: Berim A. et al. (2008) Phytochemistry 69, 374-381
- no other lignan glycosyltransferases have been identified.
- sesame most lignans exist as glycosides, but only the glycosyltransferase UGT71A9 for lignan shown in the structural formula (III) has been identified.
- This enzyme is specific to the 2-position of the compound of structural formula (III), and does not react with any position other than the 2-position or other lignan compounds.
- Other lignan glycosyltransferases are still unclear (Non-patent document 18: Ono, E. et al. (2006) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 103, 10116-10121; Non-patent document 19: Noguchi, A., et al. (2008) Plant J. 54, 415-427).
- the regioselectivity of glycosyltransferases in plants is high, and amino acid sequences between glycosyltransferases that react at the same position of the same or similar compounds are conserved across species, so that sequence homology is reduced.
- glycosyltransferases that add sugars to different positions even if they are the same or similar, have low amino acid sequence homology and are isolated based on the sequence information of glycosyltransferases that react at other positions. It is very difficult to do. Therefore, even if the same lignan compound is used, other lignan compounds such as structural formula (Ia) are added based on the information of sesame-derived UGT71A9 that adds a sugar to the 2-position of the compound of structural formula (III). It was extremely difficult to analogize and isolate the structure of a glycosyltransferase that adds a sugar to the 4-position and / or the 4′-position of furofuran lignans.
- the present invention has been made in consideration of the above situation, and includes the following polynucleotide (polynucleotide encoding furofuran-type lignan 4-position glucose transferase), protein (furofuran-type lignan 4-position glucose transferase),
- the present invention provides a vector containing a nucleotide, a transformant into which the vector is introduced, and the like.
- polynucleotide according to any one of the following (a) to (f): (A) a polynucleotide comprising a polynucleotide comprising the base sequence represented by SEQ ID NO: 3 or 5; (B) a polynucleotide containing a polynucleotide encoding a protein consisting of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 4 or 6; (C) a protein comprising an amino acid sequence in which 1 to 15 amino acids are deleted, substituted, inserted and / or added in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 4 or 6, and having glucose transferase activity for lignans A polynucleotide containing the encoding polynucleotide; (D) a polynucleotide encoding a protein having an amino acid sequence having 80% or more homology to the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 4 or 6 and having glucose transferase activity for lignans A polynucle
- the polynucleotide according to (1) which is any of the following (g) to (j): (G) a protein comprising an amino acid sequence in which no more than 10 amino acids are deleted, substituted, inserted and / or added in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 4 or 6, and having a glucose transferase activity for lignans A polynucleotide containing a polynucleotide that: (H) a polynucleotide encoding a protein having an amino acid sequence having 90% or more homology to the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 4 or 6 and having glucose transferase activity for lignans A polynucleotide; (I) a poly which hybridizes under high stringency conditions with a polynucleotide comprising a nucleotide sequence complementary to the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 3 or 5 and which encodes a protein having glucose transferase activity for lignans A polynucle
- examples of the glucose transferase activity with respect to lignan include glucose transferase activity with respect to furofuran lignan, and more specifically, the 4-position of furofuran lignan and / or Examples include glucose transferase activity for the hydroxyl group at the 4 ′ position.
- examples of the furofuran lignan include lignans represented by the following structural formula (Ia), (Ib), or (Ic).
- Examples of the polynucleotide (1) above include those containing a polynucleotide consisting of the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 3 or 5, and a protein consisting of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 4 or 6. The thing containing a polynucleotide is mentioned.
- Examples of the polynucleotides (1) and (2) above include those that are DNA.
- examples of the sugar receptor substrate include furofuran lignans.
- examples of the furofuran lignan include lignans represented by the structural formula (Ia), (Ib), or (Ic).
- the glycosyltransferase which can transfer glucose to 4th-position and / or 4'-position of furofuran-type lignan can be provided.
- a polynucleotide encoding the enzyme, a vector containing the polynucleotide, a transformant obtained using the vector, a method for producing a glucose glycoside using the enzyme, and the like can also be provided.
- the present invention is extremely useful in that useful lignan glycosides that can contribute to the development of materials and secondary metabolic molecular breeding can be produced more easily.
- DIR indicates a protein involved in the reaction in which the lignan of the structural formula (Ia) is generated from the monolignol of the structural formula (I ′), and “PLR” indicates the structural formula (IV) and the lignan of the structural formula (Ia).
- ⁇ SIRD '' indicates an enzyme that catalyzes a reaction in which a lignan of structural formula (VI) is generated from a lignan of structural formula (V)
- CYP81Q indicates an enzyme that catalyzes a reaction in which a lignan having the structural formula (Ig) and the structural formula (II) is generated from the lignan having the structural formula (Ia).
- FIG. 3 is a view showing structures of various furofuran lignans similar to the lignans of structural formula (Ia).
- the structural formula in FIG. (For the lignan of the structural formula (Ig), the structural formula in FIG. 1A may be referred to as described above).
- FIG. 4 is a diagram showing the results of SDS-PAGE (200 mM imidazole eluate) in Example 3.
- the arrow indicates the furofuran-type lignan 4th-position glucose transferase (clone 13: RengUGT13, clone 14: RengUGT14), which is an E. coli-expressed forsythia-derived forsythia-derived glucose transferase (RengUGT) protein detected at a size of about 50 KDa.
- RengUGT E. coli-expressed forsythia-derived forsythia-derived glucose transferase
- the present inventor obtained 6 kinds of forsythia UGT (RengUGT) candidate genes by screening a glucose transferase (UGT; UDP-Glucosyltransferase) -like gene from forsythia.
- UGT glucose transferase
- the structural formula (Ia ), (Ib) and (Ic) lignans represented by lignans, RengUGT13 and RengUGT14 are used as glycosyltransferases having a novel activity to specifically transfer glucose to the 4th and / or 4 'positions of phlofuran lignans. Separated and identified.
- the present invention relates to (a) a polynucleotide containing a polynucleotide comprising the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 3 or 5 (specifically, DNA; hereinafter, these are also simply referred to as “DNA”). And (b) a polynucleotide containing a polynucleotide encoding a protein having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 4 or 6.
- the DNA of interest in the present invention is not limited to the DNA encoding the furofuran type lignan 4-position glucose transferase (for example, RengUGT13 and RengUGT14). Contains DNA.
- Examples of functionally equivalent proteins include (c) an amino acid sequence in which 1 to 15 amino acids are deleted, substituted, inserted and / or added in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 4 or 6. And proteins having glucose transferase activity for lignans.
- Examples of such proteins include those in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 4 or 6, such as 1 to 15, 1 to 14, 1 to 13, 1 to 12, 1 to 11, 1 to 10 1-9, 1-8, 1-7, 1-6 (1 to several), 1-5, 1-4, 1-3, 1-2, 1 And a protein having a glucose transferase activity with respect to lignans.
- the smaller the number of amino acid residue deletions, substitutions, insertions and / or additions the better.
- Examples of functionally equivalent proteins include (d) an amino acid sequence having 80% or more homology to the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 4 or 6, and glucose transfer to lignan.
- Examples also include proteins having enzyme activity. As such a protein, about 80% or more, 81% or more, 82% or more, 83% or more, 84% or more, 85% or more, 86% or more with respect to the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 4 or 6 87% or more, 88% or more, 89% or more, 90% or more, 91% or more, 92% or more, 93% or more, 94% or more, 95% or more, 96% or more, 97% or more, 98% or more, 99 % Or more, 99.1% or more, 99.2% or more, 99.3% or more, 99.4% or more, 99.5% or more, 99.6% or more, 99.7% or more, 99.8% or more, 99.9% or more of the amino acid sequence, and Examples include proteins having glucose transferase activity for lignans.
- glucose transferase activity for lignan means that glucose is transferred to furofuran type lignan as a sugar acceptor substrate in a UDP-glucose-dependent manner as a sugar donor, and glucose glycoside ( It means an enzyme activity having an activity to catalyze a reaction to produce glucoside.
- furofuran-type lignan 4-position glucose transferase that catalyzes the reaction to transfer glucose to the 4-position and / or 4'-position hydroxyl group of furofuran-type lignan in a UDP-glucose-dependent manner to produce a glucose glycoside (glucoside)
- Furofuran lignan 4-O-glucosyltransferase for example RengUGT13 and RengUGT14
- the enzyme represented by the notation of “furofuran-type lignan 4-position glucose transferase”, as described above, is capable of transferring glucose to the hydroxyl group at the 4-position and / or the 4′-position, It is not limited to an enzyme that transfers glucose only to the hydroxyl group at the position.
- the 4th and 4 ′ positions of the furofuran lignan mean the 4th and 4 ′ positions defined according to the IUPAC nomenclature.
- Glucose transferase activity for lignans is evaluated by, for example, UDP-glucose and a sugar receptor substrate furofuran-type lignan (for example, lignans of structural formulas (Ia), (Ib) and (Ic)).
- the reaction can be carried out in the presence of an enzyme, and the resulting reaction product can be measured by HPLC or the like (more specifically, see the description of Examples below).
- the present invention also relates to (e) a protein that hybridizes with a polynucleotide comprising a nucleotide sequence complementary to the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 3 or 5 under stringent conditions and has glucose transferase activity for lignans. Also included are polynucleotides containing the polynucleotides to be treated.
- the present invention further relates to (f) hybridization under stringent conditions with a polynucleotide comprising a base sequence complementary to a base sequence of a polynucleotide encoding a protein comprising the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 4 or 6.
- polynucleotide containing a polynucleotide encoding a protein having glucose transferase activity for lignans.
- polynucleotide means DNA or RNA. Preferably, it is DNA.
- the “polynucleotide hybridizing under stringent conditions” is, for example, a polynucleotide comprising a base sequence complementary to the base sequence of SEQ ID NO: 3 or 5, or represented by SEQ ID NO: 4 or 6.
- a colony hybridization method, a plaque hybridization method, a Southern hybridization method, etc., using as a probe all or part of a polynucleotide comprising a base sequence complementary to the base sequence of a polynucleotide encoding the amino acid sequence The polynucleotide obtained by this.
- Examples of hybridization methods include “Sambrook & Russell, Molecular Cloning: A Laboratory Manual Vol.
- stringent conditions may be any of low stringent conditions, moderately stringent conditions, and highly stringent conditions.
- Low stringent conditions are, for example, conditions of 5 ⁇ SSC, 5 ⁇ Denhardt's solution, 0.5% SDS, 50% formamide, 32 ° C.
- the “medium stringent conditions” are, for example, conditions of 5 ⁇ SSC, 5 ⁇ Denhardt's solution, 0.5% SDS, 50% formamide, and 42 ° C.
- “High stringent conditions” are, for example, conditions of 5 ⁇ SSC, 5 ⁇ Denhardt's solution, 0.5% SDS, 50% formamide, 50 ° C. Under these conditions, it can be expected that DNA having higher homology can be efficiently obtained as the temperature is increased. However, multiple factors such as temperature, probe concentration, probe length, ionic strength, time, and salt concentration can be considered as factors that affect hybridization stringency. Those skilled in the art will select these factors as appropriate. It is possible to achieve similar stringency.
- the hybridizable polynucleotide is represented by the DNA of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 3 or SEQ ID NO: 4 when calculated using homology search software such as FASTA and BLAST using default parameters.
- the homology between the amino acid sequence and the base sequence is determined by the algorithm BLAST (Proc. Natl. Acad. Sci. USA, vol. 87, p. 2264-2268, 1990; Proc. Natl. Acad. Sci. USA, vol. 90, p. 5873, 1993).
- Programs called BLASTN and BLASTX based on the BLAST algorithm have been developed (Altschul SF, et al., J. Mol. Biol., Vol. 215, p. 403, 1990).
- polynucleotide of the present invention can be obtained by a known genetic engineering technique or a known synthesis technique.
- the present invention also provides a protein encoded by the above-described polynucleotide of the present invention.
- the protein of an aspect of the present invention is a protein consisting of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 4 or 6.
- Another embodiment of the present invention is a protein having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 4 or 6.
- the protein according to yet another aspect of the present invention comprises an amino acid sequence in which 1 to 15 amino acids are deleted, substituted, inserted and / or added in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 4 or 6, and It is a protein having glucose transferase activity.
- Such a protein examples include a protein having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 4 or 6 and having the homology as described above and having glucose transferase activity for lignans.
- SEQ ID NO: 4 or 6 a protein having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 4 or 6 and having the homology as described above and having glucose transferase activity for lignans.
- amino acid sequence of the protein of the present invention 1 or more (for example, 1 to 15, preferably 10 or less) amino acid residues are deleted, substituted, inserted and / or added.
- Group A leucine, isoleucine, norleucine, valine, norvaline, alanine, 2-aminobutanoic acid, methionine, o-methylserine, t-butylglycine, t-butylalanine, cyclohexylalanine;
- Group B aspartic acid, glutamic acid, isoaspartic acid , Isoglutamic acid, 2-aminoadipic acid, 2-aminosuberic acid;
- group C asparagine, glutamine;
- group D lysine, arginine, ornithine, 2,4-diaminobutanoic acid, 2,3-diaminopropionic acid;
- group E Proline, 3-hydroxyproline, 4-hydroxyproline;
- Group F serine, threonine, homoserine;
- Group G phenylalanine, tyrosine.
- the protein of the present invention can also be produced by chemical synthesis methods such as the Fmoc method (fluorenylmethyloxycarbonyl method) and the tBoc method (t-butyloxycarbonyl method). It can also be chemically synthesized using peptide synthesizers such as Advanced Chemtech, Perkin Elmer, Pharmacia, Protein Technology Instrument, Syntheselve Vega, Perceptive, Shimadzu, etc. .
- the protein of the present invention is furofuran type lignan 4-position glucose transferase. “Glucose transferase” catalyzes a reaction in which a glucose residue is transferred from a sugar donor to a sugar acceptor substrate to produce a glucose glycoside.
- the sugar acceptor substrate is furofuran lignan
- the sugar donor is UDP-glucose
- the protein of an embodiment of the present invention is obtained from UDP-glucose from position 4 and / or 4 of a furofuran-type lignan that is a sugar receptor substrate (for example, lignans of structural formulas (Ia), (Ib), and (Ic)). Transfers a glucose residue to the hydroxyl group at the 'position and catalyzes a reaction that produces a glucose glycoside and UDP.
- furofuran-type lignans of sugar receptor substrates include structural formulas (Ia), (Ib), (Ic), (Id), (Ie), (If), (Ig), and (Ih) lignans.
- lignans of structural formulas (Ia), (Ib) and (Ic) are preferred, more preferably lignans of structural formulas (Ia) and (Ic), and more preferably lignans of structural formula (Ia). .
- the present invention also provides an expression vector containing the polynucleotide of the present invention.
- the expression vector of the present invention contains the polynucleotide of the present invention (for example, the polynucleotide of any one of (a) to (j) above).
- the expression vector of the present invention contains any one of the polynucleotides (g) to (j).
- the expression vector of the present invention is a polynucleotide comprising a polynucleotide comprising the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 3 or 5 or a polynucleotide encoding a protein comprising the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 4 or 6. Containing.
- the vector of the present invention usually comprises (i) a promoter capable of being transcribed in a host cell; (ii) a polynucleotide of the present invention bound to the promoter (for example, any of the polynucleotides (a) to (j) above).
- Nucleotides and (iii) with respect to transcription termination and polyadenylation of RNA molecules, configured to include an expression cassette containing as a component a signal that functions in the host cell.
- the vector thus constructed is introduced into a host cell.
- a method for producing an expression vector a method using a plasmid, phage, cosmid or the like can be mentioned, but it is not particularly limited.
- the specific type of vector is not particularly limited, and a vector that can be expressed in a host cell can be appropriately selected. That is, if a promoter sequence is appropriately selected according to the type of host cell to ensure expression of the polynucleotide of the present invention, and a vector in which this and the polynucleotide of the present invention are incorporated into various plasmids or the like is used as an expression vector Good.
- the expression vector of the present invention contains an expression control region (for example, a promoter, a terminator and / or an origin of replication) depending on the type of host to be introduced. Conventional promoters (eg, trc promoter, tac promoter, lac promoter, etc.) are used as promoters for bacterial expression vectors.
- yeast promoters include glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase promoter, PH05 promoter, etc.
- the promoter for filamentous fungi include amylase and trpC.
- promoters for animal cell hosts include viral promoters (eg, SV40 early promoter, SV40 late promoter, etc.).
- the expression vector preferably contains at least one selectable marker. Such markers include auxotrophic markers (ura5, niaD), drug resistance markers (hygromycine, zeocin), geneticin resistance gene (G418r), copper resistance gene (CUP1) (Marin et al., Proc. Natl. Acad Sci. USA, vol. 81, p.
- cerulenin resistance gene (fas2m, PDR4) (respectively, Minoru Ogura et al., Biochemistry, vol. 64, p. 660, 1992; Hussain et al., Gene, vol. 101, p. 149, 1991) can be used.
- the present invention also provides a transformant into which the polynucleotide of the present invention (for example, any one of the polynucleotides (a) to (j) above) is introduced.
- a method for producing a transformant is not particularly limited, and examples thereof include a method for transformation by introducing the above-described recombinant vector into a host.
- the host cell used here is not particularly limited, and various conventionally known cells can be suitably used.
- bacteria such as Escherichia coli, yeasts (budding yeast Saccharomyces cerevisiae, fission yeast Schizosaccharomyces pombe), nematodes (Caenorhabditis elegans), Xenopus laevis oocytes, etc. Can do.
- Appropriate culture media and conditions for the above-described host cells are well known in the art.
- the organism to be transformed is not particularly limited, and examples thereof include various microorganisms, plants and animals exemplified in the host cell.
- a method for transforming a host cell a publicly known method can be used.
- an electroporation method Mackenxie DA et al., Appl. Environ. Microbiol., Vol. 66, p. 4655-4661, 2000
- a particle delivery method Japanese Patent Application Laid-Open No. 2005-287403, “Method of Breeding Lipid-Producing Bacteria”
- spheroplast method Proc. Natl. Acad. Sci. USA, vol. 75, p. 1929, 1978
- lithium acetate method J. Bacteriology, vol. 153, p. 163, 1983
- the transformant can be a plant transformant.
- the plant transformant according to this embodiment is obtained by introducing a recombinant vector containing the polynucleotide according to the present invention into a plant so that the polypeptide encoded by the polynucleotide can be expressed.
- a recombinant expression vector used for transformation of the plant body is not particularly limited as long as it is a vector capable of expressing the polynucleotide according to the present invention in the plant.
- Examples of such a vector include a vector having a promoter that constitutively expresses a polynucleotide in plant cells (for example, the cauliflower mosaic virus 35S promoter) or a promoter that is inducibly activated by an external stimulus.
- a promoter that constitutively expresses a polynucleotide in plant cells (for example, the cauliflower mosaic virus 35S promoter) or a promoter that is inducibly activated by an external stimulus.
- the vector which has is mentioned.
- Plants to be transformed in the present invention include whole plants, plant organs (eg leaves, petals, stems, roots, seeds, etc.), plant tissues (eg epidermis, phloem, soft tissue, xylem, vascular bundle, It means any of a palisade tissue, a spongy tissue, etc.) or a plant culture cell, or various forms of plant cells (eg, suspension culture cells), protoplasts, leaf sections, callus, and the like.
- the plant used for transformation is not particularly limited, and may be any plant belonging to the monocotyledonous plant class or the dicotyledonous plant class.
- transformation methods known to those skilled in the art for example, Agrobacterium method, gene gun, PEG method, electroporation method, etc.
- Agrobacterium method for example, Agrobacterium method, gene gun, PEG method, electroporation method, etc.
- a method using Agrobacterium and a method for directly introducing it into plant cells are well known.
- the constructed plant expression vector is introduced into an appropriate Agrobacterium (for example, Agrobacterium tumefaciens), and this strain is introduced into the leaf disk method (Hirofumi Uchimiya).
- the plant genetic manipulation manual (1990), pages 27-31, Kodansha Scientific, Tokyo) can be used to infect sterile cultured leaf pieces to obtain transformed plants.
- the method of Nagel et al. Mocribiol.
- an expression vector is first introduced into Agrobacterium, and then transformed Agrobacterium is introduced into plant cells or plant tissues by the method described in Plant Molecular Biology Manual (SBGelvin et al., Academic Press Press Publishers). It is a method to introduce.
- plant tissue includes callus obtained by culturing plant cells.
- a binary vector such as pBI121 or pPZP202 can be used.
- an electroporation method and a gene gun method are known.
- a plant body, a plant organ, and a plant tissue itself may be used as they are, or may be used after preparing a section, or a protoplast may be prepared and used.
- the sample thus prepared can be processed using a gene transfer apparatus (for example, PDS-1000 (BIO-RAD)).
- the treatment conditions vary depending on the plant or sample, but are usually performed at a pressure of about 450 to 2000 psi and a distance of about 4 to 12 cm.
- a cell or plant tissue into which a gene has been introduced is first selected for drug resistance such as hygromycin resistance, and then regenerated into a plant by a conventional method.
- Regeneration of a plant body from a transformed cell can be performed by a method known to those skilled in the art depending on the type of plant cell.
- transformation is carried out by introducing a recombinant vector into the cultured cells using a gene gun, electroporation method or the like. Callus, shoots, hairy roots, etc. obtained as a result of transformation can be used as they are for cell culture, tissue culture or organ culture, and can be used at a suitable concentration using conventionally known plant tissue culture methods. It can be regenerated into plants by administration of plant hormones (auxin, cytokinin, gibberellin, abscisic acid, ethylene, brassinolide, etc.).
- PCR Southern hybridization
- Northern hybridization or the like.
- DNA is prepared from a transformed plant, PCR is performed by designing DNA-specific primers. PCR can be performed under the same conditions as those used for preparing the plasmid. After that, the amplified product is subjected to agarose gel electrophoresis, polyacrylamide gel electrophoresis or capillary electrophoresis, stained with ethidium bromide, SYBR Green solution, etc., and the amplified product is detected as a single band, It can be confirmed that it has been transformed.
- PCR can be performed using a primer previously labeled with a fluorescent dye or the like to detect an amplification product.
- offspring can be obtained by sexual or asexual reproduction of the plant.
- seeds, fruits, cuttings, tubers, tuberous roots, strains, callus, protoplasts, etc. can be obtained from the plant or its progeny, or clones thereof, and the plant can be mass-produced based on them. it can. Therefore, the present invention also includes a plant body into which the polynucleotide according to the present invention is introduced so that it can be expressed, or a progeny of the plant body having the same properties as the plant body, or a tissue derived therefrom.
- transformant plant for example, forsythia, sesame, rice, tobacco, barley, wheat, rapeseed, potato, tomato, poplar, banana, eucalyptus, sweet potato, tides, alfalfa, lupine, corn, cauliflower, rose , Chrysanthemum, carnation, snapdragon, orchid, eustoma, freesia, gerbera, gladiolus, gypsophila, kalanchoe, lily, pelargonium, geranium, petunia, torenia, tulip, Arabidopsis thaliana, grapes, and japonica.
- the present invention also provides a method for producing the protein of the present invention using the transformant described above.
- the protein of the present invention can be obtained by separating and purifying the protein of the present invention from the culture of the transformant.
- the culture means any of a culture solution, cultured cells or cultured cells, or crushed cells of cultured cells or cultured cells. Separation and purification of the protein of the present invention can be carried out according to a usual method. Specifically, when the protein of the present invention accumulates in cultured cells or cells, the cells or cells are disrupted after culturing by an ordinary method (for example, ultrasound, lysozyme, freeze-thawing, etc.).
- a crude extract of the protein of the present invention can be obtained by a usual method (for example, centrifugation, filtration, etc.).
- a usual method for example, centrifugation, filtration, etc.
- the cells or cells and the culture supernatant are separated from each other by the usual method (for example, centrifugation, filtration, etc.) after completion of the culture.
- a culture supernatant containing the protein can be obtained. Purification of the protein of the present invention contained in the extract or culture supernatant thus obtained can be performed according to a usual separation / purification method.
- Separation / purification methods include, for example, ammonium sulfate precipitation, gel filtration chromatography, ion exchange chromatography, affinity chromatography, reverse phase high performance liquid chromatography, dialysis method, ultrafiltration method, etc., alone or in appropriate combination. be able to.
- this invention provides the method of manufacturing a glucose glycoside using the protein of this invention.
- the protein of the present invention catalyzes the reaction of transferring glucose from UDP-glucose as a sugar donor to furofuran-type lignan as a sugar acceptor substrate (specifically, the 4-position and / or the 4′-position of furofuran-type lignan). This is a reaction to transfer glucose to the hydroxyl group. Therefore, by using the protein of the present invention, a glucose glycoside can be produced using a sugar acceptor substrate and a sugar donor as raw materials.
- structural formulas (Ia), (Ib), (Ic), (Id), (Ie), (If), (Ig), and various types of furofuran lignans such as (Ih), Lignans of formulas (Ia), (Ib) and (Ic) are preferred, lignans of structural formulas (Ia) and (Ic) are more preferred, and lignans of structural formula (Ia) are more preferred.
- a glucose glycoside can be produced.
- the glucose glycoside can be separated and purified by a known method. Specifically, for example, ammonium sulfate precipitation, gel filtration chromatography, ion exchange chromatography, affinity chromatography, reverse phase high performance liquid chromatography, dialysis method and ultrafiltration method may be used alone or in appropriate combination. it can.
- Arabidopsis thaliana UGT71C1 gene (GenBank accession number: NM) against about 500,000 pfu of the above cDNA library 12852) were screened by plaque hybridization.
- the probe was labeled by PCR using a non-radioisotope DIG-nucleic acid detection system (Roche) according to the conditions recommended by the manufacturer.
- the PCR reaction solution 50 ⁇ l was used as a template: Arabidopsis root-derived cDNA, 1x Taq buffer (TakaRaBio), 0.2 mM dNTPs, gene-specific primers (SEQ ID NOs: 1 and 2) each 0.2 pmol / ⁇ l, rTaq polymerase 1.25
- the composition was U.
- PCR reaction was carried out at 94 ° C for 5 minutes, followed by 30 cycles of 94 ° C for 1 minute, 52 ° C for 1 minute, and 72 ° C for 2 minutes, and finally treated at 72 ° C for 5 minutes.
- PCR products were prepared by removing primers and unreacted dNTPs using a Mini QuickSpin column (Roche) as a probe.
- AtUGT71C1-Fw 5'-ATGGGGAAGCAAGAAGATGCAGAG-3 '(SEQ ID NO: 1)
- AtUGT71C1-Rv 5'- CTACTTACTTATAGAAACGCCGT -3 '(SEQ ID NO: 2)
- the obtained cDNA sequence was subjected to homology analysis with the Blastx program (http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi) to obtain a forsythia UGT-like gene (RengUGT).
- Clone 13 (RengUGT13) shown in SEQ ID NOs: 3 and 4 and clone 14 (RengUGT14) shown in SEQ ID NOs: 5 and 6 showed 90% sequence identity with each other at the amino acid level, and were used for probes by Blastx analysis.
- RengUGT13 cDNA sequence (SEQ ID NO: 3)
- RengUGT14 cDNA sequence (SEQ ID NO: 5)
- the full-length ORFs of the expression vector constructs RengUGT13 and RengUGT14 were amplified by PCR using primers (SEQ ID NOs: 7 and 8) to which the following restriction enzyme sites were added.
- This primer set has a common sequence capable of amplifying both RengUGTs.
- the underlined base sequence in the primer is a restriction enzyme recognition sequence added to the primer.
- the PCR reaction solution (50 ⁇ l) was composed of 1 ⁇ l of template DNA (phage solution after secondary screening), 1 ⁇ ExTaq buffer (TaKaRaBio), 0.2 mM dNTPs, each primer 0.4 pmol / ⁇ l, and ExTaq polymerase 2.5U.
- the PCR reaction was carried out at 94 ° C. for 3 minutes, followed by amplification for 30 cycles of 94 ° C. for 1 minute, 50 ° C. for 1 minute, and 72 ° C. for 2 minutes.
- the PCR product was electrophoresed on a 1% agarose gel and stained with ethidium bromide.
- E. coli Escherichia coli BL21 (DE3) strain was transformed in accordance with a conventional method using both RengUGT E. coli expression plasmids obtained above. The obtained transformant was cultured with shaking at 37 ° C overnight in 4 ml of LB medium (10 g / l typtone pepton, 5 g / l yeast extract, 1 g / l NaCl) containing 50 ⁇ g / ml ampicillin. did. 4 ml of the culture solution that reached the stationary phase was inoculated into 80 ml of the medium having the same composition and cultured with shaking at 37 ° C.
- LB medium 10 g / l typtone pepton, 5 g / l yeast extract, 1 g / l NaCl
- the obtained supernatant was recovered as a crude enzyme solution.
- the crude enzyme solution was loaded on His SpinTrap (GE Healthcare) equilibrated with Buffer S and centrifuged (70 ⁇ g, 30 sec). After washing with Buffer, the protein bound to the column was eluted stepwise with 5 ml each of Buffer S containing 100 mM and 500 mM imidazole. Each elution fraction was substituted with 20 mM HEPES buffer (pH 7.5) and 14 mM ⁇ -mercaptoethanol using Microcon YM-30 (Amicon) (dialysis magnification 1000 times).
- Standard enzyme reaction conditions are as follows. A reaction solution (1 mM UDP-glucose, 100 ⁇ M sugar receptor substrate, 100 mM potassium phosphate buffer (pH 7.5), purified enzyme solution 25 ⁇ l) was prepared to 50 ⁇ l with distilled water, and reacted at 30 ° C. for 1 hour. The reaction was stopped by adding 100 ⁇ l acetonitrile containing 50 ⁇ l 0.1% trifluoroacetic acid (TFA) and analyzed by reverse phase HPLC.
- TFA trifluoroacetic acid
- LC is Lc-2010c (Shimadzu Corporation)
- mobile phase is A solution: 0.1% TFA
- B solution 0.1% TFA
- column is Develosil-C30-UG5 (Nomura Chemical, 4.6mm x 150mm) Used at ° C. After equilibrating the column, elution was carried out at a flow rate of 1 ml / min over 20 minutes, with a linear concentration gradient of B5% ⁇ B100%, and eluted with B100% for 5 minutes. Detection was performed by measuring absorption at 280 nm.
- the lignan of structural formula (Ia) is about 11.6 minutes
- the lignan of structural formula (Ib) is about 12.2 minutes
- the lignan of structural formula (Ic) is about 13.8 minutes
- the lignan of structural formula (V) is about Detected at 9.8 minutes.
- LC-MS uses a Develosil C30-UG-3 column (Nomura Chemical Co., Ltd., 3.0 mm x 150 mm) with the LCMS-IT-TOF system (Shimadzu Corporation), and the mobile phase is 0.1% residue as liquid A.
- Water containing 100% acetonitrile containing 0.1% residue was used as solution B.
- Elution was performed using a 20-minute linear concentration gradient (B solution 5% ⁇ 100%), followed by isocratic elution with 100% B solution for 5 minutes (flow rate: 0.2 ml / min, column oven: 40). ° C).
- Detection was performed by collecting data from 230 to 500 nm with a photodiode array detector (SPD-M10A, Shimadzu Corporation), and measuring the A280 nm chromatogram. MS measurement conditions were negative mode (ionization: ESI, interface voltage: -3.5 kV). Under this condition, the peak was presumed to be a monoglucoside in which one glucose was added to the 4-position of the lignan of the structural formula (Ia) which gave a molecular ion of 519.16391 [MH]-(FIG. 4). From this, it was shown that RengUGT13 and RengUGT14 are enzymes having an activity of transferring one molecule of glucose to the lignan of the structural formula (Ia).
- RengUGT14 Since the expression level of RengUGT14 recombinant protein was high in E. coli (FIG. 2), the sugar receptor selectivity was evaluated using this enzyme. Assuming that the activity to lignan of structural formula (Ia) is 100, high transglycosylation activity of 112 for lignan of structural formula (Ib), which is the same furofuran lignan, and 128 for lignan of structural formula (Ic) showed that. On the other hand, the lignan having the structural formula (V), which is a non-furan lignan, showed almost no activity. From the above results, it was shown that RengUGT14 is a glycosyltransferase specific for position 4 of furofuran lignans.
- Gene-specific primers (SEQ ID NOs: 9 to 12) used for RT-PCR were designed so that the RengUGT13 and RengUGT14 genes could be distinguished.
- Forsythia ribosomal RNA (Forsythia rRNA; GenBank accession number: AF534808) was adopted as an internal standard gene, and amplified using the following gene-specific primers (SEQ ID NOs: 13 and 14).
- Reng13-RT-FW2 5'-TAGCGGATCAACCAACTAAAC-3 '(SEQ ID NO: 9) Reng13-RT-RV: 5'-TCTTGCCATACCGAGGAACAT-3 '(SEQ ID NO: 10)
- Reng14-RT-FW2 5'-TAGCAGATCAACCCAGTAAAT-3 '(SEQ ID NO: 11) Reng14-RT-RV: 5'-TCTTGCCATACTGACGAATGG-3 '(SEQ ID NO: 12)
- FsrRNA-Fw 5′-TAAAACGACTCTCGGCAACGGA-3 ′
- FsrRNA-Rv 5′-ATCCCGCCTGACCTGGGGTCGCT-3 ′ (SEQ ID NO: 14)
- the PCR reaction solution (50 ⁇ l) was composed of 1 ⁇ l of template cDNA, 1 ⁇ ExTaq buffer (TaKaRaBio), 0.2 mM dNTPs, each primer 0.4 pmol / ⁇ l, and ExTaq polymerase 2.5U.
- the PCR reaction was performed at 94 ° C for 3 minutes, followed by amplification at 94 ° C for 1 minute, 50 ° C for 1 minute, and 72 ° C for 2 minutes for a total of 20 to 35 cycles of amplification so that the gene expression was not saturated.
- PCR products were electrophoresed with 1% agarose and detected by ethidium bromide staining (FIG. 5).
- RengUGT13 and RengUGT14 genes were most highly expressed in the leaves, and expression was also observed in the buds and petals.
- RengUGT14 gene was specifically expressed in cultured cells, it was considered that this enzyme is responsible for the sugar transfer to lignans in the cultured cells. From the above results, it was shown that RengUGT13 and RengUGT14 are enzymes having similar structures, functions and expression regions.
- Enzyme genes that transfer glucose to the 4th and / or 4 'positions of furofuran lignans were clarified. By using this enzyme, it is possible to artificially transfer glucose to the 4th and / or 4 'position of furofuran lignans in vitro, so this enzyme is a new functional food material. Contributes to development and secondary metabolic molecular breeding. Therefore, the present invention is extremely useful in that it can be widely used in agriculture, food industry, pharmaceutical industry and related industries.
- SEQ ID NO: 1 synthetic DNA Sequence number 2: Synthetic DNA Sequence number 7: Synthetic DNA Sequence number 8: Synthetic DNA Sequence number 9: Synthetic DNA SEQ ID NO: 10: synthetic DNA SEQ ID NO: 11: synthetic DNA SEQ ID NO: 12: synthetic DNA SEQ ID NO: 13: synthetic DNA SEQ ID NO: 14: synthetic DNA
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Abstract
Description
モクセイ科レンギョウ(Forsythia属)は多年生木本性植物であり、堅強であるため栽培が容易であり、鮮やかな黄色い花をつけることから庭木に利用されることも多い。一方で、レンギョウの葉や実や花弁には、抗酸化や抗炎症作用の活性を有するリグナン類が豊富に蓄積していることが知られており、アジア(特に中国と日本)ではその葉は茶として飲用されている(非特許文献7:Guo, H. et al. (2007) Rapid Communications in Mass Spectrometry 21, 715-729;非特許文献8:Chang, M-J. et al. (2008) Biosci. Biotech. Biochem. 72, 2750-2755)。ゴマやアマなどの一年生草本性植物と異なり、レンギョウでは毎年播種及び育苗する必要はなく、数年にわたって機能性リグナンを葉から取得することが可能であるため、有用な二次代謝産物の分子育種ターゲットとされている。
一般に、植物における糖転移酵素の位置選択性は高く、同一の、もしくは類似する化合物の同じ位置に反応する糖転移酵素間のアミノ酸配列は種を超えて保存されているため、配列の相同性を利用して単離することが可能である。しかし、同一の、もしくは類似する化合物であっても、異なる位置に糖を付加する糖転移酵素はアミノ酸配列の相同性が低く、他の位置に反応する糖転移酵素の配列情報を元に単離することは非常に困難である。従って、同じリグナン化合物であっても、上記の構造式(III)の化合物の2位に糖を付加するゴマ由来UGT71A9の情報を元に、他のリグナン化合物、例えば、構造式(Ia)等のフロフラン型リグナンの4位及び/又は4'位に糖を付加する糖転移酵素の構造を類推し、これを単離することは極めて困難であった。
(a)配列番号3又は5で表される塩基配列からなるポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;
(b)配列番号4又は6で表されるアミノ酸配列からなるタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;
(c)配列番号4又は6で表されるアミノ酸配列において1~15個のアミノ酸が欠失、置換、挿入及び/若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつリグナンに対するグルコース転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;
(d)配列番号4又は6で表されるアミノ酸配列に対して、80%以上の相同性を有するアミノ酸配列を有し、かつリグナンに対するグルコース転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;
(e)配列番号3又は5で表される塩基配列と相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつリグナンに対するグルコース転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;或いは (f)配列番号4又は6で表されるアミノ酸配列からなるタンパク質をコードするポリヌクレオチドの塩基配列と相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつリグナンに対するグルコース転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド。
(2)以下の(g)~(j)のいずれかである請求項1に記載のポリヌクレオチド:
(g)配列番号4又は6で表されるアミノ酸配列において10個以下のアミノ酸が欠失、置換、挿入及び/若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつリグナンに対するグルコース転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;
(h)配列番号4又は6で表されるアミノ酸配列に対して、90%以上の相同性を有するアミノ酸配列を有し、かつリグナンに対するグルコース転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;
(i)配列番号3又は5で表される塩基配列と相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつリグナンに対するグルコース転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;或いは (j)配列番号4又は6で表されるアミノ酸配列からなるタンパク質をコードするポリヌクレオチドの塩基配列と相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつリグナンに対するグルコース転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド。
上記(1)及び(2)のポリヌクレオチドは、例えば、DNAであるものが挙げられる。
(4)上記(1)又は(2)のポリヌクレオチドを含有するベクター。
(5)上記(1)又は(2)のポリヌクレオチドが導入された形質転換体。
(6)上記(4)のベクターが導入された形質転換体。
(7)上記(5)又は(6)の形質転換体を用いる、上記(3)のタンパク質の製造方法。
(8)上記(3)のタンパク質を触媒として、UDP-グルコースと糖受容体基質とからグルコース配糖体を生成する、グルコース配糖体の製造方法。
上記(8)の方法において、糖受容体基質としては、例えば、フロフラン型リグナンが挙げられる。ここで、フロフラン型リグナンとしては、例えば、前記構造式(Ia)、(Ib)又は(Ic)で表されるリグナンが挙げられる。
本発明によれば、in vitroで、もしくは宿主細胞に本発明の遺伝子を導入することにより、フロフラン型リグナンの4位及び/又は4'位にグルコースを転移することが可能となり、新規機能性食品素材の開発や二次代謝分子育種等に貢献し得る有用リグナン配糖体をより簡便に生産することができる点で、本発明は極めて有用なものである。
1.本発明のポリヌクレオチド
まず、本発明は、(a)配列番号3又は5の塩基配列からなるポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド(具体的には、DNA、以下、これらを単に「DNA」とも称する);及び(b)配列番号4又は6で表されるアミノ酸配列を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチドを提供する。本発明で対象とするDNAは、上記のフロフラン型リグナン4位グルコース転移酵素(例えばRengUGT13及びRengUGT14)をコードするDNAに限定されるものではなく、このタンパク質と機能的に同等なタンパク質をコードする他のDNAを含む。
機能的に同等なタンパク質としては、例えば、(c)配列番号4又は6で表されるアミノ酸配列において1~15個のアミノ酸が欠失、置換、挿入及び/又は付加されたアミノ酸配列からなり、かつリグナンに対するグルコース転移酵素活性を有するタンパク質が挙げられる。このようなタンパク質としては、配列番号4又は6で表されるアミノ酸配列において、例えば、1~15個、1~14個、1~13個、1~12個、1~11個、1~10個、1~9個、1~8個、1~7個、1~6個(1~数個)、1~5個、1~4個、1~3個、1~2個、1個のアミノ酸残基が欠失、置換、挿入及び/又は付加されたアミノ酸配列からなり、かつリグナンに対するグルコース転移酵素活性を有するタンパク質が挙げられる。上記アミノ酸残基の欠失、置換、挿入及び/又は付加の数は、一般的には小さい程好ましい。
リグナンに対するグルコース転移酵素活性は、例えば、UDP-グルコースと、糖受容体基質であるフロフラン型リグナン(例えば、構造式(Ia)、(Ib)及び(Ic)のリグナン等)とを評価対象となる酵素の存在下で反応させ、得られる反応物をHPLC等で分析することによって測定することができる(より具体的には、後述の実施例の記載を参照。)。
さらに、本発明は、(f)配列番号4又は6で表されるアミノ酸配列からなるタンパク質をコードするポリヌクレオチドの塩基配列と相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつリグナンに対するグルコース転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチドも包含する。
本明細書中、「ポリヌクレオチド」とは、DNA又はRNAを意味する。好ましくは、DNAである。
本明細書中、「ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチド」とは、例えば、配列番号3又は5の塩基配列と相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、又は配列番号4又は6で表されるアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドの塩基配列と相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドの、全部又は一部をプローブとして、コロニーハイブリダイゼーション法、プラークハイブリダイゼーション法又はサザンハイブリダイゼーション法などを用いることにより得られるポリヌクレオチドをいう。ハイブリダイゼーションの方法としては、例えば、“Sambrook & Russell, Molecular Cloning: A Laboratory Manual Vol. 3, Cold Spring Harbor, Laboratory Press 2001”、“Ausubel, Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons 1987-1997”などに記載されている方法を利用することができる。
本明細書中、「ストリンジェントな条件」とは、低ストリンジェントな条件、中ストリンジェントな条件及び高ストリンジェントな条件のいずれでもよい。「低ストリンジェントな条件」は、例えば、5×SSC、5×デンハルト溶液、0.5%SDS、50%ホルムアミド、32℃の条件である。また、「中ストリンジェントな条件」は、例えば、5×SSC、5×デンハルト溶液、0.5%SDS、50%ホルムアミド、42℃の条件である。「高ストリンジェントな条件」は、例えば、5×SSC、5×デンハルト溶液、0.5%SDS、50%ホルムアミド、50℃の条件である。これらの条件において、温度を上げるほど高い相同性を有するDNAが効率的に得られることが期待できる。ただし、ハイブリダイゼーションのストリンジェンシーに影響する要素としては温度、プローブ濃度、プローブの長さ、イオン強度、時間、塩濃度など複数の要素が考えられ、当業者であればこれら要素を適宜選択することで同様のストリンジェンシーを実現することが可能である。
上記以外にハイブリダイズ可能なポリヌクレオチドとしては、FASTA、BLASTなどの相同性検索ソフトウェアにより、デフォルトのパラメーターを用いて計算したときに、配列番号3の塩基配列のDNA又は配列番号4で表されるアミノ酸配列をコードするDNAと、約60%以上、約70%以上、71%以上、72%以上、73%以上、74%以上、75%以上、76%以上、77%以上、78%以上、79%以上、80%以上、81%以上、82%以上、83%以上、84%以上、85%以上、86%以上、87%以上、88%以上、89%以上、90%以上、91%以上、92%以上、93%以上、94%以上、95%以上、96%以上、97%以上、98%以上、99%以上、99.1%以上、99.2%以上、99.3%以上、99.4%以上、99.5%以上、99.6%以上、99.7%以上、99.8%以上又は99.9%以上の相同性を有するDNAを挙げることができる。
上記した本発明のポリヌクレオチドは、公知の遺伝子工学的手法又は公知の合成手法によって取得することが可能である。
2.本発明のタンパク質 本発明は、さらに別の実施形態において、上記本発明のポリヌクレオチドにコードされるタンパク質も提供する。本発明のある態様のタンパク質は、配列番号4又は6で表されるアミノ酸配列からなるタンパク質である。本発明の別の態様のタンパク質は、配列番号4又は6で表されるアミノ酸配列を有するタンパク質である。
本発明のさらに別の態様のタンパク質は、配列番号4又は6で表されるアミノ酸配列において1~15個のアミノ酸が欠失、置換、挿入及び/又は付加されたアミノ酸配列からなり、かつリグナンに対するグルコース転移酵素活性を有するタンパク質である。このようなタンパク質としては、配列番号4又は6で表されるアミノ酸配列と上記したような相同性を有するアミノ酸配列を有し、かつリグナンに対するグルコース転移酵素活性を有するタンパク質が挙げられるこのようなタンパク質は、“Sambrook & Russell, Molecular Cloning: A Laboratory Manual Vol. 3, Cold Spring Harbor, Laboratory Press 2001”、“Ausubel, Current Protocols in Molecular Biology,John Wiley & Sons 1987-1997”、“Nuc. Acids. Res., vol. 10, p. 6487, 1982”、“Proc. Natl. Acad. Sci. USA, vol. 79, p. 6409, 1982”、“Gene, vol. 34, p. 315, 1985”、“Nuc. Acids. Res., vol. 13, p. 4431, 1985”、“Proc. Natl. Acad. Sci. USA, vol. 82, p. 488, 1985”等に記載の部位特異的変異導入法を用いて、取得することができる。
以下に、相互に置換可能なアミノ酸残基の例を示す。同一群に含まれるアミノ酸残基は相互に置換可能である。A群:ロイシン、イソロイシン、ノルロイシン、バリン、ノルバリン、アラニン、2-アミノブタン酸、メチオニン、o-メチルセリン、t-ブチルグリシン、t-ブチルアラニン、シクロヘキシルアラニン;B群:アスパラギン酸、グルタミン酸、イソアスパラギン酸、イソグルタミン酸、2-アミノアジピン酸、2-アミノスベリン酸;C群:アスパラギン、グルタミン;D群:リジン、アルギニン、オルニチン、2,4-ジアミノブタン酸、2,3-ジアミノプロピオン酸;E群:プロリン、3-ヒドロキシプロリン、4-ヒドロキシプロリン;F群:セリン、スレオニン、ホモセリン;G群:フェニルアラニン、チロシン。
また、本発明のタンパク質は、Fmoc法(フルオレニルメチルオキシカルボニル法)、tBoc法(t-ブチルオキシカルボニル法)等の化学合成法によっても製造することができる。また、アドバンスドケムテック社製、パーキンエルマー社製、ファルマシア社製、プロテインテクノロジーインストゥルメント社製、シンセセルーベガ社製、パーセプティブ社製、島津製作所等のペプチド合成機を利用して化学合成することもできる。
ここで、本発明のタンパク質は、フロフラン型リグナン4位グルコース転移酵素である。「グルコース転移酵素」とは、糖供与体から糖受容体基質にグルコース残基を転移しグルコース配糖体を生じる反応を触媒する。本発明において、糖受容体基質はフロフラン型リグナンであり、糖供与体は、UDP-グルコースである。本発明のある態様のタンパク質は、UDP-グルコースから、糖受容体基質であるフロフラン型リグナン(例えば、構造式(Ia)、(Ib)及び(Ic)のリグナン等)の4位及び/又は4'位の水酸基にグルコース残基を転移し、グルコース配糖体とUDPとを生じる反応を触媒する。
糖受容体基質のフロフラン型リグナンとしては、例えば、構造式(Ia)、(Ib)、(Ic)、(Id)、(Ie)、(If)、(Ig)及び(Ih)のリグナン等が挙げられ、中でも、構造式(Ia)、(Ib)及び(Ic)のリグナンが好ましく、より好ましくは構造式(Ia)及び(Ic)のリグナン、さらに好ましくは構造式(Ia)のリグナンである。
3.ベクター及びこれを導入した形質転換体
本発明はまた、別の実施形態において、本発明のポリヌクレオチドを含有する発現ベクターを提供する。本発明の発現ベクターは、本発明のポリヌクレオチド(例えば、前記(a)~(j)のいずれかのポリヌクレオチド)を含有する。好ましくは、本発明の発現ベクターは、前記(g)~(j)のいずれかのポリヌクレオチドを含有する。さらに好ましくは、本発明の発現ベクターは、配列番号3又は5の塩基配列からなるポリヌクレオチド、又は、配列番号4又は6で表されるアミノ酸配列からなるタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチドを含有する。 本発明のベクターは、通常、(i) 宿主細胞内で転写可能なプロモーター;(ii) 該プロモーターに結合した、本発明のポリヌクレオチド(例えば、前記(a)~(j)のいずれかのポリヌクレオチド);及び (iii) RNA分子の転写終結及びポリアデニル化に関し、宿主細胞内で機能するシグナルを構成要素として含む発現カセットを含むように構成される。このように構築されるベクターは、宿主細胞に導入される。発現ベクターの作製方法としては、プラスミド、ファージ又はコスミドなどを用いる方法が挙げられるが特に限定されない。
本発明の発現ベクターは、導入されるべき宿主の種類に依存して、発現制御領域(例えば、プロモーター、ターミネーター及び/又は複製起点等)を含有する。細菌用発現ベクターのプロモーターとしては、慣用的なプロモーター(例えば、trcプロモーター、tacプロモーター、lacプロモーター等)が使用され、酵母用プロモーターとしては、例えば、グリセルアルデヒド3リン酸デヒドロゲナーゼプロモーター、PH05プロモーター等が挙げられ、糸状菌用プロモーターとしては、例えば、アミラーゼ、trpC等が挙げられる。また動物細胞宿主用プロモーターとしては、ウイルス性プロモーター(例えば、SV40初期プロモーター、SV40後期プロモーター等)が挙げられる。
発現ベクターは、少なくとも1つの選択マーカーを含むことが好ましい。このようなマーカーとしては、栄養要求性マーカー(ura5、niaD)、薬剤耐性マーカー(hygromycine、ゼオシン)、ジェネチシン耐性遺伝子(G418r)、銅耐性遺伝子(CUP1)(Marin et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, vol. 81, p. 337, 1984)、セルレニン耐性遺伝子(fas2m, PDR4)(それぞれ、猪腰淳嗣ら, 生化学, vol. 64, p. 660, 1992;Hussain et al., Gene, vol. 101, p. 149, 1991)などが利用可能である。
形質転換体の作製方法(生産方法)は特に限定されないが、例えば、上述した組換えベクターを宿主に導入して形質転換する方法が挙げられる。ここで用いられる宿主細胞は、特に限定されるものではなく、従来公知の各種細胞を好適に用いることができる。具体的には、例えば、大腸菌(Escherichia coli)等の細菌、酵母(出芽酵母Saccharomyces cerevisiae、分裂酵母Schizosaccharomyces pombe)、線虫(Caenorhabditis elegans)、アフリカツメガエル(Xenopus laevis)の卵母細胞等を挙げることができる。上記の宿主細胞のための適切な培養培地及び条件は当分野で周知である。また、形質転換の対象となる生物も特に限定されるものではなく、上記宿主細胞で例示した各種微生物、植物又は動物が挙げられる。
宿主細胞の形質転換方法としては一般に用いられる公知の方法が利用できる。例えば、エレクトロポレーション法(Mackenxie D. A. et al., Appl. Environ. Microbiol., vol. 66, p. 4655-4661, 2000)、パーティクルデリバリー法(特開2005-287403「脂質生産菌の育種方法」に記載の方法)、スフェロプラスト法(Proc. Natl. Acad. Sci. USA, vol. 75, p. 1929, 1978)、酢酸リチウム法(J. Bacteriology, vol. 153, p. 163, 1983)、Methods in yeast genetics, 2000 Edition : A Cold Spring Harbor Laboratory Course Manualなどに記載の方法)で実施可能であるが、これらに限定されない。
組換え発現ベクターを用いる場合、植物体の形質転換に用いられる組換え発現ベクターは、当該植物内で本発明に係るポリヌクレオチドを発現させることが可能なベクターであれば特に限定されない。このようなベクターとしては、例えば、植物細胞内でポリヌクレオチドを構成的に発現させるプロモーター(例えば、カリフラワーモザイクウイルスの35Sプロモーター)を有するベクター又は外的な刺激によって誘導性に活性化されるプロモーターを有するベクターが挙げられる。
本発明において形質転換の対象となる植物は、植物体全体、植物器官(例えば葉、花弁、茎、根、種子など)、植物組織(例えば表皮、師部、柔組織、木部、維管束、柵状組織、海綿状組織など)又は植物培養細胞、あるいは種々の形態の植物細胞(例えば、懸濁培養細胞)、プロトプラスト、葉の切片、カルスなどのいずれをも意味する。形質転換に用いられる植物としては、特に限定されず、単子葉植物綱又は双子葉植物綱に属する植物のいずれでもよい。
遺伝子が導入された細胞又は植物組織は、まずハイグロマイシン耐性などの薬剤耐性で選択され、次いで定法によって植物体に再生される。形質転換細胞から植物体の再生は、植物細胞の種類に応じて当業者に公知の方法で行うことが可能である。
植物培養細胞を宿主として用いる場合は、形質転換は、組換えベクターを遺伝子銃、エレクトロポレーション法などで培養細胞に導入する。形質転換の結果得られるカルスやシュート、毛状根などは、そのまま細胞培養、組織培養又は器官培養に用いることが可能であり、また従来知られている植物組織培養法を用い、適当な濃度の植物ホルモン(オーキシン、サイトカイニン、ジベレリン、アブシジン酸、エチレン、ブラシノライドなど)の投与などによって植物体に再生させることができる。
本発明に係るポリヌクレオチドがゲノム内に組み込まれた形質転換植物体が一旦取得されれば、当該植物体の有性生殖又は無性生殖によって子孫を得ることができる。また、当該植物体又はその子孫、あるいはこれらのクローンから、例えば、種子、果実、切穂、塊茎、塊根、株、カルス、プロトプラストなどを得て、それらを基に当該植物体を量産することができる。従って、本発明には、本発明に係るポリヌクレオチドが発現可能に導入された植物体、若しくは当該植物体と同一の性質を有する当該植物体の子孫、又はこれら由来の組織も含まれる。
4.本発明のタンパク質の製造方法
本発明はまた、別の実施形態において、上記の形質転換体を用いる本発明のタンパク質の製造方法を提供する。
具体的には、上記形質転換体の培養物から、本発明のタンパク質を分離・精製することによって、本発明のタンパク質を得ることができる。ここで、培養物とは、培養液、培養菌体若しくは培養細胞、又は培養菌体若しくは培養細胞の破砕物のいずれをも意味する。本発明のタンパク質の分離・精製は、通常の方法に従って行うことができる。
具体的には、本発明のタンパク質が培養菌体内若しくは培養細胞内に蓄積される場合には、培養後、通常の方法(例えば、超音波、リゾチーム、凍結融解など)で菌体若しくは細胞を破砕した後、通常の方法(例えば、遠心分離、ろ過など)により本発明のタンパク質の粗抽出液を得ることができる。本発明のタンパク質が培養液中に蓄積される場合には、培養終了後、通常の方法(例えば、遠心分離、ろ過など)により菌体若しくは細胞と培養上清とを分離することにより、本発明のタンパク質を含む培養上清を得ることができる。
このようにして得られた抽出液若しくは培養上清中に含まれる本発明のタンパク質の精製は、通常の分離・精製方法に従って行うことができる。分離・精製方法としては、例えば、硫酸アンモニウム沈殿、ゲルろ過クロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィー、アフィニティークロマトグラフィー、逆相高速液体クロマトグラフィー、透析法及び限外ろ過法等を、単独で又は適宜組み合わせて用いることができる。
さらに、本発明は、本発明のタンパク質を用いてグルコース配糖体を製造する方法を提供する。
本発明のタンパク質は、糖受容体基質としてのフロフラン型リグナンに、糖供与体としてのUDP-グルコースからグルコースを転移する反応を触媒する(詳しくは、フロフラン型リグナンの4位及び/又は4'位の水酸基にグルコースを転移する反応である。)。従って、本発明のタンパク質を用いることにより、糖受容体基質及び糖供与体を原料として、グルコース配糖体を製造することができる。糖受容体基質としては、構造式(Ia)、(Ib)、(Ic)、(Id)、(Ie)、(If)、(Ig)及び(Ih)等の各種フロフラン型リグナンの中でも、構造式(Ia)、(Ib)及び(Ic)のリグナンが好ましく、構造式(Ia)及び(Ic)のリグナンがより好ましく、構造式(Ia)のリグナンがさらに好ましい。
本実施例において用いる分子生物学的手法は、他で詳述しない限り、Molecular Cloning(Sambrookra, Cold Spring Harbour Laboratory Press, 2001)に記載の方法に従った。
モクセイ科レンギョウ(Forsythia koreana)の葉からRNeasy Plant Miniキット(QIAGEN)を用いて総RNAを抽出し、引き続き、オリゴテックス-dT mRNA精製キット(TaKaRaBio)によりPolyA(+)RNAを得た。このポリA(+)RNA 4μgを用いて、ラムダZAP II directional cDNAライブラリー合成キット及び(Stratagen社)を用いて、同社の推奨する方法によりcDNAライブラリーを作製した。
5’-ATGGGGAAGCAAGAAGATGCAGAG -3’(配列番号1)
AtUGT71C1-Rv:
5’- CTACTTACTTATAGAAACGCCGT -3’(配列番号2)
配列番号3及び4に示されるクローン13(RengUGT13)と、配列番号5及び6に示されるクローン14(RengUGT14)についてはアミノ酸レベルでお互いに90%の配列同一性を示し、Blastx解析によってプローブに用いたシロイヌナズナのUGT71C1と約40%、ゴマのUGT71A9(構造式(III)のリグナンの2位に対する糖転移酵素)と約56%の配列同一性を示したが、明確な機能が推定できなかったため、大腸菌で発現させて機能解析を行った。
ATGGCAGAAACAAAGAAATCAGAGCTTGTTTTCATTCCTGTTCCAGGTGTAGGTCACTTGATATCAACTATTGAGATGGCTGAGCTTCTCACTGATAGAGATGAACGCCTCTCGATCACAGTCATCATCATGAAGTTGCCAATGGAGTCAAAAACCGATTTCTATTCCCGAAAATCCAATTCGCGTATACGTTTCATAGAATTTTCTCTCAACCAGCCCATTACACCCAACAACTTTGTCACTCATTTCATCGAAAGCCACAAGGATCCTATAAGAGATGCTGTCACGAAAATAGTTCGTGATGAGTCCAACTCGATCAGACTTGCTGGATTCGTTATTGATATGTTTTGTACTACTATGATTGACGTAGCCAATGAGTTTGGTGTCCCGACTTATGTTTTCTTTACAACTACTGCTGCACTGCTTGGGTTCACCTTCTATTTGCAGAGTCGCAGCGATGAACAGAAGTTGGATGTGACAGAATACAAGAACTCTAATGCTGAGTTATTGATTCCCACGTACATAAATCCAGTTCCTGCTAACGTATTTCCTTCGAGATTCTTTGATAAGGATGGTTTGGCTATGTTCCTCGGTATGGCAAGAAGGTTTAGAGAGACCAAGGGAATTATGATTAACACCTTCTTGGATTTAGAAGCTCATGCAATGAAGTCCCTCTCAGATGATCATACAATCCCACCGGTCTACTCAATAGGCCCAATAATTCATGTTACGGCTGAAAATGATGACGACAACAAAGATTATGACGAGATCATCAAGTGGCTTCACGAACAACCTGTTTCTTCTGTTGTTTTTCTTTGCTTTGGAAGTATGGGATTTTTTGATGATGAACAGGTTAAAGAGATTGCGGTTGCACTTGAAAAGAGTGGCCACCGGTTCTTGTGGTCATTGAGAAAGCCTCCTCCCAAAGACAGGTTCGAGTATCCATCAGACTACGAAAATCTTGAAGAAATTTTGCCAGAAGGGTTCTTGCAACGTACTGCAGGAATCGGGAAGGTGATTGGATGGGCTCCACAAGTGGCCGTCTTATCTCACCACTCGGTGGGAGGCTTTGTGTCGCATTGTGGTTGGAATTCGACACTGGAAAGTGTCTGGTGTGGAGTGCCAATAGCAGCATGGCCAATGTATGCTGAGCAGCAGACTAATGCCTTCGAGTTGGTGAAGGACTTGGGAATTGCTGTGGAGATTAAGATGGACTATAGGAGGGGCAGTGATGTGATTGTGAAGGCTGAAGAAATTGAGAAGGGAATCAGGCACCTAATGGAGCCTGATAGTGAAATGAGGAATAAGATGAAACAGATGAAAAACAAGAGTAGATTGGCTTTGATGGAAGGTGGCTCTTCCTACGATTTCTTGAGACATTTCATCGATAACATTCCAATGACGGAT(配列番号3)
MAETKKSELVFIPVPGVGHLISTIEMAELLTDRDERLSITVIIMKLPMESKTDFYSRKSNSRIRFIEFSLNQPITPNNFVTHFIESHKDPIRDAVTKIVRDESNSIRLAGFVIDMFCTTMIDVANEFGVPTYVFFTTTAALLGFTFYLQSRSDEQKLDVTEYKNSNAELLIPTYINPVPANVFPSRFFDKDGLAMFLGMARRFRETKGIMINTFLDLEAHAMKSLSDDHTIPPVYSIGPIIHVTAENDDDNKDYDEIIKWLHEQPVSSVVFLCFGSMGFFDDEQVKEIAVALEKSGHRFLWSLRKPPPKDRFEYPSDYENLEEILPEGFLQRTAGIGKVIGWAPQVAVLSHHSVGGFVSHCGWNSTLESVWCGVPIAAWPMYAEQQTNAFELVKDLGIAVEIKMDYRRGSDVIVKAEEIEKGIRHLMEPDSEMRNKMKQMKNKSRLALMEGGSSYDFLRHFIDNIPMTD(配列番号4)
ATGGCAGAAACAAAGAAATCAGAGCTTGTTTTCATTCCTGCACCAGGAATAGGTCACTTGATATCAACTATTGAGTTGGCTAAGCTTCTCACTGATAGAGATGAGCACCTCTCGATCACAGTCCTCATCTTGAAGTTGCCAATGGAGTCGAAAACCGATTCCTATTCCCAAAAATCCAATTCGCGTATACGTTTCATAGAATTATCTCTCAATCAACCTATTACACCCAACAACTTTGTCACTGATTTCATCGAAGGCCACAAGGATCCTATAAGAGATGCTGTCACGAAAATAGTTCGTGATGAGTCCAACTCTATTAGACTTGCTGGATTCGTTATTGATATGTTTTGTACTACTATGATTGATGTAGCCAATGAGTTTGGTGTCCCGACGTATGTTTTCTTTACAACTACTGCTGCAATGCTTGGGTTCATCTTCTATTTGCAGAGTCGCGGCGATGAACAGAAGTTGGATGTGACTGAGTACAAGAACTCAAATACTAAGTTATTGATTCCCACGTACATAAATCCGGTTCCTGCTAATGTATTTCCTTCTAAATTATTTGATAAGGATAGTTTGGCTCCATTCGTCAGTATGGCAAGAAGGTTTAGAGAGACCAAGGGAATTTTGATTAACACCTTCTTGGATTTAGAAGCTTATGCATTGAAGTCCCTCTCTGATGATCATACAATCCCACCGGTCTACTCAATAGGCCCGATACTTCATGTTAAGGTTGAAAATGATGACAAAAAGAAAGATTATGACGAGATCATCAATTGGCTTCACGAACAACCTGTTTCGTCTGTTGTTTTTCTTTGCTTTGGAAGTTTGGGTTGTTTTGATGTCGAACAGGTTAAAGAGATTGCGGTTGCACTTGAAAAGAGTGGCCACCGGTTCTTGTGGTCATTGAGAAAGCCTCCTCCCAAAGACTTCGAGCATCCATCAGACTACGAAAATTTTGAAGAAGTATTGCCAGAAGGGTTCTTGCAACGTACAGCAGGAATCGGGAAGGTGATTGGATGGGCGCCACAAGTGGCCGTCTTATCTCACCATTCGGTGGGAGGCTTTGTGTCGCATTGTGGTTGGAATTCGACGCTGGAAAGTGTCTGGTGTGGAGTGCCAATAGCGGCATGGCCAATGTATGCCGAACAGCAGACTAATGCCTTTGAGTTGGTGAAGGACTTGGGAATTGCTGTGGAGATTAAGATGGACTATAGGAAGGGCAGTGATGTGATTGTGAAGGCTGAAGAAATTGAGAAGGGAATCAAGCACCTAATGGAGCCTGATAGTGAAATGAGGAATAAGATGAAACAGATGAAAAGCAAGAGTAGATTGGCTTTGATGGAAGGTGGCTCTTCTTACAATTTCTTGAGGCGTTTCATCGATAACATTCCAATGACGGAT(配列番号5)
MAETKKSELVFIPAPGIGHLISTIELAKLLTDRDEHLSITVLILKLPMESKTDSYSQKSNSRIRFIELSLNQPITPNNFVTDFIEGHKDPIRDAVTKIVRDESNSIRLAGFVIDMFCTTMIDVANEFGVPTYVFFTTTAAMLGFIFYLQSRGDEQKLDVTEYKNSNTKLLIPTYINPVPANVFPSKLFDKDSLAPFVSMARRFRETKGILINTFLDLEAYALKSLSDDHTIPPVYSIGPILHVKVENDDKKKDYDEIINWLHEQPVSSVVFLCFGSLGCFDVEQVKEIAVALEKSGHRFLWSLRKPPPKDFEHPSDYENFEEVLPEGFLQRTAGIGKVIGWAPQVAVLSHHSVGGFVSHCGWNSTLESVWCGVPIAAWPMYAEQQTNAFELVKDLGIAVEIKMDYRKGSDVIVKAEEIEKGIKHLMEPDSEMRNKMKQMKSKSRLALMEGGSSYNFLRRFIDNIPMTD(配列番号6)
RengUGT13及びRengUGT14の完全長ORFを、下記の制限酵素サイトを付加したプライマー(配列番号7、8)を用いてPCR法によって増幅した。
このプライマーセットは両RengUGTを増幅できる共通の配列を有している。なお、プライマー中の下線を付した塩基配列は、プライマーに付加した制限酵素認識配列である。
5’-CACCCATATGGCAGAAACAAAGAAATCAGA -3’(配列番号7)
BglII-RengUGT-Rv:
5’-AGATCTTTAATCCGTCATTGGAATGTTAT -3’(配列番号8)
これらのPCR産物はpENTR-TOPO Directionalベクター(Invitrogen)に製造業者が推奨する方法でサブクローニングした。DNA Sequencer model 3100(Applied Biosystems)を用い、合成オリゴヌクレオチドプライマーによるプライマーウォーキング法によって挿入断片内にPCRによる変異が無いことを確認した。
本酵素の生化学的な機能を明らかにするために、両酵素を大腸菌において発現させた。上記で得られた両RengUGT大腸菌発現用プラスミドを用い定法に従って大腸菌BL21(DE3)株を形質転換した。得られた形質転換体を、50μg/mlのアンピシリンを含むLB培地(10 g/l typtone pepton,5 g/l yeast extract,1 g/l NaCl)4 mlにて、37℃で一晩振盪培養した。静止期に達した培養液4 mlを同組成の培地80 mlに接種し、37℃で振盪培養した。菌体濁度(OD600)がおよそ0.5に達した時点で終濃度0.5 mMのIPTGを添加し、18℃で20 hr振盪培養した。
以下のすべての操作は4℃で行った。培養した形質転換体を遠心分離(5,000×g,10 min)にて集菌し、Buffer S[20 mM HEPESバッファー(pH 7.5),20 mM imidazol, 14 mM β-メルカプトエタノール]1 ml/g cellを添加して、懸濁した。続いて、超音波破砕(15 sec×8回)を行い,遠心分離(15,000×g,15 min)を行った。得られた上清を粗酵素液として回収した。粗酵素液をBuffer Sにて平衡化したHis SpinTrap(GE Healthcare)に負荷し、遠心(70×g,30 sec)した。Bufferで洗浄後、100mM及び 500 mMのimidazoleを含むBuffer S 各5mlにて、カラムに結合したタンパク質を段階的に溶出した。各溶出画分をMicrocon YM-30(Amicon)を用いて20 mM HEPESバッファー(pH 7.5)、14 mM β-メルカプトエタノールにバッファー置換した(透析倍率1000倍)。
SDS-PAGE解析の結果、200 mM imidazole溶出画分において両RengUGTの推定分子量約50KDa付近にタンパク質を確認したので、この画分を酵素解析に用いた(図2)。
LCはLc-2010c(島津製作所)、移動相は、A液:0.1%TFA、B液:0.1%TFA、90%アセトニトリル、カラムはDevelosil-C30-UG5(野村化学, 4.6mm x 150mm)を40℃で用いた。カラムを平衡化後、20分間にわたる流速1ml/分、B5%→B100%の直線濃度勾配で溶出し、B100%で5分間溶出した。検出は280nmの吸収を測定することにより行った。SPD-10AV(島津製作所)により220nmから330nmまでスペクトルを測定した分析から、リグナン特有の2つの吸収極大(230nm及び280nm)を持つ物質を探索した。この条件下で、構造式(Ia)のリグナンは約11.6分、構造式(Ib)のリグナンは約12.2分、構造式(Ic)のリグナンは約13.8分、構造式(V)のリグナンは約9.8分に検出される。
構造式(Ia)のリグナンとRengUGT13又はRengUGT14との反応液について、上記の条件でHPLC分析を行った結果、新たに約8.7分に溶出されるピークが検出された(図3;*印)。当該ピークは糖供与体であるUDP-Glucose依存的であるため、構造式(Ia)のリグナンにグルコースが付加したリグナン配糖体のピークであることが示された。
LC-MSは、LCMS-IT-TOFシステム(島津製作所)でDevelosil C30-UG-3カラム(野村化学(株)、3.0mm×150mm)を用い、移動相は、A液として0.1%ギ残を含む水を、B液として0.1%ギ残を含む100%アセトニトリルを用いた。20分間の直線濃度勾配(B液5%→100%)を用いて溶出し、その後、B液100%で5分間のアイソクラティック溶出を行った(流速:0.2ml/分、カラムオーブン:40℃)。検出はフォトダイオードアレイ検出器(SPD-M10A、(株)島津製作所)で230~500nmのデータを収集し、A280nmのクロマトグラムを測定した。MSの測定条件はネガティブモードで行った(イオン化:ESI、インターフェイス電圧:-3.5kV)。
この条件下で、当該ピークは、519.16391[M-H]-の分子イオンを与えた構造式(Ia)のリグナンの4位にグルコースが1個付加したモノグルコシドであると推察された(図4)。このことからRengUGT13及びRengUGT14は、構造式(Ia)のリグナンに対してグルコースを一分子転移する活性を有する酵素であることが示された。
RengUGT13及びRengUGT14遺伝子の機能領域を同定するために、“Ono, E., et al. (2006) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 103, 10116-10121”に記載の方法と同様の方法で、レンギョウの各器官における遺伝子発現パターンをRT-PCRにより解析した。
レンギョウの各器官(葉、若い蕾、花弁、及び培養細胞(カルス由来))から実施例1と同様の方法でトータルRNAを抽出し、そのうち0.5μgをRandom Oligo-dTプライマーで逆転写(RT)反応することによって各器官由来のcDNAを得、これをPCRの鋳型とした。
RT-PCRに用いる遺伝子特異的プライマー(配列番号9~12)は、RengUGT13及びRengUGT14遺伝子を区別できるように設計した。内部標準遺伝子としてレンギョウのリボゾーマルRNA(レンギョウrRNA;GenBankアクセッション番号:AF534808)を採用し、以下の遺伝子特異的プライマー(配列番号13、14)を用いて増幅した。
Reng13-RT-FW2:
5’-TAGCGGATCAACCAACTAAAC -3’(配列番号9)
Reng13-RT-RV:
5’-TCTTGCCATACCGAGGAACAT -3’(配列番号10)
<RengUGT14遺伝子用プライマー>
Reng14-RT-FW2:
5’-TAGCAGATCAACCCAGTAAAT -3’(配列番号11)
Reng14-RT-RV:
5’-TCTTGCCATACTGACGAATGG -3’(配列番号12)
<レンギョウrRNA用プライマー>
FsrRNA-Fw:
5’- TAAAACGACTCTCGGCAACGGA -3’(配列番号13)
FsrRNA-Rv:
5’- ATCCCGCCTGACCTGGGGTCGCT -3’(配列番号14)
PCR産物は1%アガロースで電気泳動し、エチジウムブロマイド染色によって検出した(図5)。その結果、RengUGT13及びRengUGT14遺伝子は、葉において最も高く発現しており、蕾及び花弁においても発現が認められた。しかしながら、培養細胞においてはRengUGT14遺伝子が特異的に発現していたため、培養細胞中のリグナンへの糖転移は本酵素が担っていると考えられた。
以上の結果から、RengUGT13及びRengUGT14は、構造、機能及び発現領域が類似した酵素であることが示された。
従って、本発明は、農業、食品産業、医薬品産業及びこれらの関連産業にわたる広範な利用が可能である点で、極めて有用なものである。
配列番号2:合成DNA
配列番号7:合成DNA
配列番号8:合成DNA
配列番号9:合成DNA
配列番号10:合成DNA
配列番号11:合成DNA
配列番号12:合成DNA
配列番号13:合成DNA
配列番号14:合成DNA
Claims (16)
- 以下の(a)~(f)のいずれかに記載のポリヌクレオチド:
(a)配列番号3又は5で表される塩基配列からなるポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;
(b)配列番号4又は6で表されるアミノ酸配列からなるタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;
(c)配列番号4又は6で表されるアミノ酸配列において1~15個のアミノ酸が欠失、置換、挿入及び/若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつリグナンに対するグルコース転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;
(d)配列番号4又は6で表されるアミノ酸配列に対して、80%以上の相同性を有するアミノ酸配列を有し、かつリグナンに対するグルコース転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;
(e)配列番号3又は5で表される塩基配列と相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつリグナンに対するグルコース転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;或いは(f)配列番号4又は6で表されるアミノ酸配列からなるタンパク質をコードするポリヌクレオチドの塩基配列と相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつリグナンに対するグルコース転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド。 - 以下の(g)~(j)のいずれかである請求項1に記載のポリヌクレオチド:
(g)配列番号4又は6で表されるアミノ酸配列において10個以下のアミノ酸が欠失、置換、挿入及び/若しくは付加されたアミノ酸配列からなり、かつリグナンに対するグルコース転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;
(h)配列番号4又は6で表されるアミノ酸配列に対して、90%以上の相同性を有するアミノ酸配列を有し、かつリグナンに対するグルコース転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;
(i)配列番号3又は5で表される塩基配列と相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつリグナンに対するグルコース転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;或いは(j)配列番号4又は6で表されるアミノ酸配列からなるタンパク質をコードするポリヌクレオチドの塩基配列と相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとハイストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつリグナンに対するグルコース転移酵素活性を有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド。 - リグナンに対するグルコース転移酵素活性が、フロフラン型リグナンに対するグルコース転移酵素活性である、請求項1又は2に記載のポリヌクレオチド。
- フロフラン型リグナンに対するグルコース転移酵素活性が、フロフラン型リグナンの4位及び/又は4'位の水酸基に対するグルコース転移酵素活性である、請求項3に記載のポリヌクレオチド。
- 配列番号3又は5で表される塩基配列からなるポリヌクレオチドを含有する、請求項1に記載のポリヌクレオチド。
- 配列番号4又は6で表されるアミノ酸配列からなるタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有する、請求項1に記載のポリヌクレオチド。
- DNAである、請求項1~7のいずれか1項に記載のポリヌクレオチド。
- 請求項1~8のいずれか1項に記載のポリヌクレオチドにコードされるタンパク質。
- 請求項1~8のいずれか1項に記載のポリヌクレオチドを含有するベクター。
- 請求項1~8のいずれか1項に記載のポリヌクレオチドが導入された形質転換体。
- 請求項10に記載のベクターが導入された形質転換体。
- 請求項11又は12に記載の形質転換体を用いる、請求項9に記載のタンパク質の製造方法。
- 請求項9に記載のタンパク質を触媒として、UDP-グルコースと糖受容体基質とからグルコース配糖体を生成する、グルコース配糖体の製造方法。
- 糖受容体基質がフロフラン型リグナンである、請求項14に記載の方法。
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