WO2010064683A1 - 前立腺癌の判定方法 - Google Patents
前立腺癌の判定方法 Download PDFInfo
- Publication number
- WO2010064683A1 WO2010064683A1 PCT/JP2009/070311 JP2009070311W WO2010064683A1 WO 2010064683 A1 WO2010064683 A1 WO 2010064683A1 JP 2009070311 W JP2009070311 W JP 2009070311W WO 2010064683 A1 WO2010064683 A1 WO 2010064683A1
- Authority
- WO
- WIPO (PCT)
- Prior art keywords
- psa
- lacdinac
- sugar chain
- prostate cancer
- derived
- Prior art date
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 102
- 206010060862 Prostate cancer Diseases 0.000 title claims abstract description 49
- 208000000236 Prostatic Neoplasms Diseases 0.000 title claims abstract description 49
- CDOJPCSDOXYJJF-CAQKAZPESA-N beta-D-GalpNAc-(1->4)-D-GlcpNAc Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](NC(=O)C)C(O)O[C@H](CO)[C@H]1O[C@H]1[C@H](NC(C)=O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O1 CDOJPCSDOXYJJF-CAQKAZPESA-N 0.000 claims abstract description 101
- KFEUJDWYNGMDBV-LODBTCKLSA-N N-acetyllactosamine Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](NC(=O)C)[C@H](O)O[C@H](CO)[C@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O1 KFEUJDWYNGMDBV-LODBTCKLSA-N 0.000 claims abstract description 11
- HESSGHHCXGBPAJ-UHFFFAOYSA-N N-acetyllactosamine Natural products CC(=O)NC(C=O)C(O)C(C(O)CO)OC1OC(CO)C(O)C(O)C1O HESSGHHCXGBPAJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 11
- 229950006780 n-acetylglucosamine Drugs 0.000 claims abstract description 9
- WSSMMNVKLQZMEF-SGTWBMOHSA-N N-[(3R,4R,5S,6R)-2,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-3-yl]acetamide N-[(3R,4R,5R,6R)-2,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-3-yl]acetamide Chemical compound CC(=O)N[C@H]1C(O)O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@@H]1O.CC(=O)N[C@H]1C(O)O[C@H](CO)[C@H](O)[C@@H]1O WSSMMNVKLQZMEF-SGTWBMOHSA-N 0.000 claims abstract description 8
- 102000002068 Glycopeptides Human genes 0.000 claims description 55
- 108010015899 Glycopeptides Proteins 0.000 claims description 55
- DQJCDTNMLBYVAY-ZXXIYAEKSA-N (2S,5R,10R,13R)-16-{[(2R,3S,4R,5R)-3-{[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy}-5-(ethylamino)-6-hydroxy-2-(hydroxymethyl)oxan-4-yl]oxy}-5-(4-aminobutyl)-10-carbamoyl-2,13-dimethyl-4,7,12,15-tetraoxo-3,6,11,14-tetraazaheptadecan-1-oic acid Chemical compound NCCCC[C@H](C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O)NC(=O)CC[C@H](C(N)=O)NC(=O)[C@@H](C)NC(=O)C(C)O[C@@H]1[C@@H](NCC)C(O)O[C@H](CO)[C@H]1O[C@H]1[C@H](NC(C)=O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 DQJCDTNMLBYVAY-ZXXIYAEKSA-N 0.000 claims description 53
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 claims description 33
- 108090001090 Lectins Proteins 0.000 claims description 20
- 102000004856 Lectins Human genes 0.000 claims description 20
- 239000002523 lectin Substances 0.000 claims description 20
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 claims description 15
- 238000002372 labelling Methods 0.000 claims description 14
- 206010004446 Benign prostatic hyperplasia Diseases 0.000 claims description 10
- 208000004403 Prostatic Hyperplasia Diseases 0.000 claims description 10
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 claims description 10
- 102000007066 Prostate-Specific Antigen Human genes 0.000 abstract description 180
- 108010072866 Prostate-Specific Antigen Proteins 0.000 abstract description 180
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 abstract description 2
- 206010051482 Prostatomegaly Diseases 0.000 abstract 2
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 45
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 39
- DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N Trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 26
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 26
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 26
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 description 18
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 18
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 18
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 17
- LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I dipotassium trisodium dihydrogen phosphate hydrogen phosphate dichloride Chemical compound P(=O)(O)(O)[O-].[K+].P(=O)(O)([O-])[O-].[Na+].[Na+].[Cl-].[K+].[Cl-].[Na+] LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I 0.000 description 17
- 239000002953 phosphate buffered saline Substances 0.000 description 17
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 17
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 16
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 15
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Chemical compound O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- MBLBDJOUHNCFQT-UHFFFAOYSA-N N-acetyl-D-galactosamine Natural products CC(=O)NC(C=O)C(O)C(O)C(O)CO MBLBDJOUHNCFQT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 11
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 10
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 10
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- OVRNDRQMDRJTHS-KEWYIRBNSA-N N-acetyl-D-galactosamine Chemical compound CC(=O)N[C@H]1C(O)O[C@H](CO)[C@H](O)[C@@H]1O OVRNDRQMDRJTHS-KEWYIRBNSA-N 0.000 description 9
- 229920002684 Sepharose Polymers 0.000 description 9
- BBEAQIROQSPTKN-UHFFFAOYSA-N pyrene Chemical compound C1=CC=C2C=CC3=CC=CC4=CC=C1C2=C43 BBEAQIROQSPTKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 9
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 8
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 8
- 230000009870 specific binding Effects 0.000 description 8
- PEIBAWRLFPGPAT-UHFFFAOYSA-N 1-(diazomethyl)pyrene Chemical compound C1=C2C(C=[N+]=[N-])=CC=C(C=C3)C2=C2C3=CC=CC2=C1 PEIBAWRLFPGPAT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- HZAXFHJVJLSVMW-UHFFFAOYSA-N 2-Aminoethan-1-ol Chemical compound NCCO HZAXFHJVJLSVMW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 7
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 7
- 229920000936 Agarose Polymers 0.000 description 6
- ATRRKUHOCOJYRX-UHFFFAOYSA-N Ammonium bicarbonate Chemical compound [NH4+].OC([O-])=O ATRRKUHOCOJYRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 229910000013 Ammonium bicarbonate Inorganic materials 0.000 description 6
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 6
- 235000012538 ammonium bicarbonate Nutrition 0.000 description 6
- 239000001099 ammonium carbonate Substances 0.000 description 6
- 210000000582 semen Anatomy 0.000 description 6
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 6
- 238000001042 affinity chromatography Methods 0.000 description 5
- 230000027455 binding Effects 0.000 description 5
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 5
- VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N dithiothreitol Chemical compound SC[C@@H](O)[C@H](O)CS VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N 0.000 description 5
- GVEPBJHOBDJJJI-UHFFFAOYSA-N fluoranthrene Natural products C1=CC(C2=CC=CC=C22)=C3C2=CC=CC3=C1 GVEPBJHOBDJJJI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 239000010439 graphite Substances 0.000 description 5
- 229910002804 graphite Inorganic materials 0.000 description 5
- 238000001114 immunoprecipitation Methods 0.000 description 5
- 238000000816 matrix-assisted laser desorption--ionisation Methods 0.000 description 5
- 108090001109 Thermolysin Proteins 0.000 description 4
- 238000005804 alkylation reaction Methods 0.000 description 4
- SQVRNKJHWKZAKO-UHFFFAOYSA-N beta-N-Acetyl-D-neuraminic acid Natural products CC(=O)NC1C(O)CC(O)(C(O)=O)OC1C(O)C(O)CO SQVRNKJHWKZAKO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 4
- XBDQKXXYIPTUBI-UHFFFAOYSA-N dimethylselenoniopropionate Natural products CCC(O)=O XBDQKXXYIPTUBI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000012153 distilled water Substances 0.000 description 4
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 4
- 238000000132 electrospray ionisation Methods 0.000 description 4
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 4
- 238000002523 gelfiltration Methods 0.000 description 4
- PGLTVOMIXTUURA-UHFFFAOYSA-N iodoacetamide Chemical compound NC(=O)CI PGLTVOMIXTUURA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000011259 mixed solution Substances 0.000 description 4
- 239000008363 phosphate buffer Substances 0.000 description 4
- 229920003023 plastic Polymers 0.000 description 4
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 4
- 238000006722 reduction reaction Methods 0.000 description 4
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 4
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 4
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 102000009027 Albumins Human genes 0.000 description 3
- 108010088751 Albumins Proteins 0.000 description 3
- IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N Dimethylsulphoxide Chemical compound CS(C)=O IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N Hydrochloric acid Chemical compound Cl VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 3
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 3
- 102000000447 Peptide-N4-(N-acetyl-beta-glucosaminyl) Asparagine Amidase Human genes 0.000 description 3
- 108010055817 Peptide-N4-(N-acetyl-beta-glucosaminyl) Asparagine Amidase Proteins 0.000 description 3
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N Sulfur Chemical compound [S] NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000012190 activator Substances 0.000 description 3
- 230000029936 alkylation Effects 0.000 description 3
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 3
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 3
- 230000008859 change Effects 0.000 description 3
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 3
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 3
- 238000001035 drying Methods 0.000 description 3
- 125000000524 functional group Chemical group 0.000 description 3
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 3
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 3
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 3
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 3
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 3
- SQVRNKJHWKZAKO-OQPLDHBCSA-N sialic acid Chemical compound CC(=O)N[C@@H]1[C@@H](O)C[C@@](O)(C(O)=O)OC1[C@H](O)[C@H](O)CO SQVRNKJHWKZAKO-OQPLDHBCSA-N 0.000 description 3
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 3
- 238000001179 sorption measurement Methods 0.000 description 3
- 229910052717 sulfur Inorganic materials 0.000 description 3
- 239000011593 sulfur Substances 0.000 description 3
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 3
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 3
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 3
- WXTMDXOMEHJXQO-UHFFFAOYSA-N 2,5-dihydroxybenzoic acid Chemical compound OC(=O)C1=CC(O)=CC=C1O WXTMDXOMEHJXQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- SHZGCJCMOBCMKK-UHFFFAOYSA-N D-mannomethylose Natural products CC1OC(O)C(O)C(O)C1O SHZGCJCMOBCMKK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-QTVWNMPRSA-N D-mannopyranose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-QTVWNMPRSA-N 0.000 description 2
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 2
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 2
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 2
- 239000012541 Fractogel® Substances 0.000 description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 2
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 description 2
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 description 2
- OAKJQQAXSVQMHS-UHFFFAOYSA-N Hydrazine Chemical compound NN OAKJQQAXSVQMHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- SHZGCJCMOBCMKK-DHVFOXMCSA-N L-fucopyranose Chemical compound C[C@@H]1OC(O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H]1O SHZGCJCMOBCMKK-DHVFOXMCSA-N 0.000 description 2
- OVRNDRQMDRJTHS-CBQIKETKSA-N N-Acetyl-D-Galactosamine Chemical compound CC(=O)N[C@H]1[C@@H](O)O[C@H](CO)[C@H](O)[C@@H]1O OVRNDRQMDRJTHS-CBQIKETKSA-N 0.000 description 2
- LRHPLDYGYMQRHN-UHFFFAOYSA-N N-Butanol Chemical compound CCCCO LRHPLDYGYMQRHN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- UFWIBTONFRDIAS-UHFFFAOYSA-N Naphthalene Chemical compound C1=CC=CC2=CC=CC=C21 UFWIBTONFRDIAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 2
- 108010030544 Peptidyl-Lys metalloendopeptidase Proteins 0.000 description 2
- 229920001213 Polysorbate 20 Polymers 0.000 description 2
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N Silicium dioxide Chemical compound O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- PXIPVTKHYLBLMZ-UHFFFAOYSA-N Sodium azide Chemical compound [Na+].[N-]=[N+]=[N-] PXIPVTKHYLBLMZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108090000631 Trypsin Proteins 0.000 description 2
- 102000004142 Trypsin Human genes 0.000 description 2
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 2
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 2
- MWPLVEDNUUSJAV-UHFFFAOYSA-N anthracene Chemical compound C1=CC=CC2=CC3=CC=CC=C3C=C21 MWPLVEDNUUSJAV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 description 2
- 238000001574 biopsy Methods 0.000 description 2
- XJMXIWNOKIEIMX-UHFFFAOYSA-N bromo chloro 1h-indol-2-yl phosphate Chemical compound C1=CC=C2NC(OP(=O)(OBr)OCl)=CC2=C1 XJMXIWNOKIEIMX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000003541 chymotrypsin inhibitor Substances 0.000 description 2
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 2
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 2
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 2
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 2
- 229930182830 galactose Natural products 0.000 description 2
- 150000002430 hydrocarbons Chemical group 0.000 description 2
- 230000008105 immune reaction Effects 0.000 description 2
- JPXMTWWFLBLUCD-UHFFFAOYSA-N nitro blue tetrazolium(2+) Chemical compound COC1=CC(C=2C=C(OC)C(=CC=2)[N+]=2N(N=C(N=2)C=2C=CC=CC=2)C=2C=CC(=CC=2)[N+]([O-])=O)=CC=C1[N+]1=NC(C=2C=CC=CC=2)=NN1C1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1 JPXMTWWFLBLUCD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229920002401 polyacrylamide Polymers 0.000 description 2
- 125000003367 polycyclic group Chemical group 0.000 description 2
- 239000000256 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Substances 0.000 description 2
- 235000010486 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Nutrition 0.000 description 2
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 2
- 239000000047 product Substances 0.000 description 2
- 210000002307 prostate Anatomy 0.000 description 2
- 108020001775 protein parts Proteins 0.000 description 2
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 2
- 238000011084 recovery Methods 0.000 description 2
- 238000012552 review Methods 0.000 description 2
- 239000012723 sample buffer Substances 0.000 description 2
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 2
- 125000006850 spacer group Chemical group 0.000 description 2
- 239000012588 trypsin Substances 0.000 description 2
- 238000000108 ultra-filtration Methods 0.000 description 2
- -1 1-pyrenylmethyl Chemical group 0.000 description 1
- GLDQAMYCGOIJDV-UHFFFAOYSA-N 2,3-dihydroxybenzoic acid Chemical compound OC(=O)C1=CC=CC(O)=C1O GLDQAMYCGOIJDV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- CTACCJKMSCTZPU-UHFFFAOYSA-N 2-pyren-1-ylacetohydrazide Chemical compound C1=C2C(CC(=O)NN)=CC=C(C=C3)C2=C2C3=CC=CC2=C1 CTACCJKMSCTZPU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FPQQSJJWHUJYPU-UHFFFAOYSA-N 3-(dimethylamino)propyliminomethylidene-ethylazanium;chloride Chemical compound Cl.CCN=C=NCCCN(C)C FPQQSJJWHUJYPU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AMPDQYAONVXEGC-UHFFFAOYSA-N 3-pyren-1-ylpropan-1-amine Chemical compound C1=C2C(CCCN)=CC=C(C=C3)C2=C2C3=CC=CC2=C1 AMPDQYAONVXEGC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UORLZTLNRSHBOY-UHFFFAOYSA-N 3-pyren-1-ylpropanehydrazide Chemical compound C1=C2C(CCC(=O)NN)=CC=C(C=C3)C2=C2C3=CC=CC2=C1 UORLZTLNRSHBOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BKRIEFUMDWSFKX-UHFFFAOYSA-N 4-pyren-1-ylbutan-1-amine Chemical compound C1=C2C(CCCCN)=CC=C(C=C3)C2=C2C3=CC=CC2=C1 BKRIEFUMDWSFKX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SOPPDVMSOKMZOC-UHFFFAOYSA-N 4-pyren-1-ylbutanehydrazide Chemical compound C1=C2C(CCCC(=O)NN)=CC=C(C=C3)C2=C2C3=CC=CC2=C1 SOPPDVMSOKMZOC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 1
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 1
- 102100022524 Alpha-1-antichymotrypsin Human genes 0.000 description 1
- 102100022749 Aminopeptidase N Human genes 0.000 description 1
- RMMXTBMQSGEXHJ-UHFFFAOYSA-N Aminophenazone Chemical compound O=C1C(N(C)C)=C(C)N(C)N1C1=CC=CC=C1 RMMXTBMQSGEXHJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N Asparagine Natural products OC(=O)C(N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010049990 CD13 Antigens Proteins 0.000 description 1
- 108090000087 Carboxypeptidase B Proteins 0.000 description 1
- 102000003670 Carboxypeptidase B Human genes 0.000 description 1
- 108090000317 Chymotrypsin Proteins 0.000 description 1
- 108010062580 Concanavalin A Proteins 0.000 description 1
- YXHKONLOYHBTNS-UHFFFAOYSA-N Diazomethane Chemical group C=[N+]=[N-] YXHKONLOYHBTNS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010067770 Endopeptidase K Proteins 0.000 description 1
- PNNNRSAQSRJVSB-SLPGGIOYSA-N Fucose Natural products C[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)C=O PNNNRSAQSRJVSB-SLPGGIOYSA-N 0.000 description 1
- 108010051815 Glutamyl endopeptidase Proteins 0.000 description 1
- 108010031186 Glycoside Hydrolases Proteins 0.000 description 1
- 102000005744 Glycoside Hydrolases Human genes 0.000 description 1
- HTTJABKRGRZYRN-UHFFFAOYSA-N Heparin Chemical compound OC1C(NC(=O)C)C(O)OC(COS(O)(=O)=O)C1OC1C(OS(O)(=O)=O)C(O)C(OC2C(C(OS(O)(=O)=O)C(OC3C(C(O)C(O)C(O3)C(O)=O)OS(O)(=O)=O)C(CO)O2)NS(O)(=O)=O)C(C(O)=O)O1 HTTJABKRGRZYRN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010001336 Horseradish Peroxidase Proteins 0.000 description 1
- 206010020880 Hypertrophy Diseases 0.000 description 1
- 108010053229 Lysyl endopeptidase Proteins 0.000 description 1
- 108010090665 Mannosyl-Glycoprotein Endo-beta-N-Acetylglucosaminidase Proteins 0.000 description 1
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 1
- NQTADLQHYWFPDB-UHFFFAOYSA-N N-Hydroxysuccinimide Chemical compound ON1C(=O)CCC1=O NQTADLQHYWFPDB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OVRNDRQMDRJTHS-UHFFFAOYSA-N N-acelyl-D-glucosamine Natural products CC(=O)NC1C(O)OC(CO)C(O)C1O OVRNDRQMDRJTHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OVRNDRQMDRJTHS-RTRLPJTCSA-N N-acetyl-D-glucosamine Chemical compound CC(=O)N[C@H]1C(O)O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@@H]1O OVRNDRQMDRJTHS-RTRLPJTCSA-N 0.000 description 1
- SQVRNKJHWKZAKO-PFQGKNLYSA-N N-acetyl-beta-neuraminic acid Chemical compound CC(=O)N[C@@H]1[C@@H](O)C[C@@](O)(C(O)=O)O[C@H]1[C@H](O)[C@H](O)CO SQVRNKJHWKZAKO-PFQGKNLYSA-N 0.000 description 1
- MBLBDJOUHNCFQT-LXGUWJNJSA-N N-acetylglucosamine Natural products CC(=O)N[C@@H](C=O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO MBLBDJOUHNCFQT-LXGUWJNJSA-N 0.000 description 1
- SQVRNKJHWKZAKO-LUWBGTNYSA-N N-acetylneuraminic acid Chemical class CC(=O)N[C@@H]1[C@@H](O)CC(O)(C(O)=O)O[C@H]1[C@H](O)[C@H](O)CO SQVRNKJHWKZAKO-LUWBGTNYSA-N 0.000 description 1
- 102000005348 Neuraminidase Human genes 0.000 description 1
- 108010006232 Neuraminidase Proteins 0.000 description 1
- 206010061902 Pancreatic neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 102000057297 Pepsin A Human genes 0.000 description 1
- 108090000284 Pepsin A Proteins 0.000 description 1
- 102000035195 Peptidases Human genes 0.000 description 1
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 description 1
- 102000007079 Peptide Fragments Human genes 0.000 description 1
- 108010033276 Peptide Fragments Proteins 0.000 description 1
- 108010089814 Plant Lectins Proteins 0.000 description 1
- 229920009405 Polyvinylidenefluoride (PVDF) Film Polymers 0.000 description 1
- 102000056251 Prolyl Oligopeptidases Human genes 0.000 description 1
- 101710178372 Prolyl endopeptidase Proteins 0.000 description 1
- 239000004365 Protease Substances 0.000 description 1
- 101710118538 Protease Proteins 0.000 description 1
- XUIMIQQOPSSXEZ-UHFFFAOYSA-N Silicon Chemical compound [Si] XUIMIQQOPSSXEZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 1
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 1
- 101710120037 Toxin CcdB Proteins 0.000 description 1
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 1
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 1
- 238000005903 acid hydrolysis reaction Methods 0.000 description 1
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 description 1
- 230000032683 aging Effects 0.000 description 1
- 125000002947 alkylene group Chemical group 0.000 description 1
- 108010091628 alpha 1-Antichymotrypsin Proteins 0.000 description 1
- 150000001408 amides Chemical class 0.000 description 1
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 description 1
- BFNBIHQBYMNNAN-UHFFFAOYSA-N ammonium sulfate Chemical compound N.N.OS(O)(=O)=O BFNBIHQBYMNNAN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052921 ammonium sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011130 ammonium sulphate Nutrition 0.000 description 1
- 239000012491 analyte Substances 0.000 description 1
- 239000003098 androgen Substances 0.000 description 1
- 238000005571 anion exchange chromatography Methods 0.000 description 1
- 229960001230 asparagine Drugs 0.000 description 1
- 235000009582 asparagine Nutrition 0.000 description 1
- 125000000613 asparagine group Chemical group N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)* 0.000 description 1
- 238000007068 beta-elimination reaction Methods 0.000 description 1
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 1
- 210000001124 body fluid Anatomy 0.000 description 1
- 239000010839 body fluid Substances 0.000 description 1
- UDSAIICHUKSCKT-UHFFFAOYSA-N bromophenol blue Chemical compound C1=C(Br)C(O)=C(Br)C=C1C1(C=2C=C(Br)C(O)=C(Br)C=2)C2=CC=CC=C2S(=O)(=O)O1 UDSAIICHUKSCKT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 1
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 1
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 1
- 229960002376 chymotrypsin Drugs 0.000 description 1
- YKCWQPZFAFZLBI-UHFFFAOYSA-N cibacron blue Chemical compound C1=2C(=O)C3=CC=CC=C3C(=O)C=2C(N)=C(S(O)(=O)=O)C=C1NC(C=C1S(O)(=O)=O)=CC=C1NC(N=1)=NC(Cl)=NC=1NC1=CC=CC=C1S(O)(=O)=O YKCWQPZFAFZLBI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000004040 coloring Methods 0.000 description 1
- 239000000470 constituent Substances 0.000 description 1
- 238000001816 cooling Methods 0.000 description 1
- 230000008878 coupling Effects 0.000 description 1
- 238000010168 coupling process Methods 0.000 description 1
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 description 1
- 239000012228 culture supernatant Substances 0.000 description 1
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 1
- LRPQMNYCTSPGCX-UHFFFAOYSA-N dimethyl pimelimidate Chemical compound COC(=N)CCCCCC(=N)OC LRPQMNYCTSPGCX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000013399 early diagnosis Methods 0.000 description 1
- 239000003480 eluent Substances 0.000 description 1
- 238000010828 elution Methods 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- 238000006911 enzymatic reaction Methods 0.000 description 1
- DNJIEGIFACGWOD-UHFFFAOYSA-N ethyl mercaptane Natural products CCS DNJIEGIFACGWOD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 1
- 230000001747 exhibiting effect Effects 0.000 description 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 1
- 239000000945 filler Substances 0.000 description 1
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 1
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 1
- 229960002897 heparin Drugs 0.000 description 1
- 229920000669 heparin Polymers 0.000 description 1
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000002013 hydrophilic interaction chromatography Methods 0.000 description 1
- 238000004191 hydrophobic interaction chromatography Methods 0.000 description 1
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 1
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 1
- 230000003053 immunization Effects 0.000 description 1
- 238000002649 immunization Methods 0.000 description 1
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 description 1
- 238000007689 inspection Methods 0.000 description 1
- 238000005040 ion trap Methods 0.000 description 1
- 230000003902 lesion Effects 0.000 description 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 1
- HWYHZTIRURJOHG-UHFFFAOYSA-N luminol Chemical compound O=C1NNC(=O)C2=C1C(N)=CC=C2 HWYHZTIRURJOHG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000015486 malignant pancreatic neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 238000001906 matrix-assisted laser desorption--ionisation mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 210000004877 mucosa Anatomy 0.000 description 1
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 1
- 238000013188 needle biopsy Methods 0.000 description 1
- 238000004305 normal phase HPLC Methods 0.000 description 1
- 150000002482 oligosaccharides Polymers 0.000 description 1
- 239000003960 organic solvent Substances 0.000 description 1
- 201000002528 pancreatic cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000008443 pancreatic carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 229940111202 pepsin Drugs 0.000 description 1
- 108010066282 phytohemagglutinin L4 Proteins 0.000 description 1
- 239000003726 plant lectin Substances 0.000 description 1
- 229920002492 poly(sulfone) Polymers 0.000 description 1
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 1
- 235000019260 propionic acid Nutrition 0.000 description 1
- TZNXEWGKCWPLQI-UHFFFAOYSA-N pyren-1-ylmethanamine Chemical compound C1=C2C(CN)=CC=C(C=C3)C2=C2C3=CC=CC2=C1 TZNXEWGKCWPLQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000005581 pyrene group Chemical group 0.000 description 1
- IUVKMZGDUIUOCP-BTNSXGMBSA-N quinbolone Chemical compound O([C@H]1CC[C@H]2[C@H]3[C@@H]([C@]4(C=CC(=O)C=C4CC3)C)CC[C@@]21C)C1=CCCC1 IUVKMZGDUIUOCP-BTNSXGMBSA-N 0.000 description 1
- 239000000376 reactant Substances 0.000 description 1
- 230000009257 reactivity Effects 0.000 description 1
- 238000004366 reverse phase liquid chromatography Methods 0.000 description 1
- 238000004007 reversed phase HPLC Methods 0.000 description 1
- 239000010979 ruby Substances 0.000 description 1
- 229910001750 ruby Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 1
- 238000012764 semi-quantitative analysis Methods 0.000 description 1
- 125000005629 sialic acid group Chemical group 0.000 description 1
- 239000010703 silicon Substances 0.000 description 1
- 229910052710 silicon Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000000377 silicon dioxide Substances 0.000 description 1
- 239000002002 slurry Substances 0.000 description 1
- 239000007974 sodium acetate buffer Substances 0.000 description 1
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 description 1
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 1
- 125000004079 stearyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 108010059339 submandibular proteinase A Proteins 0.000 description 1
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 1
- 238000005987 sulfurization reaction Methods 0.000 description 1
- 238000002198 surface plasmon resonance spectroscopy Methods 0.000 description 1
- 238000001269 time-of-flight mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960001322 trypsin Drugs 0.000 description 1
- 239000000439 tumor marker Substances 0.000 description 1
- 210000002700 urine Anatomy 0.000 description 1
- 108010043166 wisteria lectin Proteins 0.000 description 1
- DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N β‐Mercaptoethanol Chemical compound OCCS DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
- G01N33/57407—Specifically defined cancers
- G01N33/57434—Specifically defined cancers of prostate
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
- G01N33/57469—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer involving tumor associated glycolinkage, i.e. TAG
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/68—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
- G01N33/6803—General methods of protein analysis not limited to specific proteins or families of proteins
- G01N33/6848—Methods of protein analysis involving mass spectrometry
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N30/00—Investigating or analysing materials by separation into components using adsorption, absorption or similar phenomena or using ion-exchange, e.g. chromatography or field flow fractionation
- G01N30/02—Column chromatography
- G01N30/88—Integrated analysis systems specially adapted therefor, not covered by a single one of the groups G01N30/04 - G01N30/86
- G01N2030/8809—Integrated analysis systems specially adapted therefor, not covered by a single one of the groups G01N30/04 - G01N30/86 analysis specially adapted for the sample
- G01N2030/8813—Integrated analysis systems specially adapted therefor, not covered by a single one of the groups G01N30/04 - G01N30/86 analysis specially adapted for the sample biological materials
- G01N2030/8831—Integrated analysis systems specially adapted therefor, not covered by a single one of the groups G01N30/04 - G01N30/86 analysis specially adapted for the sample biological materials involving peptides or proteins
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N30/00—Investigating or analysing materials by separation into components using adsorption, absorption or similar phenomena or using ion-exchange, e.g. chromatography or field flow fractionation
- G01N30/02—Column chromatography
- G01N30/62—Detectors specially adapted therefor
- G01N30/72—Mass spectrometers
- G01N30/7233—Mass spectrometers interfaced to liquid or supercritical fluid chromatograph
Definitions
- the present invention relates to a novel method for determining prostate cancer, and more particularly to a novel method for determining prostate cancer and benign prostatic hypertrophy.
- the present invention relates to a novel method for determining prostate cancer and benign prostatic hypertrophy based on the difference in the sugar chain structure of prostate-specific antigen.
- PSA Prostate specific antigen
- PC Prostate specific antigen
- PSA has a molecular weight of about 30 kDa composed of a protein part consisting of 237 amino acid residues having a molecular weight of about 26 kDa and a sugar chain part bound to the amino acid residue (such as 45th Asn) of the protein part. Or a derivative thereof.
- the sugar chain portion shows about 8% of the molecular weight of PSA.
- Binding molecules that can be used include lectins (such as PHA-L) and antibodies.
- Non-Patent Document 4 there has been a report focusing on the content of N-acetylgalactosamine (GalNAc) in PSA (see Non-Patent Document 4).
- the report examines the structure of PSA sugar chain in detail, and the content of GalNAc in the seminal plasma-derived PSA sugar chain is 25%, whereas the PSA sugar chain of prostate cancer cell line (LNCaP) contains about 65% GalNAc. It is described that.
- LNCaP prostate cancer cell line
- LNCaP prostate cancer cell line
- These authors have also observed a similar change in the pancreatic cancer-derived cell line (Capan-1) (see Non-Patent Document 5), from which the change in the content of GalNAc is attributed to a cancerous mutation. Analogy.
- Non-Patent Document 6 there has been reported a method for comprehensively analyzing sugar chains of target proteins including PSA using an array composed of specific antibodies and a large number of lectins.
- this method it has been clarified that there are many LacdiNAc structures (N-acetylgalactosamine-N-acetylglucosamine structures) at the non-reducing ends on the sugar chain structure of PSA derived from prostate cancer cell lines.
- LacdiNAc structures N-acetylgalactosamine-N-acetylglucosamine structures
- a LacdiNAc structure is disclosed as an oligosaccharide sequence that is specifically expressed in cancer cells, and a patent application has been filed for a method for detecting cancer based on its presence detected in a biological sample. (See Patent Document 3). However, a specific method relating to the detection is not described, and further, determination of PC and BPH is not targeted.
- Patent Document 4 a method for evaluating the clinical state of a subject by determining the sugar profile of the sugar chain of a target glycoprotein containing PSA has been proposed (see Patent Document 4).
- This document describes that in an analysis using the MALDI-MS method, a PSA sugar chain of a subject suffering from PC is different from a normal PSA sugar chain. However, the specific structure of the PSA sugar chain of a subject suffering from PC is not described.
- JP 2002-055108 A Special Table 2000-514919 JP 2005-500057 Gazette JP 2006-515927 A
- an object of the present invention is to detect a subject's PSA sugar chain, in particular, to detect a PSA sugar chain of a subject suffering from BPH or PC, and to accurately identify BPH and PC based on the sugar chain structure of PSA. It is to provide a determination method.
- the present inventors do not use only the presence of the LacdiNAc structure as an index in the PSA sugar chain, but by focusing on the ratio of the sugar chain having LacdiNAc and the sugar chain not having LacdiNAc, The present invention has been completed by finding that it is possible to determine judgment, in particular, prostate cancer and benign prostatic hypertrophy.
- the present invention is the following method.
- [1] Including the step of analyzing the sugar chain structure of PSA in a sample derived from a subject, wherein the amount of sugar chain (LacdiNAc (+)) having LacdiNAc (N-acetylgalactosamine-N-acetylglucosamine) does not have LacdiNAc but LacNAc
- a method for determining prostate cancer characterized by determining that it is prostate cancer when it exceeds 30% of the amount of sugar chain (LacdiNAc ( ⁇ )) having (galactose-N-acetylglucosamine).
- [2] Including the step of analyzing the sugar chain structure of PSA in a sample derived from a subject, wherein the amount of sugar chain (LacdiNAc (+)) having LacdiNAc (N-acetylgalactosamine-N-acetylglucosamine) does not have LacdiNAc but LacNAc When it exceeds 30% of the amount of sugar chain (LacdiNAc ( ⁇ )) having (galactose-N-acetylglucosamine), it is determined as prostate cancer, and when it is 30% or less, it is determined as benign prostatic hypertrophy
- the method for determining prostate cancer according to [1], wherein: [3] The sugar chain structure of the PSA is analyzed by a method in which a lectin is allowed to act on the PSA, a method in which an antibody is allowed to act on the PSA, a high performance liquid chromatography method or a mass spectrometry method, or an analysis means combining these.
- the sugar chain structure of the PSA is analyzed by a method in which a lectin is allowed to act on the PSA, a method in which an antibody is allowed to act on the PSA, a high performance liquid chromatography method or a mass spectrometry method, or an analysis means combining these.
- [5] (1) purifying PSA from a subject-derived sample; (2) preparing a PSA derivative from the PSA purified in step (1); (3) a step of labeling the PSA derivative obtained in step (2); (4) Including the step of analyzing the labeled PSA derivative obtained in step (3) by mass spectrometry, indicated by a mass difference 41 due to the presence or absence of the structure of LacdiNAc (N-acetylgalactosamine-N-acetylglucosamine)
- the signal intensity derived from the sugar chain having LacdiNAc (LacdiNAc (+)) is selected, and the sugar chain having no LacdiNAc but having LacNAc (galactose-N-acetylglucosamine) (LacdiNAc (-))
- the method for determining prostate cancer according to [3], wherein it is determined that the cancer is prostate cancer when it exceeds 30% of the signal intensity derived from.
- [6] (1) purifying PSA from a subject-derived sample; (2) preparing a PSA derivative from the PSA purified in step (1); (3) a step of labeling the PSA derivative obtained in step (2); (4) Including the step of analyzing the labeled PSA derivative obtained in step (3) by mass spectrometry, indicated by a mass difference 41 due to the presence or absence of the structure of LacdiNAc (N-acetylgalactosamine-N-acetylglucosamine)
- a signal chain derived from a sugar chain having LacdiNAc (LacdiNAc (+)), but having a signal intensity that does not have LacdiNAc but has LacNAc (galactose-N-acetylglucosamine) (LacdiNAc (-))
- the determination of prostate cancer according to [4], wherein it is determined that it is prostate cancer when it exceeds 30% of the derived signal intensity, and it is determined that it is benign prostatic hypertrophy when it is 30% or less.
- the above problems and problems can be solved. That is, it is possible to detect the sugar chain structure of prostate specific antigen (PSA) and accurately determine whether it is prostate cancer based on the difference in the structure. In particular, it is prostate cancer or benign prostatic hypertrophy It is possible to provide a method for accurately determining whether or not
- a series of LacdiNAc (+) sugar chain structures and LacdiNAc ( -) By measuring the signal strength ratio percentage R value of the sugar chain structure, PC and BPH can be distinguished and determined with high accuracy.
- the LacdiNAc (+) / LacdiNAc ( ⁇ ) signal intensity ratio percentage R value does not correlate with the serum PSA concentration, and is at least larger than the threshold value R in PC and lower than the threshold value R in BPH. Therefore, it is possible to determine whether or not the PC is highly accurate simply by setting the numerical value of the threshold value R regardless of the PSA concentration.
- the serum PSA concentration tends to increase with age. Therefore, particularly in the future aging society, the method of the present invention for determining whether or not a PC is highly accurate, and in particular, determining PC and BPH, is effective not only for medical contribution but also for the medical economy. Play.
- FIG. 2 is a diagram showing a negative ion MS spectrum obtained in Example 1.
- 6 is a diagram showing a positive ion MS spectrum obtained in Example 4.
- FIG. 6 is a diagram showing a positive ion MS spectrum obtained in Example 5.
- FIG. 10 is a diagram showing a positive ion MS spectrum obtained in Example 6.
- FIG. 6 is a diagram showing a positive ion MS spectrum obtained in Example 7.
- the method for determining PC is a step of analyzing a target by a specific binding molecule such as a lectin or a specific antibody, high performance liquid chromatography, mass spectrometry, or a combination thereof.
- a specific binding molecule such as a lectin or a specific antibody, high performance liquid chromatography, mass spectrometry, or a combination thereof.
- the detection target is determined to be prostate cancer when the set containing LacdiNAc (+) sugar chain structure exceeds 30% of the set containing LacdiNAc ( ⁇ ) sugar chain structure In particular, when it is 30% or less, it is characterized in that it is determined that the benign prostatic hypertrophy is present.
- N-acetylgalactosamine-N-acetylglucosamine is abbreviated as “LacdiNAc”
- “galactose-N-acetylglucosamine” is abbreviated as “LacNAc”.
- a sugar chain having LacdiNAc is abbreviated as “LacdiNAc (+)”
- a sugar chain having no LacdiNAc but having LacNAc is abbreviated as “LacdiNAc ( ⁇ )”.
- the “sample derived from the subject” used in the present invention includes blood (including serum, plasma, etc.), urine, body fluid such as semen (sperm), cells / tissues, and the like.
- the determination method of PC in the step of analyzing by mass spectrometry, (1) a step of purifying PSA from a subject-derived sample; (2) a step of preparing a PSA derivative from the PSA purified in step (1); (3) labeling the PSA derivative obtained in step (2), (4)
- the labeled PSA derivative obtained in step (3) is analyzed and the standard threshold value R (S) is applied
- the signal intensity derived from the LacdiNAc (+) sugar chain structure in the labeled PSA derivative Is characterized in that it is determined to be prostate cancer when it exceeds 30% of the signal intensity derived from the LacdiNAc ( ⁇ ) sugar chain structure, and in particular, when it is 30% or less, it is not prostate cancer or benign prostate It is characterized by determining that it is hypertrophy.
- step (1) PSA is purified from the sample derived from the subject.
- Step (1) can be performed by any method known in the art.
- a method combining several types of affinity chromatography can be used.
- affinity carriers based on adsorption of sulfur such as Fractogel (registered trademark) EMD TA) and Cibacron ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ Blue 3GA, or protein A Sepharose CL-4B, HiTrap heparin column HPLC, etc.
- the eluent is treated with ethanolamine to give free PSA.
- the obtained PSA is treated using the immunoprecipitation method described above to obtain a PSA derivative. According to the above-mentioned document, about 63 ⁇ g of PSA was required in the sample derived from the subject in order to analyze the obtained PSA derivative.
- the PSA can be purified using the affinity carrier based on the adsorption of sulfur in the step (1) (see Non-Patent Document 8).
- PSA is purified from human semen, prostate cancer patient serum, prostate cancer cell (LNCaP) culture supernatant by chromatography using 3S, T-gel slurry (Fractogel® EMD TA) and Western Blotting can be used to identify complexes with PSA alone or ⁇ 1-antichymotrypsin (ACT).
- PSA may be purified by combining affinity chromatography based on adsorption of parent sulfur and gel filtration (see Non-Patent Document 8).
- Fractogel (registered trademark) TA 650 (S) can be combined with Ultrogel AcA-54 which is a gel filtration carrier. In this combination method, free PSA could be recovered in a yield of 72%.
- PSA when subject-derived semen is used as the sample in step (1), PSA can be purified using the following method (see Non-Patent Documents 9 and 10). For example, PSA by sequential precipitation by addition of ammonium sulfate, hydrophobic interaction chromatography (Phenyl-Sepharose-HP column), gel filtration (SephacrylephS-200 column), and anion exchange chromatography (Resourse Q column) Can be purified. In this method, it was reported that the final PSA recovery was 30.1% when the sample contained 33.9 mg of PSA.
- PSA can be purified by a method combining ultrafiltration and various chromatographies (see Non-Patent Document 5). For example, ultrafiltration (5 kDa cutoff polysulfone membrane (Millipore)), affinity chromatography (Cibacron Blue 3GA), gel filtration (Biogel P60), affinity chromatography (Cibacron) containing LNCaP cultured by appropriate means Blue 3GA) and reverse phase chromatography (214TP-RP C4, using HPLC) can be used to purify PSA.
- ultrafiltration 5 kDa cutoff polysulfone membrane (Millipore)
- affinity chromatography Cibacron Blue 3GA
- Gel filtration Biogel P60
- affinity chromatography Cibacron containing LNCaP cultured by appropriate means Blue 3GA
- reverse phase chromatography 214TP-RP C4, using HPLC
- a PSA derivative is prepared from the purified PSA.
- the “PSA derivative” in the present invention means a sugar chain or glycopeptide derived from PSA, and specifically means a sugar chain or glycopeptide separated from PSA.
- endoprotease thermolysin, endoproteinase Arg-C, endoproteinase Lys-C, trypsin, chymotrypsin, pepsin, proline-specific endopeptidase, protease V8, proteinase K, aminopeptidase M, carboxypeptidase B, etc.
- a peptide bond cleaving agent to form a glycopeptide, and the glycopeptide may be used in step (3).
- PSA may be treated enzymatically to form free sugar chains.
- the aforementioned glycopeptide derived from PSA may be enzymatically treated to form a free sugar chain.
- the sugar chain thus obtained may be used in step (3).
- peptide N-glycanase PNGase F, PNGase A
- EndoH, EndoF endoglycosidase
- proteases trypsin, endoproteinase Lys-C, etc.
- PSA or a glycopeptide derived from PSA can be treated with chemical means (such as degradation with anhydrous hydrazine, reductive or non-reductive ⁇ -elimination) to form a free sugar chain. Good.
- the free sugar chain thus obtained may be used in the following step (3).
- a sugar chain or glycopeptide from which sialic acid has been removed by sialidase treatment or acid hydrolysis may be used.
- the above-mentioned reactant is allowed to act on the cut out band to perform in-gel digestion, and glycopeptide and / or sugar chain May be generated.
- the PSA derivative is labeled.
- the labeling compound include a condensed polycyclic hydrocarbon moiety such as naphthalene, anthracene, and pyrene, a reactive functional group capable of binding to the molecule to be analyzed, and the condensed polycyclic hydrocarbon moiety as necessary.
- a compound having a spacer portion that links the reactive functional group can be used.
- the condensed polycyclic hydrocarbon moiety is preferably pyrene.
- the reactive functional group has reactivity with the carboxy group of sialic acid or the reducing end of sugar, and includes, for example, a diazomethyl group, an amino group, a hydrazide group, and the like.
- the spacer portion includes, for example, a linear or branched alkylene group.
- Labeled compounds that can be used in the present invention include 1-pyrenyldiazomethane (PDAM), 1-pyrenebutanoic acid hydrazide (PBH), 1-pyreneacetic acid hydrazide, 1-pyrenepropionic acid hydrazide, aminopyrene (including structural isomers) 1-pyrenemethylamine, 1-pyrenepropylamine, 1-pyrenebutylamine and the like.
- the most preferably used labeling compound is PDAM.
- Step (3) can be performed by mixing and heating the PSA derivative and the labeling compound. Heating can be carried out at a temperature in the range of 40-50 ° C., for example.
- labeling may be performed in the presence of a promoter such as water soluble carbodiimide or N-hydroxysuccinimide. More preferably, the labeling can be carried out by dropping a solution of the PSA derivative on the target plate used in the MALDI method and drying it, and dropping the solution of the labeling compound on the target plate and drying by heating. .
- the present invention relates to a method for analyzing a labeled PSA derivative by mass spectrometry.
- analysis by mass spectrometry may be abbreviated as “MS analysis”.
- the ionization part that can be used in the MS analysis in the step (4) includes a matrix-assisted laser desorption ionization (MALDI) type or an electrospray ionization (ESI) type device.
- MALDI matrix-assisted laser desorption ionization
- ESI electrospray ionization
- the labeled PSA derivative of the present invention by coupling a condensed polycyclic hydrocarbon group such as pyrene, the ionization efficiency of the labeled PSA derivative in the MALDI method is improved as compared with the unlabeled PSA derivative.
- the labeled PSA derivative of the present invention is easier to apply the ESI method. Because the PSA derivative has high hydrophilicity and it is difficult to obtain an organic solution of the sample used in the ESI method, the labeled PSA derivative of the present invention can be obtained by introducing a condensed polycyclic hydrocarbon group. This is because it is soluble in an organic solvent.
- the separation unit that can be used in the MS analysis in the step (4) includes any device known in the art such as a time-of-flight type (TOF type), a double focusing type, a quadrupole focusing type, or the like.
- TOF type time-of-flight type
- a double focusing type double focusing type
- a quadrupole focusing type or the like.
- QIT-TOF quadrupole ion trap-time of flight
- any of a linear device, a reflectron device, or a circulating device may be used.
- the signal intensity S (P1) corresponding to the LacdiNAc ( ⁇ ) sugar chain and the signal intensity S (P2) corresponding to the LacdiNAc (+) sugar chain are obtained, and the signal intensity ratio percentage R value is expressed by the following equation: Calculate with The “signal intensity” in the present invention is, for example, the sum of arbitrary selections in the monoisotopic mass signal, the maximum intensity mass signal, the monoisotopic mass signal and the isotope ion signal in the MS spectrum, or the average intensity thereof. And so on.
- the “signal intensity ratio percentage R value” may be simply abbreviated as “R value”.
- R value [S (P2) / S (P1)] ⁇ 100
- the threshold value R is preferably set to about 20% for high-precision determination, and about 40% when the determination target is very small.
- a plurality of signal pairs having a mass difference 41 may be selected and the above determination procedure may be performed.
- a signal pair having a mass difference of 41 may be selected from the signals from which the labeled compound and / or sialic acid residues are desorbed in the mass spectrometer, and the above determination procedure may be performed.
- the present invention is a prostate cancer determination method for analyzing the sugar chain structure of PSA in a sample derived from a subject by mass spectrometry, and the analysis of the sugar chain structure of PSA is performed using the above PSA. It is also a method for determining prostate cancer by a method in which a lectin is acted on, a method in which an antibody is acted on the above-mentioned PSA, a high-performance liquid chromatography method or the mass spectrometry described above, or an analysis means combining these.
- PSA in the present invention may be a sample derived from a subject itself, or may be extracted or purified therefrom. Furthermore, “PSA” may be PSA complexed with antichymotrypsin or the like, free PSA, or a sugar chain or glycopeptide prepared therefrom.
- the present invention relates to a method of using high performance liquid chromatography (sometimes abbreviated as “HPLC”) as analysis means for PSA.
- HPLC high performance liquid chromatography
- separation depending on the molecular weight of a detection target is performed by normal phase HPLC represented by an Amide column or the like, or separation depending on the constituent sugar chain orientation of detection target is performed by reverse phase HPLC represented by an ODS column or the like.
- a pair of peaks corresponding to LacdiNAc (+) sugar chain and LacdiNAc ( ⁇ ) sugar chain is selected from the chromatogram obtained by the analysis, and the determination is made based on the R value calculated from the peak height or area.
- Any absorbance wavelength can be used for detection, or a specific fluorescence wavelength can be used for the selected labeled compound.
- the present invention relates to a method of using an analysis technique based on a combination of a specific binding molecule acting on PSA.
- Specific binding molecules include several lectins, antibodies and fragments thereof.
- a specific binding molecule is reacted with a detection target immobilized on an ELISA plate, a polyvinylidene fluoride (PVDF) film, a glass or silicon array chip, and the LacdiNAc structure and the entire target are quantitatively detected.
- PVDF polyvinylidene fluoride
- a lectin or an antibody conjugated with an enzyme such as alkaline phosphatase or horseradish peroxidase is used, and chemical coloring using bromochloroindolyl phosphate (BCIP) or nitroblue tetrazolium (NBT) via an enzymatic reaction, or luminol Chemiluminescence using a reagent can be used, or alternatively surface plasmon resonance can be used.
- BCIP bromochloroindolyl phosphate
- NBT nitroblue tetrazolium
- luminol Chemiluminescence using a reagent can be used, or alternatively surface plasmon resonance can be used.
- a series of detections can be performed by binding the detection target to the solid-phased specific binding molecule and reacting it with another specific lectin or specific antibody.
- “specific antibody” may be simply abbreviated as “antibody”
- specific lectin may be simply abbreviated as “lectin”.
- a LacdiNAc (+) sugar chain can be detected by allowing a WFA lectin (Wisteria floribunda agglutinin) that recognizes non-reducing terminal GalNAc to act on PSA.
- WFA lectin Baceria floribunda agglutinin
- an antibody a commercially available polyclonal antibody or monoclonal antibody can be used as an antibody against PSA.
- the present invention relates to the next step of producing a polyclonal antibody and a monoclonal antibody that recognize a LacdiNAc structure.
- a sugar chain structure containing a LacdiNAc structure, an analog or derivative thereof is prepared from a biological sample or chemically or biochemically synthesized to produce a polyvalent conjugate having the same structure.
- the animal is then immunized with a multivalent conjugate along with an immune response activator.
- the multivalent conjugate is preferably bound to an immune reaction activator, and the conjugate is used for immunization alone or together with a further immune reaction activator. More preferably, the multivalent conjugate is injected into the antibody-producing organism together with at least one adjuvant molecule or administered to the mucosa.
- Example 1 Step (1) Isolation of PSA First, immunoglobulin in serum was removed. 4 mL of protein A agarose (PIERCE) was loaded onto a disposable plastic column (PIERCE) and equilibrated with phosphate buffered saline (PBS). A mixture of serum and PBS of a subject diagnosed with BPH (T-16) and PBS was added to a column filled with protein A agarose and washed with 2 column volume (CV) of PBS. Fractions containing PSA that did not bind to the support were collected and Na 2 SO 4 was added to a final concentration of 1M.
- PIERCE protein A agarose
- PBS phosphate buffered saline
- albumin which is a major protein in serum
- 1 mL of Fractogel® EMD TA (S) (Merck) was packed in a disposable plastic column and equilibrated with 20 mM phosphate buffer (pH 7.4, containing Na 2 SO 4 (1M)).
- the fraction containing the above-mentioned PSA was added to the fructogel-packed column, and the column was washed with 7 CV of the same buffer using a liquid feed pump.
- the adsorbed protein was eluted with 20 mM phosphate buffer (pH 7.4, not containing Na 2 SO 4 ) to obtain a fraction containing PSA.
- PSA-ACT 1 -antichymotrypsin
- the dried protein was analyzed by enzyme immunoassay (ELISA, Eiken Chemical) and electrophoresis, and it was found that about 50% of the PSA contained in the first serum could be recovered.
- Step (2) Preparation of Sugar Chain (PSA Derivative)
- An aqueous solution containing 10 mM dithiothreitol (DTT) and 25 mM ammonium bicarbonate to the tube containing the dried gel obtained in step (1) (PH 8.0) was added, and the reduction reaction was carried out by shaking at 56 ° C. for 1 hour under light-shielding conditions to remove the solution in the tube.
- An aqueous solution containing 55 mM iodoacetamide was added to the tube, and the alkylation reaction was performed by shaking at room temperature for 45 minutes under light-shielding conditions to remove the solution in the tube.
- the reduced and alkylated gel was washed with 25 mM aqueous ammonium bicarbonate (pH 8.0) and acetonitrile, and then the gel was dried.
- a lysyl endopeptidase (registered trademark) solution 250 ng, Wako Pure Chemical (mass spectrometry grade), 25 mM aqueous ammonium bicarbonate solution (pH 8.0) was added to the gel obtained as described above, and the mixture was allowed to stand in ice for 45 minutes. The reaction mixture was then gently stirred for 18 hours at 37 ° C. 75% aqueous acetonitrile (containing 0.1% trifluoroacetic acid) was added and shaken for 20 minutes. Extraction was performed and the solution was recovered.
- the collected solution was dried by a centrifugal concentrator. To the residue was added 50 mM aqueous ammonium bicarbonate (pH 8.0) containing 1 ⁇ g of fetablock SC (Roche Diagnostics), followed by 1 unit (1 unit / ⁇ L) of peptide N-glycosidase F ( Sigma) was added and shaken at 37 ° C. for 18 hours. After shaking, 1 ⁇ L of 1% aqueous trifluoroacetic acid solution was added to the reaction mixture.
- a microspin column was filled with 30 mg of carbon graphite (GL Science) and washed.
- the sugar chain fraction was added to the graphite-filled microspin column, and further a 5% acetonitrile aqueous solution (0.1% trifluoroacetic acid) was added as a washing solution, followed by washing by centrifugation (300 ⁇ g, 1 minute to 2 minutes). .
- After removing the washing solution add 50% acetonitrile aqueous solution (0.1% trifluoroacetic acid), and centrifuge (300 ⁇ g, 1 minute to 2 minutes) to elute the sugar chain to obtain a sugar chain eluate. It was.
- the recovered sugar chain eluate was dried using a centrifugal concentrator and redissolved in 2 ⁇ L of pure water to obtain a sugar chain solution.
- Step (3) Labeling of Sugar Chain (PSA Derivative) 0.5 ⁇ L of the sugar chain solution obtained in Step (2) was dropped on a MALDI target plate and allowed to air dry. Next, 0.25 ⁇ L of a DMSO solution of 1-pyrenyldiazomethane (PDAM, 500 pmol) was dropped on the target plate, heated to 40 ° C. for about 25 minutes, and dried. By this operation, a sugar chain labeled with PDAM was obtained on the target plate.
- PDAM 1-pyrenyldiazomethane
- Step (4) MS analysis 50% acetonitrile solution (concentration 10 mg / mL) of 2,5-dihydroxybenzoic acid (DHBA) on the target plate carrying the labeled sugar chain obtained in step (3) 0.5 ⁇ L was added dropwise and dried at room temperature.
- DHBA 2,5-dihydroxybenzoic acid
- the obtained target plate was placed in a MALDI-QIT-TOFMS apparatus AXIMA-QIT (manufactured by Shimadzu Corporation / Kratos) and subjected to MS analysis.
- AXIMA-QIT manufactured by Shimadzu Corporation / Kratos
- MS analysis In order to make a quantitative comparison, a raster scan was performed on the area surrounded by the outer circumference larger than the spread of the sample on the target plate, and all significant signals were accumulated.
- a typical example of the obtained MS spectrum is shown in FIG.
- the structure of the precursor ion was Sia- [Gal-GlcNAc-Man- (GalNAc-GlcNAc-Man-) Man-GlcNAc- (Fuc-) GlcNAc].
- Examples 2-4 Serum of two subjects diagnosed with BPH, anonymized and given an identification code (Examples 1 and 2), and two subjects diagnosed with PC by biopsy and anonymized and given an identification code The procedure of Example 1 was repeated using serum (Examples 3 and 4). The procedure was approved by a medical institution for ethical review and informed consent was given to the subjects.
- Example 4 As a representative example when using serum from a subject diagnosed with PC, the MS spectrum obtained in Example 4 is shown in FIG.
- “Pyrene” in the formula represents pyrene labeling (1-pyrenylmethyl group) by PDAM. Further, the parentheses in the formula indicate a bond to any one of two N-acetylneuraminic acids.
- the LacdiNAc (+) / LacdiNAc ( ⁇ ) signal intensity ratio percentage R value of a sample derived from the serum of a subject diagnosed with PC is 30% (R (S) ) or more, It was found that it contains many GalNAc-substituted sugar chains.
- the signal intensity ratio percentage R value of the sample derived from the serum of the subject diagnosed with BPH was 30% (R (S) ) or less. That is, it became clear for the first time that the serum PSA sugar chain of a subject diagnosed with PC has more LacdiNAc structures than the serum PSA of a subject diagnosed with BPH.
- the signal intensity ratio R value of LacdiNAc (+) / LacdiNAc ( ⁇ ) has no correlation with the serum PSA concentration.
- the method of the present invention can be applied to samples with a wide range of serum PSA concentrations.
- the method of the present invention may be effective in distinguishing between PC and BPH with high accuracy in a serum PSA concentration range (4 to 10 ng / mL) called a gray zone.
- Example 5 This example is an example showing that glycopeptides can be used in place of the sugar chains in the previous examples.
- the glycopeptide was roughly purified and desalted from the obtained sample using Intersep GC 50 mg (GL Science), which is a carbon graphite filled cartridge.
- 1M NaOH aqueous solution, distilled water, 30% acetic acid aqueous solution, and “aqueous solution containing 5% acetonitrile and 1% trifluoroacetic acid” are sequentially fed to the cartridge to clean and equilibrate carbon graphite.
- the dried glycopeptide sample was dissolved in “an aqueous solution containing 5% acetonitrile and 1% trifluoroacetic acid” and sent to the cartridge.
- Distilled water and “an aqueous solution containing 5% acetonitrile and 1% trifluoroacetic acid” were sequentially fed to the glycopeptide adsorbed on the cartridge for washing. Thereafter, “an aqueous solution containing 80% acetonitrile and 1% trifluoroacetic acid” was fed to the cartridge to elute the adsorbed glycopeptide. The resulting glycopeptide fraction was collected and dried using a centrifugal concentrator.
- Example 2 MS analysis was performed on the obtained glycopeptide solution by applying the steps (3) and (4) of Example 1.
- the obtained MS spectrum is shown in FIG. A spectrum in which sugar chains were added to PSA-derived peptides 43-47 was obtained, and two pairs of two types of glycopeptides, P1 and P2, having a mass difference of 41 corresponding to GalNAc / Gal substitution were detected.
- the respective configurations are shown in E and G (P1), F and H (P2) of (Chemical Formula 3).
- “Peptide” in the formula indicates a peptide fragment derived from PSA.
- the average signal intensity ratio percentage R value of LacdiNAc (+) / LacdiNAc ( ⁇ ) of the standard product PSA-ACT derived from seminal plasma was 25%.
- the signal intensity ratio percentage R value of LacdiNAc (+) / LacdiNAc ( ⁇ ) of the standard product PSA is close to the result of the sugar chain analysis for BPH subjects and is 30% or less. It was different from the analysis R value.
- the PSA can be identified and the sugar chain addition position can be confirmed because the peptide is bound to the sugar chain. As a result, even when other glycoproteins are present together, it becomes possible to accurately determine the signal intensity ratio percentage R value of LacdiNAc (+) / LacdiNAc ( ⁇ ).
- Example 6 Glycopeptide analysis was performed on the serum of a subject with PC disease (N-18) shown in Example 4. Using the serum of the subject, the steps of reduction with DTT, alkylation with iodoacetamide, washing and drying described in Step (1) and Step (2) of Example 1 were performed to obtain a dried gel.
- thermolysin (Calbio Chem) 25 mM aqueous ammonium bicarbonate (pH 8.0) was added and left in an ice bath for 45 minutes to swell the gel. The swollen gel was lightly stirred at 56 ° C. for 18 hours. The extract “aqueous solution containing 70 to 80% acetonitrile and 0.1% trifluoroacetic acid” was added to the gel, and the mixture was shaken for 20 minutes to recover the solution.
- the collected solution was added to the washed 25 mg of ZIC (registered trademark) HILIC solid phase column filler (SeQuant). Subsequently, “an aqueous solution containing 80% acetonitrile and 0.1% trifluoroacetic acid” was added for washing, and the glycopeptide was eluted using an aqueous solution of 0.1% trifluoroacetic acid. The glycopeptide eluate was dried using a centrifugal concentrator, and then the solid was dissolved in 2 ⁇ L of pure water to obtain a glycopeptide solution.
- ZIC registered trademark
- HILIC solid phase column filler SeQuant
- step (3) of Example 1 The same procedure as in step (3) of Example 1 was applied to the obtained glycopeptide solution to label the glycopeptide.
- step (4) of Example 1 the MS analysis was performed by applying the procedure of step (4) of Example 1 to the obtained target plate.
- the signal strength ratio percentage R value of LacdiNAc (+) / LacdiNAc ( ⁇ ) glycopeptide was 30% or more.
- the R value obtained in this example and the R value of Example 4 in which the sugar chain analysis was performed on the serum sample were similar values.
- Example 7 is an analysis of patient serum without carrying out the steps of isolation of PSA described in step (1) of Example 1, reduction by DTT and alkylation with iodoacetamide described in step (2). This is an example.
- immunoglobulin was removed from the serum of a patient suffering from PC (N-122, PSA concentration 186 ng / mL).
- 3 mL of protein A agarose carrier (PIERCE) was equilibrated using phosphate buffered saline (PBS). This was packed in a disposable plastic column (PIERCE), a mixture of the subject's serum and PBS was added, and the mixture was shaken at 4 ° C. for 30 minutes. The fraction containing PSA that does not bind to the carrier is collected, and the fraction obtained by washing the protein A agarose carrier with 3 times the volume of the carrier (3 CV) PBS is collected. Na 2 SO 4 was added to 1M.
- albumin which is a major protein in serum
- 2.5 mL of Fractogel TM EMD TA (S) (Merck) was loaded onto a disposable plastic column and equilibrated with 20 mM phosphate buffer (pH 7.4, containing Na 2 SO 4 (1M)).
- the fraction obtained above was added to the fructogel-filled column, and 7 CV of the same buffer was sent using a pump to remove albumin.
- the protein adsorbed on Fractogel (trademark) was eluted with 20 mM phosphate buffer (pH 7.4, not containing Na 2 SO 4 ) to obtain a fraction containing PSA.
- this fraction was added to 2 mL of protein A agarose carrier equilibrated with PBS, and shaken at 4 ° C. for 30 minutes to remove immunoglobulin that could not be removed.
- anti-PSA antibody beads used for immunoprecipitation were prepared.
- NHS-activated Sepharose 4 Fast Flow (GE Healthcare Bioscience) was washed 3 times with 1 mM HCl.
- DAKO anti-human PSA / rabbit polyclonal antibody
- a 0.5 M monoethanolamine aqueous solution containing 0.5 M NaCl was added, and the remaining active groups were inactivated by shaking at room temperature for 30 minutes.
- the resulting anti-PSA antibody beads were alternately replaced with 0.1 M sodium acetate buffer (pH 4.0) containing 0.5 M NaCl and 1 M Tris buffer (pH 9.0) containing 0.5 M NaCl. Washed 3 times. The anti-PSA antibody beads were then washed 3 times with PBS. Finally, the beads were washed with PBS containing 0.02% sodium azide and stored at 4 ° C. until use.
- a part of the obtained protein fraction was subjected to Western blotting and subjected to semi-quantitative analysis. As a result, it was found that 70% or more of PSA contained in the first serum could be recovered.
- thermolysin digestion, desialic acid reaction, rough purification using a carbon graphite-filled cartridge, and purification using Sepharose CL4B were sequentially performed to obtain a glycopeptide fraction.
- the same procedure as in step (3) of Example 1 was applied to the obtained glycopeptide solution to label the glycopeptide.
- MS analysis was performed by applying the procedure of step (4) of Example 1 to the obtained target plate.
- MS analysis revealed a glycopeptide having a sugar chain bound to PSA-derived peptide 43-47.
- the obtained MS spectrum is shown in FIG.
- MS analysis it was possible to detect a signal pair, P1 and P2, of a glycopeptide having a mass difference of 41 corresponding to the presence or absence of the LacdiNAc structure.
- Example 8-12 The procedure of Example 7 was repeated using sera from 5 subjects (Examples 8 to 12) diagnosed with PC by biopsy and given an identification code. The procedure was approved by a medical institution for ethical review and informed consent was given to the subjects.
- the glycopeptide was purified from the serum of a prostate cancer patient having a low PSA concentration of 32 ng / mL, and was detected by MS. Moreover, it became clear that the R value of prostate cancer patients having a low serum PSA concentration greatly exceeds 30%, similarly to the R value of prostate cancer patient serum having a large amount of PSA.
- glycopeptides were directly prepared from the serum complex and free PSA, and PSA LacdiNAc ( (+) Glycopeptide and LacdiNAc ( ⁇ ) glycopeptide could be detected. Since this method requires fewer steps, it is simple and quick, and the recovery rate of glycopeptides is improved. This method is therefore preferred for application to clinical samples.
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Pathology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Hospice & Palliative Care (AREA)
- Oncology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
- Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Other Investigation Or Analysis Of Materials By Electrical Means (AREA)
Abstract
前立腺特異抗原(PSA)の糖鎖構造を迅速かつ高感度に検出し、その構造の差異を基に、前立腺癌であると判定する方法、特に前立腺癌と良性前立腺肥大症とを的確に判定する方法の提供を課題とする。被験者由来の試料中のPSAの糖鎖構造を分析する工程を含み、LacdiNAc(N-アセチルガラクトサミン-N-アセチルグルコサミン)を有する糖鎖(LacdiNAc(+))の量が、LacdiNAcを持たないがLacNAc(ガラクトース-N-アセチルグルコサミン)を有する糖鎖(LacdiNAc(-))の量の30%を超える際に前立腺癌であると判定することを特徴とする前立腺癌の判定方法により、特に、その値が30%を超える際に前立腺癌であると判定し、30%以下である際に良性前立腺肥大症であると判定することを特徴とする前立腺癌の判定方法により上記課題を解決した。
Description
本発明は、前立腺癌の新規な判定方法に関し、特に前立腺癌と良性前立腺肥大症とを判定する新規な方法に関する。特に本発明は、前立腺特異抗原の糖鎖構造の差異に基づき、前立腺癌と良性前立腺肥大症とを判定する新規な方法に関する。
前立腺癌(prostate carcinoma:以下「PC」と称する)は男性の主要な死亡原因の1つである。前立腺特異抗原(prostate specific antigen:以下「PSA」と称する)はPCに対する最も重要な腫瘍マーカーとして認識されている(たとえば、非特許文献1参照)。PSAは、約26kDaの分子量を有する237個のアミノ酸残基からなるタンパク部分と、該タンパク部分のアミノ酸残基(45番目のAsnなど)に結合した糖鎖部分とから構成される約30kDaの分子量を有する糖タンパク質、またはその誘導体である。糖鎖部分は、PSAの分子量の約8%を示す。
PCの初期診断に対する血清PSA濃度試験の有用性は既に多くの文献に記載されているが、良性前立腺肥大症(benign prostatic hyperplasia:以下「BPH」と称する)に罹患している男性とPCに罹患している男性との間に、グレーゾーン(gray zone)と呼ばれるPCまたはBPHの何れとも判断できないPSA濃度領域がある(たとえば、非特許文献2参照)。
この問題を解決するために、これまでにいくつかの試み(たとえば、PSA密度、PSA勾配(年間増加度)、遊離PSA/全PSAの比などによる識別)が実施されてきたが、2つの病変(lesions)の間にはかなり重複する点がある。
最近、コンカナバリンA、植物凝集素E4(PHA-E4)およびPHA-L4を用いた連続的レクチンアフィニティークロマトグラフィー法を用いた研究において、PSAのアスパラギン(N)に結合する糖鎖の構造が、PC組織とBPH組織との間で相違するという結果が報告された(非特許文献3参照)。この報告は、PSA中のN-結合糖鎖がヒト前立腺における癌化の過程で変化すること、ならびにPSA中のN-結合糖鎖がPCの診断ツールとして役立つ可能性があることを記載している。
PSAの構造を検出する方法として、PSAの糖鎖に結合する結合分子を用いるいくつかの免疫学的方法が提案されてきている。たとえば、PSAをレクチンと接触させ、PSAの糖鎖とレクチンとの親和性に基づいて分別されたPSAを測定することによって、PCとBPHとを識別する方法が報告されている(特許文献1参照)。この報告において、PSAの糖鎖とレクチン(イヌエンジュ(Maackia amurensis)レクチンなど)との親和性の差異は、糖鎖末端のシアル酸のコンフォメーションに基づくと記載されている。しかしながら、PCまたはBPHに罹患した被験者のPSA糖鎖の具体的構造を決定していない。
また、PSA中に少なくとも三分岐の糖鎖が存在するかどうかに基づいてPCを検定する方法が報告されている(特許文献2参照)。この方法においては、少なくとも三分岐の糖鎖に結合するが、一分岐および二分岐の糖鎖とは結合しない結合分子を用いる。用いることができる結合分子は、レクチン(PHA-Lなど)および抗体を含む。
さらに、PSA中のN-アセチルガラクトサミン(GalNAc)の含有量に注目した報告がなされている(非特許文献4参照)。該報告は、PSA糖鎖の構造を詳細に検証し、精漿由来PSA糖鎖におけるGalNAc含有量が25%なのに対し、前立腺癌細胞株(LNCaP)のPSA糖鎖にはGalNAcが65%程度含まれる事を記載している。この著者らは膵ガン由来細胞株(Capan-1)においても同様の変化を観察しており(非特許文献5参照)、そこからGalNAcの含有量変化は癌性変異に起因するものであると類推している。
また、特異的抗体と多数のレクチンからなるアレイを用いてPSAを含む対象タンパク質の糖鎖を網羅的に解析する手法が報告されている(非特許文献6参照)。この方法において、前立腺癌細胞株に由来するPSAの糖鎖構造上の非還元末端にはLacdiNAc構造(N-アセチルガラクトサミン-N-アセチルグルコサミン構造)が多く存在する事が明らかにされている。しかしながら、PCまたはBPHに罹患した被験者のPSA糖鎖を対象にはしていない。
関連して、LacdiNAc構造を癌細胞に特異的に発現されるオリゴ糖配列であると開示し、生物学的試料中に検出されるその存在を指標に癌の検出を行なう方法について特許出願がなされている(特許文献3参照)。しかしながらその検出に関する具体的な手法は記載されておらず、さらにはPCとBPHの判定を対象にしていない。
あるいはまた、PSAを含む標的糖タンパク質の糖鎖の糖プロファイルを決定することにより、被験者の臨床状態を評価する方法が提案されている(特許文献4参照)。該文献は、MALDI-MS法を用いた解析において、PCに罹患した被験者のPSA糖鎖が、正常なPSA糖鎖とは異なることを記載している。しかしながら、PCに罹患した被験者のPSA糖鎖の具体的構造を記載していない。
上記のように、PSA糖鎖構造が疾患により変化するという事象は多数報告されているが、BPHに罹患した被験者のPSA糖鎖の構造に関する詳細な報告は少なく、PC患者においてもPSA糖鎖の網羅的な解析は未だ例を見ない。さらに、具体的な糖鎖構造に基づいてBPHとPCとを判定することは、これまでなされていない。
Stamey他, N. Engl. J. Med., 317, 909-916(1987)
Catalona他, j. Am. Med. Assoc,279, 1542-1547(1998)
Sumi他, J. Chromatogr. B, 727, 9-14 (1994)
Peracaula他, Glycobiology,13(6),457-470 (2003)
Peracaula他, Glycobiology,13(4),227-244 (2003)
Kuno他, Mol. Cell. Proteomics, 8(1),99-108 (2009)
Tabares他,Glycobiology, 16(2), 132-145 (2006)
Bindukumar他, J.Chromatogr. B, Analyt. Technol. Biomed. Life. Sci., 813(1-2), 113-120 (2004)
Zhang他, Clin. Chem., 41(11), 1567-1573(1995)
Okada他, Biochim. Biophys. Acta,1525(1-2), 149-160 (2001)
したがって、本発明の課題は、被験者のPSA糖鎖を検出し、特に、BPHまたはPCに罹患した被験者のPSA糖鎖を検出し、PSAの糖鎖構造に基づいて、BPHとPCとを的確に判定する方法などを提供することである。
本発明者らは、PSA糖鎖において、LacdiNAc構造の存在のみを指標にするのではなく、LacdiNAcを有する糖鎖とLacdiNAcを持たない糖鎖の比率に着目することによって、前立腺癌であることの判定、特に、前立腺癌と良性前立腺肥大症とを判定できることを見出して、本発明を完成した。
すなわち、本発明は以下の方法である。
[1]
被験者由来の試料中のPSAの糖鎖構造を分析する工程を含み、LacdiNAc(N-アセチルガラクトサミン-N-アセチルグルコサミン)を有する糖鎖(LacdiNAc(+))の量が、LacdiNAcを持たないがLacNAc(ガラクトース-N-アセチルグルコサミン)を有する糖鎖(LacdiNAc(-))の量の30%を超える際に前立腺癌であると判定することを特徴とする前立腺癌の判定方法。
[2]
被験者由来の試料中のPSAの糖鎖構造を分析する工程を含み、LacdiNAc(N-アセチルガラクトサミン-N-アセチルグルコサミン)を有する糖鎖(LacdiNAc(+))の量が、LacdiNAcを持たないがLacNAc(ガラクトース-N-アセチルグルコサミン)を有する糖鎖(LacdiNAc(-))の量の30%を超える際に前立腺癌であると判定し、30%以下である際に良性前立腺肥大症であると判定することを特徴とする[1]に記載の前立腺癌の判定方法。
[3]
上記PSAの糖鎖構造の分析を、上記PSAに対してレクチンを作用させる方法、上記PSAに対して抗体を作用させる方法、高速液体クロマトグラフィー法もしくは質量分析法、またはこれらを組み合わせた分析手段により行うことを特徴とする[1]に記載の前立腺癌の判定方法。
[1]
被験者由来の試料中のPSAの糖鎖構造を分析する工程を含み、LacdiNAc(N-アセチルガラクトサミン-N-アセチルグルコサミン)を有する糖鎖(LacdiNAc(+))の量が、LacdiNAcを持たないがLacNAc(ガラクトース-N-アセチルグルコサミン)を有する糖鎖(LacdiNAc(-))の量の30%を超える際に前立腺癌であると判定することを特徴とする前立腺癌の判定方法。
[2]
被験者由来の試料中のPSAの糖鎖構造を分析する工程を含み、LacdiNAc(N-アセチルガラクトサミン-N-アセチルグルコサミン)を有する糖鎖(LacdiNAc(+))の量が、LacdiNAcを持たないがLacNAc(ガラクトース-N-アセチルグルコサミン)を有する糖鎖(LacdiNAc(-))の量の30%を超える際に前立腺癌であると判定し、30%以下である際に良性前立腺肥大症であると判定することを特徴とする[1]に記載の前立腺癌の判定方法。
[3]
上記PSAの糖鎖構造の分析を、上記PSAに対してレクチンを作用させる方法、上記PSAに対して抗体を作用させる方法、高速液体クロマトグラフィー法もしくは質量分析法、またはこれらを組み合わせた分析手段により行うことを特徴とする[1]に記載の前立腺癌の判定方法。
[4]
上記PSAの糖鎖構造の分析を、上記PSAに対してレクチンを作用させる方法、上記PSAに対して抗体を作用させる方法、高速液体クロマトグラフィー法もしくは質量分析法、またはこれらを組み合わせた分析手段により行うことを特徴とする[2]に記載の前立腺癌の判定方法。
上記PSAの糖鎖構造の分析を、上記PSAに対してレクチンを作用させる方法、上記PSAに対して抗体を作用させる方法、高速液体クロマトグラフィー法もしくは質量分析法、またはこれらを組み合わせた分析手段により行うことを特徴とする[2]に記載の前立腺癌の判定方法。
[5]
(1) 被験者由来の試料からPSAを精製する工程と、
(2) 工程(1)で精製したPSAからPSA誘導体を調製する工程と、
(3) 工程(2)で得られたPSA誘導体を標識する工程と、
(4) 工程(3)で得られた標識化PSA誘導体を質量分析法により分析する工程を含み、LacdiNAc(N-アセチルガラクトサミン-N-アセチルグルコサミン)の構造の有無に起因する質量差41で示される一対のシグナルを選定し、LacdiNAcを有する糖鎖(LacdiNAc(+))に由来するシグナル強度が、LacdiNAcを持たないがLacNAc(ガラクトース-N-アセチルグルコサミン)を有する糖鎖(LacdiNAc(-))に由来するシグナル強度の30%を超える際に前立腺癌であると判定することを特徴とする[3]に記載の前立腺癌の判定方法。
(1) 被験者由来の試料からPSAを精製する工程と、
(2) 工程(1)で精製したPSAからPSA誘導体を調製する工程と、
(3) 工程(2)で得られたPSA誘導体を標識する工程と、
(4) 工程(3)で得られた標識化PSA誘導体を質量分析法により分析する工程を含み、LacdiNAc(N-アセチルガラクトサミン-N-アセチルグルコサミン)の構造の有無に起因する質量差41で示される一対のシグナルを選定し、LacdiNAcを有する糖鎖(LacdiNAc(+))に由来するシグナル強度が、LacdiNAcを持たないがLacNAc(ガラクトース-N-アセチルグルコサミン)を有する糖鎖(LacdiNAc(-))に由来するシグナル強度の30%を超える際に前立腺癌であると判定することを特徴とする[3]に記載の前立腺癌の判定方法。
[6]
(1) 被験者由来の試料からPSAを精製する工程と、
(2) 工程(1)で精製したPSAからPSA誘導体を調製する工程と、
(3) 工程(2)で得られたPSA誘導体を標識する工程と、
(4) 工程(3)で得られた標識化PSA誘導体を質量分析法により分析する工程を含み、LacdiNAc(N-アセチルガラクトサミン-N-アセチルグルコサミン)の構造の有無に起因する質量差41で示される一対のシグナルを選定し、LacdiNAcを有する糖鎖(LacdiNAc(+))に由来するシグナル強度がLacdiNAcを持たないがLacNAc(ガラクトース-N-アセチルグルコサミン)を有する糖鎖(LacdiNAc(-))に由来するシグナル強度の30%を超える際に前立腺癌であると判定し、30%以下である際に良性前立腺肥大症であると判定することを特徴とする[4]に記載の前立腺癌の判定方法。
[7]
上記工程(2)において調製されるPSA誘導体が、PSA由来の糖鎖またはPSA由来の糖ペプチドであることを特徴とする[5]に記載の前立腺癌の判定方法。
[8]
上記工程(2)において調製されるPSA誘導体が、PSA由来の糖鎖またはPSA由来の糖ペプチドであることを特徴とする[6]に記載の前立腺癌の判定方法。
(1) 被験者由来の試料からPSAを精製する工程と、
(2) 工程(1)で精製したPSAからPSA誘導体を調製する工程と、
(3) 工程(2)で得られたPSA誘導体を標識する工程と、
(4) 工程(3)で得られた標識化PSA誘導体を質量分析法により分析する工程を含み、LacdiNAc(N-アセチルガラクトサミン-N-アセチルグルコサミン)の構造の有無に起因する質量差41で示される一対のシグナルを選定し、LacdiNAcを有する糖鎖(LacdiNAc(+))に由来するシグナル強度がLacdiNAcを持たないがLacNAc(ガラクトース-N-アセチルグルコサミン)を有する糖鎖(LacdiNAc(-))に由来するシグナル強度の30%を超える際に前立腺癌であると判定し、30%以下である際に良性前立腺肥大症であると判定することを特徴とする[4]に記載の前立腺癌の判定方法。
[7]
上記工程(2)において調製されるPSA誘導体が、PSA由来の糖鎖またはPSA由来の糖ペプチドであることを特徴とする[5]に記載の前立腺癌の判定方法。
[8]
上記工程(2)において調製されるPSA誘導体が、PSA由来の糖鎖またはPSA由来の糖ペプチドであることを特徴とする[6]に記載の前立腺癌の判定方法。
本発明によれば、上記した問題点と課題を解決できる。すなわち、前立腺特異抗原(PSA)の糖鎖構造を検出し、その構造の差異を基に、前立腺癌であるか否かを的確に判定でき、特に、前立腺癌であるか良性前立腺肥大症であるかを的確に判定する方法を提供できる。
具体的には、上記のような工程を採ることによって、血清などの中のPSA濃度がほぼ同レベルの被験者についても、そのPSA糖鎖に含まれる一連のLacdiNAc(+)糖鎖構造およびLacdiNAc(-)糖鎖構造のシグナル強度比百分率R値を測定することによって、PCとBPHとを高精度で識別判定できる。また、PCおよびBPHの両方において、LacdiNAc(+)/LacdiNAc(-)のシグナル強度比百分率R値は、血清PSA濃度に相関せず、PCにおいては少なくとも閾値Rより大きく、BPHにおいては閾値R以下であるため、PSA濃度によらず閾値Rの数値を設定するだけで、高精度でPCか否かを判定できる。
したがって、現行のPCのスクリーニングに繁用されている血清中PSA濃度を測定する方法において高いPSA値(例えば、4ng/mL以上)を示し、苦痛な2次検査である針生検を受けていた被験者についても、本発明を適用することによって、不必要な検査を回避することができる。
また、血清中PSA濃度は年齢とともに上昇する傾向があることが知られている。よって、特に、今後の高齢化社会において、高精度でPCか否かを判定し、特にPCとBPHとを判定する本発明手法は、医学的な貢献のみならず、医療経済にも良好な効果を奏する。
以下、本発明について説明するが、本発明は以下の実施の具体的態様に限定されるものではなく、任意に変形して実施することができる。
本発明に係るPCの判定方法、特にPCとBPHとの判定方法は、対象をレクチン、特異的抗体といった特異的結合分子、高速液体クロマトグラフィー、質量分析法、あるいはその組み合わせにより分析する工程において、標準閾値R(S)を適応した際に、該検出対象のLacdiNAc(+)糖鎖構造を含む集合がLacdiNAc(-)糖鎖構造を含む集合の30%を超える際に前立腺癌であると判定し、特に30%以下である際に良性前立腺肥大症であると判定する事を特徴とする。
本発明においては、「N-アセチルガラクトサミン-N-アセチルグルコサミン」を「LacdiNAc」と略記し、「ガラクトース-N-アセチルグルコサミン」を「LacNAc」と略記する。また、LacdiNAcを有する糖鎖を「LacdiNAc(+)」と略記し、LacdiNAcを有さないがLacNAcを有する糖鎖を「LacdiNAc(-)」と略記する。
また、本発明において用いられる「被験者由来の試料」は、血液(血清、血漿などを含む)、尿、精液(精漿)などの体液、細胞・組織などを含む。
また、本発明において用いられる「被験者由来の試料」は、血液(血清、血漿などを含む)、尿、精液(精漿)などの体液、細胞・組織などを含む。
特に好ましくは、本発明に係るPCの判定方法、特にPCとBPHとの判定方法は、質量分析法により分析する工程において、
(1)被験者由来の試料からPSAを精製する工程と、
(2)工程(1)で精製したPSAからPSA誘導体を調製する工程と、
(3)工程(2)で得られたPSA誘導体を標識する工程と、を含み、
(4)工程(3)で得られた標識化PSA誘導体を分析し、標準閾値R(S)を適応した際に、該標識化PSA誘導体中のLacdiNAc(+)糖鎖構造に由来するシグナル強度が、LacdiNAc(-)糖鎖構造に由来するシグナル強度の30%を超える際に前立腺癌であると判定する事を特徴とし、特に30%以下である際に、前立腺癌ではない、または良性前立腺肥大症であると判定する事を特徴とする。
(1)被験者由来の試料からPSAを精製する工程と、
(2)工程(1)で精製したPSAからPSA誘導体を調製する工程と、
(3)工程(2)で得られたPSA誘導体を標識する工程と、を含み、
(4)工程(3)で得られた標識化PSA誘導体を分析し、標準閾値R(S)を適応した際に、該標識化PSA誘導体中のLacdiNAc(+)糖鎖構造に由来するシグナル強度が、LacdiNAc(-)糖鎖構造に由来するシグナル強度の30%を超える際に前立腺癌であると判定する事を特徴とし、特に30%以下である際に、前立腺癌ではない、または良性前立腺肥大症であると判定する事を特徴とする。
工程(1)において、被験者由来の試料から、PSAを精製する。工程(1)は、当該技術において知られている任意の方法で実施することができる。
あるいは、工程(1)において被験者由来の血清を試料として用いる場合、数種のアフィニティークロマトグラフィーを組み合わせた方法を用いることができる。たとえば、被験者由来の血清に対して、親イオウ吸着に基づくアフィニティー担体であるフラクトゲル(Fractogel)(登録商標) EMD TA)やCibacron Blue 3GAなど、あるいは、プロテインAセファロースCL-4B、HiTrapヘパリンカラムHPLCなどを行う(非特許文献7参照)。その溶離液をエタノールアミンで処理して、遊離のPSAを得る。得られたPSAを前述の免疫沈降法を用いて処理し、PSA誘導体を得る。前述の文献によれば、得られたPSA誘導体の解析を行うために、被験者由来の試料中に約63μgのPSAが必要であった。
さらに、工程(1)における試料として被験者由来の血清以外を用いる場合、工程(1)の親イオウ吸着に基づく親和性担体を用いて、PSAの精製を実施することができる(非特許文献8参照)。たとえば、3S,T-gelスラリー(フラクトゲル(登録商標) EMD TA)を用いるクロマトグラフィーによって、ヒト精液、前立腺癌患者の血清、前立腺癌細胞(LNCaP)培養液の上清からPSAを精製し、ウェスタンブロット法を用いて、PSA単体またはα1-アンチキモトリプシン(ACT)などとの複合体を同定することができる。
あるいはまた、被験者由来の精液を試料として用いる場合、親イオウ吸着に基づくアフィニティークロマトグラフィーとゲル濾過を組み合わせることによって、PSAを精製してもよい(非特許文献8参照)。たとえば、フラクトゲル(登録商標) TA 650(S)と、ゲル濾過担体であるUltrogel AcA-54とを組み合わせることができる。この組み合わせ方法では、遊離のPSAを72%の収率で回収することができた。
あるいはまた、工程(1)における試料として被験者由来の精液を用いる場合、以下の方法を用いてPSAの精製を行うことができる(非特許文献9および10参照)。たとえば、硫酸アンモニウムの添加による沈殿、疎水性相互作用クロマトグラフィー(Phenyl-Sepharose-HPカラム)、ゲル濾過(Sephacryl S-200カラム)、およびアニオン交換クロマトグラフィー(Resourse Qカラム)を順次行うことによって、PSAを精製することができる。この方法において、試料中に33.9mgのPSAが含まれる場合、最終的なPSAの回収率が30.1%であったことが報告されている。
さらに、工程(1)における試料として被験者由来のアンドロゲン依存性のLNCaPを用いる場合、限外濾過と各種クロマトグラフィーとを組み合わせた方法によって、PSAを精製することができる(非特許文献5参照)。たとえば、適切な手段で培養したLNCaPを含む培養液の限外濾過(5kDaカットオフ・ポリスルホン膜(Millipore))、アフィニティークロマトグラフィー(Cibacron Blue 3GA)、ゲル濾過(Biogel P60)、アフィニティークロマトグラフィー(Cibacron Blue 3GA)、および逆相クロマトグラフィー(214TP-RP C4、HPLC使用)を順次行うことによって、PSAを精製することができる。
次いで、工程(2)において、精製されたPSAからPSA誘導体を調製する。本発明における「PSA誘導体」とは、PSA由来の糖鎖または糖ペプチドを意味し、具体的には、PSAから分離される糖鎖または糖ペプチドを意味する。たとえば、PSAに対して、エンドプロテアーゼ(サーモリシン、エンドプロテイナーゼArg-C、エンドプロテイナーゼLys-C、トリプシン、キモトリプシン、ペプシン、プロリン特異的エンドペプチダーゼ、プロテアーゼV8、プロテイナーゼK、アミノペプチダーゼM,カルボキシペプチダーゼBなど)またはペプチド結合開裂剤を作用させて糖ペプチドを形成し、糖ペプチドを工程(3)で使用してもよい。
別法として、PSAを酵素的に処理して遊離の糖鎖を形成してもよい。あるいはまた、PSAから誘導された前述の糖ペプチドを酵素的に処理して遊離の糖鎖を形成してもよい。このようにして得られた糖鎖を工程(3)で使用してもよい。この酵素的処理においては、たとえば、ペプチドN-グリカナーゼ(PNGase F、PNGase A)、エンドグリコシダーゼ(EndoH, EndoF)、および/または、1つまたは複数のプロテアーゼ(トリプシン、エンドプロテイナーゼLys-Cなど)を用いることができる。あるいはまた、PSAまたはPSAから誘導された糖ペプチドを化学的手段(無水ヒドラジンによる分解、還元的または非還元的β-脱離など)を用いて処理して、遊離の糖鎖を形成してもよい。このようにして得られる遊離の糖鎖を、以下の工程(3)で使用してもよい。また、シアリダーゼ処理または酸加水分解を行なってシアル酸を除去した糖鎖または糖ペプチドを用いてもよい。
また、工程(1)の最終段階で電気泳動を行い、PSAのバンドを切り出した場合、切り出したバンドに対して上記の反応剤を作用させてゲル内消化を行い、糖ペプチドおよび/または糖鎖を生成してもよい。
工程(3)において、PSA誘導体を標識する。標識化合物としては、ナフタレン、アントラセン、ピレンなどの縮合多環炭化水素部分と、分析対象の分子と結合することが可能である反応性官能基と、必要に応じて該縮合多環炭化水素部分と該反応性官能基とを連結するスぺーサー部分とを有する化合物を用いることができる。
縮合多環炭化水素部分は、好ましくはピレンである。反応性官能基は、シアル酸のカルボキシ基または糖の還元末端との反応性を有し、たとえばジアゾメチル基、アミノ基、ヒドラジド基などを含む。スペーサー部分は、たとえば直鎖または分岐状のアルキレン基などを含む。本発明において用いることができる標識化合物は、1-ピレニルジアゾメタン(PDAM)、1-ピレンブタン酸ヒドラジド(PBH)、1-ピレン酢酸ヒドラジド、1-ピレンプロピオン酸ヒドラジド、アミノピレン(構造異性体を含む)、1-ピレンメチルアミン、1-ピレンプロピルアミン、1-ピレンブチルアミンなどを含む。最も好ましく用いられる標識化合物は、PDAMである。
工程(3)は、PSA誘導体および標識化合物を混合し、加熱することによって行うことができる。加熱は、たとえば40~50℃の範囲内の温度で実施することができる。任意選択的に、水溶性カルボジイミドまたはN-ヒドロキシスクシンイミドなどの促進剤の存在下で、標識を行ってもよい。より好適には、MALDI法にて用いられるターゲットプレート上にPSA誘導体の溶液を滴下して乾燥させ、その上に標識化合物の溶液を滴下して加熱乾燥させることによって、標識を実施することができる。
本発明は、標識されたPSA誘導体を質量分析法により分析する方法に関する。以下、「質量分析法による分析」を「MS分析」と略記することがある。工程(4)のMS分析において用いることができるイオン化部は、マトリクス支援レーザー脱離イオン化(MALDI)型、またはエレクトロスプレーイオン化(ESI)型の装置を含む。
本発明においては、ピレンなどの縮合多環炭化水素基を結合することによって、MALDI法における標識されたPSA誘導体のイオン化効率が、未標識のPSA誘導体と比較して向上する。また、本発明の標識されたPSA誘導体は、ESI法の適用がより容易である。なぜなら、PSA誘導体は親水性が高く、ESI法に用いる試料の有機溶液を得るのが困難であるのに比較して、本発明の標識されたPSA誘導体は、縮合多環炭化水素基の導入によって有機溶媒に可溶性となっているためである。
工程(4)のMS分析において用いることができる分離部は、飛行時間型(TOF型)、二重収束型、四重極収束型などの当該技術において知られている任意の装置を含む。特に、MSn(n≧2)分析を行うことを考慮して、イオントラップを有する装置を用いることが便利である。特に好適な装置は、四重極イオントラップ-飛行時間型(QIT-TOF)である。ここで、飛行時間型装置として、リニア型、リフレクトロン型または周回型のいずれの装置を用いてもよい。
次いで、得られたMSスペクトルにおいて、LacdiNAc構造の存在/非存在に起因する、1分子のN-アセチルガラクトサミン(GalNAc)/ガラクトース(Gal)置換に相当する質量差41のシグナルP1およびP2の対を選定する。ここで、P2はGalNAc置換糖鎖(LacdiNAc(+)糖鎖)に相当するシグナルを意味し、P1はGalNAc非置換糖鎖(LacdiNAc(-))に相当するシグナルを意味する。そして、LacdiNAc(-)糖鎖に相当するシグナルの強度S(P1)、および、LacdiNAc(+)糖鎖に相当するシグナルの強度S(P2)を求め、そのシグナル強度比百分率R値を下記式で計算する。なお、本発明における「シグナル強度」は、例えば、MSスペクトルにおける、モノアイソトピック質量シグナル、最大強度質量シグナル、モノアイソトピック質量シグナル及び同位体イオンシグナルにおける任意の選択の和、あるいはその平均の強度などを挙げることができる。
以下、「シグナル強度比百分率R値」を単に「R値」と略記する場合がある。
R値=[S(P2)/S(P1)]×100
以下、「シグナル強度比百分率R値」を単に「R値」と略記する場合がある。
R値=[S(P2)/S(P1)]×100
標準閾値R(S)=30%を適応した際、得られたR値が30%より大きい場合、「被験者がPCに罹患している。」と判定し、得られたR値が30%以下である場合、「被験者がPCに罹患していない。」または「BPHに罹患している。」と判定する。閾値Rは標準閾値R(S)=30%を基準に該判定対象の量に起因する検出感度および/または判定精度に関連して、上下10%程度の幅で設定する事ができる。閾値Rは高精度判定であれば20%程度、該判定対象が微量である場合には40%程度に設定する事が好ましい。
本工程において得られるMSスペクトルにおいて、質量差41の複数のシグナルの対を選定して、上記の判定手順を実施してもよい。あるいはまた、標識化合物および/またはシアル酸残基などが質量分析装置中で脱離したシグナル中で、質量差41のシグナルの対を選定し、上記の判定手順を実施してもよい。
本発明は、上記したように、被験者由来の試料中のPSAの糖鎖構造を質量分析法により分析する前立腺癌の判定方法であると共に、上記のPSAの糖鎖構造の分析を、上記のPSAに対してレクチンを作用させる方法、上記のPSAに対して抗体を作用させる方法、高速液体クロマトグラフィー法もしくは上記した質量分析法、またはこれらを組み合わせた分析手段により行う前立腺癌の判定方法でもある。
本発明における「PSA」とは、被験者由来の試料そのものでもよいし、それから抽出したり精製したりしたものでもよい。さらに、「PSA」は、アンチキモトリプシンなどと複合体を形成したPSAでもよいし、遊離PSAでもよいし、それらから調製した糖鎖、糖ペプチドでもよい。
本発明は、PSAの分析手段として、高速液体クロマトグラフィー(「HPLC」と略記する場合がある)を用いる方法に関する。例えば、Amideカラムなどに代表される順相HPLCにより検出対象の分子量に依存した分離、あるいはODSカラムなどに代表される逆相HPLCにより検出対象の構成糖鎖配向に依存した分離を行なう。分析で得られるクロマトグラムから、LacdiNAc(+)糖鎖およびLacdiNAc(-)糖鎖に相当するピークの対を選択し、そのピーク高さまたは面積から算出したR値により判定をおこなう。検出には任意の吸光波長を用いることができ、あるいは選択した標識化合物に特定の蛍光波長を用いることができる。
あるいは、本発明は、PSAに対して特異的結合分子を作用させ、その組み合わせによる分析手法を用いる方法に関する。特異的結合分子は、数種のレクチン、抗体およびそれらの断片を含む。例えば、ELISAプレート、ポリフッ化ビニリデン(PVDF)膜、ガラスあるいはシリコン製アレイチップなどに固相化した検出対象に特異的結合分子を反応させ、LacdiNAc構造、および対象物全体を定量的に検出する。
検出には、アルカリフォスファターゼやホースラデッシュペルオキシダーゼといった酵素を結合させたレクチンや抗体を用い、酵素反応を介してブロモクロロインドリル燐酸(BCIP)またはニトロブルーテトラゾリウム(NBT)を用いた化学発色、あるいはルミノール試薬を用いた化学発光を用いることができ、あるいはまた、表面プラズモン共鳴を用いることができる。関連して、固相化した特異的結合分子に対して該検出対象を結合させ、そこに別種の特異的レクチン、または特異的抗体を反応させて、一連の検出を行う事ができる。本発明では、「特異的抗体」を単に「抗体」と、「特異的レクチン」を単に「レクチン」と略記する場合がある。
特異的結合分子としてレクチンを用いる場合、例えば、非還元末端GalNAcを認識するWFAレクチン(Wisteria floribunda agglutinin)をPSAに作用させることで、LacdiNAc(+)糖鎖を検出する事ができる。特異的結合分子として抗体を使用する際、PSAに対する抗体は、市販のポリクローナル抗体またはモノクローナル抗体を使用することができる。
特異的結合分子として特定の糖鎖構造を認識する抗体を使用する方法に関連して、本発明は、LacdiNAc構造を認識するポリクローナル抗体およびモノクローナル抗体を作製する次の工程に関する。まず、LacdiNAc構造を含む糖鎖構造、その類似体、あるいは誘導体を、生物試料から調製あるいは化学的若しくは生化学的に合成し、同構造の多価結合体を作製する。次に、免疫反応活性化物質と共に多価結合体で動物を免疫する。この時、多価結合体は免疫反応活性化物質に結合していることが好ましく、結合体は、単独で、あるいは更なる免疫反応活性化物質と共に免疫に用いる。より好ましくは、多価結合体を少なくとも一種のアジュバント分子と共に抗体産生生物に注射、あるいは粘膜投与する。
以下に、実施例を挙げて本発明を更に具体的に説明するが、本発明は、その要旨を超えない限りこれらの実施例に限定されるものではない。
実施例1
(a)工程(1) PSAの単離
最初に血清中の免疫グロブリンの除去を行った。4mLのプロテインAアガロース(PIERCE)をディスポーザブルプラスティックカラム(PIERCE)に充填し、リン酸緩衝生理食塩水(PBS)を用いて平衡化した。プロテインAアガロース充填カラムに対して、BPHと診断された被験者(T-16)の血清およびPBSの混合物を添加し、2倍のカラムボリューム(CV)のPBSにて洗浄した。この担体に結合しないPSAを含む画分を採取し、最終濃度が1MになるようにNa2SO4を加えた。
(a)工程(1) PSAの単離
最初に血清中の免疫グロブリンの除去を行った。4mLのプロテインAアガロース(PIERCE)をディスポーザブルプラスティックカラム(PIERCE)に充填し、リン酸緩衝生理食塩水(PBS)を用いて平衡化した。プロテインAアガロース充填カラムに対して、BPHと診断された被験者(T-16)の血清およびPBSの混合物を添加し、2倍のカラムボリューム(CV)のPBSにて洗浄した。この担体に結合しないPSAを含む画分を採取し、最終濃度が1MになるようにNa2SO4を加えた。
次に、血清中の主要タンパクであるアルブミンの除去を行った。1mLのフラクトゲル(登録商標) EMD TA(S)(Merck)を、ディスポーザブルプラスティックカラムに充填し、20mMリン酸緩衝液(pH7.4、Na2SO4(1M)含有)にて平衡化させた。フラクトゲル充填カラムに対して上述のPSAを含む画分を添加し、送液ポンプを用いて7CVの同緩衝液でカラムを洗浄した。次いで、吸着したタンパクを20mMリン酸緩衝液(pH7.4、Na2SO4不含)にて溶出し、PSAを含む画分を得た。
次に、血清中のPSAとa1-アンチキモトリプシンとの複合体(PSA-ACT)から、PSAを遊離させた。前述のPSAを含む画分に同量の4Mエタノールアミン溶液(pH10.5)を加え、最終のエタノールアミン濃度を2Mとし、25℃において14時間にわたって振盪して、反応させた。その後、反応混合物を氷浴で冷却しながら、2Mの塩酸を加え、反応混合物を中和した。
次に、PSA抗体を用いた免疫沈降を行った。最初に、ダイナビーズ(登録商標)プロテインG(Invitrogen)に対して、市販の抗ヒトPSA・ウサギポリクローナル抗体(DAKO社製)を結合させ、続いてジメチルピメルイミデート(DMP、PIERCE)を用いて処理して、抗体と磁気ビーズを架橋させて、抗体磁気ビーズを得た。前述の中和された反応混合物に対して、PSA抗体磁気ビーズを添加し、4℃にて1時間にわたって振盪した。続いて、PSA抗体磁気ビーズを、0.02%のTween-20を含むPBSで3回、およびPBSで1回洗浄した。さらに、PSA抗体磁気ビーズに1Mプロピオン酸を加え、4℃にて40分間にわたって振盪し、PSA抗体磁気ビーズに吸着したタンパクを溶出させて回収した。溶出したタンパクを遠心式濃縮機(SpeedVac)により乾固させた。
乾固させたタンパクを、酵素免疫定量法(ELISA、栄研化学)および電気泳動にて分析した結果、最初の血清中に含まれていたPSAの約50%を回収できることが判明した。
0.125MのTris-HCl緩衝液(pH6.8)に対して、10質量%のメルカプトエタノール、4質量%のSDS、10質量%のショ糖、0.004質量%のブロモフェノールブルーを添加して、サンプルバッファーを調製した。20μLのサンプルバッファーに対して工程(1)で精製したPSAを添加し、3分間にわたって100℃に加熱し、そして氷浴中に静置して冷却した。得られたサンプルを、10質量%ポリアクリルアミドゲル上で電気泳動により分離した。電気泳動による分離後、ポリアクリルアミドゲルを純水で軽く洗浄し、引き続いてSYPRO(登録商標) Ruby (Invitrogen)による染色を行なった。染色されたタンパク質を含むゲルを切り出し、1.5mLチューブに移した。切り出したゲルを、純水、50%アセトニトリル水溶液、およびアセトニトリルを用いて順次洗浄し、そしてゲルを乾燥させた。
また、別途、4~10ng/mLのPSA濃度を有する血清1mLを用いて上記の手順を繰り返したところ、ウェスタンブロットにてPSAのバンドが強く観察された。この結果から、このように低い濃度のPSAであっても、前述の方法によって効率よく精製することが可能であることが証明された。
(b)工程(2) 糖鎖(PSA誘導体)の調製
工程(1)で得られた乾燥ゲルの入ったチューブに対して、10mMのジチオトレイトール(DTT)および25mMの炭酸水素アンモニウムを含む水溶液(pH8.0)を加え、遮光条件下1時間にわたって56℃で振盪して還元反応を行い、チューブ内の溶液を除去した。チューブに対して55mMのヨードアセトアミドを含む水溶液を加えて、遮光条件下45分間にわたって室温で振盪してアルキル化反応を行い、チューブ内の溶液を除去した。還元およびアルキル化を行ったゲルを、25mMの炭酸水素アンモニウム水溶液(pH8.0)、およびアセトニトリルで洗浄し、その後、ゲルを乾燥させた。
工程(1)で得られた乾燥ゲルの入ったチューブに対して、10mMのジチオトレイトール(DTT)および25mMの炭酸水素アンモニウムを含む水溶液(pH8.0)を加え、遮光条件下1時間にわたって56℃で振盪して還元反応を行い、チューブ内の溶液を除去した。チューブに対して55mMのヨードアセトアミドを含む水溶液を加えて、遮光条件下45分間にわたって室温で振盪してアルキル化反応を行い、チューブ内の溶液を除去した。還元およびアルキル化を行ったゲルを、25mMの炭酸水素アンモニウム水溶液(pH8.0)、およびアセトニトリルで洗浄し、その後、ゲルを乾燥させた。
上記により得られたゲルに、リシルエンドペプチダーゼ(登録商標)溶液(250ng、和光純薬(質量分析グレード)、25mM炭酸水素アンモニウム水溶液(pH8.0)を加えて、45分間にわたって氷中で静置し、ゲルを膨潤させた。その後、18時間にわたって37℃において、反応混合物を緩やかに撹拌した。75%アセトニトリル水溶液(0.1%トリフルオロ酢酸を含む)を加えて、20分間にわたって振盪して抽出を行い、溶液を回収した。
回収した溶液を遠心濃縮機によって乾固させた。残渣に対して、1μgのフェタブロックSC(ロシュ・ダイアグノスティックス)を含む50mM炭酸水素アンモニウム水溶液(pH8.0)を加え、引き続いて1単位(1単位/μL)のペプチドN-グリコシダーゼF(Sigma)を加えて、18時間にわたって37℃で振盪した。振盪終了後、反応混合物に1μLのトリフルオロ酢酸1%水溶液を添加した。オクタデシル(C18)シリカ担体が充填されたC18チップを用いた反応混合物の吸引および排出を繰り返して、ペプチドを吸着させて、反応混合物中の糖鎖と分離し、糖鎖画分を得た。続いて、70%アセトニトリル0.1%トリフルオロ酢酸水溶液を用いて、C18チップからペプチドを溶出させて、ペプチド画分を得た。得られたペプチド画分からは、PSAに由来するペプチドが検出された。
マイクロスピンカラムに30mgのカーボングラファイト(GLサイエンス)を充填して洗浄した。グラファイト充填マイクロスピンカラムに対して糖鎖画分を加え、さらに洗浄液として5%アセトニトリル水溶液(0.1%トリフルオロ酢酸)を加え、遠心分離(300×g、1分~2分)により洗浄した。洗浄液を除去した後に、50%アセトニトリル水溶液(0.1%トリフルオロ酢酸)を加え、遠心分離(300×g、1分~2分)を行い、糖鎖を溶出させ、糖鎖溶出液を得た。回収した糖鎖溶出液を、遠心濃縮機を用いて乾固させ、2μLの純水に再溶解させて、糖鎖溶液を得た。
(c)工程(3) 糖鎖(PSA誘導体)の標識
MALDI用ターゲットプレートの上に、工程(2)で得られた糖鎖溶液0.5μLを滴下し、風乾させた。次に、ターゲットプレート上に、1-ピレニルジアゾメタン(PDAM、500pmol)のDMSO溶液0.25μLを滴下し、約25分間にわたって40℃に加熱し、乾燥させた。この操作によって、ターゲットプレート上に、PDAMで標識された糖鎖が得られた。
MALDI用ターゲットプレートの上に、工程(2)で得られた糖鎖溶液0.5μLを滴下し、風乾させた。次に、ターゲットプレート上に、1-ピレニルジアゾメタン(PDAM、500pmol)のDMSO溶液0.25μLを滴下し、約25分間にわたって40℃に加熱し、乾燥させた。この操作によって、ターゲットプレート上に、PDAMで標識された糖鎖が得られた。
(d)工程(4) MS分析
工程(3)で得られた標識糖鎖を担持したターゲットプレートに対して、2,5-ジヒドロキシ安息香酸(DHBA)の50%アセトニトリル溶液(濃度10mg/mL)0.5μLを滴下し、室温において乾燥させた。
工程(3)で得られた標識糖鎖を担持したターゲットプレートに対して、2,5-ジヒドロキシ安息香酸(DHBA)の50%アセトニトリル溶液(濃度10mg/mL)0.5μLを滴下し、室温において乾燥させた。
得られたターゲットプレートをMALDI-QIT-TOFMS装置AXIMA-QIT(島津製作所/Kratos社製)に設置し、MS分析を行った。定量的な比較を行うために、ターゲットプレート上の試料の広がりよりも大きい外周で囲まれた領域をラスタースキャンし、有意な全シグナルを積算した。得られたMSスペクトルの代表例を図1に示す。
別途、m/z=2077およびm/z=2118で得られるイオンをプリカーサーイオンとして用いたMS2分析を行った結果、図1中のm/z=2077のシグナルP1が(化1)Aに示すLacdiNAc(-)糖鎖に相当し、m/z=2118のシグナルP2が(化1)Bに示すLacdiNAc(+)糖鎖に相当することが判明した。なお、式中、「Sia」はN-アセチルノイラミン酸を示し、「Glc」はグルコース、「Gal」はガラクトース、「Man」はマンノースをそれぞれ示し、「Fuc」はフコースを示す。また、式中括弧は2ヶ所の非還元末端のいずれかへの結合を示す。他の化学式においても以下同様である。
m/z=2118のシグナルをプリカーサーイオンとして用いたMS2分析を行った結果を図2に示した。Sia-[Gal-GlcNAc-Man-(GalNAc-GlcNAc-Man-)Man-GlcNAc]の存在を示す、m/z=1751のフラグメント(イオンb6)をはじめ、Sia-GalNAc-GlcNAc-Man構造である、m/z=858のフラグメント(イオンb4)などが検出され、さらにLacdiNAc構造を含むSia-GalNAc-GlcNAcであるm/z=696のフラグメント(イオンb3)も確認された。その結果、プリカーサーイオンの構造が、Sia-[Gal-GlcNAc-Man-(GalNAc-GlcNAc-Man-)Man-GlcNAc-(Fuc-)GlcNAc]である事が確認された。
シグナルP1およびP2の強度S(P1)およびS(P2)を求め、その比R値=[S(P2)/S(P1)]×100を計算して、R値=12(%)という数値が得られた。
実施例2~4
BPHと診断され、匿名化され識別コードを付した2名の被験者の血清(実施例1および2)、ならびに、生検によりPCと診断され、匿名化され識別コードを付した2名の被験者の血清(実施例3および4)を用いて、実施例1の手順を繰り返した。なお、手順の実施に際し医療機関の倫理審査の承認を受け、被験者にはインフォームドコンセントを行なった。
BPHと診断され、匿名化され識別コードを付した2名の被験者の血清(実施例1および2)、ならびに、生検によりPCと診断され、匿名化され識別コードを付した2名の被験者の血清(実施例3および4)を用いて、実施例1の手順を繰り返した。なお、手順の実施に際し医療機関の倫理審査の承認を受け、被験者にはインフォームドコンセントを行なった。
それぞれの被験者の血清中PSA濃度およびLacdiNAc(-)(m/z=2077)、LacdiNAc(+)(m/z=2118)のシグナル強度比百分率R値を、以下の第1表に示す。
PCと診断された被験者の血清を用いた場合の代表例として、実施例4で得られたMSスペクトルを図3に示す。実施例1と同様の手順によるMS2分析によって、実施例4においては、(化1)A、Bの他に、(化2)C、Dに示した構造を有する糖鎖の存在が確認された。式中の「Pyrene」は、PDAMによるピレン標識(1-ピレニルメチル基)を示す。また、式中括弧は、2箇所のN-アセチルノイラミン酸のうちの何れかへの結合を示す。
(評価)
表1に示したように、PCと診断された被験者の血清に由来する試料のLacdiNAc(+)/LacdiNAc(-)のシグナル強度比百分率R値は30%(R(S))以上を示し、GalNAc置換糖鎖を多く含有することを見出した。それに対して、BPHと診断された被験者の血清に由来する試料のシグナル強度比百分率R値は30%(R(S))以下であった。すなわち、PCと診断された被験者の血清PSA糖鎖は、BPHと診断された被験者の血清PSAに比較して多くのLacdiNAc構造が存在することが初めて明らとなった。
表1に示したように、PCと診断された被験者の血清に由来する試料のLacdiNAc(+)/LacdiNAc(-)のシグナル強度比百分率R値は30%(R(S))以上を示し、GalNAc置換糖鎖を多く含有することを見出した。それに対して、BPHと診断された被験者の血清に由来する試料のシグナル強度比百分率R値は30%(R(S))以下であった。すなわち、PCと診断された被験者の血清PSA糖鎖は、BPHと診断された被験者の血清PSAに比較して多くのLacdiNAc構造が存在することが初めて明らとなった。
さらに、PCにおいて、LacdiNAc(+)/LacdiNAc(-)のシグナル強度比R値は、血清PSA濃度とは相関がないことが見いだされた。この結果は、本発明の方法が、PSA濃度に依存することなしにPCとBPHとを区別できる可能性を示している。したがって、本発明の方法は、広範囲の血清PSA濃度の試料に適用できる。特に、本発明の方法は、グレーゾーンと呼ばれる血清中PSA濃度の範囲(4~10ng/mL)において、高精度でのPCとBPHとの区別に有効である可能性がある。
実施例5
本実施例は、前述の実施例における糖鎖に代えて糖ペプチドを用いることができることを示す例である。
本実施例は、前述の実施例における糖鎖に代えて糖ペプチドを用いることができることを示す例である。
実施例1の、工程(1)に記載のPSA単離、工程(2)に記載のDTTによる還元およびヨードアセトアミドによるアルキル化を実施せずに、標準品PSA-ACT(CORTEX BIOCHEM)100ngに対して50単位のサーモリシン(Calbio)の50mM炭酸水素アンモニウム水溶液(pH8.0)を直接加え、18時間にわたって56℃で静置反応させた。反応混合物を遠心濃縮機によって乾固させた。得られた固形物を0.8%トリフルオロ酢酸水溶液に溶解し、40分間にわたって80℃で静置し、脱シアル酸反応を行った。反応サンプルを遠心濃縮機で乾固させた。
続いて、カーボングラファイト充填カートリッジであるIntersep GC 50mg (GLサイエンス)を用いて、得られたサンプルから糖ペプチドの粗精製および脱塩を行った。最初に、カートリッジに対して、1MのNaOH水溶液、蒸留水、30%酢酸水溶液、ならびに「5%アセトニトリルおよび1%トリフルオロ酢酸を含有する水溶液」を順次送液し、カーボングラファイトの洗浄、ならびに平衡化を行った。次に、乾固した糖ペプチドサンプルを、「5%アセトニトリルおよび1%トリフルオロ酢酸を含有する水溶液」に溶解し、カートリッジに送液した。カートリッジに吸着させた糖ペプチドに対して、蒸留水、「5%アセトニトリルおよび1%トリフルオロ酢酸を含有する水溶液」を順次送液し、洗浄を行った。その後、「80%アセトニトリルおよび1%トリフルオロ酢酸を含有する水溶液」をカートリッジに送液して、吸着した糖ペプチドを溶出した。得られた糖ペプチド画分を回収し、遠心濃縮機を用いて乾固させた。
Sepharose CL4B(シグマアルドリッチ社)を用いて、糖ペプチドの精製を行った。使用前に、Sepharoseを50%エタノール水溶液で5回洗浄し、次いで、「ブタノール:蒸留水:エタノール=4:1:1」で5回洗浄した。乾固させた粗精製糖ペプチド画分を同混合溶液に溶解し、その溶液に対して洗浄済みのSepharoseを6μL加え、1時間にわたって室温にて振盪する事で糖ペプチドをSepharoseに吸着させた。次いで、前述の混合溶液を用いて9回にわたってSepharoseを洗浄した。糖ペプチドの吸着したSepharoseに対して50%エタノール水溶液を加え、30分間にわたって室温で振盪する事により糖ペプチドの溶離を行った。溶離した糖ペプチドを含む溶液を回収し、遠心濃縮機にて乾固させた。次いで、乾固させた糖ペプチドを5%アセトニトリル水溶液4μLに溶解した。
得られた糖ペプチド溶液に対して実施例1の工程(3)、および工程(4)を適用してMS解析を行った。得られたMSスペクトルを図4に示した。PSAに由来するペプチド43-47に糖鎖が付加したスペクトルが得られ、GalNAc/Gal置換に対応する41の質量差を有する2種類の糖ペプチド、P1およびP2が2対検出された。それぞれの構成を、(化3)のEおよびG(P1)、FおよびH(P2)に示す。なお、式中の「Peptide」はPSAに由来するペプチド断片を示す。
精漿に由来する標準品PSA-ACTのLacdiNAc(+)/LacdiNAc(-)のシグナル強度比百分率R値の平均は25%であった。
以上のように、標準品PSAのLacdiNAc(+)/LacdiNAc(-)のシグナル強度比百分率R値は、BPHの被験者に対する糖鎖解析の結果に近く30%以下であり、PCの被験者に対する糖鎖解析R値とは異なっていた。また、糖ペプチドを用いる場合、糖鎖にペプチドが結合していることによって、PSAの同定および糖鎖付加位置の確認が可能となる。このことによって、他の糖タンパク質が混在する場合であっても、LacdiNAc(+)/LacdiNAc(-)のシグナル強度比百分率R値を正確に求めることが可能となる。
実施例6
実施例4に示したPC羅患の被験者(N-18)の血清を対象に糖ペプチド解析を行った。該被験者の血清を用いて、実施例1の工程(1)および工程(2)に記載のDTTによる還元、ヨードアセトアミドによるアルキル化、洗浄および乾燥の工程を実施し、乾燥ゲルを得た。
実施例4に示したPC羅患の被験者(N-18)の血清を対象に糖ペプチド解析を行った。該被験者の血清を用いて、実施例1の工程(1)および工程(2)に記載のDTTによる還元、ヨードアセトアミドによるアルキル化、洗浄および乾燥の工程を実施し、乾燥ゲルを得た。
次に、乾燥ゲルに対して、1~100単位のサーモリシン(Calbio
Chem)の25mM炭酸水素アンモニウム水溶液(pH8.0)を加えて、45分間にわたって氷浴中で静置して、ゲルを膨潤させた。膨潤したゲルを18時間にわたって56℃で軽く攪拌した。ゲルに対して、抽出液「70~80%アセトニトリルおよび0.1%トリフルオロ酢酸を含有する水溶液」を加えて20分間にわたって振盪し、溶液を回収した。
Chem)の25mM炭酸水素アンモニウム水溶液(pH8.0)を加えて、45分間にわたって氷浴中で静置して、ゲルを膨潤させた。膨潤したゲルを18時間にわたって56℃で軽く攪拌した。ゲルに対して、抽出液「70~80%アセトニトリルおよび0.1%トリフルオロ酢酸を含有する水溶液」を加えて20分間にわたって振盪し、溶液を回収した。
洗浄した25mgのZIC(登録商標)HILIC固相カラム充填剤(SeQuant)に対して、回収した溶液を加えた。続いて、「80%アセトニトリルおよび0.1%トリフルオロ酢酸を含有する水溶液」を加えて洗浄し、そして0.1%トリフルオロ酢酸の水溶液を用いて糖ペプチドを溶出させた。糖ペプチド溶出液を遠心濃縮機によって乾固させ、次いで、固形物を2μLの純水に溶解させて糖ペプチド溶液を得た。
得られた糖ペプチド溶液に対して、実施例1の工程(3)と同様の手順を適用して、糖ペプチドの標識を行った。次いで、得られたターゲットプレートに対して実施例1の工程(4)の手順を適用して、MS分析を行った。
MS分析によって、PSA由来のペプチド43-47に糖鎖が結合した糖ペプチドが検出された。得られたMSスペクトルを図5に示した。図5に示すように、GalNAc/Galの置換に対応する41の質量差を有する、4つのLacdiNAc(-)糖ペプチド(P1)およびLacdiNAc(+)糖ペプチド(P2)の対が見いだされた(化4)。
いずれの対においても、LacdiNAc(+)/LacdiNAc(-)糖ペプチドのシグナル強度比百分率R値が30%以上であった。また、本実施例で得られたR値と該血清サンプルに対して糖鎖解析を行った実施例4のR値は同様な数値であった。
以上のように、PSA誘導体として糖ペプチドを用いた場合であっても、標識後のMS分析において、GalNAc/Gal置換の有無に相当する質量差41を有する糖ペプチドのシグナルの対を検出することができた。さらに、糖ペプチドのシグナル対の強度比百分率R値は114%±2%となり、糖鎖のシグナル対の強度比百分率R値である95%±3%と同等の結果を示した。したがって、実施例1~4に示したLacdiNAc(+)/LacdiNAc(-)糖鎖のシグナル強度比R値と同様に、LacdiNAc(+)/LacdiNAc(-)糖ペプチドのシグナル強度比百分率R値を求めることによって、PCとBPHとを高精度で判別することが可能であると考えられる。
実施例7
実施例7は、実施例1の工程(1)に記載のPSAの単離、および工程(2)に記載のDTTによる還元、ヨードアセトアミドによるアルキル化の工程を実施する事なしに患者血清の分析を行った例である。
実施例7は、実施例1の工程(1)に記載のPSAの単離、および工程(2)に記載のDTTによる還元、ヨードアセトアミドによるアルキル化の工程を実施する事なしに患者血清の分析を行った例である。
最初にPCに羅患している患者(N-122、PSA濃度186ng/mL)の血清から免疫グロブリンの除去を行った。3mLのプロテインAアガロース担体(PIERCE)を、リン酸緩衝生理食塩水(PBS)を用いて平衡化した。これをディスポーザブルプラスティックカラム(PIERCE)に充填し、該被験者の血清およびPBSの混合物を添加し、4℃にて30分間振盪した。この担体に結合しないPSAを含む画分を回収し、さらに担体の3倍体積(3CV)のPBSにてプロテインAアガロース担体を洗浄した画分を回収後、両画分の混合溶液に最終濃度が1MになるようにNa2SO4を加えた。
次に、PSA含有画分から血清中の主要タンパクであるアルブミンの除去を行った。2.5mLのフラクトゲル(商標)EMD TA(S)(Merck)を、ディスポーザブルプラスティックカラムに充填し、20mMリン酸緩衝液(pH7.4、Na2SO4(1M)含有)にて平衡化させた。フラクトゲル充填カラムに対して上記にて得られた画分を添加し、ポンプを用いて7CVの同緩衝液を送液し、アルブミンの除去を行った。次いで、フラクトゲル(商標)に吸着したタンパク質を20mMリン酸緩衝液(pH7.4、Na2SO4不含)にて溶出し、PSAを含む画分を得た。引き続き、この画分をPBSにて平衡化させた2mLのプロテインAアガロース担体に添加し、4℃にて30分間振盪することにより除去しきれなかった免疫グロブリンを除去した。プロテインAアガロース担体に結合しないPSAを含む画分および3CVのPBSにて洗浄した画分の混合溶液を次の免疫沈降に用いた。
引き続いて、免疫沈降に用いる抗PSA抗体ビーズの作製をおこなった。NHS-activated Sepharose 4 Fast Flow (GEヘルスケアバイオサイエンス社)を1mMのHClで3回洗浄した。次に、洗浄したビーズに対して、市販の抗ヒトPSA・ウサギポリクローナル抗体(DAKO社)を添加し、室温にて30分間にわたって振盪することで、抗体とビーズの架橋を行った。続いて、0.5MのNaClを含む0.5Mのモノエタノールアミン水溶液を加え、室温にて30分間にわたって振盪することで、残余活性基の不活化を行った。得られた抗PSA抗体ビーズを、0.5MのNaClを含む0.1Mの酢酸ナトリウム緩衝液(pH4.0)、および0.5MのNaClを含む1Mのトリス緩衝液(pH9.0)で交互に3回洗浄した。次いで、抗PSA抗体ビーズをPBSで3回洗浄した。最後に、同ビーズを、0.02%アジ化ナトリウムを含むPBSで洗浄し、使用時まで4℃にて保存した。
次いで、免疫沈降を行った。前述のPSAを含む混合溶液画分に対して、0.1mLの抗PSA抗体ビーズを添加し、4℃にて1時間にわたり振盪した。続いて、抗PSA抗体ビーズをMicro Bio-Spinクロマトグラフィーカラム(バイオ・ラッドラボラトリーズ社)に移した。抗PSA抗体ビーズカラムを、PBSで4回、0.02%のTween-20を含むPBSで3回、および蒸留水で2回洗浄した。さらに、抗PSA抗体ビーズカラムに1Mのプロピオン酸水溶液を加え、ビーズに吸着したタンパク質を溶出させて回収した。プロピオン酸水溶液による溶出は全10回にわたって行い、その溶離液を混合して遠心濃縮機を用いて乾固させた。
得られたタンパク質画分の一部をウェスタンブロット法に供し、半定量的な解析を行ったところ、最初の血清に含まれていたPSAの70%以上を回収できる事が判明した。
続いて、実施例5に従い、サーモリシン消化、脱シアル酸反応、カーボングラファイト充填カートリッジによる粗精製、およびSepharose CL4Bを用いた精製を順次行い、糖ペプチド画分を得た。得られた糖ペプチド溶液に対して実施例1の工程(3)と同様の手順を適用して、糖ペプチドの標識を行った。次いで、得られたターゲットプレートに対して実施例1の工程(4)の手順を適用して、MS分析を行った。
MS分析によって、PSA由来のペプチド43-47に糖鎖が結合した糖ペプチドが検出された。得られたMSスペクトルを図6に示した。MS分析により、LacdiNAc構造の有無に相当する41の質量差を有する糖ペプチドのシグナル対、P1およびP2を検出することができた。
実施例8~12
生検によりPCと診断され、識別コードを付した5名の被験者の血清(実施例8~12)、を用いて、実施例7の手順を繰り返した。なお、手順の実施に際し医療機関の倫理審査の承認を受け、被験者にはインフォームドコンセントを行なった。
生検によりPCと診断され、識別コードを付した5名の被験者の血清(実施例8~12)、を用いて、実施例7の手順を繰り返した。なお、手順の実施に際し医療機関の倫理審査の承認を受け、被験者にはインフォームドコンセントを行なった。
実施例5、6および実施例7を含むそれぞれの被験者の血清中PSA濃度およびLacdiNAc(-)糖ペプチド(m/z=2386)、LacdiNAc(+)糖ペプチド(m/z=2427)のシグナル強度比百分率R値を、以下の第2表に示す。
以上のように、32ng/mLの低いPSA濃度を有する前立腺癌患者の血清から糖ペプチドを精製し、MSによって検出するに至った。また、低血清PSA濃度である前立腺癌患者のR値も、PSAを多く有する前立腺癌患者血清のR値と同様に30%を大きく上回る事が明らかとなった。
このように、実施例1に示す手法のようにPSA-ACT複合体から遊離PSAを調製することなく、血清中の複合体および遊離PSAから糖ペプチドを直接的に調製して、PSAのLacdiNAc(+)糖ペプチド、およびLacdiNAc(-)糖ペプチドを検出することができた。この方法は、工程が少なくなるので、簡便迅速となる上、糖ペプチドの回収率が向上する。したがって、この方法は臨床試料への適用に好ましい。
本願は、2008年12月3日に出願した日本の特許出願である特願2008-309012に基づくものであり、その出願の全ての内容はここに引用し、本願発明の明細書の開示として取り込まれるものである。
Claims (8)
- 被験者由来の試料中のPSAの糖鎖構造を分析する工程を含み、LacdiNAc(N-アセチルガラクトサミン-N-アセチルグルコサミン)を有する糖鎖(LacdiNAc(+))の量が、LacdiNAcを持たないがLacNAc(ガラクトース-N-アセチルグルコサミン)を有する糖鎖(LacdiNAc(-))の量の30%を超える際に前立腺癌であると判定することを特徴とする前立腺癌の判定方法。
- 被験者由来の試料中のPSAの糖鎖構造を分析する工程を含み、LacdiNAc(N-アセチルガラクトサミン-N-アセチルグルコサミン)を有する糖鎖(LacdiNAc(+))の量が、LacdiNAcを持たないがLacNAc(ガラクトース-N-アセチルグルコサミン)を有する糖鎖(LacdiNAc(-))の量の30%を超える際に前立腺癌であると判定し、30%以下である際に良性前立腺肥大症であると判定することを特徴とする請求項1に記載の前立腺癌の判定方法。
- 上記PSAの糖鎖構造の分析を、上記PSAに対してレクチンを作用させる方法、上記PSAに対して抗体を作用させる方法、高速液体クロマトグラフィー法もしくは質量分析法、またはこれらを組み合わせた分析手段により行うことを特徴とする請求項1に記載の前立腺癌の判定方法。
- 上記PSAの糖鎖構造の分析を、上記PSAに対してレクチンを作用させる方法、上記PSAに対して抗体を作用させる方法、高速液体クロマトグラフィー法もしくは質量分析法、またはこれらを組み合わせた分析手段により行うことを特徴とする請求項2に記載の前立腺癌の判定方法。
- (1) 被験者由来の試料からPSAを精製する工程と、
(2) 工程(1)で精製したPSAからPSA誘導体を調製する工程と、
(3) 工程(2)で得られたPSA誘導体を標識する工程と、
(4) 工程(3)で得られた標識化PSA誘導体を質量分析法により分析する工程を含み、LacdiNAcの構造の有無に起因する質量差41で示される一対のシグナルを選定し、LacdiNAcを有する糖鎖(LacdiNAc(+))に由来するシグナルの強度が、LacdiNAcを持たないがLacNAcを有する糖鎖(LacdiNAc(-))に由来するシグナルの強度の30%を超える際に前立腺癌であると判定することを特徴とする請求項3に記載の前立腺癌の判定方法。 - (1) 被験者由来の試料からPSAを精製する工程と、
(2) 工程(1)で精製したPSAからPSA誘導体を調製する工程と、
(3) 工程(2)で得られたPSA誘導体を標識する工程と、
(4) 工程(3)で得られた標識化PSA誘導体を質量分析法により分析する工程を含み、LacdiNAcの構造の有無に起因する質量差41で示される一対のシグナルを選定し、LacdiNAcを有する糖鎖(LacdiNAc(+))に由来するシグナルの強度がLacdiNAcを持たないがLacNAcを有する糖鎖(LacdiNAc(-))に由来するシグナルの強度の30%を超える際に前立腺癌であると判定し、30%以下である際に良性前立腺肥大症であると判定することを特徴とする請求項4に記載の前立腺癌の判定方法。 - 上記工程(2)において調製されるPSA誘導体が、PSA由来の糖鎖またはPSA由来の糖ペプチドであることを特徴とする請求項5に記載の前立腺癌の判定方法。
- 上記工程(2)において調製されるPSA誘導体が、PSA由来の糖鎖またはPSA由来の糖ペプチドであることを特徴とする請求項6に記載の前立腺癌の判定方法。
Priority Applications (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2010541349A JP5431360B2 (ja) | 2008-12-03 | 2009-12-03 | 前立腺癌の判定方法 |
US13/132,551 US20110236995A1 (en) | 2008-12-03 | 2009-12-03 | Method for determining prostate cancer |
EP09830449.6A EP2354790B1 (en) | 2008-12-03 | 2009-12-03 | Method for determining prostate cancer |
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2008-309012 | 2008-12-03 | ||
JP2008309012 | 2008-12-03 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
WO2010064683A1 true WO2010064683A1 (ja) | 2010-06-10 |
Family
ID=42233330
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
PCT/JP2009/070311 WO2010064683A1 (ja) | 2008-12-03 | 2009-12-03 | 前立腺癌の判定方法 |
Country Status (4)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US20110236995A1 (ja) |
EP (1) | EP2354790B1 (ja) |
JP (1) | JP5431360B2 (ja) |
WO (1) | WO2010064683A1 (ja) |
Cited By (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2012169648A1 (ja) * | 2011-06-09 | 2012-12-13 | 日本ケミカルリサーチ株式会社 | 糖蛋白質の分析法 |
JP2015078972A (ja) * | 2013-09-10 | 2015-04-23 | 公益財団法人野口研究所 | 糖ペプチドの質量分析法 |
WO2016021729A1 (ja) * | 2014-08-08 | 2016-02-11 | 国立大学法人北海道大学 | グリオーマの診断マーカー、判別方法、診断方法、糖鎖マーカーを検出する方法及び糖鎖マーカー |
WO2018101327A1 (ja) | 2016-11-29 | 2018-06-07 | コニカミノルタ株式会社 | 検体中の特定のpsaの含有量に基づく、前立腺癌のグリーソンスコアの推定方法、病理病期分類の推定方法、および補助情報の取得方法 |
JP2019086389A (ja) * | 2017-11-07 | 2019-06-06 | 株式会社カネカテクノリサーチ | シアロ糖鎖の分子量の測定方法 |
WO2020013097A1 (ja) | 2018-07-11 | 2020-01-16 | 公益財団法人がん研究会 | 前立腺がんに特異的な糖鎖、及びこれを用いた検査方法 |
US11105807B2 (en) | 2015-09-28 | 2021-08-31 | Konica Minolta, Inc. | Method for estimating pathological tissue diagnosis result (Gleason score) of prostate cancer |
Families Citing this family (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP5754767B2 (ja) * | 2009-02-04 | 2015-07-29 | 国立大学法人東京工業大学 | Psaの分析方法、及び前記分析方法を用いた前立腺癌と前立腺肥大症との鑑別方法 |
JP5630757B2 (ja) | 2009-10-30 | 2014-11-26 | 国立大学法人東京工業大学 | Psaの分析方法、及び前記分析方法を用いた前立腺癌と前立腺肥大症との鑑別方法 |
WO2014057983A1 (ja) * | 2012-10-12 | 2014-04-17 | 国立大学法人弘前大学 | 前立腺癌と前立腺肥大を識別するための方法およびキット |
Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2000514919A (ja) | 1996-07-03 | 2000-11-07 | ミレニアム ファーマシューティカルズ,インコーポレイテッド | 少くとも三分枝の連鎖オリゴ糖を持つ癌特異的抗原の検定による癌の検出 |
JP2002055108A (ja) | 2000-08-14 | 2002-02-20 | Tsutomu Oyama | 前立腺特異抗原の糖鎖構造の違いに基づく前立腺癌と前立腺肥大とを識別する方法 |
JP2005500057A (ja) | 2001-08-17 | 2005-01-06 | バイオティ セラピィーズ コープ | 癌特異的オリゴ糖配列およびその用途 |
JP2006515927A (ja) | 2002-12-20 | 2006-06-08 | モメンタ ファーマシューティカルズ インコーポレイテッド | 疾患を診断および監視するためのグリカンマーカー |
JP2008309012A (ja) | 2007-06-12 | 2008-12-25 | Toyota Motor Corp | 内燃機関の排気浄化装置 |
Family Cites Families (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
FI20055417A0 (fi) * | 2005-07-20 | 2005-07-20 | Glykos Finland Oy | Syöpäpesifiset glykaanit ja niiden käyttö |
-
2009
- 2009-12-03 WO PCT/JP2009/070311 patent/WO2010064683A1/ja active Application Filing
- 2009-12-03 JP JP2010541349A patent/JP5431360B2/ja not_active Expired - Fee Related
- 2009-12-03 EP EP09830449.6A patent/EP2354790B1/en not_active Not-in-force
- 2009-12-03 US US13/132,551 patent/US20110236995A1/en not_active Abandoned
Patent Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2000514919A (ja) | 1996-07-03 | 2000-11-07 | ミレニアム ファーマシューティカルズ,インコーポレイテッド | 少くとも三分枝の連鎖オリゴ糖を持つ癌特異的抗原の検定による癌の検出 |
JP2002055108A (ja) | 2000-08-14 | 2002-02-20 | Tsutomu Oyama | 前立腺特異抗原の糖鎖構造の違いに基づく前立腺癌と前立腺肥大とを識別する方法 |
JP2005500057A (ja) | 2001-08-17 | 2005-01-06 | バイオティ セラピィーズ コープ | 癌特異的オリゴ糖配列およびその用途 |
JP2006515927A (ja) | 2002-12-20 | 2006-06-08 | モメンタ ファーマシューティカルズ インコーポレイテッド | 疾患を診断および監視するためのグリカンマーカー |
JP2008309012A (ja) | 2007-06-12 | 2008-12-25 | Toyota Motor Corp | 内燃機関の排気浄化装置 |
Non-Patent Citations (16)
Title |
---|
BINDUKUMAR ET AL., J. CHROMATOGR. B, ANALYT. TECHNOL. BIOMED. LIFE SCI., vol. 813, no. 1-2, 2004, pages 113 - 120 |
CATALONA ET AL., J. AM. MED. ASSOC., vol. 279, 1998, pages 1542 - 1547 |
CHIKARA OHYAMA ET AL.: "Carbohydrate structure and differential binding of prostate specific antigen to Maackia amurensis lectin between prostate cancer and benign prostate hypertrophy", GLYCOBIOLOGY, vol. 14, no. 8, 2004, pages 671 - 679, XP008139724 * |
CHIKARA OYAMA: "Hinyoki Akusei Shuyo no Tosa Seibutsugaku", JAPANESE JOURNAL OF ELECTROPHORESIS, vol. 46, 2002, pages 51 - 54, XP008139956 * |
GLORIA TABARES ET AL.: "Different glycan structures in prostate-specific antigen from prostate cancer sera in relation to seminal plasma PSA", GLYCOBIOLOGY, vol. 16, no. 2, 2006, pages 132 - 145, XP002582316 * |
KUNO ET AL., MOL. CELL PROTEOMICS, vol. 8, no. 1, 2009, pages 99 - 108 |
OKADA ET AL., BIOCHIM. BIOPHYS. ACTA, vol. 1525, no. 1-2, 2001, pages 149 - 160 |
PERACAULA ET AL., GLYCOBILOLOGY, vol. 13, no. 4, 2003, pages 227 - 244 |
PERACAULA ET AL., GLYCOBIOLOGY, vol. 13, no. 6, 2003, pages 457 - 470 |
ROSA PERACAULA ET AL.: "Altered glycosylation pattern allows the distinction between prostate-specific antigen (PSA) from normal and tumor origins", GLYCOBIOLOGY, vol. 13, no. 6, 2003, pages 457 - 470, XP002995528 * |
See also references of EP2354790A4 |
SHUHEI SUMI ET AL.: "Serial lectin affinity chromatography demonstrates altered asparagine- linked sugar-chain structures of prostate- specific antigen in human prostate carcinoma", JOURNAL OF CHROMATOGRAPHY B, vol. 727, 1999, pages 9 - 14, XP008139533 * |
STAMEY ET AL., N. ENGL. J. MED., vol. 317, 1987, pages 909 - 916 |
SUMI ET AL., J. CHROMATOGR. B, vol. 727, 1994, pages 9 - 14 |
TABARES ET AL., GLYCOBILOLOGY, vol. 16, no. 2, 2006, pages 132 - 145 |
ZHANG ET AL., CLIN. CHEM., vol. 41, no. 11, 1995, pages 1567 - 1573 |
Cited By (8)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2012169648A1 (ja) * | 2011-06-09 | 2012-12-13 | 日本ケミカルリサーチ株式会社 | 糖蛋白質の分析法 |
JP2015078972A (ja) * | 2013-09-10 | 2015-04-23 | 公益財団法人野口研究所 | 糖ペプチドの質量分析法 |
WO2016021729A1 (ja) * | 2014-08-08 | 2016-02-11 | 国立大学法人北海道大学 | グリオーマの診断マーカー、判別方法、診断方法、糖鎖マーカーを検出する方法及び糖鎖マーカー |
US11105807B2 (en) | 2015-09-28 | 2021-08-31 | Konica Minolta, Inc. | Method for estimating pathological tissue diagnosis result (Gleason score) of prostate cancer |
WO2018101327A1 (ja) | 2016-11-29 | 2018-06-07 | コニカミノルタ株式会社 | 検体中の特定のpsaの含有量に基づく、前立腺癌のグリーソンスコアの推定方法、病理病期分類の推定方法、および補助情報の取得方法 |
JP2019086389A (ja) * | 2017-11-07 | 2019-06-06 | 株式会社カネカテクノリサーチ | シアロ糖鎖の分子量の測定方法 |
JP7039255B2 (ja) | 2017-11-07 | 2022-03-22 | 株式会社カネカテクノリサーチ | シアロ糖鎖の分子量の測定方法 |
WO2020013097A1 (ja) | 2018-07-11 | 2020-01-16 | 公益財団法人がん研究会 | 前立腺がんに特異的な糖鎖、及びこれを用いた検査方法 |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
EP2354790A1 (en) | 2011-08-10 |
JPWO2010064683A1 (ja) | 2012-05-10 |
EP2354790B1 (en) | 2013-07-17 |
JP5431360B2 (ja) | 2014-03-05 |
EP2354790A4 (en) | 2012-09-05 |
US20110236995A1 (en) | 2011-09-29 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP5431360B2 (ja) | 前立腺癌の判定方法 | |
JP5443156B2 (ja) | 前立腺癌を判定する方法 | |
Drake et al. | A lectin affinity workflow targeting glycosite-specific, cancer-related carbohydrate structures in trypsin-digested human plasma | |
EP2950098A1 (en) | Glycan markers as measure of disease state of hepatic diseases | |
US8568993B2 (en) | Detection of glycopeptides and glycoproteins for medical diagnostics | |
EP3647788A1 (en) | Biomarker for detecting colorectal cancer | |
KR20150061816A (ko) | 혈액유래 암 진단용 펩티드 마커 및 이를 이용한 암 진단방법 | |
KR20120125157A (ko) | 렉틴을 이용한 암 진단 방법 | |
JP5284958B2 (ja) | 前立腺癌と良性前立腺肥大症とを識別する方法 | |
Liu et al. | Down-regulated expression of complement factor I: a potential suppressive protein for gastric cancer identified by serum proteome analysis | |
US8030085B2 (en) | Method for discriminating between prostatic cancer and benign prostatic hyperplasia | |
WO2010071787A1 (en) | Pancreatic cancer markers and uses thereof | |
JP2010071900A (ja) | 新規非アルコール性脂肪性肝疾患バイオマーカーおよび該バイオマーカーを用いた非アルコール性脂肪性肝疾患の検出方法 | |
KR101143891B1 (ko) | 단백질의 비정상적인 당쇄화를 이용하는 암진단 마커 | |
JPWO2017126514A1 (ja) | 非アルコール性脂肪肝炎検出方法 | |
US20160209412A1 (en) | Msia-srm assay for biomarker analysis | |
KR101219516B1 (ko) | 암 진단용 펩티드 마커 및 이를 이용한 암 진단방법 | |
EP3819639B1 (en) | Sugar chain specific to prostate cancer, and test method using same | |
JP2013238614A (ja) | 前立腺癌を判定する方法 | |
KR101100809B1 (ko) | 암 진단용 펩티드 마커 및 이를 이용한 암 진단방법 | |
US20160238615A1 (en) | Solid phase extraction of global peptides, glycopeptides, and glycans using chemical immobilization in a pipette tip | |
EP2182360B1 (en) | Cancer evaluation method using haptoglobin beta-chain defined by antibody rm2 | |
US20240272117A1 (en) | Integrated method for urinary prostate specific antigen n-glycosylation profiling by capillary electrophoresis | |
Kosanovic et al. | On chip immuno-affinity profiling of cancer-and benign hyperplasia-associated free prostate specific antigen | |
WO2024172145A1 (ja) | 腎細胞癌検出用バイオマーカー |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
121 | Ep: the epo has been informed by wipo that ep was designated in this application |
Ref document number: 09830449 Country of ref document: EP Kind code of ref document: A1 |
|
WWE | Wipo information: entry into national phase |
Ref document number: 2010541349 Country of ref document: JP |
|
WWE | Wipo information: entry into national phase |
Ref document number: 2009830449 Country of ref document: EP |
|
WWE | Wipo information: entry into national phase |
Ref document number: 13132551 Country of ref document: US |
|
NENP | Non-entry into the national phase |
Ref country code: DE |