JP5431360B2 - 前立腺癌の判定方法 - Google Patents
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Description
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被験者由来の試料中のPSAの糖鎖構造を分析する工程を含み、LacdiNAc(N−アセチルガラクトサミン−N−アセチルグルコサミン)を有する糖鎖(LacdiNAc(+))の量が、LacdiNAcを持たないがLacNAc(ガラクトース−N−アセチルグルコサミン)を有する糖鎖(LacdiNAc(−))の量の30%を超える際に前立腺癌であると判定することを特徴とする前立腺癌の判定方法。
[2]
被験者由来の試料中のPSAの糖鎖構造を分析する工程を含み、LacdiNAc(N−アセチルガラクトサミン−N−アセチルグルコサミン)を有する糖鎖(LacdiNAc(+))の量が、LacdiNAcを持たないがLacNAc(ガラクトース−N−アセチルグルコサミン)を有する糖鎖(LacdiNAc(−))の量の30%を超える際に前立腺癌であると判定し、30%以下である際に良性前立腺肥大症であると判定することを特徴とする[1]に記載の前立腺癌の判定方法。
[3]
上記PSAの糖鎖構造の分析を、上記PSAに対してレクチンを作用させる方法、上記PSAに対して抗体を作用させる方法、高速液体クロマトグラフィー法もしくは質量分析法、またはこれらを組み合わせた分析手段により行うことを特徴とする[1]に記載の前立腺癌の判定方法。
上記PSAの糖鎖構造の分析を、上記PSAに対してレクチンを作用させる方法、上記PSAに対して抗体を作用させる方法、高速液体クロマトグラフィー法もしくは質量分析法、またはこれらを組み合わせた分析手段により行うことを特徴とする[2]に記載の前立腺癌の判定方法。
(1) 被験者由来の試料からPSAを精製する工程と、
(2) 工程(1)で精製したPSAからPSA誘導体を調製する工程と、
(3) 工程(2)で得られたPSA誘導体を標識する工程と、
(4) 工程(3)で得られた標識化PSA誘導体を質量分析法により分析する工程を含み、LacdiNAc(N−アセチルガラクトサミン−N−アセチルグルコサミン)の構造の有無に起因する質量差41で示される一対のシグナルを選定し、LacdiNAcを有する糖鎖(LacdiNAc(+))に由来するシグナル強度が、LacdiNAcを持たないがLacNAc(ガラクトース−N−アセチルグルコサミン)を有する糖鎖(LacdiNAc(−))に由来するシグナル強度の30%を超える際に前立腺癌であると判定することを特徴とする[3]に記載の前立腺癌の判定方法。
(1) 被験者由来の試料からPSAを精製する工程と、
(2) 工程(1)で精製したPSAからPSA誘導体を調製する工程と、
(3) 工程(2)で得られたPSA誘導体を標識する工程と、
(4) 工程(3)で得られた標識化PSA誘導体を質量分析法により分析する工程を含み、LacdiNAc(N−アセチルガラクトサミン−N−アセチルグルコサミン)の構造の有無に起因する質量差41で示される一対のシグナルを選定し、LacdiNAcを有する糖鎖(LacdiNAc(+))に由来するシグナル強度がLacdiNAcを持たないがLacNAc(ガラクトース−N−アセチルグルコサミン)を有する糖鎖(LacdiNAc(−))に由来するシグナル強度の30%を超える際に前立腺癌であると判定し、30%以下である際に良性前立腺肥大症であると判定することを特徴とする[4]に記載の前立腺癌の判定方法。
[7]
上記工程(2)において調製されるPSA誘導体が、PSA由来の糖鎖またはPSA由来の糖ペプチドであることを特徴とする[5]に記載の前立腺癌の判定方法。
[8]
上記工程(2)において調製されるPSA誘導体が、PSA由来の糖鎖またはPSA由来の糖ペプチドであることを特徴とする[6]に記載の前立腺癌の判定方法。
また、本発明において用いられる「被験者由来の試料」は、血液(血清、血漿などを含む)、尿、精液(精漿)などの体液、細胞・組織などを含む。
(1)被験者由来の試料からPSAを精製する工程と、
(2)工程(1)で精製したPSAからPSA誘導体を調製する工程と、
(3)工程(2)で得られたPSA誘導体を標識する工程と、を含み、
(4)工程(3)で得られた標識化PSA誘導体を分析し、標準閾値R(S)を適応した際に、該標識化PSA誘導体中のLacdiNAc(+)糖鎖構造に由来するシグナル強度が、LacdiNAc(−)糖鎖構造に由来するシグナル強度の30%を超える際に前立腺癌であると判定する事を特徴とし、特に30%以下である際に、前立腺癌ではない、または良性前立腺肥大症であると判定する事を特徴とする。
以下、「シグナル強度比百分率R値」を単に「R値」と略記する場合がある。
R値=[S(P2)/S(P1)]×100
(a)工程(1) PSAの単離
最初に血清中の免疫グロブリンの除去を行った。4mLのプロテインAアガロース(PIERCE)をディスポーザブルプラスティックカラム(PIERCE)に充填し、リン酸緩衝生理食塩水(PBS)を用いて平衡化した。プロテインAアガロース充填カラムに対して、BPHと診断された被験者(T−16)の血清およびPBSの混合物を添加し、2倍のカラムボリューム(CV)のPBSにて洗浄した。この担体に結合しないPSAを含む画分を採取し、最終濃度が1MになるようにNa2SO4を加えた。
工程(1)で得られた乾燥ゲルの入ったチューブに対して、10mMのジチオトレイトール(DTT)および25mMの炭酸水素アンモニウムを含む水溶液(pH8.0)を加え、遮光条件下1時間にわたって56℃で振盪して還元反応を行い、チューブ内の溶液を除去した。チューブに対して55mMのヨードアセトアミドを含む水溶液を加えて、遮光条件下45分間にわたって室温で振盪してアルキル化反応を行い、チューブ内の溶液を除去した。還元およびアルキル化を行ったゲルを、25mMの炭酸水素アンモニウム水溶液(pH8.0)、およびアセトニトリルで洗浄し、その後、ゲルを乾燥させた。
MALDI用ターゲットプレートの上に、工程(2)で得られた糖鎖溶液0.5μLを滴下し、風乾させた。次に、ターゲットプレート上に、1−ピレニルジアゾメタン(PDAM、500pmol)のDMSO溶液0.25μLを滴下し、約25分間にわたって40℃に加熱し、乾燥させた。この操作によって、ターゲットプレート上に、PDAMで標識された糖鎖が得られた。
工程(3)で得られた標識糖鎖を担持したターゲットプレートに対して、2,5−ジヒドロキシ安息香酸(DHBA)の50%アセトニトリル溶液(濃度10mg/mL)0.5μLを滴下し、室温において乾燥させた。
BPHと診断され、匿名化され識別コードを付した2名の被験者の血清(実施例1および2)、ならびに、生検によりPCと診断され、匿名化され識別コードを付した2名の被験者の血清(実施例3および4)を用いて、実施例1の手順を繰り返した。なお、手順の実施に際し医療機関の倫理審査の承認を受け、被験者にはインフォームドコンセントを行なった。
表1に示したように、PCと診断された被験者の血清に由来する試料のLacdiNAc(+)/LacdiNAc(−)のシグナル強度比百分率R値は30%(R(S))以上を示し、GalNAc置換糖鎖を多く含有することを見出した。それに対して、BPHと診断された被験者の血清に由来する試料のシグナル強度比百分率R値は30%(R(S))以下であった。すなわち、PCと診断された被験者の血清PSA糖鎖は、BPHと診断された被験者の血清PSAに比較して多くのLacdiNAc構造が存在することが初めて明らとなった。
本実施例は、前述の実施例における糖鎖に代えて糖ペプチドを用いることができることを示す例である。
実施例4に示したPC羅患の被験者(N−18)の血清を対象に糖ペプチド解析を行った。該被験者の血清を用いて、実施例1の工程(1)および工程(2)に記載のDTTによる還元、ヨードアセトアミドによるアルキル化、洗浄および乾燥の工程を実施し、乾燥ゲルを得た。
Chem)の25mM炭酸水素アンモニウム水溶液(pH8.0)を加えて、45分間にわたって氷浴中で静置して、ゲルを膨潤させた。膨潤したゲルを18時間にわたって56℃で軽く攪拌した。ゲルに対して、抽出液「70〜80%アセトニトリルおよび0.1%トリフルオロ酢酸を含有する水溶液」を加えて20分間にわたって振盪し、溶液を回収した。
実施例7は、実施例1の工程(1)に記載のPSAの単離、および工程(2)に記載のDTTによる還元、ヨードアセトアミドによるアルキル化の工程を実施する事なしに患者血清の分析を行った例である。
生検によりPCと診断され、識別コードを付した5名の被験者の血清(実施例8〜12)、を用いて、実施例7の手順を繰り返した。なお、手順の実施に際し医療機関の倫理審査の承認を受け、被験者にはインフォームドコンセントを行なった。
Claims (8)
- 被験者由来の試料中のPSAの糖鎖構造を分析する工程を含み、LacdiNAc(N−アセチルガラクトサミン−N−アセチルグルコサミン)を有する糖鎖(LacdiNAc(+))の量が、LacdiNAcを持たないがLacNAc(ガラクトース−N−アセチルグルコサミン)を有する糖鎖(LacdiNAc(−))の量の30%を超える際に前立腺癌であると判定することを特徴とする前立腺癌を判定するためのデータを提供する方法。
- 被験者由来の試料中のPSAの糖鎖構造を分析する工程を含み、LacdiNAc(N−アセチルガラクトサミン−N−アセチルグルコサミン)を有する糖鎖(LacdiNAc(+))の量が、LacdiNAcを持たないがLacNAc(ガラクトース−N−アセチルグルコサミン)を有する糖鎖(LacdiNAc(−))の量の30%を超える際に前立腺癌であると判定し、30%以下である際に良性前立腺肥大症であると判定することを特徴とする請求項1に記載の前立腺癌を判定するためのデータを提供する方法。
- 上記PSAの糖鎖構造の分析を、上記PSAに対してレクチンを作用させる方法、上記PSAに対して抗体を作用させる方法、高速液体クロマトグラフィー法もしくは質量分析法、またはこれらを組み合わせた分析手段により行うことを特徴とする請求項1に記載の前立腺癌を判定するためのデータを提供する方法。
- 上記PSAの糖鎖構造の分析を、上記PSAに対してレクチンを作用させる方法、上記PSAに対して抗体を作用させる方法、高速液体クロマトグラフィー法もしくは質量分析法、またはこれらを組み合わせた分析手段により行うことを特徴とする請求項2に記載の前立腺癌を判定するためのデータを提供する方法。
- (1) 被験者由来の試料からPSAを精製する工程と、
(2) 工程(1)で精製したPSAからPSA誘導体を調製する工程と、
(3) 工程(2)で得られたPSA誘導体を標識する工程と、
(4) 工程(3)で得られた標識化PSA誘導体を質量分析法により分析する工程を含み、LacdiNAcの構造の有無に起因する質量差41で示される一対のシグナルを選定し、LacdiNAcを有する糖鎖(LacdiNAc(+))に由来するシグナルの強度が、LacdiNAcを持たないがLacNAcを有する糖鎖(LacdiNAc(−))に由来するシグナルの強度の30%を超える際に前立腺癌であると判定することを特徴とする請求項3に記載の前立腺癌を判定するためのデータを提供する方法。 - (1) 被験者由来の試料からPSAを精製する工程と、
(2) 工程(1)で精製したPSAからPSA誘導体を調製する工程と、
(3) 工程(2)で得られたPSA誘導体を標識する工程と、
(4) 工程(3)で得られた標識化PSA誘導体を質量分析法により分析する工程を含み、LacdiNAcの構造の有無に起因する質量差41で示される一対のシグナルを選定し、LacdiNAcを有する糖鎖(LacdiNAc(+))に由来するシグナルの強度がLacdiNAcを持たないがLacNAcを有する糖鎖(LacdiNAc(−))に由来するシグナルの強度の30%を超える際に前立腺癌であると判定し、30%以下である際に良性前立腺肥大症であると判定することを特徴とする請求項4に記載の前立腺癌を判定するためのデータを提供する方法。 - 上記工程(2)において調製されるPSA誘導体が、PSA由来の糖鎖またはPSA由来の糖ペプチドであることを特徴とする請求項5に記載の前立腺癌を判定するためのデータを提供する方法。
- 上記工程(2)において調製されるPSA誘導体が、PSA由来の糖鎖またはPSA由来の糖ペプチドであることを特徴とする請求項6に記載の前立腺癌を判定するためのデータを提供する方法。
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