WO2008029619A1 - Oligonucléotide antisens ena ayant une action spécifique de la séquence - Google Patents

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Makoto Koizumi
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Definitions

  • the present invention relates to a chimeric molecule of an RNA-type modified oligonucleotide having a sequence-specific action and a DNA oligonucleotide, a composition comprising the same, and a method for suppressing the expression of a target RNA using the same.
  • Non-patent Document 1 RNA-type modified oligonucleotide having an N-type conformation such as 2′-OMe RNA has a high binding force to an RNA having a complementary sequence.
  • the double strand formed between the RNA-modified oligonucleotide and mRNA does not serve as a substrate for RNase H, which cleaves DNA / RNA double-stranded RNA, so RNA-modified oligonucleotide suppresses mRNA expression. It is difficult to use as an antisense method. Therefore, a method of activating RNase H using an RNA-type modified oligonucleotide and a DNA oligonucleotide as a chimeric molecule is used.
  • Such a chimeric oligonucleotide is called “gapmer”, and DNA is arranged in the central part called “window” of the chimeric oligonucleotide, and RNA-type modified oligonucleotides are arranged at both ends called “win g”.
  • 2'-OMe RNA is used as the RNA-type modified oligonucleotide, such gapmers arranged in wing / window / wing are expressed as 2, -OMe RNA / DNA / 2'-OMe RNA.
  • the DNA oligonucleotide in the window part requires at least 4 residues, and E.
  • coli-derived RNase H requires at least 5 residues [Patent Document 2].
  • the RNase H reaction proceeds efficiently, whereas when the length of the RNA-type modified oligonucleotide in the wing portion is long, the affinity with the target mRNA is improved. To do.
  • an appropriate balance between the window and wing parts is required. window part It is known that a DNA oligonucleotide of this type can be made highly active as an antisense molecule by lengthening it by 10 or more residues! /, [Patent Document 1].
  • RNA-type oligonucleotide ENA (2'-0,4'-C-ethylene-bridged nucleic acids) in which 2, -oxygen atoms and 4-carbon atoms of the sugar moiety are bridged with ethylene chains is complementary. It exhibits high affinity for strand nucleic acids and, in addition, has excellent nuclease stability [Non-Patent Document 3, Patent Document 2].
  • ENA antisense oligonucleotides against vascular endothelial growth factor and organic anion transporter have been reported to show intracellular antisense activity [Patent Document 4].
  • One problem with the antisense method is that the antisense oligonucleotide binds to non-target RNA, and the double strand of the antisense oligonucleotide / non-target RNA is recognized by RNase H, resulting in non-target RNA. May be cut off. It is known that chimeric oligonucleotides of DNA oligonucleotides and DNA methylphosphonates can avoid such non-specific cleavage S [Non-patent Documents 5 and 6]. In addition, it has been reported that a gapmer between 2'-OMe RNA and DNA oligonucleotide cannot avoid non-specific cleavage, or its effect is only partially!
  • Non-Patent Documents 7, 8 The method shown in Non-Patent Document 1 that lengthens the DNA oligonucleotide in the window part by 10 residues or more is likely to cause non-specific cleavage.
  • Patent Document 3 and Non-Patent Document 9 a gapmer between a 2′-oxygen atom in the sugar moiety and a 4,4-BNA / LNA in which a carbon atom is bridged with a methylene chain and a DNA oligonucleotide is designed. /! Describe! /, The effect of the force gapmer! /, Said! /, Only the ruin, and the specificity of the cleavage reaction! / / ,!
  • Patent Document 1 International Publication No. WO2006034348 Pamphlet
  • Patent Document 2 Patent No. 3420984 Specification
  • Patent Document 3 US Patent Application Publication No. 2006128646
  • Non-patent literature l Kurreck, J. (2003) Eur. J. Biochem. 270, 1628-1644
  • Non-Patent Document 2 Lima, W.F., Crooke, S.T. (1997) Biochemistry 36, 390-398
  • Non-Patent Document 3 Morita, ⁇ ⁇ , Hasegawa, C., aneko, M., Tsutsumi, S., Sone, J., Ishikaw a, ⁇ ⁇ , Imanishi, ⁇ ⁇ , Koizumi, M. (2002) Bioorg. Med. Chem. Lett. 12, 73-76.
  • Non-Patent Document 4 Koizumi, M. (2006) Curr. Opin. Mol. Ther. 8, 144-149.
  • Non-patent literature 5 Giles, RV and Tidd, DM (1992) Nucleic Acids Res. 20, 763-770.
  • Non-patent literature 6 Larrouy, BL Blonski, C, Boiziau, C, Stuer, M., Moreeau, S. , Shire D., Toulme, J.-J. (1992) Gene 121, 189-194 ⁇
  • Non-Patent Document 7 Larrouy, ⁇ ⁇ , Boiziau, C, Sproat, ⁇ ⁇ , Toulme, J.-J. (1995) Nucleic Acids Res. 23, 3434-3440 ⁇
  • Non-Patent Document 8 Shen, L.X., andimalla, E.R., Agrawal, S. (1998) Bioorg Med Chem. 6, 1695-1705.
  • Non-Patent Document 9 Frieden M, Christensen SM, Mikkelsen ND, Rosenbohm C, Thrue CA, Westergaard M, Hansen HF, Orum H, Koch T. (2003) Nucleic Acids Res. 31, 636 5-6372.
  • the antisense oligonucleotide binds to non-target RNA as well as target RNA alone, and the double strand of the antisense oligonucleotide / non-target RNA is recognized by RNase H and the non-target RNA is cleaved.
  • Antisense oligonucleotides were expected with high specificity to overcome such problems! Means for solving the problem
  • the present inventors have found a gapmer composed of an ENA oligonucleotide and a DNA oligonucleotide, in which the DNA oligonucleotide portion serving as a window is shortened.
  • the present inventors have found that the target sequence can be specifically cleaved and completed the present invention.
  • the gist of the present invention is as follows.
  • Window is a deoxyribonucleotide sequence having 5 or 6 nucleotides, R 11 and R 12 are each independently ribonucleotides,
  • Wing 1 and Wing 2 are independently ribonucleotides, ribonucleotide sequences, If it is a mixed sequence with a nucleotide, but if it is a mixed sequence with a nucleotide, then it is not a sequence that contains four or more deoxyribonucleotides in that sequence. No more than 4 consecutive deoxyribonucleotides
  • the sugar moieties 2, -0 and 4, -C are bridged by a C alkylene chain.
  • RNA has the nucleotide sequence of Gene Bank accession No. ⁇ _011061 ⁇ 1 or NM_012387
  • composition comprising the antisense oligonucleotide according to (1) or (2) or a pharmacologically acceptable salt thereof.
  • antisense oligonucleotide refers to an oligonucleotide that can regulate (for example, suppress or enhance) the expression of a specific target gene, and target RNA (sense strand). ) Having a complementary sequence.
  • the antisense oligonucleotide and the pharmacologically acceptable salt thereof of the present invention have a sequence-specific cleavage action on the target RNA, it is possible to specifically suppress the expression of the target RNA, for example, It is effective for the prevention and / or treatment of diseases involving target RNA.
  • FIG. 1 shows the mechanism of action of antisense oligonucleotides.
  • FIG. 2 Shows the structure of DNA, RNA, and PS ODN and the N and S conformations.
  • FIG. 3 shows the structure of an RNA-type modified nucleotide used in the antisense method.
  • FIG. 4 shows an antisense design using RNA-modified nucleotides.
  • FIG. 5 shows the results of gel electrophoresis of RNase H reaction on the oligonucleotide and PADI4 cRNA duplex.
  • FIG. 6 shows the results of gel electrophoresis of RNase H reaction on the oligonucleotide and PADI4 cRNA duplex.
  • FIG. 7 shows the results of suppression of mouse PADI4 mRNA expression by oligonucleotides.
  • Antisense methods using synthetic oligonucleotides target diseases such as cancer and viruses. It has also been applied to the evaluation of target genes in drug development that is not just considered to be used as a medicinal product (J. Kurreck, Eur. J. Biochem., 270, 1628 (20 03)). RS Geary, SP Henry, R Grillone., Clin. Pharmacokinet., 41, 255 (2002) .; P. Kennewell, Curr. Opin. Mol. Ther., 5, 76 (2003).). The mechanism of action of oligonucleotides used in the antisense method is based on the basic concept of binding to and acting on RNA in the living body, as shown in Fig. 1.
  • RNase H is a double strand formed by antisense oligonucleotide and mRNA. It is known that RNase H degrades mRNA and inhibits the function of mRNA (J. Kurreck, Eur. J. Biochem., 270, 1628 (2003)). Of these three, the most commonly used is the use of the action of RNase H in (3). In this case, however, when a DNA having a natural phosphodiester bond is used, it is rapidly degraded by the action of nuclease in vivo.
  • an oligonucleotide having a DNA type and having a phosphate group modified is used.
  • phosphorothioate-type modified oligonucleotides (3: PS 0 DN) are nuclease resistant, and are most commonly used because they form a substrate for RNase H when they form a double strand with RNA and have some degree of cell permeability.
  • PS ODN has a lower binding ability to RNA compared to natural DNA. Defects such as protein binding, inhibition of blood clotting system and complement system activity have been reported in in vivo adaptation. A number of artificial nucleic acids designed using RNA backbones have been reported as antisense oligonucleotides that overcome the disadvantages of PS ODN (J. Kurreck, Eur. J. Biochem., 270, 1628 ( 2003); SM F reier,. H. Altmann, Nucleic Acids Res., 25, 4429 (1997)).
  • the furanose ring of the sugar that constitutes nucleic acids is known to form two puckering modes, N-type conformation and S-type conformation (W. Saenger, Principles of nuclei c acids structure, Springer—Verlag, New York.
  • N-type conformation and S-type conformation W. Saenger, Principles of nuclei c acids structure, Springer—Verlag, New York.
  • Those with a hydroxyl group at the 2'-position of ribose that constitutes a nucleoside with an RNA backbone are N-type conformations of the ribose furanose ring due to the Gauche effect of the 2'-OH oxygen atom and the 4'-position oxygen atom. It is known that the percentage of conformation is increasing.
  • Nucleosides with a DNA skeleton have a hydrogen atom at the 2 'position of ribose, so the Gauche effect seen in the RNA skeleton is not observed and the S-type conformation is given
  • nucleosides also exist in the N-type conformation in the A-type helix formed by natural double-stranded RNA.
  • Tm melting temperature
  • RNA backbone that favors the N-type conformation.
  • RNA skeleton resistant to RNase It is not practical to use natural RNA as an antisense oligonucleotide in cell experiments as it is because it is highly sensitive to RNases present in serum and cells used for cell culture. Therefore, derivatization based on RNA skeleton resistant to RNase has been made.
  • RNA Since the 2'-OH group of RNA is essential for the degradation reaction of RNase, many derivatives of this 2'-OH group are alkylated to become 2'-0-alkyl nucleosides (4) that do not become RNase substrates. Have been reported ( Figure 3). Among them, 2'-0-methyl is a modification found in tRNA and has been used and studied well since the early days of antisense research (H. Inoue, Y. Hayase, A • Imura, S. Iwai,. Miura, E. Ohtsuka. Nucleic Acids Res. 15, 6131 (1987)). In addition, the 2'-O-methyl compound can also improve the affinity with complementary RNA ( ⁇ Tm / mod.
  • Nucleosides with alkyl groups with 5 or more carbon atoms have acquired high resistance to nucleases (EA LesniK, SH. J. uinosso, AM Kawasaki, H. 3 ⁇ 4asmor, M. Zounes, LL). Ummins, D. and Ecker, P. Dan Cook, SM Freier, Biochemistry 32, 7832 (1993) .; BP Monia, E. A. Lesnik, C. Gonzalez, WF Lima, D. Mc ee, CJ Guinosso, AM Kawasaki, P. Dan Cook, SM Freier, J. Biol. Chem. 268, 14514 (1993) .; BP Monia, J.. Jo hnson, H.
  • nucleoside (5: 2, -MOE) having a 2'-0_ (2-methoxyethyl) group, which has a substituent at the end of the alkyl group, has an affinity for RNA due to the Gauche effect of the methoxyethyl group.
  • a Tm / mod. + 2 ° C
  • nuclease resistance P. Martin, Helv. Chim. Acta 78, 486 (1995) .
  • M. Teplova G. Minasov, V. Tereshko, GB Inamati, P. Danook, M. Manoharan, M.
  • oligonucleotides containing 2 ', 4, -BNA / LNA can be obtained at A Tm / mod. Show tremendous duplex stability.
  • oligonucleotides containing 2,4, -BNA / LNA have improved stability against nucleases compared to DNA.
  • ENA (9: 2'-0,4'-C-ethylene-bridged nuclei c acids) in which the methylene chain of 2 ', 4'-BNA / LNA is bridged with an ethylene chain extended by one carbon is 2, 4, ⁇ Tm / mod ⁇ + 5, which is the same level as -BNA / LNA. It has C and, in addition, has better stability against nucleases than 2, 4, _BNA / LNA ( ⁇ ⁇ Morita, C. Hasegaw a,. Aneko, S. fsutsumi, J. Sone, ⁇ . IshiKawa, ⁇ . Imanishi, M. Koizumi, Bioorg. Med. Chem.
  • RNA-type modified antisense oligonucleotide forms a stable double strand with the target RNA.
  • Oligonucleotides consisting of RNA-modified nucleotides, folly modified oligonucleotidesj (hereinafter abbreviated as “FMO”), have an extremely strong binding force to mRNA, and as shown in Fig. 1, (1) Inhibition of the translational process in which the protein is synthesized (2) It is very useful for the purpose of inhibiting the splicing process that mRNA is generated from the mRNA precursor.
  • the double strand of FMO and target RNA does not become a substrate for RNase H (H. Inoue, Y. Hayase, S.
  • a chimeric oligonucleotide composed of an RNA-type modified nucleoside and DNA is used in the antisense method.
  • the design includes a “gapmer” that has RNA-modified nucleotides called wings on both sides of the oligonucleotide and a continuous DNA called window in the middle.
  • the gapmer has a wing-window-wing structure.
  • 2,0-methyl nucleoside (2, -OMe RNA)
  • the column is a chimeric oligonucleotide such as 2, -OMe RNA-DNA-2'-OMe RNA. Since gapmer has a continuous DNA region in the central part, the double strand of gapmer and target RNA becomes a substrate of RNase H. The length of the DNA in this window varies depending on the RNase H used.
  • 4 nucleotides or more ⁇ ⁇ Wu, W • F. Lima, ST Crooke, J Biol. Chem.
  • E. coli RNase H requires 5 nucleotides or more (WF Lima, ST Crooke, Biochemistry 36, 390 (1997)). The longer the DNA region of the window part, the easier it becomes a substrate for RNase H.
  • the modified nucleotide in the wing part is intended to increase the affinity with the target RNA, and the longer the length, the higher the affinity with the target RNA. In terms of activity as an antisense, it is necessary to balance the length of window and wing, and the good one can be highly active (EA Lesnik, CJ Guinosso, AM Kawasaki, H. Sasmor, M. Zounes, LL Cummins, DL J ⁇ cker, P.
  • 2'-OMe RNA has been reported to be an example of the functional analysis of the PTEN gene using the gapmer, which has been used in antisense research for a long time, as described above! (M. Sternberger, A. Schmiedeknecht. A. retscnmer.. Ebhardt. Leenders. P. Czauderna. I. vo n Carlowitz, M. Engle,. Giese, L. Beigelman, A. lippel, Antisense Nucleic Acids Drug Dev. 12, 131 (2002)).
  • 2'-OMe consisting of 7 nucleotides in both wing parts
  • RNA is used, the window portion uses PS ODN consisting of 9 nucleotides, and antisense consisting of 23 nucleotides in length. Furthermore, in order to increase the stability against exonuclease, tetrahydrofuran derivatives are attached to both 3 ′ and 5 ′ ends.
  • the 2'-MOE form consisting of phosphodiester bonds is rapidly excreted by urinary force, whereas the 2'-MOE form composed of phosphorothioate bonds exhibits high blood stability. It has the ability to migrate to most tissues other than the brain, such as the liver, kidneys, viscera, and bone marrow. The distribution is better than PS ODN.
  • 2'-MOE consisting of phosphorothioate linkages has been clinically developed as an antisense drug for anti-tumor, anti-inflammatory and anti-diabetic purposes.
  • 2,4,-BNA / LNA is used for wing as well as 2, -MOE, and antisense as a gapmer is designed.
  • Antisense containing 2,4, -BNA / LNA targeting rat delta opioid receptor mRNA was designed, and suppression of pain response via opioid receptor was observed by injection into rat cerebrospinal fluid.
  • the present invention provides an antisense oligonucleotide having the following sequence (I) or a pharmacologically acceptable salt thereof.
  • Window is a deoxyribonucleotide sequence having 5 or 6 nucleotides
  • R 11 and R 12 are each independently ribonucleotides
  • Wing 1 and Wing 2 are each independently a mixed sequence of ribonucleotides, ribonucleotide sequences, and devonucleotides. If it is a mixed sequence with 4 or more nucleotides in a sequence, no more than 4 consecutive deoxyribonucleotides in that sequence
  • Wing 1 - at least one ribonucleotide and R 12 constitute a sequence of R U - at least one ribonucleotide constituting an array of Wing 2, respectively, 2 '-0 and 4' -C in the sugar moiety Is bridged with a C alkylene chain.
  • the number of bases of the antisense oligonucleotide of the present invention is not particularly limited, and 8 to 25 1S is appropriate, 10 to 20 force S is preferable, and 12 to 20 is more preferable.
  • the number of nucleotides in Wing 1 and the number of nucleotides in Wing 2 are each independently preferably 0 to 18, more preferably 2 to 13, and more preferably 4 to 13 I like it.
  • At least one ribonucleotide constituting the sequence of Wing 1 — R 11 and at least one ribonucleotide constituting the sequence of R 12 — Wing 2 are each 2 ′ ⁇ of the sugar moiety. 0 and 4'-C are bridged by a C alkylene chain. Besides that, the array (I) is composed.
  • ribonucleotides and deoxyribonucleotides may be modified with sugars, bases, phosphodiester bonds, and terminal phosphates.
  • sugar modifications include 2'-0-alkylation, 2, -0-alkenylation or 2, -0-alkynylation of D-ribofuranose (eg, 2'-0-methylation, 2 ' -0-aminoethylation, 2'-0-propylation, 2'-0-arylation, 2'-0-methoxyethylation, 2'-0-butylation, 2'-0-pentylation, 2'- 0-propargylation), 2'-0,4'-C-alkyleneation of D-ribofuranose (eg 2'-0,4'-C-ethylenation, 2'-0,4'-C- Methyleneation, 2'-0,4'-C-propylene, 2'-0,4'-C-tetramethylene), 3'-deoxy-3'-amino-2
  • Examples of base modifications include cytosine 5-methylation, 5-fluorination, 5-bromination, 5-iodination, N4-methylation, thymidine 5-demethylation (uracil), 5-fluorination , 5-bromination, 5-iodination, N6-methylation of adenine, 8-bromination, N2-methylation of guanine, 8-bromination and the like.
  • Examples of the modification of the phosphodiester bond include phosphorothioate bond, methylphosphonate bond, methylthiophosphonate bond, phosphorodithioate bond, phosphoroamidate bond, and the like.
  • Examples of the modification of the terminal phosphoric acid include esterification of the terminal phosphoric acid.
  • R 1 and R 2 are the same or different and each represents a hydrogen atom, a hydroxyl-protecting group, a phosphate group, a protected phosphate group or —P (R 3 ) R 4 [wherein R 3 and R 4 are the same or different and are a hydroxyl group, a protected hydroxyl group, a mercapto group, a protected mercapto group, an amino group, an alkoxy group having 1 to 4 carbon atoms, or an alkylthio group having 1 to 4 carbon atoms.
  • A represents an alkylene group having 1 to 4 carbon atoms, and
  • B Is a substituted purine 9-yl group or substituted 2-oxo group having a substituent selected from a purine-9-yl group, 2-oxo1,2-dihydropyrimidine-1-yl, a group or the following ⁇ group:
  • 1, 2 represents a dihydropyrimidine 1-yl group.
  • Hydroxyl group protected hydroxyl group, alkoxy group having 1 to 4 carbon atoms, mercapto group, protected mercapto group, alkylthio group having 1 to 4 carbon atoms, amino group, protected amino group An amino group substituted with an alkyl group having 1 to 4 carbon atoms, an alkyl group having 1 to 4 carbon atoms, and a halogen atom.
  • examples of the “alkylene group having 1 to 4 carbon atoms” of A include methylene, ethylene, trimethylene, and tetramethylene groups, and a methylene group is preferable.
  • the “hydroxyl-protecting group” for R 1 and R 2 and the “protective hydroxyl group-protecting group” for R 3 and R 4 or ⁇ are hydrogenolysis, hydrolysis, This refers to a protecting group that can be cleaved by chemical methods such as electrolysis and photolysis or biological methods such as hydrolysis in the human body. Examples of such protecting groups include formyl, acetyl, propionic acid.
  • Halogeno lower alkylcarbonyl groups such as chloroacetyleno, dichloroacetyleno, trichloroacetyleno, trifunoleoloacetylinole, lower alkoxy lower alkylcarbonyl groups such as methoxyacetyl, ( ⁇ ) — 2-methyl-2— “Aliphatic acyl groups” such as unsaturated alkylcarbonyl groups such as butenoyl; arylocarbonyl groups such as benzoyl, ⁇ -naphthoyl, / 3-naphthoyl, halogenoaryls such as 2 bromobenzoyl, 4 benzoyl Carbonyl group, 2, 4, 6-trimethylbenzoyl, lower alkylated aryl carbonyl group such as 4 toluoyl, lower alkoxylated aryl carbonyl group such as 4-anisoyl, 2 carboxybenzoyl, 3 carboxybenz
  • Aralkyloxycarbonyl group can be mentioned, and “hydroxyl protecting group of R 1 and R 2 ” "Is preferably an" aliphatic acyl group "," aromatic acyl group ",” methyl group substituted with 1 to 3 aryl groups "," lower alkyl, lower alkoxy, halogen, cyano group ".
  • a methyl group substituted with 1 to 3 aryl groups in which the aryl ring is substituted with a silyl group and more preferably a acetyl group, a benzoyl group, a benzyl group, p-methoyl group.
  • Shibenzoiru group, dimethoxytrityl group, a Monometo Kishitorichiru group or tert- butyl diphenyl silyl group, in the "protected hydroxy groups" in R 3 and R 4 or ⁇ group is preferably "fatty Ashinore group” Or an “aromatic asinole group”, more preferably a benzoyl group.
  • the protecting group of “protected phosphate group” of R 1 and R 2 is a chemical method such as hydrogenolysis, hydrolysis, electrolysis and photolysis, or in the human body.
  • Examples of such a protective group include methyl, ethyl, ⁇ propyl, isopropyl, ⁇ butyl, isobutyl, s butynole, tert butyl, n pentyl, isopentyl, 2-methylbutyl, neopentyl, 1-ethylpropyl, n hexyl, isohexyl, 4-methylpentyl, 3-methylpentylol, 2 methylpentyl, 1-methylpentyl, 3, 3 dimethylbutyl, 2, 2 dimethylolenebutyl, “Lower alkyls” such as 1,1-dimethylbutyl, 1,2-dimethylbutyl, 1,3-dimethylbutyl, 2,3 dimethylbutyl, and 2-ethylbutyl Group ”;“ cyanated lower alkyl groups ”such as 2-cyanoethyl, 2-cyanol 1,1-dimethylethyl; 2-
  • Lower alkyl group “ aralkyl group ”or“ aralkyl group in which the aryl ring is substituted with a nitro group or a halogen atom ”, more preferably a 2-cyanoethyl group, a 2,2,2-trichlorodiethyl group. Or it is a benzyl group.
  • R 3 and R 4 or ⁇ group “alkoxy group having 1 to 4 carbon atoms” includes, for example, methoxy, ethoxy, ⁇ propoxy, isopropoxy, ⁇ butoxy, isobut Xy, s-butoxy or tert-butoxy can be mentioned, preferably a methoxy or ethoxy group.
  • examples of the protecting group for the “protected mercapto group” of the R 3 and R 4 or ⁇ groups include methylthio, ethylthio, t tert butylthio as well as those mentioned as the protecting group for the above hydroxyl group.
  • a “disulfide-forming group” such as an alkylthio group such as benzylthio, and the like, preferably an “aliphatic acyl group” or an “aromatic acyl group”, and more preferably Is a benzoyl group.
  • the “alkylthio group having 1 to 4 carbon atoms” of R 3 and R 4 or ⁇ group includes, for example, methylthio, ethylthio, propylthio, isopropylthio, butylthio, Examples thereof include isobutylthio, sbutylthio and tertbutylthio, and a methylthio or ethylthio group is preferable.
  • examples of the protecting group for R 3 and R 4 or the “protected amino group” of the ⁇ group include honoreminole, acetyl, propionyl, butyryl, isobutyryl, pentanoyl, pivalol, Valeryl, isovaleryl, otatanol, nonanoylol, decanol, 3-methinolenolyl, 8-methylnonanoyl, 3-ethyloxytanoyl, 3,7-dimethyloctanoyl, undecanol, dodecanol, tridecanol, tetradecanol, tetradecanol, tetradecanol, tetradecanol, tetradecanol 1-methylpentadecanol, 14-methylpentadecanol, 13, 1 3-dimethyltetradecanol, heptadecanol, 15 methylhexadecanol, ota
  • Aliphatic acyl group such as benzoyl, ⁇ -naphthoyl, ⁇ -naphthoyl, 2-bromobenzoyl, halogenoarylcarbonyl group such as 4-chlorobenzoyl, 2, 4, 6-trimethylenolbenzol, 4 Lower alkylated aryl carbonyl groups such as Toluoyl, Lower alkoxylated aryl carbonyl groups such as 4-A 2-syl, 2-Carboxybenzoyl, 3-Carboxybenzoyl, 4 Carboxybenzoyl Carboxylated aryl carbonyl group, 4-12 trobenzoyl, 2 2 Nitrilated aryl group such as lobenzoyl; lower alkoxyl group such as 2- (methoxycarbonyl) benzoyl, arylenorecaninol group such as 4-phenylbenzoyl, arylated aryl group such as 4-phen
  • examples of the “amino group substituted with an alkyl group having 1 to 4 carbon atoms” of R 3 and R 4 or ⁇ group include, for example, methinoreamino, ethenoreamino, propylamino, isopropylamino, butylamino, And isobutylamino, s-butylamino, tert-butylamino, dimethylamino, jetylamino, dipropylamino, diisopropylamino, dibutylamino, diisobutylamino, di (sbutyl) amino, and di (tertbutyl) amino.
  • the "number 1 to 5 substituents Shianoarukokishi group atoms" of R 3 and R 4, on SL to "number of 1-4 alkoxy group having a carbon” is Shiano group
  • Shiano group For example, cyanomethoxy, 2-cianoethoxy, 3-cyanpropoxy, 4-cyanoboxy, 3-cyano-2-methylpropoxy, or 1-cyanomethyl-1,1-dimethylmethoxy can be used.
  • examples of the “alkyl group having 1 to 4 carbon atoms” of the ⁇ group include methylol, ethyl, propyl, isopropyl, butyl, isobutyl, sbutyl, and tertbutyl. Preferably, it is a methyl or ethyl group.
  • examples of the “halogen atom” in the ⁇ group include a fluorine atom, a chlorine atom, a bromine atom or an iodine atom, and preferably a fluorine atom or a chlorine atom. .
  • suitable groups are 6-aminopurine-9-yl (ie, adenylyl), amino 6-aminopurine 9-yl with protected groups, 2, 6 diaminopurine 9-yl, 2 amino-1 6-chloropurine 9-yl, amino-protected 2 amino-6 black purine 9-yl, 2 Amino-6 fluoropurine 9 yl, amino-protected 2 amino-6 fluor-purine 9 yl, 2 amino-6 bromopurine 9 yl, amino-protected 2 —amino 1 6 bromopurine 9 9-yl, 2-amino-6-hydroxypurine-9-yl (ie, guaninyl), amino-protected 2-amino-6-hydroxypurine-9-yl, amino- and hydroxy-protected 2-amino-6-hydroxypropyl
  • the basic group is 2 1 4-amino 1, 2 dihydropyrimidine 1-yl (ie, cytosyl), 2-oxo 4 amino protected 1, 2-dihydropyrimidine 1-inore, 2 4-amino 4-amino 1 Fluoro 1, 2 Dihydropyrimidine 1-yl, protected amino group 2 oxo 4 Amino 1 5 Fluoro 1, 2 Dihydropyrimidine 1 1-yl, 4-amino 2 oxo 5 2-dihydropyrimidine 1-inore, 2-oxo 4-methoxy-1-, 2-dihydropyrimidine 1-yl, 2-oxo 4-mercapto 1, 2-dihydropyrimidine 1-1ino, 2-oxo 4-hydroxy 1, 2 —Dihydropyrimidine 1 —yl (ie, uracilyl), 2 oxo 4 hydroxy-1 5 methinole 1, 2 dihydropyrimidine 1-yl (ie thyminyl) or 4-amino- 5-methyl-2-ox
  • the antisense oligonucleotide of the present invention is an oligonucleotide analogue.
  • Nucleoside analog refers to a non-natural type of “nucleoside” in which a purine or pyrimidine base is bound to a sugar.
  • “Oligonucleotide analog” refers to a non-natural derivative of an “oligonucleotide” in which 2 to 50 identical or different “nucleosides” are linked by a phosphate ester bond, and such analogs include Preferably, a sugar derivative having a modified sugar moiety; a phosphodiester, a thioate derivative in which the linking moiety is thioated; an ester form in which the terminal phosphate moiety is esterified; an amino group on the purine base is amidated More preferred examples include saccharide derivatives in which the sugar moiety is modified and thioate derivatives in which the phosphodiester bond moiety is thioated.
  • the "pharmacologically acceptable salt thereof” refers to a salt thereof, since the antisense oligonucleotide of the present invention can be converted into a salt, and such a salt is preferably a sodium salt.
  • Alkali metal salts such as potassium salts and lithium salts, alkaline earth metal salts such as calcium salts and magnesium salts, metal salts such as aluminum salts, iron salts, zinc salts, copper salts, nickel salts and cobalt salts;
  • Inorganic salts such as salt, toctylamine salt, dibenzylamine Salt, morpholine salt, darcosamine salt, phenyldaricin alkyl ester salt, ethylene diamine salt, N-methyl darcamamine salt, guanidine salt, jetylamine salt, triethylamine salt, dicyclohexylamine salt, N, N'-dibenzylethylenedi Amine salts, black-and-white pro-in salts, pro-in salts, di
  • R 1 is a hydrogen atom, an aliphatic acyl group, an aromatic acyl group, a methyl group substituted with 1 to 3 aryl groups
  • (2) is a hydrogen atom, acetyl Group, benzoyl group, benzyl group, p methoxybenzyl group, dimethoxytrityl group, monomethoxytrityl group or tert-butyldiphenylsilyl group
  • R 2 is a hydrogen atom, aliphatic acyl group, aromatic Substituted with 1 to 3 aryl groups substituted with 1 to 3 aryl groups, methyl groups substituted with 1 to 3 aryl groups, lower alkyl,
  • a phosphonyl group or a compound that is a 2-chlorophenyl or 4-chlorophenyl phosphate group, (5) a compound that is A force S, a methylene group, (6) a B force 6-aminopurine 9-yl (ie, , Adenynyl), protected amino group 6 aminopurine 9 yl, 2, 6 di Amino-purine 9-inore, 2-amino-6-purine 9-yl, amino-protected 2-amino-6-chloro-purine 9-inore, 2-amino-6 funoleo-purine 9-inore, amino-protected 2-amino-6 fluoropurine-9yl, 2-amino-6bromopurine-9yl, amino-protected 2-amino-6bromopurine-9yl, 2-amino-6-hydroxypurine-9yl (ie, guaninyl), amino groups Protected 2-amino-6-hydroxy
  • R 1 Is arbitrarily selected from (1) to (2)
  • R 2 is arbitrarily selected from (3) to (4)
  • A is arbitrarily selected from (5)
  • B is selected from (6) to (7)
  • a compound obtained by arbitrarily selecting a force and combining them arbitrarily is also preferable, and a compound selected from the following group is particularly preferable.
  • Me represents a methyl group
  • Bn represents a benzyl group
  • Bz represents a benzoyl group
  • PMB represents a p-methoxybenzyl group
  • Tr represents a triphenylmethyl group.
  • MMTr represents a 4-methoxytriphenylmethyl (monomethoxytrityl) group
  • DMTr represents a 4,4'-dimethoxytriphenylmethyl (dimethoxytritinore) group
  • TMT r represents 4,4 ' , 4 ′ ′-trimethoxytriphenylmethyl (trimethoxytrityl) group
  • TMS represents trimethylsilyl group
  • TBDMS represents tert-butyldimethylsilyl group
  • TBDPS represents tert-butyldiphenylsilyl group
  • TIPS represents a triisopropinolesilyl group.
  • the preferred compounds are (1-5), (1-7), (123), (124), (131), (135), (139), ( 1-43), (1-49), (1 51), (1 67), (1 68), (1-75), (1--79), (1--83), (1--87), (1-93), (1-95), (1 111), (1
  • the compound of the general formula (1) can be produced by the method described in JP-A-2000-297097.
  • the antisense oligonucleotide of the present invention and pharmacologically acceptable salts thereof can also exist as solvates (preferably hydrates), and such solvates are also disclosed in the present invention. Is included.
  • RNA targeted by the antisense oligonucleotide of the present invention or a pharmacologically acceptable salt thereof is not particularly limited, and may be, for example, RNA of a gene involved in a disease.
  • the following can be illustrated as a disease.
  • Respiratory syncytial virus Respiratory syncytial virus, cytomegalovirus, hepatitis C virus, hepatitis C quinoles, herpes simplex puenoles, nopiro maunoores, ypsiutah invar virus, influenza virus, lime virus, west nile virus, HIV etc.
  • Metabolic syndrome diabetes, obesity, hyperlipidemia, hypercholesterolemia, hypertridary ceridemia, etc.
  • Alzheimer's disease Parkinson's disease, amyotrophic lateral sclerosis (ALS), etc.
  • Respiratory syncytial viruses cytomegalovirus, hepatitis C virus, hepatitis B virus, herpes simplex virus, nopiro mauinores, i Pushuinbainunoles, Infnorezainoles, Limevirus, West Nile virus, or HIV gene, PADI4, PTEN, Tumor necrosis fa ctor receptor associated death domain (TRADD), glucocorticoid receptor (G and CR) , Diacylglycerol acyltransferase 2 (DGAT2), ApoB-100, ICAM-1, rotein tyrosine ph osphatase IB (PTP1B), interleukin 4 receptor (IL4R_alpha), C_reactive protein (CP), glucagon receptor (G and GR), VLA-4 ( Very Late Antigen-4), Clustering Insulin-1 ike Growth Factor- 1 Receptor (IGF- 1R), surviving euk
  • the antisense oligonucleotide of the present invention or a pharmacologically acceptable salt thereof is, for example, a nucleic acid molecule (for example, matured) encoding peptidylarginine diminase 4 (hereinafter referred to as "PADI4 enzyme"). It may be targeted to mRNA, mature mRNA precursors, vertical DNA, etc.! /.
  • PADI4 enzyme peptidylarginine diminase 4
  • An example of the base sequence of a nucleic acid molecule encoding the PADI4 enzyme is shown in SEQ ID NOS: 1 and 3.
  • SEQ ID NOs: 1 and 3 show the base sequences of mouse and human PADI4 mRNA, respectively.
  • the nucleic acid molecule encoding the PADI4 enzyme hybridizes under stringent conditions with a sequence complementary to the nucleic acid molecule having the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1 or 3, and encodes a protein having the biological activity of the PADI4 enzyme. It may be a nucleic acid molecule.
  • the biological activity of PADI4 enzyme includes the activity of catalyzing the reaction of deiminating arginine residues in proteins in the presence of calcium ions to convert them to citrulline residues, as well as the activity as an antigen and as an immunogen. The activity of is also included. Examples of the amino acid sequence of the PADI4 enzyme are shown in SEQ ID NOs: 2 and 4.
  • SEQ ID NOs: 2 and 4 show the amino acid sequences encoded by the nucleotide sequences of SEQ ID NOS: 1 and 3, respectively.
  • an amino acid sequence in which one or several amino acids are deleted, substituted or added ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ Proteins consisting of IJ and having biological activity of PADI4 enzyme shall also be included in PADI4 enzyme.
  • Antisense sequences are usually selected from functional sites of mRNA, such as 5'-untranslated sites, start codons, splice sites, and stop codons.
  • mRNA RNA sequence
  • Several methods for determining the antisense sequence based on the nucleotide sequence of the target gene are also well known. For example, random short-chain nucleic acid fragments and target gene RNA are mixed, digested with RNase H, and the cleavage site is made into an antisense sequence (eg, Lloyd, BH et al., Nucleic Acids Research, 2001, 29, p3664_3673 Ho, SP et al., Nucleic Acids Research, 1996, 24, pl901-1907.
  • RNA There are known methods for determining the sequence to which is bound (for example, see Sohail, M. et al., Nucleic Acids Research, 2001, 29, p2041-2051). Furthermore, methods for determining antisense sequences using computer programs have also been reported (eg, Scherr, M., Nucleic Acids Research, 2000, 28, p2455- 2461. Patzel et al., Nucleic Acids Research, 1999). , 27, p4328-4334)) Using such a method, it is possible to find a site containing a single-stranded region to which an antisense molecule can easily bind from the complex higher-order structure of mRNA.
  • SEQ ID NOs: 3 and 4 Examples of the base sequence of the antisense oligonucleotide of the present invention targeting PADI4 mRNA are shown in SEQ ID NOs: 3 and 4.
  • the nucleotide sequences of SEQ ID NOs: 3 and 4 are sequences complementary to nucleotide numbers 564-581 and 867-887 of (Gene Bank accession No. NM — 011061.1), respectively.
  • Examples suitable for the antisense oligonucleotide of the present invention targeting PADI4 mRNA are shown below.
  • A, G, C, 5C, T, A S , G S , C 5 C S , f, A, G, 5C, T, A, G, 5C, A, G, 5C, T, A EL , G, G, 5C, T EL , A ELS , G ELS , 5C ELS and T ELS are represented by the following formulas (A), (G), (C), (5C), (T), (A (G *), (A S ), (G S ), (C S ), (5 C S ), (T S ), (A E2 ), (G E2 ), (5C E2 ), (T E2 ), (A ,, ( G, (5C E2T ), (A E2S ), (G E2S ), (5C E2S ), (T E2S ), (A EL ), (G EL ), (G ,, (5C, (T EL ), ( It is a group represented by A, (G, (5C ELS
  • the antisense oligonucleotide of the present invention and its pharmacologically acceptable salt have a high resistance to nuclease, which has a high binding ability to RNA, and can be subjected to sequence-specific degradation of mRNA by RNase H. . Therefore, the antisense oligonucleotide of the present invention and the pharmacologically acceptable salt thereof can suppress the expression of the target RNA.
  • the antisense oligonucleotide and pharmacologically acceptable salt thereof of the present invention are effective for the treatment and / or prevention of diseases involving target RNA.
  • the antisense oligonucleotide of the present invention or a pharmacologically acceptable salt thereof can be used to produce a medicament for preventing and / or treating a disease involving a target RNA. .
  • antisense oligonucleotides of the present invention and pharmacologically acceptable salts thereof can be used as pharmaceuticals or reagents.
  • the antisense oligonucleotide of the present invention and a pharmacologically acceptable salt thereof can be used as a medicament for the treatment and / or prevention of a disease involving a target RNA.
  • antisense oligonucleotide of the present invention and the pharmacologically acceptable salt thereof can be used in vitro or in vivo.
  • the antisense oligonucleotide of the present invention is described in literature (Nucleic Acids Research, 12, 4539 (1984)) using a commercially available synthesizer (for example, model 392 by the phosphoramidide method of PerkinElmer).
  • the phosphoramidite reagent used in this case is a natural nucleoside and 2′-0-methyl nucleoside (ie, 2′-0-methylguanosine, 2 For '-0-methyladenosine, 2'-0-methylcytosine, 2'-0_methyluridine), commercially available reagents can be used.
  • Alkylguanosine, adenosine, cytosine and uridine are as follows.
  • 2′-0_aminoethylguanosine, adenosine, cytosine, and uridine can be synthesized according to literature (Blommers et al. Biochemistry (1998), 37, 17714-17725 ⁇ ).
  • 2'-0-propylguanosine, adenosine, cytosine, and uridine can be synthesized according to literature (Lesnik, EA et al. Biochemistry (1993), 32, 7832-7838). Commercially available reagents can be used for 2'-0-arylguanosine, adenosine, cytosine, and uridine.
  • 2'-0-Methoxyethylguanosine, adenosine, cytosine, and uridine can be synthesized according to the patent (US626184 0) or literature (Martin, P. Helv. Chim. Acta. (1995) 78, 486-504.) .
  • 2′-0-Butylguanosine, adenosine, cytosine, uridine can be synthesized according to the literature (Lesnik, E.A. et al. Biochemistry (1993), 32, 7832-7838 ⁇ ).
  • 2'-0_pentylguanosine, adenosine, cytosine, and uridine can be synthesized according to the literature (Lesnik, E.A. et a 1. Biochemistry (1993), 32, 7832-7838).
  • CPG controlled pore glass
  • the antisense oligonucleotide of the present invention or a pharmacologically acceptable salt thereof is used as a therapeutic / preventive agent for a disease involving target RNA
  • the antisense oligonucleotide of the present invention or pharmacologically An acceptable salt thereof is mixed with itself or an appropriate pharmacologically acceptable excipient, diluent, etc., and orally by tablet, capsule, granule, powder or syrup, Alternatively, it can be administered parenterally by injections, suppositories, patches or external preparations.
  • excipients eg, sugar derivatives such as lactose, sucrose, sucrose, mannitol, sorbitol; starch derivatives such as corn starch, potato starch, alpha starch, dextrin; Organic derivatives such as gum arabic; dextran; pullulan; silicate derivatives such as light anhydrous silicic acid, synthetic aluminum silicate, calcium silicate, magnesium magnesium aluminosilicate; calcium hydrogen phosphate Phosphates; carbonates such as calcium carbonate; inorganic excipients such as sulfates such as calcium sulfate), lubricants (eg stearic acid, calcium stearate, metal stearate such as magnesium stearate) Salt; talc; colloidal silica; beads Borax; Adipic acid; Sulfate such as sodium sulfate; Dalicol; Fumaric acid; Sodium benzoate; DL leucine; Sodium lauryl sul
  • excipients
  • the therapeutic agent / prophylactic agent of the present invention is preferably 0.05-5 H moles / ml of the antisense oligonucleotide of the present invention or a pharmacologically acceptable salt thereof, 0.02-10% w / v of carbonated water. Contains chemical or polyhydric alcohol and 0.01-0.4% w / v pharmacologically acceptable surfactant.
  • a more preferable range of the content of the antisense oligonucleotide of the present invention or a pharmacologically acceptable salt thereof is 0.1 to 1 moles / ml.
  • carbohydrate monosaccharides and / or disaccharides are particularly preferable.
  • these carbohydrates and polyhydric alcohols include glucose, galactose, mannose, ratatose, maltose, mannitol and sorbitol. These may be used alone or in combination.
  • surfactants are preferred! /, Examples include polyoxyethylene sorbitan mono-triester, alkylphenyl polyoxyethylene, sodium taurocholate, sodium cholate, and polyhydric alcohol ester. . Of these, particularly preferred are polyoxyethylene sorbitan mono-tolyesters, and particularly preferred as esters here are oleate, laurate, stearate and palmitate. These may be used alone or in combination.
  • the therapeutic agent / prophylactic agent of the present invention is more preferably 0.03-0.09 M pharmacologically acceptable.
  • Neutral salts such as sodium chloride, potassium chloride and / or calcium chloride.
  • the therapeutic agent / prophylactic agent of the present invention may more preferably contain 0.002 to 0.05 M of a pharmacologically acceptable buffer.
  • buffering agents include sodium citrate, sodium glycinate, sodium phosphate, and tris (hydroxymethyl) aminomethane. These buffering agents may be used alone or in combination.
  • the therapeutic agent / prophylactic agent of the present invention may be supplied in a solution state. However, in cases where it is necessary to preserve for a certain period of time, it is usually preferable to freeze-dry to stabilize the antisense oligonucleotide and prevent a decrease in the therapeutic effect.
  • the solution may be reconstructed with a solution (eg, distilled water for injection), that is, in a liquid state to be administered. Therefore, the therapeutic / prophylactic agent of the present invention includes those in a lyophilized state for reconstitution with a solution so that each component is in a predetermined concentration range. For the purpose of promoting the solubility of the lyophilizate, amino acids such as albumin and glycine are further added! /.
  • the antisense oligonucleotide of the present invention or a pharmacologically acceptable salt thereof is administered to a human, for example, about 0.1 to 100 mg / kg (body weight) per day for an adult, preferably 1 to The dose is 50 mg / kg (body weight) and can be administered orally or intravenously in one or several divided doses.
  • the dose and number of doses depend on the type of disease, symptoms, age, method of administration, etc. It can be changed as appropriate.
  • the antisense oligonucleotide of the present invention or a pharmacologically acceptable salt thereof to a patient with rheumatoid arthritis can be performed, for example, as follows. That is, the antisense oligonucleotide of the present invention or a pharmacologically acceptable salt thereof is produced by a method well known to those skilled in the art, and sterilized by a conventional method to prepare, for example, a 1200 ag / ml solution for injection. To do. This solution is administered intravenously, for example in the form of an infusion, so that the dose of antisense oligonucleotide is, for example, 20 mg / kg body weight. Administration is repeated 4 times, for example, at 1-week intervals, and thereafter this treatment is repeated as appropriate while confirming the therapeutic effect using clinical symptoms and tissue findings as indices. Continue treatment unless there is a therapeutic effect and no obvious side effects.
  • Example 1200 ag / ml solution for injection to do.
  • Non-natural phosphoramidite was prepared in Example 14 (5'-0-dimethoxytrityl-2, -0,4, -C-ethylene-6-N-benzoyladenosine-3, -0_ (2-cyanoethyl N, N-diisopropyl) phosphoramidite),
  • Example 27 (5, -0-dimethoxytrityl-2, -0,4, -C-ethylene-2-N-isobutyrylguanosine-3 , -0_ (2-Cyanoethyl N, N_disopropyl) phosphoramidite)
  • Example 22 (5, -0-dimethoxytrityl-2, -0,4, -C-ethylene-4-N-benzoyl) -5-methylcytidine-3'-0_ (2-cyanoethyl N, N-diisopropyl) phosphoramidite),
  • Example 9 (5, -0-dimethoxytrityl-2, -
  • the oligomer is excised from the support, and the cyano group of the phosphate protecting group and the protecting group on the nucleobase are removed. I removed it.
  • This compound is reverse-phase HPLC (Shimadzu LC-10VP, column (Merck, Chromolith Performance RP-18e (4.6 X 100 mm)), solution A: 5% acetonitrile, 0.1 M aqueous solution of triethylamine acetate (TEAA), pH 7.0 , B solution: 25% acetonitrile, 0.1 M aqueous solution of triethylamine acetate (TEAA), pH 7.0, B%: 20% ⁇ 80% (8 min, linear gradient); 60 ° C; 2 ml / min; 260 nm) Then, it eluted at 5.22 minutes (2.62 A units). The compound was identified by negative ion ESI mass spectrometry (calculated value: 5860.96).
  • the base sequence of this compound is a sequence complementary to nucleotide number 564-581 of (Gene Bank accession No. NM_011061.1).
  • Example 2 having the target sequence in the same manner as the compound of Example 1 was synthesized.
  • This compound consists of reverse-phase HPLC (LC 10VP manufactured by Shimadzu Corporation, column (Merck, Chromolith Performance RP-18e (4.6 X 100 mm)), A solution: 5% acetonitrile, 0.1 M triethylamine acetate aqueous solution (TEAA), pH 7.0, B solution: 25% acetonitrile, 0.1 M triethylamine acetate aqueous solution (TEAA), pH 7.0, B%: 20% ⁇ 80% (8 min, linear gradient); 60 ° C; 2 ml / min; 260 nm) Was eluted at 5.22 minutes (2.63 A units). Also, the compound is a negative ion ESI quality
  • the base sequence of this compound is a sequence complementary to nucleotide number 564-581 of (Gene Bank accession No. NM_011061.1).
  • Example 3 Similar to the compound of Example 1, the compound of Example 3 having the target coordinate IJ was synthesized.
  • Deprivation Protected, reverse-phase HPLC (Shimadzu LC 10VP, column (Merck, Chromolith Performan ce RP-18e (4.6 X 100 mm)), A solution: 5% acetonitrile, 0.1 M triethylamine acetate water solution (TEAA), ⁇ 7.0 Solution B: Acetonitrile, B%: 10% ⁇ 45% (8 min, linear gradient); 60 ° C; 2 ml / min; 260 nm) to collect the peak of the target compound having dimethoxytrityl group It was. Water was added and distilled off under reduced pressure to remove TEAA.
  • This compound consists of reverse-phase HPLC (LC-10VP, Shimadzu Corporation, column (Merck, Chromolith Performance RP-18e (4.6 X 100 mm)), A solution: 5% acetonitrile, 0.1 M triethylamine acetate aqueous solution (TEAA), ⁇ 7.0, B solution: 25% acetonitrile, 0.1 M triethylamine acetate aqueous solution (TE AA), H 7.0, B%: 20% ⁇ 80% (8 min, linear gradient); 60 ° C; 2 ml / min; 260 nm) When analyzed, it eluted at 5.41 minutes (1.49 A units).
  • the compound is a negative ion ESI mass fraction
  • the base sequence of this compound is a sequence complementary to nucleotide number 867-887 of (Gene Bank accession No. NM_011061.1).
  • the compound of Reference Example 1 having the target sequence was synthesized.
  • This compound consists of reverse-phase HPLC (LC 10VP manufactured by Shimadzu Corporation, column (Merck, Chromolith Performance RP-18e (4.6 X 100 mm)), A solution: 5% acetonitrile, 0.1 M triethylamine acetate aqueous solution (TEAA), pH 7.0, B solution: 25% acetonitrile, 0.1 M triethylamine acetate aqueous solution (TEAA), pH 7.0, B%: 20% ⁇ 80% (8 min, linear gradient); 60 ° C; 2 ml / min; 260 nm) Was eluted at 5.52 minutes (3.19 A units).
  • the compound is a negative ion ESI quality
  • the base sequence of this compound is a sequence complementary to nucleotide number 564-581 of (Gene Bank accession No. NM_011061.1).
  • This compound is reverse phase HPLC (Shimadzu LC-10VP, column (Merck, Chromolith Performance RP_18e (4.6 X 100 mm)), A solution: 5% acetonitrile, 0.1 M triethylamine acetate aqueous solution (TEAA), ⁇ 7.0, B Solution: 25% acetonitrile, 0.1 M aqueous triethylamine acetate (TEAA), pH 7.0, B%: 20% ⁇ 80% (8min, linear gradient); 60 ° C; 2 ml / min; 260 nm) (2.14 A units) 0
  • the compound was also identified by negative ion ESI mass spectrometry (calculation
  • the base sequence of this compound is a sequence complementary to nucleotide number 867-887 of (Gene Bank accession No. NM_011061.1).
  • the compound of Reference Example 3 having the target sequence in the same manner as the compound of Example 1 was synthesized.
  • This compound consists of reverse-phase HPLC (LC 10VP manufactured by Shimadzu Corporation, column (Merck, Chromolith Performance RP-18e (4.6 X 100 mm)), A solution: 5% acetonitrile, 0.1 M triethylamine acetate aqueous solution (TEAA), pH 7.0, B solution: 25% acetonitrile, 0.1 M triethylamine acetate aqueous solution (TEAA), pH 7.0, B%: 20% ⁇ 80% (8 min, linear gradient); 60 ° C; 2 ml / min; 260 nm) so When analyzed, it eluted at 5.28 minutes (9.22 A units). Also, the compound is a negative ion ESI quality
  • the base sequence of this compound is a sequence complementary to nucleotide number 564-581 of (Gene Bank accession No. NM_011061.1).
  • the compound of Reference Example 4 having a sequence that does not target PADI4 mRNA was synthesized in the same manner as the compound of Example 1.
  • This compound is a reverse phase HPLC (Shimadzu LC-10VP, column (Merck, Chromolith Performance RP-18e (4.6 X 100 mm)), A solution: 5% acetonitrile, 0.1 M triethylamine acetate aqueous solution (TEAA), pH 7.0, B solution: 25% acetonitrile, 0.1 M triethylamine acetate aqueous solution (TEAA), pH 7.0, B%: 20% ⁇ 80% (8 min, linear gradient); 60 ° C; 2 ml / min; 260 nm ) Was eluted at 7.77 minutes (8.33 A units). Also
  • the compound was identified by negative ion ESI mass spectrometry (calculated value: 5851.90, measured value: 5852.9).
  • the base sequence of this compound is the sequence of nucleotide number 564-581 of (Gene Bank accession No. NM_011061.1).
  • the compound of Reference Example 5 having a sequence that does not target PADI4 mRNA was synthesized in the same manner as the compound of Example 1.
  • This compound is a reverse phase HPLC (Shimadzu LC-10VP, column (Merck, Chromolith Performance RP-18e (4.6 X 100 mm)), A solution: 5% acetonitrile, 0.1 M triethylamine acetate aqueous solution (TEAA), pH 7.0, B solution: 25% acetonitrile, 0.1 M triethylamine acetate aqueous solution (TEAA), pH 7.0, B%: 20% ⁇ 80% (8 min, linear gradient); 60 ° C; 2 ml / min; 260 nm ) Was eluted at 4.99 minutes (4.84 A units). Also
  • the compound was identified by negative ion ESI mass spectrometry (calculated value: 5880.03, measured value: 5880.04).
  • the base sequence of this compound is the sequence of nucleotide number 564-581 of (Gene Bank accession No. NM_011061.1).
  • the compound of Reference Example 6 having a sequence that does not target PADI4 mRNA was synthesized in the same manner as the compound of Example 1.
  • This compound is a reverse phase HPLC (Shimadzu LC-10VP, column (Merck, Chromolith Performance RP-18e (4.6 X 100 mm)), A solution: 5% acetonitrile, 0.1 M triethylamine acetate aqueous solution (TEAA), pH 7.0, B solution: 25% acetonitrile, 0.1 M triethylamine acetate aqueous solution (TEAA), pH 7.0, B%: 20% ⁇ 80% (8 min, linear gradient); 60 ° C; 2 ml / min; 260 nm ) Was eluted at 5.20 minutes (6.72 A units). Also
  • the compound was identified by negative ion ESI mass spectrometry (calculated value: 5866.00, measured value: 5866.06).
  • the base sequence of this compound is the sequence of nucleotide number 564-581 of (Gene Bank accession No. NM_011061.1).
  • the compound of Reference Example 7 having a sequence that does not target PADI4 mRNA was synthesized in the same manner as the compound of Example 1.
  • This compound is reverse phase HPLC (Shimadzu LC-10VP, column (Merck, Chromolith Performance RP-18e (4.6 X 100 mm)), A solution: 5% acetonitrile, 0.1 M triethylamine acetate aqueous solution (TEAA), pH 7.0, B solution: 25% acetonitrile, 0.1 M triethylamine acetate aqueous solution (TEAA), pH 7.0, B%: 20% ⁇ 80% (8 min, linear gradient); 60 ° C; 2 ml / min; 260 nm ) Was eluted at 5.33 minutes (8.56 A units). Also
  • the compound was identified by negative ion ESI mass spectrometry (calculated value: 5866.00, measured value: 5866.04).
  • the base sequence of this compound is the sequence of nucleotide number 564-581 of (Gene Bank accession No. NM_011061.1).
  • the compound of Reference Example 8 having the target sequence was synthesized.
  • This compound is reverse phase HPLC (Shimadzu LC 10VP, column (Merck, Chromolith Perform ance RP-18e (4.6 X 100 mm)), A solution: 5% acetonitrile, 0.1 M triethylamine acetate aqueous solution (TEAA), pH 7.0, B solution: 25% acetonitrile, 0.1 M triethylamine acetate aqueous solution (TEAA), pH 7.0 B%: 20% ⁇ 80% (10 min, linear gradient); 60 ° C; 2 ml / min; 260 nm), elution was performed at 6.96 minutes (8.40 A units).
  • the compound is negative ion ESI
  • the base sequence of this compound is a sequence complementary to nucleotide number 867-887 of (Gene Bank accession No. NM_011061.1).
  • the compound of Reference Example 9 having the target sequence in the same manner as the compound of Example 1 was synthesized in the same manner as the compound of Example 1.
  • This compound is reverse-phase HPLC (Shimadzu LC-10VP, column (Merck, Chromolith Performance RP-18e (4.6 X 100 mm)), A solution: 5% acetonitrinol, 0.1 M triethylamine acetate aqueous solution (TEAA), pH 7.0 B solution: 25% acetonitrile, 0.1 M aqueous triethylamine acetate (TEAA), pH 7.0, B%: 20% ⁇ 80% (8 min, linear gradient); 60 ° C; 2 ml / min; 260 nm) Eluted at 5.27 minutes (3.95 A units). Also
  • the compound was identified by negative ion ESI mass spectrometry (calculated value: 6768.60, measured value: 6768.20).
  • the base sequence of this compound is a sequence complementary to nucleotide number 867-887 of (Gene Bank accession No. NM_011061.1).
  • the compound of Reference Example 10 having the target sequence in the same manner as the compound of Example 1 was synthesized in the same manner as the compound of Example 1.
  • This compound is reverse phase HPLC (Shimadzu LC-10VP, column (Merck, Chromolith Performance RP-18e (4.6 X 100 mm)), A solution: 5% acetonitrinol, 0.1 M triethylamine acetate aqueous solution (TEAA), pH 7.0 , B solution: 25% acetonitrile, 0.1 M triethylamine acetate aqueous solution (TEAA), pH 7.0, B%: 20% ⁇ 80% (8min, linear gradient) At 60 ° C; 2 ml / min; 260 nm), eluting at 5.23 minutes (5.31 A units). Also
  • the compound was identified by negative ion ESI mass spectrometry (calculated value: 6740.54, measured value: 6740.3
  • the base sequence of this compound is a sequence complementary to nucleotide number 867-887 of (Gene Bank accession No. NM_011061.1).
  • This compound is reverse phase HPLC (LC-10VP, Shimadzu Corporation, column (Merck, Chromolith Performance RP-18e (4.6 X 100 mm)), A solution: 5% acetonitrile, 0.1 M triethylamine acetate aqueous solution (TEAA ), pH 7.0, B solution: 25% acetonitrile, 0.1 M triethylamine acetate aqueous solution (TEAA), pH 7.0, B%: 20% ⁇ 100% (8 min, linear gradient); 60 ° C; 2 ml / min; 260 nm) was eluted at 6.71 minutes (5.78 A units). Also compounds
  • the base sequence of this compound is the sequence of nucleotide number 867-887 of (Gene Bank accession No. NM_011061.1).
  • the compound of Reference Example 12 having a sequence that does not target PADI4 mRNA was synthesized in the same manner as the compound of Example 1.
  • This compound is reverse phase HPLC (Shimadzu LC-10VP, column (Merck, Chromolith Performance RP-18e (4.6 X 100 mm)), A solution: 5% acetonitrile, 0.1 M aqueous triethylamine acetate (TEAA), pH 7.0 , B solution: 25% acetonitrile, 0.1 M triethylamine acetate aqueous solution (TEAA), pH 7.0, B%: 20% ⁇ 80% (8 min, linear gradient); 60 ° C; 2 ml / min; 260 nm) Then, it eluted at 4.98 minutes (1.38 A units). Also, The compound was identified by negative ion ESI mass spectrometry (calculated value: 6825.60, measured value: 6825.23)
  • the base sequence of this compound is the sequence of nucleotide number 867-887 of (Gene Bank accession No. NM_011061.1).
  • the compound of Reference Example 12 having a sequence that does not target PADI4 mRNA was synthesized in the same manner as the compound of Example 1.
  • This compound is reverse phase HPLC (LC-10VP manufactured by Shimadzu Corporation, column (Merck, Chromolith Performance RP-18e (4.6 X 100 mm))
  • a solution 5% acetonitrile, 0.1 M aqueous solution of triethylamine acetate (TEAA), pH 7.0
  • B Solution 25% acetonitrile, 0.1 M aqueous solution of triethylamine acetate (TEAA), pH 7.0 B%: 20% ⁇ 80% (8 min, linear gradient); 60 ° C; 2 ml / min; 260 nm) ⁇ Eluted at 18 minutes (1.45 A units).
  • TEAA triethylamine acetate
  • pH 7.0 B% 20% ⁇ 80% (8 min, linear gradient); 60 ° C; 2 ml / min; 260 nm) ⁇ Elute
  • the compound was identified by negative ion ESI mass spectrometry (calculated value: 6825.60, measured value: 6825.20)
  • the base sequence of this compound is the sequence of nucleotide number 867-887 of (Gene Bank accession No. NM_011061.1).
  • the compound of Reference Example 14 having a sequence that does not target PADI4 mRNA was synthesized in the same manner as the compound of Example 1.
  • This compound is reverse phase HPLC (LC-10VP manufactured by Shimadzu Corporation, column (Merck, Chromolith Performance RP-18e (4.6 X 100 mm))
  • a solution 5% acetonitrile, 0.1 M aqueous solution of triethylamine acetate (TEAA), pH 7.0
  • B Solution 25% acetonitrile, 0.1 M aqueous triethylamine acetate (TEAA), pH 7.0 B%: 20% ⁇ 80% (8 min, linear gradient); 60 ° C; 2 ml / min; 260 nm) Eluted in minutes (2.76 A units).
  • TEAA triethylamine acetate
  • pH 7.0 B% 20% ⁇ 80% (8 min, linear gradient); 60 ° C; 2 ml / min; 260 nm) Eluted in minutes (2.76 A
  • the compound was identified by negative ion ESI mass spectrometry (calculated value: 6825.60, measured value: 6825.49) [0101]
  • the base sequence of this compound is the sequence of nucleotide number 867-887 of (Gene Bank accession No. NM_011061.1).
  • the compound of Reference Example 15 having a sequence not targeting PADI4 mRNA was synthesized in the same manner as the compound of Example 1.
  • This compound is reverse-phase HPLC (Shimadzu LC-10VP, column (Merck, Chromolith Performance RP-18e (4.6 X 100 mm)), A solution: 5% acetonitrile, 0.1 M aqueous triethylamine acetate (TEAA), pH 7.0 , B solution: 25% acetonitrile, 0.1 M triethylamine acetate aqueous solution (TEAA), pH 7.0, B%: 20% ⁇ 80% (8 min, linear gradient); 60 ° C; 2 ml / min; 260 nm) Then, it eluted at 5.40 minutes (2.62 A units). Also,
  • the compound was identified by negative ion ESI mass spectrometry (calculated value: 6797.55, measured value: 6797.46)
  • the base sequence of this compound is the sequence of nucleotide number 867-887 of (Gene Bank accession No. NM_011061.1).
  • first strand buffer (supplied with Superscript 1 ) 51, 100 mM DTT (supplied with Superscript 1 1 ) 2 ⁇ 5 ⁇ 1, 25 mM dNTPs ( 25 mM each dATP, dCTP, dGTP, dTTP) (Invitrogen) 1 ⁇ 1, 40 units / ⁇ 1 RNase inhibitor (Toyobo) 0.5 ⁇ 1, 200 units / ⁇ 1 Superscript II R Nase H— Reverse Transcriptase (Invitrogen) 1 ⁇ 1 was added to prepare a 25 ⁇ l reaction solution. The reaction was incubated at 42 ° C for 90 minutes and 70 ° C for 10 minutes, followed by DNase and RNase free wat The total amount of er was adjusted to 50 ⁇ 1, and this was used as the first strand cDNA solution night.
  • a cDNA having an ORF of a mouse PADI4 nucleotide sequence is prepared according to the following method.
  • the target cDNA was purified by electrophoresis of the reaction product on a 1% agarose gel, and after confirming amplification of the target cDNA (about 2 kbp), the QIAquick PCR Purification Kit (QIAGEN) was used according to the attached protocol.
  • the purified DNA fragment is inserted into the pCR-BluntH-TOPO vector of Zero Blunt TOPO PCR Cloning Kit (Invitrogen) according to the attached protocol, and E. coli colonies containing the plasmid on the agar medium using host E. coli. Formed. These colonies were isolated, plasmids were extracted, and a plasmid (Padi4 / pCR_BluntII) having a DNA insert of about 2 kbp was isolated.
  • Plasmid (680 ⁇ g / mL, 10 ⁇ L) containing mouse PADI4 gene prepared in Reference Example 16 was used as primer (GAATTCTAATACGACTCACTATAGGGAGAC (SEQ ID NO: 12) 10 M, TGCTGGATATCTGCAGAATTCGGCT (SEQ ID NO: 13) 10 i M) 50 i L each.
  • Amplification was performed using PCR thermal cycler PERSONAL (Takara Bio) using Takara Ex Taq 250 ⁇ L (Takara Bio) and sterilized water 140 ⁇ L.
  • reaction was incubated at 94 ° C for 10 minutes, and then the reaction at 94 ° C for 1 minute, 63 ° C for 1 minute, and 72 ° C for 1 minute was repeated 30 times.
  • Add 500 ml of reaction solution to the reaction solution add 250 ml of phenol, shake for 1 minute, and centrifuge to collect the aqueous layer. After ethanol precipitation, it was washed with jetyl ether, dissolved in about 1 ml of sterilized water, and centrifuged through a ultrafiltration membrane (Microcon, YM-50). 350 ⁇ L of sterilized water was added to the filtrate and filtered again.
  • a ultrafiltration membrane Microcon, YM-50
  • the reaction was 5 X formamide gel buffer (0.1 M MOPS pH 7.0, 40 mM sodium acetate, 5 mM EDTA) 2 / JL, 37% formaldehyde 3.5 ⁇ L, for mamide 15 and heated at 65 ° C for 15 minutes Stopped by. Further, loading solution (50% glycerol, 1 mM J ⁇ DTA pH 8.0, 0.25% bromophenol blue, 0.25% xylene cyanol FF) 2.0 a L was calorieated.
  • loading solution 50% glycerol, 1 mM J ⁇ DTA pH 8.0, 0.25% bromophenol blue, 0.25% xylene cyanol FF
  • RNA size markers include Novagen Perfect RNA T , including 1000, 800, 600, 400, 300, 200, 100 base RNA
  • Markers 0.1—lkb was used. It was stained and visualized using 7 gnoles (or Molecular Imager FX Fluoresent Imager system (Bio-Rad)) and quantified using Quantity One software (Bio-Rad).
  • Table 3 shows the oligonucleotides (AS-2, AS-2-1, AS-2-2, AS-2-3, AS-2-4, S-2, S-2-1) , S-2-2, S_2_3, S_2_4) (consecutive DNA portions are shown by double lower springs) and the number of contiguous DNAs.
  • Figure 5 shows the results of gel electrophoresis of the RNase H reaction on the oligonucleotide and PADI4 cRNA duplex. Consecutive DNA is 13
  • AS-2 having an antisense sequence caused cleavage mainly at the target site, and approximately 1230 base and 920 base cleavage fragments were observed.
  • cuts other than the target site were also observed.
  • Table 4 shows the oligonucleotides (AS-l, AS-1-1, AS-1-2, AS-1-3, S_l, S-1-1, Sl-2, S-2-3) donated to the experiment. (The continuous DNA portion is indicated by a double underline), and the number of consecutive DNAs was summarized.
  • Figure 6 shows RNas for the double strands of oligonucleotide and PADI4 cRNA. The result of gel electrophoresis of the reaction of eH is shown. AS-1 having 10 consecutive DNAs and having a sequence sequence mainly cleaved at the target site, and cleaved fragments of approximately 1540 base and 610 base were observed. In addition, cutting other than the target site was also observed.
  • S-1 which has 10 consecutive DNAs and a sense sequence that does not have a complementary sequence to PADI4, multiple cleaved fragments were observed.
  • AS-1-1 and AS-1-2 where the number of consecutive DNAs was reduced to 6 or 5, the number of cuts other than the target site decreased.
  • S-2 series having a sense sequence almost no cleavage was observed in S-1-1 and S-1-2 in which the number of consecutive DNAs was reduced to 6 or 5.
  • No cleavage by RNase H was observed in AS-2-4 and S-2-4, which have a continuous DNA power of 3 ⁇ 4 or less.
  • the plasmid containing the mouse PADI4 gene prepared in Reference Example 16 and the antisense oligonucleotide of the example for mouse PADI4 mRNA were transiently introduced into MH3T3, a mouse embryo-derived fibroblast cell line, and By quantifying mouse PADI4 mRNA, the effect of suppressing the amount of mouse PADI4 mRNA expression by the antisense oligonucleotide of the example was evaluated.
  • TaqMan Ribosomal RNA Control Reagents (18S ribosomal RNA, rRNA) was quantified using Applied Biosystems.
  • the RT-PCR reaction uses a MicroAmp Optical 96-well Reaction Plate (Applied Biosystems), and the composition of the reaction solution in one well is as follows. Total RNA solution 2 ⁇ ⁇ , 2x One-Step RT-PCR Master Mix 25 ⁇ 1, 40x Multiscribe & RNase Inhibitor Mix 1.25 ⁇ 1, TaqMan Probe 2.5 ⁇ 1, RNase free water 19.25 ⁇ 1.
  • RNA solution derived from cells into which only the mouse PADI4 gene was transiently introduced was prepared in advance for the preparation of a calibration curve, and a 5-fold dilution series was repeated for convenience. 625, 125, 25, 1, 0 Dilution series.
  • ABI 7900 TM Sequence Detection System (Applied Biosystems) was used. After reaction at 48 ° C for 30 minutes and 95 ° C for 10 minutes, 95 ° C for 10 seconds, 60 ° C. The reaction of C 1 minute was repeated 50 times, and the amount of luminescence of the reporter dye was measured every cycle. Mouse PADI4 and rRNA amplification curves were generated from the amount of luminescence from the reporter dye in each cycle.
  • Amplification curve power of dilution series of total RNA solution for creating calibration curve Horizontal axis represents concentration, vertical axis represents cycle number
  • a calibration curve was prepared, and for each expression quantification sample, the number of cycles exceeding a certain amount of luminescence arbitrarily set in the logarithmic amplification phase was plotted on the calibration curve to calculate the relative expression level.
  • the expression level of mouse PADI4 was corrected by the expression level of rRNA in the same sample.
  • the expression level of mouse PADI4 mRNA in the PADI4 gene and the oligonucleotide (A Sl-3, Sll, Sl-2, Sl-3) that is considered not to suppress the expression of PADI4 is PADI4
  • the expression level was improved compared to the gene alone. This increase in the expression level may be attributed to the change in the ratio of the cation of the amino acid group of the Transfect Reagent and the anion of the phosphate group of the nucleic acid when the oligonucleotide was added compared to the PADI4 gene alone. Therefore, the PADI4 mRNA expression level was calculated for each oligonucleotide using 100% of the oligonucleotide S-1-3, which is considered not to suppress PADI4 mRNA expression. Shown in 7.
  • Antisense oligonucleotides AS-2, AS-2-1, AS-2-2, AS-2-3, AS-2-4 and sequences complementary to antisense oligonucleotides (5, -UGU UCC AAG ACA GUG UGA C RNA oligonucleotide having GU-3 ′) (SEQ ID NO: 14) is dissolved in a melting temperature (Tm) measurement solution (12.5 mM phosphate buffer (pH 6.8)) to a final concentration of 0.33 M, Prepared. The solution containing both chains (3 mL) was heated at 90 ° C. for 5 minutes and then gradually cooled to room temperature. The sample solution was measured using a circular dichroism dispersometer (JASCO Corp. J-720 type).
  • the sample was placed in a sensor (cell thickness 10 mm), the temperature was increased from 20 ° C to 80 ° C using a Peltier thermostat, and the molar ellipticity at 260 nm was measured at 0.1 ° C intervals.
  • oligonucleotides consisting of all DNA having the same sequence as the antisense oligonucleotide (all DNA: 5, -ACG TCA CAC TGT CTT GGA ACA-3) (SEQ ID NO: 6) were used for comparison. The midpoint of the transition of molar ellipticity with increasing temperature was taken as the melting temperature (Tm).
  • Antisense oligonucleotides (AS-2, AS-2-1, AS-2-2, AS_2_3, AS-2-4) all showed higher Tm values than All DNA. This means that by introducing a 2'-0,4'-ethylene bridged nucleoside into the antisense oligonucleotide, a stable duplex is formed with the complementary RNA. Since there is no characteristic T m value in AS-2-3, which is a continuous DNA power, the sequence-specific sequence of RNase H against AS-2-3 and PADI4 cRNA observed in Test Example 1 In the cleavage reaction, the number of contiguous DNAs appears to be more important than the stability of the double strands.
  • Soft capsule A soft capsule containing 100 mg of active ingredient prepared by preparing a mixture of the compound of Example 1 in a digestible oil such as soybean oil, cottonseed oil or olive oil and injecting it into gelatin with a positive displacement pump Obtained, washed and dried.
  • a digestible oil such as soybean oil, cottonseed oil or olive oil
  • 1.5% by weight of the compound of Example 1 is prepared by stirring in 10% by volume of propylene glycol, then making up to volume with water for injection and then sterilizing.
  • an antisense oligonucleotide capable of specifically cleaving a target sequence.
  • the expression of the target RNA can be suppressed using the antisense oligonucleotide of the present invention.
  • the antisense oligonucleotide of the present invention is useful as a medicament for preventing and / or treating diseases involving target RNA. Sequence listing free text
  • SEQ ID NO: 1 shows the nucleotide sequence of mouse PADI4 mRNA (Accession No. NM_011061 registered in EMBL / GenBank).
  • SEQ ID NO: 2 shows the amino acid sequence IJ (encoded by the base sequence of SEQ ID NO: 1) encoded by the mouse PADI4 gene.
  • SEQ ID NO: 3 shows the nucleotide sequence of human PADI4 mRNA (Accession No. NM-012387 registered in EMBL / GenBank).
  • SEQ ID NO: 4 shows the amino acid sequence IJ (encoded by the base sequence of SEQ ID NO: 3) encoded by the human PADI4 gene.
  • SEQ ID NO: 5 shows the sequence complementary to nucleotide number 564-581 of the base sequence of mouse PADI4 mRNA (Accession No. NM — 011061 registered in EMBL / GenBank).
  • SEQ ID NO: 6 shows a complementary sequence to nucleotide numbers 867-887 of the base sequence of mouse PADI4 mRNA (Accession No. NM — 011061 registered in EMBL / GenBank).
  • SEQ ID NO: 7 shows the sequence of the forward primer used in Reference Example 16.
  • SEQ ID NO: 8 shows the sequence of the reverse primer used in Reference Example 16.
  • SEQ ID NO: 9 shows the sequence of the forward primer used in Reference Example 16.
  • SEQ ID NO: 10 shows the sequence of the reverse primer used in Reference Example 16. ⁇ SEQ ID NO: 11>
  • SEQ ID NO: 11 shows the sequence of mouse Padi4 cDNA obtained in Reference Example 16.
  • SEQ ID NO: 12 shows the sequence of the primer used in Reference Example 17.
  • SEQ ID NO: 13 shows the sequence of the primer used in Reference Example 17.
  • SEQ ID NO: 14 shows the sequence of the RNA oligonucleotide used in Test Example 3.

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Description

明 細 書
配列特異的作用を有する ENAアンチセンスオリゴヌクレオチド
技術分野
[0001] 本発明は、配列特異的作用を有する RNA型修飾オリゴヌクレオチドと DNAオリゴヌ クレオチドとのキメラ分子、それを含む組成物及びそれを用いて標的 RNAの発現を 抑制する方法に関する。
背景技術
[0002] 様々な修飾オリゴヌクレオチドがアンチセンス法や遺伝子評価のために設計されて おり、その中の幾つかの修飾オリゴヌクレオチドは、臨床試験が行われている [非特許 文献 1]。 2 ' -OMe RNAのような N-型コンホメーシヨンを有する RNA型修飾オリゴヌタレ ォチドは、相補配列を有する RNAとの結合力も高いことが知られている。オリゴヌタレ ォチドの全長がこのような RNA型修飾オリゴヌクレオチドからなるものは、翻訳阻害、 スプライシング制御などに応用されている 特許文献 1]。し力もながら、 RNA型修飾 オリゴヌクレオチドと mRNAとの間で形成する 2本鎖は、 DNA/RNA2本鎖の RNAを切断 する RNase Hの基質にならないので、 RNA型修飾オリゴヌクレオチドは mRNAの発現 抑制するアンチセンス法として利用しにくい。そこで、 RNA型修飾オリゴヌクレオチドと DNAオリゴヌクレオチドとをキメラ分子として用い、 RNase Hを活性する方法が用いら れている。このようなキメラオリゴヌクレオチドは、「gapmer」と呼ばれ、 DNAをキメラオリ ゴヌクレオチドの「window」と呼ばれる中央部に、 RNA型修飾オリゴヌクレオチドを「win g」と呼ばれる両端に配置する。 RNA型修飾オリゴヌクレオチドとして 2 ' -OMe RNAを 用いた場合、このような wing/window/wingに並んだ gapmerは、 2，- OMe RNA/DNA/ 2 ' -OMe RNAのように表記される。ヒト RNase H活性化のために window部分の DNA オリゴヌクレオチドは最低 4残基必要で、大腸菌由来 RNase Hでは最低 5残基は必 要である 特許文献 2]。 window部分の DNAオリゴヌクレオチドの鎖長が長い場合、 R Nase H反応が効率的に進行し、一方 wing部分の RNA型修飾オリゴヌクレオチドの鎖 長が長い場合、標的となる mRNAとの親和性が向上する。適切なアンチセンス分子を 設計するために、 window部分と wing部分の適切なバランスが必要となる。 window部分 の DNAオリゴヌクレオチドを 10残基以上長くすることで、アンチセンス分子として高活 性を示すとレ、うことが知られて!/、る [特許文献 1]。
[0003] RNA型オリゴヌクレオチドとして、糖部の 2，-酸素原子と 4，-炭素原子をエチレン鎖 で架橋した ENA (2 ' -0,4' -C-ethylene-bridged nucleic ids)は、相補鎖核酸に対し て高い親和性を示し、加えて優れたヌクレアーゼに対する安定性を有している [非特 許文献 3、特許文献 2]。また、血管内皮増殖因子、有機ァニオントランスポーターに 対する ENAアンチセンスオリゴヌクレチドは、細胞内でのアンチセンス活性を示すこと を報告されてレ、る 特許文献 4]。
[0004] アンチセンス法の 1つの問題点として、アンチセンスオリゴヌクレオチドが非標的 RN Aに結合し、アンチセンスオリゴヌクレオチド/非標的 RNAとの 2本鎖が RNase Hに認 識され、非標的 RNAが切断されてしまうことが挙げられる。 DNAオリゴヌクレオチドと D NAメチルホスホネートとのキメラオリゴヌクレオチドがそのような非特異的切断を回避 すること力 Sできること力 S知られている [非特許文献 5，6]。 また、 2 ' - OMe RNAと DNAオリ ゴヌクレオチドとの gapmerでは、非特異的切断を回避することができない、または、そ の効果は部分的にすぎな!/、ことが報告されて!/、る [非特許文献 7,8]。非特許文献 1に 示されている、 window部分の DNAオリゴヌクレオチドを 10残基以上長くする方法は、 非特異的切断が懸念される。特許文献 3及び非特許文献 9では、糖部の 2 ' -酸素原 子と 4， -炭素原子をメチレン鎖で架橋した 2，，4， -BNA/LNAと DNAオリゴヌクレオチド との gapmerの設計につ!/、て述べて!/、る力 gapmerの効果につ!/、て述べられて!/、るの みに過ぎず、切断反応の特異性につ!/、ては述べられて!/、な!/、。
[0005] 特許文献 1：国際公開第 WO2006034348号パンフレット
特許文献 2：特許第 3420984号明細書
特許文献 3：米国特許出願公開第 2006128646号明細書
非特許文献 l : Kurreck， J. (2003) Eur. J. Biochem. 270， 1628-1644·
非特許文献 2 : Lima, W.F., Crooke, S.T. (1997) Biochemistry 36， 390-398·
非特許文献 3 : Morita, Κ·， Hasegawa, C., aneko, M., Tsutsumi, S.， Sone, J. , Ishikaw a, Τ·， Imanishi, Τ·， Koizumi, M. (2002) Bioorg. Med. Chem. Lett. 12， 73—76.
非特許文献 4 : Koizumi, M. (2006) Curr. Opin. Mol. Ther. 8， 144-149. 非特許文献 5 : Giles, R.V. and Tidd, D.M. (1992) Nucleic Acids Res. 20， 763-770· 非特許文献 6 : Larrouy, B.L. Blonski, C, Boiziau, C , Stuer, M., Moreeau, S. , Shire D.， Toulme, J.-J. (1992) Gene 121， 189-194·
非特許文献 7 : Larrouy, Β·， Boiziau, C, Sproat, Β·， Toulme, J.-J. (1995) Nucleic Aci ds Res. 23， 3434-3440·
非特許文献 8 : Shen， L.X., andimalla, E.R., Agrawal, S. (1998) Bioorg Med Chem. 6， 1695-1705.
非特許文献 9 : Frieden M, Christensen SM, Mikkelsen ND, Rosenbohm C， Thrue CA ， Westergaard M, Hansen HF， Orum H， Koch T. (2003) Nucleic Acids Res. 31， 636 5-6372.
発明の開示
発明が解決しょうとする課題
[0006] アンチセンスオリゴヌクレオチドが標的 RNAだけではなぐ非標的 RNAにも結合し、 アンチセンスオリゴヌクレオチド/非標的 RNAとの 2本鎖が RNase Hに認識され、非標 的 RNA切断されてしまう。そのような問題点を克服する特異性が高!/、アンチセンスォ リゴヌクレオチドが期待されてレ、た。 課題を解決するための手段
[0007] 本発明者らは、アンチセンスオリゴヌクレオチドにつ!/、て検討した結果、 ENAオリゴ ヌクレオチドと DNAオリゴヌクレオチドからなる gapmerであって、 windowとなる DNAオリ ゴヌクレオチド部分を短くしたものに、標的となる配列を特異的に切断することができ ることを見出し、本発明を完成した。
本発明の要旨は以下の通りである。
[0008] (1)下記の配列 (I)で表されるアンチセンスオリゴヌクレオチド又は薬理学上許容され るその塩。
Wing — R —Window— R —Wing (I)
(配列 (I)中、 Windowはヌクレオチド数 5又は 6のデォキシリボヌクレオチド配列であり、 R11及び R12は、それぞれ、独立に、リボヌクレオチドであり、
Wing1及び Wing2は、それぞれ、独立に、リボヌクレオチド、リボヌクレオチド酉己列、デォ ボヌクレオチドとの混合配列であるが、 ドとの混合配列である場合、その配列において、デォキシリボヌクレオチドが 4個以上 連続することはなぐ ドとの混合配列である場合、その配列において、デォキシリボヌクレオチドが 4個以上 連続することはなぐ
Wing1— RU又は R12— Wing2の配列を構成する少なくとも 1個のリボヌクレオチドは、糖 部の 2，-0と 4，-Cが C アルキレン鎖で架橋されている。 )
1-4
[0009] (2) C アルキレン鎖がエチレン鎖である（1)記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド
1-4
又は薬理学上許容されるその塩。
(3)疾患関連遺伝子の RNAを標的とする（1)又は（2)記載のアンチセンスオリゴヌク レオチド又は薬理学上許容されるその塩。
(4)疾患関連遺伝子が PADI4遺伝子である（3)記載のアンチセンスオリゴヌクレオチ ド又は薬理学上許容されるその塩。
(5)標的 RNAが Gene Bank accession No. ΝΜ_011061· 1又は NM_012387の塩基配 列を有する（4)記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又は薬理学上許容されるその
½) (1)又は（2)記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又は薬理学上許容されるその 塩を含む組成物。
[0010] (7)医薬として使用される（6)記載の組成物。
(8)試薬として使用される（6)記載の組成物。
(9) (1)又は（2)記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又は薬理学上許容されるその 塩を用いて、標的 RNAの発現を抑制する方法。
(10) (1)又は（2)記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又は薬理学上許容されるそ の塩を用いて、標的 RNAが関与する疾患を予防及び/又は治療する方法。
(11)標的 RNAが関与する疾患を予防及び/又は治療するための医薬を製造する ための（1)又は（2)記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又は薬理学上許容される その塩の使用。
[0011] 本明細書において、「アンチセンスオリゴヌクレオチド」とは、標的とする特定の遺伝 子の発現を調節（例えば、抑制、増強）することができるオリゴヌクレオチドをいい、標 的 RNA (センス鎖）に対して相補的な配列を有する。
なお、本明細書においては、特に断らない限り、ヌクレオチド鎖を略号で表すときは 、 5'末端が左、 3'末端が右であり、ペプチドを略号で表すときは、ァミノ末端が左、力 ルポキシ末端が右である。
発明の効果
[0012] 本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチド及び薬理学上許容されるその塩は、標的 RNAに対する配列特異的切断作用を有するので、標的 RNAの発現を特異的に抑 制すること力 Sでき、例えば、標的 RNAが関与する疾患の予防及び/又は治療に有 効である。
本明細書は、本願の優先権の基礎である日本国特許出願、特願 2006-242403号の 明細書および/または図面に記載される内容を包含する。
図面の簡単な説明
[0013] [図 1]アンチセンスオリゴヌクレオチドの作用機序を示す。
[図 2]DNA、 RNA, PS ODNの構造と N、 S型配座を示す。
[図 3]アンチセンス法で用いられている RNA型修飾ヌクレオチドの構造を示す。
[図 4]RNA型修飾ヌクレオチドを用いたアンチセンスのデザインを示す。
[図 5]オリゴヌクレオチドと PADI4 cRNAの 2本鎖に対する RNase Hの反応のゲル電気 泳動の結果を示す。
[図 6]オリゴヌクレオチドと PADI4 cRNAの 2本鎖に対する RNase Hの反応のゲル電気 泳動の結果を示す。
[図 7]オリゴヌクレオチドによるマウス PADI4 mRNAの発現抑制の結果を示す。
発明を実施するための最良の形態
[0014] 以下、本発明の実施の形態についてより詳細に説明する。
[0015] 合成オリゴヌクレオチドを用いるアンチセンス法は、癌、ウィルスなどの疾患を対象と した医薬品としての利用が考えられているだけではなぐ医薬品開発における標的遺 伝子の評価のためにも応用されている（J. Kurreck, Eur. J. Biochem., 270， 1628 (20 03).; R. S. Geary, S. P. Henry,し R Grillone. , Clin. Pharmacokinet. , 41， 255 (2002). ； P. Kennewell, Curr. Opin. Mol. Ther., 5， 76 (2003)·)。アンチセンス法で用いられ ているオリゴヌクレオチドの作用機構は、図 1に示したように、生体内の RNAに結合し 作用することを基本概念とし、（1) mRNAからたんぱく質が合成される翻訳の過程を 阻害する、（2) mRNA前駆体 (pre-mRNA)から mRNAが生成するスプライシングの過程 を阻害する、（3) RNase Hがアンチセンスオリゴヌクレオチドと mRNAとが形成する 2本 鎖を基質として認識し、 RNase Hが mRNAを分解し mRNAの機能を阻害する等が知ら れている（J. Kurreck, Eur. J. Biochem., 270， 1628 (2003)·)。この 3つの中で一般的 に用いられているのは、（3)の RNase Hの作用を利用したものである。この場合に利 しながら、天然のリン酸ジエステル結合を有する DNAを用いた場合、生体内のヌクレ ァーゼの作用により速やかに分解されてしまう。そこで、細胞内でアンチセンス法を 利用する場合、図 2に示したように DNA型であってリン酸基が修飾されたオリゴヌタレ ォチドが用いられている。特にホスホロチォエート型修飾オリゴヌクレオチド（3: PS 0 DN)は、ヌクレアーゼ耐性があり、 RNAと 2本鎖を形成した場合 RNase Hの基質になり 、ある程度の細胞透過性を有することから最も一般的に用いられている (J. Kurreck, Eur. J. Biochem., 270， 1628 (2003)· ; R. S. Geary, S. P. Henry,し R Grillone., Clin. Pharmacokinet. , 41， 255 (2002)·; P. Kennewell, Curr. Opin. Mol. Ther. , 5， 76 (2003 ).) 0その反面、 PS ODNは天然の DNAと比較して、 RNAへの結合力が低下すること、 非特異的なタンパク質への結合があること、 in vivoでの適応において血液凝固系の 阻害、補体系の活性等の欠点が報告されている。それらの PS ODNの欠点を克服す るアンチセンスオリゴヌクレオチドとして、 RNA骨格を利用してデザインされた人工核 酸が数多く報告されている（J. Kurreck, Eur. J. Biochem., 270， 1628 (2003)·; S. M. F reier, . H. Altmann, Nucleic Acids Res. , 25， 4429 (1997)·)。
核酸を構成する糖のフラノース環は、図 2に示すように主に 2つのパッカリング様式 、 N型配座と S型配座を形成することが知られている（W. Saenger, Principles of nuclei c acids structure, Springer— Verlag, New York. 1984·)。 RNA骨格をもつヌクレオシド を構成するリボースの 2 '位に水酸基を有するものは、 2 ' -OH基の酸素原子と 4 '位の 酸素原子のゴーシュ効果によってリボースのフラノース環の立体配座として N型配座 の割合が多くなつていることが知られている。 DNA骨格をもつヌクレオシドは、リボース の 2 '位が水素原子になっているため、 RNA骨格でみられたゴーシュ効果がみられず S型配座を優先する。
[0017] また、天然の 2本鎖 RNAが形成する A型らせん中においても個々のヌクレオシドが N 型配座として存在しており、実際に安定性を融解温度（Tm)により測定すると、 RNAと RNAとが形成する 2本鎖の安定性は、 DNAと RNAとが形成する 2本鎖の安定性よりも 尚いことカ 艮告 れていな (W. Saenger, Principles of nucleic acias structure, Springe r- Verlag, New York. 1984·)。これらのことより、 RNAを標的とするアンチセンスオリゴ ヌクレオチドの利用を考えた場合、 N型配座を優先する RNA骨格を利用するが有利 であると考えられている。
[0018] 天然型 RNAをアンチセンスオリゴヌクレチドとしてそのまま細胞実験で使うことは、細 胞培養に用いられる血清中や細胞内に存在するリボヌクレアーゼ（RNase)に感受性 が高いために実用的ではない。そこで RNaseに耐性を示す RNA骨格をベースとした 誘導体化がなされている。
[0019] RNAの 2 ' -OH基は RNaseの分解反応に必須であるので、この 2 ' -OH基をアルキル 化し RNaseの基質にならない 2 ' -0-アルキルヌクレオシド（4)とした数多くの誘導体が 報告されている（図 3)。中でも 2 ' -0-メチル体は tRNAの中にも見られる修飾体で、ァ ンチセンス研究の初期の頃から利用されよく研究されている（H. Inoue, Y. Hayase, A • Imura, S. Iwai, . Miura, E. Ohtsuka. Nucleic Acids Res. 15， 6131 (1987)·)。さらに 2 ' -O-メチル体は相補鎖 RNAとの親和性も向上させること力 Sでき（ Δ Tm/mod.( DNA の場合と比較し一残基あたりの Tm値の変化を表し、 +の場合 RNAとの親和性が高 いことを意味する） = +1.5°C)、 RNase耐性も示す。アルキル基の炭素数を増加させる とともに RNAとの親和性が減少し、 2 ' -0_プロピル体では、 DNAと同様の A Tm/mod. 値を示し、それ以上では、 A Tm/mod.値は低下する（Ε· A. Lesnik, C. J. Guinosso, A. M. Kawasaki, H. Sasmor, M. Zounes, L. L. Cummins, D. L. J^cker, P. Dan ook, S. M. Freier, Biochemistry 32， 7832 (1993)·)。炭素数を 5つ以上のアルキル基を有 するヌクレオシドにおいては、ヌクレアーゼに対して高い耐性を獲得している（E. A. L esniK, し. J. uinosso, A. M. Kawasaki, H. ¾asmor, M. Zounes, L. L. し ummins, D. し Ecker, P. Dan Cook, S. M. Freier, Biochemistry 32， 7832 (1993).; B. P. Monia, E . A. Lesnik, C. Gonzalez, W. F. Lima, D. Mc ee, C. J. Guinosso, A. M. Kawasaki, P. Dan Cook, S. M. Freier, J. Biol. Chem. 268， 14514 (1993).; B. P. Monia, J. . Jo hnson, H. Sasmor,しし Cummins, J. Biol. Chem., 271， 14533 (1996)·)。また、アル キル基の末端に置換基を有するものとして、 2 ' -0_(2-メトキシェチル)基を有するヌク レオシド（5: 2， -MOE)は、メトキシェチル基のゴーシュ効果によって RNAとの親和性（ A Tm/mod.=+2°C)を向上させ、ヌクレアーゼ耐性も有している（P. Martin, Helv. Chi m. Acta 78， 486 (1995).; M. Teplova, G. Minasov, V. Tereshko, G. B. Inamati, P. D an Cook, M. Manoharan, M. Egli, Nature Struct. Biol. 6， 535 (1999)·)。 2，— O—ァミノ プロピル基を有するヌクレオシド (6: AP)は、 2 ' -0-プロピル体との同程度の親和性（Δ Tm/mod.=0°C)であって、 PS-ODNよりも優れたヌクレアーゼ耐性が観察されている（R . H. Griffey, B. P. Monia, L. L. Cummins, S. Freier, M. J. Greig, C. J. Guinosso, E.
Lesnik, S. M. Manalili, V. Mohan, S. Owens, B. R. Ross, H. Sasmor, E. Wancewicz, . Weiler, P. D. Wheeler, P. Dan Cook, J. Med. Chem. 39， 5100 (1996)·)。その理 由として、 APの 2 ' _0 -ァミノプロピル基のアミノ基が大腸菌由来の Klenow fragment 3 ' -5 'ェキソヌクレアーゼの金属イオンの結合部位に位置し、ヌクレアーゼの触媒反応 を阻害していること力 S、 X線結晶構造解析から明らかになつている（M. Teplova, S. T. Wallace, v . fereshko, G. Minasov, A. iVL Symons, P. Dan ook, M. Manoharan, M.
Egli, Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. 96， 14240 (1999) · )。
2， -OH基を 2， -Fに置換したヌクレオシド（7: 2， -F)を有するオリゴヌクレオチドは、 N 型配座を優先して形成し、 RNAとの親和性も高くなる（A Tm/mod.=+2.5°C) (A. M. a wasaki, . O. し asper, M. rreier, 乜. A. Lesnik, M. C. Zounes, L. L. し ummins,し.
Gonzalez, P. Dan Cook, J. Med. Chem. 36， 831 (1993)·)。しかしながら、リン酸ジェ ステル結合からなるものはヌクレアーゼ抵抗性がな!/、ので、ホスホロチォエート結合と し、ヌクレアーゼ抵抗性を持たせている（Α· M. Kawasaki, M. D. Casper, S. M. Freier ， E. A. Lesnik, M. C. Zounes, L. L. Cummins, C. Gonzalez, P. Dan Cook, J. Med. Chem. 36， 831 (1993)·)。
[0021] RNAの N型配座に完全に固定化した人工核酸として、糖部の 2 ' -酸素原子と 4' -炭 素原子をメチレン鎖で架橋した 2，，4，-BNA/LNA (8: bridged nucleic acids/locked nu cleic acids)が報告されている（S. Obika, D. Nanbu, Y. Hari, . Morio, Y. In, T. Ishi da, T. Imanishi, Tetrahedron Lett., 38， 8735 (1997).; S. Obika, D. Nanbu, Y. Hari, J. Andoh, . Morio, T. Doi, T. Imanishi, Tetrahedron Lett. , 39， 5401 (1998).; A. A. oshkin, S. . Singh, P. Nielsen, V. . Rajwanshi, R. Kumar, M. Meldgaard, C. E. Olsen, J. Wengel, Tetrahedron, 54， 3607 (1998).; S. Obika, T. Uneda, T. Sugimoto, D. Nanbu, T. Minami, T. Doi, T. Imanishi, Bioorg. Med. Chem., 9， 1001 (2001)·)。 このように核酸の糖部をメチレン鎖で架橋すると立体配座の自由度が束縛され、 2 '，4 ，-BNA/LNAを含むオリゴヌクレオチドは、 A Tm/mod.=+5〜8°Cと、驚異的な 2本鎖の 安定性を示す。また、 2，，4，-BNA/LNAを含むオリゴヌクレオチドは、 DNAと比較し、ヌ クレアーゼに対する安定性も向上している。さらに、 2 '，4' -BNA/LNAのメチレン鎖を 一炭素延ばしたエチレン鎖で架橋した ENA (9: 2 ' -0,4' -C-ethylene-bridged nuclei c acids)は、 2，，4，-BNA/LNAと同程度のΔ Tm/mod·=+5。Cを持ち、加えて 2，，4，_BNA /LNAよりも優れたヌクレアーゼに対する安定性を有している（Κ· Morita, C. Hasegaw a, . aneko, S. fsutsumi, J. Sone, Γ. IshiKawa, Γ. Imanishi, M. Koizumi, Bioorg. Med. Chem. Lett. , 12， 73 (2002).; . Morita, M. Takagi, C. Hasegawa, M. aneko, S. fsutsumi, J. Sone, T. Ishikawa, T. Imanishi, M. Koizumi, Bioorg. Med. Chem. , 11 ， 2211 (2003).)。糖部の 2 ' -酸素原子と 4' -炭素原子の架橋をプロピレン鎖にした場 合は、ヌクレアーゼ耐性は向上するが、 A Tm/mod.=+2°Cに低下してしまうことが報告 れ飞いる (Κ· Morita, M. Takagi, C. Hasegawa, M. Kaneko, S. Tsutsumi, J. Sone, T • Ishikawa, T. Imanishi, M. Koizumi, Bioorg. Med. Chem., 11， 2211 (2003)·)。
[0022] RNA型修飾アンチセンスオリゴヌクレオチドは、前述のように標的 RNAと安定な 2本 鎖を形成する。すべてが RNA型修飾ヌクレオチドからなるオリゴヌクレオチド folly mo dified oligonucleotidesj (以後「FMO」と略す）は、 mRNAとの結合力が非常に強まるこ とから、図 1に示したように（1 ) mRNAからたんばく質が合成される翻訳の過程の阻害 、（2) mRNA前駆体から mRNAが生成するスプライシングの過程を阻害する目的には 非常に有用である。しかしながら、 FMOと標的 RNAとの 2本鎖は、 RNase Hの基質に ならない（H. Inoue, Y. Hayase, S. Iwai, E. Ohtsuka FEBS Lett. 215， 327 ( 1987). ; W. F. Lima, S.T. Crooke, Biochemistry 36， 390 (1997). ; H. Wu， W. F. Lima, S.T. Cro oke, J. Biol. Chem. 274， 28270 (1999)·)。そこで図 4Aに示したように、 RNA型修飾ヌ クレオシドと DNAからなるキメラオリゴヌクレチドがアンチセンス法で用いられている。 そのデザインとして、 wingと呼ばれる RNA型修飾ヌクレオチドをオリゴヌクレオチドの両 側に配置し、 windowと呼ばれる連続した DNAを中央部に持つ「gapmer」がある。すな わち、 gapmerは、 wing—window— wingといった構造を有することになる。 ί列えは、 RNA 型修飾ヌクレオシドとして 2， -0-メチルヌクレオシド（2， -OMe RNA)を用いた場合、 2， -OMe RNA -DNA-2 ' -OMe RNAといったキメラオリゴヌクレオチドになる。 gapmerは 、中央部分に連続した DNA領域を持っために、 gapmerと標的 RNAとの 2本鎖は RNas e Hの基質になる。この windowの DNAの長さは、用いる RNase Hによって異なり、 wing 部分に 2， -OMe RNAを用いた場合、ヒト RNase H Iでは 4ヌクレオチド以上（Η· Wu， W • F. Lima, S.T. Crooke, J. Biol. Chem. 274， 28270 (1999). )、大腸菌 RNase Hでは 5 ヌクレオチド以上（W. F. Lima, S.T. Crooke, Biochemistry 36， 390 (1997)· )必要であ る。 window部分の DNA領域が長いほど RNase Hの基質になりやすい。 wing部分の修 飾ヌクレオチドは、標的 RNAとの親和性を高める目的であり、その長さが長いほど標 的 RNAとの親和性が高くなる。アンチセンスとしての活性で見た場合、 windowと wing の長さのバランスが必要になり、そのよいものが高活性になりうる（E. A. Lesnik, C. J. Guinosso, A. M. Kawasaki, H. Sasmor, M. Zounes, L. L. Cummins, D. L. J^cker, P. Dan Cook, S. M. Freier, Biochemistry 32， 7832 ( 1993)· ; B. P. Monia, E. A. Lesnik, C. Gonzalez, W. F. Lima, D . McGee, C. J. Guinosso, A. M. Kawasaki, P. Dan Cook ， S. M. Freier, J. Biol. Chem. 268， 14514 (1993). ; B. P. Monia, J. . Johnson, H. Sa smor,しし Cummins, J. Biol. Chem. , 271， 14533 (1996). ) (図 4B)。
2 ' -OMe RNAは、前述のように古く力、らアンチセンス研究に用いられている力 最 近 gapmerを用いた PTEN遺伝子の機能解析の例が報告されて!/、る (M. Sternberger, A. Schmiedeknecht . A. retscnmer. . ebhardt . Leenders . P . Czauderna. I. vo n Carlowitz, M. Engle, . Giese, L. Beigelman, A. lippel, Antisense Nucleic Acids Drug Dev. 12， 131 (2002)·)。この場合、両 wing部分に 7ヌクレオチドからなる 2 ' -OMe
RNAを用い、 window部分には 9ヌクレオチドからなる PS ODNを用いて、鎖長 23ヌク レオチドからなるアンチセンスを用いている。さらに、ェキソヌクレアーゼに対する安 定性を増すために、 3 '，5 ' -両末端にテトラヒドロフラン誘導体を結合させている。
[0024] 2， -MOEを wingとして含む gapmerの数多くのアンチセンスを用いた研究が報告され 飞いる (B. A. Zinker, C. M. Rondinone, J. M. Tr evilly an, R. J. Gum, J. E. Ciam it, J . F. Waring, N. Xie, D. Wilcox, P. Jacobson, L. Frost, P. E. roeger, R. M. Re illy, S. oterski, T. J. Opgenorth， R. G. Ulrich, S. Crosby, M. Butler, S. F. Murray, R. A. McKay, S. Bhanot, B. P. Monia, M. R. Jirousek, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 99， 11357 (2002).; H. Zhang, J. Cook, J. Nickel, R. Yu， . Stecker, . Myers, N. M. De an, Nature Biotechnol. 18， 862 (2000).; B. Z. Carter, R. Y. Wang, W. D. Schober, M. Milella, D. Chism, M. Andreeff, Cell Cycle. 2， 488 (2003)·)。 2，- MOEをアンチセ ンス法で用いる場合、そのリン酸基は、すべてホスホロチォエート結合のものが用い られている。ヌクレアーゼ耐性を獲得するためだけではなぐ in vivoでの適応を考え た場合、ホスホロチォエート結合のものの方がアンチセンスの体内動態面で有利に なることが報告されている（R. S. Geary, T. A. Watanabe,し Truong, S. Freier, E. A.
Lesnik, N. B. Sioufi, H. Sasmor, M. Manoharan, A. A. Levin, J. Pharmacol. Exp. Th er. 296， 890 (2001)·)。リン酸ジエステル結合からなる 2 ' -MOE体は、尿中力、ら速やか に排泄されてしまうのに対し、ホスホロチォエート結合からなる 2 ' -MOE体は、高い血 中安定性を示し、肝臓、腎臓、勝臓、骨髄等、脳以外のほとんどの組織への移行性 を示す。分布量は、 PS ODNよりも優れている。現在ホスホロチォエート結合からなる 2 ' -MOE体は、抗腫瘍、抗炎症、抗糖尿病を目的としたアンチセンス薬としての臨床 開発されている。
[0025] 2，，4，- BNA/LNAも 2，- MOEと同様に wingに用い、 gapmerとしてのアンチセンスがデ ザインされている。ラット delta opioid receptor mRNAを標的とした 2，，4， -BNA/LNAを 含むアンチセンスが設計され、ラット脳脊髄液中に注射することによって opioid recept orを介した痛覚応答の抑制が観察されている（C. Wahlestedt, P. Salmi,し Good, J. ela, T. Johnsson, T. Hokfelt, C. Broberger, F. Porreca, J. Lai, . Ren, M. Ossipo v， A. oshkin, N. Jakobsen, J. Skouv, H. Oerum, M. H. Jacobsen, J. Wengel, Proc Natl Acad Sci U S A. 97， 5633 (2000)·)。また、 RNA polymerase IIを標的とした 2，，4， -BNA/LNAからなる FMOアンチセンスがデザインされ、 RNA polymerase IIタンパク 質の減少が観察され、さらに腫瘍移植モデルマウスを使った in vivo系で腫瘍増殖抑 制が認められている（K. Fluiter, A.し ten Asbroek, M. B. de Wissel, M. E. Jakobs, M. Wissenbach, H. Olsson, O. Olsen, H. Oerum, F. Baas, Nucleic Acids Res. 31， 9 53 (2003).)。この場合リン酸基を修飾することなくリン酸ジエステル結合のままで用い られており、その体内動態は主に腎臓に分布し、尿中から排泄されることが示されて いる。また RNAに対して結合力が強い 2，，4，-BNA/LNAは、 2，_OMe RNAとの mixmer を用いて、 HIV-1 TAR RNAに結合し Tatの機能を阻害できることが示されている。こ の mixmerは、 12merと短鎖長にも関わらず、 mixmerと TAR RNAは peudoknot構造を 开$成し安定な複合体になる（A. Arzumanov, A. P. Walsh, V. . Rajwanshi, R. Kumar ， J. Wengel, M. J. Gait, Biochemistry 40， 14645 (2001)·)。
[0026] ENAにおいても、薬物の輸送に関与する有機ァニオントランスポーターに対する ga pmerが、塩基配列がよく類似した 3つのサブタイプに対して特異的に切断できうること が示された（M. Takagi, . Morita, D. Nakai, R. Nakagomi, T. Tokui, M. Koizumi, Bi ochemistry, 43， 4501 (2004)·)。また、 ENAと 2，_OMe RNAからなるキメラオリゴヌタレ ォチドが筋ジストロフィーの原因遺伝子であるジストロフィン遺伝子のェキソンスキッピ ング反応を促進し、治療法としての可能性が示されている（M Yagi, Y. Takeshima, A . Surono, M. Takagi, M. Koizumi, M. Matsuo, Oligonucleotides, 14， 33 (2004). ; A. S urono, T. van hanh, Y. Takeshima, H. Wada, M. Yagi, M. Takagi, M. Koizumi, M. Matsuo, Hum. Gene. Ther., 15， 749 (2004)·)。
[0027] 本発明は、下記の配列 (I)を有するアンチセンスオリゴヌクレオチド又は薬理学上許 容されるその塩を提供する。
Wing1— R11— Window― R —Wing2 (I)
(配列 (I)中、 Windowはヌクレオチド数 5又は 6のデォキシリボヌクレオチド配列であり、 R11及び R12は、それぞれ、独立に、リボヌクレオチドであり、 Wing1及び Wing2は、それぞれ、独立に、リボヌクレオチド、リボヌクレオチド酉己列、デォ ボヌクレオチドとの混合配列であるが、 ドとの混合配列である場合、その配列において、デォキシリボヌクレオチドが 4個以上 連続することはなぐ ドとの混合配列である場合、その配列において、デォキシリボヌクレオチドが 4個以上 連続することはなぐ
Wing1— RUの配列を構成する少なくとも 1個のリボヌクレオチド及び R12— Wing2の配 列を構成する少なくとも 1個のリボヌクレオチドは、それぞれ、糖部の 2' -0と 4' -Cが C アルキレン鎖で架橋されている。 )
1-4
本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドの塩基数は、特に限定されるものではない 1S 8〜25個が適当であり、 10〜20個力 S好ましく、 12〜20個がより好ましい。
配列 (I)において、 Wing1のヌクレオチド数及び Wing2のヌクレオチド数は、それぞれ、 独立に、 0個〜 18個が適当であり、 2個〜 13個が好ましぐ 4個〜 13個がより好まし い。
配列 (I)において、 Wing1— R11の配列を構成する少なくとも 1個のリボヌクレオチド及 び R12— Wing2の配列を構成する少なくとも 1個のリボヌクレオチドは、それぞれ、糖部 の 2' -0と 4' -Cが C アルキレン鎖で架橋されている。それ以外にも、配列 (I)を構成
1-4
するリボヌクレオチド及びデォキシリボヌクレオチドには、糖、塩基、リン酸ジエステル 結合、末端のリン酸の修飾がなされていてもよい。糖の修飾の例としては、 D—リボフ ラノースの 2'-0-アルキル化、 2， -0-アルケニル化若しくは 2， -0-アルキニル化（例え ば、 2'-0-メチル化、 2'-0-アミノエチル化、 2'-0-プロピル化、 2'-0-ァリル化、 2'-0- メトキシェチル化、 2'-0-ブチル化、 2'-0-ペンチル化、 2'-0-プロパルギル化など）、 D—リボフラノースの 2'-0，4'-C-アルキレン化（例えば、 2'-0，4'-C-エチレン化、 2'- 0，4'-C-メチレン化、 2'-0，4'-C-プロピレン化、 2'-0，4'-C-テトラメチレン化など）、 3' -デォキシ -3'-ァミノ- 2'-デォキシ -D-リボフラノース、 3'-デォキシ -3'-ァミノ- 2'-デォ キシ -2'-フルォ口- D-リボフラノースなどを挙げることができる。塩基の修飾の例として は、シトシンの 5-メチル化、 5-フルォロ化、 5-ブロモ化、 5-ョード化、 N4-メチル化、チ ミジンの 5-デメチル化（ゥラシル）、 5-フルォロ化、 5-ブロモ化、 5-ョード化、アデニン の N6-メチル化、 8-ブロモ化、グァニンの N2-メチル化、 8-ブロモ化などを挙げること 力できる。リン酸ジエステル結合の修飾の例としては、ホスホロチォエート結合、メチ ルホスホネート結合、メチルチオホスホネート結合、ホスホロジチォエート結合、ホス ホロアミデート結合などを挙げることができる。末端のリン酸の修飾の例としては、末 端のリン酸のエステル化などを挙げることができる。
糖部の 2 ' -0と 4' -Cが C アルキレン鎖で架橋されているリボヌクレオチドの一例を
1-4
以下に記載する。
[化 1]
Figure imgf000016_0001
(1)
[式 (1)中、 R1及び R2は、同一又は異なって、水素原子、水酸基の保護基、リン酸基、 保護されたリン酸基又は— P (R3) R4 [式中、 R3及び R4は、同一又は異なって、水酸基 、保護された水酸基、メルカプト基、保護されたメルカプト基、アミノ基、炭素数 1乃至 4個のアルコキシ基、炭素数 1乃至 4個のアルキルチオ基、炭素数 1乃至 5個のシァノ アルコキシ基又は炭素数 1乃至 4個のアルキル基で置換されたアミノ基を示す]を示 し、 Aは、炭素数 1乃至 4個のアルキレン基を示し、 Bは、プリン— 9—ィル基、 2—ォ キソー 1 , 2—ジヒドロピリミジン— 1—ィル以下、基又は下記 α群から選択される置換 基を有する置換プリン 9 ィル基若しくは置換 2 ォキソ 1 , 2 ジヒドロピリミジン 1 ィル基を示す。 ]で表わされる化合物及びその塩。
( α群）
水酸基、保護された水酸基、炭素数 1乃至 4個のアルコキシ基、メルカプト基、保護さ れたメルカプト基、炭素数 1乃至 4個のアルキルチオ基、アミノ基、保護されたァミノ基 、炭素数 1乃至 4個のアルキル基で置換されたァミノ基、炭素数 1乃至 4個のアルキ ル基、及び、ハロゲン原子。
上記一般式（1)中、 Aの「炭素数 1乃至 4個のアルキレン基」としては、例えば、メチ レン、エチレン、トリメチレン、テトラメチレン基をあげることができ、好適には、メチレン 基 ある。
上記一般式（1)中、 R1及び R2の「水酸基の保護基」、並びに R3及び R4又は α群の「 保護された水酸基」の保護基とは、加水素分解、加水分解、電気分解及び光分解の ような化学的方法又は人体内で加水分解等の生物学的方法により開裂し得る保護 基のことをいい、そのような保護基としては、例えば、ホルミル、ァセチル、プロピオ二 ノレ、ブチリノレ、イソブチリル、ペンタノィル、ピバロィル、ノ レリノレ、イソバレリル、ォクタ ノィル、ノナノィル、デカノィル、 3—メチルノナノィル、 8—メチルノナノィル、 3—ェチ ルォクタノィル、 3, 7—ジメチルォクタノィル、ゥンデカノィル、ドデカノィル、トリデカノ ィル、テトラデカノィル、ペンタデカノィル、へキサデカノィル、 1ーメチルペンタデカノ ィル、 14ーメチルペンタデカノィル、 13, 13 ジメチルテトラデカノィル、ヘプタデカ ノィル、 15 メチルへキサデカノィル、ォクタデカノィル、 1 メチルヘプタデカノィル 、ノナデカノィル、アイコサノィル及びへナイコサノィルのようなアルキルカルボニル基
、クロロアセチノレ、ジクロロアセチノレ、トリクロロアセチノレ、 トリフノレオロアセチノレのような ハロゲノ低級アルキルカルボニル基、メトキシァセチルのような低級アルコキシ低級ァ ノレキルカルボニル基、（Ε)— 2—メチル -2—ブテノィルのような不飽和アルキルカル ボニル基のような「脂肪族ァシル基」；ベンゾィル、 α ナフトイル、 /3—ナフトイルの ようなァリールカルボニル基、 2 ブロモベンゾィル、 4 クロ口ベンゾィルのようなハ ロゲノアリールカルボニル基、 2, 4, 6-トリメチルベンゾィル、 4 トルオイルのような 低級アルキル化ァリールカルボニル基、 4ーァニソィルのような低級アルコキシ化ァリ ールカルボニル基、 2 カルボキシベンゾィル、 3 カルボキシベンゾィル、 4一力ノレ ボキシベンゾィノレのようなカノレポキシィヒアリーノレカノレポ二ノレ基、 4一二トロべンゾィノレ、 2—二トロベンゾィルのようなニトロ化ァリールカルボニル基； 2—（メトキシカルボ二ノレ） ベンゾィルのような低級アルコキシカルボ二ル化ァリールカルボニル基、 4 フエ二 ルベンゾィルのようなァリール化ァリールカルボニル基のような「芳香族ァシル基」；テ トラヒドロピラン- 2 ィル、 3 ブロモテトラヒドロピラン- 2 ィル、 4ーメトキシテトラヒド 口ピラン- 4 ィル、テトラヒドロチォピラン- 2 ィル、 4—メトキシテトラヒドロチォピラン- 4ーィルのような「テトラヒドロビラニル又はテトラヒドロチォピラニル基」；テトラヒドロフラ ン -2—ィル、テトラヒドロチォフラン- 2—ィルのような「テトラヒドロフラニル又はテトラヒ ドロチオフラニル基」；トリメチルシリル、トリェチルシリル、イソプロピルジメチルシリル、 イソプロビルシリルのようなトリ低級アルキルシリル基、ジフエニルメチルシリル、ジフエ うな 1乃至 2個のァリール基で置換されたトリ低級アルキルシリル基のような「シリル基」 ；メトキシメチノレ、 1 , 1ージメチノレー 1ーメトキシメチノレ、エトキシメチノレ、プロポキシメチ ル、イソプロポキシメチル、ブトキシメチル、 t-ブトキシメチルのような「低級アルコキシ メチル基」； 2—メトキシエトキシメチルのような「低級アルコキシ化低級アルコキシメチ ル基」；2, 2, 2—トリクロ口エトキシメチル、ビス (2—クロ口エトキシ）メチルのような「ノヽ ロゲノ低級アルコキシメチル」；1 エトキシェチル、 1 （イソプロポキシ）ェチルのよ うな「低級アルコキシ化工チル基」； 2, 2, 2—トリクロ口ェチルのような「ノヽロゲン化工 チノレ基」；ベンジル、 α ナフチルメチル、 β ナフチルメチル、ジフエニルメチル、ト リフエニルメチル、 α ナフチルジフエニルメチル、 9 アンスリルメチルのような「1乃 至 3個のァリール基で置換されたメチル基」；4 メチルベンジル、 2 , 4, 6-トリメチル ベンジル、 3, 4, 5—トリメチルベンジル、 4ーメトキシベンジル、 4ーメトキシフエ二ノレ ジフエニルメチル、 4、 4 'ージメトキシトリフエニルメチル、 2 二トロベンジル、 4一二ト 口ベンジル、 4—クロ口ベンジル、 4—ブロモベンジル、 4—シァノベンジルのような「低 級アルキル、低級アルコキシ、ハロゲン、シァノ基でァリール環が置換された 1乃至 3 個のァリール基で置換されたメチル基」；メトキシカルボニル、エトキシカルボニル、 t- ブトキシカルボニル、イソブトキシカルボニルのような「低級アルコキシカルボニル基」 ; 2, 2, 2—トリクロ口エトキシカルボニル、 2—トリメチルシリルエトキシカルボニルのよ うな「ノヽロゲン又はトリ低級アルキルシリル基で置換された低級アルコキシカルボニル 基」；ビュルォキシカルボニル、ァリールォキシカルボニルのような「アルケニルォキシ カルボニル基」；ベンジルォキシカルボニル、 4ーメトキシベンジルォキシカルボニル、 3, 4ージメトキシベンジルォキシカルボニル、 2 二トロべンジルォキシカルボニル、 4一二トロべンジルォキシカルボニルのような 1乃至 2個の「低級アルコキシ又はニトロ 基でァリール環が置換されて!/、てもよ!/、ァラルキルォキシカルボニル基」をあげること ができ、 R1及び R2の「水酸基の保護基」においては、好適には、「脂肪族ァシル基」、 「芳香族ァシル基」、「1乃至 3個のァリール基で置換されたメチル基」、「低級アルキ ル、低級アルコキシ、ハロゲン、シァノ基でァリール環が置換された 1乃至 3個のァリ ール基で置換されたメチル基」又は「シリル基」であり、さらに、好適には、ァセチル基 、ベンゾィル基、ベンジル基、 p メトキシベンゾィル基、ジメトキシトリチル基、モノメト キシトリチル基又は tert-ブチルジフエニルシリル基であり、 R3及び R4又は α群の「保 護された水酸基」においては、好適には、「脂肪族アシノレ基」又は「芳香族アシノレ基」 であり、さらに好適には、ベンゾィル基である。
上記一般式（1)中、 R1及び R2の「保護されたリン酸基」の保護基とは、加水素分解 、加水分解、電気分解及び光分解のような化学的方法又は人体内で加水分解等の 生物学的方法により開裂し得る保護基のことをいい、そのような保護基としては、例え ば、メチル、ェチル、 η プロピル、イソプロピル、 η ブチル、イソブチル、 s ブチノレ 、 tert ブチル、 n ペンチル、イソペンチル、 2—メチルブチル、ネオペンチル、 1 - ェチルプロピル、 n へキシル、イソへキシル、 4ーメチルペンチル、 3—メチルペンチ ノレ、 2 メチルペンチル、 1ーメチルペンチル、 3, 3 ジメチルブチル、 2, 2 ジメチ ノレブチル、 1 , 1ージメチルブチル、 1 , 2—ジメチルブチル、 1 , 3—ジメチルブチル、 2, 3 ジメチルブチル、 2 ェチルブチルのような「低級アルキル基」；2 シァノエチ ル、 2—シァノー 1 , 1ージメチルェチルのような「シァノ化低級アルキル基」；2—メチ ノレジフエニルシリルェチル、 2—トリメチルシリルェチル、 2—トリフエニルシリルェチル のような「シリル基で置換されたェチル基」；2, 2, 2—トリクロロェチル、 2, 2, 2—トリ フ、、口モェチノレ、 2, 2, 2—卜リフノレ才ロェチノレ、 2, 2, 2—卜リクロロ 1、 1ージメチノレエ チルのような「ノヽロゲン化低級アルキル基」；ェテュル、 1 プロぺニル、 2—プロぺニ ノレ、 1—メチノレ一 2—プロぺニノレ、 1—メチノレ一 1—プロぺニノレ、 2—メチノレ一 1—プロ ぺニノレ、 2—メチノレ一 2—プロぺニノレ、 2—ェチノレ一 2—プロぺニノレ、 1—ブテニノレ、 2 ーブテュル、 1ーメチルー 2—ブテュル、 1ーメチルー 1ーブテュル、 3—メチルー 2— ブテュル、 1ーェチルー 2 ブテュル、 3 ブテュル、 1ーメチルー 3 ブテュル、 2— メチルー 3—ブテュル、 1ーェチルー 3—ブテュル、 1 ペンテュル、 2—ペンテ二ノレ 、 1ーメチルー 2—ペンテュル、 2—メチルー 2—ペンテュル、 3—ペンテュル、 1ーメ チル一 3 ペンテュル、 2 メチル 3 ペンテュル、 4 ペンテュル、 1ーメチノレー 4 ペンテニノレ、 2 メチノレー 4 ペンテニノレ、 1一へキセニノレ、 2 へキセニノレ、 3— へキセニル、 4一へキセニル、 5—へキセニルのような「低級アルケニル基」；シクロプ ロピノレ、シクロブチノレ、シクロペンチノレ、シクロへキシノレ、シクロへプチノレ、ノノレポノレ二 ル、ァダマンチルのような「シクロアルキル基」；2—シァノブテュルのような「シァノ化 低級アルケニル基」；ベンジル、 α ナフチルメチル、 /3—ナフチルメチル、インデニ ノレメチル、フエナンスレニルメチル、アントラセニルメチル、ジフエニルメチル、トリフエ ニルメチル、 1ーフエネチル、 2—フエネチル、 1 ナフチルェチル、 2—ナフチルェ チノレ、 1 フエニノレプロピノレ、 2—フエニノレプロピノレ、 3—フエニノレプロピノレ、 1 ナフ チルプロピル、 2 ナフチルプロピル、 3 ナフチルプロピル、 1 フエニルブチル、 2 フエニルブチル、 3—フエニルブチル、 4 フエニルブチル、 1 ナフチルブチル、 2—ナフチルブチル、 3—ナフチルブチル、 4 ナフチルブチル、 1 フエニルペンチ ル、 2 フエ二ルペンチル、 3 フエ二ルペンチル、 4 フエ二ルペンチル、 5 フエ二 ノレペンチル、 1 ナフチルペンチル、 2 ナフチルペンチル、 3 ナフチルペンチル 、 4 ナフチルペンチル、 5 ナフチルペンチル、 1 フエ二ルへキシル、 2 フエ二 ノレへキシノレ、 3—フエ二ルへキシル、 4 フエ二ルへキシル、 5—フエ二ルへキシル、 6 フエ二ルへキシル、 1 ナフチルへキシル、 2—ナフチルへキシル、 3—ナフチノレ へキシル、 4 ナフチルへキシル、 5—ナフチルへキシル、 6—ナフチルへキシルのよ うな「ァラルキル基」；4 クロ口ベンジル、 2—（4一二トロフエニル）ェチル、 0—二トロ ベンジノレ、 4一二トロべンジノレ、 2、 4ージニトロべンジノレ、 4 クロロー 2 二トロべンジ ルのような「ニトロ基、ハロゲン原子でァリール環が置換されたァラルキル基」；フエ二 ノレ、インデュル、ナフチル、フエナンスレニル、アントラセニルのような「ァリール基」；2 —メチルフエニル、 2, 6 ジメチルフエニル、 2 クロ口フエニル， 4 クロ口フエ二ノレ、 2, 4ージクロ口フエニノレ、 2, 5 ジクロ口フエニノレ、 2 ブロモフエニノレ、 4一二トロフエ ニル、 4 クロロー 2 二トロフエニルのような「低級アルキル基、ハロゲン原子、ニトロ 基で置換されたァリール基」を挙げる事ができ、好適には、「低級アルキル基」、「シァ ノ基で置換された低級アルキル基」、「ァラルキル基」又は「ニトロ基、ハロゲン原子で ァリール環が置換されたァラルキル基」であり、さらに好適には、 2—シァノエチル基、 2, 2, 2—トリクロ口ェチル基又はべンジル基である。
[0033] 上記一般式（1)中、 R3及び R4又は α群の「炭素数 1乃至 4個のアルコキシ基」として は、例えば、メトキシ、エトキシ、 η プロポキシ、イソプロポキシ、 η ブトキシ、イソブト キシ、 s—ブトキシ又は tert ブトキシをあげることができ、好適には、メトキシ又はエト キシ基である。
上記一般式（1)中、 R3及び R4又は α群の「保護されたメルカプト基」の保護基として は、例えば、上記水酸基の保護基としてあげたものの他、メチルチオ、ェチルチオ、 t ert ブチルチオのようなアルキルチオ基、ベンジルチオのようなァリールチオ基等の 「ジスルフイドを形成する基」をあげることができ、好適には、「脂肪族ァシル基」又は「 芳香族ァシル基」であり、さらに、好適には、ベンゾィル基である。
[0034] 上記一般式（1)中、 R3及び R4又は α群の「炭素数 1乃至 4個のアルキルチオ基」と しては、例えば、メチルチオ、ェチルチオ、プロピルチオ、イソプロピルチオ、ブチル チォ、イソブチルチオ、 s ブチルチオ、 tert ブチルチオをあげることができ、好適 には、メチルチオ又はェチルチオ基である。
[0035] 上記一般式（1)中、 R3及び R4又は α群の「保護されたァミノ基」の保護基としては、 例えば、ホノレミノレ、ァセチル、プロピオニル、ブチリル、イソブチリル、ペンタノィル、ピ バロィル、バレリル、イソバレリル、オタタノィル、ノナノィノレ、デカノィル、 3—メチノレノ ナノィル、 8—メチルノナノィル、 3—ェチルオタタノィル、 3, 7—ジメチルォクタノィル 、ゥンデカノィル、ドデカノィノレ、トリデカノィル、テトラデカノィル、ペンタデカノィル、 へキサデカノィル、 1ーメチルペンタデカノィル、 14ーメチルペンタデカノィル、 13, 1 3—ジメチルテトラデカノィル、ヘプタデカノィル、 15 メチルへキサデカノィル、オタ タデカノィル、 1 メチルヘプタデカノィル、ノナデカノィル、アイコサノィル及びへナ ィコサノィルのようなアルキルカルボニル基、スクシノィル、グルタロイル、アジポィノレ のようなカルボキシ化アルキルカルボニル基、クロロアセチル、ジクロロアセチル、トリ クロロアセチル、トリフルォロアセチルのようなハロゲノ低級アルキルカルボニル基、メ トキシァセチルのような低級アルコキシ低級アルキルカルボニル基、 （E)— 2—メチル -2—ブテノィルのような不飽和アルキルカルボニル基等の「脂肪族ァシル基」；ベンゾ ィル、 α ナフトイル、 β ナフトイルのようなァリールカルボニル基、 2—ブロモベン ゾィル、 4 クロ口ベンゾィルのようなハロゲノアリールカルボニル基、 2, 4, 6-トリメチ ノレべンゾィル、 4 トルオイルのような低級アルキル化ァリールカルボニル基、 4ーァ 二ソィルのような低級アルコキシ化ァリールカルボニル基、 2—カルボキシベンゾィル 、 3—カルボキシベンゾィル、 4 カルボキシベンゾィルのようなカルボキシ化ァリール カルボニル基、 4一二トロべンゾィル、 2 二トロベンゾィルのようなニトロ化ァリール力 ノレボニル基； 2—（メトキシカルボニル）ベンゾィルのような低級アルコキシカルボニル 化ァリーノレカノレポ二ノレ基、 4 フエニルベンゾィルのようなァリール化ァリールカルボ ニル基等の「芳香族ァシル基」；メトキシカルボニル、エトキシカルボニル、 t-ブトキシ カルボニル、イソブトキシカルボニルのような「低級アルコキシカルボニル基」； 2, 2, 2 トリクロ口エトキシカルボニル、 2—トリメチルシリルエトキシカルボニルのような「ノヽ口 ゲン又はトリ低級アルキルシリル基で置換された低級アルコキシカルボニル基」；ビニ ノレォキシカルボニル、ァリールォキシカルボニルのような「アルケニルォキシカルボ二 ノレ基」；ベンジルォキシカルボニル、 4ーメトキシベンジルォキシカルボニル、 3, 4— ジメトキシベンジルォキシカルボニル、 2 二トロべンジルォキシカルボニル、 4一二ト 口べンジルォキシカルボニルのような 1乃至 2個の「低級アルコキシ又はニトロ基でァ リール環が置換されていてもよいァラルキルォキシカルボニル基」をあげることができ 、好適には、「脂肪族ァシル基」又は「芳香族ァシル基」であり、さらに好適には、ベン ゾィル基である。
上記一般式（1)中、 R3及び R4又は α群の「炭素数 1乃至 4個のアルキル基で置換 されたアミノ基」としては、例えば、メチノレアミノ、ェチノレアミノ、プロピルァミノ、イソプロ ピルァミノ、ブチルァミノ、イソブチルァミノ、 s ブチルァミノ、 tert ブチルァミノ、ジメ チルァミノ、ジェチルァミノ、ジプロピルァミノ、ジイソプロピルァミノ、ジブチルァミノ、 ジイソブチルァミノ、ジ（s ブチル）ァミノ、ジ (tert ブチル）アミノをあげることができ 、好適には、メチルァミノ、ェチルァミノ、ジメチルァミノ、ジェチルァミノまたはジイソプ 口ピルアミノ基である。
[0037] 上記一般式（1)中、 R3及び R4の「炭素数 1乃至 5個のシァノアルコキシ基」とは、上 記「炭素数 1乃至 4個のアルコキシ基」にシァノ基が置換した基をいい、その様な基と しては、例えば、例えば、シァノメトキシ、 2 シァノエトキシ、 3 シァノプロポキシ、 4 ーシァノブトキシ、 3—シァノー 2メチルプロポキシ、又は 1ーシァノメチルー 1 , 1ージ メチルメトキシをあげることができ、好適には、 2—シァノエトキシ基である。
上記一般式（1)中、 α群の「炭素数 1乃至 4個のアルキル基」としては、例えば、メ チノレ、ェチル、プロピル、イソプロピル、ブチル、イソブチル、 s ブチル、 tert ブチ ルをあげることができ、好適には、メチル又はェチル基である。
上記一般式（1)中、 α群の「ハロゲン原子」としては、例えば、フッ素原子、塩素原 子、臭素原子又はヨウ素原子をあげることができ、好適には、フッ素原子又は塩素原 子である。
[0038] 上記一般式（1)中、 Βの「プリン 9ーィル基」及び「置換プリン 9ーィル基」全体 で、好適な基は、 6—ァミノプリン— 9—ィル (すなわち、アデニニル）、ァミノ基が保護 された 6 ァミノプリン一 9—ィル、 2, 6 ジァミノプリン一 9—ィル、 2 ァミノ一 6 ク ロロプリンー9 ィル、ァミノ基が保護された 2 アミノー 6 クロ口プリンー9 ィル、 2 アミノー 6 フルォロプリン 9 ィル、ァミノ基が保護された 2 アミノー 6 フルォ 口プリンー9 ィル、 2 アミノー 6 ブロモプリンー9 ィル、ァミノ基が保護された 2 —ァミノ一 6 ブロモプリン一 9—ィル、 2 ァミノ一 6 ヒドロキシプリン一 9—ィル（す なわち、グァニニル）、ァミノ基が保護された 2 アミノー 6 ヒドロキシプリンー9ーィ ル、アミノ基及び水酸基が保護された 2 アミノー 6 ヒドロキシプリン 9 ィル、 6— アミノー 2—メトキシプリンー9ーィノレ、 6 アミノー 2 クロ口プリンー9ーィノレ、 6 アミ ノ一 2 フルォロプリン一 9—ィル、 2, 6 ジメトキシプリン一 9—ィル、 2, 6 ジクロロ プリン 9ーィル又は 6—メルカプトプリン 9ーィル基であり、さらに好適には、 6 - ベンゾィルァミノプリンー9 ィル、アデニニル、 2 イソブチリルアミノー 6 ヒドロキシ プリン 9ーィル又はグァニニル基である。
[0039] 上記一般式（1)中、 Βの「2 ォキソ—1 , 2 ジヒドロピリミジンー1ーィル基」及び「 置換 2—ォキソ—1 , 2—ジヒドロピリミジン— 1—イノレ基」全体で、好適な基は、 2—ォ キソ一 4 ァミノ一 1 , 2 ジヒドロピリミジン一 1—ィル（すなわち、シトシ二ル）、ァミノ 基が保護された 2 ォキソ 4 アミノー 1 , 2 ジヒドロピリミジン 1ーィノレ、 2 ォキ ソ一 4 ァミノ一 5 フルォロ一 1 , 2 ジヒドロピリミジン一 1—ィル、ァミノ基が保護さ れた 2 ォキソ 4 ァミノ一 5 フルォロ一 1 , 2 ジヒドロピリミジン一 1—ィル、 4— アミノー 2 ォキソ 5 クロ口一 1 , 2 ジヒドロピリミジン一 1—ィノレ、 2 ォキソ 4 —メトキシ一 1 , 2—ジヒドロピリミジン一 1—ィル、 2—ォキソ 4—メルカプト一 1 , 2- ジヒドロピリミジン 1ーィノレ、 2—ォキソー4ーヒドロキシ 1 , 2—ジヒドロピリミジン 1 —ィル（すなわち、ゥラシ二ル）、 2 ォキソ 4 ヒドロキシ一 5 メチノレ一 1 , 2 ジヒ ドロピリミジン一 1—ィル（すなわち、チミニル）又は 4—アミノー 5—メチル 2—ォキソ - 1 , 2 ジヒドロピリミジン一 1—ィル（すなわち、 5 メチルシトシニル）基であり、さら に好適には、 2—ォキソ 4—ベンゾィルァミノ一 1 , 2—ジヒドロピリミジン一 1—ィル、 シトシニル、チミ二ノレ、ゥラシ二ル、 2 ォキソ 4 ベンゾィルアミノー 5 メチノレ一 1 ， 2—ジヒドロピリミジン 1ーィノレ、又は 5—メチルシトシニル基である。
[0040] 本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチド類縁体である。
「ヌクレオシド類縁体」とは、プリン又はピリミジン塩基と糖が結合した「ヌクレオシド」 のうち、非天然型のものを言う。
「オリゴヌクレオチド類縁体」とは、同一又は異なる上記「ヌクレオシド」がリン酸ジェ ステル結合で 2乃至 50個結合した「オリゴヌクレオチド」の非天然型誘導体をいい、そ のような類縁体としては、好適には、糖部分が修飾された糖誘導体；リン酸ジエステル 結合部分がチォエート化されたチォエート誘導体；末端のリン酸部分がエステル化さ れたエステル体；プリン塩基上のアミノ基がアミド化されたアミド体を挙げることができ 、さらに好適には、糖部分が修飾された糖誘導体及びリン酸ジエステル結合部分が チォエート化されたチォエート誘導体を挙げる事が出来る。
[0041] 「薬理上許容されるその塩」とは、本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、塩に すること力 Sできるので、その塩をいい、そのような塩としては、好適にはナトリウム塩、 カリウム塩、リチウム塩のようなアルカリ金属塩、カルシウム塩、マグネシウム塩のよう なアルカリ土類金属塩、アルミニウム塩、鉄塩、亜鉛塩、銅塩、ニッケル塩、コバルト 塩等の金属塩；アンモニゥム塩のような無機塩、 tーォクチルァミン塩、ジベンジルアミ ン塩、モルホリン塩、ダルコサミン塩、フエニルダリシンアルキルエステル塩、エチレン ジァミン塩、 N メチルダルカミン塩、グァニジン塩、ジェチルァミン塩、トリェチルアミ ン塩、ジシクロへキシルァミン塩、 N, N'—ジベンジルエチレンジァミン塩、クロ口プロ 力イン塩、プロ力イン塩、ジエタノールアミン塩、 N べンジルーフエネチルァミン塩、 ピぺラジン塩、テトラメチルアンモニゥム塩、トリス（ヒドロキシメチル）ァミノメタン塩のよ うな有機塩等のアミン塩；弗化水素酸塩、塩酸塩、臭化水素酸塩、沃化水素酸塩の ようなハロゲン原子化水素酸塩、硝酸塩、過塩素酸塩、硫酸塩、燐酸塩等の無機酸 塩；メタンスルホン酸塩、トリフルォロメタンスルホン酸塩、エタンスルホン酸塩のような 低級アルカンスルホン酸塩、ベンゼンスルホン酸塩、 p-トルエンスルホン酸塩のような ァリールスルホン酸塩、酢酸塩、りんご酸塩、フマール酸塩、コハク酸塩、クェン酸塩 、酒石酸塩、蓚酸塩、マレイン酸塩等の有機酸塩;及び、グリシン塩、リジン塩、アル ギニン塩、オル二チン塩、グルタミン酸塩、ァスパラギン酸塩のようなアミノ酸塩を挙げ ること力 Sでさる。
一般式（1)の化合物のうち、好適な化合物としては、（l) R1が、水素原子、脂肪族 ァシル基、芳香族ァシル基、 1乃至 3個のァリール基で置換されたメチル基、低級ァ ルキル、低級アルコキシ、ハロゲン若しくはシァノ基でァリール環が置換された 1乃至 3個のァリール基で置換されたメチル基、又は、シリル基である化合物、（2) が、水 素原子、ァセチル基、ベンゾィル基、ベンジル基、 p メトキシベンジル基、ジメトキシ トリチル基、モノメトキシトリチル基又は tert-ブチルジフエニルシリル基である化合物、 (3) R2が、水素原子、脂肪族ァシル基、芳香族ァシル基、 1乃至 3個のァリール基で 置換されたメチル基、低級アルキル、低級アルコキシ、ハロゲン若しくはシァノ基でァ リール環が置換された 1乃至 3個のァリール基で置換されたメチル基、シリル基、ホス ホロアミダイト基、ホスホニル基、リン酸基又は保護されたリン酸基である化合物、（4) R2が、水素原子、ァセチル基、ベンゾィル基、ベンジル基、 p—メトキシベンジル基、 t ert-ブチルジフエニルシリル基、 _P(OC H CN)(N(CH(CH ) ) )、 -P(OCH )(N(CH(CH
2 4 3 2 2 3 3
) ) )、ホスホニル基、又は、 2 クロ口フエニル若しくは 4 クロ口フエニルリン酸基であ る化合物、（5) A力 S、メチレン基である化合物、（6) B力 6—ァミノプリン 9ーィル（ すなわち、アデニニル）、ァミノ基が保護された 6 ァミノプリンー9 ィル、 2, 6 ジ ァミノプリン 9ーィノレ、 2 アミノー 6 クロ口プリン一 9—ィル、ァミノ基が保護された 2 アミノー 6 クロ口プリン一 9—ィノレ、 2 アミノー 6 フノレオ口プリン一 9—ィノレ、ァ ミノ基が保護された 2 アミノー 6 フルォロプリンー9 ィル、 2 アミノー 6 ブロモ プリンー9 ィル、ァミノ基が保護された 2 アミノー 6 ブロモプリンー9 ィル、 2— アミノー 6—ヒドロキシプリンー9ーィル（すなわち、グァニニル）、ァミノ基が保護され た 2 アミノー 6 ヒドロキシプリン 9 ィル、アミノ基及び水酸基が保護された 2— ァミノ一 6 ヒドロキシプリン一 9—ィル、 6 ァミノ一 2—メトキシプリン一 9—ィル、 6— アミノー 2 クロ口プリン一 9—ィノレ、 6 アミノー 2 フノレオ口プリン一 9—ィノレ、 2, 6 - ジメトキシプリンー9 ィル、 2, 6 ジクロ口プリンー9 ィル、 6 メルカプトプリンー9 —ィル、 2—ォキソ 4—ァミノ一 1 , 2—ジヒドロピリミジン一 1—ィル（すなわち、シトシ 二ル）、ァミノ基が保護された 2 ォキソ 4 ァミノ一 1 , 2 ジヒドロピリミジン一 1— ィル、 2 ォキソー 4 アミノー 5 フルオロー 1 , 2 ジヒドロピリミジン一 1—ィル、アミ ノ基が保護された 2 ォキソ 4 アミノー 5 フルオロー 1 , 2 ジヒドロピリミジン 1 —ィノレ、 4 アミノー 2 ォキソ 5 クロ口一 1 , 2 ジヒドロピリミジン一 1—ィノレ、 2 - ォキソ 4—メトキシ一 1 , 2—ジヒドロピリミジン 1ーィノレ、 2—ォキソ 4—メルカプ ト一 1 , 2 ジヒドロピリミジン一 1—ィル、 2 ォキソ 4 ヒドロキシ一 1 , 2 ジヒドロ ピリミジン一 1—ィル（すなわち、ゥラシ二ル）、 2 ォキソ 4 ヒドロキシ一 5 メチル - 1 , 2 ジヒドロピリミジン一 1—ィル（すなわち、チミ二ル）、 4 ァミノ一 5 メチル一 2 ォキソ 1 , 2 ジヒドロピリミジンー1ーィル（すなわち、 5 メチルシトシニル）基 又はアミノ基が保護された 4 アミノー 5 メチルー 2 ォキソ 1 , 2 ジヒドロピリミジ ン 1ーィル基である化合物、（7) Bが、 6 べンゾィルァミノプリンー9 ィル、アデ ニニル、 2 イソブチリルアミノー 6 ヒドロキシプリンー9 ィル、グァニニル、 2 ォ キソ一 4 ベンゾィルァミノ一 1 , 2 ジヒドロピリミジン一 1—ィル、シトシニル、 2 ォ キソ一 5—メチル 4—ベンゾィルァミノ一 1 , 2—ジヒドロピリミジン一 1—ィル、 5—メ チルシトシニル、ゥラシ二ル又はチミニル基である化合物をあげることができる。
又、上記（1)乃至（2)、（3)乃至（4)又は（6)乃至（7)は、番号が大きくなるに従って 、より好適な化合物を示し、一般式（1)において、 R1を（1)乃至（2)から任意に選択し 、 R2を（3)乃至（4)から任意に選択し、 Aを（5)から任意に選択し、 Bを（6)乃至（7) 力 任意に選択し、又、これらを任意に組み合わせて得られた化合物も好適であり、 特に好適には、下記群から選択される化合物である。
(化合物群）
2，-0，4，-C-エチレングアノシン、 2，-0，4，-C-エチレンアデノシン、 3，，5，-ジ-〇- ベンジル- 2， -0, 4， -C-エチレン- 6- N-ベンゾィルアデノシン、 3，，5，-ジ- 0-ベンジ ノレ- 2， -0，4， -C-エチレン- 2-N-イソブチリルグアノシン、 5， -0-ジメトキシトリチノレ- 2 ， -0，4， -C-エチレン- 6- N-ベンゾィルアデノシン、 5， -O-ジメトキシトリチル- 2， - 0, 4， -C-エチレン- 2-N-イソブチリルグアノシン、 2， -0，4， -C-エチレン- 2-N-イソブ チリルグアノシン、 2'-0，4，-C-エチレン- 6- N-ベンゾィルアデノシン、 5'-0-ジメトキ シトリチル -2'-0，4'-C-エチレン- 6-N-ベンゾィルアデノシン- 3'-0- (2-シァノエチ ノレ N, N—ジイソプロピノレ）ホスホロアミダイト 5'-0-ジメトキシトリチル -2'-0，4'-C-ェ チレン- 2-N-イソブチリルグアノシン- 3'-0- (2-シァノエチル N, N—ジイソプロピル )ホスホロアミダイト 2， -0，4， -C-エチレンゥリジン、 2， -0，4， -C-エチレン 5—メチルゥ リジン、 2，-0，4，-C-エチレンシチジン、 2，-0，4，-C-エチレン- 5-メチルシチジン、 3，， 5， -ジ- 0-ベンジル- 2， -0，4， -C-エチレンゥリジン、 5， -O-ジメトキシトリチノレ- 2， -0,4， -C-エチレンゥリジン、 3，， 5， -ジ- 0-ベンジル- 2， -0，4， -C-エチレン- 5—メチ ルゥリジン、 5，-0-ジメトキシトリチル -2， -0, 4， -C-エチレン- 5—メチルゥリジン、 3，， 5， -ジ -0-ベンジル -2， -0，4， -C-エチレン- 4-N-ベンゾィルシチジン、 5， -〇_ジメト キシトリチル-2，-0，4，-C-ェチレン-4-N-べンゾィルシチジン、 3，，5，-ジ -0-ベンジ ノレ- 2， -0，4， _C_エチレン- 4-N -ベンゾィル -5-メチルシチジン、 5 ' -0 -ジメトキシトリ チノレ- 2， -0,4， -C-エチレン- 4- N-ベンゾィル -5-メチルシチジン、 2， -0，4， - C-ェ チレン- 4-N-ベンゾィルシチジン、 2， -0，4， -C-エチレン- 4-N-ベンゾィル -5-メチ ルシチジン、 5'-0 -ジメトキシトリチル _2'-0，4'-C -エチレン -ゥリジン- 3'-0- (2-シァ ノエチノレ N, N—ジイソプロピノレ）ホスホロアミダイト、 5'-0-ジメトキシトリチル -2'-〇，4 '-C-エチレン- 5—メチルゥリジン- 3'-0- (2-シァノエチル N, N—ジイソプロピル）ホ スホロアミダイト、 5'-0-ジメトキシトリチル -2'-0，4'-C-エチレン- 4-N-ベンゾィルシ チジン- 3'-0- (2-シァノエチル N, N—ジイソプロピル）ホスホロアミダイト、及び、 5'- 0-ジメトキシトリチル -2'-0，4'-C-エチレン- 4-N-ベンゾィルー 5—メチルシチジン- 3'-0- (2-シァノエチル N, N—ジイソプロピル）ホスホロアミダイト。
一般式（1)の化合物に包含される、具体的な化合物を表 1及び表 2に例示する。但 し、これらに限定されるものではない。
表 1及び表 2において、 Meは、メチル基を示し、 Bnは、ベンジル基を示し、 Bzは、 ベンゾィル基を示し、 PMBは、 p—メトキシベンジル基を示し、 Trは、トリフエ二ルメチ ル基を示し、 MMTrは、 4ーメトキシトリフエニルメチル（モノメトキシトリチル）基を示し 、 DMTrは、 4, 4'ージメトキシトリフエニルメチル（ジメトキシトリチノレ）基を示し、 TMT rは、 4, 4' , 4' '—トリメトキシトリフエニルメチル（トリメトキシトリチル）基を示し、 TMS は、トリメチルシリル基を示し、 TBDMSは、 tert—ブチルジメチルシリル基を示し、 T BDPSは、 tert—ブチルジフエニルシリル基を示し、 TIPSは、トリイソプロピノレシリル 基を示す。
[化 2]
Figure imgf000028_0001
例示
化合物
番号 A R1 R: R R
1-1 CH H H H H
2
1-2 CH H H H NH
2
1-3 CH H H H
2
1—4 CH H H OH - -5 CH H H OH NH
2 2
- -6 CH H H OH OH
2
- -7 CH H H NH H
2 2
- -8 CH H H NH NH
2 2 2
- -9 CH H H NH CI
2 2
- -10 CH H H NH F
2 2
- -11 CH H H NH Br
2 2
- -12 CH H H NH OH
2 2
- -13 CH H H OMe H
2
- -14 CH H H OMe OMe
2
- -15 CH H H OMe NH
2 2
- -16 CH H H CI H
2
- -17 CH H H Br H
2
- -18 CH H H F H
2
- -19 CH H H CI CI
2
- -20 CH H H SH H
2
- -21 CH Bn H NHBz H
2
- -22 CH Bn H OH NHCOCH(CH )
2 3 2- -23 CH Bn Bn NHBz H
2
- -24 CH Bn Bn OH NHCOCH(CH )
2 3 2- -25 CH PMB H NHBz H
2
- -26 CH PMB H OH NHCOCH(CH )
2 3 2- -27 CH PMB PMB NHBz H
2
- -28 CH PMB PMB OH NHCOCH(CH )
2 3 2- -29 CH Tr H NHBz H
2
- -30 CH MMTr H NHBz H
2
- -31 CH DMTr H NHBz H
2
- -32 CH TMTr H NHBz H -33 CH Tr H OH NHCOCH(CH )
3 2-34 CH MMTr H OH NHCOCH(CH )
3 2-35 CH DMTr H OH NHCOCH(CH )
3 2-36 CH TMTr H OH NHCOCH(CH )
3 2-37 CH TMS H NHBz H
-38 CH TBDMS H NHBz H
-39 CH TBDPS H NHBz H
-40 CH TIPS H NHBz H
-41 CH TMS H OH NHCOCH(CH )
3 2-42 CH TBDMS H OH NHCOCH(CH )
3 2-43 CH TBDPS H OH NHCOCH(CH )-44 CH TIPS H OH NHC(
-45 (CH H H H H
-46 (CH H H H NH
2
-47 (CH H H H OH
-48 (CH H H OH H
-49 (CH H H OH NH
2
-50 (CH H H OH OH
-51 (CH H H NH H
2
-52 (CH H H NH NH
2 2
-53 (CH H H NH CI
2
-54 (CH H H NH F
2
-55 (CH H H NH Br
2
-56 (CH H H NH OH
2
-57 (CH H H OMe H
-58 (CH H H OMe OMe
-59 (CH H H OMe NH
2
-60 (CH H H CI H
( )S〇C〇CC TIP HH NHHH
( ) s 〇C〇CC TroDH NHHH
( )S 〇C〇CC TroDM HH NHHH
( )S 〇C〇CC TM HH NHHH
ί I— ί ί I— ί ί I— ί ί I— ί ί I— ί ί I— ί ί I— ί ί I— ί ί I— ί ί I— ί ί I— ί ί I— ί ί I— ί ί I— ί ί I— ί ί I— ί ί I— ί ί I— ί ί I— ί ί I— ί ί I— ί
Figure imgf000031_0001
Figure imgf000031_0002
( ) 〇C〇CCH NHHH
ΝΗωζ H
( ) 〇C〇CCH NHHH
ΝΗωζ H
( ) 〇C〇CCH NHHH
( )〇C〇CC MB PMroH NHHH
MB PMro NHroz H
( ) 〇C〇CC M IH NHHH
Π Π Π Π M I ΝΗωζ H Π Π Π Π Π Π Π Π Π Π Π Π Π Π Π Π Π Π Π Π Π Π Π Π X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X
( ) 〇C〇CCH NHHH
D D D D
ω ω ェ ェ ェ ェ ェ ェ ェ ェ ェ ェ ェ ェ
Figure imgf000032_0001
Figure imgf000033_0001
η π π π π ο η η π π π π π η η π π π π π η η ο π π π π η χ χ χ χ χ χ χ χ χ χ χ χ χ χ χ χ χ χ χ χ χ χ χ χ χ ί I— ί ί I— ί ί I— ί ί I— ί ί I— ί ί I— ί ί I— ί ί I— ί ί I— ί ί I— ί ί I— ί ί I— ί ~ L| ~ L| I— ― L| L|
Figure imgf000033_0002
Figure imgf000033_0003
) 〇C〇C(CSH NHHH TIP H
( ) 〇C〇CCsH NHHH Troop I
( ) 〇C〇C:C:SH NHHH TroDM Η
( ) 〇C〇CCSH NHHH TM Η
H
ΝΗωζ H
ΝΗωζ H
H
( ) 〇C〇CCH NHHH ΤΜΤΓ Η
( ) 〇C〇〇C:H NHHH DMTr Η
( ) 〇C〇CCH NHHH ΜΜΤΓ Η
( ) 〇C〇CCH NHHH ΤΓ Η
H Η H Η H Η
NHBz H Tr Η 1- -145 (CH ) H H OMe H
2 4
1- -146 (CH ) H H OMe OMe
2 4
NH
Figure imgf000034_0001
1- -152 (CH ) H H SH H
2 4
1- -153 (CH ) Bn H NHBz H
Figure imgf000034_0002
1- 160 (CH ) PMB PMB OH NHCOCH(CH )
2 4 3 2
1- -161 (CH ) Tr H NHBz H
2 4
1- -162 (CH ) MMTr H NHBz H
2 4
1- 163 (CH ) DMTr H NHBz H
2 4
1- -164 (CH ) TMTr H NHBz H
2 4
((() > )00C〇C2H DMTr pNiprH NHroz H- ((() > )( )99C 〇C〇C〇CC1H DMTr pNiprHH NHHH
((() > )98C 〇C1H DMTr pNiprH NHBz H
((() > )( )C 〇C 〇C〇CCH DMTr pNiprHH NHHH
Figure imgf000035_0001
H H H NHroz
H HH
H
( ) C 〇C〇CCH H HH NHHH
(( )76C 〇C〇CC1H HH NHHH
(( )Cs 〇C〇CCH Troop IH NHHH
(( )CS 〇C〇CCH TroDM HH NHHH (( )CS 〇C〇CCH TM HH NHHH
Figure imgf000036_0001
¾ g ¾ ¾ * <H - -4 CH H H NH CH- -5 CH H H NH F- -6 CH H H CI H- -7 CH H H ◦Me H- -8 CH H H SH H- -9 CH Bn H OH H- -10 CH Bn Bn OH H- -11 CH PMB H OH H- -12 CH PMB PMB OH H- -13 CH Tr H OH H- -14 CH MMTr H OH H- -15 CH DMTr H OH H- -16 CH TMTr H OH H- -17 CH TMS H OH H- -18 CH TBDMS H OH H- -19 CH TBDPS ； H OH H- -20 CH TIPS H OH H- -21 CH Bn H OH CH- -22 CH Bn Bn OH CH- -23 CH PMB H OH CH- -24 CH PMB PMB OH CH- -25 CH Tr H OH CH- -26 CH MMTr H OH CH- -27 CH DMTr H OH CH- -28 CH TMTr H OH CH- -29 CH TMS H OH CH- -30 CH TBDMS H OH CH- -31 CH TBDPS H OH CH - -32 CH TIPS H OH CH
2 3- -33 CH Bn H NHBz H
2
- -34 CH Bn Bn NHBz H
2
- -35 CH PMB H NHBz H
2
- -36 CH PMB PMB NHBz H
2
- -37 CH Tr H NHBz H
2
- -38 CH MMTr H NHBz H
2
- -39 CH DMTr H NHBz H
2
- -40 CH TMTr H NHBz H
2
- -41 CH TMS H NHBz H
2
- -42 CH TBDMS H NHBz H
2
- -43 CH TBDPS H NHBz H
2
- -44 CH TIPS H NHBz H
2
- -45 CH Bn H NHBz CH
2 3- -46 CH Bn Bn NHBz CH
2 3- -47 CH PMB H NHBz CH
2 3- -48 CH PMB PMB NHBz CH
2
- -49 CH Tr H NHBz CH
2 3- -50 CH MMTr H NHBz CH
2 3- -51 CH DMTr H NHBz CH
2 3- -52 CH TMTr H NHBz CH
2 3- -53 CH TMS H NHBz CH
2 3- -54 CH TBDMS H NHBz CH
2
- -55 CH TBDPS H NHBz CH
2 3- -56 CH TIPS H NHBz CH
2 3- -57 (CH ) H H OH H
2 2
- -58 (CH ) H H OH CH
2 2 3- -59 (CH ) H H NH H
2 2 2 - -60 (CH ) H H NH CH
2 2 2 3- -61 (CH ) H H NH F
2 2 2
- -62 (CH ) H H CI H
2 2
- -63 (CH ) H H OMe H
2 2
- -64 (CH ) H H SH H
2 2
- -65 (CH ) Bn H OH H
2 2
- -66 (CH ) Bn Bn OH H
2 2
- -67 (CH ) PMB H OH H
2 2
- -68 (CH ) PMB PMB OH H
2 2
- -69 (CH ) Tr H OH H
2 2
- -70 (CH ) MMTr H OH H
2 2
- -71 (CH ) DMTr H OH H
2 2
- -72 (CH ) TMTr H OH H
2 2
- -73 (CH ) TMS H OH H
2 2
- -74 (CH ) TBDMS H OH H
2 2
- -75 (CH ) TBDPS H OH H
2 2
- -76 (CH ) TIPS H OH H
2 2
- -77 (CH ) Bn H OH CH
2 2 3- -78 (CH ) Bn Bn OH CH
2 2 3- -79 (CH ) PMB H OH CH
2 2 3- -80 (CH ) PMB PMB OH CH
2 2
- -81 (CH ) Tr H OH CH
2 2 3- -82 (CH ) MMTr H OH CH
2 2
- -83 (CH ) DMTr H OH CH
2 2 3- -84 (CH ) TMTr H OH CH
2 2 3- -85 (CH ) TMS H OH CH
2 2 3- -86 (CH ) TBDMS H OH CH
2 2
- -87 (CH ) TBDPS H OH CH H H
〇 C HHH
CO CO
〇 HH H o o o o o CO CJ1 C o CO
o
n n n n n n n n n n n n n n n n CP H NHrozH n n n n n n n n n n n n X X X X X X X X X X X
Croop I NHrozH
CroDM H NHrozH
CM H NHrozH
CMTr H NHrozH
Figure imgf000040_0001
C H NHrozH
C H NHrozH
C H NHrozH
Figure imgf000040_0002
C MB PMro NHrozH
C M I NHrozH
C ron NHrozH
C H NHrozH
H H
roD I ΝΗωζ H
roDM H ΝΗωζ H
H H H H H H
ΝΗωζ H
ΝΗωζ H
H H
S 〇 C TIP HHH - -116 (CH ) H H NH CH- -117 (CH ) H H NH F- -118 (CH ) H H CI H- -119 (CH ) H H OMe H- -120 (CH ) H H SH H- -121 (CH ) Bn H OH H- -122 (CH ) Bn Bn OH H- -123 (CH ) PMB H OH H- -124 (CH ) PMB PMB OH H- -125 (CH ) Tr H OH H- -126 (CH ) MMTr H OH H- -127 (CH ) DMTr H OH H- -128 (CH ) TMTr H OH H- -129 (CH ) TMS H OH H- 130 (CH ) TBDMS H OH H- -131 (CH ) TBDPS H OH H- -132 (CH ) TIPS H OH H- 133 (CH ) Bn H OH CH- -134 (CH ) Bn Bn OH CH- 135 (CH ) PMB H OH CH- 136 (CH ) PMB PMB OH CH- 137 (CH ) Tr H OH CH- 138 (CH ) MMTr H OH CH- 139 (CH ) DMTr H OH CH- 140 (CH ) TMTr H OH CH- 141 (CH ) TMS H OH CH- 142 (CH ) TBDMS H OH CH- 143 (CH ) TBDPS H OH CH - -144 (CH： TIPS H OH CH- -145 (CH： Bn H NHBz H- -146 (CH： Bn Bn NHBz H- -147 (CH： PMB H NHBz H- -148 (CH： PMB PMB NHBz H- -149 (CH： Tr H NHBz H- 150 (CH： MMTr H NHBz H- -151 (CH： DMTr H NHBz H- -152 (CH： TMTr H NHBz H- -153 (CH： TMS H NHBz H- -154 (CH： TBDMS H NHBz H- -155 (CH： TBDPS H NHBz H- -156 (CH： TIPS H NHBz H- -157 (CH： Bn H NHBz CH- -158 (CH： Bn Bn NHBz CH- -159 (CH： PMB H NHBz CH- 160 (CH： PMB PMB NHBz CH- -161 (CH： Tr H NHBz CH- -162 (CH： MMTr H NHBz CH- 163 (CH： DMTr H NHBz CH- -164 (CH： TMTr H NHBz CH- -165 (CH： TMS H NHBz CH- 166 (CH： TBDMS H NHBz CH- -167 (CH： TBDPS H NHBz CH- -168 (CH： TIPS H NHBz CH- 169 (CH： H H OH H- 170 (CH： H H OH CH- -171 (CH： H H NH H - -172 (CH ) H H NH CH- -173 (CH ) H H NH F- -174 (CH ) H H CI H- -175 (CH ) H H OMe H- -176 (CH ) H H SH H- -177 (CH ) Bn H OH H- -178 (CH ) Bn Bn OH H- -179 (CH ) PMB H OH H- -180 (CH ) PMB PMB OH H- -181 (CH ) Tr H OH H- -182 (CH ) MMTr H OH H- -183 (CH ) DMTr H OH H- -184 (CH ) TMTr H OH H- -185 (CH ) TMS H OH H- -186 (CH ) TBDMS H OH H- -187 (CH ) TBDPS H OH H- -188 (CH ) TIPS H OH H- -189 (CH ) Bn H OH CH- 190 (CH ) Bn Bn OH CH- 191 (CH ) PMB H OH CH- 192 (CH ) PMB PMB OH CH- 193 (CH ) Tr H OH CH- 194 (CH ) MMTr H OH CH- 195 (CH ) DMTr H OH CH- 196 (CH ) TMTr H OH CH- 197 (CH ) TMS H OH CH- 198 (CH ) TBDMS H OH CH- 199 (CH ) TBDPS H OH CH - -200 (CH ) TIPS H OH CH
2 4 3- -201 (CH ) Bn H NHBz H
2 4
- -202 (CH ) Bn Bn NHBz H
2 4
- -203 (CH ) PMB H NHBz H
2 4
- -204 (CH ) PMB PMB NHBz H
2 4
- -205 (CH ) Tr H NHBz H
2 4
- -206 (CH ) MMTr H NHBz H
2 4
- -207 (CH ) DMTr H NHBz H
2 4
- -208 (CH ) TMTr H NHBz H
2 4
- -209 (CH ) TMS H NHBz H
2 4
- -210 (CH ) TBDMS H NHBz H
2 4
- -211 (CH ) TBDPS H NHBz H
2 4
- -212 (CH ) TIPS H NHBz H
2 4
- -213 (CH ) Bn H NHBz CH
2 4 3- -214 (CH ) Bn Bn NHBz CH
2 4 3- -215 (CH ) PMB H NHBz CH
2 4 3- -216 (CH ) PMB PMB NHBz CH
2 4 3- -217 (CH ) Tr H NHBz CH
2 4 3- -218 (CH ) MMTr H NHBz CH
2 4 3- -219 (CH ) DMTr H NHBz CH
2 4 3- -220 (CH ) TMTr H NHBz CH
2 4 3- -221 (CH ) TMS H NHBz CH
2 4 3- -222 (CH ) TBDMS H NHBz CH
2 4
- -223 (CH ) TBDPS H NHBz CH
2 4 3- -224 (CH ) TIPS H NHBz CH
2 4 3- -225 CH H H NHBz H
2
- -226 CH H H NHBz CH
2 3- -227 (CH ) H H NHBz H
2 2 )〇CH NHroz
) 〇C 〇HH
Figure imgf000045_0001
) 〇C 〇HH
n n n ) n 〇CH NHroz Π n n n n n n n n n Π n n n n n n n n n Π Π Π Π
X X X X X X X X X X X
) 〇CH NHroz
Ό a a a a a a a a a a a a a a a a a a a a a a
) 〇C 〇HH
H H
) 〇C 〇HH X X
2： 〇c C HN NHroz 2：
〇c C HN NHroz
〇c C 〇 HNH
〇c C 〇 HNH
〇c C HN NHroz
〇c C HN NHroz
^ ェ ェ
〇c C 〇 HNH
Π X Π X Π X Π X X X X X X Π X Π X Π X Π
〇c C 〇 HNH X X X X
〇c C HN NHroz
〇c C HN NHroz
〇c C 〇 HNH
〇c C 〇 HNH
〇c C HN NHroz
〇c C HN NHroz
〇c C HN
〇c C HN
NHroz
NHroz
NHroz
NHroz
NHroz 2-256 (CH ) DMTr P(N(iPr) )(OCH ) NHBz CH
2 2 2 3
2-257 (CH ) DMTr P(N(iPr) )(OCH ) OH H
2 3 2 3
2-258 (CH ) DMTr P(N(iPr) )(OCH ) OH CH
2 3 2 3 3
2-259 (CH ) DMTr P(N(iPr) )(OCH ) NHBz H
2 3 2 3
2-260 (CH ) DMTr P(N(iPr) )(OCH ) NHBz CH
2 3 2 3 3
2-261 (CH ) DMTr P(N(iPr) )(OCH ) OH H
2 4 2 3
2-262 (CH ) DMTr P(N(iPr) )(OCH ) OH CH
2 4 2 3 3
2-263 (CH ) DMTr P(N(iPr) )(OCH ) NHBz H
2 4 2 3
2-264 (CH ) DMTr P(N(iPr) )(OCH ) NHBz CH
2 4 2 3
上記表 1乃至 2中、好適な化合物は、 (1 - 5) , (1 - 7) , (1 23)、 （1 24)、 (1 31)、 （1 35)、 （1 39)、 (1—43)、 (1—49)、 (1 51)、 （1 67)、 （1 68) 、 (1— 75)、 (1— 79)、 (1— 83)、 (1— 87)、 (1— 93)、 (1— 95)、 (1 111)、 (1
— 112)、 （1— 119)、 （1— 123)、 （1— 127)、 （1— 131)、 （1— 137)、 （1— 139)、 (1— 155)、 （1— 156)、 （1— 163)、 （1— 167)、 （1— 171)、 （1— 175)、 （1— 177 )、 （1— 178)、 （1— 185)、 （1— 186)、 （1— 193)、 （1— 194)、 （1— 201)、 （1— 2 02)、 (2- 1) , (2- 2) , (2- 3) , (2— 4)、 （2— 10)、 （2— 15)、 （2— 19)、 (2- 2 2)、 （2— 27)、 （2— 31)、 （2— 34)、 （2— 39)、 （2— 43)、 (2— 46)、 (2— 51)、 (2 55)、 （2— 57)、 （2— 58)、 （2— 59)、 （2— 60)、 （2— 66)、 （2— 71)、 （2— 75)
、（2— 78)、 （2— 83)、 （2— 87)、 （2— 90)、 （2— 95)、 （2— 99)、 (2— 102)、 (2
— 107)、 （2— 111)、 （2— 113)、 （2— 114)、 （2— 115)、 （2— 116)、 （2— 122)、 (2— 127)、 （2— 131)、 （2— 134)、 （2— 139)、 （2— 143)、 （2— 146)、 （2— 151 )、 （2— 155)、 （2— 158)、 （2— 163)、 （2— 167)、 （2— 169)、 （2— 170)、 （2— 1 71)、 （2— 172)、 （2— 178)、 （2— 183)、 （2— 187)、 （2— 190)、 （2— 195)、 (2
— 199)、 （2— 202)、 （2— 207)、 （2— 211)、 （2— 214)、 （2— 219)、 （2— 223)、 (2— 225)、 （2— 226)、 （2— 233)、 （2— 234)、 （2— 235)又は（2— 236)であり、 さらに好適には、 2，-0，4，-C-エチレングアノシン（1— 5)、 2，-0，4，-C-エチレンァ デノシン（ 1— 7)、 3，， 5， -ジ- 0-ベンジル- 2， -0，4， - C-エチレン- 6- N -ベンゾィノレ アデノシン（ 1— 23)、 3，， 5， -ジ- 0-ベンジル- 2， -0，4， -C-エチレン- 2- N イソブ チリルグアノシン（ 1— 24)、 5， -O-ジメトキシトリチル- 2， -0,4， - C-エチレン- 6-N— ベンゾィルアデノシン （1— 31)、 5，-0-ジメトキシトリチル- 2，-0，4，-C-エチレン- 2 -N—イソブチリルグアノシン（1— 35)、 2，-0，4，-C-ェチレン-2-N ィソブチリルグ ァノシン（1— 177)、 2'-〇，4， -C-エチレン- 6- N ベンゾィルアデノシン（1— 178) 、 5'-0-ジメトキシトリチル -2'-0，4'-C-エチレン- 2-N—イソブチリルグアノシン- 3'- 0- (2-シァノエチル N, N ジイソプロピル）ホスホロアミダイト（1— 185)、 5'-0-ジメ トキシトリチル -2'-0，4'-C-エチレン- 6-N-ベンゾィルアデノシン- 3'-0- (2-シァノエ チノレ N, N ジイソプロピノレ）ホスホロアミダイト（1— 186)、 2，-0，4，-C-エチレンゥ リジン（2— 1)、 2，-0，4，-C-エチレン 5 メチルゥリジン（2— 2)、 2，-0，4，-C_ェチ レンシチジン（2— 3)、 2，-〇，4，-じ-ェチレン-5-メチルシチジン（2— 4)、 3，，5，-ジ- 0-ベンジル- 2， -0，4， -C-エチレンゥリジン（2— 10)、 5， -O-ジメトキシトリチル- 2， - 0,4， -C-エチレンゥリジン（2— 15)、 3，， 5， -ジ- 0-ベンジル- 2， -0,4， - C-エチレン -5 メチルゥリジン（2— 22)、 5，-0-ジメトキシトリチル- 2，-0，4，-C-エチレン- 5 メ チルゥリジン（2— 27)、 3，， 5， -ジ- 0-ベンジル- 2， -0，4， - C-エチレン- 4- N -ベン ゾィルシチジン（2— 34)、 5， -0-ジメトキシトリチル -2， -0，4， エチレン- 4-N— ベンゾィルシチジン（2— 39)、 3，， 5， -ジ- 0-ベンジル- 2， -0，4， - C-エチレン- 4- N ベンゾィル -5-メチルシチジン（2— 46)、 5，-0-ジメトキシトリチル-2，-0，4，-じ- エチレン- 4- N ベンゾィル -5-メチルシチジン（2— 51)、 2，-0，4，-C-エチレン- 4- N ベンゾィルシチジン（2— 225)、 2，-0，4，-C-エチレン- 4- N ベンゾィル - 5-メ チルシチジン（2— 226)、 5'-0-ジメトキシトリチル -2'-0，4'-C-エチレン-ゥリジン- 3' -0- (2-シァノエチル N, N ジイソプロピル）ホスホロアミダイト（2— 233)、 5'-〇-ジ メトキシトリチル _2'-0，4'-C -エチレン- 5 メチルゥリジン- 3'-0- (2-シァノエチル N , N ジィソプロピル）ホスホロァミダィト（2— 234)、 5'-0-ジメトキシトリチル-2'-0，4 '-C-エチレン- 4- N-ベンゾィルシチジン- 3'-0- (2-シァノエチル N, N ジイソプロ ピル）ホスホロアミダイト（2— 235)、又は、 5'-0-ジメトキシトリチル -2'-0，4'-C-ェチ レン- 4- N-ベンゾィル 5 メチルシチジン- 3'-0- (2-シァノエチル N, N ジイソ プロピル）ホスホロアミダイト（2— 236)である。
[0046] 一般式（1)の化合物は、特開 2000— 297097に記載の方法により、製造すること ができる。
なお、本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチド及び薬理学上許容されるその塩は、 溶媒和物（好適には水和物）としても存在すること力 Sでき、そのような溶媒和物も本発 明に包含される。
本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチド又は薬理学上許容されるその塩が標的と する RNAは、特に限定されないが、例えば、疾患に関与する遺伝子の RNAであると よい。
疾患としては、以下のものを例示することができる。
[0047] 1. ウィルス性疾患
呼吸器多核体ウィルス（respiratory syncytial virus) ,サイトメガロウィルス、 C型肝炎 ウィルス、 Β型肝炎ゥイノレス、単純へノレぺスゥイノレス、ノ ピロ一マウイノレス、ィプシユタ インバーウィルス、インフルエンザウイルス、ライムウィルス、西ナイルウィルス、 HIVな ど
2.炎症性疾患
クローン病、潰瘍性大腸炎、慢性関節リウマチ、喘息、乾癬、アトピー性皮膚炎
3.メタボリック関連疾患など
メタボリックシンドローム、糖尿病、肥満、高脂血症、高コレステロール血症、高トリダリ セリド血症など
4.心血管疾患
家族性高コレステロール血症、非家族性高コレステロール血症、脂肪血症、 /3リポ蛋 白血症、ァテローム性動脈硬化症、冠状動脈疾患、心筋梗塞、高血圧、頸動脈病、 脳卒中、末梢血管疾患、血栓症または動脈の動脈瘤など
5.ガン
皮膚、結合組織、脂肪、胸、肺、胃、すい臓、卵巣、頸部、子宮、腎臓、膀胱、大腸、 前立腺、中枢神経系（CNS)、網膜または循環する腫瘍 (例えば白血病とリンパ腫)な ど 6.中枢性疾患
アルツハイマー病、パーキンソン病、筋萎縮性側索硬化症 (ALS)など
[0048] 疾患に関与する遺伝子としては、呼吸器多核体ウィルス (respiratory syncytial viru s)，サイトメガロウィルス、 C型肝炎ウィルス、 B型肝炎ウィルス、単純へルぺスウィルス 、ノ ピロ一マウイノレス、ィプシユタインバーゥイノレス、インフノレエンザゥイノレス、ライムゥ ィルス、西ナイルウィルス、または、 HIVの遺伝子、 PADI4、 PTEN、 Tumor necrosis fa ctor receptor associated death domain (TRADD)、 glucocorticoid receptor (Gし CR)、 diacylglycerol acyltransferase 2 (DGAT2)、 ApoB- 100、 ICAM- 1、 rotein tyrosine ph osphatase IB (PTP1B)、 interleukin 4 receptor (IL4R_alpha)、 C_reactive protein (C P)、 glucagon receptor (Gし GR)， VLA-4 (Very Late Antigen-4), Clustering Insulin-1 ike Growth Factor- 1 Receptor (IGF- 1R)、 surviving eukaryotic initiation factor- 4E (el F— 4E)， c-Rar kinase、 heat shock protein 27 (Hsp27), Cu/Zn Superoxide Dismutate (S0D 1)、 Telomerase, beト 2， VEGF, VEGF— R， Hif— 1 alpha, H— Ras， N-Ras, -Ras, TNF-R, ribonucleotide reductase (RNR)などを例示することができる。
[0049] 本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチド又は薬理学上許容されるその塩は、例え ば、ぺプチジルアルギニンディミナーゼ 4(以下、「PADI4酵素」という)をコードする核 酸分子（例えば、成熟 mRNA、成熟 mRNAの前駆体、铸型 DNAなど）を標的とする ものであってもよ!/、。 PADI4酵素をコードする核酸分子の塩基配列の一例を配列番 号 1及び 3に示す。配列番号 1及び 3は、それぞれ、マウス及びヒト PADI4 mRNAの塩 基配列を示す。 PADI4酵素をコードする核酸分子は、配列番号 1又は 3の塩基配列 を有する核酸分子に相補的な配列とストリンジェントな条件下でハイブリダィズし、か つ PADI4酵素の生物学的活性を有するタンパク質をコードする核酸分子であってもよ い。 PADI4酵素の生物学的活性とは、カルシウムイオンの存在下でタンパク質中のァ ルギニン残基を脱ィミノ化してシトルリン残基に変換する反応を触媒する活性の他、 抗原としての活性、免疫原としての活性も含むものとする。また、 PADI4酵素のァミノ 酸配列の一例を配列番号 2及び 4に示す。配列番号 2及び 4は、それぞれ、配列番 号 1及び 3の塩基配列がコードするアミノ酸配列を示す。配列番号 2又は 4のアミノ酸 配列において、 1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配 歹 IJからなり、かつ PADI4酵素の生物学的活性を有するタンパク質も PADI4酵素に含ま れるものとする。
[0050] アンチセンス配列は、通常 mRNAの機能部位、例えば、 5'-非翻訳部位、開始コドン 近傍、スプライス部位、終止コドン近傍などから選ばれる場合が多い。標的遺伝子の ヌクレオチド配列に基づいてアンチセンス配列を決定するいくつかの方法も周知であ る。例えば、ランダムな短鎖核酸断片と標的遺伝子の RNAを混ぜ、 RNase Hで消化し 、切断部位をアンチセンス配列とする方法（例えば、 Lloyd, B.H. et al., Nucleic Acids Research, 2001， 29， p3664_3673. Ho, S.P. et al., Nucleic Acids Research, 1996， 24 ， pl901-1907. Matveeva, 0·， 1997， 25， p5010-5016. 参照）；ランダムな短鎖 DNA 断片と標的遺伝子の RNAを混ぜ、結合したものをゲルシフト法や oligodT担体を用い た回収法により選択し、結合部位を決定する方法（例えば、 Bruce, T.W. and Lima, W.F., Biochemistry, 1997， 36， p5004_5019. Takagi, M. et al Biochemistry, 2004， 43 ， 4501. 参照）；アンチセンス配列を有する 20量体程度のオリゴヌクレオチドをガラス プレート等に固定化したアレイを作製し、ラジオアイソトープ等で標識した標的遺伝 子の RNAを用いてハイブリダィゼーシヨンを行!/、、 RNAが結合する配列を決定する方 法（例えば、 Sohail,M. et al. , Nucleic Acids Research, 2001， 29， p2041- 2051·参照） 等が知られている。さらに、コンピュータープログラムを用いてアンチセンス配列を決 定する方法も報告されている（例えば、 Scherr,M., Nucleic Acids Research, 2000， 28， p2455- 2461. Patzel et al., Nucleic Acids Research, 1999， 27， p4328- 4334·参照）こ のような方法を用い、 mRNAの複雑な高次構造からアンチセンス分子が結合しやすい 一本鎖領域を含む部位を見出すことができる。
[0051] PADI4 mRNAを標的とする本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドの塩基配列の 例を配列番号 3及び 4に示す。配列番号 3及び 4の塩基配列は、それぞれ、 (Gene B ank accession No. NM_011061.1)のヌクレオチド番号 564-581及び 867-887に相補 的な配列である。
PADI4 mRNAを標的とする本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドとして好適なも のを以下に例示する。
[0052] (1) HO-Te2-C-Te2-T-5Ce2-G-Te2-G-C-T-T-A-Ge2-G-Ge2-T-5Ce2-Ae2t-H (AS- 1-2 H- -o- - - - _丄ー o_丄ー - V_ V- -0- - V- -ΟΗ
H- - V- -o- - - - _丄ー o_丄ー - V_ V- -0- - -Z3v- -ΟΗ ( )
H-p- v- - V- -o- - - L J L J - _丄ー o_丄ー - - Z3V-D-Z3V- -0-丄 -0- Z3V- -ΟΗ
- v-丄-丄 - - -0- 丄 -ΟΗ (ιζ)
Figure imgf000051_0001
H— ^3 - 3DS-丄- _V_丄 _丄_」_"3_丄_ _ 丄 _0Η (6ΐ )
Figure imgf000051_0002
I I LL ^J 」 ^L _ i i ^
Figure imgf000051_0003
H— 30-0— 0-V-丄-丄 -0-0— 丄 -O— S— OH (£1)
Figure imgf000051_0004
H— 3V— S—丄 0-0— 0-V-丄-丄 -0-0— 丄 -O— S— OH (Οΐ) H- 3V- S-丄 0-0- 0-V-丄-丄 -0-0- 丄 -O- S-丄 -OH (6)
I J g ^ ノ
Figure imgf000051_0005
、 )
I I LL LL _
」
Figure imgf000051_0006
、 )
(£-ZS— 3V— — V— V— O— O—丄— 丄— —丄— O—丄— — V— — V— —丄— O— — V— OH (C)
Z990/L00ZdT/13d 6V 6Ϊ96蘭 OOZ OAV (25) HO-AE2-C-GE2-T-C-AE2-C-AE2-C-T-G-T-C-TE2-T-GE2-G -H
(26) HO-AE2-C-GE2-T-C-AE2-C-AE2-C-T-G-T-C-TE2-T-GE2T-H
(27) HO-C-GE2-T-C-AE2-C-AE2-C-T-G-T-C-TE2-T-GE2-G-A-AE2-C-AE2T-H
(28) HO-GE2-T-C-AE2-C-AE2-C-T-G-T-C-TE2-T-GE2-G-A-AE2-C-AE2T-H
(29) HO-T-C-AE2-C-AE2-C-T-G-T-C-TE2-T-GE2-G-A-AE2-C-AE2T-H
(30) HO-C-AE2-C-AE2-C-T-G-T-C-TE2-T-GE2-G-A-AE2-C-AE2T-H
(31) HO-AE2-C-AE2-C-T-G-T-C-TE2-T-GE2-G-A-AE2-C-AE2T-H
(32) HO-C-GE2-T-C-AE2-C-AE2-C-T-G-T-C-TE2-T-GE2-G-A-AE2-C -H
(33) HO-GE2-T-C-AE2-C-AE2-C-T-G-T-C-TE2-T-GE2-G-A-AE2T-H
(34) HO-T-C-AE2-C-AE2-C-T-G-T-C-TE2-T-GE2-G-A -H
(35) HO-C-AE2-C-AE2-C-T-G-T-C-TE2-T-GE2-G-A -H
(36) HO-AE2-C-AE2-C-T-G-T-C-TE2-T-GE2-G -H
(37) HO-AE2-C-AE2-C-T-G-T-C-TE2-T-GE2T-H
なお、本明細書において、 A、 G、 C、 5C、 T、
Figure imgf000052_0001
AS、 GS、 C 5CS、 f 、 A 、 G 、 5C 、 T 、 A 、 G 、 5C 、 A 、 G 、 5C 、 T 、 AEL、 G 、 G 、 5C 、 TEL 、 AELS、 GELS、 5CELS及び TELSは、それぞれ、下記の式 (A)、（G)、（C)、（5C)、（T)、 (A (G*) 、
Figure imgf000052_0002
(AS)、（GS)、（CS)、（5CS)、（TS)、 (AE2)、 (GE2)、 (5CE2)、 (TE2)、 (A,、 (G 、（5CE2T)、（AE2S)、（GE2S)、（5CE2S)、（TE2S)、（AEL)、（GEL)、 (G,、 (5C 、 (TEL)、 (A 、 (G 、 ( 5CELS)及び (TELS)で表される基である。
[化 4]
Figure imgf000053_0001
Figure imgf000054_0001
OS) (ZaOS)
Figure imgf000054_0002
(sZ30)
Figure imgf000054_0003
M7Z990/.00Zdf/X3d 39 6Ϊ96蘭 OOZ OAV
Figure imgf000055_0001
(Ae ) (Ae1s)
Figure imgf000055_0002
(Ge1«) (Ge1) (Ge1s)
Figure imgf000055_0003
(5Ce1) (5Ce1s)
Figure imgf000055_0004
本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチド及び薬理学上許容されるその塩は、 RNA に対する結合力が高ぐヌクレアーゼに対する耐性が高い上に、 RNase Hによる mRN Aの分解作用を配列特異的に受けることができる。従って、本発明のアンチセンスォ リゴヌクレオチド及び薬理学上許容されるその塩は、標的 RNAの発現を抑制すること ができる。本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチド及び薬理学上許容されるその塩 は、標的 RNAが関与する疾患の治療及び/又は予防などに有効である。
[0053] 本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチド又は薬理学上許容されるその塩は、標的 RNAが関与する疾患を予防及び/又は治療するための医薬を製造するために使 用すること力 Sでさる。
本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチド及び薬理学上許容されるその塩は医薬又 は試薬として使用すること力 Sできる。
本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチド及び薬理学上許容されるその塩は、標的 RNAが関与する疾患の治療及び/又は予防のための医薬として使用することがで きる。
また、本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチド及び薬理学上許容されるその塩は、 in vitro in vivo又は ex vivoで使用することカできる。
[0054] 本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、市販の合成機（例えば、パーキンエル マー社のホスホロアミダイド法によるモデル 392)などを用いて、文献（Nucleic Acids Research, 12， 4539 (1984》に記載の方法に準じて合成することができる。その際に用 いられるホスホロアミダイト試薬は、天然型のヌクレオシド及び 2'-0-メチルヌクレオシ ド（すなわち、 2'-0-メチルグアノシン、 2'-0-メチルアデノシン、 2'-0-メチルシトシン 、 2'-0_メチルゥリジン）については、市販の試薬を用いることができる。アルキル基の 炭素数が 2〜6個の 2'-0-アルキルグアノシン、アデノシン、シトシンおよびゥリジンに ついては、以下の通りである。
2'-0_アミノエチルグアノシン、アデノシン、シトシン、ゥリジンは、文献（Blommers et al. Biochemistry (1998), 37， 17714-17725·)に従って合成できる。
[0055] 2'-0-プロピルグアノシン、アデノシン、シトシン、ゥリジンは、文献（Lesnik，E.A. et al . Biochemistry (1993)， 32， 7832-7838·)に従って合成できる。 2'-0 -ァリルグアノシン、アデノシン、シトシン、ゥリジンは、市販の試薬を用いること ができる。
2'-0-メトキシェチルグアノシン、アデノシン、シトシン、ゥリジンは、特許（US626184 0)または、文献（Martin, P. Helv. Chim. Acta. (1995) 78， 486-504.)に従って合成で きる。
2'-0-ブチルグアノシン、アデノシン、シトシン、ゥリジンは、文献（Lesnik，E.A. et al. Biochemistry (1993)， 32， 7832-7838·)に従って合成できる。
[0056] 2'-0_ペンチルグアノシン、アデノシン、シトシン、ゥリジンは、文献（Lesnik，E.A. et a 1. Biochemistry (1993)， 32， 7832-7838·)に従って合成できる。
2'-0_プロパルギルグアノシン、アデノシン、シトシン、ゥリジンは、市販の試薬を用 いること力 Sでさる。
2 ' -0 -ァリルグアノシン、アデノシン、シトシン、ゥリジンは、市販の試薬を用いること ができる。 いては、 W099/14226に記載の方法に従って、アルキレン基の炭素数が 2〜5個の 2' ては、 WO00/47599に記載の方法に従って製造することができる。
[0057] リン酸基をチォエート化する場合は、 3価の亜リン酸に反応してチォエートを形成す る試薬である硫黄、テトラエチルチウラムジスルフイド (TETD、アプライドバイオシス テムズ社）、 Beaucage試薬（Glen Research社）、キサンタンヒドリドなどを用い、文献（T etrahedron Letters, 32， 3005(1991)、 J. Am. Chem. So ， 112， 1253(1990))記載の方 法に準じてチォエート誘導体を得ることができる。
[0058] 合成機で用いるコントロールド ポア グラス（CPG)としては、 2'-0-メチルヌクレオ シドの結合したものは、市販のものを利用することができる。また、 2'-0， 4'-C_メチレ ングアノシン、アデノシン、 5-メチルシトシンおよびチミジンについては、 W099/14226 に記載の方法に従って、アルキレン基の炭素数が 2〜5個の 2'-0， 4'-C-アルキレン グアノシン、アデノシン、 5-メチルシトシンおよびチミジンについては、 WO00/47599に 記載の方法に従って製造したヌクレオシドを文献（Oligonucleotide Synthesis, Edited by M.J.Gait, Oxford University Press, 1984)に従って、 CPGに結合すること力 Sできる 。修飾された CPG (特開平 7— 87982の実施例 12bに記載）を用いることにより、 3'末 端に 2-ヒドロキシェチルリン酸基が結合したオリゴヌクレオチドを合成できる。また、 3' -amino-Modifier C3 CPG, 3 -amino-Modifier C7 CPG, Glyceryl CPG, (Glen Resear ch), 3'-specer C3 SynBase CPG 1000， 3'_specer C9 SynBase CPG 1000 (link techn ologies)を使えば、 3'末端にヒドロキシアルキルリン酸基、または、アミノアルキルリン 酸基が結合したオリゴヌクレオチドを合成できる。
[0059] 本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチド又は薬理学上許容されるその塩を標的 R NAが関与する疾患の治療 ·予防剤として使用する場合には、本発明のアンチセンス オリゴヌクレオチド又は薬理学上許容されるその塩を、それ自体あるいは適宜の薬理 学上許容される賦形剤、希釈剤などと混合し、錠剤、カプセル剤、顆粒剤、散剤若し くはシロップ剤などにより経口的に、あるいは、注射剤、坐剤、貼付剤若しくは外用剤 などにより非経口的に投与することができる。
[0060] これらの製剤は、賦形剤（例えば、乳糖、白糖、葡萄糖、マンニトール、ソルビトール のような糖誘導体；トウモロコシデンプン、バイレショデンプン、 α澱粉、デキストリンの ような澱粉誘導体；結晶セルロースのようなセルロース誘導体；アラビアゴム；デキスト ラン;プルランのような有機系賦形剤；軽質無水珪酸、合成珪酸アルミニウム、珪酸カ ルシゥム、メタ珪酸アルミン酸マグネシウムのような珪酸塩誘導体；燐酸水素カルシゥ ムにょうな燐酸塩;炭酸カルシウムのような炭酸塩;硫酸カルシウムのような硫酸塩な どの無機系賦形剤など）、滑沢剤（例えば、ステアリン酸、ステアリン酸カルシウム、ス テアリン酸マグネシウムのようなステアリン酸金属塩；タルク；コロイドシリカ；ビーズヮッ タス、ゲイ蠟のようなワックス類；硼酸；アジピン酸；硫酸ナトリウムのような硫酸塩；ダリ コール；フマル酸；安息香酸ナトリウム； DLロイシン；ラウリル硫酸ナトリウム、ラウリル 硫酸マグネシウムのようなラウリル硫酸塩：無水珪酸、珪酸水和物のような珪酸類；上 記澱粉誘導体など）、結合剤 (例えば、ヒドロキシプロピルセルロース、ヒドロキシプロ ピルメチルセルロース、ポリビュルピロリドン、マクロゴール、前記賦形剤と同様の化 合物など）、崩壊剤（例えば、低置換度ヒドロキシプロピルセルロース、カルボキシメチ ノレセノレロース、カノレポキシメチノレセノレロースカノレシゥム、内部架橋カノレボキシメチノレ セルロースナトリウムのようなセルロース誘導体；カルボキシメチルスターチ、カルボキ シメチルスターチナトリウム、架橋ポリビュルピロリドンのような化学修飾されたデンプ ン.セルロース類など）、乳化剤（例えば、ベントナイト、ビーガムのようなコロイド性粘 土；水酸化マグネシウム、水酸化アルミニウムのような金属水酸化物；ラウリル硫酸ナ トリウム、ステアリン酸カルシウムのような陰イオン界面活性剤；塩化ベンザルコニゥム のような陽イオン界面活性剤；ポリオキシエチレンアルキルエーテル、ポリオキシェチ レンソルビタン脂肪酸エステル、ショ糖脂肪酸エステルのような非イオン界面活性剤 など）、安定剤（メチルパラベン、プロピルパラベンのようなパラォキシ安息香酸エステ ノレ類；クロロブタノール、ベンジルアルコール、フエニルエチルアルコールのようなァ ノレコール類；塩化ベンザルコニゥム；フエノール、タレゾールのようなフエノール類；チ メロサール；デヒドロ酢酸；ソルビン酸など）、矯味矯臭剤（例えば、通常使用される甘 味料、酸味料、香料など）、希釈剤などの添加剤を用いて周知の方法で製造される。
[0061] 本発明の治療'予防剤は、好ましくは、 0.05〜5 H moles/mlの本発明のアンチセ ンスオリゴヌクレオチド又は薬理学上許容されるその塩、 0.02〜10 %w/vの炭水化 物又は多価アルコール及び 0.01〜0.4 %w/vの薬理学上許容される界面活性剤を 含有する。本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチド又は薬理学上許容されるその塩 の含有量の更に好ましい範囲は、 0.1〜1 〃 moles/mlである。
上記炭水化物としては、単糖類及び/又は 2糖類が特に好ましい。これら炭水化物 及び多価アルコールの例としては、グルコース、ガラクトース、マンノース、ラタトース、 マルトース、マンニトール及びソルビトールが挙げられる。これらは、単独で用いても、 併用してもよい。
[0062] また、界面活性剤の好まし!/、例としては、ポリオキシエチレンソルビタンモノ〜トリ エステル、アルキルフエ二ルポリオキシエチレン、ナトリウムタウロコラート、ナトリウムコ ラート、及び多価アルコールエステルが挙げられる。このうち特に好ましいのは、ポリ ォキシエチレンソルビタンモノ〜トリーエステルであり、ここにおいてエステルとして特 に好ましいのは、ォレエート、ラウレート、ステアレート及びパルミテートである。これら は単独で用いても、併用してもよい。
また、本発明の治療'予防剤は、更に好ましくは、 0.03〜0.09 Mの薬理学上許容さ れる中性塩、例えば、塩化ナトリウム、塩化カリウム及び/又は塩化カルシウムを含有 する。
[0063] また、本発明の治療'予防剤は、更に好ましくは、 0.002〜0.05 Mの薬理学上許容 される緩衝剤を含有することができる。好ましい緩衝剤の例としては、クェン酸ナトリウ ム、ナトリウムグリシネート、リン酸ナトリウム、トリス（ヒドロキシメチル）ァミノメタンが挙げ られる。これらの緩衝剤は、単独で用いても、併用してもよい。
[0064] さらに、本発明の治療'予防剤は、溶液状態で供給してもよい。しかし、ある期間保 存する必要がある場合等のために、アンチセンスオリゴヌクレオチドを安定化して治 療効果の低下を防止する目的で通常は凍結乾燥しておくことが好ましぐその場合 は用時に溶解液（注射用蒸留水など）で再構成 (reconstruction)して、即ち投与され る液体状態にして用いればよい。従って、本発明の治療 ·予防剤は、各成分が所定 の濃度範囲になるよう溶解液で再構成して使用するための、凍結乾燥された状態の ものも包含する。凍結乾燥物の溶解性を促進する目的で、アルブミン、グリシン等の アミノ酸を更に含有させてお!/、てもよレ、。
[0065] 本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチド又は薬理学上許容されるその塩をヒトに投 与する場合には、例えば、成人 1日あたり約 0.1〜100 mg/kg (体重）、好ましくは 1〜5 0 mg/kg (体重）の投与量で、 1回または数回に分けて経口投与または静注するとよ いが、その投与量や投与回数は、疾患の種類、症状、年齢、投与方法などにより適 宜変更しうる。
[0066] 関節リウマチ患者への本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチド又は薬理学上許容 されるその塩の投与は、例えば、以下のようにして行うことができる。すなわち、本発 明のアンチセンスオリゴヌクレオチド又は薬理学上許容されるその塩を当業者に周知 の方法で製造し、これを常法により滅菌処理し、例えば 1200 a g/mlの注射用溶液 を調製する。この溶液を、患者静脈内にアンチセンスオリゴヌクレオチドの投与量が 体重 lkg当たり例えば 20 mgとなるように、例えば輸液の形で点滴投与する。投与は 、例えば 1週間の間隔で 4回繰り返し、その後も、臨床症状や組織所見を指標とした 治療効果の確認をしながら、適宜この治療を繰り返す。治療効果があり、明らかな副 作用が見られない限り、治療を継続する。 実施例
[0067] 以下、本発明を実施例、参考例、試験例及び製剤例によって具体的に説明する。
なお、これらの実施例等は、本発明を説明するためのものであって、本発明の範囲を 限定するものではない。
[0068] [実施例 1]
HO-Te2-C-Te2-T-5Ce2-G-Te2-G-C-T-T-A-Ge2-G-Ge2-T-5Ce2-Ae2t-H (AS-1-2)の 合成
核酸自動合成機（パーキンエルマ一社製 ABI model 394 DNA/RNA synthesizer) を用い、 40nmolスケールのプログラムに従って行った。各合成サイクルにおける溶媒 、試薬、ホスホロアミダイトの濃度は天然オリゴデォキシヌクレオチド合成の場合と同じ ものを用いた。非天然型のホスホロアミダイトは特許 3420984号の実施例 14(5' -0-ジ メトキシトリチル -2， -0,4， -C-エチレン- 6-N-ベンゾィルアデノシン- 3， -0_(2-シァノ ェチル N，N-ジイソプロピル)ホスホロアミダイト)、実施例 27 (5，-0-ジメトキシトリチル- 2， -0,4， -C-エチレン- 2-N-イソブチリルグアノシン- 3， -0_(2-シァノエチル N，N_ジィ ソプロピル)ホスホロアミダイト)、実施例 22 (5， -0-ジメトキシトリチル -2， -0,4， -C-ェチ レン- 4-N-ベンゾィル -5-メチルシチジン- 3' -0_(2-シァノエチル N，N-ジイソプロピル )ホスホロアミダイト）、実施例 9 (5， -0 -ジメトキシトリチル -2， -0,4， -C-エチレン- 5-メ チルゥリジン- 3，-0-(2-シァノエチル N，N-ジイソプロピノレ)ホスホロアミダイト）、の化 合物を用いた。固相担体として、 Universaト Q-CPG (Glen Research製) 0·2 molを用 い、表記の化合物を合成した。但し、非天然型のホスホロアミダイトをカップリングさせ る時間は、 15分間とした。
[0069] 目的配列を有する保護されたオリゴヌクレオチド類縁体を濃アンモニア水で処理す ることによってオリゴマーを支持体から切り出すとともに、リン酸基の保護基のシァノエ チル基と核酸塩基上の保護基をはずした。溶媒を減圧下留去し、残った残渣を逆相 HPLC (島津製作所製 LC— 10VP、カラム（Merck, Chromolith Performance RP_18e ( 4.6 X 100 mm))、 A溶液： 5%ァセトニトリル、 0.1 M酢酸トリェチルァミン水溶液 (TEAA), Η 7.0、 B溶液：ァセトニトリル、 B% : 10%→ 45%(8min, linear gradient)； 60°C； 2 ml/min ; 260 nm)にて精製し、 ジメトキシトリチル基を有する目的物のピークを集めた。水を 加え、減圧下留去することで、 TEAAを除いた。 80%酢酸水溶液（500 1)を加え、 20 分放置することで、ジメトキシトリチル基の脱保護を行った。溶媒を留去したのち、残 渣を 500 μ 1の水に溶解し、 0.45 μ mのフィルター（MILLIPORE, Ultrafree-MC)でろ過 し、 目的とするオリゴヌクレオチドを得た。本化合物は、逆相 HPLC (島津製作所製 L C— 10VP、カラム（Merck, Chromolith Performance RP- 18e (4.6 X 100 mm))、 A溶液 : 5%ァセトニトリル、 0.1 M酢酸トリェチルァミン水溶液 (TEAA), pH 7.0、 B溶液： 25%ァ セトニトリル、 0.1 M酢酸トリェチルァミン水溶液 (TEAA), pH 7.0、 B% : 20%→ 80%(8min ， linear gradient) ; 60°C； 2 ml/min； 260 nm)で分析すると、 5.22分に溶出された（2.62 A units)。また、化合物は、負イオン ESI質量分析により同定した（計算値： 5860.96
260
、測定値： 5861.01)。
[0070] 本化合物の塩基配列は、（Gene Bank accession No. NM_011061.1)のヌクレオチド 番号 564-581に相補的な配列である。
[実施例 2]
HO-Te2-5Ce2-T-Te2-C-Ge2-T-G-C-T-T-A-Ge2-G-Ge2-T-5Ce2-Ae2t-H (AS- 1-1)の 合成
実施例 1の化合物と同様に目的配列を有する実施例 2の化合物を合成した。本化 合物は、逆相 HPLC (島津製作所製 LC 10VP、カラム（Merck, Chromolith Perform ance RP- 18e (4.6 X 100 mm))、 A溶液： 5%ァセトニトリル、 0.1 M酢酸トリェチルァミン 水溶液 (TEAA), pH 7.0、 B溶液： 25%ァセトニトリル、 0.1 M酢酸トリェチルアミン水溶 液 (TEAA), pH 7.0、 B% : 20%→ 80%(8min, linear gradient) ; 60°C ; 2 ml/min； 260 nm)で 分析すると、 5.22分に溶出された（2.63 A units)。また、化合物は、負イオン ESI質
260
量分析により同定した（計算値 : 5860.96、測定値: 5861.01)。
[0071] 本化合物の塩基配列は、（Gene Bank accession No. NM_011061.1)のヌクレオチド 番号 564-581に相補的な配列である。
[0072] [実施例 3]
HO-Ae2-C-Ge2-T-C-Ae2-C-Ae2-C-T-G-T-C-Te2-T-Ge2-G-A-Ae2-C-Ae2t-H (AS-2 -3)の合成
実施例 1の化合物と同様に目的配歹 IJを有する実施例 3の化合物を合成した。脱保 護後、逆相 HPLC (島津製作所製 LC 10VP、カラム（Merck, Chromolith Performan ce RP-18e (4.6 X 100 mm))、 A溶液： 5%ァセトニトリル、 0.1 M酢酸トリェチルァミン水 溶液 (TEAA), ρΗ 7.0、 B溶液：ァセトニトリル、 B% : 10%→ 45%(8min, linear gradient) ; 6 0°C ; 2 ml/min ; 260 nm)にて精製し、 ジメトキシトリチル基を有する目的物のピークを 集めた。水を加え、減圧下留去することで、 TEAAを除いた。 80%酢酸水溶液（500 1 )を加え、 20分放置することで、ジメトキシトリチル基の脱保護を行った。溶媒を留去し たのち、残渣を 500 1の水に溶解し、酢酸ェチルで洗浄後、 0.45 mのフィルター（M ILLIPORE, Ultrafree-MC)でろ過し、 目的とするオリゴヌクレオチドを得た。本化合物 は、逆相 HPLC (島津製作所製 LC— 10VP、カラム（Merck, Chromolith Performance RP-18e (4.6 X 100 mm))、 A溶液： 5%ァセトニトリル、 0.1 M酢酸トリェチルアミン水溶 液 (TEAA), ρΗ 7.0、 B溶液： 25%ァセトニトリル、 0.1 M酢酸トリェチルァミン水溶液 (TE AA), H 7.0、 B% : 20%→ 80%(8min, linear gradient) ; 60°C； 2 ml/min； 260 nm)で分析 すると、 5.41分に溶出された（1.49 A units)。また、化合物は、負イオン ESI質量分
260
析により同定した（計算値： 6726.51、測定値： 6726.27)。
[0073] 本化合物の塩基配列は、（Gene Bank accession No. NM_011061.1)のヌクレオチド 番号 867-887に相補的な配列である。
[0074] [参考例 1]
HO-Te2-5Ce2-Te2-Te2-C-G-T-G-C-T-T-A-G-G-Ge2-Te2-5Ce2-Ae2t-H (AS- 1)の合 成
実施例 1の化合物と同様に目的配列を有する参考例 1の化合物を合成した。本化 合物は、逆相 HPLC (島津製作所製 LC 10VP、カラム（Merck, Chromolith Perform ance RP- 18e (4.6 X 100 mm))、 A溶液： 5%ァセトニトリル、 0.1 M酢酸トリェチルァミン 水溶液 (TEAA), pH 7.0、 B溶液： 25%ァセトニトリル、 0.1 M酢酸トリェチルアミン水溶 液 (TEAA), pH 7.0、 B% : 20%→ 80%(8min, linear gradient) ; 60°C ; 2 ml/min； 260 nm)で 分析すると、 5.52分に溶出された（3.19 A units)。また、化合物は、負イオン ESI質
260
量分析により同定した（計算値 : 5860.88、測定値: 5860.3)。
[0075] 本化合物の塩基配列は、（Gene Bank accession No. NM_011061.1)のヌクレオチド 番号 564-581に相補的な配列である。 [0076] [参考例 2]
HO-Ae2-C-Ge2-T-5Ce2-A-5Ce2-A-C-T-G-T-C-T-Te2-G-Ge2A-Ae2-C-Ae2t-H (AS_ 2-2)の合成
実施例 1の化合物と同様に目的配列を有する参考例 2の化合物を合成した。脱保 護後、逆相 HPLC (島津製作所製 LC 10VP、カラム（Merck, Chromolith Performan ce RP-18e (4.6 X 100 mm))、 A溶液： 5%ァセトニトリル、 0.1 M酢酸トリェチルァミン水 溶液 (TEAA), ρΗ 7.0、 B溶液：ァセトニトリル、 B% : 10%→ 45%(8min, linear gradient) ; 6 0°C ; 2 ml/min ; 260 nm)にて精製し、 ジメトキシトリチル基を有する目的物のピークを 集めた。水を加え、減圧下留去することで、 TEAAを除いた。 80%酢酸水溶液（500 1 )を加え、 20分放置することで、ジメトキシトリチル基の脱保護を行った。溶媒を留去し たのち、残渣を 500 μ 1の水に溶解し、 0.45 μ mのフィルター（MILLIPORE, Ultrafree- MC)でろ過し、 目的とするオリゴヌクレオチドを得た。本化合物は、逆相 HPLC (島津 製作所製 LC— 10VP、カラム（Merck, Chromolith Performance RP_18e (4.6 X 100 m m))、 A溶液： 5%ァセトニトリル、 0.1 M酢酸トリェチルァミン水溶液 (TEAA), ρΗ 7.0、 B 溶液： 25%ァセトニトリル、 0.1 M酢酸トリェチルァミン水溶液 (TEAA), pH 7.0、 B% : 20% → 80%(8min, linear gradient) ; 60°C； 2 ml/min； 260 nm)で分析すると、 5.23分に溶出 された（2.14 A units) 0また、化合物は、負イオン ESI質量分析により同定した（計算
260
値： 6754.57、測定値： 6754.21)。
[0077] 本化合物の塩基配列は、（Gene Bank accession No. NM_011061.1)のヌクレオチド 番号 867-887に相補的な配列である。
[0078] [参考例 3]
HO-Te2-C-Te2-T-C-Ge2-T-G-5Ce2-Te2-T-A-Ge2-G-G-Te2-C-Ae2t-H (AS- 1-3)の 合成
実施例 1の化合物と同様に目的配列を有する参考例 3の化合物を合成した。本化 合物は、逆相 HPLC (島津製作所製 LC 10VP、カラム（Merck, Chromolith Perform ance RP- 18e (4.6 X 100 mm))、 A溶液： 5%ァセトニトリル、 0.1 M酢酸トリェチルァミン 水溶液 (TEAA), pH 7.0、 B溶液： 25%ァセトニトリル、 0.1 M酢酸トリェチルアミン水溶 液 (TEAA), pH 7.0、 B% : 20%→ 80%(8min, linear gradient) ; 60°C ; 2 ml/min； 260 nm)で 分析すると、 5.28分に溶出された（9.22 A units)。また、化合物は、負イオン ESI質
260
量分析により同定した（計算値： 5846.94、測定値： 5846.97)。
[0079] 本化合物の塩基配列は、（Gene Bank accession No. NM_011061.1)のヌクレオチド 番号 564-581に相補的な配列である。
[0080] [参考例 4]
HO-Te2-Ge2-Ae2-5Ce2-C-C-T-A-A-G-C-A-C-G-Ae2-Ae2-G-Ae2t-H (S-1)の合成
PADI4 mRNAを標的としない配列を有する参考例 4の化合物は、実施例 1の化合物 と同様に合成した。本化合物は、逆相 HPLC (島津製作所製 LC— 10VP、カラム（Mer ck， Chromolith Performance RP- 18e (4.6 X 100 mm))、 A溶液： 5%ァセトニトリル、 0.1 M酢酸トリェチルァミン水溶液 (TEAA), pH 7.0、 B溶液： 25%ァセトニトリル、 0.1 M酢 酸トリエチルァミン水溶液 (TEAA), pH 7.0、 B% : 20%→ 80%(8min, linear gradient) ; 60 °C ; 2 ml/min ; 260 nm)で分析すると、 7.77分に溶出された（8.33 A units)。また、化
260
合物は、負イオン ESI質量分析により同定した（計算値: 5851.90、測定値: 5852.9)。
[0081] 本化合物の塩基配列は、（Gene Bank accession No. NM_011061.1)のヌクレオチド 番号 564-581の配列である。
[0082] [参考例 5]
HO-Te2-Ge2A-5Ce2-C-5Ce2-T-A-A-G-C-A-5Ce2-G-Ae2-A-Ge2-Ae2t-H (S-1-1)の 合成
PADI4 mRNAを標的としない配列を有する参考例 5の化合物は、実施例 1の化合物 と同様に合成した。本化合物は、逆相 HPLC (島津製作所製 LC— 10VP、カラム（Mer ck， Chromolith Performance RP- 18e (4.6 X 100 mm))、 A溶液： 5%ァセトニトリル、 0.1 M酢酸トリェチルァミン水溶液 (TEAA), pH 7.0、 B溶液： 25%ァセトニトリル、 0.1 M酢 酸トリエチルァミン水溶液 (TEAA), pH 7.0、 B% : 20%→ 80%(8min, linear gradient) ; 60 °C； 2 ml/min； 260 nm)で分析すると、 4.99分に溶出された（4.84 A units)。また、化
260
合物は、負イオン ESI質量分析により同定した（計算値: 5880.03、測定値: 5880.04)。
[0083] 本化合物の塩基配列は、（Gene Bank accession No. NM_011061.1)のヌクレオチド 番号 564-581の配列である。
[0084] [参考例 6] HO- Te2-G_Ae2-C-5Ce2-C_Te2-A_A_G_C_A-5Ce2-G_Ae2-A_Ge2-Ae2t-H (S-l-2)の 合成
PADI4 mRNAを標的としない配列を有する参考例 6の化合物は、実施例 1の化合物 と同様に合成した。本化合物は、逆相 HPLC (島津製作所製 LC— 10VP、カラム（Mer ck， Chromolith Performance RP- 18e (4.6 X 100 mm))、 A溶液： 5%ァセトニトリル、 0.1 M酢酸トリェチルァミン水溶液 (TEAA), pH 7.0、 B溶液： 25%ァセトニトリル、 0.1 M酢 酸トリエチルァミン水溶液 (TEAA), pH 7.0、 B% : 20%→ 80%(8min, linear gradient) ; 60 °C ; 2 ml/min； 260 nm)で分析すると、 5.20分に溶出された（6.72 A units)。また、化
260
合物は、負イオン ESI質量分析により同定した（計算値: 5866.00、測定値: 5866.06)。
[0085] 本化合物の塩基配列は、（Gene Bank accession No. NM_011061.1)のヌクレオチド 番号 564-581の配列である。
[0086] [参考例 7]
HO-Te2-G-Ae2-C-C-5Ce2-T-A-Ae2-Ge2-C-A-5Ce2-G-A-Ae2-G-Ae2t-Hの（S-1-3) 合成
PADI4 mRNAを標的としない配列を有する参考例 7の化合物は、実施例 1の化合物 と同様に合成した。本化合物は、逆相 HPLC (島津製作所製 LC— 10VP、カラム（Mer ck， Chromolith Performance RP- 18e (4.6 X 100 mm))、 A溶液： 5%ァセトニトリル、 0.1 M酢酸トリェチルァミン水溶液 (TEAA), pH 7.0、 B溶液： 25%ァセトニトリル、 0.1 M酢 酸トリエチルァミン水溶液 (TEAA), pH 7.0、 B% : 20%→ 80%(8min, linear gradient) ; 60 °C ; 2 ml/min； 260 nm)で分析すると、 5.33分に溶出された（8.56 A units)。また、化
260
合物は、負イオン ESI質量分析により同定した（計算値: 5866.00、測定値: 5866.04)。
[0087] 本化合物の塩基配列は、（Gene Bank accession No. NM_011061.1)のヌクレオチド 番号 564-581の配列である。
[0088] [参考例 8]
HO-Ae2-5Ce2-Ge2-Te2-C-A-C-A-C-T-G-T-C-T-T-G-G-Ae2-Ae2-5Ce2-Ae2t-H (AS -2)の合成
実施例 1の化合物と同様に目的配列を有する参考例 8の化合物を合成した。本化 合物は、逆相 HPLC (島津製作所製 LC 10VP、カラム（Merck, Chromolith Perform ance RP- 18e (4.6 X 100 mm))、 A溶液： 5%ァセトニトリル、 0.1 M酢酸トリェチルァミン 水溶液 (TEAA), pH 7.0、 B溶液： 25%ァセトニトリル、 0.1 M酢酸トリェチルアミン水溶 液 (TEAA), pH 7.0、 B% : 20%→ 80%(10min, linear gradient) ; 60°C； 2 ml/min； 260 nm) で分析すると、 6.96分に溶出された（8.40 A units)。また、化合物は、負イオン ESI
260
質量分析により同定した（計算値： 6754.57、測定値： 6755.9)。
[0089] 本化合物の塩基配列は、（Gene Bank accession No. NM_011061.1)のヌクレオチド 番号 867-887に相補的な配列である。
[0090] [参考例 9]
HO-Ae2-5Ce2-G-T-5Ce2-Ae2-C-A-C-T-G-T-C-T-T-Ge2-Ge2-A-A-5Ce2-Ae2-H (A S-2-1)の合成
実施例 1の化合物と同様に目的配列を有する参考例 9の化合物を、実施例 1の化 合物と同様に合成した。本化合物は、逆相 HPLC (島津製作所製 LC— 10VP、カラム (Merck, Chromolith Performance RP- 18e (4.6 X 100 mm))、 A溶液： 5%ァセトニトリノレ 、 0.1 M酢酸トリェチルァミン水溶液 (TEAA), pH 7.0、 B溶液： 25%ァセトニトリル、 0.1 M酢酸トリェチルァミン水溶液 (TEAA), pH 7.0、 B% : 20%→ 80%(8min, linear gradient) ; 60°C ; 2 ml/min； 260 nm)で分析すると、 5.27分に溶出された（3.95 A units)。また
260
、化合物は、負イオン ESI質量分析により同定した（計算値: 6768.60、測定値: 6768.2 0)。
[0091] 本化合物の塩基配列は、（Gene Bank accession No. NM_011061.1)のヌクレオチド 番号 867-887に相補的な配列である。
[0092] [参考例 10]
HO-Ae2-C-G-Te2-C-A-5Ce2-A-C-Te2-G-Te2-C-T-Te2-G-G-Ae2-A-C-Ae2t-H (AS_ 2-4)の合成
実施例 1の化合物と同様に目的配列を有する参考例 10の化合物を、実施例 1の化 合物と同様に合成した。本化合物は、逆相 HPLC (島津製作所製 LC— 10VP、カラム (Merck, Chromolith Performance RP- 18e (4.6 X 100 mm))、 A溶液： 5%ァセトニトリノレ 、 0.1 M酢酸トリェチルァミン水溶液 (TEAA), pH 7.0、 B溶液： 25%ァセトニトリル、 0.1 M酢酸トリェチルァミン水溶液 (TEAA), pH 7.0、 B% : 20%→ 80%(8min, linear gradient) ; 60°C ; 2 ml/min； 260 nm)で分析すると、 5.23分に溶出された（5.31 A units)。また
260
、化合物は、負イオン ESI質量分析により同定した（計算値: 6740.54、測定値: 6740.3
9)。
[0093] 本化合物の塩基配列は、（Gene Bank accession No. NM_011061.1)のヌクレオチド 番号 867-887に相補的な配列である。
[0094] [参考例 11]
HO-Te2-Ge2-Te2-Te2-C-C-A-A-G-A-C-A-G-T-G-T-G-Ae2-5Ce2-Ge2-Te2t-H (S-2 )の合成
PADI4 mRNAを標的としない配列を有する参考例 11の化合物は、実施例 1の化合 物と同様に合成した。但し、文献 Bioorg. Med. Chem. (2003) 11， 2211-2226に記載 された 5 ' -0-ジメトキシトリチル -2 ' -0,4' -C-エチレン- 5-メチルゥリジンが結合した C PGを用いた。本化合物は、逆相 HPLC (島津製作所製 LC— 10VP、カラム（Merck, C hromolith Performance RP- 18e (4.6 X 100 mm))、 A溶液： 5%ァセトニトリル、 0.1 M酢 酸トリエチルァミン水溶液 (TEAA), pH 7.0、 B溶液： 25%ァセトニトリル、 0.1 M酢酸トリ ェチルァミン水溶液 (TEAA), pH 7.0、 B% : 20%→ 100%(8min, linear gradient) ; 60°C； 2 ml/min； 260 nm)で分析すると、 6.71分に溶出された（5.78 A units)。また、化合物
260
は、負イオン ESI質量分析により同定した（計算値: 6811.40、測定値: 6811.9)。
[0095] 本化合物の塩基配列は、（Gene Bank accession No. NM_011061.1)のヌクレオチド 番号 867-887の配列である。
[0096] [参考例 12]
HO-Te2-Ge2-T-T-5Ce2-5Ce2-A-A-G-A-C-A-G-T-G-Te2-Ge2-A-C-Ge2-Te2t-H (S- 2-1)の合成
PADI4 mRNAを標的としない配列を有する参考例 12の化合物は、実施例 1の化合 物と同様に合成した。本化合物は、逆相 HPLC (島津製作所製 LC— 10VP、カラム（ Merck, Chromolith Performance RP- 18e (4.6 X 100 mm))、 A溶液： 5%ァセトニトリル、 0.1 M酢酸トリェチルァミン水溶液 (TEAA), pH 7.0、 B溶液： 25%ァセトニトリル、 0.1 M 酢酸トリェチルァミン水溶液 (TEAA), pH 7.0、 B% : 20%→ 80%(8min, linear gradient) ; 6 0°C ; 2 ml/min； 260 nm)で分析すると、 4.98分に溶出された（1.38 A units)。また、 化合物は、負イオン ESI質量分析により同定した（計算値: 6825.60、測定値: 6825.23)
[0097] 本化合物の塩基配列は、（Gene Bank accession No. NM_011061.1)のヌクレオチド 番号 867-887の配列である。
[0098] [参考例 13]
HO-Te2-G-Te2-T-5Ce2-C-Ae2-A-G-A-C-A-G-T-Ge2-T-Ge2-A-5Ce2-G-Te2t-H (S_ 2-2)の合成
PADI4 mRNAを標的としない配列を有する参考例 12の化合物は、実施例 1の化合 物と同様に合成した。本化合物は、逆相 HPLC (島津製作所製 LC— 10VP、カラム（ Merck, Chromolith Performance RP- 18e (4.6 X 100 mm)) A溶液： 5%ァセトニトリル、 0.1 M酢酸トリェチルァミン水溶液 (TEAA), pH 7.0 B溶液： 25%ァセトニトリル、 0.1 M 酢酸トリェチルァミン水溶液 (TEAA), pH 7.0 B% : 20%→ 80%(8min, linear gradient) ; 6 0°C ; 2 ml/min； 260 nm)で分析すると、 5· 18分に溶出された（1.45 A units)。また、
260
化合物は、負イオン ESI質量分析により同定した（計算値: 6825.60、測定値: 6825.20)
[0099] 本化合物の塩基配列は、（Gene Bank accession No. NM_011061.1)のヌクレオチド 番号 867-887の配列である。
[0100] [参考例 14]
HO-Te2-G-Te2-T-C-5Ce2-A-Ae2-G-A-C-A-G-Te2-G-Te2-G-A-5Ce2-G-Te2t-H (S_ 2-3)の合成
PADI4 mRNAを標的としない配列を有する参考例 14の化合物は、実施例 1の化合 物と同様に合成した。本化合物は、逆相 HPLC (島津製作所製 LC— 10VP、カラム（ Merck, Chromolith Performance RP- 18e (4.6 X 100 mm)) A溶液： 5%ァセトニトリル、 0.1 M酢酸トリェチルァミン水溶液 (TEAA), pH 7.0 B溶液： 25%ァセトニトリル、 0.1 M 酢酸トリェチルァミン水溶液 (TEAA), pH 7.0 B% : 20%→ 80%(8min, linear gradient) ; 6 0°C ; 2 ml/min； 260 nm)で分析すると、 5.23分に溶出された（2.76 A units)。また、
260
化合物は、負イオン ESI質量分析により同定した（計算値: 6825.60、測定値: 6825.49) [0101] 本化合物の塩基配列は、（Gene Bank accession No. NM_011061.1)のヌクレオチド 番号 867-887の配列である。
[0102] [参考例 15]
HO-Te2-G-T-Te2-C-C-Ae2-A-G-Ae2-C-Ae2-G-T-Ge2-T-G-Ae2-C-G-Te2t-H (S-2- 4)の合成
PADI4 mRNAを標的としない配列を有する参考例 15の化合物は、実施例 1の化合 物と同様に合成した。本化合物は、逆相 HPLC (島津製作所製 LC— 10VP、カラム（ Merck, Chromolith Performance RP- 18e (4.6 X 100 mm))、 A溶液： 5%ァセトニトリル、 0.1 M酢酸トリェチルァミン水溶液 (TEAA), pH 7.0、 B溶液： 25%ァセトニトリル、 0.1 M 酢酸トリェチルァミン水溶液 (TEAA), pH 7.0、 B% : 20%→ 80%(8min, linear gradient) ; 6 0°C； 2 ml/min； 260 nm)で分析すると、 5.40分に溶出された（2.62 A units)。また、
260
化合物は、負イオン ESI質量分析により同定した（計算値: 6797.55、測定値: 6797.46)
〇
[0103] 本化合物の塩基配列は、（Gene Bank accession No. NM_011061.1)のヌクレオチド 番号 867-887の配列である。
[0104] [参考例 16]
マウス PADI4遺伝子発現ベクターの構築
a) ファーストストランド cDNA合成
ファース卜ストフンド cDNAiま、 Superscript II RNase H— Reverse Transcriptase (Invi trogen)を用いて次に示す方法で合成した。マウス脾臓ポリ A+RNA (Clontech) 100 ng を铸型として、 500 a g/mlオリゴ p(dT)12-18 cDNA合成用プライマー（Roche Diagnos tic) 1 μ 1を DNase and RNase free water (Sigma)に溶解し、最終容量を 15 μ 1として 7 0°Cで 10分インキュベートした。その後、氷上に移して急冷し、 5分間静置した後に 5x f irst strand buffer (Superscript ΙΠこ添付) 5 1、 100 mM DTT (Superscript1 ιΠこ添 付） 2·5 μ 1、 25 mM dNTPs (25 mM each dATP、 dCTP、 dGTP、 dTTP) (Invitrogen) 1 μ 1、 40 units/ μ 1 RNase inhibitor (Toyobo) 0.5 μ 1、 200 units/ μ 1 Superscript II R Nase H— Reverse Transcriptase (Invitrogen) 1 μ 1を加え 25 μ 1の反応液を調整した。 反応液は 42°Cで 90分、 70°Cで 10分インキュベートした後、 DNase and RNase free wat erをカロえ全量を 50 μ 1とし、これを first strand cDNA溶 ί夜とした。
b)マウス Padi4 cDNAの取得
a)で得られたファーストストランド cDNAを出発材料として、下記の方法に従ってマ ウス PADI4ヌクレオチド配列の ORFを有する cDNAは、フォワードプライマー （5'_TAT
番号 8)を用い、 OD DNAポリメラーゼ（TOYOBO)をその添付プロトコールに従って 用いることにより取得した。 目的 cDNAは反応物を 1%のァガロースゲルで電気泳動し 、 目的 cDNA (約 2kbp)の増幅を確認後、 QIAquick PCR Purification Kit (QIAGEN) をその添付プロトコールに従って用いることにより精製した。精製された DNA断片を Z ero Blunt TOPO PCR Cloning Kit (Invitrogen)の pCR— BluntH—TOPOベクターにその 添付のプロトコールに従って用いることにより揷入し、宿主大腸菌を用いて寒天培地 上にプラスミドを含む大腸菌コロニーを形成させた。これらのコロニーを単離してブラ スミドを抽出し、約 2kbpの DNAインサートを有するプラスミド（Padi4/pCR_BluntII)を 単離した。続いて、マウス Padi4動物細胞で発現させるためのベクターは、フォワード
GGTGCGGTGATCCACGTG-3' ) (配列番号 9)、リバースプライマー（5'- CCCGGA
C-3' ) (配列番号 10)を用いて、 Padi4/pCR-BluntIIから Pfe DNAポリメラーゼ（Invitr ogen)をその添付プロトコールに従って用いることにより構築した。得られた PCR反応 中に約 2kbpの DNA断片が特異的増幅されていることをァガロース電気泳動にて確 認し、 QIAquick Gel Extraction Kit (QIAGEN)を用いて DNA断片を添付のプロトコ ールに従って精製した。精製した DNA断片は、添付のバッファーを含む反応液中で Hind IIIおよび Bam HI制限酵素で消化し、 Hind IIIおよび Bam HI消化したプラスミドべ クタ一 pCR3.1 (Invitrogen)に揷入し、宿主大腸菌を用いて寒天培地上にプラスミドを 含む大腸菌コロニーを形成させた。これらのコロニーを単離してプラスミドを抽出し、 約 2kbpの DNAインサートを有するプラスミドを単離した。得られたプラスミドに揷入さ れて!/、る cDNAの全ヌクレオチド配列を ABIプリズム 3700DNAシークェンサ一（Appl
Figure imgf000072_0001
GAGGATCC (配列番号 11)
[参考例 17]
PADI4 cRNAの調製
参考例 16で調製したマウス PADI4遺伝子を有するプラスミド（680 μ g/mL, 10 μ L) を primer (GAATTCTAATACGACTCACTATAGGGAGAC (配列番号 12) 10 M， TGCTGGATATCTGCAGAATTCGGCT (配列番号 13) 10 i M) 50 i Lずつ、 Takar a Ex Taq 250 μ L (タカラバイオ)、滅菌水 140 μ Lを用いて、 PCRサーマルサイクラ 一 PERSONAL (タカラバイオ）用いて増幅した。反応は、 94°Cで 10分間保温の後、 9 4°Cで 1分間、 63°Cで 1分間、 72°Cで 1分間の反応を 30回繰り返した。反応液 500 し にクロ口ホルム 250 し，フエノール 250 しを加え 1分間振とう後、遠心し、水層を回収 した。エタノール沈殿を行った後、ジェチルエーテルで洗浄し、滅菌水 約 1 mlに溶 解し、限界ろ過膜 (Microcon, YM-50)で遠心ろ過した。ろ液に滅菌水 350 μ Lを加え 、再びろ過した。この操作を 3回繰り返し、フィルター上部の溶液を集め、滅菌水で 20 0〃Lにメスアップした。さらに、 4Μ酢酸アンモニゥム水溶液 200 し、冷却したェタノ ール 1 mLをカロえ、エタノール沈殿をし、 0.302 μ g/ μ 1の濃度の DNA断片を 100 μ 1 (0 .603 OD)調製した。調製した DNA断片から AmpliScribe T7 Transcription kitsを用い て cRNAを調製した。上記の DNA断片溶液 6.63 μ Lに 10 X T7 Reaction buffer 4.0 μ L， 100 mm ATP 3.0 μ L， 100 mM CTP 3.0 μ L， 100 mM GTP 3.0 μ L， 100 mM UTP 3.0 a L， 10 mM DTT 4.0 μ L， Ampliscribe T7 Enzyme solution 4.0 μ Lをカロ え、 DEPC処理水で総量 40.0 しとし、 37°Cで 2時間加熱したのち、エタノール沈殿を 行った。 UVを測定することにより定量し、 7.33 Mの濃度の cRNAを調製した。 cRNA は、フリーザーで保管し、適宜溶解し、次の反応に用いた。
[0107] [試験例 1] およそ 18 pmolの PADI4 cRNAと 100 pmolの実施例または参考例で合成したオリゴヌ クレオチドを RNase H buffer ( 40 mM Tris- HCl pH 7.7, 4 mM MgCl ， 1 mM DTT, 40 %グリセローノレ， 0.03% BSA,タカラバイオ)で総量を 3.4 a Lとし、 W大 菌由来 RNa se H (l.O ^ L,タカラバイオ）， 0.1Uヒト胎盤由来 RNase inhibitor (0.1 L、タカラバ ィォ）の存在下 37°C 15分処理した。反応は 5 X formamide gel buffer ( 0.1 M MOPS p H 7.0, 40 mM sodium acetate, 5 mM EDTA ) 2 /J L , 37% formaldehyde 3.5 ^ L , for mamide 15 しをカロえ、 65°Cで 15分加熱することにより停止した。さらに loading soluti on (50% glycerol, 1 mM J^DTA pH 8.0， 0.25% bromophenol blue, 0.25% xylene cyanol FF ) 2.0 a Lをカロえた。 RNase Hによる cRNAの分解は、ホルムアルデヒドを含む 2%ァ ガロースゲル電気泳動 (lx MOPS-EDTA, 70V、 2時間)を用いェチジゥムブロミドで染 色し RNAを鎖長により分離することによって解析した。 RNAのサイズを示すマーカー は、 1000， 800， 600， 400， 300， 200, 100 baseの RNAを含む Novagen社製 Perfect RNAT
Markers, 0.1— lkbを用レヽた。染色し 7こグノレ (ま Molecular Imager FX Fluoresent Imag er system (Bio-Rad製)を用いて可視化し、 Quantity Oneソフトウェア (Bio-Rad製)を用 いて定量した。
[0108] 表 3に実験に供与したオリゴヌクレオチド（AS-2, AS-2-1, AS-2-2, AS-2-3, AS-2- 4， S-2, S-2-1, S-2-2, S_2_3， S_2_4)の配列（連続した DNA部分は、 2重下泉で示し た）、連続した DNA数についてまとめた。図 5にオリゴヌクレオチドと PADI4 cRNAの 2 本鎖に対する RNase Hの反応のゲル電気泳動の結果を示す。連続した DNAが 13で あり、かつ、アンチセンス配列を有する AS-2は、主に目的部位での切断を起こし、お よそ 1230 base及び 920 baseの切断断片が観察された。また一部目的部位以外の切 断も観察された。連続した DNAが 13であり、かつ、 PADI4と相補的な配列を持たない センス配列を有する S-2では、複数の切断断片が観察された。連続した DNA数を 9,7 または 5に減少させた AS-2-1, AS-2-2, AS_2_3では、 目的部位以外の切断が減少し た。また、センス配列をもつ S-2のシリーズにおいても、連続した DNA数を 9,7または 5 に減少させた S-2-1, S-2-2, S-2-3において、連続した DNA数に応じて切断断片が 見られなくなり、特に連続した DNA数力 ¾つである S-2-3では、ほとんど切断が観察さ れなくなった。連続した DNA数力 ¾以下である AS-2-4, S-2-4においては、 RNase Hに よる切断は観察されな力 た。
1]
Figure imgf000075_0001
表 4に実験に供与したオリゴヌクレオチド（AS-l, AS-1-1, AS-1-2, AS-1-3, S_l， S -1-1， S-l-2, S-2-3)の配列（連続した DNA部分は、 2重下線で示した）、連続した DN A数についてまとめた。図 6にオリゴヌクレオチドと PADI4 cRNAの 2本鎖に対する RNas e Hの反応のゲル電気泳動の結果を示す。連続した DNAが 10であり、かつ、 ンス配列を有する AS-1は、主に目的部位での切断を起こし、およそ 1540 base及び 61 0 baseの切断断片が観察された。また一部目的部位以外の切断も観察された。連続 した DNAが 10であり、かつ、 PADI4と相補的な配列を持たないセンス配列を有する S- 1では、複数の切断断片が観察された。連続した DNA数を 6または 5に減少させた AS- 1-1， AS-1-2では、 目的部位以外の切断が減少した。また、センス配列をもつ S-2の シリーズにおいても、連続した DNA数を 6または 5に減少させた S-1-1, S-1-2において 、ほとんど切断が観察されなくなった。連続した DNA数力 ¾以下である AS-2-4, S-2-4 においては、 RNase Hによる切断は観察されなかった。
2]
Figure imgf000076_0001
これらのことから、連続した DNA数力 ¾または 6つである場合、アンチセンス配列をも つオリゴヌクレオチドにおいて目的部位での特異的切断が認められ、コントロールで あるセンス配列をもつオリゴヌクレオチドにおいては非特異的な切断がほとんど抑制 されることが明らかになった。 [0109] [試験例 2]
アンチセンスオリゴヌクレオチドによるマウス PADI4 mRNAの発現抑制の評価
マウス胎児由来の繊維芽細胞株である MH3T3に、参考例 16で調製したマウス PA DI4遺伝子を有するプラスミド、及び、マウス PADI4 mRNAに対する実施例のアンチセ ンスオリゴヌクレオチドを一過性に細胞導入し、細胞内のマウス PADI4 mRNAを定量 することにより、実施例アンチセンスオリゴヌクレオチドによるマウス PADI4 mRNA発現 量抑制効果を評価した。
マウス PADI4遺伝子を有するプラスミド、及び、実施例または試験例のオリゴヌタレ ォチドの細胞への導入は、 SuperFect Transfect Reagent (QIAGEN)を使用し、添付 プロトコールに従って実施した。導入から 24時間経過した細胞から全 RNAを RNeasy 9 6 kit (QIAGEN)を使用して抽出し、その後、 DNase-free Kit (AMBION)使って、得ら れた全 RNA力、らゲノム DNAを除去した。各々は添付のプロトコールに準じて実施した
〇
[0110] マウス PADI4 mRNAの発現定量は TaqMan (Applied Biosystems; Assay ID： Mm004 78086— ml)
を用い、また、マウス PADI4 mRNA発現量を標準化するために、 TaqMan Ribosomal R NA Control Reagents (Applied Biosystemsノを使つて、 18S ribosomal RNA、rRNA)を 定量した。 RT- PCR反応は、 MicroAmp Optical 96-well Reaction Plate (Applied Bios ystems)を用い、反応溶液の 1 well中の組成は以下の通りである。全 RNA溶液 2 β \ 、 2x One-Step RT-PCR Master Mix 25 μ 1、 40x Multiscribe & RNase Inhibitor Mix 1.25 μ 1、 TaqMan Probe 2.5 μ 1、 RNase free water 19.25 μ 1。
[0111] また、検量線作成用にマウス PADI4遺伝子のみを一過性に導入した細胞由来の全 RNA溶液をあらかじめ調整し、 5倍希釈系列を繰り返して便宜上、 625， 125， 25， 1， 0 の希釈系列とした。反応および検出は、 ABI 7900ΗΤ Sequence Detection System(Ap plied Biosystems)を使い、 48°C 30分、 95°C 10分の反応後、 95°C 10秒、 60。C 1分の 反応を 50回繰り返し、 1サイクル毎にレポーター色素の発光量を測定した。各サイク ルのレポーター色素の発光量からマウス PADI4、 rRNAの増幅曲線を作成した。検量 線作成用全 RNA溶液の希釈系列の増幅曲線力 横軸に濃度、縦軸にサイクル数を とった検量線を作成し、各発現定量用サンプルはその対数増幅期において任意に 設定した一定の発光量を超えたサイクル数を検量線上にプロットし、相対的な発現量 を算出した。マウス PADI4の発現量は同一サンプルにおける rRNAの発現量の値で補 正を行った。
[0112] PADI4遺伝子、及び、 PADI4の発現を抑制しないと考えられるオリゴヌクレオチド（A S-l-3，S-l-l，S-l-2，S-l-3)を導入したものにおいて、マウス PADI4 mRNAの発現量 は、 PADI4遺伝子単独のものよりも発現量の向上が認められた。この発現量の向上 は、 PADI4遺伝子単独と比較してオリゴヌクレオチドを添加した場合、 Transfect Reag entのァミノ基のカチオンと核酸のリン酸基のァニオンの比率が変わったことに由来 すると考えられる。そこで、 PADI4 mRNA発現を抑制しないと考えられるオリゴヌクレオ チド S-1-3を用いた場合を 100%として、個々のオリゴヌクレオチドを用いた場合の PA DI4 mRNA発現量を算出し、その結果を図 7に示した。
[0113] 連続した DNAが 10であり、かつ、アンチセンス配列を有する AS-1では、 PADI4 mRN A発現の抑制が観察された。連続した DNAが 10であり、かつ、 PADI4と相補的な配列 を持たないセンス配列を有する S-1でも、 PADI4 mRNA発現の抑制が観察された。そ れと比較して、連続した DNA数を 6または 5に減少させ、かつ、アンチセンス配列を有 する AS-1-1, AS-1-2では、 PADI4 mRNA発現の抑制が認められた力 S、連続した DNA 数を 6または 5に減少させ、かつ、 PADI4と相補的な配列を持たな!/、センス配列を有す る S-1-1, S-1-2において、 PADI4 mRNA発現の抑制が認められなかった。
[0114] これらのことから、連続した DNA数力 ¾または 6つである場合、アンチセンス配列をも つオリゴヌクレオチドにおいて PADI4 mRNA発現の抑制が認められ、コントロールであ るセンス配列をもつオリゴヌクレオチドにお!/、ては PADI4 mRNA発現の抑制が認めら れないことが明らかになり、特異性の高いアンチセンスオリゴヌクレオチドの設計がで きることが明ら力、となった。
[0115] [試験例 3]
融解温度測定試験
アンチセンスオリゴヌクレオチド（AS-2, AS-2-1, AS-2-2, AS-2-3, AS-2-4)と、アン チセンスオリゴヌクレオチドと相補的な配列（5， -UGU UCC AAG ACA GUG UGA C GU -3 ' ) (配列番号 14)を有する RNAオリゴヌクレオチドを、最終濃度が 0.33 Mに なるように融解温度（Tm)測定用溶液（12.5 mMリン酸緩衝液 (pH 6.8) )で溶解し、 調製した。両鎖が入った溶液（3 mL)を 90°Cで 5分間加温し、室温まで徐冷した。サン プル溶液は円二色性分散計（日本分光 J-720型）を用いて測定した。サンプルはセ ノレ (セル厚 10 mm)内に入れ、温度はペルチェ式恒温装置を使用して 20°Cから 80°C まで上昇させ、 0.1°C間隔で 260 nmにおけるモル楕円率を測定した。コントロールとし て、アンチセンスオリゴヌクレオチドと同配列を持つすべて DNAからなるオリゴヌクレオ チド（all DNA : 5，- ACG TCA CAC TGT CTT GGA ACA- 3，） （配列番号 6)を用い 比較した。温度上昇におけるモル楕円率の転移の中点を融解温度（Tm)とした。アン チセンスオリゴヌクレオチド（AS-2, AS-2-1, AS-2-2, AS_2_3， AS-2-4)は All DNAに 比べ、すべて高い Tm値を示した。このことは、アンチセンスオリゴヌクレオチド内に 2 ' -0,4' -エチレン架橋ヌクレオシドを導入することで、相補鎖 RNAとの間で安定な 2本 鎖を形成することを意味する。連続した DNA数力 である AS-2-3において特徴的な T m値を示していないことから、試験例 1で観察された AS-2-3と PADI4 cRNAに対する R Nase Hの配列特異的な切断反応は、 2本鎖の安定性が影響しているというよりも、連 続した DNA数が重要であると考えられる。
表 5
Figure imgf000079_0001
All DNA 21 49
AS-2 13 64
AS-2-1 9 69
AS-2-2 7 70
AS-2-3 5 68
AS-2-4 no gap 71
(製剤例 1)
ソフトカプセル剤 消化性油状物、例えば、大豆油、綿実油又はオリーブ油中に入れた、実施例 1の 化合物の混合物を調製し、正置換ポンプでゼラチン中に注入して、 100 mgの活性成 分を含有するソフトカプセルを得、洗浄後、乾燥する。
[0117] (製剤例 2)
錠剤
常法に従って、 100 mgの実施例 1の化合物、 0.2 mgのコロイド性二酸化珪素、 5 mg のステアリン酸マグネシウム、 275 mgの微結晶性セルロース、 11 mgのデンプン及び 9 8.8 mgのラタトースを用いて製造する。
[0118] 尚、所望により、剤皮を塗布する、
(製剤例 3)
懸濁剤
5 mL中に、 100 mgの実施例 1の化合物、 100 mgのナトリウムカルボキシ基メチルセ ノレロース、 5 mgの安息香酸ナトリウム、 1.0 gのソルビトール溶液（日本薬局方）及び 0. 025 mLのバニリンを含有するように製造する。
[0119] (製剤例 4)
注射剤
1.5重量％の実施例 1の化合物を、 10容量％のプロピレングリコール中で攪拌し、次い で、注射用水で一定容量にした後、滅菌して製造する。
[0120] (製剤例 5)
注射剤
N— —トリメチルアンモニオアセチノレ)一ジドデシル一 D—グルタメート クロリド（ 最終濃度 30 nmol/mL)、ジラウロイルホスファチジルコリン（最終濃度 60 nmol/mL)、 ジォレオイルホスファチジルエタノールァミン（最終濃度 60 nmol/mL)及び 1.5重量％ の実施例 1の化合物を、 10容量％のプロピレングリコール中で攪拌し、次いで、注射用 水を一定容量にした後、滅菌して製造する。
[0121] 本明細書で引用した全ての刊行物、特許および特許出願をそのまま参考として本 明細書にとり入れるものとする。
産業上の利用可能性 [0122] 本発明により、標的となる配列を特異的に切断することができるアンチセンスオリゴ ヌクレオチドが提供された。本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドを用いて、標的 RNAの発現を抑制することができる。本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、標 的 RNAが関与する疾患を予防及び/又は治療するための医薬として有用である。 配列表フリーテキスト
[0123] <配列番号 1〉
配列番号 1は、マウス PADI4 mRNAの塩基配列 (EMBL/GenBankに登録されている Accession No. NM_011061)を示す。
<配列番号 2〉
配列番号 2は、マウス PADI4遺伝子がコードするアミノ酸配歹 IJ (配列番号 1の塩基配 列によりコードされるもの)を示す。
<配列番号 3〉
配列番号 3は、ヒト PADI4 mRNAの塩基配列 (EMBL/GenBankに登録されている Acc ession No. NM— 012387)を示す。
<配列番号 4〉
配列番号 4は、ヒト PADI4遺伝子がコードするアミノ酸配歹 IJ (配列番号 3の塩基配列 によりコードされるもの)を示す。
<配列番号 5〉
配列番号 5は、マウス PADI4 mRNAの塩基配列 (EMBL/GenBankに登録されている Accession No. NM_011061)のヌクレオチド番号 564-581に相補的な配列を示す。 <配列番号 6〉
配列番号 6は、マウス PADI4 mRNAの塩基配列 (EMBL/GenBankに登録されている Accession No. NM_011061)のヌクレオチド番号 867-887に相補的な配列を示す。 <配列番号 7〉
配列番号 7は、参考例 16で使用したフォワードプライマーの配列を示す。 <配列番号 8〉
配列番号 8は、参考例 16で使用したリバースプライマーの配列を示す。
<配列番号 9〉 配列番号 9は、参考例 16で使用したフォワードプライマーの配列を示す。 <配列番号 10〉
配列番号 10は、参考例 16で使用したリバースプライマーの配列を示す。 <配列番号 11〉
配列番号 11は、参考例 16で取得したマウス Padi4 cDNAの配列を示す。 <配列番号 12〉
配列番号 12は、参考例 17で使用したプライマーの配列を示す。
<配列番号 13〉
配列番号 13は、参考例 17で使用したプライマーの配列を示す。
<配列番号 14〉
配列番号 14は、試験例 3で使用した RNAオリゴヌクレオチドの配列を示す。

Claims

請求の範囲
[1] 下記の配列 (I)で表されるアンチセンスオリゴヌクレオチドの又は薬理学上許容される その塩。
Wing — R —Window— R —Wing (I)
(配列 (I)中、 Windowはヌクレオチド数 5又は 6のデォキシリボヌクレオチド配列であり、 R11及び R12は、それぞれ、独立に、リボヌクレオチドであり、
Wing1及び Wing2は、それぞれ、独立に、リボヌクレオチド、リボヌクレオチド酉己列、デォ ボヌクレオチドとの混合配列であるが、 ドとの混合配列である場合、その配列において、デォキシリボヌクレオチドが 4個以上 連続することはなぐ ドとの混合配列である場合、その配列において、デォキシリボヌクレオチドが 4個以上 連続することはなぐ
Wing1— RU又は R12— Wing2の配列を構成する少なくとも 1個のリボヌクレオチドは、糖 部の 2，-0と 4，-Cが C アルキレン鎖で架橋されている。 )
1-4
[2] C アルキレン鎖がエチレン鎖である請求項 1記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド
1-4
又は薬理学上許容されるその塩。
[3] 疾患関連遺伝子の RNAを標的とする請求項 1又は 2記載のアンチセンスオリゴヌタレ ォチド又は薬理学上許容されるその塩。
[4] 疾患関連遺伝子が PADI4遺伝子である請求項 3記載のアンチセンスオリゴヌクレオチ ド又は薬理学上許容されるその塩。
[5] 標的 RNAが Gene Bank accession No. ΝΜ_011061· 1又は NM_012387の塩基配列を 有する請求項 4記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又は薬理学上許容されるその
[6] 請求項 1又は 2記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又は薬理学上許容されるその 塩を含む組成物。
[7] 医薬として使用される請求項 6記載の組成物。
[8] 試薬として使用される請求項 6記載の組成物。
[9] 請求項 1又は 2記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又は薬理学上許容されるその 塩を用いて、標的 RNAの発現を抑制する方法。
[10] 請求項 1又は 2記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又は薬理学上許容されるその 塩を用いて、標的 RNAが関与する疾患を予防及び/又は治療する方法。
[11] 標的 RNAが関与する疾患を予防及び/又は治療するための医薬を製造するため の請求項 1又は 2記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又は薬理学上許容されるそ の塩の使用。
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WO (1) WO2008029619A1 (ja)

Cited By (29)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2014132671A1 (en) 2013-03-01 2014-09-04 National University Corporation Tokyo Medical And Dental University Chimeric single-stranded antisense polynucleotides and double-stranded antisense agent
WO2014192310A1 (en) 2013-05-30 2014-12-04 National University Corporation Tokyo Medical And Dental University Double-stranded agents for delivering therapeutic oligonucleotides
WO2015178277A1 (ja) * 2014-05-19 2015-11-26 神戸天然物化学株式会社 ＣＤ４４遺伝子のバリアントエクソンのスキッピングを誘導し、正常型ＣＤ４４ｍＲＮＡの発現を増加させる核酸医薬
US9328346B2 (en) 2010-11-12 2016-05-03 The General Hospital Corporation Polycomb-associated non-coding RNAs
US9580708B2 (en) 2011-09-14 2017-02-28 Rana Therapeutics, Inc. Multimeric oligonucleotides compounds
WO2017142054A1 (ja) 2016-02-17 2017-08-24 国立大学法人東京工業大学 人工ヌクレオシド及び人工ヌクレオチド並びに人工オリゴヌクレオチド
US9790494B2 (en) 2012-09-14 2017-10-17 Translate Bio Ma, Inc. Multimeric oligonucleotide compounds having non-nucleotide based cleavable linkers
US9816089B2 (en) 2011-12-16 2017-11-14 National University Corporation Tokyo Medical And Dental University Chimeric double-stranded nucleic acid
US9920317B2 (en) 2010-11-12 2018-03-20 The General Hospital Corporation Polycomb-associated non-coding RNAs
WO2018143475A1 (ja) 2017-02-06 2018-08-09 日産化学工業株式会社 一本鎖オリゴヌクレオチド
US10059941B2 (en) 2012-05-16 2018-08-28 Translate Bio Ma, Inc. Compositions and methods for modulating SMN gene family expression
US10058623B2 (en) 2012-05-16 2018-08-28 Translate Bio Ma, Inc. Compositions and methods for modulating UTRN expression
US10174315B2 (en) 2012-05-16 2019-01-08 The General Hospital Corporation Compositions and methods for modulating hemoglobin gene family expression
US10174323B2 (en) 2012-05-16 2019-01-08 The General Hospital Corporation Compositions and methods for modulating ATP2A2 expression
US10174328B2 (en) 2013-10-04 2019-01-08 Translate Bio Ma, Inc. Compositions and methods for treating amyotrophic lateral sclerosis
US10190117B2 (en) 2013-06-16 2019-01-29 National University Corporation Tokyo Medical And Dental University Double-stranded antisense nucleic acid with exon-skipping effect
WO2019022196A1 (ja) 2017-07-26 2019-01-31 日産化学株式会社 一本鎖オリゴヌクレオチド
WO2019182037A1 (ja) 2018-03-20 2019-09-26 国立大学法人東京工業大学 毒性が低減されたアンチセンスオリゴヌクレオチド
WO2020022499A1 (ja) 2018-07-27 2020-01-30 国立大学法人大阪大学 老化の抑制、加齢性の疾患もしくは症状の予防、改善、もしくは治療、または寿命の延長のための組成物
US10655128B2 (en) 2012-05-16 2020-05-19 Translate Bio Ma, Inc. Compositions and methods for modulating MECP2 expression
US10758558B2 (en) 2015-02-13 2020-09-01 Translate Bio Ma, Inc. Hybrid oligonucleotides and uses thereof
WO2020184700A1 (ja) 2019-03-14 2020-09-17 レナセラピューティクス株式会社 Ｉｈｈ発現を調節するための核酸複合体
US10837014B2 (en) 2012-05-16 2020-11-17 Translate Bio Ma, Inc. Compositions and methods for modulating SMN gene family expression
US10858650B2 (en) 2014-10-30 2020-12-08 The General Hospital Corporation Methods for modulating ATRX-dependent gene repression
US10900036B2 (en) 2015-03-17 2021-01-26 The General Hospital Corporation RNA interactome of polycomb repressive complex 1 (PRC1)
WO2021153747A1 (ja) 2020-01-31 2021-08-05 株式会社三和化学研究所 Ａｔｎ１のアンチセンスオリゴヌクレオチド
WO2021177418A1 (ja) 2020-03-04 2021-09-10 日産化学株式会社 Ｃａｌｍ２のアンチセンスオリゴヌクレオチド
WO2022255273A1 (ja) 2021-05-31 2022-12-08 レナセラピューティクス株式会社 リガンド結合核酸複合体
WO2023080159A1 (ja) 2021-11-02 2023-05-11 レナセラピューティクス株式会社 リガンド結合核酸複合体

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2004065633A1 (ja) * 2003-01-21 2004-08-05 Riken ペプチジルアルギニン・デイミナーゼ・タイプⅳの利用方法
WO2006059507A1 (ja) * 2004-11-30 2006-06-08 Sankyo Company, Limited 11β-HSD1アンチセンス化合物

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2004065633A1 (ja) * 2003-01-21 2004-08-05 Riken ペプチジルアルギニン・デイミナーゼ・タイプⅳの利用方法
WO2006059507A1 (ja) * 2004-11-30 2006-06-08 Sankyo Company, Limited 11β-HSD1アンチセンス化合物

Non-Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
MIHO TAKAGI-SATO ET AL.: "Design of ENA gapmers as fine-tuning antisense oligonucleotides with sequence-specific inhibitory activity on mouse PADI4 mRNA expression", NUCLEIC ACIDS SYMPOSIUM SERIES, no. 50, 2006, pages 319 - 320, XP003021650 *
MORITA K. ET AL.: "Inhibition of VEGF mRNA by 2'-O,4'-C-ethylene-bridged nucleic acids (ENA) antisense oligonucleotides and their influence on off-target gene expressions", NUCLEOSIDES NUCLEOTIDES NUCLEIC ACIDS, vol. 25, no. 4-6, 29 August 2006 (2006-08-29), pages 503 - 521, XP003021633 *
RUS'D A.A. ET AL.: "Molecular cloning of cDNAs of mouse peptidylarginine deiminase type I, type III and typ IV, and the expression pattern of type I in mouse", EUR. J. BIOCHEM., vol. 25, no. 3, 1999, pages 660 - 669, XP002177600 *
WU H. ET AL.: "Properties of cloned and expressed human RNase H1", J. BIOL. CHEM., vol. 274, no. 40, 1999, pages 28270 - 28278, XP002951227 *

Cited By (49)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US9816094B2 (en) 2010-11-12 2017-11-14 The General Hospital Corporation Polycomb-associated non-coding RNAs
US9856479B2 (en) 2010-11-12 2018-01-02 The General Hospital Corporation Polycomb-associated non-coding RNAs
US10053694B2 (en) 2010-11-12 2018-08-21 The General Hospital Corporation Polycomb-associated non-coding RNAS
US10119144B2 (en) 2010-11-12 2018-11-06 The General Hospital Corporation Polycomb-associated non-coding RNAs
US9920317B2 (en) 2010-11-12 2018-03-20 The General Hospital Corporation Polycomb-associated non-coding RNAs
US11066673B2 (en) 2010-11-12 2021-07-20 The General Hospital Corporation Polycomb-associated non-coding RNAs
US10358644B2 (en) 2010-11-12 2019-07-23 The General Hospital Corporation Polycomb-associated non-coding RNAs
US9328346B2 (en) 2010-11-12 2016-05-03 The General Hospital Corporation Polycomb-associated non-coding RNAs
US9732341B2 (en) 2011-09-14 2017-08-15 Translate Bio Ma, Inc. Methods of delivering multiple targeting oligonucleotides to a cell using cleavable linkers
US10093924B2 (en) 2011-09-14 2018-10-09 Translate Bio Ma, Inc. Multimetric oligonucleotide compounds
US9580708B2 (en) 2011-09-14 2017-02-28 Rana Therapeutics, Inc. Multimeric oligonucleotides compounds
US10704046B2 (en) 2011-09-14 2020-07-07 Translate Bio Ma, Inc. Multimeric oligonucleotide compounds
US9732340B2 (en) 2011-09-14 2017-08-15 Translate Bio Ma, Inc. Multimeric oligonucleotides compounds having cleavable linkers
US11034955B2 (en) 2011-12-16 2021-06-15 National University Corporation Tokyo Medical And Dental University Chimeric double-stranded nucleic acid
US10329567B2 (en) 2011-12-16 2019-06-25 Osaka University Chimeric double-stranded nucleic acid
US9816089B2 (en) 2011-12-16 2017-11-14 National University Corporation Tokyo Medical And Dental University Chimeric double-stranded nucleic acid
US10337006B2 (en) 2011-12-16 2019-07-02 Osaka University Chimeric double-stranded nucleic acid
US10837014B2 (en) 2012-05-16 2020-11-17 Translate Bio Ma, Inc. Compositions and methods for modulating SMN gene family expression
US10058623B2 (en) 2012-05-16 2018-08-28 Translate Bio Ma, Inc. Compositions and methods for modulating UTRN expression
US10059941B2 (en) 2012-05-16 2018-08-28 Translate Bio Ma, Inc. Compositions and methods for modulating SMN gene family expression
US11788089B2 (en) 2012-05-16 2023-10-17 The General Hospital Corporation Compositions and methods for modulating MECP2 expression
US10174315B2 (en) 2012-05-16 2019-01-08 The General Hospital Corporation Compositions and methods for modulating hemoglobin gene family expression
US10174323B2 (en) 2012-05-16 2019-01-08 The General Hospital Corporation Compositions and methods for modulating ATP2A2 expression
US10655128B2 (en) 2012-05-16 2020-05-19 Translate Bio Ma, Inc. Compositions and methods for modulating MECP2 expression
US9790494B2 (en) 2012-09-14 2017-10-17 Translate Bio Ma, Inc. Multimeric oligonucleotide compounds having non-nucleotide based cleavable linkers
US10844375B2 (en) 2012-09-14 2020-11-24 Translate Bio Ma, Inc. Multimeric oligonucleotide compounds having non-nucleotide based cleavable linkers
US10844374B2 (en) 2013-03-01 2020-11-24 National University Corporation Tokyo Medical And Dental University Chimeric single-stranded antisense polynucleotides and double-stranded antisense agent
WO2014132671A1 (en) 2013-03-01 2014-09-04 National University Corporation Tokyo Medical And Dental University Chimeric single-stranded antisense polynucleotides and double-stranded antisense agent
US11028387B2 (en) 2013-05-30 2021-06-08 National University Corporation Tokyo Medical And Dental University Double-stranded agents for delivering therapeutic oligonucleotides
WO2014192310A1 (en) 2013-05-30 2014-12-04 National University Corporation Tokyo Medical And Dental University Double-stranded agents for delivering therapeutic oligonucleotides
CN105264073A (zh) * 2013-05-30 2016-01-20 国立大学法人东京医科齿科大学 用于递送治疗性寡核苷酸的双链剂
US10190117B2 (en) 2013-06-16 2019-01-29 National University Corporation Tokyo Medical And Dental University Double-stranded antisense nucleic acid with exon-skipping effect
US10174328B2 (en) 2013-10-04 2019-01-08 Translate Bio Ma, Inc. Compositions and methods for treating amyotrophic lateral sclerosis
WO2015178277A1 (ja) * 2014-05-19 2015-11-26 神戸天然物化学株式会社 ＣＤ４４遺伝子のバリアントエクソンのスキッピングを誘導し、正常型ＣＤ４４ｍＲＮＡの発現を増加させる核酸医薬
JPWO2015178277A1 (ja) * 2014-05-19 2017-04-20 神戸天然物化学株式会社 ＣＤ４４遺伝子のバリアントエクソンのスキッピングを誘導し、正常型ＣＤ４４ｍＲＮＡの発現を増加させる核酸医薬
US10174319B2 (en) * 2014-05-19 2019-01-08 Knc Laboratories Co., Ltd. Nucleic acid drug for inducing skipping of variant exon of CD44 gene and increasing expression of normal type CD44 mRNA
US10858650B2 (en) 2014-10-30 2020-12-08 The General Hospital Corporation Methods for modulating ATRX-dependent gene repression
US10758558B2 (en) 2015-02-13 2020-09-01 Translate Bio Ma, Inc. Hybrid oligonucleotides and uses thereof
US10900036B2 (en) 2015-03-17 2021-01-26 The General Hospital Corporation RNA interactome of polycomb repressive complex 1 (PRC1)
WO2017142054A1 (ja) 2016-02-17 2017-08-24 国立大学法人東京工業大学 人工ヌクレオシド及び人工ヌクレオチド並びに人工オリゴヌクレオチド
WO2018143475A1 (ja) 2017-02-06 2018-08-09 日産化学工業株式会社 一本鎖オリゴヌクレオチド
WO2019022196A1 (ja) 2017-07-26 2019-01-31 日産化学株式会社 一本鎖オリゴヌクレオチド
WO2019182037A1 (ja) 2018-03-20 2019-09-26 国立大学法人東京工業大学 毒性が低減されたアンチセンスオリゴヌクレオチド
WO2020022499A1 (ja) 2018-07-27 2020-01-30 国立大学法人大阪大学 老化の抑制、加齢性の疾患もしくは症状の予防、改善、もしくは治療、または寿命の延長のための組成物
WO2020184700A1 (ja) 2019-03-14 2020-09-17 レナセラピューティクス株式会社 Ｉｈｈ発現を調節するための核酸複合体
WO2021153747A1 (ja) 2020-01-31 2021-08-05 株式会社三和化学研究所 Ａｔｎ１のアンチセンスオリゴヌクレオチド
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