WO2008016141A1 - Peptide dérivé de kif capable de se lier à une molécule hla-a24 - Google Patents

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Ryuya Yamanaka
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Definitions

  • the present invention relates to a KIF-derived peptide useful for specific immunotherapy for HLA-A24-positive Dariosoma patients.
  • Non-patent Documents 1 and 2 The prognosis and survival rate of patients with malignant Dario has not improved so much over the past 10 years despite the development of effective combination therapies (Non-patent Documents 1 and 2). Therefore, new therapies need to be developed and specific immunotherapy is one option.
  • Recent advances in tumor immunity have identified several cancer antigens and their epitopes that are recognized by cytotoxic T cells (Non-patent Document 3).
  • Darioma-related antigens and peptides derived from them have also been reported to have very limited numbers! /, (6).
  • Non-Patent Document 1 Karpeh MS, Kelsen DP, Tepper JE (2001) Cancer of the stomach.In: Devita VT Jr. editor.Cancer: principles & practice of oncology.6th ed. Philadelphi a: Lippincott Williams &Wilkins; p. 1092-1121
  • Non-Patent Document 2 Stewart LA (2002) Chemotherapy in adult high-grade glioma: s syste matic review and meta-analysis of individual patient data from 12 randomized trials. Lancet 359: 1011-1018
  • Non-patent literature 3 Renkvist N, Castelli C, Robbins PF, Purani G (2001) A listing of hu man tumor antigens recognized by T cells. Cancer Immuno Immunother 50: 3-15
  • Non-patent literature 4 Liu G, Ying H, Zeng G, Wheeler CJ, Black K, Yu JS (2004) HER-2, gplOO, and MAGE-1 are expressed in human glioblastoma and recognized by cytoto xic T cells. Cancer Res 64: 4980-4986
  • Non-Patent Document 5 Murayama, Kobayashi, Imaizumi, Mastunaga, Kurimoto, S higemori M, Shichijo S, Itoh (2000) Expression of the SART3 tumor-rejection anti gen in brain tumors and induction of cytotoxic T lymphocytes by its peptides . J Imm unother 23: 511-518
  • Non-Patent Document 6 Tsuda N, Nonaka Y, Shichijo S, Yamada A, Ito M, Maeda Y, Harada M, Kamura T, Itoh K (2002) UDP-Gal: bGlcNAc bl, 3-galactosyltransferase, polype ptide 3 (GALT3 ) is a tumour antigen recognized by HLA_A2_restricted cytotoxic T lymphocytes from patients with brain tumour.Br J Cancer 87: 1006—1012
  • An object of the present invention is to provide a peptide derived from a Darioma-related antigen that is useful for specific immunotherapy for Darioma patients.
  • the present invention provides a KIF-derived peptide that can bind to an HLA-A24 molecule and is recognized by cellular immunity. Specifically, the present invention provides a peptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 3 or 15 or a derivative thereof. The present invention also provides a nucleic acid molecule encoding the peptide or derivative of the present invention and a vector containing the nucleic acid molecule.
  • the present invention also provides a pharmaceutical composition for treating or preventing Darioma comprising the peptide, derivative or vector of the present invention, particularly the pharmaceutical composition which is a cancer vaccine.
  • the present invention relates to a Dario-ima reactive cell cytotoxicity comprising contacting peripheral blood mononuclear cells collected from a HLA-A24 molecule-positive Dario-ima patient with the peptide or derivative of the present invention. Methods for inducing T cells are provided.
  • the present invention provides a cell having antigen-presenting ability derived from an HLA-A24 molecule-positive Dario-oma patient, or introduces the vector of the present invention.
  • a method for preparing an antigen-presenting cell that presents a complex of a KIF-derived peptide or a derivative thereof and an HLA-A24 molecule on the cell surface.
  • the present invention further includes a method for treating or preventing Darioma, comprising administering the peptide, derivative or vector of the present invention to a Darioma patient, particularly from the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 3 or 15.
  • a method for treating or preventing Dariooma comprising administering the peptide, derivative or vector of the present invention to a Darioma patient, particularly from the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 3 or 15.
  • the present invention further provides the use of a peptide, derivative or vector of the present invention for the manufacture of a pharmaceutical composition for treating or preventing Darioma, in particular for treating or preventing Darioma.
  • a peptide comprising the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 3 or 15 is used for the production of a cancer vaccine.
  • a KIF-derived peptide capable of inducing CTL capable of damaging Dario cell cells in HLA-A24-positive cancer patients.
  • the KIF-derived peptide of the present invention enables specific immunotherapy for HLA-A24-positive Darioma patients.
  • FIG. 1 mRNA expression of three KIF genes in five Dario-ima cell lines (A) and a series of normal tissues (B).
  • the following Dario cell lines were tested: KNS-81 (malignant daloma), KALS-1 (glioblastoma), INGS-1 (anaplastic astrocytoma), Becher (astrocytoma) , And No. 11 (anaplastic astrocytoma).
  • Actin expression was examined as a control.
  • FIG. 3 (A) Inhibition of cytotoxicity of KIF peptide-stimulated PBMC-derived purified CD8 positive T cells against KNS-81 cells by mAb. * P ⁇ 0.05 by two-sided student t-test. (B) Cold inhibition test of cytotoxicity of KIF peptide-stimulated PBMC-derived purified CD8-positive T cells against KNS-81 cells. * P ⁇ 0.05 by two-sided student t-test.
  • KIF-derived peptide or “KIF peptide” means a peptide fragment consisting of a part of the amino acid sequence of KIF1C, KIF3C, or KIF21B, which is a kinesin superfamily protein.
  • the amino acid sequences of KIF1C, KIF3C, and KIF21B are disclosed in Genebank (NM_006612, NM.002254, and XM_37133, respectively) 2).
  • HLA-A24 molecule means that the peptide can form a complex with the HLA-A24 molecule and be presented on the cell surface.
  • peptides that bind to HLA molecules have a regular amino acid sequence that depends on the type of HLA.
  • the regular amino acid sequence is called a binding motif.
  • the binding motif for the HLA-A24 molecule refers to a sequence in which the second amino acid from the N-terminus is tyrosine or phenylalanin, and the C-terminal amino acid is isoguchi isine, leucine, or phenylalanin.
  • Binding of a peptide having an HLA-A24 molecule-binding motif to an HLA-A24 molecule can be determined by computer analysis such as Bioinformatics and Molecular Analysis Section (NIH, Bethesda, MD) (Parker KC, et al., J. Immunol., 152: 163-175, 1994).
  • the phrase "recognized by cellular immunity” means that the peptide is recognized by specific CTL, in other words, has the ability to induce peptide-specific CTL. Whether or not it has the ability to induce peptide-specific CTL, for example, by interferon (IFN) ⁇ in response to antigen-presenting cells pulsed with the corresponding peptide in peripheral blood mononuclear cells (PBMC) stimulated with the peptide It is possible to measure whether or not a cyto force-in such as ⁇ is produced by measuring by ELISA or the like. In addition, the cytotoxic activity of the induced CTL can be confirmed by a 51 Cr release test or the like.
  • the number of amino acid residues in the peptide of the present invention is preferably in the range of 8 to 14; more preferably 8 to 11; particularly preferably 9 or 10 It is a piece.
  • the phrase "recognized by humoral immunity” means that IgG specific to the peptide exists in the living body, that is, peptide-specific IgG is detected from plasma. Peptides recognized by both cellular immunity and humoral immunity are preferred as the peptides of the present invention because they are expected to have high immunogenicity and excellent CTL inducing ability. Specific IgG in plasma can be measured by a conventional ELISA method or the like.
  • peptide of the present invention is IYCERVRDLL (KIF1C, SEQ ID NO:
  • the KIF-derived peptide derivative refers to the amino acid sequence of the KIF-derived peptide.
  • Substitution of amino acids from the viewpoint of not changing the properties of peptides such as homologous amino acids (polar amino acids, nonpolar amino acids, hydrophobic amino acids, hydrophilic amino acids, positively charged amino acids, negatively charged amino acids, aromatic amino acids, etc.) ) Is preferable. Deletion and attachment of amino acids are preferably performed so that the derivative has 8 to 11 amino acid residues.
  • amino acid substitutions, deletions and / or additions are preferably allowed on the HLA molecule-binding motif. That is, amino acid substitutions, deletions and / or additions are such that the second amino acid from the N-terminus of the derivative's amino acid sequence is tyrosine or phenylalanin, and the C-terminal amino acid force S isoleucine, leucine, or phenylalanin. It is preferable to do so.
  • a derivative particularly suitable for the present invention is the substitution of the second amino acid from the N-terminus of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3 with phenylalanine and / or the C-terminal amino acid with isoleucine or phenylalanine.
  • the amino acids constituting the peptides and derivatives of the present invention may be natural amino acids or amino acid analogs, and examples of amino acid analogs include N-acylated, 0-acylated, esterified, and acid amino acids. Examples include amidated products and alkylated products.
  • the peptides and derivatives of the present invention may be modified in their constituent amino acids or carboxyl groups as long as the functions are not significantly impaired. Modifications include binding of formyl, acetyl, and t-butoxycarbonyl groups to the N-terminus and free amino groups, and methyl, ethyl, and t-butyl groups to the C-terminus and free carboxyl groups. And those that bind a benzyl group or the like.
  • the peptides and derivatives of the present invention can be produced by ordinary peptide synthesis.
  • the Examples of such methods include Peptide Synthesis, Interscience, New York, 1966; The Proteins, Vol2, Academic Press Inc., New York, 1976; Peptide Synthesis, Maruzen Co., 1975; , Maruzen Co., Ltd., 1985; Development of pharmaceuticals, Vol. 14-Peptide synthesis, Hirokawa Shoten, 1991).
  • the peptide and derivative of the present invention may be produced by fragmentation of a polypeptide containing the amino acid sequence IJ of the peptide or derivative of the present invention in a cell.
  • the invention also encompasses the use of the peptides or derivatives of the invention in such embodiments.
  • the number of amino acid residues and amino acid sequence of the polypeptide are arbitrary.
  • Dario-ma refers to the change of glial cells that support neurons into a tumor.
  • the peptides and derivatives of the present invention can efficiently induce and proliferate CTLs that specifically damage HLA-A24 molecular positive Darioma cells, and are useful in the treatment of Dariooma patients.
  • the present invention provides a pharmaceutical composition for treating or preventing Darioma comprising the peptide or derivative of the present invention.
  • the pharmaceutical composition of the present invention may contain one kind of peptide or derivative, or may contain two or more kinds of peptides and / or derivatives in combination. Since CTL in cancer patients is a collection of cells that recognize different cancer antigen peptides, it is more effective to use a combination of multiple types of peptides and / or derivatives. You may combine with cancer antigen peptides other than the peptide of this invention.
  • the pharmaceutical composition of the present invention may contain a pharmaceutically acceptable carrier in addition to the peptide or derivative.
  • a pharmaceutically acceptable carrier cellulose, polymerized amino acid, albumin and the like can be used.
  • the pharmaceutical composition of the present invention may be a ribosome preparation, a particulate preparation bound to beads having a diameter of several inches, a preparation bound to lipid, and the like.
  • adjuvants that have been conventionally used for vaccine administration so that an immune response is effectively established.
  • the administration method is, for example, intradermal administration or subcutaneous administration.
  • the pharmaceutical composition of the present invention can be used as a cancer vaccine. The dose can be appropriately adjusted depending on the disease state, the age, weight, etc. of each individual patient.
  • the amount of peptide or (derivative) in the pharmaceutical composition (0. OOO lmg to; 1000 mg, preferably (O.001 mg to 100 mg, more preferably (O.O lmg to; 10 mg, even more preferably (O. ;; to 5 mg or (or 0.5 to 3 mg. This may be several days, weeks or It is preferable to administer once every few months for 1 to 3 years.
  • the present invention provides a nucleic acid molecule encoding the peptide or derivative of the present invention and a vector comprising the nucleic acid molecule.
  • a vector containing the nucleic acid molecule of the present invention expresses the peptide or derivative of the present invention and presents them on the cell surface as a complex with an HLA molecule.
  • This antigen-presenting cell can efficiently proliferate CTL that damages Dario-polymer cells in a peptide-specific manner.
  • Examples of the vector incorporating the nucleic acid molecule of the present invention include various plasmids and virus vectors such as adenovirus, adeno-associated virus, retrovirus, vaccinia virus and the like (Liu M, Acres B, Balloul JM, Bizouarne). N, Paul S, Slos P, Squiban P. ene-based vaccines and immunotherapeutics. Proc Natl Acad Sci USA 101 Sup pi, 14567-71, 2004). Vector preparation methods are well known in the art (Molecular Cloning: A laboraroy manual, 2nd edn. New York, Cold Spring Harbor Laboratory).
  • the vector of the present invention can be administered to a patient to express the peptide or derivative of the present invention in an antigen-presenting cell in the patient.
  • the vector of the present invention may be introduced into a patient-derived dendritic cell outside the patient's body, and the cell expressing the peptide or derivative of the present invention may be returned to the patient.
  • These methods are well known in the art (Hrouda D, Dalgieish AG. Ene therapy for prostate cancer. Gene Ther 3: 84 5-52, 1996).
  • the dosage varies depending on the disease state, age, weight, etc. of the individual patient.
  • the DNA amount is 0.1 g to 100 mg, preferably 1 ⁇ g. ⁇ 50mg.
  • the administration method include intravenous injection, subcutaneous administration, intradermal administration and the like.
  • the CTL induction method of the present invention induces CTL that damages HLA-A24 molecule-positive Dario cell.
  • Dario-oma reactivity means cancer on Dario-oma cells It means that it has the ability to recognize a complex of an antigenic peptide and an HLA molecule and damage the cell.
  • Induction of CTL is performed, for example, by culturing PBMC collected from an HLA-A24-positive Dario-ma patient in the presence of the peptide or derivative of the present invention in vitro.
  • the CTL induction method of the present invention is useful for adoptive immunotherapy in which cancer cells are damaged by returning CTLs induced in the body of a patient from whom PBMCs have been collected.
  • the CTL induction kit of the present invention is used for carrying out the CTL induction method.
  • the kit of the present invention contains one or more of the peptides and derivatives of the present invention, and may further contain an appropriate buffer or medium.
  • the antigen-presenting cell preparation method of the present invention is to prepare an antigen-presenting cell capable of inducing CTL that damages an HLA-A24 molecule-positive Dario cell.
  • the antigen-presenting cell preparation method of the present invention includes, for example, culturing cells having antigen-presenting ability derived from an HLA-A24-positive Dariooma patient together with the peptide or derivative of the present invention, and converting the peptide or derivative into an HLA-A24 molecule. By combining and presenting.
  • a vector capable of expressing such a peptide may be introduced into a cell having an antigen-presenting ability derived from an HLA-A24-positive Darioma patient and expressed.
  • the cell having the antigen presentation ability is, for example, a dendritic cell.
  • the patient-derived dendritic cells can be obtained, for example, by separating cultured plate adherent cells from PBMC collected from the patient and culturing the cells in the presence of IL-4 and GM-CSF for about 1 week.
  • Antigen-presenting cells prepared by the method of the present invention can induce CTLs that specifically recognize a complex of a peptide or derivative presented on the cell surface and an HLA-A24 molecule. When administered to a patient, it can enhance the induction of Dario-reactive CTL in the patient.
  • the antigen-presenting cell preparation kit of the present invention is used for performing the antigen-presenting cell preparation method.
  • the kit of the present invention contains one or more of the peptides and / or derivatives of the present invention, and may further contain an appropriate buffer or medium.
  • the present invention further provides a method of treating or preventing Darioma comprising administering to a patient a peptide, derivative or vector of the present invention.
  • the present invention also provides the use of a peptide, derivative or vector of the present invention for the manufacture of a medicament for treating or preventing Darioma.
  • the labeled cDNA was purified by QIAquick PCR Purification column (Qiagen, Valencia, CA, USA) and concentrated by vacuum centrifugation. Suspend the cDNA in the hybridization buffer and follow the Agilent protocol on an Agilent human 1 cDNA mi- croarray (Agilent Technologies) 17 hours 65. I made noisy in C. Each sample is individually labeled and hybridized with a normal brain sample labeled with a complementary dye so that there is no difference between the wrong groups by randomly combining glyoma samples with a 2-channel cDNA array! did. Normal brain samples were obtained by pooling equal amounts of RNA from each control sample and labeling each sample. Further, each sample was subjected to cyanine dye switch hybridization.
  • Normal brain samples were purchased from Clontech (Tokyo, Japan). After washing the tip with 5% SSC / 0.1% SDS solution, measure the fluorescence intensity with a laser scanner and use Feature extraction software (ver. A.4.0.45; Agilent Technologies). As explained, I analyzed and analyzed 12,729 genes in total.
  • C1R-A24 is HLA-A * 2402 Is a sub-cell line of C1R lymphoma that expresses (provided by Prof. Masafumi Takiguchi, Kumamoto University).
  • RT-PCR Reverse transcription polymerase chain reaction
  • PCR is performed using TaqDNA polymerase in a DNA thermorecycler (iCycler, Bio-Rad laboratories, Hercules, CA, USA) at 95 ° C for 30 seconds, 60 ° C for 30 seconds, 72 ° C for 30 seconds, 30 cycles. It was. PCR products were separated by electrophoresis on a 2% agarose gel.
  • Anti-peptide antibody (IgG) levels were measured as previously reported by the Luminex TM method (omatsu N et al, Scand J Clin Invest 2004; 64: 1-11). Specifically, plasma was incubated with peptide-conjugated color-coded beads (Luminex Corp., Austin, TX, USA) (25 ⁇ 1) on a plate shaker for 2 hours at room temperature. After incubation, the mixture was washed with a vacuum branching apparatus and reacted with biotinylated goat anti-HgG (BA-3080, Vector Laboratories, Burlingame, Calif., USA) (100 1) for 1 hour at room temperature.
  • Flu virus-derived peptide (RFYIQMCTEL (SEQ ID NO: 26)), EB virus Rus derived peptide (TYGPVFMCL (SEQ ID NO: 27)) and HIV derived peptide (RYLRQ QLLGI (SEQ ID NO: 28)) were used as controls to bind to the HLA-A24 allele.
  • Peptide-reactive CTLs were detected by modifying the previously reported method (Hida N et al, Cancer Immunol Immunother 2002; 51: 219-28).
  • PBMCs were incubated with each peptide (10 ⁇ l / ml) in 4 well sets in 96 Uenore micro force plates (Nunc, Roskilde, Denmark).
  • the main culture was 45% RPMI 1640, 45% AIM-V medium (Life Technologies, Gaithersburg, MD, USA), 10% FCS, 100 U / ml interleukin-2 (IL-2) and O.lmM MEM non- Consists of essential amino acid solution (Life Technologies).
  • the cultured cells were divided into 4 wells. Two wells were used for C1R-A 24 cells pulsed with the corresponding peptide, and the other two wells were cultured with C1R-A24 cells pulsed with HIV peptide. After incubation for 18 hours, the supernatant was collected, and IFN- ⁇ production was measured by enzyme-linked immunoassay (ELISA).
  • ELISA enzyme-linked immunoassay
  • cytotoxic activity of peptide-stimulated PB MC against No. 11 (HLA-A24 negative) and KNS-81 (HLA-A24 positive) was measured by a standard 6 hour 51 Cr release test.
  • HLA-A24-positive healthy hematohemadalchun (PHA) activated T cells (T blast-like cells) were used as negative control cells.
  • PBMC were stimulated with each KIF peptide (10 ⁇ g / ml) for 15 days every 3 days in the presence of IL-2 (100 units / ml), and then cultured with IL-2 alone for an additional 15 days.
  • anti-HLA class I mAb W6 / 32, mouse IgG2a (BioLegend, Camino Santa Fe, San Diego, CA, USA)
  • anti-HLA class II H LA-DR
  • anti-CD14 mAb JML-H14, mouse IgG2a (established at Kurume University Immunology Course)
  • Peptide stimulated PBMC specificity was confirmed by cold inhibition test.
  • 20,000 unlabeled C1R-A24 cells pre-pulsed with either HIV peptide or the corresponding peptide were used as cold target cells. Unlabeled C1R-A24 cells were added at a hot to cold ratio of 10: 1.
  • mRNA expression of these genes was examined by RT-PCR (Fig. 1A). MRNA expression of all three genes was detected in four of the five Dario-ima cell lines. MRNA expression of the three genes was also detected in PHA activated T cells (Fig. 1A) and some normal tissues (Fig. 1B). The mRNA of the KIF1C gene was expressed more widely in normal tissues than in the other two types of KIF genes! The KIF3C gene mRNA was detected in the spleen, heart, and testis. KIF21B gene mRNA expression was detected in lung, brain, testis, and thymus.
  • KIF1C-derived peptides 25 peptides derived from 3 types of KIF (8 KIF1C-derived peptides, 11 KIF3C-derived peptides, and 6 KIF21B-derived peptides) were prepared based on the binding motif for the HLA-A24 molecule (Parker C et al, J Immunol 152: 163-175, 2004).
  • IgG that reacts with CTL-inducing peptides can be detected in the plasma of patients with various cancers (Nakatsura T et al, Eur J Immunol 32: 826-836, 2002), and the clinical response of patients receiving peptide vaccines is in good agreement with IgG levels (Mine T et al, Clin Cancer Res 10: 929-937, 2004; Yajima N et al , Clin Cacer Res 11: 5 900-5911, 2005), we next examined whether these KIF-derived peptides could be recognized by IgG in Darioma patients.
  • KIF1C peptide IgG reacting with the corresponding peptide will be used when the immunofluorescence intensity of 1: 100 diluted plasma exceeds 1.25 times the fluorescence intensity of the control sample without peptide. Judgment was significant.
  • the results for KIF1C peptide are shown in Table 2. Of the 8 peptides, 3 KIF1C peptides, IF1C, IF1C, and KIF1C are the other 5
  • 6/10 8/10 7/10 0/10 7/10 5/10 1/10 5/10 IgG reacting with the corresponding peptide has an absorbance of 1: 100 diluted serum that is 1.25 times the absorbance of the controsamp without peptide. When it exceeded, it was judged to be significant. Significant differences are evaluated for each plasma sample and positive results are shown in bold italics.
  • KIF3C peptide is HLA-A24 positive dario
  • PBMCs from patients 3 and 5 that were stimulated in vitro were compared to HLA-A24 positive KNS-81 cells, HLA-A24 negative No. 11 cells, and HLA-A24 positive T blast-like cells. It showed a higher level of cytotoxicity than before.
  • CD8 positive T cells were used for the following experiments. As shown in Figure 3A, CD8 positives induced by KIF1C and KIF3C peptides from HLA-A24 positive Dario patients.
  • cytotoxicity of sex T cells to KNS-81 was significantly inhibited by the addition of anti-HLA class I mAb, but by the addition of anti-HLA class II and 8 to 014 mAb (isotype-matched control). Is an uninhibited force.
  • cytotoxicity was not significantly inhibited by the addition of unlabeled C1R-A24 cells norsed with the corresponding KIF peptide, nor by addition of C1R-A24 cells pulsed with the HIV peptide ( ( Figure 3B).
  • Cytotoxicity can be attributed to the corresponding peptide-specific CD8 positive T cells.
  • KIF-derived peptides especially KIF1C and KIF3C peptides

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Description

明 細 書
HLA-A24分子結合性 KIF由来ペプチド
技術分野
[0001] 本発明は、 HLA-A24陽性ダリオ一マ患者に対する特異的免疫療法に有用な KIF由 来ペプチドに関する。
背景技術
[0002] 悪性ダリオ一マ患者の予後および生存率は、効果的な併用療法が開発されて!/、る にもかかわらずここ 10年以上それほど改善されていない(非特許文献 1、 2)。それゆ え新しい治療法を開発する必要があり、特異的免疫療法はその選択肢の 1つである 。腫瘍免疫における近年の進歩により、いくつかの癌抗原および細胞傷害性 T細胞 に認識されるそれらのェピトープペプチドが同定されている(非特許文献 3)。ダリオ 一マ関連抗原およびそれらに由来するペプチドもまた報告されている力 その数は 非常に限られて!/、る(非特許文献 4 6)。
非特許文献 1 : Karpeh MS, Kelsen DP, Tepper JE (2001) Cancer of the stomach. In: Devita VT Jr. editor. Cancer: principles & practice of oncology. 6th ed. Philadelphi a: Lippincott Williams & Wilkins; p. 1092-1121
非特許文献 2: Stewart LA (2002) Chemotherapy in adult high-grade glioma: s syste matic review and meta-analysis of individual patient data from 12 randomized trials. Lancet 359: 1011-1018
非特許文献 3 : Renkvist N, Castelli C, Robbins PF, Parmiani G (2001) A listing of hu man tumor antigens recognized by T cells. Cancer Immuno Immunother 50: 3-15 非特許文献 4 : Liu G, Ying H, Zeng G, Wheeler CJ, Black Kし, Yu JS (2004) HER-2, gplOO, and MAGE-1 are expressed in human glioblastoma and recognized by cytoto xic T cells. Cancer Res 64: 4980-4986
非特許文献 5: Murayama , Kobayashi Τ, Imaizumi Τ, Mastunaga , Kurimoto Τ, S higemori M, Shichijo S, Itoh (2000) Expression of the SART3 tumor-rejection anti gen in brain tumors and induction of cytotoxic T lymphocytes by its peptides. J Imm unother 23: 511-518
非特許文献 6 : Tsuda N, Nonaka Y, Shichijo S, Yamada A, Ito M, Maeda Y, Harada M, Kamura T, Itoh K (2002) UDP-Gal: bGlcNAc bl, 3-galactosyltransferase, polype ptide 3 (GALT3) is a tumour antigen recognized by HLA_A2_restricted cytotoxic T lymphocytes from patients with brain tumour. Br J Cancer 87: 1006—1012
発明の開示
発明が解決しょうとする課題
[0003] 本発明は、ダリオ一マ患者に対する特異的免疫療法に有用な、ダリオ一マ関連抗 原由来ペプチドを提供することを目的とする。
課題を解決するための手段
[0004] 本発明は、 KIF由来ペプチドであって、 HLA-A24分子に結合でき、かつ細胞性免 疫に認識されるペプチドを提供する。具体的には、本発明は、配列番号 3または 15 に示すアミノ酸配列からなるペプチドまたはその誘導体を提供する。また本発明は、 本発明のペプチドまたは誘導体をコードする核酸分子、該核酸分子を含むベクター を提供する。
[0005] 本発明はまた、本発明のペプチド、誘導体、またはベクターを含むダリオ一マを処 置または予防するための医薬組成物、特に癌ワクチンである該医薬組成物、を提供 する。
[0006] さらに、本発明は、 HLA-A24分子陽性ダリオ一マ患者より採取された末梢血単核 細胞を本発明のペプチドまたは誘導体と接触させることを含む、ダリオ一マ反応性細 胞傷害性 T細胞を誘導する方法を提供する。
[0007] また、本発明は、 HLA-A24分子陽性ダリオ一マ患者に由来する抗原提示能を有す る細胞に、本発明のペプチドまたは誘導体を取り込ませること、または本発明のベタ ターを導入することを含む、 KIF由来ペプチドまたはその誘導体と HLA-A24分子との 複合体を細胞表面に提示する抗原提示細胞を調製する方法を提供する。
[0008] 本発明はさらに、本発明のペプチド、誘導体またはベクターをダリオ一マ患者に投 与することを含む、ダリオ一マを処置または予防する方法、特に配列番号 3または 15 に示すアミノ酸配列からなるペプチドを癌ワクチンとしてダリオ一マ患者に投与するこ とを含む、ダリオ一マを処置または予防する方法を提供する。
[0009] 本発明はさらに、ダリオ一マを処置または予防するための医薬組成物の製造のた めの本発明のペプチド、誘導体またはベクターの使用、特に、ダリオ一マを処置また は予防するための配列番号 3または 15に示すアミノ酸配列からなるペプチドの癌ワク チンの製造のための使用を提供する。
発明の効果
[0010] 本発明により、 HLA-A24陽性癌患者においてダリオ一マ細胞を傷害しうる CTLを誘 導することができる KIF由来ペプチドが提供された。本発明の KIF由来ペプチドは、 H LA-A24陽性ダリオ一マ患者に対する特異的免疫療法を可能とする。
図面の簡単な説明
[0011] [図 1]5種類のダリオ一マ細胞株(A)および一連の正常組織(B)における 3種類の KI F遺伝子の mRNA発現。試験したダリオ一マ細胞株は以下である: KNS-81 (悪性ダリ ォーマ)、 KALS-1 (神経膠芽腫)、 INGS-1 (未分化星状細胞腫)、 Becher (星状細胞 腫)、および No. 11 (未分化星状細胞腫)。 /3ァクチンの発現をコントロールとして調べ た。
[図 2]KIF1C および KIF3C ペプチドによる HLA-A24陽性ダリオ
149-158 512-520 一マ患者か らのグリオ一マ反応性 CTLの誘導。 HLA-A24陽性 KNS-81細胞、並びに HLA-A24陰 性 No. 11細胞および HLA-A24陽性 PHA芽球様細胞(ネガティブコントロール)に対す る細胞傷害性を調べた。 *両側スチューデント t検定により P< 0.05。
[図 3](A) KIFぺプチド刺激 PBMC由来精製 CD8陽性 T細胞の KNS-81細胞に対する 細胞傷害性の mAbによる阻害。 *両側スチューデント t検定により P< 0.05。 (B) KIFぺ プチド刺激 PBMC由来精製 CD8陽性 T細胞の KNS-81細胞に対する細胞傷害性につ いてのコールド阻害試験。 *両側スチューデント t検定により P< 0.05。
発明を実施するための最良の形態
[0012] 本発明において「KIF由来ペプチド」または「KIFペプチド」とは、キネシンスーパー ファミリータンパク質である KIF1C、 KIF3C、または KIF21Bのアミノ酸配列の一部から なるペプチド断片を意味する。 KIF1C、 KIF3C、および KIF21Bのアミノ酸配列は、 Gen ebankにおいて開示されている(それぞれ NM_006612、 NM.002254,および XM_37133 2)。
[0013] 「HLA-A24分子に結合できる」とは、ペプチドが HLA-A24分子と複合体を形成し細 胞表面に提示されうることを意味する。一般に HLA分子に結合するペプチドは、 HLA の型に依存する規則性あるアミノ酸配列を有する。その規則性あるアミノ酸配列は、 結合モチーフと呼ばれる。 HLA-A24分子に対する結合モチーフとは、 N末端から第 2 番目のアミノ酸がチロシンまたはフエ二ルァラニンであり、 C末端アミノ酸がイソ口イシ ン、ロイシン、またはフエ二ルァラニンである配列をいう。 HLA-A24分子結合モチーフ を有するペプチドの HLA-A24分子に対する結合は、 Bioinformatics and Molecular A nalysis Section (NIH, Bethesda, MD)等のコンピューター解析により決定することがで きる(Parker KC, et al., J. Immunol., 152: 163-175, 1994)。
[0014] ペプチドが「細胞性免疫に認識される」とは、そのペプチドが特異的な CTLに認識 される、言い換えればペプチド特異的 CTLを誘導する能力を有することを意味する。 ペプチド特異的 CTLを誘導する能力を有するか否かは、例えば、ペプチドで刺激し た末梢血単核細胞(PBMC)が対応ペプチドをパルスした抗原提示細胞に反応してィ ンターフェロン(IFN) - γのようなサイト力インを産生するか否かを ELISA法等で測定し て調べること力 Sできる。また、誘導された CTLの細胞傷害活性は、 51Cr放出試験等に より確認すること力できる。 CTLによる認識性を考慮すると、本発明のペプチドのアミ ノ酸残基数は 8〜; 14個の範囲内であることが好ましぐより好ましくは 8〜; 11個、特に 好ましくは 9または 10個である。
[0015] ペプチドが「液性免疫に認識される」とは、そのペプチドに特異的な IgGが生体内に 存在すること、つまりはペプチド特異的 IgGが血漿から検出されることを意味する。細 胞性免疫と液性免疫の両方に認識されるペプチドは、免疫原性が高く CTL誘導能に 優れると期待されるため、本発明のペプチドとして好ましい。血漿中の特異的 IgGは、 常套的な ELISA法等によって測定することができる。
[0016] 本発明のペプチドとして特に好ましいのは、 IYCERVRDLL (KIF1C 、配列番号
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3)または KYKAMESKL ( IF3C 、配列番号 15)のアミノ酸配列からなるペプチド
512-520
である。
[0017] 本発明において、 KIF由来ペプチドの誘導体とは、 KIF由来ペプチドのアミノ酸配列 において 1または 2個のアミノ酸の置換、欠失および/または付加が導入されたァミノ 酸配列からなり、かつ HLA-A24分子に結合でき、細胞性免疫に認識されるペプチド を意味する。誘導体が所望の性質を有するか否かは、前述の方法により調べることが できる。
[0018] アミノ酸の置換は、ペプチドの性質を変化させない観点から、同族アミノ酸 (極性ァ ミノ酸、非極性アミノ酸、疎水性アミノ酸、親水性アミノ酸、陽性荷電アミノ酸、陰性荷 電ァミノおよび芳香族アミノ酸等)の間で行うことが好ましい。アミノ酸の欠失および付 カロは、誘導体のアミノ酸残基数が 8〜; 11個となるように行うことが好ましい。
[0019] また、アミノ酸の置換、欠失および/または付加は、 HLA分子結合モチーフ上許容 されるものが好ましい。すなわち、アミノ酸の置換、欠失および/または付加は、誘導 体のアミノ酸配列の N末端から第 2番目のアミノ酸がチロシンまたはフエ二ルァラニン であり、 C末端アミノ酸力 Sイソロイシン、ロイシン、またはフエ二ルァラニンとなるように行 うことが好ましい。
[0020] 本発明に特に好適な誘導体は、配列番号 3のアミノ酸配列の N末端から第 2番目の アミノ酸をフエ二ルァラニンで置換し、および/または C末端アミノ酸をイソロイシンま たはフエ二ルァラニンで置換したアミノ酸配列からなる誘導体、および配列番号 15の アミノ酸配列の N末端から第 2番目のアミノ酸をフエ二ルァラニンで置換し、および/ または C末端アミノ酸をイソロイシンまたはフエ二ルァラニンで置換したアミノ酸配列か らなる誘導体である。
[0021] 本発明のペプチドおよび誘導体を構成するアミノ酸は、天然のアミノ酸またはァミノ 酸アナログであってよく、アミノ酸アナログとしては、アミノ酸の N-ァシル化物、 0-ァシ ル化物、エステル化物、酸アミド化物、アルキル化物等が挙げられる。本発明のぺプ チドおよび誘導体は、機能を著しく損なわない限りにおいてその構成アミノ酸または カルボキシル基などが修飾されていてもよい。修飾は、 N末端や遊離のァミノ基にホ ルミル基、ァセチル基、 t-ブトキシカルボ二ル基等を結合するものや、 C末端や遊離 のカルボキシル基にメチル基、ェチル基、 t-ブチル基、ベンジル基等を結合するもの が挙げられる。
[0022] 本発明のペプチドおよび誘導体は、通常のペプチド合成により製造することができ る。そのような方法として、 列えば、 Peptide Synthesis, Interscience, New York, 1966 ; The Proteins, Vol2, Academic Press Inc.,New York, 1976 ;ペプチド合成、丸善(株) 、 1975 ;ペプチド合成の基礎と実験、丸善 (株)、 1985 ;医薬品の開発続第十四巻- ペプチド合成、広川書店、 1991)などに記載されている方法が挙げられる。
[0023] 本発明のペプチドおよび誘導体は、本発明のペプチドまたは誘導体のアミノ酸配 歹 IJを含むポリペプチドが細胞内で断片化されることで生じる場合もある。本発明は、 そのような態様で本発明のペプチドまたは誘導体を利用することも包含する。本発明 のペプチドまたは誘導体を提供できる限り、ポリペプチドのアミノ酸残基数およびアミ ノ酸配列は任意である。
[0024] この度、本発明者らは、 KIF1C、 KIF3C、および KIF21Bが悪性ダリオ一マ組織にお いて高発現していることを発見した。ダリオ一マとは、神経細胞を支持するグリア細胞 が腫瘍に変化したものをいう。本発明のペプチドおよび誘導体は、 HLA-A24分子陽 性ダリオ一マ細胞を特異的に傷害する CTLを効率的に誘導し増殖させることができ、 ダリオ一マ患者の治療に有用である。
[0025] 本発明は、本発明のペプチドまたは誘導体を含む、ダリオ一マを処置または予防 するための医薬組成物を提供する。本発明の医薬組成物は、 1種類のペプチドまた は誘導体を含むものであってもよぐ 2種類以上のペプチドおよび/または誘導体を 組み合わせて含んでも良!/、。癌患者の CTLは相異なる癌抗原ペプチドを認識する細 胞の集合なので、複数種類のペプチドおよび/また誘導体を組み合わせて使用す るとさらに効果的である。本発明のペプチド以外の癌抗原ペプチドと組み合わせても 良い。
[0026] 本発明の医薬組成物は、ペプチドまたは誘導体に加えて、医薬上許容される担体 などを含むことができる。担体としては、セルロース、重合アミノ酸、アルブミン等が使 用できる。本発明の医薬組成物は、リボソーム製剤、直径数 inのビーズに結合させ た粒子状の製剤、リピッドを結合させた製剤などであってもよい。また、免疫応答が効 果的に成立するように、従来からワクチン投与に用いられることが知られているアジュ ノ ントとともに投与することもできる。投与方法は、例えば皮内投与または皮下投与な どである。 [0027] 本発明の医薬組成物は、癌ワクチンとして使用可能である。投与量は、疾患の状態 、個々の患者の年齢、体重等により適宜調整することができるが、通常医薬組成物中 のペプチドまた (ま誘導体の量 (ま、 0. OOO lmg〜; 1000mg、好ましく (ま 0. 001mg〜 100mg、より好ましく (ま 0. O lmg〜; 10mg、より一層好ましく (ま 0. ;!〜 5mgまた (ま 0. 5〜3mgである。これを数日、数週または数ケ月に 1回、 1〜3年間継続して投与する ことが好ましい。
[0028] 本発明は、本発明のペプチドまたは誘導体をコードする核酸分子および前記核酸 分子を含むベクターを提供する。本発明の核酸分子を含むベクターは、抗原提示細 胞に導入されると本発明のペプチドまたは誘導体を発現し、それらを HLA分子との複 合体として細胞表面に提示させる。この抗原提示細胞は、ペプチド特異的にダリオ一 マ細胞を傷害する CTLを効率的に増殖させることができる。
[0029] 本発明の核酸分子を組み込むベクターとしては、各種プラスミドおよびウィルスべク ター、例えばアデノウイルス、アデノ関連ウィルス、レトロウイルス、ワクシニアウィルス 等が挙げられる (Liu M, Acres B, Balloul JM, Bizouarne N, Paul S, Slos P, Squiban P . ene-based vaccines and immunotherapeutics . Proc Natl Acad Sci U S A 101 Sup pi, 14567-71 , 2004)。ベクターの調製方法は当業界にて周知である(Molecular Clon ing: A laboraroy manual, 2nd edn. New York, Cold Spring Harbor Laboratoryノ。
[0030] 本発明のベクターは、患者体内の抗原提示細胞において本発明のペプチドまたは 誘導体を発現させるため患者に投与することができる。あるいは、患者体外において 例えば患者由来の樹状細胞に本発明のベクターを導入し、本発明のペプチドまたは 誘導体を発現させた細胞を患者に戻しても良い。これら方法は当業界において周知 で、ある (Hrouda D, Dalgieish AG. ene therapy for prostate cancer. Gene Ther 3: 84 5-52, 1996)。
[0031] 本発明のベクターを患者に投与する場合、投与量は疾患の状態、個々の患者の年 齢、体重等により変化するが、例えば DNA量として、 0.1 g〜100mg、好ましくは 1 μ g 〜50mgである。投与方法には、静脈注射、皮下投与、皮内投与等が挙げられる。
[0032] 本発明の CTL誘導方法は、 HLA-A24分子陽性ダリオ一マ細胞を傷害する CTLを 誘導するものである。 CTLについて「ダリオ一マ反応性」とは、ダリオ一マ細胞上の癌 抗原ペプチドと HLA分子との複合体を認識し、その細胞を傷害する能力を有すること を意味する。 CTLの誘導は、例えば、 HLA-A24陽性ダリオ一マ患者から採取された P BMCを、 in vitroで本発明のペプチドまたは誘導体の存在下培養することにより行う。 本発明の CTL誘導方法は、 PBMCを採取した患者の体内に誘導した CTLを戻して癌 細胞を傷害する養子免疫療法に有用である。
[0033] 本発明の CTL誘導キットは、前記 CTL誘導方法を実施するために用いられる。本発 明のキットは、本発明のペプチドおよび誘導体を 1または 2種類以上含み、さらに適 当な緩衝液や培地などを含む場合もある。
[0034] 本発明の抗原提示細胞調製方法は、 HLA-A24分子陽性ダリオ一マ細胞を傷害す る CTLを誘導しうる抗原提示細胞を調製するものである。本発明の抗原提示細胞調 製方法は、例えば、 HLA-A24陽性ダリオ一マ患者由来の抗原提示能を有する細胞 を本発明のペプチドまたは誘導体とともに培養し、そのペプチドまたは誘導体を HLA -A24分子に結合および提示させるにより行う。あるいはそのようなペプチドを発現可 能なベクターを、 HLA-A24陽性ダリオ一マ患者由来の抗原提示能を有する細胞に 導入し発現させてもよい。抗原提示能を有する細胞は、例えば樹状細胞である。患 者由来の樹状細胞は、例えば、患者より採取した PBMCから培養プレート接着細胞を 分離し、その細胞を IL-4および GM-CSFの存在下で約 1週間培養することで得られる 。本発明の方法により調製された抗原提示細胞は、その細胞表面に提示するぺプチ ドまたは誘導体と HLA-A24分子との複合体を特異的に認識する CTLを誘導すること ができ、ダリオ一マ患者に投与された場合患者体内でダリオ一マ反応性 CTLの誘導 を促進すること力できる。
[0035] 本発明の抗原提示細胞調製キットは、前記抗原提示細胞調製方法を行うために用 いられる。本発明のキットは、本発明のペプチドおよび/または誘導体を 1または 2種 類以上含み、さらに適当な緩衝液や培地などを含む場合もある。
[0036] 本発明はさらに、本発明のペプチド、誘導体、またはベクターを患者に投与すること を含む、ダリオ一マを処置または予防する方法を提供する。また本発明は、ダリオ一 マを処置または予防するための医薬を製造するための本発明のペプチド、誘導体、 またはベクターの使用を提供する。 [0037] 本発明を以下の実施例によりさらに詳細に説明する力 本発明はいかなる意味に おいてもこれら実施例により制限されるものではない。
実施例
[0038] 1.材料および方法
1.1サンプルおよび cDNAマイクロアレイ
サンプルは、手術を受けた 52人のダリオ一マ患者力 得た。本試験は新潟大学倫 理委員会の承認を受け、全ての患者から書面による同意を得た。患者は、 WHOダレ ード分類 (Kleihues et al, J Neuropathol Exp Neurol 61 : 215-225, 2002)によると、グレ ード IIが 16人、グレード IIIが 14人、グレード IVが 22人であった。遺伝子解析は、 Agilent の cDNAマイクロアレイ(Agilent Technologies, Palo Alto, CA, USA)を用いて行った。 全 RNA (20 μ g)を、 Agilent direct-label cDNA synthesis kit (Agilent Technologies)を 用いて、製造元の説明にしたがい逆転写した。標識化 cDNAを QIAquick PCR Purific ation column (Qiagen, Valencia, CA, USA)により精製し、真空遠心分離により濃縮し た。 cDNAをハイブリダィゼーシヨンバッファーに懸濁し、 Agilent human 1 cDNA micr oarray (Agilent Technologies)に Agilentのプロトコ一ノレにしたがい 17時間 65。Cにてノヽ イブリダィズさせた。 2チャンネル cDNAアレイにお!/ヽてグリオ一マサンプルをランダム に組み合わせることで誤ったグループ間の差が生じないように、各サンプルを個別に 標識し、相補色素で標識した正常脳サンプルと共にハイブリダィズした。正常脳サン プルは、各コントロールサンプルから等量の RNAをプールし、各サンプルについて標 識することにより得た。さらに、各サンプルについて、シァニン色素スィッチハイブリダ ィゼーシヨンを行った。正常脳サンプルは、 Clontech (Tokyo, Japan)より購入した。チ ップを 5% SSC/0.1% SDS溶液にて洗浄した後、蛍光強度をレーザースキャナーで測 疋し、 Feature extraction software (ver. A.4.0.45; Agilent Technologiesノを用レヽて 造元の説明にしたがレ、解析した。全部で 12,729遺伝子を解析した。
[0039] 1.2細胞株
本研究では、以下のグリオ一マ細胞株を使用した: KNS-81 (JCRB Cell Bank, IFO 50359)、 KALS-1 (JCRB Cell Bank, IFO 50434)、 KINGS-1 (久留米大学脳神経外科 )、 Becher、および No. 11 (JCRB Cell Bank, IFO 50369)。 C1R- A24は、 HLA- A*2402 を発現する C1Rリンパ腫の亜細胞株である(熊本大学滝口雅文先生より供与)。
[0040] 1.3逆転写ポリメラーゼ連鎖反応(RT-PCR)
全 RNAは、 RNAzol (商標) B (Tel-Test Inc., Friendswood, TX, USA)を用いて癌細 胞株から単離した。 cDNAは、 Superscript (商標) Preamplification System for First- St rand cDNA Synthesis (Invitrogen)を用いて調製し、以下のプライマーを用いて増幅し た。
KIF1C センス 5' -CAAGTGTGTGGTCA GCAT GC-3' (配列番号 2 9 )
アンチ 5'-CTCTGGTTCTCACTAAGCG-3' (配列番号 3 0 )
KIF3C センス 5' -TATGATGCCAGCTC CAAG C-3' (配列番号 3 1 )
アンチ 5'-ATTCTTGGTGACGAAGGAGG- 3' (配列番号 3 2 )
KIF21B センス 5'-AATGTGATCAGCGCCTTAGG-3' (配列番号 3 3 )
アンチ 5' -TGTAGCATGGCATT CTCT CG-3' (配列番号 3 4 ) ァクチン センス 5' - CTTCGCGGGCGACGATGC - 3' (配列番号 3 5 )
5' -CGTACATGGCTGGG GTGT TG-3' (配列番号 3 6 )
PCRは、 TaqDNAポリメラーゼを用いて、 DNAサーマノレサイクラ一(iCycler, Bio-Rad laboratories, Hercules, CA, USA)において 95°C30秒、 60°C30秒、 72°C30秒、 30サイ クルにて行った。 PCR産物は、 2%ァガロースゲルにおける電気泳動により分離した。
[0041] 1.4抗ペプチド抗体の測定
抗ペプチド抗体(IgG)のレベルは、 Luminex (商標)法により既報のように測定した( omatsu N et al, Scand J Clin Invest 2004;64: 1-11)。詳細には、血漿を、ペプチドを 結合したカラーコードビーズ(Luminex Corp. , Austin, TX, USA) (25 ^ 1)と、プレート シェーカー上にて室温で 2時間インキュベートした。インキュベーション後、混合物を 真空分岐装置で洗浄し、ビォチン化ャギ抗ヒ HgG (BA-3080, Vector Laboratories, Burlingame, CA, USA) (100 1)と 1時間室温で反応させた。プレートを洗浄し、ストレ プトアビジン標識 PE dOO ^u L) (S-866, Molecular Probes, Eugene, Oregon, USA)を 各ゥエルに加え、プレートシェーカー上にて室温で 30分インキュベートした。結合した ビーズを 3回洗浄し、続いて Tween-PBS dOO l)を各ゥエルに添加した。その後、各 サンプル 50 μ 1を Luminex (商標)法により調べた。
[0042] 1.5 PBMCからのペプチド特異的 CTLの誘導
純度〉 90%のペプチドを、 Hokkaido System Science (Sapporo, Japan)より購入した。
ザ(Flu)ウィルス由来ペプチド(RFYIQMCTEL (配列番号 26) )、 EBウイ ルス由来ペプチド(TYGPVFMCL (配列番号 27) )、および HIV由来ペプチド(RYLRQ QLLGI (配列番号 28) )を、 HLA-A24アレルに結合するコントロールとして使用した。 ペプチド反応性 CTLは、既報の方法に一部変更を加えて検出した(Hida N et al, Ca ncer Immunol Immunother 2002;51:219— 28)。 96ウエノレマイクロ力ノレチヤ一プレート(N unc, Roskilde, Denmark)において、 PBMCを各ペプチド(10 μ 1/ml)と 4ゥエルー組に てインキュベートした。本培養液は 45% RPMI 1640、 45% AIM-V培地(Life Technologi es, Gaithersburg, MD, USA)、 10% FCS、 100 U/mlインターロイキン- 2 (IL- 2)および O. lmM MEM非必須アミノ酸溶液(Life Technologies)より構成された。培養 15日目に 、培養細胞を 4つのゥエルに分けた。 2つのゥエルは対応ペプチドをパルスした C1R-A 24細胞について使用し、他の 2つのゥエルは HIVペプチドをパルスした C1R-A24細胞 と培養した。 18時間インキュベートした後上清を回収し、 IFN- γ産生を酵素結合免疫 測定法(ELISA)により測定した。ペプチド反応性 CTLの誘導は、両側スチューデント t 検定により P< 0.05であり、かつ HIVペプチドと比較した IFN- γ産生の差が 100 pg/ml を超える場合に陽性と判断した。
1.6細胞傷害性試験
No. 11 (HLA-A24陰性)および KNS-81 (HLA-A24陽性)に対するペプチド刺激 PB MCの細胞傷害活性は、標準的 6時間51 Cr放出試験により測定した。 HLA-A24陽性 健常人由来のフイトへマダルチュン (PHA)活性化 T細胞 (T芽球様細胞)を陰性対照 細胞として使用した。 PBMCを IL-2 (100 units /ml)の存在下に各 KIFペプチド (10〃 g/ ml)により 3日毎に 15日間刺激し、続いて IL-2のみでさらに 15日間培養した。 CD8-pos itive isolation kit (Dynal, Oslo, Norway)により CD8陽性 T細胞を単離した後、丸底 96 ゥエルプレートにおいて各ゥエルにつき 2000個の51 Cr標識細胞を、エフェクター細胞 とともに培養した。特異的51 Cr放出は、以下の式により計算した:特異的溶解(%) = ( 被験サンプルの放出 自然放出 ) x 100/ (最大放出 自然放出)。エフェクター細胞 なしでインキュベートしたサンプルの上清を用いて自然放出を決定し、次いで 1% Trit on X (Wako Pure Chemical Industries, Osaka, Japan)とインキュへートしにサンプノレ の上清から最大放出を決定した。一部の実験では、抗 HLAクラス I mAb (W6/32,マ ウス IgG2a) (BioLegend, Camino Santa Fe, SanDiego, CA, USA),抗 HLAクラス II (H LA-DR) mAb (L243,マウス IgG2a) (ATCC # HB- 55)、および抗 CD14 mAb (JML- H14,マウス IgG2a) (久留米大学免疫学講座にて樹立)を培養開始時に添加した。 ペプチド刺激 PBMCの特異性は、コールド阻害試験によって確認した。 HIVペプチド または対応ペプチドのいずれかを事前にパルスした 20,000個の非標識 C1R-A24細 胞を、コールド標的細胞として使用した。非標識 C1R-A24細胞は、ホット対コールド 比 10: 1にて添加した。
[0044] 2.結果
2.1ダリオ一マ組織および正常組織における 3種類の KIF遺伝子の mRNA発現
52人のダリオ一マ患者から得たサンプルを Agilentの cDNAマイクロアレイにより解析 した。 36人の悪性ダリオ一マ組織の蛍光強度を 16人の正常ダリオ一マ組織および正 常脳組織の蛍光強度と比較した。ここでは全部で 12,729遺伝子を解析し、 17種類の 遺伝子が、悪性ダリオ一マ組織において、良性ダリオ一マ組織および脳、副腎、骨髄 、大腸、肝臓、胎児肝臓、心臓、腎臓、肺、乳腺、前立腺、唾液腺、筋肉、腸、脊髄、 脾臓、胃、精巣、胸腺、気管支、甲状腺、および子宮を含む一連の正常組織におい てよりも高度に発現していることがわ力 た。これら 17種類の遺伝子には、 3種類の KI F遺伝子、 KIF1C、 KIF3C、および KIF21B遺伝子が含まれ、本研究ではこれらに焦点 をあてた。
[0045] はじめに、これら遺伝子の mRNA発現を RT-PCRにより調べた(図 1A)。 3種類の遺 伝子の mRNA発現はいずれも、 5種類のダリオ一マ細胞株のうち 4種類において検出 された。 3種類の遺伝子の mRNA発現はまた、 PHA活性化 T細胞(図 1A)およびいく つかの正常組織においても検出された(図 1B)。 KIF1C遺伝子の mRNAは、他の 2種 類の KIF遺伝子よりも正常組織にお!/、て広範に発現して!/、た。 KIF3C遺伝子の mRN Aは、脾臓、心臓、および精巣において検出された。 KIF21B遺伝子の mRNA発現は、 肺、脳、精巣、および胸腺において検出された。
[0046] 2.2 KIF由来ペプチドに反応する IgGの検出
次に、これら 3種類の KIFの免疫原性を調べた。 3種類の KIFに由来する 25種類のぺ プチド(KIF1C由来ペプチド 8種類、 KIF3C由来ペプチド 11種類、および KIF21B由来 ペプチド 6種類)を、 HLA-A24分子に対する結合モチーフに基づき調製した(Parker C et al, J Immunol 152: 163-175, 2004)。
) (表 1)。
[表 1] 表 1 HLA-A24分子結合性 KIP由来ペプチド
ペプチド アミノ酸配列 配列番号 長さ 結合スコア IF1C
73-82 VYRDIGEEML 1 10 240.0
149-157 IYCERVRDL 2 9 240.0
149-158 IYCE V DLL 3 10 336.0
331-339 NYEETLSTL 4 9 360.0
340-348 RYADRT QI 5 9 120.0
725-734 VYQIPQRRRL 6 10 300.0
756-764 CYEVALADF 7 9 150.0
968-977 RFVPPHDCKL 8 10 79.2 IF3C
137-145 QYLVRASYL 9 9 300.0
147-155 IYQEEIRDL 10 9 360.0
147-156 IYQEEIRDLL 1 1 10 504.0
174-182 VYI DLSSF 12 9 150.0
347-355 SYDESし STL 13 9 240.0
458-467 NYLQEQKERL 14 10 300.0
512-520 KYKAMES L 15 9 440.0
607-61 EYIRVRQDL 16 9 504.0
629-637 GYLIIENFI 17 9 126.0
702-710 RYRAENIMF 18 9 200.0
702-711 YRAENIMFL 19 10 400.0
KIF21B
220-228 GYASTDEEI 20 9 55.0
473482 KYCSHSGLVF 2L L0 200.0
621-630 HYDGIECLAI 22 10 50.0
670-678 AFIPGRPML 23 9 36.0
670-679 AFIPG PMLL 24 10 36.0
731-740 NYVPGLTPCL 25 10 432.0 結合スコアはウェブサイ卜で得られる HLAグラス I分子からの予想解離半減期に基づき計算した
(Bioimormatics and Molecular Analvsis Section, Computed Bioscience and Engineering Laboratory,
Division of Computer Research and Technology, NIH)0 既報のように、 CTL誘導性ペプチドに反応する IgGが各種の癌の患者の血漿にお いて検出可能であること (Nakatsura T et al, Eur J Immunol 32: 826-836, 2002)、およ びペプチドワクチン投与を受けた患者の臨床応答が IgGレベルとよく一致すること (Mi ne T et al, Clin Cancer Res 10: 929-937, 2004 ;Yajima N et al, Clin Cacer Res 11 : 5 900-5911, 2005)から、次にそれら KIF由来ペプチドがダリオ一マ患者の IgGに認識さ れぅるかについて調べた。対応ペプチドに反応する IgGは、 1 : 100希釈血漿の免疫蛍 光強度がペプチドなしのコントロールサンプルの蛍光強度の 1.25倍を超える場合に 有意と判断した。 KIF1Cペプチドのこの結果を表 2に示す。 8種類のペプチドのうち、 3 種類の KIF1Cペプチド、 IF1C 、 IF1C 、および KIF1C は、他の 5種
149-157 149-158 340-348
類のペプチドよりもダリオ一マ患者の血漿中の IgGにより認識される頻度が高力 た。 同様の結果が健常人のサンプルでも得られた。同じアツセィを、 11種類の KIF3C由来 ペプチドおよび 6種類の KIF21B由来ペプチドについても行い、結果を表 3にまとめた 。 3種類の KIF3C由来ペプチド、 KIF3C 、 KIF3C 、および KIF3C 、並
458-467 512-520 702-710 びに 2種類の KIF21B由来ペプチド、 KIF21B および KIF21B 力 S、グリオ
220-228 621-630 一マ 患者および健常人の血漿中の IgGに認識される頻度が他のペプチドよりも高力 た。 これら知見に基づき、以下の実験では、この 8種類の KIF由来ペプチド (KIF1C由来ぺ プチド 3種類、 KIF3C由来ペプチド 3種類、および KIF21B遺伝子由来ペプチド 2種類) に焦点をあてた。
[表 2]
表 2 グリオ一マ患者および健常人の血漿中に存在する KIF由来ペプチド特異的 IgG
KIF1Cペプチド
ペプチドなし 被験者 73-82 149-157 149-158 331-339 340-348 725-734 756-764 968-977
免疫蛍光強度
患"^
1 57.8 98.5 114.5 33.5 103.0 65.5 36.5 77.0 74.0
2 80.5 117.5 98.5 39.5 102.0 85.3 45.0 86.0 68.5
3 46.8 124,3 109, 0 22.0 85.5 61.3 28.8 83.5 48.5
4 17.5 29,5 55.8 10.5 26.0 19.5 11.5 27.0 36.0
5 119.0 132.0 163.0 53.5 173.5 98.5 58.0 97.0 93.5
6 388.5 1066.0 706.0 86.5 595.5 385.0 185.8 533.8 155.5
7 68.5 108.0 Ϊ05.0 15.5 103.8 134.3 40.3 74.8 66.5
8 11.5 12.3 16.0 8.5 14.8 10.0 6.5 12.5 30.5
9 11.0 27.3 19.5 5.5 17,5 9.3 7.5 19.5 28.0
10 1585.0 1688.3 1264.0 485.4 2174.5 1187.8 658.0 1132.5 640.0
3/10 7/10 8/10 0/L0 7/10 4/10 0/10 4/10
;常人
1 122.5 122.3 213.0 70.0 141,8 99.5 87.3 117.0 97.0
2 19.5 31.8 41.0 13.5 21.5 19 5 14.0 23.5 36—0
3 64.5 113.3 112.0 29.0 74.5 66.8 46.8 76.5 55.3
4 29.5 47.8 55.8 16.5 45.3 30.5 20.0 33.0 49.5
5 50.0 87.8 245.8 35.0 59.0 52.5 40.3 58.5 61.0
6 97.0 134.8 189.5 40.0 156.0 87.0 47.5 94.0 69.3
7 648.5 468.8 442.0 233 0 1599.0 660.0 196.0 498.5 369.5
8 6937.5 4962.8 4708.0 4133.0 9638.0 4984,0 3893-5 5813,0 3604.5
9 36.5 39.5 97.5 22.5 34.0 35.3 27.0 32.3 26.5
10 96.5 1103 147.5 62.5 121,5 93.8 82.0 94.0 56.3
6/10 8/10 7/10 0/10 7/10 5/10 1/10 5/10 対応ペプチドに反応する IgGは、 1:100希釈血清の吸光度がペプチドなしのコントロ サンプ 吸光度の 1.25倍を超える場合に 有意と判断した。各血漿サンプルについて有意差を評価し、陽性の結果を太字の斜体で示す。
[表 3]
表 3 患者および健常人の血漿における KIF由来ペプチド反応性 IgGのまとめ
»性ケース/全ケース
ペプチド 患者 健常人 に IF1C
73-82 3/10 6/10 9/20
149-157 7/10 8/10 15/20
149-158 S/10 7/10 15/20
331-339 0/10 0/10 0/20
340-348 7/10 7/10 14/20
725-734 3/10 5/10 8/20
756-764 0/10 1/10 1/20
968-977 4/10 5/10 9/20
KIF3C
137-145 2/10 1/10 3/20
147-155 0/10 1/10 1/20
147-156 0/10 1/10 1/20
174-182 1/10 2/10 3/20
347-355 0/10 0/10 0/20
458-467 4/10 4/10 8/20
512-520 5/10 4/10 9/20
607-615 2/10 3/10 5/20
629-637 0/10 1/10 1/20
702-710 7/10 9/10 16/20
702-711 2/10 5/10 7/20 IF21B
220-228 2/10 3/10 5/20
473-482 2/10 2/10 4/20
621 -630 2/10 5/10 7/20
670-678 2/10 2/10 4/20
670-679 2/10 2/10 4/20
731-740 1/10 1/10 2/20
2.3グリオ一マ患者 PBMCからの KIFペプチド反応性 CTLの誘導
次に、ダリオ一マ患者にお!/、て IgGに認識される頻度の高!/、8種類の KIFペプチドが 、 HLA-A24陽性ダリオ一マ患者の PBMCからペプチド反応性 CTLを誘導する能力を 有するかについて調べた。 PBMCを in vitroで各ペプチドまたはコントロールペプチド で刺激し、対応ペプチドをパルスした C1R-A24細胞に応答する IFN- γ産生について 調べた(表 4)。ペプチド反応性 CTLの誘導は、 P< 0.05であり、かつコントロールの HI Vペプチドと比較した IFN- γ産生の差が 100 pg/mlを超える場合に陽性と判断した。 陽性の結果を太字の斜体で示す。 8種類のペプチドはいずれも、 HLA-A24陽性ダリ ォーマ患者 10人のうち 3または 4人の PBMCから対応ペプチド反応性 CTLを誘導した 。これに対して、 KIF1C ペプチドのみが 5人の HLA-A24陽性健常人うち 1人に
Figure imgf000018_0001
[0049] 2.4 HLA-A24陽性ダリオ一マ患者からのダリオ一マ反応性 CTLの誘導 これら KIFペプチドが HLA-A24拘束性のダリオ一マ反応性 CTLを誘導できるか否力、 を調べることが重要であった。このため、 HLA-A24陽性ダリオ一マ患者由来の PBMC を 8種類の KIFペプチドの各々で刺激し、ペプチド反応性 CTLがダリオ一マ細胞に対 して細胞傷害性を示しうるかについて検討した。 8種類の KIFペプチドのうち、 KIF1C
1 および KIF3C ペプチドが、 HLA-A24陽性ダリオ
512-520 一マ患者の PBMCから効
49-158
率的にダリオ一マ反応性 CTLを誘導した(図 2)。 KIF1C または KIF3C ぺ
、ずれかで in vitroにおいて刺激した患者 3および 5由来の PBMCは、 HLA- A24陽性 KNS-81細胞に対して、 HLA-A24陰性 No. 11細胞および HLA-A24陽性 T芽 球様細胞に対してよりも高レベルの細胞傷害性を示した。
[0050] 2.5ダリオ一マ細胞に対する KIFペプチド特異的 CD8陽性 T細胞に依存する細胞傷 害性
さらに、ペプチド刺激 PBMCの細胞傷害性に関与する細胞を同定することを試みた 。精製 CD8陽性 T細胞を以下の実験に使用した。図 3Aに示すように、 HLA-A24陽性 ダリオ一マ患者から KIF1C および KIF3C ペプチドにより誘導された CD8陽
149-158 512-520
性 T細胞の KNS-81に対する細胞傷害性は、抗 HLAクラス I mAbの添加により有意に 阻害されたが、抗 HLAクラス II し八-0 または抗じ014 mAb (アイソタイプ適合コント ロール)の添加によっては阻害されな力、つた。さらに、細胞傷害性は、対応 KIFぺプチ ドをノルスした非標識 C1R-A24細胞の添加により有意に阻害された力 S、HIVペプチド をパルスした C1R-A24細胞の添加によっては阻害されなかった(図 3B)。これらをまと めると、 IF1C および KIF3C ペプチド刺激 PBMCの KNS-81細胞に対する
149-158 512-520
細胞傷害性は、対応ペプチド特異的 CD8陽性 T細胞に起因するといえる。
[0051] 3.まとめ
以上の結果は、 KIF由来ペプチド、特に KIF1C および KIF3C ペプチドが
149-158 512-520
、ダリオ一マ患者に対する癌ワクチンとして有用であることを示す。

Claims

請求の範囲
[1] 配列番号 3または 15に示すアミノ酸配列からなるペプチド。
[2] 請求項 1記載のペプチドを含む、ダリオ一マを処置または予防するための医薬組成 物。
[3] 請求項 1記載のペプチドを含む、癌ワクチンである請求項 2記載の医薬組成物。
[4] HLA-A24陽性ダリオ一マ患者より採取された末梢血単核細胞を請求項 1記載のぺ プチドと接触させることを含む、ダリオ一マ反応性細胞傷害性 T細胞を誘導する方法
[5] 請求項 1に記載のペプチドを含む、ダリオ一マ反応性細胞傷害性 T細胞を誘導す るためのキット。
[6] HLA-A24陽性ダリオ一マ患者に由来する抗原提示能を有する細胞に、請求項 1記 載のペプチドを取り込ませることを含む、 KIF由来ペプチドと HLA-A24分子との複合 体を細胞表面に提示する抗原提示細胞を調製する方法。
[7] 請求項 1記載のペプチドを含む、 KIF由来ペプチドと HLA-A24分子との複合体を細 胞表面に提示する抗原提示細胞を調製するためのキット。
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