WO2002048691A1 - Dispositif de renforcement de fluorescence large bande a faibles pertes et capteur optique biologique ou chimique l'utilisant. - Google Patents

Dispositif de renforcement de fluorescence large bande a faibles pertes et capteur optique biologique ou chimique l'utilisant. Download PDF

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chemical
biological
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thin
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Patrick Chaton
Françoise Vinet
Pierre Barritault
Stéphane Getin
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Commissariat A L'energie Atomique
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    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N21/00Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
    • G01N21/62Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light
    • G01N21/63Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light optically excited
    • G01N21/64Fluorescence; Phosphorescence
    • G01N21/6428Measuring fluorescence of fluorescent products of reactions or of fluorochrome labelled reactive substances, e.g. measuring quenching effects, using measuring "optrodes"
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
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    • Y10TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC
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    • Y10S435/00Chemistry: molecular biology and microbiology
    • Y10S435/808Optical sensing apparatus

Definitions

  • the invention relates to a low-loss broadband fluorescence enhancement device. It also relates to a biological or chemical optical sensor using such a fluorescence enhancement device.
  • This evanescent wave creates an overcurrent which makes it possible to excite the fluorophore in such a way that it emits a significant amount of light.
  • the objective of the invention is to strengthen the fluorescence by conventional waves (propagating), which allows a reading of the fluorescence signal by commercial instruments. It is also a question of widening the possibilities of enhancement of fluorescence by using a component operating on a broad spectral band. Finally, the aim is to limit non-radiative losses due to imperfections in the materials used.
  • a first object of the invention consists of a fluorescence enhancement device comprising a support supporting fluorescence enhancement means, the fluorescence enhancement means providing a receiving face for chemical or biological elements intended to be read by detection of '' a fluorescence signal emitted by a fluorophore, associated with chemical or biological elements, under the effect of an excitation light beam, characterized in that the fluorescence enhancement means consist of a thin dielectric layer transparent or a stack of thin transparent dielectric layers providing a mirror function for the fluorescence signal and for the excitation light beam, the material of the thin layer or of each thin layer of the stack being chosen from the following materials: Ti0 2 , Ta 2 0 5 , Hf0 2 , Zr0 2 , MgO, Si0 2 , Si 3 N 4 , MgF 2 and YF 3 .
  • the thickness e of the thin layer or the thickness of each thin layer of the stack can be calculated from the following formula:
  • the fluorescence enhancement means are means deposited on a structured face of the support.
  • said receiving face can be a face offering hydroxyl functions or a face offering aldehyde functions.
  • a second object of the invention consists of a biological or chemical optical sensor constituted by the device described above, said receiving face supporting chemical or biological elements marked with a fluorophore.
  • FIG. 1 is a cross-sectional view of an optical sensor according to the present invention
  • FIG. 2 is a cross-sectional view of a fluorescence enhancement device according to the present invention.
  • Figure 1 is a cross-sectional view of an optical, biological or chemical sensor according to the present invention. It represents a substrate 1 supporting fluorescence enhancement means 2 which in turn support chemical or biological substances marked with a fluorophore. These substances are represented in the form of a layer 3. In this figure is shown a focusing lens 4 and a reading beam 5 to symbolize the reading and excitation system by epifluorescence microscopy.
  • the fluorescence enhancement means 2 can consist of a stack of thin dielectric layers. These thin layers can be made from the following materials: Ti0 2 , Ta 2 0 5 , Hf0 2 , Zr0 2 , MgO, Si0 2 , Si 3 N 4 , MgF 2 and YF 3 . These materials can be deposited by PVD type techniques (electron gun, sputtering), by CVD type techniques or by sol-gel deposition. These fluorescence enhancement means in the form of thin layers can be deposited on the entire substrate or on a structured substrate. In the latter case, they can be located by conventional techniques • Lithography, "lift off” or mechanical masking. In all cases, the stoichiometry of the materials must be perfectly controlled. Particular care is taken at the last layer to avoid the creation of non-radiative losses.
  • the last thin layer must have biological compatibility with the probes to be grafted onto this layer.
  • Silica or silicon nitride have this quality of biological compatibility.
  • N being the refractive index of the material considered at the excitation wavelength
  • k being an odd integer
  • the excitation wavelength
  • e the optical thickness of the layer considered.
  • optical thickness is understood to mean the product of the refractive index with the mechanical thickness of the thin layer for the wavelength considered.
  • FIG. 2 shows, in cross section, such a device.
  • the fluorescence enhancement means 11 have been deposited in the form of five layers referenced 12 to 16. This device is provided for an excitation wavelength of the fluorophore CY3 of approximately 550 nm
  • the layers 12, 14 and 16 are made of Si0 2 , of refractive index 1.46 for the excitation wavelength considered.
  • Layers 13 and 15 are in
  • the bandwidth available for excitation is + or - 100 nm around the centering wavelength of
  • a microscope optimized for CY3 can be used. It is fitted with an optical filter for selecting the excitation light at 546 nm for a spectral width of approximately 10 nm.
  • the Si0 2 layers can be deposited by a CVD type process at 800 ° C.
  • the Si 3 N 4 layers can be deposited by a CVD type process at 730 ° C.
  • the fluorescence enhancement means may comprise only a single layer, for example a layer of Si0 2 with a mechanical thickness of 500 nm.
  • a first example concerns the grafting of oligonucleotides in situ.
  • the free face of the fluorescence enhancement means is treated chemically to obtain hydroxyl functions on the surface.
  • the functionalized device is then introduced into an automatic oligonucleotide synthesizer (Expedite 8909, PE Biosystems) which makes it possible to grow base by base an oligonucleotide of 20 mothers of sequence 3 'TTT TTA TCT CAC CCA AAT Ag5'.
  • a second example concerns the grafting of presynthesized oligonucleotides.
  • the free face of the fluorescence enhancement means is treated chemically to obtain in this case an aldehyde function.
  • the device is rinsed in a solution of SDS (sodium dodecyl sulfate) and then in water. Since the imine bond is not very stable, a step of reducing the double bond is planned in the presence of Na 2 BH 4 for 10 minutes. The device is rinsed again with SDS and then with water. It is then dried under a stream of nitrogen.
  • the hybridization step consists in bringing together, the device comprising the probes and a solution consisting of a buffer and targets of sequence complementary to the probes comprising a fluorophore CY3 in position 5 '.
  • the hybridization conditions allowing the pairing of the probes and the targets are the following: hybridization solution: 300 ⁇ l of targets at 0.2 ⁇ M + 900 ⁇ l of H-7140 / Sigma hybridization buffer,
  • TEOS tetraethoxysilane
  • the stack of thin optical dielectric layers makes it possible to verify several points.
  • this stack which can be likened to a "one-dimensional photonic crystal" has band gap properties which give it a wide spectral field of excitation.
  • the excitation wavelength can be chosen over the entire bandwidth of the mirror dielectric (typically> 100 nm). This also allows the simultaneous use of several fluorophores compatible with this spectral band. This is not the case for the devices of the prior art.
  • the above property also has the consequence of introducing flexibility in the choice of the incidence of the excitation light. This is not the case for the devices of the prior art.
  • the excitation of the fluorophores of the biosensor is carried out with a non-dedicated system.
  • the invention is compatible with commercial devices.
  • the invention makes it possible to block the excitation light in the stack and to limit the parasitic fluorescence coming from the substrate.
  • the invention also makes it possible not to use thin metallic layers in the stack.
  • the presence of these materials causes the appearance of non-radiative losses which limit the effectiveness of the fluorescence enhancement.
  • the invention provides stacks of high optical quality in terms of absorption losses.

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Abstract

L'invention concerne un dispositif de renforcement de fluorescence comprenant un support (10) supportant des moyens de renforcement de fluorescence (11), les moyens de renforcement de fluorescence offrant une face de réception pour des éléments chimiques ou biologiques destinés à être lus par détection d'un signal de fluorescence émis par un fluorophore, associé aux éléments chimiques ou biologiques, sous l'effet d'un faisceau lumineux d'excitation. Les moyens de renforcement de fluorescence (11) sont constitués par une couche mince diélectrique transparente ou un empilement de couches minces diélectriques transparentes (12 à 16) assurant une fonction miroir pour le signal de fluorescence et pour le faisceau lumineux d'excitation, le matériau de la couche mince ou de chaque couche mince de l'empilement étant choisi parmi les matériaux suivants : TiO2, Ta205, HfO2, ZrO2, MgO, SiO2, Si3N4, MgF2 et YF3.

Description

DISPOSITIF DE RENFORCEMENT DE FLUORESCENCE LARGE BANDE
A FAIBLES PERTES ET CAPTEUR OPTIQUE BIOLOGIQUE OU
CHIMIQUE L'UTILISANT
DESCRIPTION
DOMAINE TECHNIQUE
L'invention concerne un dispositif de renforcement de fluorescence large bande à faibles pertes. Elle concerne aussi un capteur optique biologique ou chimique utilisant un tel dispositif de renforcement de fluorescence.
ETAT DE LA TECHNIQUE ANTERIEURE
La détection de réactions chimiques ou biologiques sur un support solide par marquage fluorescent est rendue difficile par les faibles niveaux de signal émis par les fluorophores .
Il existe deux méthodes permettant de renforcer le signal émis par les fluorophores . Elles sont basées sur 1 ' exacerbation du champ excitateur par des ondes évanescentes . Ces méthodes impliquent l'utilisation de scanners dédiés. Du fait de leurs principes de fonctionnement avec des modes guidés, ces méthodes ne sont pas large-bande. L'excitation doit s'effectuer avec une condition de résonance bien déterminée .
Le document "Sensivity enhancement of optical immunosensors by the use of a surface plasmon résonance fluoroimmunoassay" de F. . ATTRIDGE et al., Biosensors & Bioelectronics, vol. 6, 1991, page 201 à 214, divulgue une méthode de renforcement de fluorescence basée sur les plasmons de surface. Cette méthode consiste à déposer sur le biocapteur, entre le substrat et la couche contenant les éléments chimiques ou biologiques, une couche mince métallique (d'argent par exemple) recouverte par une couche de silice. Le biocapteur est placé sur une lentille hémi-sphérique (ou un prisme). Le faisceau d'excitation traverse ce composant et arrive sur la couche d'argent de telle manière que des plasmons de surface soient générés. Ce phénomène crée un champ excitateur intense qui permet d'exacerber l'émission en fluorescence. Malheureusement, l'emploi d'une couche mince métallique implique l'existence de pertes non radiatives préjudiciables au renforcement de fluorescence.
Le document "Slab aveguides in Chemistry "de L. KANG et al., Critical Reviews in Analytical Chemistry, vol. 21, N° 6, 1990, pages 377 à 388, divulgue une méthode de renforcement de fluorescence basée sur l'optique guidée. Cette méthode consiste à déposer sur le biocapteur, entre le substrat et la couche contenant les éléments chimiques ou biologiques, une structure guidante. Par un dispositif de couplage approprié (prisme, réseau) la lumière est injectée dans le guide. La réflexion de la lumière guidée à 1 ' interface guide/milieu contenant les fluorophores crée une onde évanescente dans le milieu contenant les fluorophores . Cette onde évanescente crée une surintensité qui permet d'exciter le fluorophore de telle manière qu'il émet une quantité importante de lumière . Ces deux méthodes permettent donc d'augmenter le signal de fluorescence. Cependant, comme il a été dit plus haut, ces méthodes impliquent l'utilisation de scanners. Ces méthodes ne sont pas large-bande.
EXPOSÉ DE L'INVENTION
L'objectif de l'invention est de renforcer la fluorescence par des ondes classiques (propagatives) , ce qui permet une lecture du signal de fluorescence par des instruments commerciaux. Il s'agit de plus d'élargir les possibilités de renforcement de fluorescence en utilisant un composant fonctionnant sur une bande spectrale large. Il s'agit enfin de limiter les pertes non radiatives dues aux imperfections des matériaux employés .
La technique de détection proposée par l'invention est basée sur le dépôt d'un empilement de couches minces optiques réalisant une fonction miroir à faibles pertes non radiatives. Un premier objet de l'invention consiste en un dispositif de renforcement de fluorescence comprenant un support supportant des moyens de renforcement de fluorescence, les moyens de renforcement de fluorescence offrant une face de réception pour des éléments chimiques ou biologiques destinés à être lus par détection d'un signal de fluorescence émis par un fluorophore, associé aux éléments chimiques ou biologiques, sous l'effet d'un faisceau lumineux d'excitation, caractérisé en ce que les moyens de renforcement de fluorescence sont constitués par une couche mince diélectrique transparente ou un empilement de couches minces diélectriques transparentes assurant une fonction miroir pour le signal de fluorescence et pour le faisceau lumineux d'excitation, le matériau de la couche mince ou de chaque couche mince de l'empilement étant choisi parmi les matériaux suivants : Ti02, Ta205, Hf02, Zr02, MgO, Si02, Si3N4, MgF2 et YF3.
L'épaisseur e de la couche mince ou l'épaisseur de chaque couche mince de l'empilement peut être calculée à partir de la formule suivante :
N.e = k.λ/4 où N est 1 ' indice de réfraction du matériau de couche mince pour la longueur λ du signal de lecture et k est un entier impair. Eventuellement, les moyens de renforcement de fluorescence sont des moyens déposés sur une face structurée du support .
Selon les applications, ladite face de réception peut être une face offrant des fonctions hydroxyles ou une face offrant des fonctions aldéhydes.
Un deuxième objet de l'invention consiste en un capteur optique biologique ou chimique constitué par le dispositif décrit ci-dessus, ladite face de réception supportant des éléments chimiques ou biologiques marqués par un fluorophore.
BRÈVE DESCRIPTION DES DESSINS
L'invention sera mieux comprise et d'autres avantages et particularités apparaîtront à la lecture de la description qui va suivre, donnée à titre d'exemple non limitatif, accompagnée des dessins annexés parmi lesquels :
- la figure 1 est une vue en coupe transversale d'un capteur optique selon la présente invention,
- la figure 2 est une vue en coupe transversale d'un dispositif de renforcement de fluorescence selon la présente invention.
DESCRIPTION DETAILLEE DE MODES DE REALISATION DE L ' INVENTION
La figure 1 est une vue en coupe transversale d'un capteur optique, biologique ou chimique, selon la présente invention. Elle représente un substrat 1 supportant des moyens de renforcement de fluorescence 2 qui supportent à leur tour des substances chimiques ou biologiques marquées par un fluorophore. Ces substances sont représentées sous la forme d ' une couche 3. On a représenté sur cette figure une lentille de focalisation 4 et un faisceau de lecture 5 pour symboliser le système de lecture et d'excitation par microscopie en épifluorescence.
Les moyens de renforcement de fluorescence 2 peuvent être constitués par un empilement de couches minces diélectriques. Ces couches minces peuvent être constituées à partir des matériaux suivants : Ti02, Ta205, Hf02, Zr02, MgO, Si02, Si3N4, MgF2 et YF3. Ces matériaux peuvent être déposés par des techniques de type PVD (canon à électrons, pulvérisation.), par des techniques de type CVD ou par dépôt sol-gel. Ces moyens de renforcement de fluorescence sous forme de couches minces peuvent être déposés sur 1 ' ensemble du substrat ou sur un substrat structuré . Dans ce dernier cas, ils peuvent être localisés par des techniques classiques de lithographie, de "lift off" ou de masquage mécanique. Dans tous les cas, la stoechiométrie des matériaux doit être parfaitement maîtrisée. Un soin particulier est apporté à la dernière couche pour éviter la création de pertes non radiatives.
La dernière couche mince doit présenter une compatibilité biologique avec les sondes à greffer sur cette couche. La silice ou le nitrure de silicium présentent cette qualité de compatibilité biologique. Les moyens de renforcement de fluorescence assurent une fonction miroir pour la longueur d'onde d'excitation. Pour cela, il suffit que les épaisseurs optiques des différentes couches minces suivent la règle suivante : λ N.e = k. - (1)
4
N étant 1 ' indice de réfraction du matériau considéré à la longueur d'onde d'excitation, k étant un nombre entier impair, λ la longueur d'onde d'excitation et e l'épaisseur optique de la couche considérée. On entend par "épaisseur optique" le produit de l'indice de réfraction avec l'épaisseur mécanique de la couche mince pour la longueur d'onde considérée.
On va maintenant décrire la réalisation d'un dispositif de renforcement de fluorescence pour une biopuce à ADN, ce dispositif étant optimisé pour le fluorophore CY3.
La figure 2 montre, en coupe transversale, un tel dispositif. Sur un substrat 10 en silicium, les moyens de renforcement de fluorescence 11 ont été déposés sous la forme de cinq couches référencées 12 à 16. Ce dispositif est prévu pour une longueur d'onde d'excitation du fluorophore CY3 d'environ 550 nm
Les couches 12, 14 et 16 sont en Si02, d'indice de réfraction 1,46 pour la longueur d'onde d'excitation considérée. Les couches 13 et 15 sont en
Si3N4, d'indice de réfraction 2 pour la longueur d'onde d'excitation considérée.
En appliquant la règle (1) ci-dessus, on obtient, pour k = 1, une épaisseur mécanique de 94 nm pour chaque couche de Si02 et une épaisseur mécanique de 69 nm pour chaque couche de Si3N .
Avec cet empilement de couches, la largeur de bande disponible pour l'excitation est de + ou - 100 nm autour de la longueur d'onde de centrage de
550 nm. Il est donc compatible à la fois pour le fluorophore CY3 et le fluorophore CY5.
Pour la lecture en fluorescence, on peut utiliser un microscope optimisé pour CY3. Il est doté d'un filtre optique de sélection de la lumière d'excitation à 546 nm pour une largeur spectrale de 10 nm environ.
Les couches de Si02 peuvent être déposées par un procédé de type CVD à 800°C. Les couches de Si3N4 peuvent être déposées par un procédé de type CVD à 730°C. Les moyens de renforcement de fluorescence peuvent ne comporter qu'une seule couche, par exemple une couche de Si02 d'épaisseur mécanique 500 nm.
On va maintenant décrire quelques étapes de greffage et d'hybridation sur le dispositif de renforcement de fluorescence selon l'invention.
Un premier exemple concerne le greffage d' oligonucléotides in situ. La face libre des moyens de renforcement de fluorescence est traitée par voie chimique pour obtenir des fonctions hydroxyles en surface. Le dispositif fonctionnalisé est ensuite introduit dans un synthétiseur automatique d' oligonucléotides (Expedite 8909, PE Biosystems) qui permet de faire croître base par base un oligonucléotide de 20 mères de séquence 3' TTT TTA TCT CAC CCA AAT Ag5 ' .
Un deuxième exemple concerne le greffage d' oligonucléotides présynthétisés. La face libre des moyens de renforcement de fluorescence est traitée par voie chimique pour obtenir dans ce cas une fonction aldéhyde. Une solution d' oligonucléotides (5 μM) comportant une fonction NH2 en 5' dans un tampon phosphate est déposée sur le substrat dans des conditions permettant la formation d'une liaison covalente imine (-CH = N-) entre le dispositif et 1 'oligonucléotide. Après une nuit d'incubation à température ambiante, le dispositif est rincé dans une solution de SDS (dodécylsulfate de sodium) puis dans l'eau. La liaison imine n'étant pas très stable, il est prévu une étape de réduction de la double liaison en présence de Na2BH4 pendant 10 minutes. Le dispositif est à nouveau rincé avec du SDS puis avec de l'eau. Il est ensuite séché sous flux d'azote.
L'étape d'hybridation consiste à mettre en présence, le dispositif comportant les sondes et une solution constituée d'un tampon et de cibles de séquence complémentaire aux sondes comportant un fluorophore CY3 en position 5'. Les conditions d'hybridation permettant 1 ' appariement des sondes et des cibles sont les suivantes : - solution d'hybridation : 300 μl de cibles à 0,2 μM + 900 μl de tampon d'hybridation H-7140/Sigma,
- incubation dans une étuve à 40°C pendant 1 heure du dispositif recouvert de la solution,
- rinçage dans un bain de tampon SSC 2X (S- 6639/Sigma) pendant 1 minute,
- rinçage dans un bain de tampon SSC 0 , 2X (S-6639/Sigma) pendant 1 minute,
- séchage sous flux d'azote. L'observation faite avec un microscope en fluorescence (Olympus BX60) de différents empilements selon l'invention, conduit aux intensités de fluorescence suivantes pour des temps d'intégration de 1 seconde et un objectif 5X (les unités sont exprimées en unité arbitraire UA) : - Support en Si et monocouche de Si0 de
500 nm d'épaisseur déposé par décomposition de tétraéthoxysilane (TEOS) , synthèse in situ : 225 UA.
- Support en Si et empilement de couches de Si02 et de Si3N4, synthèse in situ : 593 UA. Pour ce type de greffage, le même rapport de renforcement de fluorescence est obtenu avec une concentration de cibles 4 fois plus faible (0,05 μM au lieu de 0,2 μM) .
- Support en Si et monocouche de Si02 de 500 nm d'épaisseur déposé par décomposition de TEOS, oligonucléotides présynthétisés : 140 UA.
- Support en Si et empilement de couches de Si02 et de Si3N4, oligonucléotides présynthétisés : 326 UA.
Il faut noter que l'invention s'applique également à des systèmes de lecture de type scanners confocaux.
L'empilement de couches minces optiques diélectriques permet de vérifier plusieurs points.
Il est possible d'augmenter le champ d'excitation des fluorophores par rapport à une configuration sans empilement de couches minces. Ceci permet d'augmenter la quantité de lumière émise par les fluorophores. La solution la plus simple consiste à déposer un empilement de type quart d'onde. II est possible d'améliorer la directionnalité de la lumière émise par les fluorophores . Ceci permet d'améliorer la quantité de lumière collectée par le microscope ou le scanner de lecture. Ce n'est pas le cas pour les dispositifs de l'art antérieur.
L'emploi de cet empilement, que l'on peut assimiler à un "cristal photonique à une dimension", présente des propriétés de bande interdite qui lui procure un large domaine spectral d'excitation. La longueur d'onde d'excitation peut être choisie sur 1 ' ensemble de la largeur de bande du miroir diélectrique (typiquement > 100 nm) . Ceci permet par ailleurs l'emploi simultané de plusieurs fluorophores compatibles avec cette bande spectrale. Ceci n'est pas le cas pour les dispositifs de l'art antérieur. La propriété précédente a également pour conséquence d'introduire une souplesse sur le choix de l'incidence de la lumière d'excitation. Ceci n'est pas le cas pour les dispositifs de l'art antérieur.
Il est possible d'obtenir un renforcement du signal en travaillant en incidence normale, dans l'espace libre sans faire appel à des structures guidantes. Dans ce cas, l'excitation des fluorophores du biocapteur est réalisée avec un système non dédié. L'invention est compatible avec des appareils commerciaux.
L'invention permet de bloquer la lumière d'excitation dans l'empilement et de limiter la fluorescence parasite venant du substrat .
L'invention permet aussi de ne pas employer de couches minces métalliques dans l'empilement. La présence de ces matériaux provoque l'apparition de pertes non radiatives qui limitent l'efficacité du renforcement de fluorescence.
L'invention propose des empilements de haute qualité optique en termes de pertes par absorption. En particulier, on cherche à minimiser l'influence de la dernière couche mince (celle sur laquelle sont déposés les fluorophores) . Cette couche est particulièrement optimisée. On cherche à obtenir des coefficients d'extinction les plus faibles possible (indice imaginaire) . Typiquement, des coefficients d'extinction inférieures à 10"3 sont requis. Dans ce cas, les pertes non radiatives sont limitées.

Claims

REVENDICATIONS
1. Dispositif de renforcement de fluorescence comprenant un support (1, 10) supportant des moyens de renforcement de fluorescence (2, 11), les moyens de renforcement de fluorescence offrant une face de réception pour des éléments chimiques ou biologiques
(3) destinés à être lus par détection d'un signal de fluorescence émis par un fluorophore, associé aux éléments chimiques ou biologiques, sous l'effet d'un faisceau lumineux d'excitation, caractérisé en ce que les moyens de renforcement de fluorescence (2, 11) sont constitués par une couche mince diélectrique transparente ou un empilement de couches minces diélectriques transparentes (12 à 16) assurant une fonction miroir pour le signal de fluorescence et pour le faisceau lumineux d'excitation, le matériau de la couche mince ou de chaque couche mince de l'empilement étant choisi parmi les matériaux suivants : Ti02, Ta20s, Hf02, Zr02, MgO, Si02, Si3N4, MgF2 et YF3.
2. Dispositif selon la revendication 1, caractérisé en ce que l'épaisseur e de la couche mince (2) ou l'épaisseur de chaque couche mince (12 à 16) de l'empilement est calculée à partir de la formule suivante :
N.e = k.λ/4 où N est l'indice de réfraction du matériau de couche mince pour la longueur λ du signal de lecture et k est un entier impair.
3. Dispositif selon l'une des revendications 1 ou 2, caractérisé en ce que les moyens de renforcement de fluorescence sont des moyens déposés sur une face structurée du support .
4. Dispositif selon l'une quelconque des revendications 1 à 3, caractérisé en ce que ladite face de réception est une face offrant des fonctions hydroxyles .
5. Dispositif selon l'une quelconque des revendications 1 à 3, caractérisé en ce que ladite face de réception est une face offrant des fonctions aldéhydes .
6. Capteur optique biologique ou chimique constitué par le dispositif selon l'une quelconque des revendications 1 à 5, ladite face de réception supportant des éléments chimiques ou biologiques marqués par un fluorophore.
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Cited By (14)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
FR2848670A1 (fr) * 2002-12-17 2004-06-18 Commissariat Energie Atomique Micro-composant etalon pour le calibrage ou l'etalonnage d'equipements de mesure de fluorescence et biopuce le comportant
EP1431747A2 (fr) * 2002-12-20 2004-06-23 Commissariat A L'energie Atomique Biocapteur à substrat quelconque pouvant être caracterisé en deflexion photothermique
FR2854696A1 (fr) * 2003-05-06 2004-11-12 Commissariat Energie Atomique Support de biopuce utilisant des couches minces de materiau sol gel et procede de realisation
WO2004106902A1 (fr) * 2003-06-03 2004-12-09 Unaxis Balzers Aktiengesellschaft Substrat optique servant a ameliorer la detection de la fluorescence
WO2004109264A1 (fr) * 2003-06-06 2004-12-16 Unaxis Balzers Aktiengesellschaft Substrat echantillon presentant un revetement d'interference multicouche
EP1591773A2 (fr) * 2004-03-17 2005-11-02 Schott AG Dispositif de renforcement de fluorescence
FR2893415A1 (fr) * 2005-11-15 2007-05-18 Commissariat Energie Atomique Biopuce a rapport signal fluorescent/signal parasite ameliore
WO2008019651A2 (fr) * 2006-07-31 2008-02-21 Nikolaus Bartels Dispositif de détermination de substances, procédé de réalisation et utilisation de ce dispositif
US7988918B2 (en) 2007-11-01 2011-08-02 Complete Genomics, Inc. Structures for enhanced detection of fluorescence
US9551026B2 (en) 2007-12-03 2017-01-24 Complete Genomincs, Inc. Method for nucleic acid detection using voltage enhancement
WO2019232321A1 (fr) 2018-06-01 2019-12-05 NanoView Biosciences, Inc. Compositions, systèmes et procédés de détection améliorée sans marqueur et à base de fluorescence de nanoparticules
US11262359B2 (en) 2016-02-05 2022-03-01 NanoView Biosciences, Inc. Detection of exosomes having surface markers
US11275030B2 (en) 2005-04-25 2022-03-15 Trustees Of Boston University Structured substrates for optical surface profiling
US11835437B2 (en) 2011-11-02 2023-12-05 Complete Genomics, Inc. Treatment for stabilizing nucleic acid arrays

Families Citing this family (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
KR100634505B1 (ko) * 2004-06-16 2006-10-16 삼성전자주식회사 패턴화된 박막층을 갖는 마이크로어레이 기판 및마이크로어레이, 상기 마이크로어레이 기판 및마이크로어레이를 제조하는 방법
US7704751B2 (en) * 2006-09-18 2010-04-27 3M Innovative Properties Company Polymeric fluorescent chemical sensor
US8545761B2 (en) * 2010-03-25 2013-10-01 Raytheon Company Chemical and biological sensor
US10208332B2 (en) 2014-05-21 2019-02-19 Integenx Inc. Fluidic cartridge with valve mechanism
EP3209410A4 (fr) 2014-10-22 2018-05-02 IntegenX Inc. Systèmes et méthodes de préparation, de traitement et d'analyse d'échantillon

Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE2946234A1 (de) * 1979-11-16 1981-05-27 Theodor Prof. Dr. 4400 Münster Eckert Verfahren zur erhoehung der empfindlichkeit der fluoreszens- und/oder absorptionsmessung von substanzen nach duennschichtchromatographischer trennung
US5478755A (en) * 1988-07-25 1995-12-26 Ares Serono Research & Development Ltd. Long range surface plasma resonance immunoassay
US5552272A (en) * 1993-06-10 1996-09-03 Biostar, Inc. Detection of an analyte by fluorescence using a thin film optical device

Family Cites Families (13)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US3979184A (en) * 1975-05-27 1976-09-07 General Electric Company Diagnostic device for visually detecting presence of biological particles
US6060237A (en) 1985-02-26 2000-05-09 Biostar, Inc. Devices and methods for optical detection of nucleic acid hybridization
US5482830A (en) 1986-02-25 1996-01-09 Biostar, Inc. Devices and methods for detection of an analyte based upon light interference
US5468606A (en) 1989-09-18 1995-11-21 Biostar, Inc. Devices for detection of an analyte based upon light interference
CA1317206C (fr) * 1986-09-22 1993-05-04 Takeyuki Kawaguchi Methode pour la detection d'un composant d'un systeme biologique, et dispositif et trousse de detection utilises a cette fin
SE462454B (sv) * 1988-11-10 1990-06-25 Pharmacia Ab Maetyta foer anvaendning i biosensorer
US5639671A (en) 1989-09-18 1997-06-17 Biostar, Inc. Methods for optimizing of an optical assay device
US5541057A (en) 1989-09-18 1996-07-30 Biostar, Inc. Methods for detection of an analyte
US5550063A (en) 1991-02-11 1996-08-27 Biostar, Inc. Methods for production of an optical assay device
US5955377A (en) 1991-02-11 1999-09-21 Biostar, Inc. Methods and kits for the amplification of thin film based assays
US5418136A (en) 1991-10-01 1995-05-23 Biostar, Inc. Devices for detection of an analyte based upon light interference
EP1126278B1 (fr) 1992-07-31 2007-05-23 Inverness Medical - BioStar Inc. Dispositifs et méthodes de détection d'un analyte basés sur l'interférence de lumière
FR2813121A1 (fr) 2000-08-21 2002-02-22 Claude Weisbuch Dispositif perfectionne de support d'elements chromophores

Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE2946234A1 (de) * 1979-11-16 1981-05-27 Theodor Prof. Dr. 4400 Münster Eckert Verfahren zur erhoehung der empfindlichkeit der fluoreszens- und/oder absorptionsmessung von substanzen nach duennschichtchromatographischer trennung
US5478755A (en) * 1988-07-25 1995-12-26 Ares Serono Research & Development Ltd. Long range surface plasma resonance immunoassay
US5552272A (en) * 1993-06-10 1996-09-03 Biostar, Inc. Detection of an analyte by fluorescence using a thin film optical device

Cited By (28)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
FR2848670A1 (fr) * 2002-12-17 2004-06-18 Commissariat Energie Atomique Micro-composant etalon pour le calibrage ou l'etalonnage d'equipements de mesure de fluorescence et biopuce le comportant
WO2004065946A1 (fr) * 2002-12-17 2004-08-05 Commissariat A L'energie Atomique Micro-composant étalon pour le calibrage ou l'étalonnage d'équipements de mesure de fluorescence et biopuce le comportant.
EP1431747A2 (fr) * 2002-12-20 2004-06-23 Commissariat A L'energie Atomique Biocapteur à substrat quelconque pouvant être caracterisé en deflexion photothermique
EP1431747A3 (fr) * 2002-12-20 2009-11-04 Commissariat A L'energie Atomique Biocapteur à substrat quelconque pouvant être caracterisé en deflexion photothermique
FR2854696A1 (fr) * 2003-05-06 2004-11-12 Commissariat Energie Atomique Support de biopuce utilisant des couches minces de materiau sol gel et procede de realisation
WO2004099776A1 (fr) * 2003-05-06 2004-11-18 Commissariat A L'energie Atomique Support de biopuce utilisant des couches minces de materiau sol gel et procede de realisation
US7227633B2 (en) 2003-06-03 2007-06-05 Oc Oerlikon Balzers Ag Optical substrate for enhanced detectability of fluorescence
JP2006526768A (ja) * 2003-06-03 2006-11-24 ユナキス・バルツェルス・アクチェンゲゼルシャフト 蛍光の検出能を向上させるための光学基板
JP4745220B2 (ja) * 2003-06-03 2011-08-10 エリコン・トレーディング・アクチェンゲゼルシャフト,トリュープバッハ 蛍光の検出能を向上させるための光学基板
US7405819B2 (en) 2003-06-03 2008-07-29 Oc Oerlikon Balzers Ag Optical substrate for enhanced detectability of fluorescence
WO2004106902A1 (fr) * 2003-06-03 2004-12-09 Unaxis Balzers Aktiengesellschaft Substrat optique servant a ameliorer la detection de la fluorescence
US7285789B2 (en) 2003-06-06 2007-10-23 Oc Oerlikon Balzers Ag Optical device for surface-generated fluorescence
WO2004109264A1 (fr) * 2003-06-06 2004-12-16 Unaxis Balzers Aktiengesellschaft Substrat echantillon presentant un revetement d'interference multicouche
EP1591773A2 (fr) * 2004-03-17 2005-11-02 Schott AG Dispositif de renforcement de fluorescence
EP1591773A3 (fr) * 2004-03-17 2005-11-09 Schott AG Dispositif de renforcement de fluorescence
US7939339B2 (en) 2004-03-17 2011-05-10 Schott Ag Arrangement for fluorescence amplification
US11275030B2 (en) 2005-04-25 2022-03-15 Trustees Of Boston University Structured substrates for optical surface profiling
FR2893415A1 (fr) * 2005-11-15 2007-05-18 Commissariat Energie Atomique Biopuce a rapport signal fluorescent/signal parasite ameliore
WO2007057557A1 (fr) * 2005-11-15 2007-05-24 Commissariat A L'energie Atomique Biopuce a rapport signal fluorescent/signal parasite ameliore
WO2008019651A2 (fr) * 2006-07-31 2008-02-21 Nikolaus Bartels Dispositif de détermination de substances, procédé de réalisation et utilisation de ce dispositif
WO2008019651A3 (fr) * 2006-07-31 2008-06-05 Nikolaus Bartels Dispositif de détermination de substances, procédé de réalisation et utilisation de ce dispositif
US7988918B2 (en) 2007-11-01 2011-08-02 Complete Genomics, Inc. Structures for enhanced detection of fluorescence
US8287812B2 (en) 2007-11-01 2012-10-16 Complete Genomics, Inc. Structures for enhanced detection of fluorescence
US9551026B2 (en) 2007-12-03 2017-01-24 Complete Genomincs, Inc. Method for nucleic acid detection using voltage enhancement
US11835437B2 (en) 2011-11-02 2023-12-05 Complete Genomics, Inc. Treatment for stabilizing nucleic acid arrays
US11262359B2 (en) 2016-02-05 2022-03-01 NanoView Biosciences, Inc. Detection of exosomes having surface markers
US12038439B2 (en) 2016-02-05 2024-07-16 Unchained Labs Detection of exosomes having surface markers
WO2019232321A1 (fr) 2018-06-01 2019-12-05 NanoView Biosciences, Inc. Compositions, systèmes et procédés de détection améliorée sans marqueur et à base de fluorescence de nanoparticules

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