WO2001009591A9 - Verfahren zur optischen anregung von fluorophor-markieter dna und rna - Google Patents

Verfahren zur optischen anregung von fluorophor-markieter dna und rna

Info

Publication number
WO2001009591A9
WO2001009591A9 PCT/EP2000/006546 EP0006546W WO0109591A9 WO 2001009591 A9 WO2001009591 A9 WO 2001009591A9 EP 0006546 W EP0006546 W EP 0006546W WO 0109591 A9 WO0109591 A9 WO 0109591A9
Authority
WO
WIPO (PCT)
Prior art keywords
excitation
fluorophores
fluorescence
fish
fluorophore
Prior art date
Application number
PCT/EP2000/006546
Other languages
English (en)
French (fr)
Other versions
WO2001009591A1 (de
Inventor
Karsten Koenig
Karl-Juergen Halbhuber
Peter Fischer
Iris Riemann
Original Assignee
Zeiss Carl Jena Gmbh
Karsten Koenig
Karl-Juergen Halbhuber
Peter Fischer
Iris Riemann
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Zeiss Carl Jena Gmbh, Karsten Koenig, Karl-Juergen Halbhuber, Peter Fischer, Iris Riemann filed Critical Zeiss Carl Jena Gmbh
Priority to US09/806,375 priority Critical patent/US6528802B1/en
Priority to JP2001514553A priority patent/JP2003506677A/ja
Priority to EP00954464A priority patent/EP1117985A1/de
Publication of WO2001009591A1 publication Critical patent/WO2001009591A1/de
Publication of WO2001009591A9 publication Critical patent/WO2001009591A9/de

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6813—Hybridisation assays
    • C12Q1/6841—In situ hybridisation

Definitions

  • the invention relates to a method for the optical excitation of fluorophore-labeled DNA and of fluorophore-labeled RNA, in particular of specific localizations of DNA and RNA marked by fluorescence in situ hybridization (FISH).
  • FISH fluorescence in situ hybridization
  • the method is suitable for the excitation and spatially resolved detection of FISH-labeled chromosomal structures and enables the simultaneous excitation of several fluorophores. The method is therefore recommended for multi-gene detection.
  • DAPI 4,6-diamidino-2-phenylindole hydrochloride
  • Hoechst 33342 on the other hand by specifically binding fluorophores, which enable detection of small gene and chromosome areas as well as whole, special chromosomes.
  • the fluorophore is coupled to the desired DNA region by fluorescence in situ hybridization (FISH).
  • FISH fluorescence in situ hybridization
  • a wide-ranging application of the FISH technique is given by the use of several fluorophores with different emission behavior for the localization of specific DNA areas, which thus enable multi-gene detection through "multi-color detection”.
  • This special technique becomes multiplex -FISH, M-FISH or Multi-Color-FISH.
  • different excitation wavelengths are used for the excitation of the different fluorophores.
  • the latter emissions are, for example, staggered by filter wheels (non-simultaneous) or by special filters with transmission for several excitation wavelengths (e.g. Dan Pinkel filter) or a multi-line output of a laser (e.g. US Patent 5, 127,730) simultaneously (simultaneously
  • filter wheels non-simultaneous
  • special filters with transmission for several excitation wavelengths
  • a multi-line output of a laser e.g. US Patent 5, 127,730
  • a cytogenetic study of hu manen chromosomes often the UV emission of a light source, e.g. B.
  • a mercury or xenon high-pressure lamp used for the fluorescence excitation of a non-specific DNA marker (also known as counterstain), as well as a blue emission of the light source for the excitation of a FISH fluorophore with fluorescence in the green area and the green emission of the light source for excitation of a FISH fluorophore with fluorescence in the red area.
  • a three-dimensional representation (3D) with high spatial resolution is not possible with these non-coherent excitation sources.
  • FISH fluorescence in situ hybridization
  • 3 D images are taken with the blue / green excitation wavelengths of the argon ion laser at 488 nm and 514 nm and with the wavelengths 536 nm and 633 nm of the He-Ne laser.
  • Such laser scanning microscopes usually have do not have an additional UV light source for the 3D excitation of the non-specific DNA markers Hoechst and DAPI.
  • NIR near infrared
  • Multiphoton excitations with NIR excitation radiation typically require light intensities of more than 100 MW / cm.
  • Such high intensities can be achieved by means of continuously focussing (cw) lasers or pulsed lasers, preferably in the picosecond range and femtosecond range of moderate laser power through high focusing, e.g. B. by diffraction-limited focusing with high numerical aperture objectives can be achieved (e.g. Science 248 (1990), 73-76; Nature 377 (1995), 20-21; J. Microsc. 1 (1998), 28).
  • cw continuously focussing
  • the invention is based on the object of specifying a method which, with less effort, enables simultaneous, high-contrast excitation of several FISH fluorophores to be detected and represented in three dimensions with different fluorescence characteristics, and the excitation and detection of the fluorophores at a depth of more than 100 biological material Micrometers guaranteed and which does not have the disadvantages of previous methods listed above.
  • the FISH fluorophores and the non-specific DNA markers with excitation rays are only of one wavelength in the range of 700 nm to 1000 nm excited, the radiation can be both unpulsed and pulsed and the light intensity in a spatially limited volume is more than 100 MW / cm.
  • FISH fluorophores and non-specific DNA markers are efficient and rich in contrast as well could be stimulated to fluorescence with the possibility of a three-dimensional representation.
  • the fluorescence maximum varied in a range from 480 nm to 650 nm and was therefore at least 150 nm away from the excitation wavelength.
  • the separation of excitation photons and fluorescence photons was therefore not a problem and was achieved by using a simple short pass age, e.g. B. only radiation smaller than 700 nm, realized.
  • the fluorophores were bound to human chromosomes.
  • light excitation with the intense laser beam in the near infrared range is based on multi-photon excitation, in which two photons (two-photon excitation) or three photons (three-photon excitation) are absorbed simultaneously and each photon only one Provides a fraction of the energy required for a transition to the excited electronic state (see FIG. 1).
  • multiphoton excitation in which two photons (two-photon excitation) or three photons (three-photon excitation) are simultaneously absorbed and each photon provides only a fraction of the energy required for a transition to the excited electronic state (see FIG. 1 ), is not known to the experts for the investigation of FISH fluorophores and DNA markers and for the implementation of a novel multiplex FISH display.
  • the inventors were able to perform three-dimensional multiplex FISH images of human beings with the laser beam at both 770 nm and 800 nm Create fluorescence-labeled chromosomes after multiple FISH labeling with a lateral resolution of less than 500 nm and an axial resolution of less than 1000 nm without using pinholes.
  • the sample was scanned by the high-intensity laser beam.
  • the different fluorescences excited by the near infrared laser beam were displayed simultaneously using appropriate dichroic mirrors and broadband filters and with different detectors.
  • the FISH fluorophores were first detected and then the DNA was labeled and detected with the fluorophore DAPI.
  • Fig. 1 Schematic representation of a 1-, 2- and 3-photon absorption
  • Fig. 2 triple fluorophore-labeled amniotic fluid cell with fluorescence excitation according to the invention
  • 3 depth-resolved optical sections of a quadruple staining of the cell nuclei of two amniotic fluid cells excited in the NIR to fluoresce
  • 1 shows the principle of action of the multiphoton-excited visible fluorescence with intensive near infrared laser radiation in comparison to a single-photon excitation. Two or three photons are absorbed simultaneously and together provide the necessary energy to occupy the required high-energy state from which the fluorescence emission originates.
  • FIG. 2 shows depth-resolved images of a triple fluorophore-labeled amniotic fluid cell which was irradiated with NIR radiation of wavelength 770 nm for fluorescence.
  • the non-specific DNA marker DAPI and the FISH fluorophores rhodamine (centromer of chromosome 18 marked) and FITC (centromer of chromosome 8 marked) were stimulated to produce visible fluorescence by means of a two-photon excitation.
  • the appearance of three rhodamine hybridization signals indicates to the examined amniotic fluid cell that there is genetic damage in the form of a trisomy 18.
  • the centromeres of chromosomes 8 and 18 are not in one plane, but can be localized with the possibility of 3D representation in the form of depth-resolved optical sections with an axial distance of 1 ⁇ m.
  • FIG. 3 shows depth-resolved optical sections of a quadruple staining of the cell nuclei of two amniotic fluid cells with the FISH fluorophores
  • Spectrum Aqua centromer of chromosome 18 marked
  • Spectrum Green centromer of the X chromosome marked
  • Spectrum Orange centromer of the Y chromosome marked
  • Spectrum Aqua shows in Single-photon absorption spectrum and in the fluorescence spectrum bands at 433 nm and 480 nm, Spectrum Green at 509 nm and 538 nm, Spectrum Orange at 559 nm and 588 nm, and DAPI at 358 nm and 561 nm.
  • the fluorescence images of the nuclei shown in FIG. 3 have red and green fluorescent FISH signals which indicate a female embryo.
  • One of the cores also has three blue fluorescent signals that indicate a trisomy 18.
  • the images, which were taken in different planes of the cell nucleus with an axial distance of 0.5 ⁇ m, show the spatial arrangement of the cell nuclei based on the DAPI fluorescence as well as the spatial position of the FISH-labeled centromeres in the approx.

Abstract

Die Erfindung betrifft ein Verfahren zur optischen Anregung von Flurorophor-markierter DNA und von Fluorophor-markierter RNA, insbesondere von durch Fluoreszenz in situ Hybridisierung (FISH) markierten, spezifischen Lokalisationen der DNA und RNA. Mit dem Verfahren soll mit geringerem Aufwand eine kontrastreiche simultane Anregung von mehreren zu detektierenden und dreidimensional darstellbaren FISH-Fluorophoren unterschiedlicher Fluoreszenzcharakteristik ermöglicht werden. Die Anregung und Detektion der Fluorophore soll dabei in einer Tiefe des biologischen Materials von mehr als 100 Mikrometern gewährleistet sein. Erfindungsgemäß werden die FISH-Fluorophore und DNA-Marker mit einer Multiphotonen-Anregung simultan durch gepulste oder ungepulste Strahlung einer einzigen Wellenlänge im Bereich von 700 nm bis 1000 nm, vorzugsweise zwischen 760 nm und 820 nm, zur Fluoreszenz angeregt. Insgesamt wurden 20 auf dem Markt befindliche FISH-Fluorophore und DNA-Marker getestet. Der Nachweis von simultan Multiphotonen-angeregten Fluorophoren gelang in allen untersuchten Fällen.

Description

Beschreibung der Erfindung
Verfahren zur optischen Anregung von Fluorophor-markierter DNA und RNA
Die Erfindung betrifft ein Verfahren zur optischen Anregung von Fluorophor- markierter DNA und von Fluorophor-markierter RNA, insbesondere von durch Fluoreszenz in situ Hybridisierung (FISH) markierten, spezifischen Lokalisationen der DNA und RNA. Das Verfahren eignet sich für die Anregung und räumlich-aufgelöste Detektion von FISH-markierten chromosomalen Strukturen und ermöglicht die simultane Anregung mehrerer Fluorophore. Die Methode empfiehlt sich daher für eine Multi-Gen- Detektion.
Es sind bereits Verfahren bekannt, Fluorophor-markierte DNA und RNA mittels optischer Strahlung von nichtkohärenten Lichtquellen (Lampen) oder von kohärenten Lichtquellen (Lasern) anzuregen und die Fluoreszenz mit geeigneten Detektoren zweidimensional oder auch dreidimensional zu detektieren: (beispielsweise US 5 792 610, US 5 759 781, DE 196 22 904, DE 4 216 949, Science 273 (1996), 430 und 494, Nature Genet. 12 (1996), 368, Hum. Mol. Genet. 2 (1993), 505, Cytometry 10(1989), 20 und 11 (1990), 126, Proc. Natl. Acad. Sei. (USA) 89 (1992), 1388). Die Markierung erfolgt einerseits mit unspezifischen DNA Markern, z. B. DAPI (4,6-diamidino-2- phenylindole hydrochlorid) und Hoechst 33342, andererseits durch spezifisch bindende Flurophore, die sowohl eine Detektion von kleinen Gen- und Chromosomenbereichen als auch von ganzen, speziellen Chromosomen ermöglichen. Die Kopplung des Fluorophors an die gewünschte DNA-Region erfolgt durch die Fluoreszenz in situ Hybridisierung (FISH). Eine weitreichende Anwendung der FISH-Technik ist durch die Verwendung von mehreren Fluorophoren mit unterschiedlichem Emissionsverhalten für die Lokalisation spezifischer DNA-Bereiche gegeben, die so eine Multi-Gen- Detektion durch den „Multi-Color-Nachweis" ermöglichen. Diese spezielle Technik wird Multiplex-FISH, M-FISH oder auch Multi-Color-FISH genannt. Typischerweise werden für die Anregung der verschiedenen Fluorophore verschiedene Anregungswellenlängen eingesetzt. Diese werden entweder durch mehrere unterschiedliche Lichtquellen oder durch Lichtquellen mit unterschiedlichen Emissionswellenlängen bereit gestellt. Letztere Emissionen werden z. B. durch Filterräder zeitlich versetzt (nicht-simultan) oder durch Spezialfilter mit Transmission für mehrere Anregungswellenlängen (z. B. Dan Pinkel Filter) oder einen Multi-Line-Output eines Lasers (z. B. US-Patent 5, 127,730) gleichzeitig (simultan) bereitgestellt. Zum Beispiel wird bei einer zytogenetischen Untersuchung von humanen Chromosomen oft die UV- Emission einer Lichtquelle, z. B. einer Quecksilber- oder Xenonhochdrucklampe, für die Fluoreszenzanregung eines unspezifischen DNA-Markers (auch als counterstain bezeichnet) eingesetzt, sowie eine blaue Emission der Lichtquelle für die Anregung eines FISH-Fluorophors mit Fluoreszenz im grünen Bereich und die Grünemission der Lichtquelle für eine Anregung eines FISH-Fluorophors mit Fluoreszenz im roten Bereich. Eine dreidimensionale Darstellung (3D) mit hoher räumlicher Auflösung ist mit diesen nichtkohärenten Anregungsquellen nicht möglich.
Die Nutzung unterschiedlicher Anregungswellenlängen verursacht erhebliche Probleme infolge chromatischer Abberation der Optik (unterschiedliche Fokuslängen), der Notwendigkeit von UV-Optiken und durch die aufwendige Separation von Anregungs- und Fluoreszenzphotonen im Fall der simultanen Anregung. Bei einer nichtsimultanen Anregung bestehen Probleme bei der Strahljustierung und infolge aufwendiger Schaltvorrichtungen, z. B. beim Betrieb von schaltbaren Filterrädern.
Alle bekannten derartigen Verfahren zur optischen Anregung und Detektion von durch Fluoreszenz in situ Hybridisierung (FISH) markierten, spezifischen Lokalisationen der DNA und RNA beruhen auf einer linearen Anregung bzw. einer Einphotonen-Ariregung. Bei einer Einphotonen-Anregung wird die Fluoreszenz durch Photonen induziert, die über eine ausreichende Photonenenergie verfügen, um den Fluorophor in einen energiereichen elektronischen Zustand zu überführen. Fluoreszenz erfolgt infolge des strahlenden Übergangs in den Grundzustand des Fluorophors. Bei der Einphotonen-Anregung ist die Anregungswellenlänge stets kleiner als die Fluoreszenzwellenlänge. Eine Fluoreszenzanregung erfolgt innerhalb des gesamten von der Fluoreszenzanregungsstrahlung getroffenen Probenbereiches. Auch außerhalb des Fokusvolumens kommt es dadurch zu Proben- und Fluorophorzerstörungen. Um eine hochauflösende 3D-Fluoreszenzdarstellung von FISH-Fluorophoren zu erhalten, wurden bislang konfokale Laser- scanningmikroskope eingesetzt, die durch die Verwendung von Lochblenden die Detektion des Fluoreszenzsignals aus verschiedenen Probentiefen ermöglichen. Auch hier besteht das Problem der Proben- und Fluorophor- zerstörung außerhalb der Detektionsebene durch das große Anregungsvolumen. Dreidimenisonal aufgelöste M-FISH-Technik ist mit dem konventionellen konfokalen Laserscanningmikroskop nicht oder nur sehr eingeschränkt möglich, da in der Regel nur sehr wenige Anregungswellenlängen zur Verfügung stehen. Typischerweise werden 3 D- Aufnahmen mit den blau/grünen Anregungswellenlängen des Argonionenlasers bei 488 nm und 514 nm sowie mit den Wellenlängen 536 nm und 633 nm des He-Ne-Lasers durchgeführt. Üblicherweise verfügen derartige Laserscanning-Mikroskope nicht über eine zusätzliche UV-Lichtquelle für die 3D Anregung der unspezifischen DNA-Marker Hoechst und DAPI.
Nachteile der bisherigen M-FISH- Verfahren, die auf Einphotonen-Anregun- gen basieren, sind somit
1. die Verwendung von mehreren Anregungswellenlängen, einschließlich ultravioletter Strahlung mehrerer Lichtquellen oder Multilinien/Multiban- den-Output einer Lichtquelle bei simultaner oder nichtsimultaner Fluorophor-Anregung und damit verbundener Probleme durch chromatische Abberation,
2. die fehlende oder stark eingeschränkte Möglichkeit der 3D Darstellung hoher räumlicher Auflösung,
3. das Auftreten erheblicher Filterprobleme, insbesondere bei der simultanen Anregung von mehreren Fluorophoren mit verschiedenen Anregungswellenlängen,
4. die geringe Eindringtiefe der Fluorophor- Anregungsstrahlung, insbesondere der UV-Strahlung
5. das große Anregungsvolumen und die damit auftretenden Prozesse der weiträumigen Fluorophor-Zerstörung durch Photobleaching und Photodestruktion sowie der möglichen weiträumigen Zerstörung des biologischen Präparates und
6. die Untergrundfluoreszenz und damit verbundenen erheblichen Kontrastproblemen.
Darüber hinaus ist an sich eine Multiphotonenanregung bekannt, die bereits 1931 durch Göppert-Meyer (Ann. Phys. 9(1931)273) vorausgesagt und 1961 erstmals realisiert wurde. Für Multiphotonen-Anregungen biologischer Proben wird bevorzugt Strahlung im Nahen Infaroten (NIR) Spektralbereich verwendet, da dort nur wenige effiziente zelleigene Absorber vorhanden sind und so thermische oder photochemische Schädigungen durch lineare Absorption nahezu ausgeschlossen werden können.
Multiphotonenanregungen mit NIR-Anregungsstrahlung erfordern typischer- weise Lichtintensitäten von mehr als 100 MW/cm . Derartige hohe Intensitäten können mittels kontinuierlich emittierendem (cw) Laser oder gepulstem Laser bevorzugt im Pikosekundenbereich und Femtosekunden- bereich moderater Laserleistung durch hohe Fokussierung, z. B. durch beugungsbegrenzte Fokussierung mit Objektiven hoher numerischer Apertur, erzielt werden (z. B. Science 248 (1990), 73-76; Nature 377 (1995), 20-21 ; J. Microsc. 1 (1998), 28). Im Patent US 5.034.613 bzw. in der Zeitschrift Science 248 (1990), 73-76 wird ein Zweiphotonenmikroskop zur Fluores- zenzdetektion und zur photoinduzierten Stofffreisetzung vorgestellt, bei dem Laser mit Pulsbreiten im Subpikosekundenbereich zum Einsatz kommen. Mit Multiphotonen-Mikroskopen wurde z. B. die nichtlineare Anregung der DNA-Fluoreszenzfarbstoffe DAPI und Hoechst demonstriert (Gryczynski et al. Bioimaging 4 (1996), 138-148). Eine Anwendung der Multiphotonen- Anregung zur Untersuchung von FISH-Fluorophoren und zur Realisierung einer Multiplex-FISH-Darstellung ist jedoch nicht bekannt.
Der Erfindung liegt die Aufgabe zu Grunde, ein Verfahren anzugeben, welches mit geringerem Aufwand eine kontrastreiche simultane Anregung von mehreren zu detektierenden und dreidimensional darstellbaren FISH- Fluorophoren unterschiedlicher Fluoreszenzcharakteristik ermöglicht sowie die Anregung und Detektion der Fluorophore in einer Tiefe des biologischen Materials von mehr als 100 Mikrometern gewährleistet und welches die oben aufgeführten Nachteile bisheriger Verfahren nicht aufweist.
Erfmdungsgemäß werden die FISH-Fluorophore und die unspezifischen DNA-Marker mit Anregungsstrahlen nur einer Wellenlänge im Bereich von 700 nm bis 1000 nm angeregt, wobei die Strahlung sowohl ungepulst als auch gepulst vorliegen kann und die Lichtintensität in einem räumlich eng begrenzten Volumen mehr als 100 MW/cm beträgt.
Überraschend wurde festgestellt, daß eine Vielzahl herkömmlicher FISH- Fluorophore und unspezifischer DNA-Marker auch durch intensitätsreiche nahe infrarote Laserstrahlung einer einzigen geeigneten Wellenlänge simultan angeregt werden kann, obwohl im Einphotonen-Anregungsspektrum keine Absorptionsbanden bei der Anregungswellenlänge und erhebliche Unterschiede im Absorptionsverhalten der einzelnen Fluorophore mit unterschiedlichen Absorptionsbanden im ultravioletten und sichtbaren Bereich auftreten. So zeigte es sich, daß mit gepulster Laserstrahlung einer Wellenläge von 770 nm, einer Pulsdauer von 200 fs, einer Pulsfolgefrequenz von 76 MHz und einer Lichtintensität von etwa 500 GW/cm zwanzig kommerziell erhältliche FISH-Fluorophore und unspezifische DNA-Marker effizient und kontrastreich sowie mit der Möglichkeit einer dreidimensionalen Darstellung zur Fluoreszenz angeregt werden konnten. Das Fluoreszenzmaximum variierte dabei in einem Bereich von 480 nm bis 650 nm und lag damit mindestens 150 nm von der Anregungswellenlänge entfernt. Die Separation von Anregungsphotonen und Fluoreszenzphotonen bereitete daher keine Probleme und wurde durch die Verwendung eines einfachen Kurzpaß Alters, der z. B. nur Strahlung kleiner 700 nm transmittiert, realisiert. Die Fluorophore waren dabei an humane Chromosomen gebunden.
Die Lichtanregung mit dem intensiven Laserstrahl im nahen Infrarotbereich basiert im Gegensatz zu konventionellen FISH- Verfahren auf einer Multi- photonen-Anregegung, bei der zwei Photonen (Zweiphotonen-Anregung) oder drei Photonen (Dreiphotonen-Anregung) simultan absorbiert werden und jedes Photon nur einen Bruchteil der notwendigen Energie für einen Übergang in den angeregten elektronischen Zustand bereitstellt (vgl. Fig. 1). Eine derartige Multiphotonen- Anregung, bei der zwei Photonen (Zweiphotonen-Anregung) oder drei Photonen (Dreiphotonen- Anregung) simultan absorbiert werden und jedes Photon nur einen Bruchteil der notwendigen Energie für einen Übergang in den angeregten elektronischen Zustand bereitstellt (vgl. Fig. 1), ist der Fachwelt zur Untersuchung von FISH-Fluorophoren und DNA- Markem sowie zur Realisierung einer neuartigen Multiplex-FISH-Darstellung nicht bekannt.
Unter Verwendung eines Laserscanning-Mikroskops mit einem Phasenkontrast-Objektiv hoher numerischer Apertur (63x, 1,25) und einer motorisierten Tiefenverstellung der Probe konnten die Erfinder mit dem Laserstrahl sowohl bei 770 nm als auch bei 800 nm dreidimensionale Multiplex-FISH- Aufnahmen von humanen fluoreszenzmarkierten Chromosomen nach Mehrfach- FISH-Markierung mit einer lateralen Auflösung von weniger als 500 nm und einer axialen Auflösung von weniger als 1000 nm ohne Verwendung von Lochblenden erstellen. Die Probe wurde dabei durch den intensitätsreichen Laserstrahl abgerastert. Die verschiedenen, vom nahen infraroten Laserstrahl angeregten Fluoreszenzen wurden unter Verwendung entsprechender dichroi- tischer Spiegel und Breitbandfilter sowie mit unterschiedlichen Detektoren simultan dargestellt. Teilweise erfolgte auch zunächst die Detektion der FISH-Fluorophore und anschließend die Markierung und Detektion der DNA mit dem Fluorophor DAPI.
Die Erfindung soll nachstehend anhand von in der Zeichnung dargestellten Ausführungsbeispielen näher erläutert werden. Es zeigen:
Fig. 1 : Prinzipdarstellung einer 1-, 2- und 3 -Photonenabsorption Fig. 2: dreifach-Fluorophor-markierte Fruchtwasserzelle mit erfindungsgemäßer Fluoreszenzanregung Fig. 3: tiefenaufgelöste optische Schnitte einer Vierfachfärbung der Zellkerne zweier im NIR zur Fluoreszenz angeregter Fruchtwasserzellen
In Fig. 1 ist das Wirkprinzip der Multiphotonen-angeregten sichtbaren Fluoreszenz mit intensiver naher infraroter Laserstrahlung im Vergleich zu einer Einphotonenanregung dargestellt. Zwei oder drei Photonen werden jeweils gleichzeitig absorbiert und liefern zusammen die notwendige Energie, um den erforderlichen energiereichen Zustand zu besetzen, von dem die Fluoreszenzemission ausgeht.
Fig. 2 zeigt tiefenaufgelöste Aufnahmen von einer Dreifach-Fluorophor- markierten Fruchtwasserzelle, die mit NIR-Strahlung der Wellenlänge 770 nm zur Fluoreszenz bestrahlt wurde. Zur sichtbaren Fluoreszenz angeregt wurden der unspezifische DNA Marker DAPI sowie die FISH-Fluorophore Rhodamin (Zentromer des Chromosoms 18 markiert) und FITC (Zentromer des Chromosoms 8 markiert) durch eine vorgenannte Zweiphotonen-Anregung. Das Auftreten von drei Rhodamin Hybridisierungssignalen weist in diesem Fall der untersuchten Fruchtwasserzelle auf eine genetische Schädigung in Form einer Trisomie 18 hin. Die Zentromere der Chromosomen 8 und 18 liegen nicht in einer Ebene, können jedoch durch die Möglichkeit der 3D Darstellung in Form tiefenaufgelöster optischer Schnitte mit einer einer axialen Entfernung von 1 μm lokalisiert werden.
Fig. 3 zeigt tiefenaufgelöste optische Schnitte einer Vierfachfärbung der Zellkerne zweier Fruchtwasserzellen mit den FISH-Fluorophoren Spectrum Aqua (Zentromer des Chromosoms 18 markiert), Spectrum Green (Zentromer des X-Chromosoms markiert) und Spectrum Orange (Zentromer des Y- Chromosoms markiert) sowie dem unspezifischen DNA-Marker DAPI unter Verwendung von 800 nm Anregungsstrahlung. Spectrum Aqua weist im Einphotonen-Absorptionsspektrum und im Fluoreszenzspektrum Banden bei 433 nm und 480 nm, Spectrum Green bei 509 nm und 538 nm, Spectrum Orange bei 559 nm und 588 nm, sowie DAPI bei 358 nm und 561 nm auf. Die in Fig. 3 dargestellten Fluoreszenzaufnahmen der Kerne weisen rot und grün fluoreszierende FISH-Signale auf, die auf ein weibliches Embryo deuten. Einer der Kerne weist dabei zudem drei blaufluoreszierende Signale auf, die eine Trisomie 18 anzeigen. Die Aufnahmen, die in unterschiedlichen Ebenen des Zellkerns mit einem axialen Abstand von 0,5 μm erstellt wurden, zeigen die räumliche Anordnung der Zellkerne anhand der DAPI Fluoreszenz sowie die räumliche Position der FISH-markierten Zentromere in den ca. 10 μm großen Zellkernen.

Claims

Patentansprüche
1. Verfahren zur optischen Anregung von Fluorophor-markierter DNA und RNA, bei dem gleichzeitig mehrere zu detektierende Fluorophore mit unterschiedlichem Fluoreszenzspektrum durch Strahlung zur Fluoreszenz im sichtbaren Spektralbereich angeregt werden, dadurch gekennzeichnet, daß die Fluorophore simultan durch Strahlung einer einzigen Wellenlänge im Bereich zwischen 700 nm und 1000 nm zur Fluoreszenz angeregt werden.
2. Verfahren nach Anspruch 1, dadurch gekennzeichnet, daß die Fluoreszenzanregung mit Strahlung einer Wellenlänge zwischen 730 nm und 820 nm erfolgt.
3. Verfahren nach Anspruch 1, dadurch gekennzeichnet, daß die Strahlung zur Fluoreszenzanregung durch Fokussierung in einem räumlich eng begrenzten Volumen eine Intensität von mindestens 100 MW/cm und höchstens 10 TW/cm2 aufweist.
4. Verfahren nach Anspruch 1, dadurch gekennzeichnet, daß die Fluoreszenzanregung mit ungepulster Strahlung erfolgt.
5. Verfahren nach Anspruch 1, dadurch gekennzeichnet, daß die Fluoreszenzanregung mit gepulster Strahlung erfolgt.
PCT/EP2000/006546 1999-07-29 2000-07-11 Verfahren zur optischen anregung von fluorophor-markieter dna und rna WO2001009591A1 (de)

Priority Applications (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US09/806,375 US6528802B1 (en) 1999-07-29 2000-07-11 Method for optical excitation of fluorophore marked DNA and RNA
JP2001514553A JP2003506677A (ja) 1999-07-29 2000-07-11 蛍光体でマーキングしたｄｎａおよびｒｎａの光励起法
EP00954464A EP1117985A1 (de) 1999-07-29 2000-07-11 Verfahren zur optischen anregung von fluorophor-markieter dna und rna

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
DE19935766A DE19935766A1 (de) 1999-07-29 1999-07-29 Verfahren zur optischen Anregung von Fluorophor-markierter DNA und RNA
DE19935766.8 1999-07-29

Publications (2)

Publication Number Publication Date
WO2001009591A1 WO2001009591A1 (de) 2001-02-08
WO2001009591A9 true WO2001009591A9 (de) 2002-09-06

Family

ID=7916558

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PCT/EP2000/006546 WO2001009591A1 (de) 1999-07-29 2000-07-11 Verfahren zur optischen anregung von fluorophor-markieter dna und rna

Country Status (5)

Country Link
US (1) US6528802B1 (de)
EP (1) EP1117985A1 (de)
JP (1) JP2003506677A (de)
DE (1) DE19935766A1 (de)
WO (1) WO2001009591A1 (de)

Families Citing this family (39)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6819411B1 (en) 1997-01-31 2004-11-16 Xy, Inc. Optical apparatus
US6149867A (en) * 1997-12-31 2000-11-21 Xy, Inc. Sheath fluids and collection systems for sex-specific cytometer sorting of sperm
AR018234A1 (es) 1998-07-30 2001-11-14 Xy Inc Metodo para producir una muestra para inseminacion de flujo de equinos y disposicion de citometria de flujo.
US7208265B1 (en) * 1999-11-24 2007-04-24 Xy, Inc. Method of cryopreserving selected sperm cells
DE10015448A1 (de) * 2000-03-29 2001-10-11 November Ag Molekulare Medizin Verfahren zum Nachweisen und/oder Quantifizieren des Bindens erster Moleküle an dazu affine zweite Moleküle
RU2297198C2 (ru) 2000-05-09 2007-04-20 Кси, Инк. Способ разделения клеток спермы, несущих x-хромосому, и клеток спермы, несущих y-хромосому
HUP0303158A2 (hu) * 2000-06-12 2003-12-29 Colorado State University Izolált X-, illetve Y-kromoszómákat hordozó spermium-populációk alkalmazásán alapuló integrált állattenyésztési rendszer
DE10035190C5 (de) * 2000-07-20 2009-07-16 MAX-PLANCK-Gesellschaft zur Förderung der Wissenschaften e.V. Verfahren und Vorrichtung zur Fluoreszenzmessung
WO2002043574A2 (en) 2000-11-29 2002-06-06 Xy, Inc. System to separate frozen-thawed spermatozoa into x-chromosome bearing and y-chromosome bearing populations
US7713687B2 (en) 2000-11-29 2010-05-11 Xy, Inc. System to separate frozen-thawed spermatozoa into x-chromosome bearing and y-chromosome bearing populations
AU2002239581B2 (en) * 2000-12-15 2006-09-28 The Arizona Board Of Regents On Behalf Of The University Of Arizona Method for patterning metal using nanoparticle containing precursors
DE10065146A1 (de) * 2000-12-22 2002-07-11 Karsten Koenig Verfahren und Anordnung zur nicht-invasiven dreidimensionalen optischen Untersuchung und Therapie der Haut
DE10120425C2 (de) * 2001-04-26 2003-12-18 Leica Microsystems Scanmikroskop
US7280680B2 (en) 2002-03-04 2007-10-09 Riken Method and apparatus for observing three-dimensional localizations of in vivo expressed genes as well as method and apparatus for observing minute three-dimensional localizations of in vivo expressed genes
US20070096039A1 (en) * 2002-05-03 2007-05-03 Rakesh Kapoor Evaluation Of Multicomponent Mixtures Using Modulated Light Beams
US20030205682A1 (en) * 2002-05-03 2003-11-06 Rakesh Kapoor Evaluation of multicomponent mixtures using modulated light beams
US8486618B2 (en) 2002-08-01 2013-07-16 Xy, Llc Heterogeneous inseminate system
JP4595067B2 (ja) 2002-08-01 2010-12-08 エックスワイ，エルエルシー 低圧精子細胞分離システム
JP2005535346A (ja) 2002-08-15 2005-11-24 エックスワイ，インコーポレイテッド 高分解能フローサイトメーター
US7169548B2 (en) 2002-09-13 2007-01-30 Xy, Inc. Sperm cell processing and preservation systems
US20040184144A1 (en) * 2002-12-31 2004-09-23 Goodwin Paul C. Wavelength-specific phase microscopy
BRPI0408857B1 (pt) 2003-03-28 2018-09-11 Inguran Llc aparelho, métodos e processos para separar partículas e para prover esperma de animal separado por sexo
AU2004242121B2 (en) 2003-05-15 2010-06-24 Xy, Llc. Efficient haploid cell sorting for flow cytometer systems
JP4521517B2 (ja) * 2004-03-01 2010-08-11 独立行政法人産業技術総合研究所 微小対象物放出光検出装置
BRPI0509485A (pt) 2004-03-29 2007-09-11 Monsanto Technology Llc suspensões de esperma para uso em inseminação
US8323886B2 (en) * 2004-06-18 2012-12-04 Wlodek Mandecki Fluorescence methods of detecting a protein-elongation related complex and corollary sequence information
EP2269617B1 (de) 2004-07-22 2016-04-27 Inguran, LLC Spermasuspensionen zur Sortierung in X- oder Y-Chromosomen-tragende angereicherte Populationen
US9040305B2 (en) 2004-09-28 2015-05-26 Singulex, Inc. Method of analysis for determining a specific protein in blood samples using fluorescence spectrometry
US8685711B2 (en) 2004-09-28 2014-04-01 Singulex, Inc. Methods and compositions for highly sensitive detection of molecules
CN104673903B (zh) * 2005-06-20 2018-11-13 领先细胞医疗诊断有限公司 检测单个细胞中的核酸和鉴定异质大细胞群中罕见细胞的方法
US7618770B2 (en) * 2005-07-29 2009-11-17 Xy, Inc. Methods and apparatus for reducing protein content in sperm cell extenders
DE102006029809B3 (de) 2006-06-28 2007-11-08 Ltb Lasertechnik Berlin Gmbh Ortsaufgelöstes Messverfahren für die Detektion von Melanin in Fluorophorgemischen in einer Festkörperprobe
US8101426B2 (en) * 2007-03-02 2012-01-24 Icyt Mission Technology, Inc. System and method for the measurement of multiple fluorescence emissions in a flow cytometry system
CA2709217C (en) 2007-12-19 2021-01-05 Singulex, Inc. Scanning analyzer for single molecule detection and methods of use
JP5525776B2 (ja) * 2009-07-31 2014-06-18 オリンパス株式会社 Ｆｉｓｈ細胞画像解析方法、ｆｉｓｈ細胞画像解析システム及びｆｉｓｈ細胞画像解析装置
CA2826384C (en) * 2011-02-04 2020-08-04 The Trustees Of The University Of Pennsylvania A method for detecting chromosome structure and gene expression simultaneously in single cells
WO2013049202A1 (en) 2011-09-26 2013-04-04 Roukes Michael L Brain-machine interface based on photonic neural probe arrays
US20160150963A1 (en) * 2011-09-26 2016-06-02 Michael Lee Roukes One-photon integrated neurophotonic systems
ES2893100T3 (es) 2015-10-12 2022-02-08 Advanced Cell Diagnostics Inc Detección in situ de variantes de nucleótidos en muestras con un elevado nivel de ruido, y composiciones y métodos relacionados con ésta

Family Cites Families (12)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5171534A (en) * 1984-01-16 1992-12-15 California Institute Of Technology Automated DNA sequencing technique
US5062942A (en) * 1989-04-12 1991-11-05 Hitachi, Ltd. Fluorescence detection type electrophoresis apparatus
US5034613A (en) * 1989-11-14 1991-07-23 Cornell Research Foundation, Inc. Two-photon laser microscopy
JP2814409B2 (ja) * 1990-11-30 1998-10-22 日立ソフトウェアエンジニアリング 株式会社 多色泳動パターン読み取り装置
US5936731A (en) * 1991-02-22 1999-08-10 Applied Spectral Imaging Ltd. Method for simultaneous detection of multiple fluorophores for in situ hybridization and chromosome painting
JP2815506B2 (ja) * 1992-04-14 1998-10-27 株式会社日立製作所 光検出型電気泳動装置
DE19533092A1 (de) * 1995-09-07 1997-03-13 Basf Ag Vorrichtung zur parallelisierten Zweiphotonen-Fluoreszenz-Korrelations-Spektroskopie (TPA-FCS) und deren Verwendung zum Wirkstoff-Screening
DE69635521T2 (de) * 1995-09-19 2006-08-17 Cornell Research Foundation, Inc. Multiphoton-lasermikroskopie
US5784157A (en) * 1995-11-21 1998-07-21 The Research Foundation Of State University Of New York Method and apparatus for identifying fluorophores
AU5054198A (en) * 1996-12-03 1998-06-29 Erkki Soini Biospecific, two photon excitation, fluorescence detection and device
US6049380A (en) * 1997-11-12 2000-04-11 Regents Of The University Of California Single molecule identification using selected fluorescence characteristics
US6221602B1 (en) * 1998-11-10 2001-04-24 Bio-Pixels Ltd. Functionalized nanocrystals and their use in labeling for strand synthesis or sequence determination

Also Published As

Publication number Publication date
DE19935766A1 (de) 2001-02-01
JP2003506677A (ja) 2003-02-18
WO2001009591A1 (de) 2001-02-08
EP1117985A1 (de) 2001-07-25
US6528802B1 (en) 2003-03-04

Similar Documents

Publication Publication Date Title
WO2001009591A9 (de) Verfahren zur optischen anregung von fluorophor-markieter dna und rna
EP2069761B1 (de) Verfahren und vorrichtung zum hochaufgelösten optischen abtasten einer probe
DE10035190C5 (de) Verfahren und Vorrichtung zur Fluoreszenzmessung
EP1584918B1 (de) Verfahren und Vorrichtung zur Fluoreszenz-Lebensdauer-Imaging-Nanoskopie
DE69635521T2 (de) Multiphoton-lasermikroskopie
EP2067020A1 (de) Auflösungsgesteigerte lumineszenzmikroskopie
WO2009024529A1 (de) Sted-fluoreszenzmikroskopie mit zweiphotonen-anregung
EP2032970B1 (de) Ortsaufgelöstes messverfahren für die detektion von melanin in fluorophorgemischen in einer festkörperprobe
EP1891416A1 (de) Verfahren und vorrichtung zum optischen messen einer probe
EP2718762A1 (de) Hochauflösende lumineszenzmikroskopie
EP2803977A1 (de) Verfahren zur 3D-hochauflösenden Lokalisierungsmikroskopie
EP3427036A1 (de) Verfahren zum hochaufgelösten lokalen abbilden einer struktur in einer probe, um reaktionen eines interessierenden objekts auf veränderte umgebungsbedingungen zu erfassen
DE102016117096A1 (de) Verfahren zum hochaufgelösten lokalen Abbilden einer Struktur in einer Probe
DE102009055216A1 (de) Lumineszenzmikroskopie
DE102006060180B9 (de) Verfahren und Vorrichtung zum räumlich hochaufgelösten Abbilden einer mit einer Substanz markierten Struktur
EP1903336B1 (de) Verfahren zur räumlich hochauflösenden Untersuchung von einer mit einer fluoreszierenden Substanz markierten Struktur einer Probe
EP3365662B1 (de) Verfahren und vorrichtung zum hochauflösenden abbilden einer mit fluoreszenzmarkern markierten struktur einer probe
DE102004029733B4 (de) Rastermikroskop und Verfahren zur Rastermikroskopie
WO2004113987A1 (de) Vrefahren zur fluoreszenzmikroskopie
DE19939706A1 (de) Fluorophor für die Multi-Photonen-Laser-Scanning-Mikroskopie
DE10065784A1 (de) Verfahren und Vorrichtung zum Auffinden von Probenbereichen
DE102017111578A1 (de) Verfahren zur Unterscheidung einzelner fluoreszierender Markierungsstoffmoleküle in der SPDM-Lokalisationsmikroskopie durch deren zeitliches Langzeit-Emissionsverhalten über 10ms

Legal Events

Date Code Title Description
AK Designated states

Kind code of ref document: A1

Designated state(s): JP US

AL Designated countries for regional patents

Kind code of ref document: A1

Designated state(s): AT BE CH CY DE DK ES FI FR GB GR IE IT LU MC NL PT SE

ENP Entry into the national phase

Ref country code: JP

Ref document number: 2001 514553

Kind code of ref document: A

Format of ref document f/p: F

WWE Wipo information: entry into national phase

Ref document number: 2000954464

Country of ref document: EP

121 Ep: the epo has been informed by wipo that ep was designated in this application
WWE Wipo information: entry into national phase

Ref document number: 09806375

Country of ref document: US

WWP Wipo information: published in national office

Ref document number: 2000954464

Country of ref document: EP

COP Corrected version of pamphlet

Free format text: PAGES 1/3-3/3, DRAWINGS, REPLACED BY NEW PAGES 1/3-3/3; DUE TO LATE TRANSMITTAL BY THE RECEIVING OFFICE

WWW Wipo information: withdrawn in national office

Ref document number: 2000954464

Country of ref document: EP