WO1998005965A1 - Methode d'identification de cellules eucaryotes par fixation desdites cellules sur un support et support pour mettre en oeuvre ladite methode - Google Patents
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Definitions
- the present invention relates to a method for identifying eukaryotic cells, in particular mammals, by simple or double labeling (cytological and / or cytogenetic).
- the present invention is applicable to the determination of characteristics making it possible to identify a particular type of cells possibly present in a heterogeneous population, for example by immunological reaction (certain metastatic cells, residual leukocyte cells during allografts etc.).
- the present invention particularly relates to a method of identifying a genetic characteristic of a eukaryotic cell, in particular of mammals, in particular a fetal cell, from a heterogeneous population of eukaryotic cells.
- Fetal cell samples are now commonly taken from pregnant women at risk, that is, over 38 years of age or from a family with a history of genetic abnormalities.
- the fetal cell sampling techniques currently used are invasive and present significant risks of spontaneous abortion. In fact, they require perforation of the fetal or placental membranes. This is particularly the case for amniocentesis, choriocentesis or cordocentesis.
- amniocentesis is deemed to present little risk of complications, it can only be performed after the 1st 7 weeks of amenorrhea, in the second trimester of pregnancy.
- Patent application EP-A-412 700 describes a preparation of monoclonal antibodies specific for first trimester cytotrophoblastic cells which can be used in prenatal diagnostics (karyotype, identification of polymorphisms of limited length, linked to genetic diseases such as thalassemia, sickle cell anemia, insulin-dependent diabetes and Huntington's disease).
- US Patent 5,432,054 describes a method of separation of fetal nucleated erythrocytes present in a sample of blood of pregnant women.
- the method according to this application provides for a step of pre-enrichment in trophoblastic cells by means of common antileukocytic antibodies marking the major part of the leukocytes of the leukocyte fraction making it possible to separate said leukocytes.
- Non-invasive diagnostic methods using these techniques have certain drawbacks with regard to the precision of the measurements and ultimately, the diagnosis that the practitioner will have to make. We agree that in this area, only equal precision 100% may be acceptable.
- these non-invasive antenatal diagnostic methods use labeling techniques making it possible to identify fetal cells on the one hand and the specific genetic characteristics which are to be identified on the other (double marking technique ).
- Patent application WO-A-94/02646 relates to a method of identifying fetal cells by hybridization of the nucleic acid of fetal cells.
- the fetal cells are fixed on a solid support by precipitation or bypass.
- precipitation involves drying, which damages the cells in many cases.
- crosslinking reduces the efficiency of hybridization as indicated on page 22, line 28 to page 23, line 3.
- Patent application EP-A-396 116 relates to functionalized microspheres linked by a heterobifunctional arm to a protein.
- Patent application WO-A-94/02830 also describes attachment by adsorption of cells (cytocentrifugation) as indicated on page 9, lines 15-17.
- Patent application WO-A-96/03632 describes a method for detecting cells which are suspended.
- the present invention provides a new method for identifying cells that go against those previously described.
- the inventors have in fact demonstrated that the problem in question can be satisfactorily resolved without the need to purify the cells to be identified.
- This method although particularly advantageous in the case of double marking, can also be applied to identification techniques by simple marking.
- the object of the present invention is in general to propose a new simple and reliable diagnostic method, allowing the detection of a characteristic of a eukaryotic cell by simple or double labeling, while avoiding the various drawbacks. cited above.
- Another object of the present invention is to provide a non-invasive antenatal diagnostic method which provides clear results with a success rate close to 100%.
- Another object of the present invention is to provide solid supports making it possible to implement said diagnostic method.
- the invention relates firstly to a method of identifying at least one characteristic of a eukaryotic cell, in particular of mammals, characterized in that a substantially monocellular layer of a population of eukaryotic cells is covalently immobilized on a solid functionalized support and in that the layer of immobilized cells is subjected to a reaction allowing determine a cytological and / or cytogenetic characteristic and in that the result is evaluated.
- the support is flat.
- the diagnostic method according to the invention ensures immobilization of the cells on a flat solid support while avoiding the drawbacks described above.
- the solid support is preferably of mineral nature (glass for example) although organic supports may also be suitable.
- the solid support is functionalized by a spacer arm with a terminal function capable of reacting with functional groups present on the cell wall.
- the groups present on the cell wall are in particular the thiol, carboxyl or primary amino groups located on the protein part. These groups react, after optional activation, with the appropriate terminal function of the chain.
- the groups can also be present on the sugar part associated with proteins, such as hydroxyl groups, transformed in known manner into reactive aldehyde groups.
- the reactive terminal functions will ensure a covalent bond with said reactive groups under appropriate conditions: - when the functional group is a thiol group or a disulphide bridge (the latter will be reduced beforehand), the terminal function is a maleimido, iodoacetyl radical , dithio-pyridyl; when the functional group is an amino group primary, the terminal function is an aldehyde, activated carboxylate, N-hydroxysuccinimide, ⁇ -dibromo radical;
- the terminal function is a primary or secondary amine
- the terminal function is a hydroxysuccinimidc radical, activated carboxylate
- the terminal function is glyoxal.
- the functional group is a thiol group and the terminal function is a maleimido radical.
- the solid support is mineral in nature, for example glass, and the spacer arm is attached to the end opposite to said terminal function via the silanol functions of the solid support.
- the covalent bond between the glass and the spacer arm is ensured in particular by the reaction of a group Si (OR ⁇ ) - with a silanol radical of the glass in a known manner, OR-i being a group capable of being hydrolyzed.
- R 1 is a radical (C pC f alkyl and advantageously
- the spacer arm is constituted by a divalent chain terminated at its ends with a bet by the terminal function and on the other hand by Si (OR ⁇ ) 3 .
- the divalent chain is advantageously hydrocarbon optionally comprising one or more heteroatoms, optionally branched, optionally unsaturated. It essentially has no affinity for the support in a variant according to the invention. This helps to limit non-specific interactions with the support.
- the spacer arm will advantageously include 8 to 30 atoms and will respond to the formula:
- R 2 being a hydrocarbon chain of 8 to 30 atoms optionally comprising one or more heteroatoms, optionally branched, optionally unsaturated.
- the spacer arm corresponds to the formula:
- H O o n, m independently of each other being a positive integer less than or equal to 10, preferably less than or equal to 5.
- a method for functionalizing the solid support consists in silanizing it using an omega-aminoalkyltrialkoxy silane of formula
- the solid support is functionalized by silanization using 3-aminopropyltrialcoxy silane then subsequent reaction with the N-hydroxysuccinimide ester of ⁇ -maleimido butyric acid.
- the functionalized solid support thus obtained is washed with a coupling buffer suitable for the reaction considered.
- the so-called simple labeling method is characterized in that the population of eukaryotic cells is chosen from the group consisting of: - the population of cells capable of comprising metastatic cells,
- the population of cells resulting from preparation of bone marrow during allografts likely to contain residual leukocyte cells
- the population of cells likely to contain circulating bacteria
- the cells to be identified are marked with a specific marker said cells to be identified.
- the so-called simple labeling method is characterized in that the population of eukaryotic cells is chosen from the group consisting of: - the population of cells likely to contain cells having an abnormal genetic characteristic, and in that the the layer of immobilized cells is subjected to a cytogenetic reaction making it possible to reveal the genetic characteristic to be identified.
- the double marking identification method is characterized in that a sample of cells taken from an individual is subjected to the following reactions: a) the eukaryotic cells are immobilized covalently on a functionalized support, b) the immobilized cells are optionally permeabilized, c) the cells to be identified are marked with a specific marker for said cells to be identified, d) the layer of immobilized cells is subjected to a cytogenetic reaction allowing the genetic characteristic to be identified to be revealed, e) it is evaluated the result.
- step a) a cell sorting of said sample to obtain a fraction enriched in eukaryotic cells to identify.
- the anucleated cells represent more than 99% of the circulating blood cells, and block the attachment of the nucleated cells to the activated support.
- this operation is all the more necessary as the circulating fetal population is present with a percentage of less than 1 per 100,000 nucleated cells in the mother's blood.
- This elimination can be carried out in a known manner by negative sorting, in particular by centrifugation on a density gradient, for example according to the FICOLL® method in the case of blood cells.
- FICOLL® is a sucrose polymer whose use for purifying blood mononuclear cells is perfectly standardized. Solutions of FICOLL®, of precalibrated densities, are commercially available and are used in the form of cushions, gradients of discontinuous density or gradients of continuous density, on which the blood cells are separated.
- the cells are preferably washed intensively in order to remove the major part of the contaminating proteins originating from the medium in which they were initially found, in particular the blood.
- the cells are suspended in coupling buffer at a concentration which usually varies between 105 to 10 7 cells / ml although this interval is not critical, spread on the functionalized support and stored in a humid chamber at appropriate temperature, in particular ambient, for a determined period, one hour for example, to allow the cells to sediment and form a covalent bond with the terminal function of the spacer arm.
- the support is then rinsed to complete the fixation of the cells which have not yet reacted and to eliminate the cells which are not covalently linked. After the covalent immobilization of the cells, it is advantageous to fix them, for example by treatment with paraformaldehyde, washing and neutralization of the residual aldehyde functions.
- Permeabilization if necessary, is carried out in a known manner, in particular by treatment with Triton X100 (> for example. This permeabilization is in particular useful in the case of intracellular antigenic motifs.
- the specific marker is an antibody substantially specific for said cells to be identified associated with a substance capable of being identified by an appropriate means.
- the membrane marking must be compatible with the method according to the invention which uses double marking.
- trophoblastic cells within the meaning of the present invention is meant any trophoblast cell, syncytiotrophoblast or cytotrophoblast of villous or extravillous origin whatever its type, anucleated, mononuclear, polynucleated and whatever the time of their appearance in maternal blood in relation to the duration of gestation.
- said substance is a conjugate coupled to alkaline phosphatase and the marker is revealed by means of a chromogenic substrate.
- the revealing substrate called "Fast Red”, hydrolyzed by alkaline phosphatase (PA) gives an insoluble pink-red precipitate which can be viewed with a dichroic filter and in optics.
- PA alkaline phosphatase
- the specific antibody is fixed on the cells and then the cells are brought into contact with an anti-antibody specific for the cells, coupled to alkaline phosphatase.
- an antibody of the type GB 17, GB 25 developed by Aster Biotechnologies will advantageously be used. These two types of antibodies have a strict specificity restricted to these cells only. It is however possible to envisage the use of a third antibody, an anti-cytoeratin 18. Although not specific for trophoblasts, it has been developed against keratinocytes, it does not give a cross-reaction with the cells blood.
- the antibodies will be associated by an epitope with an antibody specific for the heavy and light chains of said anti-trophoblastic cell antibodies, coupled to alkaline phosphatase (GAM-PA).
- the cells are saturated with an appropriate buffer.
- the specific monoclonal antibody is incubated at the appropriate concentration for a determined period, one hour for example, in a humid chamber and at room temperature.
- the second antibody coupled to alkaline phosphatase, and which can conjugate to an epitope of the specific antibody, is left to incubate under conditions similar to said specific antibody.
- the washing techniques are used in known manner during and after the phosphatase labeling procedure, for example with the TBS buffer.
- the development of the alkaline phosphatase enzyme is carried out by incubating the slides for a period of the order of 30 minutes with a buffer such as Tris to which the development substrate has been added.
- a buffer such as Tris to which the development substrate has been added.
- this contains the "Fast Red” which hydrolyzes with alkaline phosphatase gives an insoluble precipitate pink red viewable with a dichroic filter and in optics.
- TBS Trist Red
- development with the chromogenic substrate is carried out in the presence of an inhibitor of endogenous alkaline phosphates such as levamisole.
- the background noise is sufficiently reduced not to affect the intensity of the positive signal. It is moreover desirable to choose a sufficiently short revelation time of the order of ten minutes usually between 5 and 15 minutes.
- the dilution of the antibody coupled to alkaline phosphatase should advantageously be between 1 / 60th and 1 / 480th in order to obtain an optimal signal. However, this interval varies according to the antibodies.
- the optimal dilution of a second layer antibody, conjugated to an enzyme (alkaline phosphatase or other), will depend on the concentration at which it is found in the mother solution. This dilution will be optimized by manipulations within the reach of those skilled in the art.
- the in situ hybridization technique allows rapid detection of cytogenetic defects.
- This technique generally uses a fluorescent probe and is known by the name FISH (in English: fluorescence in situ hybridization).
- FISH fluorescence in situ hybridization
- This technique uses specific probes of a chromosome associated with a marker to allow the identification of chromosomal aberrations in number as in structure.
- in situ hybridization can be applied directly to fetal cells isolated from maternal blood and are available for chromosomes 18, X and Y as well as for both chromosomes 1 and 21.
- the method according to the invention is not limited to application to fetal cells, in particular trophoblastics circulating in maternal blood, but on the contrary extends to the detection of other eukaryotic cells, for example:
- the model may be applicable to cellular screening rather than serological antigen P24 / P25 (immunological screening of the protein or its MRNA m TR-
- This so-called double marking identification method finds a particularly advantageous application in the case of the detection of chromosomal abnormality of the fetal cells and allows their detection in the first months of pregnancy with a particularly clear resolution and a percentage very high success rate approaching 100%.
- the invention therefore relates in particular to a method of antenatal diagnosis comprising the following steps: a) a blood sample is taken from the peripheral circulation system of the mother carrying the fetus, b) the erythrocytes are removed from said sample by negative sorting, c ) the leukocyte fraction is covalently immobilized on the functionalized solid support described above, d) the immobilized cells are optionally permeabilized, e) the cells to be identified are marked with a specific marker for trophoblastic cells, f) the cell layer is subjected immobilized in a cytogenetic analysis method allowing to reveal the genetic characteristic to identify, g) the result is evaluated.
- step f) consists in bringing the layer of immobilized cells into contact with a labeled complementary probe specific for the genetic characteristic to be identified.
- the specific marker is a monoclonal antibody associated with a substance coupled to alkaline phosphatase.
- an endogenous alkaline phosphatase inhibitor such as levamisole at a concentration preferably between 1 and 5 mM.
- levamisole also inhibits alkaline phosphatase of intestinal origin coupled with antibodies.
- the monoclonal antibodies are preferably chosen from the group consisting of GB17 or GB25.
- the complementary labeled probe is preferably specific for the centrometric region of chromosome 18 or of the terminal band 21q22.3 of chromosome 21.
- the cells are fixed, after covalent immobilization on the solid support, by any appropriate means, in particular by treatment with paraformaldehyde.
- the invention therefore also relates to an ide soil support covalently functionalized by a spacer arm with a terminal function capable of reacting with functional groups present on the cell wall as just described above.
- the support is mineral in nature and is attached to the spacer arm by means of the silanol radicals of the support.
- the supports are glass slides used in microscopy.
- the slides are placed in a bath containing 12N HCL and ethanol (lv. 9v). After one hour of soaking at room temperature, the slides are rinsed with water and dried at 37 "C.
- This treatment has the effect of cleaning the slides and generating the silanol (Si-OH) on their surface.
- the slides After rinsing with distilled water, drying at 200 ° C., the slides are put to soak in toluene at reflux containing 5% amino or thiosilane and maintained at reflux for 16 h. For this step, preferably using aminopropyl triethoxysilane The slides are rinsed successively with toluene and ethanol, then dried before storage. The slides can be used immediately or dried and stored in the absence of dust.
- silanized slides are rinsed in 100 mM sodium phosphate buffer, 50 mM NaCl, pH 6.8 (coupling buffer).
- GMBS n-hydroxysuccinimide ester of ⁇ -maleimido butyric acid
- the microscope slides are covered with 200 ⁇ l of this solution, with a coverslip, and incubated for 2 hours at room temperature in a humid chamber.
- the slides are washed with coupling buffer (2 baths of 10 minutes at room temperature).
- the microscope slides are then immediately used as a support to fix the cells.
- a blood sample is taken from the peripheral venous circulation of a pregnant woman at 9 weeks gestation.
- the erythrocytes are separated and the fraction enriched in leukocytes is washed intensively in order to remove the major part of the contaminating proteins originating from the blood.
- the cells are suspended in PBS (34 mM NaCl 1, 2.6 mM K.C1, 6.4 mM Na 2 HP0 4 6.4 mM, KH 2 P0 4 1, 46 mM), at a concentration of 1.5 to 2.5
- PBS 34 mM NaCl 1, 2.6 mM K.C1, 6.4 mM Na 2 HP0 4 6.4 mM, KH 2 P0 4 1, 46 mM
- This suspension (200 ⁇ l) is spread on a slide using a pipetman tip and stored in a humid chamber at room temperature for 1 hour to allow the cells to sediment and form thioether bonds with GMBS.
- the slides are finally rinsed with PBS protein to block the maleimyl groups which would not have reacted and to eliminate the cells which are not covalently linked.
- the surface density of the cells is of the order of 2500 cells / mm 2 .
- the cells covalently bound to the support are rinsed with PBS (NaCl 134 mM, KC1 2.6 mM, Na 2 HP ⁇ 4 6.4 mM, H 2 FO 4 1, 46 mM) and then fixed in incubating them for 17 min at 20 ° C in paraformaldehyde (PFA) in 2% solution in PBS.
- PFA paraformaldehyde
- the slides are rinsed in PBS and the residual PFA is neutralized by a bath of 15 min at 20 ° C in NH 4 CI in solution at 50 mM in PBS
- the cells are permeabilized with Triton X100 (0.1% in PBS; 4 min incubation at 4 ° C).
- the cells are then incubated for 16 h at 4 "C with the following antibodies: - GB 17 (syncytiotrophoblasts)
- the cells are incubated (1 h at room temperature with polyclonal goat anti-mouse immunoglobulin antibodies conjugated with alkaline phosphatase.
- the immunoenzymatic complexes are revealed by using fast red alkaline phosphatase as a substrate brought into solution in 100 mM Tris / HCl buffer pH 8.2 containing an inhibitor of endogenous alkaline phosphalase (preferably levamisole at a concentration of 5 mM is used)
- the hydrolysis of the phosphates is continued for 20 min at 20 ° C.
- the cells After having rinsed them with PBS, the cells are posi-fixed with PFA under the same conditions as those described above. The cells are then incubated at 50 ° C. for 3 successive baths of buffer 2 SSC (0.3 M NaCl, 0.06 M sodium citrate pH 7.2). Containing 0.05% Tween 20 before undergoing a progressive dehydration in successive baths, of 70, 80 and 100% ethanol, the cellular DNA is then denatured by incubating the slides for 8 min at 70 ° C. in 2 SSC buffer containing 70% of formamide. then dehydrated with ethanol as described above.
- buffer 2 SSC 0.3 M NaCl, 0.06 M sodium citrate pH 7.2
- chromosome probes (chromosome Y: DYZI / DYZ3 biotinylated; chromosome X: DXZ1, digoxigeninylated) are denatured at 70 "C (10 min incubation) and stored at 4" C before being deposited (separately or in combination ) on the cells between slides and strips sealed with latex.
- Hybridization of the probes to cellular DNA is continued for 16 h at 37 ° C. After rinsing the slides by 3 successive baths in buffer
- the probes (preferably used in biotinylated and digoxigeninylated form), hybridized with cellular DNA are revealed respectively with avidin and anti-digoxigenin antibodies conjugated to fluorochromes (eg fluorescein).
- fluorochromes eg fluorescein
- the cells are finally rinsed, covered with a mounting medium containing DAPI (0.3 ⁇ g / ml) to counter-color the nuclei and a coverslip, then examined by fluorescence microscopy.
- DAPI 0.3 ⁇ g / ml
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Abstract
La présente invention concerne une méthode d'identification d'une ou plusieurs caractéristiques de cellules eucaryotes, notamment de mammifères, caractérisée en ce que l'on immobilise de façon covalente une couche substantiellement monocellulaire d'une population de cellules eucaryotes sur un support solide fonctionnalisé et en ce que l'on soumet la couche de cellules immobilisées à une réaction permettant de déterminer une caractéristique cytologique et/ou cytogénétique desdites cellules et en ce que l'on évalue le résultat. L'invention concerne également un support solide fonctionnalisé par un bras espaceur à fonction terminale susceptible de réagir avec des groupements fonctionnels présents sur la paroi cellulaire. Application au diagnostic des cellules foetales anormales.
Description
METHODE D'IDENTIFICATION DE C ELLULES EUCARYOTES PAR FIXATION DESDITES CELLULES SUR UN SUPPORT ET SUPPORT POU R METTRE EN OEUVRE LADITE METHODE
La présente invention concerne une méthode d'identification de cellules eucaryotes, notamment de mammifères, par simple ou double marquage (cytologique et/ou cytogénétique).
La présente invention est applicable ù la détermination de caractéristiques permettant d'identifier un type particulier de cellules présentes éventuellement dans une population hétérogène, par exemple par réaction immunologique (certaines cellules métastatiques, cellules leucocytaires résiduelles lors d'allogreffes etc.).
Elle est également applicable à la détermination d'une caractéristique génétique de cellules d'un sujet particulier (par exemple sujet porteur du gène de la mucoviscidose, du sida, etc.). La présente invention concerne particulièrement une méthode d'identification d'une caractéristique génétique d'une cellule eucaryote, notamment de mammifères, en particulier une cellule foetale, à partir d'une population hétérogène de cellules eucaryotes.
Elle concerne également un support solide fonctionnalisé destiné notamment à la mise en oeuvre desdites méthodes.
En ce qui concerne les cellules foetales, de nombreux désordres génétiques affectant le foetus sont désormais détectables in utero. Certains de ces désordres ont des conséquences extrêmement graves qui pourraient rendre désirable pour les parents l'arrêt de la grossesse. Les prélèvements de cellules foetales sont maintenant couramment effectués chez les femmes enceintes dites à risque, c'est-à-dire ayant plus de 38 ans ou appartenant à une famille ayant des antécédents d'anomalies génétiques.
Une étude du patrimoine génétique du foetus peut alors être réalisée sur ces cellules et éventuellement permettre de mettre en évidence des trisomies, des translocations ou autres anomalies chromosomiques.
Les techniques de prélèvements des cellules foetales utilisées actuellement sont invasives et présentent des risques importants d'avortement spontané. En effet, elles nécessitent de perforer les membranes foetales ou placentaires. C'est le cas notamment de l'amniocentèse, de la choriocentèse ou de la cordocentèse.
En outre, bien que l'amniocentèse soit réputée présenter peu de risques de complication, elle ne peut être effectuée qu'après la 1 7ème
semaines d'aménorrhée, soit au second trimestre de grossesse.
Or, il est maintenant clairement établi qu'au cours de la grossesse différents types de cellules foetales telles que les cellules trophoblastiques DU les leucocytes ou les érythroblastes peuvent passer du placenta vers la circulation sanguine périphérique de la mère dès la 6ème semaine.
Il serait donc hautement souhaitable de pouvoir isoler les cellules foetales à partir du sang maternel prélevé par simple prise de sang (ce qui représente une technique non invasive de prélèvement de cellules foetales ne présentant aucun risque d'avortement), pour établir un diagnostic génétique antenatal. Malheureusement, la population foetale circulante est présente avec un pourcentage inférieur à 1 pour 100 000 cellules nuclées dans le sang de la mère.
C'est pourquoi, on a déjà proposé de trier les cellules foetales au moyen d'outils de haute spécificité et de forte affinité, tels que les anticorps. De nombreux procédés d'enrichissement en cellules foetales d'un échantillon de sang ont donc été proposés.
La demande de brevet EP-A-412 700 décrit une préparation d'anticorps monoclonaux spécifiques des cellules cytotrophoblastiques du premier trimestre qui peuvent être utilisées dans les diagnostics prénataux (caryotype, identification des polymorphismes de longueur restreinte, liés à des maladies génétiques telles que les thalassémies, l'anémie falciforme, les diabètes insulino-dépendants et la maladie d'Huntington).
Le brevet US 5 432 054 décrit une méthode de séparation d'érythrocytes nuclées foetaux présents dans un échantillon de sang de femme enceinte.
On a également proposé dans la demande de brevet FR-A-2 682 481 un procédé d'obtention de cellules trophoblastiques d'un foetus permettant l 'isolement d'une fraction substantiellement pure en cell u les trophoblastiques, voire l'obtention d'un nombre suffisant de cellules trophoblastiques dûment isolées.
Le procédé selon cette demande prévoit une étape de préenrichissement en cellules trophoblastiques au moyen d'anticorps antileucocytaire commun marquant la majeure partie des leucocytes de la fraction leucocytaire permettant de séparer lesdits leucocytes. Les méthodes de diagnostic non invasives faisant appel à ces techniques présentent cependant certains inconvénients en ce qui concerne la précision des mesures et en définitive, le diagnostic que le praticien era amené à faire. On conviendra que dans ce domaine, seule une précision égale
à 100 % peut être acceptable.
On rappelera que ces méthodes de diagnostic antenatales non invasives font appel à des techniques de marquage permettant de repérer d'une part les cellules foetales et d'autre part les caractéristiques génétiques particulières qu'il s'agit d'identifier (technique du double marquage).
La demande de brevet WO-A-94/02646 concerne une méthode d'identification de cellules foetales par hybridation de l'acide nucléique des cellues foetales.
Les cellules foetales sont fixées sur un support solide par précipitation ou pontage. D'une part la précipitation implique un séchage, ce qui abime les cellules dans de nombreux cas. D'autre part, le pontage entre cellules (crosslinking) réduit l'efficacité de l'hybridation comme indiqué page 22, ligne 28 à page 23, ligne 3.
La demande de brevet EP-A-396 116 est relative à des microsphères fonctionnalisées reliées par un bras hétérobifonctionnel à une protéine.
La demande de brevet WO-A-94/02830 décrit également la fixation par adsorption de cellules (cytocentrifugation) comme indiqué page 9, lignes 15-17.
La demande de brevet WO-A-96/03632 décrit une méthode de détection de cellules qui sont mises en suspension.
La présente invention propose une nouvelle méthode d'identification de cellules allant à rencontre de celles précédemment décrites. Les inventeurs ont en effet mis en évidence que le problème en cause pouvait être résolu de façon satisfaisante sans qu'il soit nécessaire de purifier les cellules à identifier. Cette méthode, bien que particulièrement intéressante dans le cas du double marquage peut également être appliquée aux techniques d'identification par simple marquage.
C'est pourquoi, l'objet de la présente invention est en général de proposer une nouvelle méthode de diagnostic simple et fiable, permettant la détection d'une caractéristique d'une cellule eucaryote par simple ou double marquage, tout en évitant les différents inconvénients cités ci-dessus.
Un autre objet de la présente invention est de proposer une méthode de diagnostic antenatal non invasive qui procure des résultats nets avec un pourcentage de réussite proche de 100 %. Un autre objet de la présente invention est de proposer des supports solides permettant de mettre en oeuvre ladite méthode de diagnostic. L' invention concerne en premier lieu une mét hode d'identification d'au moins une caractéristique d'une cellule eucaryote,
notamment de mammifères, caractérisée en ce que l'on immobilise de façon covalente une couche substantiellement monocellulaire d'une population de cellules eucaryotes sur un support solide fonctionnalisé et en ce que l'on soumet la couche de cellules immobilisées, à une réaction permettant de déterminer une caractéristique cytologique et/ou cytogénétique et en ce que l'on évalue le résultat.
Avantageusement, le support est plan.
Pour éviter de purifier les cellules trophoblastiques, on aurait pu envisager d'adsorber l'échantillon de cellules, éventuellement triées, sur une lame de verre par exemple, afin de mettre en oeuvre les méthodes de diagnostic sur la couche de cellules obtenues.
Cependant, il est nécessaire dans ce cas de prévoir une étape de séchage afin d'immobiliser ces cellules sur la lame. En effet, sans cette étape de séchage, les cellules sont détachées par les différentes étapes de lavage, ce qui rend la méthode inopérante. Malheureusement, l'étape de séchage dans de nombreux cas, abime ces cellules.
La méthode de diagnostic selon l'invention assure une immobilisation des cellules sur un support solide plan tout en évitant les inconvénients décrits ci-dessus. Le support solide est de préférence de nature minérale (verre par exemple) bien que des supports organiques puissent également convenir.
Le support solide est fonctionnalisé par un bras espaceur à fonction terminale susceptible de réagir avec des groupements fonctionnels présents sur la paroi cellulaire. Les groupements présents sur la paroi cellulaire sont notamment les groupements thiol, carboxyle ou amino primaire situés sur la partie protéique. Ces groupements réagissent, après activation éventuelle, avec la fonction terminale appropriée de la chaîne.
Les groupements peuvent également être présents sur la partie sucre associée aux protéines, tels que les groupements hydroxyle, transformés de manière connue en groupements aldéhyde réactifs.
Les fonctions terminales réactives permettront d'assurer une liaison covalente avec lesdits groupements réactifs dans des conditions appropriées : - lorsque le groupement fonctionnel est un groupement thiol ou un pont disulfure (ce dernier sera préalablement réduit), la fonction terminale est un radical maléimido, iodoacétyle, dithio-pyridyle ; lorsque le groupement fonctionnel est un groupement amino
primaire, la fonction terminale est un radical aldéhyde, carboxylate activé, N-hydroxysuccinimide, α-dibromo ;
- lorsque le groupement fonctionnel est un groupement carboxylate activé (notamment avec des carbodiimides), la fonction terminale est une aminé primaire ou secondaire ;
- lorsque le groupement fonctionnel est un groupement hydroxyle, la fonction terminale est un radical hydroxysuccinimidc, carboxylate activé ;
- lorsque le groupement fonctionnel est l'arginine, la fonction terminale est le glyoxal.
Selon une variante préférée, le groupement fonctionnel est un groupement thiol et la fonction terminale est un radical maléimido.
De préférence le support solide est de nature minérale, par exemple le verre, et le bras espaceur est attaché à l'extrémité opposée à ladite fonction terminale par l'intermédiaire des fonctions silanols du support solide.
La liaison covalente entre le verre et le bras espaceur est assurée notamment par la réaction d'un groupement Si(ORι)- avec un radical silanol du verre d'une manière connue, OR-i étant un groupement susceptible d'être hydrolyse.
De préférence R1 est un radical (C pCf alkyle et avantageusement
(CrC ) alkyle.
De préférence, le bras espaceur est constitué par une chaî ne divalente terminée à ses extrémités d'une pari par la fonction terminale et d'autre part par Si(ORι)3.
La chaîne divalente est avantageusement hydrocarbonée comportant éventuellement un ou plusieurs hétéroatomes, éventuellement ramifiés, éventuellement insaturés. Elle ne présente essentiellement pas d'affinité vis-à-vis du support dans une variante selon l'invention. Cela permet de limiter les interactions non spécifiques avec le support.
Le bras espaceur comprendra avantageusement 8 à 30 atomes et répondra à la formule :
- Si - R2 - fonction terminale
R2 étant une chaîne hydrocarbonée de 8 à 30 atomes comportant éventuellement un ou plusieurs hétéroatomes, éventuellement ramifiée, éventuellement insaturée.
De préférence, le bras espaceur répond à la formule :
-Si - (CH2)n - N - C - (CHz)m - N > J.l i I I
H O o n, m indépendamment l'un de l'autre étant un nombre entier positif inférieur ou égal à 10, de préférence inférieur ou égal à 5. Avantageusement :
O
-Si- CH2CH2CH2- N-C-CH2Œ2 CH2 - N I 1 1 \
H O
Un procédé pour fonctionnaliser le support solide consiste à le silaniser à l'aide d'un oméga-aminoalkyltrialcoxy silane de formule
(CH2)n-NH2, Ri étant un radical alkyle de C x à C8, préférentiellement C*. à C , puis à faire réagir le support greffé obtenu avec une chaîne divalente munie à une extrémité d'une fonction réactive vis-à-vis du radical amino et à l'autre extrémité d'une fonction réactive ( fonction terminale) vis-à-vis du groupement fonctionnel présent sur la cellule.
De préférence, le support solide est fonctionnalisé par silanisation à l'aide de 3-aminopropyltrialcoxy silane puis réaction subséquente avec l'ester N-hydroxysuccinimide de l'acide γ -maléimido butyrique. Le support solide fonctionnalisé ainsi obtenu est lavé avec un tampon de couplage adapté à la réaction considérée.
Selon une variante, la méthode dite de simple marquage est caractérisée en ce que la population de cellules eucaryotes est choisie dans le groupe constitué par : - la population de cellules susceptibles de comprendre des cellules métastatiques,
- la population de cellules issues de préparation de moelle osseuse lors d'allogreffes susceptible de contenir des cellules leucocytaires résiduelles, - la population de cellules susceptible de contenir des bactéries circulantes, et en ce qu'on marque les cellules à identifier avec un marqueur spécifique
desdites cellules à identifier.
Selon une variante, la méthode dite de simple marquage est caractérisée en ce que la population de cellules eucaryotes est choisie dans le groupe constitué par : - la population de cellules suceptibles de contenir des cellules ayant une caractéristique génétique anormale, et en ce que l'on soumet la couche de cellules immobilisées à une réaction cytogénétique permettant de révéler la caractéristique génétique à identifier. Selon une autre variante, la méthode d'identification de double marquage est caractérisée en ce qu'un échantillon de cellules prélevées sur un individu est soumis aux réactions suivantes : a) on immobilise de façon covalente les cellules eucaryotes sur un support fonctionnalisé, b) on perméabilise éventuellement les cellules immobilisées, c) on marque les cellules à identifier avec un marqueur spécifique desdites cellules à identifier, d) on soumet la couche de cellules immobilisées à une réaction cytogénétique permettant de révéler la caractérististique génétique à identifier, e) on évalue le résultat.
Il est souhaitable, afin d'enrichir l'échantillon en cellules à détecter, d'effectuer préalablement à l'étape a) un tri cellulaire dudit échantillon pour obtenir une fraction enrichie en cellules eucaryotes à identifier. Dans le cas d'un échantillon sanguin, les cellules anuclées représentent plus de 99 % des cellules sanguines circulantes, et bloquent la fixation des cellules nuclées sur le support activé.
Dans le cas des cellules foetales, cette opération est d'autant plus nécessaire que la population foetale circulante est présente avec un pourcentage inférieur à 1 pour 100 000 cellules nuclées dans le sang de la mère.
Cette élimination peut être effectuée de manière connue par tri négatif, notamment par centrifugation sur gradient de densité, par exemple selon la méthode FICOLL® dans le cas des cellules sanguines. On rappelera que le FICOLL® est un polymère de saccharose dont l'utilisation pour purifier des cellules mononuclées sanguines est parfaitement normalisé. Des solutions de FICOLL®, de densités précalibrées, sont disponibles commercialement et s'emploient sous la forme de coussins, de gradients de densité discontinue ou
de gradients de densité continue, sur lesquels sont séparées les cellules sanguines.
Par ailleurs, les cellules sont de préférence lavées intensivement afin d'éliminer la majeure partie des protéines contaminantes provenant du milieu dans lequel elles se trouvaient initialement, le sang notamment.
Les cellules sont mises en suspension dans du tampon de couplage à une concentration qui, usuellement, varie entre 105 à 107 cellules/ml bien que cet intervalle ne soit pas critique, étalées sur le support fonctionnalisé et stockées en chambre humide à température appropriée, notamment ambiante, pendant une durée déterminée, une heure par exemple, pour permettre aux cellules de sédimenter et de former une liaison covalente avec- la fonction terminale du bras espaceur. Le support est alors rincé pour achever la fixation des cellules qui n'auraient pas encore réagi et éliminer les cellules qui ne sont pas liées de façon covalente. Après l'immobilisation covalente des cellules, il est avantageux de les fixer par exemple par traitement avec du paraformaldéhyde, lavage puis neutralisation des fonctions aldéhydiques résiduelles.
La perméabilisation, si nécessaire, est effectuée de manière connue, notamment par traitement avec du Triton X100( > par exemple. Cette perméabilisation est notamment utile dans le cas des motifs antigéniques intracellulaires.
Le marqueur spécifique est un anticorps substantiellement spécifique desdites cellules à identifier associé à une substance capable d'être repérée par un moyen approprié. Le marquage membranaire doit être compatible avec la méthode selon l'invention qui fait appel au double marquage.
On a constaté que les anticorps spécifiques qui portent directement des produits chromophores tels qu'un groupement chimique fluorescent (fluorescéine) ne convenaient pas dans le cadre de la présente invention car le signal fluorescent disparaissait après l'étape de dénaturation ultérieure nécessaire à l'hybridation. C'est le cas, notamment des anticorps anti-cellules trophoblastiques.
Par cellules "trophoblastiques" au sens de la présente invention, on entend toute cellule du trophoblaste, syncytiotrophoblaste ou cytotrophoblaste d'origine villeuse ou extravilleuse quel que soit son type, anuclée, mononuclée, polynuclée et quelle que soit l'époque de leur apparition dans le sang maternel par rapport à la durée de la gestation.
On a trouvé que le procédé de marquage au moyen de la
phosphatase alcaline permettait une identification satisfaisante des cellules. Cela nécessite une révélation subséquente de cette enzyme par un substrat approprié qui par réaction avec l'enzyme conduira à une visualisation.
Dans ce cas, ladite substance est un conjugué couplé à la phosphatase alcaline et on révèle le marqueur au moyen d'un substrat chromogène.
Par exemple, le substrat de révélation dénommé "Fast Red ", hydrolyse par la phosphatase alcaline (PA) donne un précipité insoluble rose-rouge visualisable avec un filtre dichroïque et en optique. Selon cette variante, l'anticorps spécifique est fixé sur les cellules puis on met en contact les cellules avec un anticorps anti-anticorps spécifique des cellules, couplé à la phosphatase alcaline.
Parmi les anticorps anti-cellules trophoblastiques retenus on utilisera avantageusement un anticorps du type GB 17, GB 25 développés par Aster Biotechnologies. Ces deux types d'anticorps présentent une spécificité stricte restreinte à ces seules cellules. Il est possible cependant d'envisager l'emploi d'un troisième anticorps, un anti-cyto ératine 18. Bien que non spécifique des trophoblastes, celui-ci a été développé contre les kératinocytes, il ne donne pas de réaction croisée avec les cellules sanguines. Les anticorps seront associés par un épitope à un anticorps spécifique des chaînes lourdes et légères desdits anticorps anti-cellules trophoblastiques, couplé à la phosphatase alcaline (GAM-PA).
Selon un mode de réalisation, une saturation des cellules est effectuée avec un tampon approprié. Après quoi, l'anticorps monoclonal spécifique est incubé à la concentration appropriée pendant une durée déterminée, une heure par exemple, en chambre humide et à température ambiante. Puis le deuxième anticorps, couplé à la phosphatase alcaline, et pouvant se conjuguer à un épitope de l'anticorps spécifique, est laissé en incubation dans des conditions similaires audit anticorps spécifique. Les techniques de lavage sont utilisées de manière connue au cours et après la procédure de marquage à la phosphatase par exemple avec le tampon TBS.
La révélation de l'enzyme phosphatase alcaline est effectuée par incubation des lames durant une durée de l'ordre de 30 minutes avec un tampon tel que le Tris dans lequel a été ajouté le substrat de révélation. De préférence, celui-ci contient le "Fast Red" qui hydrolyse par la phosphatase alcaline donne un précipité insoluble rose rouge visualisable avec un filtre dichroïque et en optique. Après l'incubation les lames sont lavées au TBS.
Selon un mode de réalisation préféré, la révélation avec le substrat chromogène est effectuée en présence d'un inhibiteur des phosphata.ses alcalines endogènes tel que le levamisole.
En effet, en absence d'un tel inhibiteur, un bruit de fond résiduel est observé en raison de la présence de phosphatases alcalines endogènes toujours actives.
A partir d'une concentration en levamisole de 5 mM, le bruit de fond est suffisamment diminué pour ne pas affecter l'intensité du signal positif. Il est souhaitable, de plus, de choisir un temps de révélation suffisamment court de l'ordre d'une dizaine de minutes usuellement entre 5 et 15 minutes. La dilution de l'anticorps couplé à la phosphatase alcaline doit être avantageusement comprise entre l/60ème et l/480ème afin d'obtenir un signal optimal. Néanmoins, cet intervalle varie selon les anticorps. La dilution optimale d'un anticorps de deuxième couche, conjugué à une enzyme (phosphatase alcaline ou autre), va dépendre de la concentration à laquelle il se trouve dans la solution mère. Cette dilution sera optimisée par des manipulations à la portée de l'homme du métier.
La technique d'hybridation in situ permet la détection rapide de défauts cytogénétiques. Cette technique utilise généralement une sonde fluorescente et est connue sous l'appellation FISH (en anglais : fluorescence in situ hybridization). Cette technique utilise des sondes spécifiques d'un chromosome associé à un marqueur pour permettre l'identification d'aberrations chromosomiques en nombre comme en structure.
On peut utiliser de façon générale un marquage chaud (radioactif) ou froid (enzyme ou radical biotinyle).
Cette méthode est utilisée avec succès pour le diagnostic des trisomies. Une méthode de diagnostic de la trisomie 18 a été utilisée avec- succès avec une sonde de séquences répétitives et spécifique de la région centromérique du chromosome 18. De même, les sondes ADN qui marquent spécifiquement la bande terminale 21 q 22.3 permet par hybridation in situ une détection rapide du nombre d'aberrations du chromosome 21 ainsi que de la structure de ces aberrations.
En général, l'hybridation in situ peut être appliquée directement aux cellules foetales isolées du sang maternel et sont disponibles pour les chromosomes 18, X et Y ainsi que pour les deux chromosomes 1 et 21.
Bien entendu, la méthode selon l'invention n'est pas limitée à l'application aux cellules foetales, notamment trophoblastiques circulant dans le sang maternel, mais s'étend au contraire à la détection d'autres
cellules eucaryotes, par exemple :
- recherche et identification de cellules métastiques non seulement dans le sang, mais également dans d'autres liquides physiologiques tels que la lymphe, - recherche de cellules leucocytaires résiduelles dans les préparations de moelle osseuse lors d'allogreffes,
- analyse fine d'anomalies génétiques ou détection de la présence d'ADN étranger par amplification génique ( PCR) in situ, sur cellules fixées (cette technique est actuellement difficilement réalisable sur lame en raison de la perte cellulaire importante qui se produit au cours du processus). Cette dernière application présente un intérêt primordial dans le dépistage précoce du sida chez des patients séronégatifs au stade de primo-infection ou chez des enfants nés de mères séropositives, et également dans l'exploration des séronégativations (disparition des anticorps alors que le processus infectieux est toujours présent).
Toujours dans le cadre de cette pathologie, le modèle pourrait être applicable au dépistage cellulaire et non plus sérologique, de l'antigène P24/P25 (dépistage immunologique de la protéine ou de son ARNMm par TR-
PCR), - recherche et identification de bactéries circulantes.
Toutes les techniques relatives à l'hybridation in situ peuvent être utilisées dans le cadre de la présente invention.
Il existe sur le marché des sondes qui sont directement couplées à des fluorochromes. Elles génèrent en général des signaux de faible intensité après hybridation. On leur préfère actuellement deux autres types de sondes :
- des sondes qui sont conjuguées à de la biotine ; la révélation est réalisée alors avec de l'avidine ou avec un anticorps antibiotine, conjugués à un fluorochrome (fluorescéine ou rhodamine).
- des sondes qui sont conjuguées à la digoxigénine et que l'on révèle après hybridation avec des anticorps anti-digoxigénine conjugués à un fluorochrome.
Cette méthode d'identification dite de double marquage trouve une application particulièrement avantageuse dans le cas de la détection d'anormalité chromosomique des cellules foetales et permet une détection de celles-ci dans les premiers mois de la grossesse avec une résolution particulièrement nette et un pourcentage de réussite très élevé approchant 100 %.
L'invention concerne donc en particulier une méthode de diagnostic antenatal comprenant les étapes suivantes : a) on prélève un échantillon de sang du système de circulation périphérique de la mère portant le foetus, b) on élimine les érythrocytes dudit échantillon par tri négatif, c) on immobilise de façon covalente la fraction leucocytaire sur le support solide fonctionnalisé précédemment décrit, d) on perméabilise éventuellement les cellules immobilisées, e) on marque les cellules à identifier avec un marqueur spécifique des cellules trophoblastiques, f) on soumet la couche de cellules immobilisées à une méthode d'analyse cytogénétique permettant de révéler la caractérististique génétique à identifier, g ) on évalue le résultat. Les différentes variantes décrites ci-dessus sont comprises dans la méthode de diagnostic antenatale indiquée. De préférence, l'étape f) consiste à mettre en contact la couche de cellules immobilisées avec une sonde marquée complémentaire spécifique de la caractéristique génétique à identifier. De préférence, le marqueur spécifique est un anticorps monoclonal associé à une substance couplée à la phosphatase alcaline.
Lors de la révélation, il est avantageux de mettre la fraction leucocytaire immobilisée en présence d'un inhibiteur de phosphatase alcaline endogène tel que le levamisole à une concentration de préférence comprise entre 1 et 5 mM.
Au-delà de 5 mM, le levamisole inhibe également la phosphatase alcaline d'origine intestinale couplée aux anticorps.
Il existe également un inhibiteur utilisé moins couramment, le tripeptide phénylalanine-glycine-glycine. Les anticorps monoclonaux sont de préférence choisis dans le groupe constitué par le GB17 ou le GB25.
La sonde marquée complémentaire est de préférence spécifique de la région centrométrique du chromosome 18 ou de la bande terminale 21q22.3 du chromosome 21. Selon une variante avantageuse, les cellules sont fixées, après immobilisation covalente sur le support solide, par tout moyen approprié, notamment par traitement avec du paraformaldéhyde.
L'invention concerne donc également un support sol ide fonctionnalisé de façon covalente par un bras espaceur à fonction terminale susceptible de réagir avec des groupements fonctionnels présents sur la paroi cellulaire tel qu'il vient d'être décrit précédemment. De préférence, le support est de nature minérale et est attaché au bras espaceur par l'intermédiaire des radicaux silanols du support.
Bien que toutes les variantes décrites précédemment sont comprises dans la définition du présent support fonctionnalisé, avantageusement le bras espaceur répond à la formule :
-Si- (CH2)n -
n, m indépendamment l'un de l'autre étant un nombre entier positif inférieur ou égal à 10, de préférence inférieur ou égal à 5, et de préférence :
-Si - CH2CH2CH2 -
MODE OPERATOIRE
Préparation du support fonctionnalisé
Les supports sont des lames de verre utilisées cn microscopie.
Les lames sont placées dans un bain contenant de l'HCL 12N et de l'éthanol (lv. 9v). Après une heure de trempage à température ambiante, les lames sont rincées à l'eau et séchées à 37"C.
Ce traitement a pour effet de nettoyer les lames et de générer les silanol (Si-OH) sur leur surface.
Après rinçage à l'eau distillée, séchage à 200"C, les lames sont mises à tremper dans du toluène à reflux contenant 5 % d'amino ou de thiosilane et maintenues à reflux pendant 16 h. Pour cette étape, on utilise préférentiellement de l'aminopropyl triethoxysilane. Les lames sont rincées successivement avec du toluène et de l'éthanol, puis séchées avant stockage. Les lames peuvent être utilisées immédiatement ou séchées et stockées à l'abri de la poussière.
Cette étape peut être évitée en utilisant des lames pré ilanisées disponibles commercialement.
Les lames silanisées sont rincées dans du tampon phosphate de sodium 100 mM, NaCl 50 mM, pH 6.8 (tampon de couplage).
Une solution de l'ester n-hydroxysuccinimide de l'acide γ- maleimido butyrique (GMBS)(200 mg/ml) est préparée extemporanémeni dans du N,N-diméthylformamide ou du DMSO puis diluée au 1 :30 dans du tampon de couplage.
Les lames de microscopes sont recouvertes de 200 μl de celte solution, d'une lamelle, et incubées pendant 2 heures à température ambiante en chambre humide. Les lames sont lavées avec du tampon de couplage (2 bains de 10 minutes à température ambiante).
Les lames de microscopes sont alors immédiatement utilisées comme support pour fixer les cellules.
Immobilisation covalente des cellules
Un échantillon de sang est prélevé sur la circulation veineuse périphérique d'une femme enceinte à 9 semaines d'aménorrhée.
Par tri négatif, les érythrocytes sont séparés et la fraction enrichie en leucocytes est lavée intensivement afin d'éliminer la majeure partie des protéines contaminantes provenant du sang.
Les cellules sont mises en suspension dans du PBS (NaCl 1 34 mM, K.C1 2,6 mM, Na2HP046,4 mM, KH2P04 1 ,46 mM), à une concentration de 1,5 à 2,5
106 cellules/ml. Cette suspension (200 μl) est étalée sur une lame à l'aide d'une pointe de pipetman et stockée en chambre humide à température ambiante pendant 1 heure pour permettre aux cellules de sédimenter et de former des liaisons thioether avec le GMBS.
Les lames sont finalement rincées avec du PBS protéine pour bloquer les groupements maléimyl qui n'auraient pas réagi et éliminer les cellules qui ne sont pas liées covalemment. La densité surfacique des cellules est de l'ordre de 2500 cellules/mm2.
Après élimination du tampon de couplage, les cellules liées covalemment au support sont rincées avec du PBS (NaCl 134 mM, KC1 2,6 mM, Na2HPθ4 6,4 mM, H2FO4 1 ,46 mM) puis fixées en les incubant pendant 17 min à 20°C dans du paraformaldéhyde (PFA) en solution à 2 % dans du PBS.
Les lames sont rincées dans du PBS et le PFA résiduel est neutralisé par un bain de 15 min à 20°C dans du NH4CI en solution à 50 mM dans du PBS
(PH 7.2).
Identification des cellules foetales
Après rinçage des lames dans du PBS (5min à 20"C), les cellules sont perméabilisées avec du Triton X100 (0, 1 % dans du PBS ; 4 min d'incubation à 4°C).
Après 3 lavages de 10 min à 20°C avec du tampon PBS, les lames sont saturées pendant 10 min à température ambiante avec du sérum de chèvre dilué à 10 % dans du tampon TBS (NaCl 136 mM, KC1 2,6 mM rouge de phénol 0,042 mM, Tris 25 mM pH 7,4).
Les cellules sont ensuite incubées pendant 16 h à 4"C avec les anticorps suivants : - GB 17 (syncytiotrophoblastes)
- GB 25 (syncytio+cytotophoblastes)
- anti-cytokératine 18 (syncytio + cytrotrophoblastes)
- anti-hémoglobine foetale (érythroblastes)
- anti-récepteur de la transferrine CD 71 (érythroblastes) utilisés seuls ou de préférence en combinaison en solution dans du tampon TBS contenant 10 % de sérum de chèvre.
Après lavage, les cellules sont incubées ( l h à température ambiante avec des anticorps polyclonaux de chèvre anti-immunoglobulines de souris conjugués à la phosphatase alcaline. Les complexes immunoenzymatiques sont révélés en utilisant comme substrat de la phosphatase alcaline du fast red amené en solution dans du tampon Tris/HCl 100 mM pH 8,2 contenant un inhibiteur des phosphalase alcalins endogènes (on utilise de préférence du levamisole à une concentration de 5 mM). L'hydrolyse des phosphates est poursuivie pendant 20 min à 20°C.
Détermination cytogénétique
Après les avoir rincées avec du PBS, les cellules sont posi-fixées avec du PFA dans les mêmes conditions que celles décrites précédemment.
Les cellules sont alors incubées à 50"C pendant 3 bains successifs de tampon 2 SSC (NaCl 0,3 M, citrate de sodium 0,06 M pH 7,2). contenant du Tween 20 à 0,05 % avant de subir une déshydratation progressive dans des bains successifs, d'éthanol à 70, 80 et 100 %. L'ADN cellulaire est ensuite dénaturé en incubant les lames pendant 8 min à 70°C dans du tampon 2 SSC contenant 70 % de formamide. Les lames sont ensuite déshydratées à l'éthanol comme décrit précédemment.
Parallèlement, les sondes chromosomiques (chromosome Y : DYZI/DYZ3 biotinylée ; chromosome X : DXZ1 , digoxigéninylées) sont dénaturées à 70"C ( 10 min d'incubation) et stockées à 4"C avant d'être déposées (séparément ou en combinaison) sur les cellules entre lames et lamelles scellées au latex.
L'hybridation des sondes à l'ADN cellulaire est poursuivie pendant 16 h à 37°C. Après rinçage des lames par 3 bains successifs dans du tampon
2SSC et saturation avec une solution protéinée ( 2 SSC contenant 1 % d'albumine bovine ou 5 % de lait écrémé en poudre), les sondes (utilisées de préférence sous forme biotinylées et digoxigéninylées), hybridées à l'ADN cellulaire sont révélées respectivement avec de l'avidine et des anticorps antidigoxigénine conjugués à des fluorochromes (par exemple de la fluorescéine).
Les cellules sont finalement rincées, recouvertes d'un milieu de montage contenant du DAPI (0,3 μg/ml) pour contrecolorer les noyaux et d'une lamelle, puis examinées en microscopie à fluorescence.
Claims
1. Méthode d'identification d'au moins une caractéristique d'une cellule eucaryote, notamment de mammifères, caractérisée en ce que l'on immobilise de façon covalente une couche substantiellement monocellulaire d'une population de cellules eucaryotes sur un support solide fonctionnalisé et en ce que l'on soumet la couche de cellules immobilisées, à une réaction permettant de déterminer une caractéristique cytologique et/ou cytogénétique et en ce que l'on évalue le résultat.
2. Méthode d'identification selon la revendication 1 , caractérisée en ce que les cellules sont immobilisées de façon covalente sur un support solide plan fonctionnalisé, de nature minérale.
3. Méthode d'identification selon la revendication 1 ou 2 , caractérisée en ce que le support solide est fonctionnalisé par un bras espaceur à fonction terminale susceptible de réagir avec des groupements fonctionnels présents sur la paroi cellulaire.
4. Méthode d'identification selon la revendication 3, caractérisée en ce que le support solide est en verre et le bras espaceur est attaché à l'extrémité opposée à ladite fonction terminale par les fonctions silanols du support solide.
5. Méthode d'identification selon la revendication 3, caractérisée en ce que :
- lorsque le groupement fonctionnel est un groupement thiol ou un pont disulfure (préalablement réduit), la fonction terminale est un radical maléimido, iodoacétyle, dithio-pyridyle. - lorsque le groupement fonctionnel est un groupement amino primaire, la fonction terminale est un radical aldéhyde, carboxylate activé, N-hydroxysuccinimide, α-dibromo,
- lorsque le groupement fonctionnel est un groupement carboxylate activé (notamment avec des carboiimides), la fonction terminale est une aminé primaire ou secondaire,
- lorsque le groupement fonctionnel est un groupemen t hydroxyle, la fonction terminale est un radical N-hydroxy succinimide, carboxylate activé,
- lorsque le groupement fonctionnel est l'arginine, la fonction terminale est le glyoxal.
6. Méthode d'identification selon la revendication 3, caractérisée en ce que le bras espaceur comporte une chaine divalente hydrocarbonée comprenant éventuellement un ou plusieurs hétéroatomes, éventuellement ramifiée, éventuellement insaturée.
7. Méthode d'identification selon la revendication 6, caractérisée en ce que le bras espaceur répond à la formule :
- Si - R2 - fonction terminale
R2 étant une chaîne hydrocarbonée de 8 à 30 atomes comportant éventuellement un ou plusieurs hétéroatomes, éventuellement ramifiée, éventuellement insaturée.
8. Méthode d'identification selon la revendication 7, caractérisée en ce que le bras espaceur répond à la formule :
O
-Si- (CH2)n - N - C - (CH2)m -
I t l
H O n, m indépendamment l'un de l'autre étant un nombre entier positif inférieur ou égal à 10.
9. Méthode d'identification selon la revendication 8, caractérisée en ce que le bras espaceur répond à la formule :
•Si- CH2CH2CH2- N-C-CH2CH2CH2 - N M
H O 0
10. Méthode d'identification selon l'une des revendications précédentes, caractérisée en ce que la population de cellules eucaryotes est choisie dans le groupe constitué par : - la population de cellules susceptibles de comprendre des cellules métastatiques,
- la population de cellules issues de préparation de moelle osseuse, lors d'allogreffes, susceptibles de contenir des cellules leucocytaires résiduelles, - la population de cellules susceptibles de contenir des solutions des bactéries circulantes, et en ce que l'on marque les cellules à identifier avec un marqueur spécifique desdites cellules à identifier.
11. Méthode d'identification selon l'une des revendications 1 à 9, caractérisée en ce que la population de cellules eucaryotes est choisie dans le groupe constitué par
- la population de cellules susceptibles de contenir des cellules ayant une caractéristique génétique anormale, et en ce que l'on soumet la couche de cellules fixées à une réaction cytogénétique permettant de révéler la caractéristique génétique à identifier.
12. Méthode d'identification selon l'une des revendications 1 à 9, d'une caractéristique génétique d'une cellule eucaryote, notamment de mammifères, à partir d'une population hétérogène de cellules eucaryotes, caractérisée en ce qu'un échantillon de cellules prélevées sur un individu est soumis aux réactions suivantes : a) on immobilise de façon covalente les cellules eucaryotes sur un support fonctionnalisé, b) on perméabilise éventuellement les cellules immobilisées, c) on marque les cellules à identifier avec un marqueur biologique spécifique desdites cellules à identifier, d) on soumet la couche de cellules immobilisées à une réaction cytogénétique permettant de révéler la caractérististique génétique à identifier, e) on évalue le résultat.
13. Méthode d'identification selon l'une des revendications 10 à 12, caractérisée en ce qu'avant l'étape a) on effectue un tri pour obtenir une fraction enrichie en cellules eucaryotes.
14. Méthode d'identification selon la revendication 10 ou 1 , caractérisée en ce que le marqueur spécifiq ue est un anticorps substantiellement spécifique desdites cellules à identifier, associé à une substance capable d'être repérée par un moyen approprié.
15. Méthode d'identification selon la revendication 1 4, caractérisée en ce que la substance est un conjugué couplé à la phosphatase alcaline et on révèle le marqueur au moyen d'un substrat chromogène.
16. Méthode d'identification selon l'une des revendications 10 à 12, caractérisée en ce que les cellules immobilisées de façon covalente au support sont fixées par un moyen approprié, notamment le paraformaldéhyde.
17. Méthode d'identification selon la revendication 1 6 , caractérisée en ce que la réaction cytogénétique consiste à mettre en contact la couche de cellules immobilisées et fixées avec une sonde marquée complémentaire spécifique de la caractéristique génétique à identifier.
18. Méthode d'identification selon la revendication 1 7, caractérisée en ce que la sonde est radio-active ou attachée à une enzyme ou à un radical biotinyle ou digoxigénine.
19. Méthode d'identification selon la revendication 1 2 , caractérisée en ce que les cellules à identifier sont choisies dans le groupe constitué par les cellules trophoblastiques.
20. Méthode d'identification selon l'une des revendications 12 à 19, caractérisée en ce qu'elle est appliquée au diagnostic antenatal et en ce qu'un échantillon de sang du système de circulation périphérique d'une femme enceinte, est soumis aux étapes suivantes : a) on élimine les érythrocytes dudit échantillon notamment par tri négatif, b) on immobilise de façon covalente la fraction leucocytaire sur le support solide fonctionnalisé selon les revendications 2 à 9, c) éventuellement on perméabilise les cellules, d) on marque les cellules à identifier avec un marqueur spécifique des cellules trophoblastiques, e) on soumet la couche de cellules immobilisées à une méthode d'analyse cytogénétique permettant de révéler la caractérististique génétique à identifier, f ) on évalue le résultat.
21. Méthode d'identification selon la revendication 20, caractérisée en ce que le marqueur spécifique est un anticorps monoclonal.
22. Méthode d'identification selon la revendication 20 ou 1 , caractérisée en ce que le marqueur spécifique est associé à une substance capable d'être repérée par un moyen approprié, notamment un conjugué couplé à la phosphatase alcaline.
23. Méthode d'identification selon la revendication 2 2 , caractérisée en ce qu'on met en présence la fraction leucocytaire avec un inhibiteur de phosphatase alcaline endogène, lors de la révélation au moyen du substrat chromogène.
24. Méthode d'identification selon la revendication 23 , caractérisée en ce que l'inhibiteur de phosphatase alcaline endogène est le levamisole.
25. Méthode d'identification selon la revendication 23 ou 24, caractérisée en ce que la concentration en inhibiteur de phosphatase alcaline endogène est comprise entre 1 et 5 mM.
26. Méthode d'identification selon la revendication 2 1 , caractérisée en ce que l'anticorps monoclonal est choisi dans le groupe constitué par le GB17, GB25 ou un anti-cytokératine 18.
27. Méthode d'identification selon la revendication 20 ,
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