TWI544930B - Ｎ端修飾之干擾素－α - Google Patents

Description

N端修飾之干擾素-α 相關申請案段落之交叉參照

本申請案主張美國臨時申請案第60/976,696號(2007年10月1日申請)之權益。其內容於此以其全體併入作為參考。

本發明係關於一種降低成熟IFN-α之非天然性雙硫鍵之形成之方法以及經如此修飾之IFN-α。

干擾素(IFNs)，包括IFN-α、IFN-β及IFN-γ，係由免疫細胞因反應來物(如，致病原)或異常之自體物(如，癌細胞)所產生之天然蛋白質。干擾素已被廣泛用於治療病毒感染及癌症。

成熟之人類IFN-α-2b(hIFN-α2b)及其在其他生物種中之對應物具有兩個天然存在之雙硫鍵，該等雙硫鏈對於其醫療應用而言非常重要。在hIFN-α2b中，該兩個雙硫鍵分別形成於Cys₁ -Cys₉₈ 及Cys₂₉ -Cys₁₃₈ 之間。前者係蛋白質活性所必須者。另一方面，後者之喪失會致使該蛋白具免疫原性。

hIFN-α2b常藉由在大腸桿菌(E. coli)中表現其編碼的cDNA而製備。咸已發現，如此製備之蛋白質含有大量之結構異構物，包括寡聚物及緩慢單體，兩者在非還原條件下之SDS-聚丙烯醯胺凝膠電泳中，移動皆較其天然之對應物緩慢。此等由非天然性分子間或分子內之雙硫鍵之形成所造成之異構物，因其無活性或具免疫原性，故不具有治療價值。因此高度需要發展製備具有極少異構物污染之IFN-α蛋白之新穎技術。

本發明係基於非預期的發現，在成熟hIFN-α2b之N端半胱胺酸(Cys₁ )添加胺基酸殘基可減少非天然性雙硫鍵之形成，因而顯著地降低其結構異構物之含量。

在一態樣中，本發明之特徵為一種經分離之多肽，包括第一片段，其具有1至5個(如，1、2及3個)胺基酸殘基，以及第二片段，其N端部分係具有Cys₁ 之成熟IFN-α(如，成熟hIFN-α2b)。該第一片段經由肽鍵而連結至該成熟IFN-α之Cys₁ 。在一實例中，該第一片段係單一胺基酸，如，脯胺酸。應注意者，當該第一片段係單一胺基酸時，其不為甲硫胺酸。此種多肽可用以治療疾病，諸如，病毒感染及癌症。

在另一態樣中，本發明之特徵為一種核酸，包括編碼上述多肽之核苷酸序列。

本發明之範圍中亦包括一種降低成熟IFN-α之非天然性雙硫鍵之形成之方法，其係藉由將1至5個胺基酸殘基添加至該成熟IFN-α之Cys₁ 而進行。舉例而言，在hIFN-α2b中之降低的非天然性雙硫鍵之形成係藉著將一個脯胺酸殘基添加至其Cys₁ 而達成。

本發明之其他特徵或優點將可由下列之圖式及數種具體實例之詳述以及附呈之申請專利範圍而清楚呈現。

本發明之目標在於降低成熟IFN-α之非天然性雙硫鍵之形成，其係藉由將1至5個胺基酸殘基添加至該成熟IFN-α之Cys₁ 而達成。

因此，本發明提供一種經分離之多肽，其包括兩個片段：第一片段係由最多五個胺基酸殘基所構成，以及第二片段係在其N端部分包括成熟IFN-α。該第一片段係經由肽鍵而連結至該成熟IFN-α之Cys₁ 。在成熟形式中具有Cys₁ 之IFN-α蛋白質可藉著搜尋蛋白資料庫(如，GenBank資料庫)而予以辨識。此等IFN-α蛋白質之實例包括人類IFN-α2b(GenBank登錄號AAP20099；亦參見圖1)、豬IFN-α(GenBank登錄號BAE93462)、狗IFN-α(GenBank登錄號BAE92736)及牛IFN-α(GenBank登錄號AAP87280)。

前述第一片段可為單一胺基酸，如，脯胺酸。然而，此單一胺基酸殘基不可為甲硫胺酸，因其會在細胞中予以移除。該第一片段亦可為具有2至5個胺基酸殘基之肽，其序列並不重要。

前上述分離之多肽可使用重組技術予以製備。以下為一種實例。可由技藝中已知之方法分離一編碼IFN-α之基因。參見，如，Sambrook等人,Molecular Cloning:A Laboratory Manual 第二版，Cold Spring Harbor,N.Y.,1989。此基因接著藉由將編碼上述片段之核苷酸序列直接添加至編碼該IFN-α之Cys₁ 之基因密碼子而予以修飾。此一修飾作用可藉由，如，聚合物酶連鎖反應(PCR)而達成。該經修飾之基因(其編碼N端經修飾之IFN-α)接著可在大腸桿菌、酵母菌、昆蟲或哺乳動物細胞中表現。

該分離之多肽亦可藉由合成方法或是合成方法結合重組方法製備。在一實例中，前述第一片段係藉由合成方法而添加至從宿主細胞表現及純化之成熟IFN-α之N端。

吾人可將該分離之多肽與醫藥可接受性之載體共同調配，以形成醫藥組合物。醫藥可接受性或體係指可與該組合物之活性成分相容(且較佳者，可安定該活性成分)且不會對該待治療之對象有害之載體。適當之載體包括微晶纖維素、甘露糖醇、葡萄糖、脫脂奶粉、聚乙烯吡咯啶酮及澱粉或其組合。此種組合物可以各種不同之形式呈現，諸如，錠劑、膠囊、粉末或液體。

含有該分離之多肽之組合物可經由適當途徑而投藥至一對象，如，靜脈注射或皮下注射，每天一或多次或是數天一次。無菌的可注射性組合物可為一在非毒性腸外可接受性稀釋劑或溶劑中之溶液或懸浮液，諸如，在1,3-丁二醇中之溶液。可用之可接受性載劑或溶劑包括甘露糖醇、水、林格氏(Ringer)溶液以及等滲氯化鈉溶液。此外，非揮發性油係習知地作為溶劑或懸浮基質(如，合成性之單甘油酯或二甘油酯)。脂肪酸(諸如，油酸及其甘油酯衍生物)可用於製備可注射物，而天然之醫藥可接受性油類(諸如，橄欖油或蓖麻油)亦然，特別係其聚氧乙烯化之形式。此等油溶液或懸浮液亦可含有長鏈醇稀釋劑或分散劑、羧甲基纖維素或類似之分散劑。其他常用之界面活性劑(諸如，Tweens或Spans)或其他類似之乳化劑或生物利用率增進劑(其常用於製造醫藥可接受性固體、液體或其他劑型)亦可因調配之目的而使用。

在不須進一步詳盡闡述之情形下，咸信上文之敘述已適當使本發明可據以實施。因此，下述之實例僅被視為說明，且不以任何方式限制本揭示內容之其他部分。所有本文所引述之出版物在此以其全文併入本文作為參考。

實例1：重組hIFN-α2b及N端經修飾之hIFN-α2b(Pro-hIFN-α2b)之製備

使用人類基因組DNA作為模板，以PCR擴增編碼hIFN-α2b之第一核酸。參見圖1。PCR引子此係根據hIFN-α2b基因(GenBank登錄號NM_000605)之編碼區域之兩側序列設計而得。將如此取得之PCR產物選殖進入pGEM-T載體(Promega)，接著再次選殖進入蛋白表現載體pET-24a(Novagen)。

使用根據圖2所示之核酸序列而設計之引子，經由PCR擴增而修飾前述第一核酸，進而獲得編碼Pro-hIFN-α2b之第二核酸。簡言之，將兩個額外之密碼子ATG及CCG(分別編碼Met及Pro)添加至編碼成熟hIFN-α2b之Cys₁ 之密碼子TGT之5'端。亦將該核酸選殖進入表現載體pET-24a。

將著使帶有hIFN-α2b及Pro-hIFN-α2b基因之pET-24a載體轉形至大腸桿菌(E .coli )BLR-CodonPlus(DE3)-RIL菌株(Novagene)中。選擇表現高含量之此兩種蛋白質之大腸桿菌純系(clones)。如所設計者，由該Pro-hIFN-α2b基因表現之初生蛋白質在其N端具有Met(Met-Pro-Cys--)。此Met殘基在大腸桿菌中會經由內部之酶消化作用而移除，造成具有連結於hIFN-α2b之Cys₁ 之N端Pro之成熟蛋白質(Pro-Cys--)。

將表現hIFN-α2b或Pro-hIFN-α2b之大腸桿菌純系，培養於含有具卡那黴素(karamycin)(50μg/mL)及氯黴素(50μg/mL)之250ml SYN Broth培養液(大豆腖、酵母萃取物及NaCl)之1000ml培養瓶中，在37℃、200rpm下培養16小時。接著將220ml之隔夜培養物移至5升發酵缸(Bioflo 3000;New Brunswick Scientific Co.,Edison,NJ)中，其含有具卡那黴素(25μg/mL)、氯黴素(25μg/mL)、0.4%甘油及0.5%(v/v)微量元素(10g/L之FeSO₄ ‧7H₂ O、2.25g/L之ZnSO₄ ‧7H₂ O、1g/L之CuSO₄ ‧5H₂ O、0.5g/L之MnSO₄ ‧H₂ O、0.3g/L之H₃ BO₃ 、2g/L之CaCl₂ ‧2H₂ O、0.1g/L之(NH₄ )₆ Mo₇ O₂₄ 、0.84g/L EDTA及50ml/LHCl)之3L限定培養液(10g/L葡萄糖、0.7g/LMgSO₄ ‧7H₂ O、4g/L(NH₄ )₂ HPO₄ 、3g/LKH₂ PO₄ 、6g/LK₂ HPO₄ 、1.7g/L檸檬酸鹽、10g/L酵母萃取物、10ml/L微量元素及2g/L異白胺酸)。將該培養液中之氧濃度控制在35%，並藉著在需要時添加37%氨水而使其pH維持在7.1。製備含有800g/L之葡萄糖及20g/L之MgSO₄ ‧7H₂ O之餵養溶液(feeding solution)。當溶氧上升至大於設定點之值時，加入適當體積之餵養溶液以增加培養基中之葡萄糖濃度。以終濃度0.7mM之IPTG誘發hIFN-α2b及Pro-hIFN-α2b基因之表現，接著加入餵養物質(酵母萃取物及微量元素)。在IPTG誘發後五小時收集表現此等蛋白質之大腸桿菌細胞。

將該等經收集之大腸桿菌細胞以1:10(淨重g/mL)之比例再以懸浮於TEN緩衝液(50mM TrisHCl，pH 7.0；1mM EDTA及100mM NaCl)中，以勻質機予以破壞，接著以10,000rpm離心20分鐘。以TEN緩衝液清洗含有包涵體(IBs)之沈澱物兩次，然後依前述方式予以離心，再使其以1ml溶液：2.5g沈澱物淨重g/mL之比例懸浮於4M胍HCl(GnHCl)水溶液中，然後以20,000rpm離心20分鐘。接著，將含有重組hIFN-α2b之IBs溶解於50mL之具5mM DTT之6M GuHCl中，接著在室溫下攪拌1.5小時，再於25℃下以20,000rpm離心20分鐘。收集上清液。在此過程中，該等重組hIFN-α2b或Pro-hIFN-α2b蛋白質係受到變性。

實例2：hIFN-α2b及Pro-hIFN-α2b之再褶疊

將前述IBs與1.5L新鮮製備之再褶疊緩衝液(100mM Tris-HCl(pH 7.0)，0.5ML-精胺酸，2mM EDTA)混合。使如此形成之反應混合物在室溫下反應24至36小時(不予攪拌)，以容許該等重組hIFN-α2b及Pro-hIFN-α2b蛋白質之再褶疊。接著，使該等經再摺疊之蛋白質對20mM Tris-HCl緩衝液(pH 7.0)進行透析，並以下述之Q-瓊脂糖管柱層析予以進一步純化。

以20mM Tris-HCl緩衝液(pH 7.0)預先平衡及清洗Q-瓊脂糖管柱(GE Healthcare,Pittsburgh,PA)。接著，將該等經再摺疊之重組蛋白質加樣至經平衡的Q-瓊脂糖管柱上，並以含80mM NaCl之20mM Tris-HCl緩衝液(pH 7.0)進行溶析。基於280nm之吸收值收集含Pro-hIFN-α2b之組份。使用Bradford法之蛋白分析套組(Pierce,Rockford,IL)測定此等蛋白質之濃度。

使用C18反相HPLC(RP-HPLC)測定該等經再摺疊之重組蛋白質之構形，其中天然形成之蛋白質及緩慢單體可予以分離(由圖3及4中所示之不同峰表示)。該RP-HPLC係在配備自動梯度控制器、兩個緩衝液泵、UV偵測器以及記錄積分器之Angilent HPLC系統上進行。以80%緩衝液A(0.2%(v/v)TFA於30:70之乙腈：水(HPLC級))平衡C18 HPLC管柱(46mm x 250mm，5μm顆粒大小；300孔徑大小)。根據下列之梯度，以1ml/min之流速，使用緩衝液B(0.2% TFA於80:20之乙腈：水中)，自該C18 HPLC管柱溶析蛋白質。

由該C18 HPLC分析之結果指出，大量之該等經再摺疊之重組hIFN-α2b蛋白質係緩慢單體(圖3中之右峰)。不同的是，在經再摺疊之重組Pro-hIFN-α2b蛋白質中，僅有極少量之緩慢單體之污染，參見圖4之峰B。

實例3：天然hIFN-α2b及hIFN-α2b異構物之分離

依前述方式，以Q-瓊脂糖管柱層析純化hIFN-α2b。根據美國專利第4,534,906號所述方法，除去該等經純化蛋白質中所含之hIFN-α2b異構物，包括寡聚物及緩慢單體。簡言之，將該等蛋白質與ASP緩衝液(3M硫酸銨及1M NaOAc)混合至終濃度為0.9M硫酸銨及20mM NaOAc，pH值為4.5。將該混合物置於室溫下(如，34至40℃)反應20分鐘，以形成蛋白質沈澱物，其中包括緩慢單體及寡聚物。以離心方式除去該等沈澱物，再收集含有天然形式之hIFN-α2b之上清液。以C18反相HPLC分析經硫酸銨/氯化鈉處理前及處理後之蛋白質樣本，而如此取得之結果係示於圖5。以Q-瓊脂糖管柱純化製備之hIFN-α2b蛋白包括大量之異構物。參見圖5之上方部分之右峰。此等異構物在硫酸銨/氯化鈉之處理後已被移除。

其他具體實例

所有揭示於此說明書中之特徵可以任何組合而進行組合。各個揭示於此說明書中之特徵可以另一為了相同、相當、或類似目的之替代特徵取代。因此，除非明確聲明為其他，各個經揭示之特徵僅係一概述系列之相當或類似特徵之實例。由上文之敘述，熟習技藝者可輕易確認本發明之必要特徵，且在不偏離本發明精神及範圍之情形下，熟習技藝者可實施本發明之各種不同變化及修飾，以使其適應各種用途及條件。因此，其他具體實例亦涵括於下述申請專利範圍之範圍中。

圖1顯示hIFN-α2b之胺基酸序列及其編碼之核酸序列。

圖2顯示經修飾之成熟hIFN-α2b(Pro-hIFN-α2b)之胺基酸序列及其編碼之核酸序列。

圖3係顯示不同時間點下成熟hIFN-α2b之再摺疊之高效液相層析(「HPLC」)圖。右峰：hIFN-α2b之緩慢單體。左峰：天然形式之hIFN-α2b。

圖4係顯示不同時間點下Pro-IFN-α2b之再摺疊之HPLC圖。峰A：未摺疊之Pro-IFN-α2b。峰B：Pro-IFN-α2b之緩慢單體。峰C：天然形式之Pro-IFN-α2b。

圖5係顯示經硫酸銨/氯化鈉處理前及處理後之hIFN-α2b之天然及結構異構物之HPLC圖。峰A：hIFN-α2b之緩慢單體。峰B：天然形式之hIFN-α2

<110> 藥華醫藥股份有限公司

<120> N端修飾之干擾素-α

<170> PatentIn version 3.5

<210> 1

<211> 595

<212> DNA

<213> Homo sapiens

<220>

<221> CDS

<222> (54)..(551)

<400> 1

<210> 2

<211> 166

<212> PRT

<213> Homo sapiens

<400> 2

<210> 3

<211> 598

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide

<220>

<221> CDS

<222> (64)..(564)

<400> 3

<210> 4

<211> 167

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide

<400> 4

Claims (9)

1. 一種可在細菌生產系統中高度正確摺疊的分離之多肽，其係由下列所組成：第一片段，其係以Xn表示，X係胺基酸殘基，其中n係1且X係Pro；及第二片段，其包括成熟干擾素α，其N端係Cys，該成熟干擾素α形成該第二片段之N端部分，其中該Cys係經由肽鍵而連結至該第一片段。
2. 根據請求項1之多肽，其中該干擾素α係人類干擾素α-2b。
3. 一種分離之核酸，其包含編碼一多肽之核苷酸序列，該多肽在細菌生產系統中高度正確摺疊，且該多肽係由下列所組成：第一片段，其係以Xn表示，X係胺基酸殘基，其中n係1且X係Pro；及第二片段，其包括成熟干擾素α，其N端係Cys，該成熟干擾素α形成該第二片段之N端部分，其中該Cys係經由肽鍵而連結至該第一片段。
4. 根據請求項3之核酸，其中該干擾素α係人類干擾素α-2b。
5. 一種載體，其包含根據請求項3之核酸。
6. 一種轉形細胞，其包含根據請求項5之載體。
7. 一種如請求項1之多肽在製備用於治療病毒感染之醫藥組合物之用途。
8. 一種降低干擾素α之非天然性雙硫鍵之形成之方法，其包含將一個Pro添加至成熟干擾素α之N端Cys。
9. 根據請求項8之方法，其中該干擾素α係人類干擾素α-2b。