TW202412851A - 蛋白激酶降解劑、藥物及應用 - Google Patents
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Abstract
本發明屬於生物醫藥技術領域,具體涉及一種可作為蛋白激酶降解劑的化合物、醫藥組合物及應用。本發明所公開的可作為蛋白激酶降解劑的化合物為如通式(Ⅰ)所示的化合物,或其醫藥上可接受的鹽、立體異構體、酯、前驅藥、溶劑化物、氘代化合物。本發明所公開的醫藥組合物包括可作為蛋白激酶降解劑的化合物。本發明還公開了可作為蛋白激酶降解劑的化合物的醫藥用途。
Description
本發明屬於生物醫藥技術領域,涉及一種蛋白激酶降解劑、藥物及應用。
蛋白激酶(PK)是一類結構式相關的磷醯基轉移酶,具有高度保守的結構和催化功能,在細胞內的分佈遍及核、線粒體、微粒體和胞液。蛋白激酶在細胞生長和分化的調控中起到了關鍵作用,負責控制各種各樣的細胞轉導過程。正常或突變蛋白激酶的過度表現或不適當的表現在多種疾病和病症發展中起到了重要的作用。
原肌球蛋白受體激酶(Tropomyosin receptor kinase,TRK)屬於細胞表面的跨膜型受體酪胺酸激酶,主要包括TRKA、TRKB和TRKC三個亞型,分別由NTRK1、NTRK2和NTRK3基因編碼。當染色體變異發生NTRK基因融合後,會導致TRK激酶被磷酸化並啟動下游信號通路,從而調控細胞的生長、分化、侵襲、遷移、凋亡等。
目前已經上市的TRK抑制劑包括選擇性TRKA/B/C抑制劑拉羅替尼(larotrectinib)和同時具有ALK、ROS1和TRKs等激酶抑制活性多靶點的抑制劑恩曲替尼(entrectinib)。這兩款藥物對攜帶NTRK融合的腫瘤患者提供了較好的治療效果,但是隨著藥物的使用,臨床耐藥突變隨之而來,如溶劑前沿點突變TRKAG595R和TRKCG623R,xDFG突變TRKAG667C和TRKAG667A等。PROTAC (proteolysis-targeting chimeras)是一種利用泛素-蛋白酶體系統對靶蛋白進行降解的技術,分子通過降解靶蛋白或者靶蛋白的突變蛋白,進而使得目標蛋白無法發揮其功能。本發明旨在提供一類新型的蛋白激酶降解化合物。
有鑑於此,本發明的目的在於提供一種蛋白激酶降解劑、藥物及應用,以解決現有方法所存在的以上問題。優選地,所述蛋白激酶為TRK。優選地,所述TRK為野生型TRK、融合的TRK、突變的TRK或融合突變的TRK。
其技術方案如下:
第一態樣:
在第一態樣的一個技術方案中,本發明提供了一種化合物,所述化合物為:化學結構如通式(Ⅰ)所示的化合物:
(Ⅰ);
所述E3泛素化連接酶配體中,所述E3泛素化連接酶選自CRBN (Celebron)或vHL (von Hippel-Lindau),所述vHL的配體選自VH032或其類似物,所述CRBN的配體選自來那度胺、來那度胺的類似物、泊馬度胺、泊馬度胺的類似物、沙利度胺或沙利度胺的類似物;
L為連接子;
所述原肌球蛋白相關激酶配體選自蛋白激酶抑制劑或蛋白激酶抑制劑片段,所述原肌球蛋白相關激酶配體至少通過與蛋白激酶、蛋白激酶突變、蛋白激酶融合和蛋白激酶缺失突變中的一種結合而發揮作用。
在本文中,除非另有說明,E3泛素化連接酶配體連接在L的左側,原肌球蛋白相關激酶配體連接在L的右側。
在第一態樣的進一步技術方案中,本發明進一步涉及式(A)化合物或其醫藥上可接受的鹽:
式(A)
其中
A為E3泛素化連接酶配體,所述E3泛素化連接酶選自CRBN或vHL,所述vHL的配體選自VH032或其類似物,所述CRBN的配體選自來那度胺、來那度胺的類似物、泊馬度胺、泊馬度胺的類似物、沙利度胺或沙利度胺的類似物;
就-O-(CH
2)
x-(O(CH
2)
y)
z-O-而言,x為1、2、3、4、5、6、7、8、9或10,y在每次使用時獨立為1、2、3、4、5、6、7、8、9或10,z在每次使用時獨立為0、1、2、3、4、5、6、7、8、9或10,最左側的O任選被替換為NH,最右側的O任選被替換為NH,(O(CH
2)
y)
z中的一個或多個(例如1、2、3或4個)O任選被替換為NH,(CH
2)
x中的一個或多個(例如1、2、3或4個)CH
2任選被側氧基(=O)取代,(CH
2)
y中的一個或多個(例如1、2、3或4個)CH
2任選被側氧基(=O)取代,-(CH
2)
x-中的一個CH
2任選被替換為哌𠯤-1,4-亞基或7至11元飽和二氮雜螺環亞基(例如2,6-二氮雜螺[3.3]庚烷-2,6-亞基或3,9-二氮雜螺[5.5]十一烷-3,9-亞基)。
在第一態樣的進一步技術方案中,本發明進一步涉及式(B)化合物或其醫藥上可接受的鹽:
式(B)
其中
A為E3泛素化連接酶配體,所述E3泛素化連接酶選自CRBN或vHL,所述vHL的配體選自VH032或其類似物,所述CRBN的配體選自來那度胺、來那度胺的類似物、泊馬度胺、泊馬度胺的類似物、沙利度胺或沙利度胺的類似物;
就-O-(CH
2)
x-(O(CH
2)
y)
z-(哌啶-1,4-亞基)-O-而言,x為1、2、3、4、5、6、7、8、9或10,y在每次使用時獨立為1、2、3、4、5、6、7、8、9或10,z在每次使用時獨立為0、1、2、3、4、5、6、7、8、9或10,最左側的O任選被替換為NH,最右側的O任選被替換為NH,(O(CH
2)
y)
z中的一個或多個(例如1、2、3或4個)O任選被替換為NH,(CH
2)
x中的一個或多個(例如1、2、3或4個)CH
2任選被側氧基(=O)取代,(CH
2)
y中的一個或多個(例如1、2、3或4個)CH
2任選被側氧基(=O)取代,-(CH
2)
x-中的一個CH
2任選被替換為哌𠯤-1,4-亞基或7至11元飽和二氮雜螺環亞基(例如2,6-二氮雜螺[3.3]庚烷-2,6-亞基或3,9-二氮雜螺[5.5]十一烷-3,9-亞基)。
在第一態樣的進一步技術方案中,本發明進一步涉及式(C)化合物或其醫藥上可接受的鹽:
式(C)
其中
A為E3泛素化連接酶配體,所述E3泛素化連接酶選自CRBN或vHL,所述vHL的配體選自VH032或其類似物,所述CRBN的配體選自來那度胺、來那度胺的類似物、泊馬度胺、泊馬度胺的類似物、沙利度胺或沙利度胺的類似物;
就-(CH
2)
x-和-(CH
2)
y-而言,x為1、2、3、4、5、6、7、8、9或10,y在每次使用時獨立為1、2、3、4、5、6、7、8、9或10,(CH
2)
x中的一個或多個(例如1、2、3或4個)CH
2任選被側氧基(=O)取代,(CH
2)
y中的一個或多個(例如1、2、3或4個)CH
2任選被側氧基(=O)取代。
第一態樣的其它技術方案如下所述:
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述原肌球蛋白相關激酶配體具有如通式(Ⅱ)所示的化學結構:
(Ⅱ);
其中,R
1為H、鹵素、C1~C6烷基、C1~C6烷氧基或鹵素取代的C1~C6烷基;R
2為H、氟取代的C1~C4烷基、取代或未取代的含1‑3個N環原子的5‑6元雜環基;R
3為H、鹵素、胺基或者C1~C3烷基取代的胺基、取代或未取代的C1~C10烷基、取代或未取代的C1~C10烷氧基、取代或未取代的含1‑3個N環原子的5‑10元雜環基、取代或未取代的含1‑3個N環原子的5‑10元雜芳基;R
4為C1~C6烷基;
R
5為‑NR
6R
7,其中,R
6、R
7分別獨立地選自:‑(CH
2)
mNR
8R
9、‑(CH
2)
nCR
10R
11R
12、‑(CH
2)
pOR
12,或者R
6、R
7與它們所連接的氮原子一起形成被取代或未被取代的含有雜原子的單環、稠環、螺環或橋環;R
8、R
9分別獨立地選自:H、C1~C20烷基;或者R
8、R
9與它們所連接的氮原子一起形成被取代或未被取代的含有1‑3個雜原子的單環、稠環、螺環或橋環;R
10、R
11與它們所連接的碳原子一起形成被取代或未被取代的含有1‑3個雜原子的單環、稠環、螺環或橋環;R
12選自:H、C1~C20烷基;m、n、p分別獨立地選自:0‑10的整數。優選地,所述原肌球蛋白相關激酶配體通過在將式(Ⅱ)中R
5上的取代基去除後形成的鍵與L連接。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述原肌球蛋白相關激酶配體具有如通式(Ⅱ
1)所示的化學結構:
(Ⅱ
1);
其中,t為1、2或者3,X為H、Cl或者Br。優選地,所述原肌球蛋白相關激酶配體通過在將式(Ⅱ
1)中的OH去除後形成的鍵與L連接。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述原肌球蛋白相關激酶配體具有以下任一結構:
,
,
,
,
,
,
,
,
,
,
,
。
優選地,所述原肌球蛋白相關激酶配體通過在將上述結構中的OH或NH
2去除後形成的鍵與L連接。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述原肌球蛋白相關激酶配體為
,其通過在將OH去除後形成的鍵與L連接。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述L具有如通式(Ⅲ)所示的化學結構:
(Ⅲ);
其中,Y
1、Z
1獨立地為O、S或者NH,W
1、W
2獨立地為空、O、NH、
、C1~C6直鏈烷烴基、
,a
1、b
1、a
2、b
2、a
3、a
4獨立地為0到20的正整數,Q
1、Q
2、Q
3、Q
4獨立地為-CH
2-、
、NH、
以及O,W
1、W
2獨立為NH或者直鏈烷烴基時,可被羥基、C1-C10烷基、C1-C6烷氧基、鹵素取代,
表示連接點。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述L具有以下任一結構:
,
,
,
,
,
,
,
,
,
,
,
,
,
,
,
,
,
。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述L具有如通式(Ⅳ)所示的化學結構:
(Ⅳ);
其中,Y
2、Z
2為O、S或者NH,W
3、W
4、W
5獨立地為空、O、NH、
、C1~C6直鏈烷烴基、
,c、d、e、f、g、h獨立地為0到20的正整數,M
1、M
2獨立地為-CH-或者N,Q
4、Q
5、Q
6、Q
7獨立地為-CH
2-、
、NH、
或O。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述L具有以下任一結構:
,
,
,
,
,
,
,
。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述L具有如通式(Ⅴ)所示的化學結構:
(Ⅴ);
其中,Y
3、Z
3為O、S或者NH,W
6、W
7為空、O、NH、
、C1~C6直鏈烷烴基、
,i、n'獨立地為0到16的正整數,螺環部分中的M
3、M
4獨立地選自NH或者CH,j、k、l、m'獨立地選自0、1、2、3,Q
8、Q
9獨立地為-CH
2-、
、NH、
或O。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述L具有以下任一結構:
,
,
,
,
。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述C1~C6直鏈烷烴基選自以下任一基團:
,
,
,
,
,
。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述L為-O-(CH
2)
x-(O(CH
2)
y)
z-O-。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述L為-O-(CH
2)
x-(O(CH
2)
y)
z-O-,其中x為1、2、3、4、5、6、7、8、9或10。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述L為-O-(CH
2)
x-(O(CH
2)
y)
z-O-,其中y在每次使用時獨立為1、2、3、4、5、6、7、8、9或10。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述L為-O-(CH
2)
x-(O(CH
2)
y)
z-O-,其中z在每次使用時獨立為0、1、2、3、4、5、6、7、8、9或10。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述L為-O-(CH
2)
x-(O(CH
2)
y)
z-O-,其中最左側的O任選被替換為NH。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述L為-O-(CH
2)
x-(O(CH
2)
y)
z-O-,其中最右側的O任選被替換為NH。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述L為-O-(CH
2)
x-(O(CH
2)
y)
z-O-,其中(O(CH
2)
y)
z中的一個或多個(例如1、2、3或4個)O任選被替換為NH。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述L為-O-(CH
2)
x-(O(CH
2)
y)
z-O-,其中(CH
2)
x中的一個或多個(例如1、2、3或4個)CH
2任選被側氧基(=O)取代。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述L為-O-(CH
2)
x-(O(CH
2)
y)
z-O-,其中(CH
2)
y中的一個或多個(例如1、2、3或4個)CH
2任選被側氧基(=O)取代。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述L為-O-(CH
2)
x-(O(CH
2)
y)
z-O-,其中-(CH
2)
x-中的一個CH
2任選被替換為哌𠯤-1,4-亞基或7至11元飽和二氮雜螺環亞基(例如2,6-二氮雜螺[3.3]庚烷-2,6-亞基或3,9-二氮雜螺[5.5]十一烷-3,9-亞基)。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述L通過其所包含的-(哌啶-1,4-亞基)-O-與原肌球蛋白相關激酶配體連接,其中哌啶-1,4-亞基在其1位元與左側部分連接,在其4位元與右側部分連接。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述L為-O-(CH
2)
x-(O(CH
2)
y)
z-(哌啶-1,4-亞基)-O-。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述L為-O-(CH
2)
x-(O(CH
2)
y)
z-(哌啶-1,4-亞基)-O-,其中x為1、2、3、4、5、6、7、8、9或10。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述L為-O-(CH
2)
x-(O(CH
2)
y)
z-(哌啶-1,4-亞基)-O-,其中y在每次使用時獨立為1、2、3、4、5、6、7、8、9或10。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述L為-O-(CH
2)
x-(O(CH
2)
y)
z-(哌啶-1,4-亞基)-O-,其中z在每次使用時獨立為0、1、2、3、4、5、6、7、8、9或10。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述L為-O-(CH
2)
x-(O(CH
2)
y)
z-(哌啶-1,4-亞基)-O-,其中最左側的O任選被替換為NH。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述L為-O-(CH
2)
x-(O(CH
2)
y)
z-(哌啶-1,4-亞基)-O-,其中最右側的O任選被替換為NH。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述L為-O-(CH
2)
x-(O(CH
2)
y)
z-(哌啶-1,4-亞基)-O-,其中(O(CH
2)
y)
z中的一個或多個(例如1、2、3或4個)O任選被替換為NH。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述L為-O-(CH
2)
x-(O(CH
2)
y)
z-(哌啶-1,4-亞基)-O-,其中哌啶-1,4-亞基在其1位元與左側部分連接,在其4位元與右側部分連接。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述L為-O-(CH
2)
x-(O(CH
2)
y)
z-(哌啶-1,4-亞基)-O-,其中(CH
2)
x中的一個或多個(例如1、2、3或4個)CH
2任選被側氧基(=O)取代。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述L為-O-(CH
2)
x-(O(CH
2)
y)
z-(哌啶-1,4-亞基)-O-,其中(CH
2)
y中的一個或多個(例如1、2、3或4個)CH
2任選被側氧基(=O)取代。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述L為-O-(CH
2)
x-(O(CH
2)
y)
z-(哌啶-1,4-亞基)-O-,其中-(CH
2)
x-中的一個CH
2任選被替換為哌𠯤-1,4-亞基或7至11元飽和二氮雜螺環亞基(例如2,6-二氮雜螺[3.3]庚烷-2,6-亞基或3,9-二氮雜螺[5.5]十一烷-3,9-亞基)。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述L為(哌啶-1,4-亞基)-(CH
2)
x-(哌啶-1,4-亞基)-(CH
2)
y-(哌啶-1,4-亞基)-O-。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述L為(哌啶-1,4-亞基)-(CH
2)
x-(哌啶-1,4-亞基)-(CH
2)
y-(哌啶-1,4-亞基)-O-,其中x為1、2、3、4、5、6、7、8、9或10。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述L為(哌啶-1,4-亞基)-(CH
2)
x-(哌啶-1,4-亞基)-(CH
2)
y-(哌啶-1,4-亞基)-O-,其中y在每次使用時獨立為1、2、3、4、5、6、7、8、9或10。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述L為(哌啶-1,4-亞基)-(CH
2)
x-(哌啶-1,4-亞基)-(CH
2)
y-(哌啶-1,4-亞基)-O-,其中每個哌啶-1,4-亞基在其1位元與左側部分連接,在其4位元與右側部分連接。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述L為(哌啶-1,4-亞基)-(CH
2)
x-(哌啶-1,4-亞基)-(CH
2)
y-(哌啶-1,4-亞基)-O-,其中(CH
2)
x中的一個或多個(例如1、2、3或4個)CH
2任選被側氧基(=O)取代。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述L為(哌啶-1,4-亞基)-(CH
2)
x-(哌啶-1,4-亞基)-(CH
2)
y-(哌啶-1,4-亞基)-O-,其中(CH
2)
y中的一個或多個(例如1、2、3或4個)CH
2任選被側氧基(=O)取代。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述L為
、
、
、
、
、
、
、
、
、
、
、
、
、
、
、
、
、
、
、
、
、
、
、
、
、
、
、
、
、
、
、
、
、
、
、
、
、
。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述L為
、
、
、
、
、
、
。
在第一態樣的上述任一技術方案中,作為E3泛素化連接酶配體的VH032、來那度胺、泊馬度胺、沙利度胺分別具有以下結構:
VH032 | 來那度胺 | ||
泊馬度胺 | 沙利度胺 |
在第一態樣的上述任一技術方案中,VH032通過在將其結構中的乙醯基去除後形成的鍵與L連接。
在第一態樣的上述任一技術方案中,來那度胺、泊馬度胺通過在將其結構中的NH
2去除後形成的鍵與L連接。
在第一態樣的上述任一技術方案中,沙利度胺通過在將其1,3-二側氧基異吲哚啉的4位或5位上的H去除後形成的鍵與L連接。
在第一態樣的一個技術方案中,包括以下任意一種化合物:
,
,
,
,
,
,
,
,
,
,
,
,
,
,
,
,
,
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,
,
,
,
,
,
,
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,
,
,
,
,
,
,
,
,
,
,
,
,
,
,
,
,
,
,
,
,
,
,
,
,
,
,
,
,
,
,
。
在第一態樣的一個技術方案中,所述化合物為實施例1-38的標題化合物。
在第一態樣的一個技術方案中,所述化合物為實施例5、9、11、12、25、26和33的標題化合物。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述化合物還包括:所述化合物在醫藥上可接受的鹽、立體異構體、酯、前驅藥、溶劑化物和氘代化合物。
在第一態樣的上述任一技術方案中,所述化合物為蛋白激酶降解劑。優選地,所述蛋白激酶為TRK。優選地,所述TRK為野生型TRK、融合的TRK、突變的TRK或融合突變的TRK。
第二態樣,本發明還提供了一種醫藥組合物,包括上述的化合物。優選地,所述化合物為蛋白激酶降解劑。優選地,所述蛋白激酶為TRK。優選地,所述TRK為野生型TRK、融合的TRK、突變的TRK或融合突變的TRK。
第三態樣,本發明還提供了前述可作為蛋白激酶降解劑的化合物或上述醫藥組合物在製備用於預防、診斷或治療由於蛋白激酶的表現、突變或者融合造成的蛋白激酶介導的疾病的藥物中的應用。優選地,所述蛋白激酶為TRK。優選地,所述TRK為野生型TRK、融合的TRK、突變的TRK或融合突變的TRK。
優選地,所述蛋白激酶介導的疾病為腫瘤,所述腫瘤包括非小細胞肺癌、乳腺癌、結腸癌、前列腺癌、甲狀腺癌、惡性黑色素瘤、神經母細胞瘤和乳腺樣分泌癌中的至少一種。
優選地,所述藥物的施用方式包括口服、皮內注射、皮下注射、塗抹於皮膚、腸胃外、直腸中的至少一種。
第四態樣,本發明還提供了一種用於預防、診斷或治療由於蛋白激酶蛋白的表現、突變或者融合造成的蛋白激酶介導的疾病的方法,所述方法包括向有此需要的受試者施用前述可作為蛋白激酶降解劑的化合物。優選地,所述蛋白激酶為TRK。優選地,所述TRK為野生型TRK、融合的TRK、突變的TRK或融合突變的TRK。
優選地,所述蛋白激酶介導的疾病為腫瘤,所述腫瘤包括非小細胞肺癌、乳腺癌、結腸癌、前列腺癌、甲狀腺癌、惡性黑色素瘤、神經母細胞瘤和乳腺樣分泌癌中的至少一種。
第五態樣,本發明還提供了上述可作為蛋白激酶降解劑的化合物,其用於預防、診斷或治療由於蛋白激酶蛋白的表現、突變或者融合造成的蛋白激酶介導的疾病。優選地,所述蛋白激酶為TRK。優選地,所述TRK為野生型TRK、融合的TRK、突變的TRK或融合突變的TRK。
優選地,所述蛋白激酶介導的疾病為腫瘤,所述腫瘤包括非小細胞肺癌、乳腺癌、結腸癌、前列腺癌、甲狀腺癌、惡性黑色素瘤、神經母細胞瘤和乳腺樣分泌癌中的至少一種。
本文所用的術語「烷基」是指飽和或不飽和的直鏈、支鏈或環形的多至10個碳原子的烷基碳鏈。直鏈烷基包括如甲基、乙基、正丙基、正丁基、正戊基、正己基、正庚基和正辛基。支鏈烷基包括如異丙基、二級丁基、異丁基、三級丁基、新戊基。環烷基包括如環丙基、環丁基、環戊基和環己基。不飽和烷基包括如含有雙鍵、共軛雙鍵、三鍵的烷基碳鏈。烷基可被一個或多個取代基取代,取代基的非限定性例子包括NH
2、NO
2、N(CH
3)
2、ONO
2、F、Cl、Br、I、OH、OCH
3、CO
2H、CO
2CH
3、CN、硝酮基、芳基和雜芳基。術語「烷基」也指未取代或取代的直鏈、支鏈或環狀的含有多至10個碳原子的在鏈上含有至少一個雜原子(例如氮、氧或硫)的烷基。上述直鏈烷基包括,例如,CH
2CH
2OCH
3、CH
2CH
2N(CH
3)
2和CH
2CH
2SCH
3。支鏈基團包括,例如,CH
2CH(OCH
3)CH
3、CH
2CH(N(CH
3)
2)CH
3和CH
2CH(OCH
3)CH
3。上述環狀基團包括,例如六元環CH(CH
2CH
2)
2O,CH(CH
2CH
2)
2NCH
3和CH(CH
2CH
2)
2S及相應的五元環等。上述烷基可被一個或多個取代基取代。上述取代基的非限定性例子包括NH
2、NO
2、N(CH
3)
2、ONO
2、F、Cl、Br、I、OH、OCH
3、CO
2H、CO
2CH
3、CN、芳基和雜芳基。本文所用的術語「芳基」是指取代或未被取代的芳香化合物、碳環基團和芳雜基。芳基是單環或者是多環稠合化合物。例如,苯基是單環芳基。萘基是具有多環稠合的芳基的例子。芳基可以被一個或多個取代基取代,取代基的非限制性的例子包括NH
2、NO
2、N(CH
3)
2、ONO
2、F、Cl、Br、I、OH、OCH
3、CO
2H、CO
2CH
3、CN、硝酮基、芳基和芳雜基。芳雜基涉及到取代的或非取代的單環或多環的基團,環內至少包括一個雜原子,譬如氮、氧以及硫。舉例來說,典型的雜環基團包括一個或多個氮原子譬如四唑基、吡咯基、吡啶基(如4-吡啶基,3-吡啶基,2-吡啶基等)、嗒𠯤基、吲哚基、喹啉基(如2-喹啉基,3-喹啉基等)、咪唑基、異喹啉基,吡唑基、吡𠯤基、嘧啶基、吡啶酮基或嗒𠯤基;典型的含一個氧原子的雜環基團包括2-呋喃基,3-呋喃基或苯並呋喃基;典型的硫雜原子基團包括噻吩基、苯並噻吩基;典型的混合雜原子基團包括呋吖基、㗁唑基、異㗁唑基、噻唑基和啡㗁噻基。雜環基團能被一個或多個取代基取代。這些取代基包括NH
2、NO
2、O-烷基、NH-烷基、N(烷基)
2、NHC(O)-烷基、ONO
2、F、Cl、Br、I、OH、OCF
3、OSO
2CH
3、CO
2H、CO
2-烷基、CN、硝酮基、以及芳基和多芳基。這些情況同時包括環內雜原子被氧化,譬如形成N-氧化物、酮或碸。
本發明實施例所涉及的化合物,可作為一種藥用活性成分,以有效治療劑量複配醫藥上可接受的載劑和賦形劑製成具體的藥物,用於預防、診斷或治療由於蛋白激酶的表現、突變或者融合造成的蛋白激酶介導疾病。該疾病優選腫瘤,腫瘤包括非小細胞肺癌、乳腺癌、結腸癌、前列腺癌、甲狀腺癌、惡性黑色素瘤、神經母細胞瘤和乳腺樣分泌癌中的至少一種。其中,有效治療劑量是指達到治療效果所必須的劑量。
本文使用的術語「醫藥上可接受的」指的是在化合物如鹽或賦形劑中不具有不能接受的毒性。醫藥上可接受的鹽包括無機陰離子,例如氯離子、溴離子、碘離子、硫酸根、亞硫酸根、硝酸根、亞硝酸根、磷酸根、磷酸氫根等。有機陰離子包括乙酸根、丙酸根、肉桂酸根、苯甲磺酸根、檸檬酸根、乳酸根、葡萄糖酸根等。醫藥上可接受的賦形劑在後文有描述。
本發明實施例的化合物可以製成多種劑型,包括固體劑型、半固體劑型、液體製劑和氣霧劑(Remington’s Pharmaceutical Sciences, Mack Publishing Company (1995), Philade lphia, PA, 19th ed)。這幾類劑型中的具體劑型包括片劑、丸劑、糖錠劑、顆粒劑、凝膠劑、膏劑、溶液劑、栓劑、注射劑、吸入劑以及噴霧劑。這些劑型既能用於局部或全身施用又能用於速釋或緩續施用,此類藥物的施用方式有很多種,除了上述方式,還有口腔施用、面頰施用、直腸施用、腹膜施用、腹膜內施用、皮表施用、皮下施用和氣管內施用等。
本發明實施例的化合物在注射施用時,可以用水溶性或脂溶性的溶劑將此類化合物配製成溶液劑,懸濁劑和乳劑。脂溶性溶劑具體包括植物油及類似油類,合成脂肪酸甘油酯,高級脂肪酸酯以及乙二醇酯(roylene glycol)這類化合物更易溶於Hank’s溶液,Ringer’s溶液或者生理鹽水。
本發明實施例的化合物在口服施用時,可以採用常用技術將其與醫藥可接受的賦形劑製成複合物。這些賦形劑可以將這些化合物製成多種可以被病人劑型,如片劑、丸劑、混懸劑、凝膠劑等。口服製劑的配製有多種方法,如先把化合物和固體賦形劑混勻,充分研磨混合物,添加適當的輔料,加工處理成顆粒。可以用於製成口服劑型的輔料包括:糖類如乳糖、蔗糖、甘露醇或山梨醇;纖維素類如玉米澱粉、小麥澱粉、馬鈴薯澱粉、明膠、西黃蓍膠、甲基纖維素、羥丙甲基纖維素、甲基纖維素納、聚乙烯吡咯酮等。
本發明實施例的化合物也可以製成噴霧劑,此種劑型是通過一個加壓器和一個噴霧器或者一個乾粉吸入裝置而實現的。可以用作噴射器裡合適的噴射劑如二氯二氟甲烷、氟三氯甲烷、二氯四氟乙烷、二氧化碳和二甲醚等。氣霧劑施用的劑量可以通過噴射器的閥門來調節。
本發明實施例的化合物涉及的各種劑型都關係到所涉及化合物的有效治療劑量。該類化合物的有效治療劑量取決於接受治療的病人。在決定適宜的劑量時,病人的體重、病情、服藥方式以及處方醫師的主觀判斷因素都要納入考慮。該類多重作用機制的化合物及其衍生物的治療有效量應該由有能力和豐富經驗的處方醫師決定。
本發明實施例進一步包括施加於蛋白激酶介導疾病患者的附加治療方案,所述附加治療方案包括手術治療與放射治療。
為使本發明上述實施細節和操作能清楚地被本領域技術人員理解,以及本發明實施例化合物、藥物及應用的進步性能顯著地體現,以下通過實施例對本發明的實施進行舉例說明。
效果例1:NTRK融合的Ba/F3細胞抑制率測定
1)使用同一批次的發光細胞活力測試實驗評估本發明的化合物對含有NTRK融合的Ba/F3細胞增殖的影響。
2)使用CellTilter-Glo(CTG)檢測套組,檢測Ba/F3細胞增殖狀況。
將Ba/F3細胞株(Ba/F3-LMNA-NTRK1、Ba/F3-LMNA-NTRK1-G667C)在37°C,5% CO2的培養箱中進行培養。定期傳代,取處於對數生長期的細胞用於鋪板。用台盼蘭進行細胞染色並計數活細胞,要求細胞活率90%以上。將細胞濃度調整至合適濃度。在化合物檢測細胞板中每孔加入95 μL細胞懸液,在Min對照孔中加入不含細胞(含0.1%)的培養液,培養24h。取5 μL的20×化合物工作液加入到細胞培養板中。在Max對照中加入5 μL DMSO-細胞培養液混合液。DMSO終濃度為0.1%。將培養板在37°C,5% CO2培養箱中培養72h。72h後,取出細胞培養板放置10 min使其平衡至室溫。在每孔中加入50 μL的CellTiter-Glo工作液。將培養板在軌道搖床上振搖2 min以誘導細胞裂解。在SpectraMax Paradigm讀板器上檢測發光信號,得出對應的每孔螢光值RLU。細胞增殖抑制率(Inhibition Rate)資料採用下列公式來處理:
Inhibition Rate(Inh%)=100-(RLUDrug-RLUMin)/(RLUMax-RLUMin)*100%。在EXCEL中計算不同濃度化合物對應的抑制率。
化合物對含有NTRK融合及融合突變的Ba/F3細胞增殖抑制率在相應實施例結尾處給出。
效果例2:Western blot檢測化合物對目標蛋白的降解能力
1)培養Ba/F3-LMNA-NTRK1-G667C細胞,至覆蓋度60-70%時,加入對應濃度的化合物後培養24h;在8000 rpm的轉速下離心3 min收集細胞,加入68 μl冰浴的RIPA裂解液,混勻後冰上靜置30 min,每隔10 min渦旋顛倒使裂解充分,離心後置於冰上。
2)用蛋白標準品定量後,上樣並進行電泳;電泳完成後將凝膠取出,用於甲醇中浸泡30 s的PVDF膜以及海綿、濾紙等夾好,插入電泳槽中,恒壓100 V電泳轉移1.5 h。
3)電轉完成後,將PVDF膜放入5%脫脂牛奶的封閉液中1 h,在TBST中緩慢洗滌3次,每次10 min,將洗好的PVDF膜放入含有一抗的盒中置於4℃搖床培育(10-16 h);取出PVDF膜用TBST中緩慢洗滌3次後,加入二抗,室溫培育1 h;結束後,取出PVDF膜用TBST洗滌3次;將顯色液混合,均勻加在膜的表面,放入Tanon 5200發光成像儀中曝光顯影,拍照保存圖片。
Ba/F3-LMNA-NTRK1-G667C細胞在用化合物處理後的TRK降解率在相應實施例結尾處給出。
以下實施例所使用的英文簡稱資訊如下:
Cbz:苄氧羰基;
DIEA:N,N-二異丙基乙胺;
DMF:N,N-二甲基甲醯胺;
DMSO:二甲基亞碸;
ESI:電噴霧離子源;
FA:甲酸;
HATU:2-(7-氮雜苯並三氮唑)-N,N,N',N'-四甲基脲六氟磷酸酯;
HPLC:高效液相層析;
MS:質譜;
NMP:N-甲基吡咯啶酮;
NMR:核磁共振波譜;
PE:石油醚;
Ph:苯基;
TEA:三乙胺;
TFA:三氟乙酸;
THF:四氫呋喃。
實施例 1 :1-(3-((3-((3-氯-5-(三氟甲基)苯基)胺基甲醯基)-2-甲基苯基)乙炔基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-6-基)哌啶-4-基(4-(2-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)氧基)乙醯胺基)丁基)胺基甲酸酯
按照如下所示的合成路線合成了實施例1標題化合物。
步驟1:2-甲基-3-((三甲基矽基)乙炔基)苯甲酸甲酯(1-1)
在氬氣保護下,於一250mL圓底燒瓶中,加入3-碘代-2-甲基苯甲酸甲酯(15.0g,54.3mmol),CuI(2.06g,10.8mmol),THF(150mL),TEA(27.4g,271mmol),乙炔基三甲基矽烷(13.3g,135mmol)和(PPh
3)
2PdCl
2(3.81g,5.43mmol),室溫攪拌反應4小時。然後,將反應液倒入冰水(500mL)中。水相以EtOAc(500mL×3)萃取。合併有機相,以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,餘物以矽膠柱層析(PE:EtOAc(v/v) = 20:1)分離得到產物1-1(12.0g,48.7mmol,產率:89.7%),為無色油狀物。
1HNMR (400MHz, CDCl
3): δ 7.79 (dd,
J= 8.0, 1.6Hz, 1H), 7.59 (dd,
J= 7.6 Hz, 1.2 Hz , 1H), 7.17 (t,
J= 7.6 Hz, 1H), 3.89 (s, 3H), 2.69 (s, 3H), 0.27 (s, 9H)。
步驟2:3-乙炔基-2-甲基苯甲酸甲酯(1-2)
2-甲基-3-((三甲基矽基)乙炔基)苯甲酸甲酯(12.0g,48.7mmol),K
2CO
3(13.4g,97.4mmol)和MeOH(100mL)加到250mL圓底燒瓶中,室溫攪拌反應16小時。反應完成後,應液減壓濃縮,餘物以矽膠柱層析(PE:EtOAc(v/v) = 10:1)分離得到產物1-2 (7.00g,40.2mmol,產率:82.5%),為無色油狀物。
1HNMR (400MHz, CDCl
3): δ 7.82 (dd,
J= 8.0 Hz, 1.2 Hz, 1H), 7.62 (dd,
J= 7.6 Hz, 1.2 Hz, 1H), 7.20 (dd,
J= 8.0 Hz, 1H), 3.90 (s, 3H), 3.32 (s, 1H), 2.71 (s, 3H)。
步驟3:甲基 3-((6-氯咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲酸酯(1-3)
在氬氣保護下,3-乙炔基-2-甲基苯甲酸甲酯(5.00g,28.7mmol),6-氯-3-碘代咪唑並[1,2-b]嗒𠯤(8.02g,28.7mmol),(PPh
3)
2PdCl
2(2.01g,2.87mmol),CuI(5.48g,28.7mmol)和TEA(30mL)溶於DMF(400mL),室溫攪拌反應16小時。反應完成後,將反應液倒入H
2O(1L)中,過濾,濾渣以MeOH(200mL)洗滌,得黃色固體,為產物1-3(2.60g,7.98mmol,產率:27.8%),MS (ESI) m/z: 326.0 [M+H]
+。
步驟4:3-((6-氯咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲酸(1-4)
於一100mL圓底燒瓶中,加入甲基 3-((6-氯咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲酸酯(2.60g,7.98mmol),LiOH.H
2O(1.68g,39.9mmol),THF(26mL)和H
2O(26mL),然後加熱至40℃攪拌反應16小時。反應完成後,反應液冷卻至室溫,減壓濃縮以除去THF,加水(100mL)稀釋,水相以DCM(100mL×3)萃取除去雜質。水相用稀鹽酸(1M)調pH=2,用DCM(100mL×3)萃取,合併第二次萃取有機相,以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,餘物以MeOH(20mL)打漿,過濾,得到目標化合物1-4 (2.00g,6.42mmol,產率:80.4%),為黃色固體。MS(ESI) m/z: 312.1 [M+H]
+。
步驟5:
N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-氯咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺(1-5)
3-((6-氯咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲酸(2.00 g,6.42 mmol),3-氯-5-(三氟甲基)苯胺(2.50 g,12.8 mmol)分散於吡啶(30mL)中,冷卻至0℃。緩慢滴入POCl
3(1.97g,12.8mmol),維持溫度攪拌反應20分鐘。反應完成後,將反應液小心倒入冰水(100mL)中,攪拌30分鐘。水相以DCM(50mL×3)萃取。有機相依次以稀鹽酸(1M)和飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,餘物以MeOH(20mL)打漿,過濾,得到目標化合物1-5(1.80g,3.68mmol,產率:57.3%),為黃色固體。MS(ESI) m/z:489.1[M+H]
+。
步驟6:
N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-(4-羥基哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺(1-6)
N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-氯咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺(1.10g,2.25mmol),哌啶-4-醇(455mg,4.50mmol),K
2CO
3(932mg,6.75mmol)分散於DMF(10mL),加熱至100℃攪拌反應16小時。反應完成後,體系冷至室溫,將反應液倒入水(50mL)中,水相以EtOAc (50mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,餘物以矽膠柱層析(DCM:MeOH (v/v) = 30:1)分離得到產物1-6 (700mg,1.26mmol,產率:56.0%),為黃色固體。MS(ESI)m/z:554.1[M+H]
+。
步驟7:1-(3-((3-((3-氯-5-(三氟甲基)苯基)胺基甲醯基)-2-甲基苯基)乙炔基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-6-基)哌啶-4-基(4-硝基苯基)碳酸酯(1-7)
N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-(4-羥基哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺(300mg,0.542mmol),4-二甲胺基吡啶(7mg,0.0542mmol)和吡啶(128mg,1.63mmol)分散於DCM (4mL)中,室溫攪拌下,緩慢加入4-硝基苯基氯甲酯(218mg,1.08mmol),室溫攪拌反應16小時。反應完成後,將反應液減壓濃縮,餘物以矽膠柱層析(100% EtOAc)分離得到產物1-7 (200mg,0.278mmol,產率:51.3%),為白色固體。MS(ESI)m/z:719.4[M+H]
+。
步驟8:2-(2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)氧基乙酸三級丁酯(1-8)
2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-4-羥基異吲哚啉-1,3-二酮(1.00g,3.64mmol),和2-溴乙酸三級丁酯(710mg,3.64mmol)溶於DMF(10mL),加入K
2CO
3(1.00g,7.25mmol),然後室溫攪拌反應16小時。反應完成後,加水(50mL)稀釋,以EtOAc (50mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,餘物以矽膠柱層析(PE:EtOAc(v/v) = 1:1)分離得到產物1-8(450mg,1.16mmol,產率:31.8%),為白色固體。MS(ESI)m/z: 333.0[M+H-56]
+。
步驟9:2-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)氧基)乙酸(1-9)
2-(2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)氧基乙酸三級丁酯(450mg,1.16mmol)溶於DCM(1mL),加入TFA(1mL),室溫攪拌反應2小時。反應完成後,將反應液減壓濃縮,得到白色固體1-9 (350mg,1.05mmol),直接用於下步反應。MS(ESI) m/z: 333.0[M+H]
+。
步驟10:(4-(2-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)氧基)乙醯胺基)丁基)胺基甲酸三級丁酯(1-10)
於一25 mL圓底燒瓶中,加入2-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)氧基)乙酸(350mg,1.05mmol),(4-胺基丁基)胺基甲酸三級丁酯(397mg,2.11mmol),HATU(600mg,1.58mmol),DIEA(492mg,3.81mmol)和DMF(2mL),室溫攪拌反應2小時。反應完成後,加水(10mL)稀釋,以EtOAc (20mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,餘物製備HPLC(移動相:乙腈-水,0.1%FA)分離,得到目標化合物1-10(350mg,0.697mmol,產率:66.4%),白色固體。MS(ESI)m/z:403.2[M+H-100]
+。
步驟11:
N-(4-胺基丁基)-2-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)氧基)乙醯胺(1-11)
(4-(2-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)氧基)乙醯胺基)丁基)胺基甲酸三級丁酯(350mg,0.697mmol)溶於TFA(1mL)和DCM(1mL)的混合溶液,室溫攪拌反應2小時。反應完成後,反應液減壓濃縮,得到目標化合物1-11 (350mg,TFA鹽1:1),白色固體,直接用於下步反應。MS(ESI)m/z:403.2[M+H]
+。
步驟12:1-(3-((3-((3-氯-5-(三氟甲基)苯基)胺基甲醯基)-2-甲基苯基)乙炔基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-6-基)哌啶-4-基(4-(2-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)氧基)乙醯胺基)丁基)胺基甲酸酯
1-(3-((3-((3-氯-5-(三氟甲基)苯基)胺基甲醯基)-2-甲基苯基)乙炔基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-6-基)哌啶-4-基(4-硝基苯基)碳酸酯(100mg,0.139mmol),
N-(4-胺基丁基)-2-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)氧基)乙醯胺(56mg,0.139mmol),DIEA(54mg,0.417mmol)分散於NMP(1mL),室溫攪拌反應1小時。反應完成後,反應液直接製備HPLC(移動相:乙腈-水,0.1%FA)分離,得到產物(28.7mg,0.0292mmol,產率:21.0%),白色固體。
1HNMR (400MHz, DMSO-d6): δ 11.11 (s, 1H), 10.91 (s, 1H), 8.14–8.10 (m, 2H), 7.97–7.90 (m, 3H), 7.81 (d,
J= 7.6Hz, 1H), 7.69 (dd,
J= 7.6 Hz, 0.8 Hz, 1H), 7.59–7.58 (m, 1H), 7.55 (dd,
J= 8.0 Hz, 0.8 Hz, 1H), 7.49 (d,
J= 7.2 Hz, 1H), 7.43–7.40 (m, 1H), 7.39–7.32 (m, 2H), 7.09 (t,
J= 5.6 Hz, 1H), 5.14–5.09 (m, 1H), 4.80–4.70 (m, 3H), 3.99–3.93 (m, 2H), 3.43–3.41 (m, 2H), 3.15–3.11 (m, 2H), 2.98–2.93 (m, 2H), 2.90–2.86 (m, 1H), 2.63 (s, 3H), 2.57–2.53 (m, 2H), 2.05–2.01 (m, 1H), 1.96–1.90 (m, 2H), 1.64–1.53 (m, 2H), 1.45–1.35 (m, 4H)。MS(ESI) m/z: 1004.6[M+Na]
+。
在1μM的濃度下,實施例1標題化合物對Ba/F3-LMNA-NTRK1-G667C的抑制率為>90%。
實施例 2:
N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-(4-((1-(6-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)胺基)己醯基)哌啶-4-基)氧基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺
合成路線如下所示:
步驟1:6-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)胺基)己酸(2-1)
在氬氣保護下,2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-4-氟異吲哚啉-1,3-二酮(1.00g,3.62mmol),6-胺基己酸(594mg,4.53mmol)和DIEA(1.41g,10.9mmol)溶於NMP(10mL),加熱至140°C攪拌反應2小時。反應完成後,體系冷至室溫,加水(50mL)稀釋,以EtOAc (30mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,餘物以矽膠柱層析(PE:EtOAc(v/v) = 1:1)分離得到產物2-1 (800mg,2.07mmol,產率57.1%),綠色油狀物。MS (ESI) m/z:388.2 [M+H]
+。
步驟2:三級丁基4-((1-(3-((3-((3-氯-5-(三氟甲基)苯基)胺基甲醯基)-2-甲基苯基)乙炔基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-6-基)哌啶-4-基)氧基)哌啶-1-甲酸酯(2-2)
N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-氯咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺(688mg,1.41mmol),4-(哌啶-4-基氧基)哌啶-1-羧酸三級丁酯(400mg,1.41mmol),K
2CO
3(584mg,4.23mmol)分散於DMF(10mL),加熱至100℃攪拌反應16小時。反應完成後,體系冷至室溫,將反應液倒入水(50mL)中,水相以EtOAc (50mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,餘物以矽膠柱層析(DCM:MeOH (v/v) = 30:1)分離得到產物2-2 (350mg,0.475mmol,產率:33.7%),為黃色固體。MS (ESI) m/z:737.4[M+H]
+。
步驟3:N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-2-甲基-3-((6-(4-(哌啶-4-基氧基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)苯甲醯胺(2-3)
三級丁基4-((1-(3-((3-((3-氯-5-(三氟甲基)苯基)胺基甲醯基)-2-甲基苯基)乙炔基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-6-基)哌啶-4-基)氧基)哌啶-1-甲酸酯(350mg,0.475mmol)溶於TFA(1mL)和DCM(1mL)的混合溶液中,室溫攪拌反應2小時。反應完成後,將反應液減壓濃縮,得到2-3 (350mg,TFA鹽1:1,0.466mmol),黃色油狀物,直接用於下步反應。MS (ESI) m/z:637.2[M+H]
+。
步驟4:
N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-(4-((1-(6-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)胺基)己醯基)哌啶-4-基)氧基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺
於一25 mL圓底燒瓶中,加入6-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)胺基)己酸(70mg,0.181mmol),N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-2-甲基-3-((6-(4-(哌啶-4-基氧基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)苯甲醯胺(138mg,0.218mmol),HATU(83mg,0.218mmol),DIEA(141mg,1.09mmol)和DMF(2mL),室溫攪拌反應1小時。反應完成後,將反應液倒入水(20mL)中,水相以EtOAc (20mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,餘物以製備HPLC(移動相:乙腈-水,0.1%TFA)分離純化後,用飽和碳酸氫鈉水溶液(30mL)洗滌,得到產物(25.0mg,0.0234mmol,產率:13.7%),為黃色固體。
1HNMR (400MHz,DMSO-d6): δ 11.09 (s, 1H), 10.92 (s, 1H), 8.13–8.11 (m, 2H), 7.93–7.89 (m, 2H), 7.68 (d,
J= 7.2Hz, 1H), 7.59–7.55 (m, 3H), 7.42 (t,
J= 7.6Hz, 1H), 7.32 (d,
J= 10.0Hz, 1H), 7.08 (d,
J= 8.4Hz, 1H), 7.01 (d,
J= 7.2Hz, 1H), 6.53 (brs, 1H), 5.07–5.02 (m, 1H), 3.97–3.93 (m, 2H), 3.85–3.81 (m, 1H), 3.72–3.61 (m, 3H), 3.30–3.25 (m, 4H), 3.17–3.12 (m, 1H), 3.04–2.99 (m, 1H), 2.92–2.83 (m, 1H), 2.63 (s, 3H), 2.62–2.50 (m, 2H), 2.29–2.27 (m, 2H), 2.03–2.00 (m, 1H), 1.91–1.88 (m, 2H), 1.79–1.70 (m, 2H), 1.61–1.48 (m, 6H), 1.38-1.31 (m, 4H)。MS (ESI) m/z:1006.4[M+H]
+。
在1μM的濃度下,實施例2標題化合物對Ba/F3-LMNA-NTRK1-G667C的抑制率為>90%。
實施例 3:
N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-(4-(2-(2-(3-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-二側氧基異吲哚啉-4-基)胺基)-3-側氧基丙氧基)乙氧基)乙氧基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺
合成路線如下所示:
步驟1:中間體3-1的製備
在0℃,向2-(2-(苄氧基)乙氧基)乙烷-1-醇(10.0g,51.0mmol),TEA(10.3g,102mmol)和DCM(100mL)的混合物加入對甲苯磺醯氯(11.7g,61.1mmol)。在0℃攪拌2小時後,反應液用水(200mL)稀釋並用乙酸乙酯(100mL*3)萃取。有機相用鹽水洗滌,經Na
2SO
4乾燥,過濾並真空濃縮得到殘留物,隨後通過矽膠柱層析法(PE/乙酸乙酯=10:1)純化得到目標化合物3-1(13.0g,37.1mmol,產率:72.8%),為無色油狀物。MS(ESI)m/z:351.2[M+H]
+。
步驟2:中間體3-2的製備
在氬氣保護下,將2-(2-(苄氧基)乙氧基)乙基4-甲基苯磺酸酯(13.0g,37.1mmol),溴化鋰(32.2g,371mmol)和丙酮(130mL)的混合物加熱至65℃攪拌4小時。冷卻至室溫後,將反應液用水(200mL)稀釋並用乙酸乙酯(200mL*3)萃取。有機相用鹽水洗滌,經Na
2SO
4乾燥,過濾並真空濃縮得到殘留物,隨後通過矽膠柱層析法(PE/乙酸乙酯=5:1)純化得到目標化合物3-2(8.10g,31.3mmol,產率:84.3%),為無色油狀物。MS(ESI)m/z:281.0[M+Na]
+。
步驟3:中間體3-3的製備
在氬氣保護及0℃下,向4-羥基哌啶-1-羧酸苄酯(2.30g,9.78mmol)的DMF(20mL)溶液加入NaH(704mg,60%w/w,17.6mmol)。在0℃攪拌30分鐘,隨後向其加入((2-(2-溴乙氧基)乙氧基)甲基)苯(3.80g,14.7mmol)並升溫至室溫下繼續攪拌16小時。然後,反應液用水(100mL)稀釋並用乙酸乙酯(100mL*3)萃取。有機相用鹽水洗滌,經Na
2SO
4乾燥,過濾並真空濃縮得到殘留物,隨後通過矽膠柱層析法(PE/乙酸乙酯=5:1)純化得到目標化合物3-3(1.32g,3.19mmol,產率:32.7%),為黃色油狀物。MS(ESI)m/z:414.2[M+H]
+。
步驟4:中間體3-4的製備
在氫氣氛圍(15psi),將4-(2-(2-(苄氧基)乙氧基)乙氧基)哌啶-1-羧酸苄酯(1.32g,3.19mmol),Pd/C(300mg,10%w/w),HCl(2mL,2N的二氧六環溶液)和MeOH(30mL)的混合物加熱至65℃攪拌4小時。然後,過濾反應液,濾液真空濃縮,得到目標化合物3-4(650mg,粗品),為無色油狀物,直接用於下一步。MS(ESI)m/z:190.2[M+H]
+。
步驟5:中間體3-5的製備
在0℃,向2-(2-(哌啶-4-基氧基)乙氧基)乙烷-1-醇(650mg,粗品)和TEA(1.04g,10.3mmol)在DCM(8mL)的溶液加入CbzCl(878mg,5.15mmol)。在室溫下攪拌2小時,將反應液用水(50mL)稀釋並用乙酸乙酯(50mL*3)萃取。有機相用鹽水洗滌,經Na
2SO
4乾燥,過濾並真空濃縮得到殘留物,隨後通過製備HPLC(移動相:乙腈-水,0.1%FA)純化,得到目標化合物3-5(500mg,1.55mmol,產率:48.6%,兩步),為黃色油狀物。MS(ESI)m/z:324.2[M+H]
+。
步驟6:中間體3-6的製備
氬氣保護下,4-(2-(2-羥基乙氧基)乙氧基)哌啶-1-甲酸苄酯(400mg,1.24mmol)溶於DMF(2mL),置於冰水浴中冷卻,加入NaH(99mg,60%w/w,2.47mmol),攪拌30分鐘,然後加入3-溴丙酸三級丁酯(518mg,2.48mmol),自然升室溫攪拌反應16小時。反應完成後,加水稀釋,水相以EtOAc (100mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,餘物以製備HPLC(移動相:乙腈-水,0.1%FA)分離純化,得到產物3-6 (130mg,0.329mmol,產率:26.5%),黃色油狀物。MS (ESI) m/z: 396.2 [M+H]
+。
步驟7:中間體3-7的製備
3-(2-(2-((1-((苄氧基)羰基)哌啶-4-基)氧基)乙氧基)乙氧基)丙酸(130mg,0.329mmol)溶於MeOH(10mL),加入Pd/C(35mg,10%w/w),在氫氣氛圍下(15psi)室溫攪拌反應2小時。反應完成後,過濾,濾液減壓濃縮得到產物3-7 (80mg),黃色油狀物,直接用於下步反應。MS(ESI)m/z: 262.2 [M+H]
+。
步驟8:中間體3-8的製備
氬氣保護下,3-(2-(2-(哌啶-4-基氧基)乙氧基)乙氧基)丙酸(80mg),
N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-氯咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺(150mg,0.306mmol)和K
2CO
3(127mg,0.918mmol)分散於DMF(0.5mL)中,加熱至100℃攪拌反應16小時。反應完成後,冷至室溫,加水(30mL)稀釋,水相以EtOAc (100mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,餘物以製備HPLC(移動相:乙腈-水,0.1%FA)分離純化,得到產物3-8 (70mg,兩步產率:29.8%),白色固體。MS(ESI)m/z: 714.2 [M+H]
+。步驟9:實施例3標題化合物
3-(2-(2-((1-(3-((3-((3-氯-5-(三氟甲基)苯基)胺基甲醯基)-2-甲基苯基)乙炔基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-6-基)哌啶-4-基)氧基)乙氧基)乙氧基)丙酸(70mg,0.098mmol)和4-胺基-2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)異吲哚啉-1,3-二酮(54mg,0.196mmol)溶於吡啶(2mL)中,冷至0℃,小心緩慢加入POCl
3(30mg,0.196mmol),加完後維持溫度攪拌反應20分鐘。反應完成後,小心緩慢加入MeOH(2mL)淬滅反應。所得溶液直接以製備HPLC(移動相:乙腈-水,0.1%FA)純化,得到目標終產物(23.0mg,產率:24.2%),白色固體。MS (ESI) m/z: 969.3 [M+H]
+。
1HNMR (400MHz, DMSO-
d6): δ 11.13 (s, 1H), 10.91 (s, 1H), 9.84 (s, 1H), 8.53 (d,
J= 8.4Hz, 1H), 8.20–8.08 (m, 2H), 7.95–7.85 (m, 2H), 7.82 (t,
J= 7.6Hz, 1H), 7.68 (d,
J= 7.2Hz, 1H), 7.62–7.52 (m, 3H), 7.41 (t,
J= 7.2Hz, 1H), 7.30–7.27 (m, 1H), 5.15–5.10 (m, 1H), 3.95–3.85 (m, 2H), 3.75–3.69 (m, 2H), 3.60–3.42 (m, 11H), 2.92–2.85 (m, 1H), 2.70–2.65 (m, 2H), 2.63 (s,3H), 2.62–2.56 (m, 2H), 2.10–2.00 (m, 1H), 1.94–1.82 (m,2H),1.55-1.40 (m,2H)。
在1μM的濃度下,實施例3標題化合物對Ba/F3-LMNA-NTRK1和Ba/F3-LMNA-NTRK1-G667C的抑制率分別為>90%和>90%。
實施例 4:
N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-(4-((1-(3-(2-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)胺基)乙氧基)丙醯基)哌啶-4-基)氧基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺
合成路線如下:
步驟1:中間體4-1的製備
在氬氣保護下,將2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-4-氟異吲哚啉-1,3-二酮(1.00g,3.62mmol),3-(2-胺基乙氧基)丙酸三級丁酯(856mg,4.53mmol),DIEA(1.40g,10.9mmol)和NMP(10mL)的混合物加熱至140℃攪拌2小時。冷卻至室溫後,將反應液用水(50mL)稀釋並用乙酸乙酯(50mL*3)萃取。有機相用鹽水洗滌,經Na
2SO
4乾燥,過濾並真空濃縮得到殘留物,隨後通過矽膠柱層析法(PE:乙酸乙酯=1:1)純化得到目標化合物4-1(1.40g,3.14mmol,產率:86.8%),為綠色油狀物。MS(ESI)m/z:468.3[M+Na]
+。
步驟2:中間體4-2的製備
將3-(2-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)胺基)乙氧基)丙酸三級丁酯(1.40g,3.14mmol)和TFA(5mL)在DCM(5mL)的溶液於室溫攪拌2小時。然後,將反應液真空濃縮,得到目標化合物4-2(1.10g,2.83mmol,產率:90.1%),為黃色固體。MS(ESI)m/z:390.2[M+H]
+。
步驟3:實施例4標題化合物的製備
將2-(2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)胺基乙氧基)丙酸(70mg,0.181mmol),N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-2-甲基-3-((6-(4-(哌啶-4-基氧基)哌啶-1-基)咪唑[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)苯甲醯胺(138mg,0.218mmol),HATU(83mg,0.218mmol),DIEA(141mg,1.09mmol)和DMF(2mL)的混合物室溫攪拌1小時。然後,將反應液用水(10mL)稀釋並用乙酸乙酯(20mL*3)萃取。將有機相用鹽水洗滌,經Na
2SO
4乾燥,過濾並真空濃縮得到殘留物,隨後通過製備HPLC(移動相:乙腈-水,0.1%FA)純化,得到目標終產物(21.0mg,0.0208mmol,產率:11.5%),為黃色固體。
1HNMR(400MHz,DMSO-d6): δ11.08(s,1H), 10.92(s,1H), 8.12(s,2H), 7.93–7.89(m,2H), 7.69(d,J=7.6Hz,1H), 7.59–7.55(m,3H), 7.44–7.40(m,1H), 7.33–7.31(m,1H), 7.12(d,J=8.4Hz,1H), 7.02(d,J=6.8Hz,1H), 6.58–6.55(m,1H), 5.07–5.02(m,1H), 3.98–3.92(m,2H), 3.85–3.79(m,1H), 3.72–3.58(m,8H), 3.47–3.43(m,2H), 3.18–3.11(m,1H), 3.05–2.99(m,1H), 2.91–2.83(m,1H), 2.64(s,3H), 2.63–2.51(m,5H), 2.04–1.98(m,1H), 1.92–1.83(m,2H), 1.77–1.68(m,2H), 1.51–1.43(m,2H), 1.39–1.24(m,2H)。MS(ESI)m/z:1008.1[M+H]
+。
在1μM的濃度下,實施例4標題化合物對Ba/F3-LMNA-NTRK1和Ba/F3-LMNA-NTRK1-G667C的抑制率分別為99.6%和99.7%。Ba/F3-LMNA-NTRK1-G667C細胞在用濃度為0.10μM的實施例4標題化合物處理後的TRK降解率為60.16%。
實施例 5:
N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-(4-(2-(2-(2-(2-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)胺基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺
步驟1:中間體5-1的製備
在0℃,向4-羥基哌啶-1-羧酸苄酯(275mg,1.17mmol)的無水DMF(3mL)溶液中加入NaH(94mg,60%wt,2.34mmol)。在0℃攪拌30分鐘,將(2-(2-(2-(2-溴乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙基)胺基甲酸三級丁酯(500mg,1.40mmol)加入到反應混合物中並繼續室溫攪拌過夜。然後,將反應液用水(50mL)稀釋並用乙酸乙酯(20mL*3)萃取。有機相用鹽水洗滌,經Na
2SO
4乾燥,過濾並真空濃縮得到殘留物,隨後通過製備HPLC(移動相:乙腈-水,0.1%FA)純化得到目標化合物5-1(150mg,0.294mmol,產率:25.1%)為黃色油狀物。MS(ESI)m/z:533.4[M+Na]
+。
步驟2:中間體5-2的製備
在氫氣氛圍(15psi),將4-((2,2-二甲基-4-側氧基-3,8,11,14-四氧雜-5-氮雜十六烷-16-基)氧基)哌啶-1-羧酸苄酯(150mg,0.294mmol),Pd/C(20mg,10%w/w)和MeOH(10mL)的混合物室溫攪拌4小時。然後,過濾反應液,濾液真空濃縮,得到目標化合物5-2(100mg,粗品),為無色油狀物,直接用於下一步。MS(ESI)m/z:377.2[M+H]
+。
步驟3:中間體5-3的製備
將N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-氯咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺(119mg,0.244mmol),(2-(2-(2-(2-(哌啶-4-基氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙基)胺基甲酸三級丁酯(100mg,粗品),K
2CO
3(101mg, 0.732mmol)和DMF(1mL)的混合物加熱至100℃攪拌過夜。冷卻至室溫後,將反應液通過製備HPLC(移動相:乙腈-水,0.1%FA)純化,得到目標化合物5-3(100mg,0.121mmol,收率:41.0%,兩步),為黃色油狀物。MS(ESI)m/z:829.8[M+H]
+。
步驟4:中間體5-4的製備
三級丁基 (2-(2-(2-(2-((1-(3-((3-((3-氯-5-(三氟甲基)苯基)胺基甲醯基)-2-甲基苯基)乙炔基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-6-基)哌啶-4-基)氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙基)胺基甲酸酯(100mg,0.121mmol)和TFA(1mL)溶於DCM(3mL)中並室溫攪拌2小時。然後,將反應液真空濃縮,得到目標化合物5-4(100mg,TFA鹽1:1,0.119mmol,產率:98.3%),為黃色油狀物。MS(ESI)m/z:729.3[M+H]
+。
步驟5:實施例5標題化合物的製備
在氬氣保護下,將3-((6-(4-(2-(2-(2-胺基乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-2-甲基苯甲醯胺(100mg,0.119mmol),2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-4-氟異吲哚啉-1,3-二酮(66mg,0.238mmol)和DIEA(62mg,0.476mmol)溶於NMP(1mL)中並加熱至140℃攪拌2小時。然後,反應液通過製備HPLC(移動相:乙腈-水,0.1%FA)純化,得到目標終產物(25.9mg,0.0263mmol,產率:22.1%),為黃色固體。
1HNMR(400MHz, DMSO-d6): δ 11.08(s, 1H), 10.93(s, 1H), 8.13(s, 2H), 7.91–7.88 (m, 2H), 7.68 (d,
J= 7.6Hz, 1H), 7.59–7.52 (m, 3H), 7.42 (t,
J= 7.6Hz, 1H), 7.34 (d,
J= 10.0 Hz, 1H), 7.09 (d,
J= 8.4Hz, 1H), 7.00 (d,
J= 7.2Hz, 1H), 6.57 (t,
J= 4.8Hz, 1H), 5.06–5.02 (m, 1H), 3.97–3.90 (m, 2H), 3.63–3.46 (m, 17H), 3.27–3.25 (m, 2H), 2.92–2.83 (m, 1H), 2.64 (s, 3H), 2.59–2.55 (m, 2H), 2.07–1.99 (m, 1H), 1.95–1.85 (m, 2H), 1.55–1.45 (m, 2H)。MS(ESI)m/z:985.5[M+H]
+。
在1μM的濃度下,實施例5標題化合物對Ba/F3-LMNA-NTRK1和Ba/F3-LMNA-NTRK1-G667C的抑制率分別為>90%和>90%。Ba/F3-LMNA-NTRK1-G667C細胞在用濃度為0.10μM的實施例5標題化合物處理後的TRK降解率為86.08%。
實施例 6:1-(3-(3-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)胺基甲醯基)-2-甲基苯基)乙炔基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-6-基)哌啶-4-基(4-(2-(2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)胺基)乙醯胺基)丁基)胺基甲酸酯
合成路線如下所示:
步驟1:中間體6-1的製備
在氬氣保護下,甘氨酸三級丁酯(800mg,6.10mmol),2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-4-氟異吲哚啉-1,3-二酮(1.12g,4.07mmol)和DIEA(1.57g,12.2mmol)溶於NMP(12mL),然後加熱至140℃攪拌反應2小時。反應完成後,體系冷至室溫,加水(50mL)稀釋,以EtOAc (30mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,餘物以矽膠柱層析(PE:EtOAc(v/v) = 1:1)分離得到目標化合物6-1 (1.20g,3.10mmol,產率:76.2%),黃色固體。MS(ESI)m/z:332.1 [M+H-56]
+。
步驟2:中間體6-2的製備
2-(2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)甘氨酸三級丁酯(1.20g,3.10mmol)和TFA(3mL)溶於DCM(10mL)並室溫攪拌3小時。然後,將反應液真空濃縮,得到目標化合物6-2(850mg,2.57mmol,產率:82.9%),為黃色固體。MS(ESI)m/z:332.0[M+H]
+。
步驟3:中間體6-3的製備
(2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)甘氨酸(850mg,2.57mmol),(4-胺基丁基)胺基甲酸三級丁酯(380mg,3.08mmol),HATU(1.17g,3.08mmol)和DIEA(994mg,7.71mmol)溶於DMF(10mL)中並室溫攪拌2小時。然後,將反應液用水稀釋(50mL)並用乙酸乙酯(50mL*3)萃取。有機相用鹽水洗滌,經Na
2SO
4乾燥,過濾並真空濃縮得到殘留物,隨後通過矽膠柱層析法(PE:乙酸乙酯=1:1)純化得到目標化合物6-3(550mg,1.10mmol,產率:42.7%),為黃色固體。MS(ESI)m/z:524.2[M+Na]
+。
步驟4:中間體6-4的製備
(4-(2-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)胺基)乙醯胺基)丁基)胺基甲酸三級丁酯(550mg,1.10mmol)和TFA(1mL)溶於DCM(3mL)中並室溫攪拌2小時。然後,將反應液真空濃縮,得到目標化合物6-4(300mg,TFA鹽1:1,0.583mmol,產率:58.2%),為黃色固體。MS(ESI)m/z:402.0[M+H]
+。
步驟5:實施例6標題化合物的製備
1-(3-((3-((3-氯-5-(三氟甲基)苯基)胺基甲醯基)-2-甲基苯基)乙炔基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-6-基)哌啶-4-基(4-硝基苯基)碳酸酯(100mg,0.139mmol),N-(4-胺基丁基)-2-(2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)胺基)乙醯胺(56mg,0.139mmol)和DIEA(54mg,0.417mmol)溶於NMP(1mL)中並室溫攪拌1小時。反應液通過製備HPLC(移動相:乙腈-水,0.1%FA)純化,得到目標終產物(26.0mg,0.0265mmol,產率:19.1%),為黃色固體。
1HNMR(400MHz,DMSO-d6): δ11.10(s,1H), 10.91(s,1H), 8.12(brs,2H), 8.09–8.06(m,1H), 7.94–7.90(m,2H), 7.68(d,J=7.6Hz,1H), 7.60–7.54(m,3H),7.42(t,J=7.6Hz,1H), 7.34–7.31(m,1H), 7.10–7.05(m,2H), 6.95–6.92(m,1H), 6.84(d,J=8.8Hz,1H), 5.09–5.04(m,1H), 4.79–4.73(m,1H), 3.98–3.87(m,4H), 3.40–3.35(m,2H), 3.10–3.07(m,2H), 2.97–2.94(m,2H), 2.89–2.83(m,1H), 2.63(s,3H), 2.57–2.53(m,2H), 2.04–2.00(m,1H), 1.99–1.93(m,2H), 1.65–1.55(m,2H), 1.40–1.34(m,4H)。MS(ESI)m/z:981.3[M+H]
+。
在1μM的濃度下,實施例6標題化合物對Ba/F3-LMNA-NTRK1-G667C的抑制率為>90%。
實施例 7 : N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-(4-((1-(3-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)胺基)丙醯基)哌啶-4-基)氧基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺
步驟1:三級丁基 (3-(4-((1-(3-((3-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)胺基甲醯基)-2-甲基苯基)乙炔基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-6-基)哌啶-4-基)氧基)哌啶-1-基)-3-側氧基丙基)胺基甲酸酯
室溫下,在25 ml反應瓶中加入
N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-2-甲基-3-((6-(4-(哌啶-4-基氧基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)苯甲醯胺(200 mg,0.31 mmol),DMF(4 mL),3-((三級丁氧基羰基)胺基)丙酸(89 mg,0.47 mmol)和HATU(239 mg,0.63 mmol),室溫攪拌反應10分鐘,然後加入Et
3N(95 mg,0.94 mmol),室溫反應0.5小時。反應完成後,將反應液倒入水(100mL)中,水相以EtOAc (50mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,餘物以矽膠柱層析(DCM:MeOH (v/v) = 20:1)分離得到產物4-1 (190mg,產率:74.8%),黃色固體。MS (ESI) m/z:708.2[M+H-100]
+。
步驟2:3-((6-(4-((1-(3-胺基丙醯基)哌啶-4-基)氧基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-
N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-2-甲基苯甲醯胺
室溫下,在50 ml反應瓶中加入三級丁基 (3-(4-((1-(3-((3-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)胺基甲醯基)-2-甲基苯基)乙炔基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-6-基)哌啶-4-基)氧基)哌啶-1-基)-3-側氧基丙基)胺基甲酸酯(190 mg,0.24 mmol),二氯甲烷(3 mL)和TFA(2 mL),室溫攪拌反應2小時。反應完成後,減壓濃縮除去溶劑,余物加水(30 mL),用10% NaOH水溶液調pH=9~10,水相以EtOAc (30mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,得黃色固體為產物150 mg,直接用於下步反應。MS (ESI) m/z: 708.2 [M + H]
+。
步驟3:
N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-(4-((1-(3-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)胺基)丙醯基)哌啶-4-基)氧基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺
氮氣保護下,於一50 ml反應瓶中,加入3-((6-(4-((1-(3-胺基丙醯基)哌啶-4-基)氧基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-
N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-2-甲基苯甲醯胺(150 mg,0.21 mmol),NMP(3 mL),2-(2,6-側氧基哌啶-3-基)-4-氟異吲哚啉-1,3-二酮(88 mg,0.32 mmol)和Et
3N(64 mg,0.64 mmol),加熱到90℃反應3小時。反應完成後,將反應液倒入水(100mL)中,水相以EtOAc (50mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,餘物以矽膠柱層析(DCM:MeOH (v/v) = 20:1)分離得到產物(70 mg,產率34.3%),黃色固體。MS (ESI) m/z: 964.2 [M +H]
+。
1H NMR (500 MHz, CDCl
3) δ 8.51 – 8.48 (m, 1H), 8.28 – 8.25 (m, 1H), 8.05 (s, 1H), 7.86 (s, 1H), 7.73 (s, 1H), 7.65 – 7.61 (m, 2H), 7.48 (t,
J= 7.8 Hz, 1H), 7.41 – 7.38 (m, 2H), 7.23 (d,
J= 7.6 Hz, 1H), 7.06 (d,
J= 7.1 Hz, 1H), 6.93 (d,
J= 8.5 Hz, 1H), 6.89 – 6.82 (m, 1H), 6.52 (t,
J= 6.0 Hz, 1H), 4.89 – 4.85 (m, 1H), 3.84 – 3.76 (m, 3H), 3.73 – 3.53 (m, 5H), 3.44 – 3.19 (m, 4H), 2.90 – 2.52 (m, 8H), 2.11 – 2.07 (m, 1H), 1.87 – 1.82 (m, 2H), 1.79 – 1.46 (m, 4H), 1.27 – 1.22 (m, 2H).
在1μM的濃度下,實施例7標題化合物對Ba/F3-LMNA-NTRK1和Ba/F3-LMNA-NTRK1-G667C的抑制率分別為98.7%和99.5%。
實施例 8 : N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-(4-((1-(4-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)胺基)丁醯基)哌啶-4-基)氧基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺
按實施例7的方法合成得到,MS (ESI) m/z: 978.3 [M +H]
+。
1H NMR (500 MHz, CDCl
3) δ 8.32 (s, 1H), 8.16 (s, 1H), 8.04 (s, 1H), 7.84 (s, 1H), 7.76 (s, 1H), 7.65 – 7.61 (m, 2H), 7.47 (t,
J= 7.8 Hz, 1H), 7.41 – 7.38 (m, 2H), 7.23 (d,
J= 7.6 Hz, 1H), 7.06 (d,
J= 7.1 Hz, 1H), 6.96 (d,
J= 8.6 Hz, 1H), 6.87 (d,
J= 9.9 Hz, 1H), 6.29 (t,
J= 6.0 Hz, 1H), 4.89 – 4.85 (m, 1H), 3.84 – 3.76 (m, 3H), 3.68 – 3.65 (m, 3H), 3.37 – 3.20 (m, 6H), 2.90 – 2.68 (m, 6H), 2.45 – 2.41 (m, 2H), 2.14 – 2.08 (m, 1H), 1.96 – 1.82 (m, 4H), 1.79 – 1.46 (m, 4H), 1.27 – 1.22 (m, 2H).
在1μM的濃度下,實施例8標題化合物對Ba/F3-LMNA-NTRK1和Ba/F3-LMNA-NTRK1-G667C的抑制率分別為99.5%和99.8%。
實施例 9 : N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-(4-((1-(3-(2-(2-(2-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)胺基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)丙醯基)哌啶-4-基)氧基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺
按實施例7的方法合成得到,MS (ESI) m/z: 1096.4 [M+H]
+。
1H NMR (500 MHz, CDCl
3) δ 8.65 (s, 1H), 8.33 (s, 1H), 8.04 (s, 1H), 7.84 (s, 1H), 7.77 (s, 1H), 7.65 – 7.61 (m, 2H), 7.47 (t,
J= 7.8 Hz, 1H), 7.43 – 7.36 (m, 2H), 7.23 (d,
J= 7.6 Hz, 1H), 7.07 (d,
J= 7.1 Hz, 1H), 6.96 – 6.86 (m, 2H), 6.45 (t,
J= 6.0 Hz, 1H), 4.89 – 4.85 (m, 1H), 3.86 – 3.84 (m, 3H), 3.78 – 3.70 (m, 2H), 3.69 – 3.59 (m, 13H), 3.47 – 3.40 (m, 2H), 3.38 – 3.20 (m, 4H), 2.87 – 2.70 (m, 6H), 2.61 – 2.57 (m, 2H), 2.13 – 2.05 (m, 1H), 1.96 – 1.52 (m, 6H), 1.35 – 1.26 (m, 2H).
在1μM的濃度下,實施例9標題化合物對Ba/F3-LMNA-NTRK1和Ba/F3-LMNA-NTRK1-G667C的抑制率分別為99.9%和99.8%。
實施例 10 : N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-(4-((1-(4-(2-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)胺基)乙氧基)丁醯基)哌啶-4-基)氧基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺
按實施例2的方法合成得到,MS (ESI) m/z: 1022.4 [M+H]
+。
1H NMR (500 MHz, CDCl
3) δ 8.20 (s, 1H), 8.04 (s, 1H), 7.88 – 7.73 (m, 2H), 7.65 – 7.61 (m, 2H), 7.47 – 7.36 (m, 3H), 7.28 – 7.21 (m, 1H), 7.16 – 7.08 (m, 1H), 6.95 – 6.79 (m, 2H), 4.97 – 4.86 (m, 1H), 4.11 – 3.95 (m, 2H), 3.94 – 3.77 (m, 3H), 3.75 – 3.60 (m, 3H), 3.59 – 3.41 (m, 4H), 3.41 – 3.18 (m, 4H), 2.99 – 2.86 (m, 1H), 2.81 – 2.68 (m, 4H), 2.44 – 2.30 (m, 2H), 2.15 – 1.64 (m, 8H), 1.42 – 1.17 (m, 4H).
在1μM的濃度下,實施例10標題化合物對Ba/F3-LMNA-NTRK1和Ba/F3-LMNA-NTRK1-G667C的抑制率分別為88.3%和99.1%。
實施例 11 : N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-(4-((1-(1-((1-(2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)哌啶-4-基)甲基)哌啶-4-羰基)哌啶-4-基)氧基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺
按實施例7的方法合成得到,MS (ESI) m/z: 1101.3 [M+H]
+。
1H NMR (500 MHz, DMSO-
d 6) δ 11.06 (s, 1H), 10.90 (s, 1H), 8.19 – 8.08 (m, 2H), 7.96 – 7.86 (m, 2H), 7.74 – 7.64 (d, 2H), 7.59 (s, 1H), 7.56 (d,
J= 7.4 Hz, 1H), 7.42 (t,
J= 7.6 Hz, 1H), 7.38 – 7.26 (m, 3H), 5.12 – 5.04 (m, 1H), 4.00 – 3.91 (m, 2H), 3.90 – 3.82 (m, 1H), 3.80 – 3.62 (m, 5H), 3.60 – 3.50 (m, 2H), 3.15 – 2.78 (m, 9H), 2.67 – 2.56 (m, 5H), 2.21 – 2.00 (m, 3H), 1.96 – 1.22 (m, 18H).
在1μM的濃度下,實施例11標題化合物對Ba/F3-LMNA-NTRK1和Ba/F3-LMNA-NTRK1-G667C的抑制率分別為99.2%和99.1%。
實施例 12 : N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-(4-((1-(2-(6-(2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)-2,6-二氮雜螺[3.3]庚烷-2-基)乙醯基)哌啶-4-基)氧基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺
按實施例7的方法合成得到,MS (ESI) m/z: 1031.4 [M+H]
+。
1H NMR (500 MHz, CDCl
3) δ 8.22 (s, 1H), 8.13 – 7.97 (m, 2H), 7.88 – 7.73 (m, 2H), 7.70 – 7.62 (m, 2H), 7.46 – 7.38 (m, 3H), 7.31 – 7.26 (m, 1H), 7.15 (d,
J= 7.0 Hz, 1H), 6.88 (d,
J= 9.9 Hz, 1H), 6.55 (d,
J= 8.5 Hz, 1H), 4.95 – 4.81 (m, 1H), 4.31 (s, 4H), 3.95 – 3.78 (m, 3H), 3.75 – 3.61 (m, 3H), 3.49 (s, 4H), 3.41 – 3.18 (m, 6H), 2.91 – 2.62 (m, 6H), 2.14 – 2.02 (m, 1H), 1.99 – 1.88 (m, 2H), 1.87 – 1.75 (m, 2H), 1.74 – 1.65 (m, 2H), 1.55 – 1.50 (m, 2H).
在1μM的濃度下,實施例12標題化合物對Ba/F3-LMNA-NTRK1和Ba/F3-LMNA-NTRK1-G667C的抑制率分別為99.7%和99.1%。
實施例 13 : N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-(4-((1-(2-(1-(2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)哌啶-4-基)乙醯基)哌啶-4-基)氧基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺
按實施例7的方法合成得到,MS (ESI) m/z: 1018.4 [M+H]
+。
1H NMR (500 MHz, CDCl
3) δ 8.34 (s, 1H), 8.13 – 8.01 (m, 2H), 7.84 (s, 1H), 7.80 – 7.74 (m, 2H), 7.62 (d,
J= 7.6 Hz, 1H), 7.55 (t,
J= 7.8 Hz, 1H), 7.46 – 7.39 (m, 2H), 7.35 (d,
J= 7.1 Hz, 1H), 7.28 (s, 1H), 7.15 (d,
J= 8.4 Hz, 1H), 6.93 (d,
J= 9.9 Hz, 1H), 4.98 – 4.90 (m, 1H), 3.95 – 3.78 (m, 3H), 3.76 – 3.65 (m, 5H), 3.48 – 3.25 (m, 4H), 2.94 – 2.79 (m, 4H), 2.70 (s, 3H), 2.32 – 2.25 (m, 2H), 2.20 – 2.05 (m, 3H), 1.95 – 1.78 (m, 6H), 1.74 – 1.65 (m, 2H), 1.64 – 1.46 (m, 4H).
在1μM的濃度下,實施例13標題化合物對Ba/F3-LMNA-NTRK1-G667C的抑制率為97.2%。
實施例 14 : N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-(4-(4-(2-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-5-基)胺基)乙氧基)丁醯胺基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺
步驟1:三級丁基 (1-(3-((3-((3-氯-5-(三氟甲基)苯基)胺基甲醯基)-2-甲基苯基)乙炔基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-6-基)哌啶-4-基)胺基甲酸酯(14-1)
N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-氯咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺(3.0 g,6.13 mmol),哌啶-4-基胺基甲酸三級丁酯(1.8 g,9.2 mmol),K
2CO
3(1.7 g,12.3 mmol)分散於DMF(50mL),加熱至110℃攪拌反應16小時。反應完成後,體系冷至室溫,將反應液倒入水(50mL)中,水相以EtOAc (50mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,餘物以矽膠柱層析(PE:EtOAc(v/v) = 1:1)分離得到產物14-1 (3.1 g,產率:77.4%),白色固體。MS(ESI)m/z:653.2[M+H]
+。
步驟2:3-((6-(4-胺基哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-
N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-2-甲基苯甲醯胺
於一50 ml反應瓶中,三級丁基 (1-(3-((3-((3-氯-5-(三氟甲基)苯基)胺基甲醯基)-2-甲基苯基)乙炔基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-6-基)哌啶-4-基)胺基甲酸酯(2.5 g,3.82 mmol)溶於DCM(10.0 mL),然後加入TFA(10.0 mL),室溫攪拌反應3小時,反應完成後,減壓濃縮,余物加水稀釋,以5% NaHCO
3水溶液調pH = 7,水相以EtOAc (150mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,得白色固體1.7 g,為目標化合物,直接用於下步反應。MS(ESI)m/z:553.1[M+H]
+。
步驟3:4-(2-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-5-基)胺基)乙氧基)丁酸三級丁酯
氮氣保護下,於一50 ml反應瓶中,加入4-(2-溴乙氧基)丁酸三級丁酯(250 mg,0.94 mmol),DMF(4 mL),5-胺基-2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)異吲哚啉-1,3-二酮(332 mg,1.22 mmol)和K
2CO
3(388 mg,2.81 mmol),室溫攪拌反應3小時。反應完成後,反應液倒入水(80 mL)中,水相以EtOAc (50mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,餘物以矽膠柱層析(PE:EtOAc(v/v) = 1:1)分離得到產物14-3 (110 mg,產率:25.6%),白色固體。MS(ESI)m/z:482.2[M+Na]
+。
步驟4:4-(2-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-5-基)胺基)乙氧基)丁酸
於一50 ml反應瓶中加入4-(2-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-5-基)胺基)乙氧基)丁酸三級丁酯(110 mg,0.24 mmol)溶於DCM(3 mL),加入TFA(2 mL),室溫攪拌反應2小時。反應完成後,減壓濃縮得油狀物100 mg,直接用於下步反應。MS(ESI)m/z:404.1[M+H]
+。
步驟5:
N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-(4-(4-(2-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-5-基)胺基)乙氧基)丁醯胺基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺
於一50 ml圓底燒瓶中加入3-((6-(4-胺基哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-
N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-2-甲基苯甲醯胺(137 mg,0.25 mmol),DMF(4 mL),4-(2-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-5-基)胺基)乙氧基)丁酸(100 mg,0.25 mmol),Et
3N(100 mg,0.99 mmol)和HATU(188 mg,0.50 mmol),室溫攪拌反應1小時。反應完成後,反應液倒入水(100 mL)中,水相以EtOAc (50mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,餘物以矽膠柱層析(DCM:MeOH(v/v) = 10:1)分離得到產物(40 mg,產率:17.2%),白色固體。MS(ESI)m/z:938.3[M+H]
+。
1H NMR (500 MHz, CDCl
3) δ 8.66 (s, 1H), 8.07 (s, 1H), 7.87 (s, 1H), 7.75 (s, 1H), 7.65 – 7.52 (m, 2H), 7.51 – 7.34 (m, 3H), 7.26 – 7.22 (m, 1H), 6.89 (s, 1H), 6.82 – 6.77 (m, 1H), 6.71 – 6.59 (m, 1H), 6.48 – 6.28 (m, 1H), 4.90 – 4.75 (m, 1H), 4.53 (s, 2H), 4.21 – 3.84 (m, 5H), 3.61 – 3.30 (m, 4H), 3.16 – 2.99 (m, 2H), 2.72 – 2.58 (m, 5H), 2.27 – 2.10 (m, 2H), 1.96 – 1.74 (m, 4H), 1.53 – 1.40 (m, 2H).
在1μM的濃度下,實施例14標題化合物對Ba/F3-LMNA-NTRK1和Ba/F3-LMNA-NTRK1-G667C的抑制率分別為98.7%和99.0%。
實施例 15 : N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-(4-(4-(2-(2-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-5-基)胺基)乙氧基)乙氧基)丁醯胺基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺
按實施例14的方法合成得到,MS (ESI) m/z: 982.0 [M+H]
+。
1H NMR (500 MHz, CDCl
3) δ 8.77 (s, 1H), 8.07 (s, 1H), 7.88 (s, 1H), 7.75 (s, 1H), 7.62 – 7.56 (m, 2H), 7.52 – 7.47 (m, 1H), 7.43 – 7.36 (m, 2H), 7.26 – 7.22 (m, 1H), 6.92 (d,
J= 2.1 Hz, 1H), 6.82 – 6.73 (m, 2H), 6.42 (d,
J= 7.9 Hz, 1H), 4.85 – 4.78 (m, 1H), 4.53 (s, 2H), 4.14 – 3.81 (m, 5H), 3.59 – 3.37 (m, 8H), 3.08 – 2.99 (m, 2H), 2.70 – 2.63 (m, 5H), 2.27 – 2.21 (m, 2H), 1.88 – 1.82 (m, 4H), 1.49 – 1.41 (m, 2H).
在1μM的濃度下,實施例15標題化合物對Ba/F3-LMNA-NTRK1-G667C的抑制率為98.9%。
實施例 16 : N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-(4-(5-(2-(2-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-5-基)胺基)乙氧基)乙氧基)戊醯胺基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺
按實施例14的方法合成得到,MS (ESI) m/z: 996.4 [M+H]
+。
1H NMR (500 MHz, CDCl
3) δ 8.56 (s, 1H), 8.06 (s, 1H), 7.85 (s, 1H), 7.77 (s, 1H), 7.67 – 7.58 (m, 2H), 7.52 (d,
J= 8.2 Hz, 1H), 7.46 – 7.34 (m, 2H), 7.31 – 7.26 (m, 1H), 6.93 (d,
J= 2.1 Hz, 1H), 6.87 – 6.71 (m, 2H), 6.20 (d,
J= 7.9 Hz, 1H), 4.89 – 4.76 (m, 1H), 4.51 (s, 2H), 4.18 – 3.80 (m, 5H), 3.55 – 3.41 (m, 8H), 3.16 – 2.99 (m, 2H), 2.74 – 2.61 (m, 5H), 2.21 – 2.13 (m, 2H), 2.08 – 1.85 (m, 3H), 1.74 – 1.63 (m, 3H), 1.51 – 1.36 (m, 2H).
在1μM的濃度下,實施例16標題化合物對Ba/F3-LMNA-NTRK1和Ba/F3-LMNA-NTRK1-G667C的抑制率分別為71.9%和98.8%。
實施例 17 : N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-(4-(4-(2-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-5-基)氧基)乙氧基)丁醯胺基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺
按實施例14的方法合成得到,MS (ESI) m/z: 939.3 [M+H]
+。
1H NMR (500 MHz, CDCl
3) δ 8.54 (s, 1H), 8.45 (s, 1H), 8.04 (s, 1H), 7.84 (s, 1H), 7.73 (s, 1H), 7.69 – 7.54 (m, 3H), 7.41 – 7.36 (m, 3H), 7.25 – 7.20 (m, 1H), 7.15 (dd,
J= 8.3, 2.3 Hz, 1H), 6.80 (d,
J= 9.9 Hz, 1H), 5.83 (d,
J= 7.8 Hz, 1H), 4.90 – 4.83 (m, 1H), 4.24 – 4.20 (m, 2H), 4.16 – 4.04 (m, 2H), 4.00 – 3.87 (m, 1H), 3.82 – 3.78 (m, 2H), 3.55 (t,
J= 5.9 Hz, 2H), 3.09 – 3.00 (m, 2H), 2.89 – 2.61 (m, 6H), 2.26 (t,
J= 7.2 Hz, 2H), 2.13 – 2.07 (m, 1H), 2.00 – 1.88 (m, 4H), 1.50 – 1.40 (m, 2H).
在1μM的濃度下,實施例17標題化合物對Ba/F3-LMNA-NTRK1和Ba/F3-LMNA-NTRK1-G667C的抑制率分別為94.6%和98.9%。
實施例 18 : N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-(4-(4-(2-(2-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-5-基)氧基)乙氧基)乙氧基)丁醯胺基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺
按實施例14的方法合成得到,MS (ESI) m/z: 983.0 [M+H]
+。
1H NMR (500 MHz, CDCl
3) δ 8.80 (s, 1H), 8.50 (s, 1H), 8.11 (s, 1H), 7.89 (s, 1H), 7.70(s, 1H), 7.59-7.50 (m, 3H), 7.40-7.32 (m, 2H), 7.26-7.18(m, 2H), 7.18-7.10 (m, 1H), 6.70(d,
J= 10Hz, 1H), 6.06 (d,
J= 7.5Hz, 1H), 4.91--4.88 (m, 1H), 4.17-4.05 (m, 4H), 3.90-3.80 (m, 1H), 3.75 – 3.70 (m, 2H), 3.60-3.55 (m, 2H), 3.53-3.51 (m, 2H), 3.48-3.41 (m, 2H), 3.05 – 2.98 (m, 2H), 2.87-2.69 (m, 6H), 2.23-2.10 (m, 3H), 1.89-1.75(m, 4H), 1.49-1.25(m, 2H).
在1μM的濃度下,實施例18標題化合物對Ba/F3-LMNA-NTRK1和Ba/F3-LMNA-NTRK1-G667C的抑制率分別為99.0%和99.4%。
實施例 19 : N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-(4-(4-(3-(2-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-5-基)氧基)乙氧基)丙氧基)丁醯胺基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺
按實施例14的方法合成得到,MS (ESI) m/z: 997.3 [M+H]
+。
1H NMR (500 MHz, CDCl
3) δ 8.42 (s, 1H), 8.27 (s, 1H), 8.05 (s, 1H), 7.84 (s, 1H), 7.76 (s, 1H), 7.71 – 7.55 (m, 3H), 7.43 – 7.36 (m, 2H), 7.26-7.18(m, 2H), 7.16 (dd,
J= 8.3, 2.3 Hz, 1H), 6.83 (d,
J= 10.0 Hz, 1H), 5.84 (d,
J= 7.8 Hz, 1H), 4.93 – 4.86 (m, 1H), 4.24 – 4.05 (m, 4H), 4.02-3.89 (m, 1H), 3.76 (t,
J= 4.6 Hz, 2H), 3.57 (t,
J= 6.3 Hz, 2H), 3.52 – 3.36 (m, 4H), 3.12 – 3.04 (m, 2H), 2.94 – 2.63 (m, 6H), 2.23 (t,
J= 7.2 Hz, 2H), 2.16 – 2.09 (m, 1H), 2.06 – 1.94 (m, 2H), 1.90 – 1.79 (m, 4H), 1.49 – 1.41 (m, 2H).
在1μM的濃度下,實施例19標題化合物對Ba/F3-LMNA-NTRK1和Ba/F3-LMNA-NTRK1-G667C的抑制率分別為98.9%和99.0%。
實施例 20 : N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-(4-(5-(2-(2-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-5-基)氧基)乙氧基)乙氧基)戊醯胺基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺
按實施例14的方法合成得到,MS (ESI) m/z: 997.3 [M+H]
+。
1H NMR (500 MHz, CDCl
3) δ 8.50 (s, 1H), 8.31 (s, 1H), 8.05 (s, 1H), 7.84 (s, 1H), 7.76 (s, 1H), 7.70 – 7.56 (m, 3H), 7.45 – 7.36 (m, 2H), 7.29 – 7.22 (m, 2H), 7.16 (dd,
J= 8.3, 2.3 Hz, 1H), 6.82 (d,
J= 9.9 Hz, 1H), 5.84 (d,
J= 7.9 Hz, 1H), 4.94 – 4.85 (m, 1H), 4.24 – 4.06 (m, 4H), 4.03 – 3.90 (m, 1H), 3.82 (t,
J= 4.6 Hz, 2H), 3.69 – 3.63 (m, 2H), 3.60 – 3.53 (m, 2H), 3.47 (t,
J= 6.0 Hz, 2H), 3.12 – 3.02 (m, 2H), 2.93 – 2.63 (m, 6H), 2.21 – 2.08 (m, 3H), 2.03 – 1.94 (m, 2H), 1.72 – 1.62 (m, 2H), 1.60 – 1.53 (m, 2H), 1.52 – 1.40 (m, 2H).
在1μM的濃度下,實施例20標題化合物對Ba/F3-LMNA-NTRK1和Ba/F3-LMNA-NTRK1-G667C的抑制率分別為99.4%和99.4%。
實施例 21 : N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-(4-((5-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)氧基)戊基)氧基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺
步驟1:三級丁基 4-((5-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)氧基)戊基)氧基)哌啶-1-甲酸酯
於一50 ml反應瓶中,加入4-((5-溴戊基)氧基)哌啶-1-甲酸三級丁酯(370 mg,1.06 mmol),DMF(5 mL),2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-4-羥基異吲哚啉-1,3-二酮(376 mg,1.37 mmol)和Et
3N(320 mg,3.17 mmol),加熱到70℃攪拌反應3小時。反應完成後,反應液倒入水(80 mL)中,水相以EtOAc (50mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,餘物以矽膠柱層析(DCM:MeOH(v/v) = 20:1)分離得到產物21-1 (400 mg,產率:69.7%)。MS(ESI)m/z:444.1[M+H-100]
+。
步驟2:2-(2,6-二側氧基哌啶 -3-基)-4-((5-(哌啶-4-基氧基)戊基)氧基)異吲哚啉-1,3-二酮
於一50 ml反應瓶中, 三級丁基 4-((5-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)氧基)戊基)氧基)哌啶-1-甲酸酯(400 mg,0.74 mmol)溶於DCM(10.0 mL),然後加入TFA(6.0 mL),室溫攪拌反應1小時,反應完成後,減壓濃縮,余物加水稀釋,以5% Na
2CO
3水溶液調pH = 9-10,水相以EtOAc (100mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,得油狀物330 mg,為目標化合物,直接用於下步反應。MS(ESI)m/z:444.1[M+H]
+。
步驟3:
N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-(4-((5-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)氧基)戊基)氧基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺
氮氣保護下,
N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-氯咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺(364 mg,0.74 mmol),2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-4-((5-(哌啶-4-基氧基)戊基)氧基)異吲哚啉-1,3-二酮(330 mg,0.74 mmol),Et
3N(301 mg,2.98 mmol)溶於DMF(3mL),加熱至95℃攪拌反應5小時。反應完成後,體系冷至室溫,將反應液倒入水(50mL)中,水相以EtOAc (50mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,餘物以矽膠柱層析(DCM:MeOH (v/v) = 10:1)分離得到產物(50mg,產率:7.5%),黃色固體。MS (ESI) m/z:896.1[M+H]
+。
1H NMR (500 MHz, CDCl
3) δ 8.48 (s, 1H), 8.20 (s, 1H), 8.03 (s, 1H), 7.86 (s, 1H), 7.70 (s, 1H), 7.65 – 7.53 (m, 2H), 7.42 – 7.35 (m, 3H), 7.17 (d,
J= 8.4 Hz, 1H), 6.90 (d,
J= 9.2 Hz, 1H), 4.82 – 4.76 (m, 1H), 4.24 – 4.06 (m, 3H), 3.87 – 3.84 (m, 2H), 3.58 – 3.52 (m, 3H), 3.37 – 3.30 (m, 2H), 2.92 – 2.60 (m, 6H), 2.03 – 1.72 (m, 4H), 1.42 – 1.20 (m, 6H).
在1μM的濃度下,實施例21標題化合物對Ba/F3-LMNA-NTRK1-G667C的抑制率為99.7%。
實施例 22 : N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-(4-((5-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)胺基)戊基)氧基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺
按實施例21的方法合成得到,MS (ESI) m/z: 895.3 [M+H]
+。
1H NMR (500 MHz, CDCl
3) δ 8.21 (s, 1H), 8.05 (s, 1H), 7.83 (s, 1H), 7.70 (s, 1H), 7.61 (d,
J= 7.2 Hz, 1H), 7.52 (s, 1H), 7.42 – 7.35 (m, 3H), 7.26 – 7.24 (m, 1H), 7.09 (d,
J= 6.8 Hz, 1H), 6.89 (s, 1H), 6.82 (d,
J= 8.1 Hz, 1H), 4.91 – 4.79 (m, 1H), 3.80 – 3.75 (m, 4H), 3.58 – 3.25 (m, 4H), 2.78 – 2.60 (m, 5H), 2.03 – 1.70 (m, 4H), 1.46 – 1.33 (m, 6H).
在1μM的濃度下,實施例22標題化合物對Ba/F3-LMNA-NTRK1-G667C的抑制率為98.0%。
實施例 23 : N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-(4-((9-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)胺基)壬基)氧基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺
按實施例21的方法合成得到,MS (ESI) m/z: 951.2 [M+H]
+。
1H NMR (400 MHz, CDCl
3) δ 8.27 (s, 1H), 8.05 (s, 1H), 7.83 (s, 1H), 7.75 (s, 1H), 7.63 – 7.55 (m, 2H), 7.42 – 7.35 (m, 3H), 7.24 (d,
J= 7.7 Hz, 1H), 7.12 (d,
J= 7.1 Hz, 1H), 6.87 – 6.81 (m, 2H), 4.91 – 4.81 (m, 1H), 3.92 – 3.84 (m, 2H), 3.78 – 3.69 (m, 2H), 3.58 – 3.24 (m, 5H), 2.92 – 2.60 (m, 6H), 2.03 – 1.82 (m, 4H), 1.69 – 1.40 (m, 5H), 1.39 – 1.21 (m, 9H).
實施例 24 : N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-(4-((1-(7-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)胺基)庚基)哌啶-4-基)氧基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺
步驟1:4-((7-溴庚基)胺基)-2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)異吲哚啉-1,3-二酮
室溫下,在25 ml反應瓶中依次加入4-胺基-2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)異吲哚啉-1,3-二酮(110 mg,0.40 mmol),NMP(2 mL),1,7-二溴庚烷(156 mg,0.60 mmol)和K
2CO
3(139 mg,1.00 mmol),室溫攪拌反應3小時。反應完成後,反應液倒入水(80 mL)中,水相以EtOAc (50mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,餘物以矽膠柱層析(PE:EtOAc(v/v) = 1:1)分離得到產物24-1 (80 mg,產率:44.1%),油狀物。MS(ESI)m/z:450.1[M+H]
+。
步驟2:
N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-(4-((1-(7-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)胺基)庚基)哌啶-4-基)氧基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺
室溫下,在25 ml反應瓶中依次加入4-((7-溴庚基)胺基)-2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)異吲哚啉-1,3-二酮(80 mg,0.18 mmol),DMF(2 mL),N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-2-甲基-3-((6-(4-(哌啶-4-基氧基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)苯甲醯胺(113 mg,0.18 mmol)和K
2CO
3(61mg,0.44 mmol),室溫攪拌反應3小時。反應完成後,反應液倒入水(80 mL)中,水相以EtOAc (50mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,餘物以矽膠柱層析(DCM:MeOH(v/v) = 10:1)分離得到產物(35 mg,產率:19.6%),黃色固體。MS(ESI)m/z:1006.3[M+H]
+。
1H NMR (500 MHz, CDCl
3) δ 8.36 (s, 1H), 8.06 (s, 1H), 7.86 (s, 1H), 7.75 (s, 1H), 7.68 – 7.62 (m, 2H), 7.42 – 7.35 (m, 3H), 7.26 – 7.24 (m, 1H), 7.11 (d,
J= 5.5 Hz, 1H), 6.89 – 6.85 (m, 2H), 4.91 – 4.79 (m, 1H), 3.80 – 3.75 (m, 5H), 3.68 – 3.65 (m, 4H), 3.37 – 2.64 (m, 10H), 2.45 – 2.08 (m, 2H), 1.96 – 1.46 (m, 9H), 1.40 – 1.22 (m, 9H).
在1μM的濃度下,實施例24標題化合物對Ba/F3-LMNA-NTRK1和Ba/F3-LMNA-NTRK1-G667C的抑制率分別為90.8%和99.7%。
實施例 25 : N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-(4-((1-(7-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)氧基)庚基)哌啶-4-基)氧基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺
按實施例24的方法合成得到,MS (ESI) m/z: 1007.3 [M+H]
+。
1H NMR (500 MHz, CDCl
3) δ 8.58 (s, 1H), 8.05 (s, 1H), 7.88 (s, 1H), 7.77 (s, 1H), 7.68 – 7.59 (m, 3H), 7.42 – 7.35 (m, 3H), 7.26 – 7.24 (m, 1H), 7.19 (d,
J= 8.5 Hz, 1H), 6.85 (d,
J= 9.9 Hz, 1H), 4.93 (dd,
J= 11.8, 5.1 Hz, 1H), 4.16 – 4.12 (m, 2H), 3.80 – 3.70 (m, 3H), 3.68 – 3.65 (m, 1H), 3.37 – 2.88 (m, 5H), 2.85 – 2.61 (m, 8H), 2.45 – 2.08 (m, 3H), 1.96 – 1.46 (m, 8H), 1.40 – 1.20 (m, 9H).
在1μM的濃度下,實施例25標題化合物對Ba/F3-LMNA-NTRK1和Ba/F3-LMNA-NTRK1-G667C的抑制率分別為99.6%和99.4%。
實施例 26 : N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-(4-(2-(2-(2-(2-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)胺基)丙氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺
按實施例4的方法合成得到,MS (ESI) m/z: 999.3 [M+H]
+。
1H NMR (500 MHz, CDCl
3) δ 8.52 (s, 1H), 8.05 (s, 1H), 7.86 (s, 1H), 7.74 (s, 1H), 7.64 (d,
J= 9.9 Hz, 1H), 7.59 (d,
J= 7.7 Hz, 1H), 7.45 (t,
J= 7.8 Hz, 1H), 7.41 – 7.33 (m, 2H), 7.23 (t,
J= 7.7 Hz, 1H), 7.02 (d,
J= 7.1 Hz, 1H), 6.87 (t,
J= 9.0 Hz, 2H), 6.42 (t,
J= 5.7 Hz, 1H), 4.87 – 4.79 (m, 1H), 3.91 – 3.85 (m, 2H), 3.70 – 3.62 (m, 10H), 3.62 – 3.52 (m, 4H), 3.41 – 3.26 (m, 4H), 3.00 – 2.59 (m, 7H), 2.11 – 2.05 (m, 1H), 1.98 – 1.84 (m, 4H), 1.74 – 1.67 (m, 2H).
在1μM的濃度下,實施例26標題化合物對Ba/F3-LMNA-NTRK1和Ba/F3-LMNA-NTRK1-G667C的抑制率分別為99.9%和99.3%。
實施例 27 : N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-(4-(2-(2-(2-(2-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺
按實施例21的方法合成得到,MS (ESI) m/z: 986.3 [M+H]
+。
1H NMR (500 MHz, CDCl
3) δ 8.36 (s, 1H), 8.14 (s, 1H), 8.05 (s, 1H), 7.86 (s, 1H), 7.78 (d,
J= 5.7 Hz, 1H), 7.69 (d,
J= 9.8 Hz, 1H), 7.63 – 7.58 (m, 1H), 7.56 (d,
J= 7.7 Hz, 1H), 7.46 – 7.35 (m, 3H), 7.25 – 7.16 (m, 2H), 6.88 (d,
J= 9.9 Hz, 1H), 4.92 – 4.86 (m, 1H), 4.25 (t,
J= 4.5 Hz, 2H), 3.92 – 3.81 (m, 4H), 3.70 – 3.56 (m, 13H), 3.39 – 3.28 (m, 2H), 2.89 – 2.66 (m, 6H), 2.12–2.05 (m, 1H), 1.99–1.88 (m, 2H), 1.76 – 1.68 (m, 2H).
在1μM的濃度下,實施例27標題化合物對Ba/F3-LMNA-NTRK1和Ba/F3-LMNA-NTRK1-G667C的抑制率分別為99.2%和99.1%。
實施例 28 : N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-(4-((2-(2-(2-(2-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)胺基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙基)胺基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺
步驟1:3-((6-(4-((2-(2-(2-(2-溴乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙基)胺基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-
N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-2-甲基苯甲醯胺
於一50 mL反應瓶中,加入3-((6-(4-胺基哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-
N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-2-甲基苯甲醯胺(200.0 mg,0.36 mmol),DMF(3.0 mL),1-溴-2-(2-(2-(2-溴乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙烷(115.2 mg,0.36 mmol)和K
2CO
3(99.4 mg,0.72 mmol),室溫攪拌反應16小時。反應完成後,反應液倒入水(80 mL)中,水相以EtOAc (80mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,餘物以矽膠柱層析(DCM:MeOH(v/v) = 20:1)分離得到產物28-1 (180 mg,產率:63.1%),白色固體。MS(ESI)m/z:791,793[M+H]
+。
步驟2:三級丁基 (2-(2-(2-(2-溴乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙基)(1-(3-((3-((3-氯-5-三氟甲基苯基)胺基甲醯基)-2-甲基苯基)乙炔基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-6-基)哌啶-4-基)胺基甲酸酯
在50 ml反應瓶中,3-((6-(4-((2-(2-(2-(2-溴乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙基)胺基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-
N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-2-甲基苯甲醯胺(180.0 mg,0.23 mmol)溶於THF(3.0 mL),加入(Boc)
2O(99.1 mg,0.46 mmol),室溫攪拌反應16小時。反應完成後,反應液倒入水(50 mL)中,水相以EtOAc (50mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,餘物以矽膠柱層析(DCM:MeOH(v/v) = 50:1)分離得到產物28-2 (160 mg,產率:78.2%),白色固體。MS(ESI)m/z:791,793[M+H-100]
+。
步驟3:三級丁基 (1-(3-((3-((3-氯-5-三氟甲基苯基)胺基甲醯基)-2-甲基苯基)乙炔基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-6-基)哌啶-4-基)(2-(2-(2-(2-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)胺基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙基)胺基甲酸酯
三級丁基 (2-(2-(2-(2-溴乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙基)(1-(3-((3-((3-氯-5-三氟甲基苯基)胺基甲醯基)-2-甲基苯基)乙炔基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-6-基)哌啶-4-基)胺基甲酸酯(160.0 mg,0.18 mmol),4-胺基-2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)異吲哚啉-1,3-二酮(49.1 mg,0.18 mmol)和K
2CO
3(49.7 mg,0.36 mmol)分散於DMF(5.0 mL),室溫下攪拌反應16小時,反應完成後,反應液倒入水(100 mL)中,水相以EtOAc (100mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,餘物以矽膠柱層析(DCM:MeOH(v/v) = 40:1)分離得到產物28-3 (86.0 mg,產率:44.1%),黃色固體。MS(ESI)m/z:1084.3[M+H]
+。
步驟4:
N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-(4-((2-(2-(2-(2-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)胺基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙基)胺基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺
三級丁基 (1-(3-((3-((3-氯-5-三氟甲基苯基)胺基甲醯基)-2-甲基苯基)乙炔基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-6-基)哌啶-4-基)(2-(2-(2-(2-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)胺基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙基)胺基甲酸酯(86.0 mg,0.079 mmol)溶於DCM(1.0 mL),加入TFA(2.0 mL),室溫攪拌反應1小時。反應完成後,減壓濃縮,余物加水稀釋,以5% Na
2CO
3水溶液調pH = 9-10,水相以EtOAc (100mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,餘物以矽膠柱層析(DCM:MeOH(v/v) = 10:1)分離得到產物(30.0 mg,產率:38.6%),黃色固體。MS(ESI)m/z:984.0[M+H]
+。
1H NMR (500 MHz, CDCl
3) δ 8.93 (s, 1H), 8.09(s, 1H), 7.93 (s, 1H), 7.69 (s, 1H), 7.59-7.55(m, 2H), 7.37 (s, 2H), 7.21 (s, 1H), 7.05(s, 1H), 6.84-6.80 (m, 2H), 4.92 – 4.86 (m, 1H), 4.17-4.12(m, 3H), 3.95-3.91 (m, 2H), 3.70-3.55(m, 13H), 2.96-2.82 (m, 3H), 2.77-2.58 (m, 5H), 2.12-1.95 (m, 4H), 1.80-1.54 (m, 2H).
在1μM的濃度下,實施例28標題化合物對Ba/F3-LMNA-NTRK1-G667C的抑制率為98.6%。
實施例 29 : N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-(4-(2-(2-((2-(2-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)氧基)乙氧基)乙基)胺基)乙氧基)乙氧基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺
按實施例28的方法合成得到,MS (ESI) m/z: 985.3 [M+H]
+。
1H NMR (500 MHz, DMSO-
d 6) δ 11.07 (s, 1H), 10.93 (s, 1H), 8.16–8.11 (m, 2H), 7.97 – 7.86 (m, 2H), 7.77 (t,
J= 7.9, 1H), 7.68 (d,
J= 7.6 Hz, 1H), 7.59 – 7.54 (m, 2H), 7.49 (d,
J= 8.5 Hz, 1H), 7.46–7.38 (m, 2H), 7.30 (d,
J= 10.0 Hz, 1H), 5.10–5.03 (m, 1H), 4.36 – 4.32 (m, 2H), 4.07 – 3.99 (m, 1H), 3.96 – 3.89 (m, 2H), 3.83 – 3.79 (m, 2H), 3.75 – 3.70 (m, 2H), 3.62 – 3.51 (m, 7H), 3.03 – 2.96 (m, 4H), 2.93 – 2.82 (m, 1H), 2.68 – 2.51 (m, 5H), 2.07 – 1.96 (m, 2H), 1.94 – 1.86 (m, 2H), 1.56 – 1.44 (m, 2H).
在1μM的濃度下,實施例29標題化合物對Ba/F3-LMNA-NTRK1-G667C的抑制率為98.8%。
實施例 30 : N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-(4-(2-((2-(2-(2-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)胺基)乙氧基)乙氧基)乙基)胺基)乙氧基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺
按實施例28的方法合成得到,MS (ESI) m/z: 984.2 [M+H]
+。
1H NMR (500 MHz, CDCl
3) δ 9.22 – 8.84 (m, 2H), 8.18 (s, 1H), 7.99 (s, 1H), 7.72 (s, 1H), 7.63 (d,
J= 7.7 Hz, 1H), 7.48 – 7.32 (m, 3H), 7.31 – 7.27 (m, 1H), 7.10 (d,
J= 7.0 Hz, 1H), 6.91 – 6.77 (m, 2H), 5.43 – 5.18 (m, 2H), 4.98 – 4.92 (m, 1H), 4.01 – 3.72 (m, 8H), 3.70 – 3.45 (m, 8H), 3.28 – 3.22 (m, 4H), 2.93 – 2.61 (m, 6H), 2.11 – 1.84 (m, 4H), 1.76 – 1.67 (m, 2H).
在1μM的濃度下,實施例30標題化合物對Ba/F3-LMNA-NTRK1-G667C的抑制率為98.7%。
實施例 31 : N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-(4-(2-(2-((2-(2-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)胺基)乙氧基)乙基)胺基)乙氧基)乙氧基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺
按實施例28的方法合成得到,MS (ESI) m/z: 984.2 [M+H]
+。
1H NMR (500 MHz, CDCl
3) δ 9.11 (s, 1H), 8.14 (s, 1H), 7.99 (s, 1H), 7.78 (s, 1H), 7.69 (d,
J= 9.8 Hz, 1H), 7.60 (d,
J= 7.7 Hz, 1H), 7.45 (d,
J= 7.7 Hz, 1H), 7.37 – 7.34 (m, 2H), 7.31 – 7.27 (m, 1H), 7.10 – 7.05 (m, 2H), 6.90 – 6.79 (m, 2H), 5.37 – 5.34 (m, 2H), 5.03 – 4.88 (m, 1H), 4.08 – 3.95 (m, 1H), 3.91 – 3.73 (m, 5H), 3.71 – 3.44 (m, 10H), 3.21 – 3.10 (m, 4H), 2.83 – 2.55 (m, 6H), 2.09 – 1.86 (m, 4H), 1.44 – 1.40 (m, 2H).
在1μM的濃度下,實施例31標題化合物對Ba/F3-LMNA-NTRK1-G667C的抑制率為98.0%。
實施例 32 : N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-(4-(2-(2-(4-(2-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)氧基)乙基)哌𠯤-1-基)乙氧基)乙氧基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺
按實施例21的方法合成得到,MS (ESI) m/z: 1010.2 [M+H]
+。
1H NMR (500 MHz, CDCl
3) δ 8.79 (s, 1H), 8.44 (s, 1H), 8.10 (s, 1H), 7.90 (s, 1H), 7.75 (s, 1H), 7.68 – 7.59 (m, 2H), 7.53 (d,
J= 7.7 Hz, 1H), 7.47 – 7.31 (m, 3H), 7.21 (t,
J= 7.7 Hz, 1H), 7.13 (d,
J= 8.3 Hz, 1H), 6.87 (d,
J= 9.9 Hz, 1H), 4.93 – 4.87 (m, 1H), 4.34 – 4.05 (m, 3H), 3.92 – 3.79 (m, 2H), 3.73 – 3.47 (m, 8H), 3.40 – 3.21 (m, 2H), 2.98 – 2.53 (m, 15H), 2.18 – 1.85 (m, 4H), 1.76 – 1.63 (m, 2H).
在1μM的濃度下,實施例32標題化合物對Ba/F3-LMNA-NTRK1和Ba/F3-LMNA-NTRK1-G667C的抑制率分別為98.8%和98.8%。
實施例 33 : N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-(4-(2-(2-(4-(2-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)胺基)乙基)哌𠯤-1-基)乙氧基)乙氧基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺
按實施例5的方法合成得到,MS (ESI) m/z: 1009.3 [M+H]
+。
1H NMR (500 MHz, CDCl
3) δ 8.33 – 8.19 (m, 1H), 8.09 (s, 1H), 7.90 (s, 1H), 7.78 (s, 1H), 7.71 – 7.55 (m, 2H), 7.50 – 7.32 (m, 3H), 7.26 – 7.15 (m, 1H), 7.06 (d,
J= 7.2 Hz, 1H), 6.87 (d,
J= 9.8 Hz, 1H), 6.79 (d,
J= 8.5 Hz, 1H), 6.62 – 6.58 (m, 1H), 5.00 – 4.77 (m, 1H), 4.23 – 3.99 (m, 1H), 3.90 – 3.52 (m, 9H), 3.43 – 3.11 (m, 4H), 2.93 – 2.40 (m, 16H), 2.19 – 1.89 (m, 4H), 1.60 – 1.47 (m, 2H).
在1μM的濃度下,實施例33標題化合物對Ba/F3-LMNA-NTRK1和Ba/F3-LMNA-NTRK1-G667C的抑制率分別為99.8%和99.4%。
實施例 34 : N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-(4-(2-(9-(2-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基吲哚啉-4-基)胺基)乙基)-3,9-二氮雜螺[5.5]十一烷-3-基)-2-側氧基乙氧基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺
步驟1:乙基 2-((1-(3-((3-((3-氯-5-(三氟甲基)苯基)胺基甲醯基)-2-甲基苯基)乙炔基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-6-基)哌啶-4-基)氧基)乙酸酯
2-(哌啶-4-基氧基)乙酸乙酯(100 mg,0.53 mmol),K
2CO
3(200 mg,1.06 mmol)和
N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-氯咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺(313 mg,0.64 mmol)分散於DMF(4 mL)中,加熱至100℃反應12 h。反應完成後,加水稀釋,水相以EtOAc (100mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,餘物以矽膠柱層析(DCM:MeOH(v/v) = 25:1)分離得到產物(100 mg,產率29.2%),黃色固體。MS (ESI) m/z: 640.2 [M+H]
+。
步驟2:2-((1-(3-((3-((3-氯-5-(三氟甲基)苯基)胺基甲醯基)-2-甲基苯基)乙炔基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-6-基)哌啶-4-基)氧基)乙酸
乙基 2-((1-(3-((3-((3-氯-5-(三氟甲基)苯基)胺基甲醯基)-2-甲基苯基)乙炔基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-6-基)哌啶-4-基)氧基)乙酸酯(100 mg,0.15 mmol)溶於MeOH(2 mL)和水(2 mL)的混合溶液中,加入無水LiOH(54 mg,0.574 mmol),室溫攪拌反應2 小時。反應完成後,加入水(20 mL)稀釋,用1 M的鹽酸溶液調pH = 5,水相以EtOAc (50mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,餘物以矽膠柱層析(DCM:MeOH(v/v) = 10:1)分離得到產物(72 mg,產率75.3%),淡黃色固體。MS (ESI) m/z: 612.2 [M+H]
+。
步驟3:三級丁基 9-(2-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)胺基)乙基)-3,9-二氮雜螺[5.5]十一烷-3-甲酸酯
於一25 mL圓底燒瓶中,加入9-(2-胺基乙基)-3,9-二氮雜螺[5.5]十一烷-3-甲酸三級丁酯(60 mg,0.2 mmol),DIPEA(120 mg,0.6 mmol),2-(2,6-側氧基哌啶-3-基)-4-氟異吲哚啉-1,3-二酮(83.5 mg,0.3 mmol)和DMSO(3 mL),加熱至100℃攪拌反應4 小時。反應完成後,加水稀釋,水相以EtOAc (50mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,餘物以矽膠柱層析(DCM:MeOH(v/v) = 20:1)分離得到產物(53 mg,產率47.5%),淡黃色固體。MS (ESI) m/z: 554.3 [M+H]
+。
步驟4:4-((2-(3,9-二氮雜螺[5.5]十一烷-3-基)乙基)胺基)-2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)異吲哚啉-1,3-二酮
三級丁基 9-(2-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基異吲哚啉-4-基)胺基)乙基)-3,9-二氮雜螺[5.5]十一烷-3-甲酸酯(53 mg,0.095 mmol)溶於HCl/MeOH(6M,5 mL)溶液,室溫攪拌反應1小時。反應完全後,減壓濃縮,余物加水稀釋,以5% Na
2CO
3水溶液調pH = 9-10,水相以EtOAc (50mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,得黃色固體42 mg,為目標化合物,直接用於下步反應。MS(ESI)m/z:454.3[M+H]
+。
步驟5:
N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-(4-(2-(9-(2-((2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)-1,3-二側氧基吲哚啉-4-基)胺基)乙基)-3,9-二氮雜螺[5.5]十一烷-3-基)-2-側氧基乙氧基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺
於一25mL圓底燒瓶中,加入2-((1-(3-((3-((3-氯-5-(三氟甲基)苯基)胺基甲醯基)-2-甲基苯基)乙炔基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-6-基)哌啶-4-基)氧基)乙酸(50 mg,0.08 mmol),HATU(80 mg,0.21mmol),DMF(3 mL),Et
3N(24 mg,0.24mmol)和4-((2-(3,9-二氮雜螺[5.5]十一烷-3-基)乙基)胺基)-2-(2,6-二側氧基哌啶-3-基)異吲哚啉-1,3-二酮(40.76 mg,0.089 mmol),室溫攪拌反應2 小時。反應完成後,加水稀釋,水相以EtOAc (50mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,餘物以矽膠柱層析(DCM:MeOH(v/v) = 20:1)分離得到產物(25 mg,產率30%),淡黃色固體。MS (ESI) m/z: 1047.4 [M+H]
+。
1H NMR (500 MHz, DMSO-
d 6) δ 11.07 (s, 1H), 10.90 (s, 1H), 8.15 – 8.11 (m, 2H), 7.94 – 7.87 (m, 2H), 7.68 (d,
J= 7.8 Hz, 1H), 7.63 – 7.51 (m, 3H), 7.45 – 7.40 (m, 2H), 7.35 – 7.29 (m, 2H), 5.13 – 4.98 (m, 1H), 4.18 – 4.14 (m, 2H), 4.00 – 3.85 (m, 2H), 3.78 – 3.58 (m, 2H), 3.51 – 3.30 (m, 9H), 3.15 – 2.98 (m, 1H), 2.98 – 2.80 (m, 1H), 2.71 – 2.56 (m, 5H), 2.43 – 2.29 (m, 1H), 2.09 – 1.78 (m, 6H), 1.66 – 1.30 (m, 10H).
在1μM的濃度下,實施例34標題化合物對Ba/F3-LMNA-NTRK1和Ba/F3-LMNA-NTRK1-G667C的抑制率分別為99.0%和98.7%。
實施例 35 :(2
S,4
R)-1-((S)-2-(8-(4-((1-(3-((3-((3-氯-5-(三氟甲基)苯基)胺基甲醯基)-2-甲基苯基)乙炔基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-6-基)哌啶-4-基)氧基)哌啶-1-基)-8-側氧基辛醯胺基)-3,3-二甲基丁醯胺基)-4-羥基-
N-((
S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯啶-2-甲醯胺
步驟1:甲基 8-(((
S)-1-((2
S,4
R)-4-羥基-2-(((
S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)胺基甲醯基)吡咯啶-1-基)-3,3-二甲基-1-側氧基丁烷-2-基)胺基)-8-側氧基辛酸酯
8-甲氧基-8-側氧基辛酸(126.7 mg, 0.67 mmol)溶於DMF(5.0 mL)中,加入HATU (381.9 mg,1.0 mmol)和Et
3N(135.3 mg,2 mmol),室溫攪拌反應1小時。然後加入(2
S,4
R)-1-((
S)-2-胺基-3,3-二甲基丁醯基)-4-羥基-
N-((
S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯啶-2-甲醯胺(126.7 mg,0.67 mmol),室溫攪拌反應1小時。反應完成後,加水稀釋,水相以EtOAc (80mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,餘物以矽膠柱層析(PE:EtOAc (v/v) = 1:1)分離得到產物(260 mg,產率63%),白色固體。MS (ESI) m/z: 615.3 [M+H]
+。
步驟2:8-(((
S)-1-((2
S,4
R)-4-羥基-2-(((
S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)胺基甲醯基)吡咯啶-1-基)-3,3-二甲基-1-側氧基丁烷-2-基)胺基)-8-側氧基辛酸
甲基 8-(((
S)-1-((2
S,4
R)-4-羥基-2-(((
S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)胺基甲醯基)吡咯啶-1-基)-3,3-二甲基-1-側氧基丁烷-2-基)胺基)-8-側氧基辛酸酯(260 mg,0.42 mmol)溶於MeOH(5 mL)和水(2 mL)的混合溶液中,加入無水LiOH(177.8 mg, 4.2 mmo),室溫攪拌反應3小時。反應完成後,加入水(50 mL)稀釋,用2 M的鹽酸溶液調pH = 5,水相以EtOAc (80mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,餘物以矽膠柱層析(DCM:MeOH(v/v) = 10:1)分離得到產物(190 mg,產率75.3%),白色固體。MS (ESI) m/z: 601.3 [M+H]
+。
步驟3:(2
S,4
R)-1-((S)-2-(8-(4-((1-(3-((3-((3-氯-5-(三氟甲基)苯基)胺基甲醯基)-2-甲基苯基)乙炔基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-6-基)哌啶-4-基)氧基)哌啶-1-基)-8-側氧基辛醯胺基)-3,3-二甲基丁醯胺基)-4-羥基-
N-((
S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯啶-2-甲醯胺
8-(((
S)-1-((2
S,4
R)-4-羥基-2-(((
S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)胺基甲醯基)吡咯啶-1-基)-3,3-二甲基-1-側氧基丁烷-2-基)胺基)-8-側氧基辛酸(80.0 mg, 0.13 mmol)溶於DMF(2.0 mL)中,加入HATU (76.0 mg, 0.20 mmol)和Et
3N(26.3 mg, 0.26 mmol),室溫攪拌反應1小時。然後加入N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-2-甲基-3-((6-(4-(哌啶-4-基氧基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)苯甲醯胺(84.8 mg,0.13 mmol),室溫攪拌反應1小時。反應完成後,加水稀釋,水相以EtOAc (80mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,餘物以矽膠柱層析(DCM:MeOH (v/v) = 20:1)分離得到產物(32 mg,產率20%),白色固體。MS (ESI) m/z: 1217 [M-H]
-。
1HNMR (500 MHz, CDCl
3) δ 8.77-8.65(m, 2H), 8.07(s, 1H), 7.95-7.88 (m, 2H), 7.61 (s, 1H), 7.59(s, 1H), 7.46-7.28 (m, 8H), 7.05(d,
J= 6.0, Hz, 1H), 6.22(d,
J= 8.5, Hz, 1H), 5.07-5.04 (m, 1H), 4.72(s, 1H), 4.57-4.47 (m, 2H), 4.10-4.08 (m, 1H), 3.86-3.72 (m, 2H), 3.69-3.53(m, 8H), 3.46-3.40 (m, 2H), 3.29-3.24 (m, 2H), 2.67 (s, 3H), 2.51-2.48 (m, 5H), 2.25-2.20 (m, 5H), 1.80-1.71(m, 4H), 1.45-1.39(m, 5H), 1.29-1.25(m, 6H), 1.01(s, 9H).
在1μM的濃度下,實施例35標題化合物對Ba/F3-LMNA-NTRK1和Ba/F3-LMNA-NTRK1-G667C的抑制率分別為89.2%和99.5%。
實施例 36 :(2
S,4
R)-1-((S)-2-(9-(4-((1-(3-((3-((3-氯-5-(三氟甲基)苯基)胺基甲醯基)-2-甲基苯基)乙炔基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-6-基)哌啶-4-基)氧基)哌啶-1-基)-9-側氧基壬醯胺基)-3,3-二甲基丁醯胺基)-4-羥基-
N-((
S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯啶-2-甲醯胺
按實施例35的方法合成得到,MS (ESI) m/z: 1231 [M-H]
-。
1H NMR (500 MHz, CDCl
3) δ 9.24-9.22 (m, 1H), 8.68 (s, 1H), 8.17-7.88 (m, 3H), 7.70(s, 1H), 7.52-7.50 (m, 3H), 7.46-7.37(m, 6H), 7.07-7.03 (m, 1H), 6.24-6.20 (m, 1H), 5.07-5.04 (m, 1H), 4.72 (s, 1H), 4.57-4.48 (m, 2H), 4.10-4.08 (m, 1H), 3.86-3.42 (m, 8H), 3.27-3.22 (m, 2H), 2.67(s, 3H), 2.57-2.42 (m, 5H), 2.40-2.20 (m, 9H), 1.97-1.91 (m, 4H), 1.45-1.40 (m, 6H), 1.25-1.20(m, 7H), 1.10-1.0 (m, 9H).
在1μM的濃度下,實施例36標題化合物對Ba/F3-LMNA-NTRK1和Ba/F3-LMNA-NTRK1-G667C的抑制率分別為78.7%和99.5%。
實施例 37 : N 1-(3-((1-(3-((3-((3-氯-5-(三氟甲基)苯基)胺基甲醯基)-2-甲基苯基)乙炔基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-6-基)哌啶-4-基)氧基)丙基)-
N 9-((
S)-1-((2
S,4
R)-4-羥基-2-(((
S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)胺基甲醯基)吡咯啶-1-基)-3,3-二甲基-1-側氧基丁烷-2-基)壬二醯胺
步驟1:甲基 9-((3-((1-(3-((3-((3-氯-5-(三氟甲基)苯基)胺基甲醯基)-2-甲基苯基)乙炔基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-6-基)哌啶-4-基)氧基)丙基)胺基)-9-側氧基壬酸酯
甲基 9-側氧基-9-((3-(哌啶-4-基氧基)丙基)胺基)壬酸酯(360 mg,1.05 mmol),
N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-氯咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺(617 mg,1.26 mmol)和K
2CO
3(200 mg,2.1 mmol)分散於DMF(5 mL)中,加熱至100℃攪拌反應12 小時。反應完成後,加水稀釋,水相以EtOAc (80mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,餘物以矽膠柱層析(DCM:MeOH (v/v) = 50:1)分離得到產物(154 mg,產率20%),淡黃色固體。MS (ESI) m/z: 795.3 [M+H]
+。
步驟2:9-((3-((1-(3-((3-((3-氯-5-(三氟甲基)苯基)胺基甲醯基)-2-甲基苯基)乙炔基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-6-基)哌啶-4-基)氧基)丙基)胺基)-9-側氧基壬酸
甲基 9-((3-((1-(3-((3-((3-氯-5-(三氟甲基)苯基)胺基甲醯基)-2-甲基苯基)乙炔基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-6-基)哌啶-4-基)氧基)丙基)胺基)-9-側氧基壬酸酯(154 mg,0.197 mmol)溶於MeOH(4 mL)和水(4 mL)的混合溶液中,加入無水LiOH(54 mg,0.574 mmol),室溫攪拌反應2小時。反應完成後,加入水(50 mL)稀釋,用1 M的鹽酸溶液調pH = 5,水相以EtOAc (80mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,餘物以矽膠柱層析(DCM:MeOH(v/v) = 20:1)分離得到產物(130 mg,產率84.5%),淡黃色固體。MS (ESI) m/z: 601.3 [M+H]
+。
步驟3:
N 1-(3-((1-(3-((3-((3-氯-5-(三氟甲基)苯基)胺基甲醯基)-2-甲基苯基)乙炔基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-6-基)哌啶-4-基)氧基)丙基)-
N 9-((
S)-1-((2
S,4
R)-4-羥基-2-(((
S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)胺基甲醯基)吡咯啶-1-基)-3,3-二甲基-1-側氧基丁烷-2-基)壬二醯胺
9-((3-((1-(3-((3-((3-氯-5-(三氟甲基)苯基)胺基甲醯基)-2-甲基苯基)乙炔基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-6-基)哌啶-4-基)氧基)丙基)胺基)-9-側氧基壬酸(130 mg,0.166 mmol)溶於DMF(4.0 mL)中,加入HATU (95.0 mg,0.25 mmol)和Et
3N(50 mg,0.50 mmol),室溫攪拌反應1小時。然後加入(2
S,4
R)-1-((
S)-2-胺基-3,3-二甲基丁醯基)-4-羥基-
N-((
S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯啶-2-甲醯胺(84.91mg,0.216 mmol),室溫攪拌反應1小時。反應完成後,加水稀釋,水相以EtOAc (80mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,餘物以矽膠柱層析(DCM:MeOH (v/v) = 15:1)分離得到產物(31 mg,產率16%),白色固體。MS (ESI) m/z: 1027.5 [M+H]
+。
1H NMR (500 MHz, CDCl
3) δ 9.25 (s, 1H), 8.65 (s, 1H), 8.15 (s, 1H), 7.96 (s, 1H), 7.87 (d,
J= 9.9 Hz, 1H), 7.80 (s, 1H), 7.60 (d,
J= 7.7 Hz, 1H), 7.49 – 7.37 (m, 9H), 7.02 (d,
J= 9.9 Hz, 1H), 6.26 (d,
J= 8.8 Hz, 1H), 6.15 (s, 1H), 5.07-5.04 (m, 1H), 4.70 (t,
J= 8.2 Hz, 1H), 4.57 (d,
J= 8.8 Hz, 1H), 4.50 – 4.45 (m, 1H), 4.01 (d,
J= 11.4 Hz, 1H), 3.86-3.80 (m, 2H), 3.62 – 3.51 (m, 5H), 3.39 (t,
J= 10.5 Hz, 2H), 3.32 (q,
J= 5.9 Hz, 2H), 2.69 (s, 3H), 2.51 (s, 3H), 2.45 – 2.36 (m, 1H), 2.12 – 1.98 (m, 4H), 1.80-1.71(m, 4H), 1.45-1.39(m, 9H), 1.20 – 1.12 (m, 6H), 1.02 (s, 9H).
在1μM的濃度下,實施例37標題化合物對Ba/F3-LMNA-NTRK1和Ba/F3-LMNA-NTRK1-G667C的抑制率分別為88.0%和99.7%。
實施例 38 :(2
S,4
R)-1-((
S)-2-(三級丁基)-16-((1-(3-((3-((3-氯-5-(三氟甲基)苯基)胺基甲醯基)-2-甲基苯基)乙炔基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-6-基)哌啶-4-基)氧基)-4,12-二側氧基-6-氧雜-3,9,13-三氮雜十六醯基)-4-羥基-
N-((
S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯啶-2-甲醯胺
步驟1:三級丁基 (3-((1-(3-((3-((3-氯-5-(三氟甲基)苯基)胺基甲醯基)-2-甲基苯基)乙炔基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-6-基)哌啶-4-基)氧基)丙基)胺基甲酸酯
三級丁基 (3-(哌啶-4-基氧基)丙基)胺基甲酸酯(210 mg,0.81 mmol l),
N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-3-((6-氯咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-2-甲基苯甲醯胺(398 mg,0.81 mmol)和K
2CO
3(337 mg,2.44 mmol)分散於DMF(5 mL)中,加熱至100℃攪拌反應18小時。反應完成後,加水稀釋,水相以EtOAc (80mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,餘物以矽膠柱層析(DCM:MeOH (v/v) = 20:1)分離得到產物(320 mg,產率55%),黃色固體。MS (ESI) m/z: 611.2 [M+H-100]
+。
步驟2:3-((6-(4-(3-胺基丙氧基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-
N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-2-甲基苯甲醯胺
三級丁基 (3-((1-(3-((3-((3-氯-5-(三氟甲基)苯基)胺基甲醯基)-2-甲基苯基)乙炔基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-6-基)哌啶-4-基)氧基)丙基)胺基甲酸酯(320 mg,0.45 mmol)溶於DCM(3 mL),加入TFA(3 mL),室溫攪拌反應2小時。反應完全後,減壓濃縮,余物加水稀釋,以5% Na
2CO
3水溶液調pH = 9-10,水相以EtOAc (50mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,得黃色固體260 mg,為目標化合物,直接用於下步反應。MS(ESI)m/z:611.2[M+H]
+。
步驟3:乙基 3-((三級丁氧羰基)(2-(2-(((
S)-1-((2
S,4
R)-4-羥基-2-(((
S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基) 苯基)乙基)胺基甲醯基)吡咯啶-1-基)-3,3-二甲基-1-側氧基丁烷-2-基)胺基)-2-側氧基乙氧基)乙基)胺基)丙酸酯
於一25 ml圓底燒瓶中,加入2-(2-((三級丁氧羰基)(3-乙氧基-3-側氧基丙基)胺基)乙氧基)乙酸 (160 mg,0.50 mmol),(2
S,4
R)-1-((
S)-2-胺基-3,3-二甲基丁醯基)-4-羥基-
N-((
S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯啶-2-甲醯胺 (245 mg,0.55 mmol),Et
3N(177 mg,1.75 mmol)和DMF(4.0 mL),攪拌溶解後加入HATU (286 mg,0.75 mmol),室溫攪拌反應1小時。反應完成後,加水稀釋,水相以EtOAc (80mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,餘物以矽膠柱層析(DCM:MeOH (v/v) = 10:1)分離得到產物(230 mg,產率62%),黃色固體。MS (ESI) m/z: 646.4 [M+H-100]
+。
步驟4:3-((三級丁氧羰基)(2-(2-(((
S)-1-((2
S,4
R)-4-羥基-2-(((
S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基) 苯基)乙基)胺基甲醯基)吡咯啶-1-基)-3,3-二甲基-1-側氧基丁烷-2-基)胺基)-2-側氧基乙氧基)乙基)胺基)丙酸
乙基 3-((三級丁氧羰基)(2-(2-(((
S)-1-((2
S,4
R)-4-羥基-2-(((
S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基) 苯基)乙基)胺基甲醯基)吡咯啶-1-基)-3,3-二甲基-1-側氧基丁烷-2-基)胺基)-2-側氧基乙氧基)乙基)胺基)丙酸酯(230 mg,0.31 mmol)溶於MeOH(2 mL)和水(2 mL)的混合溶液中,加入LiOH.H
2O(130 mg,3.08 mmol),室溫攪拌反應2小時。反應完成後,加入水(50 mL)稀釋,用2 M的鹽酸溶液調pH = 3-4,水相以EtOAc (80mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮得固體,為目標產物,直接用於下步反應。MS (ESI) m/z: 618.3 [M+H-100]
+。
步驟5:三級丁基 (3-((3-((1-(3-((3-((3-氯-5-(三氟甲基)苯基)胺基甲醯基)-2-甲基苯基)乙炔基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-6-基)哌啶-4-基)氧基)丙基)胺基)-3-側氧基丙基)(2-(2-(((
S)-1-((2
S,4
R)- 4-羥基-2-(((
S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)胺基甲醯基)吡咯啶-1-基)-3,3-二甲基-1-側氧基丁烷-2-基)胺基)-2-側氧基乙氧基)乙基)胺基甲酸
3-((三級丁氧羰基)(2-(2-(((
S)-1-((2
S,4
R)-4-羥基-2-(((
S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)胺基甲醯基)吡咯啶-1-基)-3,3-二甲基-1-側氧基丁烷-2-基)胺基)-2-側氧基乙氧基)乙基)胺基)丙酸(125 mg,0.17 mmol)溶於DMF(4.0 mL)中,加入HATU (132 mg,0.35 mmol)和Et
3N(70 mg,0.70 mmol),室溫攪拌反應1小時。然後加入3-((6-(4-(3-胺基丙氧基)哌啶-1-基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-3-基)乙炔基)-
N-(3-氯-5-(三氟甲基)苯基)-2-甲基苯甲醯胺(128 mg,0.21 mmol),室溫攪拌反應1小時。反應完成後,加水稀釋,水相以EtOAc (80mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,餘物以矽膠柱層析(DCM:MeOH (v/v) = 10:1)分離得到產物(160 mg,產率70%),白色固體。MS (ESI) m/z: 1210.5 [M+H-100]
+。
步驟6:(2
S,4
R)-1-((
S)-2-(三級丁基)-16-((1-(3-((3-((3-氯-5-(三氟甲基)苯基)胺基甲醯基)-2-甲基苯基)乙炔基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-6-基)哌啶-4-基)氧基)-4,12-二側氧基-6-氧雜-3,9,13-三氮雜十六醯基)-4-羥基-
N-((
S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯啶-2-甲醯胺
三級丁基 (3-((3-((1-(3-((3-((3-氯-5-(三氟甲基)苯基)胺基甲醯基)-2-甲基苯基)乙炔基)咪唑並[1,2-b]嗒𠯤-6-基)哌啶-4-基)氧基)丙基)胺基)-3-側氧基丙基)(2-(2-(((
S)-1-((2
S,4
R)-4-羥基-2-(((
S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)胺基甲醯基)吡咯啶-1-基)-3,3-二甲基-1-側氧基丁烷-2-基)胺基)-2-側氧基乙氧基)乙基)胺基甲酸(160 mg,0.12 mmol)溶於DCM(3 mL),加入TFA(3 mL),室溫攪拌反應2小時。反應完全後,減壓濃縮,余物加水稀釋,以5% Na
2CO
3水溶液調pH = 9-10,水相以EtOAc (50mL×3)萃取。有機相以飽和NaCl水溶液洗滌,無水Na
2SO
4乾燥,過濾後減壓濃縮,餘物以矽膠柱層析(DCM:MeOH (v/v) = 5:1)分離得到產物(35 mg,產率3.7%)。MS(ESI)m/z:1210.4[M+H]
+。
1H NMR (500 MHz, CDCl
3) δ 9.40 (s, 1H), 8.64 (s, 1H), 8.17 (s, 1H), 7.95 (s, 1H), 7.80 (s, 1H), 7.73 (d,
J= 9.8 Hz, 1H), 7.63 – 7.49 (m, 3H), 7.43 – 7.28 (m, 8H), 7.21 (t,
J= 7.7 Hz, 1H), 6.89 (d,
J= 9.9 Hz, 1H), 5.05 – 4.98 (m, 1H), 4.53 – 4.48 (m, 2H), 4.37 – 4.34 (m, 1H), 3.99 – 3.93 (m, 1H), 3.90 – 3.79 (m, 3H), 3.73 – 3.67 (m, 1H), 3.65 – 3.18 (m, 12H), 2.89 – 2.68 (m, 4H), 2.64 (s, 3H), 2.57 – 2.45 (m, 4H), 2.35 – 2.18 (m, 2H), 2.10 – 1.89 (m, 4H), 1.79 – 1.65 (m, 2H), 1.47 (d,
J= 6.9 Hz, 3H), 0.97 (s, 9H).
以上所述僅為本發明的較佳實施例而已,並不用以限制本發明,凡在本發明的精神和原則之內所作的任何修改、等同替換和改進等,均應包含在本發明的保護範圍之內。
無
無
無。
Claims (17)
- 一種化合物,其特徵在於,所述化合物為:化學結構如通式(Ⅰ)所示的化合物: (Ⅰ); 所述E3泛素化連接酶配體中,所述E3泛素化連接酶選自CRBN或vHL,所述vHL的配體選自VH032或其類似物,所述CRBN的配體選自來那度胺、來那度胺的類似物、泊馬度胺、泊馬度胺的類似物、沙利度胺或沙利度胺的類似物; L為連接子; 所述原肌球蛋白相關激酶配體選自蛋白激酶抑制劑或蛋白激酶抑制劑片段,所述原肌球蛋白相關激酶配體至少通過與蛋白激酶、蛋白激酶突變、蛋白激酶融合和蛋白激酶缺失突變中的一種結合而發揮作用。
- 如請求項1所述的化合物,其特徵在於,所述原肌球蛋白相關激酶配體具有如通式(Ⅱ)所示的化學結構: (Ⅱ); 其中,R 1為H、鹵素、C1~C6烷基、C1~C6烷氧基或鹵素取代的C1~C6烷基;R 2為H、氟取代的C1~C4烷基、取代或未取代的含1‑3個N環原子的5‑6元雜環基;R 3為H、鹵素、胺基或者C1~C3烷基取代的胺基、取代或未取代的C1~C10烷基、取代或未取代的C1~C10烷氧基、取代或未取代的含1‑3個N環原子的5‑10元雜環基、取代或未取代的含1‑3個N環原子的5‑10元雜芳基;R 4為C1~C6烷基; R 5為‑NR 6R 7,其中,R 6、R 7分別獨立地選自:‑(CH 2) mNR 8R 9、‑(CH 2) nCR 10R 11R 12、‑(CH 2) pOR 12,或者R 6、R 7與它們所連接的氮原子一起形成被取代或未被取代的含有雜原子的單環、稠環、螺環或橋環;R 8、R 9分別獨立地選自:H、C1~C20烷基;或者R 8、R 9與它們所連接的氮原子一起形成被取代或未被取代的含有1‑3個雜原子的單環、稠環、螺環或橋環;R 10、R 11與它們所連接的碳原子一起形成被取代或未被取代的含有1‑3個雜原子的單環、稠環、螺環或橋環;R 12選自:H、C1~C20烷基;m、n、p分別獨立地選自:0‑10的整數。
- 如請求項2所述的化合物,其特徵在於,所述原肌球蛋白相關激酶配體具有如通式(Ⅱ 1)所示的化學結構: (Ⅱ 1); 其中,t為1、2或者3,X為H、Cl或者Br。
- 如請求項3所述的化合物,其特徵在於,所述原肌球蛋白相關激酶配體具有以下任一結構: , , , , , , , , , , , 。
- 如請求項1所述的化合物,其特徵在於,所述L具有如通式(Ⅲ)所示的化學結構: (Ⅲ); 其中,Y 1、Z 1獨立地為O、S或者NH,W 1、W 2獨立地為空、O、NH、 、C1~C6直鏈烷烴基、 ,a 1、b 1、a 2、b 2、a 3、a 4獨立地為0到20的正整數,Q 1、Q 2、Q 3、Q 4獨立地為-CH 2-、 、NH、 以及O,W 1、W 2獨立為NH或者直鏈烷烴基時,可被羥基、C1-C10烷基、C1-C6烷氧基、鹵素取代, 表示連接點。
- 如請求項5所述的化合物,其特徵在於,所述L具有以下任一結構: , , , , , , , , , , , , , , , , , 。
- 如請求項1所述的化合物,其特徵在於,所述L具有如通式(Ⅳ)所示的化學結構: (Ⅳ); 其中,Y 2、Z 2為O、S或者NH,W 3、W 4、W 5獨立地為空、O、NH、 、C1~C6直鏈烷烴基、 ,c、d、e、f、g、h獨立地為0到20的正整數,M 1、M 2獨立地為-CH-或者N,Q 4、Q 5、Q 6、Q 7獨立地為-CH 2-、 、NH、 或O。
- 如請求項7所述的化合物,其特徵在於,所述L具有以下任一結構: , , , , , , , 。
- 如請求項1所述的化合物,其特徵在於,所述L具有如通式(Ⅴ)所示的化學結構: (Ⅴ); 其中,Y 3、Z 3為O、S或者NH,W 6、W 7為空、O、NH、 、C1~C6直鏈烷烴基、 ,i、n'獨立地為0到16的正整數,螺環部分中的M 3、M 4獨立地選自NH或者CH,j、k、l、m'獨立地選自0、1、2、3,Q 8、Q 9獨立地為-CH 2-、 、NH、 或O。
- 如請求項9所述的化合物,其特徵在於,所述L具有以下任一結構: , , , , 。
- 如請求項5、7或9所述的化合物,其特徵在於,所述C1~C6直鏈烷烴基選自以下任一基團: , , , , , 。
- 如請求項1所述的化合物,其特徵在於,包括以下任一一種化合物: , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , 。
- 如請求項1至10、12中任一項所述的化合物,其特徵在於,所述化合物還包括:所述化合物在醫藥上可接受的鹽、立體異構體、酯、前驅藥、溶劑化物和氘代化合物。
- 一種醫藥組合物,其特徵在於,包括如請求項1至13中任一項所述的化合物。
- 如請求項1至13中任一項所述的化合物或如請求項14所述的醫藥組合物在製備用於預防、診斷或治療由於蛋白激酶的表現、突變或者融合造成的蛋白激酶介導的疾病的藥物中的應用。
- 如請求項15所述的應用,其特徵在於,所述蛋白激酶介導的疾病的藥物用於預防、診斷或治療蛋白激酶所介導的腫瘤,所述腫瘤包括非小細胞肺癌、乳腺癌、結腸癌、前列腺癌、甲狀腺癌、惡性黑色素瘤、神經母細胞瘤和乳腺樣分泌癌中的至少一種。
- 如請求項15所述的應用,其特徵在於,所述藥物的施用方式包括口服、皮內注射、皮下注射、塗抹於皮膚、腸胃外、直腸中的至少一種。
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TW202412851A true TW202412851A (zh) | 2024-04-01 |
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