TW201920165A - 氮吲哚化合物作為組蛋白甲基轉移酶抑制劑 - Google Patents

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Abstract

本揭露提供某些角形三環化合物,其為組蛋白甲基轉移酶G9a及/或GLP的抑制劑,且因此可用於治療可藉由抑制G9a及/或GLP而治療的疾病,如癌症及血紅素病(例如,β-地中海貧血及鐮狀細胞疾病)。亦提供了含有此類化合物的醫藥組成物以及用於製備此類化合物的過程。

Description

氮吲哚化合物作為組蛋白甲基轉移酶抑制劑
本揭露提供某些氮吲哚化合物,其為組蛋白甲基轉移酶G9a及/或GLP的抑制劑,且因此可用於治療可藉由抑制G9a及/或GLP而治療的疾病,如癌症及血紅素病(例如,β-地中海貧血及鐮狀細胞疾病)。亦提供了含有此類化合物的醫藥組成物以及用於製備此類化合物的過程。
染色質修飾在轉錄調節中發揮必要作用。這些修飾(包括DNA甲基化、組蛋白乙醯化及組蛋白甲基化)在多種生物過程中是重要的,包括蛋白質生產及細胞分化,並且正成為各種人類疾病中具有吸引力的藥物靶標。與組蛋白甲基化相關的兩種特定酶為G9a及GLP,也稱為EHMT2及EHMT1(真染色質組蛋白-離胺酸N-甲基轉移酶2及1)。G9a及GLP是將組蛋白H3的Lys 9單甲基化及二甲基化(H3K9me1及H3K9me2)的主要酶,且主要是以G9a-GLP雜聚複合物的形式存在,其在體內似乎為功能性H3K9甲基轉移酶。在結構上,G9a或GLP係由催化性SET結構域及在N-端區域上的核定位信號構成,該催化性SET結構域是含有(涉及蛋白質-蛋白質交互作用之)錨蛋白重複的結構域。SET結構域負責將甲基基團添加到H3上,而錨蛋白重複被觀察到代表單-及二甲基離胺酸結合區域。因此G9a-GLP複合物不僅能夠甲基化兩個組蛋白尾而且能夠識別這種修飾,而且充當作為募集染色質上的其他靶標分子的支架。見Shinkai等人,Genes Dev., 2011; 25(8):781-8;及Shankar等人,Epigenetics, 2013; 8(1):16-22。
許多研究報告,G9a及GLP在各種生物過程中發揮關鍵作用。幾份報告強調了其與各種癌症的關聯。見Cascielle等人,Front Immunol., 2015 25; 6:487。其在肝細胞癌、B細胞急性淋巴母細胞白血病、及肺癌中上調。此外,G9a在侵襲性肺癌中的升高表現與不良預後相關,而在體內小鼠模型中其在高度侵入性肺癌細胞中的敲低抑制轉移。在前列腺癌細胞(PC3)中,G9a敲低造成顯著的形態學變化及細胞生長的抑制。見Liu等人,J. Med Chem., 2013; 56(21):8931-42.;及Sweis等人,ACS Med Chem Lett., 2014; 5(2):205-9。已經證明喪失G9a可損害DNA損傷修復且增強癌細胞對輻射及化學治療劑的敏感性。見Yang等人,Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2017, doi: 10.1073/pnas. 1700694114。
有趣的是,最近的研究還顯示,藉由基因耗減或藥理學介入來抑制G9a及GLP增加了胎兒血紅素(HbF)基因在類紅血球中的表現。見Krivega等人,Blood, 2015; 126(5):665-72;及Renneville等人,Blood, 2015; 126(16):1930-9。誘導胎兒球蛋白基因將潛在地在治療上有益於血紅素病的疾病,包括β-地中海貧血,其中正常β球蛋白(成人血紅素的組分)的生產受損。類似地,誘導HbF將潛在地藉由稀釋血紅素S (HbS)分子的濃度,藉此減少HbS的聚合作用而達到有益作用。見Sankaran等人,Cold Spring Harb Perspect Med., 2013; 3(1): a011643。此外,G9a或GLP抑制可加強其他臨床上使用的療法,例如羥基脲或HDAC抑制劑。這些藥劑可以至少部分地藉由經由不同機制增加γ球蛋白基因表現來作用。見Charache等人,Blood, 1992; 79(10):2555-65。因此,需要開發能夠抑制G9a及/或GLP的活性的小分子。本揭露的化合物滿足了這一及相關的需要。
在一態樣中,提供了式(I)之化合物:(I) 其中: X可為N(氮)或CR1 ; Y可為N(氮)或CR2 ; P、Q、T、及U可獨立地為CH、C(碳)(當附接R4 或R5 時)、或N(氮);前提條件是P、Q、T及U中的至少一個且不多於兩個為N(氮); Z可為O(氧)、S(硫)、或NR6 ,其中R6 可為氫、烷基、或環烷基; R1 可為氫、烷基、烷氧基、鹵基、鹵烷基、鹵烷氧基、或環烷基; R2 可為氫、烷基、烷氧基、鹵基、鹵烷基、鹵烷氧基、或環烷基; R3 可為–W-伸烷基-R7 ,其中: W可為鍵、NH、O(氧)或S(硫); 伸烷基可為可選地經R8 取代,其中R8 可為鹵基、鹵烷基、鹵烷氧基、羥基、或烷氧基,且該伸烷基中的一個CH2 可為可選地經NH或O(氧)置換;且 R7 可為-NRa Rb ,其中Ra 及Rb 可獨立地為氫、烷基、或鹵烷基;或Ra 及Rb 可連同彼等所附接的氮一起形成雜環胺基、橋接雜環胺基、或螺雜環胺基,其中該雜環胺基、該橋接雜環胺基及該螺雜環胺基可選地經一個或兩個獨立地選自烷基、鹵基、鹵烷基、羥基、烷氧基、及鹵烷氧基的取代基取代;或 R7 可為以環碳原子附接至該伸烷基的雜環基,且可為可選地經一個或兩個獨立地選自烷基、鹵基、鹵烷基、羥基、烷氧基及鹵烷氧基的取代基取代; R4 及R5 可獨立地為烷基、烯基、炔基、環烷基、環烯基、鹵基、羥基、鹵烷氧基、烷氧基、氰基、NH2 、NRc Rd 、烷氧基烷基胺基、羥基烷基胺基、胺基烷基胺基、羥烷基、烷氧基烷基、烷硫基、烷氧基烷基氧基、苯基、雜芳基、雜芳基氧基、雜環基、雜環基氧基、雜環基胺基、5至8員橋接雜環胺基或螺雜環胺基,其中該苯基、該環烷基、該雜芳基、及該雜環基單獨或作為另一基團的一部分都可選地經一個、兩個、或三個獨立地選自烷基、鹵基、鹵烷基、鹵烷氧基、羥基、羥烷基、烷氧基、NH2 、烷基胺基、二烷基胺基、羧基、羧基烷基、及烷氧羰基的取代基取代,且其中R4 及R5 的該烷基可選地經環烷基取代,且R4 及R5 的該烯基及該炔基獨立地可選地經羥基或環烷基取代; Rc 為氫、烷基、環烷基、或雜環基; Rd 為烷基、環烷基、或雜環基;或 Rc 及Rd 連同彼等所附接的氮一起形成4至7員雜環胺基;且 v及w獨立地為0或1; 或其醫藥上可接受之鹽。
在第二態樣中,本揭露涉及醫藥組成物,該組成物包含式(I)之化合物(或本文描述之任何實施例)、或其醫藥上可接受之鹽;及醫藥上可接受之賦形劑。
在第三態樣中,本揭露涉及一種治療疾病的方法,該疾病可藉由抑制有此需要之對象體內的G9a及/或GLP而治療,該方法包含向該對象投予治療有效量的式(I)之化合物(或本文所述之其任何實施例)、或其醫藥上可接受之鹽;或包含治療有效量的式(I)之化合物(或本文所述之其任何實施例)、或其醫藥上可接受之鹽、及醫藥上可接受之賦形劑的醫藥組成物。在一實施例中,疾病可為血紅素病,如β-地中海貧血及鐮狀細胞疾病。見Krivega等人,Blood, 2015; 126(5):665-72;及Renneville等人,Blood. 2015 Oct 15; 126(16):1930-9。在第二實施例中,疾病可為癌症或腫瘤,例如,其中G9a或GLP可被過度表達的癌症或腫瘤。見Cascielle等人,Front Immunol, 2015; 6:487。在第三實施例中,治療癌症及/或腫瘤包含增加無腫瘤存活率及/或減少腫瘤質量及/或減緩腫瘤生長。在第四實施例中,疾病可以是癌症傾向症候群,諸如多發性缺陷瘤症候群。見You等人,Cancer Cell, 2012; 22(1):9-20。在第五實施例中,疾病可以是發炎性及/或自身免疫性疾病,諸如治療腸道炎症。見Antignano等人,J Clin Invest, 2014; 124(5):1945-55。在第六實施例中,疾病可以是代謝疾病,如糖尿病及/或肥胖,例如糖尿病及肥胖。見Wang等人,EMBO J., 2013; 32(1):45-59。在第七實施例中,疾病可為與骨骼肌發育及再生相關。見Ling等人,Proc Natl Acad Sci U S A., 2012; 109(3):841-6。在第八實施例中,疾病可以是病毒疾病,如HIV-1(人類免疫不全病毒1)及HBV(B型肝炎病毒)。見Imai等人,J Biol Chem., 2010; 285(22):16538-45;及Merkling等人,PLoS Pathog., 2015; 11(4):e1004692。本文描述之化合物及組成物可與一或多種另外的治療劑一起投予,包括但不限於抗癌劑及抗病毒劑。見例如Front Immunol., 2015; 6:487;Agarwal等人,Cancer Lett.2016:467及Zhang等人,Oncotarget 2015, 6(5):2917。
在第四態樣中,提供了式(I)之化合物(或本文描述之其任何實施例)、或其醫藥上可接受之鹽於治療本文第三態樣所提供的疾病的用途。
在第五態樣中,本揭露涉及一種抑制G9a及/或GLP的方法,該方法包含使細胞與治療有效量的式(I)之化合物(或本文描述之其任何實施例)、或其醫藥上可接受之鹽接觸。在一些實施例中,細胞患有本文第三態樣所提供的一或多種疾病。
以引用方式併入任何優先權申請案中 任何及所有聲明主張國際或國內優先權的申請案,例如在隨本申請案提交的申請書資料表或請求書中聲明者,特此根據37 CFR 1.57及法則4.18及20.6以引用方式併入本文中,包括2017年6月9日提出的美國臨時專利申請案第62/517,410號。
定義: 除非另外指明,在本說明書及申請專利範圍中使用的以下用語係出於本申請案的目的被定義,並且具有以下含義: 「烷基(Alkyl)」是指具有一至六個碳原子的直鏈飽和單價烴基或具有三至六個碳原子的支鏈飽和單價烴基,例如甲基、乙基、正丙基、2-丙基(異丙基)、正丁基、二級丁基、異丁基、三級丁基、戊基(直鏈或支鏈)、己基(直鏈或支鏈)、及類似物。
除非另外指明,「伸烷基(Alkylene)」是指具有一至六個碳原子的直鏈飽和二價烴基或具有三至六個碳原子的支鏈飽和二價烴基,例如亞甲基、伸乙基、伸丙基、1-甲基伸丙基、2-甲基伸丙基、伸丁基、伸戊基、及類似物。
「烯基(Alkenyl)」是指具有二至六個碳原子的直鏈烴基或具有3至6個碳原子的支鏈烴基,其包括一個或兩個雙鍵,如乙烯基、丙烯基(直鏈或支鏈)、丙二烯基、丁烯基(直鏈或支鏈)、戊烯基(直鏈或支鏈)及己烯基(直鏈或支鏈)。
「炔基(Alkynyl)」是指具有二至六個碳原子的直鏈烴基或具有3至6個碳原子的支鏈烴基,其包括一個或兩個參鍵,如乙炔基、丙炔基(直鏈或支鏈)、丁炔基(直鏈或支鏈)、戊炔基(直鏈或支鏈)及己炔基(直鏈或支鏈)。
「烷氧基(Alkoxy)」是指-OR自由基,其中R為如上定義之烷基,例如甲氧基、乙氧基、丙氧基、或2-丙氧基、正丁氧基、異丁氧基、三級丁氧基、及類似物。
「烷氧基烷基(Alkoxyalkyl)」是指經一個或兩個如上定義之烷氧基取代的如上定義之烷基,例如甲氧基乙基、乙氧基乙基、甲氧基丙基、及類似物。
「烷氧基烷基胺基(Alkoxyalkylamino)」是指其中R是如上定義之烷氧基烷基的-NHR自由基,例如甲氧基乙基胺基、1-、2-或3-甲氧基丙基胺基、及類似物。
「烷氧基烷基氧基(Alkoxyalkyloxy)」是指其中R是如上定義之烷氧基烷基的-OR自由基,例如甲氧基乙基氧基、乙氧基乙基氧基、及類似物。
「羥基烷基胺基(Hydroxyalkylamino)」是指其中R是如本文定義之羥基烷基的-NHR自由基,例如羥基乙基胺基、1-、2-或3-羥基丙基胺基、及類似物。
「烷基羰基(Alkylcarbonyl)」或「醯基(Acyl)」是指其中R是如上定義之烷基的-COR自由基,例如甲基羰基、乙基羰基、及類似物。
「胺基烷基(Aminoalkyl)」是指其中R’及R”獨立地為氫或如上定義之烷基的-(伸烷基)-NR’R”自由基。
「胺基烷基胺基(Aminoalkylamino)」是指其中R是如上定義之胺基烷基的-NHR自由基,例如胺基乙基胺基、甲基胺基乙基胺基、二甲基胺基乙基胺基、二乙基胺基乙基胺基、及類似物。
「烷基胺基(Alkylamino)」是指其中R’是如上定義之烷基的-NHR’自由基。
「烷基硫基(Alkylthio)」是指其中R’是如上定義之烷基的-SR’自由基。
「橋接雜環胺基(Bridged heterocycloamino)」是指如本文中定義之具有5至8個環原子的飽和雜環胺基自由基,其中二個非相鄰碳原子或非相鄰碳及氮原子係由如本文中定義之伸烷基鏈連結。
「環烷基(Cycloalkyl)」除非另有說明,否則是指具有三至十個碳原子的環狀飽和單價烴基,例如環丙基、環丁基、環戊基、或環己基、及類似物。
「環烯基(Cycloalkenyl)」除非另有說明,否則是指具有三至十個碳原子且含有一或二個雙鍵的環狀非芳族烴基,例如環丙烯基、環丁烯基、環戊烯基、環己烯基、及類似物。
「羧基(Carboxy)」是指–C(=O)OH基團。
「羧基烷基(Carboxyalkyl)」是指經羧基取代的如上所定義的烷基自由基。
「二烷基胺基(Dialkylamino)」是指其中R及R’是如上定義之烷基的-NRR’自由基。
「鹵基(halo)」或「鹵素(halogen)」是指氟基、氯基、溴基、或碘基,較佳的是氟基或氯基。
「鹵烷基(Haloalkyl)」是指經一或多個鹵素原子(如一至五個鹵素原子,如氟或氯)取代的如上定義之烷基自由基,包括該些經不同鹵素取代者,例如-CH2 Cl、-CF3 、-CHF2 、-CH2 CF3 、及-CF2 CF3 、-CF(CH3 )2 、及類似物。當烷基僅被氟取代時,其可在本申請案中被稱為氟烷基。
「鹵烷氧基(Haloalkoxy)」是指–OR自由基,其中R是如本文中定義之鹵烷基,例如-OCF3 、-OCH2 Cl、-OCHF2 、-OCH2 CF3 、及-OCF2 CF3 、-OCHF2 、及類似物。當鹵烷氧基的鹵烷基是僅被氟取代的烷基時,其被稱為氟烷氧基。
「羥基烷基(Hydroxyalkyl)」是指經一個或兩個如上定義之羥基取代的如上定義之烷基,例如羥基乙基、羥基乙基、1,3-二羥基丙基、及類似物。
「雜環基(Heterocyclyl)」是指具有3至8個環原子的飽和或不飽和的、非芳族的單價單環基團,其中一個或兩個環原子是獨立地選自N、O、及S(O)n 的雜原子,其中n為0至2的整數,且其餘環原子為C,除非另有說明。此外,雜環基環中的一個或兩個環碳原子可可選地經–C(=O)-基團置換。更具體地講,用語雜環基包括但不限於吡咯啶基、哌啶基、升哌啶基、2-側氧基吡咯啶基、2-側氧基哌啶基、嗎啉基、哌基、二氫哌喃基、硫代嗎啉基、及類似物。當雜環基環不飽和時,其可含有一個或兩個環雙鍵,前提條件是環為非芳族的。當雜環基含有至少一個氮原子(例如吡咯啶基、哌啶基、升哌啶基、嗎啉基、哌基、硫代嗎啉基、及類似物),該雜環基環亦可在本文中稱為「雜環胺基(heterocycloamino)」且為雜環基的子集。
「雜環基氧基(Heterocyclyloxy)」是指其中R是如上定義之雜環基的-OR自由基,例如吡咯啶基氧基、四氫呋喃基氧基、及類似物。
「雜環基胺基(Heterocyclylamino)」是指其中R是如上定義之雜環基的-NHR自由基,例如吡咯啶基胺基、四氫呋喃基胺基、哌啶胺基、及類似物。
除非另外指明,「雜芳基(Heteroaryl)」是指具有5至10個環原子的單價單環或雙環芳族自由基,其中一或多個(在一實施例中,一、二、或三個)環原子為獨立地選自N、O、及S的雜原子,且其餘的環原子為碳。代表性實例包括但不限於吡咯基、噻吩基、噻唑基、咪唑基、呋喃基、吲哚基、異吲哚基、唑基、異唑基、苯并噻唑基、苯并唑基、喹啉基、異喹啉基、吡啶基、嘧啶基、吡基、嗒基、三唑基、四唑基、及類似物。當雜芳基環含有5或6個環原子時,其也在本文中被稱為5或6員雜芳基。
「雜芳基氧基(Heteroaryloxy)」是指其中R是如上定義之雜芳基的-OR自由基,例如吡啶基氧基、呋喃基氧基、及類似物。
「側氧基(oxo)」是指=(O)基團。如所屬技術領域中具有通常知識者所將顯而易見的,「羰基(carbonyl)」是指附接至碳原子的側氧基自由基,即−C(=O)−。
「螺雜環胺基(Spiroheterocycloamino)」是指具有7至10個環原子的飽和雙環狀環,其中一個、兩個、或三個環原子是選自N、N-氧化物、O、及S(O)n 的雜原子,其中n是0至2的整數,其餘環原子是C,前提條件是至少一個環原子是N,且該等環僅經由一個原子連接。連接原子也稱為螺原子,且最常見為四級碳(「螺碳(spiro carbon)」)。
本揭露還包括本揭露的化合物的受保護的衍生物。例如,當本揭露的化合物包含基團如羥基、羧基、氫硫基或任何含有(多個)氮原子的基團,該等基團可以用合適的保護基進行保護。合適保護基的全面列表可見T.W.Greene,Protective Groups in Organic Synthesis , John Wiley & Sons, Inc. (1999),其揭示內容係以引用方式整體併入本文中。本揭露之化合物的受保護衍生物可藉由本領域熟知的方法製備。
化合物的「醫藥上可接受之鹽(pharmaceutically acceptable salt)」是指可藥用的並且具有母體化合物所欲之藥理活性的鹽。此類鹽包括: 與無機酸例如鹽酸、氫溴酸、硫酸、硝酸、磷酸等所形成的酸加成鹽;或與有機酸例如甲酸、乙酸、丙酸、己酸、環戊烷丙酸、乙醇酸、丙酮酸、乳酸、丙二酸、琥珀酸、蘋果酸、馬來酸、富馬酸、酒石酸、檸檬酸、苯甲酸、3-(4-羥基苯甲醯基)苯甲酸、肉桂酸、杏仁酸、甲磺酸、乙磺酸、1,2-乙二磺酸、2-羥基乙磺酸、苯磺酸、4-氯苯磺酸、2-萘磺酸、4-甲苯磺酸、樟腦磺酸、葡萄庚酸、4,4'-亞甲基二-(3-羥基-2-烯-1-羧酸)、3-苯基丙酸、三甲基乙酸、三級丁基乙酸、月桂基硫酸、葡糖酸、麩胺酸、羥基萘甲酸、水楊酸、硬脂酸、黏康酸等所形成的酸加成鹽;或 當母體化合物中存在的酸性質子被金屬離子(例如鹼金屬離子、鹼土金屬離子或鋁離子)所置換而形成的鹽;或與有機鹼(例如乙醇胺、二乙醇胺、三乙醇胺、胺基丁三醇、N- 甲基葡糖胺等)配位所形成的鹽。應理解醫藥上可接受之鹽是無毒的。有關合適醫藥上可接受之鹽的額外資訊可見於Remington’s Pharmaceutical Sciences , 17th ed., Mack Publishing Company, Easton, PA, 1985,其整體以引用方式併入本文中。
本揭露的化合物可以具有不對稱中心。本揭露的含有不對稱取代的原子的化合物可以光學活性形式或外消旋形式被分離。本領域熟知如何製備光學活性形式,諸如藉由材料的拆分。除非具體地指出特定的立體化學形式或異構物形式,所有的手性形式、非鏡像異構物形式、所有手性形式或非鏡像異構物形式的混合物、及外消旋形式都在本揭露的範圍之內。所屬技術領域中具有通常知識者還應理解的是當化合物被指示為(R)立體異構物時,其可以含有對應的(S)立體異構物作為雜質,即(S)立體異構物按重量計少於約5%、較佳的2%,當其被指示為R及S異構物的混合物時,R或S異構物在混合物中的量大於約5%、較佳的2% w/w。
本揭露的某些化合物可以作為互變異構物及/或幾何異構物存在。所有可能的互變異構物及順式及反式異構物,作為單一的形式及其混合物都在本揭露範圍之內。此外,本文中所使用之用語烷基雖然僅列出幾個實例,但是用語烷基包括該烷基基團的所有可能的異構形式。另外,當環狀基團(例如芳基、雜芳基、雜環基)被取代時,雖然僅列出幾個實例,但是彼等包括所有位置異構物。另外,本揭露的化合物的所有水合物係在本揭露的範圍內。
「可選的(optional)」或「可選地(optionally)」是指其後描述之事件或情況可以發生但不必要發生,且該描述包括其中該事件或情況發生之例子及其中該事件或情況不發生之例子。例如,「可選地經烷基取代的雜環基(heterocyclyl group optionally substituted with an alkyl group)」指的是該烷基可以存在但不必要存在,並且該描述包括其中該雜環基經烷基取代的情形以及其中該雜環基未經烷基取代的情形。
應理解,若在本文中揭示之化合物具有未填滿價數,則價數應以氫填滿。
本文還提供了本文所述之化合物的同位素體(同位素標記類似物)。以諸如氘之同位素取代可得到由較高代謝穩定性帶來的某些治療優點,例如體內半衰期增長或劑量需求降低。在一些實施例中,在本文所述化合物或其醫藥上可接受之鹽的任何具有氫的位置,該氫原子可被氫-2(氘)或氫-3(氚)置換。例如,一或多個R1 、R2 、Ra 、Rb 及/或R4 可包括一或多個氘(如1、2或3個氘)。
「醫藥上可接受之載劑或賦形劑(pharmaceutically acceptable carrier or excipient)」是指可用於製備通常為安全、無毒性、不是生物非所欲也不是其他方式非所欲之醫藥組成物的載劑或賦形劑,且包括獸醫用途以及人類醫藥用途可接受之載劑或賦形劑。在本說明書及申請專利範圍中使用的「醫藥上可接受之載劑/賦形劑(A pharmaceutically acceptable carrier/excipient)」包括一種該賦形劑及多於一種該賦形劑兩者。
「對象(subject)」是指其為治療、觀察或實驗目標的動物。「動物(Animal)」包括冷血及溫血脊椎動物及無脊椎動物,例如魚、甲殼類動物、爬蟲類及特別是哺乳動物。「哺乳動物(Mammal)」包括但不限於小鼠、大鼠、兔、天竺鼠、犬、貓、綿羊、山羊、牛、馬、靈長類動物例如猴、黑猩猩及猿、及特別是人類。在一些實施例中,對象可以是人。在一些實施例中,對象可以是兒童及/或嬰兒,例如患有發燒的兒童或嬰兒。在其他實施例中,對象可為成人。
疾病的「治療(treating或treatment)」包括: (1)預防疾病,即使得疾病的臨床症狀在可暴露於或易患該疾病但尚未經歷或顯示該疾病症狀的對象中不發展; (2)抑制疾病,即阻礙或減少疾病或其臨床症狀的發展;或 (3)減輕疾病,即使得疾病或其臨床症狀消退。
「治療有效量(therapeutically effective amount)」是指將本揭露的化合物及/或其醫藥上可接受之鹽投予對象用於治療疾病時,足以實現該疾病的該治療的量。「治療有效量」將視化合物、疾病、疾病之嚴重性、接受治療之對象的年齡、體重等因素而異。
實施例 : 在以下進一步實施例1至61中,本揭露包括: 1. 在實施例1中,式(I)之化合物、或其醫藥上可接受之鹽如發明內容中所定義。在實施例1中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,Z為NR6 。在實施例1中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,當Z為NR6 時,R6 為H。在實施例1中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,當Z為NR6 時,R6 為烷基,如甲基或乙基。在實施例1中,在又另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,當Z為NR6 時,R6 為環烷基。在實施例1中,在又另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,當Z為NR6 時,R6 為環丙基。 2. 在實施例2中,實施例1的化合物及其中包含的該組化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中X為CR1 且Y為CR2 者,其中R1 為氫、烷基、烷氧基、鹵基、鹵烷基、鹵烷氧基、或環烷基且R2 為氫、烷基、烷氧基、鹵基、鹵烷基、鹵烷氧基、或環烷基。在實施例2中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,X為CR1 且Y為CR2 ,其中R1 為氫。在實施例2中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,X為CR1 且Y為CR2 ,其中R2 為氫。在實施例2中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,X為CR1 且Y為CR2 ,其中R1 及R2 各自為氫。在實施例2中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,X為CR1 ,其中R1 為烷基(例如甲基、乙基、正丙基或異丙基),且Y為CR2 。在實施例2中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,X為CR1 ,其中R1 為烷氧基(如甲氧基、乙氧基、正丙氧基及異丙氧基),且Y為CR2 。在實施例2中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,X為CR1 ,其中R1 為鹵基(如氟或氯),且Y為CR2 。在實施例2中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,X為CR1 ,其中R1 為鹵烷基(例如,CF3 ),且Y為CR2 。在實施例2中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,X為CR1 ,其中R1 為鹵烷氧基(例如,CF3 ),且Y為CR2 。在實施例2中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,X為CR1 ,其中R1 為環烷基(如環丙基),且Y為CR2 。在實施例2的組中,在一組化合物中,X為CR1 且Y為CH。在實施例2的組中,在一組化合物中,R1 為甲氧基。在實施例2中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,X為CR1 ,其中R1 為烷氧基(如甲氧基、乙氧基、正丙氧基及異丙氧基),且Y為CR2 ,其中R2 為氫。在實施例2中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,X為CR1 ,其中R1 為甲氧基,且Y為CR2 ,其中R2 為氫。在實施例2中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,X為CR1 且Y為CR2 ,其中R2 為烷氧基(例如甲氧基、乙氧基、正丙氧基或異丙氧基)。在實施例2中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,X為CR1 且Y為CR2 ,其中R1 為氫且R2 為烷氧基(例如甲氧基、乙氧基、正丙氧基或異丙氧基)。在實施例2中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,X為CR1 ,其中R1 為烷基且Y為CR2 。在實施例2中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,X為CR1 ,其中R1 為烷基(例如甲基、乙基、正丙基或異丙基),且Y為CR2 ,其中R2 為氫。 3. 在實施例3中,實施例1的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中X為CR1 且Y為N者。在實施例3中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,X為CR1 ,其中R1 為氫,且Y為N。在實施例3中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,X為CR1 ,其中R1 為烷基(例如甲基、乙基、正丙基或異丙基),且Y為N。在實施例3中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,X為CR1 ,其中R1 為烷氧基(例如甲氧基、乙氧基、正丙氧基或異丙氧基),且Y為N。在實施例3中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,X為CR1 ,其中R1 為鹵基(如氟、或氯),且Y為N。在實施例3中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,X為CR1 ,其中R1 為鹵烷基(例如CF3 ),且Y為N。在實施例3中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,X為CR1 ,其中R1 為鹵烷氧基(例如OCF3 ),且Y為N。在實施例3中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,X為CR1 ,其中R1 為環烷基(如環丙基),且Y為N。 4. 在實施例4中,實施例1、2或3的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中Q為N,且P、T、及U為CH或C(當附接R4 或R5 時)者。在實施例4中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,P為CR4 。在實施例4的組中,在另一組化合物中,P為CR4 且T為CR5 。在實施例4的組中,在另一組化合物中,P為CR4 且T為CH。在實施例4的組中,在另一組化合物中,P為CR4 且U為CR5 。在實施例4的組中,在另一組化合物中,P為CR4 且U為CH。 5. 在實施例5中,實施例1、2或3的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中Q及U各自為N,且P及T各自為CH或C(當附接R4 或R5 時)者。在實施例5的組中,在另一組化合物中,P為CR4 且T為CR5 。在實施例5的組中,在另一組化合物中,P為CR4 且T為CH。 6. 在實施例6中,實施例1、2或3的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中P為N(氮);且Q、T、及U各自為CH者。 7. 在實施例7中,實施例1、2或3的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中P、Q及U各自為CH;且T為N(氮)者。 8. 在實施例8中,實施例1、2或3的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中P及T各自為N(氮);且Q及U各自為CH者。 9. 在實施例9中,實施例1、2或3的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中P為C(其中附接R4 );Q為N(氮);且T及U各自為CH者。 10. 在實施例10中,實施例1、2或3的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中P、T及U各自為CH;且Q為N(氮)者。 11. 在實施例11中,實施例1、2或3的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中P、Q及T各自為CH;且U為N(氮)者。 12. 在實施例12中,實施例1、2或3的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中P及U各自為CH;T為C(其中附接R5 )且Q為N(氮)者。 13. 在實施例13中,實施例1、2或3的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中P為C(其中附接R4 );Q為N(氮);T為C(其中附接R5 );且U為CH者。 14. 在實施例14中,實施例1、2或3的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中P及T各自為CH;Q及U為N(氮)者。 15. 在實施例15中,實施例1、2或3的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中P及Q各自為CH;T為C(其中附接R5 );且U為N(氮)者。 16. 在實施例16中,實施例1、2或3的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中P為C(其中附接R4 );Q為N(氮);T為CH;且U為C(其中附接R5 )者。 17. 在實施例17中,實施例1、2或3的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中P為C(其中附接R4 );Q為N(氮);T為CH;且U為N(氮)者。 18. 在實施例18中,實施例1、2或3的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中P為C(其中附接R4 );Q為N(氮);T為CR5 (其中附接R5 );且U為N(氮)者。 19. 在實施例19中,實施例1、2或3的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中Q為N(氮);且P、T、及U獨立地為CH或C(當附接R4 或R5 時)者。 20. 在實施例20中,實施例1、2或3的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中Q為N(氮);且P、T、及U獨立地為CH或C(當附接R4 或R5 時)者。在實施例20中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,P為CR4 。在實施例20中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,T為CH。在實施例20中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,T為CR5 。在實施例20中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,U為CH。在實施例20中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,U為CR5 。在實施例20中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,T及U各自為CH。 21. 在實施例21中,實施例1至20中任一項及其中所含之組的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中R3 為-W-伸烷基-R7 者,其中W為鍵。 22. 在實施例22中,實施例1至20中任一項及其中所含之組的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中R3 為-W-伸烷基-R7 者,其中W為NH。 23. 在實施例23中,實施例1至20中任一項及其中所含之組的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中R3 為-W-伸烷基-R7 者,其中W為O(氧)。 24. 在實施例24中,實施例1至20中任一項及其中所含之組的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中R3 為-W-伸烷基-R7 者,其中W為S(硫)。 25. 在實施例25中,實施例21至24中任一項及其中所含之組的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中伸烷基為未經取代的伸烷基(如未經取代的C1-4 伸烷基)者。 26. 在實施例26中,實施例21至24中任一項及其中所含之組的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中伸烷基為經R8 取代的經取代的伸烷基者,其中R8 為鹵基(如氟或氯)、鹵烷基(例如-CH2 Cl、-CF3 、-CHF2 、-CH2 CF3 、及-CF2 CF3 )、鹵烷氧基(如-OCF3 、-OCH2 Cl、-OCHF2 、 -OCH2 CF3 、及-OCF2 CF3 )、羥基、或烷氧基(例如甲氧基、乙氧基、正丙氧基或異丙氧基)、及/或伸烷基中的一個CH2 可選地被NH或O(氧)置換。在實施例26中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,其中伸烷基中被置換的一個CH2 為在W後的伸烷基中的第一CH2 後的CH2 。例如,用氧置換在W後的伸烷基中的第一CH2 後的CH2 (即,在最初W後的伸烷基中的第二CH2 ),其中伸烷基在置換前的初始長度為3個碳,會導致具有式-CH2 O-CH2 -*的自由基,其中*指示附接至R7 的點。在實施例26中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,其中伸烷基中被置換的一個CH2 為在W後的伸烷基中的第二CH2 後的CH2 。置換W後的伸烷基中的第二CH2 後的CH2 的實例為 -CH2 CH2 O-CH2 -*,其中該置換用氧進行,在置換前初始伸烷基長度為4個碳,且*指示附接至R7 的點。 27. 在實施例27中,實施例21、23、25或26及其中所含之組的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中在R3 中之-W-伸烷基-為–(CH2 )2 -* 、–(CH2 )3 -*、-(CH2 )4 -*、-CH2 CH(CH3 )CH2 -*、*-CH2 CH(CH3 )CH2 - 、-O-(CH2 )-*、-O-(CH2 )2 -*、-O-(CH2 )2 -O-(CH2 )2 -*、-O-(CH2 )3 -*、 -OCH2 CH(F)CH2 -*、-OCH2 CH(OH)CH2 -*、-OCH2 CH(OCH3 )CH2 -* 、或-OCH2 CH(OCF3 )CH2 -*者,其中*指示附接至R7 的點。在實施例27中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,其中-W-伸烷基-為–(CH2 )2 -*、–(CH2 )3 -*、-(CH2 )4 -*、-CH2 CH(CH3 )CH2 -*、-O-(CH2 )2 -* 、或-O-(CH2 )3 -*,其中*指示附接至R7 的點。在實施例27中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,其中-W-伸烷基-為-O-(CH2 )3 -* ,其中*指示附接至R7 的點。 28. 在實施例28中,實施例21至27中任一項及其中所含之組的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中R7 為-NRa Rb 者,其中Ra 及Rb 獨立地為氫、烷基、或鹵烷基。在實施例28中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R7 為-NRa Rb ,其中-NRa Rb 為NH2 、甲基胺基、乙基胺基、二甲基胺基、二乙基胺基、二異丙基胺基或(乙基)(甲基)胺基。 29. 在實施例29中,實施例21至27中任一項及其中所含之組的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中R7 為-NRa Rb 者,其中Ra 及Rb 連同彼等所附接的氮一起形成雜環胺基、橋接雜環胺基、或螺雜環胺基,其中該雜環胺基、該橋接雜環胺基及該螺雜環胺基可選地經一個或兩個獨立地選自烷基、鹵基、鹵烷基、羥基、烷氧基、及鹵烷氧基的取代基取代。在實施例29中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,雜環胺基可為未經取代的。在實施例29中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,雜環胺基可為經一個或兩個獨立地選自烷基(如甲基、乙基、正丙基或異丙基)、鹵基(例如氟基或氯基)、鹵烷基(例如-CH2 Cl、-CF3 、-CHF2 、-CH2 CF3 、及-CF2 CF3 )、羥基、烷氧基(例如,甲氧基、乙氧基、正丙氧基或異丙氧基)及鹵烷氧基(如-OCF3 、 -OCH2 Cl、-OCHF2 、-OCH2 CF3 、及-OCF2 CF3 )的取代基取代。在實施例29中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,雜環胺基可為吖呾-1-基、吡咯啶-1-基、哌啶-1-基、哌-1-基、嗎啉-4-基、硫嗎啉-4-基或3-氮雜雙環[3.1.1]庚烷-3-基,各雜環胺基可選地經一個或兩個獨立地選自烷基、鹵基、鹵烷基、羥基、烷氧基、及鹵烷氧基如甲基、羥基、甲氧基、及氟基的取代基取代。在實施例29中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R7 為-NRa Rb ,其中Ra 及Rb 連同彼等所附接的氮一起形成吡咯啶-1-基、3(S)-氟吡咯啶-1-基、3(R)-氟吡咯啶-1-基、2-甲基吡咯啶-1-基、3,5-二甲基吡咯啶-1-基、或3,3-二甲基吡咯啶-1-基。在實施例29中,在其他組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R7 為-NRa Rb ,其中Ra 及Rb 連同彼等所附接的氮一起形成吡咯啶-1-基。 30. 在實施例30中,實施例21至27中任一項及其中所含之組的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中R7 為以環碳原子附接至該伸烷基的雜環基,且可選地經一個或兩個獨立地選自烷基、鹵基、鹵烷基、羥基、烷氧基及鹵烷氧基的取代基取代者。在實施例30中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,其中R7 為含氮雜環基。例如,R7 的雜環基可為吡咯啶基、哌啶基、升哌啶基、2-側氧基吡咯啶基、2-側氧基哌啶基、嗎啉基、哌基、二氫哌喃基、或硫代嗎啉基。在實施例30中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,其中R7 為未經取代的雜環基,如未經取代的含氮雜環基。在實施例30中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,其中R7 為經取代的雜環基,如經取代的含氮雜環基,其中雜環基為一個或兩個獨立地選自烷基(如甲基、乙基、正丙基或異丙基)、鹵基(例如氟基或氯基)、鹵烷基(例如-CH2 Cl、-CF3 、-CHF2 、-CH2 CF3 、及-CF2 CF3 )、羥基、烷氧基(例如,甲氧基、乙氧基、正丙氧基或異丙氧基)及鹵烷氧基(如-OCF3 、-OCH2 Cl、-OCHF2 、-OCH2 CF3 、及-OCF2 CF3 )的取代基。在實施例30中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,其中R7 為可選地經烷基取代的哌啶-3-基。 31. 在實施例31中,實施例1至20中任一項及其中所含之組的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中R3 為-O-(CH2 )3 -吡咯啶-1-基、-O-(CH2 )3 -哌啶-1-基、-O-(CH2 )-哌啶-3-基、或-O-(CH2 )3 -嗎啉-4-基者,其中吡咯啶-1-基、哌啶-1-基、哌啶-3-基及嗎啉-4-基各自可選地經一個或兩個獨立地選自甲基、羥基、甲氧基、及氟基的取代基取代。 32. 在實施例32中,實施例1至24中任一項及其中所含之組的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中在R3 中之-W-伸烷基-為-(CH2 )-O-(CH2 )2 -*、或-(CH2 )2 -O-(CH2 )2 -*者,其中*指示附接至-NRa Rb 的點。在實施例32中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R7 為 -NRa Rb ,其中-NRa Rb 為NH2 、甲基胺基、乙基胺基、二甲基胺基、或二乙基胺基。在實施例32中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R7 為-NRa Rb ,其中-NRa Rb 連同彼等所附接的氮一起形成雜環胺基,其中雜環胺基可選地經一個或兩個獨立地選自烷基、鹵基、鹵烷基、羥基、烷氧基及鹵烷氧基的取代基取代。在實施例32中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R7 為-NRa Rb ,其中 -NRa Rb 連同彼等所附接的氮一起形成飽和雜環胺基(如吖呾-1-基、吡咯啶-1-基、哌啶-1-基、嗎啉-4-基、或硫嗎啉-4-基),其可選地經一個或兩個獨立地選自甲基、羥基、甲氧基、及氟基的取代基取代。在實施例32中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R3 為 -(CH2 )-O-(CH2 )2 -吡咯啶-1-基、-(CH2 )-O-(CH2 )2 -哌啶-1-基、或 -(CH2 )-O-(CH2 )2 -嗎啉-4-基,其中吡咯啶-1-基、哌啶-1-基、及嗎啉-4-基各自可選地經一個或兩個獨立地選自甲基、羥基、甲氧基、及氟基的取代基取代。在實施例32中,在又另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R3 為-(CH2 )-O-(CH2 )2 -NRa Rb ,其中NRa Rb 為吡咯啶-1-基、3-羥基-3-甲基吡咯啶-1-基、3-羥基-3-甲基吖呾-1-基、3-氟吖呾基、3-氟吡咯啶基、3(R)-氟吡咯啶基、3(S)-氟吡咯啶基、3,5-二甲基吡咯啶-1-基、或3,3-二甲基吡咯啶-1-基,較佳為吡咯啶-1-基。 33. 在實施例33中,實施例1至32中任一項及其中所含之組的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中w為0者。 34. 在實施例34中,實施例1至32中任一項及其中所含之組的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中w為1者。在實施例34中,一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中R5 為NH2 、鹵基、烷基、羥基、烷氧基、環烷基、或羥烷基者。在實施例34中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R5 為羥基、NH2 、氟基、氯基、甲基、乙基、羥基、甲氧基、環丙基、環戊基、或羥甲基。在實施例34中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R5 為NH2 。在實施例34中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R5 為烷基(如C1-6 烷基)。在實施例34中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R5 為甲基。在實施例34中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R5 為環烷基(例如C3-6 烷基)。在實施例34中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R5 為環丙基。在實施例34中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R5 為鹵基(例如,氟基或氯基)。在實施例34中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R5 為羥基或羥烷基(羥基(C1-4 烷基))。在實施例34中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R5 為羥甲基。在實施例34中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R5 為烷氧基(如C1-6 烷氧基)。在實施例34中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R5 為甲氧基。 35. 在實施例35中,實施例1至34中任一項及其中所含之組的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中v為0者。在實施例35中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,w為0。在實施例35中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,w為1。當w為1時,在一組或化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R5 可選自在實施例34中提供的化合物、或其醫藥上可接受之鹽的任何基團。 36. 在實施例36中,實施例1至34中任一項及其中所含之組的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中v為1者。在實施例36中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,w為0。在實施例36中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,w為1。當w為1時,在一組或化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R5 可選自在實施例34中提供的化合物、或其醫藥上可接受之鹽的任何基團。 37. 在實施例37中,實施例36及其中所含之組的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中R4 為羥基者。 38. 在實施例38中,實施例36及其中所含之組的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中R4 為烷基、環烷基、環烯基、鹵基、鹵烷氧基、烷氧基、氰基、NH2 、NRc Rd 、烷氧基烷基胺基、羥基烷基胺基、胺基烷基胺基、羥烷基、烷氧基烷基、烷硫基、烷氧基烷基氧基、苯基、雜芳基、雜芳基氧基、雜環基、雜環基氧基、5至8員橋接雜環胺基或螺雜環胺基者,其中該苯基、該雜芳基、及該雜環基單獨或為另一基團的一部分都可選地經一個、兩個、或三個獨立地選自烷基、鹵基、鹵烷基、鹵烷氧基、羥基、烷氧基、NH2 、烷基胺基、二烷基胺基、羧基、羧基烷基、及烷氧羰基的取代基取代,且其中R4 的該烷基可選地經未經取代的環烷基取代;Rc 為氫、烷基、環烷基、或雜環基;且Rd 為烷基、環烷基、或雜環基;或Rc 及Rd 連同彼等所附接的氮一起形成4至7員雜環胺基。在實施例38中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R4 為烷基或環烷基。在實施例38中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R4 為NH2 、NRc Rd 、烷氧基烷基胺基、羥基烷基胺基或胺基烷基胺基。在實施例38中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R4 為雜芳基、雜環基、5至8員橋接雜環胺基或螺雜環胺基,其中該雜芳基及該雜環基單獨或作為另一基團的一部分都可選地經一個、兩個、或三個獨立地選自烷基、鹵基、鹵烷基、鹵烷氧基、羥基、烷氧基、NH2 、烷基胺基、二烷基胺基、羧基、羧基烷基、及烷氧羰基的取代基取代。在實施例38中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R4 為甲基、乙基、正丙基、異丙基、三級丁基、乙炔基、氟基、氯基、環丙基、1-甲基環丙基、環丁基、環戊基、環戊-1-烯-1-基、2-環丙基乙炔基、2-環丙基乙烯基、2-環丙基乙基、吡咯啶-1-基、3-羥基吡咯啶-1-基、2-異丙基吡咯啶-1-基、2,2-二甲基吡咯啶-1-基、2-異丙基吡咯啶-1-基、2-(羧甲基)吡咯啶-1-基、2-羧基吡咯啶-1-基、吡啶-2-基、吡啶-3-基、吡啶-4-基、哌啶-1-基、哌啶-2-基、哌啶-3-基、哌啶-4-基、4-羥基哌啶-1-基、嗎啉-4-基、氧雜環丁烷-3-基、氧雜環丁烷-2-基、烷-2-基(oxan-2-yl)、烷-3-基、烷-4-基、四氫哌喃-4-基、1,2,3,6-四氫吡啶-4-基、3,6-二氫-2H-哌喃-4-基、四氫呋喃-3-基、吖呾-1-基、3-羥基吖呾-1-基、吡咯啶-3-基氧基、1-甲基吡咯啶-3-基氧基、烷-4-基氧基、吡咯啶-3-基氧基、2-乙氧基乙-1-基、3-甲氧基丙-1-基、甲基胺基、乙基胺基、正丙基胺基、正丁基胺基、異丙基胺基、異丁基胺基、三級丁基胺基、環丙基胺基、環丁基胺基、環戊基胺基、環己基胺基、環庚基胺基、(環丙基甲基)胺基、(環丁基甲基)胺基、(環戊基甲基)胺基、(環己基甲基)胺基、二甲基胺基、二乙基胺基、二甲基胺基、二-(正丙基)胺基、二-(異丙基)胺基、二-(正丁基)胺基、二-(異丁基)胺基、二-(三級丁基)胺基、(甲基)(乙基)胺基、2-乙氧基乙基胺基、3-甲氧基丙-2-基胺基、噻唑-2-基、噻唑-4-基、噻唑-5-基、吡唑-1-基、吡唑-3-基、吡唑-4-基、咪唑-1-基、咪唑-2-基、咪唑-4-基、咪唑-5-基、唑-5-基、唑-2-基、唑-4-基、1,2,4-三唑-5-基、1,2,4-三唑-3-基、1,2,4-三唑-1-基、羥甲基、4-二氟甲氧基苯基、3-二氟甲氧基苯基、2-二氟甲氧基吡啶-4-基、6-二氟甲氧基吡啶-3-基、4-甲基胺基吡啶-2-基、2-甲基胺基吡啶-4-基、6-甲基胺基-吡啶-2-基、4-二氟甲基苯基、2-羥丙-2-基、4-(2-羥丙基)苯基、4-(2-羥丙烷-2-基)苯基、2-(羧甲基)苯基、2-羧基苯基、2-甲氧基乙氧基、甲氧基、乙氧基、正丙氧基、異丙氧基、正丁氧基、異丁氧基及三級丁氧基、羥基、甲基次磺醯基、3-羥基-3-甲基丁-1-炔-1-基、3-羥基-3-甲基丁-1-烯-1-基、3-羥基-3-甲基丁基、2-羥丙烷-2-基、1-氮雜螺[3,4]辛烷-1-基、4-氮雜螺[2,4]庚烷-4-基、5-氮雜螺[3,4]辛烷-5-基、1-氮雜螺[3,3]庚烷-1-基、2-氧雜-5-氮雜螺[3,4]辛烷-5-基、6-氧雜-1-氮雜螺[3,3]庚烷-1-基、6-氧雜-1-氮雜螺[3,4]辛烷-1-基、7-氧雜-1-氮雜螺[4,4]壬烷-1-基、8-氧雜-3-氮雜雙環[3.2.1]辛烷-3-基、或7,7-二氧代-7-噻-1-氮雜螺[4.4]壬烷-1-基。在實施例38中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R4 為甲基、乙基、正丙基、異丙基、或三級丁基。在實施例38中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R4 為甲基、乙基、正丙基、或異丙基。在實施例38中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R4 為環丙基、1-甲基環丙基、環丁基、或環戊基。在實施例38中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R4 為環丙基。在實施例38中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R4 為吡咯啶-1-基、3-羥基吡咯啶-1-基、2-異丙基吡咯啶-1-基、2,2-二甲基吡咯啶-1-基、2-異丙基吡咯啶-1-基、2-(羧甲基)吡咯啶-1-基、2-羧基吡咯啶-1-基、吡啶-2-基、吡啶-3-基、吡啶-4-基、哌啶-1-基、哌啶-2-基、哌啶-3-基、哌啶-4-基、4-羥基哌啶-1-基、嗎啉-4-基、氧雜環丁烷-3-基、氧雜環丁烷-2-基、烷-2-基、烷-3-基、烷-4-基、四氫哌喃-4-基、1,2,3,6-四氫吡啶-4-基、3,6-二氫-2H-哌喃-4-基、四氫呋喃-3-基、吖呾-1-基、3-羥基吖呾-1-基、噻唑-2-基、噻唑-4-基、噻唑-5-基、吡唑-1-基、吡唑-3-基、吡唑-4-基、咪唑-1-基、咪唑-2-基、咪唑-4-基、咪唑-5-基、唑-5-基、唑-2-基、唑-4-基、1,2,4-三唑-5-基、1,2,4-三唑-3-基、1,2,4-三唑-1-基、羥甲基、4-二氟甲氧基苯基、3-二氟甲氧基苯基、2-二氟甲氧基吡啶-4-基、6-二氟甲氧基吡啶-3-基、4-甲基胺基吡啶-2-基、2-甲基胺基吡啶-4-基、或6-甲基胺基-吡啶-2-基。在實施例38中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R4 為吡咯啶-1-基、3-羥基吡咯啶-1-基、2-異丙基吡咯啶-1-基、2,2-二甲基吡咯啶-1-基、2-異丙基吡咯啶-1-基、2-(羧甲基)吡咯啶-1-基、或2-羧基吡咯啶-1-基。在實施例38中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R4 為吡咯啶-1-基。在實施例38中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R4 為1-氮雜螺[3,4]辛烷-1-基、4-氮雜螺[2,4]庚烷-4-基、5-氮雜螺[3,4]辛烷-5-基、1-氮雜螺[3,3]庚烷-1-基、2-氧雜-5-氮雜螺[3,4]辛烷-5-基、6-氧雜-1-氮雜螺[3,3]庚烷-1-基、6-氧雜-1-氮雜螺[3,4]辛烷-1-基、7-氧雜-1-氮雜螺[4,4]壬烷-1-基、8-氧雜-3-氮雜雙環[3.2.1]辛烷-3-基、或7,7-二氧代-7-噻-1-氮雜螺[4.4]壬烷-1-基。在實施例38中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R4 為甲基胺基、乙基胺基、正丙基胺基、正丁基胺基、異丙基胺基、異丁基胺基、三級丁基胺基、環丙基胺基、環丁基胺基、環戊基胺基、環己基胺基、環庚基胺基、(環丙基甲基)胺基、(環丁基甲基)胺基、(環戊基甲基)胺基、(環己基甲基)胺基、二甲基胺基、二乙基胺基、二甲基胺基、二-(正丙基)胺基、二-(異丙基)胺基、二-(正丁基)胺基、二-(異丁基)胺基、二-(三級丁基)胺基、或(甲基)(乙基)胺基。 39. 在實施例39中,實施例1的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中Z為R6 ,其中R6 為氫;X為CR1 ;Y為CR2 ,P為CH或CR4 ;Q為N;T為CH或CR5 ;U為CH或N;R1 及R2 獨立地為氫或甲氧基;R3 為-O-(CH2 )2 -R7 、-O-(CH2 )3 -R7 或-O-(CH2 )4 -R7 ;R7 為-NRa Rb ,其中Ra 及Rb 獨立地為甲基、乙基、正丙基或異丙基,或-NRa Rb 連同彼等所附接的氮一起形成4員雜環胺基或5員雜環胺基,其中各雜環胺基可選地經一個或兩個獨立地選自烷基、鹵基、鹵烷基、羥基、烷氧基及鹵烷氧基的取代基取代;R4 為甲基、乙基、正丙基、異丙基、環丙基、環丁基、環戊基、雜環基、NH2 、或NRc Rd ,其中該環丙基、該環丁基、及該環戊基可選地經一個、兩個、或三個獨立地選自烷基、鹵基、鹵烷基、鹵烷氧基、羥基、烷氧基、NH2 、烷基胺基、二烷基胺基、羧基、羧基烷基、及烷氧羰基的取代基取代;R5 為NH2 ;Rc 為氫、烷基、環烷基、或雜環基;且Rd 為烷基、環烷基或雜環基;或Rc 及Rd 連同彼等所附接的氮一起形成4至7員雜環胺基者。在實施例39中,當X為CR1 ;Y為CR2 ,P為CH或CR4 ;Q為N;T為CH或CR5 ;且U為CH或N時,式(I)之化合物具有下列結構(以下稱為「式(Ia)之化合物、或其醫藥上可接受之鹽」):(Ia)。 在實施例39中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R1 為甲氧基且R2 為氫。在實施例39中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R1 為氫且R2 為甲氧基。在實施例39中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R3 為-O-(CH2 )2 -R7 。在實施例39中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R3 為-O-(CH2 )3 -R7 。在實施例39中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R3 為-O-(CH2 )4 -R7 。在實施例39中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R7 為-NRa Rb ,其中Ra 及Rb 獨立地為甲基、乙基、正丙基或異丙基。在實施例39中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R7 為-NRa Rb ,其中Ra 及Rb 獨立地為甲基、乙基、正丙基或異丙基。在實施例39中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,Ra 及Rb 各自為甲基。在實施例39中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R7 為-NRa Rb ,其中-NRa Rb 連同彼等所附接的氮一起形成4員雜環胺基或5員雜環胺基,其中各雜環胺基可選地經一個或兩個獨立地選自烷基、鹵基、鹵烷基、羥基、烷氧基及鹵烷氧基的取代基取代。在實施例39中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,NRa Rb 連同彼等所附接的氮一起形成吡咯啶-1-基。在實施例39中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,NRa Rb 連同彼等所附接的氮一起形成吖呾-1-基。在實施例39中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,v為0且w為0。在實施例39中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,v為1且w為0。在實施例39中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,v為0且w為1。在實施例39中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,v為1且w為1。在實施例39中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,P為CH。在實施例39中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,P為CR4 ,其中R4 為甲基、乙基、正丙基、或異丙基。在實施例39中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,P為CR4 ,其中R4 為環丙基、環丁基、或環戊基,其中環丙基、環丁基、或環戊基可選地經一個、兩個、或三個獨立地選自烷基(如C1-4 烷基)、鹵基(如F)、鹵烷基(如CF3 )、鹵烷氧基(如OCF3 )、羥基、烷氧基(如C1-4 烷氧基)、NH2 、烷基胺基(如C1-4 烷基胺基)、二烷基胺基(例如二烷基胺基,其中各烷基獨立地為C1-4 烷基)、羧基、羧基烷基(如C2-5 羧基烷基)、及烷氧羰基(如C2-5 烷氧羰基)的取代基取代。在實施例39中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,P為CR4 ,其中R4 為4至6員雜環基(如氧雜環丁烷基、四氫呋喃基、或四氫哌喃基)。在實施例39中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,P為CR4 ,其中R4 為NH2 或NRc Rd ,其中Rc 為氫、烷基、環烷基、或雜環基;且Rd 為烷基、環烷基、或雜環基。在實施例39中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,P為CR4 ,其中R4 為NRc Rd ,其中Rc 及Rd 連同彼等所附接的氮一起形成4至6員雜環胺基(例如吖呾基、吡咯啶基、哌啶基、哌基、或嗎啉基)。在實施例39中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,T為CH。在實施例39中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,T為CR5 ,其中R5 為NH2 。在實施例39中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,U為CH。在實施例39中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,U為N。如實施例39中所定義之X、Y、R1 、R2 、R3 、R4 (包括Rc 及Rd )、R5 、R7 (包括Ra 及Rb )、T、及U的任何組合由本揭露涵蓋。 40. 在實施例40中,實施例1的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中式(I)之化合物具有式(Ib)的結構者、或其醫藥上可接受之鹽:(Ib) 其中R1 、R2 、R3 、R4 (包括Rc 及Rd )、R5 、R7 (包括Ra 及Rb )、T、及U如發明內容中所定義。在實施例40中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R1 為甲氧基且R2 為氫。在實施例40中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R1 為氫且R2 為甲氧基。在實施例40中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R3 為-O-(CH2 )2 -R7 。在實施例40中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R3 為-O-(CH2 )3 -R7 。在實施例40中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R3 為-O-(CH2 )4 -R7 。在實施例40中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R7 為-NRa Rb ,其中Ra 及Rb 獨立地為甲基、乙基、正丙基或異丙基。在實施例40中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,Ra 及Rb 各自為甲基。在實施例40中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R7 為-NRa Rb ,其中-NRa Rb 連同彼等所附接的氮一起形成4員雜環胺基或5員雜環胺基,其中各雜環胺基可選地經一個或兩個獨立地選自烷基、鹵基、鹵烷基、羥基、烷氧基及鹵烷氧基的取代基取代。在實施例40中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,NRa Rb 連同彼等所附接的氮一起形成吡咯啶-1-基。在實施例40中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,NRa Rb 連同彼等所附接的氮一起形成吖呾-1-基。在實施例37中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R4 為甲基、乙基、正丙基、或異丙基。在實施例40中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R4 為環丙基、環丁基、或環戊基,其中環丙基、環丁基、或環戊基可選地經一個、兩個、或三個獨立地選自烷基(如C1-4 烷基)、鹵基(如F)、鹵烷基(如CF3 )、鹵烷氧基(如OCF3 )、羥基、烷氧基(如C1-4 烷氧基)、NH2 、烷基胺基(如C1-4 烷基胺基)、二烷基胺基(例如二烷基胺基,其中各烷基獨立地為C1-4 烷基)、羧基、羧基烷基(如C2-5 羧基烷基)、及烷氧羰基(如C2-5 烷氧羰基)的取代基取代。在實施例40中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R4 為4至6員雜環基(如氧雜環丁烷基、四氫呋喃基、或四氫哌喃基)。在實施例40中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R4 為NH2 或NRc Rd ,其中Rc 為氫、烷基、環烷基或雜環基,且Rd 為烷基、環烷基或雜環基。在實施例40中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R4 為NRc Rd ,其中Rc 及Rd 連同彼等所附接的氮一起形成4至6員雜環胺基(例如吖呾基、吡咯啶基、哌啶基、哌基、或嗎啉基)。在實施例40中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,T為CH。在實施例40中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,T為CR5 ,其中R5 為NH2 。在實施例40中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,U為CH。在實施例40中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,U為N。如實施例40中所定義之R1 、R2 、R3 、R4 (包括Rc 及Rd )、R5 、R7 (包括Ra 及Rb )、T、及U的任何組合由本揭露涵蓋。 41. 在實施例41中,實施例1的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中式(I)之化合物具有式(Ic)的結構者、或其醫藥上可接受之鹽:(Ic) 其中Ra 、Rb 、及R4 (包括Rc 及Rd )如發明內容中所定義。在實施例41中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,Ra 及Rb 獨立地為甲基、乙基、正丙基或異丙基。在實施例41中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,Ra 及Rb 各自為甲基。在實施例41中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,-NRa Rb 連同彼等所附接的氮一起形成4員雜環胺基或5員雜環胺基,其中各雜環胺基可選地經一個或兩個獨立地選自烷基、鹵基、鹵烷基、羥基、烷氧基及鹵烷氧基的取代基取代。在實施例41中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,NRa Rb 連同彼等所附接的氮一起形成吡咯啶-1-基。在實施例41中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R4 為甲基、乙基、正丙基、或異丙基。在實施例41中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R4 為環丙基、環丁基、或環戊基,其中環丙基、環丁基、或環戊基可選地經一個、兩個、或三個獨立地選自烷基(如C1-4 烷基)、鹵基(如F)、鹵烷基(如CF3 )、鹵烷氧基(如OCF3 )、羥基、烷氧基(如C1-4 烷氧基)、NH2 、烷基胺基(如C1-4 烷基胺基)、二烷基胺基(例如二烷基胺基,其中各烷基獨立地為C1-4 烷基)、羧基、羧基烷基(如C2-5 羧基烷基)、及烷氧羰基(如C2-5 烷氧羰基)的取代基取代。在實施例41中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R4 為甲基、乙基、正丙基、異丙基、或環丙基。在實施例41中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,Ra 及Rb 各自為甲基;且R4 為甲基、乙基、正丙基、異丙基、或環丙基。在實施例41中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R4 為4至6員雜環基(如氧雜環丁烷基、四氫呋喃基、或四氫哌喃基)。在實施例41中,在另一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R4 為NH2 或NRc Rd ,其中Rc 為氫、烷基、環烷基或雜環基,且Rd 為烷基、環烷基或雜環基。在實施例41中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,R4 為NRc Rd ,其中Rc 及Rd 連同彼等所附接的氮一起形成4至6員雜環胺基(例如吖呾基、吡咯啶基、哌啶基、哌基、或嗎啉基)。如實施例41中所定義之R4 (包括Rc 及Rd )、Ra 、及Rb 的任何組合由本揭露涵蓋。 42. 在實施例42中,實施例1的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中該化合物、或其醫藥上可接受之鹽選自如表1或表2所示之下列化合物編號者:1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、 15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29 、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、 44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、55、56、57、58、59 、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88 、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102 、1a、2a、3a、4a、5a、6a、7a、8a、9a、10a、11a、12a、13a、14a 、15a、16a、17a、18a、19a、20a、21a、22a、23a、24a、25a、26a 、27a、28a、29a、30a、31a、32a、33a、34a、35a、36a、37a、38a 、39a、40a、41a、42a、43a、44a、45a、46a、47a、48a、49a、50a 、51a、52a、53a、54a、55a、56a、57a、58a、59a、60a、61a、62a 、63a、64a、65a、66a及67a、或如表1所示之鹽的母體化合物、或該母體化合物的醫藥上可接受之鹽。 43. 在實施例43中,實施例1的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中該化合物、或其醫藥上可接受之鹽選自如表1所示之下列化合物編號者:1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30 、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、55、56、57、58、59、60 、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75 、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101及102、或如表1所示之鹽的母體化合物、或該母體化合物的醫藥上可接受之鹽。 44. 在實施例44中,實施例1的化合物、或其醫藥上可接受之鹽是那些其中該化合物、或其醫藥上可接受之鹽選自下列化合物編號者:1a、2a、3a、4a、5a、6a、7a、8a、9a、10a、11a、12a、13a、14a、15a 、16a、17a、18a、19a、20a、21a、22a、23a、24a、25a、26a、27a 、28a、29a、30a、31a、32a、33a、34a、35a、36a、37a、38a、39a 、40a、41a、42a、43a、44a、45a、46a、47a、48a、49a、50a、51a 、52a、53a、54a、55a、56a、57a、58a、59a、60a、61a、62a、63a 、64a、65a、66a及67a。 45. 實施例45提供一種醫藥組成物,其包含如實施例1至44中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,及醫藥上可接受之賦形劑。 46. 實施例46提供一種抑制G9a的活性的方法,該方法包含使含有G9a的細胞與有效量的如實施例1至44中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽接觸,從而抑制該G9a的活性。在實施例46中,在一組方法中,該方法可在體外進行。在實施例46中,在另一組方法中,細胞可處於對象中,且該對象患有可藉由抑制G9a而治療的疾病。 47. 實施例47提供一種抑制GLP的活性的方法,該方法包含使含有GLP的細胞與有效量的如實施例1至44中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽接觸,從而抑制GLP的活性。在實施例47中,在一組方法中,該方法可在體外進行。在實施例47中,在另一組方法中,細胞可處於對象中,且該對象患有可藉由抑制GLP而治療的疾病。 48. 實施例48提供一種增加胎兒血紅素(HbF)蛋白水平的方法,該方法包括使表徵為具有β球蛋白生產受損的細胞與有效量的如實施例1至44中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽接觸,從而增加胎兒血紅素(HbF)蛋白水平。 49. 實施例49提供一種減少血紅素S分子的濃度的方法,該方法包含使表徵為具有血紅素S突變的細胞與有效量的如實施例1至44中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽接觸,從而減少血紅素S分子的濃度。實施例49還提供一種抑制血紅素S分子的聚合的方法,該方法包含使表徵為具有血紅素S突變的細胞與有效量的如實施例1至44中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽接觸,從而抑制血紅素S分子的聚合。所屬技術領域中具有通常知識者理解,血紅素S可在低氧條件下聚合以形成血紅素聚合物,導致紅血球(RBC)喪失其可變形性且採用鐮狀形狀。見例如Rees等人,Lancet 2010, 376, 2018−2031。如本文中所使用,「抑制血紅素S分子的聚合(inhibiting the polymerization of hemoglobin S molecules)」是指抑制該等血紅素聚合物的形成。 50. 實施例50提供一種抑制對象體內G9a活性的方法,該方法包含向患有可由胎兒血紅素治療的疾病之該對象投予有效量的如實施例1至44中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽。 51. 實施例51提供一種抑制對象體內GLP活性的方法,該方法包含向患有可由胎兒血紅素治療的疾病之該對象投予有效量的如實施例1至44中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽。 52. 實施例52提供一種用於治療疾病的方法,該方法包含向患有可由胎兒血紅素治療的疾病之對象投予有效量的如實施例1至44中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽。 53. 實施例53提供一種用於治療由β球蛋白生產受損表徵之疾病的方法,該方法包含向患有由β球蛋白生產受損表徵之該疾病之對象投予有效量的如實施例1至44中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽。在實施例53中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,該疾病為β-地中海貧血。 54. 實施例54提供一種用於治療由聚合的血紅素S分子濃度增加表徵之疾病的方法,該方法包含向患有由聚合的血紅素S分子濃度增加表徵之該疾病之對象投予有效量的如實施例1至44中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽。在實施例54中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,該疾病為鐮狀細胞疾病。 55. 實施例55提供一種改善或治療血紅素病的方法,其包含向有此需要之對象投予有效量的如實施例1至44中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽、或如實施例45之醫藥組成物。在實施例55中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,該血紅素病為鐮狀細胞疾病。在實施例55中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,該血紅素病為β-地中海貧血。 56. 實施例56提供一種有效量的如實施例1至44中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽在製備用於抑制含有G9a的細胞中的G9a活性的藥物的用途。 57. 實施例57提供一種有效量的如實施例1至44中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽在製備用於抑制含有GLP的細胞中的GLP活性的藥物的用途。 58. 實施例58提供一種有效量的如實施例1至44中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽在製備用於增加表徵為具有β球蛋白生產受損的細胞中的胎兒血紅素(HbF)蛋白水平的藥物的用途。 59. 實施例59提供一種有效量的如實施例1至44中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽在製備用於減少表徵為具有血紅素S突變的細胞中的血紅素S分子的濃度的藥物的用途。實施例59還提供一種有效量的如實施例1至44中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽在製備用於抑制表徵為具有血紅素S突變的細胞中的血紅素S分子的聚合的藥物的用途。 60. 實施例60提供一種有效量的如實施例1至44中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽在製備用於治療可由胎兒血紅素治療的疾病的藥物的用途。 61. 實施例61提供一種有效量的如實施例1至44中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽在製備用於治療可由胎兒血紅素治療的疾病的藥物的用途。 62. 實施例62提供一種有效量的如實施例1至44中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽在製備用於治療由β球蛋白生產受損表徵之疾病的藥物的用途。在實施例62中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,該疾病為β-地中海貧血。 63. 實施例63提供一種有效量的如實施例1至44中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽在製備用於治療由聚合的血紅素S分子濃度增加表徵之疾病的藥物的用途。在實施例63中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,該疾病為鐮狀細胞疾病。 64. 實施例64提供一種有效量的如實施例1至44中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽在製備用於改善或治療血紅素病的藥物的用途。在實施例64中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,該血紅素病為鐮狀細胞疾病。在實施例64中,在一組化合物、或其醫藥上可接受之鹽中,該血紅素病為β-地中海貧血。
代表性的式(I)之化合物或其鹽在下面的表1及表2中揭示。雖然表1及表2可顯示式(I)之化合物的特定鹽,但所屬技術領域中具有通常知識者將能夠識別該些表1及表2中之化合物的母體化合物(其中「母體化合物(parent compound)」為不存在鹽部分的化合物)及其他鹽,如醫藥上可接受之鹽。 1
額外的式(I)之化合物是那些在下表2中揭示者。 2
一般合成方案 本揭露的化合物可藉由下文所示的反應方案中所示的方法製備。
製備這些化合物所使用的起始材料及試劑為可購自商業供應商如Sigma-Aldrich Chemical Co., (Milwaukee, Wis.)、Bachem (Torrance, Calif.),或可藉由所屬技術領域中具有通常知識者已知之方法依照參考文獻如Fieser and Fieser’s Reagents for Organic Synthesis, Volumes 1-17 (John Wiley and Sons, 1991);Rodd’s Chemistry of Carbon Compounds, Volumes 1-5 and Supplementals (Elsevier Science Publishers, 1989);Organic Reactions, Volumes 1-40 (John Wiley and Sons, 1991);March’s Advanced Organic Chemistry, (John Wiley and Sons, 4th Edition)及Larock’s Comprehensive Organic Transformations (VCH Publishers Inc., 1989)所闡述之程序製備。這些方案僅僅是舉例說明可合成本揭露的化合物的一些方法,並且可對這些方案進行各種修改,並且所屬技術領域中具有通常知識者閱讀本揭露時可得到啟示。若有需要,(多種)反應的起始材料、中間物、及最終產物可以使用常規技術(包括但不限於過濾、蒸餾、結晶、層析、及類似者)進行單離及純化。此類材料可使用常規手段來表徵,包括物理常數及光譜資料。
除非相反地指明,否則本文所述之反應在大氣壓下、在約 -78℃至約150℃的溫度範圍內發生,諸如約0℃至約125℃,並且進一步諸如約室溫(或環境)溫度,例如約20℃。本文所顯示及描述的途徑僅為舉例說明,且不旨在也不應被解讀為以無論任何方式限制申請專利範圍的範圍。所屬技術領域中具有通常知識者將可辨識對揭示合成之改良並基於在本文中之揭露來設計替代途徑;所有該等改良及替代途徑係屬申請專利範圍之範圍內。
式(I)之化合物(其中Z為NR6 且X、Y、P、Q、T、U、R1 、R2 、R3 、R4 、R5 、v及w如發明內容中所定義)可以藉由如下方案1中描述的下列程序製備。方案 1
將其中X1 為鹵基(如氯基、溴基、或碘基,較佳為溴基)且R1 、R2 、及R3 如發明內容中所定義或為其前驅基團的式1之化合物用含硝酸的硫酸或乙酸處理,提供式2之化合物。式1之化合物為市售品或可藉由所屬技術領域中已知之方法製備。例如,其中R3 是–W-伸烷基-R7 ,其中W是NH、O、或S;伸烷基可選地經R8 取代(其中R8 是鹵基、鹵烷基、鹵烷氧基、羥基、或烷氧基)且伸烷基鏈中的一個CH2 可選地經NH或O置換,且R7 是-NRa Rb 其中Ra 及Rb 如發明內容中定義的式1之化合物可藉由將市售起始材料(如4-溴-2-甲氧基苯酚、4-溴-2-甲基酚、4-溴-2-乙基酚、4-溴-2-甲氧基苯胺、4-溴-2-甲氧基硫酚、3-溴-6-羥基-2-甲基吡啶、5-溴-2-氟甲氧苯、4-溴-1-碘-2-甲氧苯、1-苄氧基-4-溴-2-甲氧苯、5-(苄氧基)-2-溴-4-甲氧基苯酚、4-碘-2-甲氧基苯酚、或4-氯-2-甲苄胺)與式LG-(伸烷基)-NRa Rb 之胺(其中Ra 及Rb 如發明內容中定義或為合適的胺基保護基且LG是合適的脫離基如鹵基)在合適烷基化反應條件下反應製備,例如藉由將式1之化合物與上述胺在鹼(如碳酸鉀、碳酸銫、二乙胺、及類似物)存在下且在合適有機溶劑(如二甲基甲醯胺、四氫呋喃、及類似物)中反應。式LG-(伸烷基)-NRa Rb 之胺如1-(3-氯丙基)吡咯啶、1-(3-氯丙基)二甲胺、及2-(2-氯乙氧基)乙基]二甲胺為市售品。
將式2之化合物用式3之化合物(其中P、Q、T、U如發明內容中所定義且R4 及R5 如發明內容中所定義或為其前驅基團,D為H或鹵基,且Y’為硼酸或硼酸酯)在鈴木(Suzuki)偶合反應條件下處理,提供式4之化合物。式3之化合物為市售品或可藉由所屬技術領域中已知之方法自對應的式3之鹵化物(其中Y’為鹵基)製備。其中Y’為硼酸或硼酸酯或Y’為鹵基的式3之化合物,如吡啶-3-硼酸、吡啶-3-硼酸酯、2-氟吡啶-3-硼酸、2-甲氧基吡啶-3-硼酸、2-氯吡啶-3-硼酸、2-氟吡啶-3-硼酸、酯、2-溴吡啶-3-硼酸、2-甲基吡啶-3-硼酸、2-(三級丁氧基羰基胺基)吡啶-3-硼酸、2-氰吡啶-3-硼酸酯、2-乙基-3-吡啶基硼酸、2-嗎啉基吡啶-3-硼酸、2-(4-三級丁氧基羰基哌基)吡啶-3-硼酸酯、2-苯基-3-(四甲基-1,3,2-二氧雜硼雜環戊-2-基)吡啶、2-(二甲基胺基)吡啶-3-基硼酸、N,N-二甲基-2-((3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧雜硼雜環戊-2-基)吡啶-2-基)氧基)乙胺、2-(4-甲基-1H-吡唑-1-基)-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧雜硼雜環戊-2-基)吡啶、4-氟吡啶-3-硼酸、4-氟-3-(四甲基-1,3,2-二氧雜硼雜環戊-2-基)吡啶-2-甲醛、2-氯-6-甲基吡啶-3-硼酸、(2-氯-6-胺基吡啶-3-基)硼酸、5-氯-2-氟吡啶-3-硼酸、3-溴-2-甲基吡啶、3-溴吡啶、3-溴-2-羥基甲基吡啶、3-溴-2-環丙基吡啶、2-(3-溴-吡啶-2-基)-丙烷-2-醇、3-溴-2-丙基吡啶、及3-溴-2-(三級丁基)吡啶為市售品。
所屬技術領域中具有通常知識者也可輕易認知到,其中X’為鹵基的式2之化合物可轉換成對應的硼酸或硼酸酯並與其中Y’為鹵基的式3之化合物反應,提供式4之化合物。其中D為氫的式4之化合物可在Cadogan反應條件下轉換成式(I)之化合物。見例如,Majgier-Baranowska等人,Tetrahedron Letters 53 (2012) 4785–4788;及Karimi等人,Tetrahedron Letters 58 (2017) 2223–2227(特別是方案3b)。替代地,式4之化合物中的硝基可先還原成胺基以提供具有胺基的式5之化合物,然後可在芳基環化反應條件下被轉換成式(I)之化合物。
式(I)之化合物可轉換成其他式(I)之化合物。例如,其中R6 為烷基或環烷基的式(I)之化合物可藉由將對應的其中R6 為氫的式(I)之化合物分別與烷基或環烷基鹵化物在烷化反應條件下反應製備。烷基鹵化物及環烷基鹵化物如碘甲烷、碘乙烷、2-碘-丙烷、1-溴丁烷、及環丙基溴化物為市售品。
式(I)之化合物(其中R4 及/或R5 為鹵基)可在鹼存在下經NRc Rd 、烷氧基烷基胺基、雜環胺基、螺雜環胺基、5員含NH雜芳基、苯基、雜芳基硼酸、雜芳基硼酸酯或醇例如甲胺、乙胺、正丙胺、異丙胺、二甲胺、二乙胺、三級丁胺、吖呾、吡咯啶、3-胺基-吖呾、3-羥基吡咯啶、咪唑、吡唑、嗎啉、N-甲基-嗎啉、4-羥基-哌啶、哌啶、2-乙氧基乙胺、4-氮雜螺[2.4]庚烷、2-氧雜-5-氮雜螺[3.4]辛烷、2-異丙基吡咯啶、及7-氧雜-1-氮雜螺[4.4]壬烷取代,以提供式(I)之化合物,其中R4 及/或R5 為烷氧基、NH2 、NRc Rd 、烷氧基烷基氧基、苯基、雜芳基、雜芳基氧基、雜環基氧基、雜環胺基、5至8員橋接雜環胺基、或螺雜環胺基,其中該苯基、該雜芳基、及該雜環基單獨或為另一基團的一部分都可選地經一個、兩個、或三個獨立地選自烷基、鹵基、鹵烷基、鹵烷氧基、羥基、羥烷基、烷氧基、NH2 、烷基胺基、二烷基胺基、羧基、羧基烷基、及烷氧羰基的取代基取代,其中該烷基、該烯基及該炔基可選地經羥基及環烷基取代。
替代地,式(I)之化合物(其中Z為NR6 且X、Y、P、Q、T、U、R1 、R2 、R3 、R4 、R5 、v及w如發明內容中所定義)可以藉由如下方案2中描述的下列程序製備。方案 2
替代地,如以上方案1中所定義的式1之化合物可與包括硝基的式6之化合物(其中P、Q、T及U如發明內容中所定義且R4 及R5 如發明內容中所定義或為其前驅基團,且Y’為硼酸或硼酸酯)在鈴木偶合反應條件下反應,提供式7之化合物。然後將化合物7還原成式(I)之化合物,如以上方案1中所述。
測試 本揭露之化合物的G9a抑制活性可使用以下生物實例1中所述的體外測定測試。本揭露之化合物刺激胎兒血紅素的能力可使用以下生物實例2中所述的體外測定測試。
投予及醫藥組成物 一般來說,本揭露之化合物將以治療有效量、藉由用於類似應用的藥劑的任何接受的投予模式進行投予。本揭露之化合物的治療有效量的範圍可以是每天從約0.01至約500 mg/kg對象體重,其可以按單一或多個劑量來投予。合適的劑量水平可以是每天從約0.1至約250 mg/kg或每天約0.5至約100 mg/kg。合適的劑量水平可以是每天約0.01至約250 mg/kg、每天約0.05至約100 mg/kg、或每天約0.1至約50 mg/kg。在此範圍內,劑量可以是每天約0.05至約0.5、約0.5至約5或約5至約50 mg/kg。對於口服投予,組成物可以按含有約1.0至約1000毫克活性成分、特別是約1、5、10、15、20、25、50、75、100、150、200、250、300、400、500、600、750、800、900、或1000毫克活性成分的錠劑形式提供。本揭露之化合物(即活性成分)的實際量,將取決於多種因素,例如待治療的疾病的嚴重性、對象的年齡及相對健康狀況、所利用的化合物的效力、投予的途徑及形式、及其他因素。
一般來說,本揭露之化合物將作為醫藥組成物藉由以下路徑中的任一者來投予:口服、全身(例如經皮、鼻內或藉由栓劑)、或腸胃外(例如肌肉內、靜脈內或皮下)投予。較佳的投予方式是使用便利的日劑量方案口服,該方案可以根據病情程度來調整。組成物可採取錠劑、丸劑、膠囊、半固體、粉末、持續釋放配方、溶液、懸浮液、酏劑、氣溶膠、或任何其他適當組成物的形式。
配方的選擇取決於多種因素例如藥物投予模式(例如對於口服投予,較佳的配方為錠劑、丸劑、或膠囊形式,包括腸溶包衣的或延遲釋放的錠劑、丸劑、或膠囊)以及藥物物質的生體可用率。近來,已經特別針對顯示不良生體可用率的藥物開發醫藥配方,基本原則為增加表面積(即降低粒度)可增加生體可用率。例如,美國專利第4,107,288號描述具有粒子大小範圍從10到1,000 nm的醫藥配方,其中活性材料係由大分子的交聯基質支撐。美國專利第5,145,684號描述醫藥配方的生產,其中藥物物質在表面改性劑存在下被粉碎成奈米粒子(平均粒度為400 nm),然後分散在液體介質中以給出展現明顯高生體可用率的醫藥配方。
組成物一般來說包含本揭露之化合物與至少一種醫藥上可接受之賦形劑的組合。可接受的賦形劑為無毒的、有助投予,並且不會不利地影響本揭露之化合物的治療益處。此類賦形劑可以是任何固體、液體、半固體,或在氣溶膠組成物的情況下係所屬技術領域中具有通常知識者通常可用的氣體賦形劑。
固體醫藥賦形劑包括澱粉、纖維素、滑石、葡萄糖、乳糖、蔗糖、明膠、麥芽、水稻、麵粉、白堊、矽膠、硬脂酸鎂、硬脂酸鈉、單硬脂酸甘油酯、氯化鈉、乾燥脫脂牛奶及類似物。液體和半固體賦形劑可選自甘油、丙二醇、水、乙醇以及各種油,包括該些石油、動物、植物或合成來源者,例如花生油、大豆油、礦物油、芝麻油等。較佳的液體載體特別是用於注射用溶液者包括水、鹽水、右旋糖水溶液及乙二醇。
壓縮氣體可用於將本揭露之化合物分散為氣溶膠形式。適用於此目的的惰性氣體為氮氣、二氧化碳等。
其他合適的醫藥賦形劑及彼等之配方係描述於Remington’s Pharmaceutical Sciences, edited by E. W. Martin (Mack Publishing Company, 20th ed., 2000)。
配方中的化合物的水平可以在所屬技術領域中具有通常知識者採用的全範圍內改變。一般而言,配方將基於總配方含有按重量百分比(wt. %)計的從約0.01至99.99 wt. %的本揭露之化合物,餘量為一或多種合適的醫藥賦形劑。例如,化合物以約1至80 wt. %的水平存在。
在治療本揭露之化合物或其他藥物可具有效用的疾病或病況中,本揭露之化合物可與一或多種其他藥物組合使用。這樣的(多種)其他藥物可藉由其通常使用的途徑及量與本揭露之化合物同時或順序投予。當本揭露之化合物與一或多種其他藥物同時使用時,含有此類其他藥物及本揭露之化合物的單位劑型醫藥組成物係較佳的。然而,組合療法還可以包括其中本揭露之化合物及一或多種其他藥物按照不同的重疊時間表來投予的療法。還考慮了當與一或多種其他活性成分組合使用時,本揭露之化合物及其他活性成分可以按比單獨使用各者時更低的劑量來使用。
因此,本揭露的醫藥組成物還包括該些除了本揭露之化合物以外含有一或多種其他藥物者。
上述組合不僅包括本揭露之化合物與一種其他藥物的組合,還包括本揭露之化合物與二或更多種其他活性藥物的組合。同樣地,本揭露之化合物可與其他用於預防、治療、控制、改善、或減少本揭露之化合物有用的疾病或病況的風險的藥物組合使用。這樣的其他藥物可藉由其通常使用的途徑及量與本揭露之化合物同時或順序投予。當本揭露之化合物與一或多種其他藥物同時使用時,可使用除了本揭露之化合物以外含有此類其他藥物的醫藥組成物。因此,本揭露的醫藥組成物還包括該些除了本揭露之化合物以外還含有一或多種其他活性成分者。本揭露之化合物與第二活性成分的重量比可以變化,並且將取決於每種成分的有效劑量。通常,將使用各者的有效劑量。
當有需要的對象患有或處於患有癌症風險時,可以對該對象用本揭露之化合物與一或多種其他抗癌劑及/或抗癌療法的任何組合來治療。在一些實施例中,抗癌療法可為手術及/或輻射療法。在一些實施例中,一或多種抗癌劑為促細胞凋亡劑。抗癌劑的實例包括但不限於下列任一者:棉酚、根納三思(genasense)、多酚E、氯富辛(Chlorofusin)、所有的反式視黃酸(ATRA)、苔蘚蟲素、腫瘤壞死因子相關的細胞凋亡誘導配體(TRAIL)、5-氮雜-2’-去氧胞苷、所有的反式視黃酸、多柔比星(doxorubicin)、長春新鹼(vincristine)、依託泊苷(etoposide)、吉西他濱(gemcitabine)、伊馬替尼(imatinib) (Gleevec )、格爾德黴素(geldanamycin)、17-N-烯丙基胺基-17-去甲氧基格爾德黴素(17-AAG)、夫拉平度(flavopiridol)、LY294002、硼替佐米(bortezomib)、曲妥單抗(trastuzumab)、BAY 11-7082、PKC412、或PD184352、Taxol (又名「太平洋紫杉醇(paclitaxel)」,係熟知的抗癌藥,其藉由增強並穩定化微管形成來作用)、以及多西他賽(docetaxel)的類似物(Taxol )如Taxotere 。具有基本紫杉烷骨架作為共同結構特徵的化合物也顯示出因穩定的微管而具有阻礙G2-M期細胞的能力,並且可與本文描述的化合物組合用於治療癌症。
用於與本揭露之化合物組合使用的抗癌劑的進一步實例包括致裂物質活化蛋白質激酶傳訊的抑制劑,例如U0126、PD98059、PD184352、PD0325901、ARRY-142886、SB239063、SP600125、BAY 43-9006、渥曼青黴素(wortmannin)、或LY294002;Syk抑制劑;抗體(例如美羅華(rituxan));MET抑制劑,例如佛裡替尼(foretinib)、卡博替尼(carbozantinib)、或克唑替尼(crizotinib);VEGFR抑制劑,例如舒尼替尼(sunitinib)、索拉非尼(sorafenib)、瑞格非尼(regorafinib)、樂伐替尼(lenvatinib)、凡德他尼(vandetanib)、卡博替尼(carbozantinib)、或阿西替尼(axitinib);EGFR抑制劑,例如阿法替尼(afatinib)、布立尼布(brivanib)、carbozatinib、埃羅替尼(erlotinib)、吉非替尼(gefitinib)、來那替尼(neratinib)、或拉帕替尼(lapatinib);PI3K抑制劑,例如XL147、XL765、BKM120(布帕昔布(buparlisib))、GDC-0941、BYL719、IPI145、BAY80-6946。BEX235(達托里斯(dactolisib))、CAL101(依德里斯(idelalisib))、GSK2636771、或TG100-115;MTOR抑制劑,例如雷帕黴素(rapamycin)(西羅莫司(sirolimus))、西羅莫司脂化物(temsirolimus)、依維莫司(everolimus)、XL388、XL765、AZD2013、PF04691502、PKI-587、BEZ235、或GDC0349;MEK抑制劑,例如AZD6244、曲美替尼(trametinib)、PD184352、皮馬替尼(pimasertinib)、GDC-0973、或AZD8330;以及蛋白酶體抑制劑,例如卡非佐米(carfilzomib)、MLN9708、德蘭佐米(delanzomib)、或硼替佐米(bortezomib)。
其他可以與本揭露之化合物組合使用的抗癌劑包括阿黴素(Adriamycin);放線菌素D (Dactinomycin);博來黴素(Bleomycin);長春鹼(Vinblastine);順鉑(Cisplatin);阿西維辛(acivicin);阿柔比星(aclarubicin);阿考達唑鹽酸鹽(acodazole hydrochloride);阿克羅寧(acronine);阿多來新(adozelesin);阿地白介素(aldesleukin);六甲蜜胺(altretamine);安波黴素(ambomycin);阿美蒽醌乙酸酯(ametantrone acetate);胺魯米特(aminoglutethimide);安吖啶(amsacrine);阿那曲唑(anastrozole);安麯黴素(anthramycin);天冬醯胺酶(asparaginase);曲林菌素(asperlin);阿紮胞苷(azacitidine);阿紮替派(azetepa);阿佐黴素(azotomycin);巴馬司他(batimastat);苯佐替派(benzodepa);比卡魯胺(bicalutamide);比生群鹽酸鹽(bisantrene hydrochloride);二甲磺酸雙奈法德(bisnafide dimesylate);比折來新(bizelesin);博來黴素硫酸鹽(bleomycin sulfate);布喹那鈉(brequinar sodium);溴匹立明(bropirimine);白消安(busulfan);放線菌素C (cactinomycin);卡普睪酮(calusterone);卡醋胺(caracemide);卡貝替姆(carbetimer);卡鉑(carboplatin);卡莫司汀(carmustine);卡柔比星鹽酸鹽(carubicin hydrochloride);卡折來新(carzelesin);西地芬戈(cedefingol);苯丁酸氮芥(chlorambucil);西羅黴素(cirolemycin);克拉屈濱(cladribine);甲橫酸克立那托(crisnatol mesylate);環磷醯胺(cyclophosphamide);阿糖胞苷(cytarabine);達卡巴嗪(dacarbazine);道諾黴素鹽酸鹽(daunorubicin hydrochloride);地西他濱(decitabine);右奧馬鉑(dexormaplatin);地紮胍寧(dezaguanine);地紮胍寧甲磺酸酯(dezaguanine mesylate);地吖醌(diaziquone);多柔比星(doxorubicin);多柔比星鹽酸鹽(doxorubicin hydrochloride);屈洛昔芬(droloxifene);梓樣酸屈洛昔芬梓(droloxifene citrate);丙酸屈他雄酮(dromostanolone propionate);達佐黴素(duazomycin);依達曲沙(edatrexate);鹽酸依氟鳥胺酸(eflornithine hydrochloride);依沙蘆星(elsamitrucin);恩洛鉑(enloplatin);恩普胺酯(enpromate);依匹哌啶(epipropidine);表柔比星鹽酸鹽(epirubicin hydrochloride);厄布洛唑(erbulozole);鹽酸伊索比星(esorubicin hydrochloride);雌莫司汀(estramustine);雌莫司汀磷酸鈉(estramustine phosphate sodium);依他硝唑(etanidazole);依託泊苷(etoposide);磷酸依託泊苷(etoposide phosphate);氯苯乙嘧胺(etoprine);法倔唑鹽酸鹽(fadrozole hydrochloride);法紮拉濱(fazarabine);芬維A胺(fenretinide);氟尿苷(floxuridine);氟達拉濱磷酸鹽(fludarabine phosphate);氟尿嘧啶(fluorouracil);氟西他濱(flurocitabine);磷喹酮(fosquidone);福司曲星鈉(fostriecin sodium);吉西他濱(gemcitabine);吉西他濱鹽酸鹽(gemcitabine hydrochloride);羥基脲;伊達比星鹽酸鹽(idarubicin hydrochloride);依弗醯胺(ifosfamide);伊莫福新(ilmofosine);介白素II(包括重組介白素II、或Ril2)、干擾素α-2a;干擾素α-2b;干擾素α-n1;干擾素α-n3;干擾素β-1a;干擾素γ-1 b;異丙鉑(iproplatin);伊立替康鹽酸鹽(irinotecan hydrochloride);蘭瑞肽乙酸酯(lanreotide acetate);來曲唑(letrozole);亮丙瑞林乙酸酯(leuprolide acetate);利阿唑鹽酸鹽(liarozole hydrochloride);洛美曲索鈉(lometrexol sodium);洛莫司汀(lomustine);洛索蒽醌鹽酸鹽(losoxantrone hydrochloride);馬索羅酚(masoprocol);美坦辛(maytansine);甲基二(氯乙基)胺鹽酸鹽(mechlorethamine hydrochloride);甲地孕酮乙酸酯(megestrol acetate);美侖孕酮乙酸酯(melengestrol acetate);美法侖(melphalan);美諾立爾(menogaril);巰嘌呤(mercaptopurine);甲胺蝶呤(methotrexate);甲胺蝶呤鈉;氯苯胺啶(metoprine);美妥替呱(meturedepa);米丁度胺(mitindomide);米托剋星(mitocarcin);絲裂紅素(mitocromin);米托潔林(mitogillin);米托馬星(mitomalcin);絲裂黴素(mitomycin);米托司培(mitosper);米托坦(mitotane);米托蒽醌鹽酸鹽(mitoxantrone hydrochloride);麥考酚酸(mycophenolic acid);諾考達唑(nocodazole);諾拉黴素(nogalamycin);奧馬鉑(ormaplatin);奧昔舒侖(oxisuran);培門冬酶(pegaspargase);培利黴素(peliomycin);戊氮芥(pentamustine);硫酸培洛黴素(peplomycin sulfate);培磷醯胺(perfosfamide);哌泊溴烷(pipobroman);哌泊舒凡(piposulfan);吡羅蒽醌鹽酸鹽(piroxantrone hydrochloride);普卡黴素(plicamycin);普洛美坦(plomestane);卟吩姆鈉(porfimer sodium);泊非黴素(porfiromycin);潑尼莫司汀(prednimustine);丙卡巴肼鹽酸鹽(procarbazine hydrochloride);嘌呤黴素(puromycin);鹽酸嘌呤黴素(puromycin hydrochloride);吡唑呋林(pyrazofurin);利波腺苷(riboprine);羅穀亞胺(rogletimide);沙芬戈(safingol);鹽酸沙芬戈(safingol hydrochloride);司莫司汀(semustine);辛曲秦(simtrazene);司泊索非鈉(sparfosate sodium);司帕黴素(sparsomycin);鹽酸鍺螺胺(spirogermanium hydrochloride);螺莫司汀(spiromustine);螺鉑(spiroplatin);鏈黑黴素(streptonigrin);鏈佐星(streptozocin);磺氯苯脲(sulofenur);太利蘇黴素(talisomycin);替可加蘭鈉(tecogalan sodium);替加氟(tegafur);鹽酸替洛蒽醌(teloxantrone hydrochloride);替莫泊芬(temoporfin);替尼泊苷(teniposide);替羅昔隆(teroxirone);睪內酯(testolactone);硫咪嘌呤(thiamiprine);硫鳥嘌呤(thioguanine);塞替派(thiotepa);噻唑呋林(tiazofurin);替拉紮明(tirapazamine);枸櫞酸托瑞米芬(toremifene citrate);曲托龍乙酸酯(trestolone acetate);磷酸曲西立濱(triciribine phosphate);三甲曲沙(trimetrexate);葡萄糖醛酸三甲曲沙(trimetrexate glucuronate);曲普瑞林(triptorelin);鹽酸妥布氯唑(tubulozole hydrochloride);尿嘧啶氮芥(uracil mustard);烏瑞替派(uredepa);伐普肽(vapreotide);維替泊芬(verteporfin);長春鹼硫酸鹽(vinblastine sulfate);長春新鹼硫酸鹽(vincristine sulfate);長春地辛(vindesine);長春地辛硫酸鹽(vindesine sulfate);長春匹定硫酸鹽(vinepidine sulfate);長春甘酯硫酸鹽(vinglycinate sulfate);長春羅新硫酸鹽(vinleurosine sulfate);長春瑞濱酒石酸鹽(vinorelbine tartrate);長春羅定硫酸鹽(vinrosidine sulfate);長春利定硫酸鹽(vinzolidine sulfate);伏氯唑(vorozole);折尼鉑(zeniplatin);淨司他丁(zinostatin);及佐柔比星鹽酸鹽(zorubicin hydrochloride)。
其他可與本揭露之化合物組合使用的抗癌劑如1,25二羥基維生素D3的20-epi-類似物;5-乙炔基尿嘧啶;阿比特龍(abiraterone);阿柔比星(aclarubicin);醯基夫文(acylfulvene);腺環戊醇(adecypenol);阿多來新(adozelesin);阿地介白素(aldesleukin);ALL-TK拮抗劑;六甲蜜胺(altretamine);胺莫司汀(ambamustine);阿米多克斯(amidox);胺磷汀(amifostine);胺基乙醯丙酸(aminolevulinic acid);胺柔比星(amrubicin);安吖啶(amsacrine);阿那格雷(anagrelide);阿那曲唑(anastrozole);穿心蓮內酯(andrographolide);血管生成抑制劑;拮抗劑D;拮抗劑G;安雷利克斯(antarelix);抗背部形態發生蛋白-1 (anti-dorsalizing morphogenetic protein-1);前列腺癌抗雄激素;抗雌激素;抗腫瘤物質(antineoplaston);反義寡核苷酸;阿非迪黴素甘胺酸(aphidicolin glycinate);細胞凋亡基因調節劑;細胞凋亡調節劑;類嘌呤酸;ara-CDP-DL-PTBA;精胺酸脫胺酶;阿蘇拉尼(asulacrine);阿他美坦(atamestane);阿莫司汀(atrimustine);海洋環肽1 (axinastatin 1);海洋環肽2 (axinastatin 2);海洋環肽3 (axinastatin 3);阿紮司瓊(azasetron);阿紮毒素(azatoxin);重氮酪胺酸(azatyrosine);巴卡丁(baccatin) III衍生物;巴拉醇(balanol);巴馬司他(batimastat);BCR/ABL拮抗劑;苯並二氫卟酚(benzochlorins);苯甲醯星狀孢菌素(benzoylstaurosporine);β內醯胺衍生物;β-阿勒欣(beta-alethine);亞阿克拉黴素B (betaclamycin B);樺木酸(betulinic acid);Bfgf抑制劑;比卡魯胺(bicalutamide);比生群(bisantrene);雙吖丙啶基精胺(bisaziridinylspermine);雙奈法德(bisnafide);比斯他西A (bistratene A);比折來新(bizelesin);布瑞福特(breflate);溴匹立明(bropirimine);布度鈦(budotitane);丁胱亞磺醯亞胺(buthionine sulfoximine);卡泊三醇(calcipotriol);卡弗他丁C (calphostin C);喜樹鹼衍生物;金絲雀痘病毒IL-2 (canarypox IL-2);卡培他濱(capecitabine);甲醯胺-胺基-三唑;羧基醯胺基三唑;CaRest M3;CARN 700;軟骨衍生的抑制劑;卡折來新(carzelesin);酪蛋白激酶抑制劑(ICOS);粟樹精胺(castanospermine);天蠶素B (cecropin B);西曲瑞克(cetrorelix);氯喹喔啉磺醯胺(chloroquinoxaline sulfonamide);西卡前列素(cicaprost);順卟啉(cis-porphyrin);克拉屈濱(cladribine);氯米芬類似物(clomifene analogues);克黴唑(clotrimazole);柯林斯黴菌素A (collismycin A);柯林斯黴菌素B;康普瑞汀A4 (combretastatin A4);考布他汀類似物(combretastatin analogue);科納基尼(conagenin);克拉貝司丁816 (crambescidin 816);克立那托(crisnatol);念珠藻環肽8 (cryptophycin 8);念珠藻環肽A衍生物;庫拉素A (curacin A);環戊蒽醌;環普拉坦(cycloplatam);撥霄素(cypemycin);阿糖胞苷十八烷基磷酸鹽(cytarabine ocfosfate);溶細胞因子;磷酸己烷雌酚(cytostatin);達昔單抗(dacliximab);地西他濱(decitabine);去氫膜海鞘素B (dehydrodidemnin B);德舍瑞林(deslorelin);地塞米松(dexamethasone);右異環磷醯胺(dexifosfamide);右雷佐生(dexrazoxane);右維拉帕米(dexverapamil);地吖醌(diaziquone);膜海鞘素B (didemnin B);地多克斯(didox);二乙基去甲精胺(diethylnorspermine);二氫-5-氮雜胞嘧啶核苷;9-多喜黴素(9-dioxamycin);二苯基螺莫司汀(diphenyl spiromustine);多西他賽;二十二烷醇;多拉司瓊(dolasetron);去氧氟尿苷(doxifluridine);屈洛昔芬(droloxifene);屈大麻酚(dronabinol);多卡米星SA (duocarmycin SA);依布硒(ebselen);依考莫司汀(ecomustine);依地福新(edelfosine);依決洛單抗(edrecolomab);依氟鳥胺酸(eflomithine);欖香烯(elemene);乙嘧替氟(emitefur);表柔比星(epirubicin);愛普列特(epristeride);雌莫司汀(estramustine)類似物;雌激素激動劑;雌激素拮抗劑;依他硝唑(etanidazole);磷酸依託泊苷(etoposide phosphate);依西美坦(exemestane);法屈唑(fadrozole);法紮拉濱(fazarabine);芬維A胺(fenretinide);非格司亭(filgrastim);非那雄胺(fmasteride);夫拉平度(flavopiridol);氟卓斯汀(flezelastine);16α-氟-5-雄甾烯-17-酮(fluasterone);氟達拉濱(fludarabine);鹽酸氟多若辛(fluorodaunorunicin hydrochloride);福酚美克(forfenimex);福美司坦(formestane);福司曲星(fostriecin);福莫司汀(fotemustine);釓德克薩卟啉(gadolinium texaphyrin);硝酸鎵;加洛他濱(galocitabine);加尼瑞克(ganirelix);明膠酶抑制劑;吉西他濱(gemcitabine);麩胱甘肽抑制劑;海普沙凡(hepsulfam);海瑞古林(heregulin);六亞甲基雙乙醯胺;金絲桃素(hypericin);伊班膦酸(ibandronic acid);伊達比星(idarubicin);艾多昔芬(idoxifene);伊屈孟酮(idramantone);伊莫福新(ilmofosine);伊洛馬司他(ilomastat);咪唑吖啶酮(imidazoacridones);咪喹莫特(imiquimod);免疫刺激肽;胰島素樣生長因子-1受體抑制劑;干擾素激動劑;干擾素;介白素;碘苄胍(iobenguane);碘阿黴素(iododoxorubicin);4-番薯酮醇(ipomeanol, 4-);伊羅普拉(iroplact);伊索拉定(irsogladine);異苯嘎唑(isobengazole);異高軟海綿素B (isohomohalicondrin B);伊他司瓊(itasetron);加斯諾利(jasplakinolide);卡哈立得F (kahalalide F);三乙酸片螺素-N (lamellarin-N triacetate);蘭瑞肽(lanreotide);雷納黴素(leinamycin);來格司亭(lenograstim);硫酸香菇多糖(lentinan sulfate);來普他汀(leptolstatin);來曲唑(letrozole);白血病抑制因子;白血球α干擾素;亮丙瑞林(leuprolide)+雌激素+黃體酮(progesterone);亮丙瑞林(leuprorelin);左旋咪唑(levamisole);利阿唑(liarozole);線性聚胺類似物;親脂性二糖肽;親脂性鉑化合物;利索裏胺7 (lissoclinamide 7);洛鉑(lobaplatin);蚯蚓磷脂(lombricine);洛美曲索(lometrexol);氯尼達明(lonidamine);洛索蒽醌(losoxantrone);洛伐他汀(lovastatin);洛索立賓(loxoribine);勒托替康(lurtotecan);鑥德克薩卟啉(lutetium texaphyrin);利索茶鹼(lysofylline);溶菌肽;美坦辛(maitansine);曼諾他丁A (mannostatin A);馬立馬司他(marimastat);馬索羅酚(masoprocol);乳腺絲胺酸蛋白酶抑制劑(maspin);基質裂解蛋白(matrilysin)抑制劑;基質金屬蛋白酶抑制劑;美諾立爾(menogaril);美巴龍(merbarone);美替瑞林(meterelin);甲硫胺酸酶(methioninase);甲氧氯普胺(metoclopramide);MIF抑制劑;米非司酮(mifepristone);米替福新(miltefosine);米立司亭(mirimostim);錯配雙股RNA;米托胍腙(mitoguazone);二溴衛矛醇(mitolactol);絲裂黴素類似物;米托萘胺(mitonafide);刺尾魚毒素(mitotoxin)纖維母細胞生長因子-皂草素(saporin);米托蒽醌(mitoxantrone);莫法羅汀(mofarotene);莫拉司亭(molgramostim);人類絨膜促性腺激素單株抗體;單磷醯基脂質diethylstilbe細胞壁sk;莫哌達醇(mopidamol);多藥耐藥基因抑制劑;基於多發性腫瘤抑制因子1之療法;芥子抗癌劑;印度洋海綿B (mycaperoxide B);分枝桿菌細胞壁提取物;美拉普龍(myriaporone);N-乙醯基地那林(N-acetyldinaline);N-取代之苯甲醯胺;那法瑞林(nafarelin);那瑞替普(nagrestip);納洛酮(naloxone)+潘他唑新(pentazocine);納帕維(napavin);萘萜二醇(naphterpin);那托司亭(nartograstim);奈達鉑(nedaplatin);奈莫柔比星(nemorubicin);奈立膦酸(neridronic acid);中性內肽酶;尼魯米特(nilutamide);尼賽黴素(nisamycin);氧化氮調節劑;氮氧化物抗氧化劑;尼圖侖(nitrullyn);O6-苄基鳥嘌呤;奧曲肽(octreotide);奧克西農(okicenone);寡核苷酸;奧那司酮(onapristone);昂丹司瓊(ondansetron);昂丹司瓊(ondansetron);奧拉辛(oracin);口服細胞因子誘導物;奧馬鉑(ormaplatin);奧沙特隆(osaterone);奧沙利鉑(oxaliplatin);奧沙黴素(oxaunomycin);帕洛胺(palauamine);棕櫚醯基根瘤菌素(palmitoylrhizoxin);帕米膦酸(pamidronic acid);人參炔三醇(panaxytriol);帕諾米芬(panomifene);副球菌素(parabactin);帕折普汀(pazelliptine);培門冬酶(pegaspargase);培得星(peldesine);木聚硫鈉(pentosan polysulfate sodium);噴司他汀(pentostatin);噴曲唑(pentrozole);全氟溴烷(perflubron);培磷醯胺(perfosfamide);紫蘇醇(perillyl alcohol);苯連氮黴素(phenazinomycin);乙酸苯酯;磷酸酶抑制劑;必醫你舒(picibanil);鹽酸匹魯卡品(pilocarpine hydrochloride);吡柔比星(pirarubicin);吡曲克辛(piritrexim);胎盤素A (placetin A);胎盤素B (placetin B);胞漿素原活化劑抑制劑;鉑錯合物;鉑化合物;鉑-三胺錯合物;卟吩姆鈉(porfimer sodium);波弗黴素(porfiromycin);潑尼松(prednisone);丙基雙吖啶酮;前列腺素J2;蛋白酶體抑制劑;基於蛋白質A之免疫調節劑;微藻蛋白質激酶C抑制劑(protein kinase C inhibitors, microalgal);蛋白質酪胺酸磷酸酶抑制劑;嘌呤核苷磷酸化酶抑制劑;紅紫素(purpurin);吡唑啉吖啶(pyrazoloacridine);吡哆醛化血紅素聚氧化乙烯接合物;raf拮抗劑;雷替曲塞(raltitrexed);雷莫司瓊(ramosetron);ras法尼基蛋白質轉移酶抑制劑;ras抑制劑;ras-GAP抑制劑;去甲基化瑞替普汀(retelliptine demethylated);錸Re 186依替膦酸鹽(rhenium Re 186 etidronate);根瘤菌素(rhizoxin);核糖酶;R11 維甲醯胺(retinamide);羅穀亞胺(rogletimide);羅希吐鹼(rohitukine);羅莫肽(romurtide);羅喹美克(roquinimex);魯比津酮B1 (rubiginone B1);如波西(ruboxyl);沙芬戈(safingol);聖特平(saintopin);SarCNU;肌肉葉綠醇A (sarcophytol A);沙格司亭(sargramostim);Sdi 1模擬物;司莫司汀(semustine);衰老源抑制劑1 (senescence derived 1);正義寡核苷酸;信號轉導抑制劑;信號轉導調節劑;單鏈抗原結合蛋白;西佐喃(sizofuran);索布佐生(sobuzoxane);硼卡鈉(sodium borocaptate);苯基乙酸鈉;索喔醇(solverol);體介素結合蛋白;索納明(sonermin);膦門冬酸(sparfosic acid);穗黴素D (spicamycin D);螺莫司汀(spiromustine);脾臟五肽(splenopentin);海綿抑制素1 (spongistatin 1);角鯊胺(squalamine);幹細胞抑制劑;幹細胞分裂抑制劑;斯替匹醯胺(stipiamide);基質溶素(stromelysin)抑制劑;蘇非諾辛(sulfinosine);強效血管活性腸肽拮抗劑;磺酸化偏端黴素(suradista);舒拉明(suramin);苦馬豆素(swainsonine);合成糖胺聚多糖;他莫司汀(tallimustine);泰莫西芬甲碘化物(tamoxifen methiodide);牛磺莫司汀(tauromustine);他紮羅汀(tazarotene);替可加蘭鈉(tecogalan sodium);替加氟(tegafur);碲雜吡喃鎓(tellurapyrylium);端粒酶抑制劑;替莫泊芬(temoporfin);替莫唑胺(temozolomide);替尼泊苷(teniposide);四氯癸烷氧化物(tetrachlorodecaoxide);四唑胺(tetrazomine);厚果糖松草鹼(thaliblastine);噻可拉林(thiocoraline);血小板生成素;血小板生成素模擬物;胸腺法新(thymalfasin);胸腺生成素受體激動劑;胸腺曲南(thymotrinan);甲狀腺刺激激素;乙基錫初紫紅素(tin ethyl etiopurpurin);替拉紮明(tirapazamine);二氯化二茂鈦(titanocene bichloride);托普升替(topsentin);托瑞米芬(toremifene);全能幹細胞因子;轉譯抑制劑;維甲酸;三乙醯基尿苷;曲西立濱(triciribine);三甲曲沙(trimetrexate);曲普瑞林(triptorelin);托烷司瓊(tropisetron);妥羅雄脲(turosteride);酪胺酸激酶抑制劑;酪胺酸磷酸化抑制劑(tyrphostin);UBC抑制劑;烏苯美司(ubenimex);尿殖竇衍生之生長抑制因子;尿激酶受體拮抗劑;伐普肽(vapreotide);瓦立奧林B (variolin B);紅血球基因療法載體系統;維拉雷瑣(velaresol);藜蘆胺(veramine);維丁(verdins);維替泊芬(verteporfin);長春瑞賓(vinorelbine);維克薩汀(vinxaltine);維他辛(vitaxin);伏氯唑(vorozole);紮諾特隆(zanoterone);折尼鉑(zeniplatin);亞苄維C (zilascorb);及淨司他丁斯酯(zinostatin stimalamer)。
可與本揭露之化合物組合使用的仍其他抗癌劑包括烷化劑、抗代謝劑、天然產物、或激素,例如氮芥(例如甲氯乙胺、環磷醯胺、苯丁酸氮芥(chlorambucil)等)、烷基磺酸鹽(例如白消安等)、亞硝基脲(例如卡莫司汀、魯莫司汀(lomusitne)等)、或三氮烯(氮烯咪胺等)。抗代謝劑的實例包括但不限於葉酸類似物(例如甲胺喋呤)、嘧啶類似物(例如阿糖胞苷等)、或嘌呤類似物(例如巰基嘌呤、硫鳥嘌呤、噴司他丁等)。
可與本揭露之化合物組合使用的天然產物的實例包括但不限於長春花生物鹼(例如長春新鹼等)、表鬼臼毒素(epipodophyllotoxin)(例如依託泊苷等)、抗生素(例如道諾黴素(daunorubicin)、多柔比星、博來黴素等)、酶(例如L-天冬醯胺酶等)、或生物反應調節劑(例如干擾素α等)。
可與本揭露之化合物組合使用的烷化劑實例包括但不限於氮芥(例如甲氯乙胺、環磷醯胺、苯丁酸氮芥、美法侖等)、乙烯亞胺及甲基蜜胺(例如六甲基蜜胺、噻替派等)、烷基磺酸鹽(例如白消安等)、亞硝基脲(例如卡莫司汀、魯莫司汀、司莫司汀、鏈脲菌素等)、或三氮烯(氮烯咪胺等)。抗代謝劑的實例包括但不限於葉酸類似物(例如甲胺喋呤等)、嘧啶類似物(例如氟尿嘧啶、氟尿苷(floxuridine)、阿糖胞苷等)、或嘌呤類似物(例如巰基嘌呤、硫鳥嘌呤、噴司他丁等)。 可與本揭露之化合物組合使用的激素及拮抗劑的實例包括但不限於腎上腺皮質類固醇(例如潑尼松等)、黃體激素(progestins)(例如己酸羥孕酮、甲地孕酮乙酸酯、及乙酸甲羥孕酮等)、雌激素(例如己烯雌酚(diethylstilbestrol)、及乙炔雌二醇等)、抗雌激素(例如泰莫西芬等)、雄性激素(例如睪固酮丙酸酯、氟甲睪酮等)、抗雄性激素(例如氟他胺等)、及促性腺素釋放激素類似物(例如亮丙瑞林等)。可用於本文描述的方法及組成物中以用於治療或預防癌症的其他藥劑包括鉑配位錯合物(例如順鉑、卡鉑等)、蒽二酮(例如米托蒽醌等)、經取代的脲(例如羥基脲等)、甲基肼衍生物(例如甲基苄肼等)及腎上腺皮質抑制劑(例如米托坦(mitotane)、胺魯米特(aminoglutethimide)等)。
作用為藉由因穩定的微管而阻礙G2-M期細胞並且可與不可逆Btk抑制劑化合物組合使用的抗癌劑實例包括但不限於以下市售藥物和開發中的藥物:厄布洛唑(Erbulozole)(還稱為R-55104)、尾海兔素(Dolastatin) 10(還稱為DLS-10及NSC-376128)、微管抑素羥乙基磺酸鹽(Mivobulin isethionate)(還稱為CI-980)、長春新鹼、NSC-639829、圓皮海綿內酯(Discodermolide)(還稱為NVP-XX-A-296)、ABT-751(Abbott,還稱為E-7010)、阿托海汀(Altorhyrtin)(例如阿托海汀A及阿托海汀C)、海綿抑素(Spongistatin)(例如海綿抑素1、海綿抑素2、海綿抑素3、海綿抑素4、海綿抑素5、海綿抑素6、海綿抑素7、海綿抑素8、及海綿抑素9)、鹽酸西馬多丁(Cemadotin hydrochloride)(還稱為LU-103793及NSC-D-669356)、埃博黴素(Epothilone)(例如埃博黴素A、埃博黴素B、埃博黴素C(還稱為去氧埃博黴素A或dEpoA))、埃博黴素D(還稱作KOS-862、dEpoB、及去氧埃博黴素B)、埃博黴素E、埃博黴素F、埃博黴素B N-氧化物、埃博黴素A N-氧化物、16-氮雜-埃博黴素B、21-胺基埃博黴素B(還稱為BMS-310705)、21-羥基埃博黴素D(還稱為去氧埃博黴素F及dEpoF)、26-氟埃博黴素、奧瑞斯他汀(Auristatin) PE(還稱為NSC-654663)、索利多丁(Soblidotin)(還稱為TZT-1027)、LS-4559-P(Pharmacia,還稱為LS-4577)、LS-4578(Pharmacia,還稱為LS-477-P)、LS-4477 (Pharmacia)、LS-4559 (Pharmacia)、RPR-112378 (Aventis)、長春新鹼硫酸鹽、DZ-3358 (Daiichi)、FR-182877(Fujisawa,還稱為WS-9885B)、GS-164 (Takeda)、GS-198 (Takeda)、KAR-2 (Hungarian Academy of Sciences)、BSF-223651(BASF,還稱為ILX-651和LU-223651)、SAH-49960 (Lilly/Novartis)、SDZ-268970 (Lilly/Novartis)、AM-97 (Armad/Kyowa Hakko)、AM-132 (Armad)、AM-138 (Armad/Kyowa Hakko)、IDN-5005 (Indena)、念珠藻素(Cryptophycin) 52(還稱為LY-355703)、AC-7739(Ajinomoto,還稱為AVE-8063A及CS-39.HCl)、AC-7700(Ajinomoto,還稱為AVE-8062、AVE-8062A、CS-39-L-Ser.HCl、及RPR-258062A)、維替利胺(Vitilevuamide)、解微管素A (Tubulysin A)、迦納單索(Canadensol)、矢車菊黃素(Centaureidin)(還稱為NSC-106969)、T-138067(Tularik,還稱為T-67、TL-138067及TI-138067)、COBRA-1(Parker Hughes Institute,還稱為DDE-261和WHI-261)、H10 (Kansas State University)、H16 (Kansas State University)、萬可啶A1 (Oncocidin A1)(還稱為BTO-956和DIME)、DDE-313 (Parker Hughes Institute)、福佳立德B (Fijianolide B)、勞馬立德(Laulimalide)、SPA-2 (Parker Hughes Institute)、SPA-1(Parker Hughes Institute,還稱為SPIKET-P)、3-IAABU (Cytoskeleton/Mt. Sinai School of Medicine,還稱為MF-569)、納可辛(Narcosine)(還稱為NSC-5366)、那可汀(Nascapine)、D-24851 (Asta Medica)、A-105972 (Abbott)、哈米特林(Hemiasterlin)、3-BAABU(Cytoskeleton/Mt. Sinai School of Medicine,還稱為MF-191)、TMPN (Arizona State University)、氧化二乙醯丙酮合釩(Vanadocene acetylacetonate)、T-138026 (Tularik)、孟沙醇(Monsatrol)、依那辛(Inanocine)(還稱為NSC-698666)、3-1AABE (Cytoskeleton/Mt. Sinai School of Medicine)、A-204197 (Abbott)、T-607(Tuiarik,還稱為T-900607)、RPR-115781 (Aventis)、艾榴素類(Eleutherobins)(諸如去甲基艾榴素(Desmethyleleutherobin)、脫乙醯艾榴素(Desaetyleleutherobin)、異艾榴素A (Isoeleutherobin A)、及Z-艾榴素)、卡利貝昔(Caribaeoside)、卡利貝林(Caribaeolin)、大田軟海綿素B (Halichondrin B)、D-64131 (Asta Medica)、D-68144 (Asta Medica)、達佐醯胺A (Diazonamide A)、A-293620 (Abbott)、NPI-2350 (Nereus)、箭根薯酮內酯A (Taccalonolide A)、TUB-245 (Aventis)、A-259754 (Abbott)、戴佐斯他汀(Diozostatin)、(-)-苯基阿夕斯他汀((-)-Phenylahistin)(還稱為NSCL-96F037)、D-68838 (Asta Medica)、D-68836 (Asta Medica)、肌基質蛋白B (Myoseverin B)、D-43411(Zentaris,還稱為D-81862)、A-289099 (Abbott)、A-318315 (Abbott)、HTI-286(還稱為SPA-110,三氟乙酸鹽)(Wyeth)、D-82317 (Zentaris)、D-82318 (Zentaris)、SC-12983 (NCI)、瑞伐斯他汀磷酸鈉(Resverastatin phosphate sodium)、BPR-OY-007 (National Health Research Institutes)及SSR-250411 (Sanofi)。
實例 給出了式(I)之化合物(實例)及中間物(參考)的下列製備,以使所屬技術領域中具有通常知識者能夠更清楚地理解及實施本揭露。彼等不應被視為限制本揭露的範圍,而僅僅是作為其舉例說明及代表。
參考 1 1-(苄氧基)-4-溴-2-甲氧基-5-硝基苯的合成步驟1 將4-溴-2-甲氧基苯酚(5.0 g, 24.6 mmol)、苄基溴化物(3.2 mL, 27.1 mmol)、及碳酸鉀(6.8 g, 49.3 mmol)加入到乙腈(123 mL)中,並且將反應混合物加熱至80℃達6 h。將反應冷卻至室溫並用水稀釋,並用乙酸乙酯萃取。將合併的有機物用MgSO4 乾燥、過濾並在減壓下濃縮,得到1-(苄氧基)-4-溴-2-甲氧基苯(7.2 g, 100%)為粗油狀物。
步驟2 將硝酸(5.0 mL)加入到在0℃下的含1-(苄氧基)-4-溴-2-甲氧基苯(7.2 g, 24.6 mmol)的乙酸(40.0 mL)溶液中。將反應混合物在室溫下攪拌16 h。將反應混合物在減壓下濃縮,移除主體乙酸。加入水,並且將反應混合物冷卻至0℃,從而沉澱。過濾沉澱物,用水洗滌固體,並且在減壓下乾燥,得到1-(苄氧基)-4-溴-2-甲氧基-5-硝基苯(8.30 g; 99%)為黃色固體。
參考 2 1-[3-(4-溴-2-甲氧基苯氧基)丙基]吡咯啶的合成將4-溴-2-甲氧基苯酚(1.6 g, 7.88 mmol)、1-(3-氯-丙基)吡咯啶鹽酸鹽(1.9 g, 9.46 mmol)、與碳酸鉀(3.3 g, 23.64 mmol)在DMF (39.4 mL)中的混合物在100℃下加熱16小時。將反應混合物用水稀釋反應,並用乙酸乙酯洗滌水層。將合併的有機物用MgSO4 乾燥、過濾、在減壓下濃縮,並且藉由矽膠使用含10% MeOH的DCM純化,得到1-[3-(4-溴-2-甲氧基苯氧基)-丙基]吡咯啶(1.3 g, 53%)為棕色油狀物。
參考3 1-(3-(4-溴-2-甲氧基-5-硝基苯氧基)丙基)吡咯啶的合成攪拌含1-[3-(4-溴-2-甲氧基苯氧基)丙基]吡咯啶(17.0 g, 54.10 mmol)的乙酸(150.0 mL),然後在0℃下逐滴加入HNO3 (65%/wt. %, 30.00 mL)。將所得反應混合物在室溫下攪拌2 h。加入冰水(500 ml),並且將混合物在室溫下攪拌1 h,從而形成沉澱物。藉由過濾收集固體。將所得濾餅用水(2 × 30 mL)洗滌,並在減壓下乾燥,得到1-(3-(4-溴-2-甲氧基-5-硝基苯氧基)丙基)吡咯啶為黃色固體(10.6 g, 55%)。
參考4 1-{3-[4-(4,4-二甲基-1,3,2-二氧雜硼雜環戊-2-基)-2-甲氧基-5-硝基苯氧基]-丙基}吡咯啶的合成將1-[3-(4-溴-2-甲氧基-5-硝基苯氧基)丙基]吡咯啶(8.0 g, 22.27 mmol)、雙(頻哪醇根基)二硼(8.51 g, 33.51 mmol)、乙酸鉀(4.4 g, 44.63 mmol)、與Pd(dppf)2 Cl2 DCM (1.63 g, 2.23 mmol)在1,4-二烷(200 mL)中的混合物在N2 下在110℃下攪拌並加熱3 h。將混合物在減壓下濃縮。將所得殘餘物藉由矽膠管柱使用含10% MeOH的DCM純化,得到1-{3-[4-(4,4-二甲基-1,3,2-二氧雜硼雜環戊-2-基)-2-甲氧基-5-硝基苯氧基]丙基}吡咯啶(6.1 g, 67%)為灰色固體。
參考5 三級丁基7-(苄氧基)-1-氯-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯的合成
步驟1 在20 mL微波小瓶中,將Pd(dppf)2Cl2.DCM (63 mg, 0.08 mmol)加入到含1-(苄氧基)-4-溴-2-甲氧基-5-硝基苯(870 mg, 2.57 mmol)、2-氯-3-吡啶基硼酸(526 mg, 3.34 mmol)、及2M乙酸鉀(3.3 mL, 6.69 mmol)的DMF (9 mL)溶液中。在微波中,將反應加熱至130℃達1 h。將反應混合物用乙酸乙酯稀釋並通過矽藻土塞過濾。將水加入到濾液中。使用乙酸乙酯洗滌水層。將合併的有機物用MgSO4 乾燥、過濾、並在減壓下濃縮。將所得殘餘物藉由矽膠管柱使用含0%至50%乙酸乙酯的己烷純化,得到3-[4-(苄氧基)-5-甲氧基-2-硝基苯基]-2-氯吡啶(560 mg, 59%)為黃色油狀物。
步驟2 將含3-[4-(苄氧基)-5-甲氧基-2-硝基苯基]-2-氯吡啶(1.50 g, 4.05 mmol)的亞磷酸三乙酯(8.0 mL)在130℃下攪拌並加熱24 h。將反應混合物冷卻至室溫。將反應混合物在減壓下濃縮,得到7-(苄氧基)-1-氯-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚(1.37 g, 99%)為粗製橘色固體。
步驟3 將二-三級丁基二碳酸酯(1.32 g, 6.07 mmol)加入到含有7-(苄氧基)-1-氯-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚(1.37 g, 4.04 mmol)、Hunig's鹼(1.0 mL, 6.07 mmol)、與DMAP (0.10 g, 0.80 mmol)在1,4-二烷(11 mL)中的混合物中。將反應混合物攪拌15分鐘,然後在減壓下濃縮。將所得殘餘物用含10% DCM的己烷研磨,得到標題化合物三級丁基7-(苄氧基)-1-氯-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(0.62 g; 34.93%)為白色固體。MS (ESI,正離子) m/z: 439.0 (M+1)。
參考6 7-(苄氧基)-4-氯-1-氟-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚的合成如參考5所述製備標題化合物,但將2-氯-3-吡啶基硼酸取代為(5-氯-2-氟吡啶-3-基)硼酸。MS (ESI,正離子) m/z: 357.0 (M+1)。
參考7 三級丁基7-羥基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯將三級丁基7-(苄氧基)-1-氯-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(290.00 mg; 0.66 mmol; 1.00 eq.)與10%碳載鈀(70.32 mg; 0.07 mmol; 0.10 eq.)在甲醇(20 mL)及DCM (10 mL)中合併。在經由氣球的氫氣(1 atm)存在下攪拌。將反應加熱至40℃達1小時。然後將反應混合物通過矽藻土塞過濾並將濾液濃縮,得到三級丁基7-羥基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(207.69 mg; 100.00%)為白色固體。MS (ESI,正離子) m/z: 357.0 (M-56)。
參考8 三級丁基1-環丙基-7-羥基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯
步驟1 將三級丁基7-(苄氧基)-1-氯-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(10.00 g; 22.78 mmol; 1.00 eq.)、環丙基硼酸(6.85 g; 79.74 mmol; 3.50 eq.)、三環己基磷烷(638.93 mg; 2.28 mmol; 0.10 eq.)與磷酸三鉀(9.67 g; 45.57 mmol; 2.00 eq.)在甲苯(113.92 mL)及水(5.70 mL)中的混合物用氮吹掃10分鐘。然後加入乙酸鈀(511.52 mg; 2.28 mmol; 0.10 eq.)並將混合物在密封燒瓶中加熱至100 C達4小時。將混合物用EtOAc稀釋並用水及鹽水洗滌。將有機層在MgSO4上乾燥、過濾並濃縮。將所得殘餘物藉由管柱層析法以含0至50% EtOAc的庚烷洗提純化,獲得三級丁基7-(苄氧基)-1-環丙基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(8.85 g; 87%)為灰白色固體。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 8.32 (d, J = 5.7 Hz, 1H), 8.00 (s, 1H), 7.88 (d, J = 5.7 Hz, 1H), 7.83 (s, 1H), 7.50 – 7.45 (m, 2H), 7.42 – 7.36 (m, 2H), 7.36 – 7.29 (m, 1H), 5.19 (s, 2H), 3.90 (s, 3H), 2.79 (p, J = 6.5 Hz, 1H), 1.66 (s, 9H), 1.15 – 1.08 (m, 4H)。
步驟2 燒瓶加入三級丁基7-(苄氧基)-1-環丙基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(9.02 g; 20.29 mmol; 1.00 eq.)在乙醇(902.00 mL)中的混合物,並將燒瓶用N2吹掃10 min。將氫氧化鈀(0.57 g; 4.06 mmol; 0.20 eq.)加入到反應混合物中,並將系統用氮然後用氫吹掃。使混合物在經由氣球的氫氣下持續攪拌2小時。將反應混合物用矽藻土過濾並將濾液濃縮至乾,得到三級丁基1-環丙基-7-羥基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(5.72g; 79%)。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 9.64 (s, 1H), 8.28 (d, J = 5.7 Hz, 1H), 7.85 – 7.78 (m, 2H), 7.76 (s, 1H), 3.89 (s, 3H), 2.81 – 2.68 (m, 1H), 1.67 (s, 9H), 1.13 – 1.06 (m, 4H)。
參考9 三級丁基1-氯-7-羥基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯將三級丁基7-(苄氧基)-1-氯-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(401 mg, 0.91 mmol)與Pd(OH)2 (101 mg)在THF (25 mL)中的混合物用N2 吹掃10 min,隨後在經由氣球的氫氣下處理10分鐘。使所得混合物在室溫下在氫氣氛下攪拌8分鐘。將反應混合物通過一小塊矽藻土墊過濾並用MeOH沖洗。將所得濾液合併,並在減壓下移除有機溶劑,提供三級丁基1-氯-7-羥基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯的粗產物(260 mg, 80%)。
參考10 4-氯-1-氟-7,8-二甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚
步驟1 將1-溴-4,5-二甲氧基-2-硝基苯(3.4g; 12.97 mmol; 1.00 eq.)、(5-氯-2-氟吡啶-3-基)硼酸(4.6 g; 25.95 mmol; 2.00 eq.)、Pd(dppf)2Cl2.DCM (529.76 mg; 0.65 mmol; 0.05 eq.)、與碳酸鉀(4.5 g; 32.44 mmol; 2.50 eq.)在1,4-二烷(90 mL)中的混合物加熱至100℃達4小時。讓反應冷卻至rt。將反應混合物用水稀釋。用乙酸乙酯萃取水層。將合併的有機物用MgSO4乾燥、過濾、並在減壓下濃縮。將所得殘餘物藉由矽膠使用含0%至50%乙酸乙酯的己烷純化,得到5-氯-3-(4,5-二甲氧基-2-硝基苯基)-2-氟吡啶(3.3g; 81%)。MS (ESI,正離子) m/z: 313.0 (M+1)。
步驟2 將5-氯-3-(4,5-二甲氧基-2-硝基苯基)-2-氟吡啶(3.3 g; 10.5 mmol; 1.00 eq.)在亞磷酸三乙酯(35 mL; 0.30 mol/L; 10.55 mmol; 1.00 eq.)中的混合物加熱至120℃達16小時。將混合物冷卻至室溫並在減壓下濃縮。將所得殘餘物用含33% DCM的庚烷研磨、過濾、並在高真空下乾燥,得到標題化合物(1.7 g; 57%)。MS (ESI,正離子) m/z: 313.0 (M+1)。
參考11 3-(4-溴-2-甲氧基-5-硝基苯氧基)-N,N-二甲基丙-1-胺向含[3-(4-溴-2-甲氧基苯氧基)丙基]二甲胺(22.38 g; 77.66 mmol; 1.00 eq.)的冰醋酸(194.15 mL)溶液加入15.8N硝酸(22.38 mL)。將反應在室溫下攪拌18小時。在反應混合物中形成黃色沉澱。使用40℃水浴,將主體乙酸在減壓下移除。用水稀釋。緩慢加入2M NaOH直到pH約為4。由於水量過多,加入固體NaOH並攪拌直到pH約為9。讓不勻混合物攪拌30分鐘並過濾。過濾期間用水洗滌固體。在高真空下乾燥後,獲得標題化合物(22.60 g; 87.34%)為淺黃色固體。1 H NMR (400 MHz,乙腈-d 3 ) δ 7.59 (s, 1H), 7.27 (s, 1H), 4.09 (t,J = 6.5 Hz, 2H), 3.91 (s, 3H), 2.38 (t,J = 7.0 Hz, 2H), 2.18 (s, 6H), 1.94 – 1.87 (m, 2H)。MS (ESI,正離子) m/z: 332.9 (M+1)。
實例1 1-[3-({6-甲氧基-5H-吡啶并[3,2-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]吡咯啶的合成
步驟1 在20 mL微波小瓶中,將4-溴-2-甲氧基苯酚(1.50 g, 7.39 mmol)、雙(頻哪醇根基)二硼(2.44 g, 9.6 mmol)、乙酸鉀(2.18 g, 22.2 mmol)、與Pd(dppf)2 Cl2 .DCM (150.83 mg, 0.2 mmol)在1,4-二烷(8.0 mL)中的混合物在微波反應器中加熱至130℃達1 h。將反應混合物通過矽藻土塞過濾並在減壓下濃縮,得到2-甲氧基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧雜硼雜環戊-2-基)苯酚(1.84 g, 100%)為粗油狀物。
步驟2 在20 mL微波小瓶中,將2-甲氧基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧雜硼雜環戊-2-基)苯酚(1.84 g, 8.1 mmol)、2-溴-3-硝基吡啶(1 65 g, 8.1 mmol)、乙酸鉀(2.18 g, 22.2 mmol)、與Pd(dppf)2 Cl2 .DCM (181.00 mg, 0.2 mmol)在DMF (8.0 mL)中的混合物在微波反應器中加熱至130℃達30分鐘。將反應混合物通過矽藻土塞過濾並在減壓下濃縮。將所得殘餘物藉由製備型HPLC純化(Prep-C18,Phenomenex Luna管柱,21.2 × 250 mm;含0至60% MeCN的水梯度洗提16 min期間,其中水含有0.1% HCl,流速:20 mL/min),得到2-甲氧基-4-(3-硝基吡啶-2-基)苯酚(0.40 g, 22%)為白色固體。
步驟3 將2-甲氧基-4-(3-硝基吡啶-2-基)苯酚(0.40 g, 1.6 mmol)、1-(3-氯丙基)吡咯啶鹽酸鹽(0.30 g, 1.6 mmol)、與碳酸鉀(0.68 g, 4.9 mmol)在DMF (10.0 mL)中的混合物加熱至100℃達16 h。將反應混合物冷卻至室溫,用水稀釋並用乙酸乙酯萃取。將合併的有機物用MgSO4 乾燥、過濾、並在減壓下濃縮。將所得殘餘物藉由矽膠管柱使用含0%至10% MeOH的DCM純化,得到2-{3-甲氧基-4-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]苯基}-3-硝基吡啶(0.31 g, 53%)。
步驟4 將2-{3-甲氧基-4-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]苯基}-3-硝基吡啶(0.10 g, 0.3 mmol)與亞磷酸三乙酯(2.0 mL)的混合物攪拌並加熱至120℃達24 h。將所得殘餘物冷卻至室溫並在減壓下濃縮。將所得殘餘物藉由製備型HPLC純化(Prep-C18,Phenomenex Luna管柱,21.2 × 250 mm;含0至60% MeCN的水梯度洗提16 min期間,其中水含有0.1% HCl,流速:20 mL/min)。較具極性的化合物為1-[3-({8-甲氧基-5H-吡啶并[3,2-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]吡咯啶(7.0 mg, 7%),MS (ESI,正離子) m/z: 326.5 (M+1)。較不具極性的化合物為1-[3-({6-甲氧基-5H-吡啶并[3,2-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]吡咯啶(18.0 mg, 17%),MS (ESI,正離子) m/z: 326.5 (M+1)。
實例2 1-[3-({6-甲氧基-9H-吡啶并[3,4-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]吡咯啶的合成
步驟1 在5 mL微波小瓶中,將1-(苄氧基)-4-溴-2-甲氧基-5-硝基苯(0.40 g, 1.2 mmol)、4-吡啶基硼酸(0.22 g; 1.8 mmol)、2M碳酸鉀(1.77 mL, 3.6 mmol)、與Pd(dppf)2 Cl2 .DCM (24.2 mg, 0.03 mmol)在DMF (2.0 mL)中的混合物在微波反應器中加熱至130℃達30分鐘。將反應混合物通過矽藻土塞過濾。將濾液用水稀釋並用乙酸乙酯萃取。將合併的有機物用MgSO4 乾燥、過濾、並在減壓下濃縮。將所得殘餘物藉由矽膠管柱使用含0%至50%乙酸乙酯的己烷純化,得到4-[4-(苄氧基)-5-甲氧基-2-硝基苯基]吡啶(0.30 g; 75%)。
步驟2 將4-[4-(苄氧基)-5-甲氧基-2-硝基苯基]吡啶(0.3 g, 0.9 mmol)與亞磷酸三乙酯(2.0 mL)的混合物加熱至130℃達24 h。將反應冷卻至室溫並在減壓下濃縮。將所得殘餘物藉由矽膠管柱使用含0%至75%乙酸乙酯的己烷純化,得到7-(苄氧基)-6-甲氧基-9H-吡啶并[3,4-b]吲哚(110.00 mg, 41%)。
步驟3 將二-三級丁基二碳酸酯(95 mg, 0.43 mmol)加入到含7-(苄氧基)-6-甲氧基-9H-吡啶并[3,4-b]吲哚(110 mg, 0.36 mmol)及DMAP (9 mg; 0.07 mmol)的1,4-二烷(4.0 mL)溶液中。將反應混合物在室溫下攪拌1 h並在減壓下濃縮。將所得殘餘物藉由矽膠管柱使用含0%至45%乙酸乙酯的己烷純化,得到三級丁基7-(苄氧基)-6-甲氧基-9H-吡啶并[3,4-b]吲哚-9-羧酸酯(70.00 mg; 48%)。
步驟4 將三級丁基7-(苄氧基)-6-甲氧基-9H-吡啶并[3,4-b]吲哚-9-羧酸酯(70 mg, 0.17 mmol)與10%碳載鈀(18 mg, 0.02 mmol)在甲醇(2.0 mL)中的混合物在室溫下在經由氣球的1 atm H2 下攪拌。將反應混合物攪拌1 h並通過矽藻土塞過濾。將濾液在減壓下濃縮,得到三級丁基7-羥基-6-甲氧基-9H-吡啶并[3,4-b]吲哚-9-羧酸酯(54 mg, 99%)。
步驟5 將三級丁基7-羥基-6-甲氧基-9H-吡啶并[3,4-b]吲哚-9-羧酸酯(54 mg, 0.2 mmol)、1-(3-氯丙基)吡咯啶鹽酸鹽(47 mg, 0.3 mmol)、與碳酸鉀(71 mg, 0.5 mmol)在DMF (3.0 mL)中的混合物加熱至100℃達16 h。將反應混合物用水稀釋並用乙酸乙酯萃取。將合併的有機物用MgSO4 乾燥、過濾並在減壓下濃縮。將所得粗製物用1M HCl (1.0 mL)處理並攪拌1 h。將水性混合物藉由製備型HPLC純化(Prep-C18,Phenomenex Luna管柱,21.2 × 250 mm;含0至60% MeCN的水梯度洗提16 min期間,其中水含有0.1% HCl,流速:20 mL/min),得到標題化合物1-[3-({6-甲氧基-9H-吡啶并[3,4-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]吡咯啶(10 mg, 18%)。MS (ESI,正離子) m/z: 326.0 (M+1)。
實例3 1-[3-({8-甲氧基-1-甲基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]吡咯啶的合成如實例2所述製備標題化合物,但將4-吡啶基硼酸取代為(2-甲基吡啶-3-基)硼酸。MS (ESI,正離子) m/z: 340.0 (M+1)。
實例4 1-[3-({8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]吡咯啶及 1-[3-({6-甲氧基-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]吡咯啶的合成
步驟1 在5 mL微波小瓶中,將1-(苄氧基)-4-溴-2-甲氧基-5-硝基苯(0.62 g, 1.83 mmol)、3-吡啶基硼酸(0.34 g; 2.75 mmol)、Pd(dppf)2 Cl2 .DCM (37 mg; 0.05 mmol)、與2M碳酸鉀(2.8 mL, 5.50 mmol)在DMF (2.00 mL)中的混合物在微波反應器中加熱至130℃達30分鐘。將反應混合物用乙酸乙酯稀釋並通過矽藻土塞過濾。將水加入到濾液中,並且將層分離。用乙酸乙酯洗滌水層。將合併的有機物用MgSO4 乾燥、過濾、並在減壓下濃縮。將所得殘餘物藉由矽膠使用含0%至50%乙酸乙酯的己烷純化,得到3-(4-(苄氧基)-5-甲氧基-2-硝基苯基)吡啶(0.31 g; 50%)為深色油狀物。
步驟2 將三氟乙酸(2 mL)加入到3-(4-(苄氧基)-5-甲氧基-2-硝基苯基)吡啶(0.31 g, 0.91 mmol)中並在室溫下攪拌16 h。將反應混合物在減壓下濃縮。將所得殘餘物藉由矽石管柱使用含0%至80%乙酸乙酯的己烷純化,得到2-甲氧基-5-硝基-4-(吡啶-3-基)苯酚(0.1 g, 45%)。
步驟3 將2-甲氧基-5-硝基-4-(吡啶-3-基)苯酚(0.1 g, 0.41 mmol)、1-(3-氯丙基)吡咯啶鹽酸鹽(92 mg, 0.61 mmol)與碳酸鉀(0.17 g, 1.22 mmol)在DMF (2.0 mL)中的混合物加熱至100℃達18 h。將反應混合物冷卻至室溫。將反應混合物用水稀釋。用乙酸乙酯萃取水溶液。將合併的有機物用MgSO4 乾燥、過濾、並在減壓下濃縮。將所得殘餘物藉由矽膠管柱使用含0%至10% MeOH的DCM純化,得到3-{5-甲氧基-2-硝基-4-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]苯基}吡啶(0.1 g, 69%)。
步驟4 將3-{5-甲氧基-2-硝基-4-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]苯基}吡啶(0.1 g, 0.28 mmol)與亞磷酸三乙酯(2.0 mL)的混合物加熱至120℃達24 h。將反應混合物冷卻至室溫。將所得殘餘物在減壓下濃縮並藉由製備型HPLC純化(Prep-C18,Phenomenex Luna管柱,21.2 × 250 mm;含0至60% MeCN的水梯度洗提16 min期間,其中水含有0.1% HCl,流速:20 mL/min),得到較具極性的位置異構物1-[3-({8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]-吡咯啶(8.0 mg, 3%),MS (ESI,正離子) m/z: 326.2 (M+1),及較不具極性的位置異構物1-[3-({6-甲氧基-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]吡咯啶(18.0 mg; 10%),MS (ESI,正離子) m/z: 326.0 (M+1)。
實例5 8-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-3-胺的合成
步驟1 在5 mL微波小瓶中,將5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧雜硼雜環戊-2-基)-2-吡啶基胺(0.3 g, 1.36 mmol)、1-[3-(4-溴-2-甲氧基-5-硝基苯氧基)丙基]吡咯啶(0.5 g, 1.36 mmol)、Pd(dppf)2 Cl2 .DCM (33 mg, 0.04 mmol)、與2M碳酸鉀(1.4 mL, 2.73 mmol)在DMF (2.7 mL)中的混合物在微波反應器中加熱至120℃達1 h。將反應混合物用水稀釋。用乙酸乙酯萃取水層。將合併的有機物用MgSO4 乾燥、過濾、並在減壓下濃縮。將所得殘餘物藉由矽膠管柱使用含0%至10% MeOH的DCM純化,得到5-{5-甲氧基-2-硝基-4-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]苯基}吡啶-2-胺(0.33 g, 65%)為棕色油狀物。
步驟2 將二-三級丁基二碳酸酯(316.45 mg; 1.45 mmol)加入到5-{5-甲氧基-2-硝基-4-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]苯基}吡啶-2-胺(180.00 mg; 0.48 mmol)與N,N-二甲基胺基吡啶(11.81 mg; 0.10 mmol)在乙腈(5 mL)中的混合物中。將反應混合物加熱至50℃達1 h。將反應混合物冷卻至室溫。將反應混合物在減壓下濃縮。將所得殘餘物藉由矽膠管柱使用含0%至10% MeOH的DCM純化,得到三級丁基N-[(三級丁氧基)羰基]-N-(5-{5-甲氧基-2-硝基-4-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]苯基}吡啶-2-基)胺甲酸酯(0.16 g, 57%)。
步驟3 將三級丁基N-[(三級丁氧基)羰基]-N-(5-{5-甲氧基-2-硝基-4-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]苯基}吡啶-2-基)胺甲酸酯(0.16 g, 0.28 mmol)與亞磷酸三乙酯(3.0 mL)的混合物加熱至120℃達24 h。將反應混合物冷卻至室溫並在減壓下濃縮。將1M HCl (3 mL)加入到所得殘餘物中並加熱至50℃達1 h。將溶液藉由製備型HPLC純化(Prep-C18,Phenomenex Luna管柱,21.2 × 250 mm;含0至60% MeCN的水梯度洗提16 min期間,其中水含有0.1% HCl,流速:20 mL/min),得到較具極性的位置異構物8-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-3-胺(20.0 mg, 21%)。MS (ESI,正離子) m/z: 341.4 (M+1)。
實例6 1-[3-({1-氟-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]吡咯啶的合成如實例5所述製備標題化合物,但將5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧雜硼雜環戊-2-基)-2-吡啶基胺取代為(2-氟吡啶-3-基)硼酸。MS (ESI,正離子) m/z: 344.0 (M+1)。
實例7 8-甲氧基-1-甲基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-3-胺的合成
步驟1 將二-三級丁基二碳酸酯(2.6 g, 11.76 mmol)加入到5-溴-6-甲基吡啶-2-胺(1.1 g, 5.88 mmol)與DMAP (0.14 g, 1.18 mmol)在THF (20.0 mL)中的混合物中。將反應混合物加熱至50℃達1 h。將反應混合物冷卻至室溫。將反應混合物在減壓下濃縮。將所得殘餘物藉由矽膠使用含0%至30%乙酸乙酯的己烷純化,得到三級丁基N-(5-溴-6-甲基吡啶-2-基)-N-[(三級丁氧基)羰基]胺甲酸酯(2.1 g, 92%)。
步驟2 在20 mL微波小瓶中,將三級丁基N-(5-溴-6-甲基吡啶-2-基)-N-[(三級丁氧基)羰基]胺甲酸酯(1.4 g, 3.62 mmol)、雙(頻哪醇根基)二硼(1.4 g, 5.42 mmol)、Pd(dppf)2 Cl2 .DCM (74 mg, 0.09 mmol)、與碳酸鉀(2.0 g, 14.46 mmol)在1,4-二烷(12.0 mL)中的混合物加熱至130℃達7 h。將反應混合物用水稀釋。用乙酸乙酯萃取水層。將合併的有機物用MgSO4 乾燥、過濾、並在減壓下濃縮。將所得殘餘物藉由矽膠管柱使用含0%至50%乙酸乙酯的己烷純化,得到三級丁基N-[(三級丁氧基)羰基]-N-[6-甲基-5-(四甲基-1,3,2-二氧雜硼雜環戊-2-基)吡啶-2-基]胺甲酸酯(1.5 g, 95%)。
步驟3 在5 mL微波小瓶中,將三級丁基N-[(三級丁氧基)羰基]-N-[6-甲基-5-(四甲基-1,3,2-二氧雜硼雜環戊-2-基)吡啶-2-基]胺甲酸酯(0.40 g, 0.92 mmol)、1-[3-(4-溴-2-甲氧基-5-硝基苯氧基)丙基]吡咯啶(0.33 g, 0.92 mmol)、Pd(dppf)2 Cl2 .DCM (23 mg, 0.03 mmol)、與2M碳酸鉀(0.90 mL, 1.84 mmol)在NMP (2.5 mL)中的混合物在微波反應器中加熱至130℃達30分鐘。將反應混合物用水稀釋。用乙酸乙酯萃取水層。將合併的有機物用MgSO4 乾燥、過濾、並在減壓下濃縮。將所得殘餘物藉由矽膠管柱使用含0%至10% MeOH的DCM純化,得到三級丁基N-[(三級丁氧基)羰基]-N-(5-{5-甲氧基-2-硝基-4-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]苯基}-6-甲基吡啶-2-基)胺甲酸酯(0.35 g, 65%)。
步驟4 將三級丁基N-[(三級丁氧基)羰基]-N-(5-{5-甲氧基-2-硝基-4-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]苯基}-6-甲基吡啶-2-基)胺甲酸酯(0.35 g, 0.60 mmol)與亞磷酸三乙酯(6 mL)的混合物加熱至120℃達24 h。將反應混合物在減壓下濃縮。將1M鹽酸(3.00 mL)溶液加入到所得殘餘物中並攪拌3 h。將水溶液藉由製備型HPLC純化(Prep-C18,Phenomenex Luna管柱,21.2 × 250 mm;含0至60% MeCN的水梯度洗提16 min期間,其中水含有0.1% HCl,流速:20 mL/min),得到標題化合物8-甲氧基-1-甲基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-3-胺(8 mg, 4%)。MS (ESI,正離子) m/z: 355.0 (M+1)。
實例8 (3S)-1-{8-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基}吡咯啶-3-醇的合成
步驟1 在20 mL微波小瓶中,將Brettphos G1 (25 mg, 0.03 mmol)、三級丁基7-(苄氧基)-1-氯-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(270 mg, 0.62 mmol)、(3S)-3-吡咯啶醇(161 mg, 1.85 mmol)、與三級丁氧化鉀(207 mg, 1.85 mmol)在NMP (6.0 mL)中的混合物在微波反應器中加熱至140℃達1.5 h。將反應混合物用水稀釋。用乙酸乙酯萃取水層。將合併的有機物用MgSO4 乾燥、過濾、並在減壓下濃縮。將所得殘餘物藉由矽膠管柱使用含0%至80%乙酸乙酯的己烷純化,得到(3S)-1-[7-(苄氧基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基]吡咯啶-3-醇(239 mg, 99%)。
步驟2 將二-三級丁基二碳酸酯(269 mg, 1.23 mmol)加入到(3S)-1-[7-(苄氧基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基]吡咯啶-3-醇(239 mg, 0.62 mmol)、DMAP (15 mg, 0.12 mmol)、與Hunig's鹼(0.21 mL, 1.23 mmol)在乙腈(3 mL)中的混合物中。將反應混合物在室溫下攪拌2h,並在減壓下濃縮。將所得殘餘物藉由矽膠管柱使用含0%至30%乙酸乙酯的己烷純化,得到三級丁基7-(苄氧基)-1-[(3S)-3-{[(三級丁氧基)羰基]氧基}吡咯啶-1-基]-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(363 mg, 99%)。
步驟3 將三級丁基7-(苄氧基)-1-[(3S)-3-{[(三級丁氧基)羰基]氧基}吡咯啶-1-基]-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(363.00 mg, 0.62 mmol)與10%wt碳載鈀(33 mg, 0.03 mmol)在甲醇(10 mL)中的混合物在經由氣球的氫氣壓力下攪拌1 h。將反應混合物通過矽藻土塞過濾並在減壓下濃縮,得到三級丁基1-[(3S)-3-{[(三級丁氧基)羰基]氧基}吡咯啶-1-基]-7-羥基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(300 mg, 97%)。
步驟4 將三級丁基1-[(3S)-3-{[(三級丁氧基)羰基]氧基}吡咯啶-1-基]-7-羥基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(300 mg, 0.60 mmol)、1-(3-氯丙基)吡咯啶鹽酸鹽(240 mg, 1.20 mol)、與碳酸鉀(331 mg, 2.40 mol)在DMF (6 mL)中的混合物加熱至100℃達16 h。將反應混合物冷卻至室溫、過濾、並在減壓下濃縮。將1M HCl (5 mL)加入到所得殘餘物中並加熱至50℃達1 h。將水溶液藉由製備型HPLC純化(Prep-C18,Phenomenex Luna管柱,21.2 × 250 mm;含0至60% MeCN的水梯度洗提16 min期間,其中水含有0.1% HCl,流速:20 mL/min),得到標題化合物(3S)-1-{8-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基}吡咯啶-3-醇(110 mg, 38%)。
實例9 (3R)-1-{8-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基}吡咯啶-3-醇的合成如實例8所述製備標題化合物,但將(3S)-3-吡咯啶醇取代為(3R)-3-吡咯啶醇。MS (ESI,正離子) m/z: 411.0 (M+1)。
實例10 8-甲氧基-N-[(2S)-1-甲氧基丙烷-2-基]-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-胺的合成如實例8所述製備標題化合物,但將(3S)-3-吡咯啶醇取代為(2S)-1-甲氧基丙烷-2-胺。MS (ESI,正離子) m/z: 413.0 (M+1)。
實例11 1-{8-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基}吡咯啶的合成如實例8所述製備標題化合物,但將(3S)-3-吡咯啶醇取代為吡咯啶。MS (ESI,正離子) m/z: 395.0 (M+1)。
實例12 1-{8-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基}哌啶-4-醇的合成如實例8所述製備標題化合物,但將(3S)-3-吡咯啶醇取代為4-羥基哌啶。MS (ESI,正離子) m/z: 425.0 (M+1)。
實例13 4-{8-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基}嗎啉的合成如實例8所述製備標題化合物,但將(3S)-3-吡咯啶醇取代為嗎啉。MS (ESI,正離子) m/z: 411.0 (M+1)。
實例14 1-{8-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基}吖呾-3-醇的合成如實例8所述製備標題化合物,但將(3S)-3-吡咯啶醇取代為3-羥基吖呾。MS (ESI,正離子) m/z: 397.0.0 (M+1)。
實例15 3-{8-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基}-8-氧雜-3-氮雜雙環[3.2.1]辛烷的合成如實例8所述製備標題化合物,但將(3S)-3-吡咯啶醇取代為8-氧雜-3-氮雜雙環[3.2.1]辛烷。MS (ESI,正離子) m/z: 437.1 (M+1)。
實例16 N-(2-乙氧基乙基)-8-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-胺的合成
步驟1 在20 mL微波小瓶中,將7-(苄氧基)-4-氯-1-氟-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚(600 mg, 1.68 mmol)、2-乙氧基乙胺(450 mg, 5.05 mmol)、與Hunig's鹼(0.29 mL, 1.68 mmol)在NMP (6 mL)中的混合物在微波反應器中加熱至120℃達5 h。將反應混合物在減壓下濃縮。將所得殘餘物藉由矽膠管柱使用含0%至50%乙酸乙酯的己烷純化,得到7-(苄氧基)-4-氯-N-(2-乙氧基乙基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-胺(320 mg; 44%)。
步驟2 將二-三級丁基二碳酸酯(522 mg, 2.39 mmol)加入到7-(苄氧基)-4-氯-N-(2-乙氧基乙基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-胺(340 mg, 0.80 mmol)與DMAP (20 mg, 0.16 mmol)在乙腈(4 mL)中的混合物中。將反應混合物加熱至45℃達1 h。將反應混合物冷卻至室溫並在減壓下濃縮。將所得殘餘物藉由矽膠管柱使用含0%至30%乙酸乙酯的己烷純化,得到三級丁基7-(苄氧基)-1-{[(三級丁氧基)羰基](2-乙氧基乙基)胺基}-4-氯-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(150 mg, 30%)。
步驟3 將三級丁基7-(苄氧基)-1-{[(三級丁氧基)羰基](2-乙氧基乙基)胺基}-4-氯-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(150 mg, 0.24 mmol)與10%wt碳載鈀(25 mg, 0.02 mmol)在甲醇(2.40 mL)中的混合物在經由氣球的氫氣下攪拌1 h。將反應混合物通過矽藻土塞過濾並在減壓下濃縮,得到三級丁基1-{[(三級丁氧基)羰基](2-乙氧基乙基)胺基}-7-羥基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(120 mg, 99%)。
步驟4 將三級丁基1-{[(三級丁氧基)羰基](2-乙氧基乙基)胺基}-7-羥基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(120 mg, 0.24 mmol)、1-(3-氯丙基)吡咯啶鹽酸鹽(88 mg, 0.48 mmol)、與碳酸鉀(132 mg, 0.96 mmol)在DMF (2.4 mL)中的混合物加熱至100℃達16 h。將反應混合物用水稀釋。用乙酸乙酯萃取水層。將合併的有機物用MgSO4 乾燥、過濾、並在減壓下濃縮。將所得殘餘物藉由製備型HPLC純化(Prep-C18,Phenomenex Luna管柱,21.2 × 250 mm;含0至60% MeCN的水梯度洗提16 min期間,其中水含有0.1% HCl,流速:20 mL/min),得到N-(2-乙氧基乙基)-8-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-胺(65 mg, 56%)。MS (ESI,正離子) m/z: 413.4 (M+1)。
實例17 1-[3-({1-環丙基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]吡咯啶的合成如實例7所述製備標題化合物,但修改步驟1如下。MS (ESI,正離子) m/z: 366.0.0 (M+1)。
步驟1 將三級丁基7-(苄氧基)-1-氯-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(100 mg, 0.23 mmol)、環丙基硼酸(69 mg, 0.80 mmol)、三環己基磷烷(6 mg, 0.02 mmol)、與磷酸三鉀(97 mg, 0.46 mmol)在甲苯(1.1 mL)及水(0.06 mL)中的混合物用氮吹掃10分鐘。然後加入乙酸鈀(5.1 mg; 0.02 mmol),並將密封小瓶加熱至100℃達5 h。將混合物用乙酸乙酯稀釋並用水及鹽水洗滌。將有機層在MgSO4 上乾燥、過濾並在減壓下濃縮。將所得殘餘物藉由矽膠管柱以含0%至60%乙酸乙酯的己烷洗提純化,獲得三級丁基7-(苄氧基)-1-環丙基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(90 mg, 88%)為灰白色固體。
實例18 1-[3-({8-甲氧基-5H-嘧啶并[5,4-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]吡咯啶的合成
步驟1 將1-{3-[2-甲氧基-5-硝基-4-(四甲基-1,3,2-二氧雜硼雜環戊-2-基)苯氧基]丙基}吡咯啶(500 mg, 1.23 mmol)、4,5-二氯嘧啶(220 mg, 1.48 mmol)、Pd(amphos)Cl2 (59 mg, 0.08 mmol)、與2M碳酸鈉(1.23 mL, 2.46 mmol)在1,4-二烷(5 mL)中的混合物用N2 吹掃6 min。將所得混合物密封並在90℃下持續攪拌45分鐘。將所得混合物冷卻至室溫、用水稀釋並用乙酸乙酯萃取。將合併的有機層用水洗滌。在減壓下移除有機溶劑後,將殘餘物藉由急速層析法在矽膠管柱上以含0至100%溶劑A的CH2 Cl2 洗提純化(溶劑A:0.2% NH4 OH/10% MeOH/88.9% CH2 Cl2 ),提供5-氯-4-{5-甲氧基-2-硝基-4-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]苯基}-嘧啶為棕色固體(422 mg, 87%)。
步驟2 將5-氯-4-{5-甲氧基-2-硝基-4-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]苯基}-嘧啶(420 mg, 1.07 mmol)在乙酸乙酯(5 mL)中的混合物加入到裝有無水SnCl2 (439 mg, 2.3 mmol)的小瓶中。使該混合物在95℃下持續攪拌2 h。向混合物加入額外的無水SnCl2 (200 mg, 1.04 mmol)及乙酸乙酯(2.5 mL)。將所得混合物密封,並使其在65℃下攪拌24 h。將粗溶液冷卻至室溫、用水處理然後用20% NaOH水溶液處理。將混合物用25%i PrOH/75%氯仿的溶劑混合物萃取三次。在減壓下移除有機溶劑後,將殘餘物藉由急速層析法在矽膠管柱上以含0至100%溶劑A的溶劑B洗提純化(溶劑A:0.2% NH4 OH/10% MeOH/88.9% CH2 Cl2 ;溶劑B:1% NH4 OH/99% MeOH),提供2-(5-氯嘧啶-4-基)-4-甲氧基-5-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]苯胺(150 mg, 39%)為棕色漿料。
步驟3 將2-(5-氯嘧啶-4-基)-4-甲氧基-5-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]苯胺(120 mg, 0.33 mmol)、三級丁氧化鉀(371 mg, 3.31 mmol)、與Brettphos G1 (34 mg, 0.04 mmol)在1,4-二烷(10 mL)中的混合物用N2 吹掃5分鐘。將所得混合物密封,並使其在90℃下攪拌45分鐘。將粗混合物冷卻至室溫並用水處理。在減壓下移除揮發物後,將殘餘物溶於DMSO (6 mL)中,通過一小塊矽藻土墊過濾,並藉由製備型HPLC純化(Prep-C18,Phenomenex Luna管柱,21.2 × 250 mm;含0至60% MeCN的水梯度洗提16 min期間,其中水含有0.1% HCl,流速:20 mL/min),提供標題化合物(1-[3-({8-甲氧基-5H-嘧啶并[5,4-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]吡咯啶(34 mg, 32%)。MS (ESI,正離子) m/z: 327.0.0 (M+1)。
實例19 3-{8-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基}-8-氧雜-3-氮雜雙環[3.2.1]辛烷如實例36步驟1至4所述製備標題化合物,但將(3S)-3-吡咯啶醇取代為8-氧雜-3-氮雜雙環[3.2.1]辛烷。MS (ESI,正離子) m/z: 437.1 (M+1)。
實例20 N-(2-乙氧基乙基)-8-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-胺
步驟1 在微波小瓶中將7-(苄氧基)-4-氯-1-氟-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚(600 mg, 1.68 mmol)、2-乙氧基乙胺(450 mg, 5.05 mmol)、及Hunig's鹼(0.29 mL, 1.68 mmol)在NMP (6 mL)中合併。在微波中將反應加熱至120℃達5小時。在減壓下濃縮並將所得殘餘物藉由矽膠管柱使用含0%至50%乙酸乙酯的己烷純化,得到7-(苄氧基)-4-氯-N-(2-乙氧基乙基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-胺(320 mg; 44%)。
步驟2 將二-三級丁基二碳酸酯(522 mg, 2.39 mmol)加入到含有7-(苄氧基)-4-氯-N-(2-乙氧基乙基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-胺(340 mg, 0.80 mmol)及DMAP (20 mg, 0.16 mmol)的乙腈(4 mL)溶液中。將反應加熱至45℃達1小時。濃縮並藉由矽膠管柱使用含0%至30%乙酸乙酯的己烷純化,得到三級丁基7-(苄氧基)-1-{[(三級丁氧基)羰基](2-乙氧基乙基)胺基}-4-氯-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(150 mg, 30%)。
步驟3 將三級丁基7-(苄氧基)-1-{[(三級丁氧基)羰基](2-乙氧基乙基)胺基}-4-氯-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(150 mg, 0.24 mmol)與10%wt碳載鈀(25 mg, 0.02 mmol)在甲醇(2.40 mL)中合併。在經由氣球的氫氣下攪拌1小時。通過矽藻土塞過濾並在減壓下濃縮,得到三級丁基1-{[(三級丁氧基)羰基](2-乙氧基乙基)胺基}-7-羥基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(120 mg, 99%)。
步驟4 將三級丁基1-{[(三級丁氧基)羰基](2-乙氧基乙基)胺基}-7-羥基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(120 mg, 0.24 mmol)、1-(3-氯丙基)吡咯啶鹽酸鹽(88 mg, 0.48 mmol)、與碳酸鉀(132 mg, 0.96 mmol)在DMF (2.4 mL)中合併。將反應加熱至100℃達16小時。用水稀釋反應。用乙酸乙酯洗滌水層。將有機物合併、用MgSO4 乾燥、過濾、並在減壓下濃縮。藉由製備型HPLC純化(Prep-C18,Phenomenex Luna管柱,21.2 × 250 mm;含0至60% MeCN的水梯度洗提16 min期間,其中水含有0.1% HCl,流速:20 mL/min),得到標題化合物(65 mg, 56%)。1 H NMR (400 MHz,甲醇-d 4 ) δ 7.91 (s, 1H), 7.67 (d,J = 7.0 Hz, 1H), 7.26 (s, 1H), 7.11 (d,J = 7.0 Hz, 1H), 4.28 (t,J = 5.5 Hz, 2H), 4.03 (s, 3H), 3.92 – 3.76 (m, 4H), 3.58 (q,J = 7.0 Hz, 2H), 3.50 (t,J = 7.0 Hz, 2H), 3.16 (dt,J = 10.0, 7.5 Hz, 2H), 2.34 (dq,J = 12.6, 6.5, 6.0 Hz, 2H), 2.26 – 2.14 (m, 2H), 2.13 – 1.98 (m, 2H), 1.16 (t,J = 7.0 Hz, 3H)。MS (ESI,正離子) m/z: 413.4 (M+1)。
實例21 1-[3-({8-甲氧基-1-丙基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]吡咯啶鹽酸鹽
步驟1 將裝有參考 8 步驟1的三級丁基7-(苄氧基)-1-環丙基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(1.77 g; 3.98 mmol; 1.00 eq.)與碳載鈀(0.88 g; 0.83 mmol; 0.21 eq.)在MeOH (60 mL)中的混合物的燒瓶用N2 吹掃10 min,隨後用經由氣球的氫氣吹掃22小時。將反應混合物通過一小塊矽藻土墊過濾並用MeOH沖洗。將有機溶液合併。在減壓下移除有機溶劑後,將所得殘餘物藉由急速層析法在矽膠管柱上以含0至100% EtOAc的己烷洗提純化,提供三級丁基7-羥基-8-甲氧基-1-丙基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯為白色固體(0.52 g)及三級丁基1-環丙基-7-羥基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯為白色固體(0.78)。
步驟2 向裝有三級丁基7-羥基-8-甲氧基-1-丙基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(44.00 mg; 0.14 mmol; 1.00 eq.)的小瓶加入含(三丁基亞磷基(tributylphosphoranylidene))乙腈(130.76 mg; 0.54 mmol)的CH2 Cl2 (0.5 mL)溶液。使混合物在60℃下攪拌,用N2 管線完全吹滅溶劑。向所得殘餘物加入含3-(吡咯啶-1-基)丙-1-醇(58.18 mg; 0.45 mmol; 1.50 eq.)的CH2 Cl2 (0.3 mL)。在N2 管線下移除溶劑後,將小瓶密封並使殘餘物在60℃下加熱1小時。將混合物藉由急速層析法在矽膠管柱上以含0至100%溶劑A(溶劑A:0.3% NH4 OH/10% MeOH/89.7% CH2 Cl2 )的CH2 Cl2 洗提純化,提供三級丁基8-甲氧基-1-丙基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯為無色固體(38 mg, 63%)。MS (ESI,正離子) m/z: 468.2 (M+1)。
步驟3 使三級丁基8-甲氧基-1-丙基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(38 mg, 0.08 mmol)在TFA (2.0 mL)中的混合物在90℃下攪拌20 min。使所得混合物冷卻至室溫,並將殘餘物藉由製備型HPLC純化(Waters XSelect CSH C18管柱,19 × 150 mm;含0至40% CH3 CN的水0.1%甲酸梯度洗提20 min期間,流速28 ml/min),提供標題化合物(11 mg, 28%)。1 H NMR (400 MHz, DMSO-d 6 ) δ 13.09 (s, 1H), 10.76 (s, 1H), 8.35 (d,J = 6.7 Hz, 1H), 7.78 (d,J = 6.7 Hz, 1H), 7.58 (s, 1H), 7.32 (s, 1H), 4.21 (t,J = 6.1 Hz, 2H), 3.91 (s, 3H), 3.58 – 3.44 (m, 4H), 3.27 (s, 2H), 3.00 (s, 2H), 2.23 (dq,J = 12.7, 6.4 Hz, 2H), 1.98 (d,J = 7.7 Hz, 2H), 1.87 (h,J = 7.2 Hz, 4H), 0.99 (t,J = 7.3 Hz, 3H)。MS (ESI,正離子) m/z: 368.1 (M+1)。
實例22 1-[3-({6-甲氧基-9H-嘧啶并[4,5-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]吡咯啶鹽酸鹽
步驟1 向1-(苄氧基)-4-溴-2-甲氧基-5-硝基苯(參考 1 )(2.0 g; 5.91 mmol; 1.00 eq.)、5-嘧啶基硼酸(1.1 mg; 8.87 mmol; 1.50 eq.)、Pd(dppf)2 Cl2 -CH2 Cl2 (483.00 mg; 0.59 mmol; 0.10 eq.)與碳酸銫(3.85 mg; 11.83 mmol; 2.00 eq.)在DMF (12 mL)的混合物加入飽和NaHCO3 水溶液(5 mL)。將混合物用N2 吹掃5 min、密封並使其在N2 下在120℃下攪拌30 min。使所得反應混合物冷卻至rt,用水稀釋並用25%i PrOH/氯仿萃取三次。將有機溶液合併。在減壓下移除揮發物後,將殘餘物藉由急速層析法在矽膠管柱上以含0至100%溶劑A(溶劑A:0.3% NH4 OH/10% MeOH/89.7% CH2 Cl2 )的CH2 Cl2 洗提純化,提供5-[4-(苄氧基)-5-甲氧基-2-硝基苯基]嘧啶(2.05 g)為無色漿料。MS (ESI,正離子) m/z: 338.2 (M+1)。
步驟2 向裝有5-[4-(苄氧基)-5-甲氧基-2-硝基苯基]嘧啶(1.20 g, 3.56 mmol, 1.00 eq.)的小瓶加入亞磷酸三乙酯(5 mL)。將該混合物密封並使其在120℃下攪拌30 h。在減壓下移除揮發物後,使殘餘物在25 g矽膠管柱上使用含0至100%溶劑A(溶劑A:0.3% NH4 OH/10% MeOH/89.7% CH2 Cl2 )的CH2 Cl2 進行純化,提供7-(苄氧基)-6-甲氧基-9H-嘧啶并[4,5-b]吲哚為棕色漿料(387 mg, 35%)。MS (ESI,正離子) m/z: 306.1 (M+1)。
步驟3 使7-(苄氧基)-6-甲氧基-9H-嘧啶并[4,5-b]吲哚(0.370 g, 1.21 mmol, 1.00 eq.)、二-三級丁基碳酸酯(310 mg, 1.82 mmol, 1.5 eq.)、N,N-二甲基吡啶-4-胺(145 mg, 1.21 mmol, 1.0 eq.)在CH2 Cl2 (4 mL)及Et3 N (1 mL)中的混合物在rt下攪拌12 hr。在減壓下移除揮發物後,使殘餘物在10 g矽膠管柱上使用含0至50%溶劑A(溶劑A:0.3% NH4 OH/10% MeOH/89.7% CH2 Cl2 )的CH2 Cl2 進行純化,提供三級丁基7-(苄氧基)-6-甲氧基-9H-嘧啶并[4,5-b]吲哚-9-羧酸酯為無色固體(284 mg, 58%)。MS (ESI,正離子) m/z: 306.0 (M-100+1)。
步驟4 將三級丁基7-(苄氧基)-6-甲氧基-9H-嘧啶并[4,5-b]吲哚-9-羧酸酯(283.00 mg; 0.70 mmol)及Pd/C (80 mg)在MeOH (10 mL)中的懸浮液分別用N2 隨後用H2 吹掃5 mins。使混合物在rt下攪拌3.0 h。將固體通過一小塊矽藻土墊濾出並用MeOH洗滌三次。將有機溶液合併。在減壓下移除揮發物,提供三級丁基7-羥基-6-甲氧基-9H-嘧啶并[4,5-b]吲哚-9-羧酸酯為粗固體(185 mg, 85%)。MS (ESI,正離子) m/z: 215.8 (M-100+1)。
步驟5 依照類似實例21所述的合成序列,自三級丁基7-羥基-6-甲氧基-9H-嘧啶并[4,5-b]吲哚-9-羧酸酯製備標題化合物。將粗產物用製備型HPLC純化(Prep-C18,Waters SunFire管柱,19 × 150 mm;含0至40% CH3 CN的水梯度洗提20 min期間,其中兩種溶劑均含有0.1% HCl),提供標題化合物。1 H NMR (400 MHz, DMSO-d 6 ) δ 13.53 (br, 1H), 10.85 (br, 1H), 9.60 (s, 1H), 9.18 (s, 1H), 8.01 (s, 1H), 7.21 (s, 1H), 4.21 (t,J = 6.1 Hz, 2H), 3.86 (s, 3H), 3.55 (m, 2H), 3.28 (m, 2H), 2.99 (dq,J = 10.3, 7.3 Hz, 2H), 2.23 (dq,J = 12.7, 6.3 Hz, 2H), 2.04 – 1.77 (m, 4H);MS (ESI,正離子) m/z: 326.8 (M+1)。
實例23 4-{8-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基}吡啶雙鹽酸鹽如實例24步驟1至4所述製備標題化合物,但將4-吡啶基硼酸取代為3-吡啶基硼酸。1 H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) δ 13.58 (s, 1H), 11.06 (s, 1H), 9.10 – 9.04 (m, 2H), 8.58 (d,J = 6.6 Hz, 1H), 8.16 – 8.10 (m, 2H), 8.01 (d,J = 6.6 Hz, 1H), 7.34 (s, 1H), 6.88 (s, 1H), 4.21 – 4.19 (m, 2H), 3.60 (s, 3H), 3.56 – 3.48 (m, 2H), 3.29 – 3.21 (m, 2H), 3.01 – 2.91 (m, 2H), 2.26 – 2.18 (m, 2H), 1.99 – 1.81 (m, 4H)。MS (ESI,正離子) m/z: 403.3 (M+1)。
實例24 3-{8-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基}吡啶雙鹽酸鹽
步驟1 將三級丁基7-(苄氧基)-1-氯-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(參考 5 )(0.10 g; 0.23 mmol; 1.00 eq.)及3-吡啶基硼酸(33.61 mg; 0.27 mmol; 1.20 eq.)懸浮於1,2-二甲氧基乙烷(3.5 mL)中。用氬氣吹掃混合物。下一步加入水(0.6 mL)及碳酸鈉溶液(0.46 mL; 2.50 mol/L; 1.14 mmol; 5.00 eq.)。然後加入四(三苯基磷烷)鈀(13.16 mg; 0.01 mmol; 0.05 eq.)並將反應容器密封並在100℃下的熱塊中攪拌。在6 h後,使反應冷卻,並發現其為約4:1的des Boc:N-Boc產物混合物。將反應混合物分配到乙酸乙酯、水及碳酸氫鈉溶液中。將相分離,將水相用乙酸乙酯多萃取2次,並將合併的有機相在硫酸鎂上乾燥。在蒸發後,將混合物藉由矽膠層析法純化(10至80%乙酸乙酯/二氯甲烷,然後0至10%甲醇/二氯甲烷),給出殘餘物三級丁基7-(苄氧基)-8-甲氧基-1-(吡啶-3-基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(40 mg, 14%),MS (ESI,正離子) m/z: 482.3 (M+1),及固體3-[7-(苄氧基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基]吡啶(210 mg, 85%)。MS (ESI,正離子) m/z: 482.3 (M+1)。
步驟2 將3-[7-(苄氧基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基]吡啶(0.21 g; 0.56 mmol; 1.00 eq.)懸浮於1,4-二烷(6 mL)中。加入Hunig's鹼(0.20 mL; 1.13 mmol; 2.00 eq.)、含二-三級丁基二碳酸酯(0.18 g; 0.85 mmol; 1.50 eq.)之1,4-二烷(1 mL)及N,N-二甲基胺基吡啶(6.89 mg; 0.06 mmol; 0.10 eq.),並將反應在30℃下攪拌16 h。然後將溶液分配到乙酸乙酯、水及碳酸氫鈉溶液中。將相分離。用乙酸乙酯萃取水相。將合併的有機相用氯化鈉溶液洗滌並在硫酸鎂上乾燥。在蒸發後,將殘餘物藉由矽膠層析法純化(10%至80%乙酸乙酯/二氯甲烷),給出三級丁基7-(苄氧基)-8-甲氧基-1-(吡啶-3-基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(266 mg, 98%)的膜。MS (ESI,正離子) m/z: 482.3 (M+1)。
步驟3 將三級丁基7-(苄氧基)-8-甲氧基-1-(吡啶-3-基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(308.00 mg; 0.64 mmol; 1.00 eq.)溶於乙醇(7 mL)中。小心加入10%碳載鈀(10.21 mg; 0.01 mmol; 0.01 eq.) (Aldrich 10%),然後用H2 氣球充填反應容器。在1.5 h後,加入更多碳載鈀(10.21 mg; 0.01 mmol; 0.01 eq.)並將反應攪拌14 h。在接下來的9 h中,再加入兩份碳載鈀(總共85 mg)並使反應再攪拌14 h。然後將混合物用氮氣吹掃、通過矽藻土過濾、用甲醇沖洗並蒸發至發泡殘餘物三級丁基7-羥基-8-甲氧基-1-(吡啶-3-基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(226 mg, 95%)。MS (ESI,正離子) m/z: 392.2 (M+1)。
步驟4 將三級丁基7-羥基-8-甲氧基-1-(吡啶-3-基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(226.00 mg; 0.58 mmol; 1.00 eq.)溶於N,N-二甲基甲醯胺(6 mL)中。加入1-(3-氯丙基)吡咯啶-1-鎓氯化物(159.45 mg; 0.87 mmol; 1.50 eq.)及碳酸鉀(278.88 mg; 2.02 mmol; 3.50 eq.),然後將反應在98℃的熱塊中攪拌。在13 h後,將混合物分配到乙酸乙酯、水及碳酸氫鈉溶液中。將相分離,將水相用乙酸乙酯多萃取3次,將合併的有機相用氯化鈉溶液洗滌並在硫酸鎂上乾燥。在蒸發後,將殘餘物溶於二氯甲烷(6 mL)中,並緩慢加入三氟乙酸(2.90 mL; 0.20 mol/L; 0.58 mmol; 1.00 eq.)。反應在1.5 h後蒸發至乾,然後加入甲苯(20 mL)。將殘餘物研磨,並且蒸發溶劑。將殘餘物藉由逆相層析法純化(Phenomenex Luna C18,21 × 250 mm,0至50%乙腈/0.1% HCl水溶液梯度10分鐘,流速28 ml/min),給出黃色固體的3-{8-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基}吡啶雙鹽酸鹽(102 mg, 37%)。1 H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) δ 15.46 (s, 1H), 13.56 (s, 1H), 11.07 (s, 1H), 9.19 (d,J = 2.2 Hz, 1H), 9.02 (dd,J = 5.0, 1.6 Hz, 1H), 8.60 (d,J = 6.7 Hz, 1H), 8.53 (dt,J = 8.0, 2.0 Hz, 1H), 8.02 (d,J = 6.6 Hz, 1H), 7.92 (dd,J = 7.9, 5.0 Hz, 1H), 7.37 (s, 1H), 6.83 (s, 1H), 4.23 (t,J = 6.2 Hz, 2H), 3.62 – 3.52 (m, 5H), 3.32 – 3.24 (m, 2H), 3.05 – 2.96 (m, 2H), 2.29 – 2.21 (m, 2H), 2.04 – 1.84 (m, 4H)。MS (ESI,正離子) m/z: 403.3 (M+1)。
實例25 2-{8-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基}吡啶雙鹽酸鹽
步驟1 將三級丁基7-(苄氧基)-1-氯-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(0.25 g; 0.57 mmol; 1.00 eq.)(中間物- )懸浮於1,4-二烷(7 mL)中。將混合物用氬氣吹掃。加入2-(三丁基錫烷基)吡啶(0.20 mL; 0.63 mmol; 1.10 eq.)然後加入四(三苯基磷烷)鈀(65.82 mg; 0.06 mmol; 0.10 eq.),並將反應密封且在105℃下的熱塊中攪拌。在3.5 h後,將反應冷卻並發現具有5:1 N-Boc產物與des-Boc產物的混合物。然後將反應通過矽藻土過濾、用乙酸乙酯沖洗並蒸發。將殘餘物藉由矽膠層析法純化(10至67%乙酸乙酯/二氯甲烷,然後0至10%甲醇/二氯甲烷),給出固體的三級丁基7-(苄氧基)-8-甲氧基-1-(吡啶-2-基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(約0.25 g)。MS (ESI,正離子) m/z: 482.2 (M+1)。
步驟2 將三級丁基7-(苄氧基)-8-甲氧基-1-(吡啶-2-基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(308.00 mg; 0.64 mmol; 1.00 eq.)懸浮於乙醇(7 mL)中。小心加入10%碳載鈀(10.21 mg; 0.01 mmol; 0.01 eq.) (Aldrich 10%),並用H2 氣球充填反應容器。在30 m後,加入更多碳載鈀(10.21 mg; 0.01 mmol; 0.01 eq.)並將反應攪拌14 h。在接下來的6 d中,再加入七份碳載鈀(總共485 mg)並將反應繼續攪拌21 h。然後將反應用氮氣吹掃、通過矽藻土過濾、用甲醇及乙醇沖洗、並蒸發。將粗製物藉由矽膠層析法純化(0至10%甲醇/二氯甲烷),分離過度還原的產物。將三級丁基7-羥基-8-甲氧基-1-(吡啶-2-基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(146 mg, 58%)單離為玻璃狀殘餘物。
步驟3 將三級丁基7-羥基-8-甲氧基-1-(吡啶-2-基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(146.00 mg; 0.37 mmol; 1.00 eq.)溶於N,N-二甲基甲醯胺(4 mL)中。加入1-(3-氯丙基)吡咯啶-1-鎓氯化物(103.01 mg; 0.56 mmol; 1.50 eq.)及碳酸鉀(180.16 mg; 1.31 mmol; 3.50 eq.),並將混合物在98℃的熱塊中攪拌。在5.5 h後,將反應冷卻並分配到乙酸乙酯、水及碳酸氫鈉溶液中。將相分離,將水相用乙酸乙酯多萃取3次,將合併的有機相用氯化鈉溶液洗滌並在硫酸鎂上乾燥。蒸發溶劑,並將殘餘物溶於二氯甲烷(4 mL)中。緩慢加入三氟乙酸(1.85 mL; 0.20 mol/L; 0.37 mmol; 0.99 eq.)並將溶液攪拌3 h。將反應蒸發至乾,然後加入甲苯(20 mL)。將殘餘物研磨、蒸發溶劑,然後藉由逆相層析法純化(Waters XSelect CSH C18管柱,19 × 250 mm,0至65%乙腈/0.1% HCl水溶液梯度10分鐘,流速28 ml/min),給出橘色固體的2-{8-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基}吡啶雙鹽酸鹽(77 mg, 43%)。1 H NMR (400 MHz, DMSO-d 6) δ 13.43 (s, 1H), 10.86 (s, 1H), 9.08 – 9.03 (m, 1H), 8.57 (d,J = 6.7 Hz, 1H), 8.32 – 8.23 (m, 2H), 8.03 (d,J = 6.6 Hz, 1H), 7.83 (ddd,J = 6.8, 4.8, 1.9 Hz, 1H), 7.46 (s, 1H), 7.36 (s, 1H), 4.25 (t,J = 6.2 Hz, 2H), 3.60 – 3.55 (m, 2H), 3.33 – 3.26 (m, 2H), 3.06 – 2.96 (m, 2H), 2.30 – 2.21 (m, 2H), 2.06 – 1.95 (m, 2H), 1.95 – 1.84 (m, 2H)。MS (ESI,正離子) m/z: 403.3 (M+1)。
實例26 1-[3-({6-甲氧基-5H-吡啶并[3,2-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]吡咯啶鹽酸鹽
實例27 1-[3-({8-甲氧基-5H-吡啶并[3,2-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]吡咯啶鹽酸鹽
步驟1 將4-溴-2-甲氧基苯酚(1.50 g, 7.39 mmol)、雙(頻哪醇根基)二硼(2.44 g, 9.6 mmol)、乙酸鉀(2.18 g, 22.2 mmol)、與含Pd(dppf)2 Cl2 .DCM (150.83 mg, 0.2 mmol)的1,4-二烷(8.0 mL)合併在微波小瓶中。將混合物在微波反應器中加熱至130℃達1小時。然後將混合物通過矽藻土塞過濾並在減壓下濃縮,得到2-甲氧基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧雜硼雜環戊-2-基)苯酚(1.84 g, 100%)為粗油狀物。
步驟2 將2-甲氧基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧雜硼雜環戊-2-基)苯酚(1.84 g, 8.1 mmol)、2-溴-3-硝基吡啶(1 65 g, 8.1 mmol)、乙酸鉀(2.18 g, 22.2 mmol)、與Pd(dppf)2 Cl2 .DCM (181.00 mg, 0.2 mmol)合併在微波小瓶中的DMF (8.0 mL)中。將混合物在微波反應器中加熱至130℃達30分鐘。將混合物通過矽藻土塞過濾,然後濃縮。將殘餘物藉由製備型HPLC純化(Prep-C18,Phenomenex Luna管柱,21.2 × 250 mm;含0至60% MeCN的水梯度洗提16 min期間,其中水含有0.1% HCl,流速:20 mL/min),得到2-甲氧基-4-(3-硝基吡啶-2-基)苯酚(0.40 g, 22%)為白色固體。
步驟3 將2-甲氧基-4-(3-硝基吡啶-2-基)苯酚(0.40 g, 1.6 mmol)、1-(3-氯丙基)吡咯啶鹽酸鹽(0.30 g, 1.6 mmol)與含碳酸鉀(0.68 g, 4.9 mmol)的DMF (10.0 mL)合併,然後加熱至100℃整夜。將混合物用水稀釋、用乙酸乙酯萃取、合併有機物、用MgSO4 乾燥、過濾、在減壓下濃縮,並藉由矽膠管柱使用含0%至10% MeOH的DCM純化,得到2-{3-甲氧基-4-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]苯基}-3-硝基吡啶(0.31 g, 53%)。
步驟4 將2-{3-甲氧基-4-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]苯基}-3-硝基吡啶(0.10 g, 0.3 mmol)與亞磷酸三乙酯(2.0 mL)合併。將混合物加熱至120℃達24小時。將混合物在減壓下濃縮並藉由製備型HPLC純化(Prep-C18,Phenomenex Luna管柱,21.2 × 250 mm;含0至60% MeCN的水梯度洗提16 min期間,其中水含有0.1% HCl,流速:20 mL/min)。較具極性的化合物為1-[3-({8-甲氧基-5H-吡啶并[3,2-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]吡咯啶(實例26,7.0 mg,7%),MS (ESI,正離子) m/z: 326.5 (M+1)。較不具極性的化合物為1-[3-({6-甲氧基-5H-吡啶并[3,2-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]吡咯啶(實例27,18.0 mg,17%),MS (ESI,正離子) m/z: 326.5 (M+1)。
實例28 1-[3-({6-甲氧基-9H-吡啶并[3,4-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]吡咯啶鹽酸鹽
步驟1 將1-(苄氧基)-4-溴-2-甲氧基-5-硝基苯(0.40 g, 1.2 mmol)、4-吡啶基硼酸(0.22 g; 1.8 mmol)、2M碳酸鉀(1.77 mL, 3.6 mmol)與Pd(dppf)2 Cl2 .DCM (24.2 mg, 0.03 mmol)合併在微波小瓶中的DMF (2.0 mL)中。將混合物在微波中在130℃下加熱30分鐘。將混合物通過矽藻土塞過濾。然後將混合物用水稀釋,並用乙酸乙酯萃取。將合併的有機物用MgSO4 乾燥、過濾、在減壓下濃縮,並藉由矽膠管柱使用含0%至50%乙酸乙酯的己烷純化,獲得4-[4-(苄氧基)-5-甲氧基-2-硝基苯基]吡啶(0.30 g; 75%)。MS (ESI,正離子) m/z: 337.2 (M+1)。
步驟2 將4-[4-(苄氧基)-5-甲氧基-2-硝基苯基]吡啶(0.3 g, 0.9 mmol)與亞磷酸三乙酯(2.0 mL)合併,並將所得混合物加熱至130℃達24小時。將反應冷卻至室溫,然後在減壓下濃縮並藉由矽膠管柱使用含0%至75%乙酸乙酯的己烷純化,得到7-(苄氧基)-6-甲氧基-9H-吡啶并[3,4-b]吲哚(110.00 mg, 41%)。MS (ESI,正離子) m/z: 305.2 (M+1)。
步驟3 將7-(苄氧基)-6-甲氧基-9H-吡啶并[3,4-b]吲哚(110 mg, 0.36 mmol)、DMAP (9 mg; 0.07 mmol)、與二-三級丁基二碳酸酯(95 mg, 0.43 mmol)合併在1,4-二烷(4.0 mL)中。將反應在室溫下攪拌1小時,然後在減壓下濃縮並藉由矽膠管柱使用含0%至45%乙酸乙酯的己烷純化,得到三級丁基7-(苄氧基)-6-甲氧基-9H-吡啶并[3,4-b]吲哚-9-羧酸酯(70.00 mg; 48%)。MS (ESI,正離子) m/z: 348.9 (M-56)。
步驟4 將三級丁基7-(苄氧基)-6-甲氧基-9H-吡啶并[3,4-b]吲哚-9-羧酸酯(70 mg, 0.17 mmol)與10%碳載鈀(18 mg, 0.02 mmol)合併在甲醇(2.0 mL)中。將混合物在室溫下在經由氣球的1 atm H2 下攪拌1小時。將混合物通過矽藻土塞過濾,然後濃縮得到三級丁基7-羥基-6-甲氧基-9H-吡啶并[3,4-b]吲哚-9-羧酸酯(54 mg, 99%)。MS (ESI,正離子) m/z: 258.9 (M-56)。
步驟5 將三級丁基7-羥基-6-甲氧基-9H-吡啶并[3,4-b]吲哚-9-羧酸酯(54 mg, 0.2 mmol)、1-(3-氯丙基)吡咯啶鹽酸鹽(47 mg, 0.3 mmol)、與碳酸鉀(71 mg, 0.5 mmol)合併在DMF (3.0 mL)中。將混合物加熱至100℃達16小時。將混合物用水稀釋,並用乙酸乙酯萃取。將合併的有機物用MgSO4 乾燥、過濾並濃縮得到粗產物。將所得粗製物用1M HCl (1.0 mL)處理、攪拌1小時、然後藉由製備型HPLC純化(Prep-C18,Phenomenex Luna管柱,21.2 × 250 mm;含0至60% MeCN的水梯度洗提16 min期間,其中水含有0.1% HCl,流速:20 mL/min),得到標題化合物(10 mg, 18%)。MS (ESI,正離子) m/z: 326.0 (M+1)。
實例29 1-[3-({8-甲氧基-1-甲基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]吡咯啶鹽酸鹽如以上實例28步驟1至5所述製備標題化合物,但將4-吡啶基硼酸取代為(2-甲基吡啶-3-基)硼酸。MS (ESI,正離子) m/z: 340.0 (M+1)。
實例30 1-[3-({6-甲氧基-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]吡咯啶鹽酸鹽
步驟1 將1-(苄氧基)-4-溴-2-甲氧基-5-硝基苯(0.62 g, 1.83 mmol)、3-吡啶基硼酸(0.34 g; 2.75 mmol)、Pd(dppf)2 Cl2 .DCM (37 mg; 0.05 mmol)與2M碳酸鉀(2.8 mL, 5.50 mmol)合併在微波小瓶中的DMF (2.00 mL)中。將反應在微波中加熱至130℃達30分鐘。將混合物用乙酸乙酯稀釋反應,並通過矽藻土塞過濾。然後加入水,並將層分離。用乙酸乙酯洗滌水層。將合併的有機物用MgSO4 乾燥、過濾、濃縮,並藉由矽膠使用含0%至50%乙酸乙酯的己烷純化,得到3-(4-(苄氧基)-5-甲氧基-2-硝基苯基)吡啶(0.31 g; 50%)為深色油狀物。MS (ESI,正離子) m/z: 337.0 (M+1)。
步驟2 將3-(4-(苄氧基)-5-甲氧基-2-硝基苯基)吡啶(0.31 g, 0.91 mmol)合併在TFA中達16小時。將混合物在減壓下濃縮並藉由矽石管柱使用含0%至80%乙酸乙酯的己烷純化,得到2-甲氧基-5-硝基-4-(吡啶-3-基)苯酚(0.1 g, 45%)。
步驟3 將2-甲氧基-5-硝基-4-(吡啶-3-基)苯酚(0.1 g, 0.41 mmol)、1-(3-氯丙基)吡咯啶鹽酸鹽(92 mg, 0.61 mmol)、與碳酸鉀(0.17 g, 1.22 mmol)合併在DMF (2.0 mL)中。將混合物加熱至100℃達18小時,然後冷卻至室溫。將水加入到混合物中,然後用乙酸乙酯萃取混合物。將合併的有機物用MgSO4 乾燥、過濾、濃縮,並藉由矽膠管柱使用含0%至10% MeOH的DCM純化,得到3-{5-甲氧基-2-硝基-4-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]苯基}吡啶(0.1 g, 69%)。MS (ESI,正離子) m/z: 358.1 (M+1)。
步驟4 將3-{5-甲氧基-2-硝基-4-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]苯基}吡啶(0.1 g, 0.28 mmol)與亞磷酸三乙酯(2.0 mL)合併。將混合物加熱至120℃達24小時。然後將混合物在減壓下濃縮並藉由製備型HPLC純化(Prep-C18,Phenomenex Luna管柱,21.2 × 250 mm;含0至60% MeCN的水梯度洗提16 min期間,其中水含有0.1% HCl,流速:20 mL/min),得到標題化合物(18.0 mg; 10%),MS (ESI,正離子) m/z: 326.0 (M+1)。
實例31 1-[3-({8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]吡咯啶鹽酸鹽將三級丁基7-羥基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(參考 7 )(300 mg; 0.95 mmol; 1.00 eq.)、1-(3-氯丙基)吡咯啶鹽酸鹽(262 mg; 1.43 mmol; 1.50 eq.)與碳酸鉀(395 mg; 2.86 mmol; 3.00 eq.)合併在DMF (5 mL)中。將反應加熱至100℃達16小時,然後冷卻至rt。將混合物通過矽藻土塞過濾並濃縮。加入1M HCl (5 mL),並將混合物加熱至50℃達1小時。將混合物在減壓下濃縮。將所得殘餘物藉由製備型HPLC純化(Prep-C18,Phenomenex Luna管柱,21.2 × 250 mm;含0至60% MeCN的水梯度洗提16 min期間,其中水含有0.1% HCl,流速:20 mL/min),得到標題化合物(90 mg; 24%)。1 H NMR (400 MHz,甲醇-d 4 ) δ 9.43 (d,J = 0.8 Hz, 1H), 8.42 (dd,J = 6.8, 0.9 Hz, 1H), 7.95 (s, 1H), 7.88 (dd,J = 6.8, 0.7 Hz, 1H), 7.33 (s, 1H), 4.32 (t,J = 5.5 Hz, 2H), 4.00 (s, 3H), 3.89 – 3.77 (m, 2H), 3.50 (t,J = 7.1 Hz, 2H), 3.16 (ddt,J = 10.9, 8.3, 4.6 Hz, 2H), 2.35 (ddd,J = 12.7, 6.9, 5.3 Hz, 2H), 2.27 – 2.15 (m, 2H), 2.14 – 1.98 (m, 2H)。MS (ESI,正離子) m/z: 326.2 (M+1)。
實例32 8-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-3-胺鹽酸鹽
實例33 6-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-2-胺鹽酸鹽
步驟1 將5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧雜硼雜環戊-2-基)-2-吡啶基胺(0.3 g, 1.36 mmol)、1-[3-(4-溴-2-甲氧基-5-硝基苯氧基)丙基]吡咯啶(0.5 g, 1.36 mmol)、Pd(dppf)2 Cl2 .DCM (33 mg, 0.04 mmol)、及2M碳酸鉀(1.4 mL, 2.73 mmol)合併在微波小瓶中的DMF (2.7 mL)中。將反應在微波中加熱至120℃達1小時。將混合物用水稀釋。用乙酸乙酯洗滌水層。將合併的有機物用MgSO4 乾燥、過濾、濃縮,並藉由矽膠管柱使用含0%至10% MeOH的DCM純化,得到5-{5-甲氧基-2-硝基-4-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]苯基}吡啶-2-胺(0.33 g, 65%)為棕色油狀物。MS (ESI,正離子) m/z: 373.2 (M+1)。
步驟2 將5-{5-甲氧基-2-硝基-4-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]苯基}吡啶-2-胺(180.00 mg; 0.48 mmol; 1.00 eq.)、二-三級丁基二碳酸酯(316.45 mg; 1.45 mmol; 3.00 eq.)、與N,N-二甲基胺基吡啶(11.81 mg; 0.10 mmol; 0.20 eq.)合併在乙腈(4.83 mL)中。將反應加熱至50℃達1小時,然後冷卻至室溫。將混合物在減壓下濃縮,然後藉由矽膠管柱使用含0%至10% MeOH的DCM純化,得到三級丁基N-[(三級丁氧基)羰基]-N-(5-{5-甲氧基-2-硝基-4-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]苯基}吡啶-2-基)胺甲酸酯(0.16 g, 57%)。
步驟3 將三級丁基N-[(三級丁氧基)羰基]-N-(5-{5-甲氧基-2-硝基-4-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]苯基}吡啶-2-基)胺甲酸酯(0.16 g, 0.28 mmol)與亞磷酸三乙酯(3.0 mL)合併。將混合物加熱至120℃達24小時,然後冷卻至室溫。將混合物在減壓下濃縮,並將1M HCl (3 mL)加入到所得殘餘物。將水層加熱至50℃達1小時,然後藉由製備型HPLC純化(Prep-C18,Phenomenex Luna管柱,21.2 × 250 mm;含0至60% MeCN的水梯度洗提16 min期間,其中水含有0.1% HCl,流速:20 mL/min),得到較具極性的產物8-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-3-胺鹽酸鹽(實例32,20.0 mg,21%),1 H NMR (400 MHz,甲醇-d 4 ) δ 8.54 (s, 1H), 7.68 (s, 1H), 7.07 (s, 1H), 6.67 (s, 1H), 4.25 (t,J = 5.5 Hz, 2H), 3.94 (s, 3H), 3.81 (s, 2H), 3.48 (d,J = 7.0 Hz, 2H), 3.14 (s, 2H), 2.36 – 2.25 (m, 2H), 2.20 (s, 2H), 2.06 (s, 2H),MS (ESI,正離子) m/z: 341.4 (M+1),及較不具極性的產物6-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-9H-吡啶并[2,3-b]吲哚-2-胺鹽酸鹽(實例33,9.0 mgs,9%),1 H NMR (400 MHz,甲醇-d 4 ) δ 8.40 (d,J = 8.7 Hz, 1H), 7.57 (s, 1H), 7.15 (s, 1H), 6.58 (d,J = 8.8 Hz, 1H), 4.23 (t,J = 5.5 Hz, 2H), 3.94 (s, 3H), 3.88 – 3.75 (m, 2H), 3.48 (t,J = 7.0 Hz, 2H), 3.21 – 3.07 (m, 2H), 2.34 – 2.24 (m, 2H), 2.19 (dq,J = 11.0, 6.2, 4.5 Hz, 2H), 2.08 (ddt,J = 13.9, 10.9, 4.7 Hz, 2H),MS (ESI,正離子) m/z: 340.9 (M+1)。
實例34 1-[3-({1-氟-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]吡咯啶鹽酸鹽如以上實例7步驟1至3所述製備標題化合物,但將5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧雜硼雜環戊-2-基)-2-吡啶基胺取代為(2-氟吡啶-3-基)硼酸。MS (ESI,正離子) m/z: 344.0 (M+1)。
實例35 8-甲氧基-1-甲基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-3-胺鹽酸鹽
步驟1 將5-溴-6-甲基吡啶-2-胺(1.1 g, 5.88 mmol)、二-三級丁基二碳酸酯(2.6 g, 11.76 mmol)、與DMAP (0.14 g, 1.18 mmol)合併在THF (20.0 mL)中,並將反應加熱至50℃達1小時。將混合物在減壓下濃縮,然後將所得殘餘物藉由矽膠使用含0%至30%乙酸乙酯的己烷純化,得到三級丁基N-(5-溴-6-甲基吡啶-2-基)-N-[(三級丁氧基)羰基]胺甲酸酯(2.1 g, 92%)。1 H NMR (400 MHz,乙腈-d3 ) δ 7.93 (d, J= 8.4 Hz, 1H), 7.10 (dd, J= 8.4, 0.7 Hz, 1H), 2.57 (s, 3H), 1.44 (s, 18H)。
步驟2 將三級丁基N-(5-溴-6-甲基吡啶-2-基)-N-[(三級丁氧基)羰基]胺甲酸酯(1.4 g, 3.62 mmol)、雙(頻哪醇根基)二硼(1.4 g, 5.42 mmol)、Pd(dppf)2 Cl2 .DCM (74 mg, 0.09 mmol)、與碳酸鉀(2.0 g, 14.46 mmol)合併在微波小瓶中的1,4-二烷(12.0 mL)中。將反應在微波中在130℃下加熱7小時。將混合物用水稀釋。用乙酸乙酯洗滌水層。將合併的有機物用MgSO4 乾燥、過濾、在減壓下濃縮,並藉由矽膠管柱使用含0%至50%乙酸乙酯的己烷純化,得到三級丁基N-[(三級丁氧基)羰基]-N-[6-甲基-5-(四甲基-1,3,2-二氧雜硼雜環戊-2-基)吡啶-2-基]胺甲酸酯(1.5 g, 95%)。1 H NMR (400 MHz,乙腈-d3 ) δ 8.00 (d, J= 8.4 Hz, 1H), 7.17 (dd, J= 8.4, 0.7 Hz, 1H), 2.62 (s, 3H), 1.45 (s, 18H), 1.35 (s, 12H)。
步驟3 將三級丁基N-[(三級丁氧基)羰基]-N-[6-甲基-5-(四甲基-1,3,2-二氧雜硼雜環戊-2-基)吡啶-2-基]胺甲酸酯(0.40 g, 0.92 mmol)、1-[3-(4-溴-2-甲氧基-5-硝基苯氧基)丙基]吡咯啶(0.33 g, 0.92 mmol)、Pd(dppf)2 Cl2 .DCM (23 mg, 0.03 mmol)與2M碳酸鉀(0.90 mL, 1.84 mmol)合併在微波小瓶中的NMP (2.5 mL)中。將反應在微波中加熱至130℃達30分鐘。將反應用水稀釋。用乙酸乙酯洗滌水層。將合併的有機物用MgSO4 乾燥、過濾、在減壓下濃縮,並藉由矽膠管柱使用含0%至10% MeOH的DCM純化,得到三級丁基N-[(三級丁氧基)羰基]-N-(5-{5-甲氧基-2-硝基-4-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]苯基}-6-甲基吡啶-2-基)胺甲酸酯(0.35 g, 65%)。MS (ESI,正離子) m/z: 587.6 (M+1)。
步驟4 將三級丁基N-[(三級丁氧基)羰基]-N-(5-{5-甲氧基-2-硝基-4-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]苯基}-6-甲基吡啶-2-基)胺甲酸酯(0.35 g, 0.60 mmol)與亞磷酸三乙酯(6 mL)合併,然後將反應加熱至120℃達24小時。將混合物在減壓下濃縮。加入1M HCl (3.00 mL)溶液。將混合物攪拌3小時,然後藉由製備型HPLC純化(Prep-C18,Phenomenex Luna管柱,21.2 × 250 mm;含0至60% MeCN的水梯度洗提16 min期間,其中水含有0.1% HCl,流速:20 mL/min),得到標題化合物(8 mg, 4%)。MS (ESI,正離子) m/z: 355.0 (M+1)。
實例36 (3S)-1-{8-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基}吡咯啶-3-醇鹽酸鹽
步驟1 將Brettphos G1 (25 mg, 0.03 mmol)加入到微波小瓶中含有三級丁基7-(苄氧基)-1-氯-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(270 mg, 0.62 mmol)、(3S)-3-吡咯啶醇(161 mg, 1.85 mmol)、及三級丁氧化鉀(207 mg, 1.85 mmol)的NMP (6.0 mL)溶液中。將反應在微波中加熱至140℃達1.5小時。將反應用水稀釋。用乙酸乙酯洗滌水層。將合併的有機物用MgSO4 乾燥、過濾、並在減壓下濃縮。將所得殘餘物藉由矽膠管柱使用含0%至80%乙酸乙酯的己烷純化,得到(3S)-1-[7-(苄氧基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基]吡咯啶-3-醇(239 mg, 99%)。MS (ESI,正離子) m/z: 390.3 (M+1)。
步驟2 將(3S)-1-[7-(苄氧基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基]吡咯啶-3-醇(239 mg, 0.62 mmol)、二-三級丁基二碳酸酯(269 mg, 1.23 mmol)、DMAP (15 mg, 0.12 mmol)、與Hunig's鹼(0.21 mL, 1.23 mmol)合併在乙腈(3 mL)中。將混合物在室溫下攪拌2小時。然後將混合物在減壓下濃縮並藉由矽膠管柱使用含0%至30%乙酸乙酯的己烷純化,得到三級丁基7-(苄氧基)-1-[(3S)-3-{[(三級丁氧基)羰基]氧基}吡咯啶-1-基]-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(363 mg, 99%)。MS (ESI,正離子) m/z: 590.4 (M+1)。
步驟3 將三級丁基7-(苄氧基)-1-[(3S)-3-{[(三級丁氧基)羰基]氧基}吡咯啶-1-基]-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(363.00 mg, 0.62 mmol)、與10%wt碳載鈀(33 mg, 0.03 mmol)合併在甲醇(10 mL)中。將反應在經由氣球的氫氣壓力下攪拌1小時。將混合物通過矽藻土塞過濾,然後在減壓下濃縮得到三級丁基1-[(3S)-3-{[(三級丁氧基)羰基]氧基}吡咯啶-1-基]-7-羥基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(300 mg, 97%)。MS (ESI,正離子) m/z: 500.4 (M+1)。
步驟4 將三級丁基1-[(3S)-3-{[(三級丁氧基)羰基]氧基}吡咯啶-1-基]-7-羥基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(300 mg, 0.60 mmol)、1-(3-氯丙基)吡咯啶鹽酸鹽(240 mg, 1.20 mol)與碳酸鉀(331 mg, 2.40 mol)合併在DMF (6 mL)中。將反應加熱至100℃達16小時,然後冷卻至室溫。過濾混合物,然後在減壓下濃縮。加入1M HCl (5 mL),然後將混合物加熱至50℃達1小時。將混合物藉由製備型HPLC純化(Prep-C18,Phenomenex Luna管柱,21.2 × 250 mm;含0至60% MeCN的水梯度洗提16 min期間,其中水含有0.1% HCl,流速:20 mL/min),得到標題化合物(110 mg, 38%)。1 H NMR (400 MHz,甲醇-d 4 ) δ 7.67 (d,J = 6.9 Hz, 1H), 7.63 (s, 1H), 7.22 (s, 1H), 7.14 (d,J = 6.9 Hz, 1H), 4.68 (dq,J = 5.3, 3.1, 2.4 Hz, 1H), 4.28 (t,J = 5.6 Hz, 2H), 4.22 – 4.08 (m, 2H), 3.97 (s, 3H), 3.94 – 3.75 (m, 4H), 3.50 (t,J = 7.1 Hz, 2H), 3.22 – 3.08 (m, 2H), 2.33 (tt,J = 12.0, 5.1 Hz, 3H), 2.20 (qt,J = 11.0, 4.5 Hz, 3H), 2.07 (td,J = 7.3, 3.8 Hz, 2H)。MS (ESI,正離子) m/z: 411.5 (M+1)。
實例37 (3R)-1-{8-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基}吡咯啶-3-醇如以上實例36步驟1至4所述製備標題化合物,但將(3S)-3-吡咯啶醇取代為(3R)-3-吡咯啶醇。1 H NMR (400 MHz,甲醇-d 4 ) δ 7.68 (d,J = 6.9 Hz, 1H), 7.65 (s, 1H), 7.24 (s, 1H), 7.15 (d,J = 6.9 Hz, 1H), 4.68 (m, 1H), 4.28 (t,J = 5.5 Hz, 2H), 4.22 – 4.08 (m, 2H), 3.97 (s, 3H), 3.95 – 3.76 (m, 4H), 3.49 (t,J = 7.0 Hz, 2H), 3.22 – 3.09 (m, 2H), 2.33 (h,J = 5.3, 4.5 Hz, 3H), 2.21 (q,J = 7.5, 6.9 Hz, 3H), 2.07 (dt,J = 12.9, 9.1 Hz, 2H)。MS (ESI,正離子) m/z: 411.0 (M+1)。
實例38 8-甲氧基-N-[(2S)-1-甲氧基丙烷-2-基]-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-胺如以上實例36步驟1至4所述製備標題化合物,但將(3S)-3-吡咯啶醇取代為(2S)-1-甲氧基丙烷-2-胺。MS (ESI,正離子) m/z: 413.1 (M+1)。
實例39 1-{8-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基}吡咯啶如以上實例36步驟1至4所述製備標題化合物,但修改步驟1如下。MS (ESI,正離子) m/z: 395.0 (M+1)。(步驟1-不使用Brettphos G1。將原本的胺、鹼、及溶劑用吡咯啶、三乙胺及無溶劑取代。將反應加熱至120℃達3小時。)
實例40 1-{8-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基}哌啶-4-醇如以上實例36步驟1至4所述製備標題化合物,但修改步驟1如下。MS (ESI,正離子) m/z: 425.0 (M+1)。(步驟1-不使用Brettphos G1。將原本的胺、鹼、及溶劑用4-羥基哌啶、碳酸鉀及DMSO取代。將應加熱至160℃達48小時。)
實例41 4-{8-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基}嗎啉如以上實例36步驟1至4所述製備標題化合物,但修改步驟1如下。MS (ESI,正離子) m/z: 411.0 (M+1)。(步驟1-不使用Brettphos G1。將原本的胺、鹼、及溶劑用嗎啉、碳酸鉀及DMSO取代。將反應加熱至120℃達3小時。)
實例42 1-{8-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基}吖呾-3-醇如以上實例36步驟1至4所述製備標題化合物,但將(3S)-3-吡咯啶醇取代為3-羥基吖呾。MS (ESI,正離子) m/z: 397.0.0 (M+1)。
實例43 1-[3-({1-環丙基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]吡咯啶如以上實例35步驟1至4所述製備標題化合物,但修改步驟1如下。MS (ESI,正離子) m/z: 366.0.0 (M+1)。
步驟1 將三級丁基7-(苄氧基)-1-氯-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(100 mg, 0.23 mmol)、環丙基硼酸(69 mg, 0.80 mmol)、三環己基磷烷(6 mg, 0.02 mmol)、與磷酸三鉀(97 mg, 0.46 mmol)在甲苯(1.1 mL)及水(0.06 mL)中的混合物用氮噴氣10分鐘。然後加入乙酸鈀(5.1 mg; 0.02 mmol),並將密封小瓶加熱至100℃達5小時。將混合物用乙酸乙酯稀釋並用水及鹽水洗滌。將有機層在MgSO4 上乾燥、過濾並在減壓下濃縮。將所得殘餘物藉由矽膠管柱以含0%至60%乙酸乙酯的己烷洗提純化,獲得三級丁基7-(苄氧基)-1-環丙基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(90 mg, 88%)為灰白色固體。
實例44 1-[3-({8-甲氧基-5H-嘧啶并[5,4-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]吡咯啶
步驟1 將1-{3-[2-甲氧基-5-硝基-4-(四甲基-1,3,2-二氧雜硼雜環戊-2-基)苯氧基]丙基}吡咯啶(500 mg, 1.23 mmol)、4,5-二氯嘧啶(220 mg, 1.48 mmol)、Pd(amphos)Cl2 (59 mg, 0.08 mmol)與2M碳酸鈉(1.23 mL, 2.46 mmol)合併在1,4-二烷(5 mL)中。將混合物用N2 吹掃6 min、密封並在90℃下持續攪拌45分鐘。將混合物冷卻至室溫、用水稀釋並用乙酸乙酯萃取。將合併的有機層用水洗滌。在減壓下移除有機溶劑後,將殘餘物藉由急速層析法在矽膠管柱上以含0至100%溶劑A的CH2 Cl2 洗提純化(溶劑A:0.2% NH4 OH/10% MeOH/88.9% CH2 Cl2 ),提供標題化合物為棕色固體(422 mg, 87%)。MS (ESI,正離子) m/z: 393.0 (M+1)。
步驟2 將5-氯-4-{5-甲氧基-2-硝基-4-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]苯基}嘧啶(420 mg, 1.07 mmol)在乙酸乙酯(5 mL)中的混合物加入到裝有無水SnCl2 (439 mg, 2.3 mmol)的小瓶中。使該混合物在95℃下持續攪拌2小時。加入額外的無水SnCl2 (200 mg, 1.04 mmol)及乙酸乙酯(2.5 mL)。將混合物密封,並使其在65°下攪拌24小時。將粗溶液冷卻至室溫、用水處理然後用20% NaOH水溶液處理。將混合物用25%i PrOH/75%氯仿的溶劑混合物萃取(3x)。在減壓下移除有機溶劑後,將殘餘物藉由急速層析法在矽膠管柱上以含0至100%溶劑A的溶劑B洗提純化(溶劑A:0.2% NH4 OH/10% MeOH/88.9% CH2 Cl2 ;溶劑B:1% NH4 OH/99% MeOH),提供2-(5-氯嘧啶-4-基)-4-甲氧基-5-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]苯胺(150 mg, 39%)為棕色漿料。MS (ESI,正離子) m/z: 363.0.0 (M+1)。
步驟3 將2-(5-氯嘧啶-4-基)-4-甲氧基-5-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]苯胺(120 mg, 0.33 mmol)、三級丁氧化鉀(371 mg, 3.31 mmol)與Brettphos G1 (34 mg, 0.04 mmol)在1,4-二烷(10 mL)中的混合物用N2 吹掃5分鐘。將混合物密封,並使其在90℃下攪拌45分鐘。將粗混合物冷卻至室溫並用水處理。在減壓下移除揮發物後,將殘餘物溶於DMSO (6 mL)中,並通過一小塊矽藻土墊過濾,並藉由製備型HPLC純化(Prep-C18,Phenomenex Luna管柱,21.2 × 250 mm;含0至60% MeCN的水梯度洗提16 min期間,其中水含有0.1% HCl,流速:20 mL/min),提供標題化合物(34 mg, 32%)。MS (ESI,正離子) m/z: 327.0.0 (M+1)。
實例45 乙基[3-({8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]甲胺鹽酸鹽
步驟1 將三級丁基7-羥基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(200.00 mg; 0.64 mmol; 1.00 eq.)、(3-氯丙基)(乙基)甲胺鹽酸鹽(164.25 mg; 0.95 mmol; 1.50 eq.)、與碳酸鉀(439.02 mg; 3.18 mmol; 5.00 eq.)在N,N-二甲基甲醯胺(4.00 mL)中的混合物加熱至100℃達90分鐘。將反應混合物冷卻至RT並通過矽藻土塞過濾。將濾液在減壓下濃縮,給出粗製三級丁基7-(3-(乙基(甲基)胺基)丙氧基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯,MS (ESI,正離子) m/z: 415.0 (M+1),其亦含有一些得自保護基喪失的副產物,MS (ESI,正離子) m/z: 315.0 (M+1)。將粗混合物不純化用於下一步驟。
步驟2 將氯化氫(4.84 mL)的3M溶液加入到含有粗製三級丁基7-{3-[乙基(甲基)胺基]丙氧基}-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(150.00 mg; 0.36 mmol; 1.00 eq.)的燒瓶中並使反應混合物在RT下持續攪拌整夜。將溶劑在真空下移除並將殘餘物溶於1 mL水中,且用NaHCO3的飽和溶液處理直到中性pH。將溶劑在真空下移除並將產物溶於DMSO中,並藉由製備型HPLC製備型HPLC純化(Prep-C18,Phenomenex Luna管柱,21.2 × 250 mm;含0至30% MeCN的水梯度洗提16 min期間,其中水含有0.1% HCl,流速:20 mL/min),得到標題化合物N-乙基-3-((8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基)氧基)-N-甲基丙烷-1-胺鹽酸鹽(42 mg, 30%)。1 H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 14.79 (s, 1H), 12.96 (s, 1H), 10.08 (s, 1H), 9.57 (s, 1H), 8.51 (d,J = 6.7 Hz, 1H), 8.05 (s, 1H), 7.90 (d,J = 6.7 Hz, 1H), 7.29 (s, 1H), 4.19 (t,J = 6.1 Hz, 2H), 3.88 (s, 3H), 3.13 (dddd,J = 33.3, 13.0, 8.0, 6.5 Hz, 4H), 2.75 (d,J = 4.9 Hz, 3H), 2.21 (t,J = 7.4 Hz, 2H), 1.23 (t,J = 7.2 Hz, 3H)。MS (ESI,正離子) m/z: 314.3 (M+1)。
實例46 [3-({1-環丙基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)丙基](乙基)甲胺鹽酸鹽
步驟1 將三級丁基1-環丙基-7-羥基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(105.00 mg; 0.30 mmol; 1.00 eq.)、(3-氯丙基)(乙基)甲胺鹽酸鹽(76.48 mg; 0.44 mmol; 1.50 eq.)、與碳酸鉀(204.43 mg; 1.48 mmol; 5.00 eq.)在N,N-二甲基甲醯胺(2.10 mL)中的混合物加熱至100℃達16小時。將反應混合物冷卻至RT、通過矽藻土塞過濾並在減壓下濃縮。粗製物為三級丁基1-環丙基-7-(3-(乙基(甲基)胺基)丙氧基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯的混合物,MS (ESI,正離子) m/z: 454.4 (M+1),其亦含有一些得自保護基喪失的副產物,MS (ESI,正離子) m/z: 353.8 (M+1)。將粗混合物不純化用於下一步驟。
步驟2 將氯化氫(4.84 mL)的3M溶液加入到含有粗製三級丁基1-環丙基-7-(3-(乙基(甲基)胺基)丙氧基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(150.00 mg; 0.36 mmol; 1.00 eq.)的燒瓶中並使反應混合物在RT下持續攪拌整夜。將溶劑在真空下移除並將殘餘物溶於1 mL水中,且用NaHCO3的飽和溶液處理直到中性pH。將溶劑在真空下移除並將產物溶於DMSO中,並藉由製備型HPLC製備型HPLC純化(Prep-C18,Phenomenex Luna管柱,21.2 × 250 mm;含0至30% MeCN的水梯度洗提16 min期間,其中水含有0.1% HCl,流速:20 mL/min),得到標題化合物(12 mg, 10%)。1 H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 14.03 (s, 1H), 13.03 (s, 1H), 10.37 – 10.14 (m, 1H), 8.21 (dd, J = 6.7, 4.4 Hz, 1H), 7.85 (s, 1H), 7.74 (d, J = 6.7 Hz, 1H), 7.33 (s, 1H), 4.20 (t, J = 6.1 Hz, 2H), 3.91 (s, 3H), 3.22 – 2.97 (m, 5H), 2.74 (d, J = 4.9 Hz, 3H), 2.23 (p, J = 6.7 Hz, 2H), 1.43 (dt, J = 8.3, 3.2 Hz, 2H), 1.37 – 1.31 (m, 2H), 1.23 (t, J = 7.2 Hz, 3H)。MS (ESI,正離子) m/z: 353.8 (M+1)。
實例47 [3-({1-環丙基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]二甲胺鹽酸鹽
步驟1 使三級丁基1-環丙基-7-羥基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(288.00 mg; 0.81 mmol; 1.00 eq.)、N-(3-氯丙基)-N,N-二甲胺鹽酸鹽(138.35 mg; 1.14 mmol; 1.40 eq.)與K2 CO3 ((280.36 mg; 2.03 mmol; 2.50 eq.)在DMF (22 mL)中的混合物在100℃下攪拌6 h。然後將混合物冷卻至rt、用水稀釋並用iPrOH/CHCl3 (1/3)萃取兩次。然後將合併的有機相用水(30 mL)、鹽水(20 mL)洗滌,在Na2 SO4 上乾燥。在減壓下移除有機揮發物後,將三級丁基1-環丙基-7-[3-(二甲基胺基)丙氧基]-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯的剩餘粗產物用於進行下一步驟。
步驟2 使含上述粗產物三級丁基1-環丙基-7-[3-(二甲基胺基)丙氧基]-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯的TFA (2.5 mL)溶液在90℃下攪拌20 min。使所得混合物冷卻至rt並使殘餘物進行(Waters XSelect CSH C18管柱,19 × 150 mm,含0至40% CH3 CN的水梯度洗提20 min期間,流速28 ml/min),提供標題化合物為TFA鹽固體(107 mg,31%,二步驟)。1 H NMR (400 MHz,甲醇-d 4 ) δ 8.18 (d,J = 6.8 Hz, 1H), 7.93 (s, 1H), 7.73 (d,J = 6.8 Hz, 1H), 7.36 (s, 1H), 4.33 (t,J = 5.6 Hz, 2H), 4.03 (s, 3H), 3.45 (t,J = 7.2 Hz, 2H), 3.01 (s, 6H), 3.02 – 2.91 (m, 1H), 2.41 – 2.30 (m, 2H), 1.61 – 1.49 (m, 2H), 1.35 – 1.23 (m, 2H)。MS (ESI,正離子) m/z: 340.2 (M+1)。
實例48 4-{7-[3-(二甲基胺基)丙氧基]-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基}-2-甲基丁-3-炔-2-醇鹽酸鹽
步驟1 依照所述的合成序列(實例47,步驟1),將三級丁基1-氯-7-羥基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯轉換成三級丁基1-氯-7-[3-(二甲基胺基)丙氧基]-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯。
步驟2 將2-甲基-3-丁炔-2-醇(146 mg; 1.75 mmol; 6.00 eq.)、碘化銅(12 mg; 0.05 mmol; 0.22 eq.)、四(三苯基膦)鈀(99 mg; 0.10 mmol; 0.30 eq.)與三級丁基1-氯-7-[3-(二甲基胺基)丙氧基]-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(125 mg; 0.06 mmol; 1.00 eq.)在DMF/Et3 N (1.2 mL/0.5 mL)中的混合物用N2 吹掃5 min。將反應小瓶密封並使其在95℃下攪拌90分鐘。使所得混合物冷卻至rt、用水稀釋、並用20%i PrOH/氯仿萃取三次。將合併的有機層在減壓下濃縮,並將剩餘的殘餘物藉由急速層析法在10g矽膠管柱上以含0至100%溶劑A(溶劑A:0.3% NH4 OH/10% MeOH/89.7% CH2 Cl2 )的CH2 Cl2 洗提純化,提供三級丁基7-[3-(二甲基胺基)丙氧基]-1-(3-羥基-3-甲基丁-1-炔-1-基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯為棕色漿料(55 mg, 42%)。
步驟3 依照所述的合成序列(實例47步驟2),自三級丁基7-[3-(二甲基胺基)丙氧基]-1-(3-羥基-3-甲基丁-1-炔-1-基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯合成標題化合物為白色固體。1 H NMR (400 MHz,甲醇-d 4 ) δ 8.35 (d,J = 6.7 Hz, 1H), 8.07 (s, 1H), 7.82 (dd,J = 15.2, 6.6 Hz, 1H), 7.36 (s, 1H), 4.33 (td,J = 5.6, 2.8 Hz, 2H), 4.03 (d,J = 3.2 Hz, 3H), 3.44 (t,J = 7.1 Hz, 2H), 3.00 (s, 6H), 2.36 (p,J = 6.4 Hz, 2H), 1.75 (s, 6H)。MS (ESI,正離子) m/z: 382.1 (M+1)。
實例49 4-{7-[3-(二甲基胺基)丙氧基]-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基}-2-甲基丁-2-醇鹽酸鹽將裝有4-{7-[3-(二甲基胺基)丙氧基]-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基}-2-甲基丁-3-炔-2-醇(實例48,35 mg,0.09 mmol 1.00 eq.)與碳載鈀(20 mg)在MeOH (1.5 mL)中的混合物的燒瓶用N2 吹掃3 min,隨後用經由氣球的氫氣吹掃並攪拌26小時min。將反應混合物通過一小塊矽藻土墊過濾並用MeOH沖洗三次。將有機溶液合併。在真空下移除有機溶劑後,將所得殘餘物藉由製備型HPLC純化(Waters XSelect CSH C18管柱,19 × 150 mm;含0至25% CH3 CN的水0.1% HCl梯度洗提20 min期間,流速28 ml/min),提供標題化合物(15 mg, 35%)。1 H NMR (400 MHz,甲醇-d 4 ) δ 8.25 (d,J = 6.6 Hz, 1H), 7.87 (s, 1H), 7.71 (d,J = 6.6 Hz, 1H), 7.30 (s, 1H), 4.32 (t,J = 5.4 Hz, 2H), 3.99 (s, 3H), 3.57 – 3.42 (m, 4H), 3.01 (s, 6H), 2.37 (dd,J = 8.8, 4.1 Hz, 2H), 1.99 – 1.90 (m, 2H), 1.36 (s, 6H)。MS (ESI,正離子) m/z: 386.0 (M+1)。
實例50 4-{7-[3-(二甲基胺基)丙氧基]-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基}丁-3-炔-2-醇鹽酸鹽依照實例48所述的合成序列,自三級丁基1-氯-7-[3-(二甲基胺基)丙氧基]-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯合成標題化合物,不同的是使用丁-3-炔-2-醇代替2-甲基-3-丁炔-2-醇。1 H NMR (400 MHz,甲醇-d 4 ) δ 8.35 (dd,J = 6.5, 2.3 Hz, 1H), 8.02 (s, 1H), 7.89 – 7.80 (m, 1H), 7.36 (d,J = 9.7 Hz, 1H), 5.01 (q,J = 6.7 Hz, 1H), 4.34 (t,J = 5.5 Hz, 2H), 4.01 (s, 3H), 3.45 (t,J = 7.1 Hz, 2H), 3.01 (s, 6H), 2.36 (p,J = 6.2 Hz, 2H), 1.68 (d,J = 6.7 Hz, 3H)。MS (ESI,正離子) m/z: 368.0 (M+1)。
實例51 (3-{[1-(2-環丙基乙炔基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基]氧基}丙基)二甲胺鹽酸鹽依照實例48所述的合成序列,自三級丁基1-氯-7-[3-(二甲基胺基)丙氧基]-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯合成標題化合物,不同的是使用乙炔基環丙烷代替2-甲基-3-丁炔-2-醇。1 H NMR (400 Mhz,甲醇-d 4 ) δ 8.29 (d,J = 6.7 Hz, 1H), 7.88 (s, 1H), 7.78 (d,J = 6.8 Hz, 1H), 7.35 (s, 1H), 4.33 (t,J = 5.6 Hz, 2H), 4.03 (s, 3H), 3.45 (t,J = 7.2 Hz, 2H), 3.01 (s, 6H), 2.36 (s, 1H), 2.41 – 2.30 (m, 1H), 1.94 (tt,J = 8.2, 5.0 Hz, 1H), 1.34 – 1.20 (m, 2H), 1.24 – 1.09 (m, 2H)。MS (ESI,正離子) m/z: 364.2 (M+1)。
實例52 3-((1-(2-環丙基乙基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基)氧基)-N,N-二甲基丙-1-胺鹽酸鹽將來自實例48的(3-{[1-(2-環丙基乙炔基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基]氧基}丙基)二甲胺的混合物(5.60 mg; 0.02 mmol; 1.00 eq.)溶於甲醇(1.68 mL)中。將系統用氮吹掃,並將碳載鈀(0.16 mg; 0.00 mmol; 0.10 eq.)加入到反應燒瓶中。使用來自氣球的H2 在大氣壓力下將反應混合物氫化90分鐘。將反應混合物用矽藻土過濾並將餅狀物用甲醇洗滌。將合併的有機物濃縮至乾,給出所欲的3-((1-(2-環丙基乙基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基)氧基)-N,N-二甲基丙-1-胺鹽酸鹽(3.9 mg, 69%)。MS (ESI,正離子) m/z: 368.2 (M+1)。
實例53 {2-[2-({1-環丙基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)乙氧基]乙基}二甲胺鹽酸鹽
步驟1 向裝有三級丁基1-環丙基-7-羥基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(48.00 mg; 0.15 mmol; 1.00 eq.)的小瓶加入含三丁基亞磷基(tributylphosphoranylidene)乙腈(150.76 mg; 0.59 mmol)的CH2 Cl2 (0.5 mL)溶液。使混合物在60℃下攪拌,用N2 管線完全吹滅溶劑。向所得殘餘物加入含2-[2-(二甲基胺基)乙氧基]乙-1-醇(60.13 mg; 0.45 mmol; 2.50 eq.)的CH2 Cl2 (0.8 mL)。在N2 管線下移除溶劑後,將小瓶密封並使殘餘物在85℃下加熱90 min。將反應混合物藉由急速層析法在矽膠管柱上以含0至100%溶劑A(溶劑A:0.3% NH4 OH/10% MeOH/89.7% CH2 Cl2 )的CH2 Cl2 洗提純化,提供三級丁基1-環丙基-7-{2-[2-(二甲基胺基)乙氧基]乙氧基}-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯為黃色油狀物(26 mg, 41%)。
步驟2 依照實例21步驟3所述的合成序列,自三級丁基1-環丙基-7-{2-[2-(二甲基胺基)乙氧基]乙氧基}-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯合成標題化合物。1 H NMR (400 MHz,甲醇-d 4 ) δ 132.51 (s, 1H), 8.18 (d,J = 6.7 Hz, 1H), 7.91 (dd,J = 4.8, 1.8 Hz, 1H), 7.73 (d,J = 6.8 Hz, 1H), 7.35 (d,J = 1.8 Hz, 1H), 4.38 – 4.31 (m, 2H), 4.05 – 3.80 (m, 4H), 3.46 – 3.36 (m, 2H), 2.94 (s, 6H), 2.65 (dd,J = 2.2, 1.3 Hz, 1H), 1.65 – 1.49 (m, 2H), 1.35 – 1.24 (m, 2H)。MS (ESI,正離子) m/z: 370.4 (M+1)。
實例54 7-(3-氯丙氧基)-1-環丙基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚鹽酸鹽將標題化合物自實例102步驟4所述之純化單離為二次產物(7.9 mg; 26%);1 H NMR (400 MHz, DMSO-d 6 ) δ 13.82 (s, 1H), 12.76 (s, 1H), 8.21 (d,J = 6.7 Hz, 1H), 7.85 (s, 1H), 7.72 (d,J = 6.7 Hz, 1H), 7.34 (s, 1H), 4.22 (t,J = 6.0 Hz, 2H), 3.90 (s, 3H), 3.82 (t,J = 6.4 Hz, 2H), 3.00 (td,J = 8.6, 4.3 Hz, 1H), 2.24 (p,J = 6.2 Hz, 2H), 1.42 (dt,J = 6.9, 3.3 Hz, 2H), 1.33 – 1.27 (m, 2H)。MS (ESI,正離子) m/z: 331.3 (M+1)。
實例55 [3-({8-甲氧基-1-丙基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]二甲胺鹽酸鹽依照類似實例21所述的合成序列,自三級丁基7-羥基-8-甲氧基-1-丙基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯合成標題化合物,不同的是在步驟2中使用3-(二甲基胺基)丙-1-醇代替3-(吡咯啶-1-基)丙-1-醇。1 H NMR (400 MHz,甲醇-d 4 ) δ 8.29 (d,J = 6.8 Hz, 1H), 7.77 (d,J = 6.8 Hz, 1H), 7.64 (s, 1H), 7.37 (s, 1H), 4.33 (t,J = 5.6 Hz, 2H), 4.03 (s, 3H), 3.51 (dd,J = 8.5, 6.9 Hz, 2H), 3.45 (t,J = 7.2 Hz, 2H), 3.00 (s, 6H), 2.41 – 2.29 (m, 2H), 2.00 (h,J = 7.4 Hz, 2H), 1.13 (t,J = 7.4 Hz, 3H)。MS (ESI,正離子) m/z: 342.2 (M+1)。
實例56 [3-({1-環戊基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]二甲胺鹽酸鹽
步驟1 將三級丁基7-(苄氧基)-1-氯-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(650.00 mg; 1.48 mmol; 1.00 eq.)、1-環戊烯-1-基硼酸(580.20 mg; 5.18 mmol; 3.50 eq.)、三環己基磷烷(41.53 mg; 0.15 mmol; 0.10 eq.)與磷酸三鉀(628.72 mg; 2.96 mmol; 2.00 eq.)在甲苯(10 mL)及水(0.8 mL)中的混合物用氮吹掃10分鐘。向混合物加入乙酸鈀(33.25 mg; 0.15 mmol; 0.10 eq.)。使混合物在N2 氣氛下在回流下攪拌2h。使反應混合物冷卻至rt、用水稀釋並用EtOAc萃取三次。將合併的有機溶液在減壓下濃縮。將殘餘物藉由急速層析法在25 g矽膠管柱上以含0至60% EtOAc的己烷洗提純化,提供三級丁基7-(苄氧基)-1-(環戊-1-烯-1-基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(540 mg, 78%)。
步驟2 將裝有三級丁基7-(苄氧基)-1-(環戊-1-烯-1-基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(540 mg, 1.45 mmol; 1.00 eq.)與碳載鈀(0.32 g; 0.31 mmol; 0.21 eq.)在MeOH (24 mL)中的混合物的燒瓶用N2 吹掃10 min,隨後用H2 氣球吹掃8 min。使所得混合物在rt下在H2 氣球下攪拌12 hr。將固體通過一小塊矽藻土墊濾出並用MeOH沖洗。將有機溶液合併。在減壓下移除有機溶劑,提供三級丁基1-環戊基-7-羥基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯的粗產物(398 mg, 91%)。
步驟3 依照實例47步驟2所述的合成序列,自上述粗產物三級丁基1-環戊基-7-羥基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯合成標題化合物。1 H NMR (400 MHz,甲醇-d 4 ) δ 8.26 (d,J = 6.8 Hz, 1H), 7.79 – 7.70 (m, 2H), 7.34 (s, 1H), 4.31 (t,J = 5.6 Hz, 2H), 4.03 (s, 3H), 3.44 (t,J = 7.2 Hz, 2H), 3.00 (s, 6H), 2.44 (s, 2H), 2.40 – 2.29 (m, 1H), 2.35 (s, 1H), 2.05 -1.95 (m, 7H)。MS (ESI,正離子) m/z: 368.1 (M+1)。
實例57 (3-{[1-(2-乙氧基乙基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基]氧基}丙基)二甲胺鹽酸鹽
步驟1 將三級丁基7-(苄氧基)-1-氯-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(450.00 mg; 1.03 mmol; 1.00 eq.)、2-[(E)-2-乙氧基乙烯基]-4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧雜硼雜環戊烷(365.53 mg; 1.85 mmol; 1.80 eq.)、Pd(dppf)2Cl2.DCM (83.73 mg; 0.10 mmol; 0.10 eq.)與碳酸銫(1 336.23 mg; 4.10 mmol; 4.00 eq.)在甲苯(12 mL)及水(1 mL)中的混合物用氮吹掃10分鐘。使所得混合物在N2 氣氛下回流4 h。使反應混合物冷卻至rt、用水稀釋並用EtOAc萃取三次。將合併的有機溶液在減壓下濃縮。將殘餘物藉由急速層析法在25 g矽膠管柱上以含0至60% EtOAc的己烷洗提純化,提供三級丁基7-(苄氧基)-1-[(E)-2-乙氧基乙烯基]-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯為白色固體(393 mg, 81%)。
步驟2 將裝有三級丁基7-(苄氧基)-1-(環戊-1-烯-1-基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯為白色固體(321 mg, 0.68 mmol; 1.00 eq.)與碳載鈀(139 mg; 0.13 mmol; 0.21 eq.)在MeOH (11 mL)中的混合物的燒瓶用N2 吹掃10 min,隨後用H2 氣球吹掃8 min。使所得混合物在rt下在H2 氣球下攪拌12 hr。將固體通過一小塊矽藻土墊濾出並用MeOH沖洗。將有機溶液合併。在減壓下移除有機溶劑,提供三級丁基1-(2-乙氧基乙基)-7-羥基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯的粗產物(209 mg, 81%)。
步驟3 依照實例47步驟2所述的合成序列,自上述粗產物三級丁基1-(2-乙氧基乙基)-7-羥基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯合成標題化合物。1 H NMR (400 MHz,甲醇-d 4 ) δ 8.30 (d,J = 6.6 Hz, 1H), 7.81 – 7.69 (m, 2H), 7.36 (s, 1H), 4.33 (t,J = 5.3 Hz, 2H), 4.01 (d,J = 7.5 Hz, 5H), 3.78 (t,J = 5.6 Hz, 2H), 3.46 (q,J = 7.0 Hz, 4H), 3.01 (s, 6H), 2.36 (t,J = 6.1 Hz, 2H), 1.04 (t,J = 6.9 Hz, 3H)。MS (ESI,正離子) m/z: 372.2 (M+1)。
實例58 (3-{[8-甲氧基-1-(3-甲氧基丙基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基]氧基}丙基)二甲胺鹽酸鹽
步驟1 將三級丁基7-(苄氧基)-1-氯-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(150.00 mg; 0.34 mmol; 1.00 eq.)、三氟[(1E)-3-甲氧基丙-1-烯-1-基]-¿4-硼烷氫化鉀(122.36 mg; 0.68 mmol; 2.00 eq.)、乙酸鈀(15.35 mg; 0.07 mmol; 0.20 eq.)、三環己基膦(14.38 mg; 0.05 mmol; 0.15 eq.)與磷酸三鉀(290.18 mg; 1.37 mmol; 4.00 eq.)在甲苯及水(5 mL /1.2 mL)中的混合物用N2 吹掃10 min。使混合物在110℃下在回流N2 氣氛下吹掃70 min。使反應混合物冷卻至室溫、用水稀釋並用EtOAc萃取三次。將有機溶液合併。在減壓下移除揮發物後,將殘餘物藉由急速層析法在矽膠管柱上以含0至50%溶劑A(溶劑A:0.3% NH4 OH/10% MeOH/89.7% CH2 Cl2 )的CH2 Cl2 洗提純化,提供三級丁基7-(苄氧基)-8-甲氧基-1-[(1E)-3-甲氧基丙-1-烯-1-基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯為白色固體(112 mgs, 69%)。
步驟2 依照實例57步驟2及3所述的合成序列,自上述產物三級丁基7-(苄氧基)-8-甲氧基-1-[(1E)-3-甲氧基丙-1-烯-1-基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯製備標題產物。1 H NMR (400 MHz,甲醇-d 4 ) δ 8.25 (d,J = 6.6 Hz, 1H), 7.75 – 7.64 (m, 2H), 7.27 (s, 1H), 4.30 (t,J = 5.5 Hz, 2H), 3.98 (s, 3H), 3.59 – 3.42 (m, 6H), 3.36 (s, 3H), 3.02 (s, 6H), 2.37 (t,J = 6.2 Hz, 2H), 2.14 – 2.05 (m, 2H)。MS (ESI,正離子) m/z: 372.2 (M+1)。
實例59 [3-({1-乙炔基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]二甲胺鹽酸鹽
步驟1 依照實例48步驟3所述的合成序列,將三級丁基1-氯-7-[3-(二甲基胺基)丙氧基]-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯轉換成三級丁基7-[3-(二甲基胺基)丙氧基]-8-甲氧基-1-[2-(三甲基矽基)乙炔基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯為白色固體,不同的是使用乙炔基三甲基矽烷代替2-甲基-3-丁炔-2-醇。
步驟2 將含有三級丁基7-[3-(二甲基胺基)丙氧基]-8-甲氧基-1-[2-(三甲基矽基)乙炔基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(25 mg, 0.05 mml, 1.0 eq.)的CH2 Cl2 (0.8 mL)溶液與TFA (0.3 mL)合併。使反應混合物在rt下攪拌30分鐘。將所得溶液在減壓下濃縮。將剩餘殘餘物用TBAF(1.0 mL,1.0 mmol,1.0 M在THF中)處理並使所得混合物在rt下攪拌16小時。在減壓下移除有機溶劑後,將所得殘餘物在製備型HPLC上純化(Waters XSelect CSH C18管柱,19 × 150 mm;含0至45% CH3 CN的水0.1% HCl梯度洗提20 min期間,流速28 ml/min),提供標題化合物(4 mg, 20%)。1 H NMR (400 MHz,甲醇-d 4 ) δ 8.39 (d,J = 6.6 Hz, 1H), 8.01 (s, 1H), 7.89 (d,J = 6.6 Hz, 1H), 7.37 (s, 1H), 5.27 (s, 1H), 4.34 (t,J = 5.4 Hz, 2H), 4.00 (s, 3H), 3.44 (t,J = 7.1 Hz, 2H), 3.00 (s, 6H), 2.36 (q,J = 6.2 Hz, 2H)。MS (ESI,正離子) m/z: 324.0 (M+1)。
實例60 1-[3-({1-環丙基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]-2-甲基吡咯啶鹽酸鹽
步驟1 將三級丁基7-(苄氧基)-1-氯-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(參考 5 ;1 000.00 mg;2.28 mmol;1.00 eq.)、環丙基硼酸(684.98 mg; 7.97 mmol; 3.50 eq.)、三環己基磷烷(63.89 mg; 0.23 mmol; 0.10 eq.)與磷酸三鉀(967.26 mg; 4.56 mmol; 2.00 eq.)在甲苯(11.39 mL)及水(0.57 mL)中的混合物用氮噴氣10分鐘。然後加入乙酸鈀(51.15 mg; 0.23 mmol; 0.10 eq.),並將混合物加熱至100℃。在3.5 h後,將混合物用EtOAc稀釋並用水及鹽水洗滌。將有機層在MgSO4 上乾燥、過濾並濃縮。將殘餘物藉由管柱層析法(40 G ISCO Gold)以含0至60% EtOAc的庚烷洗提純化,獲得所欲產物為灰白色固體(900 mg;89%產率)。
步驟2 將三級丁基7-(苄氧基)-1-環丙基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(700.00 mg; 1.57 mmol; 1.00 eq.)與碳載鈀(5.03 mg; 0.05 mmol; 0.03 eq.)在甲醇(15.75 mL)中的混合物在來自氣球的H2 氣氛下攪拌(排空後重新充填H2 三次)。在17 h後,將混合物與額外的MeOH過濾並濃縮,提供粗製灰白色固體,其不經進一步純化用於進一步步驟。
步驟3 將三級丁基1-環丙基-7-羥基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(50.00 mg; 0.14 mmol; 1.00 eq.)、1-氯-3-碘丙烷(0.03 mL; 0.28 mmol; 2.00 eq.)與碳酸鉀(21.42 mg; 0.16 mmol; 1.10 eq.)在乙腈(0.71 mL)中的混合物加熱至80℃。在3.5 h後,將混合物用EtOAc稀釋、用鹽水洗滌、在MgSO4 上乾燥、過濾並濃縮以提供黃色油狀物。將粗材料藉由管柱層析法(12 G ISCO Gold)以0至40% EtOAc/己烷洗提純化,獲得半純的無色油狀物。將此材料(40 mg)不經進一步純化用於下列步驟。
步驟4 將三級丁基7-(3-氯丙氧基)-1-環丙基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(40.00 mg; 0.09 mmol; 1.00 eq.)、碘化鉀(1.54 mg; 0.01 mmol; 0.10 eq.)與2-甲基吡咯啶(0.07 mL; 0.60 mmol; 6.50 eq.)在N,N-二甲基甲醯胺(0.46 mL)中的混合物加熱至70℃。在2 h後,將混合物冷卻至環境溫度、用1:1 PhMe/EtOAc稀釋、用等量的H2 O洗滌、在MgSO4上乾燥、過濾並濃縮。將粗製橘色固體溶於DCM (1 mL)中並在環境溫度下用TFA (0.5 mL)處理。在2 h後,將混合物在真空中濃縮。將油狀殘餘物溶於1N HCl(約1.0 mL)中並藉由製備型HPLC純化(Phenomenex Luna C18,21 × 250 mm,0至60%乙腈/0.1% HCl水溶液梯度13分鐘,流速22 ml/min),提供標題化合物(6 mg; 17%)。1 H NMR (400 MHz, DMSO-d 6 ) δ 13.79 (s, 1H), 12.84 (s, 1H), 9.65 (s, 1H), 8.21 (d,J = 6.6 Hz, 1H), 7.85 (s, 1H), 7.73 (s, 1H), 7.32 (s, 1H), 4.21 (t,J = 6.0 Hz, 2H), 3.91 (s, 3H), 3.67-3.63 (m, 1H), 3.50-3.40 (m, 2H), 3.15-307 (m, 2H), 3.03-2.97 (m, 1H), 2.23-2.16 (m, 2H), 1.99-1.87 (m, 2H), 1.65-1.55 (m, 2H), 1.47-1.39 (m, 2H), 1.35 (d,J = 6.4 Hz, 3H), 1.31-1.26 (s, 2H);MS (ESI,正離子) m/z: 380.4 (M+1)。
實例61 [3-({1-環丙基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]雙(丙烷-2-基)胺鹽酸鹽使用實例60所述之合成序列製備標題化合物,但改變步驟4如下。將7-(3-氯丙氧基)-1-環丙基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚(45.00 mg; 0.14 mmol; 1.00 eq.)、碘化鉀(2.26 mg; 0.01 mmol; 0.10 eq.)與N,N-二異丙胺(89.47 mg; 0.88 mmol; 6.50 eq.)在N,N-二甲基甲醯胺(0.68 mL)中的混合物加熱至80℃。在整夜後,將混合物(仍顯示不完全轉化)冷卻至環境溫度、用H2 O稀釋、用1N HCl酸化並經由製備型HPLC純化(Phenomenex Luna C18,21 × 250 mm,0至70%乙腈/0.1% HCl水溶液梯度13分鐘,流速22 ml/min),提供[3-({1-環丙基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]雙(丙烷-2-基)胺為灰白色固體。1 H NMR (400 MHz, DMSO-d 6 ) δ 13.08 (s, 1H), 9.75 (s, 1H), 8.21 (dd,J = 6.8, 3.6 Hz, 1H), 7.85 (s, 1H), 7.74 (d,J = 6.7 Hz, 1H), 7.31 (s, 1H), 4.22 (t,J = 6.0 Hz, 2H), 3.91 (s, 3H), 3.63 (ddd,J = 13.1, 8.8, 5.6 Hz, 2H), 3.24 (ddd,J = 11.4, 6.9, 4.1 Hz, 2H), 3.06 – 2.97 (m, 1H), 2.30 – 2.22 (m, 2H), 1.46 – 1.40 (m, 2H), 1.37 (dt,J = 5.5, 2.9 Hz, 2H), 1.33 (d,J = 6.5 Hz, 6H), 1.29 (d,J = 6.5 Hz, 6H)。MS (ESI,正離子) m/z: 396.4 (M+1)。
實例62 (3R)-1-[3-({1-環丙基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]-3-氟吡咯啶鹽酸鹽使用實例60所述之合成序列製備標題化合物,但改變步驟4如下: 將三級丁基7-(3-氯丙氧基)-1-環丙基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(50.00 mg; 0.12 mmol; 1.00 eq.)、碘化鉀(1.93 mg; 0.01 mmol; 0.10 eq.)與(3R)-3-氟吡咯啶-1-鎓氯化物(94.71 mg; 0.75 mmol; 6.50 eq.)在N,N-二甲基甲醯胺(0.58 mL)中的混合物加熱至80℃。在3.5 h後,將混合物冷卻至環境溫度、用1:1 PhMe/EtOAc稀釋、用H2 O洗滌、在MgSO4 上乾燥、過濾並濃縮。
將粗製橘色油溶於DCM (1.2 mL)中並在環境溫度下用TFA (0.6 mL)處理。在4.5 h後,將混合物在真空中濃縮。將油狀殘餘物溶於1N HCl(約1.2 mL)中並藉由製備型HPLC純化(Phenomenex Luna C18,21 × 250 mm,0至70%乙腈/0.1% HCl水溶液梯度13分鐘,流速22 ml/min),提供(3R)-1-[3-({1-環丙基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]-3-氟吡咯啶為白色鬆散粉末。1 H NMR (400 MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.97 (s, 1H), 11.27 (s, 1H), 10.72 (s, 1H), 8.21 (d,J = 6.7 Hz, 1H), 7.85 (s, 1H), 7.73 (d,J = 6.7 Hz, 1H), 7.32 (s, 1H), 5.46 (d,J = 53.4 Hz, 1H), 4.20 (d,J = 6.2 Hz, 2H), 3.91 (s, 3H), 3.72 (br s, 1H), 3.40-3.35 (m, 2H), 3.28-3.20 (m, 2H), 3.07-2.94 (m, 1H), 2.24 (t,J = 7.4 Hz, 2H), 2.21-2.05 (m, 2H), 1.42 (dt,J = 8.3, 3.2 Hz, 2H), 1.34 (dq,J = 7.7, 4.8, 4.2 Hz, 2H)。MS (ESI,正離子) m/z: 384.4 (M+1)。
實例63 (3S)-1-[3-({1-環丙基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]-3-氟吡咯啶鹽酸鹽使用實例60所述之合成序列製備標題化合物,但改變步驟4如下: 將三級丁基7-(3-氯丙氧基)-1-環丙基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(38.00 mg; 0.09 mmol; 1.00 eq.)、碘化鉀(1.46 mg; 0.01 mmol; 0.10 eq.)、Hunig's鹼(0.10 mL; 0.57 mmol; 6.50 eq.)與(3S)-3-氟吡咯啶-1-鎓氯化物(71.98 mg; 0.57 mmol; 6.50 eq.)在N,N-二甲基甲醯胺(0.44 mL)中的混合物加熱至80℃。在2 h後,將混合物冷卻至環境溫度、用1:1 PhMe/EtOAc稀釋、用H2 O洗滌、在MgSO4 上乾燥、過濾並濃縮。
將粗製橘色油溶於DCM (1.0 mL)中並在環境溫度下用TFA (0.5 mL)處理。在2 h後,將混合物在真空中濃縮。將油狀殘餘物溶1N HCl(約1 mL)中並藉由製備型HPLC純化(Phenomenex Luna C18,21 × 250 mm,0至70%乙腈/0.1% HCl水溶液梯度13分鐘,流速22 ml/min),提供標題化合物。1 H NMR (400 MHz, DMSO-d 6 ) δ 13.03 (s, 1H), 11.46 (s, 1H), 10.89 (s, 1H), 8.20 (d,J = 6.7 Hz, 1H), 7.85 (s, 1H), 7.73 (d,J = 6.7 Hz, 1H), 7.32 (s, 1H), 5.45 (d,J = 53.4 Hz, 1H), 4.21 (t,J = 6.1 Hz, 2H), 3.91 (s, 3H), 3.72 (s, 1H), 3.40-3.32 (m, 2H), 3.28-3.21 (m, 2H), 3.01 (tt,J = 8.5, 5.4 Hz, 1H), 2.35-2.12 (m, 4H), 1.47 – 1.39 (m, 2H), 1.36 (tt,J = 5.3, 2.9 Hz, 2H)。MS (ESI,正離子) m/z: 384.4 (M+1)。
實例64 1-(3-{[1-(3,6-二氫-2H-哌喃-4-基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基]氧基}丙基)吡咯啶鹽酸鹽及1-(3-{[8-甲氧基-1-(烷-4-基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基]氧基}丙基)吡咯啶鹽酸鹽(2:1混合物)
步驟1 將三級丁基7-(苄氧基)-1-氯-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(參考 5 ;150.00 mg;0.34 mmol;1.00 eq.)、4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧雜硼雜環戊-2-基)-3,6-二氫-2H-哌喃(107.69 mg; 0.51 mmol; 1.50 eq.)、1,1'-雙(二苯基膦基)二茂鐵]-二氯鈀(II) (25.01 mg; 0.03 mmol; 0.10 eq.)與碳酸鈉(108.67 mg; 1.03 mmol; 3.00 eq.)在1,4-二烷(1.14 mL)及水(0.34 mL)中的混合物加熱至100℃。在2小時後,將混合物冷卻至環境溫度、用EtOAc稀釋、用水及鹽水洗滌、在MgSO4 上乾燥、過濾並濃縮。將殘餘物藉由管柱層析法(12 G ISCO Gold)以含0至80% EtOAc的己烷洗提純化,提供三級丁基7-(苄氧基)-1-(3,6-二氫-2H-哌喃-4-基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(76 mg;46%產率)。
步驟2 將三級丁基7-(苄氧基)-1-(3,6-二氫-2H-哌喃-4-基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(76.00 mg; 0.16 mmol; 1.00 eq.)與碳載鈀(0.50 mg; 0.00 mmol; 0.03 eq.)在甲醇(1.56 mL)中的混合物在來自氣球的H2 氣氛下攪拌。在整夜後(仍不完全轉化),加入更多催化劑並將混合物再攪拌額外7 h。然後將混合物與額外的MeOH過濾並濃縮。粗製灰白色固體(1 H NMR顯示含痕量四氫哌喃之二氫哌喃;兩種質量皆由LC/MS偵測)不經進一步純化繼續使用,假定100%產率(62 mg,100%產率)。
步驟3 將三級丁基1-(3,6-二氫-2H-哌喃-4-基)-7-羥基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(62.00 mg; 0.16 mmol; 1.00 eq.)(亦含有還原四氫哌喃)、1-(3-氯丙基)吡咯啶-1-鎓氯化物(57.59 mg; 0.31 mmol; 2.00 eq.)與碳酸鉀(86.33 mg; 0.63 mmol; 4.00 eq.)在N,N-二甲基甲醯胺(1.56 mL)中的混合物在100℃下攪拌。在7 h後,將混合物冷卻至環境溫度、用1:1 PhMe/EtOAc稀釋、用水洗滌、在MgSO4 上乾燥、過濾並濃縮以提供橘色油狀物。
將油溶於2.0 mL的DCM中並在環境溫度下用1.0 mL TFA處理。在2小時後,將反應混合物在真空中濃縮。將殘餘物溶於1N HCl(約1.5 mL)中並藉由製備型HPLC純化(Phenomenex Luna C18,21 × 250 mm,0至70%乙腈/0.1% HCl水溶液梯度13分鐘,流速22 ml/min),提供1-(3-{[1-(3,6-二氫-2H-哌喃-4-基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基]氧基}丙基)吡咯啶鹽酸鹽及1-(3-{[8-甲氧基-1-(烷-4-基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基]氧基}丙基)吡咯啶鹽酸鹽(2:1混合物)為黃色粉末。1H NMR(僅主要組分)(400 MHz, DMSO-d 6 ) δ 13.13 (s, 1H), 10.71 (s, 1H), 8.39 (d,J = 6.7 Hz, 1H), 7.82 (d,J = 6.8 Hz, 1H), 7.48 (s, 1H), 7.32 (s, 1H), 6.58 (d,J = 2.9 Hz, 1H), 4.41 (q,J = 2.8 Hz, 2H), 4.20 (d,J = 6.1 Hz, 2H), 4.00 (t,J = 5.3 Hz, 2H), 3.84 (s, 3H), 3.60-3.50 (m, 2H), 3.29-3.24 (m, 2H), 3.05-2.95 (m, 2H), 2.69-2.62 (m, 2H), 2.26-2.18 (m, 2H), 2.02-1.94 (m, 2H), 1.92-1.84 (m, 2H)。MS (ESI,正離子) m/z: 408.4 (M+1)。
實例65 1-(3-{[8-甲氧基-1-(烷-4-基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基]氧基}丙基)吡咯啶鹽酸鹽及1-(3-{[1-(3,6-二氫-2H-哌喃-4-基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基]氧基}丙基)吡咯啶鹽酸鹽(4:1混合物)使用實例64所述之合成程序製備標題化合物,但改變步驟2如下: 將三級丁基7-(苄氧基)-1-(3,6-二氫-2H-哌喃-4-基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(50.00 mg; 0.10 mmol; 1.00 eq.)與銠(5% wt在氧化鋁上)(1.06 mg; 0.01 mmol; 0.10 eq.)在甲醇(1.03 mL)中的混合物在來自氣球的H2 氣氛下攪拌。在48後,將混合物與額外的MeOH過濾並濃縮。粗製灰白色物不經進一步純化繼續使用,假定100%產率(40 mg)
在步驟3(如實例64所述)後,獲得1-(3-{[8-甲氧基-1-(烷-4-基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基]氧基}丙基)吡咯啶鹽酸鹽及1-(3-{[1-(3,6-二氫-2H-哌喃-4-基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基]氧基}丙基)吡咯啶鹽酸鹽(4:1混合物)為白色粉末。1H NMR(僅主要組分)(400 MHz, DMSO-d 6 ) δ 13.07 (s, 1H), 10.47 (s, 1H), 8.34 (d,J = 6.7 Hz, 1H), 7.81 (d,J = 7.0 Hz, 1H), 7.64 (s, 1H), 7.33 (s, 1H), 4.22 (t,J = 6.1 Hz, 2H), 4.08 – 4.04 (m, 2H), 3.93 (s, 3H), 3.73 (td,J = 11.7, 1.9 Hz, 2H), 3.61-3.52 (m, 2H), 3.28-3.25 (m, 2H), 3.05-2.97 (m, 2H), 2.65-2.62 (m, 1H), 2.26-2.18 (m, 2H), 2.11 (td,J = 12.3, 4.2 Hz, 2H), 2.02 – 1.84 (m, 6H)。MS (ESI,正離子) m/z: 410.5 (M+1)。
實例66 4-{8-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基}-1,2,3,6-四氫吡啶雙鹽酸鹽
步驟1 將三級丁基7-(苄氧基)-1-氯-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(參考 5 ;200.00 mg; 0.46 mmol; 1.00 eq.)、三級丁基4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧雜硼雜環戊-2-基)-3,6-二氫-1(2H)-吡啶羧酸酯(211.35 mg; 0.68 mmol; 1.50 eq.)、1,1'-雙(二苯基膦基)二茂鐵]二氯鈀(II) (33.34 mg; 0.05 mmol; 0.10 eq.)與碳酸鈉(144.89 mg; 1.37 mmol; 3.00 eq.)在1,4-二烷(1.52 mL)及水(0.46 mL)中的混合物加熱至100℃。然後將混合物冷卻至環境溫度、用EtOAc稀釋、用水及鹽水洗滌、在MgSO4上乾燥、過濾並濃縮。將殘餘物藉由管柱層析法(24 G ISCO Gold)以含0至100% EtOAc的庚烷洗提純化,提供三級丁基4-[7-(苄氧基)-5-[(三級丁氧基)羰基]-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基]-1,2,3,6-四氫吡啶-1-羧酸酯為白色發泡體(166 mg;62%產率)。
步驟2 將三級丁基4-[7-(苄氧基)-5-[(三級丁氧基)羰基]-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基]-1,2,3,6-四氫吡啶-1-羧酸酯(50.00 mg; 0.09 mmol; 1.00 eq.)與碳載鈀(0.91 mg; 0.01 mmol; 0.10 eq.)在甲醇(0.85 mL)中的混合物在來自氣球的H2 氣氛下攪拌。在整夜攪拌後,將混合物與額外的MeOH過濾並濃縮。此材料不經進一步純化繼續使用,假定100%產率(40 mg)。
步驟3 將三級丁基4-{5-[(三級丁氧基)羰基]-7-羥基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基}-1,2,3,6-四氫吡啶-1-羧酸酯(40.00 mg; 0.08 mmol; 1.00 eq.)、1-(3-氯丙基)吡咯啶-1-鎓氯化物(29.72 mg; 0.16 mmol; 2.00 eq.)與碳酸鉀(44.55 mg; 0.32 mmol; 4.00 eq.)在N,N-二甲基甲醯胺(0.81 mL)中的混合物在100℃下攪拌。然後將混合物冷卻至環境溫度、用1:1 PhMe/EtOAc稀釋、用水洗滌、在MgSO4 上乾燥、過濾並濃縮以提供橘色油狀物。
將油溶於DCM (1 mL)中並在環境溫度下用TFA (0.5 mL)處理。在2 h後,將混合物在真空中濃縮。將殘餘物溶於1.5 mL 1N HCl中、通過注射筒過濾器過濾並藉由製備型HPLC純化((Phenomenex Luna C18,21 × 250 mm,0至70%乙腈/0.1% HCl水溶液梯度13分鐘,流速22 ml/min),提供4-{8-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基}-1,2,3,6-四氫吡啶雙鹽酸鹽為黃色固體,20.2 mg。1 H NMR (400 MHz, DMSO-d 6 ) δ 13.11 (s, 1H), 10.49 (s, 1H), 9.76 (br s, 2H), 8.41 (d,J = 6.7 Hz, 1H), 7.83 (s, 1H), 7.62 (s, 1H), 7.29 (s, 1H), 6.54 (s, 1H), 4.20 (t,J = 6.0 Hz, 2H), 3.96-3-91 (m, 4H), 3.61-3.52 (m, 2H), 3.48-3.41 (m, 2H), 3.28-3.24 (m, 2H), 3.04-2.93 (m, 4H), 2.25-2.17 (m, 2H), 2.02-1.95 (m, 2H), 1.92-1.82 (m, 2H);MS (ESI,正離子) m/z: 407.3 (M+1)。
實例67 (3-{[8-甲氧基-1-(丙烷-2-基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基]氧基}丙基)二甲胺鹽酸鹽
步驟1 向在環境溫度下的三級丁基7-(苄氧基)-1-氯-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(參考 5 ;300 mg;0.68 mmol;1.00 eq.)、與參((3Z)-4-羥基戊-3-烯-2-酮)鐵(12 mg; 0.03 mmol; 0.05 eq.)在四氫呋喃(5 mL)及NMP (0.5 mL)的混合物加入(異丙基)溴化鎂(0.8 mL; 1.00 mol/L; 0.82 mmol; 1.20 eq.)並將混合物在環境溫度下攪拌。在0.5 h後,將混合物用EtOAc稀釋、用水洗滌、在MgSO4 上乾燥、過濾並濃縮。將殘餘物藉由管柱層析法(24 G ISCO Gold)以含0至60% EtOAc的庚烷洗提純化,獲得產物與未反應起始材料的無分離(NO SEPARATION)。將半純化材料溶於DMF中並藉由製備型HPLC純化(Phenomenex Luna C18,21 × 250 mm,5至95%乙腈/0.1% HCl水溶液梯度13分鐘,流速22 ml/min),提供三級丁基7-(苄氧基)-8-甲氧基-1-(丙烷-2-基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯為白色粉末(60 mg.19%)
步驟2 將三級丁基7-(苄氧基)-8-甲氧基-1-(丙烷-2-基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(60 mg; 0.13 mmol; 1.00 eq.)與碳載鈀(2 mg; 0.01 mmol; 0.10 eq.)在甲醇(3 mL)中的混合物在來自氣球的H2 氣氛下攪拌。在4後,將混合物與額外的MeOH過濾並濃縮。粗製白色固體不經進一步純化用於下一步驟,假定100%產率。
步驟3 將三級丁基7-羥基-8-甲氧基-1-(丙烷-2-基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(47 mg; 0.13 mmol; 1.00 eq.)、(3-氯丙基)二甲胺(32 mg; 0.26 mmol; 2.00 eq.)與碳酸鉀(73 mg; 0.53 mmol; 4.00 eq.)在DMF (2 mL)中的混合物在100℃下攪拌。在2 h後,將混合物冷卻至環境溫度、用1:1 PhMe/EtOAc稀釋、用水洗滌、用MgSO4 乾燥、過濾並濃縮,提供無色油狀物。將油溶於DCM (1 mL)中並在環境溫度下用TFA (0.5 mL)處理。在1.5 h後,將混合物在真空中濃縮。將殘餘物溶於1.5 mL 1N HCl中並藉由逆相HPLC純化(Phenomenex Luna C18,21 × 250 mm,0至60%乙腈/0.1% HCl水溶液梯度13分鐘,流速22 ml/min),提供(3-{[8-甲氧基-1-(丙烷-2-基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基]氧基}丙基)二甲胺鹽酸鹽為白色粉末。1 H NMR (400 MHz, DMSO-d 6 ) δ 13.11 (s, 1H), 10.40 (s, 1H), 8.34 (d,J = 6.7 Hz, 1H), 7.79 (d,J = 6.7 Hz, 1H), 7.68 (s, 1H), 7.33 (s, 1H), 4.21 (dt,J = 11.9, 6.4 Hz, 3H), 3.92 (s, 3H), 3.25 – 3.18 (m, 2H), 2.78 (s, 3H), 2.77 (s, 3H), 2.22 (p,J = 6.2 Hz, 2H), 1.54 (s, 3H), 1.52 (s, 3H)。MS (ESI,正離子) m/z: 342.4 (M+1)。
實例 68 (3-{[8-甲氧基-1-(烷-4-基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基]氧基}丙基)二甲胺鹽酸鹽使用實例64所述之合成程序製備標題化合物,但改變步驟2及3如下:
步驟2 將三級丁基7-(苄氧基)-1-(3,6-二氫-2H-哌喃-4-基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(100.00 mg; 0.21 mmol; 1.00 eq.)與碳載鈀(2.19 mg; 0.02 mmol; 0.10 eq.)在乙酸乙酯(2.06 mL)中的混合物在來自氣球的H2 氣氛下攪拌。在整夜後,將混合物加熱至50℃達6 h。然後將混合物與額外的EtOAc過濾並濃縮。粗材料不經進一步純化用於下一步驟,假定100%產率。
步驟3 將三級丁基7-羥基-8-甲氧基-1-(烷-4-基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(80.00 mg; 0.20 mmol; 1.00 eq.)、(3-氯丙基)二甲胺(48.83 mg; 0.40 mmol; 2.00 eq.)與碳酸鉀(110.83 mg; 0.80 mmol; 4.00 eq.)在N,N-二甲基甲醯胺(2.01 mL)中的混合物在100℃下攪拌。在1.5後,將混合物冷卻至環境溫度、用1:1 PhMe/EtOAc稀釋、用水洗滌、在MgSO4 上乾燥、過濾並濃縮以提供黃色蠟。將蠟溶於DCM (1.5 mL)中並在環境溫度下用TFA (0.7 mL)處理。在1.5 h後,將混合物在真空中濃縮。將殘餘物溶於1.5 mL 1N HCl中並藉由製備型HPLC純化(Phenomenex Luna C18,21 × 250 mm,0至60%乙腈/0.1% HCl水溶液梯度13分鐘,流速22 ml/min),提供(3-{[8-甲氧基-1-(烷-4-基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基]氧基}丙基)二甲胺鹽酸鹽為白色粉末(39 mg)。1 H NMR (400 MHz, DMSO-d 6 ) δ 14.28 (s, 1H), 13.17 (s, 1H), 10.46 (s, 1H), 8.35 (d,J = 6.7 Hz, 1H), 7.81 (d,J = 6.7 Hz, 1H), 7.64 (s, 1H), 7.34 (s, 1H), 4.20 (t,J = 6.2 Hz, 2H), 4.06 (dd,J = 11.4, 4.1 Hz, 3H), 3.93 (s, 3H), 3.73 (td,J = 11.6, 1.8 Hz, 2H), 3.22 (s, 2H), 2.78 (s, 3H), 2.77 (s, 3H), 2.26 – 2.19 (m, 2H), 2.14 (td,J = 12.4, 4.3 Hz, 1H), 1.97 – 1.90 (m, 2H)。MS (ESI,正離子) m/z: 384.4 (M+1)。
實例69 [3-({1-環丁基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]二甲胺鹽酸鹽使用實例67所述之合成程序製備標題化合物,但改變步驟1如下: 向在環境溫度下在氬下的三級丁基7-(苄氧基)-1-氯-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(參考 5 ;300.00 mg;0.68 mmol;1.00 eq.)與1,1'-雙(二苯基膦基)二茂鐵]二氯鈀(II) (50.01 mg; 0.07 mmol; 0.10 eq.)在1,4-二烷(6.84 mL)中的混合物逐滴加入溴(環丁基)鋅(2.73 mL; 0.50 mol/L; 1.37 mmol; 2.00 eq.)。添加完成後,將混合物在氬下加熱至80℃。在2h後,將混合物冷卻至環境溫度,加入水並將懸浮液劇烈攪拌10分鐘。然後用EtOAc萃取混合物。將有機相用鹽水洗滌一次並將合併的水相用EtOAc回萃。將合併的有機相在MgSO4 上乾燥、過濾並濃縮。將殘餘物藉由管柱層析法(24 G ISCO Gold)以含0至50% EtOAc的庚烷洗提純化,獲得三級丁基7-(苄氧基)-1-環丁基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯與未反應起始材料的幾乎完全分離。此材料不經進一步純化用於下一步驟(95 mg;30%產率)。
在步驟3後,獲得[3-({1-環丁基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]二甲胺鹽酸鹽為白色粉末(54 mg)。1 H NMR (400 MHz, DMSO-d 6 ) δ 14.25 (s, 1H), 13.09 (s, 1H), 10.45 (s, 1H), 8.34 (d,J = 6.8 Hz, 1H), 7.79 (d,J = 6.7 Hz, 1H), 7.67 (s, 1H), 7.31 (s, 1H), 4.73 (p,J = 8.7 Hz, 1H), 4.19 (t,J = 6.1 Hz, 2H), 3.94 (s, 3H), 3.22 (q,J = 7.3, 5.7 Hz, 2H), 2.78 (s, 3H), 2.77 (s, 3H), 2.60 (td,J = 8.8, 8.3, 5.7 Hz, 4H), 2.31 – 2.23 (m, 1H), 2.24 - 2.16 (m, 2H), 2.01 - 1.92 (m, 1H)。MS (ESI,正離子) m/z: 354.4 (M+1)。
實例70 [2-({8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)乙基]二甲胺鹽酸鹽
步驟1 將三級丁基7-(苄氧基)-1-氯-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(參考 5 610.00 mg; 1.39 mmol; 1.00 eq.)與碳載鈀(29.58 mg; 0.28 mmol; 0.20 eq.)在四氫呋喃(13.90 mL)中的混合物在來自氣球的H2 氣氛下攪拌。在24 h後,將混合物與額外的MeOH過濾並濃縮。粗製橘色油狀物不經進一步純化用於下一步驟,假定100%產率。
步驟2 將三級丁基7-羥基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(100.00 mg; 0.32 mmol; 1.00 eq.)、2-(二甲基胺基)乙醇(0.04 mL; 0.35 mmol; 1.10 eq.)與(三丁基亞磷基(tributylphosphoranylidene))乙腈(153.56 mg; 0.64 mmol; 2.00 eq.)在甲苯(1.06 mL)中的混合物加熱至110℃。在30分鐘後,將混合物冷卻至環境溫度並在真空中濃縮。將殘餘物溶於DMF及1N HCl中(總共1.5 mL)並藉由製備型HPLC純化(Phenomenex Luna C18,21 × 250 mm,0至60%乙腈/0.1% HCl水溶液梯度13分鐘,流速22 ml/min),提供[2-({8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)乙基]二甲胺鹽酸鹽為褐色固體。12.9 mg。1 H NMR (400 MHz, DMSO-d 6 ;含有2滴D2 O) δ 9.53 (s, 1H), 8.47 (dd,J = 6.7, 0.9 Hz, 1H), 8.04 (s, 1H), 7.90 (d,J = 6.7 Hz, 1H), 7.38 (s, 1H), 4.46 (t,J = 5.0 Hz, 2H), 3.87 (s, 3H), 3.57 (t,J = 5.0 Hz, 2H), 2.88 (s, 6H)。MS (ESI,正離子) m/z: 286.4 (M+1)。
實例71 1-[2-({8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)乙基]吡咯啶鹽酸鹽使用實例70所述之合成程序製備標題化合物,但改變步驟2如下: 將三級丁基7-羥基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(100.00 mg; 0.32 mmol; 1.00 eq.)、2-(1-吡咯啶基)乙醇(146.56 mg; 1.27 mmol; 4.00 eq.)與(三丁基亞磷基(tributylphosphoranylidene))乙腈(153.56 mg; 0.64 mmol; 2.00 eq.)在甲苯(1.06 mL)中的混合物加熱至115℃。在1 h後,將混合物冷卻至環境溫度並在真空中濃縮。將粗製深色油溶於DCM (1 mL)中並在環境溫度下用TFA (0.5 mL)處理。在3 h後,將混合物在真空中濃縮。將殘餘物溶於1N HCl中(總共1.5 mL)並藉由製備型HPLC純化(Phenomenex Luna C18,21 × 250 mm,0至40%乙腈/0.1% HCl水溶液梯度13分鐘,流速22 ml/min),提供1-[2-({8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)乙基]吡咯啶鹽酸鹽為灰白色固體28.9 mg。1 H NMR (400 MHz, DMSO-d 6 ) δ 13.09 (s, 1H), 11.19 (s, 1H), 9.60 (s, 1H), 8.51 (d,J = 6.7 Hz, 1H), 8.10 (s, 1H), 7.91 (d,J = 6.7 Hz, 1H), 7.36 (s, 1H), 4.50 (t,J = 5.0 Hz, 2H), 3.89 (s, 3H), 3.68 - 3.57 (m, 4H), 3.13 (br s, 2H), 1.99 (br s, 2H), 1.88 (br s, 2H)。MS (ESI,正離子) m/z: 312.3 (M+1)。
實例72 1-[3-({8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]吖呾鹽酸鹽使用實例70所述之合成程序製備標題化合物,但改變步驟2如下: 將三級丁基7-羥基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(140.00 mg; 0.45 mmol; 1.00 eq.)、3-(吖呾-1-基)丙-1-醇(205.19 mg; 1.78 mmol; 4.00 eq.)與(三丁基亞磷基(tributylphosphoranylidene))乙腈(214.99 mg; 0.89 mmol; 2.00 eq.)在甲苯(1.48 mL)中的混合物加熱至115℃。在0.5 h LC/MS後,將混合物冷卻至環境溫度並在真空中濃縮。將粗製深色油溶於DCM (1.5 mL)中並在環境溫度下用TFA (1.3 mL)處理。在2 h後,將混合物在真空中濃縮。將殘餘物溶於1N HCl (1.5 mL)及DMF (0.5 mL)中並藉由製備型HPLC純化(Phenomenex Luna C18,21 × 250 mm,0至40%乙腈/0.1% HCl水溶液梯度13分鐘,流速22 ml/min),提供1-[3-({8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]吖呾鹽酸鹽,12.5 mg。1 H NMR (400 MHz, DMSO-d 6 ) δ 13.00 (s, 1H), 10.56 (s, 1H), 9.57 (s, 1H), 8.51 (d,J = 6.7 Hz, 1H), 8.05 (s, 1H), 7.90 (d,J = 6.7 Hz, 1H), 7.28 (s, 1H), 4.17 (t,J = 6.1 Hz, 2H), 4.10 (dt,J = 8.8, 5.5 Hz, 2H), 4.03 – 3.94 (m, 2H), 3.18 - 3.28 (m, 2H), 2.42 – 2.33 (m, 1H), 2.26 (ddd,J = 10.7, 7.9, 4.4 Hz, 1H), 2.02 (p,J = 6.5 Hz, 2H)。MS (ESI,正離子) m/z: 312.3 (M+1)。
實例73 1-(3-{[8-甲氧基-1-(烷-4-基氧基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基]氧基}丙基)吡咯啶三氟乙酸鹽
步驟1 在100-mL圓底燒瓶中,放入3-溴吡啶-2-醇(4 g, 22.99 mmol, 1.00 eq.)、四氫呋喃(40 mL)、四氫-2H-哌喃-4-醇(2.34 g, 22.91 mmol, 1.00 eq.)、PPh3 (7.23 g, 27.56 mmol, 1.20 eq.),然後逐滴加入DEAD (4.8 g, 27.56 mmol, 1.20 eq.)。將所得溶液在25℃下攪拌1 h。將所得混合物在真空下濃縮。將殘餘物用乙酸乙酯/石油醚(1:5)施加至矽膠管柱上。合併收集的流份並在真空下濃縮。這導致2.58 g (43%)的3-溴-2-((四氫-2H-哌喃-4-基)氧基)吡啶(無色油狀物)。MS (ESI,正離子) m/z: 258.1 (M+1)。
步驟2 在100-mL圓底燒瓶中,放入2-[4-(苄氧基)-5-甲氧基-2-硝基苯基]-4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧雜硼雜環戊烷(850 mg, 2.21 mmol, 1.00 eq.)、二烷(30 mL)、水(10 mL)、3-溴-2-((四氫-2H-哌喃-4-基)氧基)吡啶(570 mg, 2.21 mmol, 1.00 eq.)、Cs2 CO3 (2158 mg, 6.62 mmol, 3.00 eq.)、Pd(PPh3 )4 (255 mg, 0.22 mmol, 0.10 eq.)。將所得溶液在100℃下攪拌6 h。將所得混合物在真空下濃縮。將所得溶液用50 mL的EA稀釋並用2×30 mL的水洗滌。將殘餘物用乙酸乙酯/石油醚(1:3)施加至矽膠管柱上。合併收集的流份並在真空下濃縮。這導致285 mg (30%)的3-(4-(苄氧基)-5-甲氧基-2-硝基苯基)-2-((四氫-2H-哌喃-4-基)氧基)吡啶(黃色固體)。MS (ESI,正離子) m/z: 437.2 (M+1)。
步驟3 在50-mL圓底燒瓶中,放入3-(4-(苄氧基)-5-甲氧基-2-硝基苯基)-2-((四氫-2H-哌喃-4-基)氧基)吡啶(285 mg, 0.65 mmol, 1.00 eq.)、P(OEt)3 (8 mL)。將所得溶液在130℃下攪拌24 h。將所得混合物在真空下濃縮。將殘餘物用乙酸乙酯/石油醚(1:1)施加至矽膠管柱上。合併收集的流份並在真空下濃縮。這導致120 mg (45%)的7-(苄氧基)-8-甲氧基-1-((四氫-2H-哌喃-4-基)氧基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚(淺黃色固體)。MS (ESI,正離子) m/z: 405.2 (M+1)。
步驟4 在50-mL圓底燒瓶中,放入7-(苄氧基)-8-甲氧基-1-((四氫-2H-哌喃-4-基)氧基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚(120 mg, 0.30 mmol, 1.00 eq.)、四氫呋喃(10 mL)、4-二甲基胺基吡啶(36 mg, 0.29 mmol, 1.00 eq.)、Boc2 O (65 mg, 0.30 mmol, 1.00 eq.)。將所得溶液在25℃下攪拌6 h。將所得混合物在真空下濃縮。將殘餘物用乙酸乙酯/石油醚(1:4)施加至矽膠管柱上。合併收集的流份並在真空下濃縮。這導致130 mg (87%)的三級丁基7-(苄氧基)-8-甲氧基-1-((四氫-2H-哌喃-4-基)氧基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(黃色固體)。MS (ESI,正離子) m/z: 405.2 (M+1)。
步驟5 向含三級丁基7-(苄氧基)-8-甲氧基-1-((四氫-2H-哌喃-4-基)氧基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(120 mg, 0.24 mmol, 1.00 eq.)的MeOH (12 mL)溶液加入12 mg的10% Pd/C(50%水分)。將混合物除氣並用氫吹掃三次。將所得混合物在室溫下在H2 氣氛下攪拌4h。濾出固體。將所得混合物在真空下濃縮。這導致80 mg (81%)的三級丁基7-羥基-8-甲氧基-1-((四氫-2H-哌喃-4-基)氧基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(淺黃色固體)。MS (ESI,正離子) m/z: 405.2 (M+1)。
步驟6 在50-mL圓底燒瓶中,放入三級丁基7-羥基-8-甲氧基-1-(烷-4-基氧基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(80 mg, 0.19 mmol, 1.00 eq.)、MeCN (6 mL)、1-(3-氯丙基)吡咯啶鹽酸鹽(36 mg, 0.20 mmol, 1.00 eq.)、碳酸鉀(80 mg, 0.58 mmol, 3.00 eq.)。將所得溶液在60℃下攪拌3 h。將反應混合物冷卻至室溫。濾出固體。將所得混合物在真空下濃縮。這導致98 mg (97%)的三級丁基8-甲氧基-7-(3-(吡咯啶-1-基)丙氧基)-1-((四氫-2H-哌喃-4-基)氧基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(黃色固體)。MS (ESI,正離子) m/z: 526.3 (M+1)。
步驟7 在50-mL圓底燒瓶中,放入三級丁基8-甲氧基-7-(3-(吡咯啶-1-基)丙氧基)-1-((四氫-2H-哌喃-4-基)氧基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(88 mg, 0.17 mmol, 1.00 eq.)、二氯甲烷(5 mL)、氯化氫(g)/二烷(1 mL, 2M)。將所得溶液在25℃下攪拌1 h。將所得混合物在真空下濃縮。將粗反應混合物過濾並進行逆相製備型HPLC(Waters SunFire管柱,19 × 150 mm;含10% MeCN的水至含20% MeCN的水梯度洗提10 min期間,其中兩種溶劑均含有0.05% TFA),提供標題化合物為淺黃色固體(18.4 mg, 20%)。1 H NMR (300 MHz, DMSO-d6 ):δ 11.60 (br, 1H), 9.50 (s, 1H), 7.90 (d,J = 5.9 Hz, 1H), 7.62 (s, 1H), 7.21 – 7.07 (m, 2H), 5.54 (dq,J = 8.2, 4.3, 3.8 Hz, 1H), 4.17 (t,J = 5.9 Hz, 2H), 4.02 – 3.89 (m, 2H), 3.65 (qd,J = 9.8, 7.9, 5.2 Hz, 4H), 3.37 (q,J = 6.8 Hz, 2H), 3.08 (dq,J = 13.9, 7.5 Hz, 2H), 2.27-1.87 (m,10 H)。MS (ESI,正離子) m/z: 426.2 (M+1)。
實例74 3-({8-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基}氧基)吡咯啶雙(2,2,2-三氟乙酸鹽)如以上實例73步驟1至7所述製備標題化合物,但將四氫-2H-哌喃-4-醇取代為三級丁基3-羥基吡咯啶-1-羧酸酯。1 H NMR (300 MHz, DMSO-d6 )δ 11.63 (s, 1H), 9.70 (br, 1H), 9.30 (br, 1H), 9.14 (br, 1H), 7.91(d,J= 5.7 Hz, 1H), 7.64 (s, 1H), 7.16-7.13 (m, 2H), 5.87 (d,J =3.6 Hz, 1H), 4.15 (t,J =5.9 Hz, 2H), 3.90 (s, 3H), 3.66-3.49 (m, 6H), 3.47-3.40 (m, 2H), 3.47-3.33 (m, 2H), 3.13-3.05 (m, 2H), 2.42-2.38 (m, 2H), 2.28-2.17 (m, 2H), 2.13-2.06 (m, 2H), 1.95-1.87 (m, 2H)。MS (ESI,正離子) m/z: 411.2 (M+1)。
實例75 1-(3-{[8-甲氧基-1-(丙烷-2-基氧基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基]氧基}丙基)吡咯啶三氟乙酸鹽如以上實例73步驟1至7所述製備標題化合物,但將四氫-2H-哌喃-4-醇取代為異丙醇。1 H NMR (300 MHz, DMSO-d6 )δ 11.60 (s, 1H), 9.48 (br, 1H), 7.90 (d,J= 6.0 Hz, 1H), 7.59 (s, 1H), 7.14 (s, 1H), 7.10 (d,J= 6.0 Hz, 1H), 5.54-5.46 (m, 1H), 4.16 (t,J= 6.0 Hz, 2H), 3.88 (s, 3H), 3.67-3.65 (m, 2H), 3.41-3.34 (m, 2H), 3.11-3.05 (m, 2H), 2.22-2.17 (m, 2H), 2.07-1.93 (m, 2H), 1.95-1.89 (m, 2H), 1.46 (d,J= 6.0 Hz, 3H) MS (ESI,正離子) m/z: 384.2 (M+1)。
實例76 1-{8-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基}-1H-咪唑三氟乙酸鹽
步驟1 在用氮的惰性氣氛吹掃並維持的40-mL小瓶中,放入參考 5 三級丁基7-(苄氧基)-1-氯-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(1.0 g, 2.28 mmol, 1.00 eq.)、DMSO (20 mL)、咪唑(1.55 g, 22.77 mmol, 10.00 eq.)、Cu2 O (33 mg, 0.23 mmol, 0.10 eq.)、茚三酮(81 mg, 0.456 mmol, 0.20 eq.)與氫氧化鉀(255 mg, 4.54 mmol, 2.00 eq.)的混合物。將所得混合物在氮氣氛下在150℃下攪拌24小時。將反應混合物冷卻至室溫。將所得溶液倒入H2 O (200 mL)中、用乙酸乙酯(3×150 mL)萃取。將合併的有機層用鹽水(150 mL)洗滌、在無水硫酸鈉上乾燥並在真空下濃縮。將殘餘物藉由急速管柱以EtOAc/DCM (3/1)洗提純化。這導致500 mg (59%)的標題化合物(棕色固體)。MS (ESI,正離子) m/z: 371.1 (M+1)。
步驟2 在40-mL小瓶中,放入1-[7-(苄氧基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基]-1H-咪唑(500 mg, 1.35 mmol, 1.00 eq.)、四氫呋喃(10 mL)、Boc2 O (443 mg, 2.03 mmol, 1.50 eq.)與4-二甲基胺基吡啶(41 mg, 0.34 mmol, 0.25 eq.)的混合物。將所得溶液在室溫下攪拌1小時。將溶液在真空下濃縮。將殘餘物用MeOH (50 mL)研磨。藉由過濾收集固體。這導致365 mg (57%)的三級丁基7-(苄氧基)-1-(1H-咪唑-1-基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯。MS (ESI,正離子) m/z: 471.2 (M+1)。
步驟3 在50-mL圓底燒瓶中,放入含三級丁基7-(苄氧基)-1-(1H-咪唑-1-基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(350 mg, 0.74 mmol, 1.00 eq.)的甲醇(20 mL)溶液。向其加入10%碳載鈀(105 mg,濕)。將燒瓶真空化並用氫沖洗三次。將混合物在室溫下在氫(氣球)氣氛下攪拌16小時。濾出固體。將濾餅用甲醇(3 × 50 mL)及DCM/MeOH (V/V=10/1, 20 mL)洗滌。將濾液在真空下濃縮。這導致215 mg (76%)的三級丁基7-羥基-1-(1H-咪唑-1-基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯。MS (ESI,正離子) m/z: 381.1 (M+1)。
步驟4 在40-mL小瓶中,放入三級丁基7-羥基-1-(1H-咪唑-1-基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(100 mg, 0.26 mmol, 1.00 eq.)、CH3 CN (15 mL)、1-(3-氯丙基)吡咯啶鹽酸鹽(73 mg, 0.39 mmol, 1.50 eq.)、Cs2 CO3 (257 mg, 3.00 eq.)與KI (66 mg, 0.39 mmol, 1.50 eq.)的混合物。將所得混合物在80℃下攪拌16小時。將粗反應混合物過濾並進行逆相製備型HPLC(Waters SunFire管柱,19 × 150 mm;含2% MeCN的水至含15% MeCN的水梯度洗提10 min期間,其中兩種溶劑均含有0.05% TFA)。這導致10.9 mg (11%)的標題化合物(棕色油狀物)。1 H NMR (300 MHz, DMSO-d6 , ppm ): 12.17 (s, 1H), 9.97 (s, 1H), 8.46 (d,J =1.5 Hz, 1H), 8.33-8.29 (m, 2H), 8.18 (s, 1H), 7.67 (d,J =5.7 Hz, 1H), 7.10 (s, 1H), 6.91 (s, 1H), 4.44 (d,J =6.9 Hz, 2H), 3.75 (s, 3H), 2.53-2.50 (m, 2H), 2.48-2.44 (m, 4H), 2.18-2.09 (m, 2H), 1.70-1.63 (m, 4H)。MS (ESI,正離子) m/z: 392.2 (M+1)。
實例77 1-[8-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基]-1H-吡唑三氟乙酸鹽如以上實例76步驟1至4所述製備標題化合物,但將咪唑取代為吡唑。1 H NMR (300 MHz, DMSO-d6 )δ 11.60 (s, 1H), 9.48 (br, 1H), 7.90 (d,J= 6.0 Hz, 1H), 7.59 (s, 1H), 7.14 (s, 1H), 7.10 (d,J= 6.0 Hz, 1H), 5.54-5.46 (m, 1H), 4.16 (t,J= 6.0 Hz, 2H), 3.88 (s, 3H), 3.67-3.65 (m, 2H), 3.41-3.34 (m, 2H), 3.11-3.05 (m, 2H), 2.22-2.17 (m, 2H), 2.07-1.93 (m, 2H), 1.95-1.89 (m, 2H), 1.46 (d,J= 6.0 Hz, 3H) MS (ESI,正離子) m/z: 384.2 (M+1)。
實例78 5-{8-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基}-1,3-噻唑三氟乙酸鹽
步驟1 在用氮的惰性氣氛吹掃並維持的25-mL圓底燒瓶中,放入三級丁基7-(苄氧基)-1-氯-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(1.0 g, 2.28 mmol, 1.00 eq.)、甲苯(10 mL)、5-(三丁基錫烷基)-1,3-噻唑(1278 mg, 3.42 mmol, 1.50 eq.)、Pd(PPh4 )3 (132 mg, 0.11 mmol, 0.05 eq.)的混合物。將所得溶液在110℃下攪拌16 h。將反應混合物在真空下濃縮。將殘餘物藉由矽膠管柱以乙酸乙酯/石油醚(1:1)洗提純化,提供三級丁基7-(苄氧基)-8-甲氧基-1-(1,3-噻唑-5-基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(610 mg, 55%)為白色固體。MS (ESI,正離子) m/z: 488.2 (M+1)。
步驟2 在10-mL圓底燒瓶中,放入含三級丁基7-(苄氧基)-8-甲氧基-1-(1,3-噻唑-5-基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(300 mg, 0.62 mmol, 1.00 eq.)的三氟乙酸(5 mL)溶液。將所得溶液在50℃下攪拌16 h。將溶液在真空下濃縮,提供8-甲氧基-1-(1,3-噻唑-5-基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-醇(400 mg,粗製)為黃色固體。MS (ESI,正離子) m/z: 298.1 (M+1)。
步驟3 在用氮的惰性氣氛吹掃並維持的10-mL圓底燒瓶中,放入8-甲氧基-1-(1,3-噻唑-5-基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-醇(300 mg, 1.01 mmol, 1.00 eq.)、N,N-二甲基甲醯胺(5 mL)、1-(3-氯丙基)吡咯啶鹽酸鹽(94 mg, 0.50 mmol, 0.50 eq.)、Cs2 CO3 (659 mg, 2.02 mmol, 2.00 eq.)與KI (17 mg, 0.10 mmol, 0.10 eq.)的混合物。將所得混合物在80℃下攪拌16 h。將粗反應混合物過濾並進行逆相製備型HPLC(Waters SunFire管柱,19 × 150 mm;含15% MeCN的水至含29% MeCN的水梯度洗提10 min期間,其中兩種溶劑均含有0.05% TFA),提供標題化合物(36.9 mg, 9%)為淺黃色固體。1 H NMR (300 MHz, DMSO-d6 ): δ 11.83 (s, 1H), 9.31 (s, 1H), 8.53 (s, 1H), 8.37 (d,J =5.4 Hz, 1H), 7.50 (s, 1H), 7.47 (d,J =5.7 Hz, H), 7.18 (s, 1H), 4.19 (t,J =6.0 Hz, 2H), 3.75 (s, 3H), 3.39-3.30 (m, 2H), 3.20-3.12 (m, 4H), 2.21-2.14 (m, 2H), 1.94-1.85 (m, 4H)。MS (ESI,正離子) m/z: 409.1 (M+1)。
實例79 {8-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-3-基}甲醇三氟乙酸鹽
步驟1 在100-mL圓底燒瓶中,放入1-(苄氧基)-4-溴-2-甲氧基-5-硝基苯(2.0 g, 5.91 mmol, 1.00 eq.)、二烷(50 mL)、水(10 mL)、[6-(甲氧基羰基)吡啶-3-基]硼酸(1.61 g, 8.90 mmol, 1.50 eq.)、Cs2 CO3 (5.78 g, 17.74 mmol, 3.00 eq.)與Pd(PPh3 )4 (0.34 g, 0.30 mmol, 0.05 eq.)的混合物。將所得混合物在N2 下在80℃下攪拌3 h,並且在真空下濃縮。將殘餘物藉由矽膠管柱以乙酸乙酯/石油醚(1/1)洗提純化,提供甲基5-(4-(苄氧基)-5-甲氧基-2-硝基苯基)吡啶甲酯(1.47 g, 63%)。MS (ESI,正離子) m/z: 395.1 (M+1)。
步驟2 將含甲基5-[4-(苄氧基)-5-甲氧基-2-硝基苯基]吡啶-2-羧酸酯(1.45 g, 3.68 mmol, 1.00 eq.)的P(OEt)3 (20 mL)溶液在130℃下攪拌16 h。將反應混合物在真空下濃縮。將殘餘物溶於DMF (10 mL)中、過濾並進行逆相製備型HPLC(Waters SunFire管柱,19 × 150 mm;含20% MeCN的水至含30% MeCN的水梯度洗提10 min期間,其中兩種溶劑均含有0.05% TFA),提供甲基7-(苄氧基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-3-羧酸酯(0.32 g, 24%)。MS (ESI,正離子) m/z: 363.1 (M+1)。
步驟3 在25-mL圓底燒瓶中,放入含甲基7-(苄氧基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-3-羧酸酯(500 mg, 1.38 mmol, 1.00 eq.)、THF (10 mL)、4-二甲基胺基吡啶(17 mg, 0.14 mmol, 0.10 eq.)及Boc2 O (602 mg, 2.76 mmol, 2.00 eq.)的溶液。將所得溶液在室溫下攪拌6 h並在真空下濃縮。將殘餘物藉由矽膠管柱以乙酸乙酯/石油醚(1/1)洗提純化,提供5-(三級丁基) 3-甲基7-(苄氧基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-3,5-二羧酸酯(140 mg, 22%)。MS (ESI,正離子) m/z: 463.2 (M+1)。
步驟4 向5-三級丁基3-甲基7-(苄氧基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-3,5-二羧酸酯(130 mg, 0.28 mmol, 1.00 eq.)在甲醇(26 mL)中的混合物加入130 mg的10% Pd/C(60%水分)。將混合物除氣並用氫吹掃三次。將所得混合物在室溫下在H2 氣氛下攪拌6 h。濾出固體,並將濾液在真空下濃縮。這導致100 mg (96%)的5-(三級丁基)3-甲基7-羥基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-3,5-二羧酸酯。MS (ESI,正離子) m/z: 373.1 (M+1)。
步驟5 在25-mL圓底燒瓶中,放入5-三級丁基3-甲基7-羥基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-3,5-二羧酸酯(100 mg, 0.27 mmol, 1.00 eq.)、MeCN (10 mL)、1-(3-氯丙基)吡咯啶鹽酸鹽(49 mg, 0.27 mmol, 1.00 eq.)與碳酸鉀(111 mg, 0.80 mmol, 3.00 eq.)的混合物。將所得混合物在60℃下攪拌6 h並在真空下濃縮。將殘餘物藉由矽膠管柱以乙酸乙酯/石油醚(1/1)洗提純化,提供5-(三級丁基)3-甲基8-甲氧基-7-(3-(吡咯啶-1-基)丙氧基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-3,5-二羧酸酯(98 mg, 75%)。MS (ESI,正離子) m/z: 484.2 (M+1)。
步驟6 向在0℃下的5-三級丁基3-甲基8-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-3,5-二羧酸酯(98 mg, 0.20 mmol, 1.00 eq.)在THF (10 mL)中的混合物分批加入LiAlH4 (15 mg, 0.40 mmol, 2.00 eq.)。將所得混合物在N2 下在25℃下攪拌1 h。將反應混合物用THF (10 mL)稀釋、用水(0.1 mL)淬熄並在真空下濃縮。將殘餘物溶於DMF (5 mL)中、過濾並進行逆相製備型HPLC(Waters SunFire管柱,19 × 150 mm;含15% MeCN的水至含25% MeCN的水梯度洗提10 min期間,其中兩種溶劑均含有0.05% TFA),提供標題化合物為灰色固體(19.1 mg, 16%)。1 H NMR (300 MHz, DMSO-d6 )δ 14.46 (br, 1H), 12.76 (s, 1H), 9.62 (br, 1H), 9.54 (s, 1H), 8.09 (s, 1H), 7.83 (s, 1H), 7.28 (s, 1H), 6.20 (br, 1H), 4.91 (s, 2H), 4.21 (t,J =5.4 Hz, 2H), 3.91 (s, 3H), 3.75-3.65 (m, 2H), 3.37-3.31 (m, 2H), 3.12-3.05 (m, 2H), 2.24-2.14 (m, 2H), 2.06-1.96 (m, 2H), 1.94-1.88 (m, 2H)。MS (ESI,正離子) m/z: 356.2 (M+1)。
實例80 8-甲氧基-7-(3-(吡咯啶-1-基)丙氧基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-3-醇甲酸鹽
步驟1 在250-mL圓底燒瓶中,放入1-(苄氧基)-4-溴-2-甲氧基-5-硝基苯(參考 1 )(2.0 g, 5.91 mmol, 1.00 eq.)、二烷(100 mL)、水(20 mL)、2-甲氧基-5-(四甲基-1,3,2-二氧雜硼雜環戊-2-基)吡啶(2.1 g, 8.93 mmol, 1.50 eq.)、Cs2 CO3 (5.78 g, 17.74 mmol, 3.00 eq.)與Pd(PPh3 )4 (340 mg, 0.29 mmol, 0.05 eq.)的混合物。將所得混合物在N2 下在80℃下攪拌8 h。將反應混合物冷卻至室溫並在真空下濃縮。將殘餘物藉由矽膠管柱以乙酸乙酯/石油醚(1/2)洗提純化,提供5-(4-(苄氧基)-5-甲氧基-2-硝基苯基)-2-甲氧基吡啶(1.25 g, 58%)。MS (ESI,正離子) m/z: 367.1 (M+1)。
步驟2 將含5-[4-(苄氧基)-5-甲氧基-2-硝基苯基]-2-甲氧基吡啶(1.15 g, 3.14 mmol, 1.00 eq.)的P(OEt)3 (20 mL)溶液在130℃下攪拌24 h。將反應溶液冷卻至室溫並在真空下濃縮。將殘餘物藉由矽膠管柱以乙酸乙酯/石油醚(1/1)洗提純化,提供7-(苄氧基)-3,8-二甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚(210 mg, 20%)。MS (ESI,正離子) m/z: 335.1 (M+1)。
步驟3 在25-mL圓底燒瓶中,放入含7-(苄氧基)-3,8-二甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚(210 mg, 0.63 mmol, 1.00 eq.)、THF (10 mL)、4-二甲基胺基吡啶(7 mg, 0.06 mmol, 0.10 eq.)及Boc2 O (270 mg, 1.24 mmol, 2.00 eq.)的溶液。將所得溶液在25℃下攪拌3 h並在真空下濃縮。將殘餘物藉由矽膠管柱以乙酸乙酯/石油醚(1/3)洗提純化,提供三級丁基7-(苄氧基)-3,8-二甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(230 mg, 84%)。MS (ESI,正離子) m/z: 435.2 (M+1)。
步驟4 向三級丁基7-(苄氧基)-3,8-二甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(220 mg, 0.51 mmol, 1.00 eq.)在MeOH (22 mL)中的混合物加入220 mg的10% Pd/C(60%水分)。將混合物除氣並用氫吹掃三次。將所得混合物在室溫下在H2 氣氛下攪拌6 h。濾出固體,並將濾液在真空下濃縮。這導致156 mg (89%)的三級丁基7-羥基-3,8-二甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯。MS (ESI,正離子) m/z: 345.1 (M+1)。
步驟5 在25-mL圓底燒瓶中,放入三級丁基7-羥基-3,8-二甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(150 mg, 0.44 mmol, 1.00 eq.)、MeCN (10 mL)、1-(3-氯丙基)吡咯啶鹽酸鹽(80 mg, 0.43 mmol, 1.00 eq.)與碳酸鉀(181 mg, 1.31 mmol, 3.00 eq.)的混合物。將所得混合物在60℃下攪拌6 h。將反應混合物冷卻至室溫。濾出固體,並將濾液在真空下濃縮。這導致135 mg (68%)的三級丁基3,8-二甲氧基-7-(3-(吡咯啶-1-基)丙氧基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯。MS (ESI,正離子) m/z: 456.2 (M+1)。
步驟6 在25-mL圓底燒瓶中,放入含三級丁基3,8-二甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(125 mg, 0.27 mmol, 1.00 eq.)、乙醇(5 mL)及濃縮HCl (aq., 5 mL)的溶液。將所得溶液在80℃下攪拌16 h。將反應混合物冷卻至室溫並在真空下濃縮。將殘餘物溶於DMF (5 mL)中、過濾並進行逆相製備型HPLC(Waters SunFire管柱,19 × 150 mm;含15% MeCN的水至含25% MeCN的水梯度洗提10 min期間,其中兩種溶劑均含有0.1%甲酸),提供標題化合物為淺黃色固體(42.6 mg, 40%)。1 H NMR (300 MHz, DMSO-d6 )δ 11.0 (s, 1H), 8.69 (s, 1H), 8.15 (s, 1H), 7.45 (s, 1H), 6.98 (s, 1H), 6.62 (s, 1H), 4.11 (t,J= 6.0 Hz,, 2H), 3.88 (s, 3H), 3.14-3.03 (m, 6H), 2.11-2.06 (m, 2H), 1.90-1.85 (m, 4H)。MS (ESI,正離子) m/z: 342.2 (M+1)。
實例81 4-[8-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基]-1H-吡唑鹽酸鹽
步驟1 向在0℃下的含7-(苄氧基)-1-氯-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚(參考 5 步驟2)(3.2 g, 9.45 mmol, 1.00 eq.)的二氯甲烷(50 mL)溶液加入TEA (1.9 g, 18.90 mmol, 2.00 eq.)隨後加入TsCl (2.2 g, 11.34 mmol, 1.20 eq.)及4-二甲基胺基吡啶(116 mg, 0.95 mmol, 0.10 eq.)。將所得溶液在室溫下攪拌1 h並在真空下濃縮。將殘餘物藉由管柱層析法在矽膠上以乙酸乙酯/石油醚(1/1)洗提純化,提供7-(苄氧基)-1-氯-8-甲氧基-5-[(4-甲苯)磺醯基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚(3.8 g, 82%)。MS (ESI,正離子) m/z: 493.2 (M+1)。
步驟2 將含7-(苄氧基)-1-氯-8-甲氧基-5-[(4-甲苯)磺醯基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚(3.8 g, 7.71 mmol, 1.00 eq.)的三氟乙酸(30 mL)溶液在室溫下攪拌16 h。將所得溶液在真空下濃縮。將殘餘物藉由管柱層析法在矽膠上以二氯甲烷/甲醇(10/1)洗提純化,提供甲基1-氯-8-甲氧基-5-[(4-甲苯)磺醯基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-醇(4.03 g)。MS (ESI,正離子) m/z: 403.1 (M+1)。
步驟3 在250-mL圓底燒瓶中,放入1-氯-8-甲氧基-5-[(4-甲苯)磺醯基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-醇(4.3 g, 10.67 mmol, 1.00 eq.)、CH3 CN (150 mL)、1-(3-氯丙基)吡咯啶鹽酸鹽(2.15 g, 11.74 mmol, 1.10 eq.)、Cs2 CO3 (10.4 g, 32.01 mmol, 3.00 eq.)與KI (178 mg, 1.07 mmol, 0.10 eq.)的混合物。將所得混合物在N2 下在85℃下攪拌2 h。將混合物過濾並將濾餅用CH3 CN (2 × 50 mL)洗滌。將合併的濾液在真空下濃縮。將殘餘物藉由管柱層析法在矽膠上以二氯甲烷/甲醇(10/1)洗提純化,提供1-[3-([1-氯-8-甲氧基-5-[(4-甲苯)磺醯基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基]氧基)丙基]吡咯啶(1.6 g, 29%)。MS (ESI,正離子) m/z: 514.1 (M+1)。
步驟4 在40-mL小瓶中,放入1-[3-([1-氯-8-甲氧基-5-[(4-甲苯)磺醯基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基]氧基)丙基]吡咯啶(300 mg, 0.58 mmol, 1.00 eq.)、二烷(20 mL)、水(2 mL)、1-[(三級丁氧基)羰基]-1H-吡唑-4-基硼酸(250 mg, 1.16 mmol, 2.00 eq.)、Cs2 CO3 (567 mg, 1.74 mmol, 3.00 eq.)與Pd(PPh3 )4 (35 mg, 0.03 mmol, 0.05 eq.)的混合物。將所得混合物在N2 下在80℃下攪拌8 h,然後在真空下濃縮。將殘餘物藉由管柱層析法在矽膠上以二氯甲烷/甲醇(5/1)洗提純化,提供4-[8-甲氧基-5-[(4-甲苯)磺醯基]-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基]-1H-吡唑(310 mg, 97%)。MS (ESI,正離子) m/z: 546.3 (M+1)。
步驟5 在40-mL小瓶中,放入4-[8-甲氧基-5-[(4-甲苯)磺醯基]-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基]-1H-吡唑(350 mg, 0.64 mmol, 1.00 eq.)、二烷(10 mL)、水(2 mL)與氫氧化鈉(76.8 mg, 1.92 mmol, 3.00 eq.)的混合物。將所得混合物在80℃下攪拌16 h,然後在真空下濃縮。將殘餘物藉由管柱層析法在矽膠上以二氯甲烷/甲醇(6/1)洗提純化,得到游離標題化合物。向含所獲得化合物的DCM (5 mL)加入HCl/二烷(4 M/二烷,1 mL)並攪拌0.5 h。藉由過濾收集固體,提供標題化合物為黃色固體(125.7 mg, 46%)。1 H NMR (300 MHz, DMSO-d6 ) δ 14.96 (br, 1H), 13.46 (s, 1H), 11.20 (br, 1H), 8.50 (s, 1H), 8.48 (s, 1H), 8.40 (d,J =6.0 Hz, 1H), 7.84 (d,J =6.6 Hz, 1H), 7.43 (s, 1H), 7.33 (s, 1H), 4.24 (t,J =5.7 Hz, 2H), 3.76 (s, 3H), 3.59-3.54 (m, 2H), 3.39-3.27 (m, 2H), 3.07-2.99 (m, 2H), 2.32-2.23 (m, 2H), 2.05-1.81 (m, 4H)。MS (ESI,正離子) m/z: 392.2 (M+1)。
實例82 8-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基]甲醇三氟乙酸鹽
步驟1 在50-mL密封管中,放入1-[3-([1-氯-8-甲氧基-5-[(4-甲苯)磺醯基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基]氧基)丙基]吡咯啶(實例81,步驟3)(320 mg, 0.62 mmol, 1.00 eq.)、甲醇(10 mL)、TEA (182 mg, 1.80 mmol, 3.00 eq.)與Pd(dppf)Cl2 (22 mg, 0.03 mmol, 0.05 eq.)的混合物。將混合物除氣並用CO吹掃3次,然後在80℃下在CO (20 atm)下攪拌16 h。將反應混合物在真空下濃縮。將殘餘物藉由管柱層析法在矽膠上以二氯甲烷/甲醇(10/1)洗提純化,提供甲基8-甲氧基-5-[(4-甲苯)磺醯基]-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-羧酸酯(135 mg, 40%)。MS (ESI,正離子) m/z: 538.1 (M+1)。
步驟2 向在0℃下冷卻的[8-甲氧基-5-[(4-甲苯)磺醯基]-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基]甲醇(135 mg, 0.25 mmol, 1.00 eq.)在四氫呋喃(10 mL)中的混合物邊攪拌邊加入LAH (19 mg, 0.5 mmol, 2.0 eq.)。將所得混合物在室溫下攪拌1 h。將反應混合物用四氫呋喃(10 mL)稀釋,用水(0.02 mL)、15%氫氧化鈉水溶液(0.02 mL)及水(0.06 mL)淬熄。將混合物過濾並將濾液在真空下濃縮。將殘餘物用DMF (5 mL)稀釋並進行逆相製備型HPLC(Waters SunFire管柱,19 × 150 mm;含2% MeCN的水至含17% MeCN的水梯度洗提10 min期間,其中兩種溶劑均含有0.05% TFA),提供標題化合物為淺黃色固體(30.4 mg, 17%)。1 H NMR (300 MHz, DMSO-d6 ) δ14.18 (br, 1H), 13.06 (s, 1H), 9.76 (br, 1H), 8.39 (d,J =6.6 Hz, 1H), 7.88 (d,J =6.6 Hz, 1H), 7.62 (s, 1H), 7.36 (s, 1H), 5.47 (s, 2H), 4.23 (t,J =6.0 Hz, 2H), 3.96 (s, 3H), 3.69-3.65 (m, 2H), 3.37-3.35 (m, 2H), 3.10-3.03 (m, 2H), 2.27-2.25 (m, 2H), 2.10-2.06 (m, 2H), 1.96-1.90 (m, 2H)。MS (ESI,正離子) m/z: 356.2 (M+1)。
實例83 3-[8-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基]-4H-1,2,4-三唑甲酸鹽
步驟1 在40-mL小瓶中,放入含甲基8-甲氧基-5-[(4-甲苯)磺醯基]-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-羧酸酯(實例82,步驟1)(350 mg, 0.65 mmol, 1.00 eq.)、乙醇(10 mL)及N2 H4 .H2 O (98%, 5 mL)的溶液。將所得溶液在80℃下攪拌16 h。將反應溶液在真空下濃縮,提供標題化合物為棕色油狀物(320 mg粗製)。MS (ESI,正離子) m/z: 384.2 (M+1)。
步驟2 在40-mL小瓶中,放入含8-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-卡肼(320 mg, 0.83 mmol, 1.00 eq.)、二氯甲烷(10 mL)及DMFDMA (1 mL)的溶液。將所得溶液在50℃下攪拌3 h,然後在真空下濃縮。將殘餘物藉由管柱層析法在矽膠上以二氯甲烷/甲醇(10/1)洗提純化,提供N'-(8-甲氧基-7-(3-(吡咯啶-1-基)丙氧基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-羰基)-N,N-二甲基甲亞肼基醯胺(135 mg, 37%)。MS (ESI,正離子) m/z: 439.3 (M+1)。
步驟3 在5-mL小瓶中,放入N'-(8-甲氧基-7-(3-(吡咯啶-1-基)丙氧基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-羰基)-N,N-二甲基甲亞肼基醯胺(135 mg, 0.31 mmol, 1.00 eq.)、乙酸胺(71.6 mg, 0.93 mmol, 3.00 eq.)及乙酸(5 mL)的溶液。將所得溶液在100℃下攪拌16 h,然後在真空下濃縮。將殘餘物用MeOH (5 mL)稀釋、過濾並進行逆相製備型HPLC(Waters Xbridge管柱,19 × 150 mm;含2% MeCN的水至含18% MeCN的水梯度洗提6 min期間,其中兩種溶劑均含有0.1%甲酸),提供標題化合物為淺棕色固體(22.5 mg, 17%)。1 H NMR (300 MHz, DMSO-d6 )δ 11.74 (br, 1H), 9.26 (s, 1H), 8.46 (d,J =5.4 Hz, 1H), 8.36 (s, 1H), 8.24 (s, 2H), 7.57 (d,J =5.4 Hz, 1H), 7.13 (s, 1H), 4.16 (t,J =6.0 Hz, 2H), 3.88 (s, 3H), 2.87-2.82 (m, 2H), 2.80-2.77 (m, 4H), 2.12-2.04 (m, 2H), 1.82-1.75 (m, 4H)。MS (ESI,正離子) m/z: 393.2 (M+1)。
實例84 1-(1H-咪唑-5-基)-8-甲氧基-7-(3-(吡咯啶-1-基)丙氧基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚三氟乙酸鹽
步驟1 在50-mL圓底燒瓶中,放入1-(3-[[1-氯-8-甲氧基-5-(4-甲苯磺醯基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基]氧基]丙基)吡咯啶(200 mg, 0.39 mmol, 1 eq.)、二烷(5 mL)、水(1 mL)、1-(烷-2-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧雜硼雜環戊-2-基)-1H-咪唑(130 mg, 0.47 mmol, 1.20 eq.)、K2 CO3 (161 mg, 1.17 mmol, 3.00 eq.)、Pd(PPh3 )4 (23 mg, 0.02 mmol, 0.05 eq.)。將所得溶液在N2 下在100℃下攪拌16 h。合併反應混合物並在真空下濃縮。使產物進行逆相製備型HPLC(Waters SunFire管柱,19 × 150 mm;含20% MeCN的水至含30% MeCN的水梯度洗提10 min期間,其中兩種溶劑均含有0.05% TFA),提供8-甲氧基-7-(3-(吡咯啶-1-基)丙氧基)-1-(1-(四氫-2H-哌喃-2-基)-1H-咪唑-5-基)-5-甲苯磺醯基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚(150 mg, 61%)。MS (ESI,正離子) m/z: 630.3 (M+1)。
步驟2 在50-mL圓底燒瓶中,放入8-甲氧基-7-(3-(吡咯啶-1-基)丙氧基)-1-(1-(四氫-2H-哌喃-2-基)-1H-咪唑-5-基)-5-甲苯磺醯基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚(105 mg, 0.17 mmol, 1 eq.)、水(5 mL)、氯化氫(12M, 1 mL)。將所得溶液在25℃下攪拌1 hr。將所得混合物濃縮。這導致100 mg(粗製)的1-(1H-咪唑-5-基)-8-甲氧基-7-(3-(吡咯啶-1-基)丙氧基)-5-甲苯磺醯基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚(淺黃色固體)。MS (ESI,正離子) m/z: 546.2 (M+1)。
步驟3 在50-mL圓底燒瓶中,放入1-(1H-咪唑-5-基)-8-甲氧基-7-(3-(吡咯啶-1-基)丙氧基)-5-甲苯磺醯基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚(100 mg, 0.18 mmol, 1 eq.)、水(2 mL)、二烷(2 mL)、NaOH (15 mg, 0.37 mmol, 2 eq.)。將所得溶液在80℃下攪拌8 hr。將所得混合物在真空下濃縮。將粗反應混合物過濾並進行逆相製備型HPLC(Waters SunFire管柱,19 × 150 mm;含20% MeCN的水至含30% MeCN的水梯度洗提10 min期間,其中兩種溶劑均含有0.05% TFA),提供標題化合物為棕色固體(20.1 mg, 22%)。1 H NMR (300 MHz, DMSO-d6 ): δ13.09 (s, 1H), 9.80 (br, 1H), 8.84 (s, 1H), 8.42-8.40 (m, 1H) , 8.34 (s, 1H), 8.27 (s, 1H), 7.82 (d,J = 6.7 Hz, 1H), 7.31 (s, 1H), 4.23-4.17 (m, 2H), 3.88 (s, 3H), 3.65 (2, 3H), 3.35 (m, 2H), 3.08 (m, 2H), 2.23-1.90 (m, 6H)。MS (ESI,正離子) m/z: 392.2 (M+1)。
實例85 N,N-二乙基-8-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-胺雙甲酸鹽
步驟1 在微波小瓶中,將7-(苄氧基)-4-氯-1-氟-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚(參考 6 )(210 mg; 0.59 mmol; 1.00 eq.)與二乙胺(215 mg; 2.94 mmol; 5.00 eq.)在NMP (2 mL)中的混合物加熱至100℃達6小時。將反應混合物在減壓下濃縮,並藉由矽膠使用含0%至50%乙酸乙酯的己烷純化,得到7-(苄氧基)-4-氯-N,N-二乙基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-胺(200 mg; 82%)。MS (ESI,正離子) m/z: 410.0 (M+1)。
步驟2 在50 mL圓底燒瓶中,將二-三級丁基二碳酸酯(160 mg; 0.73 mmol; 1.50 eq.)加入到7-(苄氧基)-4-氯-N,N-二乙基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-胺(200 mg; 0.49 mmol; 1.00 eq.)與DMAP (12 mg; 0.10 mmol; 0.20 eq.)在乙腈(5 mL)中的混合物。將反應攪拌2小時。將反應混合物在減壓下濃縮,並藉由矽膠管柱使用含0%至30%乙酸乙酯的己烷純化,得到三級丁基7-(苄氧基)-4-氯-1-(二乙基胺基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(240 mg; 96%)。
步驟3 在50 mL圓底燒瓶中,將三級丁基7-(苄氧基)-4-氯-1-(二乙基胺基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(240 mg; 0.47 mmol; 1.00 eq.)與碳載鈀(50 mg; 0.05 mmol; 0.10 eq.)在甲醇(5 mL)中的混合物在經由氣球的氫氣下攪拌2小時。將反應混合物通過矽藻土塞過濾並在減壓下濃縮,得到三級丁基1-(二乙基胺基)-7-羥基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(180 mg; 99%)。MS (ESI,正離子) m/z: 329.9 (M-56)。
步驟4 將三級丁基1-(二乙基胺基)-7-羥基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(200 mg; 0.52 mmol; 1.00 eq.)、1-(3-氯丙基)吡咯啶(143 mg; 0.78 mmol; 1.50 eq.)、與碳酸鉀(215 mg; 1.56 mmol; 3.00 eq.)在10 mL的DMF中的混合物加熱至100℃達16小時。將反應混合物冷卻至rt。將反應混合物用水稀釋。用乙酸乙酯萃取水層。將合併的有機物用MgSO4乾燥、過濾、並在減壓下濃縮。將所得殘餘物用1M HCl (4 mL)稀釋並加熱至50℃達1小時。將水層藉由製備型HPLC純化(Phenomenex Luna C18,21 × 250 mm,0至60%乙腈/0.1%甲酸水溶液梯度13分鐘,流速22 ml/min),得到標題化合物(42 mg; 20%)。1 H NMR (400 MHz,甲醇-d 4 ) δ 8.45 (s, 2H), 7.93 (d,J = 6.3 Hz, 1H), 7.54 (s, 1H), 7.22 (d,J = 6.3 Hz, 1H), 7.20 (s, 1H), 4.28 (t,J = 5.5 Hz, 2H), 3.98 (s, 3H), 3.63 (q,J = 7.1 Hz, 4H), 3.47 (t,J = 7.0 Hz, 6H), 2.40 – 2.23 (m, 2H), 2.21 – 2.05 (m, 4H), 1.19 (t,J = 7.1 Hz, 6H)。MS (ESI,正離子) m/z: 392.2 (M+1)。
實例86 1-{4-氯-8-甲氧基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基}吡咯啶鹽酸鹽
步驟1 將7-(苄氧基)-4-氯-1-氟-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚(參考 6 )(810 mg; 2.27 mmol; 1.00 eq.)與吡咯啶(807 mg; 11.35 mmol; 5.00 eq.)在NMP (8 mL)中的混合物在微波中在100℃下加熱2小時。將反應混合物用水稀釋並用乙酸乙酯萃取。將合併的有機物用MgSO4乾燥、過濾並在減壓下濃縮,得到粗製1-[7-(苄氧基)-4-氯-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基]吡咯啶(926 mg; 99%)。
步驟2 將1-[7-(苄氧基)-4-氯-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基]吡咯啶(310 mg; 0.76 mmol; 1.00 eq.)與銠(5% wt在氧化鋁上)(78 mg; 0.04 mmol; 0.05 eq.)在甲醇(8 mL)中的混合物在經由氣球的氫壓力下攪拌30分鐘。將反應混合物通過矽藻土塞過濾並在減壓下濃縮,得到粗製4-氯-8-甲氧基-1-(吡咯啶-1-基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-醇(241 mg; 99%)。MS (ESI,正離子) m/z: 317.7 (M+1)。
步驟3 將4-氯-8-甲氧基-1-(吡咯啶-1-基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-醇(241 mg; 0.76 mmol; 1.00 eq.)、1-(3-氯丙基)吡咯啶(208 mg; 1.14 mmol; 1.50 eq.)、與碳酸鉀(314 mg; 2.28 mmol; 3.00 eq.)在DMF (5 mL)中的混合物加熱至100℃達16小時。將反應混合物冷卻至rt。過濾並藉由製備型HPLC純化(Phenomenex Luna C18,21 × 250 mm,0至60%乙腈/0.1%甲酸水溶液梯度13分鐘,流速22 ml/min),得到標題化合物(12 mg; 4%)。1 H NMR (400 MHz,甲醇-d 4 ) δ 7.78 (s, 1H), 7.63 (s, 1H), 7.26 (s, 1H), 4.30 (t,J = 5.6 Hz, 2H), 3.97 (s, 7H), 3.89 – 3.76 (m, 2H), 3.50 (t,J = 7.1 Hz, 2H), 3.16 (ddt,J = 11.3, 8.2, 4.4 Hz, 2H), 2.34 (t,J = 6.2 Hz, 2H), 2.20 (h,J = 3.4, 2.7 Hz, 6H), 2.07 (dq,J = 10.8, 5.8, 4.7 Hz, 2H)。MS (ESI,正離子) m/z: 429.2 (M+1)。
實例87 3-[({8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)甲基]哌啶鹽酸鹽將三級丁基7-羥基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(參考 7 )(200.00 mg; 0.64 mmol; 1.00 eq.)、三級丁基3-(溴甲基)-1-哌啶羧酸酯(265.50 mg; 0.95 mmol; 1.50 eq.)、與碳酸鉀(175.61 mg; 1.27 mmol; 2.00 eq.)在乙腈(7 mL)中的混合物加熱至85℃達4小時。將反應混合物冷卻至rt並通過矽藻土塞過濾。將反應混合物在減壓下濃縮,並用5 mL的1M HCl稀釋。將酸性溶液加熱至50℃達1小時並藉由製備型HPLC純化(Phenomenex Luna C18,21 × 250 mm,0至60%乙腈/0.1%HCl水溶液梯度13分鐘,流速22 ml/min),得到標題化合物(146.00 mg; 60%)。1 H NMR (400 MHz,甲醇-d 4 ) δ 9.40 (s, 1H), 8.41 (dd,J = 6.7, 0.9 Hz, 1H), 7.91 (s, 1H), 7.87 (dd,J = 6.8, 0.7 Hz, 1H), 7.30 (s, 1H), 4.18 (dd,J = 9.6, 4.8 Hz, 1H), 4.06 (dd,J = 9.6, 6.9 Hz, 1H), 3.97 (s, 3H), 3.62 (dd,J = 12.6, 3.9 Hz, 1H), 3.44 – 3.33 (m, 1H), 3.00 (dd,J = 13.3, 10.7 Hz, 2H), 2.41 (dq,J = 7.9, 3.9 Hz, 1H), 2.13 – 1.97 (m, 2H), 1.93 – 1.73 (m, 1H), 1.67 – 1.50 (m, 1H)。MS (ESI,正離子) m/z: 429.2 (M+1)。
實例88 [3-({8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]二甲胺鹽酸鹽依照實例87所述的合成序列,自三級丁基7-羥基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(參考 7 )合成標題化合物,不同的是使用(3-氯丙基)二甲胺代替三級丁基3-(溴甲基)-1-哌啶羧酸酯。1 H NMR (400 Mhz,甲醇-d 4 ) δ 9.40 (s, 1H), 8.41 (dd,J = 6.7, 0.9 Hz, 1H), 7.91 (s, 1H), 7.87 (dd,J = 6.8, 0.7 Hz, 1H), 7.30 (s, 1H), 4.18 (dd,J = 9.6, 4.8 Hz, 1H), 4.06 (dd,J = 9.6, 6.9 Hz, 1H), 3.62 (dd,J = 12.6, 3.9 Hz, 1H), 3.44 – 3.33 (m, 1H), 3.00 (dd,J = 13.3, 10.7 Hz, 2H), 2.41 (dq,J = 7.9, 3.9 Hz, 1H), 2.13 – 1.97 (m, 2H), 1.93 – 1.73 (m, 1H), 1.67 – 1.50 (m, 1H)。MS (ESI,正離子) m/z: 300.1 (M+1)。
實例89 1-{8-甲氧基-4-甲基-7-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基}吡咯啶鹽酸鹽
步驟1 將1-[7-(苄氧基)-4-氯-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基]吡咯啶(實例86步驟1)(1.50 g; 3.68 mmol; 1.00 eq.)、二-三級丁基二碳酸酯(1.2 g; 5.52 mmol; 1.50 eq.)、與N,N-二甲基胺基吡啶(90 mg; 0.74 mmol; 0.20 eq.)在二氯甲烷(20 mL)中的混合物攪拌整夜。將反應混合物在減壓下濃縮,並藉由矽膠管柱使用含0%至40%乙酸乙酯的己烷純化,得到三級丁基7-(苄氧基)-4-氯-8-甲氧基-1-(吡咯啶-1-基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(1.45 g; 78%)。MS (ESI,正離子) m/z: 508.2 (M+1)。
步驟2 將三級丁基7-(苄氧基)-4-氯-8-甲氧基-1-(吡咯啶-1-基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(300 mg; 0.59 mmol; 1.00 eq.)、三環己基膦(17 mg; 0.06 mmol; 0.10 eq.)、甲基硼酸(106 mg; 1.77 mmol; 3.00 eq.)、二乙醯氧基鈀(13 mg; 0.06 mmol; 0.10 eq.)、與碳酸鉀(245 mg; 1.77 mmol; 3.00 eq.)在DMF (3 mL)中的混合物在微波中在140℃下加熱1小時。將反應混合物用水稀釋。用乙酸乙酯萃取水層。將合併的有機物用MgSO4 乾燥、過濾、濃縮,並藉由矽膠管柱使用含0%至45%乙酸乙酯的己烷純化,得到三級丁基7-(苄氧基)-8-甲氧基-4-甲基-1-(吡咯啶-1-基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(200 mg; 69%)。MS (ESI,正離子) m/z: 488.0 (M+1)。
步驟3 將三級丁基7-(苄氧基)-8-甲氧基-4-甲基-1-(吡咯啶-1-基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(200 mg; 0.41 mmol; 1.00 eq.)與碳載鈀(44 mg; 0.04 mmol; 0.10 eq.)在甲醇(5 mL)中的混合物在經由氣球的氫壓力下攪拌。將反應混合物攪拌1小時。將反應混合物通過矽藻土塞過濾並在減壓下濃縮,得到粗製三級丁基7-羥基-8-甲氧基-4-甲基-1-(吡咯啶-1-基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(163.00 mg; 99%)。
步驟4 將三級丁基7-羥基-8-甲氧基-4-甲基-1-(吡咯啶-1-基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(163 mg; 0.41 mmol; 1.00 eq.)、1-(3-氯丙基)吡咯啶(113 mg; 0.62 mmol; 1.50 eq.)、與碳酸鉀(141 mg; 1.03 mmol; 2.50 eq.)在DMF (3 mL)中的混合物加熱至100℃達16小時。將反應混合物冷卻至rt、通過矽藻土塞過濾、並在減壓下濃縮。將所得殘餘物用1M HCl (5 mL)稀釋並加熱至50℃達1小時。將水層藉由製備型HPLC HPLC純化(Phenomenex Luna C18,21 × 250 mm,0至60%乙腈/0.1% HCl水溶液梯度13分鐘,流速22 ml/min),得到標題化合物(47 mg; 28%)。1 H NMR (400 MHz,甲醇-d 4 ) δ 7.65 (s, 1H), 7.49 (d,J = 1.2 Hz, 1H), 7.24 (s, 1H), 4.29 (t,J = 5.5 Hz, 2H), 3.97 (s, 3H), 3.96 – 3.90 (m, 4H), 3.83 – 3.81 (m, 2H), 3.50 (t,J = 7.1 Hz, 2H), 3.16 (q,J = 8.7, 7.9 Hz, 2H), 2.46 (d,J = 1.1 Hz, 3H), 2.33 (p,J = 6.5 Hz, 2H), 2.18 (p,J = 3.2 Hz, 6H), 2.07 (dd,J = 7.8, 4.9 Hz, 2H)。MS (ESI,正離子) m/z: 408.9 (M+1)。
實例90 [3-({8-甲氧基-1-甲基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]二甲胺鹽酸鹽
步驟1 將三級丁基7-(苄氧基)-1-氯-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(250 mg; 0.57 mmol; 1.00 eq.)、甲基硼酸(68 mg; 1.14 mmol; 2.00 eq.)、碳酸鉀(314 mg; 2.28 mmol; 4.00 eq.)、與Pd(dppf)2Cl2.DCM (46 mg; 0.06 mmol; 0.10 eq.)在NMP (3 mL)中的混合物放入微波小瓶中。在微波中將反應加熱至120℃達1小時。用水稀釋反應。用乙酸乙酯萃取水層、合併有機物、用MgSO4乾燥、過濾、並在減壓下濃縮。將所得殘餘物藉由矽膠管柱使用含0%至50%乙酸乙酯的己烷純化,得到三級丁基7-(苄氧基)-8-甲氧基-1-甲基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(180 mg; 75%)。MS (ESI,正離子) m/z: 363.0 (M-56)。
步驟2 合併三級丁基7-(苄氧基)-8-甲氧基-1-甲基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(180 mg; 0.43 mmol; 1.00 eq.)、10%碳載鈀(45 mg; 0.04 mmol; 0.10 eq.)、與甲醇(5 mL)。在經由氣球的氫壓力下攪拌3小時。通過矽藻土塞過濾並在減壓下濃縮,得到三級丁基7-羥基-8-甲氧基-1-甲基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(140 mg; 99%)為粗製物。MS (ESI,正離子) m/z: 273.0 (M-56)。
步驟3 將三級丁基7-羥基-8-甲氧基-1-甲基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(140 mg; 0.43 mmol; 1.00 eq.)、(3-氯丙基)二甲胺(104 mg; 0.85 mmol; 2.00 eq.)、與碳酸鉀(118 mg; 0.85 mmol; 2.00 eq.)在DMF (5 mL)中合併。將反應加熱至100℃達5小時。讓反應冷卻至rt。通過矽藻土塞過濾並在減壓下濃縮。將1M HCl加入到所得殘餘物中,並加熱至50℃達1小時。將殘餘物藉由製備型HPLC純化(Phenomenex Luna C18,21 × 250 mm,0至60%乙腈/0.1% HCl水溶液梯度13分鐘,流速22 ml/min),得到標題化合物(90.00 mg; 67%)。1 H NMR (400 MHz,甲醇-d 4 ) δ 8.26 (d,J = 6.8 Hz, 1H), 7.74 (d,J = 6.8 Hz, 1H), 7.72 (s, 1H), 7.35 (s, 1H), 4.32 (t,J = 5.6 Hz, 2H), 4.04 (s, 3H), 3.45 (t,J = 7.2 Hz, 2H), 3.20 (s, 3H), 3.01 (s, 6H), 2.43 – 2.28 (m, 2H)。MS (ESI,正離子) m/z: 314.5 (M+1)。
實例91 [3-({1-乙基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]二甲胺鹽酸鹽依照類似實例90所述的合成序列,自三級丁基7-(苄氧基)-1-氯-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(參考 5 )合成標題化合物,使用乙基硼酸代替甲基硼酸。1 H NMR (400 Mhz,甲醇-d 4 ) δ 8.29 (d,J = 6.8 Hz, 1H), 7.76 (d,J = 6.8 Hz, 1H), 7.68 (s, 1H), 7.36 (s, 1H), 4.33 (t,J = 5.6 Hz, 2H), 4.03 (s, 3H), 3.57 (q,J = 7.6 Hz, 2H), 3.44 (q,J = 7.5 Hz, 2H), 3.00 (s, 6H), 2.40 – 2.28 (m, 2H), 1.56 (t,J = 7.6 Hz, 3H)。MS (ESI,正離子) m/z: 328.1 (M+1)。
實例92 (3-{[8-甲氧基-1-(吡咯啶-1-基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基]氧基}丙基)二甲胺鹽酸鹽
步驟1 將7-(苄氧基)-4-氯-1-氟-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚(參考 6 )(810 mg; 2.27 mmol; 1.00 eq.)與吡咯啶(807 mg; 11.35 mmol; 5.00 eq.)在NMP (7.5 mL)中的混合物在微波中在100℃下加熱2小時。將反應混合物用水稀釋並用乙酸乙酯萃取。將合併的有機物用MgSO4乾燥、過濾並在減壓下濃縮,得到1-[7-(苄氧基)-4-氯-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基]吡咯啶(926 mg; 99%)。
步驟2 將1-[7-(苄氧基)-4-氯-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-基]吡咯啶(1.5 g; 3.68 mmol; 1.00 eq.)、二-三級丁基二碳酸酯(1.2g; 5.52 mmol; 1.50 eq.)、與DMAP (90 mg; 0.74 mmol; 0.20 eq.)在二氯甲烷(18 mL)中的混合物攪拌整夜。將反應混合物在減壓下濃縮,並藉由矽膠管柱使用含0%至40%乙酸乙酯的己烷純化,得到三級丁基7-(苄氧基)-4-氯-8-甲氧基-1-(吡咯啶-1-基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(1.45 g; 78%)。MS (ESI,正離子) m/z: 508.2 (M+1)。
步驟3 在50 mL圓底燒瓶中,將三級丁基7-(苄氧基)-4-氯-8-甲氧基-1-(吡咯啶-1-基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(750 mg; 1.48 mmol; 1.00 eq.)、10%碳載鈀(157 mg; 0.15 mmol; 0.10 eq.)、及甲醇(15 mL)在經由氣球的氫壓力下攪拌。將反應攪拌3小時。將反應混合物通過矽藻土塞過濾並濃縮,獲得三級丁基7-羥基-8-甲氧基-1-(吡咯啶-1-基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(566 mg; 99%)為粗製物。MS (ESI,正離子) m/z: 327.8 (M-56)。
步驟4 在10 mL閃爍小瓶中,將含三級丁基7-羥基-8-甲氧基-1-(吡咯啶-1-基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(170 mg; 0.44 mmol; 1.00 eq.)、(3-氯丙基)二甲胺(70 mg; 0.58 mmol; 1.30 eq.)、及碳酸鉀(183 mg; 1.33 mmol; 3.00 eq.)的DMF (3 mL)加熱至100℃達3小時。將反應混合物冷卻至rt。將反應通過矽藻土塞過濾並在減壓下濃縮。將1M HCl加入到所得殘餘物中,並在50℃下攪拌1小時。將所得混合物在減壓下濃縮並藉由製備型HPLC純化(Phenomenex Luna C18,21 × 250 mm,0至60%乙腈/0.1%水性HCl梯度13分鐘,流速22 ml/min),得到標題化合物(100 mg; 51%)。1 H NMR (400 MHz,甲醇-d 4 ) δ 7.65 (d,J = 6.9 Hz, 1H), 7.60 (s, 1H), 7.21 (s, 1H), 7.10 (d,J = 6.9 Hz, 1H), 4.28 (t,J = 5.6 Hz, 2H), 3.96 (d,J = 7.1 Hz, 7H), 3.44 (t,J = 7.2 Hz, 2H), 3.00 (s, 6H), 2.33 (p,J = 6.5 Hz, 2H), 2.25 – 2.09 (m, 4H)。MS (ESI,正離子) m/z: 369.0 (M+1)。
實例93 7-[3-(二甲基胺基)丙氧基]-8-甲氧基-N,N-二甲基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-胺鹽酸鹽使用實例92所述之合成序列製備標題化合物,但改變步驟1如下: 在加蓋微波小瓶中,將7-(苄氧基)-4-氯-1-氟-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚(參考 6 )(220 mg; 0.62 mmol; 1.00 eq.)及2M氫氧化鈉(0.40 mL; 0.80 mmol; 1.30 eq.)在DMF (4 mL)中放入微波反應器中。在微波中將反應在160℃下加熱1小時。讓反應冷卻至rt。用水稀釋反應,並用乙酸乙酯萃取水層。將有機物合併、用MgSO4乾燥、過濾並濃縮,得到7-(苄氧基)-4-氯-8-甲氧基-N,N-二甲基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-胺(235 mg; 99%)為粗混合物。
依照用於製備實例92步驟2至4的程序,自7-(苄氧基)-4-氯-8-甲氧基-N,N-二甲基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-胺製備標題化合物。1 H NMR (400 MHz,甲醇-d 4 ) δ 7.78 (d,J = 6.8 Hz, 1H), 7.40 (s, 1H), 7.27 (d,J = 6.9 Hz, 1H), 7.24 (s, 1H), 4.28 (t,J = 5.6 Hz, 2H), 3.99 (s, 3H), 3.46 (t,J = 7.2 Hz, 2H), 3.36 (s, 6H), 3.01 (s, 6H), 2.35 (t,J = 6.5 Hz, 2H)。MS (ESI,正離子) m/z: 343.3 (M+1)。
實例94 1-[3-({8-甲氧基-5-甲基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]吡咯啶鹽酸鹽將1-[3-({8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]吡咯啶、實例88 (70 mg; 0.22 mmol; 1.00 eq.)、碳酸二甲酯(39 mg; 0.43 mmol; 2.00 eq.)、與碳酸鉀(59 mg; 0.43 mmol; 2.00 eq.)在DMF (2 mL)中的混合物放入微波小瓶中。在微波中將反應加熱至100℃達30分鐘。將反應混合物過濾並藉由製備型HPLC純化(Phenomenex Luna C18,21 × 250 mm,0至60%乙腈/0.1% HCl水溶液梯度13分鐘,流速22 ml/min),得到標題化合物(10 mg; 11%)。1 H NMR (400 MHz,甲醇-d 4 ) δ 9.42 (s, 1H), 8.47 (dd,J = 6.9, 0.9 Hz, 1H), 8.00 (d,J = 8.3 Hz, 2H), 7.46 (s, 1H), 4.43 – 4.36 (m, 2H), 4.08 (s, 3H), 4.00 (s, 3H), 3.91 – 3.75 (m, 2H), 3.50 (q,J = 6.4, 5.8 Hz, 2H), 3.17 (dt,J = 13.3, 7.1 Hz, 2H), 2.36 (h,J = 7.5, 7.0 Hz, 2H), 2.20 (d,J = 7.6 Hz, 2H), 2.13 – 2.00 (m, 2H)。MS (ESI,正離子) m/z: 340.1 (M+1)。
實例95 (3-{[8-甲氧基-1-(甲基氫硫基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基]氧基}丙基)二甲胺鹽酸鹽
步驟1 向微波小瓶中的[3-(4-溴-2-甲氧基-5-硝基苯氧基)丙基]二甲胺(300 mg; 0.90 mmol; 1.00 eq.)與2-氯-3-吡啶基硼酸(240 mg; 1.53 mmol; 1.70 eq.)在DMF (5 mL)中的混合物加入碳酸鉀(0.90 mL; 2.00 mol/L; 1.80 mmol; 2.00 eq.)隨後加入Pd(dppf)2 Cl2 .DCM (37 mg; 0.05 mmol; 0.05 eq.)。將反應加熱至120℃達30分鐘。將反應用水稀釋並用乙酸乙酯萃取。將合併的有機物用MgSO4 乾燥、過濾、並濃縮,得到{3-[4-(2-氯吡啶-3-基)-2-甲氧基-5-硝基苯氧基]丙基}二甲胺(250 mg; 76%)為粗製物。MS (ESI,正離子) m/z: 366.2 (M+1)。
步驟2 將甲硫醇鈉(144 mg; 2.05 mmol; 3.00 eq.)加入到微波小瓶中含有{3-[4-(2-氯吡啶-3-基)-2-甲氧基-5-硝基苯氧基]丙基}二甲胺(250 mg; 0.68 mmol; 1.00 eq.)的DMSO (3 mL)溶液中。在微波中將反應加熱至100℃達40分鐘。將反應用1M HCl (10 mL)稀釋並用乙酸乙酯洗滌。收集酸性水層並藉由製備型HPLC純化產物(Phenomenex Luna C18,21 × 250 mm,0至60%乙腈/0.1% HCl水溶液梯度13分鐘,流速22 ml/min),得到(3-{2-甲氧基-4-[2-(甲基氫硫基)吡啶-3-基]-5-硝基苯氧基}丙基)二甲胺(50 mg; 19%)。MS (ESI,正離子) m/z: 378.1 (M+1)。
步驟3 在加蓋的20 mL閃爍小瓶中,將含(3-{2-甲氧基-4-[2-(甲基氫硫基)吡啶-3-基]-5-硝基苯氧基}丙基)二甲胺(50 mg; 0.13 mmol; 1.00 eq.)的亞磷酸三乙酯(2 mL)溶液加熱至120℃達18小時。將反應冷卻至rt並在減壓下濃縮。將所得殘餘物用1M HCl稀釋並藉由製備型HPLC純化(Phenomenex Luna C18,21 × 250 mm,0至60%乙腈/0.1%水性HCl梯度13分鐘,流速22 ml/min),得到標題化合物(4 mg; 7%)。1 H NMR (400 Mhz,甲醇-d 4 ) δ 8.27 (d,J = 6.8 Hz, 1H), 7.87 (s, 1H), 7.69 (d,J = 6.8 Hz, 1H), 7.35 (s, 1H), 4.32 (t,J = 5.6 Hz, 2H), 4.02 (s, 3H), 3.44 (t,J = 7.1 Hz, 2H), 3.01 (s, 3H), 3.00 (s, 6H), 2.35 (ddd,J = 12.7, 7.0, 5.5 Hz, 2H)。MS (ESI,正離子) m/z: 346.2 (M+1)。
實例96 1-(3-{[8-甲氧基-1-(2-甲氧基乙氧基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基]氧基}丙基)吡咯啶三氟乙酸鹽
步驟1 將1-[3-(4-溴-2-甲氧基-5-硝基苯氧基)丙基]吡咯啶(參考 3 )(800 mg; 2.23 mmol; 1.00 eq.)、2-氟-3-吡啶基硼酸(627 mg; 4.45 mmol; 2.00 eq.)、碳酸鉀(3.3 mL; 2.00 mol/L; 6.68 mmol; 3.00 eq.)與Pd(dppf)2 Cl2 .DCM (182 mg; 0.22 mmol; 0.10 eq.)合併在微波小瓶中的DMF (8 mL)中。在微波反應器中將反應加熱至130℃達1小時。將反應通過矽藻土塞過濾,用水稀釋濾液並用乙酸乙酯洗滌水層。將有機物合併、用MgSO4乾燥、過濾、並在減壓下濃縮。將所得殘餘物利用矽膠使用0%至20%在DCM中的甲醇純化,得到2-氟-3-{5-甲氧基-2-硝基-4-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]苯基}吡啶(316.00 mg; 38%)。
步驟2 在50-mL圓底燒瓶中,放入2-氟-3-[5-甲氧基-2-硝基-4-[3-(吡咯啶-1-基)丙氧基]苯基]吡啶(300 mg, 0.80 mmol, 1.00 eq.)、N,N-二甲基甲醯胺(10 mL)、2-甲氧基乙-1-醇(91.2 mg, 1.20 mmol, 1.50 eq.)、Cs2 CO3 (782 mg, 2.40 mmol, 3.00 eq.)。將所得溶液在100℃下攪拌3 h。將粗反應混合物過濾並進行逆相製備型MPLC(Prep-C18,120 g,Tianjin Bonna-Agela Technologies;含10% MeCN的水至含20% MeCN的水梯度洗提10 min期間,其中兩種溶劑均含有0.1%甲酸),提供3-(5-甲氧基-2-硝基-4-(3-(吡咯啶-1-基)丙氧基)苯基)-2-(2-甲氧基乙氧基)吡啶為黃色固體(0.18 g, 52%)。MS (ESI,正離子) m/z: 432.2 (M+1)。
步驟3 在50-mL圓底燒瓶中,放入3-(5-甲氧基-2-硝基-4-(3-(吡咯啶-1-基)丙氧基)苯基)-2-(2-甲氧基乙氧基)吡啶(150 mg, 0.35 mmol, 1.00 eq.)、P(OEt)3 (8 mL)。將所得溶液在120℃下攪拌16 h。將混合物在真空下濃縮。將粗反應混合物過濾並進行逆相製備型HPLC(Prep-C18,Waters SunFire管柱,19 × 150 mm;含20% MeCN的水至含30% MeCN的水梯度洗提10 min期間,其中兩種溶劑均含有0.05%TFA),提供標題化合物為淺黃色半固體(15.9 mg, 8.9%)。1 HNMR (300 MHz, DMSO-d6) δ11.58 (s, 1H), 9.59 (br, 1H), 7.89 (d,J = 5.9 Hz, 1H), 7.60 (s, 1H), 7.16-7.07 (m, 2H), 4.62 (dd,J = 5.8, 3.7 Hz, 2H), 4.15 (t,J = 5.8 Hz, 2H), 3.83 (d,J = 4.4 Hz, 1H), 3.66 (dt,J = 11.1, 6.0 Hz, 2H), 3.39 (d,J = 10.5 Hz, 6H), 3.07 (dq,J = 14.3, 7.5 Hz, 2H), 2.19 (dq,J = 12.4, 6.4 Hz, 2H), 2.04 (q,J = 6.9, 5.9 Hz, 2H), 1.89 (p,J = 5.3 Hz, 2H)。MS (ESI,正離子) m/z: 400.2 (M+1)。
實例97 8-甲氧基-7-(3-(吡咯啶-1-基)丙氧基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-1-醇三氟乙酸鹽
步驟1 在50-mL圓底燒瓶中,放入7-(苄氧基)-1-氯-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚(參考 5 )(400 mg, 1.18 mmol, 1.00 eq.)、甲醇鈉-MeOH (30%, 10 mL)。將所得溶液在120℃下攪拌48 h。將所得混合物在真空下濃縮。將殘餘物用乙酸乙酯/石油醚(1:1)施加至矽膠管柱上。這導致285 mg (72%)的7-(苄氧基)-1,8-二甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚(黃色固體)。MS (ESI,正離子) m/z: 335.1 (M+1)。
步驟2 在50-mL圓底燒瓶中,放入7-(苄氧基)-1,8-二甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚(275 mg, 0.82 mmol, 1.00 eq.)、四氫呋喃(10 mL)、4-二甲基胺基吡啶(100 mg, 0.82 mmol, 1.00 eq.)、Boc2 O (180 mg, 0.82 mmol, 1.00 eq.)。將所得溶液在25℃下攪拌4 h。將所得混合物在真空下濃縮。將殘餘物用乙酸乙酯/石油醚(1:3)施加至矽膠管柱上。這導致260 mg (73%)的三級丁基7-(苄氧基)-1,8-二甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(黃色固體)。MS (ESI,正離子) m/z: 435.2 (M+1)。
步驟3 向含三級丁基7-(苄氧基)-1,8-二甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(250 mg, 0.58 mmol, 1.00 eq.)的MeOH (25 mL)溶液加入25 mg的10% Pd/C(50%水分)。將混合物除氣並用氫吹掃三次。將所得混合物在室溫下在H2 氣氛下攪拌6h。濾出固體。將過濾在真空下濃縮。這導致200 mg(粗製)的三級丁基1,7-二羥基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(淺黃色固體)。MS (ESI,正離子) m/z: 331.1 (M+1)。
步驟4 在50-mL圓底燒瓶中,放入三級丁基1,7-二羥基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(190 mg, 0.55 mmol, 1.00 eq.)、MeCN (8 mL)、碳酸鉀(229 mg, 1.66 mmol, 3.00 eq.)、1-(3-氯丙基)吡咯啶鹽酸鹽(101.5 mg, 0.55 mmol, 1.00 eq.)。將所得溶液在60℃下攪拌3 h。濾出固體。將過濾在真空下濃縮。這導致120 mg (48%)的三級丁基1,8-二甲氧基-7-(3-(吡咯啶-1-基)丙氧基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(淺黃色固體)。MS (ESI,正離子) m/z: 456.2 (M+1)。
步驟5 在50-mL圓底燒瓶中,放入三級丁基1,8-二甲氧基-7-(3-(吡咯啶-1-基)丙氧基)-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(110 mg, 0.24 mmol, 1.00 eq.)、乙醇(3 mL)、氯化氫(3 mL)。將所得溶液在100℃下攪拌24 h。將所得混合物在真空下濃縮。將粗反應混合物過濾並進行逆相製備型HPLC(Prep-C18,Waters SunFire管柱,19 × 150 mm;含20% MeCN的水至含30% MeCN的水梯度洗提10 min期間,其中兩種溶劑均含有0.05% TFA),提供標題化合物為灰白色固體(39.1 mg, 28%)。1 H NMR (300 MHz, DMSO-d6) δ 11.48 (s, 1H), 11.01 (d,J = 5.8 Hz, 1H), 9.53 (br, 1H), 7.62 (s, 1H), 7.20 (t,J = 6.5 Hz, 1H), 7.08 (s, 1H), 6.48 (d,J = 7.1 Hz, 1H), 4.12 (t,J = 5.8 Hz, 2H), 3.85 (s, 3H) , 3.65 (s, 2H), 3.36 (q,J = 7.0 Hz, 2H), 3.03-3.12 (m, 2H), 2.15-2.20 (m, 2H), 2.06-2.10 (m, 2H), 1.87-1.96 (m, 2H)。MS (ESI,正離子) m/z: 342.2 (M+1)。
實例98 3-[3-({8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]-3-氮雜雙環[3.1.1]庚烷鹽酸鹽
步驟1 將三級丁基7-羥基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(參考 7 )(65.00 mg; 0.21 mmol; 1.00 eq.)懸浮於乙腈(3 mL)中。加入1-氯-3-碘丙烷(44 µL; 0.41 mmol; 2.00 eq.),然後加入碳酸鉀(37 mg; 0.268 mmol; 1.28 eq.)。將反應在80℃下的熱塊中攪拌。在6 h後,將反應冷卻、過濾、用熱乙腈沖洗並蒸發。將混合物藉由矽膠層析法(甲醇/二氯甲烷梯度)純化,給出一些三級丁基7-(3-氯丙氧基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(9 mg, 11%)。MS (ESI,正離子) m/z: 391.2 (M+1)。
步驟2 將三級丁基7-(3-氯丙氧基)-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(38.00 mg; 0.10 mmol; 1.00 eq.)溶於DMF (1 mL)中。將3-氮雜雙環[3.1.1]庚烷鹽酸鹽(19.49 mg; 0.15 mmol; 1.50 eq.)溶於N,N-二甲基甲醯胺(0.5 mL)中,加入碘化鉀(16.14 mg; 0.10 mmol; 1.00 eq.)及碳酸鉀(33.54 mg; 0.24 mmol; 2.50 eq.)。將反應在80℃下的熱塊中攪拌。在14 h後,將反應蒸發。將殘餘物溶於庚烷中、再次蒸發並放在真空下。藉由逆相層析法純化(Waters XSelect CSH C18管柱,19 × 250 mm,0至60%乙腈/0.1% HCl水溶液梯度)給出標題化合物(5.6 mg, 13%)。1 H NMR (400 MHz,甲醇-d 4 ) δ 9.58 (s, 1H), 8.53 (d,J = 6.9 Hz, 1H), 7.89 – 7.81 (m, 2H), 7.13 (s, 1H), 4.75 (t,J = 7.3 Hz, 2H), 4.03 (s, 3H), 3.91 – 3.86 (m, 2H), 3.42 – 3.36 (m, 4H), 2.64 – 2.59 (m, 2H), 2.55 – 2.52 (m, 2H), 2.42 – 2.37 (m, 1H), 2.33 – 2.27 (m, 1H), 2.02 – 1.98 (m, 1H), 1.58 – 1.51 (m, 1H)。MS (ESI,正離子) m/z: 352.3 (M+1)。
實例99 1-[3-({8-甲氧基-3-甲基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]吡咯啶鹽酸鹽使用實例29所述之合成程序製備標題化合物,但改變步驟1如下: 將1-(苄氧基)-4-溴-2-甲氧基-5-硝基苯(參考 1 ;500.00 mg;1.48 mmol;1.00 eq.)、6-甲基-3-吡啶基硼酸(222.74 mg; 1.63 mmol; 1.10 eq.)、碳酸鈉(235.07 mg; 2.22 mmol; 1.50 eq.)與1,1'-雙(二苯基膦基)二茂鐵]二氯鈀(II) (54.10 mg; 0.07 mmol; 0.05 eq.)在1,4-二烷(14.79 mL)及水(1.10 mL)中的混合物進行三個排空/重新填充氬循環,然後將其在氬氣氛下加熱至85℃。在36 h後,將混合物冷卻至環境溫度並濃縮。將殘餘物溶於EtOAc中、用水及鹽水洗滌、在MgSO4 上乾燥、過濾並濃縮以獲得深色油狀物。將該材料吸收到矽膠塞上並藉由管柱層析法(24 G ISCO Gold)以含0至70% EtOAc的庚烷洗提純化,提供5-[4-(苄氧基)-5-甲氧基-2-硝基苯基]-2-甲基吡啶(219 mg; 42%)。
在步驟5後,獲得標題化合物為無色自由流動粉末(8.2 mg; 50%)。1 H NMR (400 MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.65 (s, 1H), 9.99 (s, 1H), 9.40 (s, 1H), 7.97 (s, 1H), 7.69 (s, 1H), 7.22 (s, 1H), 4.18 (t,J = 6.0 Hz, 2H), 3.87 (s, 3H), 3.59 (br. s, 2H), 3.36 -3.30 (m, 2H), 3.02 (br. s, 2H), 2.71 (s, 3H), 2.19 (p,J = 7.4 Hz, 2H), 2.02 (br. s, 2H), 1.86 (br. s, 2H)。MS (ESI,正離子) m/z: 340.3 (M+1)。
實例100 1-[3-({1,8-二甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]吡咯啶鹽酸鹽使用實例29所述之合成程序製備標題化合物,但改變步驟1如下: 將1-(苄氧基)-4-溴-2-甲氧基-5-硝基苯(參考 1 ;488.00 mg;1.44 mmol;1.00 eq.)、(來自先前反應的RSM)2-甲氧基-3-吡啶基硼酸(242.79 mg; 1.59 mmol; 1.10 eq.)、碳酸鈉(229.43 mg; 2.16 mmol; 1.50 eq.)與1,1'-雙(二苯基膦基)二茂鐵]二氯鈀(II) (52.80 mg; 0.07 mmol; 0.05 eq.)在1,4-二烷(14.43 mL)及水(1.07 mL)中的混合物進行三個排空/重新填充氬循環,然後將其在氬氣氛下加熱至85℃。在17 h後,將混合物冷卻至環境溫度並濃縮。將殘餘物溶於EtOAc中、用水及鹽水洗滌、在MgSO4 上乾燥、過濾並濃縮以獲得深色油狀物。將該材料吸收到矽膠塞上並藉由管柱層析法(24 G ISCO Gold)以含0至40% EtOAc的庚烷洗提純化,提供3-[4-(苄氧基)-5-甲氧基-2-硝基苯基]-2-甲氧基吡啶(200 mg; 38%)。
在步驟5後,獲得標題化合物為無色自由流動粉末(75.2 mg; 71%)。MS (ESI,正離子) m/z: 356.4 (M+1)。
實例101 1-[3-({3-環丙基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]吡咯啶鹽酸鹽使用實例29所述之合成程序製備標題化合物,但改變步驟1及新增步驟4A(介於步驟4與5之間)如下:
步驟1 將1-(苄氧基)-4-溴-2-甲氧基-5-硝基苯(參考 1 ;600.00 mg;1.77 mmol;1.00 eq.)、6-氯-3-吡啶基硼酸(307.14 mg; 1.95 mmol; 1.10 eq.)、碳酸鈉(282.09 mg; 2.66 mmol; 1.50 eq.)與1,1'-雙(二苯基膦基)二茂鐵]二氯鈀(II) (64.91 mg; 0.09 mmol; 0.05 eq.)在1,4-二烷(17.74 mL)及水(1.31 mL)中的混合物進行三個排空/重新填充氬循環,然後將其在氬氣氛下加熱至85℃。在17 h後,將混合物冷卻至環境溫度並濃縮。將殘餘物溶於EtOAc中、用水及鹽水洗滌、在MgSO4 上乾燥、過濾並濃縮以獲得深色油狀物。將該材料吸收到矽膠塞上並藉由管柱層析法(40 G ISCO Gold)以含0至50% EtOAc的己烷洗提純化,提供5-[4-(苄氧基)-5-甲氧基-2-硝基苯基]-2-氯吡啶(462 mg; 70%)。
步驟4A 將三級丁基7-(苄氧基)-3-氯-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(71.00 mg; 0.16 mmol; 1.00 eq.)、環丙基硼酸(48.63 mg; 0.57 mmol; 3.50 eq.)、三環己基磷烷(4.54 mg; 0.02 mmol; 0.10 eq.)與磷酸三鉀(68.68 mg; 0.32 mmol; 2.00 eq.)在甲苯(0.81 mL)及水(0.04 mL)中的混合物用氮噴氣10分鐘。然後加入乙酸鈀(3.63 mg; 0.02 mmol; 0.10 eq.)並將密封小瓶加熱至100℃整夜。然後將混合物冷卻至環境溫度、用EtOAc稀釋並用水及鹽水洗滌。將有機層在MgSO4 上乾燥、過濾並濃縮。
將殘餘物藉由管柱層析法(4 G ISCO Gold)以含0至40% EtOAc的庚烷洗提純化,獲得三級丁基7-(苄氧基)-3-環丙基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯為白色固體。
在步驟5後,獲得標題化合物為無色自由流動粉末(75.2 mg; 71%)。1 H NMR (400 MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.58 (s, 1H), 10.33 (s, 1H), 9.34 (s, 1H), 8.00 (s, 1H), 7.45 (s, 1H), 7.21 (s, 1H), 4.17 (t,J = 6.0 Hz, 2H), 3.86 (s, 3H), 3.62 - 3.52 (m, 2H), 3.32 - 3.29 (m, 2H), 3.06 - 2.95 (m, 2H), 2.40 (dq,J = 8.7, 5.2, 4.4 Hz, 1H), 2.20 (p,J = 6.2 Hz, 2H), 2.05 - 1.95 (m, 2H), 1.92 – 1.81 (m, 2H), 1.26 - 1.19 (d,J = 8.1 Hz, 2H), 1.14 – 1.08 (m, 2H)。MS (ESI,正離子) m/z: 366.4 (M+1)。
實例102 [3-({1-環丙基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-7-基}氧基)丙基]二乙胺鹽酸鹽使用實例29所述之合成序列製備標題化合物,但改變步驟4如下: 將三級丁基7-(3-氯丙氧基)-1-環丙基-8-甲氧基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-羧酸酯(40.00 mg; 0.09 mmol; 1.00 eq.)、碘化鉀(1.54 mg; 0.01 mmol; 0.10 eq.)與N-乙基乙胺(0.06 mL; 0.60 mmol; 6.50 eq.)在N,N-二甲基甲醯胺(0.46 mL)中的混合物加熱至70℃。在3 h後,將混合物冷卻至環境溫度、用1:1 PhMe/EtOAc稀釋、用水洗滌、在MgSO4 上乾燥、過濾並濃縮。
將粗製油溶於DCM (1.5 mL)中並在環境溫度下用TFA (0.7 mL)處理。在3 h後,將混合物在真空中濃縮。將油狀殘餘物溶於1N HCl(約1.5 mL)中並藉由製備型HPLC純化(Phenomenex Luna C18,21 × 250 mm,0至70%乙腈/0.1% HCl水溶液梯度13分鐘,流速22 ml/min),提供標題化合物(18 mg; 53%)。1 H NMR (400 MHz, DMSO-d 6 ) δ 13.95 (s, 1H), 12.96 (s, 1H), 10.05 (s, 1H), 8.21 (d,J = 6.7 Hz, 1H), 7.85 (s, 1H), 7.73 (d,J = 6.7 Hz, 1H), 7.32 (s, 1H), 4.21 (t,J = 6.0 Hz, 2H), 3.91 (s, 3H), 3.22 (p,J = 5.0 Hz, 2H), 3.14 (td,J = 7.3, 4.8 Hz, 4H), 3.02 (ddd,J = 13.8, 8.6, 5.3 Hz, 1H), 2.20 (q,J = 7.4, 6.7 Hz, 2H), 1.46 – 1.39 (m, 2H), 1.35 – 1.30 (m, 2H), 1.22 (t,J = 7.2 Hz, 6H)。MS (ESI,正離子) m/z: 368.4 (M+1)。
生物實例 實例1 G9a酶活性測定的判定 使用G9a AlphaLISA測定偵測化合物對生物素化組蛋白H3肽的甲基修飾。這些修飾是藉由G9a酶的組蛋白甲基轉移酶活性完成。該測定由在615 nm處讀取化學發光信號組成;該信號藉由在680 nm下的雷射激發產生,該雷射激發在供體珠與受體珠之間轉移反應性單態氧。供體珠接合鏈黴抗生物素蛋白且結合至肽上的生物素。受體珠接合辨識肽上特異性G9a甲基標記的抗體。如果肽上有甲基標記,受體珠將結合至該肽。在結合時,受體珠將處於供體珠的近鄰(<200 nm)且當供體珠被激發時,氧的轉移可發生且將產生強信號。如果沒有甲基標記,則珠之間的交互作用將不會發生,且信號將維持背景水平。
對於該測定,使用以下緩衝劑來設置反應:50 mM Tris-HCl pH9、50 mM NaCl、0.01% Tween-20及1 mM DTT(開始反應之前新鮮加入)。藉由添加最終濃度0.15nM G9a、10 uM S-腺苷-甲硫胺酸及100nM生物素化組蛋白3肽來設置該測定(1-21)。將反應在室溫下孵養1 h,且後續藉由添加最終濃度20 ug/mL的受體珠(抗H3k9me2 AlphaLISA受體珠,PerkinElmer #AL117)淬熄。將受體珠孵養1 h。在1 h後,加入最終濃度20ug/mL的供體珠(α鏈黴抗生物素蛋白供體珠,PerkinElmer #6760002)。將供體珠孵養0.5 h。在加入到反應中之前,供體珠及受體珠兩者皆重懸於AlphaLISA 5X Epigenetics Buffer 1 Kit (PerkinElmer # AL008)中。對供體珠及受體珠的所有操作及孵養都是在黯淡的光照下完成。信號在α模式下的EnVision板讀取儀中偵測(見ACS Med Chem Lett.2014 Jan 2;5(2):205-9)計算每種化合物稀釋的抑制百分比,並計算產生50%抑制的濃度。該值呈現為IC50 。本揭露之代表性化合物數量的IC50 值IC50 值(nM)係提供於下。
表B
實例 2 胎兒血紅素誘導測定 將獲自健康成人人類供體的冷凍保存骨髓CD34+ 造血細胞用於所有研究。利用由兩期組成的21天離體無血清培養系統。在培養期I(培養日1至7)中,將CD34+ 細胞置於含有StemPro-34完全介質(l-麩醯胺酸、pen-strep及StemPro-34營養補充劑)(Invitrogen, Carlsbad, CA)的介質中,其補充有50 ng/mL SCF (HumanZyme, Chicago, IL)、50 ng/mL FLT3-配體(HumanZyme)及10 ng/mL IL-3 (HumanZyme)。在培養的第一期(第0至7天)期間,CD34+ 細胞分化成包括紅血球母細胞的祖細胞族群。在7天後,將細胞轉移至紅血球生成素(EPO; Stemcell)補充介質(第2期;培養7至21天)中,其包含下列:StemPro-34完全介質、4 U/mL EPO、3 µM米非司酮(mifepristone) (Sigma Aldrich, St. Louis, MO)、10 µg/mL胰島素(Sigma Aldrich)、3 U/mL肝素(Sigma Aldrich)及0.8 mg/mL全轉鐵蛋白(Sigma Aldrich)。在第2期加入化合物;第7至21天測試胎兒血紅素生產(見Blood.2015 Jul 30;126(5):665-72)。
α、β及γ球蛋白基因的表現水平藉由定量PCR分析進行評估。HbF蛋白質水平藉由人類血紅素F連結酶免疫吸收測定(ELISA)定量套組(Bethyl Laboratory, Montgomery, TX, USA)進行評估。通過流動式細胞測量術分析評估表現HbF的細胞百分比。簡而言之,根據製造商說明書(Qiagen, Germany)製備RNA樣本並合成互補DNA。使用TaqMan Gene Expression Master執行人類球蛋白基因的qRT-PCR分析。
表C
配方實例 以下是含有本揭露的化合物的代表性醫藥配方。
錠劑配方 將下列成分密切混合,並壓製成有單一刻痕的錠劑。
膠囊配方 將下列成分密切混合,並裝入硬殼明膠膠囊中。
注射用配方 含本揭露之化合物(例如化合物1)的2% HPMC、含1% Tween 80的DI水,用MSA使pH為2.2,加足量至至少20 mg/mL
吸入組成物 為了製備用於吸入遞送的醫藥組成物,將20 mg的本文所揭示的化合物與50 mg的無水檸檬酸及100 mL的0.9%氯化鈉溶液混合。將混合物併入適於吸入投予的吸入遞送單位中,例如噴霧器。
局部凝膠組成物 為了製備醫藥局部凝膠組成物,將100 mg本文所揭示的化合物與1.75 g羥丙基纖維素、10 mL丙二醇、10 mL肉豆蔻酸異丙酯及100 mL純化的醇USP混合。然後將所得凝膠混合物併入適於局部投予的容器中,例如軟管。
眼用溶液組成物 為了製備醫藥眼用溶液組成物,將100 mg本文所揭示的化合物與0.9 g NaCl在100 mL純化水中混合,並使用0.2微米過濾器過濾。然後將所得的等張溶液併入適於眼用投予的眼用遞送單位中,諸如點眼劑容器。
鼻噴霧溶液 為了製備醫藥鼻噴霧溶液,將10 g本文所揭示的化合物與30 mL的0.05M磷酸鹽緩衝液(pH 4.4)混合。將溶液放入鼻腔給藥器中,該給藥器是設計為每次施用遞送100 µL的噴霧。

Claims (124)

  1. 一種式(I)之化合物:(I) 其中: X為N或CR1 ; Y為N或CR2 ; P、Q、T、及U獨立地為CH、C(當附接R4 或R5 時)、或N;前提條件是P、Q、T及U中的至少一個且不多於兩個為N; Z為O、S、或NR6 ,其中R6 為氫、烷基、或環烷基; R1 為氫、烷基、烷氧基、鹵基、鹵烷基、鹵烷氧基、或環烷基; R2 為氫、烷基、烷氧基、鹵基、鹵烷基、鹵烷氧基、或環烷基; R3 為-W-伸烷基-R7 ,其中: W為鍵、NH、O、或S; 伸烷基可選地經R8 取代,其中R8 為鹵基、鹵烷基、鹵烷氧基、羥基、或烷氧基,且該伸烷基中的一個CH2 可選地經NH或O置換;且 R7 是-NRa Rb ,其中Ra 及Rb 獨立地為氫、烷基、或鹵烷基;或Ra 及Rb 連同彼等所附接的氮一起形成雜環胺基、橋接雜環胺基、或螺雜環胺基,其中該雜環胺基、該橋接雜環胺基及該螺雜環胺基可選地經一個或兩個獨立地選自烷基、鹵基、鹵烷基、羥基、烷氧基、及鹵烷氧基的取代基取代;或 R7 是以環碳原子附接至該伸烷基的雜環基,且可選地經一個或兩個獨立地選自烷基、鹵基、鹵烷基、羥基、烷氧基及鹵烷氧基的取代基取代; R4 及R5 獨立地為烷基、烯基、炔基、環烷基、環烯基、鹵基、羥基、鹵烷氧基、烷氧基、氰基、NH2 、NRc Rd 、烷氧基烷基胺基、羥基烷基胺基、胺基烷基胺基、羥烷基、烷氧基烷基、烷硫基、烷氧基烷基氧基、苯基、雜芳基、雜芳基氧基、雜環基、雜環基氧基、雜環基胺基、5至8員橋接雜環胺基或螺雜環胺基,其中該苯基、該環烷基、該雜芳基、及該雜環基單獨或作為另一基團的一部分都可選地經一個、兩個、或三個獨立地選自烷基、鹵基、鹵烷基、鹵烷氧基、羥基、羥烷基、烷氧基、NH2 、烷基胺基、二烷基胺基、羧基、羧基烷基、及烷氧羰基的取代基取代,且其中R4 及R5 的該烷基可選地經環烷基取代,且R4 及R5 的該烯基及該炔基獨立地可選地經羥基或環烷基取代; Rc 為氫、烷基、環烷基、或雜環基; Rd 為烷基、環烷基、或雜環基;或 Rc 及Rd 連同彼等所附接的氮一起形成4至7員雜環胺基;且 v及w獨立地為0或1; 或其醫藥上可接受之鹽。
  2. 如請求項1之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中Z為NR6
  3. 如請求項2之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R6 為H。
  4. 2、或3之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中X為CR1 ;且Y為CR2
  5. 如請求項1至4中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R2 為氫。
  6. 如請求項1至4中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R2 為烷氧基。
  7. 2、或3之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中X為CR1 ;且Y為N。
  8. 如請求項1至7中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R1 為氫。
  9. 如請求項1至7中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R1 為烷氧基。
  10. 如請求項9之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R1 為甲氧基。
  11. 如請求項1至7中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R1 為烷基。
  12. 如請求項1至11中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中P為N;且Q、T、及U各為CH。
  13. 如請求項1至11中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中P、Q及U各為CH;且T為N。
  14. 如請求項1至11中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中P及T各為N;且Q及U各為CH。
  15. 如請求項1至11中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中P為C(其中附接R4 );Q為N;且T及U各為CH。
  16. 如請求項1至11中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中P、T及U各為CH;且Q為N。
  17. 如請求項1至11中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中P、Q及T各為CH;且U為N。
  18. 如請求項1至11中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中P及U各為CH;T為C(其中附接R5 )且Q為N。
  19. 如請求項1至11中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中P為C(其中附接R4 );Q為N;T為C(其中附接R5 );且U為CH。
  20. 如請求項1至11中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中P及T各為CH;Q及U為N。
  21. 如請求項1至11中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中P及Q各為CH;T為C(其中附接R5 );且U為N。
  22. 如請求項1至11中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中P為C(其中附接R4 );Q為N;T為CH;且U為C(其中附接R5 )。
  23. 如請求項1至11中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中P為C(其中附接R4 );Q為N;T為CH;且U為N。
  24. 如請求項1至11中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中P為C(其中附接R4 );Q為N;T為CR5 (其中附接R5 );且U為N。
  25. 如請求項1至11中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中Q為N;且P、T、及U獨立地為CH或C(當附接R4 或R5 時)。
  26. 如請求項25之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中P為CR4
  27. 如請求項25或26之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中T為CH。
  28. 如請求項25或26之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中T為CR5
  29. 如請求項25至27中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中U為CH。
  30. 如請求項25至27中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中U為CR5
  31. 如請求項1至30中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中W為O。
  32. 如請求項1至31中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中在-W-伸烷基-R7 中之該伸烷基未經取代。
  33. 如請求項1至30中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中在R3 中之-W-伸烷基-為–(CH2 )2 -*、–(CH2 )3 -*、-(CH2 )4 -*、-CH2 CH(CH3 )CH2 -*、*-CH2 CH(CH3 )CH2 -、-O-(CH2 )-*、-O-(CH2 )2 -*、-O-(CH2 )2 -O-(CH2 )2 -*、-O-(CH2 )3 -*、-OCH2 CH(F)CH2 -*、-OCH2 CH(OH)CH2 -*、-OCH2 CH(OCH3 )CH2 -*、或-OCH2 CH(OCF3 )CH2 -* ,其中*指示附接至R7 的點。
  34. 如請求項1至30中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中-W-伸烷基-為–(CH2 )2 -*、–(CH2 )3 -*、-(CH2 )4 -*、-CH2 CH(CH3 )CH2 -*、-O-(CH2 )2 -*、-O-(CH2 )2 -O-(CH2 )2 -*、或-O-(CH2 )3 -*,其中*指示附接至R7 的點。
  35. 如請求項34之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中-W-伸烷基-為-O-(CH2 )3 -*,其中*指示附接至R7 的點。
  36. 如請求項1至35中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R7 為-NRa Rb ,其中Ra 及Rb 獨立地為氫、烷基、或鹵烷基。
  37. 如請求項36之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中Ra 及Rb 獨立地為甲基、乙基、正丙基或異丙基。
  38. 如請求項36之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中-NRa Rb 為NH2 、甲基胺基、乙基胺基、二甲基胺基、二乙基胺基、二異丙基胺基或(乙基)(甲基)胺基。
  39. 如請求項38之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中-NRa Rb 為二甲基胺基。
  40. 如請求項1至35中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R7 為-NRa Rb ,其中-NRa Rb 連同彼等所附接的氮一起形成雜環胺基,其中該雜環胺基可選地經一個或兩個獨立地選自烷基、鹵基、鹵烷基、羥基、烷氧基及鹵烷氧基的取代基取代。
  41. 如請求項40之化合物,其中該雜環胺基為4員雜環胺基或5員雜環胺基,其可選地經一個或兩個獨立地選自烷基、鹵基、鹵烷基、羥基、烷氧基及鹵烷氧基的取代基取代。
  42. 如請求項40之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中該雜環胺基為吖呾-1-基、吡咯啶-1-基、哌啶-1-基、哌-1-基、嗎啉-4-基、硫嗎啉-4-基或3-氮雜雙環[3.1.1]庚烷-3-基,各雜環胺基可選地經一個或兩個獨立地選自甲基、羥基、甲氧基、及氟基的取代基取代。
  43. 如請求項40至42中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R7 為-NRa Rb ,其中Ra 及Rb 連同彼等所附接的氮一起形成吡咯啶-1-基、3(S)-氟吡咯啶-1-基、3(R)-氟吡咯啶-1-基、2-甲基吡咯啶-1-基、3,5-二甲基吡咯啶-1-基、或3,3-二甲基吡咯啶-1-基。
  44. 如請求項43之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R7 為-NRa Rb ,其中Ra 及Rb 連同彼等所附接的氮一起形成吡咯啶-1-基。
  45. 如請求項1至35中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R7 是以環碳原子附接至該伸烷基的雜環基,且可選地經一個或兩個獨立地選自烷基、鹵基、鹵烷基、羥基、烷氧基及鹵烷氧基的取代基取代。
  46. 如請求項45之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R7 為哌啶-3-基。
  47. 如請求項45之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R7 為可選地經烷基取代的哌啶-3基。
  48. 如請求項1至30中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R3 為-O-(CH2 )3 -吡咯啶-1-基、-O-(CH2 )3 -哌啶-1-基、-O-(CH2 )-哌啶-3-基、或-O-(CH2 )3 -嗎啉-4-基,其中吡咯啶-1-基、哌啶-1-基、哌啶-3-基及嗎啉-4-基各自可選地經一個或兩個獨立地選自甲基、羥基、甲氧基、及氟基的取代基取代。
  49. 如請求項1至11、18、19、21、22或24至48中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中w為0。
  50. 如請求項1至48中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中w為1。
  51. 如請求項50之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R5 為NH2 、鹵基、烷基、羥基、烷氧基、環烷基、或羥烷基。
  52. 如請求項51之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R5 為NH2 、氟基、氯基、甲基、乙基、羥基、甲氧基、環丙基、環戊基、或羥甲基。
  53. 如請求項51之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R5 為烷基。
  54. 如請求項51之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R5 為環烷基。
  55. 如請求項51之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R5 為鹵基。
  56. 如請求項51之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R5 為羥基或羥烷基。
  57. 如請求項51之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R5 為NH2
  58. 如請求項51之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R5 為烷氧基。
  59. 如請求項1至11、15、19、或22至58中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中v為0。
  60. 如請求項1至58中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中v為1。
  61. 如請求項60之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R4 為羥基。
  62. 如請求項60之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R4 為烷基、烯基、炔基、環烷基、環烯基、鹵基、鹵烷氧基、烷氧基、氰基、NH2 、NRc Rd 、烷氧基烷基胺基、羥基烷基胺基、胺基烷基胺基、羥烷基、烷氧基烷基、烷硫基、烷氧基烷基氧基、苯基、雜芳基、雜芳基氧基、雜環基、雜環基氧基、5至8員橋接雜環胺基或螺雜環胺基,其中該苯基、該雜芳基、及該雜環基單獨或作為另一基團的一部分都可選地經一個、兩個、或三個獨立地選自烷基、鹵基、鹵烷基、鹵烷氧基、羥基、烷氧基、NH2 、烷基胺基、二烷基胺基、羧基、羧基烷基、及烷氧羰基的取代基取代,且其中R4 的該烷基可選地經環烷基取代,且R4 的該烯基及該炔基可選地經羥基或環烷基取代;Rc 為氫、烷基、環烷基、或雜環基;且Rd 為烷基、環烷基、或雜環基;或Rc 及Rd 連同彼等所附接的氮一起形成4至6員雜環胺基。
  63. 如請求項62之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R4 為烷基或環烷基。
  64. 如請求項63之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R4 為選自由環丙基、環丁基、或環戊基所組成之群組的環烷基,其中該環丙基、該環丁基、及該環戊基可選地經一個、兩個、或三個獨立地選自烷基、鹵基、鹵烷基、鹵烷氧基、羥基、烷氧基、NH2 、烷基胺基、二烷基胺基、羧基、羧基烷基、及烷氧羰基的取代基取代。
  65. 如請求項62之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R4 為NH2 、NRc Rd 、烷氧基烷基胺基、羥基烷基胺基或胺基烷基胺基。
  66. 如請求項62之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R4 為雜芳基、雜環基、5至8員橋接雜環胺基或螺雜環胺基,其中該雜芳基及該雜環基單獨或作為另一基團的一部分都可選地經一個、兩個、或三個獨立地選自烷基、鹵基、鹵烷基、鹵烷氧基、羥基、烷氧基、NH2 、烷基胺基、二烷基胺基、羧基、羧基烷基、及烷氧羰基的取代基取代。
  67. 如請求項62或66之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R4 為雜環基。
  68. 如請求項62、66或67之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中該雜環基為雜環胺基,其可選地經一個、兩個、或三個獨立地選自烷基、鹵基、鹵烷基、鹵烷氧基、羥基、烷氧基、NH2 、烷基胺基、二烷基胺基、羧基、羧基烷基、及烷氧羰基的取代基取代,且其中該烷基、烯基及炔基可選地經羥基及未取代的環烷基取代。
  69. 如請求項68之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中該雜環胺基為氧雜環丁烷基、四氫呋喃基、或四氫哌喃基。
  70. 如請求項62或65之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R4 為NRc Rd
  71. 如請求項70之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中Rc 及Rd 連同彼等所附接的氮一起形成4至6員雜環胺基。
  72. 如請求項62之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R4 為甲基、乙基、正丙基、異丙基、三級丁基、乙炔基、氟基、氯基、環丙基、1-甲基環丙基、環丁基、環戊基、環戊-1-烯-1-基、2-環丙基乙炔基、2-環丙基乙烯基、2-環丙基乙基、吡咯啶-1-基、3-羥基吡咯啶-1-基、2-異丙基吡咯啶-1-基、2,2-二甲基吡咯啶-1-基、2-異丙基吡咯啶-1-基、2-(羧甲基)吡咯啶-1-基、2-羧基吡咯啶-1-基、吡啶-2-基、吡啶-3-基、吡啶-4-基、哌啶-1-基、哌啶-2-基、哌啶-3-基、哌啶-4-基、4-羥基哌啶-1-基、嗎啉-4-基、氧雜環丁烷-3-基、氧雜環丁烷-2-基、烷-2-基(oxan-2-yl)、烷-3-基、烷-4-基、四氫哌喃-4-基、1,2,3,6-四氫吡啶-4-基、3,6-二氫-2H-哌喃-4-基、四氫呋喃-3-基、吖呾-1-基、3-羥基吖呾-1-基、吡咯啶-3-基氧基、1-甲基吡咯啶-3-基氧基、烷-4-基氧基、吡咯啶-3-基氧基、2-乙氧基乙-1-基、3-甲氧基丙-1-基、甲基胺基、乙基胺基、正丙基胺基、正丁基胺基、異丙基胺基、異丁基胺基、三級丁基胺基、環丙基胺基、環丁基胺基、環戊基胺基、環己基胺基、環庚基胺基、(環丙基甲基)胺基、(環丁基甲基)胺基、(環戊基甲基)胺基、(環己基甲基)胺基、二甲基胺基、二乙基胺基、二甲基胺基、二-(正丙基)胺基、二-(異丙基)胺基、二-(正丁基)胺基、二-(異丁基)胺基、二-(三級丁基)胺基、(甲基)(乙基)胺基、2-乙氧基乙基胺基、3-甲氧基丙-2-基胺基、噻唑-2-基、噻唑-4-基、噻唑-5-基、吡唑-1-基、吡唑-3-基、吡唑-4-基、咪唑-1-基、咪唑-2-基、咪唑-4-基、咪唑-5-基、唑-5-基、唑-2-基、唑-4-基、1,2,4-三唑-5-基、1,2,4-三唑-3-基、1,2,4-三唑-1-基、羥甲基、4-二氟甲氧基苯基、3-二氟甲氧基苯基、2-二氟甲氧基吡啶-4-基、6-二氟甲氧基吡啶-3-基、4-甲基胺基吡啶-2-基、2-甲基胺基吡啶-4-基、6-甲基胺基-吡啶-2-基、4-二氟甲基苯基、2-羥丙-2-基、4-(2-羥丙基)苯基、4-(2-羥丙烷-2-基)苯基、2-(羧甲基)苯基、2-羧基苯基、2-甲氧基乙氧基、甲氧基、乙氧基、正丙氧基、異丙氧基、正丁氧基、異丁氧基及三級丁氧基、羥基、甲基次磺醯基、3-羥基-3-甲基丁-1-炔-1-基、3-羥基-3-甲基丁-1-烯-1-基、3-羥基-3-甲基丁基、2-羥丙烷-2-基、1-氮雜螺[3,4]辛烷-1-基、4-氮雜螺[2,4]庚烷-4-基、5-氮雜螺[3,4]辛烷-5-基、1-氮雜螺[3,3]庚烷-1-基、2-氧雜-5-氮雜螺[3,4]辛烷-5-基、6-氧雜-1-氮雜螺[3,3]庚烷-1-基、6-氧雜-1-氮雜螺[3,4]辛烷-1-基、7-氧雜-1-氮雜螺[4,4]壬烷-1-基、8-氧雜-3-氮雜雙環[3.2.1]辛烷-3-基、或7,7-二氧代-7-噻-1-氮雜螺[4.4]壬烷-1-基。
  73. 如請求項72之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R4 為甲基、乙基、正丙基、異丙基、正丁基、異丁基、或三級丁基。
  74. 如請求項73之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R4 為甲基、乙基、正丙基、或異丙基。
  75. 如請求項72之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R4 為環丙基、1-甲基環丙基、環丁基、或環戊基。
  76. 如請求項75之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R4 為環丙基。
  77. 如請求項72之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R4 為吡咯啶-1-基、3-羥基吡咯啶-1-基、2-異丙基吡咯啶-1-基、2,2-二甲基吡咯啶-1-基、2-異丙基吡咯啶-1-基、2-(羧甲基)吡咯啶-1-基、2-羧基吡咯啶-1-基、吡啶-2-基、吡啶-3-基、吡啶-4-基、哌啶-1-基、哌啶-2-基、哌啶-3-基、哌啶-4-基、4-羥基哌啶-1-基、嗎啉-4-基、氧雜環丁烷-3-基、氧雜環丁烷-2-基、烷-2-基、烷-3-基、烷-4-基、四氫哌喃-4-基、1,2,3,6-四氫吡啶-4-基、3,6-二氫-2H-哌喃-4-基、四氫呋喃-3-基、吖呾-1-基、3-羥基吖呾-1-基、噻唑-2-基、噻唑-4-基、噻唑-5-基、吡唑-1-基、吡唑-3-基、吡唑-4-基、咪唑-1-基、咪唑-2-基、咪唑-4-基、咪唑-5-基、唑-5-基、唑-2-基、唑-4-基、1,2,4-三唑-5-基、1,2,4-三唑-3-基、1,2,4-三唑-1-基、羥甲基、4-二氟甲氧基苯基、3-二氟甲氧基苯基、2-二氟甲氧基吡啶-4-基、6-二氟甲氧基吡啶-3-基、4-甲基胺基吡啶-2-基、2-甲基胺基吡啶-4-基、或6-甲基胺基-吡啶-2-基。
  78. 如請求項77之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R4 為吡咯啶-1-基、3-羥基吡咯啶-1-基、2-異丙基吡咯啶-1-基、2,2-二甲基吡咯啶-1-基、2-異丙基吡咯啶-1-基、2-(羧甲基)吡咯啶-1-基、或2-羧基吡咯啶-1-基。
  79. 如請求項72之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R4 為1-氮雜螺[3,4]辛烷-1-基、4-氮雜螺[2,4]庚烷-4-基、5-氮雜螺[3,4]辛烷-5-基、1-氮雜螺[3,3]庚烷-1-基、2-氧雜-5-氮雜螺[3,4]辛烷-5-基、6-氧雜-1-氮雜螺[3,3]庚烷-1-基、6-氧雜-1-氮雜螺[3,4]辛烷-1-基、7-氧雜-1-氮雜螺[4,4]壬烷-1-基、8-氧雜-3-氮雜雙環[3.2.1]辛烷-3-基、或7,7-二氧代-7-噻-1-氮雜螺[4.4]壬烷-1-基。
  80. 如請求項72之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R4 為甲基胺基、乙基胺基、正丙基胺基、正丁基胺基、異丙基胺基、異丁基胺基、三級丁基胺基、環丙基胺基、環丁基胺基、環戊基胺基、環己基胺基、環庚基胺基、(環丙基甲基)胺基、(環丁基甲基)胺基、(環戊基甲基)胺基、(環己基甲基)胺基、二甲基胺基、二乙基胺基、二甲基胺基、二-(正丙基)胺基、二-(異丙基)胺基、二-(正丁基)胺基、二-(異丁基)胺基、二-(三級丁基)胺基、或(甲基)(乙基)胺基。
  81. 如請求項1之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中X為CR1 ;Y為CR2 ,P為CH或CR4 ;Q為N;T為CH或CR5 ;U為CH或N;R1 及R2 獨立地為氫或甲氧基;R3 為-O-(CH2 )2 -R7 、-O-(CH2 )3 -R7 或-O-(CH2 )4 -R7 ;R7 為-NRa Rb ,其中Ra 及Rb 獨立地為甲基、乙基、正丙基或異丙基,或-NRa Rb 連同彼等所附接的氮一起形成4員雜環胺基或5員雜環胺基,其中各雜環胺基可選地經一個或兩個獨立地選自烷基、鹵基、鹵烷基、羥基、烷氧基及鹵烷氧基的取代基取代;R4 為甲基、乙基、正丙基、異丙基、環丙基、環丁基、環戊基、雜環基、NH2 、或NRc Rd ,其中該環丙基、該環丁基、及該環戊基可選地經一個、兩個、或三個獨立地選自烷基、鹵基、鹵烷基、鹵烷氧基、羥基、烷氧基、NH2 、烷基胺基、二烷基胺基、羧基、羧基烷基、及烷氧羰基的取代基取代;R5 為NH2 ;Rc 為氫、烷基、環烷基、或雜環基;且Rd 為烷基、環烷基或雜環基;或Rc 及Rd 連同彼等所附接的氮一起形成4至7員雜環胺基。
  82. 如請求項81之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R1 為甲氧基;且R2 為氫。
  83. 如請求項81或82之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R3 為-O-(CH2 )3 -R7
  84. 如請求項81至83中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R7 為-NRa Rb ,其中Ra 及Rb 獨立地為甲基、乙基、正丙基或異丙基。
  85. 如請求項84之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中Ra 及Rb 各為甲基。
  86. 如請求項81至85中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R7 為-NRa Rb ,其中-NRa Rb 連同彼等所附接的氮一起形成4員雜環胺基或5員雜環胺基,其中各雜環胺基可選地經一個或兩個獨立地選自烷基、鹵基、鹵烷基、羥基、烷氧基及鹵烷氧基的取代基取代。
  87. 如請求項86之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中NRa Rb 連同彼等所附接的氮一起形成吡咯啶-1-基。
  88. 如請求項81至87中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中P為CH。
  89. 如請求項81至87中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中P為CR4
  90. 如請求項89之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R4 為甲基、乙基、正丙基、異丙基、或環丙基。
  91. 如請求項89之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R4 為環丙基、環丁基、或環戊基,其中環丙基、環丁基、及環戊基可選地經一個、兩個、或三個獨立地選自烷基、鹵基、鹵烷基、鹵烷氧基、羥基、烷氧基、NH2 、烷基胺基、二烷基胺基、羧基、羧基烷基、及烷氧羰基的取代基取代。
  92. 如請求項89之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中R4 為NH2 、NRc Rd 、或4至6員雜環基。
  93. 如請求項81至92中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中T為CH。
  94. 如請求項81至93中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中U為CH。
  95. 如請求項1之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中該式(I)之化合物係選自由下列所組成之群組:如表1所示之1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101及102、或如表1所示之鹽的母體化合物、或該母體化合物的醫藥上可接受之鹽。
  96. 如請求項1之化合物、或其醫藥上可接受之鹽,其中該式(I)之化合物係選自由下列所組成之群組:如表2所示之1a、2a、3a、4a、5a、6a、7a、8a、9a、10a、11a、12a、13a、14a、15a、16a、17a、18a、19a、20a、21a、22a、23a、24a、25a、26a、27a、28a、29a、30a、31a、32a、33a、34a、35a、36a、37a、38a、39a、40a、41a、42a、43a、44a、45a、46a、47a、48a、49a、50a、51a、52a、53a、54a、55a、56a、57a、58a、59a、60a、61a、62a、63a、64a、65a、66a及67a。
  97. 一種醫藥組成物,其包含如請求項1至96中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽;及醫藥上可接受之賦形劑。
  98. 一種抑制G9a的活性的方法,該方法包含使含有G9a的細胞與有效量的如請求項1至96中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽接觸,從而抑制該G9a的活性。
  99. 一種抑制GLP的活性的方法,該方法包含使含有GLP的細胞與有效量的如請求項1至96中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽接觸,從而抑制GLP的活性。
  100. 一種增加胎兒血紅素(HbF)蛋白水平的方法,該方法包括使表徵為具有β球蛋白生產受損的細胞與有效量的如請求項1至96中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽接觸,從而增加胎兒血紅素(HbF)蛋白水平。
  101. 一種抑制血紅素S分子的聚合的方法,該方法包含使表徵為具有血紅素S突變的細胞與有效量的如請求項1至96中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽接觸,從而抑制血紅素S分子的聚合。
  102. 一種抑制對象體內G9a活性的方法,該方法包含向患有可由胎兒血紅素治療的疾病之該對象投予有效量的如請求項1至96中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽。
  103. 一種抑制對象體內GLP活性的方法,該方法包含向患有可由胎兒血紅素治療的疾病之該對象投予有效量的如請求項1至96中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽。
  104. 一種用於治療疾病的方法,該方法包含向患有可由胎兒血紅素治療的疾病之對象投予有效量的如請求項1至96中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽。
  105. 一種用於治療由β球蛋白生產受損表徵之疾病的方法,該方法包含向患有由β球蛋白生產受損表徵之該疾病之對象投予有效量的如請求項1至96中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽。
  106. 如請求項105之方法,其中該疾病為β-地中海貧血。
  107. 一種用於治療由聚合的血紅素S分子濃度增加表徵之疾病的方法,該方法包含向患有由聚合的血紅素S分子濃度增加表徵之該疾病之對象投予有效量的如請求項1至96中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽。
  108. 如請求項107之方法,其中該疾病為鐮狀細胞疾病。
  109. 一種改善或治療血紅素病的方法,其包含向有此需要之對象投予有效量的如請求項1至96中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽、或如請求項97之醫藥組成物。
  110. 如請求項109之方法,其中該血紅素病為鐮狀細胞疾病。
  111. 如請求項109之方法,其中該血紅素病為β-地中海貧血。
  112. 一種有效量的如請求項1至96中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽在製備用於抑制含有G9a的細胞中的G9a活性的藥物的用途。
  113. 一種有效量的如請求項1至96中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽在製備用於抑制含有GLP的細胞中的GLP活性的藥物的用途。
  114. 一種有效量的如請求項1至96中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽在製備用於增加表徵為具有β球蛋白生產受損的細胞中的胎兒血紅素(HbF)蛋白水平的藥物的用途。
  115. 一種有效量的如請求項1至96中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽在製備用於抑制表徵為具有血紅素S突變的細胞中的血紅素S分子的聚合的藥物的用途。
  116. 一種有效量的如請求項1至96中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽在製備用於治療可由胎兒血紅素治療的疾病的藥物的用途。
  117. 一種有效量的如請求項1至96中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽在製備用於治療可由胎兒血紅素治療的疾病的藥物的用途。
  118. 一種有效量的如請求項1至96中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽在製備用於治療由β球蛋白生產受損表徵之疾病的藥物的用途。
  119. 如請求項118之用途,其中該疾病為β-地中海貧血。
  120. 一種有效量的如請求項1至96中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽在製備用於治療由聚合的血紅素S分子濃度增加表徵之疾病的藥物的用途。
  121. 如請求項120之用途,其中該疾病為鐮狀細胞疾病。
  122. 一種有效量的如請求項1至96中任一項之化合物、或其醫藥上可接受之鹽在製備用於改善或治療血紅素病的藥物的用途。
  123. 如請求項122之用途,其中該血紅素病為鐮狀細胞疾病。
  124. 如請求項122之用途,其中該血紅素病為β-地中海貧血。
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