TW201805305A - Gitr抗體,方法及用途 - Google Patents
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Abstract
本文中提供特異性結合至GITR之抗體。亦描述能夠編碼所提供之GITR特異性抗體或抗原結合片段的相關多核苷酸、表現所提供之抗體或抗原結合片段的細胞、以及相關聯之載體和經可偵測標示之抗體或抗原結合片段。此外,描述使用所提供抗體之方法。舉例而言,所提供之抗體可用來增強對象對抗癌症的免疫反應。
Description
本申請案主張2015年3月8日提出申請之美國臨時申請案序號62/305,270及2016年10月12日提出申請之美國臨時申請案序號62/407,106之優先權。前述申請案之完整內容全文以引用方式併入本文中。
本申請案含有序列表,其已經以ASCII格式藉由電子方式提交且其全文以引用方式併入本文中。該ASCII副本(建立於2017年2月21日)被命名為JBI5082USNP_SL.txt且檔案大小為92,231位元組。
在本文中提供之本揭露關於特異性結合糖皮質素誘導性腫瘤壞死因子受體(GITR)之單株抗體以及生產及使用所述抗體之方法。
糖皮質素誘導性TNFR相關蛋白(GITR;又名AITR、TNFRSF18、或CD357)是TNFR超家族的一員,其表現於先天及適應性免疫系統的許多組分中,且刺激後天及先天免疫性兩者(Nocentini G等人,(1994)PNAS 94:6216-6221;Hanabuchi S等人,(2006)Blood 107:3617-3623;Nocentini G & Riccardi C(2005)Eur J Immunol 35:1016-
1022;Nocentini G等人,(2007)Eur J Immunol 37:1165-1169)。其表現於數種細胞及組織中,包括T細胞、B細胞、樹突細胞(DC)及自然殺手(NK)細胞,且藉由其配體GITR-L來活化,GITR-L主要表現於抗原呈現細胞(APC)及內皮細胞上,也表現於腫瘤細胞中。
GITR-GITRL系統參與自體免疫/發炎反應之發展並強化對感染及腫瘤之反應。舉例而言,用GITR-Fc融合蛋白質治療動物改善自體免疫/發炎性疾病,然而引發GITR可有效治療病毒性、細菌性及寄生蟲感染,同時加強對抗腫瘤的免疫反應(Nocentini G等人,(2012)Br J Pharmacol 165:2089-99)。這些效應係因數種並行機制所致,包括:共活化效應T細胞、抑制調節T(Treg)細胞、調控NK及樹突細胞功能、活化巨噬細胞、及調節外滲過程。GITR之膜表現在T細胞活化後增加(Hanabuchi S等人,(2006)同上;Nocentini G & Riccardi C同上)。其引發共活化效應T淋巴球(McHugh RS等人,(2002)Immunity 16:311-323;Shimizu J等人,(2002)Nat Immunol 3:135-142;Roncheti S等人,(2004)Eur J Immunol 34:613-622;Tone M等人,(2003)PNAS 100:15059-15064)。GITR活化增加對腫瘤及病毒性感染的抵抗性,並涉及自體免疫/發炎過程且調節白血球外滲(Nocentini G & Riccardi C(2005)同上;Cuzzocrea S等人,(2004)J Leukoc Biol 76:933-940;Shevach EM & Stephens GL(2006)Nat Rev Immunol 6:613-618;Cuzzocrea S等人,(2006)J Immunol 177:631-641;Cuzzocrea S等人,(2007)FASEB J 21:117-129)。
人類GITR以非常低的水平表現於周邊(非活化)T細
胞。在T細胞活化之後,GITR在CD4+及CD8+二種細胞中強烈上調數天(Kwon B等人,(1999)J Biol Chem 274:6056-6061;Gurney AL等人,(1999)Curr Biol 9:215-218;Ronchetti S等人,(2004)同上;Shimizu J等人,(2002)同上;Ji HB等人,(2004)同上;Ronchetti S等人,(2002)Blood 100:350-352;Li Z等人,(2003)J Autoimmun 21:83-92),且CD4+細胞比起CD8+細胞具有較高GITR表現(Kober J等人,(2008)Eur J Immunol 38(10):2678-88;Bianchini R等人,(2011)Eur J Immunol 41(8):2269-78)。
人類GITR在調控免疫反應中的作用顯示其可能是基於抗體之對抗疾病(諸如癌症)之療法的合適目標。抗GITR之抗體經描述(例如WO200610502、WO2011028683、WO2015031667、WO20150353637、WO2015187835、WO2015184099、US9255151及US9255152),但仍持續需要新穎的藥物及方法來調控GITR活性以對抗疾病,諸如癌症。
本文中提供特異性結合至GITR之抗體及其抗原結合片段。亦描述能夠編碼所提供之GITR特異性抗體及抗原結合片段的相關多核苷酸、表現所提供之抗體及抗原結合片段的細胞、以及相關聯之載體和經可偵測標示之抗體及抗原結合片段。此外,描述使用所提供抗體及抗原結合片段之方法。舉例而言,鑒於GITR在調控免疫反應中扮演的角色,GITR特異性抗體具有治療各種其中調控免疫反應係為所欲之GITR相關疾病或病症的效用。舉例而言,GITR特異性抗體可用於各種免疫療法應
用,諸如治療各種癌症。
本文中描述對於GITR具有特異性之單離抗體及抗原結合片段。在一些實施例中,該等GITR特異性抗體及抗原結合片段結合人類GITR。在一些實施例中,該等GITR特異性抗體及抗原結合片段結合人類GITR及石蟹獼猴(cynomolgus monkey)GITR。在一些實施例中,該等GITR特異性抗體及抗原結合片段結合至一表位,該表位包括一或多個來自如SEQ ID NO:59所定義之GITR胞外域(ECD)的殘基。此GITR特異性抗體或抗原結合片段可以30nM或更小之結合親和力結合至GITR、可在NF-κB螢光素酶基因測定中誘導螢光素酶表現增加且可以67ng/mL或更小之EC50在活體外(in vitro)誘導ADCC。
在一些實施例中提供包含重鏈及輕鏈之GITR特異性抗體、或其抗原結合片段,該重鏈包含表1中所述抗體之任一者的CDR1、CDR2、及CDR3,該輕鏈包含表1中所述抗體之任一者的CDR1、CDR2、及CDR3。
IgG類別在人類中係分成四種同型(isotype):IgG1、IgG2、IgG3及IgG4。它們的Fc區之胺基酸序列具有超過95%的同源性,但鉸鏈區的胺基酸組成及結構顯示主要差異。Fc區媒介效應功能,諸如抗體依賴性細胞性細胞毒性(ADCC)及補體依賴性細胞毒性(CDC)。在ADCC及ADCP中,抗體之Fc區結合至免疫效應細胞(諸如自然殺手細胞或巨噬細
胞)表面上之Fc受體(FcgR),導致溶解或吞噬標靶細胞。在CDC中,抗體藉由在細胞表面引發補體級聯反應(complement cascade)來殺滅標靶細胞。本文中所述之抗體包括具有所述可變域特性與任何IgG同型組合的抗體,包括其中Fc序列已經修飾以致使不同效應功能之經修飾版本。
在一些實施例中,該等抗體包含上表1中所示之抗體的CDR。在一些實施例中,所述抗體能夠以30nM或更小之解離常數結合至GITR,如由表面電漿共振(surface plasmon resonance,SPR)所測得者。在一些實施例中,所述抗體能夠在NF-κB螢光素酶基因測定中誘導螢光素酶表現增加。在一些實施例中,所述抗體能夠以67ng/mL或更小之EC50在活體外誘導ADCC。
除了所述之GITR特異性抗體及抗原結合片段外,亦提供能夠編碼所述抗體及抗原結合片段之多核苷酸序列。亦提供包含所述多核苷酸之載體,如表現本文中所提供之GITR特異性抗體或抗原結合片段的細胞。亦描述能夠表現所揭示載體之細胞。這些細胞可為哺乳動物細胞(諸如293F細胞、CHO細胞)、昆蟲細胞(諸如Sf7細胞)、酵母菌細胞、植物細胞、或細菌細胞(諸如E.coli)。亦提供一種用於生產所述抗體或抗原結合片段之過程。
亦揭示使用所述GITR特異性抗體或抗原結合片段之方法。此節中討論之方法所使用的特定抗體包括具有如表1所述之抗體的CDR組之抗體。舉例而言,GITR在免疫反應中扮演的關鍵角色使其成為
免疫療法中具吸引力的目標,包括誘導或增強針對所欲腫瘤抗原或病原體抗原(例如病毒及其他病原生物)的免疫反應。因此,GITR特異性抗體具有治療各種癌症及感染性疾病的效用。
如上所述,GITR活化傳送共活化信號至CD4+及CD8+ T細胞並防止調節T細胞阻抑免疫反應。因此,在一實施例中,GITR特異性抗體係經投予以抑制調節T細胞阻抑效應T細胞活性。該抑制可用所屬技術領域中所習知的各種方法測定,包括例如監測T細胞增生、表現習知活化標記、或細胞介素分泌。在另一實施例中,GITR特異性抗體係經投予至對象以降低調節T細胞之水平,例如腫瘤調節T細胞的水平。在又另一實施例中,效應T細胞的活性藉由投予本文中所提供之GITR特異性抗體來誘導或增強。這些方法之各者的特定測定係提供於實例中。
本文中所述者為包括所揭示之GITR特異性抗體或其抗原結合片段之套組。所述套組可用來進行該等使用本文中所提供之GITR特異性抗體或抗原結合片段之方法,或者所屬領域中具有通常知識者所習知之其他方法。在一些實施例中,所述套組可包括本文中所述之抗體或抗原結合片段及用於偵測生物樣本中之GITR之存在的試劑。因此,所述套組可包括本文中所述之抗體(或其抗原結合片段)之一或多者及用於容納未使用時之該抗體或片段之容器、該抗體或片段之使用說明、固定至固相撐體(solid support)之抗體或片段、及/或該抗體或片段之可偵測標示形式,如本文中所述。
圖1A至1C:由來自傳統篩選組之抗GITR mAb所展現的促效劑活性。所顯示的數據係來自細胞的Cell-Titer Glo信號,該等細胞在僅經NF-kB螢光素酶報導基因轉染(Luc)或經GITR表現載體與NF-kB螢光素酶報導基因兩者轉染(GITR-Luc)之後用所示試劑處理。生產大於用PBS處理所見之信號的抗體被初步歸類為促效劑。
圖2A至2E:由來自次世代定序組之抗GITR mAb所展現的促效劑活性。所顯示的數據係來自細胞的Cell-Titer Glo信號,該等細胞在僅經NF-kB螢光素酶報導基因轉染或經GITR表現載體與NF-kB螢光素酶報導基因兩者轉染之後用所示試劑處理。
圖3A至3D:抗GITR抗體接合對NF-κB活性的影響。所示結果代表SEAP活性,其為NF-κB在GITR穩定轉染之HEK-Blue NF-κB細胞中活化的測量指標。細胞係在25ng/mL之可溶GITR配體不存在(3A,3B)或存在下(3C,3D),用變化濃度的抗GITR抗體處理。介質及CNTO3930係用來作為無抗體及同型抗體對照。
圖4A及圖4B:抗GITR抗體對於記憶T細胞對CMV及TT之反應的影響。在抗GITR抗體不存在或存在下、在CNTO3930同型對照抗體或無抗體下,將血清陽性PBMC用CMV及TT抗原脈衝。收集上清液並測量IFNγ之存在。
圖5A及圖5B:替代(surrogate)抗GITR抗體(DTA-1)在同基因MC38結腸癌模型中之單一劑抗腫瘤活性。當腫瘤體積達到100mm3時,開
始將DTA-1或同型大鼠IgG2b以200ug/小鼠在黑色箭頭指示的天數投予至動物(每組n=10)。DTA-1治療在5/10隻動物中導致完全腫瘤緩解。
圖6A至6C:替代抗GITR抗體(DTA-1)與抗PD-1抗體(RMP1-14)之組合在同基因MC38結腸癌模型中導致協同的抗腫瘤活性。當腫瘤體積達到200mm3時,開始將同型大鼠IgG2b(6A)、DTA-1(6B)或DTA-1+RMP1-14(6C)以100ug/抗體/小鼠在黑色箭頭指示的天數投予至動物(每組n=10)。組合治療在5/10隻動物中導致腫瘤緩解。
圖7A至7C:替代抗GITR抗體(DTA-1)與抗CTLA-4抗體(9D9)之組合在同基因MC38結腸癌模型中導致協同的抗腫瘤活性。當腫瘤體積達到200mm3時,開始將同型大鼠IgG2b(7A)、DTA-1(7B)或DTA-1+9D9(7C)以100ug/抗體/小鼠在黑色箭頭指示的天數投予至動物(每組n=10)。組合治療在3/10隻動物中導致腫瘤緩解。
圖8A至8D:替代抗GITR抗體(DTA-1)與抗OX-40抗體(OX-86)之組合在同基因MC38結腸癌模型中優於單獨OX-86。當腫瘤體積達到200mm3時,開始將同型大鼠IgG2b(8A)、或DTA-1(8B)的三次注射以100ug/抗體/小鼠在黑色箭頭指示的天數投予至動物(每組n=10)。DTA-1(d1)然後OX-86(d5、d9,圖7D)之順序優於同型Ab然後OX-86(7C)之順序。
圖9A至9F:組合抗GITR/抗PD-1療法加上疫苗接種加強Ag特異性CD8+ T細胞的擴增、功能及分化。將未處理過(naïve)之B6非荷瘤小鼠(n=5/組)用OVA257-264肽免疫一次(第0天),加上單一或組合
療法:在第0、3及6天200μg之抗GITR或對照大鼠IgG,及在第3、6、9及12天200μg之抗PD-1。在第7天(d7)及第14天(d14)監測血液及/或脾臟中之所欲免疫反應。A,以酶聯免疫斑點法(ELISpot)分析來自經OVA257-264特異性肽刺激之小鼠的脾臟之IFNγ分泌型T細胞(d7)。B,柱狀圖顯示在脾臟中因應OVA257-264刺激而釋放效應細胞介素IFNγ、TNFα、及IL-2的單-、雙-及三陽性CD8+ T細胞多功能亞群(d7)。C,溶細胞性表型之輪廓(d7)。D,在周邊血液中之OVA特異性CD8+ T細胞(d7)。點圖,代表D中顯示的5隻小鼠。E,在d14在周邊血液中之OVA特異性CD8+ T細胞。E至F,在免疫之後d14在來自經治療小鼠的血液中之OVA四聚體特異性CD8+記憶T細胞的分化。以上各實驗重複至少二次得到類似結果。*P<0.05;**P<0.01;***P<0.001。誤差槓指示SEM。EM:效應記憶;CM:中樞記憶。
圖10A至10D:活體內(in vivo)組合療法加上疫苗接種在小鼠中促進B16-OVA腫瘤排斥(tumor rejection)。A,已建立的B16-OVA腫瘤(約30至40mm3)用所示治療處理。B,隨時間監測個別腫瘤反應、組別腫瘤測量(平均+/-SEM,C)及存活(D)。圖代表每組研究動物的平均腫瘤體積,而圖表指示無腫瘤數/總數(C)。圖代表3次獨立實驗中的1次代表性結果。*P<0.05;**P<0.01;***P<0.001。
圖11A至11D:組合Vax/抗GITR/抗PD-1療法協同以增強CD8+ TIL的疫苗誘導性抗原特異性反應之頻率及功能。所顯示的概要數據係在腫瘤植入之後12至15天經OVA257-264限制(CD8)肽刺激(A至B)或PMA/ION刺激(D)後,CD8+ TIL的細胞內細胞介素IFNγ、TNFα、
INFγ/TNFα及CD107a/IFNγ染色。C,條形圖顯示在腫瘤中H2-Kb-SIINFEKL-限制OVA四聚體特異性CD8+ TIL佔總CD45+細胞之百分比。實驗重複至少二次得到類似結果。*P<0.05;**P<0.01;***P<0.001。誤差槓指示n=4至5/組之SEM。
圖12A至12D:組合療法在B16-OVA腫瘤中增強CD8+ T細胞浸潤並減少Treg頻率。A,圖9B至9D之非荷瘤小鼠脾臟的Treg百分比,B16-OVA荷瘤小鼠世代係用Vax、抗GITR、及/或PD-1組合治療(如圖10所示)。B,在腫瘤植入之後15天,CD8+ TIL佔總CD45+細胞之百分比。C至D,代表性流式點圖及顯示在腫瘤植入之後15天經治療小鼠的腫瘤中Treg佔CD45+ TIL之百分比及CD8+效應T細胞對Treg之比例的概要數據。統計分析係與Vax/抗GITR/抗PD-1比較。結果代表每組4至5隻小鼠的2至3個獨立實驗。*P<0.05;**P<0.01;***P<0.001。誤差槓指示SEM。
圖13A至13D:Vax/抗GITR/抗PD-1療效取決於CD8+ T細胞且治療誘導長期記憶。A,治療性耗乏研究的給藥計畫。將B6小鼠(n=10/組)用4×105 B16-OVA腫瘤細胞皮下(s.c.)注射,且當腫瘤直徑達到約40mm3時,在第7、8、9、11、14、17天對每隻小鼠投予各200μg的mAb,以耗乏牠們的CD8細胞、CD4細胞、或NK細胞;第8天是開始Vax/抗GITR/抗PD-1或IgG治療的天數。疫苗在腫瘤植入後第8天;抗GITR在第8及14天;抗PD-1在第10、13、16、及19天給藥。B,每周監測二次腫瘤體積(平均+/-SEM)。C至D,經組合治療之後無腫瘤的小鼠(每組n=6至9)在初次腫瘤排斥之後六個月在
相同側腹上用B16-OVA(2×105個;C)或B16.F10(1.5×105個;D)細胞再激發(re-challenge)。使用年齡相符的小鼠作為再激發對照。結果代表2至3個獨立實驗。
圖14A至14D:組合Vax/抗GITR/抗PD-1療法擴增腫瘤特異性CD8+ TIL並誘導KLRG1+效應記憶CD8+ T細胞所媒介之腫瘤清除。在腫瘤接種之後15天(4至5隻小鼠/組),代表性散布圖顯示(A)H2-Kb-SIINFEKL-限制OVA特異性CD8+ T細胞之百分比,(B)KLRG1+CD8+ TIL之百分比,及(C)四聚體結合性KLRG1+CD8+ TIL之百分比。D,將B6小鼠(每組10隻)用4×105 B16-OVA腫瘤細胞皮下注射並在第8天當腫瘤直徑達到約50mm3時,啟始如圖13之療法。在第7、8、9、11、14、17、20天投予200μg之aKLRG1 mAb;第8天是開始治療的天數。每周監測二次腫瘤體積及存活。整體圖敘述至少二個獨立實驗的平均+/-SEM。*P<0.05;**P<0.01;***P<0.001。
圖15A及圖15B:雙重抗GITR/抗PD-1組合與基於TRP2之肽疫苗協同以誘導已建立之B16-OVA腫瘤的緩解。將B6小鼠(每組10隻)用4×105 B16-OVA腫瘤細胞皮下注射;當腫瘤達到約50mm3時啟始治療。A,在B16-OVA荷瘤小鼠中TRP2肽疫苗接種單獨或與抗GITR/抗PD-1療法之組合(或相符同型IgG)的計畫示意圖。B,隨時間監測組別(平均+/-SEM)及個體之腫瘤生長。實驗進行至少二次得到類似結果。**P<0.01。
圖16:耗乏CD25+細胞加上組合Vax/抗GITR/抗PD-1療法不廢除或增強腫瘤療效。組合治療及200μg抗CD25之給藥係如圖5A所示遞
送。每周監測二次腫瘤體積(以平均+/-SEM作圖)。結果代表每組10隻小鼠的二個獨立實驗。
圖17A至17C:抗KLRG1抗體耗乏KLRG1+CD8+目標族群。A至B,如圖9對未處理過之無腫瘤小鼠給予Vax/抗GITR/抗PD-1組合及同型。抗KLRG1治療小鼠於疫苗接種後第2、4、及6天經投予100μg之抗KLRG1 mAb。在疫苗接種後第7天犧牲小鼠並自血液及脾臟收集淋巴球以評估CD8、KLRG1、及CD44之表現。A,在抗KLRG-1抗體治療之後,脾臟中CD8+ T細胞之百分比。B,代表性流式圖顯示血液及脾臟中KLRG1+CD8+之百分比及(C)血液及脾臟中KLRG1+CD8+CD44+及KLRG1+CD8+Tet+細胞(分別為左圖及右圖)之頻率及/或總細胞數的彙總數據。結果代表每組5隻小鼠的2個獨立實驗。*P<0.05;**P<0.01;***P<0.001。誤差槓指示SEM。
圖18A及18B繪示小鼠(每組n=10)的腫瘤生長(圖12A)及存活(圖12B),該等小鼠經植入B16-OVA細胞(400,000個),接著在植入後第7天如所示經抗CD122 mAb 5H4(投予5次,間隔2至3天)、或肽疫苗複合物(1劑)、或組合之治療。
圖19A至19D:繪示在B16-OVA植入(400,000細胞)後第16天收集之TIL的頻率,及腫瘤浸潤性G-MDSC(CD11b+Ly6G+Ly6C-)(圖13A)、腫瘤浸潤性IFNγ+TNFα+細胞介素分泌型CD8+ T細胞在離體(ex-vivo)OVA257-264肽之刺激下(圖13B)、H2-Kb-SIINFEKL OVA特異性CD8+ TIL(圖13C)、及腫瘤浸潤性Treg
(CD4+CD44+FOXP3+CD25+)(圖13D)的百分比。aCD122:抗CD122單株抗體。*P<0.05;**P<0.01;***P<0.001;****P<0.0001。
圖20A至20C:繪示抗CD122療法在非荷瘤小鼠之周邊中增強疫苗誘導性抗原特異性CD8+ T細胞反應:H2-Kb-SIINFEKL-限制OVA特異性CD8+ T細胞之百分比(圖31A);在抗CD122治療之後在非荷瘤小鼠之血液中CD8+CD122+ T細胞族群之百分比(圖31B),在療法治療之後在荷瘤小鼠之腫瘤中CD8+CD122+ T細胞族群之百分比(圖31C)。aCD122:抗CD122單株抗體;Vax:疫苗。*P<0.05;**P<0.01;***P<0.001;****P<0.0001。誤差槓指示SEM。
圖21A及圖21B:繪示小鼠的存活,該等小鼠經植入B16-OVA細胞(400,000個),接著經抗CD122與肽疫苗接種(3劑)之組合治療(圖32A)。圖32A中用疫苗/抗CD122治療且存活無腫瘤的小鼠用B16-ova細胞再激發;圖顯示排斥二次腫瘤激發(tumor challenge)的小鼠之百分比(圖32B)。
圖22A及圖22B:繪示未處理過小鼠(每組n=10)的腫瘤生長及存活,該等小鼠接受B16-OVA細胞(400,000個)植入,接著在植入後第4天如所示經抗CD122、或抗GITR、或抗CD122與抗GITR之組合之治療。*P<0.05;**P<0.01;***P<0.001;****P<0.0001。
圖23:在TRGB191.CLF存在或不存在下,GITR-CED之各區段氘化水平的差異。各區塊代表可經定位的肽及相對於對照在60、600、3,600及14,400秒之交換程度。灰色:無氘保護;深灰色:與mAb結合時強烈保護;淺灰色:與mAb結合時中度保護。
圖24:GITR ECD單體之空間填充模型,且TRGB191表位以黑色強調。
圖25A及圖25B:TRGB191.CLF在初代靜止及活化CD4+及CD8+ T細胞上之ADCC活性。評估TRGB191.CLF及CNTO3930(同型對照抗體)在靜止CD4+(A,左圖)及靜止CD8+ T細胞(B,左圖)或活化CD4+(A,右圖)及CD8+ T細胞(B,右圖)上之ADCC活性。特異性溶解百分比係顯示為平均±平均之標準誤差(SEM)。E:T比例係指示於圖例中。N=3個實驗複製(replicate),每個數據點n=12。[Ab]=抗體濃度。
圖26:TRGB191.CLF在JJN-3細胞系上之ADCC活性。使用JJN-3目標細胞及NK-92 158 V/V效應細胞,評估TRGB191.CLF及CNTO3930(同型對照抗體)之ADCC活性。特異性溶解百分比係顯示為平均±平均之標準誤差(SEM)。N=6個實驗複製,每個數據點n=12至24。[Ab]=抗體濃度。
圖27:使用NK-92 158 V/V效應細胞,測試TRGB191.CLF及CNTO3930同型對照抗體在JJN-3目標細胞及在活體外(in vitro)分化作為目標細胞之Treg上的ADCC活性。特異性溶解百分比係顯示為平均±平均之標準誤差(SEM)。N=3個實驗複製,每個數據點n=12。[Ab]=抗體濃度,EC50=半最大有效濃度,Bmax=最大溶解。
圖28A及圖28B:使用高及低親和力FcγRIIIA多型性效應細胞的TRGB191.CLF之ADCC活性。使用表現(A)158V/V高親和力變異體或(B)158F/F低親和力變異體的NK-92效應細胞,測試TRGB191.CLF
及CNTO3930在JJN-3目標細胞上之ADCC活性。特異性溶解百分比係顯示為平均±平均之標準誤差(SEM)。N=3個實驗複製,每個數據點n=12。[Ab]=抗體濃度,EC50=半最大有效濃度,Bmax=最大溶解。
圖29:DTA-1+FGK4.5治療在從100mm3腫瘤體積開始的MC38模型中導致更完全的腫瘤緩解。
圖30:DTA-1+FGK4.5治療在從230mm3腫瘤體積開始的MC38模型中導致更完全的腫瘤緩解。
圖31:DTA-1+OX86治療在從100mm3腫瘤體積開始的MC38模型中導致更完全的腫瘤緩解。
圖32:DTA-1+RMP1-14治療在從100mm3腫瘤體積開始的MC38模型中導致更完全的腫瘤緩解。
各種關於實施方式之態樣的用語係用於說明書與申請專利範圍的各個部分中。這些用語係以其在該項技術領域中之原始意義來使用,除非另有指示。其他經特別定義之用語的解讀係與本說明書中所提供之定義一致。
於本說明書及隨附的申請專利範圍中,除非內文另有明確說明,否則單數形式的「一(a/an)」及「該(the)」皆包括複數指稱。因此,例如對於「一細胞(a cell)」之指稱包括兩或更多個細胞之組合與類似者。
本文中所使用之用語「約(about)」在指稱一可測量的值(諸如數量、持續時間及類似者)時,意欲涵蓋在指定值之高達±10%內
的變異,若此類變異為適合執行所揭示之方法者。除非另有指示,所有用於說明書及申請專利範圍中以表達成分量、特性(諸如分子量、反應條件等)之數目應理解為在所有情況中皆經用語「約(about)」所修飾。因此,除非另有相反指示,以下說明書及隨附申請專利範圍中所提出之數值參數為近似值,其可視本發明所尋求獲得之所欲特性而有所變化。無論如何,且並非意圖限制申請專利範圍的範疇之等效原則的應用,每一個數值參數應至少鑑於所報導的有效位數之數目並藉由應用一般捨入計數來加以詮釋。
儘管闡明本發明內容之廣域範圍的數值範圍及參數為近似值,仍盡可能精確地報導特定實例中所提出的數值。然而,任何數值固有地包含由在它們的個別測試測量值中發現之標準偏差所必然產生的某些誤差。
「單離(isolated)」意指生物組分(諸如核酸、肽或蛋白質)已經與該組分所天然出現於內之生物體中的其他生物組分(即其他染色體及染色體外DNA及RNA、和蛋白質)實質上分開、與該等其他生物組分分開生產、或經純化而遠離該等其他生物組分。已「單離」之核酸、肽及蛋白質因而包括藉由標準純化方法所純化之核酸及蛋白質。「單離」核酸、肽及蛋白質可為組成物之一部分且仍為單離,只要該組成物並非該核酸、肽及蛋白質之原生環境的一部分。該用語亦包含藉由在宿主細胞中重組表現所製備之核酸、肽及蛋白質以及化學合成之核酸。本文中所使用之「單離」抗體或抗原結合片段意指實質上不含其他具有不同抗原特異性之抗體或抗原結合片段的抗體或抗原結合片段(例如,特異性結合至
GITR之單離抗體係實質上不含特異性結合GITR以外之抗原的抗體)。然而,特異性結合至GITR之表位、異構體或變異體的單離抗體可對於其他相關抗原例如來自其他物種之相關抗原(諸如GITR物種同源物)具有交叉反應性。
如本文所用,用語「糖皮質素誘導性TNFR相關蛋白(glucocorticoid-induced TNFR-related protein)」及「GITR」尤其包括人類GITR蛋白,例如描述於GenBank登錄號AF241229、NCBI參考序列:NP_004186.1、及UniProtKB/Swiss-Prot登錄號Q9Y5U5(亦參見Kwon等人1999,J.Biol.Chem.274,6056-6061)。GITR在科學文獻中亦稱為AITR、CD357、TNFRSF18、及GITR-D。
如本文中所使用,用語「GITR配體(GITR ligand)」、「GITRL」、及「GITR-L」係指糖皮質素誘導性TNFR相關蛋白配體。GITRL也稱為活化誘導性TNF相關配體(AITRL)及腫瘤壞死因子配體超家族成員18(TNFSF18)。GenBank登錄號AF125303提供例示性人類GITRL核酸序列。GenBankTM登錄號NP 005083及Swiss-Prot登錄號Q9UNG2提供例示性人類GITRL胺基酸序列。在特定實施例中,GITRL係SEQ ID NO:65之人類GITRL。
「抗體(antibody)」係指免疫球蛋白之所有同型(IgG、IgA、IgE、IgM、IgD、及IgY),包括各種單體、聚合及嵌合形式,除非另有指定。用語「抗體」所具體涵蓋者為多株抗體、單株抗體(mAb)、及類抗體多肽,諸如嵌合抗體及人化抗體。
「抗原結合片段(antigen-binding fragment)」為可對特定抗
原展現結合親和力之任何蛋白質結構。抗原結合片段包括藉由任何習知技術所提供者,諸如酶切割、肽合成、及重組技術。一些抗原結合片段係由保有親系抗體分子之抗原結合特異性的完整抗體之部分組成。舉例而言,抗原結合片段可包含已知結合特定抗原之抗體的至少一個可變區(重鏈或輕鏈可變區)或一或多個CDR。合適抗原結合片段之實例包括但不限於雙價抗體(diabody)及單鏈分子以及Fab、F(ab’)2、Fc、Fabc、及Fv分子、單鏈(Sc)抗體、個別抗體輕鏈、個別抗體重鏈、抗體鏈或CDR及其他蛋白質、蛋白質支架間之嵌合融合物、重鏈單體或二聚體、輕鏈單體或二聚體、由一個重鏈及一個輕鏈所組成之二聚體、由VL、VH、CL及CH1域所組成之單價片段、或如WO2007059782中所述之單價抗體、包含兩個由鉸鏈區之雙硫橋所連接之Fab片段之雙價片段、主要由V.sub.H及C.sub.H1域所組成之Fd片段;主要由抗體單臂之VL及VH域所組成的Fv片段、dAb片段(Ward等人,Nature 341,544-546(1989))(其主要由VH域組成且亦稱為域抗體(domain antibody))(Holt等人;Trends Biotechnol.2003 Nov.;21(11):484-90);駱駝或奈米抗體(Revets等人;Expert Opin Biol Ther.2005 Jan.;5(1):111-24);單離互補決定區(CDR)、及類似者。所有抗體同型皆可用來生產抗原結合片段。此外,抗原結合片段可包括非抗體蛋白質架構諸如蛋白質支架,以成功地將多肽區段納入可賦予對所關注之指定抗原的親和力之位向。抗原結合片段可經重組生產,或藉由酶或化學切割完整抗體來生產。片語「抗體或其抗原結合片段(an antibody or antigen-binding fragment thereof)」可用來意謂指定抗原結合片段納入該片語中所指涉之抗體的一或多個胺基酸區段。
用語「CDR」及其複數「CDRs」係指互補決定區(CDR),其中三個構成輕鏈可變區之結合特徵(CDRL1、CDRL2及CDRL3)及三個構成重鏈可變區之結合特徵(CDRH1、CDRH2及CDRH3)。CDRs有助於抗體分子的功能活性並被包含支架或架構區的胺基酸序列分開。確切的定義性CDR邊界及長度有不同的分類及編號系統。因此CDRs可用Kabat、Chothia、contact或任何其他邊界定義來指稱。儘管邊界不同,這些系統之各者在可變序列內所謂的「超變異區(hypervariable region)」的組成上具有一些程度的重疊。因此根據這些系統的CDR定義在關於相鄰架構區的長度及的邊界區域方面可能不同。見例如Kabat等人,Sequences of Proteins of Immunological Interest,5th ed.NIH Publication No.91-3242(1991);Chothia等人,「Canonical Structures For the Hypervariable Regions of Immunoglobulins,」J.Mol.Biol.196:901(1987);及MacCallum等人,「Antibody-Antigen Interactions:Contact Analysis and Binding Site Topography,」J.Mol.Biol.262:732(1996),各者之全文以引用方式併入本文中。
一般而言,CDRs形成可被歸類為正則結構之圈環結構。用語「正則結構(canonical structure)」係指抗原結合(CDR)圈環所採取的主鏈構形。從比較性結構研究中,發現六個抗原結合圈環中的五個僅具有有限的可用構形類型(repertoire)。各正則結構可藉由多肽主鏈的扭轉角來表徵。因此,抗體之間的對應圈環可能具有非常類似的三維結構,儘管圈環的大部分中具有高度胺基酸序列變異性(Chothia等人,「Canonical Structures For the Hypervariable Regions of Immunoglobulins,」J.Mol.Biol.
196:901(1987);Chothia等人,「Conformations of Immunoglobulin Hypervariable Regions,」I 342:877(1989);Martin and Thornton,「Structural Families in Loops of Homologous Proteins:Automatic Classification,Modelling and Application to Antibodies,」J.Mol.Biol.263:800(1996),各者之全文以引用方式併入本文中。)另外,所採取的圈環結構與其周圍的胺基酸序列之間存在一種關係。特定正則類別的構形係由圈環長度及位於圈環內以及保留性架構內(即在圈環之外)的關鍵位置之胺基酸殘基來判定。因此可基於這些關鍵胺基酸殘基的存在來指派特定正則類別。
用語「多肽(polypeptide)」與用語「蛋白質(protein)」可交換使用,且就其最廣義來說係指二或更多個次單位胺基酸、胺基酸類似物或擬肽物之化合物。次單位可藉由肽鍵連接。在另一實施例中,次單位可藉由其他鍵連接,例如酯、醚等。如本文中所使用之用語「胺基酸(amino acid)」係指天然及/或非天然或合成胺基酸,包括甘胺酸及D和L光學異構物、胺基酸類似物及擬肽物。三或更多個胺基酸的肽通常被稱為寡肽,如果肽鏈很短。如果肽鏈很長,該肽通常被稱為多肽或蛋白質。當「特異性結合(specifically binds/binds specifically)」或其衍生用語用於抗體、或抗體片段的上下文時,代表經由免疫球蛋白基因或免疫球蛋白基因片段所編碼之域結合至所關注蛋白質之一或多個表位,並且在含有混合分子群體之樣本中不會優先結合其他分子。典型而言,抗體以小於約1×10-8M之Kd結合至同源(cognate)抗原,如由表面電漿共振測定或細胞結合測定所測得者。諸如「[抗原]特異性([antigen]-specific)」抗體之片語(例如GITR特異性抗體)係意欲表達該引述之抗體特異性結合該引述之抗原。
「多核苷酸(polynucleotide)」同義地稱為「核酸分子(nucleic acid molecule)」、「核苷酸(nucleotide)」、或「核酸(nucleic acid)」,係指任何多核糖核苷酸或多去氧核糖核苷酸,其可為未經修飾之RNA或DNA或經修飾之RNA或DNA。「多核苷酸」包括但不限於單股及雙股DNA、為單股及雙股區之混合物的DNA、單股及雙股RNA、及為單股及雙股區之混合物的RNA、包含可為單股或(更典型地)雙股或單股及雙股區之混合物的DNA及RNA之混雜分子。此外,「多核苷酸」係指包含RNA或DNA或RNA及DNA兩者的三股區。用語多核苷酸亦包括含有一或多個經修飾鹼基之DNA或RNA及具有為了穩定性或其他理由經修飾之主鏈的DNA或RNA。「經修飾(modified)」鹼基包括例如三苯甲基化(tritylated)鹼基及不常見鹼基諸如肌苷(inosine)。可對於DNA及RNA進行各種修飾;因此,「多核苷酸」包含典型在自然界所發現之經化學、酶、或代謝修飾之多核苷酸形式,以及病毒和細胞所特有之DNA及RNA的化學形式。「多核苷酸」亦包含相對短之核酸鏈,其通常稱為寡核苷酸。
「載體(vector)」是一種複製子(replicon),諸如質體、噬菌體、黏質體(cosmid)、或病毒,可將另一個核酸區段可操作地插入其中,從而使該區段複製或表現。
如本文中所使用,用語「宿主細胞(host cell)」可為任何類型的細胞,例如初代細胞、培養物中之細胞、或來自細胞系之細胞。在特定實施例中,用語「宿主細胞」係指經核酸分子轉染的細胞及該細胞的後代或潛在後代。該細胞的後代可能因為例如發生在後繼世代或核酸分子整合至宿主細胞基因體時發生的突變或環境影響,而不與經核酸分子轉染之
親代細胞同一。用語「表現(expression)」及「生產(production)」在本文中係同義地使用,並且係指基因產物之生物合成。這些用語涵蓋將基因轉錄成RNA。這些用語亦涵蓋將RNA轉譯成一或多種多肽,並且進一步涵蓋所有天然發生之轉錄後及轉譯後修飾。抗體或其抗原結合片段之表現或生產可在細胞之細胞質內,或者進到細胞外環境中,諸如細胞培養之生長介質。「實質上相同(substantially the same)」之意義可隨著使用該用語處之上下文而有所不同。由於在重鏈及輕鏈及編碼彼等之基因中可能存在有天然序列變異,可預期在胺基酸序列或編碼本文所述之抗體或抗原結合片段之基因中發現某種程度的變異,此變異對於彼等之獨特結合特性(例如,特異性及親和力)幾乎沒有影響。此預期一部分是由於基因密碼的簡併性(degeneracy of the genetic code),以及由於保守性胺基酸序列變異(不會可察覺地改變所編碼之蛋白質的本質)之演化成功所致。因此,在提及核酸序列時,「實質上相同」意指在兩或更多個序列之間有至少65%同一性(identity)。較佳的是,該用語係指在兩或更多個序列間有至少70%同一性,更佳為至少80%同一性,更佳為至少85%同一性,更佳為至少90%同一性,更佳為至少91%同一性,更佳為至少92%同一性,更佳為至少93%同一性,更佳為至少94%同一性,更佳為至少95%同一性,更佳為至少96%同一性,更佳為至少97%同一性,更佳為至少98%同一性,而更佳為至少99%或更高之同一性。兩個序列間之同一性百分比為該等序列所共有之同一性位置數目的函數(即同源性%=同一性位置#/總位置#×100),並且將需要被導入以最佳排比這兩個序列之缺口(gap)數目及各缺口長度納入考慮。兩個核苷酸或胺基酸序列間的同一性百分比可使用例如E.Meyers
and W.Miller,Comput.Appl.Biosci 4,11-17(1988)之演算法來判定,該演算法已納入ALIGN程式(版本2.0)中,其採用PAM120加權殘基表、缺口長度罰分為12及缺口罰分為4。此外,兩個胺基酸序列間的同一性百分比可使用Needleman and Wunsch,J.Mol.Biol.48,444-453(1970)演算法來判定。
在蛋白質之胺基酸序列內發生不會實質影響蛋白質功能之變異的程度遠低於核酸序列,因為相同的簡併性理論不適用於胺基酸序列。因此,在提及抗體或抗原結合片段時,「實質上相同」意指抗體或抗原結合片段與所述抗體或抗原結合片段具有90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、或99%同一性。其他實施例所包括的GITR特異性抗體、或抗原結合片段具有不與本文中所述之抗體及抗原結合片段共有顯著同一性之架構、支架、或其他非結合區,但的確包含一或多個CDR或其他賦予結合所需且與本文中所述之此等序列具有90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、或99%同一性的序列。
「結合親和力(binding affinity)」通常係指分子(例如抗體)之單一結合部位與其結合夥伴(例如抗原)之間非共價交互作用之總和強度。除非另有指示,本文中所使用之「結合親和力」係指反映結合對的成員(例如抗體及抗原)之間1:1交互作用的固有結合親和力。分子X對其夥伴Y之親和力通常可藉由解離常數(KD)表示。親和力可由所屬技術領域中所習知之多種方式來測量及/或表現,包括但不限於平衡解離常數(KD)及平衡締合常數(KA)。KD係由koff/kon之商計算,然而KA係由kon/koff
之商計算。kon係指例如抗體與抗原之締合速率常數,且koff係指例如抗體與抗原之解離。kon及koff可藉由所屬技術領域中具有通常知識者所習知之技術諸如表面電漿共振來判定。
用語「對象(subject)」係指人類及非人類動物,包括所有脊椎動物,例如哺乳動物及非哺乳動物,諸如非人類靈長動物、小鼠、兔、綿羊、狗、貓、馬、牛、雞、兩棲動物、及爬蟲動物。在所述方法之許多實施例中,該對象為人類。
本文中描述特異性結合GITR之單離單株抗體或抗原結合片段。抗體分子之一般結構包含抗原結合域,其包括重鏈及輕鏈;及Fc域,其具有各式功能,包括補體固定(complement fixation)及結合抗體受體。
所述GITR特異性抗體或抗原結合片段包括所有同型(IgA、IgD、IgE、IgG及IgM)、及四鏈免疫球蛋白結構之合成性多聚體。所述抗體或抗原結合片段亦包括通常在母雞或火雞血清及母雞或火雞蛋黃中所發現之IgY同型。
GITR特異性抗體及抗原結合片段可藉由重組手段而衍生自任何物種。舉例而言,該等抗體或抗原結合片段可為小鼠、大鼠、山羊、馬、豬、牛、雞、兔、駱駝、驢、人、或其等之嵌合版本。針對投予至人類之用途,非人類衍生性抗體或抗原結合片段可經基因或結構改造以在投予至人類病患時較不具抗原性。
在一些實施例中,該等抗體或抗原結合片段係嵌合者。本文中所用之用語「嵌合(chimeric)」係指抗體、或其抗原結合片段具有衍生自非人類哺乳動物、囓齒動物、或爬蟲動物之抗體胺基酸序列的至少一個可變域之至少一些部分,並且該抗體、或其抗原結合片段之剩餘部分係衍生自人類。
在一些實施例中,該等抗體為人化(humanized)抗體。人化抗體可為含有衍生自非人類免疫球蛋白之最小序列的嵌合免疫球蛋白、免疫球蛋白鏈或其片段(諸如Fv、Fab、Fab’、F(ab’)2或抗體之其他抗原結合子序列)。大體上,人化抗體為人類免疫球蛋白(接受者抗體(recipient antibody)),其中來自該接受者之互補決定區(CDR)的殘基係經來自具有所欲特異性、親和力、及能力之非人類物種(供體抗體)諸如小鼠、大鼠或兔之CDR的殘基置換。一般而言,該人化抗體將包含實質上所有至少一個及典型地兩個可變域,其中所有或實質上所有CDR區對應非人類免疫球蛋白之CDR區,並且所有或實質上所有架構區係人類免疫球蛋白序列之架構區。人化抗體可包括免疫球蛋白恆定區(Fc)之至少一部分,典型為人類免疫球蛋白之恆定區。
本文中所述之抗體或抗原結合片段可以各種形式出現,但將包括表1中所示之抗體CDR的一或多者。
本文中描述特異性結合至GITR之單離抗體及抗原結合片段。在一些實施例中,該等GITR特異性抗體或抗原結合片段係人類IgG、或其衍生物。雖然本文中所例示之GITR特異性抗體或抗原結合片段係人類抗體或抗原結合片段,所例示之抗體或抗原結合片段可經嵌合化。
在一些實施例中提供包含重鏈及輕鏈之GITR特異性抗體、或其抗原結合片段,該重鏈包含表1中所述抗體之任一者的CDR1、CDR2、及CDR3,該輕鏈包含表1中所述抗體之任一者的CDR1、CDR2、及CDR3。
在一些實施例中,該等GITR特異性抗體及抗原結合片段包含:含有SEQ ID NO:1之重鏈CDR1、含有SEQ ID NO:5之重鏈CDR2、含有SEQ ID NO:12之重鏈CDR3、含有SEQ ID NO:28之輕鏈CDR1、含有SEQ ID NO:32之輕鏈CDR2、及含有SEQ ID NO:35之輕鏈CDR3。此GITR特異性抗體或抗原結合片段可包含人類架構序列。此GITR特異性抗體或抗原結合片段可以30nM或更小之親和力結合至GITR、可在NF-κB螢光素酶基因測定中誘導螢光素酶表現增加且可以67ng/mL或更小之EC50在活體外(in vitro)誘導ADCC。在一些實施例中,該等GITR特異性抗體及抗原結合片段包含與SEQ ID NO:39實質上相同或與其同一之重鏈及與SEQ ID NO:55實質上相同或與其同一之輕鏈。此段中所討論之抗體重鏈及輕鏈係適合納入雙特異性建構體中,該建構體中有一個臂係抗GITR臂。
在一些實施例中,該等GITR特異性抗體及抗原結合片段包含:含有SEQ ID NO:2之重鏈CDR1、含有SEQ ID NO:5之重鏈CDR2、含有SEQ ID NO:13之重鏈CDR3、含有SEQ ID NO:29之輕鏈CDR1、含有SEQ ID NO:32之輕鏈CDR2、及含有SEQ ID NO:36之輕鏈CDR3。此GITR特異性抗體或抗原結合片段可包含人類架構序列。此GITR特異性抗體或抗原結合片段可以30nM或更小之親和力結合至
GITR、可在NF-κB螢光素酶基因測定中誘導螢光素酶表現增加且可以67ng/mL或更小之EC50在活體外誘導ADCC。在一些實施例中,該等GITR特異性抗體及抗原結合片段包含與SEQ ID NO:40實質上相同或與其同一之重鏈及與SEQ ID NO:56實質上相同或與其同一之輕鏈。此段中所討論之抗體重鏈及輕鏈係適合納入雙特異性建構體中,該建構體中有一個臂係抗GITR臂。
在一些實施例中,該等GITR特異性抗體及抗原結合片段包含:含有SEQ ID NO:1之重鏈CDR1、含有SEQ ID NO:6之重鏈CDR2、含有SEQ ID NO:14之重鏈CDR3、含有SEQ ID NO:30之輕鏈CDR1、含有SEQ ID NO:33之輕鏈CDR2、及含有SEQ ID NO:37之輕鏈CDR3。此GITR特異性抗體或抗原結合片段可包含人類架構序列。此GITR特異性抗體或抗原結合片段可以30nM或更小之親和力結合至GITR、可在NF-κB螢光素酶基因測定中誘導螢光素酶表現增加且可以67ng/mL或更小之EC50在活體外誘導ADCC。在一些實施例中,該等GITR特異性抗體及抗原結合片段包含與SEQ ID NO:41實質上相同或與其同一之重鏈及與SEQ ID NO:57實質上相同或與其同一之輕鏈。此段中所討論之抗體重鏈及輕鏈係適合納入雙特異性建構體中,該建構體中有一個臂係抗GITR臂。
在一些實施例中,該等GITR特異性抗體及抗原結合片段包含:含有SEQ ID NO:3之重鏈CDR1、含有SEQ ID NO:7之重鏈CDR2、含有SEQ ID NO:15之重鏈CDR3、含有SEQ ID NO:28之輕鏈CDR1、含有SEQ ID NO:32之輕鏈CDR2、及含有SEQ ID NO:35之輕鏈
CDR3。此GITR特異性抗體或抗原結合片段可包含人類架構序列。此GITR特異性抗體或抗原結合片段可以30nM或更小之親和力結合至GITR、可在NF-κB螢光素酶基因測定中誘導螢光素酶表現增加且可以67ng/mL或更小之EC50在活體外誘導ADCC。在一些實施例中,該等GITR特異性抗體及抗原結合片段包含與SEQ ID NO:42實質上相同或與其同一之重鏈及與SEQ ID NO:55實質上相同或與其同一之輕鏈。此段中所討論之抗體重鏈及輕鏈係適合納入雙特異性建構體中,該建構體中有一個臂係抗GITR臂。
在一些實施例中,該等GITR特異性抗體及抗原結合片段包含:含有SEQ ID NO:3之重鏈CDR1、含有SEQ ID NO:7之重鏈CDR2、含有SEQ ID NO:16之重鏈CDR3、含有SEQ ID NO:28之輕鏈CDR1、含有SEQ ID NO:32之輕鏈CDR2、及含有SEQ ID NO:35之輕鏈CDR3。此GITR特異性抗體或抗原結合片段可包含人類架構序列。此GITR特異性抗體或抗原結合片段可以30nM或更小之親和力結合至GITR、可在NF-κB螢光素酶基因測定中誘導螢光素酶表現增加且可以67ng/mL或更小之EC50在活體外誘導ADCC。在一些實施例中,該等GITR特異性抗體及抗原結合片段包含與SEQ ID NO:43實質上相同或與其同一之重鏈及與SEQ ID NO:55實質上相同或與其同一之輕鏈。此段中所討論之抗體重鏈及輕鏈係適合納入雙特異性建構體中,該建構體中有一個臂係抗GITR臂。
在一些實施例中,該等GITR特異性抗體及抗原結合片段包含:含有SEQ ID NO:4之重鏈CDR1、含有SEQ ID NO:8之重鏈
CDR2、含有SEQ ID NO:17之重鏈CDR3、含有SEQ ID NO:28之輕鏈CDR1、含有SEQ ID NO:32之輕鏈CDR2、及含有SEQ ID NO:35之輕鏈CDR3。此GITR特異性抗體或抗原結合片段可包含人類架構序列。此GITR特異性抗體或抗原結合片段可以30nM或更小之親和力結合至GITR、可在NF-κB螢光素酶基因測定中誘導螢光素酶表現增加且可以67ng/mL或更小之EC50在活體外誘導ADCC。在一些實施例中,該等GITR特異性抗體及抗原結合片段包含與SEQ ID NO:44實質上相同或與其同一之重鏈及與SEQ ID NO:55實質上相同或與其同一之輕鏈。此段中所討論之抗體重鏈及輕鏈係適合納入雙特異性建構體中,該建構體中有一個臂係抗GITR臂。
在一些實施例中,該等GITR特異性抗體及抗原結合片段包含:含有SEQ ID NO:4之重鏈CDR1、含有SEQ ID NO:9之重鏈CDR2、含有SEQ ID NO:18之重鏈CDR3、含有SEQ ID NO:28之輕鏈CDR1、含有SEQ ID NO:32之輕鏈CDR2、及含有SEQ ID NO:35之輕鏈CDR3。此GITR特異性抗體或抗原結合片段可包含人類架構序列。此GITR特異性抗體或抗原結合片段可以30nM或更小之親和力結合至GITR、可在NF-κB螢光素酶基因測定中誘導螢光素酶表現增加且可以67ng/mL或更小之EC50在活體外誘導ADCC。在一些實施例中,該等GITR特異性抗體及抗原結合片段包含與SEQ ID NO:45實質上相同或與其同一之重鏈及與SEQ ID NO:55實質上相同或與其同一之輕鏈。此段中所討論之抗體重鏈及輕鏈係適合納入雙特異性建構體中,該建構體中有一個臂係抗GITR臂。
在一些實施例中,該等GITR特異性抗體及抗原結合片段包含:含有SEQ ID NO:4之重鏈CDR1、含有SEQ ID NO:10之重鏈CDR2、含有SEQ ID NO:19之重鏈CDR3、含有SEQ ID NO:28之輕鏈CDR1、含有SEQ ID NO:32之輕鏈CDR2、及含有SEQ ID NO:35之輕鏈CDR3。此GITR特異性抗體或抗原結合片段可包含人類架構序列。此GITR特異性抗體或抗原結合片段可以30nM或更小之親和力結合至GITR、可在NF-κB螢光素酶基因測定中誘導螢光素酶表現增加且可以67ng/mL或更小之EC50在活體外誘導ADCC。在一些實施例中,該等GITR特異性抗體及抗原結合片段包含與SEQ ID NO:46實質上相同或與其同一之重鏈及與SEQ ID NO:55實質上相同或與其同一之輕鏈。此段中所討論之抗體重鏈及輕鏈係適合納入雙特異性建構體中,該建構體中有一個臂係抗GITR臂。
在一些實施例中,該等GITR特異性抗體及抗原結合片段包含:含有SEQ ID NO:3之重鏈CDR1、含有SEQ ID NO:7之重鏈CDR2、含有SEQ ID NO:20之重鏈CDR3、含有SEQ ID NO:31之輕鏈CDR1、含有SEQ ID NO:34之輕鏈CDR2、及含有SEQ ID NO:38之輕鏈CDR3。此GITR特異性抗體或抗原結合片段可包含人類架構序列。此GITR特異性抗體或抗原結合片段可以30nM或更小之親和力結合至GITR、可在NF-κB螢光素酶基因測定中誘導螢光素酶表現增加且可以67ng/mL或更小之EC50在活體外誘導ADCC。在一些實施例中,該等GITR特異性抗體及抗原結合片段包含與SEQ ID NO:47實質上相同或與其同一之重鏈及與SEQ ID NO:58實質上相同或與其同一之輕鏈。此段中所討論
之抗體重鏈及輕鏈係適合納入雙特異性建構體中,該建構體中有一個臂係抗GITR臂。
在一些實施例中,該等GITR特異性抗體及抗原結合片段包含:含有SEQ ID NO:3之重鏈CDR1、含有SEQ ID NO:11之重鏈CDR2、含有SEQ ID NO:21之重鏈CDR3、含有SEQ ID NO:31之輕鏈CDR1、含有SEQ ID NO:34之輕鏈CDR2、及含有SEQ ID NO:38之輕鏈CDR3。此GITR特異性抗體或抗原結合片段可包含人類架構序列。此GITR特異性抗體或抗原結合片段可以30nM或更小之親和力結合至GITR、可在NF-κB螢光素酶基因測定中誘導螢光素酶表現增加且可以67ng/mL或更小之EC50在活體外誘導ADCC。在一些實施例中,該等GITR特異性抗體及抗原結合片段包含與SEQ ID NO:48實質上相同或與其同一之重鏈及與SEQ ID NO:58實質上相同或與其同一之輕鏈。此段中所討論之抗體重鏈及輕鏈係適合納入雙特異性建構體中,該建構體中有一個臂係抗GITR臂。
在一些實施例中,該等GITR特異性抗體及抗原結合片段包含:含有SEQ ID NO:3之重鏈CDR1、含有SEQ ID NO:7之重鏈CDR2、含有SEQ ID NO:22之重鏈CDR3、含有SEQ ID NO:28之輕鏈CDR1、含有SEQ ID NO:32之輕鏈CDR2、及含有SEQ ID NO:35之輕鏈CDR3。此GITR特異性抗體或抗原結合片段可包含人類架構序列。此GITR特異性抗體或抗原結合片段可以30nM或更小之親和力結合至GITR、可在NF-κB螢光素酶基因測定中誘導螢光素酶表現增加且可以67ng/mL或更小之EC50在活體外誘導ADCC。在一些實施例中,該等GITR
特異性抗體及抗原結合片段包含與SEQ ID NO:49實質上相同或與其同一之重鏈及與SEQ ID NO:55實質上相同或與其同一之輕鏈。此段中所討論之抗體重鏈及輕鏈係適合納入雙特異性建構體中,該建構體中有一個臂係抗GITR臂。
在一些實施例中,該等GITR特異性抗體及抗原結合片段包含:含有SEQ ID NO:3之重鏈CDR1、含有SEQ ID NO:7之重鏈CDR2、含有SEQ ID NO:23之重鏈CDR3、含有SEQ ID NO:28之輕鏈CDR1、含有SEQ ID NO:32之輕鏈CDR2、及含有SEQ ID NO:35之輕鏈CDR3。此GITR特異性抗體或抗原結合片段可包含人類架構序列。此GITR特異性抗體或抗原結合片段可以30nM或更小之親和力結合至GITR、可在NF-κB螢光素酶基因測定中誘導螢光素酶表現增加且可以67ng/mL或更小之EC50在活體外誘導ADCC。在一些實施例中,該等GITR特異性抗體及抗原結合片段包含與SEQ ID NO:50實質上相同或與其同一之重鏈及與SEQ ID NO:55實質上相同或與其同一之輕鏈。此段中所討論之抗體重鏈及輕鏈係適合納入雙特異性建構體中,該建構體中有一個臂係抗GITR臂。
在一些實施例中,該等GITR特異性抗體及抗原結合片段包含:含有SEQ ID NO:3之重鏈CDR1、含有SEQ ID NO:7之重鏈CDR2、含有SEQ ID NO:24之重鏈CDR3、含有SEQ ID NO:28之輕鏈CDR1、含有SEQ ID NO:32之輕鏈CDR2、及含有SEQ ID NO:35之輕鏈CDR3。此GITR特異性抗體或抗原結合片段可包含人類架構序列。此GITR特異性抗體或抗原結合片段可以30nM或更小之親和力結合至
GITR、可在NF-κB螢光素酶基因測定中誘導螢光素酶表現增加且可以67ng/mL或更小之EC50在活體外誘導ADCC。在一些實施例中,該等GITR特異性抗體及抗原結合片段包含與SEQ ID NO:51實質上相同或與其同一之重鏈及與SEQ ID NO:55實質上相同或與其同一之輕鏈。此段中所討論之抗體重鏈及輕鏈係適合納入雙特異性建構體中,該建構體中有一個臂係抗GITR臂。
在一些實施例中,該等GITR特異性抗體及抗原結合片段包含:含有SEQ ID NO:3之重鏈CDR1、含有SEQ ID NO:7之重鏈CDR2、含有SEQ ID NO:25之重鏈CDR3、含有SEQ ID NO:28之輕鏈CDR1、含有SEQ ID NO:32之輕鏈CDR2、及含有SEQ ID NO:35之輕鏈CDR3。此GITR特異性抗體或抗原結合片段可包含人類架構序列。此GITR特異性抗體或抗原結合片段可以30nM或更小之親和力結合至GITR、可在NF-κB螢光素酶基因測定中誘導螢光素酶表現增加且可以67ng/mL或更小之EC50在活體外誘導ADCC。
在一些實施例中,該等GITR特異性抗體及抗原結合片段包含與SEQ ID NO:52實質上相同或與其同一之重鏈及與SEQ ID NO:55實質上相同或與其同一之輕鏈。此段中所討論之抗體重鏈及輕鏈係適合納入雙特異性建構體中,該建構體中有一個臂係抗GITR臂。
在一些實施例中,該等GITR特異性抗體及抗原結合片段包含:含有SEQ ID NO:27之重鏈CDR1、含有SEQ ID NO:5之重鏈CDR2、含有SEQ ID NO:26之重鏈CDR3、含有SEQ ID NO:28之輕鏈CDR1、含有SEQ ID NO:32之輕鏈CDR2、及含有SEQ ID NO:35之輕鏈
CDR3。此GITR特異性抗體或抗原結合片段可包含人類架構序列。此GITR特異性抗體或抗原結合片段可以30nM或更小之親和力結合至GITR、可在NF-κB螢光素酶基因測定中誘導螢光素酶表現增加且可以67ng/mL或更小之EC50在活體外誘導ADCC。在一些實施例中,該等GITR特異性抗體及抗原結合片段包含與SEQ ID NO:53實質上相同或與其同一之重鏈及與SEQ ID NO:55實質上相同或與其同一之輕鏈。此段中所討論之抗體重鏈及輕鏈係適合納入雙特異性建構體中,該建構體中有一個臂係抗GITR臂。
在一些實施例中,該等GITR特異性抗體及抗原結合片段包含:含有SEQ ID NO:3之重鏈CDR1、含有SEQ ID NO:11之重鏈CDR2、含有SEQ ID NO:21之重鏈CDR3、含有SEQ ID NO:28之輕鏈CDR1、含有SEQ ID NO:32之輕鏈CDR2、及含有SEQ ID NO:35之輕鏈CDR3。此GITR特異性抗體或抗原結合片段可包含人類架構序列。此GITR特異性抗體或抗原結合片段可以30nM或更小之親和力結合至GITR、可在NF-κB螢光素酶基因測定中誘導螢光素酶表現增加且可以67ng/mL或更小之EC50在活體外誘導ADCC。在一些實施例中,該等GITR特異性抗體及抗原結合片段包含與SEQ ID NO:54實質上相同或與其同一之重鏈及與SEQ ID NO:55實質上相同或與其同一之輕鏈。此段中所討論之抗體重鏈及輕鏈係適合納入雙特異性建構體中,該建構體中有一個臂係抗GITR臂。
在一些實施例中,該等GITR特異性抗體及抗原結合片段包含:含有SEQ ID NO:3之重鏈CDR1、含有SEQ ID NO:7之重鏈
CDR2、含有SEQ ID NO:16之重鏈CDR3、含有SEQ ID NO:28之輕鏈CDR1、含有SEQ ID NO:32之輕鏈CDR2、及含有SEQ ID NO:35之輕鏈CDR3。此GITR特異性抗體或抗原結合片段可包含人類架構序列。此GITR特異性抗體或抗原結合片段可以30nM或更小之親和力結合至GITR、可在NF-κB螢光素酶基因測定中誘導螢光素酶表現增加且可以67ng/mL或更小之EC50在活體外誘導ADCC。在一些實施例中,該等GITR特異性抗體及抗原結合片段包含與SEQ ID NO:63實質上相同或與其同一之重鏈及與SEQ ID NO:55實質上相同或與其同一之輕鏈。此段中所討論之抗體重鏈及輕鏈係適合納入雙特異性建構體中,該建構體中有一個臂係抗GITR臂。
在一些實施例中,該等GITR特異性抗體及抗原結合片段包含:含有SEQ ID NO:27之重鏈CDR1、含有SEQ ID NO:5之重鏈CDR2、含有SEQ ID NO:26之重鏈CDR3、含有SEQ ID NO:28之輕鏈CDR1、含有SEQ ID NO:32之輕鏈CDR2、及含有SEQ ID NO:35之輕鏈CDR3。此GITR特異性抗體或抗原結合片段可包含人類架構序列。此GITR特異性抗體或抗原結合片段可以30nM或更小之親和力結合至GITR、可在NF-κB螢光素酶基因測定中誘導螢光素酶表現增加且可以67ng/mL或更小之EC50在活體外誘導ADCC。在一些實施例中,該等GITR特異性抗體及抗原結合片段包含與SEQ ID NO:64實質上相同或與其同一之重鏈及與SEQ ID NO:55實質上相同或與其同一之輕鏈。此段中所討論之抗體重鏈及輕鏈係適合納入雙特異性建構體中,該建構體中有一個臂係抗GITR臂。
亦揭示編碼該等特異性結合至GITR之抗體或抗原結合片段的單離多核苷酸。該等能夠編碼本文中所提供之可變域區段的單離多核苷酸可被包括於相同(或不同)之載體上以生產抗體或抗原結合片段。
編碼重組抗原結合蛋白質之多核苷酸亦在本揭露之範疇內。在一些實施例中,所述多核苷酸(及彼等所編碼之肽)包括前導序列(leader sequence)。可採用所屬技術領域中所習知的任何前導序列。前導序列可包括但不限於限制部位(restriction site)或轉譯起始部位(translation start site)。
本文中所述之GITR特異性抗體或抗原結合片段包括具有單一或多個胺基酸取代、刪除、或添加之變異體,並且該等變異體保留了所述GITR特異性抗體或抗原結合片段之生物特性(例如,結合親和力或免疫效應活性)。這些變異體可包括:(a)其中一或多個胺基酸殘基係經保留性或非保留性胺基酸取代之變異體、(b)其中一或多個胺基酸係經添加至該多肽或自該多肽刪除之變異體、(c)其中一或多個胺基酸包括取代基之變異體、及(d)其中該多肽係與另一肽或多肽(諸如融合夥伴、蛋白質標籤或其他化學部分,其可將有用特性賦予該多肽,諸如例如針對抗體之表位、多組胺酸序列、生物素部分及類似者)融合之變異體。本文中所述之抗體或抗原結合片段可包括其中來自一個物種之保留性或非保留性位置之胺基酸殘基係經另一物種之對應殘基所取代的變異體。在其他實施例中,非保守性位置之胺基酸殘基係經保守性或非保守性殘基取代。獲得這些變異體之技術(包括基因(刪除、突變等)、化學、及酶技術)皆為所屬技術領域中具有通常知識者所習知。
本文中所述之GITR特異性抗體或抗原結合片段可體現數種抗體同型,諸如IgM、IgD、IgG、IgA及IgE。在一些實施例中,該抗體同型係IgG1、IgG2、IgG3、或IgG4同型,較佳為IgG1同型。抗體或其抗原結合片段之特異性大部分是由CDR之胺基酸序列及排列來決定。因此,一種同型之CDR可轉移到另一種同型而不會改變抗原特異性。或者,已經建立使融合瘤從生產一種抗體同型轉換到生產另一種(同型轉換)而不會改變抗原特異性之技術。因此,此等抗體同型係在所述抗體或抗原結合片段之範疇內。
本文所述之GITR特異性抗體或抗原結合片段具有對GITR之結合親和力,其包括小於約30nM之解離常數(KD)。所述之GITR特異性抗體或抗原結合片段之親和力可藉由所屬技術領域中已知之多種方法來判定,諸如表面電漿共振或基於ELISA之方法。用於藉由SPR測量親和力之測定包括使用BIAcore 3000機器所執行之測定,其中測定係在室溫(例如25℃或接近25℃)下執行,其中能夠結合至GITR之抗體係藉由抗Fc抗體(例如山羊抗人類IgG Fc特異性抗體,Jackson ImmunoResearch laboratories Prod # 109-005-098)捕獲至BIAcore感測晶片上達75RU左右之水平,接著在40μl/min之流率下收集締合及解離數據。
亦提供包含本文中所述之多核苷酸的載體。該等載體可為表現載體(expression vector)。含有編碼所關注之多肽的序列之重組表現載體因而被考慮為在本揭露之範疇內。該表現載體可含有一或多個額外序列,諸如但不限於調節序列(例如,啟動子、增強子)、選擇標記、及多腺核苷酸化信號。用於轉形廣泛各種宿主細胞之載體係廣為周知,並且包
括但不限於質體、噬菌體質體(phagemid)、黏質體(cosmid)、桿狀病毒、桿粒(bacmid)、人造細菌染色體(BAC)、人造酵母菌染色體(YAC)、以及其他細菌、酵母及病毒載體。
本實施方式之範疇內的重組表現載體包括編碼至少一種與合適調節元件可操作地連接之重組蛋白質的合成性、基因體性、或cDNA衍生性核酸片段。此等調節元件可包括轉錄啟動子、編碼合適mRNA核糖體結合部位之序列、及控制轉錄和轉譯之終止的序列。表現載體(尤其是哺乳動物表現載體)亦可包括一或多種非轉錄元件,諸如複製起源、連接至所欲表現基因之合適啟動子及增強子、其他5'或3'側翼(flanking)非轉錄序列、5'或3'非轉譯序列(諸如必要的核糖體結合部位)、多腺核苷酸化部位、剪接供體及受體部位、或轉錄終止序列。亦可納入賦予在宿主中複製之能力的複製起源。
在用來轉形脊椎動物細胞之表現載體中的轉錄及轉譯控制序列可由病毒來源提供。例示性載體可如以下文獻所述建構:Okayama and Berg,3Mol.Cell.Biol.280(1983)。
在一些實施例中,抗體編碼序列或抗原結合片段編碼序列係置於強大組成性啟動子的控制之下,諸如下列基因的啟動子:次黃嘌呤磷酸核糖轉移酶(HPRT)、腺苷去胺酶、丙酮酸激酶、β肌動蛋白、人類肌凝蛋白、人類血紅素、人類肌肉肌酸、及其他。此外,許多病毒啟動子在真核細胞中組成性地發揮作用,並且適合搭配所述實施例使用。此等病毒啟動子包括但不限於巨細胞病毒(CMV)立即早期啟動子、SV40之早期及晚期啟動子、小鼠乳房腫瘤病毒(MMTV)啟動子、莫洛尼白血病病毒
(Maloney leukemia virus)之長末端重複(LTR)、人類免疫不全病毒(HIV)、艾巴二氏病毒(EBV)、勞斯肉瘤病毒(RSV)、及其他反轉錄病毒、和單純皰疹病毒(Herpes Simplex Virus)之胸苷激酶啟動子。在一個實施例中,GITR特異性抗體或其抗原結合片段編碼序列係置於誘導性啟動子的控制之下,諸如金屬硫蛋白啟動子、四環素誘導性啟動子、多西環素(doxycycline)誘導性啟動子、含有一或多種干擾素刺激回應元件(ISRE)之啟動子,諸如蛋白質激酶R 2',5'-寡腺苷酸合成酶、Mx基因、ADAR1、及類似者。
本文中所述之載體可含有一或多個內部核糖體進入部位(IRES)。將IRES序列納入融合載體中可有利於增強一些蛋白質之表現。在一些實施例中,載體系統將包括一或多個多腺核苷酸化部位(例如SV40),其可在任一前述核酸序列之上游或下游。載體組分可相鄰地連接,或者以提供用於表現基因產物之最佳間隔的方式來排列(即藉由在ORF之間引入「間隔子(spacer)」核苷酸),或者以其他方式放置。調節元件(諸如IRES模體)亦可經排列以提供用於表現之最佳間隔。
該等載體可包含選擇標記,其為所屬技術領域中所廣為周知。選擇標記包括正向及負向選擇標記,例如抗生素抗藥性基因(例如新黴素抗藥性基因、溼球菌素(hygromycin)抗藥性基因、康黴素(kanamycin)抗藥性基因、四環素抗藥性基因、青黴素抗藥性基因)、麩胺酸鹽合成酶基因、HSV-TK、用於更昔洛威(ganciclovir)選擇之HSV-TK衍生物、或用於6-甲基嘌呤選擇之細菌性嘌呤核苷磷酸化酶基因(Gadi等人,7 Gene Ther.1738-1743(2000))。編碼選擇標記或選殖部位之核酸序列可在編碼所關注多肽或選殖部位之核酸序列的上游或下游。
本文中所述之載體可用來以編碼所述抗體或抗原結合片段之基因轉形各種細胞。舉例而言,該等載體可用來產製生產GITR特異性抗體或抗原結合片段的細胞。因此,另一個態樣的特點在於經載體轉形的宿主細胞,該載體包含編碼特異性結合GITR之抗體或其抗原結合片段(諸如本文中所描述及例示之抗體或抗原結合片段)的核酸序列。
許多用於將外來基因引入細胞之技術皆為所屬技術領域所習知,並且可用來建構重組細胞以依據本文中所描述及例示之各式實施例來實施所述之方法。所使用之技術應提供異源基因序列之穩定轉移至宿主細胞,以使該異源基因序列可由細胞後代所繼承及表現,並且使接受者細胞之必要發育及生理功能不受干擾。可使用之技術包括但不限於染色體轉移(例如,細胞融合、染色體媒介之基因轉移、微細胞媒介之基因轉移)、物理方法(例如,轉染、球形質體(spheroplast)融合、微注射、電穿孔、脂質體載劑)、病毒載體轉移(例如,重組DNA病毒、重組RNA病毒)及類似者(描述於Cline,29Pharmac.Ther.69-92(1985))。磷酸鈣沉澱及聚乙二醇(PEG)誘導之細菌原生質體與哺乳動物細胞融合亦可用來轉形細胞。
適用於表現本文中所述之GITR特異性抗體或抗原結合片段的細胞,較佳為真核細胞,更佳為源自植物、囓齒動物、或人類之細胞,例如但不限於NSO、CHO、CHOK1、perC.6、Tk-ts13、BHK、HEK293細胞、COS-7、T98G、CV-1/EBNA、L細胞、C127、3T3、HeLa、NS1、Sp2/0骨髓瘤細胞、及BHK細胞系、和其他者。此外,抗體之表現可使用融合瘤細胞來達成。用於生產融合瘤之方法在所屬技術領域
中已充分建立。
經本文中所述之表現載體轉形的細胞可針對本文中所述之抗體或抗原結合片段的重組表現來選擇或篩選。重組陽性細胞係經擴增並針對展現所欲表型之次殖株(subclone)進行篩選,所欲表型諸如高表現水平、增強之生長特性、或產出例如由於蛋白質修飾或經修改之轉譯後修飾而具有所欲生化特徵之蛋白質的能力。這些表型可能是因給定次殖株之固有特性或因突變而來。突變可透過使用化學品、UV波長光、放射線、病毒、插入型致突變原、抑制DNA不匹配修復、或此等方法之組合來實現。
本文中提供用於治療之GITR特異性抗體或其抗原結合片段。特定而言,這些抗體或抗原結合片段可用來治療癌症。因此,本發明提供一種治療癌症之方法,該方法包含投予如本文中所述之抗體,諸如GITR特異性抗體或抗原結合片段。GITR生物學上的二個態樣使其成為治療各種癌症的潛在目標。第一是GITR的活化(如上詳細說明)可活化免疫系統。此外,GITR表現性效應T細胞及調節T細胞浸潤多種腫瘤類型,然而非造血細胞上很少或不表現GITR。此分布輪廓表示GITR表現性細胞可集中在腫瘤中。此活性與分布的組合總體來說使GITR標靶化成為治療多種癌症的具吸引力的方式。抗原結合蛋白質可被用來治療實質腫瘤以及血液癌症,包括白血病。
用於這些方法中之抗體包括那些上文所述的抗體,例如具
有表1所述特徵(例如CDR或可變域序列)及在這些抗體的進一步討論中之特徵之GITR特異性抗體或抗原結合片段。
在本文中所述之一些實施例中,GITR特異性抗體之免疫效應(effector)性質可透過以所屬領域中具有通常知識者習知之技術所進行之Fc修飾來調控。舉例而言,Fc效應功能(諸如Clq結合、補體依賴性細胞毒性(CDC)、抗體依賴性細胞媒介細胞毒性(ADCC)、抗體依賴性細胞媒介吞噬作用(ADCP)、向下調控細胞表面受體(例如B細胞受體;BCR)等)可藉由修飾Fc中負責這些活性之殘基來提供及/或控制。
「抗體依賴性細胞媒介細胞毒性(antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity)」或「ADCC」係指一種細胞媒介反應,其中表現Fc受體(FcR)之非特異性細胞毒性細胞(例如自然殺手(NK)細胞、嗜中性球、及巨噬細胞)辨識目標細胞上的已結合抗體,然後造成目標細胞溶解。
單株抗體誘導ADCC之能力可藉由工程改造其寡醣組分來增強。人類IgG1或IgG3係在Asn297處經N-醣基化並且大部分聚醣係呈廣為周知之雙觸角(biantennary)G0、G0F、G1、G1F、G2或G2F形式。由未經工程改造之CHO細胞所生產之抗體典型具有約至少85%之聚醣海藻糖(glycan fucose)含量。自附接至Fc區之雙觸角複合型寡醣移除核心海藻糖經由改善Fc.gamma.RIIIa結合且不改變抗原結合或CDC活性來增強抗體之ADCC。此等mAb可使用已報導會導致成功表現相對高量去海藻糖基化(defucosylated)抗體(帶有雙觸角複合型之Fc寡醣)的不同方法來達成,諸如控制培養滲透壓(Konno等人,Cytotechnology 64:249-65,
2012)、應用變異體CHO系Lec13作為宿主細胞系(Shields等人,J Biol Chem 277:26733-26740,2002)、應用變異體CHO系EB66作為宿主細胞系(Olivier等人,MAbs;2(4),2010;紙本發行前之電子發行版本;PMID:20562582)、應用大鼠融合瘤細胞系YB2/0作為宿主細胞系(Shinkawa等人,J Biol Chem 278:3466-3473,2003)、引入特異性針對α1,6-海藻糖基轉移酶(FUT8)基因之小型干擾RNA(Mori等人,Biotechnol Bioeng 88:901-908,2004)、或共表現β-1,4-N-乙醯葡萄糖胺基轉移酶III及高基氏體α-甘露糖苷酶II或強效α-甘露糖苷酶I抑制劑kifunensine(Ferrara等人,J Biol Chem 281:5032-5036,2006,Ferrara等人,Biotechnol Bioeng 93:851-861,2006;Xhou等人,Biotechnol Bioeng 99:652-65,2008)。
在本文中所述之一些實施例中,由GITR抗體所誘發之ADCC亦可藉由抗體Fc中之某些取代而增強。例示性取代例如為在胺基酸位置256、290、298、312、356、330、333、334、360、378或430處之取代(殘基編號依據EU索引),如美國專利第6,737,056號中所述。
本文中所提供之醫藥組成物包含:a)有效量之本發明之GITR特異性抗體或抗體片段、及b)醫藥上可接受之載劑,其可為惰性或生理活性。在較佳實施例中,GITR特異性抗體係如本文中所述之GITR特異性抗體或其抗原結合片段。本文中所用之用語「醫藥上可接受之載劑(pharmaceutically acceptable carrier)」包括生理相容之任何及所有溶劑、分
散介質、塗層、抗菌和抗真菌劑、及類似者。合適載劑、稀釋劑及/或賦形劑之實例包括下列之一或多者:水、鹽水、磷酸鹽緩衝鹽水、葡萄糖、甘油、乙醇、及類似物,以及其任何組合。在許多情況中,較佳的是將等張劑(諸如糖、多元醇、或氯化鈉)納入該組成物中。特定而言,合適載劑之相關實例包括:(1)達爾伯克氏(Dulbecco)磷酸鹽緩衝鹽水,pH約7.4,含有或未含有約1mg/mL至25mg/mL人類血清白蛋白、(2)0.9%鹽水(0.9% w/v氯化鈉(NaCl))、及(3)5%(w/v)葡萄糖;並且亦可含有抗氧化劑如色胺(tryptamine)及穩定劑如Tween 20 ®。
本文中之組成物亦可包含視需要用於治療特定病症之額外治療劑。較佳的是,GITR特異性抗體或抗體片段與補充性活性化合物將具有不會互相不利影響之互補活性。在較佳實施例中,該額外治療劑係阿糖胞苷(cytarabine)、蒽環素(anthracycline)、組織胺二鹽酸鹽、或介白素2。在較佳實施例中,該額外治療劑係化學治療劑。
本發明之組成物可呈各種形式。這些包括例如液體、半固體、及固體劑量形式,但較佳形式取決於預期投予模式及治療應用。典型較佳組成物係呈可注射或可輸注溶液之形式。較佳投予模式係非經腸(例如,靜脈內、肌肉內、腹膜內、皮下)。在較佳實施例中,本發明之組成物係以推注(bolus)靜脈內投予或藉由在一段時間內連續輸注投予。在另一較佳實施例中,彼等係藉由肌肉內、皮下、關節內、滑膜內、腫瘤內、腫瘤周圍、病灶內、或病灶周圍途徑來注射,以產生局部以及全身性治療效果。
用於非經腸投予之無菌組成物可藉由將本發明之抗體、抗
體片段或抗體共軛物(conjugate)以所需量納入適當溶劑中,接著藉由微過濾進行滅菌來製備。在溶劑或媒劑方面,可使用水、鹽水、磷酸鹽緩衝鹽水、葡萄糖、甘油、乙醇、及類似者,以及其組合。在許多情況中,較佳的是將等張劑(諸如糖、多元醇、或氯化鈉)納入該組成物中。這些組成物亦可含有佐劑,尤其是潤濕、等張、乳化、分散及穩定劑。用於非經腸投予之無菌組成物亦可製備為無菌固體組成物之形式,其可在使用時溶於無菌水或任何其他注射用無菌介質中。
GITR特異性抗體或抗體片段亦可經口投予。在經口投予之固體組成物方面,可使用錠劑、丸劑、粉劑(明膠膠囊、囊劑(sachet))或粒劑。在這些組成物中,依據本發明之活性成分係於氬氣流下與一或多種惰性稀釋劑(諸如澱粉、纖維素、蔗糖、乳糖、或二氧化矽)混合。這些組成物亦可包含非為稀釋劑之物質,例如一或多種潤滑劑(諸如硬脂酸鎂或滑石)、著色劑、塗層(糖衣錠)或糖釉(glaze)。
在經口投予之液體組成物方面,可使用含有惰性稀釋劑(諸如水、乙醇、甘油、植物油或石蠟油)之醫藥上可接受之溶液、懸浮液、乳液、糖漿及酏劑。這些組成物可包含非為稀釋劑之物質,例如潤濕、增甜、增稠、調味或穩定用產品。
劑量取決於所欲之效果、治療持續期間及所使用之投予途徑;成人口服劑量通常介於每天5mg到1000mg,並且單位劑量含有範圍在1mg到250mg的活性物質。一般而言,醫師將會視待治療對象之年齡、體重及任何其他特定因素來決定適當劑量。
本文中亦提供用於殺滅Treg細胞之方法,其係向有需要之
病患投予具有ADCC活性且能夠徵集免疫細胞以殺滅該GITR表現性Treg細胞之GITR特異性抗體。任何本發明之GITR特異性抗體或抗體片段皆可使用在治療上。在較佳實施例中,GITR特異性抗體係如本文中所述之GITR特異性抗體或其抗原結合片段。
在較佳實施例中,本發明之GITR特異性抗體或抗體片段係用於治療哺乳動物中之過度增生性病症。在更佳實施例中,以上所揭露並且含有本發明之GITR特異性抗體或抗體片段的醫藥組成物之一者係用於治療哺乳動物中之過度增生性病症。在一實施例中,該病症係癌症。各種不同的癌性腫瘤已顯現含有GITR陽性免疫細胞。因此,這些腫瘤是特別具吸引力的目標。該等腫瘤包括例如黑色素瘤(包括第III及第IV期惡性黑色素瘤)、肺癌(例如非小細胞肺癌一NSCLC)、頭頸癌、前列腺癌、腎細胞癌及結直腸癌。在較佳實施例中,GITR特異性抗體係如本文中所述之GITR特異性抗體或其抗原結合片段。
其他可用抗原結合蛋白質治療的癌症包括但不限於乳癌、前列腺癌、子宮內膜癌、膀胱癌、腎癌、食道癌、睪丸癌、卵巢癌、膀胱癌、鱗狀細胞癌(例如頭頸鱗狀細胞癌一SCCHN)、葡萄膜黑色瘤、濾泡性淋巴瘤、子宮頸癌、腦癌、胰臟癌、肝癌、淋巴瘤、霍奇金氏病、多發性骨髓瘤、胃癌、及星形細胞癌。
在治療任何前述癌症時,可在具有腫瘤之個體中利用所提供之治療方法來抑制腫瘤進一步生長、誘導腫瘤緩解、增加無進展存活及/或延長整體存活。在一些實施例中,GITR特異性抗體亦可延緩或預防轉移之開始。可使用各種方法監測治療之進展。例如,抑制可導致減少腫瘤
大小及/或降低腫瘤內的代謝活性。這二種參數皆可用例如MRI或PET掃描來測量。抑制亦可藉由活體組織切片監測以確定壞死水平、腫瘤細胞死亡及腫瘤內之血管化水平。轉移程度可使用習知方法監測。因此,本發明之醫藥組成物可用於治療或預防各種癌症的轉移,包括(但不限於)下列:黑色素瘤、肺癌、頭頸癌、腎細胞癌、結直腸癌、乳癌、前列腺癌、子宮內膜癌、膀胱癌、腎癌、食道癌、睪丸癌、卵巢癌、鱗狀細胞癌(例如頭頸鱗狀細胞癌一SCCHN)、葡萄膜黑色瘤、濾泡性淋巴瘤、子宮頸癌、腦癌、胰臟癌、肝癌、淋巴瘤、霍奇金氏病、多發性骨髓瘤、胃癌、及星形細胞癌。
類似地,本文中進一步提供一種用於抑制所選細胞群體生長之方法,其包含使GITR表現性免疫細胞與有效量之本發明之GITR特異性抗體或抗體片段(單獨或組合其他治療劑)接觸。在較佳實施例中,GITR特異性抗體係如本文中所述之GITR特異性抗體或其抗原結合片段。在較佳實施例中,進一步治療劑係免疫療法,即誘導或增強免疫反應之免疫刺激劑。該等藥物可包括例如:1)樹突細胞活化劑、2)疫苗佐劑、3)T細胞刺激劑、4)免疫檢查點抑制劑、及5)阻抑性細胞(suppressive cell)、細胞介素及/或酶之抑制劑。
在一實施例中,該免疫刺激劑係癌症疫苗。除了包含癌症相關抗原之癌症疫苗以外,可與GITR特異性抗體組合使用之疫苗包括但不限於GM-CSF DNA及基於細胞之疫苗、樹突細胞疫苗、重組病毒(例如牛痘病毒)疫苗、及熱休克蛋白(HSP)疫苗。有用的疫苗亦包括腫瘤疫苗,諸如黑色素瘤細胞所形成之疫苗;且可為自體性或同種異體性。疫苗
可基於例如肽、DNA或細胞。在一實施例中,GITR特異性抗體係與CD8/CD4 Ag特異性肽疫苗組合投予。
在臨床用途中,向有需要之對象投予治療有效量之GITR特異性抗體或抗原結合片段。舉例而言,GITR特異性抗體及其抗原結合片段可用於治療含有GITR陽性免疫細胞的癌性腫瘤。在較佳實施例中,GITR特異性抗體係如本文中所述之GITR特異性抗體或其抗原結合片段。在一些實施例中,該對象為哺乳動物,較佳為人類。在一些實施例中,該GITR特異性抗體或抗原結合片段將以已測試過無菌性之溶液形式投予。
以上治療方法及用途中之劑量方案係經調整以提供最佳之所欲反應(例如,治療回應)。舉例而言,可投予單次推注、可在一段時間內投予數次分開之劑量、或者可依治療情況之急迫性所示來按比例提高或降低劑量。非經腸組成物可配製為劑量單元形式以增進投予便利性及劑量一致性。
GITR特異性抗體及片段之有效劑量及劑量方案取決於待治療之疾病及病況並且可由所屬領域中具有通常知識者決定。本發明化合物之治療有效量的例示性、非限定範圍係約0.001至10mg/kg,諸如約0.001至5mg/kg,例如約0.001至2mg/kg,諸如約0.001至1mg/kg,例如約0.001、約0.01、約0.1、約1或約10mg/kg。
所屬技術領域中具有通常知識之醫師或獸醫師可輕易決定並處方所需之醫藥組成物的有效量。舉例而言,醫師或獸醫師可從低於欲達所欲治療效果所需的該醫藥組成物中所採用之GITR特異性抗體或片段的劑量水平開始,然後逐漸提高劑量直到達到所欲效果。一般而言,本發
明之GITR特異性抗體之合適每日劑量將為該化合物有效產生治療效果之最低劑量的量。投予可為例如非經腸,諸如靜脈內、肌肉內或皮下。在一個實施例中,GITR特異性抗體或片段可依mg/m2計算之每周劑量來輸液投予。此等劑量可基於例如以上提供之mg/kg劑量,並且依據下式:劑量(mg/kg)×70提供。此投予可重複例如1至8次,諸如3至5次。該投予可藉由在2至24小時(諸如2至12小時)期間內連續輸注來執行。在一個實施例中,GITR特異性抗體或片段可藉由在長期間(諸如超過24小時)內緩慢連續輸注來投予,以降低毒性副作用。
在一個實施例中,GITR特異性抗體或片段可以每周劑量投予,該每周劑量經計算為至多給予八次之固定劑量,諸如當每周給予一次時給予四至六次。此方案可視需要例如在六個月或十二個月之後重複一或多次。此等固定劑量可基於例如以上所提供之mg/kg劑量,並且體重估計為70kg。劑量可藉由測量本發明之GITR特異性抗體經投予後在血液中的量來判定或調整,其係藉由例如採集生物樣本並使用標靶本發明之GITR特異性抗體之GITR抗原結合區的抗遺傳型抗體(anti-idiotypic antibody)來測量。
在一個實施例中,GITR特異性抗體或片段可藉由維持療法來投予,諸如例如一周一次進行六個月或更長的期間。
GITR特異性抗體或片段亦可預防性投予以降低發展癌症之風險、延緩癌症進展事件之開始發生、及/或當癌症處於緩解時降低復發之風險。
如本文中所述之GITR特異性抗體及其片段亦可以組合療
法來投予,即與所欲治療之疾病或病況的其他相關治療劑組合。因此,在一個實施例中,含抗體之藥劑係與一或多種額外治療劑(諸如化學治療劑)組合。在一些實施例中,其他治療劑包括但不限於抗腫瘤劑,包括烷化劑,包括:氮芥子氣,諸如雙氯乙基甲胺(mechlorethamine)、環磷醯胺、異環磷醯胺(ifosfamide)、黴法蘭(melphalan)及氯芥苯丁酸(chlorambucil);亞硝基尿素,諸如卡莫司汀(carmustine,BCNU)、洛莫司汀(lomustine,CCNU)及司莫司汀(semustine,甲基-CCNU);TemodalTM(替莫唑胺(temozolamide))、伸乙亞胺/甲基三聚氰胺諸如三伸乙基三聚氰胺(TEM)、三乙烯、三胺硫磷(噻替派(thiotepa))、六甲基三聚氰胺(HMM,六甲蜜胺(altretamine));磺酸烷基酯,諸如白消安(busulfan);三,諸如達卡巴嗪(dacarbazine,DTIC);抗代謝藥,包括葉酸類似物(諸如胺甲喋呤(methotrexate)及三甲曲沙(trimetrexate))、嘧啶類似物(諸如5-氟尿嘧啶(5FU)、氟去氧尿苷、吉西他濱(gemcitabine)、胞嘧啶阿拉伯糖苷(AraC,阿糖胞苷(cytarabine))、5-氮雜胞苷、2,2'-二氟去氧胞苷)、嘌呤類似物(諸如6-巰基嘌呤、6-硫鳥嘌呤、硫唑嘌呤、2'-去氧柯福黴素(2'-deoxycoformycin,噴司他汀(pentostatin))、赤羥壬基腺嘌呤(erythrohydroxynonyladenine,EHNA)、磷酸氟達拉濱(fludarabine phosphate)及2-氯去氧腺苷(克拉屈濱(cladribine),2-CdA));天然產物,包括抗有絲分裂藥物,諸如太平洋紫杉醇(paclitaxel)、長春花生物鹼(vinca alkaloid)(包括長春鹼(vinblastine,VLB)、長春新鹼(vincristine)及長春瑞濱(vinorelbine))、剋癌易(taxotere)、雌莫司汀(estramustine)及磷酸雌莫司汀;鬼臼毒素(pipodophylotoxin),諸如依託泊苷(etoposide)及替尼泊苷
(teniposide);抗生素,諸如放線菌素D(actinomycin D)、道諾黴素(daunomycin,紅比黴素(rubidomycin))、多柔比星(doxorubicin)、米托蒽醌(mitoxantrone)、伊達比星(idarubicin)、博來黴素(bleomycin)、普卡黴素(plicamycin,光輝黴素(mithramycin))、絲裂黴素C(mitomycin C)、及放線菌素;酶,諸如L-天冬醯胺酶;生物反應改質劑,諸如干擾素-α、IL-2、G-CSF及GM-CSF;其他藥劑,包括鉑配位錯合物(諸如順鉑(cisplatin)及卡鉑(carboplatin))、蒽醌(諸如米托蒽醌(mitoxantrone))、經取代脲(諸如羥基脲)、甲基肼衍生物(包括N-甲基肼(MIH)及丙卡巴肼(procarbazine))、腎上腺皮質阻抑劑(諸如米托坦(mitotane,o,p-DDD)及胺魯米特(aminoglutethimide));荷爾蒙及拮抗劑,包括腎上腺皮質類固醇拮抗劑,諸如潑尼松(prednisone)及等效物、地塞米松(dexamethasone)及胺魯米特(aminoglutethimide);GemzarTM(吉西他濱(gemcitabine))、黃體激素(諸如羥孕酮巳酯(hydroxyprogesterone caproate)、甲羥助孕酮乙酯(medroxyprogesterone acetate)及乙酸甲地孕酮(megestrol acetate));雌激素,諸如己烯雌酚(diethylstilbestrol)及乙烯雌二醇(ethinyl estradiol)等效物;抗雌激素,諸如他莫昔芬(tamoxifen);雄性激素,包含丙酸睪固酮及氟羥甲基睪酮(fluoxymesterone)/等效物;抗雄性激素,諸如氟他胺(flutamide)、促性腺激素釋放激素類似物及亮丙瑞林(leuprolide);及非類固醇抗雄性激素,例如氟他胺(flutamide)。標靶表觀遺傳學機制之療法包括但不限於組蛋白去乙醯酶抑制劑、去甲基化劑(例如,維達紮(Vidaza)),且釋放轉錄阻遏(ATRA)療法亦可與GITR抗體組合。
化學治療劑之額外特定實例包括:紫杉醇(taxol)、紫杉烯
(例如多西紫杉醇(docetaxel)及剋癌易(Taxotere))、經修飾太平洋紫杉醇(例如,阿巴生(Abraxane)及奧帕消(Opaxio))、多柔比星(doxorubicin)、癌康定(Avastin®)、舒癌特(Sutent)、雷莎瓦(Nexavar)、及其他多激酶抑制劑、順鉑(cisplatin)及卡鉑(carboplatin)、依託泊苷(etoposide)、吉西他濱(gemcitabine)、及長春鹼(vinblastine)。其他激酶之特定抑制劑亦可與GITR抗體組合使用,包括但不限於MAPK路徑抑制劑(例如ERK、JNK及p38之抑制劑)、PI3激酶/AKT抑制劑及Pim抑制劑。其他抑制劑包括Hsp90抑制劑、蛋白酶體抑制劑(例如萬珂得(Velcade))及多重作用機制抑制劑諸如萃森諾克斯(Trisenox)。
此組合式投予可為同時、分開或連續(以任何順序)進行。針對同時投予,該等劑可作為一個組成物或作為分開之組成物(視情況而定)投予。
在一實施例中,GITR特異性抗體或其片段係與另一免疫調節劑組合投予,該免疫調節劑可選自例如由樹突細胞活化劑(諸如CD40配體及抗CD40促效劑抗體)以及抗原呈現增強劑、T細胞向性增強劑、腫瘤相關免疫阻抑因子(諸如TGF-β(轉變生長因子β)及IL-10)抑制劑所組成之群組。
一些方法涉及投予GITR特異性抗體或其片段與疫苗佐劑。該等佐劑包括例如IL-12、及各種類鐸受體(TLR)促效劑(包括CpG(TLR 9促效劑)、單磷醯脂A(MPL-TLR4促效劑)、PolyI:C或PolyICLC(TLR3促效劑)、及雷西喹莫特(resiquimod)及852A(TLR 7/8促效劑))。
在其他治療方式中,GITR特異性抗體係與T細胞生長因子(諸如IL-15及/或IL-17)、或這些分子的活化劑組合投予。在相關方法中,T細胞刺激劑係與GITR抗體組合。該等刺激劑包括4-1BB之促效劑,諸如促效劑抗4-1BB抗體及4-1BBL。
在一實施例中,GITR特異性抗體或其片段係與T細胞檢查點抑制劑例如傳送抑制信號至免疫系統的分子一起投予。該等藥物之實例包括PD-1或PD-L1(B7-H1)之抑制劑,諸如抗PD-1抗體(包括尼沃魯單抗(nivolumab,Bristol-Myers Squibb)及派姆單抗(pembrolizuma,亦稱為MK-3475,Merck)、匹利珠單抗(pidilizumab,Curetech)、AMP-224(Amplimmune))、及抗PD-L1抗體(包括MPDL3280A(Roche)、MDX-1105(Bristol Myer Squibb)、MEDI-4736(AstraZeneca)及MSB-0010718C(Merck))。其他檢查點抑制劑包括CTLA-4之拮抗劑,諸如抗CTLA-4抗體。例示性抗CTLA4抗體係Bristol-Myers Squibb行銷之Yervoy®(ipilimumab)。其他例示性CTLA-4抗體包括曲美木單抗(tremelimumab,Pfizer)、替西莫單抗(Ticilimumab,AstraZeneca)及AMGP-224(Glaxo Smith Kline)。
在又其他方法中,GITR特異性抗體或其片段係與具有免疫阻抑效果的酶之抑制劑組合投予。實例係1-甲基色胺酸(1MT),其係吲哚胺2,3-二氧酶之小分子抑制劑。
GITR特異性抗體或其片段亦可與Amgen之T-VEC(塔利拉維病毒(talimogene laherparepvec))組合使用。
在某些實施例中,GITR特異性抗體或其片段係與雙特異性
抗體組合投予。雙特異性抗體可引導宿主之免疫系統(特別是T細胞之細胞毒性活性)針對癌細胞。
GITR特異性抗體或其片段亦可與各種標靶療法組合投予。標靶療法之實例包括但不限於使用治療性抗體。例示性抗體包括但不限於與存在於腫瘤細胞上之細胞表面蛋白質Her2、CDC20、CDC33、類黏液素醣蛋白、及表皮生長因子受體(EGFR)結合之抗體、OX40、PD-1、CD122、CD40、CTLA-4,且可選地在展示這些蛋白質的腫瘤細胞上誘導細胞靜止及/或細胞毒性效果。例示性抗體亦包括HERCEPTIN®(曲妥珠單抗(trastuzumab),其可用於治療乳癌及其他形式的癌症)、及RITUXAN®(利妥昔單抗(rituximab))、ZEVALINTM(替伊莫單抗(ibritumomab tiuxetan))、及LYMPHOCIDETM(依帕珠單抗(epratuzumab),其可用於治療非霍奇金氏淋巴瘤及其他形式的癌症)。某些例示性抗體亦包括帕尼單抗(panitumumab,VECTIBIX®)、ERBITUX®(IMC-C225);BEXXARTM(碘131妥司莫單抗(tositumomab));KDR(激酶域受體)抑制劑;抗VEGF抗體及拮抗劑(例如Avastin®及VEGAF-TRAP);抗VEGF受體抗體及抗原結合區;抗Ang-1及Ang-2抗體及抗原結合區;抗Tie-2之抗體及其他Ang-1及Ang-2受體;Tie-2配體;抗Tie-2激酶抑制劑之抗體;Hif-1a之抑制劑、及CampathTM(阿來組單抗(Alemtuzumab))。在某些實施例中,癌症治療劑係選擇性誘導腫瘤細胞細胞凋亡之多肽,包括但不限於TNF相關多肽TRAIL。
在一實施例中,本文中所提供之GITR特異性抗體或其片段係與一或多種降低血管生成之抗血管生成劑組合使用。某些該等藥物包
括但不限於IL-8拮抗劑;Campath、B-FGF;FGF拮抗劑;Tek拮抗劑(Cerretti等人,美國公開號2003/0162712;Cerretti等人,美國專利第6,413,932號,及Cerretti等人,美國專利第6,521,424號);抗TWEAK劑(其包括但不限於抗體及抗原結合區);可溶性TWEAK受體拮抗劑(Wiley,美國專利第6,727,225號);拮抗整合素與其配體之結合的ADAM解整合素域(Fanslow等人,美國公開號2002/0042368);抗eph受體及抗ephrin抗體;抗原結合區、或拮抗劑(美國專利第5,981,245;5,728,813;5,969,110;6,596,852;6,232,447;6,057,124號);抗VEGF劑(例如與VEGF特異性結合之抗體或抗原結合區、或可溶性VEGF受體或其配體結合區)諸如Avastin®或VEGF-TRAPTM、及抗VEGF受體劑(例如與其特異性結合之抗體或抗原結合區)、EGFR抑制劑(例如與其特異性結合之抗體或抗原結合區)諸如帕尼單抗(panitumumab)、IRESSATM(吉非替尼(gefitinib))、TARCEVATM(埃羅替尼(erlotinib))、抗Ang-1及抗Ang-2劑(例如與其或其受體特異性結合之抗體或抗原結合區,例如Tie-2/TEK)、及抗Tie-2激酶抑制劑(例如特異性結合且抑制生長因子活性之抗體或抗原結合區,諸如肝細胞生長因子(HGF,亦稱為分散因子)之拮抗劑、及與其受體「c-met」特異性結合之抗體或抗原結合區(例如利羅單抗(rilotumumab)及AMG 337,Amgen);抗PDGF-BB拮抗劑;抗PDGF-BB配體之抗體及抗原結合區;及PDGFR激酶抑制劑。
其他可與GITR特異性抗體或其片段組合使用之抗血管生成劑包括諸如MMP-2(基質金屬蛋白酶2)抑制劑、MMP-9(基質金屬蛋白酶9)抑制劑、及COX-II(環氧化酶II)抑制劑之藥物。有用COX-II
抑制劑之實例包括CELEBREXTM(塞來昔布(celecoxib))、伐地昔布(valdecoxib)、及羅非昔布(rofecoxib)。
本文中所提供之GITR特異性抗體或其片段亦可與生長因子抑制劑組合使用。該等藥物之實例包括但不限於可抑制EGF-R(表皮生長因子受體)反應之藥物,諸如EGF-R抗體(例如帕尼單抗(panitumumab,VECTIBIX®))、EGF抗體、及其係EGF-R抑制劑之分子;VEGF(血管內皮生長因子)抑制劑,諸如VEGF受體及可抑制VEGF之分子;及erbB2受體抑制劑,諸如結合至erbB2受體之有機分子或抗體,例如HERCEPTIN®(Genentech,Inc.)。EGF-R抑制劑係描述於例如美國專利第5,747,498號、WO 98/14451、WO 95/19970、及WO 98/02434。
在一些治療應用中,特別是當癌症已轉移至骨使得骨受到負面影響時,有用的是投予GITR特異性抗體或其片段與抑制進一步骨流失之治療劑或復原已流失之骨的輔助。因此,GITR特異性抗體或其片段可與治療有效量之骨生長促進(同化)劑或骨抗吸收劑一起投予,包括但不限於:命名為BMP-1至BMP-12之骨形態發生因子;轉變生長因子-β及TGF-β家族成員;纖維母細胞生長因子FGF-1至FGF-10;介白素-1抑制劑(包括IL-1ra、抗IL-1之抗體及抗IL-1受體之抗體);TNFα抑制劑(包括依那西普(etanercept)、阿達木單抗(adalimumab)及英利昔單抗(infliximab));RANK配體抑制劑(包括可溶性RANK、骨保護因子(osteoprotegerin)及與RANK或RANK配體特異性結合之拮抗性抗體,諸如迪諾單抗(denosumab,XGEVA®))、Dkk-1抑制劑(例如抗Dkk-1抗
體)、副甲狀腺素、E系列前列腺素、雙膦酸鹽類及骨增強礦物質諸如氟化物及鈣。可與GITR抗體及其功能性片段組合使用之同化劑包括副甲狀腺素及類胰島素生長因子(IGF),其中後者藥物較佳係與IGF結合蛋白質複合。適用於該組合治療之IL-1受體拮抗劑係描述於WO89/11540且合適的可溶TNF受體-1係描述於WO98/01555。例示性RANK配體拮抗劑係揭示於例如WO 03/086289、WO 03/002713、美國專利第6,740,511及6,479,635號。
在一實施例中,治療癌症之方法包括向有需要之對象投予治療有效量之如本文中所述之GITR特異性抗體,加上放射性療法。放射性療法可包含放射線照射或者相關聯之投予放射性藥品至病患。放射線源可位於受治療病患外部或內部(放射線治療例如可為體外放射治療(external beam radiation therapy,EBRT)或近程放射治療(brachytherapy,BT)之形式)。可用於實施此等方法之放射性元素包括例如鐳、銫-137、銥-192、鋂-241、金-198、鈷-57、銅-67、鎝-99、碘-123、碘-131、及銦-111。
本文中提供用於偵測生物樣本中之GITR的方法,其藉由使該樣本接觸本文中所述之抗體、或其抗原結合片段。如本文中所述,該樣本可衍生自尿液、血液、血清、血漿、唾液、腹水、循環細胞、循環腫瘤細胞、非為組織相關聯之細胞(即游離細胞)、組織(例如手術切除之腫瘤組織、活體組織切片包括細針穿刺)、組織標本、及類似者。在一些
實施例中,所述方法包括藉由使生物樣本接觸任何本文中所述之GITR特異性抗體、或其抗原結合片段來偵測該樣本中之GITR。
在一些實施例中,該樣本可與超過一種本文中所述之GITR特異性抗體或抗原結合片段接觸。舉例而言,樣本可與第一GITR特異性抗體、或其抗原結合片段接觸,接著與第二GITR特異性抗體、或其抗原結合片段接觸,其中該第一抗體或抗原結合片段與該第二抗體或抗原結合片段並非相同抗體或抗原結合片段。在一些實施例中,在接觸樣本之前,該第一抗體、或其抗原結合片段可固定至表面(諸如多孔盤、晶片、或類似基材)。在其他實施例中,在接觸樣本之前,該第一抗體、或其抗原結合片段可完全未經固定(或貼附)至任何東西。
所述GITR特異性抗體及抗原結合片段可經可偵測地標示。在一些實施例中,經標示之抗體及抗原結合片段有助於經由本文中所述之方法偵測GITR。許多此等標記係所屬領域中具有通常知識者所熟知者。舉例而言,合適標記包括(但不應將之視為限制於)放射性標記、螢光標記、表位標籤、生物素、發色團(chromophore)標記、ECL標記、或酶。更具體而言,所述標記包括釕、111In-DOTA、111In-二乙烯三胺五乙酸(DTPA)、山葵過氧化酶、鹼性磷酸酶及β-半乳糖苷酶、多組胺酸(HIS標籤)、吖啶染料、花青(cyanine)染料、螢光酮(fluorone)染料、(oxazin)染料、啡啶染料、玫瑰紅染料、Alexafluor®染料、及類似者。
所述GITR特異性抗體及抗原結合片段可用於各式測定中以偵測生物樣本中之GITR。一些合適測定包括(但不應將之視為限制於)西方墨點分析、放射免疫測定、表面電漿共振、免疫螢光法、免疫沉
澱法、平衡透析、免疫擴散法、電致化學發光(ECL)免疫測定、免疫組織化學法、螢光活化細胞分選(FACS)或ELISA測定。
本文中提供用於偵測生物樣本中之GITR的套組。這些套組包括本文中所述之一或多種GITR特異性抗體、或其抗原結合片段,以及套組之使用說明。
所提供之GITR特異性抗體、或抗原結合片段可為在溶液中;經凍乾;經固定至基材、載劑、或盤;或經可偵測地標示。
所述套組亦可包括可用於執行本文中所述之方法的額外組分。舉例來說,該等套組可包含用於自對象獲得樣本之手段、對照或參考樣本(例如來自患有緩慢進展癌症之對象及/或未患有癌症之對象的樣本)、一或多個樣本隔間、及/或描述本發明方法之執行及組織特定對照組或標準品的說明資料。
用於判定GITR水平之手段可進一步包括例如緩衝液或其他用於判定GITR水平之測定中的試劑。該等說明可為例如用於執行該測定之印刷說明及/或用於評估GITR表現水平之說明。
所述套組亦可包括用於自對象單離樣本之手段。這些手段可包含可用來自對象獲得流體或組織之一或多個設備項目或試劑。用於自對象獲得樣本之手段亦可包含用於自血液樣本單離血液組分(諸如血清)之手段。較佳的是,該套組係針對人類對象使用而設計。
為了更佳且更完全地描述本文中之申請標的,本節提供所呈現之申請標的之列舉例示性實施例。
1. 一種特異性結合至人類GITR的單離抗體或其抗原結合片段,其包含:a. 具有SEQ ID NO:1之胺基酸序列的重鏈CDR1、具有SEQ ID NO:5之胺基酸序列的重鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:12之胺基酸序列的重鏈CDR3、具有SEQ ID NO:28之胺基酸序列的輕鏈CDR1、具有SEQ ID NO:32之胺基酸序列的輕鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:35之胺基酸序列的輕鏈CDR3;b. 具有SEQ ID NO:2之胺基酸序列的重鏈CDR1、具有SEQ ID NO:5之胺基酸序列的重鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:13之胺基酸序列的重鏈CDR3、具有SEQ ID NO:29之胺基酸序列的輕鏈CDR1、具有SEQ ID NO:32之胺基酸序列的輕鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:36之胺基酸序列的輕鏈CDR3;c. 具有SEQ ID NO:1之胺基酸序列的重鏈CDR1、具有SEQ ID NO:6之胺基酸序列的重鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:14
之胺基酸序列的重鏈CDR3、具有SEQ ID NO:30之胺基酸序列的輕鏈CDR1、具有SEQ ID NO:33之胺基酸序列的輕鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:37之胺基酸序列的輕鏈CDR3;d. 具有SEQ ID NO:3之胺基酸序列的重鏈CDR1、具有SEQ ID NO:7之胺基酸序列的重鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:15之胺基酸序列的重鏈CDR3、具有SEQ ID NO:28之胺基酸序列的輕鏈CDR1、具有SEQ ID NO:32之胺基酸序列的輕鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:35之胺基酸序列的輕鏈CDR3;e. 具有SEQ ID NO:3之胺基酸序列的重鏈CDR1、具有SEQ ID NO:7之胺基酸序列的重鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:16之胺基酸序列的重鏈CDR3、具有SEQ ID NO:28之胺基酸序列的輕鏈CDR1、具有SEQ ID NO:32之胺基酸序列的輕鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:35之胺基酸序列的輕鏈CDR3;f. 具有SEQ ID NO:4之胺基酸序列的重鏈CDR1、具有SEQ ID NO:8之胺基酸序列的重鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:17之胺基酸序列的重鏈CDR3、具有SEQ ID NO:28之胺基酸序列的輕鏈CDR1、具有SEQ ID NO:32之胺基酸序列的輕鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:35之胺基酸序列的輕鏈CDR3;
g. 具有SEQ ID NO:4之胺基酸序列的重鏈CDR1、具有SEQ ID NO:9之胺基酸序列的重鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:18之胺基酸序列的重鏈CDR3、具有SEQ ID NO:28之胺基酸序列的輕鏈CDR1、具有SEQ ID NO:32之胺基酸序列的輕鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:35之胺基酸序列的輕鏈CDR3;h. 具有SEQ ID NO:4之胺基酸序列的重鏈CDR1、具有SEQ ID NO:10之胺基酸序列的重鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:19之胺基酸序列的重鏈CDR3、具有SEQ ID NO:28之胺基酸序列的輕鏈CDR1、具有SEQ ID NO:32之胺基酸序列的輕鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:35之胺基酸序列的輕鏈CDR3;i. 具有SEQ ID NO:3之胺基酸序列的重鏈CDR1、具有SEQ ID NO:7之胺基酸序列的重鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:20之胺基酸序列的重鏈CDR3、具有SEQ ID NO:31之胺基酸序列的輕鏈CDR1、具有SEQ ID NO:34之胺基酸序列的輕鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:38之胺基酸序列的輕鏈CDR3;j. 具有SEQ ID NO:3之胺基酸序列的重鏈CDR1、具有SEQ ID NO:11之胺基酸序列的重鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:21之胺基酸序列的重鏈CDR3、具有SEQ ID NO:31之胺基酸序列的輕鏈CDR1、具有SEQ ID NO:34之胺基酸序列的
輕鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:38之胺基酸序列的輕鏈CDR3;k. 具有SEQ ID NO:3之胺基酸序列的重鏈CDR1、具有SEQ ID NO:7之胺基酸序列的重鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:22之胺基酸序列的重鏈CDR3、具有SEQ ID NO:28之胺基酸序列的輕鏈CDR1、具有SEQ ID NO:32之胺基酸序列的輕鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:35之胺基酸序列的輕鏈CDR3;l. 具有SEQ ID NO:3之胺基酸序列的重鏈CDR1、具有SEQ ID NO:7之胺基酸序列的重鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:23之胺基酸序列的重鏈CDR3、具有SEQ ID NO:28之胺基酸序列的輕鏈CDR1、具有SEQ ID NO:32之胺基酸序列的輕鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:35之胺基酸序列的輕鏈CDR3;m. 具有SEQ ID NO:3之胺基酸序列的重鏈CDR1、具有SEQ ID NO:7之胺基酸序列的重鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:24之胺基酸序列的重鏈CDR3、具有SEQ ID NO:28之胺基酸序列的輕鏈CDR1、具有SEQ ID NO:32之胺基酸序列的輕鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:35之胺基酸序列的輕鏈CDR3;n. 具有SEQ ID NO:3之胺基酸序列的重鏈CDR1、具有SEQ ID NO:7之胺基酸序列的重鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:25
之胺基酸序列的重鏈CDR3、具有SEQ ID NO:28之胺基酸序列的輕鏈CDR1、具有SEQ ID NO:32之胺基酸序列的輕鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:35之胺基酸序列的輕鏈CDR3;o. 具有SEQ ID NO:27之胺基酸序列的重鏈CDR1、具有SEQ ID NO:5之胺基酸序列的重鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:26之胺基酸序列的重鏈CDR3、具有SEQ ID NO:28之胺基酸序列的輕鏈CDR1、具有SEQ ID NO:32之胺基酸序列的輕鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:35之胺基酸序列的輕鏈CDR3;或p. 具有SEQ ID NO:3之胺基酸序列的重鏈CDR1、具有SEQ ID NO:11之胺基酸序列的重鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:21之胺基酸序列的重鏈CDR3、具有SEQ ID NO:28之胺基酸序列的輕鏈CDR1、具有SEQ ID NO:32之胺基酸序列的輕鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:35之胺基酸序列的輕鏈CDR3。
2. 一種特異性結合至人類GITR的單離抗體或其抗原結合片段,其包含選自由SEQ ID NO:39至54、63及64所組成之群組的重鏈區。
3. 如實施例2所述之抗體,其中該抗體或其抗原結合片段包含選自由SEQ ID NO:55至58所組成之群組的輕鏈區。
4. 如實施例2所述之抗體,其中該抗體或其抗原結合片段包含選自由SEQ ID NO:39至54、63及64所組成之群組的重鏈區以及選自由SEQ ID NO:55至58所組成之群組的輕鏈區。
5. 如實施例4所述之抗體,其中a. 該重鏈區包含SEQ ID NO:39且與包含SEQ ID NO:55之輕鏈區配對;b. 該重鏈區包含SEQ ID NO:40且與包含SEQ ID NO:56之輕鏈區配對;c. 該重鏈區包含SEQ ID NO:41且與包含SEQ ID NO:57之輕鏈區配對;d. 該重鏈區包含SEQ ID NO:42且與包含SEQ ID NO:55之輕鏈區配對;e. 該重鏈區包含SEQ ID NO:43且與包含SEQ ID NO:55之輕鏈區配對;f. 該重鏈區包含SEQ ID NO:44且與包含SEQ ID NO:55之輕鏈區配對;g. 該重鏈區包含SEQ ID NO:45且與包含SEQ ID NO:55之輕鏈區配對;h. 該重鏈區包含SEQ ID NO:46且與包含SEQ ID NO:55之輕鏈區配對;i. 該重鏈區包含SEQ ID NO:47且與包含SEQ ID NO:58之輕鏈區配對;
j. 該重鏈區包含SEQ ID NO:48且與包含SEQ ID NO:58之輕鏈區配對;k. 該重鏈區包含SEQ ID NO:49且與包含SEQ ID NO:55之輕鏈區配對;l. 該重鏈區包含SEQ ID NO:50且與包含SEQ ID NO:55之輕鏈區配對;m. 該重鏈區包含SEQ ID NO:51且與包含SEQ ID NO:55之輕鏈區配對;n. 該重鏈區包含SEQ ID NO:52且與包含SEQ ID NO:55之輕鏈區配對;o. 該重鏈區包含SEQ ID NO:53且與包含SEQ ID NO:55之輕鏈區配對;p. 該重鏈區包含SEQ ID NO:54且與包含SEQ ID NO:55之輕鏈區配對;q. 該重鏈區包含SEQ ID NO:63且與包含SEQ ID NO:55之輕鏈區配對;或r. 該重鏈區包含SEQ ID NO:64且與包含SEQ ID NO:55之輕鏈區配對。
6. 如實施例5所述之抗體或抗原結合片段,其中該抗體藉由與人類GITR(SEQ ID NO:62)之下列胺基酸殘基交互作用來特異性結合至GITR:a. 40至45;及
b. 75至79。
7. 如實施例1所述之抗體或抗原結合片段,其中該抗體或其抗原結合片段結合至具有SEQ ID NO:59之胺基酸序列的多肽。
8. 如實施例1所述之抗體或抗原結合片段,其中該抗體或其抗原結合片段以至少30nM之結合親和力來特異性結合人類GITR,如使用實例9中所述之實驗設計由表面電漿共振所測得者。
9. 如實施例1所述之抗體或抗原結合片段,其中該抗體或抗原結合片段在NF-κB螢光素酶基因測定中誘導螢光素酶表現增加。
10. 如實施例1所述之抗體或抗原結合片段,其中該抗體或抗原結合片段以小於約67ng/mL之EC50在活體外誘導ADCC。
11. 如實施例1所述之抗體或抗原結合片段,其中該抗體或抗原結合片段係人類抗體或抗原結合片段。
12. 如實施例1所述之抗原結合片段,其中該抗原結合片段係Fab片段、Fab2片段、或單鏈抗體。
13. 如實施例1所述之抗體或抗原結合片段,其中該抗體或抗原結合片段係重組者。
14. 如實施例1所述之抗體或抗原結合片段,其中該抗體或其抗原結合片段係IgG1、IgG2、IgG3、或IgG4同型。
15. 如實施例1所述之抗體或抗原結合片段,其係IgG1同型。
16. 如實施例1中任一項所述之抗體或抗原結合片段,其中該抗體或其抗原結合片段特異性結合人類GITR及石蟹獼猴(cynomolgus monkey)GITR。
17. 一種多核苷酸,其編碼如實施例1中任一項所述之抗體或抗原結合片段。
18. 一種載體,其包含如實施例17所述之多核苷酸。
19. 一種宿主細胞,其包含如實施例18所述之載體。
20. 一種用於生產抗體或抗原結合片段之過程,其包含:在允許該抗體或抗原結合片段表現之條件下培養如實施例19所定義之宿主細胞,以及自該培養物回收該抗體或抗原結合分子。
21. 一種緩和癌症或其他腫瘤病況的症狀之方法,該方法包含向有需要之對象投予足以緩和該對象之該癌症或其他腫瘤病況之該症狀的量之如實施例1所述之抗體或其抗原結合片段。
22. 如實施例21所述之方法,其中該對象係人類。
23. 如實施例21所述之方法,其進一步包含下列一或多者:a. 投予化學療法;b. 投予放射線療法;或c. 投予一或多種額外治療劑。
24. 如實施例23所述之方法,其中該額外治療劑係免疫刺激劑。
25. 如實施例24所述之方法,其中該免疫刺激劑係選自由PD-1抗體、CTLA-4抗體、CD122抗體、CD40抗體、OX40抗體、及CD8 Ag特異性OVA肽疫苗所組成之群組。
26. 一種醫藥組成物,其包含如實施例1所述之抗體或其抗原結合片段以及醫藥上可接受之載劑。
27. 一種套組,其包含如實施例1所述之抗體或其抗原結合片段以及用於上述者之包裝。
下列實例係提供用來增補前述揭露及提供對於本文中所述之申請標的之更佳理解。不應將這些實例視為限制所述之申請標的。應瞭解本文中所述之實例及實施例僅用於說明性之目的,並且根據該等實例及實施例之各式修飾或變化將為所屬領域中具有通常知識者所顯而易知且應被納入本發明之真實範疇內,而且在不偏離本發明之真實範疇下可作出這些修飾或變化。
重組人類(h)GITR-Fc融合蛋白質(R&D Systems目錄編號689-GR)對應hGITR(SEQ ID NO:59)之胺基酸26至161。蛋白質係經生物素化以用於噬菌體淘選研究。亦將此蛋白質用於結合及親和力測量。
GITR係藉由轉染或慢病毒轉導表現於HEK293F細胞中,以用於抗GITR抗體反應性證實、測試噬菌體及次世代定序組、及檢查GITR mAb命中者對cyno-GITR之交叉反應性。
轉染細胞呈現下列GITR序列:
慢病毒轉導細胞呈現下列GITR序列:
藉由下列執行HEK 293F細胞的暫時表現:將細胞以1e6細胞/ml的密度放置於125ml通氣蓋震盪燒瓶中體積30ml的FreestyleTM 293介質(Gibco #12338)中,以130RPM震盪24小時,之後進行轉染。轉染係使用Freestyle max試劑(Invitrogen #16447)進行。進行單一次30ml轉染時,在一根試管中將37.5μl之freestyle max試劑稀釋於1ml之OptiMEM介質(Gibco #31985)中。在另一根試管中,將37.5μg之DNA(300奈克目標及37.2μg之非相關載劑質體)混合至1ml OptiMEM中。接著將二根試管混合在一起,在生物安全櫃中培養1分鐘,接著將混合物直接添加至HEK293F細胞之燒瓶中。在生長48小時之後,細胞已就緒可供所示測定使用。
將呈現Genecopoeia產製之全長GITR的慢病毒顆粒(Genecopoeia目錄# LPP-U0202-LV105-200-S用於人類GITR及Genecopoeia目錄# LPP-U0202-LV105-200-S用於石蟹獼猴GITR)使用製造商之程序轉導至細胞中。選擇穩定質體整合之轉導細胞,接著使用BD Biosciences FACS Jazz細胞分選器進行單一細胞分選。GITR表面表現係藉由流式細胞測量術定量,其以R&D Systems FAB689P抗huGITR抗體染色並在BD Biosciences Accuri C6上分析。
從頭合成(de novo)的pIX Fab庫(Shi,L.等人,J Mol Biol,2010.397(2):p.385-396.WO 2009/085462)係由VH1-69、3-23及5-51重鏈庫配對Vκ VLK3-20、VLK4-1、VLK3-11、及VLK1-39輕鏈庫所組成,將其用濃度100nM(第1至3輪)或10nM(第4輪)的生物素化人類GITR-ECD Fc融合於類似Rothe等人,J Mol Biol 376:1182-1200,2008及Steidl等人,Mol Immunol.46:135-144,2008所述之選擇過程進行淘選。
在第四輪淘選後隨即將該pIX基因自噬菌體質體DNA切下以產生可溶性經his標記之Fab編碼區。Fab在大腸桿菌(E.coli)中表現並在ELISA中針對與GITR之結合來進行篩選。簡言之,96孔Nunc Maxisorp盤(Nunc #437111)係在4℃下經PBS中之5μg/mL鏈黴抗生物素蛋白(streptavidin)(Promega)或綿羊抗人類Fd(結合部位#PC075)塗覆過夜。使含有該Fab表現載體之細菌培養物在深孔培養盤中於1mL的2xYT(卡本西林(Carbenecillin))中生長直到呈混濁(OD6000.6)。接著藉由加入IPTG達1mM的濃度來誘導Fab表現。使培養物在30℃下生長過夜,接著在隔天藉由離心使其澄清。將經鏈黴抗生物素蛋白塗覆之盤用TBS,0.5% Tween-20(Sigma #79039-10PAK)洗滌三次,注入5μg/mL之生物素化GITR-Fc,並維持在室溫下30分鐘。使用Biomek Liquid Handling Robot(Beckman Coulter),將經抗Fd塗覆之Maxisorp盤及經鏈黴抗生物素蛋白塗覆之盤兩者用TBS,0.5% Tween-20(Sigma #79039-10PAK)洗滌三次,並在室溫下用每孔200μL PBS-Tween(0.5%)+脫脂乾燥奶(3%)阻斷一小時。
在此步驟及所有後續步驟中,孔盤用TBS,0.5% Tween-20(Sigma #79039-10PAK)洗滌三次。各孔接受50μL的Fab上清液,接著在室溫下進行一小時培養。在洗滌之後,將50μL的山羊抗人類κ-HRP(Southern Biotech)以於含0.3%奶的TBST中之1:5000稀釋加入,並在室溫下培養孔盤一小時。洗滌孔盤,然後將50uL化學發光基質PoD(Roche # 121-5829500001)依據製造商說明加入。接著在EnVision(Perkin Elmer)孔盤分析儀上讀取孔盤以獲得發光值。選擇在fab表現ELISA及GITR結合ELISA兩者中皆呈陽性的殖株進行DNA定序。經由此噬菌體淘選過程,總共發現50個獨特的Fab序列。獨特的重鏈V區係經選殖至人類IgG1_G1m(17,1)表現載體,獨特的輕鏈係經選殖至人類κ表現載體,且所生成的抗體再次於ELISA中測試結合活性。
GITR抗體與經工程改造細胞之結合係使用FACS評估。篩選測定之目的是要識別出結合至表現hGITR之細胞的抗體。
簡言之,將每孔300,000個細胞接種至96孔盤(Greiner bio one cat#651261)並使細胞成團塊。將細胞用100μL之FACS染色緩衝液(BD Pharmingen Stain Buffer(BSA)目錄#554657)洗滌,在4℃下與50μL FACS染色緩衝液及每孔20μL之未經純化抗體上清液的混合物一起培養30分鐘,並用200μL之FACS染色緩衝液洗滌一次。進行偵測時,將細胞在4℃下與每孔50μL之每mL含2μg Alexa Fluor 488山羊抗人類IgG
(H+L)(Molecular Probes,cat #A11013)之FACS染色緩衝液培養30分鐘。將細胞用每孔200μL之FACS染色緩衝液洗滌一次,再懸浮於每孔150μL之FACS染色緩衝液中,接著轉移至每孔含200μL之FACS染色緩衝液之FACS試管中。接著進行FACS分析。重複該測定以確認數據一致性,並且選出前幾名結合體以進行進一步發展。
為了評估GITR抗體之促效劑活性,將抗體組使用NF-κB螢光素酶基因測定進行篩選。簡言之,HEK293細胞係經在NF-κB啟動子控制下編碼螢光素酶基因之報導質體與人類GITR表現質體一起瞬時轉染。允許細胞自轉染恢復並在37℃下表現人類GITR達四小時,此時可以開始進行測定。為了證實測定如預期般進行,將重組人類GITR配體(R&D Systems 6987-GL/CF)以最終濃度每mL 2.5微克添加至陽性對照孔。將欲進行測試之抗GITR抗體以每mL 5微克之最終濃度添加至實驗孔。孔盤接著在37℃下培養四小時。預期成功GITR傳訊將活化NF-kB路徑,然後表現螢光素酶,其可藉由添加Steady Glo(如製造商(Promega cat #E2550)所示)來偵測,並在Envision孔盤讀取儀(Perkin Elmer)中測量所生成的發光。
相較於僅用PBS處理,十五個抗體誘導螢光素酶表現增加(圖1)。相較於僅用PBS處理,生產螢光素酶表現增加的抗體被初步歸類為促效劑,而剩餘抗體可為拮抗劑或可能只與GITR結合但不影響傳訊。
在發現第一組抗GITR抗體之後,將最終輪的噬菌體選擇輸出DNA樣本提供給Beckman Coulter Genomics,使用Roche 454定序平台進行重鏈V區的次世代定序。來自Beckman Coulter Genomics的原始數據在IMGT進行初步分析,接著在內部使用Janssen專有軟體程式3DX更詳盡地檢查。使用次世代定序來更全面地檢查噬菌體選擇輸出的想法,已在最近發展為增加所發現抗體之數量及品質的方法(Ravn等人,Methods 60(2013)pg 99-110)。
將IMGT提供的序列過濾掉品質不良或含有終止密碼子的樣本,接著將剩餘序列以重鏈CDR3分選。選擇此方式是因為預期CDR3將驅動大多數抗原結合能量,而且噬菌體庫中之大多數多樣性係位於重鏈CDR3。基於發生頻率及缺乏半胱胺酸、甲硫胺酸、或高度疏水性序列這二項條件,選擇八十七個V區以進行DNA合成並選殖至人類IgG1_G1m(17)載體。
在合成之後,假定的抗GITR重鏈係如前述測試其與GITR之結合。由於次世代定序數據組不含關於這些重鏈V區的適當輕鏈夥伴之資訊,因此該等重鏈係與在噬菌體庫中所見之4種輕鏈種系基因:Vk3-20、Vk4-1、Vk3-11、及Vk1-39之各者共轉染。來自這四個標準轉染之未經純化抗體上清液係於ELISA中測試其與重組人類GITR ECD-Fc融合蛋白質結合之能力。選擇此測定中的前幾名結合體以進一步發展。
在來自次世代定序數據組的抗GITR mAb於ELISA中顯示與GITR ECD-Fc融合蛋白質結合之後,如實例3所述測試亞組與細胞表面GITR之結合。如實例3所述,使用NF-κB螢光素酶基因測定,測試陽性結合體的促效劑活性。在每mL 40微克下,誘導螢光素酶表現增加等於比用天然配體處理時所觀察到的背景值至少增加20%的抗體,被認為具有促效劑活性(圖2)。
使用流式細胞測量術,測試來自噬菌體展示及次世代定序兩者的經純化抗體與石蟹獼猴GITR之結合。將瞬時轉染細胞在2至8℃下與0.1mg/mL的測試抗體培養30分鐘,洗滌,並在2至8℃下用PE標記的山羊抗人類IgG培養30分鐘。接著將細胞洗滌並在MACSQuant流式細胞測量儀上分析。經識別為陽性結合體之抗體使人類或石蟹獼猴GITR轉染細胞的平均螢光強度,相較於空載體轉染細胞的平均螢光強度展現1.5至2對數偏移。結合結果彙總於表2。
表2:抗GITR抗體與人類或長尾獼猴GITR瞬時轉染之HEK293f細胞的結合。請注意只有顯示與石蟹獼猴GITR細胞結合之抗體才列示於此表中(經測試但並未示出的抗體未顯現出與石蟹獼猴GITR結合)。將有強烈偏移結合曲線之抗體指派為++,並將有中度偏移結合之抗體指派為+。
因此,總共發現16個GITR抗體的小組(所有皆敘述於表3)與人類及石蟹獼猴GITR結合。
16種GITR mAb之VH及VL係顯示於下表4中。
在ADCC及CDC測定中測試與人類及石蟹獼猴GITR兩者結合之抗體的活性。這些測定包括huIgG1同型對照抗體以進行比較。使用ADCC測定來檢視由NK-92細胞進行的細胞殺滅,該等細胞經基因修飾以表現高親和性FcγRIIIa 176V/V多型性。使用三種目標細胞:內源性表現人類GITR的HuT102細胞、彙集的HT1080-huGITR穩定轉染細胞、以及人類GITR或石蟹獼猴GITR瞬時轉染的HEK293細胞。為了進行ADCC測定,將目標細胞用鈣黃綠素AM標示,洗滌,再懸浮於測定介質中,並以50,000細胞/50微升/孔接種於V底96孔盤中。將抗hGITR或對照抗體以各種濃度(100微升/孔)添加至孔中。將NK-92 176V效應細胞洗滌,再懸浮於測定介質中,並以50,000細胞/50微升/孔或100,000細胞/50微升/孔接種至與目標細胞及抗體一起。包括僅介質(背景信號)、僅目標細胞(自發性溶解信號)、最後將用Triton X-100(最大溶解信號)及最終濃度1微克/mL之同型對照抗體處理之細胞作為對照。在37℃下培養1小時之後,透過添加20微升之2% Triton X-100,在最大信號孔中誘導完全細胞溶解,並將孔盤離心。將100微升之上清液移除並添加至透明底黑色孔盤中。使用Molecular Devices SpectraMax5,測量螢光強度(FI)單位。將所有孔減去在僅介質中觀察到的平均FI之後,計算特異性溶解百分
比。判定特異性溶解百分比之公式係(樣本-自發性溶解)/(最大溶解-自發性溶解)*100。在Prism中進行每種抗體的半最大有效濃度(EC50)分析。
表5敘述GITR抗體在不同的測試細胞系中之活性。
在製備細胞系發展中,啟始關於TRGB25、TRGB153、TRGB159、及TRGB160的雙基因建構。在此過程中,發現到TRGB25之重鏈係位於人類同種異型(allotype)IgG1_G1m(17,1)而非較佳的人類同種異型IgG1_G1m(17)中。在雙基因建構期間,將來自TRGB25的重鏈V區轉換至人類IgG1_G1m(17)同種異型架構中,藉以產生新的蛋白質TRGB190。此時亦注意到TRGB160在重鏈的胺基端具有架構突變。在建構雙基因期間,將TRGB160重鏈的胺基端殘基從Q轉換成E,藉以產生新的蛋白質TRGB191。此外,決定生產低海藻糖版本的TRGB191,即TRGB191.CLF。表6概述此經修飾抗GITR抗體的序列。
GITR抗體對於重組人類GITR ECD之親和力係使用ProteOn XPR36蛋白質交互作用陣列系統(BioRad)藉由表面電漿共振(SPR)來測量。
測量各變異體的GITR ECD締合及解離速率。生物感測器表面係使用製造商針對胺偶合化學之說明藉由將山羊抗人類IgG(Fc)共價偶合至GLC晶片(BioRad)之表面來製備。將約8800 RU(反應單元(response unit))的山羊抗人類IgG(Fc)抗體(Jackson ImmunoResearch laboratories Prod # 109-005-098)固定化。所固定化之RU亦包括山羊抗小鼠Fc抗體,其加入係用來捕獲未包括於此處所報告抗體之其他抗體。因為混合物為1:1,約50%的這些所固定化RU預期會是山羊抗人類Fc。結合動力學實驗係在25℃下於運行緩衝液(PBS pH 7.4,0.005% P20,3mM EDTA)中執行。在運行緩衝液中製備人類GITR ECD或石蟹獼猴GITR ECD的四倍(1:3)連續稀釋液(自100nM開始)。感測器晶片的各通道上捕獲平均300 RU的mAb(174至600)。將不含所捕獲之候選者的參考點(經山羊抗人類IgG(Fc)修飾表面)用作為參考表面。在捕獲mAb之後進行3分鐘的抗原(在40μL/min下)注射(締合相),接著進行10分鐘的緩衝液流動(解離相)。晶片表面係藉由注射0.85%磷酸(在100μL/min下)來再生。數據係在儀器軟體上處理。數據的雙參考減法係藉由從分析物注射之已扣除參考之曲線減去由緩衝液注射所產生的曲線來進行。數據的動力學分析係使用1:1 Langmuir結合模型搭配群適配(group fit)來執行。各mAb
之結果係以kon或結合速率、koff或解離速率、以及KD(平衡解離常數)之格式來報告(表7)。
結果指示,少數抗體符合以與人類GITR ECD結合五倍以內的親和力與石蟹獼猴GITR ECD結合之目標。此結果似乎與實例7中討論的細胞殺滅數據衝突,其中大部分抗體殺滅石蟹獼猴GITR表現細胞的效力,僅稍微低於殺滅人類GITR蛋白質表現細胞所顯示的效力。可能是在昆蟲細胞中過度表現的截短GITR胞外域未經適當摺疊,導致細胞殺滅與親和力分析實驗之間的歧異。進一步的可能是在人類細胞中表現的全長GITR比較可能經適當摺疊,因此對GITR表現性細胞之結合親和力的測量將比較可能與觀察到的細胞殺滅活性一致。為了測試這些可能性,應評估這些抗體對表現人類或石蟹獼猴GITR之細胞的親和力。
執行基於細胞的親和力實驗,使用MSD細胞親和力技術(MSD-CAT)評估抗GITR抗體與人類及石蟹獼猴GITR轉染HEK293細胞系的結合。MSD-CAT為自行開發之不需標記方法,使用完整細胞以高處理量格式測定親和力。使用無任何GITR表現的親代HEK293細胞系作為陰性對照。
為了以此技術測量交互作用之親和力,製備一系列具有固定濃度之抗GITR抗體(300、60、12、2.4 pM)及變化濃度之人類或石蟹獼猴GITR表現性細胞(2.0×107至1.0×103細胞/mL)的溶液,並藉由在4℃下旋轉孔盤18hr來允許其達到平衡。這些樣本係製備於含有0.05% Azide、1% BSA、3mM EDTA之DMEM Glutamax介質(Invitrogen,Prod# 10569-044)中。在平衡化之後,將孔盤以2000rpm離心5分鐘,並偵測上清液中之游離抗GITR mAb。混合物中的游離抗GITR mAb係使用MSD分析儀藉由電化學發光(ECL)來偵測。進行偵測時,將MSD鏈黴抗生物素蛋白孔盤(MesoScale Discovery,Prod# L11SA-1)經50μL/孔測定緩衝液中之0.1μg/mL生物素化人類GITR抗原塗覆並平衡過夜(在4℃下約16hr)。在平衡化之後,在未移除塗覆抗原下藉由加入150μL/孔的測定緩衝液來阻斷孔盤,在室溫下培養約1hr,並用洗滌緩衝液洗滌3次。將來自離心孔盤之上清液轉移至抗原塗覆孔盤(50μL/孔),培養60分鐘,接著用洗滌緩衝液洗滌三次。在此之後,添加50μL/孔之0.7μg/mL釕接合F(ab')2驢抗人類IgG(H+L)(Jackson ImmunoResearch;Prod# 709-006-149),並培養
1hr。在1hr之後,將孔盤用洗滌緩衝液洗滌三次,並添加每孔150μL之MSD讀取緩衝液(MesoScale Discovery Cat# R92TC-1;將原液以1:3稀釋至d.H2O中來製備)。立即在MSD Sector Imager 6000 Reader上讀取孔盤以測得發光水平。由MSD所偵測得到之ECL信號係以游離抗體在混合物中的%來表示,並且使用Prism軟體中所引入之使用者定義方程式(衍生自質量作用定律)來分析數據以決定親和力。將隨受體濃度而變動之游離mAb濃度用1:1結合模型進行非線性最小平方分析,以判定結合親和力。表8概括所有測試分子的細胞結合親和力。
藉由MSD-CAT測量TRGB25、TRGB190、TRGB160、TRGB191.CLF及TRGB153對細胞表面表現之GITR的親和力。執行四個研究,其中第一個研究被認為是初步數據且僅由一個複製(replicate)組成。
執行具有較大重複(repeat)數量之進一步研究(研究2及3)。研究2及3指示,TRGB190對石蟹獼猴GITR之mAb親和力相較於對人類GITR弱1.5至1.6倍。研究2及3亦指示,TRGB191.CLF對石蟹獼猴GITR之mAb親和力相較於對人類GITR弱1.5至3.2倍。研究4係於較晚日期進行,以證實來自較早研究之TRGB191.CLF數據。研究4之數據指示,TRGB191.CLF對石蟹獼猴GITR之mAb親和力相較於對人類GITR弱2.0倍。
經抗原初免(primed)之T淋巴球需要擴增及長存(persist)以促進適應性免疫性。所需的生長及存活信號大多是由活化T細胞中之NF-κB路徑提供。干擾素γ(IFNγ,為NF-kB轉錄因子廣為周知之目標基因)係對抗外來病原體之免疫性的關鍵細胞介素,且當抗原特異性免疫性一經發展後即由Th1 CD4及CD8細胞毒性T淋巴球(CTL)效應T細胞生產(Schoenborn JR,Wilson CB.Adv Immunol.2007;96:41-101)。
腫瘤壞死因子受體(TNFR)超家族成員(GITR係其中一員)可提供共刺激信號給T細胞。此係藉由與彼等之各別配體結合來啟始,並經由徵集稱為TRAF(TNF受體相關因子)的轉接蛋白質(adaptor protein)來透過NF-κB路徑傳訊。此外,共刺激傳訊之強度係取決於受體之低聚合,此可由三聚性或六聚性可溶配體或經由抗體媒介交聯達成。
為了偵測抗GITR抗體接合對NF-κB活性的影響,利用經修飾版本之HEK-Blue NF-κB系統(Invivogen)。這些細胞在融合至五個NF-
κB及AP-1結合部位的最小啟動子控制下表現SEAP(分泌型胚胎鹼性磷酸酶)報導基因。它們係經穩定轉染以表現人類GITR。在此系統中之GITR受體交聯驅動NF-κB活性,其可藉由上清液中之SEAP分泌來偵測。使用三聚性可溶GITR配體嵌合性蛋白質(R&D Systems)作為陽性對照。
進行「促效劑(agonist)」測試時,將25,000個HEK-Blue-NF-κB-GITR細胞用可溶GITRL(自100ng/mL開始)或抗GITR抗體(自1ug/mL開始)之連續1:2稀釋液,在5X過量交聯劑抗體(分別為抗HA或抗Fc)存在下處理16至20小時。將上清液(40uL)移除並與160uL之Quanti-BlueTM試劑混合。允許呈色反應在37℃下培養至多1hr,之後在分光比色計中在OD- 650nm下讀取。
為了在「拮抗劑(antagonist)」模式下測試抗體,將細胞用抗GITR抗體(自2ug/mL開始)之連續1:2稀釋液,在25ng/mL恆定濃度之可溶GITRL存在下處理。拮抗劑係定義為阻斷大於50%之可溶GITRL的結合及NF-κB活性之抗體。以下提供代表圖並用以說明實驗變異性。
在促效劑模式下,相較於同型對照抗體CNTO3930,抗GITR抗體能夠與HEK-Blue-NF-κB-GITR細胞上之GITR交聯,造成NF-κB活性之劑量依賴性增加(圖3)。在sGITRL存在下,觀察到一些抗GITR抗體減少sGITR依賴性NF-κB活化之水平,然而其他抗體即使以400X濃度使用時仍無此作用。TRGB191.CLF、GTRB45及GTRB49所阻斷之GITRL:GITR交互作用似乎不大於30%,這可能可歸因於測定變異
性。GTRB45及GTRB49係亦與GITR結合之未表徵抗體。
免疫性的一項特徵在於產製針對外來抗原的記憶T細胞,以使免疫反應可在後續暴露時更快速地展開。
巨細胞病毒(CMV)係疱疹病毒且係常見感染,在健康成人及兒童中通常無症狀。據估50至80%的成人在達到40歲之前會受到CMV感染。破傷風毒素(TT)係由稱為破傷風梭菌(Clostridium tetani)之細菌生產。在美國大多數成人在6歲前已接受過5次破傷風接種,且之後每10年接受一次追加注射(booster)。
藉由使血清陽性個體暴露至他們的各別抗原,記憶T細胞可經再活化以展開回憶(recall)反應。已顯示T細胞上之GITR表現及抗原呈現細胞上之GITRL表現經上調。促效劑GITR抗體可藉由透過GITR傳訊及進一步增強抗原特異性免疫反應來強化T細胞活化。
干擾素γ(IFNγ)係對抗外來病原體之免疫性的關鍵細胞介素,且當抗原特異性免疫性一經發展後即由Th1 CD4及CD8細胞毒性T淋巴球(CTL)效應T細胞生產(Schoenborn JR,Wilson CB.Adv Immunol.2007;96:41-101)。
在此,我們已發展出CMV及TT回憶測定以表徵我們的抗GITR抗體在增強T細胞活化上的能力,如由IFNγ分泌所測得者。簡言之,將150,000個獲自CMV及TT血清陽性捐贈者的PBMC,在0.1ug/mL之CMV抗原或TT抗原(CMV全抗原,Astarte #1004;TT抗原,
Astarte #1002)存在下,在經測試抗體自5ug/mL開始至156ng/mL的1:2稀釋系列(在x軸上由左至右)預先塗覆的孔中培養。經過4至6天之後收集上清液,並用MSD定量IFNγ水平。僅抗原對照係用來評估捐贈者的反應性,且CNTO3930係抗體同型對照。複製(n=6)運行各抗體濃度。
TRGB191.CLF以劑量依賴性方式放大CMV依賴性記憶T細胞活化,如由IFNγ分泌所測得者,尖峰在[Ab]=5ug/mL(圖4A)。在TT回憶測定中,在[Ab]=625ng/mL觀察到尖峰T細胞共活化(圖4B)。
抗GITR在抗腫瘤免疫性上之療效僅可在宿主具有完整免疫系統的腫瘤模型中研究。因此,GITR小鼠替代抗體DTA-1係分別於Balb/C或C57/BL6小鼠中之已建立同基因結腸癌模型CT26及MC38中研究。
將小鼠右側腹皮下(sc)植入5×105 CT26或MC38腫瘤細胞。在腫瘤細胞植入後第7天,將小鼠隨機分配至實驗組,其平均腫瘤大小分別約為85mm3或120mm3。
小鼠經腹膜內投予DTA-1(BioXcell #BE0063)或大鼠IgG2b同型對照(殖株LTF-2,BioXcell #BE0090)200μg/動物q3d至q4d,在第7、11及14天共3劑(n=10/組)。每周進行二次腫瘤卡尺測量,直到研究結束。使用下式計算腫瘤體積:腫瘤體積(mm3)=(1×w2/2);其中「1」代表由卡尺測量所判定之腫瘤長度,且「w」代表寬度,在整個研究期間每周監測二次。腫瘤生長抑制百分比(%TGI)係定義為治療組相較於對照組的
平均腫瘤體積之間的差異,計算方式為%TGI=[(TVc-TVt)/TVc)*100],其中TVc係給定對照組之平均腫瘤體積且TVt係治療組之平均腫瘤體積。依照NCI標準之定義,60% TGI被認為具有生物顯著性。
在MC38模型中,統計顯著的腫瘤生長抑制係由DTA-1治療達成(相較於同型對照,第21天達80% TGI,p<0.0001),早在DTA-1治療之後第14天觀察到腫瘤緩解,且到第28天在5/10隻動物中達到完全反應(CR)。CR似乎持久,直到最後一次治療劑量後35天未觀察到再生長。
在CT26模型中,相較於同型治療對照動物,統計顯著的腫瘤生長抑制係由DTA-1治療達成(第27天達>65% TGI,p<0.0001),早在第14天在該組半數(5/10隻動物)中觀察到腫瘤緩解,且到第31天觀察到完全反應(CR)(圖5)。CR似乎持久,直到最後一次治療劑量後42天未觀察到再生長。
使用MC38同基因結腸癌模型來評估與抗PD-1、抗CTLA-4檢查點阻斷劑或抗OX-40抗體組合之組合抗GITR療法。
將小鼠右側腹皮下(sc)植入5×105 MC38腫瘤細胞。在腫瘤細胞植入後第14至21天,將小鼠隨機分配至實驗組,其平均腫瘤大小約為200mm3。小鼠經腹膜內投予替代抗GITR(DTA-1,BioXcell #BE0063)、抗PD-1(RMP1-14,BioXcell #BE0146)、抗CTLA-4(9D9,
BioXcell # BP0164)、抗OX40(OX-86,BioXcell # BE0031)或大鼠IgG2b同型對照(LTF-2,BioXcell #BE0090)100μg/動物q4d,在隨機分組後第1、5及9天共3劑(n=10/組)。每周進行二次腫瘤卡尺測量,直到研究結束。使用下式計算腫瘤體積:腫瘤體積(mm3)=(1×w2/2);其中「1」代表由卡尺測量所判定之腫瘤長度,且「w」代表寬度,在整個研究期間每周監測二次。腫瘤生長抑制百分比(%TGI)係定義為治療組相較於對照組的平均腫瘤體積之間的差異,計算方式為%TGI=[(TVc-TVt)/TVc)*100],其中TVc係給定對照組之平均腫瘤體積且TVt係治療組之平均腫瘤體積。依照NCI標準之定義,60% TGI被認為具有生物顯著性。
相較於同型對照世代,統計顯著的腫瘤生長抑制係由抗GITR治療達成,儘管治療啟始於當腫瘤較大時,且劑量從200μg/小鼠減少至100ug/小鼠。在抗GITR+抗PD-1組合組中,到隨機分組之後第26天在5/10隻動物中觀察到腫瘤緩解(圖6)。在抗GITR+抗CTLA-4組合組中,在3/10隻動物中觀察到腫瘤緩解且在2/10隻動物中觀察到延緩腫瘤緩解(圖7)。最後,抗GITR(d1)+抗OX40(d5,d9)之組合優於單獨抗GITR療法(d1,d5,d9)及單獨抗OX40(d5,d9)(圖8)。
評估標靶GITR加上PD-1阻斷之組合療法在疫苗環境中放大Ag特異性CD8+ T細胞反應的機制。為了進行此評估,將非荷瘤小鼠用OVA免疫優勢CTL表位OVA257-264肽疫苗(以下稱為Vax)免疫一次,
並在第0、3、及6天用200μg抗GITR治療,且在第3、6、9、及12天用200μg抗PD-1治療。組合Vax/抗GITR/抗PD-1療法相較於對照組放大CD8+效應功能,證據為脾臟的Ag特異性IFNγ酶聯免疫斑點法(ELISpot)反應水平增加、多功能CD8+ T細胞反應水平增加、以及顯現出溶細胞活性之CD107a/IFNγ CD8+ T細胞水平增加(分別為圖9A、B、及C)。相較於其他治療及對照組,三重療法誘發顯著較高頻率的表現單一IFNγ、雙重IFNγ/TNFα、及三重IFNγ/TNFα/IL-2之多功能效應CD8+ T細胞(圖9B)。藉由用OVA267-264H-2Kb-SIINFEKL四聚體直接染色,Vax/抗GITR/抗PD-1顯著放大在第7及14天之周邊血液中OVA四聚體特異性CD8+ T細胞反應(圖9D及9E),暗示目標特異性CD8+ T細胞的移動。高頻率的效應細胞分泌Thl發炎性細胞介素指示抗GITR/抗PD-1之活體內(in vivo)組合可增強疫苗誘導性Ag特異性CD8+ T細胞反應。
在疫苗初免之後的14天,藉由CD44及CD62L的表面表現,判定組合療法使Ag特異性CD8+ T細胞偏向效應之於記憶表型分化的程度。中樞記憶(CM)之表型輪廓一般係CD44+及CD62L+,而效應記憶(EM)細胞係CD44+及CD62L-。相較於其他組,在給予三重組合療法的小鼠中觀察到四聚體OVA特異性EM及CM CD8+ T細胞族群顯著增加(圖9E)。另外,優勢族群KLRG1+CD8+ T細胞已被強調係保護免疫性的最佳效應亞組(25-27),且可能是與癌症免疫療法之療效相關的重要亞組(23,28-29)。因此,表現殺手細胞類凝集素(lectin-like)受體亞家族G成員1(KLRG1)之細胞表面表現的Ag特異性CD8+ T細胞族群表型被表徵為相關因子。如圖9F所示,四聚體特異性KLRG1+效應記憶CD8+ T細胞之百分
比在三重組合組中顯著高於對照組。綜合所述,這些結果顯現出抗GITR/抗PD-1組合加上疫苗接種可增強活體內之強效Ag特異性記憶CD8+ T細胞的擴增及功能。
鑒於三重組合療法在非荷瘤環境中所誘導之Ag特異性效應CD8+ T細胞反應的增加,下一個問題是該組合在使用免疫原性不良的B16-OVA黑色素瘤模型中是否可誘導抗腫瘤反應。將B16-OVA腫瘤細胞植入未處理過(naïve)之接受者B6小鼠世代(n=10/組)。在植入後七天,當腫瘤達到約30至40mm3之平均大小時,將小鼠隨機分組,並用圖10A概述之療法治療。無疫苗之抗體方案適度減緩腫瘤,但無法導致腫瘤清除,這可能是因為僅微弱誘導Ag特異性T細胞。類似地,單獨Vax或Vax與抗GITR或抗PD-1 mAb之組合也無法導致大於10至20%之存活。然而,在Vax/抗GITR/抗PD-1治療小鼠中的腫瘤生長顯著慢於所有其他組(圖10B至10C)。有趣的是,相較於其他組合療法或單獨疫苗,組合Vax/抗GITR/抗PD-1療法顯著增強大約50%之小鼠的腫瘤緩解及存活(圖10C至10D)。綜合所述,數據顯示抗GITR標靶化與抗PD-1阻斷之組合可與疫苗協同以增強整體存活。
為了瞭解組合療法之作用機制,在進行各種免疫療法後表
徵自腫瘤單離之CD8+效應細胞及CD4+ Treg的Ag特異性表型及功能反應。鑒於多功能效應CD8+ T細胞免疫性在抗腫瘤免疫性中的重要性(Villarreal DO等人,Cancer Res 2014;74:1789-800;Slaney CY等人,Cancer Res 2014;74:7168-7174),在腫瘤植入之後15天,測量回應於離體(ex vivo)OVA257-264 SIINFEKL肽刺激之Ag特異性CD8+ T細胞族群及其IFNγ及TNFα的表現(圖11A)。相較於所有其他組,Vax/抗GITR/抗PD-1組合療法顯著增加來自腫瘤中之效應CD8+ T細胞的IFNγ及TNFα生產(圖11A)。另外,Vax/抗GITR/抗PD-1療法顯示協同效果,如腫瘤內有較高頻率的OVA特異性IFNγ/TNFα雙陽性CD8+ T細胞所示(圖11A)。鑒於溶細胞性CD8+ CTL係防範腫瘤的關鍵組分(Villarreal DO等人,Cancer Res 2014;74:1789-800;Slaney CY等人,Cancer Res 2014;74:7168-7174)),藉由表現標記CD107a來判定細胞進行去顆粒的溶細胞潛力。結果顯示相較於對照組,自Vax/抗GITR/抗PD-1治療荷瘤小鼠所單離的CD8+腫瘤浸潤淋巴球(TIL)具有顯著較高頻率的對OVA257-264具有溶解活性之CD8+ T細胞,暗示這些T細胞具有較高的標靶腫瘤細胞之潛力(圖11B)。三重組合亦誘導較高頻率的四聚體OVA特異性CD8+ T細胞移動至腫瘤中(圖11C)。另外,當以PMA/ION刺激時,見到分泌IFNγ、TNFα及/或表現CD107a的CD8+ T細胞之頻率有類似趨勢,指示組合Vax/抗GITR/抗PD-1整體來說誘導更多功能性CD8+ T細胞反應(圖11D)。經Vax/抗GITR/抗PD-1處理且以PMA/ION刺激的TIL具有較高頻率的共表現CD107a+IFNγ+之溶細胞性CD8+ T細胞。此建立溶細胞活性之實質增加與其顯著控制及/或緩解小鼠中已建立的腫瘤之相關性。
鑒於抗GITR mAb的一種機制係減少腫瘤中之CD4+ Treg(Cohen AD等人,PloS one 2010;5:e10436;Schaer DA等人,Curr Opin Immunol 2012;24:217-224;Schaer DA等人,Immunother Cancer 2014:15:2-7)),評估組合式Vax/抗GITR/抗PD-1免疫療法對腫瘤中之這些細胞的影響。然而,在評估腫瘤中之Treg族群之前,監測非荷瘤小鼠第14天的脾臟Treg族群,所使用的是圖10之方案但在未荷瘤小鼠(naive bearing mice)中進行。相較於其他免疫治療組,在Vax/抗GITR/抗PD-1治療組中觀察到Treg的顯著降低(圖12A)。因此,基於這些結果,預期三重組合療法將導致腫瘤中之Treg降低。當監測在腫瘤植入後第15天之Treg族群時,抗GITR/抗PD-1及Vax/抗GITR/抗PD-1免疫療法皆類似且大幅地減少腫瘤中之浸潤Treg(圖12C至12D),指示在二種環境中組合抗GITR皆可減少腫瘤浸潤性Treg。相較於所有治療組,三重組合整體顯示較佳的減少腫瘤中之Treg。在大多數疫苗接種組中之Treg族群的整體減少可能是因為TME中有利的Th1反應,將TME從阻抑性偏移至發炎性(Tatsumi T等人,J Exp Med 2002;196:619-628;Fridman WH等人,Nat Rev Cancer 2012;12:298-306)。所有免疫療法除了抗GITR/抗PD1以外,皆強烈增加CD8+ T細胞浸潤至腫瘤中(圖12B),這可能是因為肽疫苗所誘導之Ag特異性CTL反應的誘導,如圖9及圖11A所示。因此,在腫瘤內之CD8/Treg比例明顯增加,其中三重組合療法在統計上優於任何其他Ab組合療法(圖12D),此反應已在黑色素瘤模型中被描述為治療療效的相關因子(Quezada SA等人,J Clin Invest 2006;116:1935-1945)。總體來說,組合Vax/抗GITR/抗PD-1在增強腫瘤反應性CTL反應、減少Treg、並驅動腫
瘤中更高的效應T細胞對Treg比例的協同效果,可代表更能夠媒介腫瘤清除的更具Ag特異性的發炎微環境。
腫瘤浸潤性CD8+ T細胞顯示針對Vax/抗GITR/抗PD-1組合療法中之免疫性肽的協同增強,指示強勢誘導強效CTL反應最可能是組合療法的療效關鍵。因此,探討效應族群在組合療法所誘導之腫瘤排斥上的相關性。在治療環境中,如圖13A所示,耗乏荷瘤小鼠中之CD8+ T細胞、CD4+ T細胞、及NK細胞。結果顯示完全耗乏CD8廢除由Vax/抗GITR/抗PD-1提供之有利效果,沒有小鼠存活超過移植後22天(圖13B)。相反地,耗乏CD4及NK細胞不影響Vax/抗GITR/抗PD-1療法之抗腫瘤活性(圖13B),指示這些細胞在所觀察到的療效中不具作用。整體來說,來自對照小鼠或單獨抗CD8及單獨抗NK1.1治療小鼠的腫瘤不具統計上的差異。根據先前研究(Fujiwara S等人,J Invest Dermatol 2014;134:1884-92),我們在單獨抗CD4治療之組中觀察到腫瘤生長延緩及觀察存活的顯著差異(p=0.0037;CD4耗乏相較於同型)(圖13B)。然而,投予aCD4(圖13B)或aCD25(圖16)加上組合Vax/抗GITR/抗PD-1療法並無額外效益,暗示該組合可獨立於幫手T細胞或耗乏調節CD4+ T細胞之外而作用。整體來說,結果顯現出CD8+ T細胞係負責延長存活及誘發腫瘤排斥的主要效應族群。
針對癌症的疫苗接種與主動免疫療法的終極目標,皆係產
製持久的記憶T細胞,其可快速回應於後續Ag暴露。為了評估記憶反應,在完成治療之後6個月無腫瘤的存活動物中,進行再激發(re-challenge)實驗。所有經Vax/抗GITR/抗PD-1治療而存活第一次腫瘤激發(tumor challenge)的小鼠皆存活6個月之後相同腫瘤的第二次腫瘤激發(圖13C),指示持久的抗腫瘤免疫性及誘導長期記憶反應。此外,當用親代B16.F10腫瘤株(其不表現OVA)再激發經Vax/抗GITR/抗PD-1治療而治癒的小鼠時,約80%的小鼠排斥再激發的腫瘤而保持無腫瘤(圖13D)。整體來說,這些數據暗示組合Vax/抗GITR/抗PD-1療法可誘導長期記憶反應以及針對腫瘤細胞所表現之其他抗原的表位擴展。
在所屬領域中的廣泛研究已顯現出CTL在腫瘤排斥中扮演重要角色,且腫瘤浸潤性效應CD8+ T細胞的數量通常與良好預後相關(Blohm,U.等人,Eur.J.Immunol. 2006;36:468-477;Boissonnas,A.等人,J.Exp.Med. 2007;204:345-356;Steer,H.J.等人,Oncogene 2010;29:6301-6313)。最近,數個研究已開始支持KLRG1+效應記憶CD8+ T細胞亞組可預測對病原體及腫瘤之治療療效的假設(Villarreal DO等人,Molecular Therapy 2015;10:1653-1662;Olson JA等人,Immunity 2013;38:1250-60;Cush SS,Flano E.J Immunol 2011;186:4051-8;Ye F等人,J Immunol 2012;189:5206-11;van Duikeren S等人,J Immunol 2012;189:3397-403;Villarreal DO等人,Cancer Res 2014;74:1789-800;Slaney CY等人,
Cancer Res 2014;74:7168-7174;Brunner SM等人,Hepatology 2015;61:1957-67)。圖9F中之非荷瘤小鼠的周邊血液KLRG1+CD8+ T細胞增加,暗示這些細胞可能是三重組合療法所誘發之完全腫瘤緩解的免疫相關因子(圖10)。因此,檢查腫瘤緩解是否與其驅動強健的腫瘤浸潤性KLRG1+效應記憶Ag特異性CD8+ T細胞反應的能力相關聯。在腫瘤植入之後十二天(在開始療法之後5天;圖10A),注意到組合Vax/抗GITR/抗PD-1療法具有最高的腫瘤中之四聚體特異性CD8+ T細胞反應增加(圖14A)。接著,基於表現標記KLRG1評估效應記憶CD8+ T細胞亞組。有趣的是,相較於所有其他組,Vax/抗GITR/抗PD-1療法導致腫瘤浸潤性KLRG1+CD8+效應細胞及KLRG1+CD8+Tet+細胞的頻率約2倍增加(圖14B至14C),推導出Ag特異性KLRG1+CD8+效應細胞可移動至腫瘤部位以誘發快速效應功能。整體來說,我們顯現出產製較高的KLRG1+CD8+效應T細胞,與在組合Vax/抗GITR/抗PD-1療法中所見之已建立的腫瘤之緩解相關。
若KLRG1+CD8+亞組族群的擴增係一種在組合Vax/抗GITR/抗PD-1療法中幫助建立較佳腫瘤生長控制/緩解的機制,則重要的是判定耗乏KLRG1+CD8+CD44+效應T細胞亞族群是否會導致喪失腫瘤生長控制。首先,判定抗KLRG1(aKLRG1)抗體耗乏目標族群的能力。為了檢查此,將二組非荷瘤小鼠用組合Vax/抗GITR/抗PD-1療法進行疫苗接種,並將一組在疫苗接種後第0、2、4、及6天用200μg之抗KLRG1 mAb(200μg)治療,且在療法啟始之後第7天監測來自血液及脾臟之CD8+ T細胞的KLRG1表現(圖17)。觀察到抗KLRG1 mAb減少CD8+ T細胞
之百分比(圖17A)並耗乏目標KLRG1+CD8+CD44+族群(圖17B至17C)。相較於未治療之KLRG1對照組,Vax/抗GITR/抗PD-1治療的抗KLRG1小鼠導致顯著降低血液及脾臟中KLRG1+CD8+CD44+及KLRG1+CD8+Tet+族群之頻率及/或絕對總數(圖17B至17C)。接下來,藉由耗乏荷瘤小鼠中之KLRG1+CD8+CD44+細胞,來評估KLRG1+CD8+CD44+族群在促進三重組合療法所誘導之腫瘤排斥上的貢獻。結果顯示KLRG1耗乏顯著減少保護,用KLRG1 Ab耗乏的小鼠相較於用組合治療但無KLRG1耗乏者顯示較快的腫瘤生長(圖14D)。更顯著的是,組合療法加上αKLRG1耗乏相較於無aKLRG1治療的組合療法,不再造成腫瘤緩解及長期存活(0%相較於40%的腫瘤排斥)。綜合所述,這些結果暗示三重組合所誘導之Ag特異性KLRG1+效應CD8+ T細胞的增加,係此黑色素瘤治療模型賴以促進腫瘤生長控制、緩解、及長期存活的機制。因此,擴增該效應CD8+ T細胞亞族群可係將來癌症免疫治療策略之主要效益。
發展有效癌症免疫療法之主要挑戰在於驅動針對免疫原性不良的腫瘤相關抗原(TAA)諸如自體抗原之強效抗腫瘤反應。圖13D之結果暗示組合Vax/抗GITR/抗PD-1治療可能誘導表位擴展至OVA以外的其他黑色素瘤TAA。因此,此引發關於組合抗GITR/抗PD-1療法是否可增強編碼自體腫瘤相關抗原之疫苗的療效之問題。選擇黑色素瘤腫瘤抗原酪
胺酸酶相關蛋白質-2(TRP-2),因為其係最充分研究的微弱免疫原性黑色素瘤腫瘤抗原之一。已顯示單一劑TRP2疫苗接種在B16黑色素瘤小鼠模型中的預防環境中具有強效抗腫瘤效果(Avogadri F等人,Cancer Immuno Res 2014;2:448-458;Pedersen SR等人,J Immunol 2013;191:3955-3967)。然而,在治療環境中的控制腫瘤上,此活性顯著減少且受限。同樣地,單獨抗GITR/抗PD-1抗體療法的療效有限(圖10)。因此,將嚴謹治療介入應用於8天腫瘤(平均腫瘤直徑約50mm3),如圖15A所示使用抗GITR/抗PD-1且併用TRP2肽疫苗免疫小鼠三次之組合療法。已建立腫瘤之組合治療顯示相較於對照組顯著阻抑腫瘤生長(圖15B),暗示治療能夠破壞對自體抗原之耐受性。更重要的是,3x TRP2/抗GITR6/抗PD-1組合療法在約20%的小鼠中導致完全且持久的緩解,而單一療法不誘發完全緩解(圖15B)。此觀察再度證實抗GITR/抗PD-1可與肽疫苗協同以放大抗腫瘤免疫性。整體來說,這些研究支持抗GITR/抗PD-1組合可係有用的免疫療法以放大針對自體及非自體腫瘤兩種抗原之疫苗誘導性反應的概念。
雖然抗CD122作為單一療法延緩腫瘤進展,但在測試條件下作為較為嚴謹的治療介入對7天腫瘤(平均腫瘤直徑約30mm3)並不具治癒性(圖18A至18B)。因此,在欲增強腫瘤特異性免疫反應量值之嘗試中,將基於肽的標靶新腫瘤抗原OVA(SIINFEKL)的癌症疫苗與抗
CD122療法組合使用。使用抗CD122及單次劑量的肽疫苗對7天已建立的腫瘤進行治療介入顯示顯著阻抑腫瘤生長,導致約10%長期存活,然而任一單一療法的效果極少至無(圖18A至18B)。分析TIL顯示,當抗CD122與疫苗組合時,G-MDSC之頻率相對於單獨各劑有顯著的減少(圖19A至19D)。此外,組合療法亦顯著增加效應CD8+ TIL之雙重IFNγ/TNFα生產且協同地增強腫瘤中之OVA四聚體特異性CD44+CD8+記憶T細胞(圖19A至19D)。在用組合疫苗與抗CD122療法治療的非荷瘤小鼠之周邊中亦注意到OVA四聚體特異性CD8+ T細胞之增加(圖20A至20C)。組合療法相對於單獨各劑明顯減少CD4+ Treg之比例(圖19D),暗示在組合組中觀察到的整體改善保護與腫瘤中(1)增加Ag特異性CD8+ T細胞反應、(2)降低G-MDSC及(3)減少CD4+ Treg族群相關聯。這些改變可導致更支持腫瘤排斥的環境。
初免-加強(prime-boost)疫苗接種策略係應用於第7、10、及14天以治療7天已建立的腫瘤,並且相較於在此治療性環境中之單一疫苗劑量顯示較高長期存活(30%)(圖21A)。鑒於CD8+CD122+ T細胞已被描述為具有記憶CD8+ T細胞性質(Li S等人,Cell Mol Immunol 2014;11:326-31;Liu J等人,Front Immunol 2015;6:494),我們檢查標靶該族群是否可能影響持久記憶T細胞之產製。二次腫瘤激發初免-加強治療後第80天存活者顯示無腫瘤生長,指示在組合療法期間發展出T細胞記憶水平並加以維持(圖21B)。
最後,鑒於在Vax/抗CD122組合及抗CD4/抗CD122組合研究中減少Treg的額外效益所帶來的改善療效,我們判定單獨抗CD122
是否可與能夠減少腫瘤中CD4+ Treg數量的免疫療法抗GITR mAb協同(Schaer DA等人,Curr Opin Immunol 2012;24:217-224)。使用抗CD122與抗GITR標靶性mAb之組合療法對4天腫瘤進行治療介入顯現出協同性,其相較於抗CD122單一療法顯示顯著阻抑腫瘤生長,並產出約40%長期存活(圖22A至22B)。這些研究進一步替與額外癌症免疫療法組合之GITR標靶性方式的設計奠定基礎。
為了識別在人類GITR胞外域上之TRGB191的結合表位,執行溶液氫/氘交換質譜術(HDX-MS)。
關於胃蛋白酶/蛋白酶XIII消化,將於133μL對照緩衝液(50mM磷酸鹽,100mM氯化鈉,pH 7.4)中的3.2μg人類GITR藉由加入135μL的4M胍鹽酸鹽、0.85M TCEP緩衝液(最終pH係2.5)並在25℃下培養該混合物3分鐘來變性。接著,將該混合物進行線上胃蛋白酶/蛋白酶XIII消化並將所生成的肽使用包含與Q ExactiveTM Hybrid Quadrupole-Orbitrap質譜儀(Thermo)偶聯的Waters Acquity UPLC的UPLC-MS系統分析。將含有人類GITR之樣本中的肽在50mm×1mm C8管柱上用19分鐘自2至28%溶劑B(0.2%於乙腈中之甲酸)之梯度分離。溶劑A係0.2%於水中之甲酸。注射閥及胃蛋白酶/蛋白酶XIII管柱及其相關連接管路係位於維持在11℃的冷卻箱內。且第二切換閥、C8管柱及其相
關連接不鏽鋼管路係位於維持在0℃的另一個急冷循環箱內。肽識別係利用Mascot透過搜尋MS/MS數據比對人類GITR序列進行。前驅物及產物離子的質量公差分別為10ppm及0.05Da。
將10μg人類GITR藉由與1μL之PNGase F在37℃下培養過夜來去醣基化。接著將樣本乾燥並將聚醣用5μL 400mM普魯卡因胺(procainamide)(在3:7比例的乙酸:DMSO(v/v)及1M氰基硼氫化鈉中製備)重構且在65℃下培養3h。為了移除多餘標記試劑,將樣本重構於90% ACN成為總共500μL之溶液。在用200μL水及200μL 90% ACN預處理HILIC-SPE盤之後,將樣本注入HILIC-SPE盤中,用200μL 90% ACN洗滌並用50μL 20% ACN洗提。在進一步分析之前,添加75μL ACN。聚醣質量係使用包含Waters ACQUITY UPLC及Bruker MicroTOF QII之UPLC-MS測量。
將8μL人類GITR(3.2μg)或8μL人類GITR與mAb混合物(3.2μg:24μg)以125μL氧化氘標記緩衝液(50mM磷酸鈉,100mM氯化鈉,pD 7.4)在25℃下培養0秒、60秒、300秒、1800秒、7200秒、及14400秒。藉由加入135μL的4M胍鹽酸鹽,0.85M TCEP緩衝液淬熄終止氫/氘交換(最終pH係2.5)。然後,將被淬熄終止反應的樣本如上述進行管柱上(on column)胃蛋白酶/蛋白酶XIII消化及LC-MS分析。在只有
MS模式(MS only mode)中記錄質譜。
使用HDX WorkBench(用於分析H/D交換MS數據的軟體)處理原始MS數據(J.Am.Soc.Mass Spectrom. 2012, 23(9),1512-1521)。使用氘化肽與其天然形式(t0)之間的平均質量差計算氘水平。
已識別肽處之氘水平係從LC-MS上的質量偏移來監測。天然人類GITR-ECD以SEQ ID NO:62之殘基28至50及70至79結合至mAb TRGB191.CLF時,顯示顯著減少氘攝入。這些當結合至mAb時氘攝入顯著減少的區域因而被指派為表位肽,其在圖23中以深或淺灰色強調。
mAb TRGB191結合至人類GITR ECD的HDX-MS測量值指示結合表位不連續且位於GITR的二個肽區域內:
區域1(SEQ ID NO:62之殘基28至50)
區域2(SEQ ID NO:62之殘基70至79)。
mAb TRGB191的結合表位係藉由將HDX數據定位在獲自GITR ECD與TRGB159 Fab複合之晶體結構的GITR 3D模型上而進一步精修。根據結構,二個肽的大的部分無法讓溶劑接近。肽的暴露部分在空間上靠近,且包括SEQ ID NO:62之殘基40至45及75至79(在圖24中強調)。
結構如下述判定。GITR:TRGB159複合體係藉由將Fab與25%莫耳過剩之GITR ECD混合於20mM Tris,pH 8.5,250mM NaCl中,並在在4℃下培養過夜來製備。在Superdex 200管柱上監測複合體的形成。藉由坐滴式(sitting drop)蒸氣擴散方法在20℃下進行複合體結晶。適用於X射線分析的晶體係自含14% PEG 3350及0.2M Na甲酸鹽之0.1M HEPES緩衝液,pH 7.5獲得。關於X射線數據收集,將一個晶體在含冷凍保護液的母液(用24%甘油增補)中浸泡幾秒鐘,並在液態氮中急速冷卻。X射線繞射數據係在Advanced Photon Source(Argonne,IL)使用Mar225偵測器收集。繞射強度偵測至2.8埃解析度並用程式XDS處理(Kabsch,W.(2010).XDS.Acta Cryst.D66,125-132.)。利用程式Phaser藉由分子置換解出結構(McCoy,A.J.,Grosse-Kunstleve,R.W.,Adams,P.D.,Winn,M.D.,Storoni,L.C.& Read,R.J.(2007).J.Appl.Cryst.40,658-674),使用來自蛋白質數據庫(Protein Data Bank)之結構5I16作為搜尋模型。當Fab被放置在單位晶胞中時,使用程式Coot在電子密度中手動建立GITR分子(Emsley,P.,Lohkamp,B.,Scott,W.G.& Cowtan,K.(2010).Acta Cryst.D66,486-501)。
FcγRIIIA基因(rs396991)之多型性導致位置158的胺基酸從纈胺酸取代改變成苯丙胺酸(V158F),其中158V同種異型展示對人類IgG1較高的親和力及增加的ADCC;此多型性偶而在文獻中被表示為
V176F(Wu J,Edberg JC,Redecha PB,Bansal V,Guyre PM,Coleman K,Salmon JE,Kimberly RP.J Clin Invest;1997;100(5):1059-70)。Cartron等人證實同型合子FcγRIIIA-158V基因型係與rituximab(一種作用機制包括腫瘤細胞之ADCC的抗體)之正面臨床反應相關聯的單一參數(Cartron G,Dacheux L,Salles G,Solal-Celigny P,Bardos P,Colombat P,Watier H.Blood;2002;99(3):754-8)。
TRGB191.CLF係製造為低海藻糖抗體且因此相較於相同mAb的「一般(regular)」海藻糖基化版本(RFV),對FcγRIIIA(存在NK細胞上之Fc受體)具有大約增強10倍之親和力(對高親和力FcγRIIIA-158V變異體及低親和力FcγRIIIA-158F變異體之KD分別為約37nM之於約370nM,及約180nM之於1,750nM)。
對FcγRIIIA有增強親和力之抗體已顯現出具有增加之ADCC活性(Strohl W,Strohl L.Therapeutic Antibody Engineering-Current and Future Advances Driving the Strongest Growth Area in the Pharmaceutical Industry.1st ed.Sawston:Woodhead Publishing;2012)。評估TRGB191.CLF對數種表現變化水平hGITR之目標細胞或細胞系的ADCC活性。舉例而言,靜止周邊T細胞表現最小水平的GITR,但當在活體外活化時,這些細胞上之GITR的表現上調。JJN-3細胞系係人類漿細胞白血病系,其相較於HuT102細胞以較為生理水平表現內源性hGITR,且更類似於在活化T細胞上及在活體外分化之Treg上所見之水平。
使用NK-92 158V/V效應細胞,在廣泛E:T細胞比例範圍下,表徵TRGB191.CLF在初代靜止或活化T細胞(見圖25)及JJN-3細
胞(見圖26)上之ADCC活性。
TRGB191.CLF在靜止的未活化CD4+ T細胞(見圖25A,左圖)及未活化CD8+ T細胞(見圖25B,左圖)上具有最小ADCC活性。在表現GITR之活化初代T細胞上,JNJ-64164711誘發強效ADCC活性,在最高E:T比例5:1下,EC50值的範圍從11ng/mL到32ng/mL;值隨著E:T比例而變化(見表9)。Bmax值亦取決於E:T細胞比例並隨著更多效應細胞存在於系統中而增加。同型對照抗體(CNTO3930)無法誘導ADCC。
JJN-3細胞先前經表徵為相較於HuT102細胞表現較低水平之GITR,且該等水平係在與活化初代T細胞及活體外產製之Treg較為可相比之範圍內(雖然高出數倍)。當使用NK-92 158V高親和力效應細胞以廣泛範圍之E:T比例測試JJN-3細胞時(見圖26),從50ng/mL到130ng/mL範圍的TRGB191.CLF誘導ADCC活性,其Bmax值非常類似該些在活化初代T細胞之ADCC測定中所獲得之值(見表9)。同型對照(CNTO3930)不具效果。
最近發表的數據及內部數據顯現出GITR係表現在存在於小鼠及人類二者腫瘤微環境內之腫瘤浸潤性淋巴球上,且最高表現水平在實質腫瘤中的CD4+ Treg上觀察到。
周邊CD4+ T細胞係經分化及擴增以變成定義為CD4+CD25+FOXP3+之功能阻抑性Treg。這些Treg相較於活化初代CD4+及CD8+ T細胞表現類似水平的GITR。TRGB191.CLF所誘導之抗體依賴性Treg細胞殺滅可相比於在JJN-3細胞所觀察到之效力(見圖27)。同型對照(CNTO3930)不具效果。
TRGB191.CLF相較於相同mAb之RFV對FcγRIIIA-158V/V及FcγRIIIA-158F/F兩者具有大約增強10倍之親和力;其對低親和力FcγRIIIA-158F/F變異體之KD值等於約180nM,大約是RFV對高親和力變異體受體之親和力的2倍(370nM)。
當使用表現不論是高親和力FcγRIIIA-158V/V或低親和力FcγRIIIA-158F/F變異體之NK-92效應細胞時,TRGB191.CLF對JJN-3細
胞之ADCC活性係可相比,其EC50值變化約2倍(分別為40.01ng/mL及87.44ng/mL)(見圖28)。
用同型對照抗體治療且腫瘤開始體積較小(約100mm3)的動物達到大約19天的中位至終點時間(MTE)。DTA-1以單一10mg/kg在第1天給藥導致2例持久完全緩解(CR)及MTE延緩至29.3天。FGK4.5(抗CD40)以2mg/kg在第1、5及9天給藥導致6例CR及可測量的MTE延緩60天。第1天單一注射10mg/kg之DTA-1加上FGK4.5(q4dx3)之組合,導致8例CR長達第40天,此時似乎有1例進展(圖29)。
用同型對照抗體治療且腫瘤開始體積較大(約230mm3)的動物達到大約10.5天的中位至終點時間(MTE)。FGK4.5以10mg/kg在第1、5及9天給藥導致1例完全反應(CR)及可測量的MTE延緩33天。第1天單一注射10mg/kg之DTA-1加上FGK4.5(q4dx3)之組合,導致4例持久CR(圖30)。
DTA-1(10mg/kg,q1,第1天)與OX86(抗OX40,10mg/kg,q4dx3從第1天開始)抗體之同步組合亦導致較佳抗腫瘤生長反應,其中從DTA-1的2例CR增加到DTA-1加上OX86之組合的5例CR。OX86作為單一劑無法抑制腫瘤進展(圖31)。
DTA-1(10mg/kg,q1,第1天)與RMP1-14(抗PD-1,10mg/kg,q4dx3)之同步組合亦比延緩療法更為有效,其中的一種療法在
第一劑之後二天給予。抗PD-1單一劑導致3例CR,抗GITR單一劑導致2例CR,且同步給予的組合抗GITR與抗PD-1療法導致8例CR。若將抗PD-1或抗GITR分別當作第一劑來順序給藥,此療效減少至4或5例CR(圖32)。
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奇霍伊,約翰(KEHOE,JOHN)
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<213> 智人(Homo sapiens)
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<211> 449
<212> PRT
<213> 智人(Homo sapiens)
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<211> 448
<212> PRT
<213> 智人(Homo sapiens)
<210> 52
<211> 449
<212> PRT
<213> 智人(Homo sapiens)
<210> 53
<211> 448
<212> PRT
<213> 智人(Homo sapiens)
<210> 54
<211> 449
<212> PRT
<213> 智人(Homo sapiens)
<210> 55
<211> 214
<212> PRT
<213> 智人(Homo sapiens)
<210> 56
<211> 214
<212> PRT
<213> 智人(Homo sapiens)
<210> 57
<211> 214
<212> PRT
<213> 智人(Homo sapiens)
<210> 58
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<213> 智人(Homo sapiens)
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<211> 136
<212> PRT
<213> 智人(Homo sapiens)
<210> 60
<211> 216
<212> PRT
<213> 智人(Homo sapiens)
<210> 61
<211> 216
<212> PRT
<213> 石蟹獼猴(Macaca fascicularis)
<210> 62
<211> 241
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<213> 智人(Homo sapiens)
<210> 63
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<212> PRT
<213> 智人(Homo sapiens)
<210> 64
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<212> PRT
<213> 智人(Homo sapiens)
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<212> PRT
<213> 智人(Homo sapiens)
<210> 66
<211> 8
<212> PRT
<213> 原雞(Gallus gallus)
Claims (27)
- 一種特異性結合至人類GITR的單離抗體或其抗原結合片段,其包含:a. 具有SEQ ID NO:1之胺基酸序列的重鏈CDR1、具有SEQ ID NO:5之胺基酸序列的重鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:12之胺基酸序列的重鏈CDR3、具有SEQ ID NO:28之胺基酸序列的輕鏈CDR1、具有SEQ ID NO:32之胺基酸序列的輕鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:35之胺基酸序列的輕鏈CDR3;b. 具有SEQ ID NO:2之胺基酸序列的重鏈CDR1、具有SEQ ID NO:5之胺基酸序列的重鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:13之胺基酸序列的重鏈CDR3、具有SEQ ID NO:29之胺基酸序列的輕鏈CDR1、具有SEQ ID NO:32之胺基酸序列的輕鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:36之胺基酸序列的輕鏈CDR3;c. 具有SEQ ID NO:1之胺基酸序列的重鏈CDR1、具有SEQ ID NO:6之胺基酸序列的重鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:14之胺基酸序列的重鏈CDR3、具有SEQ ID NO:30之胺基酸序列的輕鏈CDR1、具有SEQ ID NO:33之胺基酸序列的輕鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:37之胺基酸序列的輕鏈CDR3;d. 具有SEQ ID NO:3之胺基酸序列的重鏈CDR1、具有SEQ ID NO:7之胺基酸序列的重鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:15之胺基酸序列的重鏈CDR3、具有SEQ ID NO:28之胺基酸序列的輕鏈CDR1、具有SEQ ID NO:32之胺基酸序列的輕鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:35之胺基酸序列的輕鏈CDR3;e. 具有SEQ ID NO:3之胺基酸序列的重鏈CDR1、具有SEQ ID NO:7之胺基酸序列的重鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:16之胺基酸序列的 重鏈CDR3、具有SEQ ID NO:28之胺基酸序列的輕鏈CDR1、具有SEQ ID NO:32之胺基酸序列的輕鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:35之胺基酸序列的輕鏈CDR3;f. 具有SEQ ID NO:4之胺基酸序列的重鏈CDR1、具有SEQ ID NO:8之胺基酸序列的重鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:17之胺基酸序列的重鏈CDR3、具有SEQ ID NO:28之胺基酸序列的輕鏈CDR1、具有SEQ ID NO:32之胺基酸序列的輕鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:35之胺基酸序列的輕鏈CDR3;g. 具有SEQ ID NO:4之胺基酸序列的重鏈CDR1、具有SEQ ID NO:9之胺基酸序列的重鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:18之胺基酸序列的重鏈CDR3、具有SEQ ID NO:28之胺基酸序列的輕鏈CDR1、具有SEQ ID NO:32之胺基酸序列的輕鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:35之胺基酸序列的輕鏈CDR3;h. 具有SEQ ID NO:4之胺基酸序列的重鏈CDR1、具有SEQ ID NO:10之胺基酸序列的重鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:19之胺基酸序列的重鏈CDR3、具有SEQ ID NO:28之胺基酸序列的輕鏈CDR1、具有SEQ ID NO:32之胺基酸序列的輕鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:35之胺基酸序列的輕鏈CDR3;i. 具有SEQ ID NO:3之胺基酸序列的重鏈CDR1、具有SEQ ID NO:7之胺基酸序列的重鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:20之胺基酸序列的重鏈CDR3、具有SEQ ID NO:31之胺基酸序列的輕鏈CDR1、具有SEQ ID NO:34之胺基酸序列的輕鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:38之胺基酸序列的輕鏈CDR3;j. 具有SEQ ID NO:3之胺基酸序列的重鏈CDR1、具有SEQ ID NO:11 之胺基酸序列的重鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:21之胺基酸序列的重鏈CDR3、具有SEQ ID NO:31之胺基酸序列的輕鏈CDR1、具有SEQ ID NO:34之胺基酸序列的輕鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:38之胺基酸序列的輕鏈CDR3;k. 具有SEQ ID NO:3之胺基酸序列的重鏈CDR1、具有SEQ ID NO:7之胺基酸序列的重鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:22之胺基酸序列的重鏈CDR3、具有SEQ ID NO:28之胺基酸序列的輕鏈CDR1、具有SEQ ID NO:32之胺基酸序列的輕鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:35之胺基酸序列的輕鏈CDR3;l. 具有SEQ ID NO:3之胺基酸序列的重鏈CDR1、具有SEQ ID NO:7之胺基酸序列的重鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:23之胺基酸序列的重鏈CDR3、具有SEQ ID NO:28之胺基酸序列的輕鏈CDR1、具有SEQ ID NO:32之胺基酸序列的輕鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:35之胺基酸序列的輕鏈CDR3;m. 具有SEQ ID NO:3之胺基酸序列的重鏈CDR1、具有SEQ ID NO:7之胺基酸序列的重鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:24之胺基酸序列的重鏈CDR3、具有SEQ ID NO:28之胺基酸序列的輕鏈CDR1、具有SEQ ID NO:32之胺基酸序列的輕鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:35之胺基酸序列的輕鏈CDR3;n. 具有SEQ ID NO:3之胺基酸序列的重鏈CDR1、具有SEQ ID NO:7之胺基酸序列的重鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:25之胺基酸序列的重鏈CDR3、具有SEQ ID NO:28之胺基酸序列的輕鏈CDR1、具有SEQ ID NO:32之胺基酸序列的輕鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:35之胺基酸序列的輕鏈CDR3; o. 具有SEQ ID NO:27之胺基酸序列的重鏈CDR1、具有SEQ ID NO:5之胺基酸序列的重鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:26之胺基酸序列的重鏈CDR3、具有SEQ ID NO:28之胺基酸序列的輕鏈CDR1、具有SEQ ID NO:32之胺基酸序列的輕鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:35之胺基酸序列的輕鏈CDR3;或p. 具有SEQ ID NO:3之胺基酸序列的重鏈CDR1、具有SEQ ID NO:11之胺基酸序列的重鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:21之胺基酸序列的重鏈CDR3、具有SEQ ID NO:28之胺基酸序列的輕鏈CDR1、具有SEQ ID NO:32之胺基酸序列的輕鏈CDR2、及具有SEQ ID NO:35之胺基酸序列的輕鏈CDR3。
- 一種特異性結合至人類GITR的單離抗體或其抗原結合片段,其包含選自由SEQ ID NO:39至54、63及64所組成之群組的重鏈區。
- 如請求項2所述之抗體,其中該抗體或其抗原結合片段包含選自由SEQ ID NO:55至58所組成之群組的輕鏈區。
- 如請求項2所述之抗體,其中該抗體或其抗原結合片段包含選自由SEQ ID NO:39至54、63及64所組成之群組的重鏈區以及選自由SEQ ID NO:55至58所組成之群組的輕鏈區。
- 如請求項4所述之抗體,其中a. 該重鏈區包含SEQ ID NO:39且與包含SEQ ID NO:55之輕鏈區配對;b. 該重鏈區包含SEQ ID NO:40且與包含SEQ ID NO:56之輕鏈區配對;c. 該重鏈區包含SEQ ID NO:41且與包含SEQ ID NO:57之輕鏈區配對; d. 該重鏈區包含SEQ ID NO:42且與包含SEQ ID NO:55之輕鏈區配對;e. 該重鏈區包含SEQ ID NO:43且與包含SEQ ID NO:55之輕鏈區配對;f. 該重鏈區包含SEQ ID NO:44且與包含SEQ ID NO:55之輕鏈區配對;g. 該重鏈區包含SEQ ID NO:45且與包含SEQ ID NO:55之輕鏈區配對;h. 該重鏈區包含SEQ ID NO:46且與包含SEQ ID NO:55之輕鏈區配對;i. 該重鏈區包含SEQ ID NO:47且與包含SEQ ID NO:58之輕鏈區配對;j. 該重鏈區包含SEQ ID NO:48且與包含SEQ ID NO:58之輕鏈區配對;k. 該重鏈區包含SEQ ID NO:49且與包含SEQ ID NO:55之輕鏈區配對;l. 該重鏈區包含SEQ ID NO:50且與包含SEQ ID NO:55之輕鏈區配對;m. 該重鏈區包含SEQ ID NO:51且與包含SEQ ID NO:55之輕鏈區配對;n. 該重鏈區包含SEQ ID NO:52且與包含SEQ ID NO:55之輕鏈區配對;o. 該重鏈區包含SEQ ID NO:53且與包含SEQ ID NO:55之輕鏈區配對; p. 該重鏈區包含SEQ ID NO:54且與包含SEQ ID NO:55之輕鏈區配對;q. 該重鏈區包含SEQ ID NO:63且與包含SEQ ID NO:55之輕鏈區配對;或r. 該重鏈區包含SEQ ID NO:64且與包含SEQ ID NO:55之輕鏈區配對。
- 如請求項5所述之抗體或抗原結合片段,其中該抗體藉由與人類GITR(SEQ ID NO:62)之下列胺基酸殘基交互作用來特異性結合至GITR:c. 40至45;及d. 75至79。
- 如請求項1所述之抗體或抗原結合片段,其中該抗體或其抗原結合片段結合至具有SEQ ID NO:59之胺基酸序列的多肽。
- 如請求項1所述之抗體或抗原結合片段,其中該抗體或其抗原結合片段以至少30nM之結合親和力來特異性結合人類GITR,如使用實例9中所述之實驗設計由表面電漿共振所測得。
- 如請求項1所述之抗體或抗原結合片段,其中該抗體或抗原結合片段在NF-κB螢光素酶基因測定中誘導螢光素酶表現增加。
- 如請求項1所述之抗體或抗原結合片段,其中該抗體或抗原結合片段以小於約67ng/mL之EC50在活體外誘導ADCC。
- 如請求項1所述之抗體或抗原結合片段,其中該抗體或抗原結合片段係人類抗體或抗原結合片段。
- 如請求項1所述之抗原結合片段,其中該抗原結合片段係Fab片段、Fab2片段、或單鏈抗體。
- 如請求項1所述之抗體或抗原結合片段,其中該抗體或抗原結合片段 係重組者。
- 如請求項1所述之抗體或抗原結合片段,其中該抗體或其抗原結合片段係IgG1、IgG2、IgG3、或IgG4同型。
- 如請求項1所述之抗體或抗原結合片段,其係IgG1同型。
- 如請求項1中任一項所述之抗體或抗原結合片段,其中該抗體或其抗原結合片段特異性結合人類GITR及石蟹獼猴(cynomolgus monkey)GITR。
- 一種多核苷酸,其編碼如請求項1中任一項所述之抗體或抗原結合片段。
- 一種載體,其包含如請求項17所述之多核苷酸。
- 一種宿主細胞,其包含如請求項18所述之載體。
- 一種用於生產抗體或抗原結合片段之過程,其包含:在允許該抗體或抗原結合片段表現之條件下培養如請求項19所定義之宿主細胞,以及自該培養物回收該抗體或抗原結合分子。
- 一種緩和癌症或其他腫瘤病況的症狀之方法,該方法包含向有需要之對象投予足以緩和該對象之該癌症或其他腫瘤病況之該症狀的量之如請求項1所述之抗體或其抗原結合片段。
- 如請求項21所述之方法,其中該對象係人類。
- 如請求項21所述之方法,其進一步包含下列一或多者:a. 投予化學療法;b. 投予放射線療法;或c. 投予一或多種額外治療劑。
- 如請求項23所述之方法,其中該額外治療劑係免疫刺激劑。
- 如請求項24所述之方法,其中該免疫刺激劑係選自由PD-1抗體、 CTLA-4抗體、CD122抗體、CD40抗體、OX40抗體、及CD8 Ag特異性OVA肽疫苗所組成之群組。
- 一種醫藥組成物,其包含如請求項1所述之抗體或其抗原結合片段以及醫藥上可接受之載劑。
- 一種套組,其包含如請求項1所述之抗體或其抗原結合片段以及用於上述者之包裝。
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