TW201515650A - 遞送經脂質調配之核酸分子之劑量及方法 - Google Patents

遞送經脂質調配之核酸分子之劑量及方法 Download PDF

Info

Publication number
TW201515650A
TW201515650A TW103116159A TW103116159A TW201515650A TW 201515650 A TW201515650 A TW 201515650A TW 103116159 A TW103116159 A TW 103116159A TW 103116159 A TW103116159 A TW 103116159A TW 201515650 A TW201515650 A TW 201515650A
Authority
TW
Taiwan
Prior art keywords
dose
lipid
administered
rate
peg
Prior art date
Application number
TW103116159A
Other languages
English (en)
Inventor
皮亞 凱斯柏寇維茲
傑瑞德 高羅柏
Original Assignee
艾爾妮蘭製藥公司
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by 艾爾妮蘭製藥公司 filed Critical 艾爾妮蘭製藥公司
Publication of TW201515650A publication Critical patent/TW201515650A/zh

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/50—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
    • A61K47/51—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
    • A61K47/54—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an organic compound
    • A61K47/543—Lipids, e.g. triglycerides; Polyamines, e.g. spermine or spermidine
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/50—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
    • A61K47/51—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
    • A61K47/56—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an organic macromolecular compound, e.g. an oligomeric, polymeric or dendrimeric molecule
    • A61K47/59—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an organic macromolecular compound, e.g. an oligomeric, polymeric or dendrimeric molecule obtained otherwise than by reactions only involving carbon-to-carbon unsaturated bonds, e.g. polyureas or polyurethanes
    • A61K47/60—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an organic macromolecular compound, e.g. an oligomeric, polymeric or dendrimeric molecule obtained otherwise than by reactions only involving carbon-to-carbon unsaturated bonds, e.g. polyureas or polyurethanes the organic macromolecular compound being a polyoxyalkylene oligomer, polymer or dendrimer, e.g. PEG, PPG, PEO or polyglycerol
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K9/00—Medicinal preparations characterised by special physical form
    • A61K9/0012—Galenical forms characterised by the site of application
    • A61K9/0019—Injectable compositions; Intramuscular, intravenous, arterial, subcutaneous administration; Compositions to be administered through the skin in an invasive manner
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K9/00—Medicinal preparations characterised by special physical form
    • A61K9/10—Dispersions; Emulsions
    • A61K9/127—Liposomes
    • A61K9/1271—Non-conventional liposomes, e.g. PEGylated liposomes, liposomes coated with polymers
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K9/00—Medicinal preparations characterised by special physical form
    • A61K9/10—Dispersions; Emulsions
    • A61K9/127—Liposomes
    • A61K9/1271—Non-conventional liposomes, e.g. PEGylated liposomes, liposomes coated with polymers
    • A61K9/1272—Non-conventional liposomes, e.g. PEGylated liposomes, liposomes coated with polymers with substantial amounts of non-phosphatidyl, i.e. non-acylglycerophosphate, surfactants as bilayer-forming substances, e.g. cationic lipids
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K9/00—Medicinal preparations characterised by special physical form
    • A61K9/48—Preparations in capsules, e.g. of gelatin, of chocolate
    • A61K9/50—Microcapsules having a gas, liquid or semi-solid filling; Solid microparticles or pellets surrounded by a distinct coating layer, e.g. coated microspheres, coated drug crystals
    • A61K9/51—Nanocapsules; Nanoparticles
    • A61K9/5107—Excipients; Inactive ingredients
    • A61K9/5123—Organic compounds, e.g. fats, sugars
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K9/00—Medicinal preparations characterised by special physical form
    • A61K9/48—Preparations in capsules, e.g. of gelatin, of chocolate
    • A61K9/50—Microcapsules having a gas, liquid or semi-solid filling; Solid microparticles or pellets surrounded by a distinct coating layer, e.g. coated microspheres, coated drug crystals
    • A61K9/51—Nanocapsules; Nanoparticles
    • A61K9/5107—Excipients; Inactive ingredients
    • A61K9/513—Organic macromolecular compounds; Dendrimers
    • A61K9/5146—Organic macromolecular compounds; Dendrimers obtained otherwise than by reactions only involving carbon-to-carbon unsaturated bonds, e.g. polyethylene glycol, polyamines, polyanhydrides
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61M—DEVICES FOR INTRODUCING MEDIA INTO, OR ONTO, THE BODY; DEVICES FOR TRANSDUCING BODY MEDIA OR FOR TAKING MEDIA FROM THE BODY; DEVICES FOR PRODUCING OR ENDING SLEEP OR STUPOR
    • A61M5/00—Devices for bringing media into the body in a subcutaneous, intra-vascular or intramuscular way; Accessories therefor, e.g. filling or cleaning devices, arm-rests
    • A61M5/178—Syringes
    • A61M5/31—Details
    • A61M5/315—Pistons; Piston-rods; Guiding, blocking or restricting the movement of the rod or piston; Appliances on the rod for facilitating dosing ; Dosing mechanisms
    • A61M5/31533—Dosing mechanisms, i.e. setting a dose
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P9/00—Drugs for disorders of the cardiovascular system
    • A61P9/10—Drugs for disorders of the cardiovascular system for treating ischaemic or atherosclerotic diseases, e.g. antianginal drugs, coronary vasodilators, drugs for myocardial infarction, retinopathy, cerebrovascula insufficiency, renal arteriosclerosis
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10—Type of nucleic acid
    • C12N2310/11—Antisense
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10—Type of nucleic acid
    • C12N2310/14—Type of nucleic acid interfering N.A.
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30—Chemical structure
    • C12N2310/31—Chemical structure of the backbone
    • C12N2310/315—Phosphorothioates
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30—Chemical structure
    • C12N2310/32—Chemical structure of the sugar
    • C12N2310/321—2'-O-R Modification
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30—Chemical structure
    • C12N2310/32—Chemical structure of the sugar
    • C12N2310/322—2'-R Modification
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30—Chemical structure
    • C12N2310/33—Chemical structure of the base
    • C12N2310/335—Modified T or U
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30—Chemical structure
    • C12N2310/35—Nature of the modification
    • C12N2310/351—Conjugate
    • C12N2310/3515—Lipophilic moiety, e.g. cholesterol
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2320/00—Applications; Uses
    • C12N2320/30—Special therapeutic applications
    • C12N2320/32—Special delivery means, e.g. tissue-specific
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2320/00—Applications; Uses
    • C12N2320/30—Special therapeutic applications
    • C12N2320/35—Special therapeutic applications based on a specific dosage / administration regimen
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2320/00—Applications; Uses
    • C12N2320/50—Methods for regulating/modulating their activity
    • C12N2320/53—Methods for regulating/modulating their activity reducing unwanted side-effects

Abstract

本發明揭示向個體給藥以降低針對經脂質調配之核酸(例如RNA)分子的過敏性反應的方法、套組及裝置。

Description

遞送經脂質調配之核酸分子之劑量及方法 相關申請案之交叉參考
本申請案主張2013年5月6日提申之美國臨時申請案第61/820,036號的權益，該案之全部內容以引用的方式併入本文中。
輸注相關反應(IRR)係指個體在藥理學藥劑或生物藥劑輸注期間所經歷的任何徵象或症狀。此等反應可為急性反應，且典型地發生於投藥之後第一小時(前數小時)或第一天期間。急性輸注相關反應包括包括多種徵象及症狀，包括(但不限於)神經病學徵象及症狀(例如眩暈、頭痛、虛弱、昏厥、癲癇發作)、精神病學徵象及症狀(例如焦慮症)、心血管徵象及症狀(例如心搏過速、低血壓、心律不整、胸痛、局部缺血或梗死、心跳停止)、皮膚徵象及症狀(例如潮紅、紅疹、搔癢、蕁麻疹、血管性水腫、斑丘疹)，及胃腸道徵象及症狀。IRR之表現形式可不同，且可包括過敏性反應。
藥物過敏性往往由藥理學藥劑與免疫系統之間的相互作用引起。關於藥物過敏性反應的可鑑別風險因素包括年齡、雌性性別、併發性疾病及先前對相關藥物的過敏性。藥物過敏性反應可分類成免疫介導之過敏性反應及非免疫介導之過敏性反應。免疫介導之過敏性反應典型地與針對抗原(例如藥物)產生的特異性適應性免疫反應相關。此等反應可發生於致敏患者中，且可分類成以下類型：1型或快速IgE 介導反應；2型或抗體依賴性細胞毒性；3型或免疫複合物介導反應；及4型或遲發反應(T細胞介導反應)(回顧於「Drug Hypersensitivity Reactions：Risk Assessment and Management,Society for Toxicology Course」(2011))。非免疫介導過敏性反應係指由藥物之一些藥理學作用引發的藥物反應；此等反應可牽涉免疫系統組分。
非免疫介導過敏性反應，亦稱為假過敏性或類過敏性反應，具有往往與過敏性反應難以區別的臨床表現。此等反應咸信與補體活化以及肥大細胞及/或嗜鹼性細胞之脫粒有關，此又引起組織胺釋放及類似過敏的反應。非免疫介導過敏性反應咸信並非經由IgE及Fc ε受體活化來引發，且反應發生不需要預致敏。
因此，需要開發出減少針對藥物之過敏性反應的新穎方法及組合物。
本文揭示向個體給藥的方法、套組及裝置以減少針對經脂質調配之核酸(例如RNA，例如siRNA)分子的輸注相關反應(IRR)及/或過敏性反應(例如減少IRR或過敏性反應之發生率及/或嚴重程度)。不希望受理論束縛，申請人已發現，針對包括脂質調配物及核酸(例如RNA，例如siRNA)分子之組合物的輸注反應傾向於與IRR及/或過敏性反應有關，例如非免疫介導過敏性反應(本文中亦稱為假過敏性反應)。在一個實施例中，在預治療時段期間，投與第一劑量(或前劑量)之經脂質調配之RNA分子，此劑量對應於第二劑量或總劑量的一部分，或以第二劑量之輸注速率的一部分投與第一劑量，發現可減少或預防個體之IRR或過敏性反應。由此揭示向個體給藥以減少針對經脂質調配之核酸分子之IRR或過敏性反應的方法、套組及裝置。
因此，在一個態樣中，本發明描述一種減少個體中之針對組合物之輸注相關反應或過敏性反應或兩者的方法，該組合物包含脂質調 配物及核酸分子(例如能夠介導RNA干擾的RNA分子)。方法包括向個體投與第一劑量及第二劑量之該組合物。在某些實施例中，方法包括以下a)至h)中之一、二、三、四、五、六、七者或全部：a)該組合物以該第一劑量投與的量不超過該組合物以該第二劑量投與之量的1/X，其中X為3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、30、40或50；b)該組合物以該第一劑量投與的量不超過該組合物所投總量的1/X，其中X為2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、30、40或50；c)第一劑量投與的時段不超過第二劑量所投時段的1/X，其中X為2、3、4、5、6、7、8、9或10；d)第一劑量投與的時段不超過總劑量所投時段的1/X，其中X為2、3、4、5、6、7、8、9或10；e)該第一劑量之投與速率(例如以mg/min或mL/min計)不超過該第二劑量之投與速率或總劑量之投與速率的1/X，其中X為2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、30、40或50；f)該組合物以該第一劑量投與的量不超過每公斤體重1、2、5、10、20、30、40、50、60、70、80、90或100μg核酸，且第二劑量大於該第一劑量；g)該組合物以該第二劑量投與的量大於每公斤體重25、50、100、200、300、400、500、600、700、800、900或1000μg核酸，且第二劑量大於該第一劑量；或h)該第一與該第二劑量之投與劑量及時段經選擇應使得該個體不會發生實質性IRR及/或過敏性反應。
在一些實施例中，方法包括以下a)至h)中之一、二、三、四、五、六、七者或全部： a)該組合物以該第一劑量投與的量不超過該組合物以該第二劑量投與之量的1/X，其中X為9、10或15，例如10；b)該組合物以該第一劑量投與的量不超過該組合物所投總量的1/X，其中X為9、10或15，例如10；c)第一劑量投與的時段不超過第二劑量所投時段的1/X，其中X為2、3或4，例如3；d)第一劑量投與的時段不超過總劑量所投時段的1/X，其中X為3、4或5，例如4；e)該第一劑量之投與速率(例如以mg/min或mL/min計)不超過該第二劑量之投與速率或總劑量之投與速率的1/X，其中X為2、3或4，例如3；f)該組合物以該第一劑量投與的量不超過每公斤體重20、30或40μg，例如30μg核酸；g)該組合物以該第二劑量投與的量大於每公斤體重100、200或300μg，例如200μg核酸，且第二劑量大於該第一劑量；或h)該第一與該第二劑量之投與劑量及時段經選擇應使得該個體不會發生實質性IRR及/或過敏性反應。
在另一個態樣中，本發明描述一種在個體中降低目標基因之表現或治療與目標基因相關之病症的方法。方法包括向個體投與第一劑量及第二劑量之組合物，該組合物包含脂質調配物及核酸分子(例如能夠介導RNA干擾的RNA分子)，其中該第一與該第二劑量的投與量足以在個體中降低目標基因之表現或治療病症。在某些實施例中，方法包括以下a)至g)中之一、二、三、四、五、六者或全部：a)該組合物以該第一劑量投與的量不超過該組合物以該第二劑量投與之量的1/X，其中X為3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、30、40或50； b)該組合物以該第一劑量投與的量不超過該組合物所投總量的1/X，其中X為2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、30、40或50；c)第一劑量投與的時段不超過第二劑量所投時段的1/X，其中X為2、3、4、5、6、7、8、9或10；d)第一劑量投與的時段不超過總劑量所投時段的1/X，其中X為2、3、4、5、6、7、8、9或10；e)該第一劑量之投與速率(例如以mg/min或mL/min計)不超過該第二劑量或總劑量之投與速率的1/X，其中X為2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、30、40或50；f)該組合物以該第一劑量投與的量不超過每公斤體重1、2、5、10、20、30、40、50、60、70、80、90或100μg核酸，且該第一劑量小於該第二劑量；或g)該組合物以該第二劑量投與的量大於每公斤體重25、50、100、200、300、400、500、600、700、800、900或1000μg核酸，且該第二劑量大於該第一劑量。
在一些實施例中，方法包括以下a)至g)中之一、二、三、四、五、六者或全部：a)該組合物以該第一劑量投與的量不超過該組合物以該第二劑量投與之量的1/X，其中X為9、10或15，例如10；b)該組合物以該第一劑量投與的量不超過該組合物所投總量的1/X，其中X為9、10或15，例如10；c)第一劑量投與的時段不超過第二劑量所投時段的1/X，其中X為2、3或4，例如3；d)第一劑量投與的時段不超過總劑量所投時段的1/X，其中X為3、4或5，例如4； e)該第一劑量之投與速率(例如以mg/min或mL/min計)不超過該第二劑量之投與速率或總劑量之投與速率的1/X，其中X為2、3或4，例如3；f)該組合物以該第一劑量投與的量不超過每公斤體重20、30或40μg，例如30μg核酸，且第二劑量大於該第一劑量；或g)該組合物以該第二劑量投與的量大於每公斤體重100、200或300μg，例如200μg核酸，且第二劑量大於該第一劑量。
例示性確定第一及第二劑量及投與速率
投藥之量、劑量及速率可根據組合物之脂質含量(本文中亦稱為「脂質」量、劑量或劑量率)；或根據組合物之RNA分子含量(本文中稱為「RNA」、「iRNA」或「siRNA」量、劑量或劑量率)計算。
在一個實施例中，在微劑量方案中，對具有W(kg)之體重的個體，在第一時段T1(min)期間投與總劑量D(μg/kg)之1/X且在第二時段T2(min)期間投與相同總劑量之(X-1)/X。因此，第一劑量的投與劑量率為D/X/T1(μg/kg/min)(或W*D/X/T1(μg/min))且第二劑量的投與劑量率為D/T2-D/X/T2(μg/kg/min)(或W*(D/T2-D/X/T2)(μg/min))。在一例示性實施例中，第一及第二劑量率如下獲得：對於具有80kg體重之個體，在第一時段(例如15分鐘)期間投與總劑量之1/10作為第一劑量(例如微劑量)，隨後在第二時段(例如60分鐘)期間投與總劑量之9/10作為第二劑量。舉例而言，作為第一劑量率，在15分鐘之第一時段期間投與總siRNA劑量300μg/kg(亦即30μg/kg)之1/10，從而產生2μg/kg/min(或160μg/min)之第一劑量率(iRNA劑量率)。剩餘劑量或第二劑量((10-1)/10=9/10之300μg/kg總iRNA劑量=270μg/kg)係在60min期間投與，從而產生4.5μg/kg/min(或360μg/min)之第二劑量率。為了計算脂質劑量率，假定轉化之總脂質/siRNA比率為12.23：1(wt/wt)。在此等實施例中，第一劑量係以約24μg/kg/min(或1920 μg/min)(或以約2μg/kg/min之iRNA劑量率)在約15分鐘期間內投與，且第二劑量係以約55μg/kg/min(或4400μg/min)(或以約4.5μg/kg/min之siRNA劑量率)在約60分鐘期間內投與。
第一及第二劑量率之值可根據適用於上述準則的其他總劑量獲得。在一個實施例中，第一及第二劑量獲自以LNP調配物形式(例如如本文所述的LNP11調配物)調配而成的組合物，其投與的總劑量範圍為約0.05mg/kg至約5mg/kg(例如10、50、150及300微克/公斤)iRNA。總脂質/iRNA比率之範圍為約5至約30，例如約8至約20，或約10至約15。
對iRNA之其他劑量(例如10、50及150微克/公斤)應用相同方法，獲得第一及第二劑量率之以下值：對於10μg/kg劑量之iRNA為0.07μg/kg/min(第一iRNA劑量率)及0.15μg/kg/min(第二iRNA劑量率)；對於50μg/kg劑量之iRNA為0.33μg/kg/min(第一iRNA劑量率)及0.75μg/kg/min(第二iRNA劑量率)；對於150μg/kg劑量之iRNA為1μg/kg/min(第一iRNA劑量率)及2μg/kg/min(第二iRNA劑量率)。上述劑量率可基於個體之體重、使用本文所述計算方法換算為μg/min。
或者，或與上文例示性實施例組合，以非微劑量輸注速率之1/10(例如60min輸注速率之1/10)微給藥15min(第一劑量)，隨後以非微劑量60min輸注速率給予剩餘劑量(第二劑量)，總給藥時間視個體體重而定)。
舉例而言，在非微給藥方案中，總劑量D(μg/kg)係以劑量率R(μg/kg/min)在總時段T(min)期間投與。因此R=D/T。在相應微給藥方案中，第一劑量係以劑量率R(μg/kg/min)之1/X在第一時段T1(min)期間投與且剩餘劑量係以劑量率R在第二時段T2(min)期間投與。因此T2=T-T1/X。舉例而言，在非微給藥方案中，300μg/kg總siRNA劑量係以iRNA劑量率300/60=5μg/kg/min在60分鐘總時段期間投 與。在相應微給藥方案中，第一劑量係以5μg/kg/min iRNA劑量率之1/10=0.5μg/kg/min在第一時段15分鐘期間投與且剩餘劑量係以5μg/kg/min siRNA劑量率在第二時段60-15/10=58.5分鐘期間投與。在此例示性計算中，使用12.23(wt/wt)之總脂質/siRNA比率進行換算。在此等實施例中，第一劑量係以約6.1μg/kg/min之脂質劑量率(或以約0.5μg/kg/min之iRNA劑量率)在約15分鐘期間內投與，且第二劑量係以約61μg/kg/min之脂質劑量率(或以約5μg/kg/min之iRNA劑量率)在約60分鐘期間內投與。
第一及第二劑量率之值可根據適用於上述準則的其他總劑量獲得。在一個實施例中，第一及第二劑量獲自以LNP調配物形式(例如如本文所述的LNP11調配物)調配而成的組合物，其投與的總劑量範圍為約0.05mg/kg至約5mg/kg(例如10、50、150及300微克/公斤)iRNA。總脂質/iRNA比率之範圍為約5至約30，例如約8至約20，或約10至約15。
對iRNA之其他劑量(例如10、50及150微克/公斤)應用相同方法，獲得第一及第二劑量率之以下值：對於10μg/kg劑量之iRNA為0.017μg/kg/min(第一iRNA劑量率)及0.17μg/kg/min(第二iRNA劑量率)；對於50μg/kg劑量之iRNA為0.083μg/kg/min(第一iRNA劑量率)及0.83μg/kg/min(第二iRNA劑量率)；對於150μg/kg劑量之iRNA為0.25μg/kg/min(第一iRNA劑量率)及2.5μg/kg/min(第二iRNA劑量率)。上述劑量率可基於個體之體重、使用本文所述計算方法換算為μg/min。
作為另一實例，在非微劑量方案中，對於具有W(kg)之體重的個體，總劑量D(μg/kg)係以劑量率R(μg/min)在總時段T(min)期間投與。在相應微劑量方案中，第一劑量係以劑量率R(μg/min)之1/X在第一時段T1(min)期間投與且剩餘劑量(W*D-T1*R/X(μg))係以劑量率R在第二時段T2(min)期間投與。因此T2=W*D/R-T1/X。舉例而言，在 非微劑量方案中，對於具有80kg體重的個體，總siRNA劑量300μg/kg係以400μg/min之iRNA劑量率在60分鐘之總時段期間投與。在相應微劑量方案中，第一劑量係以iRNA劑量率400μg/min之1/10=40μg/min在第一時段15分鐘期間投與且剩餘劑量(80(kg)x 300(μg/kg)-40(μg/min)x 15(min)=23400μg)係以400μg/min之siRNA劑量率在第二時段期間23400(μg)/400(μg/min)=58.5min期間投與。使用12.23(wt/wt)之總脂質/siRNA比率進行換算。在此等實施例中，第一劑量係以約489.2μg/min之脂質劑量率(或以約40μg/min之iRNA劑量率)在約15分鐘期間內投與，且第二劑量係以約4892μg/min之脂質劑量率(或以約40μg/min之iRNA劑量率)在約60分鐘期間內投與。
第一及第二劑量率之值可根據適用於上述準則的其他總劑量獲得。在一個實施例中，第一及第二劑量獲自以LNP調配物形式(例如如本文所述的LNP11調配物)調配而成的組合物，其投與的總劑量範圍為約0.05mg/kg至約5mg/kg(例如10、50、150及300微克/公斤)iRNA。總脂質/iRNA比率之範圍為約5至約30，例如約8至約20，或約10至約15。
對iRNA之其他劑量(例如10、50及150微克/公斤)應用相同方法，對於具有80kg體重之個體獲得第一及第二劑量率之以下值：對於10μg/kg劑量之iRNA為1.3μg/min(第一iRNA劑量率)及13.3μg/min(第二iRNA劑量率)；對於50μg/kg劑量之iRNA為6.7μg/min(第一iRNA劑量率)及66.7μg/min(第二iRNA劑量率)；對於150μg/kg劑量之iRNA為20μg/min(第一iRNA劑量率)及200μg/min(第二iRNA劑量率)。
作為另一實例，在非微劑量方案中，0.30mg/kg iRNA之總劑量在60分鐘期間內以3mL/min投與。在70分鐘期間內投與的相應微劑量方案中，第一劑量係以1mL/min在15分鐘期間內投與且第二劑量係以3mL/min在55分鐘期間內投與(總劑量為180mL的0.30mg/kg iRNA)。
對於個體獲得第一及第二iRNA劑量率之以下值：1.67μg/kg/min(第一iRNA劑量率)及5μg/kg/min(第二iRNA劑量率)。對於個體獲得第一及第二脂質劑量率(脂質：siRNA比率=11.6：1)之以下值：19.4μg/kg/min(第一脂質劑量率)及58μg/kg/min(第二脂質劑量率)。
根據投藥時段，對於個體獲得第一及第二iRNA劑量之以下值：25μg/kg(第一iRNA劑量)及275μg/kg(第二iRNA劑量)。根據投藥時段，對於個體獲得第一及第二脂質劑量(脂質：siRNA比率=11.6：1)之以下值：290μg/kg(第一脂質劑量)及3190μg/kg(第二脂質劑量)。
上述劑量率及劑量可根據個體體重換算為mg/min。
對於具有70kg體重之個體獲得第一及第二iRNA劑量率之以下值：0.117mg/min(第一iRNA劑量率)及0.35mg/min(第二iRNA劑量率)。對於具有70kg體重之個體獲得第一及第二脂質劑量率(脂質：siRNA比率=11.6：1)之以下值：1.36mg/min(第一脂質劑量率)及4.06mg/min(第二脂質劑量率)。
根據投藥時段，對於具有70kg體重之個體獲得第一及第二iRNA劑量之以下值：1.75mg(第一iRNA劑量)及19.25mg(第二iRNA劑量)。根據投藥時段，對於具有70kg體重之個體獲得第一及第二脂質劑量(脂質：siRNA比率=11.6：1)之以下值：20.3mg(第一脂質劑量)及223.3mg(第二脂質劑量)。
對於iRNA之任何其他總劑量(例如0.01、0.05或0.15mg/kg)、脂質：siRNA比率(例如11.5至14.1之間)、體重及/或投藥時段(例如如本文所述)可應用相同方法。
本發明之其他特徵及實施例描述如下：
劑量
在某些實施例中，以該第一劑量投與之該組合物的量選自(且包括)該組合物之總量之約1%至約25%、約3%至約20%、約5%至約 15%、或約8%至約12%(例如約9%至10%)，或以該第二劑量投與之組合物的量。
在一個實施例中，以該第一劑量投與之脂質調配物的量選自約5μg/kg至約3000μg/kg、約50μg/kg至約2000μg/kg、約100μg/kg至約1500μg/kg、約200μg/kg至約1000μg/kg，或約300μg/kg至約500μg/kg。
或者，或與本文所述第一劑量值組合，以該第二劑量投與之脂質調配物的量選自約125μg/kg至約15000μg/kg、約500μg/kg至約10000μg/kg、約1000μg/kg至約7500μg/kg、約2000μg/kg至約5000μg/kg，或約3000μg/kg至約4000μg/kg。
在其他實施例中，該第一劑量中之核酸(例如RNA)分子的量選自約0.1μg/kg至約100μg/kg、約0.5μg/kg至約75μg/kg、約1μg/kg至約50μg/kg、約2μg/kg至約30μg/kg、約5μg/kg至約15μg/kg。
或者，或與本文所述的第一劑量值組合，該第二劑量中之RNA分子的量選自約5μg/kg至約1000μg/kg、約25μg/kg至約800μg/kg、約50μg/kg至約600μg/kg、約100μg/kg至約400μg/kg，或約200μg/kg至約300μg/kg。
在一些實施例中，該第一劑量及該第二劑量中之RNA分子的總量選自約100μg/kg至約500μg/kg，或約200μg/kg至約400μg/kg，例如約300μg/kg。
在一些實施例中，個體之體重選自約50kg至約150kg、約50kg至約104kg、約60kg至約100kg、約70kg至約90kg，例如約80kg。
應瞭解，在本文所述的方法、套組及裝置中，本文針對基於組合物、脂質調配物及/或RNA分子之第一及第二劑量提供之劑量範圍值可以任何次序組合。在某些實施例中，上文針對劑量範圍所述之任何值可與本文所述之投藥速率及投藥時段組合。
劑量率
在其他實施例中，該第一劑量之投藥速率(例如以mg/min或mL/min計)不超過該第二劑量之投藥速率或總劑量之投藥速率之1/X，其中X為3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、30、40或50。在一個實施例中，該第一劑量之投藥速率(例如以mg/min或mL/min計)選自以下一或多者：第二劑量或總劑量之投藥速率的約5%至50%、約5%至約20%、約5%至10%、約8%至45%、約10%及40%、約10%至約20%，或約10%至35%，或約20%至約40%(例如約10%至33%)。
在其他實施例中，脂質調配物以該第一劑量投藥之速率選自約0.05μg/min/kg至約50μg/min/kg、約0.1μg/min/kg至約25μg/min/kg、約1μg/min/kg至約15μg/min/kg，或約5μg/min/kg至約10μg/min/kg。在其他實施例中，脂質調配物以該第一劑量投藥之速率選自約2.5μg/min至約5000μg/min、約5μg/min至約2500μg/min、約50μg/min至約1500μg/min，或約250μg/min至約1000μg/min。
或者，或與本文針對第一劑量所述之投藥速率值組合，脂質調配物以該第二劑量投藥之速率選自約0.5μg/min/kg至約500μg/min/kg、約1μg/min/kg至約250μg/min/kg、約10μg/min/kg至約150μg/min/kg，或約50μg/min/kg至約100μg/min/kg。在其他實施例中，脂質調配物以該第二劑量投藥之速率選自約25μg/min至約50000μg/min、約50μg/min至約25000μg/min、約500μg/min至約15000μg/min，或約2500μg/min至約10000μg/min。
在其他實施例中，核酸(例如RNA)分子以該第一劑量投藥之速率選自約0.01μg/min/kg至約5μg/min/kg、約0.02μg/min/kg至約2.5μg/min/kg、約0.05μg/min/kg至約1μg/min/kg，或約0.1μg/min/kg至約0.5μg/min/kg。在其他實施例中，核酸(例如RNA)分子以該第一劑量投藥之速率選自約0.5μg/min至約600μg/min、約1μg/min至約250 μg/min、約2.5μg/min至約100μg/min，或約5μg/min至約50μg/min。
或者，或與本文針對第一劑量所述之投藥速率值組合，核酸(例如RNA)分子以該第二劑量投藥之速率選自約0.1μg/min/kg至約50μg/min/kg、約0.2μg/min/kg至約25μg/min/kg、約0.5μg/min/kg至約10μg/min/kg，或約1μg/min/kg至約5μg/min/kg。在其他實施例中，核酸(例如RNA)以該第二劑量投藥之速率選自約5μg/min至約6000μg/min、約10μg/min至約2500μg/min、約25μg/min至約1000μg/min，或約50μg/min至約500μg/min。
在其他實施例中，以該第一劑量投藥之速率選自約0.5mL/min至約2mL/min，例如約1mL/min。
或者，或與本文針對第一劑量所述之投藥速率值組合，以該第二劑量投藥之速率選自約2mL/min至約4mL/min，例如約3mL/min。
應瞭解，在本文所述的方法、套組及裝置中，本文針對基於組合物、脂質調配物及/或RNA分子之第一及第二劑量提供之投藥速率值可以任何次序組合。在某些實施例中，上文針對投藥速率所述的任何值可與本文所述之劑量範圍及投藥時段組合。
舉例而言，第一及第二投藥速率值可如下組合：i)該脂質調配物以該第一劑量投藥之速率選自約0.05μg/min/kg至約50μg/min/kg、約0.1μg/min/kg至約25μg/min/kg、約1μg/min/kg至約15μg/min/kg，或約5μg/min/kg至約10μg/min/kg；及ii)該脂質調配物以該第二劑量投藥之速率選自約0.5μg/min/kg至約500μg/min/kg、約1μg/min/kg至約250μg/min/kg、約10μg/min/kg至約150μg/min/kg，或約50μg/min/kg至約100μg/min/kg。
作為另一實例，第一及第二投藥速率值可如下組合：i)該脂質調配物以該第一劑量投藥之速率選自約2.5μg/min至約5000μg/min、約5μg/min至約2500μg/min、約50μg/min至約1500 μg/min，或約250μg/min至約1000μg/min；及ii)該脂質調配物以該第二劑量投藥之速率選自約25μg/min至約50000μg/min、約50μg/min至約25000μg/min、約500μg/min至約15000μg/min，或約2500μg/min至約10000μg/min。
作為又一實例，第一及第二投藥速率值可如下組合：i)以該第一劑量投藥之速率選自約0.5mL/min至約2mL/min，例如約1mL/min；及ii)以該第二劑量投藥之速率選自約2mL/min至約4mL/min，例如約3mL/min。
在其他實施例中，i)該脂質調配物以該第一劑量投藥之速率選自約0.05μg/min/kg至約50μg/min/kg、約0.1μg/min/kg至約25μg/min/kg、約1μg/min/kg至約15μg/min/kg，或約5μg/min/kg至約10μg/min/kg；及ii)該脂質調配物以該第二劑量投藥之速率選自約0.5μg/min/kg至約500μg/min/kg、約1μg/min/kg至約250μg/min/kg、約10μg/min/kg至約150μg/min/kg，或約50μg/min/kg至約100μg/min/kg；及其中第一劑量投與的時段不大於總劑量所投時段的1/X，其中X=2、3、4、5、6、7、8、9或10(例如X為3、4或5，例如4)。
在其他實施例中，i)該脂質調配物以該第一劑量投藥之速率選自約2.5μg/min至約5000μg/min、約5μg/min至約2500μg/min、約50μg/min至約1500μg/min，或約250μg/min至約1000μg/min；及ii)該脂質調配物以該第二劑量投藥之速率選自約25μg/min至約50000μg/min、約50μg/min至約25000μg/min、約500μg/min至約15000μg/min，或約2500μg/min至約10000μg/min。
其中第一劑量投與的時段不大於總劑量所投時段的1/X，其中X =2、3、4、5、6、7、8、9或10(例如X為3、4或5，例如4)。
在其他實施例中，第一及第二投藥速率值可如下組合：(i)核酸(例如RNA)分子以該第一劑量投藥之速率選自約0.01μg/min/kg至約5μg/min/kg、約0.02μg/min/kg至約2.5μg/min/kg、約0.05μg/min/kg至約1μg/min/kg，或約0.1μg/min/kg至約0.5μg/min/kg；及(ii)核酸(例如RNA)分子以該第二劑量投藥之速率選自約0.1μg/min/kg至約50μg/min/kg、約0.2μg/min/kg至約25μg/min/kg、約0.5μg/min/kg至約10μg/min/kg，或約1μg/min/kg至約5μg/min/kg。
在其他實施例中，第一及第二投藥速率值可如下組合：(i)核酸(例如RNA)分子以該第一劑量投藥之速率選自約0.5μg/min至約600μg/min、約1μg/min至約250μg/min、約2.5μg/min至約100μg/min，或約5μg/min至約50μg/min；及(ii)核酸(例如RNA)分子以該第二劑量投藥之速率選自約5μg/min至約6000μg/min、約10μg/min至約2500μg/min、約25μg/min至約1000μg/min，或約50μg/min至約500μg/min。
在其他實施例中，第一及第二投藥速率值可如下組合：(i)核酸(例如RNA)分子以該第一劑量投藥之速率選自約0.01μg/min/kg至約5μg/min/kg、約0.02μg/min/kg至約2.5μg/min/kg、約0.05μg/min/kg至約1μg/min/kg，或約0.1μg/min/kg至約0.5μg/min/kg；及(ii)核酸(例如RNA)分子以該第二劑量投藥之速率選自約0.1μg/min/kg至約50μg/min/kg、約0.2μg/min/kg至約25μg/min/kg、約0.5μg/min/kg至約10μg/min/kg，或約1μg/min/kg至約5μg/min/kg；及其中第一劑量投與的時段不大於總劑量所投時段的1/X，其中X =2、3、4、5、6、7、8、9或10(例如X為3、4或5，例如4)。
在其他實施例中，第一及第二投藥速率值可如下組合：(i)核酸(例如RNA)分子以該第一劑量投藥之速率選自約0.5μg/min至約600μg/min、約1μg/min至約250μg/min、約2.5μg/min至約100μg/min，或約5μg/min至約50μg/min；及(ii)核酸(例如RNA)分子以該第二劑量投藥之速率選自約5μg/min至約6000μg/min、約10μg/min至約2500μg/min、約25μg/min至約1000μg/min，或約50μg/min至約500μg/min；及其中第一劑量投與的時段不大於總劑量所投時段的1/X，其中X=2、3、4、5、6、7、8、9或10。
在其他實施例中，第一及第二投藥速率值可如下組合：i)以該第一劑量投藥之速率選自約0.5mL/min至約2mL/min，例如約1mL/min；及ii)以該第二劑量投藥之速率選自約2mL/min至約4mL/min，例如約3mL/min；及其中第一劑量投與的時段不大於總劑量所投時段的1/X，其中X=2、3、4、5、6、7、8、9或10(例如X為3、4或5，例如4)。
投藥時段
或者，或與本文所述劑量範圍及投藥速率組合，第一劑量投與的時段不大於總劑量所投時段的1/X，其中X=2、3、4、5、6、7、8、9或10。
或者，或與本文針對第一劑量所述之投藥時段組合，第二劑量投與的時段為第一劑量所投時段的至少2、3、4、5、6、7、8、9或10倍長。
在某些實施例中，第一劑量投與的時段係介於第二劑量之投藥時段的5%與50%之間、10%與45%之間、15%與40%之間、20%與35% 之間，或25%與30%之間(例如第二時段之約27%)。
在其他實施例中，第一劑量投與的時段係介於5分鐘與60分鐘之間、10分鐘與50分鐘之間、20分鐘與40分鐘之間、5分鐘與30分鐘之間，或10分鐘與20分鐘之間(例如約15分鐘)。
或者，或與本文針對第一劑量所述之投藥時段組合，第二劑量投與的時段介於30分鐘與180分鐘之間、40分鐘與120分鐘之間、45分鐘與90分鐘之間，或50分鐘與65分鐘之間(例如約55分鐘)。
在其他實施例中，第一及第二投與係依序或實質上依序達成。在一個實施例中，完成第一劑量之投與與開始第二劑量之投與之間隔時間不超過1、10、20、30、60或180分鐘。在其他實施例中，完成第一劑量之投與與開始第二劑量之投與係基本上同時的。
在某些實施例中，本文所述方法進一步包括向個體投與一或多個劑量之組合物，例如第三、第四組合物。
投藥
本文所述的劑量可藉由任何適合的投藥途徑投與，包括(但不限於)靜脈內、動脈內、皮下、腹膜內或肌內注射或輸注。在一個實施例中，第一及第二劑量之投與係靜脈內達成，例如藉由輸注(例如經由泵)達成。在實施例中，第一及第二劑量係以實質上恆定的速率投與，例如經由泵或持續或控制釋放型調配物。在其他實施例中，第一及第二劑量係以梯度或多種速率(例如兩種或兩種以上輸注速率)投與。
在一個實施例中，第一劑量之投與流量不超過該第二劑量之投與流量的1/X，其中X為2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、30、40或50。舉例而言，第一劑量之投與流量選自約0.5至1.5mL/min、約0.8至1.3mL/min，或約1至1.2mL/min(例如1mL/min或1.1mL/min)；或者，或在組合中，第二劑量之投與流量選自約2至4 mL/min、約2.5至3.7mL/min，或約3至3.5mL/min(例如3mL/min或3.3mL/min)。
在某些實施例中，總輸注體積為約100至300mL、約150至250mL、約180mL或約200mL。
亦揭示製備如本文所述之第一及第二劑量的方法。舉例而言，方法可包括改變組合物之投與速率、從而調節劑量的步驟。
在本文所提供之一態樣中，所述組合物為醫藥學上可接受之組合物，例如醫藥組合物。醫藥組合物可於無緩衝溶液(例如生理鹽水或水)中投與。在其他實施例中，醫藥組合物隨緩衝溶液一起投與。在實施例中，緩衝溶液包含乙酸鹽、檸檬酸鹽、醇溶麩蛋白、碳酸鹽或磷酸鹽，或其任何組合。在實施例中，緩衝溶液為磷酸鹽緩衝鹽水(PBS)。
在實施例中，組合物(例如醫藥組合物)係靜脈內投與。
在實施例中，組合物(例如醫藥組合物)係皮下投與。
本發明之其他特徵及實施例包括以下。
在上述方法之某些實施例中，第一劑量係以介於1.5與2μg/kg/min之間的第一核酸劑量率投與，且第二劑量係以介於4與6μg/kg/min之間的第二核酸劑量率投與；及/或第一劑量係以介於15與25μg/kg/min之間的第一脂質劑量率，且第二劑量係以介於55與75μg/kg/min之間的第二脂質劑量率投與。
在上述方法之其他實施例中，第一劑量係以介於1.5與2μg/kg/min之間的第一核酸劑量率投與，且第二劑量係以介於4與6μg/kg/min之間的第二核酸劑量率投與。
在上述方法之其他實施例中，第一脂質劑量率係介於15與25 μg/kg/min之間，且第二脂質劑量率係介於55與75μg/kg/min之間。
在上述方法之其他實施例中，投與的第一劑量介於0.5與1.5mL/min之間，且投與的第二劑量介於2.5與3.5mL/min之間。
在上述方法之其他實施例中，第一劑量係在介於10與20分鐘之間的時段內投與，且第二劑量係在介於50與60分鐘之間的時段內投與。
在上述方法之其他實施例中，第一核酸劑量係介於20與30μg/kg之間，且第二核酸劑量係介於250與300μg/kg之間。
在上述方法之其他實施例中，第一脂質劑量係介於250與400μg/kg之間，且第二脂質劑量係介於2500與4000μg/kg之間。
在上述方法之其他實施例中，第一劑量與第二劑量中之總核酸劑量係介於0.2與0.4mg/kg之間，例如0.3mg/kg。
在上述方法之其他實施例中，第一劑量與第二劑量中之總脂質劑量係介於3.0與4.5mg/kg之間。
在上述方法之其他實施例中，第一核酸劑量率係介於0.1與0.15mg/min之間，且第二核酸劑量率係介於0.3與0.4mg/min之間。
在上述方法之其他實施例中，第一脂質劑量率係介於1.0與1.5mg/min之間，且第二脂質劑量率係介於3.5與4.5mg/min之間。
在上述方法之其他實施例中，第一核酸劑量係介於1.5與2.0mg之間且第二核酸劑量係介於15與25mg之間。
在上述方法之其他實施例中，第一脂質劑量係介於15與25mg之間且第二脂質劑量係介於200與300mg之間。
在另一個態樣中，提供一種減少個體中之針對包含脂質調配物之組合物之輸注相關反應或過敏性反應或兩者的方法，該脂質調配物包含MC3及siRNA分子。方法包括向個體投與：第一劑量之該組合物；及 第二劑量之該組合物；其中該第一劑量係以介於1.5與2μg/kg/min之間的第一siRNA劑量率投與，且其中該第二劑量係以介於4與6μg/kg/min之間的第二siRNA劑量率投與；及/或其中該第一劑量係以介於15與25μg/kg/min之間的第一脂質劑量率投與，且其中該第二劑量係以介於55與75μg/kg/min之間的第二脂質劑量率投與。
在又一個態樣中，本發明提供一種在個體中降低目標基因之表現或治療與目標基因相關之病症的方法。方法包括：向該個體投與組合物之第一劑量及第二劑量，該組合物包含含有MC3及siRNA分子的脂質調配物，其中該第一與該第二劑量係以足以減少個體中目標基因之表現或治療個體之病症的量投與；且其中該第一劑量係以介於1.5與2μg/kg/min之間的第一siRNA劑量率投與，且其中該第二劑量係以介於4與6μg/kg/min之間的第二siRNA劑量率投與；及/或其中該第一劑量係以介於15與25μg/kg/min之間的第一脂質劑量率投與，且其中該第二劑量係以介於55與75μg/kg/min之間的第二脂質劑量率投與。
在上述方法之某些實施例中，第一劑量係以介於1.5與2μg/kg/min之間的第一siRNA劑量率投與，且其中該第二劑量係以介於4與6μg/kg/min之間的第二siRNA劑量率投與。
在上述方法之其他實施例中，第一脂質劑量率係介於15與25μg/kg/min之間，且第二脂質劑量率係介於55與75μg/kg/min之間。
在上述方法之其他實施例中，投與的第一劑量介於0.5與1.5mL/min之間，且投與的第二劑量介於2.5與3.5mL/min之間。
在上述方法之其他實施例中，第一劑量係介於10與20分鐘之間的時段內投與，且第二劑量係介於50與60分鐘之間的時段內投與。
在上述方法之其他實施例中，第一siRNA劑量係介於20與30μg/kg之間，且第二siRNA劑量係介於250與300μg/kg之間。
在上述方法之其他實施例中，第一脂質劑量係介於250與400μg/kg之間，且第二脂質劑量係介於2500與4000μg/kg之間。
在上述方法之其他實施例中，第一劑量與第二劑量中之總siRNA劑量係介於0.2與0.4mg/kg之間，例如0.3mg/kg。
在上述方法之其他實施例中，第一劑量與第二劑量中之總脂質劑量係介於3.0與4.5mg/kg之間。
在上述方法之其他實施例中，第一siRNA劑量率係介於0.1與0.15mg/min之間，且第二siRNA劑量率係介於0.3與0.4mg/min之間。
在上述方法之其他實施例中，第一脂質劑量率係介於1.0與1.5mg/min之間，且第二脂質劑量率係介於3.5與4.5mg/min之間。
在上述方法之其他實施例中，第一siRNA劑量係介於1.5與2.0mg之間且第二siRNA劑量係介於15與25mg之間。
在上述方法之其他實施例中，第一脂質劑量係介於15與25mg之間且第二脂質劑量係介於200與300mg之間。
在上述方法之其他實施例中，脂質調配物為LNP11調配物。
IRR、過敏性反應及生物標記偵測
當增加本文所述之組合物劑量(例如約300μg/kg之劑量)時，可能發生過敏性反應。在所增加劑量之彼等實施例中，個體可用本文所述 的方法及給藥方案治療。或者，或在組合中，個體可用類固醇、組織胺阻斷劑或乙醯胺苯酚中之一或多者預先治療。
在一些實施例中，本文所述之劑量及劑量投與時段經選擇應使得個體不會發生實質性IRR及/或過敏性反應(例如可偵測的過敏性反應)。IRR或過敏性反應可為急性反應(例如可在劑量投與期間發生或可在完成第二劑量投與後開始)。在一些實施例中，個體為人類。或者，個體可為動物(例如補體介導之過敏性反應的動物模型(例如如本文所述的豬模型))。在其他實施例中，個體罹患與本文所揭示之一或多種目標基因之表現相關的病症，或處於發展與目標基因之表現相關之病症的風險中。
在某些實施例中，本文所述的方法進一步包括在投與第一劑量、第二劑量或兩者之後評估個體之以下一或多者之存在的步驟：皮膚反應(例如蕁麻疹、紅疹、水腫、皮疹、搔癢、疹)；血液動力學變化，例如血壓變化(例如低血壓或高血壓)；呼吸道問題(例如喉痙攣、喉水腫、支氣管痙攣、呼吸困難)、疼痛(例如關節痛、背痛、腹痛或胸痛)，或過敏性之其他表現形式(例如發燒、寒顫、噁心、嘔吐或神經病變中之一或多者)。在一個實施例中，偵測步驟包括評估一或多種心血管參數。
或者，或在組合中，本文所述方法進一步包括在投與第一劑量、第二劑量或兩者之後評估個體中之補體標記之變化(例如補體活化之變化(例如選自Bb或C3ab之一或多種補體因子之變化))的步驟，其中補體生物標記含量之增加指示過敏性反應。
補體標記之變化可活體內偵測或使用活體外分析偵測。舉例而言，補體活化之變化可使用偵測補體級聯組分的分析法偵測，例如偵測以下一或多者的分析法(例如ELISA)：總補體蛋白(例如C3及C5)；補體分裂產物(例如Bb、C3a或C5a)，或末端補體補體複合物：sC5b- 9。評估補體活性之活體外分析法之其他實例包括CH50：殘餘總溶血補體活性，或AH50：殘餘溶血補體替代途徑活性。或者，可使用動物模型偵測補體活化變化。在實施例中，可自暴露於本文所述組合物的個體獲得待評估的樣品。舉例而言，樣品可為針對活體內分析而獲得的血清/血漿樣品。在其他實施例中，可利用未處理血清/血漿建立活體外補體活化之模型。
或者，或在組合中，本文所述方法進一步包括在投與第一劑量、第二劑量或兩者之後評估個體中之血栓素含量(例如血漿中之血栓素B2)之變化的步驟，其中血栓素含量之增加指示過敏性反應增強，例如急性過敏性反應增強。
或者，或在組合中，本文所述方法進一步包括在投與第一劑量、第二劑量或兩者之後評估個體中之一或多種細胞激素之變化的步驟，該等細胞激素選自干擾素-α、干擾素-γ、腫瘤壞死因子-α、介白素1β、介白素1受體拮抗劑(IL-1RA)、介白素-6、介白素-8、介白素-12、介白素-18、干擾素誘導蛋白-10、顆粒球群落刺激因子，或C反應蛋白(CRP)。在某些實施例中，IL-6、IL-8、IL-1RA或CRP含量增加指示過敏性反應增強，例如相對於參考參數而言(例如暴露於單次劑量之個體，或治療之前的個體)。
在一些實施例中，本文所述方法不引起可偵測的過敏性反應，例如根據本文所述的一或多種分析或症狀所量測。在實施例中，該方法引起過敏性反應降低，此降幅小於1%、5%、10%、25%、30%、35%或40%，例如根據本文所述的一或多種分析或症狀所量測。在某些實施例中，將本文所述的變化與參考參數(例如暴露於單次劑量的個體，或治療之前的個體)進行比較。
在一個實施例中，作為對本文揭示之第一及第二劑量方案的反應，個體顯示過敏性反應相對於參考參數(例如暴露於單次劑量的個 體，或治療之前的個體)而言降低(例如血液動力學變化減少)。
在某些實施例中，本文所述的方法引起過敏性反應降低，例如在投與類固醇(例如地塞米松(dexamethasone)或等效物)、止痛藥(例如撲熱息痛(paracetamol)或組織胺受體拮抗劑(例如H1或H2阻斷劑)時導致降低(例如部分或完全降低)。在其他實施例中，個體在任一次開始投與該第一劑量之X小時內不接受類固醇(例如地塞米松或等效物)之投與，其中X小於1小時、2小時、3小時、5小時、10小時、15小時、24小時或48小時。
脂質調配物
在一些實施例中，組合物中之脂質調配物為脂質-核酸顆粒，例如奈米顆粒。在一個實施例中，本文所述的核酸分子調配於穩定的核酸脂質顆粒(SNALP)中。在實施例中，脂質核酸顆粒的平均直徑為約50nm至約200nm，例如約50nm至約150nm、約60nm至約130nm、約70nm至約110nm，或約70nm至約90nm。在其他實施例中，脂質-核酸顆粒的平均直徑為約70至約200nm，例如約70至約150nm、約120至約200nm，或約90至約130nm。
典型地，組合物中之脂質與藥物比率(質量/質量比)(例如脂質與RNA分子比率)係在約1：1至約50：1、約1：1至約25：1、約3：1至約15：1、約4：1至約13：1、約4：1至約10：1、約5：1至約9：1、約6：1至約9：1範圍內，或為約13：1、約12：1、約11：1、約10：1、約9：1、約8：1、約7：1、約6：1、約5：1。在某些實施例中，脂質與藥物比率(質量/質量比)(例如脂質與RNA分子比率)係在約5：1至30：1、約6：1至25：1或約10：1至15：1範圍內。在其他實施例中，脂質-核酸顆粒中之核酸與脂質重量比不小於約0.1，例如大於約0.1、大於約0.2、大於約0.3或大於約0.4，例如在約0.1與約0.4之間，或在約0.2與約0.3之間。在另一個實施例中，脂質：核酸比率為至少約1：1、至少約2：1、至少約3：1、至少約 4：1、至少約5：1、至少約6：1、至少約7：1、至少約8：1、至少約10：1、至少約11：1、至少約12：1、至少約15：1或至少30：1，例如約0.5：1至約15：1、約1：1至約20：1、約3：1至約15：1、約4：1至約15：1，或約5：1至約13：1。
脂質可為陽離子型或非陽離子型脂質，或其組合。在其他實施例中，脂質調配物包含脂質-核酸顆粒，包含陽離子型脂質、非陽離子型脂質、PEG-脂質結合物。脂質調配物可進一步包括固醇，例如膽固醇。
在實施例中，陽離子型脂質包含存在於調配物中之約20mol%至約60mol%，或約40mol%總脂質。在其他實施例中，陽離子型脂質包含存在於脂質調配物中之約2wt%至約55wt%(例如約5wt%至約45wt%、約10wt%至約40wt%、約5wt%至約15wt%，或約40wt%至約50wt%)總脂質。陽離子型脂質之實例包括(但不限於)氯化N,N-二油基-N,N-二甲基銨(DODAC)、溴化N,N-二硬脂醯基-N,N-二甲基銨(DDAB)、氯化N-(1-(2,3-二油醯基氧基)丙基)-N,N,N-三甲基銨(DOTAP)、氯化N-(1-(2,3-二油基氧基)丙基)-N,N,N-三甲基銨(DOTMA)、N,N-二甲基-2,3-二油基氧基)丙胺(DODMA)、1,2-二亞麻油基氧基-N,N-二甲基胺基丙烷(DLinDMA)、1,2-二次亞麻油基氧基-N,N-二甲基胺基丙烷(DLenDMA)、1,2-二亞麻油基胺基甲醯基氧基-3-二甲基胺基丙烷(DLin-C-DAP)、1,2-二亞油氧基-3-(二甲基胺基)乙醯氧基丙烷(DLin-DAC)、1,2-二亞油氧基-3-嗎啉基丙烷(DLin-MA)、1,2-二亞油醯基-3-二甲基胺基丙烷(DLinDAP)、1,2-二亞麻油基硫基-3-二甲基胺基丙烷(DLin-S-DMA)、1-亞油醯基-2-亞麻油基氧基-3-二甲基胺基丙烷(DLin-2-DMAP)、1,2-二亞麻油基氧基-3-三甲基胺基丙烷氯化物鹽(DLin-TMA.Cl)、1,2-二亞油醯基-3-三甲基胺基丙烷氯化物鹽(DLin-TAP.Cl)、1,2-二亞麻油基氧基-3-(N-甲基哌嗪基)丙烷 (DLin-MPZ)，或3-(N,N-二亞麻油基胺基)-1,2-丙二醇(DLinAP)、3-(N,N-二油基胺基)-1,2-丙二醇(DOAP)、9-((4-(二甲基胺基)丁醯基)氧基)十七烷二酸雙(3-戊基辛基)酯、1,2-二亞麻油基側氧基-3-(2-N,N-二甲基胺基)乙氧基丙烷(DLin-EG-DMA)、1,2-二次亞麻油基氧基-N,N-二甲基胺基丙烷(DLinDMA)、2,2-二亞麻油基-4-二甲基胺基甲基-[1,3]-二氧雜環戊烷(DLin-K-DMA)或其類似物、(3aR,5s,6aS)-N,N-二甲基-2,2-二((9Z,12Z)-十八-9,12-二烯基)四氫-3aH-環戊并[d][1,3]二氧雜環戊烯-5-胺(ALN100)、4-(二甲基胺基)丁酸(6Z,9Z,28Z,31Z)-四十七-6,9,28,31-四烯-19-基酯(MC3)、1,1'-(2-(4-(2-((2-(雙(2-羥基十二烷基)胺基)乙基)(2-羥基十二烷基)胺基)乙基)哌嗪-1-基)乙基氮二基)二-十二烷-2-醇(Tech G1)，或其混合物。其他脂質描述於例如美國專利第5,976,567號、第6,858,225號及第6,825,432號中，該等專利以引用的方式併入本文中。在一個實施例中，陽離子型脂質係選自由以下組成之群：DODAC、DDAB、DOTAP、DOTMA、DOSPA、DMRIE、DOGS、DC-Chol及其組合。
在實施例中，調配物中之脂質為非陽離子型脂質，例如陰離子型脂質或中性脂質。在實施例中，若包括膽固醇，則非陽離子型脂質在存在於調配物中之總脂質中佔約5mol%至約90mol%、約10mol%或約58mol%。在其他實施例中，非陽離子型脂質在存在於脂質調配物中之總脂質中佔約37wt%至約89wt%，例如約37wt%至約75wt%，或40wt%至約70wt%。陽離子型脂質之實例包括(但不限於)二硬脂醯基磷脂醯膽鹼(DSPC)、二油醯基磷脂醯膽鹼(DOPC)、二棕櫚醯基磷脂醯膽鹼(DPPC)、二油醯基磷脂醯甘油(DOPG)、二棕櫚醯基磷脂醯甘油(DPPG)、二油醯基-磷脂醯乙醇胺(DOPE)、棕櫚醯基油醯基磷脂醯膽鹼(POPC)、棕櫚醯基油醯基磷脂醯乙醇胺(POPE)、二油醯基-磷脂醯乙醇胺4-(N-順丁烯二醯亞胺基甲基)-環己烷-1-甲酸酯 (DOPE-mal)、二棕櫚醯基磷脂醯乙醇胺(DPPE)、二肉豆蔻醯基磷酸乙醇胺(DMPE)、二硬脂醯基-磷脂醯基-乙醇胺(DSPE)、16-O-單甲基PE、16-O-二甲基PE、18-1-反式PE、1-硬脂醯基-2-油醯基-磷脂醯乙醇胺(SOPE)、膽固醇，或其混合物。在其他實施例中，非陽離子型脂質係選自由以下組成之群：DOPE、POPC、EPC、ESM、基於聚乙二醇之聚合物，及其組合。
調配物中之脂質組分例如可經結合或經修飾，以防止或減少顆粒聚集。在某些實施例中，所結合脂質在存在於調配物中之總脂質中佔約0mol%至約20mol%，例如約1%至約15%，或約2mol%。
在一個實施例中，經結合或修飾之脂質為經聚乙二醇修飾之脂質，例如經聚乙二醇修飾之神經醯胺，或經聚醯胺寡聚物修飾之脂質。在一個實施例中，PEG-脂質在存在於調配物中之總脂質中佔約1wt%至約15wt%，例如約3wt%至約12wt%，例如約10wt%。在實施例中，PEG或經PEG修飾之脂質存在於脂質調配物中的莫耳量為約0.5%至約20%，例如約0.5%至約10%、約0.5%至約5%、約1.5%、約0.5%、約1.5%、約3.5%或約5%。PEG或經PEG修飾之脂質可包含平均分子量不大於2,000Da(例如約2,000Da、約1,500Da、約1,000Da或約500Da)的PEG分子。
結合PEG之脂質可選自聚乙二醇(PEG)-脂質，包括(不限於)PEG-二醯基甘油(DAG)、PEG-二烷氧基丙基(DAA)、PEG-磷脂、PEG-神經醯胺(Cer)，或其混合物。PEG-DAA結合物可為例如PEG-二月桂基氧基丙基(Ci2)、PEG-二肉豆蔻基氧基丙基(Ci4)、PEG-二棕櫚基氧基丙基(Ci6)，或PEG-二硬脂醯氧基丙基(Ci8)。在一個實施例中，經修飾之脂質為PEG-CerC14或PEG-CerC20。在其他實施例中，脂質調配物進一步包含PEG或經PEG修飾之脂質(例如經PEG修飾之脂質選自PEG-C14至PEG-C22、PEG-Cer14至PEG-C20或PEG-DSPE中之一或多 者)。
在實施例中，脂質-核酸顆粒進一步包括膽固醇，例如為調配物中存在之總脂質的約10mol%至約60mol%、約15%至約50%，或約48mol%。
在一些實施例中，脂質調配物包含脂質-核酸顆粒，此顆粒包含包圍且囊封含有核酸(例如聚陰離子核酸)之中心區域的脂質層，其中該脂質層包含含有可質子化基團之可滴定脂質，其具有約4至約11之pKa(例如pKa為約4至約7、約4至約6，或約5至約7)。在一個實施例中，可滴定脂質為胺基脂質，例如DODAP。
在一個實施例中，在37℃在血清中培育30分鐘之後，脂質調配物中之核酸未實質上降解。
在某些實施例中，脂質調配物包含DLinDMA、MC3或C12-200。例示性脂質調配物可包括式I/MC3之陽離子型脂質(亦稱為DLin-M-C3-DMA、MC3或M-C3，其描述於例如本文中及US 8,158,601中，US 8,158,601以引用的方式併入本文中，且在本文中稱為「MC3」或「式I/MC3」)，或其醫藥學上可接受之鹽。在某些實施例中，式I/MC3之陽離子型脂質存在於脂質調配物中的莫耳量為約25%至約75%，例如約35%至約65%、約45%至約65%、約60%、約57.5%、約50%或約40%。在一個實施例中，脂質調配物進一步包含中性脂質(例如中性脂質選自DSPC、DPPC、DMPC、POPC、DOPE或SM，或其組合)。在實施例中，中性脂質存在於脂質調配物中的莫耳量為約0.5%至約15%，例如約3%至約12%、約5%至約10%、約15%、約10%或約7.5%。在實施例中，脂質調配物進一步包含固醇，例如膽固醇。固醇存在於脂質調配物中的莫耳量可為約5%至約50%，例如約15%至約45%、約20%至約40%、約40%、約38.5%、約35%或約31%。在其他實施例中，脂質調配物進一步包含PEG或經PEG修飾之脂質(例如經 PEG修飾之脂質選自PEG-C14至PEG-C22、PEG-Cer14至PEG-C20或PEG-DSPE中之一或多者)。
在一個實施例中，脂質調配物包含式I/MC3之陽離子型脂質、中性脂質、固醇及PEG或經PEG修飾之脂質。在實施例中，脂質調配物可包含：(i)以莫耳計，約25-75%之式I/MC3陽離子型脂質、約0.5-15%中性脂質、約5-50%固醇及約0.5-20% PEG或經PEG修飾之脂質；(ii)以莫耳計，約35-65%之式I/MC3陽離子型脂質、約3-12%中性脂質、約15-45%固醇及約0.5-10% PEG或經PEG修飾之脂質；(iii)以莫耳計，約45-65%之式I/MC3陽離子型脂質、約5-10%中性脂質、約25-40%固醇及約0.5-10% PEG或經PEG修飾之脂質；(iv)約40-65%之式I/MC3陽離子型脂質、約5-10%中性脂質、約25-40%固醇，及約0.5-10% PEG或經PEG修飾之脂質；(v)約50%之式I陽離子型脂質、約10%中性脂質(例如DSPC)、約38.5%固醇(例如膽固醇)，及約1.5% PEG或經PEG修飾之脂質(例如PEG-DMG)；(v)約50%之式I/MC3陽離子型脂質、約10%中性脂質、約35%固醇及約5% PEG或經PEG修飾之脂質；或(vi)約57.2%之式I/MC3陽離子型脂質、約7.1%中性脂質、約34.3%固醇及約1.4% PEG或經PEG修飾之脂質。
在一個實施例中，脂質調配物包含約50%之式I/MC3陽離子型脂質、約10%中性脂質(例如DSPC)、約38.5%固醇(例如膽固醇)，及約1.5% PEG或經PEG修飾之脂質(例如PEG-DMG)。此脂質調配物在本文中亦稱為LNP-11(參見例如表1)。
本文所述的調配物可藉由在線混合方法製備。在其他實施例中，調配物藉由擠出方法製備。
在其他實施例中，脂質調配物可進一步包含至少一種脂蛋白元 (例如ApoE、活性多晶型、同功異型物、變異體及突變體，及其片段或截斷形式)。
在其他實施例中，脂質調配物進一步包含目標脂質，例如N-乙醯基半乳糖胺。N-乙醯基半乳糖胺可包含單分支、二分支或三分支糖單元。在實施例中，目標脂質存在於調配物中的莫耳量為約0.001%至約5%，例如約0.005%至約1.5%，例如約0.005%、約0.15%、約0.3%、約0.5%、約1.5%、約2%、約2.5%、約3%、約4%或約5%。
在其他實施例中，目標脂質為選自由以下組成之群的化合物：GalNAc3-DSG(例如在US 8,158,601中稱為式II)、GalNAc3-PEG-DSG(例如在US 8,158,601中稱為式III)、(GalNAc)3-PEG-LCO(例如在US 8,158,601中稱為式IV)、葉酸酯-PEG2000-DSG(例如在US 8,158,601中稱為式VI)，及葉酸酯-PEG3400-DSG(例如在US 8,158,601中稱為式VII)。
核酸/RNA分子
在一些實施例中，組合物中之核酸分子選自：雙股RNA(dsRNA)分子、單股RNAi分子、微RNA(miRNA)、反義RNA、短髮夾RNA(shRNA)、抗miRNA寡核苷酸、mRNA、誘餌RNA、DNA、質體或適體。在一個實施例中，核酸分子為RNA分子，例如本文所述的RNA分子(例如能夠介導RNA干擾或iRNA的RNA分子)。在一個實施例中，RNA分子為雙股RNA分子。在實施例中，RNA分子包含有義股及反義股。舉例而言，RNA分子為dsRNA，其形成長度介於15個與30個鹼基對之間的雙螺旋結構。在一個實施例中，各股之間的互補區域長度為至少17個核苷酸(例如19至25個，例如19至21個核苷酸長度)。在實施例中，核酸(例如RNA)分子中之各股長度不超過30個核苷酸。
在其他實施例中，組合物中所包括之核酸(例如RNA)分子包涵具有RNA股(反義股)的dsRNA，該RNA股(反義股)具有與目標mRNA之 至少一部分實質上互補的區域，例如長度為30個核苷酸或少於30個核苷酸(通常為19-24個核苷酸)的區域。
在其他實施例中，核酸(例如RNA)分子為單股分子，例如包含反義股。
在一些實施例中，核酸(例如RNA)分子長度為19-21個核苷酸。在一些實施例中，iRNA具有19-21個核苷酸長度且存在於脂質調配物中，例如脂質奈米顆粒(LNP)調配物(例如LNP11調配物)。
在其他實施例中，核酸(例如RNA)分子長度為21-23個核苷酸。
在一些實施例中，核酸(例如RNA)分子具有約15至約25個核苷酸長度，且在其他實施例中，核酸(例如RNA)分子具有約25至約30個核苷酸長度。核酸(例如RNA)分子可使目標基因表現抑制至少10%、至少20%、至少25%、至少30%、至少35%或至少40%或大於40%，諸如藉由如本文所述的方法分析。
在其他實施例中，核酸(例如RNA)分子包含至少一種經修飾核苷酸。經修飾之核苷酸可選自以下一或多者：經2'-O-甲基修飾之核苷酸、包含5'-硫代磷酸酯基的核苷酸，及連接至膽固醇基衍生物或十二烷酸雙癸基醯胺基；或經2'-脫氧-2'-氟修飾之核苷酸、經2'-脫氧-修飾之核苷酸、鎖定核苷酸、無鹼基核苷酸、經2'-胺基-修飾之核苷酸、經2'-烷基-修飾之核苷酸、嗎啉基核苷酸、胺基磷酸酯，及包含非天然鹼基的核苷酸。
在其他實施例中，核酸(例如RNA)分子中之至少一個股包含至少2個核苷酸之3'突出物。在其他實施例中，雙股分子之一個末端為鈍化端。
在實施例中，核酸(例如RNA)分子具有與目標mRNA至少70%(例如80%、90%、95%或高於95%)一致的序列。在一個實施例中，核酸(例如RNA)分子具有與目標mRNA互補(例如完全互補或實質上互補) 的序列。
在某些實施例中，目標mRNA選自哺乳動物mRNA、植物mRNA、病原體相關mRNA、病毒性mRNA或疾病相關mRNA。目標mRNA可與疾病相關，例如腫瘤相關mRNA，或自體免疫疾病相關mRNA。
目標基因可選自：因子VII、Eg5、PCSK9、TPX2、apoB、SAA、TTR、RSV、PDGFβ基因、Erb-B基因、Src基因、CRK基因、GRB2基因、RAS基因、MEKK基因、JNK基因、RAF基因、Erk1/2基因、PCNA(p21)基因、MYB基因、JUN基因、FOS基因、BCL-2基因、HAMP、活化蛋白C基因、週期素D基因、VEGF基因、抗凝血酶3基因、胺基乙醯丙酸酯合成酶1基因、α1-抗胰蛋白酶基因、tmprss6基因、apoa1基因、apoc3基因、bc11a基因、klf基因、angptl3基因、plk基因、PKN3基因、HBV、HCV、p53基因、血管生成素基因、血管生成素樣3基因、補體組分3(C3)基因，或補體組分5(C5)基因。在某些實施例中，目標選自：Eg5、PCSK9、TTR、HAMP、VEGF基因、抗凝血酶3基因、胺基乙醯丙酸酯合成酶1基因、α1-抗胰蛋白酶基因，或tmprss6基因。
在某些實施例中，如本文所述的核酸分子靶向野生型目標RNA轉錄物變異體、突變體轉錄物或其組合。舉例而言，核酸分子可靶向目標基因之多形性變異體，諸如單核苷酸多形性(SNP)。在另一個實施例中，核酸分子靶向野生型與突變型目標基因轉錄物。在其他實施例中，核酸分子靶向目標RNA轉錄物之非編碼區，諸如轉錄物之5'或3'未轉譯區域。
套組
在另一個態樣中，本發明描述一種用於投與組合物之第一劑量及第二劑量(例如本文所述的第一及第二劑量)的套組。套組包括： 提供組合物，該組合物包含脂質調配物及核酸(例如RNA)分子，其中該第二劑量大於該第一劑量；及投藥說明書，其中指示第一劑量投與的時段不超過第二劑量所投時段的1/X，其中X為2、3、4、5、6、7、8、9或10；及該第一劑量之投與速率(例如以mg/min或mL/min計)不超過該第二劑量之投與速率的1/X，其中X為2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、30、40或50。
裝置
在另一個態樣中，本發明描述一種裝置，例如用於靜脈內投藥的裝置，包含：含有組合物(例如可以如本文所述之第一及/或第二劑量投與的組合物)的儲集器，例如袋，該組合物包含如本文所述的脂質調配物及核酸(例如RNA)分子；管路(例如導管)；用於調節組合物之投與速率的構件(例如閥)；及(視情況存在)針；其中該管路使該儲集器與該構件(例如閥)(及視情況存在之連接至該針的第二管路)連通，及其中：a)組合物以第一劑量(例如本文所述的第一劑量)投與的時段不超過第二劑量所投之時段的1/X，其中X為2、3、4、5、6、7、8、9或10；或b)該第一劑量之投與速率(例如以mg/min或mL/min計)不超過該第二劑量之投與速率的1/X，其中X為2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、30、40或50。
本文提及的所有公開案、專利申請案、專利及其他參考文獻均 以全文引用的方式併入本文中。
本發明之各種實施例詳細陳述於下文實施方式中。本發明之其他特徵、目標及優勢由實施方式及圖式及申請專利範圍將顯而易見。
圖1描繪siRNA-LNP調配物之第一單次劑量之後，豬1中之血液動力學變化(PAP、SAP及HR)。
圖2描繪siRNA-LNP調配物之第一單次劑量之後，豬3中之血液動力學變化(PAP、SAP及HR)。
圖3描繪以0.5mg/kg之劑量、以50mL體積輸注60分鐘之豬01中的血液動力學變化(PAP、SAP及HR)。
圖4描繪在兩個步驟中、以0.5mg/kg之劑量、以50mL體積輸注之豬06中的血液動力學變化(PAP、SAP及HR)：總劑量之1/10歷時15分鐘，剩餘9/10劑量另外歷時60分鐘。
圖5為條形圖，其顯示與患者之輸注相關反應(IRR)相關之劑量的百分比，該等患者依不同劑量率/方案、藉由IV輸注投與0.30mg/kg siRNA-LNP調配物之總劑量。總劑量係基於調配物中之siRNA的量。在60分鐘方案中，輸注以3mL/min之速率輸滿60分鐘。在70分鐘方案中，前15分鐘以1mL/min的速率且剩餘時間以3mL/min的速率進行輸注。
輸注相關反應(IRR)係指患者在藥理學藥劑或生物藥劑(例如藥物)輸注期間所經歷的任何徵象或症狀。此等反應可為急性反應，且典型地發生於投藥之後第一小時(前數小時)或第一天期間。急性輸注相關反應包括包括多種徵象及症狀，包括(但不限於)神經病學徵象及症狀(例如眩暈、頭痛、虛弱、昏厥、癲癇發作)、精神病學徵象及症狀(例如焦慮症)、心血管徵象及症狀(例如心搏過速、低血壓、心律不 整、胸痛、局部缺血或梗死、心跳停止)、皮膚徵象及症狀(例如潮紅、紅疹、搔癢、蕁麻疹、血管性水腫、斑丘疹)，及胃腸道徵象及症狀。IRR之表現形式可不同，且可包括藥物過敏性反應(回顧於例如Kang,S.P.及Saif,M.S.(2007)The Journal of Supportive Oncology,Vol.5(9)：451-457)。
過敏性反應可分類成免疫介導之過敏性反應及非免疫介導之過敏性反應。免疫介導之過敏性反應係指針對抗原(例如藥物)產生的特異性適應性免疫反應。非免疫介導過敏性反應係指由藥物之一些藥理學作用引發的藥物反應；此等反應可牽涉免疫系統組分。非免疫介導過敏性反應，亦稱為假過敏性或類過敏性反應，具有往往與過敏性反應難以區別的臨床表現。此等反應咸信與補體活化以及肥大細胞及/或嗜鹼性細胞之脫粒有關，此引起組織胺釋放及類似過敏的反應。非免疫介導之過敏性反應可經由藥理學作用直接地或經由抗體依賴性細胞介導之細胞毒性(ADCC)間接地牽涉細胞激素釋放症候群。Id。
不希望受理論束縛，申請人已發現，針對包括脂質調配物及RNA分子之組合物的輸注反應似乎與IRR或過敏性反應相關。舉例而言，在經類固醇、H1/H2阻斷劑及乙醯胺苯酚預先治療的人類個體中，0.1至1.25mg/kg siRNAs之劑量範圍已顯示可活化約15%患者中的過敏性反應。此等劑量範圍典型地在預定時段(例如60分鐘)期間以連續的單次劑量投與。IRR或過敏性反應之發生率與脂質劑量率(例如具有約13mg/min之臨限值)相關。此等IRR或過敏性反應已藉由劑量之再投與而減少。功效改良之經修飾脂質-核酸顆粒(例如LNP-11調配顆粒)使劑量範圍降低至0.01-0.5mg/kg siRNA，限制條件為輸注時段為60分鐘。接受經修飾之脂質-核酸顆粒之個體的約8mg/min脂質劑量率與過敏性反應相關。一個體在較高劑量(例如0.5mg/kg)下顯示過敏性反應，藉由減慢輸注速率，個體能夠完成劑量。
在一個實施例中，已發現在預治療時段期間，投與第一劑量(或前劑量)之經脂質調配之RNA分子，此劑量對應於第二劑量或總劑量的一部分，或以第二劑量之輸注速率的一部分投與第一劑量，發現可減少或預防個體之IRR或過敏性反應。因此，揭示向個體給藥以減少針對經脂質調配之RNA分子之IRR或過敏性反應的方法、套組及裝置。
術語「輸注相關反應」或「IRR」係指個體(例如患者)在藥理學或生物學藥劑(例如藥物)輸注期間所經歷的任何跡象或症狀。此等反應可為急性反應，且典型地發生於投藥之後第一小時(前數小時)或第一天期間。IRR可包括(但不限於)本文所述的過敏性反應。
如本文所用，術語「過敏性反應」包涵與投與藥劑(例如本文所述的RNA分子或iRNA)相關的任何不利事件(例如免疫介導及非免疫介導)，不論病因學。在一個實施例中，過敏性反應為非免疫介導之過敏性反應或假過敏性反應。與過敏性反應(免疫與非免疫反應)相關的症狀包括(但不限於)潮紅、各種類型之皮疹(例如蕁麻疹、紅疹、水腫、皮疹、搔癢、疹)；血液動力學變化，例如血壓(例如低血壓或高血壓)及/或心率之變化；呼吸道問題(例如喉痙攣、喉水腫、支氣管痙攣、氣喘或胸部不適)；疼痛(例如關節疼痛、背痛、腹痛或胸痛)；或過敏性之其他表現形式(例如發燒、寒顫、噁心、胃腸道失調(例如嘔吐)、低氧、神經病變或心跳停止或休克中之一或多者。
定義
為方便起見，下文提供說明書、實例及隨附申請專利範圍中所用之某些術語及片語的含義。若本說明書其他部分中術語之用法與本章節中所提供之其定義之間存在明顯差異，則應以本章節中之定義為準。
「G」、「C」、「A」、「T」及「U」通常各代表分別含有鳥嘌呤、 胞嘧啶、腺嘌呤、胸苷及尿嘧啶作為鹼基的核苷酸。然而，應瞭解術語「核糖核苷酸」或「核苷酸」亦可指如下文進一步詳述之經修飾核苷酸，或替代置換部分。熟習此項技術者非常瞭解，鳥嘌呤、胞嘧啶、腺嘌呤及尿嘧啶可經其他部分置換而不會實質上改變包含具有此置換部分之核苷酸之寡核苷酸的鹼基配對特性。舉例而言(不受限制)，包含肌苷作為其鹼基的核苷酸可與含有腺嘌呤、胞嘧啶或尿嘧啶的核苷酸進行鹼基配對。因此，在本發明所述之dsRNA之核苷酸序列中，含有尿嘧啶、鳥嘌呤或腺嘌呤的核苷酸可經含有例如肌苷的核苷酸置換。在另一實例中，寡核苷酸中任一處之腺嘌呤及胞嘧啶可分別經鳥嘌呤及尿嘧啶置換，以與目標mRNA形成G-U搖擺鹼基對。含有此等置換部分的序列適合於本發明所述的組合物及方法。
如本文所用，術語「iRNA」、「RNAi」、「iRNA劑」或「RNAi劑」係指一種藥劑，其含有RNA(該術語定義於本文中)且介導RNA轉錄物之靶向分裂，例如經由RNA誘導之靜默複合物(RISC)路徑。在一個實施例中，如本文所述的iRNA達成TTR表現之抑制。目標基因表現之抑制可根據目標基因mRNA含量之減少或目標基因蛋白含量之減少來評估。如本文所用，「目標序列」係指在目標基因轉錄期間所形成之mRNA分子之核苷酸序列的鄰接部分，包括作為主要轉錄產物之RNA加工產物的mRNA。序列之目標部分至少長足以作為受質用於iRNA導引之位於或靠近該部分的分裂。舉例而言，目標序列通常具有9-36個核苷酸長度，例如15-30個核苷酸長度，包括其間所有子範圍。作為非限制性實例，目標序列可為15-30核苷酸、15-26核苷酸、15-23核苷酸、15-22核苷酸、15-21核苷酸、15-20核苷酸、15-19核苷酸、15-18核苷酸、15-17核苷酸、18-30核苷酸、18-26核苷酸、18-23核苷酸、18-22核苷酸、18-21核苷酸、18-20核苷酸、19-30核苷酸、19-26核苷酸、19-23核苷酸、19-22核苷酸、19-21核苷酸、19-20核苷 酸、20-30核苷酸、20-26核苷酸、20-25核苷酸、20-24核苷酸、20-23核苷酸、20-22核苷酸、20-21核苷酸、21-30核苷酸、21-26核苷酸、21-25核苷酸、21-24核苷酸、21-23核苷酸或21-22核苷酸。
如本文所用，術語「包含序列之股」係指包含核苷酸鏈的寡核苷酸，該核苷酸鏈係利用標準核苷酸命名法、依據所提及之序列加以描述。
如本文所用，且除非另外說明，否則術語「互補」當用於相對於第二核苷酸序列描述第一核苷酸序列時，係指包含第一核苷酸序列之寡核苷酸或聚核苷酸能夠在一定條件下與包含第二核苷酸序列之寡核苷酸或聚核苷酸雜交且形成雙螺旋結構，如熟習此項技術者所瞭解。此等條件可為例如嚴格條件，其中嚴格條件可包括：400mM NaCl、40mM PIPES pH 6.4、1mM EDTA，50℃或70℃歷時12-16小時，隨後洗滌。可應用如生物體內可能遇到的其他條件，諸如生理學有關條件。熟習此項技術者能夠根據雜交核苷酸之最終應用而確定最適於測試兩個序列之互補性的一組條件。
iRNA內(例如如本文所述的dsRNA內)的互補序列包括包含第一核苷酸序列之寡核苷酸或聚核苷酸與包含第二核苷酸序列之寡核苷酸或聚核苷酸在一或兩個核苷酸序列之全長上的鹼基配對。此等序列在本文中可稱為彼此「完全互補」。然而，在本文中稱第一序列相對於第二序列「實質上互補」的情況下，兩個序列可完全互補，或其在至多30個鹼基對之雙螺旋體雜交時可形成一或多個、但通常不超過5、4、3或2個錯配鹼基對，同時保留在與其最終應用最相關之條件下雜交的能力，例如經由RISC路徑抑制基因表現。然而，在兩個寡核苷酸經設計可在雜交時形成一或多個單股突出物的情況下，就確定互補性而言，不應認為此等突出物是錯配。舉例而言，包含21個核苷酸長度之一個寡核苷酸及23個核苷酸長度之另一個寡核苷酸的dsRNA(其中較 長寡核苷酸包含與較短寡核苷酸完全互補的21個核苷酸序列)仍然可稱為「完全互補」，用於本文所述之目的。
只要滿足關於其雜交能力之要求，則如本文所用的「互補」序列亦可包括或完全由非沃森-克里科鹼基對(non-Watson-Crick base pairs)及/或由非天然及經修飾核苷酸所形成之鹼基對形成。此等非沃森-克里科鹼基對包括(但不限於)G：U搖擺鹼基對或胡斯坦鹼基對(Hoogstein base pairing)。
本文中術語「互補」、「完全互補」及「實質上互補」可用於dsRNA之有義股與反義股之間的鹼基匹配，或iRNA劑之反義股與目標序列之間的鹼基匹配，如根據其使用背景所瞭解。
如本文所用，與信使RNA(mRNA)之「至少一部分實質上互補」的聚核苷酸係指與所關注之mRNA(例如編碼目標基因蛋白的mRNA)之鄰接部分實質上互補的聚核苷酸。舉例而言，若序列與編碼目標基因之mRNA之非間斷部分實質上互補，則聚核苷酸與目標基因mRNA之至少一部分互補。作為另一實例，若序列與編碼目標基因之mRNA之非間斷部分實質上互補，則聚核苷酸與目標基因mRNA之至少一部分互補。
如本文所用，術語「雙股RNA」或「dsRNA」係指iRNA，包括具有雜交雙螺旋區域的RNA分子或分子複合物，該雜交雙螺旋區域包含兩條逆平行且實質上互補的核酸股，相對於目標RNA而言，稱為具有「有義」與「反義」取向。雙螺旋區域可具有允許所要目標RNA經由例如RISC路徑發生特異性降解的任何長度，但長度範圍典型地為9至36個鹼基對，例如15-30個鹼基對。考慮9個與36個鹼基對之間的雙螺旋，該雙螺旋可具有例如9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35或36之範圍及其間任何子範圍內之任何長度，包括(但不 限於)15-30個鹼基對、15-26個鹼基對、15-23個鹼基對、15-22個鹼基對、15-21個鹼基對、15-20個鹼基對、15-19個鹼基對、15-18個鹼基對、15-17個鹼基對、18-30個鹼基對、18-26個鹼基對、18-23個鹼基對、18-22個鹼基對、18-21個鹼基對、18-20個鹼基對、19-30個鹼基對、19-26個鹼基對、19-23個鹼基對、19-22個鹼基對、19-21個鹼基對、19-20個鹼基對、20-30個鹼基對、20-26個鹼基對、20-25個鹼基對、20-24個鹼基對、20-23個鹼基對、20-22個鹼基對、20-21個鹼基對、21-30個鹼基對、21-26個鹼基對、21-25個鹼基對、21-24個鹼基對、21-23個鹼基對或21-22個鹼基對。細胞中經Dicer及類似酶加工而產生的dsRNAs通常在19-22個鹼基對長度的範圍內。dsDNA之雙螺旋區域中之一個股包含與目標RNA之區域實質上互補的序列。形成雙螺旋結構的兩個股可來自具有至少一個自補區域的單一RNA分子，或可由兩個或兩個以上各別RNA分子形成。在雙螺旋區域由單一分子之兩個股形成的情況下，該分子可具有在一個股之3'端與相應另一股之5'端之間經核苷酸之單股鏈(本文中稱為「髮夾環」)分隔的雙螺旋區域。髮夾環可包含至少一個不成對核苷酸；在一些實施例中，髮夾環可包含至少3個、至少4個、至少5個、至少6個、至少7個、至少8個、至少9個、至少10個、至少20個、至少23個或超過23個不成對核苷酸。在各別RNA分子包含dsRNA之兩條實質上互補股的情況下，彼等分子不必定、但可經共價連接。在兩條股藉由除髮夾環之外之方式共價連接的情況下，連接結構稱為「連接子」。術語「siRNA」在本文中亦用於指如上文所述的dsRNA。
在另一個實施例中，iRNA劑可為引入細胞或生物體內以抑制目標mRNA的「單股siRNA」。單股RNAi劑結合至RISC核酸內切酶Argonaute 2，其接著使目標mRNA分裂。單股siRNA通常為15-30個核苷酸且經化學修飾。單股siRNA之設計及測試描述於美國專利第 8,101,348號中及Lima等人，(2012)Cell 150：883-894中，該等各文獻之全部內容以引用的方式併入本文中。本文所述的任何反義核苷酸序列(例如表2、3、6、7、8、9、14、15、18及20中所提供之序列)可用作如本文所述的單股siRNA或藉由Lima等人，(2012)Cell 150；：883-894中所述之方法進行化學修飾。
在另一個態樣中，RNA劑為「單股反義RNA分子」。單股反義RNA分子與目標mRNA內之序列互補。單股反義RNA分子可藉由與mRNA鹼基配對及物理上阻礙轉譯機器、以化學計量方式抑制轉譯，參見Dias,N.等人，(2002)Mol Cancer Ther 1：347-355。或者，單股反義分子藉由與目標雜交且經由RNaseH分裂事件使目標分裂來抑制目標mRNA。單股反義RNA分子可具有約10至約30個核苷酸長度且具有與目標序列互補的序列。舉例而言，單股反義RNA分子可包含來自本文所述任一種反義核苷酸序列之至少約10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20或超過20個鄰接核苷酸的序列，例如表2、3、6、7、8、9、14、15、18及20之任一表中所提供的序列。
熟習此項技術者將認識到，術語「RNA分子」或「核糖核酸分子」不僅包涵如自然界中所表現或發現的RNA分子，而且包涵包含一或多種如本文所述或如此項技術中已知之核糖核苷酸/核苷類似物或衍生物的RNA類似物及衍生物。嚴格而言，「核糖核苷」包括核苷鹼基及核糖，且「核糖核苷酸」為具有一、兩或三個磷酸酯部分的核糖核苷。然而，術語「核糖核苷」及「核糖核苷酸」如本文所用可視為等效物。RNA可在核鹼基結構中或在核糖-磷酸酯主鏈結構中加以修飾，例如如下文所述。然而，包含核糖核苷類似物或衍生物的分子必須保留形成雙螺旋的能力。作為非限制性實例，RNA分子亦可包括至少一個經修飾核糖核苷，包括(但不限於)2'-O-甲基修飾之核苷、包含5'硫代磷酸酯基之核苷、連接至膽固醇基衍生物或十二烷酸雙癸基醯 胺基之末端核苷、鎖定核苷、無鹼基核苷、2'-脫氧-2'-氟修飾之核苷、2'-胺基-修飾之核苷、2'-烷基-修飾之核苷、嗎啉基核苷、包含胺基磷酸酯或非天然鹼基之核苷，或其任何組合。或者，在dsRNA分子之至多整個長度上，RNA分子可包含至少2個、至少3個、至少4個、至少5個、至少6個、至少7個、至少8個、至少9個、至少10個、至少15個、至少20個或超過20個經修飾核糖核苷。RNA分子中之此等複數個經修飾核糖核苷中之每一者的修飾不必相同。在一個實施例中，預期用於本文所述之方法及組合物中的經修飾RNA為能夠形成所需雙螺旋結構且允許或介導目標RNA之特異性降解(例如經由RISC路徑)的肽核酸(PNA)。
在一個態樣中，經修飾之核糖核苷包括脫氧核糖核苷。在此情況下，iRNA劑可包含一或多個脫氧核苷，包括例如脫氧核苷突出物，或位於dsRNA之雙股部分內的一或多個脫氧核苷。然而，不證自明的是，術語「iRNA」在任何情況下均不包涵雙股DNA分子。
在一個態樣中，RNA干擾劑包括與目標RNA序列相互作用以導引目標RNA分裂的單股RNA。不希望受理論束縛，引入細胞內的長雙股RNA藉由稱為Dicer的III型核酸內切酶分解為siRNA(Sharp等人，Genes Dev.2001,15：485)。Dicer(核糖核酸酶-III樣酶)將dsRNA加工成19-23個鹼基對的干擾性短RNA，其特徵為兩個鹼基3'突出物(Bernstein等人，(2001)Nature 409：363)。接著將siRNA併入RNA誘導之靜默複合物(RISC)中，其中一或多個螺旋酶使siRNA雙螺旋展開，從而能夠使互補性反義股導引目標識別(Nykanen等人，(2001)Cell 107：309)。結合至適當目標mRNA時，RISC內之一或多種核酸內切酶使目標分裂以誘導靜默(Elbashir等人，(2001)Genes Dev.15：188)。因此，在一個態樣中，本發明係關於一種單股RNA，其促進RISC複合物形成以實現目標基因之靜默。
如本文所用，術語「核苷酸突出物」係指自iRNA(例如dsRNA)之雙螺旋結構突出的至少一個不成對核苷酸。舉例而言，當dsRNA之一個股的3'端延長超過另一股之5'端時(或反之亦然)，存在核苷酸突出物。A dsRNA可包含至少一個核苷酸之突出物；或者，突出物可包含至少兩個核苷酸、至少三個核苷酸、至少四個核苷酸、至少五個核苷酸或超過五個核苷酸。核苷酸突出物可包含或由核苷酸/核苷類似物組成，包括脫氧核苷酸/核苷。突出物可位於有義股、反義股或其任何組合上。此外，突出物之核苷酸可存在於dsRNA之反義或有義股的5'端、3'端或兩端。
在一個實施例中，dsRNA之反義股在3'端及/或5'端具有1至10個核苷酸突出物。在一個實施例中，dsRNA之有義股在3'端及/或5'端具有1至10個核苷酸突出物。在另一個實施例中，突出物中之一或多個核苷酸經核苷硫代磷酸酯置換。
如本文關於dsRNA所用的術語「鈍頭」或「鈍端」意謂dsRNA之指定末端不存在不成對核苷酸或核苷酸類似物，亦即無核苷酸突出物。dsRNA之一或兩端可為鈍頭的。在dsRNA之兩端為鈍頭的情況下，稱dsRNA為鈍端。為清楚起見，「鈍端」dsRNA為兩端為鈍頭的dsRNA，亦即在分子之任一端無核苷酸突出物。此分子在其整個長度上.通常為雙股分子。
術語「反義股」或「導引股」係指iRNA之股，例如dsRNA，包括與目標序列實質上互補的區域。如本文所用，術語「互補區」係指反義股上之與如本文定義的序列(例如目標序列)實質上互補的區域。在互補區與目標序列不完全互補的情況下，錯配可位於分子之內部或末端區域。一般而言，最能容忍的錯配位於末端區域，例如位於5'及/或3'末端之5、4、3或2個核苷酸內。
如本文所用，術語「有義股」或「隨從股」係指iRNA之股，該 股包括與反義股(該術語定義於本文中)之區域實質上互補的區域。
如本文所用，術語「SNALP」係指穩定的核酸-脂質顆粒。SNALP表示包覆減小之水性內部的脂質微脂粒，該水性內部包含核酸，諸如iRNA，或轉錄iRNA之質體。SNALP描述於例如美國專利申請公開案第20060240093號、第20070135372號及國際申請案第WO 2009082817號中。此等申請案以全文引用的方式併入本文中。
提及iRNA時，「引入細胞內」意謂促進或達成攝入或吸收至細胞內，如熟習此項技術者所瞭解。iRNA之吸收或攝入可經由獨立的擴散或活性細胞過程，或藉由助劑或裝置發生。此術語之含義不限於活體外細胞；iRNA亦可「引入細胞」內，其中細胞為活生物體之一部分。在此情況下，引入細胞內包括遞送至生物體中。舉例而言，對於活體內遞送而言，可將iRNA注入組織部位中或全身性投與。活體內遞送亦可藉由β-葡聚糖遞送系統達成，諸如美國專利第5,032,401號及第5,607,677號以及美國公開案第2005/0281781號中所述的彼等遞送系統，該等案以全文引用的方式併入本文中。活體外引入細胞內包括此項技術中已知的方法，諸如電穿孔及脂質轉染。其他方法描述於下文中或已知於此項技術中。
如本文所用，術語「調節表現」係指，與對照細胞表現目標基因相比，至少部分地「抑制」或部分地「活化」經如本文所述之iRNA組合物處理之細胞表現目標基因。對照細胞包括未經處理的細胞，或經非靶向對照iRNA處理的細胞。
術語「活化」、「增強」、「上調表現」、「增強表現」及其類似術語，就其關於目標基因而言，在本文中係指至少部分地活化目標基因表現，如根據目標基因mRNA之量增加所表明，該目標基因mRNA可自目標基因已轉錄的第一細胞或細胞群分離或偵測到，該第一細胞或細胞群已經處理，以使得與實質上與第一細胞或細胞群相同、但尚未 經如此處理的第二細胞或細胞群(對照細胞)相比，目標基因之表現增強。
在一個實施例中，投與如本文所述之iRNA使目標基因表現活化至少約10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%或50%。在一些實施例中，投與本發明所述之iRNA使目標基因活化至少約60%、70%或80%。在一些實施例中，投與如本文所述的iRNA使目標基因表現活化至少約85%、90%或95%或超過95%。在一些實施例中，與未經處理之細胞中的表現相比，經如本文所述之iRNA處理之細胞中的目標基因表現增強至少1倍、至少2倍、至少5倍、至少10倍、至少50倍、至少100倍、至少500倍、至少1000倍或超過1000倍。藉由小dsRNA活化表現描述於例如Li等人，2006 Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.103：17337-42及US20070111963及US2005226848中，各文獻以引用的方式併入本文中。
術語「靜默」、「抑制表現」、「下調表現」、「抑止表現」及其類似術語就其關於目標基因而言，在本文中係指至少部分地抑止目標基因表現，如例如根據目標基因mRNA表現、目標基因蛋白表現、或在功能上與目標基因表現相關的另一參數所評估。舉例而言，目標基因表現之抑制可依據目標基因mRNA之量之減少來表明，該目標基因mRNA可自目標基因已轉錄的第一細胞細胞群分離或偵測到，該第一細胞或細胞群已經處理，以使得與對照物相比，目標基因之表現被抑制。對照物可為與第一細胞或細胞群相同的第二細胞或細胞群，但其中第二細胞或細胞群尚未如此經處理(對照細胞)。抑制程度通常以對照位準之百分比表示，例如
或者，抑制程度可依據在功能上與目標基因表現相關之參數(例 如目標基因所編碼之蛋白質的量)之降低來得到。在功能上與目標基因表現相關之參數之降低可類似地以對照位準之百分比表示。原則上，可組成性地或藉由基因組工程改造及藉由任何適當分析來測定表現目標基因之任何細胞中的目標基因靜默。然而，當為了確定指定iRNA是否將目標基因表現抑制到某種程度而需要參考值且本發明因此包涵此參考值時，下文實例中所提供的分析應充當此參考值。
舉例而言，在某些情況下，投與本發明所述之iRNA使目標基因表現抑止至少約10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%或50%。在一些實施例中，投與本發明所述之iRNA使目標基因抑止至少約60%、65%、70%、75%或80%。在一些實施例中，投與如本文所述的iRNA使目標基因抑止至少約85%、90%、95%、98%、99%或超過99%。
如本文在目標基因表現之背景下所用，術語「治療」及其類似術語係指減輕或減緩與目標基因表現相關的病理過程。在本發明之背景下，在其關於下文中所述之任何其他病狀(除與目標基因表現相關之病理過程之外)的範圍內，術語「治療」及其類似術語意謂預防、減輕或緩解至少一種與此病狀相關的症狀，或減緩或逆轉此病狀之進展或預期進展。因此，除非上下文另有明確指示，否則術語「治療」及其類似術語意欲包涵防治(例如預防)與目標基因表現相關的病症及/或病症症狀。
在疾病標記或症狀之背景下，「降低」意謂此程度在統計上或臨床上之明顯降低。降幅可為例如至少10%、至少20%、至少30%、至少40%或超過40%，且典型地降至視作未患此病症之個體之正常範圍內的程度。
如本文所用，片語「治療有效量」及「預防有效量」係指在治療、預防或管理與目標基因表現相關之病理過程中提供治療益處的 量。治療有效的特定量容易由普通從醫者確定，且可根據此項技術中已知的因素變化，諸如病理過程之類型、患者病史及年齡、病理過程之階段，及其他藥劑之投與。
如本文所用，「醫藥組合物」包含藥理學有效量之iRNA及醫藥學上可接受之載劑。如本文所用，「藥理學有效量」、「治療有效量」或簡稱「有效量」係指iRNA有效產生預定藥理學、治療或預防結果的量。舉例而言，在治療與目標基因表現相關之病症的方法中，有效量包括有效減少與疾病相關之一或多種症狀的量，或有效減少與疾病相關之發展條件之風險的量。舉例而言，若與疾病或病症相關之可量測參數存在至少10%減幅時，指定臨床療法視為有效，則藥物用於治療該疾病或病症的治療有效量為達成該參數之至少10%減幅所必需的量。舉例而言，靶向目標基因之iRNA的治療有效量可使目標基因蛋白含量降低任何可量測的量，例如至少10%、20%、30%、40%或50%。
術語「醫藥學上可接受之載劑」係指投與治療劑的載劑。此等載劑包括(但不限於)生理鹽水、緩衝鹽水、右旋糖、水、甘油、乙醇及其組合。該術語特別排除細胞培養基。對於經口投與的藥物而言，醫藥學上可接受之載劑包括(但不限於)醫藥學上可接受之賦形劑，諸如惰性稀釋劑、崩解劑、黏合劑、潤滑劑、甜味劑、調味劑、著色劑及防腐劑。適合惰性稀釋劑包括碳酸鈉及碳酸鈣、磷酸鈉及磷酸鈣以及乳糖，而玉米澱粉及海藻酸為適合崩解劑。黏合劑可包括澱粉及明膠，而潤滑劑若存在則通常為硬脂酸鎂、硬脂酸或滑石。需要時，錠劑可用諸如單硬脂酸甘油酯或二硬脂酸甘油酯之材料包覆包衣，以延遲吸收於胃腸道中。藥物調配物中所包括的藥劑進一步描述於下文中。
提及數字或數值範圍時，術語「約」意謂所提及的數字或數值 範圍為實驗變化性範圍內(或統計實驗誤差範圍內)的近似值，且因此數字或數值範圍可在例如所述數字或數值範圍之1%與15%之間變化。
雙股核糖核酸(dsRNA)
本文中描述抑制目標基因表現的iRNA藥劑。在一個實施例中，iRNA藥劑包括用於抑制細胞或個體(例如哺乳動物，例如人類)中之目標基因表現的雙股核糖核酸(dsRNA)分子，其中dsRNA包括具有互補區的反義股，該互補區與表現目標基因時所形成之mRNA的至少一部分互補，且其中該互補區具有30個核苷酸或小於30個核苷酸長度，通常為19-24個核苷酸長度，且其中dsRNA在與表現目標基因之細胞接觸時將目標基因表現抑制至少10%，如藉由例如PCR或基於分支DNA(bDNA)之方法或藉由基於蛋白質之方法(諸如西方墨點法)所分析。在一個實施例中，iRNA藥劑活化細胞或哺乳動物中之目標基因表現。目標基因在細胞培養物中(諸如在COS細胞、希拉細胞、初級肝細胞、HepG2細胞、原代培養細胞中)或在來自個體之生物樣品中的表現可藉由量測目標基因mRNA含量來分析，諸如藉由bDNA或TaqMan分析，或藉由量測蛋白質含量，諸如藉由免疫螢光分析，例如使用西方墨點法或流式細胞測定技術。
dsRNA包括兩個RNA股，此兩個RNA股充分互補而在使用dsRNA的條件下雜交形成雙螺旋結構。dsRNA之一個股(反義股)包括與目標序列實質上互補且通常完全互補的互補區，該目標序列來源於在表現目標基因期間所形成之mRNA的序列。另一股(有義股)包括與反義股互補的區域，使得兩個股當在適合條件下合併時雜交且形成雙螺旋結構。一般而言，雙螺旋結構之鹼基對長度介於包括15個與30個之間，更通常在包括18個與25個之間，然而更通常在包括19個與24個之間，且最通常在包括19個與21個之間。類似地，與目標序列互補之區域的核苷酸長度介於包括15個與30個之間，更通常在包括18個與25個之 間，然而更通常在包括19個與24個之間，且最通常在包括19個與21個之間。在一些實施例中，dsRNA的核苷酸長度介於包括15個與20個之間，且在其他實施例中，dsRNA的核苷酸長度介於包括25個與30個之間。如一般熟習此項技術者將認識到，分裂所靶向之RNA的目標區通常為較大RNA之一部分，通常為mRNA分子之一部分。在相關的情況下，mRNA目標之「一部分」為長度足以作為供RNAi導引之分裂(亦即經由RISC路徑分裂)之受質的mRNA目標之鄰接序列。具有短至9個鹼基對之雙螺旋的dsRNA在一些環境下可介導RNAi導引之RNA分裂。目標通常具有至少15個核苷酸長度，例如15-30個核苷酸長度。
熟習此項技術者亦將認識到，雙螺旋區域為dsRNA之主要功能部分，例如9至36個，例如15至30個鹼基對的雙螺旋區域。因此，在一個實施例中，就其加工成靶向供分裂用之所要RNA之例如15-30個鹼基對的功能性雙螺旋而言，具有大於30個鹼基對之雙螺旋區域之RNA分子或RNA分子複合物為dsRNA。因此，一般熟習此項技術者將認識到，接著在一個實施例中，miRNA為dsRNA。在另一個實施例中，dsRNA不為天然存在之miRNA。在另一個實施例中，在目標細胞中藉由分裂較大dsRNA並不產生適用於靶向目標基因表現的iRNA藥劑。
如本文所述的dsRNA可進一步包括一或多個單股核苷酸突出物。如下文進一步論述，dsRNA可藉由此項技術中已知的標準方法，例如使用自動化DNA合成儀(諸如市購自例如Biosearch,Applied Biosystems,Inc的自動化DNA合成儀)來合成。在一個實施例中，目標基因為人類目標基因。在另一個實施例中，目標基因為小鼠或大鼠目標基因。在特定實施例中，第一序列為包括有義序列的dsRNA有義股，且第二序列為包括反義序列的dsRNA反義股。靶向除本文揭示之dsRNA序列外之序列的替代dsRNA藥劑可容易使用目標序列及側接目標基因序列確定。
熟習此項技術者瞭解，具有20個與23個之間之(但特別是21個)鹼基對之雙螺旋結構的dsRNA已視為在誘導RNA干擾方面特別有效(Elbashir等人，EMBO 2001,20：6877-6888)。然而，其他人已發現較短或較長RNA雙螺旋結構亦可有效。在上述實施例中，本文所述的dsRNA可包括至少一個具有最少21個核苷酸長度之股。可合理地預期，一端或兩端僅缺少幾個核苷酸的較短雙螺旋可與上述dsRNA同樣有效。因此，本發明涵蓋具有至少15、16、17、18、19、20或超過20個鄰接核苷酸之部分序列的dsRNA，其抑制目標基因表現的能力不同，不超過包含全長序列之dsRNA之抑制作用的5%、10%、15%、20%、25%或30%。
另外，RNA識別目標基因轉錄物中之對RISC介導之分裂敏感的位點。因而，本發明進一步描述靶向此等序列之一的iRNA。如本文所用，若iRNA促進轉錄物在此特定位點之任何處分裂，則稱iRNA靶向RNA轉錄物之一特定位點。此iRNA一般包括與其他核苷酸序列偶合之至少15個鄰接核苷酸，此等其他核苷酸序列取自與目標基因中之所選序列鄰接的區域。
雖然目標序列一般具有15-30個核苷酸長度，但特定序列在此範圍內具有較寬之適於導引任何指定目標RNA分裂的變化。本文所述之各種套裝軟體及準則為鑑別任何指定目標基因之最佳目標序列提供引導，但亦可採用實驗方法，其中指定尺寸(作為非限制性實例，21個核苷酸)之「窗」或「罩」按照字面上地或比喻性地(包括例如計算機)置放於目標RNA序列上以鑑別可充當目標序列之尺寸範圍的序列。藉由向目標序列初始位置之上游或下游逐漸地移動序列「窗」，可鑑別下一個潛在目標序列，直至根據所選任何指定目標尺寸鑑別出整套可能序列。此方法聯合系統性合成及測試所鑑別序列(使用如本文所述或如此項技術中已知的分析)(以鑑別出效能最佳的彼等序列)，可鑑別 出當用iRNA藥劑靶向時介導目標基因表現之最佳抑制的彼等RNA序列。因此預期抑制效率之進一步最佳化可如下達成：將該窗向指定序列之上游或下游逐漸地「移動」一個核苷酸，以鑑別出具有相等或較佳抑制特徵的序列。
此外，預期鑑別用於進一步最佳化的任何序列可如下達成：系統性地添加或移除核苷酸以產生較長或較短序列且測試彼等序列，且藉由將較長或較短尺寸之窗自該點沿著目標RNA向上或向下移動來產生序列。又，將產生新候選目標的此方法與以此項技術中所知或如本文所述之抑制分析測試基於彼等目標序列之iRNA之有效性聯合可進一步提高抑制效率。此外，此等最佳化序列可如下調整：例如引入如本文所述或如此項技術中所知之經修飾核苷酸、突出物之添加或變化，或如此項技術中所知及/或本文論述之可進一步最佳化作為表現抑制劑之分子(例如增強血清穩定性或循環半衰期、增強熱穩定性、增強跨膜遞送、靶向特定位置或細胞類型、增強與靜默路徑酶的相互作用、增強內體釋放等)的其他修飾。
如本文所述的iRNA可含有一或多個相對於目標序列的錯配。在一個實施例中，如本文所述的iRNA含有不超過3個錯配。若iRNA之反義股含有相對於目標序列的錯配，則錯配區域較佳不位於互補區之中心。若iRNA之反義股含有相對於目標序列的錯配，則錯配較佳限於互補區之5'端或3'端之末尾5個核苷酸內。舉例而言，對於與目標基因區域互補之23個核苷酸iRNA藥劑RNA股而言，RNA股在中心13個核苷酸內一般不含有任何錯配。本文所述的方法或此項技術中已知的方法可用於確定含有相對於目標序列之錯配的iRNA是否有效抑制目標基因表現。考慮具有錯配之iRNA抑制目標基因表現的功效具有重要作用，尤其是目標基因內之特定互補區已知具有群體內之多形性序列變異。
在一個實施例中，dsRNA之至少一個末端具有1至4個，通常1或2個核苷酸之單股核苷酸突出物。具有至少一個核苷酸突出物的dsRNA相對於其鈍端對應物而言具有出乎意料的優良抑制特性。在又一個實施例中，iRNA之RNA(例如dsRNA)經化學修飾以增強穩定性或其他有益特徵。本發明所述的核酸可藉由此項技術中已確立的方法合成及/或修飾，諸如以下文獻中所述的方法："Current protocols in nucleic acid chemistry," Beaucage,S.L.等人(編)，John Wiley & Sons,Inc.,New York,NY,USA，該文獻以引用的方式併入本文中。修飾包括例如(a)末端修飾，例如5'端修飾(磷酸化、結合、倒連接等)、3'端修飾(結合、DNA核苷酸、倒連接等)；(b)鹼基修飾，例如用穩定鹼基、不穩定鹼基或與譜系擴增之搭配物鹼基配對的鹼基置換、移除鹼基(無鹼基核苷酸)或結合鹼基；(c)糖修飾(例如在2'位置或4'位置)或糖置換，以及(d)骨架修飾，包括磷酸二酯鍵之修飾或置換。適用於本發明之RNA化合物之特定實例包括(但不限於)含有經修飾骨架或無天然核苷間鍵聯的RNA。具有經修飾骨架的RNA尤其包括骨架中不具有磷原子的彼等物。為了本說明書之目的，且有時如此項技術中所提及，核苷間骨架中不具有磷原子的經修飾RNA亦可視為寡核苷。在特定實施例中，經修飾RNA在其核苷間骨架中具有磷原子。
經修飾RNA骨架包括例如硫代磷酸酯、對掌性硫代磷酸酯、二硫代磷酸酯、磷酸三酯、胺基烷基磷酸三酯、甲基及其他烷基膦酸酯(包括膦酸3'-伸烷酯及對掌性膦酸酯)、亞膦酸酯、胺基磷酸酯(包括3'-胺基胺基磷酸酯及胺基烷基胺基磷酸酯)、硫代胺基磷酸酯、硫代烷基磷酸酯、硫代烷基磷酸三酯，及硼烷磷酸酯，此等物具有正常3'-5'鍵聯、2'-5'鍵聯型類似物，及具有反極性的彼等物，其中相鄰核苷單元對為3'-5'連接至5'-3'或2'-5'連接至5'-2'。亦包括各種鹽、混鹽及游離酸形式。
教示製備上述含磷鍵聯的代表性美國專利包括(但不限於)美國專利第3,687,808號、第4,469,863號、第4,476,301號、第5,023,243號、第5,177,195號、第5,188,897號、第5,264,423號、第5,276,019號、第5,278,302號、第5,286,717號、第5,321,131號、第5,399,676號、第5,405,939號、第5,453,496號、第5,455,233號、第5,466,677號、第5,476,925號、第5,519,126號、第5,536,821號、第5,541,316號、第5,550,111號、第5,563,253號、第5,571,799號、第5,587,361號、第5,625,050號、第6,028,188號、第6,124,445號、第6,160,109號、第6,169,170號、第6,172,209號、第6,239,265號、第6,277,603號、第6,326,199號、第6,346,614號、第6,444,423號、第6,531,590號、第6,534,639號、第6,608,035號、第6,683,167號、第6,858,715號、第6,867,294號、第6,878,805號、第7,015,315號、第7,041,816號、第7,273,933號、第7,321,029號及美國專利RE39464，各專利以引用的方式併入本文中。
其中不包括磷原子的經修飾RNA骨架具有由以下鍵聯形成的骨架：短鏈烷基或環烷基核苷間鍵聯、混合雜原子及烷基或環烷基核苷間鍵聯，或一或多個短鏈雜原子或雜環核苷間鍵聯。此等骨架包括具有嗎啉基鍵聯(部分地由核苷之糖部分形成)；矽氧烷骨架；硫化物、亞碸及碸骨架；甲醛基及硫代甲醛基骨架；亞甲基甲醛基及硫代甲醛基骨架；含有烯烴的骨架；胺基磺酸酯骨架；亞甲基亞胺基及亞甲基肼基骨架；磺酸酯及磺醯胺骨架；醯胺骨架；及具有N、O、S及CH2混合組成部分之其他骨架。
教示製備上述寡核苷之代表性美國專利包括(但不限於)美國專利第5,034,506號、第5,166,315號、第5,185,444號、第5,214,134號、第5,216,141號、第5,235,033號、第5,64,562號、第5,264,564號、第5,405,938號、第5,434,257號、第5,466,677號、第5,470,967號、第 5,489,677號、第5,541,307號、第5,561,225號、第5,596,086號、第5,602,240號、第5,608,046號、第5,610,289號、第5,618,704號、第5,623,070號、第5,663,312號、第5,633,360號、第5,677,437號、第5,677,439號，各專利以引用的方式併入本文中。
在適用於或預期用於iRNA的其他RNA模擬物中，核苷酸單元之糖與核苷間鍵聯(亦即骨架)經新穎基團置換。基本單元經維持以便與適當核酸目標化合物雜交。一種此寡聚化合物(已顯示具有優良雜交特性的RNA模擬物)稱為肽核酸(PNA)。在PNA化合物中，RNA之糖骨架經含有醯胺之骨架(特定而言，胺基乙基甘胺酸骨架)置換。核鹼基經保留且直接或間接地結合至骨架之醯胺部分的氮雜氮原子。教示製備PNA化合物的代表性美國專利包括(但不限於)美國專利第5,539,082號、第5,714,331號及第5,719,262號，各專利以引用的方式併入本文中。PNA化合物之其他教示內容見於例如Nielsen等人，Science,1991,254,1497-1500。
本發明中所述的一些實施例包括具有硫代磷酸酯骨架的RNA及具有雜原子骨架的寡核苷，特定而言，上文提及之美國專利第5,489,677號中之--CH2--NH--CH2--、--CH2--N(CH3)--O--CH2--[稱為亞甲基(甲基亞胺基)或MMI骨架]、--CH2--O--N(CH3)--CH2--、--CH2--N(CH3)--N(CH3)--CH2--及--N(CH3)--CH2--CH2--[其中原生磷酸二酯骨架以--O--P--O--CH2--表示]，上文提及之美國專利第5,602,240號中之醯胺骨架。在一些實施例中，本文中所述之RNA具有上文提及之美國專利第5,034,506號中之嗎啉基骨架結構。
經修飾之RNA亦可含有一或多個經取代糖部分。本文中所述之iRNA(例如dsRNA)可包括位於2'位置之以下之一：OH；F；O-、S-或N-烷基；O-、S-或N-烯基；O-、S-或N-炔基；或O-烷基-O-烷基，其中該烷基、烯基及炔基可為經取代或未經取代之C1至C10烷基或C2至 C10烯基及炔基。例示性適合修飾包括O[(CH2)nO]mCH3、O(CH2)．nOCH3、O(CH2)nNH2、O(CH2)nCH3、O(CH2)nONH2及O(CH2)nON[(CH2)nCH3)]2，其中n及m為1至約10。在其他實施例中，dsRNA包括位於2'位置之以下之一：C1至C10低碳烷基、經取代之低碳烷基、烷芳基、芳烷基、O-烷芳基或O-芳烷基、SH、SCH3、OCN、Cl、Br、CN、CF3、OCF3、SOCH3、SO2CH3、ONO2、NO2、N3、NH2、雜環烷基、雜環烷芳基、胺基烷基胺基、聚烷基胺基、經取代之矽烷基、RNA分裂基團、報導基團、插入劑、用於改良iRNA之藥物動力學特性的基團、或用於改良iRNA之藥效學特性的基團，及具有類似特性的其他取代基。在一些實施例中，修飾包括2'-甲氧基乙氧基(2'-O--CH2CH2OCH3，亦稱為2'-O-(2-甲氧基乙基)或2'-MOE)(Martin等人，Helv.Chim.Acta,1995,78：486-504)，亦即烷氧基-烷氧基。另一例示性修飾為如下文實例中所述的2'-二甲基胺基氧基乙氧基，亦即O(CH2)2ON(CH3)2基團，亦稱為2'-DMAOE；及亦如下文實例中所述的2'-二甲基胺基乙氧基乙氧基(此項技術中亦稱為2'-O-二甲基胺基乙氧基乙基或2'-DMAEOE)，亦即2'-O--CH2--O--CH2--N(CH2)2。
其他修飾包括2'-甲氧基(2'-OCH3)、2'-胺基丙氧基(2'-OCH2CH2CH2NH2)及2'-氟(2'-F)。在iRNA之RNA的其他位置上亦可進行類似修飾，特別是在3'末端核苷酸之糖的3'位置上或在2'-5'鍵聯型dsRNA中及在5'末端核苷酸之5'位置上。iRNA亦可以糖模擬物(諸如環丁基部分)代替五呋喃糖基糖。教示製備此等經修飾之糖結構的代表性美國專利包括(但不限於)美國專利第4,981,957號、第5,118,800號、第5,319,080號、第5,359,044號、第5,393,878號、第5,446,137號、第5,466,786號、第5,514,785號、第5,519,134號、第5,567,811號、第5,576,427號、第5,591,722號、第5,597,909號、第5,610,300號、第 5,627,053號、第5,639,873號、第5,646,265號、第5,658,873號、第5,670,633號及第5,700,920號，其中某些專利與本申請案係共同擁有，且各專利以引用的方式併入本文中。
iRNA亦可包括核鹼基(此項技術中通常簡稱為「鹼基」)修飾或取代。如本文所用，「未經修飾」或「天然」核鹼基包括嘌呤鹼基腺嘌呤(A)及鳥嘌呤(G)，及嘧啶鹼基胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)及尿嘧啶(U)。經修飾之核鹼基包括其他合成及天然核鹼基，諸如5-甲基胞嘧啶(5-me-C)、5-羥甲基胞嘧啶、黃嘌呤、次黃嘌呤、2-胺基腺嘌呤、腺嘌呤及鳥嘌呤之6-甲基及其他烷基衍生物、腺嘌呤及鳥嘌呤之2-丙基及其他烷基衍生物、2-硫尿嘧啶、2-硫胸腺嘧啶及2-硫胞嘧啶、5-鹵基尿嘧啶及胞嘧啶、5-丙炔基尿嘧啶及胞嘧啶、6-偶氮基尿嘧啶、胞嘧啶及胸腺嘧啶、5-尿嘧啶(假尿嘧啶)、4-硫尿嘧啶；8-鹵基、8-胺基、8-硫醇、8-硫烷基、8-羥基及其他8位經取代之腺嘌呤及鳥嘌呤；5-鹵基(特別是5-溴)、5-三氟甲基及其他5位經取代之尿嘧啶及胞嘧啶；7-甲基鳥嘌呤及7-甲基腺嘌呤、8-氮雜鳥嘌呤及8-氮雜腺嘌呤、7-脫氮鳥嘌呤及7-脫氮腺嘌呤，及3-脫氮鳥嘌呤及3-脫氮腺嘌呤。其他核鹼基包括美國專利第3,687,808號中所揭示之彼等物；Modified Nucleosides in Biochemistry,Biotechnology and Medicine,Herdewijn,P.編，Wiley-VCH,2008中所揭示之彼等物；The Concise Encyclopedia Of Polymer Science And Engineering，第858-859頁，Kroschwitz,J.L，編，John Wiley & Sons,1990中所揭示之彼等物；Englisch等人，Angewandte Chemie,International Edition,1991,30,613中所揭示之彼等物；及Sanghvi,Y S.，第15章，dsRNA Research and Applications，第289-302頁，Crooke,S.T.及Lebleu,B.，編，CRC Press,1993中所揭示之彼等物。其中某些核鹼基特別適用於增強本發明中所述之寡聚化合物的結合親和力。此等核鹼基包括5位經取代之嘧啶、 6-氮雜嘧啶及N-2、N-6及0-6位經取代之嘌呤，包括2-胺基丙基腺嘌呤、5-丙炔基尿嘧啶及5-丙炔基胞嘧啶。5-甲基胞嘧啶取代已顯示可使核酸雙螺旋穩定性提高0.6-1.2℃(Sanghvi,Y.S.,Crooke,S.T.及Lebleu,B.，編，dsRNA Research and Applications,CRC Press,Boca Raton,1993，第276-278頁)且為例示性鹼基取代，甚至更特別的是與2'-O-甲氧基乙基糖修飾組合。
教示製備某些上述經修飾之核鹼基以及其他經修飾之核鹼基的代表性美國專利包括(但不限於)上述美國專利第3,687,808號以及美國專利第4,845,205號、第5,130,30號、第5,134,066號、第5,175,273號、第5,367,066號、第5,432,272號、第5,457,187號、第5,459,255號、第5,484,908號、第5,502,177號、第5,525,711號、第5,552,540號、第5,587,469號、第5,594,121、第5,596,091號、第5,614,617號、第5,681,941號、第6,015,886號、第6,147,200號、第6,166,197號、第6,222,025號、第6,235,887號、第6,380,368號、第6,528,640號、第6,639,062號、第6,617,438號、第7,045,610號、第7,427,672號、第7,495,088號，各專利以引用的方式併入本文中；及美國專利第5,750,692號，其亦以引用的方式併入本文中。
iRNA中之RNA亦可經修飾以包括一或多個鎖定核酸(LNA)。鎖定核酸為具有經修飾之核糖部分的核苷酸，其中核糖部分包含連接2'碳與4'碳的額外橋。此結構有效地「鎖定」呈3'-內接結構構形的核糖。鎖定核酸添加至siRNA中已顯示可增強血清中之siRNA穩定性及減少脫靶效應(Elmen,J.等人，(2005)Nucleic Acids Research 33(1)：439-447；Mook,OR.等人，(2007)Mol Canc Ther 6(3)：833-843；Grunweller,A.等人，(2003)Nucleic Acids Research 31(12)：3185-3193)。
教示製備鎖定核酸核苷酸的代表性美國專利包括(但不限於)以 下：美國專利第號6,268,490、第6,670,461號、第6,794,499號、第6,998,484號、第7,053,207號、第7,084,125號及第7,399,845號，各案以全文引用的方式併入本文中。
對於RNA分子之末端而言，潛在穩定的修飾可包括N-(乙醯基胺基己醯基)-4-羥基脯胺醇(Hyp-C6-NHAc)、N-(己醯基-4-羥基脯胺醇(Hyp-C6)、N-(乙醯基-4-羥基脯胺醇(Hyp-NHAc)、胸苷-2'-O-脫氧胸苷(醚)、N-(胺基己醯基)-4-羥基脯胺醇(Hyp-C6-胺基)、2-二十二烷醇-尿苷-3"-磷酸酯、倒鹼基dT(idT)及其他。此修飾之揭示內容可見於PCT公開案第WO 2011/005861號中。
iRNA基元
在一個實施例中，有義股序列可由式(I)表示：5' np-Na-(X X X)i-Nb-Y Y Y-Nb-(Z Z Z)j-Na-nq 3' (I)
其中：i及j各獨立地為0或1；p及q各獨立地為0-6；各Na獨立地表示包含0-25個經修飾核苷酸之寡核苷酸序列，各序列包含至少兩個經不同修飾之核苷酸；各Nb獨立地表示包含0-10個經修飾核苷酸之寡核苷酸序列；各np及nq獨立地表示突出物核苷酸；其中Nb及Y不具有相同修飾；及XXX、YYY及ZZZ各獨立地表示三個連續核苷酸具有三個相同修飾的一個基元。YYY較佳為經2'-F修飾之所有核苷酸。
在一個實施例中，Na及/或Nb包含替代模式之修飾。
在一個實施例中，YYY基元存在於或靠近有義股之分裂位點。舉例而言，當RNAi藥劑具有17-23個核苷酸長度的雙螺旋區域時，YYY基元可存在於或靠近分裂位點(例如可存在於有義股之位置6、 7、8；7、8、9；8、9、10；9、10、11；10、11、12；或11、12、13)，此計數係自5'端之第一個核苷酸開始，或視情況，計數始於5'端之雙螺旋區域內之第一個成對核苷酸。
在一個實施例中，i為1且j為0，或i為0且j為1，或i與j均為1。有義股因此可由下式表示：5' np-Na-YYY-Nb-ZZZ-Na-nq 3' (Ib)；5' np-Na-XXX-Nb-YYY-Na-nq 3' (Ic)；或5' np-Na-XXX-Nb-YYY-Nb-ZZZ-Na-nq 3' (Id)。
當有義股由式(Ib)表示時，Nb表示包含0-10、0-7、0-5、0-4、0-2或0個經修飾核苷酸的寡核苷酸序列。各Na可獨立地表示包含2-20、2-15或2-10個經修飾核苷酸的寡核苷酸序列。
當有義股由式(Ic)表示時，Nb表示包含0-10、0-7、0-5、0-4、0-2或0個經修飾核苷酸的寡核苷酸序列。各Na可獨立地表示包含2-20、2-15或2-10個經修飾核苷酸的寡核苷酸序列。
當有義股由式(Id)表示時，各Nb獨立地表示包含0-10、0-7、0-5、0-4、0-2或0個經修飾核苷酸的寡核苷酸序列。Nb較佳為0、1、2、3、4、5或6。各Na可獨立地表示包含2-20、2-15或2-10個經修飾核苷酸的寡核苷酸序列。
X、Y及Z中之每一者彼此可相同或不同。
在其他實施例中，i為0且j為0，且有義股可由下式表示：5' np-Na-YYY-Na-nq 3' (Ia)。
當有義股由式(Ia)表示，各Na可獨立地表示包含2-20、2-15或2-10個經修飾核苷酸之寡核苷酸序列。
在一個實施例中，RNAi之反義股序列可由式(II)表示：5' nq'-Na'-(Z'Z'Z')k-Nb'-Y'Y'Y'-Nb'-(X'X'X')l-N'a-np' 3' (II)
其中： k及l各獨立地為0或1；p'及q'各獨立地為0-6；各Na'獨立地表示包含0-25個經修飾核苷酸之寡核苷酸序列，各序列包含至少兩個經不同修飾之核苷酸；各Nb'獨立地表示包含0-10個經修飾核苷酸之寡核苷酸序列；各np'及nq'獨立地表示突出物核苷酸；其中Nb'及Y'不具有相同修飾；及X'X'X'、Y'Y'Y'及Z'Z'Z'各獨立地表示三個連續核苷酸具有三個相同修飾的一個基元。
在一個實施例中，Na'及/或Nb'包含替代模式之修飾。
Y'Y'Y'基元存在於或靠近反義股之分裂位點。舉例而言，當RNAi藥劑具有17-23個核苷酸長度之雙螺旋區域時，Y'Y'Y'基元可存在於反義股之位置9、10、11；10、11、12；11、12、13；12、13、14；或13、14、15，其中計數始於5'端之第一核苷酸；或視情況，計數始於5'端之雙螺旋區域內的第一個成對核苷酸。Y'Y'Y'基元較佳存在於位置11、12、13。
在一個實施例中，Y'Y'Y'基元為所有經2'-OMe修飾之核苷酸。
在一個實施例中，k為1且l為0，或k為0且l為1，k與l均為1。
反義股因此可由下式表示：5' nq'-Na'-Z'Z'Z'-Nb'-Y'Y'Y'-Na'-np' 3' (IIb)；5' nq'-Na'-Y'Y'Y'-Nb'-X'X'X'-np' 3' (IIc)；或5' nq'-Na'-Z'Z'Z'-Nb'-Y'Y'Y'-Nb'-X'X'X'-Na'-np' 3' (IId)。
當反義股由式(IIb)表示時，Nb'表示包含0-10、0-7、0-5、0-4、0-2或0個經修飾核苷酸的寡核苷酸序列。各Na'獨立地表示包含2-20、2-15或2-10個經修飾核苷酸的寡核苷酸序列。
當反義股由式(IIc)表示時，Nb'表示包含0-10、0-7、0-5、0-4、0-2或0個經修飾核苷酸的寡核苷酸序列。各Na'獨立地表示包含2-20、2-15或2-10個經修飾核苷酸的寡核苷酸序列。
當反義股由式(IId)表示時，各Nb'獨立地表示包含0-10、0-7、0-5、0-4、0-2或0個經修飾核苷酸的寡核苷酸序列。各Na'獨立地表示包含2-20、2-15或2-10個經修飾核苷酸的寡核苷酸序列。Nb較佳為0、1、2、3、4、5或6。
在其他實施例中，k為0且l為0且反義股可由下式表示：5' np'-Na'-Y'Y'Y'-Na'-nq' 3' (Ia)。
當反義股由式(IIa)表示，各Na'獨立地表示包含2-20、2-15或2-10個經修飾核苷酸之寡核苷酸序列。
X'、Y'及Z'中之每一者彼此可相同或不同。
有義股及反義股中之各核苷酸可獨立地經LNA、HNA、CeNA、2'-甲氧基乙基、2'-O-甲基、2'-O-烯丙基、2'-C-烯丙基、2'-羥基或2'-氟修飾。舉例而言，有義股及反義股中之各核苷酸獨立地經2'-O-甲基或2'-氟修飾。特定而言，各X、Y、Z、X'、Y'及Z'可表示2'-O-甲基修飾或2'-氟修飾。
在一個實施例中，當雙螺旋區域為21nt時，RNAi藥劑中之有義股可含有存在於該股之位置9、10及11的YYY基元，計數始於5'端之第一核苷酸，或視情況，計數始於5'端之雙螺旋區域內的第一個成對核苷酸；且Y表示2'-F修飾。有義股另外可在雙螺旋區域之相對末端含有XXX基元或ZZZ基元作為側翼修飾；且XXX及ZZZ各獨立地表示2'-OMe修飾或2'-F修飾。
在一個實施例中，反義股可含有存在於該股之位置11、12、13的Y'Y'Y'基元，計數始於5'端之第一核苷酸，或視情況，計數始於5'端之雙螺旋區域內的第一個成對核苷酸；且Y'表示2'-O-甲基修飾。反義 股另外可在雙螺旋區域之相對端含有X'X'X'基元或Z'Z'Z'基元作為側翼修飾；且X'X'X'及Z'Z'Z'各獨立地表示2'-OMe修飾或2'-F修飾。
由上述式(Ia)、(Ib)、(Ic)及(Id)中之任一者表示的有義股分別與由式(IIa)、(IIb)、(IIc)及(IId)中之任一者表示的反義股形成雙螺旋。
因此，用於本發明方法中之RNAi藥劑可包含有義股及反義股，各股具有14至30個核苷酸，RNAi雙螺旋由式(III)表示：有義股：5' np-Na-(X X X)i-Nb-Y Y Y-Nb-(Z Z Z)j-Na-nq 3'反義股：3' np '-Na '-(X'X'X')k-Nb '-Y'Y'Y'-Nb '-(Z'Z'Z')l-Na '-nq ' 5' (III)
其中：i、j、k及l各獨立地為0或1；p、p'、q及q'各獨立地為0-6；各Na及Na'獨立地表示包含0-25個經修飾核苷酸之寡核苷酸序列，各序列包含至少兩個經不同修飾之核苷酸；各Nb及Nb'獨立地表示包含0-10個經修飾核苷酸之寡核苷酸序列；其中各np'、np、nq'及nq(各自可或可不存在)獨立地表示突出物核苷酸；及XXX、YYY、ZZZ、X'X'X'、Y'Y'Y'及Z'Z'Z'各自獨立地表示三個連續核苷酸上具有三個相同修飾的一個基元。
在一個實施例中，i為0且j為0；或i為1且j為0；或i為0且j為1；或i與j均為0；或i與j均為1。在另一個實施例中，k為0且l為0；或k為1且l為0；k為0且l為1；或k與l均為0；或k與l均為1。
形成RNAi雙螺旋之有義股與反義股之例示性組合包括下式： 5' np-Na-Y Y Y-Na-nq 3' 3' np '-Na '-Y'Y'Y'-Na 'nq ' 5' (IIIa)
5' np-Na-Y Y Y-Nb-Z Z Z-Na-nq 3' 3' np '-Na '-Y'Y'Y'-Nb '-Z'Z'Z'-Na 'nq ' 5' (IIIb)
5' np-Na-X X X-Nb-Y Y Y-Na-nq 3' 3' np '-Na '-X'X'X'-Nb '-Y'Y'Y'-Na '-nq ' 5' (IIIc)
5' np-Na-X X X-Nb-Y Y Y-Nb-Z Z Z-Na-nq 3' 3' np '-Na '-X'X'X'-Nb '-Y'Y'Y'-Nb '-Z'Z'Z'-Na-nq ' 5' (IIId)
當RNAi藥劑由式(IIIa)表示，各Na可獨立地表示包含2-20、2-15或2-10個經修飾核苷酸之寡核苷酸序列。
當RNAi藥劑由式(IIIb)表示時，各Nb獨立地表示包含1-10、1-7、1-5或1-4個經修飾核苷酸的寡核苷酸序列。各Na獨立地表示包含2-20、2-15或2-10個經修飾核苷酸的寡核苷酸序列。
當RNAi藥劑由式(IIIc)表示時，各Nb、Nb'獨立地表示包含0-10、0-7、0-5、0-4、0-2或0個經修飾核苷酸的寡核苷酸序列。各Na獨立地表示包含2-20、2-15或2-10個經修飾核苷酸的寡核苷酸序列。
當RNAi藥劑由式(IIId)表示時，各Nb、Nb'獨立地表示包含0-10、0-7、0-5、0-4、0-2或0個經修飾核苷酸的寡核苷酸序列。各Na、Na'獨立地表示包含2-20、2-15或2-10個經修飾核苷酸的寡核苷酸序列。Na、Na'、Nb及Nb'中之每一者獨立地包含替代修飾模式。
式(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IIIc)及(IIId)之X、Y及Z中之每一者彼此可相同或不同。
當RNAi藥劑由式(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IIIc)及(IIId)表示時，Y核苷酸中之至少一者可與Y'核苷酸之一形成鹼基對。或者，Y核苷酸中之至少兩者與對應Y'核苷酸形成鹼基對；或所有三個Y核苷酸與對應Y'核苷酸皆形成鹼基對。
當RNAi藥劑由式(IIIb)或(IIId)表示時，Z核苷酸中之至少一者可與Z'核苷酸之一形成鹼基對。或者，Z核苷酸中之至少兩者與對應Z'核苷酸形成鹼基對；或所有三個Z核苷酸與對應Z'核苷酸皆形成鹼基對。
當RNAi藥劑由式(IIIc)或(IIId)表示時，X核苷酸中之至少一者可與X'核苷酸之一形成鹼基對。或者，X核苷酸中之至少兩者與對應X'核苷酸形成鹼基對；或所有三個X核苷酸與對應X'核苷酸皆形成鹼基對。
在一個實施例中，對Y核苷酸之修飾不同於對Y'核苷酸之修飾，對Z核苷酸之修飾不同於對Z'核苷酸之修飾，且/或對X核苷酸之修飾不同於對X'核苷酸之修飾。
在一個實施例中，當RNAi藥劑由式(IIId)表示時，Na修飾為2'-O-甲基或2'-氟修飾。在另一個實施例中，當RNAi藥劑由式(IIId)表示時，Na修飾為2'-O-甲基或2'-氟修飾且np'>0且至少一個np'經由硫代磷酸酯鍵聯連接至相鄰核苷酸。在又一個實施例中，當RNAi藥劑由式(IIId)表示時，Na修飾為2'-O-甲基或2'-氟修飾，np'>0且至少一個np'經由硫代磷酸酯鍵聯連接至相鄰核苷酸，且有義股與經由二價或三價分支鏈連接子連接之一或多個GalNAc衍生物結合。在另一個實施例中，當RNAi藥劑由式(IIId)表示時，Na修飾為2'-O-甲基或2'-氟修飾，np'>0且至少一個np'經由硫代磷酸酯鍵聯連接至相鄰核苷酸，有義股包含至少一個硫代磷酸酯鍵聯，且有義股與經由二價或三價分支鏈連接子連接之一或多個GalNAc衍生物結合。
在一個實施例中，當RNAi藥劑由式(IIIa)表示時，Na修飾為2'-O-甲基或2'-氟修飾，np'>0且至少一個np'經由硫代磷酸酯鍵聯連接至相鄰核苷酸，有義股包含至少一個硫代磷酸酯鍵聯，且有義股與經由二價或三價分支鏈連接子連接之一或多個GalNAc衍生物結合。
在一個實施例中，RNAi藥劑為含有至少兩個由式(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IIIc)及(IIId)表示之雙螺旋的多聚體，其中雙螺旋藉由連接子連接。連接子可為可分裂的或不可分裂的。多聚體視情況進一步包含配位體。雙螺旋各靶向相同基因或兩個不同基因；或雙螺旋各靶向位於兩個不同靶點的相同基因。
在一個實施例中，RNAi藥劑為含有三、四、五、六或超過六個由式(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IIIc)及(IIId)表示之雙螺旋的多聚體，其中雙螺旋藉由連接子連接。連接子可為可分裂的或不可分裂的。多聚體視情況進一步包含配位體。雙螺旋各靶向相同基因或兩個不同基因；或雙螺旋各靶向位於兩個不同靶點的相同基因。
在一個實施例中，兩種由式(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IIIc)及(IIId)表示的RNAi藥劑在5'端及3'端之一或兩者處彼此連接，且視情況與配位體結合。藥劑各靶向相同基因或兩個不同基因；或藥劑各靶向位於兩個不同靶點的相同基因。
iRNA結合物
本文揭示的iRNA藥劑可呈結合物形式。結合物可在iRNA分子中之任何適合位置處連接，例如有義股或反義股之3'端或5'端。結合物視情況經由連接子連接。
在一些實施例中，本文所述的iRNA藥劑化學連接至一或多種配位體、部分或結合物，從而可賦予功能性，例如影響(例如增強)iRNA之活性、細胞分佈或細胞吸收。此等部分包括(但不限於)脂質部分，諸如膽固醇部分(Letsinger等人，Proc.Natl.Acid.Sci.USA,1989, 86：6553-6556)；膽酸(Manoharan等人，Biorg.Med.Chem.Let.,1994,4：1053-1060)；硫醚，例如己基均三苯基甲硫醇(Manoharan等人，Ann.N.Y.Acad.Sci.,1992,660：306-309；Manoharan等人，Biorg.Med.Chem.Let.,1993,3：2765-2770)；巰基膽固醇(Oberhauser等人，Nucl.Acids Res.,1992,20：533-538)；脂族鏈，例如十二烷二醇或十一烷基殘基(Saison-Behmoaras等人，EMBO J,1991,10：1111-1118；Kabanov等人，FEBS Lett.,1990,259：327-330；Svinarchuk等人，Biochimie,1993,75：49-54)；磷脂，例如二-十六烷基-外消旋-甘油或三乙基銨1,2-二-O-十六烷基-外消旋-甘油基-3-膦酸酯(Manoharan等人，Tetrahedron Lett.,1995,36：3651-3654；Shea等人，Nucl.Acids Res.,1990,18：3777-3783)；聚胺或聚乙二醇鏈(Manoharan等人，Nucleosides & Nucleotides,1995,14：969-973)；或金剛烷乙酸(Manoharan等人，Tetrahedron Lett.,1995,36：3651-3654)；棕櫚基部分(Mishra等人，Biochim.Biophys.Acta,1995,1264：229-237)；或十八烷基胺或己胺基-羰基氧基膽固醇部分(Crooke等人，J.Pharmacol.Exp.Ther.,1996,277：923-937)。
在一個實施例中，配位體使其所併入之iRNA藥劑的分佈、目標或壽命改變。在一些實施例中，配位體使得針對選定目標(例如分子、細胞或細胞類型、代謝區(例如細胞或器官代謝區)、身體之組織、器官或區域)的親和力增強，例如與缺乏此配位體的物種相比。典型配位體不參與雙螺旋核酸之雙螺旋配對。
配位體可包括天然存在之物質，諸如蛋白質(例如人類血清白蛋白(HSA)、低密度脂蛋白(LDL)或球蛋白)；碳水化合物(例如葡聚糖、支鏈澱粉、甲殼素、幾丁聚糖、菊糖、環糊精或玻糖醛酸)；或脂質。配位體亦可為重組或合成分子，諸如合成聚合物，例如合成聚胺基酸。聚胺基酸之實例包括以下聚胺基酸：聚離胺酸(PLL)、聚L-天 冬胺酸、聚L-麩胺酸、苯乙烯-順丁烯二酸酐共聚物、聚(L-丙交酯-共-乙交酯)共聚物、二乙烯基醚-順丁烯二酸酐共聚物、N-(2-羥基丙基)甲基丙烯醯胺共聚物(HMPA)、聚乙二醇(PEG)、聚乙烯醇(PVA)、聚胺基甲酸酯、聚(2-乙基丙烯酸)、N-異丙基丙烯醯胺聚合物，或聚磷嗪。聚胺實例包括：聚伸乙亞胺、聚離胺酸(PLL)、精胺、亞精胺、聚胺、假肽-聚胺、肽模擬物聚胺、樹枝狀聚合物聚胺、精胺酸、脒、魚精蛋白、陽離子型脂質、陽離子型卟啉、聚胺之季鹽，或α螺旋肽。
配位體亦可包括結合至指定細胞類型(諸如腎臟細胞)的靶向基團，例如細胞或組織靶向藥劑，例如凝集素、糖蛋白、脂質或蛋白質，例如抗體。靶向基團可為促甲狀腺素、促黑素、凝集素、糖蛋白、界面活性劑蛋白質A、黏蛋白碳水化合物、多價乳糖、多價半乳糖、N-乙醯基-半乳糖胺、N-乙醯基-葡糖胺多價甘露糖、多價海藻糖、糖基化聚胺基酸、多價半乳糖、轉鐵蛋白、雙膦酸酯、聚麩胺酸、聚天冬胺酸、脂質、膽固醇、類固醇類固醇、膽汁酸、葉酸酯、維生素B12、生物素，或RGD肽或RGD肽模擬物。
在一些實施例中，配位體為包含一或多種N-乙醯半乳糖胺(GalNAc)衍生物的GalNAc配位體。GalNAc配位體之其他說明提供於標題為碳水化合物結合物的章節中。
配位體之其他實例包括染料、插入劑(例如吖啶)、交聯劑(例如補骨脂素(psoralene)、絲裂黴素C(mitomycin C))、卟啉(TPPC4、德卟啉(texaphyrin)、假藍寶石(Sapphyrin))、多環芳烴(例如啡嗪、二氫啡嗪)、人造核酸內切酶(例如EDTA)、親脂性分子(例如膽固醇、膽酸、金剛烷乙酸、1-芘丁酸、二氫睾酮、1,3-雙-O(十六烷基)甘油、香葉基氧基己基、十六基甘油、冰片、薄荷腦、1,3-丙二醇、十七烷基、棕櫚酸、肉豆蔻酸、O3-(油醯基)石膽酸、O3-(油醯基)膽烯酸、二甲 氧基三苯甲基或啡噁嗪)及肽結合物(例如觸角足蛋白肽(antennapedia peptide)、Tat肽)、烷基化劑、磷酸酯、胺基、巰基、PEG(例如PEG-40K)、MPEG、[MPEG]2、聚胺基、烷基、經取代之烷基、放射性標記之標記、酵素、半抗原(例如生物素)、運輸/吸收促進劑(例如阿司匹靈(aspirin)、維生素E、葉酸)、合成核糖核酸酶(例如咪唑、雙咪唑、組織胺、咪唑叢集、吖啶-咪唑結合物、四氮雜巨環之Eu3+錯合物)、二硝基苯基、HRP或AP。
配位體可為蛋白質，例如糖蛋白；或肽，例如對共配位體具有特定親和力的分子；或抗體，例如結合至指定細胞類型(諸如癌細胞、內皮細胞或骨細胞)的抗體。配位體亦可包括激素及激素受體。其亦可包括非肽物質，諸如脂質、凝集素、碳水化合物、維生素、輔因子、多價乳糖、多價半乳糖、N-乙醯基-半乳糖胺、N-乙醯基-葡糖胺多價甘露糖，或多價海藻糖。配位體可為例如脂多糖、p38 MAP激酶活化劑、或NF-κ B活化劑。
配位體可為增強iRNA藥劑吸收至細胞中(例如藉由分裂細胞的細胞骨架，例如分裂細胞微小管、微絲及/或中間絲)的物質，例如藥物。藥物可為例如太平洋紫杉醇(taxon)、長春新鹼(vincristine)、長春鹼(vinblastine)、細胞遲緩素(cytochalasin)、諾考達唑(nocodazole)、甲普拉諾(japlakinolide)、紅海海綿素A(latrunculin A)、鬼筆毒素(phalloidin)、斯溫毒素A(swinholide A)、印丹諾辛(indanocine)或米薩維(myoservin)。
在一些實施例中，連接至如本文所述之iRNA的配位體充當藥物動力學調節劑(PK調節劑)。PK調節劑包括親脂體、膽汁酸、類固醇、磷脂類似物、肽、蛋白結合劑、PEG、維生素等。例示性PK調節劑包括(但不限於)膽固醇、脂肪酸、膽酸、石膽酸、二烷基甘油酯、二醯基甘油酯、磷脂、鞘脂(sphingolipids)、萘普生(naproxen)、布洛 芬(ibuprofen)、維生素E、生物素等。包含許多硫代磷酸酯鍵聯的寡核苷酸亦已知可結合至血清蛋白，從而結合至短寡核苷酸，例如骨架中包含多個硫代磷酸酯鍵聯的約5個鹼基、10個鹼基、15個鹼基或20個鹼基之寡核苷酸亦可作為配位體(例如作為PK調節性配位體)涵蓋於本發明。另外，結合血清組分(例如血清蛋白)的適體在本文所述之實施例中亦適用作PK調節性配位體。
本發明之配位體與寡核苷酸結合物可藉由使用具有側接反應性官能基的寡核苷酸(諸如連接分子連接至寡核苷酸上所得之寡核苷酸)來合成。此反應性寡核苷酸可與市售配位體(經合成而具有多種保護基中之任一者的配位體，或連接有連接部分的配位體)直接反應。
用於本發明結合物中之寡核苷酸可方便地且常規地經由熟知的固相合成技術製備。此合成設備由若干供應商出售，包括例如Applied Biosystems(Foster City,Calif.)。另外或可替代地使用此項技術中已知之用於此合成的任何其他方式。亦已知可使用類似技術製備其他寡核苷酸，諸如硫代磷酸酯及烷基化衍生物。
在本發明之配位體與寡核苷酸結合物及具有序列特異性所連核苷之配位體分子中，寡核苷酸及寡核苷可經由適合DNA合成儀、使用標準核苷酸或核苷前驅物或已具有連接部分之核苷酸或核苷結合物前驅物、已具有配位體分子之配位體-核苷酸或核苷結合物前驅物、或具有非核苷配位體之基本組分組裝而成。
使用已具有連接部分之核苷酸結合物前驅物時，典型地完成序列特異性所連核苷之合成，且接著使配位體分子與連接部分反應以形成配位體與寡核苷酸結合物。在一些實施例中，本發明之寡核苷酸或所連核苷係藉由自動化合成儀、使用衍生自配位體-核苷結合物之亞磷醯胺(除市售及通常用於合成寡核苷酸的標準亞磷醯胺及非標準亞磷醯胺之外)合成。
脂質結合物
在一個實施例中，配位體為脂質或基於脂質之分子。此脂質或基於脂質之分子可典型地結合血清蛋白，諸如人類血清白蛋白(HSA)。HSA結合配位體使得結合物可分佈至目標組織，例如身體之非腎臟目標組織。舉例而言，目標組織可為肝臟，包括肝臟之實質細胞。可結合HSA的其他分子亦可用作配位體。舉例而言，可使用萘普生或阿司匹靈。脂質或基於脂質之配位體可(a)增強結合物之抗降解性，(b)增強靶向或運輸至目標細胞或細胞膜中，及/或(c)可用於調節與例如HSA之血清蛋白的結合。
基於脂質之配位體可用於調節(例如控制(例如抑制))結合物與目標組織之結合。舉例而言，與HSA結合更強的脂質或基於脂質之配位體靶向腎臟的可能性較小且因此自身體排除的可能性較小。與HSA結合不太強的脂質或基於脂質之配位體可用於使結合物靶向腎臟。
在一個實施例中，基於脂質之配位體結合HSA。舉例而言，配位體可以足以增強結合物分佈至非腎臟組織的親和力結合HSA。然而，親和力典型地不會強的使HSA-配位體結合不能逆轉。
在另一個實施例中，基於脂質之配位體與HSA的結合較弱或根據不結合，從而增強結合物分佈至腎臟中。代替或除基於脂質之配位體之外，亦可使用靶向腎臟細胞的其他部分。
在另一個態樣中，配位體為由目標細胞(例如增殖細胞)吸收的部分，例如維生素。此等部分特別適用於治療以非所需細胞增殖為特徵的病症，例如惡性或非惡性類型(例如癌細胞)之病症。例示性維生素包括維生素A、E及K。其他例示性維生素包括維生素B，例如葉酸、B12、核黃素、維生素H、吡哆醛或癌細胞所吸收的其他維生素或營養。亦包括HSA及低密度脂蛋白(LDL)。
細胞滲透劑
在另一個態樣中，配位體為細胞滲透劑，諸如螺旋形細胞滲透劑。在一個實施例中，該藥劑為兩親藥劑。例示性藥劑為肽，諸如Tat或觸角足蛋白。若藥劑為肽，則其可經修飾，包括肽模擬物、反轉異構體、非肽或假肽鍵聯，及使用D-胺基酸。螺旋劑典型地為α-螺旋劑，且可具有親脂相及疏脂相。
配位體可為肽或肽模擬物。肽模擬物(本文中亦稱為寡肽模擬物)為能夠摺疊成類似於天然肽之所定義三維結構的分子。肽及肽模擬物連接至iRNA劑可影響iRNA之藥物動力學分佈，諸如增強細胞識別及吸收。肽或肽模擬物部分可為約5-50個胺基酸長，例如約5、10、15、20、25、30、35、40、45或50個胺基酸長。
肽或肽模擬物可為例如細胞滲透肽、陽離子型肽、兩性肽或疏水性肽(例如主要由Tyr、Trp或Phe組成)。肽部分可為樹枝狀聚合物肽、限制肽或交聯肽。在另一替代方案中，肽部分可包括疏水性膜易位序列(MTS)。例示性疏水性含MTS肽為具有胺基酸序列AAVALLPAVLLALLAP(SEQ ID NO：1)的RFGF。含有疏水性MTS的RFGF類似物(例如胺基酸序列AALLPVLLAAP(SEQ ID NO：2))亦可為靶向部分。肽部分可為「遞送」肽，其可攜帶大極性分子(包括肽、寡核苷酸及蛋白質)越過細胞膜。舉例而言，已發現HIV Tat蛋白(GRKKRRQRRRPPQ(SEQ ID NO：3))及果蠅觸角足蛋白(RQIKIWFQNRRMKWKK(SEQ ID NO：4))的序列能夠起遞送肽的作用。肽或肽模擬物可由DNA之隨機序列編碼，諸如自噬菌體呈現文庫鑑別之肽，或一珠粒-一化合物(OBOC)組合文庫(Lam等人，Nature,354：82-84,1991)。典型地，經由所合併單體單元系連至dsRNA藥劑的肽或肽模擬物為細胞靶向肽，諸如精胺酸-甘胺酸-天冬胺酸(RGD)-肽，或RGD模擬物。肽部分的長度可在約5個胺基酸至約40個胺基酸範圍內。肽部分可具有結構性修飾，以便增強穩定性或導引構形性特 性。可使用任何結構性修飾。
用於本發明之組合物及方法中的RGD肽可為線性或環形，且可經修飾，例如糖基化或甲基化，以促進靶向特定組織。含RGD肽及肽模擬物可包括D-胺基酸以及合成RGD模擬物。除RGD之外，可使用靶向整合素配位體的其他部分。此配位體之較佳結合物靶向PECAM-1或VEGF。
RGD肽部分可用於靶向特定細胞類型，例如腫瘤細胞，諸如內皮腫瘤細胞或乳癌腫瘤細胞(Zitzmann等人，Cancer Res.,62：5139-43,2002)。RGD肽可促進dsRNA藥劑靶向多種其他組織之腫瘤，包括肺、腎臟、脾臟或肝臟(Aoki等人，Cancer Gene Therapy 8：783-787,2001)。典型地，RGD肽促進iRNA藥劑靶向腎臟。RGD肽可為線性或環形，且可經修飾，糖基化或甲基化，以促進靶向特定組織。舉例而言，糖基化RGD肽可將iRNA藥劑遞送至表現αVβ3的腫瘤細胞(Haubner等人，Jour.Nucl.Med.,42：326-336,2001)。
「細胞滲透肽」能夠滲透細胞，例如微生物細胞，諸如細菌或真菌細胞，或哺乳動物細胞，諸如人類細胞。微生物細胞滲透肽可為例如α-螺旋形線性肽(例如LL-37或Ceropin P1)、含有二硫鍵之肽(例如α-防禦素(α-defensin)、β-防禦素或抗菌肽(bactenecin))，或僅含有一或兩個主導胺基酸的肽(例如PR-39或封閉肽(indolicidin))。細胞滲透肽亦可包括核定位信號(NLS)。舉例而言，細胞滲透肽可為對分兩性肽，諸如MPG，其來源於HIV-1 gp41之融合肽域及SV40大型T抗原之NLS(Simeoni等人，Nucl.Acids Res.31：2717-2724,2003)。
碳水化合物結合物
在本發明之組合物及方法的一些實施例中，iRNA寡核苷酸進一步包含碳水化合物。碳水化合物與iRNA結合物有利於活體內遞送適於活體內治療性用途之核酸以及組合物，如本文所述。如本文所用， 「碳水化合物」係指本身為碳水化合物的化合物，其由一或多個具有至少6個碳原子與鍵結至各碳原子之氧、氮或硫原子的單糖單元(其可為線性、分支鏈或環狀)組成；或碳水化合物部分作為其一部分的化合物，該碳水化合物部分由一或多個各具有至少六個碳原子與鍵結至各碳原子之氧、氮或硫原子的單糖單元(其可為線性、分支鏈或環狀)組成。代表性碳水化合物包括糖(含有約4、5、6、7、8或9個單糖單元的單糖、二糖、三糖及寡糖)，及多糖，諸如澱粉、糖原、纖維素及多糖樹膠。特定單糖包括C5及上述(例如C5、C6、C7或C8)糖；二糖及三糖，包括具有兩或三個單糖單元的糖(例如C5、C6、C7或C8)。
在一個實施例中，碳水化合物結合物包含單糖。在一個實施例中，單糖為N-乙醯半乳糖胺(GalNAc)。GalNAc結合物描述於例如美國專利第8,106,022號中，該專利之全部內容以引用的方式併入本文中。在一些實施例中，GalNAc結合物充當使iRNA靶向特定細胞的配位體。在一些實施例中，GalNAc結合物使iRNA靶向肝細胞，例如充當肝臟細胞(例如肝細胞)之脫唾液酸醣蛋白受體的配位體。
在一些實施例中，碳水化合物結合物包含一或多種GalNAc衍生物。GalNAc衍生物可經由連接子連接，例如經由二價或三價分支連接子連接。在一些實施例中，GalNAc結合物與有義股之3'端結合。在一些實施例中，GalNAc結合物經由連接子(例如如本文所述的連接子)與iRNA藥劑(例如與有義股之3'端)結合。
在一些實施例中，GalNAc結合物為
在一些實施例中，RNAi藥劑與如表2中所定義且如下文所示之L96結合
在一些實施例中，碳水化合物結合物進一步包含一或多種如上文所述的其他配位體，諸如(但不限於)PK調節劑及/或細胞滲透肽。
在一個實施例中，本發明之iRNA經由連接子與碳水化合物結合。
連接子
在一些實施例中，本文所述的結合物或配位體可經由可分裂或不可分裂的各種連接子連接至iRNA寡核苷酸。
術語「連接子」或「連接基團」意謂使化合物之兩個部分連接(例如使化合物之兩個部分共價連接)的有機部分。連接子典型地包含直接鍵或原子，諸如氧或硫；單元，諸如NR8、C(O)、C(O)NH、SO、SO2、SO2NH或原子鏈，諸如(但不限於)經取代或未經取代之烷基、經取代或未經取代之烯基、經取代或未經取代之炔基、芳基烷基、芳基烯基、芳基炔基、雜芳基烷基、雜芳基烯基、雜芳基炔基、雜環基烷基、雜環基烯基、雜環基炔基、芳基、雜芳基、雜環基、環 烷基、環烯基、烷基芳基烷基、烷基芳基烯基、烷基芳基炔基、烯基芳基烷基、烯基芳基烯基、烯基芳基炔基、炔基芳基烷基、炔基芳基烯基、炔基芳基炔基、烷基雜芳基烷基、烷基雜芳基烯基、烷基雜芳基炔基、烯基雜芳基烷基、烯基雜芳基烯基、烯基雜芳基炔基、炔基雜芳基烷基、炔基雜芳基烯基、炔基雜芳基炔基、烷基雜環基烷基、烷基雜環基烯基、烷基雜環基炔基、烯基雜環基烷基、烯基雜環基烯基、烯基雜環基炔基、炔基雜環基烷基、炔基雜環基烯基、炔基雜環基炔基、烷基芳基、烯基芳基、炔基芳基、烷基雜芳基、烯基雜芳基、炔基雜芳基(其中一或多個亞甲基可由O、S、S(O)、SO2、N(R8)、C(O)間雜或封端)、經取代或未經取代之芳基、經取代或未經取代之雜芳基、經取代或未經取代之雜環，其中R8為氫、醯基、脂族或經取代之脂族。在一個實施例中，連接子為約1-24個原子、2-24個原子、3-24個原子、4-24個原子、5-24個原子、6-24個原子、6-18個原子、7-18個原子、8-18個原子、7-17個原子、8-17個原子、6-16個原子、7-16個原子，或8-16個原子。
在一個實施例中，本發明之dsRNA與二價或三價分支連接子結合，該連接子選自式(XXXI)至式(XXXIV)任一者所示之結構之群。
其中：q2A、q2B、q3A、q3B、q4A、q4B、q5A、q5B及q5C每次出現時獨立地表示0-20且其中重複單元可相同或不同；P2A、P2B、P3A、P3B、P4A、P4B、P5A、P5B、P5C、T2A、T2B、T3A、T3B、T4A、T4B、T4A、T5B、T5C每次出現時各自獨立地為不存在、CO、NH、O、S、OC(O)、NHC(O)、CH2、CH2NH或CH2O；Q2A、Q2B、Q3A、Q3B、Q4A、Q4B、Q5A、Q5B、Q5C每次出現時獨立地為不存在、伸烷基、經取代之伸烷基，其中一或多個亞甲基可由以下一或多者間雜或封端：O、S、S(O)、SO2、N(RN)、C(R')=C(R")、C≡C或C(O)；R2A、R2B、R3A、R3B、R4A、R4B、R5A、R5B、R5C每次出現時各自獨立地為不存在、NH、O、S、CH2、C(O)O、C(O)NH、 NHCH(Ra)C(O)、-C(O)-CH(Ra)-NH-、CO、CH=N-O、、 、、、或雜環 基；L2A、L2B、L3A、L3B、L4A、L4B、L5A、L5B及L5C表示配位體；亦即每次出現時各自獨立地為單糖(諸如GalNAc)、二糖、三糖、四糖、寡糖或多糖；且Ra為H或胺基酸側鏈。三價結合性GalNAc衍生物特別適合與抑制目標基因表現的RNAi藥劑一起使用，諸如式(XXXV)之彼等物： 其中L5A、L5B及L5C表示單糖，諸如GalNAc衍生物。
與GalNAc衍生物結合之適合二價及三價分支連接基團之實例包括(但不限於)如上文式II、VII、XI、X及XIII所述之結構。
可分裂連接基團為在細胞外足夠穩定、但在進入目標細胞內時分裂而釋放兩個部分的連接基團，該兩個部分經連接子而固持在一起。在較佳實施例中，可分裂連接基團在目標細胞中或在第一參考條件(例如可經選擇以模擬或代表細胞內條件)下分裂的速度為在個體之血液中或在第二參考條件(例如可經選擇以模擬或代表發現於血液或血清中的條件)下之分裂速度的至少約10倍、20倍、30倍、40倍、50倍、60倍、70倍、80倍、90倍或超過90倍。
可分裂連接基團對分裂劑(例如pH、氧化還原電位或降解分子之存在)敏感。一般而言，與血清或血液中相比，分裂劑在細胞內的含量或活性更佔優勢或發現更高。此等降解劑之實例包括：選作特定受質或不具有受質特異性的氧化還原劑，包括例如存在於細胞中之可藉由還原而使氧化還原性可分裂連接基團降解的氧化或還原酶或還原 劑，諸如硫醇；酯酶；內體或可產生酸性環境的藥劑，例如使得pH值為5或低於5的彼等物；可藉由充當通用酸而使酸可分裂連接基團水解或降解的酶；肽酶(其可具受質特異性)；及磷酸酶。
可分裂鍵聯基團(諸如二硫鍵)可對pH敏感。人類血清之pH值為7.4，而平均細胞內pH值稍微較低，其範圍為約7.1-7.3。內體具有5.5-6.0範圍內之更具酸性的pH值，且溶酶體具有約5.0之更具酸性的pH值。一些連接子具有在較佳pH下分裂的可分裂連接基團，從而在細胞內使陽離子型脂質自配位體釋放，或釋入細胞之所要代謝區中。
連接子可包括可藉由特定酶分裂的可分裂連接基團。併入連接子內之可分裂連接基團的類型可視所靶向的細胞而定。舉例而言，靶向肝臟的配位體可經由包括酯基的連接子連接至陽離子型脂質。肝細胞富含酯酶，且因此連接子在肝細胞中的分裂效率高於不富含酯酶的細胞類型。富含酯酶的其他細胞類型包括肺、腎皮質及睾丸之細胞。
當靶向富含肽酶的細胞類型(諸如肝細胞及滑膜細胞)時，可使用含有肽鍵的連接子。
一般而言，候選可分裂連接基團之適合性可藉由測試降解劑(或條件)使候選連接基團分裂的能力來評估。亦合乎需要的是亦測試候選可分裂連接基團在血液中或與其他非目標組織接觸時抗分裂的能力。因此，可測定第一條件與第二條件之間對分裂的相對敏感性，其中第一條件經選擇可指示分裂發生於目標細胞中且第二條件經選擇可指示分裂發生於其他組織或生物學流體中，例如血液或血清。評估可針對無細胞系統、細胞、細胞培養物、器官或組織培養物或完整動物進行。其可適用於初始在無細胞或培養條件下進行評估及藉由對完整動物進一步評估來證明。在較佳實施例中，有用候選化合物在細胞中(或在為模擬細胞內條件所選的活體外條件下)的分裂速度為在血液或血清中(或在為模擬細胞外條件所選的活體外條件下)的至少約2、4、 10、20、30、40、50、60、70、80、90或約100倍。
氧化還原性可分裂連接基團
在一個實施例中，可分裂連接基團為在還原或氧化下分裂的氧化還原性可分裂連接基團。還原性可分裂連接基團之實例為二硫化物連接基團(-S-S-)。為確定候選可分裂連接基團是否為適合的「還原性可分裂連接基團」或例如是否適合與特定iRNA部分及特定靶向劑一起使用，可關注本文所述的方法。舉例而言，候選物可藉由與二硫蘇糖醇(DTT)或其他還原劑(使用此項技術中已知的試劑)一起培育來評估，從而模擬可在細胞(例如目標細胞)中觀測到之分裂的速率。候選物亦可在經選擇可模擬血液或血清條件的條件下評估。在一種條件下，候選化合物在血液中分裂至多約10%。在其他實施例中，有用候選化合物在細胞中(或在為模擬細胞內條件所選的活體外條件下)的降解速度為在血液中(或在為模擬細胞外條件所選的活體外條件下)的至少約2、4、10、20、30、40、50、60、70、80、90或約100倍。候選化合物之分裂速率可使用標準酶動力學分析、在為模擬細胞內介質所選的條件下測定且與為模擬細胞外介質所選之條件進行比較。
基於磷酸酯之可分裂連接基團
在另一個實施例中，可分裂連接子包含基於磷酸酯之可分裂連接基團。基於磷酸酯之可分裂連接基團係藉由使磷酸酯基降解或水解的藥劑分裂。使磷酸酯基在細胞中分裂的藥劑實例為酶，諸如細胞中之磷酸酶。基於磷酸酯之連接基團之實例為-O-P(O)(ORk)-O-、-O-P(S)(ORk)-O-、-O-P(S)(SRk)-O-、-S-P(O)(ORk)-O-、-O-P(O)(ORk)-S-、-S-P(O)(ORk)-S-、-O-P(S)(ORk)-S-、-S-P(S)(ORk)-O-、-O-P(O)(Rk)-O-、-O-P(S)(Rk)-O-、-S-P(O)(Rk)-O-、-S-P(S)(Rk)-O-、-S-P(O)(Rk)-S-、-O-P(S)(Rk)-S-。較佳實施例為-O-P(O)(OH)-O-、-O-P(S)(OH)-O-、-O-P(S)(SH)-O-、-S-P(O)(OH)-O-、-O-P(O)(OH)-S-、-S-P(O)(OH)-S-、-O- P(S)(OH)-S-、-S-P(S)(OH)-O-、-O-P(O)(H)-O-、-O-P(S)(H)-O-、-S-P(O)(H)-O、-S-P(S)(H)-O-、-S-P(O)(H)-S-、-O-P(S)(H)-S-。較佳實施例為-O-P(O)(OH)-O-。此等候選物可使用類似於上述方法的方法評估。
酸可分裂連接基團
在另一個實施例中，可分裂連接子包含酸可分裂連接基團。酸可分裂連接基團為在酸性條件下分裂的連接基團。在較佳實施例中，酸可分裂連接基團係在pH值為約6.5或低於6.5(例如約6.0、5.75、5.5、5.25、5.0或低於5.0)的酸性環境下分裂，或藉由藥劑(諸如可充當通用酸的酶)分裂。在細胞中，特定低pH胞器(諸如內體及溶酶體)可為酸可分裂連接基團提供分裂環境。酸可分裂連接基團之實例包括(但不限於)腙、酯及胺基酸之酯。酸可分裂基團可具有通式-C=NN-、C(O)O或-OC(O)。較佳實施例為連接至酯(烷氧基)中之氧的碳為芳基、經取代之烷基或第三烷基，諸如二甲基戊基或第三丁基。此等候選物可使用類似於上述方法的方法評估。
基於酯之可分裂連接基團
在另一個實施例中，可分裂連接子包含基於酯之可分裂連接基團。基於酯之可分裂連接基團藉由細胞中之酶(諸如酯酶及醯胺酶)分裂。基於酯之可分裂連接基團之實例包括(但不限於)伸烷基、伸烯基及伸炔基之酯。酯可分裂連接基團具有通式-C(O)O-或-OC(O)-。此等候選物可使用類似於上述方法的方法評估。
基於肽之可分裂連接基團
在又一個實施例中，可分裂連接子包含基於肽之可分裂連接基團。基於肽之可分裂連接基團藉由細胞中之肽酶及蛋白酶分裂。基於肽之可分裂連接基團為胺基酸之間形成的肽鍵以產生寡肽(例如二肽、三肽等)及多肽。基於肽之可分裂基團不包括醯胺基(-C(O)NH-)。 醯胺基可形成於任何伸烷基、伸烯基或伸炔基之間。肽鍵為胺基酸之間形成的特定類型之醯胺鍵以產生肽及蛋白質。基於肽之分裂基團通常限於胺基酸之間所形成的肽鍵(亦即醯胺鍵)，從而產生肽及蛋白質，且不包括整個醯胺官能基。基於肽之可分裂連接基團具有通式-NHCHRAC(O)NHCHRBC(O)-，其中RA及RB為兩個相鄰胺基酸之R基團。此等候選物可使用類似於上述方法的方法評估。
教示製備RNA結合物之代表性美國專利包括(但不限於)美國專利第4,828,979號、第4,948,882號、第5,218,105號、第5,525,465號、第5,541,313號、第5,545,730號、第5,552,538號、第5,578,717號、第5,580,731號、第5,591,584號、第5,109,124號、第5,118,802號、第5,138,045號、第5,414,077號、第5,486,603號、第5,512,439號、第5,578,718號、第5,608,046號、第4,587,044號、第4,605,735號、第4,667,025號、第4,762,779號、第4,789,737號、第4,824,941號、第4,835,263號、第4,876,335號、第4,904,582號、第4,958,013號、第5,082,830號、第5,112,963號、第5,214,136號、第5,082,830號、第5,112,963號、第5,214,136號、第5,245,022號、第5,254,469號、第5,258,506號、第5,262,536號、第5,272,250號、第5,292,873號、第5,317,098號、第5,371,241號、第5,391,723號、第5,416,203號、第5,451,463號、第5,510,475號、第5,512,667號、第5,514,785號、第5,565,552號、第5,567,810號、第5,574,142號、第5,585,481號、第5,587,371號、第5,595,726號、第5,597,696號、第5,599,923號、第5,599,928號及第5,688,941號、第6,294,664號、第6,320,017號、第6,576,752號、第6,783,931號、第6,900,297號、第7,037,646號、第8,106,022號，該等專利每一者之全部內容以引用的方式併入本文中。
指定化合物中之所有位置不必均一地經修飾，且實際上，超過一個上述修飾可併入單一化合物中或甚至併入iRNA內之單一核苷 中。本發明亦包括作為嵌合化合物的iRNA化合物。
在本發明之上下文中，「嵌合」iRNA化合物或「嵌合體」為含有兩種或兩種以上化學不同區域的iRNA化合物，例如dsRNA，該等區域各由至少一個單體單元(在dsRNA化合物情況下，亦即核苷酸)組成。此等iRNA典型地含有至少一個其中RNA經修飾的區域，以便iRNA增強之抗核酸酶降解性、增強之細胞吸收及/或增強之對於目標核酸的結合親和力。iRNA之另一區域可充當受質以便酶能夠使RNA：DNA或RNA：RNA雜合體。舉例而言，核糖核酸酶H為使RNA：DNA雙螺旋之RNA股分裂的細胞核酸內切酶。因此活化核糖核酸酶H可使RNA目標分裂，從而大大增強iRNA抑制基因表現的效率。因此，與硫代磷酸酯脫氧dsRNA與相同目標區雜交相比，使用嵌合dsRNA時，由較短iRNA通常可得到類似的結果。RNA目標之分裂通常可藉由凝膠電泳偵測且必要時藉由此項技術中已知的相關核酸雜交技術偵測。
在某些情況下，iRNA中之RNA可由非配位體基團修飾。為了增強iRNA之活性、細胞分佈或細胞吸收，已使多種非配位體分子與iRNA結合，且可利用科學文獻中之程序執行此等結合。此等非配位體部分包括脂質部分，諸如膽固醇(Kubo,T.等人，Biochem.Biophys.Res.Comm.,2007,365(1)：54-61；Letsinger等人，Proc.Natl.Acad.Sci.USA,1989,86：6553)、膽酸(Manoharan等人，Bioorg.Med.Chem.Lett.,1994,4：1053)、硫醚(例如己基均三苯基甲硫醇)(Manoharan等人，Ann.N.Y.Acad.Sci.,1992,660：306；Manoharan等人，Bioorg.Med.Chem.Let.,1993,3：2765)、硫代膽固醇(Oberhauser等人，Nucl.Acids Res.,1992,20：533)、脂族鏈(例如十二烷二醇或十一烷基殘基)(Saison-Behmoaras等人，EMBO J.,1991,10：111；Kabanov等人，FEBS Lett.,1990,259：327；Svinarchuk等人，Biochimie,1993,75：49)、磷脂(例如二-十六烷基-外消旋-甘油或三乙銨1,2-二-O-十六烷基-外消旋-甘油基 -3-H-膦酸酯)(Manoharan等人，Tetrahedron Lett.,1995,36：3651；Shea等人，Nucl.Acids Res.,1990,18：3777)、聚胺或聚乙二醇鏈(Manoharan等人，Nucleosides & Nucleotides,1995,14：969)或金剛烷乙酸(Manoharan等人，Tetrahedron Lett.,1995,36：3651)、棕櫚基部分(Mishra等人，Biochim.Biophys.Acta,1995,1264：229)或十八烷基胺或己胺基羰基氧基膽固醇部分(Crooke等人，J.Pharmacol.Exp.Ther.,1996,277：923)。教示製備此等RNA結合物的代表性美國專利已列於上文中。典型結合方案包括合成在序列之一或多個位置具有胺基連接子的RNA。接著使用適當偶合或活化試劑使胺基與所結合之分子反應。結合反應可用仍結合至固體載體之RNA執行或在RNA於液相中分裂之後執行。藉由HPLC純化RNA結合物，通常得到純結合物。
遞送核酸分子(iRNA)
遞送iRNA至有需要之個體可以許多不同的方式達成。活體內遞送可藉由將包含iRNA(例如dsRNA)的組合物投與個體來直接執行。或者，遞送可藉由投與一或多個編碼且導引iRNA表現的載體來間接地執行。此等替代方案進一步論述於下文中。
直接遞送
一般而言，遞送核酸分子的任何方法可適用於iRNA(參見例如Akhtar S.及Julian RL.(1992)Trends Cell.Biol.2(5)：139-144以及WO94/02595，該等文獻以全文引用的方式併入本文中)。然而，為了成功地活體內遞送iRNA分子，存在三個重要的考慮因素：(a)所遞送分子之生物學穩定性，(2)防止非特異性作用，及(3)所遞送分子於目標組織中之積聚。iRNA之非特異性作用可藉由局部投藥來最小化，例如藉由直接注入或植入組織(作為非限制性實例，腫瘤)內或表面投與製劑。局部投與治療部位可最大化藥劑之局部濃度，限制藥劑暴露於可能會受該藥劑損傷或可能使該藥劑降解的全身組織，且允許所投 與之iRNA分子的總劑量降低。若干研究已顯示當iRNA局部投與時，基因產物被成功地阻斷。舉例而言，VEGF dsRNA藉由玻璃體內注射眼內遞送於食蟹猴中(Tolentino,MJ.等人，(2004)Retina 24：132-138)與視網膜下注射於小鼠中(Reich,SJ.等人，(2003)Mol.Vis.9：210-216)均已顯示可在年齡相關性黃斑部變性之實驗模型中預防新血管生成。另外，dsRNA直接腫瘤內注射於小鼠中可減小腫瘤體積(Pille,J.等人，(2005)Mol.Ther.11：267-274)且可延長具有腫瘤之小鼠的存活期(Kim,WJ.等人，(2006)Mol.Ther.14：343-350；Li,S.等人，(2007)Mol.Ther.15：515-523)。RNA干擾亦已顯示藉由直接注射可成功地局部遞送至CNS(Dorn,G.等人，(2004)Nucleic Acids 32：e49；Tan,PH.等人，(2005)Gene Ther.12：59-66；Makimura,H.等人，(2002)BMC Neurosci.3：18；Shishkina,GT.等人，(2004)Neuroscience 129：521-528；Thakker,ER.等人，(2004)Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.101：17270-17275；Akaneya,Y.等人，(2005)J.Neurophysiol.93：594-602)及藉由鼻內投與而遞送至肺(Howard,KA.等人，(2006)Mol.Ther.14：476-484；Zhang,X.等人，(2004)J.Biol.Chem.279：10677-10684；Bitko,V.等人，(2005)Nat.Med.11：50-55)。全身性投與iRNA用於治療疾病時，RNA可經修飾或者使用藥物遞送系統遞送；兩種方法均可防止dsRNA在活體內被內切核酸酶及外切核酸酶快速降解。
修飾RNA或醫藥載劑亦可允許iRNA組合物靶向目標組織且避免非所需的脫靶效應。iRNA分子可藉由化學結合至其他基團(例如本文所述的脂質或碳水化合物基團)而加以修飾。此等結合物可用於使iRNA靶向特定細胞，例如肝臟細胞，例如肝細胞。舉例而言，GalNAc結合物或脂質(例如LNP)調配物可用於使iRNA靶向特定細胞，例如肝臟細胞，例如肝細胞。
親脂性基團(諸如膽固醇)增強細胞吸收且防止降解。舉例而言， 針對ApoB之iRNA與親脂性膽固醇部分的結合物全身性注入小鼠中且使得肝臟與空腸中之apoB mRNA基因表現被阻斷(Soutschek,J.等人，(2004)Nature 432：173-178)。iRNA與適體結合已顯示可在小鼠前列腺癌模型中抑制腫瘤生長及介導腫瘤消退(McNamara,JO.等人，(2006)Nat.Biotechnol.24：1005-1015)。在一個替代性實施例中，iRNA可使用藥物遞送系統(諸如奈米顆粒、樹枝狀聚合物、聚合物、脂質體或陽離子型遞送系統)遞送。帶正電荷的陽離子型遞送系統促進iRNA分子(帶負電荷)之結合且亦增強在帶負電荷細胞膜處的相互作用以允許細胞有效吸收iRNA。陽離子型脂質、樹枝狀聚合物或聚合物可結合至iRNA，或經誘導而形成封閉iRNA的微脂粒或微胞(參見例如Kim SH.等人，(2008)Journal of Controlled Release 129(2)：107-116)。當全身性投與時，形成微脂粒或微胞進一步防止iRNA降解。製備及投與陽離子型iRNA複合物的方法完全在熟悉此項技術者之能力範圍內(參見例如Sorensen,DR.等人，(2003)J.Mol.Biol 327：761-766；Verma,UN.等人，(2003)Clin.Cancer Res.9：1291-1300；Arnold,AS等人(2007)J.Hypertens.25：197-205，該等文獻以全文引用的方式併入本文中)。適用於全身性遞送iRNA之藥物遞送系統之一些非限制性實例包括DOTAP(Sorensen,DR.等人，(2003),supra；Verma,UN.等人，(2003)，同上)、Oligofectamine(「固體核酸脂質顆粒」)(Zimmermann,TS.等人，(2006)Nature 441：111-114)、心磷脂(Chien,PY.等人，(2005)Cancer Gene Ther.12：321-328；Pal,A.等人，(2005)Int J.Oncol.26：1087-1091)、聚伸乙基亞胺(Bonnet ME.等人，(2008)Pharm.Res.8月16日(電子版先於印刷版)；Aigner,A.(2006)J.Biomed.Biotechnol.71659)、Arg-Gly-Asp(RGD)肽(Liu,S.(2006)Mol.Pharm.3：472-487)，及聚醯胺基胺(Tomalia,DA.等人，(2007)Biochem.Soc.Trans.35：61-67；Yoo,H.等人，(1999)Pharm.Res. 16：1799-1804)。在一些實施例中，iRNA與環糊精形成複合物用於全身性投與。iRNA與環糊精之投與方法及醫藥組合物可見於美國專利第7,427,605號，該專利以全文引用的方式併入本文中。
載體所編碼之iRNA
在另一個態樣中，靶向目標基因的iRNA可由插入DNA或RNA載體中的轉錄單元表現(參見例如Couture,A等人，TIG.(1996),12：5-10；Skillern,A.等人，國際PCT公開案第WO 00/22113號；Conrad，國際PCT公開案第WO 00/22114號，及Conrad，美國專利第6,054,299號)。根據所用特定構築體及目標組織或細胞類型，表現可為短暫的(約數小時至數週)或持續的(數週至數月或更長)。此等轉殖基因可以線性構築體、環狀質體或病毒載體形式引入，該載體可為整合或非整合載體。轉殖基因亦可經構築以允許其以染色體外質體形式遺傳(Gassmann等人，Proc.Natl.Acad.Sci.USA(1995)92：1292)。
iRNA之個別股可自表現載體上之啟動子轉錄。在兩個各別股經表現而產生例如dsRNA的情況下，可將兩個各別表現載體共引入(例如藉由轉染或感染)入目標細胞中。或者，dsRNA之各個別股可藉由均位於同一表現質體上的啟動子轉錄。在一個實施例中，dsRNA以倒位重複形式表現，該倒位重複藉由連接子聚核苷酸序列連接，以使得dsRNA具有莖及環結構。
iRNA表現載體通常為DNA質體或病毒載體。與真核細胞(例如脊椎動物細胞)相容的表現載體可用於產生表現本文所述之iRNA的重組構築體。真核細胞表現載體已熟知於此項技術中且可獲自許多商業來源。通常，此等載體含有適宜的限制性位點供所要核酸區段插入。遞送iRNA表現載體可為全身性的，諸如藉由靜脈內或肌內投與、藉由投與自患者移植之目標細胞、隨後再引入患者體內，或藉由允許引入所要目標細胞內的任何其他方式。
iRNA表現質體可以與陽離子型脂質載劑(例如Oligofectamine)或基於非陽離子型脂質之載劑(例如Transit-TKOTM)的複合物形式轉染至目標細胞內。本發明亦涵蓋多次脂質轉染以便iRNA介導之阻斷基因表現在一週或超過一週期間內靶向目標RNA之不同區域。載體成功的引入宿主細胞內可使用多種已知方法監測。舉例而言，短暫轉染可用報導分子(諸如螢光標記，諸如綠色螢光蛋白(GFP))指示。離體細胞之穩定轉染可使用使所轉染細胞具有針對特定環境因素(例如抗生素及藥物)之抗性(諸如潮黴素B抗性)的標記確保。
可用於本文所述方法及組合物的病毒載體系統包括(但不限於)(a)腺病毒載體；(b)逆轉錄病毒載體，包括(但不限於)慢病毒載體、莫洛尼鼠科白血病病毒(moloney murine leukemia virus)等；(c)腺病毒相關病毒載體；(d)單純疱疹病毒載體；(e)SV40載體；(f)多形瘤病毒載體；(g)乳頭狀瘤病毒載體；(h)微小核糖核酸病毒載體；(i)痘病毒載體，諸如正痘病毒，例如痘苗病毒載體或禽痘病毒，例如金絲雀痘或禽痘；及(j)輔助依賴型或無腸腺病毒。複製缺陷性病毒亦可為有利的。不同載體可或不可併入細胞基因組內。需要時，構築體可包括用於轉染的病毒序列。或者，構築體可併入能夠進行游離型複製的載體內，例如EPV及EBV載體。用於重組表現iRNA的構築體通常需要調控元件，例如啟動子、增強子等，以確保目標細胞表現iRNA。考慮用於載體及構築體的其他態樣進一步描述於下文中。
適用於遞送iRNA的載體包括足以使所要目標細胞或組織表現iRNA的調控元件(啟動子、增強子等)。調控元件可經選擇以提供組成性或調控性/誘導性表現。
iRNA之表現可精確地加以調控，例如藉由使用對某些生理學調節劑(例如循環葡萄糖含量或激素)敏感的誘導性調控序列加以調控(Docherty等人，1994,FASEB J.8：20-24)。適於控制細胞或哺乳動物表 現dsRNA的此等誘導性表現系統包括例如藉由蛻皮激素、雌激素、孕酮、四環素、二聚合化學誘導劑及異丙基-β-D1-硫代半乳糖苷(IPTG)調控。熟習此項技術者能夠根據iRNA轉殖基因之預定用途選擇適當調控/啟動子序列。
在一特定實施例中，可使用含有編碼iRNA之核酸序列的病毒載體。舉例而言，可使用逆轉錄病毒載體(參見Miller等人，Meth.Enzymol.217：581-599(1993))。此等逆轉錄病毒載體含有病毒基因組之正確包裝及整合入宿主細胞DNA中所必需的組分。將編碼iRNA的核酸序列選殖入一或多個載體中，此有利於將核酸遞送至患者中。關於逆轉錄病毒載體的更多細節可見於例如Boesen等人，Biotherapy 6：291-302(1994)中，其描述使用逆轉錄病毒載體將mdr1基因遞送至造血幹細胞中以便製備對化學療法更具抗性的幹細胞。說明使用逆轉錄病毒載體於基因療法中的其他參考文獻為：Clowes等人，J.Clin.Invest.93：644-651(1994)；Kiem等人，Blood 83：1467-1473(1994)；Salmons及Gunzberg,Human Gene Therapy 4：129-141(1993)；及Grossman及Wilson,Curr.Opin.於Genetics and Devel.3：110-114(1993)。預期使用的慢病毒載體包括例如基於HIV之載體，其描述於美國專利第6,143,520號、第5,665,557號及第5,981,276號中，該等專利以引用的方式併入本文中。
亦預期腺病毒用於遞送iRNA。腺病毒為特別有吸引力的媒劑，例如用於遞送基因至呼吸道上皮。腺病毒容易感染呼吸道上皮，引起輕度疾病。基於腺病毒之遞送系統的其他目標為肝臟、中樞神經系統、內皮細胞及肌肉。腺病毒具有能夠感染非分裂細胞的優勢。Kozarsky及Wilson,Current Opinion in Genetics and Development 3：499-503(1993)評述了基於腺病毒之基因療法。Bout等人，Human Gene Therapy 5：3-10(1994)顯示使用腺病毒載體將基因轉殖入恆河猴 呼吸道上皮中。使用腺病毒於基因療法中之其他情形可見於Rosenfeld等人，Science 252：431-434(1991)；Rosenfeld等人，Cell 68：143-155(1992)；Mastrangeli等人，J.Clin.Invest.91：225-234(1993)；PCT公開案WO94/12649中；及Wang等人，Gene Therapy 2：775-783(1995)。適用於表現本發明所述之iRNA的AV載體、用於建構重組AV載體的方法及用於遞送載體至目標細胞中的方法描述於Xia H等人，(2002),Nat.Biotech. 20：1006-1010。
亦預期使用腺病毒相關病毒(AAV)載體(Walsh等人，Proc.Soc.Exp.Biol.Med.204：289-300(1993)；美國專利第5,436,146號)。在一個實施例中，iRNA可以兩種各別的互補單股RNA分子形式由具有例如U6或H1 RNA啟動子或巨細胞病毒(CMV)啟動子的重組AAV載體表現。適用於表現本發明所述之dsRNA的AAV載體、用於建構重組AV載體的方法及用於遞送載體至目標細胞中的方法描述於Samulski R等人，(1987),J.Virol.61：3096-3101；Fisher K J等人，(1996),J.Virol,70：520-532；Samulski R等人，(1989),J.Virol.63：3822-3826；美國專利第5,252,479號；美國專利第5,139,941號；國際專利申請案第WO 94/13788號；及國際專利申請案第WO 93/24641號，該等文獻之全部揭示內容以引用的方式併入本文中。
另一種典型病毒載體為痘病毒，諸如痘苗病毒，例如減毒豆苗，諸如經修飾之病毒安卡拉(Modified Virus Ankara，MVA)或NYVAC(一種禽痘病毒，諸如禽痘或金絲雀痘)。
適當時，可藉由用被膜蛋白或來自其他病毒之其他表面抗原對載體進行假型包裝或藉由不同病毒衣殼蛋白取代來修改病毒載體之向性。舉例而言，慢病毒載體可用來自水皰性口腔炎病毒(VSV)、狂犬病、埃博拉病毒(Ebola)、莫科拉病毒(Mokola)及其類似病毒的表面蛋白進行假型包裝。可藉由對載體進行工程改造以表現不同衣殼蛋白血 清型來製得靶向不同細胞的AAV載體；參見例如Rabinowitz J E等人，(2002),J Virol 76：791-801，該文獻之全部揭示內容以引用的方式併入本文中。
載體之醫藥製劑可包括載體於可接受之稀釋劑中，或可包括嵌埋遞送媒劑的緩釋基質。或者，在可由重組細胞完整產生全基因遞送載體(例如逆轉錄病毒載體)的情況下，醫藥製劑可包括一或多個產生基因遞送系統的細胞。
含有核酸分子(iRNA)的醫藥組合物
在一個實施例中，本發明提供醫藥組合物，其含有本文所述之iRNA及醫藥學上可接受之載劑。含有iRNA的醫藥組合物適用於治療與目標基因表現或活性相關的疾病或病症。此等醫藥組合物係根據遞送模式加以調配。舉例而言，組合物係根據經由非經腸遞送的全身性投與(例如靜脈內(IV)遞送)加以調配。在一些實施例中，本文提供的組合物(例如LNP調配物)係根據靜脈內遞送加以調配。在一些實施例中，本文提供的組合物(例如包含GalNAc結合物的組合物)係根據皮下遞送加以調配。
本文描述的醫藥組合物係以足以抑制目標基因表現的劑量投與。一般而言，iRNA之適合劑量在每公斤接受者體重每天0.01至200.0毫克範圍內，通常在每公斤體重每天1至50mg範圍內。舉例而言，以單次劑量計，dsRNA可以0.05mg/kg、0.5mg/kg、1mg/kg、1.5mg/kg、2mg/kg、3mg/kg、10mg/kg、20mg/kg、30mg/kg、40mg/kg或50mg/kg投與。醫藥組合物可每日投與一次，或iRNA可在整日之適當間隔時間以兩、三或三個以上次劑量投與，或甚至使用連續輸注或遞送、經由控制釋放型調配物投與。在彼情況下，各次劑量中所含之iRNA必須相應地較小，以便達成每日總劑量。劑量單元亦可經混配以便在若干日期間遞送，例如使用習知持續釋放型調配物，其 提供iRNA在若干日期間之持續釋放。持續釋放型調配物已熟知於此項技術中且特別適用於在特定部位(諸如可使用本發明藥劑之部位)遞送藥劑。在此實施例中，劑量單元含有相應多個每日劑量。
單次劑量對目標基因含量的作用可為長效的，使得在不超過3、4或5日間隔時間或在不超過1、2、3或4週間隔時間投與後續劑量。
熟習此項技術者將瞭解，某些因素可能影響有效治療個體所必需的劑量及時機，包括(但不限於)疾病或病症之嚴重程度、先前療法、個體之一般健康狀況及/或年齡，及存在的其他疾病。此外，用治療有效量之組合物治療個體可包括單一治療或一系列治療。利用習知方法或根據使用適當動物模型的活體內測試可估算本發明所包涵之個別iRNA的有效劑量及活體內半衰期，如本文中別處所述。
小鼠遺傳學之發展已產生多種小鼠模型供研究各種人類疾病之用，諸如與目標基因表現相關的病理過程。此等模型可用於活體內測試iRNA，以及用於確定治療有效劑量及/或有效給藥方案。
適合的小鼠模型為例如含有轉殖基因、表現人類目標基因的小鼠。具有敲入突變的小鼠可用於確定目標基因siRNA之治療有效劑量及/或持續投與時間。本發明亦包括醫藥組合物及調配物，其包括本發明所述之iRNA化合物。本發明之醫藥組合物可以多種方式投與，此視是否需要局部或全身性治療及所治療之區域而定。投藥可為局部(例如藉由經皮貼片)、肺(例如藉由吸入或吹入粉末或氣溶膠，包括藉由噴霧器吸入或吹入)、氣管內、鼻內、表皮及經皮、經口或非經腸。非經腸投藥包括靜脈內、動脈內、皮下、腹膜內或肌內注射或輸注；皮下，例如經由所植入裝置；或顱內(例如腦實質內)、鞘內或心室內投藥。
iRNA可以靶向特定組織(諸如產生紅血球的組織)的方式遞送。舉例而言，iRNA可遞送至骨髓、肝臟(例如肝臟之肝細胞)、淋巴腺、 脾臟、肺(例如肺之胸膜)或脊柱。在一個實施例中，iRNA遞送至骨髓中。
用於局部投藥的醫藥組合物及調配物可包括經皮貼片、軟膏、洗液、乳膏、凝膠、滴劑、栓劑、噴霧劑、液體及散劑。習知醫藥載劑、水性、粉末或油性基質、增稠劑及其類似物可為必需的或合乎需要的。塗佈避孕套、手套及其類似物亦可為有用的。適合的局部調配物包括其中本發明所述之iRNA與局部遞送劑(諸如脂質、脂質體、脂肪酸、脂肪酸酯、類固醇、螯合劑及界面活性劑)混合的彼等物。適合的脂質及脂質體包括中性(例如二油醯基磷脂醯基乙醇胺DOPE、二肉豆蔻醯基磷脂醯基膽鹼DMPC、二硬脂醯磷脂醯基膽鹼)、陰離子型(例如二肉豆蔻醯基磷脂醯基甘油DMPG)及陽離子型(例如二油醯基四甲基胺基丙基DOTAP及二油醯基磷脂醯基乙醇胺DOTMA)。本發明所述之iRNA可囊封於脂質體內或可與其形成複合物，特定而言，與陽離子型脂質體形成複合物。或者，iRNA可與脂質(特定而言，陽離子型脂質)形成複合物。適合脂肪酸及酯包括(但不限於)花生四烯酸、油酸、花生酸、月桂酸、辛酸、癸酸、肉豆蔻酸、棕櫚酸、硬脂酸、亞油酸、亞麻酸、二癸酸酯、三癸酸酯、單油酸甘油酯、二月桂酸甘油酯、1-單癸酸甘油酯、1-十二烷基氮雜環庚-2-酮、醯基肉鹼、醯基膽鹼、或C1-20烷基酯(例如肉豆蔻酸異丙酯IPM)、單酸甘油酯、二酸甘油酯或其醫藥學上可接受之鹽。局部調配物詳細描述於美國專利第6,747,014號中，該專利以引用的方式併入本文中。
脂質體調配物
除微乳液之外，已研究許多有機化界面活性劑結構且用於調配藥物。此等結構包括單層、微胞、雙層及微脂粒。根據藥物遞送之觀點，微脂粒(諸如脂質體)因其提供的特異性及持續作用時間而受到較大關注。如本發明中所用，術語「脂質體」意謂由以球形雙層排列之 兩親脂質組成的微脂粒。
脂質體為單層或多層微脂粒，其具有由親脂性材料形成的膜及水性內部。水性部分含有所遞送的組合物。陽離子型脂質體具有能夠與細胞壁融合的優點。非陽離子型脂質體雖然不能有效地與細胞壁融合，但被活體內巨噬細胞吸收。
為了穿過完整哺乳動物皮膚，脂質微脂粒必須在適合經皮梯度的影響下通過一系列各具小於50nm直徑的精細孔隙。因此，需要使用高度可變形且能夠通過此等精細孔隙的脂質體。
脂質體之其他優點包括；獲自天然磷脂的脂質體具生物相容性及生物降解性；脂質體可合併多種水溶性及脂質溶解性藥物；脂質體可防止其內部隔室中所囊封之藥物發生代謝及降解(Rosoff，於Pharmaceutical Dosage Forms,Lieberman,Rieger及Banker(編)，1988,Marcel Dekker,Inc.,New York,N.Y.，第1卷，第245頁)。製備脂質體調配物的重要考量為脂質表面電荷、微脂粒尺寸及脂質體之含水體積。
脂質體適用於將活性成分轉移及遞送至作用位點。因為脂質體膜在結構上類似於生物膜，因此當脂質體施加於組織時，脂質體開始與細胞膜融合且隨著脂質體與細胞之融合進展，脂質體內含物排入細胞中，活性劑在細胞中可起作用。
脂質體調配物作為許多藥物之遞送模式已成為廣泛研究之焦點。愈來愈多的證據表明，就局部投藥而言，脂質體呈現優於其他調配物的若干優勢。此等優勢包括與所投藥物之高度全身性吸收相關的副作用減少、所投藥物在所要目標處的積聚增加，及能夠將多種親水性及疏水性藥物投與皮膚內。
若干報導已詳述脂質體能夠將包括高分子量DNA的藥劑遞送至皮膚內。包括止痛劑、抗體、激素及高分子量DNA的化合物已投與皮 膚。大部分用藥可靶向上表層。
脂質體分成兩個寬廣類別。陽離子型脂質體為帶正電荷的脂質體，其與帶負電荷的DNA分子相互作用而形成穩定複合物。帶正電荷的DNA/脂質體複合物結合至帶負電荷的細胞表面且在內體中內在化。脂質體由於內體內之酸性pH而發生破裂，從而將其內含物釋入細胞的細胞質中(Wang等人，Biochem.Biophys.Res.Commun.,1987,147,980-985)。
對pH敏感的或帶負電荷的脂質體截留DNA，而非與其形成複合物。由於DNA與脂質帶電相似，因此存在斥力，而非形成複合物。然而，一些DNA截留於此等脂質體之水性內部。pH敏感性脂質體已用於將編碼胸苷激酶基因的DNA遞送至培養中之細胞單層。偵測到外源基因在目標細胞中之表現(Zhou等人，Journal of Controlled Release,1992,19,269-274)。
一種主要類型的脂質體組合物包括除天然來源之磷脂醯膽鹼之外的磷脂。中性脂質體組合物例如可由二肉豆蔻醯基磷脂醯膽鹼(DMPC)或二棕櫚醯磷脂醯膽鹼(DPPC)形成。陰離子型脂質體組合物通常由二肉豆蔻醯基磷脂醯甘油形成，而陰離子型膜融合脂質體主要由二油醯磷脂醯乙醇胺(DOPE)形成。另一類型的脂質體組合物由磷脂醯膽鹼(PC)(例如大豆PC及卵PC)形成。另一種類型係由磷脂及/或磷脂醯膽鹼及/或膽固醇之混合物形成。
若干研究已對脂質體藥物調配物局部遞送至皮膚進行評估。含有干擾素之脂質體施加於天竺鼠皮膚可減少皮膚疱疹潰瘍，而經由其他方式遞送干擾素的效率低(Weiner等人，Journal of Drug Targeting,1992,2,405-410)。此外，另一研究測試作為脂質體調配物(利用水系統投與干擾素)之一部分投與之干擾素的功效，且推斷出脂質體調配物優於水溶液投藥(du Plessis等人，Antiviral Research,1992,18,259- 265)。
亦已檢查非離子型脂質體系統(特定而言，包含非離子型界面活性劑及膽固醇的系統)以測定其遞送藥物至皮膚的效用。包含NovasomeTM I(二月桂酸甘油酯/膽固醇/聚氧乙烯-10-十八烷基醚)及NovasomeTM II(二硬脂酸甘油酯/膽固醇/聚氧乙烯-10-十八烷基醚)的非離子型脂質體調配物用於將環孢菌素-A(cyclosporin-A)遞送至小鼠皮膚之真皮中。結果表明此等非離子型脂質體系統有效促進環孢菌素-A沈積於皮膚之不同層中(Hu等人，S.T.P.Pharma.Sci.,1994,4,6,466)。
脂質體亦包括「空間穩定化」脂質體，如本文所用，該術語係指包含一或多種特殊化脂質的脂質體，該等脂質併入脂質體中時，使得循環壽命比缺乏此等特殊化脂質的脂質體延長。空間穩定化脂質體之實例為如下脂質體：脂質體之微脂粒形成脂質部分中的一部分(A)包含一或多種糖脂，諸如單唾液酸神經節苷脂GM1，或(B)經一或多種親水性聚合物(諸如聚乙二醇(PEG)部分)衍生化。不希望受任何特定理論束縛，此項技術中認為，至少對於含有神經節苷脂、神經鞘磷脂或PEG衍生化脂質的空間穩定化脂質體而言，此等空間穩定化脂質體之循環半衰期延長歸因於網狀內皮系統(RES)之細胞吸收減少(Allen等人，FEBS Letters,1987,223,42；Wu等人，Cancer Research,1993,53,3765)。
包含一或多種糖脂的各種脂質體已知於此項技術中。Papahadjopoulos等人(Ann.N.Y.Acad.Sci.,1987,507,64)報導單唾液酸神經節苷脂GM1、半乳糖腦苷脂硫酸酯及磷脂醯肌醇能夠延長血液中脂質體半衰期。Gabizon等人解釋了此等發現(Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.,1988,85,6949)。美國專利第4,837,028號及WO 88/04924(均頒予Allen等人)揭示包含(1)神經鞘磷脂及(2)神經節苷脂GM1或半乳糖 腦苷脂硫酸酯的脂質體。美國專利第5,543,152號(Webb等人)揭示包含神經鞘磷脂的脂質體。包含1,2-sn-二肉豆蔻醯基磷脂醯膽鹼的脂質體揭示於WO 97/13499(Lim等人)中。
經一或多種親水性聚合物衍生化的包含脂質之許多脂質體及其製備方法已知於此項技術中。Sunamoto等人(Bull.Chem.Soc.Jpn.,1980,53,2778)描述包含含有PEG部分之非離子型洗滌劑2C1215G的脂質體。Illum等人(FEBS Lett.,1984,167,79)提及聚合物二醇親水性塗佈聚苯乙烯顆粒使血液半衰期明顯延長。Sears(美國專利第4,426,330號及第4,534,899號)描述藉由連接聚烷二醇(例如PEG)之羧基來修飾合成磷脂。Klibanov等人(FEBS Lett.,1990,268,235)描述的實驗顯示，包含經PEG或PEG硬脂酸酯衍生化之磷脂醯乙醇胺(PE)的脂質體之血液循環半衰期明顯延長。Blume等人(Biochimica et Biophysica Acta,1990,1029,91)將此等觀測結果推廣至其他PEG衍生化磷脂，例如由二硬脂醯磷脂醯乙醇胺(DSPE)與PEG組合而形成的DSPE-PEG。外表面上共價結合PEG部分的脂質體描述於歐洲專利第EP 0 445 131 B1號及WO 90/04384(頒予Fisher)。Woodle等人(美國專利第5,013,556號及第5,356,633號)及Martin等人(美國專利第5,213,804號及歐洲專利第EP 0 496 813 B1號)描述含有1-20莫耳%之PEG衍生化PE的脂質體組合物及其使用方法。包含許多其他脂質-聚合物結合物的脂質體揭示於WO 91/05545及美國專利第5,225,212號(兩者均頒予Martin等人)及WO 94/20073(Zalipsky等人)中。包含經PEG修飾之神經醯胺脂質的脂質體描述於WO 96/10391(Choi等人)中。美國專利第5,540,935號(Miyazaki等人)及美國專利第5,556,948號(Tagawa等人)描述含有PEG之脂質體，其可在其表面上經官能部分進一步衍生化。
包含核酸的多種脂質體已知於此項技術中。頒予Thierry等人的WO 96/40062揭示將高分子量核酸囊封於脂質體中的方法。頒予 Tagawa等人的美國專利第5,264,221號揭示蛋白質鍵結之脂質體且宣稱此等脂質體之內含物可包括dsRNA。頒予Rahman等人的美國專利第5,665,710號描述將寡脫氧核苷酸囊封於脂質體中的某些方法。頒予Love等人的WO 97/04787揭示包含靶向raf基因之dsRNA的脂質體。
傳遞體為又一種類型的脂質體，且為高度可變形的脂質聚集物，其為有吸引力的藥物遞送媒劑候選物。傳遞體可描述為脂質小滴，其如此高度可變形以致其能容易穿透小於小滴的孔隙。傳遞體可適應於其所使用的環境，例如其為自最佳化(適應於皮膚中孔隙之形狀)、自修復的，通常到達其目標而不碎裂，且通常為自裝載的。為製備傳遞體，可將表面邊緣活化劑(通常為界面活性劑)添加至標準脂質體組合物中。傳遞體已用於將血清白蛋白遞送至皮膚中。傳遞體介導之血清白蛋白遞送已顯示與皮下注射含有血清白蛋白的溶液同樣有效。
界面活性劑廣泛應用於調配物中，諸如乳液(包括微乳液)及脂質體。對許多不同類型之界面活性劑(天然與合成)之特性進行分類及分級的最常見方式為利用親水/親油平衡值(HLB)。親水基(亦稱為「頭」)之性質為對調配物中所用之不同界面活性劑分類提供最有用的方式(Rieger，於Pharmaceutical Dosage Forms,Marcel Dekker,Inc.,New York,N.Y.,1988，第285頁)。
若界面活性劑分子不發生離子化，則其歸類為非離子型界面活化劑。非離子型界面活性劑廣泛應用於醫藥及化妝品產品中且可在很寬的pH值內使用。一般而言，視其結構而定，其HLB值範圍為2至約18。非離子型界面活性劑包括非離子型酯，諸如乙二醇酯、丙二醇酯、甘油酯、聚甘油酯、脫水山梨糖醇酯、蔗糖酯及乙氧基化酯。非離子型烷醇醯胺及醚，諸如脂肪醇乙氧基化物、丙氧基化醇及乙氧基化/丙氧基化嵌段共聚物，亦包括於此類別中。聚氧乙烯界面活性劑 為非離子型界面活化劑類別中的最通用成員。
若界面活性劑分子溶解或分散於水中時攜帶負電荷，則該界面活性劑歸類為陰離子型。陰離子型界面活性劑包括羧酸酯，諸如皂、醯基乳酸酯、胺基酸之醯胺、硫酸之酯(諸如烷基硫酸酯及乙氧基化烷基硫酸酯)、磺酸酯(諸如烷基苯磺酸酯)、醯基羥乙基磺酸酯、醯基牛磺酸酯及磺基丁二酸酯及磷酸酯。陰離子型界面活化劑類別之最重要成員為烷基硫酸酯及皂。
若界面活性劑分子溶解或分散於水中時攜帶正電荷，則該界面活性劑歸類為陽離子型。陽離子型界面活性劑包括季銨鹽及乙氧基化胺。季銨鹽為此類別之最常用成員。
若界面活性劑分子具有攜帶正或負電荷的能力，則該界面活性劑歸類為兩性型。兩性型界面活性劑包括丙烯酸衍生物、經取代之烷基醯胺、N-烷基甜菜鹼及磷脂。
界面活性劑於藥品、調配物及乳液中之用途已有評述(Rieger，於Pharmaceutical Dosage Forms,Marcel Dekker,Inc.,New York,N.Y.,1988，第285頁)。
核酸脂質顆粒
在一個實施例中，目標基因dsRNA完全囊封於脂質調配物中，例如以形成SPLP、pSPLP、SNALP或其他核酸脂質顆粒。如本文所用，術語「SNALP」係指穩定的核酸-脂質顆粒，包括SPLP。如本文所用，術語「SPLP」係指包含質體DNA的核酸脂質顆粒，該質體DNA囊封於脂質微脂粒內。SNALP及SPLP通常含有陽離子型脂質、非陽離子型脂質及防止顆粒聚集的脂質(例如PEG-脂質結合物)。SNALP及SPLP非常適用於全身性用藥，因為其在靜脈內(i.v.)注射及在遠端部位(例如在身體上與投藥部位分隔的部位)聚集之後展現延長的循環壽命。SPLP包括「pSPLP」，其包括囊封之凝聚劑-核酸複合物，如PCT 公開案第WO 00/03683號中所述。本發明之顆粒通常具有約50nm至約150nm，更通常約60nm至約130nm，更通常約70nm至約110nm，最通常約70nm至約90nm之平均直徑，且實質上無毒。另外，核酸存在於本發明之核酸-脂質顆粒中時，在水溶液中對核酸酶之降解作用具有抗性。核酸-脂質顆粒及其製備方法揭示於例如美國專利第5,976,567號、第5,981,501號、第6,534,484號、第6,586,410號、第6,815,432號及PCT公開案第WO 96/40964號中。
在一個實施例中，脂質相對於藥物之比率(質量/質量比)(例如脂質相對於dsRNA之比率)的範圍為約1：1至約50：1、約1：1至約25：1、約3：1至約15：1、約4：1至約10：1、約5：1至約9：1，或約6：1至約9：1。
陽離子型脂質可為例如氯化N,N-二油基-N,N-二甲基銨(DODAC)、溴化N,N-二硬脂醯基-N,N-二甲基銨(DDAB)、氯化N-(1-(2,3-二油醯基氧基)丙基)-N,N,N-三甲基銨(DOTAP)、氯化N-(1-(2,3-二油基氧基)丙基)-N,N,N-三甲基銨(DOTMA)、N,N-二甲基-2,3-二油基氧基)丙胺(DODMA)、1,2-二亞麻油基氧基-N,N-二甲基胺基丙烷(DLinDMA)、1,2-二次亞麻油基氧基-N,N-二甲基胺基丙烷(DLenDMA)、1,2-二亞麻油基胺基甲醯基氧基-3-二甲基胺基丙烷(DLin-C-DAP)、1,2-二亞油氧基-3-(二甲基胺基)乙醯氧基丙烷(DLin-DAC)、1,2-二亞油氧基-3-嗎啉基丙烷(DLin-MA)、1,2-二亞油醯基-3-二甲基胺基丙烷(DLinDAP)、1,2-二亞麻油基硫基-3-二甲基胺基丙烷(DLin-S-DMA)、1-亞油醯基-2-亞麻油基氧基-3-二甲基胺基丙烷(DLin-2-DMAP)、1,2-二亞麻油基氧基-3-三甲基胺基丙烷氯化物鹽(DLin-TMA.Cl)、1,2-二亞油醯基-3-三甲基胺基丙烷氯化物鹽(DLin-TAP.Cl)、1,2-二亞麻油基氧基-3-(N-甲基哌嗪基)丙烷(DLin-MPZ)，或3-(N,N-二亞麻油基胺基)-1,2-丙二醇(DLinAP)、3-(N,N-二油基胺基)-1,2-丙二醇(DOAP)、1,2-二亞麻油基側氧基-3-(2-N,N-二甲基胺基)乙 氧基丙烷(DLin-EG-DMA)、1,2-二次亞麻油基氧基-N,N-二甲基胺基丙烷(DLinDMA)、2,2-二亞麻油基-4-二甲基胺基甲基-[1,3]-二氧雜環戊烷(DLin-K-DMA)或其類似物、(3aR,5s,6aS)-N,N-二甲基-2,2-二((9Z,12Z)-十八-9,12-二烯基)四氫-3aH-環戊并[d][1,3]二氧雜環戊烯-5-胺(ALN100)、4-(二甲基胺基)丁酸(6Z,9Z,28Z,31Z)-四十七-6,9,28,31-四烯-19-基酯(MC3)、1,1'-(2-(4-(2-((2-(雙(2-羥基十二烷基)胺基)乙基)(2-羥基十二烷基)胺基)乙基)哌嗪-1-基)乙基氮二基)二-十二烷-2-醇(Tech G1)，或其混合物。陽離子型脂質在存在於顆粒中之總脂質中佔約20mol%至約50mol%或約40mol%。
在另一個實施例中，化合物2,2-二亞麻油基-4-二甲基胺基乙基-[1,3]-二氧雜環戊烷可用於製備脂質-siRNA奈米顆粒。2,2-二亞麻油基-4-二甲基胺基乙基-[1,3]-二氧雜環戊烷之合成描述於2008年10月23日申請之美國臨時專利申請案第61/107,998中，該案以引用的方式併入本文中。
在一個實施例中，脂質-siRNA顆粒包括40% 2,2-二亞麻油基-4-二甲基胺基乙基-[1,3]-二氧雜環戊烷：10% DSPC：40%膽固醇：10% PEG-C-DOMG(莫耳%)，其粒徑為63.0±20nm且siRNA/脂質比率為0.027。
非陽離子型脂質可為陰離子型脂質或中性脂質，包括(但不限於)二硬脂醯基磷脂醯膽鹼(DSPC)、二油醯基磷脂醯膽鹼(DOPC)、二棕櫚醯基磷脂醯膽鹼(DPPC)、二油醯基磷脂醯甘油(DOPG)、二棕櫚醯基磷脂醯甘油(DPPG)、二油醯基磷脂醯乙醇胺(DOPE)、棕櫚醯基油醯基磷脂醯膽鹼(POPC)、棕櫚醯基油醯基磷脂醯乙醇胺(POPE)、二油醯基磷脂醯乙醇胺4-(N-順丁烯二醯亞胺基甲基)-環己烷-1-甲酸酯(DOPE-mal)、二棕櫚醯基磷脂醯乙醇胺(DPPE)、二肉豆蔻醯基磷酸乙醇胺(DMPE)、二硬脂醯基磷脂醯基乙醇胺(DSPE)、16-O-單甲基 PE、16-O-二甲基PE、18-1-反式PE、1-硬脂醯基-2-油醯基磷脂醯乙醇胺(SOPE)、膽固醇、或其混合物。若包括膽固醇，則非陽離子型脂質可為存在於顆粒中之總脂質的約5mol%至約90mol%、約10mol%、或約58mol%。
抑制顆粒聚集之所結合脂質可為例如聚乙二醇(PEG)-脂質，包括(不限於)PEG-二醯基甘油(DAG)、PEG-二烷氧基丙基(DAA)、PEG-磷脂、PEG-神經醯胺(Cer)，或其混合物。PEG-DAA結合物可為例如PEG-二月桂基氧基丙基(Ci2)、PEG-二肉豆蔻基氧基丙基(Ci4)、PEG-二棕櫚基氧基丙基(Ci6)，或PEG-二硬脂醯氧基丙基(Ci8)。防止顆粒聚集之所結合脂質可為存在於顆粒中之總脂質的0mol%至約20mol%，或約2mol%。
在一些實施例中，核酸脂質顆粒進一步包括膽固醇，例如存在於顆粒中之總脂質之約10mol%至約60mol%、或約48mol%的膽固醇。
在一些實施例中，iRNA於脂質奈米顆粒(LNP)中調配。
LNP01
在一個實施例中，可使用類脂質ND98．4HCl(MW 1487)(參見2008年3月26日申請的美國專利申請案第12/056,230號，該案以引用的方式併入本文中)、膽固醇(Sigma-Aldrich)及PEG-神經醯胺C16(Avanti Polar Lipids)製備脂質-dsRNA奈米顆粒(例如LNP01顆粒)。每一者於乙醇中之儲備溶液可如下製備：ND98，133mg/mL；膽固醇，25mg/mL，PEG-神經醯胺C16，100mg/mL。接著可將ND98、膽固醇及PEG-神經醯胺C16儲備溶液以例如42：48：10莫耳比合併。所合併之脂質溶液可與dsRNA水溶液(例如於乙酸鈉中，pH 5)混合，使得最終乙醇濃度為約35-45%且最終乙酸鈉濃度為約100-300mM。脂質-dsRNA奈米顆粒通常在混合時自發地形成。視所要粒徑分佈而定，所 得奈米顆粒混合物可利用例如熱筒擠出機(諸如Lipex擠出機(Northern Lipids,Inc))經由聚碳酸酯膜(例如100nm截止)擠出。在一些情況下，可省略擠出步驟。藉由例如透析或切向流過濾可達成乙醇移除及同時緩衝液交換。緩衝液可與例如磷酸鹽緩衝鹽水(PBS)在約pH 7(例如約pH 6.9、約pH 7.0、約pH 7.1、約pH 7.2、約pH 7.3或約pH 7.4)發生交換。
LNP01調配物描述於例如國際申請公開案第WO 2008/042973號中，該案以引用的方式併入本文中。
其他例示性脂質-dsRNA調配物提供於下表中。
DSPC：二硬脂醯基磷脂醯膽鹼
DPPC：二棕櫚醯基磷脂醯膽鹼
PEG-DMG：PEG-二肉豆蔻醯基甘油(C14-PEG，或PEG-C14)(PEG平均分子量為2000)
PEG-DSG：PEG-二苯乙烯基甘油(C18-PEG，或PEG-C18)(PEG平均分子量為2000)
PEG-cDMA：PEG-胺甲醯基-1,2-二肉豆蔻基氧基丙基胺(PEG平均分子量為2000)
包含SNALP(1,2-二次亞麻油基氧基-N,N-二甲基胺基丙烷(DLinDMA))的調配物描述於2009年4月15日申請的國際公開案第WO2009/127060號中，該案以引用的方式併入本文中。
包含XTC的調配物描述於例如2009年1月29日之美國臨時申請案第號、2009年3月2日申請之美國臨時申請案第61/156,851號、2009年6月10日申請之美國臨時申請案第號、2009年7月24日申請之美國臨時申請案第61/228,373號、2009年9月3日申請之美國臨時申請案第61/239,686號及2010年1月29日申請之國際申請案第PCT/US2010/022614號中，該等案以引用的方式併入本文中。
包含MC3的調配物描述於例如2009年9月22日申請之美國臨時申請案第61/244,834號、2009年6月10日申請之美國臨時申請案第61/185,800號及2010年6月10日申請之國際申請案第PCT/US10/28224號中，該等案以引用的方式併入本文中。
包含ALNY-100的調配物描述於例如2009年11月10日申請之國際專利申請案第PCT/US09/63933中，該案以引用的方式併入本文中。
包含C12-200的調配物描述於2009年5月5日申請之美國臨時申請案第61/175,770號及2010年5月5日申請之國際申請案第PCT/US10/33777號中，該等案以引用的方式併入本文中。
合成陽離子型脂質
本發明所述之核酸脂質顆粒中所用的任何化合物(例如陽離子型脂質及其類似物)可藉由已知的有機合成技術(包括實例中更詳細描述的方法)製備。除非另有說明，所有取代基如下文定義。
「烷基」意謂含有1至24個碳原子的直鏈或分支鏈、非環狀或環狀飽和脂族烴。代表性飽和直鏈烷基包括甲基、乙基、正丙基、正丁基、正戊基、正己基及其類似烷基；而飽和分支鏈烷基包括異丙基、第二丁基、異丁基、第三丁基、異戊基及其類似烷基。代表性飽和環烷基包括環丙基、環丁基、環戊基、環己基及其類似環烷基；而不飽和環烷基包括環戊烯基及環己烯基，及其類似環烷基。
「烯基」意謂如上文定義的烷基，含有至少一個位於相鄰碳原子之間的雙鍵。烯基包括順式及反式異構體。代表性直鏈及分支鏈烯基包括乙烯基、丙烯基、1-丁烯基、2-丁烯基、異丁烯基、1-戊烯基、2-戊烯基、3-甲基-1-丁烯基、2-甲基-2-丁烯基、2,3-二甲基-2-丁烯基及其類似烯基。
「炔基」意謂如上文定義的任何烷基或烯基另外含有至少一個位於相鄰碳之間的參鍵。代表性直鏈及分支鏈炔基包括乙炔基、丙炔基、1-丁炔基、2-丁炔基、1-戊炔基、2-戊炔基、3-甲基-1-丁炔基及其類似炔基。
「醯基」意謂任何烷基、烯基或炔基，其中位於連接點的碳經如下文定義的側氧基取代。舉例而言，-C(=O)烷基、-C(=O)烯基及-C(=O)炔基為醯基。
「雜環」意謂5員至7員單環或7員至10員雙環雜環，其為飽和、不飽和或芳族，且含有1或2個獨立選自氮、氧及硫之雜原子，且其中氮及硫雜原子可視情況經氧化，且氮雜原子可視情況四級化，包括其中任何上述雜環與苯環稠合的雙環。雜環可經由任何雜原子或碳原子連接。雜環包括如下文定義的雜芳基。雜環包括嗎啉基、吡咯啶酮 基、吡咯啶基、哌啶基、哌嗪基、乙內醯脲基、戊內醯胺基、環氧乙烷基、氧雜環丁烷基、四氫呋喃基、四氫哌喃基、四氫吡啶基、四氫嘧啶基、四氫噻吩基、四氫硫哌喃基、四氫嘧啶基、四氫噻吩基、四氫硫哌喃基及其類似雜環。
術語「視情況經取代之烷基」、「視情況經取代之烯基」、「視情況經取代之炔基」、「視情況經取代之醯基」及「視情況經取代之雜環」意謂經取代時，至少一個氫原子經取代基置換。在側氧基取代基(=O)的情況下，兩個氫原子被置換。就此而言，取代基包括側氧基、鹵素、雜環、-CN、-ORx、-NRxRy、-NRxC(=O)Ry 、-NRxSO2Ry、-C(=O)Rx、-C(=O)ORx、-C(=O)NRxRy、-SOnRx及-SOnNRxRy，其中n為0、1或2，Rx及Ry相同或不同且獨立地為氫、烷基或雜環，且該烷基及雜環取代基中之每一者可進一步經以下一或多者取代：側氧基、鹵素、-OH、-CN、烷基、-ORx、雜環、-NRxRy、-NRxC(=O)Ry、-NRxSO2Ry、-C(=O)Rx、-C(=O)ORx、-C(=O)NRxRy、-SOnRx及-SOnNRxRy。
「鹵素」意謂氟、氯、溴及碘。
在一些實施例中，本發明所述方法可能需要使用保護基。保護基方法已為熟習此項技術者所熟知(參見例如PROTECTIVE GROUPS IN ORGANIC SYNTHESIS,Green,T.W.等人，Wiley-Interscience,New York City,1999)。簡言之，在本發明之上下文內，保護基為降低或排除官能基之非所需反應性的任何基團。保護基可添加至官能基中以遮蔽其在某些反應期間的反應性且接著移除以暴露原始官能基。在一些實施例中，使用「醇保護基」。「醇保護基」為降低或排除醇官能基之非所需反應性的任何基團。保護基可利用此項技術中熟知的技術添加及移除。
式A之合成
在一個實施例中，本發明所述之核酸-脂質顆粒係使用式A之陽離子型脂質調配： 其中R1及R2獨立地為各自可視情況經取代之烷基、烯基或炔基，且R3及R4獨立地為低碳烷基或R3與R4可合起來形成視情況經取代之雜環。在一些實施例中，陽離子型脂質為XTC(2,2-二亞麻油基-4-二甲基胺基乙基-[1,3]-二氧雜環戊烷)。一般而言，上述式A之脂質可藉由以下反應流程1或2製備，其中所有取代基如上文定義，除非另有說明。
脂質A可根據流程1製備，其中R1及R2獨立地為各自可視情況經取代之烷基、烯基或炔基，且R3及R4獨立地為低碳烷基或R3與R4可合起來形成視情況經取代之雜環。酮1及溴化物2可購買或根據一般熟習此項技術者已知的方法製備。1與2反應而產生縮酮3。縮酮3用胺4處理，產生式A之脂質。式A之脂質可用式5之有機鹽轉化為相應銨鹽， 其中X為選自鹵素、氫氧根、磷酸根、硫酸根或其類似離子的陰離子相對離子。
或者，酮1起始物質可根據流程2製備。格林納試劑6及氰化物7可購買或根據一般熟習此項技術者已知的方法製備。6與7反應而產生酮1。酮1轉化為式A之相應脂質描述於流程1中。
MC3之合成
DLin-M-C3-DMA(亦即4-(二甲基胺基)丁酸(6Z,9Z,28Z,31Z)-四十七-6,9,28,31-四烯-19-基酯)如下製備。(6Z,9Z,28Z,31Z)-四十七-6,9,28,31-四烯-19-醇(0.53g)、4-N,N-二甲基胺基丁酸鹽酸鹽(0.51g)、4-N,N-二甲基胺基吡啶(0.61g)及1-乙基-3-(3-二甲基胺基丙基)碳化二亞胺鹽酸鹽(0.53g)於二氯甲烷(5mL)中的溶液在室溫下攪拌隔夜。溶液用稀鹽酸洗滌，隨後用稀碳酸氫鈉水溶液洗滌。有機部分經無水硫酸鎂乾燥，過濾且在旋轉蒸發器上移除溶劑。使殘餘物向下通過使用1-5%甲醇/二氯甲烷溶離梯度的矽膠管柱(20g)。合併含有純化產物的溶離份且移除溶劑，產生無色油狀物(0.54g)。
ALNY-100之合成
使用以下流程3合成縮酮519[ALNY-100]：
515之合成：
在0℃，在氮氣氛圍下，向兩頸RBF(1L)中之LiAlH4(3.74g，0.09852mol)於200ml無水THF中之經攪拌懸浮液中緩慢添加514(10g，0.04926mol)於70mL THF中之溶液。完全添加之後，將反應混合物溫熱至室溫且接著加熱至回流維持4小時。藉由TLC監測反應進展。反應完成(根據TLC)之後，將混合物冷卻至0℃且經由小心添加飽和Na2SO4溶液加以淬滅。反應混合物在室溫下攪拌4小時且過濾。殘餘物用THF充分洗滌。將濾液與洗滌液混合且用400mL二噁烷及26mL濃HCl稀釋且在室溫下攪拌20分鐘。在真空下汽提揮發物，得到呈白色固體狀之515鹽酸鹽。產量：7.12g。1H-NMR(DMSO,400MHz)：δ=9.34(寬，2H),5.68(s,2H),3.74(m,1H),2.66-2.60(m,2H),2.50-2.45(m,5H)。
516之合成：
向250mL兩頸RBF中之515於100mL無水DCM中之經攪拌溶液中添加NEt3(37.2mL，0.2669mol)且在氮氣氛圍下冷卻至0℃。緩慢添加含有N-(苯甲氧基-羰氧基)-丁二醯亞胺(20g，0.08007mol)之50mL無水DCM之後，將反應混合物溫熱至室溫。反應完成(2至3小時，根據TLC)之後，混合物依次用1N HCl溶液(1 x 100mL)及飽和NaHCO3溶液(1 x 50mL)洗滌。有機層接著經無水Na2SO4乾燥且蒸發溶劑，得到粗物質，藉由矽膠管柱層析法純化，得到呈黏塊狀之516。產量：11g(89%)。1H-NMR(CDCl3,400MHz)：δ=7.36-7.27(m,5H),5.69(s, 2H),5.12(s,2H),4.96(br.,1H)2.74(s,3H),2.60(m,2H),2.30-2.25(m,2H)。LC-MS[M+H]-232.3(96.94%)。
517A及517B之合成：
在500mL單頸RBF中，將環戊烯516(5g，0.02164mol)溶於220mL丙酮與水(10：1)之溶液中，且在室溫下向其中添加N-甲基嗎啉-N-氧化物(7.6g，0.06492mol)，隨後添加4.2mL之OsO4(0.275g，0.00108mol)於第三丁醇中之7.6%溶液。反應完成(約3小時)之後，經由添加固體Na2SO3來淬滅混合物且所得混合物在室溫下攪拌1.5小時。反應混合物用DCM(300mL)稀釋且用水(2 x 100mL)洗滌，隨後用飽和NaHCO3(1 x 50mL)溶液、水(1 x 30mL)洗滌且最後用鹽水(1 x 50mL)洗滌。有機相經Na2SO4乾燥且真空移除溶劑。粗物質經矽膠管柱層析法純化，得到非對映異構體混合物，藉由製備性HPLC分離。產量：6g粗物質。
517A-峰-1(白色固體)，5.13g(96%)。1H-NMR(DMSO,400MHz)：δ=7.39-7.31(m,5H),5.04(s,2H),4.78-4.73(m,1H),4.48-4.47(d,2H),3.94-3.93(m,2H),2.71(s,3H),1.72-1.67(m,4H)。LC-MS-[M+H]-266.3,[M+NH4+]-283.5存在，HPLC-97.86%。根據X射線確認立體化學構型。
518之合成：
使用類似於針對合成化合物505所述的程序獲得呈無色油狀之化合物518(1.2g，41%)。1H-NMR(CDCl3,400MHz)：δ=7.35-7.33(m,4H),7.30-7.27(m,1H),5.37-5.27(m,8H),5.12(s,2H),4.75(m,1H),4.58-4.57(m,2H),2.78-2.74(m,7H),2.06-2.00(m,8H),1.96-1.91(m,2H),1.62(m,4H),1.48(m,2H),1.37-1.25(br m,36H),0.87(m,6H)。HPLC-98.65%。
合成化合物519之通用程序：
化合物518(1eq)於己烷(15mL)中之溶液逐滴添加至LAH於THF(1M，2eq)中之冰冷溶液中。完全添加之後，混合物在40℃加熱0.5小時，接著再次在冰浴上冷卻。混合物小心地用Na2SO4飽和水溶液水解，接著經由矽藻土過濾且濃縮為油狀物。管柱層析得到純519(1.3g，68%)，其以無色油狀形式獲得。13C NMR=130.2,130.1(x2),127.9(x3),112.3,79.3,64.4,44.7,38.3,35.4,31.5,29.9(x2),29.7,29.6(x2),29.5(x3),29.3(x2),27.2(x3),25.6,24.5,23.3,226,14.1；電噴霧MS(+ve)：C44H80NO2(M+H)+分子量計算值654.6，實驗值654.6。
藉由標準方法或非擠出方法製備的調配物可以類似方式表徵。舉例而言，調配物通常藉由目測檢查來表徵。其應為不含聚集物或沈降物之稍帶白色的半透明溶液。脂質奈米顆粒之粒徑及粒徑分佈可藉由光散射、使用例如Malvern Zetasizer Nano ZS(Malvern,USA)量測。粒徑應為約20-300nm，諸如40-100nm。粒徑分佈應為單峰分佈。調配物中之總dsRNA濃度以及截留分率係使用染料排阻分析法估算。所調配dsRNA之樣品可與RNA結合染料(諸如Ribogreen(Molecular Probes))在調配物干擾性界面活性劑(例如0.5% Triton-X100)存在或不存在下培育。調配物中之總dsRNA可根據來自含有界面活性劑之樣品的信號相對於標準曲線來測定。截留分率係藉由自總dsRNA含量減去「自由」dsRNA含量(如根據缺乏界面活性劑時之信號所量測)來測定。所截留dsRNA百分比通常>85%。對於SNALP調配物而言，粒徑為至少30nm、至少40nm、至少50nm、至少60nm、至少70nm、至少80nm、至少90nm、至少100nm、至少110nm及至少120nm。適合範圍通常為約至少50nm至約至少110nm、約至少60nm至約至少100nm，或約至少80nm至約至少90nm。
經口投與的組合物及調配物包括散劑或顆粒、微顆粒、奈米顆 粒、於水或非水介質中之懸浮液或溶液、膠囊、凝膠膠囊、藥囊、錠劑或小型錠劑。增稠劑、調味劑、稀釋劑、乳化劑、分散助劑或黏合劑可為需要的。在一些實施例中，口服調配物為其中本發明所述之dsRNA結合一或多種穿透增強劑、界面活性劑及螯合劑投與的彼等物。適合界面活性劑包括脂肪酸及/或其酯或鹽、膽汁酸及/或其鹽。適合膽汁酸/鹽包括鵝脫氧膽酸(CDCA)及熊脫氧膽酸(UDCA)、膽酸、脫氫膽酸、脫氧膽酸、甘膽酸、甘胺膽酸、甘胺脫氧膽酸、牛磺膽酸、牛磺脫氧膽酸、牛磺-24,25-二氫-梭鏈孢酸鈉及甘胺二氫梭鏈孢酸鹽鈉。適合脂肪酸包括花生四烯酸、十一烷酸、油酸、月桂酸、辛酸、癸酸、肉豆蔻酸、棕櫚酸、硬脂酸、亞油酸、亞麻酸、二癸酸酯、三癸酸酯、單油酸甘油酯、二月桂酸甘油酯、1-單癸酸甘油酯、1-十二烷基氮雜環庚-2-酮、醯基肉鹼、醯基膽鹼、或單酸甘油酯、二酸甘油酯或其醫藥學上可接受之鹽(例如鈉鹽)。在一些實施例中，穿透增強劑組合使用，例如脂肪酸/鹽與膽汁酸/鹽組合。一種例示性組合為月桂酸、癸酸及UDCA之鈉鹽。其他穿透增強劑包括聚氧乙烯-9-十二烷基醚、聚氧乙烯-20-十六烷基醚。本發明所述之DsRNA可以顆粒形式(包括噴霧乾燥顆粒)經口遞送，或經複合而形成微顆粒或奈米顆粒。DsRNA複合劑包括聚胺基酸；聚亞胺；聚丙烯酸酯；聚烷基丙烯酸酯、聚氧雜環丁烷、聚烷基氰基丙烯酸酯；陽離子化明膠、白蛋白、澱粉、丙烯酸酯、聚乙二醇(PEG)及澱粉；聚烷基氰基丙烯酸酯；DEAE衍生化聚亞胺、普魯蘭多糖(pollulans)、纖維素及澱粉。適合複合劑包括幾丁聚糖、N-三甲基幾丁聚糖、聚L-離胺酸、聚組胺酸、聚鳥胺酸、聚精胺、魚精蛋白、聚乙烯基吡啶、聚硫代二乙基胺基甲基伸乙基P(TDAE)、聚胺苯乙烯(例如對胺基)、聚(甲基氰基丙烯酸酯)、聚(乙基氰基丙烯酸酯)、聚(丁基氰基丙烯酸酯)、聚(異丁基氰基丙烯酸酯)、聚(異己基氰基丙烯酸酯)、DEAE-甲基丙烯酸酯、 DEAE-己基丙烯酸酯、DEAE-丙烯醯胺、DEAE-白蛋白及DEAE-葡聚糖、聚甲基丙烯酸甲酯、聚己基丙烯酸酯、聚(D,L-乳酸)、聚(DL-乳酸-共-乙醇酸)(PLGA)、海藻酸酯、及聚乙二醇(PEG)。dsRNA之口服調配物及其製劑詳細描述於美國專利6,887,906、美國公開案第20030027780號及美國專利第6,747,014號中，該等案各以引用的方式併入本文中。
非經腸、腦實質內(入腦)、鞘內、心室內或肝內投與之組合物及調配物可包括無菌水溶液，其亦可含有緩衝劑、稀釋劑及其他適合添加劑，諸如(但不限於)穿透增強劑、載劑化合物及其他醫藥學上可接受之載劑或賦形劑。
本發明之醫藥組合物包括(但不限於)溶液、乳液及含有脂質體的調配物。此等組合物可由包括(但不限於)預形成液體、自乳化固體及自乳化半固體的多種組分產生。
宜以單位劑型呈遞之本發明所述醫藥調配物可根據製藥工業中熟知的習知技術製備。此等技術包括將活性成分與醫藥載劑或賦形劑合併的步驟。一般而言，調配物係藉由將活性成分與液體載劑或細粉狀固體載劑或兩者均一且緊密地合併且必要時接著使產物成形來製備。
本發明所述組合物可調配成多種可能劑型中之任一者，諸如(但不限於)錠劑、膠囊、凝膠膠囊、液體糖漿、軟凝膠、栓劑及灌腸劑。組合物亦可於水性、非水性或混合介質中調配成懸浮液。水性懸浮液可進一步含有使懸浮液之黏度增強的物質，包括例如羧甲基纖維素鈉、山梨糖醇及/或葡聚糖。懸浮液亦可含有穩定劑。
其他調配物 乳液
本發明之組合物可製備且調配成乳液。乳液通常為一種液體分 散於另一種呈液滴形式之直徑超過0.1mm之液體中的非均相系統(參見例如Ansel's Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems,Allen,LV.,Popovich NG.，及Ansel HC.,2004,Lippincott Williams & Wilkins(第8版)，New York,NY；Idson，於Pharmaceutical Dosage Forms,Lieberman,Rieger及Banker(編)，1988,Marcel Dekker,Inc.,New York,N.Y.，第1卷，第199頁；Rosoff，於Pharmaceutical Dosage Forms,Lieberman,Rieger及Banker(編)，1988,Marcel Dekker,Inc.,New York,N.Y.，第1卷，第245頁；Block，於Pharmaceutical Dosage Forms,Lieberman,Rieger及Banker(編)，1988,Marcel Dekker,Inc.,New York,N.Y.，第2卷，第335頁；Higuchi等人，於Remington's Pharmaceutical Sciences,Mack Publishing Co.,Easton,Pa.,1985，第301頁)。乳液通常為雙相系統，其包含兩個緊密混合且彼此間分散的不混溶液相。一般而言，乳液可為油包水(w/o)或水包油(o/w)類型。當水相經精細分裂成及分散成微小液滴進入整體油相中時，所得組合物稱作油包水型(w/o)乳液。或者，當水相精細分裂成及分散成微小液滴進入整體水相中時，所得組合物稱作水包油型(o/w)乳液。乳液可含有除分散相之外的其他組分，及可以溶液形式存在於水相、油相中或自身以分相存在的活性藥物。需要時，醫藥賦形劑(諸如乳化劑、穩定劑、染料及抗氧化劑)亦可存在於乳液中。醫藥乳液亦可為包含超過兩個相的多重乳液，諸如在油包水包油型(o/w/o)及水包油包水型(w/o/w)乳液之情況下。此等複合調配物通常提供簡單二元乳液不具有的某些優勢。其中o/w型乳液之個別油滴封閉小水滴的多重乳液組成w/o/w型乳液。同樣，穩定存在於連續油相中之水珠中所封閉之油滴的系統提供o/w/o型乳液。
乳液具有很小或無熱力學穩定性的特徵。通常，乳液之分散相或不連續相完全分散於外相或連續相中且經由乳化劑之方式或調配物 之黏性而維持此形式。乳液中之任一相可為半固體或固體，乳液型軟膏基質及乳膏就是如此。穩定乳液之其他方式需要使用可併入乳液之任一相中的乳化劑。乳化劑可廣泛分成四類：合成界面活性劑、天然存在之乳化劑、吸收性基質及精細分散之固體(參見例如Ansel's Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems,Allen,LV.,Popovich NG.，及Ansel HC.,2004,Lippincott Williams & Wilkins(第8版)，New York,NY；Idson，於Pharmaceutical Dosage Forms,Lieberman,Rieger及Banker(編)，1988,Marcel Dekker,Inc.,New York,N.Y.，第1卷，第199頁)。
合成界面活性劑(亦稱為表面活性劑)廣泛適用於調配乳液且已評述於文獻中(參見例如Ansel's Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems,Allen,LV.,Popovich NG.，及Ansel HC.,2004,Lippincott Williams & Wilkins(第8版)，New York,NY；Rieger，於Pharmaceutical Dosage Forms,Lieberman,Rieger及Banker(編)，1988,Marcel Dekker,Inc.,New York,N.Y.，第1卷，第285頁；Idson，於Pharmaceutical Dosage Forms,Lieberman,Rieger及Banker(編)，Marcel Dekker,Inc.,New York,N.Y.,1988，第1卷，第199頁)。界面活性劑通常為兩親型且包含親水性及疏水性部分。界面活性劑之親水性與疏水性之比率稱為親水/親油平衡值(HLB)且為製備調配物時分類及選擇界面活性劑的重要工具。界面活性劑可根據親水基之性質分成不同類別：非離子型、陰離子型、陽離子型及兩性型(參見例如Ansel's Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems,Allen,LV.,Popovich NG.，及Ansel HC.,2004,Lippincott Williams & Wilkins(第8版)，New York,NY Rieger，於Pharmaceutical Dosage Forms,Lieberman,Rieger及Banker(編)，1988,Marcel Dekker,Inc.,New York,N.Y.，第1卷，第285頁)。
乳液調配物中所用之天然存在之乳化劑包括羊毛脂、蜂蠟、磷脂、卵磷脂及阿拉伯膠。吸收性基質具有親水特性，使得其可吸收水而形成w/o型乳液，但保留其半固體稠度，諸如無水羊毛脂及親水性石蠟脂。細粉狀固體亦已作為良好乳化劑(特別是與界面活性劑組合)用於黏性製劑。此等固體包括極性無機固體，諸如重金屬氫氧化物、非溶脹黏土(諸如皂土、鎂質膨土、鋰皂石、高嶺土、蒙脫石、膠體矽酸鋁及膠體矽酸鎂鋁)、顏料及非極性固體，諸如碳或三硬脂酸甘油酯。
多種非乳化物質亦包括於乳液調配物中且促成乳液之特性。此等物質包括脂肪、油、蠟、脂肪酸、脂肪醇、脂肪酸酯、保濕劑、親水膠體、防腐劑及抗氧化劑(Block，於Pharmaceutical Dosage Forms,Lieberman,Rieger及Banker(編)，1988,Marcel Dekker,Inc.,New York,N.Y.，第1卷，第335頁；Idson，於Pharmaceutical Dosage Forms,Lieberman,Rieger及Banker(編)，1988,Marcel Dekker,Inc.,New York,N.Y.，第1卷，第199頁)。
親水膠體或水狀膠體包括天然存在之樹膠及合成聚合物，諸如多糖(例如阿拉伯膠、瓊脂、海藻酸、角叉菜膠、瓜耳豆膠、刺梧桐樹膠及黃著膠)、纖維素衍生物(例如羧甲基纖維素及羧丙基纖維素)，及合成聚合物(例如卡波姆(carhomer)、纖維素醚及羧乙烯基聚合物)。此等物分散或溶脹於水中而形成膠體溶液，此等膠體溶液藉由圍繞分散相液滴形成強界面薄膜及藉由提高外相黏度而使乳液穩定。
因為乳液通常含有容易促進微生物生長的許多成分，諸如碳水化合物、蛋白質、固醇及磷脂，此等調配物通常合併有防腐劑。乳液調配物中所包括之常用防腐劑包括對羥基苯甲酸甲酯、對羥苯甲酸丙酯、季銨鹽、氯化苯甲烴銨、對羥基苯甲酸酯及硼酸。乳液調配物中通常亦添加抗氧化劑以防止調配物變質。所用抗氧化劑可為自由基清 除劑，諸如生育酚、沒食子酸烷基酯、丁基化羥基甲氧苯、丁基化羥基甲苯；或還原劑，諸如抗壞血酸及偏亞硫酸氫鈉；及抗氧化增效劑，諸如檸檬酸、酒石酸及卵磷脂。
乳液調配物經由皮膚、經口及非經腸途徑之施藥及其製造方法已評述於文獻中(參見例如Ansel's Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems,Allen,LV.,Popovich NG.，及Ansel HC.,2004,Lippincott Williams & Wilkins(第8版)，New York,NY；Idson，於Pharmaceutical Dosage Forms,Lieberman,Rieger及Banker(編)，1988,Marcel Dekker,Inc.,New York,N.Y.，第1卷，第199頁)。經口遞送之乳液調配物因容易調配以及功效(根據吸收及生物可利用性觀點)而使用非常廣泛(參見例如Ansel's Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems,Allen,LV.,Popovich NG.，及Ansel HC.,2004,Lippincott Williams & Wilkins(第8版)，New York,NY；Rosoff，於Pharmaceutical Dosage Forms,Lieberman,Rieger及Banker(編)，1988,Marcel Dekker,Inc.,New York,N.Y.，第1卷，第245頁；Idson，於Pharmaceutical Dosage Forms,Lieberman,Rieger及Banker(編)，1988,Marcel Dekker,Inc.,New York,N.Y.，第1卷，第199頁)。礦物質-油基瀉藥、油溶性維生素及高脂肪營養製劑為通常以o/w型乳液形式經口投與的物質。
在本發明之一個實施例中，iRNA與核酸之組合物調配成微乳液。微乳液可定義為水、油及兩親體之系統，該系統為單一光學各向同性及熱力學穩定液體溶液(參見例如Ansel's Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems,Allen,LV.,Popovich NG.，及Ansel HC.,2004,Lippincott Williams & Wilkins(第8版)，New York,NY；Rosoff，於Pharmaceutical Dosage Forms,Lieberman,Rieger及Banker(編)，1988,Marcel Dekker,Inc.,New York,N.Y.，第1卷，第245頁)。通 常，微乳液為如下製備的系統：首先將油分散於界面活性劑水溶液中且接著添加足量之第四組分(通常為中等鏈長醇)以形成透明系統。因此，微乳液亦描述成兩種不混溶液體之熱力學穩定、各向同性透明分散液，其藉由表面活性分子之界面薄膜穩定化(Leung及Shah，於：Controlled Release of Drugs：Polymers and Aggregate Systems,Rosoff,M.編，1989,VCH Publishers,New York，第185-215頁)。微乳液通常經由三至五種組分之組合(包括油、水、界面活性劑、共界面活性劑及電解質)來製備。微乳液是否為油包水型(w/o)或水包油型(o/w)取決於油及所用界面活性劑之特性及界面活性劑分子之結構及極性頭及烴尾之幾何組裝(Schott，於Remington's Pharmaceutical Sciences,Mack Publishing Co.,Easton,Pa.,1985，第271頁)。
利用相圖的現象學方法已得到廣泛研究且讓熟悉此項技術者全面地瞭解如何調配微乳液(參見例如Ansel's Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems,Allen,LV.,Popovich NG.，及Ansel HC.,2004,Lippincott Williams & Wilkins(第8版)，New York,NY；Rosoff，於Pharmaceutical Dosage Forms,Lieberman,Rieger及Banker(編)，1988,Marcel Dekker,Inc.,New York,N.Y.，第1卷，第245頁；Block，於Pharmaceutical Dosage Forms,Lieberman,Rieger及Banker(編)，1988,Marcel Dekker,Inc.,New York,N.Y.，第1卷，第335頁)。與習知乳液相比，微乳液提供的優勢為使水不溶性藥物溶解於自發形成之熱力學穩定液滴之調配物中。
用於製備微乳液的界面活性劑包括(但不限於)單獨或與共界面活性劑組合的離子型界面活性劑、非離子型界面活性劑、Brij 96、聚氧乙烯油基醚、脂肪酸聚甘油酯、單月桂酸四甘油酯(ML310)、單油酸四甘油酯(MO310)、單油酸六甘油酯(PO310)、五油酸六甘油酯(PO500)、單癸酸十甘油酯(MCA750)、單油酸十甘油酯(MO750)、倍 半油酸十甘油酯(SO750)、十油酸十甘油酯(DAO750)。由於界面活性劑分子間產生空隙空間，因此共界面活性劑(通常為短鏈醇，諸如乙醇、1-丙醇及1-丁醇)藉由滲入界面活性劑膜中且因此產生無序膜而用於增強界面流動性。然而，微乳液可不使用共界面活性劑製備且非醇自乳化微乳液系統已知於此項技術中。水相通常可為(但不限於)水、藥物之水溶液、甘油、PEG300、PEG400、聚甘油、丙二醇，及乙二醇之衍生物。油相可包括(但不限於)諸如以下物質：Captex 300、Captex 355、Capmul MCM、脂肪酸酯、中鏈(C8-C12)單甘油酯、二甘油酯及三甘油酯、聚氧乙基化甘油基脂肪酸酯、脂肪醇、聚乙二醇化甘油酯、飽和聚乙二醇化C8-C10甘油酯、植物油及聚矽氧油。
根據藥物增溶及藥物吸收增強之觀點，微乳液特別受到關注。已提出基於脂質之微乳液(o/w與w/o)可增強藥物之口服生物可利用性，包括肽(參見例如美國專利第6,191,105號、第7,063,860號、第7,070,802號、第7,157,099號；Constantinides等人，Pharmaceutical Research,1994,11,1385-1390；Ritschel,Meth.Find.Exp.Clin.Pharmacol.,1993,13,205)。微乳液提供如下優點：改良之藥物增溶、防止藥物被酶促水解、藥物吸收因界面活性劑誘導之膜流動性及滲透性變化而可能增強、易製備、易經口投與固體劑型、改良之臨床效力，及減小之毒性(參見例如美國專利第6,191,105號、第7,063,860號、第7,070,802號、第7,157,099號；Constantinides等人，Pharmaceutical Research,1994,11,1385；Ho等人，J.Pharm.Sci.,1996,85,138-143)。微乳液組分在周圍溫度下合併在一起時，通常可自發地形成微乳液。調配熱不穩定性藥物、肽或iRNA時，此可為特別有利的。在化妝品與醫藥應用中，微乳液亦可有效地經皮遞送活性組分。預期本發明之組合物及調配物有利於增強iRNA及核酸經由胃腸道之全身性吸收，以及改良iRNA及核酸之局部細胞吸收。
本發明之微乳液亦可含有其他組分及添加劑，諸如單硬脂酸脫水山梨糖醇酯(Grill 3)、Labrasol及穿透增強劑，以改良本發明調配物之特性及增強本發明之iRNA及核酸的吸收。本發明之微乳液中所用的穿透增強劑可歸屬於五大類之一：界面活性劑、脂肪酸、膽汁鹽、螯合劑及非螯合非界面活性劑(Lee等人，Critical Reviews in Therapeutic Drug Carrier Systems,1991，第92頁)。此等類別各已論述於上文中。
穿透增強劑
在一個實施例中，本發明係使用各種穿透增強劑實現核酸(特別是iRNA)有效遞送至動物皮膚。大部分藥物以離子化與非離子化形式存在於溶液中。然而，通常僅脂質溶解性或親脂性藥物容易穿越細胞膜。已發現，若待穿越的膜經穿透增強劑處理，則甚至非親脂性藥物可穿越細胞膜。除有助於非親脂性藥物擴散穿過細胞膜之外，穿透增強劑亦增強親脂性藥物之滲透性。
穿透增強劑可歸屬於五大類之一，亦即界面活性劑、脂肪酸、膽汁鹽、螯合劑及非螯合非界面活性劑(參見例如Malmsten,M.Surfactants and polymers in drug delivery,Informa Health Care,New York,NY,2002；Lee等人，Critical Reviews in Therapeutic Drug Carrier Systems,1991，第92頁)。上述各類穿透增強劑更詳細地描述如下。
界面活性劑：就本發明而言，界面活性劑(或「表面活性劑」)為當溶於水溶液中時降低溶液之表面張力或水溶液與另一液體之間之界面張力的化學實體，從而增強iRNA通過黏膜之吸收。除膽汁鹽及脂肪酸之外，此等穿透增強劑包括例如十二烷基硫酸鈉、聚氧乙烯-9-十二烷基醚及聚氧乙烯-20-十六烷基醚(參見例如Malmsten,M.Surfactants and polymers in drug delivery,Informa Health Care,New York,NY,2002；Lee等人，Critical Reviews in Therapeutic Drug Carrier Systems,1991，第92頁)；及全氟化合物乳液，諸如FC-43(Takahashi 等人，J.Pharm.Pharmacol.,1988,40,252)。
脂肪酸：充當穿透增強劑之各種脂肪酸及其衍生物包括例如油酸、月桂酸、癸酸(正癸酸)、肉豆蔻酸、棕櫚酸、硬脂酸、亞油酸、亞麻酸、二癸酸酯、三癸酸酯、單油酸甘油酯(1-單油醯基-外消旋-甘油)、二月桂酸甘油酯、辛酸、花生四烯酸、1-單癸酸甘油酯、1-十二烷基氮雜環庚-2-酮、醯基肉鹼、醯基膽鹼、其C1-20烷基酯(例如甲基、異丙基及第三丁基)、及其單甘油酯及二甘油酯(亦即油酸酯、月桂酸酯、癸酸酯、肉豆蔻酸酯、棕櫚酸酯、硬脂酸酯、亞油酸酯等)(參見例如Touitou,E.等人，Enhancement in Drug Delivery,CRC Press,Danvers,MA,2006；Lee等人，Critical Reviews in Therapeutic Drug Carrier Systems,1991，第92頁；Muranishi,Critical Reviews in Therapeutic Drug Carrier Systems,1990,7,1-33；El Hariri等人，J.Pharm.Pharmacol.,1992,44,651-654)。
膽汁鹽：膽汁之生理作用包括促進脂質及脂溶性維生素之分散及吸收(參見例如Malmsten,M.Surfactants and polymers in drug delivery,Informa Health Care,New York,NY,2002；Brunton，第38章，於：Goodman & Gilman's The Pharmacological Basis of Therapeutics,第9版，Hardman等人編，McGraw-Hill,New York,1996，第934-935頁)。各種天然膽汁鹽及其合成衍生物充當穿透增強劑。因此，術語「膽汁鹽」包括膽汁之任何天然存在之組分以及其任何合成衍生物。適合膽汁鹽包括例如膽酸(或其醫藥學上可接受之鈉鹽膽酸鈉)、脫氫膽酸(脫氫膽酸鈉)、脫氧膽酸(脫氧膽酸鈉)、甘膽酸(甘膽酸鈉)、甘胺膽酸(甘胺膽酸鈉)、甘胺脫氧膽酸(甘胺脫氧膽酸鈉)、牛磺膽酸(牛磺膽酸鈉)、牛磺脫氧膽酸(牛磺脫氧膽酸鈉)、鵝脫氧膽酸(鵝脫氧膽酸鈉)、熊脫氧膽酸(UDCA)、牛磺-24,25-二氫-梭鏈孢酸鈉(STDHF)、 甘胺二氫梭鏈孢酸鈉及聚氧乙烯-9-十二烷基醚(POE)(參見例如Malmsten,M.Surfactants and polymers in drug delivery,Informa Health Care,New York,NY,2002；Lee等人，Critical Reviews in Therapeutic Drug Carrier Systems,1991，第92頁；Swinyard，第39章，於：Remington's Pharmaceutical Sciences，第18版，Gennaro編，Mack Publishing Co.,Easton,Pa.,1990，第782-783頁；Muranishi,Critical Reviews in Therapeutic Drug Carrier Systems,1990,7,1-33；Yamamoto等人，J.Pharm.Exp.Ther.,1992,263,25；Yamashita等人，J.Pharm.Sci.,1990,79,579-583)。
螯合劑：如結合本發明所用的螯合劑可定義為藉由與金屬離子形成錯合物而移除溶液中之金屬離子道化合物，從而增強iRNA通過黏膜之吸收。螯合劑就其在本發明中用作穿透增強劑而言，具有亦充當脫氧核糖核酸酶抑制劑的額外優點，因為大部分經表徵之DNA核酸酶需要二價金屬離子進行催化作用且從而被螯合劑抑制(Jarrett,J.Chromatogr.,1993,618,315-339)。適合螯合劑包括(但不限於)乙二胺四乙酸二鈉(EDTA)、檸檬酸、水楊酸鹽(例如水楊酸鈉、5-甲氧基水楊酸鹽及高香蘭酸鹽)、膠原蛋白之N-醯基衍生物、月桂醇醚-9及β-二酮之N-胺基醯基衍生物(烯胺)(參見例如Katdare,A.等人，Excipient development for pharmaceutical,biotechnology,and drug delivery,CRC Press,Danvers,MA,2006；Lee等人，Critical Reviews in Therapeutic Drug Carrier Systems,1991，第92頁；Muranishi,Critical Reviews in Therapeutic Drug Carrier Systems,1990,7,1-33；Buur等人，J.Control Rel.,1990,14,43-51)。
非螯合非界面活性劑：如本文所用，非螯合非界面活性劑滲透增強化合物可定義為活性不如螯合劑或不如界面活性劑明顯、但仍然增強iRNA通過消化性黏膜吸收的化合物(參見例如Muranishi,Critical Reviews in Therapeutic Drug Carrier Systems,1990,7,1-33)。此類穿透增強劑包括例如不飽和環脲、1-烷基-及1-烯基氮雜環烷酮衍生物(Lee等人，Critical Reviews in Therapeutic Drug Carrier Systems,1991,第92頁)；及非類固醇消炎劑，諸如雙氯芬酸鈉(diclofenac sodium)、吲哚美辛(indomethacin)及苯基丁氮酮(phenylbutazone)(Yamashita等人，J.Pharm.Pharmacol.,1987,39,621-626)。
在細胞層面上增強iRNA吸收的藥劑亦可添加至本發明之醫藥及其他組合物中。舉例而言，陽離子型脂質，諸如脂質體(Junichi等人，美國專利第5,705,188號)、陽離子型甘油衍生物及聚陽離子型分子，諸如聚離胺酸(Lollo等人，PCT申請案WO 97/30731)，亦已知可增強細胞吸收dsRNA。市售轉染試劑之實例尤其包括例如LipofectamineTM(Invitrogen；Carlsbad,CA)、Lipofectamine 2000TM(Invitrogen；Carlsbad,CA)、293fectinTM(Invitrogen；Carlsbad,CA)、CellfectinTM(Invitrogen；Carlsbad,CA)、DMRIE-CTM(Invitrogen；Carlsbad,CA)、FreeStyleTM MAX(Invitrogen；Carlsbad,CA)、LipofectamineTM 2000 CD(Invitrogen；Carlsbad,CA)、LipofectamineTM(Invitrogen；Carlsbad,CA)、RNAiMAX(Invitrogen；Carlsbad,CA),OligofectamineTM(Invitrogen；Carlsbad,CA)、OptifectTM(Invitrogen；Carlsbad,CA)、X-tremeGENE Q2轉染試劑(Roche；Grenzacherstrasse,Switzerland)、DOTAP脂質體轉染試劑(Grenzacherstrasse,Switzerland)、DOSPER脂質體轉染試劑(Grenzacherstrasse,Switzerland)或Fugene(Grenzacherstrasse,Switzerland)、Transfectam®試劑(Promega；Madison,WI)、TransFastTM轉染試劑(Promega；Madison,WI)、TfxTM-20試劑(Promega；Madison,WI)、TfxTM-50試劑(Promega；Madison,WI)、DreamFectTM(OZ Biosciences；Marseille,France)、EcoTransfect(OZ Biosciences；Marseille,France)、TransPassa D1轉染試劑(New England Biolabs；Ipswich,MA,USA)、LyoVecTM/LipoGenTM(Invivogen；San Diego,CA,USA)、PerFectin轉染試劑(Genlantis；San Diego,CA,USA)、NeuroPORTER轉染試劑(Genlantis；San Diego,CA,USA)、GenePORTER轉染試劑(Genlantis；San Diego,CA,USA)、GenePORTER 2轉染試劑(Genlantis；San Diego,CA,USA)、Cytofectin轉染試劑(Genlantis；San Diego,CA,USA)、BaculoPORTER轉染試劑(Genlantis；San Diego,CA,USA)、TroganPORTERTM轉染試劑(Genlantis；San Diego,CA,USA)、RiboFect(Bioline；Taunton,MA,USA)、PlasFect(Bioline；Taunton,MA,USA)、UniFECTOR(B-Bridge International；Mountain View,CA,USA)、SureFECTOR(B-Bridge International；Mountain View,CA,USA)或HiFectTM(B-Bridge International,Mountain View,CA,USA)。
可使用其他藥劑增強所投核酸之滲透，包括二醇，諸如乙二醇及丙二醇；吡咯，諸如2-吡咯；氮酮；及萜，諸如檸檬烯及薄荷酮。
載劑
本發明之某些組合物在調配時亦合併有載劑化合物。如本文所用，「載劑化合物」或「載劑」可指核酸或其類似物，其呈惰性(亦即本身不具有生物活性)，但因活體內過程而被認為是核酸，此等活體內過程藉由例如使生物活性核酸降解或促進其自循環中移除而降低具有生物活性之核酸的生物可利用性。核酸與載劑化合物共投與(通常載劑化合物過量)可實質性降低肝臟、腎臟或其他外循環儲集器中所回收之核酸量，此大概由於載劑化合物與核酸之間對於共同受體的競爭。舉例而言，當其與聚肌苷酸、硫酸葡聚糖、聚胞嘧啶核苷酸或4-乙醯胺基-4'-異硫氰基-芪-2,2'-二磺酸共投與時，可降低部分硫代磷酸酯dsRNA在肝組織中的回收(Miyao等人，DsRNA Res.Dev.,1995,5,115-121；Takakura等人，DsRNA & Nucl.Acid Drug Dev.,1996,6,177- 183)。
賦形劑
與載劑化合物相比，「醫藥載劑」或「賦形劑」為醫藥學上可接受之溶劑、懸浮劑，或用於遞送一或多種核酸至動物的任何其他藥理學惰性媒劑。賦形劑可為液體或固體且依計劃投藥方式加以選擇，以便當與核酸及指定醫藥組合物之其他組分組合時提供所要容積、稠度等。典型醫藥載劑包括(但不限於)黏合劑(例如預膠凝化玉米澱粉、聚乙烯吡咯啶酮或羥丙基甲基纖維素等)；填充劑(例如乳糖及其他糖、微晶纖維素、果膠、明膠、硫酸鈣、乙基纖維素、聚丙烯酸酯或磷酸氫鈣等)；滑潤劑(例如硬脂酸鎂、滑石、二氧化矽、膠體二氧化矽、硬脂酸、金屬硬脂酸鹽、氫化植物油、玉米澱粉、聚乙二醇、苯甲酸鈉、乙酸鈉等)；崩解劑(例如澱粉、乙醇酸澱粉鈉等)；及濕潤劑(十二烷基硫酸鈉等)。
適於經腸投藥、與核酸無有害反應的醫藥學上可接受之有機或無機賦形劑亦可用於調配本發明組合物。適合的醫藥學上可接受之載劑包括(但不限於)水、鹽溶液、醇、聚乙二醇、明膠、乳糖、直鏈澱粉、硬脂酸鎂、滑石、矽酸、黏性石蠟、羥甲基纖維素、聚乙烯吡咯啶酮及其類似物。
用於局部投與核酸的調配物可包括無菌及非無菌水溶液、共同溶劑(諸如醇)中之非水溶液，或核酸於液體或固體油基質中的溶液。溶液亦可含有緩衝劑、稀釋劑及其他適合添加劑。可使用適於經腸投藥、與核酸無有害反應的醫藥學上可接受之有機或無機賦形劑。
適合的醫藥學上可接受之賦形劑包括(但不限於)水、鹽溶液、醇、聚乙二醇、明膠、乳糖、直鏈澱粉、硬脂酸鎂、滑石、矽酸、黏性石蠟、羥甲基纖維素、聚乙烯吡咯啶酮及其類似物。
其他組分
本發明之組合物可另外含有習知發現於醫藥組合物中的其他輔助組分，其具有此項技術中已確立的使用量。因此，舉例而言，組合物可含有其他相容性醫藥活性物質，諸如止癢劑、收斂劑、局部麻醉劑或消炎劑，或可含有適用於物理上調配本發明組合物之各種劑型的其他物質，諸如染料、調味劑、防腐劑、抗氧化劑、遮光劑、增稠劑及穩定劑。然而，此等物質添加時，不應過度干擾本發明組合物中之各組分的生物活性。調配物可經滅菌且需要時與助劑混合，例如滑潤劑、防腐劑、穩定劑、濕潤劑、乳化劑、影響滲透壓之鹽、緩衝劑、著色劑、調味劑及/或芳族物質及其類似物，該等助劑與調配物中之核酸無有害相互作用。
水性懸浮液可含有提高懸浮液黏度的物質，包括例如羧甲基纖維素鈉、山梨糖醇及/或葡聚糖。懸浮液亦可含有穩定劑。
在一些實施例中，本發明所述之醫藥組合物包括(a)一或多種iRNA化合物及(b)一或多種藉由非RNAi機制發揮作用的生物藥劑。此等生物藥劑之實例包括干擾目標基因與至少一種目標基因結合搭配物相互作用的藥劑。
此等化合物之毒性及治療功效可於細胞培養或實驗動物中藉由標準醫藥程序測定，例如用於測定LD50(50%群體致死劑量)及ED50(50%群體治療有效劑量)的標準醫藥程序。毒性與治療效果之間的劑量比為治療指數且其可以比率LD50/ED50表示。展現高治療指數的化合物為典型的。
獲自細胞培養分析及動物研究的資料可用於制定用於人類的劑量範圍。本發明所述之組合物的劑量通常在循環濃度之範圍內，包括具有很小或無毒性的ED50。根據所用劑型及所用投藥途徑，劑量可在此範圍內變化。對於本發明所述之方法中所用的任何化合物而言，初始可利用細胞培養分析估算治療有效劑量。可用動物模型制定劑量 以使化合物或適當時目標序列之多肽產物達成循環血漿濃度範圍(例如使多肽達成降低之濃度)，此範圍包括如細胞培養中所測定之IC50(亦即使症狀達成半最大抑制的測試化合物濃度)。此資訊可用於更準確地確定適用於人類之劑量。血漿含量可藉由例如高效液相層析法量測。
如上文所論述，除其投與之外，本發明所述之iRNA可與有效治療與目標基因表現相關之疾病或病症的其他已知藥劑組合投與。在任何情況下，給藥醫師可根據使用此項技術中已知或本文所述的標準功效量測法調整iRNA投與量及時機。
調節目標基因表現的方法
在又一個態樣中，本發明提供一種調節(例如抑制或活化)目標基因例如在細胞中或在個體中之表現的方法。在一些實施例中，細胞為離體、活體外或活體內細胞。在一些實施例中，細胞為類紅血球或肝細胞。在一些實施例中，細胞存在於個體(例如哺乳動物，諸如人類)體內。在一些實施例中，個體(例如人類)處於與目標基因表現相關之疾病的風險中，或經診斷患有與目標基因表現相關之疾病，如上文所述。
在一個實施例中，方法包括使細胞與有效減弱細胞表現目標基因之量的如本文所述之iRNA接觸。如本文所用，「接觸」包括直接接觸細胞，以及間接接觸細胞。舉例而言，當包含iRNA的組合物投與(例如靜脈內或皮下投與)個體時，可接觸個體體內之細胞(例如類紅血球或肝臟細胞，諸如肝細胞)。
目標基因之表現可根據目標基因mRNA、目標基因蛋白質之表現量，或在功能上與目標基因表現量相關之參數級別加以評估。在一些實施例中，目標基因之表現被抑制至少5%、至少10%、至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少35%、至少40%、至少45%、至少 50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%或至少95%。在一些實施例中，iRNA具有如下範圍內之IC50：0.001-0.01nM、0.001-0.10nM、0.001-1.0nM、0.001-10nM、0.01-0.05nM、0.01-0.50nM、0.02-0.60nM、0.01-1.0nM、0.01-1.5nM、0.01-10nM。IC50值可相對於適當控制值(例如非靶向iRNA之IC50)校正。
在一些實施例中，方法包括將如本文所述的iRNA引入細胞內及使細胞維持足以使目標基因之mRNA轉錄物降解的時間，從而抑制細胞表現目標基因。
在一個實施例中，方法包括向哺乳動物投與本文所述的組合物，例如包含靶向目標基因之iRNA的組合物，使得目標基因表現降低諸如延長的持續時間，例如至少兩天、三天、四天或四天以上，例如一週、兩週、三週或四週或四週以上。在一些實施例中，目標基因表現之降低可在首次投與1小時、2小時、4小時、8小時、12小時或24小時內偵測到。
在另一個實施例中，方法包括向哺乳動物投與如本文所述之組合物，使得目標基因之表現與未經治療的動物相比提高例如至少10%。在一些實施例中，目標基因之活化存在延長的持續時間，例如至少兩天、三天、四天或四天以上，例如一週、兩週、三週、四週或四週以上。不希望受理論束縛，iRNA可藉由穩定目標基因mRNA轉錄物、與基因組中之啟動子相互作用及/或抑制目標基因表現抑制劑來活化目標基因表現。
適用於本發明所述方法及組合物中的iRNA特異性靶向目標基因之RNA(初始或經加工)。使用iRNA抑制目標基因表現的組合物及方法可如本文中別處所述製備及執行。
在一個實施例中，方法包括投與含有iRNA之組合物，其中iRNA 包括與所治療之哺乳動物之目標基因之RNA轉錄物的至少一部分互補的核苷酸序列。當所治療之生物體為哺乳動物(諸如人類)時，組合物可藉由此項技術中已知的任何方式投與，包括(但不限於)經口、腹膜內或非經腸途徑，包括顱內(例如心室內、腦實質內及鞘內)、靜脈內、肌內、皮下、經皮、氣管(氣溶膠)、鼻、直腸及局部(包括頰內及舌下)投藥
在某些實施例中，組合物藉由靜脈內輸注或注射投與。在一些此等實施例中，組合物包含經脂質調配之siRNA(例如LNP調配物，諸如LNP11調配物，如本文所述)用於靜脈內輸注。
在其他實施例中，組合物係皮下投與。在一些此等實施例中，組合物包含與GalNAc配位體結合之iRNA。
目標基因及治療與目標基因表現相關之疾病的方法
本文所述的給藥方案及方法可用於抑制目標基因表現及/或治療與目標基因表現相關的疾病、病症或病理過程。在某些實施例中，目標基因係選自：因子VII、Eg5、PCSK9、TPX2、apoB、SAA、TTR、RSV、PDGFβ基因、Erb-B基因、Src基因、CRK基因、GRB2基因、RAS基因、MEKK基因、JNK基因、RAF基因、Erk1/2基因、PCNA(p21)基因、MYB基因、JUN基因、FOS基因、BCL-2基因、HAMP、活化蛋白C基因、週期素D基因、VEGF基因、抗凝血酶3基因、胺基乙醯丙酸酯合成酶1基因、α1-抗胰蛋白酶基因、tmprss6基因、apoa1基因、apoc3基因、bc11a基因、klf基因、angptl3基因、plk基因、PKN3基因、HBV、HCV、p53基因、血管生成素基因或血管生成素樣3基因。在某些實施例中，目標選自：Eg5、PCSK9、TTR、HAMP、VEGF基因、抗凝血酶3基因、胺基乙醯丙酸酯合成酶1基因、α1-抗胰蛋白酶基因，或tmprss6基因。
TTR目標基因
在一個實施例中，目標基因為TTR基因。能夠降低TTR基因表現(例如減少TTR澱粉樣蛋白沈積，或治療TTR介導之澱粉樣變性(ATTR))的核酸(例如RNA)分子描述於例如WO 2011/056883中，該案之內容以引用的方式特別併入本文中。在某些實施例中，RNA分子包含反義股，該反義股包含或由10、15、20、25個或超過25個與轉甲狀腺素mRNA(例如野生型或突變型TTR mRNA，例如V30M突變型TTR)互補的連續核苷酸組成。在某些實施例中，RNA分子包含：包含或由例如WO 2011/056883中所揭示之反義寡核苷酸序列中的10、15、20、25個或超過25個連續核苷酸組成的反義股，例如SEQ ID NO：170、730或1010。在某些實施例中，RNA分子包含：包含或由例如WO 2011/056883中所揭示之反義寡核苷酸序列中之10、15、20、25或超過25個連續核苷酸組成的反義股，例如SEQ ID NO：170、730或1010；及例如WO 2011/056883中所揭示之有義股，例如SEQ ID NO：169、729或1009。
PCSK9目標基因
在一個實施例中，目標基因為PCSK9基因。能夠降低PCSK9基因表現的核酸(例如RNA)分子(例如治療PCSK9相關病症，例如降低血清膽固醇)描述於例如WO 2012/05869、WO 2011/005861、WO 2011/028938、WO 2010/148013、WO 2009/134487及WO 2007/134161中，該等專利之內容以引用的方式特別併入本文中。在某些實施例中，RNA分子包含反義股，該反義股包含10、15、20、25或超過25個與PCSK9 mRNA(例如野生型或突變型PCSK9 mRNA)互補的連續核苷酸。在某些實施例中，RNA分子包含反義股，該反義股包含或由例如WO 2012/05869、WO 2011/005861、WO 2011/028938、WO 2010/148013、WO 2009/134487及WO 2007/134161中所揭示之反義寡核苷酸序列中的10、15、20、25或超過25個連續核苷酸組成。在某些 實施例中，RNA分子包含：包含或由例如WO 2012/05869、WO 2011/005861、WO 2011/028938、WO 2010/148013、WO 2009/134487及WO 2007/134161中所揭示之反義寡核苷酸序列中之10、15、20、25個或超過25個連續核苷酸組成的反義股；及例如WO 2012/05869、WO 2011/005861、WO 2011/028938、WO 2010/148013、WO 2009/134487及WO 2007/134161中所揭示之有義股。
Eg5目標基因
在一個實施例中，目標基因為Eg5基因。能夠降低Eg5基因表現的核酸(例如RNA)分子(例如治療Eg5相關病症)描述於例如WO 2011/034798、WO 2010/105209、WO 2009/111658及WO 2007/115168中，該等案之內容以引用的方式特別併入本文中。在某些實施例中，RNA分子包含反義股，該反義股包含10、15、20、25或超過25個與Eg5 mRNA(例如野生型或突變型Eg5 mRNA)互補的連續核苷酸。在某些實施例中，RNA分子包含反義股，該反義股包含或由例如WO 2011/034798、WO 2010/105209、WO 2009/111658及WO 2007/115168中所揭示之反義寡核苷酸序列中的10、15、20、25或超過25個連續核苷酸組成。在某些實施例中，RNA分子包含：包含或由例如WO 2011/034798、WO 2010/105209、WO 2009/111658及WO 2007/115168中所揭示之反義寡核苷酸序列中之10、15、20、25或超過25個連續核苷酸組成的反義股；及例如WO 2011/034798、WO 2010/105209、WO 2009/111658及WO 2007/115168中所揭示之有義股。
VEGF目標基因
在一個實施例中，目標基因為VEGF基因。能夠降低VEGF基因表現的核酸(例如RNA)分子(例如治療VEGF相關病症)描述於例如WO 2011/034798、WO 2010/105209、WO 2009/111658及WO 2005/089224中，該等案之內容以引用的方式特別併入本文中。在某些實施例中， RNA分子包含反義股，該反義股包含10、15、20、25或超過25個與VEGF mRNA(例如野生型或突變型VEGF mRNA)互補的連續核苷酸。在某些實施例中，RNA分子包含反義股，該反義股包含或由例如WO 2011/034798、WO 2010/105209、WO 2009/111658及WO 2005/089224中所揭示之反義寡核苷酸序列中的10、15、20、25或超過25個連續核苷酸組成。在某些實施例中，RNA分子包含：包含或由例如WO 2011/034798、WO 2010/105209、WO 2009/111658及WO 2005/089224中所揭示之反義寡核苷酸序列中之10、15、20、25或超過25個連續核苷酸組成的反義股；及例如WO 2011/034798、WO 2010/105209、WO 2009/111658及WO 2005/089224中所揭示之有義股。
HAMP目標基因
在一個實施例中，目標基因為鐵調素抗微生物肽(HAMP)基因。能夠降低HAMP基因表現的核酸(例如RNA)分子(例如治療HAMP相關病症，例如微生物感染)描述於例如WO 2008/036933及WO 2012/177921中，該等案之內容以引用的方式特別併入本文中。在某些實施例中，RNA分子包含反義股，該反義股包含10、15、20、25或超過25個與HAMP mRNA(例如野生型或突變型HAMP mRNA)互補的連續核苷酸。在某些實施例中，RNA分子包含反義股，該反義股包含或由例如WO 2008/036933及WO 2012/177921中所揭示之反義寡核苷酸序列中的10、15、20、25個或超過25個連續核苷酸組成。在某些實施例中，RNA分子包含：包含或由例如WO 2008/036933及WO 2012/177921中所揭示之反義寡核苷酸序列中之10、15、20、25或超過25個連續核苷酸組成的反義股；及例如WO 2008/036933及WO 2012/177921中所揭示之有義股。
TMPRSS6目標基因
在一個實施例中，目標基因為TMPRSS6基因。能夠降低TMPRSS6基因表現的核酸(例如RNA)分子(例如治療TMPRSS6相關病症)描述於例如WO 2012/135246中，該案之內容以引用的方式特別併入本文中。在某些實施例中，RNA分子包含反義股，該反義股包含10、15、20、25或超過25個與TMPRSS6 mRNA(例如野生型或突變型TMPRSS6 mRNA)互補的連續核苷酸。在某些實施例中，RNA分子包含反義股，該反義股包含或由例如WO 2012/135246中所揭示之反義寡核苷酸序列中的10、15、20、25個或超過25個連續核苷酸組成。在某些實施例中，RNA分子包含：包含或由例如WO 2012/135246中所揭示之反義寡核苷酸序列中之10、15、20、25個或超過25個連續核苷酸組成的反義股；及例如WO 2012/135246中所揭示之有義股。
5'-胺基乙醯丙酸合成酶1(ALAS1)基因
在一個實施例中，目標基因為ALAS1基因。能夠降低ALAS1基因表現的核酸(例如RNA)分子(例如治療ALAS1相關病症，例如牽涉卟啉或卟啉路徑缺陷的病理過程，諸如卟啉症)描述於例如2013年3月15日申請之USSN 13/835,613中，該案之內容以引用的方式特別併入本文中。在某些實施例中，RNA分子包含反義股，該反義股包含10、15、20、25或超過25個與ALAS1 mRNA(例如野生型或突變型ALAS1 mRNA)互補的連續核苷酸。在某些實施例中，RNA分子包含反義股，該反義股包含或由例如USSN 13/835,613中所揭示之反義寡核苷酸序列中的10、15、20、25個或超過25個連續核苷酸組成。在某些實施例中，RNA分子包含：包含或由例如USSN 13/835,613中所揭示之反義寡核苷酸序列中之10、15、20、25個或超過25個連續核苷酸組成的反義股；及例如USSN 13/835,613中所揭示之有義股。
補體組分3(C3)基因
在一個實施例中，目標基因為補體組分3(C3)基因。核酸(例如 RNA)分子能夠降低C3基因表現(例如治療C3相關病症)。C3在補體系統中起著重要作用且促成先天免疫。在人類中，其由染色體19上之稱為C3的基因編碼。在某些實施例中，RNA分子包含反義股，該反義股包含10、15、20、25或超過25個與C5 mRNA(例如野生型或突變型C3 mRNA)互補的連續核苷酸。
補體組分5(C5)基因
在一個實施例中，目標基因為補體組分5(C5)基因。核酸(例如RNA)分子能夠降低C5基因表現(例如治療C5相關病症，例如牽涉發炎及細胞殺死過程的病理過程)。此蛋白質由經二硫橋鍵連接的α及β多肽鏈組成。活化肽C5a(其為具有強致痙攣及趨化活性的過敏毒素)來源於α多肽(經由轉化酶之分裂作用)。在某些實施例中，RNA分子包含反義股，該反義股包含10、15、20、25或超過25個與C5 mRNA(例如野生型或突變型C5 mRNA)互補的連續核苷酸。
如本文所用，「與目標基因表現相關的病症」、「與目標基因表現相關的疾病」、「與目標基因表現相關的病理過程」或其類似表述包括其中目標基因表現改變(例如提高)的任何病狀、病症或疾病。舉例而言，靶向ALAS1目標基因的iRNA或其組合可用於治療其中卟啉或卟啉前驅物(例如ALA或PBG)之含量提高的病狀(例如某些卟啉症)，或其中原血紅素生物合成途徑中之酶存在缺陷的病狀(例如某些卟啉症)。與目標基因表現相關的病症包括例如X聯鐵粒母細胞性貧血(XLSA)、ALA脫水酶缺乏卟啉症(Doss卟啉症)、急性間歇性卟啉症(AIP)、先天性生血性卟啉症、遲發性皮膚卟啉症、遺傳性糞卟啉症(糞卟啉症)、混合型卟啉症、生血性原卟啉症(EPP)及嬰兒暫時性紅血球卟啉症。
如本文所用，根據本文所述方法治療的「個體」包括人類或非人類動物，例如哺乳動物。哺乳動物可為例如嚙齒動物(例如大鼠或 小鼠)、豬或靈長類動物(例如猴)。在一些實施例中，個體為人類。
在一些實施例中，個體罹患與目標基因表現相關的病症，或處於發展與目標基因表現相關之病症的風險中。
在一些實施例中，靶向目標基因的iRNA係連同可用於緩解一或多種症狀的另一種療法投與(例如在另一種療法之前、之後或同時)。
術語「降低」(或「提高」)意指可量測的變化，例如統計顯著變化。變化可為例如至少5%、10%、20%、30%、40%、50%或超過50%變化(例如相對於參考值(例如其中未提供iRNA的參考物)的降低(或提高))。
本發明進一步係關於iRNA或其醫藥組合物與其他醫藥及/或其他治療方法(例如與已知醫藥及/或已知治療方法，諸如當前用於治療病症的彼等醫藥及/或方法)組合用於例如治療與目標基因表現相關之病症的用途。
用於治療與目標基因表現相關之病症的有效量視以下而定：所治療之病症類型、症狀嚴重程度、所治療之個體、個體之性別、年齡及一般狀況、投藥模式等。在任何指定情況下，適當「有效量」可由一般熟悉此項技術者使用常規實驗確定。藉由量測任一項此等參數或任何參數組合來監測治療或預防功效係在熟悉此項技術者之能力範圍內。就投與靶向目標基因之iRNA或其醫藥組合物而言，「有效針對」與目標基因表現相關之病症表明，以臨床適當方式投藥可產生有益效果，例如對於個別患者或至少一部分患者(例如統計顯著部分之患者)而言。有益效果包括例如預防或減少症狀或其他效果。舉例而言，有益效果包括例如症狀改善(例如嚴重程度或頻率降低)、嚴重降低或發病頻率降低、發展相關疾病(例如神經病變(例如漸進性神經病變)、肝細胞癌)之風險降低、耐受催發因素之能力改善、生活品質改善、目標基因表現降低、疾病標記之含量(例如血漿或尿含量)降低，或熟悉 治療特定類型病症之內科醫生通常認為積極的其他效果。
當疾病狀況之一或多種參數存在改善(例如統計顯著改善)時，或以其他方式預期不會惡化或發展症狀時，治療或預防效果為明顯的。舉例而言，疾病之可量測參數出現至少10%之有利變化(例如至少20%、30%、40%、50%或超過50%)可指示有效治療。指定iRNA藥物或該藥物之調配物的功效亦可使用此項技術中已知之指定疾病的實驗動物模型判斷。使用實驗動物模型時，當觀測到標記或症狀存在統計顯著性降低時，證明存在治療功效。
可向患者投與治療量之iRNA。治療量可為例如0.01-50mg/kg、0.01-10mg/kg、0.01-5mg/kg、0.01-2mg/kg、0.01-1mg/kg，且更通常為0.01-0.5mg、0.1至0.3mg/kg。舉例而言，治療量可為0.05、0.1、0.2、0.3、0.4、0.5、0.6、0.7、0.8、0.9、1.0、1.5、2.0或2.5、3.0、3.5、4.0、4.5、5、10、15、20、25、30、35、40、45或50mg/kg dsRNA。本文所述的給藥方案及方法中可使用任何此等劑量。
在一些實施例中，iRNA調配為脂質調配物，例如本文所述的LNP調配物。在一些此等實施例中，治療量為0.01-5mg/kg，0.01、0.02、0.03、0.04、0.05、0.1、0.2、0.3、0.4、0.5、0.6、0.7、0.8、0.9、1.0、1.5、2.0、2.5、3.0、3.5、4.0、4.5或5.0mg/kg dsRNA。本文所述的給藥方案及方法中可使用任何此等劑量。
在一些實施例中，脂質調配物(例如LNP調配物)係靜脈內投與。
在一些實施例中，iRNA藉由靜脈內輸注投與一段時間，諸如5分鐘、10分鐘、15分鐘、20分鐘、25分鐘、30分鐘、40分鐘、50分鐘、55分鐘、60分鐘、65分鐘或70分鐘時段。
在一些實施例中，iRNA呈如本文所述的GalNAc結合物形式。在一些此等實施例中，治療量為0.5-50mg/kg，例如0.5、0.6、0.7、0.8、0.9、1.0、1.5、2.0、2.5、3.0、3.5、4.0、4.5、5.0、6、7、8、 9、10、15、20、25、30、35、40、45或50mg/kg dsRNA。在一些實施例中，GalNAc結合物係皮下投與。本文所述的給藥方案及方法中可使用任何此等劑量。
在一些實施例中，重複投藥，例如定期重複投藥，諸如每日、雙週(亦即每兩週)、一個月、兩個月、三個月、四個月或長於四月。初始治療方案之後，投與療法的頻率較小。舉例而言，每兩週投藥歷時三個月之後，每月可重複投藥一次歷時六個月或一年或更長。
在一些實施例中，iRNA藥劑係以兩個或兩個以上劑量投與(例如本文所述的兩個或兩個以上劑量)。在一些實施例中，第一及第二劑量經調整以便降低過敏性反應。在其他實施例中，後續劑量之次數或量取決於所要效果之達成，例如目標基因之抑止，或治療或預防效果之達成，例如與目標基因病症相關之一或多種症狀之減少或預防。
在一些實施例中，iRNA藥劑係根據時程投與。舉例而言，iRNA藥劑可每週投與一次，每週投與兩次，每週投與三次，每週投與四次，或每週投與五次。在一些實施例中，時程包括定期投藥，例如每小時、每四個小時、每六個小時、每八個小時、每十二個小時、每天、每2天、每3天、每4天、每5天、每週、每兩週或每月。
在一些實施例中，預定之減幅為目標基因表現或症狀(例如標記含量)降低至少10%、20%、30%、40%或50%。
在一些實施例中，預定之減幅為減少至少1、2、3個或超過3個標準差，其中標準差，其中標準差係根據參考樣品(例如本文所述的參考樣品)之值確定。
iRNA之投與可降低目標基因mRNA或蛋白質含量，例如使患者之細胞、組織、血液、尿或其他代謝區中的目標基因mRNA或蛋白質含量降低至少10%、至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少40%、至少50%、至少60%、至少70%、至少80%或至少90%或超過 90%。投與iRNA可降低與目標基因表現相關之產物的含量。
投與全部劑量之iRNA之前，可向患者投與較小劑量，諸如5%、8%或10%輸注劑量，且監測不良影響，諸如過敏性或過敏反應，或升高之脂質含量或血壓。在另一實例中，可監測患者的非所要效果。
過敏性反應及生物標記偵測
當增加本文所述之組合物劑量(例如約300μg/kg之劑量)時，可能發生過敏性反應。在所增加劑量之彼等實施例中，個體可用本文所述的方法及給藥方案治療。
在一些實施例中，本文所述之劑量及劑量投與時段經選擇應使得個體不會發生實質性IRR及/或過敏性反應(例如可偵測的IRR或過敏性反應)。過敏性反應可為急性反應。在一些實施例中，個體為人類。或者，個體可為動物(例如補體或過敏性反應之動物模型(例如本文中及以下文獻中所述的豬模型：Szebeni等人，Nanomedicine.2012 Feb；8(2)：176-84；Szebeni等人Adv Drug Deliv Rev.2011 Sep 16；63(12)：1020-30(2012)；Szebeni等人Adv Drug Delivery Rev))。
在一些實施例中，本文所述方法不引起可偵測的過敏性反應，例如根據本文所述的一或多種分析或症狀所量測。在實施例中，該方法引起過敏性反應降低，此降幅小於1%、5%、10%、25%、30%、35%或40%，例如根據本文所述的一或多種分析或症狀所量測。在某些實施例中，將本文所述的變化與參考參數(例如暴露於單次劑量的個體，或治療之前的個體)進行比較。
在一個實施例中，作為對本文揭示之第一及第二劑量方案的反應，個體顯示過敏性反應相對於參考參數(例如暴露於單次劑量的個體，或治療之前的個體)而言降低(例如血液動力學變化減少)。
在某些實施例中，本文所述的方法引起過敏性反應降低，例如在投與類固醇(例如地塞米松或等效物)、止痛藥(例如撲熱息痛或組織 胺受體拮抗劑(例如H1或H2阻斷劑)時引起過敏性反應降低(例如部分或完全降低)。在其他實施例中，個體在該第一劑量開始投與之任何X小時內不接受類固醇(例如地塞米松或等效物)之投與，其中X小於1小時、2小時、3小時、5小時、10小時、15小時、24小時或48小時。
或者，或在組合中，個體可用類固醇、組織胺阻斷劑或乙醯胺苯酚中之一或多者治療或預先治療。舉例而言，在投與本文所述組合物之本文所述劑量(例如第一或第二劑量)之前(30至60分鐘)、期間或之後，個體可接受以下一或多者：類固醇(例如口服地塞米松(8mg)或靜脈內地塞米松(10mg)，或等效物)、撲熱息痛或乙醯胺苯酚(例如500mg口服撲熱息痛或等效物)、組織胺阻斷劑(例如口服H2阻斷劑(例如雷尼替丁(ranitidine)150mg或法莫替丁(famotidine)20mg，或等效物)及/或口服H1阻斷劑(例如西替利嗪(cetirizine)(10mg)或等效物)。
在某些實施例中，本文所述的方法進一步包括在投與第一劑量、第二劑量或兩者之後評估個體之以下一或多者之存在的步驟：皮膚反應(例如蕁麻疹、紅疹、水腫、皮疹、搔癢、疹)；血液動力學變化，例如血壓變化(例如低血壓或高血壓)；呼吸道問題(例如喉痙攣、喉水腫、支氣管痙攣、呼吸困難)、疼痛(例如關節痛、背痛、腹痛或胸痛)，或過敏性之其他表現形式(例如發燒、寒顫、噁心、嘔吐或神經病變中之一或多者)。
或者，或在組合中，本文所述方法進一步包括在投與第一劑量、第二劑量或兩者之後評估個體中之補體標記之變化(例如補體活化之變化(例如選自Bb或C3ab之一或多種補體因子之變化))的步驟，其中補體生物標記含量之增加指示過敏性反應。
補體標記之變化可活體內偵測或使用活體外分析偵測。舉例而言，補體活化之變化可使用偵測補體級聯組分的分析法偵測，例如偵 測以下一或多者的分析法(例如ELISA)：總補體蛋白(例如C3及C5)；補體分裂產物(例如Bb、C3a或C5a)，或末端補體補體複合物：sC5b-9。評估補體活性之活體外分析法之其他實例包括CH50：殘餘總溶血補體活性，或AH50：殘餘溶血補體替代途徑活性。或者，補體活化之變化可使用功能喪失型研究中之補體耗乏模型(例如眼鏡蛇毒因子)或補體介導過敏性之豬模型(例如本文所述豬模型)偵測。在實施例中，可自暴露於本文所述組合物的個體獲得待評估的樣品。舉例而言，樣品可為針對活體內分析而獲得的血清/血漿樣品。在其他實施例中，可利用未處理血清/血漿建立活體外補體活化之模型。
或者，或在組合中，本文所述方法進一步包括在投與第一劑量、第二劑量或兩者之後評估個體中之血栓素含量(例如血漿中之血栓素B2)之變化的步驟，其中血栓素含量之增加指示過敏性反應增強，例如急性過敏性反應增強。
或者，或在組合中，本文所述方法進一步包括在投與第一劑量、第二劑量或兩者之後評估個體中之一或多種細胞激素之變化的步驟，該等細胞激素選自干擾素-α、干擾素-γ、腫瘤壞死因子-α、介白素1β、介白素1受體拮抗劑(IL-1RA)、介白素-6、介白素-8、介白素-12、介白素-18、干擾素誘導蛋白-10、顆粒球群落刺激因子，或C反應蛋白(CRP)。在某些實施例中，IL-6、IL-8、IL-1RA或CRP含量增加指示過敏性反應增強，例如相對於參考參數而言(例如暴露於單次劑量之個體，或治療之前的個體)。
量測多肽生物標記(例如補體標記、血栓素、細胞激素)的方法包括(但不限於)西方墨點法、免疫墨點法、酶聯免疫吸附分析(ELISA)、放射免疫分析(RIA)、免疫沈澱法、表面電漿共振、化學發光、螢光極化、磷光、免疫組織化學分析、液相層析質譜(LC-MS)、基質輔助雷射解吸附/電離飛行時間(MALDI-TOF)質譜、微細胞測定 術、微陣列術、顯微術、螢光活化細胞分類(FACS)、流式細胞術、雷射掃描細胞測定術、血液學分析儀，及基於蛋白質特性(包括(但不限於)DNA結合、配位體結合或與其他蛋白質搭配物的相互作用)的分析法。
標記蛋白之活性或含量亦可藉由偵測或定量所表現之多肽來偵測及/或定量。多肽可藉由熟習此項技術者熟知之多種方式中的任一者來偵測及定量。此等方法可包括分析型生物化學方法，諸如電泳、毛細管電泳、高效液相層析(HPLC)、薄層層析(TLC)、高擴散層析及其類似方法，或各種免疫方法，諸如流體或凝膠沈澱素反應、免疫擴散(單一或雙重)、免疫電泳、放射免疫分析(RIA)、酶聯免疫吸附分析(ELISA)、免疫螢光分析、西方墨點法、免疫組織化學及其類似方法。熟習此項技術者容易調適已知蛋白質/抗體偵測方法用於測定血清樣品中一或多種生物標記之表現量。
用於偵測本發明多肽之另一種藥劑為能夠結合至多肽之對應於本發明標記的抗體，例如具有可偵測標記之抗體。抗體可為多株或單株抗體。可使用完整抗體或其片段(例如Fab或F(ab')2)。關於探針或抗體的術語「標記」意欲包涵藉由使可偵測物質偶合(亦即物理上連接)至探針或抗體來直接標記探針或抗體，以及藉由與經直接標記之另一種試劑反應而間接標記探針或抗體。間接標記之實例包括使用螢光標記之二次抗體偵測一次抗體及用維生素H對DNA探針進行末端標記，以便其可利用螢光標記之抗生蛋白鏈菌素偵測。
多肽係使用多種完全認可之免疫結合分析法中的任一者加以偵測及/或定量(參見例如美國專利第4,366,241號、第4,376,110號、第4,517,288號及第4,837,168號)。欲回顧通用免疫分析法，亦參見Asai(1993)Methods in Cell Biology第37卷：Antibodies in Cell Biology,Academic Press,Inc.New York；Stites & Terr(1991)Basic and Clinical Immunology第7版。
亦可分析標記表現量。本發明標記之表現可藉由用於偵測所轉錄分子或蛋白質之多種熟知方法中的任一者加以評估。此等方法之非限制性實例包括用於偵測所分泌之細胞表面、細胞質或核內蛋白的免疫方法、蛋白質純化方法、蛋白質功能或活性分析、核酸雜交方法、核酸逆轉錄方法，及核酸擴增方法。
在某些實施例中，特定基因之活性係藉由量測基因轉錄物(例如mRNA)、量測蛋白質轉譯量或藉由量測基因產物活性來表徵。標記表現可以多種方式監測，包括藉由偵測mRNA含量、蛋白質含量或蛋白質活性來監測，其中任一者可使用標準技術量測。偵測可包括基因表現量(例如基因組DNA、cDNA、mRNA、蛋白質或酶活性)之定量，或者可為基因表現量之定性評估(特定而言，與對照量比較)。自上下文將瞭解所偵測之對照量類型。
使用核酸雜交技術偵測及/或定量基因轉錄物(自其製得的mRNA或cDNA)的方法已為熟習此項技術者所知(參見例如Sambrook等人，同上)。舉例而言，一種評估cDNA之存在、不存在或量的方法包括如上文所述的南方轉移法。簡言之，分離mRNA(例如使用酸鈲-苯酚-氯仿萃取法，Sambrook等人，同上)且逆轉錄而產生cDNA。cDNA接著視情況消化且於緩衝液中在凝膠上跑電泳且轉移至膜上。接著使用特定用於目標cDNA的核酸探針進行雜交。
除非另有定義，否則本文所用的全部技術及科學術語具有與一般熟悉本發明所屬技術者通常所瞭解相同的含義。雖然可利用與本文所述類似或等效的方法及材料實施或測試本發明所述之iRNA及方法，但下文描述適合方法及材料。本文提及的所有公開案、專利申請案、專利及其他參考文獻均以全文引用的方式併入本文中。在有衝突的情況下，以包括定義之本說明書為準。另外，材料、方法及實例僅 具說明性，且不意欲具限制性。
實例 實例1. siRNA合成 試劑來源
在本文中未特別指定試劑來源的情況下，此試劑可依分子生物學應用中之品質/純度標準獲自分子生物學試劑之任何供應商。
寡核苷酸合成。
所有寡核苷酸均用AKTAoligopilot合成儀合成。寡核苷酸合成係使用市售可控孔隙玻璃固體載體(dT-CPG,500,Prime Synthesis)及具有標準保護基的RNA亞磷醯胺：5'-O-二甲氧基三苯甲基-N6-苯甲醯基-2'-第三丁基二甲基矽烷基-腺苷-3'-O-N,N'-二異丙基-2-氰基乙基胺基磷酸酯、5'-O-二甲氧基三苯甲基-N4-乙醯基-2'-第三丁基二甲基矽烷基-胞苷-3'-O-N,N'-二異丙基-2-氰基乙基胺基磷酸酯、5'-O-二甲氧基三苯甲基-N2-異丁基-2'-第三丁基二甲基矽烷基-鳥苷-3'-O-N,N'-二異丙基-2-氰基乙基胺基磷酸酯，及5'-O-二甲氧基三苯甲基-2'-第三丁基二甲基矽烷基-尿苷-3'-O-N,N'-二異丙基-2-氰基乙基胺基磷酸酯(Pierce Nucleic Acids Technologies)。2'-F胺基磷酸酯、5'-O-二甲氧基三苯甲基-N4-乙醯基-2'-氟-胞苷-3'-O-N,N'-二異丙基-2-氰基乙基-胺基磷酸酯及5'-O-二甲氧基三苯甲基-2'-氟-尿苷-3'-O-N,N'-二異丙基-2-氰基乙基-胺基磷酸酯購自(Promega)。所有胺基磷酸酯均於乙腈(CH3CN)中以0.2M濃度使用，但其中鳥苷係於10% THF/ANC(v/v)中以0.2M濃度使用。使用16分鐘之偶合/回收時間。活化劑為5-乙基硫代四唑(0.75M，American International Chemicals)；對於PO氧化，使用碘/水/吡啶且對於PS氧化，使用含有PADS(2%)之2,6-二甲基吡啶/ACN(1：1 v/v)。
與3'-配位體結合之股係使用含有相應配位體的固體載體合成。 舉例而言，膽固醇單元引入序列中係利用羥基脯胺醇-膽固醇胺基磷酸酯執行。膽固醇經由6-胺基己酸酯鍵聯繫連至反-4-羥基脯胺醇，以獲得羥基脯胺醇-膽固醇部分。5'端Cy-3及Cy-5.5(螢光團)標記之iRNA係利用購自Biosearch Technologies的相應Quasar-570(Cy-3)胺基磷酸酯合成。配位體與5'端及/或內部位置結合係使用經適當保護之配位體-胺基磷酸酯組分達成。胺基磷酸酯於無水CH3CN中之0.1M溶液與固體負載之所結合寡核苷酸在5-(乙硫基)-1H-四唑活化劑存在下偶合延長之15分鐘。核苷酸間亞磷酸酯氧化為磷酸酯係使用標準碘水進行，如(1)所報導，或藉由用氫過氧化第三丁基/乙腈/水(10：87：3)處理所結合之寡核苷酸10分鐘氧化等待時間來進行。藉由使用硫轉移試劑(諸如DDTT(購自AM Chemicals)、PADS及/或Beaucage試劑)將亞磷酸酯氧化為硫代磷酸酯來引入硫代磷酸酯。膽固醇胺基磷酸酯係內部合成且於二氯甲烷中以0.1M之濃度使用。膽固醇胺基磷酸酯之偶合時間為16分鐘。
脫除保護基I(核鹼基保護基脫除)
合成完成之後，將載體轉移至100mL玻璃瓶(VWR)中。在55℃，使用乙醇之氨溶液[氨：乙醇(3：1)]之80mL混合物使寡核苷酸自載體分裂，同時使鹼基及磷酸酯基的保護基脫除，歷時6.5小時。瓶子在冰上短暫冷卻且接著將乙醇之氨溶液混合物濾入新的250mL瓶子。CPG用乙醇/水(1：1 v/v)之2 x 40mL部分洗滌。接著藉由旋轉蒸發將混合物體積降低至約30mL。混合物接著在乾冰上冷凍且在真空離心乾燥機(Speed Vac)上、在真空下乾燥。
脫除保護基II(移除2'-TBDMS基團)
乾燥殘餘物再懸浮於26mL三乙胺中，三乙胺三氫氟酸鹽(TEA‧3HF)或吡啶-HF及DMSO(3：4：6)中且在60℃加熱90分鐘以移除2'位置的第三丁基二甲基矽烷基(TBDMS)基團。反應物接著用50mL 20mM 乙酸鈉淬滅且將pH值調節至6.5。寡核苷酸於冷凍機中儲存直至純化。
分析
寡核苷酸在純化之前藉由高效液相層析(HPLC)加以分析且緩衝液及管柱之選擇視序列之性質及/或所結合之配位體而定。
HPLC純化
與配位體結合之寡核苷酸係藉由逆相製備型HPLC純化。未結合之寡核苷酸係在裝填於外殼中之TSK凝膠管柱上、藉由陰離子交換HPLC加以純化。緩衝液為含有20mM磷酸鈉(pH 8.5)之10% CH3CN(緩衝液A)及含有20mM磷酸鈉(pH 8.5)之10% CH3CN、1M NaBr(緩衝液B)。將含有全長寡核苷酸的溶離份合併，脫鹽且凍乾。約0.15 OD之脫鹽寡核苷酸於水中稀釋至150μL且接著吸移至特定小瓶中用於CGE及LC/MS分析。接著藉由LC-ESMS及CGE分析化合物。
siRNA製備
在siRNA之通用製法中，將等莫耳量之有義股及反義股在1xPBS中在95℃加熱5分鐘且緩慢冷卻至室溫。藉由HPLC分析確認雙螺旋之完整性。
下文使用標準命名法且特別使用表2中之縮寫表示核酸序列。
1 L96之化學結構如下：
實例2. siRNA-LNP調配物在脂質奈米顆粒IRR/過敏性反應之豬模型中之快速給藥研究
此研究評估靜脈內(IV)快速投與siRNA-LNP至馴養約克夏豬(Yorkshire pigs)之後的急性輸注相關反應(IRR)。用此豬模型研究單次劑量之siRNA-LNP所引起之補體介導急性過敏性反應。亦測定藉由依序重複/增加siRNA-LNP之快速給藥所誘導之轉速反應。
方法及實驗設計 動物
在經麻醉之自發呼吸馴養豬中，藉由靜脈內快速注射投與測試調配物來研究siRNA-LNP對IRR的作用。
豬脂質體輸注反應緊密地模擬人類反應。在豬中投與低劑量(毫克)奈米顆粒材料可在數分鐘內引起急性心肺、血液動力學、血液學、生物化學及皮膚變化，從而模擬針對奈米醫藥及生物製品的人類IRR。
豬過敏性反應之例示性特徵包括(但不限於)心肺窘迫(高血壓/低血壓(肺性高血壓症伴隨/不伴隨全身性高血壓/低血壓)、心律不整、心搏過速、心搏徐緩、心跳停止、心輸出量降低、脈搏壓降低、左心室舒張末壓降低)、皮膚變化(潮紅、皮疹)、支氣管痙攣、氣喘/呼吸暫停、白血球減少症/白血球增多症、血小板減少症、腺苷增加、及血栓素A2增加。
豬對脂質體敏感且因此為過敏性人類個體之良好模型。補體介導之輸注反應之例示性豬模型描述於例如Szebeni J.等人，Adv.Drug Deliv.Rev.2012；64(15)：1706-1716中，該文獻之內容以引用的方式併入本文中。
此研究中使用三隻馴養的雄性約克夏豬(12-14週/34-37kg)。動物經Calypsol/Xilazine肌內注射預先麻醉且使用異氟烷氣體維持麻醉。動物自發地呼吸。使用監測氧飽和度及呼吸率的脈搏血氧計(固定於舌)監測呼吸。量測直腸溫度。呼末二氧化碳監測儀(capnograph)連接至氣管導管以監測etCO2及呼吸率。
所有切口區域均藉由充足塗覆聚維酮碘10%(povidone iodine 10%)來洗滌。
豬裝有Swan-Ganz導管，該導管經由右外頸靜脈→右心房→右心室引入肺動脈內，從而量測肺動脈壓(PAP)；壓力轉換器連接至股動脈內以記錄全身動脈壓(SAP)。導管插入左股靜脈用於採血樣。導管亦插入左外頸靜脈用於投與測試調配物及維持生理鹽水之慢滴輸注(約3mL/kg/h)。
亦連續記錄對應於Einthoven之I-II-III導線的ECG信號。
SiRNA-LNP調配物
三隻雄性豬各接受以下siRNA-LNP調配物之多次IV快速注射：MC3/DSPC/Chol/PEG2000-C-DMG(50/10/38.5/1.5mol%)。總脂質 /siRNA之比率：12.23。siRNA雙螺旋具有以下序列：GccuGGAGuuuAuucGGAAdTsdT(SEQ ID NO：5)(有義股)及UUCCGAAuAAACUCcAGGCdTsdT(SEQ ID NO：6)(反義股)。此siRNA雙螺旋靶向大鼠前蛋白轉化酶枯草桿菌蛋白/kexin 9型(PCSK9)基因且與豬序列不具有可偵測的交叉反應性。
投藥
各動物經由將導管插入左頸靜脈(用5mL生理鹽水洗滌)、藉由靜脈內快速注射來接受0mg(生理鹽水對照物)、2mg、2mg、10mg及20mg之固定單位連續劑量(所有劑量均基於siRNA含量)，其中各劑量間隔至少0.5小時以允許恢復至基線。由2mg/mL儲備溶液於0.9%無菌生理鹽水中稀釋至適當濃度來製備給藥溶液，恆定總注射體積為每次注射10mL。生理鹽水亦用作陰性對照物，各實驗開始為快速注射10mL生理鹽水以測試反應性。最後注射所測試之siRNA-LNP之後，動物接受酵母聚糖(0.5mg/kg)之靜脈內快速注射，已知酵母聚糖之靜脈內快速注射可誘導與補體活化相關的急性心血管變化。表3顯示此研究中所用的脂質劑量率及總劑量。
資料收集
評估以下參數：心血管(肺及全身壓力、心率)、ECG(Einthoven之I-II-III導線)、呼吸參數(呼吸率、呼末CO2、血液O2飽和度)、臨床徵象、血液學(血小板(PLT)、白血球(WBC)、紅血球(RBC)、血紅蛋白含量或RBC(Hb)、淋巴細胞(LYM)及粒細胞(GR))及體溫。
在給藥前及給藥後之特定時間點收集血漿樣品用於評估僅豬3之血栓素B2。在給藥前及給藥後之特定時間點收集血清及血漿樣品用於評估生物標記。
結果
在調配物之第一劑量(2mg)之後，靜脈內快速投與測試siRNA-LNP在所有三隻動物中均引起急性輸注相關反應(IRR)。
在第一動物(豬1)中，肺動脈壓(PAP)增至測試前值之370%，同時分別地，全身動脈壓(SAP)增至測試前值之130%且心率(HR)微小變化至測試前值之107%。圖1顯示豬1中之絕對值(亦即PAP)之變化，SAP以mmHg表示，HR以每分鐘脈搏數表示。
在第二隻動物(豬2)中，觀測到PAP陡增至測試前值之500%，而SAP顯示初始緩和增至SAP測試前值之107%，隨後立即陡降至SAP測試前值之28%，同時HR降至63%。圖2顯示豬2中之絕對值(亦即PAP)之變化，SAP以mmHg表示，HR以每分鐘脈搏數表示。
在第三隻動物中(豬3)，觀測到PAP陡增至測試前值之404%，而SAP分別顯示初始增至測試前值之110%，隨後陡降至測試前值之43%且HR顯示初始增至測試前值之120%，隨後陡降至測試前值之68%。
在動物2及動物3中，亦觀測到皮膚變化(全身潮紅及腹部皮疹)。動物2及動物3中發生呼吸停止且兩個動物均人工復蘇且接受腎上腺素之注射。
第二次2mg siRNA-LNP劑量在所有3隻動物中均引起可忽略的變化，表明動物對等效劑量之投與具有轉速反應。
投與隨後10mg劑量引起輕度PAP增加，而豬1及豬2中SAP或HR無變化，且豬3中僅發生可忽略的PAP增加及SAP降低。隨後20mg劑量在所有三隻動物中均引起心血管反應，與第一劑量之後所觀測到的相比，此等動物呈現較慢動力學及較輕反應：豬1：PAP出現長效雙 相增加；豬2：觀測到PAP、SAP及HR出現較短變化；豬3：PAP輕度增加且SAP穩定降低。
對於豬3而言，藉由ELISA分析血漿樣品中的血栓素B2(TXB2)含量。測試物第一劑量之後，在給藥後2分鐘，觀測到TXB2相對於基線陡增約58倍，在給藥後30分鐘降至基線之約10倍。隨後劑量未引起TXB2釋放。
每次實驗中先於測試物注射進行的媒劑注射(生理鹽水溶液，10mL靜脈內快速注射)未引起任何心血管變化。
結論
2mg(基於siRNA)單位靜脈內單次劑量(10mL)之siRNA-LNP調配物在所有動物中引起明顯IRR(基於心血管變化(PAP、SAP、HR))且.往3隻動物之2者中引起臨床毒性徵象。1至1.25小時恢復時間之後，重複投與相同劑量未引起相似反應，表明動物對於進一步刺激為難治的。隨後投與5倍較高劑量(10mg)在3隻動物之2者中引起輕度心血管反應且此等反應之動力學比2mg之第一劑量之後所觀測到的動力學慢。再投與20mg劑量之調配物之後，觀測到所有動物中出現較強反應。此等資料表明，2mg之第一及第二劑量之後所觀測到之轉速反應可藉由投與較高劑量來克服。然而，對較高劑量的反應均未呈現與第一劑量所見相同的快速動力學及嚴重程度。
實例3：siRNA-LNP調配物在脂質奈米顆粒過敏性反應之豬模型中的微劑量研究(方案I)
此研究評估siRNA-LNP以不同劑量率/方案靜脈內(IV)輸注至馴養約克夏豬之後的急性及遲發輸注相關反應(IRR)。
方法及實驗設計 動物
此研究中使用實例2中所述的相同動物模型。如實例2中所述製 備動物。另外，對於尿樣品而言，在腹部形成短中線切口，且將塑膠管插入且固定於膀胱中。
SiRNA-LNP調配物
此研究中所用之siRNA-LNP調配物描述於實例2中。
投藥
0.5mg/kg siRNA-LNP調配物之總劑量以不同劑量率/方案藉由靜脈內輸注投與六(6)隻豬(每組2隻動物)。給藥方案如下：
˙豬01及豬02：0.5mg/kg，輸注60分鐘
˙豬03及豬04：0.5mg/kg，輸注120分鐘
˙豬05及06：0.5mg/kg總劑量，該劑量之1/10輸注15分鐘，隨後立即輸注該劑量之剩餘9/10歷時60分鐘。
由1.98mg/mL儲備溶液於0.9%無菌生理鹽水中稀釋至適當濃度來製備給藥溶液，恆定總輸注體積為50mL。在心血管監測期末期，動物接受酵母聚糖(0.5mg/kg)之靜脈內快速注射，酵母聚糖之快速注射已知可誘導與補體活化相關的急性心血管變化。
資料收集
評估以下參數：心血管(肺及全身壓力、心率)、ECG(Einthoven之I-II-III導線)、呼吸參數(呼吸率、呼末CO2、血液O2飽和度)、臨床徵象、血球及血小板計數、血漿組織胺、血漿類胰蛋白酶及體溫。在輸注之前及輸注期間及輸注之後的特定時間點收集血漿及尿樣品用於評估血栓素B2。在特定時間點收集血清及血漿樣品用於評估生物標記。生物標記包括血漿血栓素B2及血清細胞激素/向化性激動素(GM-CSF、IFNγ、IL-10、IL-12、IL-18、IL-1RA、IL-1α、IL-1β、IL-2、IL-4、IL-6、IL-8及TNFα)。
結果
在豬01及豬02中，0.5mg/kg siRNA-LNP調配物靜脈內輸注60分 鐘在輸注期間引起輕度心血管變化且在輸注之後的15-30分鐘，在兩個動物中均引起嚴重變化。
在輸注期間，在豬01中，觀測到肺動脈壓僅出現緩慢中度的增加(PAP；測試前值之190%)，而在豬02中，在前5分鐘觀測到全身動脈壓(SAP)僅出現輕度增加，隨後SAP逐漸降低(測試前值之78%)。輸注之後，在兩個動物中均觀測到PAP、SAP及心率(HR)出現顯著升高，同時發生皮膚變化(豬01：全身潮紅及皮疹；豬02：全身潮紅)及ECG變化。在豬01中，PAP在輸注開始後的150分鐘增至測試前值之430%，且在175分鐘開始降低，但決不會恢復至測試前值。HR及SAP依循類似動力學。在豬02中，觀測到與豬01類似的反應，但隨後約15分鐘開始出現變化，且在輸注開始後的140分鐘，PAP達到測試前值之382%最大值。圖3顯示豬01中之絕對值(亦即PAP)之變化，SAP以mmHg表示，HR以每分鐘脈搏數表示。
在豬03及豬04中，0.5mg/kg siRNA-LNP測試調配物靜脈內輸注120分鐘在輸注期間引起輕度心血管變化且在輸注之後，在兩個動物中均引起嚴重變化。在輸注結束之後的30分鐘內，PAP開始陡升。在豬03中開始輸注後的285分鐘，PAP達到測試前值之625%最大值且在豬04中開始輸注後的240分鐘，達到測試前值之278%。在兩個動物中，均觀測到輕度皮膚潮紅及ECG變化。
在豬05及豬06中，0.5mg/kg siRNA-LNP測試調配物分兩個步驟靜脈內輸注：該劑量之1/10首先輸注15分鐘，該劑量之9/10隨後立即輸注60分鐘，總體上僅引起非常輕的變化。在整個輸注期期間，豬05中的PAP、SAP及HR穩定且豬06中之PAP僅出現測試前值之66-136%之間的最小波動。圖4顯示豬06中之絕對值(亦即PAP)之變化，SAP以mmHg表示，HR以每分鐘脈搏數表示。輸注之後，在豬05中觀測到PAP僅出現輕度的逐漸增加，在輸注開始後的160分鐘增至最大 160%。在豬05中，未觀測皮膚或ECG變化且在豬06中未見到皮膚變化且ECG僅出現最小變化。
在豬01及豬02中，血栓素B2(TxB2)血漿含量在靜脈內輸注期間保持穩定。輸注結束後，在兩個動物中均觀測到TxB2隨時間增加，其中豬01在240分鐘達到TxB2基線含量之最大5倍且豬02在150分鐘達到基線之最大16倍。TxB2釋放與PAP增加一致。對於豬01，僅分析尿TxB2含量，但所有值均高於分析中之ULOQ。
在豬03及豬04中，血漿TxB2亦隨時間而增加且在240分鐘達到基線之6.5倍最高位準且在225分鐘達到基線之4.7倍。TxB2釋放與PAP增加一致。
在豬05中，TxB2血漿含量在基線較高且隨時間降低0.3倍。在豬06中，TxB2隨時間增加且在150分鐘達到基線之4.6倍最大值，此量級與豬01、03及04類似，但PAP未出現相應增加。
對於血清細胞激素而言，觀測到IL-6、IL-8、IL-18及IL-1RA之含量增加。GM-CSF、IFNγ、IL-10、IL-12、IL-1α、IL-1β、IL-2、IL-4及TNFα未觀測到顯著變化。
結論
此研究中所用之輸注方案未產生與快速投與2mg如實例1中所述之siRNA-LNP測試調配物之數分鐘內所觀測到之反應類似的急性IRR。
藉由靜脈內輸注60分鐘或120分鐘投與0.5mg/kg siRNA-LNP測試調配物引起嚴重反應，此嚴重反應始於輸注結束後30分鐘內且特徵為肺性高血壓、全身性低血壓或高血壓、皮膚潮紅及ECG變化。1/10劑量之微給藥，隨後投與9/10劑量，在任何觀測時間均未引起顯著反應。
總體而言，三個劑量組之每一組內的兩隻動物顯示具有類似動 力學、但不同強度的反應。此與實例1中所見之反應異質性一致。因為在微劑量組中，在任何時間均未出現嚴重變化，所以與微劑量組相比，單步輸注之間存在明顯差異。此等資料表明微給藥為預防脂質奈米顆粒誘導之IRR的重要策略。
在豬01、02、03、04及06中，觀測到血漿TxB隨時間上升。微劑量組豬06中之TxB2相對於基線的誘導倍數範圍與60/120分鐘輸注組類似，且微劑量組豬05中之TxB2含量具有較高的基線含量。
實例4：siRNA-LNP調配物在脂質奈米顆粒過敏性反應之豬模型中的微劑量研究(方案II)
此研究使用替代微劑量方案評估siRNA-LNP以不同劑量率/方案靜脈內(IV)輸注至馴養約克夏豬之後的急性及遲發輸注相關反應(IRR)。
方法及實驗設計 動物
使用如實例2中所述的動物模型研究siRNA-LNP調配物之微給藥對預防或降低IRR的作用。
SiRNA-LNP調配物
此研究中所用之siRNA-LNP調配物描述於實例2中。
投藥
5.85mg/kg siRNA-LNP測試調配物之總劑量以不同劑量率/方案藉由靜脈內輸注投與六(6)隻豬(每組3隻動物)。給藥方案顯示於表4中。
各動物之總劑量(5.85mg/kg)及總輸注體積(50mL)保持恆定。基於個別動物體重，適當體積的儲備性siRNA-LNP調配物在無菌玻璃小瓶中用0.9%生理鹽水稀釋至60mL總體積。在心血管監測期末期，動物接受酵母聚糖(0.5mg/kg)之靜脈內快速注射，酵母聚糖之快速注射已知可誘導與補體活化相關的急性心血管變化。
資料評估
收集資料且如實例2及3中所述分析。
如實例4中所述進行的實驗顯示微劑量組(1mg/min，隨後為10mg/min)與直接10mg/min組之間的明顯差異。10mg/min組中的TxB2升幅明顯較高。
實例5：siRNA-LNP調配物於人類中之微劑量研究
此研究評估siRNA-LNP以不同劑量率/方案靜脈內(IV)輸注於人類患者之後的輸注相關反應(IRR)。
0.30mg/kg siRNA-LNP調配物之總劑量以不同劑量率/方案藉由靜脈內輸注投與患者。總劑量係基於siRNA於調配物中的量。脂質：siRNA比率範圍為11.5-14：1。在某些分批中，其為約11.6：1。
給藥方案如下：
˙十(10)位患者：0.30mg/kg，輸注歷時60分鐘。60分鐘輸注係 以3mL/min速率輸滿60分鐘。
˙三十二(32)位患者：0.30mg/kg，輸注歷時70分鐘(微劑量方案)。70分鐘輸注係以1mL/min速率進行前15分鐘且以3mL/min速率進行剩餘時間。
評估患者症狀，包括血壓、心率及體溫。圖5顯示與彼等患者之輸注相關反應(IRR)相關的劑量百分比。如圖5中所示，IRR發生率由接受60分鐘方案之患者中的15%(3/20)降低至接受70分鐘微劑量方案之患者中的2%(2/102)。
等效物
熟習此項技術者將認識到，或僅使用常規實驗便能夠判明本文所述之本發明特定實施例的許多等效例。希望以下申請專利範圍包涵此等等效例。
<110> 皮亞 凱斯柏寇維茲 傑瑞德 高羅柏
<120> 遞送經脂質調配之核酸分子之劑量及方法
<130> A2038-7199WO
<150> 61/820036
<151> 2013-05-06
<160> 6
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 16
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成肽
<400> 1
<210> 2
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成肽
<400> 2
<210> 3
<211> 13
<212> PRT
<213> 人類免疫缺乏病毒
<400> 3
<210> 4
<211> 16
<212> PRT
<213> 觸角足果蠅
<400> 4
<210> 5
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 組合之DNA/RNA分子之描述：合成寡核苷酸
<220>
<223> 人工序列之描述：合成寡核苷酸
<400> 5
<210> 6
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 組合之DNA/RNA分子之描述：合成寡核苷酸
<220>
<223> 人工序列之描述：合成寡核苷酸
<400> 6

Claims (145)

  1. 一種減少個體中之針對包含脂質調配物及核酸分子之組合物之輸注相關反應(IRR)及/或過敏性反應的方法，該方法包含向個體投與：第一劑量之該組合物；及第二劑量之該組合物；及其中滿足以下條件之a)至e)中的一、二、三、四者或全部：a)該組合物以該第一劑量投與的量不超過該組合物以該第二劑量投與之量的1/X，其中X為2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、30、40或50；b)該組合物以該第一劑量投與的量不超過該組合物所投總量的1/X，其中X為2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、30、40或50；c)該第一劑量投與的時段不超過該第二劑量所投時段的1/X，其中X為2、3、4、5、6、7、8、9或10；d)該第一劑量之投與速率，例如以mg/min或mL/min計，不超過該第二劑量之投與速率的1/X，其中X為2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、30、40或50；或e)該第一與該第二劑量之投與劑量及時段經選擇應使得該個體不會發生實質性IRR及/或過敏性反應。
  2. 一種降低個體中目標基因之表現或治療個體之與該目標基因相關之病症的方法，該方法包含：向該個體投與第一劑量及第二劑量之組合物，該組合物包含脂質調配物及核酸分子(例如RNA)分子，其中該第一與該第二劑量的投與量足以降低該個體中目標基因之表現或治療該個體之 該病症；及其中滿足以下條件之a)至d)中的一、二、三者或全部：a)該組合物以該第一劑量投與的量不超過該組合物以該第二劑量投與之量的1/X，其中X為2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、30、40或50；b)該組合物以該第一劑量投與的量不超過該組合物所投總量的1/X，其中X為2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、30、40或50；c)該第一劑量投與的時段不超過該第二劑量所投時段的1/X，其中X為2、3、4、5、6、7、8、9或10；或d)該第一劑量之投與速率，例如以mg/min或mL/min計，不超過該第二劑量之投與速率的1/X，其中X為2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、30、40或50。
  3. 如請求項1或2中任一項之方法，其中該第一劑量之投與速率為以下一或多者：該第二劑量之投與速率的約5%至50%、約5%至約20%、約5%至約10%、約10%至約40%、約10%至約20%，或約20%至約40%。
  4. 如請求項1至3中任一項之方法，其中該脂質調配物以該第一劑量投與的速率係選自約0.05μg/min/kg至約50μg/min/kg、約0.1μg/min/kg至約25μg/min/kg、約1μg/min/kg至約15μg/min/kg，或約5μg/min/kg至約10μg/min/kg。
  5. 如請求項1至4中任一項之方法，其中該脂質調配物以該第二劑量投與的速率係選自約0.5μg/min/kg至約500μg/min/kg、約1μg/min/kg至約250μg/min/kg、約10μg/min/kg至約150μg/min/kg，或約50μg/min/kg至約100μg/min/kg。
  6. 如請求項1至5中任一項之方法，其中： i)該脂質調配物以該第一劑量投與的速率係選自約0.05μg/min/kg至約50μg/min/kg、約0.1μg/min/kg至約25μg/min/kg、約1μg/min/kg至約15μg/min/kg，或約5μg/min/kg至約10μg/min/kg；及ii)該脂質調配物以該第二劑量投與之速率係選自約0.5μg/min/kg至約500μg/min/kg、約1μg/min/kg至約250μg/min/kg、約10μg/min/kg至約150μg/min/kg，或約50μg/min/kg至約100μg/min/kg。
  7. 如請求項1至6中任一項之方法，其中：i)該脂質調配物以該第一劑量投與的速率係選自約0.05μg/min/kg至約50μg/min/kg、約0.1μg/min/kg至約25μg/min/kg、約1μg/min/kg至約15μg/min/kg，或約5μg/min/kg至約10μg/min/kg；及ii)該脂質調配物以該第二劑量投與之速率係選自約0.5μg/min/kg至約500μg/min/kg、約1μg/min/kg至約250μg/min/kg、約10μg/min/kg至約150μg/min/kg，或約50μg/min/kg至約100μg/min/kg；及其中該第一劑量投與的時段不大於該總劑量所投時段的1/X，其中X=2、3、4、5、6、7、8、9或10。
  8. 如請求項1或2中任一項之方法，其中該核酸(例如RNA)分子以該第一劑量投與的速率係選自約0.01μg/min/kg至約5μg/min/kg、約0.02μg/min/kg至約2.5μg/min/kg、約0.05μg/min/kg至約1μg/min/kg，或約0.1μg/min/kg至約0.5μg/min/kg。
  9. 如請求項1至2或請求項8中任一項之方法，其中該核酸(例如RNA)分子以該第二劑量投與之速率係選自約0.1μg/min/kg至約50μg/min/kg、約0.2μg/min/kg至約25μg/min/kg、約0.5 μg/min/kg至約10μg/min/kg，或約1μg/min/kg至約5μg/min/kg。
  10. 如請求項1或2中任一項之方法，其中：(i)該核酸(例如RNA)分子以該第一劑量投與之速率係選自約0.01μg/min/kg至約5μg/min/kg、約0.02μg/min/kg至約2.5μg/min/kg、約0.05μg/min/kg至約1μg/min/kg，或約0.1μg/min/kg至約0.5μg/min/kg；及(ii)該核酸(例如RNA)分子以該第二劑量投與之速率係選自約0.1μg/min/kg至約50μg/min/kg、約0.2μg/min/kg至約25μg/min/kg、約0.5μg/min/kg至約10μg/min/kg，或約1μg/min/kg至約5μg/min/kg。
  11. 如請求項1或2中任一項之方法，其中：(i)該核酸(例如RNA)分子以該第一劑量投與之速率係選自約0.01μg/min/kg至約5μg/min/kg、約0.02μg/min/kg至約2.5μg/min/kg、約0.05μg/min/kg至約1μg/min/kg，或約0.1μg/min/kg至約0.5μg/min/kg；及(ii)該核酸(例如RNA)分子以該第二劑量投與之速率係選自約0.1μg/min/kg至約50μg/min/kg、約0.2μg/min/kg至約25μg/min/kg、約0.5μg/min/kg至約10μg/min/kg，或約1μg/min/kg至約5μg/min/kg；及其中該第一劑量投與的時段不大於該總劑量所投時段的1/X，其中X=2、3、4、5、6、7、8、9或10。
  12. 如請求項1或2中任一項之方法，其中該組合物以該第一劑量投與的總量係選自(且包括)：該組合物之總量的或該組合物以該第二劑量投與之量的約0.5%至20%、約1%至約15%、約1%至約10%、約1%至約5%、約2%至約10%、約2%至約5%，或約5%至約10%。
  13. 如請求項1或2中任一項之方法，其中該脂質調配物以該第一劑量投與的量係選自約0.5μg/kg至約1000μg/kg、約1μg/kg至約500μg/kg、約10μg/kg至約250μg/kg，或約50μg/kg至約150μg/kg。
  14. 如請求項1至2或請求項13中任一項之方法，其中該脂質調配物以該第二劑量投與之量係選自：約20μg/kg至約50000μg/kg、約100μg/kg至約25000μg/kg、約500μg/kg至約10000μg/kg，或約1000μg/kg至約5000μg/kg。
  15. 如請求項1或2中任一項之方法，其中：(i)該脂質調配物以該第一劑量投與的量係選自約0.5μg/kg至約1000μg/kg、約1μg/kg至約500μg/kg、約10μg/kg至約250μg/kg，或約50μg/kg至約150μg/kg；及(ii)該脂質調配物以該第二劑量投與之量係選自：約20μg/kg至約50000μg/kg、約100μg/kg至約25000μg/kg、約500μg/kg至約10000μg/kg，或約1000μg/kg至約5000μg/kg。
  16. 如請求項1或2中任一項之方法，其中：(i)該脂質調配物以該第一劑量投與的量係選自約0.5μg/kg至約1000μg/kg、約1μg/kg至約500μg/kg、約10μg/kg至約250μg/kg，或約50μg/kg至約150μg/kg；及(ii)該脂質調配物以該第二劑量投與之量係選自：約20μg/kg至約50000μg/kg、約100μg/kg至約25000μg/kg、約500μg/kg至約10000μg/kg，或約1000μg/kg至約5000μg/kg；及其中該第一劑量投與的時段不大於該總劑量所投時段的1/X，其中X=2、3、4、5、6、7、8、9或10。
  17. 如請求項1或2中任一項之方法，其中該核酸(例如RNA)分子以該第一劑量的量係選自約0.1μg/kg至約20μg/kg、約0.25μg/kg至約 15μg/kg、約0.5μg/kg至約10μg/kg，或約1μg/kg至約7.5μg/kg。
  18. 如請求項1至2及請求項17中任一項之方法，其中該核酸(例如RNA)分子以該第二劑量的量係選自約2μg/kg至約1000μg/kg、約5μg/kg至約750μg/kg、約10μg/kg至約500μg/kg，或約50μg/kg至約300μg/kg。
  19. 如請求項1或2中任一項之方法，其中：(i)該核酸(例如RNA)分子以該第一劑量的量係選自約0.1μg/kg至約20μg/kg、約0.25μg/kg至約15μg/kg、約0.5μg/kg至約10μg/kg，或約1μg/kg至約7.5μg/kg；及(ii)該核酸(例如RNA)分子以該第二劑量的量係選自約2μg/kg至約1000μg/kg、約5μg/kg至約750μg/kg、約10μg/kg至約500μg/kg，或約50μg/kg至約300μg/kg。
  20. 如請求項1或2中任一項之方法，其中：(i)該核酸(例如RNA)分子以該第一劑量的量係選自約0.1μg/kg至約20μg/kg、約0.25μg/kg至約15μg/kg、約0.5μg/kg至約10μg/kg，或約1μg/kg至約7.5μg/kg；及(ii)該核酸(例如RNA)分子以該第二劑量的量係選自約2μg/kg至約1000μg/kg、約5μg/kg至約750μg/kg、約10μg/kg至約500μg/kg，或約50μg/kg至約300μg/kg；及其中該第一劑量投與的時段不大於該總劑量所投時段的1/X，其中X=2、3、4、5、6、7、8、9或10。
  21. 如請求項1至20中任一項之方法，其中該第二劑量投與的時段為該第一劑量所投時段的至少2、3、4、5、6、7、8、9或10倍長。
  22. 如請求項1至20中任一項之方法，其中該第一劑量投與的時段不 大於該總劑量所投時段的1/X，其中X=2、3、4、5、6、7、8、9或10。
  23. 如請求項1至20中任一項之方法，其中該第一劑量投與的時段介於該第二劑量之投與時段的5%與50%之間、10%與45%之間、15%與40%之間、20%與35%之間，或25%與30%之間(例如第二時段之約27%)。
  24. 如請求項1至20中任一項之方法，其中該第一劑量投與的時段介於5分鐘與60分鐘之間、10分鐘與50分鐘之間、20分鐘與40分鐘之間、5分鐘與30分鐘之間，或10分鐘與20分鐘之間(例如約15分鐘)。
  25. 如請求項1至20中任一項之方法，其中該第二劑量投與的時段介於30分鐘與180分鐘之間、40分鐘與120分鐘之間、45分鐘與90分鐘之間，或50分鐘與65分鐘之間(例如約55分鐘)。
  26. 如請求項1至20中任一項之方法，其中完成該第一劑量之投與與開始該第二劑量之投與的間隔時間不超過1、10、20、30、60或180分鐘。
  27. 如請求項1至20中任一項之方法，其中完成該第一劑量之投與與開始該第二劑量之投與係基本上同時的。
  28. 如請求項1至27中任一項之方法，進一步包含向該個體投與該組合物之一或多個其他劑量，例如第三、第四組合物。
  29. 如請求項1至28中任一項之方法，其中該第一與該第二劑量係藉由靜脈內、動脈內、皮下、腹膜內或肌內注射或輸注來投與。
  30. 如請求項1至28中任一項之方法，其中該第一與該第二劑量係靜脈內投與，例如藉由輸注(例如經由泵)投與。
  31. 如請求項29或30中任一項之方法，其中該第一與該第二劑量係以實質上恆定速率投與，例如經由泵或持續或控制釋放型調配 物投與。
  32. 如請求項29或30中任一項之方法，其中該第一與該第二劑量係以梯度或多種速率投與。
  33. 如請求項29至32中任一項之方法，其中該第一劑量之投與流量不超過該第二劑量之投與流量的1/X，其中X為2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、30、40或50。
  34. 如請求項29至33中任一項之方法，其中該第一劑量之投與流量係選自約0.5至1.5mL/min、約0.8至1.3mL/min，或約1至1.2mL/min(例如1mL/min或1.1mL/min)。
  35. 如請求項29至34中任一項之方法，其中該第二劑量之投與流量係選自約2至4mL/min、約2.5至3.7mL/min，或約3至3.5mL/min(例如3mL/min或3.3mL/min)。
  36. 如請求項29至35中任一項之方法，其中：(i)該第一劑量之投與流量係選自約0.5至1.5mL/min、約0.8至1.3mL/min，或約1至1.2mL/min(例如1mL/min或1.1mL/min)；及(ii)該第二劑量之投與流量係選自約2至4mL/min、約2.5至3.7mL/min，或約3至3.5mL/min(例如3mL/min或3.3mL/min)。
  37. 如請求項26至36中任一項之方法，其中該輸注總體積為約100至300mL、約150至250mL，或約180mL或200mL。
  38. 如請求項1或3至37中任一項之方法，其中該IRR及/或過敏性反應為在劑量投與期間的急性過敏性反應。
  39. 如請求項1或3至37中任一項之方法，其中在該第二劑量之投與完成之後，發生該IRR及/或過敏性反應。
  40. 如請求項1至39中任一項之方法，進一步包含在投與該第一劑量、該第二劑量或該兩者之後評估該個體之以下一或多者之存 在：皮膚反應(例如蕁麻疹、紅疹、水腫、皮疹、搔癢、疹)；血液動力學變化，例如血壓變化(例如低血壓或高血壓)；呼吸道問題(例如喉痙攣、喉水腫、支氣管痙攣、呼吸困難)、疼痛(例如關節痛、背痛、腹痛或胸痛)，或過敏性之其他表現形式(例如發燒、寒顫、噁心、嘔吐或神經病變中之一或多者)。
  41. 如請求項1至40中任一項之方法，進一步包含在投與該第一劑量、該第二劑量或該兩者之後評估該個體之補體生物標記的變化，例如補體活化(例如選自Bb或C3ab之一或多種補體因子之變化)，其中補體生物標記之含量增加指示IRR及/或過敏性反應。
  42. 如請求項1至41中任一項之方法，進一步包含在投與該第一劑量、該第二劑量或該兩者之後評估該個體之血栓素含量的變化，例如血漿中之血栓素B2含量的變化，其中血栓素含量增加指示增強之過敏性反應，例如增強之急性過敏性反應。
  43. 如請求項1至42中任一項之方法，進一步包含在投與該第一劑量、該第二劑量或該兩者之後評估該個體之一或多種細胞激素的變化，該或該等細胞激素選自干擾素-α、干擾素-γ、腫瘤壞死因子-α、介白素1β、介白素1受體拮抗劑(IL-1RA)、介白素-6、介白素-8、介白素-12、介白素-18、干擾素誘導蛋白-10、顆粒球群落刺激因子或C-反應蛋白(CRP)。
  44. 如請求項43之方法，其中IL-6、IL-8、IL-1RA或CRP含量增加指示增強之過敏性反應，例如相對於參考參數(例如暴露於單次劑量之個體，或治療之前的個體)而言。
  45. 如請求項1至44中任一項之方法，其中該方法不引起可偵測到的IRR及/或過敏性反應，例如如依據請求項40至44中之一或多項所量測。
  46. 如請求項1至44中任一項之方法，其中該方法使得IRR及/或過敏 性反應降低，例如相對於參考參數(例如暴露於單次劑量的個體，或治療之前的個體)而言，此降幅小於1%、5%、10%、25%、30%、35%或40%，例如如依據請求項40至44中之一或多項所量測。
  47. 如請求項1至46中任一項之方法，其中該方法引起IRR及/或過敏性反應降低，例如在投與類固醇(例如地塞米松(dexamethasone)或等效物)、止痛劑(例如撲熱息痛(paracetamol))或組織胺受體拮抗劑(例如H1或H2阻斷劑)中之一或多者時導致降低(例如部分或完全)。
  48. 如請求項1至46中任一項之方法，其中在任一次開始投與該第一劑量之X小時內，該個體不接受類固醇(例如地塞米松或等效物)之投與，其中X小於1小時、2小時、3小時、5小時、10小時、15小時、24小時或48小時。
  49. 如請求項1至46中任一項之方法，其中若該第一及第二劑量方案提供至豬個體，則該個體將顯示降低之IRR及/或過敏性反應(例如，相對於參考參數(例如暴露於單次劑量的個體，或治療之前的個體)而言，減少之血液動力學變化)。
  50. 如請求項1至49中任一項之方法，其中該脂質調配物包含脂質核酸顆粒，例如奈米顆粒。
  51. 如請求項50之方法，其中該脂質核酸顆粒的平均直徑為約50nm至約200nm，例如約50nm至約150nm、約60nm至約130nm、約70nm至約110nm，或約70nm至約90nm。
  52. 如請求項1至51中任一項之方法，其中該脂質與藥物比率(質量/質量比)(例如脂質與RNA分子比率)係在約1：1至約50：1、約1：1至約25：1、約3：1至約15：1、約4：1至約13：1、約4：1至約10：1、約5：1至約9：1、約6：1至約9：1範圍內，或為約13：1、約12：1、約11：1、 約10：1、約9：1、約8：1、約7：1、約6：1、約5：1。
  53. 如請求項1至51中任一項之方法，其中該脂質與藥物比率(質量/質量比)(例如脂質與RNA分子比率)係在約5：1至30：1、約6：1至25：1、或約10：1至15：1範圍內。
  54. 如請求項1至53中任一項之方法，其中該脂質為陽離子型或非陽離子型脂質，或其組合。
  55. 如請求項54之方法，其中該陽離子型脂質係選自氯化N,N-二油基-N,N-二甲基銨(DODAC)、溴化N,N-二硬脂醯基-N,N-二甲基銨(DDAB)、氯化N-(1-(2,3-二油醯基氧基)丙基)-N,N,N-三甲基銨(DOTAP，在US 8,158,601中亦稱為氯化N-(2,3-二油醯基氧基)丙基)-N,N,N-三甲基銨)、氯化N-(1-(2,3-二油基氧基)丙基)-N,N,N-三甲基銨(DOTMA，在US 8,158,601中亦稱為氯化N-(2,3-二油基氧基)丙基-N,N,N-三乙銨)、N,N-二甲基-2,3-二油基氧基)丙胺(DODMA)、1,2-二亞麻油基氧基-N,N-二甲基胺基丙烷(DLinDMA)、1,2-二次亞麻油基氧基-N,N-二甲基胺基丙烷(DLenDMA)、1,2-二亞麻油基胺基甲醯基氧基-3-二甲基胺基丙烷(DLin-C-DAP)、1,2-二亞油氧基-3-(二甲基胺基)乙醯氧基丙烷(DLin-DAC)、1,2-二亞油氧基-3-嗎啉基丙烷(DLin-MA)、1,2-二亞油醯基-3-二甲基胺基丙烷(DLinDAP)、1,2-二亞麻油基硫基-3-二甲基胺基丙烷(DLin-S-DMA)、1-亞油醯基-2-亞麻油基氧基-3-二甲基胺基丙烷(DLin-2-DMAP)、1,2-二亞麻油基氧基-3-三甲基胺基丙烷氯化物鹽(DLin-TMA.Cl)、1,2-二亞油醯基-3-三甲基胺基丙烷氯化物鹽(DLin-TAP.Cl)、1,2-二亞麻油基氧基-3-(N-甲基哌嗪基)丙烷(DLin-MPZ)，或3-(N,N-二亞麻油基胺基)-1,2-丙二醇(DLinAP)、3-(N,N-二油基胺基)-1,2-丙二醇(DOAP)、9-((4-(二甲基胺基)丁醯基)氧基)十七烷二酸雙(3-戊基辛基)酯、1,2-二亞 麻油基側氧基-3-(2-N,N-二甲基胺基)乙氧基丙烷(DLin-EG-DMA)、1,2-二次亞麻油基氧基-N,N-二甲基胺基丙烷(DLinDMA)、2,2-二亞麻油基-4-二甲基胺基甲基-[1,3]-二氧雜環戊烷(DLin-K-DMA)或其類似物、(3aR,5s,6aS)-N,N-二甲基-2,2-二((9Z,12Z)-十八-9,12-二烯基)四氫-3aH-環戊并[d][1,3]二氧雜環戊烯-5-胺(ALN100)、4-(二甲基胺基)丁酸(6Z,9Z,28Z,31Z)-四十七-6,9,28,31-四烯-19-基酯(亦稱為DLin-M-C3-DMA、MC3或M-C3；在US 8,158,601中稱為式I，該案以引用的方式併入本文中；本文中稱為「MC3」或「式I/MC3」)、1,1'-(2-(4-(2-((2-(雙(2-羥基十二烷基)胺基)乙基)(2-羥基十二烷基)胺基)乙基)哌嗪-1-基)乙基氮二基)二-十二烷-2-醇(Tech G1)，或其混合物。
  56. 如請求項54或55之方法，其中該陽離子型脂質佔存在於該調配物中之總脂質中的約20mol%至約60mol%，或約40mol%。
  57. 如請求項1至56中任一項之方法，其中該脂質為非陽離子型脂質，例如陰離子型脂質或中性脂質。
  58. 如請求項57之方法，其中該非陽離子型脂質係選自二硬脂醯基磷脂醯膽鹼(DSPC)、二油醯基磷脂醯膽鹼(DOPC)、二棕櫚醯基磷脂醯膽鹼(DPPC)、二油醯基磷脂醯甘油(DOPG)、二棕櫚醯基磷脂醯甘油(DPPG)、二油醯基磷脂醯乙醇胺(DOPE，在US 8,158,601中亦稱為1,2-二油醯基-sn-3-磷酸乙醇胺)、棕櫚醯基油醯基磷脂醯膽鹼(POPC)、棕櫚醯基油醯基磷脂醯乙醇胺(POPE)、二油醯基磷脂醯乙醇胺4-(N-順丁烯二醯亞胺基甲基)-環己烷-1-甲酸酯(DOPE-mal)、二棕櫚醯基磷脂醯乙醇胺(DPPE)、二肉豆蔻醯基磷酸乙醇胺(DMPE)、二硬脂醯基磷脂醯乙醇胺(DSPE)、16-O-單甲基PE、16-O-二甲基PE、18-1-反式PE、1-硬脂醯基-2-油醯基磷脂醯乙醇胺(SOPE)、膽固醇、或其 混合物。
  59. 如請求項54至58中任一項之方法，其中若包括膽固醇，則該非陽離子型脂質為存在於該調配物中之總脂質的約5mol%至約90mol%、約10mol%，或約58mol%。
  60. 如請求項1至59中任一項之方法，其中該脂質經結合以例如防止或減少顆粒聚集。
  61. 如請求項60之方法，其中該所結合脂質係選自聚乙二醇(PEG)-脂質，包括(不限於)PEG-二醯基甘油(PEG-DAG)、PEG-二烷氧基丙基(PEG-DAA)(例如PEG-二月桂基氧基丙基(Ci2)、PEG-二肉豆蔻基氧基丙基(Ci4)、PEG-二棕櫚基氧基丙基(Ci6)，或PEG-二硬脂醯氧基丙基(Ci8))、PEG-磷脂、PEG-神經醯胺(PEG-Cer)(例如PEG-CerC14、PEG-CerC16、PEG-CerC18、PEG-CerC20，或PEG-CerC22)，或其混合物。
  62. 如請求項60或61之方法，其中該所結合脂質為存在於該調配物中之總脂質的約0mol%至約20mol%，例如約1%至約15%，或約2mol%。
  63. 如請求項50至62中任一項之方法，其中脂質核酸顆粒進一步包含存在於該調配物中之總脂質之例如約10mol%至約60mol%、約15%至約50%、或約48mol%的膽固醇。
  64. 如請求項1至63中任一項之方法，其中該脂質調配物包含DLinDMA、MC3或C12-200。
  65. 如請求項1至63中任一項之方法，其中該脂質調配物包含式I/MC3之陽離子型脂質(亦稱為DLin-M-C3-DMA、MC3或M-C3)或其醫藥學上可接受之鹽。
  66. 如請求項65之方法，其中式I/MC3之陽離子型脂質存在於該脂質調配物中的莫耳量為約25%至約75%，例如約35%至約65%、約 45%至約65%、約60%、約57.5%、約50%或約40%。
  67. 如請求項65或66之方法，其中該脂質調配物進一步包含中性脂質。
  68. 如請求項67之方法，其中該中性脂質係選自二硬脂醯基磷脂醯膽鹼(DSPC)、二棕櫚醯基磷脂醯膽鹼(DPPC)、二肉豆蔻醯基磷脂醯膽鹼(DMPC)、棕櫚醯基油醯基磷脂醯膽鹼(POPC)、二油醯基磷脂醯乙醇胺(DOPE，在US 8,158,601中亦稱為1,2-二油醯基-sn-3-磷酸乙醇胺)及神經鞘磷脂(SM)。
  69. 如請求項66或67之方法，其中該中性脂質存在於該脂質調配物中的莫耳量為約0.5%至約15%，例如約3%至約12%、約5%至約10%、約15%、約10%或約7.5%。
  70. 如請求項64至69中任一項之方法，其中該脂質調配物進一步包含固醇，例如膽固醇。
  71. 如請求項70之方法，其中該固醇存在於該脂質調配物中的莫耳量為約5%至約50%，例如約15%至約45%、約20%至約40%、約40%、約38.5%、約35%或約31%。
  72. 如請求項64至71中任一項之方法，其中該脂質調配物進一步包含PEG或經PEG修飾之脂質。
  73. 如請求項72之方法，其中該PEG脂質為PEG-C14至PEG-C22、PEG-C14至PEG-C20，或PEG-二硬脂醯基磷脂醯乙醇胺(PEG-DSPE)。
  74. 如請求項72或73之方法，其中該PEG或經PEG修飾之脂質包含平均分子量不大於2,000Da，例如約2,000Da、約1,500Da、約1,000Da或約500Da的PEG分子。
  75. 如請求項72至74中任一項之方法，其中該PEG或經PEG修飾之脂質存在於該脂質調配物中的莫耳量為約0.5%至約20%，例如約 0.5%至約10%、約0.5%至約5%、約1.5%、約0.5%、約1.5%、約3.5%或約5%。
  76. 如請求項70至75中任一項之方法，其中該脂質調配物包含式I/MC3之陽離子型脂質、中性脂質、固醇及PEG或經PEG修飾之脂質。
  77. 如請求項72至76中任一項之方法，其中該脂質調配物包含：以莫耳計，25-75%之式I/MC3陽離子型脂質、0.5-15%之中性脂質、5-50%之固醇及0.5-20%之PEG或經PEG修飾之脂質。
  78. 如請求項72至77中任一項之方法，其中該脂質調配物包含：以莫耳計，35-65%之式I/MC3陽離子型脂質、3-12%之中性脂質、15-45%之固醇及0.5-10%之PEG或經PEG修飾之脂質。
  79. 如請求項72至78中任一項之方法，其中該脂質調配物包含：以莫耳計，45-65%之式I/MC3陽離子型脂質、5-10%之中性脂質、25-40%之固醇及0.5-10%之PEG或經PEG修飾之脂質。
  80. 如請求項72至79中任一項之方法，其中該脂質調配物包含40-65%之式I/MC3陽離子型脂質、5-10%之中性脂質、25-40%之固醇及0.5-10%之PEG或經PEG修飾之脂質。
  81. 如請求項72至80中任一項之方法，其中該脂質調配物包含約50%之式I/MC3陽離子型脂質、約10%中性脂質(例如DSPC)、約38.5%固醇(例如膽固醇)及約1.5% PEG或經PEG修飾之脂質(例如PEG-DMG)(本文中亦稱為LNP-11)。
  82. 如請求項72至81中任一項之方法，其中該脂質調配物包含約50%之式I/MC3陽離子型脂質、約10%中性脂質、約35%固醇及約5% PEG或經PEG修飾之脂質。
  83. 如請求項72至82中任一項之方法，其中該脂質調配物包含約57.2%之式I/MC3陽離子型脂質、約7.1%中性脂質、約34.3%固醇 及約1.4% PEG或經PEG修飾之脂質。
  84. 如請求項72至83中任一項之方法，其中該調配物係藉由在線混合方法製備。
  85. 如請求項72至84中任一項之方法，其中該調配物係藉由擠出方法製備。
  86. 如請求項72至85中任一項之方法，其中該脂質調配物進一步包含核酸，且其中脂質：核酸比率為至少約1：1、至少約2：1、至少約3：1、至少約4：1、至少約5：1、至少約6：1、至少約7：1、至少約8：1、至少約10：1、至少約11：1、至少約12：1、至少約15：1或至少30：1，例如約0.5：1至約15：1、約1：1至約20：1、約3：1至約15：1、約4：1至約15：1，或約5：1至約13：1。
  87. 如請求項72至86中任一項之方法，其中該脂質調配物進一步包含至少一種脂蛋白元。
  88. 如請求項87之方法，其中該脂蛋白元為ApoE、活性多晶型、同功異型物、變異體及突變體，及其片段或截斷形式。
  89. 如請求項72至85中任一項之方法，其中該脂質調配物進一步包含目標脂質。
  90. 如請求項89之方法，其中該目標脂質包含N-乙醯基半乳糖胺。
  91. 如請求項90之方法，其中該N-乙醯基半乳糖胺至少包含單分支、二分支或三分支糖單元。
  92. 如請求項90或91之方法，其中該目標脂質存在於該調配物中的莫耳量為約0.001%至約5%，例如約0.005%至約1.5%，例如約0.005%、約0.15%、約0.3%、約0.5%、約1.5%、約2%、約2.5%、約3%、約4%或約5%。
  93. 如請求項90至92中任一項之方法，其中該目標脂質為選自由以下組成之群的化合物：GalNAc3-DSG(例如在US8,158,601中稱為 式II)、GalNAc3-PEG-DSG(例如在US 8,158,601中稱為式III)、(GalNAc)3-PEG-LCO(例如在US 8,158,601中稱為式IV)、葉酸酯-PEG2000-DSG(例如在US 8,158,601中稱為式VI)，及葉酸酯-PEG3400-DSG(例如在US 8,158,601中稱為式VII)。
  94. 如請求項1至93中任一項之方法，其中該核酸分子係選自：雙股RNA(dsRNA)分子、單股RNAi分子、微RNA(miRNA)、反義RNA、短髮夾RNA(shRNA)、抗miRNA寡核苷酸(antagomirs)、mRNA、誘餌RNA、DNA、質體或適體。
  95. 如請求項1至93中任一項之方法，其中該RNA分子為雙股核糖核酸(dsRNA)分子。
  96. 如請求項1至93中任一項之方法，其中該RNA分子為單股分子，例如包含反義股。
  97. 如請求項96之方法，其中該RNA分子包含有義股及反義股。
  98. 如請求項97之方法，其中該dsRNA形成長度介於15個與30個鹼基對之間的雙螺旋結構。
  99. 如請求項94至98中任一項之方法，其中該RNA分子包含至少一個經修飾之核苷酸。
  100. 如請求項99之方法，其中該等經修飾核苷酸中之至少一者選自由以下組成之群：經2'-O-甲基修飾之核苷酸、包含5'-硫代磷酸酯基之核苷酸，及連接至膽固醇基衍生物或十二烷酸雙癸基醯胺基的末端核苷酸。
  101. 如請求項99之方法，其中該經修飾之核苷酸選自由以下組成之群：經2'-脫氧-2'-氟修飾之核苷酸、經2'-脫氧-修飾之核苷酸、鎖定核苷酸、無鹼基核苷酸、經2'-胺基-修飾之核苷酸、經2'-烷基-修飾之核苷酸、嗎啉基核苷酸、胺基磷酸酯，及包含非天然鹼基的核苷酸。
  102. 如請求項94至95或98至101中任一項之方法，其中該等股之間的互補區長度為至少17個核苷酸。
  103. 如請求項94至95或98至101中任一項之方法，其中該互補區長度為19至25個，例如19至21個核苷酸。
  104. 如請求項94至95或98至101中任一項之方法，其中各股長度不超過30個核苷酸。
  105. 如請求項94至95或98至101中任一項之方法，其中至少一個股包含具有至少1個核苷酸之3'突出物。
  106. 如請求項105之方法，其中至少一個股包含具有至少2個核苷酸之3'突出物。
  107. 如請求項94至95或98至101中任一項之方法，其中該雙股分子之一端為鈍端。
  108. 如請求項94至95或98至101中任一項之方法，其中該RNA分子具有與目標mRNA至少70%(例如80%、90%、95%或高於95%)一致的序列。
  109. 如請求項94至107中任一項之方法，其中該RNA分子具有與目標mRNA互補(例如完全互補或實質上互補)的序列。
  110. 如請求項108至109之方法，其中該目標mRNA係選自哺乳動物mRNA、植物mRNA、病原體相關mRNA、病毒mRNA或疾病相關mRNA。
  111. 如請求項110之方法，其中該目標mRNA為腫瘤相關mRNA。
  112. 如請求項110之方法，其中該目標mRNA為自體免疫疾病相關mRNA。
  113. 如請求項110之方法，其中該目標係選自：因子VII、Eg5、PCSK9、TPX2、apoB、SAA、TTR、RSV、PDGFβ基因、Erb-B基因、Src基因、CRK基因、GRB2基因、RAS基因、MEKK基 因、JNK基因、RAF基因、Erk1/2基因、PCNA(p21)基因、MYB基因、JUN基因、FOS基因、BCL-2基因、HAMP、活化蛋白C基因、週期素D基因、VEGF基因、抗凝血酶3基因、胺基乙醯丙酸酯合成酶1基因、α1-抗胰蛋白酶基因、tmprss6基因、apoa1基因、apoc3基因、bc11a基因、klf基因、angptl3基因、plk基因、PKN3基因、HBV、HCV、p53基因、血管生成素基因、血管生成素樣3基因、補體組分3(C3)基因，或補體組分5(C5)基因。
  114. 如請求項110之方法，其中該目標係選自：Eg5、PCSK9、TTR、HAMP、VEGF基因、抗凝血酶3基因、胺基乙醯丙酸酯合成酶1基因、α1-抗胰蛋白酶基因，或tmprss6基因。
  115. 一種用於投與第一劑量及第二劑量之組合物的套組，該套組包含：提供組合物，該組合物包含脂質調配物及核酸(例如RNA)分子，其中該第二量大於該第一量；及投藥說明書，其中指示該第一劑量投與的時段不超過該第二劑量所投時段的1/X，其中X為2、3、4、5、6、7、8、9或10；及該第一劑量之投與速率，例如以mg/min或mL/min計，不超過該第二劑量之投與速率的1/X，其中X為2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、30、40或50。
  116. 一種製備如請求項115之套組中之第一及第二劑量的方法，該方法包含：修改該組合物之投與速率，以便調節該劑量。
  117. 一種裝置，例如用於靜脈內投藥的裝置，包含：含有組合物(例如可以如本文所述之第一及/或第二劑量投與的組合物)的儲集器，例如袋，該組合物包含如本文所述的脂質調 配物及核酸(例如RNA)分子；管路(例如導管)；用於調節該組合物之投與速率的構件(例如閥)；及(視情況存在的)針；其中該管路使該儲集器與該構件(例如閥)(及視情況存在之連接至該針的第二管路)連通，及其中：a)該組合物以第一劑量(例如本文所述的第一劑量)投與的時段不超過該第二劑量所投時段的1/X，其中X為2、3、4、5、6、7、8、9或10；或b)該第一劑量之投與速率，例如以mg/min或mL/min計，不超過該第二劑量之投與速率的1/X，其中X為2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、30、40或50。
  118. 如請求項1、2或50至114中任一項之方法，其中該第一劑量係以1.5與2μg/kg/min之間的第一核酸劑量率投與，及其中該第二劑量係以4與6μg/kg/min之間的第二核酸劑量率投與；及/或其中該第一劑量係以15與25μg/kg/min之間的第一脂質劑量率投與，及其中該第二劑量係以55與75μg/kg/min之間的第二脂質劑量率投與。
  119. 如請求項1、2或50至114中任一項之方法，其中該第一劑量係以1.5與2μg/kg/min之間的第一核酸劑量率投與，及其中該第二劑量係以4與6μg/kg/min之間的第二核酸劑量率投與。
  120. 如請求項1、2或50至114中任一項之方法，其中該第一脂質劑量 率介於15與25μg/kg/min之間，且該第二脂質劑量率介於55與75μg/kg/min之間。
  121. 如請求項1至2、50至114或118至120中任一項之方法，其中該第一劑量係介於0.5與1.5mL/min之間投與，且該第二劑量係介於2.5與3.5mL/min之間投與。
  122. 如請求項1至2、50至114或118至121中任一項之方法，其中該第一劑量係在介於10分鐘與20分鐘之間的時段內投與，且該第二劑量係在介於50分鐘與60分鐘之間的時段內投與。
  123. 如請求項1至2、50至114或118至122中任一項之方法，其中該第一核酸劑量係介於20與30μg/kg之間，且該第二核酸劑量係介於250與300μg/kg之間。
  124. 如請求項1至2、50至114或118至123中任一項之方法，其中該第一脂質劑量係介於250與400μg/kg之間，且該第二脂質劑量係介於2500與4000μg/kg之間。
  125. 如請求項1至2、50至114或118至124中任一項之方法，其中該第一與該第二劑量中之總核酸劑量係介於0.2與0.4mg/kg之間。
  126. 如請求項1至2、50至114或118至125中任一項之方法，其中該第一與該第二劑量中之總脂質劑量係介於3.0與4.5mg/kg之間。
  127. 如請求項1至2、50至114或118至126中任一項之方法，其中該第一核酸劑量率係介於0.1與0.15mg/min間，且該第二核酸劑量率係介於0.3與0.4mg/min之間。
  128. 如請求項1至2、50至114或118至127中任一項之方法，其中該第一脂質劑量率係介於1.0與1.5mg/min間，且該第二脂質劑量率係介於3.5與4.5mg/min之間。
  129. 如請求項1至2、50至114或118至128中任一項之方法，其中該第一核酸劑量係介於1.5與2.0mg之間，且該第二核酸劑量係介於 15與25mg之間。
  130. 如請求項1至2、50至114或118至128中任一項之方法，其中該第一脂質劑量係介於15與25mg之間，且該第二脂質劑量係介於200與300mg之間。
  131. 一種減少個體中之針對包含脂質調配物之組合物之輸注相關反應或過敏性反應或兩者的方法，該脂質調配物包含MC3及siRNA分子，該方法包含向個體投與：第一劑量之該組合物；及第二劑量之該組合物；其中該第一劑量係以介於1.5與2μg/kg/min之間的第一siRNA劑量率投與，及其中該第二劑量係以介於4與6μg/kg/min之間的第二siRNA劑量率投與；及/或其中該第一劑量係以介於15與25μg/kg/min之間的第一脂質劑量率投與，及其中該第二劑量係以介於55與75μg/kg/min之間的第二脂質劑量率投與。
  132. 一種降低個體中目標基因之表現或治療個體之與該目標基因相關之病症的方法，該方法包含：向該個體投與組合物之第一劑量及第二劑量，該組合物包含含有MC3及siRNA分子的脂質調配物，其中該第一與該第二劑量係以足以減少個體中目標基因之表現或治療個體之病症的量投與；且其中該第一劑量係以介於1.5與2μg/kg/min之間的第一siRNA劑量率投與，及其中該第二劑量係以介於4與6μg/kg/min之間的第二siRNA劑 量率投與；及/或其中該第一劑量係以介於15與25μg/kg/min之間的第一脂質劑量率投與，及其中該第二劑量係以介於55與75μg/kg/min之間的第二脂質劑量率投與。
  133. 如請求項131至132中任一項之方法，其中該第一劑量係以介於1.5與2μg/kg/min之間的第一siRNA劑量率投與，及其中該第二劑量係以介於4與6μg/kg/min之間的第二siRNA劑量率投與。
  134. 如請求項131至132中任一項之方法，其中該第一脂質劑量率係介於15與25μg/kg/min之間，且該第二脂質劑量率係介於55與75μg/kg/min之間。
  135. 如請求項131至134中任一項之方法，其中該第一劑量係介於0.5與1.5mL/min之間投與，且該第二劑量係介於2.5與3.5mL/min之間投與。
  136. 如請求項131至135中任一項之方法，其中該第一劑量係在介於10與20分鐘之間的時段內投與，且該第二劑量係在介於50與60分鐘之間的時段內投與。
  137. 如請求項131至136中任一項之方法，其中該第一siRNA劑量係介於20與30μg/kg之間，且第二siRNA劑量係介於250與300μg/kg之間。
  138. 如請求項131至137中任一項之方法，其中該第一脂質劑量係介於250與400μg/kg之間，且該第二脂質劑量係介於2500與4000μg/kg之間。
  139. 如請求項131至138中任一項之方法，其中該第一與該第二劑量中之總siRNA劑量係介於0.2與0.4mg/kg之間。
  140. 如請求項131至139中任一項之方法，其中該第一與該第二劑量中之總脂質劑量係介於3.0與4.5mg/kg之間。
  141. 如請求項131至140中任一項之方法，其中該第一siRNA劑量率係介於0.1與0.15mg/min之間，且該第二siRNA劑量率係介於0.3與0.4mg/min之間。
  142. 如請求項131至141中任一項之方法，其中該第一脂質劑量率係介於1.0與1.5mg/min之間，且該第二脂質劑量率係介於3.5與4.5mg/min之間。
  143. 如請求項131至142中任一項之方法，其中該第一siRNA劑量係介於1.5與2.0mg之間且該第二siRNA劑量係介於15與25mg之間。
  144. 如請求項131至143中任一項之方法，其中該第一脂質劑量係介於15與25mg之間且該第二脂質劑量係介於200與300mg之間。
  145. 如請求項131至144中任一項之方法，其中該脂質調配物為LNP11調配物。
TW103116159A 2013-05-06 2014-05-06 遞送經脂質調配之核酸分子之劑量及方法 TW201515650A (zh)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201361820036P 2013-05-06 2013-05-06

Publications (1)

Publication Number Publication Date
TW201515650A true TW201515650A (zh) 2015-05-01

Family

ID=51867849

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
TW103116159A TW201515650A (zh) 2013-05-06 2014-05-06 遞送經脂質調配之核酸分子之劑量及方法

Country Status (5)

Country Link
US (3) US10246708B2 (zh)
EP (1) EP2994167B1 (zh)
AR (2) AR096203A1 (zh)
TW (1) TW201515650A (zh)
WO (1) WO2014182661A2 (zh)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN111363822A (zh) * 2019-11-20 2020-07-03 深圳市鲲鹏未来科技有限公司 包含血液稳定性纳米颗粒的溶液、其制备方法及miRNA标志物的检测方法

Families Citing this family (37)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
AU2012272970A1 (en) 2011-06-21 2014-02-06 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Angiopoietin-like 3 (ANGPTL3) iRNA compositions and methods of use thereof
AR096203A1 (es) 2013-05-06 2015-12-16 Alnylam Pharmaceuticals Inc Dosificaciones y métodos para administrar moléculas de ácido nucleico formuladas en lípidos
WO2015048744A2 (en) 2013-09-30 2015-04-02 Moderna Therapeutics, Inc. Polynucleotides encoding immune modulating polypeptides
CA2926218A1 (en) 2013-10-03 2015-04-09 Moderna Therapeutics, Inc. Polynucleotides encoding low density lipoprotein receptor
BR112016024644A2 (pt) 2014-04-23 2017-10-10 Modernatx Inc vacinas de ácido nucleico
CA2982450A1 (en) * 2015-04-13 2016-10-20 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Angiopoietin-like 3 (angptl3) irna compositions and methods of use thereof
PT3350157T (pt) 2015-09-17 2022-03-18 Modernatx Inc Compostos e composições para administração intracelular de agentes terapêuticos
EP3364981A4 (en) 2015-10-22 2019-08-07 ModernaTX, Inc. VACCINE AGAINST THE HUMAN CYTOMEGALOVIRUS
EP3964200A1 (en) 2015-12-10 2022-03-09 ModernaTX, Inc. Compositions and methods for delivery of therapeutic agents
AU2016377681B2 (en) 2015-12-22 2021-05-13 Modernatx, Inc. Compounds and compositions for intracellular delivery of agents
WO2017186711A1 (en) 2016-04-25 2017-11-02 Invivogen Novel complexes of immunostimulatory compounds, and uses thereof
JP6980780B2 (ja) 2016-10-21 2021-12-15 モデルナティーエックス， インコーポレイテッド ヒトサイトメガロウイルスワクチン
EP3315125A1 (en) * 2016-10-31 2018-05-02 Silence Therapeutics (London) Ltd Lipid nanoparticle formulation
WO2018089540A1 (en) 2016-11-08 2018-05-17 Modernatx, Inc. Stabilized formulations of lipid nanoparticles
AU2017368050A1 (en) 2016-11-29 2019-06-20 Puretech Lyt, Inc. Exosomes for delivery of therapeutic agents
AU2017379901B2 (en) * 2016-12-21 2024-02-15 Arbutus Biopharma Corporation Methods for ameliorating infusion reactions
PL3596041T3 (pl) 2017-03-15 2023-03-06 Modernatx, Inc. Związek i kompozycje do dokomórkowego dostarczania środków terapeutycznych
US11969506B2 (en) 2017-03-15 2024-04-30 Modernatx, Inc. Lipid nanoparticle formulation
ES2911186T3 (es) 2017-03-15 2022-05-18 Modernatx Inc Formas cristalinas de aminolípidos
US11786607B2 (en) 2017-06-15 2023-10-17 Modernatx, Inc. RNA formulations
WO2019046809A1 (en) 2017-08-31 2019-03-07 Modernatx, Inc. METHODS OF MANUFACTURING LIPID NANOPARTICLES
US11492620B2 (en) 2017-12-01 2022-11-08 Suzhou Ribo Life Science Co., Ltd. Double-stranded oligonucleotide, composition and conjugate comprising double-stranded oligonucleotide, preparation method thereof and use thereof
CN110944675A (zh) 2017-12-01 2020-03-31 苏州瑞博生物技术有限公司 一种核酸、含有该核酸的组合物与缀合物及制备方法和用途
WO2019105419A1 (zh) 2017-12-01 2019-06-06 苏州瑞博生物技术有限公司 一种核酸、含有该核酸的组合物与缀合物及制备方法和用途
WO2019105414A1 (zh) 2017-12-01 2019-06-06 苏州瑞博生物技术有限公司 一种核酸、含有该核酸的组合物与缀合物及制备方法和用途
AU2018394875B2 (en) 2017-12-29 2023-08-03 Suzhou Ribo Life Science Co., Ltd. Conjugates and preparation and use thereof
EP3842534A4 (en) 2018-08-21 2022-07-06 Suzhou Ribo Life Science Co., Ltd. NUCLEIC ACID, COMPOSITION AND CONJUGATE CONTAINING NUCLEIC ACID AND METHOD OF USE THEREOF
US10940290B2 (en) * 2018-08-27 2021-03-09 Alcyone Lifesciences, Inc. Fluid delivery systems and methods
EP3862024A4 (en) 2018-09-30 2022-08-17 Suzhou Ribo Life Science Co., Ltd. SHORT INTERFERENT RNA CONJUGATE, METHOD FOR PREPARATION AND USE THEREOF
AR120080A1 (es) 2019-09-19 2022-02-02 Modernatx Inc Compuestos lipídicos de cola ramificada y composiciones para la administración intracelular de agentes terapéuticos
US11406703B2 (en) 2020-08-25 2022-08-09 Modernatx, Inc. Human cytomegalovirus vaccine
TW202233232A (zh) 2020-11-06 2022-09-01 法商賽諾菲公司 遞送mRNA疫苗的脂質奈米顆粒
WO2022260678A1 (en) * 2021-06-11 2022-12-15 Dnalite Therapeutics, Inc. Compositions and methods for biological delivery vehicles
US11524023B2 (en) 2021-02-19 2022-12-13 Modernatx, Inc. Lipid nanoparticle compositions and methods of formulating the same
WO2022187435A1 (en) 2021-03-04 2022-09-09 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Angiopoietin-like 3 (angptl3) irna compositions and methods of use thereof
CA3221699A1 (en) * 2021-06-24 2022-12-29 Glen N. Barber Sting dependent adjuvants
WO2024057237A1 (en) * 2022-09-16 2024-03-21 Pfizer Inc. Lipid nanoparticles

Family Cites Families (78)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US3687808A (en) 1969-08-14 1972-08-29 Univ Leland Stanford Junior Synthetic polynucleotides
US4376110A (en) 1980-08-04 1983-03-08 Hybritech, Incorporated Immunometric assays using monoclonal antibodies
US4366241A (en) 1980-08-07 1982-12-28 Syva Company Concentrating zone method in heterogeneous immunoassays
US4517288A (en) 1981-01-23 1985-05-14 American Hospital Supply Corp. Solid phase system for ligand assay
US4426330A (en) 1981-07-20 1984-01-17 Lipid Specialties, Inc. Synthetic phospholipid compounds
US4534899A (en) 1981-07-20 1985-08-13 Lipid Specialties, Inc. Synthetic phospholipid compounds
US5034506A (en) 1985-03-15 1991-07-23 Anti-Gene Development Group Uncharged morpholino-based polymers having achiral intersubunit linkages
CA1291031C (en) 1985-12-23 1991-10-22 Nikolaas C.J. De Jaeger Method for the detection of specific binding agents and their correspondingbindable substances
US4837028A (en) 1986-12-24 1989-06-06 Liposome Technology, Inc. Liposomes with enhanced circulation time
US4920016A (en) 1986-12-24 1990-04-24 Linear Technology, Inc. Liposomes with enhanced circulation time
GB8824593D0 (en) 1988-10-20 1988-11-23 Royal Free Hosp School Med Liposomes
US5032401A (en) 1989-06-15 1991-07-16 Alpha Beta Technology Glucan drug delivery system and adjuvant
US5356633A (en) 1989-10-20 1994-10-18 Liposome Technology, Inc. Method of treatment of inflamed tissues
US5013556A (en) 1989-10-20 1991-05-07 Liposome Technology, Inc. Liposomes with enhanced circulation time
US5225212A (en) 1989-10-20 1993-07-06 Liposome Technology, Inc. Microreservoir liposome composition and method
US5665710A (en) 1990-04-30 1997-09-09 Georgetown University Method of making liposomal oligodeoxynucleotide compositions
US5981276A (en) 1990-06-20 1999-11-09 Dana-Farber Cancer Institute Vectors containing HIV packaging sequences, packaging defective HIV vectors, and uses thereof
US5602240A (en) 1990-07-27 1997-02-11 Ciba Geigy Ag. Backbone modified oligonucleotide analogs
US5489677A (en) 1990-07-27 1996-02-06 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleoside linkages containing adjacent oxygen and nitrogen atoms
JP3220180B2 (ja) 1991-05-23 2001-10-22 三菱化学株式会社 薬剤含有タンパク質結合リポソーム
WO1994002595A1 (en) 1992-07-17 1994-02-03 Ribozyme Pharmaceuticals, Inc. Method and reagent for treatment of animal diseases
EP0673431A1 (en) 1992-12-03 1995-09-27 Genzyme Corporation Gene therapy for cystic fibrosis
JP3351476B2 (ja) 1993-01-22 2002-11-25 三菱化学株式会社 リン脂質誘導体及びそれを含有するリポソーム
WO1994018987A1 (en) 1993-02-19 1994-09-01 Nippon Shinyaku Co., Ltd. Drug composition containing nucleic acid copolymer
US5395619A (en) 1993-03-03 1995-03-07 Liposome Technology, Inc. Lipid-polymer conjugates and liposomes
US6191105B1 (en) 1993-05-10 2001-02-20 Protein Delivery, Inc. Hydrophilic and lipophilic balanced microemulsion formulations of free-form and/or conjugation-stabilized therapeutic agents such as insulin
US5540935A (en) 1993-12-06 1996-07-30 Nof Corporation Reactive vesicle and functional substance-fixed vesicle
US6054299A (en) 1994-04-29 2000-04-25 Conrad; Charles A. Stem-loop cloning vector and method
US5543152A (en) 1994-06-20 1996-08-06 Inex Pharmaceuticals Corporation Sphingosomes for enhanced drug delivery
US5820873A (en) 1994-09-30 1998-10-13 The University Of British Columbia Polyethylene glycol modified ceramide lipids and liposome uses thereof
US5665557A (en) 1994-11-14 1997-09-09 Systemix, Inc. Method of purifying a population of cells enriched for hematopoietic stem cells populations of cells obtained thereby and methods of use thereof
JP3269301B2 (ja) 1994-12-28 2002-03-25 豊田合成株式会社 ガラスラン用ゴム配合物
US7422902B1 (en) 1995-06-07 2008-09-09 The University Of British Columbia Lipid-nucleic acid particles prepared via a hydrophobic lipid-nucleic acid complex intermediate and use for gene transfer
IL122290A0 (en) 1995-06-07 1998-04-05 Inex Pharmaceuticals Corp Lipid-nucleic acid complex its preparation and use
US5981501A (en) 1995-06-07 1999-11-09 Inex Pharmaceuticals Corp. Methods for encapsulating plasmids in lipid bilayers
US5756122A (en) 1995-06-07 1998-05-26 Georgetown University Liposomally encapsulated nucleic acids having high entrapment efficiencies, method of manufacturer and use thereof for transfection of targeted cells
DE69629702T2 (de) 1995-08-01 2004-06-17 Isis Pharmaceuticals, Inc., Carlsbad Liposomale oligonukleotidzusammensetzungen
US5858397A (en) 1995-10-11 1999-01-12 University Of British Columbia Liposomal formulations of mitoxantrone
WO1997014809A2 (en) 1995-10-16 1997-04-24 Dana-Farber Cancer Institute Novel expression vectors and methods of use
US5858401A (en) 1996-01-22 1999-01-12 Sidmak Laboratories, Inc. Pharmaceutical composition for cyclosporines
US5994316A (en) 1996-02-21 1999-11-30 The Immune Response Corporation Method of preparing polynucleotide-carrier complexes for delivery to cells
DE69841002D1 (de) 1997-05-14 2009-09-03 Univ British Columbia Hochwirksame verkapselung von nukleinsäuren in lipidvesikeln
US6887906B1 (en) 1997-07-01 2005-05-03 Isispharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for the delivery of oligonucleotides via the alimentary canal
CA2335393C (en) 1998-07-20 2008-09-23 Inex Pharmaceuticals Corporation Liposomal encapsulated nucleic acid-complexes
AU6430599A (en) 1998-10-09 2000-05-01 Cytogenix, Inc. Enzymatic synthesis of ssdna
CA2345936A1 (en) 1998-10-09 2000-04-20 Ingene, Inc. Production of ssdna in a cell
WO2000050050A1 (en) 1999-02-23 2000-08-31 Isis Pharmaceuticals, Inc. Multiparticulate formulation
IT1318539B1 (it) 2000-05-26 2003-08-27 Italfarmaco Spa Composizioni farmaceutiche a rilascio prolungato per lasomministrazione parenterale di sostanze idrofile biologicamente
GB0107559D0 (en) 2001-03-27 2001-05-16 Rolls Royce Plc Apparatus and method for forming a body
US7063860B2 (en) 2001-08-13 2006-06-20 University Of Pittsburgh Application of lipid vehicles and use for drug delivery
US8101348B2 (en) 2002-07-10 2012-01-24 Max-Planck-Gesellschaft Zur Foerderung Der Wissenschaften E.V. RNA-interference by single-stranded RNA molecules
EP2567693B1 (en) 2003-07-16 2015-10-21 Protiva Biotherapeutics Inc. Lipid encapsulated interfering RNA
EP2365077B1 (en) 2004-03-12 2013-05-08 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. iRNA agents targeting VEGF
US7740861B2 (en) 2004-06-16 2010-06-22 University Of Massachusetts Drug delivery product and methods
US8101741B2 (en) 2005-11-02 2012-01-24 Protiva Biotherapeutics, Inc. Modified siRNA molecules and uses thereof
SG170780A1 (en) 2006-03-31 2011-05-30 Alnylam Pharmaceuticals Inc Compositions and methods for inhibiting expression of eg5 gene
ES2874149T3 (es) 2006-05-11 2021-11-04 Alnylam Pharmaceuticals Inc Composiciones y métodos para inhibir la expresión del gen PCSK9
AU2007299629C1 (en) 2006-09-21 2012-05-10 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for inhibiting expression of the HAMP gene
MX2009003548A (es) 2006-10-03 2009-04-15 Alnylam Pharmaceuticals Inc Formulaciones que contienen lipidos.
WO2009082607A2 (en) 2007-12-04 2009-07-02 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Targeting lipids
US9006191B2 (en) 2007-12-27 2015-04-14 Protiva Biotherapeutics, Inc. Silencing of polo-like kinase expression using interfering RNA
EP2245039A4 (en) 2008-01-31 2012-06-06 Alnylam Pharmaceuticals Inc OPTIMIZED METHODS FOR EXPORING DSRNA TO TARGET THE PCSK9 GEN
WO2009137128A2 (en) 2008-02-12 2009-11-12 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for inhibiting expression of cd45 gene
EA201301171A1 (ru) 2008-03-05 2014-10-30 Элнилэм Фармасьютикалз, Инк. Композиции и способы ингибирования экспрессии генов eg5 и vegf
CA2750561C (en) * 2009-01-26 2017-10-10 Protiva Biotherapeutics, Inc. Compositions and methods for silencing apolipoprotein c-iii expression
CN104922699B (zh) 2009-03-12 2020-07-24 阿尔尼拉姆医药品有限公司 脂质配制的组合物以及用于抑制Eg5和VEGF基因表达的方法
SI3431076T1 (sl) 2009-06-10 2022-04-29 Arbutus Biopharma Corporation Izboljšana lipidna formulacija
CN104651408A (zh) 2009-06-15 2015-05-27 阿尔尼拉姆医药品有限公司 靶向pcsk9基因的脂质配制的dsrna
US9512164B2 (en) 2009-07-07 2016-12-06 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotide end caps
WO2011028938A1 (en) 2009-09-02 2011-03-10 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Methods for lowering serum cholestrol in a subject using inhibition of pcsk9
CN107519133A (zh) 2009-09-15 2017-12-29 阿尔尼拉姆医药品有限公司 脂质配制的组合物及抑制Eg5和VEGF基因的表达的方法
WO2011056883A1 (en) 2009-11-03 2011-05-12 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Lipid formulated compositions and methods for inhibiting expression of transthyretin (ttr)
US8739864B2 (en) 2010-06-29 2014-06-03 Baker Hughes Incorporated Downhole multiple cycle tool
JP2013545736A (ja) * 2010-10-29 2013-12-26 アルナイラム ファーマシューティカルズ， インコーポレイテッド Ｐｃｓｋ９遺伝子の阻害のための組成物および方法
RU2702501C2 (ru) 2011-03-29 2019-10-08 Элнилэм Фармасьютикалз, Инк. Композиции и способы ингибирования экспрессии гена tmprss6
WO2012177921A2 (en) 2011-06-21 2012-12-27 Alnylam Pharmaceuticals, Inc Compositions and methods for inhibiting hepcidin antimicrobial peptide (hamp) or hamp-related gene expression
AR096203A1 (es) 2013-05-06 2015-12-16 Alnylam Pharmaceuticals Inc Dosificaciones y métodos para administrar moléculas de ácido nucleico formuladas en lípidos
PT3185957T (pt) 2014-08-29 2022-09-05 Alnylam Pharmaceuticals Inc Patisiran para utilização no tratamento de amoloidose mediada por transtirretina

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN111363822A (zh) * 2019-11-20 2020-07-03 深圳市鲲鹏未来科技有限公司 包含血液稳定性纳米颗粒的溶液、其制备方法及miRNA标志物的检测方法
CN111363822B (zh) * 2019-11-20 2024-03-19 深圳市鲲鹏未来科技有限公司 包含血液稳定性纳米颗粒的溶液、其制备方法及miRNA标志物的检测方法

Also Published As

Publication number Publication date
EP2994167A4 (en) 2016-10-12
US10246708B2 (en) 2019-04-02
WO2014182661A2 (en) 2014-11-13
WO2014182661A3 (en) 2015-01-08
US20160122759A1 (en) 2016-05-05
US11827883B2 (en) 2023-11-28
AR096203A1 (es) 2015-12-16
EP2994167A2 (en) 2016-03-16
EP2994167B1 (en) 2020-05-06
US20190284557A1 (en) 2019-09-19
US20210388355A1 (en) 2021-12-16
AR118087A2 (es) 2021-09-15

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP7377246B2 (ja) Ａｌａｓ１遺伝子の発現を阻害する組成物および方法
JP7062623B2 (ja) ケトヘキソキナーゼ（ＫＨＫ）ｉＲＮＡ組成物及びその使用方法
JP7101748B2 (ja) アンジオテンシノーゲン（ＡＧＴ）ｉＲＮＡ組成物およびその使用
TW201515650A (zh) 遞送經脂質調配之核酸分子之劑量及方法
TWI807302B (zh) 甲狀腺素運載蛋白（ＴＴＲ）ｉＲＮＡ組成物及其治療或預防ＴＴＲ相關疾病之使用方法
JP2020141685A (ja) アポリポタンパク質Ｃ３（ＡＰＯＣ３）ｉＲＮＡ組成物およびその使用方法
KR102558604B1 (ko) Hao1 (하이드록시산 옥시다제 1 (글리콜레이트 옥시다제)) 유전자 발현의 억제를 위한 조성물 및 방법
JP2021073290A (ja) パタチン様ホスホリパーゼドメイン含有３（ＰＮＰＬＡ３）ｉＲＮＡ組成物およびその使用方法
TWI790217B (zh) 使用甲狀腺素運載蛋白（ＴＴＲ）ｉＲＮＡ組成物於治療或預防ＴＴＲ相關疾病之方法
JP2020188756A (ja) 第ＸＩＩ因子（ハーゲマン因子）（Ｆ１２）、カリクレインＢ、血漿（フレッチャー因子）１（ＫＬＫＢ１）、及びキニノーゲン１（ＫＮＧ１）ｉＲＮＡ組成物及びその使用方法
KR20140044870A (ko) 안지오포이에틴-유사 3(ANGPTL3) iRNA 조성물 및 그 사용 방법
TWI669393B (zh) 抑制ｌｅｃｔ２基因表現之組合物及方法
TWI694080B (zh) 抑制ａｌａｓ１基因表現的組合物及方法
TW201718857A (zh) 用於抑制alas1基因表現之組合物及方法
KR20240026216A (ko) Myoc 발현을 침묵시키기 위한 조성물 및 방법
EA044209B1 (ru) КОМПОЗИЦИИ НА ОСНОВЕ iRNA ДЛЯ КЕТОГЕКСОКИНАЗЫ (KHK) И СПОСОБЫ ИХ ПРИМЕНЕНИЯ
EA042137B1 (ru) КОМПОЗИЦИИ НА ОСНОВЕ iRNA TMPRSS6 И СПОСОБЫ ИХ ПРИМЕНЕНИЯ