TW201440770A - 組合療法 - Google Patents

組合療法 Download PDF

Info

Publication number
TW201440770A
TW201440770A TW103110598A TW103110598A TW201440770A TW 201440770 A TW201440770 A TW 201440770A TW 103110598 A TW103110598 A TW 103110598A TW 103110598 A TW103110598 A TW 103110598A TW 201440770 A TW201440770 A TW 201440770A
Authority
TW
Taiwan
Prior art keywords
inhibitor
raf
compound
patient
formula
Prior art date
Application number
TW103110598A
Other languages
English (en)
Other versions
TWI603734B (zh
Inventor
Giordano Caponigro
Darrin Stuart
Parseval Laure De
Original Assignee
Novartis Ag
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Family has litigation
First worldwide family litigation filed litigation Critical https://patents.darts-ip.com/?family=50439443&utm_source=google_patent&utm_medium=platform_link&utm_campaign=public_patent_search&patent=TW201440770(A) "Global patent litigation dataset” by Darts-ip is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Application filed by Novartis Ag filed Critical Novartis Ag
Publication of TW201440770A publication Critical patent/TW201440770A/zh
Application granted granted Critical
Publication of TWI603734B publication Critical patent/TWI603734B/zh

Links

Classifications

    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33—Heterocyclic compounds
    • A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/495—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with two or more nitrogen atoms as the only ring heteroatoms, e.g. piperazine or tetrazines
    • A61K31/505—Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim
    • A61K31/506—Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim not condensed and containing further heterocyclic rings
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33—Heterocyclic compounds
    • A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/41—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having five-membered rings with two or more ring hetero atoms, at least one of which being nitrogen, e.g. tetrazole
    • A61K31/4164—1,3-Diazoles
    • A61K31/4184—1,3-Diazoles condensed with carbocyclic rings, e.g. benzimidazoles
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33—Heterocyclic compounds
    • A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/435—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with one nitrogen as the only ring hetero atom
    • A61K31/44—Non condensed pyridines; Hydrogenated derivatives thereof
    • A61K31/4427—Non condensed pyridines; Hydrogenated derivatives thereof containing further heterocyclic ring systems
    • A61K31/4439—Non condensed pyridines; Hydrogenated derivatives thereof containing further heterocyclic ring systems containing a five-membered ring with nitrogen as a ring hetero atom, e.g. omeprazole
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33—Heterocyclic compounds
    • A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/435—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with one nitrogen as the only ring hetero atom
    • A61K31/47—Quinolines; Isoquinolines
    • A61K31/4738—Quinolines; Isoquinolines ortho- or peri-condensed with heterocyclic ring systems
    • A61K31/4745—Quinolines; Isoquinolines ortho- or peri-condensed with heterocyclic ring systems condensed with ring systems having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. phenantrolines
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33—Heterocyclic compounds
    • A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/495—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with two or more nitrogen atoms as the only ring heteroatoms, e.g. piperazine or tetrazines
    • A61K31/496—Non-condensed piperazines containing further heterocyclic rings, e.g. rifampin, thiothixene or sparfloxacin
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33—Heterocyclic compounds
    • A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/495—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with two or more nitrogen atoms as the only ring heteroatoms, e.g. piperazine or tetrazines
    • A61K31/505—Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim
    • A61K31/519—Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim ortho- or peri-condensed with heterocyclic rings
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33—Heterocyclic compounds
    • A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/53—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with three nitrogens as the only ring hetero atoms, e.g. chlorazanil, melamine
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33—Heterocyclic compounds
    • A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/535—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with at least one nitrogen and one oxygen as the ring hetero atoms, e.g. 1,2-oxazines
    • A61K31/5375—1,4-Oxazines, e.g. morpholine
    • A61K31/5377—1,4-Oxazines, e.g. morpholine not condensed and containing further heterocyclic rings, e.g. timolol
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K45/00—Medicinal preparations containing active ingredients not provided for in groups A61K31/00 - A61K41/00
    • A61K45/06—Mixtures of active ingredients without chemical characterisation, e.g. antiphlogistics and cardiaca
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K9/00—Medicinal preparations characterised by special physical form
    • A61K9/0012—Galenical forms characterised by the site of application
    • A61K9/0053—Mouth and digestive tract, i.e. intraoral and peroral administration
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K9/00—Medicinal preparations characterised by special physical form
    • A61K9/20—Pills, tablets, discs, rods
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K9/00—Medicinal preparations characterised by special physical form
    • A61K9/48—Preparations in capsules, e.g. of gelatin, of chocolate
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P17/00—Drugs for dermatological disorders
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00—Antineoplastic agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00—Antineoplastic agents
    • A61P35/02—Antineoplastic agents specific for leukemia
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00—Antineoplastic agents
    • A61P35/04—Antineoplastic agents specific for metastasis
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/5005—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells
    • G01N33/5008—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells for testing or evaluating the effect of chemical or biological compounds, e.g. drugs, cosmetics
    • G01N33/5011—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells for testing or evaluating the effect of chemical or biological compounds, e.g. drugs, cosmetics for testing antineoplastic activity
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/106—Pharmacogenomics, i.e. genetic variability in individual responses to drugs and drug metabolism
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/136—Screening for pharmacological compounds
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Hospice & Palliative Care (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Physiology (AREA)
  • Nutrition Science (AREA)
  • Dermatology (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)

Abstract

本發明提供一種藉由如下方法逆轉對用於治療增生性疾病之B-Raf抑制劑的抗性的方法：自患者獲得腫瘤樣品且測試其包含BRAF、CRAF、CCND1、CDK4、HER2、IGF-1R、cMET、FGFR1、FGFR2、FGFR3 EGFR、MAP2K1、MAP2K2、NRAS、KRAS HRAS、PTEN、PIK3CA及P16之一組基因的遺傳變化，及投與包含B-Raf抑制劑及第二抑制劑之藥物組合療法而克服對B-Raf抑制劑之抗性，該第二抑制劑基於腫瘤樣品中所發現之遺傳變化選擇。

Description

組合療法
本發明係關於B-Raf抑制劑與第二抑制劑之組合用於治療罹患特徵為B-Raf突變之增生性疾病之患者的用途，其中該第二抑制劑基於腫瘤樣品中所鑑別之遺傳變化選擇。
在瞭解分子變化與黑色素瘤產生有關方面已取得重要進步。B-RAF(RAF/MEK/ERK路徑中之絲胺酸-蘇胺酸蛋白激酶)之致癌突變在黑色素瘤中尤其常見，其中40至60%黑色素瘤攜帶B-Raf基因之活化突變。胺基酸600處麩胺酸取代纈胺酸(V600E突變)代表超過95%之報導B-Raf突變。此突變組成性活化RAF/MEK/ERK路徑中之B-Raf及下游信號轉導，該等信號用於癌細胞增殖及存活。除黑色素瘤以外，已知在其他增生性疾病中亦發生該等B-Raf突變，例如結腸直腸癌、甲狀腺癌、尤其乳突狀甲狀腺癌、星形細胞瘤、胰臟癌及神經纖維瘤。儘管已知在用B-Raf抑制劑治療該等疾病時可產生顯著結果，但通常用B-Raf抑制劑治療會產生抗性，其通常在極短時段內發生。
對用B-Raf抑制劑治療產生抗性有多種路徑。主要機制使得RAF/MEK/ERK信號傳導路徑在B-Raf抑制劑存在下再活化。此再活化可經由如下方式發生：經由基因擴增及過度表現及/或配體產生提高受體酪胺酸激酶(RTK)之活性、獲取NRAS及MEK1基因之突變、經由過度表現諸如COT及RAF-1(CRAF)之激酶繞過BRAF、表現突變BRAF 對偶基因之拼接及由於例如基因擴增而提高突變BRAF對偶基因之表現。另外，經由活化RTK(例如PDGFR-β及IGF-1R)或缺失PTEN基因活化不同於MAPK路徑之存活路徑(諸如PIK3Cα信號傳導系統)亦可能在產生抗性中起作用。其他機制(經由c-MET及RTK之FGFR家族)為多種黑色素瘤中可能提高對B-Raf抑制劑之抗性的可能機制。
上述發現突顯即時鑑別抗性之重要性，以在B-Raf抑制劑治療時在復發後不久即開始合理組合療法。使用基於機制之方法且比較復發時與治療前患者腫瘤中所存在之遺傳變化，應可鑑別可能的抗性機制。此將有助於為個別患者選擇適當藥物組合療法以充分避開抗性。本發明係關於基於機制之組合治療方法以在對B-Raf抑制劑產生抗性後擴展及改良具有極不良預後之患有BRAF突變晚期或轉移黑色素瘤之患者的治療選擇。
本發明係關於用B-Raf抑制劑治療罹患特徵為B-Raf突變之增生性疾病的患者，其中藉由如下方法降低對B-Raf抑制劑之抗性：(a)測定取自患者之腫瘤樣品中的遺傳變化，(b)投與該患者由B-Raf抑制劑及第二抑制劑組成之藥物組合療法，其中該第二抑制劑基於腫瘤樣品中所存在之遺傳變化選擇。
圖1-展示如實例4所述單一藥劑及組合形式之式(I)化合物及化合物F對活體內HT-29細胞株模型之生長的作用。
圖2-展示如實例4所述單一藥劑及組合形式之式(I)化合物及化合物F對活體內RKO細胞株模型之生長的作用。
圖3-展示組合RAF抑制劑(式I化合物)與FGFR抑制劑化合物H對具有編碼BRAFV600E之BRAF對偶基因的兩種黑色素瘤衍生細胞株增殖的作用。展示如實例5中所述如使用基於阻抗之xCELLigence細胞分析 儀所量測(上部A)COLO 741及(下部B)SK-MEL-5細胞株的即時生長。如所示，FGF2及化合物H分別以100ng/ml及1μM之濃度補充至培養基中。在(A)中所用式(I)化合物為500nM且在(B)中為100nM。
圖4-組合式(I)化合物與FGFR抑制劑化合物H及EGFR配體FGF2對活體外兩種BRAFV600E突變黑色素瘤衍生細胞株之信號傳導的作用。展示用式(I)化合物(100nM)、FGF2(100ng/ml)及化合物H(1μM)處理後自(A)COLO 74及(B)SK-MEL-5細胞分離之磷酸化與總AKT、ERK1/2及MEK1/2蛋白的西方分析。如實例5中所述，用單獨及組合形式之藥劑處理細胞2及24小時。
本發明係關於一種治療罹患特徵為B-Raf突變、尤其B-Raf之V600突變之增生性疾病之患者的方法，其包含：
(a)自患者獲得腫瘤樣品且測試包含BRAF、CRAF、CCND1、CDK4、HER2、IGF-1R、cMET、FGFR1、FGFR2、FGFR3 EGFR、MAP2K1、MAP2K2、NRAS、KRAS HRAS、PTEN、PIK3CA及P16之一組基因的遺傳變化。
(b)投與包含B-Raf抑制劑及第二抑制劑之藥物組合療法，該第二抑制劑基於腫瘤樣品中所發現之遺傳變化選擇。
在一個實施例中，增生性疾病為癌症。術語「癌症」在本文中用於意謂多種腫瘤，包括所有實體腫瘤及血液科惡性疾病。所述腫瘤之實例包括(但不限於)以下之良性或惡性腫瘤：腦、肺(尤其小細胞肺癌及非小細胞肺癌)、鱗狀細胞、膀胱、胃、胰臟、乳房、頭及頸、腎(renal/kidney)、輸尿管、卵巢、前列腺、結腸直腸、食道、睾丸、婦科(例如子宮肉瘤、輸卵管、子宮內膜、子宮頸、陰道或外陰癌瘤)、甲狀腺、胰臟、骨、皮膚、黑色素瘤、子宮、卵巢、直腸、肛門、結腸、睾丸、霍奇金氏病(Hodgkin's disease)、食道、小腸、內分 泌系統(例如甲狀腺、副甲狀腺或腎上腺)、軟組織、尿道、陰莖之肉瘤、白血病、淋巴瘤、中樞神經系統之贅瘤、肉瘤、骨髓瘤、膽、肝、神經纖維瘤、急性骨髓性白血病(AML)、骨髓發育不良症候群(MDS)及卡堡氏肉瘤(Kaposi's sarcoma)。
在本發明之另一實施例中，增生性疾病為黑色素瘤、肺癌(包括非小細胞肺癌(NSCLC))、結腸直腸癌(CRC)、乳癌、腎癌(諸如腎細胞癌(RCC))、肝癌、子宮內膜癌、急性骨髓性白血病(AML)、骨髓發育不良症候群(MDS)、甲狀腺癌、尤其乳突狀甲狀腺癌、胰臟癌、神經纖維瘤或肝細胞癌。
在本發明之另一實施例中，增生性疾病為實體腫瘤。術語「實體腫瘤」尤其意謂黑色素瘤、乳癌、卵巢癌、結腸直腸癌，且一般為胃腸道、子宮頸癌、肺癌(包括小細胞肺癌及非小細胞肺癌)、頭及頸癌、膀胱癌、前列腺癌或卡堡氏肉瘤。
更特定言之，本發明係關於一種治療罹患特徵為B-Raf之V600突變(例如V600E突變)之增生性疾病之患者的方法。增生性疾病通常特徵為包括黑色素瘤、結腸直腸癌、甲狀腺癌、尤其乳突狀甲狀腺癌、星形細胞瘤、胰臟癌及神經纖維瘤之突變。本發明尤其係關於如下方法，其中增生性疾病為特徵為B-Raf之V600突變(例如V600E、V600K或V600G突變)的黑色素瘤。
B-Raf抑制劑及其用於治療增生性疾病之用途為此項技術中已知。威羅菲尼(Vemurafenib)(PLX4032)為一種BRAF抑制劑，其經FDA批准用於治療患有黑色素瘤之患者，其腫瘤表現BRAF V600E。索拉非尼(Sorafenib)及達拉非尼(dabrafenib)及CEP-32496為其他已知B-Raf抑制劑。美國專利7,482,367中所揭示之苯并咪唑基吡啶基醚為適用於本發明之組合的B-Raf抑制劑，尤其RAF265，該案以全文引用的方式併入本文中。WO 2011/025927中所揭示之吡唑嘧啶為適用於本發明 之組合的另一類B-Raf抑制劑，該案以全文引用的方式併入本文中。
欲與B-Raf抑制劑組合治療患者之適當第二抑制劑根據表1基於腫瘤樣品中所存在之遺傳變化選擇。遺傳變化可由基因擴增、基因突變或基因活性缺失產生。
關於表1中所鑑別基因之資訊、其序列及相關蛋白質為熟習此項技術者已知且見於公眾可得之資料庫，例如以下所提供之資料庫：National Center for Biotechnology Information，U.S.National Library of Medicine8600 Rockville Pike,Bethesda MD,20894USA，諸如GENE(URL：http：//www.ncbi.nlm.nih.gov/gene)，或Office of Biological and Environmental Research of the U.S.Department of Energy Office of Science，Human Genome Project Information(URL：http：//genomics.energy.gov/)。
藥物組合療法包括以一定量投與組合療法中之各藥物以足以相較於用該組合治療之病症的臨床可觀察之基線病徵及症狀提供可觀察之改良。該等藥物可以其優選之時間間隔分別給與(以時間交錯方式，尤其特定次序方式)以使得在患者中展示(較佳協同)相互作用(聯合治療作用)，尤其其中患者之對用B-Raf抑制劑治療之抗性可克服或 減少。
術語治療劑之組合的「醫藥學有效量」或「臨床有效量」或「治療有效量」為相較於用該組合治療之病症的基線臨床可觀察病徵及症狀足以提供可觀察之改良的量。
除非另外明確說明，否則，本文所用之通用術語經定義具有如下含義：
除非另外說明，否則術語「包含」及「包括」在本文中以其開放及非限制意義使用。
除非本文中另外表明或上下文明顯矛盾，否則在描述發明之上下文中(尤其在如下申請專利範圍之上下文中)術語「一(a)」及「一(an)」及「該(the)」及類似提及內容應視為包括單數與複數。若將複數形式用於化合物、鹽及其類似物，則其亦用於意謂單一化合物、鹽或其類似物。
如本文所用之術語「組合」、「治療組合」、「組合療法」或「醫藥組合」定義一種單位劑型中之固定組合或用於組合投藥之分裝部分或說明書之套組，其中B-Raf抑制劑及第二抑制劑可同時獨立投與或在使組合搭配物展示協作(例如協同)作用之時間間隔內分別投與。
如本文所定義之術語「醫藥組合物」指含有至少一種欲投與個體(例如哺乳動物或人)以預防或治療影響該哺乳動物之特定疾病或病狀的治療劑的混合物或溶液。
術語「醫藥學上可接受」在本文中定義為指如下化合物、材料、組合物及/或劑型，其在正確醫學判斷之範疇內適合於與個體(例如哺乳動物或人)之組織接觸而無過度毒性、刺激過敏反應及其他問題併發症且與合理效益/風險比相稱。
除非另外表明，否則如本文所用之「醫藥學上可接受之鹽」包括可存在於本發明化合物中之酸性及鹼性基團之鹽。性質上為鹼性的 本發明化合物能夠與各種無機及有機酸形成多種鹽。可用於製備本發明之該等鹼性化合物的醫藥學上可接受之酸加成鹽的酸為形成如下無毒酸加成鹽的酸，亦即含有醫藥學上可接受之陰離子的鹽，諸如乙酸鹽、苯甲酸鹽、溴化物、氯化物、檸檬酸鹽、反丁烯二酸鹽、氫溴化物、氫氯化物、碘化物、乳酸鹽、順丁烯二酸鹽、杏仁酸鹽、硝酸鹽、草酸鹽、水楊酸鹽、丁二酸鹽及酒石酸鹽。除非另外規定，否則本發明方法中所用之治療劑以游離形式或以醫藥學鹽形式投與。
術語「組合製劑」在本文中在如下意義上定義為尤其指「分裝部分之套組」：如上所定義之組合搭配物(a)及(b)可獨立地或藉由使用不同固定組合以組合搭配物(a)及(b)之區別量給與，亦即同時或在不同時間點給與。分裝部分之套組的分裝部分可隨後例如同時或按時間交錯投與，亦即對於分裝部分之套組的任何分裝部分在不同時間點且以相等或不同時間間隔投與。欲在組合製劑中投與之組合搭配物(a)與組合搭配物(b)之總量的比率可變化，例如以滿足欲進行治療之患者子群的需要或單個患者之需要。
如本文所用之術語「共投藥」、「組合療法」或「組合投藥」定義為涵蓋投與單個患者所選治療劑且意欲包括如下治療方案，其中該等試劑未必藉由相同投藥途徑或同時投與。
如本文所用之術語「治療(treating)」或「治療(treatment)」包含治療性緩解、減少或緩和個體之至少一種症狀或實現疾病進展延遲。舉例而言，治療可為去除病症之一種或數種症狀或完全根除病症，諸如癌症。在本發明之含義中，術語「治療」亦表示延滯、延遲疾病發作(亦即臨床表現疾病前之階段)及/或降低產生疾病或疾病惡化之風險。術語「保護」在本文中用於意謂預防、延遲或治療或視需要預防、延遲且治療個體之疾病的產生或持續或惡化。
如本文所用之術語「個體」或「患者」尤其指人類，例如罹患 增生性疾病、具有罹患增生性疾病之風險或可能罹患增生性疾病的人類。然而，其不欲排除治療哺乳動物，例如狗、牛、馬、豬、羊、山羊、貓、小鼠、兔、大鼠及轉殖基因非人類動物。
術語「約(about)」或「大約(approximately)」應具有在給定值或範圍之10%內、更佳在5%內之含義。
由此，本發明係關於一種治療罹患特徵為B-Raf突變、尤其B-Raf之V600突變之增生性疾病、極尤其特徵為B-Raf之V600突變的黑色素瘤的患者的方法，其包含：
(a)自患者獲得腫瘤樣品且測試選自包含BRAF、CRAF、CCND1、CDK4、HER2、IGF-1R、cMET、FGFR1、FGFR2、FGFR3 EGFR、MAP2K1、MAP2K2、NRAS、KRAS HRAS、PTEN、PIK3CA及P16之群的基因的遺傳變化。
(b)投與包含B-Raf抑制劑及第二抑制劑之藥物組合療法，該第二抑制劑根據表1基於腫瘤樣品中所發現之遺傳變化選擇，尤其其中，(i)當腫瘤樣品之BRAF、CRAF、MAP2K1、MAPK2、NRAS、KRAS HRAS或EGFR具有遺傳變化時第二抑制劑為Mek 1/2抑制劑，或(ii)當腫瘤樣品之CCND1、CDK4或P16具有遺傳變化時第二抑制劑為CDK 4抑制劑，或(iii)當腫瘤樣品之HER2、IGF-1R、PTEN或PIK3CA具有遺傳變化時第二抑制劑為PI3激酶抑制劑，或(iv)當腫瘤樣品之cMET具有遺傳變化時第二抑制劑為c-Met受體酪胺酸激酶抑制劑，(v)當腫瘤樣品之FGFR1、FGFR2或FGFR3具有遺傳變化時第二抑制劑為FGFR激酶抑制劑。
由此，本發明另外係關於一種治療罹患特徵為B-Raf突變、尤其 B-Raf之V600突變之增生性疾病、極尤其特徵為B-Raf之V600突變的黑色素瘤的患者的方法，其包含：
(a)自患者獲得腫瘤樣品且偵測選自包含BRAF、CRAF、MAP2K1、MAPK2、NRAS、KRAS HRAS或EGFR之群的基因的遺傳變化。
(b)投與患者包含B-Raf抑制劑及第二抑制劑之藥物組合療法，該第二抑制劑為Mek 1/2抑制劑。
由此，本發明亦關於一種治療罹患特徵為B-Raf突變、尤其B-Raf之V600突變之增生性疾病、極尤其特徵為B-Raf之V600突變的黑色素瘤的患者的方法，其包含：
(b)自患者獲得腫瘤樣品且偵測選自包含CCND1、CDK4或P16之群的基因的遺傳變化。
(d)投與患者包含B-Raf抑制劑及第二抑制劑之藥物組合療法，該第二抑制劑為CDK 4抑制劑。
由此，本發明係關於一種治療罹患特徵為B-Raf突變、尤其B-Raf之V600突變之增生性疾病、極尤其特徵為B-Raf之V600突變的黑色素瘤的患者的方法，其包含：(a)在疾病進展後自患者獲得腫瘤樣品且偵測選自包含HER2、IGF-1R、PTEN或PIK3CA之群的基因的遺傳變化，(b)投與患者包含B-Raf抑制劑及第二抑制劑之藥物組合療法，該第二抑制劑為PI3激酶抑制劑。
由此，本發明係關於一種治療罹患特徵為B-Raf突變、尤其B-Raf之V600突變之增生性疾病、極尤其特徵為B-Raf之V600突變的黑色素瘤的患者的方法，其包含：(a)獲得腫瘤樣品且偵測選自包含cMET之群的基因的遺傳變化，(b)投與患者包含B-Raf抑制劑及第二抑制劑之藥物組合療法，該 第二抑制劑為c-Met受體酪胺酸激酶抑制劑。
由此，本發明亦關於一種治療罹患特徵為B-Raf突變、尤其B-Raf之V600突變之增生性疾病、極尤其特徵為B-Raf之V600突變的黑色素瘤的患者的方法，其包含：
(a)自患者獲得腫瘤樣品且偵測選自包含FGFR1、FGFR2或FGFR3之群的基因的遺傳變化
(b)投與患者包含B-Raf抑制劑及第二抑制劑之藥物組合療法，該第二抑制劑為FGFR激酶抑制劑。
在本發明之一重要實施例中，患者先前已用B-Raf抑制劑單一療法治療。特定言之，用B-Raf抑制劑單一療法治療患者直至疾病進展，繼而用根據表1確定之藥物組合療法。
在一較佳實施例中，連續投與B-Raf抑制劑作為單一療法直至疾病進展或開始藥物組合療法，且在用藥物組合療法治療期間繼續連續投與。
在另一實施例中，以間歇給藥方案投與B-Raf抑制劑，其意謂投與B-Raf抑制劑一段時間，繼而停止用B-Raf抑制劑治療一段時間。舉例而言，每天投與Raf抑制劑3或4週，繼而1或2週不治療且重複該週期。
藉由適當臨床標準(諸如RECIST標準)評估疾病進展。RECIST(實體腫瘤之反應評估標準)為在治療期間癌症患者改良(「反應」)、保持相同(「穩定」)或惡化(「進展」)時定義之一組已刊登規則。初始標準由國際協作發佈於2000年2月，包括European Organization for Research and Treatment of Cancer(EORTC)、National Cancer Institute(NCI)of the United States及the National Cancer Institute of Canada Clinical Trials Group。發佈於2009年1月之RECIST 1.1為初始標準之更新。參見Eur.J.Cancer,45,(2009)228-247。
藉由比較復發時例如與治療前患者腫瘤中所存在之遺傳變化確定疾病進展之機制。遺傳變化可由基因擴增、基因突變或基因活性缺失產生。遺傳變化藉由此項技術中已知之方法、通常藉由已知測序方法確定。在一較佳實施例中，比較復發時與治療前所採集之腫瘤樣品中選自由B-Raf、C-Raf、CCND1、CDK4、HER2、IGF-1R、cMET、FGFR1、FGFR2、FGFR3 EGFR、MAP2K1、MAP2K2、NRAS、KRAS HRAS、PTEN、PIK3CA及P16組成之群的基因。
由此，本發明係關於測試自罹患特徵為B-Raf突變、尤其B-Raf之V600突變之增生性疾病、極尤其特徵為B-Raf之V600突變的黑色素瘤的患者獲得的腫瘤樣品的包含B-Raf、C-Raf、CCND1、CDK4、HER2、IGF-1R、cMET、FGFR1、FGFR2、FGFR3 EGFR、MAP2K1、MAP2K2、NRAS、KRAS HRAS、PTEN、PIK3CA及P16之一組基因的遺傳變化以確定用B-Raf抑制劑治療後疾病進展之機制。
本發明亦關於一種用於選擇欲與B-Raf抑制劑組合之第二抑制劑的診斷方法，其中測試腫瘤樣品之選自B-Raf、C-Raf、CCND1、CDK4、HER2、IGF-1R、cMET、FGFR1、FGFR2、FGFR3 EGFR、MAP2K1、MAP2K2、NRAS、KRAS HRAS、PTEN、PIK3CA及P16之一或多種基因的遺傳變化。第二抑制劑根據表1選擇。第二抑制劑較佳經選擇以克服對用B-Raf抑制劑治療之抗性。
本發明亦關於適用於偵測一或多種選自B-Raf、C-Raf、CCND1、CDK4、HER2、IGF-1R、cMET、FGFR1、FGFR2、FGFR3 EGFR、MAP2K1、MAP2K2、NRAS、KRAS HRAS、PTEN、PIK3CA及P16或包含上述基因之全部或子集的基因的遺傳變化的基因晶片。該基因晶片適用於確定對用B-Raf抑制劑治療之抗性的機制且適用於選擇欲用於克服該抗性之藥物組合療法的第二抑制劑。
本發明之一特定實施例為一種治療罹患特徵為B-Raf突變、尤其 B-Raf之V600突變之增生性疾病、極尤其特徵為B-Raf之V600突變的黑色素瘤的患者的方法，其包含：(a)投與患者治療有效量之B-Raf抑制劑直至患者展現疾病進展，(b)在疾病進展後自患者獲得腫瘤樣品且測試一或多種選自由BRAF、CRAF、CCND1、CDK4、HER2、IGF-1R、cMET、FGFR1、FGFR2、FGFR3 EGFR、MAP2K1、MAP2K2、NRAS、KRAS HRAS、PTEN、PIK3CA及P16組成之群的基因的遺傳變化，及(c)投與包含B-Raf抑制劑及第二抑制劑之藥物組合療法，該第二抑制劑基於腫瘤樣品中所存在之遺傳變化選擇，其中，(i)當BRAF、CRAF、MAP2K1、MAPK2、NRAS、KRAS HRAS或EGFR具有遺傳變化時第二抑制劑為Mek 1/2抑制劑，或(ii)當CCND1、CDK4或P16具有遺傳變化時第二抑制劑為CDK 4抑制劑，或(iii)當HER2、IGF-1R、PTEN或PIK3CA具有遺傳變化時第二抑制劑為PI3激酶抑制劑，或(iv)當cMET具有遺傳變化時第二抑制劑為c-Met受體酪胺酸激酶抑制劑，或(v)當FGFR1、FGFR2或FGFR3具有遺傳變化時第二抑制劑為FGFR激酶抑制劑。
適用於本發明之較佳B-Raf抑制劑為式(I)化合物
式(I)化合物及其作為B-Raf抑制劑之應用揭示於WO 2011/025927中。
由此，本發明更尤其係關於一種治療罹患特徵為B-Raf突變、尤其B-Raf之V600突變之增生性疾病、極尤其特徵為B-Raf之V600突變的黑色素瘤的患者的方法，其包含：(a)自患者獲得腫瘤樣品且測試一或多種選自由BRAF、CRAF、CCND1、CDK4、HER2、IGF-1R、cMET、FGFR1、FGFR2、FGFR3 EGFR、MAP2K1、MAP2K2、NRAS、KRAS HRAS、PTEN、PIK3CA及P16組成之群的基因的遺傳變化，及(b)投與包含式(I)之B-Raf抑制劑 或其醫藥學上可接受之鹽及第二抑制劑之藥物組合療法，該第二抑制劑根據表1基於腫瘤樣品中所發現之遺傳變化選擇，尤其其中，(i)當腫瘤樣品之BRAF、CRAF、MAP2K1、MAPK2、NRAS、KRAS HRAS或EGFR具有遺傳變化時或當步驟(b)中不存在遺傳變化時第二抑制劑為Mek 1/2抑制劑，或(ii)當腫瘤樣品之CCND1、CDK4或P16具有遺傳變化時第二抑制劑為CDK 4抑制劑，或(iii)當腫瘤樣品之HER2、IGF-1R、PTEN或PIK3CA具有遺傳變化時第二抑制劑為PI3激酶抑制劑，或 (iv)當腫瘤樣品之cMET具有遺傳變化時第二抑制劑為c-Met受體酪胺酸激酶抑制劑，或(v)當腫瘤樣品之FGFR1、FGFR2或FGFR3具有遺傳變化時第二抑制劑為FGFR激酶抑制劑。
本發明之一更特定實施例包括在藥物組合療法前用式(I)之B-Raf抑制劑提供單一療法。由此，本發明另外係關於一種治療罹患特徵為B-Raf突變、尤其B-Raf之V600突變之增生性疾病、極尤其特徵為B-Raf之V600突變的黑色素瘤的患者的方法，其包含：(a)投與患者治療有效量之式(I)之B-Raf抑制劑 或其醫藥學上可接受之鹽，直至患者展現疾病進展，(b)在疾病進展後自患者獲得腫瘤樣品且測試一或多種選自由B-Raf、C-Raf、CCND1、CDK4、HER2、IGF-1R、cMET、FGFR1、FGFR2、FGFR3 EGFR、MAP2K1、MAP2K2、NRAS、KRAS HRAS、PTEN、PIK3CA及P16組成之群的基因的遺傳變化，(c)投與包含B-Raf抑制劑及第二抑制劑之藥物組合療法，該第二抑制劑根據表1基於腫瘤樣品中所發現之遺傳變化選擇，尤其其中，(i)當疾病進展機制之特徵為BRAF、CRAF、MAP2K1、MAPK2、NRAS、KRAS HRAS或EGFR具有遺傳變化時或當步驟(b)中不存在遺傳變化時第二抑制劑為Mek 1/2抑制劑，或(ii)當疾病進展機制之特徵為CCND1、CDK4或P16具有遺傳變化 時第二抑制劑為CDK 4抑制劑，或(iii)當疾病進展機制之特徵為HER2、IGF-1R、PTEN或PIK3CA具有遺傳變化時第二抑制劑為PI3激酶抑制劑，或(iv)當疾病進展機制之特徵為cMET具有遺傳變化時第二抑制劑為c-Met受體酪胺酸激酶抑制劑，或(v)當疾病進展機制之特徵為FGFR1、FGFR2或FGFR3具有遺傳變化時第二抑制劑為FGFR激酶抑制劑。
在步驟(a)及(c)中，式(I)化合物可連續投與或以間歇給藥方案投與。較佳連續投與。
在各上述方法中，較佳實施例尤其包括如下實施例，其中增生性疾病之特徵為B-Raf之V600突變，例如V600E突變。增生性疾病通常特徵為包括黑色素瘤、結腸直腸癌、甲狀腺癌、尤其乳突狀甲狀腺癌、星形細胞瘤、胰臟癌及神經纖維瘤之突變。增生性疾病較佳為特徵為B-Raf之V600突變(例如V600E、V600K或V600G突變)的黑色素瘤或結腸直腸癌。本發明尤其係關於如下方法，其中增生性疾病為特徵為B-Raf之V600突變(例如V600E、V600K或V600G突變)的黑色素瘤。
適用於本發明方法之適當Mek 1/2抑制劑為此項技術中已知。適用於本發明之Mek 1/2抑制劑包括PD325901、PD-181461、ARRY142886/AZD6244、ARRY-509、XL518、JTP-74057、AS-701255、AS-701173、AZD8330、ARRY162、ARRY300、RDEA436、E6201、RO4987655/R-7167、GSK1120212或AS703026。
在一重要實施例中，Mek 1/2抑制劑包括WO03/077914中所述之化合物，該案以全文引用的方式併入本文中，尤其式(II)或(III)之化合物
或其醫藥學上可接受之鹽(下文分別稱為化合物A及B)及WO05/051906、WO05/023251、WO03/077855、US20050049419及US7235537中所述之化合物，該等案以全文引用的方式併入本文中，其包括N3-烷基化之苯并咪唑及其他類似雜環衍生物作為治療增生性疾病之Mek 1/2抑制劑。
CDK 4抑制劑為此項技術中已知且包括黃酮吡醇(flavopiridol)、P1446A-05、LEE011、AT7519、BMS265246、LY2835219及PD-0332991。在本發明之一特定實施例中，CDK 4抑制劑為WO2007/140222或WO 20210/020675中所揭示之化合物，該等案以全文引用的方式併入本文中。在一特定實施例中，CDK 4抑制劑為式(IV)化合物 或其醫藥學上可接受之鹽，下文稱為化合物C。
PI3激酶抑制劑為此項技術中已知且包括哌立福新(perifosine)、CAL-101、PX-866、BEZ235、SF1126、INK1117、GDC-0941、BKM120、XL147、XL765、Palomid529、GSK1059615、Zstk474、PTW33597、IC87114、TG100-115、CAL283、PI-103、BYL719、 GNE-477、CUDC-907及AEZS-136。
WO2006/122806，以全文引用的方式併入本文中，描述具有PI3-激酶抑制活性之咪唑并喹啉衍生物。極佳本發明化合物為2-甲基-2-[4-(3-甲基-2-側氧基-8-喹啉-3-基-2,3-二氫-咪唑并[4,5-c]喹啉-1-基)-苯基]-丙腈及其單甲苯磺酸鹽(化合物D)。2-甲基-2-[4-(3-甲基-2-側氧基-8-喹啉-3-基-2,3-二氫-咪唑并[4,5-c]喹啉-1-基)-苯基]-丙腈之合成例如描述於WO2006/122806中作為實例7及152-3。另一極佳本發明化合物為8-(6-甲氧基-吡啶-3-基)-3-甲基-1-(4-哌嗪-1-基-3-三氟甲基-苯基)-1,3-二氫-咪唑并[4,5-c]喹啉-2-酮(化合物E)。8-(6-甲氧基-吡啶-3-基)-3-甲基-1-(4-哌嗪-1-基-3-三氟甲基-苯基)-1,3-二氫-咪唑并[4,5-c]喹啉-2-酮之合成例如描述於WO2006/122806中作為實例86。WO07/084786描述具有PI3激酶抑制活性之嘧啶衍生物。極佳本發明化合物為5-(2,6-二嗎啉-4-基-嘧啶-4-基)-4-三氟甲基-吡啶-2-基胺(化合物F)。5-(2,6-二嗎啉-4-基-嘧啶-4-基)-4-三氟甲基-吡啶-2-基胺之合成描述於WO07/084786中作為實例10。具有PI3-激酶抑制活性之另一較佳化合物為(S)-吡咯啶-1,2-二甲酸2-醯胺1-({4-甲基-5-[2-(2,2,2-三氟-1,1-二甲基-乙基)-吡啶-4-基]-噻唑-2-基}-醯胺)(化合物X)。
c-Met受體酪胺酸激酶抑制劑為此項技術中已知且包括克卓替尼(crizotinib)、PHA-665752、SU11274、PF-04217903、福瑞替尼(foretinib)、SGX523、JNJ-38877605、GSK1363089、AMG208及INCB28060。在一特定實施例中，c-Met受體酪胺酸激酶抑制劑為式IV化合物
或其醫藥學上可接受之鹽(以下化合物G)。
根據本發明方法使用之FGFR激酶抑制劑較佳為選擇性及ATP競爭性泛FGFR激酶抑制劑，包括AZD4547及BGJ398。在一特定實施例中，FGFR激酶抑制劑為WO2006/000420中所揭示之芳基-嘧啶基脲衍生物，尤其式(V)化合物
或其醫藥學上可接受之鹽(以下化合物H)。
尤其較佳為本發明方法之實施例，其中Mek 1/2抑制劑為化合物A或化合物B、尤其化合物B，CDK 4抑制劑為化合物C，PI3激酶抑制劑為化合物D、化合物E、化合物F或化合物X、尤其化合物F，c-Met受體酪胺酸激酶抑制劑為化合物G且其中FGFR激酶抑制劑為化合物H或上述化合物之醫藥學上可接受之鹽。
式(I)之B-Raf抑制劑以每天150至600毫克、較佳每天400至600毫克、尤其450或600毫克/天之劑量投與。作為藥物組合療法之第二抑制劑，化合物B以15至60mg之劑量每天兩次、較佳45mg每天兩次投與，化合物C以100至900毫克/天、較佳200至900毫克/天(例如200、400、700或900毫克/天)之劑量投與，化合物F以30至100毫克/天、較佳60至100毫克/天或60至80毫克/天之劑量投與，化合物G以50至300mg之劑量每天兩次、較佳100至300mg每天兩次(例如100、150、200、250或300mg每天兩次)投與，或化合物H以25至125毫克/天(例如75、100或125毫克/天)之劑量投與。
在上述方法之一重要實施例中，腫瘤樣品中所發現之BRAF遺傳變化不為V600突變。
本發明另外係關於包含B-Raf抑制劑、較佳式(I)之B-Raf抑制劑及選自由PI3激酶抑制劑、c-Met受體酪胺酸激酶抑制劑及FGFR激酶抑 制劑組成之群的第二抑制劑的治療組合以分別、同時或連續投與。更特定言之，治療組合包含式(I)之B-Raf抑制劑及第二抑制劑以分別、同時或連續投與，該第二抑制劑為選自由化合物D、化合物E、化合物F及化合物X或其醫藥學上可接受之鹽組成之群的PI3激酶抑制劑；或治療組合包含式(I)之B-Raf抑制劑及第二抑制劑以分別、同時或連續投與，該第二抑制劑為選自化合物G或其醫藥學上可接受之鹽的c-Met抑制劑；或治療組合包含式(I)之B-Raf抑制劑及第二抑制劑以分別、同時或連續投與，該第二抑制劑為選自化合物H或其醫藥學上可接受之鹽的FGFR激酶抑制劑。在下文中，該等治療組合稱為本發明組合。
本發明另外係關於一種治療罹患特徵為B-Raf突變之增生性疾病(例如特徵為B-Raf之V600突變的黑色素瘤)之患者的方法，其包含投與患者治療有效量之組合，該組合包含B-Raf抑制劑、較佳式(I)之B-Raf抑制劑及選自由PI3激酶抑制劑、c-Met受體酪胺酸激酶抑制劑及FGFR激酶抑制劑組成之群的第二抑制劑。更特定言之，本發明係關於一種治療罹患特徵為B-Raf突變(諸如V600突變)之增生性疾病(例如特徵為B-Raf之V600突變的黑色素瘤)之患者的方法，其包含投與患者治療有效量之本發明組合。此等抑制劑較佳以治療有效劑量投與，其在組合時提供有益作用。投與可分別、同時或連續進行。
本發明亦關於適用於製備治療或預防有需要之患者之增生性疾病、尤其特徵為B-Raf突變、尤其B-Raf之V600突變之增生性疾病(例如特徵為B-Raf之V600突變的黑色素瘤)之醫藥組合物或藥物的本發明組合。
本發明另外提供一種市售包裝，其包含作為治療劑之本發明組合以及用於同時、分別或連續投與本發明組合以用於延遲增生性疾病之進展或增生性疾病治療的說明書。
相較於僅施用本發明組合中所用之醫藥學治療劑中之一者的單一療法，投與本發明組合不僅可產生有益作用，例如協同治療作用，例如在減輕、延遲症狀之進展或抑制症狀方面，而且可產生另外驚人有益作用，例如較少之副作用、更持久之反應、改良之生活品質或降低之罹病率。
如下實例欲說明但不限制本發明。
實例1
在研究之第一部分期間，用式(I)之B-Raf抑制劑以單一藥劑形式以450毫克/天之推薦II期劑量治療患者。經口投與調配成囊封固體分散液之式(I)之B-Raf抑制劑。
在研究之第二部分中，用式(I)之B-Raf抑制劑與第二靶向劑之組合(亦即式(I)之B-Raf抑制劑+化合物B、式(I)之B-Raf抑制劑+化合物F、式(I)之B-Raf抑制劑+化合物H、式(I)之B-Raf抑制劑+化合物G或式(I)之B-Raf抑制劑+化合物C)治療患者。各組合分支中之劑量遞增由貝氏邏輯回歸模型(Bayesian logistic regression model，BLRM)指導以建立各組合之MTD/RP2D，除非其先前已在各別組合試驗中確定。使用BLRM之開放標籤劑量遞增研究設計為估計癌症患者之MTD及/或RP2D的公認方法。自適應BLRM由控制劑量過量之遞增設計(EWOC)原理指導以控制研究中未來患者之DLT風險。在第一個週期後未經歷DLT之患者允許進行患者自身劑量遞增。
患者自身劑量遞增由BLRM用反映個別患者耐受性之改良EWOC標準指導。將貝氏反應自適應模型用於小資料集已由EMEA接受且其發展及適當使用為FDA關鍵路徑計劃(Critical Path Initiative)之一個態樣。
組合藥物選擇之基本原理
臨床前及臨床研究之資料表明藉由用式(I)之B-Raf抑制劑及化合 物B組合同時、雙重、垂直路徑抑制RAF/MEK/ERK信號傳導路徑可使臨床功效提高且可使患有BRAF V600依賴性晚期黑色素瘤之患者克服對任一單一藥劑之早期抗性。此外，再活化MAPK信號傳導或活化其他路徑(諸如PI3K/AKT信號傳導路徑)之其他機制可在BRAF抑制劑之原發性抗性及/或獲得性抗性中起作用。由此，除式(I)之B-Raf抑制劑+化合物B以外，亦評定式(I)之B-Raf抑制劑與分別靶向PI3K、c-met、FGFR及CDK4/6激酶之所選藥劑化合物F、化合物H、化合物G及化合物C之組合的抗腫瘤活性。給與個別患者之式(I)之B-Raf抑制劑組合之選擇基於式(I)之B-Raf抑制劑進展後在此患者之腫瘤樣品中所鑑別的遺傳變化(參見表1)。
研究設計之描述
此為多中心、開放標籤、II期研究，其將使約100個患有BRAF突變局部晚期或轉移黑色素瘤之患者加入且由兩個治療部分組成。
在第一部分(部分I)中，用式(I)之B-Raf抑制劑單一藥劑以450毫克/天之RP2D治療未曾用過選擇性BRAF抑制劑之患者直至疾病進展(如根據RECIST v1.1所定義)。在疾病進展時，對腫瘤進行生檢且分析所選組之基因(表1)。
在研究之部分I中復發的患者在用於抗性生檢之分子分析的預期周轉時間期間將繼續接受式(I)之B-Raf抑制劑單一藥劑，直至適當式(I)之B-Raf抑制劑合理組合可鑑別及引發。
基於復發時自腫瘤生檢所鑑別之遺傳變化，一組患者將進入研究之第二部分(部分II)以進行式(I)之B-Raf抑制劑加上第二靶向藥劑之定製組合治療。對應於所研究之5個組合治療，有5個分支：式(I)之B-Raf抑制劑+化合物B、式(I)之B-Raf抑制劑+化合物F、式(I)之B-Raf抑制劑+化合物H、式(I)之B-Raf抑制劑+化合物G及式(I)之B-Raf抑制劑+化合物C。第二藥劑之選擇按照表1標準定義。預期所加入之超過一 半患者在用式(I)之B-Raf抑制劑進展後接受式(I)之B-Raf抑制劑加上化合物B之組合治療。
曾用過BRAF抑制劑治療且在用式(I)之B-Raf抑制劑單一藥劑治療患有BRAF V600突變黑色素瘤之患者之前一研究中復發的患者可在用式(I)之B-Raf抑制劑單一藥劑進展後加入部分II。對於此等患者，在先前試驗之治療訪問結束時所收集的新鮮腫瘤生檢之分析結果將用於部分II中之組合治療分配。
在其他式(I)之B-Raf抑制劑單一藥劑研究(例如IIT)中復發之患者將在進展後自式(I)之B-Raf抑制劑治療中斷且將停止接受式(I)之B-Raf抑制劑單一藥劑，直至其可分配至研究部分II中之合理組合治療。
認為此等患者之進行性疾病可由先前研究確認且在進展時CT前與開始此研究內之研究治療之時間間隔不超過28天時用作研究之部分II的基線腫瘤評估。
所有患者均以所定義之雙重組合MTD/RP2D開始合理組合，或若未預先確定雙重組合MTD/RP2D，則使用450毫克/天之RP2D(或患者所耐受之最高末次劑量)的式(I)之B-Raf抑制劑與貝氏邏輯回歸模型允許之起始劑量的第二藥劑的組合。合理組合治療部分可以第二藥劑之可能上升劑量繼續直至已建立組合之MTD/RP2D。在對於耐受既定劑量之組合至少一個週期的患者預先定義之條件下允許進行由BLRM指導之第二藥劑的患者自身劑量遞增。
在21天週期中投與組合治療直至疾病進展，其中將組合治療期間的腫瘤評定與再計算基線(亦即在部分I或先前研究中式(I)之B-Raf抑制劑單一藥劑治療時引起PD評定之腫瘤評估結果)比較。
分子預篩檢
為進入研究之篩檢期，患者必須具有BRAF V600突變之書面文件，其應在新鮮腫瘤生檢時於當地獲得(較佳)或可使用最新歸檔腫瘤 樣品。然而，在考慮加入此研究中之時分子狀況未知且所具有之腫瘤未在當地實驗室常規篩檢BRAF突變及需要收集新鮮腫瘤的患者將簽署分子預篩檢知情同意書，以使得可收集新鮮腫瘤樣品進行突變狀況之當地評定。僅在已知或確定BRAF V600突變狀況後，患者才允許簽署主要研究知情同意書且開始篩檢。
篩檢
在已知或確定BRAF V600突變狀況後，患者才允許簽署主要研究知情同意書且開始篩檢。所有篩檢評估均要求在投與研究治療前執行。
治療期
存在兩個治療部分：部分I及部分II：
部分I=單一藥劑治療期且在第1個週期第1天開始直至開始組合治療。
部分II=組合治療，應在已知來自復發時之腫瘤生檢收集的遺傳變化後開始。
研究治療在21天週期期間投與且將持續直至疾病進展(在雙重組合治療時)、不可接受之毒性、退出知情同意書或死亡。
患者群體
在患有具有經確認BRAF V600突變之局部晚期或轉移黑色素瘤的成人患者中進行研究。
加入試驗之第一部分(部分I)的患者必須未曾用過選擇性BRAF抑制劑。
先前用式(I)之B-Raf抑制劑單一藥劑治療之患者若在復發時收集腫瘤生檢則可直接加入部分II。
加入此研究中之患者不允許參與平行研究藥物或裝置研究。此外，完成該研究之患者不可再加入第二療程。
研究者或被指定者必須確保在研究中僅向滿足所有以下包括標準且不滿足任何排除標準的患者提供治療。
包括標準
患者未曾用過式(I)之B-Raf抑制劑(適於部分I)。
適於包括在該研究中之患者必須滿足所有以下標準：
開始給藥時年齡18歲
能夠理解且自願簽署知情同意書且能夠遵守研究訪問時程及其他方案要求。所書寫之知情同意書必須在篩檢程序前獲得
組織學上確診不可切除之III期或轉移黑色素瘤(根據美國癌症聯合委員會[American Joint Committee on Cancer，AJCC]IIIC期至IV期)。
書寫BRAF V600突變文件，在基線狀況下進行新鮮腫瘤生檢，且在非醫學上不當時患者同意在復發時強制性生檢。
如由RECIST v1.1所確定，可量測疾病之證據。
注意：輻射療法前或其他局部療法(例如透皮切除)前之區域病變不應認為是可量測的，除非自該療法以來已記錄病變進展。
預期壽命3個月
世界衛生組織(World Health Organization，WHO)體能狀況2。
在所有可生育之女性中第一劑研究治療前72小時內血清妊娠測試陰性。
在式(I)之B-Raf抑制劑單一藥劑治療後復發時必須可獲得強制性新鮮生檢。
式(I)之B-Raf抑制劑之其他單一藥劑研究中記錄有進行性疾病之患者可根據抗性概況結果加入部分II，該等抗性概況結果決定用於治療之組合分支分配。
此等患者之進行性疾病必須由進行腫瘤評估評定之先前研究確認。若記錄疾病進展之腫瘤評估與第一劑組合治療之間的時間間隔大於4週(28天)，則應執行新的腫瘤評估。需要在先前研究之治療訪問結束時執行且經由全面基因組分析表徵的生檢來分配組合治療。
排除標準
適於此研究之患者不可滿足任何以下標準：
加入部分I(式(I)之B-Raf抑制劑單一藥劑治療)：
先前用RAF-抑制劑治療
症狀性或未治療之柔腦膜疾病
症狀性腦轉移。允許先前治療或未治療此等在無皮質類固醇療法下無症狀之病狀的患者加入。藉由成像證實腦轉移必須穩定至少三個月(例如篩檢時完成之腦MRI或CT展示無進行性腦轉移之當前證據)。患者不允許接受酶誘導之抗癲癇藥物。
已知急性或慢性胰臟炎
包括以下任一者之臨床上顯著之心臟病：
需要治療之CHF(NYH等級2)，如藉由MUGA掃描或ECHO測定LVEF<45%，或不受控之高血壓(請參見WHO-ISH準則)
臨床上顯著之心室調律不整或心房微顫史或存在臨床上顯著之心室調律不整或心房微顫
臨床上顯著之安靜時心搏徐緩
在開始研究藥物前，不穩定型心絞痛3個月
在開始研究藥物前，急性心肌梗塞(AMI)3個月
在篩檢ECG時QTcF>480毫秒
在基線時具有任何以下實驗值之患者：
嗜中性白血球絕對計數(ANC)<1,500/mm3[1.5×109/L]
血小板<100,000/mm3[100×109/L]
血紅蛋白<9.0g/dL
血清肌酸酐>1.5×ULN
血清總膽紅素>1.5×ULN
AST/SGOT及ALT/SGPT>2.5×ULN，或若存在肝轉移，則>5×ULN
胃腸(GI)功能損傷或可顯著改變口服介入藥物之吸收的GI疾病(例如潰瘍病、不受控之噁心、嘔吐、腹瀉、吸收不良症候群、小腸切除術)。
上述或併發惡性病。例外：經充分治療之基底細胞或鱗狀細胞皮膚癌；經有療效地治療且在進入研究前至少3年無復發證據之子宮頸原位癌瘤；或經有療效地治療且在進入研究前至少3年無復發證據之其他實體腫瘤。
過去6個月內有血栓栓塞或腦血管事件史，包括短暫性缺血性發作、腦血管意外、深靜脈血栓形成或肺栓塞。
開始研究藥物前4週(對於亞硝基脲、絲裂黴素-C為6週)內接受輻射療法(其包括>30%骨髓儲備量)、化學療法、生物學療法(例如抗體)，或在開始研究藥物前在藥劑之5個半衰期內(或在未知半衰期時4週內)用連續或間歇小分子治療劑或研究性藥劑治療或尚未自該療法之副作用(除脫髮以外)恢復的患者。
開始研究藥物前最後2週內經歷任何重大外科手術或不能自先前外科手術中完全恢復之患者。
已知人類免疫缺陷病毒(HIV)感染。
可增加與研究參與或研究藥物投與有關之風險或可干擾研究結果之說明及在研究者判斷時使患者不適於該研究的其他嚴重、急性或慢性醫學或精神病狀或實驗異常。
懷孕或哺乳(泌乳)婦女，其中懷孕定義為女性在受孕後直至妊娠 結束之狀態，其藉由陽極hCG實驗室測試(>5mIU/mL)確認。定義為生理上能夠受孕之可生育婦女不允許參與此研究，除非其使用高效方法在整個研究期間避孕且在研究藥物中斷後避孕10天。
允許停經後婦女參與此研究。婦女在其12個月自然(自發)閉經且具有適當臨床概況(例如年齡適當、血管舒縮症狀史)或六個月自發閉經且促卵泡激素(FSH)水準>40mIU/mL或在篩檢前至少六週進行外科雙側卵巢切除術(進行或不進行子宮切除術)或小管結紮時認為是停經後且不能生育。在僅進行卵巢切除術之情況下，僅在該婦女之生殖狀況已由後續激素水準評定確認時認為其不可生育。
性活躍男性在服用該藥物時且在停止治療後3個月內在性交期間必須使用保險套且不應在此期間孕育子女。亦要求切除輸精管男性使用保險套以防止經由精液傳遞藥物。
研究治療
欲用於此研究之研究藥物為式(I)之B-Raf抑制劑、化合物B、化合物F、化合物H、化合物G及化合物C。
該等研究治療為：
部分I：式(I)之B-Raf抑制劑單一藥劑
部分II：二重組合
式(I)之B-Raf抑制劑(每天一次)及化合物B(每天兩次)
式(I)之B-Raf抑制劑(每天一次)及化合物F(每天一次)
式(I)之B-Raf抑制劑(每天一次)及化合物H(每天一次)
式(I)之B-Raf抑制劑(每天一次)及化合物G(每天兩次)
式(I)之B-Raf抑制劑(每天一次)及化合物C(每天一次)
給藥方案
表2給藥及治療方案
投與式(I)之B-Raf抑制劑+第二藥劑之說明
式(I)之B-Raf抑制劑、化合物F、化合物H及化合物C以每日方案(每天一次)以平穩固定劑量而非根據體重或體表面積經口投與。
每天一次給藥：應指導患者每天在早晨用一大杯水(約250ml)服用式(I)之B-Raf抑制劑(及化合物F、化合物H或化合物C)膠囊。對於所有劑量投與，患者應在研究藥物攝入之前及之後保持空腹2小時。若患者忘記在早晨服用劑量，則其應在錯過之劑量後6小時內服用該劑量。若已經過6小時以上，則應扣除該天之劑量且患者應繼續用下一預定劑量治療。若出於任何原因未食用早餐，則患者應仍用一杯水服用預定早晨劑量。若此在完整PK取樣之日發生，則應進行記錄。
化合物B及化合物G應以每天兩次方案(每天兩次)以平穩固定劑量而非根據體重或體表面積經口投與。
每天兩次給藥：化合物B或化合物G之劑量應隔12±2小時服用。應指導患者每天在早晨及傍晚用一大杯水(約250ml)服用劑量。對於式(I)之B-Raf抑制劑與化合物G組合，對於所有劑量投與，患者應在研究藥物攝入之前及之後保持空腹2小時。對於式(I)之B-Raf抑制劑與化合物B組合，在所有早晨劑量投與日，患者不應在研究藥物攝入2小時內食用任何物質且在式(I)之B-Raf抑制劑及化合物B攝入後禁止飲食2小時。對於所有傍晚藥量投與，患者應在化合物B攝入之前及之後保持空腹1小時，請注意，兩種藥物(式(I)之B-Raf抑制劑+化合物B或化合物G)應在早晨一起服用且僅每天兩次投與之藥物(化合物B或 化合物G)應在傍晚服用。
在執行PK取樣之日投藥的說明：
應在即將攝入劑量之前收集給藥前PK樣品。
在每次訪問時，負責之現場人員應確保投與適當劑量之各研究藥物且提供患者研究藥物之正確量以用於後續給藥。應指導患者歸還未使用之研究藥物至每次訪問之現場。
應指導患者將膠囊/錠劑整個吞咽而非咀嚼或將其壓碎。
任何遺漏劑量不應在下一預定給藥期間或在後一天替換或補足，適用於任一者。
在整個研究期間且較佳在第一劑研究藥物前7天患者必須避免食用葡萄柚、石榴、楊桃、塞維利亞橙(Seville orange)或含有各自之汁液的產品，因為CYP3A4可能與研究藥物相互作用。允許食用橙汁。
若在治療過程中發生嘔吐及/或腹瀉，則在下一預定劑量前不允許向該患者再次給藥。給藥後4小時內之任何嘔吐及/或腹瀉(或大便頻率增多)的發生及頻率必須標註在eCRF之AE部分中。另外，在完整PK取樣之日，在該日給藥後前4小時內的任何嘔吐事件之發作時間應標註在相應劑量投與記錄PK eCRF中。
研究者或負責之現場人員應指導患者按照方案服用研究藥物(提高順應性)。研究期間所開立且分配至患者之所有劑量及所有劑量變化及所有錯過之劑量必須記錄在劑量投與記錄eCRF上。必須定期執行藥物計數。應指導患者在各週期結束時歸還未使用之研究藥物至現場。在每次訪問時，現場人員應確保投與適當劑量之各研究藥物且提供患者藥物之正確量以用於後續給藥。
僅對於式(I)之B-Raf抑制劑與化合物F之組合分支
在執行空腹血漿葡萄糖監測之日投藥的說明：在空腹血漿葡萄糖監測之日，患者必須保持空腹隔夜至在血液收集之前至少8小時。 空腹血漿葡萄糖抽取後可食用清淡早餐/快餐。式(I)之B-Raf抑制劑(及適用時化合物F)可在早餐後2小時投與。患者應在投與式(I)之B-Raf抑制劑(及適用時化合物F)後繼續保持空腹2小時。
治療持續時間
患者可用式(I)之B-Raf抑制劑單一藥劑持續治療直至經歷不可接受之毒性，及/或在研究者判斷下或在退出同意書時中斷治療。在疾病進展時，式(I)之B-Raf抑制劑單一藥劑治療後，患者將根據復發生檢中所鑑別之遺傳變化分配至組合治療。患者可持續組合治療直至經歷不可接受之毒性，疾病進展及/或在研究者判斷下或在退出同意書時中斷治療。
劑量遞增準則
起始劑量基本原理
式(I)之B-Raf抑制劑單一藥劑
對於加入此試驗之第一部分中之患者，式(I)之B-Raf抑制劑之劑量設定在每天一次450mg，其對應於單一藥劑RP2D。起始劑量之選擇遵循用於選擇患有癌症之患者中所進行之首次用於人類之試驗(first-in-human trial)的起始劑量的ICH S9準則且展示於表6-2中。
式(I)之B-Raf抑制劑與化合物B之組合：
式(I)之B-Raf抑制劑加上化合物B之起始劑量設定在每天一次600mg式(I)之B-Raf抑制劑及每天兩次45mg化合物B，或經證明為安全之最高劑量組合。
式(I)之B-Raf抑制劑與第二藥劑(化合物F、化合物H、化合物G或化合物C)之組合：
在此試驗之第二部分中，式(I)之B-Raf抑制劑及第二藥劑之起始劑量分別為每天一次450mg(RP2D)或式(I)之B-Raf抑制劑之可耐受最高末次劑量及BLRM允許之第二藥劑之最高劑量(參見表3)。
式(I)之B-Raf抑制劑之RP2D宣稱為每天一次450mg。
定性DDI評定預計式(I)之B-Raf抑制劑或化合物F共投與時對其暴露無顯著影響。使用SimCYP模擬之定量分析確認此評定。因此，此組合對之起始劑量經選擇對於式(I)之B-Raf抑制劑為當前建立之RP2D且對於化合物F為75% MTD：每天一次450mg式(I)之B-Raf抑制劑及75mg化合物F。
使用Simcyp模擬之定量DDI評定預計在式(I)之B-Raf抑制劑與化合物H共投與時式(I)之B-Raf抑制劑暴露之變化最小。在450mg之式(I)之B-Raf抑制劑劑量下，預期化合物H之暴露(Cmax及AUC)降低20-40%。因此，此組合對之起始劑量經選擇對於式(I)B-RaH抑制劑為當前建立之RP2D且對於化合物H為60% MTD：每天一次450mg式(I)B-RaH抑制劑及75mg化合物H。
使用Simcyp模擬之定量DDI評定預計在共投與每天一次450mg式(I)之B-Raf抑制劑及每天兩次150mg化合物G時式(I)之B-Raf抑制劑之AUC及Cmax分別增加76%及43%，以及化合物G之AUC及Cmax分別降低54%及36%。在臨床上，已以高達每天一次700mg劑量測試式(I)之B-Raf抑制劑且所觀察到之不良事件為可逆且可控制的，因此兩個分子之間的可能使得式(I)之B-Raf抑制劑濃度高於當前建立之RP2D的可能性DDI不會造成風險，因為不良事件可監測、可控制且可逆。此組合對之起始劑量經選擇對於式(I)B-RaH抑制劑為當前建立之RP2D且對於化合物G為50% MTD：每天一次450mg式(I)B-RaH抑制劑及150mg化合物G。
使用Simcyp模擬之定量DDI評定預計在共投與每天一次450mg式(I)之B-Raf抑制劑及300mg化合物C時式(I)之B-Raf抑制劑之AUC及Cmax分別增加43%及20%，以及化合物C之AUC及Cmax分別降低43%及37%。在臨床上，已以高達每天一次700mg劑量測試式(I)之B-Raf 抑制劑且所觀察到之不良事件為可逆且可控制的，因此兩個分子之間的可能使得式(I)之B-Raf抑制劑濃度高於當前建立之RP2D的可能性DDI不會造成風險，因為不良事件可監測、可控制且可逆。此組合對之起始劑量經選擇對於式(I)之B-Raf抑制劑為當前建立之RP2D且對於化合物C為當前以每天一次900mg劑量測試之劑量的約23%，因為其最大耐受劑量(MTD)尚未達成：每天一次450mg式(I)之B-Raf抑制劑及200mg化合物C。
在此研究中，應儘快在穩態下評估所有組合搭配物之藥物動力學以及其活性代謝物(適用時)且與各別單一療法研究中所得之藥物動力學以及其活性代謝物比較以評定可能的藥物-藥物相互作用。
在給與第一個患者該等組合中之一者前，用來自進行中之單一藥劑試驗的最新資料更新此組合之貝氏模型以確認式(I)之B-Raf抑制劑及第二藥劑之所建議起始劑量仍適當(亦即滿足EWOC標準)。若所建議之起始劑量不滿足該標準，則使用滿足EWOC標準之較低劑量組合。
臨時劑量
表3描述此試驗期間可評估之組合的研究治療的起始劑量及臨時劑量。若認為非當前規定之其他劑量的加入及其他患者以已測試之劑量加入為提供最佳安全性及耐受性、藥物動力學及藥效學資料所必需，則可進行該等變化。
*在研究過程中可添加其他及/或中間劑量。可以低於MTD之任何劑量添加群組以充分瞭解安全性、PK或PD。 **劑量-1及-2亦用於需要自起始劑量減少劑量之患者。此研究不允許低於劑量-2之劑量減少。
實施劑量遞增確定
在該週期之前21天期間評估個別患者對雙重組合之耐受性後進行第二藥劑劑量遞增之確定。
為實施劑量遞增確定，在劑量確定期間評估可獲得之毒性資訊(包括非DLT之不良事件及實驗室異常)、BLRM之建議及可獲得之PK及PD。直至研究者接受表明已評估前一劑量之結果且允許進行較高劑量的書面確認才可以下一較高劑量投與藥物。若確定遞增至較高劑量，但第一治療週期期間以前一劑量治療之一或多個其他患者經歷DLT，則在任何其他患者以較高劑量加入前BRLM將用此新資訊更新。
劑量遞增過程將逐步實施且用3個患者之群組進行。僅第二藥劑、化合物F、化合物H、化合物G或化合物C根據BLRM遞增。
在用式(I)之B-Raf抑制劑單一藥劑治療之部分I內的任何時間均不允許進行患者自身之劑量遞增。
在用組合治療之第二部分期間允許進行第二藥劑之患者自身劑量遞增，式(I)之B-Raf抑制劑+化合物B分支中之患者例外，其以式(I)之B-Raf抑制劑與化合物B之組合的所宣稱RP2D(每天兩次45mg)治療。
為使患者以化合物F、化合物H、化合物G或化合物C之較高劑量治療，其必須耐受較低劑量組合至少1個療法週期(例如其不可以最初分配之較低劑量對經歷CTCAE等級2之毒性，因為研究藥物之該關係不能被排除)。此外，欲用來治療患者之較高新劑量對必須滿足用 於患者自身遞增之改良EWOC標準(參考章節)。
下一群組中新加入之患者以末次劑量遞增會議所確定之劑量開始治療。隨後為下一群組更新貝氏邏輯回歸模型(BLRM)及患者自身劑量界限。
治療中止及治療中斷
若患者需要對式(I)之B-Raf抑制劑、化合物B、化合物F、化合物H、化合物C或化合物G進行自下一預定劑量之所欲日劑量延遲>21個連續日，則該患者應自該研究治療中斷。在例外情形下，若患者明顯受益於研究治療(亦即穩定疾病、部分反應、完全反應)且研究者認為不存在安全性擔憂，則患者可以基於安全性調節之劑量保留在研究治療中。
分子預篩檢
分子預篩檢知情同意書
必須在任何研究相關分子預篩檢程序前簽署分子預篩檢知情同意書(在已評定BRAF之突變狀況不屬於該研究時不適用)。此僅適用於部分1患者。
新鮮或歸檔生檢之BRAF突變狀況
為進入研究之篩檢期，患者必須已書寫BRAF V600突變之文件，其應在新鮮腫瘤生檢時於當地獲得(較佳)或可使用最新歸檔腫瘤樣品。必須在任何研究相關分子預篩檢程序前簽署分子預篩檢知情同意書(在已評定突變狀況不屬於該研究時不適用)。
藉由指定當地實驗室確認BRAF V600密碼子(例如V600E/K/D/R)突變且由現場記錄後，患者可開始篩檢程序。
治療期
治療期分成兩個部分：
部分I：在21天(3曆週(calendar week))週期中將式(I)之B-Raf抑制 劑連續給與未曾用過BRAF抑制劑之患者，其在週期1之第1天開始。週期之間無預定間隔。患者將接受式(I)之B-Raf抑制劑單一藥劑直至在發生疾病進展或不可接受之毒性(無論何者首先發生)後開始組合治療為止。
部份II：接受式(I)之B-Raf抑制劑至少一個21天週期且發生進展之患者基於復發時腫瘤生檢中所鑑別之遺傳變化進入部分II中接受式(I)之B-Raf抑制劑+第二藥劑之治療組合。
無固定治療持續時間；患者可用式(I)之B-Raf抑制劑單一藥劑繼續治療直至組合治療為止，且在第一疾病進展期間，發生不可接受之毒性而排除任何進一步治療及/或在研究者判斷下或因患者拒絕(退出同意書)而中斷治療。在第一疾病進展時，已知生檢之分析結果後，患者可開始用式(I)之B-Raf抑制劑+第二抑制劑組合治療直至第二疾病進展、發生妨礙任何進一步治療之不可接受之毒性及/或在研究者判斷下或因患者拒絕(退出同意書)而中斷治療。
儘管患者要求>21天之劑量中斷，但因為患者經歷臨床利益之客觀證據且研究者認為患者保留在研究中具有最佳利益，則將患者保留在研究中。
貝氏邏輯回歸模型
由EWOC原理指導之自適應BLRM指導各研究藥物(化合物F、化合物H、化合物G或化合物C)與式(I)之B-Raf抑制劑之組合至其各別MTD/RP2D的劑量遞增。對於各組合，對於劑量遞增期間所收集之週期1劑量限制毒性資料(亦即不存在或存在DLT)擬合組合治療之5參數BLRM以模擬與式(I)之B-Raf抑制劑組合給與之化合物F、化合物H、化合物G或化合物C的劑量-毒性關係。
附錄1中提供BLRM、模型參數之先驗分佈(基於關於靶向劑當前可獲得之資訊)及DLT率之相關先驗分佈的定義。
劑量推薦
組合搭配物之劑量推薦受限於進入部分II之患者之間可能不同之式(I)之B-Raf抑制劑之劑量。此推薦基於DLT率之後驗概述，包括平均值、中位數、標準偏差、95%可信區間及以下種類中之一者中所存在的各劑量組合之真實DLT率的概率：
[0%,16%]劑量不足
[16%,35%]靶向毒性
[35%,100%]過度毒性。
遵循EWOC之原理，對於各群組患者，推薦劑量組合為在滿足存在小於25%過度毒性之幾率的過度劑量標準的劑量之間的標靶區間[16%,35%]中具有DLT之最高後驗概率的劑量組合。另外，兩種研究藥物之群組內最大組合劑量遞增限於100%，其中100%指各研究藥物之相對遞增之總和，亦即對於式(I)之B-Raf抑制劑(其劑量不能超過450mg)及第二靶向劑(可用時其不能遞增至超過其s.a.MTD/RP2D)分別為0%及100%。
組合搭配物之患者自身劑量遞增限於50%且由BLRM根據反映個別患者耐受性之以下改良EWOC標準指導：患者之自身劑量應能夠遞增至存在小於40%幾率過度毒性的劑量。此外，若在某一劑量下在2個或2個以上患者中觀察到CTCAE 2級之治療有關毒性或若任何患者經歷3級或3級以上毒性，則組合搭配物之劑量增加應任何後續劑量增加之25%。
劑量遞增會議上使用可獲得之毒性資訊(包括非DLT之AE)、PK、PD及功效資訊以及來自貝氏模型之推薦的臨床綜合結果確定下一群組之劑量組合。研究者及試驗人員將參與決策。
若群組中之前2個可評估患者在第3個患者加入前經歷DLT，則在任何其他患者加入該群組前再評估任何組合之模型。各組合之最終推 薦MTD/RP2D係基於對來自BLRM之推薦的考慮及安全性之整體評定，該整體評定考慮到來自所測試之所有不同劑量組合的後續週期的耐受性資料。
實例2
材料及方法
在DMSO中製備化合物儲備液，其最終濃度為10mM。用適當細胞培養基以3倍增量連續稀釋操作儲備液以獲得在2.7μM至1.2nM範圍內之最終分析濃度。
細胞株、細胞培養物、細胞存活率量測
A-375及WM-266-4細胞購自美國菌種保存中心(American Type Culture Collection，ATCC)。將A-375細胞培養於DMEM培養基(ATCC)中，且將WM-266-4細胞培養於EMEM培養基(ATCC)中，其中該兩種培養基均補充有10%胎牛血清(Gibco)，且在37℃/5% CO2下培育。自Novartis-Emeryville獲得經工程改造以表現通常存在之展示抗性之對偶基因的細胞株。此等抗性模型包括表現突變型MEK1P124L、截短型p61-BRAFV600E或突變型NRASQ61K之A-375細胞及表現突變型MEK1C121S、截短型p61-BRAFV600E或突變型NRASQ61K之WM-266-4細胞。將此等細胞培養於具有選擇標記物G418且存在5μM LFE158(MEK突變株)或LIH720(截短型p61-BRAFV600E)的適當母培養基中。
培養盤佈局、細胞施配及化合物添加
為進行篩檢，使用具有8通道標準卡匣之MultiDrop Combi(Thermo-Fisher)將細胞以每孔500(A-375)或750(WM-266-4)個之細胞密度接種於384孔盤(Thermo Scientific，目錄號4332)中之80μl培養基中。為促使細胞在整個孔中均勻分佈，將細胞在1000 RPM下短暫離心且在室溫下培育30分鐘。在37℃、5% CO2下培育所有培養 盤24小時，隨後添加化合物。在適當培養基中新鮮製備化合物儲備液且使用配備有200nl銷工具之PAA機器人添加。在最少三個重複孔中，藉由根據製造商之方案經由Cell Titer Glo(Promega)定量細胞ATP含量及藉由顯微成像來評定72小時後之單一藥劑及組合作用。為進行成像，將細胞固定於培養盤且經由WellMate施配器以受控之施配速度用10% PFA、0.3% TX-100於PBS中之溶液滲透。用Hoechst 33342(H3570,Invitrogen)將細胞核染色，且藉由BioTek洗滌器執行所有必需洗滌步驟。
自動影像分析
來自InCell分析器2000(GE Healthcare,28-9534-63)之影像為TIFF格式且具有2048×2048像素之尺寸，其能捕獲384孔盤之所有孔。使用開放原始碼中之客戶定製指令碼、統計程式設計語言R及BioConductor封包EBImage函數建立自動影像分析管線作業。目標為將每孔存活(細胞)核之數目定量為細胞存活率之近似值。該管線作業包含七個步驟：(I.)使影像平滑以減少強峰之數目，(II.)使用閾值函數分離前景(信號)與背景(雜訊)，(III.)鑑別前景中之局部最大值作為細胞核之菌種，(IV.)濾除緊密接近之局部最大值，(V.)使剩餘局部最大值之細胞核繁殖，(VI.)及自繁殖之細胞核提取目的特徵(細胞核數目、尺寸特徵及強度特徵)。作為最後一步(VII.)，為不對碎片(例如破裂之細胞核)進行計數，分別使用在DMSO及星形孢菌素(Staurosporin)處理之孔中鑑別之物質獲得存活及破裂細胞核之特徵分佈。使用其設定區分存活與破裂細胞核之截止值。自所鑑別物質之總數減去破裂細胞核之數目且結果作為該孔之最終計數報導。
資料正規化
資料包含各處理(化合物)條件-DMSO處理孔之42個重複樣及星形孢菌素處理孔之2個重複樣的三份量測結果。將該等資料正規化至 DMSO量測結果之中位數且藉由計算三份結果之中位數概述。將資料引入Chalice中以計算化合物協同作用。
實例3
在七株BRAF突變CRC衍生細胞株中，RAF激酶之抑制劑(式(I)化合物)及PIK3Cα激酶之抑制劑(化合物X)的單一藥劑及組合對增殖的作用。所有細胞株表現BRAFV600E蛋白。PI3Kα基因具有已知或推定之活化突變的細胞用(*)標記且PTEN缺失之細胞用(#)標記。在72小時cell titer gloTM分析中量測細胞增殖且所提供之所有結果為至少三次量測之結果。展示式(I)化合物及化合物X之單一藥劑IC50值。表6中針對各組合提供50%作用水準下之協同作用評分(SS)量測結果以及組合指數(CI50)。當SS值2.0且CI值0.5時認為相互作用為協同作用。當SS值2.0但CI值>0.5或SS值<2.0但CI值0.5時認為相互作用為加和作 用/協同作用。當SS值<2.0且CI值>0.5時相互作用稱為加和作用。協同作用指示在「作用描述」欄中提供。
實例4
此實例研究單一藥劑形式及組合形式之式(I)化合物及化合物F對活體內HT-29及RKO細胞株模型之生長的作用。該等抑制劑之濃度及給藥方案為每天一次50mg/kg(式(I)化合物)及每天一次32.7mg/kg(化合物F)。所有化合物在其為單一藥劑形式時組合給藥。在HT-29模型中在28天停止給藥且在21天後在RKO模型中停止給藥。結果分別報導於圖1及圖2中。
實例5
所有細胞株均購自ATTC(SK-MEL-5、SK-MEL-24、UACC-62、COLO 741、COLO-800、WM-266-4、C010205、LS411N、SW 1417)、ECACC(MDST8)、DSMZ(CL-34)及NCI(LOX IMVI)。根據供應商之建議，將細胞培養於補充有10%(或對於CL-34細胞為20%)FBS(GIBCO，目錄號10099-141)之RPMI1640(ATCC，目錄號30-2001)或DMEM(ATCC，目錄號30-2002)中。將細胞株培養於37℃及5% CO2培育箱中且在T-75燒瓶中擴增。在所有情形下，將細胞自冷凍儲 備液解凍，經由1代使用1：3稀釋度擴增，計數且使用ViCell計數器(Beckman-Coulter)評定存活率，隨後塗於96孔或6孔盤中。為使細胞株分裂且擴增，使用0.25%胰蛋白酶-EDTA(GIBCO，目錄號25200)自燒瓶取出細胞。如藉由在Idexx Radil(Columbia，MO，USA)執行之PCR偵測方法所測定，所有細胞株經測定均不含支原體污染，且藉由偵測一組SNP正確鑑別。
將式(I)化合物及化合物H以10mM之濃度溶解於100% DMSO(Cellgro，目錄號25-290-CQC)中且儲存在-20℃下直至使用。將化合物排列於2ml 96孔深盤(Greiner bio-one，目錄號780271)中，連續3倍稀釋七次，得到22nM至16200nM之濃度範圍。重組人類鹼性FGF購自R&D system(目錄號233-FB)且以50μg/ml在無菌PBS中復原。在所有實驗中其以固定濃度100ng/ml使用。
為進行CellTiter-GloTM分析，將細胞施配於組織培養液處理之96孔盤(Costar，目錄號3904)中，培養基之最終體積為80μL且密度為每孔3000個細胞。塗佈後12至24小時，將20μL各化合物連續稀釋液轉移至含有細胞之培養盤，藉由3倍稀釋產生2700nM至3.7nM之化合物濃度範圍且最終DMSO濃度為0.16%。各孔之總體積為120μL。培育培養盤72小時且使用CellTiter-GloTM發光細胞存活率分析(CTG，Promega)及VictorTM X4盤讀取器(Perkin Elmer)測定化合物對細胞增殖之作用。為進行即時生長分析，將細胞以每孔4000個細胞之密度接種於xCELLigence E-盤(Roche目錄號05232368001)中總共90μl之培養基中，且塗佈後24小時，向孔中添加11μl含有或不含化合物之培養基。除LGX818+FGF2處理之COLO 741細胞(N=1)外，用所有細胞株及處理組塗佈2-4個重複孔。其中化合物及生長因子之所示最終濃度對於化合物H為1μM，對於FGF2為100ng/ml且對於式(I)化合物為100nM(SK-MEL-5)或500nM(COLO 741)。用xCELLigence基於阻抗之即 時細胞分析儀每兩個小時連續監測細胞持續七天。使用電極在E-盤上量測阻抗，其中細胞之表面積覆蓋率愈高產生之電極阻抗愈大。電極阻抗以細胞指數值呈現，且用作細胞存活率及數目之指示。在所有情形下，將細胞指數值正規化為添加化合物後所緊鄰之時間點。
為進行西方分析(Western analysis)，將細胞以每孔5×105個細胞之密度塗佈於6孔(Costar，目錄號3506)盤中之2.0ml完全培養基中。塗佈後12至24小時，用各種化合物處理細胞，且在所有實驗中，式(I)化合物、化合物H及FGF2分別以100nM、1.0μM及100ng/ml之最終濃度使用。在新鮮製備之補充有磷酸酶(PhosStop，Roche目錄號04906845001)與蛋白酶抑制劑(Roche，目錄號11697498001)的細胞溶解緩衝液(Cell Signaling Technology目錄號9803)中添加化合物後2小時及24小時收穫細胞。藉由電泳經由NuPAGE4-12% Bis-Tis midi凝膠(Novex，目錄號WG1402BX10)自細胞溶解物分離蛋白質，轉移至硝化纖維素薄膜，隨後與來自Cell Signaling Technology(Danvers，MA，USA)之抗體一起培育，該等抗體可識別p-AKT(S473，目錄號4058)、總AKT(目錄號2920)、p-ERK1/2(T202/Y204，目錄號9101)、總ERK1/2(目錄號9107)、p-MEK1/2(S217/221，目錄號9121)及β-肌動蛋白(Ambion，目錄號AM4302)。與IRDye 680RD山羊抗兔IgG(Li-Cor，目錄號926-68071)及IRDye 800 CW山羊抗小鼠IgG(Li-Cor，目錄號926-32210)一起培育且用Odyssey紅外線成像系統(Li-Cor，Lincoln，NE，USA)掃描後設想西方墨點法(Western blot)。
為判定FGFR是否可援救用式(I)化合物處理之BRAFV600E突變黑色素瘤細胞株之子集，在十一株T1799突變BRAF細胞株中在FGFR活化之配體FGF2存在或不存在下檢查其抗增殖作用。在FGF2不存在下，六株黑色素瘤及五株CRC衍生細胞株中之IC50值分別在3.0至470nM及4.0至185nM範圍內(表7)。對於該六株細胞株所量測之IC50值不 受FGF2存在影響，然而，對於剩餘五株細胞株，對式(I)化合物之反應大大減少(例如CL-34)或完全消失(例如ls 411N)。由此，FGF2之存在能夠自式(I)之B-Raf抑制劑之抗增殖作用援救BRAFV600E黑色素瘤衍生細胞株組。此外，在來源於CRC腫瘤之BRAFV600E突變細胞株中亦觀察到類似作用。
一組BRAF T1799突變黑色素瘤及CRC細胞株中存在或不存在100ng/ml FGF2下之式(I)化合物之單一藥劑IC50值。突變型(mut)及野生型(wt)狀況由發佈之資料確定。除了在分別具有V600K及V600D之MDST8(mut*)及WM-266-4(mut**)情形下，所有BRAF突變均來自V600E取代。PTEN mut名稱表示PTEN基因的基於突變、基因複本數及mRNA表現資訊的概要說法。
為判定FGF2對BRAFV600E黑色素瘤細胞株之援救是否取決於FGFR信號傳導，檢查選擇性FGFR抑制劑化合物H是否可阻止FGF2介導之援救。在化合物H存在或不存在下，將由FGF2不同程度援救之兩株細胞株(COLO 741及SK-MEL-5，表8-1)培養於含有式(I)化合物及FGF2之培養基中且即時量測生長。
與之前IC50資料一致，式(I)化合物抑制兩種細胞株之生長且此生長抑制藉由添加FGF2去除(圖3)。作為單一藥劑，化合物H不影響 任一細胞株(A組，對於SK-MEL-5未展示)之增殖且在FGF2不存在下與式(I)化合物組合時不會有助於其單一藥劑活性。在FGF2存在下與式(I)化合物組合時，化合物H恢復抗增殖作用至在FGF2不存在下所觀察到之水準。此等結果表明FGF2介導之援救可經由添加選擇性FGFR抑制劑化合物H阻止。
為研究恢復之MAPK或活化之PIK3C信號傳導是否可支持FGF2介導之援救，經由西方墨點分析磷酸化之MEK1/2(MAP2K1/2)、ERK1/2(MAPK1/2)及AKT1/2/3來檢查FGF2對MAPK及PIK3C信號傳導之作用。如圖4所示，將COLO 741及SK-MEL-5細胞與式(I)化合物一起培育在化合物添加後2小時與24小時均可顯著抑制MAPK信號傳導，其可由磷酸化MEK與ERK之水準下降判定。在COLO 741細胞中，在2小時時，AKT之磷酸化水準不受影響，但在24小時時展示略微下降。相比之下，FGF2與化合物H在以單一藥劑形式添加時均不影響2小時或24小時之信號傳導。在組合FGF2與式(I)化合物時，相對於單獨式(I)化合物，在處理後兩小時觀察到信號傳導之最小變化(但在SK-MEL-5細胞中觀察到p-ERK略微增加)，但直至24小時，磷酸化MEK與ERK之水準已大體上但非完全恢復。最後，向式(I)化合物/FGF2組合添加化合物H完全去除FGF2誘導之MAPK及PIK3C信號傳導變化。此等資料強烈表示由FGF2抑制B-Raf抑制劑之抗增殖作用係由於MAPK信號傳導之再活化，且表明化合物H能夠完全抑制此等FGF2誘導之信號傳導變化。
實例6
目的：評估式(I)化合物與CDK 4抑制劑化合物C之組合在HMEX1906原發性黑色素瘤模型中之功效，該HMEX1906原發性黑色素瘤模型在5mg/kg式(I)化合物存在下生長且耐受5mg/kg式(I)化合物(HMEX1906-R5)。
藥物調配：在0.5% MC/0.5% Tween80中調配化合物C且在20% PEG300/3% ETPGS中調配式(I)化合物。
將腫瘤剁/切成細胞株樣懸浮液(腫瘤均質化)。添加7mL基質膠及1.5mL HBSS。在手掌中溫熱懸浮液直至基質膠變稠且用18G針皮下植入雌性裸鼠右側腹。
植入後18天將小鼠分配至下組中，其中平均腫瘤體積為266mm3且平均體重為25公克。
組：10隻小鼠/組，途徑經口，給藥體積0.2mL
組1：媒劑，0mg/kg，每天兩次×14
組2：化合物C，250mg/kg，每天一次×21
組3：式(I)化合物，5mg/kg，每天兩次×21
組4：化合物C，250mg/kg，每天一次×21+式(I)化合物，5mg/kg，每天兩次×21
結果：

Claims (15)

  1. 一種組合之用途，其係用於製造用以治療罹患特徵為B-Raf突變、尤其B-Raf之V600突變之增生性疾病、極尤其特徵為B-Raf之V600突變的黑色素瘤的患者的藥物，其中自該患者獲得腫瘤樣品且測試選自包含BRAF、CRAF、CCND1、CDK4、HER2、IGF-1R、cMET、FGFR1、FGFR2、FGFR3 EGFR、MAP2K1、MAP2K2、NRAS、KRAS HRAS、PTEN、PIK3CA及P16之群的基因的遺傳變化，且其中該組合包含B-Raf抑制劑及第二抑制劑，該第二抑制劑基於該腫瘤樣品中所發現之遺傳變化選擇，其中，(i)當該腫瘤樣品之BRAF、CRAF、MAP2K1、MAPK2、NRAS、KRAS HRAS或EGFR具有遺傳變化時，該第二抑制劑為Mek 1/2抑制劑，或(ii)當該腫瘤樣品之CCND1、CDK4或P16具有遺傳變化時，該第二抑制劑為CDK 4抑制劑，或(iii)當該腫瘤樣品之HER2、IGF-1R、PTEN或PIK3CA具有遺傳變化時，該第二抑制劑為PI3激酶抑制劑，或(iv)當該腫瘤樣品之cMET具有遺傳變化時，該第二抑制劑為c-Met受體酪胺酸激酶抑制劑，(v)當該腫瘤樣品之FGFR1、FGFR2或FGFR3具有遺傳變化時，該第二抑制劑為FGFR激酶抑制劑。
  2. 如請求項1之用途，其中該B-Raf抑制劑為式(I)化合物
  3. 如請求項1及2中任一項之用途，其中自該患者獲得腫瘤樣品且偵測BRAF、CRAF、MAP2K1、MAPK2、NRAS、KRAS HRAS或EGFR之遺傳變化，及其中該組合包含該B-Raf抑制劑及第二抑制劑，該第二抑制劑為Mek 1/2抑制劑化合物B。
  4. 如請求項1及2中任一項之用途，其中自該患者獲得腫瘤樣品且偵測CCND1、CDK4或P16之遺傳變化，及其中該組合包含該B-Raf抑制劑及第二抑制劑，該第二抑制劑為CDK 4抑制劑。
  5. 如請求項1及2中任一項之用途，其中在疾病進展後自該患者獲得腫瘤樣品且偵測HER2、IGF-1R、PTEN或PIK3CA之遺傳變化，及其中該藥物組合包含該B-Raf抑制劑及第二抑制劑，該第二抑制劑為PI3激酶抑制劑。
  6. 如請求項1及2中任一項之用途，其中自該患者獲得腫瘤樣品且偵測cMET之遺傳變化，及其中該藥物組合包含該B-Raf抑制劑及第二抑制劑，該第二抑制劑為c-Met受體酪胺酸激酶抑制劑。
  7. 如請求項1及2中任一項之用途， 其中自該患者獲得腫瘤樣品且偵測FGFR1、FGFR2或FGFR3之遺傳變化，及其中該藥物組合包含該B-Raf抑制劑及第二抑制劑，該第二抑制劑為FGFR激酶抑制劑。
  8. 一種治療組合，其包含式(I)之B-Raf抑制劑及第二抑制劑化合物F或其醫藥學上可接受之鹽以分別、同時或連續投與。
  9. 一種治療組合，其包含式(I)之B-Raf抑制劑及第二抑制劑化合物G或其醫藥學上可接受之鹽以分別、同時或連續投與。
  10. 一種治療組合，其包含式(I)之B-Raf抑制劑及第二抑制劑化合物H或其醫藥學上可接受之鹽以分別、同時或連續投與。
  11. 一種治療罹患特徵為B-Raf之V600突變的增生性疾病的患者的方法，其包含投與該患者治療有效量之如請求項8、9或10中任一項之組合。
  12. 一種如請求項8、9或10中任一項之組合的用途，其係用於製備用以治療或預防增生性疾病之醫藥組合物或藥物。
  13. 一種用於選擇欲與B-Raf抑制劑組合之第二抑制劑的診斷方法，其中測試腫瘤樣品之包含B-Raf、C-Raf、CCND1、CDK4、HER2、IGF-1R、cMET、FGFR1、FGFR2、FGFR3 EGFR、MAP2K1、MAP2K2、NRAS、KRAS HRAS、PTEN、PIK3CA及P16之一組基因的遺傳變化。
  14. 一種診斷套組，其係用於偵測包含B-Raf、C-Raf、CCND1、CDK4、HER2、IGF-1R、cMET、FGFR1、FGFR2、FGFR3 EGFR、MAP2K1、MAP2K2、NRAS、KRAS HRAS、PTEN、PIK3CA及P16之一組基因的遺傳變化。
  15. 如請求項1至7及11中任一項之用途，其中該增生性疾病為特徵為B-Raf之V600突變的黑色素瘤。
TW103110598A 2013-03-21 2014-03-20 組合療法 TWI603734B (zh)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201361804056P 2013-03-21 2013-03-21

Publications (2)

Publication Number Publication Date
TW201440770A true TW201440770A (zh) 2014-11-01
TWI603734B TWI603734B (zh) 2017-11-01

Family

ID=50439443

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
TW103110598A TWI603734B (zh) 2013-03-21 2014-03-20 組合療法

Country Status (34)

Country Link
US (3) US9913844B2 (zh)
EP (1) EP2976106B1 (zh)
JP (2) JP6449234B2 (zh)
KR (2) KR102446839B1 (zh)
CN (2) CN105209073A (zh)
AR (1) AR095699A1 (zh)
AU (1) AU2014233805B2 (zh)
BR (1) BR112015023483B8 (zh)
CA (1) CA2907704C (zh)
CL (2) CL2015002807A1 (zh)
CY (1) CY1124776T1 (zh)
DK (1) DK2976106T3 (zh)
EA (1) EA201591842A1 (zh)
ES (1) ES2870716T3 (zh)
GT (1) GT201500249A (zh)
HK (1) HK1214135A1 (zh)
HU (1) HUE055072T2 (zh)
IL (2) IL241188B (zh)
JO (1) JOP20140128B1 (zh)
MA (2) MA38522A1 (zh)
MX (1) MX2015013466A (zh)
MY (1) MY181085A (zh)
NZ (1) NZ712184A (zh)
PE (1) PE20151785A1 (zh)
PH (1) PH12015502040B1 (zh)
PL (1) PL2976106T3 (zh)
PT (1) PT2976106T (zh)
SG (2) SG11201507730UA (zh)
SI (1) SI2976106T1 (zh)
TN (1) TN2015000389A1 (zh)
TW (1) TWI603734B (zh)
UA (1) UA118846C2 (zh)
WO (1) WO2014147573A2 (zh)
ZA (1) ZA201800424B (zh)

Families Citing this family (17)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
MA38522A1 (fr) 2013-03-21 2017-10-31 Novartis Ag Thérapie de combinaison comprenant un inhibiteur de b-raf et un second inhibiteur.
WO2015191996A1 (en) * 2014-06-13 2015-12-17 Genentech, Inc. Methods of treating and preventing cancer drug resistance
CN105753869B (zh) * 2015-04-01 2018-09-25 苏州晶云药物科技有限公司 一种cdk抑制剂和mek抑制剂的共晶及其制备方法
BR112017021283A2 (pt) * 2015-04-16 2018-06-26 Novartis Ag comprimido de ribociclib
EP3297630A1 (en) * 2015-05-22 2018-03-28 Plexxikon Inc. Plx-8394 or plx-7904 for use in the treatment of braf-v600-related diseases
CN105732642B (zh) * 2015-11-18 2018-09-25 苏州晶云药物科技有限公司 一种cdk抑制剂和mek抑制剂的共晶及其制备方法
US11433059B2 (en) * 2016-02-19 2022-09-06 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) BYL719 (alpelisib) for use in the treatment of PIK3CA-related overgrowth spectrum (pros-CLOVES syndrome)
KR102439911B1 (ko) 2016-06-03 2022-09-05 어레이 바이오파마 인크. 제약학적 복합제제
CN107058565A (zh) * 2016-08-31 2017-08-18 郭军 肢端型黑色素瘤的诊断和治疗
JP7114575B2 (ja) * 2016-09-19 2022-08-08 ノバルティス アーゲー Ｒａｆ阻害剤及びｅｒｋ阻害剤を含む治療用組合せ
US20200087732A1 (en) 2016-12-20 2020-03-19 Eth Zurich Identification of drugs targeting non-genetic drug tolerance programs in cancer
AU2018269982A1 (en) * 2017-05-16 2020-01-02 Biomed Valley Discoveries, Inc. Compositions and methods for treating cancer with atypical BRAF mutations
WO2018218633A1 (en) * 2017-06-02 2018-12-06 Beijing Percans Oncology Co. Ltd. Combination therapies for treating cancers
WO2019195959A1 (en) 2018-04-08 2019-10-17 Cothera Biosciences, Inc. Combination therapy for cancers with braf mutation
WO2023212071A1 (en) * 2022-04-26 2023-11-02 Beigene Switzerland Gmbh Combination and the use thereof
WO2023230554A1 (en) 2022-05-25 2023-11-30 Pfizer Inc. Combination of a braf inhibitor, an egfr inhibitor, and a pd-1 antagonist for the treatment of braf v600e-mutant, msi-h/dmmr colorectal cancer
WO2023240178A1 (en) * 2022-06-08 2023-12-14 Mapkure, Llc Methods of treating cancer with a b-raf inhibitor

Family Cites Families (27)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US7235537B2 (en) 2002-03-13 2007-06-26 Array Biopharma, Inc. N3 alkylated benzimidazole derivatives as MEK inhibitors
CA2478534A1 (en) 2002-03-13 2003-09-25 Array Biopharma, Inc. N3 alkylated benzimidazole derivatives as mek inhibitors
AU2003218157C1 (en) * 2002-03-13 2011-11-24 Array Biopharma, Inc N3 alkylated benzimidazole derivatives as mek inhibitors
US7144907B2 (en) 2003-09-03 2006-12-05 Array Biopharma Inc. Heterocyclic inhibitors of MEK and methods of use thereof
ES2369835T3 (es) 2003-11-19 2011-12-07 Array Biopharma, Inc. Inhibidores bicíclicos de mek y métodos de síntesis de los mismos.
GB0512324D0 (en) 2005-06-16 2005-07-27 Novartis Ag Organic compounds
US20060134068A1 (en) 2004-11-09 2006-06-22 Mount Sinai School Of Medicine Of New York University Treatment of cancer by simultaneous inhibiton of BRAF and restoration or mimicry of p16INK4A activity
GB0510390D0 (en) 2005-05-20 2005-06-29 Novartis Ag Organic compounds
PE20070335A1 (es) 2005-08-30 2007-04-21 Novartis Ag Benzimidazoles sustituidos y metodos para su preparacion
JO2660B1 (en) 2006-01-20 2012-06-17 نوفارتيس ايه جي Pi-3 inhibitors and methods of use
TWI398252B (zh) 2006-05-26 2013-06-11 Novartis Ag 吡咯并嘧啶化合物及其用途
AU2007323820B2 (en) * 2006-11-20 2012-02-23 Novartis Ag Salts and crystal forms of 2-methyl-2-[4-(3-methyl-2-oxo-8-quinolin-3-yl-2,3-dihydro-imidazo[4,5-c]quinolin-1-yl)-phenyl] -propionitrile
HUE034716T2 (hu) 2008-05-21 2018-02-28 Incyte Holdings Corp 2-Fluor-N-metil-4-[7-(kinolin-6-il-metil)-imidazo[1,2-b][1,2,4]triazin-2-il]benzamid sói és eljárások ezek elõállítására
EP2716643A1 (en) 2008-08-22 2014-04-09 Novartis AG Pyrrolopyrimidine compounds and their uses
UA104147C2 (uk) * 2008-09-10 2014-01-10 Новартис Аг Похідна піролідиндикарбонової кислоти та її застосування у лікуванні проліферативних захворювань
JO3002B1 (ar) * 2009-08-28 2016-09-05 Irm Llc مركبات و تركيبات كمثبطات كيناز بروتين
EP2488184A4 (en) 2009-10-12 2013-04-24 Glaxosmithkline Llc COMBINATION
TWI480276B (zh) * 2010-08-27 2015-04-11 Irm Llc 作為蛋白質激酶抑制劑之化合物及組合物
WO2012068468A1 (en) * 2010-11-19 2012-05-24 Glaxosmithkline Llc Method of treatment with braf inhibitor
US20130004481A1 (en) * 2011-01-12 2013-01-03 Boehringer Ingelheim International Gmbh Anticancer therapy
WO2012145503A1 (en) * 2011-04-21 2012-10-26 Novartis Ag Pharmaceutical combinations
WO2012178038A1 (en) 2011-06-24 2012-12-27 The Broad Institute, Inc. Methods of treating cancer
EP2570127A1 (en) 2011-09-16 2013-03-20 Sanofi Compositions and methods for treating cancer using PI3KB beta inhibitor and MAPK pathway inhibitor, including MEK and RAF inhibitors
RU2014114617A (ru) 2011-09-19 2015-10-27 Дженентек, Инк. Комбинированные виды лечения, содержащие антагонисты с-мет и антагонисты b-raf
AR091876A1 (es) * 2012-07-26 2015-03-04 Novartis Ag Combinaciones farmaceuticas para el tratamiento de enfermedades proliferativas
EA028420B1 (ru) 2012-08-07 2017-11-30 Новартис Аг Фармацевтические комбинации, содержащие ингибитор b-raf, ингибитор egfr и, необязательно, ингибитор pi3k-альфа
MA38522A1 (fr) 2013-03-21 2017-10-31 Novartis Ag Thérapie de combinaison comprenant un inhibiteur de b-raf et un second inhibiteur.

Also Published As

Publication number Publication date
BR112015023483A2 (pt) 2017-07-18
BR112015023483B8 (pt) 2023-01-31
IL241188A0 (en) 2015-11-30
CA2907704A1 (en) 2014-09-25
WO2014147573A3 (en) 2014-12-11
TN2015000389A1 (en) 2017-01-03
IL272921A (en) 2020-04-30
CY1124776T1 (el) 2022-11-25
IL272921B (en) 2022-10-01
ES2870716T3 (es) 2021-10-27
SG11201507730UA (en) 2015-10-29
JOP20140128B1 (ar) 2021-08-17
EP2976106B1 (en) 2021-04-14
MA38522A1 (fr) 2017-10-31
KR20150132205A (ko) 2015-11-25
CN105209073A (zh) 2015-12-30
JP2016522160A (ja) 2016-07-28
MX2015013466A (es) 2016-06-21
PT2976106T (pt) 2021-05-26
GT201500249A (es) 2017-09-01
US10548894B2 (en) 2020-02-04
IL241188B (en) 2021-02-28
AU2014233805B2 (en) 2018-10-18
TWI603734B (zh) 2017-11-01
US20160296520A1 (en) 2016-10-13
BR112015023483B1 (pt) 2022-07-19
US9913844B2 (en) 2018-03-13
NZ712184A (en) 2020-01-31
MA44934A1 (fr) 2020-01-31
EP2976106A2 (en) 2016-01-27
PE20151785A1 (es) 2015-12-20
KR20210110794A (ko) 2021-09-09
SI2976106T1 (sl) 2021-08-31
HK1214135A1 (zh) 2016-07-22
SG10201906270VA (en) 2019-08-27
NZ751830A (en) 2020-09-25
AU2014233805A1 (en) 2015-10-01
JP6449234B2 (ja) 2019-01-09
CA2907704C (en) 2023-01-10
PL2976106T3 (pl) 2021-10-25
BR112015023483A8 (pt) 2019-12-03
CL2015002807A1 (es) 2016-05-13
ZA201800424B (en) 2022-10-26
KR102258698B1 (ko) 2021-06-01
AR095699A1 (es) 2015-11-04
KR102446839B1 (ko) 2022-09-23
HUE055072T2 (hu) 2021-10-28
WO2014147573A2 (en) 2014-09-25
MY181085A (en) 2020-12-17
US20200246338A1 (en) 2020-08-06
JP6742391B2 (ja) 2020-08-19
CN112641787A (zh) 2021-04-13
PH12015502040A1 (en) 2016-01-18
EA201591842A1 (ru) 2016-01-29
CL2018001371A1 (es) 2018-09-07
UA118846C2 (uk) 2019-03-25
DK2976106T3 (da) 2021-06-14
MA44934B1 (fr) 2021-11-30
JP2019055978A (ja) 2019-04-11
IL272921B2 (en) 2023-02-01
PH12015502040B1 (en) 2016-01-18
US20180221370A1 (en) 2018-08-09

Similar Documents

Publication Publication Date Title
TWI603734B (zh) 組合療法
JP6974669B2 (ja) Ｂ−Ｒａｆ阻害薬、ＥＧＦＲ阻害薬及び場合によってはＰＩ３Ｋ−α阻害薬を含む組合せ医薬
RU2745678C2 (ru) Способы лечения рака
US20140024030A1 (en) Preselection of subjects for therapeutic treatment with oxygen sensitive agents based in hypoxic status
CA3158321A1 (en) Therapeutic combinations of acalabrutinib and capivasertib to treat b-cell malignancies
TW202140029A (zh) 用於治療ｂｒａｆ突變型ｎｓｃｌｃ的包含ｒａｆ抑制劑之治療組合
EA040191B1 (ru) Комбинированная терапия
NZ751830B2 (en) Combination therapy comprising a b-raf inhibitor and a second inhibitor
KR20240044419A (ko) Erk1/2 및 egfr 억제제 조합 요법
TW202110447A (zh) 降低阿帕替尼臨床毒性的方法
TW202317123A (zh) Erk1/2及cdk4/6抑制劑之組合療法