TW200300764A - Carrier for synthesis and method for preparing biological polymer - Google Patents
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Description
200300764 (發明說明應敘明：發明所屬之技術領域、先前技術、内容、實施方式及圖式簡單說明） 本發明係關於一種載體，其係用以合成有機聚合物，尤指具 有一基質之生物性聚合物，在其表面上合成該生物性聚合物，並 且具有一能量源用以有標的地活化基質部份區域，其中該生物性 聚合物係於該基質之活化部份區域處合成。該載體在醫療上，尤 其是在診斷或治療儀器上係作為感應_晶片使用。此外，本發明係 關於一種用以製備生物性聚合物之方法，於其中係使用到該載體。 生物系統係以具生物活性之大分子之交互作用為基礎。該等 父互作用之前提為大分子之活性，其由其空間結構決定。因此， 研究複雜之生物系統時，說明大分子空間結構與活性間之關係係 非苇重要。說明生物之交互作用可明暸細胞在細胞群體中如何彼 此溝通、酵素如何與其受酶質結合並且加以轉化、以及細胞之調 控機制如何運作，但卻於癌症形成時被阻斷。許多生物性大分子 可透過其二次元之表面結構以及一種特殊之電荷分佈，與其他分 子…5並且與其夂互作用。所有具有該特性之分子皆概括稱為受 te。3知<文體範例有酵素，其催化一新陳代謝中間產物之水解 =用忠白貝，其使帶有電荷之分子能夠穿越細胞膜而運送、醣 蛋白、，其使與其他細胞接觸成為可能、抗體，其在血液中循環，。 並且追蹤細菌或病毒之組成成份，然後與之結合並使之失去活 性:或DNA，其為遺傳訊息之載體，於其周邊有—連串特定之蛋 白質與之結合，而且可使其於細胞岐現其生物功能。能夠特定 結合受體Ο子皆概括稱為配合基，其中許多生物性分子一方面 產生活性之結合，另_古；么& 合基亦為受體。 卩也u分子結合，因此其既為配 許多驗證系統(試驗)係發展用以研究受體與配合基間之交互 (發明說明頁不敷使用時，請註記並使用續頁） 200300764 作用’找出其結合之親和性以及說明結合之強度及特定性。巧單 之生物性試驗仍於今天使祕醫學之檢驗上，其將細菌或病^之 抗原性斷片固定於固體表面上。接著將一病患待驗之(血液)樣本滴 至其上，由(血液)樣本中之特定性抗體與該抗原性斷片間之交互作 用可由一驗證系統加以偵測。該類抗原_抗體_驗證法仍然透過固 定於物體載體上之抗原斷片之數目而大受限制。 奇重要之模型用及研旯用之微生物，如細菌(枯草桿菌、大腸 桿菌）以及酵母菌(啤酒酵母菌、Schizosacchar〇myces p〇mbe)之完整 遺傳基目DNA序舰年紅存在於資料庫之後，*久前於人類遺 傳基因研究計畫範圍内之人類遺傳基因定序工作能夠完成。各個 活躍於各種組織及器官中之基因功能之研究，從那時起所獲得之 重要性與日倶增。瞭解癌症形成之關键在於說明基因表現之差 別。現今已習知有些個體基於特定基因類型，而具有發生癌症之 高危險性。雖然數年來多方嘗試在最小空間上，以人工方式合成 出儘可能龐大數量之DNA序列，以便研究有關其與其他分子之交 互作用，然而可供使用之位置與可能之DNA分子數目之比例，始 終為一尚未完全解決之問題。 傳統之方法係根據自動化之固定相方法，藉由加入活化之單 體於一條連接於一非溶性基質上之增長中鏈條，來合成DNA之雙 股(DNA-排列）。該類人工之生物性系統係稱為DNA晶片。在製造 DNA晶片時，首先將構成DNA-排列之單體(核苷酸），以微劑量加 至應該被合成之寡核苷酸之位置上。由於該等方法實際上非常費 時，因此其藉由用以製備高密度DNA晶片之光操控卜光石印術 photolithographische)合成法來解決，其至今仍為最常利用之方法。 藉由光操控方式合成DNA晶片時，例如其於半導體工業中所 續次頁（發明說明頁不敷使用時，請註記並使用續頁） 200300764 習知之個別模罩組，係使用於選擇性曝光。在此，一固體載體之 表面藉由對光敏感(=對光不穩定)之保護基修飾，然後透過一塊置 於其上之光石印術之模罩曝光。該曝光造成受曝光位置之保護基 選擇性地被移除，因此反應之氫氣基(OH-基)完全於受曝光區域顯 露出來。接著加入活化之去氧核苷酸，其在該方面具有一具保護 基之OH-基，使得該去氧核苷酸連結至之前曝光過之位置上。在 氧化反應後沖洗該載體，且該表面係藉由第二模罩照明，因此移 除掉其他位置上之保護基，並因重新連結而活化。隨後再次添加 具有去氧核苷酸之第二受保護之氫氧基。該由曝光至移除之保護 基、以及連結去氧核苷酸之循環，係持續進行至所期望之寡核苷酸 於该固體載體上產生為止。藉由該方式可產生高密度之DNA-排列 (Pease，et al”（1994)，PNAS，USA，Vol· 91，S· 5022, 5026)。 同樣地，在歐洲專利案ΕΡ 476 014 Β1中係描述一種用以製備 永合物資料庫於一固體載體上之方法，其同樣使用對光不穩定之 保遵基，以及其藉由相關曝光技術之分解作用。對於每一種單體 鹼基’（去氧-)腺嘌呤、（去氧_)細胞嘧啶、（去氧_)鳥糞嘌呤以及(去 氧-)胸腺嘧啶，則必須具備有不同之光石印術之模罩，以使所需之 不同模罩之數目達到所欲合成之DNA-序列之四倍長度。與人工 DNA_序列合成相比較’以模罩為依據之胜肽合成更加費時，因 為有20楂天然之氨基酸提供胜肽組成，因此模罩之數目為胜肽 =度之20倍。所需之模罩組不僅必須在合成反應開始之前製作完 王，甚至其必須在每次曝光時非常準確地校正，以避免錯誤曝光 而造成>可染。雖然由美國專利案us 5, 143, 854中習知一種光源， 其可使物體載體移動，但由於技術上十分#時，該模罩方法始終 不通用於尤其是小系列之製造，因為每次新的合成必須製備一套 0續次頁（發明說明頁不敷使用時，請註記並使用續頁) 200300764 全新之模罩組。 發展出免用模罩之系統係為避免模罩製作之昂貴及費時。由 ，利案WO 99/42813中習知，組成如DNA-排列或胜肽之生物性 聚合物，其中其係藉由個別可操控之微小鏡子而曝光。該微小鏡 子开/成彼此相關連之區域，其由電力操控之各個微小鏡子所組 成(數位鏡子裝置）。一共同之光源係歸入該微小鏡子區域。該位於 物體載體上之生物性聚合物係以特定型式加以活化，在此每種所 &供之單體(例如四種不同之鹼基)連結至於所要到達之區域上。該 過私係持續進行，直至所有所期望之長度之生物性聚合物被組成 出來。 、所这之曝光方法係使用具有先加上保護基之反應基之單體組 成元件，以便能作一定位之合成反應。光線之作用在於移除單體 、、且成元件上對光不穩定之保護基，以便接下來在光作用之位置上 發生合成反應。例如由德國專利案DE4444 9% A1中習知對光不 %足之保護基，其描述核苷酸-衍生物在鹼基之糖部份中之5，_〇h_ 5此基上，具有對光不穩定之保護基。在產生一反應之〇H_基後， 在接下來之反應步驟中，下一個單體可連結至該反應基上。依此 方式便可藉由賴基之交魏彳诗除，以及藉由連結反應來組成 任何一種聚合物。 在德國專利案DE 199 62 803 A1中係描述一種方法，在使用 平面載體時，許多不同空間上彼此分隔之聚合物係同時合成。在 此，數個發光二極管(二極管列陣)係使用為選擇性曝光。該方法係 利用電力操控之發光二極管來選擇性地移除保護基，因此雖然沒 有昂貴之模罩亦可敷使用。用來合成生物性聚合物之單體，係位 在於一透光區域下方之裝置中。在該裝置中可以個別且連續提供 二d續次頁（發明說明頁不敷使用時，請註記並使用續頁） 執行合成反應所需之化學藥劑。藉由一適當程式之電腦操控，將 二極管列陣中之各個發光二極管與連續及循環供應之各種單體連 結。為隔絕曝光期間之外在干擾影響，化學合成反應與曝光裝置 之位置在空間上係彼此嚴格相隔。因此，本方法亦如同模罩技術 以及借助於微小鏡子區域之曝光一般，基於合成與曝光間之空間 間隔，特別是曝光不清晰之下。在合成反應結束後，晶片上係不 存在真正不連續之區域，而是在二個或數個明確產物之間形成過 渡區域。孩不清晰之過渡區域在此係特別藉由光線之折射作用於 模罩上，以及由圖像複製不清晰所造成。 因此，本發明之任務係提供一載體以合成生物性聚合物，其 可避免掉光線之折射作用與複製圖像時之不清晰，並且可選出在 该載體上先七明確之範圍，隨後在其上進行生物性聚合物之合 成。應該要避免因缺少、附加或邊緣曝光而產生之非特定性過渡 區域。 該任務係根據本發明藉由一用以合成生物性聚合物之載體而 達成，其具有一基負，於其表面合成生物性聚合物，以及具有一 有標的性活化基質部份區域之能量源，在此該生物性聚合物在被 活化之基質部份區域表面上合成，而且該基質與該能量源係結合 成一體。由於基質與能量源結合成一體，可有效地防止光線 射以及折射作用。如此，生物性聚合物諸如寡核苷酸或胜肤之陣 列可於該載體之整個表面上合成。位於二種或數種明確產物間之 干擾性過渡區域之完全消失，使得可發現因曝光不良而造成之 “錯誤”之生物性聚合物之特殊對照品消失。根據該方式，在相 同之面積上係可以在該載體上合成出更多數量之生物性聚合物。 本發明接下來之標的係關於一種感應_晶片 ，以及一種在醫療 續次頁（發明說明頁不敷使用時，請註記並使用續頁） 200300764 3疋在診斷上或治療上之儀器，其包含該載體。 此#^’本發明㈣於·以合成生物性聚合物之方法，在 關於夢本發明H根據本發明之方法之其他步驟，係 部份績在敎部健域巾之保縣而有標的性地活化基質 i單二結ί物性單體之供應於其方面具有保護基，並且將生物 〜w的性活化基質部份區域整合。藉由在該 有標的性活化基質部份區域之能量係 比根據本發明《載體及^法，任何—種複製圖像光學方法 二 ==崎物之製備只需耗費較少之合成技術，且 :!·生：庐ί:"質重大改善’因為個別之生物性聚合物間之非特 疋性過渡區域，可避免合成最終產物之㈣。因此，生 物之陣列可以迅速、單獨且有彈性地製造。此外，—^ =及選擇性之合成生物性聚合物，可能在㈣上及時間上都^ 在下文中定狀概念，錢用於本發明之朗及料描述中。 1·配合基 配合基為-種分子，其藉由—狀之受體而得知。配 以存在於自然界中或由人工方式製成。配合基係例如 體之作用顯拮錢、毒素、病毒性及細錄Μ決二 (Eptitope)、賀爾蒙(〇ptiate、固醇類等）、胜肽、酵素 : 質、辅助因子、藥物、糖分子、㈣脂、寡酸、核酸、素^酶 蛋白質、胜肽以及脂肪。 人 暴酿、 續次頁（發明說明頁不敷使用時，請註記並使用續頁） 200300764 2·受體 文體為一種對一特定配合基有結合親和性之分子。受體可以 存在於自然界中或由人工方式製成。其同樣也可以其自然狀態或 以具有其他分子之聚集物形式存在。受體係麵或間接藉由特定 性結合物質或結合分子，以共價或非共狀方讀配合基結合。 受體係例如有抗體，尤其是單株及多株抗體、抗血清、細胞膜受 體、多核苷酸、核酸、辅助因子、卵磷脂、糖分子、多醣、細胞、 細胞膜以及器官。受體與其相應之配合基係藉由其分子之辨識形 成一“配合基-受體-複合體”。 y
3·有機 有機聚合物係由小型有機化合物（單體)經由本身或與其他小 型有機化合物之反應，藉由聚合作用之反應過程形成，在此所生 成之產物(聚合物）即為一具高相對分子量之化合物。有機聚合物係 例如缔類聚合物，如聚乙晞(P〇lyethylen)、聚丙烯(ρ〇1邓⑺^丨如卜 或改過之聚合物，如聚氯乙烯（p〇lyvinyk上1〇灿）、鐵氟龍 (Teflon)、聚苯乙烯(p〇lystyr〇1)、以及聚醯胺類(尼龍Nyi〇n)。
4.生物性簟^ 、生物性單體為一種個別之組成元件或一套或一組個別之小型 組成兀件，在其方面可彼此連接，並藉此形成一生物性聚合物。 生物性單體例如有二十種自然界存在之L_氨基酸、D_氨基酸、人 工合成之氨基酸、核苷酸、核苷（Nukle〇side)、糖分子如五碳糖或 穴碳糖、以及短鏈胜肽如四合體（Tetram㈣或五合體 (Pentamere)。生物性單體，如同在本發明範圍内所使用，係指所 ；3績次1 (發明說明頁不敷使用時，請註記並使用續頁） 13 200300764 有組成元件，其係使用於合成一生物性聚合物。倘若於組成一蛋 白質為生物性聚合物，非使用個別之氨基酸，而使用如四合體、 五合體或六合體之短胜肽鏈時，該由四個、五個或六個氨基酸所 組成之組成元件亦同樣稱為生物性單體。 5. 生物性聚.合物 生物性聚合物為任何一種由生物性單體合成之產物，與其長 度及其個別組成部份無關。若是使用三種不同之氨基酸作為生物 性單體時，則所得到之三合體.即稱為生物性聚合物。一種生物性 聚合物可由相同或彼此不同之生物性單體组成。 6. 保謨某 任何一種物質，其與一種單體結合並使用作為其修改，係稱 為保濩基。該保護基可以藉由一能量源之作用，例如曝光而選擇 性地分解。藉由保護基之分解，一反應力基例如一氫氧基係顯露 出末。保濩基係例如硝基藜蘆氧基羰基-(Nitr〇Veratry】〇Xy_ carbonyl十硝基桊甲氧基羰基_(沖、二甲基 一甲氧基丰甲醯氧基羰基-(Ditnethyldimethoxybenzoyloxy-carbony1士 溴 硝基氮帶滿基 (5_Bro〗no-7-nitroindo 氧基I甲基肉桂醯基-(Hydroxy，a-methylcinnamo-yl-)、2-氧亞曱基 恩酉此（2-Oxymetliylenantrachinon-)、以及p-硝基苯基乙氧基羰 基-(p-Nitr〇phenykthoxycarbonyl-)。. 7· 或衍生物 所瞭解之類似物或衍生物為所有存在於自然界中以及人工方 [3續次頁（發明說明頁不敷使用時，請註記並使用續頁）. 14 200300764 式合成之生物性單體及生物性聚合物之變化。習知之核酸類似物 例如有PNA或LNA。 下文係敘述根據本發明之載體及方法之有利之安排。 由聚合物層構成之三次元基質(3D-基質)係使用作為基質，以 有效合成生物性聚合物。其可使用非連結型或連結型之聚合物， 其特別適用於一種交又連結程度少之交又連結聚合物。適之 聚合物層具有許多個別之聚合物鏈，其與—固體表面相連^。在 遠聚合物鏈與該固體表面之間較偏好一共價性結合。除了直線型 聚合物鏈以外，亦可以使用分叉之聚合物。由於三次元聚合物層 之表面積很大^可隨意形成多處位置，且在其上開始合成生物性 聚合物。適合作為組成3D-基質之聚合物之範例，此外亦可由歐洲 專利案EP 1 035 218 A1中得知。 如果一聚合物薄層作為基質使用時，其特別具有一為3〇至 3000 nm之強度或厚度，而該生物性聚合物之合成係不受三次元聚 合物層之影響。當至少一種於部份區域中可膨脹之聚合物層作為 基質使用時，其係證明特別有用。在水中之可膨脹性可藉由成份 如丙晞酸(AcrylsSure)、曱基丙晞酸(MethacrylsSure)、二甲基丙烯 醯胺(Dimethylacrylamid)或乙烯基毗咯烷酮(vinylpyrrilid〇n)擔 保。該聚合物層於其膨脹狀態特別具有一為50至5〇〇nm之強度。 該三次元之聚合物層此外還具有反應啟動基。該反應啟動基 較偏好為氫氧基(OH·基），其直接與該三次元之聚合物層相連接。 此外，該反應啟動基亦可以藉由其他官能基，尤其是低分子化學 化合物與該聚合物層相連接。聚合物層與反應啟動基間特別適合 以共價鍵結合，其保證反應啟動基能持續固定其上。 該反應啟動基係藉由保護基保護。當保護基與啟動基結合 續次頁（發明說明頁不敷使用時，請註記並使用續頁） 15 200300764 時’其係為惰性。其先經過保罐其八 μ ；· „?r ,„；,；： -構作為早體，而證明其有意義。在此，四合㈣肖A邵知 鏈之單體匯聚成生物性聚合物。藉此=目=長 =果伴隨著純度上重大之改善，且完成所合成之 由為五提 據該方式，當使用a種四合體之寡核脊酸時， 僅猎由五個連結反應步驟便可製造出任意一個十二合踢 (Dodecamer) ’為此至目前為止需要二十個連結反應步驟。利用四 合體作為生齡單體_是在DNA j狀合絲度㈣時有優 點’因為在此僅需要少數之絲合物作為生物性單體。藉由使用 f聚合物作為生物性單體，亦可特別製造出聚合物序列，其至目 蝻為止，基於其長度或所需之連結反應步驟數目之緣故，在傳統 之固相合成法中，不能以足夠之品質及產量製造。 作為分解保護基以及與其關連之活化反應之基所需之能 量源，係適用電力操控方向之發光二極管(LED)或雷射二極管 (LD)。在使用發光二極管時，當其在紫外光區域放射能量充足之 光線時較有利。紫外光被證明特別適用於分解保護基。例如由 半導體所構成之特定化合物係可稱為紫外光-發光二極管。因此例 如由氮化鎵(Galliumnitrid，GaN)構成之LED放射波長為380 nm 之光線(請見 Rep· Prog· Phys· 61 (1998) 1_75; Group III nitride semiconductors for short wavelength-light_emitting devices)。此夕卜， 藉由使用AlGaN化合物，波長可以達到介於200及360 nm之間。 特別偏好數個LED及/或訊號處理/方向操控皆於一基底層中整合 續次頁（發明說明頁不敷使用時，請註記並使用續頁） 16 200300764 成一體。 在另-較受偏好之實施形式中，該載體不僅由_系列發光之 二極管所組成，而且其具有额外之侧器。藉由將生物性^子之 合成與建構成照相機形式之_器結合，即可放棄做任何外部之 驗證工作。該侧器本純驗證合成於基質表面之生物性聚人物 以及受試樣本間之交互作用。在此，係瞭解交互作麟所有二物 性聚合物與其他分子之間，尤其是形成共價鍵、離子性交互作用、 凡得瓦力以及氫橋键之交互作用。所有種類之生物性或人工合成 之樣本，尤其是血液樣本、病患檢體、抽取物、鼻腔以及咽喉腔 之清洗物、皮屑以及唾液樣本，係可考慮作為受試樣本。該受試 樣本在其方面具有受體或配合基，其與該生物性聚合物(在其方^ 為配合基或受體)產生交互作用。倘若例如使用到一單股核酸(單股 DNA、RNA、單股CDNA)作為生物性聚合物時，則由受試樣本中 與該股核酸互補之單股，係藉由此二條互補之股相互雜交驗證。 如此之雜交即為本發明所意涵之受體/配合基反應。驗證生物性聚 合物與受試樣本間之交互作用，可透過化學或生化反應。在此發 冷光法特別適用。然而亦可使用其他藉由鏈黴抗生物素朊或藉由 放射性標記之驗證方法’但亦可使用無標記之方法（請見例如
Souteyrand，E” Cloarec，J· P” Martin，J· R·，Wilson, C” Lawrence，I·， Mikkelsen S·，Lawrence，Μ· F·, 1997. Direct detection of the hybridisation of synthetic homo-oligomer DNA sequences by field effect· J. Phys· Chem· B，1001，2980 以及德國專利案 DE 4318519 C2 “電化學感應體”）。特別受偏好者為該感應體及其訊號處理在 基層中整合成一體。 當基質與能量源非常緊密地合為一體，且基質與能量源之間 績次頁（發明說明頁不敷使用時，請註記並使用續頁） 17 200300764 平均，距少，10 _時，其係證明特別有用處。 、藉由减小H生物性聚合物之合成反應係靠近能量源 附近$動基柄長巾之生物性聚合物，其在㈣上相當靠近發 光Γ極W其釋放出分解保護基所需要之紫外光。藉由啟動基與 發光-極g間之靠近，可有效避免光線之散射作用及折射作 用尤其可藉由直接釋放紫外光之發光二極管上塗覆一層基質， ^到^與源間之微小間距。在該類情況下所適用之基質為 乳衣氧土 丙基一甲乳基碎燒(Glycidoxypropyltrimethoxysilan)， 其可在塗覆過程中散播於發光二極管上。 本發明之實施形式係另外在圖一中說明。載體1具有一能量 源5以及一基質3，於其表面上合成生物性聚合物7。該能量源5 係建構成LED之形式。該LED具有—與絕緣器9之pn•通道。該 ρη-通道上係產生光子，且其即為能量源5。基質3與能量源$間 之平均間距少於1〇 μπι，其係由該絕緣器9決定。 本發明之另一實施形式係在圖三中說明。該載體1又再次具 有一基質3以及一能量源5。在該實施形式中，能量源5以多個 LED形式存在，使得在基質3上同時有許多生物性聚合物7可以 被合成(排列配置）。 本發明另外一項標的為一種用以合成生物性聚合物之方法， 其中係使用根據本發明之載體。該載體被製備，接著基質部份區 域係藉由分解選定部份區域之保護基而有目的地活化。隨後供應 生物性單體，於其方面具有保護基，在此生物性單體與有目的活 化之基質部份區域相互反應。前後相績循環之有目的地活化基質 邵份區域，其供應受保護之生物性單體，且該生物性單體與有目 的活化之基質部份區域之相互反應係不斷重複，直到所要求之生 Ξ續次頁（發明說明頁不敷使用時，請註記並使用續頁） 200300764 物性聚合物生成為止。在根據本發明方法之範圍内，需要作為有 目的活化基質部份區域使用之能量，係從該載體内部；放出來。 將能量源及基質緊密合為一體在此係特別適用。 電腦選擇 為同時合成許多不同之聚合物，部份之區域借助於 並且活化。 改變局部之pH-值可以用來分解保護基，以活化反應 ， 其較偏好為OH·基。在此，根據本發明之作為能量源^載體^有 電極之結構。藉由通人電壓及電流，可以在局面上產生出非常強 烈之pH·值改變。在此^各個電極間之pH_值差異可以達到大約$ 左右。移除保護基之作用例如可纟pH_值為2之情況下進行。如果 於電極上安裝上-負極電壓時，透過f極將水電解可製造出一驗 性之環境。—雜職可藉由在電極上設置-正極電壓而產生。 當水於電極上電解時，便有以下之化學反應： 2H2〇 — 4H+ + 4e-+〇2 (在正極電壓時）；以及 纽2〇 + 2e_-> 2〇η· + Η。（在負極電壓時）。 在中性ΡΗ-值為7時，反應啟動基受到未分解之保護基所保 4。絲縣賴由—微條之正㈣壓轉性地，其藉由 =源與基質在位於該保護基之附近合而為―，因為藉由正極電 必而產生局敎ΡΗ·值下降。此外，其特別有利之處為，若是有一 ΡΗ-值測量裝置(pH_ISFET)位於電極附近，藉由其之幫助—方面可 =偵：到現狀之pH_值’且另一方面可以造成由電子操控電極方 向，由此便可誘導出一局部之pHHi變動。 該排列係另外在圖四中顯示出。該載體丨具有—基質3以及 一個，量源’其建構成電極51及53。於圖四中之左邊顯示電極 5卜其具有電壓/電流負載。該pH_值為7。在右邊顯示電極Μ， 續人頁（發明說明頁不敷使用時，請註記並使用續頁） 19 200300764 其沒有電壓/電流負載。該pH_值為2。偵測裝置13，其建構成 pH-ISFET之形式，作為偵測由電極產生之局部pH_值。 就製備生物性聚合物而言，在本發明範圍内之任意生物性單 體皆可使用。特別適用者為料酸、寡贿酸，尤其是四合體、氨 基酸、胜肤、醣類，尤其是單醣及雙醣及/或其衍生物或類似物。 該生物性單體可以轉成各種不同之cDNA-、RNA-、遺傳基因 DNA-及/或胜肽_庫之篩選方法之用。 在一供料裝置中供應生物性單體係證明特別有好處。其他對 於生物性聚合物組成有益處之反應步驟，如清洗步驟，同樣可於 供料裝置中進彳亍。在供料裝置中，其表面具有相配合之反應溶液， 尤其是用生物性單體濕潤或塗覆。該供料裝置可建構成微量流體 石英小管或微量流體室之形式。為避免污染，至少有一供應反應 溶液或生物性單體裝置、以及至少—與供應裝置在㈣上分隔之 排出裝置係證财用。該微量流體石英小管之上方係在此同時有 捕捉光線之作用，使得載體可減少因散射光線引發之不良曝光。 特別有利者為，如果於該晶片上設置單_式或混合式通道時，可 避免其他LED或類似者之散射光線。 該實施形式係另外在圖二中顯示出。該載體i具有一基質3、 -能讀5以及-絕緣器9。生物性聚合物7之合成在基 槽中發生，其係建構成通道11。 / 、、此外，利用電場將帶電之生物性單體帶往活化之基質部份區 域5F證明是有好處。部份基質區域藉由設置至少—個電場而被選 出。在此，祕縣係％全移除，接著依序供麟電之生物性 該帶電之生物性單體藉由電場牽引至選出之位置，其期間於 未選出之位置上則被排斥。因此，—生物性聚合物便可藉由依序 0續次頁（發明說明頁不敷使用時，請註記並使用續頁） 20 200300764 啶以及鳥修改之含氮鹼腺嘌呤、胸腺嘧啶、細胞嘧 吸引或成。藉由在電場中對帶電之姆酸作相應之 =排斥作用，其倾帶往基質上所被期望之位置。移 乂 ’乂保護基後，又再度設置 古、: 到所期望之絲性聚合物之長度耻。絲顧核抽直至達 體時，本發明方法之範圍内使用到上述具有偵測器之載 /根據本發明之方法可以具有附加之步驟。所合成之 η 合物可與受試樣本反應，並且可藉由—生化反應，尤其 人其、t人生物性勞光反應及/或化學性螢歧應而彳貞測出受體'配 &丞-複合體。 =發明《另—標的側於—種感應_晶片，其具有根據本發明 2姐。此外，本發明亦關於—種在醫療上，尤其是—種診斷上 或治療曰上之儀器，其同樣具有根據本發明之載體。如果例如使用 感應-晶，上之感受元件，尤其是一 DNA_感應-晶片時，則本發明 允弁-場㈣制，在使用樣本分子下之攜帶式之麗八檢測分析， 其可使用性係來自於過去之分析。該種感應_晶片或醫療儀器設備 可於爆發感染疫情時，用來當場鑑識細菌彳生或病毒性之病原體， 並且將感染患者與未感染患者做區分。此外，藉由建入邏輯性控 制元件’如由儀器設計生物性聚合物之DNA檢測分析方面複雜之 問題’可以由儀器設備本身處理。該醫療儀器因此可基於當前之 問題而發展出本身相符合之感應-晶片，然後合成出所需要之生物 性聚合物，最後再計算出結果。 圖一至圖四（圖一至四)為本發明進一步之解說。圖式說明為: 圖一為本發明之第一實施形式，其中係以簡單方式圖示 出基質與能量源間之合為一體； zJ續次頁（發明說明頁不敷使用時，請註記並使用續頁） 21 200300764 回 :所發明之第二實施形式，其中生物性聚合物係於 一、貝之凹槽(通道）中形成； 圖 明之另一實施形式，其中許多LED用來同時 5成許多生物性聚合物；以及 圖為本發明之另一實施形式，其中係概略圖示出藉由 、改變局部之PH_值以移除保護基。 乂下之範例係為本發明更進_步之說明，並且為〆簡易之實 施例。 範例
1.感應體珍I CMOS-感應體係用矽烷塗覆兩小時，其中，其係浸泡於一 由乂之氧丙環氧基丙基二甲氧基梦燒(Glycidoxypropyltrimeth- oxysilan) ( 1义 g〇PS) 以及 〇]% 之三乙胺 (Triethylamin) 於甲苯 (Toluol)中所組成之溶液中。隨後將該晶片滴出，並且在12〇。〇下 固足於乾燥箱中約二小時左右。直至以保護基塗覆為止，該預備 之晶片可以在隔絕濕氣下儲藏。 覆之晶片以氤氣基功能化 該之前處理過之晶片係於高溫(7〇t：)之乙二醇(Ethylenglycol) 中反應一小時，其具有一催化作用含量之濃硫酸。接著該晶片於 乙醇中清洗並脫乾。經過該處理之後，該晶片係具有一以氫氧基 功能化之表面，在此0H-基係顯示為反應啟動基。 L將保譆某加至啟動基之上 續次頁（發明說明頁不敷使用時，請註記並使用續頁） 200300764 晶片表面上之啟動基藉由加上一種pNPEOC基而受保護。在 此’该蚰述處理過之晶片係在·15它、隔絕光線之下，於一種由2_(5一 曱乳基2-硝基本基)_乙氧基羰醯氯（2-(シMethoxy_2-Ilitrophenyl)-ethoxycarbonylchlorid) 於二氯甲 烷所成之溶液 中反應四小時 。該 保護基具有下列之化學結構式··
隨後該晶片於低溫之二氯甲烷中清洗。該晶片直到使用為止，一 直被保存於乾燥及避光狀態下。 4.於傻紫座光下在之前處理過之晶片上合成生物性聚合物 該之前處理過之晶片係置入一供料室中，且在事先決定區域 中之保護基係藉由紫外光-發光二極管之活化作用，進行二分鐘之 選擇性分解。隨後該晶片於無水乙腈中清洗，並且與第一個溶於 乙腈中之核苷酸反應。在此係使用常見之市售含有pNEP0〇保護 基之核苷酸。接著該晶片再次用乙腈清洗，而且藉由再次選擇性 之曝光可將其他或進一步之保護基移除。根據該方式，所有之位 置於其上應建入腺嘌呤-、鳥糞嘌呤…細胞嘧啶_或胸腺嘧啶_修改 之核發敗’可以選擇性地除去保護。在連結所有四種核發酸之後， 一層pNPEOC-f呆護層又再度位於該晶片之所有位置上，且其可接 D績次頁 （發明說明頁不敷使用時，請註記並使用續頁） 23 200300764 下來精由有標的性地脫去’以及供給核音酸下一層之核發酸層組 成。 常見市售胸腺核苷或細胞喃淀衍生物之範例為： -5 ’-0(2-(2-氯-6·硝基苯）乙氧基羰基胸腺嘧啶-3 ’-0((β-氰 基乙氧基)(Ν，Ν_二異丙基氨基)磷亞醯胺）， - 5’-0-(2-(2-氯-6-硝基苯）乙氧基談基)-Ν_4-(4-硝基苯）乙氧 基羰基)2’-去氧細胞嘧啶-3’-0((β-氰基乙氧基)(Ν，Ν-二異 丙基氨基)磷亞醯胺）。
續次頁 （發明說明頁不敷使用時，請註記並使用續頁） 24 200300764 元件符號表 1 載體 3 基質 5 能量源 51 電極一 pH = 7 53 電極一 pH = 2 7 生物性聚合物 9 絕緣器 11 通道 13 偵測裝置 續次頁 （發明說明頁不敷使用時，請註記並使用績頁）
Claims (1)
- 200300764 拾、申請專利範圜 ::4怒鷀_1顧它_職, 1· 一種用作合成有機聚合物之載體，尤指具有一基質之生物性 聚合物，於其表面上合成該生物性聚合物，並且具有一能量 源用作有標的性活化基質部份區域，其生物性聚合物係於該 活化基質部份區域合成，其特徵為，基質與能量源結合為一 體。 2·根據申請專利範圍第1項所述之載體，其特徵為，該基質為 一可膨脹、具反應啟動基之三次元聚合物層。 3·根據申請專利範圍第2項所述之載體，其特徵為，該聚合物 層由非連結型或連結型，尤指由交叉連結程度少之交叉連結 聚合物所組成。 4·根據申請專利範圍第2項或第3項所述之載體，其特徵為， 該聚合物層具有一介於30至3000 nm間之強度。 5·根據申請專利範圍第4項所述之載體，其特徵為，該膨脹後 之聚合物層具有一介於50至500 nm間之強度。 6·根據申請專利範圍第2項至第5項中任一項所述之載體，其 特徵為，該反應啟動基係直接或藉由其他官能基以共價键與 该聚合物層相連接。 7·根據申請專利範圍第2項至第6項中任一項所述之載體，其 特徵為，該反應之啟動基為OH·基。 8·根據申請專利範圍第2項至第7項中任一項所述之載體，其 特徵為，該反應啟動基藉由非反應之保護基所保護。 9·根據申請專利範圍第2項至弟7項中任一項所述之載體，其 特徵為’該反應之啟動基精由非反應之保護基所保護。 10·根據申請專利範圍第1項至第9項中任一項所述之載體，其 i續次頁（申請專利範圍頁不敷使用時，請註記並使用續頁） 26 200300764 特徵為，該能量源至少為一由電力操控方向之發光二極管 (LED)或至少為一雷射二極管(LD)。 U·根據申請專利範圍第1〇項所述之載體，其特徵為，該發光二 極管在紫外光區域釋放出能量充足之光線。 12·根據申請專利範圍第丨項至第n項中任一項所述之載體，其 特徵為，該載體此外至少具備有一偵測器。 U·根據申請專利範圍第12項所述之載體，其特徵為，該偵測器 係建構成照相機之形式。 根據申明專利範圍第12項或第13項所述之載體，其特徵為， 為偵測為在驗證合成於基質表面之生物性聚合物以及受試樣 本間之交互作用。 根據申請專利範圍第14項所述之載體，其特徵為，該受試樣 本具有配合基、受體、蛋白質、抗體、胜肽、核酸及/或其衍 生物或類似物。 16.根據申請專利範圍第14項或第15項所述之載體，其特徵為， 驗證交互作用可藉由一(生物_)化學反應，尤其是藉由發冷光 法、放射性及/或非放射性標記方法，特別是藉由鏈黴抗生物 素朊之加生物素反應來達成。 17·根據申請專利範圍第1項至第16項中任一項所述之載體，其 特徵為，固定於基質之生物性分子與能量源之平均間距少於 10 μπι 〇 18. 根據t請判顯第1G項至第Π項巾任—賴述之載體， 其特徵為，該釋放出紫外光之發光二極管係塗覆上一基g， 尤其疋塗覆上一層氧丙環氧基丙基三甲氧基珍燒。 、 19. 根據前述中請專利範圍中任—項所述之載體，其特徵為，該 0續次頁（申請專利範圍頁不敷使用時，請註記並使用續頁） 27 200300764 能量源整體於載體中整合。 20· —種用以合成生物性聚合物之方法，其步驟包含有： (a) 根據申請專利範圍第丨項至第19項中任—項 體之提供； 、戰 (b) 藉由分解於選定部份區域中之保護基而有標的性地活化 基質部份區域； (C)供應生物性單體，其於其他方面具有保護基； (d) 將生物性單體與步驟⑼之有標的性活化基質部份區域整 合； (e) 於必要時重複步驟(b)至步驟(d); 其特徵為，在步驟(b)中活化之能量於載體内部釋放。 21·根據申請專利範圍第20項所述之方法，其特徵為，該部份區 域係借助於電腦選擇及活化。 22·根據申請專利範圍第20項或第21項所述之方法，其特徵為， 保護基藉由改變局部之pHH直而分解。 23·根據申請專利範圍第22項所述之方法，其特徵為，局部pH_ 值係藉由至少一負載正極電壓之電極而改變。 24.根據申請專利範圍第20項至第23項中任一項所述之方法， 其特徵為，該生物性單體為核苷酸、寡核苷酸，尤其是四合體、 氣基酸、胜肽、醣類，特別是單醣及雙醣及/或其衍生物或類 似物。 25·根據申請專利範圍第20項至第24項中任一項所述之方法， 其特徵為，該生物性單體係由一 cDNA-、RNA-、遗傳基因 DNA-及/或胜肽-庫演變而成。 26·根據申請專利範圍第20項至第25項中任一項所述之方法， ϋ續次頁（申請專利範圍頁不敷使用時’請註記並使用續頁） 28 200300764 27. 28. 29. 30. 31. Y 其特徵為，該生物性單體於一供料裝置中供應。 根據本申請專利範圍第26項所述之方法，其特徵為，該供料 裝置建構成微量流體石英小管或微量流體室之形式，其具有 至少一供應生物性單體之裝置，以及至少一與供應裝置在空 間上分隔之排出裝置。 根據申請專利範圍第20項至第27項中任一項所述之方法， 其特徵為，該生物性單體帶有電荷，而且基質部份區域係藉 由設置至少一電場而選出。 根據申請專利範圍第20項至第28項中任一項所述之方法， 其特徵為’該方法附加之步驟係包含： (f) 所合成之生物性聚合物與受試樣本之反應；及 (g) 驗證交互作用可藉由（生物_)化學反應，尤其是藉由發冷光 法、放射性及/或非放射性標記方法，特別是藉由鏈黴抗生 物素朊之加生物素反應來達成。 一種感應-晶片，其具有根據申請專利範圍第1項至第19項中 任一項所述之載體。 一種I療上，尤其疋珍斷上或治療上之儀器，其包含根據申 請專利範圍第1項至第19項中任一項所述之載體。 續次頁（申請專利範圍頁不敷使用時，請註記並使用續頁） 29
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