TH17935C3 - กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน(Rifampicin)ด้วยแถบสีในขั้นตอนเดียว - Google Patents
กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน(Rifampicin)ด้วยแถบสีในขั้นตอนเดียวInfo
- Publication number
- TH17935C3 TH17935C3 TH1803001299U TH1803001299U TH17935C3 TH 17935 C3 TH17935 C3 TH 17935C3 TH 1803001299 U TH1803001299 U TH 1803001299U TH 1803001299 U TH1803001299 U TH 1803001299U TH 17935 C3 TH17935 C3 TH 17935C3
- Authority
- TH
- Thailand
- Prior art keywords
- primer
- rifampicin
- lamp
- base
- dipstick
- Prior art date
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract 14
- JQXXHWHPUNPDRT-WLSIYKJHSA-N rifampicin Chemical compound O([C@](C1=O)(C)O/C=C/[C@@H]([C@H]([C@@H](OC(C)=O)[C@H](C)[C@H](O)[C@H](C)[C@@H](O)[C@@H](C)\C=C\C=C(C)/C(=O)NC=2C(O)=C3C([O-])=C4C)C)OC)C4=C1C3=C(O)C=2\C=N\N1CC[NH+](C)CC1 JQXXHWHPUNPDRT-WLSIYKJHSA-N 0.000 title claims abstract 12
- 229960001225 rifampicin Drugs 0.000 title claims abstract 12
- 201000008827 tuberculosis Diseases 0.000 title claims abstract 11
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims abstract 19
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 claims abstract 16
- SHIBSTMRCDJXLN-UHFFFAOYSA-N Digoxigenin Natural products C1CC(C2C(C3(C)CCC(O)CC3CC2)CC2O)(O)C2(C)C1C1=CC(=O)OC1 SHIBSTMRCDJXLN-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract 11
- QONQRTHLHBTMGP-UHFFFAOYSA-N digitoxigenin Natural products CC12CCC(C3(CCC(O)CC3CC3)C)C3C11OC1CC2C1=CC(=O)OC1 QONQRTHLHBTMGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract 11
- SHIBSTMRCDJXLN-KCZCNTNESA-N digoxigenin Chemical compound C1([C@@H]2[C@@]3([C@@](CC2)(O)[C@H]2[C@@H]([C@@]4(C)CC[C@H](O)C[C@H]4CC2)C[C@H]3O)C)=CC(=O)OC1 SHIBSTMRCDJXLN-KCZCNTNESA-N 0.000 claims abstract 11
- 208000036347 rifampicin-resistant tuberculosis Diseases 0.000 claims abstract 11
- 101150090202 rpoB gene Proteins 0.000 claims abstract 9
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 claims abstract 8
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 claims abstract 8
- 239000011616 biotin Substances 0.000 claims abstract 8
- MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N fluorescein-5-isothiocyanate Chemical compound O1C(=O)C2=CC(N=C=S)=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract 5
- 238000005868 electrolysis reaction Methods 0.000 claims abstract 4
- 230000035772 mutation Effects 0.000 claims abstract 4
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims abstract 4
- LLIANSAISVOLHR-GBCQHVBFSA-N 5-[(3as,4s,6ar)-2-oxidanylidene-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoic acid Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21.N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 LLIANSAISVOLHR-GBCQHVBFSA-N 0.000 claims abstract 3
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims abstract 3
- CSNNHWWHGAXBCP-UHFFFAOYSA-L Magnesium sulfate Chemical compound [Mg+2].[O-][S+2]([O-])([O-])[O-] CSNNHWWHGAXBCP-UHFFFAOYSA-L 0.000 claims 10
- 229910052943 magnesium sulfate Inorganic materials 0.000 claims 5
- 235000019341 magnesium sulphate Nutrition 0.000 claims 5
- LCCNCVORNKJIRZ-UHFFFAOYSA-N parathion Chemical compound CCOP(=S)(OCC)OC1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1 LCCNCVORNKJIRZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 5
- 239000000243 solution Substances 0.000 claims 5
- KWIUHFFTVRNATP-UHFFFAOYSA-N Betaine Natural products C[N+](C)(C)CC([O-])=O KWIUHFFTVRNATP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 4
- KWIUHFFTVRNATP-UHFFFAOYSA-O N,N,N-trimethylglycinium Chemical compound C[N+](C)(C)CC(O)=O KWIUHFFTVRNATP-UHFFFAOYSA-O 0.000 claims 4
- 229960003237 betaine Drugs 0.000 claims 4
- 239000008366 buffered solution Substances 0.000 claims 3
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 claims 3
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 claims 3
- 102000016928 DNA-directed DNA polymerase Human genes 0.000 claims 2
- 108010014303 DNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 claims 2
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims 2
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims 2
- 239000007853 buffer solution Substances 0.000 claims 2
- 208000015355 drug-resistant tuberculosis Diseases 0.000 claims 2
- 201000009671 multidrug-resistant tuberculosis Diseases 0.000 claims 2
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 claims 2
- 239000002689 soil Substances 0.000 claims 2
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 claims 1
- 238000003556 assay Methods 0.000 claims 1
- 244000309466 calf Species 0.000 claims 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims 1
- 230000006806 disease prevention Effects 0.000 claims 1
- 231100000025 genetic toxicology Toxicity 0.000 claims 1
- 230000001738 genotoxic effect Effects 0.000 claims 1
- 230000000869 mutational effect Effects 0.000 claims 1
- 244000052769 pathogen Species 0.000 claims 1
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 claims 1
- 230000002265 prevention Effects 0.000 claims 1
- 239000011535 reaction buffer Substances 0.000 claims 1
- 238000003753 real-time PCR Methods 0.000 abstract 2
- 101100038261 Methanococcus vannielii (strain ATCC 35089 / DSM 1224 / JCM 13029 / OCM 148 / SB) rpo2C gene Proteins 0.000 abstract 1
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 abstract 1
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 abstract 1
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 abstract 1
- 101150085857 rpo2 gene Proteins 0.000 abstract 1
Abstract
บทสรุปการประดิษฐ์ซึ่งจะปรากฏบนหน้าประกาศโฆษณาReadFile:------04/12/2563------(OCR)กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน(Rifampicin)ด้วยแถบสีในขั้นตอนเดียวเริ่มจากการออกแบบไพรเมอร์5เส้นที่จำเพาะต่อลำดับเบสของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน(Rifampicin)ที่มีเบสกลายพันธุ์ที่ตำแหน่ง531ของยีนอารโพบี(rpoB)ซึ่งโดยให้ไพรเมอร์1เส้นติดฉลากด้วยไบโอติน(biotin)หรือไดกอกซิเจนิน(Digoxigenin)และให้ไพรเมอร์อีก1เส้นติดฉลากด้วยสารเรืองแสง(FITC)ในการติดตามปฏิกิริยาที่เกิดขึ้นบนแผ่นดิพสติค(dipstick)ในระบบนี้ดีเอ็นเอเป้าหมายจะถูกเพิ่มปริมาณภายใต้อุณหภูมิอุณหภูมิ61องศาเซลเซียสเป็นเวลา1ชั่วโมงในกล่องให้ความร้อน(heatingblock)แล้วอ่านผลบนแผ่นดิพสติค(dipstick)เมื่อให้ผลบวกจะปรากฏเส้นทดสอบสีชมพูบริเวณแถบทดสอบ(T)และแถบควบคุม(C)แสดงว่าในตัวอย่างพบเบสกลายพันธุ์ที่ตำแหน่ง531ของยีนอาร์โพบี(rpoB)แต่ถ้าผลลบจะปรากฏเส้นทดสอบสีชมพูเฉพาะแถบควบคุม(C)เท่านั้นวิธีการนี้เทียบเท่ากับการตรวจสอบด้วยเทคนิคพีซีอาร์(PCR)แบบเรียลไทม์(realtime)อีกทั้งยังไม่ต้องใช้เครื่องพีซีอาร์(PCR)และเครื่องแยกสารพันธุกรรมด้วยกระแสไฟฟ้าในการติดตามผลของปฏิกิริยา------------หน้า1ของจำนวน1หน้าบทสรุปการประดิษฐ์กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน(Rifampicin)ด้วยแถบสีในขั้นตอนเดียวเริ่มจากการออกแบบไพรเมอร์5เส้นที่จำเพาะต่อลำดับเบสของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน(Rifampicin)ที่มีเบสกลายพันธุ์ที่ตำแหน่ง531ของยีนอาร์โพบี(rpoB)ซึ่งโดยให้ไพรเมอร์1เส้นติดฉลากด้วยใบโอติน(biotin)หรือไดกอกซิเจนิน(Digoxigenin)และให้ไพรเมอร์อีก1เส้นติดฉลากด้วยสารเรืองแสง(FITC)ในการติดตามปฏิกิริยาที่เกิดชื้นบนแผ่นดิพสติค(dipstick)ในระบบนี้ดีเอ็นเอเป้าหมายจะถูกเพิ่มปริมาณภายใต้อุณหภูมิอุณหภูมิ61องศาเซลเซียสเป็นเวลา1ชั่วโมงในกล่องให้ความร้อน(heatingblock)แล้วอ่านผลบนแผ่นดิพสติค(dipstick)เมื่อให้ผลบวกจะปรากฏเส้นทดสอบสีชมพูบริเวณแถบทดสอบ(T)และแถบควบคุม(0แสดงว่าในตัวอย่างพบเบสกลายพันธุที่ตำแหน่ง531ของยีนอาร์โพบี(rpoB)แต่ถ้าผลลบจะปรากฏเส้นทดสอบสีชมพูเฉพาะแถบควบคุม(C)เท่านั้นวิธีการนี้เทียบเท่ากับการตรวจสอบด้วยเทคนิคพีซีอาร์(PCR)แบบเรียลไทม์(realtime)อีกทั้งยังไม่ต้องใช้เครื่องพีซีอาร์(PCR)และเครื่องแยกสารพันธุกรรมด้วยกระแสไฟฟ้าในการติดตามผลของปฏิกิริยา
Claims (5)
1.กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน(Rifampicin)ด้วยแถบสีในขั้นตอนเดียวที่ซึ่งประกอบด้วยการทำปฏิกิริยาแลมป์(LAMP)ร่วมกับการประยุกต์ใช้แผ่นดิพสติค(dipstick)ภายในปฏิกิริยาแลมป์(LAMP)25ไมโครลิตรประกอบด้วยไพรเมอร์3และไพรเมอร์4อย่างละ50พิโคโมล,ไพรเมอร์1ไพรเมอร์2และไพรเมอร์5อย่างละ5พิโคโมล,ดีเอ็นทีพี(dNTP)0.8มิลลิโมลาร์ผสมด้วยสารเบตาอีน(betaine)0.6โมลาร์,สารแมกนีเซียมซัลเฟส(MgS04)4มิลลิโมลาร์,เอนไซม์ปีเอสทีดีเอ็นเอโพลีเมอเรส(BstDNApolymerase)8Uและสารละลายบัฟเฟอร์ใช้ในการตรวจลำดับเบสกลายพันธุ์ที่ตำแหน่ง531ของยีนอาร์โพบี(rpoB)ของเชื้อวัณโรคการออกแบบไพรเมอร์สำหรับเทคนิคแลมป์(LAMP)ในการตรวจเชื้อวัณโรคที่มีเบสกลายพันธุ์เพียงหนึ่งเบสไพรเมอร์ที่ใช้ในปฏิกิริยาแลมป์(LAMP)ประกอบด้วยไพรเมอร์5เส้นที่จำเพาะต่อลำดับเบสกลายพันธุ์ที่ตำแหน่ง531ของยีนอาร์โพบี(rpoB)ของเชื้อวัณโรคโดยให้ไพรเมอร์4ติดฉลากด้วยไบโอติน(biotin)หรือไดกอกซิเจนิน(Digoxigenin)และให้ไพรเมอร์5ติดฉลากด้วยสารเรืองแสง(FITC)ในการติดตามปฏิกิริยาที่เกิดขึ้นบนแผ่นดิพสติค(dipstick)ดังนี้ ไพรเมอร์1ลำดับเบส(5'-3')gCATgTCgCggATggAg ไพรเมอร์2ลำดับเบส(5'-3')ACgCTCACgTgACAgACC ไพรเมอร์3ลำดับเบส(5'-3') ACCggCCggATgTTgATCAACgTTTTgTCCgggAgCggATgA ไพรเมอร์4ลำดับเบส(5'-3') biotin/Dig-AAggAgTTCTTCggCACCAgCCTTTTCCgggCCCCAgCgCAA ไพรเมอร์5ลำดับเบส(5'-3') FITC-AgCCAATTCATggACCAgAA Dig=Digoxigenin
2.กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน(Rifampicin)ด้วยแถบสีในขั้นตอนเดียวตามข้อถือสิทธิ1ที่ซึ่งสภาวะที่เหมาะสมในการตรวจผลผลิตจากแลมป์(LAMP)บนแผ่นดิพสติค(dipstick)มีลักษณะเฉพาะคือทำปฏิกิริยาแลมป์(LAMP)ที่อุณหภูมิ61องศาเซลเซียสเป็นเวลา1ชั่วโมงแล้วดูดสารละลายดังกล่าวจำนวน5ไมโครลิตรใส่ในหลอดที่มีสารละลายบัฟเฟอร์100ไมโครลิตรที่อุณหภูมิห้องจากนั้นจุ่มแผ่นติพสติค(dipstick)ลงในสารละลาย5นาทีแล้วอ่านผล
3.กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน(Rifampicin)ด้วยแถบสีในขั้นตอนเดียวตามข้อถือสิทธิ1ที่ซึ่งปฏิกิริยาแลมป์(LAMP)มีขั้นตอนการเพิ่มปริมาณสารพันธุกรรมของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน(rifampicin)เป็นเวลา1ชั่วโมงที่อุณหภูมิ61องศาเซลเซียสโดยให้ไพรเมอร์4ติดฉลากด้วยไบโอติน(biotin)หรือไดกอกซิเจนิน(Digoxigenin)และให้ไพรเมอร์5ติดฉลากด้วยสารเรืองแสง(FITC)ในการติดตามปฏิกิริยาที่เกิดชื้นด้วยการอ่านผลบนแผ่นดิพสติค(dipstick)เมื่อให้ผลบวกจะปรากฏเส้นทดสอบสีชมพูบริเวณแถบทดสอบ(T)และแถบควบคุม(C)แสดงว่าในตัวอย่างพบเบสกลายพันธุ์ที่ตำแหน่ง531ของยีนอาร์โพบี(rpoB)แต่ล้าผลลบจะปรากฏเส้นทดสอบสีชมพูเฉพาะแถบควบคุม(C)เท่านั้น
4.กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน(Rifampicin)ด้วยแถบสีในขั้นตอนเดียวตามข้อถือสิทธิ1ที่ซึ่งมีลักษณะเฉพาะคือไม่ต้องใช้เครื่องพีซีอาร์(PCRthermalcycler)และเครื่องแยกสารพันธุกรรมด้วยกระแสไฟฟ้า หน้า2ของจำนวน2หน้า
5.กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน(Rifampicin)ด้วยแถบสีในขั้นตอนเดียวตามข้อถือสิทธิ1ที่ซึ่งเป็นเทคนิคการตรวจสอบเบสกลายพันธุของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน(Rifampicin)ด้วยแถบสีในขั้นตอนเดียวในผู้ป่วยที่สงสัยการติดเชื้อวัณโรคดื้อยานี้เพื่อการตรวจวินิจฉัยและป้องกันการระบาดของโรค
Publications (4)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| TH17935U TH17935U (th) | 2021-06-25 |
| TH17935C3 true TH17935C3 (th) | 2021-06-25 |
| TH17935Y TH17935Y (th) | 2021-06-25 |
| TH17935A3 TH17935A3 (th) | 2021-06-25 |
Family
ID=
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| US12139768B2 (en) | Polymerase chain reaction primers and probes for Mycobacterium tuberculosis | |
| Ørum et al. | Single base pair mutation analysis by PNA directed PCR clamping | |
| AU718670B2 (en) | Method for evaluation of polymorphic genetic sequences, and the use thereof in identification of HLA types | |
| CN102209791B (zh) | Hla基因型的检测 | |
| NO300782B1 (no) | Fremgangsmåte for fremstilling av en dobbelt-trådet nukleinsyre og fremgangsmåte nyttig for påvisning av en spesifikk nukleinsyresekvens i en testpröve | |
| US10683548B2 (en) | Single nucleotide polymorphism in HLA-B*15:02 and use thereof | |
| RU2445370C1 (ru) | Способ диагностики лейкоза крупного рогатого скота методом полимеразной цепной реакции | |
| Estalilla et al. | 5′→ 3′ exonuclease-based real-time PCR assays for detecting the t (14; 18)(q32; 21): a survey of 162 malignant lymphomas and reactive specimens | |
| CN105986044B (zh) | 禽流感病毒核酸通用快速检测方法 | |
| TH17935A3 (th) | กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน(Rifampicin)ด้วยแถบสีในขั้นตอนเดียว | |
| Vinayagamoorthy et al. | Improved internal control for molecular diagnosis assays | |
| Sharma et al. | Novel molecular diagnostic technique for detecting the different species of Plasmodium | |
| TH17935Y (th) | กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (Rifampicin) ด้วยแถบสีในขั้นตอนเดียว | |
| TH17935U (th) | กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (Rifampicin) ด้วยแถบสีในขั้นตอนเดียว | |
| TH17937C3 (th) | กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไอโซไนอะซิด(isoniazid)บนยีนไอเอ็นเอชเอ(inhA)ด้วยแถบสีในขั้นตอนเดียว | |
| DE69833120D1 (de) | Verfahren zur Typisierung des HA-1 Nebenhistokompatibilitätsantigens | |
| TH17937A3 (th) | กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไอโซไนอะซิด(isoniazid)บนยีนไอเอ็นเอชเอ(inhA)ด้วยแถบสีในขั้นตอนเดียว | |
| US20130053269A1 (en) | Primer Sequences for Amplification of Sea Otter Genes, and Methods of Use Thereof | |
| TH17934C3 (th) | กรรมวิธีการตรวจสอบหาเชื้อวัณโรคชนิดมัยโคแบคทีเรียมทูเบอร์คูโลซิส(Mycobacteriumtuberculosis)ด้วยแถบสีในขั้นตอนเดียว | |
| TH1903001740C3 (th) | กรรมวิธีการตรวจสอบการกลายพันธุ์ของยีนเอพีพี (app) ความเสี่ยงอัลไซเมอร์แบบขั้นตอนเดียวด้วยแถบสี | |
| TH17934A3 (th) | กรรมวิธีการตรวจสอบหาเชื้อวัณโรคชนิดมัยโคแบคทีเรียมทูเบอร์คูโลซิส(Mycobacteriumtuberculosis)ด้วยแถบสีในขั้นตอนเดียว | |
| TH17936A3 (th) | กรรมวิธีการตรวจสอบยีนกลายพันธุ์ของเชื้อสแตฟิโลค็อกคัสออเรียส(Staphylococcusaureus)ที่ดื้อยาเมทิซิลิน(methicillin)ด้วยแถบสี | |
| TH17936C3 (th) | กรรมวิธีการตรวจสอบยีนกลายพันธุ์ของเชื้อสแตฟิโลค็อกคัสออเรียส(Staphylococcusaureus)ที่ดื้อยาเมทิซิลิน(methicillin)ด้วยแถบสี | |
| TH20107U (th) | กรรมวิธีการตรวจสอบการกลายพันธุ์ของยีนเอพีพี (app) ความเสี่ยงอัลไซเมอร์แบบขั้นตอนเดียวด้วยแถบสี | |
| TH20107Y (th) | กรรมวิธีการตรวจสอบการกลายพันธุ์ของยีนเอพีพี (app) ความเสี่ยงอัลไซเมอร์แบบขั้นตอนเดียวด้วยแถบสี |