TH12409C3 - กระบวนการสร้างห้องสมุดฟอสมิด (fosmid library) ของสิ่งมีชีวิต - Google Patents

กระบวนการสร้างห้องสมุดฟอสมิด (fosmid library) ของสิ่งมีชีวิต

Info

Publication number
TH12409C3
TH12409C3 TH1403000167U TH1403000167U TH12409C3 TH 12409 C3 TH12409 C3 TH 12409C3 TH 1403000167 U TH1403000167 U TH 1403000167U TH 1403000167 U TH1403000167 U TH 1403000167U TH 12409 C3 TH12409 C3 TH 12409C3
Authority
TH
Thailand
Prior art keywords
dna
size
organisms
target
phosphid
Prior art date
Application number
TH1403000167U
Other languages
English (en)
Other versions
TH12409A3 (th
Inventor
สมยง นางสาวสุธาสินี
ตั้งภัสสรเรือง นายสิทธิโชค
Original Assignee
นางสาวอรุณศรี ศรีธนะอิทธิพล
นางทิพวรรณ รัตนกิจ
Filing date
Publication date
Application filed by นางสาวอรุณศรี ศรีธนะอิทธิพล, นางทิพวรรณ รัตนกิจ filed Critical นางสาวอรุณศรี ศรีธนะอิทธิพล
Publication of TH12409C3 publication Critical patent/TH12409C3/th
Publication of TH12409A3 publication Critical patent/TH12409A3/th

Links

Abstract

DC60 (24/06/59) การประดิษฐ์นี้มีจุดมุ่งหมายเพื่อปรับปรุงกระบวนการสร้างห้องสมุดฟอสมิด (fosmid library) ในสิ่งมีชีวิต เพื่อเป็นอีกทางเลือกหนึ่งที่มีขั้นตอนไม่ยุ่งยาก ซึ่งจะช่วยลดระยะเวลาการทำงานลงได้ 1-2 วัน จึงมีผลต่อการลดการใช้ แรงงาน สารเคมี และค่าใช้จ่ายลง โดยที่คุณภาพของห้องสมุดฟอสมิดยังคงดีในระดับมาตรฐานยอมรับได้ เพื่อการนำ ห้องสมุดฟอสมิดไปใช้งานต่อในอนาคต โดยที่กระบวนการตามการประดิษฐ์สามารถประยุกต์ใช้ได้กับดีเอนเอของ สิ่งมีชีวิตทุกชนิดไม่ว่าจะเป็นสิ่งมีชีวิตที่มีจีโนมขนาดเล็ก เช่น จุลินทรีย์ และสามารถใช้ได้ในสิ่งมีชีวิตที่มีจีโนมขนาด ใหญ่ เช่น พืชและสัตว์ เป็นต้น โดยกระบวนการ ประกอบด้วยขั้นตอน ดังนี้ การสกัดดีเอนเอของสิ่งมีชีวิตเป้าหมาย การทำดีเอนเอของสิ่งมีชีวิตเป้าหมาย ให้มีขนาดเล็กลงด้วยวิธีทางการกายภาพ (physical shearing)เพื่อให้ได้ดีเอนเอ ขนาดเหมาะสมในการโคลนนิ่ง โดยประเมินขนาดของดีเอ็นเอเบื้องต้นบนเจลอะกาโรส (agarose gel) การคัดเลือก ดีเอนเอของสิ่งมีชีวิตเป้าหมายบนเจลอะกาโรส เพื่อให้ได้ดีเอนเอขนาดตามที่ต้องการ โดยการแยกดีเอนเอบนเจล อะกาโรสและตัดดีเอนเอบนเจลอะกาโรสในช่วง 30-60 กิโลเบส การสกัดดีเอนเอของสิ่งมีชีวิตเป้าหมายขนาดตามที่ ต้องการออกจากเจลอะกาโรส ด้วยวิธีอิเล็กโทรอีลูชั่น (Electroelution) การทำให้ดีเอนเอของสิ่งมีชีวิตเป้าหมายขนาด ตามที่ต้องการมีความเข้มข้นขึ้น (DNA concentration) ด้วยวิธีการตกตะกอนดีเอนเอด้วยเอทานอลและโซเดียม อะซิเตต การซ่อมแซมด้านปลายของดีเอนเอของสิ่งมีชีวิตเป้าหมายขนาดตามที่ต้องการ (DNA end repair) เพื่อให้ได้ ปลายดีเอนเอที่เหมาะสมในการเชื่อมต่อกับดีเอนเอพาหะ (vector) ที่มีปลายด้านทู่ได้ การเชื่อมชิ้นดีเอนเอของสิ่งมีชีวิต เป้าหมายขนาดตามที่ต้องการที่ซ่อมแซมด้านปลายแล้วเข้ากับดีเอนเอพาหะชนิดฟอสมิด (Ligation) เพื่อสร้างห้องสมุด ฟอสมิด การบรรจุห้องสมุดฟอสมิดลงในตัวฟาส (phage packaging) การโยกย้ายห้องสมุดฟอสมิดเข้าสู่เชื้อแบคทีเรีย Escherichia coli การเก็บห้องสมุดฟอสมิดลงในเพลท (Bacterial storage plate ) ที่ -80 องศาเซลเซียส แก้ไขบทสรุปการประดิษฐ์ 24/06/2559 การประดิษฐ์นี้มีจุดมุ่งหมายเพื่อปรับปรุงกระบวนการสร้างห้องสมุดฟอสมิด (fosmid library) ในสิ่งมีชีวิต เพื่อเป็นทางอีกทางเลือกที่มีขั้นตอนไม่ยุ่งยาก ซึ่งจะช่วยลดระยะเวลาการทำงานลงได้ 1-2 วัน จึงมีผลต่อการลดการใช้ แรงงาน สารเคมี และค่าใช้จ่ายลง โดยมีคุณภาพของห้องสมุดฟอสมิดยังคงดีในระดับมาตรฐานยอมรับได้ เพื่อการนำ ห้องสมุดฟอสมิดไปใช้งานต่อในอนาคต โดยที่กระบวนการตามการประดิษฐ์นี้สามารถประยุกต์ใช้ได้กับดีเอนเอของ สิ่งมีชีวิตทุกชนิดไม่ว่าจะเป็นสิ่งมีชีวิตที่มีจีโอโนมขนาดเล็ก เช่น จุลินทรีย์ และสามารถใช้ได้ในสิ่งมีชีวิตที่มีจีโนมขนาด ใหญ่ เช่น พืชและสัตว์เป็นต้น โดยกระบวนการ ประกอบด้วยขั้นตอน ดังนี้ การสกัดดีเอ็นเอของสิ่งมีชีวิตเป้าหมาย การทำดีเอ็นเอของสิ่งมีชีวิตเป้าหมาย ให้มีขนาดเล็กลงด้วยวิธีการทางภายภาพ (physical shearing)เพื่อให้ได้ดีเอนเอ ขนาดเหมาะสมในการโคลนนิ่ง โดยประเมินขนาดของดีเอ็นเอเบื้องต้นเจลอะกาโรส (agarose gel) การคัดเลือก ดีเอนเอของสิ่งมีชีวิตเป้าหมายบนเจลอะกาโรส เพื่อให้ได้ดีเอนเอขนาดตามที่ต้องการ โดยการแยกดีเอนเอบนเจล อะกาโรสและตัดดีเอนเอบนเจลอะกาโรสในช่วง 30-60 กิโลเบส การสกัดดีเอนเอของสิ่งมีชีวิตเป้าหมายขนาดตามที่ ต้องการออกจากเจลอะกาโรส ด้วยวิธีอิเล็กโทรอีลูชั่น Electroelution) การทำให้ดีเอนเอของสิ่งมีชีวิตเป้าหมายขนาด ตามที่ต้องการมีความเข้มข้นขึ้น (DNA concentration) ด้วยวิธีการตกตะกอนดีเอนเอด้วยเอทานอลและโซเดียม อะซิเตต การซ่อมแซมด้านปลายของดีเอนเอของสิ่งมีชีวิตเป้าหมายขนาดตามที่ต้องการ (DNA end repair) เพื่อให้ได้ ปลายดีเอนเอที่เหมาะสมในการเชื่อมต่อกับดีเอนเอพาหะ (vector) ที่มีปลายด้านทู่ได้ การเชื่อมชิ้นดีเอนเอของสิ่งมีชีวิต เป้าหมายขนาดตามที่ต้องการที่ซ่อมซ่อมด้านปลายแล้วเข้ากับดีเอนเอพาหะชนิดฟอสมิด (Ligation) เพื่อสร้างห้องสมุด ฟอสมิด การบรรจุห้องสมุดฟอสมิดลงในตัวฟาส (phage packaging) การโยกย้ายห้องสมุดฟอสมิดเข้าสู่เชื้อแบคทีเรีย Escherichia coli การเก็บห้องสมุดฟอสมิดลงในเพลท (Bacterial storage plate ) ที่ -80 องศาเซลเซียส ------------------------------------------------------------------ การประดิษฐ์นี้มีจุดมุ่งหมายเพื่อปรับปรุกระบวนการสร้างห้องสมุดฟอสมิด (fosmid library) ในสิ่งมีชีวิต เพื่อเป็นทางอีกทางเลือกที่มีขั้นตอนไม่ยุ่งยาก ซึ่งจะช่วยลดระยะเวลาการทำงานลงได้ 1-2 วัน จึงมีผลต่อการลดการใช้ แรงงาน สารเคมี และค่าใช้จ่ายลง โดยมีคุณภาพของห้องสมุดฟอสมิดยังคงดีในระดับมาตรฐานยอมรับได้ เพื่อการนำ ห้องสมุดฟอสมิดไปใช้งานต่อในอนาคต โดยที่กระบวนการตามการประดิษฐ์สามารถประยุกต์ใช้ได้กับดีเอนเอของ สิ่งมีชีวิตทุกชนิดไม่ว่าจะเป็นสิ่งมีชีวิตที่มีจีโอโนมขนาดเล็ก เช่น จุลินทรีย์และสามารถใช้ได้ในสิ่งมีชีวิตที่มีจีโนมขนาด ใหญ่ เช่น พืชและสัตว์เป็นต้น โดยกระบวนการ ประกอบด้วยขั้นตอน ดังนี้ การสกัดดีเอ็นเอของสิ่งมีชีวิตเป้าหมาย การทำดีเอ็นเอของสิ่งมีชีวิตเป้าหมายให้มีขนาดเล็กลงด้วยวิธีทางการภายภาพ (physical shearing)เพื่อให้ได้ดีเอนเอ ขนาดเหมาะสมในการโคลนนิ่ง โดยประเมินขนาดของดีเอ็นเอเบื้องต้นเจลอะกาโรส (agarose gel) การคัดเลือก ดีเอนเอของสิ่งมีชีวิตเป้าหมายบนเจลอะกาโรส เพื่อให้ได้ดีเอนเอขนาดตามที่ต้องการโดยการแยกดีเอนเอบนเจล อะกาโรสและตัดดีเอนเอบนเจลอะกาโรสในช่วง 30-60 กิโลเบส การสกัดดีเอนเอของสิ่งมีชีวิตเป้าหมายขนาดตามที่ต้องการออกจากเจลอะกาโรส ด้วยวิธีอิเล็กโทรอีลูชั่น Electroelution) การทำให้ดีเอนเอของสิ่งมีชีวิตเป้าหมายขนาดตามที่ต้องการมีความเข้มข้นขึ้น DNA concentration) ด้วยวิธีการตกตะกอนดีเอนเอด้วยเอทานอลและโซเดียม อะซิเตต การซ่อมแซมด้านปลายของดีเอนเอของสิ่งมีชีวิตเป้าหมายขนาดตามที่ต้องการ (DNA end repair) เพื่อให้ได้ปลายดีเอนเอที่เหมาะสมในการเชื่อมต่อกับดีเอนเอพาหะ (vector) ที่มีปลายด้านทู่ได้ การเชื่อมชิ้นดีเอนเอของสิ่งมีชีวิตเป้าหมายขนาดตามที่ต้องการที่ซ่อมซ่อมแซมด้านปลายแล้วเข้ากับดีเอนเอพาหะชนิดฟอสมิด (Ligation) เพื่อสร้างห้องสมุดฟอสมิด การบรรจุห้องสมุดฟอสมิดลงในตัวฟาส (phage packaging) การโยกย้ายห้องสมุดฟอสมิดเข้าสู่เชื้อแบคทีเรีย Escherichia coli การเก็บห้องสมุดฟอสมิดลงในเพลท (Bacterial storage plate ) ที่ -80 องศาเซลเซียส

Claims (2)

ข้อถือสิทธฺ์ (ทั้งหมด) ซึ่งจะไม่ปรากฏบนหน้าประกาศโฆษณา :แก้ไข 24/6/2559
1. กระบวนการสร้างห้องสมุดฟอสมิดของสิ่งที่ซึ่งประกอบด้วยขั้นตอนดังนี้ 1.1 การสกัดดีเอนเอของสิ่งมีชีวิตเป้าหมาย เลือกได้จาก วิธีการเตรียมในรูปของดีเอนเอฝังอยู่ในเจล (plug) หรือ การเตรียมด้วยซีแทบ (cetyl trimethyl ammonium bromide; CTAB) หรือ การเตรียมด้วย แอลคาไลน์ไลน์ไลซิส (alkaline lysis) อย่างใดอย่างหนึ่ง 1.2 การทำดีเอนเอของสิ่งมีชีวิตเป้าหมาย ให้มีขนาดเล็กลงด้วยวิธีการทางกายภาพ (physical shearing) เลือกได้จาก วิธีการดูดขึ้นดูดลง (pipetting) หรือ การเพิ่มความเย็นแล้วลดความเย็น (freeze thaw cycle) เพื่อให้ได้ดีเอนเอขนาดเหมาะสมในการโคลนนิ่ง โดยประเมินขนาดของดีเอนเอเบื้องต้นบน เจลอะกาโรส (agarose gel) 1.3 การคัดเลือกดีเอนเอของสิ่งมีชีวิตเป้าหมายบนเจลอะกาโรส เพื่อให้ได้ดีเอนเอขนาดที่ต้องการ โดยการแยกดีเอนเอเจลอะกาโรสและตัดดีเอนเอบนเจลอะกาโรสในช่วง 30-60 กิโลเบส 1.4 การสกัดดีเอนเอของสิ่งมีชีวิตเป้าหมายขนาดตามที่ต้องการออกจากเจลอะกาโรส ด้วยวิธีอิเล็กโทร อีลูชั่น (Electroelution) 1.5 การทำให้ดีเอนเอของสิ่งมีชีวิตเป้าหมายขนาดตามที่ต้องการมีความเข้มข้นขึ้น (DNA concentration) ด้วยวิธีการตกตะกอนดีเอนเอด้วยเอทานอลและโซเดียมอะซิเตต 1.6 การซ่อมแซมด้านปลายของดีเอนเอของสิ่งมีชีวิตเป้าหมายขนาดตามที่ต้องการ (DNA end repair) เพื่อให้ได้ปลายดีเอนเอที่เหมาะสมในการเชื่อมต่อกับดีเอนเอพาหะ (vector) ที่มีปลายด้านทู่ได้ 1.7 การเชื่อมชิ้นดีเอนเอของสิ่งมีชีวิตเป้าหมายขนาดตามที่ต้องการที่ซ่อมแซมด้านปลายแล้วเข้ากับ ดีเอาเอพาหะชนิดฟอสมิด (Ligation) เพื่อสร้างห้องสมุดฟอสมิด 1.8 การบรรจุห้องสมุดฟอสมิดลงในตัวฟาส (phage packaging) 1.9 การโยกย้ายห้องสมุดฟอสมิดเข้าสู่เชื้อแบคทีเรีย Escherichia coli 1.10 การเก็บห้องสมุดฟอสมิดลงในเพลท (Bacterial storahe plate) ที่ -80 องศาเซลเซียส
2. กระบวนการสร้างห้องสมุดฟอสมิดของสิ่งมีชีวิตตามข้อถือสิทธิ 1 ที่ซึ่งสิ่งมีชีวิตเป้าหมายเลือกได้จาก พืช หรือ สัตว์ หรือจุลินทรีย์ อย่างใดอย่างหนึ่ง ------------------------------------------------------------------------ 1.กระบวนการสร้างห้องสมุดฟอสมิดของสิ่งมีชีวิตที่ซึ่งประกอบด้วยขั้นตอนดังนี้ 1.1 การสกัดดีเอนเอของสิ่งมีชีวิตเป้าหมาย 1.2 การทำดีเอนเอของสิ่งมีชีวิตเป้าหมาย ให้มีขนาดเล็กลงด้วยวิธีการทางกายภาพ (physical shearing) เพื่อให้ได้ดีเอนเอขนาดเหมาะสมในการโคลนนิ่ง โดยประเมินขนาดของดีเอ็นเอเบื้องต้นเจล อะกาโรส (agarose gel) 1.3 การคัดเลือกดีเอนเอของสิ่งมีชีวิตเป้าหมายบนเจลอะกาโรส เพื่อให้ได้ดีเอนเอขนาดตามที่ต้องการ โดยการแยกดีเอนเอบนเจลอะกาโรสและตัดดีเอนเอบนเจลอะกาโรสในช่วง 30-60 กิโลเบส 1.4การสกัดดีเอนเอของสิ่งมีชีวิตเป้าหมายขนาดตามที่ต้องการออกจากเจลอะกาโรส ด้วยวิธีอิเล็กโทร อีลูชั่น Electroelution) 1.5 การทำให้ดีเอนเอของสิ่งมีชีวิตเป้าหมายขนาดตามที่ต้องการมีความเข้มข้นขึ้น DNA concentration) ด้วยวิธีการตกตะกอนดีเอนเอด้วยเอทานอลและโซเดียมอะซิเตต 1.6 การซ่อมแซมด้านปลายของดีเอนเอของสิ่งมีชีวิตเป้าหมายขนาดตามที่ต้องการ (DNA end repair) เพื่อให้ได้ปลายดีเอนเอที่เหมาะสมในการเชื่อมต่อกับดีเอนเอพาหะ (vector) ที่มีปลายด้านทู่ได้ 1.7 การเชื่อมชิ้นดีเอนเอของสิ่งมีชีวิตเป้าหมายขนาดตามที่ต้องการที่ซ่อมซ่อมแซมด้านปลายแล้วเข้ากับ ดีเอนเอพาหะชนิดฟอสมิด (Ligation) เพื่อสร้างห้องสมุดฟอสมิด 1.8 การบรรจุห้องสมุดฟอสมิดลงในตัวฟาส (phage packaging) 1.9 การโยกย้ายห้องสมุดฟอสมิดเข้าสู่เชื้อแบคทีเรีย Escherichia coli 1.10 การเก็บห้องสมุดฟอสมิดลงในเพลท (Bacterial storage plate ) ที่ -80 องศาเซลเซียส
TH1403000167U 2014-02-21 กระบวนการสร้างห้องสมุดฟอสมิด (fosmid library) ของสิ่งมีชีวิต TH12409A3 (th)

Publications (2)

Publication Number Publication Date
TH12409C3 true TH12409C3 (th) 2017-02-10
TH12409A3 TH12409A3 (th) 2017-02-10

Family

ID=

Similar Documents

Publication Publication Date Title
EA201892810A1 (ru) Гибридные последовательности нуклеиновых кислот для геномной инженерии
ES2768976T3 (es) Edición de genoma mediada por nucleasa
MX2018015529A (es) Etiquetado utilizando transposomas inmovilizados con ligadores.
US8748134B2 (en) Transcription activator-like effector assembly
CN102061291B (zh) 一种溶菌酶及其制备和应用
AU2017286122A1 (en) Use of Cpf1 endonuclease for plant genome modifications
HRP20201040T1 (hr) Inženjering složenog genoma omogućen sustavom crispr
MX388092B (es) Metodos mejorados para la modificacion de acido nucleicos diana.
EP3699280A3 (en) Novel cas9 systems and methods of use
SG10201807736SA (en) Composition and method for stabilizing nucleic acids in biological samples
WO2017109167A3 (en) Reconstitution of dna-end repair pathway in prokaryotes
TH12409C3 (th) กระบวนการสร้างห้องสมุดฟอสมิด (fosmid library) ของสิ่งมีชีวิต
TH12409A3 (th) กระบวนการสร้างห้องสมุดฟอสมิด (fosmid library) ของสิ่งมีชีวิต
CN105671061A (zh) 植物乳杆菌素plnE和plnF的异源表达方法
CN104313044A (zh) 零背景克隆载体及其制备方法和应用
RU2016145258A (ru) Микроорганизм, обладающий улучшенным уровнем внутриклеточной энергии, и способ продуцирования l-аминокислоты с его помощью
Andreou Isolation of plasmid DNA from bacteria
CN101200718B (zh) 类人胶原蛋白基因、其不同重复数的同向串联基因、含有串联基因的重组质粒及制备方法
Badr et al. Genome editing by site-directed nucleases and its applications in producing climate change resilient crop plants
EA200600585A1 (ru) Система селекции, содержащая маркеры селекции, не связанные с устойчивостью к антибиотикам
Vasilyev et al. The mathematical model of grain drying with the use of electroactivated air
CN111278983A (zh) 基因敲除方法
ROCHA et al. CRISPR/CAS GENOME EDITING: INNOVATIONS AND IMPACTS ON ANIMAL PROTEIN PRODUCTION
Moradian et al. Construction of T-vector derived from pBluescript ΙΙ SK with a positive selection marker, a rapid system for cloning
CN102286518A (zh) 构建严谨型t7表达系统宿主菌的方法