SK5402001A3 - Prv-1 gene and the use thereof - Google Patents
Prv-1 gene and the use thereof Download PDFInfo
- Publication number
- SK5402001A3 SK5402001A3 SK540-2001A SK5402001A SK5402001A3 SK 5402001 A3 SK5402001 A3 SK 5402001A3 SK 5402001 A SK5402001 A SK 5402001A SK 5402001 A3 SK5402001 A3 SK 5402001A3
- Authority
- SK
- Slovakia
- Prior art keywords
- polypeptide
- prv
- seq
- polynucleotide
- cells
- Prior art date
Links
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 title abstract description 55
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims abstract description 55
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims abstract description 54
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims abstract description 53
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims abstract description 32
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims abstract description 32
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 23
- 101000980845 Homo sapiens CD177 antigen Proteins 0.000 claims abstract 2
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims description 29
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims description 25
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 claims description 22
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 claims description 22
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 claims description 22
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 claims description 13
- 239000003102 growth factor Substances 0.000 claims description 11
- 208000037244 polycythemia vera Diseases 0.000 claims description 11
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims description 10
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 claims description 8
- 210000001185 bone marrow Anatomy 0.000 claims description 7
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 claims description 7
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims description 6
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 6
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 claims description 5
- 206010033661 Pancytopenia Diseases 0.000 claims description 4
- 238000003757 reverse transcription PCR Methods 0.000 claims description 4
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 claims description 3
- 238000012286 ELISA Assay Methods 0.000 claims description 2
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 claims description 2
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims 2
- 102100024209 CD177 antigen Human genes 0.000 claims 1
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims 1
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 claims 1
- 210000000777 hematopoietic system Anatomy 0.000 claims 1
- 238000002331 protein detection Methods 0.000 claims 1
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 73
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 25
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 25
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 24
- 240000006711 Pistacia vera Species 0.000 description 19
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 19
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 18
- 210000003714 granulocyte Anatomy 0.000 description 16
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 15
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 14
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 14
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 12
- 241001430294 unidentified retrovirus Species 0.000 description 12
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 11
- 230000003394 haemopoietic effect Effects 0.000 description 10
- 241000282414 Homo sapiens Species 0.000 description 8
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 8
- 210000003013 erythroid precursor cell Anatomy 0.000 description 8
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 8
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 8
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 8
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 8
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 7
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 6
- 230000001605 fetal effect Effects 0.000 description 6
- 239000005090 green fluorescent protein Substances 0.000 description 6
- 239000013615 primer Substances 0.000 description 6
- 108020005544 Antisense RNA Proteins 0.000 description 5
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 5
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 5
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 5
- 239000003184 complementary RNA Substances 0.000 description 5
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 5
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 4
- 238000002512 chemotherapy Methods 0.000 description 4
- 230000000925 erythroid effect Effects 0.000 description 4
- XKUKSGPZAADMRA-UHFFFAOYSA-N glycyl-glycyl-glycine Chemical compound NCC(=O)NCC(=O)NCC(O)=O XKUKSGPZAADMRA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 4
- 239000008188 pellet Substances 0.000 description 4
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 4
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 4
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 3
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 3
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 3
- NFDYGNFETJVMSE-BQBZGAKWSA-N Ser-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO NFDYGNFETJVMSE-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 3
- 208000017733 acquired polycythemia vera Diseases 0.000 description 3
- 210000003743 erythrocyte Anatomy 0.000 description 3
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 3
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 3
- 210000005229 liver cell Anatomy 0.000 description 3
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 3
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 3
- 229920000609 methyl cellulose Polymers 0.000 description 3
- 239000001923 methylcellulose Substances 0.000 description 3
- 230000002018 overexpression Effects 0.000 description 3
- OXCMYAYHXIHQOA-UHFFFAOYSA-N potassium;[2-butyl-5-chloro-3-[[4-[2-(1,2,4-triaza-3-azanidacyclopenta-1,4-dien-5-yl)phenyl]phenyl]methyl]imidazol-4-yl]methanol Chemical compound [K+].CCCCC1=NC(Cl)=C(CO)N1CC1=CC=C(C=2C(=CC=CC=2)C2=N[N-]N=N2)C=C1 OXCMYAYHXIHQOA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 3
- 239000000047 product Substances 0.000 description 3
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 3
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 3
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 3
- 208000032791 BCR-ABL1 positive chronic myelogenous leukemia Diseases 0.000 description 2
- 208000010833 Chronic myeloid leukaemia Diseases 0.000 description 2
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 2
- 239000003155 DNA primer Substances 0.000 description 2
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 2
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 2
- 102000003951 Erythropoietin Human genes 0.000 description 2
- 108090000394 Erythropoietin Proteins 0.000 description 2
- 208000032027 Essential Thrombocythemia Diseases 0.000 description 2
- MFBYPDKTAJXHNI-VKHMYHEASA-N Gly-Cys Chemical compound [NH3+]CC(=O)N[C@@H](CS)C([O-])=O MFBYPDKTAJXHNI-VKHMYHEASA-N 0.000 description 2
- NNCSJUBVFBDDLC-YUMQZZPRSA-N Gly-Leu-Ser Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O NNCSJUBVFBDDLC-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- 206010061218 Inflammation Diseases 0.000 description 2
- 208000033761 Myelogenous Chronic BCR-ABL Positive Leukemia Diseases 0.000 description 2
- 208000014767 Myeloproliferative disease Diseases 0.000 description 2
- 238000000636 Northern blotting Methods 0.000 description 2
- HEJJDUDEHLPDAW-CUJWVEQBSA-N Thr-His-Cys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N)O HEJJDUDEHLPDAW-CUJWVEQBSA-N 0.000 description 2
- NHQVWACSJZJCGJ-FLBSBUHZSA-N Thr-Thr-Ile Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O NHQVWACSJZJCGJ-FLBSBUHZSA-N 0.000 description 2
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 2
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 2
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 description 2
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 2
- 108010069495 cysteinyltyrosine Proteins 0.000 description 2
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 2
- 229940105423 erythropoietin Drugs 0.000 description 2
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 2
- 108010067216 glycyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 2
- 108010089804 glycyl-threonine Proteins 0.000 description 2
- 230000011132 hemopoiesis Effects 0.000 description 2
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 2
- 230000004054 inflammatory process Effects 0.000 description 2
- 230000016507 interphase Effects 0.000 description 2
- 235000015110 jellies Nutrition 0.000 description 2
- 239000008274 jelly Substances 0.000 description 2
- 108010064235 lysylglycine Proteins 0.000 description 2
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 2
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 2
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 2
- 238000004806 packaging method and process Methods 0.000 description 2
- 239000011535 reaction buffer Substances 0.000 description 2
- 238000010839 reverse transcription Methods 0.000 description 2
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 2
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 2
- JUEUYDRZJNQZGR-UHFFFAOYSA-N 2-[[2-[[2-[(2-amino-4-methylpentanoyl)amino]-4-methylpentanoyl]amino]acetyl]amino]-3-phenylpropanoic acid Chemical compound CC(C)CC(N)C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)NCC(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 JUEUYDRZJNQZGR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000031261 Acute myeloid leukaemia Diseases 0.000 description 1
- UWIQWPWWZUHBAO-ZLIFDBKOSA-N Ala-Leu-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](C)N)CC(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 UWIQWPWWZUHBAO-ZLIFDBKOSA-N 0.000 description 1
- IPWKGIFRRBGCJO-IMJSIDKUSA-N Ala-Ser Chemical compound C[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CO)C([O-])=O IPWKGIFRRBGCJO-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- SYIFFFHSXBNPMC-UWJYBYFXSA-N Ala-Ser-Tyr Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)O)N SYIFFFHSXBNPMC-UWJYBYFXSA-N 0.000 description 1
- OGUPCHKBOKJFMA-SRVKXCTJSA-N Arg-Glu-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N OGUPCHKBOKJFMA-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- AQPVUEJJARLJHB-BQBZGAKWSA-N Arg-Gly-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N AQPVUEJJARLJHB-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- LVMUGODRNHFGRA-AVGNSLFASA-N Arg-Leu-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O LVMUGODRNHFGRA-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- MJINRRBEMOLJAK-DCAQKATOSA-N Arg-Lys-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N MJINRRBEMOLJAK-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- VVJTWSRNMJNDPN-IUCAKERBSA-N Arg-Met-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)NCC(O)=O VVJTWSRNMJNDPN-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- KSUALAGYYLQSHJ-RCWTZXSCSA-N Arg-Met-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O KSUALAGYYLQSHJ-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 1
- PGUYEUCYVNZGGV-QWRGUYRKSA-N Asp-Gly-Tyr Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 PGUYEUCYVNZGGV-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- AITKTFCQOBRJTG-CIUDSAMLSA-N Asp-Leu-Cys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N AITKTFCQOBRJTG-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- JSNWZMFSLIWAHS-HJGDQZAQSA-N Asp-Thr-Leu Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N)O JSNWZMFSLIWAHS-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N Asparagine Natural products OC(=O)C(N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 1
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 1
- RGTVXXNMOGHRAY-WDSKDSINSA-N Cys-Arg Chemical compound SC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N RGTVXXNMOGHRAY-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- YZFCGHIBLBDZDA-ZLUOBGJFSA-N Cys-Asp-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YZFCGHIBLBDZDA-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- XLLSMEFANRROJE-GUBZILKMSA-N Cys-Leu-Glu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N XLLSMEFANRROJE-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- SRIRHERUAMYIOQ-CIUDSAMLSA-N Cys-Leu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O SRIRHERUAMYIOQ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- YNJBLTDKTMKEET-ZLUOBGJFSA-N Cys-Ser-Ser Chemical compound SC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YNJBLTDKTMKEET-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- 229920002307 Dextran Polymers 0.000 description 1
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 1
- 102100031939 Erythropoietin Human genes 0.000 description 1
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 1
- JJKKWYQVHRUSDG-GUBZILKMSA-N Glu-Ala-Lys Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O JJKKWYQVHRUSDG-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- PAQUJCSYVIBPLC-AVGNSLFASA-N Glu-Asp-Phe Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 PAQUJCSYVIBPLC-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- AUTNXSQEVVHSJK-YVNDNENWSA-N Glu-Glu-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O AUTNXSQEVVHSJK-YVNDNENWSA-N 0.000 description 1
- LRPXYSGPOBVBEH-IUCAKERBSA-N Glu-Gly-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O LRPXYSGPOBVBEH-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- ITBHUUMCJJQUSC-LAEOZQHASA-N Glu-Ile-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(O)=O ITBHUUMCJJQUSC-LAEOZQHASA-N 0.000 description 1
- SJJHXJDSNQJMMW-SRVKXCTJSA-N Glu-Lys-Arg Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O SJJHXJDSNQJMMW-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- IDEODOAVGCMUQV-GUBZILKMSA-N Glu-Ser-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O IDEODOAVGCMUQV-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- YQAQQKPWFOBSMU-WDCWCFNPSA-N Glu-Thr-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O YQAQQKPWFOBSMU-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 1
- IWAXHBCACVWNHT-BQBZGAKWSA-N Gly-Asp-Arg Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N IWAXHBCACVWNHT-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- IANBSEOVTQNGBZ-BQBZGAKWSA-N Gly-Cys-Met Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O IANBSEOVTQNGBZ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- QCTLGOYODITHPQ-WHFBIAKZSA-N Gly-Cys-Ser Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O QCTLGOYODITHPQ-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- VNBNZUAPOYGRDB-ZDLURKLDSA-N Gly-Cys-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)CN)O VNBNZUAPOYGRDB-ZDLURKLDSA-N 0.000 description 1
- CCQOOWAONKGYKQ-BYPYZUCNSA-N Gly-Gly-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)CNC(=O)CN CCQOOWAONKGYKQ-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- PAWIVEIWWYGBAM-YUMQZZPRSA-N Gly-Leu-Ala Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O PAWIVEIWWYGBAM-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- CCBIBMKQNXHNIN-ZETCQYMHSA-N Gly-Leu-Gly Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O CCBIBMKQNXHNIN-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 1
- UHPAZODVFFYEEL-QWRGUYRKSA-N Gly-Leu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)CN UHPAZODVFFYEEL-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- LHYJCVCQPWRMKZ-WEDXCCLWSA-N Gly-Leu-Thr Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O LHYJCVCQPWRMKZ-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 1
- UWQDKRIZSROAKS-FJXKBIBVSA-N Gly-Met-Thr Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O UWQDKRIZSROAKS-FJXKBIBVSA-N 0.000 description 1
- WNGHUXFWEWTKAO-YUMQZZPRSA-N Gly-Ser-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)CN WNGHUXFWEWTKAO-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- OLIFSFOFKGKIRH-WUJLRWPWSA-N Gly-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN OLIFSFOFKGKIRH-WUJLRWPWSA-N 0.000 description 1
- XHVONGZZVUUORG-WEDXCCLWSA-N Gly-Thr-Lys Chemical compound NCC(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN XHVONGZZVUUORG-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 1
- TVTZEOHWHUVYCG-KYNKHSRBSA-N Gly-Thr-Thr Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O TVTZEOHWHUVYCG-KYNKHSRBSA-N 0.000 description 1
- VPZXBVLAVMBEQI-VKHMYHEASA-N Glycyl-alanine Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)CN VPZXBVLAVMBEQI-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- 201000005569 Gout Diseases 0.000 description 1
- 206010018690 Granulocytosis Diseases 0.000 description 1
- 108010043121 Green Fluorescent Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000004144 Green Fluorescent Proteins Human genes 0.000 description 1
- 206010019233 Headaches Diseases 0.000 description 1
- 102000001554 Hemoglobins Human genes 0.000 description 1
- 108010054147 Hemoglobins Proteins 0.000 description 1
- 208000032843 Hemorrhage Diseases 0.000 description 1
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 description 1
- ZIMTWPHIKZEHSE-UWVGGRQHSA-N His-Arg-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(O)=O ZIMTWPHIKZEHSE-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- AKEDPWJFQULLPE-IUCAKERBSA-N His-Glu-Gly Chemical compound N[C@@H](Cc1cnc[nH]1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O AKEDPWJFQULLPE-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- WRPDZHJNLYNFFT-GEVIPFJHSA-N His-Thr Chemical compound C[C@@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)N)O WRPDZHJNLYNFFT-GEVIPFJHSA-N 0.000 description 1
- 206010020772 Hypertension Diseases 0.000 description 1
- MQFGXJNSUJTXDT-QSFUFRPTSA-N Ile-Gly-Ile Chemical compound N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)O MQFGXJNSUJTXDT-QSFUFRPTSA-N 0.000 description 1
- CMNMPCTVCWWYHY-MXAVVETBSA-N Ile-His-Leu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)O)N CMNMPCTVCWWYHY-MXAVVETBSA-N 0.000 description 1
- FGBRXCZYVRFNKQ-MXAVVETBSA-N Ile-Phe-Ser Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N FGBRXCZYVRFNKQ-MXAVVETBSA-N 0.000 description 1
- DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N L-asparagine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- SENJXOPIZNYLHU-UHFFFAOYSA-N L-leucyl-L-arginine Natural products CC(C)CC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCCN=C(N)N SENJXOPIZNYLHU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- HYMLKESRWLZDBR-WEDXCCLWSA-N Leu-Gly-Thr Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O HYMLKESRWLZDBR-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 1
- HRTRLSRYZZKPCO-BJDJZHNGSA-N Leu-Ile-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O HRTRLSRYZZKPCO-BJDJZHNGSA-N 0.000 description 1
- IFMPDNRWZZEZSL-SRVKXCTJSA-N Leu-Leu-Cys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O IFMPDNRWZZEZSL-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- FAELBUXXFQLUAX-AJNGGQMLSA-N Leu-Leu-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CC(C)C FAELBUXXFQLUAX-AJNGGQMLSA-N 0.000 description 1
- AMSSKPUHBUQBOQ-SRVKXCTJSA-N Leu-Ser-Lys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N AMSSKPUHBUQBOQ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- LINKCQUOMUDLKN-KATARQTJSA-N Leu-Thr-Cys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)N)O LINKCQUOMUDLKN-KATARQTJSA-N 0.000 description 1
- CNWDWAMPKVYJJB-NUTKFTJISA-N Leu-Trp-Ala Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O)=CNC2=C1 CNWDWAMPKVYJJB-NUTKFTJISA-N 0.000 description 1
- CANPXOLVTMKURR-WEDXCCLWSA-N Lys-Gly-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CCCCN CANPXOLVTMKURR-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 1
- GILLQRYAWOMHED-DCAQKATOSA-N Lys-Val-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN GILLQRYAWOMHED-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- YORIKIDJCPKBON-YUMQZZPRSA-N Met-Glu-Gly Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O YORIKIDJCPKBON-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- OSZTUONKUMCWEP-XUXIUFHCSA-N Met-Leu-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CCSC OSZTUONKUMCWEP-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 1
- KZKVVWBOGDKHKE-QTKMDUPCSA-N Met-Thr-His Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CNC=N1 KZKVVWBOGDKHKE-QTKMDUPCSA-N 0.000 description 1
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 1
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 1
- 108010079364 N-glycylalanine Proteins 0.000 description 1
- 101100205189 Neurospora crassa (strain ATCC 24698 / 74-OR23-1A / CBS 708.71 / DSM 1257 / FGSC 987) leu-5 gene Proteins 0.000 description 1
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 1
- 102000000447 Peptide-N4-(N-acetyl-beta-glucosaminyl) Asparagine Amidase Human genes 0.000 description 1
- 108010055817 Peptide-N4-(N-acetyl-beta-glucosaminyl) Asparagine Amidase Proteins 0.000 description 1
- QPVFUAUFEBPIPT-CDMKHQONSA-N Phe-Gly-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O QPVFUAUFEBPIPT-CDMKHQONSA-N 0.000 description 1
- AFNJAQVMTIQTCB-DLOVCJGASA-N Phe-Ser-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 AFNJAQVMTIQTCB-DLOVCJGASA-N 0.000 description 1
- KDBHVPXBQADZKY-GUBZILKMSA-N Pro-Pro-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H]1NCCC1 KDBHVPXBQADZKY-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- 208000003251 Pruritus Diseases 0.000 description 1
- 108010003201 RGH 0205 Proteins 0.000 description 1
- 208000001647 Renal Insufficiency Diseases 0.000 description 1
- 206010040047 Sepsis Diseases 0.000 description 1
- FIXILCYTSAUERA-FXQIFTODSA-N Ser-Ala-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O FIXILCYTSAUERA-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- YQHZVYJAGWMHES-ZLUOBGJFSA-N Ser-Ala-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YQHZVYJAGWMHES-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- HBZBPFLJNDXRAY-FXQIFTODSA-N Ser-Ala-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O HBZBPFLJNDXRAY-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- BGOWRLSWJCVYAQ-CIUDSAMLSA-N Ser-Asp-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O BGOWRLSWJCVYAQ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- FFOKMZOAVHEWET-IMJSIDKUSA-N Ser-Cys Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O FFOKMZOAVHEWET-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- YMTLKLXDFCSCNX-BYPYZUCNSA-N Ser-Gly-Gly Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O YMTLKLXDFCSCNX-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- UIGMAMGZOJVTDN-WHFBIAKZSA-N Ser-Gly-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O UIGMAMGZOJVTDN-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- XZKQVQKUZMAADP-IMJSIDKUSA-N Ser-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XZKQVQKUZMAADP-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- ILZAUMFXKSIUEF-SRVKXCTJSA-N Ser-Ser-Phe Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 ILZAUMFXKSIUEF-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- NADLKBTYNKUJEP-KATARQTJSA-N Ser-Thr-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O NADLKBTYNKUJEP-KATARQTJSA-N 0.000 description 1
- 108020004682 Single-Stranded DNA Proteins 0.000 description 1
- 238000002105 Southern blotting Methods 0.000 description 1
- 206010041660 Splenomegaly Diseases 0.000 description 1
- VUKVQVNKIIZBPO-HOUAVDHOSA-N Thr-Asp-Trp Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)O)N)O VUKVQVNKIIZBPO-HOUAVDHOSA-N 0.000 description 1
- CUTPSEKWUPZFLV-WISUUJSJSA-N Thr-Cys Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O CUTPSEKWUPZFLV-WISUUJSJSA-N 0.000 description 1
- WDFPMSHYMRBLKM-NKIYYHGXSA-N Thr-Glu-His Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)N)O WDFPMSHYMRBLKM-NKIYYHGXSA-N 0.000 description 1
- BIENEHRYNODTLP-HJGDQZAQSA-N Thr-Glu-Met Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)O)N)O BIENEHRYNODTLP-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- UDNVOQMPQBEITB-MEYUZBJRSA-N Thr-His-Phe Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O UDNVOQMPQBEITB-MEYUZBJRSA-N 0.000 description 1
- DCRHJDRLCFMEBI-RHYQMDGZSA-N Thr-Lys-Met Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O DCRHJDRLCFMEBI-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 1
- GFRIEEKFXOVPIR-RHYQMDGZSA-N Thr-Pro-Lys Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O GFRIEEKFXOVPIR-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 1
- GXDLGHLJTHMDII-WISUUJSJSA-N Thr-Ser Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O GXDLGHLJTHMDII-WISUUJSJSA-N 0.000 description 1
- ZMYCLHFLHRVOEA-HEIBUPTGSA-N Thr-Thr-Ser Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O ZMYCLHFLHRVOEA-HEIBUPTGSA-N 0.000 description 1
- XEVHXNLPUBVQEX-DVJZZOLTSA-N Thr-Trp-Gly Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)NCC(=O)O)N)O XEVHXNLPUBVQEX-DVJZZOLTSA-N 0.000 description 1
- 208000005485 Thrombocytosis Diseases 0.000 description 1
- 208000007536 Thrombosis Diseases 0.000 description 1
- DZHDVYLBNKMLMB-ZFWWWQNUSA-N Trp-Lys Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O)=CNC2=C1 DZHDVYLBNKMLMB-ZFWWWQNUSA-N 0.000 description 1
- YBRHKUNWEYBZGT-WLTAIBSBSA-N Trp-Thr Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(O)=O)=CNC2=C1 YBRHKUNWEYBZGT-WLTAIBSBSA-N 0.000 description 1
- LDKDSFQSEUOCOO-RPTUDFQQSA-N Tyr-Thr-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O LDKDSFQSEUOCOO-RPTUDFQQSA-N 0.000 description 1
- 208000025865 Ulcer Diseases 0.000 description 1
- LEHOTFFKMJEONL-UHFFFAOYSA-N Uric Acid Chemical compound N1C(=O)NC(=O)C2=C1NC(=O)N2 LEHOTFFKMJEONL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- TVWHNULVHGKJHS-UHFFFAOYSA-N Uric acid Natural products N1C(=O)NC(=O)C2NC(=O)NC21 TVWHNULVHGKJHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 description 1
- 230000002411 adverse Effects 0.000 description 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 1
- 208000007502 anemia Diseases 0.000 description 1
- 101150010487 are gene Proteins 0.000 description 1
- 229960001230 asparagine Drugs 0.000 description 1
- 235000009582 asparagine Nutrition 0.000 description 1
- 125000000613 asparagine group Chemical group N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)* 0.000 description 1
- 208000034158 bleeding Diseases 0.000 description 1
- 230000000740 bleeding effect Effects 0.000 description 1
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 description 1
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 1
- 230000032823 cell division Effects 0.000 description 1
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 1
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 1
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 1
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 1
- 230000001332 colony forming effect Effects 0.000 description 1
- 238000004440 column chromatography Methods 0.000 description 1
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 1
- 231100000433 cytotoxic Toxicity 0.000 description 1
- 230000001472 cytotoxic effect Effects 0.000 description 1
- 230000022811 deglycosylation Effects 0.000 description 1
- 239000013578 denaturing buffer Substances 0.000 description 1
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 210000002257 embryonic structure Anatomy 0.000 description 1
- 230000004720 fertilization Effects 0.000 description 1
- 239000012894 fetal calf serum Substances 0.000 description 1
- 108010006664 gamma-glutamyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 238000001415 gene therapy Methods 0.000 description 1
- 230000001279 glycosylating effect Effects 0.000 description 1
- 230000013595 glycosylation Effects 0.000 description 1
- 238000006206 glycosylation reaction Methods 0.000 description 1
- 229930004094 glycosylphosphatidylinositol Natural products 0.000 description 1
- VPZXBVLAVMBEQI-UHFFFAOYSA-N glycyl-DL-alpha-alanine Natural products OC(=O)C(C)NC(=O)CN VPZXBVLAVMBEQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 231100000869 headache Toxicity 0.000 description 1
- 238000005534 hematocrit Methods 0.000 description 1
- 208000014951 hematologic disease Diseases 0.000 description 1
- 210000003958 hematopoietic stem cell Anatomy 0.000 description 1
- 108010036413 histidylglycine Proteins 0.000 description 1
- 108010018006 histidylserine Proteins 0.000 description 1
- 210000004408 hybridoma Anatomy 0.000 description 1
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 1
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 1
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 description 1
- 230000003053 immunization Effects 0.000 description 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 1
- 108010027338 isoleucylcysteine Proteins 0.000 description 1
- 210000003734 kidney Anatomy 0.000 description 1
- 210000003292 kidney cell Anatomy 0.000 description 1
- 201000006370 kidney failure Diseases 0.000 description 1
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 1
- 108010000761 leucylarginine Proteins 0.000 description 1
- 108010091871 leucylmethionine Proteins 0.000 description 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 1
- 230000003211 malignant effect Effects 0.000 description 1
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 1
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 1
- 230000002297 mitogenic effect Effects 0.000 description 1
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 1
- 208000004235 neutropenia Diseases 0.000 description 1
- 210000000440 neutrophil Anatomy 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 1
- 210000000496 pancreas Anatomy 0.000 description 1
- 210000005259 peripheral blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000011886 peripheral blood Substances 0.000 description 1
- 230000002093 peripheral effect Effects 0.000 description 1
- 108010073101 phenylalanylleucine Proteins 0.000 description 1
- 210000001236 prokaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 1
- 108010093296 prolyl-prolyl-alanine Proteins 0.000 description 1
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 1
- 230000002285 radioactive effect Effects 0.000 description 1
- 238000003127 radioimmunoassay Methods 0.000 description 1
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 1
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 1
- 230000001177 retroviral effect Effects 0.000 description 1
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 1
- -1 secondary antibodies Substances 0.000 description 1
- 108010071207 serylmethionine Proteins 0.000 description 1
- 238000011895 specific detection Methods 0.000 description 1
- 210000000952 spleen Anatomy 0.000 description 1
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 1
- 210000000130 stem cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000004936 stimulating effect Effects 0.000 description 1
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 1
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 1
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 1
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 1
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 1
- 208000011580 syndromic disease Diseases 0.000 description 1
- 230000009885 systemic effect Effects 0.000 description 1
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 1
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 1
- 206010043554 thrombocytopenia Diseases 0.000 description 1
- 108010045269 tryptophyltryptophan Proteins 0.000 description 1
- 231100000397 ulcer Toxicity 0.000 description 1
- 241000701447 unidentified baculovirus Species 0.000 description 1
- 229940116269 uric acid Drugs 0.000 description 1
- 102000009816 urokinase plasminogen activator receptor activity proteins Human genes 0.000 description 1
- 108040001269 urokinase plasminogen activator receptor activity proteins Proteins 0.000 description 1
- 108700026220 vif Genes Proteins 0.000 description 1
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 1
- 210000005253 yeast cell Anatomy 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/475—Growth factors; Growth regulators
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/46—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
- C07K14/47—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P13/00—Drugs for disorders of the urinary system
- A61P13/12—Drugs for disorders of the urinary system of the kidneys
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P17/00—Drugs for dermatological disorders
- A61P17/04—Antipruritics
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P19/00—Drugs for skeletal disorders
- A61P19/06—Antigout agents, e.g. antihyperuricemic or uricosuric agents
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P25/00—Drugs for disorders of the nervous system
- A61P25/04—Centrally acting analgesics, e.g. opioids
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P29/00—Non-central analgesic, antipyretic or antiinflammatory agents, e.g. antirheumatic agents; Non-steroidal antiinflammatory drugs [NSAID]
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/04—Antibacterial agents
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
- A61P35/02—Antineoplastic agents specific for leukemia
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P7/00—Drugs for disorders of the blood or the extracellular fluid
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P7/00—Drugs for disorders of the blood or the extracellular fluid
- A61P7/02—Antithrombotic agents; Anticoagulants; Platelet aggregation inhibitors
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P7/00—Drugs for disorders of the blood or the extracellular fluid
- A61P7/06—Antianaemics
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P9/00—Drugs for disorders of the cardiovascular system
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P9/00—Drugs for disorders of the cardiovascular system
- A61P9/12—Antihypertensives
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Public Health (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Hematology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Diabetes (AREA)
- Pain & Pain Management (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Oncology (AREA)
- Rheumatology (AREA)
- Heart & Thoracic Surgery (AREA)
- Cardiology (AREA)
- Neurology (AREA)
- Dermatology (AREA)
- Physical Education & Sports Medicine (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Neurosurgery (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Description
Oblasť techniky
Predložený vynález sa týka nukleotidovej sekvencie, ktorá kóduje gén PRV-1, rekombinantnej DNA, ktorá obsahuje takúto nukleotidovú sekvenciu, vektora obsahujúceho túto rekombinantnú DNA a buniek transformovaných takým vektorom. Vynález sa ďalej týka polypeptidu PRV-1, protilátok proti tomuto polypeptidu, spôsobu detekcie polypeptidu PRV-1 a nakoniec tiež liečiv, ktoré obsahujú polypeptid PRV-1 alebo protilátky proti polypeptidu PRV-1.
Doterajší stav techniky
Polycythaemia rubra vera (erytrémia), skrátene tiež polycythaemia vera alebo p. vera, je malígne hematologické ochorenie, pri ktorom dochádza k zvýšenej tvorbe erytroidných, ganulocytárnych a megakaryocytárnych buniek. Ide o ochorenie klonálneho pôvodu vznikajúce v dôsledku mutácií v jedinej hematopoetickej prekurzorovej bunke. V Nemecku je výskyt p. vera 4 až 6 na milión obyvateľov. Ak sa ochorenie nelieči, vedie k úmrtiu do 18 mesiacov. Liečenie formou odberov krvi alebo chemoterapiou predlžuje čas prežitia v priemere na viac ako 13 rokov.
P. vera je diagnostikovaná na základe klinických príznakov. Ku klinickému obrazu patria bolesti hlavy, svrbenie, splenomegália u dvoch tretín pacientov, krvácanie alebo trombózy, hypertenzia u tretiny pacientov, dna vznikajúca v dôsledku zvýšenej tvorby kyseliny močovej, a v niektorých prípadoch septické vredy. Najdôležitejšími laboratórnymi nálezmi sú zvýšené hodnoty hemoglobínu, hematokritu, počtu erytrocytov a celkového objemu erytrocytov a tiež v mnohých prípadoch neutrofilná granulocytóza alebo trombocytóza. Takže vzhladom na to, že na jednej strane • ···· ·· ···· ·· ·· · ··· ··· • · · · · · · ··· · ·· ··· ·· ··· väčšina kritérií je relatívne vágnych, na druhej strane nie všetci pacienti tieto kritériá spĺňajú, je často veľmi ťažké odlíšiť p. vera od iných myeloproliferatívnych ochorení, ako je chronická granulocytárna leukémia alebo esenciálna trombocytóza, a potvrdiť tak diagnózu. Dnes sú základné príčiny ochorenia na molekulovej úrovni celkom neznáme. Avšak pretože neliečená p. vera má závažný priebeh a následky, je dôležitá presná diagnóza.
Podstata vynálezu
Predmetom a cieľom predloženého vynálezu je nájsť molekulárnu príčinu polycythaemia rubra vera a umožniť tak jej diagnostikovanie .
Ciel sa dosiahol tým, že sa izoloval gén, ktorý je špecificky exprimovaný v spojení s p. vera a nie u zdravých kontrolných jedincov. Tento gén sa nazval PRV-1 (podlá polycythaemia rubra vera).
Podobná nukleotidová sekvencia je opísaná v medzinárodnej patentovej prihláške WO 98/50552.
Jeden aspekt predloženého vynálezu sa týka polynukleotidu, ktorý kóduje gén PRV-1 a obsahuje sekvenciu č. 1. Polynukleotidom podľa vynálezu je jednoreťazcová alebo dvojreťazcová DNA alebo RNA. Keď je to RNA, je odborníkovi jasné, že sú tu nukleotidy U namiesto T nukleotidov. Termín polynukleotid podľa vynálezu označuje nukleovú kyselinu obsahujúcu 15 a viac nukleotidov.
Nukleotidová sekvencia podlá vynálezu je uvedená na obr. 1. Vynález sa teda týka polynukleotidu, ktorý zodpovedá sekvencii na obr. 1, a tiež polynukleotidu, ktorého sekvencia vykazuje menšie rozdiely. Sekvenciou s menšími rozdielmi sa podľa vynálezu rozumie sekvencia, kde len niekoľko, výhodne nie viac ako 50, výhodnejšie nie viac ako 25 nukleotidov sa môže zmeniť, avšak funkcia génu kódovaného takou nukleotidovou sekvenciou ···· ·· ···· ·· • · · · · · · e · · ··· · · ···· ····· ·· · zostáva nezmenená. Odborníkovi je známe, že triplet nukleotidov kódujúci aminokyselinu sa môže nahradiť iným tripletom, ktorý kóduje rovnakú aminokyselinu. Okrem toho úseky génu, ktoré majú menší význam, sa môžu v určitom menšom rozsahu deletovať a/alebo mutovať. V jednom uskutočnení vynálezu polynukleotid obsahuje nukleotidy 36 až 1346 zo sekvencie č. 1, to znamená kódujúci úsek z génu PRV-1. Iné uskutočnenie vynálezu obsahuje nukleotidy 36 až 1262 zo sekvencie č. 1. Predpokladá sa, že tento úsek kóduje aktívny úsek polypeptidu PRV-1. Ešte iný polynukleotid podľa vynálezu obsahuje nukleotidy 39 až 1346 alebo 39 až 1262 zo sekvencie č. 1, kde nie je prítomný kodón kódujúci začiatočný metionín. Výhodným uskutočnením vynálezu je napr. polynukleotid obsahujúci nukleotidy 9 až 1346 alebo 99 až 1262 zo sekvencie č. 1. Tak vznikajú polynukleotidy, kde kodóny na 5'-konci kódujúce signálny peptid PRV-1 polypeptidu nie sú prítomné.
Polynukleotidom podľa vynálezu je tiež fragment génu PRV-1. Spravidla má taký fragment viac ako 100 nukleotidov, avšak výhodne má viac ako 300 nukleotidov. Fragmenty sa môžu použiť ako oligonukleotidové priméry pre PCR alebo ako sondy, v takom prípade sa môžu fragmenty skrátiť tak, aby vyhovovali zamýšľanému cieľu. Oligonukleotidové priméry sú obvykle dlhé 10 až 30 nukleotidov a sondy sú dlhé 15 až 50 nukleotidov.
Gén PRV-1 je endogénny gén, ktorého expresia je u zdravých jedincov obmedzená len na niekolko málo orgánov. Normálne je exprimovaný len v orgánoch hematopoéze, to znamená v kostnej dreni a fetálnej pečeni, a slabo v slezine, ale nie je exprimovaný v srdci, v schvaloch, v pankrease alebo obličkách.
U pacientov trpiacich p.vera je však tento gén veľmi silne nadmerne exprimovaný najmä v hematopoetických bunkách.
Gén PRV-1 kóduje protein, ktorého aminokyselinová sekvencia je uvedená na obr. 2. Signálny peptid, ktorý je prítomný v proteínovej sekvencii všetkých povrchových molekúl a normálne je odstraňovaný pri opracovaní proteínu v bunke, je na obr. 2 • ···· ·· ···· ·· ·· · · · · · · • · · · ··· · · • · ··· ···· • · · · · · · ···· ····· ·· oddelený pomlčkami. Proteín má sekvenciu uvedenú na obr. 2. Ďalším aspektom vynálezu je teda v podstate čistý polypeptid, ktorý má uvedenú sekvenciu označenú ako sekvencia č. 2 alebo polypeptid ktorý má sekvenciu č. 2 ale bez signálneho peptidu (to znamená aminokyseliny 22 až 437 zo sekvencie č. 2) . Ďalšie uskutočnenie vynálezu zahŕňa aminokyseliny 1 až 409 alebo 22 až 409 sekvencie č. 2 (čo je pravdepodobne aktívny úsek proteínu).
Ak ide o biologickú aktivitu, polypeptid podľa vynálezu je výhodne glykozylovaný, najvýhodnejšie je N-glykozylovaný. V takom prípade je glykozylovaný aspoň na jednej z aminokyselín Asn-46, Asn-189 a Asn-382 polypeptidu PRV-1 (číslovanie aminokyselín zodpovedá sekvencii č. 2). Predložený vynález zahŕňa tiež fragmenty polypeptidu podľa vynálezu, ktoré sú N-glykozylované. Fragmenty sú dlhé aspoň 50 aminokyselín, výhodne aspoň 100 aminokyselín a najvýhodnejšie aspoň 150 aminokyselín. V inom uskutočnení vynálezu je polypeptid O-glykozylovaný.
Odborníkovi je jasné, že určité aminokyseliny sa môžu nahradiť inými aminokyselinami, bez toho aby došlo k poškodeniu biologickej aktivity proteínu. Také modifikované formy polypeptidu sú tiež predmetom predloženého vynálezu. Ide o také náhrady aminokyselín, ktoré nemajú negatívny vplyv na biologickú aktivitu peptidu. Odborník môže využiť známe pravidlá pre výber aminokyselín na také náhrady.
V závislosti od spôsobu prípravy polypeptid PRV-1 môže obsahovať glykozylfosfatidylinozitolovú kotvu. Tá je naviazaná na aminokyseliny 407 až 409 podľa sekvencie č. 2. Avšak z dôvodov, ktoré sa doteraz neobjasnili, GPI-viazané proteíny sú tiež uvoľňované do média. Tento proces je nazývaný lienenie (shedding“). Dodnes však nie je známe, či ide o špecifický proces, to znamená, či sú polypeptidy odštiepované od membrány enzýmami regulovaným spôsobom, alebo či ide o nešpecifickú stratu kotvy. Je teda veľmi pravdepodobné, že PRV-1 sa bude vyskytovať ako na bunkovej membráne, tak aj extracelulárne. Secernovaná forma,
• ···· | • · • · • · | ···· • ··· | • · • · · • · | |
• • | ||||
• · | • | • · | ··· | • · · |
ktorá nie je viazaná na membránu, je zrejme oveľa dôležitejšia vo funkcii rastového faktora, pretože táto forma je schopná difundovať a ako rastový faktor ovplyvniť ďalšie bunky.
Odborníkovi je jasné, že je možné ovplyvniť prichytenie proteínu na bunkovú membránu manipuláciou práve s týmito aminokyselinami. Týka sa to najmä prípravy definovaných konštruktov DNA, ktorých cieľom je expresia polypeptidu PRV-1 alebo jeho fragmentov. Kodóny kódujúce tieto aminokyseliny sa môžu mutovať alebo deletovať.
Gén kóduje povrchový receptor rodiny uPAR/Ly6. Táto receptorová rodina prenáša mitogénne signály, ktoré stimulujú bunkové delenie. Predpokladá sa preto, že nadmerná expresia (overexpression) génu PRV-1, okrem iného v granulocytoch u pacientov s p. vera, prispieva k proliferácii týchto buniek.
Zistilo sa, že PRV-1 nie je exprimovaný v granulocytoch zdravých jedincov alebo u pacientov trpiacich iným myeloproliferativnym ochorením, ako je napr. chronická granulocytárna leukémia, akútna granulocytárna leukémia alebo esenciálna trombocytóza.
Aby sa mohol použiť polypeptid kódovaný génom PRV-1 na analytické ciele a detekčné metódy, je výhodne pripravovaný rekombinantným spôsobom, keď rekombinantná DNA výhodne obsahuje nukleotidovú sekvenciu č. 1 alebo aspoň kódujúci úsek génu PRV-1, to znamená nukleotidy 36 až 1346 v sekvencii č. 1, najmenej však nukleotidy 39 až 1262, funkčne spojené s promótorom. Avšak rekombinantná DNA môže obsahovať tiež len fragment sekvencie č. 1.
Predložený vynález sa ďalej týka vektora, ktorý obsahuje rekombinantnú DNA pre polypeptid PRV-1 alebo jeho fragment, a ďalej hostitelských buniek, ktoré sú transfekované alebo transformované týmto vektorom. Hostiteľské bunky sú prokaryotické bunky, napr. baktérie ako je E. coli. Avšak exprimované
• · · · e · • · · • · ··· polypeptidy potom nie sú glykozylované. Prednostne sa teda používajú eukaryotické hostiteľské bunky schopné glykozylovať exprimovaný proteín posttranslačne a modifikovať ho aj iným spôsobom. Príkladom eukaryotických hostiteľských buniek sú bunky hmyzu, napr. bunky Sf9, na expresiu po infekcii bakulovírusovým vektorom, a cicavčie bunky, ako napr. bunky COS, CHO a HeLa. Avšak tieto príklady nie sú vyčerpávajúce. Tiež je možné použiť kvasinky ako hostiteľské bunky. Odborníkovi je jasné, že glykozylačný profil sa bude líšiť podľa typu použitých buniek. Biologická aktivita exprimovaného produktu sa preto bude tiež líšiť. Zvlášť výhodné sú preto hostiteľské bunky, ktoré glykozylujú exprimovaný produkt tak, že si uchováva svoju biologickú aktivitu.
Polypeptid PRV-1, ktorý je izolovaný z granulocytov alebo je pripravovaný rekombinantným spôsobom sa môže využiť ako na diagnostiku polycythaemia vera tak aj na liečenie tohto ochorenia.
Jednou terapeutickou možnosťou je tzv. antisense terapia. Pri tomto spôsobe sa používa antisense RNA molekula, čo je molekula RNA komplementárna k PRV-1 RNA. Pretože PRV-1 RNA začína na svojom 5'-konci sekvenciou:
5'-AAAAGCAGAAAGAGATTACCAGCC-3' (sekvencia č. 3), potom príslušná antisense RNA bude mať nasledujúcu nukleotidovú sekvenciu:
5'-GGCTGGTAATCTCTTTCTGCTTTT-3' (sekvencia č. 4). Táto antisense RNA sa vloží do vektora a vnesie do buniek p.vera. RNA sa vnesie do buniek napr. transfekciou, keď je vektor použitý na transfekciu skonštruovaný tak, aby špecificky transfekoval bunky p.vera. Expresia antisense RNA vedie k tomu, že PRV-1 mRNA už naďalej nie je translatovaná na polypeptid, takže bunky ošetrené touto antisense RNA nevytvárajú žiadny proteín PRV-1.
Predložený vynález sa preto týka tiež spôsobu detekcie
p.vera, ktorý spočíva v tom, že polypeptid PRV-1, alebo jeho
• ···· | • · | ···· | ·· | |||
• · | • | • | • | • · | ·· | |
• · | • | • | ··· | e | • | |
• · | • | • | • | • | • | |
• · · | ·· | ··· | • · | • · |
epitop, sa deteguje a určí sa rozsah jeho expresie.
Nadmerná expresia receptora na zrelých bunkách mimo kostnej drene, napr. na granulocytoch, je významnou indikáciou prítomnosti ochorenia p. vera. Táto nadmerná expresia sa výhodne deteguje použitím imunotestu s využitím protilátok proti receptoru PRV-1. Vhodné testovacie metódy sú známe varianty imunotestu, keď sa používajú protilátky špecifické k polypeptidu PRV-1 spolu s ďalšími značenými protilátkami, ktoré sú buď imobilizované alebo v roztoku. Značenie je možné uskutočniť známym spôsobom, napr. použitím rádioaktívnych izotopov alebo fluorescenčných alebo luminiscenčných značiek, pomocou enzýmov, využitím reakcie, pri ktorej vzniká farbivo alebo iné skupiny, ktoré sú vhodné na detekciu. Všetky tieto metódy a ich varianty sú odborníkom známe a nie je ich tu potrebné podrobne vysvetľovať. Podľa vynálezu je zvlášť výhodné použitie testu ELISA.
Protilátky potrebné na špecifickú detekciu receptora PRV-1 je možné pripraviť spôsobmi, ktoré sú tiež známe. Sú vhodné ako polyklonálne tak aj monoklonálne protilátky, avšak výhodné je použitie monoklonálnych protilátok.
Peptidy odvodené z proteínu sa môžu tiež použiť na prípravu protilátok. Podľa vynálezu sa s úspechom použili peptidy, ktoré mali nasledujúce sekvencie:
a) KVSDLPRQWTPKN (aminokyseliny 34 až 46) [sekvencia č. 5], a
b) SAREKRDVQPPASQH (aminokyseliny 391 až 405) [sekvencia č.
6] ·
Polyklonálne protilátky sa normálne pripravujú imunizáciou vhodného hostitela (králika) polypeptidom PRV-1, ktorý je naviazaný na vhodný imunologický nosič (adjuvans) a vyvoláva imunitnú reakciu. Monoklonálne protilátky sa pripravujú známymi metódami s využitím tzv. techniky hybridómov. Získané protilátky sa puri8
• ···· • · • e | ·· • · • · | ···· • ··· | • · • · · • · |
• · · | ·· | ··· | ·· · |
fikujú afinitnou metódou. Príprava a purifikácia protilátok sú podrobne opísané napr. v Antibodies: A Laboratory Manual, Harlow a Lane, Cold Spring Harbor Laboratory Press.
Naviac také polyklonálne alebo monoklonálne protilátky, namierené proti PRV-1, môžu sa použiť na liečenie ochorenia.
V inom uskutočnení vynálezu je receptor detegovaný použitím metódy RT-PCR. Na tento cieľ sa najskôr z buniek exprimujúcich PRV-1, čo sú spravidla granulocyty, izoluje RNA. Potom sa uskutoční reverzná transkripcia, čo je známa metóda, pomocou RT priméra. RT primér má výhodne nasledujúcu nukleotidovú sekvenciu (sekvencia č. 7):
ATTAGGTTATGAGGTCAGAGGGAGGTT.
Týmto spôsobom sa RNA špecifická pre PRV-1 transformuje na DNA. Táto DNA sa potom amplifikuje v PCR známym spôsobom. Výhodne sa na amplifikačné cykly v PCR použijú nasledujúce priméry:
sense primér (sekvencia č. 8)
GCAGAAAGAGATTACCAGCCACAGACGG, antisense primér (sekvencia č. 9)
GAATCGTGGGGGTAATAGAGTTAGCAGG.
Odborník je pritom schopný ľahko použiť sekvenciu, ktorá je opísaná v predloženom vynáleze, na nájdenie ďalších vhodných primérov.
Pretože je v tejto metóde ako východiskový materiál použitá RNA, PCR je pozitívna len v prípade, že gén PRV-1 je exprimovaný. Ako je vysvetlené skôr, je to len v prípade, že pacient trpí p.vera. PRV-1 nie je exprimovaný v ganulocytoch u zdravých jedincov. Tiež neprítomnosť signálu v RT-PCR ukazuje, že nie je prítomná p.vera.
• ···· ·· ···· ·· ·· · · · · · · • · · I ··· · · • · ··· ····
V alternatívnom postupe je možné použiť tzv. prenosové alebo hybridizačné metódy (blotting), výhodne Northern blotting, na diagnózu p.vera. Pri tejto metóde sa z granulocytov izoluje RNA a skúma sa na expresiu PRV-1 metódou prenosu a hybridizácie, výhodne Northernovej hybridizácie.
Ako sonda sa pri Northernovej hybridizácii použije cDNA so sekvenciou č. 1 alebo fragment takej sekvencie. K hybridizácii dôjde len v prípade, že granulocyty sa získali z pacienta trpiaceho p.vera, lebo len v takom prípade dochádza v granulocytoch k expresii PRV-1. Neprítomnosť hybridizačného signálu indikuje, že jedinec, z ktorého pochádzajú granulocyty, netrpí p.vera.
Na Northenovú hybridizáciu je možné použiť len fragment génu. Taký fragment je obvykle dlhý viac ako 100 báz, výhodne viac ako 300 báz. Alternatívne rôzne fragmenty génu, ktoré sa môžu využiť ako sondy na Northernovú hybridizáciu, sa môžu pripraviť naštiepením génu reštrikčnými endonukleázami. Keď sú fragmenty získané z cDNA, sú vo forme dvojreťazcovej DNA, pričom pred hybridizáciou sa musia separovať na jednotlivé reťazce. K vhodným príkladom patrí fragment BamHI-Pstl zahŕňajúci páry báz 420 až 831, alebo fragment Pstl-PstI zahŕňajúci páry báz 831 až 1900.
PRV-1 mRNA, a tiež expresia génu PRV-1, sa môžu detegovať najskôr reverznou transkripciou mRNA a potom amplifikáciou cDNA v RT-PCR, pričom amplifikovaná DNA sa deteguje hybridizáciou pomocou sondy.
V prípade pozitívnej diagnózy sa musí ochorenie liečiť, lebo inak v relatívne krátkom čase vedie k úmrtiu. Na liečenie je možné využiť špecifické protilátky namierené proti PRV-1, na ktorého cytotoxickú zložku sa viažu, keď je to vhodné.
Predložený vynález sa ďalej týka lieku, ktorý obsahuje okrem bežných excipientov protilátky, ktoré sú namierené proti recep• ··· ·· ···· ·· ·· ···· ···
-ι Λ · · · · ··· * ·
1U · · · · · ···· • · · · · · · ·· · · ····· ·· · toru PRV-1.
Pretože je receptor PRV-1 nadmerne exprimovaný u pacientov trpiacich p.vera, veľa protilátok sa naviaže na povrch postihnutých granulocytov, keď sa granulocyty dostanú do kontaktu s protilátkami anti-PRV-1. Naviazanie protilátok na tieto bunky stimuluje bunky imunitného systému na to, aby tieto granulocyty likvidovali. Týmto spôsobom je možné špecificky eliminovať bunky p.vera.
Zistilo sa tiež, že polypeptid PRV-1 má tiež hematopoetickú aktivitu. Polypeptid PRV-1 je schopný stimulovať určité hematopoetické prekurzorové bunky, aby vytvárali erytroidné kolónie. Túto funkciu prejavuje najmä NB-glykozylovaná forma polypeptidu PRV-1. Výhodné polypeptidy podľa vynálezu sú preto N-glykozylované polypeptidy PRV-1 a ich fragmenty, ktoré vykazujú aktivitu rastového faktora.
Ďalším aspektom predloženého vynálezu je preto liek, ktorý obsahuje, okrem bežných farmaceutický prijateľných excipientov, polypeptid PRV-1 alebo jeho biologicky aktívny fragment. Polypeptid PRV-1 je výhodne glykozylovaný polypeptid PRV-1, ešte výhodnejšie N-glykozylovaný polypeptid PRV-1 alebo jeho biologicky aktívny fragment.
Predložený vynález sa ďalej týka použitia polypeptidu PRV-1 alebo jeho biologicky aktívneho fragmentu, ako rastového faktora, a síce in vivo a in vitro. Polypeptid PRV-1 a jeho biologicky aktívne fragmenty sa môžu použiť na liečenie všetkých druhov pancytopénií a pancytopatii v kostnej dreni alebo v krvnom obehu (zmeny bunkových zložiek v periférnej krvi a kostnej dreni). Polypeptidy podľa vynálezu sa môžu použiť napríklad na liečenie anémií v prípade zlyhania obličiek, pri chemoterapii alebo celotelovom ožarovaní, na liečenie neutropénií a trombocytopénií v priebehu chemoterapie pri chemoterapii alebo celotelovom ožarovaní, na liečenie ex vivo periférnych kmeňových buniek alebo z kostnej dreni expanziou (multiplikáciou) a spätnou
• ···· • · • · | ·· • · • · | ···· • ··· | ·· • · · • · |
• · | • · | • | • · |
• · · | • · | • · · | ·· · |
transfúziou pacientovi, a na liečenie sepse, syndrómu systémovej zápalovej reakcie (SIRS) alebo lokálnych zápalových reakcií. Polypeptidy podľa vynálezu alebo lieky, ktoré ich obsahujú, sa podávajú rôznymi spôsobmi. K týmto spôsobom podávania patrí napr. podávanie intravenózne, intramuskulárne, subkutánne, intraperitoneálne, perorálne, transdermálne alebo transmukozálne.
Polypeptidy podľa vynálezu sa môžu tiež použiť na liečenie pancytopénií a pancytopatií. V takých prípadoch je cieľom liečby exprimovať polypeptid PRV-1 alebo jeho funkčný fragment v bunkách postihnutého pacienta. V tejto súvislosti sú hlavnými používanými metódami, metódy génovej terapie. Z postihnutého pacienta sa izolujú bunky, ktoré sa transfekujú polynukleotidom podľa vynálezu (ex vivo manipulácia), a po nej sa zasa vrátia pacientovi. Je tiež možné si predstaviť metódu, keď polynukleotid podľa vynálezu získa prístup do cieľových buniek prostredníctvom vírusového prenosu. Expresia vložených nukleových kyselín potom vedie k hematopoetickej aktivite.
Predložený vynález sa ďalej týka súprav na detekciu polycythaemia vera a tiež iných ochorení hematopoézy. Tieto súpravy obsahujú polynukleotid podľa vynálezu a/alebo polypeptid podľa vynálezu a/alebo jednu alebo viac protilátok podľa vynálezu. Okrem toho súpravy obsahujú tiež nádobku alebo prípravky vhodné na uskutočnenie detekčnej reakcie. K príkladom takých prípravkov patria pufri, reagencie na blokovanie membrány, hybridizačné roztoky, sekundárne protilátky, substrátové roztoky na detekčné reakcie a pod. Súpravy sa výhodne používajú na uskutočnenie PCR reakcií, Northernových hybridizácií, Southernových hybridizácií, Westernových blotov, ELISA testov, RIA testov a ďalších.
Na podrobnejšie vysvetlenie vynálezu sú uvedené nasledujúce príklady.
·· ···· ·· ·· ···· ··· • · · · ··· · · • · · · · » · a · • · · · · · · ····
Príklady uskutočnenia vynálezu
Príklad 1
Charakterizácia génu PRV-1
Na charakterizáciu génu PRV-1 sa uskutočnili nasledujúce pokusy:
na izoláciu granulocytov z uskladnenej krvi získanej odberom od pacientov s p.vera sa použil nasledujúci protokol:
zhodný objem 3% roztoku dextránu v 0,9% NaCl sa pridal ku krvi a zmes sa nechala stáť pri teplote miestnosti (RT) 20 minút, zmes sa rozdelila na dve fázy, vrchná svetlo sfarbená fáza sa odobrala a centrifugovala 10 minút pri 1800 g pri RT, supernatant sa odstránil a bunkový pelet sa resuspendoval v rovnakom objeme 0,9% NaCl, na každú vzorku bolo 35 ml buniek v NaCl navrstvené na 15 ml Ficoll-Hypaque, bunky na Ficoll-Hypaque sa centrifugovali 60 minút pri 1800 g pri RT bez použitia brzdy, vytvoril sa bunkový pelet a dve vrstvy s medzifázou, vrstvy s medzifázou sa odsali a bunkový pelet sa resuspendoval 30 sekúnd v 10 ml ladovo studeného 0,2% NaCl a bezprostredne po 30 sekundách sa pridalo 10 ml ladovo vychladeného 1,6% NaCl, bunky sa centrifugovali 10 minút pri 1800 g pri RT, bunky sa raz opláchli v 10 ml PBS a znova sa centrifugovali, bunkový pelet obsahoval granulocyty v 95-99% čistote, z týchto buniek sa izolovala RNA štandardným postupom, mg RNA sa vyšetrilo Northernovou hybridizáciou na ···· j ········· • · · · · · · ··· · ·· ··· ·· expresii PRV-1, ako sonda sa použila celá sekvencia uvedená tu ako sekvencia č. 1.
Tento experiment sa uskutočnil s 19 pacientmi trpiacimi p.vera a s 21 kontrolnými vzorkami skladovanej krvi. Zistilo sa, že sonda PRV-1 hybridizovala silne v prípade pacientov s p.vera a žiadny hybridizačný signál sa nepozoroval pri kontrolných vzorkách zo zdravých jedincov.
Príklad 2
PRV-1 má aktivitu rastového faktora
Z brezivých myší 13,5 dní po fertilizácii sa vybrali embryá a vypreparovali sa fetálne pečene. Bunky, obsiahnuté v nich sa zafarbili protilátkami a obohatili sa o určitý typ buniek, pričom iné bunky sa zasa odstránili, a síce stĺpcovou chromatografiou. Výsledkom je zmes buniek obohatená o určité hematopoetické prekurzorové bunky (kolónie tvoriace jednotky - erytroidy, CFU-E). Takže zatial, čo vo fetálnych pečeniach asi 2% tvoria CFU-E, v obohatenej zmesi CEU-E predstavovali 30 až 40%.
Bunky CEU-E sa transfekovali pomocou retrovírusu. Takzvaná zbalovacia bunková línia 293-T sa sama 48 hodín pred tým transfekovala. Bunky 293-T sú bunky stabilnej línie ľudských embryonálnych obličkových buniek. Bunky 293-T sú trvalo transfekované niekoľkými génmi retrovírusov. Keď sú potom tieto bunky 293-T transfekované dvoma palzmidmi, nazývanými pOS a pKAT, potom bunky 293-T produkujú retrovírusy, ktoré sú schopné infikovať myšacie fetálne pečeňové bunky. Keď sú bunky 293-T transfekované prázdnym vektorom pOS a pKAT, potom je produkovaný retrovírus divého typu, ktorý exprimuje len retrovírusové proteíny. Na druhej strane, klonovanie ludského génu, napr. génu PRV-1, do vektora pOS vedie k produkcii retrovírusu, ktorý po infekcii bunky produkuje tento proteín. Bunky 293-T secernujú retrovírus do kultivačného média.
···· ·· ···· ·· • · · · · · • · · ·· · · • · · · · · ··· · ·· ··· ··
Po dvoch dňoch sa kultivačné médium z transfekovaných buniek 293-T obsahujúcich retrovírus odoberie a filtruje sa cez 0,45 pm filter. Aby bolo možné transfekovať fetálne pečeňové bunky, tieto bunky sa zmiešajú s prefiltrovaným kultivačným médiom, ktoré obsahuje retrovírus, a potom sa centrifugujú 2 hodiny pri 1800 rpm a 20°C s prídavkom Polybrenu. Fetálne pečeňové bunky sa potom kultivujú v médiu (Methocult, od firmy Celí Systems), ktoré obsahuje okrem obvyklých solí a aminokyselín, fetálne teľacie sérum, 0,0001 až 0, IU erytropoetínu (EP0)/ml a metylcelulózu (0,8%). Bunky CFU-E potrebujú EPO, aby vytvárali hematopoetické kolónie. Metylcelulóza stužuje médium do formy rôsolu, a tak fixuje jednotlivé bunky v tomto rôsole, takže na rozdiel od kultivácie v kvapalnom médiu sa bunky nemôžu pohybovať. Je možné teda pozorovať, či sa z jednotlivých buniek tvoria hematopoetické kolónie alebo nie. CFU-E vytvárajú erytroidné kolónie, teda kolónie obsahujúce červené krvinky a ich prekurzorové bunky.
Po troch dňoch sa hematopoetické kolónie, ktoré sa vyvinuli, spočítali. Porovnali sa rôzne zmesi, pritom nie všetky zmesi sa porovnali vo všetkých pokusoch: zmesi č. 1 až 3 sú velmi podobné kontroly a každá z nich sa môže porovnať jednotlivo so zmesou
č. 4.
Zmes 1: Bunky, ktoré nie sú transfekované retrovírusom.
Zmes 2: Bunky, ktoré sa transfekovali prázdnym vektorom pOS.
Zmes 3: Bunky transfekované zeleným fluorescenčným proteínom,
GFP, to znamená proteínom, ktorý nemá hematopoetickú aktivitu.
Zmes 4: Bunky, ktoré sa transfekovali pOS-PRV-1 {to znamená vektorom s génom podľa vynálezu).
Tabuľka 1
Prehľad výsledkov získaných v troch experimentoch uskutočnených už opísaným postupom. Uvedené hodnoty predstavujú počet kolónií.
• ···· ·· ···· ·· ·· ···· ··· • · · · ··· · · ·· ·· ···· ··· · ·· ··· ·· ···
Zmes 1 | Zmes 2 | Zmes 3 | Zmes 4 | |
neboli transfekované | prázdny vektor (pOS) | GFP (pOS-GFP) | PRV-1 (pOS-PRV-1) | |
Experiment 1 | 116 | 156 | 80 | 326 |
Experiment 2 | 271 | 273 | 410 | |
Experiment 3 | 120 | 131 | 291 |
Experimenty ukázali, že bunky CFU-E, ktoré sa transfekovali PRV-1, vytvárali oveľa viac kolónii (až trikrát viac), ako rôzne kontrolné bunky. Tieto výsledky ukazujú, že PRV-1 pôsobí na CFU-E ako rastový faktor.
Príklad 3
Rozpustnosť rastového faktora PRV-1
Ďalší experiment sa uskutočnil s cielom skúmať, či PRV-1 je rozpustný rastový faktor alebo či je potrebný vzájomný kontakt buniek. Zbalovacia bunková línia 293-T po transfekcii vektormi pOS a pKAT neprodukuje len retrovírus. Bunky 293-T naviac syntetizujú proteín kódovaný génom v pOS, to znamená v tomto prípade PRV-1. Ak je génový produkt rozpustný proteín, je secernovaný do média obklopujúceho bunky 293-T. Ak sú bunky 293-T transfekované len vektorom pOS bez pKAT, netvoria sa žiadne retrovírusy. Kultivačné médium potom obsahuje len rozpustný proteín produkovaný bunkami. Médium pochádzajúce z kultivácie buniek transfekovaných pOS-PRV-1, ktoré neobsahuje žiadny retrovírus, sa zmiešalo s bunkami CFU-E a zmes sa vysiala na médium s metylcelulózou, vzniknuté kolónie sa spočítali.
V experimente sa získali nasledujúce výsledky.
·· ···· • · · • · ···
Tabulka 2
Rozpustnosť PRV-1. Uvedené hodnoty predstavujú počet kolónií.
Zmes 1 | Zmes 2 | Zmes 3 | Zmes 4 | |
neboli | prázdny | GFP | PRV-1 | |
transfekované | vektor (pOS) | (pOS-GFP) | (pOS-PRV-1) | |
Experiment 4 | 137 | 187 | 557 |
V tomto experimente tiež bunky CFU-E, ktoré sa ošetrili médiom obsahujúcim PRV-1, vytvárali oveľa viac hematopoetických kolónií ako kontrolné bunky. Z týchto výsledkov je teda možné odvodiť, že PRV-1 je rozpustný rastový faktor.
Príklad 4
Rastový faktor PRV-1 je N-glykozylovaný
Granulocyty sa izolovali z pacientov trpiacich p. vera a z týchto buniek sa štandardnými metódami pripravili proteínové extrakty. Proteínové extrakty sa ošetrili podľa návodu k súprave N-Glycosidase F Deglycosylation Kit od firmy Boehringer Mannheim. Podrobnejšie to znamená, že sa k proteínovým extraktom pridal denaturačný pufor a táto zmes sa zahriala na 3 minúty na 95°C, potom sa zmes ošetrila reakčným pufrom alebo reakčným pufrom s N-glykozidázou. Všetky zmesi sa potom inkubovali cez noc pri 37°C a potom sa proteíny analyzovali PAGE elektroforézou a potom Westernovým prenosom (Western blot). Proteín PRV-1 sa detegoval protilátkou namierenou proti proteínu, ktorý má aminokyselinovú sekvenciu uvedenú tu ako sekvencia č. 5. Výsledky ukázali, že zatial čo proteín PRV-1 purifikovaný z granulocytov má veľkosť 60 až 65 kDa, potom, ako sa naštiepil N-glykozidázou, má veľkosť len 40 kDa. Dokazuje to, že PRV-1 je glykozylovaný na asparagínovom zvyšku (asparagín=N).
• · · · · · • · • ···
Zoznam sekvencii
<210> | 1 |
<211> | 1600 |
<212> | DNA |
<213> | homo sapiens |
<220> <223> | |
<400> | 1 |
aaaagcagaa | agagattacc | agccacagac | gggtcatgag | cgcggtatta | ctgctggccc | 60 |
tcctggggtt | catcctccca | ctgccaggag | tgcaggcgct | gctctgccag | tttgggacag | 120 |
ttcagcatgt | gtggaaggtg | tccgacctgc | cccggcaatg | gacccctaag | aacaccagct | 180 |
gcgacagcgg | cttggggtgc | caggacacgt | tgatgctcat | tgagagcgga | ccccaagtga | 240 |
gcctggtgct | ctccaagggc | tgcacggagg | ccaaggacca | ggagccccgc | gtcactgagc | 300 |
accggatggg | ccccggcctc | tccctgatct | cctacacctt | cgtgtgccgc | caggaggact | 360 |
tctgcaacaa | cctcgttaac | tccctcccgc | tttgggcccc | acagccccca | gcagacccag | 420 |
gatccttgag | gtgcccagtc | tgcttgtcta | tggaaggctg | tctggagggg | acaacagaag | 480 |
agatctgccc | caaggggacc | acacactgtt | atgatggcct | cctcaggctc | aggggaggag | 540 |
gcatcttctc | caatctgaga | gtccagggat | gcatgcccca | gccaggttgc | aacctgctca | 600 |
atgggacaca | ggaaattggg | cccgtgggta | tgactgagaa | ctgcaatagg | aaagattttc | 660 |
tgacctgtca | tcgggggacc | accattatga | cacacggaaa | cttggctcaa | gaacccactg | 720 |
attggaccac | atcgaatacc | gagatgtgcg | aggtggggca | ggtgtgtcag | gagacgctgc | 780 |
tgctcataga | tgtaggactc | acatcaaccc | tggtggggac | aaaaggctgc | agcactgttg | 840 |
gggctcaaaa | ttcccagaag | accaccatcc | actcagcccc | tcctggggtg | cttgtggcct | 900 |
cctataccca | cttctgctcc | tcggacctgt | gcaatagtgc | cagcagcagc | agcgttctgc | 960 |
tgaactccct | ccctcctcaa | gctgcccctg | tcccaggaga | ccggcagtgt | cctacctgtg | 1020 |
tgcagcccct | tggaacctgt | tcaagtggct | ccccccgaat | gacctgcccc | aggggcgcca | 1080 |
ctcattgtta | tgatgggtac | attcatctct | caggaggtgg | gctgtccacc | aaaatgagca | 1140 |
ttcagggctg | cgtggcccaa | ccttccagct | tcttgttgaa | ccacaccaga | caaatcggga | 1200 |
tcttctctgc | gcgtgagaag | cgtgatgtgc | agcctcctgc | ctctcagcat | gagggaggtg | 1260 |
gggctgaggg | cctggagtct | ctcacttggg | gggtggggct | ggcactggcc | ccagcgctgt | 1320 |
ggtggggagt | ggtttgccct | tcctgctaac | tctattaccc | ccacgattct | tcaccgctgc | 1380 |
• · ··· ·
tgaccaccca | cactcaacct | ccctctgacc | tcataaccta | atggccttgg | acaccagatt | 1440 |
ctttcccatt | ctgtccatga | atcatcttcc | ccacacacaa | tcattcatat | ctactcacct | 1500 |
aacagcaaca | ctggggagag | cctggagcat | ccggacttgc | cctatgggag | aggggacgct | 1560 |
ggaggagtgg | ctgcatgtat | ctgataatac | agaccctgtc | 1600 |
<210> 2 <211> 437 <212> PRT <213> homo sapiens <400> 2
Met 1 | Ser Ala | Val Leu Leu Leu Ala Leu Leu Gly | Phe | íle | Leu | Pro 15 | Leu | ||||||||
5 | 10 ' | ||||||||||||||
Pro | Gly | Val | Gin | Ala | Leu | Leu | Cys | Gin | Phe | Gly | Thr | Val | Gin | His | Val |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Trp | Lys | Val | Ser | Asp | Leu | Pro | Arg | Gin | Trp | Thr | Pro | Lys | Asn | Thr | Ser |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Cys | Asp | Ser | Gly | Leu | Gly | Cys | Gin | Asp | Thr | Leu | Met | Leu | íle | Glu | Ser |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Gly | Pro | Gin | Val | Ser | Leu | Val | Leu | Ser | Lys | Gly | Cys | Thr | Glu | Ala | Lys |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Asp | Gin | Glu | Pro | Arg | Val | Thr | Glu | His | Arg | Met | Gly | Pro | Gly | Leu | Ser |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Leu | íle | Ser | Tyr | Thr | Phe | Val | Cys | Arg | Gin | Glu | Asp | Phe | Cys | Asn | Asn |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Leu | Val | Asn | Ser | Leu | Pro | Leu | Trp | Ala | Pro | Gin | Pro | Pro | Ala | Asp | Pro |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Gly | Ser | Leu | Arg | Cys | Pro | Val | Cys | Leu | Ser | Met | Glu | Gly | Cys | Leu | Glu |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Gly | Thr | Thr | Glu | Glu | íle | Cys | Pro | Lys | Gly | Thr | Thr | His | Cys | Tyr | Asp |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Gly | Leu | Leu | Arg | Leu | Arg | Gly | Gly | Gly | íle | Phe | Ser | Asn | Leu | Arg | Val |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Gin | Gly | Cys | Met | Pro | Gin | Pro | Gly | Cys | Asn | Leu | Leu | Asn | Gly | Thr | Gin |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
Glu | íle | Gly | Pro | Val | Gly | Met | Thr | Glu | Asn | Cys | Asn | Arg | Lys | Asp | Phe |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
Leu | Thr | Cys | His | Arg | Gly | Thr | Thr | íle | Met | Thr | His | Gly | Asn | Leu | Ala |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Gin | Glu | Pro | Thr | Asp | Trp | Thr | Thr | Ser | Asn | Thr | Glu | Met | Cys | Glu | Val |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Gly | Gin | Val | Cys | Gin | Glu | Thr | Leu | Leu | Leu | íle | Asp | Val | Gly | Leu | Thr |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
Ser | Thr | Leu | Val | Gly | Thr | Lys | Gly | Cys | Ser | Thr | Val | Gly | Ala | Gin | Asn |
260 | 265 | 270 |
• ···· ·· ···· ·· • · · ··· · · · • · · · ··· · · • · ··· ···· • · · 9 9 9 9
999 9 9 9 9 9 9 99 9
Ser Gin | Lys 275 | Thr | Thr | íle His | Ser 280 | Ala | Pro | Pro | Gly | Val 285 | Leu | Val | Ala | ||
Ser | Tyr | Thr | His | Phe | Cys | Ser | Ser | Asp | Leu | Cys | Asn | Ser | Ala | Ser | Ser |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
Ser | Ser | Val | Leu | Leu | Asn | Ser | Leu | Pro | Pro | Gin | Ala | Ala | Pro | Val | Pro |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
Gly | Asp | Arg | Gin | Cys | Pro | Thr | Cys | Val | Gin | Pro | Leu | Gly | Thr | Cys | Ser |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
Ser | Gly | Ser | Pro | Arg | Met | Thr | Cys | Pro | Arg | Gly | Ala | Thr | His | Cys | Tyr |
340 | 345 | 350 | |||||||||||||
Asp | Gly | Tyr | íle | His | Leu | Ser | Gly | Gly | Gly | Leu | Ser | Thr | Lys | Met | Ser |
355 | 360 | 365 | |||||||||||||
íle | Gin | Gly | Cys | Val | Ala | Gin | Pro | Ser | Ser | Phe | Leu | Leu | Asn | His | Thr |
370 | 375 | 380 | |||||||||||||
Arg | Gin | íle | Gly | íle | Phe | Ser | Ala | Arg | Glu | Lys | Arg | Asp | Val | Gin | Pro |
385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
Pro | Ala | Ser | Gin | His | Glu | Gly | Gly | Gly | Ala | Glu | Gly | Leu | Glu | Ser | Leu |
405 | 410 | 415 | |||||||||||||
Thr | Trp | Gly | Val | Gly | Leu | Ala | Leu | Ala | Pro | Ala | Leu | Trp | Trp | Gly | Val |
420 | 425 | 430 | |||||||||||||
Val | Cys | Pro | Ser | Cys | |||||||||||
435 |
<210> | 3 |
<211> | 24 |
<212> | RNA |
<213> | homo |
<220> <223> | |
<400> | 3 |
sapiens aaaagcagaa agagattacc agcc
<210> | 4 |
<211> | 24 |
<212> | RNA |
<213> | homo |
<220> | |
<223> | |
<400> | 4 |
sapiens ggctggtaat ctctttctgc tttt • ···· »· *··· ·· ·· · · · · ··· • · · · ··· · · • · ··· · · · · ···· ····· ·· ·
<210> 5 <211> 13 <212> PRT <213> homo <400> 5 | sapiens | ||||
Lys Val Ser 1 | Asp Leu 5 | Pro Arg | Gin | Trp | |
<210> | 6 | ||||
<211> | 15 | ||||
<212> | PRT | ||||
<213> | homo | sapiens | |||
<400> | 6 | ||||
Ser Ala Arg 1 | Glu Lys 5 | Arg Asp | Val | Gin | |
<210> | 7 | ||||
<211> | 27 | ||||
<212> | DNA | ||||
<213> | homo | sapiens | |||
<220> <223> | |||||
<400> | 7 |
Thr Pro Lys Asn 10
Pro Pro Ala Ser Gin His 10 15
attaggttat gaggtcagag ggaggtt | ||
<210> | 8 | |
<211> | 28 | |
<212> | DNA | |
<213> | homo | sapiens |
<220> | ||
<223> | ||
<400> | 8 |
gcagaaagag attaccagcc acagacgg • ···· ·· ···· ·· ·· ···· ··· • · · · ··· · · ·· ·· ···· ··· · ·· ··· ·· ···
<210> 9 <211> 28 <212> DNA <213> homo sapiens | |
<220> | |
<223> | |
<400> | 9 |
gaatcgtggg ggtaatagag ttagcagg
Claims (23)
- PATENTOVÉ NÁROKY1. N-glykozylovaný polypeptid, ktorý obsahuje jednu z nasledujúcich aminokyselinových sekvencii:aminokyseliny 1 až 437 sekvencie č. 2, aminokyseliny 1 až 409 sekvencie č. 2, aminokyseliny 22 až 437 sekvencie č. 2, aminokyseliny 22 až 409 sekvencie č. 2.
- 2. Polypeptid, ktorý obsahuje jednu z nasledujúcich aminokyselinových sekvencii:aminokyseliny 1 až 437 sekvencie č. 2, aminokyseliny 1 až 409 sekvencie č. 2, aminokyseliny 22 až 437 sekvencie č. 2, aminokyseliny 22 až 409 sekvencie č. 2.
- 3. V podstate čistý polypeptid majúci sekvenciu č. 2.
- 4. Polynukleotid ktorý obsahuje jednu z nasledujúcich nukleotidových sekvencii:
nukleotidy 1 , až 1600 sekvencie č. 1, nukleotidy 36 až 1346 sekvencie č. 1, nukleotidy 36 až 1262 sekvencie č. 1, nukleotidy 39 až 1346 sekvencie č. 1, nukleotidy 39 až 1262 sekvencie č. 1, nukleotidy 99 až 1346 sekvencie č. 1, nukleotidy 99 až 1262 sekvencie č. 1. - 5. Rekombinantná DNA, ktorá obsahuje polynukleotid podlá nároku4.
- 6. Rekombinantná DNA podľa nároku 5, kde nukleotidová sekvencia • ···· ·· ···· ·· ·· ···· ··· • « · ··· · · ··· · ·· ··· ·· ··· je funkčne spojená s promótorom.
- 7. Expresný vektor, ktorý obsahuje rekombinantnú DNA podľa nároku 5 alebo 6.
- 8. Transformovaná alebo transfekovaná hostitelská bunka, ktorá obsahuje polynukleotid podlá nároku 4.
- 9. Protilátka proti polypeptidu PRV-1 podlá ktoréhokoľvek z nárokov 1 až 3 alebo jeho epitopu.
- 10. Protilátka podľa nároku 9, ktorou je monoklonálna protilátka.
- 11. Spôsob detekcie polycythaemia vera, vyznačuj úci sa tým, že polypeptid podľa ktoréhokoľvek z nárokov 1 až 3 reaguje v imunoteste s jednou alebo niekoľkými protilátkami podľa nároku 9 alebo 10.
- 12. Spôsob podľa nároku 11, vyznačujúci sa tým, že použitou protilátkou je polyklonálna alebo monoklonálna protilátka podľa nároku 9.
- 13. Spôsob detekcie polycythaemia vera, vyznačuj úci satým, že polynukleotid podľa nároku 4 je detegovaný použitím metódy RT-PCR alebo metódou hybridizácie (blotting).
- 14. Liek na liečenie polycythaemia vera, vyznačuj úci sa t ý m, že okrem obvyklých excipientov obsahuje polyklonálne alebo monoklonálne protilátky podľa nároku 9 alebo 10.
- 15. Liek, vyznačujúci sa tým, že obsahuje polypeptid podľa ktoréhokoľvek z nárokov 1 až 3 a aspoň jeden farmaceutický prijateľný excipient.
• ···· • · • · • · ···· • ··· ·· • · • · ·· • • • · • • · ·· · ·· ·· - 16. Liek, vyznačujúci sa tým, že obsahuje polynukleotid podľa nároku 4 a aspoň jeden farmaceutický prijateľný excipient.
- 17. Použitie polypeptidu podľa ktoréhokoľvek z nárokov 1 až 3 ako rastového faktora.a
- 18. Použitie polypeptidu podľa ktoréhokoľvek z nárokov 1 až 3 na i výrobu liekov na liečenie pancytopénií a pancytopatií v kostnej dreni a v krvnom obehu.
- 19. Použitie polynukleotidu podľa nároku 4 na výrobu lieku na liečenie pancytopénií a pancytopatií v kostnej dreni a v krvnom obehu.
- 20. Použitie polypeptidu podľa ktoréhokoľvek z nárokov 1 až 3 na výrobu lieku na liečenie a/alebo multiplikáciu endogénnych buniek a/alebo bunkových línií ex vivo alebo in vitro.
- 21. Súprava na detekciu polycythaemia vera, vyznačuj ú c a sa t ý m, že obsahuje:aspoň jeden polynukleotid podľa nároku 4 alebo jeho fragment a/alebo >aspoň jeden polypeptid podlá ktoréhokoľvek z nárokov 1 až 3 a/alebo aspoň jednu protilátku podľa nároku 9 alebo 10.
- 22. Súprava na detekciu porúch hematopoetického systému, vyznačujúca sa tým, že obsahuje:aspoň jeden polynukleotid podlá nároku 4 alebo jeho fragment a/alebo ···· ·· ···· • · · • · ··· ·· • · • · • · · ·· ··· • · ·· aspoň jeden polypeptid podlá ktoréhokoľvek z nárokov 1 až 3 a/alebo aspoň jednu protilátku podľa nároku 9 alebo 10.
- 23. Súprava na detekciu proteínu PRV-1 podľa nárokov 21 alebo 22, vyznačujúca sa tým, že je to súprava ELISA testu.
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
DE19849044A DE19849044A1 (de) | 1998-10-23 | 1998-10-23 | Das Gen PRV-1 und dessen Verwendung |
PCT/EP1999/007238 WO2000024886A1 (de) | 1998-10-23 | 1999-09-30 | Das gen prv-1 und dessen verwendung |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
SK5402001A3 true SK5402001A3 (en) | 2001-09-11 |
Family
ID=7885492
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
SK540-2001A SK5402001A3 (en) | 1998-10-23 | 1999-09-30 | Prv-1 gene and the use thereof |
Country Status (28)
Country | Link |
---|---|
US (2) | US6686153B1 (sk) |
EP (1) | EP1123392B1 (sk) |
JP (1) | JP2002528077A (sk) |
KR (1) | KR20010080883A (sk) |
CN (1) | CN1190491C (sk) |
AT (1) | ATE348109T1 (sk) |
AU (1) | AU771772B2 (sk) |
BG (1) | BG105460A (sk) |
BR (1) | BR9915537A (sk) |
CA (1) | CA2349211A1 (sk) |
CZ (1) | CZ20011430A3 (sk) |
DE (2) | DE19849044A1 (sk) |
EA (1) | EA200100440A1 (sk) |
EE (1) | EE200100234A (sk) |
HR (1) | HRP20010294A2 (sk) |
HU (1) | HUP0104954A3 (sk) |
IL (1) | IL142664A0 (sk) |
LT (1) | LT4877B (sk) |
LV (1) | LV12722B (sk) |
MX (1) | MXPA01004035A (sk) |
NO (1) | NO20011961L (sk) |
NZ (1) | NZ510970A (sk) |
PL (1) | PL347413A1 (sk) |
SI (1) | SI20585A (sk) |
SK (1) | SK5402001A3 (sk) |
WO (1) | WO2000024886A1 (sk) |
YU (1) | YU29801A (sk) |
ZA (1) | ZA200103210B (sk) |
Families Citing this family (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CA2348757A1 (en) * | 1998-12-16 | 2000-06-22 | Genentech, Inc. | Secreted and transmembrane polypeptides and nucleic acids encoding the same |
DE19947010A1 (de) * | 1999-09-30 | 2001-04-05 | Universitaetsklinikum Freiburg | Das Gen PRV-1 und dessen Verwendung |
EP2205249B1 (en) | 2007-09-28 | 2018-11-07 | Intrexon Corporation | Therapeutic gene-switch constructs and bioreactors for the expression of biotherapeutic molecules, and uses thereof |
Family Cites Families (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US6084088A (en) * | 1997-05-06 | 2000-07-04 | Zymogenetics, Inc. | Polynucleotides encoding novel tumor antigens |
-
1998
- 1998-10-23 DE DE19849044A patent/DE19849044A1/de not_active Withdrawn
-
1999
- 1999-09-30 CN CNB998124834A patent/CN1190491C/zh not_active Expired - Fee Related
- 1999-09-30 DE DE59914061T patent/DE59914061D1/de not_active Expired - Lifetime
- 1999-09-30 HU HU0104954A patent/HUP0104954A3/hu unknown
- 1999-09-30 MX MXPA01004035A patent/MXPA01004035A/es unknown
- 1999-09-30 KR KR1020017005025A patent/KR20010080883A/ko not_active Application Discontinuation
- 1999-09-30 US US09/830,189 patent/US6686153B1/en not_active Expired - Fee Related
- 1999-09-30 BR BR9915537-0A patent/BR9915537A/pt not_active IP Right Cessation
- 1999-09-30 CA CA002349211A patent/CA2349211A1/en not_active Abandoned
- 1999-09-30 EP EP99947439A patent/EP1123392B1/de not_active Expired - Lifetime
- 1999-09-30 EA EA200100440A patent/EA200100440A1/ru unknown
- 1999-09-30 WO PCT/EP1999/007238 patent/WO2000024886A1/de active IP Right Grant
- 1999-09-30 YU YU29801A patent/YU29801A/sh unknown
- 1999-09-30 SK SK540-2001A patent/SK5402001A3/sk unknown
- 1999-09-30 NZ NZ510970A patent/NZ510970A/xx unknown
- 1999-09-30 JP JP2000578440A patent/JP2002528077A/ja active Pending
- 1999-09-30 AU AU60883/99A patent/AU771772B2/en not_active Ceased
- 1999-09-30 AT AT99947439T patent/ATE348109T1/de not_active IP Right Cessation
- 1999-09-30 IL IL14266499A patent/IL142664A0/xx unknown
- 1999-09-30 CZ CZ20011430A patent/CZ20011430A3/cs unknown
- 1999-09-30 SI SI9920078A patent/SI20585A/sl not_active IP Right Cessation
- 1999-09-30 EE EEP200100234A patent/EE200100234A/xx unknown
- 1999-09-30 PL PL99347413A patent/PL347413A1/xx not_active Application Discontinuation
-
2001
- 2001-04-19 ZA ZA200103210A patent/ZA200103210B/xx unknown
- 2001-04-20 BG BG105460A patent/BG105460A/xx unknown
- 2001-04-20 NO NO20011961A patent/NO20011961L/no not_active Application Discontinuation
- 2001-04-23 HR HR20010294A patent/HRP20010294A2/hr not_active Application Discontinuation
- 2001-05-22 LT LT2001055A patent/LT4877B/lt not_active IP Right Cessation
- 2001-05-22 LV LVP-01-61A patent/LV12722B/en unknown
-
2003
- 2003-12-05 US US10/727,619 patent/US20040259110A1/en not_active Abandoned
Also Published As
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
KR100210308B1 (ko) | 신규 폴리펩티드 및 이를 암호하는 디엔에이(dna) | |
JP2001524814A (ja) | 28種類のヒト分泌タンパク質 | |
JP2002516103A (ja) | インターロイキン21およびインターロイキン22 | |
JP2005218453A (ja) | 87個のヒト分泌タンパク質 | |
JP2002533058A (ja) | 97個のヒト分泌タンパク質 | |
JP2002502589A (ja) | 45個のヒト分泌タンパク質 | |
JP2001524313A (ja) | 哺乳類のサイトカイン様ポリペプチド−10 | |
JP2009131263A (ja) | 50個のヒト分泌タンパク質 | |
KR100397244B1 (ko) | 거핵구분화인자 | |
JP2001521383A (ja) | 20個のヒト分泌タンパク質 | |
JP2002512521A (ja) | 32個のヒト分泌タンパク質 | |
US5858701A (en) | DNA encoding an insulin receptor substrate | |
JP2001514885A (ja) | 70個のヒト分泌タンパク質 | |
JP2001519179A (ja) | 53個のヒト分泌タンパク質 | |
SK5402001A3 (en) | Prv-1 gene and the use thereof | |
SK4262002A3 (en) | The use of a peptide coded by the prv-1 gene or by a fragment thereof in production of a medicament acting as a growth factor | |
JP2002502601A (ja) | 樹状富化分泌リンパ球活性化分子 | |
JPH1132768A (ja) | 新規な好酸球セリンプロテアーゼ | |
US7214497B2 (en) | Viral encoded semaphorin protein receptor DNA and polypeptides | |
WO2001048222A1 (fr) | Nouveau polypeptide, unite de repetition hexapeptidique contenant une transferase 11, et polynucleotide codant pour ce polypeptide | |
WO2001000664A2 (en) | Secreted alpha-helical protein-36 | |
JPH11302298A (ja) | ヒトcc型ケモカインilc | |
JP2002510192A (ja) | 186個のヒトの分泌タンパク質 | |
AU3882897A (en) | A lysosomal-associated multispanning membrane protein, LAPTM5 and a nuclei c acid encoding LAPTM5 | |
EP1180146A1 (en) | Secreted alpha-helical protein - 32 |