RU2815686C1 - Способ выявления одноцепочечных и двуцепочечных разрывов ДНК в мужских половых клетках - Google Patents

Способ выявления одноцепочечных и двуцепочечных разрывов ДНК в мужских половых клетках Download PDF

Info

Publication number
RU2815686C1
RU2815686C1 RU2023122864A RU2023122864A RU2815686C1 RU 2815686 C1 RU2815686 C1 RU 2815686C1 RU 2023122864 A RU2023122864 A RU 2023122864A RU 2023122864 A RU2023122864 A RU 2023122864A RU 2815686 C1 RU2815686 C1 RU 2815686C1
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
fluorescence intensity
hyaluronic acid
dna
breaks
fluorescein
Prior art date
Application number
RU2023122864A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2815686C9 (ru
Inventor
Татьяна Александровна Сорокина
Владимир Александрович Трофимов
Original Assignee
Татьяна Александровна Сорокина
Filing date
Publication date
Application filed by Татьяна Александровна Сорокина filed Critical Татьяна Александровна Сорокина
Publication of RU2815686C1 publication Critical patent/RU2815686C1/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2815686C9 publication Critical patent/RU2815686C9/ru

Links

Abstract

Изобретение относится к медицине, а именно к медицинской диагностике, и может быть использовано для выявления одноцепочечных и двуцепочечных разрывов ДНК в мужских половых клетках. Осуществляют разбавление пробы эякулята мужчин in vitro в среде из гиалуроновой кислоты, меченной флуоресцеином. Полученные результаты сравнивают с биосовместимым материалом, состоящим из бактериальной целлюлозы, к которой присоединена гиалуроновая кислота, меченная флуоресцеином. Интенсивность флуоресценции биосовместимого материала принимается как 100%. Сперматозоиды имеют минимальное число разрывов ДНК и являются генетически полноценными при снижении интенсивности флуоресценции пробы эякулята в среде до 40% относительно контроля. При интенсивности флуоресценции 40% и выше относительно контроля выявляют, что сперматозоиды имеют высокий уровень разрывов цепей ДНК и являются генетически неполноценными. Способ обеспечивает повышение эффективности обнаружения разрывов в геномной ДНК сперматозоидов за счёт их фиксации на поверхности бактериальной целлюлозы через сродство гиалуроновой кислоты к рецепторам мужских половых клеток. 2 пр.

Description

Изобретение относится к области медицины для выявления одноцепочечных и двуцепочечных разрывов геномной дезоксирибонуклеиновой кислоты (ДНК) половых клеток мужчин и может быть использовано для обнаружения сперматозоидов, имеющих повреждения в ДНК, у мужчин, перенесших Covid-19.
Мужское бесплодие – это глобальная проблема человечества. Перспективным решением данной проблемы в урологии является исследование жизнеспособности мужских половых клеток и выявление фрагментации геномной ДНК за счёт меченных олигонуклеотидов.
На мировом рынке представлено много различных тестов и методик для определения разрывов в ДНК сперматозоидов.
Известен TUNEL-тест, сущность которого заключается в том, что при добавлении специального реактива находятся сперматозоиды с поврежденной ДНК и окрашиваются. Отличительной чертой позднего апоптоза является обширная фрагментация геномной ДНК, которая создает множество двунитевых разрывов ДНК (DSBs) с доступной 3'-гидроксил (3'-OH) группой. TUNEL анализ идентифицирует апоптозные клетки с помощью терминальной деоксинуклеотидил трансфераза (TdT)-опосредованного добавления меченых (X) деоксиуридин трифосфат нуклеотидов (X-dUTP) к 3’-OH концу разрыва ДНК цепи, что затем визуализируется способом, соответствующим внедренной метке, таким образом служа показателем процентного соотношения апоптозных клеток в анализируемой клеточной популяции. Чувствительность анализа зависит от эффективности внедрения модицицированных dUTP, что определяется размером прикрепленной метки (Kyrylkova, K. Detection of apoptosis by TUNEL assay / K. Kyrylkova, S. Kyryachenko. – Текст : электронный // Methods Mol Biol : электронный журнал. – URL: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22566045/. – Дата публикации: 2012).
Недостатками TUNEL-теста являются дороговизна данного метода оценки фрагментации ДНК, а также не достаточно стандартизированные пороговые значения. Также данный метод Tunel Assay является неспецифичным, так как используется для оценки других повреждений в организме.
Известен другой тест, который также представлен на рынке – HALOSPERM тест (Halotech, Испания). Он основан на обнаружении разрывов ДНК по дисперсии хроматина вокруг ядра клетки после гидролиза. Сперматозоиды обрабатывают раствором кислоты, затем после инкубации клетки прокрашивают и просматривают в световом микроскопе. Сперматозоиды, которые содержат целую ДНК, образуют ореол дисперсии («halo-эффект»). Сперматозоиды с фрагментированной ДНК образуют минимальный ореол или не образуют его вообще. Метод прост в использовании (Феськов, А.М. Исследование фрагментации ДНК сперматозоидов у мужчин с повышенным содержанием незрелых спермиев в эякуляте / А.М. Феськов. – Текст : электронный // Мир медицины и биологии : электронный журнал. – URL: https://elibrary.ru/item.asp?id=17947630. Дата публикации: 2012).
Недостатком данного способа является относительно низкая чувствительность и специфичность по сравнению с другими методами исследования фрагментации ДНК.
Известен способ оценки качества эякулята по содержанию сперматозоидов с гидроксиметилированной ДНК, заключающийся в том, что на преаналитическом этапе проводят фиксацию сперматозоидов на предметных стеклах и детектируют в них гидроксиметилированную ДНК с помощью иммунофлуоресценции, затем оценивают при микроскопическом анализе флуоресценцию в не менее чем 5000 индивидуальных сперматозоидов, при этом нормой считают долю сперматозоидов с гидроксиметилированной ДНК, не превышающую 0,5% от общего числа проанализированных сперматозоидов (RU 2673472, МПК G01N 33/53, опубл. 27.11.2018).
Недостатками заявленного способа являются сложность подготовки к исследованию, так как на рынке не представлено готового набора для проведения анализа, а также подсчёт клеток осуществляется лаборантом, где не исключается человеческая ошибка, что ведет к недостоверности данных.
Наиболее близким по сущности к предлагаемому решению является способ оценки генетической полноценности сперматозоидов , включающий использование пробы эякулята in vitro в среде для разбавления, в пробы эякулята in vitro в среде для разбавления добавляют гиалуроновую кислоту, меченную флуоресцеином, в концентрации 0,5-1,0 ммоль с последующей инкубацией при 37°С в течение 5-10 мин и регистрацией интенсивности флуоресценции с максимумом 495 нм, при интенсивности флуоресценции пробы выше 50-60 а.u. сперматозоиды считают зрелыми, генетически полноценными, при интенсивности флуоресценции пробы ниже 30-35 а.u. сперматозоиды считают генетически неполноценными (RU 2679312, МПК G01N 33/52, опубл. 07.02.2019). Данный способ является прототипом тест-системы.
Недостатками данного способа являются малая специфичность и эффективность, так как молекулы гиалуроновой кислоты, меченной флуоресцеином, находятся в растворе, что не позволяет зафиксировать клетки.
Таким образом, представленные способы оценки фрагментации ДНК в сперматозоидах малоэффективны, обладают малой чувствительностью и специфичностью, а также некоторые являются недостоверными.
Технический результат заявленного способа заключается в повышении эффективности обнаружения разрывов в геномной ДНК сперматозоидов и обеспечении доступности используемых компонентов за счёт природного механизма, основанного на взаимодействии специфических рецепторов с гиалуроновой кислотой, находящейся на поверхностной мембране яйцеклетки и изменении интенсивности флуоресценции флуоресцеина, ковалентно связанного с гиалуроновой кислотой.
Сущность изобретения заключается в том, что способ выявления одноцепочечных и двуцепочечных разрывов ДНК в мужских половых клетках включает разбавление пробы эякулята мужчин in vitro в среде из гиалуроновой кислоты, меченной флуоресцеином. Интенсивность флуоресценции регистрируется с максимумом излучения 512 нм, полученные результаты сравниваются с биосовместимым материалом, состоящим из бактериальной целлюлозы, к которой присоединена гиалуроновая кислота, меченная флуоресцеином. Интенсивность флуоресценции биосовместимого материала принимается как 100%. Сперматозоиды имеют минимальное число разрывов ДНК и являются генетически полноценными при снижении интенсивности флуоресценции пробы эякулята в среде до 40% относительно контроля. При интенсивности флуоресценции 40% и выше относительно контроля считается, что сперматозоиды имеют высокий уровень разрывов цепей ДНК и являются генетически неполноценными.
Предложенный способ обеспечивает эффективное обнаружение поврежденных сперматозоидов с фрагментированной геномной ДНК за счёт фиксации данных клеток на поверхность бактериальной целлюлозы через сродство гиалуроной кислоты к рецепторам мужских половых клеток. Это улучшает и облегчает проведение дальнейшего анализа. В данном случает используется биоразлагаемая, прочная и с высокой частотой – бактериальная целлюлоза. Одним из главных плюсов также является то, что ее можно «сшить» с любыми молекулами.
В данном способе бактериальная целлюлоза с иммобизизованной флуоресцеин гиалуроновой кислотой используется в качестве контроля для измерения интенсивности флуоресценции, а результаты исследования выражаются в процентах относительно контроля.
Способ осуществляется следующим образом. Для получения бактериальной целлюлозы используют штамм бактерии рода Gluconacetobacter. Культивирование и получение гель-пленки проводят известным способом в среде Шрама Хетрикс.
Бактериальную целлюлозу очищают от избытка клеток, промывая 4-5 раз 1Н NaOH с выдержкой 30 мин при 80°С и проводят нейтрализацию избытка щелочи промыванием дистиллированной водой до рН 7. Затем очищенную бактериальную целлюлозу размером 2×4 см, весом 8 мг и толщиной 20 мкм высушивают при комнатной температуре и проводят сшивание флуоресцеин гиалуроновой кислоты с бактерицидной целлюлозой.
Для этого 5 мг флуоресцеин гиалуроновой кислотой растворяют в 10 мл 1%-ного раствора NaOH. Разведенный раствор флуоресцеин гиалуроновой кислоты поместить в емкость с бактериальной целлюлозой, так чтобы раствор покрывал пленку. Раствор оставляют на 60 мин, переодически перемешивая по 5 мин. Сшивание производят с помощью сшивающего агента 20%-ным 1,4-бутандиол-диглицидиловым эфиром; для этого 3 мл раствора разводят в 1%-ном растворе NaOH в соотношении 1:5, добавляют к бактериальной целлюлозе. Раствор перемешать стерильной лопаточкой в течение 10 мин. Гель-пленку поместить на водяную баню на 3 часа при 52°С для лучшего протекания реакции сшивки. Об эффективности сшивки судят по интенсивности поглощения на FTIR-ИК спектрах в диапазоне 1075-1000 см-1, свидетельствующей об образовании эфирных связей между компонентами композиции.
После иммобилизации гель-пленку переместить в лабораторную посуду для in vitro исследований (чашка Петри культуральная, 60 мм с центральным отверстием), на поверхность которой наносится препарат спермы (в 1 – биологическая жидкость здоровых мужчин-доноров; во 2 – биологическая жидкость, полученная от мужчин, переболевших Covid-19) – 300-400 мкл. Полученные пробы оставить на 10-15 мин при 37°С для инкубации, после чего регистрируют интенсивность флуоресценции при длине волны возбуждения с максимумом при 494 нм и максимумом излучения при 512 нм.
Контрольным образцом является бактериальная целлюлоза с иммобилизованными остатками флуоресцеин гиалуроновой кислоты, интенсивность флуоресценции которой принимается как 100%. Снижение интенсивности флуоресценции при добавлении сперматозоидов до 40% относительно контроля считается, что сперматозоиды имеют минимальное число разрывов ДНК и являются генетически полноценными; при интенсивности флуоресценции 40% и выше относительно контроля считается, что сперматозоиды имеют высокий уровень разрывов цепей ДНК и являются генетически неполноценными.
Было показано, что у мужчин, переболевших Covid-19, процент связавшихся клеток с флуоресцеин гиалуроновой кислотой ниже за счёт снижения интенсивности флуоресценции, что свидетельствует о том, что после перенесенной болезни половые клетки утрачивают рецептор к гиалуроновой кислоте и являются генетически неполноценными.
Исследование проводилось на сперматозоидах, полученных от мужчин-доноров. У каждого мужчины уточнялись следующие данные: переболел ли Covid-19, период болезни и степень тяжести. С полученным эякулятом проводились исследования на полноценность генетической информации (Пример 1, 2).
Пример 1.
В соответствии с заявленным способом была взята проба эякулята у пациента А, который официально не болел Covid-19. Далее семенную жидкость в количестве 300-400 мкл нанесли на поверхность бактериальной целлюлозы с иммобилизованной на ней гиалуроновой кислотой, меченной флуоресцеином в чашку Петри. Данный образец оставили на 10-15 мин для инкубации при температуре 37°С. После инкубации проводили измерение интенсивности флуоресценции при длине волны 512 нм против контроля, в качестве которого использовалась бактериальная целлюлоза с иммобилизованной флуоресцеин гиалуроновой кислотой без эякулята. Интенсивность флуоресценции пробы пациента А. составила 19,33%, означающая, что сперматозоиды имеют минимальное число разрывов ДНК и являются генетически полноценными.
Пример 2.
В соответствии с заявленным способом была взята проба эякулята у пациента Б, который официально переболел Covid-19 в конце 2021 года. Далее семенную жидкость в количестве 300-400 мкл нанесли на поверхность бактериальной целлюлозы с иммобилизованной на ней гиалуроновой кислотой, меченной флуоресцеином в чашку Петри. Данный образец оставили на 10-15 мин для инкубации при температуре 37°С. После инкубации проводили измерение интенсивности флуоресценции при длине волны 512 нм против контроля, в качестве которого использовалась бактериальная целлюлоза с иммобилизованной флуоресцеин гиалуроновой кислотой без эякулята. Интенсивность флуоресценции пробы пациента Б. составила 50,7%, означающая, что сперматозоиды имеют большое количество разрывов ДНК и являются генетически неполноценными.
По сравнению с известным решением предлагаемое позволяет повысить эффективность обнаружения разрывов в геномной ДНК сперматозоидов и обеспечить доступность используемых компонентов за счёт природного механизма, основанного на взаимодействии специфических рецепторов с гиалуроновой кислотой, находящейся на поверхностной мембране яйцеклетки и изменении интенсивности флуоресценции флуоресцеина, ковалентно связанного с гиалуроновой кислотой.
Изобретение создано за счет средств Фонда содействия развитию малых форм предприятий в научно-технической сфере (соглашение № 17051ГУ/2021 от 28.10.2021).

Claims (1)

  1. Способ выявления одноцепочечных и двуцепочечных разрывов ДНК в мужских половых клетках, включающий разбавление пробы эякулята мужчин in vitro в среде из гиалуроновой кислоты, меченной флуоресцеином, отличающийся тем, что интенсивность флуоресценции регистрируется с максимумом излучения 512 нм, полученные результаты сравниваются с биосовместимым материалом, состоящим из бактериальной целлюлозы, к которой присоединена гиалуроновая кислота, меченная флуоресцеином, интенсивность флуоресценции биосовместимого материала принимается как 100%, сперматозоиды имеют минимальное число разрывов ДНК и являются генетически полноценными при снижении интенсивности флуоресценции пробы эякулята в среде до 40% относительно контроля, при интенсивности флуоресценции 40% и выше относительно контроля выявляют, что сперматозоиды имеют высокий уровень разрывов цепей ДНК и являются генетически неполноценными.
RU2023122864A 2023-09-04 Способ выявления одноцепочечных и двуцепочечных разрывов ДНК в мужских половых клетках RU2815686C9 (ru)

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2815686C1 true RU2815686C1 (ru) 2024-03-20
RU2815686C9 RU2815686C9 (ru) 2024-04-16

Family

ID=

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2679312C1 (ru) * 2017-09-12 2019-02-07 Общество с ограниченной ответственностью "Генетико-селекционный исследовательский центр "Генология-МГУ" Способ оценки генетической полноценности сперматозоидов
RU2730947C1 (ru) * 2020-01-17 2020-08-26 Общество с ограниченной ответственностью "ХалоРУС" Способ для определения целостности хроматина/ДНК в сперматозоидах

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2679312C1 (ru) * 2017-09-12 2019-02-07 Общество с ограниченной ответственностью "Генетико-селекционный исследовательский центр "Генология-МГУ" Способ оценки генетической полноценности сперматозоидов
RU2730947C1 (ru) * 2020-01-17 2020-08-26 Общество с ограниченной ответственностью "ХалоРУС" Способ для определения целостности хроматина/ДНК в сперматозоидах

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
ROMAN MONTANANA C. Assessment of DNA structure and integrity in the human spermatozoon. Tesis doctoral. Birmingham, 2019, 252 p.. GONZALEZ-MARIN C. et al. Types, Causes, Detection and Repair of DNA Fragmentation in Animal and Human Sperm Cells. Int. J. Mol. Sci. 2012; 13: 14026-14052. *

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US9428810B2 (en) Detection of a target in a preservative solution
US8026065B2 (en) Assessment of oocyte competence
JP7306723B2 (ja) 遺伝子のcpgメチル化変化を用いた肝癌の予後または危険度を評価する方法
JP6998658B2 (ja) アミノ酸代謝異常の検出のためのデバイス、及びデバイスを使用する方法
CN110198711A (zh) 癌症检测方法
DK2269065T3 (en) METHODS AND REAGENTS TO INCREASE THE SENSITIVITY OF ENZYM METALLOGRAPHIC DETECTION
KR20060069862A (ko) 자동화된 세포학적 시료 분류
CN105525029A (zh) 反映男性精子活力的精浆piRNA标志物或其组合及应用
JP2009543089A (ja) 細胞状態に関連したグリコシル化パターン検出の方法と試験(分析)
CN110108889B (zh) 一种用于诊断IgA肾病的试剂盒及其应用
US20200166528A1 (en) Methods for Improving Assays of Biological Samples
RU2815686C1 (ru) Способ выявления одноцепочечных и двуцепочечных разрывов ДНК в мужских половых клетках
RU2815686C9 (ru) Способ выявления одноцепочечных и двуцепочечных разрывов ДНК в мужских половых клетках
CN115948544B (zh) Cited4和/或metrn在椎间盘退变程度的鉴别诊断中的应用
Ansah et al. Ultrasensitive electrochemical genosensors for species-specific diagnosis of malaria
WO2019113827A1 (en) Sandwich and species-specific nucleic acid aptamers against plasmodium lactate dehydrogenase for malaria diagnosis
KR20180081445A (ko) 핵산의 신속 검출법 및 이를 이용한 질병의 신속 진단 방법
CN107779503A (zh) 阿尔茨海默相关的差异表达基因及其应用
Guo et al. Identification and validation of metabolism-related genes signature and immune infiltration landscape of rheumatoid arthritis based on machine learning
CN113278616B (zh) 可特异性识别刚地弓形虫具有RNA切割功能的DNAzyme及试剂盒
WO2009096429A1 (ja) ヌクレオチドの抽出方法
WO2017029450A1 (fr) Méthode individuelle prédictive des effets génotoxiques d'agents chimiques ou biochimiques, cassant l'adn
CN115287336A (zh) 一种检测人淋巴细胞eb病毒感染和免疫检查点表达水平的方法
CN101586165A (zh) 检测OTOF基因2975-2978delAG突变的试剂盒
EP3882361A1 (en) Lateral flow assay for detecting the presence of coronavirus in a biological sample