RU2598255C2 - Способ получения белка - Google Patents
Способ получения белка Download PDFInfo
- Publication number
- RU2598255C2 RU2598255C2 RU2013132448/10A RU2013132448A RU2598255C2 RU 2598255 C2 RU2598255 C2 RU 2598255C2 RU 2013132448/10 A RU2013132448/10 A RU 2013132448/10A RU 2013132448 A RU2013132448 A RU 2013132448A RU 2598255 C2 RU2598255 C2 RU 2598255C2
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- antibody
- pair
- gene
- gene fragment
- cell
- Prior art date
Links
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 title claims abstract description 860
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 title claims abstract description 239
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 109
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims abstract description 417
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims abstract description 307
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 claims abstract description 248
- 239000000725 suspension Substances 0.000 claims abstract description 158
- 210000004978 chinese hamster ovary cell Anatomy 0.000 claims abstract description 39
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 claims abstract description 12
- 238000012258 culturing Methods 0.000 claims abstract description 12
- 239000012679 serum free medium Substances 0.000 claims abstract description 8
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims description 203
- YPHMISFOHDHNIV-FSZOTQKASA-N cycloheximide Chemical compound C1[C@@H](C)C[C@H](C)C(=O)[C@@H]1[C@H](O)CC1CC(=O)NC(=O)C1 YPHMISFOHDHNIV-FSZOTQKASA-N 0.000 claims description 142
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 136
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 136
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims description 128
- 239000003550 marker Substances 0.000 claims description 113
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 claims description 85
- 108010020764 Transposases Proteins 0.000 claims description 81
- 102000008579 Transposases Human genes 0.000 claims description 79
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 claims description 59
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims description 30
- 238000004114 suspension culture Methods 0.000 claims description 19
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 claims description 15
- 101001127203 Homo sapiens 60S ribosomal protein L36a Proteins 0.000 claims description 7
- 102000053292 human RPL36A Human genes 0.000 claims description 7
- 230000010354 integration Effects 0.000 claims description 6
- 102000004357 Transferases Human genes 0.000 claims description 3
- 108090000992 Transferases Proteins 0.000 claims description 3
- 239000013598 vector Substances 0.000 abstract description 202
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract description 29
- 239000006285 cell suspension Substances 0.000 abstract description 4
- 230000002062 proliferating effect Effects 0.000 abstract description 3
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract 1
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 207
- 102100033400 4F2 cell-surface antigen heavy chain Human genes 0.000 description 72
- 101000800023 Homo sapiens 4F2 cell-surface antigen heavy chain Proteins 0.000 description 72
- 101000605020 Homo sapiens Large neutral amino acids transporter small subunit 1 Proteins 0.000 description 72
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 50
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 46
- 229930193140 Neomycin Natural products 0.000 description 41
- 229960004927 neomycin Drugs 0.000 description 41
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 40
- RXWNCPJZOCPEPQ-NVWDDTSBSA-N puromycin Chemical compound C1=CC(OC)=CC=C1C[C@H](N)C(=O)N[C@H]1[C@@H](O)[C@H](N2C3=NC=NC(=C3N=C2)N(C)C)O[C@@H]1CO RXWNCPJZOCPEPQ-NVWDDTSBSA-N 0.000 description 37
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 27
- 206010022000 influenza Diseases 0.000 description 25
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 25
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 24
- 241000712461 unidentified influenza virus Species 0.000 description 24
- 108060008682 Tumor Necrosis Factor Proteins 0.000 description 23
- 102000000852 Tumor Necrosis Factor-alpha Human genes 0.000 description 23
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 23
- 241000701022 Cytomegalovirus Species 0.000 description 21
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 20
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 20
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 20
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 20
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 20
- 102100022005 B-lymphocyte antigen CD20 Human genes 0.000 description 16
- 101000897405 Homo sapiens B-lymphocyte antigen CD20 Proteins 0.000 description 16
- 210000000628 antibody-producing cell Anatomy 0.000 description 15
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 14
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 14
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 description 13
- 206010059866 Drug resistance Diseases 0.000 description 12
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 12
- 101100495232 Homo sapiens MS4A1 gene Proteins 0.000 description 11
- 229950010131 puromycin Drugs 0.000 description 11
- SHZGCJCMOBCMKK-UHFFFAOYSA-N D-mannomethylose Natural products CC1OC(O)C(O)C(O)C1O SHZGCJCMOBCMKK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- PNNNRSAQSRJVSB-SLPGGIOYSA-N Fucose Natural products C[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)C=O PNNNRSAQSRJVSB-SLPGGIOYSA-N 0.000 description 10
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 description 10
- SHZGCJCMOBCMKK-DHVFOXMCSA-N L-fucopyranose Chemical compound C[C@@H]1OC(O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H]1O SHZGCJCMOBCMKK-DHVFOXMCSA-N 0.000 description 10
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 10
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 10
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 10
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 10
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 10
- 230000008488 polyadenylation Effects 0.000 description 10
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 10
- 230000017105 transposition Effects 0.000 description 10
- 206010035226 Plasma cell myeloma Diseases 0.000 description 9
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 9
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 9
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 9
- 125000001909 leucine group Chemical group [H]N(*)C(C(*)=O)C([H])([H])C(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 9
- 201000000050 myeloid neoplasm Diseases 0.000 description 9
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 9
- 101000611183 Homo sapiens Tumor necrosis factor Proteins 0.000 description 8
- 230000001464 adherent effect Effects 0.000 description 8
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 8
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 description 8
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 8
- 102000057041 human TNF Human genes 0.000 description 8
- 230000016784 immunoglobulin production Effects 0.000 description 8
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 8
- 235000000346 sugar Nutrition 0.000 description 8
- 210000004102 animal cell Anatomy 0.000 description 7
- 239000012228 culture supernatant Substances 0.000 description 7
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 7
- 230000014616 translation Effects 0.000 description 7
- 241000251468 Actinopterygii Species 0.000 description 6
- 101001014566 Homo sapiens Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3 Proteins 0.000 description 6
- 102100032517 Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3 Human genes 0.000 description 6
- 230000006978 adaptation Effects 0.000 description 6
- 125000003295 alanine group Chemical group N[C@@H](C)C(=O)* 0.000 description 6
- 230000010056 antibody-dependent cellular cytotoxicity Effects 0.000 description 6
- 230000002238 attenuated effect Effects 0.000 description 6
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 6
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 6
- 239000012636 effector Substances 0.000 description 6
- 235000019688 fish Nutrition 0.000 description 6
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 6
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 5
- 240000007019 Oxalis corniculata Species 0.000 description 5
- ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N Proline Natural products OC(=O)C1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 108010008281 Recombinant Fusion Proteins Proteins 0.000 description 5
- 102000007056 Recombinant Fusion Proteins Human genes 0.000 description 5
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 5
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 5
- BRZYSWJRSDMWLG-CAXSIQPQSA-N geneticin Natural products O1C[C@@](O)(C)[C@H](NC)[C@@H](O)[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](C(C)O)O2)N)[C@@H](N)C[C@H]1N BRZYSWJRSDMWLG-CAXSIQPQSA-N 0.000 description 5
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 5
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 5
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 5
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 5
- 241000894007 species Species 0.000 description 5
- 108020004638 Circular DNA Proteins 0.000 description 4
- 244000068988 Glycine max Species 0.000 description 4
- 235000010469 Glycine max Nutrition 0.000 description 4
- 102000003745 Hepatocyte Growth Factor Human genes 0.000 description 4
- 108090000100 Hepatocyte Growth Factor Proteins 0.000 description 4
- 108090000723 Insulin-Like Growth Factor I Proteins 0.000 description 4
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 4
- 108010000605 Ribosomal Proteins Proteins 0.000 description 4
- 102000002278 Ribosomal Proteins Human genes 0.000 description 4
- 238000007792 addition Methods 0.000 description 4
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 4
- 238000013401 experimental design Methods 0.000 description 4
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 4
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 4
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 4
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 4
- CWCMIVBLVUHDHK-ZSNHEYEWSA-N phleomycin D1 Chemical compound N([C@H](C(=O)N[C@H](C)[C@@H](O)[C@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)NCCC=1SC[C@@H](N=1)C=1SC=C(N=1)C(=O)NCCCCNC(N)=N)[C@@H](O[C@H]1[C@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@H](CO)O1)O[C@@H]1[C@H]([C@@H](OC(N)=O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1)O)C=1N=CNC=1)C(=O)C1=NC([C@H](CC(N)=O)NC[C@H](N)C(N)=O)=NC(N)=C1C CWCMIVBLVUHDHK-ZSNHEYEWSA-N 0.000 description 4
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 description 4
- 230000004481 post-translational protein modification Effects 0.000 description 4
- 125000001500 prolyl group Chemical group [H]N1C([H])(C(=O)[*])C([H])([H])C([H])([H])C1([H])[H] 0.000 description 4
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 4
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 4
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 description 4
- 230000010474 transient expression Effects 0.000 description 4
- -1 CD158 Proteins 0.000 description 3
- 102100024423 Carbonic anhydrase 9 Human genes 0.000 description 3
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 3
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 3
- YQYJSBFKSSDGFO-UHFFFAOYSA-N Epihygromycin Natural products OC1C(O)C(C(=O)C)OC1OC(C(=C1)O)=CC=C1C=C(C)C(=O)NC1C(O)C(O)C2OCOC2C1O YQYJSBFKSSDGFO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 102000014429 Insulin-like growth factor Human genes 0.000 description 3
- QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N L-alanine Chemical compound C[C@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N 0.000 description 3
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 3
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 3
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 208000036142 Viral infection Diseases 0.000 description 3
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 description 3
- 239000003114 blood coagulation factor Substances 0.000 description 3
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 3
- 230000002950 deficient Effects 0.000 description 3
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 3
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 3
- 239000003102 growth factor Substances 0.000 description 3
- 239000012535 impurity Substances 0.000 description 3
- 208000032839 leukemia Diseases 0.000 description 3
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 3
- 230000001766 physiological effect Effects 0.000 description 3
- 230000006798 recombination Effects 0.000 description 3
- 238000005215 recombination Methods 0.000 description 3
- 229960004641 rituximab Drugs 0.000 description 3
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 3
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 2
- 108010088751 Albumins Proteins 0.000 description 2
- 102000009027 Albumins Human genes 0.000 description 2
- 108010074725 Alpha,alpha-trehalose phosphorylase Proteins 0.000 description 2
- 102000045205 Angiopoietin-Like Protein 4 Human genes 0.000 description 2
- 101710085845 Angiopoietin-related protein 4 Proteins 0.000 description 2
- 102100021253 Antileukoproteinase Human genes 0.000 description 2
- 108090000935 Antithrombin III Proteins 0.000 description 2
- 102000004411 Antithrombin III Human genes 0.000 description 2
- DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N Asparagine Natural products OC(=O)C(N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000972773 Aulopiformes Species 0.000 description 2
- 208000035143 Bacterial infection Diseases 0.000 description 2
- 102000015081 Blood Coagulation Factors Human genes 0.000 description 2
- 108010039209 Blood Coagulation Factors Proteins 0.000 description 2
- 241000255789 Bombyx mori Species 0.000 description 2
- 108010051118 Bone Marrow Stromal Antigen 2 Proteins 0.000 description 2
- 102100037086 Bone marrow stromal antigen 2 Human genes 0.000 description 2
- 108700012439 CA9 Proteins 0.000 description 2
- 102100031168 CCN family member 2 Human genes 0.000 description 2
- 108010029697 CD40 Ligand Proteins 0.000 description 2
- 102100032937 CD40 ligand Human genes 0.000 description 2
- 108010022366 Carcinoembryonic Antigen Proteins 0.000 description 2
- 102100025475 Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5 Human genes 0.000 description 2
- 208000024172 Cardiovascular disease Diseases 0.000 description 2
- 102000009410 Chemokine receptor Human genes 0.000 description 2
- 108050000299 Chemokine receptor Proteins 0.000 description 2
- 102100025680 Complement decay-accelerating factor Human genes 0.000 description 2
- 108010039419 Connective Tissue Growth Factor Proteins 0.000 description 2
- 108091035707 Consensus sequence Proteins 0.000 description 2
- 102000004127 Cytokines Human genes 0.000 description 2
- 108090000695 Cytokines Proteins 0.000 description 2
- 102000001301 EGF receptor Human genes 0.000 description 2
- 108060006698 EGF receptor Proteins 0.000 description 2
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 2
- 102100037241 Endoglin Human genes 0.000 description 2
- 108010066687 Epithelial Cell Adhesion Molecule Proteins 0.000 description 2
- 102000018651 Epithelial Cell Adhesion Molecule Human genes 0.000 description 2
- 102000003951 Erythropoietin Human genes 0.000 description 2
- 108090000394 Erythropoietin Proteins 0.000 description 2
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 2
- 108091008794 FGF receptors Proteins 0.000 description 2
- 102100031517 Fc receptor-like protein 1 Human genes 0.000 description 2
- 101710120224 Fc receptor-like protein 1 Proteins 0.000 description 2
- 102000044168 Fibroblast Growth Factor Receptor Human genes 0.000 description 2
- 108090000368 Fibroblast growth factor 8 Proteins 0.000 description 2
- 102000003956 Fibroblast growth factor 8 Human genes 0.000 description 2
- 102000012673 Follicle Stimulating Hormone Human genes 0.000 description 2
- 108010079345 Follicle Stimulating Hormone Proteins 0.000 description 2
- 102100041003 Glutamate carboxypeptidase 2 Human genes 0.000 description 2
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102100034223 Golgi apparatus protein 1 Human genes 0.000 description 2
- 108010051696 Growth Hormone Proteins 0.000 description 2
- 101000856022 Homo sapiens Complement decay-accelerating factor Proteins 0.000 description 2
- 101000892862 Homo sapiens Glutamate carboxypeptidase 2 Proteins 0.000 description 2
- 101000635804 Homo sapiens Tissue factor Proteins 0.000 description 2
- 101000851018 Homo sapiens Vascular endothelial growth factor receptor 1 Proteins 0.000 description 2
- 206010020751 Hypersensitivity Diseases 0.000 description 2
- 102100026120 IgG receptor FcRn large subunit p51 Human genes 0.000 description 2
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 2
- 206010061218 Inflammation Diseases 0.000 description 2
- 108010050904 Interferons Proteins 0.000 description 2
- 102000014150 Interferons Human genes 0.000 description 2
- DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N L-asparagine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N 0.000 description 2
- KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N L-valine Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 2
- 241001529936 Murinae Species 0.000 description 2
- OVRNDRQMDRJTHS-UHFFFAOYSA-N N-acelyl-D-glucosamine Natural products CC(=O)NC1C(O)OC(CO)C(O)C1O OVRNDRQMDRJTHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- MBLBDJOUHNCFQT-LXGUWJNJSA-N N-acetylglucosamine Natural products CC(=O)N[C@@H](C=O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO MBLBDJOUHNCFQT-LXGUWJNJSA-N 0.000 description 2
- 108700020797 Parathyroid Hormone-Related Proteins 0.000 description 2
- 102000003982 Parathyroid hormone Human genes 0.000 description 2
- 108090000445 Parathyroid hormone Proteins 0.000 description 2
- 102000043299 Parathyroid hormone-related Human genes 0.000 description 2
- 102000004211 Platelet factor 4 Human genes 0.000 description 2
- 108090000778 Platelet factor 4 Proteins 0.000 description 2
- 101710120463 Prostate stem cell antigen Proteins 0.000 description 2
- 102100036735 Prostate stem cell antigen Human genes 0.000 description 2
- 108010072866 Prostate-Specific Antigen Proteins 0.000 description 2
- 102100038358 Prostate-specific antigen Human genes 0.000 description 2
- 101800004937 Protein C Proteins 0.000 description 2
- 102100036546 Salivary acidic proline-rich phosphoprotein 1/2 Human genes 0.000 description 2
- 101800001700 Saposin-D Proteins 0.000 description 2
- 108010082545 Secretory Leukocyte Peptidase Inhibitor Proteins 0.000 description 2
- 102100027717 Semaphorin-4B Human genes 0.000 description 2
- 101710199421 Semaphorin-4B Proteins 0.000 description 2
- 102100038803 Somatotropin Human genes 0.000 description 2
- 102000003978 Tissue Plasminogen Activator Human genes 0.000 description 2
- 108090000373 Tissue Plasminogen Activator Proteins 0.000 description 2
- 108010033576 Transferrin Receptors Proteins 0.000 description 2
- 102100026144 Transferrin receptor protein 1 Human genes 0.000 description 2
- 206010054094 Tumour necrosis Diseases 0.000 description 2
- KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N Valine Natural products CC(C)C(N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010073929 Vascular Endothelial Growth Factor A Proteins 0.000 description 2
- 102000005789 Vascular Endothelial Growth Factors Human genes 0.000 description 2
- 108010019530 Vascular Endothelial Growth Factors Proteins 0.000 description 2
- 102100033178 Vascular endothelial growth factor receptor 1 Human genes 0.000 description 2
- 102100033177 Vascular endothelial growth factor receptor 2 Human genes 0.000 description 2
- 241000251539 Vertebrata <Metazoa> Species 0.000 description 2
- 108010084455 Zeocin Proteins 0.000 description 2
- 208000026935 allergic disease Diseases 0.000 description 2
- 230000007815 allergy Effects 0.000 description 2
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 2
- 230000000259 anti-tumor effect Effects 0.000 description 2
- 229960005348 antithrombin iii Drugs 0.000 description 2
- 235000009582 asparagine Nutrition 0.000 description 2
- 229960001230 asparagine Drugs 0.000 description 2
- 208000022362 bacterial infectious disease Diseases 0.000 description 2
- 229940019700 blood coagulation factors Drugs 0.000 description 2
- 210000004748 cultured cell Anatomy 0.000 description 2
- 229940105423 erythropoietin Drugs 0.000 description 2
- 230000001747 exhibiting effect Effects 0.000 description 2
- 239000013613 expression plasmid Substances 0.000 description 2
- 229940028334 follicle stimulating hormone Drugs 0.000 description 2
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 2
- 239000000122 growth hormone Substances 0.000 description 2
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 2
- 230000004054 inflammatory process Effects 0.000 description 2
- 238000007689 inspection Methods 0.000 description 2
- NOESYZHRGYRDHS-UHFFFAOYSA-N insulin Chemical compound N1C(=O)C(NC(=O)C(CCC(N)=O)NC(=O)C(CCC(O)=O)NC(=O)C(C(C)C)NC(=O)C(NC(=O)CN)C(C)CC)CSSCC(C(NC(CO)C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)NC(CC=2C=CC(O)=CC=2)C(=O)NC(CCC(N)=O)C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)NC(CCC(O)=O)C(=O)NC(CC(N)=O)C(=O)NC(CC=2C=CC(O)=CC=2)C(=O)NC(CSSCC(NC(=O)C(C(C)C)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(CC=2C=CC(O)=CC=2)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(C)NC(=O)C(CCC(O)=O)NC(=O)C(C(C)C)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(CC=2NC=NC=2)NC(=O)C(CO)NC(=O)CNC2=O)C(=O)NCC(=O)NC(CCC(O)=O)C(=O)NC(CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(=O)NC(CC=3C=CC=CC=3)C(=O)NC(CC=3C=CC=CC=3)C(=O)NC(CC=3C=CC(O)=CC=3)C(=O)NC(C(C)O)C(=O)N3C(CCC3)C(=O)NC(CCCCN)C(=O)NC(C)C(O)=O)C(=O)NC(CC(N)=O)C(O)=O)=O)NC(=O)C(C(C)CC)NC(=O)C(CO)NC(=O)C(C(C)O)NC(=O)C1CSSCC2NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(NC(=O)C(CCC(N)=O)NC(=O)C(CC(N)=O)NC(=O)C(NC(=O)C(N)CC=1C=CC=CC=1)C(C)C)CC1=CN=CN1 NOESYZHRGYRDHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229940079322 interferon Drugs 0.000 description 2
- 229940028885 interleukin-4 Drugs 0.000 description 2
- 229940100602 interleukin-5 Drugs 0.000 description 2
- 229940100601 interleukin-6 Drugs 0.000 description 2
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 2
- MYWUZJCMWCOHBA-VIFPVBQESA-N methamphetamine Chemical compound CN[C@@H](C)CC1=CC=CC=C1 MYWUZJCMWCOHBA-VIFPVBQESA-N 0.000 description 2
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 2
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 2
- 239000000199 parathyroid hormone Substances 0.000 description 2
- 229960001319 parathyroid hormone Drugs 0.000 description 2
- 230000026731 phosphorylation Effects 0.000 description 2
- 238000006366 phosphorylation reaction Methods 0.000 description 2
- OXCMYAYHXIHQOA-UHFFFAOYSA-N potassium;[2-butyl-5-chloro-3-[[4-[2-(1,2,4-triaza-3-azanidacyclopenta-1,4-dien-5-yl)phenyl]phenyl]methyl]imidazol-4-yl]methanol Chemical compound [K+].CCCCC1=NC(Cl)=C(CO)N1CC1=CC=C(C=2C(=CC=CC=2)C2=N[N-]N=N2)C=C1 OXCMYAYHXIHQOA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 2
- 230000000644 propagated effect Effects 0.000 description 2
- 230000004952 protein activity Effects 0.000 description 2
- 229960000856 protein c Drugs 0.000 description 2
- 238000011160 research Methods 0.000 description 2
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 2
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 2
- 229960000187 tissue plasminogen activator Drugs 0.000 description 2
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 2
- 239000004474 valine Substances 0.000 description 2
- 108700026220 vif Genes Proteins 0.000 description 2
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 2
- 239000003643 water by type Substances 0.000 description 2
- DIGQNXIGRZPYDK-WKSCXVIASA-N (2R)-6-amino-2-[[2-[[(2S)-2-[[2-[[(2R)-2-[[(2S)-2-[[(2R,3S)-2-[[2-[[(2S)-2-[[2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2R)-2-[[(2S,3S)-2-[[(2R)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[2-[[(2S)-2-[[(2R)-2-[[2-[[2-[[2-[(2-amino-1-hydroxyethylidene)amino]-3-carboxy-1-hydroxypropylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1-hydroxyethylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1,3-dihydroxypropylidene]amino]-1-hydroxyethylidene]amino]-1-hydroxypropylidene]amino]-1,3-dihydroxypropylidene]amino]-1,3-dihydroxypropylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1,3-dihydroxybutylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1-hydroxypropylidene]amino]-1,3-dihydroxypropylidene]amino]-1-hydroxyethylidene]amino]-1,5-dihydroxy-5-iminopentylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1,3-dihydroxybutylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1,3-dihydroxypropylidene]amino]-1-hydroxyethylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1-hydroxyethylidene]amino]hexanoic acid Chemical compound C[C@@H]([C@@H](C(=N[C@@H](CS)C(=N[C@@H](C)C(=N[C@@H](CO)C(=NCC(=N[C@@H](CCC(=N)O)C(=NC(CS)C(=N[C@H]([C@H](C)O)C(=N[C@H](CS)C(=N[C@H](CO)C(=NCC(=N[C@H](CS)C(=NCC(=N[C@H](CCCCN)C(=O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)N=C([C@H](CS)N=C([C@H](CO)N=C([C@H](CO)N=C([C@H](C)N=C(CN=C([C@H](CO)N=C([C@H](CS)N=C(CN=C(C(CS)N=C(C(CC(=O)O)N=C(CN)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O DIGQNXIGRZPYDK-WKSCXVIASA-N 0.000 description 1
- MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N (2S)-2-Amino-3-hydroxypropansäure Chemical compound OC[C@H](N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- KIUKXJAPPMFGSW-DNGZLQJQSA-N (2S,3S,4S,5R,6R)-6-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-Acetamido-2-[(2S,3S,4R,5R,6R)-6-[(2R,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-2,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-4-yl]oxy-2-carboxy-4,5-dihydroxyoxan-3-yl]oxy-5-hydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-4-yl]oxy-3,4,5-trihydroxyoxane-2-carboxylic acid Chemical compound CC(=O)N[C@H]1[C@H](O)O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O[C@H]2[C@@H]([C@@H](O[C@H]3[C@@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O3)C(O)=O)O)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)NC(C)=O)[C@@H](C(O)=O)O1 KIUKXJAPPMFGSW-DNGZLQJQSA-N 0.000 description 1
- TZCPCKNHXULUIY-RGULYWFUSA-N 1,2-distearoyl-sn-glycero-3-phosphoserine Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[C@H](COP(O)(=O)OC[C@H](N)C(O)=O)OC(=O)CCCCCCCCCCCCCCCCC TZCPCKNHXULUIY-RGULYWFUSA-N 0.000 description 1
- 102100031585 ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1 Human genes 0.000 description 1
- 102000004379 Adrenomedullin Human genes 0.000 description 1
- 101800004616 Adrenomedullin Proteins 0.000 description 1
- 102000034263 Amino acid transporters Human genes 0.000 description 1
- 108050005273 Amino acid transporters Proteins 0.000 description 1
- 102100022749 Aminopeptidase N Human genes 0.000 description 1
- 241000269350 Anura Species 0.000 description 1
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 1
- 208000023275 Autoimmune disease Diseases 0.000 description 1
- 102100038080 B-cell receptor CD22 Human genes 0.000 description 1
- 102100024222 B-lymphocyte antigen CD19 Human genes 0.000 description 1
- 102100021523 BPI fold-containing family A member 1 Human genes 0.000 description 1
- 229920001342 Bakelite® Polymers 0.000 description 1
- 102100032412 Basigin Human genes 0.000 description 1
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 1
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 1
- 102100036301 C-C chemokine receptor type 7 Human genes 0.000 description 1
- 102100036303 C-C chemokine receptor type 9 Human genes 0.000 description 1
- 102100024217 CAMPATH-1 antigen Human genes 0.000 description 1
- 108091008927 CC chemokine receptors Proteins 0.000 description 1
- 102000005674 CCR Receptors Human genes 0.000 description 1
- 102000017420 CD3 protein, epsilon/gamma/delta subunit Human genes 0.000 description 1
- 108050005493 CD3 protein, epsilon/gamma/delta subunit Proteins 0.000 description 1
- 101150013553 CD40 gene Proteins 0.000 description 1
- 102100032912 CD44 antigen Human genes 0.000 description 1
- 108010065524 CD52 Antigen Proteins 0.000 description 1
- 102100022002 CD59 glycoprotein Human genes 0.000 description 1
- 102100025222 CD63 antigen Human genes 0.000 description 1
- 102100025221 CD70 antigen Human genes 0.000 description 1
- 102100037904 CD9 antigen Human genes 0.000 description 1
- 108010021064 CTLA-4 Antigen Proteins 0.000 description 1
- 229940045513 CTLA4 antagonist Drugs 0.000 description 1
- 108050007957 Cadherin Proteins 0.000 description 1
- 102000000905 Cadherin Human genes 0.000 description 1
- 241000244203 Caenorhabditis elegans Species 0.000 description 1
- 235000017399 Caesalpinia tinctoria Nutrition 0.000 description 1
- 102100025470 Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 8 Human genes 0.000 description 1
- 102000014914 Carrier Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010067225 Cell Adhesion Molecules Proteins 0.000 description 1
- 102000016289 Cell Adhesion Molecules Human genes 0.000 description 1
- 241000282693 Cercopithecidae Species 0.000 description 1
- 229920002567 Chondroitin Polymers 0.000 description 1
- 108700010070 Codon Usage Proteins 0.000 description 1
- 108010035532 Collagen Proteins 0.000 description 1
- 102000008186 Collagen Human genes 0.000 description 1
- 102000029816 Collagenase Human genes 0.000 description 1
- 108060005980 Collagenase Proteins 0.000 description 1
- 102100032768 Complement receptor type 2 Human genes 0.000 description 1
- 241000699802 Cricetulus griseus Species 0.000 description 1
- 102100039498 Cytotoxic T-lymphocyte protein 4 Human genes 0.000 description 1
- 101150074155 DHFR gene Proteins 0.000 description 1
- 101100016370 Danio rerio hsp90a.1 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100481404 Danio rerio tie1 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100285708 Dictyostelium discoideum hspD gene Proteins 0.000 description 1
- 102100024746 Dihydrofolate reductase Human genes 0.000 description 1
- 241000255601 Drosophila melanogaster Species 0.000 description 1
- 102100025137 Early activation antigen CD69 Human genes 0.000 description 1
- 102100034239 Emerin Human genes 0.000 description 1
- 108010036395 Endoglin Proteins 0.000 description 1
- 108010009900 Endothelial Protein C Receptor Proteins 0.000 description 1
- 102000009839 Endothelial Protein C Receptor Human genes 0.000 description 1
- 108010055196 EphA2 Receptor Proteins 0.000 description 1
- 102100030340 Ephrin type-A receptor 2 Human genes 0.000 description 1
- 108091006020 Fc-tagged proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000008857 Ferritin Human genes 0.000 description 1
- 108050000784 Ferritin Proteins 0.000 description 1
- 238000008416 Ferritin Methods 0.000 description 1
- 108010049003 Fibrinogen Proteins 0.000 description 1
- 102000008946 Fibrinogen Human genes 0.000 description 1
- 102100037680 Fibroblast growth factor 8 Human genes 0.000 description 1
- 102100027844 Fibroblast growth factor receptor 4 Human genes 0.000 description 1
- 101710181403 Frizzled Proteins 0.000 description 1
- 208000003098 Ganglion Cysts Diseases 0.000 description 1
- 108700028146 Genetic Enhancer Elements Proteins 0.000 description 1
- 108700007698 Genetic Terminator Regions Proteins 0.000 description 1
- WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N Glutamic acid Natural products OC(=O)C(N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZWZWYGMENQVNFU-UHFFFAOYSA-N Glycerophosphorylserin Natural products OC(=O)C(N)COP(O)(=O)OCC(O)CO ZWZWYGMENQVNFU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 1
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 description 1
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 description 1
- 108010054017 Granulocyte Colony-Stimulating Factor Receptors Proteins 0.000 description 1
- 102100039622 Granulocyte colony-stimulating factor receptor Human genes 0.000 description 1
- 108010043121 Green Fluorescent Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000009465 Growth Factor Receptors Human genes 0.000 description 1
- 108010009202 Growth Factor Receptors Proteins 0.000 description 1
- 108091008603 HGF receptors Proteins 0.000 description 1
- 102100030595 HLA class II histocompatibility antigen gamma chain Human genes 0.000 description 1
- 102000006354 HLA-DR Antigens Human genes 0.000 description 1
- 108010058597 HLA-DR Antigens Proteins 0.000 description 1
- 101710113864 Heat shock protein 90 Proteins 0.000 description 1
- 102100024025 Heparanase Human genes 0.000 description 1
- 102100022623 Hepatocyte growth factor receptor Human genes 0.000 description 1
- 102100026122 High affinity immunoglobulin gamma Fc receptor I Human genes 0.000 description 1
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 1
- 101000777636 Homo sapiens ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000757160 Homo sapiens Aminopeptidase N Proteins 0.000 description 1
- 101000884305 Homo sapiens B-cell receptor CD22 Proteins 0.000 description 1
- 101000980825 Homo sapiens B-lymphocyte antigen CD19 Proteins 0.000 description 1
- 101000899089 Homo sapiens BPI fold-containing family A member 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000798441 Homo sapiens Basigin Proteins 0.000 description 1
- 101000716065 Homo sapiens C-C chemokine receptor type 7 Proteins 0.000 description 1
- 101000716070 Homo sapiens C-C chemokine receptor type 9 Proteins 0.000 description 1
- 101000868273 Homo sapiens CD44 antigen Proteins 0.000 description 1
- 101000897400 Homo sapiens CD59 glycoprotein Proteins 0.000 description 1
- 101000934368 Homo sapiens CD63 antigen Proteins 0.000 description 1
- 101000934356 Homo sapiens CD70 antigen Proteins 0.000 description 1
- 101000738354 Homo sapiens CD9 antigen Proteins 0.000 description 1
- 101000914320 Homo sapiens Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 8 Proteins 0.000 description 1
- 101000916489 Homo sapiens Chondroitin sulfate proteoglycan 4 Proteins 0.000 description 1
- 101000941929 Homo sapiens Complement receptor type 2 Proteins 0.000 description 1
- 101000934374 Homo sapiens Early activation antigen CD69 Proteins 0.000 description 1
- 101000925840 Homo sapiens Emerin Proteins 0.000 description 1
- 101000881679 Homo sapiens Endoglin Proteins 0.000 description 1
- 101001027382 Homo sapiens Fibroblast growth factor 8 Proteins 0.000 description 1
- 101000917134 Homo sapiens Fibroblast growth factor receptor 4 Proteins 0.000 description 1
- 101001082627 Homo sapiens HLA class II histocompatibility antigen gamma chain Proteins 0.000 description 1
- 101000913074 Homo sapiens High affinity immunoglobulin gamma Fc receptor I Proteins 0.000 description 1
- 101000878602 Homo sapiens Immunoglobulin alpha Fc receptor Proteins 0.000 description 1
- 101000599852 Homo sapiens Intercellular adhesion molecule 1 Proteins 0.000 description 1
- 101001057504 Homo sapiens Interferon-stimulated gene 20 kDa protein Proteins 0.000 description 1
- 101001055144 Homo sapiens Interleukin-2 receptor subunit alpha Proteins 0.000 description 1
- 101001027081 Homo sapiens Killer cell immunoglobulin-like receptor 2DL1 Proteins 0.000 description 1
- 101000945371 Homo sapiens Killer cell immunoglobulin-like receptor 2DL2 Proteins 0.000 description 1
- 101000868279 Homo sapiens Leukocyte surface antigen CD47 Proteins 0.000 description 1
- 101000917826 Homo sapiens Low affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor II-a Proteins 0.000 description 1
- 101000917824 Homo sapiens Low affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor II-b Proteins 0.000 description 1
- 101000961414 Homo sapiens Membrane cofactor protein Proteins 0.000 description 1
- 101000934338 Homo sapiens Myeloid cell surface antigen CD33 Proteins 0.000 description 1
- 101000829725 Homo sapiens Phospholipid hydroperoxide glutathione peroxidase Proteins 0.000 description 1
- 101000586618 Homo sapiens Poliovirus receptor Proteins 0.000 description 1
- 101000891848 Homo sapiens Protein FAM3D Proteins 0.000 description 1
- 101001012157 Homo sapiens Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2 Proteins 0.000 description 1
- 101000932478 Homo sapiens Receptor-type tyrosine-protein kinase FLT3 Proteins 0.000 description 1
- 101000738771 Homo sapiens Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C Proteins 0.000 description 1
- 101000650694 Homo sapiens Roundabout homolog 1 Proteins 0.000 description 1
- 101001056234 Homo sapiens Sperm mitochondrial-associated cysteine-rich protein Proteins 0.000 description 1
- 101000873927 Homo sapiens Squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3 Proteins 0.000 description 1
- 101000874179 Homo sapiens Syndecan-1 Proteins 0.000 description 1
- 101000914496 Homo sapiens T-cell antigen CD7 Proteins 0.000 description 1
- 101000934376 Homo sapiens T-cell differentiation antigen CD6 Proteins 0.000 description 1
- 101000934346 Homo sapiens T-cell surface antigen CD2 Proteins 0.000 description 1
- 101000716102 Homo sapiens T-cell surface glycoprotein CD4 Proteins 0.000 description 1
- 101000934341 Homo sapiens T-cell surface glycoprotein CD5 Proteins 0.000 description 1
- 101000914514 Homo sapiens T-cell-specific surface glycoprotein CD28 Proteins 0.000 description 1
- 101000914484 Homo sapiens T-lymphocyte activation antigen CD80 Proteins 0.000 description 1
- 101000679857 Homo sapiens Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3 Proteins 0.000 description 1
- 101000679851 Homo sapiens Tumor necrosis factor receptor superfamily member 4 Proteins 0.000 description 1
- 101000611023 Homo sapiens Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6 Proteins 0.000 description 1
- 101000851376 Homo sapiens Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8 Proteins 0.000 description 1
- 101000851370 Homo sapiens Tumor necrosis factor receptor superfamily member 9 Proteins 0.000 description 1
- 101000851007 Homo sapiens Vascular endothelial growth factor receptor 2 Proteins 0.000 description 1
- 101000851030 Homo sapiens Vascular endothelial growth factor receptor 3 Proteins 0.000 description 1
- 101000744718 Homo sapiens YTH domain-containing family protein 3 Proteins 0.000 description 1
- 102100027735 Hyaluronan mediated motility receptor Human genes 0.000 description 1
- 108010073807 IgG Receptors Proteins 0.000 description 1
- 101710177940 IgG receptor FcRn large subunit p51 Proteins 0.000 description 1
- 102000008394 Immunoglobulin Fragments Human genes 0.000 description 1
- 108010021625 Immunoglobulin Fragments Proteins 0.000 description 1
- 102100038005 Immunoglobulin alpha Fc receptor Human genes 0.000 description 1
- 102000004877 Insulin Human genes 0.000 description 1
- 108090001061 Insulin Proteins 0.000 description 1
- 102100037852 Insulin-like growth factor I Human genes 0.000 description 1
- 108010008212 Integrin alpha4beta1 Proteins 0.000 description 1
- 102100037877 Intercellular adhesion molecule 1 Human genes 0.000 description 1
- 102000018682 Interleukin Receptor Common gamma Subunit Human genes 0.000 description 1
- 108010066719 Interleukin Receptor Common gamma Subunit Proteins 0.000 description 1
- 102100026878 Interleukin-2 receptor subunit alpha Human genes 0.000 description 1
- 108090001005 Interleukin-6 Proteins 0.000 description 1
- 102100037792 Interleukin-6 receptor subunit alpha Human genes 0.000 description 1
- 108010063738 Interleukins Proteins 0.000 description 1
- 102000015696 Interleukins Human genes 0.000 description 1
- 102100038297 Kallikrein-1 Human genes 0.000 description 1
- 101710176219 Kallikrein-1 Proteins 0.000 description 1
- 108010025815 Kanamycin Kinase Proteins 0.000 description 1
- 102100033421 Keratin, type I cytoskeletal 18 Human genes 0.000 description 1
- 108010066327 Keratin-18 Proteins 0.000 description 1
- 102100037363 Killer cell immunoglobulin-like receptor 2DL1 Human genes 0.000 description 1
- 102100033599 Killer cell immunoglobulin-like receptor 2DL2 Human genes 0.000 description 1
- ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N L-Proline Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N L-aspartic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N L-phenylalanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 1
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 1
- 101150117895 LAMP2 gene Proteins 0.000 description 1
- 101150048357 Lamp1 gene Proteins 0.000 description 1
- 108090001090 Lectins Proteins 0.000 description 1
- 102000004856 Lectins Human genes 0.000 description 1
- 102100032913 Leukocyte surface antigen CD47 Human genes 0.000 description 1
- 102100024032 Linker for activation of T-cells family member 1 Human genes 0.000 description 1
- 102100029204 Low affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor II-a Human genes 0.000 description 1
- 102100029185 Low affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor III-B Human genes 0.000 description 1
- 102000003959 Lymphotoxin-beta Human genes 0.000 description 1
- 108090000362 Lymphotoxin-beta Proteins 0.000 description 1
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 1
- 102000018697 Membrane Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010052285 Membrane Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102100039373 Membrane cofactor protein Human genes 0.000 description 1
- 241000699673 Mesocricetus auratus Species 0.000 description 1
- 108090000015 Mesothelin Proteins 0.000 description 1
- 102000003735 Mesothelin Human genes 0.000 description 1
- 102000003792 Metallothionein Human genes 0.000 description 1
- 108090000157 Metallothionein Proteins 0.000 description 1
- 101100407308 Mus musculus Pdcd1lg2 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100481406 Mus musculus Tie1 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100046559 Mus musculus Tnfrsf12a gene Proteins 0.000 description 1
- 102100038895 Myc proto-oncogene protein Human genes 0.000 description 1
- 101710135898 Myc proto-oncogene protein Proteins 0.000 description 1
- 102100025243 Myeloid cell surface antigen CD33 Human genes 0.000 description 1
- OVRNDRQMDRJTHS-RTRLPJTCSA-N N-acetyl-D-glucosamine Chemical compound CC(=O)N[C@H]1C(O)O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@@H]1O OVRNDRQMDRJTHS-RTRLPJTCSA-N 0.000 description 1
- OVRNDRQMDRJTHS-FMDGEEDCSA-N N-acetyl-beta-D-glucosamine Chemical compound CC(=O)N[C@H]1[C@H](O)O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@@H]1O OVRNDRQMDRJTHS-FMDGEEDCSA-N 0.000 description 1
- 241000244206 Nematoda Species 0.000 description 1
- 108090000028 Neprilysin Proteins 0.000 description 1
- 102000003729 Neprilysin Human genes 0.000 description 1
- 102100023181 Neurogenic locus notch homolog protein 1 Human genes 0.000 description 1
- 108700037638 Neurogenic locus notch homolog protein 1 Proteins 0.000 description 1
- KUIFHYPNNRVEKZ-VIJRYAKMSA-N O-(N-acetyl-alpha-D-galactosaminyl)-L-threonine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)[C@@H](C)O[C@H]1O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1NC(C)=O KUIFHYPNNRVEKZ-VIJRYAKMSA-N 0.000 description 1
- 108700020796 Oncogene Proteins 0.000 description 1
- 241000276568 Oryzias Species 0.000 description 1
- 108010081689 Osteopontin Proteins 0.000 description 1
- 102000004264 Osteopontin Human genes 0.000 description 1
- 108091008606 PDGF receptors Proteins 0.000 description 1
- 206010057249 Phagocytosis Diseases 0.000 description 1
- 102000011653 Platelet-Derived Growth Factor Receptors Human genes 0.000 description 1
- 102100029740 Poliovirus receptor Human genes 0.000 description 1
- 108700030875 Programmed Cell Death 1 Ligand 2 Proteins 0.000 description 1
- 102100024213 Programmed cell death 1 ligand 2 Human genes 0.000 description 1
- 102100040821 Protein FAM3D Human genes 0.000 description 1
- 229940096437 Protein S Drugs 0.000 description 1
- 108010066124 Protein S Proteins 0.000 description 1
- 102000029301 Protein S Human genes 0.000 description 1
- 229940123573 Protein synthesis inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 108010067787 Proteoglycans Proteins 0.000 description 1
- 102100027378 Prothrombin Human genes 0.000 description 1
- 108010094028 Prothrombin Proteins 0.000 description 1
- 102000014128 RANK Ligand Human genes 0.000 description 1
- 108010025832 RANK Ligand Proteins 0.000 description 1
- 101000697597 Rattus norvegicus Alcohol sulfotransferase A Proteins 0.000 description 1
- 102100030086 Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2 Human genes 0.000 description 1
- 101710100969 Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3 Proteins 0.000 description 1
- 102100029986 Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3 Human genes 0.000 description 1
- 102100029981 Receptor tyrosine-protein kinase erbB-4 Human genes 0.000 description 1
- 101710100963 Receptor tyrosine-protein kinase erbB-4 Proteins 0.000 description 1
- 102100020718 Receptor-type tyrosine-protein kinase FLT3 Human genes 0.000 description 1
- 102100037422 Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C Human genes 0.000 description 1
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 1
- 102100027702 Roundabout homolog 1 Human genes 0.000 description 1
- 108091006232 SLC7A5 Proteins 0.000 description 1
- 241000277331 Salmonidae Species 0.000 description 1
- 101100071627 Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) swo1 gene Proteins 0.000 description 1
- 102100026503 Sperm mitochondrial-associated cysteine-rich protein Human genes 0.000 description 1
- 102100035748 Squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3 Human genes 0.000 description 1
- 108091081024 Start codon Proteins 0.000 description 1
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-L Sulfate Chemical compound [O-]S([O-])(=O)=O QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 102100035721 Syndecan-1 Human genes 0.000 description 1
- 208000005400 Synovial Cyst Diseases 0.000 description 1
- 102100027208 T-cell antigen CD7 Human genes 0.000 description 1
- 102100025131 T-cell differentiation antigen CD6 Human genes 0.000 description 1
- 102100025237 T-cell surface antigen CD2 Human genes 0.000 description 1
- 102100036011 T-cell surface glycoprotein CD4 Human genes 0.000 description 1
- 102100025244 T-cell surface glycoprotein CD5 Human genes 0.000 description 1
- 102100027213 T-cell-specific surface glycoprotein CD28 Human genes 0.000 description 1
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 102100027222 T-lymphocyte activation antigen CD80 Human genes 0.000 description 1
- 101150052863 THY1 gene Proteins 0.000 description 1
- 108010090091 TIE-2 Receptor Proteins 0.000 description 1
- 102000012753 TIE-2 Receptor Human genes 0.000 description 1
- 102000002259 TNF-Related Apoptosis-Inducing Ligand Receptors Human genes 0.000 description 1
- 108010000449 TNF-Related Apoptosis-Inducing Ligand Receptors Proteins 0.000 description 1
- 241000388430 Tara Species 0.000 description 1
- 101000722167 Thermus virus P23-45 Decoration protein Proteins 0.000 description 1
- AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N Threonine Natural products CC(O)C(N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004473 Threonine Substances 0.000 description 1
- 108010022394 Threonine synthase Proteins 0.000 description 1
- 101710150448 Transcriptional regulator Myc Proteins 0.000 description 1
- 102000004142 Trypsin Human genes 0.000 description 1
- 108090000631 Trypsin Proteins 0.000 description 1
- 108060008683 Tumor Necrosis Factor Receptor Proteins 0.000 description 1
- 102100031988 Tumor necrosis factor ligand superfamily member 6 Human genes 0.000 description 1
- 108050002568 Tumor necrosis factor ligand superfamily member 6 Proteins 0.000 description 1
- 102100022156 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3 Human genes 0.000 description 1
- 102100022153 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 4 Human genes 0.000 description 1
- 102100040245 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 5 Human genes 0.000 description 1
- 102100040403 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6 Human genes 0.000 description 1
- 102100036857 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8 Human genes 0.000 description 1
- 102100036856 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 9 Human genes 0.000 description 1
- 102000003990 Urokinase-type plasminogen activator Human genes 0.000 description 1
- 108090000435 Urokinase-type plasminogen activator Proteins 0.000 description 1
- 108091008605 VEGF receptors Proteins 0.000 description 1
- 108010053099 Vascular Endothelial Growth Factor Receptor-2 Proteins 0.000 description 1
- 102000009484 Vascular Endothelial Growth Factor Receptors Human genes 0.000 description 1
- 102100033179 Vascular endothelial growth factor receptor 3 Human genes 0.000 description 1
- 102100035071 Vimentin Human genes 0.000 description 1
- 108010065472 Vimentin Proteins 0.000 description 1
- 102100023038 WD and tetratricopeptide repeats protein 1 Human genes 0.000 description 1
- 108010046377 Whey Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000007544 Whey Proteins Human genes 0.000 description 1
- 102100039674 YTH domain-containing family protein 3 Human genes 0.000 description 1
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 description 1
- 229960002964 adalimumab Drugs 0.000 description 1
- ULCUCJFASIJEOE-NPECTJMMSA-N adrenomedullin Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]1C(N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC=2C=CC=CC=2)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CSSC1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(N)=O)[C@@H](C)O)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CCSC)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@@H](N)CC=1C=CC(O)=CC=1)C1=CC=CC=C1 ULCUCJFASIJEOE-NPECTJMMSA-N 0.000 description 1
- NIGUVXFURDGQKZ-UQTBNESHSA-N alpha-Neup5Ac-(2->3)-beta-D-Galp-(1->4)-[alpha-L-Fucp-(1->3)]-beta-D-GlcpNAc Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@H](O)[C@H](C)O[C@H]1O[C@H]1[C@H](O[C@H]2[C@@H]([C@@H](O[C@]3(O[C@H]([C@H](NC(C)=O)[C@@H](O)C3)[C@H](O)[C@H](O)CO)C(O)=O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@@H](CO)O[C@@H](O)[C@@H]1NC(C)=O NIGUVXFURDGQKZ-UQTBNESHSA-N 0.000 description 1
- BFNBIHQBYMNNAN-UHFFFAOYSA-N ammonium sulfate Chemical compound N.N.OS(O)(=O)=O BFNBIHQBYMNNAN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052921 ammonium sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011130 ammonium sulphate Nutrition 0.000 description 1
- 230000001093 anti-cancer Effects 0.000 description 1
- 230000002494 anti-cea effect Effects 0.000 description 1
- 230000003432 anti-folate effect Effects 0.000 description 1
- 230000010100 anticoagulation Effects 0.000 description 1
- 229940127074 antifolate Drugs 0.000 description 1
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 1
- 230000006907 apoptotic process Effects 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000003704 aspartic acid Nutrition 0.000 description 1
- 210000002199 attachment cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000005441 aurora Substances 0.000 description 1
- 229940120638 avastin Drugs 0.000 description 1
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 1
- 239000004637 bakelite Substances 0.000 description 1
- OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N beta-carboxyaspartic acid Natural products OC(=O)C(N)C(C(O)=O)C(O)=O OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108091008324 binding proteins Proteins 0.000 description 1
- 229930189065 blasticidin Natural products 0.000 description 1
- 210000001124 body fluid Anatomy 0.000 description 1
- 239000010839 body fluid Substances 0.000 description 1
- 238000009395 breeding Methods 0.000 description 1
- 230000001488 breeding effect Effects 0.000 description 1
- 229910000389 calcium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000001506 calcium phosphate Substances 0.000 description 1
- 235000011010 calcium phosphates Nutrition 0.000 description 1
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 description 1
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- DLGJWSVWTWEWBJ-HGGSSLSASA-N chondroitin Chemical compound CC(O)=N[C@@H]1[C@H](O)O[C@H](CO)[C@H](O)[C@@H]1OC1[C@H](O)[C@H](O)C=C(C(O)=O)O1 DLGJWSVWTWEWBJ-HGGSSLSASA-N 0.000 description 1
- 239000013611 chromosomal DNA Substances 0.000 description 1
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 1
- 238000012761 co-transfection Methods 0.000 description 1
- 239000011248 coating agent Substances 0.000 description 1
- 238000000576 coating method Methods 0.000 description 1
- 229920001436 collagen Polymers 0.000 description 1
- 229960002424 collagenase Drugs 0.000 description 1
- 238000004440 column chromatography Methods 0.000 description 1
- 230000004540 complement-dependent cytotoxicity Effects 0.000 description 1
- 235000021310 complex sugar Nutrition 0.000 description 1
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 1
- 238000011109 contamination Methods 0.000 description 1
- 238000005520 cutting process Methods 0.000 description 1
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 1
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010073382 cysteine-rich fibroblast growth factor receptor Proteins 0.000 description 1
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 1
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 1
- 210000004443 dendritic cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 238000000502 dialysis Methods 0.000 description 1
- 230000012202 endocytosis Effects 0.000 description 1
- 108091007231 endothelial receptors Proteins 0.000 description 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- 108010087914 epidermal growth factor receptor VIII Proteins 0.000 description 1
- 229940082789 erbitux Drugs 0.000 description 1
- HQPMKSGTIOYHJT-UHFFFAOYSA-N ethane-1,2-diol;propane-1,2-diol Chemical compound OCCO.CC(O)CO HQPMKSGTIOYHJT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 1
- 239000012894 fetal calf serum Substances 0.000 description 1
- 229940012952 fibrinogen Drugs 0.000 description 1
- 239000003527 fibrinolytic agent Substances 0.000 description 1
- 230000003480 fibrinolytic effect Effects 0.000 description 1
- 210000002950 fibroblast Anatomy 0.000 description 1
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 1
- 238000002866 fluorescence resonance energy transfer Methods 0.000 description 1
- 102000006815 folate receptor Human genes 0.000 description 1
- 108020005243 folate receptor Proteins 0.000 description 1
- 239000004052 folic acid antagonist Substances 0.000 description 1
- 235000013305 food Nutrition 0.000 description 1
- 238000012239 gene modification Methods 0.000 description 1
- 230000005017 genetic modification Effects 0.000 description 1
- 235000013617 genetically modified food Nutrition 0.000 description 1
- 235000013922 glutamic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000004220 glutamic acid Substances 0.000 description 1
- 125000000404 glutamine group Chemical group N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)* 0.000 description 1
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 1
- 108010037536 heparanase Proteins 0.000 description 1
- 229940022353 herceptin Drugs 0.000 description 1
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000005260 human cell Anatomy 0.000 description 1
- 235000020256 human milk Nutrition 0.000 description 1
- 210000004251 human milk Anatomy 0.000 description 1
- 229940048921 humira Drugs 0.000 description 1
- 229920002674 hyaluronan Polymers 0.000 description 1
- 108010003425 hyaluronan-mediated motility receptor Proteins 0.000 description 1
- 229960003160 hyaluronic acid Drugs 0.000 description 1
- 210000004408 hybridoma Anatomy 0.000 description 1
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 1
- 102000027596 immune receptors Human genes 0.000 description 1
- 108091008915 immune receptors Proteins 0.000 description 1
- 230000001976 improved effect Effects 0.000 description 1
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 1
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 1
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 1
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 1
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 1
- 238000011081 inoculation Methods 0.000 description 1
- 229940125396 insulin Drugs 0.000 description 1
- 108010044426 integrins Proteins 0.000 description 1
- 102000006495 integrins Human genes 0.000 description 1
- 108010093036 interleukin receptors Proteins 0.000 description 1
- 102000002467 interleukin receptors Human genes 0.000 description 1
- 102000008616 interleukin-15 receptor activity proteins Human genes 0.000 description 1
- 108040002039 interleukin-15 receptor activity proteins Proteins 0.000 description 1
- 108040006858 interleukin-6 receptor activity proteins Proteins 0.000 description 1
- 238000001990 intravenous administration Methods 0.000 description 1
- AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N isoleucine Natural products CCC(C)C(N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960000310 isoleucine Drugs 0.000 description 1
- 108010028309 kalinin Proteins 0.000 description 1
- 239000002523 lectin Substances 0.000 description 1
- 238000001638 lipofection Methods 0.000 description 1
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 1
- 210000002540 macrophage Anatomy 0.000 description 1
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 1
- 201000001441 melanoma Diseases 0.000 description 1
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 1
- 239000010445 mica Substances 0.000 description 1
- 229910052618 mica group Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000012737 microarray-based gene expression Methods 0.000 description 1
- 239000011325 microbead Substances 0.000 description 1
- 238000000520 microinjection Methods 0.000 description 1
- 108010071421 milk fat globule Proteins 0.000 description 1
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 1
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 1
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 1
- 238000012243 multiplex automated genomic engineering Methods 0.000 description 1
- 229950006780 n-acetylglucosamine Drugs 0.000 description 1
- 108010068617 neonatal Fc receptor Proteins 0.000 description 1
- 210000002569 neuron Anatomy 0.000 description 1
- 239000002736 nonionic surfactant Substances 0.000 description 1
- 229960002450 ofatumumab Drugs 0.000 description 1
- 101150040063 orf gene Proteins 0.000 description 1
- 229960001972 panitumumab Drugs 0.000 description 1
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 1
- 239000000813 peptide hormone Substances 0.000 description 1
- 229960002087 pertuzumab Drugs 0.000 description 1
- 210000001539 phagocyte Anatomy 0.000 description 1
- 230000008782 phagocytosis Effects 0.000 description 1
- 239000000825 pharmaceutical preparation Substances 0.000 description 1
- 229940127557 pharmaceutical product Drugs 0.000 description 1
- COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N phenylalanine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920001993 poloxamer 188 Polymers 0.000 description 1
- 229920001481 poly(stearyl methacrylate) Polymers 0.000 description 1
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 1
- 235000004252 protein component Nutrition 0.000 description 1
- 239000000007 protein synthesis inhibitor Substances 0.000 description 1
- 229940039716 prothrombin Drugs 0.000 description 1
- 108010045647 puromycin N-acetyltransferase Proteins 0.000 description 1
- 230000005855 radiation Effects 0.000 description 1
- 108091006084 receptor activators Proteins 0.000 description 1
- 238000012827 research and development Methods 0.000 description 1
- 230000035939 shock Effects 0.000 description 1
- 238000004904 shortening Methods 0.000 description 1
- 210000001082 somatic cell Anatomy 0.000 description 1
- DUYSYHSSBDVJSM-KRWOKUGFSA-N sphingosine 1-phosphate Chemical compound CCCCCCCCCCCCC\C=C\[C@@H](O)[C@@H](N)COP(O)(O)=O DUYSYHSSBDVJSM-KRWOKUGFSA-N 0.000 description 1
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 1
- 230000003068 static effect Effects 0.000 description 1
- 238000010254 subcutaneous injection Methods 0.000 description 1
- 239000007929 subcutaneous injection Substances 0.000 description 1
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 1
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 1
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 101150047061 tag-72 gene Proteins 0.000 description 1
- ZRKFYGHZFMAOKI-QMGMOQQFSA-N tgfbeta Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)CNC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CCSC)C(C)C)[C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 ZRKFYGHZFMAOKI-QMGMOQQFSA-N 0.000 description 1
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 1
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 1
- 238000010361 transduction Methods 0.000 description 1
- 230000026683 transduction Effects 0.000 description 1
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 1
- 230000001052 transient effect Effects 0.000 description 1
- 230000014621 translational initiation Effects 0.000 description 1
- 230000005945 translocation Effects 0.000 description 1
- QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H tricalcium bis(phosphate) Chemical compound [Ca+2].[Ca+2].[Ca+2].[O-]P([O-])([O-])=O.[O-]P([O-])([O-])=O QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H 0.000 description 1
- 102000047459 trkC Receptor Human genes 0.000 description 1
- 108010064892 trkC Receptor Proteins 0.000 description 1
- 239000012588 trypsin Substances 0.000 description 1
- 102000003298 tumor necrosis factor receptor Human genes 0.000 description 1
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241001430294 unidentified retrovirus Species 0.000 description 1
- 229960005356 urokinase Drugs 0.000 description 1
- 125000002987 valine group Chemical group [H]N([H])C([H])(C(*)=O)C([H])(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 210000005048 vimentin Anatomy 0.000 description 1
- 230000009385 viral infection Effects 0.000 description 1
- 230000003442 weekly effect Effects 0.000 description 1
- 235000021119 whey protein Nutrition 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/08—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from viruses
- C07K16/10—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from viruses from RNA viruses
- C07K16/1018—Orthomyxoviridae, e.g. influenza virus
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
- C07K16/24—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against cytokines, lymphokines or interferons
- C07K16/241—Tumor Necrosis Factors
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
- C07K16/28—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
- C07K16/2887—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against CD20
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
- C07K16/28—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
- C07K16/2896—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against molecules with a "CD"-designation, not provided for elsewhere
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/85—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N5/00—Undifferentiated human, animal or plant cells, e.g. cell lines; Tissues; Cultivation or maintenance thereof; Culture media therefor
- C12N5/10—Cells modified by introduction of foreign genetic material
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P21/00—Preparation of peptides or proteins
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P21/00—Preparation of peptides or proteins
- C12P21/02—Preparation of peptides or proteins having a known sequence of two or more amino acids, e.g. glutathione
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
- C07K2317/10—Immunoglobulins specific features characterized by their source of isolation or production
- C07K2317/14—Specific host cells or culture conditions, e.g. components, pH or temperature
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2800/00—Nucleic acids vectors
- C12N2800/10—Plasmid DNA
- C12N2800/106—Plasmid DNA for vertebrates
- C12N2800/107—Plasmid DNA for vertebrates for mammalian
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2800/00—Nucleic acids vectors
- C12N2800/90—Vectors containing a transposable element
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Virology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
- Pulmonology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Abstract
Изобретение относится к биохимии. Описан способ получения интересующего белка, включающий введение по меньшей мере одного экспрессионного вектора, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, и также пару транспозонных последовательностей Tol1 или Tol2 на обоих концах генного фрагмента, в суспензионную клетку млекопитающего СНО и суспензионное культивирование клетки млекопитающего, где суспензионная клетка млекопитающего представляет собой суспензионную клетку СНО, которая способна выживать и пролиферировать в бессывороточной среде. Также представлены соответствующая суспензионная клетка и вектор. Изобретение позволяет за короткий период времени эффективно и на высоком уровне продуцировать интересующий белок. 5 н. и 26 з.п. ф-лы, 13 ил., 11 табл., 13 пр.
Description
Область техники
Данное изобретение относится к способу интеграции генного фрагмента, вставленного между парой транспозонных последовательностей, в хромосому клетки млекопитающего, включающему введение по меньшей мере одного экспрессионного вектора, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, в суспензионную клетку млекопитающего; и к способу получения белка, включающему суспензионное культивирование суспензионной клетки млекопитающего, которая продуцирует белок, суспензионной клетки млекопитающего, которая экспрессирует белок; а также к экспрессионному вектору, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента.
Уровень техники
Получение экзогенных белков методами рекомбинантных ДНК используется в различных отраслях промышленности, таких как фармацевтическая промышленность и пищевая промышленность. В большинстве случаев рекомбинантные белки получают путем введения экспрессионного вектора, содержащего нуклеотидную последовательность, кодирующую интересующий белок, в хозяина, например, Escherichia coli, дрожжи, клетку насекомого, растительную клетку и животную клетку, отбора трансформанта, в котором экспрессионный вектор интегрирован в хромосому, и последующего культивирования трансформированной линии клеток в соответствующих условиях культивирования.
Однако, чтобы создать хозяина, способного эффективно продуцировать экзогенный белок, необходимо отбирать клетку-хозяина, обладающую хорошей продуктивностью для каждого представляющего интерес белка, так что существует потребность в дальнейших технических инновациях в области методов производства экзогенного белка для каждого хозяина.
В бактериальных системах, таких как Escherichia coli, и дрожжевых системах, отличающихся от животных клеток, во многих случаях трудно добиться посттрансляционных модификаций, таких как модификации сахарной цепи, и, таким образом, возникает проблема с получением белка, обладающего присущей ему активностью.
Поскольку в системе клеток насекомых продуцируемый белок подвергается посттрансляционным модификациям, таким как фосфорилирование и добавление сахарных цепей, эта система имеет то преимущество, что может экспрессироваться белок, обладающий присущей ему физиологической активностью. Однако, поскольку структура сахарной цепи секретируемого белка отличается от таковой в клетках млекопитающих, антигенность и тому подобное становится проблемой, когда белок применяют в фармацевтических целях.
Кроме того, поскольку в системе клеток насекомых используют рекомбинантный вирус при введении экзогенного гена, с точки зрения безопасности существует проблема, связанная с необходимостью инактивации и локализации вируса.
В системе животных клеток посттрансляционные модификации, такие как фосфорилирование, добавление сахарной цепи и фолдинг, можно проводить с белками высших животных, включая человека, в большей степени аналогично тому, как это происходит с белками, продуцируемыми в живом организме. Такие точные посттрансляционные модификации необходимы для воссоздания в рекомбинантном белке физиологической активности, изначально присущей белку, и систему производства белка, в которой в качестве хозяина используется клетка млекопитающего, как правило, применяют для получения фармацевтических продуктов и тому подобного, когда необходима такая физиологическая активность.
Однако система экспрессии белка, в которой в качестве хозяина используется клетка млекопитающего, как правило, обладает низкой продуктивностью и, кроме того, во многих случаях создает проблему стабильности введенных генов. Повышение продуктивности для белка при использовании культуры клеток млекопитающих в качестве хозяина не только очень важно при производстве медикаментов для лечения, диагностических средств и тому подобного, но и вносит значительный вклад в их исследование и разработку. Таким образом, необходимо в срочном порядке разработать систему экспрессии генов, которая легко позволяет получать линию клеток с высокой продуктивностью при использовании культуры клеток млекопитающих, в частности, клеток яичника китайского хомячка (клетки CHO), в качестве хозяина.
Транспозон представляет собой мобильный генетический элемент, который может перемещаться из одного локуса в другой локус на хромосоме. Транспозон является сильным инструментом для исследований в области молекулярной биологии и генетики и используется для таких целей, как мутагенез, улавливание гена и получение трансгенных особей, у насекомых или нематод (например, Drosophila melanogaster или Caenorhabditis elegans) и растений. Однако разработка такого метода отставала в случае позвоночных животных, включая клетки млекопитающих.
Тем не менее, в последние годы появились сообщения о транспозонах, которые обладают активностью также и в организме позвоночных животных, и некоторые из них, как было показано, обладают активностью в клетках млекопитающих, например, клетках мыши и человека. Типичные примеры включают транспозоны Tol1 (патентная ссылка 1) и Tol2 (непатентная ссылка 1), клонированные из оризии (рыбы семейства карпозубых), транспозон «спящая красавица», восстановленный из неавтономного транспозона, существующего в геноме лососевых рыб (непатентная ссылка 2), искусственный транспозон «лягушачий принц» (непатентная ссылка 3), полученный из лягушки, и транспозон piggyBac (непатентная ссылка 4), полученный из насекомого.
Эти ДНК транспозоны использовали для мутагенеза, улавливания генов, получения трансгенных особей, экспрессии устойчивых к лекарственным средствам белков и тому подобного, в качестве инструмента для введения генов с целью привнесения нового фенотипа в геном клетки млекопитающего (непатентные ссылки 5-12).
В случае насекомых был изучен способ, в котором экзогенный ген вводят в хромосому шелкопряда, используя транспозон piggyback, полученный из чешуекрылого насекомого, для экспрессии белка, кодируемого указанным экзогенным геном, и был описан способ получения белка с использованием вышеуказанного метода (патентная ссылка 2).
Однако, поскольку интересующий белок не экспрессируется на достаточном уровне и производится во всем теле шелкопряда, это вызывает экономические проблемы в связи с необходимостью усовершенствованных методов очистки для извлечения экспрессированного экзогенного белка в высокоочищенной форме из жидкостей организма, содержащих большое количество примесных белков.
Кроме того, известен пример того, как белок, связанный с устойчивостью к G418, экспрессируется в клетке млекопитающего с использованием полученного из оризии транспозона Tol2 (непатентные ссылки 12 и 13).
В случае получения белкового лекарственного средства для медицинского применения с использованием культивируемой клетки млекопитающего важно, чтобы в процессе его производства отсутствовал компонент животного происхождения, с целью предотвращения неожиданного загрязнения неизвестным вирусом или патогенным полипептидом. Клетку CHO наиболее часто используют в качестве животной клетки для получения белкового лекарственного средства, и в результате исследований последних лет также была создана суспензионная линия клеток CHO, которую можно культивировать в безопасной среде без применения сыворотки или компонента животного происхождения. Однако продуктивность клеточной линии, в которую ген был введен в бессывороточных или безбелковых условиях, ограничена наполовину по сравнению с клеточной линией, в которую ген был введен в условиях наличия сыворотки (непатентная литература 14). Показано, что трансдукция генов в бессывороточных или безбелковых условиях технически сложна.
Как правило, селектируемый маркер для скрининга клеток, экспрессирующих интересующий белок, находится в том же экспрессионном векторе. Это основано на предположении, что существует область, в которой ген, присутствующий в геноме, легко экспрессируется и область, в которой ген, присутствующий в геноме, экспрессируется плохо (это называют эффектами положения, непатентная литература 15), и что представляющий интерес белок также экспрессируется, когда экспрессируется селектируемый маркер.
С другой стороны, известно также, что, когда интересующий белок состоит из двух или более полипептидов, например, антитело и тому подобное, каждый полипептид экспрессируется при помощи различных векторов. В случае антитела показано, что продуктивность возрастает, когда экспрессия тяжелой цепи антитела выше, чем экспрессия легкой цепи (непатентная литература 16). Поскольку предсказано, что экспрессия тяжелой цепи и легкой цепи становится постоянной на одном и том же векторе. Стало возможным получение линии клеток, которые экспрессируют тяжелую цепь и легкую цепь в оптимальном соотношении, путем намеренной экспрессии тяжелой цепи и легкой цепи при помощи различных векторов для достижения высокой продуктивности. Однако, если белок экспрессируется с использованием двух или более различных векторов, также необходимы два или более селектируемых маркера.
В качестве способа преодоления этого, сообщалось о случае, когда ген dhfr, исходно соответствующий одной полипептидной цепи, был разделен на две полипептидных цепи, и одна из них была размещена на экспрессионном векторе тяжелой цепи, а другая была размещена на экспрессионном векторе легкой цепи (непатентная литература 17).
Однако клетка, описанная в непатентной литературе 17, является клеткой CHO, при этом клетка зависима от наличия белкового компонента, добавленного к среде, и, как описано выше, существует вероятность того, что эффективность введения гена является высокой в отличие от случая введения гена в бессывороточных или безбелковых условиях. По прогнозам, отбор высокопродуктивной клетки по-прежнему будет труден, если ген введен в бессывороточных или безбелковых условиях, имеющих высокую степень безопасности при отсутствии опасности вирусной инфекции и тому подобного.
Перечень ссылок
Патентная литература
Патентная литература 1: W02008/072540.
Патентная литература 2: Японская опубликованная нерассмотренная патентная заявка № 2001-532188.
Непатентная литература
Непатентная литература 1: Nature 383, 30 (1996).
Непатентная литература 2: Cell 91, 501-510 (1997).
Непатентная литература 3: Nucleic Acids Res, 31, 6873-6881 (2003).
Непатентная литература 4: Insect Mol. Biol. 5, 141-151 (1996).
Непатентная литература 5: Genetics. 166, 895-899 (2004).
Непатентная литература 6: PLoS Genet, 2, el69 (2006).
Непатентная литература 7: Proc. Natl. Acad. Sei. USA 95, 10769-10773 (1998).
Непатентная литература 8: Proc. Natl. Acad. Sei. USA 98:6759-6764 (2001).
Непатентная литература 9: Nature 436, 221-22 6 (2005).
Непатентная литература 10: Nucleic Acids Res., 31, 6873-6881 (2003).
Непатентная литература 11: Nucleic Acids Res., 35, e87 (2007).
Непатентная литература 12: Proc Natl. Acad. Sei. USA, 103, 15008-15013 (2006).
Непатентная литература 13: Plos Genetics, 2,1715-1724(2006).
Непатентная литература 14: Biotech. Bioeng. 96, 1118-1126.
Непатентная литература 15: Nature Biotech. 22, 1393-1398.
Непатентная литература 16: Biotech. Bioeng. 96, 337-348 (2007).
Непатентная литература 17: Biotech. Bioeng. 84, 439-444 (2003).
Раскрытие изобретения
Проблемы, решаемые при помощи изобретения
Для получения и анализа интересующего белка необходимо выбрать линию клеток, которые стабильно и на высоком уровне экспрессируют интересующий белок, используя культивируемые клетки животного происхождения. Однако подготовка и культивирование клеток, продуцирующих интересующий белок, требует значительных усилий и времени.
Кроме того, хотя известно, что интересующий белок экспрессируется в клетке млекопитающего с использованием транспозонной последовательности, способ получения клетки, которая способна экспрессировать интересующий белок на высоком уровне и, следовательно, может быть использована в качестве системы производства белка с использованием транспозонной последовательности; способ получения клетки млекопитающего, которая способна продуцировать интересующий белок на высоком уровне с использованием транспозонной последовательности; а также способ получения белка с использованием такой клетки остаются неизвестными.
Как описано выше, существует потребность в экспрессии интересующего белка в большом количестве путем создания системы производства белка, способной продуцировать интересующий белок на высоком уровне с использованием культивируемой клетки млекопитающего эффективно и за короткий период времени. Кроме того, было бы желательно создать продуцирующую клетку, для которой не требуются какие-либо компоненты животного происхождения в период от введения гена до создания продуцирующей клетки.
Таким образом, целями изобретения являются предложение клетки, способной экспрессировать интересующий белок на высоком уровне, которую можно эффективно создавать, и способ получения интересующего белка с помощью данной клетки.
Способы решения проблем
Для решения вышеупомянутых проблем авторы настоящего изобретения провели интенсивные исследования и в результате обнаружили, что интересующий белок можно эффективно получать путем введения по меньшей мере одного экспрессионного вектора, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, в суспензионную клетку млекопитающего; и интеграции генного фрагмента, вставленного между парой (двумя) транспозонных последовательностей, в хромосому клетки млекопитающего. Кроме того, было установлено, что интересующий белок можно эффективно получать, используя такую клетку, и, таким образом, было совершено изобретение.
В частности, изобретение относится к следующему:
1. Способ получения интересующего белка, включающий введение по меньшей мере одного экспрессионного вектора, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, в суспензионную клетку млекопитающего; интеграцию генного фрагмента, содержащего ДНК, кодирующую интересующий белок, вставленного между парой транспозонных последовательностей, в хромосому клетки млекопитающего для получения клетки млекопитающего, которая экспрессирует интересующий белок; и суспензионное культивирование клетки млекопитающего.
2. Способ получения интересующего белка, включающий следующие этапы (A)-(C):
(A) этап одновременного введения следующих экспрессионных векторов (a) и (b) в суспензионную клетку млекопитающего:
(a) по меньшей мере один экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента;
(b) экспрессионный вектор, который содержит ДНК, кодирующую транспозазу, которая узнает транспозонные последовательности и обладает способностью перемещать генный фрагмент, вставленный между парой транспозонных последовательностей, в хромосому;
(B) этап получения суспензионной клетки млекопитающего, которая экспрессирует интересующий белок в результате временной экспрессии транспозазы с экспрессионного вектора, введенного в суспензионную клетку млекопитающего на этапе (A) с целью интеграции генного фрагмента, вставленного между парой транспозонных последовательностей, в хромосому клетки млекопитающего, и
(C) этап суспензионного культивирования суспензионной клетки млекопитающего, которая экспрессирует интересующий белок, полученной на этапе (B), для получения интересующего белка.
3. Способ получения суспензионной клетки млекопитающего, которая экспрессирует интересующий белок, включающий введение по меньшей мере одного экспрессионного вектора, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, в суспензионную клетку млекопитающего и интеграцию генного фрагмента, вставленного между парой транспозонных последовательностей, в хромосому клетки млекопитающего.
4. Способ, описанный в любом из вышеприведенных пунктов 1-3, в котором по меньшей мере один из экспрессионных векторов, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, представляет собой экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, и ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента.
5. Способ, описанный в любом из вышеприведенных пунктов 1-4, включающий введение экспрессионного вектора, который содержит генный фрагмент, содержащий селектируемый маркер, и содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, в клетку млекопитающего в дополнение к экспрессионному вектору, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента.
6. Способ, описанный в любом из вышеприведенных пунктов 1-5, в котором ДНК, кодирующая интересующий белок, представляет собой ДНК, кодирующую антитело.
7. Способ, описанный в вышеприведенном пункте 6, в котором ДНК, кодирующая антитело, представляет собой по меньшей мере одну из ДНК, кодирующей H-цепь антитела, и ДНК, кодирующей L-цепь антитела.
8. Способ, описанный в любом из вышеприведенных пунктов 4-7, в котором экспрессионный вектор, выбранный из следующих пунктов (a)-(d), вводят в суспензионную клетку млекопитающего:
(a) экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую H-цепь антитела, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую L-цепь антитела, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента;
(b) экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую H-цепь антитела, и ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую L-цепь антитела, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента;
(c) экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую L-цепь антитела, и ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую H-цепь антитела, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и
(d) экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую H-цепь и L-цепь антитела, и ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента.
9. Способ, описанный в любом из вышеприведенных пунктов 1-8, в котором суспензионная клетка млекопитающего представляет собой клетку, способную выживать и пролиферировать в бессывороточной среде.
10. Способ, описанный в любом из вышеприведенных пунктов 1-9, в котором суспензионная клетка млекопитающего представляет собой по меньшей мере клетку, выбранную из суспензионной клетки CHO, при этом клетка CHO адаптирована к суспензионному культивированию, клетки PER.C6, клетки крысиной миеломы YB2/3HL.P2.G11.16Ag.20 (или также называемой YB2/0) и суспензионной клетки мышиной миеломы NS0, адаптированной к суспензионному культивированию.
11. Способ, описанный в вышеприведенном пункте 10, в котором клетка CHO представляет собой по меньшей мере клетку, выбранную из CHO-K1, CHO-K1SV, DUKXB11, CHO/DG44, Pro-3 и CHO-S.
12. Способ, описанный в любом из вышеприведенных пунктов 4-11, в котором ген селектируемого маркера представляет собой ген устойчивости к циклогексимиду.
13. Способ, описанный в вышеприведенном пункте 12, в котором ген устойчивости к циклогексимиду соответствует рибосомному белку.
14. Способ, описанный в любом из вышеприведенных пунктов 1-13, в котором пара транспозонных последовательностей представляет собой нуклеотидные последовательности, полученные из пары транспозонов ДНК-типа, которые функционируют в клетке млекопитающего.
15. Способ, описанный в вышеприведенном пункте 14, в котором нуклеотидные последовательности, полученные из пары транспозонов ДНК-типа, представляют собой нуклеотидные последовательности, полученные из пары транспозонов Tol1, или нуклеотидные последовательности, полученные из пары транспозонов Tol2.
16. Способ, описанный в вышеприведенном пункте 15, в котором нуклеотидные последовательности, полученные из пары транспозонов Tol2, представляют собой нуклеотидную последовательность, содержащую нуклеотидную последовательность, приведенную в SEQ ID NO: 2, и нуклеотидную последовательность, приведенную в SEQ ID NO: 3.
17. Способ, описанный в вышеприведенном пункте 15, в котором нуклеотидные последовательности, полученные из пары транспозонов Tol1, представляют собой нуклеотидную последовательность, приведенную в SEQ ID NO: 14, и нуклеотидную последовательность, приведенную в SEQ ID NO: 15.
18. Суспензионная клетка млекопитающего, которая имеет хромосому, в которую интегрирован генный фрагмент, вставленный между парой транспозонов, и которая продуцирует интересующий белок, получаемый путем одновременного введения по меньшей мере одного экспрессионного вектора (a), который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и экспрессионного вектора (b), который содержит ДНК, кодирующую транспозазу (трансферазу), способную узнавать транспозонные последовательности и обладающую способностью переносить генный фрагмент, вставленный между парой транспозонных последовательностей, в хромосому.
19. Клетка млекопитающего, описанная в вышеприведенном пункте 18, в которой по меньшей мере один из экспрессионного вектора (a), который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, представляет собой экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, и ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента.
20. Клетка млекопитающего, описанная в вышеприведенном пункте 18 или 19, которая представляет собой клетку, полученную в результате дополнительного введения экспрессионного вектора (c), который содержит генный фрагмент, содержащий ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, в дополнение к экспрессионным векторам (a) и (b).
21. Клетка млекопитающего, описанная в любом из вышеприведенных пунктов 18-20, в которой ДНК, кодирующая интересующий белок, представляет собой ДНК, кодирующую антитело.
22. Клетка млекопитающего, описанная в вышеприведенном пункте 21, в которой ДНК, кодирующая антитело, представляет собой по меньшей мере одну из ДНК, кодирующей H-цепь антитела, и ДНК, кодирующей L-цепь антитела.
23. Клетка млекопитающего, описанная в любом из вышеприведенных пунктов 18-22, в которую введен экспрессионный вектор, выбранный из следующих (a)-(d):
(a) экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую H-цепь антитела, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую L-цепь антитела, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента;
(b) экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую H-цепь антитела, и ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую L-цепь антитела, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента;
(c) экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую L-цепь антитела, и ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую H-цепь антитела, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и
(d) экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую H-цепь и L-цепь антитела, и ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента.
24. Клетка млекопитающего, описанная в любом из вышеприведенных пунктов 18-23, представляющая собой клетку, способную выживать и пролиферировать в бессывороточной среде.
25. Клетка млекопитающего, описанная в любом из вышеприведенных пунктов 18-24, представляющая собой любую суспензионную клетку млекопитающего, выбранную из суспензионной клетки CHO, при этом клетка CHO адаптирована к суспензионному культивированию, клетки PER.C6, клетки крысиной миеломы YB2/3HL.P2.G11.16Ag.20 (или также называемой YB2/0) и суспензионной клетки мышиной миеломы NS0, адаптированной к суспензионному культивированию.
26. Клетка млекопитающего, описанная в вышеприведенном пункте 25, при этом клетка CHO представляет собой любую клетку, выбранную из CHO-K1, CHO-K1SV, DUKXB11, CHO/DG44, Pro-3 и CHO-S.
27. Клетка млекопитающего, описанная в любом из вышеприведенных пунктов 19-26, в которой ген селектируемого маркера представляет собой ген устойчивости к циклогексимиду.
28. Клетка млекопитающего, описанная в вышеприведенном пункте 27, в которой ген устойчивости к циклогексимиду представляет собой ген, кодирующий мутант человеческого рибосомного белка L36a.
29. Клетка млекопитающего, описанная в любом из вышеприведенных пунктов 19-28, в которой пара транспозонных последовательностей представляет собой нуклеотидные последовательности, полученные из пары транспозонов ДНК-типа, которые функционируют в клетке млекопитающего.
30. Клетка млекопитающего, описанная в вышеприведенном пункте 29, в которой нуклеотидные последовательности, полученные из пары транспозонов ДНК-типа, представляют собой нуклеотидные последовательности, полученные из пары транспозонов Tol1, или нуклеотидные последовательности, полученные из пары транспозонов Tol2.
31. Клетка млекопитающего, описанная в вышеприведенном пункте 30, в которой нуклеотидные последовательности, полученные из пары транспозонов Tol2, представляют собой нуклеотидную последовательность, приведенную в SEQ ID NO: 2, и нуклеотидную последовательность, приведенную в SEQ ID NO: 3.
32. Клетка млекопитающего, описанная в вышеприведенном пункте 30, в которой нуклеотидные последовательности, полученные из пары транспозонов Tol1, представляют собой нуклеотидную последовательность, приведенную в SEQ ID NO: 14, и нуклеотидную последовательность, приведенную в SEQ ID NO: 15.
33. Экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента.
34. Экспрессионный вектор, описанный в вышеприведенном пункте 33, в котором пара транспозонных последовательностей представляют собой нуклеотидные последовательности, полученные из пары транспозонов Tol1, или нуклеотидные последовательности, полученные из пары транспозонов Tol2.
35. Экспрессионный вектор для белка, описанный в вышеприведенном пункте 34, в котором нуклеотидные последовательности, полученные из пары транспозонов Tol2, представляют собой нуклеотидную последовательность, приведенную в SEQ ID NO: 2, и нуклеотидную последовательность, приведенную в SEQ ID NO: 3.
36. Экспрессионный вектор, описанный в вышеприведенном пункте 34, в котором нуклеотидные последовательности, полученные из пары транспозонов Tol1, представляют собой нуклеотидную последовательность, приведенную в SEQ ID NO: 14, и нуклеотидную последовательность, приведенную в SEQ ID NO: 15.
Эффект изобретения
Согласно способу получения белка по изобретению, интересующий белок можно эффективно производить с использованием суспензионной клетки млекопитающего. Кроме того, клетку по настоящему изобретению можно использовать в качестве продуцирующей клетки для получения рекомбинантного белка или рекомбинантного полипептида с высокой эффективностью.
Краткое описание чертежей
На фигуре 1 представлено схематическое изображение транспозонного вектора для экспрессии антитела против М2 человеческого вируса гриппа. Tol2-L представляет транспозон Tol2 с левого края (SEQ ID NO: 2), Tol2-R представляет транспозон Tol2 с правого края (SEQ ID NO: 3), CMV представляет промотор CMV, поли-A представляет сайт полиаденилирования, Hc представляет кДНК H-цепи человеческого антитела, Lc представляет кДНК L-цепи человеческого антитела и CHX-r представляет ген устойчивости к циклогексимиду.
На фигуре 2 представлено схематическое изображение экспрессионного вектора для антитела против М2 человеческого вируса гриппа. CMV представляет промотор CMV, поли-A представляет сайт полиаденилирования, Hc представляет кДНК H-цепи человеческого антитела, Lc представляет кДНК L-цепи человеческого антитела и CHX-r представляет ген устойчивости к циклогексимиду.
На фигуре 3 представлено схематическое изображение экспрессионного вектора для Tol2 транспозазы. CAGGS представляет промотор CAGGS, поли-A представляет сайт полиаденилирования и TPase кДНК представляет кДНК Tol2 транспозазы.
На фигуре 4 приведен результат исследования уровня экспрессии антитела против М2 человеческого вируса гриппа в суспензионной клетке CHO-K1 и прикрепляющейся клетке CHO-K1 при использовании Tol2 транспозонного вектора для экспрессии антитела против М2 человеческого вируса гриппа. На фигуре 4A приведен результат для суспензионной клетки CHO-K1, а на фигуре 4B приведен результат для прикрепляющейся клетки CHO-K1. На обеих фигурах на оси ординат указано количество продуцируемого антитела (мкг/мл), а на оси абсцисс указано количество трансгенных клонов каждой клетки.
На фигуре 5 представлено схематическое изображение Tol1 транспозонного вектора для экспрессии антитела против М2 человеческого вируса гриппа. Tol1-L представляет транспозон Tol1 с левого края (SEQ ID NO: 14), Tol1-R представляет транспозон Tol1 с правого края (SEQ ID NO: 15), CMV представляет промотор CMV, поли-A представляет сайт полиаденилирования, Hc представляет кДНК H-цепи человеческого антитела, Lc представляет кДНК L-цепи человеческого антитела и CHX-r представляет ген устойчивости к циклогексимиду.
На фигуре 6 представлено схематическое изображение экспрессионного вектора для Tol1 транспозазы. CAGGS представляет промотор CAGGS, поли-A представляет сайт полиаденилирования и TPase кДНК представляет кДНК Tol1 транспозазы.
На фигуре 7 приведен результат исследования уровня экспрессии антитела против М2 человеческого вируса гриппа в суспензионной клетке CHO-K1 при использовании Tol1 транспозонного вектора для экспрессии антитела против М2 человеческого вируса гриппа. На оси ординат указано количество продуцируемого антитела (мкг/мл), а на оси абсцисс указано количество трансгенных клонов каждой клетки.
На фигуре 8 представлено схематическое изображение транспозонного вектора для экспрессии тяжелой цепи антитела против CD98 человека. Tol2-L представляет транспозон Tol2 с левого края (SEQ ID NO: 2), Tol2-R представляет транспозон Tol2 с правого края (SEQ ID NO: 3), Pmo представляет промотор вируса лейкемии мышей Молони, поли-A представляет сайт полиаденилирования и Hc представляет кДНК тяжелой цепи антитела против CD98 человека (SEQ ID NO: 18).
На фигуре 9 представлено схематическое изображение транспозонного вектора для экспрессии легкой цепи антитела против CD98 человека. Tol2-L представляет транспозон Tol2 с левого края (SEQ ID NO: 2), Tol2-R представляет транспозон Tol2 с правого края (SEQ ID NO: 3), CMV представляет промотор CMV, поли-A представляет сайт полиаденилирования и Lc представляет кДНК легкой цепи антитела против CD98 человека (SEQ ID NO: 21).
На фигуре 10 представлено схематическое изображение транспозонного вектора для экспрессии гена устойчивости к циклогексимиду. Tol2-L представляет транспозон Tol2 с левого края (SEQ ID NO: 2), Tol2-R представляет транспозон Tol2 с правого края (SEQ ID NO: 3), CMV представляет промотор CMV, поли-A представляет сайт полиаденилирования и CHX-r представляет ген устойчивости к циклогексимиду. (SEQ ID NO: 7).
На фигуре 11 представлено продуцируемое количество антитела против TNFα человека при введении в клетку CHO-K1 тандемного вектора TNFα-CHX или вектора TNFαH-CHX и вектора TNFαL. На оси ординат указана концентрация антитела (мкг/мл), продуцируемого в среду, контрольная схема обозначена как «Контроль», а экспериментальная схема обозначена как «Эксперимент».
На фигуре 12 представлено продуцируемое количество антитела против CD20 человека при введении в клетку CHO-K1 тандемного вектора CD20-CHX или вектора CD20H-CHX и вектора CD20L. На оси ординат указана концентрация антитела (мкг/мл), продуцируемого в среду, контрольная схема обозначена как «Контроль», а экспериментальная схема обозначена как «Эксперимент».
На фигуре 13 представлена структура экспрессионного вектора A для антитела. На фигуре 13 Tol2-L представляет фрагмент ДНК, содержащий последовательность Tol2-L (SEQ ID NO: 2), а Tol2-R представляет фрагмент ДНК, содержащий последовательность Tol2-R (SEQ ID NO: 3), CMV представляет промотор CMV, поли-A представляет сайт полиаденилирования, Hc представляет ген тяжелой цепи антитела к CD98, Lc представляет ген легкой цепи антитела против CD98 человека, SO представляет промотор SV40, SV представляет сайт полиаденилирования SV40 и Neo-r представляет ген устойчивости к неомицину.
Варианты осуществления изобретения
Данное изобретение относится к способу получения интересующего белка, включающему введение по меньшей мере одного экспрессионного вектора, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, и также содержит транспозонные последовательности на обоих концах генного фрагмента, в суспензионную клетку млекопитающего; интеграцию генного фрагмента, вставленного между парой (двумя) транспозонных последовательностей, в хромосому клетки млекопитающего для получения суспензионной клетки млекопитающего, которая экспрессирует указанный интересующий белок; и суспензионное культивирование клетки млекопитающего.
Примеры способа получения интересующего белка в настоящем изобретении (далее в данном документе называемого способом по настоящему изобретению) включают способ получения интересующего белка, включающий следующие этапы (A)-(C):
(A) этап одновременного введения следующих экспрессионных векторов (a) и (b) в суспензионную клетку млекопитающего:
(a) по меньшей мере один экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента;
(b) вектор, который содержит ДНК, кодирующую транспозазу, которая узнает транспозонные последовательности и обладает способностью перемещать генный фрагмент, вставленный между парой транспозонных последовательностей, в хромосому;
(B) этап временной экспрессии транспозазы с экспрессионного вектора (b), который введен в суспензионную клетку млекопитающего на этапе (A) для интеграции генного фрагмента, вставленного между парой транспозонных последовательностей, в хромосому клетки млекопитающего с целью получения суспензионной клетки млекопитающего, которая экспрессирует интересующий белок, и
(C) этап суспензионного культивирования суспензионной клетки млекопитающего, которая экспрессирует интересующий белок, полученной на этапе (B), с целью получения интересующего белка.
Кроме того, настоящее изобретение относится к суспензионной клетке млекопитающего, в которую введен по меньшей мере один экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, для интеграции генного фрагмента, вставленного между парой транспозонных последовательностей, в хромосому, и которая продуцирует интересующий белок.
В настоящем изобретении интересующий белок представляет собой белок, состоящий из одного или более полипептидов, и в соответствии со способом по изобретению можно осуществлять любую экспрессию по меньшей мере одного интересующего белка и/или экспрессию по меньшей мере одного полипептида.
По меньшей мере один из экпрессионных векторов, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, означает один или два или более видов экспрессионного вектора. В частности, для экспрессии интересующего белка, состоящего из двух или более полипептидов, необходимо использовать два или более экспрессионных вектора, которые содержат генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую соответствующие полипептиды, и также содержат пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента.
Более конкретно, например, если вышеуказанный интересующий белок, состоящий из двух или более полипептидов, представляет собой антитело, H-цепь и L-цепь антитела могут быть экспрессированы с помощью одного экспрессионного вектора или могут быть экспрессированы с помощью двух экспрессионных векторов, вектора, который экспрессирует H-цепь, и вектора, который экспрессирует L-цепь, соответственно.
Способом по настоящему изобретению можно получать интересующий белок с использованием суспензионной клетки млекопитающего, продуцирующей интересующий белок, в которой генный фрагмент, вставленный между парой транспозонных последовательностей, интегрирован в хромосому, путем введения экспрессионного вектора, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента.
Ген селектируемого маркера, используемый в качестве показателя встраивания гена, можно интегрировать в тот же вектор, что и экспрессионный вектор, который содержит ДНК, кодирующую интересующий белок, или можно интегрировать в другой вектор.
То есть, по меньшей мере один из экспрессионных векторов, которые содержат генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, и также содержат пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, можно использовать в качестве экспрессионного вектора, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, и ген селекционного маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента.
Кроме того, в дополнение к экспрессионному вектору, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, в клетку млекопитающего можно дополнительно вводить экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента.
В частности, примеры способа получения интересующего белка по настоящему изобретению включают способ, включающий следующие этапы (A)-(C):
(A) этап одновременного введения следующих экспрессионных векторов (a) и (b) в суспензионную клетку млекопитающего:
(a) экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента;
(b) вектор, который содержит ДНК, кодирующую транспозазу, которая узнает транспозонные последовательности и обладает способностью переносить генный фрагмент, вставленный между парой транспозонных последовательностей, в хромосому;
(B) этап временной экспрессии транспозазы с экспрессионного вектора (b), который введен в суспензионную клетку млекопитающего на этапе (A) для интеграции генного фрагмента, вставленного между парой транспозонных последовательностей, в хромосому клетки млекопитающего, и получения суспензионной клетки млекопитающего, которая экспрессирует интересующий белок, и
(C) этап суспензионного культивирования суспензионной клетки млекопитающего, которая экспрессирует интересующий белок, полученной на этапе (B), для получения интересующего белка.
Кроме того, примеры способа получения интересующего белка по настоящему изобретению включают способ, включающий следующие этапы (A)-(C):
(A) этап одновременного введения следующих экспрессионных векторов (a), (b) и (с) в суспензионную клетку млекопитающего:
(a) по меньшей мере один экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента;
(b) экспрессионный вектор, который содержит селектируемый маркер и пару транспозонных последовательностей на обоих концах селектируемого маркера;
(с) вектор, который содержит ДНК, кодирующую транспозазу, которая узнает транспозонные последовательности и обладает способностью переносить генный фрагмент, вставленный между парой транспозонных последовательностей, в хромосому;
(B) этап временной экспрессии транспозазы с экспрессионного вектора (c), который введен в суспензионную клетку млекопитающего на этапе (A) для интеграции генного фрагмента, вставленного между парой транспозонных последовательностей, в хромосому клетки млекопитающего, и получения суспензионной клетки млекопитающего, которая экспрессирует интересующий белок, и
(C) этап суспензионного культивирования суспензионной клетки млекопитающего, которая экспрессирует интересующий белок, полученной на этапе (B), для получения интересующего белка.
Настоящее изобретение относится к суспензионной клетке млекопитающего, в которую по меньшей мере один экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и экспрессионный вектор, который содержит селектируемый маркер и пару транспозонных последовательностей на обоих концах селектируемого маркера, введены для интеграции генного фрагмента и селектируемого маркера, вставленных между парой транспозонных последовательностей, в хромосому, и которая продуцирует интересующий белок.
Кроме того, настоящее изобретение относится к суспензионной клетке млекопитающего, в которую введен экспрессионный вектор для белка, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, и селектируемый маркер, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, для интеграции генного фрагмента, вставленного между парой транспозонных последовательностей, в хромосому, и которая продуцирует интересующий белок.
Кроме того, примеры суспензионной клетки млекопитающего, которая продуцирует интересующий белок по настоящему изобретению, включают суспензионную клетку млекопитающего, в которую одновременно введены экспрессионный вектор (a), который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, и ген селектируемого маркера, и также содержит транспозонные последовательности на обоих концах генного фрагмента, и вектор (b), содержащий ДНК, кодирующую транспозазу (трансферазу), которая узнает транспозонные последовательности и обладает способностью переносить генный фрагмент, вставленный между парой транспозонных последовательностей, в хромосому для интеграции генного фрагмента, вставленного между парой транспозонных последовательностей, в хромосому, и которая продуцирует интересующий белок.
По настоящему изобретению, число экспрессионных векторов, которые содержат генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, и также содержат пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, предназначенных для введения в суспензионную клетку млекопитающего, не имеет конкретных ограничений при условии, что клетка млекопитающего может экспрессировать и продуцировать интересующий белок, и примеры включают предпочтительно от 1 до 20 видов экспрессионных векторов, более предпочтительно можно упомянуть от 2 до 10 видов экспрессионных векторов и, например, от 3 до 8 видов экспрессионных векторов, от 4 до 7 видов экспрессионных векторов, от 1 до 6 видов экспрессионных векторов, от 1 до 5 видов экспрессионных векторов, от 1 до 4 видов экспрессионных векторов, и от 1 до 3 видов экспрессионных векторов являются предпочтительными.
Кроме того, примеры вариантов осуществления настоящего изобретения включают способ увеличения интеграции генного фрагмента, вставленного между парой транспозонных последовательностей, в хромосому клетки млекопитающего путем одновременного введения в суспензионную клетку млекопитающего (a) по меньшей мере одного экспрессионного вектора, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и (b) вектора, который содержит ДНК, кодирующую транспозазу, способную узнавать транспозонные последовательности и обладающую способностью встраивать генный фрагмент, вставленный между парой транспозонных последовательностей, в хромосому, способ интеграции ДНК, кодирующей интересующий белок, в хромосому клетки млекопитающего с высокой частотой и суспензионную клетку млекопитающего, которая получена данными способами и может продуцировать интересующий белок.
Термин «транспозон» в настоящей спецификации относится к мобильному генетическому элементу и означает генетическую единицу, которая перемещается по хромосоме или с хромосомы на другую хромосому (транспозиция), сохраняя при этом определенную структуру.
Транспозон содержит повторяющиеся транспозонные последовательности (также называемые инвертированной повторяющейся последовательностью (IR последовательностью) или концевой инвертированной повторяющейся последовательностью (TIR последовательностью)), которые располагаются в том же направлении или в обратном направлении на обоих концах генетической единицы, и нуклеотидную последовательность, кодирующую транспозазу, которая узнает транспозонную последовательность для вставки гена, находящегося между транспозонными последовательностями.
Транспозаза, транслируемая с транспозона, может встраивать ДНК путем узнавания транспозонных последовательностей на обоих концах транспозона, вырезания фрагмента ДНК, вставленного между парой транспозонных последовательностей, и вставки фрагмента в сайт, в который он будет встроен.
Термин «транспозонная последовательность» в настоящей спецификации означает нуклеотидную последовательность транспозона, узнаваемую транспозазой, и имеет то же значение, что и IR последовательность или TIR последовательность. ДНК, содержащая нуклеотидную последовательность, может содержать несовершенный повторяющийся фрагмент при условии, что она может быть встроена (вставлена в другое место в геноме) в результате активности транспозазы, и существует транспозонная последовательность, специфичная для транспозазы.
В качестве транспозонной последовательности, используемой по изобретению, предпочтительной является нуклеотидная последовательность, полученная из транспозона ДНК-типа, и нуклеотидная последовательность, полученная из пары природных или искусственных транспозонов ДНК-типа, которая может узнаваться транспозазой и подвергаться перемещениям в клетках млекопитающих, является более предпочтительной.
Примеры нуклеотидной последовательности, полученной из транспозона ДНК-типа, включают нуклеотидные последовательности, полученные из транспозона Tol1 и транспозона Tol2 из рыбы оризии, транспозон «спящая красавица», восстановленный из неавтономного транспозона, существующего в геноме лососевых рыб, искусственный транспозон «лягушачий принц» из лягушки и транспозон PiggyBac из насекомого.
В частности, среди них нуклеотидные последовательности, полученные из транспозона Tol2 из рыбы оризии, содержащие нуклеотидную последовательность, приведенную в SEQ ID NO: 6, и транспозона Tol2 из рыбы оризии, содержащие нуклеотидную последовательность, приведенную в SEQ ID NO: 13, являются предпочтительными.
Примеры нуклеотидной последовательности, полученной из пары транспозонов Tol2, включают нуклеотидную последовательность в положениях 1-2229 и нуклеотидную последовательность в положениях 4148-4682 в нуклеотидной последовательности транспозона Tol2, приведенной в SEQ ID NO: 6 в списке последовательностей.
В качестве нуклеотидной последовательности, полученной из пары транспозонов Tol2, нуклеотидная последовательность в положениях 1-200 (SEQ ID NO: 2) (далее в данном документе называемая «последовательность Tol2-L») и нуклеотидная последовательность в положениях 2285-2788 (SEQ ID NO: 3) (далее в данном документе называемая «последовательность Tol2-R») в нуклеотидной последовательности транспозона Tol2, приведенной в SEQ ID NO: 1 в списке последовательностей, являются более предпочтительными.
В качестве транспозонной последовательности, полученной из пары транспозонов Tol1, пример включает нуклеотидную последовательность, содержащую нуклеотидную последовательность в положениях 1-157 и нуклеотидную последовательность в положениях 1748-1855 в нуклеотидной последовательности транспозона Tol1, приведенной в SEQ ID NO: 13 в списке последовательностей.
В качестве транспозонной последовательности, полученной из пары транспозонов Tol1, нуклеотидная последовательность в положениях 1-200 (SEQ ID NO: 14) (далее в данном документе называемая «последовательность Tol1-L») и нуклеотидная последовательность в положениях 1351-1855 (SEQ ID NO: 15) (далее в данном документе называемая «последовательность Tol1-R») в нуклеотидной последовательности транспозона Tol1, приведенной в SEQ ID NO: 13 в списке последовательностей, являются более предпочтительными.
Примеры транспозонной последовательности для использования по изобретению включают транспозонные последовательности, для которых реакции транспозиции контролируются путем использования частичной последовательности транспозонной последовательности, полученной из вышеуказанного транспозона, путем регулирования длины нуклеотидной последовательности и путем модифицирования нуклеотидной последовательности за счет добавления, делеции или замены.
В качестве способа получения интересующего белка по настоящему изобретению примеры также включают способ, в котором по меньшей мере один из интересующих белков продуцируется с использованием по меньшей мере двух транспозонных последовательностей и по меньшей мере двух транспозаз.
В частности, примеры включают способ получения белка, который включает этапы введения вектора, содержащего ДНК, кодирующую первый интересующий белок, вставленную в две транспозонные последовательности Tol1, вектора, содержащего ДНК, кодирующую второй интересующий белок, вставленную в две транспозонные последовательности Tol2, экспрессионного вектора для Tol1 транспозазы и экспрессионного вектора для Tol2 транспозазы одновременно или по порядку в хромосому клетки млекопитающего и, таким образом, получения клетки млекопитающего, которая продуцирует два интересующих белка.
Кроме того, первый интересующий белок и второй интересующий белок могут быть одинаковыми, и продуктивность для интересующего белка можно также повышать, увеличивая число копий гена, который вводят в клетку.
Что касается контроля реакции транспозиции транспозона, реакцию транспозиции можно ускорять или подавлять, ускоряя или подавляя узнавание транспозонной последовательности транспозазой, соответственно. Кроме того, что касается реакции транспозиции транспозона, реакцию транспозиции можно усиливать путем укорачивания длины нуклеотидной последовательности, вставленной между парой (двумя) транспозонных последовательностей, и реакцию транспозиции можно снижать путем увеличения этой длины. Вследствие этого, в случае экспрессии и получения интересующего белка, содержащего несколько белков, интересующие белки можно получать путем встраивания ДНК, кодирующей каждый белок, в разные экспрессионные векторы, интеграции ДНК в хромосому клетки-хозяина и получения суспензионной клетки млекопитающего, способной создавать интересующий белок, чтобы получать интересующий белок с использованием клетки.
Термин «транспозаза» в настоящей спецификации означает фермент, который узнает нуклеотидные последовательности, имеющие транспозонные последовательности, и перемещает генный фрагмент, находящийся между нуклеотидными последовательностями по хромосоме или с хромосомы на другую хромосому.
Примеры транспозазы включают ферменты из Tol1 и Tol2, полученных из рыбы оризии, транспозона «спящая красавица» (SB), восстановленного из неавтономного транспозона, существующего в геноме лососевых рыб, транспозона «спящая красавица 11» (SB11), искусственного транспозона «лягушачий принц» (FP), полученного из лягушки, и транспозона PiggyBac (PB), полученного из насекомого.
В качестве транспозазы можно использовать природный фермент, а также любую транспозазу, в которой часть ее аминокислот заменены, делетированы, вставлены и/или добавлены, при условии, что сохраняется такая же транспозиционная активность, что и у транспозазы. Контролируя ферментативную активность транспозазы, можно контролировать реакцию транспозиции ДНК, находящейся между транспозонными последовательностями.
Для анализа того, присутствует ли транспозиционная активность, подобная активности транспозазы, ее можно измерять при помощи 2-компонентной аналитической системы, раскрытой в японской опубликованной нерассмотренной патентной заявке № 235575/2003.
В частности, способен ли неавтономный элемент Tol2 переноситься и встраиваться в хромосому клетки млекопитающего за счет активности транспозазы, можно анализировать путем раздельного использования плазмиды, содержащей лишенный Tol2 транспозазы транспозон Tol2 (полученный из Tol2 неавтономный транспозон), и плазмиды, содержащей Tol2 транспозазу.
Термин «неавтономный транспозон» в настоящей спецификации означает транспозон, который утратил транспозазу, существующую внутри транспозона, и, вследствие этого, не в состоянии осуществлять собственную автономную транспозицию. Неавтономный транспозон может переносить ДНК, вставленную между транспозонными последовательностями неавтономного транспозона, в хромосому клетки-хозяина при одновременном наличии в клетке белка транспозазы, мРНК, кодирующей белок транспозазу, или ДНК, кодирующей белок транспозазу.
Ген транспозазы означает ген, кодирующий транспозазу. Для повышения экспрессионной эффективности в клетке млекопитающего, последовательность, которая регулирует пространство между консенсусной последовательностью Козака (Kozak М., Nucleic Acids Res., 12, 857-872 (1984)) или последовательностью связывания рибосомы, последовательностью Шайна-Дальгарно и инициирующим кодоном до соответствующего расстояния (например, от 6 до 18 оснований), можно присоединять к сайту, расположенному выше от кодона инициации трансляции ATG гена.
В соответствии со способом по изобретению, для того, чтобы интегрировать генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, в по меньшей мере одном экспрессионном векторе в хромосому клетки-хозяина, экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, вводят в клетку-хозяина и дают возможность транспозазе проявлять свою активность в отношении транспозонных последовательностей, содержащихся в экспрессионном векторе, который введен в клетку.
Для того, чтобы позволить транспозазе проявлять свою активность в отношении транспозонных последовательностей, содержащихся в экспрессионном векторе, который введен в клетку, транспозазу можно инъецировать в клетку, или экспрессионный вектор, содержащий ДНК, кодирующую по меньшей мере один интересующий белок, или ДНК, кодирующую интересующий белок, можно вводить в клетку-хозяина вместе с экспрессионным вектором, содержащим ДНК, кодирующую интересующий белок и ген селектируемого маркера. Кроме того, при введении РНК, кодирующей транспозазу, в клетку-хозяина транспозаза может экспрессироваться в клетке.
Не существует конкретных ограничений для экспрессионного вектора. Любой экспрессионный вектор может быть использован при произвольном выборе среди экспрессионных векторов, известных специалистам в данной области, в зависимости от клетки-хозяина, в которую вводят экспрессионный вектор, содержащий ген транспозазы; от применения и тому подобного.
В случае, когда интересующий белок, состоящий из двух или более полипептидов, или два или более интересующих белка получают способом по изобретению, продуцирующую белок клетку, в которой ДНК, кодирующая каждый белок, встроена в хромосому клетки-хозяина, можно получать путем вставки ДНК, кодирующей каждый белок, в один и тот же экспрессионный вектор, или вставки ДНК в соответствующие различные экспрессионные векторы и введения экспрессионных векторов в клетку-хозяина.
Транспозазу можно вводить в экспрессионный вектор для экспрессии совместно с интересующим белком или можно вводить в вектор, отличный от экспрессионного вектора. Можно позволять транспозазе действовать временно или можно ей позволять действовать постоянно, однако предпочтительно позволять транспозазе действовать временно, чтобы подготовить клетку к стабильной продукции.
В качестве способа создания условий для временной активности транспозазы примеры включают способ, включающий создание экспрессионного вектора, содержащего ДНК, кодирующую транспозазу, и экспрессионного вектора, содержащего ДНК, кодирующую интересующий белок, и последующее введение обеих экспрессионных плазмид одновременно в клетку-хозяина.
Термин «экспрессионный вектор» в настоящей спецификации означает экспрессионный вектор, используемый с целью введения в клетку млекопитающего и экспрессии интересующего белка. Экспрессионный вектор, используемый по изобретению, имеет структуру, в которой по меньшей мере пара транспозонных последовательностей присутствует на обоих концах экспрессионной кассеты.
Термин «экспрессионная кассета» в настоящей спецификации означает нуклеотидную последовательность, в которой имеется область, контролирующая экспрессию гена, необходимая для экспрессии интересующего белка, и последовательность, кодирующая интересующий белок. Примеры области, контролирующей экспрессию гена, включают энхансер, промотор и терминатор. Экспрессионная кассета может включать ген селектируемого маркера.
Можно использовать любой промотор, при условии, что он может функционировать в животной клетке. Примеры включают промотор IE (предраннего) гена цитомегаловируса (CMV), ранний промотор SV40, промотор ретровируса, металлотионеиновый промотор, промотор теплового шока, SRα промотор, вирус лейкемии мышей Молони, энхансер и тому подобное. Кроме того, энхансер IE гена человеческого CMV можно использовать вместе с промотором.
Термин «ген селектируемого маркера» означает дополнительный ген другого маркера, который можно использовать, чтобы отличить клетку, в которую введен плазмидный вектор, от клетки без вектора.
Примеры гена селектируемого маркера включают ген устойчивости к лекарственному средству (ген устойчивости к неомицину, ген дигидрофолатредуктазы (DHFR), ген устойчивости к пуромицину, ген устойчивости к бластицидину, ген устойчивости к зеоцину, ген устойчивости к гигромицину и ген устойчивости к циклогексимиду (японская опубликованная нерассмотренная патентная заявка № 262879/2002)), гены флуоресцентных и биолюминесцентных маркеров (например, зеленый флуоресцентный белок GFP) и тому подобное.
В данном изобретении предпочтительным селектируемым маркером является ген устойчивости к лекарственному средству, и особенно предпочтительным селектируемым маркером является ген устойчивости к циклогексимиду. Кроме того, свойство устойчивости к лекарственному средству и люминесцентное свойство белка селектируемого маркера можно также изменять, создавая вариант с модифицированными аминокислотами путем генетической модификации гена селектируемого маркера или контролируя транскрипцию или трансляцию гена селектируемого маркера (например, модификация промотора, модификация аминокислотного кодона и тому подобное). Кроме того, клетки с введенным геном селектируемого маркера, обладающие различной степенью устойчивости к лекарственному средству, можно также отбирать, регулируя концентрацию лекарственного средства.
Для контроля свойства устойчивости к лекарственному средству и люминесцентного свойства белка селектируемого маркера предпочтительно использовать ослабленный ген селектируемого маркера. Ослабленный ген селектируемого маркера представляет собой ген селектируемого маркера, который модифицирован таким образом, что активность белка, кодируемого геном селектируемого маркера, внутри клетки понижена.
Примеры гена селектируемого маркера, модифицированного таким образом, что активность в клетке становится пониженной, включают (A) ген селектируемого маркера, у которого аминокислотная последовательность белка, кодируемого геном селектируемого маркера, модифицирована так, что активность белка в клетке снижена, и (B) ген селектируемого маркера, у которого нуклеотидная последовательность, контролирующая экспрессию гена селектируемого маркера, модифицирована или нуклеотидная последовательность внутри ORF (открытой рамки считывания) модифицирована так, что экспрессия гена селектируемого маркера снижена.
Примеры гена селектируемого маркера, у которого аминокислотная последовательность белка, кодируемого геном селектируемого маркера, модифицирована таким образом, что активность белка в клетке снижена, включают ген устойчивости к неомицину, описанный Sauter et al. [Biotech. Bioeng., 89, 530-538 (2005)] или Chen et al. [.Journal of Immunological Methods, 295, 49-56 (2004)].
Примеры метода снижения уровня экспрессии белка в клетке путем модификации нуклеотидной последовательности, контролирующей экспрессию гена селектируемого маркера, включают метод модификации последовательности промотора, последовательности терминатора, последовательности энхансера, консенсусной последовательности Козака или последовательности Шайна-Дальгарно, которая контролирует экспрессию гена селектируемого маркера. Более конкретно, примеры включают метод, в котором промоторная последовательность, которая контролирует экспрессию гена селектируемого маркера, заменена более слабой промоторной последовательностью.
Примеры метода снижения уровня экспрессии белка в клетке путем модификации нуклеотидной последовательности в ORF гена селектируемого маркера включают метод, в котором кодон в ORF заменен синонимичным кодоном с более низкой частотой использования кодона в клетке.
Примеры ослабленного гена селектируемого маркера по изобретению включают селектируемый маркер, в котором вышеуказанный кодон в ORF гена заменен синонимичным кодоном с более низкой частотой использования кодона в клетке.
В клетках различных биологических видов синонимичный кодон с более низкой частотой использования среди всех синонимичных кодонов можно выбирать на основании известной литературы, баз данных и тому подобного.
В качестве такой замены синонимичным кодоном с более низкой частотой использования, в частности, в случае клетки CHO, примеры включают замену кодона лейцина на TTA, замену кодона аргинина на CGA или CGT, замену кодона аланина на GCG, замену кодона валина на GTA, замену кодона серина на TCG, замену кодона изолейцина на ATA, замену кодона треонина на ACG, замену кодона пролина на CCG, замену кодона глютаминовой кислоты на GAA, замену кодона тирозина на TAT, замену кодона лизина на AAA, замену кодона фенилаланина на TTT, замену кодона гистидина на CAT, замену кодона глютамина на CAA, замену кодона аспарагина на AAT, замену кодона аспарагиновой кислоты на GAT, замену кодона цистеина на TGT и замену кодона глицина на GGT.
В ослабленном гене селектируемого маркера число заменяемых кодонов по сравнению с геном селектируемого маркера до модификации не имеет конкретных ограничений при условии, что можно эффективно получать продуцирующую белок клетку, однако предпочтительно заменять кодоны, соответствующие 20 или более аминокислотным остаткам.
В ослабленном гене селектируемого маркера число модифицируемых оснований по сравнению с геном селектируемого маркера до модификации не имеет конкретных ограничений, однако предпочтительно модифицировать 10% или более нуклеотидной последовательности, кодирующей ген селектируемого маркера.
Кроме того, в случае ослабленного гена селектируемого маркера аминокислотные остатки, кодируемые заменяемыми кодонами, не имеют конкретных ограничений, но предпочтительные примеры включают лейцин, аланин, серин и валин.
В случае ослабленного гена селектируемого маркера, случаи замены кодонов, соответствующих лейцину, не имеют конкретных ограничений, однако предпочтительно заменять кодоны, соответствующие 70% или более остатков лейцина, среди кодонов, соответствующих всем остаткам лейцина, содержащимся в гене селектируемого маркера.
Кроме того, в случае ослабленного гена селектируемого маркера случаи замены кодонов, соответствующих аланину, не имеют конкретных ограничений, однако предпочтительно заменять кодоны, соответствующие 70% или более остатков аланина среди кодонов, соответствующих всем остаткам аланина, содержащимся в гене селектируемого маркера.
Конкретные примеры ослабленного гена селектируемого маркера, полученного при помощи такой модификации, в котором кодоны заменены синонимичными кодонами с меньшей частотой использования, включают ген устойчивости к неомицину, содержащий нуклеотидную последовательность, представленную SEQ ID NO: 37, 38 или 39, ген устойчивости к пуромицину, содержащий нуклеотидную последовательность, представленную SEQ ID NO: 41, 43 или 44, ген устойчивости к зеоцину, содержащий нуклеотидную последовательность, представленную SEQ ID NO: 45 или 46, и ген устойчивости к гигромицину, содержащий нуклеотидную последовательность, представленную SEQ ID NO: 47 или 48.
Кроме того, можно ослаблять ген селектируемого маркера также путем значительного увеличения концентрации лекарственного средства по сравнению с обычно используемой концентрацией, когда устойчивую к лекарственному средству клетку отбирают при создании продуцирующей антитело клетки, или проводя дополнительное введение до того, как ген устойчивости к лекарственному средству обеспечит преобразование и распад лекарственного средства.
Циклогексимид (далее в данном документе иногда называемый CHX) представляет собой ингибитор белкового синтеза, и примеры использования гена устойчивости к CHX в качестве гена селектируемого маркера включают известные случаи с дрожжами [Kondo K., J. Bacteriol., 177, 24, 7171-7177 (1995)] и животными клетками (JP-A-2002-262879).
В случае животных клеток было установлено, что трансформант, экспрессирующий белок, кодируемый нуклеотидной последовательностью, представленной SEQ ID NO: 7 в списке последовательностей, в котором пролин в положении 54 субъединицы L36a человеческого рибосомного белка, кодируемой нуклеотидной последовательностью, представленной SEQ ID NO: 5 в списке последовательностей, заменен глютамином, обеспечивает устойчивость к циклогексимиду. Кроме того, примеры маркера устойчивости к циклогексимиду включают мутантную субъединицу L44 человеческого рибосомного белка, когда пролин в положении 54 субъединицы L44 человеческого рибосомного белка заменен глютамином.
Метод введения вышеупомянутого экспрессионного вектора для белка, содержащего транспозонную последовательность, плазмидного вектора для экспрессии транспозазы или РНК не имеет конкретных ограничений. Примеры включают кальций-фосфатную трансфекцию, электропорацию, липосомный метод, метод генной пушки, липофекцию и тому подобное.
Примеры метода прямого введения транспозазы в форме белка включают метод микроинъекции или попадание в клетку путем эндоцитоза. Введение гена можно проводить методом, описанным в Shin Idenshi Kogaku Handbook (New Genetic Engineering Handbook) (Новый справочник по генетической инженерии), под редакцией Masami Muramatsu и Tadashi Yamamoto, опубликованном Yodo-sha, ISBN 9784897063737.
Клетка-хозяин может быть любой клеткой млекопитающего при условии, что она может быть субкультивирована и может стабильно экспрессировать интересующий белок. Примеры клетки-хозяина включают клетку PER.C6, клетку Namalwa лейкемии человека, клетку COS обезьяны, клетку YB2/3HL.P2.G11.16Ag.20 (также называемую YB2/0) крысиной миеломы, клетку NS0 мышиной миеломы, клетку SP2/0-Ag14 мышиной миеломы, клетку BHK сирийского хомячка, HBT5637 (японская нерассмотренная патентная заявка № 1998-000299), клетку CHO яичника китайского хомячка (Journal of Experimental Medicine, 108, 945 (1958); Proc. Natl. Acad. Sci. USA., 601275 (1968); Genetics, 55, 513 (1968); Chromosoma, 41, 129 (1973); Methods in Cell Science, 18, 115 (1996); Radiation Research, 148, 260 (1997); Proc. Natl. Acad. Sci. USA., 11, 4216 (1980); Proc. Natl. Acad. Sci., 60, 1275 (1968); Cell, 6, 121 (1975); Molecular Cell Genetics, Appendix I, II (pp. 883-900)), CHO/DG44, CHO-K1 (ATCC CCL-61), DUKXB11 (ATCC CCL-9096), Pro-5 (ATCC CCL-1781), CHO-S (Life Technologies, каталожный № 11619), Pro-3 и субклональную клеточную линию клетки CHO.
Кроме того, вышеуказанную клетку-хозяина можно также использовать в способе получения белка по изобретению, модифицируя клетку таким образом, чтобы она подходила для производства белка, за счет модификации хромосомной ДНК, введения экзогенного гена и тому подобного.
Кроме того, для контроля структуры сахарной цепи, связанной с продуцируемым интересующим белком, в качестве клетки-хозяина можно также использовать Lec13 с приобретенной устойчивостью к лектину [Somatic Cell and 20 Molecular Genetics, 12, 55 (1986)] и клетку CHO, из которой удален ген α1,6-фукозилтрансферазы (WO2005/35586, WO2002/31140), клетку, дефицитную по ГДФ-маннозо-4,6-дегидратазе (GMD), и клетку, дефицитную по белку Fx.
В настоящем изобретении интересующий белок также включает любой белок, состоящий из по меньшей мере одного полипептида, и сложный белок, состоящий из двух или более полипептидов белка. Кроме того, белок и полипептид являются синонимами в данном изобретении, однако белковая молекула с относительно низкой молекулярной массой или белок, являющийся составной частью сложного белка, иногда могут быть названы полипептидами.
Интересующий белок в данном изобретении может быть любым белком или полипептидом при условии, что он может быть экспрессирован способом по изобретению. В частности, примеры интересующего белка включают человеческий сывороточный белок, альбумин-связывающий белок, пептидный гормон, фактор роста, цитокин, фактор свертывания крови, фибринолитический белок, антитело, белок селектируемого маркера, мембранный белок, частичные фрагменты различных белков и тому подобное. В частности, примеры интересующего белка включают человеческий внутривенный иммуноглобулин (IVIG), эритропоэтин (EPO), альбумин, гормон роста (GH), фолликулостимулирующий гормон (FSH), фактор роста гепатоцитов (HGF), инсулин, инсулиноподобный фактор роста-I (IGF-I), интерферон (INF), Fas-лиганд, факторы свертывания крови (II, VII, VIII, IX, X), протромбин, фибриноген, протеин С, протеин S, антитромбин III (ATIII), тканевой активатор плазминогена (tPA), моноклональное антитело, поликлональное антитело и тому подобное.
Антитело представляет собой молекулу, состоящую из полипептида тяжелой цепи (H-цепи) антитела и двух полипептидов легкой цепи (L-цепи) антитела, и как подклассы известны IgA, IgD, IgE, IgG и IgM. Кроме того, IgG подразделяется на IgG1, IgG2, IgG3 и IgG4.
IgG антитело представляет собой гетеротетрамерную молекулу, состоящую из двух полипептидов H-цепи и двух полипептидов L-цепи. Каждая из H-цепи и L-цепи состоит из вариабельной области (V), имеющей отношение к связыванию антигена, и константной области (C), и каждая из них называется VH, CH, VL или CL, соответственно. Область CH дополнительно подразделяется на CH1, CH2 и CH3 области, и CH2 и CH3 области в сочетании называются Fc-областью или просто Fc.
Антитело включает моноклональное антитело, которое реагирует с единственным эпитопом, поликлональное антитело, которое реагирует с двумя или более эпитопами, и рекомбинантное антитело.
Моноклональное антитело представляет собой антитело, которое секретируется одной клональной антитело-продуцирующей клеткой и узнает только один эпитоп (также называемый антигенной детерминантой), и аминокислотная последовательность (первичная структура), составляющая моноклональное антитело, единообразна.
Поликлональное антитело представляет собой смесь моноклональных антител и может реагировать с двумя или более эпитопами.
Примеры рекомбинантного антитела включают химерное антитело, гуманизированное антитело, человеческое антитело, Fc-слитый белок, антитело с модифицированными аминокислотами в Fc и мультивалентное антитело, а также частичный фрагмент антитела. Антитело с модифицированными аминокислотами может иметь аминокислотную модификацию либо в вариабельной области, либо в константной области, и активность антитела контролируется.
Мультивалентное антитело включает мультивалентное антитело, которое реагирует с двумя или более различными эпитопами на одном антигене, мультивалентное антитело, которое реагирует с двумя или более различными антигенами, и тому подобное, но может включать любое мультивалентное антитело. Кроме того, мультивалентное антитело может быть любым мультивалентным антителом, имеющим любую структуру, при условии, что оно сохраняет способность связывать антиген (WO2001/77342, патент США № 7612181 и WO2009/131239).
В соответствии со способом получения по настоящему изобретению, любой из вышеуказанных интересующих белков и/или интересующих пептидов может быть экпрессирован и продуцирован.
Примеры клетки, в которую введена ДНК, кодирующая по меньшей мере один интересующий белок по настоящему изобретению, включают антитело-продуцирующую клетку, полученную в результате следующих этапов (A) и (B).
Этап (A) - этап одновременного введения обоих из сочетания экспрессионного вектора, выбранного из следующих (a)-(c), или экспрессионного вектора (d) и экспрессионного вектора (e) в суспензионную клетку млекопитающего:
(a) экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую H-цепь антитела, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую L-цепь антитела, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ген селектируемого маркера и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента;
(b) экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую H-цепь антитела, и ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую L-цепь антитела, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента;
(c) экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую L-цепь антитела, и ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую H-цепь антитела, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и
(d) экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую H-цепь и L-цепь антитела, и ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента;
(e) вектор, содержащий ДНК, кодирующую транспозазу, которая узнает транспозонные последовательности и обладает способностью переносить генный фрагмент, вставленный между парой транспозонных последовательностей, в хромосому; и
Этап (B) - этап отбора суспензионной клетки млекопитающего, экспрессирующей антитело, в которой гены вышеуказанных H-цепи, L-цепи и селектируемого маркера, вставленные между парой транспозонных последовательностей, интегрированы в хромосому вышеуказанной клетки млекопитающего в результате временной экспрессии транспозазы с экспрессионного вектора (e), который введен в суспензионную клетку млекопитающего на этапе (A).
Примеры способа получения антитела по настоящему изобретению включают способ получения интересующего белка, включающий следующие этапы (A)-(C).
Этап (A) - этап одновременного введения сочетания экспрессионного вектора, выбранного из следующих (a)-(c), или экспрессионного вектора (d) и экспрессионного вектора (e) в суспензионную клетку млекопитающего:
(a) экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую H-цепь антитела, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую L-цепь антитела, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ген селектируемого маркера и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента;
(b) экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую H-цепь антитела, и ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую L-цепь антитела, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента;
(c) экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую L-цепь антитела, и ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую H-цепь антитела, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и
(d) экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую H-цепь и L-цепь антитела, и ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента;
(e) вектор, содержащий ДНК, кодирующую транспозазу, которая узнает транспозонные последовательности и обладает способностью переносить генный фрагмент, вставленный между парой транспозонных последовательностей, в хромосому;
Этап (B) - этап получения суспензионной клетки млекопитающего, экспрессирующей антитело, в которой гены вышеуказанных H-цепи, L-цепи и селектируемого маркера, вставленные между парой транспозонных последовательностей, интегрированы в хромосому вышеуказанной клетки млекопитающего в результате временной экспрессии транспозазы с экспрессионного вектора (e), который введен в суспензионную клетку млекопитающего на этапе (A); и
Этап (C) - этап продуцирования антитела культивируемой в суспензии суспензионной клеткой млекопитающего, полученной на этапе (B), которая экспрессирует антитело.
Кроме того, настоящее изобретение включает способ получения линии клеток, обладающих высокой продуктивностью в отношении антитела, и способ скрининга линии клеток, включающий следующие этапы (A) и (B).
Этап (A) - этап одновременного введения сочетания экспрессионного вектора, выбранного из следующих (a)-(c), или экспрессионного вектора (d) и экспрессионного вектора (e) в суспензионную клетку млекопитающего:
(a) экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую H-цепь антитела, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую L-цепь антитела, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента;
(b) экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую H-цепь антитела, и ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую L-цепь антитела, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента;
(c) экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую L-цепь антитела, и ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую H-цепь антитела, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и
(d) экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую H-цепь и L-цепь антитела, и ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента;
(e) вектор, содержащий ДНК, кодирующую транспозазу, которая узнает транспозонные последовательности и обладает способностью переносить генный фрагмент, вставленный между парой транспозонных последовательностей, в хромосому; и
Этап (B) - этап отбора суспензионной клетки млекопитающего, экспрессирующей антитело на высоком уровне, в которой гены вышеуказанных H-цепи, L-цепи и селектируемого маркера, вставленные между парой транспозонных последовательностей, интегрированы в хромосому вышеуказанной клетки млекопитающего в результате временной экспрессии транспозазы с экспрессионного вектора (e), который введен в суспензионную клетку млекопитающего на этапе (A).
Кроме того, настоящее изобретение включает способ получения антитела, включающий следующие этапы (A), (B) и (C).
Этап (A) - этап одновременного введения сочетания экспрессионного вектора, выбранного из следующих (a)-(c), или экспрессионного вектора (d) и экспрессионного вектора (e) в суспензионную клетку млекопитающего:
(a) экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую H-цепь антитела, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую L-цепь антитела, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента;
(b) экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую H-цепь антитела, и ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую L-цепь антитела, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента;
(c) экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую L-цепь антитела, и ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую H-цепь антитела, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и
(d) экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую H-цепь и L-цепь антитела, и ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента;
(e) вектор, содержащий ДНК, кодирующую транспозазу, которая узнает транспозонные последовательности и обладает способностью переносить генный фрагмент, вставленный между парой транспозонных последовательностей, в хромосому;
Этап (B) - этап получения суспензионной клетки млекопитающего, экспрессирующей антитело, в которой гены вышеуказанных H-цепи, L-цепи и селектируемого маркера, вставленные между парой транспозонных последовательностей, интегрированы в хромосому вышеуказанной клетки млекопитающего в результате временной экспрессии транспозазы с экспрессионного вектора (e), который введен в суспензионную клетку млекопитающего на этапе (A); и
Этап (C) - этап продуцирования антитела культивируемой в суспензии суспензионной клеткой млекопитающего, полученной на этапе (B), которая экспрессирует антитело.
Примеры клетки млекопитающего, в которую введена ДНК, кодирующая по меньшей мере один интересующий белок по настоящему изобретению, включают продуцирующую поликлональное антитело клетку, в которую введены несколько различных генов антител, продуцирующую сложную молекулу клетку и тому подобное.
Примеры продуцирующей поликлональное антитело клетки включают клетку, в которую введены по меньшей мере два или более различных генов моноклональных антител, клетку, в которую введены гены нескольких моноклональных антител против нескольких антигенов, клетку, которая иммунизирована антигеном и в которую введена генная библиотека антитела, отличного от человеческого, клетку, в которую введена генная библиотека антитела, полученного от пациента, и тому подобное.
Клетка, продуцирующая сложную молекулу, может быть любой клеткой при условии, что введены ДНК, кодирующие соответствующие белки, которые совместно экспрессируются в клетке с образованием сложной молекулы. Конкретные примеры включают клетку, в которую совместно трансфицированы FcγRIII (CD 16) и общая γ-цепь, клетку, в которой совместно экспрессируются неонатальный Fc-рецептор (FcRn) и β2-макроглобулин, клетку, в которую совместно трансфицированы CD98 и LAT1 (WO2007/114496), и тому подобные.
Антитело, которое получают способом получения антитела по настоящему изобретению, может быть любым антителом, и примеры включают антитело, которое узнает связанный с опухолью антиген, антитело, которое узнает связанный с аллергией или воспалением антиген, антитело, которое узнает связанный с сердечно-сосудистым заболеванием антиген, антитело, которое узнает антиген, связанный с аутоиммунными заболеваниями, антитело, которое узнает связанный с вирусной или бактериальной инфекцией антиген, и тому подобные.
Примеры связанного с опухолью антигена включают CD1a, CD2, CD3, CD4, CD5, CD6, CD7, CD9, CD10, CD13, CD19, CD20, CD21, CD22, CD25, CD28, CD30, CD32, CD33, CD38, CD40, лиганд CD40 (CD40L), CD44, CD45, CD46, CD47, CD52, CD54, CD55, CD55, CD59, CD63, CD64, CD66b, CD69, CD70, CD74, CD80, CD89, CD95, CD98, CD105, CD134, CD137, CD138, CD147, CD158, CD160, CD162, CD164, CD200, CD227, адреномедуллин, ангиопоэтин-родственный белок 4 (ARP4), аврору, B7-H1, B7-DC, интеглин, стромальный антиген 2 костного мозга (BST2), CA125, CA19.9, карбоангидразу 9 (CA9), кадгерин, cc-хемокиновый рецептор (CCR) 4, CCR7, карциноэмбриональный антиген (CEA), богатый цистеином рецептор 1 фактора роста фибробластов (CFR-1), c-Met, c-Myc, коллаген, СТА, фактор роста соединительной ткани (CTGF), CTLA-4, цитокератин-18, DF3, E-катерин, рецептор эпидермального фактора роста (EGFR), EGFRvIII, EGFR2 (HER2), EGFR3 (HER3), EGFR4 (HER4), эндоглин, эпителиальную молекулу клеточной адгезии (EpCAM), эндотелиальный рецептор протеина С (EPCR), эфрин, эфриновый рецептор (Eph), EphA2, эндотелиазу-2 (ET2), FAM3D, белок, активирующий фибробласты (FAP), гомолог 1 Fc-рецептора (FcRH1), ферритин, фактор роста фибробластов 8 (FGF-8), рецептор FGF8, основной FGF (bFGF), рецептор bFGF, рецептор FGF (FGFR) 3, FGFR4, FLT1, FLT3, фолатный рецептор, гомолог 10 Frizzled (FZD10), рецептор 4 frizzled (FZD-4), G250, рецептор G-CSF, ганглиозид (такой как GD2, GD3, GM2 и GM3), глобо H, gp75, gp88, GPR-9-6, гепараназу I, фактор роста гепатоцитов (HGF), рецептор HGF, HLA антиген (такой как HLA-DR), HM1.24, глобулу человеческого молочного жира (HMFG), hRS7, белок теплового шока 90 (hsp90), идиотипический эпитоп, инсулин-подобный фактор роста (IGF), рецептор IGF (IGFR), интерлейкин (такой как IL-6 и IL-15), рецептор интерлейкина (такой как IL-6R и IL-15R), интегрин, связанный с транслокацией иммунного рецептора белок 4 (IRTA-4), калликреин 1, KDR, KIR2DL1, KIR2DL2/3, KS1/4, lamp-1, lamp-2, ламинин-5, Lewis y, сиалил-Lewis x, рецептор лимфотоксина-бета (LTBR), LUNX, связанный с меланомой хондроитин сульфат протеогликан (MCSP), мезотелин, MICA, рецептор II типа ингибирующего вещества Мюллера (MISIIR), муцин, молекулу адгезии нервных клеток (NCAM), Necl-5, Notch 1, остеопонтин, фактор роста тромбоцитов (PDGF), рецептор PDGF, тромбоцитарный фактор 4 (PF-4), фосфатидилсерин, простатический специфический антиген (PSA), антиген стволовых клеток простаты (PSCA), простатический специфический мембранный антиген (PSMA), белок/пептид, родственный паратиреоидному гормону (PTHrP), активатор рецептора лиганда NF-каппаВ (RANKL), рецептор для опосредованной гиалуроновой кислотой подвижности (RHAMM), ROBO1, SART3, семафорин 4B (SEMA4B), ингибитор секреторной лейкоцитарной протеазы (SLPI), SM5-1, сфингозин-1-фосфат, связанный с опухолью гликопротеин 72 (TAG-72), рецептор трансферрина (TfR), TGF бета, Thy-1, Tie-1, рецептор Tie2, T-клеточный иммуноглобулиновый домен и муциновый домен 1 (TIM-1), тканевой фактор человека (hTF), антиген Tn, фактор некроза опухоли (TNF), антиген Thomsen-Friedenreich (антиген TF), рецептор TNF, родственный фактору некроза опухоли апоптоз-индуцирующий лиганд (TRAIL), рецептор TRAIL (такой как DR4 и DR5), переносчик аминокислот 2 системы ASC (ASCT2), trkC, TROP-2, рецептор Fn14 TWEAK, коллагеназу IV типа, рецептор урокиназы, сосудистый эндотелиальный фактор роста (VEGF), рецептор VEGF (такой как VEGFR1, VEGFR2 и VEGFR3), виментин, VLA-4 и тому подобные, а также антитела против вышеуказанных антигенов.
Кроме того, примеры антитела, которое узнает связанный с опухолью антиген, включают [AntiCancer Res., 13, 331 (1993)], анти-GD3 антитело [Cancer Immunol. Immunother., 36, 260 (1993)], анти-GM2 антитело [Cancer Res., 54, 1511 (1994)], анти-CD52 антитело [Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 89, 4285 (1992)], анти-MAGE антитело [British J. Cancer, 83, 493 (2000)], анти-HM1.24 антитело [Molecular Immunol., 36, 387 (1999)], антитело против белка, родственного паратиреоидному гормону (PTHrP) [Cancer, 88, 2909 (2000)], анти-bFGF антитело, анти-FGF-8 антитело [Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 86, 9911 (1989)], анти-bFGFR антитело, анти-FGFR1 антитело (WO2005/037235), анти-FGF-8R антитело [J. Biol. Chem., 265, 16455 (1990)], анти-IGF антитело [J. Neurosci. Res., 40, 647 (1995)], анти-IGF-IR антитело [J. Neurosci. Res, 40, 647 (1995)], анти-PSMA антитело [J. Urology, 160, 2396 (1998)], анти-VEGF антитело [Cancer Res, 57, 4593 (1997), авастин (R)], анти-VEGFR антитело [Oncogene, 19, 2138 (2000), WO96/30046], анти-CD20 антитело [Curr. Opin. Oncol., 10, 548 (1998), патент США 5736137, ритуксан (R), окрелизумаб, офатумумаб], анти-EGFR антитело (эрбитукс (R), вектибикс (R)), анти-HER2 антитело [Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 89, 4285 (1992), патент США 5725856, герцептин (R), пертузумаб), анти-HER3 антитело (US2008/0124345), c-Met антитело (патент США 6468529), анти-CD10 антитело, анти-EGFR антитело (WO96/402010), анти-Apo-2R антитело (WO98/51793), anti-ASCT2 антитело (WO2010/008075), анти-CEA антитело [Cancer Res., 55 (23 suppl): 5935s-5945s, (1995)], анти-CD38 антитело, анти-CD33 антитело, анти-CD22 антитело, анти-CD20 антитело с модифицированными аминокислотами [Immunology, 115, 4393, 2010), анти-EpCAM антитело, анти-А33 антитело, антитело против фолатного рецептора (MRAb-003) и тому подобные.
Примеры антитела, которое узнает связанный с аллергией или воспалением антиген, включают антитело против интерлейкина 6 [Immunol. Rev., 127, 5 (1992)], антитело против рецептора интерлейкина 6 [Molecular Immunol., 31, 371 (1994)], антитело против интерлейкина 5 [Immunol. Rev., 127, 5 (1992)], антитело против рецептора интерлейкина 5, антитело против интерлейкина 4 [Cytokine, 3, 562 (1991)], антитело против рецептора интерлейкина 4 [J. Immunol. Meth, 217, 41 (1998)], антитело против фактора некроза опухоли [Hybridoma, 13, 183 (1994)], антитело против рецептора фактора некроза опухоли [Molecular Pharmacol., 58, 237 (2000)], анти-CCR4 антитело [Nature, 400, 776 (1999)], антитело против хемокина [Peri et al., J. Immuno. Meth., 174, 249-257 (1994)], антитело против рецептора хемокина [J. Exp. Med., 186, 1373 (1997)] и тому подобные. Примеры антитела, которое узнает связанный с сердечно-сосудистым заболеванием антиген, включают анти-GpIIb/IIIa антитело [J. Immunol., 152, 2968 (1994)], антитело против фактора роста тромбоцитов [Science, 253, 1129 (1991)], антитело против рецептора фактора роста тромбоцитов [J. Biol. Chem., 272, 17400 (1997)], антитело против фактора свертывания крови [Circulation, 101, 1158 (2000)], анти-IgE антитело, анти-αVβ3 антитело, анти-α4β7 антитело, и тому подобные.
Примеры антитела, которое узнает связанные с вирусной или бактериальной инфекцией антигены, включают анти-gp120 антитело [Structure, 8, 385 (2000)], анти-CD4 антитело [J. Rheumatology, 25, 2065 (1998)], анти-CCR5 антитело, антитело против веротоксина [J. Clin. Microbiol, 37, 396 (1999)], анти-M2 антитело (JP2003-235575), и тому подобные.
Эффекторную активность моноклонального антитела, полученного способом по настоящему изобретению, можно контролировать различными методами. Примеры известных методов включают метод контроля количества фукозы (далее в данном документе также называемой «коровая фукоза»), которая связана с N-ацетилглюкозамином (GlcNAc) посредством α-1,6 связи в восстанавливающем конце N-связанной сахарной цепи сложного типа, связанной с аспарагином (Asn) в положении 297 Fc-области антитела (WO2005/035586, WO2002/31140 и WO00/61739), метод контроля эффекторной активности путем модифицирования аминокислотного остатка(остатков) в Fc-области антитела, и тому подобные. Эффекторную активность моноклонального антитела, полученного способом по настоящему изобретению, можно контролировать, используя любой из данных методов.
«Эффекторная активность» означает зависимую от антитела активность, которая индуцируется с помощью Fc-области антитела. В качестве эффекторной активности известна антитело-зависимая клеточная цитотоксичность (ADCC активность), комплемент-зависимая цитотоксичность (CDC активность), антитело-зависимый фагоцитоз (ADP активность) фагоцитирующими клетками, такими как макрофаги или дендритные клетки, и тому подобные.
Кроме того, контролируя содержание коровой фукозы N-связанной сахарной цепи сложного типа в Fc-области моноклонального антитела, которое получают способом по настоящему изобретению, эффекторную активность антитела можно увеличивать или уменьшать.
В качестве метода снижения содержания фукозы, которая связана с N-связанной сахарной цепью сложного типа, связанной с Fc-областью антитела, можно получать антитело, с которым фукоза не связана, путем экспрессии антитела с использованием клетки CHO, дефицитной по гену, кодирующему α1,6-фукозилтрансферазу. Антитело, с которым фукоза не связана, обладает высокой ADCC активностью.
С другой стороны, в качестве метода увеличения содержания фукозы, которая связана с N-связанной сахарной цепью сложного типа, связанной с Fc-областью антитела, можно получать антитело, с которым фукоза связана, путем экспрессии антитела с использованием клетки-хозяина, в которую введен ген, кодирующий α1,6-фукозилтрансферазу. Антитело, с которым фукоза связана, обладает более низкой ADCC активностью, чем антитело, с которым фукоза не связана.
Кроме того, модифицируя аминокислотный остаток(остатки) в Fc-области антитела, ADCC активность или CDC активность можно увеличивать или уменьшать. Например, CDC активность антитела можно увеличивать, используя аминокислотную последовательность Fc-области антитела, описанную в US2007/0148165.
Кроме того, ADCC активность или CDC активность антитела можно увеличивать или уменьшать, осуществляя модификацию аминокислот, описанную в патентах США №№ 6737056 или 7297775 или 7317091.
Термин «суспензионная клетка млекопитающего» в настоящем изобретении означает клетку, которая не прикрепляется к опоре для клеточных культур, имеющей покрытие для облегчения прикрепления культивируемых клеток, такой как микрогранулы, контейнер для культивирования тканевой культуры (также называемый контейнером для культивирования тканей или контейнером для прикрепляющихся культур и тому подобное), и способна выживать и расти, будучи суспендировнной в культуральном растворе.
Поскольку клетка не прикрепляется к опоре для клеточных культур, клетка может выживать и расти в состоянии одиночной клетки в культуральном растворе или выживать и расти в состоянии массы клеток, образованной в результате слипания двух или более клеток.
Кроме того, в качестве суспензионной клетки млекопитающего, используемой по настоящему изобретению, предпочтительной является клетка, способная выживать и расти в бессывороточной среде, не содержащей эмбриональной телячьей сыворотки (далее в данном документе обозначаемой FCS), и тому подобного, при этом будучи суспендированной в культуральном растворе без прикрепления к опоре для клеточных культур, и клетка млекопитающего, способная выживать и расти, будучи суспендированной в безбелковой среде, не содержащей белка, является более предпочтительной.
Культуральный контейнер для культивирования тканей может быть любым, например, колбой, чашкой Петри и тому подобным, при условии, что на него нанесено покрытие для прикрепляющихся культур. В частности, например, является ли клетка суспензионной клеткой млекопитающего, можно подтвердить, используя коммерчески доступную колбу для культивирования тканей (производитель Greiner), колбу для прикрепляющихся культур (производитель Sumitomo Bakelite) и тому подобное.
В качестве суспензионной клетки млекопитающего, используемой по настоящему изобретению, может служить либо клетка, полученная в результате дополнительной адаптации клетки, исходно имеющей суспензионные свойства, к суспензионному культивированию, либо суспензионная клетка млекопитающего, полученная в результате адаптации прикрепляющейся клетки млекопитающего к условиям суспензионного культивирования.
Примеры клетки, исходно имеющей суспензионные свойства, включают клетку PER.C6, клетку YB2/3HL.P2.G11.16Ag.20 (или также называемую YB2/0) крысиной миеломы, клетку CHO-S (производитель Invitrogen) и тому подобные.
Вышеуказанную «суспензионную клетку млекопитающего, полученную путем адаптации прикрепляющейся клетки млекопитающего к условиям суспензионного культивирования», можно получать методом, описанным в Mol. Biotechnol., 2000, 15(3), 249-57, или методом, описанным далее, и можно получать путем создания клетки, которая демонстрирует свойство пролиферации и свойство выживания, аналогичные тем, которые существовали до адаптации к суспензионному культивированию, или превосходящие те, которые существовали до адаптации к суспензионному культивированию (J. Biotechnol., 2007, 130(3), 282-90).
Термин «аналогичные тем, которые существовали до адаптации к суспензионному культивированию» означает, что коэффициент выживаемости, скорость пролиферации (время удвоения) и тому подобное у клетки, адаптированной к суспензионному культивированию, являются практически такими же, что и у клетки до адаптации к суспензионному культивированию.
В настоящем изобретении примеры метода адаптации прикрепляющейся клетки млекопитающего к условиям суспензионного культивирования включают следующий метод. Содержание сыворотки в содержащей сыворотку среде снижают до 1/10 и повторяют субкультивирование при относительно высокой концентрации клеток. Если клетка млекопитающего становится способной выживать и пролиферировать, содержание сыворотки вновь снижают и субкультивирование повторяют. Таким методом можно получать суспензионную клетку млекопитающего, которая способна выживать и пролиферировать в бессывороточных условиях.
Кроме того, суспензионную клетку млекопитающего можно также получать методом, включающим культивирование с добавлением соответствующего неионного сурфактанта, такого как Pluronic-F68 или тому подобные, в культуральный раствор.
Примеры прикрепляющейся клетки млекопитающего, которая приобретает суспензионные свойства в результате адаптации к условиям суспензионного культивирования, включают клетку NS0 мышиной миеломы, клетку CHO и тому подобные.
В настоящем изобретении в качестве свойства, имеющегося у суспензионной клетки млекопитающего, суспензионное культивирование проводят в условиях плотности клеток 2×105 клеток/мл, а затем концентрация клеток после культивирования в течение 3 или 4 дней становится предпочтительно 5×105 клеток/мл или более, более предпочтительно 8×105 клеток/мл или более, особенно предпочтительно 1×106 клеток/мл или более, наиболее предпочтительно 1,5×106 клеток/мл или более.
Кроме того, время удвоения суспензионной клетки млекопитающего по настоящему изобретению составляет предпочтительно 48 часов или менее, более предпочтительно 24 часа или менее, особенно предпочтительно 18 часов или менее, наиболее предпочтительно 11 часов или менее.
Примеры среды для суспензионного культивирования включают коммерчески доступную среду, такую как среда CD-CHO (Invitrogen), среда EX-CELL 325-PF (SAFC Biosciences), среда SFM4CHO (HyClone) и тому подобные. Кроме того, ее также можно получать путем смешивания сахаридов, аминокислот и тому подобного, которые необходимы для культивирования клеток млекопитающих.
Суспензионную клетку млекопитающего можно культивировать, используя культуральный контейнер, который можно использовать для суспензионного культивирования в условиях культивирования, позволяющих культивировать в суспензии. Примеры культурального контейнера включают 96-луночный планшет для суспензионной клеточной культуры (производитель Corning), T-колбу (производитель Becton Dickinson), коническую колбу (производитель Corning) и тому подобное.
Что касается условий культивирования, например, можно статически культивировать в атмосфере 5% CO2 при температуре культивирования 37°C. Можно также использовать оборудование для встряхивания культуры, такое как культивационное оборудование, предназначенное исключительно для суспензионных культур, например, волновой биореактор (производитель GE Healthcare Bioscience).
Что касается условий для суспензионного культивирования суспензионной клетки млекопитающего с использованием оборудования волнового биореактора, клетку можно культивировать методом, описанным на домашней странице компании GE Healthcare Bioscience .
В дополнение к культивированию при встряхивании, можно также использовать культивирование с помощью оборудования для орбитального встряхивания, такого как биореактор. Культивирование с использованием биореактора можно проводить по методу, описанному в Cytotechnology, (2006) 52: 199-207, и тому подобным.
В настоящем изобретении при использовании линии клеток, отличных от суспензионных клеток млекопитающего, можно использовать любую линию клеток при условии, что она является линией клеток млекопитающего, адаптированной к суспензионному культивированию с помощью вышеупомянутого метода, и представляет собой линию клеток, которую можно использовать в способе получения белка по настоящему изобретению.
Очистку интересующего белка, полученного при помощи суспензионной клетки млекопитающего, проводят путем отделения интересующего белка от примесей, отличных от интересующего белка, в культуральном растворе или клеточном гомогенате, содержащем интересующий белок. Примеры методов разделения включают центрифугирование, диализ, осаждение сульфатом аммония, колоночную хроматографию, фильтрование и тому подобное. Разделение можно проводить на основании разницы в физико-химических свойствах интересующего белка и примесей, либо разницы в их авидности по отношению к самому колоночному носителю.
В качестве метода очистки интересующего белка проводят очистку методом, описанным в Protein Experimentation Note (первый том) - Extraction, Separation and Expression of Recombinant Protein (перевод учебника, написанного на японском языке) (под редакцией Masato Okada и Kaori Miyazaki, опубликовано Yodo-sha, ISBN 9784897069180), и тому подобными.
Полное содержание всех литературных источников, таких как научные документы, патенты, патентные заявки, цитируемых в данном документе, включено в данный документ посредством ссылки в той же степени, что и иллюстративно описанных источников, соответственно.
Настоящее изобретение описано выше путем демонстрации предпочтительных вариантов его осуществления ради простоты понимания. Далее в данном документе настоящее изобретение описано более конкретно на основании примеров, однако вышеупомянутые объяснения и следующие далее примеры приведены исключительно с целью иллюстрации и не предназначены для целей ограничения изобретения. Соответственно, объем изобретения не ограничен вариантами осуществления и примерами, которые конкретно описаны в настоящей спецификации, но ограничен только формулой изобретения.
Различные экспериментальные методы, относящиеся к рекомбинации, которые описаны далее, такие как клонирование и тому подобное, осуществляли в соответствии с методами генетической инженерии, описанными в Molecular Cloning, 2е издание, под редакцией J. Sambrook, E. F. Frisch и T. Maniatis, Current Protocols in Molecular Biology, под редакцией Frederick M. Ausubel et al., опубликованных Current Protocols, и тому подобного.
ПРИМЕРЫ
Пример 1
Получение транспозонного вектора для экспрессии антитела против М2 вируса гриппа человека
Плазмиду, содержащую генную экспрессионную кассету для клеток млекопитающего, включающую произвольный ген человеческого антитела и ген маркера устойчивости к лекарственному средству, вставленные между парой транспозонных последовательностей Tol2, использовали в качестве плазмидного вектора для экспрессии белка.
Каждая ДНК используемых генов была химически и искусственно синтезирована на основании известной нуклеотидной последовательности или получена путем создания праймеров для обеих ее концевых последовательностей с последующим проведением ПЦР при использовании соответствующего источника ДНК в качестве матрицы. Для последующего проведения манипуляций с генами сайт рестрикции для фермента рестрикции был добавлен к концу праймера.
В нуклеотидной последовательности (SEQ ID NO: 1) неавтономного транспозона Tol2, раскрытой в японской опубликованной нерассмотренной патентной заявке № 235575/2003, нуклеотидную последовательность в положениях 1-200 (последовательность Tol2-L) (SEQ ID NO: 2) и нуклеотидную последовательность в положениях 2285-2788 (последовательность Tol2-R) (SEQ ID NO: 3) использовали в качестве транспозонных последовательностей.
Каждый фрагмент синтетической ДНК, содержащий пару транспозонных последовательностей (производитель TAKARA BIO INC.), получали следующим методом. Получали фрагмент ДНК, содержащий нуклеотидную последовательность, в которой последовательность узнавания для фермента рестрикции NruI была присоединена как к 5'-концу, так и к 3'-концу последовательности Tol2-R. Затем получали фрагмент ДНК, содержащий нуклеотидную последовательность, в которой последовательность узнавания для фермента рестрикции FseI была присоединена к 5'-концу последовательности Tol2-L, а для фермента рестрикции AscI была присоединена к ее 3'-концу.
Затем полученные таким образом фрагменты ДНК, содержащие последовательность Tol2-R и последовательность Tol2-L, встраивали в экспрессионный вектор N5LG1_M2_Z3 (WO2006/061723), содержащий нуклеотидную последовательность, кодирующую аминокислотную последовательность антитела Z3G1 против М2 вируса гриппа человека.
Вектор N5LG1_M2_Z3 (WO2006/061723), в который нуклеотидная последовательность (SEQ ID NO: 9), кодирующая H-цепь (SEQ ID NO: 10), и нуклеотидная последовательность (SEQ ID NO: 11), кодирующая L-цепь (SEQ ID NO: 12) антитела Z3G1 против М2 вируса гриппа человека (депозитный № в ATCC PTA-5968: депонировано 13 марта 2004 г., Американская коллекция типовых культур, Manassas, VA, USA), были встроены под контролем энхансера/промотора CMV, использовали в качестве экспрессионной кассеты гена антитела.
Фрагмент ДНК, содержащий последовательность Tol2-R, вставляли в сайт фермента рестрикции NruI, расположенный на 5'-конце генного фрагмента, содержащего экспрессионную кассету гена антитела и ген селектируемого маркера в векторе N5LG1_M2_Z3. Затем фрагмент ДНК, содержащий последовательность Tol2-L, вставляли в сайты фермента рестрикции FseI и AscI, расположенные на 3'-конце.
Кроме того, был сконструирован транспозонный вектор для экспрессии антитела против М2 вируса гриппа человека (фигура 1) путем встраивания экспрессионной кассеты гена устойчивости к циклогексимиду, в которой нуклеотидная последовательность (SEQ ID NO: 5), кодирующая ген устойчивости к циклогексимиду (ген, в котором пролин в положении 54 человеческого рибосомного белка L36a заменен глютамином), введена под контролем энхансера/промотора CMV в сайт узнавания FseI вектора N5LG1_M2_Z3, связанного с транспозонной последовательностью Tol2.
С другой стороны, вектор, не содержащий транспозонных последовательностей, был назван экспрессионным вектором антитела против М2 вируса гриппа человека и использован в качестве контрольного вектора (фигура 2).
Пример 2
Получение экспрессионного вектора транспозазы
Транспозазу экспрессировали, используя экспрессионный вектор, независимый от экспрессионного вектора для интересующего антитела. То есть ген, кодирующий Tol2 транспозазу (SEQ ID NO: 4) из рыбы оризии, был вставлен ниже CAGGS промотора в векторе pCAGGS (Gene, 108, 193-200, 1991) для получения экспрессионного вектора Tol2 транспозазы (далее в данном документе называемого вектором Tol2) (фигура 3).
Пример 3
Получение трансформанта с использованием клетки животного-млекопитающего
(1) Получение суспензионной клетки CHO
Прикрепляющиеся клетки CHO, которые культивировали, используя среду α-MEM (Invitrogen), содержащую 10% сыворотки (FCS), отделяли от подложки обработкой трипсином, а затем извлекали в свежую среду α-MEM, содержащую 10% сыворотки, с последующим встряхиванием культуры при 37°C в инкубаторе с 5% CO2. Через несколько дней подтверждали рост этих клеток, а затем проводили культивирование при встряхивании путем инокуляции их в среду α-MEM, содержащую 5% FCS, в концентрации 2×105 клеток/мл с последующим встряхиванием культуры.
Спустя еще несколько дней после этого, проводили инокуляцию аналогичным образом, используя среду α-MEM, содержащую 5% FCS. В конечном итоге получали клетки, адаптированные к суспензионному культивированию, путем повторного субкультивирования и встряхивания культуры, используя бессывороточную среду α-MEM и подтверждая, что клетки обладают такой же способностью к росту, что и в случае их культивирования в присутствии сыворотки.
(2) Получение клетки CHO, продуцирующей антитело
В качестве экспрессионного вектора использовали транспозонный вектор для экспрессии антитела против М2 вируса гриппа человека, полученный в примере 1 и примере 2 (далее в данном документе называемый транспозонным вектором), и вектор Tol2 pCAGGS-T2TP (фигура 3, Kawakami K. & Noda Т., Genetics, 166, 895-899 (2004)). Кроме того, экспрессионный вектор антитела против М2 вируса гриппа человека, лишенный транспозонных последовательностей, использовали в качестве контроля.
Вводя вышеуказанные экспрессионные векторы в адаптированную к суспензионному культивированию клетку CHO-K1 (Американская коллекция типовых культур, каталожный № CCL-61) или клетку HEK293 (Invitrogen, клетка FreeStyle 293F), сравнивали частоты получения устойчивых к циклогексимиду клонов.
Клетки каждого вида (4×106 клеток) суспендировали в 400 мкл PBS, и транспозонный вектор для экспрессии антитела против М2 вируса гриппа человека (10 мкг) и вектор Tol2 (25 мкг) совместно трансфицировали напрямую в форме кольцевой ДНК методом электропорации. В связи с этим, для того, чтобы экспрессировать Tol2 транспозазу временно, вектор Tol2 был напрямую введен в форме кольцевой ДНК с целью предотвращения интеграции в хромосому хозяина.
Кроме того, в качестве контроля, экспрессионный вектор антитела против М2 вируса гриппа человека (10 мкг) был линеаризован при помощи фермента рестрикции, а затем введен в клетки каждого вида стандартным методом введения генов при помощи электропорации.
Электропорацию проводили, используя кювету с шириной зазора 4 мм (производитель Bio-Rad), при помощи электропоратора (Gene Pulser Xcell System (производитель Bio-Rad)) в условиях напряжения 300 В, электростатической мощности 500 мкФ и комнатной температуры.
После введения генов электропорацией клетки каждого вида высевали в три 96-луночных планшета и культивировали в CO2-инкубаторе в течение 3 дней, используя среду EX-CELL 325-PF от производителя SAFC Biosciences для клеток CHO и среду FreeStyle-293 (производитель Invitrogen) для клеток HEK293.
Затем, начиная со дня смены среды на 4-й день после введения генов, 3 мкг/мл циклогексимида добавляли к среде так, что клетки культивировались в присутствии циклогексимида, после чего культивировали в течение 3 недель, еженедельно производя смену среды.
После культивирования в течение 3 недель подсчитывали число лунок, в которых были обнаружены устойчивые к циклогексимиду колонии. Результаты приведены в таблице 1 и таблице 2.
Как видно из таблицы 1, каждый из экспрессионного транспозонного вектора антитела против М2 вируса гриппа человека или экспрессионного вектора антитела против М2 вируса гриппа человека вводили в суспензионную клетку CHO-К1. В результате, устойчивые к циклогексимиду трансформанты не были получены из клеток, в которые был введен экспрессионный вектор антитела против М2 вируса гриппа человека, как и в других клеточных линиях, однако устойчивые к циклогексимиду трансформанты были получены с высокой частотой из клеток, в которые был введен транспозонный вектор для экспрессии антитела против М2 вируса гриппа человека.
С другой стороны, как видно из таблицы 2, устойчивые к циклогексимиду трансформанты не были получены, когда либо транспозонный вектор для экспрессии антитела против М2 вируса гриппа человека, либо экспрессионный вектор антитела против М2 вируса гриппа человека были введены в клетки HEK293.
На основании данных результатов было установлено, что ген, кодирующий интересующий белок, и ген устойчивости к циклогексимиду, которые были вставлены между парой транспозонных последовательностей, эффективно встроились в хромосому клетки-хозяина в суспензионной клетке млекопитающего.
(3) Изучение продукции антитела в суспензионной клетке CHO и прикрепляющейся клетке CHO
Чтобы изучить эффективность продукции антитела в суспензионной клетке CHO или прикрепляющейся клетке CHO, изучали количество антител, продуцируемых каждой клеточной линией. В качестве суспензионной клетки CHO использовали суспензионную клетку CHO-K1, адаптированную к суспензионному культивированию. Кроме того, в качестве прикрепляющейся клетки CHO использовали прикрепляющуюся клетку CHO-K1 до адаптации к суспензионному культивированию.
Экспрессионный транспозонный вектор антитела против М2 вируса гриппа человека (10 мкг) и вектор Tol2 (25 мкг) вводили электропорацией в суспензионную клетку CHO-K1 и прикрепляющуюся клетку CHO-K1, соответственно. Затем суспензионную клетку CHO-K1 и прикрепляющуюся клетку CHO-K1 инокулировали в три 96-луночных планшета для каждого вида клеток.
Среду для суспензионных клеток (EX-CELL 325-PF, производитель SAFC Biosciences) использовали для суспензионной клетки CHO-K1 и среду α-MEM, содержащую 10% сыворотки, использовали для прикрепляющейся клетки CHO-K1. Клетку каждого вида культивировали в CO2-инкубаторе в течение 3 дней. Начиная со дня смены среды на 4-й день после электропорации, 3 мкг/мл циклогексимида добавляли к среде так, что клетки культивировались в присутствии циклогексимида, и клетки дополнительно культивировали в течение 3 недель. В этом случае смену среды производили каждую неделю.
В случае суспензионной клетки CHO-K1 1×106 клеток высевали в 6-луночный планшет с последующим культивированием при встряхивании в CO2-инкубаторе в течение 3 дней, и количество белка антитела измеряли методом ВЭЖХ, используя культуральный супернатант.
В случае прикрепляющейся клетки CHO-K1 смену среды производили, когда клетки достигали конфлюэнтности в 6-луночном планшете (2×106 клеток), и после статического культивирования в течение 3 дней количество белка антитела измеряли методом ВЭЖХ, используя культуральный супернатант.
Концентрацию антитела в культуральном супернатанте измеряли по методу, описанному в Yeast Res., 7 (2007), 1307-1316. Результаты приведены на фигуре 4.
Как показано на фигуре 4A, большое количество клеток, демонстрирующих заметно высокий уровень экспрессии антитела, было получено при использовании клетки CHO-K1, адаптированной для суспензионного культивирования. С другой стороны, как показано на фигуре 4B, только клетки, демонстрирующие уровень экспрессии антитела на пределе обнаружения методом ВЭЖХ (5 мкг/мл) или менее, были получены при использовании прикрепляющейся клетки CHO-K1.
На основании данных результатов установлено, что если нужно экспрессировать интересующий белок с использованием транспозонного вектора, интересующий белок может быть экспрессирован на высоком уровне, если использовать суспензионную клетку млекопитающего.
Кроме того, исходя из результатов примеров 1-3, установлено, что способ по изобретению можно использовать в качестве нового способа получения интересующего белка путем эффективного создания продуцирующей клетки, которая способна на высоком уровне экспрессировать экзогенный ген, с использованием суспензионной клетки млекопитающего, адаптированной к суспензионному культивированию.
Пример 4
Получение экспрессирующей антитело клетки с использованием Tol1 транспозона и получение антитела
(1) Получение Tol1 транспозонного вектора для экспрессии антитела против М2 вируса гриппа человека
Таким же образом, как и в примере 1, плазмиду, которая содержала генную экспрессионную кассету для клеток млекопитающего, содержащую произвольный ген человеческого антитела и ген маркера устойчивости к лекарственному средству, вставленные между парой Tol1 транспозонных последовательностей, использовали в качестве экспрессионного плазмидного вектора для белка.
Каждую ДНК используемых генов химически синтезировали искусственным образом на основании известной информации о последовательности, либо получали путем создания праймеров для обеих ее концевых последовательностей с проведением ПЦР при использовании соответствующего источника ДНК в качестве матрицы. С целью последующего проведения манипуляций с генами, сайт расщепления для ферментов рестрикции был добавлен к концу праймера.
В нуклеотидной последовательности неавтономного транспозона Tol1, представленной SEQ ID NO: 13 в списке последовательностей (WO2008/072540), нуклеотидную последовательность в положениях 1-200 (последовательность Tol1-L) (SEQ ID NO: 14) и нуклеотидную последовательность в положениях 1351-1855 (последовательность Tol1-R) (SEQ ID NO: 15) использовали в качестве транспозонных последовательностей.
Каждый из фрагментов синтетической ДНК, содержащих пару транспозонных последовательностей, получали следующим методом. Получали фрагмент ДНК, содержащий нуклеотидную последовательность, в которой последовательность узнавания для фермента рестрикции NruI была присоединена как к 5'-концу, так и к 3'-концу последовательности Tol1-R. Затем получали фрагмент ДНК, содержащий нуклеотидную последовательность, в которой последовательность узнавания для фермента рестрикции FseI была присоединена к 5'-концу последовательности Tol1-L, а для фермента рестрикции AscI была присоединена к ее 3'-концу.
Затем полученные таким образом фрагменты ДНК, содержащие последовательность Tol1-R и последовательность Tol1-L, встраивали в экспрессионный вектор N5LG1_M2_Z3. Фрагмент ДНК, содержащий последовательность Tol1-R, встраивали в сайт фермента рестрикции NruI, находящийся на 5'-конце генного фрагмента, содержащего экспрессионную кассету гена антитела и ген селектируемого маркера в векторе N5LG1_M2_Z3, а фрагмент ДНК, содержащий последовательность Tol1-L, встраивали в сайты ферментов рестрикции FseI и AscI, находящиеся на 3'-конце.
Кроме того, был сконструирован Tol1 транспозонный вектор для экспрессии антитела против М2 вируса гриппа человека (фигура 5) путем встраивания экспрессионной кассеты гена устойчивости к циклогексимиду, в которой ген устойчивости к циклогексимиду (ген, в котором пролин в положении 54 человеческого рибосомного белка L36a был заменен глютамином) введен под контролем энхансера/промотора CMV в сайт узнавания FseI вектора N5LG1_M2_Z3, связанного с Tol1 транспозонной последовательностью.
(2) Получение экспрессионного вектора Tol1 транспозазы
Транспозазу экспрессировали, используя экспрессионный вектор, независимый от экспрессионного вектора для интересующего антитела. То есть, экспрессионную кассету гена Tol1 транспозазы, в которой фрагмент ДНК, кодирующий Tol1 транспозазу из рыбы оризии (SEQ ID NO: 17), состоящий из нуклеотидной последовательности, представленной SEQ ID NO: 16, был введен под контролем энхансера/промотора CMV, встраивали в pBluescriptII SK (+) (производитель Stratagene), который затем использовали в качестве экспрессионного вектора Tol1 транспозазы pTol1ase (фигура 6).
(3) Получение клетки CHO, продуцирующей антитело
Используя экспрессионные векторы, полученные в вышеуказанных пунктах (1)-(3), эффективность введения экспрессионного вектора при помощи транспозона Tol1 изучали таким же образом, что и в примере 3. Результат приведен в таблице 3.
Таблица 3 | |
Tol1 транспозонный вектор | |
Эксперимент 1 | 133/192 |
Эксперимент 2 | 67/192 |
Эксперимент 3 | 122/192 |
Как видно из таблицы 3, когда Tol1 транспозонный вектор для экспрессии антитела против М2 вируса гриппа человека был введен в суспензионную клетку CHO-K1, устойчивые к циклогексимиду трансформанты были получены с высокой частотой, как и в случае примера 3, в котором был введен Tol2 транспозонный вектор для экспрессии антитела против М2 вируса гриппа человека.
На основании данных результатов было установлено, что ген антитела и ген устойчивости к циклогексимиду, вставленные между парой транспозонных последовательностей, эффективно трансдуцируются в хромосому клетки-хозяина, а именно, суспензионной клетки млекопитающего, также и в случае использования Tol1 транспозона.
(4) Изучение продукции антитела суспензионной клеткой CHO
Эффективность продукции антитела суспензионной клеткой CHO изучали, используя транспозон Tol1 таким же образом, что и в примере 3(3).
Концентрацию антитела в культуральном супернатанте измеряли методом, описанным в FEMS Yeast Res., 7 (2007), 1307-1316. Результаты приведены на фигуре 7.
Как видно из фигуры 7, большое число клеток, демонстрирующих заметно высокий уровень экспрессии антитела, было также получено в случае использования транспозона Tol1. На основании данного результата было установлено, что аналогично случаю использования нуклеотидной последовательности, полученной из транспозона Tol2, суспензионную клетку млекопитающего, способную на высоком уровне экспрессировать интересующий белок, можно также получать, если в качестве транспозонной последовательности использовать нуклеотидную последовательность, полученную из транспозона Tol1.
Пример 5
Получение антитела против CD98 человека
(1) Получение экспрессионного транспозонного вектора тяжелой цепи антитела против CD98 человека и экспрессионного транспозонного вектора легкой цепи антитела против CD98 человека
Для получения антитела против CD98 человека, имеющего H-цепь и L-цепь с вариабельной областью, представленные аминокислотными последовательностями SEQ ID NO: 20 и 23, соответственно, аминокислотные последовательности H-цепи и L-цепи были получены путем соединения аминокислотной последовательности константной области антитела IgG1 человека с каждой вариабельной областью антитела.
С использованием последовательностей, встроенных в вектор (N5KG1-Val C2IgG1NS/I117L), раскрытых в японском патенте № 4324637 в качестве генных последовательностей (SEQ ID NO: 18 и 21, соответственно) вариабельной области тяжелой цепи и вариабельной области легкой цепи антитела против CD98 человека, к которым присоединена сигнальная последовательность, и с использованием транспозонной последовательности и промотора, аналогичных тем, что были использованы в примере 1, были, соответственно, сконструированы экспрессионный транспозонный вектор тяжелой цепи антитела против CD98 человека (далее в данном документе называемый вектором CD98H) и экспрессионный транспозонный вектор легкой цепи антитела против CD98 человека (далее в данном документе называемый вектором CD98L), (фигуры 8 и 9).
Используемый фрагмент ДНК был химически синтезирован искусственным образом на основании общеизвестной последовательности или получен путем создания праймеров для обеих ее концевых последовательностей и проведения ПЦР с использованием соответствующего источника ДНК в качестве матрицы. Сайт расщепления для фермента рестрикции был присоединен к концу каждого праймера для последующих рекомбинационных процедур с генами.
(2) Получение экспрессионного транспозонного вектора гена устойчивости к циклогексимиду
Экспрессионный транспозонный вектор гена устойчивости к циклогексимиду (далее в данном документе называемый вектором CHX) был сконструирован путем присоединения последовательности, кодирующей ген устойчивости к циклогексимиду (SEQ ID NO: 7), под контролем энхансера/промотора CMV, описанного в примере 1, и встраивания пары транспозонных последовательностей (Tol2-L, Tol2-R) на обоих концах экспрессионной кассеты гена устойчивости к циклогексимиду (фигура 10).
Используемый фрагмент ДНК был искусственным образом химически синтезирован на основании общеизвестной последовательности, либо получен путем создания праймеров для обеих ее концевых последовательностей с последующим проведением ПЦР при использовании соответствующего источника ДНК в качестве матрицы. Сайт расщепления для фермента рестрикции был присоединен к концу каждого праймера для последующих рекомбинационных процедур с генами.
(3) Получение клетки CHO, продуцирующей антитело против CD98 человека
Вектор CD98H (фигура 8), вектор CD98L (фигура 9) и вектор CHX (фигура 10), полученные в вышеуказанных пунктах (1) и (2), и вектор Tol2 (фигура 3), полученный в примере 2, вводили в клетку CHO-K1, адаптированную к суспензионному культивированию, и сравнивали количество появившихся клеток, способных на высоком уровне экспрессировать антитело.
В экспериментальной схеме 4×106 клеток клетки CHO-K1 суспендировали в 400 мкл PBS, и вектор CD98H (10 мкг), вектор CD98L (10 мкг), вектор CHX (10 мкг) и вектор Tol2 (10 мкг) напрямую совместно трансфицировали в форме кольцевой ДНК методом электропорации. Для того чтобы экспрессия Tol2 транспозазы была временной и чтобы предотвратить интеграцию в хромосому хозяина, вектор Tol2 вводили напрямую в форме кольцевой ДНК. Электропорацию проводили при помощи электропоратора (Gene Pulser Xcell System (производитель Bio-Rad)) в условиях напряжения 300 В, электростатической мощности 500 мкФ и комнатной температуры, используя кювету с шириной зазора 4 мм (производитель Bio-Rad).
Кроме того, в контрольной схеме каждый из вектора CD98H (10 мкг), вектора CD98L (10 мкг) и вектора CHX (10 мкг) линеаризовали, используя фермент рестрикции PciI (Takara Bio Inc.), а затем проводили электропорацию таким же образом, как описано выше.
После введения генов электропорацией клетки в каждой кювете суспендировали в среде CD OptiCHO с добавлением 0,5% гидролизата соевых бобов (далее в данном документе называемой средой 0,5CD), инокулировали в один 96-луночный планшет и культивировали в течение 4 дней в CO2-инкубаторе. Затем, начиная со смены среды через 5 дней после введения генов, проводили культивирование в присутствии циклогексимида, используя среду 0,5CD с добавлением 3 мкг/мл циклогексимида (C4859, Sigma-Aldrich), и продолжали культивирование в течение 4 недель, меняя среду с интервалами в одну неделю.
Через 4 недели культивирования экспрессию антитела определяли сэндвич-методом (LENCETM, Perkin-Elmer Corp), используя FRET (резонансный перенос энергии флуоресценции). Что касается клеток, экспрессирующих антитело на высоком уровне, то клоны, экспрессирующие антитело с концентрацией в культуральном супернатанте, составляющей 5,0 мкг/мл или более, считали экспрессирующими антитело клетками, результаты приведены в таблице 4.
Таблица 4 | ||
Контрольная схема | Экспериментальная схема | |
Количество лунок, в которых экспрессировано антитело | ||
Планшет 1 | 10/96 | 29/96 |
Планшет 1 | 20/96 | 49/96 |
Как видно из таблицы 4, большое количество клеток, экспрессирующих антитело против CD98 человека, было обнаружено в экспериментальной схеме, в которой вектор Tol2 был ко-трансфицирован в суспензионную клетку CHO-K1 совместно с экспрессионным транспозонным вектором тяжелой цепи антитела против CD98 человека, экспрессионным транспозонным вектором легкой цепи антитела против CD98 человека и вектором гена устойчивости к циклогексимиду, однако клетки, экспрессирующие антитело против CD98 человека, не были обнаружены в контрольной схеме, в которой вектор Tol2 не был совместно трансфицирован, несмотря на то, что векторы были преобразованы в линейные цепи.
Пример 6
Получение антитела против CD98 человека
(1) Получение экспрессионного транспозонного вектора, содержащего генный фрагмент тяжелой цепи антитела против CD98 человека, генный фрагмент легкой цепи антитела против CD98 человека и ген устойчивости к циклогексимиду
Экспрессионный транспозонный вектор, содержащий генный фрагмент тяжелой цепи антитела против CD98 человека, генный фрагмент легкой цепи антитела против CD98 человека и ген устойчивости к циклогексимиду (далее в данном документе называемый тандемным вектором CD98-CHX), был сконструирован с использованием синтетической ДНК и метода ПЦР таким же образом, как описано выше, путем соединения экспрессионного транспозонного вектора тяжелой цепи антитела против CD98 человека, полученного в примере 5(1), с экспрессионной кассетой гена легкой цепи антитела против CD98 человека, полученной в примере 5(1), и кассетой гена устойчивости к циклогексимиду, полученной в примере 5(2).
(2) Получение экспрессионного транспозонного вектора, содержащего генный фрагмент тяжелой цепи антитела против CD98 человека и ген устойчивости к циклогексимиду
Экспрессионный транспозонный вектор, содержащий генный фрагмент тяжелой цепи антитела против CD98 человека и ген устойчивости к циклогексимиду (далее в данном документе называемый экспрессионным транспозонным вектром CD98H-CHX), был сконструирован с использованием синтетической ДНК и метода ПЦР таким же образом, как описано выше, путем соединения экспрессионного транспозонного вектора тяжелой цепи антитела против CD98 человека, полученного в примере 5(1), с кассетой гена устойчивости к циклогексимиду, полученной в примере 5(2).
(3) Получение клетки CHO, продуцирующей антитело против CD98 человека
Используя экспрессионные транспозонные векторы, полученные в описанном выше примере 5(1) и (2) и в описанном выше примере 6(1) и (2), частоту появления клеток, способных на высоком уровне экспрессировать антитело против CD98 человека, сравнивали в случае переноса генов H-цепи и L-цепи антитела против CD98 человека с использованием одного и того же экспрессионного вектора (контрольная схема), в случае переноса генов H-цепи или L-цепи антитела против CD98 человека или гена устойчивости к циклогексимиду, соответственно, с использованием различных экспрессионных векторов (экспериментальная схема 1) и в случае переноса генов H-цепи или L-цепи с использованием различных экспрессионных векторов (экспериментальная схема 2).
В экспериментальной схеме 1 4×106 клеток клетки CHO-K1 суспендировали в 400 мкл PBS, и вектор CD98H (10 мкг), вектор CD98L (10 мкг), вектор CHX (10 мкг) и вектор Tol2 (10 мкг) напрямую совместно трансфицировали в виде кольцевой ДНК методом электропорации.
В экспериментальной схеме 2 4×106 клеток клетки CHO-K1 суспендировали в 400 мкл PBS, и вектор CD98H-CHX (10 мкг), вектор CD98L (10 мкг) и вектор Tol2 (10 мкг) напрямую совместно трансфицировали в виде кольцевой ДНК методом электропорации.
В контрольной схеме 4×106 клеток клетки CHO-K1 суспендировали в 400 мкл PBS, и тандемный вектор CD98-CHX (10 мкг) и вектор Tol2 (20 мкг) напрямую совместно трансфицировали в виде кольцевой ДНК методом электропорации. Кроме того, во всех экспериментах, для того, чтобы экспрессия Tol2 транспозазы была временной и чтобы предотвратить интеграцию в хромосому хозяина, вектор Tol2 был введен напрямую в форме кольцевой ДНК.
В следующем методе частоту появления продуцирующих антитело клеток подтверждали таким же образом, как и в примере 5(3). Что касается клеток, продуцирующих антитело, то клоны, у которых концентрация антитела в культуральном супернатанте составляла 3,0 мкг/мл или более, считали экспрессирующими антитело клетками. Результаты приведены в таблице 5.
Таблица 5 | |||
Контрольная схема | Экспериментальная схема 1 | Экспериментальная схема 2 | |
Количество лунок, в которых экспрессировано антитело | |||
Планшет 1 | 18/96 | 82/96 | 95/96 |
Планшет 2 | 21/96 | 85/96 | 96/96 |
Всего | 39/192 | 167/192 | 191/192 |
В экспериментальной схеме 1, в которой вводили вектор CD98H, вектор CD98L и вектор CHX, и экспериментальной схеме 2, в которой вводили вектор CD98H и вектор CD98L, частота появления клеток, способных на высоком уровне экспрессировать антитело против CD98 человека, заметно увеличилась.
Приведенные выше результаты свидетельствуют о том, что клетки, обладающие высокой продуктивностью в отношении антитела, можно легко получать и производить, когда различные экспрессионные векторы, в которых ген тяжелой цепи антитела и ген легкой цепи антитела, соответственно, вставлены между транспозонными последовательностями, совместно трансфицированы в суспензионную клетку CHO, по сравнению со случаем, когда экспрессионный вектор, полученный путем интеграции гена тяжелой цепи антитела и гена легкой цепи антитела в один и тот же экспрессионный вектор, вводят в суспензионную клетку CHO. Кроме того, результаты экспериментальной схемы 1 и экспериментальной схемы 2 показали, что даже когда векторов для введения два или более, достаточно по меньшей мере одного гена устойчивости к лекарственному средству (гена селектируемого маркера). Кроме того, было обнаружено, что ген устойчивости к лекарственному средству может присутствовать на экспрессионном векторе, в который встроен ген тяжелой цепи антитела, либо на другом независимом векторе.
Приведенные выше результаты демонстрируют, что транспозонный вектор эффективен в качестве средства для эффективного введения генов, расположенных на двух или более векторах, в суспензию клеток млекопитающего, что обычно достигается с трудом. Кроме того, показано, что с целью достижения высокой продуктивности в отношении белка, содержащего более одного полипептида, или более чем одного белка, эффективно вводить полипептиды и белки, используя различные транспозонные векторы.
(4) Культивирование клетки CHO, продуцирующей антитело против CD98 человека
Лучшие три линии клеток с высокой продуктивностью для антитела были выбраны из клеток, в которые был введен тандемный вектор CD98-CHX, полученный в вышеупомянутом примере 6(3), и клеток, в которые были введены вектор CD98H-CHX и вектор CD98L, и было проведено сравнение их уровней экспрессии антитела. Подробности экспериментов приведены ниже.
Клетку CHO-K1, полученную в примере 6(3), выбранную на основании устойчивости к циклогексимиду и также экспрессирующую анти-CD98 антитело, культивировали для наращивания, используя 96-луночный планшет, 24-луночный планшет и 6-луночный планшет (Corning Glassworks) именно в таком порядке. После наращивания измеряли концентрацию антитела в супернатанте каждой культуры и выбирали наилучшие три клеточных линии клеток CHO с высоким уровнем экспрессии анти-CD98 антитела. Затем каждую из выбранных таким образом трех клеточных линий суспендировали в 3 мл среды 0,5% CD (Invitrogen), а именно среды 0,5CD, до плотности 2×105 клеток/мл и культивировали на шейкере в течение 5 дней при 37°C в атмосфере 5% CO2, используя 6-луночный планшет. Количество антитела в среде через 5 дней культивирования определяли методом ВЭЖХ (Waters Associates, Inc.). Результаты приведены в таблице 6.
Таблица 6 | ||||||
Клетки, полученные из контрольной схемы | Клетки, полученные из экспериментальной схемы 2 | |||||
Уровень экспрессии антитела (мг/мл) | 70 | 67 | 41 | 196 | 87 | 67 |
Как видно из таблицы 6, клетка CHO-K1, в которую были совместно трансфицированы вектор CD98H и вектор CD98L, демонстрирует высокий уровень продукции антитела по сравнению с клеткой CHO-K1, в которую был введен тандемный вектор CD98-CHX.
Приведенные выше результаты свидетельствуют не только о том, что можно с легкостью получать и производить клеточную линию, продуцирующую антитело на высоком уровне, но также о том, что полученная таким образом клетка имеет высокую продуктивность для антитела, когда различные экспрессионные векторы, в которых, соответственно, ген тяжелой цепи антитела и ген легкой цепи антитела вставлены между парой транспозонных последовательностей, совместно трансфицированы в суспензионную клетку CHO.
Пример 7
Получение антитела против фактора некроза опухоли-альфа (TNFα) человека
(1) Получение экспрессионного транспозонного вектора, содержащего генный фрагмент тяжелой цепи антитела к TNFα, генный фрагмент легкой цепи антитела к TNFα и ген устойчивости к циклогексимиду
Для получения антитела против TNFα человека с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 26 и SEQ ID NO: 29 был сконструирован экспрессионный транспозонный вектор с генным фрагментом тяжелой цепи антитела против TNFα человека, генным фрагментом легкой цепи антитела против TNFα человека и геном устойчивости к циклогексимиду (далее в данном документе называемый тандемным вектором TNFα-CHX) путем замены генных фрагментов VH и VL экспрессионного транспозонного вектора, содержащего генный фрагмент тяжелой цепи и генный фрагмент легкой цепи антитела против CD98 человека и ген устойчивости к циклогексимиду, полученного в примере 6(1) (тандемный вектор CD98-CHX) на VH и VL из антитела против TNFα человека, соответственно.
Последовательности гена тяжелой цепи и гена легкой цепи антитела против TNFα человека получали с использованием синтетической ДНК, получая аминокислотные последовательности (SEQ ID NO: 26 и 29), в которых сигнальная последовательность присоединена к аминокислотным последовательностям (SEQ ID NO: 25 и 28) субъединицы вариабельной области тяжелой цепи или субъединицы вариабельной области легкой цепи адалимумаба (рекомбинантного), изображенных на фигуре 1 и фигуре 2, соответственно, в инспекционном отчете о подкожной инъекции 40 мг HUMIRA(R) (Агентство фармацевтических препаратов и медицинских устройств, 14 февраля 2008 г.), и определяя нуклеотидные последовательности таким образом, что аминокислотные последовательности не менялись (SEQ ID NO: 24 и 27). Для последующих манипуляций с генами на конце искусственных последовательностей добавляли сайт расщепления для ферментов рестрикции.
(2) Получение экспрессионного транспозонного вектора, содержащего фрагмент тяжелой цепи антитела против TNFα человека и ген устойчивости к циклогексимиду
Экспрессионный транспозонный вектор, содержащий фрагмент тяжелой цепи антитела против TNFα человека и ген устойчивости к циклогексимиду (далее в данном документе называемый вектором TNFαH-CHX), был сконструирован путем изменения области генного фрагмента VH экспрессионного транспозонного вектора, содержащего генный фрагмент тяжелой цепи антитела против CD98 человека и ген устойчивости к циклогексимиду (вектор CD98H-CHX), полученного в примере 6(2), на генный фрагмент VH антитела к TNFα. В качестве гена тяжелой цепи антитела против TNFα человека использовали последовательность той же последовательности, которая приведена в данном пункте (1).
(3) Получение экспрессионного транспозонного вектора гена легкой цепи антитела против TNFα человека
Экспрессионный транспозонный вектор гена легкой цепи антитела против TNFα человека (далее в данном документе называемый вектором CD98L) был сконструирован путем изменения области гена легкой цепи экспрессионного транспозонного вектора гена легкой цепи антитела против CD98, полученного в примере Example 6(1), на легкую цепь антитела против TNFα человека. В качестве гена VL антитела против TNFα человека использовали ту же последовательность, что и последовательность, приведенная в данном пункте (1).
(4) Получение клетки CHO, продуцирующей антитело против TNFα человека
Для получения клетки CHO-K1, продуцирующей антитело против TNFα человека, тандемный вектор TNFα-CHX (20 мкг), полученный в вышеуказанном пункте (1), и экспрессионный вектор Tol2 транспозазы (вектор Tol2) (10 мкг), полученный в примере 2, вводили в клетку CHO-K1, адаптированную к суспензионному культивированию, полученную в примере 3 (контрольная схема).
Таким же образом, вектор TNFαH-CHX (10 мкг), вектор TNFαL (10 мкг) и вектор Tol2 (10 мкг), полученные в вышеуказанных пунктах (2) и (3), были напрямую совместно трансфицированы в форме кольцевой ДНК (экспериментальная схема). Частоту появления клеток, способных на высоком уровне экспрессировать антитело, сравнивали, проводя введение генов, культивирование клеток и тому подобное таким же образом, как в примере 6, за исключением того, что культивирование клеток с введенными генами проводили на пяти 96-луночных планшетах. Что касается клеток с высокой продуктивностью для антитела, то клоны, у которых концентрация антитела в культуральном супернатанте составляла 3,0 мкг/мл или более, считали экспрессирующими антитело клетками. Результаты приведены в таблице 7.
Таблица 7 | ||
Контрольная схема | Экспериментальная схема | |
Количество лунок, в которых экспрессировано антитело | ||
Планшет 1 | 20/96 | 83/96 |
Планшет 2 | 22/96 | 76/96 |
Планшет 3 | 21/96 | 82/96 |
Планшет 4 | 20/96 | 79/96 |
Планшет 5 | 27/96 | 81/96 |
Всего | 110/480 | 401/480 |
Как видно из таблицы 7, как и в случае клетки, продуцирующей антитело против CD98 человека, полученной в примере 6, для клетки CHO-K1, в которую вектор TNFαH-CHX и вектор TNFαL были совместно трансфицированы, наблюдали примерно в 4 раза более высокую частоту появления клеток, в которых антитело против TNFα человека экспрессировалось на высоком уровне, по сравнению с клеткой CHO-K1, в которую был введен тандемный вектор TNFα-CHX.
Данные результаты свидетельствуют о том, что в любом случае с антителом, линию клеток с высокой продуктивностью для антитела можно легко получать и производить путем совестного трансфицирования встроенных в различные экспрессионные векторы гена тяжелой цепи антитела и гена легкой цепи антитела, которые соответственно вставлены между парой транспозонных последовательностей, в суспензионную клетку CHO.
(5) Культивирование клетки CHO, продуцирующей антитело против TNFα человека
Клетки, выбранные на основании устойчивости к циклогексимиду из клеток с введенным тандемным вектором TNFα-CHX, полученные в вышеуказанном пункте (4), и клетки, в которые были совместно трансфицированы вектор TNFαH-CHX и вектор TNFαL, и также экспрессирующие антитело против TNFα человека, отбирали и культивировали для наращивания, используя 96-луночный планшет, 24-луночный планшет и 6-луночный планшет, именно в таком порядке. Что касается 4 клеточных линий из клеток, в которые был введен тандемный вектор TNFα-CHX, успешно размноженных при культивировании, и 52 клеточных линий, в которые были совместно трансфицированы вектор TNFαH-CHX и вектор TNFαL, эти клетки культивировали таким же образом, как в примере 6(4), за исключением того, что период культивирования составлял 7 дней, и измеряли уровни экспрессии антител. Результаты приведены на фигуре 11.
В результате, клетка CHO-K1, в которую были совместно трансфицированы вектор TNFαH-CHX и вектор TNFαL, продемонстрировала примерно в 2,4 раза более высокую продуктивность для антитела, чем продуктивность клетки CHO-K1, в которую был введен тандемный вектор TNFα-CHX.
Этот результат показывает, что, как и в случае примера 6(4), не только можно получать и производить клетку с высокой продуктивностью для антитела, но также полученная таким образом клетка имеет высокую продуктивность для антитела, когда различные экспрессионные векторы, в которых каждый из гена тяжелой цепи антитела и гена легкой цепи антитела, соответственно, вставлен между парой транспозонных последовательностей, совместно трансфицированы в суспензионную клетку CHO.
Пример 8
Получение антитела против CD20 человека
(1) Получение экспрессионного транспозонного вектора, содержащего генный фрагмент тяжелой цепи антитела против CD20 человека, генный фрагмент легкой цепи антитела против CD20 человека и ген устойчивости к циклогексимиду
Для получения антитела против CD20 человека, содержащего VH и VL, представленные аминокислотными последовательностями SEQ ID NO: 32 и 35, соответственно, экспрессионный транспозонный вектор, содержащий генный фрагмент тяжелой цепи антитела против CD20 человека, генный фрагмент легкой цепи антитела против CD20 человека и ген устойчивости к циклогексимиду (далее в данном документе называемый тандемным вектором CD98-CHX), был сконструирован путем замены областей генов VH и VL антитела в тандемном векторе CD98-CHX, полученном в примере 6(1) на VH и VL из антитела против CD20 человека, соответственно.
Последовательности генов области VH и области VL антитела против CD20 человека получали с использованием синтетической ДНК, получая нуклеотидную последовательность, описанную в регистрационном № GenBank AR000013, и аминокислотные последовательности (SEQ ID NO: 31 и 34, соответственно), в которых сигнальная последовательность была присоединена к аминокислотным последовательностям (SEQ ID NO: 32 и 35, соответственно) VH и VL ритуксимаба, описанным в сопроводительном листе к инспекционному отчету об инъекции 10 мг/мл Rituxan(R) (сообщение Национального института наук о здоровье, № 3395, 28 августа 2003 г.), и определяя нуклеотидные последовательности таким образом, что аминокислотные последовательности не менялись (SEQ ID NO: 30 и 33). Для последующих манипуляций с генами на конце искусственных последовательностей добавляли сайт расщепления для ферментов рестрикции.
(2) Получение экспрессионного транспозонного вектора, содержащего генный фрагмент тяжелой цепи антитела против CD20 человека и ген устойчивости к циклогексимиду
Экспрессионный транспозонный вектор, содержащий генный фрагмент тяжелой цепи антитела против CD20 человека и ген устойчивости к циклогексимиду (далее в данном документе называемый вектором CD20H-CHX), был сконструирован путем изменения области гена VH антитела в векторе CD98H-CHX, полученном в примере 6(2), на VH из антитела против CD20 человека. В качестве гена тяжелой цепи антитела против CD20 человека использовали ту же последовательность, что и последовательность, приведенная в вышеуказанном пункте (1).
(3) Получение экспрессионного транспозонного вектора гена легкой цепи антитела против CD20 человека
Экспрессионный транспозонный вектор гена легкой цепи антитела против CD20 человека (далее в данном документе называемый вектором CD20L) был сконструирован путем изменения областей гена VL антитела против CD98 человека, полученного в примере 6(1), на VL из антитела против CD20 человека. В качестве генов тяжелой и легкой цепи антитела против CD20 человека использовали те же последовательности, что и последовательность, приведенная в вышеуказанном пункте (1).
(4) Получение клетки CHO, продуцирующей антитело против CD20 человека
Для получения клетки CHO-K1, продуцирующей антитело против CD20 человека, тандемный вектор CD20-CHX, полученный в вышеуказанном пункте (1), и экспрессионный вектор Tol2 транспозазы (вектор Tol2), полученный в примере 2, были введены в клетку CHO-K1, адаптированную к суспензионному культивированию, полученную в примере 3(1) (контрольная схема).
Аналогичным образом, вектор CD20H-CHX (10 мкг) и вектор CD20L (10 мкг), полученные в вышеуказанных пунктах (2) и (3), были совместно трансфицированы в клетку CHO-K1, вместе с вектором Tol2 (10 мкг) (экспериментальная схема). Частоту появления клеток, способных на высоком уровне экспрессировать антитело, сравнивали, проводя введение генов, культивирование клеток и тому подобное таким же образом, что и в примере 6, за исключением того, что культивирование клеток с введенными генами проводили на пяти 96-луночных планшетах. Кроме того, лунки с концентрацией антитела 3,0 мкг/мл или более считали лунками с экспрессированным антителом. Результаты приведены в таблице 8.
Таблица 8 | ||
Контрольная схема | Экспериментальная схема | |
Количество лунок, в которых экспрессировано антитело | ||
Планшет 1 | 2/96 | 4/96 |
Планшет 2 | 2/96 | 9/96 |
Планшет 3 | 4/96 | 4/96 |
Планшет 4 | 1/96 | 8/96 |
Планшет 5 | 2/96 | 5/96 |
Всего | 11/480 | 30/480 |
В результате, клетка CHO-K1, в которую были совместно трансфицированы вектор CD20H-CHX и вектор CD20L, демонстрировала примерно в 3 раза более высокую частоту появления клеток, экспрессирующих на высоком уровне антитело против CD20 человека, по сравнению с клеткой CHO-K1, в которую был введен тандемный вектор CD20-CHX.
Этот результат аналогичен результату в случаях с антителом против CD98 человека и антителом против TNFα человека, описанных в примере 6(3) или примере 7(3), и свидетельствует о том, что линию клеток, продуцирующих антитело на высоком уровне, можно легко получать и производить в случае каждого из антител, когда различные экспрессионные векторы, в которые каждый из гена тяжелой цепи антитела и гена легкой цепи антитела, соответственно, вставлен между транспозонными последовательностями, совместно трансфицированы в суспензионную клетку CHO.
(5) культивирование клетки CHO, продуцирующей антитело против CD20 человека
Клетки, выбранные на основе устойчивости к циклогексимиду из клеток с введенным тандемным вектором CD20-CHX, полученные в вышеуказанном пункте (3), и клетки, в которые были совместно трансфицированы вектор CD20H-CHX и вектор CD20L, и также экспрессирующие антитело против CD20 человека, отбирали и культивировали для наращивания, используя 96-луночный планшет, 24-луночный планшет и 6-луночный планшет, именно в таком порядке. Что касается 4 клеточных линий из клеток контрольной схемы, успешно размноженных при культивировании, и 50 клеточных линий из клеток экспериментальной схемы, эти клетки культивировали таким же образом, как в примере 6(4), за исключением того, что период культивирования составлял 7 дней, и измеряли их уровни экспрессии антител. Результаты приведены на фигуре 12.
Как видно из фигуры 12, установлено, что клетка CHO-K1, в которую были совместно трансфицированы вектор CD20H-CHX и вектор CD20L, демонстрировала примерно в 1,6 раза более высокую продуктивность для антитела, чем клетка CHO-K1, в которую был введен тандемный вектор CD20-CHX.
Этот результат аналогичен результату в случаях с антителом против CD98 человека и антителом против TNFα человека, описанных в примере 6(4) или примере 7(5), и свидетельствует не только о том, что клеточную линию, имеющую высокую продуктивность для антитела, можно легко получать и производить, если различные экспрессионные векторы, в которых ген тяжелой цепи антитела и ген легкой цепи антитела, соответственно, вставлены между транспозонными последовательностями, совместно трансфицированы в суспензионную клетку CHO, но и о том, что полученная таким образом клетка имеет высокую продуктивность для антитела.
Пример 9
Получение транспозонного вектора, экспрессирующего ген устойчивости к неомицину и антитело против CD98 человека
(1) Получение транспозонного вектора, экспрессирующего ген устойчивости к неомицину дикого типа и антитело против CD98 человека
Плазмиду, которая содержала генную экспрессионную кассету для использования в клетке млекопитающего, содержащую произвольный ген антитела человека и ген маркера устойчивости к лекарственному средству, вставленные между парой полученных из Tol2 нуклеотидных последовательностей, использовали в качестве плазмидного вектора для экспрессии белка.
ДНК используемого гена получали, проводя химический синтез искусственным образом на основании общеизвестной нуклеотидной последовательности, либо путем создания праймеров для обеих ее концевых последовательностей с последующим проведением ПЦР при использовании соответствующего источника ДНК. Для последующих манипуляций с генами на конце праймера добавляли сайт расщепления для ферментов рестрикции.
В нуклеотидной последовательности неавтономного транспозона Tol2 (SEQ ID NO: 1), раскрытой в JP-A-2003-235575, нуклеотидную последовательность в положениях 1-200 (последовательность Tol2-L) (SEQ ID NO: 2) и нуклеотидную последовательность в положениях 2285-2788 (последовательность Tol2-R) (SEQ ID NO: 3) использовали в качестве транспозонных последовательностей.
Синтезировали фрагмент ДНК, содержащий каждую из последовательности Tol2-R и последовательности Tol2-L.
Получали фрагмент ДНК, содержащий нуклеотидную последовательность (SEQ ID NO: 18), кодирующую H-цепь антитела, под контролем промотора CMV, амплифицированный на основе вектора N5KG1-Val C2IgG1NS/I117L антитела против CD98 человека (японский патент № 4324637), в качестве кассеты гена тяжелой цепи антитела, и фрагмент ДНК, содержащий нуклеотидную последовательность (SEQ ID NO: 21), кодирующую легкую цепь антитела, под контролем промотора SV40, амплифицированный на основе вектора N5KG1-Val C2IgG1NS/I117L антитела против CD98 человека, в качестве кассеты гена легкой цепи антитела.
В качестве кассеты гена устойчивости к неомицину получали фрагмент ДНК, содержащий ДНК, содержащую нуклеотидную последовательность, кодирующую ген устойчивости к неомицину, под контролем промотора SV40 (ДНК, кодирующую неомицинфосфотрансферазу, состоящую из нуклеотидной последовательности, представленной SEQ ID NO: 36, и с регистрационным № GenBank U47120.2).
Экспрессионный вектор A анти-CD98 антитела получали, соединяя вышеуказанную экспрессионную кассету гена тяжелой цепи антитела, экспрессионную кассету гена легкой цепи антитела и экспрессионную кассету гена устойчивости к неомицину, и дополнительно соединяя оба его конца с фрагментом ДНК, содержащим последовательность Tol2-R, и фрагментом ДНК, содержащим последовательность Tol2-L (фигура 13).
(2) Получение экспрессионного транспозонного вектора антитела против CD98 человека, содержащего модифицированный ген устойчивости к неомицину 1
Получали экспрессионный транспозонный вектор В антитела против CD98 человека, в котором ген устойчивости к неомицину экспрессионного транспозонного вектора А антитела против CD98 человека, полученного в пункте (1), содержащего ген устойчивости к неомицину дикого типа, был заменен на модифицированный ген устойчивости к неомицину 1, содержащий нуклеотидную последовательность, представленную SEQ ID NO: 37.
Модифицированный ген устойчивости к неомицину 1 кодирует аминокислотную последовательность, идентичную последовательности гена устойчивости к неомицину дикого типа, и был изменен для получения нуклеотидной последовательности, в которой модифицированы 167 оснований, соответствующих 22% всех оснований. В частности, среди в общей сложности 32 остатков лейцина, кодоны, соответствующие 25 остаткам лейцина, были изменены на ТТА.
(3) Получение экспрессионного транспозонного вектора антитела против CD98 человека, содержащего модифицированный ген устойчивости к неомицину 2
Получали экспрессионный транспозонный вектор С антитела против CD98 человека, в котором ген устойчивости к неомицину экспрессионного транспозонного вектора А антитела против CD98 человека, полученного в пункте (1), содержащего ген устойчивости к неомицину дикого типа, был заменен на модифицированный ген устойчивости к неомицину 2, содержащий нуклеотидную последовательность, представленную SEQ ID NO: 38.
Модифицированный ген устойчивости к неомицину 2 кодировал аминокислотную последовательность, идентичную последовательности гена устойчивости к неомицину дикого типа, и имел нуклеотидную последовательность, в которой 180 оснований, соответствующих 23% всех оснований, были модифицированы. В частности, среди в общей сложности 32 остатков лейцина, кодоны, соответствующие 28 остаткам лейцина, были изменены на ТТА.
(4) Получение экспрессионного транспозонного вектора антитела против CD98 человека с модифицированным геном устойчивости к неомицину 3
Получали экспрессионный транспозонный вектор D антитела против CD98 человека, в котором ген устойчивости к неомицину экспрессионного транспозонного вектора А антитела против CD98 человека, полученного в пункте (1), содержащего ген устойчивости к неомицину дикого типа, был заменен на модифицированный ген устойчивости к неомицину 3, содержащий нуклеотидную последовательность, представленную SEQ ID NO: 39.
Модифицированный ген устойчивости к неомицину 3 кодировал аминокислотную последовательность, идентичную последовательности гена устойчивости к неомицину дикого типа, и имел нуклеотидную последовательность, в которой 203 основания, соответствующих 26% всех оснований, были модифицированы. В частности, среди в общей сложности 32 остатков лейцина, кодоны, соответствующие 30 остаткам лейцина, были измерены на ТТА.
Пример 10
Получение антитела с помощью продуцирующей антитело клетки CHO, экспрессирующей модифицированный ген устойчивости к неомицину
Получали продуцирующие антитело клетки A-D путем введения каждого из экспрессионных транспозонных векторов A-D антитела против CD98 человека, полученных в примере 9(1)-(4), в суспензионную клетку CHO-K1 вместе с вектором pCAGGS-T2TP, экспрессирующим Tol2 транспозазу с аминокислотной последовательностью, представленной SEQ ID NO: 40 [Kwakami K. & Noda T., Genetics, 166, 895-899 (2004)].
Введение векторов в суспензионную клетку CHO проводили путем суспендирования клетки CHO (4×106 клеток) в 400 мкл буфера PBS и совместного трансфицирования экспрессионного транспозонного вектора антитела против CD98 человека (10 мкг) и экспрессионного вектора Tol2 транспозазы pCAGGS-T2TP (20 мкг) напрямую в форме кольцевой ДНК методом электропорации.
В данном случае экспрессионный вектор Tol2 транспозазы был также введен в форме кольцевой ДНК для того, чтобы Tol2 транспозаза экспрессировалась временно.
Кроме того, в качестве контроля, в котором не использовали Tol2 транспозазу, экспрессионный транспозонный вектор D антитела против CD98 человека (10 мкг) из примера 19(4) был линеаризован при помощи фермента рестрикции PciI (TARA BIO INC.), а затем введен в суспензионную клетку CHO-K1 методом электропорации.
Электропорацию проводили при помощи электропоратора [Gene Pulser Xcell System (производитель Bio-Rad)] в условиях напряжения 300 В, электростатической мощности 500 мкФ и комнатной температуры, используя кювету с шириной зазора 4 мм (производитель Bio-Rad).
После введения генов электропорацией клетки в каждой кювете инокулировали в один 96-луночный планшет и культивировали в течение 3 дней в CO2-инкубаторе, используя среду CD OptiCHO (Invitrogen) с добавлением 5% гидролизата соевых бобов.
Затем, начиная со смены среды через 4 дня после введения генов, проводили культивирование в присутствии G418 (Geneticin(R), Invitrogen), добавляя G418 до получения конечной концентрации 500 мкг/мл, и культивирование продолжали в течение 3 недель, меняя среду с интервалами в одну неделю.
После культивирования экспрессию антитела определяли сэндвич-методом при помощи анализа LANCE(R) (Perkin-Elmer Corp) с применением FRET (флуоресцентного резонансного переноса энергии). Результаты приведены в таблице 9.
Таблица 9 | |||||
Продуцирующие антитело клетки | |||||
A (дикий тип) | В (модифицированный тип 1) | С (модифицированный тип 2) | D (модифицированный тип 3) | Контрольная клетка | |
Уровень экспрессии антитела (мг/л) клеток, демонстрирующих максимальную экспрессию | 0,5 | 2,0 | 1,6 | 5,1 | - |
Средний уровень экспрессии антитела (мг/л) лучших 10 клеток | 0,5 | 0,7 | 0,7 | 1,7 | - |
Как видно из таблицы 9, уровни экспрессии антитела против CD98 человека клеток В-D, экспрессирующих модифицированные гены устойчивости к неомицину, были выше, чем уровни клетки A, экспрессирующей ген устойчивости к неомицину дикого типа.
В частности, в случае клетки D, продуцирующей антитело против CD98 человека, которая экспрессирует модифицированный ген устойчивости к неомицину 3, была получена клеточная линия, демонстрирующая в 10 раз более высокий уровень экспрессии, чем таковой у клетки A, продуцирующей антитело против CD98 человека, которая экспрессирует ген устойчивости к неомицину дикого типа.
Кроме того, даже при использовании модифицированного гена устойчивости к неомицину 3, не удалось получить клетку, экспрессирующую антитело против CD98 человека, из контрольной клетки, в которую экспрессионный вектор Tol2 транспозазы не был совместно трансфицирован, несмотря на приведение вектора в линейную форму.
Пример 11
Получение транспозонного вектора, экспрессирующего ген устойчивости к пуромицину и антитело против CD98 человека
(1) Получение экспрессионного транспозонного вектора антитела против CD98 человека, содержащего модифицированный ген устойчивости к пуромицину 1
Получали экспрессионный транспозонный вектор E антитела против CD98 человека, в котором ген устойчивости к неомицину экспрессионного транспозонного вектора A антитела против CD98 человека, полученного в примере 9(1), который содержал ген устойчивости к неомицину дикого типа, был заменен на модифицированный ген устойчивости к пуромицину 1 с нуклеотидной последовательностью, представленной SEQ ID NO: 41.
Модифицированный ген устойчивости к пуромицину 1 кодировал аминокислотную последовательность, идентичную последовательности гена устойчивости к пуромицину дикого типа с нуклеотидной последовательностью, представленной SEQ ID NO: 42 (ген пуромицин-N-ацетилтрансферазы с нуклеотидной последовательностью, описанной в регистрационном № GenBank U07648.1), и имел нуклеотидную последовательность, в которой 17 оснований, соответствующих 3% всех оснований, модифицированы. В частности, среди в общей сложности 28 остатков аланина, содержащихся в гене устойчивости к пуромицину, кодоны, соответствующие 17 остаткам аланина, были изменены на GCG в результате модификации, вместе с кодонами, которые уже были кодонами GCG в диком типе, кодоны, соответствующие всем остаткам аланина, были измерены на GCG.
(2) Получение экспрессионного транспозонного вектора антитела против CD98 человека, содержащего модифицированный ген устойчивости к пуромицину 2
Получали экспрессионный транспозонный вектор F антитела против CD98 человека, в котором ген устойчивости к неомицину экспрессионного транспозонного вектора A антитела против CD98 человека, полученного в примере 9(1), содержащего ген устойчивости к неомицину дикого типа, был заменен на модифицировнный ген устойчивости к пуромицину 2 с нуклеотидной последовательностью, представленной SEQ ID NO: 43. Модифицированный ген устойчивости к пуромицину 2 кодирует аминокислотную последовательность, идентичную последовательности гена устойчивости к пуромицину дикого типа, и имеет нуклеотидную последовательность, в которой 79 оснований, соответствующих 14% общего количества оснований, модифицированы. В частности, в дополнение к модификации кодонов, соответствующих остаткам аланина модифицированного гена устойчивости к пуромицину 1, кодоны, соответствующие остаткам лейцина, были изменены на ТТА и кодоны, соответствующие остаткам валина, были изменены на GTA, и кодоны для серина были изменены на TCG.
Пример 12
Получение антитела с помощью продуцирующей антитело клетки СНО, экспрессирующей модифицированный ген устойчивости к пуромицину 1
Получали продуцирующие антитело клетки Ε и F путем введения экспрессионного транспозонного вектора Ε антитела против CD98 человека из примера 11(1), содержащего модифицированный ген устойчивости к пуромицину 1, экспрессионного транспозонного вектора F антитела против CD98 человека из примера 11(2), содержащего модифицированный ген устойчивости к пуромицину 2, и экспрессионного вектора Tol2 транспозазы pCAGGS-T2TP в суспензионную клетку CHO-К1.
Введение векторов в суспензионную клетку проводили путем суспендирования суспензионной клетки СНО (4×106 клеток) в 400 мклбуфера PBS и совместного трансфицирования экспрессионного транспозонного вектора антитела против CD98 человека, содержащего модифицированный ген устойчивости к пуромицину, в форме кольцевой ДНК (10 мкг) и pCAGGS-T2TP (20 мкг) напрямую методом электропорации.
В этом случае, экспрессионный вектор Tol2 транспозазы pCAGGS-T2TP также вводили напрямую в форме кольцевой ДНК для временной экспрессии Tol2 транспозазы.
Электропорацию проводили при помощи электропоратора [Gene Pulser Xcell System (производитель Bio-Rad)] в условиях напряжения 300 В, электростатической мощности 500 мкФ и комнатной температуры, используя кювету с шириной зазора 4 мм (производитель Bio-Rad).
После введения генов электропорацией клетки в каждой кювете инокулировали в один 96-луночный планшет и культивировали в течение 3 дней в CO2-инкубаторе, используя среду CD OptiCHO (Invitrogen) с добавлением 5% гидролизата соевых бобов.
Затем, начиная со смены среды через 2 дня после введения генов, проводили культивирование в течение 4 недель, добавляя пуромицин (P9620, Sigma-Aldrich) до конечной концентрации 5 мкг/мл и меняя среду на содержащую пуромицин среду с интервалами в одну неделю.
После культивирования уровень экспрессии антитела определяли сэндвич-методом при помощи анализа LANCE(R) (Perkin-Elmer Corp) с применением FRET (флуоресцентного резонансного переноса энергии). Результаты приведены в таблице 10.
Таблица 10 | ||
Продуцирующие антитело клетки | ||
E (Модификация 1) | F (Модификация 2) | |
Уровень экспрессии антитела (мг/л) клеток, демонстрирующих максимальную экспрессию | 1,0 | 2,2 |
Средний уровень экспрессии антитела (мг/л) лучших 10 клеток | 0,7 | 1,6 |
Как видно из таблицы 10, продуцирующая антитело клетка F, экспрессирующая модифицированный ген устойчивости к пуромицину 2, демонстрировала в два или более раза более высокую продуктивность для антитела, чем продуцирующая антитело клетка E, экспрессирующая модифицированный ген устойчивости к пуромицину 1.
Пример 13
Получение антитела с помощью продуцирующей антитело клетки CHO, экспрессирующей модифицированный ген устойчивости к пуромицину 2
Продуцирующую антитело клетку F, полученную в примере 12, экспрессирующую модифицированный ген устойчивости к пуромицину 2, культивировали в конической колбе для получения антитела против CD98 человека.
В частности, продуцирующую антитело клетку F культивировали для наращивания, используя 96-луночный планшет, 24-луночный планшет и 6-луночный планшет именно в таком порядке. Выбрали две линии клеток продуцирующей антитело клетки F, в которых число клеток было значительно повышено (клеточная линия 1 и клеточная линия 2), их, соответственно, суспендировали в 35 мл среды CD OptiCHO (Invitrogen) с добавлением 5% гидролизата соевых бобов так, чтобы получить плотность клеток 2×105 клеток/мл, и культивировали в течение 1 недели на шейкере, используя коническую колбу емкостью 125 мл (с изогнутой крышкой, Corning Glassworks), при 37°C в атмосфере 5% CO2, получая таким образом антитело против CD98 человека.
Количество антитела в среде после культивирования определяли методом ВЭЖХ (Waters Associates, Inc.). Результаты приведены в таблице 11.
Таблица 11 | ||
Клеточная линия 1 | Клеточная линия 2 | |
Уровень экспрессии антитела (мг/л) | 15,6 | 14,8 |
Приведенные выше результаты свидетельствуют о том, что в суспензионной клетке CHO ген антитела, вставленный между парой транспозонных последовательностей, и модифицированный ген устойчивости к лекарственному средству успешно встроены в хромосому хозяина и также эффективны для отбора экспрессирующей на высоком уровне клетки. Кроме того, установлено, что полученную таким образом клетку можно культивировать для наращивания и производство интересующего белка в условиях суспензионного культивирования возможно.
При помощи способа получения белка по настоящему изобретению интересующий белок можно эффективно производить, используя суспензионную клетку млекопитающего. Клетку по настоящему изобретению можно использовать в качестве продуцирующей белок клетки для получения рекомбинантного белка.
Список последовательностей
SEQ ID NO: 1 - Описание искусственной последовательности; нуклеотидная последовательность неавтономного транспозона Tol2.
SEQ ID NO: 2 - Описание искусственной последовательности; последовательность Tol2-L.
SEQ ID NO: 3 - Описание искусственной последовательности; последовательность Tol2-R.
SEQ ID NO: 7 - Описание искусственной последовательности; нуклеотидная последовательность гена устойчивости к циклогексимиду.
SEQ ID NO: 8 - Описание искусственной последовательности; аминокислотная последовательность белка, кодируемого геном устойчивости к циклогексимиду.
SEQ ID NO: 9 - Описание искусственной последовательности; нуклеотидная последовательность, кодирующая H-цепь антитела M2Z3.
SEQ ID NO: 10 - Описание искусственной последовательности; аминокислотная последовательность H-цепи антитела M2Z3.
SEQ ID NO: 11 - Описание искусственной последовательности; нуклеотидная последовательность, кодирующая L-цепь антитела M2Z3.
SEQ ID NO: 12 - Описание искусственной последовательности; аминокислотная последовательность L-цепи антитела M2Z3.
SEQ ID NO: 13 - Описание искусственной последовательности; нуклеотидная последовательность неавтономного Tol1.
SEQ ID NO: 14 - Описание искусственной последовательности; последовательность Tol1-L.
SEQ ID NO: 15 - Описание искусственной последовательности; последовательность Tol1-R.
SEQ ID NO: 18 - Описание искусственной последовательности; нуклеотидная последовательность, кодирующая вариабельную область тяжелой цепи анти-CD98 антитела.
SEQ ID NO: 19 - Описание искусственной последовательности; аминокислотная последовательность вариабельной области тяжелой цепи анти-CD98 антитела.
SEQ ID NO: 20 - Описание искусственной последовательности; аминокислотная последовательность вариабельной области тяжелой цепи анти-CD98 антитела.
SEQ ID NO: 21 - Описание искусственной последовательности; нуклеотидная последовательность, кодирующая вариабельную область легкой цепи анти-CD98 антитела.
SEQ ID NO: 22 - Описание искусственной последовательности; аминокислотная последовательность вариабельной области легкой цепи анти-CD98 антитела.
SEQ ID NO: 23 - Описание искусственной последовательности; аминокислотная последовательность вариабельной области легкой цепи анти-CD98 антитела.
SEQ ID NO: 24 - Описание искусственной последовательности; нуклеотидная последовательность, кодирующая вариабельную область тяжелой цепи антитела против TNFα человека.
SEQ ID NO: 25 - Описание искусственной последовательности; аминокислотная последовательность вариабельной области тяжелой цепи антитела против TNFα человека.
SEQ ID NO: 26 - Описание искусственной последовательности; аминокислотная последовательность вариабельной области тяжелой цепи антитела против TNFα человека.
SEQ ID NO: 27 - Описание искусственной последовательности; нуклеотидная последовательность, кодирующая вариабельную область легкой цепи антитела против TNFα человека.
SEQ ID NO: 28 - Описание искусственной последовательности; аминокислотная последовательность вариабельной области легкой цепи антитела против TNFα человека.
SEQ ID NO: 29 - Описание искусственной последовательности; аминокислотная последовательность вариабельной области легкой цепи антитела против TNFα человека.
SEQ ID NO: 30 - Описание искусственной последовательности; нуклеотидная последовательность, кодирующая вариабельную область тяжелой цепи антитела против CD20 человека.
SEQ ID NO: 31 - Описание искусственной последовательности; аминокислотная последовательность вариабельной области тяжелой цепи антитела против CD20 человека.
SEQ ID NO: 32 - Описание искусственной последовательности; аминокислотная последовательность вариабельной области тяжелой цепи антитела против CD20 человека.
SEQ ID NO: 33 - Описание искусственной последовательности; нуклеотидная последовательность, кодирующая вариабельную область легкой цепи антитела против CD20 человека.
SEQ ID NO: 34 - Описание искусственной последовательности; аминокислотная последовательность вариабельной области легкой цепи антитела против CD20 человека.
SEQ ID NO: 35 - Описание искусственной последовательности; аминокислотная последовательность вариабельной области легкой цепи антитела против CD20 человека.
SEQ ID NO: 36 - Описание искусственной последовательности; нуклеотидная последовательность гена устойчивости к неомицину дикого типа.
SEQ ID NO: 37 - Описание искусственной последовательности; нуклеотидная последовательность модифицированного гена устойчивости к неомицину.
SEQ ID NO: 38 - Описание искусственной последовательности; нуклеотидная последовательность модифицированного гена устойчивости к неомицину.
SEQ ID NO: 39 - Описание искусственной последовательности; нуклеотидная последовательность модифицированного гена устойчивости к неомицину.
SEQ ID NO: 41 - Описание искусственной последовательности; нуклеотидная последовательность модифицированного гена устойчивости к пуромицину.
SEQ ID NO: 42 - Описание искусственной последовательности; нуклеотидная последовательность гена устойчивости к пуромицину дикого типа.
SEQ ID NO: 43 - Описание искусственной последовательности; нуклеотидная последовательность модифицированного гена устойчивости к пуромицину.
SEQ ID NO: 44 - Описание искусственной последовательности; нуклеотидная последовательность модифицированного гена устойчивости к пуромицину.
SEQ ID NO: 45 - Описание искусственной последовательности; нуклеотидная последовательность модифицированного гена устойчивости к зеоцину.
SEQ ID NO: 46 - Описание искусственной последовательности; нуклеотидная последовательность модифицированного гена устойчивости к зеоцину.
SEQ ID NO: 47 - Описание искусственной последовательности; нуклеотидная последовательность модифицированного гена устойчивости к гигромицину.
SEQ ID NO: 48 - Описание искусственной последовательности; нуклеотидная последовательность модифицированного гена устойчивости к гигромицину.
Claims (31)
1. Способ получения интересующего белка, включающий введение по меньшей мере одного экспрессионного вектора, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, в суспензионную клетку млекопитающего; интеграцию генного фрагмента, содержащего ДНК, кодирующую интересующий белок, вставленного между парой транспозонных последовательностей, в хромосому клетки млекопитающего для получения клетки млекопитающего, которая экспрессирует интересующий белок; и суспензионное культивирование клетки млекопитающего,
где суспензионная клетка млекопитающего представляет собой суспензионную клетку СНО, которая способна выживать и пролиферировать в бессывороточной среде, и где пара транспозонных последовательностей представляет собой нуклеотидные последовательности, полученные из пары транспозонов Tol1, или нуклеотидные последовательности, полученные из пары транспозонов Tol2.
где суспензионная клетка млекопитающего представляет собой суспензионную клетку СНО, которая способна выживать и пролиферировать в бессывороточной среде, и где пара транспозонных последовательностей представляет собой нуклеотидные последовательности, полученные из пары транспозонов Tol1, или нуклеотидные последовательности, полученные из пары транспозонов Tol2.
2. Способ получения интересующего белка, включающий следующие этапы (А)-(С):
(А) этап одновременного введения следующих экспрессионных векторов (а) и (b) в суспензионную клетку млекопитающего:
(а) по меньшей мере один экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента;
(b) экспрессионный вектор, который содержит ДНК, кодирующую транспозазу, которая узнает транспозонные последовательности и обладает способностью перемещать генный фрагмент, вставленный между парой транспозонных последовательностей, в хромосому;
(B) этап получения суспензионной клетки млекопитающего, которая экспрессирует интересующий белок в результате временной экспрессии транспозазы с экспрессионного вектора, введенного в суспензионную клетку млекопитающего на этапе (А), с целью интеграции генного фрагмента, вставленного между парой транспозонных последовательностей, в хромосому клетки млекопитающего, и
(C) этап суспензионного культивирования суспензионной клетки млекопитающего, которая экспрессирует интересующий белок, полученной на этапе (В), для получения интересующего белка, где суспензионная клетка млекопитающего представляет собой суспензионную клетку СНО, которая способна выживать и пролиферировать в бессывороточной среде, и где пара транспозонных последовательностей представляет собой нуклеотидные последовательности, полученные из пары транспозонов Tol1, или нуклеотидные последовательности, полученные из пары транспозонов Tol2.
(А) этап одновременного введения следующих экспрессионных векторов (а) и (b) в суспензионную клетку млекопитающего:
(а) по меньшей мере один экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента;
(b) экспрессионный вектор, который содержит ДНК, кодирующую транспозазу, которая узнает транспозонные последовательности и обладает способностью перемещать генный фрагмент, вставленный между парой транспозонных последовательностей, в хромосому;
(B) этап получения суспензионной клетки млекопитающего, которая экспрессирует интересующий белок в результате временной экспрессии транспозазы с экспрессионного вектора, введенного в суспензионную клетку млекопитающего на этапе (А), с целью интеграции генного фрагмента, вставленного между парой транспозонных последовательностей, в хромосому клетки млекопитающего, и
(C) этап суспензионного культивирования суспензионной клетки млекопитающего, которая экспрессирует интересующий белок, полученной на этапе (В), для получения интересующего белка, где суспензионная клетка млекопитающего представляет собой суспензионную клетку СНО, которая способна выживать и пролиферировать в бессывороточной среде, и где пара транспозонных последовательностей представляет собой нуклеотидные последовательности, полученные из пары транспозонов Tol1, или нуклеотидные последовательности, полученные из пары транспозонов Tol2.
3. Способ получения суспензионной клетки млекопитающего, которая экспрессирует интересующий белок, включающий введение по меньшей мере одного экспрессионного вектора, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, в суспензионную клетку млекопитающего и интеграцию генного фрагмента, вставленного между парой транспозонных последовательностей, в хромосому клетки млекопитающего,
где суспензионная клетка млекопитающего представляет собой суспензионную клетку СНО, которая способна выживать и пролиферировать в бессывороточной среде, и где пара транспозонных последовательностей представляет собой нуклеотидные последовательности, полученные из пары транспозонов Tol1, или нуклеотидные последовательности, полученные из пары транспозонов Tol2.
где суспензионная клетка млекопитающего представляет собой суспензионную клетку СНО, которая способна выживать и пролиферировать в бессывороточной среде, и где пара транспозонных последовательностей представляет собой нуклеотидные последовательности, полученные из пары транспозонов Tol1, или нуклеотидные последовательности, полученные из пары транспозонов Tol2.
4. Способ по любому одному из пп. 1-3, в котором по меньшей мере один из экспрессионных векторов, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, представляет собой экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, и ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента.
5. Способ по любому одному из пп. 1-3, включающий введение экспрессионного вектора, который содержит генный фрагмент, содержащий селектируемый маркер, и содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, в клетку млекопитающего в дополнение к экспрессионному вектору, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента.
6. Способ по любому одному из пп. 1-3, в котором ДНК, кодирующая интересующий белок, представляет собой ДНК, кодирующую антитело.
7. Способ по п. 6, в котором ДНК, кодирующая антитело, представляет собой по меньшей мере одну из ДНК, кодирующей Н-цепь антитела, и ДНК, кодирующей L-цепь антитела.
8. Способ по любому одному из пп. 1-3, в котором экспрессионный вектор, выбранный из следующих пунктов (а)-(d), вводят в суспензионную клетку млекопитающего:
(a) экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую Н-цепь антитела, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую L-цепь антитела, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента;
(b) экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую Н-цепь антитела, и ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую L-цепь антитела, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента;
(c) экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую L-цепь антитела, и ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую Н-цепь антитела, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и
(d) экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую Н-цепь и L-цепь антитела, и ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента.
(a) экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую Н-цепь антитела, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую L-цепь антитела, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента;
(b) экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую Н-цепь антитела, и ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую L-цепь антитела, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента;
(c) экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую L-цепь антитела, и ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую Н-цепь антитела, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и
(d) экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую Н-цепь и L-цепь антитела, и ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента.
9. Способ по любому одному из пп. 1-3, в котором клетка СНО представляет собой по меньшей мере клетку, выбранную из CHO-K1, CHO-K1SV, DUKXB11, CHO/DG44, Pro-3 и CHO-S.
10. Способ по п. 4, в котором ген селектируемого маркера представляет собой ген устойчивости к циклогексимиду.
11. Способ по п. 10, в котором ген устойчивости к циклогексимиду представляет собой ген, кодирующий мутант человеческого рибосомного белка L36a.
12. Способ по п. 5, в котором ген селектируемого маркера представляет собой ген устойчивости к циклогексимиду.
13. Способ по п. 12, в котором ген устойчивости к циклогексимиду представляет собой ген, кодирующий мутант рибосомного белка L36a человека.
14. Способ по п. 8, в котором ген селектируемого маркера представляет собой ген устойчивости к циклогексимиду.
15. Способ по п. 14, в котором ген устойчивости к циклогексимиду представляет собой ген, кодирующий мутант рибосомного белка L36a человека.
16. Способ по любому одному из пп. 1-3, в котором нуклеотидные последовательности, полученные из пары транспозонов Tol2, представляют собой нуклеотидную последовательность, содержащую нуклеотидную последовательность, приведенную в SEQ ID NO: 2, и нуклеотидную последовательность, приведенную в SEQ ID NO: 3.
17. Способ по любому одному из пп. 1-3, в котором нуклеотидные последовательности, полученные из пары транспозонов Tol1, представляют собой нуклеотидную последовательность, приведенную в SEQ ID NO: 14, и нуклеотидную последовательность, приведенную в SEQ ID NO: 15.
18. Суспензионная клетка млекопитающего, продуцирующая интересующий белок, которая имеет хромосому, в которую интегрирован генный фрагмент, вставленный между парой транспозонов, и которая продуцирует интересующий белок, получаемый путем одновременного введения по меньшей мере одного экспрессионного вектора (а), который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и экспрессионного вектора (b), который содержит ДНК, кодирующую транспозазу (трансферазу), способную узнавать транспозонные последовательности и обладающую способностью переносить генный фрагмент, вставленный между парой транспозонных последовательностей, в хромосому, где суспензионная клетка млекопитающего представляет собой суспензионную клетку СНО, которая способна выживать и пролиферировать в бессывороточной среде, и где пара транспозонных последовательностей представляет собой нуклеотидные последовательности, полученные из пары транспозонов Tol1, или нуклеотидные последовательности, полученные из пары транспозонов Tol2.
19. Клетка млекопитающего по п. 18, в которой по меньшей мере один из экспрессионного вектора (а), который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, представляет собой экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, и ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента.
20. Клетка млекопитающего по п. 18, которая представляет собой клетку, полученную в результате дополнительного введения экспрессионного вектора (с), который содержит генный фрагмент, содержащий ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, в дополнение к экспрессионным векторам (а) и (b).
21. Клетка млекопитающего по любому одному из пп. 18-20, в которой ДНК, кодирующая интересующий белок, представляет собой ДНК, кодирующую антитело.
22. Клетка млекопитающего по п. 21, в которой ДНК, кодирующая антитело, представляет собой по меньшей мере одну из ДНК, кодирующей Н-цепь антитела, и ДНК, кодирующей L-цепь антитела.
23. Клетка млекопитающего по любому одному из пп. 18-20, в которую введен экспрессионный вектор, выбранный из следующих пунктов (а)-(d):
(a) экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую Н-цепь антитела, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую L-цепь антитела, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента;
(b) экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую Н-цепь антитела, и ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую L-цепь антитела, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента;
(c) экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую L-цепь антитела, и ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую Н-цепь антитела, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и
(d) экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую Н-цепь и L-цепь антитела, и ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента.
(a) экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую Н-цепь антитела, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую L-цепь антитела, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента;
(b) экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую Н-цепь антитела, и ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую L-цепь антитела, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента;
(c) экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую L-цепь антитела, и ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую Н-цепь антитела, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, и
(d) экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую Н-цепь и L-цепь антитела, и ген селектируемого маркера, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента.
24. Клетка млекопитающего по любому одному из пп. 18-20, при этом клетка СНО представляет собой любую клетку, выбранную из СНО-K1, CHO-K1SV, DUKXB11, CHO/DG44, Pro-3 и CHO-S.
25. Клетка млекопитающего по п. 19 или 20, в которой ген селектируемого маркера представляет собой ген устойчивости к циклогексимиду.
26. Клетка млекопитающего по п. 25, в которой ген устойчивости к циклогексимиду представляет собой ген, кодирующий мутант человеческого рибосомного белка L36a.
27. Клетка млекопитающего по п. 18, в которой нуклеотидные последовательности, полученные из пары транспозонов Tol2, представляют собой нуклеотидную последовательность, приведенную в SEQ ID NO: 2, и нуклеотидную последовательность, приведенную в SEQ ID NO: 3.
28. Клетка млекопитающего по п. 18, в которой нуклеотидные последовательности, полученные из пары транспозонов Tol1, представляют собой нуклеотидную последовательность, приведенную в SEQ ID NO: 14, и нуклеотидную последовательность, приведенную в SEQ ID NO: 15.
29. Экспрессионный вектор, который содержит генный фрагмент, содержащий ДНК, кодирующую интересующий белок, и также содержит пару транспозонных последовательностей на обоих концах генного фрагмента, где пара транспозонных последовательностей представляет собой нуклеотидные последовательности, полученные из пары транспозонов Tol1, или нуклеотидные последовательности, полученные из пары транспозонов Tol2.
30. Экспрессионный вектор для белка по п. 29, в котором нуклеотидные последовательности, полученные из пары транспозонов Tol2, представляют собой нуклеотидную последовательность, приведенную в SEQ ID NO: 2, и нуклеотидную последовательность, приведенную в SEQ ID NO: 3.
31. Экспрессионный вектор по п. 29, в котором нуклеотидные последовательности, полученные из пары транспозонов Tol1, представляют собой нуклеотидную последовательность, приведенную в SEQ ID NO: 14, и нуклеотидную последовательность, приведенную в SEQ ID NO: 15.
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2010279849 | 2010-12-15 | ||
JP2010-279849 | 2010-12-15 | ||
PCT/JP2011/078935 WO2012081628A1 (ja) | 2010-12-15 | 2011-12-14 | タンパク質の生産方法 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2013132448A RU2013132448A (ru) | 2015-01-20 |
RU2598255C2 true RU2598255C2 (ru) | 2016-09-20 |
Family
ID=46244724
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2013132448/10A RU2598255C2 (ru) | 2010-12-15 | 2011-12-14 | Способ получения белка |
Country Status (16)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US9102971B2 (ru) |
EP (1) | EP2653540B9 (ru) |
JP (1) | JP6087148B2 (ru) |
KR (1) | KR102058658B1 (ru) |
CN (2) | CN107312796A (ru) |
AU (1) | AU2011342161C1 (ru) |
BR (1) | BR112013014949B1 (ru) |
CA (1) | CA2820151C (ru) |
DK (1) | DK2653540T3 (ru) |
ES (1) | ES2661981T3 (ru) |
PT (1) | PT2653540T (ru) |
RU (1) | RU2598255C2 (ru) |
SG (2) | SG191124A1 (ru) |
TR (1) | TR201802431T4 (ru) |
TW (1) | TWI617664B (ru) |
WO (1) | WO2012081628A1 (ru) |
Families Citing this family (8)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
AU2011342162B2 (en) | 2010-12-15 | 2017-04-20 | Kyowa Kirin Co., Ltd. | Method for producing proteins |
KR102280111B1 (ko) * | 2011-12-22 | 2021-07-21 | 에프. 호프만-라 로슈 아게 | 발현 벡터 구성, 신규한 생산 세포 생성 방법 및 폴리펩티드의 재조합 생산을 위한 그의 용도 |
DK2692865T3 (en) * | 2012-07-30 | 2015-02-16 | Nbe Therapeutics Llc | Transponeringsmedieret identification of specific binding proteins, or functional |
JP6871679B2 (ja) * | 2016-03-23 | 2021-05-12 | 国立大学法人 岡山大学 | 遺伝子発現用カセット及びその産生物 |
US10960721B2 (en) * | 2018-06-26 | 2021-03-30 | Ford Global Technologies, Llc | System for detection and response to retreating trailer |
BR112022004590A2 (pt) | 2019-09-13 | 2022-06-14 | Kyowa Kirin Co Ltd | Variante dcr3 |
KR102586165B1 (ko) * | 2019-10-02 | 2023-10-10 | 아주대학교산학협력단 | 생체 조직 접착성 및 결합력이 증가된 조직 유합제 조성물 및 이의 제조방법 |
CN112480236B (zh) * | 2020-12-16 | 2022-03-29 | 熊猫乳品集团股份有限公司 | 一种生物活性肽lecvepncrskr及其制备方法和应用 |
Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2003102191A1 (en) * | 2002-05-31 | 2003-12-11 | The Secretary Of State For Defence | Immunogenic sequences |
US20100129914A1 (en) * | 2006-12-13 | 2010-05-27 | National University Corporation Nagoya University | Tol1 FACTOR TRANSPOSASE AND DNA INTRODUCTION SYSTEM USING THE SAME |
Family Cites Families (34)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5720937A (en) | 1988-01-12 | 1998-02-24 | Genentech, Inc. | In vivo tumor detection assay |
US5736137A (en) | 1992-11-13 | 1998-04-07 | Idec Pharmaceuticals Corporation | Therapeutic application of chimeric and radiolabeled antibodies to human B lymphocyte restricted differentiation antigen for treatment of B cell lymphoma |
IL117645A (en) | 1995-03-30 | 2005-08-31 | Genentech Inc | Vascular endothelial cell growth factor antagonists for use as medicaments in the treatment of age-related macular degeneration |
US5686292A (en) | 1995-06-02 | 1997-11-11 | Genentech, Inc. | Hepatocyte growth factor receptor antagonist antibodies and uses thereof |
US5667786A (en) | 1995-06-07 | 1997-09-16 | Novavax, Inc. | Method for treating tumors with a toxin |
JPH10299A (ja) | 1996-06-18 | 1998-01-06 | Matsushita Electric Ind Co Ltd | 誘導加熱式アイロン装置 |
JP2001511653A (ja) | 1997-05-15 | 2001-08-14 | ジェネンテク,インコーポレイテッド | Apo−2レセプター |
US6528624B1 (en) | 1998-04-02 | 2003-03-04 | Genentech, Inc. | Polypeptide variants |
US6737056B1 (en) | 1999-01-15 | 2004-05-18 | Genentech, Inc. | Polypeptide variants with altered effector function |
DK2270150T4 (da) | 1999-04-09 | 2019-08-26 | Kyowa Hakko Kirin Co Ltd | Fremgangsmåde til at kontrollere aktiviteten af immunologisk funktionelt molekyle. |
WO2000065042A1 (en) * | 1999-04-28 | 2000-11-02 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | P element derived vector and methods for its use |
GB9924721D0 (en) | 1999-10-19 | 1999-12-22 | Craig Roger | Protein production system |
ATE299944T1 (de) * | 1999-10-19 | 2005-08-15 | Minos Biosystems Ltd | System zur herstellung von proteinen |
EP1272647B1 (en) | 2000-04-11 | 2014-11-12 | Genentech, Inc. | Multivalent antibodies and uses therefor |
US6946292B2 (en) * | 2000-10-06 | 2005-09-20 | Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd. | Cells producing antibody compositions with increased antibody dependent cytotoxic activity |
EP2314686B2 (en) | 2000-10-06 | 2023-06-21 | Kyowa Kirin Co., Ltd. | Cells producing antibody compositions |
JP4817514B2 (ja) * | 2001-03-09 | 2011-11-16 | 協和発酵キリン株式会社 | 新規動物細胞用ベクターおよびその使用 |
JP4364474B2 (ja) * | 2002-02-15 | 2009-11-18 | 大学共同利用機関法人情報・システム研究機構 | 哺乳動物において機能的なトランスポゾン |
US7317091B2 (en) | 2002-03-01 | 2008-01-08 | Xencor, Inc. | Optimized Fc variants |
WO2004009792A2 (en) * | 2002-07-24 | 2004-01-29 | Vanderbilt University | Transposon-based vectors and methods of nucleic acid integration |
US20080241884A1 (en) | 2003-10-08 | 2008-10-02 | Kenya Shitara | Fused Protein Composition |
DK1680140T3 (da) | 2003-10-16 | 2011-06-14 | Imclone Llc | Fibrolast-vækstfaktorreceptor-1-inhibitorer og fremgangsmåde til behandling deraf |
WO2006055931A2 (en) * | 2004-11-18 | 2006-05-26 | Stratatech Corporation | Vectors for stable gene expression |
JP4881874B2 (ja) | 2004-12-06 | 2012-02-22 | 協和発酵キリン株式会社 | インフルエンザm2タンパク質に対するヒトモノクローナル抗体及びその生産方法及びその使用 |
US7923538B2 (en) | 2005-07-22 | 2011-04-12 | Kyowa Hakko Kirin Co., Ltd | Recombinant antibody composition |
US7612181B2 (en) | 2005-08-19 | 2009-11-03 | Abbott Laboratories | Dual variable domain immunoglobulin and uses thereof |
AR056857A1 (es) | 2005-12-30 | 2007-10-24 | U3 Pharma Ag | Anticuerpos dirigidos hacia her-3 (receptor del factor de crecimiento epidérmico humano-3) y sus usos |
WO2007082164A2 (en) | 2006-01-05 | 2007-07-19 | The Johns Hopkins University | Methods for identifying functional noncoding sequences |
TWI390034B (zh) | 2006-04-06 | 2013-03-21 | Kyowa Hakko Kirin Co Ltd | Novel anti-CD98 antibody |
EP2281845B1 (en) | 2008-04-25 | 2020-09-02 | Kyowa Kirin Co., Ltd. | Stable polyvalent antibody |
CN103172735B (zh) | 2008-07-17 | 2014-12-10 | 协和发酵麒麟株式会社 | 抗-系统asc氨基酸转运蛋白2(asct2)抗体 |
US9150880B2 (en) * | 2008-09-25 | 2015-10-06 | Proteovec Holding, L.L.C. | Vectors for production of antibodies |
US20100311116A1 (en) * | 2009-06-04 | 2010-12-09 | Excellgene Sa | Fast generation of high expression stable cell lines expressing recombinant proteins under minimal and short-term selective pressure |
CA2765242C (en) * | 2009-06-11 | 2019-08-27 | Inter-University Research Institute Corporation Research Organization Of Information And Systems | Method for producing proteins comprising introducing tol1 or tol2 transposons into suspension cho cells |
-
2011
- 2011-12-14 TR TR2018/02431T patent/TR201802431T4/tr unknown
- 2011-12-14 CA CA2820151A patent/CA2820151C/en active Active
- 2011-12-14 CN CN201710220003.XA patent/CN107312796A/zh active Pending
- 2011-12-14 BR BR112013014949-3A patent/BR112013014949B1/pt active IP Right Grant
- 2011-12-14 AU AU2011342161A patent/AU2011342161C1/en active Active
- 2011-12-14 ES ES11848424.5T patent/ES2661981T3/es active Active
- 2011-12-14 KR KR1020137015380A patent/KR102058658B1/ko active IP Right Grant
- 2011-12-14 EP EP11848424.5A patent/EP2653540B9/en active Active
- 2011-12-14 CN CN2011800608327A patent/CN103261414A/zh active Pending
- 2011-12-14 SG SG2013045265A patent/SG191124A1/en unknown
- 2011-12-14 WO PCT/JP2011/078935 patent/WO2012081628A1/ja unknown
- 2011-12-14 PT PT118484245T patent/PT2653540T/pt unknown
- 2011-12-14 SG SG10201602874VA patent/SG10201602874VA/en unknown
- 2011-12-14 RU RU2013132448/10A patent/RU2598255C2/ru active
- 2011-12-14 JP JP2012548816A patent/JP6087148B2/ja active Active
- 2011-12-14 DK DK11848424.5T patent/DK2653540T3/en active
- 2011-12-15 US US13/326,873 patent/US9102971B2/en active Active
- 2011-12-15 TW TW100146605A patent/TWI617664B/zh active
Patent Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2003102191A1 (en) * | 2002-05-31 | 2003-12-11 | The Secretary Of State For Defence | Immunogenic sequences |
RU2004137800A (ru) * | 2002-05-31 | 2005-10-27 | Государственный Секретарь по Обороне (Великобритани ) (GB) | Иммуногенные последовательности |
US20100129914A1 (en) * | 2006-12-13 | 2010-05-27 | National University Corporation Nagoya University | Tol1 FACTOR TRANSPOSASE AND DNA INTRODUCTION SYSTEM USING THE SAME |
Non-Patent Citations (2)
Title |
---|
PARK CW, DNA methylation of Sleeping Beauty with transposition into the mouse genome, Genes Cells 2005, 10(8), реф. ZHONG B, Comparison of transformation efficiency of piggyBac transposon among three different silkworm Bombyx mori strains, Acta Biochim Biophys Sin, 2007, 39(2), реф. * |
SUMIYAMA K, A simple and hihly efficient transgenesis method in mice with the Tol2 transposon system and cytoplasmic microinjection, Genomics, 22.02.2010, 95(2010) 306-311. * |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CA2820151A1 (en) | 2012-06-21 |
KR20140012035A (ko) | 2014-01-29 |
SG191124A1 (en) | 2013-07-31 |
CN103261414A (zh) | 2013-08-21 |
WO2012081628A1 (ja) | 2012-06-21 |
ES2661981T3 (es) | 2018-04-04 |
AU2011342161A1 (en) | 2013-05-02 |
JPWO2012081628A1 (ja) | 2014-05-22 |
EP2653540A1 (en) | 2013-10-23 |
EP2653540B1 (en) | 2018-01-24 |
EP2653540A4 (en) | 2014-05-21 |
KR102058658B1 (ko) | 2019-12-24 |
JP6087148B2 (ja) | 2017-03-01 |
PT2653540T (pt) | 2018-02-27 |
TW201231650A (en) | 2012-08-01 |
US20120196327A1 (en) | 2012-08-02 |
DK2653540T3 (en) | 2018-02-05 |
TWI617664B (zh) | 2018-03-11 |
BR112013014949A2 (pt) | 2017-05-30 |
CN107312796A (zh) | 2017-11-03 |
AU2011342161B2 (en) | 2015-09-10 |
AU2011342161C1 (en) | 2016-03-17 |
CA2820151C (en) | 2019-03-26 |
TR201802431T4 (tr) | 2018-03-21 |
EP2653540B9 (en) | 2018-05-16 |
SG10201602874VA (en) | 2016-05-30 |
US9102971B2 (en) | 2015-08-11 |
BR112013014949B1 (pt) | 2021-12-28 |
RU2013132448A (ru) | 2015-01-20 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
RU2598255C2 (ru) | Способ получения белка | |
US10358671B2 (en) | Protein production method | |
US9410176B2 (en) | Method for producing proteins |