RU2346004C2 - Экспонирование т-клеточных рецепторов - Google Patents
Экспонирование т-клеточных рецепторов Download PDFInfo
- Publication number
- RU2346004C2 RU2346004C2 RU2005117971/13A RU2005117971A RU2346004C2 RU 2346004 C2 RU2346004 C2 RU 2346004C2 RU 2005117971/13 A RU2005117971/13 A RU 2005117971/13A RU 2005117971 A RU2005117971 A RU 2005117971A RU 2346004 C2 RU2346004 C2 RU 2346004C2
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- tcr
- polypeptide
- domain
- exon
- dtcr
- Prior art date
Links
Images
Landscapes
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Abstract
Изобретение относится к биотехнологии. Описана фаговая частица, экспонирующая на своей поверхности Т-клеточный рецептор (TCR), представляющий собой scTCR человека. Экспонированная полипептидная пара dTCR или экспонированный полипептид scTCR включает последовательности α и β цепей внеклеточного константного Ig домена нативного TCR, а дисульфидная связь связывает аминокислотные остатки указанных последовательностей цепей константного Ig домена, где указанная дисульфидная связь находится между цистеиновыми остатками. Представлена библиотека полипептидных пар мутированных TCR или полипептидов scTCR, экспонированных на описанной фаговой частице. Представлена нуклеиновая кислота, кодирующая описанную фаговую частицу. Раскрыт способ идентификации TCRs. Изобретение может использоваться для создания разнообразных библиотек TCR для идентификации высокоаффинных TCRs. 7 н. и 10 з.п. ф-лы, 63 ил., 2 табл.
Description
Claims (17)
1. Фаговая частица, экспонирующая на своей поверхности Т-клеточный рецептор (TCR), характеризующаяся тем, что TCR представляет собой scTCR человека, полипептидную пару dTCR человека, или полипептидную пару dTCR не человека, а также характеризующаяся тем, что экспонированная полипептидная пара dTCR или экспонированный полипептид scTCR включает последовательности α и β цепей внеклеточного константного Ig домена нативного TCR, а дисульфидная связь связывает аминокислотные остатки указанных последовательностей цепей константного Ig домена, где указанная дисульфидная связь находится между цистеиновыми остатками, на которые замещены
Thr 48 экзона 1 TRAC*01 и Ser 57 экзона 1 TRBC1*01 или TRBC2*01, или Thr 45 экзона 1 TRAC*01 и Ser 77 экзона 1 TRBC1*01 или TRBC2*01, или Tyr 10 экзона 1 TRAC*01 и Ser 17 экзона 1 TRB1*P01 или TRBC2*01, или Thr 45 экзона 1 TRAC*01 и Asp 59 экзона 1 TRBC1*01 или TRBC2*01, или Ser 15 экзона 1 TRAC*01 и Glu 15 экзона 1 TRBC1*01 или TRBC2*01, или их эквиваленты нечеловеческого происхождения.
Thr 48 экзона 1 TRAC*01 и Ser 57 экзона 1 TRBC1*01 или TRBC2*01, или Thr 45 экзона 1 TRAC*01 и Ser 77 экзона 1 TRBC1*01 или TRBC2*01, или Tyr 10 экзона 1 TRAC*01 и Ser 17 экзона 1 TRB1*P01 или TRBC2*01, или Thr 45 экзона 1 TRAC*01 и Asp 59 экзона 1 TRBC1*01 или TRBC2*01, или Ser 15 экзона 1 TRAC*01 и Glu 15 экзона 1 TRBC1*01 или TRBC2*01, или их эквиваленты нечеловеческого происхождения.
2. Фаговая частица по п.1, у которой или
а) С-конец одного составляющего полипептидной пары dTCR или С-конец scTCR полипептида связан пептидной связью с остатком, экспонированным на поверхности фаговой частицы, или
б) С-конец одного составляющего полипептидной пары dTCR или С-конец scTCR полипептида связан дисульфидной связью с цистеиновым остатком, экспонированным на поверхности фаговой частицы.
а) С-конец одного составляющего полипептидной пары dTCR или С-конец scTCR полипептида связан пептидной связью с остатком, экспонированным на поверхности фаговой частицы, или
б) С-конец одного составляющего полипептидной пары dTCR или С-конец scTCR полипептида связан дисульфидной связью с цистеиновым остатком, экспонированным на поверхности фаговой частицы.
3. Фаговая частица по п.1, экспонирующая на своей поверхности полипептидную пару dTCR, которая включает:
первый полипептид, в котором последовательность α или β цепи вариабельного домена TCR слита с N-концом последовательности а цепи внеклеточного константного домена TCR, и
второй полипептид, в котором последовательность α или β цепи вариабельного домена TCR, слита с N-концом последовательности β цепи внеклеточного константного домена TCR.
первый полипептид, в котором последовательность α или β цепи вариабельного домена TCR слита с N-концом последовательности а цепи внеклеточного константного домена TCR, и
второй полипептид, в котором последовательность α или β цепи вариабельного домена TCR, слита с N-концом последовательности β цепи внеклеточного константного домена TCR.
4. Фаговая частица по п.1, где последовательности α и β цепей внеклеточного константного Ig домена нативного TCR усечены на своих С-концах, соответствующих таковым нативных последовательностей, таким образом, что цистеиновые остатки, формирующие нативную межцепочечную дисульфидную связь, исключаются.
5. Фаговая частица по п.2, где последовательности α и β цепей внеклеточного константного Ig домена нативного TCR усечены на своих С-концах, соответствующих таковым нативных последовательностей, таким образом, что цистеиновые остатки, формирующие нативную межцепочечную дисульфидную связь, исключаются.
6. Фаговая частица по п.3, где последовательности α и β цепей внеклеточного константного Ig домена нативного TCR усечены на своих С-концах, соответствующих таковым нативных последовательностей, таким образом, что цистеиновые остатки, формирующие нативную межцепочечную дисульфидную связь, исключаются.
7. Фаговая частица по п.1, где в последовательностях цепей внеклеточного константного Ig домена нативного TCR цистеиновые остатки, формирующие нативную межцепочечную дисульфидную связь, замещены нецистеиновыми остатками.
8. Фаговая частица по п.1, которая представляет собой нитевидную фаговую частицу, экспонирующую на своей поверхности димерную полипептидную пару Т-клеточного рецептора (dTCR), причем указанная пара включает:
первый полипептид, в котором последовательность α цепи вариабельного домена TCR слита с N-концом последовательности α цепи внеклеточного константного домена TCR, и второй полипептид, в котором последовательность β цепи вариабельного домена TCR слита с N-концом последовательности β цепи внеклеточного константного домена TCR, причем первый и второй полипептиды связаны дисульфидной связью, находящейся между цистеиновыми остатками, на которые замещены Thr 48 экзона 1 TRAC*01 и Ser 57 экзона 1 TRBC1*01 или TRBC2*01, или их эквиваленты нечеловеческого происхождения, а С-конец одного составляющего полипептидной пары dTCR связан пептидной связью с белком оболочки фага.
первый полипептид, в котором последовательность α цепи вариабельного домена TCR слита с N-концом последовательности α цепи внеклеточного константного домена TCR, и второй полипептид, в котором последовательность β цепи вариабельного домена TCR слита с N-концом последовательности β цепи внеклеточного константного домена TCR, причем первый и второй полипептиды связаны дисульфидной связью, находящейся между цистеиновыми остатками, на которые замещены Thr 48 экзона 1 TRAC*01 и Ser 57 экзона 1 TRBC1*01 или TRBC2*01, или их эквиваленты нечеловеческого происхождения, а С-конец одного составляющего полипептидной пары dTCR связан пептидной связью с белком оболочки фага.
9. Фаговая частица по п.1, которая представляет собой нитевидную фаговую частицу, экспонирующую на своей поверхности димерную полипептидную пару Т-клеточного рецептора (dTCR), причем указанная пара включает:
первый полипептид, в котором последовательность α цепи вариабельного домена TCR слита с N-концом последовательности α цепи внеклеточного константного домена TCR, и второй полипептид, в котором последовательность β цепи вариабельного домена TCR слита с N-концом последовательности β цепи внеклеточного константного домена TCR, причем первый и второй полипептиды связаны дисульфидной связью, находящейся между цистеиновыми остатками, на которые замещены Thr 48 экзона 1 TRAC*01 и Ser 57 экзона 1 TRBC1*01 или TRBC2*01, или их эквиваленты нечеловеческого происхождения, а С-конец одного составляющего полипептидной пары dTCR связан пептидной связью с белком оболочки фага, и где последовательности α и β цепей внеклеточного константного Ig домена нативного TCR усечены на своих С-концах, соответствующих таковым нативных последовательностей, таким образом, что цистеиновые остатки, формирующие нативную межцепочечную дисульфидную связь, исключаются.
первый полипептид, в котором последовательность α цепи вариабельного домена TCR слита с N-концом последовательности α цепи внеклеточного константного домена TCR, и второй полипептид, в котором последовательность β цепи вариабельного домена TCR слита с N-концом последовательности β цепи внеклеточного константного домена TCR, причем первый и второй полипептиды связаны дисульфидной связью, находящейся между цистеиновыми остатками, на которые замещены Thr 48 экзона 1 TRAC*01 и Ser 57 экзона 1 TRBC1*01 или TRBC2*01, или их эквиваленты нечеловеческого происхождения, а С-конец одного составляющего полипептидной пары dTCR связан пептидной связью с белком оболочки фага, и где последовательности α и β цепей внеклеточного константного Ig домена нативного TCR усечены на своих С-концах, соответствующих таковым нативных последовательностей, таким образом, что цистеиновые остатки, формирующие нативную межцепочечную дисульфидную связь, исключаются.
10. Библиотека полипептидных пар мутированных TCR или полипептидов scTCR, экспонированных на фаговых частицах по п.1.
11. Библиотека полипептидных пар мутированных dTCR, экспонированных на фаговых частицах dTCR по п.8.
11. Библиотека мутированных TCRs по п.10 или 11, в которой различия находятся в вариабельном домене или доменах dTCR или полипептидов scTCR.
12. Нуклеиновая кислота, кодирующая фаговую частицу по п.1.
13. Нуклеиновая кислота, кодирующая фаговую частицу по п.8.
15. Способ идентификации TCRs с характеристиками, выбираемыми из (i) усиленной экспрессируемости и/или усиленных характеристик (ii) связывания и/или (iii) стабильности, причем указанный способ заключается в том, что библиотека по п.10 подвергается: процессу отбора по указанным характеристикам с выделением фаговых частиц, экспонирующих TCR с указанными характеристиками, и, необязательно, амплификацией для увеличения количества выделенных частиц и/или процессу скрининга, который измеряет указанные характеристики, идентифицируя те фаговые частицы, которые экспонируют TCR с желаемыми характеристиками, и выделяя эти фаговые частицы и, необязательно, амплификацией для увеличения количества выделенных частиц.
16. Способ идентификации TCRs с характеристиками, выбираемыми из (i) усиленной экспрессируемости и/или усиленных характеристик (ii) связывания и/или (iii) стабильности, причем указанный способ заключается в том, что библиотека по п.11 подвергается: процессу отбора по указанным характеристикам, и выделением фаговых частиц, экспонирующих TCR с указанными характеристиками, и, необязательно, амплификацией для увеличения количества выделенных частиц и/или процессу скрининга, который измеряет указанные характеристики, идентифицируя те фаговые частицы, которые экспонируют TCR с желаемыми характеристиками, и выделяя эти фаговые частицы и, необязательно, амплификацией для увеличения количества выделенных частиц.
17. Способ по п.15 или 16, в котором усиленной характеристикой является повышенная аффинность к TCR лиганду.
Applications Claiming Priority (10)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
GB0226227.7 | 2002-11-09 | ||
GB0226227A GB0226227D0 (en) | 2002-11-09 | 2002-11-09 | Receptors |
GB0301814.0 | 2003-01-25 | ||
GB0301814A GB0301814D0 (en) | 2003-01-25 | 2003-01-25 | Substances |
GB0304067.2 | 2003-02-22 | ||
US46304603P | 2003-04-16 | 2003-04-16 | |
US60/463,046 | 2003-04-16 | ||
GB0311397.4 | 2003-05-16 | ||
GB0316356A GB0316356D0 (en) | 2003-07-11 | 2003-07-11 | Substances |
GB0316356.5 | 2003-07-11 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2005117971A RU2005117971A (ru) | 2006-03-20 |
RU2346004C2 true RU2346004C2 (ru) | 2009-02-10 |
Family
ID=36117097
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2005117971/13A RU2346004C2 (ru) | 2002-11-09 | 2003-10-30 | Экспонирование т-клеточных рецепторов |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
RU (1) | RU2346004C2 (ru) |
Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2678421C2 (ru) * | 2013-06-28 | 2019-01-28 | Экс-Боди, Инк. | Обнаружение антигена-мишени, фенотипический скрининг и его применение для идентификации специфичных эпитопов-мишеней клеток-мишеней |
RU2777769C2 (ru) * | 2013-06-28 | 2022-08-09 | Экс-Боди, Инк. | Обнаружение антигена-мишени, фенотипический скрининг и его применение для идентификации специфичных эпитопов-мишеней клеток-мишеней |
-
2003
- 2003-10-30 RU RU2005117971/13A patent/RU2346004C2/ru active
Cited By (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2678421C2 (ru) * | 2013-06-28 | 2019-01-28 | Экс-Боди, Инк. | Обнаружение антигена-мишени, фенотипический скрининг и его применение для идентификации специфичных эпитопов-мишеней клеток-мишеней |
US10370651B2 (en) | 2013-06-28 | 2019-08-06 | X-Body, Inc. | Target antigen discovery, phenotypic screens and use thereof for identification of target cell specific target epitopes |
RU2777769C2 (ru) * | 2013-06-28 | 2022-08-09 | Экс-Боди, Инк. | Обнаружение антигена-мишени, фенотипический скрининг и его применение для идентификации специфичных эпитопов-мишеней клеток-мишеней |
US11414784B2 (en) | 2013-06-28 | 2022-08-16 | X-Body, Inc. | Target antigen discovery, phenotypic screens and use thereof for identification of target cell specific target epitopes |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
RU2005117971A (ru) | 2006-03-20 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Zacharias et al. | Partitioning of lipid-modified monomeric GFPs into membrane microdomains of live cells | |
ATE253111T1 (de) | Für den capsaicin rezeptor kodierende nukleinsäuresequenzen und dem capsaicin rezeptor ähnliche polypeptide und ihre verwendung | |
JP2006525790A5 (ru) | ||
JP2008506960A5 (ru) | ||
ATE164395T1 (de) | Verfahren zur anreicherung von proteinvarianten mit geänderten bindungseigenschaften | |
ATE282631T1 (de) | Sh3-bindender peptide von cortactin und deren verwendung | |
DK1012274T3 (da) | Dödsdomæneholdig receptor-4 (DR4: dödsreceptor 4), medlem af TNF-receptorsuperfamilien og som binder til TRAIL (Apo-2L) | |
CA2265912A1 (en) | Human bad polypeptides, encoding nucleic acids and methods of use | |
RU2007106050A (ru) | Способ структурной характеристики рекомбинантного поликлонального белка или поликлональной клеточной линии | |
DK1133565T3 (da) | Generering af specifikke bindingspartnere til (poly)peptider, som der kodes for af genomiske DNA-fragmenter eller EST'er | |
IS8016A (is) | Prótín sem bindast viðtaka NOGO | |
DK2020604T3 (da) | Ligand for den G-proteinkoblede receptor FPRL2 | |
ATE335818T1 (de) | Ligand polypeptide für hypophyse g-protein gekoppeltes rezeptor-protein, deren herstellung und anwendung | |
Durek et al. | Interaction of synthetic human SLURP-1 with the nicotinic acetylcholine receptors | |
AR029642A1 (es) | Una molecula de adn aislada que codifica un ligando denominado fhm que pertenece a la familia de supergenes de ligandos de tnf, polipeptidos de fhm, anticuerpos que conjugan fhm, materiales que integran dicha molecula y metodos de uso de dichas moleculas, metodos y compuestos farmaceuticos, metodos | |
DE69834643D1 (de) | Adipozyten-spezifische protein homologe | |
ATE311443T1 (de) | Methoden zur durchforstung (screenen) von proteinen | |
RU2346004C2 (ru) | Экспонирование т-клеточных рецепторов | |
Fietzek et al. | The covalent structure of collagen: Amino acid sequence of the N-terminal region of a2-CB5 from rat skin collagen | |
Milstein et al. | Studies on the variability of immunoglobulin sequence | |
PT97355A (pt) | Processo para a preparacao de polipeptidos recombinantes contendo uma sequencia de aminoacidos de uma proteina de celulas | |
DE69535921D1 (de) | Alk-7 (aktivin-rezeptor-ähnliche kinase), ein serin/threonin kinase rezeptor | |
KR930701487A (ko) | 식물성 독소 겔로닌의 단백질 구조물 | |
ATE196775T1 (de) | Gereinigte flt3 liganden von saeugentieren, agonisten und antagonisten davon | |
DE69417223D1 (de) | Ein menschlicher t-zell rezeptor der protein g-gekoppelte rezeptor familie |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PC41 | Official registration of the transfer of exclusive right |
Effective date: 20140423 |