RU2312941C2 - Антигенные пептиды - Google Patents

Антигенные пептиды Download PDF

Info

Publication number
RU2312941C2
RU2312941C2 RU2005108567/04A RU2005108567A RU2312941C2 RU 2312941 C2 RU2312941 C2 RU 2312941C2 RU 2005108567/04 A RU2005108567/04 A RU 2005108567/04A RU 2005108567 A RU2005108567 A RU 2005108567A RU 2312941 C2 RU2312941 C2 RU 2312941C2
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
amino acid
denotes
sign
peptide
family
Prior art date
Application number
RU2005108567/04A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2005108567A (ru
Inventor
Амир Закиевич Максютов (RU)
Амир Закиевич Максютов
Александр Борисович Рыжиков (RU)
Александр Борисович Рыжиков
Александр Александрович Колобов (RU)
Александр Александрович Колобов
Заки Амирович Максютов (RU)
Заки Амирович Максютов
Original Assignee
Федеральное государственное учреждение науки "Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (ФГУН ГНЦ ВБ "Вектор"Роспотребнадзора)
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Priority claimed from RU2002126396/13A external-priority patent/RU2237065C2/ru
Application filed by Федеральное государственное учреждение науки "Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (ФГУН ГНЦ ВБ "Вектор"Роспотребнадзора) filed Critical Федеральное государственное учреждение науки "Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (ФГУН ГНЦ ВБ "Вектор"Роспотребнадзора)
Priority to RU2005108567/04A priority Critical patent/RU2312941C2/ru
Publication of RU2005108567A publication Critical patent/RU2005108567A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2312941C2 publication Critical patent/RU2312941C2/ru

Links

Images

Classifications

    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02ATECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
    • Y02A50/00TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
    • Y02A50/30Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change

Landscapes

  • Peptides Or Proteins (AREA)

Abstract

Изобретение относится к новым способам производства семейства антигенных пептидов, обладающих антивирусным действием, а также к пептидным библиотекам, полученным с использованием указанных способов, и композициям на их основе. Способ производства антигенных пептидов включает выявление множества вариабельных позиций в участке белка патогенного организма; выбор пептидной последовательности белка патогенного организма, включающей множество вариабельных позиций; подбор одного или более замещающих аминокислотных остатков для одной из вариабельных позиций или последовательностей, обладающих антигенным сходством с аминокислотными остатками в вариабельной позиции данного белка в естественных условиях, с помощью матрицы антигенного сходства аминокислот, показывающей возможность замены одного аминокислотного остатка другим с сохранением взаимодействия антитела с антигеном, скорректированный в соответствии с частотами аминокислот в гипервариабельных участках; включение подобранных замещающих аминокислотных остатков в пептидную последовательность; синтез семейства антигенных пептидов. Изобретение также относится к способу вызова иммунного ответа и способу диагностики ВИЧ-инфекции с использованием семейства пептидов, полученных согласно способам изобретения. 12 н. и 221 з.п. ф-лы, 43 табл., 1 ил.

Description

Текст описания приведен в факсимильном виде.
Figure 00000001
Figure 00000002
Figure 00000003
Figure 00000004
Figure 00000005
Figure 00000006
Figure 00000007
Figure 00000008
Figure 00000009
Figure 00000010
Figure 00000011
Figure 00000012
Figure 00000013
Figure 00000014
Figure 00000015
Figure 00000016
Figure 00000017
Figure 00000018
Figure 00000019
Figure 00000020
Figure 00000021
Figure 00000022
Figure 00000023
Figure 00000024
Figure 00000025
Figure 00000026
Figure 00000027
Figure 00000028
Figure 00000029
Figure 00000030
Figure 00000031
Figure 00000032
Figure 00000033
Figure 00000034
Figure 00000035
Figure 00000036
Figure 00000037
Figure 00000038
Figure 00000039
Figure 00000040
Figure 00000041
Figure 00000042
Figure 00000043
Figure 00000044
Figure 00000045
Figure 00000046
Figure 00000047
Figure 00000048
Figure 00000049
Figure 00000050
Figure 00000051
Figure 00000052
Figure 00000053
Figure 00000054
Figure 00000055
Figure 00000056
Figure 00000057
Figure 00000058
Figure 00000059

Claims (232)

1. Способ производства семейства антигенных пептидов, обладающих антивирусным действием, включающий:
выявление множества вариабельных позиций в участке белка патогенного организма;
выбор пептидной последовательности белка патогенного организма, включающей множество вариабельных позиций;
подбор одного или более замещающих аминокислотных остатков для одной из вариабельных позиций или последовательностей, обладающих антигенным сходством с аминокислотными остатками в вариабельной позиции данного белка в естественных условиях, с помощью матрицы антигенного сходства аминокислот, показывающей возможность замены одного аминокислотного остатка другим с сохранением взаимодействия антитела с антигеном, скорректированный в соответствии с частотами аминокислот в гипервариабельных участках;
включение подобранных замещающих аминокислотных остатков в пептидную последовательность;
синтез семейства антигенных пептидов.
2. Способ по п.1, отличающийся тем, что подбор одного или более замещающих аминокислотных остатков включает в себя определение частоты встречаемости каждого аминокислотного остатка в семействе антигенных пептидов.
3. Способ по п.1, отличающийся тем, что белок патогенного организма связан с вирусом.
4. Способ по п.3, отличающийся тем, что вирус - это ВИЧ.
5. Способ по п.1, отличающийся тем, что белок патогенного организма - это белок gp 120 ВИЧ.
6. Способ по п.5, отличающийся тем, что участок выбирается из множества, включающего в себя участки V1, V2, V3, V4 и V5.
7. Способ по п.1, включающий в себя определение антигенного сходства между пептидом семейства и участком человеческого белка.
8. Способ по п.7, включающий в себя удаление пептида из семейства антигенных пептидов перед созданием семейства в случае, если выявленное антигенное сходство пептида семейства с участком человеческого белка превышает заданный порог.
9. Способ по п.1, отличающийся тем, что семейство антигенных пептидов включает в себя члены, не встречающиеся в естественных условиях в рассматриваемой позиции, в сумме обладающие антигенным сходством со всеми встречающимися в естественных условиях последовательностями участка белка патогенного организма.
10. Способ по п.1, отличающийся тем, что подбор последовательностей включает в себя идентификацию пептидных последовательностей семейства, рассматриваемых в качестве представителей разнообразия последовательностей семейства в целом.
11. Способ по п.10, отличающийся тем, что идентифицируют менее 500 последовательностей.
12. Способ по п.10, отличающийся тем, что идентификация включает в себя расчет расстояний между пептидными последовательностями семейства.
13. Способ по п.12, отличающийся тем, что расчет расстояний включает в себя использование матрицы антигенного сходства, указанной в п.1.
14. Способ по п.1, отличающийся тем, что создание семейства антигенных пептидов включает в себя химический синтез семейства пептидов.
15. Способ по п.14, отличающийся тем, что химический синтез включает в себя комбинаторный синтез, в ходе которого пептиды формируются в смеси различных последовательностей.
16. Способ по п.14, отличающийся тем, что химический синтез включает в себя параллельный синтез, в ходе которого каждый пептид формируется отдельно от других пептидов.
17. Способ по п.16, включающий в себя смешивание отдельных пептидов.
18. Композиция для создания вакцины для профилактики и терапии вирусных заболеваний, включающая в себя семейство антигенных пептидов, полученных по способу по п.1, в котором каждый антигенный пептид семейства отличается от других антигенных пептидов этого семейства по положению хотя бы одной аминокислоты.
19. Композиция по п.18, отличающаяся тем, что семейство включает в себя более 150 антигенных пептидов.
20. Композиция по п.18, отличающаяся тем, что семейство включает в себя более 1000 антигенных пептидов.
21. Композиция по п.18, отличающаяся тем, что семейство включает в себя менее 100000 антигенных пептидов.
22. Композиция по п.18, отличающаяся тем, что семейство включает в себя менее 50000 антигенных пептидов.
23. Композиция по п.18, отличающаяся тем, что семейство включает в себя от 1000 до 50000 антигенных пептидов.
24. Композиция по п.18, отличающаяся тем, что белок патогенного организма - это белок gp120 ВИЧ.
25. Композиция по п.24, отличающаяся тем, что вариабельный участок выбирается из множества, включающего в себя участок V3.
26. Композиция по п.25, отличающаяся тем, что семейство антигенных пептидов включает в себя последовательности, обладающие антигенным сходством с последовательностями определенного подтипа ВИЧ.
27. Композиция по п.26, отличающаяся тем, что подтип выбирается из множества, включающего в себя подтип А, подтип В, подтип С, подтип D, подтип F, подтип G и их комбинации.
28. Композиция по п.18, отличающаяся тем, что, по меньшей мере, два семейства антигенных пептидов смешаны вместе.
29. Композиция по п.18, отличающаяся тем, что семейство включает в себя множественный антигенный пептид.
30. Пептидная библиотека, включающая в себя семейство пептидов, полученных по способу по п.1, обладающая антигенным сходством с участком V3 белка gp120 ВИЧ подтипов А, В, С, D, F, G формулы
X1-C-X2-R-P-X3-N-N-T-R-X4-X5-X6-X7-X8-G-X9-G-X10-X11-X12-X13-X14-T-G-X15-I-X16-G-X17-I-R-X18-A-X19-C-X20,
где каждый из участков Х120 имеет длину 0, 1, 2 или 3 аминокислотных остатка.
31. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X1 обозначает аминокислоту N, V, Т или Е.
32. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X2 обозначает аминокислоту Т или I.
33. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X3 обозначает аминокислоту N, S, G или Y.
34. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X4 обозначает аминокислоту K, Q или Т.
35. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X5 обозначает аминокислоту S, G или R.
36. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X6 обозначает аминокислоту I, Т или М.
37. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X7 обозначает аминокислоту Н, R, Р, S или N.
38. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X8 обозначает аминокислоту I или М.
39. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X9 обозначает аминокислоту Р или L.
40. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X10 обозначает аминокислоту R или Q.
41. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X11 обозначает аминокислоту А, Т или V.
42. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X12 обозначает аминокислоту F или W.
43. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X13 обозначает аминокислоту Y, F или Н.
44. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X14 обозначает аминокислоту А или Т.
45. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X15 обозначает аминокислоту D, Q, А или R.
46. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X16 обозначает аминокислоту I или Т.
47. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X17 обозначает аминокислоту D или N.
48. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак Х18 обозначает аминокислоту Q или K.
49. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X19 обозначает аминокислоту Н или Y.
50. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак Х20 обозначает аминокислоту N или Т.
51. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X1 обозначает аминокислоту N, V, Т или Е; знак X2 обозначает аминокислоту Т или I; знак X3 обозначает аминокислоту N, S, G или Y; знак X4 обозначает аминокислоту K, Q или Т; знак X5 обозначает аминокислоту S, G или R; знак X6 обозначает аминокислоту I, Т или М; знак X7 обозначает аминокислоту Н, R, Р, S или N; знак Х8 обозначает аминокислоту I или М; знак Х9 обозначает аминокислоту Р или L; знак X10 обозначает аминокислоту R или Q; знак Х11 обозначает аминокислоту А, Т или V; знак Х12 обозначает аминокислоту F или W; знак Х13 обозначает аминокислоту Y, F или Н; знак X14 обозначает аминокислоту А или Т; знак X15 обозначает аминокислоту D, Q, А или R; знак X16 обозначает аминокислоту I или Т; знак X17 обозначает аминокислоту D или N; знак X18 обозначает аминокислоту Q или K; знак X19 обозначает аминокислоту Н или Y; знак Х20 обозначает аминокислоту N или Т.
52. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что, по меньшей мере, два семейства антигенных пептидов смешаны вместе.
53. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что семейство включает в себя более 150 антигенных пептидов.
54. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что семейство включает в себя менее 100000 антигенных пептидов.
55. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что семейство включает в себя менее 500 пептидных последовательностей, рассматриваемых в качестве представителей разнообразия последовательностей семейства в целом.
56. Пептидная библиотека, включающая в себя семейство пептидов, полученных по способу по п.1, обладающая антигенным сходством с участком V3 белка gp120 ВИЧ подтипа А, формулы
X1-C-X2-R-P-X3-N-N-X4-R-X5-X6-V-X7-I-G-P-G-X8-X9-F-X10-X11-X12-X13-X14-I-X15-G-X16-I-R-X17-A-X18-C-X19,
где каждый из участков Х119 имеет длину 0, 1, 2 или 3 аминокислотных остатка.
57. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X1 обозначает аминокислоту N, Т или D.
58. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X2 обозначает аминокислоту Т или I.
59. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X3 обозначает аминокислоту N, G или S.
60. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X4 обозначает аминокислоту Т или K.
61. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X5 обозначает аминокислоту K, Т или Q.
62. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X6 обозначает аминокислоту S, G, R или N.
63. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X7 обозначает аминокислоту R или Н.
64. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак Х8 обозначает аминокислоту Q или R.
65. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X9 обозначает аминокислоту А, Т или V.
66. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X10 обозначает аминокислоту Y, F или Н.
67. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X11 обозначает аминокислоту А или Т.
68. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X12 обозначает аминокислоту Т, R, А или отсутствие остатка.
69. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X13 обозначает аминокислоту G, D или отсутствие остатка.
70. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X14 обозначает аминокислоту D, A, N, R или V.
71. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X15 обозначает аминокислоту I или Т.
72. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X16 обозначает аминокислоту D или N.
73. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X17 обозначает аминокислоту Q, К или Е.
74. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X18 обозначает аминокислоту Н или Y.
75. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X19 обозначает аминокислоту N, Т или Е.
76. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X1 обозначает аминокислоту N, Т или D; знак X2 обозначает аминокислоту Т или I; знак X3 обозначает аминокислоту N, G или S; знак X4 обозначает аминокислоту Т или К; знак X5 обозначает аминокислоту K, Т или Q; знак X6 обозначает аминокислоту S, G, R или N; знак X7 обозначает аминокислоту R или Н; знак X8 обозначает аминокислоту Q или R; знак X9 обозначает аминокислоту А, Т или V; знак X10 обозначает аминокислоту Y, F или Н; знак X11 обозначает аминокислоту А или Т; знак X12 обозначает аминокислоту Т, R, А или отсутствие остатка; знак Х13 обозначает аминокислоту G, D или отсутствие остатка; знак X14 обозначает аминокислоту D, А, N, R или V; знак X15 обозначает аминокислоту I или Т; знак X16 обозначает аминокислоту D или N; знак X17 обозначает аминокислоту Q, К или Е; знак X18 обозначает аминокислоту Н или Y; знак X19 обозначает аминокислоту N, Т или Е.
77. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что, по меньшей мере, два семейства антигенных пептидов смешаны вместе.
78. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что семейство включает в себя более 150 антигенных пептидов.
79. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что семейство включает в себя менее 100000 антигенных пептидов.
80. Пептидная библиотека по п.56(73), отличающаяся тем, что семейство включает в себя менее 500 пептидных последовательностей, рассматриваемых в качестве представителей разнообразия последовательностей семейства в целом.
81. Пептидная библиотека, включающая в себя семейство пептидов, полученных по способу по п.1, обладающая антигенным сходством с участком V3 белка gp120 ВИЧ подтипа В, формулы
X1-C-X2-R-P-X3-N-N-T-R-K-X4-I-X5-X6-G-X7-G-X8-X9-X10-X11-X12-T-X13-X14-I-X15-G-X16-I-R-X17-A-X18-C-X19,
где каждый из участков Х119 имеет длину 0, 1, 2 или 3 аминокислотных остатка.
82. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X1 обозначает аминокислоту N, Т или Н.
83. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак Х2 обозначает аминокислоту Т или I.
84. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X3 обозначает аминокислоту N, S или G.
85. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X4 обозначает аминокислоту S, G или R.
86. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X5 обозначает аминокислоту Н, Р, N, Т или Y.
87. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X6 обозначает аминокислоту I или М.
88. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X7 обозначает аминокислоту Р, L или W.
89. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X8 обозначает аминокислоту R, Q, G или S.
90. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X9 обозначает аминокислоту А, V или Т.
91. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X10 обозначает аминокислоту F, W или V.
92. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак Х11 обозначает аминокислоту Y, F или Н.
93. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X12 обозначает аминокислоту Т или А.
94. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X13 обозначает аминокислоту G, Е или R.
95. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X14 обозначает аминокислоту Е, Q, R или G.
96. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X15 обозначает аминокислоту I или Т.
97. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X16 обозначает аминокислоту D или N.
98. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X17 обозначает аминокислоту Q или K.
99. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак Х18 обозначает аминокислоту Н или Y.
100. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X19 обозначает аминокислоту N или Т.
101. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак Х1 обозначает аминокислоту N, Т или Н; знак Х2 обозначает аминокислоту Т или I; знак X3 обозначает аминокислоту N, S или G; знак X4 обозначает аминокислоту S, G или R; знак X5 обозначает аминокислоту Н, Р, N, Т или Y; знак X6 обозначает аминокислоту I или М; знак Х7 обозначает аминокислоту Р, L или W; знак Х8 обозначает аминокислоту R, Q, G или S; знак X9 обозначает аминокислоту А, V или Т; знак X10 обозначает аминокислоту F, W или V; знак Х11 обозначает аминокислоту Y, F или Н; знак Х12 обозначает аминокислоту Т или А; знак Х13 обозначает аминокислоту G, Е или R; знак X14 обозначает аминокислоту Е, Q, R или G; знак X15 обозначает аминокислоту I или Т; знак X16 обозначает аминокислоту D или N; знак X17 обозначает аминокислоту Q или K; знак X18 обозначает аминокислоту Н или Y; знак X19 обозначает аминокислоту N или Т.
102. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что, по меньшей мере, два семейства антигенных пептидов смешаны вместе.
103. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что семейство включает в себя более 150 антигенных пептидов.
104. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что семейство включает в себя менее 100000 антигенных пептидов.
105. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что семейство включает в себя менее 500 пептидных последовательностей, рассматриваемых в качестве представителей разнообразия последовательностей семейства в целом.
106. Пептидная библиотека, включающая в себя семейство пептидов, полученных по способу по п.1, обладающая антигенным сходством с участком V3 белка gp120 ВИЧ подтипа С, формулы
X1-C-X2-R-P-X3-N-N-T-R-X4-X5-X6-X7-I-G-P-G-Q-X8-F-X9-X10-T-X11-X12-I-X13-G-X14-I-R-Х15-А-Х16-С-Х17,
где каждый из участков X1-X17 имеет длину 0, 1, 2 или 3 аминокислотных остатка.
107. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X1 обозначает аминокислоту V, N, Е, Т, М или R.
108. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак Х2 обозначает аминокислоту Т, I или А.
109. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X3 обозначает аминокислоту N, G, S или Н.
110. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X4 обозначает аминокислоту K, Е или Q.
111. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X5 обозначает аминокислоту S или G.
112. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X6 обозначает аминокислоту I или М.
113. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X7 обозначает аминокислоту R или G.
114. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X8 обозначает аминокислоту Т, А или V.
115. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X9 обозначает аминокислоту Y или F.
116. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X10 обозначает аминокислоту А или Т.
117. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак Х11 обозначает аминокислоту G, N, D, K или Т.
118. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X12 обозначает аминокислоту D, G, N, S или I.
119. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X13 обозначает аминокислоту I или Т.
120. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X14 обозначает аминокислоту D или N.
121. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X15 обозначает аминокислоту Q, K, Е, L или Н.
122. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X16 обозначает аминокислоту Н, Y или N.
123. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X17 обозначает аминокислоту N, Т, I, D или Н.
124. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X1 обозначает аминокислоту V, N, Е, Т, М или R; знак X2 обозначает аминокислоту Т, I или А; знак X3 обозначает аминокислоту N, G, S или Н; знак X4 обозначает аминокислоту K, Е или Q; знак X5 обозначает аминокислоту S или G; знак X6 обозначает аминокислоту I или М; знак X7 обозначает аминокислоту R или G; знак Х8 обозначает аминокислоту Т, А или V; знак Х9 обозначает аминокислоту Y или F; знак Х10 обозначает аминокислоту А или Т; знак Х11 обозначает аминокислоту G, N, D, K или Т; знак X12 обозначает аминокислоту D, G, N, S или I; знак X13 обозначает аминокислоту I или Т; знак X14 обозначает аминокислоту D или N; знак X15 обозначает аминокислоту Q, K, Е, L или Н; знак X16 обозначает аминокислоту Н, Y или N; знак X17 обозначает аминокислоту N, Т, I, D или Н.
125. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что, по меньшей мере, два семейства антигенных пептидов смешаны вместе.
126. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что семейство включает в себя более 150 антигенных пептидов.
127. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что семейство включает в себя менее 100000 антигенных пептидов.
128. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что семейство включает в себя менее 500 пептидных последовательностей, рассматриваемых в качестве представителей разнообразия последовательностей семейства в целом.
129. Пептидная библиотека, включающая в себя семейство пептидов, полученных по способу по п.1, обладающая антигенным сходством с участком V3 белка gp120 ВИЧ подтипа D, формулы
X1-C-X2-R-P-X3-X4-X5-X6-R-X7-X8-X9-X10-I-G-X11-G-X12-X13-X14-X15-X16-T-X17-X18-G-X19-I-X2021-А-Х22-С-Х23,
где каждый из участков Х123 имеет длину 0, 1, 2 или 3 аминокислотных остатка.
130. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X1 обозначает аминокислоту N или Т.
131. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак Х2 обозначает аминокислоту Т или I.
132. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X3 обозначает аминокислоту Y или N.
133. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X4 обозначает аминокислоту N или К.
134. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X5 обозначает аминокислоту N или К.
135(167). Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X6 обозначает аминокислоту Т, I или К.
136. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X7 обозначает аминокислоту Q или R.
137. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак Х8 обозначает аминокислоту S, R или G.
138. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X9 обозначает аминокислоту Т или I.
139. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X10 обозначает аминокислоту Н, Р, S или R.
140. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак Х11 обозначает аминокислоту Р, L, S или Q.
141. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X12 обозначает аминокислоту Q или R.
142. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X13 обозначает аминокислоту А или Т.
143. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X14 обозначает аминокислоту L или Y.
144. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X15 обозначает аминокислоту Y или F.
145. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X16 обозначает аминокислоту Т или А.
146. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X17 обозначает аминокислоту I или K.
147. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X18 обозначает аминокислоту I, Т или K.
148. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X19 обозначает аминокислоту D или N.
149. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X20 обозначает аминокислоту R или G.
150. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X21 обозначает аминокислоту Q или К.
151. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X22 обозначает аминокислоту Н или Y.
152. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X23 обозначает аминокислоту N, Т или K.
153. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак Х1 обозначает аминокислоту N или Т; знак Х2 обозначает аминокислоту Т или I; знак X3 обозначает аминокислоту Y или N; знак X4 обозначает аминокислоту N или K; знак X5 обозначает аминокислоту N или K; знак X6 обозначает аминокислоту Т, I или K; знак X7 обозначает аминокислоту Q или R; знак X8 обозначает аминокислоту S, R или G; знак X9 обозначает аминокислоту Т или I; знак X10 обозначает аминокислоту Н, Р, S или R; знак Х11 обозначает аминокислоту Р, L, S или Q; знак Х12 обозначает аминокислоту Q или R; знак X13 обозначает аминокислоту А или Т; знак X14 обозначает аминокислоту L или Y; знак X15 обозначает аминокислоту Y или F; знак X16 обозначает аминокислоту Т или А; знак Х17 обозначает аминокислоту I или K; знак Х18 обозначает аминокислоту I, Т или K; знак X19 обозначает аминокислоту D или N; знак X20 обозначает аминокислоту R или G; знак X21 обозначает аминокислоту Q или K; знак X22 обозначает аминокислоту Н или Y; знак X23 обозначает аминокислоту N, Т или K.
154. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что, по меньшей мере, два семейства антигенных пептидов смешаны вместе.
155. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что семейство включает в себя более 150 антигенных пептидов.
156. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что семейство включает в себя менее 100000 антигенных пептидов.
157. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что семейство включает в себя менее 500 пептидных последовательностей, рассматриваемых в качестве представителей разнообразия последовательностей семейства в целом.
158. Пептидная библиотека, включающая в себя семейство пептидов, полученных по способу по п.1, обладающая антигенным сходством с участком V3 белка gp120 ВИЧ подтипа F, формулы
X1-C-T-R-P-X2-N-N-X3-R-K-X4-I-X5-L-G-P-G-X6-X7-X8-X9-X10-X11-X12-X13-I-X14-G-Х15-I-R-X16-A-X17-C-Х18,
где каждый из участков Х1-X18 имеет длину 0, 1, 2 или 3 аминокислотных остатка.
159. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X1 обозначает аминокислоту N или Т.
160. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак Х2 обозначает аминокислоту N или S.
161. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X3 обозначает аминокислоту Т или I.
162. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X4 обозначает аминокислоту S, G или R.
163. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X5 обозначает аминокислоту Н, R, Q, Р, Y или S.
164. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X6 обозначает аминокислоту Q, R или Н.
165. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X7 обозначает аминокислоту А, V или Т.
166. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X8 обозначает аминокислоту F или I.
167. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X9 обозначает аминокислоту Y, Н или F.
168. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X10 обозначает аминокислоту А или Т.
169. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X11 обозначает аминокислоту Т или А.
170. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X12 обозначает аминокислоту G, D или S.
171. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X13 обозначает аминокислоту D, А или N.
172. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X14 обозначает аминокислоту I или Т.
173. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X15 обозначает аминокислоту D или N.
174. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X16 обозначает аминокислоту К или Q.
175. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X17 обозначает аминокислоту Н или Y.
176. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак Х18 обозначает аминокислоту N, I, D или K.
177. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак Х1 обозначает аминокислоту N или Т; знак Х2 обозначает аминокислоту N или S; знак X3 обозначает аминокислоту Т или I; знак X4 обозначает аминокислоту S, G или R; знак X5 обозначает аминокислоту Н, R, Q, Р, Y или S; знак X6 обозначает аминокислоту Q, R или Н; знак X7 обозначает аминокислоту А, V или Т; знак X8 обозначает аминокислоту F или I; знак X9 обозначает аминокислоту Y, Н или F; знак X10 обозначает аминокислоту А или Т; знак Х11 обозначает аминокислоту Т или А; знак X12 обозначает аминокислоту G, D или S; знак X13 обозначает аминокислоту D, А или N; знак X14 обозначает аминокислоту I или Т; знак X15 обозначает аминокислоту D или N; знак X16 обозначает аминокислоту К или Q; знак X17 обозначает аминокислоту Н или Y; знак Х18 обозначает аминокислоту N, I, D, K или X.
178. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что, по меньшей мере, два семейства антигенных пептидов смешаны вместе.
179. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что семейство включает в себя более 150 антигенных пептидов.
180. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что семейство включает в себя менее 100000 антигенных пептидов.
181. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что семейство включает в себя менее 500 пептидных последовательностей, рассматриваемых в качестве представителей разнообразия последовательностей семейства в целом.
182. Пептидная библиотека, включающая в себя семейство пептидов, полученных по способу по п.1, обладающая антигенным сходством с участком V3 белка gp120 ВИЧ подтипа G, формулы
X1-C-X2-R-P-X3-N-N-T-R-K-S-X4-X5-X6-G-X7-X8-X9-X10-X11-X12-X13-T-X14-I-X15-G-X16-I-R-Х17-А-Х18-С-Х19,
где каждый из участков Х119 имеет длину 0, 1, 2 или 3 аминокислотных остатка.
183. Пептидная библиотека по п.182, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X1 обозначает аминокислоту N, I, Т, М или R.
184. Пептидная библиотека по п.182, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X2 обозначает аминокислоту Т или I.
185. Пептидная библиотека по п.182, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X3 обозначает аминокислоту N или S.
186. Пептидная библиотека по п.182, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X4 обозначает аминокислоту I или K.
187. Пептидная библиотека по п.182, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X5 обозначает аминокислоту Т, R, Н, Р или N.
188. Пептидная библиотека по п.182, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X6 обозначает аминокислоту F или I.
189. Пептидная библиотека по п.182, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X7 обозначает аминокислоту Р, Т, или L.
190. Пептидная библиотека по п.182, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X8 обозначает аминокислоту G или R.
191. Пептидная библиотека по п.182, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X9 обозначает аминокислоту Q, R, Н или G.
192. Пептидная библиотека по п.182, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X10 обозначает аминокислоту А, Т или V.
193. Пептидная библиотека по п.182, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X11 обозначает аминокислоту F, I или S.
194. Пептидная библиотека по п.182, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X12 обозначает аминокислоту Y или Н.
195. Пептидная библиотека по п.182, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X13 обозначает аминокислоту А или Т.
196. Пептидная библиотека по п.182, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X14 обозначает аминокислоту G, D или S.
197. Пептидная библиотека по п.182, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X15 обозначает аминокислоту I или Т.
198. Пептидная библиотека по п.182, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X16 обозначает аминокислоту D или N.
199. Пептидная библиотека по п.182, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X17 обозначает аминокислоту Q, L, K или Р.
200. Пептидная библиотека по п.182, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X18 обозначает аминокислоту Н, Y или F.
201. Пептидная библиотека по п.182, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X19 обозначает аминокислоту N, К или Т.
202. Пептидная библиотека по п.182, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X1 обозначает аминокислоту N, I, Т, М или R; знак X2 обозначает аминокислоту Т или I; знак X3 обозначает аминокислоту N или S; знак X4 обозначает аминокислоту I или K; знак X5 обозначает аминокислоту Т, R, Н, Р или N; знак Х6 обозначает аминокислоту F или I; знак Х7 обозначает аминокислоту Р, Т, или L; знак X8 обозначает аминокислоту G или R; знак X9 обозначает аминокислоту Q, R, Н или G; знак X10 обозначает аминокислоту А, Т или V; знак X11 обозначает аминокислоту F, I или S; знак X12 обозначает аминокислоту Y или Н; знак X13 обозначает аминокислоту А или Т; знак X14 обозначает аминокислоту G, D или S; знак Х15 обозначает аминокислоту I или Т; знак X16 обозначает аминокислоту D или N; знак Х17 обозначает аминокислоту Q, L, К или Р; знак X18 обозначает аминокислоту Н, Y или F; знак X19 обозначает аминокислоту N, K или Т.
203. Пептидная библиотека по п.182, отличающаяся тем, что, по меньшей мере, два семейства антигенных пептидов смешаны вместе.
204. Пептидная библиотека по п.182, отличающаяся тем, что семейство включает в себя более 150 антигенных пептидов.
205. Пептидная библиотека по п.182, отличающаяся тем, что семейство включает в себя менее 100000 антигенных пептидов.
206. Пептидная библиотека по п.182, отличающаяся тем, что семейство включает в себя менее 500 пептидных последовательностей, рассматриваемых в качестве представителей разнообразия последовательностей семейства в целом.
207. Способ вызова иммунного ответа, включающий в себя введение объекту композиции, содержащей семейство антигенных пептидов, полученных по п.1, в которое входят последовательности аминокислот, обладающие антигенным сходством с аминокислотными последовательностями вариабельного участка белка патогенного организма.
208. Способ по п.207, отличающийся тем, что композиция вводится объекту до инфицирования патогенным организмом.
209. Способ по п.208, отличающийся тем, что семейство антигенных пептидов включает в себя последовательности аминокислот, обладающие антигенным сходством с аминокислотными последовательностями подтипа белка патогенного организма.
210. Способ по п.208, отличающийся тем, что семейство антигенных пептидов включает в себя последовательности аминокислот, обладающие антигенным сходством с аминокислотными последовательностями более чем одного подтипа белка патогенного организма.
211. Способ по п.207, отличающийся тем, что композиция вводится объекту, инфицированному патогенным организмом.
212. Способ по п.211, отличающийся тем, что объект инфицирован подтипом патогенного организма.
213. Способ по п.212, отличающийся тем, что семейство антигенных пептидов включает в себя последовательности аминокислот, обладающие антигенным сходством с аминокислотными последовательностями того подтипа, которым инфицирован объект.
214. Способ создания семейства пептидных последовательностей, обладающих антивирусным действием, включающий:
выявление множества вариабельных позиций в участке белка соответствующего патогенного организма;
выбор пептидной последовательности белка соответствующего патогенного организма, включающей множество вариабельных позиций;
подбор одного или более замещающих аминокислотных остатков для одной из вариабельных позиций или последовательностей, обладающих антигенным сходством с аминокислотными остатками в вариабельной позиции данного белка в естественных условиях, с помощью матрицы антигенного сходства аминокислот, показывающей возможность замены одного аминокислотного остатка другим с сохранением взаимодействия антитела с антигеном, скорректированный в соответствии с частотами аминокислот в гипервариабельных участках;
создание семейства пептидных последовательностей.
215. Способ по п.214, включающий в себя приписывание определенной частоты встречаемости каждому замещающему аминокислотному остатку в семействе антигенных пептидов.
216. Способ по п.215, отличающийся тем, что включает в себя определение частоты встречаемости вариаций в естественных условиях.
217. Способ по п.214, включающий в себя определение антигенного сходства между пептидом семейства и участком человеческого белка.
218. Способ по п.217, включающий в себя удаление пептида из семейства антигенных пептидов в случае, если выявленное антигенное сходство пептида семейства с участком человеческого белка превышает заданный порог.
219. Способ по п.214, отличающийся тем, что семейство антигенных пептидов включает в себя члены, не встречающиеся в естественных условиях в рассматриваемой позиции, в сумме обладающие антигенным сходством со всеми встречающимися в естественных условиях последовательностями участка белка патогенного организма.
220. Способ по п.214, отличающийся тем, что подбор последовательностей включает в себя идентификацию пептидных последовательностей семейства, рассматриваемых в качестве представителей разнообразия последовательностей семейства в целом.
221. Способ по п.220, отличающийся тем, что идентифицируют менее 500 последовательностей.
222. Способ по п.220, отличающийся тем, что идентификация включает в себя расчет расстояний между пептидными последовательностями семейства.
223. Способ по п.222, отличающийся тем, что расчет расстояний включает в себя использование матрицы антигенного сходства, указанной в п.214.
224. Способ по п.256, включающий в себя идентификацию пептидных последовательностей семейства, обладающих антигенным сходством с подтипом белка патогенного организма.
225. Способ по п.214, отличающийся тем, что патогенный организм - это вирус.
226. Способ по п.225, отличающийся тем, что вирус - это ВИЧ.
227. Способ по п.226, отличающийся тем, что белок патогенного организма - это gp120.
228. Способ по п.227, отличающийся тем, что участок выбирается из множества, включающего в себя участки V1, V2, V3, V4 и V5.
229. Способ диагностики ВИЧ-инфекции, включающий в себя контакт исследуемого образца с семейством пептидов, полученных способом по п.1, содержащих аминокислотные последовательности, обладающие антигенным сходством с аминокислотными последовательностями вариабельного участка белка патогенного организма, определяемое на основе использования матрицы, указанной в п.1, в котором каждый антигенный пептид семейства отличается от других антигенных пептидов этого семейства по положению хотя бы одной аминокислоты.
230. Способ по п.229, отличающийся тем, что семейство пептидов обладает антигенным сходством с gp120 определенного подтипа ВИЧ.
231. Способ по п.229, отличающийся тем, что семейство пептидов обладает антигенным сходством с gp120 более чем одного подтипа ВИЧ.
232. Способ по п.229, включающий в себя иммобилизацию семейства пептидов на субстрате перед контактом с исследуемым образцом.
233. Способ по п.229, включающий в себя определение в образце антител, специфически связывающихся семейством пептидов.
RU2005108567/04A 2002-10-03 2003-09-25 Антигенные пептиды RU2312941C2 (ru)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2005108567/04A RU2312941C2 (ru) 2002-10-03 2003-09-25 Антигенные пептиды

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2002126396 2002-10-03
RU2002126396/13A RU2237065C2 (ru) 2002-10-03 2002-10-03 Иммуногенная библиотека химерных пептидов, мимикрирующая генетическое многообразие гипервариабельного района v3 белка оболочки gp120 вируса иммунодефицита человека
RU2005108567/04A RU2312941C2 (ru) 2002-10-03 2003-09-25 Антигенные пептиды

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2005108567A RU2005108567A (ru) 2005-11-20
RU2312941C2 true RU2312941C2 (ru) 2007-12-20

Family

ID=35867075

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2005108567/04A RU2312941C2 (ru) 2002-10-03 2003-09-25 Антигенные пептиды

Country Status (1)

Country Link
RU (1) RU2312941C2 (ru)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2013040040A1 (en) * 2011-09-12 2013-03-21 New York University School Of Medicine Peptides mimicking hiv-1 viral epitopes in the v2 loop for the gp120 surface envelope glycoprotein

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
ESTAQUIER J. et al., "The mixitope: a combinatorial library as Т cell and В cell immunogen", EurJ Immunol. 1994; 24(11), p.2789-2795. CARLOS M.P. at al., "Immunogenicity of a vaccine preparation representing the variable regions of the HIV type 1 envelope glycoprotein", AIDS Research and Human Retroviruses, 2000; 16(2), p.153-161. *

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2013040040A1 (en) * 2011-09-12 2013-03-21 New York University School Of Medicine Peptides mimicking hiv-1 viral epitopes in the v2 loop for the gp120 surface envelope glycoprotein
US9611294B2 (en) 2011-09-12 2017-04-04 New York University Peptides mimicking HIV-1 viral epitopes in the V2 loop for the GP120 surface envelope glycoprotein

Also Published As

Publication number Publication date
RU2005108567A (ru) 2005-11-20

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US20060240030A1 (en) Anti-hiv immunogenic formulation and process for preparation thereof
Flores et al. A dot hybridisation assay for detection of rotavirus
RU2136697C1 (ru) Способ получения олигопептидов
TWI232108B (en) Synthetic peptide vaccines for foot-and-mouth disease
CN104244973B (zh) 针对口蹄疫(fmd)的基于合成肽的紧急疫苗
HUP0002176A2 (hu) Vakcinákban vagy diagnosztikai vizsgálatokban alkalmazható PRRSV-peptidszekvenciákat azonosító PRRSV-antigénhelyek
RU2007146137A (ru) Иммуногенные композиции на основе chlamydia trachomatis
JPH11322792A (ja) ヒト免疫不全レトロウイルス(ウイルスhiv)に対して誘導された抗体により認識できるペプチド、及び前記ウイルスの或る種に起因する感染の診断、場合によってはエイズに対するワクチン接種における該ペプチドの使用。
WO1989002277A2 (en) Prophylaxis and therapy of acquired immunodeficiency syndrome
CN104903343A (zh) 抗乙型肝炎病毒的疫苗
CN1054772A (zh) 合成多肽
US20100322972A1 (en) HCV Vaccines For Chronic HCV Patients
JPH10503473A (ja) 細胞傷害性tリンパ球刺激およびhcv曝露診断用c型肝炎ウイルスコアペプチド
RU2312941C2 (ru) Антигенные пептиды
JPS59501866A (ja) 腸内ウイルスに対するワクチン接種に有用なポリペプチド
EP0601108B1 (en) Multideterminant peptide antigens that stimulate helper t lymphocyte response to hiv in a range of human subjects
CA2472265C (en) Immunogenic formulations of variable peptidic epitopes and process for preparation thereof
CN1130911A (zh) 用于对抗hiv的多分支型肽构建物
EP0966296A1 (en) Conjugated peptides, immunological reagent containing same and use thereof for treatment of immunological disorders
CA1268600A (fr) Molecules comportant au moins une sequence peptidique porteuse d'un epitope caracteristique d'une proteine produite par des cellules infectees par les parasites du paludisme et compositions les contenant
Jacobson Immune response to retroviruses in the central nervous system
Warren et al. Serologic evaluation of human immunodeficiency virus type 1-infected individuals from Argentina and the United States indicates a similar distribution of subgroup B isolates
CN101374857A (zh) 新的t辅助细胞抗原决定簇(thd)肽
KR0135885B1 (ko) 인체 면역결핍증의 레트로비루스(hiv )에 대해 유도된 항체에 의해 인식될 수 있는 펩티드 및 이 비루스 감염 진단과 aids 백신 제조에 이를 사용하는 방법
Werkhoven et al. Chemical approaches for localization, characterization and mimicry of peptide epitopes

Legal Events

Date Code Title Description
PD4A Correction of name of patent owner
MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20180926