RU2052503C1 - Полипептид, фрагмент днк нс 360, штамм бактерий escherichia coli - продуцент полипептида, слитого с бета-галактозидазой e.coli - Google Patents
Полипептид, фрагмент днк нс 360, штамм бактерий escherichia coli - продуцент полипептида, слитого с бета-галактозидазой e.coli Download PDFInfo
- Publication number
- RU2052503C1 RU2052503C1 SU5057397A RU2052503C1 RU 2052503 C1 RU2052503 C1 RU 2052503C1 SU 5057397 A SU5057397 A SU 5057397A RU 2052503 C1 RU2052503 C1 RU 2052503C1
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- strain
- polypeptide
- hepatitis
- dna
- virus
- Prior art date
Links
Landscapes
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Abstract
Сущность изобретения состоит в том, что получен полипептид со свойствами внутреннего антигена вируса гепатита C, обладающий способностью связывать антитела к кор-антигену ВГС, вызывать образование специфических антител к кор-антигену вируса гепатита C после введения лабораторным животным и предназначенный для определения антител к вирусу гепатита C и получения специфических антител к кор-антигену вируса гепатита C. Полипептид синтезируется штаммом бактерий Escherichia coli, полученным путем трансформации штамма PLT90 рекомбинантной плазмидой pH 115, содержащей нуклеотидную последовательность гена кор-антигена, слитой с бета-галактозидазой E. coli или штаммом E. coli, трансформированным плазмидой pH360F, в которой фрагмент ДНК НС 360 находится непосредственно под контролем промотора бактериофага лямбда cro lac Z. 3 с. п. ф-лы.
Description
Изобретение относится к биотехнологии, генной инженерии и иммунологии и может быть использовано для проведения серодиагностики гепатита С.
Гепатит С возникает в результате заражения вирусом гепатита С (ВГС) и отличается от других форм вирусассоциированных заболеваний печени, включая уже известные гепатит А, гепатит В, гепатит D, а также гепатитов, вызванных вирусом Эпштейн-Барра или цитомегаловирусом. Заражение ВГС, как правило, осуществляется при переливании крови. ВГС при попадании в организм поражает клетки печени. Клинически гепатит С протекает более легко, чем гепатит В. Однако показано, что почти у пятидесяти процентов пациентов болезнь принимает хроничеcкое течение c периодичеcким обоcтрением процеccа и у двадцати процентов хронических больных гепатитом С заболевание приводит к циррозу печени. Кроме того, имеются данные о том, что заражение вирусом гепатита С имеет прямое отношение к возникновению первичного рака печени. Поэтому для проведения противоэпидемических, профилактических мероприятий и своевременного выявления ВГС-инфекции крайне актуальна разработка диагностических препаратов, позволяющих выявлять инфицированных ВГС.
Многочисленные исследования ВГС позволили определить его структуру, организацию генома, выяснить механизм экспрессии и функции отдельных вирусных белков. ВГС имеет позитивный РНК-геном, состоящий примерно из 9400 нуклеотидов. Данная последовательность нуклеотидов содержит единственную большую открытую рамку считывания, которая перекрывает большую часть вирусного генома и может кодировать большой вирусспецифический полипептид, состоящий из 3010 3011 аминокислотных остатков, который является предшественником индивидуальных структурных и неструктурных вирусных белков. Данный белок процессируется под действием клеточных и вирусспецифической протеаз. К структурным белкам ВГС относятся кор(ядерный)антиген размером 19 кДа. Кор-антиген обладает способностью связывать РНК и образует нуклеокапсид ВГС. Два других структурных белка представлены гликопротеинами размером около 32 кДа и 72 кДа, которые процессируются, как и корантиген, с N-концевой областью вирусспецифического полипротеина. Белок размером 32 кДа предположительно является матриксным или поверхностным белком вириона ВГС,0 а белок размером 72 кДа является либо поверхностным белком вириона, либо первым неструктурным белком ВГС (NSl). Белок NS2 ВГС размером 23 кДа ассоциирован с мембранами зараженных вирусом клеток, однако его функциональная роль неизвестна. Белок NS3 размером 60 кДа обладает: во-первых, нуклеотид трифосфат-связывающей геликазной активностью и, по-видимому, участвует в репликации генома ВГС; во-вторых, ферментативной активностью сериновой протеазы, которая, по-видимому, обеспечивает процессирование неструктурных белков. Продукты экспрессии генов NS4 и NS5 еще не охарактеризованы, однако они могут кодировать белки размером 52 и 116 кДа соответственно. Как и белок NS2, NS4 очень гидрофобен и, вероятно, является мембраносвязывающим белком с неизвестной функцией. Продукт экспрессии гена NS5, по-видимому, многофункционален, обладает РНК-зависимой РНК-полимеразной активностью, которая используется при репликации вирусного генома.
Большинство методов диагностики ВГС-инфекции основано на определении антител к белкам ВГС в сыворотках крови (серодиагностика). Для этих целей используются различные подходы, в которых применяются принципы иммуноферментного анализа (ИФА), реакции агглютинации (латекса, эритроцитов), иммунофлуоресценции, иммуноблотинга и радиоиммунопреципитации. Одним из наиболее перспективных путей совершенствования всех этих диагностических тест-систем является использование в качестве антитело-связывающего субстрата рекомбинантных белков ВГС, синтезированных в различных экспрессирующих системах. Использование таких рекомбинантных белков, сохраняющих антигенные детерминанты ВГС, вместо вирусных антигенов не только увеличивает специфичность и чувствительность тест-систем, но и делает их безопасными в работе. Существует значительное число разработок, направленных на создание рекомбинантных белков-продуктов генов ВГС, и в частности гена корантигена ВГС [1 5]
В настоящее время ведется поиск по-липептидов, наиболее перспективных для диагностики, лечения и профилактики гепатита С. Исследования ведутся как в направлении выбора клеток продуцентов [3] так и в направлении выбора наиболее антигеноактивных детерминант [1] и создания рекомбинантных полипептидов, продуктов генов ВГС.
В настоящее время ведется поиск по-липептидов, наиболее перспективных для диагностики, лечения и профилактики гепатита С. Исследования ведутся как в направлении выбора клеток продуцентов [3] так и в направлении выбора наиболее антигеноактивных детерминант [1] и создания рекомбинантных полипептидов, продуктов генов ВГС.
Сущность данного технического решения состоит в том, что предложен оригинальный гибридный полипептид HC115, состоящий из продукта экспрессии фрагмента генома ВГС (115 аминокислотных остатков корантигена), свободный или слитный с бета-галактозидазой E.coli, связывающий антитела к продукту гена корантигена ВГС, отличающийся от известных: во-первых, размером полипептиды p1 и p35 (патенты ЕР 0 445 423) соответствуют 1-75 и 35-75 аминокислотным остаткам корантигена ВГС; пептид СВ 279а соответствует 1-84 аминокислотным остаткам корантигена ВГС, во-вторых, наличием аминокислотных замен (например, R <->К в 9-м положении, Т <->N в 13-м положении, Р<->Т в 49-м положении по сравнению с пептидами p1 и р35 [1] Фрагмент ДНК НС360, кодирующий полипептид НС115. Сущность изобретения состоит также в штамме E.colli НС115 ВКПМ, трансформированном рекомбинантной плазмидой рНС115, содержащей фрагмент ДНК НС115 и экспрессирующей белок НС115.
Штамм-продуцент характеризуется следующими признаками: клетки прямые, палочковидной формы, подвижные с перитрихиальными жгутиками, грамотрицательные, неспороносные. Клетки растут на среде LB и других питательных средах, используемых для культивирования Escherichia coli, и простых питательных средах, содержащих 10 мкг/мл тетрациклина и 50 мкг/мл ампициллина. При выращивании на питательных агаризованных средах при 37оС колонии клеток гладкие, круглые, блестящие, бледно-желтые, прозрачные, края ровные. При росте на тех же средах, но при 30-32оС колонии клеток имеют "слизистый" фенотип, характерный для колоний клеток с lon мутациями, растущими при пониженной температуре. При росте на жидких средах клетки образуют ровную интенсивную муть. Клетки хорошо растут при температуре от 4 до 37оС при оптимуме рН от 6,8 до 7,5. В качестве источника азота клетки используют как минеральные соли в аммонийной и нитратной форме, так и органические формы в виде пептона и аминокислот. Нитраты восстанавливают до нитритов. Желатину не разжижают. Мальтозу не сбраживают. Уреазная активность не образуется. Трансформацию клеток плазмидами с промоторами бактериофага проводят по стандартным методикам. Полученные клоны клеток с плазмидами выращивают на среде LB при температуре 30-32оС. Препаративную ферментацию для наработки рекомбинантного белка проводят при температуре 39 42оС. Продуктивность штамма при иcполь-зовании плазмидных векторов экcпреccии c промоторами бактериофага составляет около 500 кг рекомбинантного белка на 1 л клеточной суспензии при плотности культуры 1 х 10 кл/мл. Белок стабилен при температуре 4оС в течение 3-4 месяцев.
Рекомбинантный полипептид С115, выделенный и очищенный из штамма продуцента, иммобилизованный на твердом носителе (полихлорвиниловые или полистироловые планшеты, нитроцеллюлоза, найлон, латексы, эритроциты и др.), связывает антитела к продуктам гена корантигена ВГС в сыворотках крови и др. биологических жидкостях. Штамм депонирован в коллекции промышленных микроорганизмов НИИ генетики и селекции промышленных микроорганизмов ВКПМ.
П р и м е р 1. Получение фрагмента ДНК НС360.
Для получения фрагмента ДНК были использованы олигонуклеотиды:
cr1 5' GATCCCATGAGCACGAATCCTAAACCTCAAAGAAAAAC 3'
cr2 5' CAAACGTAACACCAACCGCCGCCCACAGGACGTCAAGTTC 3'
cr3 5' CCGGGCGGTGGTCAGATCGTTGGTGGAGTTTACCTGTTGCCGCGCAGG 3'
cr4 5' GGCCCCAGGTTGGGTGTGCGCGCGCCCAGGAAGACTTC 3'
cr5 5' CGAGCGGTCGCAACCTCGTGGAAGGCGACAACCTATCCC 3'
cr6 5' CAAGGCTCGCCGGCCCGAGGGCAGGACCTGGGCTCAGCCCGGGTAC 3'
cr7 5' CCTTGGCCTCTCTATGGCAATGAGGGCTTAGGGTGGG 3'
cr8 5' CAGGATGGCTCCTGTCACCCCGCGGCTCCCGGCCTAGTTGGGGCCCCACG 3'
cr9 5' GACCCCCGGCGTAGGTAATAATAGCTGCA 3'
rc1 5' GCCCGGGAACTTGACGTCCTGTGGGCGGCGGTTGGTGTTACGTTTGGTTTTTC
TTTGAGGTTTAGGATTCGTCTCATGG 3'
rc2 5' GGCCCCTGCGCGGCAACAGGTAAACTCCACCAACGATCTGACCACC 3'
rc3 5' GAGGTTGCGACCGCTCGGAAGTCTTCCTGGGCGCGCGCACACCCAACCTGG 3'
rc4 5' CCGGGCTGAGCCCAGGTCCTGCCCTCGGGCCGGCGAGCCTTGGGGATAGGTTGTCG
CCTTCCAC 3'
rc5 5' GAGCCATCCTGCCCACCCTAAGCCCTCATTGCCATAGAGAGGCCAAGGGTAC 3'
rc6 5' CCGGGGGTCCGTGGGGCCCCAACTAGGCCGGGAGCCGCGGGGTGACAG 3'
rc7 5' GCTATTATTACCTACG 3'
Олигонуклеотиды cr 1,2,3,4,5,6 и rc 1,2,3,4 смешивают и кинируют с помощью полинуклеотидкиназы фага Т4. Для этого в эппендорфовскую пробирку на 1,5 мл вносят по 50 пмолей каждого из олигонуклеотидов, 50 мкл десятикратного буфера для киназы (0,5 М трис НСl, рН 7,6, 0,1 М MgCl 50 мМ дитиотрейтол, 1 мМ спермидина и 1 мМ ЭДТА), 250 пмолями (150 мкКИ) [гамма- Р] АТФ (удельная активность 3000 Ки/ммоль), 150 единицами активности полинуклеотидкиназы фага Т4 и бидистиллированной воды до объема 500 мкл и инкубируют 30-60 мин при 37оС. Затем реакционную смесь нагревают до температуры 98оС, охлаждают до 16оС и сшивают ДНК-лигазой. Для этого 100 мкл смеси обработанных киназой олигонуклеотидов смешивают с 12 мкл десятикратного буфера для лигирования (0,66 М трис-НСl, рН 7,6, 50 мМ MgCl, 50 мМ дитиотрейтол и 10 мМ АТФ), 8 мкл (50 единиц активности) ДНК-лигазы фага Т4 и инкубируют при 4оС в течение 5 ч. Затем реакционную смесь нагревают до температуры 65оС в течение 15 мин для инактивации фермента. 10 мкл раствора обработанных киназой и лигазой олигонуклеотидов используют для анализа ДНК методом электрофореза в 12% полиакриламидном геле по обычной методике (Molecular cloning, New York, CSHL, 1982). После радиоавтографии геля виден фрагмент размером около 249 п. н. 100 мкл раствора полученного фрагмента ДНК гидролизуют рестриктазами BamHI и KpnI в буферном растворе для рестрикции (конечная концентрация 20 мМ трис-HСl рН 7,5, 50 мМ NaCl, 10 мМ MgCl, 1 мМ дитиотрейтол) в течение 5 ч при температуре 37оС. Ферменты инактивируют нагреванием при 70оС. 10 мкл раствора фрагментов ДНК, гидролизованных рестрикционными эндонуклеазами, используют для анализа ДНК в 12% полиакриламидном геле (после радиоавтографии виден фрагмент размером около 249 п.н.).
cr1 5' GATCCCATGAGCACGAATCCTAAACCTCAAAGAAAAAC 3'
cr2 5' CAAACGTAACACCAACCGCCGCCCACAGGACGTCAAGTTC 3'
cr3 5' CCGGGCGGTGGTCAGATCGTTGGTGGAGTTTACCTGTTGCCGCGCAGG 3'
cr4 5' GGCCCCAGGTTGGGTGTGCGCGCGCCCAGGAAGACTTC 3'
cr5 5' CGAGCGGTCGCAACCTCGTGGAAGGCGACAACCTATCCC 3'
cr6 5' CAAGGCTCGCCGGCCCGAGGGCAGGACCTGGGCTCAGCCCGGGTAC 3'
cr7 5' CCTTGGCCTCTCTATGGCAATGAGGGCTTAGGGTGGG 3'
cr8 5' CAGGATGGCTCCTGTCACCCCGCGGCTCCCGGCCTAGTTGGGGCCCCACG 3'
cr9 5' GACCCCCGGCGTAGGTAATAATAGCTGCA 3'
rc1 5' GCCCGGGAACTTGACGTCCTGTGGGCGGCGGTTGGTGTTACGTTTGGTTTTTC
TTTGAGGTTTAGGATTCGTCTCATGG 3'
rc2 5' GGCCCCTGCGCGGCAACAGGTAAACTCCACCAACGATCTGACCACC 3'
rc3 5' GAGGTTGCGACCGCTCGGAAGTCTTCCTGGGCGCGCGCACACCCAACCTGG 3'
rc4 5' CCGGGCTGAGCCCAGGTCCTGCCCTCGGGCCGGCGAGCCTTGGGGATAGGTTGTCG
CCTTCCAC 3'
rc5 5' GAGCCATCCTGCCCACCCTAAGCCCTCATTGCCATAGAGAGGCCAAGGGTAC 3'
rc6 5' CCGGGGGTCCGTGGGGCCCCAACTAGGCCGGGAGCCGCGGGGTGACAG 3'
rc7 5' GCTATTATTACCTACG 3'
Олигонуклеотиды cr 1,2,3,4,5,6 и rc 1,2,3,4 смешивают и кинируют с помощью полинуклеотидкиназы фага Т4. Для этого в эппендорфовскую пробирку на 1,5 мл вносят по 50 пмолей каждого из олигонуклеотидов, 50 мкл десятикратного буфера для киназы (0,5 М трис НСl, рН 7,6, 0,1 М MgCl 50 мМ дитиотрейтол, 1 мМ спермидина и 1 мМ ЭДТА), 250 пмолями (150 мкКИ) [гамма- Р] АТФ (удельная активность 3000 Ки/ммоль), 150 единицами активности полинуклеотидкиназы фага Т4 и бидистиллированной воды до объема 500 мкл и инкубируют 30-60 мин при 37оС. Затем реакционную смесь нагревают до температуры 98оС, охлаждают до 16оС и сшивают ДНК-лигазой. Для этого 100 мкл смеси обработанных киназой олигонуклеотидов смешивают с 12 мкл десятикратного буфера для лигирования (0,66 М трис-НСl, рН 7,6, 50 мМ MgCl, 50 мМ дитиотрейтол и 10 мМ АТФ), 8 мкл (50 единиц активности) ДНК-лигазы фага Т4 и инкубируют при 4оС в течение 5 ч. Затем реакционную смесь нагревают до температуры 65оС в течение 15 мин для инактивации фермента. 10 мкл раствора обработанных киназой и лигазой олигонуклеотидов используют для анализа ДНК методом электрофореза в 12% полиакриламидном геле по обычной методике (Molecular cloning, New York, CSHL, 1982). После радиоавтографии геля виден фрагмент размером около 249 п. н. 100 мкл раствора полученного фрагмента ДНК гидролизуют рестриктазами BamHI и KpnI в буферном растворе для рестрикции (конечная концентрация 20 мМ трис-HСl рН 7,5, 50 мМ NaCl, 10 мМ MgCl, 1 мМ дитиотрейтол) в течение 5 ч при температуре 37оС. Ферменты инактивируют нагреванием при 70оС. 10 мкл раствора фрагментов ДНК, гидролизованных рестрикционными эндонуклеазами, используют для анализа ДНК в 12% полиакриламидном геле (после радиоавтографии виден фрагмент размером около 249 п.н.).
ДНК осаждают этиловым спиртом и растворяют в 20 мкл дистиллированной воды. 10 мкл обработанного рестрикционными эндонуклеазами фрагмента ДНК вносят в эппендорфовскую пробирку, содержащую 7 мкл (0,1 мкг/мл) ДНК векторной плазмиды pUC18, обработанной рестриктазами BamHI и KpnI, 2 мкл десятикратного буфера для лигирования, 1 мкл (5 единиц активности) ДНК-лигазы фага Т4 и инкубируют при 4оС в течение 5 ч. Полученной лигазной смесью трансформируют клетки E. coli штамм DH5альфа по обычной методике (Molecular cloning, New York, CSHL, 1982). Трансформированные клетки высевают на чашки с 1,2% LB-агаром, содержащим 50 мкг/мл ампициллина. Выросшие колонии проверяют на наличие рекомбинантных плазмид. Для этого бактериальные клетки лигируют и выделяют плазмидную ДНК, как описано (Nature, 1981, 145, 1365). Выделенную плазмидную ДНК обрабатывают рестриктазами Bam HI и KpnI и гидролизат исследуют электрофорезом в 12% полиакриламидном геле. Отбирают штамм HCBK. Гидролизат плазмидной ДНК из рекомбинантного штамма НСВК имеет на электрофореграмме 2 полосы ДНК размерами 2686 и 249 п.н. что соответствует размерам вектора и синтезированного фрагмента ДНК.
Олигонуклеотиды cr 7,8,9 и rc 5,6,7 смешивают и обрабатывают последовательно полинуклеотидкиназной и ДНК лигазой фага Т4, как описано выше.
100 мкл раствора полученного фрагмента ДНК гидролизуют рестриктазами РstI и KpnI в буферном растворе для рестрикции (конечная концентрация 20 мМ трис-НСl рН 7,5, 50 мМ NaCl, 10 мМ MgCl, 1 мМ дитио-трейтол) в течение 5 ч при температуре 37оС. Ферменты инактивируют нагреванием при 70оС, 10 мкл раствора фрагментов ДНК, гидролизованных рестрикционными эндонуклеазами, используют для анализа ДНК в 12% полиакриламидном геле (после радиавтографии виден фрагмент размером около 116 п.н.).
ДНК осаждают этиловым спиртом и растворяют в 20 мкл дистиллированной воды. 10 мкл обработанного рестрикционными эндонуклеазами фрагмента ДНК вносят в эппендорфовскую пробирку, содержащую 7 мкл (0,1 мкг/мл) ДНК векторной плазмиды pUC18, обработанной рестриктазами PstI и KpnI, 2 мкл десятикратного буфера для лигирования, 1 мкл (5 единиц активности) ДНК-лигазы фага Т4 и инкубируют при 4оС в течение 5 ч.
Полученной лигазной смесью трансформируют клетки E.coli штамм DH5альфа. Трансформированные клетки высевают на чашки с 1,2% LB-агаром, содержащим 50 мкг/мл ампициллина. Выросшие колонии проверяют на наличие рекомбинантных плазмид. Для этого бактериальные клетки лизируют и выделяют плазмидную ДНК. Выделенную плазмидную ДНК обрабатывают рестриктазами PstI и KpnI и гидролизат исследуют электрофорезом в 12% полиакриламидном геле. Отбирают штамм НСРК. Гидролизат плазмидной ДНК из рекомбинантного штамма НСКР имеет на электрофореграмме 2 полосы ДНК размерами 2686 и 116 п.н. что соответствует размерам вектора и синтезированного нами фрагмента ДНК.
Плазмидную ДНК из штаммов НСВК и НСКР использовали для получения фрагмента ДНК НС360. Для этого бактериальные клетки штаммов НСВК и НСКР лизируют и выделяют плазмидную ДНК. Выделенную плазмидную ДНК и рНСВК обрабатывают рестриктазами BamHI и KpHI, а ДНК рНСВК обрабатывают рестриктазами PstI и KpnI. Продукты гидролиза фракционируют в полиакриламидном геле и выделяют фрагменты ДНК размером 116 п.н. (фрагмент КР) и 249 п.н. (фрагмент ВК) по обычной методике (Molecular cloning, New York, СSHL, 1982). Изолированные фрагменты ДНК осаждают этиловым спиртом и растворяют в 20 мкл дистиллированной воды. По 5 мкл фрагментов ДНК ВК и КР лигируют с ДНК векторной плазмиды pUC18, обработанной рестриктазами PstI и BamHI.
Лигазной смесью трансформируют клетки E.coli штамм DH5альфа. Клетки высевают на чашки с 1,2% LB-агаром, содержащим 50 мкг/мл ампициллина. Колонии проверяют на наличие рекомбинантных плазмид. Для этого бактериальные клетки лизируют и выделяют плазмидную ДНК. Выделенную плазмидную ДНК обрабатывают рестриктазами PstI и BamHI и гидролизат исследуют электрофорезом в 12% полиакриламидном геле. Отбирают штамм HCBР. Гидролизат плазмидной ДНК из рекомбинантного штамма НСВР имеет на электрофореграмме 2 полосы ДНК размерами 2686 (ДНК плазмиды pUC18) и 360 п.н. (фрагмент ДНК НС360).
Методом Сэнгера (PNAS, 1977, 74, 5463) определяют нуклеотидную последовательность фрагмента ДНК HС360:
GATCCCATGAGCACGAATCCTAAACCTCAAAGAAAAACCAAACGTAACACCAACCGCCGC
CCACAGGACGTCAAGTTCCCGGGCGGTGGTCAGATCGTTGGTGGAGTTTACCTGTTGCCG
CGCAGGGGCCCCAGGTTGGGTGTGCGCGCGAAGCCCAGGACTTCCGAGCGGTCGCAACCT
CGTGGAAGGCGACAACCTATCCCCAAGGCTCGCCGGCCCGAGGGCAGGACCTGGGCTCAG
CCCGGGTACCCTTGGCCTCTCTATGGCAATGAGGGCTTAGGGTGGGCAGGATGGCTCCTG
TCACCCCGCGGCTCCCGGCCTAGTTGGGGCCCCACGGACCCCCGGCGTAGGTAATAATAG
CTGCA
Данный фрагмент ДНК НС360 также был получен путем известного метода цепной реакции полимеризации с использованием олигонуклеотидов cr1 и rc7.
GATCCCATGAGCACGAATCCTAAACCTCAAAGAAAAACCAAACGTAACACCAACCGCCGC
CCACAGGACGTCAAGTTCCCGGGCGGTGGTCAGATCGTTGGTGGAGTTTACCTGTTGCCG
CGCAGGGGCCCCAGGTTGGGTGTGCGCGCGAAGCCCAGGACTTCCGAGCGGTCGCAACCT
CGTGGAAGGCGACAACCTATCCCCAAGGCTCGCCGGCCCGAGGGCAGGACCTGGGCTCAG
CCCGGGTACCCTTGGCCTCTCTATGGCAATGAGGGCTTAGGGTGGGCAGGATGGCTCCTG
TCACCCCGCGGCTCCCGGCCTAGTTGGGGCCCCACGGACCCCCGGCGTAGGTAATAATAG
CTGCA
Данный фрагмент ДНК НС360 также был получен путем известного метода цепной реакции полимеризации с использованием олигонуклеотидов cr1 и rc7.
П р и м е р 2. Получение плазмиды рНС115.
Фрагмент ДНК НС360 лигируют с ДНК векторной плазмиды pEL5А, обработанной рестриктазами BamHI и PstI. Лигазной смесью трансформируют клетки E.coli штамм PLT90. Трансформированные клетки высевают на чашки с 1% LB-агаром, содержащие 50 мкг/мл ампициллина. Выросшие колонии проверяют на наличие рекомбинантных плазмид. Для этого бактериальные клетки лизируют и выделяют плазмидную ДНК. Выделенную плазмидную ДНК обрабатывают рестриктазами BamHI и PstI и гидролизат исследуют электрофорезом в 2% агарозе. Отбирают штамм HC115. Гидролизат плазмидной ДНК из рекомбинантного штамма НС115 имеет на электрофореграмме 2 полосы ДНК размерами 6400 и 360 нуклеотидов, что соответствует размерам вектора и синтезированного фрагмента ДНК НС360. При определении нуклеотидной последовательности плазмиды рНС115 установлено, что синтезированный фрагмент гена корантигена ВГС через BamHI сайт присоединен к 3'-концу гена бета-галактозидазы E.coli. Таким образом плазмида НС360 кодирует рекомбинантный белок, содержащий аминокислотные последовательности корантигена ВГС, слитые с последовательностью бета-галактозидазы E.coli. Аналогичным образом получена плазмида рНС360F, в которой фрагмент ДНК НС360 находится непосредственно под контролем промотора бактериофага лямбда croLacZ. Данная плазмидная ДНК обеспечивает синтез рекомбинантного корантигена ВГС, свободного от аминокислотных последовательностей бета-галактозидазы E. coli.
П р и м е р 3. Синтез белка HC115.
Штамм E.coli РС115, содержащий плазмиду рНС115, выращивают в 100 мл среды LB при 30оС до плотности 8 х 10 кл/мл. После этого температуру повышают до 40оС и растят клетки еще в течение 2 ч. Клетки собирают центрифугированием при 4000 об/мин в течение 15 мин. Клетки лизируют ультразвуком и выделяют белки по описанному методу (EMBO J. 1984, 3, 1429).
Выделенные белки анализируют в 10% ПААГ по стандартному методу Лэммли (Nature, 227, 680-685, 1970). В качестве маркеров молекулярных масс белков используют набор фирмы "Pharmacia", содержащий маркеры молекулярных масс от 20 до 160 кД. В качестве контроля используют полученный аналогичным образом лизат клеток штамма E.coli PLТ90, содержащий векторную плазмиду pEL5А и не содержащий плазмиду pHC115. Сравнительный анализ белкового состава показывает, что штамм E.coli HC115, содержащий плазмиду рНС115, экспрессирует гибридный полипептид с молекулярной массой 150 160 кД. Этот полипептид назван С115. Аминокислотная последовательность гибридного полипептида (последовательность бета-галактозидазы не представлена), определенная на основании нуклеотидной последовательности клонированного фрагмента провирусной ДНК ВГС, представлена ниже:
M S T N P K P Q R K T K R N T N R R P Q D V K F P G
G G Q I V G G V Y L L P R R G P R L G V R A P R K T
S E R S Q P R G R R Q P I P K A R R P E G R T W A Q
P G Y P W P L Y G N E G L G W A G W L L S P R G S R
P S W G P T D P R R R
слитный с бета-галактозидазой E.coli.
M S T N P K P Q R K T K R N T N R R P Q D V K F P G
G G Q I V G G V Y L L P R R G P R L G V R A P R K T
S E R S Q P R G R R Q P I P K A R R P E G R T W A Q
P G Y P W P L Y G N E G L G W A G W L L S P R G S R
P S W G P T D P R R R
слитный с бета-галактозидазой E.coli.
П р и м е р 4. Контроль антигенной активности.
Контроль антигенной активности препаратов осуществляют методом иммуноблотинга. Для этого проводят процедуру электрофореза (как описано в примере 3), затем осуществляют перенос электрофоретически разделенных белков на нитроцеллюлозные мембраны ВН85 с помощью аппарата для электроблотинга в режиме 24В, 400 мА в течение 1 ч. Качество переноса проверяют окрашиванием мембран раствором 0,2 Понсо S в 3%-ной ТХУ в течение 5 мин при комнатной температуре. Краску дважды отмывают в течение 30 мин буфером TBS (0,15М NaCl, 20 mM трис-HCL, рН 7,4) с 0,05% Твина-20 при комнатной температуре. На следующем этапе проводят блокирование нитроцеллюлозных мембран с иммобилизованными белками раствором 5%-ного обезжиренного сухого молока, приготовленным на 0,1 М Na-фосфатном буфере, рН 7,4, в течение 30 мин при комнатной температуре. После блокирования мембраны в течение 1 ч при 37оС обрабатывают сыворотками, содержащими антитела к ВГС, в разведении 1:100. Затем проводят трехкратную отмывку мембран TBS с 0,05%-ным Твином-20 в течение 30 мин при комнатной температуре. Выявление специфических антител осуществляют инкубацией фильтра с антивидовым пероксидазным конъюгатом при 37оС в течение часа. Далее повторяют процедуру трехкратной отмывки. Реакцию проверяют добавлением 100 мкл 30% -ной перекиси водорода и 50 мл раствора 4-хлор-1-нафтола (20 мг в 0,1М трис-НСl, рН 8,0). Анализ показывает, что полипептид С115 связывается с антителами к вирусу гепатита С.
П р и м е р 5. Получение специфических антител к корантигену ВГС.
Штамм E.coli HC115, содержащий плазмиду рНС115, выращивают в 100 мл среды LB при 30оС до плотности 8х10 кл/мл. После этого температуру повышают до 40оС и растят клетки еще в течение 2 ч. Клетки собирают центрифугированием при 4000 об/мин в течение 15 мин. Клетки лизируют ультразвуком и выделяют белки по описанному методу (EMBO J. 1984, 3, 1429). Выделенные белки фракционируют в 10% ПААГ по стандартному методу Лэммли (Nature, 227, 680-685, 1970). В качестве маркеров молекулярных масс белков используют набор фирмы "Pharmacia", содержащий маркеры молекулярных масс от 20 до 160 кД. По обычной методике (Molecular cloning, New York, CSHL, 1982) из геля выделяют мажорный белок с молекулярной массой 150-160 килодальтон. 3 мг очищенного с помощью гель-электрофореза белка используют для иммунизации 3-6 месячных самок мышей BALB/с. Белок вводят внутрибюшинно с интервалом 2 недели с полным адъювантом Фрейнда (при первых двух иммунизациях) и неполным адъювантом Фрейнда (при последующих двух иммунизациях). Выявление антител к корантигену ВГС в сыворотках крови иммунизированных животных проводят с помощью вестерн-блот-анализа. Для этого через две недели после последней иммунизации у животных берут кровь и получают сыворотку, используя стандартные методы (LNA cloning, Oxford, 1987). Затем фракционируют плазму крови больных гепатитом С методом электрофореза в полиакриламидном геле и белки переносят на нитроцеллюлозный фильтр, блокирование нитроцеллюлозных мембран с иммобилизованными белками, обработку сыворотками животных, иммунизированных рекомбинантными белками, выявление специфических антител с помощью антивидового конъюгата, отмывки проводят как описано в примере 4. Анализ показывает, что сыворотки животных, иммунизированных рекомбинантными белками, содержат антитела, которые специфически взаимодействуют с корантигеном ВГС (полипептид с молекулярной массой 19 килодальтон).
Таким образом, объектом защиты изобретения является полипептид со свойствами внутреннего антигена вируса гепатита С, взаимодействующий с антителами к корантигену ВГС, способный вызывать образование специфических антител к корантигену вируса гепатита С после введения лабораторным животным.
Claims (3)
1. Полипептид, полученный в штаммме бактерий Esscherichia coli, трансформированном рекомбинантной плазмидной ДНК, содержащей фрагмент ДНК с нуклеотидной последовательностью, R и аминокислотной последовательностью R1, приведенными в описании, где R и R1 = 0, или R - это последовательность нуклеотидов, кодирующая бета-галактозидазу, R1 - аминокислотная последовательность бета-галактозидазы,
обладающий способностью связывать анититела к продукту гена корантигена вируса гепатита С и вызывать образование специфических антител к вирусу гепатита С полсе введения лабораторным животным.
обладающий способностью связывать анититела к продукту гена корантигена вируса гепатита С и вызывать образование специфических антител к вирусу гепатита С полсе введения лабораторным животным.
2. Фрагмент ДНК НС 360, полученный с помощью искусственного химического синтеза или реакции полимеризации цепи ДНК с нуклеотидной последовательностью, приведенной в описании, содержащий на 3′ -конце стоп-кодон.
3. Штамм бактерий Escherichia coli ВКПМ N В - 6254 - продуцент полпептида НС115, слитого с бета-галактозидазой E. coli.
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
SU5057397 RU2052503C1 (ru) | 1992-07-03 | 1992-07-03 | Полипептид, фрагмент днк нс 360, штамм бактерий escherichia coli - продуцент полипептида, слитого с бета-галактозидазой e.coli |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
SU5057397 RU2052503C1 (ru) | 1992-07-03 | 1992-07-03 | Полипептид, фрагмент днк нс 360, штамм бактерий escherichia coli - продуцент полипептида, слитого с бета-галактозидазой e.coli |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2052503C1 true RU2052503C1 (ru) | 1996-01-20 |
Family
ID=21610934
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
SU5057397 RU2052503C1 (ru) | 1992-07-03 | 1992-07-03 | Полипептид, фрагмент днк нс 360, штамм бактерий escherichia coli - продуцент полипептида, слитого с бета-галактозидазой e.coli |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
RU (1) | RU2052503C1 (ru) |
-
1992
- 1992-07-03 RU SU5057397 patent/RU2052503C1/ru active
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
1. Европейский патент N 0445423, кл. G 01N 33/576, 1990. 2. Авторское свидетельство СССР N 0419182, кл. C 12N 15/51, 1990. 3. Европейский патент N 0388232, C 12N 15/51, 1990. 4. Европейский патент N 0406511, кл. C 12N 15/51, 1990. 5. Европейский патент N 0416725, кл. C 12N 15/51, 1990. * |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
KR100217483B1 (ko) | C형 간염 바이러스 에피토프 | |
Boulain et al. | Mutagenesis by random linker insertion into the lamB gene of Escherichia coli K12 | |
Einberger et al. | Purification, renaturation, and reconstituted protein kinase activity of the Sendai virus large (L) protein: L protein phosphorylates the NP and P proteins in vitro | |
KR0181517B1 (ko) | 비-에이 비-비형 간염-특이 항원 및 간염 진단에서 그의 용도 | |
Smit et al. | Cloning of the major protein of the Caulobacter crescentus periodic surface layer: detection and characterization of the cloned peptide by protein expression assays | |
JP2679973B2 (ja) | 免疫学的に反応性のウイルス蛋白質の発現 | |
CN110845624B (zh) | 一种sumo-cp融合蛋白及其制备方法以及其多克隆抗体的制备方法 | |
CN111848750B (zh) | 一种快速富集和检测2019-nCoV的方法及试剂盒 | |
Leibowitz et al. | Detection of a murine coronavirus nonstructural protein encoded in a downstream open reading frame | |
JP2887238B2 (ja) | ポリペプチド | |
US4940781A (en) | Peptides comprising an immunogenic side of poliovirus and DNAs containing nucleotide sequences coding for these peptides | |
EP0586065B1 (en) | Antigenic peptides for grouping hepatitis C virus, kit comprising the same and methods for its grouping using the same | |
JP4641695B2 (ja) | 新規なhev抗原性ペプチド及び方法 | |
CN110257405B (zh) | 牛支原体乙醇脱氢酶基因及其编码蛋白与应用 | |
RU2052503C1 (ru) | Полипептид, фрагмент днк нс 360, штамм бактерий escherichia coli - продуцент полипептида, слитого с бета-галактозидазой e.coli | |
RU2041949C1 (ru) | Фрагмент днк нс365, полипептид, штамм бактерий escherichia coli - продуцент полипептида, обладающего способностью связывать антитела к вирусу гепатита c | |
RU2058391C1 (ru) | ПОЛИПЕПТИД, ФРАГМЕНТ ДНК НС270, ШТАММ БАКТЕРИЙ ESCHERICHIA COLI - ПРОДУЦЕНТ ПОЛИПЕПТИДА НС86, СЛИТОГО С β ГАЛАКТОЗИДАЗОЙ ESCHERICHIA COLI | |
RU2052504C1 (ru) | Полипептид, фрагмент днк hc 256 и штамм бактерий escherichia coli - продуцент полипептида нс 80, слитого с бета-галактозизадой e.coli | |
RU2073719C1 (ru) | Фрагмент днк нс 250, полученный с помощью химического синтеза, рекомбинантный полипептид нс 250 молекулярной массы 120 - 130 кда, обладающий способностью связывать антитела к продукту гена белка ns3 вируса гепатита с, полученный при культивировании штамма бактерий escherichia coli и штамм бактерий escherichia coli - продуцент рекомбинантного полипептида нс 250, обладающего способностью связывать антитела к продукту гена белка ns3 вируса гепатита с | |
RU2073718C1 (ru) | Фрагмент днк нс 280, полученный с помощью химического синтеза, рекомбинантный полипептид нс 280 молекулярной массы 120-130 кда, обладающий способностью связывать антитела к продукту гена белка ns4 вируса гепатита с, полученный при культивировании штамма бактерий escherichia coli - штамм бактерий escherichia coli - продуцент рекомбинантного полипептида нс 280, обладающего способностью связывать антитела к продукту гена белка ns4 вируса гепатита с | |
JPH09504685A (ja) | Hardsウイルスの組換えdna抗原を製造する分子クローン | |
Aschauer et al. | Biologically active protease 3C of human rhinovirus 1A is expressed from a cloned cDNA segment in Escherichia coli | |
US7198891B2 (en) | Hepatitis C virus peptides and uses thereof | |
EP0698104B1 (en) | Hippuricase gene | |
US6803214B1 (en) | Nucleic acids and new polypeptides associated with and/or overlapping with hepatitis C virus core gene products |