RU2021132728A - Способ получения полноразмерной последовательности митохондриальной ДНК человека с использованием набора олигонуклеотидов методом мультиплексной амплификации для работы с образцами деградированной ДНК - Google Patents

Способ получения полноразмерной последовательности митохондриальной ДНК человека с использованием набора олигонуклеотидов методом мультиплексной амплификации для работы с образцами деградированной ДНК Download PDF

Info

Publication number
RU2021132728A
RU2021132728A RU2021132728A RU2021132728A RU2021132728A RU 2021132728 A RU2021132728 A RU 2021132728A RU 2021132728 A RU2021132728 A RU 2021132728A RU 2021132728 A RU2021132728 A RU 2021132728A RU 2021132728 A RU2021132728 A RU 2021132728A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
mitochondrial dna
human mitochondrial
dna
full
pcr
Prior art date
Application number
RU2021132728A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2818323C2 (ru
Inventor
Татьяна Владимировна Андреева
Анастасия Петровна Григоренко
Фёдор Евгеньевич Гусев
Original Assignee
Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук (ИОГЕН РАН)
Filing date
Publication date
Application filed by Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук (ИОГЕН РАН) filed Critical Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук (ИОГЕН РАН)
Publication of RU2021132728A publication Critical patent/RU2021132728A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2818323C2 publication Critical patent/RU2818323C2/ru

Links

Claims (11)

  1. Формула изобретения
  2. 1. Способ получения полноразмерной последовательности митохондриальной ДНК человека с использованием набора олигонуклеотидов методом мультиплексной амплификации для работы с образцами деградированной ДНК, характеризующийся тем, что для генотипирования митохондриальной ДНК используется композиция из 447 оригинальных синтетических олигонуклеотидных праймеров для проведения мультиплексной полимеразной цепной реакции (ПЦР), позволяющие амплифицировать короткие перекрывающиеся участки митохондриальной ДНК человека.
  3. 2. Способ по п.1, отличающийся тем, композиция для генотипирования образована 446 синтетических оригинальных олигонуклеотидных праймеров, выбранных из группы SEQ ID NO: 1- SEQ ID NO 446, представленных в Табл.1.
  4. 3. Способ получения полноразмерной последовательности митохондриальной ДНК человека по п.1, включающий генетическое исследования биологического образца, содержащего ДНК, выделенную из любого биологического материала в соответствии со стандартными методами, обеспечивающими качественную очистку ДНК от белков и примесей, с использованием мультиплексной полимеразно-цепной реакции (мультиплексной ПЦР) и последующего определения нуклеотидной последовательности продуктов амплификации, содержащих короткие перекрывающиеся участки митохондриальной ДНК человека.
  5. 4. Способ по п 3., отличающийся тем, что олигонуклеотидные праймеры для мультиплексной ПЦР выбрана из композиции по п.2,
  6. 5. Способ по п.3, отличающийся тем, что размер полученных ПЦР-продуктов составляет не более 145 п.н.
  7. 6. Способ по п.3, отличающийся тем, что полученные в результате мультиплексной амплификации ПЦР продукты, содержащие короткие перекрывающиеся участки митохондриальной ДНК человека используются в качестве матрицы для различных методов генетического определения нуклеотидной последовательности.
  8. 7. Способ по п.3, отличающийся тем, что определение нуклеотидной последовательности продуктов амплификации (ПЦР-продуктов) проводят секвенированием по методу “массового параллельного секвенирования” (NGS), секвенированием по методу Сэнгера, методом TaqMan Real-Time PCR, а также проводят любым доступным способом определения нуклеотидной последовательности.
  9. 8. Способ по п.3, отличающийся тем, что биологический образец содержит деградированную ДНК.
  10. 9. Набор для генотипирования (тест-система ДНК) индивида для осуществления способа по п.1, используемый для получения полноразмерной последовательности митохондриальной ДНК человека, включающий, по крайней мере одну нуклеотидную последовательность выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1- SEQ ID NO 446; и их любых комбинаций.
  11. 10. Применения способа по п.1 для получения полноразмерной последовательности митохондриальной ДНК человека, для идентификации личности в российских популяциях.
RU2021132728A 2021-11-10 Способ получения полноразмерной последовательности митохондриальной ДНК человека с использованием набора олигонуклеотидов методом мультиплексной амплификации для работы с образцами деградированной ДНК RU2818323C2 (ru)

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2021132728A true RU2021132728A (ru) 2023-05-11
RU2818323C2 RU2818323C2 (ru) 2024-05-02

Family

ID=

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Leutenegger et al. Quantitative real-time PCR for the measurement of feline cytokine mRNA
KR0185376B1 (ko) 리보핵산의 합성방법
Umetsu et al. Multiplex amplified product‐length polymorphism analysis of 36 mitochondrial single‐nucleotide polymorphisms for haplogrouping of East Asian populations
JP6100933B2 (ja) アレリックラダー遺伝子座
EP0875582B1 (en) Process for HLA Class 1 DNA typing using PCR amplification
US20110306505A1 (en) X-STR multiplex PCR amplification system
JP2018516594A5 (ru)
RU2021132728A (ru) Способ получения полноразмерной последовательности митохондриальной ДНК человека с использованием набора олигонуклеотидов методом мультиплексной амплификации для работы с образцами деградированной ДНК
KR102368835B1 (ko) 한우의 육량 관련 hspb1 유전자의 유전형 결정용 프라이머 세트 및 이의 용도
CN112609006B (zh) 人类白细胞抗原一步测序分型方法及其应用
CA2907068A1 (en) Kir3dl1 allele classification kit and method
CN110885884A (zh) 用于同步检测cyp2c19基因*2、*3、*17位点基因多态性的方法
RU2021132744A (ru) Способ получения однонуклеотидных молекулярных маркеров для идентификации неизвестного индивида методом мультиплексной амплификации для работы с образцами деградированной ДНК
RU2021132848A (ru) Способ получения молекулярных STR-маркеров Y-хромосомы методом мультиплексной амплификации
KR101845711B1 (ko) Ociad2 유전자 유래의 유전체 각인 판별용 snp 마커 및 이를 이용한 판별 방법
RU2021115050A (ru) Способ получения молекулярных маркеров для определения вероятной внешности человека методом мультиплексной амплификации для работы с образцами деградированной ДНК
RU2799797C2 (ru) Способ получения молекулярных STR-маркеров Y-хромосомы человека для идентификации неизвестного индивида и определения биологического родства методом мультиплексной амплификации, набор олигонуклеотидов для осуществления способа
RU2021132836A (ru) Способ получения молекулярных STR-маркеров Х-хромосомы методом мультиплексной амплификации для работы с образцами малых количеств ДНК
RU2804111C1 (ru) Набор олигонуклеотидных праймеров для определения метилирования промотора гена человека CCR5 в образах биологического материала, подвергшегося предварительной бисульфитной конверсии, методом пиросеквенирования
JPWO2020138435A1 (ja) 眼内悪性リンパ腫の補助的診断法
RU2021134298A (ru) Способ получения молекулярных маркеров для идентификации личности на основе аутосомных STR-маркеров методом мультиплексной амплификации
RU2021132736A (ru) Способ получения однонуклеотидных молекулярных маркеров для определения вероятного этногеографического происхождения человека методом мультиплексной амплификации для работы с образцами деградированной ДНК
RU2804112C1 (ru) Набор олигонуклеотидных праймеров для определения метилирования промотора гена человека CXCR4 в образах биологического материала, подвергшегося предварительной бисульфитной конверсии, методом пиросеквенирования
CN108517371B (zh) 用于二倍体d基因组棉种或四倍体棉种鉴定的引物及方法
JP7488519B2 (ja) Lampプライマーセット及びプライマー対