RU2020118691A - Идентификация лизинов и их производных, обладающих антибактериальной активностью против pseudomonas aeruginosa - Google Patents
Идентификация лизинов и их производных, обладающих антибактериальной активностью против pseudomonas aeruginosa Download PDFInfo
- Publication number
- RU2020118691A RU2020118691A RU2020118691A RU2020118691A RU2020118691A RU 2020118691 A RU2020118691 A RU 2020118691A RU 2020118691 A RU2020118691 A RU 2020118691A RU 2020118691 A RU2020118691 A RU 2020118691A RU 2020118691 A RU2020118691 A RU 2020118691A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- lysine
- gram
- lysine polypeptide
- fragment
- polypeptide
- Prior art date
Links
- 241000589517 Pseudomonas aeruginosa Species 0.000 title claims 3
- 230000000844 anti-bacterial effect Effects 0.000 title 1
- 150000002669 lysines Chemical class 0.000 title 1
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 45
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 claims 45
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims 33
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims 33
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims 33
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 claims 19
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims 18
- 230000002101 lytic effect Effects 0.000 claims 18
- 238000000034 method Methods 0.000 claims 10
- 241000894007 species Species 0.000 claims 10
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims 7
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 claims 6
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 claims 5
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims 5
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 claims 4
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 claims 4
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims 4
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims 4
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 claims 4
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 claims 4
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 claims 4
- 208000035143 Bacterial infection Diseases 0.000 claims 3
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 claims 3
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 claims 3
- 208000022362 bacterial infectious disease Diseases 0.000 claims 3
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 claims 3
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 claims 3
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims 3
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims 3
- MYSWGUAQZAJSOK-UHFFFAOYSA-N ciprofloxacin Chemical compound C12=CC(N3CCNCC3)=C(F)C=C2C(=O)C(C(=O)O)=CN1C1CC1 MYSWGUAQZAJSOK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- 238000011260 co-administration Methods 0.000 claims 2
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 claims 2
- 230000008029 eradication Effects 0.000 claims 2
- 241000588919 Citrobacter freundii Species 0.000 claims 1
- 108010078777 Colistin Proteins 0.000 claims 1
- 241000588914 Enterobacter Species 0.000 claims 1
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 claims 1
- CEAZRRDELHUEMR-URQXQFDESA-N Gentamicin Chemical compound O1[C@H](C(C)NC)CC[C@@H](N)[C@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](NC)[C@@](C)(O)CO2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N CEAZRRDELHUEMR-URQXQFDESA-N 0.000 claims 1
- 229930182566 Gentamicin Natural products 0.000 claims 1
- 241000588748 Klebsiella Species 0.000 claims 1
- GSDSWSVVBLHKDQ-JTQLQIEISA-N Levofloxacin Chemical compound C([C@@H](N1C2=C(C(C(C(O)=O)=C1)=O)C=C1F)C)OC2=C1N1CCN(C)CC1 GSDSWSVVBLHKDQ-JTQLQIEISA-N 0.000 claims 1
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims 1
- 229930182555 Penicillin Natural products 0.000 claims 1
- JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N Penicillin G Chemical compound N([C@H]1[C@H]2SC([C@@H](N2C1=O)C(O)=O)(C)C)C(=O)CC1=CC=CC=C1 JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N 0.000 claims 1
- 108010093965 Polymyxin B Proteins 0.000 claims 1
- 241000293869 Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium Species 0.000 claims 1
- WKDDRNSBRWANNC-UHFFFAOYSA-N Thienamycin Natural products C1C(SCCN)=C(C(O)=O)N2C(=O)C(C(O)C)C21 WKDDRNSBRWANNC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 241000607479 Yersinia pestis Species 0.000 claims 1
- 239000000443 aerosol Substances 0.000 claims 1
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims 1
- 229960004821 amikacin Drugs 0.000 claims 1
- LKCWBDHBTVXHDL-RMDFUYIESA-N amikacin Chemical compound O([C@@H]1[C@@H](N)C[C@H]([C@@H]([C@H]1O)O[C@@H]1[C@@H]([C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](CO)O1)O)NC(=O)[C@@H](O)CCN)[C@H]1O[C@H](CN)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O LKCWBDHBTVXHDL-RMDFUYIESA-N 0.000 claims 1
- 229940126575 aminoglycoside Drugs 0.000 claims 1
- -1 aminoglycosides Chemical compound 0.000 claims 1
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 claims 1
- 229960002100 cefepime Drugs 0.000 claims 1
- HVFLCNVBZFFHBT-ZKDACBOMSA-N cefepime Chemical compound S([C@@H]1[C@@H](C(N1C=1C([O-])=O)=O)NC(=O)\C(=N/OC)C=2N=C(N)SC=2)CC=1C[N+]1(C)CCCC1 HVFLCNVBZFFHBT-ZKDACBOMSA-N 0.000 claims 1
- 229960004682 cefoperazone Drugs 0.000 claims 1
- GCFBRXLSHGKWDP-XCGNWRKASA-N cefoperazone Chemical compound O=C1C(=O)N(CC)CCN1C(=O)N[C@H](C=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H]1C(=O)N2C(C(O)=O)=C(CSC=3N(N=NN=3)C)CS[C@@H]21 GCFBRXLSHGKWDP-XCGNWRKASA-N 0.000 claims 1
- 229960000484 ceftazidime Drugs 0.000 claims 1
- NMVPEQXCMGEDNH-TZVUEUGBSA-N ceftazidime pentahydrate Chemical compound O.O.O.O.O.S([C@@H]1[C@@H](C(N1C=1C([O-])=O)=O)NC(=O)\C(=N/OC(C)(C)C(O)=O)C=2N=C(N)SC=2)CC=1C[N+]1=CC=CC=C1 NMVPEQXCMGEDNH-TZVUEUGBSA-N 0.000 claims 1
- 229950004259 ceftobiprole Drugs 0.000 claims 1
- VOAZJEPQLGBXGO-SDAWRPRTSA-N ceftobiprole Chemical compound S1C(N)=NC(C(=N\O)\C(=O)N[C@@H]2C(N3C(=C(\C=C/4C(N([C@H]5CNCC5)CC\4)=O)CS[C@@H]32)C(O)=O)=O)=N1 VOAZJEPQLGBXGO-SDAWRPRTSA-N 0.000 claims 1
- 229960003405 ciprofloxacin Drugs 0.000 claims 1
- 229960003346 colistin Drugs 0.000 claims 1
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 claims 1
- 230000006378 damage Effects 0.000 claims 1
- 229960000895 doripenem Drugs 0.000 claims 1
- AVAACINZEOAHHE-VFZPANTDSA-N doripenem Chemical compound C=1([C@H](C)[C@@H]2[C@H](C(N2C=1C(O)=O)=O)[C@H](O)C)S[C@@H]1CN[C@H](CNS(N)(=O)=O)C1 AVAACINZEOAHHE-VFZPANTDSA-N 0.000 claims 1
- 230000008030 elimination Effects 0.000 claims 1
- 238000003379 elimination reaction Methods 0.000 claims 1
- 239000000839 emulsion Substances 0.000 claims 1
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 claims 1
- 229960002518 gentamicin Drugs 0.000 claims 1
- 229960002182 imipenem Drugs 0.000 claims 1
- ZSKVGTPCRGIANV-ZXFLCMHBSA-N imipenem Chemical compound C1C(SCC\N=C\N)=C(C(O)=O)N2C(=O)[C@H]([C@H](O)C)[C@H]21 ZSKVGTPCRGIANV-ZXFLCMHBSA-N 0.000 claims 1
- 229960003376 levofloxacin Drugs 0.000 claims 1
- 229960002260 meropenem Drugs 0.000 claims 1
- DMJNNHOOLUXYBV-PQTSNVLCSA-N meropenem Chemical compound C=1([C@H](C)[C@@H]2[C@H](C(N2C=1C(O)=O)=O)[C@H](O)C)S[C@@H]1CN[C@H](C(=O)N(C)C)C1 DMJNNHOOLUXYBV-PQTSNVLCSA-N 0.000 claims 1
- JORAUNFTUVJTNG-BSTBCYLQSA-N n-[(2s)-4-amino-1-[[(2s,3r)-1-[[(2s)-4-amino-1-oxo-1-[[(3s,6s,9s,12s,15r,18s,21s)-6,9,18-tris(2-aminoethyl)-3-[(1r)-1-hydroxyethyl]-12,15-bis(2-methylpropyl)-2,5,8,11,14,17,20-heptaoxo-1,4,7,10,13,16,19-heptazacyclotricos-21-yl]amino]butan-2-yl]amino]-3-h Chemical compound CC(C)CCCCC(=O)N[C@@H](CCN)C(=O)N[C@H]([C@@H](C)O)CN[C@@H](CCN)C(=O)N[C@H]1CCNC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CCN)NC(=O)[C@H](CCN)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CCN)NC1=O.CCC(C)CCCCC(=O)N[C@@H](CCN)C(=O)N[C@H]([C@@H](C)O)CN[C@@H](CCN)C(=O)N[C@H]1CCNC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CCN)NC(=O)[C@H](CCN)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CCN)NC1=O JORAUNFTUVJTNG-BSTBCYLQSA-N 0.000 claims 1
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 claims 1
- 229940049954 penicillin Drugs 0.000 claims 1
- 229960002292 piperacillin Drugs 0.000 claims 1
- IVBHGBMCVLDMKU-GXNBUGAJSA-N piperacillin Chemical compound O=C1C(=O)N(CC)CCN1C(=O)N[C@H](C=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H]1C(=O)N2[C@@H](C(O)=O)C(C)(C)S[C@@H]21 IVBHGBMCVLDMKU-GXNBUGAJSA-N 0.000 claims 1
- 229920000024 polymyxin B Polymers 0.000 claims 1
- XDJYMJULXQKGMM-UHFFFAOYSA-N polymyxin E1 Natural products CCC(C)CCCCC(=O)NC(CCN)C(=O)NC(C(C)O)C(=O)NC(CCN)C(=O)NC1CCNC(=O)C(C(C)O)NC(=O)C(CCN)NC(=O)C(CCN)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(CCN)NC1=O XDJYMJULXQKGMM-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- KNIWPHSUTGNZST-UHFFFAOYSA-N polymyxin E2 Natural products CC(C)CCCCC(=O)NC(CCN)C(=O)NC(C(C)O)C(=O)NC(CCN)C(=O)NC1CCNC(=O)C(C(C)O)NC(=O)C(CCN)NC(=O)C(CCN)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(CCN)NC1=O KNIWPHSUTGNZST-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 229960005266 polymyxin b Drugs 0.000 claims 1
- 239000000843 powder Substances 0.000 claims 1
- 238000003259 recombinant expression Methods 0.000 claims 1
- 229960001225 rifampicin Drugs 0.000 claims 1
- JQXXHWHPUNPDRT-WLSIYKJHSA-N rifampicin Chemical compound O([C@](C1=O)(C)O/C=C/[C@@H]([C@H]([C@@H](OC(C)=O)[C@H](C)[C@H](O)[C@H](C)[C@@H](O)[C@@H](C)\C=C\C=C(C)/C(=O)NC=2C(O)=C3C([O-])=C4C)C)OC)C4=C1C3=C(O)C=2\C=N\N1CC[NH+](C)CC1 JQXXHWHPUNPDRT-WLSIYKJHSA-N 0.000 claims 1
- 239000000243 solution Substances 0.000 claims 1
- 239000007921 spray Substances 0.000 claims 1
- 239000000725 suspension Substances 0.000 claims 1
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 claims 1
- 230000009885 systemic effect Effects 0.000 claims 1
- 229960004659 ticarcillin Drugs 0.000 claims 1
- OHKOGUYZJXTSFX-KZFFXBSXSA-N ticarcillin Chemical compound C=1([C@@H](C(O)=O)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)C=CSC=1 OHKOGUYZJXTSFX-KZFFXBSXSA-N 0.000 claims 1
- 229960000707 tobramycin Drugs 0.000 claims 1
- NLVFBUXFDBBNBW-PBSUHMDJSA-N tobramycin Chemical compound N[C@@H]1C[C@H](O)[C@@H](CN)O[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N NLVFBUXFDBBNBW-PBSUHMDJSA-N 0.000 claims 1
Classifications
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
- A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- A61K38/43—Enzymes; Proenzymes; Derivatives thereof
- A61K38/46—Hydrolases (3)
- A61K38/47—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2), e.g. cellulases, lactases
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
- A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- A61K38/43—Enzymes; Proenzymes; Derivatives thereof
- A61K38/46—Hydrolases (3)
- A61K38/48—Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
- A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- A61K38/162—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from virus
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
- A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- A61K38/164—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K45/00—Medicinal preparations containing active ingredients not provided for in groups A61K31/00 - A61K41/00
- A61K45/06—Mixtures of active ingredients without chemical characterisation, e.g. antiphlogistics and cardiaca
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/04—Antibacterial agents
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
- C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
- C12N9/2462—Lysozyme (3.2.1.17)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y302/00—Hydrolases acting on glycosyl compounds, i.e. glycosylases (3.2)
- C12Y302/01—Glycosidases, i.e. enzymes hydrolysing O- and S-glycosyl compounds (3.2.1)
- C12Y302/01017—Lysozyme (3.2.1.17)
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K2300/00—Mixtures or combinations of active ingredients, wherein at least one active ingredient is fully defined in groups A61K31/00 - A61K41/00
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K9/00—Medicinal preparations characterised by special physical form
- A61K9/0012—Galenical forms characterised by the site of application
- A61K9/007—Pulmonary tract; Aromatherapy
- A61K9/0073—Sprays or powders for inhalation; Aerolised or nebulised preparations generated by other means than thermal energy
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K9/00—Medicinal preparations characterised by special physical form
- A61K9/0012—Galenical forms characterised by the site of application
- A61K9/007—Pulmonary tract; Aromatherapy
- A61K9/0073—Sprays or powders for inhalation; Aerolised or nebulised preparations generated by other means than thermal energy
- A61K9/0075—Sprays or powders for inhalation; Aerolised or nebulised preparations generated by other means than thermal energy for inhalation via a dry powder inhaler [DPI], e.g. comprising micronized drug mixed with lactose carrier particles
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K9/00—Medicinal preparations characterised by special physical form
- A61K9/10—Dispersions; Emulsions
- A61K9/107—Emulsions ; Emulsion preconcentrates; Micelles
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
- Y02A50/00—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
- Y02A50/30—Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Public Health (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
- Oncology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Pulmonology (AREA)
- Otolaryngology (AREA)
- Virology (AREA)
- Dispersion Chemistry (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
Claims (23)
1. Фармацевтическая композиция, содержащая: выделенный полипептид лизина, выбранный из группы, состоящей из одного или более из GN147, GN146, GN156, GN92, GN54, GN201, GN202, GN121, GN94, GN200, GN204, GN205, или его фрагмент, обладающий активностью лизина, или его вариант, обладающий литической активностью и имеющий по меньшей мере 80% идентичность последовательности с указанным полипептидом лизина, и фармацевтически приемлемый носитель, причем указанный полипептид лизина или фрагмент, или вариант присутствует в количестве, эффективном для ингибирования роста или уменьшения популяции, или уничтожения P. aeruginosa и необязательно по меньшей мере одного другого вида грамотрицательных бактерий.
2. Фармацевтическая композиция, содержащая эффективное количество выделенного полипептида лизина, выбранного из группы, состоящей из одного или более из GN3, GN13, GN17, GN9, GN10, GN105, GN108, GN123, GN150, GN203, или его фрагмента, обладающего активностью лизина, или его варианта, обладающего литической активностью и имеющего по меньшей мере 80% идентичность последовательности с указанным полипептидом лизина, и фармацевтически приемлемый носитель, причем указанный полипептид лизина присутствует в количестве, эффективном для ингибирования роста или уменьшения популяции, или уничтожения P. aeruginosa и необязательно по меньшей мере одного другого вида грамотрицательных бактерий; и фармацевтически приемлемый носитель.
3. Фармацевтическая композиция по п. 1 или 2, которая представляет собой раствор, суспензию, эмульсию, ингалируемый порошок, аэрозоль или спрей.
4. Фармацевтическая композиция по п. 2, содержащая дополнительно один или более антибиотиков, подходящих для лечения грамотрицательных бактерий.
5. Вектор, содержащий выделенный полинуклеотид, содержащий молекулу нуклеиновой кислоты, которая кодирует полипептид лизина по п. 1 или 2, причем указанный кодируемый полипептид лизина ингибирует рост или уменьшает популяцию, или уничтожает P. aeruginosa и необязательно по меньшей мере одного другого вида грамотрицательных бактерий, или комплементарную последовательность указанного полинуклеотида.
6. Рекомбинантный вектор экспрессии, содержащий нуклеиновую кислоту, кодирующую полипептид лизина, содержащий аминокислотную последовательность полипептида по п. 1 или 2, причем указанный кодируемый полипептид лизина обладает свойством ингибировать рост или уменьшать популяцию, или приводить к уничтожению P. aeruginosa и необязательно по меньшей мере одного другого вида грамотрицательных бактерий, при этом указанная нуклеиновая кислота функционально связана с гетерологичным промотором.
7. Клетка-хозяин, содержащая вектор по п. 5 или 6.
8. Рекомбинантный вектор по п. 5 или 6, характеризующийся тем, что указанная последовательность нуклеиновой кислоты представляет собой последовательность кДНК.
9. Выделенный полинуклеотид, содержащий молекулу нуклеиновой кислоты, которая кодирует полипептид лизина, выбранный из группы, состоящей из GN147, GN146, GN156, GN92, GN54, GN201, GN202, GN121, GN94, GN200, GN204, GN205, или его фрагмент, обладающий активностью лизина, или его вариант, обладающий литической активностью и имеющий по меньшей мере 80% идентичность последовательности с указанным полипептидом лизина, причем указанный полипептид лизина ингибирует рост или уменьшает популяцию, или уничтожает P. aeruginosa и необязательно по меньшей мере одного другого вида грамотрицательных бактерий.
10. Полинуклеотид по п. 9, который представляет собой кДНК.
11. Способ ингибирования роста или уменьшения популяции, или уничтожения по меньшей мере одного вида грамотрицательных бактерий, причем указанный способ включает приведение указанных бактерий в контакт с фармацевтической композицией, содержащей полипептид лизина, выбранный из группы, состоящей из одного или более из GN147, GN146, GN156, GN92, GN54, GN201, GN202, GN121, GN94, GN200, GN204, GN205, GN3, GN13, GN17, GN9, GN10, GN105, GN108, GN123, GN150, GN203, или его фрагмент, обладающий литической активностью, или его вариант, обладающий литической активностью и имеющий по меньшей мере 80% идентичность последовательности с указанным полипептидом лизина, в количестве, эффективном для ингибирования роста или уменьшения популяции, или уничтожения P. aeruginosa и необязательно по меньшей мере одного другого вида грамотрицательных бактерий.
12. Способ лечения бактериальной инфекции, вызванной грамотрицательными бактериями, выбранными из группы, состоящей из P. aeruginosa и необязательно одного или более дополнительных видов грамотрицательных бактерий, включающий введение субъекту, у которого диагностирована, который подвержен риску или у которого наблюдаются симптомы бактериальной инфекции, композиции, содержащей полипептид лизина, выбранный из группы, состоящей из одного или более из GN147, GN146, GN156, GN92, GN54, GN201, GN202, GN121, GN94, GN200, GN204, GN 205, GN3, GN13, GN17, GN9, GN10, GN105, GN108, GN123, GN150, GN203, или его фрагмент, обладающий активностью лизина, или его вариант, обладающий литической активностью и имеющий по меньшей мере 80% идентичность последовательности с указанным полипептидом лизина, в количестве, эффективном для ингибирования роста или уменьшения популяции, или уничтожения P. aeruginosa и необязательно по меньшей мере одного другого вида грамотрицательных бактерий.
13. Способ по п. 12, характеризующийся тем, что по меньшей мере один вид грамотрицательных бактерий выбран из группы, состоящей из Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella spp., Enterobacter spp., Escherichia coli, Citrobacter freundii, Salmonella typhimurium, Yersinia pestis и Franciscella tulerensis.
14. Способ по п. 12, характеризующийся тем, что указанная инфекция, вызванная грамотрицательными бактериями, представляет собой инфекцию, вызванную Pseudomonas aeruginosa.
15. Способ лечения местной или системной патогенной бактериальной инфекции, вызванной грамотрицательными бактериями, выбранными из группы, состоящей из P. aeruginosa и необязательно одного или более дополнительных видов грамотрицательных бактерий, у субъекта, включающий введение субъекту композиции, содержащей полипептид лизина, выбранный из группы, состоящей из одного или более из GN147, GN146, GN156, GN92, GN54, GN201, GN202, GN121, GN94, GN200, GN204, GN 205,GN3, GN13, GN17, GN9, GN10, GN105, GN108, GN123, GN150, GN203, или его фрагменты, обладающие активностью лизина, или его варианты, обладающие литической активностью и имеющие по меньшей мере 80% идентичность последовательности с указанным полипептидом лизина, в количестве, эффективном для ингибирования роста или уменьшения популяции, или уничтожения P. aeruginosa и необязательно по меньшей мере одной другой грамотрицательной бактерии.
16. Способ предотвращения или лечения бактериальной инфекции, включающий совместное введение субъекту, у которого диагностирована, который подвержен риску или у которого наблюдаются симптомы бактериальной инфекции, комбинации первого эффективного количества указанной композиции, содержащей эффективное количество выбранного из группы, состоящей из одного или более из GN147, GN146, GN156, GN92, GN54, GN201, GN202, GN121, GN94, GN200, GN204, GN 205, GN3, GN13, GN17, GN9, GN10, GN105, GN108, GN123, GN150, GN203, или его фрагмента, обладающего литической активностью, или его варианта, обладающего литической активностью и имеющего по меньшей мере 80% идентичность последовательности с указанным полипептидом лизина, и второго эффективного количества антибиотика, подходящего для лечения инфекции, вызванной грамотрицательными бактериями.
17. Способ по п. 16, характеризующийся тем, что указанный антибиотик выбран из одного или более из цефтазидима, цефепима, цефоперазона, цефтобипрола, ципрофлоксацина, левофлоксацина, аминогликозидов, имипенема, меропенема, дорипенема, гентамицина, тобрамицина, амикацина, пиперациллина, тикарциллина, пенициллина, рифампицина, полимиксина В и колистина.
18. Способ повышения эффективности антибиотика, подходящего для лечения инфекции, вызванной грамотрицательными бактериями, включающий совместное введение указанного антибиотика в комбинации с одним или более полипептидами лизина, выбранными из группы, состоящей из одного или более из GN147, GN146, GN156, GN92, GN54, GN201, GN202, GN121, GN94, GN200, GN204, GN205, GN3, GN13, GN17, GN9, GN10, GN105, GN108, GN123, GN150, GN203, или его фрагментом, обладающим литической активностью, или его вариантом, обладающим литической активностью и имеющим по меньшей мере 80% идентичность последовательности с указанным полипептидом лизина, причем введение указанной комбинации более эффективно ингибирует рост или уменьшает популяцию, или уничтожает грамотрицательных бактерий, чем введение либо указанного антибиотика, либо указанного полипептида лизина, либо его активного фрагмента по отдельности.
19. Выделенный полипептид лизина, выбранный из группы, состоящей из GN147, GN146, GN156, GN92, GN54, GN201, GN202, GN121, GN94, GN200, GN204, GN205, или его фрагмент, обладающий активностью лизина, или его вариант, обладающий литической активностью и имеющий по меньшей мере 80% идентичность последовательности с указанным полипептидом лизина, причем указанный полипептид лизина ингибирует рост или уменьшает популяцию, или уничтожает P. aeruginosa, и необязательно по меньшей мере одного другого вида грамотрицательных бактерий.
20. Полипептид лизина, содержащий нативный лизин против грамотрицательных бактерий, выбранный из группы, состоящей из GN3, GN9, GN10, GN13, GN17,GN105, GN108, GN123, GN150 и GN203, или его фрагмент, обладающий литической активностью, или его вариант, обладающий литической активностью и имеющий по меньшей мере 80% идентичность последовательности с указанным полипептидом лизина, причем указанный нативный лизин или фрагмент необязательно модифицирован путем замены 1-3 заряженных остатков аминокислот незаряженными остатками аминокислот, при этом указанный модифицированный нативный лизин или фрагмент сохраняет литическую активность.
21. Полипептид лизина, содержащий нативный лизин против грамотрицательных бактерий, выбранный из группы, состоящей из GN2, GN4, GN14, GN43 и GN37, или его фрагмент, обладающий литической активностью, или его вариант, обладающий литической активностью и имеющий по меньшей мере 80% идентичность последовательности с указанным полипептидом лизина, причем указанный нативный лизин или вариант, или фрагмент модифицирован путем замены 1-3 заряженных остатков аминокислот незаряженными остатками аминокислот, при этом указанный модифицированный нативный лизин или фрагмент сохраняет литическую активность.
22. Фармацевтическая композиция по п. 1 или 2, отличающаяся тем, что указанный полипептид лизина выбран из группы, состоящей из одного или более из GN156, GN121, GN108 и GN123 или их активных фрагментов или их вариантов, обладающих литической активностью и имеющих по меньшей мере 80% идентичность последовательности с указанным полипептидом лизина.
23. Способ по п. 11, характеризующийся тем, что указанные бактерии находятся в биопленке, причем указанный способ приводит к разрушению биопленки.
Applications Claiming Priority (5)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US201762597577P | 2017-12-12 | 2017-12-12 | |
| US62/597,577 | 2017-12-12 | ||
| US201862721969P | 2018-08-23 | 2018-08-23 | |
| US62/721,969 | 2018-08-23 | ||
| PCT/US2018/065265 WO2019118632A1 (en) | 2017-12-12 | 2018-12-12 | Identification of lysins and derivatives thereof with bacterial activity against pseudomonas aeruginosa |
Publications (3)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2020118691A true RU2020118691A (ru) | 2022-01-13 |
| RU2807688C2 RU2807688C2 (ru) | 2023-11-21 |
| RU2807688C9 RU2807688C9 (ru) | 2023-12-26 |
Family
ID=
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| MX2020006098A (es) | 2020-08-24 |
| KR20200098615A (ko) | 2020-08-20 |
| US20210085758A1 (en) | 2021-03-25 |
| JP2024010053A (ja) | 2024-01-23 |
| IL275060B1 (en) | 2023-06-01 |
| IL275060A (en) | 2020-07-30 |
| BR112020011433A2 (pt) | 2020-12-01 |
| IL275060B2 (en) | 2023-10-01 |
| AU2018384790A1 (en) | 2020-07-30 |
| CN111971058A (zh) | 2020-11-20 |
| IL303122A (en) | 2023-07-01 |
| CA3085644A1 (en) | 2019-06-20 |
| EP3723789A4 (en) | 2021-12-01 |
| WO2019118632A1 (en) | 2019-06-20 |
| JP2021506769A (ja) | 2021-02-22 |
| EP3723789A1 (en) | 2020-10-21 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2018107245A (ru) | Полипептиды лизина, активные против грамотрицательных бактерий | |
| JP2021506769A5 (ru) | ||
| Łusiak-Szelachowska et al. | Bacteriophages and lysins in biofilm control | |
| Łusiak-Szelachowska et al. | Bacteriophages and antibiotic interactions in clinical practice: what we have learned so far | |
| Gawande et al. | Antibiofilm and antimicrobial efficacy of DispersinB®-KSL-W peptide-based wound gel against chronic wound infection associated bacteria | |
| JP2024010053A (ja) | シュードモナス・エルギノーサに対する殺菌活性を有する溶解素及びその誘導体の特定 | |
| RU2017102306A (ru) | Лизины ацинетобактеров | |
| RU2020128276A (ru) | МОДИФИЦИРОВАННЫЕ ЛИЗИНЫ PlySs2 И ВАРИАНТЫ ИХ ПРИМЕНЕНИЯ | |
| JPWO2019191633A5 (ru) | ||
| Kozlovska et al. | The effect of antimicrobial agents on planktonic and biofilm forms of bacteria that are isolated from chronic anal fissures | |
| Huang et al. | Inhibition of phage-resistant bacterial pathogen re-growth with the combined use of bacteriophages and EDTA | |
| RU2020112725A (ru) | Композиции и способы для борьбы с инфекциями, вызванными синегнойной палочкой (pseudomonas aeruginosa) | |
| JPWO2020046747A5 (ru) | ||
| Łusiak-Szelachowska et al. | Anti-biofilm activity of bacteriophages and lysins in chronic rhinosinusitis. | |
| RU2021128336A (ru) | Лизины и их производные с бактерицидной активностью против pseudomonas aeruginosa в присутствии сыворотки крови человека | |
| RU2020131450A (ru) | Происходящие из бактериофагов противомикробные полипептиды и их применение против грамотрицательных бактерий | |
| RU2020129467A (ru) | Полипептидные конструкции лизин-противомикробный пептид (amp), лизины, выделенные полинуклеотиды, кодирующие их, а также варианты их применения | |
| JPWO2020206327A5 (ru) | ||
| RU2020129478A (ru) | Полипептидные конструкции лизин-противомикробный пептид (amp), лизины, выделенные полинуклеотиды, кодирующие их, а также варианты их применения | |
| JPWO2021097192A5 (ru) | ||
| RU2021137156A (ru) | Происходящие из бактериофагов противомикробные полипептиды и их применение против грамотрицательных и кислотоустойчивых бактерий | |
| EP4138883A1 (en) | A chimeric endolysin polypeptide | |
| JPWO2019191598A5 (ru) | ||
| Faheem et al. | 1. Recent developments in methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) management and potential antimicrobial alternatives to combat the antibiotic resistance challenge: A review | |
| Shahrour et al. | Israa Dandache, Sergio Bárcena-Varela, Susana Sánchez-Gómez, Ali Chokr, and Guillermo Martinez-de-Tejada |