RU2020111214A - Слитый белок из белка dctn1 с белком ret - Google Patents

Слитый белок из белка dctn1 с белком ret Download PDF

Info

Publication number
RU2020111214A
RU2020111214A RU2020111214A RU2020111214A RU2020111214A RU 2020111214 A RU2020111214 A RU 2020111214A RU 2020111214 A RU2020111214 A RU 2020111214A RU 2020111214 A RU2020111214 A RU 2020111214A RU 2020111214 A RU2020111214 A RU 2020111214A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
seq
polynucleotide
protein
ret
polypeptide
Prior art date
Application number
RU2020111214A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2020111214A3 (ru
RU2813996C2 (ru
Inventor
Кохеи ХАЯСИ
Кейдзи ИСИДА
Original Assignee
Тайхо Фармасьютикал Ко., Лтд.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Тайхо Фармасьютикал Ко., Лтд. filed Critical Тайхо Фармасьютикал Ко., Лтд.
Publication of RU2020111214A publication Critical patent/RU2020111214A/ru
Publication of RU2020111214A3 publication Critical patent/RU2020111214A3/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2813996C2 publication Critical patent/RU2813996C2/ru

Links

Classifications

    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
    • G01N33/57407—Specifically defined cancers
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/46—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
    • C07K14/47—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00—Antineoplastic agents
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/82—Translation products from oncogenes
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/32—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against translation products of oncogenes
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K19/00—Hybrid peptides, i.e. peptides covalently bound to nucleic acids, or non-covalently bound protein-protein complexes
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/10—Transferases (2.)
    • C12N9/12—Transferases (2.) transferring phosphorus containing groups, e.g. kinases (2.7)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/02—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving viable microorganisms
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6806—Preparing nucleic acids for analysis, e.g. for polymerase chain reaction [PCR] assay
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6813—Hybridisation assays
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/15—Medicinal preparations ; Physical properties thereof, e.g. dissolubility
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33—Heterocyclic compounds
    • A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/435—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with one nitrogen as the only ring hetero atom
    • A61K31/47—Quinolines; Isoquinolines
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33—Heterocyclic compounds
    • A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/495—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with two or more nitrogen atoms as the only ring heteroatoms, e.g. piperazine or tetrazines
    • A61K31/505—Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim
    • A61K31/517—Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim ortho- or peri-condensed with carbocyclic ring systems, e.g. quinazoline, perimidine
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33—Heterocyclic compounds
    • A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/495—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with two or more nitrogen atoms as the only ring heteroatoms, e.g. piperazine or tetrazines
    • A61K31/505—Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim
    • A61K31/519—Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim ortho- or peri-condensed with heterocyclic rings
    • A61K31/52—Purines, e.g. adenine
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33—Heterocyclic compounds
    • A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/535—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with at least one nitrogen and one oxygen as the ring hetero atoms, e.g. 1,2-oxazines
    • A61K31/5375—1,4-Oxazines, e.g. morpholine
    • A61K31/5377—1,4-Oxazines, e.g. morpholine not condensed and containing further heterocyclic rings, e.g. timolol
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K45/00—Medicinal preparations containing active ingredients not provided for in groups A61K31/00 - A61K41/00
    • A61K45/06—Mixtures of active ingredients without chemical characterisation, e.g. antiphlogistics and cardiaca
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2319/00—Fusion polypeptide
    • C07K2319/40—Fusion polypeptide containing a tag for immunodetection, or an epitope for immunisation
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • C12N15/1135—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing against oncogenes or tumor suppressor genes
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10—Type of nucleic acid
    • C12N2310/14—Type of nucleic acid interfering N.A.
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/158—Expression markers
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
    • G01N2800/52—Predicting or monitoring the response to treatment, e.g. for selection of therapy based on assay results in personalised medicine; Prognosis

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Hospice & Palliative Care (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)

Claims (41)

1. Полипептид, где N-концевая часть белка DCTN1 слита с C-концевой частью белка RET.
2. Полипептид по п. 1, выбранный из следующих (a) - (c):
(a) полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, представленную SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 14, SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 22 или SEQ ID NO: 24;
(b) полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, где одна или несколько аминокислот заменены, делетированы или добавлены в аминокислотной последовательности, представленной SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 14, SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 22 или SEQ ID NO: 24 ; и
(c) полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 90% идентичность с аминокислотной последовательностью, представленной SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 14, SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 22 или SEQ ID NO: 24.
3. Полинуклеотид, кодирующий полипептид по п. 1 или 2.
4. Полинуклеотид по п. 3, выбранный из следующих (d) - (f):
(d) полинуклеотид, кодирующий полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, представленную SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 14, SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 22 или SEQ ID NO: 24;
(e) полинуклеотид, кодирующий полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, где одна или несколько аминокислот заменены, делетированы или добавлены в аминокислотной последовательности, представленной SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 14, SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 22 или SEQ ID NO: 24; и
(f) полинуклеотид, кодирующий полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 90% идентичность с аминокислотной последовательностью, представленной SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 14, SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 22 или SEQ ID NO: 24.
5. Полинуклеотид по п. 3, выбранный из следующих (g) - (i):
(g) полинуклеотид, содержащий последовательность оснований, представленную SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 21 или SEQ ID NO: 23;
(h) полинуклеотид, гибридизующийся в строгих условиях с полинуклеотидом, содержащим последовательность оснований, комплементарную последовательности оснований, представленной SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 21 или SEQ ID NO: 23; и
(i) полинуклеотид, имеющий по меньшей мере 90% идентичность с последовательностью оснований, представленной SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 21 или SEQ ID NO: 23.
6. Экспрессирующий вектор, содержащий полинуклеотид по любому из пп. 3-5.
7. Клетка, трансфицированная полинуклеотидом по любому из пп. 3-5.
8. Антитело, специфически связывающееcя с полипептидом по п. 1 или 2.
9. Способ детекции присутствия полипептида по п. 1 или 2 в образце.
10. Праймер или зонд для детекции присутствия полинуклеотида по любому из пп. 3-5 в образце, представляющий собой полинуклеотид, выбранный из следующих (j) - (l):
(j) полинуклеотид, представляющий собой по меньшей мере один зонд, выбранный из группы, состоящей из зондов, гибридизующихся с полинуклеотидом, кодирующим белок DCTN1, и зондов, гибридизующихся с полинуклеотидом, кодирующим белок RET;
(k) полинуклеотид, представляющий собой зонд, гибридизующийся с точкой слияния между полинуклеотидом, кодирующим белок DCTN1, и полинуклеотидом, кодирующим белок RET; и
(l) полинуклеотид, представляющий собой набор из смыслового праймера и антисмыслового праймера, разработанных для обрамления точки слияния между полинуклеотидом, кодирующим белок DCTN1, и полинуклеотидом, кодирующим белок RET.
11. Способ детекции присутствия полинуклеотида по любому из пп. 3-5 в образце.
12. Способ диагностики злокачественной опухоли у пациента, когда присутствие полипептида по п.1 или 2 или полинуклеотида по любому из пп. 3-5 детектируют в образце, полученном от пациента, посредством способа детекции по п. 9 или 11.
13. Фармацевтическая композиция для лечения злокачественной опухоли, которая является положительной по гену, слитому из гена DCTN1 и гена RET, и/или положительной по белку, слитому из белка DCTN1 и белка RET, где композиция содержит соединение, ингибирующее RET, в качестве активного ингредиента.
14. Способ скрининга соединения, ингибирующего экспрессию и/или активность полипептида по п. 1 или 2 или экспрессию полинуклеотида по любому из пп. 3-5, включающий следующие стадии (1) и (2):
(1) стадию приведения полипептида по п. 1 или 2, клетки, экспрессирующей полипептид по п. 1 или 2, или полинуклеотида по любому из пп. 3-5, или клетки по п. 7 в контакт с тестируемым соединением; и
(2) стадию измерения того, ингибирована ли экспрессия и/или активность полипептида по п. 1 или 2 или экспрессия полинуклеотида по любому из пп. 3-5 на стадии (1), или стадию измерения того, ингибирован ли рост клетки на стадии (1).
15. Способ с использованием полипептида по п. 1 или 2, или полинуклеотида по любому из пп. 3-5 в качестве индикатора для определения того, является ли эффективной химиотерапия с использованием соединения, ингибирующего RET,
включающий определение того, что химиотерапия с использованием соединения, ингибирующего RET, является эффективной, когда полипептид по п. 1 или 2 детектируют в образце посредством способа детекции по п. 9, и/или когда присутствие полинуклеотида по любому из пп. 3-5 детектируют в образце посредством способа детекции по п. 11.
16. Биомаркер для детекции злокачественной опухоли, содержащий по меньшей мере один член, выбранный из группы, состоящей из полипептидов, где N-концевая часть белка DCTN1 слита с C-концевой частью белка RET, и полинуклеотидов, кодирующих полипептиды.
17. Способ лечения злокачественной опухоли, включающий
проведение химиотерапии с использованием соединения, ингибирующего RET, для пациента с злокачественной опухолью, положительной по гену, слитому из гена DCTN1 и гена RET, и/или положительной по белку, слитому из белка DCTN1 и белка RET.
18. Способ лечения злокачественной опухоли, включающий
детекцию присутствия полипептида по п. 1 или 2, и/или присутствия полинуклеотида по любому из пп. 3-5 в образце, полученном от тестируемого субъекта, и
проведение химиотерапии с использованием соединения, ингибирующего RET, для тестируемого субъекта, когда детектировано присутствие полипептида по п. 1 или 2, и/или детектировано присутствие полинуклеотида по любому из пп. 3-5.
19. Соединение, ингибирующее RET, для применения в лечении пациента со злокачественной опухолью, положительной по гену, слитому из гена DCTN1 и гена RET, и/или положительной по белку, слитому из белка DCTN1 и белка RET.
20. Применение соединения, ингибирующего RET, для получения фармацевтической композиции для лечения злокачественной опухоли для лечения пациента со злокачественной опухолью, положительной по гену, слитому из гена DCTN1 и гена RET, и/или положительной по белку, слитому из белка DCTN1 и белка RET.
21. Способ получения реагента для определения того, является ли химиотерапия с использованием соединения, ингибирующего RET, эффективной, с использованием средств для детекции присутствия полипептида по п. 1 или 2 в образце, и/или средств для детекции присутствия полинуклеотида по любому из пп. 3-5 в образце.
22. Комбинация антитела к DCTN1 и антитела к RET для детекции присутствия полинуклеотида по любому из пп. 3-5.
23. Применение антитела по п. 8, комбинации антител по п. 22 или праймера или зонда по п. 10 для получения детектирующего реагента для детекции присутствия полипептида по п. 1 или 2, или присутствия полинуклеотида по любому из пп. 3-5.
RU2020111214A 2017-08-21 2018-08-20 Слитый белок из белка dctn1 с белком ret RU2813996C2 (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP2017158796 2017-08-21
JP2017-158796 2017-08-21
PCT/JP2018/030688 WO2019039439A1 (ja) 2017-08-21 2018-08-20 Ｄｃｔｎ１タンパク質とｒｅｔタンパク質との融合タンパク質

Publications (3)

Publication Number Publication Date
RU2020111214A true RU2020111214A (ru) 2021-09-24
RU2020111214A3 RU2020111214A3 (ru) 2021-12-17
RU2813996C2 RU2813996C2 (ru) 2024-02-21

Family

ID=

Also Published As

Publication number Publication date
SG11202001212SA (en) 2020-03-30
PH12020500269A1 (en) 2020-09-21
MX2020002002A (es) 2020-07-20
EP3674325A4 (en) 2021-11-03
KR20200038528A (ko) 2020-04-13
WO2019039439A1 (ja) 2019-02-28
RU2020111214A3 (ru) 2021-12-17
EP3674325A1 (en) 2020-07-01
MA49988A (fr) 2020-07-01
BR112020003006A2 (pt) 2020-08-11
US20200190154A1 (en) 2020-06-18
CN111032696A (zh) 2020-04-17
JP7033143B2 (ja) 2022-03-09
AU2018322286B2 (en) 2022-03-10
AU2018322286A1 (en) 2020-04-02
MY201941A (en) 2024-03-25
TW201915027A (zh) 2019-04-16
CN111032696B (zh) 2023-11-03
CA3073375A1 (en) 2019-02-28
JPWO2019039439A1 (ja) 2020-08-13

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Kobayashi et al. The c‐Cbl/CD2AP complex regulates VEGF‐induced endocytosis and degradation of Flt‐1 (VEGFR‐1)
JP2019518452A5 (ru)
Mouton et al. Ascribing novel functions to the sarcomeric protein, myosin binding protein H (MyBPH) in cardiac sarcomere contraction
JP4394924B2 (ja) 膵癌の診断および治療のための方法、ならびにそれらに有用な組成物
Kim et al. Basal STAT3 activities are negatively correlated with tumor size in papillary thyroid carcinomas
RU2020111214A (ru) Слитый белок из белка dctn1 с белком ret
Dye et al. hShroom1 links a membrane bound protein to the actin cytoskeleton
CN108152483A (zh) 一种免疫电化学分析仪
JP2003510053A (ja) ヘパラナーゼ蛋白質ファミリーの１種、ヘパラナーゼ−２
Shi et al. A Stable Cell Line Co-expressing hTRPV1 and GCaMP6s: A Novel Cell-based Assay For High-throughput Screening of hTRPV1 Agonists
US7399830B2 (en) Synaptic activation protein compositions and method
CN103797369A (zh) 抗wt1抗体的测定方法
KR101556403B1 (ko) 지방간, 비만 및 당뇨병과 관련된 유전자 및 그의 용도
KR101058783B1 (ko) 간암진단용 ｐｐｉａ 마커, 항체 및 이들을 이용한간암치료용 화합물의 스크리닝 방법
US20070298022A1 (en) Identification of Phospholipase A2 as Target in Cancer Treatment, with Special Emphasis on Colorectal Cancer and Its Mechanism of Action
US20060194293A1 (en) Rb1 gene induced protein (rb1cc1) and gene
US10023915B2 (en) Method for screening for a cancer treatment agent using the interaction between PAUF and a binding partner thereof
KR20120005891A (ko) 유비퀴틴 특이적 프로테아제 44（ｕｓｐ４４）의 에피토프 펩타이드 및 이의 이용
KR20070027659A (ko) 유방암 특이적 단백질, 그를 코딩하는 유전자, 및 상기단백질 또는 유전자를 이용한 유방암의 진단 방법
KR100993531B1 (ko) 백혈병 진단용 핵산
CN103288930A (zh) 转移肿瘤缺失蛋白二聚化荧光探针及其应用
Moriya et al. Expression of the WT1 gene-KTS domain isoforms suppresses the invasive ability of human lung squamous cell carcinoma cells
WO2005033266A2 (en) Regulation of acheron expression
WO2023137331A3 (en) Compositions and methods for treatment of cytokine storm and related conditions
US6331390B1 (en) Cell-cycle regulatory proteins, and uses related thereto