RU2018124295A - Композиции и способы для иммуноонкологии - Google Patents

Композиции и способы для иммуноонкологии Download PDF

Info

Publication number
RU2018124295A
RU2018124295A RU2018124295A RU2018124295A RU2018124295A RU 2018124295 A RU2018124295 A RU 2018124295A RU 2018124295 A RU2018124295 A RU 2018124295A RU 2018124295 A RU2018124295 A RU 2018124295A RU 2018124295 A RU2018124295 A RU 2018124295A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
seq
target
molecule
cell
nrna
Prior art date
Application number
RU2018124295A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2018124295A3 (ru
RU2771624C2 (ru
Inventor
Мин-Вэй Чэнь
Мелисса Дек
Гленн Дранофф
Крейг Микенин
Рейнальд Лескарбо
Селеста Ричардсон
Морег Стюарт
И Ян
Original Assignee
Новартис Аг
Интеллиа Терапьютикс, Инк.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Новартис Аг, Интеллиа Терапьютикс, Инк. filed Critical Новартис Аг
Publication of RU2018124295A publication Critical patent/RU2018124295A/ru
Publication of RU2018124295A3 publication Critical patent/RU2018124295A3/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2771624C2 publication Critical patent/RU2771624C2/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70—Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7088—Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K35/00—Medicinal preparations containing materials or reaction products thereof with undetermined constitution
    • A61K35/12—Materials from mammals; Compositions comprising non-specified tissues or cells; Compositions comprising non-embryonic stem cells; Genetically modified cells
    • A61K35/14—Blood; Artificial blood
    • A61K35/17—Lymphocytes; B-cells; T-cells; Natural killer cells; Interferon-activated or cytokine-activated lymphocytes
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
    • A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • A61K38/17—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • A61K38/177—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
    • A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • A61K38/17—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • A61K38/177—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • A61K38/1774—Immunoglobulin superfamily (e.g. CD2, CD4, CD8, ICAM molecules, B7 molecules, Fc-receptors, MHC-molecules)
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
    • A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • A61K38/43—Enzymes; Proenzymes; Derivatives thereof
    • A61K38/46—Hydrolases (3)
    • A61K38/465—Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1), e.g. lipases, ribonucleases
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/46—Cellular immunotherapy
    • A61K39/461—Cellular immunotherapy characterised by the cell type used
    • A61K39/4611—T-cells, e.g. tumor infiltrating lymphocytes [TIL], lymphokine-activated killer cells [LAK] or regulatory T cells [Treg]
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/46—Cellular immunotherapy
    • A61K39/463—Cellular immunotherapy characterised by recombinant expression
    • A61K39/4631—Chimeric Antigen Receptors [CAR]
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/46—Cellular immunotherapy
    • A61K39/463—Cellular immunotherapy characterised by recombinant expression
    • A61K39/4632—T-cell receptors [TCR]; antibody T-cell receptor constructs
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/46—Cellular immunotherapy
    • A61K39/464—Cellular immunotherapy characterised by the antigen targeted or presented
    • A61K39/4643—Vertebrate antigens
    • A61K39/4644—Cancer antigens
    • A61K39/464402—Receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • A61K39/464411—Immunoglobulin superfamily
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/46—Cellular immunotherapy
    • A61K39/464—Cellular immunotherapy characterised by the antigen targeted or presented
    • A61K39/4643—Vertebrate antigens
    • A61K39/4644—Cancer antigens
    • A61K39/464402—Receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • A61K39/464411—Immunoglobulin superfamily
    • A61K39/464412—CD19 or B4
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/46—Cellular immunotherapy
    • A61K39/464—Cellular immunotherapy characterised by the antigen targeted or presented
    • A61K39/4643—Vertebrate antigens
    • A61K39/4644—Cancer antigens
    • A61K39/464402—Receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • A61K39/464416—Receptors for cytokines
    • A61K39/464417—Receptors for tumor necrosis factors [TNF], e.g. lymphotoxin receptor [LTR], CD30
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K45/00—Medicinal preparations containing active ingredients not provided for in groups A61K31/00 - A61K41/00
    • A61K45/06—Mixtures of active ingredients without chemical characterisation, e.g. antiphlogistics and cardiaca
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K9/00—Medicinal preparations characterised by special physical form
    • A61K9/0002—Galenical forms characterised by the drug release technique; Application systems commanded by energy
    • A61K9/0009—Galenical forms characterised by the drug release technique; Application systems commanded by energy involving or responsive to electricity, magnetism or acoustic waves; Galenical aspects of sonophoresis, iontophoresis, electroporation or electroosmosis
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00—Antineoplastic agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00—Antineoplastic agents
    • A61P35/02—Antineoplastic agents specific for leukemia
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/705—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • C07K14/70503—Immunoglobulin superfamily
    • C07K14/7051—T-cell receptor (TcR)-CD3 complex
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
    • C12N15/102—Mutagenizing nucleic acids
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • C12N15/1135—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing against oncogenes or tumor suppressor genes
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • C12N15/1138—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing against receptors or cell surface proteins
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/87—Introduction of foreign genetic material using processes not otherwise provided for, e.g. co-transformation
    • C12N15/90—Stable introduction of foreign DNA into chromosome
    • C12N15/902—Stable introduction of foreign DNA into chromosome using homologous recombination
    • C12N15/907—Stable introduction of foreign DNA into chromosome using homologous recombination in mammalian cells
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N5/00—Undifferentiated human, animal or plant cells, e.g. cell lines; Tissues; Cultivation or maintenance thereof; Culture media therefor
    • C12N5/06—Animal cells or tissues; Human cells or tissues
    • C12N5/0602—Vertebrate cells
    • C12N5/0634—Cells from the blood or the immune system
    • C12N5/0636—T lymphocytes
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14—Hydrolases (3)
    • C12N9/16—Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1)
    • C12N9/22—Ribonucleases RNAses, DNAses
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K2239/00—Indexing codes associated with cellular immunotherapy of group A61K39/46
    • A61K2239/26—Universal/off- the- shelf cellular immunotherapy; Allogenic cells or means to avoid rejection
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2319/00—Fusion polypeptide
    • C07K2319/01—Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif
    • C07K2319/03—Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif containing a transmembrane segment
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10—Type of nucleic acid
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10—Type of nucleic acid
    • C12N2310/20—Type of nucleic acid involving clustered regularly interspaced short palindromic repeats [CRISPRs]
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30—Chemical structure
    • C12N2310/31—Chemical structure of the backbone
    • C12N2310/315—Phosphorothioates
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30—Chemical structure
    • C12N2310/32—Chemical structure of the sugar
    • C12N2310/321—2'-O-R Modification
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2320/00—Applications; Uses
    • C12N2320/30—Special therapeutic applications
    • C12N2320/32—Special delivery means, e.g. tissue-specific
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2320/00—Applications; Uses
    • C12N2320/30—Special therapeutic applications
    • C12N2320/35—Special therapeutic applications based on a specific dosage / administration regimen
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2510/00—Genetically modified cells
    • Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
    • Y02A50/00—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
    • Y02A50/30—Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Developmental Biology & Embryology (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)

Claims (80)

1. Композиция, содержащая молекулу нРНК, включающую tracr и crРНК, где crРНК включает направляющий домен, который комплементарен последовательности-мишени мишени аллогенной T-клетки, выбранной из B2M, CD247, CD3D, CD3E, CD3G, TRAC, TRBC1, TRBC2, HLA-A, HLA-B, HLA-C, DCK, CD52, FKBP1A, CIITA, NLRC5, RFXANK, RFX5, RFXAP или NR3C1, где:
(a) мишенью аллогенной T-клетки является B2M, и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 1 - SEQ ID NO: 83 или SEQ ID NO: 5492 - SEQ ID NO: 5527;
(b) мишенью аллогенной T-клетки является TRAC, и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 5528 - SEQ ID NO: 5623 или SEQ ID NO: 5816 - SEQ ID NO: 5965;
(c) мишенью аллогенной T-клетки является TRBC1, и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 5624 - SEQ ID NO: 5643 или SEQ ID NO: 5966 - SEQ ID NO: 6097;
(d) мишенью аллогенной T-клетки является TRBC2, и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 5644 - SEQ ID NO: 5719 или SEQ ID NO: 6098 - SEQ ID NO: 6226;
(e) мишенью аллогенной T-клетки является CD247, и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 84 - SEQ ID NO: 392;
(f) мишенью аллогенной T-клетки является CD3D, и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 393 - SEQ ID NO: 532 или SEQ ID NO: 10780 - SEQ ID NO: 10794;
(g) мишенью аллогенной T-клетки является CD3E, и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 533 - SEQ ID NO: 839 или SEQ ID NO: 10677 - SEQ ID NO: 10764;
(h) мишенью аллогенной T-клетки является CD3G, и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 840 - SEQ ID NO: 968 или SEQ ID NO: 10765 - SEQ ID NO: 10779;
(i) мишенью аллогенной T-клетки является HLA-A, и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 969 - SEQ ID NO: 1345;
(j) мишенью аллогенной T-клетки является HLA-B, и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 1346 - SEQ ID NO: 1698;
(k) мишенью аллогенной T-клетки является HLA-C, и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 1699 - SEQ ID NO: 2068;
(l) мишенью аллогенной T-клетки является DCK, и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 5278 - SEQ ID NO: 5491;
(m) мишенью аллогенной T-клетки является CD52, и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 6227 - SEQ ID NO: 6324;
(n) мишенью аллогенной T-клетки является FKBP1A, и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 6325 - SEQ ID NO: 6583 или SEQ ID NO: 6662 - SEQ ID NO: 6749;
(o) мишенью аллогенной T-клетки является NR3C1, и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 2069 - SEQ ID NO: 2941;
(p) мишенью аллогенной T-клетки является CIITA, и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 6750 - SEQ ID NO: 7716 или SEQ ID NO: 7717 - SEQ ID NO: 7804; или
(q) мишенью аллогенной T-клетки является NLRC5, и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 8622 - SEQ ID NO: 10089.
2. Композиция по п.1, где
(a) мишенью аллогенной T-клетки является TRAC, и направляющий домен включает SEQ ID NO: 5569, SEQ ID NO: 5585, SEQ ID NO: 5587, SEQ ID NO: 5592, SEQ ID NO: 5601, SEQ ID NO: 5589, SEQ ID NO: 5600, SEQ ID NO: 5594, SEQ ID NO: 5571, SEQ ID NO: 5593, SEQ ID NO: 5574, SEQ ID NO: 5598, SEQ ID NO: 5586, SEQ ID NO: 5599, SEQ ID NO: 5591, SEQ ID NO: 5610, SEQ ID NO: 5608, SEQ ID NO: 5617, SEQ ID NO: 5619, SEQ ID NO: 5620, SEQ ID NO: 5567, SEQ ID NO: 5568 или SEQ ID NO: 5835;
(b) мишенью аллогенной T-клетки является TRBC2, и направляющий домен включает SEQ ID NO: 5719, SEQ ID NO: 5694, SEQ ID NO: 5706, SEQ ID NO: 5696, SEQ ID NO: 5711, SEQ ID NO: 5708, SEQ ID NO: 5709, SEQ ID NO: 5712, SEQ ID NO: 5703, SEQ ID NO: 5707, SEQ ID NO: 5687, SEQ ID NO: 5705, SEQ ID NO: 5713, SEQ ID NO: 5715 или SEQ ID NO: 5710;
(c) мишенью аллогенной T-клетки является B2M, и направляющий домен включает SEQ ID NO: 5519, SEQ ID NO: 5497, SEQ ID NO: 5499, SEQ ID NO: 5498, SEQ ID NO: 5503, SEQ ID NO: 5496, SEQ ID NO: 5507, SEQ ID NO: 5515, SEQ ID NO: 5493, SEQ ID NO: 5506, SEQ ID NO: 5509, SEQ ID NO: 5517, SEQ ID NO: 5521, SEQ ID NO: 5520, SEQ ID NO: 5500, SEQ ID NO: 5494, SEQ ID NO: 5508, SEQ ID NO: 5514 или SEQ ID NO: 5492;
(d) мишенью аллогенной T-клетки является CIITA, и направляющий домен включает SEQ ID NO: 7771, SEQ ID NO: 7769, SEQ ID NO: 7773, SEQ ID NO: 7726, SEQ ID NO: 7758, SEQ ID NO: 7739, SEQ ID NO: 7779, SEQ ID NO: 7770, SEQ ID NO: 7749, SEQ ID NO: 7754, SEQ ID NO: 7745, SEQ ID NO: 7785, SEQ ID NO: 7731, SEQ ID NO: 7772, SEQ ID NO: 7743 или SEQ ID NO: 7750;
(e) мишенью аллогенной T-клетки является CD3E, и направляющий домен включает SEQ ID NO: 10729, SEQ ID NO: 10719, SEQ ID NO: 10764, SEQ ID NO: 10789, SEQ ID NO: 10701, SEQ ID NO: 10700 или SEQ ID NO: 10722, или
(f) мишенью аллогенной T-клетки является FKBP1A, и направляющий домен включает SEQ ID NO: 6693, SEQ ID NO: 6705, SEQ ID NO: 6694, SEQ ID NO: 6708 или SEQ ID NO: 6699.
3. Композиция, содержащая молекулу нРНК, включающую tracr и crРНК, где crРНК включает направляющий домен, который комплементарен последовательности-мишени ингибирующей молекулы или нижестоящего эффектора сигнализации через ингибирующую молекулу, выбранных из CD274, HAVCR2, LAG3, PDCD1, PD-L2, CTLA4, CEACAM, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4, CD80, CD86, B7-H3 (CD113), B7-H4 (VTCN1), HVEM (TNFRSF14 или CD107), KIR, A2aR, MHC класса I, MHC класса II, GAL9, аденозина и TGF-бета или PTPN11, где
(a) ингибирующей молекулой является CD274 (PD-L1), и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 2942 - SEQ ID NO: 3270;
(b) ингибирующей молекулой является HAVCR2 (TIM3), и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 3271 - SEQ ID NO: 3541;
(c) ингибирующей молекулой является LAG3, и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 3542 - SEQ ID NO: 4032;
(d) ингибирующей молекулой является PDCD1 (PD-1), и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 4033 - SEQ ID NO: 4589 или SEQ ID NO: 5720 - SEQ ID NO: 5815; или
(e) нижестоящим эффектором сигнализации через ингибирующую молекулу является PTPN1, и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 4590 - SEQ ID NO: 5277.
4. Композиция по любому из предыдущих пунктов, где направляющий домен состоит из 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23 или 24 последовательных нуклеиновых кислот любой из указанных последовательностей направляющего домена.
5. Композиция по любому из предыдущих пунктов, где направляющий домен и tracr расположены на отдельных молекулах нуклеиновой кислоты, и где молекула нуклеиновой кислоты, включающая направляющий домен, включает SEQ ID NO: 6607, необязательно расположенный непосредственно 3' от направляющего домена, и молекула нуклеиновой кислоты, включающая tracr, включает SEQ ID NO: 6660.
6. Композиция по любому из предыдущих пунктов, где одна или, необязательно, больше чем одна из молекул нуклеиновых кислот, включающих молекулу нРНК, включает:
a) одну или несколько фосфотиоатных модификаций на 3'-конце указанной молекулы или молекул нуклеиновых кислот;
b) одну или несколько фосфотиоатных модификаций на 5'-конце указанной молекулы или молекул нуклеиновых кислот;
c) одну или несколько 2'-O-метил модификаций на 3'-конце указанной молекулы или молекул нуклеиновых кислот;
d) одну или несколько 2'-O-метил модификаций на 5'-конце указанной молекулы или молекул нуклеиновых кислот;
e) одну или несколько 2'-O-метил модификаций на каждом из 4-го от конца, 3-го от конца и 2-го от конца 3' остатков указанной молекулы или молекул нуклеиновых кислот; или
f) их любую комбинацию.
7. Композиция по любому из предыдущих пунктов, дополнительно включающая молекулу Cas9.
8. Композиция по п.7, где молекула Cas9 включает любой из SEQ ID NO: 6611 или SEQ ID NO: 7821 - SEQ ID NO: 7831, или молекулу Cas9, обладающую по меньшей мере 95% гомологией с ними.
9. Композиция по любому из пп.7, 8, где первая молекула нРНК и молекула Cas9 присутствует в рибонуклеопротеиновом комплексе (РНП).
10. Композиция по любому из пп.7-9, дополнительно включающая вторую молекулу нРНК; вторую молекулу нРНК и третью молекулу нРНК; или вторую молекулу нРНК, третью молекулу нРНК и четвертую молекулу нРНК, где каждая молекула нРНК в композиции комплементарна определенной последовательности-мишени.
11. Композиция по п.1, где направляющий домен молекулы нРНК является направляющим доменом по любому из пп.1(a), 1(i), 1(j) или 1(к), и композиция дополнительно включает вторую молекулу нРНК по любому из пп.1-6, где направляющий домен указанной второй молекулы нРНК является направляющим доменом по любому из пп.1(b), 1(c), 1(d), 1(f), 1(g), 1(h) или 1(i).
12. Композиция по п.2, где направляющий домен молекулы нРНК является направляющим доменом по п.2(а); и композиция дополнительно включает вторую молекулу нРНК, где направляющий домен второй молекулы нРНК является направляющим доменом по п.3(с).
13. Композиция по любому из пп.7-12, дополнительно включающая третью молекулу нРНК по любому из пп.1-6, где направляющий домен указанной третьей молекулы нРНК является направляющим доменом по любому их пп.1(n), 1(p) или 1(q).
14. Композиция по п.13, где направляющий домен указанной третьей молекулы нРНК является направляющим доменом по п.1(p).
15. Композиция по любому из пп. 13, 14, дополнительно включающая четвертую молекулу нРНК, где направляющий домен указанной четвертой молекулы нРНК комплементарен последовательности-мишени мишени NK-ингибирующей молекулы.
16. Композиция по п.15, где мишенью NK-ингибирующей молекулы является LILRB1.
17. Композиция по п.16, где направляющий домен указанной четвертой молекулы нРНК включает:
a) любой из SEQ ID NO: 10090 - SEQ ID NO: 10673;
b) 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23 или 24 последовательных нуклеотидов, предпочтительно 20 последовательных нуклеотидов, любого из SEQ ID NO: 10090 - SEQ ID NO: 10673;
c) 5' 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23 или 24 нуклеотидов, предпочтительно 20 нуклеотидов, любого из SEQ ID NO: 10090 - SEQ ID NO: 10673; или
d) 3' 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23 или 24 нуклеотида, предпочтительно 20 нуклеотидов, любого из SEQ ID NO: 10090 - SEQ ID NO: 10673.
18. Нуклеиновая кислота, содержащая последовательность, которая кодирует молекулу нРНК по любому из пп.1-6, или вектор, содержащий нуклеиновую кислоту, содержащую последовательность, которая кодирует молекулу нРНК по любому из пп.1-6.
19. Композиция по любому из пп.7-17, дополнительно включающая матричную нуклеиновую кислоту.
20. Композиция по п.19, где матричная нуклеиновая кислота включает нуклеиновую кислоту, кодирующую химерный антигенный рецептор (CAR).
21. Композиция по п.20, где CAR является:
(a) CD19 CAR или
(b) BCMA CAR.
22. Способ изменения последовательности-мишени клетки, включающий контакт указанной клетки с:
a) молекулой нРНК по любому из пп.1-6 и молекулой Cas9;
b) молекулой нРНК по любому из пп.1-6 и нуклеиновой кислотой, кодирующей молекулу Cas9;
c) нуклеиновой кислотой, кодирующей молекулу нРНК по любому из пп.1-6, и молекулой Cas9;
d) нуклеиновой кислотой, кодирующей молекулу нРНК по любому из пп.1-6, и нуклеиновой кислотой, кодирующей молекулу Cas9;
e) любым из a)-d), выше, и матричной нуклеиновой кислотой; или
f) любым из a)-d) выше, и нуклеиновой кислотой, включающей последовательность, кодирующую матричную нуклеиновую кислоту.
23. Способ по п.22, включающий: (a) модификацию клеток путем снижения или устранения экспрессии компонента T-клеточного рецептора (TCR), включающую введение в указанные клетки молекулы нРНК по любому из пп.1b-1h, 2(a), 2(b), 3(e); (b) модификацию клеток путем снижения или устранения экспрессии HLA или B2M, включающую введение в указанные клетки молекулы нРНК по любому из пп. 1(a), 1(i), 1 (j) или 1(k), 3(c); и/или (c) модификацию клеток путем снижения или устранения экспрессии мишени для иммуносупрессии, включающую введение в указанные клетки молекулы нРНК по любому из пп.1(l), 1(m), 1(n), 1(o) или 2(f); и (d) размножение указанных клеток.
24. Способ по п.23, где молекула нРНК или нуклеиновая кислота, кодирующая молекулу нРНК, и молекула Cas9 или нуклеиновая кислота, кодирующая молекулу Cas9, включены в состав одной композиции.
25. Клетка, содержащая композицию по любому из пп. 1-17 или 19-21 или нуклеиновую кислоту или вектор по п.18.
26. Клетка по п.25 для применения при лечении заболевания, связанного с экспрессией антигена опухоли.
27. Клетка, включающая:
(a) последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую CAR;
(b) необязательно, последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую HLA-G или слитый белок HLA-G:B2M;
(c) индел в или вблизи от последовательности гена, кодирующего компонент TCR, выбранный из TRAC, TRBC1 TRBC2, CD3E, CD3D или CD3G, в или вблизи от последовательности-мишени нРНК, включающей направляющий домен TRAC, TRBC1, TRBC2, CD3E, CD3D, или CD3G, перечисленный в Таблице 1, Таблице 4, Таблице 5, Таблице 6e, Таблице 6f или Таблице 6g;
(d) индел в или вблизи от последовательности гена, кодирующего B2M, в или вблизи от последовательности-мишени нРНК, включающей направляющий домен к B2M, перечисленный в Таблице 1 или Таблице 3;
(e) необязательно, индел в или вблизи от последовательности гена, кодирующего CIITA, в или вблизи от последовательности-мишени нРНК, включающей направляющий домен к CIITA, перечисленный в Таблице 1 или Таблице 6c; и
(f) необязательно, индел в или вблизи от последовательности гена, кодирующего LILRB1, в или вблизи от последовательности-мишени нРНК, включающей направляющий домен к LILRB1;
где клетка (или популяция клеток, включающих указанную клетку) экспрессирует CAR и, необязательно, NK-ингибирующую молекулу, и демонстрирует сниженную или устраненную экспрессию и/или функцию одного или более из: i) компонента TCR, выбранного из TRAC, TRBC1 TRBC2, CD3D, CD3E или CD3G, ii) B2M, iii) CIITA и/или iv) LILRB1.
RU2018124295A 2015-12-04 2016-12-02 Композиции и способы для иммуноонкологии RU2771624C2 (ru)

Applications Claiming Priority (7)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201562263169P 2015-12-04 2015-12-04
US62/263,169 2015-12-04
US201662316784P 2016-04-01 2016-04-01
US62/316,784 2016-04-01
US201662394290P 2016-09-14 2016-09-14
US62/394,290 2016-09-14
PCT/IB2016/057318 WO2017093969A1 (en) 2015-12-04 2016-12-02 Compositions and methods for immunooncology

Related Child Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2022103587A Division RU2022103587A (ru) 2015-12-04 2016-12-02 Композиции и способы для иммуноонкологии

Publications (3)

Publication Number Publication Date
RU2018124295A true RU2018124295A (ru) 2020-01-13
RU2018124295A3 RU2018124295A3 (ru) 2020-10-23
RU2771624C2 RU2771624C2 (ru) 2022-05-11

Family

ID=

Also Published As

Publication number Publication date
AU2016362129A1 (en) 2018-06-14
IL259576A (en) 2018-07-31
SG11201804373VA (en) 2018-06-28
CA3006432A1 (en) 2017-06-08
WO2017093969A1 (en) 2017-06-08
BR112018011089A2 (pt) 2018-12-04
AU2023201162A1 (en) 2023-04-13
PH12018501159A1 (en) 2019-01-21
HK1257295A1 (zh) 2019-10-18
SG10202109655VA (en) 2021-10-28
MX2018006767A (es) 2019-03-14
JP2022137032A (ja) 2022-09-21
RU2018124295A3 (ru) 2020-10-23
KR20180133840A (ko) 2018-12-17
CN108699557A (zh) 2018-10-23
US20180362975A1 (en) 2018-12-20
IL259576B (en) 2022-09-01
JP2018536436A (ja) 2018-12-13
EA201891338A1 (ru) 2018-12-28
AU2020230334A1 (en) 2020-10-01
IL295858A (en) 2022-10-01
UA126373C2 (uk) 2022-09-28
EP3384027A1 (en) 2018-10-10

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP2021505131A (ja) 増強されたｉＰＳＣ由来のエフェクター細胞を用いた免疫療法
JP2018536436A5 (ru)
BR112020007710A2 (pt) métodos para produzir células que expressam receptor de antígeno quimérico
RU2018107802A (ru) Полностью человеческие антитела к мезотелину и иммунные эффекторные клетки, нацеленные на мезотелин
US20200216805A1 (en) Gene editing t cell and use thereof
WO2015136001A1 (en) Method for generating t-cells compatible for allogenic transplantation
CN110268050A (zh) 经修饰的t细胞和它们的使用方法
CN109055380B (zh) 一种通用型car-t细胞的制备方法
RU2018111462A (ru) Химерные антигенные рецепторы, нацеленные на антиген созревания b-клеток
Lucar et al. A natural impact: NK cells at the intersection of cancer and HIV disease
WO2021163618A1 (en) Method of predicting response to chimeric antigen receptor therapy
US20220211759A1 (en) Modulation of expression of genes related to t cell exhaustion
TW201905201A (zh) 體外剔除Ｔ細胞中靶基因的方法以及該方法中使用的ｃｒＲＮＡ
JP2021501587A (ja) Ｃｄ３８指向性キメラ抗原受容体構築物
US20220062394A1 (en) Methods for identifying neoantigens
Schafer et al. KIR3DL01 recognition of Bw4 ligands in the rhesus macaque: maintenance of Bw4 specificity since the divergence of apes and Old World monkeys
US20210102168A1 (en) Methods and compositions for the modulation of cell interactions and signaling in the tumor microenvironment
CA3139131A1 (en) Compositions and methods of acetylcholine receptor chimeric autoantibody receptor cells
Sun et al. Negative regulation and protective function of natural killer cells in HIV infection: two sides of a coin
Maloveste et al. Degenerate recognition of MHC class I molecules with Bw4 and Bw6 motifs by a killer cell Ig-like receptor 3DL expressed by macaque NK cells
US20240190988A1 (en) Novel chimeric antigen receptors and libraries
RU2018124295A (ru) Композиции и способы для иммуноонкологии
KR20210111244A (ko) 태반-유래 동종이계 car-t 세포 및 이의 용도
EP4058474B1 (en) Compositions and methods for treating egfr positive cancers
JP2020506943A5 (ru)