RU2018112506A - Лечение пигментного ретинита - Google Patents

Лечение пигментного ретинита Download PDF

Info

Publication number
RU2018112506A
RU2018112506A RU2018112506A RU2018112506A RU2018112506A RU 2018112506 A RU2018112506 A RU 2018112506A RU 2018112506 A RU2018112506 A RU 2018112506A RU 2018112506 A RU2018112506 A RU 2018112506A RU 2018112506 A RU2018112506 A RU 2018112506A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
seq
position corresponding
paragraphs
nucleotide sequence
polynucleotide
Prior art date
Application number
RU2018112506A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2018112506A3 (ru
RU2737049C2 (ru
Inventor
Роберт МАКЛАРЕН
Доминик ФИШЕР
Original Assignee
Оксфорд Юниверсити Инновейшн Лимитед
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Family has litigation
First worldwide family litigation filed litigation Critical https://patents.darts-ip.com/?family=54362987&utm_source=google_patent&utm_medium=platform_link&utm_campaign=public_patent_search&patent=RU2018112506(A) "Global patent litigation dataset” by Darts-ip is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Application filed by Оксфорд Юниверсити Инновейшн Лимитед filed Critical Оксфорд Юниверсити Инновейшн Лимитед
Publication of RU2018112506A publication Critical patent/RU2018112506A/ru
Publication of RU2018112506A3 publication Critical patent/RU2018112506A3/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2737049C2 publication Critical patent/RU2737049C2/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/46—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
    • C07K14/47—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
    • C07K14/4701—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals not used
    • C07K14/4702—Regulators; Modulating activity
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K48/00—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
    • A61K48/005—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy characterised by an aspect of the 'active' part of the composition delivered, i.e. the nucleic acid delivered
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P27/00—Drugs for disorders of the senses
    • A61P27/02—Ophthalmic agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/85—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
    • C12N15/86—Viral vectors
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/10—Transferases (2.)
    • C12N9/12—Transferases (2.) transferring phosphorus containing groups, e.g. kinases (2.7)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Y—ENZYMES
    • C12Y207/00—Transferases transferring phosphorus-containing groups (2.7)
    • C12Y207/11—Protein-serine/threonine kinases (2.7.11)
    • C12Y207/11014—Rhodopsin kinase (2.7.11.14)
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K48/00—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2750/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssDNA viruses
    • C12N2750/00011—Details
    • C12N2750/14011—Parvoviridae
    • C12N2750/14111—Dependovirus, e.g. adenoassociated viruses
    • C12N2750/14141—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector
    • C12N2750/14143—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector viral genome or elements thereof as genetic vector
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2750/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssDNA viruses
    • C12N2750/00011—Details
    • C12N2750/14011—Parvoviridae
    • C12N2750/14111—Dependovirus, e.g. adenoassociated viruses
    • C12N2750/14171—Demonstrated in vivo effect
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2800/00—Nucleic acids vectors
    • C12N2800/22—Vectors comprising a coding region that has been codon optimised for expression in a respective host
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2830/00—Vector systems having a special element relevant for transcription
    • C12N2830/008—Vector systems having a special element relevant for transcription cell type or tissue specific enhancer/promoter combination

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Ophthalmology & Optometry (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
  • Pigments, Carbon Blacks, Or Wood Stains (AREA)
  • Compounds Of Unknown Constitution (AREA)
  • Saccharide Compounds (AREA)

Claims (59)

1. Полинуклеотид, содержащий нуклеотидную последовательность, кодирующую изоформу ORF15 регулятора ГТФазы пигментного ретинита (RPGRORF15), при этом кодирующая RPGRORF15 нуклеотидная последовательность была кодон-оптимизирована для повышения точности репликации последовательности.
2. Полинуклеотид по п. 1, отличающийся тем, что кодирующая RPGRORF15 нуклеотидная последовательность была кодон-оптимизирована для уменьшения числа пуриновых нуклеотидов в сравнении с последовательностью дикого типа.
3. Полинуклеотид по п. 1 или 2, отличающийся тем, что закодированный белок RPGRORF15 представляет собой человеческий RPGRORF15.
4. Полинуклеотид по любому из пунктов 1-3, отличающийся тем, что кодирующая RPGRORF15 нуклеотидная последовательность не содержит пуриновые нуклеотиды в положениях, соответствующих нуклеотидам 33, 58, 59, 114, 123, 129, 181, 182, 213, 219, 226, 227, 237, 267, 285, 306, 309, 315, 324, 330, 339, 400, 401, 444, 456, 478, 480, 510, 594, 606, 618, 639, 697, 726, 744, 777, 807, 852, 877, 879, 888, 891, 921, 930, 960, 1042, 1050, 1116, 1140, 1183, 1184, 1194, 1197, 1221, 1249, 1251, 1257, 1273, 1276, 1281, 1290, 1293, 1357, 1372, 1373, 1413, 1446, 1452, 1464, 1474, 1475, 1482, 1519, 1520, 1542, 1584, 1590, 1599, 1608, 1653, 1668, 1674, 1689, 1692, 1734, 1761, 1776, 1788, 1803, 1824, 1845, 1854, 1881, 1893, 1902, 1909, 1910, 1929, 1932, 1960, 1987, 1988, 1992, 1998, 2020, 2031, 2047, 2049, 2062, 2067, 2076, 2121, 2167, 2169, 2190, 2193, 2208, 2229, 2259, 2283, 2298, 2323, 2343, 2346, 2361, 2373, 2382, 2388, 2403, 2409, 2410, 2412, 2448, 2457, 2472, 2476, 2478, 2505, 2520, 2547, 2574, 2622, 2634, 2661, 2673, 2706, 2712, 2763, 2775, 2796, 2811, 2817, 2832, 2838, 2871, 2886, 2892, 2898, 2910, 2922, 2931, 2937, 2958, 2970, 2997, 3033, 3039, 3069, 3075, 3117, 3129, 3156, 3166, 3235, 3246, 3273, 3285, 3306, 3321, 3369, 3399, 3405 и/или 3438 в SEQ ID NO: 2.
5. Полинуклеотид по любому из пп. 1-4, отличающийся тем, что кодирующая RPGRORF15 нуклеотидная последовательность не содержит пуриновые нуклеотиды в положениях, соответствующих нуклеотидам 1689 и/или 3438 в SEQ ID NO: 2.
6. Полинуклеотид по любому из пп. 1-5, отличающийся тем, что кодирующая RPGRORF15 нуклеотидная последовательность содержит нуклеотид T в положении, соответствующем положению 3405 в SEQ ID NO: 2.
7. Полинуклеотид по любому из предшествующих пунктов, отличающийся тем, что кодирующая RPGRORF15 нуклеотидная последовательность не содержит пуриновые нуклеотиды по меньшей мере в 2, 3, 4, 5, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 110, 120, 130, 140, 150, 160, 170, 180 или во всех из нуклеотидных положений, перечисленных в п. 4.
8. Полинуклеотид по любому из предшествующих пунктов, отличающийся тем, что кодирующая RPGRORF15 нуклеотидная последовательность не содержит пуриновые нуклеотиды по меньшей мере во всех из нуклеотидных положений, перечисленных в п. 4.
9. Полинуклеотид по любому из пп. 1-8, отличающийся тем, что кодирующая RPGRORF15 нуклеотидная последовательность содержит последовательность, выбранную из группы, состоящей из:
(a) нуклеотидной последовательности, кодирующей аминокислотную последовательность, которая имеет по меньшей мере 80% идентичности с SEQ ID NO: 1; и/или
(b) нуклеотидной последовательности, которая имеет по меньшей мере 80% идентичности с SEQ ID NO: 3; или
(c) нуклеотидной последовательности SEQ ID NO: 3.
10. Полинуклеотид по п. 9(a), при этом указанная аминокислотная последовательность имеет по меньшей мере 85, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентичности с SEQ ID NO: 1.
11. Полинуклеотидная последовательность по любому из предшествующих пунктов, при этом кодирующая RPGRORF15 нуклеотидная последовательность содержит один или более нуклеотидов, выбранных из: C в положении, соответствующем положению 30 в SEQ ID NO: 2, T в положении, соответствующем положению 33 в SEQ ID NO: 2, A в положении, соответствующем положению 966 в SEQ ID NO: 2, A в положении, соответствующем положению 969 в SEQ ID NO: 2, T в положении, соответствующем положению 1011 в SEQ ID NO: 2, T в положении, соответствующем положению 1014 в SEQ ID NO: 2, T в положении, соответствующем положению 1029 в SEQ ID NO: 2, A в положении, соответствующем положению 1299 в SEQ ID NO: 2, C в положении, соответствующем положению 1689 в SEQ ID NO: 2, G в положении, соответствующем положению 3363 в SEQ ID NO: 2, T в положении, соответствующем положению 3405 в SEQ ID NO: 2, A в положении, соответствующем положению 3408 в SEQ ID NO: 2, A в положении, соответствующем положению 3409 в SEQ ID NO: 2, G в положении, соответствующем положению 3410 в SEQ ID NO: 2, G в положении, соответствующем положению 3432 в SEQ ID NO: 2, C в положении, соответствующем положению 3438 в SEQ ID NO: 2, и A в положении, соответствующем положению 3456 в SEQ ID NO: 2.
12. Полинуклеотидная последовательность по любому из предшествующих пунктов, при этом кодирующая RPGRORF15 нуклеотидная последовательность содержит один или более нуклеотидов, выбранных из: C в положении, соответствующем положению 30 в SEQ ID NO: 2, T в положении, соответствующем положению 33 в SEQ ID NO: 2, A в положении, соответствующем положению 48 в SEQ ID NO: 2, A в положении, соответствующем положению 57 в SEQ ID NO: 2, T в положении, соответствующем положению 60 в SEQ ID NO: 2, T в положении, соответствующем положению 69 в SEQ ID NO: 2, A в положении, соответствующем положению 72 в SEQ ID NO: 2, C в положении, соответствующем положению 171 в SEQ ID NO: 2, C в положении, соответствующем положению 189 в SEQ ID NO: 2, T в положении, соответствующем положению 441 в SEQ ID NO: 2, T в положении, соответствующем положению 537 в SEQ ID NO: 2, C в положении, соответствующем положению 546 в SEQ ID NO: 2, T в положении, соответствующем положению 786 в SEQ ID NO: 2, T в положении, соответствующем положению 792 в SEQ ID NO: 2, A в положении, соответствующем положению 966 в SEQ ID NO: 2, A в положении, соответствующем положению 969 в SEQ ID NO: 2, A в положении, соответствующем положению 990 в SEQ ID NO: 2, T в положении, соответствующем положению 1011 в SEQ ID NO: 2, T в положении, соответствующем положению 1014 в SEQ ID NO: 2, T в положении, соответствующем положению 1029 в SEQ ID NO: 2, A в положении, соответствующем положению 1299 в SEQ ID NO: 2, C в положении, соответствующем положению 1689 в SEQ ID NO: 2, A в положении, соответствующем положению 3355 в SEQ ID NO: 2, G в положении, соответствующем положению 3357 в SEQ ID NO: 2, G в положении, соответствующем положению 3363 в SEQ ID NO: 2, T в положении, соответствующем положению 3403 в SEQ ID NO: 2, C в положении, соответствующем положению 3404 в SEQ ID NO: 2, T в положении, соответствующем положению 3405 в SEQ ID NO: 2, A в положении, соответствующем положению 3408 в SEQ ID NO: 2, A в положении, соответствующем положению 3409 в SEQ ID NO: 2, G в положении, соответствующем положению 3410 в SEQ ID NO: 2, G в положении, соответствующем положению 3432 в SEQ ID NO: 2, C в положении, соответствующем положению 3438 в SEQ ID NO: 2, и A в положении, соответствующем положению 3456 в SEQ ID NO: 2.
13. Полинуклеотид, содержащий нуклеотидную последовательность, кодирующую изоформу ORF15 регулятора ГТФазы пигментного ретинита (RPGRORF15) или ее функциональный вариант, имеющий по меньшей мере 80, 85, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентичности с SEQ ID NO: 1, при этом нуклеотидная последовательность содержит один или более нуклеотидов, выбранных из: C в положении, соответствующем положению 30 в SEQ ID NO: 2, T в положении, соответствующем положению 33 в SEQ ID NO: 2, A в положении, соответствующем положению 966 в SEQ ID NO: 2, A в положении, соответствующем положению 969 в SEQ ID NO: 2, T в положении, соответствующем положению 1011 в SEQ ID NO: 2, T в положении, соответствующем положению 1014 в SEQ ID NO: 2, T в положении, соответствующем положению 1029 в SEQ ID NO: 2, A в положении, соответствующем положению 1299 в SEQ ID NO: 2, C в положении, соответствующем положению 1689 в SEQ ID NO: 2, G в положении, соответствующем положению 3363 в SEQ ID NO: 2, T в положении, соответствующем положению 3405 в SEQ ID NO: 2, A в положении, соответствующем положению 3408 в SEQ ID NO: 2, A в положении, соответствующем положению 3409 в SEQ ID NO: 2, G в положении, соответствующем положению 3410 в SEQ ID NO: 2, G в положении, соответствующем положению 3432 в SEQ ID NO: 2, C в положении, соответствующем положению 3438 в SEQ ID NO: 2, и A в положении, соответствующем положению 3456 в SEQ ID NO: 2.
14. Полинуклеотид, содержащий нуклеотидную последовательность, кодирующую изоформу ORF15 регулятора ГТФазы пигментного ретинита (RPGRORF15) или ее функциональный вариант, имеющий по меньшей мере 80, 85, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 или 100% идентичности с SEQ ID NO: 1, при этом нуклеотидную последовательность выбирают из группы, состоящей из:
(a) нуклеотидной последовательности, которая имеет по меньшей мере 80% идентичности с SEQ ID NO: 3, при этом указанная последовательность содержит один или более нуклеотидов, выбранных из: C в положении, соответствующем положению 30 в SEQ ID NO: 2, T в положении, соответствующем положению 33 в SEQ ID NO: 2, A в положении, соответствующем положению 48 в SEQ ID NO: 2, A в положении, соответствующем положению 57 в SEQ ID NO: 2, T в положении, соответствующем положению 60 в SEQ ID NO: 2, T в положении, соответствующем положению 69 в SEQ ID NO: 2, A в положении, соответствующем положению 72 в SEQ ID NO: 2, C в положении, соответствующем положению 171 в SEQ ID NO: 2, C в положении, соответствующем положению 189 в SEQ ID NO: 2, T в положении, соответствующем положению 441 в SEQ ID NO: 2, T в положении, соответствующем положению 537 в SEQ ID NO: 2, C в положении, соответствующем положению 546 в SEQ ID NO: 2, T в положении, соответствующем положению 786 в SEQ ID NO: 2, T в положении, соответствующем положению 792 в SEQ ID NO: 2, A в положении, соответствующем положению 966 в SEQ ID NO: 2, A в положении, соответствующем положению 969 в SEQ ID NO: 2, A в положении, соответствующем положению 990 в SEQ ID NO: 2, T в положении, соответствующем положению 1011 в SEQ ID NO: 2, T в положении, соответствующем положению 1014 в SEQ ID NO: 2, T в положении, соответствующем положению 1029 в SEQ ID NO: 2, A в положении, соответствующем положению 1299 в SEQ ID NO: 2, C в положении, соответствующем положению 1689 в SEQ ID NO: 2, A в положении, соответствующем положению 3355 в SEQ ID NO: 2, G в положении, соответствующем положению 3357 в SEQ ID NO: 2, G в положении, соответствующем положению 3363 в SEQ ID NO: 2, T в положении, соответствующем положению 3403 в SEQ ID NO: 2, C в положении, соответствующем положению 3404 в SEQ ID NO: 2, T в положении, соответствующем положению 3405 в SEQ ID NO: 2, A в положении, соответствующем положению 3408 в SEQ ID NO: 2, A в положении, соответствующем положению 3409 в SEQ ID NO: 2, G в положении, соответствующем положению 3410 в SEQ ID NO: 2, G в положении, соответствующем положению 3432 в SEQ ID NO: 2, C в положении, соответствующем положению 3438 в SEQ ID NO: 2, и A в положении, соответствующем положению 3456 в SEQ ID NO: 2; или/и
(b) нуклеотидной последовательности SEQ ID NO: 3.
15. Полинуклеотид по любому из предшествующих пунктов, отличающийся тем, что кодирующая RPGRORF15 нуклеотидная последовательность функционально связана с полинуклеотидом, содержащим элемент промотора, который способен управлять экспрессией RPGRORF15 или его функционального варианта в палочковидных и колбочковидных фоторецепторных клетках человека.
16. Полинуклеотид по любому из предшествующих пунктов, отличающийся тем, что кодирующая RPGRORF15 нуклеотидная последовательность функционально связана с промотором родопсин-киназы (GRK1), предпочтительно промотором GRK1 человека.
17. Полинуклеотид по п. 16, отличающийся тем, что указанный промотор GRK1 содержит нуклеотидную последовательность SEQ ID NO: 7 или функциональный вариант, имеющий по меньшей мере 90 или 95% идентичности с ней.
18. Полинуклеотид по любому из предшествующих пунктов, отличающийся тем, что кодирующая RPGRORF15 нуклеотидная последовательность содержит менее 165 динуклеотидов CpG и/или содержит не более двух CpG-островков.
19. Полинуклеотид по любому из предшествующих пунктов, имеющий по существу такую же, или повышенную, точность репликации в сравнении с эквивалентным полинуклеотидом, содержащим человеческий RPGRORF15 дикого типа с SEQ ID NO: 2.
20. Полинуклеотид по любому из предшествующих пунктов, имеющий повышенную стабильность и/или менее подверженный мутациям, возникающим в процессе циклов репликации полинуклеотида, в сравнении с эквивалентным полинуклеотидом, содержащим человеческий RPGRORF15 дикого типа с SEQ ID NO: 2.
21. Полинуклеотид по любому из предшествующих пунктов, обеспечивающий более высокие скорости трансляции и/или экспрессии белка в сравнении с эквивалентным полинуклеотидом, содержащим человеческий RPGRORF15 дикого типа с SEQ ID NO: 2.
22. Полинуклеотид по любому из предшествующих пунктов, способствующий уменьшению или предотвращению образования альтернативно сплайсированных вариантов и/или укороченных белков в сравнении с эквивалентным полинуклеотидом, содержащим человеческий RPGRORF15 дикого типа с SEQ ID NO: 2.
23. Вирусный вектор, содержащий полинуклеотид по любому из предшествующих пунктов.
24. Вирусный вектор по п. 23, представляющий собой аденоассоциированный вирусный (AAV), ретровирусный, лентивирусный или аденовирусный вектор.
25. Вирусный вектор по п. 23 или 24, представляющий собой AAV вектор.
26. Вирусный вектор по любому из пп. 23-25, имеющий форму вирусной частицы.
27. Вирусный вектор по п. 26, представляющий собой транскапсидированный AAV вектор.
28. Вирусный вектор по п. 26, содержащий геном AAV2 и капсидные белки AAV5 (AAV2/5) или AAV8 (AAV2/8).
29. AAV вектор по п. 25 или 26, представляющий собой AAV вектор, содержащий геном AAV2 и/или капсидный белок AAV8.
30. Система продуцирования вирусного вектора, содержащая набор полинуклеотидов, кодирующих компоненты, необходимые для продуцирования вирусного вектора, при этом геном вирусного вектора содержит полинуклеотид по любому из пунктов 1-22.
31. Конструкция ДНК для применения в системе продуцирования вирусного вектора по п. 30, содержащая полинуклеотид по любому из пп. 1-22.
32. Клетка, продуцирующая вирусный вектор, которая содержит полинуклеотид по любому из пп. 1-22, систему продуцирования вирусного вектора по п. 30 или конструкцию ДНК по п. 31.
33. Способ продуцирования вирусного вектора, включающий введение полинуклеотида по любому из пп. 1-22 в клетку и культивирование клетки в условиях, подходящих для продуцирования вирусного вектора.
34. Вирусный вектор, получаемый с применением продуцирующей вирусный вектор клетки по п. 32 или способа по п. 33.
35. Клетка, трансфицированная полинуклеотидом по любому из пунктов 1-22 или трансдуцированная вирусным вектором по любому из пп. 23-29 или 34.
36. Способ по п. 33 или клетка по п. 35, при этом указанная клетка представляет собой клетку HEK293 или HEK293T.
37. Фармацевтическая композиция, содержащая полинуклеотид по любому из пп. 1-22, вирусный вектор по любому из пп. 23-29 или 34, или клетку по п. 35 в сочетании с фармацевтически приемлемым носителем, разбавителем или эксципиентом.
38. Применение полинуклеотида по любому из пп. 1-22 или вирусного вектора по любому из пп. 23-29 или 34 для лечения или предотвращения пигментного ретинита.
39. Применение полинуклеотида по любому из пп. 1-22 или вирусного вектора по любому из пунктов 23-29 или 34 для уменьшения гибели фоторецепторных клеток у субъекта, страдающего от, или имеющего риск развития, пигментного ретинита.
40. Применение по п. 38 или 39, при этом пигментный ретинит представляет собой X-связанный пигментный ретинит.
41. Применение по любому из пп. 38-40, при этом вирусный вектор вводят в глаз субъекта субретинальной, прямой ретинальной или интравитреальной инъекцией.
42. Применение по любому из пп. 38-41, при этом субретинальная инъекция включает этапы:
(a) введения раствора субъекту субретинальной инъекцией в количестве, эффективном для по меньшей мере частичного отслоения сетчатки, с образованием субретинального пузыря, при этом раствор не содержит полинуклеотид или вирусный вектор; и
(b) введения лекарственной композиции субретинальной инъекцией в пузырь, образованный на этапе (a), при этом лекарственная композиция содержит полинуклеотид или вирусный вектор.
43. Применение по любому из пп. 38-42, при этом вирусный вектор вводят субъекту одной дозой.
44. Применение по любому из пп. 38-43, при этом дегенерация фоторецепторных клеток вследствие пигментного ретинита по существу предотвращается на всем протяжении жизни субъекта.
45. Применение по любому из пп. 38-44, при этом зрительная функция по существу восстанавливается или сохраняется в получающем лечение глазу.
46. Способ лечения или предотвращения пигментного ретинита, включающий введение полинуклеотида по любому из пп. 1-22 или вирусного вектора по любому из пп. 23-29 или 34 субъекту, который нуждается в этом.
47. Способ уменьшения гибели фоторецепторных клеток у субъекта, страдающего от, или имеющего риск развития, пигментного ретинита, включающий введение полинуклеотида по любому из пп. 1-22 или вирусного вектора по любому из пп. 23-29 или 34 субъекту.
48. Применение полинуклеотида по любому из пп. 1-22 или вирусного вектора по любому из пп. 23-29 или 34 для:
(a) уменьшения или предотвращения образования альтернативно сплайсированных вариантов и/или укороченных белков RPGRORF15 в сравнении с вектором или полинуклеотидом, содержащим ген RPGRORF15 дикого типа, и/или
(b) повышения стабильности и/или точности репликации нуклеотидной последовательности, содержащей ген RPGRORF15, в сравнении с нуклеотидной последовательностью, содержащей ген RPGRORF15 дикого типа, и/или
(c) повышения скоростей трансляции и/или экспрессии белка RPGRORF15 в сравнении с вектором или полинуклеотидом, содержащим ген RPGRORF15 дикого типа, и/или
(d) увеличения продуцирования кодирующей RPGRORF15 нуклеотидной последовательности в сравнении с нуклеотидной последовательностью, содержащей ген RPGRORF15 дикого типа.
RU2018112506A 2015-09-10 2016-09-09 Лечение пигментного ретинита RU2737049C2 (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
GB1516066.6 2015-09-10
GBGB1516066.6A GB201516066D0 (en) 2015-09-10 2015-09-10 Treatment of retinitis pigmentosa
PCT/GB2016/052802 WO2017042584A1 (en) 2015-09-10 2016-09-09 Treatment of retinitis pigmentosa

Related Child Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2020137429A Division RU2020137429A (ru) 2015-09-10 2016-09-09 Лечение пигментного ретинита

Publications (3)

Publication Number Publication Date
RU2018112506A true RU2018112506A (ru) 2019-10-10
RU2018112506A3 RU2018112506A3 (ru) 2020-01-27
RU2737049C2 RU2737049C2 (ru) 2020-11-24

Family

ID=54362987

Family Applications (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2018112506A RU2737049C2 (ru) 2015-09-10 2016-09-09 Лечение пигментного ретинита
RU2020137429A RU2020137429A (ru) 2015-09-10 2016-09-09 Лечение пигментного ретинита

Family Applications After (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2020137429A RU2020137429A (ru) 2015-09-10 2016-09-09 Лечение пигментного ретинита

Country Status (14)

Country Link
US (3) US20180273594A1 (ru)
EP (1) EP3347371B1 (ru)
JP (1) JP7011580B2 (ru)
KR (1) KR20180043373A (ru)
CN (1) CN108699118A (ru)
AU (2) AU2016320551C1 (ru)
CA (1) CA2995656A1 (ru)
GB (1) GB201516066D0 (ru)
HK (1) HK1250727A1 (ru)
IL (1) IL257881B (ru)
MX (2) MX2018002899A (ru)
RU (2) RU2737049C2 (ru)
SG (1) SG10202013246VA (ru)
WO (1) WO2017042584A1 (ru)

Families Citing this family (18)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
PL3104814T3 (pl) 2014-02-12 2021-10-11 Gyroscope Therapeutics Limited Aparat do nadnaczyniówkowego podawania środka leczniczego
US9925088B2 (en) 2014-06-06 2018-03-27 Janssen Biotech, Inc. Sub-retinal tangential needle catheter guide and introducer
US9949874B2 (en) 2014-06-06 2018-04-24 Janssen Biotech, Inc. Therapeutic agent delivery device with convergent lumen
US10219936B2 (en) 2014-09-11 2019-03-05 Orbit Biomedical Limited Therapeutic agent delivery device with advanceable cannula and needle
US10258502B2 (en) 2014-09-18 2019-04-16 Orbit Biomedical Limited Therapeutic agent delivery device
GB201516066D0 (en) * 2015-09-10 2015-10-28 Young & Co Llp D Treatment of retinitis pigmentosa
US10478553B2 (en) 2016-03-09 2019-11-19 Orbit Biomedical Limited Apparatus for subretinal administration of therapeutic agent via a curved needle
US10806629B2 (en) 2016-06-17 2020-10-20 Gyroscope Therapeutics Limited Injection device for subretinal delivery of therapeutic agent
US10646374B2 (en) 2016-06-17 2020-05-12 Orbit Biomedical Limited Apparatus and method to form entry bleb for subretinal delivery of therapeutic agent
US11000410B2 (en) 2016-06-17 2021-05-11 Gyroscope Therapeutics Limited Guide apparatus for tangential entry into suprachoroidal space
US11273072B2 (en) 2017-01-13 2022-03-15 Gyroscope Therapeutics Limited Suprachoroidal injection device
US11076984B2 (en) 2017-03-13 2021-08-03 Gyroscope Therapeutics Limited Method of performing subretinal drainage and agent delivery
JOP20210054A1 (ar) * 2018-09-21 2020-03-21 Nightstarx Ltd تركيبات وطرق لعلاج التهاب الشبكية الصباغي
JP2020174859A (ja) * 2019-04-17 2020-10-29 学校法人日本医科大学 網膜剥離が生じるリスクが低い網膜変性症（ｒｄ）モデルマウスを取得する方法
GB202005641D0 (en) * 2020-04-17 2020-06-03 Ucl Business Plc Gene therapy for bardet-biedl syndrome
WO2022021149A1 (zh) * 2020-07-29 2022-02-03 北京中因科技有限公司 Aav介导的rpgr x连锁视网膜变性的基因编辑治疗
EP4196140A1 (en) * 2020-08-14 2023-06-21 Case Western Reserve University Plasmid vectors and nanoparticles for treating ocular disorders
JP2023539368A (ja) 2020-09-02 2023-09-13 ４ディー モレキュラー セラピューティクス インコーポレイテッド コドン最適化したｒｐｇｒｏｒｆ１５遺伝子およびその使用

Family Cites Families (14)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
GB0008801D0 (en) 2000-04-10 2000-05-31 Medical Res Council Sequences
US7799904B2 (en) * 2003-06-13 2010-09-21 University Of Kentucky Research Foundation Gilvocarcin gene cluster, recombinant production and use thereof
US7943374B2 (en) 2005-08-21 2011-05-17 Markus Hildinger Super-size adeno-associated viral vector harboring a recombinant genome larger than 5.7 kb
US20090214478A1 (en) * 2008-02-21 2009-08-27 Alberto Auricchio Method of treating ocular diseases by gene therapy
FR2949115B1 (fr) 2009-08-14 2012-11-02 Sanofi Aventis OLIGOSACCHARIDES N-SULFATES ACTIVATEURS DES RECEPTEURS DES FGFs, LEUR PREPARATION ET LEUR APPLICATION EN THERAPEUTIQUE
ES2362604B1 (es) 2009-12-22 2012-06-28 Bcn Peptides, S.A. Formulación tópica oftálmica de péptidos.
AU2012321102C1 (en) * 2011-10-27 2016-11-10 Pharma Cinq, Llc Vectors encoding rod-derived cone viability factor
AU2013243951A1 (en) 2012-04-02 2014-10-30 Moderna Therapeutics, Inc. Modified polynucleotides for the production of secreted proteins
US9163259B2 (en) * 2012-05-04 2015-10-20 Novartis Ag Viral vectors for the treatment of retinal dystrophy
CA2878171C (en) 2012-07-11 2021-04-27 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Aav-mediated gene therapy for rpgr x-linked retinal degeneration
AU2015247777B2 (en) * 2014-04-15 2019-03-21 Beacon Therapeutics Limited Codon optimized nucleic acid encoding a retinitis pigmentosa GTPase regulator (RPGR)
GB201412011D0 (en) 2014-07-04 2014-08-20 Ucl Business Plc Treatments
US10314924B2 (en) 2014-07-24 2019-06-11 Massachusetts Eye & Ear Infirmary RPGR gene therapy for retinitis pigmentosa
GB201516066D0 (en) * 2015-09-10 2015-10-28 Young & Co Llp D Treatment of retinitis pigmentosa

Also Published As

Publication number Publication date
MX2018002899A (es) 2018-09-12
WO2017042584A1 (en) 2017-03-16
EP3347371B1 (en) 2023-05-10
US20200002392A1 (en) 2020-01-02
IL257881A (en) 2018-05-31
JP7011580B2 (ja) 2022-01-26
CA2995656A1 (en) 2017-03-16
KR20180043373A (ko) 2018-04-27
AU2016320551B2 (en) 2021-11-25
US20210130425A1 (en) 2021-05-06
EP3347371A1 (en) 2018-07-18
GB201516066D0 (en) 2015-10-28
SG10202013246VA (en) 2021-02-25
AU2022200306A1 (en) 2022-02-10
IL257881B (en) 2022-12-01
HK1250727A1 (zh) 2019-01-11
AU2016320551C1 (en) 2023-12-14
RU2020137429A (ru) 2022-01-17
US10836803B2 (en) 2020-11-17
US20180273594A1 (en) 2018-09-27
AU2016320551A1 (en) 2018-03-08
CN108699118A (zh) 2018-10-23
RU2018112506A3 (ru) 2020-01-27
JP2018529336A (ja) 2018-10-11
MX2022003859A (es) 2022-06-09
RU2737049C2 (ru) 2020-11-24

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2018112506A (ru) Лечение пигментного ретинита
US11447797B2 (en) AAV with unique capsid protein VP1 and methods of using for treatment
JP2019089787A5 (ru)
JP2021534809A (ja) Ａａｖカプシドの向性の再指向化
JP2015523379A5 (ru)
US10413598B2 (en) Factor IX gene therapy
JP2020073536A5 (ru)
RU2019103488A (ru) Способы и композиции для лечения нарушений и заболеваний, связанных с rdh12
JP7291423B2 (ja) ＡＩＭＰ２－ＤＸ２およびｍｉＲ－１４２の標的核酸を含むベクター、ならびにその使用
JP2017523239A5 (ru)
BR112021012048A2 (pt) Fator complementar i e cofator de fator complementar i, vetores que codificam os mesmos e uso terapêutico
RU2019126509A (ru) Выделенный модифицированный белок VP1 капсида аденоассоциированного вируса 5 серотипа (AAV5), капсид и вектор на его основе
JP2019524090A5 (ru)
US20170137480A1 (en) Rpgr-ofr15 variant gene in the treatment of retinitis pigmentosa
ES2835032T3 (es) Terapia génica para el tratamiento de una enfermedad de las células de cono retinianas
US20230212609A1 (en) Codon-optimized nucleic acid encoding smn1 protein
CN110799649A (zh) 用于减少有需要的受试者中nkcc1表达的载体和药物组合物，以及相关的治疗处理方法
JP2020533968A (ja) 組換えアデノ随伴ベクター
WO2007001010A1 (ja) パーキンソン病の治療のための医薬
CN114729009A (zh) 用于眼部基因递送的aav载体变体
US20210301306A1 (en) Gene therapy methods to control organ function
CN115927412A (zh) 密码子优化的补体因子i
KR102626543B1 (ko) AIMP2-DX2 및 miR-142의 표적 핵산을 포함하는 재조합 벡터
US20230220420A1 (en) Gene therapy for bardet-biedl syndrome
US20230119699A1 (en) Diagnostic methods using sirt1 expression