RU2016133965A - Усовершенствованная стратификация пациентов для оценки пригодности терапии - Google Patents
Усовершенствованная стратификация пациентов для оценки пригодности терапии Download PDFInfo
- Publication number
- RU2016133965A RU2016133965A RU2016133965A RU2016133965A RU2016133965A RU 2016133965 A RU2016133965 A RU 2016133965A RU 2016133965 A RU2016133965 A RU 2016133965A RU 2016133965 A RU2016133965 A RU 2016133965A RU 2016133965 A RU2016133965 A RU 2016133965A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- protein
- transcription factors
- complex
- cascade
- patient
- Prior art date
Links
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
- G01N33/57407—Specifically defined cancers
- G01N33/57415—Specifically defined cancers of breast
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
- G01N33/57407—Specifically defined cancers
- G01N33/57434—Specifically defined cancers of prostate
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/74—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving hormones or other non-cytokine intercellular protein regulatory factors such as growth factors, including receptors to hormones and growth factors
- G01N33/743—Steroid hormones
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
- G01N2800/52—Predicting or monitoring the response to treatment, e.g. for selection of therapy based on assay results in personalised medicine; Prognosis
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Immunology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Pathology (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Hospice & Palliative Care (AREA)
- Oncology (AREA)
- Endocrinology (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Public Health (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Claims (33)
1. Способ стратификации пациента для оценки пригодности терапии для пациента, причем терапия направлена против каскада передачи сигнала, включающий следующую стадию:
i) определение состояния активации каскада передачи сигнала ER и/или PR с использованием анализа близкого лигирования для обнаружения в образце ткани пациента присутствия по меньшей мере одного представителя семейства ER, причем указанный по меньшей мере один представитель является частью комплекса факторов транскрипции, и по меньшей мере одного белка, выбранного из группы, состоящей из TAF, TBP, POLII, TFII, p300, CREP1 и CBP, где по меньшей мере один белок является частью того же комплекса факторов транскрипции,
где стратификация основана на состоянии активации, определенном на стадии (i), и на основании стратификации оценивают пригодность терапии.
2. Способ по п.1, где по меньшей мере один представитель семейства ER представляет собой димер ER.
3. Способ по п.1, дополнительно включающий следующую стадию:
(ii) определение состояния активации каскада передачи сигнала, который отличается от каскада передачи сигнала, оцененного на стадии (i), с использованием способа окрашивания in situ для обнаружения в том же или в отличающемся образце ткани пациента присутствия по меньшей мере одного представителя семейства ER и по меньшей мере одного белка, выбранного из группы, состоящей из c-Fos, c-Jun (AP1), SP1, CREB, фактора транскрипции GATA, семейства NFkappaB, белков c/EBP, FOXO, белков-факторов транскрипции SMAD,
где стратификация далее основана на состоянии активации, определенном на стадии (ii).
4. Способ по п.1, дополнительно включающий следующую стадию:
(iii) определение состояния фосфорилирования по меньшей мере одного представителя семейства ER в положении серина 305 в образце ткани пациента,
где стратификация далее основана на состоянии фосфорилирования, определенном на стадии (iii).
5. Способ по п.1, дополнительно включающий следующую стадию:
(iv) определение состояния активации одного или нескольких каскадов передачи сигнала, который отличается/отличаются от каскада передачи сигнала, оцененного на стадии (i), и выбран/выбраны из группы, состоящей из каскада PI3K, каскада Wnt, каскада hedgehog (HH), NFkappaB, каскада Notch, каскадов TGFbeta, FGF, VEGF, EMT, других каскадов ядерных рецепторов, таких как каскады AR, RAR, PPAR, глюкокортикоидов, VitD, и каскадов факторов роста, таких как инсулин-GF и EGF, с использованием анализа окрашивания in situ, где используют тот же или отличающийся образец ткани пациента,
где стратификация далее основана на состоянии активации, определенном на стадии (iv).
6. Способ по п.1, дополнительно включающий следующую стадию:
(v) определение состояния активации каскада PI3K с использованием анализа окрашивания in situ для обнаружения в том же или в отличающемся образце ткани пациента активного белка PKB/Akt путем количественного определения состояния фосфорилирования PBK/Akt,
где стратификация далее основана на состоянии активации, определенном на стадии (v).
7. Способ по п.1, дополнительно включающий следующую стадию:
(vi) применение анализа окрашивания in situ для обнаружения в том же или в отличающемся образце ткани пациента присутствия по меньшей мере одного представителя семейства ER и по меньшей мере одного компонента, который, как ожидается, присутствует в любом половинном участке ERE (элемент ответа на эстроген) или в любом не являющемся ERE участке, и/или где по меньшей мере один компонент выбран из группы, состоящей из AP1, связывающего элемент ответа на cAMP белка/CREB, фактора транскрипции GATA, и белков-факторов транскрипции NFkappaB, SP1, C/EBP, FOXO, SMAD,
где стратификация далее основана на обнаружении на стадии (vi).
8. Способ прогнозирования исхода заболевания у пациента, где способ включает определение состояния активации каскада передачи сигнала ER и/или PR с использованием анализа близкого лигирования для обнаружения в образце ткани пациента присутствия по меньшей мере одного представителя семейства ER, причем указанный по меньшей мере один представитель является частью комплекса факторов транскрипции, и по меньшей мере одного белка, выбранного из группы, состоящей из TAF, TBP, POLII, TFII, p300, CREP1 и CBP, где по меньшей мере один белок является частью того же комплекса факторов транскрипции, где прогноз основан на определенном состоянии активации.
9. Способ предсказания и/или обнаружения резистентности пациента к терапии, где способ включает определение состояния активации каскада передачи сигнала ER и/или PR с использованием анализа близкого лигирования для обнаружения в образце ткани пациента присутствия по меньшей мере одного представителя семейства ER, причем указанный по меньшей мере один представитель является частью комплекса факторов транскрипции, и по меньшей мере одного белка, выбранного из группы, состоящей из TAF, TBP, POLII, TFII, p300, CREP1 и CBP, где по меньшей мере один белок является частью того же комплекса факторов транскрипции, где предсказание и/или обнаружение основаны на определенном состоянии активации.
10. Набор, содержащий следующие компоненты:
- первое антитело, направленное против эпитопа представителя семейства ER, причем указанный представитель является частью комплекса факторов транскрипции, и
второе антитело, направленное против эпитопа белка, выбранного из группы, состоящей из TAF, TBP, POLII, TFII, p300, CREP1 и CBP, где белок является частью того же комплекса факторов транскрипции, что и представитель семейства ER.
11. Применение набора в способе по п.1, причем указанный набор содержит следующие компоненты:
первое антитело, направленное против эпитопа фактора транскрипции или, соответственно, комплекса факторов транскрипции, или, соответственно, рецептора, являющегося частью комплекса факторов транскрипции, и
второе антитело, направленное против эпитопа соответствующего белка-соактиватора, где, если применимо, белок (соактиватор) является частью того же комплекса факторов транскрипции.
12. Применение набора в способе по п.8, причем указанный набор содержит следующие компоненты:
первое антитело, направленное против эпитопа фактора транскрипции или, соответственно, комплекса факторов транскрипции, или, соответственно, рецептора, являющегося частью комплекса факторов транскрипции, и
второе антитело, направленное против эпитопа соответствующего белка-соактиватора, где, если применимо, белок (соактиватор) является частью того же комплекса факторов транскрипции.
13. Применение набора в способе по п.9, причем указанный набор содержит следующие компоненты:
первое антитело, направленное против эпитопа фактора транскрипции или, соответственно, комплекса факторов транскрипции, или, соответственно, рецептора, являющегося частью комплекса факторов транскрипции, и
второе антитело, направленное против эпитопа соответствующего белка-соактиватора, где, если применимо, белок (соактиватор) является частью того же комплекса факторов транскрипции.
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| EP14152183 | 2014-01-22 | ||
| EP14152183.1 | 2014-01-22 | ||
| PCT/EP2015/051051 WO2015110440A1 (en) | 2014-01-22 | 2015-01-21 | Improved stratification of patients for assessing the suitability of a therapy |
Publications (3)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2016133965A true RU2016133965A (ru) | 2018-02-28 |
| RU2016133965A3 RU2016133965A3 (ru) | 2018-09-27 |
| RU2711452C2 RU2711452C2 (ru) | 2020-01-17 |
Family
ID=49999759
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2016133965A RU2711452C2 (ru) | 2014-01-22 | 2015-01-21 | Усовершенствованная стратификация пациентов для оценки пригодности терапии |
Country Status (7)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US11199546B2 (ru) |
| EP (1) | EP3097421B1 (ru) |
| JP (1) | JP6700186B2 (ru) |
| CN (1) | CN105917231B (ru) |
| BR (1) | BR112016016675B1 (ru) |
| RU (1) | RU2711452C2 (ru) |
| WO (1) | WO2015110440A1 (ru) |
Families Citing this family (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| EP3469368A1 (en) * | 2016-06-13 | 2019-04-17 | Koninklijke Philips N.V. | Method for inferring activity of a transcription factor of a signal transduction pathway in a subject |
Family Cites Families (11)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| GB9708676D0 (en) * | 1997-04-30 | 1997-06-18 | Imp Cancer Res Tech | Chemical compounds |
| AU4674600A (en) * | 1999-04-30 | 2000-11-17 | North Shore Long Island Jewish Health System | Estrogen signalling pathway regulators and uses thereof |
| DE19936618A1 (de) * | 1999-08-04 | 2001-03-15 | Monotec Gmbh | Diagnostisches Kit und dessen Verwendung |
| CA2663595A1 (en) * | 2006-08-07 | 2008-02-14 | The Board Of Regents Of The University Of Texas System | Proteomic patterns of cancer prognostic and predictive signatures |
| WO2009089521A2 (en) | 2008-01-10 | 2009-07-16 | Nuvera Biosciences, Inc. | Predictors for evaluating response to cancer therapy |
| US8227202B2 (en) | 2008-07-10 | 2012-07-24 | Nodality, Inc. | Methods for diagnosis, prognosis and methods of treatment |
| EP2391962B1 (en) | 2009-01-28 | 2016-12-21 | University of Notre Dame du Lac | Accelerated progression relapse test |
| DE102009034665A1 (de) | 2009-07-24 | 2011-01-27 | Neumayer Tekfor Holding Gmbh | Befestigungsvorrichtung und Befestigungssystem |
| JP5808349B2 (ja) * | 2010-03-01 | 2015-11-10 | カリス ライフ サイエンシズ スウィッツァーランド ホールディングスゲーエムベーハー | セラノーシスのためのバイオマーカー |
| PT2553118E (pt) * | 2010-03-31 | 2014-12-17 | Sividon Diagnostics Gmbh | Método para previsão da recorrência de cancro da mama em tratamento endócrino |
| AU2013294967A1 (en) * | 2012-07-27 | 2015-02-19 | Centre Leon Berard | Detection of the ERa/Src/PI3K complex as predictive marker in breast cancer |
-
2015
- 2015-01-21 WO PCT/EP2015/051051 patent/WO2015110440A1/en active Application Filing
- 2015-01-21 EP EP15700732.9A patent/EP3097421B1/en active Active
- 2015-01-21 CN CN201580005565.1A patent/CN105917231B/zh active Active
- 2015-01-21 RU RU2016133965A patent/RU2711452C2/ru not_active IP Right Cessation
- 2015-01-21 US US15/111,328 patent/US11199546B2/en active Active
- 2015-01-21 JP JP2016547165A patent/JP6700186B2/ja active Active
- 2015-01-21 BR BR112016016675-2A patent/BR112016016675B1/pt active IP Right Grant
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| CN105917231B (zh) | 2021-05-11 |
| RU2711452C2 (ru) | 2020-01-17 |
| CN105917231A (zh) | 2016-08-31 |
| JP2017508137A (ja) | 2017-03-23 |
| JP6700186B2 (ja) | 2020-05-27 |
| EP3097421A1 (en) | 2016-11-30 |
| BR112016016675B1 (pt) | 2024-01-16 |
| US11199546B2 (en) | 2021-12-14 |
| WO2015110440A1 (en) | 2015-07-30 |
| BR112016016675A2 (ru) | 2017-08-08 |
| EP3097421B1 (en) | 2019-11-13 |
| US20160334405A1 (en) | 2016-11-17 |
| RU2016133965A3 (ru) | 2018-09-27 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| Nowak et al. | RelA Ser276 phosphorylation is required for activation of a subset of NF-κB-dependent genes by recruiting cyclin-dependent kinase 9/cyclin T1 complexes | |
| Capri et al. | Identification of miR‐31‐5p, miR‐141‐3p, miR‐200c‐3p, and GLT 1 as human liver aging markers sensitive to donor–recipient age‐mismatch in transplants | |
| Klein et al. | Atorvastatin inhibits proliferation and apoptosis, but induces senescence in hepatic myofibroblasts and thereby attenuates hepatic fibrosis in rats | |
| Balistreri et al. | The cannabinoid WIN55, 212-2 abrogates dermal fibrosis in scleroderma bleomycin model | |
| Yang et al. | Screening with a novel cell-based assay for TAZ activators identifies a compound that enhances myogenesis in C2C12 cells and facilitates muscle repair in a muscle injury model | |
| Kuzmanov et al. | Global phosphoproteomic profiling reveals perturbed signaling in a mouse model of dilated cardiomyopathy | |
| Carbone et al. | Angiotensin II activates the RhoA exchange factor Arhgef1 in humans | |
| MX2016016742A (es) | Ceramidas y su uso en el diagnostico de enfermedad cardiovascular (ecv). | |
| WO2014162008A3 (en) | Biomarker signatures for predicting drug response in hodkin's lymphoma | |
| MX2019008911A (es) | Metodos, matrices y usos de estos. | |
| Tan et al. | Analysis of Wnt signaling β-catenin spatial dynamics in HEK293T cells | |
| Terry et al. | Where does the time go?: Mixing and the depth-dependent distribution of fossil ages | |
| Sabatier et al. | Dynamic proteomics reveals high plasticity of cellular proteome: growth‐related and drug‐induced changes in cancer cells are comparable | |
| RU2016133965A (ru) | Усовершенствованная стратификация пациентов для оценки пригодности терапии | |
| Deswal et al. | Quantitative analysis of protein phosphorylations and interactions by multi-colour IP-FCM as an input for kinetic modelling of signalling networks | |
| BR112022011674A2 (pt) | Biblioteca de micropartículas pré-fabricadas e suas precursoras | |
| Zhao et al. | Evaluation of Urinary Proteome Library Generation Methods on Data‐Independent Acquisition MS Analysis and its Application in Normal Urinary Proteome Analysis | |
| Haslbauer et al. | Interstitial pulmonary fibrosis and extensive dendriform ossification with persistent viral load: A rare presentation of post-COVID-19 condition in need of lung transplantation | |
| WO2015006657A8 (en) | Method for the diagnosis and prognosis of cancer | |
| Fowler et al. | Regulation of primary response genes in B cells | |
| Horn et al. | New approach for interpreting changes in circulating tumour cells (CTC) for evaluation of treatment effect in metastatic breast cancer | |
| ES2533782A1 (es) | Procedimiento para la determinación secuencial de nitrito y nitrato. | |
| Méhes et al. | Platelet‐derived growth factor receptor β (PDGFR β) immunohistochemistry highlights activated bone marrow stroma and is potentially predictive for fibrosis progression in prefibrotic myeloproliferative neoplasia | |
| Yang et al. | Hepatic expression profile of forkhead transcription factor genes in normal Balb/c mice and their dynamic changes after bile duct ligation | |
| Hammad et al. | Repeated toxic injuries of murine liver are tolerated through microsteatosis and mild inflammation |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| MM4A | The patent is invalid due to non-payment of fees |
Effective date: 20210122 |