RU2015143410A - Праймер и способ мультиплексного тестирования с помощью суспензионных микрочипов патогенов, передающихся клещами - Google Patents
Праймер и способ мультиплексного тестирования с помощью суспензионных микрочипов патогенов, передающихся клещами Download PDFInfo
- Publication number
- RU2015143410A RU2015143410A RU2015143410A RU2015143410A RU2015143410A RU 2015143410 A RU2015143410 A RU 2015143410A RU 2015143410 A RU2015143410 A RU 2015143410A RU 2015143410 A RU2015143410 A RU 2015143410A RU 2015143410 A RU2015143410 A RU 2015143410A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- primer
- microspheres
- biotin
- diagnostic detection
- pcr
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
- C12Q1/689—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for bacteria
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
- C12Q1/6893—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for protozoa
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/16—Primer sets for multiplex assays
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Immunology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- Pathology (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Claims (21)
1. Праймер для мультиплексного недиагностического выявления с помощью суспензионных микрочипов патогенов, передающихся клещами, причем его последовательность является следующей:
2. Способ мультиплексного недиагностического выявления с помощью суспензионных микрочипов патогенов, передающихся клещами, с применением праймера по п. 1, включающий следующие этапы:
1) разработка праймеров для специфического выявления согласно нуклеотидной последовательности ПЦР-амплицированной области, подтверждение специфичности праймера, выявленного в GenBank, связывание специфической Tag с 5'-концом прямого праймера и проведение мечения биотином 5'-конца обратного праймера в процессе синтеза;
2) перекрестное сшивание продукта реакции с соответствующей кодированной микросферой после ПЦР;
3) специфическое захватывание Tag-последовательности ПЦР-продукта с помощью анти-Tag на микросферах при определенных условиях и
4) добавление стрептавидин-фикоэритрина для связывания с биотином на ПЦР-продукте, захваченном микросферами, выявление с применением системы суспензионных микрочипов LUMINAX и проведение качественного и количественного анализа выявляемых объектов посредством возбуждения красной флуоресценции в среде микросфер и фикоэритрина, связанного посредством определенных реакций на поверхности микросфер.
3. Способ недиагностического выявления по п. 2, где к 5'-концу прямого праймера необходимо искусственно добавлять участок метки, который связан со вставочной последовательностью, и 5'-конец обратного праймера метят биотином.
4. Способ недиагностического выявления по п. 2, где микросферы, ПЦР-амплифицированный продукт, SA-PE добавляют одновременно с перекрестным сшиванием при температуре 37°С, в то же время при этих условиях могут осуществлять объединение стрептавидин-фикоэритрина с биотином на ПЦР продукте, захваченном микросферами.
5. Усовершенствованный способ мультиплексного недиагностического выявления с помощью суспензионных микрочипов патогенов, передающихся клещами, где способ недиагностического выявления включает следующие этапы:
1) проведение ПЦР-амплификации выявляемых образцов;
2) добавление соответствующей микросферы для перекрестного сшивания с ПЦР- продуктом и
3) использование компьютера для выявления микросфер после перекрестного сшивания;
где специфический праймер, применяемый для выявления, разрабатывают в соответствии с определяемым вирусом и 5'-конец прямого праймера связывают со специфической Tag, обеспечивают включение С9 или С18 между праймером и Tag в качестве дополнительного плеча и 5'-конец обратного праймера метят биотином.
6. Способ недиагностического выявления по п. 5, где праймерной последовательностью, вовлеченной в способ недиагностического выявления, является следующая:
7. Способ недиагностического выявления по п. 6, где к 5'-концу прямого праймера необходимо искусственно добавлять участок метки, который связан со вставочной последовательностью, и 5'-конец обратного праймера метят биотином.
8. Способ недиагностического выявления по п. 5, где микросферы, ПЦР-амплифицированный продукт, SA-PE добавляют одновременно для перекрестного сшивания при температуре 37°С, и в то же время при этих условиях могут осуществлять присоединение стрептавидин-фикоэритрина к биотину на ПЦР продукте, захваченном микросферами.
9. Способ недиагностического выявления по п. 5, где условия амплификации являются следующими
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| CN201310102092.X | 2013-03-27 | ||
| CN201310102092.XA CN103173567B (zh) | 2013-03-27 | 2013-03-27 | 一种针对蜱传病原的悬浮芯片多重非诊断性检测方法 |
| PCT/CN2013/085199 WO2014153948A1 (zh) | 2013-03-27 | 2013-10-14 | 针对蜱传病原的悬浮芯片多重检测引物及方法 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2015143410A true RU2015143410A (ru) | 2017-05-16 |
| RU2633692C2 RU2633692C2 (ru) | 2017-10-16 |
Family
ID=48633754
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2015143410A RU2633692C2 (ru) | 2013-03-27 | 2013-10-14 | Праймер и способ мультиплексного тестирования с помощью суспензионных микрочипов патогенов, передающихся клещами |
Country Status (3)
| Country | Link |
|---|---|
| CN (1) | CN103173567B (ru) |
| RU (1) | RU2633692C2 (ru) |
| WO (1) | WO2014153948A1 (ru) |
Families Citing this family (5)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN103173567B (zh) * | 2013-03-27 | 2015-01-14 | 中国检验检疫科学研究院 | 一种针对蜱传病原的悬浮芯片多重非诊断性检测方法 |
| CN105483232A (zh) * | 2015-12-24 | 2016-04-13 | 四川国际旅行卫生保健中心 | 一种立克次体液相基因芯片的检测方法 |
| CN105543346B (zh) * | 2015-12-24 | 2019-04-16 | 四川国际旅行卫生保健中心 | 一种立克次体多重荧光pcr检测方法 |
| CN113444773B (zh) * | 2021-08-17 | 2023-06-16 | 黑龙江省牡丹江林业中心医院 | 一种基于液相芯片检测蜱虫病原体核酸的方法及试剂盒 |
| CN114058716A (zh) * | 2021-12-08 | 2022-02-18 | 河套学院 | 蜱媒病原体多样性的分析方法 |
Family Cites Families (8)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2062470C1 (ru) * | 1992-07-06 | 1996-06-20 | Омский научно-исследовательский институт природноочаговых инфекций ГК санитарно-эпидемиологического надзора РФ | Способ диагностики клещевого энцефалита |
| RU2233888C1 (ru) * | 2002-12-15 | 2004-08-10 | Дальневосточный государственный медицинский университет | Способ обнаружения микроорганизма "montezuma" |
| CN101560557B (zh) * | 2009-03-04 | 2012-07-04 | 中国检验检疫科学研究院 | 一种联合检测五种烈性病原菌的基因液相芯片及其非诊断性检测方法 |
| CN101560558B (zh) * | 2009-03-04 | 2013-03-27 | 中国检验检疫科学研究院 | 多重pcr产物的悬浮芯片的非诊断性检测方法 |
| WO2010126771A1 (en) * | 2009-04-27 | 2010-11-04 | University Of Miami | Systems, kits and methods of identifying ocular fungal and amoebic pathogens |
| RU2415947C1 (ru) * | 2009-10-13 | 2011-04-10 | Закрытое акционерное общество "Научно-производственная фирма ДНК-Технология" | НАБОР СИНТЕТИЧЕСКИХ ОЛИГОНУКЛЕОТИДОВ ДЛЯ ВЫЯВЛЕНИЯ ДНК ВОЗБУДИТЕЛЯ ЧЕЛОВЕЧЕСКОГО МОНОЦИТАРНОГО ЭРЛИХИОЗА Ehrlichia spp. МЕТОДОМ ПОЛИМЕРАЗНОЙ ЦЕПНОЙ РЕАКЦИИ "В РЕАЛЬНОМ ВРЕМЕНИ" |
| CN102943128B (zh) * | 2012-10-29 | 2013-12-25 | 中国检验检疫科学研究院 | 一种针对蚊媒病毒的悬浮芯片多重非诊断性检测方法 |
| CN103173567B (zh) * | 2013-03-27 | 2015-01-14 | 中国检验检疫科学研究院 | 一种针对蜱传病原的悬浮芯片多重非诊断性检测方法 |
-
2013
- 2013-03-27 CN CN201310102092.XA patent/CN103173567B/zh not_active Expired - Fee Related
- 2013-10-14 RU RU2015143410A patent/RU2633692C2/ru active
- 2013-10-14 WO PCT/CN2013/085199 patent/WO2014153948A1/zh active Application Filing
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| RU2633692C2 (ru) | 2017-10-16 |
| CN103173567A (zh) | 2013-06-26 |
| CN103173567B (zh) | 2015-01-14 |
| WO2014153948A1 (zh) | 2014-10-02 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2015143410A (ru) | Праймер и способ мультиплексного тестирования с помощью суспензионных микрочипов патогенов, передающихся клещами | |
| US11898142B2 (en) | Multi-effector CRISPR based diagnostic systems | |
| US20220080427A1 (en) | Apparatus and methods for molecular diagnostics | |
| ES2559108T3 (es) | Método de detección de nucleótidos simples | |
| Cheung et al. | Salmonella in food surveillance: PCR, immunoassays, and other rapid detection and quantification methods | |
| JP2014502513A5 (ru) | ||
| JP2012522517A5 (ru) | ||
| JP2009521707A5 (ru) | ||
| EP2172567A3 (en) | Methods for detecting nucleic acids in a sample | |
| JP2015533503A5 (ru) | ||
| Wang | One-pot detection of COVID-19 with real-time reverse-transcription loop-mediated isothermal amplification (RT-LAMP) assay and visual RT-LAMP assay | |
| Veronesi et al. | Comparison of PCR assays targeting the multi-copy targets B1 gene and 529 bp repetitive element for detection of Toxoplasma gondii in swine muscle | |
| WO2014152775A3 (en) | Nucleic acid-based authentication and identification codes | |
| JP2017501733A5 (ru) | ||
| CN108220450B (zh) | 肉制品中动物源性成分的鉴定方法及鉴定试剂盒 | |
| JP2013519395A5 (ru) | ||
| Mulholland et al. | The development of an accelerated reverse-transcription loop mediated isothermal amplification for the serotype specific detection of bluetongue virus 8 in clinical samples | |
| JP2014083052A5 (ru) | ||
| US20150133310A1 (en) | Nucleic acid sequencing systems and methods | |
| JP6231350B2 (ja) | 鶏封入体肝炎ウイルス検出用オリゴヌクレオチド | |
| Chung et al. | A sexually transmitted disease (STD) DNA chip for the diagnosis of genitourinary infections | |
| Wax et al. | Fast and User-Friendly Detection of Flatfish Species (Pleuronectes platessa and Solea solea) via Loop-Mediated Isothermal Amplification (LAMP) | |
| TWI512109B (zh) | Method for the detection of animal flu | |
| US20230105360A1 (en) | Apparatus and methods for molecular diagnostics | |
| Hediningsih | similiraty dan bukti korespondensi Optimization and Evaluation of Whole genome sequencing of SARS CoV-2 at the Center for Health Laboratory and Testing of Medical Devices in Central Java Province |