RU2014129220A - Новый аттенуированный полиовирус: pv-1 mono-cre-x - Google Patents
Новый аттенуированный полиовирус: pv-1 mono-cre-x Download PDFInfo
- Publication number
- RU2014129220A RU2014129220A RU2014129220A RU2014129220A RU2014129220A RU 2014129220 A RU2014129220 A RU 2014129220A RU 2014129220 A RU2014129220 A RU 2014129220A RU 2014129220 A RU2014129220 A RU 2014129220A RU 2014129220 A RU2014129220 A RU 2014129220A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- protein
- poliovirus
- genome
- less
- sequence encoding
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N7/00—Viruses; Bacteriophages; Compositions thereof; Preparation or purification thereof
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/12—Antivirals
- A61P31/14—Antivirals for RNA viruses
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2770/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssRNA viruses positive-sense
- C12N2770/00011—Details
- C12N2770/32011—Picornaviridae
- C12N2770/32311—Enterovirus
- C12N2770/32321—Viruses as such, e.g. new isolates, mutants or their genomic sequences
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2770/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssRNA viruses positive-sense
- C12N2770/00011—Details
- C12N2770/32011—Picornaviridae
- C12N2770/32311—Enterovirus
- C12N2770/32334—Use of virus or viral component as vaccine, e.g. live-attenuated or inactivated virus, VLP, viral protein
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2770/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssRNA viruses positive-sense
- C12N2770/00011—Details
- C12N2770/32011—Picornaviridae
- C12N2770/32311—Enterovirus
- C12N2770/32361—Methods of inactivation or attenuation
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2770/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssRNA viruses positive-sense
- C12N2770/00011—Details
- C12N2770/32011—Picornaviridae
- C12N2770/32611—Poliovirus
- C12N2770/32661—Methods of inactivation or attenuation
- C12N2770/32662—Methods of inactivation or attenuation by genetic engineering
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Zoology (AREA)
- Virology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
- Oncology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Public Health (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
Abstract
1. Геном аттенуированного полиовируса, содержащий:один активный cis-действующий элемент репликации (cre), причем указанный элемент cre локализован в спейсерной области 5′-НТО между клеверным листом и участком внутренней посадки рибосомы (IRES), ипоследовательность, кодирующую белок полиовируса, с меньшим отклонением в частоте использования пар кодонов, чем отклонение в частоте использования пар кодонов исходной последовательности, кодирующей данный белок полиовируса, из которой ее получают.2. Геном аттенуированного полиовируса по п. 1, который содержит один активный элемент cre, встроенный около нуклеотида 102/103.3. Геном аттенуированного полиовируса по п. 1, отличающийся тем, что элемент cre располагается как в SEQ ID NO: 1.4. Геном аттенуированного полиовируса по п. 1, отличающийся тем, что в последовательности, кодирующей белок, отклонение в частоте использования пар кодонов по меньшей мере примерно на 0,05 меньше, предпочтительно по меньшей мере примерно на 0,1 меньше, более предпочтительно по меньшей мере примерно на 0,2 меньше, чем отклонение в частоте использования пар кодонов в исходной последовательности, кодирующей данный белок.5. Геном аттенуированного полиовируса по п. 1, отличающийся тем, что в последовательности, кодирующей белок, отклонение в частоте использования пар кодонов составляет примерно -0,05 или меньше, предпочтительно примерно -0,1 или меньше, более предпочтительно примерно -0,2 или меньше, более предпочтительно примерно -0,3 или меньше, более предпочтительно примерно -0,4 или меньше.6. Геном аттенуированного полиовируса по п. 1, отличающийся тем, что последовательность, кодирующая белок, меньше, чем на 90% идентична, предпочтительно меньше чем на 80% идентична последовательности,
Claims (16)
1. Геном аттенуированного полиовируса, содержащий:
один активный cis-действующий элемент репликации (cre), причем указанный элемент cre локализован в спейсерной области 5′-НТО между клеверным листом и участком внутренней посадки рибосомы (IRES), и
последовательность, кодирующую белок полиовируса, с меньшим отклонением в частоте использования пар кодонов, чем отклонение в частоте использования пар кодонов исходной последовательности, кодирующей данный белок полиовируса, из которой ее получают.
2. Геном аттенуированного полиовируса по п. 1, который содержит один активный элемент cre, встроенный около нуклеотида 102/103.
3. Геном аттенуированного полиовируса по п. 1, отличающийся тем, что элемент cre располагается как в SEQ ID NO: 1.
4. Геном аттенуированного полиовируса по п. 1, отличающийся тем, что в последовательности, кодирующей белок, отклонение в частоте использования пар кодонов по меньшей мере примерно на 0,05 меньше, предпочтительно по меньшей мере примерно на 0,1 меньше, более предпочтительно по меньшей мере примерно на 0,2 меньше, чем отклонение в частоте использования пар кодонов в исходной последовательности, кодирующей данный белок.
5. Геном аттенуированного полиовируса по п. 1, отличающийся тем, что в последовательности, кодирующей белок, отклонение в частоте использования пар кодонов составляет примерно -0,05 или меньше, предпочтительно примерно -0,1 или меньше, более предпочтительно примерно -0,2 или меньше, более предпочтительно примерно -0,3 или меньше, более предпочтительно примерно -0,4 или меньше.
6. Геном аттенуированного полиовируса по п. 1, отличающийся тем, что последовательность, кодирующая белок, меньше, чем на 90% идентична, предпочтительно меньше чем на 80% идентична последовательности, кодирующей данный белок исходного вируса.
7. Геном аттенуированного полиовируса по п. 1, отличающийся тем, что последовательность, кодирующая белок, и исходная последовательность, кодирующая данный белок, кодируют одинаковый белок.
8. Геном аттенуированного полиовируса по п. 1, отличающийся тем, что исходная последовательность, кодирующая белок, кодирует природный изолят данного белка.
9. Геном аттенуированного полиовируса по п. 1, отличающийся тем, что исходная последовательность, кодирующая белок, представляет собой последовательность штамма Mahoney.
10. Геном аттенуированного полиовируса по п. 1, отличающийся тем, что последовательность, кодирующая белок, кодирует белок, который отличается от природного изолята примерно на 10 аминокислот или меньше, предпочтительно примерно на 20 аминокислот или меньше.
11. Геном аттенуированного полиовируса по п. 1, отличающийся тем, что последовательность, кодирующая модифицированный белок, содержит последовательность PV-Min (SEQ ID NO: 2) от нуклеотида 755 до нуклеотида 1514.
12. Геном аттенуированного полиовируса по п. 1, который содержит SEQ ID NO: 3.
13. Аттенуированный полиовирус, содержащий геном полиовируса по любому из пп. 1-12.
14. Способ получения генома аттенуированного полиовируса, который включает:
получение последовательности нуклеиновой кислоты, которая содержит
cis-действующий элемент репликации (cre), локализованный в спейсерной области 5′-НТО между клеверным листом и участком внутренней посадки рибосомы (IRES), и
последовательность, кодирующую белок полиовируса с меньшим отклонением в частоте использования пар кодонов, чем отклонение в частоте использования пар кодонов исходной последовательности, кодирующей данный белок полиовируса, из которой ее получают.
15. Способ по п. 14, отличающийся тем, что последовательность генома аттенуированного полиовируса, кодирующую белок полиовируса, составляют путем реаранжировки кодонов исходной нуклеотидной последовательности полиовируса для получения мутированной нуклеотидной последовательности, которая кодирует такую же аминокислотную последовательность, как и исходная нуклеотидная последовательность полиовируса.
16. Способ по любому из пп. 14 или 15, который дополнительно включает введение полиовируса в соответствующую клетку-хозяина и культивирование клетки-хозяина для получения полиовируса.
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US201161576706P | 2011-12-16 | 2011-12-16 | |
| US61/576,706 | 2011-12-16 | ||
| PCT/US2012/069868 WO2013090795A1 (en) | 2011-12-16 | 2012-12-14 | Novel attenuated poliovirus: pv-1 mono-cre-x |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2014129220A true RU2014129220A (ru) | 2016-02-10 |
Family
ID=48613234
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2014129220A RU2014129220A (ru) | 2011-12-16 | 2012-12-14 | Новый аттенуированный полиовирус: pv-1 mono-cre-x |
Country Status (11)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US20140356962A1 (ru) |
| EP (1) | EP2791326A4 (ru) |
| JP (1) | JP2015502158A (ru) |
| KR (1) | KR20140105781A (ru) |
| CN (1) | CN104204196A (ru) |
| AR (1) | AR089282A1 (ru) |
| BR (1) | BR112014014654A2 (ru) |
| CA (1) | CA2859044A1 (ru) |
| RU (1) | RU2014129220A (ru) |
| TW (1) | TW201333196A (ru) |
| WO (1) | WO2013090795A1 (ru) |
Families Citing this family (5)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US20190169235A1 (en) * | 2015-11-05 | 2019-06-06 | The Research Foundation For The State University Of New York | Modified protein encoding sequences having increased rare hexamer content |
| WO2017184655A1 (en) * | 2016-04-18 | 2017-10-26 | University Of Florida Research Foundaiton, Inc. | Stable poliovirus variants and uses thereof |
| CN110225765B (zh) * | 2016-11-30 | 2024-03-12 | 勃林格殷格翰动物保健美国公司 | 减毒猪流感疫苗以及其制备和使用方法 |
| KR20200103020A (ko) * | 2017-12-22 | 2020-09-01 | 코다제닉스 인코포레이티드 | 코돈쌍 탈최적화 영역을 가진 재조합 바이러스 및 암 치료를 위한 이의 용도 |
| SG11202008126QA (en) * | 2018-03-08 | 2020-09-29 | Codagenix Inc | Attenuated flaviviruses |
Family Cites Families (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US6264940B1 (en) * | 1998-08-05 | 2001-07-24 | The Research Foundation Of State University Of New York | Recombinant poliovirus for the treatment of cancer |
| PL2139515T5 (pl) * | 2007-03-30 | 2024-04-08 | The Research Foundation Of The State University Of New York | Atenuowane wirusy przydatne w szczepionkach |
| US8066983B2 (en) * | 2008-03-14 | 2011-11-29 | The Research Foundation Of State University Of New York | Attenuated poliovirus |
-
2012
- 2012-12-14 KR KR1020147017425A patent/KR20140105781A/ko not_active Application Discontinuation
- 2012-12-14 BR BR112014014654A patent/BR112014014654A2/pt not_active IP Right Cessation
- 2012-12-14 EP EP12857668.3A patent/EP2791326A4/en not_active Withdrawn
- 2012-12-14 WO PCT/US2012/069868 patent/WO2013090795A1/en active Application Filing
- 2012-12-14 RU RU2014129220A patent/RU2014129220A/ru not_active Application Discontinuation
- 2012-12-14 CN CN201280066104.1A patent/CN104204196A/zh active Pending
- 2012-12-14 US US14/365,854 patent/US20140356962A1/en not_active Abandoned
- 2012-12-14 JP JP2014547510A patent/JP2015502158A/ja active Pending
- 2012-12-14 CA CA2859044A patent/CA2859044A1/en not_active Abandoned
- 2012-12-17 AR ARP120104772A patent/AR089282A1/es unknown
- 2012-12-17 TW TW101147987A patent/TW201333196A/zh unknown
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| US20140356962A1 (en) | 2014-12-04 |
| JP2015502158A (ja) | 2015-01-22 |
| EP2791326A4 (en) | 2015-09-02 |
| EP2791326A1 (en) | 2014-10-22 |
| WO2013090795A1 (en) | 2013-06-20 |
| CA2859044A1 (en) | 2013-06-20 |
| CN104204196A (zh) | 2014-12-10 |
| KR20140105781A (ko) | 2014-09-02 |
| BR112014014654A2 (pt) | 2019-09-24 |
| TW201333196A (zh) | 2013-08-16 |
| AR089282A1 (es) | 2014-08-13 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2018131966A (ru) | Рнк-репликон для универсальной и эффективной генной экспрессии | |
| RU2014129220A (ru) | Новый аттенуированный полиовирус: pv-1 mono-cre-x | |
| EA201492202A1 (ru) | Способ экспрессии гетерологичных белков с использованием рекомбинантного вирусного вектора с минус-нитью рнк | |
| DK1976871T3 (da) | Vacciner og immunterapeutika under anvendelse af codonoptimerede IL-15 og fremgangsmåder til anvendelse deraf | |
| JP2019530466A5 (ru) | ||
| JP2015533297A5 (ru) | ||
| JP2013507935A5 (ru) | ||
| WO2008140621A3 (en) | Transgenic oncolytic viruses and uses thereof | |
| EA201692359A1 (ru) | Композиция на основе нового штамма prrsv или его белков, продукт, их применение, вирус prrsv, выделенная нк и рекомбинантный вектор экспрессии для получения этого вируса | |
| ES2623149T3 (es) | Parvovirus atenuado vivo | |
| EA201391160A1 (ru) | Молекула нуклеиновой кислоты, кодирующей коровый белок вируса гепатита в, и вакцина, содержащая указанную молекулу | |
| RU2012142309A (ru) | Рекомбинантный аттенуированный парвовирус | |
| JP2014520527A5 (ru) | ||
| SG10201405123WA (en) | Recombinant avian paramyxovirus vaccine and method for making and using thereof | |
| EA201001202A1 (ru) | Атенуированные онколитические парамиксовирусы, кодирующие птичьи цитокины | |
| JP2016513457A5 (ru) | ||
| JP2013520977A5 (ru) | ||
| EA201691192A1 (ru) | Гены токсинов axmi477, axmi482, axmi486 и axmi525 и способы их применения | |
| RU2017128752A (ru) | Новая лизиндекарбоксилаза и способ получения кадаверина с ее использованием | |
| RU2377248C2 (ru) | Устойчивые к грибкам растения и их использование | |
| JP6235697B2 (ja) | 変異ワクシニアウイルス株、その使用およびそれを作製する方法 | |
| JP2010183921A5 (ru) | ||
| NO20081541L (no) | Ny sjo-lus vaksine | |
| MX2021002374A (es) | Metodos y composiciones para producir un virus. | |
| NZ629391A (en) | Plants having improved growth properties |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| FA93 | Acknowledgement of application withdrawn (no request for examination) |
Effective date: 20151215 |