RU2011143425A - Способ диагностики рака и мониторинга лечения рака - Google Patents
Способ диагностики рака и мониторинга лечения рака Download PDFInfo
- Publication number
- RU2011143425A RU2011143425A RU2011143425/10A RU2011143425A RU2011143425A RU 2011143425 A RU2011143425 A RU 2011143425A RU 2011143425/10 A RU2011143425/10 A RU 2011143425/10A RU 2011143425 A RU2011143425 A RU 2011143425A RU 2011143425 A RU2011143425 A RU 2011143425A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- cancer
- fragment
- range
- nature
- patient
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
- C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/106—Pharmacogenomics, i.e. genetic variability in individual responses to drugs and drug metabolism
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Immunology (AREA)
- Pathology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Hospice & Palliative Care (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Oncology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
1. Способ диагностики рака, включающий стадии:(а) определения характера фрагментации ДНК повторяющихся элементов или мультикопийных генов, представленных 4-6 фрагментами из 80-500 п.о. в образце жидкости тела, взятом у пациента, который предположительно болен раком,(б) сравнения характера фрагментации ДНК, определенного на стадии (а), с характером фрагментации ДНК в контрольном образце, выделенном от индивидуума, не имеющего ракового заболевания,(в) определения уровня указанных фрагментов ДНК, которые по-разному экспрессируются в образце, выделенном от диагностируемого пациента, по сравнению с контрольным образцом,причем уровень фрагментов ДНК в случае существенного отличия от уровня в контрольном образце свидетельствует о том, что исследуемый пациент вероятно болен раком.2. Способ по п.1, в котором характер фрагментации ДНК представлен 5 фрагментами.3. Способ по п.2, в котором размер первого фрагмента находится в диапазоне 80-160 п.о., второго фрагмента находится в диапазоне 200-220 п.о., третьего фрагмента находится в диапазоне 240-260 п.о., четвертого фрагмента находится в диапазоне 300-380 п.о. и пятого фрагмента находится в диапазоне 400-500 п.о.4. Способ по одному из пп.1-3, в котором повторяющимся элементом является LINE1, SINE1 или LTR и мультикопийным геном является ген U1 РНК.5. Способ по п.1, в котором повторяющимся элементом является LINE1.6. Способ по п.1, в котором жидкостью тела является кровь, сыворотка, плазма, моча, костный мозг, жидкость брюшной полости или спинномозговая жидкость.7. Способ по п.6, в котором жидкостью тела является сыворотка или плазма.8. Способ по п.1, в котором раком является рак печени, рак груди, рак толстой кишки, рак лег�
Claims (20)
1. Способ диагностики рака, включающий стадии:
(а) определения характера фрагментации ДНК повторяющихся элементов или мультикопийных генов, представленных 4-6 фрагментами из 80-500 п.о. в образце жидкости тела, взятом у пациента, который предположительно болен раком,
(б) сравнения характера фрагментации ДНК, определенного на стадии (а), с характером фрагментации ДНК в контрольном образце, выделенном от индивидуума, не имеющего ракового заболевания,
(в) определения уровня указанных фрагментов ДНК, которые по-разному экспрессируются в образце, выделенном от диагностируемого пациента, по сравнению с контрольным образцом,
причем уровень фрагментов ДНК в случае существенного отличия от уровня в контрольном образце свидетельствует о том, что исследуемый пациент вероятно болен раком.
2. Способ по п.1, в котором характер фрагментации ДНК представлен 5 фрагментами.
3. Способ по п.2, в котором размер первого фрагмента находится в диапазоне 80-160 п.о., второго фрагмента находится в диапазоне 200-220 п.о., третьего фрагмента находится в диапазоне 240-260 п.о., четвертого фрагмента находится в диапазоне 300-380 п.о. и пятого фрагмента находится в диапазоне 400-500 п.о.
4. Способ по одному из пп.1-3, в котором повторяющимся элементом является LINE1, SINE1 или LTR и мультикопийным геном является ген U1 РНК.
5. Способ по п.1, в котором повторяющимся элементом является LINE1.
6. Способ по п.1, в котором жидкостью тела является кровь, сыворотка, плазма, моча, костный мозг, жидкость брюшной полости или спинномозговая жидкость.
7. Способ по п.6, в котором жидкостью тела является сыворотка или плазма.
8. Способ по п.1, в котором раком является рак печени, рак груди, рак толстой кишки, рак легких, рак простаты, рак яичника или рак желудка.
9. Способ по п.8, в котором раком печени является первичный и вторичный рак печени.
10. Способ по п.9, в котором первичным раком печени является гепатоклеточная карцинома.
11. Способ мониторинга прогрессирования или рецессии заболевания у пациента, больного раком и подвергаемого лечению от рака, включающему стадии:
(а) определения характера фрагментации ДНК повторяющихся элементов или мультикопийных генов, представленных 4-6 фрагментами из 80-500 п.о. в образце жидкости тела, выделенном от подвергаемого мониторингу пациента, в конце лечения,
(б) сравнения характера фрагментации ДНК, определенного на стадии (а), с характером фрагментации ДНК в контрольном образце, выделенном от того же индивидуума до лечения,
(в) определения уровня указанных фрагментов ДНК, которые по-разному экспрессируются в образце, выделенном от пациента, подвергаемого лечению и мониторингу, по сравнению с контрольным образцом,
причем уровень фрагментов ДНК в случае существенного отличия от уровня фрагментов ДНК в контрольном образце свидетельствует о том, что заболевание раком вероятно находится на более продвинутой стадии или на менее продвинутой стадии у подвергаемого мониторингу пациента, чем в контрольном образце, выделенном от того же пациента, или подвергаемый мониторингу пациент вероятно слабее или сильнее реагирует на лечение рака.
12. Способ по п.11, в котором характер фрагментации ДНК представлен 5 фрагментами.
13. Способ по п.12, в котором размер первого фрагмента находится в диапазоне 80-160 п.о., второго фрагмента находится в диапазоне 200-220 п.о., третьего фрагмента находится в диапазоне 240-260 п.о., четвертого фрагмента находится в диапазоне 300-380 п.о. и пятого фрагмента находится в диапазоне 400-500 п.о.
14. Способ по одному из пп.11-13, в котором повторяющимся элементом является LINE1, SINE1 или LTR и мультикопийным геном является ген U1 РНК.
15. Способ по п.11, в котором повторяющимся элементом является LINE1.
16. Способ по п.11, в котором жидкостью тела является кровь, сыворотка, плазма, моча, костный мозг, жидкость брюшной полости или спинномозговая жидкость.
17. Способ по п.16, в котором жидкостью тела является сыворотка или плазма.
18. Способ по п.11, в котором раком является рак печени, рак груди, рак толстой кишки, рак легких, рак простаты, рак яичника или рак желудка.
19. Способ по п.18, в котором раком печени является первичный и вторичный рак печени.
20. Способ по п.19, в котором первичным раком печени является гепатоклеточная карцинома.
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| EP09004687 | 2009-03-31 | ||
| EP09004687.1 | 2009-03-31 | ||
| PCT/EP2010/053152 WO2010112316A1 (en) | 2009-03-31 | 2010-03-12 | Method for diagnosis of cancer and monitoring of cancer treatments |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2011143425A true RU2011143425A (ru) | 2013-05-10 |
Family
ID=41087367
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2011143425/10A RU2011143425A (ru) | 2009-03-31 | 2010-03-12 | Способ диагностики рака и мониторинга лечения рака |
Country Status (10)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US20120021428A1 (ru) |
| EP (1) | EP2414540A1 (ru) |
| JP (1) | JP2012521772A (ru) |
| CN (1) | CN102369299A (ru) |
| AU (1) | AU2010230417B2 (ru) |
| CA (1) | CA2757131A1 (ru) |
| NZ (1) | NZ595993A (ru) |
| RU (1) | RU2011143425A (ru) |
| SG (1) | SG174401A1 (ru) |
| WO (1) | WO2010112316A1 (ru) |
Families Citing this family (19)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US20100240049A1 (en) | 2009-01-16 | 2010-09-23 | Cepheid | Methods of Detecting Cervical Cancer |
| EP4212630A1 (en) | 2009-11-06 | 2023-07-19 | The Chinese University of Hong Kong | Size-based genomic analysis |
| EP2771483A1 (en) * | 2011-10-25 | 2014-09-03 | ONCOTYROL - Center for Personalized Cancer Medicine GmbH | Method for diagnosing a disease based on plasma-dna distribution |
| US9892230B2 (en) * | 2012-03-08 | 2018-02-13 | The Chinese University Of Hong Kong | Size-based analysis of fetal or tumor DNA fraction in plasma |
| US11261494B2 (en) | 2012-06-21 | 2022-03-01 | The Chinese University Of Hong Kong | Method of measuring a fractional concentration of tumor DNA |
| ES2832554T3 (es) | 2012-06-22 | 2021-06-10 | Leica Biosystems Nussloch Gmbh | Recipiente para muestras de tejido |
| EP2864467B1 (en) | 2012-06-22 | 2019-04-03 | Leica Biosystems Nussloch GmbH | Biopsy tissue sample transport device |
| US9389154B2 (en) | 2013-03-15 | 2016-07-12 | Leica Biosystems Nussloch Gmbh | Tissue cassette with biasing element |
| CA2845830C (en) | 2013-03-15 | 2020-10-27 | Leica Biosystems Nussloch Gmbh | Tissue cassette with retractable member |
| US9052256B2 (en) | 2013-03-15 | 2015-06-09 | Leica Biosystems Nussloch Gmbh | Method for processing and embedding tissue |
| AU2015292311B2 (en) | 2014-07-25 | 2022-01-20 | University Of Washington | Methods of determining tissues and/or cell types giving rise to cell-free DNA, and methods of identifying a disease or disorder using same |
| JP2017538404A (ja) | 2014-11-14 | 2017-12-28 | リキッド ジェノミクス，インコーポレイティド | 癌を診断及び／又は観察するための循環無細胞ｒｎａの使用 |
| US10364467B2 (en) | 2015-01-13 | 2019-07-30 | The Chinese University Of Hong Kong | Using size and number aberrations in plasma DNA for detecting cancer |
| KR20170125044A (ko) | 2015-02-10 | 2017-11-13 | 더 차이니즈 유니버시티 오브 홍콩 | 암 스크리닝 및 태아 분석을 위한 돌연변이 검출법 |
| WO2017014177A1 (ja) * | 2015-07-17 | 2017-01-26 | 凸版印刷株式会社 | 健康状態の評価方法及び抗がん剤に対する長期奏功性の予測方法 |
| WO2017190067A1 (en) * | 2016-04-28 | 2017-11-02 | Impact Genomics, Inc. | Methods of assessing and monitoring tumor load |
| AU2017347790B2 (en) | 2016-10-24 | 2024-06-13 | Grail, Inc. | Methods and systems for tumor detection |
| CA3051509A1 (en) | 2017-01-25 | 2018-08-02 | The Chinese University Of Hong Kong | Diagnostic applications using nucleic acid fragments |
| AU2020280543A1 (en) * | 2019-05-23 | 2022-01-27 | Xiamen University | Anti-hepatitis B virus antibodies and use thereof |
Family Cites Families (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| AU2006251937A1 (en) | 2005-05-27 | 2006-11-30 | John Wayne Cancer Institute | Use of free circulating DNA for diagnosis, prognosis, and treatment of cancer |
| EP2147123A4 (en) | 2007-04-25 | 2010-05-26 | Wayne John Cancer Inst | USE OF METHYLATED OR UNMETHYLATED LINE-1 DNA AS CANCER MARKERS |
-
2010
- 2010-03-12 SG SG2011066479A patent/SG174401A1/en unknown
- 2010-03-12 CN CN2010800157614A patent/CN102369299A/zh active Pending
- 2010-03-12 AU AU2010230417A patent/AU2010230417B2/en not_active Ceased
- 2010-03-12 NZ NZ595993A patent/NZ595993A/xx not_active IP Right Cessation
- 2010-03-12 EP EP10709480A patent/EP2414540A1/en not_active Withdrawn
- 2010-03-12 JP JP2012502549A patent/JP2012521772A/ja not_active Withdrawn
- 2010-03-12 CA CA2757131A patent/CA2757131A1/en not_active Abandoned
- 2010-03-12 RU RU2011143425/10A patent/RU2011143425A/ru not_active Application Discontinuation
- 2010-03-12 WO PCT/EP2010/053152 patent/WO2010112316A1/en active Application Filing
- 2010-03-12 US US13/262,363 patent/US20120021428A1/en not_active Abandoned
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| AU2010230417A1 (en) | 2011-11-17 |
| AU2010230417B2 (en) | 2013-10-10 |
| US20120021428A1 (en) | 2012-01-26 |
| CA2757131A1 (en) | 2010-10-07 |
| NZ595993A (en) | 2013-05-31 |
| EP2414540A1 (en) | 2012-02-08 |
| JP2012521772A (ja) | 2012-09-20 |
| WO2010112316A1 (en) | 2010-10-07 |
| SG174401A1 (en) | 2011-11-28 |
| CN102369299A (zh) | 2012-03-07 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2011143425A (ru) | Способ диагностики рака и мониторинга лечения рака | |
| Lukasik et al. | In silico identification of plant miRNAs in mammalian breast milk exosomes–a small step forward? | |
| AU2020265027A1 (en) | Microrna marker combination for diagnosing gastric cancer and diagnostic kit | |
| CN108676878B (zh) | 检测ndrg4基因甲基化位点的产品在制备结直肠癌早期检测的产品的用途 | |
| CN105950753B (zh) | 一种与肺腺癌辅助诊断相关的血浆miRNA标志物及其应用 | |
| CN106119393B (zh) | 一种与食管鳞癌辅助诊断相关的血浆miRNA标志物及其应用 | |
| Pennathur et al. | Gene expression profiles in esophageal adenocarcinoma predict survival after resection | |
| Yendamuri et al. | MicroRNA biomarkers in lung cancer: MiRacle or quagMiRe? | |
| WO2011146403A3 (en) | Identification of polymorphic hepatitis b viruses and kras oncogene mutations and clinical use | |
| CN105176983A (zh) | 一种用于检测食管鳞癌相关血清miRNAs基因的试剂盒 | |
| CN108103198A (zh) | 一种与胰腺癌辅助诊断相关的血浆miRNA标志物及其应用 | |
| JP2015521475A5 (ru) | ||
| Imbar et al. | Introduction: MicroRNAs in human reproduction: small molecules with crucial regulatory roles | |
| CN109055557A (zh) | 一种与胰腺癌辅助诊断相关的血清miRNA标志物及其应用 | |
| CN104498606A (zh) | microRNAs在制备早期筛查或诊断Brachyury阳性肿瘤试剂或试剂盒中的应用 | |
| CN109355385A (zh) | Linc00266-1 rna作为实体瘤标志物的应用 | |
| CN110257514B (zh) | 一种新的食管癌血液miRNA标志物及其应用 | |
| CN111321222B (zh) | 用于结直肠癌无创诊断的血清piRNA标志物及检测试剂盒 | |
| WO2011027332A2 (en) | Microrna expression signature in peripheral blood of patients affected by hepatocarcinoma or hepatic cirrhosis and uses thereof | |
| CN103173449B (zh) | 与食管癌术后早期复发和预后相关的miRNA标志物及其应用 | |
| WO2020010311A2 (en) | Viral oncogene influences and gene expression patterns as indicators of early tumorigenesis | |
| CN106350582A (zh) | 一种与肺鳞癌辅助诊断相关的血清miRNA标志物及其应用 | |
| CN109563548A (zh) | 用于鉴定胰腺癌或胰腺导管内乳头状粘液性瘤的体外方法 | |
| CN106367477A (zh) | 一种与结直肠癌辅助诊断相关的血清miRNA标志物及其应用 | |
| RU2786386C1 (ru) | Тест-система "miR-M-SCREEN" для прогнозирования развития метастазов у больных колоректальным раком на основании уровня микро-РНК miR-26a и miR-143 в плазме крови |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| FA92 | Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted) |
Effective date: 20140619 |