RU2010121852A - Растения с измененным строением корня, связанные конструкты и способы, вовлекающие гены, кодирующие полипептиды семейства экзостозина и их гомологи - Google Patents

Растения с измененным строением корня, связанные конструкты и способы, вовлекающие гены, кодирующие полипептиды семейства экзостозина и их гомологи Download PDF

Info

Publication number
RU2010121852A
RU2010121852A RU2010121852/10A RU2010121852A RU2010121852A RU 2010121852 A RU2010121852 A RU 2010121852A RU 2010121852/10 A RU2010121852/10 A RU 2010121852/10A RU 2010121852 A RU2010121852 A RU 2010121852A RU 2010121852 A RU2010121852 A RU 2010121852A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
plant
dna construct
acid sequence
recombinant dna
descendant
Prior art date
Application number
RU2010121852/10A
Other languages
English (en)
Inventor
Грациана ТАРАМИНО (US)
Грациана ТАРАМИНО
Хадзиме САКАИ (US)
Хадзиме САКАИ
Скотт В. ТИНГИ (US)
Скотт В. ТИНГИ
Стефен М. АЛЛЕН (US)
Стефен М. АЛЛЕН
Дуайт ТОМЗ (US)
Дуайт ТОМЗ
Стенли ЛАК (US)
Стенли ЛАК
Сяому НЮ (US)
Сяому НЮ
Original Assignee
Е.И.Дюпон де Немур энд Компани (US)
Е.И.Дюпон Де Немур Энд Компани
Пайонир Хай-Бред Интернэшнл, Инк. (Us)
Пайонир Хай-Бред Интернэшнл, Инк.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Е.И.Дюпон де Немур энд Компани (US), Е.И.Дюпон Де Немур Энд Компани, Пайонир Хай-Бред Интернэшнл, Инк. (Us), Пайонир Хай-Бред Интернэшнл, Инк. filed Critical Е.И.Дюпон де Немур энд Компани (US)
Publication of RU2010121852A publication Critical patent/RU2010121852A/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8261—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/415—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from plants
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8201—Methods for introducing genetic material into plant cells, e.g. DNA, RNA, stable or transient incorporation, tissue culture methods adapted for transformation
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8261—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
    • C12N15/8271—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance
    • Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
    • Y02A40/00—Adaptation technologies in agriculture, forestry, livestock or agroalimentary production
    • Y02A40/10—Adaptation technologies in agriculture, forestry, livestock or agroalimentary production in agriculture
    • Y02A40/146—Genetically Modified [GMO] plants, e.g. transgenic plants

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Botany (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

1. Растение, содержащее в своем геноме рекомбинантный ДНК-конструкт, который включает полинуклеотид, функционально связанный, по меньшей мере, с одним регуляторным элементом, где указанный полинуклеотид кодирует полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, по меньшей мере, на 50% идентичную, на основании метода выравнивания Clustal V, SEQ ID NO: 15, 17, 19, 21, 23, 25, 27, 29, 31 или 34, и указанное растение проявляет измененное строение корня по сравнению с контрольным растением, не включающим указанный рекомбинантный ДНК-конструкт. ! 2. Растение по п.1, отличающееся тем, что растение является растением маиса или растением сои. ! 3. Растение, содержащее в своем геноме: ! рекомбинантный ДНК-конструкт, который включает: ! (a) полинуклеотид, функционально связанный, по меньшей мере, с одним регуляторным элементом, где указанный полинуклеотид кодирует полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, которая, по меньшей мере, на 50% идентична, на основании метода выравнивания Clustal V, SEQ ID NO: 15, 17, 19, 21, 23, 25, 27, 29, 31 или 34, или ! (b) супрессорный ДНК-конструкт, который включает в себя, по меньшей мере, один регуляторный элемент, функционально связанный с: ! (i) всей (всем) или частью: (A) последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, по меньшей мере, на 50% идентичную, на основании метода выравнивания Clustal V, SEQ ID NO: 15, 17, 19, 21, 23, 25, 27, 29, 31 или 34, или (B) полного комплемента последовательности нуклеиновой кислоты (b)(i)(A); или ! (ii) участком, полученным из всей или части смысловой цепи или антисмысловой цепи представляющего интерес гена-мишени, где указанный участок имеет последовательность нук�

Claims (47)

1. Растение, содержащее в своем геноме рекомбинантный ДНК-конструкт, который включает полинуклеотид, функционально связанный, по меньшей мере, с одним регуляторным элементом, где указанный полинуклеотид кодирует полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, по меньшей мере, на 50% идентичную, на основании метода выравнивания Clustal V, SEQ ID NO: 15, 17, 19, 21, 23, 25, 27, 29, 31 или 34, и указанное растение проявляет измененное строение корня по сравнению с контрольным растением, не включающим указанный рекомбинантный ДНК-конструкт.
2. Растение по п.1, отличающееся тем, что растение является растением маиса или растением сои.
3. Растение, содержащее в своем геноме:
рекомбинантный ДНК-конструкт, который включает:
(a) полинуклеотид, функционально связанный, по меньшей мере, с одним регуляторным элементом, где указанный полинуклеотид кодирует полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, которая, по меньшей мере, на 50% идентична, на основании метода выравнивания Clustal V, SEQ ID NO: 15, 17, 19, 21, 23, 25, 27, 29, 31 или 34, или
(b) супрессорный ДНК-конструкт, который включает в себя, по меньшей мере, один регуляторный элемент, функционально связанный с:
(i) всей (всем) или частью: (A) последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, по меньшей мере, на 50% идентичную, на основании метода выравнивания Clustal V, SEQ ID NO: 15, 17, 19, 21, 23, 25, 27, 29, 31 или 34, или (B) полного комплемента последовательности нуклеиновой кислоты (b)(i)(A); или
(ii) участком, полученным из всей или части смысловой цепи или антисмысловой цепи представляющего интерес гена-мишени, где указанный участок имеет последовательность нуклеиновой кислоты, по меньшей мере, на 50% идентичную, на основании метода выравнивания Clustal V, указанной всей или части смысловой цепи или антисмысловой цепи, из которой получен указанный участок, и где указанный представляющий интерес ген-мишень кодирует EXST или EXST-подобный полипептид,
и где указанное растение проявляет изменение, по меньшей мере, одной агрономической характеристики по сравнению с контрольным растением, не содержащим указанный рекомбинантный ДНК-конструкт.
4. Растение по п.3, отличающееся тем, что растение является растением маиса или растением сои.
5. Растение по п.3, отличающееся тем, что указанное растение проявляет указанное изменение указанной, по меньшей мере, одной агрономической характеристики, при изменяющихся условиях окружающей среды, по сравнению с указанным контрольным растением, не содержащим указанный рекомбинантный ДНК-конструкт.
6. Растение по п.5, отличающееся тем, что указанное изменяющееся условие окружающей среды является, по меньшей мере, одним, выбранным из засухи, азота или заболевания.
7. Растение по п.5, отличающееся тем, что растение является растением маиса или растением сои.
8. Растение по п.7, отличающееся тем, что растение является растением кукурузы или растением сои.
9. Растение по п.3, отличающееся тем, что указанная, по меньшей мере, одна агрономическая характеристика выбрана из группы, состоящей из зелени, полезной продуктивности, скорости роста, биомассы, сырого веса на момент созревания, сухого веса на момент созревания, плодовой продуктивности, семенной продуктивности, общего содержания азота в растении, содержания азота в плодах, содержания азота в семенах, содержания азота в вегетативной ткани, общего содержания свободных аминокислот в растении, содержания свободных аминокислот в плодах, содержания свободных аминокислот в семенах, содержания свободных аминокислот в вегетативной ткани, общего содержания белка в растении, содержания белка в плодах, содержания белка в семенах, содержания белка в вегетативной ткани, засухоустойчивости, накопления азота, корневого полегания, стеблевого полегания, высоты растения, длины початка и отношения массы урожая к общей массе растений.
10. Растение по п.9, отличающееся тем, что растение является растением маиса или растением сои.
11. Растение по п.3, отличающееся тем, что указанное растение проявляет увеличение указанной, по меньшей мере, одной агрономической характеристики по сравнению с указанным контрольным растением.
12. Растение по п.11, отличающееся тем, что растение является растением маиса или растением сои.
13. Способ изменения строения корня в растении, который включает стадии, на которых:
(a) вводят в регенерируемую растительную клетку рекомбинантный ДНК-конструкт, включающий полинуклеотид, функционально связанный, по меньшей мере, с одной регуляторной последовательностью, где полинуклеотид кодирует полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, по меньшей мере, на 50% идентичную, на основании метода выравнивания Clustal V, SEQ ID NO: 15, 17, 19, 21, 23, 25, 27, 29, 31 или 34; и
(b) регенерируют трансгенное растение из регенерируемой растительной клетки после стадии (а), где трансгенное растение содержит в своем геноме рекомбинантный ДНК-конструкт и проявляет измененное строение корня по сравнению с контрольным растением, не содержащим рекомбинантный ДНК-конструкт.
14. Способ по п.13, дополнительно включающий стадии, на которых:
(c) получают растение-потомок, происходящее от трансгенного растения, где указанное растение-потомок содержит в своем геноме рекомбинантный ДНК-конструкт и проявляет измененное строение корня по сравнению с контрольным растением, не содержащим рекомбинантный ДНК-конструкт.
15. Способ оценки строения корня у растения, который включает стадии, на которых:
(a) вводят в регенерируемую растительную клетку рекомбинантный ДНК-конструкт, включающий в себя полинуклеотид, функционально связанный, по меньшей мере, с одной регуляторной последовательностью, где полинуклеотид кодирует полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, по меньшей мере, на 50% идентичную, на основании метода выравнивания Clustal V, SEQ ID NO: 15, 17, 19, 21, 23, 25, 27, 29, 31 или 34;
(b) регенерируют трансгенное растение из регенерируемой растительной клетки после стадии (а), где трансгенное растение содержит в своем геноме рекомбинантный ДНК-конструкт; и
(c) оценивают строение корня трансгенного растения по сравнению с контрольным растением, не содержащим рекомбинантный ДНК-конструкт.
16. Способ по п.15, дополнительно включающий стадии, на которых:
(d) получают растение-потомок, происходящее от трансгенного растения, где растение-потомок содержит в своем геноме рекомбинантный ДНК-конструкт; и
(e) оценивают строение корня растения-потомка по сравнению с контрольным растением, не содержащим рекомбинантный ДНК-конструкт.
17. Способ оценки строения корня у растения, который включает стадии, на которых:
(a) вводят в регенерируемую растительную клетку рекомбинантный ДНК-конструкт, включающий в себя полинуклеотид, функционально связанный, по меньшей мере, с одной регуляторной последовательностью, где полинуклеотид кодирует полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, по меньшей мере, на 50% идентичную, на основании метода выравнивания Clustal V, SEQ ID NO: 15, 17, 19, 21, 23, 25, 27, 29, 31 или 34;
(b) регенерируют трансгенное растение из регенерируемой растительной клетки после стадии (а), где трансгенное растение содержит в своем геноме рекомбинантный ДНК-конструкт;
(c) получают растение-потомок, происходящее от трансгенного растения, где растение-потомок содержит в своем геноме рекомбинантный ДНК-конструкт; и
(d) оценивают строение корня растения-потомка по сравнению с контрольным растением, не содержащим рекомбинантный ДНК-конструкт.
18. Способ определения изменения агрономической характеристики у растения, который включает стадии, на которых:
(a) вводят в регенерируемую растительную клетку рекомбинантный ДНК-конструкт, включающий в себя полинуклеотид, функционально связанный, по меньшей мере, с одной регуляторной последовательностью, где полинуклеотид кодирует полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, по меньшей мере, на 50% идентичную, на основании метода выравнивания Clustal V, SEQ ID NO: 15, 17, 19, 21, 23, 25, 27, 29, 31 или 34;
(b) регенерируют трансгенное растение из регенерируемой растительной клетки после стадии (а), где трансгенное растение содержит в своем геноме рекомбинантный ДНК-конструкт; и
(c) определяют, проявляет ли трансгенное растение изменение, по меньшей мере, одной агрономической характеристики по сравнению с контрольным растением, не содержащим рекомбинантный ДНК-конструкт.
19. Способ по п.18, дополнительно включающий стадии, на которых:
(d) получают растение-потомок, происходящее от трансгенного растения, где растение-потомок содержит в своем геноме рекомбинантный ДНК-конструкт; и
(e) определяют, проявляет ли растение-потомок изменение, по меньшей мере, одной агрономической характеристики по сравнению с контрольным растением, не содержащим рекомбинантный ДНК-конструкт.
20. Способ по п.19, отличающийся тем, что указанная стадия определения включает в себя определение того, проявляет ли трансгенное растение изменение, по меньшей мере, одной агрономической характеристики по сравнению с контрольным растением, не содержащим рекомбинантный ДНК-конструкт, при изменяющихся условиях окружающей среды.
21. Способ по п.19, отличающийся тем, что указанная стадия определения (e) включает определение того, проявляет ли растение-потомок изменение, по меньшей мере, одной агрономической характеристики по сравнению с контрольным растением, не содержащим рекомбинантный ДНК-конструкт, при изменяющихся условиях окружающей среды.
22. Способ определения изменения агрономической характеристики у растения, который включает стадии, на которых:
(a) вводят в регенерируемую растительную клетку рекомбинантный ДНК-конструкт, включающий в себя полинуклеотид, функционально связанный, по меньшей мере, с одной регуляторной последовательностью, где полинуклеотид кодирует полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, по меньшей мере, на 50% идентичную, на основании метода выравнивания Clustal V, SEQ ID NO: 15, 17, 19, 21, 23, 25, 27, 29, 31 или 34;
(b) регенерируют трансгенное растение из регенерируемой растительной клетки после стадии (а), где трансгенное растение содержит в своем геноме рекомбинантный ДНК-конструкт;
(c) получают растение-потомок, происходящее от трансгенного растения, где растение-потомок содержит в своем геноме рекомбинантный ДНК-конструкт; и
(d) определяют, проявляет ли растение-потомок изменение, по меньшей мере, одной агрономической характеристики по сравнению с контрольным растением, не содержащим рекомбинантный ДНК-конструкт.
23. Способ по п.22, отличающийся тем, что указанная стадия определения включает в себя определение того, проявляет ли трансгенное растение изменение, по меньшей мере, одной агрономической характеристики по сравнению с контрольным растением, не содержащим рекомбинантный ДНК-конструкт, при изменяющихся условиях окружающей среды.
24. Способ определения изменения агрономической характеристики у растения, который включает стадии, на которых:
(a) вводят в регенерируемую растительную клетку супрессорный ДНК-конструкт, включающий в себя, по меньшей мере, один регуляторный элемент, функционально связанный с:
(i) всей или частью: (А) последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид, который имеет аминокислотную последовательность, по меньшей мере, на 50% идентичную, на основании метода выравнивания Clustal V, SEQ ID NO: 15, 17, 19, 21, 23, 25, 27, 29, 31 или 34, или (B) полного комплемента последовательности нуклеиновой кислоты по (а)(i)(A); или
(ii) участком, полученным из всей или части смысловой цепи или антисмысловой цепи представляющего интерес гена-мишени, где указанный участок содержит последовательность нуклеиновой кислоты, по меньшей мере, на 50% идентичную, на основании метода выравнивания Clustal V, указанной всей или части смысловой цепи или антисмысловой цепи, из которой получен указанный участок, и где указанный представляющий интерес ген-мишень кодирует EXST или EXST-подобный полипептид;
(b) регенерируют трансгенное растение из регенерируемой растительной клетки после стадии (а), где трансгенное растение содержит в своем геноме супрессорный ДНК-конструкт; и
(c) определяют, проявляет ли трансгенное растение изменение, по меньшей мере, одной агрономической характеристики по сравнению с контрольным растением, не содержащим супрессорный ДНК-конструкт.
25. Способ по п.24, отличающийся тем, что указанная стадия определения включает в себя определение того, проявляет ли трансгенное растение изменение, по меньшей мере, одной агрономической характеристики по сравнению с контрольным растением, не содержащим супрессорный ДНК-конструкт, при изменяющихся условиях окружающей среды.
26. Способ по п.24, дополнительно включающий стадии, на которых:
(d) получают растение-потомок, происходящее от трансгенного растения, где растение-потомок содержит в своем геноме супрессорный ДНК-конструкт; и
(e) определяют, проявляет ли растение-потомок изменение, по меньшей мере, одной агрономической характеристики по сравнению с контрольным растением, не содержащим супрессорный ДНК-конструкт.
27. Способ по п.26, отличающийся тем, что указанная стадия определения (e) включает в себя определение того, проявляет ли растение-потомок изменение, по меньшей мере, одной агрономической характеристики по сравнению с контрольным растением, не содержащим супрессорный ДНК-конструкт, при изменяющихся условиях окружающей среды.
28. Способ определения изменения агрономической характеристики у растения, который включает стадии, на которых:
(a) вводят в регенерируемую растительную клетку супрессорный ДНК-конструкт, включающий в себя, по меньшей мере, один регуляторный элемент, функционально связанный с:
(i) всей (всем) или частью: (А) последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид, который имеет аминокислотную последовательность, по меньшей мере, на 50% идентичную, на основании метода выравнивания Clustal V, SEQ ID NO: 15, 17, 19, 21, 23, 25, 27, 29, 31 или 34, или (B) полного комплемента последовательности нуклеиновой кислоты по (а)(i)(A), или
(ii) участком, полученным из всей или части смысловой цепи или антисмысловой цепи представляющего интерес гена-мишени, где указанный участок содержит последовательность нуклеиновой кислоты, по меньшей мере, на 50% идентичную, на основании метода выравнивания Clustal V, указанной всей или части смысловой цепи или антисмысловой цепи, из которой получен указанный участок, и где указанный представляющий интерес ген-мишень кодирует EXST или EXST-подобный полипептид;
(b) регенерируют трансгенное растение из регенерируемой растительной клетки после стадии (а), где трансгенное растение содержит в своем геноме супрессорный ДНК-конструкт и проявляет измененное строение корня по сравнению с контрольным растением, не содержащим супрессорный ДНК-конструкт;
(c) получают растение-потомок, происходящее от трансгенного растения, где растение-потомок содержит в своем геноме супрессорный ДНК-конструкт; и
(d) определяют, проявляет ли растение-потомок изменение, по меньшей мере, одной агрономической характеристики по сравнению с контрольным растением, не содержащим супрессорный ДНК-конструкт.
29. Способ по п.28, отличающийся тем, что указанная стадия определения включает в себя определение того, проявляет ли трансгенное растение изменение, по меньшей мере, одной агрономической характеристики по сравнению с контрольным растением, не содержащим рекомбинантный ДНК-конструкт, при изменяющихся условиях окружающей среды.
30. Способ изменения строения корня у растения, который включает стадии, на которых:
(a) вводят в регенерируемую растительную клетку супрессорный ДНК-конструкт, включающий в себя, по меньшей мере, один регуляторный элемент, функционально связанный с:
(i) всей (всем) или частью: (А) последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид, который имеет аминокислотную последовательность, по меньшей мере, на 50% идентичную, на основании метода выравнивания Clustal V, SEQ ID NO: 15, 17, 19, 21, 23, 25, 27, 29, 31 или 34, или (B) полного комплемента последовательности нуклеиновой кислоты по (а)(i)(A); или
(ii) участком, полученным из всей или части смысловой цепи или антисмысловой цепи представляющего интерес гена-мишени, где указанный участок содержит последовательность нуклеиновой кислоты, по меньшей мере, на 50% идентичную, на основании метода выравнивания Clustal V, указанной всей или части смысловой цепи или антисмысловой цепи, из которой получен указанный участок, и где указанный представляющий интерес ген-мишень кодирует EXST или EXST-подобный полипептид; и
(b) регенерируют трансгенное растение из регенерируемой растительной клетки после стадии (а), где трансгенное растение содержит в своем геноме супрессорный ДНК-конструкт, и где трансгенное растение проявляет измененное строение корня по сравнению с контрольным растением, не содержащим супрессорный ДНК-конструкт.
31. Способ по п.30, дополнительно включающий стадии, на которых:
(c) получают растение-потомок, происходящее от трансгенного растения, где указанное растение-потомок содержит в своем геноме рекомбинантный ДНК-конструкт, и где растение-потомок проявляет измененное строение корня по сравнению с контрольным растением, не содержащим супрессорный ДНК-конструкт.
32. Способ оценки строения корня у растения, который включает стадии, на которых:
(a) вводят в регенерируемую растительную клетку супрессорный ДНК-конструкт, включающий в себя, по меньшей мере, один регуляторный элемент, функционально связанный с:
(i) всей (всем) или частью: (А) последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид, который имеет аминокислотную последовательность, по меньшей мере, на 50% идентичную, на основании метода выравнивания Clustal V, SEQ ID NO: 15, 17, 19, 21, 23, 25, 27, 29, 31 или 34, или (B) полного комплемента последовательности нуклеиновой кислоты по (а)(i)(A); или
(ii) участком, полученным из всей или части смысловой цепи или антисмысловой цепи представляющего интерес гена-мишени, где указанный участок содержит последовательность нуклеиновой кислоты, по меньшей мере, на 50% идентичную, на основании метода выравнивания Clustal V, указанной всей или части смысловой цепи или антисмысловой цепи, из которой получен указанный участок, и где указанный представляющий интерес ген-мишень кодирует EXST или EXST-подобный полипептид;
(b) регенерируют трансгенное растение из регенерируемой растительной клетки после стадии (а), где трансгенное растение содержит в своем геноме супрессорный ДНК-конструкт; и
(c) оценивают строение корня трансгенного растения по сравнению с контрольным растением, не содержащим супрессорный ДНК-конструкт.
33. Способ по п.32, дополнительно включающий стадии, на которых:
(d) получают растение-потомок, происходящее от трансгенного растения, где растение-потомок содержит в своем геноме супрессорный ДНК-конструкт; и
(e) оценивают строение корня растения-потомка по сравнению с контрольным растением, не содержащим супрессорный ДНК-конструкт.
34. Способ оценки строения корня у растения, который включает стадии, на которых:
(a) вводят в регенерируемую растительную клетку супрессорный ДНК-конструкт, включающий в себя, по меньшей мере, один регуляторный элемент, функционально связанный с:
(i) всей (всем) или частью: (А) последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид, который имеет аминокислотную последовательность, по меньшей мере, на 50% идентичную, на основании метода выравнивания Clustal V, SEQ ID NO: 15, 17, 19, 21, 23, 25, 27, 29, 31 или 34, или (B) полного комплемента последовательности нуклеиновой кислоты по (а)(i)(A); или
(ii) участком, полученным из всей или части смысловой цепи или антисмысловой цепи представляющего интерес гена-мишени, где указанный участок содержит последовательность нуклеиновой кислоты, по меньшей мере, на 50% идентичную, на основании метода выравнивания Clustal V, указанной всей или части смысловой цепи или антисмысловой цепи, из которой получен указанный участок, и где указанный представляющий интерес ген-мишень кодирует EXST или EXST-подобный полипептид;
(b) регенерируют трансгенное растение из регенерируемой растительной клетки после стадии (а), где трансгенное растение содержит в своем геноме супрессорный ДНК-конструкт;
(c) получают растение-потомок, происходящее от трансгенного растения, где растение-потомок содержит в своем геноме супрессорный ДНК-конструкт; и
(d) оценивают строение корня растения-потомка по сравнению с контрольным растением, не содержащим супрессорный ДНК-конструкт.
35. Выделенный полинуклеотид, который включает в себя последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую EXST или EXST-подобный полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, по меньшей мере, на 80% идентичную SEQ ID NO: 15 или 31 или, по меньшей мере, на 95% идентичную SEQ ID NO: 25, на основании метода выравнивания Clustal V, или полный комплемент указанной последовательности нуклеиновой кислоты.
36. Полинуклеотид по п.35, отличающийся тем, что аминокислотная последовательность полипептида и аминокислотная последовательность SEQ ID NO: 15 или 31 имеют идентичность последовательности, по меньшей мере, 85% на основании метода выравнивания Clustal V.
37. Полинуклеотид по п.35, отличающийся тем, что аминокислотная последовательность полипептида и аминокислотная последовательность SEQ ID NO: 15 или 31 имеют идентичность последовательности, по меньшей мере, 90% на основании метода выравнивания Clustal V.
38. Полинуклеотид по п.35, отличающийся тем, что аминокислотная последовательность полипептида и аминокислотная последовательность SEQ ID NO: 15 или 31 имеют идентичность последовательности, по меньшей мере, 95% на основании метода выравнивания Clustal V.
39. Полинуклеотид по п.35, отличающийся тем, что аминокислотная последовательность полипептида включает SEQ ID NO: 15, 25 или 31.
40. Полинуклеотид по п.35, отличающийся тем, что последовательность нуклеиновой кислоты включает SEQ ID NO: 14, 24 или 30.
41. Вектор, который включает в себя полинуклеотид по п.35.
42. Рекомбинантный ДНК-конструкт, который включает в себя полинуклеотид по п.35, функционально связанный, по меньшей мере, с одной регуляторной последовательностью.
43. Способ трансформирования клетки, включающий трансформирование клетки полинуклеотидом по п.35.
44. Клетка, которая включает в себя рекомбинантный ДНК-конструкт по п.42.
45. Способ продуцирования растения, включающий трансформирование растительной клетки полинуклеотидом по п.35 и регенерирование растения из трансформированной растительной клетки, в дальнейших вариантах осуществления изобретения векторы и рекомбинантные конструкты включают в себя любой из вышеуказанных полинуклеотидов или клеток, включающих в себя рекомбинантные конструкты.
46. Способ картирования наследственных изменений, проявляющих изменение строение корня и/или изменение, по меньшей мере, в одной агрономической характеристике у растений, включающий стадии, на которых:
(a) скрещивают два сорта растений; и
(b) оценивают наследственные изменения относительно последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из группы, которая включает SEQ ID NO: 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, 30 или 33; или
(ii) последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид, выбранный из группы, которая включает SEQ ID NO: 15, 17, 19, 21, 23, 25, 27, 29, 31 или 34;
у растений-потомков, происходящих от скрещивания стадии (а), где оценку осуществляют с использованием метода, выбранного из группы, состоящей из: ПДРФ-анализа, ОНП-анализа, анализа на основе ПЦР.
47. Способ молекулярного скрещивания для изменения строения корня и/или изменения, по меньшей мере, одной агрономической характеристики у растений, который включает в себя стадии, на которых:
(a) скрещивают два сорта растений; и
(b) оценивают наследственные изменения относительно
(i) последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, 30 или 33; или
(ii) последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид, выбранный из группы, состоящей из SEQ ID NO: 15, 17, 19, 21, 23, 25, 27, 29, 31 или 34;
у растений-потомков, полученных от скрещивания стадии (а), где оценку осуществляют с использованием способа, выбранного из группы, которая состоит из: ПДРФ-анализа, ОНП-анализа, анализа на основе ПЦР.
RU2010121852/10A 2007-10-31 2008-10-30 Растения с измененным строением корня, связанные конструкты и способы, вовлекающие гены, кодирующие полипептиды семейства экзостозина и их гомологи RU2010121852A (ru)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US98402807P 2007-10-31 2007-10-31
US60/984,028 2007-10-31

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2010121852A true RU2010121852A (ru) 2011-12-10

Family

ID=40243645

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2010121852/10A RU2010121852A (ru) 2007-10-31 2008-10-30 Растения с измененным строением корня, связанные конструкты и способы, вовлекающие гены, кодирующие полипептиды семейства экзостозина и их гомологи

Country Status (9)

Country Link
US (3) US20090113570A1 (ru)
EP (1) EP2212346A2 (ru)
CN (1) CN101848931B (ru)
BR (1) BRPI0817134A2 (ru)
CA (1) CA2703151A1 (ru)
MX (1) MX2010004809A (ru)
RU (1) RU2010121852A (ru)
WO (1) WO2009058947A2 (ru)
ZA (1) ZA201002308B (ru)

Families Citing this family (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20150324975A1 (en) * 2012-12-20 2015-11-12 Pioneer Hi-Bred International Inc. Non-destructive imaging of crop plants
CN106682570A (zh) * 2016-11-04 2017-05-17 东莞市隆声智能科技有限公司 一种植物的长势监控方法和装置
US11382260B2 (en) * 2020-02-03 2022-07-12 International Business Machines Corporation Estimation of crop type and/or sowing date
CN112331263B (zh) * 2020-10-22 2021-07-23 华南农业大学 一种基于个体遗传竞争与环境空间分析的林木基因组选择方法及其应用

Family Cites Families (10)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
SG60056A1 (en) * 1997-04-17 1999-02-22 Inst Of Molecular Agrobilogy Alteration of plant morphology by control of profilin expression
US20090087878A9 (en) * 1999-05-06 2009-04-02 La Rosa Thomas J Nucleic acid molecules associated with plants
US7214786B2 (en) * 2000-12-14 2007-05-08 Kovalic David K Nucleic acid molecules and other molecules associated with plants and uses thereof for plant improvement
DE10105383C2 (de) * 2001-02-06 2003-06-05 Heptec Gmbh Antischnarchgerät
US7619146B2 (en) * 2001-06-18 2009-11-17 Frankard Valerie Method for modifying plant morphology, biochemistry and physiology
US7592507B2 (en) * 2001-09-14 2009-09-22 Croodesign, N.V. Method to modify cell number, architecture and yield of plants by overexpressing the E2F transcription factor
JP2005185101A (ja) * 2002-05-30 2005-07-14 National Institute Of Agrobiological Sciences 植物の全長ｃＤＮＡおよびその利用
US20040216190A1 (en) * 2003-04-28 2004-10-28 Kovalic David K. Nucleic acid molecules and other molecules associated with plants and uses thereof for plant improvement
WO2004106531A1 (en) 2003-05-22 2004-12-09 E.I. Dupont De Nemours And Company Method for manipulating growth, yield, and architecture in plants
TWI285870B (en) * 2003-08-27 2007-08-21 Chi Mei Optoelectronics Corp Liquid crystal display and driving method

Also Published As

Publication number Publication date
CA2703151A1 (en) 2009-05-07
US20160017361A1 (en) 2016-01-21
CN101848931B (zh) 2013-11-06
BRPI0817134A2 (pt) 2017-05-02
WO2009058947A3 (en) 2009-06-25
MX2010004809A (es) 2010-06-11
US20090113570A1 (en) 2009-04-30
CN101848931A (zh) 2010-09-29
US9115203B2 (en) 2015-08-25
ZA201002308B (en) 2011-10-26
EP2212346A2 (en) 2010-08-04
US20110035822A1 (en) 2011-02-10
WO2009058947A2 (en) 2009-05-07

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Papini-Terzi et al. Sugarcane genes associated with sucrose content
Blum Genetic and physiological relationships in plant breeding for drought resistance
Rauf Breeding sunflower (Helianthus annuus L.) for drought tolerance
Waclawovsky et al. Sugarcane for bioenergy production: an assessment of yield and regulation of sucrose content
Bradshaw et al. Emerging model systems in plant biology: poplar (Populus) as a model forest tree
JP2011504728A5 (ru)
DE112008001277T5 (de) Transgene Pflanzen mit erhöhter Stresstoleranz und erhöhtem Ertrag
CN105646684B (zh) 一种水稻粒型相关蛋白glw2及其编码基因与应用
RU2010122899A (ru) Растения, имеющие измененные агрономические характеристики в условиях ограничения азота, и родственные конструкты и способы вовлечения генов, кодирующих полипептиды lnt2 и их гомологи
JP5259717B2 (ja) トマトの収穫量を増加させるためのプロモーター配列および遺伝子構築物
Arús et al. Review of fruit genetics and breeding programmes and a new European initiative to increase fruit breeding efficiency
Blackman Interacting duplications, fluctuating selection, and convergence: the complex dynamics of flowering time evolution during sunflower domestication
CN107299104A (zh) Revoluta基因在调控豆科植物小叶片数目和叶茎比中的应用
Moyle et al. Reciprocal insights into adaptation from agricultural and evolutionary studies in tomato
RU2010121852A (ru) Растения с измененным строением корня, связанные конструкты и способы, вовлекающие гены, кодирующие полипептиды семейства экзостозина и их гомологи
US11603537B2 (en) Method for improving rice yield by jointly knocking out ABA receptor PYL family genes and use thereof
CN105949291A (zh) 水稻mis1蛋白及其编码基因与应用
CN101370937A (zh) 赋予植物被调节的生长速率和生物量的核苷酸序列及相应多肽
CN102703468B (zh) 用于调控作物株高的基因、多肽及其应用
CN106046132A (zh) 水稻RPS3a基因及其编码蛋白的应用
Satyanarayana et al. Breeding strategies for lodging resistance in rice
CN103429072A (zh) 耐干旱植物
CN107384939A (zh) MtUNUSUAL FLORAL ORGANS基因在调控小叶数量和叶茎比中的应用
RU2011106766A (ru) Растения с измененным строением корня, связанные конструкции и способы, вовлекающие гены, кодирующие полипептиды rep2 и их гомологи
Dhutmal et al. A review on molecular approaches in breeding for abiotic stress tolerance

Legal Events

Date Code Title Description
FA93 Acknowledgement of application withdrawn (no request for examination)

Effective date: 20120110