RU2010111120A - Eb13, dlx5, nptx1 и cdkn3 в качестве генов-мишеней для терапии и диагностики рака легкого - Google Patents

Eb13, dlx5, nptx1 и cdkn3 в качестве генов-мишеней для терапии и диагностики рака легкого Download PDF

Info

Publication number
RU2010111120A
RU2010111120A RU2010111120/10A RU2010111120A RU2010111120A RU 2010111120 A RU2010111120 A RU 2010111120A RU 2010111120/10 A RU2010111120/10 A RU 2010111120/10A RU 2010111120 A RU2010111120 A RU 2010111120A RU 2010111120 A RU2010111120 A RU 2010111120A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
polypeptide
level
ebi3
lung cancer
cdkn3
Prior art date
Application number
RU2010111120/10A
Other languages
English (en)
Inventor
Юсуке НАКАМУРА (JP)
Юсуке Накамура
Ятаро ДАИГО (JP)
Ятаро ДАИГО
Суити НАКАЦУРУ (JP)
Суити НАКАЦУРУ
Original Assignee
Онкотерапи Сайенс, Инк. (Jp)
Онкотерапи Сайенс, Инк.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Онкотерапи Сайенс, Инк. (Jp), Онкотерапи Сайенс, Инк. filed Critical Онкотерапи Сайенс, Инк. (Jp)
Publication of RU2010111120A publication Critical patent/RU2010111120A/ru

Links

Classifications

    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70—Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P11/00—Drugs for disorders of the respiratory system
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00—Antineoplastic agents
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/46—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
    • C07K14/47—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
    • C07K14/4701—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals not used
    • C07K14/4702—Regulators; Modulating activity
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/22—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against growth factors ; against growth regulators
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/24—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against cytokines, lymphokines or interferons
    • C07K16/244—Interleukins [IL]
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/28—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • C07K16/30—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants from tumour cells
    • C07K16/3023—Lung
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
    • G01N33/57407—Specifically defined cancers
    • G01N33/57423—Specifically defined cancers of lung
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/505—Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising antibodies
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/30—Immunoglobulins specific features characterized by aspects of specificity or valency
    • C07K2317/34—Identification of a linear epitope shorter than 20 amino acid residues or of a conformational epitope defined by amino acid residues
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/70—Immunoglobulins specific features characterized by effect upon binding to a cell or to an antigen
    • C07K2317/73—Inducing cell death, e.g. apoptosis, necrosis or inhibition of cell proliferation
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/70—Immunoglobulins specific features characterized by effect upon binding to a cell or to an antigen
    • C07K2317/77—Internalization into the cell
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10—Type of nucleic acid
    • C12N2310/11—Antisense
    • C12N2310/111—Antisense spanning the whole gene, or a large part of it
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10—Type of nucleic acid
    • C12N2310/14—Type of nucleic acid interfering N.A.
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
    • G01N2800/54—Determining the risk of relapse

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Hospice & Palliative Care (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Toxicology (AREA)

Abstract

1. Выделенная двухцепочечная молекула, которая при введении в клетку ингибирует экспрессию EBI3, CDKN3, EF-1delta или NPTXR, а также клеточную пролиферацию в условиях in vitro, где указанная молекула содержит смысловую цепь и комплементарную ей антисмысловую цепь, где указанные цепи гибридизуются друг с другом с образованием двухцепочечной молекулы. ! 2. Двухцепочечная молекула по п.1, в которой смысловая цепь содержит последовательность, соответствующую последовательности-мишени, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO:18, 20, 49, 51, 84 и 85. ! 3. Двухцепочечная молекула по п.2, где двухцепочечная молекула представляет олигонуклеотид длиной в пределах примерно от 19 до примерно 25 нуклеотидов. ! 4. Двухцепочечная молекула по п.1, которая состоит из одного полинуклеотида, содержащего смысловую и антисмысловую цепи, связанные промежуточной одной цепью. ! 5. Двухцепочечная молекула по п.4, которая имеет общую формулу 5'-[A]-[B]-[A']-3', в которой [A] является смысловой цепью, содержащей последовательность, соответствующую последовательности-мишени, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO:18, 20, 49, 51, 84 и 85, [B] является промежуточной одной цепью, состоящей из 3-23 нуклеотидов, и [A'] является антисмысловой цепью, содержащей последовательность, комплементарную [A]. ! 6. Вектор, экспрессирующий двухцепочечную молекулу по любому из пп.1-5. ! 7. Способ лечения злокачественной опухоли, экспрессирующей, по меньшей мере, один ген, выбранный из группы, состоящей из гена EBI3, CDKN3, EF-1delta и/или NPTXR, где способ включает стадию введения, по меньшей мере, одной выделенной двухцепочечной молекулы по любому из пп.1-5 или вектора по п.6. ! 8. Способ по п.7, в котором злокачественная опухоль, к�

Claims (55)

1. Выделенная двухцепочечная молекула, которая при введении в клетку ингибирует экспрессию EBI3, CDKN3, EF-1delta или NPTXR, а также клеточную пролиферацию в условиях in vitro, где указанная молекула содержит смысловую цепь и комплементарную ей антисмысловую цепь, где указанные цепи гибридизуются друг с другом с образованием двухцепочечной молекулы.
2. Двухцепочечная молекула по п.1, в которой смысловая цепь содержит последовательность, соответствующую последовательности-мишени, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO:18, 20, 49, 51, 84 и 85.
3. Двухцепочечная молекула по п.2, где двухцепочечная молекула представляет олигонуклеотид длиной в пределах примерно от 19 до примерно 25 нуклеотидов.
4. Двухцепочечная молекула по п.1, которая состоит из одного полинуклеотида, содержащего смысловую и антисмысловую цепи, связанные промежуточной одной цепью.
5. Двухцепочечная молекула по п.4, которая имеет общую формулу 5'-[A]-[B]-[A']-3', в которой [A] является смысловой цепью, содержащей последовательность, соответствующую последовательности-мишени, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO:18, 20, 49, 51, 84 и 85, [B] является промежуточной одной цепью, состоящей из 3-23 нуклеотидов, и [A'] является антисмысловой цепью, содержащей последовательность, комплементарную [A].
6. Вектор, экспрессирующий двухцепочечную молекулу по любому из пп.1-5.
7. Способ лечения злокачественной опухоли, экспрессирующей, по меньшей мере, один ген, выбранный из группы, состоящей из гена EBI3, CDKN3, EF-1delta и/или NPTXR, где способ включает стадию введения, по меньшей мере, одной выделенной двухцепочечной молекулы по любому из пп.1-5 или вектора по п.6.
8. Способ по п.7, в котором злокачественная опухоль, которая подвергается лечению, представляет собой рак легкого.
9. Композиция для лечения злокачественной опухоли, экспрессирующей, по меньшей мере, один ген, выбранный из группы, состоящей из гена EBI3, CDKN3, EF-1delta и NPTXR, где композиция содержит, по меньшей мере, одну выделенную двухцепочечную молекулу по любому из пп.1-5 или вектор по п.6.
10. Композиция по п.9, где злокачественная опухоль, которая подвергается лечению, представляет собой рак легкого.
11. Способ диагностики рака легкого у субъекта, где способ включает стадии:
(I) (а) определение уровня экспрессии гена в биологическом образце, полученном от субъекта, любым способом, выбранным из группы, состоящей из:
(i) детектирования мРНК, выбранной из группы, состоящей из EBI3, DLX5 и CDKN3,
(ii) детектирования белка, выбранного из группы, состоящей из EBI3, DLX5 и CDKN3, и
(iii) детектирования биологической активности белка, выбранного из группы, состоящей из EBI3, DLX5 и CDKN3; и
(b) соотношение повышения уровня экспрессии, определенного на стадии (а) по сравнению с нормальным контрольным уровнем гена, с наличием рака легкого;
или
(II) (а) отбор образца крови у субъекта, которому следует поставить диагноз;
(b) определение уровня белка EBI3 в образце крови;
(с) сравнение уровня EBI3, определенного на стадии (b), с нормальным контрольным уровнем, где высокий уровень EBI3 в образце крови по сравнению с нормальным контрольным уровнем указывает на то, что субъект страдает раком легкого;
или
(III) (а) отбор образца крови у субъекта, которому следует поставить диагноз;
(b) определение уровня NPTX1 и CYFRA в образце крови;
(с) сравнение уровня NPTX1 и CYFRA, определенного на стадии (b), с нормальным контрольным уровнем;
(d) решение о том, что один или оба из высокого уровня NPTX1 и высокого уровня CYFRA в образце крови по сравнению с нормальным контрольным уровнем указывает на то, что субъект страдает раком легкого.
12. Способ по п.11(I), в котором уровень экспрессии, определенный на стадии (а), по меньшей мере, на 10% выше по сравнению с нормальным контрольным уровнем.
13. Способ по п.11(I), в котором уровень экспрессии, определенный на стадии (а), определяют детектированием связывания антитела против белка, выбранного из группы, состоящей из EBI3, DLX5 и CDKN3.
14. Способ по п.11(I), в котором биологический образец, полученный из субъекта, включает биопсийный материал, мокроту, кровь, плевральную жидкость или мочу.
15. Способ по п.11(II), в котором образец крови выбран из группы, состоящей из цельной крови, сыворотки крови и плазмы крови.
16. Способ по п.11(II), в котором белок EBI3 детектируют иммуноанализом.
17. Способ по п.16, в котором иммуноанализ представляет собой ELISA.
18. Способ по п.11(II), дополнительно включающий стадии:
(d) определение уровня CEA в образце крови;
(e) сравнение уровня CEA, определенного на стадии (d), с нормальным контрольным уровнем,
где один или оба из высокого уровня EBI3 и высокого уровня CEA в образце крови по сравнению с нормальным контрольным уровнем указывают на то, что субъект страдает раком легкого.
19. Способ по п.18, в котором рак легкого представляет собой NSCLC.
20. Способ по п.11(II), дополнительно включающий стадии:
(d) определение уровня CYFRA в образце крови;
(e) сравнение уровня CYFRA, определенного на стадии (d), с нормальным контрольным уровнем,
где один или оба из высокого уровня EBI3 и высокого уровня CYFRA в образце крови по сравнению с нормальным контрольным уровнем указывают на то, что субъект страдает раком легкого.
21. Способ по п.20, в котором рак легкого представляет собой SCC.
22. Способ по п.11(II), дополнительно включающий стадии:
(d) определение уровня pro-GRP в образце крови;
(e) сравнение уровня pro-GRP, определенного на стадии (d), с нормальным контрольным уровнем,
где один или оба из высокого уровня EBI3 и высокого уровня pro-GRP в образце крови по сравнению с нормальным контрольным уровнем указывают на то, что субъект страдает раком легкого.
23. Способ по п.22, в котором рак легкого представляет собой SCLC.
24. Способ по п.11(III), в котором рак легкого представляет собой плоскоклеточный рак легкого (SCC).
25. Способ по п.11(III), в котором образец крови выбран из группы, состоящей из цельной крови, сыворотки крови и плазмы крови.
26. Способ оценки или определения прогноза у пациента с раком легкого, где способ включает стадии:
(а) детектирование уровня экспрессии гена в биологическом образце, полученном от субъекта;
(b) сравнение детектированного уровня экспрессии с контрольным уровнем; и
(с) определение прогноза у пациента на основе сравнения, проведенного на стадии (b),
и где ген выбран из группы, состоящей из EBI3, DLX5, CDKN3 или EF-1delta.
27. Способ по п.26, в котором контрольный уровень является контрольным уровнем с благоприятным прогнозом, и повышение уровня экспрессии по сравнению с контрольным уровнем определяется как неблагоприятный прогноз.
28. Способ по п.26, в котором повышение составляет, по меньшей мере, 10% по сравнению с контрольным уровнем.
29. Способ по п.26, в котором уровень экспрессии определяют одним из способов, выбранным из группы, состоящей из:
(а) детектирования мРНК EBI3, DLX5, CDKN3 или EF-1delta,
(b) детектирования белка EBI3, DLX5, CDKN3 или EF-1delta; и
(c) детектирования биологической активности белка EBI3, DLX5, CDKN3 или EF-1delta.
30. Способ по п.26, в котором биологический образец, полученный от пациента, включает биопсийный материал, мокроту, кровь, плевральную жидкость или мочу.
31. Набор для диагностики рака легкого или оценки, или определения прогноза у пациента с раком легкого, который содержит реагент, выбранный из группы, состоящей из:
(а) реагента для детектирования мРНК гена;
(b) реагента для детектирования белка, кодированного геном; и
(с) реагента для детектирования биологической активности белка,
и где ген выбран из группы, состоящей из EBI3, DLX5, CDKN3 или EF-1delta.
32. Набор по п.31, в котором реагент представляет зонд к генному транскрипту гена.
33. Набор по п.31, в котором реагент представляет антитело против белка, кодируемого геном.
34. Набор для детектирования злокачественной опухоли, экспрессирующей EBI3, где набор содержит:
(i) реагент для иммуноанализа для определения уровня EBI3 в образце крови; и
(ii) положительный контрольный образец на EBI3.
35. Набор по п.34, который дополнительно содержит:
(iii) реагент для иммуноанализа для определения уровня CEA, CYFRA и/или pro-GRP в образце крови; и
(iv) положительный контрольный образец на CEA, CYFRA и/или pro-GRP.
36. Набор по п.35, в котором положительный контрольный образец является положительным на EBI3, CEA, CYFRA и/или pro-GRP.
37. Набор для детектирования злокачественной опухоли, экспрессирующей белок NPTX1 и CYFRA, где набор содержит:
(i) реагент для иммуноанализа для определения уровня белка NPTX1 и CYFRA в образце крови; и
(ii) положительный контрольный образец на белок NPTX1 и CYFRA.
38. Способ скрининга соединения-кандидата для лечения или профилактики рака легкого, или ингибирования роста клеток рака легкого, где указанный способ включает стадии:
(а) приведение испытуемого соединения в контакт с полипептидом, кодируемым полинуклеотидом EBI3, DLX5 или CDKN3;
(b) детектирование связывающей активности между полипептидом и испытуемым соединением; и
(с) отбор соединения, которое связывается с полипептидом.
39. Способ скрининга соединения-кандидата для лечения или профилактики рака легкого, или ингибирования роста клеток рака легкого, где указанный способ включает стадии:
(i) (а) приведение испытуемого соединения в контакт с полипептидом, кодируемым полинуклеотидом EBI3, DLX5 или CDKN3;
(b) детектирование биологической активности полипептида со стадии (а); и
(с) отбор испытуемого соединения, которое подавляет биологическую активность полипептида, кодируемого полинуклеотидом EBI3, DLX5 или CDKN3, по сравнению с биологической активностью указанного полипептида при отсутствии испытуемого соединения;
или
(ii) (а) приведение соединения-кандидата в контакт с клеткой, экспрессирующей EBI3, DLX5 или CDKN3;
(b) отбор соединения-кандидата, которое снижает уровень экспрессии EBI3, DLX5 или CDKN3 по сравнению уровнем экспрессии, детектированным при отсутствии испытуемого соединения;
или
(iii) (а) приведение соединения-кандидата в контакт с клеткой, в которую введен вектор, содержащий регуляторную последовательность транскрипции EBI3, DLX5 или CDKN3 и ген-репортер, который экспрессируется под контролем регуляторной последовательности транскрипции;
(b) определение экспрессии или активности указанного гена-репортера; и
(с) отбор соединения-кандидата, которое снижает уровень экспрессии или активности указанного гена-репортера по сравнению с контролем;
(iv) (а) приведение полипептида CDKN3 или его функционального эквивалента в контакт с партнером по взаимодействию, выбранным из группы, состоящей из полипептида VRS, полипептида EF-1alpha, полипептида EF-1beta, полипептида EF-1gamma, полипептида EF-1delta и их функциональных эквивалентов, в присутствии испытуемого соединения;
(b) детектирование связывания между полипептидами; и
(с) отбор испытуемого соединения, которое ингибирует связывание между данными полипептидами.
40. Способ по п.39(i), в котором биологическая активность выбрана из группы, состоящей из стимуляции пролиферации клеток, клеточной инвазии, внеклеточной секреции, активности фосфатазы и фосфорилирования Akt.
41. Способ по п.40, в котором активность фосфатазы определяют с EF-1delta.
42. Способ по п.39(iv), в котором функциональный эквивалент полипептида EF-1delta содержит полипептид с последовательностью SEQ ID NO:48.
43. Способ по п.39(iv), в котором функциональный эквивалент полипептида CDKN3 содержит аминокислотную последовательность связывающей области полипептида VRS, полипептида EF-1alpha, полипептида EF-1beta, полипептида EF-1gamma или полипептида EF-1delta.
44. Способ скрининга соединения для лечения или профилактики рака легкого, где указанный способ включает стадии:
(а) приведение соединения-кандидата в контакт с клетками со сверхэкспрессией CDKN3;
(b) определение фосфорилирования Akt Ser473; и
(с) отбор соединения-кандидата, которое снижает фосфорилирование по сравнению с контролем.
45. Полипептид, содержащий последовательность ENQSLRGVVQELQQAISKL (SEQ ID NO:61); или аминокислотную последовательность полипептида, в функциональном отношении эквивалентного полипептиду, где у полипептида отсутствует биологическая функция пептида с последовательностью SEQ ID NO:8.
46. Полипептид по п.45, где биологическая функция представляет клеточную пролиферативную активность.
47. Полипептид по п.45, где полипептид состоит из 8-30 остатков.
48. Полипептид по п.45, в котором полипептид модифицирован соединением, делающим мембрану клеток проницаемой.
49. Полипептид по п.45, который имеет следующую общую формулу:
[R]-[D],
в которой [R] и [D] можно связать прямо или опосредованно через линкер, такой как GGG,
в которой [R] представляет соединение, делающее мембрану клеток проницаемой, и [D] является аминокислотной последовательностью фрагмента последовательности, которая содержит ENQSLRGVVQELQQAISKL (SEQ ID NO:61); или аминокислотную последовательность полипептида, функционально эквивалентного полипептиду, содержащему указанный фрагмент последовательности, где у полипептида отсутствует биологическая функция пептида, содержащего последовательность SEQ ID NO:8.
50. Полипептид по п.49, в котором соединение, делающее мембрану клеток проницаемой, представляет любое, выбранное из группы, состоящей из:
полиаргинин;
Tat/RKKRRQRRR/SEQ ID NO:63;
пенетратин/RQIKIWFQNRRMKWKK/SEQ ID NO:64;
буфорин II/TRSSRAGLQFPVGRVRLLRK/SEQ ID NO:65;
транспортан/GWTLNSAGYLLGKINLKAALAKKIL/SEQ ID NO:66;
МАР (модельный амфипатический пептид/KLALKLALKALKAALKLA/SEQ ID NO:67;
K-FGF/AAVALLPAVLLALLAP/SEQ ID NO:68;
Ku70/VPMLK/SEQ ID NO:69;
Ku70/PMLKE/SEQ ID NO:70;
прион/MANLGYWLLALFVTMWTDVGLCKKRPKP/SEQ ID NO:71;
pVEC/LLIILRRRIRKQAHAHSK/SEQ ID NO:72;
Pep-1/KETWWETWWTEWSQPKKKRKV/SEQ ID NO:73;
SynB1/RGGRLSYSRRRFSTSTGR/SEQ ID NO:74;
Pep-7/SDLWEMMMVSLACQY/SEQ ID NO:75;
HN-1/TSPLNIHNGQKL/SEQ ID NO:76.
51. Полипептид по п.50, где полиаргинин представляет 11 Arg
(RRRRRRRRRRR/SEQ ID NO:77).
52. Средство для лечения или профилактики злокачественной опухоли, содержащее в качестве активного ингредиента полипептид по любому из пп.45-51.
53. Средство по п.52, где злокачественная опухоль представляет собой рак легкого.
54. Способ лечения или профилактики злокачественной опухоли, включающий стадию введения полипептида по любому из пп.45-51.
55. Способ по п.54, в котором злокачественная опухоль представляет собой рак легкого.
RU2010111120/10A 2007-08-24 2008-08-21 Eb13, dlx5, nptx1 и cdkn3 в качестве генов-мишеней для терапии и диагностики рака легкого RU2010111120A (ru)

Applications Claiming Priority (4)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US95795607P 2007-08-24 2007-08-24
US60/957,956 2007-08-24
US97736007P 2007-10-03 2007-10-03
US60/977,360 2007-10-03

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2010111120A true RU2010111120A (ru) 2011-09-27

Family

ID=40387295

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2010111120/10A RU2010111120A (ru) 2007-08-24 2008-08-21 Eb13, dlx5, nptx1 и cdkn3 в качестве генов-мишеней для терапии и диагностики рака легкого

Country Status (10)

Country Link
US (1) US20110152345A1 (ru)
EP (1) EP2198021A4 (ru)
JP (1) JP2010536366A (ru)
KR (1) KR20100075857A (ru)
CN (1) CN101835894A (ru)
BR (1) BRPI0815769A2 (ru)
CA (1) CA2697513A1 (ru)
RU (1) RU2010111120A (ru)
TW (1) TW200920406A (ru)
WO (1) WO2009028580A1 (ru)

Families Citing this family (20)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
TW200413725A (en) * 2002-09-30 2004-08-01 Oncotherapy Science Inc Method for diagnosing non-small cell lung cancers
JP2009502115A (ja) * 2005-07-27 2009-01-29 オンコセラピー・サイエンス株式会社 小細胞肺癌の診断方法
WO2011145085A2 (en) * 2010-05-21 2011-11-24 Procognia (Israel) Ltd Novel antibodies and methods of use for the treatment and diagnosis of cancer
WO2011150974A1 (en) * 2010-06-03 2011-12-08 Porto Conte Ricerche S.R.L. Biomarkers for lung neuroendocrine tumors
US20130225442A1 (en) * 2010-10-20 2013-08-29 Rush University Medical Center Lung Cancer Tests
WO2012158780A2 (en) * 2011-05-16 2012-11-22 The Regents Of The University Of Michigan Lung cancer signature
US9753037B2 (en) 2013-03-15 2017-09-05 Rush University Medical Center Biomarker panel for detecting lung cancer
US20150038365A1 (en) * 2013-08-01 2015-02-05 Meso Scale Technologies, Llc Lung cancer biomarkers
WO2015088947A1 (en) 2013-12-09 2015-06-18 Rush University Medical Center Biomarkers of rapid progression in advanced non-small cell lung cancer
KR101583673B1 (ko) 2014-02-28 2016-01-08 이화여자대학교 산학협력단 난소암 환자의 항암제 치료 반응성 예측을 위한 마커 dlx5
KR101601942B1 (ko) 2014-02-28 2016-03-09 이화여자대학교 산학협력단 난소암 환자의 항암제 치료 반응성 예측을 위한 마커 tet1
KR101601943B1 (ko) 2014-02-28 2016-03-09 이화여자대학교 산학협력단 난소암 환자의 항암제 치료 반응성 예측을 위한 마커 uchl1
KR101601941B1 (ko) 2014-02-28 2016-03-09 이화여자대학교 산학협력단 난소암 환자의 항암제 치료 반응성 예측을 위한 마커 mta3
CN106018807A (zh) * 2016-05-11 2016-10-12 卢氏实验室公司 一种快速诊断和监控肺癌的免疫层析检测条及其制备方法
CN108182346B (zh) * 2016-12-08 2021-07-30 杭州康万达医药科技有限公司 预测siRNA针对某类细胞的毒性的机器学习模型的建立方法及其应用
US11619634B2 (en) * 2017-08-21 2023-04-04 Savicell Diagnostic Ltd. Methods of diagnosing and treating lung cancer
CN116059349A (zh) * 2018-01-26 2023-05-05 国立大学法人东海国立大学机构 靶点为受体蛋白的治疗药物、检测药物、与受体蛋白结合的抗体及分子靶向药物的筛选方法
SG10201802979VA (en) * 2018-04-10 2019-11-28 Kah Meng Lim Immunological extract and method of production
CN110938129B (zh) * 2019-11-08 2021-07-13 上海交通大学 一种生物活性多肽sklvpvgygirkl及其制备方法和应用
CN111116744A (zh) * 2020-01-07 2020-05-08 长江大学 哺乳动物eEF1Bα蛋白磷酸化Ser106位点的特异性抗体的制备方法及其应用

Family Cites Families (38)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US3773919A (en) 1969-10-23 1973-11-20 Du Pont Polylactide-drug mixtures
US4816567A (en) 1983-04-08 1989-03-28 Genentech, Inc. Recombinant immunoglobin preparations
US5260203A (en) 1986-09-02 1993-11-09 Enzon, Inc. Single polypeptide chain binding molecules
US5567610A (en) 1986-09-04 1996-10-22 Bioinvent International Ab Method of producing human monoclonal antibodies and kit therefor
GB8823869D0 (en) 1988-10-12 1988-11-16 Medical Res Council Production of antibodies
US5175384A (en) 1988-12-05 1992-12-29 Genpharm International Transgenic mice depleted in mature t-cells and methods for making transgenic mice
US5229275A (en) 1990-04-26 1993-07-20 Akzo N.V. In-vitro method for producing antigen-specific human monoclonal antibodies
US5571894A (en) 1991-02-05 1996-11-05 Ciba-Geigy Corporation Recombinant antibodies specific for a growth factor receptor
US5565332A (en) 1991-09-23 1996-10-15 Medical Research Council Production of chimeric antibodies - a combinatorial approach
US5587458A (en) 1991-10-07 1996-12-24 Aronex Pharmaceuticals, Inc. Anti-erbB-2 antibodies, combinations thereof, and therapeutic and diagnostic uses thereof
DE69333807T2 (de) 1992-02-06 2006-02-02 Chiron Corp., Emeryville Marker für krebs und biosynthetisches bindeprotein dafür
WO1993016177A1 (en) 1992-02-11 1993-08-19 Cell Genesys, Inc. Homogenotization of gene-targeting events
US5573905A (en) 1992-03-30 1996-11-12 The Scripps Research Institute Encoded combinatorial chemical libraries
US5641870A (en) 1995-04-20 1997-06-24 Genentech, Inc. Low pH hydrophobic interaction chromatography for antibody purification
CN1151842C (zh) 1995-07-27 2004-06-02 基因技术股份有限公司 稳定等渗的冻干蛋白制剂
WO1997013589A1 (en) * 1995-10-10 1997-04-17 Minnesota Mining And Manufacturing Company Corrosion protection coating system
US5770380A (en) 1996-09-13 1998-06-23 University Of Pittsburgh Synthetic antibody mimics--multiple peptide loops attached to a molecular scaffold
US6818418B1 (en) 1998-12-10 2004-11-16 Compound Therapeutics, Inc. Protein scaffolds for antibody mimics and other binding proteins
US7115396B2 (en) 1998-12-10 2006-10-03 Compound Therapeutics, Inc. Protein scaffolds for antibody mimics and other binding proteins
US20050048512A1 (en) 2001-04-26 2005-03-03 Avidia Research Institute Combinatorial libraries of monomer domains
US20050089932A1 (en) 2001-04-26 2005-04-28 Avidia Research Institute Novel proteins with targeted binding
US20040175756A1 (en) 2001-04-26 2004-09-09 Avidia Research Institute Methods for using combinatorial libraries of monomer domains
US20050053973A1 (en) 2001-04-26 2005-03-10 Avidia Research Institute Novel proteins with targeted binding
DK1390535T3 (da) 2001-04-26 2010-12-06 Amgen Mountain View Inc Kombinatoriske biblioteker af monomer-domæner
US20040038877A1 (en) * 2001-10-02 2004-02-26 Alsobrook John P. Therapeutic polypeptides, nucleic acids encoding same, and methods of use
EP1549676A1 (en) * 2002-09-30 2005-07-06 Oncotherapy Science, Inc. Genes and polypeptides relating to human myeloid leukemia
US20060024692A1 (en) * 2002-09-30 2006-02-02 Oncotherapy Science, Inc. Method for diagnosing non-small cell lung cancers
WO2004094636A1 (en) * 2003-04-24 2004-11-04 Galapagos Genomics N.V. Effective sirna knock-down constructs
ATE496142T1 (de) * 2004-03-23 2011-02-15 Oncotherapy Science Inc Verfahren zur diagnose von nicht-kleinzelligem lungenkrebs
US8030284B2 (en) 2004-08-23 2011-10-04 Sylentis S.A.U. Treatment of eye disorders characterized by an elevated intraocular pressure by siRNAs
CN101175862A (zh) * 2005-02-10 2008-05-07 肿瘤疗法科学股份有限公司 诊断膀胱癌的方法
CA2607133A1 (en) * 2005-05-02 2006-11-09 Toray Industries, Inc. Composition and method for diagnosing esophageal cancer and metastasis of esophageal cancer
WO2007086915A2 (en) * 2005-05-12 2007-08-02 Applied Genomics, Inc. Reagents and methods for use in cancer diagnosis, classification and therapy
JP2009502115A (ja) * 2005-07-27 2009-01-29 オンコセラピー・サイエンス株式会社 小細胞肺癌の診断方法
JP5150909B2 (ja) * 2005-07-27 2013-02-27 オンコセラピー・サイエンス株式会社 食道癌を診断する方法
DE102005049800B4 (de) * 2005-10-18 2009-09-17 Johannes-Gutenberg-Universität Mainz Verfahren zur Auffindung von Inhibitoren des Epstein-Barr-Virus-induzierten Gens 3 (EBI 3) und deren Verwendungen bei der Behandlung von metastasierenden Tumoren und allergischem Asthma
CA2821426A1 (en) * 2005-12-22 2007-07-05 Abbott Laboratories Methods and marker combinations for screening for predisposition to lung cancer
JP2010501172A (ja) * 2006-08-25 2010-01-21 オンコセラピー・サイエンス株式会社 肺癌に対する予後マーカーおよび治療標的

Also Published As

Publication number Publication date
TW200920406A (en) 2009-05-16
EP2198021A1 (en) 2010-06-23
CA2697513A1 (en) 2009-03-05
JP2010536366A (ja) 2010-12-02
US20110152345A1 (en) 2011-06-23
BRPI0815769A2 (pt) 2017-08-08
CN101835894A (zh) 2010-09-15
WO2009028580A1 (en) 2009-03-05
KR20100075857A (ko) 2010-07-05
EP2198021A4 (en) 2011-01-19

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2010111120A (ru) Eb13, dlx5, nptx1 и cdkn3 в качестве генов-мишеней для терапии и диагностики рака легкого
Du et al. S100P dissociates myosin IIA filaments and focal adhesion sites to reduce cell adhesion and enhance cell migration
RU2009109692A (ru) Лечение или предотвращение развития злокачественных опухолей, сверхэкспрессирующих reg4 или kiaa0101
US20050003390A1 (en) Targets for controlling cellular growth and for diagnostic methods
JP5150855B2 (ja) Ｃｄｃａ１−ｋｎｔｃ２複合体を標的とするスクリーニングおよびｎｓｃｌｃの治療方法
JP2010500003A5 (ru)
JP2010512730A5 (ru)
JP2010536366A5 (ru)
WO2004076682A2 (en) Targets for controlling cellular growth and for diagnostic methods
Jarray et al. Disruption of phactr-1 pathway triggers pro-inflammatory and pro-atherogenic factors: New insights in atherosclerosis development
JP2010512730A (ja) 肺癌の腫瘍マーカーおよび治療標的としてのｔｔｋ
US20110237518A1 (en) Method for treating or preventing bladder cancer using the depdc1 polypeptide
RU2010111116A (ru) Pkib и naaladl2 в качестве генов-мишеней в терапии и диагностике рака предстательной железы
CA2687997A1 (en) Diagnostic methods and markers
JP2010523081A5 (ru)
RU2011111532A (ru) Твс1d7 в качестве опухолевого маркера и терапевтической мишени в случае злокачественной опухоли
D'Alessandro et al. Molecular detection of neuron-specific ELAV-like-positive cells in the peripheral blood of patients with small-cell lung cancer
Sun et al. Absent expression of FLNA is correlated with poor prognosis of nasopharyngeal cancer
WO2006108225A1 (en) Method of screening for compounds that modulate cell proliferation
Kobayashi et al. Nucleobindin-2 Mediates Transforming Growth Factor-β1–Driven Phenotypes in Zinc Finger E-Box Binding Homeobox 1–High Uterine Carcinosarcoma
JP2007282628A (ja) 抗癌剤のスクリーニング方法
KR101722836B1 (ko) 암 발병의 예측, 조기 진단 및 치료제로써의 nkx6.3의 용도
KR20160083742A (ko) Emt 저해제 스크리닝 방법
KR102569463B1 (ko) Setd6의 set 도메인이 융합된 단백질을 포함하는 염증성 질환 예방 또는 치료용 조성물
US11525165B2 (en) Method of selection of an IRE1-inhibitor therapy for patient suffering from cancer

Legal Events

Date Code Title Description
FA91 Application withdrawn (on applicant's request)

Effective date: 20120404