RU2008146997A - Способ блокирования заражения флавивирусами молекулы и применения - Google Patents
Способ блокирования заражения флавивирусами молекулы и применения Download PDFInfo
- Publication number
- RU2008146997A RU2008146997A RU2008146997/13A RU2008146997A RU2008146997A RU 2008146997 A RU2008146997 A RU 2008146997A RU 2008146997/13 A RU2008146997/13 A RU 2008146997/13A RU 2008146997 A RU2008146997 A RU 2008146997A RU 2008146997 A RU2008146997 A RU 2008146997A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- virus
- sequence
- list
- interaction
- seq
- Prior art date
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract 30
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 title claims abstract 6
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 title claims abstract 6
- 206010054261 Flavivirus infection Diseases 0.000 title 1
- 230000002458 infectious effect Effects 0.000 title 1
- 241000700605 Viruses Species 0.000 claims abstract 21
- 230000003993 interaction Effects 0.000 claims abstract 20
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims abstract 8
- 108010003533 Viral Envelope Proteins Proteins 0.000 claims abstract 7
- 241000710831 Flavivirus Species 0.000 claims abstract 5
- 241000725619 Dengue virus Species 0.000 claims abstract 4
- 102000018265 Virus Receptors Human genes 0.000 claims abstract 4
- 108010066342 Virus Receptors Proteins 0.000 claims abstract 4
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 claims abstract 4
- 102100033312 Alpha-2-macroglobulin Human genes 0.000 claims abstract 2
- 241000710842 Japanese encephalitis virus Species 0.000 claims abstract 2
- 241000710770 Langat virus Species 0.000 claims abstract 2
- 102000001851 Low Density Lipoprotein Receptor-Related Protein-1 Human genes 0.000 claims abstract 2
- 241000710908 Murray Valley encephalitis virus Species 0.000 claims abstract 2
- 108010015078 Pregnancy-Associated alpha 2-Macroglobulins Proteins 0.000 claims abstract 2
- 241000710771 Tick-borne encephalitis virus Species 0.000 claims abstract 2
- 108010067390 Viral Proteins Proteins 0.000 claims abstract 2
- 201000006449 West Nile encephalitis Diseases 0.000 claims abstract 2
- 241000710772 Yellow fever virus Species 0.000 claims abstract 2
- 206010014599 encephalitis Diseases 0.000 claims abstract 2
- 101150084157 lrp-1 gene Proteins 0.000 claims abstract 2
- 229940051021 yellow-fever virus Drugs 0.000 claims abstract 2
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims 13
- AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N L-threonine Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N 0.000 claims 10
- AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N Threonine Natural products CC(O)C(N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 10
- 239000004473 Threonine Substances 0.000 claims 10
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 claims 10
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 claims 10
- 235000008521 threonine Nutrition 0.000 claims 10
- 229960002898 threonine Drugs 0.000 claims 10
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 claims 9
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims 9
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims 9
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 claims 8
- 229960000310 isoleucine Drugs 0.000 claims 8
- AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N isoleucine Natural products CCC(C)C(N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 8
- 235000014705 isoleucine Nutrition 0.000 claims 8
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N L-phenylalanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 claims 7
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 claims 7
- KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N L-valine Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N 0.000 claims 7
- KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N Valine Natural products CC(C)C(N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 7
- 229960005190 phenylalanine Drugs 0.000 claims 7
- COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N phenylalanine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 7
- 235000008729 phenylalanine Nutrition 0.000 claims 7
- 229960004441 tyrosine Drugs 0.000 claims 7
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 7
- 235000002374 tyrosine Nutrition 0.000 claims 7
- 229960004295 valine Drugs 0.000 claims 7
- 239000004474 valine Substances 0.000 claims 7
- 235000014393 valine Nutrition 0.000 claims 7
- DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N Asparagine Natural products OC(=O)C(N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 6
- WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N Glutamic acid Natural products OC(=O)C(N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 6
- DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N L-asparagine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N 0.000 claims 6
- 235000009582 asparagine Nutrition 0.000 claims 6
- 229960001230 asparagine Drugs 0.000 claims 6
- 235000013922 glutamic acid Nutrition 0.000 claims 6
- 239000004220 glutamic acid Substances 0.000 claims 6
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 5
- MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N (2S)-2-Amino-3-hydroxypropansäure Chemical compound OC[C@H](N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N 0.000 claims 4
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 claims 4
- ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P L-argininium(2+) Chemical compound NC(=[NH2+])NCCC[C@H]([NH3+])C(O)=O ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P 0.000 claims 4
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N L-aspartic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 claims 4
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 4
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 claims 4
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 4
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 4
- 229960003121 arginine Drugs 0.000 claims 4
- 235000009697 arginine Nutrition 0.000 claims 4
- 235000003704 aspartic acid Nutrition 0.000 claims 4
- 229960005261 aspartic acid Drugs 0.000 claims 4
- OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N beta-carboxyaspartic acid Natural products OC(=O)C(N)C(C(O)=O)C(O)=O OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 4
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 claims 4
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 4
- 235000018977 lysine Nutrition 0.000 claims 4
- 235000004400 serine Nutrition 0.000 claims 4
- 229960001153 serine Drugs 0.000 claims 4
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 claims 3
- ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N L-glutamine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N 0.000 claims 3
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims 3
- 235000004554 glutamine Nutrition 0.000 claims 3
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 3
- 239000003446 ligand Substances 0.000 claims 3
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 claims 3
- CPYVQXAASIFAMD-KNIFDHDWSA-N (2s)-2-aminobutanedioic acid;(2s)-2,6-diaminohexanoic acid Chemical group OC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O.NCCCC[C@H](N)C(O)=O CPYVQXAASIFAMD-KNIFDHDWSA-N 0.000 claims 2
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 claims 2
- QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N L-alanine Chemical compound C[C@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N 0.000 claims 2
- WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N L-glutamic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N 0.000 claims 2
- HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N L-histidine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N 0.000 claims 2
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 claims 2
- KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N L-lysine Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N 0.000 claims 2
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 claims 2
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 claims 2
- 230000021736 acetylation Effects 0.000 claims 2
- 238000006640 acetylation reaction Methods 0.000 claims 2
- 230000010933 acylation Effects 0.000 claims 2
- 238000005917 acylation reaction Methods 0.000 claims 2
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 claims 2
- 229960003767 alanine Drugs 0.000 claims 2
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims 2
- 125000003636 chemical group Chemical group 0.000 claims 2
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims 2
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims 2
- 229940079593 drug Drugs 0.000 claims 2
- 229960002743 glutamine Drugs 0.000 claims 2
- 235000014304 histidine Nutrition 0.000 claims 2
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- 229960002885 histidine Drugs 0.000 claims 2
- 229960003136 leucine Drugs 0.000 claims 2
- 229960003646 lysine Drugs 0.000 claims 2
- 230000011987 methylation Effects 0.000 claims 2
- 238000007069 methylation reaction Methods 0.000 claims 2
- 238000003032 molecular docking Methods 0.000 claims 2
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 claims 2
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims 2
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 claims 2
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 claims 2
- 108090000565 Capsid Proteins Proteins 0.000 claims 1
- ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N L-Proline Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N 0.000 claims 1
- QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N L-tryptophane Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N 0.000 claims 1
- ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N Proline Natural products OC(=O)C1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N Tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 230000000840 anti-viral effect Effects 0.000 claims 1
- 239000002981 blocking agent Substances 0.000 claims 1
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 claims 1
- 125000002915 carbonyl group Chemical group [*:2]C([*:1])=O 0.000 claims 1
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 claims 1
- 238000007385 chemical modification Methods 0.000 claims 1
- 230000002860 competitive effect Effects 0.000 claims 1
- 229960002989 glutamic acid Drugs 0.000 claims 1
- 229960002449 glycine Drugs 0.000 claims 1
- 230000002452 interceptive effect Effects 0.000 claims 1
- 108020001756 ligand binding domains Proteins 0.000 claims 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 claims 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 claims 1
- 235000013930 proline Nutrition 0.000 claims 1
- 229960002429 proline Drugs 0.000 claims 1
- 238000011002 quantification Methods 0.000 claims 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 claims 1
- 229960004799 tryptophan Drugs 0.000 claims 1
- 230000009385 viral infection Effects 0.000 claims 1
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 claims 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/005—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/705—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
- C07K14/70596—Molecules with a "CD"-designation not provided for elsewhere
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/81—Protease inhibitors
- C07K14/8107—Endopeptidase (E.C. 3.4.21-99) inhibitors
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2770/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssRNA viruses positive-sense
- C12N2770/00011—Details
- C12N2770/24011—Flaviviridae
- C12N2770/24111—Flavivirus, e.g. yellow fever virus, dengue, JEV
- C12N2770/24122—New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
- Y02A50/00—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
- Y02A50/30—Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Biophysics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Virology (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Abstract
1. Способ блокирования заражения флавивирусами, включающий нарушение взаимодействия белка вирусной оболочки с рецептором альфа-2 макроглобулина с последовательностью SEQ ID NO:NO:3, представленной в списке последовательностей, или с альфа-2 макроглобулином с последовательностью SEQ ID NO:NO:2, представленной в списке последовательностей. ! 2. Способ по п.1, в котором флавивирус представляет собой вирус денге, вирус желтой лихорадки, вирус японского энцефалита, вирус клещевого энцефалита, вирус энцефалита долины Мэррей, вирус энцефалита Западного Нила, вирус Куньин, вирус Повассан, вирус Лангат или вирус энцефалита Сан-Луи. ! 3. Способ по п.1 или 2, в котором последовательность вирусного белка, по меньшей мере, на 60% является гомологичной последовательности SEQ ID NO:1, представленной в списке последовательностей. ! 4. Способ по п.1 или 2, в котором фрагмент последовательности рецептора вируса представляет любой из фрагментов, расположенных между аминокислотными остатками 25-66 или 70-110, или 852-892, или 893-933, или 934-973, или 974-1013, или 1014-1053, или 1060-1099, или 1102-1142, или 1143-1182, или 2522-2563, или 2564-2602, или 2603-2641, или 2642-2690, или 2694-2732, или 2733-2771, или 2772-2814, или 2816-2855, или 2856-2899, или 2902-2940, или 3332-3371, или 3372-3410, или 3411-3450, или 3451-3491, или 3492-3533, или 3534-3572, или 3573-3611, или 3612-3649, или 3652-3692, или 3693-3733, или 3739-3778, в последовательности, относящейся к SEQ ID NO:3 в списке последовательностей. ! 5. Способ по п.1 или 2, в котором фрагмент последовательности рецептора вируса, по меньшей мере, на 60% является гомологичным любому из фрагментов, расположенных между аминокислотными остатками 25-66 или 70-110, или 852-892, или 893-933, или 934-973, или 974-1013, или 1014-1053, или 1060-1099, или 1102-1142, или 1143-1182, или 2522-2563, или 2564-2602, или 260
Claims (25)
1. Способ блокирования заражения флавивирусами, включающий нарушение взаимодействия белка вирусной оболочки с рецептором альфа-2 макроглобулина с последовательностью SEQ ID NO:NO:3, представленной в списке последовательностей, или с альфа-2 макроглобулином с последовательностью SEQ ID NO:NO:2, представленной в списке последовательностей.
2. Способ по п.1, в котором флавивирус представляет собой вирус денге, вирус желтой лихорадки, вирус японского энцефалита, вирус клещевого энцефалита, вирус энцефалита долины Мэррей, вирус энцефалита Западного Нила, вирус Куньин, вирус Повассан, вирус Лангат или вирус энцефалита Сан-Луи.
3. Способ по п.1 или 2, в котором последовательность вирусного белка, по меньшей мере, на 60% является гомологичной последовательности SEQ ID NO:1, представленной в списке последовательностей.
4. Способ по п.1 или 2, в котором фрагмент последовательности рецептора вируса представляет любой из фрагментов, расположенных между аминокислотными остатками 25-66 или 70-110, или 852-892, или 893-933, или 934-973, или 974-1013, или 1014-1053, или 1060-1099, или 1102-1142, или 1143-1182, или 2522-2563, или 2564-2602, или 2603-2641, или 2642-2690, или 2694-2732, или 2733-2771, или 2772-2814, или 2816-2855, или 2856-2899, или 2902-2940, или 3332-3371, или 3372-3410, или 3411-3450, или 3451-3491, или 3492-3533, или 3534-3572, или 3573-3611, или 3612-3649, или 3652-3692, или 3693-3733, или 3739-3778, в последовательности, относящейся к SEQ ID NO:3 в списке последовательностей.
5. Способ по п.1 или 2, в котором фрагмент последовательности рецептора вируса, по меньшей мере, на 60% является гомологичным любому из фрагментов, расположенных между аминокислотными остатками 25-66 или 70-110, или 852-892, или 893-933, или 934-973, или 974-1013, или 1014-1053, или 1060-1099, или 1102-1142, или 1143-1182, или 2522-2563, или 2564-2602, или 2603-2641, или 2642-2690, или 2694-2732, или 2733-2771, или 2772-2814, или 2816-2855, или 2856-2899, или 2902-2940, или 3332-3371, или 3372-3410, или 3411-3450, или 3451-3491, или 3492-3533, или 3534-3572, или 3573-3611, или 3612-3649, или 3652-3692, или 3693-3733, или 3739-3778, в последовательности, относящейся к SEQ ID NO:3 в списке последовательностей.
6. Способ по п.1 или 2, в котором последовательность белка, функционирующего в качестве носителя для вируса, по меньшей мере, на 60% является гомологичной последовательности SEQ ID NO:2, представленной в списке последовательностей.
7. Способ по п.1 или 2, в котором средство, нарушающее взаимодействие белка вирусной оболочки с белком с последовательностью SEQ ID NO:3, представленной в списке последовательностей, является антителом или конкурентным лигандом рецептора, или последовательностью SEQ ID NO:26, представленной в списке последовательностей.
8. Способ по п.1 или 2, в котором средство, нарушающее взаимодействие белка вирусной оболочки с белком с последовательностью SEQ ID NO:3, представленной в списке последовательностей, получают химическим синтезом или методами рекомбинантной ДНК, или из природного источника.
9. Способ по п.1 или 2, в котором средство, нарушающее взаимодействие вируса с рецептором, представляет собой один из пептидов с последовательностями SEQ ID NO:4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17 и 18, представленными в списке последовательностей.
10. Способ по п.1 или 2, в котором средство, нарушающее взаимодействие вируса, является химической модификацией любого из пептидов, описанных в п.9.
11. Способ по п.10, в котором указанный пептид имеет химическую структуру, описанную формулой Nt-C1-F2-F3-F4-F5-F6-T7-T8-T9-T10-T11-T12-G13-G14-G15-G16-G17-C18-Ct, в которой
Nt представляет собой необязательное N-концевое удлинение, образованное химической группой, ковалентно связанной с N-концевой группой, например, ацетилирование, или метилирование, или любое ацилирование, или пептид, или полиэтиленгликоль;
С1: цистеин (образует дисульфидный мостик с другим цистеином в С18), лизин (глутаминовая кислота/аспарагиновая кислота), ковалентно связанный амидной связью с боковой цепью глутаминовой кислоты/аспарагиновой кислоты (лизина) в положении С18;
F2: серин, аспарагин, валин, изолейцин, треонин, фенилаланин, тирозин;
F3: тирозин, аспарагин, изолейцин;
F4: изолейцин, валин, треонин, фенилаланин, тирозин;
F5: валин, изолейцин, тирозин, треонин, фенилаланин;
F6: изолейцин, валин, треонин, фенилаланин, тирозин;
T7: глицин;
T8: валин, аланин, изолейцин, серин, треонин, аргинин;
T9: глицин, глутаминовая кислота;
T10: глутаминовая кислота, аспарагиновая кислота, треонин, аспарагин, пролин;
T11: лизин, аргинин, аспарагин, глицин, серин, треонин, глутамин;
T12: глутамин, аланин, аргинин;
T13: изолейцин, лейцин, валин, фенилаланин, треонин;
T14: лизин, аргинин, аспарагин, треонин;
Т15: лейцин, изолейцин, валин, фенилаланин, тирозин, треонин, гистидин;
Т16: аспарагин, аспарагиновая кислота, серин, гистидин, глутамин;
Т17: триптофан, фенилаланин, тирозин;
С18: цистеин (образует дисульфидный мостик с другим цистеином в С1), лизин (глутаминовая кислота/аспарагиновая кислота), ковалентно связанный амидной связью с боковой цепью глутаминовой кислоты/аспарагиновой кислоты (лизина) в положении С1;
Ct представляет собой необязательное С-концевое удлинение, химическую группу, ковалентно связанную с концевой карбонильной группой, ацетилирование, метилирование, пептид, полиэтиленгликоль, ацилирование.
12. Способ по п.1 или 2, в котором средство, которое блокирует заражение, нарушает взаимодействие белка с последовательностью SEQ ID NO:1, представленной в списке последовательностей, с одним или более остатками, определенными в качестве связывающего лиганд участка в белке с последовательностью SEQ ID NO:3, представленной в списке последовательностей.
13. Способ по п.1 или 2, в котором средство, нарушающее взаимодействие вируса, по пп.7, 8, 9, 10, 11 и 12 представляет активный компонент фармацевтической композиции.
14. Способ по п.1 или 2, в котором нарушение взаимодействия вируса с рецептором включает блокирование экспрессии белка с последовательностью SEQ ID NO:3, представленной в списке последовательностей.
15. Способ по п.14, в котором экспрессия белка с последовательностью SEQ ID NO:3, представленной в списке последовательностей, блокируется интерферирующей РНК.
16. Способ по п.1 или 2, в котором средство, нарушающее взаимодействие вируса с рецептором, получают
а) инкубацией рецептора флавивируса с последовательностью SEQ ID NO:3 с препаратом, содержащим белок вирусной оболочки с последовательностью SEQ ID NO:1 и блокирующим соединением;
b) количественным определением белка вирусной оболочки, связанного с рецептором;
с) сравнением с количеством связанного с рецептором белка вирусной оболочки в отсутствие блокирующего соединения.
17. Способ по п.1 или 2, в котором средство, нарушающее взаимодействие вируса с рецептором, получают
а) применением атомных координат модели трехмерной структуры пептида с последовательностью по п.9 или 10 в конформации структуры антипараллельной бета-«шпильки», которая содержит бета-виток в соединительной петле между бета-цепями;
b) применением атомных координат модели трехмерной структуры одного из связывающих лиганд доменов с последовательностью SEQ ID NO:3, представленной в списке последовательностей, которая определена экспериментально или моделирована с помощью компьютерных средств;
с) компьютерным методом “стыковки” молекул, который позволяет воспроизвести атомные детали взаимодействия структур по п.16а со структурами по п.16b;
d) применением метода компьютерной “стыковки” по п.16с для отбора из базы данных молекулярных структур таких соединений, которые воспроизводят характеристики взаимодействия по п.16с, в качестве блокирующих средств в отношении заражения вирусом.
18. Способ по п.1 или 2, в котором средство, нарушающее взаимодействие белка вирусной оболочки с белком с последовательностью SEQ ID NO:2, представленной в списке последовательностей, является антителом или лигандом для альфа-2 макроглобулина, или пептидом.
19. Способ по п.1 или 2, в котором средство, нарушающее взаимодействие белка вирусной оболочки с белком с последовательностью SEQ ID NO:2, представленной в списке последовательностей, получают химическим синтезом или методами рекомбинантной ДНК, или из природного источника.
20. Способ по п.1 или 2, в котором средство, нарушающее взаимодействие вируса по пп.18 и 19, представляет собой активный компонент фармацевтической композиции.
21. Применение средств, нарушающих взаимодействие вируса, по пп.7, 8, 9, 10, 11 и 12 для определения чувствительности клетки и/или организма к заражению вирусом денге.
22. Применение средств, нарушающих взаимодействие вируса по пп.18 и 19, для определения чувствительности организма к заражению вирусом денге.
23. Пептид из п.9 с последовательностями SEQ ID NO:4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17 или 18, где указанный пептид является средством, которое нарушает взаимодействие вируса с клеточным рецептором.
24. Пептид по п.23, где указанный пептид является средством, которое нарушает взаимодействие вируса с клеточным рецептором с последовательностью SEQ ID NO:3, представленной в списке последовательностей.
25. Пептид по п.23 или 24, где указанный пептид представляет собой активный компонент фармацевтической композиции с противовирусными свойствами.
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| CU20060091A CU23632A1 (es) | 2006-04-28 | 2006-04-28 | Métodos para la identificación de candidatos terapéuticos contra enfermedades causadas por flavivirus y moléculas antivirales. |
| CU2006-0091 | 2006-04-28 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2008146997A true RU2008146997A (ru) | 2010-06-10 |
Family
ID=38476089
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2008146997/13A RU2008146997A (ru) | 2006-04-28 | 2007-04-26 | Способ блокирования заражения флавивирусами молекулы и применения |
Country Status (11)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US8420311B2 (ru) |
| EP (1) | EP2022506B1 (ru) |
| CN (1) | CN101472606B (ru) |
| AR (1) | AR060827A1 (ru) |
| AU (1) | AU2007246076B2 (ru) |
| CA (1) | CA2650591C (ru) |
| CU (1) | CU23632A1 (ru) |
| ES (1) | ES2645679T3 (ru) |
| MY (1) | MY150685A (ru) |
| RU (1) | RU2008146997A (ru) |
| WO (1) | WO2007124698A2 (ru) |
Families Citing this family (13)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CU23245A1 (es) | 2001-07-16 | 2007-10-17 | Inst De Medicina Tropical Pedr | CADENAS QUIMéRICAS CODIFICANTES PARA PROTEINAS INDUCTORAS DE EFECTOS CONTRA VIRUS. PREPARADOS UTILIZANDO PROTEINAS QUIMéRICAS |
| CU23578A1 (es) | 2005-09-16 | 2010-09-30 | Ct Ingenieria Genetica Biotech | Proteína de la cápsida del virus dengue inductora de respuesta protectora y composición vacunal |
| CU23630A1 (es) | 2006-10-30 | 2011-02-24 | Ct Ingenieria Genetica Biotech | Moléculas peptídicas quiméricas con propiedades antivirales contra los virus de la familia flaviviridae |
| CU20080028A6 (es) | 2008-02-29 | 2011-02-24 | Ct Ingenieria Genetica Biotech | Compuestos químicos obtenidos in silico para la preparación de composiciones farmacéuticas para atenuar o inhibir la infección por virus dengue y otros flavivirus |
| US10265388B2 (en) | 2012-02-21 | 2019-04-23 | Cytonics Corporation | Systems, compositions, and methods for transplantation |
| SG11201500605TA (en) * | 2012-08-07 | 2015-02-27 | Massachusetts Inst Technology | Anti-dengue virus antibodies and uses thereof |
| WO2014160088A2 (en) * | 2013-03-14 | 2014-10-02 | Rhode Island Hospital, A Lifespan-Partner | Treating hepatitis b virus infections |
| CN106413749B (zh) | 2014-02-11 | 2022-04-05 | 麻省理工学院 | 新颖全谱抗登革抗体 |
| CA2938590C (en) | 2014-02-11 | 2023-10-17 | Visterra, Inc. | Antibody molecules to dengue virus and uses thereof |
| CU20140026A7 (es) * | 2014-03-03 | 2015-11-27 | Ct De Ingeniería Genética Y Biotecnología Biocubafarma | Péptidos horquilla beta con propiedades antivirales contra el virus dengue |
| TWI763660B (zh) | 2016-03-25 | 2022-05-11 | 美商威特拉公司 | 登革病毒的抗體分子之配方設計 |
| WO2017189988A1 (en) * | 2016-04-29 | 2017-11-02 | Araim Pharmaceuticals, Inc. | Tissue protective peptides for preventing and treating diseases and disorders associated with tissue damage |
| CN111537316A (zh) * | 2020-06-17 | 2020-08-14 | 陕西健吉跃生物科技有限公司 | 一种检测蛋白含量的氨基黑染色液、试剂盒及方法 |
Family Cites Families (7)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US5494671A (en) * | 1990-08-27 | 1996-02-27 | The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services | C-terminally truncated dengue and Japanese encephalitis virus envelope proteins |
| US6403092B1 (en) | 1998-04-01 | 2002-06-11 | Duke University | Immune response modulator alpha-2 macroglobulin complex |
| WO2004016586A2 (en) | 2002-08-16 | 2004-02-26 | Board Of Regents The University Of Texas System | Compositions and methods related to flavivirus envelope protein domain iii antigens |
| US7449321B2 (en) * | 2003-01-22 | 2008-11-11 | National University Of Singapore | Molecules, compositions, methods and kits for applications associated with flaviviruses |
| CA2548808C (en) * | 2003-12-08 | 2015-07-07 | The Government Of The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services | Monoclonal antibodies that bind or neutralize dengue virus |
| WO2005123774A2 (en) * | 2004-06-15 | 2005-12-29 | Erol Fikrig | Antibodies to west nile virus polypeptides |
| DE102006014892B4 (de) | 2005-03-31 | 2020-09-24 | Ngk Spark Plug Co., Ltd. | Gassensorelement, Verfahren zu seiner Herstellung, und Gassensor |
-
2006
- 2006-04-28 CU CU20060091A patent/CU23632A1/es unknown
-
2007
- 2007-04-26 MY MYPI20084354 patent/MY150685A/en unknown
- 2007-04-26 ES ES07721810.5T patent/ES2645679T3/es active Active
- 2007-04-26 WO PCT/CU2007/000014 patent/WO2007124698A2/es active Application Filing
- 2007-04-26 CN CN2007800224852A patent/CN101472606B/zh active Active
- 2007-04-26 AU AU2007246076A patent/AU2007246076B2/en not_active Ceased
- 2007-04-26 CA CA2650591A patent/CA2650591C/en active Active
- 2007-04-26 EP EP07721810.5A patent/EP2022506B1/en active Active
- 2007-04-26 RU RU2008146997/13A patent/RU2008146997A/ru not_active Application Discontinuation
- 2007-04-26 US US12/298,808 patent/US8420311B2/en active Active
- 2007-04-27 AR ARP070101838A patent/AR060827A1/es active IP Right Grant
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| AU2007246076A1 (en) | 2007-11-08 |
| AU2007246076B2 (en) | 2011-06-23 |
| EP2022506A2 (en) | 2009-02-11 |
| MY150685A (en) | 2014-02-28 |
| WO2007124698A3 (es) | 2007-12-27 |
| US8420311B2 (en) | 2013-04-16 |
| CN101472606B (zh) | 2012-09-19 |
| CA2650591A1 (en) | 2007-11-08 |
| US20110212105A1 (en) | 2011-09-01 |
| AR060827A1 (es) | 2008-07-16 |
| CU23632A1 (es) | 2011-02-24 |
| CA2650591C (en) | 2014-10-07 |
| EP2022506B1 (en) | 2017-10-11 |
| ES2645679T3 (es) | 2017-12-07 |
| WO2007124698A2 (es) | 2007-11-08 |
| CN101472606A (zh) | 2009-07-01 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2008146997A (ru) | Способ блокирования заражения флавивирусами молекулы и применения | |
| CA2584228A1 (en) | Vaccines against japanese encephalitis virus and west nile virus | |
| DE602005020165D1 (de) | Verfahren zur herstellung von l-arginin, l-ornithin oder l-citrullin | |
| WO2000031129A1 (en) | Pharmaceutical compounds for the inhibition of hepatitis c virus ns3 protease | |
| Laufer et al. | Can N‐methylated amino acids serve as substitutes for prolines in conformational design of cyclic pentapeptides? | |
| JP2014527072A5 (ru) | ||
| BRPI0411363A (pt) | seqüências de ácidos nucléicos codificando e composições compreendendo peptìdeo sinal ige e/ou il-15 e processos para uso das mesmas | |
| Hibino et al. | Evaluation of acid‐labile S‐protecting groups to prevent Cys racemization in Fmoc solid‐phase peptide synthesis | |
| JP2009504135A5 (ru) | ||
| Kang et al. | Protein folding determinants: structural features determining alternative disulfide pairing in α-and χ/λ-conotoxins | |
| DK1691827T3 (da) | Anvendelse af peptider, der er afledt fra beta-kæden af det humane fibrinogen, til behandlling af shock | |
| ATE555800T1 (de) | Zusammensetzung mit dem polyprotein ns3/ns4 und dem polypeptid ns5b von hcv, expressionsvektoren mit den entsprechenden nukleinsäuresequenzen und ihre therapeutische verwendung | |
| US9499585B2 (en) | Bioactive peptide complexes | |
| Chang et al. | Small‐molecule peptides inhibit Z α1‐antitrypsin polymerization | |
| de la Guardia et al. | Phage-displayed peptides selected to bind envelope glycoprotein show antiviral activity against dengue virus serotype 2 | |
| US20050256056A1 (en) | Peptide inhibitors of HIV | |
| DE60033668D1 (de) | N-substituierte d-aminosäuren enthaltende peptide, zur prävention der beta-strang assoziation | |
| Wittelsberger et al. | Introduction of a cis-prolyl mimic in position 7 of the peptide hormone oxytocin does not result in antagonistic activity | |
| US20190309022A1 (en) | Novel modulators of melanocortin receptors | |
| JP2005503782A5 (ru) | ||
| EP3392263A1 (en) | Polypeptide compound, preparation method therefor and use thereof | |
| Wan et al. | Inhibition of the norepinephrine transporter by χ‐conotoxin dendrimers | |
| Kamalov et al. | Intermolecular Peptide Cross‐Linking by Using Diaminodicarboxylic Acids | |
| TH97794A (th) | วิธีการกีดขวางการติดเชื้อฟลาวิไวรัส โมเลกุลและการใช้ | |
| TH72045B (th) | วิธีการกีดขวางการติดเชื้อฟลาวิไวรัส โมเลกุลและการใช้ |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| FA92 | Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted) |
Effective date: 20110627 |