RU2008118836A - METHOD FOR DETECTING MYCOBACTERIA TUBERCULOSIS BEIJING GENOTYPE - Google Patents

METHOD FOR DETECTING MYCOBACTERIA TUBERCULOSIS BEIJING GENOTYPE Download PDF

Info

Publication number
RU2008118836A
RU2008118836A RU2008118836/13A RU2008118836A RU2008118836A RU 2008118836 A RU2008118836 A RU 2008118836A RU 2008118836/13 A RU2008118836/13 A RU 2008118836/13A RU 2008118836 A RU2008118836 A RU 2008118836A RU 2008118836 A RU2008118836 A RU 2008118836A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
beijing genotype
pcr
genotype
mycobacteria tuberculosis
determining
Prior art date
Application number
RU2008118836/13A
Other languages
Russian (ru)
Other versions
RU2405836C2 (en
Inventor
Игорь Владиславович Мокроусов (RU)
Игорь Владиславович Мокроусов
Татьяна Фердинановна Оттен (RU)
Татьяна Фердинановна Оттен
Анна Александровна Вязовая (RU)
Анна Александровна Вязовая
Борис Израилевич Вишневский (RU)
Борис Израилевич Вишневский
Ольга Викторовна Нарвская (RU)
Ольга Викторовна Нарвская
Original Assignee
Федеральное государственное учреждение "Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт фтизиопульмонологии Федерального аге
Федеральное государственное учреждение "Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт фтизиопульмонологии Федерального агентства по высокотехнологичной медицинской помощи"
Федеральное государственное учреждение науки "Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии и
Федеральное государственное учреждение науки "Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Пастера" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Федеральное государственное учреждение "Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт фтизиопульмонологии Федерального аге, Федеральное государственное учреждение "Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт фтизиопульмонологии Федерального агентства по высокотехнологичной медицинской помощи", Федеральное государственное учреждение науки "Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии и, Федеральное государственное учреждение науки "Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Пастера" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека filed Critical Федеральное государственное учреждение "Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт фтизиопульмонологии Федерального аге
Priority to RU2008118836/10A priority Critical patent/RU2405836C2/en
Publication of RU2008118836A publication Critical patent/RU2008118836A/en
Application granted granted Critical
Publication of RU2405836C2 publication Critical patent/RU2405836C2/en

Links

Landscapes

  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

Способ определения микобактерий туберкулеза генотипа Beijing путем определения специфических участков генома между соседними копиями элемента IS6110 посредством ПЦР, отличающийся тем, что применяют ПЦР с использованием двух инвертированных праймеров, расположенных на концах IS6110, и при амплификации фрагментов ДНК длиной 290 пн и 490 пн или 260 пн, 290 пн и 490 пн судят о принадлежности М. tuberculosis к «древнему» (атипичному) и «современному» (типичному) вариантам генотипа Beijing, соответственно.A method for determining the Mycobacterium tuberculosis of the Beijing genotype by determining specific genome regions between adjacent copies of the IS6110 element by PCR, characterized in that PCR is used using two inverted primers located at the ends of IS6110, and when amplifying DNA fragments of 290 bp and 490 bp or 260 bp length , 290 bp and 490 bp judge M. tuberculosis as belonging to the “ancient” (atypical) and “modern” (typical) variants of the Beijing genotype, respectively.

Claims (1)

Способ определения микобактерий туберкулеза генотипа Beijing путем определения специфических участков генома между соседними копиями элемента IS6110 посредством ПЦР, отличающийся тем, что применяют ПЦР с использованием двух инвертированных праймеров, расположенных на концах IS6110, и при амплификации фрагментов ДНК длиной 290 пн и 490 пн или 260 пн, 290 пн и 490 пн судят о принадлежности М. tuberculosis к «древнему» (атипичному) и «современному» (типичному) вариантам генотипа Beijing, соответственно. A method for determining the Mycobacterium tuberculosis of the Beijing genotype by determining specific genome regions between adjacent copies of the IS6110 element by PCR, characterized in that PCR is used using two inverted primers located at the ends of IS6110, and when amplifying DNA fragments of 290 bp and 490 bp or 260 bp length , 290 bp and 490 bp judge M. tuberculosis as belonging to the “ancient” (atypical) and “modern” (typical) variants of the Beijing genotype, respectively.
RU2008118836/10A 2008-05-12 2008-05-12 Method for mycobacterium tuberculosis beijing genotype detection RU2405836C2 (en)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2008118836/10A RU2405836C2 (en) 2008-05-12 2008-05-12 Method for mycobacterium tuberculosis beijing genotype detection

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2008118836/10A RU2405836C2 (en) 2008-05-12 2008-05-12 Method for mycobacterium tuberculosis beijing genotype detection

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2008118836A true RU2008118836A (en) 2009-11-20
RU2405836C2 RU2405836C2 (en) 2010-12-10

Family

ID=41477566

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2008118836/10A RU2405836C2 (en) 2008-05-12 2008-05-12 Method for mycobacterium tuberculosis beijing genotype detection

Country Status (1)

Country Link
RU (1) RU2405836C2 (en)

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2485177C1 (en) * 2012-03-07 2013-06-20 Федеральное Государственное Бюджетное Учреждение науки Институт химической биологии и фундаментальной медицины Сибирского отделения РАН (ИХБФМ СО РАН) METHOD OF DETECTING RIFAMPICIN-RESISTANT ISOLATES Mycobacterium tuberculosis
CN108410971A (en) * 2018-06-04 2018-08-17 上海市食品药品检验所 A kind of bacterial nucleic acid sequencing identification method and bacterial identification kits based on DNA characteristics sequence

Families Citing this family (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2528866C2 (en) * 2011-07-15 2014-09-20 Федеральное государственное бюджетное учреждение "Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт фтизиопульмонологии" Министерства здравоохранения и социального развития Российской Федерации Method for real-time detection of beijing genotype mycobacterium tuberculosis
RU2551764C2 (en) * 2013-07-04 2015-05-27 Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Научно-исследовательский институт физико-химической медицины Федерального медико-биологического агентства (ФГБУН НИИ ФХМ ФМБА России) METHOD FOR DETECTING TUBERCULOUSIS MYCOBACTERIA OF GENETIC CLUSTER Beijing B0/W148
RU2547598C1 (en) * 2013-12-12 2015-04-10 Автономная Некоммерческая Организация "Научно-исследовательский центр биотехнологии антибиотиков и других биотехнически активных веществ "БИОАН" METHOD OF GENOTYPING STRAINS Mycobacterium tuberculosis
RU2743365C1 (en) * 2020-05-12 2021-02-17 Федеральное государственное бюджетное учреждение "Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт фтизиопульмонологии" Министерства здравоохранения Российской Федерации (ФГБУ "СПб НИИФ" Минздрава России) Method of detecting phylogenetic sublines of beijing mycobacterium tuberculosis genotype in real time format

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2485177C1 (en) * 2012-03-07 2013-06-20 Федеральное Государственное Бюджетное Учреждение науки Институт химической биологии и фундаментальной медицины Сибирского отделения РАН (ИХБФМ СО РАН) METHOD OF DETECTING RIFAMPICIN-RESISTANT ISOLATES Mycobacterium tuberculosis
CN108410971A (en) * 2018-06-04 2018-08-17 上海市食品药品检验所 A kind of bacterial nucleic acid sequencing identification method and bacterial identification kits based on DNA characteristics sequence

Also Published As

Publication number Publication date
RU2405836C2 (en) 2010-12-10

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2008118836A (en) METHOD FOR DETECTING MYCOBACTERIA TUBERCULOSIS BEIJING GENOTYPE
WO2015081229A3 (en) Selective amplification of nucleic acid sequences
JP2008245635A5 (en)
EA201170933A1 (en) ANALYSIS OF NUCLEIC ACIDS OBTAINED FROM SINGLE CELLS
EA201101141A1 (en) OBTAINING CLOSED LINEAR DNA
WO2009015863A3 (en) Methods of detecting methylated dna at a specific locus
WO2009092035A3 (en) Methods and compositions for the analysis of biological molecules
EA201100001A3 (en) NUCLEOTIDES AND NUCLEOSIDES AND METHODS OF THEIR USE IN DNA SEQUENCY
GB201317477D0 (en) Methods, compositions and kits for determing the presence/absnece of a variant nucleic acid sequence
IN2012DN06299A (en)
EP2582850A4 (en) Compositions, kits, and methods for synthesis and/or detection of nucleic acids
WO2014052487A8 (en) Two-primer pcr for microrna multiplex assay
WO2010107816A3 (en) Nucleic acid binding dyes and uses therefor
WO2014143714A3 (en) Methods for one step nucleic acid amplification of non-eluted samples
RU2015150098A (en) METHOD OF DNA AMPLIFICATION BASED ON INTRODUCTION TO THE CHAIN
WO2012103442A3 (en) Paired end bead amplification and high throughput sequencing
GB2519465A (en) Solid matrix for one step nucleic acid amplification
WO2008076856A3 (en) Reagents and methods for detecting cyp2d6 polymorphisms
MY184632A (en) A method of identifying parentage in freshwater prawn macrobrachium rosenbergii
UA99793C2 (en) Set for determination of hepatitis b virus
EP2058392A4 (en) Dna fragment used in the form attached to 5'-terminus of primer for use in amplification reaction of nucleic acid, and use thereof
WO2014102761A8 (en) Primers for the detection and typing of carbapenemase-producing bacterial strains, and detection method and kit
WO2014136124A3 (en) Multiplex real time pcr testing kit for the simultaneous detection of hepatitis virus
WO2006103111A3 (en) Improved bisulfite conversion of dna
RU2011152586A (en) USE OF GENES OF TOXIN-ANTITOXIN SYSTEMS RelBE AND MazEF FOR SPECIES AND STRAIN IDENTIFICATION OF LACTOBACILLES

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20110513