RU2007101914A

RU2007101914A - Гены corynebacterium glutamicum, кодирующие белки, участвующие в метаболизме углерода и продуцировании энергии

Info

Publication number: RU2007101914A
Application number: RU2007101914/13A
Authority: RU
Inventors: Маркус ПОМПЕЙУС (DE); Маркус ПОМПЕЙУС; Буркхард КРЕГЕР (DE); Буркхард КРЕГЕР; Хартвиг ШРЕДЕР (DE); Хартвиг ШРЕДЕР; Оскар ЦЕЛЬДЕР (DE); Оскар Цельдер; Грегор ХАБЕРХАУЕР (DE); Грегор ХАБЕРХАУЕР
Original assignee: Басф Акциенгезелльшафт (De); Басф Акциенгезелльшафт
Priority date: 1999-06-25
Filing date: 2007-01-18
Publication date: 2008-07-27
Also published as: RU2321634C2; RU2002101727A; RU2005120507A; RU2310686C2; RU2007101915A; RU2007101911A; RU2007101910A; RU2007101913A

Claims

1. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, содержащая нуклеотидную последовательность SEQ ID NO:53, или комплементарная ей последовательность.

2. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, которая кодирует полипептид, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO:54, или комплементарная ей последовательность.

3. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, которая кодирует природный аллельный вариант полипептида, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO:54, или комплементарная ей последовательность.

4. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, содержащая нуклеотидную последовательность, которая по меньшей мере на 50% идентична полноразмерной нуклеотидной последовательности SEQ ID NO:53, или комплементарная ей последовательность.

5. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, содержащая фрагмент из по меньшей мере 15 последовательных нуклеотидов нуклеотидной последовательности SEQ ID NO:53, или комплементарная ей последовательность.

6. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, которая кодирует полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 50% идентична полноразмерной аминокислотной последовательности SEQ ID NO:54, или комплементарная ей последовательность.

7. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, которая гибридизуется с комплементарной нуклеотидной последовательностью SEQ ID NO:53 в 6Х хлориде натрия/цитрате натрия (SSC) при 65°С, или комплементарная ей последовательность.

8. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, содержащая молекулу нуклеиновой кислоты по любому из пп.1-7 и нуклеотидную последовательность, кодирующую гетерологичный полипептид.

9. Вектор, содержащий молекулу нуклеиновой кислоты по любому из пп.1-8.

10. Вектор по п.9, который является вектором экспрессии.

11. Клетка-хозяин, трансфецированная вектором экспрессии по п.10.

12. Клетка-хозяин по п.11, где указанная клетка является микроорганизмом.

13. Клетка-хозяин по п.12, где указанная клетка принадлежит роду Corynebacterium или Brevibacterium.

14. Клетка-хозяин по п.11, где экспрессия указанной молекулы нуклеиновой кислоты приводит к модуляции продукции химического продукта тонкого органического синтеза указанной клеткой.

15. Клетка-хозяин по п.14, где указанный химический продукт тонкого органического синтеза выбран из группы, состоящей из органических кислот, протеиногенных и непротеиногенных аминокислот, пуриновых и пиримидиновых оснований, нуклеозидов, нуклеотидов, липидов, насыщенных и ненасыщенных жирных кислот, двухатомных спиртов, углеводов, ароматических соединений, витаминов, кофакторов, поликетидов и ферментов.

16. Способ получения полипептида, предусматривающий культивирование клетки-хозяина по п.11 в подходящей культуральной среде с получением, таким образом, полипептида.

17. Выделенный полипептид, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO:54.

18. Выделенный полипептид, содержащий природный аллельный вариант полипептида, содержащего аминокислотную последовательность SEQ ID NO:54.

19. Выделенный полипептид, который кодируется молекулой нуклеиновой кислоты, содержащей нуклеотидную последовательность, которая по меньшей мере на 50% идентична полноразмерной нуклеотидной последовательности SEQ ID NO:53.

20. Выделенный полипептид, содержащей аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 50% идентична полноразмерной аминокислотной последовательности SEQ ID NO:54.

21. Выделенный полипептид, содержащий фрагмент аминокислотной последовательности SEQ ID NO:54, где указанный полипептидный фрагмент сохраняет биологическую активность полипептида, содержащего аминокислотную последовательность SEQ ID NO:54.

22. Выделенный полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, которая кодируется молекулой нуклеиновой кислоты, содержащей нуклеотидную последовательностью SEQ ID NO:53.

23. Выделенный полипептид по любому из пп.17-22, дополнительно содержащий гетерологичную аминокислотную последовательность.

24. Способ получения химического продукта тонкого органического синтеза, предусматривающий культивирование клетки по п.11 с получением химического продукта тонкого органического синтеза.

25. Способ по п.24, где указанный способ дополнительно предусматривает стадию выделения химического продукта тонкого органического синтеза из указанной культуры.

26. Способ по п.24, где указанная клетка принадлежит роду Corynebacterium или Brevibacterium.

27. Способ по п.24, где указанная клетка выбрана из группы, состоящей из Corynebacterium glutamicum, Corynebacterium herculis, Corynebacterium lilium, Corynebacterium acetoacidophilum, Corynebacterium acetoglutamicum, Corynebacterium acetophilum, Corynebacterium ammoniagenes, Corynebacterium fujiokense, Corynebacterium nitrilophilus, Brevibacterium ammoniagenes, Brevibacterium butanicum, Brevibacterium divaricatum, Brevibacterium flavum, Brevibacterium healii, Brevibacterium ketoglutamicum, Brevibacterium ketosoreductum, Brevibacterium lactofermentum, Brevibacterium linens, Brevibacterium paraffinolyticum и штаммов, представленных в таблице 3.

28. Способ по п.24, где экспрессия молекулы нуклеиновой кислоты из указанного вектора приводит к модуляции продукции указанного химического продукта тонкого органического синтеза.

29. Способ по п.24, где указанный химический продукт тонкого органического синтеза выбран из группы, состоящей из органических кислот, протеиногенных и непротеиногенных аминокислот, пуриновых и пиримидиновых оснований, нуклеозидов, нуклеотидов, липидов, насыщенных и ненасыщенных жирных кислот, двухатомных спиртов, углеводов, ароматических соединений, витаминов, кофакторов, поликетидов и ферментов.

30. Способ по п.24, где указанный химический продукт является аминокислотой.

31. Способ по п.30, где указанная аминокислота выбрана из группы, состоящей из лизина, глутамата, глутамина, аланина, аспартата, глицина, серина, треонина, метионина, цистеина, валина, лейцина, изолейцина, аргинина, пролина, гистидина, тирозина, фенилаланина и триптофана.

32. Способ получения химического продукта тонкого органического синтеза, предусматривающий культивирование клетки, геномная ДНК которой была изменена введением молекулы нуклеиновой кислоты по любому из пп.1-7.

33. Способ диагностики или определение активности Corynebacterium diphtheriae у пациента, предусматривающий определение по меньшей мере одной молекулы нуклеиновой кислоты по пп.1-7 или по меньшей мере одной молекулы полипептида по пп.17-22, то есть диагностика или определение активности Corynebacterium diphtheriae.

34. Клетка-хозяин, содержащая молекулу нуклеиновой кислоты SEQ ID NO:53, где молекула нуклеиновой кислоты разрушена.

35. Клетка-хозяин, содержащая молекулу нуклеиновой кислоты SEQ ID NO:53, где молекула нуклеиновой кислоты содержит одну или несколько модификаций нуклеиновой кислоты по сравнению с последовательностью SEQ ID NO:53.

36. Клетка-хозяин, содержащая молекулу нуклеиновой кислоты SEQ ID NO:53, где регуляторная область молекулы нуклеиновой кислоты модифицирована по сравнению с регуляторной областью молекулы дикого типа.