Claims (30)
1. Способ детектирования комплексной вертебральной мальформации (CVM) крупного рогатого скота у особи крупного рогатого скота, в котором идентифицируют присутствие, по меньшей мере, одного генетического маркера, расположенного на хромосоме ВТАЗ крупного рогатого скота в области, фланкируемой и включающей полиморфные микросателлитные маркеры ВМ4129 и BMS1266, связанные с комплексной вертебральной мальформацией (CVM) у крупного рогатого скота, включающий1. A method for detecting complex vertebral malformation (CVM) of cattle in an individual cattle, which identifies the presence of at least one genetic marker located on the BTA chromosome of cattle in the region flanked and including polymorphic microsatellite markers BM4129 and BMS1266 associated with complex vertebral malformation (CVM) in cattle, including
а) обеспечение генетического материала крупного рогатого скота, иa) providing the genetic material of cattle, and
б) детектирование, в указанном генетическом материале, присутствия или отсутствия, по меньшей мере, одного генетического маркера, который связывают с проявлением признаков заболевания комплексной вертебральной мальформацией крупного рогатого скота.b) detecting, in said genetic material, the presence or absence of at least one genetic marker, which is associated with the manifestation of signs of the disease by complex vertebral malformation of cattle.
2. Способ по п.1, в котором по меньшей мере один генетический маркер располагается в области от около 59,5 сМ до около 67,9 сМ.2. The method according to claim 1, in which at least one genetic marker is located in the region from about 59.5 cm to about 67.9 cm.
3. Способ по п.2, в котором по меньшей мере один генетический маркер располагается в области, фланкируемой и включающей полиморфные микросателлитные маркеры INRAA003 и BMS937.3. The method according to claim 2, in which at least one genetic marker is located in the region flanked and includes polymorphic microsatellite markers INRAA003 and BMS937.
4. Способ по п.3, в котором по меньшей мере один генетический маркер располагается в области, фланкируемой и включающей полиморфные микросателлитные маркеры INRAA003 и ILSTS029.4. The method according to claim 3, in which at least one genetic marker is located in the region flanked and includes polymorphic microsatellite markers INRAA003 and ILSTS029.
5. Способ по п.1, в котором по меньшей мере один генетический маркер является микросателлитным маркером INRAA003.5. The method of claim 1, wherein the at least one genetic marker is an INRAA003 microsatellite marker.
6. Способ по п.1, в котором по меньшей мере, один генетический маркер является микросателлитным маркером BMS2790.6. The method according to claim 1, in which at least one genetic marker is a microsatellite marker BMS2790.
7. Способ по п.1, в котором по меньшей мере один генетический маркер является микросателлитным маркером ILSTS029.7. The method according to claim 1, in which at least one genetic marker is a microsatellite marker ILSTS029.
8. Способ по п.1, в котором по меньшей мере один генетический маркер является микросателлитным маркером INRA123.8. The method of claim 1, wherein the at least one genetic marker is an INRA123 microsatellite marker.
9. Способ по п.1, в котором по меньшей мере один генетический маркер является микросателлитным маркером ВМ220.9. The method of claim 1, wherein the at least one genetic marker is a BM220 microsatellite marker.
10. Способ по п.1,в котором по меньшей мере один генетический маркер является микросателлитным маркером HUJ246.10. The method according to claim 1, in which at least one genetic marker is a microsatellite marker HUJ246.
11. Способ по п.1, в котором по меньшей мере один генетический маркер является микросателлитным маркером BMS862.11. The method according to claim 1, in which at least one genetic marker is a microsatellite marker BMS862.
12. Способ по п.1, в котором по меньшей мере, один генетический маркер является микросателлитным маркером BMS937.12. The method according to claim 1, in which at least one genetic marker is a microsatellite marker BMS937.
13. Способ по п.1, в котором по меньшей мере один генетический маркер сцеплен с геном, вызывающим заболевание комплексной вертебральной мальформацией у крупного рогатого скота.13. The method according to claim 1, in which at least one genetic marker is linked to a gene causing a disease of complex vertebral malformation in cattle.
14. Способ по п.13, в котором ген, вызывающий заболевание комплексной вертебральной мальформацией у крупного рогатого скота, является геном SLC35A3 крупного рогатого скота.14. The method according to item 13, in which the gene that causes the disease of complex vertebral malformation in cattle is the SLC35A3 gene of cattle.
15. Способ по п.14, в котором ген SLC35A3 крупного рогатого скота кодирует белок SLC35A3 крупного рогатого скота, включающий аминокислотную последовательность, которая представлена в виде SEQ ID NO: 17.15. The method of claim 14, wherein the cattle SLC35A3 gene encodes a cattle SLC35A3 protein comprising an amino acid sequence that is presented as SEQ ID NO: 17.
16. Способ по п.15, в котором белок SLC35A3 крупного рогатого скота кодируют с помощью кДНК последовательности, включающей нуклеотидную последовательность SEQ ID NO: 18.16. The method of claim 15, wherein the cattle SLC35A3 protein is encoded using a cDNA sequence comprising the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 18.
17. Способ по п.16, в котором генетический маркер представляет полиморфизм единичного нуклеотида в положении, являющимся эквивалентным положению 559 нуклеотида SEQ ID NO: 18.17. The method according to clause 16, in which the genetic marker represents a single nucleotide polymorphism at a position that is equivalent to position 559 of the nucleotide SEQ ID NO: 18.
18. Способ по п.17, в котором полиморфизм единичного нуклеотида представляет G/T полиморфизм.18. The method according to 17, in which the polymorphism of a single nucleotide is a G / T polymorphism.
19. Способ по п.18, в котором детектирование G/T полиморфизма проводят путем применения методики, выбранной из группы, состоящей из аллель-специфической ПЦР, минисеквенирования, удлинения праймера, пиросеквенирования, ПЦР-ПДРФ, аллель-специфической амплификации по типу катящегося кольца и удлинения праймера с последующей MALDI-TOF масс-спектрометрией.19. The method according to p. 18, in which the detection of G / T polymorphism is carried out by applying a technique selected from the group consisting of allele-specific PCR, minisequencing, primer extension, pyrosequencing, PCR-RFLP, allele-specific amplification according to a rolling ring and primer extension followed by MALDI-TOF mass spectrometry.
20. Способ по п.1, в котором указанный по меньшей мере один генетический маркер генетически связан с геном или проявлением признаков заболевания, приводящим к заболеванию комплексной вертебральной мальформацией крупного рогатого скота, при величине количественного показателя сцепления генов, равной 3,0, такой как, по меньшей мере, равной 4,0, включающей, по меньшей мере, величину 5,0, такой как, по меньшей мере, равной 6,0, включающей, по меньшей мере, величину 7,0, такой как, по меньшей мере, равной 8,0, включающей, по меньшей мере, величину 9,0, такой как, по меньшей мере, равной 10,0, включающей, по меньшей мере, величину 11,0, такой как, по меньшей мере, равной 12,0.20. The method according to claim 1, wherein said at least one genetic marker is genetically linked to a gene or manifestation of disease signs resulting in a disease of complex vertebral malformation of cattle, with a quantitative gene linkage of 3.0, such as at least 4.0, including at least 5.0, such as at least 6.0, including at least 7.0, such as at least equal to 8.0, including at least a value of 9.0, such as, at least 10.0, including at least 11.0, such as at least 12.0.
21. Способ по п.1, в котором по меньшей мере один маркер представляет собой комбинацию генетических маркеров.21. The method according to claim 1, in which at least one marker is a combination of genetic markers.
22. Способ по п.5, в котором пара праймеров для амплификации микросателлитного маркера INRAA003 представляет последовательности SEQ ID NO: 1 и SEQ ID NO: 2.22. The method according to claim 5, in which a pair of primers for amplification of the microsatellite marker INRAA003 represents the sequence of SEQ ID NO: 1 and SEQ ID NO: 2.
23. Способ по п.6, в котором пара праймеров для амплификации микросателлитного маркера BMS2790 представляет последовательности SEQ ID NO: 3 и SEQ ID NO: 4.23. The method according to claim 6, in which a pair of primers for amplification of the microsatellite marker BMS2790 represents the sequence of SEQ ID NO: 3 and SEQ ID NO: 4.
24. Способ по п.7, в котором пара праймеров для амплификации микросателлитного маркера ILSTS029 представляет последовательности SEQ ID NO: 5 и SEQ ID NO: 6.24. The method according to claim 7, in which a pair of primers for amplification of the microsatellite marker ILSTS029 represents the sequence of SEQ ID NO: 5 and SEQ ID NO: 6.
25. Способ по п.8, в котором пара праймеров для амплификации микросателлитного маркера INRA123 представляет последовательности SEQ ID NO: 7 и SEQ ID NO: 8.25. The method of claim 8, in which the pair of primers for amplification of the microsatellite marker INRA123 represents the sequence of SEQ ID NO: 7 and SEQ ID NO: 8.
26. Способ по п.9, в котором пара праймеров для амплификации микросателлитного маркера ВМ220 представляет последовательности SEQ ID NO: 9 и SEQ ID NO: 10.26. The method according to claim 9, in which a pair of primers for amplification of microsatellite marker BM220 represents the sequence of SEQ ID NO: 9 and SEQ ID NO: 10.
27. Способ по п.10, в котором пара праймеров для амплификации микросателлитного маркера HUJ246 представляет последовательности SEQ ID NO: 11 и SEQ ID NO: 12.27. The method according to claim 10, in which a pair of primers for amplification of the microsatellite marker HUJ246 represents the sequence of SEQ ID NO: 11 and SEQ ID NO: 12.
28. Способ по п.11, в котором пара праймеров для амплификации микросателлитного маркера BMS862 представляет последовательности SEQ ID NO: 13 и SEQ ID NO: 14.28. The method according to claim 11, in which a pair of primers for amplification of the microsatellite marker BMS862 represents the sequence of SEQ ID NO: 13 and SEQ ID NO: 14.
29. Способ по п.12, в котором пара праймеров для амплификации микросателлитного маркера BMS937 представляет последовательности SEQ ID NO: 15 и SEQ ID NO: 16.29. The method according to item 12, in which a pair of primers for amplification of the microsatellite marker BMS937 represents the sequence of SEQ ID NO: 15 and SEQ ID NO: 16.
30. Диагностический набор для использования при детектировании присутствия у особи крупного рогатого скота, по меньшей мере, одного генетического маркера, связанного с комплексной вертебральной мальформацией (CVM) крупного рогатого скота, включающий, по меньшей мере, одну олигонуклеотидную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 14, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 33, SEQ ID NO: 34, SEQ ID NO: 35, SEQ ID NO: 36, SEQ ID NO: 37 и SEQ ID NO: 38, и их комбинаций.30. A diagnostic kit for use in detecting the presence in an individual of cattle of at least one genetic marker associated with complex vertebral malformation (CVM) of cattle, comprising at least one oligonucleotide sequence selected from the group consisting of from SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 14, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO : 33, SEQ ID NO: 34, SEQ ID NO: 35, SEQ ID NO: 36, SEQ ID NO: 37 and SEQ ID NO: 38, and combinations thereof.