RS64941B1 - Spojevi i metode za smanjenje tau ekspresije - Google Patents

Spojevi i metode za smanjenje tau ekspresije

Info

Publication number
RS64941B1
RS64941B1 RS20231188A RSP20231188A RS64941B1 RS 64941 B1 RS64941 B1 RS 64941B1 RS 20231188 A RS20231188 A RS 20231188A RS P20231188 A RSP20231188 A RS P20231188A RS 64941 B1 RS64941 B1 RS 64941B1
Authority
RS
Serbia
Prior art keywords
modified
modified oligonucleotide
compound
salt
oligonucleotide
Prior art date
Application number
RS20231188A
Other languages
English (en)
Inventor
Holly Kordasiewicz
Original Assignee
Biogen Ma Inc
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Family has litigation
First worldwide family litigation filed litigation Critical https://patents.darts-ip.com/?family=61760152&utm_source=google_patent&utm_medium=platform_link&utm_campaign=public_patent_search&patent=RS64941(B1) "Global patent litigation dataset” by Darts-ip is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Application filed by Biogen Ma Inc filed Critical Biogen Ma Inc
Publication of RS64941B1 publication Critical patent/RS64941B1/sr

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70—Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7088—Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
    • A61K31/7125—Nucleic acids or oligonucleotides having modified internucleoside linkage, i.e. other than 3'-5' phosphodiesters
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/02—Inorganic compounds
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/46—Ingredients of undetermined constitution or reaction products thereof, e.g. skin, bone, milk, cotton fibre, eggshell, oxgall or plant extracts
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K9/00—Medicinal preparations characterised by special physical form
    • A61K9/0012—Galenical forms characterised by the site of application
    • A61K9/0019—Injectable compositions; Intramuscular, intravenous, arterial, subcutaneous administration; Compositions to be administered through the skin in an invasive manner
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P25/00—Drugs for disorders of the nervous system
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P25/00—Drugs for disorders of the nervous system
    • A61P25/08—Antiepileptics; Anticonvulsants
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P25/00—Drugs for disorders of the nervous system
    • A61P25/14—Drugs for disorders of the nervous system for treating abnormal movements, e.g. chorea, dyskinesia
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P25/00—Drugs for disorders of the nervous system
    • A61P25/28—Drugs for disorders of the nervous system for treating neurodegenerative disorders of the central nervous system, e.g. nootropic agents, cognition enhancers, drugs for treating Alzheimer's disease or other forms of dementia
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10—Type of nucleic acid
    • C12N2310/11—Antisense
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30—Chemical structure
    • C12N2310/31—Chemical structure of the backbone
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30—Chemical structure
    • C12N2310/31—Chemical structure of the backbone
    • C12N2310/315—Phosphorothioates
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30—Chemical structure
    • C12N2310/32—Chemical structure of the sugar
    • C12N2310/321—2'-O-R Modification
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30—Chemical structure
    • C12N2310/32—Chemical structure of the sugar
    • C12N2310/322—2'-R Modification
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30—Chemical structure
    • C12N2310/33—Chemical structure of the base
    • C12N2310/334—Modified C
    • C12N2310/3341—5-Methylcytosine
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30—Chemical structure
    • C12N2310/34—Spatial arrangement of the modifications
    • C12N2310/341—Gapmers, i.e. of the type ===---===
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30—Chemical structure
    • C12N2310/34—Spatial arrangement of the modifications
    • C12N2310/345—Spatial arrangement of the modifications having at least two different backbone modifications
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30—Chemical structure
    • C12N2310/35—Nature of the modification
    • C12N2310/351—Conjugate
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30—Chemical structure
    • C12N2310/35—Nature of the modification
    • C12N2310/352—Nature of the modification linked to the nucleic acid via a carbon atom
    • C12N2310/3525—MOE, methoxyethoxy

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Neurosurgery (AREA)
  • Neurology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Psychology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Pain & Pain Management (AREA)
  • Psychiatry (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Hospice & Palliative Care (AREA)
  • Dermatology (AREA)
  • Botany (AREA)
  • Inorganic Chemistry (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Saccharide Compounds (AREA)
  • Medicinal Preparation (AREA)

Description

Oblast
[0001] Obezbeđena su jedinjenja, uključujući za upotrebu u postupcima, i farmaceutske kompozicije za smanjenje količine ili aktivnosti Tau iRNK u ćeliji ili životinji, i u nekim slučajevima za smanjenje količine Tau proteina u ćeliji ili životinji. Takva jedinjenja, postupci i farmaceutske kompozicije su korisne za poboljšanje najmanje jednog simptoma neurodegenerativne bolesti. Ovi simptomi uključuju gubitak pamćenja, gubitak motoričke funkcije i povećanje broja i/ili zapremine neurofibrilarnih inkluzija. Ove neurodegenerativne bolesti uključuju tauopatije, Alchajmerovu bolest, fronto-temporalnu demenciju (FTD), FTDP-17, progresivnu supranuklearnu paralizu (PSP), hroničnu traumatsku encefalopatiju (CTE), degeneraciju kortikobazalnih ganglija (CBD), epilepsiju i Dravetov sindrom.
Osnov pronalaska
[0002] Primarna funkcija Tau je da se veže za, i stabilizuje, mikrotubule, koje su važne strukturne komponente citoskeleta uključene u mitozu, citokinezu i vezikularni transport. Tau se nalazi u većem broju tkiva, ali posebno je obilan u aksonima neurona. Kod ljudi postoji šest izoformi Tau koji se generišu alternativnim splajsovanjem egzona 2, 3 i 10. Splajsovanje egzona 2 i 3 na N-terminusu proteina dovodi do uključivanja nula, jednog ili dva aminokiselinska domena sa 29 aminokiselina i označeno je kao 0N, 1N ili 2N Tau. Uticaj ovih domena na funkciju Tau nije potpuno jasan, mada može da igra ulogu u interakciji sa plazma membranom. Uključivanje egzona 10 na C-terminus dovodi do uključivanja vezujućeg domena za mikrotubule koji je kodiran egzonom 10. Pošto na drugim mestima Tau postoje 3 vezujuća domena za mikrotubule, ova Tau izoforma (sa uključenim egzonom 10) je označena kao 4R Tau, gde se 'R' odnosi na broj ponovaka vezujućih domena za mikrotubule. Tau bez egzona 10 označen je kao 3R Tau. Budući da više vezujućih domena za mikrotubule (4R u poređenju sa 3R) povećava vezivanje za mikrotubule, 4R Tau verovatno značajno povećava vezivanje za mikrotubule i sklapanje. Odnos 3R/4R Tau je regulisan tokom razvoja, pri čemu fetalna tkiva eksprimiraju isključivo 3R Tau, a ljudska tkiva odraslih jedinki eksprimiraju približno jednak nivo 3R/4R Tau.Odstupanja od normalnog odnosa 3R/4R Tau karakteristična su za neurodegenerativne FTD tauopatije.Nije poznato kako promena odnosa 3R/4R Tau u kasnijoj fazi kod odrasle životinje utiče na patogenezu Tau.
[0003] Serin-treonin usmerena fosforilacija reguliše sposobnost Tau da se veže za mikrotubule.Hiperfosforilacija pospešuje odvajanje Tau od mikrotubula.Opisane su i druge post-translacione modifikacije Tau; međutim, njihov značaj je nejasan.Fosforilacija Tau je takođe regulisana tokom razvoja, pri čemu je fosforilacija viša u fetalnim tkivima, a mnogo niža kododraslih jedinki.Jedna od karakteristika neurodegenerativnih poremećaja je aberantno povećana fosforilacija Tau.Mreža mikrotubula je uključena u mnoge važne procese unutar ćelije, uključujući strukturni integritet koji je neophodan za održavanje morfologije ćelija i funkcionisanje transportne mašinerije.S obzirom da vezivanje Tau za mikrotubule stabilizuje mikrotubule, Tau je verovatno ključni posrednik u nekim od ovih procesa i prekid normalnih Tau kod neurodegenerativnih bolesti može poremetiti neke od ovih ključnih ćelijskih procesa.Jedan od ranih pokazatelja da je Tau može da bude važan kod neurodegenerativnih sindroma bilo je saznanje da je Tau ključna komponenta neurofibrilarnih inkluzija u Alchajmerovoj bolesti.U stvari, neurofibrilarne inkluzije su agregati hiperfosforilisanog Tau proteina.Zajedno sa plakovima koji sadrže amiloid beta, neurofibrilarne inkluzije predstavljaju obeležje Alchajmerove bolesti i u značajnoj su korelaciji sa kognitivnim oštećenjem. 95% akumulacija Tau u AD nalazi se u neuronskim nastavcima i smatra se distrofijom neurita.Proces(i) putem koga se ovaj protein asociran sa mikrotubulama odvaja od mikrotubula i formira akumulacije proteina, kao i u kakvoj je to vezi sa neuronskom toksičnošću, nije dobro shvaćen.
[0004] Neuronske inkluzije Tau su patološka karakteristika ne samo Alchajmerove bolesti, već i podskupa frontotemporalne demencije (FTD), PSP i CBD.Veza između Tau i neurodegeneracije je učvršćena otkrićem da mutacije u Tau genu izazivaju podskup FTD.Ovi genetički podaci su takođe istakli značaj odnosa Tau 3R:4R.Mnoge od Tau mutacija koje izazivaju FTD, dovode do promene Tau splajsovanja što vodi do preferencijalnog uključivanja egzona 10, a time i do povećanog 4R Tau.Ukupan nivo Tau je normalan. Ostaje nepoznato da li neurodegeneraciju izaziva izmena Tau izoforme ili izmena amino kiselina.Skorašnji podaci pokazuju da PSP takođe može da bude povezan sa povećanim odnosom 4R:3R Tau.
[0005] Da bi se razumeo uticaj Tau odnosa na neurodegeneraciju, model miša zasnovan na jednoj od Tau mutacija (N279K) splajsovanja, generisan je pomoću minigena koji uključuje Tau promotor i bočne intronske sekvence egzona 10.Kao i kod ljudi, ovi miševi pokazuju povećane nivoe 4R Tau u poređenju sa transgenim životinjama koje eksprimiraju WT Tau i razvijaju abnormalnosti u ponašanju i kretanju, kao i akumulacije agregatnog Tau u mozgu i kičmenoj moždini.
[0006] Tau protein je povezan sa više bolesti mozga uključujući Alchajmerovu bolest, FTD, PSP, CBD, demenciju pugilisticu, parkinsonizam povezan sa hromozomom, Lytico-Bodig bolest, zamršena- pretežna demencija, gangliogliom, gangliocitoma, meningioangiomatozu, subakutni sklerotični panencefalitis, olovna encefalopatija, tuberozna skleroza, Hallervorden-Spatz bolest, Pikova bolest, argirofilna bolest žitarica, kortikosalna degeneracija ili degeneraciju frontotemporalnih režnjeva i druge.Tau-asocirani poremećaji kao što je AD su najčešći uzrok demencije kod starijih osoba.Prema procenama, AD pogađa 15 miliona ljudi širom sveta i 40% populacije iznad 85 godina starosti.AD karakterišu dve patološke oznake: Tau neurofibrilarne inkluzije (NFT) i amiloid-β (Aβ) plakovi.
[0007] Trenutno je prisutan nedostatak prihvatljivih opcija za lečenje ovih neurodegenerativnih bolesti.Stoga je ovde cilj da se obezbede modifikovani oligonukleotidi, soli, jedinjenja i farmaceutske kompozicije za upotrebu u lečenju ovih bolesti.
Kratak opis pronalaska
[0008] Predmetni pronalazak obezbeđuje modifikovani oligonukleotid prema sledećoj formuli:
ili njihovu so.
[0009] Pronalazak takođe obezbeđuje jedinjenje koje sadrži modifikovani oligonukleotid, pri čemu je modifikovani oligonukleot gapmer koji se sastoji od 5' krilnog segmenta , centralnog segmenta praznine i 3' krilnog segmenta, gde:
5' krilni segment se sastoji od pet 2'-MOE nukleozida,
centralni segment praznine se sastoji se od osam 2'-dezoksinukleozida i
3' krilni segment se sastoji od pet 2'-MOE nukleozida;
pri čemu modifikovani oligonukleotid ima sekvencu nukleobaza 5'-CCGTTTTCTTACCACCCT-3' (SEQ ID NO: 8), gde je svaki citozin 5-metilcitozin; i pri čemu su internukleozidne veze modifikovanog nukleotida, od 5' do 3', sossssssssssssoss, gde je svaki s fosforotioatna veza i svaki o je fosfodiestarska veza.
[0010] Pronalazak takođe obezbeđuje modifikovani oligonukleotid, pri čemu je modifikovani oligonukleotid gapmer koji se sastoji od 5' krilnog segmenta, centralnog segmenta praznine i 3' krilnog segmenta, gde:
5' krilni segment se sastoji od pet 2'-MOE nukleozida,
centralni segment praznine se sastoji se od osam 2'-dezoksinukleozida i
3' krilni segment se sastoji od pet 2'-MOE nukleozida,
pri čemu modifikovani oligonukleotid ima sekvencu nukleobaza 5'-CCGTTTTCTTACCACCCT-3' (SEQ ID NO: 8), gde je svaki citozin 5-metilcitozin; i pri čemu su internukleozidne veze modifikovanog nukleotida, od 5' do 3', sossssssssssssoss, gde je svaki s fosforotioatna veza i svaki o je fosfodiestarska veza.
[0011] Pronalazak takođe obezbeđuje modifikovani oligonukleotid ili njegovu so, jedinjenje ili farmaceutsku kompoziciju, kao što je definisano u priloženim patentnim zahtevima, za upotrebu u terapiji, uključujući upotrebu u lečenju bolesti povezane sa tau, na primer neurodegenerativne bolesti uključujući tauopatiju, Alchajmerovu bolest, frontotemporalnu demenciju (FTD), FTDP-17, progresivnu supranuklearnu paralizu (PSP), hroničnu traumatsku encefalopatiju (CTE), degeneraciju kortikobazalnih ganglija (CBD), epilepsiju ili Dravetov sindrom.
[0012] Dalji primeri izvođenja prema pronalasku definisani su u priloženim patentnim zahtevima.
[0013] Ovde su, dakle, obezbeđena jedinjenja i njihova upotreba u postupcima za smanjenje količine ili aktivnosti Tau iRNK, i, u nekim primerima izvođenja, za smanjenje količine Tau proteina u ćeliji ili životinji. U nekim primerima izvođenja, životinja ima neurodegenerativnu bolest.U nekim primerima izvođenja, životinja ima tauopatiju, Alchajmerovu bolest, fronto-temporalnu demenciju (FTD), FTDP-17, progresivnu supranuklearnu paralizu (PSP), hroničnu traumatsku encefalopatiju (CTE), degeneraciju kortikobazalnih ganglija (CBD), epilepsiju ili Dravetov sindrom.U nekim primerima izvođenja, jedinjenja korisna za smanjenje ekspresije Tau iRNK su oligomerna jedinjenja.U nekim primerima izvođenja, jedinjenje br.
814907 je korisno za smanjenje ekspresije Tau iRNK i/ili Tau proteina.
[0014] Ovde su takođe otkriveni postupci korisni za prevenciju ili poboljšanje najmanje jednog simptoma neurodegenerativne bolesti.U nekim slučajevima, ovi simptomi uključuju gubitak pamćenja, gubitak motoričke funkcije i povećanje broja i/ili zapremine neurofibrilarnih inkluzija.U nekim slučajevima, prevencija ili poboljšanje rezultiraju održavanjem ili poboljšanjem pamćenja, održavanjem ili poboljšanjem motoričke funkcije, i/ili održavanjem ili smanjenjem broja i/ili zapremine neurofibrilarnih inkluzija.U nekim slučajevima, ova prevencija ili poboljšanje simptoma je smanjenje brzine progresije ili odlaganje kod najtežih takvih simptoma.
Detaljan opis pronalaska
[0015] Treba imati na umu da su i prethodno dat opšti opis i detaljan opis koji sledi, dati samo kao primer i objašnjenje i da nisu ograničavajući.Ovde upotreba jednine uključuje množinu osim ako nije specifično drugačije navedeno.Kao što se ovde koristi, upotreba "ili" znači "i/ili" osim ako nije drugačije navedeno.Pored toga, upotreba termina "uključujući" kao i drugih oblika, kao što su "uključuje" i "uključeno", nije ograničavajuća.Takođe, termini kao što su "element" ili "komponenta" obuhvataju i elemente i komponente koji sadrže jednu jedinicu i elemente i komponente koji sadrže više od jedne jedinice, osim ako nije specifično drugačije navedeno.
[0016] Naslovi odeljaka koji se ovde koriste su samo u organizacione svrhe i ne treba ih smatrati ograničavajućim za opisani predmet.
Definicije
[0017] Ukoliko nisu obezbeđene specifične definicije, nomenklatura koja se koristi u vezi, i procedure i tehnike, analitičke hemije, sintetičke organske hemije i medicinske i farmaceutske hemije, koje su ovde opisane, dobro su poznate i često se koriste u stanju tehnike.
[0018] Osim ako nije drugačije naznačeno, sledeći termini imaju sledeća značenja:
Definicije
[0019] Kao što se ovde koristi, "2'-deozoksinukleozid" označava nukleozid koji sadrži komponentu 2'-H(H) furanozil šećera, kao što se nalazi u dezoksiribonukleinskoj kiselini (DNK) koja se javlja u prirodi.U nekim primerima izvođenja, 2'- dezoksinukleozid može da sadrži modifikovanu nukleobazu ili može da sadrži RNK nukleobazu (uracil).
[0020] Kao što se ovde koristi, "2'-supstituisani nukleozid" označava nukleozid koji sadrži komponentu sa 2'-supstituisanim šećerom.Kao što se ovde koristi, "2'-supstituisan" u vezi sa šećernom komponentom označava komponentu šećera koja sadrži najmanje jednu grupu 2'-supstituenta koja nije H ili OH.
[0021] Kao što se ovde koristi, "primena" označava obezbeđivanje farmaceutskog agensa životinji.
[0022] Kao što se ovde koristi, "životinja" označava životinju koja je čovek ili koja nije čovek.
[0023] Kao što se ovde koristi, "antisens aktivnost" označava svaku detektabilnu i/ili merljivu promenu koja se može pripisati hibridizaciji antisens jedinjenja sa svojom ciljnom nukleinskom kiselinom.U nekim primerima izvođenja, antisens aktivnost je smanjenje količine ili ekspresije ciljne nukleinske kiseline ili proteina kodiranog takvom ciljnom nukleinskom kiselinom u poređenju sa nivoom ciljne nukleinske kiseline ili nivoom ciljnog proteina u odsustvu antisens jedinjenja.
[0024] Kao što se ovde koristi, "antisens jedinjenje" označava oligomerno jedinjenje ili oligomerni dupleks koji je u stanju da ostvari najmanje jednu antisens aktivnost.
[0025] Kao što se ovde koristi, "poboljšati", u vezi sa lečenjem, označava poboljšanje najmanje jednog simptoma u odnosu na isti simptom u odsustvu tretmana.U nekim primerima izvođenja, poboljšanje je smanjenje ozbiljnosti ili učestalosti simptoma ili odloženi početak ili usporavanje progresije u smislu ozbiljnosti ili učestalosti simptoma.U nekim primerima izvođenja simptom je gubitak pamćenja, gubitak motoričke funkcijeili povećanje broja i/ili zapremine neurofibrilarnih inkluzija.U nekim slučajevima, poboljšanje ovih simptoma rezultira održavanjem ili poboljšanjem pamćenja, održavanjem ili poboljšanjem motoričke funkcije, i/ili održavanjem ili smanjenjem broja i/ili zapremine neurofibrilarnih inkluzija.
[0026] Kao što se ovde koristi, "najmanje jedan simptom neurodegenerativne bolesti" uključuje gubitak pamćenja, gubitak motoričke funkcije ili povećanje broja i/ili zapremine neurofibrilarnih inkluzija.
[0027] Kao što se ovde koristi, "biciklični nukleozid" ili "BNA" označava nukleozid koji sadrži komponentu bicikličnog šećera.Kao što se ovde koristi, "biciklični šećer" ili "komponenta bicikličnog šećera" modifikovanu komponentu šećera koja sadrži dva prstena, pri čemu se drugi prsten formira preko mosta koji povezuje dva od atoma u prvom prstenu i tako formira bicikličnu strukturu.U nekim primerima izvođenja, prvi prsten biciklične šećerne komponente je furanozil komponenta.U nekim primerima izvođenja, biciklična komponenta šećera ne sadrži furanozil komponentu.
[0028] Kao što se ovde koristi, "hiralno obogaćena populacija" označava mnoštvo molekula identične molekulske formule, gde je broj ili procenat molekula unutar populacije koji sadrže određenu stereohemijsku konfiguraciju na određenom hiralnom centru veći od broja ili procenta molekula za koje se očekuje da sadrže istu određenu stereohemijsku konfiguraciju na istom određenom hiralnom centru unutar populacije u kojoj bi određeni hiralni centar imao slučajnu orjentaciju.Hiralno obogaćena populacija molekula koji imaju više hiralnih centara unutar svakog molekula može da sadrži jedan ili više hiralnih centara sa slučajnom orijentacijom.U nekim primerima izvođenja molekuli su modifikovani oligonukleotidi.U nekim primerima izvođenja molekuli su jedinjenja koja sadrže modifikovane oligonukleotide.
[0029] Kao što se ovde koristi, "odvojiva komponenta" označava vezu ili grupu atoma koji se odvajaju pod fiziološkim uslovima, na primer, unutar ćelije, životinje ili čoveka.
[0030] Kao što se ovde koristi, "komplementarno" u vezi sa oligonukleotidom znači da je najmanje 70% nukleobaza u oligonukleotidu ili jednom ili više njegovih regiona i nukleobaza u drugoj nukleinskoj kiselini ili jednom ili više njenih regiona u stanju da se povežu jedna sa drugom vodoničnom vezom, kada se sekvenca nukleobaza u oligonukleotidu i u drugoj nukleinskoj kiselini poravnaju u suprotnim smerovima.Komplementarne nukleobaze označavaju nukleobaze koje su u stanju da formiraju vodonične veze jedna sa drugom.Komplementarni parovi nukleobaza uključuju adenin (A) i timin (T), adenin (A) i uracil (U), citozin (C) i guanin (G), 5-metilcitozin (mC) i guanin (G).Komplementarni oligonukleotidi i/ili nukleinske kiseline ne moraju da imaju komplementarnost nukleobaza na svakom nukleozidu.Umesto toga, određen broj pogrešnih sparivanja se toleriše.Kao što se ovde koristi, "potpuno komplementarni" ili "100% komplementarni" u vezi sa oligonukleotidima znači da su oligonukleotidi komplementarni sa drugim oligonukleotidom ili nukleinskom kiselinom na svakom nukleozidu u oligonukleotidu.
[0031] Kao što se ovde koristi, "konjugovana grupa" grupu atoma koji su direktno ili indirektno prikačeni na oligonukleotid.Konjugovane grupe uključuju konjugovanu komponentu i linker za kojugaciju koji povezuje konjugovanu komponentu sa oligonukleotidom.
[0032] Kao što se ovde koristi, "linker za konjugaciju" označava grupu atoma koji sadrže najmanje jednu vezu koja povezuje konjugovanu komponentu sa oligonukleotidom.
[0033] Kao što se ovde koristi, "konjugovana komponenta" označava grupu atoma koji se vezuju za oligonukleotid preko linkera za konjugaciju.
[0034] Kao što se ovde koristi, "kontinuirani" u kontekstu oligonukleotida odnosi se na nukleozide, nukleobaze, šećerne komponente ili internukleozidne veze koje su neposredno susedne jedna drugoj.Na primer, "kontinuirane nukleobaze" označava nukleobaze koje su neposredno susedne jedna drugoj u sekvenci.
[0035] Kao što se ovde koristi, "gapmer" označava modifikovani oligonukleotid koji se sastoji od unutrašnjeg regiona koji ima veći broj nukleozida koji podržava cepanje RNazom H pozicionirano između spoljašnjih regiona sačinjenih od jednog ili više nukleotida, pri čemu su nukleozidi koji sačinjavaju unutrašnji region hemijski razlikuje od jednog ili više nukleozida koji sačinjavaju spoljašnje regione.Unutrašnji region može da se označava kao "praznina", a spoljašnji regioni mogu da se označavaju kao "krila".Osim ako nije drugačije naznačeno, "gapmer" se odnosi na motiv šećera.Osim ako nije drugačije naznačeno, šećerne komponte nukleozida u praznini gapmera su nemodifikovani 2'-dezoksifuranozili.Stoga, izraz "MOE gapmer" označava gapmer koji ima motiv šećera od 2'-MOE nukleozida u oba krila i prazninu od 2'-dezoksinukleozida.Osim ako nije drugačije naznačeno, MOE gapmer može da sadrži jednu ili više modifikovanih internukleozidnih veza i/ili modifikovanih nukleobaza i ove modifikacije ne prate nužno obrazac modifikacija šećera u gapmeru.
[0036] Kao što se ovde koristi, "hibridizacija" označava sparivanje ili aniling komplementarnih oligonukleotida i/ili nukleinskih kiselina.Premda nije ograničen na određeni konkretni mehanizam, najčešći mehanizam hibridizacije uključuje vodonične veze, koje mogu da budu Watson-Crick, Hoogsteen ili reverzne Hoogsteen vodonične veze između komplementarnih nukleobaza.
[0037] Kao što se ovde koristi, termin "internukleozidna veza" je kovalentna veza između susednih nukleozida u oligonukleotidu.Kao što se ovde koristi, "modifikovana internukleozidna veza" označava bilo koju internukleozidnu vezu koja nije fosfodiestarska internukleozidna veza."Fosforotioatna veza" je modifikovana internukleozidna veza u kojoj se jedan od atoma kiseonika fosfodiestarske internukleozidne veze, koji ne formira most, zamenjuje atomom sumpora.
[0038] Kao što se ovde koristi, "linker-nukleozid" označava nukleozid koji povezuje, bilo direktno ili indirektno, oligonukleotid sa konjugovanom komponentom.Linker-nukleozidi se nalaze u okviru linkera za konjugaciju u oligomernom jedinjenju.Linker-nukleozidi se ne smatraju delom oligonukleotidnog dela oligomernog jedinjenja čak i ako su u kontinuitetu sa oligonukleotidom.
[0039] Kao što se ovde koristi, "ne-biciklična modifikovana komponenta šećera" označava modifikovanu komponentu šećera koja sadrži modifikaciju, kao što je supstituent, koja ne formira most između dva atoma šećera kako bi se formirao drugi prsten.
[0040] Kao što se ovde koristi, "pogrešno sparivanje" ili "nekomplementarno" označava nukleobazu prvog oligonukleotide koja nije komplementarna sa odgovarajućom nukleobazom drugog oligonukleotida ili ciljne nukleinske kiseline, kada se prvo i drugo oligomerno jedinjenje poravnaju.
[0041] Kao što se ovde koristi, "MOE" označava metoksi etil. "2'-MOE" označava -OCH2CH2OCH3grupu na 2' poziciji furanozil prstena.
[0042] Kao što se ovde koristi, "motiv" označava obrazac nemodifikovanih i/ili modifikovanih šećernih komponenti, nukleobaza i/ili internukleozidnih veza u oligonukleotidu.
[0043] Kao što se ovde koristi, "iRNK" označava RNK transkript koji kodira protein i uključuje pre-iRNK i zrelu iRNK, osim ako nije drugačije navedeno.
[0044] Kao što se ovde koristi, "nukleobaza" označava nemodifikovanu nukleobazu ili modifikovanu nukleobazu.Kao što se ovde koristi "nemodifikovana nukleobaza" je adenin (A), timin (T), citozin (C), uracil (U) i guanin (G).Kao što se ovde koristi, "modifikovana nukleobaza" je grupa atoma koja nije nemodifikovani A, T, C, U ili G i koja je sposobna da se spari sa najmanje jednom nemodifikovanom nukleobazom."5-metilcitozin" je modifikovana nukleobaza.Univerzalna baza je modifikovana nukleobaza koja može da se spari sa bilo kojom od pet nemodifikovanih nukleobaza.Kao što se ovde koristi, "sekvenca nukleobaza" označava redosled kontinuiranih nukleobaza u nukleinskoj kiselini ili oligonukleotidu nezavisno od bilo koje modifikacije šećera ili internukleozidne veze.
[0045] Kao što se ovde koristi, "nukleozid" označava jedinjenje koje sadrži nukleobazu i komponentu šećera.Nukleobaza i komponenta šećera su svaka nezavisno, nemodifikovane ili modifikovane.Kao što se ovde koristi, "modifikovani nukleozid" označava nukleozid koji sadrži modifikovanu nukleobazu i/ili modifikovanu komponentu šećera.Modifikovane nukleozidi uključuju abazne nukleozide koji nemaju nukleobazu."Povezani nukleozidi" su nukleozidi koji su povezani u kontinuiranu sekvencu (npr. između nukleozida koji su povezani nisu prisutni dodatni nukleozidi).
[0046] Kao što se ovde koristi, "oligomerno jedinjenje" označava oligonukleotid i opciono jednu ili više dodatnih funkcija, kao što su konjugovana grupa ili terminalna grupa.Oligomerno jedinjenje može da bude spareno sa drugim oligomernim jedinjenjem koje je komplementarno sa prvim oligomernim jedinjenjem ili može da bude nespareno."Jednolančano oligomerno jedinjenje" je nespareno oligomerno jedinjenje.Termin "oligomerni dupleks" označava dupleks formiran od strane dva oligomerna jedinjenja koja imaju komplementarne sekvence nukleobaza.Svako oligomerno jedinjenje oligomernog dupleksa može da se označava kao "dupleksno oligomerno jedinjenje".
[0047] Kao što se ovde koristi, "oligonukleotid" označava lanac povezanih nukleozida koji su povezani internukleozidnima vezama, gde svaki nukleozid i internukleozidna veza mogu da budu modifikovani ili nemodifikovani.Osim ako nije drugačije naznačeno, oligonukleotidi sadrže 8-50 povezanih nukleozida.Kao što se ovde koristi, "modifikovani oligonukleotid" označava oligonukleotid, gde je modifikovana najmanje jedna nukleozid ili internukleozidna veza.Kao što se ovde koristi, "nemodifikovani oligonukleotid" označava oligonukleotid koji ne sadrži nikakve nukleozidne modifikacije ili internukleozidne modifikacije.
[0048] Kao što se ovde koristi, "farmaceutski prihvatljiv nosač ili razblaživač" označava bilo koju supstancu pogodnu za upotrebu pri primeni kod životinje. Neki od ovih nosača omogućavaju da se farmaceutske kompozicije formulišu kao, na primer, tablete, pilule, dražeje, kapsule, tečnosti, gelovi, sirupi, emulzije, suspenzije i lozenge za oralno unošenje od strane subjekta.U nekim primerima izvođenja, farmaceutski prihvatljiv nosač ili razblaživač je sterilna voda; sterilni fiziološki rastvor; ili sterilni puferski rastvor.
[0049] Kao što se ovde koristi, "farmaceutski prihvatljiva so" označava fiziološki i farmaceutski prihvatljive soli jedinjenja, kao što su oligomerna jedinjenja, tj. soli koje zadržavaju željenu biološku aktivnost matičnog jedinjenja i ne dodaju im neželjene toksikološke efekte.
[0050] Kao što se ovde koristi "Farmaceutska kompozicija" označava mešavinu supstanci pogodnih za primenu kod subjekta.Na primer, Farmaceutska kompozicija može da sadrži antisens jedinjenje i sterilni vodeni rastvor.U nekim primerima izvođenja, Farmaceutska kompozicija pokazuje aktivnost u testu slodnog preuzimanja u nekim ćelijskim linijama.
[0051] Kao što se ovde koristi, "fosforna komponenta" označava grupu atoma koja sadrži atom fosfora.U nekim primerima izvođenja, fosforna komponenta obuhvata mono-, di-, ili tri-fosfat, ili fosforotioat.
[0052] Kao što se ovde koristi, "prolek" označava terapeutski agens koji je u određenom obliku izvan tela i koji se konvertuje u različit oblik unutar životinje ili njenih ćelija.Obično je konverzija proleka unutar životinje olakšana delovanjem enzima (npr. endogenog ili virusnog enzima) ili hemikalija prisutnih u ćelijama ili tkivima, i/ili fiziološkim stanjima.
[0053] Kao što se ovde koristi, "smanjenje ili inhibicija količine ili aktivnosti" odnosi se na smanjenje ili blokiranje transkripcione ekspresije ili aktivnosti u odnosu na transkripcionu ekspresiju ili aktivnost u netretiranom ili kontrolnom uzorku, i ne ukazuje nužno na potpunu eliminaciju transkripcione ekspresije ili aktivnosti.
[0054] Kao što se ovde koristi, "RNAi jedinjenje" označava antisens jedinjenje koje deluje, najmanje delom, preko RISC ili Ago2 kako bi se modulisalo ciljnu nukleinsku kiselinu i/ili protein kodiran ciljnom nukleinom kiselinom.RNAi jedinjenja uključuju, ali nisu ograničena na dvolančanu siRNA, jednolančanu RNK (ssRNA) i microRNA, uključujući microRNA mimetike.U nekim primerima izvođenja, RNAi jedinjenje modulira količinu, aktivnost i/ili splajsovanje ciljne nukleinske kiseline.Termin RNAi jedinjenje isključuje antisens jedinjenja koja deluju preko RNaze H.
[0055] Kao što se ovde koristi, "autokomplementarni" u vezi sa oligonukleotidom označava oligonukleotid koji se najmanje delimično hibridizuje sam sa sebom.
[0056] Kao što se ovde koristi, "standardni ćelijski test" označava test opisan u primeru 1 i njegove smislene varijacije.
[0057] Kao što se ovde koristi, "stereohemijski nasumičan hiralni centar" u kontekstu populacije molekula identične molekulske formule označava hiralni centar koji ima nasumičnu stereohemijsku konfiguraciju.Na primer, u populaciji molekula koji sadrže stereohemijski nasumičan hiralni centar, broj molekula koji imaju (S) konfiguraciju na stereohemijski nasumičnom hiralnom centru može da bude, ali nije nužno isti kao i broj molekula koji imaju (R) konfiguraciju na stereohemijski nasumičnom hiralnom centru.Stereohemijska konfiguracija hiralnog centra smatra se nasumičnom kada je rezultat sintetičkog postupka koji nije dizajniran tako da kontroliše stereohemijsku konfiguraciju.U nekim primerima izvođenja, sterehemijski nasumični hiralni centar je sterehemijski nasumična fosforotioatna internukleozidna veza.
[0058] Kao što se ovde koristi, "šećerna komponenta" označava nemodifikovanu komponentu šećera ili modifikovanu komponentu šećera.Kao što se ovde koristi, "nemodifikovana komponenta šećera" označava 2'-OH(H) furanozil komponentu kakva se nalazi u RNK ("nemodifikovana RNK šećerna komponenta"), ili 2'-H(H) komponentu kakva se nalazi u DNK ("nemodifikovana DNK šećerna komponenta").Nemodifikovane komponente šećera imaju po jedan vodonik na svakoj od pozicija 1', 3' i 4', kiseonik na poziciji 3' i dva vodonika na poziciji 5'.Kao što se ovde koristi, "modifikovana komponenta šećera" ili "modifikovani šećer" označava modifikovanu furanozil komponentu šećera ili surogata šećera.Kao što se ovde koristi, modifikovana šećerna furanozil komponenta označava furanozil šećer koji sadrži ne-vodonični supstituent umesto najmanje jednog vodonika u nemodifikovanoj šećernoj komponenti.U nekim primerima izvođenja, modifikovana furanozil komponenta šećera je 2'- supstituisana šećerna komponenta.Ovakve modifikovane furanozil šećerne komponente uključuju biciklične šećere i ne-biciklične šećere.
[0059] Kao što se ovde koristi, "surogat šećera" označava modifikovanu komponentu šećera koja ima komponentu koja nije furanozil komponenta i koja može da poveže nukleobazu sa drugom grupom, kao što je internukleozidna veza, konjugovana grupa ili terminalna grupa u oligonukleotidu.Modifikovane nukleozidi koji sadrže šećerne surogate mogu da se ugrade na jednoj ili više pozicija unutar oligonukleotida i takvi oligonukleotidi su u stanju da se hibridizuju sa komplementarnim oligomernim jedinjenjima ili nukleinskim kiselinama.
[0060] Kao što se ovde koristi, "ciljna nukleinska kiselina" i "ciljna RNK" označavaju nukleinsku kiselinu, gde je antisens jedinjenje dizajnirano tako da deluje na nju.
[0061] Kao što se ovde koristi, "ciljni region" označava deo ciljne nukleinske kiseline, gde je oligomerno jedinjenje dizajnirano tako da se hibridizuje sa tim delom.
[0062] Kao što se ovde koristi, "terminalna grupa" označava hemijsku grupu ili grupu atoma koja je kovalentno povezana sa terminusom oligonukleotida.
[0063] Kao što se ovde koristi, "terapeutski efikasna količina" označava količinu farmaceutskog agensa koja obezbeđuje terapeutsku korist za životinju. Na primer, terapeutski efikasna količina poboljšava simptom bolesti.
I. Neki oligonukleotidi
[0064] U nekim primerima izvođenja, ovde su obezbeđeni oligonukleotidi koji sadrže povezanih nukleozida.Oligonukleotidi mogu da budu nemodifikovani oligonukleotidi (RNK ili DNK) ili mogu da budu modifikovani oligonukleotidi.Modifikovani oligonukleotidi sadrže najmanje jednu modifikaciju u odnosu na nemodifikovanu RNK ili DNK.Odnosno, modifikovani oligonukleotidi sadrže najmanje jedan modifikovani nukleozid (koji sadrži modifikovanu komponentu šećera i/ili modifikovanu nukleobazu) i/ili najmanje jednu modifikovanu internukleozidnu vezu.
A. Neki modifikovani nukleozidi
[0065] Modifikovani nukleozidi sadrže modifikovanu komponentu šećera ili modifikovanu nukleobazu ili i modifikovanu komponentu šećera i modifikovanu nukleobazu.
1. Neke šećerne komponente
[0066] U nekim primerima izvođenja, modifikovane šećerne komponente su ne-biciklične modifikovane šećerne komponente.U nekim slučajevima, modifikovane šećerne komponente su biciklične ili triciklične šećerne komponente.U nekim slučajevima, modifikovane šećerne komponente su surogati šećera.Ovi surogati šećera mogu da sadrže jednu ili više supstitucija koje odgovaraju supstitucijama drugih vrsta modifikovanih šećernih komponenti.
[0067] U nekim primerima izvođenja, modifikovane šećerne komponente su ne-biciklične modifikovane šećerne komponente koje sadrže furanozil prsten sa jednom ili više supstituentnih grupa od kojih nijedna ne formira most između dva atoma furanozil prstena kako bi se formirala biciklična struktura.Ovakvi supstituenti koji ne formiraju most mogu da budu na bilo kojoj poziciji furanozila, uključujući, ali ne i ograničeno na, supstituente na pozicijama od 2', 4' i/ili 5'.U nekim slučajevima jedan ili više supstituenata na ne-bicikličnim modifikovanim šećernim komponentama su razgranati.Primeri 2'-supstituentih grupa koje su pogodne za ne-biciklične modifikovane šećerne komponente uključuju ali nisu ograničeni na: 2'-F, 2'- OCH3("OMe" ili "O-metil") i 2'-O(CH2)2OCH3("MOE").U nekim primerima, 2'-supstituentne grupe su izabrane od: halo, alil, amino, azido, SH, CN, OCN, CF3, OCF3, O-C1-C10alkoksi, O-C1-C10supstituisani alkoksi, O-C1-C10alkil, O-C1-C10supstituisani alkil, S-alkil, N(Rm)-alkil, O-alkenil, S-alkenil, N(Rm)-alkenil, O-alkinil, S-alkinil, N(Rm)-alkinil, O-alkilenil-O-alkil, alkinil, alkaril, aralkil, O-alkaril, O-aralkil, O(CH2)2SCH3,O(CH2)2ON(Rm)(Rn) ili OCH2C(=O)-N(Rm)(Rn), gde je svaki Rmi Rn, nezavisno, H, amino protektivna grupa koja štiti, ili supstituisani ili nesupstituisani C1-C10alkil, i 2'- supstituentne grupe opisane u Cook et al., SAD 6.531.584; Cook et al., SAD 5.859.221; i Cook et al., SAD 6.005.087.Neki primeri ovih 2'-supstituentnih grupa mogu dodatno da se supstituišu sa jednim ili više supstituentnih grupa nezavisno izabranim od: hidroksila, amina, alkoksi, karboksi, benzil, fenil, nitro (NO2), tilo, tioalkoksi, tioalkila, halogena, alkila, arila, alkenila i alkinila.Primeri 4'-supstituentih grupa koje su pogodne za ne-biciklične modifikovane šećerne komponente uključuju, ali nisu ograničeni na, alkoksi (nmp., metoksi), alkil, i grupe opisane u publikaciji Manoharan et al., WO 2015/106128. Primeri 5'-supstituentih grupa koje su pogodne za ne-biciklične modifikovane šećerne komponente uključuju, ali nisu ograničeni na: 5'-metil (R ili S), 5'- vinil i 5'-metoksi.U nekim slučajevima, ne-biciklični modifikovani šećerni hidrati sadrže više od jedne zamene šećera koji se ne premošćava, na primer, 2'-F-5'-metil šećerne komponente i modifikovane komponenti šećera i modifikovane nukleozidi opisane u Migawa et al., WO 2008/101157 i Rajeev et al., US2013/0203836.).
[0068] U nekim slučajevima, 2'-supstituisani ne-biciklični modifikovani nukleozid sadrži šećernu komponentu koja sadrži 2'-supstituentnu grupu koja ne formira most, izabranu od: F, NH2, N3, OCF3, OCH3, O(CH2)3NH2, CH2CH=CH2, OCH2CH=CH2, OCH2CH2OCH3, O(CH2)2SCH3, O(CH2)2ON(Rm)(Rn), O(CH2)2O(CH2)2N(CH3)2, i N-supstituisani acetamid (OCH2C(=O)-N(Rm)(Rn)), gde je svaki Rmi Rn, nezavisno, H, amino protektivna grupa ili supstituisani ili nesupstituisani C1-C10alkil.
[0069] U nekim slučajevima, 2'-supstituisani nukleozid, ne-biciklični modifikovani nukleozid, sadrži šećernu komponentu koja sadrži 2'-supstituentnu grupu koja ne formira most, izabranu od: F, OCF3, OCH3, OCH2CH2OCH3, O(CH2)2SCH3, O(CH2)2ON(CH3)2, O(CH2)2O(CH2)2N(CH3)2i OCH2C(=O)-N(H)CH3("NMA").
[0070] U nekim slučajevima, 2'-supstituisani nukleozid, ne-biciklični modifikovani nukleozid sadrži šećernu komponentu koja sadrži 2'-supstituentnu grupu koja ne formira most, izabranu od: F, OCH3i OCH2CH2OCH3.
[0071] Određene modifikovane šećerne komponente sadrže supstituent koji premošćuje dva atoma u furanozil prstenu kako bi se formirao drugi prsten, što rezultira bicikličnom šećernom komponentom.U nekim ovakvim slučajevima, biciklična komponenta šećera sadrži most između 4' i 2' atoma furanoznog prstena.Primeri takvih 4' do 2' premošćujućih šećernih supstituenata uključuju, ali nisu ograničeni na: 4'-CH2-2', 4'-(CH2)2-2', 4'-(CH2)3-2', 4'-CH2-O-2' ("LNA"), 4'-CH2-S-2', 4'-(CH2)2-O-2' ("ENA"), 4'-CH(CH3)-O-2' (naziva se "ograničeni etil" ili "cEt"), 4'-CH2- O-CH2-2', 4'-CH2-N(R)-2', 4'-CH(CH2OCH3)-O-2' ("ograničeni MOE" ili "cMOE") i njihove analoge (videti, npr., Seth et al., U.S.7,399,845, Bhat et al., U.S.7,569,686, Swayze et al., U.S. 7,741,457, i Swayze et al., U.S.8,022,193), 4'-C(CH3)(CH3)-O-2' i njegove analoge (videti, npr., Seth et al., U.S.8,278,283), 4'- CH2-N(OCH3)-2' i njegove analoge (videti, npr., Prakash et al., U.S.8,278,425), 4'-CH2-O-N(CH3)-2' (videti, npr., Allerson et al., U.S.7,696,345 i Allerson et al., U.S. 8,124,745), 4'-CH2-C(H)(CH3)-2' (videti, npr. Zhou, et al., J. Org. Chem.,2009, 74, 118-134), 4'-CH2-C(=CH2)-2' i njegove analoge (videti npr., Seth et al., U.S. 8,278,426), 4'-C(RaRb)-N(R)-O-2', 4'-C(RaRb)-O-N(R)-2', 4'-CH2-O-N(R)-2', i 4'-CH2-N(R)-O-2', gde je svaki R, Ra,i Rb, nezavisno, H, protektivna grupa ili C1-C12alkil (videti, npr.Imanishi et al., U.S.
7.427.672).
[0072] U nekim slučajevima, takvi mostovi od 4' do 2' nezavisno sadrže 1 do 4 povezane grupe nezavisno odabrane iz: -[C(Ra)(Rb)]n-, -[C(Ra)(Rb)]n-O-, -C(Ra)=C(Rb)-, -C(Ra)=N-, -C(=NRa)-, - C(=O)-, -C(=S)-, -O-, -Si(Ra)2-, -S(=O)X-, i -N(Ra)-;
gde:
x je 0, 1 ili 2;
n je 1, 2, 3 ili 4;
svaki Rai Rbje , nezavisno, H, grupa za zaštitu, hidroksil, C1-C12alkil, zamenjen C1-C12alkil, C2-C12alkenil, zamenjen C2-C12alkenil, C2-C12alkinil, zamenjen C2-C12alkinil, C5-C20aril, zamenjen C5-C20aril, heterocikl radikal, zamenjen heterocikl radikalnim, heteroarilnim, zamenjenim heteroarilom, C5-C7alicikličnim radikalom, zamenjenim C5-C7alicikličnim radikalnim, halogenim,OJ1, NJ1J2, SJ1, N3, COOJ1, acyl (C(=O)- H), zamenjeni acil, CN, sulfonil (S(=O)2-J1) ili sulfoksil (S(=O)-J1); I
svaki J1i J2je, nezavisno, H, C1-C12alkil, supstituisani C1-C12alkil, C2-C12alkenil, supstituisani C2-C12alkenil, C2-C12alkinil, supstituisani C2-C12alkinil, C5-C20aril, supstituisani C5-C20aril, acyl (C(=O)- H), supstituisani acilom, heterocikl radikal, supstituisani heterocikl radikal, C1-C12aminoalkil, supstituisani C1-C12aminoalkil, ili protektivna grupa,
[0073] Dodatne biciklične šećerne komponente su poznate u stanju tehnike, videti, na primer: Freier et al., Nucleic Acids Research, 1997, 25(22), 4429-4443, Albaek et al., J. Org. Chem., 2006, 71, 7731-7740, Singh et al., Chem. Commun., 1998, 4, 455-456; Koshkin et al., Tetrahedron, 1998, 54, 3607-3630; Kumar et al., Bioorg. Med. Chem. Lett., 1998,8, 2219-2222; Singh et al., J. Org. Chem., 1998,63, 10035-10039; Srivastava et al., J. Am. Chem. Soc., 20017,129, 8362-8379; Wengel et a., SAD 7.053.207; Imanishi et al., SAD 6.268.490; Imanishi et al. SAD 6.770.748; Imanishi et al., U.S. RE44,779; Wengel et al., SAD 6.794.499; Wengel et al., SAD 6.670.461; Wengel et al., SAD 7.034.133; Wengel et al., SAD 8.080.644; Wengel et al., SAD 8.034.909; Wengel et al., SAD 8.153.365; Wengel et al., SAD 7.572.582; i Ramasamy et al., SAD 6.525.191;; Torsten et al., WO 2004/106356; Wengel et al., WO 1999/014226; Seth et al., WO 2007/134181; Seth et al., SAD 7.547.684; Seth et al., SAD 7.666.854; Seth et al., SAD 8.088.746; Seth et al., SAD 7.750.131; Seth et al., SAD 8.030.467; Seth et al., SAD 8.268.980; Seth et al., SAD 8.546.556; Seth et al., SAD 8.530.640; Migawa et al., SAD 9.012.421; Seth et al., SAD 8.501.805; i U.S. Patent Publication Nos. Allerson et al., US2008/0039618 and Migawa et al., US2015/0191727.
[0074] U nekim slučajevima, biciklične šećerne komponente i nukleozidi u koje su ugrađene ove biciklične šećerne komponente, dodatno su definisane izomernom konfiguracijom.Na primer, LNA nukleozid (opisan ovde) može da bude u α-L konfiguraciji ili u β-D konfiguraciji.
LNA (β-D-konfiguracija) α-L-LNA (α-L-konfiguracija)
most = 4'-CH2-O-2' most = 4'-CH2-O-2'
α-L-metilenoksi (4'-CH2-O-2') ili α-L-LNA biciklični nukleozidi su ugrađeni u oligonukleotide koji su pokazali antisens aktivnost (Frieden et al., Nucleic Acids Research, 2003, 21, 6365- 6372).Ovde opšti opisi bicikličnih nukleozida uključuju obe izomerne konfiguracije.Kada su pozicije specifičnih bicikličnih nukleozida (npr. LNA ili cEt) identifikovane u tipičnim ovde navedenim slučajevima, one se nalaze u β-D konfiguraciji, osim ako nije drugačije navedeno.
[0075] U nekim slučajevima, modifikovane šećerne komponente sadrže jedan ili više nepremošćujućih šećernih supstituenata i jedan ili više premošćujućih šećernih supstituenata (npr.
5'-supstituisani i 4'-2' premošćeni šećeri).
[0076] U nekim slučajevima, modifikovane šećerne komponente su surogati šećera.U nekim takvim slučajevima, atom kiseonika komponente šećera se zamenjuje, npr., atomom sumpora, ugljenika ili azota.U nekim takvim slučajevima, ove modifikovane šećerne komponente takođe sadrže premošćujuće i/ili nepremošćujuće supstituente, kao što je ovde opisano.Na primer, neki surogati šećera sadrže atom 4'-sumpora i supstituciju na 2'-poziciji (videti, npr. Bhat et al., U.S. 7,875,733 i Bhat et al., U.S.7,939,677) i/ili 5' poziciji.
[0077] U nekim slučajevima, surogati šećera sadrže prstenove koji imaju broj atoma različit od 5.Na primer, u nekim slučajevima, šećerni surogat sadrži šestočlani tetrahidropiran ("THP").Ovi tetrahidropirani mogu da budu dodatno modifikovani ili supstituisani.Nukleozidi koji sadrže tako modifikovane tetrahidropirane uključuju, ali nisu ograničene na, heksitolnu nukleinsku kiselinu ("HNA"), anitolnu nukleinsku kiselinu ("ANA"), manitolnu nukleinsku kiselinu ("MNA") (vidi, npr . Leumann, CJ. Bioorg. & Med. Chem. 2002,10, 841-854), fluoro HNA:
F-HNA
("F-HNA ", videti npr.Swayze et al., U.S.8,088,904; Swayze et al., U.S.8,440,803; Swayze et al., U.S.8,796,437; i Swayze et al., U.S.9,005,906; F-HNA može da se označava i kao F-THP ili 3'-fluoro tetrahidropiran), i nukleozidi koji sadrže dodatna modifikovana THP jedinjenja koja imaju formulu:
gde, nezavisno, za svaki od navedenih modifikovanih THP nukleozida:
Bx je komponenta nukleobaze;
T3i T4su, svaki nezavisno, internukleozidne povezujuće grupe koje povezuju modifikovani THP nukleozid sa ostatkom oligonukleotida, ili je jedan od T3i T4internukleozidna povezujuća grupa koja povezuje modifikovani THP nukleozid sa ostatkom oligonukleotida, a drugi od T3i T4je H, hidroksilna protektivna grupa, povezujuća konjugovana grupa ili 5' ili 3'-terminalna grupa;
q1, q2, q3, q4, q5, q6i q7su svaki, nezavisno, H, C1-C6alkil, supstituisani C1-C6alkil, C2-C6alkenil, supstituisani C2-C6alkenil, C2-C6alkinil ili supstituisani C2-C6alkinil; i
svaki od R1i R2je nezavisno izabran od: vodonika, halogena, supstituisanog ili nesupstituisanog alkoksi, NJ1J2, SJ1, N3, OC(=X)J1, OC(=X)NJ1J2, NJ3C(=X)NJ1J2, i CN, gde je X O, S ili NJ1, i svaki od J1, J2i J3je, nezavisno, H ili C1-C6alkil.
[0078] U nekim slučajevima, obezbeđeni su modifikovani THP nukleozidi u kojima, svaki q1, q2, q3, q4, q5, q6i q7je H. U nekim slučajevima, najmanje jedan od q1, q2, q3, q4, q5, q6i q7je različit od H. U nekim slučajevima, bar jedan od q1, q2, q3, q4, q5, q6i q7je metil.U nekim slučajevima, obezbeđeni su modifikovani THP nukleozidi u kojima, jedan od R1i R2je F. U nekim slučajevima, R1je F, a R2je H, u nekim slučajevima, R1je metoksi, a R2H, i, u nekim slučajevima, R1je metoksietoksi, a R2je H.
[0079] U nekim slučajevima, surogati šećera sadrže prstenove koji imaju više od 5 atoma i više od jednog heteroatoma.Na primer, zabeleženi su nukleozidi koji sadrže morfolino šećerne komponente i njihova upotreba u oligonukleotidima (videti, npr. Braasch et al., Biochemistry, 2002, 41, 4503-4510 i Summerton et al., U.S. 5,698,685; Summerton et al., U.S. 5,166,315; Summerton et al., U.S. 5,185,444; i Summerton et al., U.S. 5,034,506).Kao što se ovde koristi, termin "morfolino" označava surogat šećera koji ima sledeću strukturu:
U nekim slučajevima, morfolino mogu da budu modifikovani, na primer dodavanjem ili menjanjem različitih supstituentnih grupa iz gore navedene morfolino strukture.Ovi surogati šećera ovde se označavaju kao "modifikovani morfolino".
[0080] U nekim slučajevima, surogati šećera sadrže aciklične komponente.Primeri nukleozida i oligonukleotida koji sadrže ovakve aciklične šećerne surogate uključuju, ali nisu ograničeni na: peptidnu nukleinsku kiselinu ("PNA"), acikličnu butil nukleinsku kiselinu (videti, npr., Kumar et al., Org. Biomol. Chem., 2013, 11, 5853-5865), i nukleozide i oligonukleotide opisane u Manoharan et al., WO2011/133876.
[0081] U stanju tehnike su poznati mnogi drugi biciklični i triciklični sistemi šećera i šećernih surogata sa prstenovima, koji mogu da se koriste u modifikovanim nukleozidima).
2. Neke modifikovane nukleobaze
[0082] U nekim primerima izvođenja, modifikovani oligonukleotidi sadrže jedan ili više nukleozida koji sadrže nemodifikovanu nukleobazu.U nekim primerima izvođenja, modifikovani oligonukleotidi sadrže jedan ili više nukleozida koji sadrže modifikovanu nukleobazu.U nekim slučajevima, modifikovani oligonukleotidi sadrže jedan ili više nukleozida koji ne sadrže nukleobazu, i koji se označavaju kao abazni nukleozidi.
[0083] U nekim slučajevima, modifikovane nukleobaze su odabrane od: 5-supstituisanih pirimidina, 6-azapirimidina, alkil ili alkinil supstituisanih pirimidina, alkil supstituisanih purina i N-2, N-6 i O-6 supstituisanih purina.U nekim slučajevima, modifikovane nukleobaze su izabrane od: 2-aminopropiladenin, 5- hidroksimetilcitozin, ksantin, hipoksantin, 2-aminoadenin, 6-N-metilguanine, 6-N-metiladenin, 2-propiladenine , 2-tiouracil, 2-tiothymine i 2-tiocitozin, 5-propynyl i-CH uracil, 5- propynylcitozin, 6-azouracil, 6-azocitozin, 6-azothymine, 5-riboziluracil (pseudouracil), 4-tiouracil, 8- halo, 8-amino, 8-tiol, 8-tioalkil, 8-hidroksil, 8-aza i drugi 8-supstituisani purini, 5-halo naročito 5- bromo, 5-trifluorometil, 5-halouracil, i 5-halocitozin, 7-metilguanine, 7-metiladenin, 2-F-adenin, 2-aminoadenin, 7-deazaguanin, 7-deazaadenin, 3-deazaguanine, 3-deazaadenin, 6-N-benzoiladenine, 2- N-isobutyrylguanine, 4-N-benzoilcitozin, 4-N-benzoiluracil, 5-metil 4-N-benzoilcitozin, 5-metil 4-N- benzoiluracil, univerzalne baze, hidrofobne baze, promiskuitetne baze, baze šire veličine i fluorinirane baze.Dalje modifikovane nukleobaze uključuju triciklične pirimidine, kao što su l,3-diazafenoksazin-2-on, 1,3- diazaphenothiazine-2-on i 9-(2-aminoetoksi)-l,3-diazafenoksazin-2-on (G- klema). Modifikovane nukleobaze mogu da sadrže i one u kojima se baza purina ili pirimidina zamenjuje drugim heterociklima, na primer 7-deaza-adenine, 7-deazaguanozin, 2-aminopiridine i 2-piridin.Dodatne nukleobaze uključuju nukleobaze otkrivene u Merigan et al., U.S. 3,687,808, nukleobaze otkrivene u The Concise Encyclopedia Of Polymer Science And Engineering, Kroschwitz, J.I., Ed., John Wiley & Sons, 1990, 858- 859; Englisch et al., Angewandte Chemie, International Edition, 1991, 30, 613; Sanghvi, Y.S., Chapter 15, Antisense Research and Applications, Crooke, S. T. and Lebleu, B., Eds., CRC Press, 1993, 273-288; nukleobaze otkrivene u poglavljima 6 i 15, Antisense Drug Technology, Crooke S.T., Ed., CRC Press, 2008, 163- 166 and 442-443.
[0084] Publikacije koje daju uputstvo za pripremu nekih od prethodno pomenutih nukleobaza, kao i drugih modifikovanih nukleobaza, uključuju, bez ograničenja, Manohara et al., US2003/0158403; Manoharan et al., US2003/0175906; Dinh et al., U.S.4,845,205; Spielvogel et al., U.S.5,130,302; Rogers et al., U.S. 5,134,066; Bischofberger et al., U.S.5,175,273; Urdea et al., U.S.5,367,066; Benner et al., U.S.5,432,272; Matteucci et al., U.S.5,434,257; Gmeiner et al., U.S. 5,457,187; Cook et al., U.S.5,459,255; Froehler et al., U.S.5,484,908; Matteucci et al., U.S.
5,502,177; Hawkins et al., U.S.5,525,711; Haralambidis et al., U.S.5,552,540; Cook et al., U.S.
5,587,469; Froehler et al., U.S. 5,594,121; Switzer et al., U.S. 5,596,091; Cook et al., U.S.
5,614,617; Froehler et al., U.S. 5,645,985; Cook et al., U.S. 5,681,941; Cook et al., U.S.
5,811,534; Cook et al., U.S.5,750,692; Cook et al., U.S. 5,948,903; Cook et al., U.S.5,587,470; Cook et al., U.S.5,457,191; Matteucci et al., U.S.5,763,588; Froehler et al., U.S.5,830,653; Cook et al., U.S.5,808,027; Cook et al., 6,166,199; i Matteucci et al., U.S. 6,005,096.
3. Neke modifikovane internukleozidne veze
[0085] Nukleozidi modifikovanih oligonukleotida mogu da budu međusobno povezani pomoću bilo koje internukleozidne veze.Dve glavne klase internukleozidnih vezujućih grupa definisane su prisustvom ili odsustvom atoma fosfora.Reprezentativne internukleozidne veze koje sadrže fosfor uključuju, ali nisu ograničene na, fosfate, koje sadrže fosfodiestarsku vezu ("P=O") (koja se naziva i nemodifikovana ili prirodna veza), fosfotriestre, metilfosfonate, fosforamidate i fosforotioate ("P=S"), kao i fosforoditioate ("HS-P=S").Reprezentativne internukleozidne povezujuće grupe koje ne sadrže fosfor uključuju, ali nisu ograničene na metilenmetilimino (-CH2-N(CH3)-O-CH2-), tiodiestar, tionokarbamat (-O-C(=O)(NH)-S-); siloksan (-O-SiH2-O-); i N,N'-dimetilhidrazin (-CH2-N(CH3)- N(CH3)-).Modifikovane internukleozidne veze, u poređenju sa prirodnim fosfatnim vezama, mogu da se koriste da bi se izmenila, obično povećala, otpornosti oligonukleotida na nukleaze.Postupci pripreme internukleozidnih veza koje sadrže fosfor i koji ne sadrže fosfor dobro su poznati stručnjacima u oblasti.
[0086] Reprezentativne internukleozidne veze koje imaju hiralni centar uključuju, ali nisu ograničene na, alkilfosfonate i fosforotioate.Modifikovani oligonukleotidi koji sadrže internukleozidne veza koje imaju hiralni centar mogu se pripremiti kao populacije modifikovanih oligonukleotida koje sadrže stereohemijski nasumične internukleozidne veze, ili kao populacije modifikovanih oligonukleotida koji sadrže fosforotioatne veze u određenoj stereohemijskoj konfiguraciji.U nekim primerima izvođenja, populacije modifikovanih oligonukleotida sadrže fosforotioatne internukleozidne veze gde su sve fosforotioatne internukleozidne veze stereohemijski nasumične.Ovi modifikovani oligonukleotidi mogu da se generišu pomoću sintetičkih postupaka koji rezultiraju nasumičnom selekcijom stereohemijske konfiguracije svake fosforotioatne veze.Uprkos tome, kao što ga dobro razumeju stručnjaci u oblasti, svaki pojedinačni fosforotioat svakog pojedinačnog molekula oligonukleotida ima definisanu stereohemijsku konfiguraciju.U nekim primerima izvođenja, populacije modifikovanih oligonukleotida obogaćene su modifikovanim oligonukleotidima koji sadrže jednu ili više određenih fosforotioatnih internukleozidnih veza u određenoj, nezavisno odabranoj stereohemijskoj konfiguraciji.U nekim primerima izvođenja, određena konfiguracija određene fosforotioatne veze prisutna je u najmanje 65% molekula u populaciji.U nekim primerima izvođenja, određena konfiguracija određene fosforotioatne veze prisutna je u najmanje 70% molekula u populaciji.U nekim primerima izvođenja, određena konfiguracija određene fosforotioatne veze prisutna je u najmanje 80% molekula u populaciji.U nekim primerima izvođenja, određena konfiguracija određene fosforotioatne veze prisutna je u najmanje 90% molekula u populaciji.U nekim primerima izvođenja, određena konfiguracija određene fosforotioatne veze prisutna je u najmanje 99% molekula u populaciji.Takve hiralno obogaćene populacije modifikovanih oligonukleotida mogu dase generišu sintetičkim postupcima poznatim u stanju tehnike, npr., postupcima opisanim u Oka et al., JACS 125, 8307 (2003), Wan et al. Nuc. Acid. Res. 42, 13456 (2014), i WO 2017/015555.U nekim primerima izvođenja, populacija modifikovanih oligonukleotida obogaćena je modifikovanim oligonukleotidima koji imaju najmanje jedan naznačeni fosforotioat u (Sp) konfiguraciji.U nekim primerima izvođenja, populacija modifikovanih oligonukleotida obogaćena je modifikovanim oligonukleotidima koji imaju najmanje jedan naznačeni fosforotioat u (Rp) konfiguraciji.U nekim primerima izvođenja, modifikovani oligonukleotidi koji sadrže (Rp) i/ili (Sp) fosforotioate obuhvataju jednu ili više sledećih formula, redom, pri čemu "B" označava nukleobazu:
Osim ako nije drugačije naznačeno, hiralne internukleozidne veze modifikovanih oligonukleotida koji su ovde opisani mogu da budu stereohemijski nasumične ili u određenoj stereohemijskoj konfiguraciji.
[0087] Neutralne internukleozidna veze uključuju, bez ograničenja, fosfotriestre, metilfosfonate, MMI (3'-CH2-N(CH3)-O-5'), amid-3 (3'-CH2-C(=O)-N(H)-5'), amid-4 (3'-CH2-N(H)-C(=O)-5'), formacetal (3'-O-CH2-O-5'), metoksipropil i tioformacetal (3'-S-CH2-O-5').Dalje neutralne internukleozidne veze uključuju ne-jonske veze koje sadrže siloksane (dialkilsiloksan), karboksilat estar, karboksamid, sulfid, sulfonatni estar i amide (Videti na primer: Carbohydrate Modifications in Antisense Research; Y.S. Sanghvi and P.D. Cook, Eds., ACS Symposium Series 580; Chapters 3 and 4, 40-65).Dalje neutralne internukleozidne veze uključuju ne-jonske veze koje sadrže mešovite N, O, S i CH2delove komponenti.
B. Neki motivi
[0088] U nekim primerima izvođenja, modifikovani oligonukleotidi sadrže jedan ili više modifikovanih nukleozida koji sadrže modifikovanu komponentu šećera.U nekim primerima izvođenja, modifikovani oligonukleotidi sadrže jedan ili više modifikovanih nukleozida koji sadrže modifikovanu nukleobazu.U nekim primerima izvođenja, modifikovani oligonukleotidi sadrže jednu ili više modifikovanih internukleozidnih veza.U ovim primerima izvođenja, modifikovane, nemodifikovane i drugačije modifikovane šećerne komponente, nukleobaze i/ili internukleozidne veze modifikovanog oligonukleotida definišu obrazac ili motiv.U nekim primerima izvođenja, obrasci šećernih komponenti, nukleobaza i internukleozidnih veza su nezavisni jedni od drugih.Dakle, modifikovani oligonukleotid može da se opiše svojim motivom šećera, motivom nukleobaza i/ili motivom internukleozidnih veza (kao što se ovde koristi, motiv nukleobaze opisuje modifikacije nukleobaza nezavisno od sekvence nukleobaza).
1. Neki motivi šećera
[0089] U nekim primerima izvođenja, oligonukleotidi sadrže jednu ili više vrsta modifikovane šećerne i/ili nemodifikovane šećerne komponente, raspoređene duž oligonukleotida ili njegovog regiona u definisanom obrascu ili motivu šećera.U nekim slučajevima, takvi motivi šećera uključuju, ali nisu ograničeni na, bilo koju modifikaciju šećera koja se ovde razmatra.
[0090] U nekim primerima izvođenja, modifikovani oligonukleotidi sadrže, ili se sastoje od, regiona koji ima gapmer motiv, koji je definisan sa dva spoljna regiona ili "krila" i centralnim ili unutrašnjim regionom ili "prazninom".Tri regiona gapmer motiva (5'-krilo, praznina i 3'-krilo) formiraju kontinuiranu sekvencu nukleozida gde se najmanje neke od šećernih komponenti nukleozida u svakom od krila razlikuju od najmanje nekih šećernih komponenti nukleozida praznine.Konkretno, najmanje šećerne komponente nukleozida u svakom od krila koje su najbliže praznini (nukleozid najbliži 3'-kraju 5'-krila i nukleozid najbliži 5'-kraju 3'-krila) razlikuju se od šećerne komponente susednih nukleozida praznine, čime se definiše granica između krila i praznine (npr. krilo/praznina spoj).U nekim primerima izvođenja, šećerne komponente unutar praznine su iste.U nekim slučajevima, jaz uključuje jedan ili više nukleozida koji imaju komponentu šećera koja se razlikuje od komponente šećera jednog ili više drugih nukleozida praznine.U nekim primerima izvođenja, šećerni motivi u dva krila su isti (simetrična praznina).U nekim slučajevima, šećerni motiv 5'-krila razlikuje se od šećernog motiva 3'-krila (asimetrična praznina).
[0091] U nekim primerima izvođenja, svaki nukleozid u svakom od krila gapmera je modifikovani nukleozid.
[0092] U nekim primerima izvođenja, svaki nukleozid praznine gapmera je nemodifikovani 2'-dezoksi nukleozid.
[0093] U nekim primerima izvođenja, gapmer je dezoksi gapmer.U primerima izvođenja, nukleozidi na strani svakog krilo/praznina spoja ka praznini su nemodifikovani 2'-dezoksi nukleozidi, a nukleozidi na strani svakog krilo/praznina spoja ka krilima su modifikovani nukleozidi.U nekim primerima izvođenja, svaki nukleozid praznine je nemodifikovani 2'-dezoksi nukleozid.U nekim primerima izvođenja, svaki nukleozid svakog krila gapmera je modifikovani nukleozid.
[0094] U nekim primerima izvođenja, modifikovani oligonukleotidi se sastoje ili sadrže regiona koji ima potpuno modifikovani motiv šećera.U ovim primerima izvođenja, svaki nukleozid potpuno modifikovanog regiona modifikovanog oligonukleotida sadrži modifikovanu komponentu šećera.U nekim slučajevima, svaki nukleozid celog modifikovanog oligonukleotida sadrži modifikovanu komponentu šećera.U nekim primerima izvođenja, modifikovani oligonukleotidi sadrže, ili se sastoje od, regiona koji ima potpuno modifikovani motiv šećera, pri čemu svaki nukleozid unutar potpuno modifikovanog regiona sadrži istu modifikovanu komponentu šećera, koja se ovde označava kao uniformno modifikovani motiv šećera.U nekim slučajevima, potpuno modifikovani oligonukleotid je uniformno modifikovani oligonukleotid.U nekim slučajevima, svaki nukleozid od uniformno modifikovanih sadrži istu 2'-modifikaciju.
[0095] Ovde, dužine (broj nukleozida) tri regiona gapmera mogu da budu obezbeđene korišćenjem notacije [br. nukleozida u 5'-krilu] - [br. nukleozida u praznini] - [br. nukleozida u 3'-krilu].Dakle, 5-8-5 gapmer se sastoji od 5 povezanih nukleozida u svakom krilu i 8 povezanih nukleozida u praznini.Ako ovu nomenklaturu prati specifična modifikacija, ta modifikacija je modifikacija u krilima, a nukleozidi praznine sadrže nemodifikovani dezoksinukleozidne šećere.Tako se 5-8-5 MOE gapmer sastoji od 5 povezanih MOE modifikovanih nukleozida u 5'-krilu, 8 povezanih dezoksinukleozida u praznini i 5 povezanih MOE nukleozidi u 3'-krilu.U nekim primerima izvođenja, modifikovani oligonukleotidi su 5-8-5 MOE gapmeri.
2. Neki motivi nukleobaza
[0096] U nekim primerima izvođenja, oligonukleotidi sadrže modifikovane i/ili nemodifikovane nukleobaze raspoređene duž oligonukleotida ili njegovog regiona u definisanom obrascu ili motivu.U nekim slučajevima, svaka nukleobaza je modifikovana.U nekim slučajevima nijedna od nukleobaza nije modifikovana.U nekim slučajevima, svaki purin ili svaki pirimidin je modifikovan.U nekim slučajevima, svaki adenin je modifikovan.U nekim slučajevima, svaki guanin je modifikovan.U nekim slučajevima, svaki timin je modifikovan.U nekim slučajevima, svaki uracil je modifikovan.U nekim primerima izvođenja svaki citozin je modifikovan.U nekim primerima izvođenja, neke ili sve citozinske nukleobaze u modifikovanom oligonukleotidu su 5-metilcitozini.U nekim primerima izvođenja, sve citozinske nukleobaze su 5-metilcitozini, a sve ostale nukleobaze modifikovanog oligonukleotida su nemodifikovane nukleobaze.
[0097] U nekim primerima izvođenja, modifikovani oligonukleotidi sadrže blok modifikovanih nukleobaza.U nekim ovakvim primerima izvođenja, blok je na 3'-kraju oligonukleotida.U nekim primerima izvođenja blok se nalazi unutar 3 nukleozida od 3'-kraja oligonukleotida.U nekim ovakvim primerima izvođenja, blok je na 5'-kraju oligonukleotida.U nekim primerima izvođenja blok se nalazi unutar 3 nukleozida od 5'-kraja oligonukleotida.
[0098] U nekim primerima izvođenja, oligonukleotidi koji imaju gapmer motiv sadrže nukleozid koji sadrži modifikovanu nukleobazu.U nekim ovakvim primerima izvođenja, jedan nukleozid koji sadrži modifikovanu nukleobazu nalazi se u centralnoj praznini oligonukleotida koji ima gapmer motiv.U nekim ovakvim primerima izvođenja, šećerna komponenta navedenog nukleozida je 2'-dezoksiribozil komponenta.U nekim slučajevima, modifikovana nukleobaza je izabrana od: 2-tiopirimidina i 5-propinpirimidina.
3. Neki motivi internukleozidnih veza
[0099] U nekim primerima izvođenja, oligonukleotidi sadrže modifikovane i/ili nemodifikovane internukleozidne veze raspoređene duž oligonukleotida ili njegovog regiona u definisanom obrascu ili motivu.U nekim slučajevima, svaka internukleozidna povezujuća grupa je fosfodiestarska internukleozidna veza (P=O).U nekim slučajevima, svaka internukleozidna povezujuća grupa modifikovanog oligonukleotida je fosforotioatna internukleozidna veza (P=S).U nekim primerima izvođenja, svaka internukleozidna veza modifikovanog oligonukleotida je nezavisno izabrana od fosforotioatne internukleozidne veze i fosfodiestarske internukleozidne veze.U nekim primerima izvođenja, svaka fosforotioatna internukleozidna veza je nezavisno izabrana od stereohemjski nasumičnog fosforotioata, (Sp) fosforotioata i (Rp) fosforotioata.U nekim primerima izvođenja, šećerni motiv modifikovanog oligonukleotida je gapmer i sve internukleozidne veze unutar praznine su modifikovane.U nekim ovakvim primerima izvođenja, neke od internukleozidnih veza u krilima su nemodifikovane fosfatne veze.U nekim primerima izvođenja, terminalne internukleozidne veze su modifikovane.U nekim primerima izvođenja, šećerni motiv modifikovanog oligonukleotida je gapmer, a motiv internukleozidne veza sadrži najmanje jednu fosfodiestarsku internukleozidnu vezu u najmanje jednom krilu, pri čemu najmanje jedna fosfodiestarska veza nije terminalna internukleozidna veza, a preostale internukleozidne veze su fosforotioatne internukleozidne veze.U nekim ovakvim primerima izvođenja, sve fosforotioatne veze su stereohemijski nasumične.U nekim primerima izvođenja, sve fosforotioatne veze u krilima su (Sp) fosforotioatne, a praznina sadrži najmanje jedan Sp, Sp, Rp motiv.U nekim primerima izvođenja, populacije modifikovanih oligonukleotida obogaćene su modifikovanim oligonukleotidima koji sadrže ove motive internukleozidnih veza.
C. Neke dužine
[00100] Moguće je da se dužina oligonukleotida poveća ili smanji, a da se pri tom ne eliminiše aktivnost.Na primer, u publikaciji Woolf et al. (Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89:7305-7309, 1992), testirana je sposobnost serije oligonukleotida, dužine 13-25 nukleobaza, da indukuju cepanje ciljne iRNK u modelu injeciranja oocita.Oligonukleotidi dugački 25 nukleobaza sa 8 ili 11 pogrešno sparenih baza blizu krajeva oligonukleotida, bili su u stanju da usmere specifično cepanje ciljne iRNK, doduše u manjoj meri nego oligonukleotidi koji nisu sadržali pogrešne parove.Slično tome, cepanje specifično za ciljni molekul postignuto je korišćenjem oligonukleotida od 13 nukleobaza, uključujući i one sa 1 ili 3 pogrešna para.
[00101] Modifikovani oligonukleotidi prema pronalasku imaju dužinu od 18 povezanih nukleozida.
D. Neki modifikovani oligonukleotidi
[00102] U nekim primerima izvođenja, prethodno navedene modifikacije (šećer, nukleobaza, internukleozidna veza) se ugrađuju u modifikovani oligonukleotid.U nekim primerima izvođenja, modifikovane oligonukleotide karakterišu njihovi motivi modifikacije i ukupne dužine.U nekim primerima izvođenja, ovi parametri su nezavisni jedni od drugih.Stoga, osim ako nije drugačije naznačeno, svaka internukleozidna veza oligonukleotida koja ima šećerni motiv gapmera može da bude modifikovana ili nemodifikovana i može, ali i ne mora, da prati obrazac modifikacije gapmera šećernim modifikacijama.Na primer, internukleozidne veze unutar regiona krila šećernog gapmera mogu da budu iste ili različite jedna od druge, i mogu da budu iste ili različite od internukleozidnih veza regiona praznine šećernog motiva.Isto tako, ovakvi oligonukleotidi sa gapmerima šećera mogu da sadrže jednu ili više modifikovanih nukleobaza nezavisno od obrascašećernih modifikacija u gapmeru.Osim ako nije drugačije naznačeno, sve izmene su nezavisne od sekvence nukleobaza.
E. Neke populacije modifikovanih oligonukleotida
[00103] Populacije modifikovanih oligonukleotida u kojima svi modifikovani oligonukleotidi u populaciji imaju istu molekulsku formulu, mogu da budu stereohemijski nasumične populacije ili hiralno obogaćene populacije.Svi hiralni centri svih modifikovanih oligonukleotida su stereohemijski nasumični u stereohemijski nasumičnoj populaciji.Kod hiralno obogaćene populacije, najmanje jedan određeni hiralni centar nije stereohemijski nasumičan u modifikovanim oligonukleotidima populacije.U nekim primerima izvođenja, modifikovani oligonukleotidi hiralno obogaćene populacije obogaćeni su β-D ribozil šećernim komponentama, a sve fosforotioatne internukleozidne veze su stereohemijski nasumične.U nekim primerima izvođenja, modifikovani oligonukleotidi hiralno obogaćene populacije obogaćeni su i β-D ribozil šećernim komponentama i najmanje jednom, određenom fosforotioatnom internukleozidnom vezom u određenoj stereohemijskoj konfiguraciji.
F. Sekvenca nukleobaza
[00104] U nekim primerima izvođenja, oligonukleotidi (nemodifikovani ili modifikovani oligonukleotidi) dodatno su opisani sekvencama svojih nukleobaza.U nekim primerima izvođenja oligonukleotidi imaju sekvencu nukleobaza koja je komplementarna sa drugom oligonukleotidom ili identifikovanom referentnom nukleinskom kiselinom, kao što je ciljna nukleinska kiselina.U nekim primerima izvođenja, region oligonukleotida ima sekvencu nukleobaze koja je komplementarna sa drugom oligonukleotidom ili identifikovanom referentnom nukleinskom kiselinom, kao što je ciljna nukleinska kiselina.U nekim primerima izvođenja, sekvenca nukleobaza regiona ili cele dužine oligonukleotida je najmanje 50%, najmanje 60%, najmanje 70%, najmanje 80%, najmanje 85%, najmanje 90%, najmanje 95% ili najmanje 100% komplementarna sa drugim oligonukleotidom ili nukleinskom kiselinom, kao što je ciljna nukleinska kiselina.
II. Neka oligomerna jedinjenja
[00105] U nekim primerima izvođenja, pronalazak obezbeđuje oligomerna jedinjenja, koja se sastoje od oligonukleotida (modifikovanog ili nemodifikovanog) i opciono, jedne ili više konjugovanih grupa i/ili terminalnih grupa.Konjugovane grupe se sastoje od jedne ili više konjugovanih komponenti i linkera za konjugaciju koji povezuje konjugovanu komponentu sa oligonukleotidom.Konjugovane grupe mogu da budu vezane za bilo koji od dva, ili za oba, kraja oligonukleotida i/ili na bilo kojoj unutrašnjoj poziciji.U nekim primerima izvođenja, konjugovana grupa je vezana za 2'-poziciju nukleozida u modifikovanom oligonukleotidu.U nekim primerima izvođenja, konjugovane grupe koje su vezane za bilo koji od dva, ili za oba, kraja oligonukleotida su terminalne grupe.U nekim ovakvim primerima izvođenja, konjugovane grupe ili terminalne grupa su vezane na 3' i/ili 5'-kraju oligonukleotida.U nekim ovakvim primerima izvođenja, konjugovane grupe (ili terminalne grupe) su vezane na 3'-kraju oligonukleotida.U nekim primerima izvođenja, konjugovane grupe su vezane blizu 3'-kraja oligonukleotida.U nekim ovakvim primerima izvođenja, konjugovane grupe (ili terminalne grupe) su vezane na 5'-kraju oligonukleotida.U nekim primerima izvođenja, konjugovane grupe su vezane blizu 5'-kraja oligonukleotida.
[00106] Primeri terminalnih grupa uključuju, ali nisu ograničeni na konjugovane grupe, grupe za dodavanje kape, fosfatne komponente, protektivne grupe, modifikovane ili nemodifikovane nukleozide, i na dva ili više nukleozida koje su nezavisno modifikovani ili nemodifikovani.
A. Neke konjugovane grupe
[00107] U nekim primerima izvođenja, oligonukleotidi su kovalentno vezani za jednu ili više konjugovanih grupa. U nekim primerima izvođenja, konjugovane grupe modifikuju jedno ili više svojstava vezanog oligonukleotida, uključujući, ali ne i ograničeno na, farmakodinamiku, farmakokinetiku, stabilnost, vezivanje, apsorpciju, distribuciju u tkivima, ćelijsku distribuciju, preuzimanje u ćelije, punjenje i uklanjanje.U nekim primerima izvođenja, konjugovane grupe obezbeđuju novo svojstvo za vezani oligonukleotid, npr., fluorofore ili reporterske grupe koje omogućavaju detekciju oligonukleotida.Neke konjugovane grupe i konjugovane komponente već su opisane, na primer: komponenta holesterola (Letsinger et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1989, 86, 6553-6556), holna kiselina (Manoharan et al., Bioorg. Med. Chem. Lett., 1994, 4, 1053-1060), tioetar, npr., heksil-S-tritiltiol (Manoharan et al., Ann. N.Y. Acad. Sci., 1992, 660, 306-309; Manoharan et al., Bioorg. Med. Chem. Lett., 1993, 3, 2765-2770), tioholesterol (Oberhauser et al., Nucl. Acids Res., 1992, 20, 533- 538), alifatični lanac, npr., do-dekan-diol ili undecil ostaci (Saison-Behmoaras et al., EMBO J., 1991, 10, 1111-1118; Kabanov et al., FEBSLett., 1990, 259, 327-330; Svinarchuk et al., Biochimie, 1993 , 75, 49- 54), fosfolipid, npr., di-heksadecil-rac-glicerol ili trietil-amonijum l,2-di-O-heksadecil-rac-glicero-3- H-fosfonat (Manoharan et al., Tetrahedron Lett., 1995, 36, 3651-3654; Shea et al., Nucl. Acids Res., 1990, 18, 3777-3783), poliaminski ili polietilen glikolni lanac (Manoharan et al., Nucleosides & Nucleotides, 1995, 14, 969-973), ili adamantan sirćetna kiselina i palmitil komponenta (Mishra et al., Biochim. Biophys. Acta, 1995,1264, 229-237), oktadecilamin ili heksilamino-karbonil-oksiholesterol komponenta (Crooke et al., J. Pharmacol. Exp. Ther., 1996, 277, 923-937), tokoferol grupa (Nishina et al., Molecular Therapy Nucleic Acids, 2015, 4, e220; i Nishina et al., Molecular Therapy, 2008,16, 734-740), ili GalNAc klaster (npr., WO2014/179620).
1. Konjugovane komponente
[00108] Konjugovane komponente uključuju, bez ograničenja, interkalatore, reporter molekule, poliamine, poliamide, peptide, ugljene hidrate, vitaminske komponente, polietilen glikole, tioetre, polietre, holesterole, tioholesterole, komponente holne kiseline, folate, lipide, fosfoolipide, biotin, fenazin, fenantridin, antrahinon, adamantan, akridin, fluoresceine, rodamine, kumarine, fluorofore, i boje.
[00109] U nekim primerima izvođenja, konjugovana komponenta sastoji se od aktivne supstance leka, na primer aspirina, varfarina, fenilbutazona, ibuprofena, suprofena, fen-bufena, ketoprofena, (S)-(+)-pranoprofena, karprofena, dansilsarkozina, 2,3,5-trijodobenzoeve kiseline, fingolimoda, flufenaminske kiseline, folne kiseline, benzotiadiazida, hlorotiazida, diazepina, indo-meticina, barbiturata, cefalosporina, sulfa leka, antidijabetika, antibakterijskog leka ili antibiotika.
2. Linkeri za konjugaciju
[00110] Konjugovane komponente su vezane za oligonukleotide preko linkera za konjugaciju.Kod određenih oligomernih jedinjenja, linker za konjugaciju je jednostruka hemijska veza (npr. konjugovana komponenta je vezana direktno sa oligonukleotidom preko jednostruke veze).U nekim primerima izvođenja, linker za konjugaciju sadrži strukturu lanca, kao što je hidrokarbil lanac, ili oligomer sa jedinicama koje se ponavljaju, kao što su etilen glikol, nukleozidi ili amino kiselinske jedinice.
[00111] U nekim primerima izvođenja, linker za konjugaciju sadrži jednu ili više grupa izabranih od alkila, amina, okso, amida, disulfida, polietilen glikola, etra, tioetra i hidroksilamino.U nekim ovakvim primerima izvođenja, linker za konjugaciju sadrže grupe izabrane od alkil, amin, okso, amid i etarskih grupa.U nekim primerima izvođenja, linker za konjugaciju sadrže grupe izabrane od alkil i amid grupa.U nekim primerima izvođenja, linker za konjugaciju sadrže grupe izabrane iz alkil i etarskih grupa.U nekim primerima izvođenja, linker za konjugaciju sadrži najmanje jednu fosfornu komponentu.U nekim primerima izvođenja, linker za konjugaciju sadrži najmanje jednu fosfatnu grupu.U nekim primerima izvođenja, linker za konjugaciju uključuje najmanje jednu neutralnu grupu za povezivanje.
[00112] U nekim primerima izvođenja, linker za konjugaciju, uključujući i konjugacione linkere opisane prethodno u tekstu, predstavljaju bifunkcionalne povezujuće komponente, npr., one za koje je u stanju tehnike poznato da su korisne za povezivanje konjugovanih grupa sa matičnim jedinjenjim, kao što su ovde obezbeđeni oligonukleotidi.U principu, bifunkcionalna povezujuća komponenta sadrži najmanje dve funkcionalne grupe.Jedna od funkcionalnih grupa je izabrana tako da se vezuje za određenu lokaciju na matičnom jedinjenju, a druga je izabrana tako da se vezuje za konjugovanu grupu.Primeri funkcionalnih grupa koje se koriste u bifunkcionalnoj povezujućoj komponenti uključuju, ali nisu ograničeni na, elektrofile za reagovanje sa nukleofilnim grupama i nukleofile za reagovanje sa elektrofilnim grupama.U nekim primerima izvođenja, bifunkcionalne povezujuće komponente sadrže jednu ili više grupa izabranih od amina, hidroksila, karboksilne kiseline, tiola, alkila, alkenila i alkinila.
[00113] Primeri linkera za konjugaciju uključuju, ali nisu ograničeni na, pirolidin, 8-amino-3,6-dioksaoktansku kiselinu (ADO), sukcinimidil 4-(N-maleimidometil) cikloheksan-1-karboksilat (SMCC) i 6-aminoheksansku kiselinu (AHEX ili AHA).Drugi linkeri za konjugaciju uključuju, ali nisu ograničeni na, supstituisani ili nesupstituisani C1-C10alkil, supstituisani ili nesupstituisani C2-C10alkenil ili supstituisani ili nesupstituisani C2-C10alkinil, pri čemu neograničavajuća lista poželjnih substituentnih grupa uključuje hidroksil, amino, alkoksi, karboksi, benzil, fenil, nitro, tiol, tioalkoksi, halogen, alkil, aril, alkenil i alkinil.
[00114] U nekim primerima izvođenja, linkeri za konjugaciju sadrže 1-10 linker-nukleozida.U nekim primerima izvođenja, linkeri za konjugaciju sadrže 2-5 linker-nukleozida.U nekim primerima izvođenja, linkeri za konjugaciju sadrže tačno 3 linker-nukleozida.U nekim primerima izvođenja, linkeri za konjugaciju sadrže TCA motiv.U nekim primerima izvođenja, ovi linker-nukleozidi su modifikovani nukleozidi.U nekim primerima izvođenja ovi linker-nukleozidi sadrže modifikovanu komponentu šećera.U nekim primerima izvođenja, linker-nukleozidi su nemodifikovani.U nekim primerima izvođenja, linker-nukleozidi sadrže opciono zaštićene heterociklične baze izabrane od purina, supstituisanog purina, pirimidina ili supstituisanog pirimidina.U nekim primerima izvođenja, degradabilna komponenta je nukleozid izabran od uracila, timina, citozina, 4-N-benzoilcitozina, 5- metilcitozina, 4-N-benzoil-5-metilcitozina, adenina, 6-N-benzoiladenina, guanina i 2-N-izobutirilguanina.Obično je poželjno da linker-nukleozidi bude uklonjeni degradacijom iz oligomernog jedinjenja nakon što ono stigne u ciljno tkivo.U skladu sa tim, linker-nukleozidi su obično povezani jedni sa drugima i sa ostatkom oligomernog jedinjenja putem degradabilnih veza.U nekim primerima izvođenja, ove degradabilne veze su su fosfodiestarske veze.
[00115] U ovom tekstu se ne smatra da su linker-nukleozidi deo oligonukleotida.U skladu sa tim, u primerima izvođenja u kojima oligomerno jedinjenje sadrži oligonukleotid koji se sastoji od specifično navedenog broja ili opsega povezanih nukleozida i/ili specifično navedenog procenta komplementarnosti u odnosu na referentnu nukleinsku kiselinu i oligomerno jedinjenje takođe sadrži konjugovanu grupu koja sadrži linker za konjugaciju koji sadrži linker-nukleozide, ovi linker-nukleozidi se ne računaju u dužinu oligonukleotida i ne koriste se za određivanju procenta komplementarnosti oligonukleotida za referentnu nukleinsku kiselinu.Na primer, oligomerno jedinjenje može da sadrži (1) modifikovani oligonukleotid koji se sastoji od 8-30 nukleozida i (2) konjugovanu grupu koja sadrži 1-10 linker-nukleozida koji su u kontinuitetu sa nukleozidima modifikovanog oligonukleotida.Ukupan broj kontinuiranih povezanih nukleozida u takvom oligomernom jedinjenju je veći od 30.Alternativno, oligomerno jedinjenje može da sadrži modifikovani oligonukleotid koji se sastoji od 8-30 nukleozida i nema konjugovanu grupu.Ukupan broj kontinuiranih povezanih nukleozida u takvom oligomernom jedinjenju nije veći od 30.Osim ako nije drugačije naznačeno linkeri za konjugaciju sadrže ne više od 10 linker-nukleozida.U nekim primerima izvođenja, linkeri za konjugaciju sadrže ne više od 5 linker-nukleozida.U nekim primerima izvođenja, linkeri za konjugaciju sadrže ne više od 3 linker-nukleozida.U nekim primerima izvođenja, linkeri za konjugaciju sadrže ne više od 2 linker-nukleozida.U nekim primerima izvođenja, linkeri za konjugaciju sadrže ne više od 1 linker-nukleozida.
[00116] U nekim primerima izvođenja, poželjno je da se konjugovana grupa uklanja iz oligonukleotida degradacijom.Na primer, u određenim okolnostima oligomerna jedinjenja koja sadrže određenu konjugovanu komponentu bolje se preuzima od strane određenog tipa ćelije, ali kada je oligomerno jedinjenje preuzeto, poželjno je da se konjugovana grupa ukloni degradacijom kako bi se oslobodio nekonjugovani ili matični oligonukleotid.Tako neki linkeri za konjugaciju mogu da sadrže jednu ili više degradabilnih komponenti.U nekim primerima izvođenja, degradabilna komponenta je degradabilna veza.U nekim primerima izvođenja, degradabilna komponenta je grupa atoma koja sadrži najmanje jednu degradabilnu vezu.U nekim primerima izvođenja, degradabilna komponenta sadrži grupu atoma koji imaju jednu, dve, tri, četiri ili više od četiri degradabilne veze.U nekim primerima izvođenja, degradabilna komponenta se selektivno uklanja degradacijom unutar ćelije ili subcelularnog odeljka, kao što je lizozom.U nekim primerima izvođenja, degradabilna komponenta se selektivno uklanja degradacijom endogenim enzimima, kao što su nukleaze.
[00117] U nekim primerima izvođenja, degradabilna veza je izabrana od: amida, estra, etra, jednog ili oba estra fosfodiestra, fosfatnog estra, karbamata ili disulfida.U nekim primerima izvođenja, degradabilna veza je jedna ili obe od estara u fosfodiestru.U nekim primerima izvođenja, degradabilna komponenta sadrži fosfat ili fosfodiestar.U nekim primerima izvođenja, degradabilna komponenta je fosfatna veza između oligonukleotida i konjugovane komponente ili konjugovane grupe.
[00118] U nekim primerima izvođenja, degradabilna komponenta sadrži ili se sastoji od jednog ili više linker-nukleozida.U nekim ovakvim primerima izvođenja, jedan ili više linker-nukleozida je povezano jedan sa drugim i/ili sa ostatkom oligomernog jedinjenja putem degradabilnih veza.U nekim primerima izvođenja, ove degradabilne veze su nemodifikovane fosfodiestarske veze.U nekim primerima izvođenja, degradabilna komponenta je 2'-dezoksi nukleozid koji je vezan ili sa 3' ili sa 5'-terminalnim nukleozidom u oligonukleotidu preko fosfatne internukleozidne veze i kovalentno povezan sa ostatkom linkera za konjugaciju ili konjugovanom komponentom preko fosfata ili fosforotioatne veze.U nekim ovakvim primerima izvođenja, degradabilna komponenta je 2'- dezoksi adenozin.
B. Neke terminalne grupe
[00119] U nekim primerima izvođenja, oligomerna jedinjenja sadrže jednu ili više terminalnih grupa.U nekim ovakvim primerima izvođenja, oligomerna jedinjenja sadrže stabilizovani 5'-fosfat.Stabilizovani 5'-fosfati uključuju, ali nisu ograničeni na, 5'-fosfonate, uključujući, ali ne i ograničeno na, 5'-vinilfosfonate.U nekim primerima izvođenja, terminalne grupe sadrže jedan ili više abaznih nukleozida i/ili invertnih nukleozida.U nekim primerima izvođenja, terminalne grupe sadrže jedan ili više 2'- povezanih nukleozida.U nekim ovakvim primerima izvođenja, 2'-povezani nukleozid je abazni nukleozid.
III. Oligomerni dupleksi
[00120] U nekim primerima izvođenja, ovde opisana oligomerna jedinjenja sadrže oligonukleotid koji ima sekvencu nukleobaza koja je komplementarna sekvenci ciljne nukleinske kiseline.U nekim primerima izvođenja, oligomerno jedinjenje je spareno sa drugim oligomernim jedinjenjem kako bi se formirao oligomerni dupleks.Takvi oligomerni dupleksi sadrže prvo oligomerno jedinjenje koje ima region komplementaran sa ciljnom nukleinskom kiselinom i drugo oligomerno jedinjenje koje ima region komplementaran sa prvim oligomernim jedinjenjem.U nekim primerima izvođenja, prvo oligomerno jedinjenje oligomernog dupleksa sadrži ili se sastoji od (1) modifikovanog ili nemodifikovanog oligonukleotida i, opciono, konjugovane grupe i (2) drugog modifikovanog ili nemodifikovanog oligonukleotida, i, opciono, konjugovane grupe.Jedno ili oba oligomerna jedinjenja oligomernog dupleksa mogu da sadrže konjugovanu grupu.Oligonukleotidi svakog oligomernog jedinjenja u oligomernom dupleksu mogu da uključuju nekonplementarne nesparene nukleozide.
IV. Antisens aktivnost
[00121] U nekim primerima izvođenja, oligomerna jedinjenja i oligomerni dupleksi sposobni su da se hibridizuju sa ciljnom nukleinskom kiselinom, što rezultira najmanje jednom antisens aktivnošću; takva oligomerna jedinjenja i oligomerni dupleksi su antisens jedinjenja.U nekim primerima izvođenja, antisens jedinjenja imaju antisens aktivnost kada smanjuju ili inhibiraju količinu ili aktivnost ciljne nukleinske kiseline za 25% ili više u standardnom ćelijskom testu.U nekim primerima izvođenja, antisens jedinjenja selektivno utiču na jednu ili više ciljnih nukleinskih kiselina.Takva antisens jedinjenja sadrže sekvencu nukleobaza koja se hibridizuje sa jednom ili više ciljnih nukleinskih kiselina, što rezultira jednom ili više željenih antisens aktivnosti i ne hibridizuje sa jednom ili više ne-ciljnih nukleinskih kiselina ili ne hibridizuje sa jednom ili više ne-ciljnih nukleinskih kiselina na takav način da rezultira značajnom neželjenom antisens aktivnošću.
[00122] U nekim antisens aktivnostima, hibridizacija antisens jedinjenja sa ciljnom nukleinskom kiselinom rezultira regrutovanjem proteina koji degraduje ciljnu nukleinsku kiselinu.Na primer, određena antisens jedinjenja rezultiraju time da je RNaza H posmreo dekolte ciljne nukleisne kiseline.RNaza H je ćelijska endonukleaza koja degraduje RNK lanac RNK:DNK dupleksa.DNK u takvoj RNK:DNK dupleks ne mora biti nemodifikovana DNK.U nekim primerima izvođenja, opisanim ovde su antisens jedinjenja koja su dovoljna "DNK nalik" da iniciraju aktivnost RNaze H.U nekim primerima izvođenja, jedna ili više ne-DNK nukleozida u raskoraku se toleriše.
[00123] U nekim antisens aktivnostima, antisens jedinjenje ili deo antisens jedinjenja se dodaje u kompleks za RNK-indukovano utišavanje (RISC), što na kraju rezultira degradacijom ciljne nukleinske kiseline.Na primer, neka antisens jedinjenja rezultiraju degradacijom ciljne nukleinske kiseline pomoću Argonauta. Antisens jedinjenja koja se dodaju u RISC su RNAi jedinjenja.RNAi jedinjenja mogu da budu dvolančana (siRNA) ili jednolančana (ssRNA).
[00124] U nekim primerima izvođenja, hibridizacija antisens jedinjenja sa ciljnom nukleinskom kiselinom ne rezultira regrutovanjem proteina koji degradira tu ciljnu nukleinsku kiselinu.U nekim primerima izvođenja, hibridizacija antisens jedinjenja sa ciljnom nukleinskom kiselinom rezultira izmenom splajsovanja ciljne nukleinske kiseline.U nekim primerima izvođenja, hibridizacija antisens jedinjenja sa ciljnom nukleinskom kiselinom rezultira inhibicijom interakcije vezivanja između ciljne nukleinske kiseline i proteina ili druge nukleinske kiseline.U nekim primerima izvođenja, hibridizacija antisens jedinjenja sa ciljnom nukleinskom kiselinom rezultira izmenom translacije ciljne nukleinska kiseline.
[00125] Antisens aktivnosti se mogu posmatrati direktno ili indirektno.U nekim primerima izvođenja, posmatranje ili detekcija antisens aktivnosti uključuje posmatranje ili detekciju promene u količini ciljne nukleinske kiseline ili proteina kodiranog ovom ciljnom nukleinskom kiselinom, promene u udelu splajsing varijanti nukleinske kiseline ili proteina, i/ili fenotipske promene u ćeliji ili životinji.
V. Neke ciljne nukleinske kiseline
[00126] U nekim primerima izvođenja, oligomerna jedinjenja sadrže, ili se sastoje od oligonukleotida koji sadrže region koji je komplementaran sa ciljnom nukleinskom kiselinom.U nekim primerima izvođenja, ciljna nukleinska kiselina je endogeni RNK molekul.U nekim primerima izvođenja, ciljna nukleinska kiselina kodira protein.U nekim ovakvim primerima izvođenja, ciljna nukleinska kiselina je izabrana od: zrele iRNK i pre-iRNK, uključujući intronske, egzonske i netranslatirane regione.U nekim primerima izvođenja, ciljna RNK je zrela iRNK.U nekim primerima izvođenja, ciljna nukleinska kiselina je pre-iRNK.U nekim ovakvim primerima izvođenja, ciljni region je u potpunosti unutar introna.U nekim primerima izvođenja, ciljni region se prostire preko spoja intron/egzon.U nekim primerima izvođenja, ciljni region je najmanje 50% unutar introna.
A. Komplementarnost/pogrešno sparivanje sa ciljnom nukleinskom kiselinom [00127] Uvođenje baza koje se pogrešno sparuju je moguće bez eliminisanja aktivnosti.Na primer, Gautschi et al (J. Natl. Cancer Inst.93:463-471, March 2001) demonstrirali su sposobnost oligonukleotida koji ima 100% komplementarinosti sa bcl-2 iRNK i koji ima 3 pogrešna sparivanja sa bcl-xL iRNK da smanji ekspresiju kao bcl-2, tako i bcl-xL in vitro i in vivo.Štaviše, ovaj oligonukleotid je demonstrirao snažnu antitumorsku aktivnost u vivo.Maher and Dolnick (Nuc.Acid.Res. 16:3341-3358, 1988) testirali su sposobnost serije tandem oligonukleotida od 14 nukleobaza, i oligonukleotide od 28 i 42 nukleobaza sačinjenih od sekvenci dva ili tri tandem oligonukleotida, redom, da zaustave translaciju humane DHFR u testu sa retikulocitima zeca.Svaki od tri oligonukleotida od 14 nukleobaza, sam je mogao da inhibira translaciju, premda u skromnijem nivou nego oligonukleotidi sa 28 ili 42 nukleobaze.
[00128] U nekim primerima izvođenja, oligomerna jedinjenja sadrže oligonukleotide koji su komplementarni sa ciljnom nukleiskom kiselinom, celom dužinom oligonukleotida.U nekim primerima izvođenja, oligonukleotidi su 99%, 95%, 90%, 85%, ili 80% komplementarni sa ciljnom nukleinskom kiselinom.U nekim primerima izvođenja, oligonukleotidi su najmanje 80% komplementarni sa ciljnom nukleinskom kiselinom, celom dužinom oligonukleotida, i sadrže region koji je 100% ili potpuno komplementaran sa ciljnom nukleinskom kiselinom.U nekim primerima izvođenja, dužina regiona pune komplementarnosti je od 6 do 20, 10 do 18, ili 18 do 20 nukleobaza.
[00129] U nekim primerima izvođenja, oligonukleotidi sadrže jednu ili više pogrešno sparenih nukleobaza u odnosu na ciljnu nukleinsku kiselinu.U nekim primerima izvođenja, antisens aktivnost usmerena na ciljni molekul se smanjuje ovim pogrešnim sparivanjem, ali aktivnost usmerena na ne-ciljni molekul se smanjuje u većoj meri.Tako se u nekim primerima izvođenja selektivnost oligomernog jedinjenja koje sadrži oligonukleotid poboljšava.U nekim primerima izvođenja, pogrešno sparivanje je specifično pozicionirano unutar oligonukleotida koji ima gapmer motiv.U nekim primerima izvođenja, pogrešno sparivanje je na poziciji 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 ili 8 od 5'-kraja regiona praznine.U nekim primerima izvođenja, pogrešno sparivanje je na poziciji 9, 8, 7, 6, 5, 4, 3, 2, 1 od 3'-kraja regiona praznine.U nekim primerima izvođenja, pogrešno sparivanje je na poziciji 1, 2, 3 ili 4 od 5'-kraja regiona krila.U nekim primerima izvođenja, pogrešno sparivanje je na poziciji 4, 3, 2 ili 1 od 3'-kraja regiona krila.
B. Tau
[00130] Oligomerna jedinjenja prema pronalasku sadrže, ili se sastoje od, oligonukleotida koji sadrži region koji je komplementaran ciljnoj nukleinskoj kiselini, gde je ciljna nukleinska kiselina Tau.U nekim primerima izvođenja, Tau nukleinska kiselina ima sekvencu izloženu u SEQ ID NO: 1 (GENBANK Accession No. NT_010783.14, skraćeno za nukleotide 2624000 do 2761000).
[00131] U nekim primerima izvođenja, dovođenje ćelije u kontakt sa oligomernim jedinjenjem komplementarnim sa SEQ ID NO: 1 smanjuje količinu Tau iRNK, a u nekim primerima izvođenja smanjuje količinu Tau proteina.Kod nekih primera izvođenja, dovođenje ćelije u životinji u kontakt sa oligomernim jedinjenjem komplementarnim sa SEQ ID NO: 1 poboljšava jedan ili više simptoma neurodegenerativne bolesti.U nekim primerima izvođenja simptom je gubitak pamćenja, gubitak motoričke funkcije ili povećanje broja i/ili zapremine neurofibrilarnih inkluzija.U nekim primerima izvođenja, dovođenje ćelije u životinji u kontakt sa oligomernim jedinjenjem komplementarnim sa SEQ ID NO: 1 rezultira održavanjem ili poboljšanjem pamćenja, održavanjem ili poboljšanjem motoričke funkcije, i/ili održavanjem ili smanjenjem broja i/ili zapremine neurofibrilarnih inkluzija.
C. Neke ciljne nukleinske kiseline u određenim tkivima
[00132] U nekim primerima izvođenja, oligomerna jedinjenja sadrže, ili se sastoje od oligonukleotida koji se sastoji od regiona koji je komplementaran sa ciljnom nukleinskom kiselinom, gde se ciljna nukleinska kiselina eksprimira u centralnom nervnom sistemu (CNS). VI. Neke farmaceutske kompozicije
[00133] U nekim primerima izvođenja, ovde su opisane farmaceutske kompozicije koje sadrže jedno ili više oligomernih jedinjenja ili njihovu so.U nekim primerima izvođenja, farmaceutska kompozicija sadrži farmaceutski prihvatljiv razblaživač ili nosač.U nekim primerima izvođenja, Farmaceutska kompozicija sadrži sterilni fiziološki rastvor i jedno ili više oligomernih jedinjenja.U nekim primerima izvođenja, farmaceutska kompozicija se sastoji od sterilnog fiziološkog rastvora i jednog ili više oligomernih jedinjenja.U nekim primerima izvođenja, sterilni fiziološki rastvor je fiziološki rastvor za farmaceutsku upotrebu.U nekim primerima izvođenja, farmaceutska kompozicija sadrži jedno ili više oligomernih jedinjenja i sterilnu vodu.U nekim primerima izvođenja, farmaceutska kompozicija se sastoji od jednog oligomernog jedinjenja i sterilne vode.U nekim primerima izvođenja, sterilna voda je voda za farmaceutsku upotrebu.U nekim primerima izvođenja, farmaceutska kompozicija sadrži jedno ili više oligomernih jedinjenja i fosfatni pufer (PBS).U nekim primerima izvođenja, farmaceutska kompozicija se sastoji od jednog ili više oligomernih jedinjenja i sterilnog PBS.U nekim primerima izvođenja, sterilni PBS je PBS za farmaceutsku upotrebu.
[00134] U nekim primerima izvođenja, farmaceutske kompozicije sadrže jedno ili više oligomernih jedinjenja i jedan ili više ekscipijenasa.U nekim primerima izvođenja, ekscipijensi su izabrani od vode, rastvorasoli , alkohola, polietilen glikola, želatina, laktoze, amilaze, magnezijum stearate, talka, silicijumske kiseline, viskoznog parafina, hidroksimetilceluloze i polivinilpirolidona.
[00135] U nekim primerima izvođenja, oligomerna jedinjenja mogu da se mešaju sa farmaceutski prihvatljivim aktivnim i/ili inertnim supstancama za pripremu farmaceutskih kompozicija ili formulacija.Kompozicije i postupci za formulisanje farmaceutskih kompozicija zavise od više kriterijuma, uključujući, ali ne i ograničeno na, rutu primene, obim bolesti ili dozu koja se primenjuje.
[00136] U nekim primerima izvođenja, farmaceutske kompozicije koje sadrže oligomerno jedinjenj obuhvataju bilo koju farmaceutski prihvatljivu so oligomernog jedinjenja, estre oligomernog jedinjenja ili soli ovih estara.U nekim primerima izvođenja, farmaceutske kompozicije koje sadrže oligomerna jedinjenja koja sadrže jedan ili više oligonukleotida, kada se primene kod životinje, uključujući i čoveka, u stanju su da obezbede (direktno ili indirektno) biološki aktivni metabolit ili njegov ostatak. U skladu sa tim, na primer, otkrivanje je takođe usmereno i na farmaceutski prihvatljive soli oligomernih jedinjenja, prolekove, farmaceutski prihvatljive soli ovih prolekova, kao i druge bioekvivalente.Pogodne farmaceutski prihvatljive soli uključuju, ali nisu ograničene na, natrijumove i kalijumove soli.U nekim primerima izvođenja, prolekovi sadrže jednu ili više konjugovanih grupa vezanih za oligonukleotid, pri čemu se konjugovana grupa uklanja degradacijom pomoću endogenih nukleaza unutar tela.
[00137] Lipidne komponente su korišćene u terapijama nukleinskim kiselinama u nizu različitih postupaka.U nekim ovakvim postupcima, nukleinska kiselina, recimo oligomerno jedinjenje, uvodi se u prethodno formulisane lipozome ili lipoplekse napravljene od mešavina katjonskih lipida i neutralnih lipida.U nekim postupcima, DNK kompleksi sa mono-ili poli-katjonskim lipidima, formiraju bez prisustva neutralnog lipida.U nekim primerima izvođenja bira se lipidna komponenta koja će povećati distribuciju farmaceutskog agensa na određenu ćeliju ili tkivo.U nekim primerima izvođenja bira se lipidna komponenta koja će povećati distribuciju farmaceutskog agensa na masno tkivo.U nekim primerima izvođenja bira se lipidna komponenta koja će povećati distribuciju farmaceutskog agensa na mišićno tkivo.
[00138] U nekim primerima izvođenja, farmaceutske kompozicije sadrže sistem za isporučivanje.Primeri sistema za isporučivanje uključuju, ali nisu ograničeni na, lipozome i emulzije.Neki sistemi za isporučivanje su korisni za pripremanje izvesnih farmaceutskih kompozicija uključujući i one koji sadrže hidrofobna jedinjenja.U nekim primerima izvođenja koriste se određeni organski rastvarači kao što je dimetilsulfoksid.
[00139] U nekim primerima izvođenja, farmaceutske kompozicije sadrže jedan ili više molekula za isporučivanje, koji su specifični za tkivo i dizajnirani tako da isporučuju jedan ili više farmaceutskih agenasa prema predmetnom pronalasku u specifična tkiva ili tipove ćelija.Na primer, u nekim primerima izvođenja, farmaceutske kompozicije uključuju lipozome obložene antitelom specifičnim za tkivo.
[00140] U nekim primerima izvođenja, farmaceutske kompozicije sadrže sistem ko-rastvarača.Neki od ovih sistema ko-rastvarača sadrže, na primer, benzil alkohol, nepolarni surfaktant, organski polimer koji može da se meša sa vodom, i vodenu fazu.U nekim primerima izvođenja, ovi sistemi ko-rastvarača se koriste za hidrofobna jedinjenja.Neograničavajući primer takvog sistema ko-rastvarača je VPD sistem ko-rastvarača, koji je rastvor apsolutnog etanola koji sadrži 3% tež./zap. benzil alkohola, 8% tež./zap. nepolarnog surfaktanta Polysorbate 80™ i 65% tež./zap. polietilen glikola 300.Proporcije takvih sistema ko-rastvarača mogu znatno da se razlikuju, a da se pritom njihove karakteristike rastvorljivosti i toksičnosti na izmene značajno.Pored toga, identitet komponenti ko-rastvarača može da bude raznovrstan: na primer, drugi surfaktati mogu da se koriste umesto Polisorbate 80™; veličina frakcije polietilen glikola može da varira; drugi biokompatibilni polimeri mogu da zamene polietilen glikol, npr. polivinil pirolidom; i drugi šećeri ili polisaharidi mogu da zamene dekstroze.
[00141] U nekim primerima izvođenja, farmaceutske kompozicije su pripremljene za oralnu primenu.U nekim primerima izvođenja, farmaceutske kompozicije su pripremljene za bukalnu primenu.U nekim primerima izvođenja, Farmaceutska kompozicija je pripremljena za primenu injekcijom (npr. intravenskom, potkožnom, intramuskularnom, intratekalnom, intracerebroventrikularnom, itd.).U nekim ovakvim primerima izvođenja, farmaceutska kompozicija sadrži nosač i formulisana je u vodenom rastvoru, kao što su vodeni ili fiziološki kompatibilni puferi, recimo Henksov rastvor, Ringerov rastvor ili pufer sa fiziološkim rastvorom.U nekim primerima izvođenja, uključeni su i drugi sastojci (npr. sastojci koji pomažu u rastvorljivosti ili služe kao konzervansi).U nekim primerima izvođenja, suspenzije koje se injeciraju pripremaju se korišćenjem odgovarajućih tečnih nosača, sredstvima za suspendovanje i slično.Neke farmaceutske kompozicije za injekcije su predstavljene u obliku jedinične doze, npr., u ampulama ili u kontejnerima za više doza.Neke farmaceutske kompozicije za injekcije su suspenzije, rastvori ili emulzije u uljanim ili vodenim vehikulumima, a mogu da sadrže sredstva za formulisanje kao što su sredstva za suspendovanje, stabilizaciju i/ili dispergovanje.Neki rastvarači pogodni za upotrebu u farmaceutskim kompozicijama za injekcije uključuju, ali nisu ograničeni na, lipofilne rastvarače i masna ulja, kao što su susamovo ulje, sintetičke estre masnih kiselina, kao što su etil oleat ili trigliceridi, i lipozome.Voden suspenzije za injekcije mogu da sadrže.
VII. Neka jedinjenja
[00142] U nekim primerima izvođenja, jedinjenje br. 814907 je okarakterisano kao 5-8-5 MOE gapmer, koji ima sekvencu (od 5' do 3') CCGTTTTCTTACCACCCT (SEQ ID NO: 8), gde je svaki od nukleozida 1-5 i 14-18 2'-MOE nukleozid i svaki od nukleozida 6-13 je 2'-deozoksinukleozid, pri čemu internukleozidne veze između nukleozida 2 i nukleozida 3 i nukleozida 15 sa nukleozidom 16 predstavljaju fosfodiestarske internukleozidne veze, a preostale internukleozidne veze su fosforotioatne internukleozidne veze, i pri čemu je svaki citozin 5-metilcitozin.
[00143] U nekim primerima izvođenja, jedinjenje br.814907 karakteriše sledeća hemijska notacija: mCes mCeo Ges Tes Tes Tds Tds mCds Tds Tds Ads mCds mCds Aes mCeo mCes mCes Te; pri čemu,
A = adenin,
mC = 5-metilcitozin,
G = guanin,
T = timin,
e = 2'-MOE nukleozid,
d = 2'-deozoksinukleozid,
s = fosforotioatna internukleozidna veza, i
o = fosfodiestarska internukleozidna veza.
[00144] U nekim primerima izvođenja, jedinjenje br. 814907 se odlikuje sledećom hemijskom strukturom:
Struktura 1. Jedinjenje br. 814907
VIII. Neke odrednice
[00145] U nekim primerima izvođenja, jedinjenje br. 623782 (okarakterisano u nastavku teksta, u primeru 1), prvi put opisano u WO 2015/010135, predstavlja standard.Jedinjenje br.
623782 je imalo najbolje karakteristike među jedinjenjima opisanim u WO 2015/010135 u smislu potencije, efikasnosti i podnošenja.Jedinjenje br. 623782 je obezbeđen kao referenca za demonstraciju superiorne efikasnosti i podnošenja jedinjenja br. 814907 (okarakterisano u nastavku teksta u primeru 1) u poređenju sa jedinjenjem br. 623782 u uporednim studijama opisane u nastavku teksta u primeru 1 i primeru 2.
[00146] Kao što je pokazano u primeru 1, jedinjenje br.814907 je postiglo ED50od 25 μg u Tau transgenim miševima tretiranim sa 30 μg, 100 μg, 500 μg, dok je jedinjenje br. 623782 postiglo ED50vrednosti od 94 μg u Tau transgenim miševima tretiranim sa 10 μg, 30 μg, 100 μg, 300 μg, 700 μg.Dakle, jedinjenje br.814907 efikasniji od jedinjenja br.623782.
[00147] Kao što je pokazano u primeru 2, primena jedinjenja br.814907 kod miševa divljeg tipa nije rezultirala gubitkom Purkinjeovih ćelija, dok je primena jedinjenja br.623782 rezultirala gubitkom Purkinjeovih ćelija u kalbindinom bojenim presecima cerebeluma kod 3 od 11 životinja.Dakle, jedinjenje br.814907 se bolje podnosi od jedinjenja br.623782.
Prikaz
[00148] Iako su neka ovde opisana jedinjenja, kompozicije i postupci opisani sa specifičnošću u skladu sa određenim primerima izvođenja, sledeći primeri služe samo da ilustruju ovde opisana jedinjenja i nije predviđeno da ih ograniče.
[00149] Iako spisak sekvenci koji prati ovaj podnesak identifikuje svaku sekvencu ili kao "RNK" ili kao "DNK" kao što je propisano, u stvarnosti te sekvence mogu da budu modifikovane bilo kojom kombinacijom hemijskih modifikacija.Stručnjak u oblasti će lako razumeti da je takvo označavanje, kao "RNK" ili "DNK", za opisivanje modifikovanih oligonukleotida, u nekim slučajevima proizvoljno."Na primer, oligonukleotid koji sadrži nukleozid koji sadrži 2'-OH šećernu komponentu i bazu timin, mogao bi se opisati kao DNK koja ima modifikovani šećer (2'-OH umesto jednog 2'-H DNK) ili kao RNK koja ima modifikovanu bazu (timin (metilovani uracil) umesto uracila u RNK).U skladu sa tim, predviđeno je da ovde opisane sekvence nukleinskih kiselina, uključujući, ali ne i ograničavajući se na, one na spisku sekvenci, obuhvataju nukleinske kiseline koje sadrže bilo koju kombinaciju prirodne ili modifikovane RNK i/ili DNK, uključujući, ali ne i ograničeno na, one nukleinske kiseline koje imaju modifikovane nukleobaze.Kao dodatni primer, i bez ograničenja, oligomerno jedinjenje koje ima sekvencu nukleobaza "ATCGATCG" obuhvata sva oligomerna jedinjenja koja imaju ovu sekvencu nukleobaza, bilo modifikovanih ili nemodifikovanih, uključujući, ali ne i ograničeno na, ona jedinjenja koja sadrže RNK baze, kao što su ona koja imaju sekvencu "AUCGAUCG" i ona koja imaju neke DNK baze i neke RNK baze kao što je "AUCGATCG" i oligomerna jedinjenja koja imaju druge modifikovane nukleobaze kao što je "AT<m>CGAUCG", gde<m>C označava bazu citozin koja sadrži metil grupu na 5-poziciji.
[00150] Neka ovde opisana jedinjenja (npr. modifikovani oligonukleotidi) imaju jedan ili više asimetričnih centara i na taj način daju enantiomere, dijastereoizomere i druge stereoizomerne konfiguracije koje se mogu definisati, u smislu apsolutne stereohemije, kao (R) ili (S), kao α ili β, kao što je slučaj za anomere šećera, ili kao (D) ili (L), kao što je kod aminokiselina, itd. Jedinjenja opisana ovde koja su nacrtana ili opisana kao da imaju određene stereoizomerne konfiguracije uključuju samo naznačena jedinjenja.Ovde opisana jedinjenja koja su nacrtana ili opisana sa nedefinisanom stereohemijom uključuju sve moguće izomere, uključujući njihove stereohemijski nasumične i optički čiste oblike, osim ako nije drugačije specifično navedeno.Isto tako, tautomerni oblici jedinjenja ovde su takođe uključeni, osim ako nije drugačije naznačeno.Osim ako nije drugačije naznačeno, predviđeno je da ovde opisana oligomerna jedinjenja i modifikovani oligonukleotidi uključuju odgovarajuće oblike soli.
[00151] Ovde opisana jedinjenja uključuju varijacije u kojima su jedan ili više atoma zamenjeni neradioaktivnim izotopom ili radioaktivnim izotopom naznačenog elementa.Na primer, jedinjenja u ovom tekstu, koja sadrže atome vodonika obuhvataju sve moguće supstitucije deuterijumom za svaki od<1>H atoma vodonika.Izotopske supstitucije obuhvaćene jedinjenjima u ovom tekstu uključuju, ali nisu ograničene na:<2>H ili<3>H umesto<1>H,<13>C ili<14>C umesto<12>C,<15>N umesto<14>N,<17>O ili<18>O umesto<16>O, i<33>S,<34>S,<35>S ili<36>S umesto<32>S. U nekim primerima izvođenja, ne-radioaktivne izotopske zamene mogu da obezbede nova svojstva na za oligomerno jedinjenje koje je korisno za upotrebu kao terapeutski ili istraživački alat.U nekim primerima izvođenja, radioaktivne izotopske zamene mogu da učine jedinjenje pogodnim za istraživačke ili dijagnostičke svrhe kao što je vizualizacija.
PRIMERI
[00152] Sledeći primeri ilustruju neke primere izvođenja prema predmetnom prikazu i nisu ograničavajući.Štaviše, kada su obezbeđeni specifični primeri izvođenja, pronalazači su imali u vidu generičku primenu tih specifičnih primera izvođenja.Na primer, otkrivanje oligonukleotida koji ima određeni motiv podržava razumnoj meri dodatne oligonukleotide koji imaju isti ili sličan motiv.I, na primer, kada se određena modifikacija visokog afiniteta pojavi na određenoj poziciji, druge modifikacije visokog afiniteta na istoj poziciji smatraju se pogodnim, osim ako nije drugačije naznačeno.
Primer 1: Efekti modifikovanih oligonukleotida na humanu Tau iRNK kod transgenih miševa
[00153] Modifikovani oligonukleotidi prikazani u tabeli ispod su 100% komplementarni sa ljudskim Tau pre- iRNK (GENBANK Accession No. NT_010783.14, skraćeno od nukleotida 2624000 do 2761000, označeno ovde kao SEQ ID NO: 1).Efikasnost modifikovanih oligonukleotida testirana je kod ljudskih Tau transgenih miševa (Duff et al., Neurobiology of Disease 7:87-98, 2000).Svaki miš je dobio dozu modifikovanog oligonukleotida navedenog u tabeli ispod, ili samo PBS vehikulum, ICV bolus injekcijom.Svaka grupa za tretman se sastojala od 2 do 4 miševa.Nekoliko dana posle primene oligonukleotida, miševi su žrtvovani i tkiva su sakupljena.RNK je ekstrahovana iz korteksa i analizirana pomoću RT-qPCR u cilju utvrđivanja nivoa ljudske Tau iRNK.Korišćen je set prajmera RTS3104, sa sledećim sekvencama: uzvodni prajmer 5'-AAGATTGGGTCCCTGGACAAT-3', označen ovde kao SEQ ID NO: 5; reverzni prajmer 5'-AGCTTGTGGGTTTCAATCTTTTTATT-3', označen ovde kao SEQ ID NO: 6; proba 5'- CACCCACGTCCCTGGCGGA-3', označena ovde kao SEQ ID NO: 7. Rezultati su predstavljeni u tabeli ispod kao prosečna procentualna inhibicija ekspresije humane Tau iRNK za svaku grupu tretmana u poređenju sa grupom koja je tretirana vehikulumom.Polovina maksimalne efektivne doze (ED50) za svaki modifikovani oligonukleotid je izračunata pomoću nelinearne regresivne analize.
Tabela 1
Procenat inhibicije nivoa humane Tau iRNK kod hTau miševa
Indeksi: "e" predstavlja nukleo stranu od 2'MOE; "d" predstavlja 2'-dezoksinukleozid; "o" predstavlja internukleozid vezu fosfodiestera; a "s" predstavlja fosforotioate internukleozidna veza.Eksponentno "m" koje prethodi "C" ukazuje na to da je citozin 5-metilcitozin.
Primer 2: Podnošenje modifikovanih oligonukleotida koji ciljano deluju na humani Tau [00154] Tolerabilnost modifikovanih oligonukleotida opisanih u primeru 1 testirana je kod miševa divljeg tipa. Svaki miš je primio injekciju od 700μg jedinjenje br.623782 ili jedinjenje br.
814907 na 700μg doze, odnosno samo PBS vehikulum. Osam nedelja nakon primene modifikovanih oligonukleotida, miševi su žrtvovani, a tkiva sakupljena. Histopatologija je izvedena na presecima cerebeluma koristeći H&E, IBA1, GFAP i bojenje kalbindinom, a nije primećena abnormalnost u odnosu na miševe tretirane vehikulumom za miševe tretirane jedinjenjem br. 814907. U uporednom eksperimentu, gubitak Purkinjeovih ćelija primećen je u presecima cerebeluma obojenim kalbindinom kod 3 od 11 životinja tretiranih jedinjenjem br.
623782.
Primer 3: Efekat jedinjenja br. 814907 kod cinomolgus majmuna nakon ponovljene doze intratekalne injekcije 13 nedelja
[00155] Cinomolgus majmuni su lečeni jedinjenjem br.814907 kako bi se utvrdila lokalna i sistemska tolerabilnost i farmakokinetika na tri nivoa doze, nakon ponovljenih intratekalnih lumbalnih bolus injekcija tokom 13 nedelja. Jedinjenje br. 814907 deli kompletnu sekvencu homologije majmunu Tau iRNK i demonstriralo je farmakološku aktivnost kod ove vrste.
Tretman
[00156] Cinomolgus majmuni starosti od 2-4 godine tretirani su kontrolnim vehikulumom (n=12) ili jedinjenjem br.814907 intratekalno (između L3-L4). Životinje su dozirane na dan 1, 14, 28, 56 i 84. Grupe za tretman su dobile 4 mg (n=6), 12 mg (n=6) ili 35 mg (n=14) jedinjenja br.
814907. Životinje su žrtvovane ili na dan 98 ili 155 (4 životinje iz grupe sa kontrolnim vehikulumom i 4 životinje iz grupe za lečenje od 35 mg).
Podnošenje
[00157] Procena podnošenja se zasnivala na kliničkim posmatranjima, telesnim težinama, konzumiranju hrane, fizičkim i neurološkim pregledima, neurobihejvioralnim posmatranjima (modifikovani Irvin test (Irvin, 1968)), elektrokardiogram (ECG) i procena krvnog pritiska, oftalmologija, koagulacija, hematologija, klinička hemija (krv i cerebralna kičmena tečnost [CSF]), broj ćelija (samo CSF), proceni gasa u krvi, analizi urina i anatomsko-patološkoj evaluaciji.Kompletne nekropsije su izvršene sa snimkom bilo koje makroskopske abnormalnosti.Uzimani su težine organa i obavljeni su mikroskopski pregledi. Krv je prikupljena za analizu komplementa. Pored toga, krv, CSF i tkiva (kod nekropsije) prikupljeni su za toksikokinetičke procene.
[00158] Intratekalna primena od 4 mg, 12 mg ili 35 mg jedinjenje br.814907 za 13 nedelja (na dve nedelje prvih mesec dana, zatim jednom mesečno nakon toga) pokazala je dobru lokalnu i sistemsku tolerabilnost kod muških i ženskih cinomolgus majmuna na svim testiranim režimima doza.
Aktivnost
[00159] Inhibicija Tau iRNK cinomolgus majmuna je analizirana u tkivu mozga i kičmene moždine. Prikupljeni su preseci mozga i uzorci kičmene moždine i brzo zamrznuti u tečnom azotu i uskladišteni zamrznuti (-60°C do - 90°C).U vreme uzorkovanja, 2 mm biopsije su korišćene za prikupljanje uzoraka za RNK analizu iz zamrznutih moždanih preseka.Uzorci su uzeti iz više kičmene moždine i moždanih region.
[00160] Totalna RNK iz uzoraka mozga i kičmene moždine cinomolgus majmuna tretiranih kontrolom ili Jedinjenjem br.814907 prečišćena je pomoću kompleta za prečišćavanje mini RNK kompanije Life Technologies i podvrgnuta PCR analizi u realnom vremenu.Set prajmera i probe za majmune rhMATPT LTS01278 (uzvodna sekvenca AGGACAGAGTGCAGTCGAAGATC, označen ovde kao SEQ ID NO: 9; reverzna sekvenca AGGTCAGCTTGTGGGTTTCAA, označena ovde kao SEQ ID NO: 10; sekvenca probe CACCCATGTCCCTGGCGGAGG, označena ovde kao SEQ ID NO: 11) je korišćena za merenje RNK nivoa.Tau RNK je tada normalizovan hauskiping genom za ciklofilin A. Sve qPCR reakcije su bile pokrenuti u triplikatu.Podaci se navode u odnosu na nivo iRNK kod životinja tretiranih veštačkom CSF.
[00161] Kao što je prikazano u tabeli ispod, došlo je do značajnog i dozno-responsivnog smanjenja nivoa Tau RNK u kičmenoj moždini i više CNS region nakon tretmana jedinjenjem br.
814907, u poređenju sa kontrolnim tretiranim majmunima.
Tabela 2
Procenat inhibicije nivoa cinomolgus Tau iRNK kod cinomolgus majmuna
Primer 4: Kliničko ispitivanje na ljudima, faze I-IIa, sa jedinjenjem br. 814907
[00162] Višestruke rastuće doze jedinjenja br. 814907 procenjene su u randomizovanoj, dvostruko slepoj studiji kontrolisanoj placebom, kako bi se evaluirala bezbednost, podnošenje, pharmokinetika i farmakokodinamika kod pacijenata sa blagom Alchajmerovom bolešću (AD) starosti od 50 do 74 godine.Podobni pacijenti će pored ispunjavanja kliničkih kriterijuma za AD imati i CSF AD biomarker dokaze o amiloidnoj i tau patologiji.Četiri kohorte nivoa doze blagih AD pacijenata biće upisane uzastopno i nasumično 3:1 da bi se primilo jedinjenje br. 814907 ili placebo.Svaki pacijent će dobiti 4 doze jedinjenja br.814907 ili placebo sa intervalom od 28 dana između doza.Pacijenti će dobiti 4 intratekalne (IT) bolus doze jedinjenja Br 814907 u intervalima od 4 nedelje tokom 3 meseca lečenja (dana 1, 29, 57, 85).Svaka doza jedinjenja br. 814907 ili placebo biće dat kao jedna injekcija od 20 mL IT bolusa.primena će biti putem lumbalne punkcije koristeći malu iglu za merenje ubačenu u prostor L3/L4.
Procene bezbednosti i podnošenja
[00163] Bezbednost pacijenata biće pažljivo praćena tokom studije.Procene bezbednosti i podnošenja uključuju: fizički pregled i standardnu neurološku procenu (uključujući funduse), vitalne znake (HR, BP, ortostatske promene, težina), ECG, AE i konkomitantne lekove, skalu Columbia Suicide Severity Rating Scale (C - SSRS), bezbednosne laboratorijske protokole za CSF (broj ćelija, proteini, glukoza), laboratorijske testove sa plazmom (klinička hemija, hematologija), analizu urina, a neuro-vizuelne procene biće sprovedeni pomoću 3T MRI skenera.Klinička i volumetrijska neuro-vizuelna merenja će se koristiti za praćenje neočekivanog pogoršanja.
Farmakokinetičke procene
[00164] Uzorak CSF će biti prikupljen za PK analize pre doziranja svakog dana primene (dani 1, 29, 57, 85) i tokom perioda posle tretmana.
Istraživačke procene
[00165] Biće procenjeni biohemijski, neuro-vizuelni, funkcionalni/sposobnosti obavljanja aktivnosti svakodnevnog života, kognitivni, kao i neuropsihijatrijski parametri.
[00166] Biohemijski parametri uključuju potencijalne CSF i biomarkere za krv/plazmu, uključujući ciljano angažovanje, markere neuronske i sinaptičke povreda, markere aktivacije urođene imunosti, komponente komplementa i biomarkere vezane za lipide.
[00167] Neuro-vizuelni parametri uključuju strukturnu MRI (hipokampus, ceo mozak i ventrikularni volumeni), arterijsko markiranje spinova (ASL), difuziono-tenzornu vizualizaciju (DTI) i FDG-PET (samo kohorte C i D).
[00168] Parametri funkcionisanja/mogućnost obavljanja svakodnevnih životnih aktivnosti obuhvata evaluaciju pomoću upitnika Functional Activities Questionnaire (FAQ)
[00169] Kognitivni parametri uključuju procenu pomoću instrumenata Ponovljiva baterija za procenu neuropsihološkog statusa (RBANS) i Mini pregled mentalnog stanja (MMSE)
[00170] Neuropsihijatrijski parametri uključuju procenu pomoću upitnika Neuropsychiatric Inventory - Questionnaire (NPI-Q)

Claims (20)

  1. PATENTNI ZAHTEVI: 1. Modifikovani oligonukleotid prema sledećoj formuli:
    (SEQ ID NO: 8) ili njegova so.
  2. 2. So modifikovanog oligonukleotida prema patentnom zahtevu 1, naznačena time što so uključuje natrijumovu so i/ili kalijumovu so.
  3. 3. Jedinjenje koje sadrži modifikovani oligonukleotid, pri čemu je modifikovani oligonukleotid gapmer koji se sastoji od 5' krilnog segmenta, centralnog segmenta praznine i 3' krilnog segmenta, naznačeno time što: 5' krilni segment se sastoji od pet 2'-MOE nukleozida, centralni segment praznine se sastoji od osam 2'-dezoksinukleozida, i 3' krilni segment se sastoji od pet 2'-MOE nukleozida, pri čemu modifikovani oligonukleotid ima sekvencu nukleobaza 5'-CCGTTTTCTTACCACCCT-3' (SEQ ID NO: 8), gde je svaki citozin 5-metilcitozin; i pri čemu su internukleozidne veze modifikovanog nukleotida, od 5' do 3', sossssssssssssoss, gde je svaki s fosforotioatna veza i svaki o je fosfodiestarska veza.
  4. 4. Modifikovani oligonukleotid, naznačen time što je modifikovani oligonukleotid gapmer koji se sastoji od 5' krilnog segmenta, centralnog segmenta praznine i 3' krilnog segmenta, pri čemu: 5' krilni segment se sastoji od pet 2'-MOE nukleozida, centralni segment praznine sastoji se od osam 2'-dezoksinukleozida, i 3' krilni segment se sastoji od pet 2'-MOE nukleozida, pri čemu modifikovani oligonukleotid ima sekvencu nukleobaza 5'-CCGTTTTCTTACCACCCT-3' (SEQ ID NO: 8), gde je svaki citozin 5-metilcitozin; i pri čemu su internukleozidne veze modifikovanog nukleotida, od 5' do 3', sossssssssssssoss, gde je svaki s fosforotioatna veza i svaki o je fosfodiestarska veza.
  5. 5. Populacija modifikovanih oligonukleotida ili njihovih soli prema bilo kom od patentnih zahteva 1, 2 ili 4, naznačena time što su sve fosforotioatne internukleozidne veze modifikovanog oligonukleotida stereohemijski nasumične.
  6. 6. Jedinjenje prema patentnom zahtevu 3 ili modifikovani oligonukleotid prema patentnom zahtevu 4, naznačen time što je modifikovani oligonukleotid povezan sa konjugovanom grupom.
  7. 7. Oligomerni dupleks koji sadrži modifikovani oligonukleotid ili njegovu so prema patentnom zahtevu 1 ili 2, jedinjenje prema patentnom zahtevu 3 ili modifikovani oligonukleotid prema patentnom zahtevu 4.
  8. 8. Farmaceutska kompozicija koja sadrži modifikovani oligonukleotid ili njegovu so prema patentnom zahtevu 1 ili 2, jedinjenje prema patentnom zahtevu 3 ili modifikovani oligonukleotid prema patentnom zahtevu 4, i farmaceutski prihvatljiv razblaživač ili nosač.
  9. 9. Farmaceutska kompozicija prema patentnom zahtevu 8, koja sadrži farmaceutski prihvatljiv razblaživač, naznačena time što je farmaceutski prihvatljiv razblaživač fosfatni pufer (PBS) ili veštačka CSF (aCSF).
  10. 10. Farmaceutska kompozicija prema patentnom zahtevu 9, naznačena time što je farmaceutski prihvatljiv razblaživač veštačka CSF (aCSF).
  11. 11. Modifikovani oligonukleotid ili njegova so prema patentnom zahtevu 1 ili 2, jedinjenje prema patentnom zahtevu 3, modifikovani oligonukleotid prema patentnom zahtevu 4, ili farmaceutska kompozicija prema bilo kom od zahteva 8-10, za upotrebu u terapiji.
  12. 12. Modifikovani oligonukleotid ili so prema patentnom zahtevu 1 ili 2, jedinjenje prema patentnom zahtevu 3, modifikovani oligonukleotid prema patentnom zahtevu 4, ili farmaceutska kompozicija prema bilo kom od zahteva 8-10, za upotrebu u lečenju bolesti povezane sa tau.
  13. 13. Modifikovani oligonukleotid, so, jedinjenje ili farmaceutska kompozicija za upotrebu prema patentnom zahtevu 12, naznačen time što je bolest povezana sa tau neurodegenerativna bolest.
  14. 14. Modifikovani oligonukleotid, so, jedinjenje ili farmaceutska kompozicija za upotrebu prema patentnom zahtevu 13, naznačen time što je neurodegenerativna bolest tauopatija.
  15. 15. Modifikovani oligonukleotid, so, jedinjenje ili farmaceutska kompozicija za upotrebu prema patentnom zahtevu 13, naznačen time što je neurodegenerativna bolest Alchajmerova bolest, fronto-temporalna demencija (FTD), FTDP-17, progresivna supranuklearna paraliza (PSP), hronična traumatska encefalopatija (CTE), degeneracija kortikobazalnih ganglija (CBD) ili Dravetov sindrom.
  16. 16. Modifikovani oligonukleotid, so, jedinjenje ili farmaceutska kompozicija za upotrebu prema patentnom zahtevu 15, naznačen time što je neurodegenerativna bolest Alchajmerova bolest.
  17. 17. Modifikovani oligonukleotid, so, jedinjenje ili farmaceutska kompozicija za upotrebu prema patentnom zahtevu 16, naznačen time što je Alchajmerova bolest blaga Alchajmerova bolest.
  18. 18. Modifikovani oligonukleotid, so, jedinjenje ili farmaceutska kompozicija za upotrebu prema patentnom zahtevu 15, naznačen time što je neurodegenerativna bolest fronto-temporalna demencija (FTD) .
  19. 19. Modifikovani oligonukleotid, so, jedinjenje ili farmaceutska kompozicija za upotrebu prema patentnom zahtevu 15, naznačen time što je neurodegenerativna bolest progresivna supranuklearna paraliza (PSP).
  20. 20. Modifikovani oligonukleotid, so, jedinjenje ili farmaceutska kompozicija za upotrebu prema bilo kom od patentnih zahteva od 11 do 19, naznačen time što se modifikovani oligonukleotid, so, jedinjenje ili farmaceutska kompozicija primenjuje putem intratekalne primena. Izdaje i štampa: Zavod za intelektualnu svojinu, Beograd, Kneginje Ljubice 5
RS20231188A 2016-09-29 2017-09-29 Spojevi i metode za smanjenje tau ekspresije RS64941B1 (sr)

Applications Claiming Priority (4)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201662401723P 2016-09-29 2016-09-29
US201762450469P 2017-01-25 2017-01-25
PCT/US2017/054540 WO2018064593A1 (en) 2016-09-29 2017-09-29 Compounds and methods for reducing tau expression
EP17857565.0A EP3519572B1 (en) 2016-09-29 2017-09-29 Compounds and methods for reducing tau expression

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RS64941B1 true RS64941B1 (sr) 2024-01-31

Family

ID=61760152

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RS20231188A RS64941B1 (sr) 2016-09-29 2017-09-29 Spojevi i metode za smanjenje tau ekspresije

Country Status (32)

Country Link
US (3) US10407680B2 (sr)
EP (2) EP4335923A3 (sr)
JP (4) JP6738004B2 (sr)
KR (2) KR20210097228A (sr)
CN (2) CN113481201A (sr)
AU (3) AU2017336093B2 (sr)
BR (2) BR122020019785B1 (sr)
CA (1) CA3038891C (sr)
CL (2) CL2019000703A1 (sr)
CO (1) CO2019001385A2 (sr)
CR (2) CR20210028A (sr)
DK (1) DK3519572T5 (sr)
ES (1) ES2963428T3 (sr)
FI (1) FI3519572T3 (sr)
HR (1) HRP20231606T1 (sr)
HU (1) HUE065170T2 (sr)
IL (3) IL299615A (sr)
JO (2) JOP20190065A1 (sr)
LT (1) LT3519572T (sr)
MD (1) MD3519572T2 (sr)
MX (2) MX2019003633A (sr)
MY (1) MY210293A (sr)
NZ (1) NZ750642A (sr)
PE (1) PE20190655A1 (sr)
PL (1) PL3519572T3 (sr)
PT (1) PT3519572T (sr)
RS (1) RS64941B1 (sr)
SG (1) SG11201901140QA (sr)
SI (1) SI3519572T1 (sr)
SM (1) SMT202300441T1 (sr)
WO (1) WO2018064593A1 (sr)
ZA (2) ZA201900920B (sr)

Families Citing this family (16)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US10273474B2 (en) 2012-03-30 2019-04-30 Washington University Methods for modulating Tau expression for reducing seizure and modifying a neurodegenerative syndrome
WO2013159108A2 (en) * 2012-04-20 2013-10-24 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligomeric compounds comprising bicyclic nucleotides and uses thereof
RU2745324C2 (ru) 2013-03-14 2021-03-23 Ионис Фармасьютикалз, Инк. Композиции и способы модулирования экспрессии tau
TWI772856B (zh) 2013-07-19 2022-08-01 美商百健Ｍａ公司 用於調節τ蛋白表現之組合物
JOP20190065A1 (ar) 2016-09-29 2019-03-28 Ionis Pharmaceuticals Inc مركبات وطرق لتقليل التعبير عن tau
EA202091693A1 (ru) 2018-01-12 2021-04-14 Бристол-Маерс Сквибб Компани Антисмысловые олигонуклеотиды, целенаправленно воздействующие на альфа-синуклеин, и их применения
MX2020007433A (es) 2018-01-12 2020-09-14 Bristol Myers Squibb Co Oligonucleotidos antisentido que actuan sobre alfa-sinucleina, y usos de estos.
PE20220013A1 (es) * 2018-07-03 2022-01-11 Hoffmann La Roche Oligonucleotidos para modular la expresion de tau
AR124302A1 (es) * 2020-12-11 2023-03-15 Eisai R&D Man Co Ltd Gápmeros de oligonucleótidos de objetivo tau
CN117337168A (zh) 2021-04-01 2024-01-02 渤健马萨诸塞州股份有限公司 向中枢神经系统的核酸递送
KR20240023602A (ko) 2021-06-18 2024-02-22 아이오니스 파마수티컬즈, 인코포레이티드 Ifnar1 발현을 감소시키기 위한 화합물 및 방법
EP4373936A1 (en) * 2021-07-23 2024-05-29 Biogen MA Inc. Methods for reducing tau expression
US20240401055A1 (en) * 2021-07-23 2024-12-05 University Of Kentucky Research Foundation Inhibition of neurofibrillary tangles using oligonucleotides against circular rnas from the microtubule associated protein tau (mapt) locus
MX2024003519A (es) 2021-09-24 2024-04-01 Alnylam Pharmaceuticals Inc Composiciones de agentes de acido ribonucleico de interferencia (arni) de proteina tau asociada a microtubulos (mapt) y sus metodos de uso.
WO2025043202A1 (en) * 2023-08-23 2025-02-27 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compounds and methods for reducing atn1 expression
WO2026025082A1 (en) * 2024-07-25 2026-01-29 Biogen Ma Inc. Methods for treating alzheimer's disease

Family Cites Families (144)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US1027347A (en) 1910-11-23 1912-05-21 Columbus K Lassiter Multiple-spindle drill.
US3687808A (en) 1969-08-14 1972-08-29 Univ Leland Stanford Junior Synthetic polynucleotides
US4880635B1 (en) 1984-08-08 1996-07-02 Liposome Company Dehydrated liposomes
US5367066A (en) 1984-10-16 1994-11-22 Chiron Corporation Oligonucleotides with selectably cleavable and/or abasic sites
FR2575751B1 (fr) 1985-01-08 1987-04-03 Pasteur Institut Nouveaux nucleosides de derives de l'adenosine, leur preparation et leurs applications biologiques
US5034506A (en) 1985-03-15 1991-07-23 Anti-Gene Development Group Uncharged morpholino-based polymers having achiral intersubunit linkages
US5185444A (en) 1985-03-15 1993-02-09 Anti-Gene Deveopment Group Uncharged morpolino-based polymers having phosphorous containing chiral intersubunit linkages
US5166315A (en) 1989-12-20 1992-11-24 Anti-Gene Development Group Sequence-specific binding polymers for duplex nucleic acids
US5506337A (en) 1985-03-15 1996-04-09 Antivirals Inc. Morpholino-subunit combinatorial library and method
US4921757A (en) 1985-04-26 1990-05-01 Massachusetts Institute Of Technology System for delayed and pulsed release of biologically active substances
US4920016A (en) 1986-12-24 1990-04-24 Linear Technology, Inc. Liposomes with enhanced circulation time
JPH0825869B2 (ja) 1987-02-09 1996-03-13 株式会社ビタミン研究所 抗腫瘍剤包埋リポソ−ム製剤
US4917951A (en) 1987-07-28 1990-04-17 Micro-Pak, Inc. Lipid vesicles formed of surfactants and steroids
US4911928A (en) 1987-03-13 1990-03-27 Micro-Pak, Inc. Paucilamellar lipid vesicles
EP0366685B1 (en) 1987-06-24 1994-10-19 Howard Florey Institute Of Experimental Physiology And Medicine Nucleoside derivatives
US5175273A (en) 1988-07-01 1992-12-29 Genentech, Inc. Nucleic acid intercalating agents
US5134066A (en) 1989-08-29 1992-07-28 Monsanto Company Improved probes using nucleosides containing 3-dezauracil analogs
US5130302A (en) 1989-12-20 1992-07-14 Boron Bilogicals, Inc. Boronated nucleoside, nucleotide and oligonucleotide compounds, compositions and methods for using same
US5457191A (en) 1990-01-11 1995-10-10 Isis Pharmaceuticals, Inc. 3-deazapurines
US6005087A (en) 1995-06-06 1999-12-21 Isis Pharmaceuticals, Inc. 2'-modified oligonucleotides
US5859221A (en) 1990-01-11 1999-01-12 Isis Pharmaceuticals, Inc. 2'-modified oligonucleotides
US5587470A (en) 1990-01-11 1996-12-24 Isis Pharmaceuticals, Inc. 3-deazapurines
US5681941A (en) 1990-01-11 1997-10-28 Isis Pharmaceuticals, Inc. Substituted purines and oligonucleotide cross-linking
US5459255A (en) 1990-01-11 1995-10-17 Isis Pharmaceuticals, Inc. N-2 substituted purines
US5149797A (en) 1990-02-15 1992-09-22 The Worcester Foundation For Experimental Biology Method of site-specific alteration of rna and production of encoded polypeptides
EP0544824B1 (en) 1990-07-27 1997-06-11 Isis Pharmaceuticals, Inc. Nuclease resistant, pyrimidine modified oligonucleotides that detect and modulate gene expression
US5432272A (en) 1990-10-09 1995-07-11 Benner; Steven A. Method for incorporating into a DNA or RNA oligonucleotide using nucleotides bearing heterocyclic bases
US6582908B2 (en) 1990-12-06 2003-06-24 Affymetrix, Inc. Oligonucleotides
US5948903A (en) 1991-01-11 1999-09-07 Isis Pharmaceuticals, Inc. Synthesis of 3-deazapurines
US5594121A (en) 1991-11-07 1997-01-14 Gilead Sciences, Inc. Enhanced triple-helix and double-helix formation with oligomers containing modified purines
US5484908A (en) 1991-11-26 1996-01-16 Gilead Sciences, Inc. Oligonucleotides containing 5-propynyl pyrimidines
TW393513B (en) 1991-11-26 2000-06-11 Isis Pharmaceuticals Inc Enhanced triple-helix and double-helix formation with oligomers containing modified pyrimidines
AU3222793A (en) 1991-11-26 1993-06-28 Gilead Sciences, Inc. Enhanced triple-helix and double-helix formation with oligomers containing modified pyrimidines
WO2002081494A1 (en) 2001-03-26 2002-10-17 Sirna Therapeutics, Inc. Oligonucleotide mediated inhibition of hepatitis b virus and hepatitis c virus replication
US20040054156A1 (en) 1992-05-14 2004-03-18 Kenneth Draper Method and reagent for inhibiting hepatitis B viral replication
US5434257A (en) 1992-06-01 1995-07-18 Gilead Sciences, Inc. Binding compentent oligomers containing unsaturated 3',5' and 2',5' linkages
KR940021073A (ko) 1993-03-02 1994-10-17 미야베 요시가즈 알쯔하이머병의 예방 또는 치료제, 그 스크리닝 방법 및 인간 유래의 타우 단백질 키나아제 i
US5502177A (en) 1993-09-17 1996-03-26 Gilead Sciences, Inc. Pyrimidine derivatives for labeled binding partners
US5801154A (en) 1993-10-18 1998-09-01 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense oligonucleotide modulation of multidrug resistance-associated protein
US5457187A (en) 1993-12-08 1995-10-10 Board Of Regents University Of Nebraska Oligonucleotides containing 5-fluorouracil
US5596091A (en) 1994-03-18 1997-01-21 The Regents Of The University Of California Antisense oligonucleotides comprising 5-aminoalkyl pyrimidine nucleotides
US5525711A (en) 1994-05-18 1996-06-11 The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Department Of Health And Human Services Pteridine nucleotide analogs as fluorescent DNA probes
USRE44779E1 (en) 1997-03-07 2014-02-25 Santaris Pharma A/S Bicyclonucleoside and oligonucleotide analogues
US6770748B2 (en) 1997-03-07 2004-08-03 Takeshi Imanishi Bicyclonucleoside and oligonucleotide analogue
JP3756313B2 (ja) 1997-03-07 2006-03-15 武 今西 新規ビシクロヌクレオシド及びオリゴヌクレオチド類縁体
US6794499B2 (en) 1997-09-12 2004-09-21 Exiqon A/S Oligonucleotide analogues
US7572582B2 (en) 1997-09-12 2009-08-11 Exiqon A/S Oligonucleotide analogues
DE69829760T3 (de) 1997-09-12 2016-04-14 Exiqon A/S Bi- und tri-zyklische - nukleosid, nukleotid und oligonukleotid-analoga
US20030228597A1 (en) 1998-04-13 2003-12-11 Cowsert Lex M. Identification of genetic targets for modulation by oligonucleotides and generation of oligonucleotides for gene modulation
WO1999062548A1 (en) 1998-06-01 1999-12-09 Advanced Research And Technology Institute Methods and compositions for diagnosing tauopathies
KR100573231B1 (ko) 1999-02-12 2006-04-24 상꾜 가부시키가이샤 신규 뉴클레오시드 및 올리고뉴클레오티드 유사체
US7084125B2 (en) 1999-03-18 2006-08-01 Exiqon A/S Xylo-LNA analogues
BR0009884A (pt) 1999-04-21 2002-01-08 American Home Prod Processos e composições para a inibição da função das sequências de polinucleotìdeos
AU776362B2 (en) 1999-05-04 2004-09-09 Roche Innovation Center Copenhagen A/S L-ribo-LNA analogues
US6525191B1 (en) 1999-05-11 2003-02-25 Kanda S. Ramasamy Conformationally constrained L-nucleosides
JP4151751B2 (ja) 1999-07-22 2008-09-17 第一三共株式会社 新規ビシクロヌクレオシド類縁体
EP1097941A1 (en) 1999-11-05 2001-05-09 Max-Planck-Gesellschaft zur Förderung der Wissenschaften e.V. Substance capable of controlling the inclusion of exon 10 of the tau gene, and its therapeutic use against tauopathies
JP2004509604A (ja) 2000-03-28 2004-04-02 アイシス・ファーマシューティカルス・インコーポレーテッド ｍＲＮＡプロセッシングのアンチセンスモジュレーションによる、細胞行動の改変
AU2001250572A1 (en) 2000-04-07 2001-10-23 Epigenomics Ag Detection of single nucleotide polymorphisms (snp's) and cytosine-methylations
US20050019915A1 (en) 2001-06-21 2005-01-27 Bennett C. Frank Antisense modulation of superoxide dismutase 1, soluble expression
US20030158403A1 (en) 2001-07-03 2003-08-21 Isis Pharmaceuticals, Inc. Nuclease resistant chimeric oligonucleotides
US20030175906A1 (en) 2001-07-03 2003-09-18 Muthiah Manoharan Nuclease resistant chimeric oligonucleotides
CA2452458A1 (en) 2001-07-03 2003-01-16 Isis Pharmaceuticals, Inc. Nuclease resistant chimeric oligonucleotides
EP1472335A4 (en) 2001-11-08 2005-12-28 Univ Johns Hopkins METHODS AND SYSTEMS FOR SEQUENCING NUCLEIC ACIDS
US20070203333A1 (en) 2001-11-30 2007-08-30 Mcswiggen James RNA interference mediated inhibition of vascular endothelial growth factor and vascular endothelial growth factor receptor gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
US20050153336A1 (en) 2002-03-29 2005-07-14 Bennett C. F. Compositions and their uses directed to nucleic acid binding proteins
US7569575B2 (en) 2002-05-08 2009-08-04 Santaris Pharma A/S Synthesis of locked nucleic acid derivatives
WO2004011613A2 (en) 2002-07-29 2004-02-05 Epigenesis Pharmaceuticals, Inc. Composition & methods for treatment and screening
US20050106731A1 (en) 2002-08-05 2005-05-19 Davidson Beverly L. siRNA-mediated gene silencing with viral vectors
US20040241854A1 (en) 2002-08-05 2004-12-02 Davidson Beverly L. siRNA-mediated gene silencing
AU2003255435A1 (en) 2002-08-14 2004-03-03 Universitat Zurich A cellular assay system for neurofibrillary tangle formation
WO2004035765A2 (en) 2002-10-18 2004-04-29 Nucleonics, Inc. Double-stranded rna structures and constructs, and methods for generating and using the same
EP1562971B1 (en) 2002-11-05 2014-02-12 Isis Pharmaceuticals, Inc. Polycyclic sugar surrogate-containing oligomeric compounds and compositions for use in gene modulation
AU2003295387A1 (en) 2002-11-05 2004-06-03 Isis Parmaceuticals, Inc. Modified oligonucleotides for use in rna interference
US8090542B2 (en) 2002-11-14 2012-01-03 Dharmacon Inc. Functional and hyperfunctional siRNA
US20080318210A1 (en) 2003-08-27 2008-12-25 Rosetta Genomics Bioinformatically detectable group of novel regulatory viral and viral associated oligonucleotides and uses thereof
US6673661B1 (en) 2002-12-20 2004-01-06 Taiwan Semiconductor Manufacturing Co., Ltd. Self-aligned method for forming dual gate thin film transistor (TFT) device
WO2004106356A1 (en) 2003-05-27 2004-12-09 Syddansk Universitet Functionalized nucleotide derivatives
AU2003904328A0 (en) 2003-08-13 2003-08-28 Garvan Institute Of Medical Research Diagnosis and treatment of neurodegenerative disorders
DK1661905T3 (da) 2003-08-28 2012-07-23 Takeshi Imanishi Hidtil ukendte syntetiske nukleinsyrer af N-O-krydsbindingstype
AU2004274021B2 (en) 2003-09-18 2009-08-13 Isis Pharmaceuticals, Inc. 4'-thionucleosides and oligomeric compounds
US20050108783A1 (en) 2003-09-23 2005-05-19 Chihiro Koike Porcine invariant chain protein, full length cDNA, genomic organization, and regulatory region
US20050244851A1 (en) 2004-01-13 2005-11-03 Affymetrix, Inc. Methods of analysis of alternative splicing in human
AU2005248147A1 (en) 2004-05-11 2005-12-08 Alphagen Co., Ltd. Polynucleotides for causing RNA interference and method for inhibiting gene expression using the same
CN100410383C (zh) 2004-05-11 2008-08-13 中国农业科学院生物技术研究所 一种昆虫杆状病毒生物反应器的制备方法
AU2005253776B8 (en) 2004-06-21 2012-02-02 King's College London Screening methods using c-Abl, Fyn and Syk in combination with tau protein
US7964346B2 (en) 2004-10-27 2011-06-21 Rubin Donald H Mammalian genes involved in infection
US20080003570A1 (en) 2004-12-22 2008-01-03 The General Hospital Corporation Translation enhancer elements of genes encoding human Tau protein and human alpha-synuclein protein
US20060216722A1 (en) 2005-03-25 2006-09-28 Christer Betsholtz Glomerular expression profiling
JP5523705B2 (ja) 2005-08-29 2014-06-18 レグルス・セラピューティクス・インコーポレイテッド Ｍｉｒ−１２２ａをモジュレートする使用方法
ATE529441T1 (de) 2005-08-30 2011-11-15 Novo Nordisk As Expression von proteinen in e.coli
US7569686B1 (en) 2006-01-27 2009-08-04 Isis Pharmaceuticals, Inc. Compounds and methods for synthesis of bicyclic nucleic acid analogs
CA2640171C (en) 2006-01-27 2014-10-28 Isis Pharmaceuticals, Inc. 6-modified bicyclic nucleic acid analogs
US8178503B2 (en) 2006-03-03 2012-05-15 International Business Machines Corporation Ribonucleic acid interference molecules and binding sites derived by analyzing intergenic and intronic regions of genomes
GB0605337D0 (en) 2006-03-17 2006-04-26 Genomica Sau Treatment of CNS conditions
CA3044969A1 (en) * 2006-05-05 2007-12-21 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compounds and methods for modulating gene expression
US7666854B2 (en) 2006-05-11 2010-02-23 Isis Pharmaceuticals, Inc. Bis-modified bicyclic nucleic acid analogs
JP5441688B2 (ja) 2006-05-11 2014-03-12 アイシス ファーマシューティカルズ， インコーポレーテッド ５’修飾二環式核酸類似体
US20110150897A1 (en) 2006-10-11 2011-06-23 Meyer Thomas F Influenza targets
JP2010507387A (ja) 2006-10-25 2010-03-11 クアーク・ファーマスーティカルス、インコーポレイテッド 新規のｓｉＲＮＡおよびその使用方法
WO2008101157A1 (en) 2007-02-15 2008-08-21 Isis Pharmaceuticals, Inc. 5'-substituted-2'-f modified nucleosides and oligomeric compounds prepared therefrom
WO2008124066A1 (en) 2007-04-05 2008-10-16 The J. David Gladstone Institutes Agents that reduce neuronal overexcitation
KR20170056032A (ko) 2007-05-01 2017-05-22 로슈 이노베이션 센터 코펜하겐 에이/에스 Ｔｎｆ 슈퍼패밀리 수용체에 대한 스플라이스 스위칭 올리고머 및 질병 치료에 있어서의 그의 용도
EP2170917B1 (en) 2007-05-30 2012-06-27 Isis Pharmaceuticals, Inc. N-substituted-aminomethylene bridged bicyclic nucleic acid analogs
ES2386492T3 (es) 2007-06-08 2012-08-21 Isis Pharmaceuticals, Inc. Análogos de ácidos nucleicos bicíclicos carbocíclicos
US20100261175A1 (en) 2007-06-15 2010-10-14 Exiqon A/S Use of short oligonucleotides for reagent redundancy experiments in rna functional analysis
CN101796062B (zh) 2007-07-05 2014-07-30 Isis制药公司 6-双取代双环核酸类似物
JP5572090B2 (ja) 2007-08-15 2014-08-13 アイシス ファーマシューティカルズ， インコーポレーテッド テトラヒドロピラン核酸類似体
US20090076725A1 (en) 2007-09-14 2009-03-19 Kulvir Singh Bhogal Conveyance mode aware navigation device
WO2009067647A1 (en) 2007-11-21 2009-05-28 Isis Pharmaceuticals, Inc. Carbocyclic alpha-l-bicyclic nucleic acid analogs
EP2265627A2 (en) 2008-02-07 2010-12-29 Isis Pharmaceuticals, Inc. Bicyclic cyclohexitol nucleic acid analogs
AU2009235941A1 (en) 2008-04-07 2009-10-15 Riken RNA molecules and uses thereof
DK2356129T3 (da) 2008-09-24 2013-05-13 Isis Pharmaceuticals Inc Substituerede alpha-L-bicykliske nukleosider
PT3449926T (pt) 2009-06-17 2019-11-12 Cold Spring Harbor Laboratory Composições e métodos de modulação de excisões de smn2 em um sujeito
US20140004565A1 (en) 2009-07-06 2014-01-02 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Cell-based bioprocessing
EP2451823A4 (en) 2009-07-06 2013-07-03 Alnylam Pharmaceuticals Inc COMPOSITIONS AND METHODS FOR ENHANCING THE PRODUCTION OF A BIOLOGICAL PRODUCT
US20110041191A1 (en) 2009-07-09 2011-02-17 Bettina Platt Animal model, and products and methods useful for the production thereof
WO2011017521A2 (en) 2009-08-06 2011-02-10 Isis Pharmaceuticals, Inc. Bicyclic cyclohexose nucleic acid analogs
EP3561060A1 (en) 2010-02-08 2019-10-30 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Selective reduction of allelic variants
US9102938B2 (en) 2010-04-01 2015-08-11 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. 2′ and 5′ modified monomers and oligonucleotides
KR20130103662A (ko) 2010-04-19 2013-09-24 엔라이프 떼라퓨틱스, 에스.엘. 올리고뉴클레오티드 분자들의 특정 뉴런 유형들로의 선택적인 전달을 위한 조성물들 및 방법
US10913767B2 (en) 2010-04-22 2021-02-09 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotides comprising acyclic and abasic nucleosides and analogs
EP2601204B1 (en) 2010-04-28 2016-09-07 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modified nucleosides and oligomeric compounds prepared therefrom
WO2012005898A2 (en) 2010-06-15 2012-01-12 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Chinese hamster ovary (cho) cell transcriptome, corresponding sirnas and uses thereof
WO2012018881A2 (en) 2010-08-03 2012-02-09 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Methods and compositions for the regulation of rna
WO2012145582A2 (en) 2011-04-22 2012-10-26 Dicerna Pharmaceuticals, Inc. Methods and compositions for the specific inhibitions of egfr by double-stranded rna
WO2012177639A2 (en) 2011-06-22 2012-12-27 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Bioprocessing and bioproduction using avian cell lines
WO2013066721A2 (en) 2011-11-04 2013-05-10 Dicerna Pharmaceuticals, Inc. Methods and compositions for the specific inhibition of met by double-stranded rna
US10273474B2 (en) 2012-03-30 2019-04-30 Washington University Methods for modulating Tau expression for reducing seizure and modifying a neurodegenerative syndrome
CA2873801A1 (en) 2012-05-16 2013-11-21 Rana Therapeutics Inc. Compositions and methods for modulating apoa1 and abca1 expression
KR20240148947A (ko) 2012-07-13 2024-10-11 웨이브 라이프 사이언시스 리미티드 키랄 제어
GB201301233D0 (en) 2013-01-24 2013-03-06 Queen Mary & Westfield College Method
RU2745324C2 (ru) 2013-03-14 2021-03-23 Ионис Фармасьютикалз, Инк. Композиции и способы модулирования экспрессии tau
PE20152002A1 (es) 2013-05-01 2016-01-21 Isis Pharmaceuticals Inc Composiciones y metodos para modular la expresion de ttr y vhb
TWI772856B (zh) * 2013-07-19 2022-08-01 美商百健Ｍａ公司 用於調節τ蛋白表現之組合物
US10119136B2 (en) 2014-01-09 2018-11-06 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. RNAi agents modified at the 4′-C position
KR101614358B1 (ko) * 2014-03-02 2016-04-21 신창섭 지면 밀착식 박판형 확대 지압판
US20170211064A1 (en) 2014-07-29 2017-07-27 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for modulating tau expression
UY36550A (es) 2015-02-04 2016-08-31 Roche Innovation Ct Copenhagen As Oligómeros antisentido de tau y sus usos
EP3253871A1 (en) 2015-02-04 2017-12-13 Bristol-Myers Squibb Company Lna oligonucleotides with alternating flanks
EP3274456B1 (en) 2015-03-25 2020-06-24 Università Degli Studi Di Trento Rna interference mediated therapy for neurodegenerative diseases
CN108025089A (zh) 2015-07-22 2018-05-11 波涛生命科学有限公司 寡核苷酸组合物及其方法
JOP20200228A1 (ar) 2015-12-21 2017-06-16 Novartis Ag تركيبات وطرق لخفض تعبير البروتين tau
JOP20190065A1 (ar) * 2016-09-29 2019-03-28 Ionis Pharmaceuticals Inc مركبات وطرق لتقليل التعبير عن tau

Also Published As

Publication number Publication date
AU2023229540A1 (en) 2023-10-05
ES2963428T3 (es) 2024-03-27
DK3519572T5 (da) 2024-09-02
BR112019003162A2 (pt) 2019-07-09
HRP20231606T1 (hr) 2024-03-15
AU2017336093A1 (en) 2019-03-07
MY210293A (en) 2025-09-09
FI3519572T3 (fi) 2023-12-13
CA3038891C (en) 2025-11-25
US20240301422A1 (en) 2024-09-12
US11053498B2 (en) 2021-07-06
JP2024091814A (ja) 2024-07-05
JOP20240072A1 (ar) 2024-03-27
US20200199589A1 (en) 2020-06-25
EP4335923A3 (en) 2024-05-29
JOP20190065A1 (ar) 2019-03-28
EP3519572B1 (en) 2023-11-22
JP2019529489A (ja) 2019-10-17
EP3519572A1 (en) 2019-08-07
AU2017336093B2 (en) 2020-08-13
CL2019000703A1 (es) 2019-08-09
CL2020000183A1 (es) 2020-07-24
PL3519572T3 (pl) 2024-02-26
KR102286223B1 (ko) 2021-08-11
CN109790543A (zh) 2019-05-21
BR122020019785B1 (pt) 2023-10-03
CO2019001385A2 (es) 2019-02-19
MX2023009095A (es) 2023-08-09
SMT202300441T1 (it) 2024-01-10
DK3519572T3 (da) 2023-12-18
AU2020267230A1 (en) 2020-12-10
LT3519572T (lt) 2023-12-11
US10407680B2 (en) 2019-09-10
NZ750642A (en) 2020-08-28
IL299615A (en) 2023-03-01
EP3519572A4 (en) 2020-06-17
IL265124B (en) 2022-02-01
CN113481201A (zh) 2021-10-08
EP4335923A2 (en) 2024-03-13
CN109790543B (zh) 2021-07-16
WO2018064593A1 (en) 2018-04-05
BR112019003162B1 (pt) 2022-03-15
PT3519572T (pt) 2023-11-30
US20180119145A1 (en) 2018-05-03
CR20210028A (es) 2021-02-26
MX2019003633A (es) 2019-09-19
JP2020193199A (ja) 2020-12-03
IL289789A (en) 2022-03-01
MD3519572T2 (ro) 2024-03-31
ZA201900920B (en) 2021-06-30
SG11201901140QA (en) 2019-03-28
CR20190214A (es) 2019-07-11
IL289789B2 (en) 2023-06-01
JP6738004B2 (ja) 2020-08-12
HUE065170T2 (hu) 2024-05-28
KR20210097228A (ko) 2021-08-06
SI3519572T1 (sl) 2024-02-29
PE20190655A1 (es) 2019-05-08
JP7477569B2 (ja) 2024-05-01
KR20190054145A (ko) 2019-05-21
JP2022168013A (ja) 2022-11-04
CA3038891A1 (en) 2018-04-05
ZA202101001B (en) 2022-06-29

Similar Documents

Publication Publication Date Title
EP3519572B1 (en) Compounds and methods for reducing tau expression
TWI833770B (zh) 用於減少 lrrk2 表現之化合物及方法
CN112423767B (zh) 用于减少atxn2表达的化合物和方法
EP3484524B1 (en) Compounds and methods for modulation of smn2
EP4434585B1 (en) Compounds and methods for reducing snca expression
CN113286886B (zh) 用于减少朊病毒表达的化合物和方法
EP3538656B1 (en) Compounds for reducing atxn3 expression
EP4663758A2 (en) Compounds and methods for reducing atxn3 expression
US20190211332A1 (en) Compounds and methods for reducing tau expression
CN121674396A (zh) 用于降低kcnt1表达的化合物和方法
EP3976791B1 (en) Compounds and methods for reducing fus expression
HK40107010A (en) Compounds and methods for reducing tau expression
HK40011819B (en) Compounds and methods for reducing tau expression
HK40011819A (en) Compounds and methods for reducing tau expression
HK40116398A (en) Compounds and methods for reducing snca expression
EA042908B1 (ru) Модифицированные олигонуклеотиды и их применение для снижения экспрессии тау-белка
HK40008058B (en) Compounds and methods for modulation of smn2
HK40008058A (en) Compounds and methods for modulation of smn2