PT2330131E - Anticorpos contra a variante truncada de her-2 ctf-611 - Google Patents

Description

DESCRIÇÃO "ANTICORPOS CONTRA A VARIANTE TRUNCADA DE HER-2 CTF-611"

Descrição A presente invenção refere-se a um método de diagnóstico em amostras isoladas de cancros expressando a variante truncada CTF-611 do recetor HER2. A invenção também fornece compostos para uso no diagnóstico precoce e identificação do cancro assim como para uso em terapia.

ANTECEDENTES DA TÉCNICA DA ARTE HER2 (também conhecido como c-erbB2, ErbB2 ou Neu) é uma proteina transmembranar tipo I pertencente à familia dos recetores do fator de crescimento epidérmico ou EGFR, também conhecido como HERl ou ErbBl. Dois membros adicionais, HER3 e HER4 completam esta familia. Quando HERl, 3 ou 4 se liga a um ligando de tipo EGF, o seu dominio extracelular adota a conformação referida como "aberta", que permite a formação de homodimeros e heterodimeros. Mesmo se não se ligar a qualquer ligando, HER2 também interage com outros recetores HER ligados a um ligando, devido ao facto de que o seu dominio extracelular está constitutivamente em conformação "aberta". A dimerização dirigida pelo dominio extracelular leva a interação da cinase intracelular dos recetores HER e à transfosforilação posterior de alguns residuos de tirosina. Estas fosfotirosinas atuam como acopladores de um grupo de proteínas intracelulares que se ligam a fosfotirosina. As interações estabelecidas na membrana plasmática são transduzidas para o núcleo da célula por meio de diferentes vias de sinalização, tais como a via da proteína cinase ativada pela mitogen activated protein kinase (MAPK), a via de proteína cinase ativada por stress (JNK), fosfolipase C gama, etc. Todos estes circuitos de sinalização controlam a expressão de genes que atuam de forma coordenada para modificar aspetos determinantes do estado da célula, tais como a proliferação celular, migração, sobrevivência e adesão. Portanto, dependendo do contexto da célula, a ativação dos recetores HER resulta numa resposta celular dramática, que pode variar de transformação para uma célula maligna a uma senescência prematura.

Em tumores mamários humanos, uma série de fragmentos carboxi-terminais ou CTFs têm sido frequentemente encontrados, que são assumidos incluir os domínios transmembranares e citoplasmáticos de HER2. (Molina et ai, "NH(2)-terminal truncated HER2 protein but not full-length receptor is associated with nodal metastasis in human breast câncer", Clinicai Câncer Research-2002, Vol. 8, pp. 347-353). Também é sabido que pacientes com cancro da mama expressando os CTFs de HER2, ou o que vêm a ser as mesmas formas truncadas que não incluem a extremidade N-terminal de HER2 (CTFs de HER2), têm uma maior probabilidade de desenvolver metástases (Molina et ai. 2002 - supra) e um pior prognóstico do que aqueles pacientes que expressam principalmente a forma completa de HER2 (Saez et ai., "p95HER2 predicts worse outcome in patients with HER2-positive breast câncer", Clinicai Câncer Research-2006, Vol. 12, pp. 424-431).

Portanto, é muito importante ser capaz de detetar a presença de HER2 em tumores atempadamente e ainda mais determinar se se encontra na forma completa ou truncada (CTF) .

Hoje em dia, a nivel de exames clinicos de rotina anticorpos são usados para detetar a presença da forma completa de HER2, a fim de determinar o tipo de tumor mamário em questão. No caso de se detetar a presença de HER2, a terapia recomendada consiste em administrar anticorpos monoclonais terapêuticos, tais como trastuzumabe da Genentech. 0 uso deste anticorpo monoclonal para o tratamento de cancro é descrito no pedido WO 8906692 em nome da Genentech. WO 8906692 descreve anticorpos monoclonais ou policlonais dirigidos contra a região extracelular de HER2, esta região extracelular correspondendo à parte externa completa da proteina, que é a sua extremidade N-terminal. Como mencionado anteriormente, os epitopos reconhecidos pelos anticorpos citados em WO 8906692 são regiões antigénicas do dominio extracelular da forma completa de HER2 e não estão incluídos em formas truncadas ou fragmentos carboxi-terminais de HER2. Portanto, com os anticorpos e o método de diagnóstico descrito em WO 8906692 não será possivel detetar a presença de HER2 truncado (CTFs). Também, em tumores mamários onde os CTFs de HER2 referidos são expressos, anticorpos tais como trastuzumabe não são terapêuticos, uma vez que não reconhecem qualquer epitopo. Este facto explica a resistência ao tratamento com trastuzumabe observada em pacientes expressando formas truncadas (CTFs) de HER2.

Pacientes que expressam formas truncadas de HER2 ou CTFs devem ser tratados com terapias alternativas para evitar os números de mau prognóstico observados por Saez et ai 2006 (supra). Para efeitos de deteção (diagnóstico) e tratamento logo que possivel de pessoas com tumores onde formas truncadas de HER2 são expressas, é muito interessante ser capaz de distinguir qual a forma de HER2 que é expressa para atuar conformemente. 0 documento de Anido et ai., "Biosynthesis of tumorigenic HER2 C-terminal fragments by alternative initiation of translation", European Molecular Biology Organization (EMBO) Journal - 2006, Vol. 25, pp. 3234-3244, descreve que em adição ao fragmento gerado pela ação das alfa-secretases sobre o HER2, que dá origem a uma forma truncada (CTF) conhecida como P95 que inclui o fragmento transmembranar e citoplasmático do recetor, duas formas truncadas (CTF) são também geradas através de um mecanismo de iniciação da tradução alternativo a partir de duas metioninas situadas a montante e a jusante, respetivamente, do dominio transmembranar de HER2. Especificamente, as metioninas para a iniciação de tradução alternativa correspondem a metionina 611 e metionina 687 da sequência de aminoácidos com número de acesso M11730.1 da base de dados UniGene do National Center for Biotechnology Information (NCBI) . Este documento também mostra que estas formas alternativas do recetor HER2 (CTFs) estão presentes em tumores mamários. Em particular, indica que a mais abundante corresponde à forma conhecida como CTF687, ou em outras palavras, à proteina obtida pela iniciação alternativa da tradução a partir da metionina na posição 687. Anido et ai. propõem como terapia o uso de inibidores da atividade da tirosina cinase de HER2, tais como o lapatinib, a fim de minimizar o crescimento dos tumores expressando estas formas truncadas de HER2. Os inibidores de tirosina cinases atuam interagindo com a extremidade C-terminal do recetor HER2 que está presente de forma integral em ambos os recetores completos e nos CTFs derivados dos mesmos ou produzidos pela iniciação alternativa da tradução. 0 documento de Scaltriti et ai, "Expression of p95HER2, a truncated form of the HER2 Receptor, and response to anti-HER2 therapies in breast câncer", Journal of National Câncer Institute-2007, Vol. 99, pp. 628-368, representa um exemplo de um estudo sobre uma metodologia alternativa para detetar a presença de uma das formas do recetor truncado HER2 e lista algumas das possíveis causas da resistência ao tratamento com trastuzumabe (Herceptin). Em particular, salienta a acumulação do fragmento p95HER2 (produto da proteólise de HER2 por alfa-secretases) e outras formas truncadas do recetor, que não possuem o dominio extracelular reconhecido por Trastuzumabe. Scaltriti propõe um método de imunofluorescência para detetar o fragmento p95HER2 (produto de proteólise por alfa-secretases) . Este novo método de deteção pode ser realizado em secções de tecido incorporado em parafina e fixado com formalina seguindo protocolos clinicos. A nova metodologia surge da observação de que a forma truncada p95HER2, e não a forma completa do recetor, está localizado tanto na membrana plasmática como no citoplasma da célula. Este método propõe comparar se há expressão de p95HER2 por meio de coloração do citoplasma detetado com um anticorpo anti-HER2 que se liga ao dominio citoplasmático do recetor; e confirmar estes resultados com os de uma deteção com um anticorpo anti-citoqueratina, uma proteina cuja distribuição tem sido extensivamente usada como uma ferramenta para o diagnóstico de tumores. No entanto, não é claro se este método distingue de forma eficiente esses tumores que expressam a forma completa de HER2 daqueles que expressam as formas truncadas. 0 documento de Pedersen et al. , "A naturally occurring HER2 carboxy-terminal fragment promotes mammary tumor growth and metstasis", Molecular and Cellular Biology, 2009, Vol. 29(12), pp. 3319-3331, descreve a relevância funcional da variante truncada CTF-611 do recetor HER2. É mostrado que a presença de CTF-611 leva ao aumento da expressão de diversos genes que estão causalmente envolvidos em metástases, tais como MMP1, ANGPTL4, MET e IL11, e dos genes que contribuem para diferentes aspetos do desenvolvimento maligno, como CD44, BCL2A1, ADAM9, PLAUR e EPHA1. In vivo, expressão de CTF-611 na glândula mamária de ratinho levou ao desenvolvimento de tumores agressivos, que adicionalmente levaram a metástase pulmonar a alta frequência. WO 2010/000 565 Al divulga anticorpos anti-HERÉ produzidos por outras linhas celulares. Há uma necessidade de localizar alvos novos e eficientes para diagnóstico e terapia, devidamente correlacionados com o tipo de cancro em questão e que tornam possível tratar atempadamente com terapias eficientes esses tumores que apresentam o pior prognóstico, descartando-se desde o início as terapias que foram observadas não serem eficazes. À luz de estudos anteriores é necessário distinguir a variante truncada CTF-611 do recetor HER2 das versões completas e outras truncadas, tais como p95-HER2, uma vez que CTF-611 está envolvido no desenvolvimento de tumores mais agressivos com maior tendência à metástase em comparação com outras formas do recetor HER2. A presente invenção oferece benefícios relacionados com os problemas citados acima e representa uma nova solução na classificação precoce do cancro, especialmente cancro da mama.

SUMÁRIO DA INVENÇÃO

Foi determinado que a presença de uma das formas truncadas (CTF) de HER2, gerada pela iniciação alternativa da tradução, correlaciona-se muito bem com a previsão do tipo de cancro a ser tratado, tornando mais fácil a tarefa do médico no momento da prescrição de um regime de tratamento. Esta forma truncada de HER2 (CTF-611) foi identificada e descoberta possuir a sequência representada por SEQ ID NO: 1.

Esta sequência tem sido utilizada para desenvolver diversas ferramentas para detetar a sua presença em amostras de tecido e preferencialmente para distingui-la de p95-HER2 e HER2 de sequência completa, assim fornecendo um conjunto de diagnóstico novo e sólido que é também aplicável nas rotinas clínicas. A presente invenção fornece novos anticorpos, ou fragmentos dos mesmos, que reconhecem esta forma truncada CTF-611 de HER2, que não é reconhecida por trastuzumabe. Estes anticorpos reconhecem um epítopo que é definido por uma sequência incluída na SEQ ID NO:2. A invenção também fornece linhas celulares de hibridoma adequadas para a produção de tais anticorpos. Anticorpos anti-HER2 disponíveis atualmente reconhecem CTFs e HER2 ou apenas HER2, tornando muito difícil discriminar pacientes que expressam apenas HER2 de pacientes que expressam HER2 e CTFs. Em contraste com anticorpos anti-HER2 disponíveis, os anticorpos descritos aqui ligam-se preferencialmente a CTF-611, permitindo a identificação de pacientes que expressam este CTF.

Os anticorpos fornecidos pela presente invenção detetam especificamente CTF-611, representada pela SEQ ID NO:1 e são capazes de distinguir CTF-611 de CTF-616 e preferencialmente capazes de distinguir CTF-611 de CTF-613. Os anticorpos fornecidos pela presente invenção, no entanto, preferencialmente não se ligam a HER2 de sequência completa e p95-HER2. A presente invenção também se refere a um método de diagnóstico de cancro em amostras de pacientes que compreende a deteção da presença nas amostras referidas da forma truncada de recetor HER2 consistindo da SEQ ID NO:1. A presente invenção fornece também o uso do anticorpo ou fragmento do mesmo da presente invenção para o diagnóstico e determinação do prognóstico em amostras isoladas de cancros onde o recetor HER2 é expresso. A presente invenção fornece adicionalmente um agente de diagnóstico e determinação do prognóstico em amostras isoladas de cancros onde o recetor HER2 e/ou fragmentos C-terminais é expresso, que inclui pelo menos um anticorpo ou um fragmento do mesmo conforme descrito acima. A presente invenção também fornece um kit de diagnóstico e determinação do prognóstico em amostras isoladas de cancros, onde o recetor HER2 é expresso, que compreende meios para detetar a presença na amostra referida da forma truncada do recetor HER2 consistindo da SEQ ID NO:1. A invenção também fornece um anticorpo ou um fragmento do mesmo conforme descrito acima para uso em terapia ou no fabrico de um medicamento. Em particular, o medicamento é para o tratamento ou prevenção de cancros onde pelo menos a forma truncada do recetor HER2 consistindo da SEQ ID NO:1 é expressa.

De acordo com uma outra caracteristica da invenção, o uso de anticorpos ou fragmentos é para o fabrico de um medicamento para tratar ou prevenir cancro da mama em mamíferos, incluindo seres humanos.

Outro objeto da presente invenção é uma composição farmacológica para o tratamento de cancros em que pelo menos a forma truncada do recetor HER2 consistindo da SEQ ID NO:1 é expressa, que compreende um anticorpo ou um fragmento do mesmo conforme descrito acima e pelo menos um excipiente e/ou portador farmacologicamente aceitável.

BREVE DESCRIÇÃO DOS DESENHOS

Fig.l: Diagrama da sequência proteica da forma truncada CTF-611, em comparação com a sequência do recetor HER2 completo e com a forma truncada conhecida como p95 (648-CTF/p95), produto da proteólise por alfa-secretases. 0 dominio transmembranar é representado como uma linha helicoidal. A molécula restante é indicada com uma caixa cinzenta. A sequência do péptido usado para gerar anticorpos mono e policlonais aparece sublinhada. As posições de pontes dissulfeto intramoleculares são também indicadas com conexões entre as cisteinas.

Fig.2: Eletroforese e Western-blot (transferência para membrana) das amostras de cancro da mama. (S) significa a fração solúvel e (M) fração de membrana. A fim de detetar HER2 completo e a forma CTF-611, anticorpos dirigidos ao dominio citoplasmático das proteínas foram usados. DHL: Lacatato Desidrogenase (usado como controlo).

Fig.3: Resultados da avaliação do número de tumores desenvolvidos em ratinhos transgénicos que expressam a forma truncada CTF-611 (Fig. 3A) em comparação com ratinhos transgénicos que expressam o recetor HER2 completo; e os resultados do volume dos tumores detetados. (FIG. 3B) . No eixo Y, N e V significam Número de Tumores e Volume dos Tumores, respetivamente. No eixo X, T refere-se a Tempo em semanas.

Fig.4: Western blot: lisados celulares de células MCF7 transfetadas de forma estável com construções de cDNA codificando HER2 (poços da esquerda), 611-CTF (poços do meio) e 648-CTF (poços da direita) foram analisados com CB11 (A), um anticorpo monoclonal comercial dirigido contra o dominio intracelular de HER2, com o anticorpo monoclonal 214D8cl2h4 (B) , ou com o anticorpo monoclonal 226H4e8dlO. Apenas os resultados correspondentes a 214D8cl2h4 são mostrados. Resultados semelhantes foram obtidos com 226H4e8dlO.

Fig.5: Imunoprecipitação: Uma mistura 1:1:1 de lisados celulares de células MCF7 transfetadas de forma estável com construções de cDNA codificando HER2, 611-CTF e CTF-648 foi incubada com anticorpos CB11, trastuzumabe (um anticorpo monoclonal contra o dominio extracelular de HER2 que não reconhece 611-CTF), 214D8cl2h4 ou 226H4e8dlO. Imuno-complexos foram recolhidos com proteina A, lavados e analisados por Western blot com CB11. Apenas os resultados correspondentes a 214D8cl2h4 são mostrados. Resultados semelhantes foram obtidos com 226H4e8dlO.

Fig.6: Mapeamento de epitopo: A: Ilustração esquemática de CTF-611, 613-CTF e CTF-616 B: Western blot: Lisados de células expressando CTF-611, 613-CTF e CTF-616 foram analisados com CB11 (esquerda), um anticorpo monoclonal comercial dirigido contra o dominio intracelular de HER2, com o anticorpo monoclonal 214D8cl2h4 (meio), ou com o anticorpo monoclonal 226H4e8dlO (direita).

Fig.7: Imunofluorescência: células MCF7 transfetadas de forma estável com construções de cDNA codificando HER2 (imagens na coluna da esquerda), 611-CTF (imagens na coluna do meio) e 648-CTF (imagens na coluna da direita) foram analisadas por imunofluorescência indireta com CB11, um anticorpo monoclonal comercial dirigido contra o dominio intracelular de HER2, com o anticorpo monoclonal 214D8cl2h4, ou com o anticorpo monoclonal 226H4e8dlO.

Fig.8: Imuno-histoquimica: células MCF7 transfetadas de forma estável com construções de cDNA codificando HER2, 611-CTF e CTF-648 foram analisadas por imuno-histoquimica com CB11 (imagens na coluna da esquerda), um anticorpo monoclonal comercial dirigido contra o domínio intracelular de HER2, ou o anticorpo monoclonal 214D8cl2h4 (imagens na coluna da direita) ou os anticorpos monoclonais 226H4. Apenas os resultados correspondentes a 214D8 são mostrados. Resultados semelhantes foram obtidos com 226D8.

DESCRIÇÃO PORMENORIZADA CTF-611

Como mencionado anteriormente, os inventores descobriram que, surpreendentemente, a deteção diferencial da forma truncada de HER2 referida com SEQ ID NO:1 correlaciona-se muito bem com a manifestação de um tipo comum de cancro no tecido mamário com um mau prognóstico. Portanto, a Fig. 3 mostra os resultados da avaliação do número de tumores desenvolvidos em ratinhos transgénicos expressando a forma truncada CTF-611 (SEQ ID NO:1). A fim de obter os resultados desta Fig. 3, construções de cDNA foram expressas no epitélio mamário de ratinhos, tais construções codificando a SEQ ID NO:1 (CTF-611) humana, identificada na figura como M611-CTF. Esta construção compreende a SEQ ID NO:1 sob o controlo do promotor do vírus do tumor mamário de ratinho (MMTV). Como controlo a linha de ratinho FVB/N-Tg(MMTVneu)202J que expressa a forma completa de HER2 foi usada, também sob controlo do promotor MMTV. Como pode ser deduzido da Fig. 3A, o número de tumores em ratinhos expressando a construção de cDNA com a forma CTF-611 (SEQ ID NO:1) é muito mais alto do que o da linha FVB/N-Tg(MMTVneu)202J, identificada nesta figura com a designação HER2/neu. Os tumores nos animais transgénicos foram detetados a 17 semanas de idade dos animais transgénicos expressando CTF-611, o que representa três meses antes da primeira deteção em ratinhos FVB/N-Tg(MMTVneu)202J. Este facto explicaria a maior agressividade dos tumores que expressam fragmentos de HER2 em relação àqueles tumores que expressam a forma completa. A Fig. 3B mostra também que o volume dos tumores é muito maior nos animais expressando a forma truncada CTF de HER2 com SEQ ID NO:1, em relação àqueles animais que expressam constitutivamente o recetor completo, também conhecido como HER2/neu. Este segundo facto também explica a maior agressividade deste tipo de tumores. Os inventores também determinaram que os tumores expressando a forma truncada de sequência SEQ ID NO:1 mostraram indices de metástases pulmonares mais elevados do que aqueles observados nos tumores expressando HER2/neu. Experiências adicionais provando a relevância clinica são fornecidas no Exemplo 7 abaixo.

Todos estes dados com animais transgénicos revelam que a deteção diferencial da forma truncada do recetor HER2 de SEQ ID NO:1 em relação à forma completa do recetor é muito necessária.

Evidentemente, a SEQ ID NO:1 referida inclui todas as variantes derivadas de variações alélicas entre indivíduos, o que implica variações no número e tipo, de alguns aminoácidos, tais como mais ou menos do que dois ou três aminoácidos, ou a substituição de um aminoácido por outro que não modifica a estrutura global do recetor.

Estas formas truncadas de HER2 podem conter neo-epitopos, em outras palavras, novos determinantes antigénicos não presentes na molécula do recetor completo, significando que eles não interagem da mesma forma com as moléculas como com o recetor completo (anticorpos, medicamentos, etc.).

Anticorpos para CTF-611

Os inventores puderam produzir anticorpos monoclonais para CTF-611. Estes anticorpos reconhecem um epítopo que é definido por uma sequência incluída na SEQ ID N0:2, preferencialmente por uma sequência incluída em ou definida pela SEQ ID NO:3. Mais preferidos são anticorpos que reconhecem um epítopo que está incluído em ou definido por MPIWKFPDEEGAS (SEQ ID N0:5).

No contexto da presente invenção, por epítopo entende-se a parte de uma macromolécula de tipo peptídico (ou de um antigénio), cuja sequência e/ou configuração espacial é reconhecida pelo sistema imune (anticorpos, células T, Células B).

Os anticorpos de acordo com a presente invenção são capazes de reconhecer CTF-611 e distinguir CTF-611 de CTF-616 (SEQ ID N0:7), e preferencialmente distinguir CTF-611 de CTF-613 (SEQ ID NO:6).

Os anticorpos da presente invenção preferencialmente podem distinguir a proteína da SEQ ID NO:1 do recetor HER2. Além disso, os anticorpos da presente invenção preferencialmente podem distinguir a proteína de SEQ ID NO:1 da forma truncada 648-CTF/p95 do recetor HER2. Esta distinção pode ser visualizada por uma ou mais de imunof luorescência, citometria de fluxo, imuno-histoquímica em células cultivadas, e imuno-histoquímica em amostras de pacientes. É particularmente preferido que a distinção possa ser quantificada em citometria de fluxo e imunoprecipitação. 0 anticorpo pode ser monoclonal.

No sentido da presente invenção, "anticorpo policlonal" deve ser entendido significar o grupo de anticorpos produzidos por diferentes linhas de células B (linfócitos B). Anticorpos policlonais são misturas de imunoglobulinas secretadas contra um antigénio (macromolécula) , cada uma destas imunoglobulinas sendo capaz de reconhecer um epitopo diferente, uma vez que tem origem numa célula B diferente. Assim, dentro das diferentes populações de imunoglobulinas contidas num anticorpo policlonal, há um tipo de imunoglobulina que reconhece o epitopo ou epitopos de interesse de um antigénio especifico. É divulgado neste documento que os anticorpos policlonais podem ser produzidos por exemplo conjugando o péptido da SEQ ID N0:2, SEQ ID N0:3, SEQ ID NO:4 ou SEQ ID NO:5 com um imunogénio tal como hemocianina de Megathura crenulata e imunizando coelhos com este conjugado.

Os anticorpos monoclonais podem ser produzidos usando os mesmos ou semelhantes imunogénios. Linhas celulares de hibridoma podem ser produzidas de uma forma conhecida para o perito na arte. A linha celular de hibridoma pode então ser cultivada em meio de cultura adequado a partir do qual o anticorpo monoclonal é recuperado.

Os anticorpos monoclonais da invenção são produzidos pelas linhas celulares de hibridoma depositadas com o "Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH - DSMZ" com números de acesso DSM ACC3016 (214D8cl2h4) e DSM ACC3017 (226H4e8dlO) em conformidade com o Tratado de Budapeste.

Anticorpos monoclonais produzidos por estas linhas celulares de hibridoma, assim como anticorpos monoclonais que são funcionalmente equivalentes, pelo menos, são divulgados. Funcionalmente de modo pelo menos equivalente são aqueles anticorpos que podem discriminar entre CTF-611 e CTF-616, preferencialmente CTF-613, e entre CTF-611 e HER2 igualmente bem ou até melhor.

Anticorpos úteis também incluem anticorpos humanizados e humanos.

Em vez do anticorpo completo, um fragmento do mesmo pode ser usado de acordo com a presente invenção. Os fragmentos de anticorpos são selecionados a partir do grupo compreendido por F(ab), F(ab') e Fv. No contexto da presente invenção, um fragmento de um anticorpo refere-se a uma parte do anticorpo que é de tamanho suficiente e estrutura adequada para se ligar a um epitopo presente na forma truncada do recetor HER2 e assim permitir sua deteção numa amostra. 0 Exemplo 3 mostra anticorpos monoclonais específicos. Evidentemente, a divulgação estende-se neste documento a outros anticorpos policlonais ou monoclonais dirigidos contra o epitopo da forma truncada CTF-611 que é definido pelas sequências SEQ ID N0:2 e SEQ ID NO: 3 que podem discriminar entre CTF-611 e CTF-616, preferencialmente CTF-613, uma vez que, com base nos ensinamentos desta invenção eles podem ser derivados diretamente por um perito na arte.

De igual modo, a invenção estende-se aos fragmentos de anticorpos referidos, tais como F(ab), F(ab'), Fv, etc., ou qualquer linha celular de hibridoma capaz de produzir anticorpos monoclonais dirigidos contra os péptidos da SEQ ID N0:2 e SEQ ID N0:3 que podem discriminar entre CTF-611 e CTF-616, preferencialmente CTF-613. Métodos de diagnóstico

No método de diagnóstico de acordo com a invenção a deteção da presença da forma truncada do recetor HER2 pode ser efetuada através de meios selecionados independentemente do grupo compreendendo: deteção por migração diferencial num sistema fase móvel - fase estacionária da forma truncada do recetor HER2 consistindo da SEQ ID NO:1 em relação à forma completa do recetor HER2 referido; e deteção por ligação com anticorpos específicos da forma truncada do recetor HER2 contendo a SEQ ID NO:1.

Deteção através de migração diferencial deve ser entendida significar, no contexto da presente invenção, qualquer técnica analítica que permite a separação dos compostos a serem detetados com base na sua mobilidade diferente num sistema fase móvel - fase estacionária especifico, tal como uma eletroforese. Tal diferente mobilidade pode ser causada por uma carga elétrica diferente no composto, peso molecular diferente, ou diferente afinidade por outros compostos.

Esta deteção diferencial pode ser realizada através de técnicas analíticas conhecidas pelo perito na arte tais como eletroforese de proteínas, cromatografias de exclusão molecular, testes de afinidade de anticorpos, imunofluorescência, imunocitoquímica, imuno-histoquímica, citometria de fluxo, etc. Particularmente preferida é imuno-histoquímica. Um ou mais destes métodos pode(m) ser combinado(s) para aumentar a fiabilidade.

Deteção diferencial da forma truncada do recetor HER2 consistindo da SEQ ID NO:1, também referida nesta invenção como CTF-611, relativamente a todo ou completo recetor HER2, implica ser capaz de visualizar duas proteínas com diferentes pesos moleculares e sequências diferentes como pode ser desejado da Fig. 1. A forma truncada com SEQ ID NO:1 consiste da proteína que resulta da iniciação alternativa da tradução através de metionina 611 da sequência completa do recetor HER2. Esta forma ou CTF compreende portanto um novo domínio extracelular, um fragmento transmembranar, e um domínio citosólico. 0 fragmento transmembranar e o domínio citosólico são os mesmos da forma completa do recetor HER2. Outra forma truncada corresponde à da Fig. 1 referida como p95 ou CTF-648. Esta última forma é o produto da ação das alfa-secretases no recetor HER2 completo, que dividem uma grande parte do domínio extracelular.

De acordo com outra forma de realização da invenção, a etapa de detetar a presença na amostra da forma truncada do recetor HER2 consistindo da SEQ ID NO:1, compreende a deteção com pelo menos um anticorpo como definido acima. Numa forma de realização particular, o método de diagnóstico de acordo com a invenção compreende a deteção do epítopo definido pela SEQ ID N0:3.

Numa forma de realização da invenção, os anticorpos ou fragmentos dos mesmos da presente invenção são usados como agentes para o diagnóstico e a determinação de prognóstico, ou diretamente marcados na sua própria sequência peptidica (por exemplo com radioisótopos) ou indiretamente (por exemplo por adição ou ligando um agente fluorescente ou um agente capaz de produzir fluorescência por reação num meio de reação selecionado), todos os acima mencionados com o objetivo de gerar um sinal visivel, e se possível quantif icável, com o qual detetar a presença da forma truncada do recetor HER2 consistindo da sequência SEQ ID NO:1 numa amostra.

Da mesma forma, está previsto o agente de diagnóstico contendo pelo menos os anticorpos serem aderidos a um suporte sólido, direta ou indiretamente por meio de um segmento de espaçamento. Um agente deste tipo permite a captura da forma de sequência SEQ ID NO:1 de uma amostra, a fim de determinar a sua presença posteriormente com outros anticorpos não específicos (tais como CB11).

Os agentes de diagnóstico e determinação do prognóstico de acordo com a invenção podem também ser aplicados em protocolos de imuno-histoquímica. Para este efeito, os anticorpos monoclonais ou policlonais (primários ou secundários) devem ser devidamente marcados para produzir um sinal visível, e no melhor dos casos quantificável, assim que tiveram contacto com o tecido testado e foram permitidos interagir com as proteínas destinadas a deteção, noutras palavras, com o fragmento CTF de HER2 de sequência SEQ ID NO:1.

Com o objetivo de facilitar a tarefa de análise, diagnóstico e determinação de prognóstico ao médico, está previsto que o agente de diagnóstico é fornecido na forma de um kit que inclui, além dos anticorpos, os reagentes (p.ex., reagentes necessários para a coloração imuno-histoquimica), tampões e soluções de deteção adaptados para determinar a presença de forma truncada de SEQ ID NO:1 numa amostra, possivelmente amostras controlo que representam niveis de expressão diferentes de CTF-611 e possivelmente também instruções detalhadas, auxiliando o médico na avaliação do diagnóstico. Este kit também pode incluir um meio para a realização de um ensaio de imuno-histoquimica semi-quantitativo para a determinação de HER2 (tal como Herceptest™).

Assim, a invenção fornece um kit para diagnóstico e determinação do prognóstico, que compreende pelo menos um anticorpo ou um fragmento do mesmo conforme definido nas reivindicações, em adição aos meios de reagente e tampões adequados para realizar a interação do anticorpo com o epitopo e que são extensivamente conhecidos pelos peritos na arte. 0 método de diagnóstico da presente invenção, e o kit da presente invenção, podem permitir a previsão de metástase nodal, mau prognóstico, e resistência a Herceptin™.

Outro tipo de kit também objeto da invenção, compreende todos os meios necessários para realizar a deteção através da migração diferencial da forma truncada do recetor HER2 consistindo da sequência SEQ ID NO:1, em relação à forma completa do recetor HER2.

Dentro do grupo de cancros que expressam o recetor HER2 ou as suas variantes truncadas, destaca-se o cancro da mama. Outros tipos de cancro onde estas proteínas também são expressas incluem o cancro do pulmão, pâncreas, cólon, estômago, próstata, cabeça e pescoço, pele, rim, testículo, glândula tiroide, bexiga urinária, útero, vulva, endométrio, ovário, esófago, boca, glândula salivar, laringe, peritoneu, região do nariz e garganta, trompas de Falópio, tumores de Wilms assim como linfomas, sarcomas de Swing, sarcoma sinovial, meduloblastomas, tumores trofoblásticos, gliomas, glioblastomas, colangiocarcinomas, colesteatoma, condrossarcoma, ependimoma, neurilemomas, neuromas, rabdomiosarcomas. 0 método de diagnóstico da presente invenção é portanto particularmente adequado para o diagnóstico de um destes cancros. Além da deteção ex-vivo de CTFs os anticorpos podem ser usados para imagiologia in vivo. Métodos terapêuticos

Os anticorpos da presente invenção, ou fragmentos dos mesmos, também são úteis em terapia, especialmente na terapia do cancro, particularmente os cancros que expressam o recetor HER2 ou as suas variantes truncadas. Anticorpos humanos e humanizados, e fragmentos dos mesmos, são preferidos.

Os anticorpos desta invenção são também usados em composições farmacológicas úteis para o tratamento de cancros em que pelo menos a forma truncada do recetor HER2 consistindo da SEQ ID NO:1 é expressa. A composição compreende os portadores ou excipientes farmacologicamente aceitáveis e pelo menos um anticorpo conforme definido nas reivindicações. A composição farmacológica pode também incluir uma mistura de anticorpos que, além de um anticorpo da presente invenção, contém outros anticorpos contra HER2 ou fragmentos dos mesmos, tais como Herceptin™.

Baseado nos valores apresentados no presente documento e sempre por meio de exemplos ilustrativos mas não limitativos, abaixo estão descritos o método de diagnóstico e determinação do prognóstico do cancro onde o recetor HER2 e/ou os seus fragmentos carboxi-terminais (variantes truncadas) são expressos; novos péptidos e anticorpos específicos contra os péptidos referidos; novas linhas celulares; agentes de diagnóstico e kits para a deteção, todos os quais sendo objetos da invenção.

Embora não especificado, todos os termos técnicos e científicos usados na descrição têm o significado que um perito na arte atribuiria aos mesmos. Métodos e materiais similares ou equivalentes aos descritos neste documento podem ser usados na prática da presente invenção. Ao longo da descrição e reivindicações a palavra "compreende" e variações da palavra, tais como "compreendendo", não se destina a excluir outras caracteristicas técnicas, aditivos, componentes, ou etapas. Objetos adicionais, vantagens e caracteristicas da invenção tornar-se-ão aparentes para aqueles qualificados na arte durante a análise da descrição ou podem ser aprendidos pela prática da invenção. Os seguintes exemplos e desenhos são fornecidos a titulo de ilustração, e não se destinam a ser um fator limitante da presente invenção. Além disso, entende-se que a presente invenção cobre todas as combinações possíveis de grupos preferenciais e específicos descritos acima.

EXEMPLOS

Os exemplos seguintes mostram diferentes modos de detetar a presença da forma truncada da sequência SEQ ID NO:1, numa amostra isolada de cancro do tipo que expressa o recetor HER2 e/ou as suas variantes truncadas.

Procedimentos experimentais Células. Células MCF7 Tet-Off (BD bioscience) foram mantidas a 37°C e 5% C02 em DMEM/F-12 (1:1) (Gibco) contendo 10% FBS (Gibco) , 4 mM L-Glutamina (PAA Laboratories), 0,2 mg/mL G418 (Gibco) e 1 mg/mL doxiciclina (Sigma). As células foram transfetadas com os vários plasmídeos de expressão usando FuGENEô (Roche). Clones estáveis individuais com plasmídeos baseados em pUHD10-3h integrados foram selecionados com 0,1 mg/mL higromicina B (Invitrogen). Expressão de cDNAs de HER2 e CTFs codificados em pUHD10-3h foi induzida através da remoção de doxiciclina. Inicialmente as células foram desanexadas com 0,5% Tripsina-EDTA (GIBCO), lavado três vezes por centrifugação e o meio mudado 10 horas após a inoculação em placas de cultura. Homogeneidade dos clones individuais foi verificada por microscopia confocal de imunofluorescência com anticorpos contra o domínio citoplasmático de HER2. Dois clones estáveis independentemente selecionados foram usados nas experiências.

Western blot. Células que expressam as diferentes isoformas de HER2 foram lisadas em tampão RIPA modificado (20 mM NaH2P04/NaOH pH 7,4, 150 mM NaCl, 1% Triton X-100, 5 mM EDTA, 100 mM PMSF, 25 mM NaF, 16 pg/mL Aprotinina, 10 pg/mL Leupeptina e 1,3 mM Na3VO4) e as concentrações proteicas determinadas com reagentes de ensaio de proteína DC (BIORAD). As amostras foram misturadas com loading buffer (concentrações finais: 62 mM Tris pH 6,8, 12% glicerol, 2,5% SDS) com 5% beta-Mercaptoetanol e incubadas a 99°C durante 5 min antes de fracionamento de 15 mg de proteina por SDS-PAGE. Sinais específicos em Western blot foram quantificados com o software ImageJ 1.38 (NIH). Imunoprecipitação. Lisados celulares foram incubados com anticorpos diferentes durante 1 hora a 4°C. De seguida, imuno-complexos foram purificados com proteina A. Os imunoprecipitados foram lavados três vezes com tampão de lise, misturados com loading buffer e analisados por Western blot. Células para microscopia de imunofluorescência inoculadas em lamelas de vidro foram lavadas com PBS, fixadas com paraformaldeido 4% durante 20 min e permeabilizadas com 0,2% Triton X-100 durante 10 min. Para bloqueio e ligação de anticorpo nós usámos PBS com 1% de BSA, 0,1% de saponina e 0,02% NaN3, e para a montagem Vectashield com DAPI (Vector laboratories). Anticorpos foram usados a 1 mg/mL.

Imuno-histoquimica. Células MCF7 expressando HER2, 611-CTF ou 648-CTF foram lavadas a 4°C com PBS e desanexadas em PBS contendo 5 mM de EDTA. Em seguida, as células foram centrifugadas e pellets de células foram fixados em formol neutro 10%, desidratados e incorporados em parafina. Secções de pellets de células ou de tecidos humanos de 4 mm de espessura foram colocadas em lâminas de vidro revestidas com poli-lisina. Análises de imuno-histoquimica foram realizadas utilizando o seguinte protocolo: 1. Desparafinizar e reidratar a seção 1.1 Incubar as lâminas 30 min a 60°C. 1.2 Desparafinizar as lâminas com três incubações de 5 min de xileno limpo, seguido de duas lavagens de 3 min com etanol absoluto. 1.3 Transferir gradualmente para água destilada: Etanol a 95°C 3 min, Etanol 70°C 3 min, Etanol a 50°C 3 min, água destilada. 2. Recuperação do antigénio PT Link a baixo pH (6), ENVISION FLEX TARGET RETRIEVAL SOLUTION HIGH pH lOx. DM 812. 20 min a 95°C. Lavar com tampão de lavagem Envision Flex xlO DM 811 15 min. 3. Coloração imuno-histoquimica

AUTOSTAINER plus Link DAKO KIT: ENVISION FLEX + MOUSE, High pH (Link):

Envision Flex Peroxidase Blocking SM801.

Envision Flex/ HRP SM 802.

Envision Flex DAB+CHROMOGEN DM 807.

Envision Flex Substrate Buffer SM 803.

Envision Flex Wash Buffer lOx DM 811.

Envision Flex Target Retrieval Solution High Ph lOx DM 812 .

Envision Flex+ Mouse (linker) SM 84.

Peroxidase 5 min e lavar com tampão de lavagem.

Bloqueio de proteínas 5% 15-20 min.

Lavar com tampão de lavagem. 214D8cl2h4 ou 226H4e8dlO a 0,2 mg/mL 2 horas.

Lavar com tampão de lavagem.

Secundário (Flex HRP, Flex+Mouse/Rabbit) 20 min.

Lavar com tampão de lavagem. DAB 5 min.

Lavar com tampão de lavagem.

Hematoxilina.

Lavar com água destilada. 3. Desidratação e estabilização com meio de montagem 3.1 Gradualmente lavar com concentrações crescentes de etanol (50%, 70%, 95%, 2 min cada lavagem). 3.2 Gradualmente adicionar a água destilada (etanol 95%, 70%, 50%, água destilada, 3 min cada lavagem). 3.3 Lavar com Xileno/eucaliptol (3 lavagens 2 min cada). 3.4 Montar com DPX.

Ratinhos transgénicos

Ratinhos TG 611 e TG 687 foram projetados clonando as sequências de codificação 687-CTF e CTF-611 no local de clonagem múltipla II a jusante do long terminal repeat do vírus de tumor mamário de ratinho melhorada por vírus sarcoma de Rous do vetor pMB (um amável presente do Dr. Marcos Malumbres, CNIO, Madrid). Linhas iniciais foram geradas micro-injetando DNA de plasmídeo linearizado em oócitos fertilizados recolhidos de ratinhos FVB superovulados no Centro de Biotecnologia Animal e Terapia Génica (Centre de Biotecnologia Animal i Terapia Gènica, Universitat Autónoma de Barcelona). Ratinhos iniciais foram genotipados por análise de hibridação Southern. Após a identificação dos animais iniciais, manutenção da colónia de rotina foi realizada por genotipagem PCR. Os ratinhos FVB/N-Tg(MMTVneu)202J machos e fêmeas foram obtidos do laboratório Jackson (Bar Harbor, ME). Ratinhos iniciais foram genotipados por análise de hibridação Southern. Após a identificação dos animais iniciais, manutenção de colónias de rotina foi realizada por genotipagem por PCR. Os ratinhos FVB/N-Tg(MMTVneu)202J machos e fêmeas foram obtidos do Laboratório Jackson (Bar Harbor, ME).

Montagens "Whole Mount" e Histologia

As glândulas mamárias foram montadas em lâminas de vidro, fixadas overnight em 4% paraformaldeído e transferidas para 70% etanol. As lâminas foram lavadas em água durante 5 min e coradas com uma solução filtrada de carmim 0,2% durante 24 horas. As glândulas foram então desidratadas sequencialmente com concentrações decrescentes de etanol, depois desengorduradas e armazenadas em salicilato de metilo. Para análise histológica, as glândulas fixadas foram bloqueadas em parafina, seccionadas, e coradas com hematoxilina e eosina. EXEMPLO 1: Deteção do fragmento da SEQ ID NO:1 através de migração diferencial.

Na Fig. 2, que corresponde a uma imagem de um gel de eletroforese e subsequente transferência de tipo Western (Western-blot), amostras diferentes de cancro da mama (108, 114, 101, 103, 131, 134 e 145) foram carregadas nos poços. De cada amostra tanto a fração solúvel (S) como a fração de membrana (M) do lisado celular foram analisadas, a fim de visualizar que tipo de molécula de HER2 estava presente e em que frações. Em princípio, espera-se que tanto o recetor completo como a forma da SEQ ID NO:1 estejam na membrana celular. Para a deteção de HER2 completo e da forma CTF- 611, foram usados anticorpos (CB11) dirigidos ao dominio citoplasmático das proteinas, que é um dominio comum em ambas as formas da proteina. Como um controlo da análise a presença da enzima lactato desidrogenase (DHL) foi detetada. Na maioria das amostras, bandas correspondentes ao recetor HER2 completo e na fração de membrana, uma banda correspondente à forma CTF-611 da SEQ ID NO:1 aparece. A Fig. 2 mostra portanto que a deteção do tipo de formas truncadas do recetor HER2 pode ser realizada através de uma análise de eletroforese de proteinas. Além disso, a presença de um fragmento de HER2 de sequência SEQ ID NO:1 é indicativa de um determinado tipo de cancro, no caso do exemplo, o cancro da mama, que precisa ser avaliado e tratado como um caso individual dentro dos cancros que expressam HER2. EXEMPLO 2: Deteção da presença do fragmento de HER2 de sequência SEQ ID NO:1 com anticorpos monoclonais dirigidos a neo-epitopos definidos pela SEQ ID N0:2 ou SEQ ID N0:3.

Usando o péptido tendo a sequência SEQ ID NO:4, os anticorpos monoclonais foram obtidos. Este péptido corresponde aos 32 aminoácidos da extremidade N-terminal da forma CTF-611 ou de SEQ ID NO:1, em que a maioria das cisternas foram substituídas por serinas com a finalidade de o conjugar com o antigénio conhecido como hemocianina de Megathura crenulata (KLH).

A SEQ ID NO:4 corresponde portanto a um péptido equivalente àquele da SEQ ID NO:3, embora adaptado a fim de realizar a técnica de imunização. Um perito na arte vai entender que os anticorpos dirigidos contra o péptido sintetizado da SEQ ID NO:4 também irão reconhecer o epítopo definido pela SEQ ID NO:3 presente na forma truncada do recetor HER2 (SEQ ID NO:1 ou CTF-611) . Da mesma forma, um perito na arte pode compreender que se o péptido sintetizado usado para imunização consiste da SEQ ID N0:2, que compreende todos os aminoácidos do recetor CTF-611 localizado na zona extracelular, os resultados com anticorpos dirigidos contra este outro péptido são equivalentes e portanto úteis para a mesma finalidade.

Anticorpo monoclonal 214D8cl2h4 produzido pela linha celular de hibridoma com número de acesso DSM ACC3016 e anticorpo monoclonal 226H4e8dlO produzido pela linha celular de hibridoma com número de acesso DSM ACC3017 foram selecionados. Os resultados obtidos com este anticorpo são mostrados na Fig. 4 e Fig. 5. SDS-PAGE e a subsequente transferência Western com Usados celulares de células MCF7 transfetadas de forma estável com construções de cDNA codificando HER2, 611-CTF e CTF-648 foram realizadas. Estes foram analisados com CB11, um anticorpo monoclonal comercial dirigido contra o dominio intracelular de HER2, ou com 214D8cl2h4 ou o anticorpo monoclonal 226H4e8dlO. 0 anticorpo CB11 reconhece HER2, 611-CTF e 648-CTF (Fig. 4). Os anticorpos monoclonais 214D8cl2h4 e 226H4e8dlO reconhecem HER2 de sequência completa e 611-CTF quando analisados por Western blot. Nenhum dos anticorpos monoclonais reconhece 648-CTF, que não possui o epitopo. Apenas os resultados correspondentes a 214D8 são mostrados. Resultados semelhantes foram obtidos com 226D8. CTF-611 na realidade apareceu como dois fragmentos de semelhante peso molecular. Como pode ser derivado de testes realizados com Glicosidase-F, uma enzima que elimina os N-glicanos de proteínas (não mostradas), o fragmento CTF-611 é um substrato de modificações pós-traducionais. Especificamente, um fragmento com aproximadamente 110 kDa corresponde à forma que é sintetizada e posteriormente entra na via de secreção, onde se torna N-glicosilada.

Além disso, um ensaio de imunoprecipitação foi realizado com os anticorpos monoclonais 214D8cl2h4 e 226H4e8dlO em comparação com o anticorpo CB11 (que reconhece o domínio citosólico dos recetores) e o anticorpo Trastuzumabe (que reconhece um epítopo do domínio extracelular de HER2 que é diferente do epítopo reconhecido por anticorpos de acordo com a presente invenção e não reconhece CTF-611) . Uma mistura 1:1:1 de lisados celulares de células MCF7 transfetadas de forma estável com construções de cDNA codificando HER2, 611-CTF e CTF-648 foi incubada com anticorpos CB11, trastuzumabe, 214D8cl2h4 ou 226H4e8dlO. Imuno-complexos foram recolhidos com proteína A, lavados e analisados por Western blot com CB11 (Fig. 5) . Apenas os resultados correspondentes a 214D8cl2h4 são mostrados. Resultados semelhantes foram obtidos com 226H4e8dlO.

Enquanto CB11 imunoprecipi ta espécies de HER2 das três construções de cDNA, trastuzumabe apenas imunoprecipita HER2 de sequência completa. 214D8cl2h4 e 226H4e8dlO ligam-se preferencialmente a CTF-611, indicando que estes anticorpos são específicos para este fragmento de HER2 e que o epítopo que reconhecem está escondido na molécula de sequência completa.

No poço correspondente à imunoprecipitação com o anticorpo monoclonal 214D8cl2h4 (Fig. 5, coluna da direita), somente as bandas da forma glicosilada e não-glicosilada da forma truncada CTF-611 podem ser distinguidas. Resultados semelhantes foram obtidos com o anticorpo monoclonal 226H4e8dlO. Assim, os anticorpos monoclonais 214D8cl2h4 e 226H4e8dlO são capazes de imunoprecipitar CTF-611 mas não HER2 de sequência completa e CTF-648. Destes dados pode concluir-se que os anticorpos monoclonais 214D8cl2h4 e 226H4e8dlO reconhecem especificamente CTF-611 e não mostram nenhuma reatividade com HER2 de sequência completa e CTF-648. Nesse sentido, podem ser usados para a deteção diferencial e altamente seletiva de que forma do recetor HER2 é expressa numa amostra isolada de tecido do tumor. A caracterização de anticorpos monoclonais dirigidos contra um péptido correspondendo a uma sequência N-terminal com 32 aminoácidos de comprimento de CTF-611, confirma a existência de epitopo(s) escondidos em HER2 de sequência completa mas expostos em CTF-611. Estes epitopos são escondidos tanto na molécula solubilizada como em células intactas. EXEMPLO 3: Caracterização dos epitopos reconhecidos pelos anticorpos monoclonais 214D8cl2h4 e 226H4e8dlO contra o N-terminal da CTF-611 A Fig. 6A mostra um diagrama esquemático que representa a sequência principal da região justa membranar de CTF-611. 0 N- e o C-terminal da molécula são indicados. Os dominios transmembranar e da cinase são indicados por um tracejado e uma caixa cinzenta, respetivamente. A sequência das construções de deleção 613-CTF e CTF-616 é indicada.

Para caracterizar o epítopo reconhecido pelos anticorpos 214D8cl2h4 e 226H4e8dlO, células transfetadas com construções de cDNA expressando CTF-611, 613-CTF ou CTF-616 foram usadas. Lisados celulares foram analisados por Western blot com CB11 (Fig. 6B, painel da esquerda), um anticorpo contra o domínio citoplasmático de HER2, com 214D8cl2h4 (Fig. 6B, painel do meio) ou com 226H4e8dlO (Fig. 6B, painel da direita).

Conclusões. A análise Western blot de lisados de células expressando CTF-611, 613-CTF e CTF-616 mostra que anticorpos 214D8cl2h4 e 226H4e8dlO reconhecem epitopos diferentes. 0 epitopo reconhecido por 214D8cl2h4 é interrompido na construção CTF-613. Em contraste, o epitopo reconhecido por 226H4e8dlO é preservado na mesma construção. EXEMPLO 4: Caracterização de anticorpos monoclonais 214D8cl2h4 e 226H4e8dlO contra o N-terminal da CTF-611 por imunofluorescência Células MCF7 transfetadas de forma estável com construções de cDNA codificando HER2, 611-CTF e CTF-648 foram analisadas por imunofluorescência indireta com CB11, um anticorpo monoclonal comercial dirigido contra o dominio intracelular de HER2, com anticorpo monoclonal 214D8cl2h4 ou com anticorpo monoclonal 226H4e8dlO (Fig. 7).

Como esperado, anticorpos CB11 coram todas as três linhas celulares. Os anticorpos monoclonais 214D8cl2h4 e 226H4e8dlO só coram CTF-611. Este resultado mostra que anticorpos 214D8cl2h4 e 226H4e8dlO reconhecem um epitopo na construção CTF-611 que está escondido nas moléculas de sequência completa. Assim, estes anticorpos são ferramentas úteis para detetar especificamente a presença de CTF-611. EXEMPLO 5: Caracterização de anticorpos monoclonais 214D8cl2h4 e 226H4e8dlO contra o N-terminal da CTF-611 por imuno-histoquimica Células MCF7 transfetadas de forma estável com construções de cDNA codificando HER2, CTF-611 e 648-CTF foram analisadas por imuno-histoquimica com CB11, um anticorpo monoclonal comercial dirigido contra o dominio intracelular de HER2, com anticorpo monoclonal 214D8cl2h4 ou com anticorpo monoclonal 226H4e8dlO. 0 resultado é mostrado na Figura 8. Apenas os resultados correspondentes a 214D8cl2h4 são mostrados. Resultados semelhantes foram obtidos com 226H4e8dlO.

Conclusões. Como esperado, anticorpos CB11 coram todas as três linhas celulares. Os anticorpos monoclonais 214D8cl2h4 e 226H4e8dlO só coram CTF-611. Este resultado mostra que anticorpos 214D8cl2h4 e 226H4e8dlO reconhecem um epitopo na construção CTF-611 que está escondido nas moléculas de sequência completa. Assim, estes anticorpos são ferramentas úteis para detetar especificamente a presença de CTF-611. Este resultado é particularmente relevante dando que a imuno-histoquimica é a técnica de escolha para a maioria dos testes de rotina nas clinicas. EXEMPLO 6: Geração de Modelos Animais para Caracterizar o Efeito da expressão de CTF in vivo

Modelos de ratinho têm sido instrumentais para mostrar o potencial e relevância oncogénica de HER2 na progressão do tumor. Para caracterizar o sua potencial oncogénico, estabelecemos ratinhos transgénicos (TG) expressando CTF-611 sob o controlo do long terminal repeat do vírus de tumor mamário de ratinho, que é preferencialmente ativo na glândula mamária. Embora os modelos celulares tenham indicado que CTFs intracelulares solúveis são inativos, para explorar adicionalmente as consequências da expressão destes fragmentos, também gerámos animais TG expressando 687-CTF. Como um controlo, usámos o modelo clássico e bem caracterizado expressando HER2 de tipo selvagem (ou seja, ratazana neu). A 7 semanas de idade, os níveis de CTF-611 expresso nas linhas heterozigóticas TG 611 F3 e F2 foram ~ iguais a e 1/3 de, respetivamente, os níveis de HER2 endógenos, enquanto o nível na F1 foi abaixo do limite de deteção. Os níveis de 687-CTF nas linhas homozigóticas desenvolvidas variaram do dobro para metade dos níveis de HER2 nas linhas TG 687 F2 e Fl, respetivamente.

Glândulas mamárias dos animais TG não exibiram anormalidades macroscópicas na idade de 7 semanas. No entanto, análise morfológica de montagens completas coradas com carmim revelou anormalidades de hiperplasia nas árvores ductais mamárias de ratinhos TG HER2. Anormalidades semelhantes, embora menos pronunciadas, estavam presentes em todas as três linhas de ratinhos TG 611. Em contraste, as glândulas de ratinhos TG 687 eram indistinguíveis daquelas dos ratinhos de tipo selvagem.

EXEMPLO 7: Expressão de CTF-611 leva ao desenvolvimento de tumores mamários agressivos

Apesar da hiperplasia mais pronunciada em ratinhos TG HER2, as três linhas de animais TG 611 desenvolveram tumores mais agressivos em termos do número de tumores por animal, crescimento do tumor e o aparecimento de tumor:

Glândulas Mamárias

(0 aparecimento de tumores mamários foi monitorizado por palpação semanalmente.)

Tumores ou anormalidades não foram observados em animais TG 687 mesmo após um acompanhamento de mais de um ano.

Análise histológica dos tumores mostrou os mesmos carcinomas nodulares sólidos tipicamente invasivos induzidos por HER2 em ratinhos TG 611. A única diferença histológica entre os tumores iniciados por HER2 e CTF-611 foi um maior número de imagens mitóticas nos de ratinhos TG 611.

Como anteriormente mostrado, ratinhos TG HER2 desenvolveram metástase pulmonar. Três a seis semanas após a deteção de tumores, - 1/4 de animais TG HER2 possuíam nódulos detetáveis nos pulmões:

(Os ratinhos foram sacrificados 3-6 semanas após a deteção do tumor por palpação, e o aparecimento de metástases monitorizado por imuno-histoquimica).

Análise histológica das metástases pulmonares confirmou a expressão de HER2 e coloração com citoqueratina 18 verificou que as células originaram-se do tumor primário. Em comparação com TG HER2, o número de animais expressando CTF-611 com metástases detetáveis foi mais que o dobro. Isto mostra que os tumores iniciados por este CTF têm uma tendência mais pronunciada para invadir os pulmões.

SEQUÊNCIAS

Claims (15)

REIVINDICAÇÕES

1. Um anticorpo ou um fragmento do mesmo que reconhece um epítopo de uma forma truncada do recetor HER2, o epítopo referido sendo definido por uma sequência incluída na SEQ ID N0:2, que é produzido pela linha celular de hibridoma depositada com o "Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellen - DSMZ" com número de acesso DSM ACC3016 ou a linha celular de hibridoma depositada com o "Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellen - DSMZ" com o número de acesso DSM ACC3017, e em que o anticorpo ou fragmento do mesmo referido é capaz de discriminar entre a variante truncada de HER2-CTF611 representada pela SEQ ID NO:1 e CTF-616, representada pela SEQ ID N0:7.

2. Uma hibridoma produzindo o anticorpo monoclonal ou fragmento do mesmo da reivindicação 1.

3. Um método para produzir um anticorpo monoclonal ou fragmento do mesmo pela linha celular de hibridoma de acordo com a reivindicação 2.

4. Um método de diagnóstico de cancro, que compreende a deteção da presença da forma truncada do recetor HER2 consistindo da sequência de aminoácidos SEQ ID NO:1 numa amostra de paciente, usando um ou mais anticorpos ou fragmentos dos mesmos, conforme definido na reivindicação 1.

5. 0 método de acordo com a reivindicação 4, que é um método de prognóstico que permite o prognóstico de progressão do crescimento do tumor e/ou metástases.

6. Uso de um anticorpo ou um fragmento do mesmo de acordo com a reivindicação 1, para o diagnóstico e a determinação de prognóstico em amostras isoladas de cancros em que o recetor HER2 é expresso.

7. Um agente para diagnóstico e determinação de prognóstico em amostras isoladas de cancros do tipo que expressam o recetor HER2 ou as suas variantes truncadas, que compreende pelo menos um anticorpo ou um fragmento do mesmo de acordo com a reivindicação 1.

8. 0 agente para o diagnóstico de acordo com a reivindicação 7, em que o anticorpo ou o fragmento do mesmo é preparado sobre um suporte sólido.

9. Um kit para diagnóstico e determinação de prognóstico em amostras isoladas de cancros do tipo que expressam o recetor HER2 ou as suas variantes truncadas, em que os meios de deteção compreendem pelo menos um agente de acordo com as reivindicações 7 ou 8.

10. Um anticorpo ou um fragmento do mesmo de acordo com a reivindicação 1 para uso terapêutico.

11. 0 anticorpo ou fragmento de acordo com a reivindicação 1, para usar no tratamento ou prevenção de cancros em que pelo menos a forma truncada do recetor HER2 consistindo da SEQ ID N0:l é expressa.

12. 0 anticorpo ou fragmento de acordo com a reivindicação 11 para o uso de acordo com a reivindicação 11, para uso no tratamento ou prevenção de cancros da mama em mamíferos, incluindo seres humanos.

13. 0 anticorpo ou fragmento de acordo com uma ou mais das reivindicações 11 a 12 para o uso de acordo com as reivindicações 11 e 12, respetivamente, para uso no tratamento ou prevenção de cancros selecionados a partir do grupo compreendendo cancro do pulmão, pâncreas, cólon, estômago, próstata, cabeça e pescoço, pele, rim, testículo, glândula tiroide, bexiga urinária, útero, vulva, endométrio, ovário, esófago, boca, glândula salivar, laringe, peritoneu, região do nariz e garganta, trompas de Falópio, tumores de Wilms assim como linfomas, sarcomas de Swing, sarcoma sinovial, meduloblastomas, tumores trofoblásticos, gliomas, glioblastomas, colangiocarcinomas, colesteatoma, condrossarcoma, ependimoma, neurilemomas, neuromas, rabdomiosarcomas.

14. Um uso de um anticorpo ou fragmento do mesmo conforme definido na reivindicação 1 para o fabrico de um medicamento para o tratamento de cancro.

15. Composição farmacológica para o tratamento de cancros em que pelo menos a forma truncada do recetor HER2 contendo a SEQ ID NO:1 é expressa, caracterizada em que compreende um anticorpo ou um fragmento do mesmo de acordo com a reivindicação 1 e pelo menos um excipiente e/ou portador farmacologicamente aceitável. Lisboa, 23 de Dezembro de 2014