PL190734B1 - Analog czynnika X, rekombinowany DNA, kompozycje,zastosowanie rekombinowanego kwasu nukleinowego DNA oraz sposoby wytwarzania kompozycji - Google Patents
Analog czynnika X, rekombinowany DNA, kompozycje,zastosowanie rekombinowanego kwasu nukleinowego DNA oraz sposoby wytwarzania kompozycjiInfo
- Publication number
- PL190734B1 PL190734B1 PL98335382A PL33538298A PL190734B1 PL 190734 B1 PL190734 B1 PL 190734B1 PL 98335382 A PL98335382 A PL 98335382A PL 33538298 A PL33538298 A PL 33538298A PL 190734 B1 PL190734 B1 PL 190734B1
- Authority
- PL
- Poland
- Prior art keywords
- factor
- analog
- arg
- analogue
- amino acid
- Prior art date
Links
- 108010014173 Factor X Proteins 0.000 title claims abstract description 370
- 102100029117 Coagulation factor X Human genes 0.000 title 1
- 108010074860 Factor Xa Proteins 0.000 claims abstract description 192
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 claims abstract description 135
- 239000004365 Protease Substances 0.000 claims abstract description 134
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 claims abstract description 92
- 230000007017 scission Effects 0.000 claims abstract description 92
- 230000004048 modification Effects 0.000 claims abstract description 76
- 238000012986 modification Methods 0.000 claims abstract description 76
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 74
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims abstract description 27
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 claims abstract description 19
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 claims abstract description 14
- 102000035195 Peptidases Human genes 0.000 claims description 134
- 108090001126 Furin Proteins 0.000 claims description 110
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims description 94
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims description 84
- 102000004961 Furin Human genes 0.000 claims description 80
- 230000004913 activation Effects 0.000 claims description 66
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims description 55
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims description 41
- 101710118538 Protease Proteins 0.000 claims description 34
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 claims description 34
- 102000012479 Serine Proteases Human genes 0.000 claims description 32
- 108010022999 Serine Proteases Proteins 0.000 claims description 32
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 32
- 102100035233 Furin Human genes 0.000 claims description 30
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims description 27
- 108060005987 Kallikrein Proteins 0.000 claims description 24
- 102000001399 Kallikrein Human genes 0.000 claims description 24
- 101710172072 Kexin Proteins 0.000 claims description 24
- 230000002950 deficient Effects 0.000 claims description 24
- 101800001401 Activation peptide Proteins 0.000 claims description 23
- 108010080805 Factor XIa Proteins 0.000 claims description 23
- -1 factor XHa Proteins 0.000 claims description 23
- 102400000069 Activation peptide Human genes 0.000 claims description 22
- 101001098833 Homo sapiens Proprotein convertase subtilisin/kexin type 6 Proteins 0.000 claims description 20
- 102100038946 Proprotein convertase subtilisin/kexin type 6 Human genes 0.000 claims description 20
- 239000002243 precursor Substances 0.000 claims description 17
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 claims description 15
- 239000000543 intermediate Substances 0.000 claims description 15
- 230000035772 mutation Effects 0.000 claims description 15
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 claims description 14
- 230000008569 process Effects 0.000 claims description 13
- 108010029144 Factor IIa Proteins 0.000 claims description 12
- 108010054218 Factor VIII Proteins 0.000 claims description 12
- 102000001690 Factor VIII Human genes 0.000 claims description 12
- 229960000301 factor viii Drugs 0.000 claims description 12
- 230000009466 transformation Effects 0.000 claims description 12
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 claims description 11
- 108010071241 Factor XIIa Proteins 0.000 claims description 10
- 230000037430 deletion Effects 0.000 claims description 10
- 238000012217 deletion Methods 0.000 claims description 10
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 claims description 9
- 108020005038 Terminator Codon Proteins 0.000 claims description 8
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims description 8
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 claims description 8
- 238000003259 recombinant expression Methods 0.000 claims description 8
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims description 8
- 230000000468 autoproteolytic effect Effects 0.000 claims description 7
- 229960000182 blood factors Drugs 0.000 claims description 7
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims description 7
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims description 7
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims description 7
- 239000007857 degradation product Substances 0.000 claims description 5
- 230000037431 insertion Effects 0.000 claims description 5
- 238000003780 insertion Methods 0.000 claims description 5
- 125000001433 C-terminal amino-acid group Chemical group 0.000 claims description 4
- 230000002797 proteolythic effect Effects 0.000 claims description 4
- 238000000746 purification Methods 0.000 claims description 2
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims 15
- 102100037486 Reverse transcriptase/ribonuclease H Human genes 0.000 abstract 1
- 235000019419 proteases Nutrition 0.000 description 90
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 70
- 235000013351 cheese Nutrition 0.000 description 53
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 52
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 39
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 37
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 36
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 31
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 31
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 27
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 25
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 25
- 125000000174 L-prolyl group Chemical group [H]N1C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[C@@]1([H])C(*)=O 0.000 description 24
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 24
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 22
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 20
- 210000004978 chinese hamster ovary cell Anatomy 0.000 description 20
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 20
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 18
- 125000002059 L-arginyl group Chemical group O=C([*])[C@](N([H])[H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])N([H])C(=N[H])N([H])[H] 0.000 description 17
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 17
- 101100275473 Caenorhabditis elegans ctc-3 gene Proteins 0.000 description 15
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 15
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 15
- 239000000047 product Substances 0.000 description 12
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 12
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 10
- 239000013613 expression plasmid Substances 0.000 description 10
- 238000011282 treatment Methods 0.000 description 10
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 8
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 8
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 8
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 8
- 108010054265 Factor VIIa Proteins 0.000 description 7
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 7
- 229940012414 factor viia Drugs 0.000 description 7
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 description 7
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 7
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 7
- 101001030665 Dictyostelium discoideum GDP-L-fucose synthase Proteins 0.000 description 6
- JBCLFWXMTIKCCB-UHFFFAOYSA-N H-Gly-Phe-OH Natural products NCC(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 JBCLFWXMTIKCCB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- KOSRFJWDECSPRO-UHFFFAOYSA-N alpha-L-glutamyl-L-glutamic acid Natural products OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(CCC(O)=O)C(O)=O KOSRFJWDECSPRO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 230000015271 coagulation Effects 0.000 description 6
- 238000005345 coagulation Methods 0.000 description 6
- 239000012084 conversion product Substances 0.000 description 6
- 108010055341 glutamyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 6
- 108010081551 glycylphenylalanine Proteins 0.000 description 6
- 108010062466 Enzyme Precursors Proteins 0.000 description 5
- 102000010911 Enzyme Precursors Human genes 0.000 description 5
- 208000009292 Hemophilia A Diseases 0.000 description 5
- 102000007056 Recombinant Fusion Proteins Human genes 0.000 description 5
- 108010008281 Recombinant Fusion Proteins Proteins 0.000 description 5
- 108090000190 Thrombin Proteins 0.000 description 5
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 5
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 5
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 5
- 230000023555 blood coagulation Effects 0.000 description 5
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 5
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 5
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 5
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 5
- 150000003904 phospholipids Chemical class 0.000 description 5
- 108010014806 prothrombinase complex Proteins 0.000 description 5
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 5
- 238000003860 storage Methods 0.000 description 5
- 229960004072 thrombin Drugs 0.000 description 5
- 102100023804 Coagulation factor VII Human genes 0.000 description 4
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 4
- AMRLSQGGERHDHJ-FXQIFTODSA-N Cys-Ala-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O AMRLSQGGERHDHJ-FXQIFTODSA-N 0.000 description 4
- VXLXATVURDNDCG-CIUDSAMLSA-N Cys-Lys-Asp Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N VXLXATVURDNDCG-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 4
- 108010079356 FIIa Proteins 0.000 description 4
- 108010023321 Factor VII Proteins 0.000 description 4
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 208000031220 Hemophilia Diseases 0.000 description 4
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 4
- 230000003197 catalytic effect Effects 0.000 description 4
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 4
- 229940012413 factor vii Drugs 0.000 description 4
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 4
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 4
- 108010015792 glycyllysine Proteins 0.000 description 4
- 239000000463 material Substances 0.000 description 4
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 4
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 4
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- GSCLWXDNIMNIJE-ZLUOBGJFSA-N Ala-Asp-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O GSCLWXDNIMNIJE-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 3
- LDLSENBXQNDTPB-DCAQKATOSA-N Ala-Lys-Arg Chemical compound NCCCC[C@H](NC(=O)[C@@H](N)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N LDLSENBXQNDTPB-DCAQKATOSA-N 0.000 description 3
- GOWZVQXTHUCNSQ-NHCYSSNCSA-N Arg-Glu-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O GOWZVQXTHUCNSQ-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 3
- GNKVBRYFXYWXAB-WDSKDSINSA-N Asn-Glu-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O GNKVBRYFXYWXAB-WDSKDSINSA-N 0.000 description 3
- 102000015081 Blood Coagulation Factors Human genes 0.000 description 3
- 108010039209 Blood Coagulation Factors Proteins 0.000 description 3
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 3
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 3
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 3
- 108010048049 Factor IXa Proteins 0.000 description 3
- WNRZUESNGGDCJX-JYJNAYRXSA-N Glu-Leu-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O WNRZUESNGGDCJX-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 3
- KKBWDNZXYLGJEY-UHFFFAOYSA-N Gly-Arg-Pro Natural products NCC(=O)NC(CCNC(=N)N)C(=O)N1CCCC1C(=O)O KKBWDNZXYLGJEY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- MOJKRXIRAZPZLW-WDSKDSINSA-N Gly-Glu-Ala Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O MOJKRXIRAZPZLW-WDSKDSINSA-N 0.000 description 3
- BIRKKBCSAIHDDF-WDSKDSINSA-N Gly-Glu-Cys Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O BIRKKBCSAIHDDF-WDSKDSINSA-N 0.000 description 3
- VBOBNHSVQKKTOT-YUMQZZPRSA-N Gly-Lys-Ala Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O VBOBNHSVQKKTOT-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 3
- NEEOBPIXKWSBRF-IUCAKERBSA-N Leu-Glu-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O NEEOBPIXKWSBRF-IUCAKERBSA-N 0.000 description 3
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 3
- 101100170937 Mus musculus Dnmt1 gene Proteins 0.000 description 3
- ALHULIGNEXGFRM-QWRGUYRKSA-N Phe-Cys-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 ALHULIGNEXGFRM-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 3
- MPFGIYLYWUCSJG-AVGNSLFASA-N Phe-Glu-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 MPFGIYLYWUCSJG-AVGNSLFASA-N 0.000 description 3
- FIRWJEJVFFGXSH-RYUDHWBXSA-N Phe-Glu-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 FIRWJEJVFFGXSH-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 3
- LRBSWBVUCLLRLU-BZSNNMDCSA-N Phe-Leu-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)Cc1ccccc1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O LRBSWBVUCLLRLU-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 3
- GPSMLZQVIIYLDK-ULQDDVLXSA-N Phe-Lys-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O GPSMLZQVIIYLDK-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 3
- PULPZRAHVFBVTO-DCAQKATOSA-N Pro-Glu-Arg Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O PULPZRAHVFBVTO-DCAQKATOSA-N 0.000 description 3
- 108010094028 Prothrombin Proteins 0.000 description 3
- NAXBBCLCEOTAIG-RHYQMDGZSA-N Thr-Arg-Lys Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](NC(=O)[C@@H](N)[C@H](O)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O NAXBBCLCEOTAIG-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 3
- 108010000499 Thromboplastin Proteins 0.000 description 3
- 102000002262 Thromboplastin Human genes 0.000 description 3
- 208000007536 Thrombosis Diseases 0.000 description 3
- 108090000631 Trypsin Proteins 0.000 description 3
- 102000004142 Trypsin Human genes 0.000 description 3
- CLEGSEJVGBYZBJ-MEYUZBJRSA-N Tyr-Thr-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@H](O)C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 CLEGSEJVGBYZBJ-MEYUZBJRSA-N 0.000 description 3
- ZLFHAAGHGQBQQN-GUBZILKMSA-N Val-Ala-Pro Natural products CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O ZLFHAAGHGQBQQN-GUBZILKMSA-N 0.000 description 3
- CEKSLIVSNNGOKH-KZVJFYERSA-N Val-Thr-Ala Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](C)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N)O CEKSLIVSNNGOKH-KZVJFYERSA-N 0.000 description 3
- 230000009471 action Effects 0.000 description 3
- 238000001042 affinity chromatography Methods 0.000 description 3
- 108010047857 aspartylglycine Proteins 0.000 description 3
- 208000015294 blood coagulation disease Diseases 0.000 description 3
- 239000003114 blood coagulation factor Substances 0.000 description 3
- 239000006143 cell culture medium Substances 0.000 description 3
- 230000008859 change Effects 0.000 description 3
- 108010060199 cysteinylproline Proteins 0.000 description 3
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 3
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 3
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 3
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 3
- 210000003292 kidney cell Anatomy 0.000 description 3
- 108010034529 leucyl-lysine Proteins 0.000 description 3
- 108010003700 lysyl aspartic acid Proteins 0.000 description 3
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 3
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 3
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 description 3
- 239000012588 trypsin Substances 0.000 description 3
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 3
- JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 2-[4-(2-hydroxyethyl)piperazin-1-yl]ethanesulfonic acid Chemical compound OCC[NH+]1CCN(CCS([O-])(=O)=O)CC1 JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000007469 Actins Human genes 0.000 description 2
- 108010085238 Actins Proteins 0.000 description 2
- DKJPOZOEBONHFS-ZLUOBGJFSA-N Ala-Ala-Asp Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O DKJPOZOEBONHFS-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 2
- UXJCMQFPDWCHKX-DCAQKATOSA-N Arg-Arg-Glu Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O UXJCMQFPDWCHKX-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- ASQYTJJWAMDISW-BPUTZDHNSA-N Arg-Asp-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N ASQYTJJWAMDISW-BPUTZDHNSA-N 0.000 description 2
- NYZGVTGOMPHSJW-CIUDSAMLSA-N Arg-Glu-Cys Chemical compound C(C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N)CN=C(N)N NYZGVTGOMPHSJW-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- KZXPVYVSHUJCEO-ULQDDVLXSA-N Arg-Phe-Lys Chemical compound NC(=N)NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 KZXPVYVSHUJCEO-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 2
- PRLPSDIHSRITSF-UNQGMJICSA-N Arg-Phe-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O PRLPSDIHSRITSF-UNQGMJICSA-N 0.000 description 2
- BZMWJLLUAKSIMH-FXQIFTODSA-N Asn-Glu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O BZMWJLLUAKSIMH-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- COUZKSSMBFADSB-AVGNSLFASA-N Asn-Glu-Phe Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N COUZKSSMBFADSB-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- FHETWELNCBMRMG-HJGDQZAQSA-N Asn-Leu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O FHETWELNCBMRMG-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 2
- RLHANKIRBONJBK-IHRRRGAJSA-N Asn-Met-Phe Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N RLHANKIRBONJBK-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- ZUFPUBYQYWCMDB-NUMRIWBASA-N Asn-Thr-Glu Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O ZUFPUBYQYWCMDB-NUMRIWBASA-N 0.000 description 2
- CBWCQCANJSGUOH-ZKWXMUAHSA-N Asn-Val-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O CBWCQCANJSGUOH-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 2
- GBAWQWASNGUNQF-ZLUOBGJFSA-N Asp-Ala-Cys Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N GBAWQWASNGUNQF-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 2
- QHAJMRDEWNAIBQ-FXQIFTODSA-N Asp-Arg-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O QHAJMRDEWNAIBQ-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- DONWIPDSZZJHHK-HJGDQZAQSA-N Asp-Lys-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N)O DONWIPDSZZJHHK-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 2
- RVMXMLSYBTXCAV-VEVYYDQMSA-N Asp-Pro-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O RVMXMLSYBTXCAV-VEVYYDQMSA-N 0.000 description 2
- JDDYEZGPYBBPBN-JRQIVUDYSA-N Asp-Thr-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O JDDYEZGPYBBPBN-JRQIVUDYSA-N 0.000 description 2
- 101800001415 Bri23 peptide Proteins 0.000 description 2
- 102400000107 C-terminal peptide Human genes 0.000 description 2
- 101800000655 C-terminal peptide Proteins 0.000 description 2
- 102100022641 Coagulation factor IX Human genes 0.000 description 2
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 2
- AEJSNWMRPXAKCW-WHFBIAKZSA-N Cys-Ala-Gly Chemical compound SC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(O)=O AEJSNWMRPXAKCW-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- BDWIZLQVVWQMTB-XKBZYTNZSA-N Cys-Glu-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N)O BDWIZLQVVWQMTB-XKBZYTNZSA-N 0.000 description 2
- 241000271032 Daboia russelii Species 0.000 description 2
- 108010076282 Factor IX Proteins 0.000 description 2
- 108010014172 Factor V Proteins 0.000 description 2
- 108010074864 Factor XI Proteins 0.000 description 2
- 108010080865 Factor XII Proteins 0.000 description 2
- 102000000429 Factor XII Human genes 0.000 description 2
- CELXWPDNIGWCJN-WDCWCFNPSA-N Gln-Lys-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O CELXWPDNIGWCJN-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 2
- IRDASPPCLZIERZ-XHNCKOQMSA-N Glu-Ala-Pro Chemical compound C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N IRDASPPCLZIERZ-XHNCKOQMSA-N 0.000 description 2
- LXAUHIRMWXQRKI-XHNCKOQMSA-N Glu-Asn-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)C(=O)O LXAUHIRMWXQRKI-XHNCKOQMSA-N 0.000 description 2
- CGOHAEBMDSEKFB-FXQIFTODSA-N Glu-Glu-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O CGOHAEBMDSEKFB-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- SJPMNHCEWPTRBR-BQBZGAKWSA-N Glu-Glu-Gly Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O SJPMNHCEWPTRBR-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- OCJRHJZKGGSPRW-IUCAKERBSA-N Glu-Lys-Gly Chemical compound NCCCC[C@@H](C(=O)NCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O OCJRHJZKGGSPRW-IUCAKERBSA-N 0.000 description 2
- MIIGESVJEBDJMP-FHWLQOOXSA-N Glu-Phe-Tyr Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 MIIGESVJEBDJMP-FHWLQOOXSA-N 0.000 description 2
- VXKCPBPQEKKERH-IUCAKERBSA-N Gly-Arg-Pro Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](NC(=O)CN)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O VXKCPBPQEKKERH-IUCAKERBSA-N 0.000 description 2
- DTPOVRRYXPJJAZ-FJXKBIBVSA-N Gly-Arg-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CCCN=C(N)N DTPOVRRYXPJJAZ-FJXKBIBVSA-N 0.000 description 2
- IWAXHBCACVWNHT-BQBZGAKWSA-N Gly-Asp-Arg Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N IWAXHBCACVWNHT-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- SUDUYJOBLHQAMI-WHFBIAKZSA-N Gly-Asp-Cys Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O SUDUYJOBLHQAMI-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- COVXELOAORHTND-LSJOCFKGSA-N Gly-Ile-Val Chemical compound NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O COVXELOAORHTND-LSJOCFKGSA-N 0.000 description 2
- UUYBFNKHOCJCHT-VHSXEESVSA-N Gly-Leu-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)CN UUYBFNKHOCJCHT-VHSXEESVSA-N 0.000 description 2
- FHQRLHFYVZAQHU-IUCAKERBSA-N Gly-Lys-Gln Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O FHQRLHFYVZAQHU-IUCAKERBSA-N 0.000 description 2
- GBYYQVBXFVDJPJ-WLTAIBSBSA-N Gly-Tyr-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)NC(=O)CN)O GBYYQVBXFVDJPJ-WLTAIBSBSA-N 0.000 description 2
- RVKIPWVMZANZLI-UHFFFAOYSA-N H-Lys-Trp-OH Natural products C1=CC=C2C(CC(NC(=O)C(N)CCCCN)C(O)=O)=CNC2=C1 RVKIPWVMZANZLI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 208000032843 Hemorrhage Diseases 0.000 description 2
- OQDLKDUVMTUPPG-AVGNSLFASA-N His-Leu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O OQDLKDUVMTUPPG-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- GBMSSORHVHAYLU-QTKMDUPCSA-N His-Val-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)N)O GBMSSORHVHAYLU-QTKMDUPCSA-N 0.000 description 2
- 108010065920 Insulin Lispro Proteins 0.000 description 2
- LJHGALIOHLRRQN-DCAQKATOSA-N Leu-Ala-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N LJHGALIOHLRRQN-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- WNGVUZWBXZKQES-YUMQZZPRSA-N Leu-Ala-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(O)=O WNGVUZWBXZKQES-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- ZURHXHNAEJJRNU-CIUDSAMLSA-N Leu-Asp-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O ZURHXHNAEJJRNU-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- JQSXWJXBASFONF-KKUMJFAQSA-N Leu-Asp-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O JQSXWJXBASFONF-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- RVVBWTWPNFDYBE-SRVKXCTJSA-N Leu-Glu-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O RVVBWTWPNFDYBE-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- HVJVUYQWFYMGJS-GVXVVHGQSA-N Leu-Glu-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O HVJVUYQWFYMGJS-GVXVVHGQSA-N 0.000 description 2
- KGCLIYGPQXUNLO-IUCAKERBSA-N Leu-Gly-Glu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O KGCLIYGPQXUNLO-IUCAKERBSA-N 0.000 description 2
- CSFVADKICPDRRF-KKUMJFAQSA-N Leu-His-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C([O-])=O)CC1=CN=CN1 CSFVADKICPDRRF-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- YOKVEHGYYQEQOP-QWRGUYRKSA-N Leu-Leu-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O YOKVEHGYYQEQOP-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 2
- OVZLLFONXILPDZ-VOAKCMCISA-N Leu-Lys-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O OVZLLFONXILPDZ-VOAKCMCISA-N 0.000 description 2
- JVTYXRRFZCEPPK-RHYQMDGZSA-N Leu-Met-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCSC)NC(=O)[C@H](CC(C)C)N)O JVTYXRRFZCEPPK-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 2
- VULJUQZPSOASBZ-SRVKXCTJSA-N Leu-Pro-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O VULJUQZPSOASBZ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- VHTIZYYHIUHMCA-JYJNAYRXSA-N Leu-Tyr-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O VHTIZYYHIUHMCA-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 2
- WSXTWLJHTLRFLW-SRVKXCTJSA-N Lys-Ala-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O WSXTWLJHTLRFLW-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- WLCYCADOWRMSAJ-CIUDSAMLSA-N Lys-Asn-Cys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O WLCYCADOWRMSAJ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- HWMZUBUEOYAQSC-DCAQKATOSA-N Lys-Gln-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O HWMZUBUEOYAQSC-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- WGLAORUKDGRINI-WDCWCFNPSA-N Lys-Glu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O WGLAORUKDGRINI-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 2
- NKKFVJRLCCUJNA-QWRGUYRKSA-N Lys-Gly-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN NKKFVJRLCCUJNA-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 2
- SQJSXOQXJYAVRV-SRVKXCTJSA-N Lys-His-Asn Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N SQJSXOQXJYAVRV-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- YUAXTFMFMOIMAM-QWRGUYRKSA-N Lys-Lys-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)NCC(O)=O YUAXTFMFMOIMAM-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 2
- TVHCDSBMFQYPNA-RHYQMDGZSA-N Lys-Thr-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O TVHCDSBMFQYPNA-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 2
- GPAHWYRSHCKICP-GUBZILKMSA-N Met-Glu-Glu Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O GPAHWYRSHCKICP-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- 108010002311 N-glycylglutamic acid Proteins 0.000 description 2
- HWMGTNOVUDIKRE-UWVGGRQHSA-N Phe-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 HWMGTNOVUDIKRE-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- RIYZXJVARWJLKS-KKUMJFAQSA-N Phe-Asp-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 RIYZXJVARWJLKS-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- QEPZQAPZKIPVDV-KKUMJFAQSA-N Phe-Cys-His Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)O)N QEPZQAPZKIPVDV-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- JWBLQDDHSDGEGR-DRZSPHRISA-N Phe-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 JWBLQDDHSDGEGR-DRZSPHRISA-N 0.000 description 2
- KDYPMIZMXDECSU-JYJNAYRXSA-N Phe-Leu-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 KDYPMIZMXDECSU-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 2
- ALJGSKMBIUEJOB-FXQIFTODSA-N Pro-Ala-Cys Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 ALJGSKMBIUEJOB-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- GNFHQWNCSSPOBT-ULQDDVLXSA-N Pro-Trp-Gln Chemical compound C1C[C@H](NC1)C(=O)N[C@@H](CC2=CNC3=CC=CC=C32)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O GNFHQWNCSSPOBT-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 2
- CWZUFLWPEFHWEI-IHRRRGAJSA-N Pro-Tyr-Asp Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O CWZUFLWPEFHWEI-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- 108010054530 RGDN peptide Proteins 0.000 description 2
- VFEHSAJCWWHDBH-RHYQMDGZSA-N Thr-Arg-Leu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O VFEHSAJCWWHDBH-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 2
- MSIYNSBKKVMGFO-BHNWBGBOSA-N Thr-Gly-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)NCC(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N)O MSIYNSBKKVMGFO-BHNWBGBOSA-N 0.000 description 2
- WRQLCVIALDUQEQ-UNQGMJICSA-N Thr-Phe-Arg Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O WRQLCVIALDUQEQ-UNQGMJICSA-N 0.000 description 2
- MYNYCUXMIIWUNW-IEGACIPQSA-N Thr-Trp-Lys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N)O MYNYCUXMIIWUNW-IEGACIPQSA-N 0.000 description 2
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 2
- IUFQHOCOKQIOMC-XIRDDKMYSA-N Trp-Asn-Lys Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N IUFQHOCOKQIOMC-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 2
- DZIKVMCFXIIETR-JSGCOSHPSA-N Trp-Gly-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O DZIKVMCFXIIETR-JSGCOSHPSA-N 0.000 description 2
- MNMYOSZWCKYEDI-JRQIVUDYSA-N Tyr-Asp-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O MNMYOSZWCKYEDI-JRQIVUDYSA-N 0.000 description 2
- FNWGDMZVYBVAGJ-XEGUGMAKSA-N Tyr-Gly-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)N FNWGDMZVYBVAGJ-XEGUGMAKSA-N 0.000 description 2
- HSBZWINKRYZCSQ-KKUMJFAQSA-N Tyr-Lys-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O HSBZWINKRYZCSQ-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- VYTUETMEZZLJFU-IHRRRGAJSA-N Tyr-Pro-Cys Chemical compound C1C[C@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O VYTUETMEZZLJFU-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- XQVRMLRMTAGSFJ-QXEWZRGKSA-N Val-Asp-Arg Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)O)N XQVRMLRMTAGSFJ-QXEWZRGKSA-N 0.000 description 2
- UEHRGZCNLSWGHK-DLOVCJGASA-N Val-Glu-Val Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O UEHRGZCNLSWGHK-DLOVCJGASA-N 0.000 description 2
- PIFJAFRUVWZRKR-QMMMGPOBSA-N Val-Gly-Gly Chemical compound CC(C)[C@H]([NH3+])C(=O)NCC(=O)NCC([O-])=O PIFJAFRUVWZRKR-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 2
- RHYOAUJXSRWVJT-GVXVVHGQSA-N Val-His-Glu Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)N RHYOAUJXSRWVJT-GVXVVHGQSA-N 0.000 description 2
- OTJMMKPMLUNTQT-AVGNSLFASA-N Val-Leu-Arg Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N OTJMMKPMLUNTQT-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- MNSSBIHFEUUXNW-RCWTZXSCSA-N Val-Thr-Arg Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N MNSSBIHFEUUXNW-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 2
- YQYFYUSYEDNLSD-YEPSODPASA-N Val-Thr-Gly Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(O)=O YQYFYUSYEDNLSD-YEPSODPASA-N 0.000 description 2
- ZHWZDZFWBXWPDW-GUBZILKMSA-N Val-Val-Cys Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O ZHWZDZFWBXWPDW-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- 229930003448 Vitamin K Natural products 0.000 description 2
- 239000012190 activator Substances 0.000 description 2
- 108010070944 alanylhistidine Proteins 0.000 description 2
- 108010011559 alanylphenylalanine Proteins 0.000 description 2
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 2
- 108010036533 arginylvaline Proteins 0.000 description 2
- 238000005844 autocatalytic reaction Methods 0.000 description 2
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 2
- 208000034158 bleeding Diseases 0.000 description 2
- 230000000740 bleeding effect Effects 0.000 description 2
- 229910001424 calcium ion Inorganic materials 0.000 description 2
- 108090001015 cancer procoagulant Proteins 0.000 description 2
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 2
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 2
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 2
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 2
- 239000003593 chromogenic compound Substances 0.000 description 2
- 230000035602 clotting Effects 0.000 description 2
- 230000004186 co-expression Effects 0.000 description 2
- AGVAZMGAQJOSFJ-WZHZPDAFSA-M cobalt(2+);[(2r,3s,4r,5s)-5-(5,6-dimethylbenzimidazol-1-yl)-4-hydroxy-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] [(2r)-1-[3-[(1r,2r,3r,4z,7s,9z,12s,13s,14z,17s,18s,19r)-2,13,18-tris(2-amino-2-oxoethyl)-7,12,17-tris(3-amino-3-oxopropyl)-3,5,8,8,13,15,18,19-octamethyl-2 Chemical group [Co+2].N#[C-].[N-]([C@@H]1[C@H](CC(N)=O)[C@@]2(C)CCC(=O)NC[C@@H](C)OP(O)(=O)O[C@H]3[C@H]([C@H](O[C@@H]3CO)N3C4=CC(C)=C(C)C=C4N=C3)O)\C2=C(C)/C([C@H](C\2(C)C)CCC(N)=O)=N/C/2=C\C([C@H]([C@@]/2(CC(N)=O)C)CCC(N)=O)=N\C\2=C(C)/C2=N[C@]1(C)[C@@](C)(CC(N)=O)[C@@H]2CCC(N)=O AGVAZMGAQJOSFJ-WZHZPDAFSA-M 0.000 description 2
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 2
- 108010016616 cysteinylglycine Proteins 0.000 description 2
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 2
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 2
- 230000006624 extrinsic pathway Effects 0.000 description 2
- 229960004222 factor ix Drugs 0.000 description 2
- 230000020764 fibrinolysis Effects 0.000 description 2
- 210000004907 gland Anatomy 0.000 description 2
- 108010080575 glutamyl-aspartyl-alanine Proteins 0.000 description 2
- 235000011187 glycerol Nutrition 0.000 description 2
- XBGGUPMXALFZOT-UHFFFAOYSA-N glycyl-L-tyrosine hemihydrate Natural products NCC(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 XBGGUPMXALFZOT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010077435 glycyl-phenylalanyl-glycine Proteins 0.000 description 2
- 108010089804 glycyl-threonine Proteins 0.000 description 2
- 108010020688 glycylhistidine Proteins 0.000 description 2
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 2
- 230000006623 intrinsic pathway Effects 0.000 description 2
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 2
- 210000005229 liver cell Anatomy 0.000 description 2
- 108010053062 lysyl-arginyl-phenylalanyl-lysine Proteins 0.000 description 2
- 108010045397 lysyl-tyrosyl-lysine Proteins 0.000 description 2
- 108010017391 lysylvaline Proteins 0.000 description 2
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 2
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 2
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 2
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 2
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 2
- SHUZOJHMOBOZST-UHFFFAOYSA-N phylloquinone Natural products CC(C)CCCCC(C)CCC(C)CCCC(=CCC1=C(C)C(=O)c2ccccc2C1=O)C SHUZOJHMOBOZST-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010079317 prolyl-tyrosine Proteins 0.000 description 2
- 230000017854 proteolysis Effects 0.000 description 2
- 238000011403 purification operation Methods 0.000 description 2
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 2
- 108010031491 threonyl-lysyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 2
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 description 2
- 239000002821 viper venom Substances 0.000 description 2
- 235000019168 vitamin K Nutrition 0.000 description 2
- 239000011712 vitamin K Substances 0.000 description 2
- 150000003721 vitamin K derivatives Chemical class 0.000 description 2
- 229940046010 vitamin k Drugs 0.000 description 2
- DIGQNXIGRZPYDK-WKSCXVIASA-N (2R)-6-amino-2-[[2-[[(2S)-2-[[2-[[(2R)-2-[[(2S)-2-[[(2R,3S)-2-[[2-[[(2S)-2-[[2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2R)-2-[[(2S,3S)-2-[[(2R)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[2-[[(2S)-2-[[(2R)-2-[[2-[[2-[[2-[(2-amino-1-hydroxyethylidene)amino]-3-carboxy-1-hydroxypropylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1-hydroxyethylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1,3-dihydroxypropylidene]amino]-1-hydroxyethylidene]amino]-1-hydroxypropylidene]amino]-1,3-dihydroxypropylidene]amino]-1,3-dihydroxypropylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1,3-dihydroxybutylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1-hydroxypropylidene]amino]-1,3-dihydroxypropylidene]amino]-1-hydroxyethylidene]amino]-1,5-dihydroxy-5-iminopentylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1,3-dihydroxybutylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1,3-dihydroxypropylidene]amino]-1-hydroxyethylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1-hydroxyethylidene]amino]hexanoic acid Chemical compound C[C@@H]([C@@H](C(=N[C@@H](CS)C(=N[C@@H](C)C(=N[C@@H](CO)C(=NCC(=N[C@@H](CCC(=N)O)C(=NC(CS)C(=N[C@H]([C@H](C)O)C(=N[C@H](CS)C(=N[C@H](CO)C(=NCC(=N[C@H](CS)C(=NCC(=N[C@H](CCCCN)C(=O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)N=C([C@H](CS)N=C([C@H](CO)N=C([C@H](CO)N=C([C@H](C)N=C(CN=C([C@H](CO)N=C([C@H](CS)N=C(CN=C(C(CS)N=C(C(CC(=O)O)N=C(CN)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O DIGQNXIGRZPYDK-WKSCXVIASA-N 0.000 description 1
- ZXJZGWOMAFPSJH-DCAQKATOSA-N (2S)-1-[2-[[2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[(2-aminoacetyl)amino]-3-carboxypropanoyl]amino]-3-hydroxypropanoyl]amino]acetyl]amino]acetyl]pyrrolidine-2-carboxylic acid Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)NCC(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O ZXJZGWOMAFPSJH-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 1
- TYMLOMAKGOJONV-UHFFFAOYSA-N 4-nitroaniline Chemical compound NC1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1 TYMLOMAKGOJONV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108020003589 5' Untranslated Regions Proteins 0.000 description 1
- ZCYVEMRRCGMTRW-UHFFFAOYSA-N 7553-56-2 Chemical group [I] ZCYVEMRRCGMTRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 1
- 229920000936 Agarose Polymers 0.000 description 1
- JBGSZRYCXBPWGX-BQBZGAKWSA-N Ala-Arg-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)C)CCCN=C(N)N JBGSZRYCXBPWGX-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- LWUWMHIOBPTZBA-DCAQKATOSA-N Ala-Arg-Lys Chemical compound NC(=N)NCCC[C@H](NC(=O)[C@@H](N)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O LWUWMHIOBPTZBA-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- PJNSIUPOXFBHDM-GUBZILKMSA-N Ala-Arg-Val Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O PJNSIUPOXFBHDM-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- CCUAQNUWXLYFRA-IMJSIDKUSA-N Ala-Asn Chemical compound C[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@H](C([O-])=O)CC(N)=O CCUAQNUWXLYFRA-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- SHYYAQLDNVHPFT-DLOVCJGASA-N Ala-Asn-Phe Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 SHYYAQLDNVHPFT-DLOVCJGASA-N 0.000 description 1
- ZIWWTZWAKYBUOB-CIUDSAMLSA-N Ala-Asp-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O ZIWWTZWAKYBUOB-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- CXZFXHGJJPVUJE-CIUDSAMLSA-N Ala-Cys-Leu Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)O)N CXZFXHGJJPVUJE-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- PUBLUECXJRHTBK-ACZMJKKPSA-N Ala-Glu-Ser Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O PUBLUECXJRHTBK-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- PCIFXPRIFWKWLK-YUMQZZPRSA-N Ala-Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](C)N PCIFXPRIFWKWLK-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- XZWXFWBHYRFLEF-FSPLSTOPSA-N Ala-His Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CN=CN1 XZWXFWBHYRFLEF-FSPLSTOPSA-N 0.000 description 1
- ANGAOPNEPIDLPO-XVYDVKMFSA-N Ala-His-Cys Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N ANGAOPNEPIDLPO-XVYDVKMFSA-N 0.000 description 1
- IORKCNUBHNIMKY-CIUDSAMLSA-N Ala-Pro-Glu Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O IORKCNUBHNIMKY-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- HOVPGJUNRLMIOZ-CIUDSAMLSA-N Ala-Ser-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](C)N HOVPGJUNRLMIOZ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- BUQICHWNXBIBOG-LMVFSUKVSA-N Ala-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)N BUQICHWNXBIBOG-LMVFSUKVSA-N 0.000 description 1
- CLOMBHBBUKAUBP-LSJOCFKGSA-N Ala-Val-His Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)N CLOMBHBBUKAUBP-LSJOCFKGSA-N 0.000 description 1
- 241000024188 Andala Species 0.000 description 1
- HJVGMOYJDDXLMI-AVGNSLFASA-N Arg-Arg-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@@H](N)CCCNC(N)=N HJVGMOYJDDXLMI-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- BEXGZLUHRXTZCC-CIUDSAMLSA-N Arg-Gln-Ser Chemical compound C(C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N)CN=C(N)N BEXGZLUHRXTZCC-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- MZRBYBIQTIKERR-GUBZILKMSA-N Arg-Glu-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O MZRBYBIQTIKERR-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- IYMAXBFPHPZYIK-BQBZGAKWSA-N Arg-Gly-Asp Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O IYMAXBFPHPZYIK-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- OQCWXQJLCDPRHV-UWVGGRQHSA-N Arg-Gly-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O OQCWXQJLCDPRHV-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- FSNVAJOPUDVQAR-AVGNSLFASA-N Arg-Lys-Arg Chemical compound NC(=N)NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O FSNVAJOPUDVQAR-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- PYZPXCZNQSEHDT-GUBZILKMSA-N Arg-Met-Asn Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N PYZPXCZNQSEHDT-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- JQHASVQBAKRJKD-GUBZILKMSA-N Arg-Ser-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N JQHASVQBAKRJKD-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- KSHJMDSNSKDJPU-QTKMDUPCSA-N Arg-Thr-His Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CN=CN1 KSHJMDSNSKDJPU-QTKMDUPCSA-N 0.000 description 1
- VYZBPPBKFCHCIS-WPRPVWTQSA-N Arg-Val-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N VYZBPPBKFCHCIS-WPRPVWTQSA-N 0.000 description 1
- YQNBILXAUIAUCF-CIUDSAMLSA-N Asn-Cys-Lys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N YQNBILXAUIAUCF-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- VJTWLBMESLDOMK-WDSKDSINSA-N Asn-Gln-Gly Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)NCC(O)=O VJTWLBMESLDOMK-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- OKZOABJQOMAYEC-NUMRIWBASA-N Asn-Gln-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O OKZOABJQOMAYEC-NUMRIWBASA-N 0.000 description 1
- IICZCLFBILYRCU-WHFBIAKZSA-N Asn-Gly-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O IICZCLFBILYRCU-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- GQRDIVQPSMPQME-ZPFDUUQYSA-N Asn-Ile-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O GQRDIVQPSMPQME-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 1
- WQAOZCVOOYUWKG-LSJOCFKGSA-N Asn-Val-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N WQAOZCVOOYUWKG-LSJOCFKGSA-N 0.000 description 1
- OEUQMKNNOWJREN-AVGNSLFASA-N Asp-Gln-Phe Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N OEUQMKNNOWJREN-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- WBDWQKRLTVCDSY-WHFBIAKZSA-N Asp-Gly-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O WBDWQKRLTVCDSY-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- QCVXMEHGFUMKCO-YUMQZZPRSA-N Asp-Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O QCVXMEHGFUMKCO-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- SPWXXPFDTMYTRI-IUKAMOBKSA-N Asp-Ile-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O SPWXXPFDTMYTRI-IUKAMOBKSA-N 0.000 description 1
- WOPJVEMFXYHZEE-SRVKXCTJSA-N Asp-Phe-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O WOPJVEMFXYHZEE-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- UKGGPJNBONZZCM-WDSKDSINSA-N Asp-Pro Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O UKGGPJNBONZZCM-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- XOASPVGNFAMYBD-WFBYXXMGSA-N Asp-Trp-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O XOASPVGNFAMYBD-WFBYXXMGSA-N 0.000 description 1
- 241001416181 Axis axis Species 0.000 description 1
- 235000014469 Bacillus subtilis Nutrition 0.000 description 1
- UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L Calcium chloride Chemical compound [Cl-].[Cl-].[Ca+2] UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 206010053567 Coagulopathies Diseases 0.000 description 1
- FEJCUYOGOBCFOQ-ACZMJKKPSA-N Cys-Asp-Gln Chemical compound C(CC(=O)N)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N FEJCUYOGOBCFOQ-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- QADHATDBZXHRCA-ACZMJKKPSA-N Cys-Gln-Asn Chemical compound C(CC(=O)N)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N QADHATDBZXHRCA-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- DZSICRGTVPDCRN-YUMQZZPRSA-N Cys-Gly-Lys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CS)N DZSICRGTVPDCRN-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- KPENUVBHAKRDQR-GUBZILKMSA-N Cys-His-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O KPENUVBHAKRDQR-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- ODDOYXKAHLKKQY-MMWGEVLESA-N Cys-Ile-Pro Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N ODDOYXKAHLKKQY-MMWGEVLESA-N 0.000 description 1
- BLGNLNRBABWDST-CIUDSAMLSA-N Cys-Leu-Asp Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N BLGNLNRBABWDST-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- WXOFKRKAHJQKLT-BQBZGAKWSA-N Cys-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CS WXOFKRKAHJQKLT-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- IDFVDSBJNMPBSX-SRVKXCTJSA-N Cys-Lys-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O IDFVDSBJNMPBSX-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- BCWIFCLVCRAIQK-ZLUOBGJFSA-N Cys-Ser-Cys Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N)O BCWIFCLVCRAIQK-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- FTTZLFIEUQHLHH-BWBBJGPYSA-N Cys-Thr-Cys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N)O FTTZLFIEUQHLHH-BWBBJGPYSA-N 0.000 description 1
- OEDPLIBVQGRKGZ-AVGNSLFASA-N Cys-Tyr-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O OEDPLIBVQGRKGZ-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- 101150074155 DHFR gene Proteins 0.000 description 1
- 102100031780 Endonuclease Human genes 0.000 description 1
- 108010042407 Endonucleases Proteins 0.000 description 1
- 102000005593 Endopeptidases Human genes 0.000 description 1
- 108010059378 Endopeptidases Proteins 0.000 description 1
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 1
- 241000206602 Eukaryota Species 0.000 description 1
- 206010016077 Factor IX deficiency Diseases 0.000 description 1
- 201000003542 Factor VIII deficiency Diseases 0.000 description 1
- 108010061932 Factor VIIIa Proteins 0.000 description 1
- 108010074105 Factor Va Proteins 0.000 description 1
- 102000009123 Fibrin Human genes 0.000 description 1
- 108010073385 Fibrin Proteins 0.000 description 1
- BWGVNKXGVNDBDI-UHFFFAOYSA-N Fibrin monomer Chemical compound CNC(=O)CNC(=O)CN BWGVNKXGVNDBDI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010049003 Fibrinogen Proteins 0.000 description 1
- 102000008946 Fibrinogen Human genes 0.000 description 1
- FAQVCWVVIYYWRR-WHFBIAKZSA-N Gln-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O FAQVCWVVIYYWRR-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- WUAYFMZULZDSLB-ACZMJKKPSA-N Gln-Ala-Asn Chemical compound NC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O WUAYFMZULZDSLB-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- XXLBHPPXDUWYAG-XQXXSGGOSA-N Gln-Ala-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O XXLBHPPXDUWYAG-XQXXSGGOSA-N 0.000 description 1
- IPHGBVYWRKCGKG-FXQIFTODSA-N Gln-Cys-Glu Chemical compound NC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O IPHGBVYWRKCGKG-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- SNLOOPZHAQDMJG-CIUDSAMLSA-N Gln-Glu-Glu Chemical compound NC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O SNLOOPZHAQDMJG-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- NSNUZSPSADIMJQ-WDSKDSINSA-N Gln-Gly-Asp Chemical compound NC(=O)CC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O NSNUZSPSADIMJQ-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- XSBGUANSZDGULP-IUCAKERBSA-N Gln-Gly-Lys Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O XSBGUANSZDGULP-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- HMIXCETWRYDVMO-GUBZILKMSA-N Gln-Pro-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O HMIXCETWRYDVMO-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- WOMUDRVDJMHTCV-DCAQKATOSA-N Glu-Arg-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O WOMUDRVDJMHTCV-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- RDPOETHPAQEGDP-ACZMJKKPSA-N Glu-Asp-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O RDPOETHPAQEGDP-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- ALCAUWPAMLVUDB-FXQIFTODSA-N Glu-Gln-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O ALCAUWPAMLVUDB-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- HNVFSTLPVJWIDV-CIUDSAMLSA-N Glu-Glu-Gln Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O HNVFSTLPVJWIDV-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- PHONAZGUEGIOEM-GLLZPBPUSA-N Glu-Glu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O PHONAZGUEGIOEM-GLLZPBPUSA-N 0.000 description 1
- SOEPMWQCTJITPZ-SRVKXCTJSA-N Glu-Met-Lys Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N SOEPMWQCTJITPZ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- IDEODOAVGCMUQV-GUBZILKMSA-N Glu-Ser-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O IDEODOAVGCMUQV-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- JWNZHMSRZXXGTM-XKBZYTNZSA-N Glu-Ser-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O JWNZHMSRZXXGTM-XKBZYTNZSA-N 0.000 description 1
- VHPVBPCCWVDGJL-IRIUXVKKSA-N Glu-Thr-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O VHPVBPCCWVDGJL-IRIUXVKKSA-N 0.000 description 1
- BKMOHWJHXQLFEX-IRIUXVKKSA-N Glu-Tyr-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)O BKMOHWJHXQLFEX-IRIUXVKKSA-N 0.000 description 1
- RQZGFWKQLPJOEQ-YUMQZZPRSA-N Gly-Arg-Gln Chemical compound C(C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)CN)CN=C(N)N RQZGFWKQLPJOEQ-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- SCCPDJAQCXWPTF-VKHMYHEASA-N Gly-Asp Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O SCCPDJAQCXWPTF-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- XEJTYSCIXKYSHR-WDSKDSINSA-N Gly-Asp-Gln Chemical compound C(CC(=O)N)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)CN XEJTYSCIXKYSHR-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- KTSZUNRRYXPZTK-BQBZGAKWSA-N Gly-Gln-Glu Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O KTSZUNRRYXPZTK-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- IEFJWDNGDZAYNZ-BYPYZUCNSA-N Gly-Glu Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O IEFJWDNGDZAYNZ-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- CUYLIWAAAYJKJH-RYUDHWBXSA-N Gly-Glu-Tyr Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 CUYLIWAAAYJKJH-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- GDOZQTNZPCUARW-YFKPBYRVSA-N Gly-Gly-Glu Chemical compound NCC(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O GDOZQTNZPCUARW-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- BUEFQXUHTUZXHR-LURJTMIESA-N Gly-Gly-Pro zwitterion Chemical compound NCC(=O)NCC(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O BUEFQXUHTUZXHR-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- CCBIBMKQNXHNIN-ZETCQYMHSA-N Gly-Leu-Gly Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O CCBIBMKQNXHNIN-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 1
- VLIJYPMATZSOLL-YUMQZZPRSA-N Gly-Lys-Cys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)CN VLIJYPMATZSOLL-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- JBCLFWXMTIKCCB-VIFPVBQESA-N Gly-Phe Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 JBCLFWXMTIKCCB-VIFPVBQESA-N 0.000 description 1
- IGOYNRWLWHWAQO-JTQLQIEISA-N Gly-Phe-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CC1=CC=CC=C1 IGOYNRWLWHWAQO-JTQLQIEISA-N 0.000 description 1
- OLIFSFOFKGKIRH-WUJLRWPWSA-N Gly-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN OLIFSFOFKGKIRH-WUJLRWPWSA-N 0.000 description 1
- HUFUVTYGPOUCBN-MBLNEYKQSA-N Gly-Thr-Ile Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O HUFUVTYGPOUCBN-MBLNEYKQSA-N 0.000 description 1
- GNNJKUYDWFIBTK-QWRGUYRKSA-N Gly-Tyr-Asp Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O GNNJKUYDWFIBTK-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 1
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 description 1
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 description 1
- FRJIAZKQGSCKPQ-FSPLSTOPSA-N His-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 FRJIAZKQGSCKPQ-FSPLSTOPSA-N 0.000 description 1
- HTZKFIYQMHJWSQ-INTQDDNPSA-N His-Ala-Pro Chemical compound C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CN=CN2)N HTZKFIYQMHJWSQ-INTQDDNPSA-N 0.000 description 1
- QZAFGJNKLMNDEM-DCAQKATOSA-N His-Asn-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 QZAFGJNKLMNDEM-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- VLPMGIJPAWENQB-SRVKXCTJSA-N His-Cys-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O VLPMGIJPAWENQB-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- JCOSMKPAOYDKRO-AVGNSLFASA-N His-Glu-Lys Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N JCOSMKPAOYDKRO-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- 101000756632 Homo sapiens Actin, cytoplasmic 1 Proteins 0.000 description 1
- NAFIFZNBSPWYOO-RWRJDSDZSA-N Ile-Thr-Gln Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)N NAFIFZNBSPWYOO-RWRJDSDZSA-N 0.000 description 1
- WXLYNEHOGRYNFU-URLPEUOOSA-N Ile-Thr-Phe Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)N WXLYNEHOGRYNFU-URLPEUOOSA-N 0.000 description 1
- WCNWGAUZWWSYDG-SVSWQMSJSA-N Ile-Thr-Ser Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N WCNWGAUZWWSYDG-SVSWQMSJSA-N 0.000 description 1
- KXUKTDGKLAOCQK-LSJOCFKGSA-N Ile-Val-Gly Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)NCC(O)=O KXUKTDGKLAOCQK-LSJOCFKGSA-N 0.000 description 1
- JZBVBOKASHNXAD-NAKRPEOUSA-N Ile-Val-Ser Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N JZBVBOKASHNXAD-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 1
- WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N L-glutamic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- KFKWRHQBZQICHA-STQMWFEESA-N L-leucyl-L-phenylalanine Natural products CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 KFKWRHQBZQICHA-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N L-lysine Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- FBOZXECLQNJBKD-ZDUSSCGKSA-N L-methotrexate Chemical compound C=1N=C2N=C(N)N=C(N)C2=NC=1CN(C)C1=CC=C(C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)C=C1 FBOZXECLQNJBKD-ZDUSSCGKSA-N 0.000 description 1
- PNUCWVAGVNLUMW-CIUDSAMLSA-N Leu-Cys-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O PNUCWVAGVNLUMW-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- WIDZHJTYKYBLSR-DCAQKATOSA-N Leu-Glu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O WIDZHJTYKYBLSR-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- USLNHQZCDQJBOV-ZPFDUUQYSA-N Leu-Ile-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O USLNHQZCDQJBOV-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 1
- PDQDCFBVYXEFSD-SRVKXCTJSA-N Leu-Leu-Asp Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O PDQDCFBVYXEFSD-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- RXGLHDWAZQECBI-SRVKXCTJSA-N Leu-Leu-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O RXGLHDWAZQECBI-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- VVQJGYPTIYOFBR-IHRRRGAJSA-N Leu-Lys-Met Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)O)N VVQJGYPTIYOFBR-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- JIHDFWWRYHSAQB-GUBZILKMSA-N Leu-Ser-Glu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O JIHDFWWRYHSAQB-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- BRTVHXHCUSXYRI-CIUDSAMLSA-N Leu-Ser-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O BRTVHXHCUSXYRI-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- ZJZNLRVCZWUONM-JXUBOQSCSA-N Leu-Thr-Ala Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O ZJZNLRVCZWUONM-JXUBOQSCSA-N 0.000 description 1
- ZDJQVSIPFLMNOX-RHYQMDGZSA-N Leu-Thr-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N ZDJQVSIPFLMNOX-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 1
- AAORVPFVUIHEAB-YUMQZZPRSA-N Lys-Asp-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O AAORVPFVUIHEAB-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- KWUKZRFFKPLUPE-HJGDQZAQSA-N Lys-Asp-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O KWUKZRFFKPLUPE-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- MWVUEPNEPWMFBD-SRVKXCTJSA-N Lys-Cys-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN MWVUEPNEPWMFBD-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- UGTZHPSKYRIGRJ-YUMQZZPRSA-N Lys-Glu Chemical group NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O UGTZHPSKYRIGRJ-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- UETQMSASAVBGJY-QWRGUYRKSA-N Lys-Gly-His Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CNC=N1 UETQMSASAVBGJY-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- VSTNAUBHKQPVJX-IHRRRGAJSA-N Lys-Met-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O VSTNAUBHKQPVJX-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- JHNOXVASMSXSNB-WEDXCCLWSA-N Lys-Thr-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(O)=O JHNOXVASMSXSNB-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 1
- BDFHWFUAQLIMJO-KXNHARMFSA-N Lys-Thr-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N)O BDFHWFUAQLIMJO-KXNHARMFSA-N 0.000 description 1
- WINFHLHJTRGLCV-BZSNNMDCSA-N Lys-Tyr-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 WINFHLHJTRGLCV-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 1
- FYRUJIJAUPHUNB-IUCAKERBSA-N Met-Gly-Arg Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N FYRUJIJAUPHUNB-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- LCPUWQLULVXROY-RHYQMDGZSA-N Met-Lys-Thr Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O LCPUWQLULVXROY-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 1
- 102000003792 Metallothionein Human genes 0.000 description 1
- 108090000157 Metallothionein Proteins 0.000 description 1
- 108010086093 Mung Bean Nuclease Proteins 0.000 description 1
- SITLTJHOQZFJGG-UHFFFAOYSA-N N-L-alpha-glutamyl-L-valine Natural products CC(C)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(O)=O SITLTJHOQZFJGG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XMBSYZWANAQXEV-UHFFFAOYSA-N N-alpha-L-glutamyl-L-phenylalanine Natural products OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 XMBSYZWANAQXEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KZNQNBZMBZJQJO-UHFFFAOYSA-N N-glycyl-L-proline Natural products NCC(=O)N1CCCC1C(O)=O KZNQNBZMBZJQJO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000001429 N-terminal alpha-amino-acid group Chemical group 0.000 description 1
- 229930193140 Neomycin Natural products 0.000 description 1
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 1
- 241001631646 Papillomaviridae Species 0.000 description 1
- UEHNWRNADDPYNK-DLOVCJGASA-N Phe-Cys-Ala Chemical compound C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)N UEHNWRNADDPYNK-DLOVCJGASA-N 0.000 description 1
- FXPZZKBHNOMLGA-HJWJTTGWSA-N Phe-Ile-Arg Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)N FXPZZKBHNOMLGA-HJWJTTGWSA-N 0.000 description 1
- PTDAGKJHZBGDKD-OEAJRASXSA-N Phe-Thr-Lys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)N)O PTDAGKJHZBGDKD-OEAJRASXSA-N 0.000 description 1
- MMPBPRXOFJNCCN-ZEWNOJEFSA-N Phe-Tyr-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O MMPBPRXOFJNCCN-ZEWNOJEFSA-N 0.000 description 1
- 108010051456 Plasminogen Proteins 0.000 description 1
- 102100038124 Plasminogen Human genes 0.000 description 1
- GDXZRWYXJSGWIV-GMOBBJLQSA-N Pro-Asp-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 GDXZRWYXJSGWIV-GMOBBJLQSA-N 0.000 description 1
- HXNYBZQLBWIADP-WDSKDSINSA-N Pro-Cys Chemical compound OC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 HXNYBZQLBWIADP-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- VPEVBAUSTBWQHN-NHCYSSNCSA-N Pro-Glu-Val Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O VPEVBAUSTBWQHN-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- LPGSNRSLPHRNBW-AVGNSLFASA-N Pro-His-Val Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C([O-])=O)NC(=O)[C@H]1[NH2+]CCC1)C1=CN=CN1 LPGSNRSLPHRNBW-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- ZKQOUHVVXABNDG-IUCAKERBSA-N Pro-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 ZKQOUHVVXABNDG-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- MRYUJHGPZQNOAD-IHRRRGAJSA-N Pro-Leu-Lys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 MRYUJHGPZQNOAD-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- OFGUOWQVEGTVNU-DCAQKATOSA-N Pro-Lys-Ala Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O OFGUOWQVEGTVNU-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- AWQGDZBKQTYNMN-IHRRRGAJSA-N Pro-Phe-Asp Chemical compound C1C[C@H](NC1)C(=O)N[C@@H](CC2=CC=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O AWQGDZBKQTYNMN-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- DCHQYSOGURGJST-FJXKBIBVSA-N Pro-Thr-Gly Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(O)=O DCHQYSOGURGJST-FJXKBIBVSA-N 0.000 description 1
- IALSFJSONJZBKB-HRCADAONSA-N Pro-Tyr-Pro Chemical compound C1C[C@H](NC1)C(=O)N[C@@H](CC2=CC=C(C=C2)O)C(=O)N3CCC[C@@H]3C(=O)O IALSFJSONJZBKB-HRCADAONSA-N 0.000 description 1
- FIDNSJUXESUDOV-JYJNAYRXSA-N Pro-Tyr-Val Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O FIDNSJUXESUDOV-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- 108010029485 Protein Isoforms Proteins 0.000 description 1
- 102000001708 Protein Isoforms Human genes 0.000 description 1
- 102100027378 Prothrombin Human genes 0.000 description 1
- 102000002085 Prothrombin/thrombin Human genes 0.000 description 1
- 108050009405 Prothrombin/thrombin Proteins 0.000 description 1
- 101710130181 Protochlorophyllide reductase A, chloroplastic Proteins 0.000 description 1
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 1
- BYIROAKULFFTEK-CIUDSAMLSA-N Ser-Asp-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO BYIROAKULFFTEK-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- JFWDJFULOLKQFY-QWRGUYRKSA-N Ser-Gly-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O JFWDJFULOLKQFY-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- VZQRNAYURWAEFE-KKUMJFAQSA-N Ser-Leu-Phe Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 VZQRNAYURWAEFE-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- XQAPEISNMXNKGE-FXQIFTODSA-N Ser-Pro-Cys Chemical compound C1C[C@H](N(C1)C(=O)[C@H](CO)N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O XQAPEISNMXNKGE-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- FKYWFUYPVKLJLP-DCAQKATOSA-N Ser-Pro-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)CO FKYWFUYPVKLJLP-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- XQJCEKXQUJQNNK-ZLUOBGJFSA-N Ser-Ser-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XQJCEKXQUJQNNK-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- PMTWIUBUQRGCSB-FXQIFTODSA-N Ser-Val-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O PMTWIUBUQRGCSB-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- 108090000787 Subtilisin Proteins 0.000 description 1
- IGROJMCBGRFRGI-YTLHQDLWSA-N Thr-Ala-Ala Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O IGROJMCBGRFRGI-YTLHQDLWSA-N 0.000 description 1
- HYLXOQURIOCKIH-VQVTYTSYSA-N Thr-Arg Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N HYLXOQURIOCKIH-VQVTYTSYSA-N 0.000 description 1
- UTSWGQNAQRIHAI-UNQGMJICSA-N Thr-Arg-Phe Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](NC(=O)[C@@H](N)[C@H](O)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 UTSWGQNAQRIHAI-UNQGMJICSA-N 0.000 description 1
- QGXCWPNQVCYJEL-NUMRIWBASA-N Thr-Asn-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O QGXCWPNQVCYJEL-NUMRIWBASA-N 0.000 description 1
- MMTOHPRBJKEZHT-BWBBJGPYSA-N Thr-Cys-Ser Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O MMTOHPRBJKEZHT-BWBBJGPYSA-N 0.000 description 1
- UZJDBCHMIQXLOQ-HEIBUPTGSA-N Thr-Cys-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)O)N)O UZJDBCHMIQXLOQ-HEIBUPTGSA-N 0.000 description 1
- CQNFRKAKGDSJFR-NUMRIWBASA-N Thr-Glu-Asn Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N)O CQNFRKAKGDSJFR-NUMRIWBASA-N 0.000 description 1
- GKWNLDNXMMLRMC-GLLZPBPUSA-N Thr-Glu-Gln Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)N)O GKWNLDNXMMLRMC-GLLZPBPUSA-N 0.000 description 1
- IMULJHHGAUZZFE-MBLNEYKQSA-N Thr-Gly-Ile Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O IMULJHHGAUZZFE-MBLNEYKQSA-N 0.000 description 1
- VTVVYQOXJCZVEB-WDCWCFNPSA-N Thr-Leu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O VTVVYQOXJCZVEB-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 1
- VUXIQSUQQYNLJP-XAVMHZPKSA-N Thr-Ser-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N)O VUXIQSUQQYNLJP-XAVMHZPKSA-N 0.000 description 1
- HLDFBNPSURDYEN-VHWLVUOQSA-N Trp-Ile-Asp Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)N HLDFBNPSURDYEN-VHWLVUOQSA-N 0.000 description 1
- VDUJEEQMRQCLHB-YTQUADARSA-N Trp-Lys-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CC2=CNC3=CC=CC=C32)N)C(=O)O VDUJEEQMRQCLHB-YTQUADARSA-N 0.000 description 1
- GAYLGYUVTDMLKC-UWJYBYFXSA-N Tyr-Asp-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 GAYLGYUVTDMLKC-UWJYBYFXSA-N 0.000 description 1
- HPYDSVWYXXKHRD-VIFPVBQESA-N Tyr-Gly Chemical compound [O-]C(=O)CNC(=O)[C@@H]([NH3+])CC1=CC=C(O)C=C1 HPYDSVWYXXKHRD-VIFPVBQESA-N 0.000 description 1
- FGVFBDZSGQTYQX-UFYCRDLUSA-N Tyr-Phe-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O FGVFBDZSGQTYQX-UFYCRDLUSA-N 0.000 description 1
- QFHRUCJIRVILCK-YJRXYDGGSA-N Tyr-Thr-Cys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)N)O QFHRUCJIRVILCK-YJRXYDGGSA-N 0.000 description 1
- PWKMJDQXKCENMF-MEYUZBJRSA-N Tyr-Thr-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O PWKMJDQXKCENMF-MEYUZBJRSA-N 0.000 description 1
- 108091023045 Untranslated Region Proteins 0.000 description 1
- 108010064997 VPY tripeptide Proteins 0.000 description 1
- 241000700618 Vaccinia virus Species 0.000 description 1
- ZLFHAAGHGQBQQN-AEJSXWLSSA-N Val-Ala-Pro Chemical compound C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N ZLFHAAGHGQBQQN-AEJSXWLSSA-N 0.000 description 1
- UPJONISHZRADBH-XPUUQOCRSA-N Val-Glu Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O UPJONISHZRADBH-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 1
- SDUBQHUJJWQTEU-XUXIUFHCSA-N Val-Ile-Lys Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N SDUBQHUJJWQTEU-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 1
- APQIVBCUIUDSMB-OSUNSFLBSA-N Val-Ile-Thr Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N APQIVBCUIUDSMB-OSUNSFLBSA-N 0.000 description 1
- SDHZOOIGIUEPDY-JYJNAYRXSA-N Val-Ser-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)C(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 SDHZOOIGIUEPDY-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 1
- 108091005605 Vitamin K-dependent proteins Proteins 0.000 description 1
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 1
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 1
- 108010005233 alanylglutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010044940 alanylglutamine Proteins 0.000 description 1
- 108010047495 alanylglycine Proteins 0.000 description 1
- 108010087924 alanylproline Proteins 0.000 description 1
- 230000003024 amidolytic effect Effects 0.000 description 1
- 238000010171 animal model Methods 0.000 description 1
- 238000005571 anion exchange chromatography Methods 0.000 description 1
- 150000001450 anions Chemical class 0.000 description 1
- 239000005557 antagonist Substances 0.000 description 1
- 230000002364 anti-haemorrhagic effect Effects 0.000 description 1
- 239000003146 anticoagulant agent Substances 0.000 description 1
- 229940127219 anticoagulant drug Drugs 0.000 description 1
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 1
- 108010013835 arginine glutamate Proteins 0.000 description 1
- 108010072041 arginyl-glycyl-aspartic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010068380 arginylarginine Proteins 0.000 description 1
- 108010062796 arginyllysine Proteins 0.000 description 1
- 108010077245 asparaginyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 108010040443 aspartyl-aspartic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010069205 aspartyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 108010093581 aspartyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 1
- 239000012620 biological material Substances 0.000 description 1
- 239000006227 byproduct Substances 0.000 description 1
- 239000001110 calcium chloride Substances 0.000 description 1
- 235000011148 calcium chloride Nutrition 0.000 description 1
- 229910001628 calcium chloride Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 1
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 1
- 238000005277 cation exchange chromatography Methods 0.000 description 1
- 230000006037 cell lysis Effects 0.000 description 1
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 description 1
- 239000013522 chelant Substances 0.000 description 1
- 238000011097 chromatography purification Methods 0.000 description 1
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 229910052956 cinnabar Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000003501 co-culture Methods 0.000 description 1
- 239000012141 concentrate Substances 0.000 description 1
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 1
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 1
- 230000006735 deficit Effects 0.000 description 1
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 1
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 1
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 1
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 1
- 238000010828 elution Methods 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- 201000007219 factor XI deficiency Diseases 0.000 description 1
- 229950003499 fibrin Drugs 0.000 description 1
- 229940012952 fibrinogen Drugs 0.000 description 1
- 230000003480 fibrinolytic effect Effects 0.000 description 1
- 239000012467 final product Substances 0.000 description 1
- 230000005714 functional activity Effects 0.000 description 1
- 230000006251 gamma-carboxylation Effects 0.000 description 1
- 238000002523 gelfiltration Methods 0.000 description 1
- 238000001415 gene therapy Methods 0.000 description 1
- 238000007429 general method Methods 0.000 description 1
- 230000000762 glandular Effects 0.000 description 1
- 108010037389 glutamyl-cysteinyl-lysine Proteins 0.000 description 1
- 108010051307 glycyl-glycyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 108010010147 glycylglutamine Proteins 0.000 description 1
- YMAWOPBAYDPSLA-UHFFFAOYSA-N glycylglycine Chemical compound [NH3+]CC(=O)NCC([O-])=O YMAWOPBAYDPSLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010087823 glycyltyrosine Proteins 0.000 description 1
- 208000009429 hemophilia B Diseases 0.000 description 1
- 208000031169 hemorrhagic disease Diseases 0.000 description 1
- 230000023597 hemostasis Effects 0.000 description 1
- 206010073071 hepatocellular carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 108010040030 histidinoalanine Proteins 0.000 description 1
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 1
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 230000002458 infectious effect Effects 0.000 description 1
- 238000001802 infusion Methods 0.000 description 1
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 1
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 1
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 1
- 238000004255 ion exchange chromatography Methods 0.000 description 1
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- 229960000310 isoleucine Drugs 0.000 description 1
- AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N isoleucine Natural products CCC(C)C(N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010044374 isoleucyl-tyrosine Proteins 0.000 description 1
- 108010044056 leucyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 1
- 239000012669 liquid formulation Substances 0.000 description 1
- 108010009298 lysylglutamic acid Chemical group 0.000 description 1
- 108010054155 lysyllysine Proteins 0.000 description 1
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 1
- 230000035800 maturation Effects 0.000 description 1
- 229910021645 metal ion Inorganic materials 0.000 description 1
- 229960000485 methotrexate Drugs 0.000 description 1
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 1
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 1
- 229960004927 neomycin Drugs 0.000 description 1
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 1
- SBUYBNIDQXQZSZ-UHFFFAOYSA-N p-aminophenylphosphocholine Chemical compound C[N+](C)(C)CCOP([O-])(=O)OC1=CC=C(N)C=C1 SBUYBNIDQXQZSZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 1
- 238000005192 partition Methods 0.000 description 1
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 1
- 230000007030 peptide scission Effects 0.000 description 1
- 239000000825 pharmaceutical preparation Substances 0.000 description 1
- 108010083476 phenylalanyltryptophan Proteins 0.000 description 1
- 230000008488 polyadenylation Effects 0.000 description 1
- 239000003805 procoagulant Substances 0.000 description 1
- 230000009465 prokaryotic expression Effects 0.000 description 1
- 230000002035 prolonged effect Effects 0.000 description 1
- 108010070643 prolylglutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010090894 prolylleucine Proteins 0.000 description 1
- 235000004252 protein component Nutrition 0.000 description 1
- 230000006337 proteolytic cleavage Effects 0.000 description 1
- 229940039716 prothrombin Drugs 0.000 description 1
- 229940024790 prothrombin complex concentrate Drugs 0.000 description 1
- 108010012557 prothrombin complex concentrates Proteins 0.000 description 1
- 239000013014 purified material Substances 0.000 description 1
- 238000003908 quality control method Methods 0.000 description 1
- 239000000376 reactant Substances 0.000 description 1
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 1
- 230000001177 retroviral effect Effects 0.000 description 1
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 1
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 1
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 241000894007 species Species 0.000 description 1
- 230000006641 stabilisation Effects 0.000 description 1
- 238000011105 stabilization Methods 0.000 description 1
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 1
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 1
- 230000001502 supplementing effect Effects 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 229910052715 tantalum Inorganic materials 0.000 description 1
- GUVRBAGPIYLISA-UHFFFAOYSA-N tantalum atom Chemical compound [Ta] GUVRBAGPIYLISA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 1
- 108010061238 threonyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 1
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 1
- 230000014621 translational initiation Effects 0.000 description 1
- 108010087967 type I signal peptidase Proteins 0.000 description 1
- 241000701447 unidentified baculovirus Species 0.000 description 1
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 1
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/48—Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
- C12N9/50—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25)
- C12N9/64—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from animal tissue
- C12N9/6421—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from animal tissue from mammals
- C12N9/6424—Serine endopeptidases (3.4.21)
- C12N9/6432—Coagulation factor Xa (3.4.21.6)
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P7/00—Drugs for disorders of the blood or the extracellular fluid
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P7/00—Drugs for disorders of the blood or the extracellular fluid
- A61P7/04—Antihaemorrhagics; Procoagulants; Haemostatic agents; Antifibrinolytic agents
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y304/00—Hydrolases acting on peptide bonds, i.e. peptidases (3.4)
- C12Y304/21—Serine endopeptidases (3.4.21)
- C12Y304/21006—Coagulation factor Xa (3.4.21.6)
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Public Health (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Diabetes (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
Abstract
1. Analog czynnika X, znamienny tym, ze posiada modyfikacje w rejonie naturalnie wy- stepujacego miejsca rozszczepienia aktywacyjnego do czynnika Xa w sekwencji czynnika X Gly228-R6-R5-R4-R3-R2-Arg234-R1, przy czym modyfikacja ta stanowi miejsce przeksztalcania dla nienaturalnie w tym rejonie sekwencji czynnika X rozszczepiajacej proteazy, a R1 oznacza aminokwas wybrany z grupy Ile, Val, Ser, Thr lub Ala R2 oznacza aminokwas wybrany z grupy Pro, Gly, Lys lub Arg R3 oznacza aminokwas wybrany z grupy Phe, Lys, Met, Gln, Glu, Ser, Val, Arg lub Pro R4 oznacza aminokwas wybrany z grupy Asp, Ile, Ser, Met, Pro, Thr, Arg lub Lys R5 oznacza aminokwas wybrany z grupy Asn, Lys, Ser, Glu, Ala, Gln, His lub Arg i R6 oznacza aminokwas wybrany z grupy Asp, Phe, Thr, Arg, Leu lub Ser. 19. Kompozycja, znamienna tym, ze zawiera oczyszczony analog czynnika X lub jego bialko prekursorowe z modyfikacja w rejonie naturalnie wystepujacego miejsca rozszczepienia aktywacyjnego czynnika X w sekwencji czynnika X w sekwencji Gly228-R6-R5-R4-R3- -R2-Arg234-R1, przy czym modyfikacja ta stanowi miejsce przeksztalcenia nienaturalnie w tym rejonie sekwencji czynnika X rozszczepiajacej proteazy, a R1 oznacza aminokwas wybrany z grupy Ile, Val, Ser, Thr lub Ala R2 oznacza aminokwas wybrany z grupy Pro, Gly, Lys lub Arg R3 oznacza aminokwas wybrany z grupy Phe, Lys, Met, Gin, Glu, Ser, V al, Arg lub Pro R4 oznacza aminokwas wybrany z grupy Asp, Ile, Ser, Met, Pro, Thr, Arg lub Lys R5 oznacza aminokwas wybrany z grupy Asn, Lys, Ser, Glu, Ala, Gln, His lub Arg i R6 oznacza aminokwas wybrany z grupy Asp, Phe, Thr, Arg, Leu lub Ser. PL
Description
Przedmiotem wynalazku jest analog czynnika X, rekombinowany DNA, kompozycje, zastosowanie rekombinowanego kwasu nukleinowego DNA oraz sposoby wytwarzania kompozycji.
Po zapoczątkowaniu procesu krzepnięcia krwi kaskada krzepnięcia przebiega poprzez sekwencyjne aktywowanie różnych proenzymów (zymogenów) we krwi do ich aktywnych postaci, proteaz serynowych. Należą do nich między innymi: czynnik XII/XIIa, czynnik XI/XIa, czynnik X/Xa, czynnik VII/VIIa i protrombina/trombina. Większość spośród tych enzymów jest aktywna w stanie fizjologicznym tylko wtedy, gdy tworzą one kompleks połączony z powierzchnią błony. W wiele tych procesów są włączone jony Ca. Krzepnięcie krwi następuje na szlaku wewnątrzpochodnym, na którym wszystkie składniki białkowe znajdują się we krwi, lub na szlaku zewnętrzpochodnym na którym krytyczną rolę odgrywa czynnik tkankowy błony komórkowej. Zamknięcie rany następuje ostatecznie w wyniku rozszczepienia fibrynogenu do fibryny przez trombinę.
Za aktywowanie protrombiny do trombiny jest odpowiedzialny kompleks protrombinazowy. Trombina jest ważnym enzymem, który może działać zarówno jako prokoagulant jak i jako antykoagulant. Kompleks protrombinazowy, w którym mają udział między innymi czynnik Va (jako kofaktor i czynnik Xa (jako proteaza serynowa), wchodzi w skład zależnego od Ca związku asocjacyjnego na powierzchni fosfolipidów. Przedmiotem dyskusji jest przy tym problem, czy czynnik Xa jest składnikiem katalitycznym kompleksu protrombinazowego.
Czynnik X (czynnik Stuarta/Prowera) jest zależną od witaminy K glikoproteiną koagulacyjną, która może być aktywowana przez wewnętrzną i zewnętrzną kaskadę krzepnięcia. Pierwotny produkt translacji czynnika X (prepro-FX) zawiera 488 aminokwasów i najpierw jest syntetyzowany jako jednołańcuchowe białko prekursorowe 75 kD przez wątrobę lub komórki wątrobiaka ludzkiego. W osoczu krwi czynnik X występuje w znacznym stopniu jako cząsteczka dwuhańcuchowa (Fair i wsp., 1984, Blood 64:194-204).
Podczas biosyntezy, po odszczepieniu pre-sekwencji przez peptydazę sygnałową (między Ser23/Leu24) i propeptydu (między Arg40/Ala41), rozszczepia się cząsteczkę jednołańcuchowego czynnika X przez przekształcenie i usunięcie tripeptydu Arg180-Lys181-Arg182 do postaci dwułańcuchowej, składającej się z lekkiego łańcucha około 22 kD i ciężkiego łańcucha około 50 kD, które są połączone ze sobą poprzez mostek disiarczkowy (fig. 1). Czynnik X krąży więc w osoczu jako cząsteczka dwułańcuchowa.
Podczas trwania procesu krzepnięcia krwi czynnik X ulega konwersji z nieaktywnego zymogenu w aktywny proteazowy czynnik Xa przez limitowaną proteolizę, przy czym aktywowanie czynnika X do czynnika Xa może następować w 2 kompleksach połączonych z błoną: zewnętrznym kompleksie czynnika VIIa/czynnika tkankowego lub wewnętrznym kompleksie czynnika VIIIa-czynnika IXa-fosfolipidu-Ca lub „kompleksie tenazowym” (Mertens i wsp., 1980, Biochem. J. 185:647-658). Rozszczepienie proteolityczne między aminokwasami Arg 234/IIe235 prowadzi do uwolnienia peptydu aktywacyjnego o długości 52 aminokwasów z N-końca ciężkiego łańcucha i w efekcie do powstania aktywnego enzymu, czynnika Xa. Ośrodek katalityczny czynnika Xa jest zlokalizowany na ciężkim łańcuchu.
Aktywowanie przez kompleks czynnika VIIa-TF (zewnętrzny) prowadzi do powstania czynnika Xaa (35 kD) i czynnika XaP (31 kD), przy czym w razie małego stężenia czynnika VIIa w kompleksie występuje także polipeptyd o 42 kD. Czynnik Xaa powstaje w wyniku rozszczepienia ciężkiego łańcucha przy Arg234/Ile235 i reprezentuje aktywowanie czynnika X do czynnika Xa. Występowanie czynnika Xap jest prawdopodobnie wynikiem autokatalitycznego odszczepienia przy Arg469/Gly470 na C-końcu ciężkiego łańcucha czynnika Xaa i odszczepienia peptydu 4,5 kD. Czynnik XaP tak samo jak czynnik Xaa ma aktywność katalityczną. Wykazano jednak, że w wyniku rozszczepienia czynnika Xaa do czynnika Xap powstaje miejsce wiązania plazminogenu i czynnik Xap posiada również aktywność fibrynolityczną lub uczestniczy w fibrynolizie jako kofaktor. Przekształcanie czynnika Xaa w czynnik Xaβ jest jednak powolniejsze niż tworzenie trombiny, co stanowi przeszkodę w zapoczątkowaniu fibrynolizy przed powstaniem skrzepu krwi (Pryzdial i wsp., 1996, J. Biol. Chem. 271:16614-16620; Pryzdial i wsp., 1996, J. Biol. Chem. 271:16621-16626).
Polipeptyd 42 kD powstaje w wyniku przekształcenia w C-końcu ciężkiego łańcucha między Arg469/Gly470 bez poprzedniego przekształcenia między Arg234/Ile235. Ten produkt
190 734 pośredni, tak samo jak fragment czynnika Xay, który powstaje w wyniku proteolizy przy Lys370, nie ma aktywności katalitycznej (Mertens i wsp., 1980, Biochem J. 185:647-658; Pryzdial i wsp., 1996, J. Biol. Chem. 271:16614-16620).
Aktywowanie czynnika X na szlaku wewnątrzpochodnym jest katalizowana przez kompleks czynnika EXa-czynnika VUIa. Podczas aktywowania otrzymuje się takie same produkty przekształcenia, lecz czynnik XaP jako produkt otrzymuje się w większej ilości niż inne produkty przekształcania czynnika X (Jesty i wsp., 1974, J. Biol. Chem. 249:5614).
In vitro czynnik X można aktywować np. za pomocą jadu żmii Russelła (Vipera russelli) (RW) lub trypsyny (Bajaj i wsp., 1973, J. Biol. Chem. 248:7729-7741) albo oczyszczonych aktywatorów fizjologicznych, takich jak kompleks FVIIa/TF lub kompleks czynnika IXa/czynnika VHIa (Mertens i wsp., 1980, Biochem. J. 185:647-658).
Dostępne w handlu produkty czynnika X z osocza zawierają najczęściej mieszaninę czynnika Xaa i czynnika Χηβ, gdyż po aktywowaniu czynnika X do czynnika Xa powstaje przede wszystkim czynnik Xaa, który w procesie autokatalitycznym znowu zostaje rozszczepiony do czynnika Xap. W celu wytworzenia czynnika Xa jako jednolitego produktu o wysokiej jednorodności cząsteczkowej, zaproponowano w EP 0 651 054 aktywowanie czynnika X przez dłuższy czas przez RW, tak że powstały tak produkt końcowy zawierał głównie czynnik Xap. Zarówno produkty uboczne, np. czynnik Xaa, jak i proteazę usuwano następnie za pomocą kilku operacji chromatograficznych.
cDNA dla czynnika X został wyodrębniony i scharakteryzowany (Leytus i wsp., 1984, Proc. Natl. Acad. Sci., USA, 82:3699-3702; Fung i wsp., 1985, Proc. Natl. Acad. Sci., USA, 82:3591-3595). Ludzki czynnik X poddawano in vitro ekspresji w różnego rodzaju komórkach, takich jak ludzkie zarodkowe komórki nerkowe lub komórki CHO (Rudolph i wsp., 1997, Prot. Expr. Purif. 10:373-378; Wolf i wsp., 1991, J. Biol. Chem. 266:13726-13730).
Stwierdzono jednak, że przy ekspresji rekombinacyjnej ludzkiego czynnika X przekształcenie w pozycji Arg40/Ala41 w przeciwieństwie do sytuacji in vivo przebiega z małą wydajnością i w lekkim łańcuchu czynnika X powstają różne N-końce (Wolf i wsp., 1991, J. Biol. Chem. 266:13726-13730). Rekombinowany czynnik X (rFX) został aktywowany in vitro przez RW do r-czynnika Xa (rFXa) lub rFXa został bezpośrednio poddany ekspresji, przy czym peptyd aktywacyjny od aminokwasu 183 do aminokwasu 234 został poddany delecji i zastąpiony przez tripeptyd, aby umożliwić bezpośrednie przekształcenie w dwułańcuchową postać rFXa. Oczyszczony rFX został przekształcony w około 70% w lekkie i ciężkie łańcuchy, podczas gdy pozostałe 30% stanowiły jednołańcuchowe rFX o 75 kD. Wprawdzie bezpośrednia ekspresja rFXa prowadziła do powstania aktywnego czynnika Xa, to jednak także spowodowała wytworzenie się nieaktywnych produktów pośrednich. Wolf i wsp. (1991, J. Biol. Chem. 266:13726-13730) stwierdzili ponadto mniejszą aktywność rekombinowanego czynnika X, którą tłumaczyli gorszym aktywowaniem rFX przez RW oraz nieaktywną populacją białek i polipeptydów jednołańcuchowej cząsteczki prekursora wej. Stwierdzili oni zwłaszcza dużą niestabilność rFXa przy ekspresji przez rekombinowane komórki, co tłumaczyli dużą prędkością autoproteolizy.
W celu zbadania działania C-końcowego peptydu czynnika Xaa, Eby i wsp. (1992, Blodd 80 (Suppl. 1): 1214A) wprowadzili kodon zatrzymujący w pozycji Gly430 sekwencji czynnika X. Nie stwierdzili oni jednak żadnej różnicy między stopniem aktywowania czynnika Xa (FXaa) z β-peptydem a mutanta delecyjnego bez β-peptydu (FXaP).
Czynnik Xa jest ważną częścią składową kompleksu protrombinazowego, więc mógłby być stosowany do leczenia pacjentów z zaburzeniami krzepnięcia krwi, np. przy hemofilii.
Leczenie chorych na hemofilię pacjentów z niedoborem czynnika VIII lub czynnika IX przy użyciu koncentratów czynników, otrzymanych z osocza, jest jednak często trudne przy dłuższym czasie leczenia, ponieważ są wytwarzane przeciwciała hamujące przeciwko tym czynnikom. Opracowano więc cały szereg alternatywnych sposobów leczenia pacjentów chorych na hemofilię przy użyciu czynników o aktywności bypass'owej. Zaproponowano stosowanie w tym celu koncentratu kompleksu protrombinowego, częściowo aktywowanego kompleksu protrombinazowego (APPC), czynnika VIIa lub FEIBA. Dostępnymi w handlu preparatami z czynnikiem VIIa o aktywności bypass'owej (FEIBA) są np. FEIBA® lub Autoplex®. FEIBA zawiera np. porównywalne jednostki czynnika II, czynnika VII, czynnika EX,
190 734 czynnika X i FEIBA, małe ilości czynnika VIII i czynnika V, oraz śladowe ilości aktywowanych czynników koagulacyjnych, takich jak trombina i czynnik Xa lub czynnik o aktywności podobnej do aktywności czynnika X (Elsinger, 1982, Activated Prothrombin Complex Concentrates. Ed. Mariani, Russo, Mandelli, p. 77-87). Elsinger zwraca uwagę zwłaszcza na znaczenie aktywności „podobnej jak czynnika Xa” w FEIBA. Aktywność bypass'owa czynnika VIII została pokazana na modelu zwierzęcym przez Gilesa i wsp. (1988, British J. Haematology 9:491-497) dla mieszaniny oczyszczonego czynnika Xa i fosfolipidów.
Istnieje duże zapotrzebowanie i szereg różnych dziedzin stosowania dla czynnika X/X a lub białek podobnych do czynnika X/Xa, samego lub jako składnika kompleksu koagulacyjnego w terapii przeciwkrwotocznej.
Okres półtrwania czynnika Xa w porównaniu z zymogenem jest silnie obniżony zarówno in vivo jak i in vitro. Tak np. czynnik X w glicerynie może być przechowywany stabilnie przez 18 miesięcy, podczas gdy czynnik Xa w takich samych warunkach jest stabilny tylko przez 5 miesięcy (Bajaj i wsp., 1973, J. Biol. Chem 248:7729-7241) albo w glicerynie w temperaturze 4°C wykazuje po upływie 8 miesięcy zmniejszenie aktywności o powyżej 60% (Teng i wsp., 1981, Thrombosis Res. 22: 213-220). Okres półtrwania czynnika Xa w surowicy wynosi tylko 30 sekund.
Ze względu na niestabilność czynnika Xa zaproponowano podawanie preparatów czynnika X (US 4,501,731). Przy groźnych dla życia krwawieniach, zwłaszcza u pacjentów chorych na hemofilię, podawanie czynnika X jest jednak nieskuteczne, gdyż wskutek braku funkcjonalnego „kompleksu tenasowego” na wewnątrzpochodnym szklaku krzepnięcia krwi nie może nastąpić wystarczająca aktywacja czynnika X do czynnika Xa a aktywacja na szlaku zewnątrzpochodnym częstokroć przebiega za wolno, aby osiągnąć szybkie działanie.
Ponadto u pacjentów chorych na hemofilię występuje wystarczająco dużo czynnika X, który jednak w porównaniu z czynnikiem Xa ma 1000-krotnie mniejszą aktywność protrombinazową. W takich przypadkach wymagane jest bezpośrednie podawanie aktywowanego czynnika Xa, ewentualnie razem z fosfolipidami, jak pisali Giles i wsp. (1988, British J. Haematology 9:491-497), lub razem z innymi czynnikami krzepnięcia, np. z czynnikiem VIII o aktywności bypass'owej.
Wytwarzanie czynnika Xa z czynnika X odbywało się dotychczas najczęściej przez aktywację niefizjologicznymi aktywatorami o pochodzeniu zwierzęcym, takimi jak RVV lub trypsyna, przy czym jednak konieczna była absolutna pewność, że produkt końcowy jest całkowicie wolny od tych proteaz. Jak już wspomniano wyżej, podczas aktywowania czynnika X do czynnika Xa tworzy się duża ilość częściowo także nieaktywnych produktów pośrednich (Bajaj i wsp., 1973, J. Bio. Chem. 248 : 7729-7741; Mertens i wsp., 1980, Biochem. J. 185:647-658). Obecność takich produktów pośrednich powoduje zmniejszenie aktywności właściwej produktu i ewentualnie takie produkty pośrednie mogą działać jako antagoniści aktywnej proteazy serynowej. Do wytwarzania jednorodnego, czystego produktu o dużej aktywności właściwej są więc potrzebne w konwencjonalnych metodach pracochłonne sposoby aktywowania oraz oczyszczania chromatograficznego.
Przedmiotem niniejszego wynalazku jest analog czynnika X, charakteryzujący się tym, że posiada modyfikację w rejonie naturalnie występującego miejsca rozszczepienia aktywacyjnego do czynnika Xa w sekwencji czynnika X Gly228-R6-R5-R4-R3-IR2-Arg234-R1, przy czym modyfikacja ta stanowi miejsce przekształcania dla nienaturalnie w tym rejonie sekwencji czynnika X rozszczepiającej proteazy, a
R1 oznacza aminokwas wybrany z grupy Ile, Val, Ser, Thr lub Ala
R2 oznacza aminokwas wybrany z grupy Pro, Gly, Lys lub Arg
R3 oznacza aminokwas wybrany z grupy Phe, Lys, Met, Gln, Glu, Ser, Val, Arg lub Pro
R4 oznacza aminokwas wybrany z grupy Asp, Ile, Ser, Met, Pro, Thr, Arg lub Lys
R5 oznacza aminokwas wybrany z grupy Asn, Lys, Ser, Glu, Ala, Gln, His lub Arg i
R6 oznacza aminokwas wybrany z grupy Asp, Phe, Thr, Arg, Leu lub Ser.
Korzystnie modyfikacja dotyczy co najmniej jednego aminokwasu wewnątrz sekwencji aminokwasowej peptydu aktywacyjnego, korzystniej modyfikacja ta stanowi wymianę co najmniej jednego aminokwasu między Gly228 a Arg 234 oraz ewentualnie Ile235, w odniesieniu do numeracji aminokwasów według fig. 1.
190 734
Korzystnie modyfikacja stanowi miejsce przekształcania dla proteazy wybranej z grupy endoproteaz, takich jak np. keksyna/Kex2, furyna/PACE, PC1/PC3, PC2, PC4, PACE4, LPC/PC7, proteaz serynowych, takich jak np. czynnik Ha, czynnik XHa, czynnik XIa, czynnik Xa> lub kalikreiny, albo pochodnej tych proteaz.
Korzystnie analog czynnika X posiada modyfikację w rejonie C-końcowej sekwencji aminokwasowej czynnika X, korzystniej posiada modyfikację w rejonie C-końcowego miejsca rozszczepienia β-peptydu, jeszcze korzystniej modyfikację stanowi mutacja, delecją lub insercją w rejonie sekwencji aminokwasowej czynnika X między pozycjami aminokwasów Arg469 a Ser476.
Korzystnie modyfikacja zapobiega odszczepieniu β-peptydu.
Korzystnie analog czynnika X posiada delecję β-peptydu czynnika X.
Korzystnie analog czynnika X posiada sygnał zatrzymania translacji w rejonie C-końcowym sekwencji czynnika X, korzystniej posiada sygnał zatrzymania translacji w pozycji aminokwasu 470 sekwencji czynnika X.
Korzystnie analog czynnika X posiada modyfikację w rejonie peptydu aktywacyjnego umożliwiającą aktywowanie in vitro analogu czynnika X do natywnego czynnika Xa lub analogu czynnika Xa, przy czym korzystniej modyfikacja ta umożliwia aktywowanie przez proteazę wybraną z grupy endoproteaz, takich jak keksyna/Kex2, furyna/PACE, PC1/PC3, PC2, PC4, PACE4, LPC/PC7, grupy proteaz serynowych, takich jak np. czynnik Ha, czynnik XHa, czynnik XIa, czynnik Xa, lub kalikreinę, albo pochodną tych proteaz.
Korzystnie analog czynnika X posiada modyfikację umożliwiającą aktywowanie in vivo analogu czynnika X do natywnego czynnika Xa lub analogu czynnika Xa, przy czym korzystniej modyfikacja ta umożliwia aktywowanie przez proteazę wybraną z grupy proteaz serynowych, takich jak np. czynnik XHa, czynnik XIa, czynnik Ha, czynnik Xa, lub przez kalikreinę.
Korzystnie analog czynnika X stanowi analog czynnika X z nienaruszonym (β-peptydem lub analog czynnika X skrócony na C-końcu.
Korzystnie analog czynnika X stanowi cząsteczkę jednołańcuchową.
Przedmiotem wynalazku jest ponadto rekombinowany DNA charakteryzujący się tym, że koduje analog czynnika X jak określono powyżej, zawarty w wektorze do rekombinacyjnej ekspresji kodowanego białka.
Przedmiotem wynalazku jest również kompozycja zawierająca oczyszczony analog czynnika X lub jego białko prekursorowe z modyfikacją w rejonie naturalnie występującego miejsca rozszczepienia aktywacyjnego czynnika X w sekwencji czynnika X w sekwencji Gly228-R6-R5-R4-R3-R2-Arg234-Rl, przy czym modyfikacja ta stanowi miejsce przekształcenia nienaturalnie w tym rejonie sekwencji czynnika X rozszczepiającej proteazy, a
Rl oznacza aminokwas wybrany z grupy De, Val, Ser, Thr lub Ala
R2 oznacza aminokwas wybrany z grupy Pro, Gly, Lys lub Arg
R3 oznacza aminokwas wybrany z grupy Phe, Lys, Met, Gln, Glu, Ser, Val, Arg lub Pro
R4 oznacza aminokwas wybrany z grupy Asp, Ile, Ser, Met, Pro, Thr, Arg lub Lys
R5 oznacza aminokwas wybrany z grupy Asn, Lys, Ser, Glu, Ala, Gln, His lub Arg i
R6 oznacza aminokwas wybrany z grupy Asp, Phe, Thr, Arg, Leu lub Ser.
Korzystnie modyfikacja stanowi miejsce rozszczepienia dla proteazy, wybranej z grupy endoproteaz dwuzasadowych, takich jak np. keksyna/Kex2, furyna/PACE, PC1/PC3, PC2, PC4, PACE4, LPC/PC7, proteaz serynowych, takich jak np. czynnik IIa, czynnik XHa, czynnik XIa, czynnik Xa, lub kalikreiny.
Korzystniej analog czynnika X stanowi analog FXa.
Korzystniej analog czynnika X stanowi analog czynnika X skrócony na C-końcu.
Korzystnie kompozycja zawiera analog czynnika X jako cząsteczkę jednołańcuchową w postaci wyodrębnionej, a zwłaszcza jednołańcuchowy analog czynnika X w enzymatycznie nieaktywnej postaci o czystości co najmniej 80%, korzystnie 90%, szczególnie korzystnie 95%, i nie zawiera nieaktywnych, proteolitycznych produktów pośrednich analogu czynnika X/Xa.
Korzystnie kompozycja zawiera analog czynnika X jako cząsteczkę dwułańcuchową w postaci wyodrębnionej.
190 734
Korzystnie kompozycja zawiera analog czynnika X, posiadający modyfikację, która umożliwia aktywowanie in vitro analogu czynnika X do natywnego czynnika Xa lub analogu czynnika Xa.
Korzystnie kompozycja ma postać preparatu farmaceutycznego.
Korzystnie kompozycja umieszczona jest w odpowiednim urządzeniu, zwłaszcza w urządzeniu aplikacyjnym, w kombinacji z proteazą, wybraną z grupy endoproteaz, takich jak np. keksyna/Kex2, furyna/PACE, PC1/PC3, PC2, PC4, PACE4, LPC/PC7, grupy proteaz serynowych, takich jak np. czynnik XIIa, czynnik XIa, czynnik Xa, lub kałkoremą, ćlll^o pochodną tych proteaz, korzystniej składniki są oddzielone od siebie przestrzennie.
Korzystnie kompozycja zawiera analog czynnika X, posiadający modyfikację, która umożliwia aktywowanie in vivo analogu czynnika X do natywnego czynnika Xa lub analogu czynnika Xa.
Kolejnym przedmiotem wynalazku jest kompozycja charakteryzująca się tym, że zawiera analog czynnika Xa i jest wolna od nieaktywnych produktów pośrednich analogu czynnika X/Xa oraz autoproteolitycznych produktów rozkładu czynnika X, i która może być otrzymywana przez aktywowanie analogu czynnika X jak określono powyżej.
Korzystnie kompozycja zawiera dopuszczalny fizjologicznie nośnik i jest w postaci stabilnej podczas składowania.
Korzystnie kompozycja zawiera ewentualnie jako dalszą część składową czynnik krwi lub aktywowaną postać czynnika krwi, korzystniej zawiera jako dalszą część składową co najmniej jeden składnic z czynnikiem VIII o aktywności bypass'owej.
Korzystnie kompozycja stanowi składnik zestawu farmaceutycznego i ewentualnie ma postać preparatu kilku-składnikowego.
Przedmiotem wynalazku jest też zastosowanie kompozycji jak określono powyżej do wytwarzania środka leczniczego.
Przedmiotem wynalazku jest ponadto zastosowanie rekombinowanego kwasu nukleinowego DNA kodującego analog czynnika X jak określono powyżej, i zawartego w wektorze do rekombinacyjnej ekspresji kodowanego białka do wytwarzania środka leczniczego.
Przedmiotem wynalazku jest również sposób wytwarzania kompozycji zawierającej oczyszczony rekombinowany analog czynnika X polegający na tym, że otrzymany rekombinacją nie analog czynnika X wyodrębnia się i oczyszcza metodą chromatograficzną.
Korzystnie sposób obejmuje etapy, w których:
- dostarcza się kwas nukleinowy określony powyżej
- transformuje się odpowiednią komórkę
- poddaje się ekspresji analog czynnika X
- ewentualnie inkubuje się analog czynnika X z proteazą
- wyodrębnia się analog czynnika X i
- oczyszcza się analog czynnika X metodą chromatograficzną.
Korzystnie analog czynnika X wyodrębnia się jako cząsteczkę dwułańcuchową.
Korzystniej dwułańcuchowy analog czynnika X kontaktuje się z proteazą wybraną z grupy endoproteaz, takich jak np. keksyna/Kex2, furyna/PACE, PC1/PC3, PC2, PC4, PACE4, LPC/PC7, grupy proteaz serynowych, takich jak np. czynnik IIa, czynnik Xlla, czynnik XIa, czynnik Xa, lub kalikreinaą albo pochodną tych proteaz, w warunkach, w których analog czynnika X aktywuje się do natywnego czynnika Xa lub analogu czynnika Xa, i korzystniej stosuje się komórkę, która może przeprowadzać rozszczepianie pojedynczego łańcucha na lekki i ciężki łańcuch czynnika X lub analogu czynnika X, nie eksprymuje i ewentualnie posiada deficyt proteazy, a zwłaszcza stosuje się komórkę nie eksprymującą endoproteazy, takiej jak np. keksyna, furyna, PACE lub ich pochodna.
Korzystnie analog czynnika X wyodrębnia się jako cząsteczkę jednołańcuchową.
Korzystniej jednołańcuchowy ewentualnie wyodrębniony analog czynnika X kontaktuje się z proteazą wybraną z grupy endoproteaz, takich jak keksyna/Kex2, furyna/PACE, PC1/PC3, PC2, PC4, PACE4, LPC/PC7, lub pochodną tych proteaz, w warunkach w jakich rozszczepia się jednołańcuchowy analog czynnika X do dwułańcuchowej postaci czynnika X, korzystniej jednołańcuchowy analog czynnika X, ewentualnie przez kontaktowanie z proteazą, aktywuje się bezpośrednio do czynnika Xa lub analogu czynnika Xa.
190 734
Korzystnie dwułańcuchowy analog czynnika X kontaktuje się z dalszą inną niz poprzednia proteazą i aktywuje do analogu czynnika Xa lub natywnego czynnika Xa.
Korzystnie stosuje się proteazę unieruchomioną.
Przedmiotem wynalazku jest także sposób wytwarzania kompozycji zawierającej aktywny czynnik Xa lub analog czynnika Xa polegający na tym, że analog czynnika X otrzymany sposobem określonym powyżej poddaje się operacji aktywowania.
Analog czynnika X według wynalzku może posiadać modyfikację w rejonie naturalnie występującego miejsca rozszczepiania aktywacyjnego czynnika Xa. Modyfikacja w rejonie miejsca rozszczepiania aktywacyjnego jest nowym, występującym nienaturalnie w tej pozycji polipeptydu miejscem rozpoznania lub przekształcenia dla proteazy, która zwykle nie rozszczepia polipeptydu w tym miejscu.
Analog czynnika X według wynalazku może posiadać przy tym modyfikację zwłaszcza w peptydzie aktywacyjnym, który zostaje odszczepiony podczas aktywowania czynnika X do czynnika Xa. Modyfikacja dotyczy przy tym co najmniej jednego aminokwasu wewnątrz sekwencji aminokwasowej peptydu aktywacyjnego czynnika X. Modyfikacja ma przy tym miejsce zwłaszcza w rejonie C-końcowym peptydu aktywacyjnego i stanowi co najmniej jedną wymianę co najmniej jednego aminokwasu między pozycjami Gly228 a Arg234 sekwencji aminokwasowej czynnika X. Pozycje aminokwasów odnoszą się przy tym do numeracji sekwencji przedstawionej na fig. 1 zaczynającej się od Met1 i kończącej na Lys488.
Modyfikację w analogu czynnika X według wynalazku stanowi przede wszystkim wymiana występującego w tym rejonie miejsca przekształcenia czynnika VIIa lub czynnika IXa na alternatywne miejsce rozszczepiania dla proteazy. Modyfikacją może być przy tym zastąpienie co najmniej jednego aminokwasu lub wstawienie sekwencji peptydowej, która stanowi miejsce rozpoznania proteazy lub miejsce odszczepienia. Modyfikacja w analogu czynnika X według wynalazku jest przy tym przeważnie tego rodzaju, że stanowi ona sekwencję rozpoznania lub odszczepienia dla proteazy z grupy endoproteaz, takich jak np. keksyna/Kex2, furyna/PACE, PC1/PC3, PC2, PC4, PACE 4, LPC/PC7 (jak opisano w Barr i wsp., 1991, Celi 66:1-3 lub US 5,460,950), proteaz serynowych, takich jak np. czynnik XHa, czynnik XIa, czynnik IIa, czynnik Xa lub kalikreiny, albo pochodnej tych proteaz.
Modyfikacja jest dobrana przede wszystkim tak, że przekształcenie przez jedną z tych proteaz prowadzi do odpowiadającego natywnemu czynnikowi Xa polipeptydu, który zasadniczo jest podobny do występującej naturalnie sekwencji czynnika Xa i również posiada aktywność czynnika Xa.
W celu osiągnięcia optymalnego przekształcenia, może być potrzebna w pojedynczych przypadkach dodatkowa wymiana aminokwasu Ile235. Po aktywacji przeważnie powinna być jednak pozostawiona izoleucyna, NH2-końcowy aminokwas ciężkiego łańcucha, gdyż ten aminokwas pełni ważną funkcję w tworzeniu kieszeni wiążącej substrat (Watzke i wsp., 1995, Molecular Basis of Thrombosis and Hemostasis ed. Katherine High & Harold Roberts). Analogi czynnika X według wynalazku wykazują różnicę struktualną, zwłaszcza na płaszczyźnie aminokwasowej w porównaniu z natywną sekwencją czynnika X, wykazują jednak porównywalną aktywowalność, takąjak występujący naturalnie czynnik X lub po aktywacji aktywność czynnika Xa.
Przykładowo pewna ilość analogów czynnika X według wynalazku może posiadać modyfikacje w peptydzie aktywacyjnym w stosunku do występującej naturalnie sekwencji czynnika X oraz zmienioną swoistość proteazową.
Modyfikacje mogą mieć miejsce w jednej lub kilku pozycjach w rejonie między aminokwasami Gly228 a Arg234 i ewentualnie Ile235, w odniesieniu do sekwencji czynnika X o numeracji od Met1 do L^i^^488 według fig. 1. Zastępowanie aminokwasów może się przy tym odbywać w pozycji Ile235 (R1), Arg234, Thr233 (R2), Leu232 (R3), Asn231 (R4), Asn230 (R5) i Asp229 (R6), przy czym jednak przeważnie Arg234 pozostaje bez zmiany.
Analogi czynnika X według wynalazku zawierają przeważnie sekwencję czynnika X z Gly 228-R6-R5-R4-R3-R2-Arg234 z R1=Ile, Val, Ala, Ser lub Thr; R2 = Thr, Pro, Gly, Lys lub Arg; R3 = Leu, Phe, Lys Glu, Met, Gln, Ser, Val, Arg lub Pro; R4 = Asn, Asp, Ile, Ser, Met, Pro, Thr, Lys lub Arg; R5 = Asn, Lys, Ser, Glu, Ala, Gln, His lub Arg oraz R6 = Asp, Phe, Thr, Arg, Leu lub Ser.
190 734
Zalecaną postacią realizacji analogów czynnika X według wynalazku są analogi czynnika X, które posiadają modyfikację:
a) R1 = Val, R2 = Thr, R3 = Phe, R4 = Asp, R5 = Asn i ewentualnie R6 = Phe (fig. 2A) i przekształca się go za pomocą czynnika X3a;
b) R1 = Ser, R2 = Arg, R3 = Thr, R4 = Leu (fig. 2B) i przekształca się go za pomocą FIIa;
c) R1 = Ile, R2 = Pro, R3 = Lys, R4 = Ile i ewentualne R5 = Lys i/lub r6 = Thr (fig. 2C) albo R1 - Ile, R2 = Thr, R3 = Ser, r4 = Thr i ewentualnie R5 = Lys i/lub R6 = Thr (fig. 21) i przekształca się je za pomocą czynnika XIIa;
d) R1 = Ile, R2 = Thr, R3 = Met, R4 = Ser i ewentualnie R5 = Ser ί/lub R6 = Leu (fig. 2D) i przekształca się go za pomocą kalikreiny;
e) R1 = De, R2 = Gly, R3 = Gln, R4 = Pro i ewentualne R5 = Lys i/lub R6 = Ser (fig. 2H) albo
R1 = Ile, R2 = Thr, R3 = Lys i R4 = Met (fig. 2E) albo R1 = Ile, R2 = Gly, R3 = Glu i R4 = Ile (fig. 2F) i przekształca się go za pomocą czynnika Xa;
f) R1 = Ile, R2 = Lys, R3 = Arg, R4 = Arg i ewentualnie R5 = Glu i/lub R6 = Leu albo
R1 = Ile, R2 = Thr, R3 = Val, R4 = Arg i ewentualnie R5 = Ala i/lub R6 = Leu albo
R1 = Ile, R2 = Arg, R3 = Val, R4 = Arg i ewentualnie R5 = Gln i/lub R6 = Leu albo
R1 = Ile, R2 = Arg, R3 = Arg, R4 = Arg i ewentualnie R5 = His i/lub R6 = Leu albo
R1 = Ile, R2 = Lys, R3 = Pro, R4 = Arg i ewentualnie R5 = Asn i/lub R6 = Leu albo
R1 = Ile, R2 = Lys, Re = Arg, R4 = Ile i ewentualnie R5 = Arg i/lub R6 = Leu albo
R1 = Ile, R2 = Lys, R3 = Ser i R4 = Arg albo
R1 = Ile, R2 = Thr, R3 = Val i R4 = Arg albo
R1 = Ile, R2 = Lys, R3 = Leu i R4 = Arg (patrz wszystkie fig. 2G), przy czym grupy wymienione w f) przekształca się za pomocą endoproteazy dwuzasadowej takiej jak np. furyna, PACE, keksyna/Kex2, furyna/PACE, PC1/PC3, PC2, PC4, PACE4, LPC/PC7 lub pochodnej jednej z tych proteaz.
Wybór możliwych modyfikacji i wymian aminokwasów, które prowadzą do zmienionych swoistości proteaz są podane na fig. 2A-I.
Modyfikacje można przy tym wykonywać za pomocą prowadzonej in vitro mutagenazy lub PGR albo innej znanej ze stanu techniki metody genowej, które nadają się do swoistego zmieniania sekwencji DNA w celu zrealizowania docelowej wymiany aminokwasów.
Aktywowanie analogu czynnika X według wynalazku do natywnego czynnika Xa lub analogu czynnika Xa przeprowadza się według niniejszego wynalazku przeważnie za pomocą proteazy, wybranej z grupy endoproteaz, takich jak np. keksyna/Kex2, furyna/PACE, PC1/PC3, PC2, PC4, PACE4, LPC/PC7, grupy proteaz serynowych, takich jak np. czynnik XIIa, czynnik XIa, czynnik Xa, czynnik IIa lub kalikreiny, albo pochodnej tych proteaz.
Jedną z trudności występujących przy wytwarzaniu aktywnego czynnika Xa jest jego niestabilność, gdyż wskutek autokatalizy powstają z niego oprócz czynnika Xao i czynnika Xap także inne nieaktywne produkty pośrednie. W celu zapewnienia wytwarzania zasadniczo nienaruszonego, aktywnego czynnika X/Xa lub cząsteczek podobnych do czynnika X/Xa byłoby więc pożądane otrzymywanie tylko takich białek, które prowadzą do stabilnych produktów końcowych.
Wiadomo, że uprzywilejowane miejsce rozszczepiania do przekształcania czynnika Xaa (FXaa) w czynnik Xap (FXap) leży między Arg469/Gly470. Na podstawie badań Eby, i wsp. (1992, Blood. Vol. 80, Suppl 1, 1214) wykryto oprócz sławnego peptydu C-końcowego (rodników aminokwasów 476 do 487) czynnika X dalszy krótszy peptyd (rodniki aminokwasów 474 do 477), który powstaje w wyniku autokatalizy czynnika Xarn
W celu zapewnienia docelowego przekształcenia nienaruszonego czynnika X w zasadniczo aktywny czynnik Xa, bez równoczesnego otrzymywania nieaktywnych produktów pośrednich tego przekształcenia, analogi czynnika X według wynalazku posiadają ewentualnie dalsze modyfikacje.
Analog czynnika X według wynalazku posiada więc zgodnie ze specjalną postacią wykonania wynalazku dalszą modyfikację w rejonie C-końcowym sekwencji aminokwasowej czynnika X.
W jednej z postaci wykonania wynalazku analog czynnika X wyżej opisanego rodzaju może posiadać nieaktywny β-peptyd (FXo). Analog czynnika X według wynalazku może po12
190 734 siadać przy tym modyfikację zwłaszcza w rejonie C-końcowego miejsca odszczepienia β-peptydu, które zapobiega temu, aby po aktywacji czynnika X do czynnika Xa nastąpiło odszczepienie β-peptydu od czynnika X. Dzięki temu otrzymuje się cząsteczkę czynnika Xa, która może zostać wyodrębniona w ilości do 100% jako nieczynna cząsteczka czynnika Xaa.
Modyfikacją może być mutacja, delecja lub insercja w rejonie sekwencji aminokwasowej czynnika X między pozycją aminokwasu Arg469 a Ser476 i ewentualnie Lys370. Uprzywilejowane jest jednak takie zastąpienie aminokwasu, przy którym w wyniku wymiany aminokwasu nie może nastąpić pofałdowanie polipeptydu wpływające na strukturę i przez to ewentualnie na działanie i aktywność białka.
W jednej z postaci wykonania wynalazku analogi czynnika X według wynalazku mogą posiadać wymianę jednego z aminokwasów w pozycji Arg469 i/lub Gly470, przy czym Arg469 wymienia się zwłaszcza na Lys, His lub Ile a Gly470 zwłaszcza na Ser, Ala, Val lub Thr.
Analogi czynnika X według wynalazku mogą posiadać oprócz mutacji w pozycji Arg469 i/lub Gly470 dalszą mutację w pozycji Lys370 i/lub Lys475 i/lub Ser476.
Przez zastąpienie aminokwasu w jednej z tych pozycji unika się przekształcenia czynnika Xaa w czynnik Xae lub w czynnik Xay, ponieważ występująca(e) naturalnie sekwencja(e) przekształceniowa(e) jest(są) tak zmodyfikowana(e), że nie może już nastąpić ewentualne autokatalityczne odszczepienie peptydu C-końcowego.
W innej postaci wykonania wynalazku analog czynnika X według wynalazku może posiadać delecję C-końcowego β-peptydu (łŃfi). Taki analog czynnika X można otrzymać, gdy cDNA kodujący analog czynnika X podda się ekspresji w rekombinacyjnym układzie ekspresyjnym, przy czym zostają klonowane tylko te sekwencje, które kodują aminokwasy Met1 do Arg469.
W dalszej postaci wykonania wynalazku analog czynnika X według wynalazku może posiadać sygnał zatrzymywania translacji w rejonie C-końcowym sekwencji czynnika X. Sygnał zatrzymania translacji znajduje się przy tym przeważnie w pozycji, która następuje po aminokwasie C-końcowym powstałym w wyniku naturalnego przekształcenia. Sygnał zatrzymania translacji znajduje się więc przeważnie w pozycji aminokwasu 470 sekwencji czynnika X, przez co zostaje zachowany znajdujący się na końcu aminokwas Arg469 czynnika Xa β. Równocześnie kodon GGC kodujący aminokwas Gly470 zostaje zastąpiony przez TAA, TAG lub TGA.
Analogi czynnika X według wynalazku mogą także obejmować takie analogi czynnika X według wynalazku, które przez działanie na nie in vitro odpowiednią proteazą aktywuje się do natywnego czynnika Xa lub analogu czynnika Xa. Zależnie od rodzaju użytego i aktywowanego analogu czynnika X, otrzymuje się odpowiadający natywnemu czynnikowi Xa i zasadniczo identyczny z nim polipeptyd lub polipeptyd, który wprawdzie ma aktywność czynnika Xa, lecz w stosunku do sekwencji natywnego czynnika Xa posiada modyfikacje, które jednak nie obniżająjego aktywności biologicznej.
W wyniku aktywowania analogów czynnika X, które posiadają modyfikację w rejonie peptydu aktywacyjnego w sekwencji peptydu aktywacyjnego, otrzymuje się wyłącznie polipeptydy odpowiadające cząsteczce natywnego czynnika Xa. Jeżeli taki analog czynnika X ewentualnie posiada dodatkowo sygnał zatrzymania translacji w rejonie C-końcowym β-peptydu, wówczas otrzymuje się cząsteczki homologu czynnika Xaβ. Jeżeli jednak stosuje się analog czynnika X, który posiada modyfikację(e) wewnątrz sekwencji β-peptydu, które powodują, że β-peptyd nie zostaje odszczepiony, wtedy otrzymuje się analog czynnika Xaa z wymianą aminokwasu na C-końcu cząsteczki.
Analogi czynnika X według wynalazku posiadają wyłącznie takie modyfikacje, które zmieniają swoistość aktywowalności ale nie wpływają na aktywność. W każdym przypadku otrzymuje się więc aktywną(y) biologicznie i czynnościowo cząsteczkę czynnika Xa lub analog czynnika Xa.
Aktywowanie in vitro można wykonać za pomocą proteazy z grupy endoproteaz, takich jak np. keksyna/Kex2, furyna/PACE, PC1/PC3, PC2, PC4, PACE4, LPC/PC7, grupy proteaz serynowych, takich jak np. czynnik XHa, czynnik XIa, czynnik Xa, lub kalikreiny, albo pochodnej tych proteaz. W zakres niniejszego wynalazku wchodzi jednak stosowanie każdej dowolnej proteazy, z wyjątkiem RVV, trypsyny, czynnika IXa lub czynnika VIIa, jeżeli jest ona zdolna do przekształcenia analogu czynnika X w czynnik Xa.
190 734
Analog czynnika X według wynalazku może zawierać modyfikację, która umożliwia aktywowanie in vivo analogu czynnika X do czynnika Xa, zwłaszcza do natywnego czynnika Xa. „Natywny” czynnik Xa oznacza w tym kontekście, ze aktywowany czynnik Xa, wywodzący się z analogu czynnika X według wynalazku, posiada sekwencję aminokwasową odpowiadającą natywnemu czynnikowi Xa i homologiczną sekwencję aminokwasową oraz zawiera aktywność czynnika Xa. Jest przy tym wybrana taka modyfikacja, aby przekształcenie czynnika X w czynnik Xa nastąpiło w wyniku działania proteazy występującej in vivo, a więc w ciele, zwłaszcza proteazy znajdującej się w kasdadzie krzepnięcia krwi. Proteaza może być przy tym wybrana z grupy proteaz serynowych, takich jak np. czynnik IIa, czynnik XIIa, czynnik XIa, czynnik Xa lub kalikreina. Analogi czynnika X, które oprócz modyfikacji w peptydzie aktywacyjnym posiadają modyfikację w rejonie C-końcowym cząsteczki czynnika X, aktywuje się, jak wyżej opisano, także in vivo do odpowiedniego analogu czynnika Xa.
Chociaż np. Wolf i wsp. (1991, J. Biol. Chem. 266: 13726-13730) przypuścili, ze endopeptydaza taka jak Kex2, furyna lub PACE bierze udział w przekształceniu opisnego w tej grupie mutantu delecyjnego czynnika Xa, nie podali żadnych wskazówek na temat wpływu którejś z tych proteaz na przekształcanie czynnika X. W US 5,660,950 także opisano rekombinacyjne wytwarzanie PACE i stosowanie proteazy do polepszenia przekształcania białek zależnych od witaminy K. W szeregu wyliczeń wymieniono wraz z innymi czynnikami krwi także czynnik X, przy czym jednak brak jest w tej relacji danych liczbowych.
W ramach niniejszego wynalazku pokazano wyraźnie po raz pierwszy, że proteazą koniecznie potrzebną w procesie dojrzewania czynnika X jest endoproteaza dwuzasadowa, zwłaszcza występująca endogennie furyna. In vivo endoproteaza pośredniczy przede wszystkim w rozszczepieniu jednołańcuchowej cząsteczki czynnika X do dojrzałej postaci składającej się z cięższego i lżejszego łańcucha. In vitro pośredniczy ona dodatkowo w odszczepianiu sekwencji propeptydu czynnika X (przykład 2).
Analogi czynnika X według wynalazku, które posiadaj ją miejsce rozszczepiania proteazowego dla proteazy nienaturalnie występującej w komórce, rozszczepia się na drodze selektywnej reakcji przekształcania tylko w takich miejscach, które także ulegają rozszczepianiu w natywnym czynniku X. W ten sposób otrzymuje się rekombinowaną cząsteczkę czynnika X, która składa się tylko z lekkiego łańcucha 22 kD i ciężkiego łańcucha o około 50 kD i nie posiada nieaktywnej cząsteczki czynnika X powstałej w wyniku nieswoistego przekształcenia. Te modyfikowane cząsteczki czynnika X, tak samo jak natywne cząsteczki czynnika X, nie zostają aktywowane do czynnika Xa przez proteazę wewnątrzkomórkową. Zostają one aktywowane do czynnika Xa dopiero później przez odpowiednie proteazy (głównie proteazy serynowe lub proteazy spokrewnione z subtylizyną).
Analog czynnika X według wynalazku może więc mieć postać dwułańcuchowego analogu czynnika X.
Sposobem według wynalazku można wytwarzać analogi czynnika X, które występują jako cząsteczki jednołańcuchowe przeważnie w postaci oczyszczonej. Przez poddanie ekspresji analogu czynnika X w komórkach z deficytem proteazy dwuzasadowej, otrzymuje się proczynnik X w formie cząsteczki jednołańcuchowej. Jednołańcuchowa cząsteczka czynnika X odznacza się dużą stabilnością i jednorodnością cząsteczkową. Dotychczas nie można było wyodrębniać jednołańcuchowej cząsteczki czynnika X w postaci oczyszczonej, gdyż bardzo prędko ulega ona przekształceniu w postać dwułańcuchową(Fair i wsp., 1984, Blood 64:194-204). Rekombinowane jednołańcuchowe analogi czynnika X można przez specjalną obróbkę przekształcać w dwułańcuchową postać czynnika X i następnie aktywować do czynnika Xa lub analogu czynnika Xa. Można to wykonać w ten sposób, że wyodrębnioną z komórki z deficytem proteazy jednołańcuchową rekombinowaną cząsteczkę czynnika X kontaktuje się z proteazą dwuzasadową, taką jak furyna/PACE lub Kex2, i przekształca w dwułańcuchowy analog czynnika X.
Dwułańcuchowy analog czynnika X można aktywować do czynnika Xa lub analogu czynika Xa. Może to nastąpić np. w ten sposób, że analog czynnika X, który w wyniku modyfikacji w rejonie peptydu aktywacyjnego posiada swoiste furynowe miejsce rozszczepiania, wyodrębnia się jako cząsteczkę jednołańcuchową z komórki z deficytem furyny i następnie przez zetknięcie z endoproteazą przekształca w aktywowaną cząsteczkę czynnika Xa.
190 734
Można także wyodrębnić jednołańcuchowy analog czynnika X, który posiada modyfikację w peptydzie aktywacyjnym, umożliwiającą alternatywne przekształcenie przez proteazę z grupy proteaz .serynowych lub kalikreinę, rozszczepić dopiero przez działanie endoproteazą dwuzasadową, taką jak np. furyna, do dwułańcuchowej cząsteczki czynnika X i tę ostatnią, następnie tak kontaktować z proteazą serynową, aby nastąpiło aktywowanie do czynnika Xa lub analogu czynnika Xa.
Analog czynnika X wyodrębniony z hodowli komórkowej w postaci cząsteczki dwułańcuchowej można bezpośrednio poddać działaniu proteazy swoistej dla aktywowania.
Tak otrzymany czynnik Xa lub analog czynnika Xa posiada ze względu na selektywną i ukierunkowaną reakcję przekształcania dużą stabilność i jednorodność strukturalną a zwłaszcza jest wolny od nieaktywnych produktów pośrednich analogu czynnika X/Xa i autoproteolitycznych produktów rozkładu.
Rekombinowany DNA według wynalazku kodujący analog czynnika X według wynalazku daje w wyniku ekspresji analog czynnika X z sekwencją aminokwasową odpowiadająca ludzkiemu czynnikowi X, chyba że posiada on modyfikację, która wpływa na swoistość przekształcenia i produkty przekształcenia, na co zasadniczo nie wpływa aktywność biologiczna czynnika powodującego krzepnięcie krwi.
Rekombinowany kwas nukleinowy DNA może być również zawarty w komórkach transformowanych.
Kompozycja według wynalazku zawiera oczyszczony analog czynnika X lub jego białko prekursorowe, który(a) posiada modyfikację w rejonie występującego naturalnie miejsca aktywowania czynnika Xa. Modyfikacja w rejonie miejsca rozszczepienia aktywacyjnego jest nowym występującym nienaturalnie w tej pozycji w polipeptydzie miejscem rozpoznania lub rozszczepienia dla proteazy, która normalnie w tym miejscu nie przekształca polipeptydu. Kompozycja może być przy tym oczyszczoną kompozycją jednołańcuchowego lub dwułańcuchowego analogu czynnika X, przy czym polipeptydy otrzymuje się z układu hodowli komórkowej po wyodrębnieniu ich z zasobu hodowli komórkowej lub z ekstraktu hodowli komórkowej. Wstępnie oczyszczony analog czynnika X z układu hodowli komórkowej można dalej oczyścić metodą znaną ze stanu techniki. Nadają się do tego zwłaszcza metody chromatograficzne, takie jak filtracja żelowa, chromatografia na bazie wymieniaczy jonowych lub chromatografia powinowactwa.
W jednej z postaci wykonana wynalazku kompozycja według wynalazku może zawierać analog czynnika X zwłaszcza jako cząsteczkę jednołańcuchową w postaci wyodrębnionej. Kompozycję tego rodzaju można wytwarzać tak, że analog czynnika X otrzymany przez wytwarzanie rekombinacyjne jako cząsteczka jednołańcuchowa z układu komórkowego, zwłaszcza z hodowli komórek, nie zawierających endoproteazy, rozszczepia się na ciężki i lekki łańcuch.
W pewnej postaci realizacji wynalazku kompozycja może zawierać jednołańcuchowy analog czynnika X z modyfikacją, która umożliwia aktywowanie go in vitro do czynnika Xa przez jedną z proteaz, wybranych z grupy endoproteaz dwuzasadowych, takich jak np. keksyna/Kex2, ffiryna/PACE, PC1/PC3, PC2, PC4, PACE4, LPC/PC7. Aktywowanie następuje przy tym przez kontaktowane analogu czynnika X z proteazą, przy czym w wymku zachodzącego naturalnie przekształcenia następuje rozszczepienie do dojrzalej postaci czynnika X i przez modyfikację odszczepienie peptydu aktywacyjnego oraz powstaje czynnik Xa lub analog czynnika Xa.
W kompozycji według wynalazku analog czyimika X może występować albo jako cząsteczka jednołańcuchowa w formie czynnika Xa (FXa) albo z delecją β-peptydu. Kompozycja może zawierać zwłaszcza analog czynnika X w nieaktywnej enzymatyczne postaci o czystości co najmniej 80%, korzystnie 90%, szczególnie korzystnie 95%, i nie zawierać nieaktywnych, proteolitycznych produktów pośrednich analogu czynnika XJXa.
Kompozycja według wynalazku może zawierać analog czynnika X zwłaszcza jako cząsteczkę dwułańcuchową w wyodrębnionej postaci. W tym celu np. analog czynnika X otrzymany z układu komórkowego przez wytwarzanie rekombinacyjne jako cząsteczka jednołańcuchowa rozszczepia się do postaci dwułańcuchowej in vitro, a więc na zewnątrz komórki, za pomocą proteazy, zwłaszcza proteazy dwuzasadowej. Może się to odbywać w ten sposób, że protezę miesza się bezpośrednio z zasobem hodowli klonów poddających ekspresji analog
190 734 czynnika X, albo przez mieszanie oczyszczonej proteazy lub zasobu hodowli komórkowej z pochodzącego z hodowli komórkowej wytwarzającej przez ekspresję proteazę w postaci rekombinowanej, albo przez współhodowlę klonów dających ekspresję analogu czynnika X i proteazy.
Można także kontaktować zasób hodowli komórkowej, zawierający analog czynnika X lub oczyszczony analog czynnika X, z unieruchomioną proteazą, przy czym wtedy następuje przekształcenie w postać dwułańcuchową. W tym sposobie proteaząjest związana przeważnie z matrycą a zasób hodowli komórkowej zawierający analog czynnika X kieruje się przez tę matrycę. Możliwe jest jednak także unieruchomienie analogu czynnika X, podczas gdy proteazą znajduje się w fazie ruchomej. Można także zmieszać reagenty (analog czynnika X i proteazę) i inkubować przez pewien czas. Proteazę usuwa się następnie z mieszaniny za pomocą chromatografii powinowactwa.
Postać dwułmrcuchową analogu czynnika X można otrzymać także przez wspólekspresję proteazy i analogu czynnika X bezpośrednio w danej komórce i ewentualnie oczyścić.
Kompozycja według wynalazku może zawierać jednołańcuchowy lub dwułańcuchowy analog czynnika X z modyfikacją która umożliwia aktywowanie in vitro do czynnika Xa lub analogu czynnika Xa. Aktywowanie analogu czynnika X do czynnika Xa lub analogu czynnika Xa może przy tym nastąpić w wyniku zetknięcia analogu czynnika X z proteazą wybraną z grupy endoproteaz dwuzasadowych, takich jak np. keksyna/Kex2, furyna/PACE, PC1/PC3, PC2, PC4, PACE4, LPC/PC7, grupy proteaz serynowych, takich jak np. czynnik XIIa, czynnik XIa, czynnik Ra, czynnik Xa, lub kalikreiną albo z pochodną tych proteaz. Proteaza może być przy tym unieruchomiona na nośniku.
Kompozycja według wynalazku może służyć jako materiał wyjściowy do wytwarzania i otrzymywania czynnika Xa. W tym celu w dużym urządzeniu technicznym kontaktuje się kompozycję, zawierającą jednołańcuchowy lub dwułańcuchowy analog czynnika X, np. z ewentualnie unieruchomioną prroteazą w warunkach, które umożliwiają optymalne aktywowanie analogu czynnika X do czynnika Xa i otrzymywanie czynnika Xa lub analogu czynnika Xa. Tak otrzymany czynnik Xa/analog czynnika Xa można następnie zastosować do wytworzenia zestawu farmaceutycznego.
Kompozycję według wynalazku zawierającą oczyszczony jednołańcuchowy lub dwułańcuchowy analog czynnika X według wynalazku i dopuszczalny fizjologicznie nośnik można preparować jako preparat farmaceutyczny. Preparowanie można przeprowadzić w znany sposób i preparować preparat farmaceutyczny przez zmieszanie z buforem zawierającym sole, takie jak NaCl, CaCF, i aminokwasy, takie jak glicyna i/lub lizyna, przy pH w przedziale od 6 do 8. Oczyszczoną kompozycję zawierającą analog czynnika X można przygotować jako przechowywalny produkt w postaci gotowego roztworu, liofilizatu lub zamrożoną aż do całkowitego zużycia. Kompozycję przechowuje się głównie w postaci liofilizatu i rozpuszcza w odpowiednim roztworze rekonstytucyjnym otrzymując wizualnie klarowny roztwór.
Kompozycję według niniejszego wynalazku można jednak także wytwarzać jako preparat ciekły lub w postaci zamrożonego roztworu. Kompozycja według wynalazku jest szczególnie stabilna, to znaczy że w stanie rozpuszczonym może ona stać przez dłuższy czas przed jej użyciem. Okazało się, że kompozycja według wynalazku przez kilka godzin do kilku dni nie wykazuje żadnej straty aktywności.
Kompozycja według wynalazku może być umieszczona w odpowiednim urządzeniu, zwłaszcza w urządzeniu aplikacyjnym, w kombinacji z proteazą wybraną z grupy endoproteaz, takich jak np. keksyna/Kex2, furyna/PACE, PC1/PC3, PC2, PC4, PACE4, LPC/PC7, grupy proteaz serynowych, takich jak np. czynnik IIa, czynnik XIIa, czynnik XIa, czynnik Xa, lub kalikreiną albo z pochodną tych proteaz.
Kompozycję według wynalazku zawierającą analog czynnika X w mieszaninie z proteazą, która jest w stanie aktywować analog czynnika X do czynnika Xa lub analogu czynnika Xa, można przygotować jako preparat skojarzony, składający się ze zbiornika zawierającego proteazę unieruchomioną na nośniku, ewentualnie w postaci minikolumny lub strzykawki zawierającej proteazę i zbiornika zawierającego kompozycję farmaceutyczną z analogiem czynnika X. W celu aktywowania analogu czynnika X tłoczy się roztwór zawierający analog czynnika X np. przez unieruchomioną proteazę. Roztwór zawierający analog czynnika X jest przy tym pod16
190 734 czas składowania preparatu oddzielony przestrzennie od proteazy. Kompozycja według wynalazku może być umieszczona w tym samym zbiorniku co proteazą, przy czym składniki są jednak oddzielone od siebie przestrzennie nieprzepuszczalną ścianką działową, która w przypadku ewentualnego użycia jest łatwa do usunięcia. Roztwory można także przechowywać w oddzielnych zbiornikach i dopiero na krótko przed użyciem kontaktować je ze sobą.
Zaleca się również by proteazę stosowaną do aktywowania stanowiła proteazą serynowa uczestnicząca także w stanie naturalnym w krzepnięciu krwi, taka jak np. cynnik XHa lub czynnik XIa, która przed zastosowaniem nie musi być oddzielona od aktywowanego czynnika Xa lub może być użyta razem z nim.
Aktywowanie analogu czynnika X do czynnika Xa może nastąpić na krótko przed bezpośrednim użyciem, a więc przed podaniem pacjentowi. Aktywowanie może nastąpić przez kontaktowaie z unieruchomioną proteazą lub przez zmieszanie roztworu zawierającego proteazę z roztworem zawierającym analog czynnika X. Jest więc możliwe oddzielne trzymanie roztworów obydwóch składników i mieszanie ich za pomocą odpowiedniego urządzenia infuzyjnego, w którym podczas przepływu składniki kontaktują się ze sobą, i w ten sposób aktywowanie każdej cząsteczki do czynnika Xa lub analogu czynnika Xa. Pacjentowi podaje się więc mieszaninę czynnika Xa i dalszej proteazy serynowej, która spowodowała aktywowanie. Należy przy tym zwracać szczególną uwagę na dawkowanie, gdyż przez dodatkowe podanie proteazy serynowej zostaje aktywowany także endogenny czynnik X i przez to może zostać skrócony czas krzepnięcia.
Zaleca się szczególnie by kompozycję według wynalazku umieścić w w odpowiednim urządzeniu, zwłaszcza w urządzeniu aplikacyjnym, albo w postaci zamrożonej cieczy albo w postaci liofilizatu. Odpowiednim urządzeniem aplikacyjnym może być przy tym dwukomorowy korpus strzykawkowy opisany w opisie patentowym nr AT 366 916 lub AT 382 783.
Kompozycja według wynalazku może zawierać analog czynnika X z modyfikacją, która umożliwia aktywowanie in vivo analogu czynnika X do czynnika Xa. Analogi czynnika X w preparacji według wynalazku posiadają przeważnie modyfikację, która stanowi miejsce rozpoznania/miejsce rozszczepienia dla proteazy wybranej z grupy proteaz serynowych, takich jak np. czynnik XHa, czynnik XIa, czynnik Xa, lub kalikreina i przez jedną z wymienionych proteaz są rozszczepiane in vivo do natywnego czynnika Xa lub analogu czynnika Xa. Przy tym szczególnie korzystne do stosowania leczniczego są takie analogi czynnika X, które posiadaj ją miejsce rozpoznania/miejsce rozszczepienia dla proteazy wewnątrz kaskady krzepnięcia niezaleznej od kompleksu czynnika Vna/tkanki i kompleksu tenazowego. Dzięki temu preparację według wynalazku można stosować do zatrzymywania krwawienia u pacjentów z deficytem zarówno czynnika IX i czynnika VII jak również czynnika VIII. Pacjentom, u których występuje zaburzenie krzepnięcia krwi z powodu deficytu czynnika XI lub czynnika XII, nie należy podawać kompozycji farmaceutycznych zawierających analog czynnika X, który jest aktywowany przez czynnik XIIa lub czynnik XIa. W przypadku np. deficytu czynnika XI byłoby wskazane zastosowanie analogu czynnika X z miejscem cięcia czynnikiem XJIa.
Kompozycja według wynalazku może ewentualnie zawierać jako dalszy składnik czynnik krwi w postaci zymogenu lub aktywnej proteazy serynowej. Jako dalsze składniki są przy tym zalecane składniki z czynnikiem VIII o aktywności bypass'owej. Należą do nich zwłaszcza: czynnik II, czynnik VII, czynnik IX, czynnik VIII, czynnik V i/lub aktywne dla nich proteazy serynowe. Dalszymi składnikami mogą być jednak także fosfolipidy, jony Ca itp. W jednej z postaci wykonania wynalazku kompozycja według wynalazku może zawierać jako co najmniej jeden dalszy składnik czynnik VIII o aktywności bypass'owej.
Kompozycja według wynalazku może mieć formę kompozycji farmaceutycznej z aktywnością czynnika Xa w postaci preparatu jednoskładnikowego lub mieszaniny z innymi czynnikami jako preparat kilkuskładnikowy.
Przed wytworzeniem kompozycji farmaceutycznej oczyszczone białko poddaje się zwykłym kontrolom jakości i nadaje jej postać do podawania leczniczego. W przypadku wytwarzania rekombinacyjnego bada się oczyszczony preparat na nieobecność kwasów nukleinowych pochodzących z komórek i z wektora ekspresyjnego, głównie metodą opisaną w opisie patentowym nr EP 0 714 987.
190 734
Ponieważ zasadniczo każdy materiał biologiczny może być zanieczyszczony drobnoustrojami zakaźnymi, więc w celu wytworzenia bezpiecznego preparatu ewentualnie poddaje się kompozycję obróbce w celu dezaktywacji i usunięcia wirusów.
Kompozycję według wynalazku zawierającą analog czynnika Xa o dużej stabilności i jednorodności strukturalnej, zwłaszcza wolną od nieaktywnych produktów pośrednich analogu czynnika X/Xa i autoproteolitycznych produktów rozkładu można otrzymać w ten sposób, że aktywuje się analog czynnika X wyżej opisanego rodzaju i przygotowuje z niego odpowiednią kompozycję.
W jednej postaci realizacji wynalazku opisywane jest zastosowanie kompozycji wyżej opisanego rodzaju do wytwarzania środka leczniczego. Środek leczniczy zawierający analog czynnika X lub analog czynnika Xa według wynalazku nadaje się zwłaszcza do leczenia pacjentów z zaburzeniami krzepnięcia krwi, takich jak np. pacjenci chorzy na hemofilię lub pacjenci, którzy wytworzyli w swoim organizmie przeciwciała hamujące działające przeciwko zwykle stosowanym do leczenia czynnikom VIII i/lub IX, i zwłaszcza jako preparat z czynnikiem VIII o aktywności bypass'owej.
W jednej postaci realizacji wynalazku opisywane jest zastosowanie kwasu nukleinowego DNA według wynalazku zawierającego sekwencje kodujące analogi czynnika X według wynalazku do wytwarzania środka leczniczego. Przy tym kwas nukleinowy według wynalazku, jeżeli zawiera on odpowiednie sekwencje kontroli ekspresji, może być stosowany jako sam kwas nukleinowy, może być włączony w rekombinowany wektor ekspresyjny lub połączony z nośnikiem, takim jak fosfolipid lub cząstka wirusowa. Kwas nukleinowy według wynalazku można przy tym zastosować do wytwarzania środka leczniczego, który nadaje się zwłaszcza do leczenia pacjentów z zaburzeniami krzepnięcia krwi, takich jak np. pacjenci chorzy na hemofolię lub pacjenci hemofilni z przeciwciałami hamującymi. Możliwe jest także stosowanie kwasu nukleinowego według wynalazku w terapii genowej.
Wynalazek opisuje również sposób wytwarzania analogu czynnika X według wynalazku i kompozycji zawierającej analog c:zynrika X według wynalazku. W tym celu umieszcza się w odpowiednim układzie ekspresyjnym sekwencję kodującą analog czynnika X i transfekuje rekombinowanym DNA odpowiednie komórki, zwłaszcza trwałe linie komórkowe. Komórki hoduje się w warunkach optymalnych dla ekspresji genu i wyodrębnia analog czynnika X z ekstrdktu hodowli komórek lub z zasobu hodowli komórek. Cząsteczki rekombinowane można oczyszczać wszystkimi znanymi metodami chromatograficznymi, takimi jak chromatografia z zastosowaniem wymieniaczy anionowych lub kationowych, chromatografia powinowactwa albo chromatografia powinowactwa immunologicznego, lub kombinacja tych metod.
Dla potrzeb wytwarzania analogów czynnika X według wynalazku klonuje się w wektorze ekspresyjnym kompletny cDNA kodujący czynnik X. Wykonuje się to odpowiednimi ogólnie znanymi metodami klonowania. Sekwencję nukleotydową jodującą czynnik X modyfikuje się następnie tak, aby sekwencja kodująca została tak zmieniona w rejonie peptydu aktywacyjnego i ewentualnie także w rejonie C-końcowego β -peptydu, aby mogła być wytwarzana cząsteczka czynnika X wyżej opisanego rodzaju. Wykonuje się to metodami techniki genowej znanymi ze stanu techniki, takimi jak swoiście wyregulowana mutageneza in vitro, lub delecja sekwencji, np. przez trawienie restrykcyjne endonukleazą i włączenie innej, zmienionej sekwencji, lub za pomocą PGR. Tak otrzymane mutanty czynnika X włącza się następnie w układ ekspresyjny odpowiedni do ekspresji rekombinacyjnej i poddaje ekspresji.
Analogi czynnika X według wynalazku można także wytwarzać na drodze syntezy chemicznej.
Analogi czynnika X wytwarza się przeważnie za pomocą ekspresji rekombinacyjnej. Wytwarzanie metodami techniki genowej można realizować przy użyciu wszystkich możliwych układów ekspresyjnych, takich jak np. trwałe linie komórkowe lub wirusowe układy ekspresyjne. Trwałe linie komórkowe wytwarza się przez stabilne włączanie obcego DNA w chromosom komórki gospodarza np. z Vero, MRC5, CHO, BHK, 293, Sk-Hepl, zwłaszcza komórek wątroby i nerek, lub przez wektor episomalny, wywodzący się np. z wirusa brodawczaka. Można stosować także wirusowe układy ekspresyjne, np. takie jak wirus ospy bydlęcej, bakulowirus lub układy retrowirusowe. Jako linie komórkowe stosuje się powszechnie Vero, MRC5, CHO, BHK, 293, Sk-Hepl, komórki gruczołów, wątroby i nerek. Jako eukariotyczne
190 734 układy ekspresyjne można stosować także drożdże, gruczoły endogenne (np. gruczoły zwierząt transgenicznych) i komórki innych rodzajów. Do ekspresji polipeptydów tu opisywanych lub ich pochodnych można oczywiście stosować także zwierzęta transgeniczne. Szczególnie przydatne do ekspresji białek rekombinowanych okazały się komórki CHO-DHFR* (Uriaub i wsp., 1980, Proc. Natl. Acad. Sei., USA, 77:4216-4220).
Do rekombinacyjnego wytwarzania analogów czynnika X według wynalazku można stosować także prokarioyczne układy ekspresyjne. Nadają się do tego zwłaszcza takie układy, które umożliwiają ekspresję w E. coli lub B. subtilis.
Analogi czynnika X poddaje się ekspresji w odpowiednich układach ekspresyjnych pod kontrolą odpowiedniego promotora. W przypadku ekspresji w eukariontach nadają się do tego wszystkie znane promotory, takie jak promotor SV40, CMV, RSV, HSV, EBV, promotor β-aktyny, hGH lub promotory indukowalne, takie jak np. promotor hsp lub promotor metalotioneinowy. Analogi czynnika X poddaje się ekspresji przeważnie w komórkach CHO pod kontrolą promotora β-aktyny
Sposób wytwarzania kompozycji według wynalazku może obejmować operacje wytwarzania DNA kodującego analog czynnika X, transformację komórki rekombinowanym DNA, ekspresję analogu czynnika X, ewentualnie w obecności proteazy, wyodrębnianie analogu czyn:nLka X i ewentualnie oczyszczanie metodą chromatograficzną.
Według jednej z postaci wykonania sposobu można wyodrębniać analog czynnika X jako cząsteczkę dwułańcuchową. W W tym celu analog czynnika X poddaje się ekspresji w komórce, która umożliwia przekształcenie analogu pro-czynnika X w dwułańcuchowy analog czynnika X. Komórką jest przy tym przeważnie komórka, która z ekspresją zdolnej do przekształcenia prekursora czynnika X proteazy, np. proteazy dwuzasadowej, takiej jak furyna lub jej pochodna. W celu zwiększenia lub polepszenia efektywności przekształcenia można ewentualnie tak zmodyfikować komórki, aby one silniej ekśprymowały proteazę. Może to nastąpić np. w wyniku współekspresj i odpowiedniej endoproteazy dwuzasadowej, takiej jak np. furyna/PACE, Kex2 lub ich pochodnej.
Analog czynnika X według wynalazku można także poddać ekspresji w komórce, która posiada normalne lub przez to suboptymalne dla przekształcenia stężenie endogenne proteazy i wskutek tego zachodzi niecałkowite przekształcenie w postać dwułańcuchową. Następujące po tym przekształcanie na ciężkie i lekkie łańcuchy zachodzi w tym przypadku wtedy, gdy wydzieli się z zasobu komórkowego jednołańcuchowy analog czynnika X, jak wyżej opisano, przez współhodowlę z komórkami poddającymi ekspresji proteazę lub przez zetknięcie z ewentualnie unieruchomiona proteazą. Zasób komórkowy można także tłoczyć pompą poprzez matrycę nośną z którą jest związana proteazą, w wyniku czego otrzymuje się w eluacie dwułańcuchowy analog czynnika X. Można także zmieszać reagenty w roztworze, inkubować przez pewien czas i następnie usunąć proteazę np. za pomocą matrycy powinowactwa.
Tak otrzymany dwułańcuchowy analog czynnika X można następnie wyodrębnić, oczyścić i do dalszego użycia przechowywać stabilnie, jak wyżej opisano.
Dwułańcuchowy, ewentualnie oczyszczony analog czynnika X według wynalazku można in vitro kontaktować z proteazą wybraną z grupy endoproteaz, takich jak np. keksyna/Kex2, furyna/PACE, PC1/PC3, PC2, PC4, PACE4, LPC/PC7 grupy proteaz serynowych, takich jak np. czynnik XIIa, czynnik XIa, czynnik Xa, czynnik IIa, lub kalikreiną, albo pochodną tych proteaz, w warunkach, w których analog czynnika X aktywuje się do natywnego czynnika Xa lub analogu czynnika Xa.
W jednej z postaci wykonania wynalazku aktywowanie może następować w ramach operacji chromatograficznej, w której proteazą jest unieruchomiona na nośniku. Oczyszczony dwułańcuchowy analog czynnika X kieruje się w tym celu przez matrycę, z którą jest związana proteazą, i wyodrębnia z eluatu oczyszczony czynnik Xa.
W innej postaci wykonania wynalazku składniki można mieszać i usuwać selektywnie proteazę z mieszaniny.
Możliwa jest oczywiście także kombinacja przekształcania jednołańcuchowego analogu pro-czynnika X w dwułańcuchową postać analogu czynnika X i aktywowania do czynnika Xa w jednym procesie. W tym celu kontaktuje się bezpośrednio jednołańcuchowy analog czynnika X lub jego prekursor z proteazą dwuzasadową, zwłaszcza z furyną lub z jej pochodną któ190 734 ra umożliwia przekształcenie w ciężki i lekki łańcuch i aktywowanie do czynnika Xa. Analog czynnika X, który nie posiada w peptydzie aktywacyjnym miejsca rozszczepienia dla furyny lub jej pochodnej, kontaktuje się ewentualnie z dalsza, inną od pierwszej proteazą, która jednak nie umożliwia aktywowania. Proteazy można stosować w postaci mieszaniny, np. furyny z czynnikiem XIa.
Aktywowanie można także przeprowadzić przez powiązanie obydwóch operacji w szeregowo połączonych bezpośrednio ze sobą urządzniach, zwłaszcza nośnikach, takich jak np. kolumny, na których jest(są) unieruchomiona(e) proteaza(y). Przy tym na pierwszym nośniku następuje rozszczepienie czynnika X na ciężkie i lekkie łańcuchy a na drugim aktywowanie do czynnika Xa przez unieruchomioną proteazę. Nośniki można przy tym sprzęgnąć ze sobą przez bezpośrednie połączenie wylotu z pierwszej kolumny z wlotem do drugiej kolumny.
Warunki reakcji przekształcania i aktywowania mogą być łatwo zoptymalizowane przez specjalistę zależnie od ustalonych doświadczalnie warunków ramowych. Dla czasu kontaktowania ma przy tym szczególnie duże znaczenie prędkość przepływu stosowanych reagentów. W idealnym przypadku powinna ona mieścić się między 0,01 ml/min i 1 ml/min. Jako dalsze parametry mają znaczenie temperatura, wartość pH i warunki eluowania. Po przepłynięciu przez urządzenie aktywowany czynnik Xa można ewentualnie dalej oczyścić przez selektywną chromatografię. Wykonanie sposobu z proteazą umieszczoną na każdym z nośników jest szczególnie zalecane dlatego, że urządzenie reakcyjne przez zastosowanie nośników, zwłaszcza kolumn chromatograficznych, umożliwia dodatkową operację oczyszczania.
W ramach wytwarzania analogu czynnika X według wynalazku można wyodrębniać analog czynnika X jako cząsteczkę jednołańcuchową. Następnie analog czynnika X poddaje się ekspresji w komórce, która nie pomaga w przekształcaniu pojedynczego łańcucha w lekki i ciężki łańcuch. Komórka ma przy tym przeważnie deficyt endoproteazy dwuzasadowej, takiej jak np. keksyna, furyna, PACE. Jak stwierdzono w ramach wynalazku, ważną i odpowiedzialną za rozszczepianie czynnika X na lekki i ciężki łańcuch ąroteazą jest furyna. Z takiej zmutowanej komórki z deficytem endoproteazy można wyodrębnić analog czynnika X w postaci cząsteczki jednołańcuchowej. Tak wyodrębniony i ewentualnie oczyszczony analog czynnika X kontaktuje się następnie z proteazą wybraną z grupy endoproteaz, takich jak np. keksyna/Kex2, furyna/PACE, PC1/PC3, PC2, PC4, PACE4, LPC/PC7, w warunkach w jakich rozszczepia się jednołańcuchowy analog czynnika X do dwułańcuchowej postaci czynnika X. Analogi czynnika X według wynalazku, posiadające modyfikację w rejonie peptydu aktywacyjnego, która umożliwia rozszczepianie przez jedną z tych endoproteaz, mogą ewentualnie zostać aktywowane do czynnika Xa lub analogu czynnika Xa bezpośrednio przez zetknięcie z endoproteaząjednołańcuchowego analogu czynnika X.
Analogi czynnika X według wynalazku, posiadające modyfikację w rejonie peptydu aktywacyjnego, która umożliwia rozszczepianie przez jedną z proteaz serynowych lub przez kalikreinę, po przekształceniu ich w dwułańcuchowy analog czynnika X, można kontaktować z dalszą, różną od pierwszej proteazą i aktywować do analogu czynnika Xa.
Sposobem według wynalazku można także otrzymać kompozycję zawierającą aktywny czynnik Xa lub aktywny analog czynnika Xa w taki sposób, że wytworzony jak opisano powyżej analog czynnika X poddaje się operacji aktywowania i aktywowany polipeptyd przerabia dalej na oczyszczoną kompozycję, która ewentualnie jest wytwarzana jako zestaw farmaceutyczny.
Wytwarzając analogi czynnika X według wynalazku, które aktywuje się wyżej opisanym sposobem do czynnika Xa, otrzymuje się oczyszczony czynnik Xa lub analog czynnika Xa o dużej stabilności i jednorodności strukturalnej a zwłaszcza wolny od nieaktywnych produktów pośrednich czynnika X/Xa.
Wynalazek opisują bliżej poniższe przykłady i figury rysunków, przy czym nie jest on jednak ograniczony do tych specjalnych przykładów wykonania.
Przykład 1 opisuje konstrukcję i ekspresję r-czynnika X; przykład 2 opisuje przekształcanie r-czynnika X w lekki i ciężki łańcuch przez fiirynę; przykład 3 opisuje przekształcanie pro-czynnika X za pomocą unieruchomionej proteazy; przykład 4 opisuje aktywność przekształconego in vitro r-czynnika X; przykład 5 opisuje ekspresję r-czynnika X w komórkach z deficytem furyny; przykład 6 opisuje konstrukcję i ekspresję analogów r-czynnika X; przy20
190 734 kład 7 opisuje oznaczanie N-końców produktów przekształcania czynnika X; przykład 8 opisuje ekspresję i charakterystykę analogu FX z furynowym miejscem rozszczepiania Arg-Arg-Lys-Arg/IUe (rFXRRKRi); przykład 9 opisuje aktywowanie in vitro białka rFX przez pochodną r-furyny; przykład 10 opisuje funkcjonalność aktywowanego in vitro rekombinowanego analogu FX rFX ; przykład 11 opisuje aktywowanie in vitro analogu rFX z miejscem rozszczepiania FXIa Asp-Phe-Thr-Arg/Val dla FXIa.
Figury przedstawiają:
figura 1 : sekwencję nukłeotydu i aminokwasu czynnika X figura 2 : schematyczny szkic analogów czynnika X z modyfikowanymi miejscami cięcia proteazowego w rejonie peptydu aktywacyjnego figura 3 : schematyczny szkic wektora ekspresyjnego phAct-rFX figura 4 : analizę Westernblot r-czynnika X poddanego ekspresji w komórkach CHO przed i po amplifikacji figura 5 : analizę Westernblot r-czynnika X po rozszczepieniu in vitro pochodną furyny figura 6 : analizę Westernblot cząsteczek r-czynnika X poddanego ekspresji w komór kach zawierających furynę i w komórkach z deficytem furyny figura 7: schematyczny szkic konstruktu analogonu rFX/rFXa ze zmienionymi
C-końcami ciężkiego łańcucha figura 8: schematyczny szkic N-końców produktów przekształcenia r-czynnika X w komórkach CHO zawierających furynę i w komórkach CHO z deficytem furyny przed i po działaniu r-furyny figura 9 : analizę Westernblot r-czynnika fxRRKR (; p^dcOnego eksprej i w komórkach CHO figura 10: analizę Westernblot r-czynnika FXRRRR po aktywowaniu in vitro pochodną furyny figura 11 : analizę Westernblot r-czynnika FxDFI'Rvpo aktywowaniu in vitro pochodną furyny. Wektory ekspresyjne wytworzono standardowymi metodami klonowania (Maniatis i wsp., „Molecular Cloning” - A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, New York, USA, 1983). Fragmenty DNA wytworzono za pomocą reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR) ogólnymi metodami (Clackson i wsp., 1991 m, PCR A practical approach. ED. McPherson, Quirke, Taylor, S. 187 - 214).
Przykład 1
Ekspresja i przekształcenie jednołańcuchowego rFX w rFX z lekkim/ciężkim łańcuchem
a. Wytwarzanie wektora ekspresyjnego dla rFX
W celu otrzymania rekombinowanego FX (rFX) wyodrębniono cDNA FX z wątroby ludzkiej z banku cDNA-lambda tak, jak opisali to Messier et. al. (1991, Gene 99:291-294). Z dodatniego klonu amplifikowano za pomocą PCR z oligonukleotydem #2911 (5'-ATTACTCGAGAAGCTTACCATGGGCGCCACTG-3') (SEQ. ID. Nr 1) jako 5'-starterem i oligonukleotydem #2912 (5'-ATTACAATrG-CTGCAGGGATCCAC-3') (SEQ. ID. Nr 2) jako 3'-starterem fragment DNA, który zawierał sekwencję kodującą FX 1,467 kB oraz nie ulegający translacji rejon 3' 39 pz, flankowany przez miejsce cięcia Xhol na 5'-końcu i miejsce cięcia Mfel na 3'-końcu. Dodatkowo została wbudowana przez starter #2911 sekwencja ACC przed ATG w FX, tak że powstała optymalna sekwencja inicjacji translacji Kozak. Następnie ten produkt PCR klonowano jako fragment XhoI/MfeI w wektor ekspresyjny phAct cięty przez SalI i EcoRI. Otrzymany plazmid ekspresyjny oznaczono jako phAct-rFx (fig. 3). Wektor ekspresyjny phAct obejmuje ludzki promotor β-aktyny, 78 pz 5'UTR oraz intron, miejsce wielokrotnego klonowania i miejsce poliadenylacji SV40.
b. Ekspresja rFX w komórkach CHO
W celu założenia stabilnej linii komórkowej dającej ekspresję rFX współtransfekowano komórki CHO z deficytem dhfr za pomocą plazmidu ekspresyjnego phAct-rFX i plazmidu markera selekcyjnego pSV-dhfr. Dla wszystkich dalszych analiz ekspresji i działania inkubowano hodowle komórkowe przez 24 godziny z wolną od osocza pożywką selekcyjną w obecności 10 pg/ml witaminy K. Ekspresję rFX w wynikowych klonach komórkowych zbadano na podstawie ilości antygenu (ELISA, Asserachrom, Boehringer Mannheim) i następnie scharakteryzowano rekombinowane białko za pomocą SDS-PAGE (fig. 4A i B). W klonach wyjściowych i ich subklonach leży, co jest rozpoznawalne w Western Blot (fig. 4A), rekombinowane
190 734 białko FX w postaci lekkiego łańcucha (LC) o 22 kD i ciężkiego łańcucha HC o 50 kD, które są identyczne z białkiem FX osocza.
Dodatkowo można rozpoznać przy 75 kD smugę białkową, która odpowiada cząsteczce jednołańcuchowej (SC) i której obecność opisano w komórkach CHO transfekowanych przez FX (Wolf i wsp., J. Biol. Chem 266:13726-13730, 1991) oraz w osoczu ludzkim (Fair i wsp., Blood 64:194-204, 1984). W celu otrzymania klonów ulegających silnej ekspresji amplikowano klony wyjściowe rosnącymi ilościami metotreksatu a następnie subklonowano w celu ustabilizowania. Ekspresję można było zwiększyć z około 200 - 500 ng/10E6 komórek lub lgg/ml do 78 pg/10E6 komórek lub 120 pg/ml na 24 godziny. Analiza Western Biot tych silnie ulegających ekspresji zasobów komórkowych (fig. 4B i fig. 5A, ślad 2) pokazuje wzbogacenie w jednołańcuchowe cząsteczki rFX oraz obecność dodatkowych postaci lekkiego łańcucha.
Oprócz postaci 22 kD lekkiego łańcucha, który odpowiada postaci osoczowej (całkowicie karboksylowany i bez propeptydu) istnieją trzy dalsze warianty lekkiego łańcucha o około 21 kD, 22,5 kD i 20 kD. Heterogenność lekkiego łańcucha w tych klonach można wytłumaczyć za pomocą N-końcowego sekwencj onowania materiału rekombinowanego niecałkowitym odszczepieniem propeptydu (tu: około 50% materiału rFX) oraz do niedokarboksylowaniem (tu: około 50% rFX). Białko 21 kD jest niedokarboksylowaną zawierającą propeptyd a białko 20 kD niedokarboksylowaną wolną od propeptydu postacią lekkiego łańcucha, podczas gdy smuga 25,5 kD reprezentuje całkowicie karboksylowaną, lecz zawierającą propeptyd postać LC.
Przykład 2
Przekształcenie jednołańcuchowego rFX w rFX z lekkiem/ciężkim łańcuchem przez pochodne r-furyny
Na podstawie podobieństwa miejsc rozszczepiania między propeptydem czynnika Χ/Ν-końcem lekkiego łańcucha (RYTR^A) i między lekkim/ciężkim łańcuchem (RXKR4rS) z sekwencją rozpoznania konsensusu furyny (RXK/RR^X), istniała możliwość polepszenia przekształcania in vitro zarówno jednołańcuchowych jak i zawierających propeptyd cząsteczek rFX przez pochodne r-furyny. W literaturze wymienia się proteazy dla obydwóch operacji przekształcania, lecz nie chodzi tam o furynę (Rehemtulla i wsp., 1992, Blood 79: 2349-2355; Wallin i wsp., 1994, Thromb. Res. 1994:395-403).
Zasoby hodowli komórkowej CHO-rFX i CHO-r-furyny AATM6xHis (zgłoszenie patentowe EP 0 775 750 A2) oraz CHO-rFX i nietransfekowanych CHO (jako kontroli ujemnej) zmieszano w stosunku 1:1 i inkubowano w temperaturze 37°C. Próbki zestawów reakcyjnych zbadano przed inkubacją (t=0) i po upływie różnych czasów inkubacji (t=2, 4, 6 godzin) za pomocą analizy Western Biot na przekształcony rFX (fig. 5). rFX wykrywano w zasobach kultur komórkowych za pomocą antyludzkiej surowicy FX (fig. 5 A) lub przeciwciała monoklonalnego swoistego dla lekkiego łańcucha FX (fig. 5B).
W przeciwieństwie do mieszaniny CHO-rFX/CHO mieszanina CHO-rFX/CHO-r-furyna już po dwóch godzinach inkubacji w temperaturze 37°C (fig. 5 A, ślad 7; fig. 5B, ślad 8) została prawie całkowicie przekształcona. Jednołańcuchowy rFX został w większości przekształcony w postać z lekkim i ciężkim łańcuchem. W rejonie lekkiego łańcucha znaleziono tylko jeszcze przekształcone wolne od propeptydu postacie o 22 kD (postać karboksylowana) i 20 kD (postać niedokarboksylowaną) w stosunku około 50 : 50. Przez optymalizację warunków hodowli komórkowej można ten stosunek zwiększyć z korzyścią do postaci karboksylowanej. Prawidłowość rozszczepienia między Arg-1 i Ala+1 i jednorodność lekkiego łańcucha stwierdzono za pomocą sekwencjonowania N-końcowego. W doświadczeniu kontrolnym, w którym CHO-rFX zmieszano z zasobami CHO, nie stwierdzono nawet po 6-godzinnej inkubacji żadnej zmiany wzoru pasma rFX (fig. 5 A, ślad 5; fig. 5B, ślad 6). W ten sposób stwierdzono, że furyna w zasobie komórek CHO jest aktywna biologicznie i może przeprowadzać zarówno przekształcenie propeptydu jak i ciężkich/lekkich łańcuchów rFX.
Przykład 3
Przekształcenie czynnika X za pomocą r-furyny unieruchomionej na chelatowym żelu tentakelowym
W celu stwierdzenia, czy podłoże może zostać rozszczepione przez związaną z kolumną pochodną r-furyny, zbadano, czy jako matrycę kolumnową można zastosować w zestawie do22
190 734 świadczałnym zamiast agarozy Ni2+-NTA zel tantakelowy Fractogel EMD® (firmy Merck). Ponieważ w porównaniu z agaro:oąNi2+-NTAjony metalu są tu przestrzennie bardziej oddalone od właściwej matrycy kolumnowej, możliwa była lepsza dostępność przestrzenna podłoża do związanej pochodnej r-furyny. W niniejszym założeniu przekształcono pro-czynnik X za pomocą pochodnej r-fiiryny związanej z żelem tantalekowym: zgodnie z przepisem producenta żel tantakelowy Fractogel eMD® obładowano jonami Na2+ i zrównoważono wolną od surowicy świeżą pożywką do hodowli komórek. Następnie załadowano kolumnę wolnym od surowicy zasobem pochodnej r-furyny z CHO. Operacje przemywania wykonano wolną od surowicy pożywką do hodowli komórek zawierającą i^dazol w stężeniach wzrastających do 40 mM. Następnie przepuszczono przez kolumnę pro-czynnik X jako wolny od surowicy zasób CHO. Za pomocą analizy Western Biot ze swoistą antywsurowicą czynnika X zbadano w przepływie kolumny przekształcenie pro-czynnika X w dwułańcuchowy czynnik X.
Przykład 4
Aktywność przekstałconego in vitro rekombinowanego czynnika X
Rekombinowany prekursor czynnika X inkubowano z r-furyną i bez niej w temperaturze 4°C. W różnych odstępach czasu pobrano próbki i zamrożono je w temperaturze -20°C. Po zakończeniu inkubacji (po upływie 4 dni) zbadano aktywność wszystkich próbek za pomocą zestawu FX-Coatest Kit (firmy Chromogenix). W tym celu do 50 pl każdej próbki dodano 50 μΐ osocza ludzkiego z deficytem FX i zgodnie z protokółem producenta przekształcono rFX w rFXa przez działanie jadem żmii Russell'a (RW) w obecności CaCfe; następnie za pomocą rFXa zhydrolizowano substrat chromogenny (S-2337) powodując wydzielenie zabarwionej na żółto paranitroaniliny. Ponieważ ilość rFXa i intensywność barwy są do siebie proporcjonalne, więc za pomocą prostej wzorcowej, interpolowanej szeregiem rozcieńczeniowym osocza, oznaczono ilość rFX/ml zasobu hodowli komórkowej aktywowanego do rFX. Z tych wyników i ze znanych ilości antygenu rFX (danych testu ELISA) można było obliczyć udział procentowy rFX aktywowanego do czynnika Xa.
Wyniki są przedstawione w tabeli 1.
W celu wykluczenia nieswoistej, proteolitycznej aktywności w zasobach CHO i CHO-r-fiiryny zbadano także mieszaninę obydwóch tych zasobów hodowli komórkowych.
CHO-rFX inkubowany wraz z zasobami CHO (bez r-furyny) jako kontrola nie pokazał nawet po upływie 4 dni żadnej istotnej zmiany aktywności rFXa, która z powodu odchyleń doświadczalnych wynosiła 800 mU/ml i odpowiadała 55% - 61% funkcjonalnego rFX. Gdy dla porównania inkubowano CHO-rFX z CHO-r-furyną, wówczas nastąpił w czasie inkubacji stały wzrost aktywności rFX, która wzrosła od około 61% (chwila T=0) do 86% (tabela 1).
Tym samym udowodniono, że w wyniku przekształcenia in vitro CHO-rFX z klonów z silną ekspresją za pomocą pochodnej r-furyny udział rFX aktywowalnego do funkcjonalnego rFXa został znacznie zwiększony.
Tabela 1
Inkubacja w dniach | Aktywność w mU | Ilość antygenu w pg/ml | Udział funkcjonalnego rFX w % | |
CHO-rFX+CHO | 0 | 814 | 14 | 58 |
1 | 847 | 14 | 61 | |
2 | 835 | 14 | 60 | |
3 | 790 | 14 | 56 | |
4 | 763 | 14 | 55 | |
CHO-rFX+CHO-r- | 0 | 853 | 14 | 61 |
-furyna | 1 | 1018 | 14 | 73 |
2 | 1099 | 14 | 79 | |
3 | 1135 | 14 | 81 | |
4 | 1198 | 14 | 86 | |
CHO+CHO-r-furyna | 0 | |||
FX z osocza 500 mU | 585 |
190 734
Przykład 5
Ekspresja rekombinowanego czynnika X w komórkach z deficytem fiiryny
Jak pokazano w poprzednich przykładach, w przypadku białka prekursorowego czynnika X zarówno odszczepiame propeptydu jak i rozszczepianie pojedynczego łańcucha na lekki/ciężki łańcuch in vitro jest załatwiane przez furynę. To nasuwa wniosek, że te operacje są także wykonywane endogennie w komórce przez wszędzie występującą furynę, z różną efektywnością zależną od ilości r-czynnika X każdorazowo poddawanego ekspresji. To prowadzi natomiast do wytwarzania mieszaniny niejednorodnych postaci r-czynnika X.
Hamowanie rozszczepiania r-czynnika X przez proteazy endogenne, a zwłaszcza przez furynę, daje możliwość wytwarzania jednorodnej i do tego stabilnej postaci cząsteczek r-czynnika X, a więc produkowania funkcjonalnie nieaktywnego prekursora r-czynnika X (który przez późniejsze dalsze jego przekształcenie, dokładnie tuż przed użyciem, może zostać przekształcony w jego funkcjonalnie aktywną postać).
Ten sposób jest szczególnie korzystny przy wytwarzaniu analogu FX, który zawiera furynowe miejsce rozszczepiania zamiast pierwotnego miejsca aktywowania. W przypadku tych konstruktów aktywowanie takich rekombinowanych mutanów rFX może zachodzić in vivo w wyniku działania endogennej fiiryny i prowadzić do wydzielania aktywowanych niestabilnych postaci rFX. Rozkład tych postaci przez proteazy CHO, np. w warunkach hodowli komórkowej z dużą liżą komórek, podczas przechowywania zasobów hodowli komórkowej lub w trakcie operacji oczyszczania albo wskutek autoproteolizy, może prowadzić do nieaktywnych produktów rozkładu (Wolf i wsp., 1991).
Cel ten można osiągnąć np. przez uzupełnienie pożywki do hodowli komórek środkiem, który może zmniejszyć lub zlikwidować wewnątrzkomórkową aktywność furyny.
Inną możliwość stanowi stosowanie komórek z deficytem furyny (Mohring i wsp., 1983, Infect. Immun. 41:998-1009; Ohnishi i wsp., 1994, J. Yirol. 68:4075-4079; Gordon i wsp., 1995, Infect. Immun. 63:82-87).
W tym celu współtransfekowano klon komórkowy CHO FD11 mający deficyt furyny (Gordon i wsp., 1995, Infect. Immun. 63:82-87) z 20 pg phAct-FX i 1 pg pUCSV-neo (zawierającym gen oporności na neomycynę w wektorze pUC pod kontrolą promotora SV40). W celu otrzymania stabilnych klonów uzupełniono pożywkę przez dodanie 0,8 pg G418/ml. Przez porównanie oddzielonych cząsteczek r-czynnika X w wolnych od surowicy zasobach klonów CHO zawierających furynę i mających deficyt furyny okazało się w Western Biot, że w komórkach z deficytem furyny nie zachodzi przekształcanie prekursora r-czynnika X i znajduje się w nich tylko jednołańcuchowy prekursor czynnika X (fig. 6); w przeciwieństwie do tego r-czynnik X „normalnych” komórek przy skromnej ekspresji ulega jeszcze całkowicie przekształceniu, lecz przy większej ekspresji, pomimo endogennej furyny, zostaje przekształcony tylko w bardzo ograniczonym stopniu. Że względu na niski poziom ekspresji użytego klonu komórkowego nie widać w Western Biot lekkiego łańcucha r-czynnika X.
Przykład 6
Wytwarzanie analogów czynnika X (najbardziej zalecana postać realizacji)
6.1 Konstruowanie plazmidów ekspresyjnych do wytwarzania analogów czynnika X
Dla potrzeb wytwarzania rekombinacyjnego analogu r-czynnika X zastąpiono miejsce rozszczepiania Asn-Leu-Thr-Arg/Ile (aminokwasy 231 do 235), które służy do aktywowania czynnika X do czynnika Xa, miejscem rozszczepiania swoistym dla innej proteazy, takiej jak furyna, FXIa, FXa, FXIIa, FIIa lub kalikreina. Wszystkie plazmidy ekspresyjne dla tego analogu czynnika X wywodzą się z plazmidu phAct-FX (opisanego w przykładzie 1).
W celu uproszczenia klonowania plazmidu ekspresyjnego czynnika X, włączono fragment DNA HindIII-Nael z plazmidu ekspresyjnego phAct-FX, który obejmuje kodujący czynnik X rejon pozycji +1 do +1116, w miejsce cięcia restrykcyjnego HindII/SmaI plazmidu pUC19. Plazmid wynikowy oznaczono przez pUC/FX.
Dzięki temu można było łatwo usunąć z plazmidu pUC/FX sekwencję nukleotydową czynnika X w pozycjach 508 do 705 (aminokwasy 160 do 235) i zastąpić ją przez różne mutacyjne fragmenty DNA czynnika X. Te fragmenty DNA są identyczne z poddanym delecji dzikim typem sekwencji czynnika X, oprócz pozycji 691 do 705 (aminokwasy 231 do 235), które koduj ą nowe miejsca rozszczepiania.
190 734
Dziki typ sekwencji czynnika X usunięto z plazmidu pUC/FX przez cięcia restrykcyjne Bspl20I oraz BstXL 3'-występ miejsca BstX3 usunięto dodatkowo nukleaząMung Bean (Biolab).
Mutacje fragmentów DNA czynnika X wytworzono za pomocą PCR. 5'-Starter jest identyczny dla wszystkich klonowań i zawiera sekwencję czynnika X od pozycji 496 do 516. 3'-Primery zawierają sekwencję uzupełniającą czynnik X (pozycje 676 do 690) i nieuzupełniający 5'-występ, który niesie sekwencje dla nowego miejsca rozszczepiania i miejsca cięcia restrykcyjnego. Amplifikowany produkt PCR cięto następnie odpowiednim(i) enzymem(ami) restrykcyjnym(i) i klonowano w przygotowanym wektorze pUC/FX (patrz wyżej).
Mutacje fragmentów DNA czynnika X przeklonowano następnie za pomocą HindTT-Agel z plazmidu pUC/FX do wektora phAct-FX. Konstrukty końcowe są przedstawione schematycznie na fig. 2.1 i 2.2. Jako konstrukt referencyjny jest podany dziki typ czynnika X. Aminokwasy podano w kodzie jednoliterowym. Pozycje będące mutacjami są dodatkowo pocieniowane.
Do wytworzenia miejsca rozszczepienia Asp-Phe-Thr-Arg/Val dla FXIa użyto jako 5'-starter oligonukleotyd #1001 (5'-CCC ACA GGG CCC TAC CCC TGT-3') (SEQ. ID. Nr 3) a jako 3'-starter oligonukleotyd # 1002 (5'-ACCA GTT AAC CCT GGT GAA GTC GTT GTC GCC CCT CTC-3') (SEQ. ID. Nr 4). Aminokwasy Asn, Leu i Ile w pozycjach 231, 232 i 235 sekwencji czynnika X zamieniono więc na Asp, Phe i Val. Fragment PCR odcięto przy użyciu Bstl20I i HpaI (fig. 2A).
Do wytworzenia miejsca rozszczepienia Arg/Ser dla FIIa użyto jako 5'-starter oligonukleotyd #1001 (5-CCC ACA GGG CCC TAC CCC TGT-3') (SEQ. ID. Nr 3) a jako 3'-starter oligonukleotyd #1003 (5'-ACCA TCG CGA CCT GGT CAG GTT GTT GTC-31) (SEQ. ID. Nr 5). Wykonano więc mutację aminokwasu Ile w pozycji 235 na Ser. Fragment PCR odcięto za pomocą Bsp 1201 i NruI (fig. 2B).
Do wytworzenia miejsca rozszczepienia Ile, Lys, Pro, Arg/Ile dla FXIIa użyto jako 5'-starter oligonukleotyd #1001 (5'-CCC ACA GGG CCC TAC CCC TGT-3') (SEQ. ID. Nr 3) a jako 3'-starter oligonukleotyd #1004 (5'-ACC AGA ATC GAT TCT GGG TTT GAT GTT GTC GCC CCT CTC-3') (SEQ. ID. Nr 6). Wykonano więc mutację aminokwasów Asn, Leu i Thr w pozycjach 231, 232 i 233 sekwencji FX na Ile, Lys i Pro. Fragment PCR odcięto częściowo za pomocą Bstl20I i XmnI (fig. 2C).
Do wytworzenia miejsca rozszczepienia Ser-Met-Thr-Arg/Ile dla kalikreiny użyto jako 5’-starter oligonukleotyd #1001 (5'-CCC ACA GGG CCC TAC CCC TGT-3') (SEQ. ID. Nr 3) a jako 3'-starter oligonukleotyd #1005 (5'-ACC AGA ATC GAT TCT GGT CAT GCT GTT GTC GCC CCT CTC-3' (SEQ. ED. Nr 7). Wykonano więc mutacje aminokwasów Asn, Leu w pozycjach 231, 232 sekwencji czynnika X na Ser, Met. Fragment PCR odcięto częściowo za pomocą Bst120I i XmnI (fig. 2D).
Do wytworzenia miejsca rozszczepienia Pro-Gln-Gly-Arg/He dla FXa użyto jako 5'-starter oligonukleotyd #1001 (5'-CCC ACA GGG CCC TAC CCC TGT-3') (SEQ. ID. Nr 3) a jako 3'-starter oligonukleotyd #1016 (5'-ACC AGA ATC GAT TCT TCC TTG GGG GTT GTC GCC CCT CTC-3') (sEq. ID. Nr 8). Wykonano więc mutacje aminokwasów Asn, Leu i Thr w pozycjach 231, 232 i 233 białka FX na Pro, Gln i Gly. Fragment PCR odcięto częściowo za pomocą Bst120I i XmnI (fig. 2H).
Do wytworzenia miejsca rozszczepienia Met-Lys-Thr-Arg/Ile dla FXa użyto jako 5'-starter oligonukleotyd #1001 (5'-CCC ACA GGG CCC TAC CCC TGT-3') (SEQ. ID. Nr 3) a jako 3'-starter oligonukleotyd #1014 (5'-ACC AGA ATC GAT TCT CGT tTt CAT GTT GTC GCC CCT CTC-3') (SEQ. ID. Nr 9). Wykonano więc mutacje aminokwasów Asn, Leu w pozycjach 231, 232 białka FX na Pro, Lys. Fragment PCR odcięto częściowo za pomocą Bst120I i Xmnf (fig. 2E).
Do wytworzenia miejsca rozszczepienia Ile-Glu-Gly-Arg/Ile dla FXa użyto jako 5'-starter oligonukleotyd #1001 (5'-CCC ACA GGG CCC TAC CCC TGT-3') (SEQ. ED. Nr 3) a jako 3'-starter oligonukleotyd #1015 (5'-ACC AGA ATC GAT TCT TCC CTC GAT GTT GTC GCC CCT CTC-3) (SeQ. ID. Nr 10). Wykonano więc mutacje aminokwasów Asn, Leu, Thr w pozycjach 231 do 233 białka FX na Ile, Glu, Gly. Fragment PCR odcięto częściowo za pomocąBst120I i XmnI. (fig. 2F).
190 734
Do wytworzenia miejsca rozszczepienia Arg-Arg-Lys-Arg/De dla furyny użyto jako 5'-starter oligonukleotyd #1001 (5'-CCC ACA GGG CCC TAC CCC TGT-3) (SEQ. ID. Nr 3) a jako 3'-starter oligonukleotyd #1006 (5'-ACC AGA ATC GAT TCT TTT CCT CCT GTT GTC GCC CCT CTC-3') (SEQ. ID. Nr 11). Wykonano więc mutacje aminokwasów Asn, Leu i Thr w pozycjach 231 do 233 na Arg, Arg i Lys. Fragment PCR odcięto za pomocą Bspl20I i XmnI (fig. 2G).
Do wytworzenia miejsca rozszczepienia Arg-Val-Arg-Arg/He dla furyny użyto jako 5'-starter oligonukleotyd #1001 (5'-CCC ACA GGG CCC TAC CCC TGT-3') (SEQ. ID. Nr 3) a jako 3'-starter oligonukleotyd #1007 (5'-ACC AGA ATC GAT TCT CCT CAC CCT GTT GTC GCC CCT CTC-3') (SEQ. ID. Nr 12). Wykonano więc mutacje aminokwasów Asn, Leu i Thr w pozycjach 231 do 233 na Arg, Val i Arg. Fragment PCR odcięto częściowo za pomocą Bspl20I i XmnI (fig. 2G).
Do wytworzenia miejsca rozszczepienia Arg-Arg-Arg-Arg/Ue dla furyny użyto jako 5'-starter oligonukleotyd #1001 (5'-CCC ACA GGG CCC TAC CCC TGT-3') (SEQ. ID. Nr 3) a jako 3'-starter oligonukleotyd #1008 (5'-ACC AGA ATC GAT TCT CCT CCT CCT GTT GTC GCC CCT CTC-3') (SEQ. ID. Nr 13). Wykonano więc mutacje aminokwasów Asn, Leu i Thr w pozycjach 231 do 233 na Arg, Arg i Arg. Fragment PCR odcięto częściowo za pomocą Bsp120I i XmnI (fig. 2G).
Do wytworzenia miejsca rozszczepienia Arg-Pro-Lys-Arg/Ue dla furyny użyto jako 5'-starter oligonukleotyd #1001 (5'-CCC ACA GGG CCC TAC CCC TGT-3') (SEQ. ID, Nr 3) a jako 3'-starter oligonukleotyd #1009 (5'-ACC AGA ATC GAT TCT TTT GGG CCT GTT GTC GCC CCT CTC-3') (SEQ. ID. Nr 14). Wykonano więc mutacje aminokwasów Asn, Leu i Thr w pozycjach 231 do 233 na Arg, Pro i Lys. Fragment PCR odcięto częściowo za pomocą Bspl20I i XmnI (fig. 2g).
Do wytworzenia miejsca rozszczepienia Ile-Ag-Lys-Ag/Ue dla furyny użyto jako 5'-starter oligonukleotyd #1001 (5'-CCC ACA GGG CCC TAC CCC TGT-3') (SEQ. ID. Nr 3) a jako 3'-starter oligonukleotyd #1010 (5'-ACC AGA ATC GAT TCT TTT CCT GAT GTT GTC GCC CCT CTC-3') (SEQ. ID Nr 15). Wykonano więc mutacje aminokwasów Asn, Leu i Thr w pozycjach 231 do 233 na Ile, Arg i Lys. Fragment PCR odcięto częściowo za pomocą Bsp120I i XmnI (fig. 2G).
Do wytworzenia miejsca rozszczepienia Ag-Ser-Lys-Arg/Ile dla furyny użyto jako 5'-starter oligonukleotyd #1001 (5'-CCC ACA GGG CCC TAC CCC TGT-3') (SEQ. ID. Nr 3) a jako 3'-starter oligonukleotyd #1011 (5-ACC AGA ATC GAT TCT TTT GCT CCT GTT GTC GCC CCT CTC-3') (SEQ. ID. Nr 16). Wykonano więc mutacje aminokwasów Asn, Leu i Thr w pozycjach 231 do 233 na Arg, Ser i Lys. Fragment PCR odcięto częściowo za pomocą Bsp120I i XmnI (fig. 2G).
Do wytworzenia miejsca rozszczepienia Arg-Val-Thr-Arg/Ile dla furyny użyto jako 5'-starter oligonukleotyd #1001 (5'-CCC ACA GGG CCC TAC CCC TGT-3') (SEQ. ID. Nr 3) a jako 3'-starter oligonukleotyd #1012 (5'-ACC AGA ATC GAT TCT GGT CaC CCT GTT GTC GCC CCT CTC-3') (SEQ. ID. Nr 17). Wykonano więc mutację aminokwasów Asn, Leu w pozycjach 231, 232 na Arg, Val. Fragment PCR odcięto częściowo za pomocą Bsp120I i XmnI (fig. 2G).
Do wytworzenia miejsca rozszczepienia Ag-Leu-Lys-Ag/Ue dla furyny użyto jako 5'-starter oligonukleotyd #1001 (5'-CCC ACA GGG CCC TAC CCC TGT-3') (SEQ. ID. Nr 3) a jako 3'-starter nukleotyd #1013 (5'-ACC AGA ATC GAT TCT TTT GAG CCT GTT GTC GCC CCT CTC-3') (SEQ ID. Nr 18). Wykonano więc mutacje aminokwasów Asn i Thr w pozycjach 231 i 233 na Arg i Lys. Fragment PCR odcięto częściowo za pomocą Bsp120I i XmnI (fig. 2G).
Do wytworzenia miejsca rozszczepienia Thr-Ser-Thr-Arg/Ile dla FXIIa użyto jako 5'-starter oligonukleotyd #1001 (5'-CCC ACA GGG CCC TAC CCC TGT-3' (SEQ. ID. Nr 3) a jako 3'-starter oligonukleotyd #1017 (5-ACC AGA ATC GAT TCT CGT GCT CGT GTT GTC GCC CCT CTC-3') (SEQ. ID. Nr 19). Wykonano więc mutacje aminokwasów Asn, Leu w pozycjach 231, 232 białka FX na Ile, Lys. Fragment PCR odcięto częściowo za pomocą Bst120I i XmnI (fig. 21).
190 734
6.2. Kontruowanie plazmidów ekspresyjnych do wytwarzania analogu ΕΧβ
Te konstrukty otrzymano z wyżej opisanych konstruktów analogu czynnika X, wbudowując kodon zatrzymujący TGA w pozycji 470. Ponadto usunięto za pomocą Spel i częściowo przez trawienie przy użyciu BstEII aminokwasy z pozycji 457 na poziomie cDNA aż do kodonu zatrzymującego i zastąpiono je parą oligonukleotydów #0003 (5'-GTC ACC GCC TTC CTC AAG TGG ATC GAC AGG TCC ATG AAA ACC AGG TGA A-3') (SEQ. ID. Nr 20) i #0004 (5'-CTA GTT CAC CTG GTT TTC ATG GAC CTG TCG ATC CAC TTG AGG AAG GCG-3') (SEQ. ID. Nr 21). Schemat konstruktów analogu czynnika χβ pokazano na fig. 7. W celu uproszczenia rysunku wszystkie analogi czynnika χβ przedstawiono jako jeden ogólny konstrukt, w którym zmienione aminokwasy w rejonach miejsc rozszczepiania podano jako zacieniowanie ,,X’.
6.3. Konstruowanie plazmidów ekspresyjnych do wytwarzania analogu FXa
Aktywując czynnik X przez odszczepienie peptydu aktywacyjnego 4,5 kD na N-końcu ciężkiego łańcucha otrzymano postać czynnika Xaa. W wyniku aktywności autoproteolitycznęj tej postaci i odszczepienia C-końca ciężkiego łańcucha między Arg 469 i Gly 470 uległa ona przekształceniu w postać ΕΧηβ. W celu otrzymania plazmidu ekspresyjnego czynnika X, który po aktywowaniu istnieje tylko w postaci FXaa z nienaruszonym β-peptydem, wykonano więc mutację aminokwasu Arg 469 na Lys, tak że nie mogło już nastąpić żadne przekształcenie w rejonie C-końcowym ciężkiego łańcucha.
Ponadto usunięto C-końcową sekwencję aminokwasów czynnika X od pozycji 1363 aż do sygnału zatrzymania przez częściowe strawienie za pomocą BstEH-Spel i zastąpiono ją parą połączonych ze sobą oligonukleotydów. Oligonukleotyd #0005 (5-GTC ACC GCC TTC CTC AAG TGG ATC GAC AGG TCC ATG AAA ACC AAG GGC TTG CCC AAG-3') (SEQ. ED. Nr 22) i Oligonukleotyd #0006 (5'-TTG GCC TTG GGC AAG CCC TTG GTT TTC ATG GAC CTG TCG ATC CAC TTG AGG AAG GCG-3') (SEQ. ID. Nr 23) zostały poddane ligacji z oligonukleotydem #0007 (5'-GCC AAG AGC CAT GCC CCG GAG GTC ATA ACG TCC TCT CCA TTA AAG TGA GAT CCC A-3’) (SEQ. ID. Nr 24) i oligonukleotydem #0008 (5-CTA GTG GGA TCT CAC TTT AAT GGA GAG GAC GTT ATG ACC TCC GGG GCA TGG CT3-3') (SEQ. ID. Nr 25). Jako mutację aminokwasu Arg 469 wprowadzono parę nukleotydów #0005-#0006. Analog FX pokazano schematycznie na fig. 7.
Przykład 7
Oznaczanie N-końców czynnika X i produktu przekształcenia za pomocą r-furyny i bez niej
Rekombinowany czynnik X poddano ekspresji w komórkach CHO z endogenną furyną (jak opisano w przykładzie 1) lub w komórkach z deficytem furyny (jak opisano w przykładzie 5). r-Czynnik X wyodrębniono zarówno z a) nie poddanego wstępnej obróbce, b) inkubowanego przez dalsze 12 godzin w temperaturze 37°C i c) poddanego przez 12 godzin wstępnej obróbce w temperaturze 37°C zasobem r-furyny z zasobu hodowli komórkowej CHO poddanych silnej ekspresji klonów rFX w CHO, jak również d) nie poddanego wstępnej obróbce i e) poddanego przez 12 godzin wstępnej obróbce w temperaturze 37°C zasobem r-furyny w CHO zasobu hodowli komórkowej klonów rFX z CHO-FD11. N-końcowe aminokwasy czynnika X i produkty przekształcenia poszczególnych zestawów reakcyjnych a) do e) zostały oznaczone przez wykonanie analizy Edmana. Wyniki przedstawiono schematycznie na fig. 8.
r-Czynnik X z poddanych silnej ekspresji komórek CHO występował w postaci dojrzałych ciężkich i lekkich łańcuchów, jak również jako jednołańcuchowy, częściowo zawierający jeszcze propeptyd. Po inkubacji tych zasobów hodowli komórkowej przez 12 godzin w temperaturze 37°C (b) występują dodatkowo, jak już opisali to Wolf i wsp. (1991, J. Bio. Chem. 266:13726-13730), wadliwe N-końce lekkiego łańcucha rFX z 3 dodatkowymi aminokwasami Vall38-Thr39-Arg40. Takie ukryte końce znaleziono także podczas sekwencjonowania materiału rFX z nie poddanych wstępnej obróbce komórek CHO-FD11 (d). Ta obserwacja pokazała, że można uniknąć tych wadliwych N-końców, gdy zastosuje się optymalne warunki lub parametry hodowli komórek, składowania i metod oczyszczania w celu zm i nimal izowania proteolizy rFX przez proteazy CHO.
190 734
W przeciwieństwie do oczyszczonego materiału z komórek CHO (a i b), rFX z nie amplifikowanych komórek z deficytem furyny (d) występuje tylko w postaci nieprzekształconych jednołańcuchowych prekursorów. Nie znaleziono także sekwencji N-końcowych, odpowiadających udziałowi propeptydu. Wykazano więc w ten sposób, że w komórkach CHO z deficytem furyny (d) nie zachodzi przekształcanie jednołańcuchowych prekursorów rFX w lekkie/ciężkie łańcuchy, co pozwala na wyciągnięcie wniosku, że w tej operacji przekształcania in vivo główną rolę pełni endoproteaza furyna.
Dodatkowo pokazano, że przekształcanie cząsteczek rFX zawierających propeptyd zachodzi także w komórkach CHO z deficytem furyny, a więc furyna nie gra in vivo istotnej roli w tej operacji przekształcania. Po inkubacji w obecności furyny rFX z komórek CHO (c) iż komórek CHO-FD11 (e) znaleziono wyłącznie lekkie i ciężkie łańcuchy z prawidłowymi N-końcami. Udowodniono więc, że zarówno jednołańcuchowe prekursory FX jak i cząsteczki rFX zawierające propeptyd przez przekształcanie in vitro zostają przetworzone w jednorodny, dojrzały czynnik X. Czynnik X przekształcony w obecności furyny posiada więc nadzwyczajną jednorodność i jednolitość strukturalną..
Przykład 8
Ekspresja i charakterystyka analogu FX z miejscem rozszczepienia przez furynę ArgArg-Lys-Arg/Ile (fETRR^)
W celu otrzymania rekombinowanego białka rFTRR poddano współtransfekcji w komórkach CHO plazmid ekspresyjny FX z miejscem rozszczepienia Arg-Arg-Lys-Arg/Ile (patrz przykład 6.1, fig. 2G) i plazmid selekcyjny pSV/dkfr, jak opisano w przykładzie 1.
Analiza Western Biot zasobów hodowli komórkowej (fig. 9) pokazała, że rekombinowane białko w przeważającym stopniu występuje w postaci dwułańcuchowej. W porównaniu z FX z osocza ciężki łańcuch ma około 46 kD zamiast 50 kD, co przypuszczalnie można wytłumaczyć różnymi scukrzeniami rekombinowanego białka. Dodatkowo są widoczne, jak już zaobserwowano przy ekspresji dzikiego typu rFX (przykład 1.b.), małe ilości prekursorów jednołańcuchowych (SC), jak również izoformy LC4 lekkiego łańcucha. Te postacie cząsteczkowe analogu rFX wskazują na ograniczenie zarówno przekształcania jednołańcuchowego prekursora FX przez proteazy endogenne jak i γ-karboksylowania lekkiego łańcucha. Chociaż miejsce rozszczepienia wstawione w analog FX reprezentuje sekwencję zgody dla furyny, to jednak nie są widoczne pasma białkowe, które odpowiadają aktywowanym postaciom białka (35 kD, 31 kD). Zarówno struktura w rejonie miejsca rozszczepienia jak i otaczająca sekwencja aminokwasowa prawdopodobnie aktywowanego doprowadziły do tego, że przekształcenie zmodyfikowanego miejsca aktywowania przez furynę tworzy tylko suboptymalne warunki.
Przykład 9
Aktywowanie in vitro białka rPXRxκx/I przez pochodne r-furyny
Zbadano in vitro aktywowalność rekombinowanego analogu FX do postaci FXaa (35 kD) i β (:31 kD) przez r-furynę, tak jak w opisie dla doświadczeń mieszanych w przykładzie 2, z tą różnicą, że użyto oczyszczoną pochodną r-furyny, a mianowicie r-furinAACys-Spacer-lOxHis, opisaną w opisie patentowym EP 0 75 750 A2, w 10 mM Hepes, pH 7,0, 150 mM NaCl, 2 mM CaCl2 i 0,2% BSA zamiast zasobu r-furyny z CHO. W doświadczeniu kontrolnym bez r-furyny zmieszano w stosunku 1: 1 zasób analogu rFX z CHO z buforem 10 mM Hepes, pH 7,0,150 mM NaCl, 2 mM CaCl2 i 0,2% BSA. Próbki powyższych zestawów zbadano za pomocą Western Biot na aktywowanie rFX przed i po czasie inkubacji 6, 24, 48 i 72 (t=0, 6, 24, 48, 72) godziny w temperaturze 37°C (fg. 10). Podczas gdy wzór pasmowy rFX w nieobecności pochodnej r-furyny jest niezmieniony nawet po 72 godzinach inkubacji (fig. 10B) to w obecności r-furyny już po 6 godzinach (fig. 10A, ślad 5) jest widoczne ciężkie pasmo białkowe 35 kD, które odpowiada postaci a FX z osocza (fig. 10A, ślad 9). Podczas trwania inkubacji ta postać a gromadzi się i po 72 godzinach inkubacji (fig. 10a, ślad 8) około 50% materiału wyjściowego (HC) jest przetworzone w postać aktywowaną. Dodatkowe pasmo białkowe o masie 31 kD, które staje się rozpoznawalne po 24 godzinach (fig. 10A, ślad 6) i odpowiada postaci β aktywowanego FX z osocza (fig. 10a, ślad 9), pokazuje, że powstała z rekombinowanego analogu FX postać a ma aktywność autoproteolityczną a więc jest funkcjonalna.
190 734
Te wyniki dowodzą, że niejednorodne miejsce rozszczepienia aktywacyjnego Arg-ArgLys-Arg/Ile w analogu rFX jest swoiście rozpoznawane i prawidłowo rozszczepiane in vitro przez pochodną r-furyny, a więc nadaje się do aktywowania analogu rFX w cząsteczkę FIAA i cząsteczkę FXap.
Przykład 10
Funkcjonalność aktywowanego in vitro analogu FX rFXRRKR
Próbki z badań mieszanych według przykładu 9 zbadano za pomocą testu chromogenowego na aktywność FXa. W tym celu do próbek dodano substrat chromogenny S2337 (600 pM) w 50 mM tris, pH 7,3, 150 mM NaCl i 0,1% BSA. Po inkubacji trwającej 3 minuty w temperaturze 37°C zatrzymano reakcję za pomocą 20% kwasu octowego i następnie zmierzono gęstość optyczną (OD) przy 405 nm. Przez porównanie z wykresem w postaci linii prostej wzorcowej, otrzymanym za pomocą oszyszczonego, aktywowanego przy użyciu RVV FXa z osocza, oznaczono w zestawach reakcyjnych wartości aktywności rekombinowanego FXa. Wyniki tej analizy, obejmujące użyte ilości antygenu (wartości ELISA), jak również obliczone z tego aktywności swoiste, podano w tabeli 2.
W celu wykluczenia nieswoistych aktywności amidolitycznych w roztworze r-furyny i w zasobie z hodowli komórek CHO, zbadano także na aktywność FXa (CHO+r-furyna) mieszaninę zasobu nie poddanych transfekcji komórek CHO. W tej mieszaninie, tak samo jak w mieszaninie analog rFX/bufor (rFX + bufor), nie stwierdzono także aktywności FXa po 72 godzinach inkubacji. W przeciwieństwie do tego w przypadku reakcji z r-furynąjuż po 6-godzinach inkubacji była mierzalna aktywność rFXa wynosząca 56 mU, która wzrastała podczas dalszej inkubacji i po 72 godzinach osiągnęła 133 mU. Chociaż w tym czasie, według Western Biot, tylko około połowa analogu rFX została przetworzona w aktywowane postacie a i p (fig. 10A, ślad 8), to aktywowany in vitro materiał analogu rFX osiągając 190 mU/pg miał dużą, większą aktywność swoistą niż całkowicie aktywowany przy użyciu RVV FX z osocza (153 mU/pg). Zmierzone wzrosty aktywności mają swoje odbicie w występowaniu postaci a i p w Western Blot (fig. 10A, ślady 5 - 8).
W ten sposób stwierdzono, że w FX można wbudowywać niejednorodne miejsca cięcia dla proteazy, miejsca te mogą być rozpoznawane i rozszczepiane przez przynależną proteazę i można wytwarzać rekombinacyjnie wysokowartościowy rFXa (lub ewentualnie analogi rFXa z aktywnością FXa) w funkcjonalnej postaci.
T a b el a 2
Czas inkubacji w godzinach | Aktywność w mU/ml | Ilość antygenu w pg/ml | Aktywność swoista w mU/pg | |
rpxRRKR +bufor | 0 | <25 | 0,7 | 0 |
6 | <25 | 0,7 | 0 | |
24 | <25 | 0,7 | 0 | |
48 | <25 | 0,7 | 0 | |
72 | <25 | 0,7 | 0 | |
rFXRRR -H-Turyna | 0 | <25 | 0,7 | 0 |
6 | 56 | 0,7 | 80 | |
24 | 101 | 0,7 | 144 | |
48 | 124 | 0,7 | 177 | |
72 | 133 | 0,7 | 190 | |
CHO + r-fryna | 0 | <25 | 0 | |
6 | <25 | 0 | ||
24 | <25 | 0 | ||
48 | <25 | 0 | ||
72 | <25 | 0 | ||
FX z osocza aktywowany przez RVV | 614 | 4 |
190 734
Przykład 11
Aktywowanie in vitro analogu rFX z rozszczepienia FXIa Asp-Phe-Thr-Arg/Val (rFX ) przez FXIa z osocza
Przez mutagenezę sekwencji aktywacyjnej FX na miejsce rozszczepienia FXIa otrzymano konstrukt analogu FX. Następnie wytworzono stabilne klony komórek CHO, które poddają ekspresji te cząsteczki. Zasób hodowli komórek CHO z rFX zmieszano z oczyszczonym FXIa z osocza (100 pg/ml) w obecności 10 mM tris, pH 7,3 150 mM NaCl, 8mM CaCl2, PCPS i 0,1% BSA i inkubowano w temperaturze 37°C w ciągu różnych czasów. Jako kontrolę ujemną inkubowano zasób hodowli komórek tylko z buforem zawierającym BSA. Białko rFX i wynikowe produkty aktywowania scharakteryzowano za pomocą analizy Western Biot (fig. 11).
Jak można rozpoznać w mieszaninie bez FXIa przed inkubacją (t=0), rekombinowane białko (fig. 11, ślad 5) jest wydzielona w postaci dwułańcuchowej prawie identycznej jak FX z osocza (ślad 2) z tą różnicą, że ciężki łańcuch (HC), jak już to zaobserwowano u rFXRRR*z przykładu 8, ma masę cząsteczkową trochę mniejszą niz 50 kD. Podczas inkubacji tej mieszaniny w temperaturze 37°C (fig. 11, ślad 6) nie jest widoczna żadna istotna zmiana wzoru pasma. W mieszaninie CHO-rFX/FXIa można rozpoznać, już na krótko przed dodaniem oczyszczonego FXIa ale jeszcze przed właściwą inkubacją zasobu hodowli komórkowej (fig. 11, ślad 3), pasma białkowe 35 kD i 31 kD, które odpowiadają pod względem wielkości osoczowym postaciom a i β ciężkiego łańcucha (fig. 11, ślad 9). Obydwie te postacie powiększają się mocno po 4-godzinnej inkubacji z FXIa (fig. 11, ślad 4).
Tym samym pokazano, że analog FX, który obejmuje niejednorodne proteazowe miejsce rozszczepienia dla enzymu proteolitycznego aktywnego w kaskadzie krzepnięcia, może zostać skutecznie przekształcony przez ten ostatni.
Przez wystąpienie pasm rFXaβ została skutecznie pokazana, dodatkowo do wyniku aktywności autoproteolitycznej analogu rFXaa, funkcjonalna aktywność tak powstałego rFXaa.
190 734
Lista sekwencji (1) Ogólne dane (i) Zzłaszzjący (A) Nazwa: Baxter AG (B) Ulica: Industriestrasse 67 (C) Miejscowość: Wiedeń (D) Kraj federalny: Austria (E) Kraj:AusAia (F) Pocztowy numer kierunkowy: 1220 (A) Imię i nazwisko: Michele Himmelspach (B) Ulica; Breitstetten 19 (C) Miejscowość: Leopoldsdorf (D) Kraj federalny: Austria (E) Kraj: Austria (F) Pocztowy numer kierunkowy: 2285 (A) Imię i nazwisko: Uwe Schlokat (B) Ulica: Hauptstrasse 51 (C) Miejscowość: Orth/Donau (D) Kraj federalny: Austria (E) Kraj: Austria (F) Pocztowy numer kierunkowy: 2304 (A) Imię i nazwisko: Andreas Fisch (B) Ulica: Tellstrasse 19 (c) Miejscowość: St. Gallen (D) Kraj federalny: Austria (E) Kraj: Szwajcaria (F) Pocztowy numer kierunkowy: 9000 (A) Imię i nazwisko: Friedrich Domer (B) Ulica: Peterlinigasse 17 (C) Miejscowość: Wiedeń (D) Kraj federalny: Austria (E) Kraj: Austria (F) Pocztowy numer kierunkowy: 1230 (A) Imię i nazwisko: Johann Eibl (B) Ulica: Gustav Tschermakgasse 2 (C) Miejscowość: Wiedeń (D) Kraj federalny: Austria (E) Kraj: Austria (F) Pocztowy numer kierunkowy: 1180 (ii) Tytuł wynalazku: Analog czynnika X, rekombinowany DNA, kompozycje, zastosowanie rekombinowanego kwasu nuikleinowego DNA oraz sposoby wytwarzania kompozycji (iii) Liczba sekwencji: 27 (iv) Tekst czytelny dla komputera:
(A) Nośnik danych: dyskietka (B) Komputer: kompatybilny z IBM PC (C) System pracy: PC-DOS/MS-DOS (D) Software: Patentln wydanie #1.0, wersja #1.30 (EPA)
190 734 (2) Dane dla SEQ ID NR: 1 :
(i) Cechy sekwencji:
(A) Długość: 34 pary zasad (B) Rodzaj: nukleotyd (C) Postać nici: nić pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Rodzaj cząsteczki: genomowy DNA (xi) opis sekwencji: SEQ ID NR: 1:
ATTACTCGAG AAGCTTACCA TGGGGCGCCC ACTG 34 (2) Dane dla SEQ ID. Nr: 2:
(i) Cechy sekwencji (A) Długość: -24 pary zasad (B) Rodzaj: nukleotyd (C) Postać nici: nić pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Rodzaj cząsteczki: genomowy DNA (xi) Opis sekwencji: SEQ ID NR: 2:
ATTACAATTG CTGCAGGGAT CCAC 24 (2) Dane dla SEQ ID NR: 3:
(i) Cechy sekwencji:
(A) Długość: 21 par zasad (B) Rodzaj: nukleotyd (C) Postać nici: nić pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Rodzaj cząsteczki: genomowy DNA (xi) Opis sekwencji: SEQ ID NR: 3:
CCCACAGGGC CCTACCCCTG T 21 (2) Dane dla SEQ ID NR: 4:
(i) Cechy sekwencji:
(A) Długość: 37 par zasad (B) Rodzaj: nukleotyd (C) Postać nici: nić pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Rodzaj cząsteczki: genomowy DNA (xi) Opis sekwencji: SEQ ID NR: 4:
ACCAGTTAAC CCTGGTGAAG TCGTTGTCGC CCCTCTC 37 (2) Dane dla SEQ ID NR: 5:
(i) Cechy sekwencji:
(A) Długość: 28 par zasad (B) Rodzaj: nukleotyd (C) Postać nici: nić pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Rodzaj cząsteczki: genomowy DNA (xi) Opis sekwencji: SEQ ID NR: 5:
ACCATCGCGA CCTGGTCAGG TTGTTGTC 28 (2) Dane dla SEQ ID NR: 6:
(i) Cechy sekwencji:
190 734 (A) Długość: 39 par zasad (B) Rodzaj: nukleotyd (C) Postać nici: nić pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Rodzaj cząsteczki: genomowy DNA (xi) Opis sekwencji: SEQ ID NR: 6:
ACCAGAATCG ATTCTGGGTT TGATGTTGTC GCCCCTCTC 39 (2) Dane dla SEQ ID NR: 7:
(i) Cechy sekwencji:
(A) Długość: 39 par zasad (B) Rodzaj: nukleotyd (C) Postać nici: nić pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Rodzaj cząsteczki: genomowy DNA (xi) Opis sekwencji: SEQ ID NR: 7:
ACCAGAATCG ATTCTGGTCA TGCTGTTGTC GCCCCTCTC 39 (2) Dane dla SEQ ED NR: 8:
(i) Cechy sekwencji:
(A) Długość: 39 par zasad (B) Rodzaj: nukleotyd (C) Postać nici: nić pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Rodzaj cząsteczki: genomowy DNA (xi) Opis sekwencji: SEQ ID NR: 8:
ACCAGAATCG ATTCTTCCTT GGGGGTTGTC GCCCCTCTC 39 (2) Dane dla SEQ ID NR: 9:
(i) Cechy sekwencji:
(A) Długość: 39 par zasad (B) Rodzaj: nukleotyd (C) Postać nici: nić pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Rodzaj cząsteczki: genomowy DNA (xi) Opis sekwencji: SEQ ED NR: 9:
ACCAGAATCG ATTCTCGTTT TCATGTTGTC GCCCCTCTC 39 (2) Dane dla SEQ ED NR: 10:
(i) Cechy sekwencji:
(A) Długość: 39 par zasad (B) Rodzaj: nukleotyd (C) Postać nici: nić pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Rodzaj cząsteczki: genomowy DNA (xi) Opis sekwencji: SEQ ID NR: 10:
ACCAGAATCG ATTCTTCCCT CGATGTTGTG GCCCCTCTC 39 (2) Dane dla SEQ ID NR: 11:
(i) Cechy sekwencji:
(A) Długość: 39 par zasad (B) Rodzaj: nukleotyd (C) Postać nici: nić pojedyncza (D) Topologia: liniowa
190 734 (ii) Rodzaj cząsteczki: genomowy DNA (xi) Opis sekwencji: SEQ ID NR: 11:
ACCAGAATCG ATTCTTTTCC TCCTGTTGTC GCCCCTCTC 39 (2) Dane dla SEQ ID NR: 12:
(i) Cechy sekwencji:
(A) Długość: 39 par zasad (B) Rodzaj: nukleotyd (C) Postać nici: nić pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Rodzaj cząsteczki: genomowy DNA (xi) Opis sekwencji: SEQ ID,NR: 12:
ACCAGAATCG ATTCTCCTCA CCCTGTTGTC GCCCCTCTC 39 (2) Dane dla SEQ ID NR: 13:
(i) Cechy sekwencji:
(A) Długość: 39 par zasad (B) Rodzaj: nukleotyd (C) Postać nici: nić pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Rodzaj cząsteczki: genomowy DNA (xi) Opis sekwencji: SEQ ID NR: 13:
ACCAGAATCG ATTCTCCTCC TCCTGTTGTC GCCCCTCTC 39 (2) Dane dla SEQ ID NR: 14:
(i) Cechy sekwencji:
(A) Długość: 39 par zasad (B) Rodzaj: nukleotyd (C) Postać nici: nić pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Rodzaj cząsteczki: genomowy DNA (xi) Opis sekwencji: SEQ ID NR: 14:
ACCAGAATCG ATTCTTTTGG GCCTGTTGTC GCCCCTCTC 39 (2) Dane dla SEQ ID NR: 15:
(i) Cechy sekwencji:
(A) Długość: 39 par zasad (B) Rodzaj: nukleotyd (c) Postać nici: nić pojedyncza (D)Topologia: liniowa (ii) Rodzaj cząsteczki: genomowy DNA (xi) Opis sekwencji: SEQ ID NR: 15:
ACCAGAATCG ATTCTTTTCC TGATGTTGTC GCCCCTCTC 39 (2) Dane dla SEQ ID NR: 16:
(i) Cechy se^e^k^^^^c^:
(A) Długość: 39 par zasad (B) Rodzaj: nukleotyd (c) Postać nici: nić pojedyncza (D) Topologia: liniowa
190 734 (ii) Rodzaj cząsteczki: genomowy DNA (xi) Opis sekwencji: SEQ ID NR: 16:
ACCAGAATCG ATTCTTTTGC TCCTGTTGTC GCCCCTCTC 39 (2) Dane dla SEQ ID NR: 17:
(i) Cechy sekwencji:
(A) Długość: 39 par zasad (B) Rodzaj: nukleotyd (C) Postać nici: nić pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Rodzaj cząsteczki: genomowy DNA (xi) Opis sekwencji: SEQ ID NR: 17:
ACCAGAATCG ATTCTGGTCA CCCTGTTGTC GCCCCTCTC 39 (2) Dane dla SEQ ID NR: 18:
(i) Cechy sekwencji:
(A) Długość: 39 par zasad (B) Rodzaj: nukleotyd (C) Postać nici: nić pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Rodzaj cząsteczki: genomowy DNA (xi) Opis sekwencji: SEQ ID NR: 18:
ACCAGAATCG ATTCTTTTGA GCCTGTTGTC GCCCCTCTC 39 (2) Dane dla SEQ ID NR: 19:
(i) Cechy sekwencji:
(A) Długość: 39 par zasad (B) Rodzaj: nukleotyd (C) Postać nici: nić pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Rodzaj cząsteczki: genomowy DNA (xi) Opis sekwencji: SEQ ID NR: 19:
ACCAGAATCG ATTCTCGTGC TCGTGTTGTC GCCCCTCTC 39 (2) Dane dla SEQ ID NR: 20:
(i) Cechy sekwencji:
(A) Długość: 49 par zasad (B) Rodzaj : nukleotyd (C) Postać nici: nić pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Rodzaj cząsteczki: genomowy DNA (xi) Opis sekwencji: SEQ DD NR: 20:
GTCACCGCCT TCCTCAAGTG GATCGACAGG TCCATGAAAA CCAGGTGAA 49 (2) Dane dla SEQ ID NR: 21:
(i) Cechy selcwencji:
(A) Długość: 48 par zasad (B) Rodzaj: nukleotyd (C) Postać nici: nić pojedyncza (D) Topologia: liniowa
190 734 (ii) Rodzaj cząsteczki: genomowy DNA (xi) Opis sekwencji: SEQ DD NR: 21:
CTAGTTCACC TGGTTTTCAT GGACCTGTCG ATCCACTTGA GGAAGGCG 48 (2) Dane dla SEQ ID NR: 22:
(i) Cechy sekwencji (A) Długość: 57 par zasad (B) Rodzaj: nukleotyd (C) Postać nici: nić pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Rodzaj cząsteczki: genomowy DNA (xi) Opis sekwencji: SEQ ED NR: 22:
GTCACCGCCT TCCTCAAGTG GATCGACAGG TCCATGAAAA CCAAGGGCTT GCCCAAG 57 (2) Dane dla SEQ ID NR: 23:
(i) Cechy sekwencji:
(A) Długość: 57 par zasad (B) Rodzaj: nukleotyd (C) Postać nici: nić pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Rodzaj cząsteczki: genomowy DNA (xi) Opis sekwencji: SEQ ID NR: 23:
TTGGCCTTGG GCAAGCCCTT GGTTTTCATG GACCTGTCGA TCCACTTGAG GAAGGCG 55 (2) Dane dla SEQ ID NR: 24:
(i) Cechy sekwencji:
(A) Długość: 55 par zasad (B) Rodzaj: nukleotyd (C) Postać nici: nić pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Rodzaj cząsteczki: genomowy DNA (xi) Opis sekwencji: SEQ ID NR: 24:
GCCAAGAGCC ATGCCCCGGA GGTCATAACG TCCTCTCCAT TAAAGTGAGA TCCCA 55 (2) Dane dla SEQ ID NR: 25:
(i) Cechy sekwencji:
(A) Długość: 54 pary zasad (B) Rodzaj: nukleotyd (C) Postać nici: nić pojedyncza (D) Topologia: liniowa (ii) Rodzaj cząsteczki: genomowy DNA (xi) Opis sekwencji: SEQ ID NR: 25:
190 734
CTAGTGGGAT CTCACTTTAA TGGAGAGGAC GTTATGACCT CCGGGGCATG GCTC 54 (2) Dane dla SEQ ID NR: 26:
(i) Cechy sekwencji:
(A) Długość: 1467 par zasad (B) Rodzaj: nukleotyd (C) Postać nici: nić pojedyńcza (D) Topologia: liniowa (ii) Rodzaj cząsteczki: genomowy DNA (ix) Charakterystyka:
(A) Nazwa/klucz: CDS (B) Położenie: 1..1467 (xi) Opis sekwencji: SEQ ID NR: 26:
ATG | GGG | CGC | CCA | CTG | CAC | CTC | GTC | CTG | CTC | AGT | GCC | TCC | CTG | GCT | GGC | 48 |
Met | Gly | Arg | Pro | Leu | His | Leu | Val | Leu | Leu | Ser | Ala | Ser | Leu | Ala | Gly | |
1 | 5 | 10 | 15 | |||||||||||||
CTC | CTG | CTG | CTC | GGG | GAA | AGT | CTG | TTC | ATC | CGC | AGG | GAG | CAG | GCC | AAC | 96 |
Leu | Leu | Leu | Leu | Gly | Glu | Ser | Leu | Phe | Ile | Arg | Arg | Glu | Gln | Ala | Asn | |
20 | 25 | 30 | ||||||||||||||
AAC | ATC | CTG | GCG | AGG | GTC | ACG | AGG | GCC | AAT | TCC | TTT | CTT | GAA | GAG | ATG | 144 |
Asn | Ile | Leu | Ala | Arg | Val | Thr | Arg | Ala | Asn | Ser | Phe | Leu | Glu | Glu | Met | |
35 | 40 | 45 | ||||||||||||||
AAG | AAA | GGA | CAC | CTC | GAA | AGA | GAG | TGC | ATG | GAA | GAG | ACC | TGC | TCA | TAC | 192 |
Lys | Lys | Gly | His | Leu | Glu | Arg | Glu | Cys | Met | Glu | Glu | Thr | Cys | Ser | Tyr | |
50 | 55 | 60 | ||||||||||||||
GAA | GAG | GCC | CGC | GAG | GTC | TTT | GAG | GAC | AGC | GAC | AAG | ACG | AAT | GAA | TTC | 240 |
Glu | Glu | Ala | Arg | Glu | Val | Phe | Glu | Asp | Ser | Asp | Lys | Thr | Asn | Glu | Phe |
190 734
TGG | AAT | AAA | TAC | AAA | GAT | GGC | GAC | CAG | TGT | GAG | ACC | AGT | CCT | TGC | CAG | 288 |
Trp | Asn | Lys | Tyr | Lys | Asp | Gly | Asp | Gln | Cys | Glu | Thr | Ser | Pro | Cys | Gln | |
85 | 90 | 95 | ||||||||||||||
AAC | CAG | GGC | AAA | TGT | AAA | GAC | GGC | CTC | GGG | GAA | TAC | ACC | TGC | ACC | TGT | 336 |
Asn | Gln | Gly | Lys | Cys | Lys | Asp | Gly | Leu | Gly | Glu | Tyr | Thr | Cys | Thr | Cys | |
100 | 105 | 110 | ||||||||||||||
TTA | GAA | GGA | TTC | GAA | GGC | AAA | AAC | TGT | GAA | TTA | TTC | ACA | CGG | AAG | CTC | 384 |
Leu | Glu | Gly | Phe | Glu | Gly | Lys | Asn | Cys | Glu | Leu | Phe | Thr | Arg | Lys | Leu | |
115 | 120 | 125 | ||||||||||||||
TGC | AGC | CTG | GAC | AAC | GGG | GAC | TGT | GAC | CAG | TTC | TGC | CAC | GAG | GAA | CAG | 432 |
Cys | Ser | Leu | Asp | Asn | Gly | Asp | Cys | Asp | Gln | Phe | Cys | His | Glu | Glu | Gln | |
130 | 135 | 140 | ||||||||||||||
AAC | TCT | GTG | GTG | TGC | TCC | TGC | GCC | CGC | GGG | TAC | ACC | CTG | GCT | GAC | AAC | 480 |
Asn | Ser | Val | Val | Cys | Ser | Cys | Ala | Arg | Gly | Tyr | Thr | Leu | Ala | Asp | Asn | |
145 | 150 | 155 | 160 | |||||||||||||
GGC | AAG | GCC | TGC | ATT | CCC | ACA | GGG | CCC | TAC | CCC | TGT | GGG | AAA | CAG | ACC | 528 |
Gly | Lys | Ala | Cys | Ile | Pro | Thr | Gly | Pro | Tyr | Pro | Cys | Gly | Lys | Gln | Thr | |
165 | 170 | 175 | ||||||||||||||
CTG | GAA | CGC | AGG | AAG | AGG | TCA | GTG | GCC | CAG | GCC | ACC | AGC | AGC | AGC | GGG | 576 |
Leu | Glu | Arg | Arg | Lys | Arg | Ser | Val | Ala | Gln | Ala | Thr | Ser | Ser | Ser | Gly | |
180 | 185 | 190 | ||||||||||||||
GAG | GCC | CCT | GAC | AGC | ATC | ACA | TGG | AAG | CCA | TAT | GAT | GCA | GCC | GAC | CTG | 624 |
Glu | Ala | Pro | Asp | Ser | Ile | Thr | Trp | Lys | Pro | Tyr | Asp | Ala | Ala | Asp | Leu | |
195 | 200 | 205 | ||||||||||||||
GAC | CCC | ACC | GAG | AAC | CCC | TTC | GAC | CTG | CTT | GAC | TTC | AAC | CAG | ACG | CAG | 672 |
Asp | Pro | Thr | Glu | Asn | Pro | Phe | Asp | Leu | Leu | Asp | Phe | Asn | Gln | Thr | Gln |
210
215
220
190 734
CCT GAG | AGG GGC | GAC | AAC AAC CTC | ACC AGG | ATC | GTG GGA | GGC CAG GAA | 720 |
Pro Glu | Arg Gly | Asp | Asn Asn Leu | Thr Arg | Ile | Val Gly | Gly Gln Glu | |
225 | 230 | 235 | 240 | |||||
TGC AAG | GAC GGG | GAG | TGT CCC TGG | CAG GCC | CTG | CTC ATC | AAT GAG GAA | 768 |
Cys Lys | Asp Gly | Glu | Cys Pro Trp | Gln Ala | Leu | Leu Ile | Asn Glu Glu | |
245 | 250 | 255 | ||||||
AAC GAG | GGT TTC | TGT | GGT GGA ACT | ATT CTG | AGC | GAG TTC | TAC ATC CTA | 816 |
Asn Glu | Gly Phe | Cys | Gly Gly Thr | Ile Leu | Ser | Glu Phe | Tyr Ile Leu | |
260 | 265 | 270 | ||||||
ACG GCA | GCC CAC | TGT | CTC TAC CAA | GCC AAG | AGA | TTC AAG | GTG AGG GTA | 864 |
Thr Ala | Ala His | Cys | Leu Tyr Gln | Ala Lys | Arg | Phe Lys | Val Arg Val | |
275 | 280 | 285 | ||||||
GGG GAC | CGG AAC | ACG | GAG CAG GAG | GAG GGC | GGT | GAG GCG | GTG CAC GAG | 912 |
Gly Asp | Arg Asn | Thr | Glu Gln Glu | Glu Gly | Gly | Glu Ala | Val His Glu | |
290 | 295 | 300 | ||||||
GTG GAG | GTG GTC | ATC | AAG CAC AAC | CGG TTC | ACA | AAG GAG | ACC TAT GAC | 960 |
Val Glu | Val Val | Ile | Lys His Asn | Arg Phe | Thr | Lys Glu | Thr Tyr Asp | |
305 | 310 | 315 | 320 | |||||
TTC GAC | ATC GCC | GTG | CTC CGG CTC | AAG ACC | CCC | ATC ACC | TTC CISC ATG 1008 | |
Phe Asp | Ile Ala | Val | Leu Arg Leu | Lys Thr | Pro | Ile Thr | Phe Arg Met | |
325 | 330 | 335 | ||||||
AAC GTG | GCG CCT | GCC | TGC CTC CCC | GAG CGT | GAC | TGG GCC | GAG TCC ACG 1056 | |
Asn Val | Ala Pro | Ala | Cys Leu Pro | Glu Arg | Asp | Trp Ala | Glu Ser Thr | |
340 | 345 | 350 | ||||||
CTG ATG | ACG CAG | AAG | ACG GGG ATT | GTG AGC | GGC | TTC GGG | CGC ACC CAC 1104 | |
Leu Met | Thr Gln | Lys | Thr Gly Ile | Val Ser | Gly | Phe Gly | Arg Thr His |
355
360
365
190 734
GAG AAG GGC CGG | CAG TCC ACC AGG CTC AAG ATG | CTG GAG | GTG CCC TAC 1152 |
Glu Lys Gly Arg | Gln Ser Thr Arg Leu Lys Met | Leu Glu | Val Prc Tyr |
370 | 375 | 380 | |
GTG GAC CGC AAC | AGC TGC AAG CTG TCC AGC AGC | TTC ATC | ATC ACC CAG 1200 |
Val Asp Arg Asn | Ser Cys Lys Leu Ser Ser Ser | Phe Ile | Ile Thi Gln |
385 | 390 395 | 400 | |
AAC ATG TTC TGT | GCC GGC TAC GAC ACC AAG CAG | GAG GAT | GCC TGC CAG 1248 |
Asn Met Phe Cys | Ala Gly Tyr Asp Thr Lys Gln | Glu Asp | Ala Cys Gln |
405 410 | 415 | ||
GGG GAC AGC GGG | GGC CCG CAC GTC ACC CGC TTC | AAG GAC | ACC TAC TTC 1296 |
Gly Asp Ser Gly | Gly Pro His Val Thr Arg Phe | Lys Asp | Thr Tyr Phe |
420 | 425 | 430 | |
GTG ACA GGC ATC | GTC AGC TGG GGA GAG AGC TGT | GCC CGT | AAG GGG AAG 1344 |
Val Thr Gly Ile | Val Ser Trp Gly Glu Ser Cys | Ala Arg | Lys Gly Lys |
435 | 440 | 445 | |
TAC GGG ATC TAC | ACC AAG GTC ACC GCC TTC CTC | AAG TGG ATC GAC AGG 1392 | |
Tyr Gly Ile Tyr | Thr Lys Val Thr Ala Phe Leu | Lys Trp | Ile Asp Arg |
450 | 455 | 460 | |
TCC ATG AAA ACC | AGG GGC TTG CCC AAG GCC AAG | AGC CAT GCC CCG GAG 1440 | |
Ser Met Lys Thr | Arg Gly Leu Pro Lys Ala Lys | Ser His | Ala Pro Glu |
465 | 470 475 | 480 | |
GTC ATA ACG TCC | TCT CCA TTA AAG TGA | 1467 | |
Val Ile Thr Ser | Ser Pro Leu Lys * |
485 (2) Dane dla SEQ ID NR: 27:
(i) Cechy sekwencji:
(A) Długość:: 489 aminokwasów (B) Rodzaj: aminokwas
190 734 (D) Topologia: liniowa (ii) Rodzaj cząsteczki: białko
(xi) Opis | sekwencj i: | SEQ | ID NR: | 27: | |
Met | Gly Arg Pro | Leu His Leu | Val | Leu Leu | Ser Ala Ser Leu Ala Gly |
1 | 5 | 10 | 15 | ||
Leu | Leu Leu Leu | Gly Glu Ser | Leu | Phe Ile | Arg Arg Glu Gln Ala Asn |
20 | 25 | 30 | |||
Asn | Ile Leu Ala | Arg Val Thr | Arg | Ala Asn | Ser Phe Leu Glu Glu Met |
35 | 40 | 45 | |||
Lys | Lys Gly His | Leu Glu Arg | Glu | Cys Met | Glu Glu Thr Cys Ser Tyr |
50 | 55 | 60 | |||
Glu | Glu Ala Arg | Glu Val Phe | Glu | Asp Ser | Asp Lys Thr Asn Glu Phe |
65 | 70 | 75 80 | |||
Trp | Asn Lys Tyr | Lys Asp Gly | Asp | Gln Cys | Glu Thr Ser Pro Cys Gln |
85 | 90 | 95 | |||
Asn | Gln Gly Lys | Cys Lys Asp | Gly | Leu Gly | Glu Tyr Thr Cys Thr Cys |
100 | 105 | 110 | |||
Leu | Glu Gly Phe | Glu Gly Lys | Asn | Cys Glu | Leu Phe Thr Arg Lys Leu |
115 | 120 | 125 | |||
Cys | Ser Leu Asp | Asn Gly Asp | Cys | Asp Gln | Phe Cys His Glu Glu Gln |
130 | 135 | 140 | |||
Asn | Ser Val Val | Cys Ser Cys | Ala | Arg Gly | Tyr Thr Leu Ala Asp Asn |
145 | 150 | 155 160 | |||
Gly | Lys Ala Cys | Ile Pro Thr | Gly | Pro Tyr | Pro Cys Gly Lys Gln Thr |
165 | 170 | 175 | |||
Leu | Glu Arg Arg | Lys Arg Ser | Val | Ala Gln | Ala Thr Ser Ser Ser Gly |
180 | 185 | 190 | |||
Glu | Ala Pro Asp | Ser Ile Thr | Trp | Lys Pro | Tyr Asp Ala Ala Asp Leu |
195
200
205
190 734
Asp | Pro 210 | Thr | Glu Asn Pro | Phe Asp 215 | Leu Leu Asp | Phe 220 | Asn | Gln | Thr | Gln | |||||
Pro | Glu | Arg | Gly | Asp | Asn | Asn | Leu | Thr | Arg | Ile | Val | Gly | Gly | Gln | Glu |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Cys | Lys | Asp | Gly | Glu | Cys | Pro | Trp | Gln | Ala | Leu | Leu | Ile | Asn | Glu | Glu |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
Asn | Glu | Gly | Phe | Cys | Gly | Gly | Thr | Ile | Leu | Ser | Glu | Phe | Tyr | Ile | Leu |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
Thr | Ala | Ala | His | Cys | Leu | Tyr | Gln | Ala | Lys | Arg | Phe | Lys | Val | Arg | Val |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
Gly | Asp | Arg | Asn | Thr | Glu | Gln | Glu | Glu | Gly | Gly | Glu | Ala | Val | His | Glu |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
Val | Glu | Val | Val | Ile | Lys | His | Asn | Arg | Phe | Thr | Lys | Glu | Thr | Tyr | Asp |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
Phe | Asp | Ile | Ala | Val | Leu | Arg | Leu | Lys | Thr | Pro | Ile | Thr | Phe | Arg | Met |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
Asn | Val | Ala | Pro | Ala | Cys | Leu | Pro | Glu | Arg | Asp | Trp | Ala | Glu | Ser | Thr |
340 | 345 | 350 | |||||||||||||
Leu | Met | Thr | Gln | Lys | Thr | Gly | Ile | Val | Ser | Gly | Phe | Gly | Arg | Thr | His |
355 | 360 | 365 | |||||||||||||
Glu | Lys | Gly | Arg | Gln | Ser | Thr | Arg | Leu | Lys | Met | Leu | Glu | Val | Pro | Tyr |
370 | 375 | 380 | |||||||||||||
Val | Asp | Arg | Asn | Ser | Cys | Lys | Leu | Ser | Ser | Ser | Phe | Ile | Ile | Thr | Gln |
385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
Asn | Met | Phe | Cys | Ala | Gly | Tyr | Asp | Thr | Lys | Gln | Glu | Asp | Ala | Cys | Gln |
405 | 410 | 415 | |||||||||||||
Gly | Asp | Ser | Gly | Gly | Pro | His | Val | Thr | Arg | Phe | Lys | Asp | Thr | Tyr | Phe |
420 425 430
190 734
Val | Thr | Gly | Ile | Val | Ser | Trp | Gly | Glu | Ser | Cys | Ala | Arg | Lys | Gly | Lys |
435 | 440 | 445 | |||||||||||||
Tyr | Gly | Ile | Tyr | Thr | Lys | Val | Thr | Ala | Phe | Leu | Lys | Trp | Ile | Asp | Arg |
450 | 455 | 460 | |||||||||||||
Ser | Met | Lys | Thr | Arg | Gly | Leu | Pro | Lys | Ala | Lys | Ser | His | Ala | Pro | Glu |
465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
Val | Ile | Thr | Ser | Ser | Pro | Leu | Lys |
485
190 734 (-40)
Met Gly Arg Pro Leu Hi3 Leu Val Leu Leu Ser Ala Ser Leu Ala Gly Leu Leu Leu ATG GGG CGC CCA CTG CAC CTC GTC CTG CTC AGT GCC TCC CTG GCT GGC CTC CTG CTG
9 | 18 | 27 | 36 | 45 | 54 | |
(-4) | (-1 | |||||
40 | ||||||
Leu Gly Glu Ser Leu Phe Ile Arg Arg Glu Gln Ala Asn Asn Ile Leu Ala Arg Val Thr Arg | ||||||
CTC GGG GAA AGT CTG TTC ATC CGC AGG GAG CAG GCC AAC AAC ATC CTG GCG AGG GTC ACG AGG | ||||||
66 75 | • 84 | ί 93 | i 102 | 111 | 120 | |
(+D | ||||||
41 | ||||||
Ala | . Asn Ser Phe Leu Glu | Glu Met Lys | Lys Gly His | Leu Glu Arg Glu | Cy3 Met Glu | Glu Thr |
GCC | AAT TCC TTT CTT GAA | GAG ATG AAG | AAA GGA CAC | CTC GAA AGA GAG | : TGC ATG GAA | GAG ACC |
129 138 | 147 | 156 | 165 | 174 | 183 | |
Cys | Ser Tyr Glu Glu Ala | Arg Glu Val | Phe Glu Asp | Ser Asp Lys Thr | Asn Glu Phe | Trp Asn |
TGC | TCA TAC GAA GAG GCC | CGC GAG GTC | TTT GAG GAC | AGC GAC AAG ACG | AAT GAA TTC | TGG AAT |
192 201 | 210 | 219 | 228 | 237 | 246 | |
Lys | Tyr Lys Asp Gly Asp | Gln Cys Glu | Thr Ser Pro | Cys Gln Asn Gln | Gly Lys Cys | Lys Asp |
AAA | TAC AAA GAT GGC GAC | CAG TCT GAG | ACC AGT CCT | TGC CAG AAC CAG | GGC AAA TCT | AAA GAC |
255 264 | 273 | 282 | 291 | 300 | 309 | |
Gly | Leu Gly Glu Tyr Thr | Cys Thr Cys | Leu Glu Gly | Phe Glu Gly Lys | Asn Cy3 Glu | Leu Phe |
GGC | CTC GGG GAA TAC ACC | TGC ACC TCT | TTA GAA GGA | TTC GAA GGC AAA | AAC TGT GAA | TTA TTC |
318 327 | 336 | 345 | 3S4 | 363 | 372 | |
Thr | Arg Lys Leu Cys Ser | Leu Asp Asn | Gly Asp Cys | Asp Gln Phe Cys | His Glu Glu | Gln Asn |
ACA | CGG AAG CTC TGC AGC | CTG GAC AAC | GGG GAC TCT | GAC CAG TTC TGC | CAC GAG GAA | CAG AAC |
381 390 | 399 | 408 | 417 | 426 | 435 | |
Ser | Val val Cys Ser Cys | Ala Arg Gly | Tyr Thr Leu | Ala Asp Asn Gly | Lys Ala Cys | Ile Pro |
TCT | GTG GTG TGC TCC TGC | GCC CGC GGG | TAC ACC CTG | GCT GAC AAC GGC | AAG GCC TGC | ATT CCC |
444 453 | 462 | 471 | 480 | 489 | 498 | |
178 | 179 180 181 182 | 183 | ||||
Thr | Gly Pro Tyr Pro Cys | Gly Lys Gln | Thr Leu Glu | Arg Arg Lys Arg | Ser Val Ala | Gln Ala |
ACA | GGG COC TAC CCC TGT | GGG AAA CAG | ACC CTG GAA | OGC AGG AAG AGG | TCA GTG GCC | CAG GCC |
507 516 | 525 | 534 | 543 | 552 | 561 | |
Thr | Ser Ser Ser Gly Glu | Ala Pro Asp | Ser Ile Thr | Trp Lys Pro Tyr | Asp Ala Ala | Asp Leu |
ACC | AGC AGC AGC GGG GAG | GCC CCT GAC | AGC ATC ACA | TGG AAG CCA TAT | GAT GCA GCC | GAC CTG |
570 579 | 588 | 597 | 606 | 615 | 624 | |
R6 | ||||||
229 | ||||||
Asp | Pro Thr Glu Asn Pro | Phe Asp Leu | Leu Asp Phe | Asn Gln Thr Gln | Pro Glu Arg | Gly Asp |
GAC | CCC ACC GAG AAC CCC | TTC GAC CTG | CTT GAC TTC | AAC CAG ACG CAG | CCT GAG AGG | GGC GAC |
633 642 | 651 | 660 | 669 | 678 | 687 | |
R5 | R4 R3 R2 Rl | |||||
234 235 | ||||||
Asn | A3n Leu Thr Arg Ile | Val Gly Gly | Gln Glu Cys | Lys Asp Gly Glu | Cys Pro Trp | Gln Ala |
AAC | AAC CTC ACC AGG ATC | GTG GGA GGC | CAG GAA TGC | AAG GAC GGG GAG | TGT CCC TGG | CAG GCC |
696 705 | 714 | 723 | 732 | 74 L | 750 |
Fig. 1-1
190 734
Leu Leu Ile CTG CTC ATC
759
Asn Glu Glu AAT GAG GAA
768
Asn Glu Gly AAC GAG GGT
777
Phe Cys Gly TTC TGT GGT
786
Gly Thr Ile GGA ACT ATT
795
Leu Ser Glu CTG AGC GAG
804
Phe Tyr Ile TTC TAC ATC
813
Leu Thr Ala CTA ACG GCA
822
Ala His Cy3 GCC CAC TGT
831
Leu Tyr Gln CTC TAC CAA
840
Ala Lys Arg GCC AAG AGA
849
Phe Lys Val TTC AAG GTG
858
Arg Val Gly AGG GTA GGG
867
Asp Arg Asn GAC CGG AAC
876
Thr Glu Gln ACG GAG CAG
885
Glu Glu Gly GAG GAG GGC
894
Gly Glu Ala GGT GAG GCG
903
Val His Glu GTG CAC GAG
912
Val Glu Val GIG GAG GTG
921
Val Ile Lys GTC ATC AAG
930
His Asn Arg CAC AAC CGG
939
Phe Thr Lys TTC ACA AAG
948
Glu Thr Tyr GAG ACC TAT
957
Asp Phe Asp GAC TTC GAC
966
Ile Ala Val ATC GCC GTG
975
Leu Arg Leu CTC CGG CTC
984
Lys Thr Pro AAG ACC CCC
993
Ile Thr Phe ATC ACC TTC
1002
Arg Met Asn CGC ATG AAC
1011
Val Ala Pro GTG GCG OCT
1020
Ala Cys Leu GOC TGC CTC
1029
Pro Glu Arg CCC GAG CGT
1038
Asp Trp Ala GAC TGG GCC
1047
Glu Ser Thr GAG TCC ACG
1056
Leu Met Thr CTG ATG ACG
1065
Gln Lys Thr CAG AAG ACG
1074
Gly Ile Val GGG ATT GTG
1083
Ser Gly Phe AGC GGC TTC
1092
Gly Arg Thr GGG CGC ACC
1101
His Glu Lys CAC GAG AAG
1110
Gly Arg Gln GGC CGG CAG
1119
Ser Thr Arg TCC ACC AGG
1128
Leu Lys Met CTC AAG ATG
1137
Leu Glu Val CTG GAG GTG
1146
Pro Tyr Val COC TAC GTG
1155
Asp Arg Asn GAC CGC AAC
1164
Ser Cys Lys AGC TGC AAG
1173
Leu Ser Ser CTG TCC AGC
1182
Ser Phe Ile AGC TTC ATC
1191
Ile Thr Gln ATC ACC CAG
1200
Asn Met Phe AAC ATG TTC
1209
Cys Ala Gly TGT GCC GGC
1218
Tyr Asp Thr TAC GAC ACC
1227
Lys Gln Glu AAG CAG GAG
1236
Asp Ala Cys GAT GCC TGC
1245
Gln Gly Asp CAG GGG GAC
1254
Ser Gly Gly AGC GGG GGC
1263
Pro His Val CCG CAC GTC
1272
Thr Arg Phe ACC CGC TTC
1281
Lys Asp Thr AAG GAC ACC
1290
Tyr Phe Val TAC TTC GTG
1299
Thr GLy Ile ACA GGC ATC
1308
Val Ser Trp GTC AGC TGG
1317
Gly Glu Ser GGA GAG AGC
1326
Cys Ala Arg TGT GCC CGT
1335
Lys Gly Lys AAG GGG AAG
1344
Tyr Gly Ile TAC GGG ATC
1353
Tyr Thr Lys TAC ACC AAG
1362
Val Thr Ala GTC ACC GCC
1371
Phe Leu Lys TTC CTC AAG
1380
Trp Ile Asp TGG ATC GAC
1389
Arg Ser Met AGG TCC ATG
1398
Ile Thr Ser ATA ACG TCC
1452
Ser Pro Leu TCT CCA TTA
1461
469 Lys Thr Arg AAA ACC AGG 1407
488
Lys TER AAG TGA
1467
470
Gly Leu Pro GGC TTG CCC
1416
475 Lys Ala Lys AAG GCC AAG 1425
476
Ser His Ala AGC CAT GCC
1434
480 Pro Glu Val CCG GAG GTC
1443
Pre-/propeptyd Peptyd łączący Peptyd aktywacyjny
Fig. 1-2
190 734 ftf
4J •N α
5 | flj |
Ό | •H |
M | G |
Φ | m |
e | Z |
•H | 0 |
G | |
Λ | O |
nJ | rH Λί |
M (d | O |
CM | Ό |
CM s
o g
τ-
id □
CN
Fig.
> X G Pm
O G ύ>
<D <y ν Ρί Ό
H
Λί
190 734 <β
•p4 C ti Z £ c | |
*0 | 0 |
iH | |
a) | Λί |
6 | |
•H | 0 |
M | TJ |
Qi | ti |
ti | P |
M | >1 |
ti | *N |
Ai | 3 |
ΙΟ ο
^ćcca:^:
££££ΐ£££
Α4444444 (EccflCtncccEffia:
COCOCOCOPOCOCOCO δ: i a: a: a: a: a: cc ιτπ* » ο-’Γ S'’ S %iff <5 Ab °% r-4 i ł I »“ł i ł l f—4 r—1 TJ W Tl TT) TJ tj «flr-ałgO^cfJT 88800000 gggglggg rł- a
CN
CN
Fig ti •w a
0) a >
O) C ti
Q> | N | >1 | ti | 25 | |||
U | 0 | ti | ti X | X | X | ||
OJ | N | X | u. | LU | U- | ||
ΓΛ | ti | u. | *H | ||||
a) | N | ti | |||||
•H s | 0 M | <—i TJ | U4 | u. | O | X | — |
190 734
Fig. 3
190 734
VI •rł
X
OJ
KLONY
INICJALNE
SUBKLONY 799-6 ♦H fi
N
O <0
G
N
OJ
N
O
O
Ul o
O a
U
O | 00 ·* | O\ | |||
m | en | r* | i-* | wH | |
O\ | ds | *A | iA | <A | A |
os | os | CM | CM | CM | CM |
e*- | C | 00 | 00 | 00 | 00 |
O m
I m
cm
220kD
97kD
66kD
46kD.
30kD
213kD.
-f τ,-
-..tj· <
Ul
H
X
Φ
SC
HC
LC
G
H υ
nl £
CO <e
N
O
O
Ul o
AMPLIFIKACJA NA 20nM METOTREKSACIE en «
Ό r*·
Ό
o> | r-> | en | TT | |
«—4 | os | Tt | »4 | |
r^· | C* | r-· | ||
so | so | Ό | SO | Ό |
0Q | 00 | OO | 00 | 00 |
220kD
97kD
66kD
46kD·
30kD
21.5kO
|53i mi ¢$91JWŚI ϋ** >
14kl)
Fig. 4
SC
HC
LC
190 734
Fig. 5 (O
N
O o
O) o
CHO-rFTCCHO CHO-rFX7CHQ· ,
II II II fi II II 11 u
97,4 kD 66 kD 4ńkD kD
213kD 143 kD
«· *9 Μ BBB*
SC
HC
LC
Surowica anty-FX
N o
o ω
o
CHO-rFX/CHO CHO-rFX/CHO^-furyna
II II II II II II II II
W W *4 -W x
213 kD 143 kl^
O C4 Tf Ό
CM β· Ό
- —
SC
LC anty-FX LC mAb t = czas inkubacji w temperaturze 37 C podany w godzinach
190 734
Fig. 6
< | fc tH ł-H p | £ fc | |
N U | fc | u | |
tn O | ó | O | o |
N | ffi | W | ffi |
X fc | u | o | U |
U—4
SC
HC
(LC)
190 734 nukleotydów nj h
<d id •H c
fd o
c o
rd
X o
Ό id
4J >, «Ν to
190 734 ^4 •N
W >1 £
•ΓΊ
U
Ss u
Ai
AJ
s.
μ
Q<
<u
Om
cn | m | <n | <0 | |||
H | t- | t- | ł- | |||
< | < | < | < | |||
σ | a | σ | σ | |||
<r | < | < | < | |||
> | > | > | > | |||
ω | m | CZ) | 0) |
NL”
Ό >,
-P <D
CM
O
M
Q<
(U | UJ | Ul | ||
UJ | IU | UJ | ||
_j | -i | u | ||
u. | u. | u. | ||
cn | cn | cn | ||
z | z | z | ||
A. | SL | a. |
UJ
UJ
σ | σ | |
Ul | Ul | |
s | ac | |
Ł | X | |
UL | u. | |
-1 | U |
Cn
Ή &4 ferencyjny iki typ FX
X
Uh* ó
X o
X
O AJ x 5 o H o° rm ω
N >9 M c μ <a M Φ i*
Φ μ (ϋ
X * h O
Ϊ3
O X aj c CJ -H
ra | <a | ||
G | G | ||
X | >1 | ||
μ | M | ||
3 | 3 | ||
μ | M | ||
1 O | i a | ||
MO | MO | ||
I | t r·* | ||
O <*i | O | ||
W | X | ||
o ω | U o | ||
N | N | ||
>1 M | X | Μ M | |
3 | X | 3 | |
>1 μ | U. | M | X μ |
G <ti | Iw | 1 | g <a |
0)
CU
E <U •U
Q
U.
Ó
X o
ι—I (0 ι-l $ Q O
O Ai X G U -H
M
OJ e1 (U μ
(T5 (U
190 734
220 kD 97,4 kD
kD
210 kD
N | ||
N | X | U |
O | tl | O |
O | tn | |
cn | O | |
o | C3 | |
O | tg | |
<SJ | ni | |
X tl | § | X tl |
Fig. 9 •SC
HC aHC pHC
LC2
LC4
190 734 oh <u c
e cn =k m
OJ
CU ω
fl
N
O
O
W
O + r-furyna
G
O ε
o o
U*) f0
N o
o cn
O
N
220 kD °70kD ćbkD 46 kD kD
210 kD
cr
3s
HC aHC pHC
LC2
LC4 s
ci oi <u
G
O x
u nj
N
U
O
W
O
N
X fc + r-furyna o
II
Ό li
TT c4
II
TT li (M r*
II
220 kD 97,5 kD kD 46 kD kD
21,5 kD
HC
LC2
LC4
Fig. 10
190 734 ιβ
Ν
Ο
Ο «
Ο
Μ
Ο
Ψι
Λ
220 kD 97,4 kD kD 46 kD kD
21,5kD
es
Fig,
190 734
Departament Wydawnictw UP RP. Nakład 50 egz
Cena 6,00 zł.
Claims (49)
- Zastrzeżenia patentowe1. Analog czynnika X, znamienny tym, że posiada modyfikację w rejonie naturalnie występującego miejsca rozszczepienia aktywacyjnego do czynnika Xa w sekwencji czynnika X Gly228-R6-R5-R4-R3-R2-Arg234-R1, przy czym modyfikacja ta stanowi miejsce przekształcania dla nienaturalnie w tym rejonie sekwencji czynnika X rozszczepiającej proteazy, aR1 oznacza aminokwas wybrany z grupy Ile, Val, Ser, Thr lub AlaR2 oznacza aminokwas wybrany z grupy Pro, Gly, Lys lub ArgR3 oznacza aminokwas wybrany z grupy Phe, Lys, Met, Gln, Glu, Ser, Val, Arg lub ProR4 oznacza aminokwas wybrany z grupy Asp, Ile, Ser, Met, Pro, Thr, Arg lub LysR5 oznacza aminokwas wybrany z grupy Asn, Lys, Ser, Glu, Ala, Gln, His lub Arg iR6 oznacza aminokwas wybrany z grupy Asp, Phe, Thr, Arg, Leu lub Ser.
- 2. Analog czynnika X według zastrz. 1, znamienny tym, że modyfikacja dotyczy co najmniej jednego aminokwasu wewnątrz sekwencji aminokwasowej peptydu aktywacyjnego.
- 3. Analog czynnika X według zastrz. 1 albo 2, znamienny tym, że modyfikacja stanowi wymianę co najmniej jednego aminokwasu między Gly228 a Arg 234 oraz ewentualnie Ile235, w odniesieniu do numeracji aminokwasów według fig. 1.
- 4. Analog czynnika X według zastrz. 1, znamienny tym, że modyfikacja stanowi miejsce przekształcania dla proteazy wybranej z grupy endoproteaz, takich jak np. keksyna/Kex2, furyna/PACE, PC1/PC3, PC2, PC4, PACE4, LPC/PC7, proteaz serynowych, takich jak np. czynnik IIa, czynnik XHa, czynnik XIa, czynnik Xa, lub kalikreiny, albo pochodnej tych proteaz.
- 5. Analog czynnika X według zastrz. 1, znamienny tym, że posiada modyfikację w rejonie C-końcowej sekwencji aminokwasowej czynnika X.
- 6. Analog czynnika X według zastrz. 5, znamienny tym, że posiada modyfikację w rejonie C-końcowego miejsca rozszczepienia β-peptydu.
- 7. Analog czynnika X według zastrz. 6, znamienny tym, że modyfikację stanowi mutacja, delecja lub insercja w rejonie sekwencji aminokwasowej czynnika X między pozycjami aminokwasów Arg469 a Ser476.
- 8. Analog czynnika X według zastrz. 5 albo 6, albo 7, znamienny tym, że modyfikacja zapobiega odszczepieniu β-peptydu.
- 9. Analog czynnika X według zastrz. 5, znamienny tym, że posiada delecję β-peptydu czynnika X.
- 10. Analog czynnika X według zastrz. 5, znamienny tym, że posiada sygnał zatrzymania translacji w rejonie C-końcowym sekwencji czynnika X.
- 11. Analog czynnika X według zastrz. 10, znamienny tym, że posiada sygnał zatrzymania translacji w pozycji aminokwasu 470 sekwencji czynnika X.
- 12. Analog czynnika X według zastrz. 1, znamienny tym, że modyfikacja w rejonie peptydu aktywacyjnego umożliwia aktywowanie in vitro analogu czynnika X do natywnego czynnika Xa lub analogu czynnika Xa.
- 13. Analog czynnika X według zastrz. 12, znamienny tym, że modyfikacja umożliwia aktywowanie przez proteazę wybraną z grupy endoproteaz, takich jak keksyna/Kex2, furyna/PACE, PC1/PC3, PC2, PC4, PACE4, LPC7PC7, grupy proteaz serynowych, takich jak np. czynnik IIa, czynnik XIIa, czynnik XIa, czynnik Xa, lub kalikreinę, albo pochodną tych proteaz.
- 14. Analog czynnika X według zastrz. 1, znamienny tym, że modyfikacja umożliwia aktywowanie in vivo analogu czynnika X do natywnego czynnika Xa lub analogu czynnika Xa.
- 15. Analog czynnika X według zastrz. 14, znamienny tym, że modyfikacja umożliwia aktywowanie przez proteazę wybraną z grupy proteaz serynowych, takich jak np. czynnik XHa, czynnik XIa, czynnik IIa, czynnik Xa, lub przez kalikreinę.190 734
- 16. Analog czynnika X według zastrz. 1, znamienny tym, że stanowi analog czynnika X z nienaruszonym β-peptydem lub analog czynnika skrócony na C-końcu.
- 17. Analog czynnika X według zastrz. 1, znamienny tym, że stanowi cząsteczkę jednołańcuchową
- 18. Rekombinowany DNA znamienny tym, ze koduje analog czynnika X jak określono w zastrz. 1 do 17, i zawarty jest w wektorze do rekombinacyjnej ekspresji kodowanego białka.
- 19. Kompozycja, znamienna tym, że zawiera oczyszczony analog czynnika X lub jego białko prekursorawe z modyfikacją w rejonie naturalnie występującego miejsca rozszczepienia aktywacyjnego czynnika X w sekwencji czynnika X w sekwencji Gly228-R6-R5-R4-R3-R2-Arg234-R1, przy czym modyfikacja ta stanowi miejsce przekształcenia nienaturalnie w tym rejonie sekwencji czynnika X rozszczepiającej proteazy, aR1 oznacza aminokwas wybrany z grupy Ile, Val, Ser, Thr lub AlaR2 oznacza aminokwas wybrany z grupy Pro, Gly, Lys lub ArgR3 oznacza aminokwas wybrany z grupy Phe, Lys, Met, Gln, Glu, Ser, Val, Arg lub ProR4 oznacza aminokwas wybrany z grupy Asp, Ile, Ser, Met, Pro, Thr, Arg lub LysR5 oznacza aminokwas wybrany z grupy Asn, Lys, Ser, Glu, Ala, Gln, His lub Arg iR6 oznacza aminokwas wybrany z grupy Asp, Phe, Thr, Arg, Leu lub Ser.
- 20. Kompozycja według zastrz. 19, znamienna tym, że modyfikacja stanowi miejsce rozszczepienia dla proteazy, wybranej z grupy endoproteaz dwuzasadowych, takich jak np. keksyna/Kex2, furyna/PACE, PC1/PC3, PC2, PC4, PACE4, LPC/PC7, proteaz serynowych, takich jak np. czynnik IIa, czynnik XHa, czynnik XIa, czynnik Xa, lub kalikreiny.
- 21. Kompozycja według zastrz. 19 albo 20, znamienna tym, że analog czynnika X stanowi analog FXe.
- 22. Kompozycja według jednego z zastrz. 19 albo 20, znamienna tym, że analog czynnika X stanowi analog czynnika X skrócony na C-końcu.
- 23. Kompozycja według zastrz. 19, znamienna tym, że zawiera analog czynnika X jako cząsteczkę jednołańcuchową w postaci wyodrębnionej.
- 24. Kompozycja według zastrz. 23, znamienna tym, ze zawiera jednołańcuchowy analog czynnika X w enzymatycznie nieaktywnej postaci o czystości co najmniej 80%, korzystnie 90%, szczególnie korzystnie 95%, i nie zawiera nieaktywnych, proteolitycznych produktów pośrednich analogu czynnika X7Xa.
- 25. Kompozycja według zastrz. 19, znamienna tym, że zawiera analog czynnika X jako cząsteczkę dwułańcuchową w postaci wyodrębnionej.
- 26. Kompozycja według zastrz. 19, znamienna tym, że zawiera analog czynnika X, posiadający modyfikację, która umożliwia aktywowanie in vitro analogu czynnika X do natywnego czynnika Xa lub analogu czynnika Xa.
- 27. Kompozycja według zastrz. 19, znamienna tym, ze ma postać preparatu farmaceutycznego.
- 28. Kompozycja według zastrz. 19, znamienna tym, że jest umieszczona w odpowiednim urządzeniu, zwłaszcza w urządzeniu aplikacyjnym, w kombinacji z proteazą, wybraną z grupy endoproteaz, takich jak np. keksyna/Kex2, furyna/PACE, PC1/PC3, PC2, PC4, PACE4, LPC/PC7, grupy proteaz serynowych, takich jak np. czynnik XHa, czynnik XIa, czynnik Xa, lub kalikreiną, albo pochodną tych proteaz.
- 29. Kompozycja według zastrz. 28, znamienna tym, że składniki są oddzielone od siebie przestrzennie.
- 30. Kompozycja według zastrz. 19, znamienna tym, że zawiera analog czynnika X, posiadający modyfikację, która umożliwia aktywowanie in vivo analogu czynnika X do natywnego czynnika Xa lub analogu czynnika Xa.
- 31. Kompozycja, znamienna tym, że zawiera analog czynnika Xa i jest wolna od nieaktywnych produktów pośrednich analogu czynnika X/Xa, i autoproteolitycznych produktów rozkładu czynnika X, i może być otrzymywana przez aktywowanie analogu czynnika X jak określono w zastrz. 1 do 17.
- 32. Kompozycja według zastrz. 19, znamienna tym, że zawiera dopuszczalny fizjologicznie nośnik i jest w postaci stabilnej podczas składowania.190 734
- 33. Kompozycja według zastrz. 19, znamienna tym, że zawiera ewentualnie jako dalszą część składową czynnik krwi lub aktywowaną postać czynnika krwi.
- 34. Kompozycja według zastrz. 33, znamienna tym, że zawiera jako dalszą część składową co najmniej jeden składnik z czynnikiem VIII o aktywności bypass'owej.
- 35. Kompozycja według zastrz. 19, znamienna tym, że stanowi składnik zestawu farmaceutycznego i ewentualnie ma postać preparatu kilku-składnikowego.
- 36. Zastosowanie kompozycji jak określono w zastrz. 19 do 35 do wytwarzania środka leczniczego.
- 37. Zastosowanie rekombinowanego kwasu nukleinowego DNA kodującego analog czynnika X jak określono w zastrz. 1 do 17 i zawartego w wektorze do rekombinacyjnej ekspresji kodowanego białka do wytwarzania środka leczniczego.
- 38. Sposób wytwarzania kompozycji zawierającej oczyszczony rekombinowany analog czynnika X, znamienny tym, że otrzymany rekombinacyjnie analog czynnika X wyodrębnia się i oczyszcza metodą chromatograficzną.
- 39. Sposób według zastrz. 38, znamienny tym, że:- dostarcza się kwas nukleinowy określony w zastrz. 18- transformuje się odpowiednią komórkę- poddaje się ekspresji analog czynnika X- ewentualnie inkubuje się analog czynnika X z proteazą- wyodrębnia się analog czynnika X i- oczyszcza się analog czynnika X metodą chromatograficzną,
- 40. Sposób według zastrz. 39, znamienny tym, że analog czynnika X wyodrębnia się jako cząsteczkę dwułańcuchową.
- 41. Sposób według zastrz. 38 albo 39, albo 40, znamienny tym, że dwułańcuchowy analog czynnika X kontaktuje się z proteazą wybraną z grupy endoproteaz, takich jak np. keksyna/Kex2, furyna/PACE, PC1/PC3, PC2, PC4, PACE4, LPC/PC7, grupy proteaz serynowych, takich jak np. czynnik IIa, czynnik XIIa, czynnik XIa, czynnik Xa, lub kalikreiną, albo pochodną tych proteaz, w warunkach, w których analog czynnika X aktywuje się do natywnego czynnika Xa lub analogu czynnika Xa.
- 42. Sposób według zastrz. 41, znamienny tym, że stosuje się komórkę, która może przeprowadzać rozszczepianie pojedynczego łańcucha na lekki i ciężki łańcuch czynnika X lub analogu czynnika X, nie eksprymuje i ewentualnie posiada deficyt proteazy.
- 43. Sposób według zastrz. 42, znamienny tym, że stosuje się komórkę nie eksprymującą endoproteazy, takiej jak np. keksyna, furyna, PACE lub ich pochodna.
- 44. Sposób według zastrz. 42 albo 43, znamienny tym, że analog czynnika X wyodrębnia się jako cząsteczkę jednołańcuchową.
- 45. Sposób według zastrz. 44, znamienny tym, że jednołańcuchowy ewentualnie wyodrębniony analog czynnika X kontaktuje się z proteazą wybraną z grupy endoproteaz, takich jak keksyna/Kex2, furyna/PACE, PC1/PC3, PC2, PC4, PACE4, LPC/PC7, lub pochodną tych proteaz, w warunkach w jakich rozszczepia się jednołańcuchowy analog czynnika X do dwułańcuchowej postaci czynnika X.
- 46. Sposób według zastrz. 45, znamienny tym, że jednołańcuchowy analog czynnika X ewentualnie przez kontaktowanie z proteazą aktywuje się bezpośrednio do czynnika Xa lub analogu czynnika Xa.
- 47. Sposób według zastrz. 45, znamienny tym, że dwułańcuchowy analog czynnika X kontaktuje się z dalszą inną niż poprzednia proteazą i aktywuje do analogu czynnika Xa lub natywnego czynnika Xa.
- 48. Sposób według zastrz. 38, znamienny tym, że stosuje się proteazę unieruchomioną
- 49. Sposób wytwarzania kompozycji zawierającej aktywny czynnik Xa lub analog czynnika Xa, znamienny tym, że analog czynnika X otrzymany sposobem określonym w zastrz. 38 poddaje się operacji aktywowania.190 734
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
AT0033597A AT405516B (de) | 1997-02-27 | 1997-02-27 | Faktor x-analoge mit modifizierter proteasespaltstelle |
PCT/AT1998/000045 WO1998038317A1 (de) | 1997-02-27 | 1998-02-27 | Faktor x-analoge mit modifizierter proteasespaltstelle |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
PL335382A1 PL335382A1 (en) | 2000-04-25 |
PL190734B1 true PL190734B1 (pl) | 2005-12-30 |
Family
ID=3487868
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
PL98335382A PL190734B1 (pl) | 1997-02-27 | 1998-02-27 | Analog czynnika X, rekombinowany DNA, kompozycje,zastosowanie rekombinowanego kwasu nukleinowego DNA oraz sposoby wytwarzania kompozycji |
Country Status (17)
Country | Link |
---|---|
US (2) | US6573071B1 (pl) |
EP (1) | EP0966536B1 (pl) |
JP (1) | JP4317976B2 (pl) |
AR (1) | AR012034A1 (pl) |
AT (2) | AT405516B (pl) |
AU (1) | AU744428B2 (pl) |
BR (1) | BR9807627A (pl) |
CA (1) | CA2282707A1 (pl) |
CZ (1) | CZ298298B6 (pl) |
DE (1) | DE59813518D1 (pl) |
ES (1) | ES2263199T3 (pl) |
HU (1) | HU225246B1 (pl) |
IL (2) | IL131346A0 (pl) |
NO (1) | NO327878B1 (pl) |
PL (1) | PL190734B1 (pl) |
SK (1) | SK286359B6 (pl) |
WO (1) | WO1998038317A1 (pl) |
Families Citing this family (46)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
AT405517B (de) * | 1997-02-27 | 1999-09-27 | Immuno Ag | Faktor x-deletionsmutanten und analoge davon |
IL129427A0 (en) * | 1999-04-13 | 2000-02-17 | Yeda Res & Dev | Preparation of biologically active molecules |
AT410216B (de) * | 1999-08-10 | 2003-03-25 | Baxter Ag | Faktor x-analogon mit verbesserter aktivierbarkeit |
AU2001249389A1 (en) * | 2000-03-22 | 2001-10-03 | The Children's Hospital Of Philadelphia | Modified blood clotting factors and methods of use |
US7223577B2 (en) * | 2000-11-17 | 2007-05-29 | Allergan, Inc. | Post-translational modifications and Clostridial neurotoxins |
FR2831170B1 (fr) * | 2001-10-19 | 2004-03-19 | Inst Nat Sante Rech Med | Proteines c modifiees activables directement par la thrombine |
FR2841904B1 (fr) * | 2002-07-03 | 2004-08-20 | Inst Nat Sante Rech Med | Analogues de facteurs x clivables par la thrombine |
US20040132156A1 (en) * | 2002-10-04 | 2004-07-08 | Schering Aktiengesellschaft | Modified hepsin molecules having a substitute activation sequence and uses thereof |
ES2346072T3 (es) * | 2004-08-17 | 2010-10-08 | Csl Behring Gmbh | Polipeptidos modificados dependientes de la vitamina k. |
EP1728798A1 (en) * | 2005-06-01 | 2006-12-06 | ZLB Behring GmbH | Coagulation factor X polypeptides with modified activation properties |
US7846445B2 (en) * | 2005-09-27 | 2010-12-07 | Amunix Operating, Inc. | Methods for production of unstructured recombinant polymers and uses thereof |
US7855279B2 (en) * | 2005-09-27 | 2010-12-21 | Amunix Operating, Inc. | Unstructured recombinant polymers and uses thereof |
MX336958B (es) * | 2005-11-15 | 2016-02-05 | Philadelphia Children Hospital | Metodos y composiciones para modular la hemostasia. |
EP1820508A1 (en) | 2006-02-21 | 2007-08-22 | CSL Behring GmbH | Coagulation factor X polypeptides with modified activation properties |
JP5093783B2 (ja) | 2006-04-20 | 2012-12-12 | クリングルファーマ株式会社 | Hgf前駆体蛋白質改変体及びその活性型蛋白質 |
GB0710321D0 (en) * | 2007-05-30 | 2007-07-11 | Nhs Blood & Transplant | Method |
US9956272B2 (en) | 2007-05-30 | 2018-05-01 | Bio Products Laboratory Limited | Methods for preparing factor X, activated factor X, inactivated factor X and inactivated factor Xa, and pharmaceutical compositions comprising same |
EP2185701A4 (en) * | 2007-08-15 | 2011-03-02 | Amunix Operating Inc | COMPOSITIONS AND METHODS FOR ENHANCING THE PRODUCTION OF RECOMBINANT POLYPEPTIDES |
DK2193196T3 (en) | 2007-09-28 | 2016-11-07 | Portola Pharm Inc | Clinical profile of Factor Xa inhibitors, and methods of use thereof |
US8268783B2 (en) | 2007-09-28 | 2012-09-18 | Portola Pharmaceuticals, Inc. | Antidotes for factor Xa inhibitors and methods of using the same |
WO2010056765A2 (en) * | 2008-11-14 | 2010-05-20 | Portola Pharmaceuticals, Inc. | Antidotes for factor xa inhibitors and methods of using the same in combination with blood coagulating agents |
US8703717B2 (en) * | 2009-02-03 | 2014-04-22 | Amunix Operating Inc. | Growth hormone polypeptides and methods of making and using same |
CA2748314C (en) | 2009-02-03 | 2018-10-02 | Amunix Operating Inc. | Extended recombinant polypeptides and compositions comprising same |
US8680050B2 (en) * | 2009-02-03 | 2014-03-25 | Amunix Operating Inc. | Growth hormone polypeptides fused to extended recombinant polypeptides and methods of making and using same |
US9849188B2 (en) | 2009-06-08 | 2017-12-26 | Amunix Operating Inc. | Growth hormone polypeptides and methods of making and using same |
DK2440228T3 (en) * | 2009-06-08 | 2018-12-17 | Amunix Operating Inc | Glucose regulating polypeptides and methods for their preparation and use |
CA2767858C (en) | 2009-07-15 | 2019-02-12 | Portola Pharmaceuticals, Inc. | Unit dose formulation of antidotes for factor xa inhibitors and methods of using the same |
AU2010290131C1 (en) * | 2009-08-24 | 2015-12-03 | Amunix Operating Inc. | Coagulation factor VII compositions and methods of making and using same |
WO2011123830A2 (en) | 2010-04-02 | 2011-10-06 | Amunix Operating Inc. | Alpha 1-antitrypsin compositions and methods of making and using same |
WO2013049804A1 (en) | 2011-09-30 | 2013-04-04 | The Children's Hospital Of Philadelphia | Compositions and methods for modulating hemostasis |
ES2771208T3 (es) | 2012-02-15 | 2020-07-06 | Bioverativ Therapeutics Inc | Composiciones de factor VIII y métodos de preparación y uso de las mismas |
DK2822577T3 (en) | 2012-02-15 | 2019-04-01 | Bioverativ Therapeutics Inc | RECOMBINANT FACTOR VIII PROTEINS |
EP3406347A3 (en) | 2012-02-27 | 2019-02-13 | Amunix Operating Inc. | Xten conjugate compositions and methods of making same |
GB201211617D0 (en) * | 2012-06-29 | 2012-08-15 | Univ Aberdeen | Production of cyclic peptides |
CN104755492A (zh) | 2012-07-25 | 2015-07-01 | 催化剂生物科学公司 | 修饰的因子x多肽及其应用 |
MX2015008813A (es) | 2013-01-31 | 2016-03-31 | Pfizer | Composiciones y metodos para contrarrestar la inhibicion del factor xa. |
FR3001729B1 (fr) * | 2013-02-04 | 2015-03-06 | Lab Francais Du Fractionnement | Mutants du facteur x |
JP2016510984A (ja) * | 2013-03-12 | 2016-04-14 | ノヴォ ノルディスク アー/エス | トロンビン感受性凝固第x因子分子 |
WO2015023891A2 (en) | 2013-08-14 | 2015-02-19 | Biogen Idec Ma Inc. | Factor viii-xten fusions and uses thereof |
WO2015044836A1 (en) | 2013-09-24 | 2015-04-02 | Pfizer Inc. | Compositions comprising heterogeneous populations of recombinant human clotting factor xa proteins |
RU2585532C2 (ru) * | 2014-01-31 | 2016-05-27 | Федеральное государственное учреждение "Федеральный исследовательский центр "Фундаментальные основы биотехнологии" Российской академии наук"(ФИЦ Биотехнологии РАН) | Плазмида для экспрессии рекомбинантного фактора свёртываемости крови ix человека, клетка сно - продуцент рекомбинантного фактора свёртываемости крови ix человека и способ получения указанного фактора |
US10676731B2 (en) | 2014-08-19 | 2020-06-09 | The Children's Hospital Of Philadelphia | Compositions and methods for modulating factor IX function |
WO2017024060A1 (en) | 2015-08-03 | 2017-02-09 | Biogen Ma Inc. | Factor ix fusion proteins and methods of making and using same |
MX2018002226A (es) | 2015-08-28 | 2018-03-23 | Amunix Operating Inc | Ensamble de polipeptido quimerico y metodos para hacer y usar el mismo. |
NZ769677A (en) | 2018-05-18 | 2024-07-05 | Bioverativ Therapeutics Inc | Methods of treating hemophilia a |
KR102613936B1 (ko) * | 2020-11-13 | 2023-12-15 | 한국생명공학연구원 | 자가분해능이 저하된 켁신 효소 및 이의 생산 방법 |
Family Cites Families (10)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
AT366916B (de) | 1980-04-02 | 1982-05-25 | Immuno Ag | Vorrichtung zur applikation eines gewebeklebstoffes auf basis von menschlichen oder tierischenproteinen |
US4501731A (en) | 1983-06-27 | 1985-02-26 | Tishkoff Garson H | Treatment of disparate bleeding disorders with factor X zymogen |
AT382783B (de) | 1985-06-20 | 1987-04-10 | Immuno Ag | Vorrichtung zur applikation eines gewebeklebstoffes |
US5597799A (en) | 1990-09-04 | 1997-01-28 | Cor Therapeutics, Inc. | Recombinant agents affecting thrombosis |
JP4236698B2 (ja) | 1990-11-26 | 2009-03-11 | ジェネティックス インスティチュート,リミテッド ライアビリティ カンパニー | 宿主細胞でのpaceの発現およびその使用法 |
US5621039A (en) | 1993-06-08 | 1997-04-15 | Hallahan; Terrence W. | Factor IX- polymeric conjugates |
DE4325872C1 (de) | 1993-08-02 | 1994-08-04 | Immuno Ag | Virusinaktivierte Faktor Xa-Präparation |
AT401270B (de) | 1994-09-26 | 1996-07-25 | Immuno Ag | Verfahren zur quantifizierung von genomischer dna |
AT404838B (de) | 1995-11-24 | 1999-03-25 | Immuno Ag | Herstellung von proteinen aus pro-proteinen durch fusionsproteine abgeleitet von furin oder furinanalogen |
AT405517B (de) | 1997-02-27 | 1999-09-27 | Immuno Ag | Faktor x-deletionsmutanten und analoge davon |
-
1997
- 1997-02-27 AT AT0033597A patent/AT405516B/de not_active IP Right Cessation
-
1998
- 1998-02-25 AR ARP980100832A patent/AR012034A1/es not_active Application Discontinuation
- 1998-02-27 EP EP98903943A patent/EP0966536B1/de not_active Expired - Lifetime
- 1998-02-27 US US09/367,791 patent/US6573071B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1998-02-27 ES ES98903943T patent/ES2263199T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1998-02-27 CZ CZ0303299A patent/CZ298298B6/cs not_active IP Right Cessation
- 1998-02-27 SK SK1171-99A patent/SK286359B6/sk not_active IP Right Cessation
- 1998-02-27 HU HU0100652A patent/HU225246B1/hu not_active IP Right Cessation
- 1998-02-27 AU AU62002/98A patent/AU744428B2/en not_active Ceased
- 1998-02-27 BR BR9807627-2A patent/BR9807627A/pt not_active IP Right Cessation
- 1998-02-27 JP JP53706298A patent/JP4317976B2/ja not_active Expired - Lifetime
- 1998-02-27 PL PL98335382A patent/PL190734B1/pl not_active IP Right Cessation
- 1998-02-27 DE DE59813518T patent/DE59813518D1/de not_active Expired - Lifetime
- 1998-02-27 CA CA002282707A patent/CA2282707A1/en not_active Abandoned
- 1998-02-27 WO PCT/AT1998/000045 patent/WO1998038317A1/de active IP Right Grant
- 1998-02-27 AT AT98903943T patent/ATE324454T1/de active
- 1998-02-27 IL IL13134698A patent/IL131346A0/xx active IP Right Grant
-
1999
- 1999-08-10 IL IL131346A patent/IL131346A/en not_active IP Right Cessation
- 1999-08-26 NO NO19994139A patent/NO327878B1/no not_active IP Right Cessation
-
2003
- 2003-04-04 US US10/407,123 patent/US7220569B2/en not_active Expired - Lifetime
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
DE59813518D1 (de) | 2006-06-01 |
CZ303299A3 (cs) | 2000-02-16 |
CA2282707A1 (en) | 1998-09-03 |
ATA33597A (de) | 1999-01-15 |
IL131346A0 (en) | 2001-01-28 |
HUP0100652A1 (hu) | 2001-06-28 |
NO327878B1 (no) | 2009-10-12 |
JP2001513631A (ja) | 2001-09-04 |
US6573071B1 (en) | 2003-06-03 |
HU225246B1 (en) | 2006-08-28 |
NO994139L (no) | 1999-10-27 |
EP0966536A1 (de) | 1999-12-29 |
IL131346A (en) | 2007-05-15 |
WO1998038317A1 (de) | 1998-09-03 |
JP4317976B2 (ja) | 2009-08-19 |
AU744428B2 (en) | 2002-02-21 |
US7220569B2 (en) | 2007-05-22 |
HUP0100652A3 (en) | 2003-01-28 |
CZ298298B6 (cs) | 2007-08-22 |
BR9807627A (pt) | 2000-02-22 |
AT405516B (de) | 1999-09-27 |
AU6200298A (en) | 1998-09-18 |
US20030181381A1 (en) | 2003-09-25 |
AR012034A1 (es) | 2000-09-27 |
PL335382A1 (en) | 2000-04-25 |
EP0966536B1 (de) | 2006-04-26 |
ES2263199T3 (es) | 2006-12-01 |
SK117199A3 (en) | 2000-05-16 |
NO994139D0 (no) | 1999-08-26 |
SK286359B6 (sk) | 2008-08-05 |
ATE324454T1 (de) | 2006-05-15 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
PL190734B1 (pl) | Analog czynnika X, rekombinowany DNA, kompozycje,zastosowanie rekombinowanego kwasu nukleinowego DNA oraz sposoby wytwarzania kompozycji | |
US9758776B2 (en) | Coagulation factor IX compositions and methods of making and using same | |
JP4108761B2 (ja) | X因子欠失突然変異体およびそのアナログ | |
US6958322B1 (en) | Factor X analog with an improved ability to be activated | |
MXPA99007817A (en) | Factor x deletion mutants and analogues thereof | |
MXPA99007768A (en) | Factor x analogues with a modified protease cleavage site |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
RECP | Rectifications of patent specification | ||
LAPS | Decisions on the lapse of the protection rights |
Effective date: 20100227 |