KR20240028539A - 급속 진행형 섬유육종 폴리펩티드의 표적화 분해를 위한 다중 고리 화합물 및 방법 - Google Patents

급속 진행형 섬유육종 폴리펩티드의 표적화 분해를 위한 다중 고리 화합물 및 방법 Download PDF

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키이스 알. 혼버거
징 왕
크레이그 엠. 크루즈
사울 제이미-피게로아
한칭 동
이민 치안
커트 짐머만
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아비나스 오퍼레이션스, 인코포레이티드
예일 유니버시티
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Abstract

본 발명은 급속 진행형 섬유육종(c-RAF, A-RAF 및/또는 B-RAF와 같은 RAF; 표적 단백질)의 조절제로서 유용성을 갖는 이작용성 화합물, ULM―L―PTM에 관한 것이다. 특히, 본 발명은, 일 단부 상에 E3 유비퀴틴 리가아제에 결합하는 폰 히펠 린다우, 세레블론, 아폽토시스 단백질 억제제 또는 마우스 이중-분 상동체 2 리간드를 함유하고, 다른 단부 상에는 표적 단백질 RAF에 결합하는 잔기를 함유하는 이작용성 화합물에 관한 것으로서, 표적 단백질은 유비퀴틴 리가아제의 근접에 위치하여 표적 단백질의 분해(및 억제)를 일으킨다. 본 발명은 표적 단백질의 분해/억제와 관련된 광범위한 약리학적 활성을 보여준다. 표적 단백질의 응집 또는 축적으로부터 기인하는 질환 또는 장애, 또는 표적 단백질의 구성적인 활성화는 본 발명의 화합물 및 조성물로 치료 또는 예방된다.

Description

급속 진행형 섬유육종 폴리펩티드의 표적화 분해를 위한 다중 고리 화합물 및 방법{POLYCYCLIC COMPOUNDS AND METHODS FOR THE TARGETED DEGRADATION OF RAPIDLY ACCELERATED FIBROSARCOMA POLYPEPTIDES}
관련 출원에 대한 상호 참조
본 개시는 2018년 9월 7일에 출원된 미국 가출원 제62/728,581호의 우선권을 주장하며, 2016년 12월 23일에 출원된 미국 가출원 제62/438,803호 및 2017년 11월 7일에 출원된 미국 가출원 제62/582,698호의 우선권을 주장하는, 2018년 6월 28일에 미국 특허출원 공개 제2018/0179183A1호로서 공개된 2017년 12월 22일에 출원된 미국 특허출원 제15/853,166호의 부분 계속출원이며, 이들 모두는 그 전체가 참조로서 본원에 통합된다.
참조로서 통합
2016년 8월 5일에 출원된 미국 특허출원 제15/230,354호; 및 2016년 7월 11일에 출원된 미국 특허출원 제15/206,497호; 및 2016년 7월 13일에 출원된 미국 특허출원 제15/209,648호; 및 2016년 10월 11일에 출원된 미국 특허출원 제62/406,888호; 및 미국 특허출원 공개 제2015/0291562호로서 공개된 2015년 4월 14일에 출원된 미국 특허출원 제14/686,640호; 및 미국 특허출원 공개 제2016/0058872호로서 공개된 2015년 7월 6일에 출원된 미국 특허출원 제14/792,414호; 및 미국 특허출원 공개 제2014/0356322호로서 공개된 2014년 7월 11일에 출원된 미국 특허출원 제14/371,956호; 및 미국 특허출원 공개 제2016/0272639호로서 공개된 2016년 3월 18일에 출원된 미국특허 출원 제15/074,820호는 그 전체가 참조로서 본원에 통합된다. 또한, 본원에서 인용된 모든 참조 문헌은 그 전체가 참조로서 본원에 통합된다.
연방 지원 연구에 관한 명시
본 발명은, 미국 국립 보건원(National Institutes of Health)에 의해 발행된 바와 같이, 정부 지원 수여번호 NIH R35CA197589로 이루어졌다. 본 발명에서 정부는 특정 권리를 갖는다.
기술 분야
본 명세서는 표적 단백질 결합 모이어티 및 E3 유비퀴틴 리가아제 결합 모이어티를 포함하는 이작용성 화합물 및 관련된 사용 방법을 제공한다. 이작용성 화합물은, 특히 본 발명에 따른 이작용성 화합물에 의해 분해되고/분해되거나 그렇지 않으면 억제되는, 급속 진행형 섬유육종(Rapidly Accelerated Fibrosarcoma, RAF) 단백질에 관하여, 표적화된 유비퀴틴화의 조절제로서 유용하다.
대부분의 소분자 약물은 타이트하고 잘 정의된 포켓 내에서 효소 또는 수용체를 결합시킨다. 반면, 단백질-단백질 상호작용은 큰 접촉면 및 얕은 홈 또는 이와 관련된 평면형 계면으로 인해 소분자를 사용하여 표적화하기에는 매우 어렵다. E3 유비퀴틴 리가아제(수백 개가 인체에 알려져 있음)는 유비퀴틴화에 대한 기질 특이성을 부여하며, 특정 단백질 기질에 대한 특이성으로 인해 일반적인 프로테아좀 억제제보다 더 각광받는 치료 표적이다. E3 리가아제의 리간드의 개발은, 부분적으로 단백질-단백질 상호작용을 파괴해야 한다는 사실 때문에, 어려운 것으로 입증되었다. 그러나, 최근의 개발은 이들 리가아제에 결합하는 특정 리간드를 제공하였다. 예를 들어, 최초의 소분자 E3 리가아제 억제제인 뉴트린(nutlin)의 발견 이후, E3 리가아제를 표적으로 하는 추가적인 화합물이 보고되었지만, 그 분야는 아직 미개발 상태로 남아있다. 예를 들어, 최초의 소분자 E3 리가아제 마우스 이중 분 2 동족체(MDM2) 억제제인 뉴트린(Nutlins)의 발견 이후, MDM2(즉, 인간 이중 분 2 또는 HDM2) E3 리가아제를 표적으로 하는 추가적인 화합물이 보고되었다(J. Di, 등, Current Cancer Drug Targets (2011), 11(8), 987-994).
종양 억제 유전자 p53은 DNA 손상 또는 스트레스에 반응하여 세포 성장 정지 및 세포 사멸에 있어서 중요한 역할을 하고(A. Vazquez 등, Nat. Rev. Drug. Dis. (2008), 7, 979-982), p53의 불활성화는 종양 세포 생존에 대한 주요 경로 중 하나로 제시되었다(A. J. Levine 등, Nature (2000), 408, 307-310). 암 환자 중, 약 50%는 p53 돌연변이를 가지는 것으로 발견되었으나(M. Hollstein 등, Science (1991), 233, 49-53), 야생형 p53을 가진 환자들은 종종 p53 및 MDM2의 단백질-단백질 상호작용을 통한 MDM2에 의한 p53 하향 조절이 발견되었다(P. Chene. Nat. Rev. Cancer (2003), 3, 102-109). 종양 형성 스트레스 신호가 없는 정상적인 세포 조건 하에서, MDM2는 p53을 저 농도로 유지한다. DNA 손상 또는 세포 스트레스에 반응하여, p53 레벨은 증가하고 이는 또한 p53/MDM2 자동 조절 시스템으로부터의 피드백 루프로 인한 MDM2의 증가를 야기한다. 즉, p53은 전사 레벨에서 MDM2를 조절하고, MDM2는 그의 활성 레벨에서 p53을 조절한다(A. J. Levine 등, Genes Dev. (1993) 7, 1126-1132).
여러 메커니즘은 MDM2에 의한 p53 하향 조절을 설명할 수 있다. 먼저, MDM2는 p53의 N-말단 도메인에 결합하고 p53-반응성 유전자의 발현을 차단한다(J. Momand 등, Cell (1992), 69, 1237-1245). 둘째, MDM2는 p53을 핵으로부터 세포질로 이동시켜 단백질 가수 분해를 촉진한다(J. Roth 등, EMBO J. (1998), 17, 554-564). 마지막으로, MDM2는 유비퀴틴 의존성 26s 프로테아좀 시스템(UPS)을 통한 분해를 위해 유비퀴틴을 p53에 접합시키는 고유의 E3 리가아제 활성을 보유한다(Y. Haupt 등, Nature (1997) 387, 296-299). 이와 같이, MDM2는 E3 리가아제로서 기능하기 때문에, MDM2를 질환 유발 단백질에 동원하고 그의 유비퀴틴화 및 분해를 수행하는 것은 약물 발견에 대한 주목받는 접근이다.
흥미로운 치료 잠재력을 갖는 하나의 E3 리가아제는 E3 리가아제 복합체 VCB의 기질 인식 서브유닛인 폰 히펠 린다우(VHL, von Hippel-Lindau) 종양 억제제이며, 이는 또한 엘론긴(eleongin) B 및 C, Cul2 및 Rbx1으로 구성된다. VHL의 주요 기질은 저산소증 유도성 인자 1α(HIF-1α)로서, 저산소 수준에 반응하여 전구 혈관 형성 성장 인자(VEGF) 및 적혈구 유도 사이토카인 에리스로포이에틴(cytokine erythropoietin)과 같은 유전자를 상향 조절하는 전사 인자이다. E3 리가아제의 기질 인식 서브유닛에 대한 폰 히펠 린다우(VHL)의 제1 소분자 리간드가 생성되었고, 그 화합물이 VHL의 주요 기질인 전사 인자 HIF-1α의 결합 모드를 모방한다는 것을 확인하는 결정 구조를 얻었다.
세레블론은 인체 내에서 CRBN 유전자에 의해 암호화되는 단백질이다. CRBN 오르소로그는 주로 식물로부터 인체 내로 보존되며, 이는 CRBN 오르소로그의 생리학적 중요성을 강조한다. 세레블론은 손상된 DNA 결합 단백질 1(DDB1), 쿨린(cullin)-4A(CUL4A), 및 쿨린 1의 조절체(ROC1)와 함께 E3 유비퀴틴 리가아제 복합체를 형성한다. 이 복합체는 다수의 다른 단백질을 유비퀴틴화한다. 완전히 규명되지 않은 기구를 통해, 표적 단백질의 세레블론 유비퀴틴화는 섬유아세포 성장 인자 8(FGF8) 및 섬유아세포 성장 인자 10(FGF10)의 레벨을 증가시킨다. FGF8은 결국 사지 및 청각적 소포 형성과 같은 다수의 발달 과정을 조절한다. 최종적인 결과는 이 유비퀴틴 리가아제 복합체가 배아에서의 사지 성장에 중요하다는 것이다. 세레블론의 부재 시, DDB1은 DNA 손상 결합 단백질로서 기능하는 DDB2와 복합체를 형성한다.
세포 사멸(Apotosis) 단백질 억제제(IAP)는 세포 사멸, 즉 세포의 사망을 억제하는 데 관여하는 단백질 족이다. 인간 IAP 족은 8개의 구성원을 포함하고, 다수의 다른 생물체는 IAP 동족체를 포함한다. IAP는 기질을 인식하고 그들의 유비퀴틴화를 촉진하는 E3 리가아제 특이적 도메인 및 바큘로바이러스(Baculoviral) IAP 반복(BIR) 도메인을 함유한다. IAP는 유비퀴틴화를 촉진하고 카스파제에 직접 결합하고 이를 억제할 수 있다. 카스파제는 세포 사멸을 구현하는 프로테아제(예를 들어, 카스파제-3, 카스파제-7 및 카스파제-9)이다. 이와 같이, 카스파제의 결합을 통해, IAP는 세포 사멸을 억제한다. 그러나, 프로-세포 사멸 자극은 미토콘드리아 단백질 DIABLO(카스파제의 제2 미토콘드리아 유래 활성제 또는 SMAC로도 알려짐) 및 HTRA2(Omi로도 알려짐)의 방출을 야기할 수 있다. DIABLO와 HTRA2의 결합은 IAP 활성을 차단하는 것으로 보인다.
SMAC는 XIAP, c-IAP1, c-IAP2, NIL-IAP, 브루스(Bruce) 및 서바이빈(survivin)을 포함하는 본질적으로 모든 공지된 IAP와 상호 작용한다. 성숙한 SMAC의 처음 4개의 아미노산(AVPI)은 IAP의 일부에 결합하며, 이는 IAP의 항-세포 사멸 효과를 차단하는 데 필수적인 것으로 여겨진다.
미국 특허 출원 공개 제2015-0291562호 및 제2014-0356322호(본원에 참조로서 통합됨)에 기술된 것과 같은, 이작용성 화합물들은, 분해를 위해 내인성 단백질을 E3 유비퀴틴 리가아제에 동원하는 기능을 한다. 특히, 간행물은 이어서 이작용성 화합물에 의해 분해 및/또는 그렇지 않으면 이작용성 화합물에 의해 억제되는, 다양한 폴리펩티드 및 다른 단백질의 표적화된 유비퀴틴화의 조절제로서 유용성을 발견하는, 이작용성 또는 단백질 분해 표적화 키메라(PROTAC) 화합물을 기술한다.
급속 진행성 섬유육종(RAF)의 과발현 또는 응집, 또는 RAF의 과활성화(구성적으로 활성 RAF)와 관련된 질환에 대한 효과적인 치료를 위해 본 분야에서는 계속 진행해야 할 필요성이 존재한다. 예를 들어, 현재의 BRaf 억제제(예컨대, 베무라페닙 및 다브라페닙)는 V600 돌연변이 BRaf를 표적화할 수 있다. 따라서, 현재 시판 중인 제제에 민감하지 않은 상이한 BRaf 돌연변이를 갖는 질환 또는 장애(예: 흑색종, 폐암, 췌장암, 및/또는 대장암)를 위한 필요성이 존재한다. 또한, 내성 돌연변이는 BRaf/MEK 억제제 요법에 반응하여 나타날 수 있다. 예를 들어, p61 스플라이스 변이체는 BRaf/MEK 억제제로 치료된 흑색종 환자에서 나타날 수 있으며, 이는 환자를 임상적인 선택이 없는 상태로 남기게 된다. 현재 시판되고 있는 제제는 또한 야생형 BRaf에 결합하여 야생형 BRaf의 역설적 활성화를 일으키며, 이는 임상적 합병증을 야기한다. 또한, CRaf와 이종이량체화를 통해 신호를 보내는 저활성형 분류 III BRaf 돌연변이체의 군은 비소 세포 폐암(NSCLC)의 Braf 돌연변이의 40%를 차지하고, 다른 암을 통해 산발적으로 나타나며, 현재 승인되거나 임상 단계인 BRaf 억제제로 표적화될 수 없다. 분류 I BRAF 돌연변이체(V600E, V600K, V600D)는 높은 키나아제 활성을 가지며, Ras 및 이량체화 독립적이며, 베무라게닙에 민감하다. 분류 II BRAF 돌연변이체는 고 내지 중간 키나아제 활성을 가지며, Ras-독립적이고 이량체화 의존적이며, 베무라페닙에 민감하지 않다. 분류 III BRAF 돌연변이는 키나아제 활성이 많거나 전혀 없으며, Ras 및 이량체화 의존적이며, 베무라페닙에 민감하지 않다.
따라서, 비-특이적 효과 및 RAF를 표적화하고 조절하지 못하는 것은 효과적인 치료제의 개발에 장애물로 남아있다. 이와 같이, RAF를 효과적으로 표적화하고(예를 들어, 야생형 BRaf는 남겨 두고 BRaf의 돌연변이 형태를 효과적으로 억제하고/하거나 분해하는 것), VHL, 세레블론, MDM2 및 IAP의 기질 특이성을 효능화하거나 강화하는 소분자 치료제는 매우 유용할 것이다.
본 발명은 분해를 위해 E3 유비퀴틴 리가아제에 내인성 단백질을 동원시키는 이작용성 화합물, 및 이를 사용하는 방법을 기술한다. 특히, 본 발명은, 이어서 이작용성 화합물에 의해 분해 및/또는 그렇지 않으면 이작용성 화합물에 의해 억제되는, 다양한 폴리펩티드 및 다른 단백질의 표적화된 유비퀴틴화의 조절제로서 유용성을 발견하는, 이작용성 또는 단백질 분해 표적화 키메라(PROTAC) 화합물을 제공한다. 본원에서 제공되는 화합물의 이점은, 사실상 모든 단백질 부류 또는 족으로부터 표적화된 폴리펩티드의 분해/억제에 부합하는 광범위한 약리학적 활성이 가능하다는 것이다. 또한, 본 발명은 암(예를 들어, 신장 세포 암종, 췌장암, 결장직장암, 폐암, 난소암, 갑상선 암, 골판 아스트로세포마, 전립선암, 위암, 간세포암종, 전립선암, 위암, 간세포암종, 및 흑색종), 심장 대피피부 증후군, 신경 섬유종증 제1형, 코스텔로 증후군, 누난 증후군, LEOPARD(흑자(Lentigo), 심전도 이상(Electrocardiographic abnormalities), 안구 고혈압증(Ocular hypertelorism), 폐 협착증(Pulmonary stenosis), 비정상적 성기(Abnormal genitalia), 지연 성장(Retarded growth), 청각 장애(Deafness)) 증후군과 같은 질병 상태의 치료 또는 완화를 위해 본원에 기술된 바와 같은 유효량의 화합물을 사용하는 방법들을 제공한다.
이와 같이, 일 양태에서, 본 발명은 표적 단백질/폴리펩티드가 유비퀴틴 리가아제에 근접하여 위치되어 그 단백질의 분해(및 억제)에 영향을 미치도록, E3 유비퀴틴 리가아제 결합 모이어티(즉, E3 유비퀴틴 리가아제에 대한 리간드 또는 "ULM" 기), 및 표적 단백질에 결합하는 모이어티(즉, 단백질/폴리펩티드 표적화 리간드 또는 "PTM" 기)를 포함하는, 이작용성 화합물 또는 PROTAC 화합물을 제공한다. 바람직한 구현예에서, ULM(유비퀴틴화 리가아제 조절제)은 폰 히펠 린다우(Von Hippel-Lindau) E3 유비퀴틴 리가아제(VHL) 결합 모이어티(VHL), 또는 세레블론 E3 유비퀴틴 리가아제 결합 모이어티(CLM), 또는 마우스 이중 분 2 동족체(MDM2) E3 유비퀴틴 리가아제 결합 모이어티(MLM), 또는 IAP E3 유비퀴틴 리가아제 결합 모이어티(즉, "ILM")일 수 있다. 예를 들어, 이작용성 화합물의 구조는 다음과 같이 표현될 수 있다:
PTM 및 ULM 모이어티(예를 들어, VLM, CLM, MLM 또는 ILM)의 각각의 위치 뿐만 아니라 본원에서 도시된 그의 수는 단지 예로서 제공되며, 어떠한 형태로든 화합물을 한정지으려 하는 것은 아니다. 당업자에 의해 이해될 수 있는 바와 같이, 본원에 기술된 바와 같은 이작용성 화합물은 각각의 기능적 모이어티의 수 및 위치가 목적하는 대로 변경될 수 있도록 합성될 수 있다.
특정 구현예에서, 이작용성 화합물은 추가로 화학적 연결기("L")를 포함한다. 본 예에서, 이작용성 화합물의 구조는 다음과 같이 표현될 수 있다:
여기서 PTM은 단백질/폴리펩티드 표적화 모이어티고, L은 연결기(예를 들어, PTM에 ULM을 연결하는 결합 또는 화학적 기)이고, ULM은 IAP E3 유비퀴틴 리가아제 결합 모이어티, 또는 폰 히펠 린다우 E3 유비퀴틴 리가아제(VHL) 결합 모이어티(VLM), 또는 세레블론 E3 유비퀴틴 리가아제 결합 모이어티(CLM), 마우스 이중 분 2 동족체(MDM2) E3 유비퀴틴 리가아제 결합 모이어티(MLM)이다.
예를 들어, 이작용성 화합물의 구조는 다음과 같이 표현될 수 있다:
여기서 PTM은 단백질/폴리펩티드 표적화 모이어티이고; "L"은 PTM 및 VLM, CLM, MLM, ILM, 또는 이들의 조합 중 적어도 하나를 연결하는 연결기(예를 들어, 결합 또는 화학적 연결기)이고; VLM은 VHL E3 리가아제에 결합하는 폰 히펠 린다우 E3 유비퀴틴 리가아제이고; CLM은 세레블론에 결합하는 세레블론 E3 유비퀴틴 리가아제 결합 모이어티이고; MLM은 MDM2 E3 유비퀴틴 리가아제 결합 모이어티이고; ILM은 IAP에 결합하는 IAP 결합 모이어티이다.
소정의 바람직한 구현예에서, ILM은 AVPI 테트라펩티드 단편이다. 이와 같이, 추가의 특정 구현예에서, 이작용성 화합물의 ILM은 아미노산 알라닌(A), 발린(V), 프롤린(P), 및 이소류신(I) 또는 이들의 비자연적인 모방체를 각각 포함한다. 추가적인 구현예에서, AVPI 테트라펩티드 단편의 아미노산은 아미드 결합(즉, -C(O)NH- 또는 -NHC(O)-)를 통해 서로 연결된다.
특정 구현예에서, 본원에 기술된 화합물은 다수의 독립적으로 선택되는 ULM, 다수의 PTM, 다수의 화학적 연결기 또는 이들의 조합을 포함한다.
소정의 구현예에서, ILM은 본원에 기재된 것과 같은 화학적 모이어티를 포함한다.
추가의 구현예에서, VLM은 하이드록시프롤린 또는 이의 유도체일 수 있다. 또한, 다른 고려된 VLM은 미국 특허출원 공개 제2014/03022523호에 포함되며, 전술한 바와 같이, 그 전체가 본원에 통합된다.
일 구현예에서, CLM은 이미드, 티오이미드, 아미드, 또는 티오아미드로부터 유래된 화학적 기를 포함한다. 특정 구현예에서, 화학적 기는 프탈이미도기, 또는 그의 유사체 또는 유도체이다. 소정의 구현예에서, CLM은 탈리도미드, 레날리도미드, 포말리도미드, 이의 유사체, 이의 동배체, 또는 이의 유도체이다. 다른 고려된 CLM은 그 전체가 본원에 통합되는 미국 특허출원 공개 제2015/0291562호에 기술되어 있다.
소정의 구현예에서, MLM은 누트린 또는 이의 유도체일 수 있다. 또한, 다른 고려된 MLM은 2016년 7월 11일자로 출원된 미국 특허출원 제15/206,497호에 포함되며, 전술한 바와 같이, 그 전체가 본원에 통합된다. 소정의 추가적인 구현예에서, 이작용성 화합물의 MLM은 치환된 이미다졸린, 치환된 스피로-인돌리논, 치환된 피롤리딘, 치환된 피페리디논, 치환된 모르폴리논, 치환된 피롤로피리미딘, 치환된 이미다졸로피리딘, 치환된 티아졸로이미다졸린, 치환된 피롤로피롤리디논, 및 치환된 이소퀴놀리논과 같은 화학적 모이어티를 포함한다.
추가적인 구현예에서, MLM은 시스- 또는 트랜스-구성으로서 위치된 인접한 비스-아릴 치환기와 함께 전술한 코어 구조를 포함한다.
소정의 구현예에서, "L"은 결합이다. 추가적인 구현예에서, 연결기 "L"은 1 내지 20 개 범위의 선형 비-수소 원자 수를 갖는 연결기이다. 연결기 "L"은 에테르, 아미드, 알칸, 알켄, 알킨, 케톤, 하이드록실, 카르복실산, 티오에테르, 설폭시드 및 설폰과 같은 작용 기를 포함할 수 있지만, 이에 제한되지는 않는다. 연결기는 방향족, 헤테로방향족, 고리형, 이중고리형 및 삼중고리형 모이어티를 함유할 수 있다. Cl, F, Br 및 I와 같은 할로겐에 의한 치환이 연결기에 포함될 수 있다. 불소 치환의 경우, 단일 또는 다수의 불소가 포함될 수 있다.
특정 구현예에서, VLM은 트랜스-3-하이드록시프롤린의 유도체이며, 여기서 트랜스-3-하이드록시프롤린의 질소 및 카르복실산 둘 다가 아미드로서 관능화된다.
특정 구현예에서, CLM은 피페리딘-2,6-디온의 유도체(피페리딘-2,6-디온은 3-위치에서 치환될 수 있고, 3-치환은 C-N 결합 또는 C-C 결합으로서의 연결을 가진 이중고리 헤테로-방향족일 수 있음)이다. CLM의 예는, 이에 한정되지는 않지만, 포말리도미드, 레날리도미드 및 탈리도미드 및 이들의 유도체일 수 있다.
추가적인 양태에서, 본 명세서는 본원에 기술된 바와 같은 유효량의 화합물 또는 이의 염 형태, 및 약제학적으로 허용가능한 담체를 포함하는 치료 조성물을 제공한다. 치료 조성물은 환자 또는 대상물, 예를 들어 인간과 같은 동물의 단백질 분해를 조절하고, 분해된 단백질을 통해 조절되는 질환 상태 또는 병태를 치료 또는 완화시키기 위해 사용될 수 있다. 특정 구현예에서, 본원에 기술된 치료 조성물은 질환, 예를 들어, 암의 치료 또는 완화를 위한 목적 단백질의 분해를 유도하는 데 사용될 수 있다. 또 다른 양태에서, 본 발명은 세포 내 표적 단백질을 유비퀴틴화/분해하는 방법을 제공한다. 특정 구현예에서, 방법은, 바람직하게는 연결기 모이어티를 통해 연결된, ILM 및 PTM, PTM 및 VLM, 또는 PTM 및 CLM, 또는 PTM 및 MLM을 포함하는 본원에 기술된 바와 같은 이작용성 화합물을 투여하는 단계를 포함하며, VLM/ILM/CLM/MLM은 연결기를 통해 PTM에 결합되어 분해를 위해 PTM에 결합하는 단백질을 표적화한다. 유사하게, PTM은 연결기를 통해 VLM 또는 CLM 또는 MLM 또는 ILM에 결합되어 분해를 위해 단백질 또는 폴리펩티드를 표적화할 수 있다. 표적 단백질의 분해는 표적 단백질이 E3 유비퀴틴 리가아제에 근접하여 위치될 때 발생할 것이고, 이에 따라 표적 단백질의 영향의 분해/억제 및 단백질 레벨의 조절이 야기된다. 본 발명에 의해 제공되는 단백질 레벨의 조절은 질환 상태 또는 병태의 치료를 제공하며, 이는 환자의 세포 내에서의 해당 단백질의 레벨을 낮춤으로써 표적 단백질을 통해 조절된다.
또 다른 측면에서, 본 발명은, 본원에서 기술된 바와 같은 유효량(예를 들어, 약제학적으로 허용가능한 양)의 화합물 또는 그로부터의 염, 및 약제학적으로 허용가능한 담체를 포함하는 조성물을 이를 필요로 하는 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 대상체 또는 환자(예를 들어 인간과 같은 동물)의 질환, 장애 또는 증상을 치료하거나 완화하기 위한 방법을 제공하되, 조성물은 대상체의 질환 또는 장애 또는 증상을 치료하거나 완화시키는 데 효과적이다.
다른 양태에서, 본 명세서는 본 발명에 따른 화합물을 사용하는 생물학적 시스템에서 관심 단백질의 분해의 효과를 식별하는 방법을 제공한다.
전술한 대체적인 유용성 영역은 단지 예시로서 주어지며, 본 발명 및 첨부된 청구 범위를 제한하는 것은 아니다. 본 발명의 조성물, 방법 및 공정과 관련된 추가적인 목적 및 이점은 본원의 청구 범위, 상세한 설명 및 실시예에 비추어 당업자에 의해 이해될 것이다. 예를 들어, 본 발명의 다양한 양태 및 구현예는 다수의 조합으로 이용될 수 있으며, 이들 모두는 본 명세서에서 명백히 고려된다. 이러한 추가적인 양태 및 구현예는 본 발명의 범위 내에 명백히 포함된다. 본 발명의 배경을 밝히기 위해, 그리고 특별한 경우, 사례를 나타내는 추가적인 세부 사항을 제공하기 위해 본원에서 사용된 간행물 및 다른 자료들은 참조로서 통합된다.
본 명세서에 포함되고 본 명세서의 일부를 형성하는 첨부 도면은 본 발명의 여러 구현예를 도시하고, 설명과 함께 본 발명의 원리를 설명하는 역할을 한다. 도면은 본 발명의 구현예를 도시하기 위한 목적으로만 사용되며, 본 발명을 제한하는 것으로 해석되어서는 안 된다. 본 발명의 추가적인 목적, 특징 및 이점은 본 발명의 예시적인 구현예를 도시하는 첨부 도면과 관련하여 취해진 다음의 상세한 설명으로부터 명백해질 것이다.
도 1a 및 도 1b. 본 개시내용의 이작용성 화합물에 대한 일반 원리의 도면. (a) 예시적인 이작용성 화합물은 단백질 표적 모이어티(PTM; 어두운 음영 직사각형), 유비퀴틴 리가아제 결합 모이어티(ULM; 밝은 음영 삼각형), 및 선택적으로 PTM을 ULM에 결합 또는 연결시키는 연결기 모이어티(L; 검정색 선)을 포함한다. (b) 본원에 기술된 바와 같은 이작용성 화합물의 기능적 활용을 도시한다. 간략하게, ULM은 특이적 E3 유비퀴틴 리가아제를 인식하고 이에 결합하며, PTM은 표적 단백질을 결합하고 동원하여 이를 E3 유비퀴틴 리가아제에 근접하게 한다. 전형적으로, E3 유비퀴틴 리가아제는 E2 유비퀴틴-접합 단백질과 착화되고, 단독으로 또는 E2 단백질을 통해 유비퀴틴(어두운 원)을 표적 단백질 상의 리신에 이소펩티드 결합을 통해 부착하는 것을 촉매한다. 그런 다음, 폴리-유비퀴틴화된 단백질(맨 오른쪽)이 세포의 프로테오좀 기구에 의한 분해를 위해 표적화된다.
도 2a. 표 1A. 본 발명의 예시적인 단백질 표적화 모이어티 및 화합물.
도 2b. 표 1B. 본 발명의 예시적인 단백질 표적화 모이어티 및 화합물.
도 2c. 표 1C. 본 발명의 예시적인 단백질 표적화 모이어티 및 화합물.
도 2d. 표 1D. 본 발명의 예시적인 단백질 표적화 모이어티 및 화합물.
도 3a. 표 2A. 본 발명의 예시적인 단백질 표적화 모이어티 및 화합물의 데이터.
도 3b. 표 2B. 본 발명의 예시적인 단백질 표적화 모이어티 및 화합물의 데이터.
도 3c. 표 2C. 본 발명의 예시적인 단백질 표적화 모이어티 및 화합물의 데이터.
도 3d. 표 2D. 본 발명의 예시적인 단백질 표적화 모이어티 및 화합물의 데이터.
도 4. 본 발명의 이작용성 화합물의 일반 원리의 도면.
도 5. 본 발명의 예시적인 이작용성 화합물은 BRAF의 돌연변이 선택성 분해를 유도한다.
도 6a, 도 6b 및 도 6c. 본 발명의 예시적인 이작용성 화합물은 야생형 BRAF를 보존하면서, 돌연변이 BRAF 분해를 유도하고, 세포 증식을 억제하고, MAPK 신호 전달을 억제한다.
도 7. 본 발명의 예시적인 이작용성 화합물은 베무라페닙 내성 돌연변이 p61의 분해를 유도한다.
도 8a 및 도 8b. 본 발명의 예시적인 이작용성 화합물은 생체 내에서 돌연변이 BRAF의 분해를 유도하고 (a) 종양 부피를 감소시킨다 (b).
도 9a 및 도 9b. 예시적인 이작용성 화합물의 선택성의 기초가 되는 메커니즘.
도 10. 야생형 BRAF는 쿨린 2(활성 E3 리가아제)를 동원할 수 없다.
이하는 당업자가 본 발명을 실시함에 있어서 도움을 주기 위해 제공되는 상세한 설명이다. 당업자는 본 발명의 사상 또는 범위를 벗어나지 않으면서 본원에서 설명된 구현예에 변형과 변경을 가할 수 있다. 본원에서 언급된 모든 간행물, 특허 출원, 특허, 도면 및 다른 참조는 그 전체가 참조로써 통합된다.
본원에서는, 일단 E3 유비퀴틴 리가아제 단백질(예를 들어, 세포 사멸 단백질 억제제(IAP), 폰 히펠 린다우 E3 유비퀴틴 리가아제(VHL), 세레블론 E3 유비퀴틴 리가아제, 또는 마우스 이중 분 2 동족체(MDM2) E3 유비퀴틴 리가아제) 및 표적 단백질이 E3 유비퀴틴 리가아제 단백질 및 표적 단백질을 결합시키는 이작용성 또는 키메라 구조체에 의해 인접하여 위치하게 되면 표적 단백질을 유비퀴틴화한다는 놀랍고도 예기치 못한 발견과 관련된 조성물과 방법이 기술된다. 이와 같이, 본 발명은 단백질 표적 결합 모이어티("PTM")에 결합된 E3 유비퀴틴 리가아제 결합 모이어티("ULM")를 포함하는 이러한 화합물 및 조성물을 제공하며, 이는 프로테아좀에 의한 표적 단백질의 분해(및/또는 억제)로 이어지는 선택된 표적 단백질의 유비퀴틴화를 야기한다(도 1 참조). 본 발명은 또한 조성물 라이브러리 및 이의 사용법을 제공한다.
특정 양태에서, 본 발명은 리간드, 예를 들어, IAP, VHL, MDM2 또는 세레블론과 같은 유비퀴틴 리가아제에 결합할 수 있는 소분자 리간드(예를 들어, 2,000, 1,000, 500 또는 200달톤 이하의 분자량)를 포함하는 화합물을 제공한다. 화합물은 또한, 표적 단백질의 분해(및/또는 억제)를 위해 표적 단백질이 유비퀴틴 리가아제에 근접되어 위치되도록 하는 방식으로, 표적 단백질에 결합할 수 있는 모이어티를 포함한다. 소분자는 전술한 것 외에, 펩티드가 아닌, 즉 일반적으로 펩티드로 간주되지 않는, 예를 들어, 4, 3, 또는 2개 미만의 아미노산을 포함하는 분자일 수도 있다. 본 발명에 따르면, PTM, ULM 또는 PROTAC 분자는 소분자일 수 있다.
달리 정의되지 않는 한, 본원에 사용된 모든 기술적 및 과학적 용어는 본 발명에 속하는 당업자에 의해 널리 이해되는 것과 동일한 의미를 가진다. 본 명세서에 사용된 용어는 특정 구현예를 설명하기 위한 것이고, 본 발명을 제한하려는 것이 아니다.
값의 범위가 제공되는 경우, 문맥상 명백하게 달리 기술되지 않는 한(예를 들어, 다수의 탄소 원자를 함유하는 경우, 그러한 범위 내에 속하는 각각의 탄소 원자의 수가 제공됨), 그 범위의 상한치와 하한치 사이에 하한치의 단위의 10분의 1까지 각각의 그 사이의 값, 그리고 명시된 범위에서 임의의 다른 명시되거나 그 사이에 있는 값은 본 발명 내에 포함되는 것으로 이해된다. 이러한 더 작은 범위의 상한치 및 하한치는 독립적으로 더 작은 범위 내에 포함될 수 있고, 또한 명시된 범위 내의 임의의 구체적으로 배제된 제한치에 종속되어 본 발명의 범위 내에 포함된다. 명시된 범위가 제한치 중 하나 또는 둘 모두를 포함하는 경우, 포함된 제한치 중 어느 하나 또는 둘 모두를 배제하는 범위 또한 본 발명에 포함된다.
다음의 용어는 본 발명을 설명하기 위해 사용된다. 용어가 본원에서 구체적으로 정의되지 않는 경우, 해당 용어는 본 발명을 설명함에 있어서 그 용어의 용도와 관련하여 적용되며, 그 용어는 당업자에 의해 당 업계에 공지된 의미로 주어진다.
본원 및 첨부된 청구 범위에서 사용되는, "일" 및 "하나"라는 단수형은 문맥상 달리 명시하지 않는 한, 그 단수형의 문법상 대상의 하나 또는 둘 이상(예를 들어, 적어도 하나)을 언급하는 데 사용된다. 예로서, "일 요소"는 하나의 요소 또는 둘 이상의 요소를 의미한다.
본 명세서 및 청구 범위에서 사용된 "및/또는"이라는 문구는, 결합되는 요소들의 "하나 또는 둘 다", 즉, 일부 경우에서는 결합하여 존재하고 다른 경우에서는 분리되어 존재하는 요소들을 의미하는 것으로 이해되어야 한다. "및/또는"과 함께 열거된 다수의 요소들은 동일한 방식, 즉, 결합되는 요소들의 "하나 또는 그 이상의"로 해석되어야 한다. 구체적으로 식별되는 요소들과 관련되든 관련되지 않든, "및/또는" 문구에 의해 구체적으로 식별되는 요소들 이외의 다른 요소들도 선택적으로 존재할 수 있다. 따라서, 비제한적인 예로서, "A 및/또는 B"에 대한 언급은, "포함하는"과 같은 개방형 언어와 함께 사용될 때, 일 구현예에서, 오직 A만(선택적으로, B 이외의 요소를 포함함); 또 다른 구현예에서, 오직 B만(선택적으로 A 이외의 요소를 포함함); 또 다른 구현예에서, A 및 B 둘 다(선택적으로 다른 요소를 포함함); 등을 지칭할 수 있다.
본 명세서 및 청구 범위에 있어서 본원에서 사용되는 바와 같이, "또는"은 위에서 정의한 바와 같은 "및/또는"과 동일한 의미를 갖는 것으로 이해되어야 한다. 예를 들어, 목록 내의 항목들을 분리할 경우, "또는" 또는 "및/또는"은 포괄적인 것, 즉, 적어도 하나를 포함하지만, 둘 이상의 개수 또는 요소의 항목, 그리고 선택적으로, 열거되지 않은 추가적인 항목들을 포함하는 것으로 해석되어야 한다. 반대로, "단지 하나" 또는 "정확히 하나"와 같이 명확하게 표시되거나, 또는 청구항에서 사용되는 경우에서만, "~(으)로 이루어지는(이루어진)"은, 하나의 숫자 또는 요소들의 항목 중 정확히 하나의 요소만를 포함하는 것을 의미한다. 대체적으로, 본원에서 사용된 용어 "또는"이 배타적인 다른 용어(예를 들어, "~ 중 어느 하나의", "~ 중 하나의", "단지 하나의" 또는 "정확히 하나의")에 선행하는 경우, 배타적 대안(즉, "하나 또는 다른 하나, 그러나 둘 모두는 아닌")을 나타내는 것으로서 해석되어야 한다.
전술한 명세서뿐만 아니라, 청구항에서, "~을(를) 포함하는", "~을(를) 가지는", "~을(를) 수반하는", "~을(를) 갖는", "~을(를) 함유하는", "~을(를) 포괄하는", "~을(를) 보유하는", "~(으)로 이루어지는" 등과 같은 모든 접속 문구는 개방된 것, 즉, 이에 한정되지 않는 것을 의미하는 것으로 이해되어야 한다. "~(으)로 구성된" 및 "~(으)로 본질적으로 구성된"이라는 접속 문구만이, 미국 특허국 매뉴얼의 특허 심사 절차, 섹션 제2111.03항에 명시된 바와 같이, 각각 폐쇄형 또는 반폐쇄형 접속 문구이다.
본 명세서 및 청구 범위에 있어서 본원에서 사용되는 바와 같이, 하나 이상의 요소의 항목에 관하여 "적어도 하나의"라는 문구는, 요소들의 항목 내의 임의의 요소 또는 그 이상의 요소들로부터 선택되는 적어도 하나의 요소를 의미하는 것으로 이해되어야 하지만, 요소들의 항목 내에서 구체적으로 나열된 적어도 하나의 각 요소 및 모든 요소를 반드시 포함할 필요는 없으며, 요소들의 항목 내에서의 요소들의 임의의 조합을 배제하는 것은 아니라는 것이 이해되어야 한다. 이러한 정의는, 구체적으로 식별된 요소들이 관련되든 관련되지 않든, "적어도 하나"라는 문구가 언급된 요소들의 목록 내에서 구체적으로 식별되는 요소 이외의 요소가 또한 선택적으로 존재할 수 있게 한다. 따라서, 비제한적인 예로서, "A 및 B 중 적어도 하나" (또는 균등하게, "A 또는 B 중 적어도 하나", 또는 균등하게 "A 및/또는 B 중 적어도 하나")는, 일 구현예에서, B가 존재하지 않는 (및 선택적으로 B 이외의 요소를 포함하는) 적어도 하나의 A(선택적으로 하나보다 많은 A를 포함함); 또 다른 구현예에서, A가 존재하지 않는 (및 선택적으로 A 이외의 요소를 포함하는) 적어도 하나의 B(선택적으로 하나보다 많은 B를 포함함); 또 다른 구현예에서, 적어도 하나의 A(선택적으로 하나보다 많은 A를 포함함), 및 적어도 하나의 B(선택적으로 하나보다 많은 B를 포함함); 등을 지칭할 수 있다.
또한, 둘 이상의 단계 또는 행위를 포함하는 본원에서 설명된 특정 방법에서, 단계 또는 행위의 순서는, 문맥에서 달리 명시되지 않는 한, 방법의 단계 또는 행위가 언급되는 순서로 반드시 한정되지는 않는다는 점을 이해해야 한다.
치료제가 환자 체내에 어느 정도, 바람직하게는 효과적인 양으로 동시에 존재하는 한, 용어 "병용 투여" 및 "병용 투여하는 단계" 또는 "병용 요법"은 동시 투여(동시에 2개 이상의 치료제의 투여) 및 시간차를 둔 투여(추가 치료제 또는 제제의 투여와 상이한 시간에 한 번에 하나 이상의 치료제의 투여) 모두를 지칭한다. 특정 바람직한 양태에서, 본원에서 기술된 하나 이상의 본 발명의 화합물은 특히 항암제를 포함하여 적어도 하나의 추가적인 생리활성제와 조합되어 병용 투여된다. 특정 바람직한 양태에서, 화합물의 병용 투여는 항암 요법을 포함하는 상승 활성 및/또는 치료로 결부된다.
본원에서 사용되는 용어 "화합물"은 달리 명시되지 않는 한, 본원에 개시된 임의의 특이적 화학적 화합물을 지칭하며, 이의 호변이성질체, 위치이성질체, 기하이성질체, 및 적용 가능한 경우, 광학 이성질체(거울상 이성질체) 및 다른 입체이성질체(부분입체이성질체)를 포함하는 입체이성질체 뿐만 아니라, 문맥에서 적용 가능한 경우, 전구약물 및/또는 이의 중수소화된 형태를 포함하는 약제학적으로 허용가능한 염 및 유도체를 포함한다. 고려되는 중수소화된 소분자는 약물 분자에 함유된 하나 이상의 수소 원자가 중수소로 대체된 것들이다.
문맥에서의 사용에 있어서, 용어 "화합물"은 일반적으로 단일 화합물을 지칭하지만, 개시된 화합물의 다른 화합물, 예를 들어, 입체이성질체, 위치이성질체 및/또는 광학 이성질체(라세미 혼합물 포함)뿐만 아니라, 특정한 거울상 이성질체 또는 거울상 이성질성으로 농축된 혼합물을 또한 포함할 수 있다. 문맥에서, 전술한 용어는 또한 활성 부위로의 화합물의 투여 및 전달을 용이하게 하도록 변형된 화합물의 전구약물 형태를 지칭한다. 본 화합물을 설명함에 있어서, 본 화합물에 연관된 다수의 치환기 및 변수들이 다른 것들 중에서 기술됨을 유의한다. 본원에 기술된 분자는 대체적으로 본 명세서에서 후술되는 바와 같은 안정적인 화합물인 것으로 당업자에 의해 이해된다. 결합부가 도시될 경우, 이중 결합 및 단일 결합 둘 모두는 도시된 화합물의 문맥 및 원자가 상호 작용의 규칙 내에서 표현되거나 이해된다.
용어 "유비퀴틴 리가아제"는 분해를 위해 기질 단백질을 표적화하여, 특이적 기재 단백질로의 유비퀴틴의 전달을 촉진시키는 단백질 군을 지칭한다. 예를 들어, IAP는 E3 유비퀴틴 리가아제 단백질로서, 그 단독으로 또는 E2 유비퀴틴 접합 효소와 조합하여 유비퀴틴이 표적 단백질 상의 리신에 부착되도록 하고, 이어서 프로테아좀에 의한 분해를 위해 특이적 단백질 기재를 표적화한다. 따라서, E3 유비퀴틴 리가아제는 단독으로 또는 E2 유비퀴틴 접합 효소와 조합하여 유비퀴틴을 표적화된 단백질에 전달하는 역할을 한다. 대체적으로, 유비퀴틴 리가아제는, 제2 유비퀴틴이 제1 유비퀴틴에 부착되고; 제3 유비퀴틴이 제2 유비퀴틴에 부착되도록 하는, 폴리유비퀴틴화(polyubiquitination)에 관여한다. 폴리유비퀴틴화는 프로테아좀에 의해 분해하기 위한 단백질을 표시한다. 그러나, 유비퀴틴 리가아제에 의해 하나의 유비퀴틴만이 기질 분자에 첨가되는, 모노유비퀴틴화(mono-ubiquitination)에 한정되는 일부 유비퀴틴화의 경우가 존재한다. 모노유비퀴틴화된 단백질은 분해를 위한 프로테아좀에 대해 표적화되지 않지만, 그 대신, 예를 들어 유비퀴틴에 결합할 수 있는 도메인을 가진 다른 단백질에 결합함으로써 그의 세포 위치 또는 기능을 변경할 수 있다. 더 복잡한 문제는, 유비퀴틴 상의 상이한 리신이 E3에 의해 표적화되어 사슬을 만들 수 있다는 것이다. 가장 흔한 리신은 유비퀴틴 사슬 상의 Lys48이다. 이는 폴리유비퀴틴을 만드는 데 사용되는 리신이며, 프로테아좀에 의해 인식된다.
용어 "환자" 또는 "대상체"는 본 발명에 따른 조성물로, 예방적 처치를 포함한 치료가 제공되는 동물, 바람직하게는 인간 또는 가축을 기술하기 위해 명세서 전반에서 이용된다. 인간 환자와 같은 특정한 동물에 특이적인 감염증, 병태 또는 질환 상태의 치료의 경우, 용어 "환자"는 가축, 예를 들어, 개 또는 고양이 또는 경작용 동물, 예를 들어, 말, 소, 양 등을 포함하는 특정한 동물을 지칭한다. 대체적으로, 본 발명에서, 용어 "환자"는, 용어의 이용의 문맥으로부터 달리 기술하지 않거나 암시되지 않는 한 인간 환자를 지칭한다.
용어 "효과적인"은 의도된 용도의 문맥 내에서 이용될 경우, 의도된 결과를 달성하는 화합물, 조성물 또는 성분의 양을 설명하기 위해 이용된다. 용어 "효과적인"은 본 출원에서 달리 기술되거나 또는 이용되는 모든 다른 유효량 또는 효과적인 농도 용어들을 포함한다.
화합물 및 조성물
일 양태에서, 본 발명은 IAP E3 유비퀴틴 리가아제 결합 모이어티("ILM"), 세레블론 E3 유비퀴틴 리가아제 결합 모이어티("CLM"), 폰 히펠 린다우 E3 유비퀴틴 리가아제(VHL) 결합 모이어티(VLM), 및/또는 마우스 이중 분 2 동족체(MDM2) E3 유비퀴틴 리가아제 결합 모이어티(MLM)인 E3 유비퀴틴 리가아제 결합 모이어티("ULM")를 포함하는 화합물을 제공한다. 예시적인 구현예에서, ULM은 다음의 구조에 따른 화학적 연결기(L)를 통해 표적 단백질 결합 모이어티(PTM)에 결합되며:
(A) PTM-L-ULM
여기서, L은 결합 또는 화학적 연결기이고, ULM은 E3 유비퀴틴 리가아제 결합 모이어티이고, PTM은 표적 단백질 결합 모이어티이다. 본원에 도시된 화합물에서의 모이어티의 수 및/또는 상대 위치는 단지 예로서 제공된다. 당업자에 의해 이해될 수 있는 바와 같이, 본원에서 기술된 바와 같은 화합물은 각각의 기능성 모이어티의 임의의 바람직한 수 및/또는 상대 위치로 합성될 수 있다.
문맥에서 달리 표시하지 않는 한, 용어 ULM, ILM, VLM, MLM 및 CLM은 포괄적인 의미로 사용된다. 예를 들어, 용어 ULM은 IAP(즉, ILM), MDM2(즉, MLM), 세레블론(즉, CLM), 및 VHL(즉, VLM)에 결합하는 것들을 포함하는 모든 ULM을 포함한다. 또한, 용어 ILM은 모든 가능한 IAP E3 유비퀴틴 리가아제 결합 모이어티를 포함하며, 용어 MLM은 모든 가능한 MDM2 E3 유비퀴틴 리가아제 결합 모이어티를 포함하며, 용어 VLM은 모든 가능한 VHL 결합 모이어티를 포함하며, 용어 CLM은 모든 세레블론 결합 모이어티를 포함한다.
또 다른 양태에서, 본 발명은 표적 단백질의 분해를 유도함으로써 단백질 활성을 조절하는 데 유용한 이작용성 또는 다작용성 화합물(예를 들어, PROTAC)을 제공한다. 특정 구현예에서, 화합물은 표적 단백질에 결합하는 모이어티(즉, 단백질 표적화 모이어티 또는 "PTM")에 결합(예를 들어, 공유 결합, 직접 결합 또는 간접 결합)된 ILM 또는 VLM 또는 CLM 또는 MLM을 포함한다. 특정 구현예에서, ILM/VLM/CLM/MLM 및 PTM은 화학적 연결기(L)를 통해 연결되거나 결합된다. ILM은 IAP E3 유비퀴틴 리가아제에 결합하고, VLM은 VHL에 결합하고, CLM은 세레블론 E3 유비퀴틴 리가아제에 결합하고, MLM은 MDM2 E3 유비퀴틴 리가아제에 결합하고, PTM은 표적 단백질을 인식하고, 각 모이어티의 그의 표적과의 상호 작용은 표적 단백질을 유비퀴틴 리가아제 단백질에 근접하여 위치시킴으로써 표적 단백질의 분해를 용이하게 한다. 예시적인 이작용성 화합물은 다음과 같이 표현될 수 있다:
(B) PTM―ILM
(C) PTM―CLM
(D) PTM―VLM
(E) PTM―MLM
특정 구현예에서, 이작용성 화합물은 추가로 화학적 연결기("L")를 포함한다. 예를 들어, 이작용성 화합물은 다음과 같이 표현될 수 있으며:
(F) PTM―L―ILM
(G) PTM―L―CLM
(H) PTM―L―VLM
(I) PTM―L―MLM
여기서 PTM은 단백질/폴리펩티드 표적화 모이어티고, L은 화학적 연결기이고, ILM은 IAP E3 유비퀴틴 리가아제 결합 모이어티고, CLM은 세레블론 E3 유비퀴틴 리가아제 결합 모이어티고, VLM은 VHL 결합 모이어티고, MLM은 MDM2 E3 유비퀴틴 리가아제 결합 모이어티다.
특정 구현예에서, ULM(예를 들어, ILM, CLM, VLM, 또는 MLM)은 활성을 나타내거나, 약 200 μM 미만의 IC50으로 E3 유비퀴틴 리가아제(예를 들어, IAP E3 유비퀴틴 리가아제, 세레블론 E3 유비퀴틴 리가아제, VHL, 또는 MDM2 E3 유비퀴틴 리가아제)에 결합한다. IC50은 당 기술분야에 공지된 임의의 방법, 예를 들어 형광 편광 검정에 따라 결정될 수 있다.
추가적인 특정 구현예에서, 본원에 기술된 이작용성 화합물은 약 100, 50, 10, 1, 0.5, 0.1, 0.05, 0.01, 0.005, 0.001 mM 미만, 또는 약 100, 50, 10, 1, 0.5, 0.1, 0.05, 0.01, 0.005, 0.001 μM 미만, 또는 약 100, 50, 10, 1, 0.5, 0.1, 0.05, 0.01, 0.005, 0.001 nM 미만, 또는 약 100, 50, 10, 1, 0.5, 0.1, 0.05, 0.01, 0.005, 0.001 pM 미만의 IC50으로 활성을 나타낸다.
특정 구현예에서, 본원에 기술된 화합물은 다수의 PTM(동일하거나 상이한 단백질 표적을 표적화함), 다수의 ULM, 하나 이상의 ULM(즉, 다중/상이한 E3 유비퀴틴 리가아제, 예를 들어 VHL, IAP, 세레블론 및/또는 MDM2에 특이적으로 결합하는 모이어티) 또는 이들의 조합을 포함한다. 본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, PTM 및 ULM(예를 들어, ILM, VLM, CLM 및/또는 MLM)은 직접적으로 또는 하나 이상의 화학적 연결기 또는 이들의 조합을 통해 결합될 수 있다. 추가적인 구현예에서, 화합물이 다수의 ULM을 갖는 경우, ULM은 동일한 E3 유비퀴틴 리가아제에 대한 것일 수 있거나 각각의 ULM은 상이한 E3 유비퀴틴 리가제에 특이적으로 결합할 수 있다. 또 다른 구현예에서, 화합물이 다수의 PTM을 갖는 경우, PTM는 동일한 표적 단백질에 결합할 수 있거나 각각의 PTM은 상이한 표적 단백질에 특이적으로 결합할 수 있다.
특정 구현예에서, 화합물이 다수의 ULM을 포함하는 경우, ULM들은 동일하다. 추가적인 구현예에서, 화합물은 복수의 ULM(예를 들어, ULM, ULM' 등), 직접적으로 또는 화학적 연결기(L) 또는 둘 모두를 통해 ULM에 결합된 적어도 하나의 PTM을 포함한다. 추가적인 특정 구현예에서, 복수의 ULM을 포함하는 화합물은 다수의 PTM을 추가로 포함한다. 또 다른 구현예에서, PTM은 동일하거나 선택적으로 상이하다. 또 다른 구현예에서, PTM이 상이한 경우, 각각의 PTM은 동일한 단백질 표적에 결합하거나 상이한 단백질 표적에 특이적으로 결합할 수 있다.
특정 구현예에서, 화합물은 복수의 ULM 및/또는 복수의 ULM'을 포함할 수 있다. 다른 구현예에서, 적어도 2개의 상이한 ULM, 복수의 ULM, 및/또는 복수의 ULM'을 포함하는 화합물은 ULM 또는 ULM'에 직접적으로 또는 화학적 연결기 또는 둘 모두에 결합된 적어도 하나의 PTM을 추가로 포함한다. 본원에 기술된 임의의 구현예에서, 적어도 2개의 상이한 ILM을 포함하는 화합물은 다수의 PTM을 더 포함할 수 있다. 또 다른 구현예에서, PTM은 동일하거나 선택적으로 상이하다. 또 다른 구현예에서, PTM이 상이한 경우, 각각의 PTM은 동일한 단백질 표적에 결합하거나 상이한 단백질 표적에 특이적으로 결합할 수 있다. 또 다른 구현예에서, PTM 자체는 ILM, 예컨대 ILM, VLM, CLM, MLM, ILM', VLM', CLM' 및/또는 MLM'과 같은 ULM(또는 ULM')이다.
추가적인 구현예에서, 본 명세서는 본원에 기술된 바와 같은 화합물을 제공하며, 상기 화합물은 이의 약제학적으로 허용가능한 염 형태(예를 들어, 산성 및 염기성 염 형태)를 포함하는, 이의 거울상 이성질체, 부분 입체 이성질체, 용매화물 및 다형체를 포함한다.
본원에서 용어 "독립적으로"는 독립적으로 적용되고, 용도에 따라 독립적으로 변하는 변수를 나타내는 데 사용된다.
용어 "알킬"은 그의 문맥 내에서, 선형, 분지-사슬 또는 고리형 완전 포화 탄화수소 라디칼 또는 알킬기, 바람직하게는 C1-C10, 보다 바람직하게는 C1-C6, 대안적으로는 C1-C3 알킬기를 의미하며, 이는 선택적으로 치환될 수 있다. 알킬기의 예는, 다른 것들 중에서, 메틸, 에틸, n-부틸, 이차 부틸, n-헥실, n-헵틸, n-옥틸, n-노닐, n-데실, 이소프로필, 2-메틸-프로필, 시클로프로필, 시클로-프로필-메틸, 시클로부틸, 시클로펜틸, 시클로펜틸에틸, 시클로헥실에틸 및 시클로헥실이다. 특정 구현예에서, 알킬기는 할로겐 기(At, Br, Cl, F, 또는 I)로 말단-캡핑된다. 특정 바람직한 구현예에서, 본 발명에 따른 화합물은 디할로게나제 효소에 공유 결합하는 데 사용될 수 있다. 이들 화합물은 일반적으로 그 말단에 할로겐 치환기(종종 염소 또는 브롬)를 갖는 알킬기 내에서 종결되는 측쇄(종종 폴리에틸렌 글리콜기를 통해 연결됨)를 함유하며, 이는 이러한 모이어티를 함유하는 화합물의 단백질에 대한 공유 결합을 야기한다.
용어 "알케닐"은 적어도 하나의 C=C 결합을 함유하는 선형, 분지-사슬형 또는 고리형 C2-C10 (바람직하게는 C2-C6) 탄화수소 라디칼을 지칭한다.
용어 "알키닐"은 적어도 하나의 C≡C 결합을 함유하는 선형, 분지-사슬형 또는 고리형 C2-C10 (바람직하게는 C2-C6) 탄화수소 라디칼을 지칭한다.
용어 "알킬렌"은, 사용될 경우, 선택적으로 치환될 수 있는, -(CH2)n- 기(n은 일반적으로 0 내지 6인 정수임)를 지칭한다. 치환될 경우, 알킬렌기는 바람직하게는 하나 이상의 메틸렌기 상에서 C1-C6 알킬기(시클로프로필기 또는 t-부틸기 포함)로 치환되지만, 본원에서 다르게 기술되지 않는 이상, 1개 이상의 할로기, 바람직하게는 1 내지 3 개의 할로기, 또는 1 또는 2개의 하이드록실기, O-(C1-C6 알킬) 기 또는 아미노산 측쇄로 또한 치환될 수 있다. 특정 구현예에서, 알킬렌기는 단일 할로겐기, 바람직하게는 염소기로 치환된 알킬 사슬로 (바람직하게는, 폴리에틸렌 글리콜 사슬의 말단 상에서 독점적이지 않게) 치환된 (1 내지 10개, 바람직하게는 1 내지 6개, 종종 1 내지 4개의 에틸렌 글리콜 단위의) 폴리에틸렌 글리콜 사슬로 추가로 치환된 우레탄 또는 알콕시기(또는 다른 기)로 치환될 수 있다. 또 다른 구현예에서, 알킬렌(종종, 메틸렌)기는, 천연 또는 인공 아미노산의 측쇄 기, 예를 들어, 알라닌, β-알라닌, 아르기닌, 아스파라긴, 아스파르트산, 시스테인, 시스틴, 글루탐산, 글루타민, 글리신, 페닐알라닌, 히스티딘, 이소류신, 리신, 류신, 메티오닌, 프롤린, 세린, 트레오닌, 발린, 트립토판 또는 티로신과 같은 아미노산 측쇄 기로 치환될 수 있다.
용어 "미치환된"은 수소 원자로만 치환된 것을 의미한다. C0를 포함하는 탄소 원자의 범위는, 탄소가 부재하고 H로 대체됨을 의미한다. 따라서 C0-C6인 탄소 원자의 범위는 1, 2, 3, 4, 5 및 6의 탄소 원자를 포함하고, C0의 경우, H가 탄소를 대신한다.
"치환된" 또는 "선택적으로 치환된"이라는 용어는, 문맥 내에서 분자의 어느 곳에서나 탄소 (또는 질소) 위치에서 독립적으로 (즉, 보다 많은 치환기가 발생하는 경우, 각 치환기는 다른 치환기에 독립적임) 하나 이상의 치환기를 (독립적으로 최대 5개의 치환기, 바람직하게는 최대 3개의 치환기, 종종 본 개시에 따른 화합물의 모이어티 상의 1 또는 2개의 치환기 및 그 자체가 추가로 치환될 수 있는 치환기를 포함할 수 있음) 의미할 것이며, 치환기 하이드록실, 티올, 카르복실, 시아노 (C≡N), 니트로 (NO2), 할로겐(바람직하게는, 1, 2 또는 3 할로겐, 특히 알킬, 특히 트리플루오로메틸 등의 메틸 기), 알킬기(바람직하게는, C1-C10, 더바람직하게, C1-C6), 아릴(특히 페닐과 치환된 페닐, 예컨대 벤질 또는 벤조일), 알콕시 기(바람직하게는, 페닐 및 치환된 페닐 포함, C1-C6 알킬 또는 아릴), 티오에테르 (C1-C6 알킬 또는 아릴), 아실(바람직하게는, C1-C6 아실), 에스테르 또는 티오에스테르(바람직하게는, C1-C6 알킬또는 아릴)(알킬렌 에스테르 ((바람직하게는 C1-C6 알킬 또는 아릴기로 치환되는 에스테르 작용기에서보다는, 알킬렌기에 부착되도록 하는) 알킬렌 에스테르를 포함), 바람직하게, C1-C6 알킬 또는 아릴, 할로겐(바람직하게는, F 또는 Cl), 아민(5- 또는 6-원 고리형 알킬렌 아민 포함, 추가로 알킬기가 1 또는 2개의 하이드록실기로 치환될 수 있는 C1-C6 알킬 아민 또는 C1-C6 디알킬 아민 포함) 또는 선택적으로 치환된 -N(C0-C6 알킬)C(O)(O-C1-C6 알킬) 기 (선택적으로 단일 할로겐, 바람직하게는 염소 치환기를 함유하는 알킬기가 추가로 결합되는 폴리에틸렌 글리콜 사슬로 치환될 수 있음), 히드라진, 아미도, (바람직하게는 1 또는 2개의 C1-C6 알킬기로 치환됨) (선택적으로 C1-C6 알킬기로 치환된 카르복사미드를 포함함), 알카놀 (바람직하게는, C1-C6 알킬 또는 아릴), 또는 알카노산 (바람직하게는, C1-C6 알킬 또는 아릴)을 포함한다. 본 발명에 따른 치환기는, 예를 들어 -SiR1R2R3기를 포함할 수 있으며, 여기서, 각각의 R1 및 R2는 본원에서 달리 설명되는 바와 같고, R3는 H 또는 C1-C6 알킬기, 바람직하게는 R1, R2, R3는 이러한 문맥에서 C1-C3 알킬기(이소프로필기 또는 t-부틸기를 포함함)이다. 전술한 각각의 기는 치환된 모이어티에 직접적으로 연결될 수 있거나, 대안적으로, 치환기는, 선택적으로 치환된 -(CH2)m- 또는 대안으로 선택적으로 치환된 -(OCH2)m-, -(OCH2CH2)m-, 또는 -(CH2CH2O)m- 기를 통해, 치환된 모이어티(바람직하게는, 아릴 또는 헤테로아릴 모이어티의 경우)에 연결될 수 있고, 이는 전술한 치환기 중 임의의 하나 이상으로 치환될 수 있다. 알킬렌기 -(CH2)m- 또는 -(CH2)n-기, 또는 에틸렌 글리콜 사슬과 같은 다른 사슬은, 위에서 나타낸 바와 같이, 사슬 상의 임의의 위치에서 치환될 수 있다. 알킬렌기 상의 바람직한 치환기는 할로겐 또는 C1-C6(바람직하게는 C1-C3) 알킬기를 포함하고, 이는 1개 또는 2개의 하이드록실기, 1개 또는 2개의 에테르기(O-C1-C6 기), 3개 이하의 할로기(바람직하게는 F), 또는 본원에서 달리 기술된 바와 같은 아미노산의 측쇄 및 선택적으로 치환된 아미드(바람직하게는 전술한 바와 같이 치환된 카르복사미드) 또는 우레탄기(종종, 1개 또는 2개의 C0-C6 알킬 치환기를 가지고, 더 치환될 수 있음)로 선택적으로 치환될 수 있다. 특정 구현예에서, 알킬렌기(종종 단일 메틸렌기)는 1개 또는 2개의 선택적으로 치환된 C1-C6 알킬기, 바람직하게는 C1-C4 알킬기, 가장 빈번하게는 메틸 또는 O-메틸기 또는 본원에서 달리 기술된 바와 같은 아미노산의 측쇄로 치환된다. 본 발명에서, 분자의 모이어티는 5개 까지의 치환기, 바람직하게는 3개 까지의 치환기로 선택적으로 치환될 수 있다. 가장 빈번하게는, 본 발명에서 치환되는 모이어티는 1개 또는 2개의 치환기로 치환된다.
용어 "치환된"(각 치환기는 임의의 다른 치환기와 독립됨)은 또한, 사용되는 문맥 내에서 C1-C6 알킬, C1-C6 알콕시, 할로겐, 아미도, 카르복사미도, 설폰아미드를 포함하는 설폰, 케토, 카르복시, C1-C6 에스테르(옥시에스테르 또는 카르보닐에스테르), C1-C6 케토, 우레탄 -O-C(O)-NR1R2 또는 -N(R1)-C(O)-O-R1, 니트로, 시아노 및 아민(특히 1개 또는 2개 하이드록실기로 선택적으로 치환될 수 있는 C1-C6 알킬렌-NR1R2, 모노- 또는 디- C1-C6 알킬 치환된 아민을 포함함)을 의미한다. 이러한 기 각각은, 달리 지시되지 않는 한, 문맥 내에서 1 내지 6개의 탄소 원자를 함유한다. 특정 구현예에서, 바람직한 치환기는, 예를 들어, 치환기의 사용 맥락에 따라, -NH-, -NHC(O)-, -O-, =O, -(CH2)m- (여기서, m 및 n은 문맥상, 1, 2, 3, 4, 5 또는 6임), -S-, -S(O)-, SO2- 또는 -NH-C(O)-NH-, -(CH2)nOH, -(CH2)nSH, -(CH2)nCOOH, C1-C6 알킬, -(CH2)nO-(C1-C6 알킬), -(CH2)nC(O)-(C1-C6 알킬), -(CH2)nOC(O)-(C1-C6 알킬), -(CH2)nC(O)O-(C1-C6 알킬), -(CH2)nNHC(O)-R1, -(CH2)nC(O)-NR1R2, -(OCH2)nOH, -(CH2O)nCOOH, C1-C6 알킬, -(OCH2)nO-(C1-C6 알킬), -(CH2O)nC(O)-(C1-C6 알킬), -(OCH2)nNHC(O)-R1, -(CH2O)nC(O)-NR1R2, -S(O)2-RS, -S(O)-RS (RS는 C1-C6 알킬 또는 -(CH2)m-NR1R2 기임), NO2, CN 또는 할로겐 (F, Cl, Br, I, 바람직하게는 F 또는 Cl)를 포함할 것이다. R1 및 R2는 각각, 문맥 내에서, H 또는 C1-C6 알킬기(1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개 까지의 할로겐기, 바람직하게는 불소로 선택적으로 치환될 수 있음)이다. 용어 "치환된"은 또한, 정의된 화합물 및 이용된 치환기의 화학적 문맥 내에서, 본원에서 달리 기술된 바와 같이 선택적으로 치환된 아릴 또는 헤테로아릴기 또는 선택적으로 치환된 헤테로고리기를 의미한다. 알킬렌기는, 비록 다수의 다른 기들이 치환기로서 이용될 수 있지만, 본원에서 달리 기술된 바와 같이, 바람직하게는 선택적으로 치환된 C1-C6 알킬기(결과적으로 키랄 중심을 제공하는 메틸, 에틸 또는 하이드록시메틸 또는 하이드록시에틸이 바람직함), 본원에서 달리 기술된 바와 같은 아미노산 기의 측쇄, 전술한 바와 같은 아미도기, 또는 우레탄기 O-C(O)-NR1R2 기(여기서, R1 및 R2는 본원에서 달리 기술된 바와 같음)로 치환될 수 있다. 다양한 선택적으로 치환된 모이어티는 3개 이상의 치환기, 바람직하게는 3개 이하의 치환기 및 바람직하게는 1개 또는 2개의 치환기로 치환될 수 있다. 화합물 내 분자의 특정 위치에서 치환이 필요하지만 (주로, 원자가 때문에), 어떠한 치환도 표시되지 않는 경우라면, 그 치환기는, 치환의 문맥에서 달리 제시되지 않는 한, H인 것으로 해석되거나 또는 이해되는 것에 유의한다.
용어 "아릴" 또는 "방향족"은, 문맥 내에서, 단일 고리(예를 들어, 벤젠, 페닐, 벤질) 또는 축합 고리(예를 들어, 나프틸, 안트라세닐, 페난트레닐 등)를 갖는 치환되거나(본원에서 달리 기재된 바와 같음) 미치환된 일가 방향족 라디칼을 지칭하고, 고리(들) 상에서 임의의 이용가능한 안정된 위치에서 또는 제시된 화학 구조 내에서 달리 지시된 바와 같이, 본 발명에 따른 화합물에 결합될 수 있다. 아릴기의 다른 예는, 문맥 내에서, 다른 것들 중에서, 헤테로고리 방향족 고리 시스템, 고리(단일 고리) 내에 하나 이상의 질소, 산소, 또는 황 원자를 갖는 "헤테로아릴"기, 예컨대 이미다졸, 푸릴, 피롤, 푸라닐, 티엔, 티아졸, 피리딘, 피리미딘, 피라진, 트리아졸, 옥사졸, 또는 융합된 고리 시스템, 예컨대 인돌, 퀴놀린, 인돌리진, 아자인돌리진, 벤조푸라잔 등을 포함할 수 있고, 이는 전술된 바와 같이 선택적으로 치환될 수 있다. 언급될 수 있는 헤테로아릴기 중, 다른 것들 중에서, 질소 함유 헤테로아릴기, 예컨대 피롤, 피리딘, 피리돈, 피리다진, 피리미딘, 피라진, 피라졸, 이미다졸, 트리아졸, 트리아진, 테트라졸, 인돌, 이소인돌, 인돌리진, 아자인돌리진, 퓨린, 인다졸, 퀴놀린, 디하이드로퀴놀린, 테트라하이드로퀴놀린, 이소퀴놀린, 디하이드로이소퀴놀린, 테트라하이드로이소퀴놀린, 퀴놀리진, 프탈라진, 나프티리딘, 퀴녹살린, 퀴나졸린, 신놀린, 프테리딘, 이미다조피리딘, 이미다조트리아진, 피라지노피리다진, 아크리딘, 페난트리딘, 카바졸, 카바졸린, 피리미딘, 페난트롤린, 페나센, 옥사디아졸, 벤즈이미다졸, 피롤로피리딘, 피롤로피리미딘 및 피리도피리미딘; 황 함유 방향족 헤테로고리, 예컨대 티오펜 및 벤조티오펜; 산소 함유 방향족 헤테로고리, 예컨대 푸란, 피란, 시클로펜타피란, 벤조푸란 및 이소벤조푸란; 및 질소, 황 및 산소 중에서 선택된 2개 이상의 헤테로 원자를 포함하는 방향족 헤테로고리, 예컨대, 티아졸, 티아디졸, 이소티아졸, 벤조옥사졸, 벤조티아졸, 벤조티아디아졸, 페노티아진, 이소옥사졸, 푸라잔, 페녹사진, 피라졸옥사졸, 이미다조티아졸, 티에노푸란, 푸로피롤, 피리독사진, 푸로피리딘, 푸로피리미딘, 티에노피리미딘 및 옥사졸로서, 이들 모두 선택적으로 치환될 수 있다.
용어 "치환된 아릴"은 적어도 하나의 방향족 고리 또는 복수(이들 중 적어도 하나는 방향족임)의 축합된 고리로 구성된 방향족 카보시클릭기를 지칭하며, 여기서 고리(들)은 하나 이상의 치환기로 치환된다. 예를 들어, 아릴기는 -(CH2)nOH, -(CH2)n-O-(C1-C6)알킬, -(CH2)n-O-(CH2)n-(C1-C6)알킬, -(CH2)n-C(O)(C0-C6) 알킬, -(CH2)n-C(O)O(C0-C6)알킬, -(CH2)n-OC(O)(C0-C6)알킬, 아민, 모노- 또는 디-(C1-C6 알킬) 아민(아민 상의 알킬기는 1 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개 까지의 할로기(바람직하게는, F, Cl)로 선택적으로 치환됨), OH, COOH, C1-C6 알킬, 바람직하게는 CH3, CF3, OMe, OCF3, NO2, 또는 CN 기(이들 각각은 페닐 고리의 오르토-, 메타- 및/또는 파라-, 바람직하게는 파라- 에서 치환될 수 있음), 선택적으로 치환된 페닐기(바람직하게는 페닐기 자체는 연결기를 통해 ULM기를 포함하는 PTM 기에 연결됨), 및/또는 적어도 하나의 F, Cl, OH, COOH, CH3, CF3, OMe, OCF3, NO2, 또는 CN 기(페닐 고리의 오르토-, 메타- 및/또는 파라-위치, 바람직하게는 파라-위치), 선택적으로 치환될 수 있는 나프틸기, 선택적으로 치환된 헤테로아릴, 바람직하게는 메틸 치환된 이속사졸을 포함하는 선택적으로 치환된 이속사졸, 메틸 치환된 옥사졸을 포함하는 선택적으로 치환된 옥사졸, 메틸 치환된 티아졸을 포함하는 선택적으로 치환된 티아졸, 메틸 치환된 이소티아졸을 포함하는 선택적으로 치환된 이소티아졸, 메틸 치환된 피롤을 포함하는 선택적으로 치환된 피롤, 메틸이미다졸을 포함하는 선택적으로 치환된 이미다졸, 선택적으로 치환된 벤즈이미다졸 또는 메톡시벤질이미다졸, 선택적으로 치환된 옥시미다졸 또는 메틸옥시미다졸, 메틸디아졸기를 포함하는 선택적으로 치환된 디아졸기, 메틸 치환된 티아졸기를 포함하는 선택적으로 치환된 티아졸기, 할로-(바람직하게는 F) 또는 메틸 치환된 피리딘기 또는 옥사피리딘기(피리딘기는 산소에 의해 페닐기와 연결됨)를 포함하는 피리딘기, 선택적으로 치환된 푸란, 선택적으로 치환된 벤조푸란, 선택적으로 치환된 디하이드로벤조푸란, 선택적으로 치환된 인돌, 인돌리진 또는 아자인돌리진(2, 3, 또는 4-아지인돌리진), 선택적으로 치환된 퀴놀린, 및 이들의 조합으로부터 선택된 치환기(들)를 포함할 수 있다.
"카르복실"은, R이 수소, 알킬, 치환된 알킬, 아릴, 치환된 아릴, 헤테로아릴 또는 치환된 헤테로아릴인 --C(O)OR 기이지만, 이들 일반 치환기는 본원에서 정의된 이에 상응하는 기의 정의와 동일한 의미를 갖는다.
용어 "헤테로아릴" 또는 "헤트아릴"은, 선택적으로 치환된 퀴놀린(약물중합체에 부착되거나 퀴놀린 고리 내의 임의의 탄소 원자 상에 치환될 수 있음), 선택적으로 치환된 인돌(디하이드로인돌을 포함함), 선택적으로 치환된 인돌리진, 선택적으로 치환된 아자인돌리진(2, 3 또는 4-아자인돌리진), 선택적으로 치환된 벤즈이미다졸, 벤조디아졸, 벤즈옥소푸란, 선택적으로 치환된 이미다졸, 선택적으로 치환된 이속사졸, 선택적으로 치환된 옥사졸(바람직하게는 메틸 치환됨), 선택적으로 치환된 디아졸, 선택적으로 치환된 트리아졸, 테트라졸, 선택적으로 치환된 벤조푸랄, 선택적으로 치환된 티오펜, 선택적으로 치환된 티아졸(바람직하게는 메틸 및/또는 티올 치환됨), 선택적으로 치환된 이소티아졸, 선택적으로 치환된 트리아졸(바람직하게는 메틸기로 치환된 1,2,3-트리아졸, 트리이소프로필실릴기, 선택적으로 치환된 -(CH2)m-O-C1-C6 알킬기 또는 선택적으로 치환된 -(CH2)m-C(O)-O-C1-C6 알킬기), 선택적으로 치환된 피리딘(2-, 3- 또는 4-피리딘) 또는 다음의 화학 구조식에 따른 기를 의미할 수 있지만, 어떤 식으로든지 이에 한정되지는 않는다:
여기서,
Sc는 CHRSS, NRURE, 또는 O이고;
RHET는, H, CN, NO2, 할로(바람직하게는 Cl 또는 F), 선택적으로 치환된 C1-C6 알킬(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기(예를 들어, CF3)로 치환됨), 선택적으로 치환된 O(C1-C6 알킬)(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기로 치환됨) 또는 선택적으로 치환된 아세틸렌기 -C≡C-Ra(여기서 Ra는 H 또는 C1-C6 알킬기(바람직하게는 C1-C3 알킬)임)이고;
RSS는, H, CN, NO2, 할로(바람직하게는 F 또는 Cl), 선택적으로 치환된 C1-C6 알킬(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기로 치환됨), 선택적으로 치환된 O-(C1-C6 알킬(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기로 치환됨) 또는 선택적으로 치환된 -C(O)(C1-C6 알킬)(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기로 치환됨)이고;
RURE는, H, C1-C6 알킬(바람직하게는 H 또는 C1-C3 알킬) 또는 -C(O)(C1-C6 알킬)(이들 기 각각은 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개 까지의 할로겐, 바람직하게는 불소기로 선택적으로 치환됨), 또는 선택적으로 치환된 헤테로고리, 예를 들어, 각각 선택적으로 치환된, 피페리딘, 모르폴린, 피롤리딘, 테트라하이드로푸란, 테트라하이드로티오펜, 피페리딘, 피페라진이고, 그리고
YC는, N 또는 C-RYC이고, 여기서 RYC는 H, OH, CN, NO2, 할로(바람직하게는 Cl 또는 F), 선택적으로 치환된 C1-C6 알킬(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기(예를 들어, CF3)로 치환됨), 선택적으로 치환된 O(C1-C6 알킬) (바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기로 치환됨) 또는 선택적으로 치환된 아세틸렌기 -C≡C-Ra (여기서 Ra는 H 또는 C1-C6 알킬기(바람직하게는 C1-C3 알킬)임)이다.
용어 "아랄킬" 및 "헤테로아릴알킬"은 전술한 정의에 따른 아릴 또는 각각 헤테로아릴뿐만 아니라 알킬 및/또는 헤테로알킬 및/또는 카보시클릭 및/또는 헤테로시클로알킬 고리 시스템을 포함하는 기를 지칭한다.
본원에 사용되는 용어 "아릴알킬"은 위에 정의된 알킬기에 연결된 위에 정의된 바와 같은 아릴기를 지칭한다. 아릴알킬기는 1 내지 6개의 탄소 원자인 알킬기를 통해 모 모이어티(parent moiety)에 부착된다. 아릴알킬기 내의 아릴기는 위에 정의된 바와 같이 치환될 수 있다.
용어 "헤테로고리"는 적어도 하나의 헤테로원자, 즉 N, O 또는 S를 함유하고 방향족(헤테로아릴) 또는 비방향족일 수 있는 고리형 기를 지칭한다. 따라서, 헤테로아릴 모이어티는 사용되는 문맥에 따라 헤테로고리의 정의 하에 포함된다. 예시적인 헤테로아릴기는 본원에 기술되어 있다.
예시적인 헤테로고리류는 다른 것들 중에서도, 아제티디닐, 벤즈이미다졸릴, 1,4- 벤조디옥사닐, 1,3-벤조디옥솔릴, 벤즈옥사졸릴, 벤조티아졸릴, 벤조티에닐, 디하이드로이미다졸릴, 디하이드로피라닐, 디하이드로푸라닐, 디옥사닐, 디옥솔라닐, 에틸렌우레아, 1,3-디옥솔란, 1,3-디옥산, 1,4-디옥산, 푸릴, 호모피페리디닐, 이미다졸릴, 이미다졸리닐, 이미다졸리디닐, 인돌리닐, 인돌릴, 이소퀴놀리닐, 이소티아졸리디닐, 이소티아졸릴, 이속사졸리디닐, 이속사졸릴, 모르폴리닐, 나프티리디닐, 옥사졸리디닐, 옥사졸릴, 피리돈, 2-피롤리돈, 피리딘, 피페라지닐, N-메틸피페라지닐, 피페리디닐, 프탈이미드, 석신이미드, 피라지닐, 피라졸리닐, 피리딜, 피리미디닐, 피롤리디닐, 피롤리닐, 피롤릴, 퀴놀리닐, 테트라하이드로푸라닐, 테트라하이드로피라닐, 테트라하이드로퀴놀린, 티아졸리디닐, 티아졸릴, 티에닐, 테트라하이드로티오펜, 옥산, 옥세타닐, 옥사티올라닐, 티안을 포함한다.
헤테로고리기는 알콕시, 치환된 알콕시, 시클로알킬, 치환된 시클로알킬, 시클로알케닐, 치환된 시클로알케닐, 아실, 아실아미노, 아실옥시, 아미노, 아미노아실, 아미노아실옥시, 옥시아미노아실, 아지도, 시아노, 할로겐, 하이드록실, 케토, 티오케토, 카르복시, 카르복시알킬, 티오아릴옥시, 티오헤테로아릴옥시, 티오헤테로시클로옥시, 티올, 티오알콕시, 치환된 티오알콕시, 아릴, 아릴옥시, 헤테로아릴, 헤테로아릴옥시, 헤테로고리, 헤테로시클로옥시, 하이드록시아미노, 알콕시아미노, 니트로, -SO-알킬, -SO-치환된 알킬, -SO아릴, -SO-헤테로아릴, -SO2-알킬, -SO2-치환된 알킬, -SO2-아릴, 옥소(=O), 및 -SO2-헤테로아릴로 이루어진 군으로부터 선택되는 구성원으로 선택적으로 치환될 수 있다. 이러한 헤테로고리기는 단일 고리 또는 다수의 축합된 고리를 가질 수 있다. 질소 헤테로고리 및 헤테로아릴의 예는, 피롤, 이미다졸, 피라졸, 피리딘, 피라진, 피리미딘, 피리다진, 인돌리진, 이소인돌, 인돌, 인다졸, 퓨린, 퀴놀리진, 이소퀴놀린, 퀴놀린, 프탈라진, 나프틸피리딘, 퀴녹살린, 퀴나졸린, 시놀린, 프테리딘, 카바졸, 카볼린, 페난트리딘, 아크리딘, 페난트롤린, 이소티아졸, 페나진, 이속사졸, 페녹사진, 페노티아진, 이미다졸리딘, 이미다졸린, 피페리딘, 피페라진, 인돌린, 모르폴리노, 피페리디닐, 테르라하이드로푸라닐, 등 및 N-알콕시-질소 함유 헤테로고리를 포함하지만, 이에 한정되지는 않는다. 용어 "헤테로고리"는 또한 임의의 헤테로고리가 벤젠 고리 또는 시클로헥산 고리 또는 다른 헤테로고리(예를 들어, 인돌릴, 퀴놀릴, 이소퀴놀릴, 테트라하이드로퀴놀릴 등)에 융합되는 이중고리기를 포함한다.
용어 "시클로알킬"은 본원에서 정의된 바와 같은 단일 고리형 또는 다중 고리형 알킬기, 예를 들어, 시클로프로필, 시클로부틸, 시클로펜틸, 시클로헥실, 시클로헵틸 등을 포함하는 고리 내에 3 내지 20개의 탄소 원자를 가진 포화 단일 고리형 탄화수소기로부터 유도된 1가(univalent) 기를 의미하지만, 이에 한정되지는 않는다. 용어 "치환된 시클로알킬"은 단일 고리형 또는 다중 고리형 알킬기 및 하나 이상의 치환기, 예를 들어, 아미노, 할로겐, 알킬, 치환된 알킬, 카빌옥시, 카빌메르캅토, 아릴, 니트로, 메르캅토 또는 설포로 치환된 것을 의미하지만 이에 한정되지 않는 반면, 이들 일반 치환기는 본원에서 정의된 이에 상응하는 기의 정의와 동일한 의미를 갖는다.
"헤테로시클로알킬"은 단일 고리형 또는 다중 고리형 알킬기를 지칭하며, 여기서 그의 고리 구조의 적어도 하나의 고리 탄소 원자는 N, O, S 또는 P로 이루어지는 군으로부터 선택되는 헤테로원자로 대체된다. "치환된 헤테로시클로알킬"은 단일 고리형 또는 다중 고리형 알킬기를 지칭하며, 여기서 그의 고리 구조의 적어도 하나의 탄소 원자는 N, O, S 또는 P로 이루어지는 군으로부터 선택되는 헤테로원자로 대체되고, 이 군은 할로겐, 알킬, 치환된 알킬, 카빌옥시, 카빌메르캅토, 아릴, 니트로, 메르캅토 또는 설포로 이루어지는 군으로부터 선택되는 하나 이상의 치환기를 함유하는 반면, 이들 일반 치환기는 본원에서 정의된 이에 상응하는 기의 정의와 동일한 의미를 갖는다.
용어 "탄화수소"는 탄소 및 수소를 함유한 화합물, 완전히 포화되거나, 부분적으로 불포화된 방향족일 수 있는 화합물, 및 아릴기, 알킬기, 알케닐기 및 알키닐기를 포함하는 화합물을 의미한다.
본원에서 용어 "독립적으로"는 독립적으로 적용되고, 용도에 따라 독립적으로 변하는 변수를 나타내는 데 사용된다.
용어 "저급 알킬"은 메틸, 에틸 또는 프로필을 지칭한다.
용어 "저급 알콕시"는 메톡시, 에톡시 또는 프로폭시를 지칭한다.
본원에서 기술된 임의의 구현예에서, W, X, Y, Z, G, G', R, R', R'', Q1-Q4, 및 A,은 연결기 및/또는 하나 이상의 PTM, ULM, ILM 또는 ILM' 기가 부착되는 연결기에 독립적으로 공유 결합될 수 있다.
예시적인 CLM
네오-이미드 화합물
일 양태에서, 본 명세서는 세레블론을 결합 및/또는 억제하는 데 유용한 화합물을 제공한다. 특정 구현예에서, 화합물은 다음의 화학 구조식으로 이루어진 군으로부터 선택된다:
여기서,
식 (a) 내지 (e) [예, (a1), (b), (c), (d1), (e), (f), (a2), (d2), (a3), 및 (a4)]의 W는 CH2, O, CHR, C=O, SO2, NH, 선택적으로 치환된 시클로알킬(예를 들어, 선택적으로 치환된 3-6원 시클로알킬, 선택적으로 치환된 시클로프로필기, 또는 선택적으로 치환된 시클로부틸기), 선택적으로 치환된 헤테로시클로알킬, 및 N-알킬 군으로부터 독립적으로 선택되고;
W3은 C 또는 N으로부터 선택되고;
식 (a) 내지 (e)의 X는 부재하거나, O, S 및 CH2 군으로부터 독립적으로 선택되고;
식 (a) 내지 식 (e)의 Y는 CH2, -C=CR', NH, N-알킬, N-아릴, N-헤트아릴, N-시클로알킬, N-헤테로시클릴, O, 및 S 군으로부터 독립적으로 선택되고;
식 (a) 내지 식 (e)의 Z는 (X와 Z 둘 모두가 부재 또는 CH2일 수 없다는 점을 제외하고) 부재하거나, O, S, 또는 CH2 군으로부터 독립적으로 선택되고;
식 (a) 내지 식 (e)의 G 및 G'는 H, 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 알킬, OH, R'OCOOR, R'OCONRR", -(CH2)n'-O-P(=O)(O-C1-6알킬)(OH), -(CH2)n'-O-P(=O)(O-C1-6알킬)2,-(CH2)n'-O-P(=O)(OH)2, -CH2OCOO(CH2CH2O)n"CH3, R'로 선택적으로 치환된 CH2-헤테로시클릴, 및 R'로 선택적으로 치환된 벤질 군으로부터 독립적으로 선택되고;
n"은 8 내지 35의 정수이고(예를 들어, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17. 18. 19. 20. 21. 22. 23 24. 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 또는 35);
식 (a) 내지 (e)의 Q1 내지 Q4는 각각 독립적으로, H, R, N 또는 N-산화물로부터 독립적으로 선택되는 기로 치환된 탄소 C를 나타내고;
식 (a) 내지 (e)의 A는 H, 선택적으로 치환된 선형, 분지형 알킬, 시클로알킬, Cl 및 F 군으로부터 독립적으로 선택되고;
식 (a) 내지 (e)의 R은 이에 한정되지 않지만, 다음을 포함하고: H, -CONR'R", -OR', -NR'R", -SR', -SO2R', -SO2NR'R", -CR'R"-, -CR'NR'R"-, (-CR'O)n'R", 할로겐, 선택적으로 치환된-아릴(예를 들어, 선택적으로 치환된 C5-C7 아릴), 선택적으로 치환된 알킬-아릴(예를 들어, 선택적으로 치환된 C1-C6 알킬, 선택적으로 치환된 C5-C7 아릴, 또는 이들의 조합 중 적어도 하나를 포함하는 알킬-아릴), 선택적으로 치환된-헤테로아릴(예를 들어, 선택적으로 치환된 C5-C7 헤테로아릴), 치환되지 않거나 치환된 선형 또는 분지형 알킬(예: 1개 이상의 할로겐으로 선택적으로 치환된 C1-C6 선형 또는 분지형 알킬, 시클로알킬(예: C3-C6 시클로알킬), 또는 아릴(예를 들어, C5-C7 아릴)), 선택적으로 치환된 알콕실기(예를 들어, 메톡시, 에톡시, 부톡시, 프로폭시, 펜톡시, 또는 헥옥시; 여기서 상기 알콕실은 1개 이상의 할로겐, 알킬, 할로알킬, 플루오로알킬, 시클로알킬(예: C3-C6 시클로알킬), 또는 아릴(예를 들어, C5-C7 아릴)으로 치환될 수 있다), 선택적으로 치환된 (예를 들어, 1개 이상의 할로겐, 알킬, 할로알킬, 플루오로알킬, 시클로알킬(예: C3-C6 시클로알킬), 또는 아릴(예를 들어, C5-C7 아릴)으로 선택적으로 치환됨), 선택적으로 치환된 (예를 들어, 1개 이상의 할로겐, 알킬, 할로알킬, 플루오로알킬, 시클로알킬(예: C3-C6 시클로알킬), 또는 아릴(예를 들어, C5-C7 아릴)으로 선택적으로 치환됨), 선택적으로 치환된-시클로알킬(예를 들어, 선택적으로 치환된 C3-C7 시클로알킬), 선택적으로 치환된-헤테로시클릴(예: 선택적으로 치환된 C3-C7 헤테로시클릴), -P(O)(OR')R", -P(O)R'R", -OP(O)(OR')R", -OP(O)R'R", -Cl, -F, -Br, -I, -CF3, -CN, -NR'SO2NR'R", -NR'CONR'R", -CONR'COR", -NR'C(=N-CN)NR'R", -C(=N-CN)NR'R", -NR'C(=N-CN)R", -NR'C(=C-NO2)NR'R", -SO2NR'COR", -NO2, -CO2R', -C(C=N-OR')R", -CR'=CR'R", -CCR', -S(C=O)(C=N-R')R", -SF5 및 -OCF3;
x, y, 및 z의 각각은 독립적으로 0, 1, 2, 3, 4, 5, 또는 6이고;
식 (a) 내지 (e)의 R' 및 R"는 H, 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 알킬, 선택적으로 치환된 시클로알킬, 선택적으로 치환된 아릴, 선택적으로 치환된 헤테로아릴, 선택적으로 치환된 헤테로시클릭, -C(=O)R, 선택적으로 치환된 헤테로시클릴로부터 독립적으로 선택되고;
식 (a) 내지 (e)의 n 및 n'은 1 내지 10의 정수(예를 들어, 1 내지 4, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 또는 10)이고;
은 단일 결합 또는 이중 결합을 나타내고; 및
식 (a) 내지 (e)의 은 입체 특이적((R) 또는 (S)) 또는 비-입체 특이적일 수 있는 결합을 나타낸다.
예시적인 CLM
본원에서 기술된 임의의 화합물에서, CLM은 다음의 군으로부터 선택되는 화학 구조식을 포함한다:
여기서,
식 (a) 내지 (e) [예, (a1), (b), (c), (d1), (e), (f), (a2), (d2), (a3), 및 (a4)]의 W는 CH2, O, CHR, C=O, SO2, NH, 선택적으로 치환된 시클로알킬(예를 들어, 선택적으로 치환된 3-6원 시클로알킬, 선택적으로 치환된 시클로프로필기, 또는 선택적으로 치환된 시클로부틸기), 선택적으로 치환된 헤테로시클로알킬(예를 들어, 선택적으로 치환된 3-6원 헤테로시클로알킬), 및 N-알킬 군으로부터 독립적으로 선택되고;
W3은 C 또는 N으로부터 선택되고;
식 (a) 내지 (e)의 X는 부재하거나, O, S 및 CH2 군으로부터 독립적으로 선택되고;
식 (a) 내지 식 (e)의 Y는 CH2, -C=CR', NH, N-알킬, N-아릴, N-헤트아릴, N-시클로알킬, N-헤테로시클릴, O, 및 S 군으로부터 독립적으로 선택되고;
식 (a) 내지 식 (e)의 Z는 (X와 Z 둘 모두가 부재 또는 CH2일 수 없다는 점을 제외하고) 부재하거나, O, S, 또는 CH2 군으로부터 독립적으로 선택되고;
식 (a) 내지 식 (e)의 G 및 G'는 H, 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 알킬, OH, R'OCOOR, R'OCONRR", -(CH2)n'-O-P(=O)(O-C1-6알킬)(OH), -(CH2)n'-O-P(=O)(O-C1-6알킬)2, -(CH2)n'-O-P(=O)(OH)2, -CH2OCOO(CH2CH2O)n"CH3, R'로 선택적으로 치환된 CH2-헤테로시클릴, 및 R'로 선택적으로 치환된 벤질 군으로부터 독립적으로 선택되고; -
n"은 8 내지 35의 정수이고(예를 들어, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17. 18. 19. 20. 21. 22. 23 24. 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 또는 35);
식 (a) 내지 (e)의 Q1 내지 Q4는 각각 독립적으로, H, R, N 또는 N-산화물로부터 독립적으로 선택되는 기로 치환된 탄소 C를 나타내고;
식 (a) 내지 (e)의 A는 H, 선택적으로 치환된 선형, 분지형 알킬, 시클로알킬, Cl 및 F 군으로부터 독립적으로 선택되고;
식 (a) 내지 (e)의 R은 이에 한정되지 않지만, 다음을 포함하고: H, -CONR'R", -OR', -NR'R", -SR', -SO2R', -SO2NR'R", -CR'R"-, -CR'NR'R"-, (-CR'O)n'R", 할로겐, 선택적으로 치환된 헤테로시클릴(예를 들어, 선택적으로 치환된 C3-C7 헤테로시클릴), 선택적으로 치환된-아릴(예를 들어, 선택적으로 치환된 C5-C7 아릴), 선택적으로 치환된 알킬-아릴(예를 들어, 선택적으로 치환된 C1-C6 알킬, 선택적으로 치환된 C5-C7 아릴, 또는 이들의 조합 중 적어도 하나를 포함하는 알킬-아릴), 선택적으로 치환된-헤테로아릴(예를 들어, 선택적으로 치환된 C5-C7 헤테로아릴), 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형-알킬(예: 1개 이상의 할로겐으로 선택적으로 치환된 C1-C6 선형 또는 분지형 알킬, 시클로알킬(예: C3-C6 시클로알킬), 또는 아릴(예를 들어, C5-C7 아릴)), 선택적으로 치환된 알콕실기(예를 들어, 메톡시, 에톡시, 부톡시, 프로폭시, 펜톡시, 또는 헥옥시; 여기서 상기 알콕실은 1개 이상의 할로겐, 알킬, 할로알킬, 플루오로알킬, 시클로알킬(예: C3-C6 시클로알킬), 또는 아릴(예를 들어, C5-C7 아릴)으로 치환될 수 있다), 선택적으로 치환된 (예를 들어, 1개 이상의 할로겐, 알킬, 할로알킬, 플루오로알킬, 시클로알킬(예: C3-C6 시클로알킬), 또는 아릴(예를 들어, C5-C7 아릴)으로 선택적으로 치환됨), 선택적으로 치환된 (예를 들어, 1개 이상의 할로겐, 알킬, 할로알킬, 플루오로알킬, 시클로알킬(예: C3-C6 시클로알킬), 또는 아릴(예를 들어, C5-C7 아릴)으로 선택적으로 치환됨), 선택적으로 치환된 시클로알킬(예를 들어, 선택적으로 치환된 C3-C7 시클로알킬), 선택적으로 치환된-헤테로알킬(예: 선택적으로 치환된 C3-C7 헤테로알킬), 선택적으로 치환된-헤테로시클릴(예: 선택적으로 치환된 C3-C7 헤테로시클릴), -P(O)(OR')R", -P(O)R'R", -OP(O)(OR')R", -OP(O)R'R", -Cl, -F, -Br, -I, -CF3, -CN, -NR'SO2NR'R", -NR'CONR'R", -CONR'COR", -NR'C(=N-CN)NR'R", -C(=N-CN)NR'R", -NR'C(=N-CN)R", -NR'C(=C-NO2)NR'R", -SO2NR'COR", -NO2, -CO2R', -C(C=N-OR')R", -CR'=CR'R", -CCR', -S(C=O)(C=N-R')R", -SF5 및 -OCF3, (여기서 적어도 하나의 R(예를 들어, O, OH, N, NH, NH2, C1-C6 알킬, C1-C6 알콕시, 선택적으로 치환된-시클로알킬(예를 들어, 선택적으로 치환된 C3-C7 시클로알킬), 선택적으로 치환된-헤테로시클릴(예: 선택적으로 치환된 C3-C7 헤테로시클릴), -알킬-아릴(예를 들어, C1-C6 알킬, C4-C7 아릴, 또는 이들의 조합 중 적어도 하나를 포함하는 -알킬-아릴), 아릴(예: C5-C7 아릴), 헤테로아릴 아릴 (예를 들어, C5-C7 헤테로아릴), 아민, 아미드, 또는 카르복시 중 적어도 하나)는 PTM, 화학적 연결기(L), ULM, CLM'(예를 들어, CLM'은 제1 CLM과 동일하거나 상이한 구조를 갖는 추가 CLM임), 또는 이들의 조합에 공유 결합되도록 변형된다)
x, y, 및 z의 각각은 독립적으로 0, 1, 2, 3, 4, 5, 또는 6이고;
식 (a) 내지 (e)의 R' 및 R"은 결합, H, 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 알킬, 선택적으로 치환된 시클로알킬, 선택적으로 치환된 아릴, 선택적으로 치환된 헤테로아릴, 선택적으로 치환된 헤테로시클릭, -C(=O)R, 선택적으로 치환된 헤테로시클릴로부터 독립적으로 선택되고;
식 (a) 내지 (e)의 n 및 n'은 1 내지 10의 정수(예를 들어, 1 내지 4, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 또는 10)이고;
식 (a) 내지 (e)의 은 입체 특이적((R) 또는 (S)) 또는 비-입체 특이적일 수 있는 결합을 나타낸다
본원에서 기술된 특정 구현예에서, CLM 또는 ULM은 다음의 군으로부터 선택되는 화학 구조식을 포함한다:
식 (g)
여기서,
식 (g)의 W는 CH2, C=O, NH, 및 N-알킬 군으로부터 독립적으로 선택되고;
식 (g)의 A는 H, 메틸, 알킬(예를 들어, (선형, 분지형, 선택적으로 치환된) a 또는 C1-C6 알킬)로부터 독립적으로 선택되고;
식 (g)의 R은 H,, OH,, NH2, 할로겐, 메틸, 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 알킬(예를 들어, 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 C1-C6 알킬), 선택적으로 치환된 C1-C6 알콕시, 선택적으로 치환된-시클로알킬(예를 들어, 선택적으로 치환된 C3-C7 시클로알킬), 선택적으로 치환된-헤테로시클릴(예: 선택적으로 치환된 C3-C7 헤테로시클릴), 선택적으로 치환된-알킬-아릴(예를 들어, C1-C6 알킬, C4-C7 아릴, 또는 이들의 조합 중 적어도 하나를 포함하는 -알킬-아릴), 선택적으로 치환된 아릴(예를 들어, C5-C7 아릴), 아민, 아미드, 또는 카르복시)로부터 독립적으로 선택되고;
식 (g)의 n은 1 내지 4의 정수(예를 들어, 1, 2, 3 또는 4)를 나타내며, 여기서 적어도 하나의 R(예를 들어, OH, NH2, 할로겐, C1-C6 알킬, C1-C6 알콕시, -알킬-아릴(예를 들어, C1-C6 알킬, C4-C7 아릴, 또는 이들의 조합 중 적어도 하나를 포함하는 -알킬-아릴), 아릴(예를 들어, C5-C7 아릴), 아민, 아미드, 또는 카르복시 중 적어도 하나)는 PTM, 화학적 연결기(L), ULM, CLM (또는 CLM'), 또는 이들의 조합에 공유 결합되도록 변형되고; 및
식 (g)의 은 입체 특이적((R) 또는 (S)) 또는 비-입체 특이적일 수 있는 결합을 나타낸다.
본원에서 기술된 임의의 구현예에서, 식 (a) 내지 (g) [예를 들어, (a1), (b), (c), (d1), (e), (f), (a2), (d2), (a3), (a4), 및 (g)]의 W, X, Y, Z, G, G', R, R', R'', Q1 내지 Q4, 및 A는 연결기 및/또는 하나 이상의 PTM, ULM, CLM 또는 CLM' 기가 부착되는 연결기에 독립적으로 공유 결합될 수 있다.
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 상기 CLM은 Q1, Q2, Q3, Q4, 또는 이들의 조합 상에 1 내지 4개의 R 기를 포함하고, 여기서 각각의 R은 독립적으로 선택된 작용기 또는 원자, 예를 들어, OH, 할로겐, C1-C6 알킬, C1-C6 알콕시, 선택적으로 치환된-시클로알킬(예를 들어, 선택적으로 치환된 C3-C7 시클로알킬), 선택적으로 치환된-헤테로시클릴(예: 선택적으로 치환된 C3-C7 헤테로시클릴), -알킬-아릴(예를 들어, C1-C6 알킬, C4-C7 아릴, 또는 이들의 조합 중 적어도 하나를 포함하는 -알킬-아릴), 아릴(예: C5-C7 아릴), 아민, 아미드, 시아노, 또는 카르복시이고, 및 선택적으로, 이들 중 하나는 PTM, 화학적 연결기(L), ULM, CLM(또는 CLM') 또는 이들의 조합에 공유 결합되도록 변형된다.
일부 구현예에서, CLM은 연결기 부착 지점을 나타내는 점선을 가진 다음의 구조식으로 나타내어진다:
보다 구체적으로, CLM의 비제한적인 예는 다음에 도시된 화합물 뿐만 아니라, 다음의 화합물 내에서 도시된 1개 이상의 상이한 특징부의 조합으로부터 발생하는 "하이브리드" 분자를 포함한다.
본원에서 기술된 임의의 화합물에서, CLM은 다음의 군으로부터 선택되는 화학 구조식을 포함한다:
여기서,
W는 CH2, O, CHR, C=O, SO2, NH, 선택적으로 치환된 시클로알킬, 선택적으로 치환된 헤테로시클알킬, 및 N-알킬로부터 독립적으로 선택되고;
Q1, Q2, Q3, Q4, Q5는 각각 독립적으로 H, R', N 또는 N-산화물로부터 독립적으로 선택된 기로 치환된 탄소 C 또는 N를 나타내고;
R1은 부재하거나, H, OH, CN, C1-C3 알킬, C=O로부터 선택되고;
R2는 부재하거나, H, OH, CN, C1-C3 알킬, CHF2, CF3, CHO, C(=O)NH2 군으로부터 선택되고;
R3는 H, 알킬(예를 들어, C1-C6 또는 C1-C3 알킬), 치환된 알킬(예를 들어, 치환된 C1-C6 또는 C1-C3 알킬), 알콕시(예를 들어, C1-C6 또는 C1-C3 알콕실), 치환된 알콕시(예를 들어, 치환된 C1-C6 또는 C1-C3 알콕실)로부터 선택되고;
R4는 H, 알킬, 치환된 알킬로부터 선택되고;
R5 및 R6는 각각 독립적으로 H, 할로겐, C(=O)R', CN, OH, CF3이고;
X는 C, CH, C=O, 또는 N이고;
X1은 C=O, N, CH 또는 CH2이고;
R'은 H, OH, 할로겐, 아민, 시아노, 알킬(예를 들어, C1-C3 알킬), 치환된 알킬(예를 들어, 치환된 C1-C3 알킬), 알콕시(예를 들어, C1-C3 알콕실), 치환된 알콕시(예를 들어, 치환된 C1-C3 알콕실), NR2R3, C(=O)OR2, 선택적으로 치환된 페닐로부터 선택되고;
n은 0 내지 4이고;
는 단일 또는 이중 결합이고; 및
상기 CLM은 PTM, 화학적 연결기(L), ULM, CLM(또는 CLM') 또는 이들의 조합에 공유 결합된다.
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, CLM 또는 CLM'은, 식 (h) 내지 식 (ab)의 R기(예를 들어, R, R1, R2, R3, R4 또는 R'), W, X, 또는 Q기(예를 들어, Q1, Q2, Q3, Q4, 또는 Q5)를 통해 PTM, 화학적 연결기(L), ULM, CLM, CLM', 또는 이들의 조합에 공유 결합된다.
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, CLM 또는 CLM'은, 식 (h) 내지 식 (ab)의 W, X, R, R1, R2, R3, R4, R5, R', Q1, Q2, Q3, Q4, 및 Q5를 통해 PTM, 화학적 연결기(L), ULM, CLM, CLM', 또는 이들의 조합에 공유 결합된다.
본원에 기술된 임의의 구현예에서, 식 (h) 내지 식 (ab)의 W, X, R1, R2, R3, R4, R', Q1, Q2, Q3, Q4, 및 Q5는, 연결기 및/또는 하나 이상의 PTM, ULM, ULM', CLM 또는 CLM'기에 부착되는 연결기에 독립적으로 공유 결합될 수 있다.
보다 구체적으로, CLM의 비제한적인 예는 다음에 도시된 화합물 뿐만 아니라, 다음의 화합물의 1개 이상의 특징부를 조합하여 발생하는 "하이브리드" 분자 또는 화합물을 포함한다:
여기서,
W는 CH2, CHR, C=O, SO2, NH, 및 N-알킬 군으로부터 독립적으로 선택되고;
R1은 부재하거나, H, CH, CN, C1-C3 알킬 군으로부터 선택되고;
R2는 H 또는 C1-C3 알킬이고;
R3는 H, 알킬, 치환된 알킬, 알콕시, 치환된 알콕시로부터 선택되고;
R4은 메틸 또는 에틸이고;
R5는 H 또는 할로이고;
R6는 H 또는 할로이고;
CLM의 R은 H이고;
R'는 H이거나 PTM, PTM', 화학적 연결기(L), ULM, CLM, CLM'에 대한 부착 지점이고,
Q1 및 Q2는 각각 독립적으로 H 또는 C1-C3 알킬로부터 독립적으로 선택되는 기로 치환된 C 또는 N이고;
는 단일 또는 이중 결합이고;
n은 1 내지 4의 정수(예를 들어, 1, 2, 3 또는 4)이고; 및
R은 다음을 포함한다: H, -CONR'R", -OR', -NR'R", -SR', -SO2R', -SO2NR'R", -CR'R"-, -CR'NR'R"-, (-CR'O)n'R", 할로겐, 선택적으로 치환된 헤테로시클릴, 선택적으로 치환된-아릴(예를 들어, 선택적으로 치환된 C5-C7 아릴), 선택적으로 치환된 알킬-아릴(예를 들어, 선택적으로 치환된 C1-C6 알킬, 선택적으로 치환된 C5-C7 아릴, 또는 이들의 조합 중 적어도 하나를 포함하는 알킬-아릴), 선택적으로 치환된-헤테로아릴(예를 들어, 선택적으로 치환된 C5-C7 아릴), -선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 알킬(예: 1개 이상의 할로겐으로 선택적으로 치환된 C1-C6 선형 또는 분지형 알킬, 시클로알킬(예: C3-C6 시클로알킬), 또는 아릴(예를 들어, C5-C7 아릴)), 선택적으로 치환된 알콕실기(예를 들어, 메톡시, 에톡시, 부톡시, 프로폭시, 펜톡시, 또는 헥옥시; 여기서 상기 알콕실은 1개 이상의 할로겐, 알킬, 할로알킬, 플루오로알킬, 시클로알킬(예: C3-C6 시클로알킬), 또는 아릴(예를 들어, C5-C7 아릴)으로 치환될 수 있다), 선택적으로 치환된 (예를 들어, 1개 이상의 할로겐, 알킬, 할로알킬, 플루오로알킬, 시클로알킬(예: C3-C6 시클로알킬), 또는 아릴(예를 들어, C5-C7 아릴)으로 선택적으로 치환됨), 선택적으로 치환된 (예를 들어, 1개 이상의 할로겐, 알킬, 할로알킬, 플루오로알킬, 시클로알킬(예: C3-C6 시클로알킬), 또는 아릴(예를 들어, C5-C7 아릴)으로 선택적으로 치환됨), 선택적으로 치환된 시클로알킬, 선택적으로 치환된 헤테로시클릴, -P(O)(OR')R", -P(O)R'R", -OP(O)(OR')R", -OP(O)R'R", -Cl, -F, -Br, -I, -CF3, -CN, -NR'SO2NR'R", -NR'CONR'R", -CONR'COR", -NR'C(=N-CN)NR'R", -C(=N-CN)NR'R", -NR'C(=N-CN)R", -NR'C(=C-NO2)NR'R", -SO2NR'COR", -NO2, -CO2R', -C(C=N-OR')R", -CR'=CR'R", -CCR', -S(C=O)(C=N-R')R", -SF5 및 -OCF3.
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, Q1, Q2, Q3, Q4, Q5, 또는 이들의 조합의 적어도 하나의 R (예를 들어, OH, NH2, C1-C6 알킬, C1-C6 알콕시, -알킬-아릴 (예를 들어, C1-C6 알킬, C4-C7 아릴, 또는 이들의 조합 중 적어도 하나를 포함하는 -알킬-아릴), 아릴(예: C5-C7 아릴), 아민, 아미드, 또는 카르복시 중 적어도 하나)는 PTM, 화학적 연결기(L), ULM, CLM'(예를 들어, CLM'은 제1 CLM과 동일하거나 상이한 구조를 갖는 추가 CLM임), 또는 이들의 조합에 공유 결합되도록 변형된다.
본원에 기술된 임의의 구현예에서, 식 (ac) 내지 (an)의 W, R1, R2, Q1, Q2, Q3, Q4, 및 R은, 연결기 및/또는 하나 이상의 PTM, ULM, ULM', CLM 또는 CLM'기가 부착되는 연결기에 독립적으로 공유 결합될 수 있다.
본원에 기술된 임의의 구현예에서, 식 (ac) 내지 (an)의 R1, R2, Q1, Q2, Q3, Q4, 및 R은, 연결기 및/또는 하나 이상의 PTM, ULM, ULM', CLM 또는 CLM'기가 부착되는 연결기에 독립적으로 공유 결합될 수 있다.
본원에 기술된 임의의 구현예에서, 식 (ac) 내지 (an)의 Q1, Q2, Q3, Q4, 및 R은, 연결기 및/또는 하나 이상의 PTM, ULM, ULM', CLM 또는 CLM'기가 부착되는 연결기에 독립적으로 공유 결합될 수 있다.
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 식 (ac) 내지 (an)의 R은 연결기(L), PTM, ULM, CLM과 동일한 화학적 구조를 갖는 제2 CLM, CLM', 제2 연결기, 또는 이들의 임의의 다수 또는 조합에 공유 결합되도록 변형된다.
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, CLM은 다음으로부터 선택된다:
여기서 R'은 할로겐이고 R1은 본원에서 기술되는 임의의 양태 또는 구현예에 기술된 바와 같다.
특정 경우에, CLM은 세레블론 E3 리가아제에 결합하는 이미드일 수 있다. 이들 이미드 및 연결기 부착 지점은 다음의 구조일 수 있지만 이에 한정되지는 않는다:
, 여기서 R'는 할로겐이다.
예시적인 VLM
본원에서 기술된 바와 같은 화합물의 특정 구현예에서, ULM은 VLM이고, 다음 ULM-a의 화학 구조식을 포함한다:
ULM-
여기서,
점선은, 적어도 하나의 PTM, 또 다른 ULM 또는 VLM 또는 MLM 또는 ILM 또는 CLM(즉, ULM' 또는 VLM' 또는 CLM' 또는 ILM' 또는 MLM'), 또는 적어도 하나의 PTM, ULM' 또는 VLM' 또는 CLM' 또는 ILM' 또는 MLM'을 연결기의 다른 말단에 결합시키는 화학적 연결기 모이어티의 부착점을 나타내고;
식 ULM-a의 X1, X2는, 결합부, O, NRY3, CRY3RY4, C=O, C=S, SO, 및 SO2의 군으로부터 각각 독립적으로 선택되고;
식 ULM-a의 RY3, RY4는 H, 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 C1-6 알킬(예를 들어, 1개 이상의 할로로 선택적으로 치환됨), 선택적으로 치환된 C1-6 알콕실(예를 들어, 0 내지 3개의 RP 기로 선택적으로 치환됨)의 군으로부터 각각 독립적으로 선택되고;
식 ULM-a의 RP는 H, 할로, -OH, C1-3 알킬, C=O로부터 각각 독립적으로 선택되는, 0개, 1개, 2개 또는 3개의 기이고;
식 ULM-a의 W3는, 선택적으로 치환된 T, 선택적으로 치환된 -T-N(R1aR1b)X3, 선택적으로 치환된 -T-N(R1aR1b), 선택적으로 치환된 -T-아릴, 선택적으로 치환된 -T-헤테로아릴, 선택적으로 치환된 T-바이헤테로아릴, 선택적으로 치환된 -T-헤테로고리, 선택적으로 치환된 -T-바이헤테로시클릴, 선택적으로 치환된 -NR1-T-아릴, 선택적으로 치환된 -NR1-T-헤테로아릴, 또는 선택적으로 치환된 -NR1-T-헤테로고리의 군으로부터 선택되고;
식 ULM-a의 X3는 C=O, R1, R1a, R1b이고;
R1, R1a, R1b는 H, 1개 이상의 할로 또는 -OH기로 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 C1-C6 알킬기, RY3C=O, RY3C=S, RY3SO, RY3SO2, N(RY3RY4)C=O, N(RY3RY4)C=S, N(RY3RY4)SO, 및 N(RY3RY4)SO2로 이루어진 군으로부터 각각 독립적으로 선택되고;
식 ULM-a의 T는 선택적으로 치환된 알킬, -(CH2)n- 기의 군으로부터 선택되며, 여기서 각각의 메틸렌 기는 할로겐, 메틸, 선택적으로 치환된 알콕시, -(CH2)m'C(=O)(CH2)m'C(=O)(OH), (CH2)m'OCOCH2(CH2)m'OCH2(CH2)m'CO(CH2)m'OH, (CH2)m'OCOCH2(CH2)m'CO(CH2)m'OH, 1개 이상의 할로겐 또는 OH로 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 C1-C6 알킬기, C(O) NR1R1a , 또는 NR1R1a의 군으로부터 선택된 1개 또는 2개의 치환기로 선택적으로 치환되고, 또는 R1 및 R1a는 선택적으로 치환된 헤테로고리, 또는 -OH기 또는 선택적으로 치환된 아미노산 측쇄를 형성하기 위해 결합되고;
각각의 m'은 개별적으로 1 내지 4의 정수(예를 들어, 1, 2, 3 또는 4)이고;
식 ULM-a의 W4는 선택적으로 치환된 -NR1-T-아릴이고 (여기서 아릴 기는, 선택적으로 치환된 5-6 원 헤테로아릴, 선택적으로 치환된 아릴, 또는 선택적으로 치환된 알콕시기로 선택적으로 치환될 수 있음), 선택적으로 치환된 -NR1-T-헤테로아릴기 또는 선택적으로 치환된 -NR1-T-헤테로고리이고, 여기서 -NR1은 X2에 공유 결합되고 R1은 H 또는 CH3, 바람직하게는 H이다; 및
n은 0 내지 6, 종종 0, 1, 2, 또는 3, 바람직하게는 0 또는 1이다.
본원에 기술된 임의의 구현예에서, T는 선택적으로 치환된 알킬, -(CH2)n- 기의 군으로부터 선택되며, 여기서 각각의 메틸렌 기는 할로겐, 메틸, 선택적으로 치환된 알콕시, -(CH2)m'C(=O)(CH2)m'C(=O)(OH), (CH2)m'OCOCH2(CH2)m'OCH2(CH2)m'CO(CH2)m'OH, (CH2)m'OCOCH2(CH2)m'CO(CH2)m'OH, 1개 이상의 할로겐 또는 OH, C(O) NR1R1a , 또는 NR1R1a로 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 C1-C6 알킬기의 군으로부터 선택된 1개 또는 2개의 치환기로 선택적으로 치환되고, 또는 R1 및 R1a는 선택적으로 치환된 헤테로고리, 또는 -OH기 또는 선택적으로 치환된 아미노산 측쇄를 형성하기 위해 결합되고; 각각의 m'은 개별적으로 1 내지 4의 정수(예를 들어, 1, 2, 3, 또는 4)이고, n은 0 내지 6, 종종 0, 1, 2, 또는 3, 바람직하게는 0 또는 1이다.
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 식 ULM-a의 W4는 , 여기서:
W5는 선택적으로 치환된 페닐, 선택적으로 치환된 나프틸, 또는 선택적으로 치환된 5-10원 헤테로아릴이고(예를 들어, W5는 하나 이상의 [예컨대, 1, 2, 3, 4 또는 5] 할로, CN, 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 C1-C12 알킬(선택적으로 하나 이상의 (예를 들어, 1, 2, 3, 4 또는 그 이상의) 탄소 원자가 산소 원자로 대체됨), 선택적으로 치환된 할로알킬, 선택적으로 치환된 알콕시, 하이드록시, 또는 선택적으로 치환된 할로알콕시로 치환됨);
R14a, R14b는 H, 할로알킬, 선택적으로 치환된 알콕시, 선택적으로 치환된 하이드록실 알킬, -(CH2)m'C(=O)(CH2)m'C(=O)(OH), (CH2)m'OCOCH2(CH2)m'OCH2(CH2)m'CO(CH2)m'OH, (CH2)m'OCOCH2(CH2)m'CO(CH2)m'OH, 또는 선택적으로 하나 이상의 탄소 원자가 산소 원자로 대체된 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 알킬의 군으로부터 각각 독립적으로 선택되고;
각각의 m'은 개별적으로 1 내지 4의 정수(예를 들어, 1, 2, 3 또는 4)이고;
R1은 H, 1개 이상의 할로 또는 -OH 기로 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 C1-C6 알킬기이고;
W6은 선택적으로 치환된 8-14원 이중고리 헤테로고리(예를 들어, 또는 )이고; 및
R15는 H, 할로겐, CN, OH, NO2, N R14aR14b, OR14a, CONR14aR14b, NR14aCOR14b, SO2NR14aR14b, NR14a SO2R14b, 선택적으로 치환된 알킬, 선택적으로 치환된 할로알킬, 선택적으로 치환된 알콕시, 선택적으로 치환된 할로알콕시 선택적으로 치환된 아릴, 선택적으로 치환된 헤테로아릴, 선택적으로 치환된 시클로알킬, 또는 선택적으로 치환된 시클로헤테로알킬의 군으로부터 선택된다.
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 식 ULM-a의 W5는 선택적으로 치환된 페닐 또는 선택적으로 치환된 5-10원 헤테로아릴이고(예를 들어, W5는 하나 이상의 [예컨대, 1, 2, 3, 4 또는 5] 할로, CN, 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 C1-C12 알킬(선택적으로 하나 이상의 (예를 들어, 1, 2, 3, 4 또는 그 이상의) 탄소 원자가 산소 원자로 대체됨), 선택적으로 치환된 할로알킬, 선택적으로 치환된 알콕시, 선택적으로 치환된 할로알콕시, 또는 하이드록시로 치환됨),
식 ULM-a의 R15는 H, 할로겐, CN, OH, NO2, N R14aR14b, OR14a, CONR14aR14b, NR14aCOR14b, SO2NR14aR14b, NR14a SO2R14b, 선택적으로 치환된 알킬, 선택적으로 치환된 할로알킬, 선택적으로 치환된 알콕시, 선택적으로 치환된 할로알콕시, 선택적으로 치환된 아릴, 선택적으로 치환된 헤테로아릴, 선택적으로 치환된 시클로알킬, 또는 선택적으로 치환된 시클로헤테로알킬의 군으로부터 선택되고;
본원에 기술된 양태 또는 구현예에서, 본 발명에서 사용하기 위한 W4 치환기는 본원에 개시된 식별된 화합물에서 발견되는 W4 치환기를 특이적으로 (및 개시된 특이적 화합물에 제한 없이) 또한 포함한다. 이들 각각의 W4 치환기는 본원에 개시된 임의의 수의 W3 치환기와 함께 사용될 수 있다.
본원에 기술된 양태 또는 구현예에서, ULM-a는 피롤리딘 모이어티에서 0 내지 3개의 RP 기로 선택적으로 치환된다. 각각의 RP는 독립적으로 H, 할로, -OH, C1-3알킬, C=O이다.
본원에 기술된 양태 또는 구현예에서, 식 ULM-a의 W3, W4는 하나 이상의 PTM 기에 부착된 연결기에 독립적으로 공유 결합될 수 있다.
점선은 적어도 하나의 PTM, 다른 ULM(ULM'), 또는 적어도 하나의 PTM 또는 ULM' 또는 둘 모두를 ULM에 결합시키는 화학적 연결기 모이어티의 부착 지점을 나타낸다.
특정 구현예에서, ULM은 VHL이고, 다음의 구조식으로 표시된다:
ULM-b
여기서,
식 ULM-b의 W3은 선택적으로 치환된 아릴, 선택적으로 치환된 헤테로아릴, 또는 의 군으로부터 선택되고;
식 ULM-b의 R9 및 R10은 독립적으로 수소, 선택적으로 치환된 알킬, 선택적으로 치환된 시클로알킬, 선택적으로 치환된 하이드록시알킬, 선택적으로 치환된 헤테로아릴, 또는 할로알킬이거나, R9, R10 및 이들이 부착되는 탄소 원자는 선택적으로 치환된 시클로알킬을 형성하고;
식 ULM-b의 R11은 선택적으로 치환된 헤테로고리, 선택적으로 치환된 알콕시, 선택적으로 치환된 헤테로아릴, 선택적으로 치환된 아릴, 또는 의 군으로부터 선택되고;
식 ULM-b의 R12는 H 또는 선택적으로 치환된 알킬의 군으로부터 선택되고;
식 ULM-b의 R13은 H, 선택적으로 치환된 알킬, 선택적으로 치환된 알킬카르보닐, 선택적으로 치환된 (시클로알킬)알킬카르보닐, 선택적으로 치환된 아랄킬카르보닐, 선택적으로 치환된 아릴카르보닐, 선택적으로 치환된 (헤테로시클릴)카르보닐, 또는 선택적으로 치환된 아랄킬의 군으로부터 선택되고;
식 ULM-b의 R14a, R14b는 H, 할로알킬, 선택적으로 치환된 알콕시, 선택적으로 치환된 하이드록실 알킬, -(CH2)m'C(=O)(CH2)m'C(=O)(OH), (CH2)m'OCOCH2(CH2)m'OCH2(CH2)m'CO(CH2)m'OH, (CH2)m'OCOCH2(CH2)m'CO(CH2)m'OH, 또는 하나 이상의 탄소 원자가 산소 원자로 대체된 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 알킬의 군으로부터 각각 독립적으로 선택되고;
R1은 H, 1개 이상의 할로 또는 -OH 기로 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 C1-C6 알킬기이고;
각각의 m'은 개별적으로 1 내지 4의 정수(예를 들어, 1, 2, 3 또는 4)이고;
식 ULM-b의 W5은 선택적으로 치환된 페닐 또는 선택적으로 치환된 5-10원 헤테로아릴의 군으로부터 선택되고,
식 ULM-b의 R15는 H, 할로겐, CN, OH, NO2, N R14aR14b, OR14a, CONR14aR14b, NR14aCOR14b, SO2NR14aR14b, NR14a SO2R14b, 선택적으로 치환된 알킬, 선택적으로 치환된 할로알킬, 선택적으로 치환된 할로알콕시, 선택적으로 치환된 아릴, 선택적으로 치환된 헤테로아릴, 선택적으로 치환된 시클로알킬, 또는 선택적으로 치환된 시클로헤테로알킬의 군으로부터 선택되고;
식 ULM-b의 각각의 R16은 H, CN, 할로, 하나 이상의 탄소 원자가 산소 원자로 대체된 선택적으로 치환된 알킬(예를 들어, CN 또는 OH로 선택적으로 치환됨), 선택적으로 치환된 할로알킬, 하이드록시, 또는 선택적으로 치환된 할로알콕시의 군으로부터 독립적으로 선택되고;
식 ULM-b의 o는 0, 1, 2, 3, 또는 4이고;
식 ULM-b의 R18은 H, 할로, 선택적으로 치환된 알콕시, 시아노, 선택적으로 치환된 알킬, 할로알킬, 할로알콕시 또는 연결기로 이루어진 군으로부터 독립적으로 선택되고; 및
식 ULM-b의 p는 0, 1, 2, 3 또는 4이고, 점선은 적어도 하나의 PTM, 또 다른 ULM(ULM'), 또는 적어도 하나의 PTM 또는 ULM' 또는 둘 모두를 ULM에 결합시키는 화학적 연결기 모이어티의 부착 지점을 나타낸다.
특정 구현예에서, 식 ULM-b의 R15은 이되, R17은 H, 할로, 선택적으로 치환된 C3-6시클로알킬, 선택적으로 치환된 C1-6알킬, 선택적으로 치환된 C1-6알케닐, 및 C1-6할로알킬이고; Xa는 S 또는 O이다.
특정 구현예에서, 식 ULM-b의 R17은 메틸, 에틸, 이소프로필 및 시클로프로필의 군으로부터 선택된다.
추가적인 특정 구현예에서, 식 ULM-b의 R15는 다음으로 이루어진 군으로부터 선택된다:
및 로 이루어진 군으로부터 선택된다.
특정 구현예에서, 식 ULM-b의 R11은 다음으로 이루어진 군으로부터 선택된다:
특정 구현예에서, ULM은 다음의 군으로부터 선택되는 화학 구조식을 가지고:
여기서,
식 ULM-c, ULM-d, 및 ULM-e의 R1은 H, 에틸, 이소프로필, 삼차-부틸, 이차-부틸, 시클로프로필, 시클로부틸, 시클로펜틸, 또는 시클로헥실; 선택적으로 치환된 알킬, 선택적으로 치환된 하이드록시알킬, 선택적으로 치환된 헤테로아릴, 또는 할로알킬이고;
식 ULM-c, ULM-d, 및 ULM-e의 R14a는 H, 할로알킬, 선택적으로 치환된 알킬, 메틸, 플루오로메틸, 하이드록시메틸, 에틸, 이소프로필, (CH2)m'OCOCH2(CH2)m'OCH2(CH2)m'CO(CH2)m'OH, (CH2)m'OCOCH2(CH2)m'CO(CH2)m'OH, 또는 시클로프로필이고;
각각의 m'은 개별적으로 1 내지 4의 정수(예를 들어, 1, 2, 3 또는 4)이고;
식 ULM-c, ULM-d, 및 ULM-e의 R15는 H, 할로겐, CN, OH, NO2, 선택적으로 치환된 헤테로아릴, 선택적으로 치환된 아릴; 선택적으로 치환된 알킬, 선택적으로 치환된 할로알킬, 선택적으로 치환된 할로알콕시, 시클로알킬, 또는 시클로헤테로알킬의 군으로부터 선택되고;
식 ULM-c, ULM-d, 및 ULM-e의 X는 C, CH2, 또는 C=O이고
식 ULM-c, ULM-d, 및 ULM-e의 R3는 부재하거나 결합 또는 선택적으로 치환된 5 또는 6 원 헤테로아릴이고; 및
점선은 적어도 하나의 PTM, 또 다른 ULM(ULM'), 또는 적어도 하나의 PTM 또는 ULM' 또는 둘 모두를 ULM에 결합시키는 화학적 연결기 모이어티의 부착 지점을 나타낸다.
특정 구현예에서, ULM은 다음의 화학 구조식에 따른 군을 포함한다:
여기서,
식 ULM-f의 R14a는 H, 할로알킬, 선택적으로 치환된 알킬, 메틸, 플루오로메틸, 하이드록시메틸, 에틸, 이소프로필, (CH2)m'OCOCH2(CH2)m'OCH2(CH2)m'CO(CH2)m'OH, (CH2)m'OCOCH2(CH2)m'CO(CH2)m'OH, 또는 시클로프로필이고;
각각의 m'은 개별적으로 1 내지 4의 정수(예를 들어, 1, 2, 3 또는 4)이고;
식 ULM-f의 R9은 H이고;
식 ULM-f의 R10은 H, 에틸, 이소프로필, 삼차-부틸, 2차-부틸, 시클로프로필, 시클로부틸, 시클로펜틸, 또는 시클로헥실이고;
식 ULM-f의 R11은 또는 선택적으로 치환된 헤테로아릴이고;
식 ULM-f의 p는 0, 1, 2, 3, 또는 4이고;
식 ULM-f의 각각의 R18은 독립적으로 할로, 선택적으로 치환된 알콕시, 시아노, 선택적으로 치환된 알킬, 할로알킬, 할로알콕시 또는 연결기이고;
식 ULM-f의 R12은 H, C=O이고;
식 ULM-f의 R13은 H, 선택적으로 치환된 알킬, 선택적으로 치환된 알킬카르보닐, 선택적으로 치환된 (시클로알킬)알킬카르보닐, 선택적으로 치환된 아랄킬카르보닐, 선택적으로 치환된 아릴카르보닐, 선택적으로 치환된 (헤테로시클릴)카르보닐, 또는 선택적으로 치환된 아랄킬이고,
식 ULM-f의 R15는 H, 할로겐, Cl, CN, OH, NO2, 선택적으로 치환된 헤테로아릴, 선택적으로 치환된 아릴; 선택적으로 치환된 시클로헤테로알킬;
의 군으로부터 선택되고; 및
식 ULM-f의 점선은 적어도 하나의 PTM, 또 다른 ULM(ULM'), 또는 적어도 하나의 PTM 또는 ULM' 또는 둘 모두를 ULM에 결합시키는 화학적 연결기 모이어티의 부착 지점을 나타낸다.
특정 구현예에서, ULM은 다음의 화학 구조식으로부터 선택된다:
여기서, n은 0 또는 1이다.
특정 구현예에서, ULM은 다음의 화학 구조식으로부터 선택된다:
여기서, ULM-a1 내지 ULM-a15, ULM-b1 내지 ULM-b12, ULM-c1 내지 ULM-c15 및 ULM-d1 내지 ULM-d9에서의 페닐 고리는, 불소, 저급 알킬 및 알콕시기로 선택적으로 치환되고, 여기서, 점선은 적어도 하나의 PTM, 또 다른 ULM(ULM') 또는 적어도 하나의 PTM 또는 ULM' 또는 둘 모두를 ULM-a에 결합시키는 화학적 연결기 모이어티의 부착 지점을 나타낸다.
일 구현예에서, ULM-a1 내지 ULM-a15, ULM-b1 내지 ULM-b12, ULM-c1 내지 ULM-c15 및 ULM-d1 내지 ULM-d9에서의 페닐 고리는, 에스테르로서 기능화되어 전구약물의 일부가 될 수 있다.
특정 구현예에서, ULM-a1 내지 ULM-a15, ULM-b1 내지 ULM-b12, ULM-c1 내지 ULM-c15 및 ULM-d1 내지 ULM-d9에서의 피롤리딘 상의 하이드록실기는 각각 에스테르-연결 전구약물 모이어티를 포함한다.
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, ULM 및 ULM'(존재할 경우)은 각각 독립적으로 다음의 화학 구조식에 따른 기:
(여기서,
ULM-g의 R1'은 선택적으로 치환된 C1-C6 알킬기, 선택적으로 치환된 -(CH2)nOH, 선택적으로 치환된 -(CH2)nSH, 선택적으로 치환된 (CH2)n-O-(C1-C6)알킬 기, 선택적으로 치환된 (CH2)n-WCOCW-(C0-C6)알킬 기(에폭시드 모이어티 WCOCW를 포함하고 각각의 W는 독립적으로 H 또는 C1-C3 알킬 기를 포함함), 선택적으로 치환된 -(CH2)nCOOH, 선택적으로 치환된 -(CH2)nC(O)-(C1-C6 알킬), 선택적으로 치환된 -(CH2)nNHC(O)-R1, 선택적으로 치환된 -(CH2)nC(O)-NR1R2, 선택적으로 치환된 -(CH2)nOC(O)-NR1R2, -(CH2O)nH, 선택적으로 치환된 -(CH2)nOC(O)-(C1-C6 알킬), 선택적으로 치환된 -(CH2)nC(O)-O-(C1-C6 알킬), 선택적으로 치환된 -(CH2O)nCOOH, 선택적으로 치환된 -(OCH2)nO-(C1-C6 알킬), 선택적으로 치환된 -(CH2O)nC(O)-(C1-C6 알킬), 선택적으로 치환된 -(OCH2)nNHC(O)-R1, 선택적으로 치환된 -(CH2O)nC(O)-NR1R2, -(CH2CH2O)nH, 선택적으로 치환된 -(CH2CH2O)nCOOH, 선택적으로 치환된 -(OCH2CH2)nO-(C1-C6 알킬), 선택적으로 치환된 -(CH2CH2O)nC(O)-(C1-C6 알킬), 선택적으로 치환된 -(OCH2CH2)nNHC(O)-R1, 선택적으로 치환된 -(CH2CH2O)nC(O)-NR1R2,선택적으로 치환된 -SO2RS, 선택적으로 치환된 S(O)RS, NO2, CN 또는 할로겐 (F, Cl, Br, I, 바람직하게는 F 또는 Cl)이고;
ULM-g의 R1 및 R2는 각각 독립적으로 H 또는 C1-C6 알킬기(1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개 까지의 할로겐기(바람직하게는 불소)로 선택적으로 치환될 수 있음)이고;
ULM-g의 RS는 C1-C6 알킬기, 선택적으로 치환된 아릴, 헤테로아릴이거나 헤테로고리기 또는 -(CH2)mNR1R2 기이고;
ULM-g의 X 및 X'은 각각 독립적으로 C=O, C=S, -S(O), S(O)2이고(바람직하게는 X 및 X'는 모두 C=O임);
ULM-g의 R2'는 선택적으로 치환된 -(CH2)n-(C=O)u(NR1)v(SO2)w알킬기, 선택적으로 치환된 -(CH2)n-(C=O)u(NR1)v(SO2)wNR1NR2N 기, 선택적으로 치환된 -(CH2)n-(C=O)u(NR1)v(SO2)w-아릴, 선택적으로 치환된 -(CH2)n-(C=O)u(NR1)v(SO2)w-헤테로아릴, 선택적으로 치환된 -(CH2)n-(C=O)vNR1(SO2)w-헤테로고리, 선택적으로 치환된 -NR1-(CH2)n-C(O)u(NR1)v(SO2)w-알킬, 선택적으로 치환된 -NR1-(CH2)n-C(O)u(NR1)v(SO2)w- NR1NR2N, 선택적으로 치환된 -NR1-(CH2)n-C(O)u(NR1)v(SO2)w-NR1C(O)R1N, 선택적으로 치환된 -NR1-(CH2)n-(C=O)u(NR1)v(SO2)w-아릴, 선택적으로 치환된 -NR1-(CH2)n-(C=O)u(NR1)v(SO2)w-헤테로아릴 또는 선택적으로 치환된 -NR1-(CH2)n-(C=O)vNR1(SO2)w-헤테로고리, 선택적으로 치환된 -XR2'-알킬기; 선택적으로 치환된 -XR2'-아릴기; 선택적으로 치환된 -XR2'-헤테로아릴기; 선택적으로 치환된 -XR2'-헤테로고리기; 선택적으로 치환된;
ULM-g의 R3'는 선택적으로 치환된 알킬, 선택적으로 치환된 -(CH2)n-(O)u(NR1)v(SO2)w-알킬, 선택적으로 치환된 -(CH2)n-C(O)u(NR1)v(SO2)w-NR1NR2N, 선택적으로 치환된 -(CH2)n-C(O)u(NR1)v(SO2)w-NR1C(O)R1N, 선택적으로 치환된 -(CH2)n-C(O)u(NR1)v(SO2)w-C(O)NR1R2, 선택적으로 치환된 -(CH2)n-C(O)u(NR1)v(SO2)w-아릴, 선택적으로 치환된 -(CH2)n-C(O)u(NR1)v(SO2)w-헤테로아릴, 선택적으로 치환된 -(CH2)n-C(O)u(NR1)v(SO2)w-헤테로고리, 선택적으로 치환된 -NR1-(CH2)n-C(O)u(NR1)v(SO2)w-알킬, 선택적으로 치환된 -NR1-(CH2)n-C(O)u(NR1)v(SO2)w- NR1NR2N, 선택적으로 치환된 -NR1-(CH2)n-C(O)u(NR1)v(SO2)w-NR1C(O)R1N, 선택적으로 치환된 -NR1-(CH2)n-C(O)u(NR1)v(SO2)w-아릴, 선택적으로 치환된 -NR1-(CH2)n-C(O)u(NR1)v(SO2)w-헤테로아릴, 선택적으로 치환된 -NR1-(CH2)n-C(O)u(NR1)v(SO2)w-헤테로고리, 선택적으로 치환된 -O-(CH2)n-(C=O)u(NR1)v(SO2)w-알킬, 선택적으로 치환된 -O-(CH2)n-(C=O)u(NR1)v(SO2)w-NR1NR2N, 선택적으로 치환된 -O-(CH2)n-(C=O)u(NR1)v(SO2)w-NR1C(O)R1N, 선택적으로 치환된 -O-(CH2)n-(C=O)u(NR1)v(SO2)w-아릴, 선택적으로 치환된 -O-(CH2)n-(C=O)u(NR1)v(SO2)w-헤테로아릴 또는 선택적으로 치환된 -O-(CH2)n-(C=O)u(NR1)v(SO2)w-헤테로고리; -(CH2)n-(V)n'-(CH2)n-(V)n'-알킬기, 선택적으로 치환된 -(CH2)n-(V)n'-(CH2)n-(V)n'-아릴기, 선택적으로 치환된 -(CH2)n-(V)n'-(CH2)n-(V)n'-헤테로아릴기, 선택적으로 치환된 -(CH2)n-(V)n'-(CH2)n-(V)n'-헤테로고리'기, 선택적으로 치환된 -(CH2)n-N(R1')(C=O)m'-(V)n'-알킬기, 선택적으로 치환된 -(CH2)n-N(R1')(C=O)m'-(V)n'-아릴기, 선택적으로 치환된 -(CH2)n-N(R1')(C=O)m'-(V)n'-헤테로아릴기, 선택적으로 치환된 -(CH2)n-N(R1')(C=O)m'-(V)n'-헤테로고리기, 선택적으로 치환된 -XR3'- 알킬기; 선택적으로 치환된 -XR3'-아릴기; 선택적으로 치환된 -XR3'-헤테로아릴기; 선택적으로 치환된 -XR3'-헤테로고리기; 선택적으로 치환되며;
ULM-g의 R1N 및 R2N은 각각 독립적으로 H, C1-C6 알킬(1개 또는 2개의 하이드록실기 및 3개까지의 할로겐기로 선택적으로 치환됨), 또는 선택적으로 치환된 -(CH2)n-아릴, -(CH2)n-헤테로아릴 또는 -(CH)2)n-헤테로고리기이고;
ULM-g의 V는 O, S 또는 NR1이고;
ULM-g의 R1은 전술한 바와 같고;
ULM-g의 R1 및 R1'은 각각 독립적으로 H 또는 C1-C3 알킬기이고;
ULM-g의 XR2' 및 XR3'은 각각 독립적으로, 선택적으로 치환된 -CH2)n-, -CH2)n-CH(Xv)=CH(Xv)- (시스 또는 트랜스), -CH2)n-CH≡CH-, -(CH2CH2O)n- 또는 C3-C6 시클로알킬기, 여기서 Xv는 H, 할로 또는 선택적으로 치환된 C1-C3 알킬기이고;
ULM-g의 각각의 m은 독립적으로 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6이고;
ULM-g의 각각의 m'은 독립적으로 0 또는 1이고;
ULM-g의 각각의 n은 독립적으로 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6이고;
ULM-g의 각각의 n' 은 독립적으로 0 또는 1이고;
ULM-g의 각각의 u는 독립적으로 0 또는 1이고;
ULM-g의 각각의 v는 독립적으로 0 또는 1이고;
ULM-g의 각각의 w는 독립적으로 0 또는 1이고; 및
PTM이 ULM'이 아닐 경우, ULM-g의 R1', R2', R3', X 및 X' 중 임의의 하나 이상은 연결기를 통해 상기 PTM기에 공유 결합되도록 선택적으로 변형되거나, PTM이 ULM'일 경우, ULM 및 ULM' 각각의 R1', R2', R3', X 및 X' 중 임의의 하나 이상은 서로에게 직접적으로, 또는 연결기를 통해 공유 결합되도록 선택적으로 변형됨), 또는 이의 약제학적으로 허용가능한 염, 입체이성질체, 용매화물 또는 다형체이다.
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, ULM 및 ULM'(존재할 경우)은 각각 독립적으로 다음의 화학 구조식에 따른 기:
(여기서,
ULM-h의 각각의 R1', R2' 및 R3'은 전술한 바와 같고, X는 C=O, C=S, -S(O)기 또는 S(O)2기, 보다 바람직하게는 C=O기이고,
PTM이 ULM'이 아닐 경우, ULM-h의 R1', R2' 및 R3' 중 임의의 하나 이상은 PTM 기에 추가적으로 공유 결합되는 연결 기에 결합되도록 선택적으로 변형되고, 또는 PTM이 ULM'일 경우, ULM 및 ULM' 각각의 R1', R2', R3' 중 임의의 하나 이상은 서로에게 직접적으로, 또는 연결기를 통해 공유 결합되도록 선택적으로 변형됨), 또는
이의 약제학적으로 허용가능한 염, 거울상 이성질체, 부분입체이성질체, 용매화물 또는 다형체이다.
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, ULM 및 ULM'(존재할 경우)은 각각 독립적으로 다음의 화학 구조식에 따른 기:
(여기서,
PTM이 ULM'이 아닐 경우, ULM-I의 R1', R2' 및 R3' 중 임의의 하나 이상은 PTM 기에 추가적으로 공유 결합되는 연결 기에 결합되도록 선택적으로 변형되고, 또는 PTM이 ULM'일 경우, ULM 및 ULM' 각각의 R1', R2', R3' 중 임의의 하나 이상은 서로에게 직접적으로, 또는 연결기를 통해 공유 결합되도록 선택적으로 변형됨), 또는
이의 약제학적으로 허용가능한 염, 거울상 이성질체, 부분입체이성질체, 용매화물 또는 다형체이다.
본 발명의 다른 양태에서, ULM-g의 R1'은, 바람직하게는 하이드록실기 또는 하이드록실 또는 카르복실기로 대사될 수 있는 기로서, 그 화합물은 활성 화합물의 전구약물 형태를 나타낸다. 예시적인 바람직한 R1' 기는, 예를 들어 -(CH2)nOH, (CH2)n-O-(C1-C6)알킬 기, -(CH2)nCOOH, -(CH2O)nH, 선택적으로 치환된 -(CH2)nOC(O)-(C1-C6 알킬), 또는 선택적으로 치환된 -(CH2)nC(O)-O-(C1-C6 알킬)을 포함한다(여기서, n은 0 또는 1임). 여기서, R1'는 카르복실산기, 하이드록실기 또는 아민기, (각각 선택적으로 치환될 수 있는) 하이드록실기, 카르복실산기 또는 아민기이거나 이를 함유하고, PTM기(ULM' 기를 포함함)가 결합되는 연결기에 공유 연결을 제공하도록 추가적으로 화학적으로 변형될 수 있고;
ULM-g 및 ULM-h의 X 및 X'(존재하는 경우)는 바람직하게는 C=O, C=S, -S(O)기 또는 S(O)2기, 보다 바람직하게는 C=O기이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 R2'는, 바람직하게는 선택적으로 치환된 -NR1-T-아릴, 선택적으로 치환된 -NR1-T-헤테로아릴기 또는 선택적으로 치환된 -NR1-T-헤테로고리이고, 여기서 R1은 H 또는 CH3, 바람직하게는 H이고, T는 선택적으로 치환된 -(CH2)n- 기이되, 각각의 메틸렌기는, 바람직하게는 할로겐, 본원에서 달리 기술된 바와 같은 아미노산 측쇄 또는 C1-C3 알킬기, 바람직하게는 선택적으로 치환될 수 있는 1개 또는 2개의 메틸기로부터 선택되는 1개 또는 2개의 치환기로 선택적으로 치환될 수 있으며; n은 0 내지 6(예를 들어, 0, 1, 2 또는 3, 예컨대 0 또는 1)이다. 대안적으로, T는 또한 -(CH2O)n- 기, -(OCH2)n- 기, -(CH2CH2O)n- 기, -(OCH2CH2)n- 기일 수 있으며, 모든 기는 선택적으로 치환된다.
ULM-g 내지 ULM-i의 R2'에 대해 바람직한 아릴 기는, 선택적으로 치환된 페닐 또는 나프틸 기, 바람직하게는 페닐 기 (여기서 페닐 또는 나프틸 기는 PTM 기(ULM' 기를 포함)가 부착되는 연결기를 통해 PTM에 선택적으로 연결됨), 할로겐(바람직하게는 F 또는 Cl), 아민, 모노알킬- 또는 디알킬 아민(바람직하게는, 디메틸아민), F, Cl, OH, COOH, C1-C6 알킬, 바람직하게는 CH3, CF3, OMe, OCF3, NO2, 또는 CN 기(이들 각각은 페닐 고리의 오르토-, 메타- 및/또는 파라- 위치에 있을 수 있고 바람직하게는 파라-위치에 있음), 선택적으로 치환된 페닐 기(페닐 기 자체는 ULM' 기를 포함한, PTM 기에 연결기로 선택적으로 연결됨), 및/또는 F, Cl, OH, COOH, CH3, CF3, OMe, OCF3, NO2, 또는 CN 기(페닐 고리의 오르토-, 메타- 및/또는 파라- 위치, 바람직하게는 파라-위치에서), 나프틸 기(선택적으로 치환될 수 있음), 선택적으로 치환된 헤테로아릴, 바람직하게는 메틸치환 이속사졸을 포함한 선택적으로 치환된 이속사졸, 메틸치환 옥사졸을 포함한 선택적으로 치환된 옥사졸, 메틸 치환된 이소티아졸을 포함한 선택적으로 치환된 티아졸, 메틸 치환된 피롤을 포함한 선택적으로 치환된 피롤, 메틸이미다졸을 포함한 선택적으로 치환된 이미다졸, 선택적으로 치환된 벤즈이미다졸 또는 메톡시벤질이미다졸, 선택적으로 치환된 옥시이미다졸 또는 메틸옥시이미다졸, 메틸디아졸 기를 포함한 선택적으로 치환된 디아졸 기, 메틸치환 트리아졸 기를 포함한 선택적으로 치환된 트리아졸 기, 할로-(바람직하게는 F) 또는 메틸치환피리딘 기 또는 옥시피리딘 기(여기서 피리딘 기는 산소에 의해 페닐 기에 연결됨)를 포함한 선택적으로 치환된 피리딘 기, 선택적으로 치환된 푸란, 선택적으로 치환된 벤조푸란, 선택적으로 치환된 디하이드로 벤조푸란, 선택적으로 치환된 인돌, 인돌리진 또는 아자인돌리진(2, 3, 또는 4-아자인돌리진), 선택적으로 치환된 퀴놀린, 본 화학 구조식에 따른 선택적으로 치환된 기를 포함한다:
여기서,
ULM-g 내지 ULM-i의 Sc는 CHRSS, NRURE, 또는 O이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 RHET는, H, CN, NO2, 할로(바람직하게는 Cl 또는 F), 선택적으로 치환된 C1-C6 알킬(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기(예를 들어, CF3)로 치환됨), 선택적으로 치환된 O(C1-C6 알킬)(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기로 치환됨) 또는 선택적으로 치환된 아세틸렌기 -C≡C-Ra(여기서 Ra는 H 또는 C1-C6 알킬기(바람직하게는 C1-C3 알킬)임)이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 RSS는, H, CN, NO2, 할로(바람직하게는 F 또는 Cl), 선택적으로 치환된 C1-C6 알킬(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기로 치환됨), 선택적으로 치환된 O-(C1-C6 알킬(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기로 치환됨) 또는 선택적으로 치환된 -C(O)(C1-C6 알킬)(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기로 치환됨)이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 RURE는, H, C1-C6 알킬(바람직하게는 H 또는 C1-C3 알킬) 또는 -C(O)(C1-C6 알킬)(이들 기 각각은 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로겐, 바람직하게는 불소기로 선택적으로 치환됨), 또는 선택적으로 치환된 페닐기, 선택적으로 치환된 헤테로아릴, 또는 선택적으로 치환된 헤테로고리(바람직하게는, 예를 들어, 피페리딘, 모르폴린, 피롤리딘, 테트라하이드로푸란)이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 RPRO는 H, 선택적으로 치환된 C1-C6 알킬 또는 선택적으로 치환된 아릴(페닐 또는 나프틸), 옥사졸, 이속사졸, 티아졸, 이소티아졸, 이미다졸, 디아졸, 옥시이미다졸, 피롤, 피롤리딘, 푸란, 디하이드로푸란, 테트라하이드로푸란, 티엔, 디하이드로티엔, 테트라하이드로티엔, 피리딘, 피페리딘, 피페라진, 모르폴린, 퀴놀린 (각각 바람직하게는 C1-C3 알킬기, 바람직하게는 메틸 또는 할로기, 바람직하게는 F 또는 Cl로 치환됨), 벤조푸란, 인돌, 인돌리진, 아자인돌리진으로 이루어진 군으로부터 선택되는 헤테로아릴 또는 헤테로고리기이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 RPRO1 및 RPRO2는 각각 독립적으로 H, 선택적으로 치환된 C1-C3 알킬기, 또는 함께 케토기를 형성하고; 및
ULM-g 내지 ULM-i의 각각의 n은 독립적으로 0, 1, 2, 3, 4, 5, 또는 6(바람직하게는 0 또는 1)이거나, 선택적으로 치환된 헤테로고리, 바람직하게는 테트라하이드로푸란, 테트라하이드로티엔, 피페리딘, 피페라진 또는 모르폴린(이들 각각의 기는 치환될 경우, 바람직하게는 메틸 또는 할로(F, Br, Cl)로 치환되고, 이들 각각의 기는 연결기를 통해 PTM기(ULM'기를 포함함)에 선택적으로 연결됨)이다.
바람직한 특정 양태에서, ULM-g 내지 ULM-i의 는, 또는 기이고,
여기서 ULM-g 내지 ULM-i의 RPRO 및 n은 전술한 바와 같다.
ULM-g 내지 ULM-i의 R2'에 대한 바람직한 헤테로아릴기는, 선택적으로 치환된 퀴놀린(약물중합체에 부착되거나 퀴놀린 고리 내의 임의의 탄소 원자 상에 치환될 수 있음), 선택적으로 치환된 인돌, 선택적으로 치환된 인돌리진, 선택적으로 치환된 아자인돌리진, 선택적으로 치환된 벤조푸란을 포함하는 선택적으로 치환된 이속사졸, 선택적으로 치환된 티아졸, 선택적으로 치환된 이소티아졸, 선택적으로 치환된 티오펜, 선택적으로 치환된 피리딘(2-, 3, 또는 4-피리딘), 선택적으로 치환된 이미다졸, 선택적으로 치환된 피롤, 선택적으로 치환된 디아졸, 선택적으로 치환된 트리아졸, 테트라아졸, 선택적으로 치환된 옥시미다졸, 또는 다음의 화학 구조식에 따른 기를 포함하고:
여기서,
ULM-g 내지 ULM-i의 Sc는 CHRSS, NRURE, 또는 O이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 RHET는, H, CN, NO2, 할로(바람직하게는 Cl 또는 F), 선택적으로 치환된 C1-C6 알킬(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기(예를 들어, CF3)로 치환됨), 선택적으로 치환된 O(C1-C6 알킬)(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기로 치환됨) 또는 선택적으로 치환된 아세틸렌기 -C≡CRa(ULM-g 내지 ULM-i의 Ra는 H 또는 C1-C6 알킬기(바람직하게는 C1-C3 알킬)임)이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 RSS는, H, CN, NO2, 할로(바람직하게는 F 또는 Cl), 선택적으로 치환된 C1-C6 알킬(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기로 치환됨), 선택적으로 치환된 O-(C1-C6 알킬(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기로 치환됨) 또는 선택적으로 치환된 -C(O)(C1-C6 알킬)(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기로 치환됨)이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 RURE는, H, C1-C6 알킬(바람직하게는 H 또는 C1-C3 알킬) 또는 -C(O)(C1-C6 알킬)(이들 기 각각은 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로겐, 바람직하게는 불소기로 선택적으로 치환됨), 또는 선택적으로 치환된 헤테로고리, 예를 들어, 각각 선택적으로 치환된, 피페리딘, 모르폴린, 피롤리딘, 테트라하이드로푸란, 테트라하이드로티오펜, 피페리딘, 피페라진이고, 및
ULM-g 내지 ULM-i의 YC는, N 또는 C-RYC이고, 여기서 RYC는 H, OH, CN, NO2, 할로(바람직하게는 Cl 또는 F), 선택적으로 치환된 C1-C6 알킬(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기(예를 들어, CF3)로 치환됨), 선택적으로 치환된 O(C1-C6 알킬) (바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기로 치환됨) 또는 선택적으로 치환된 아세틸렌기 -C≡CRa (Ra는 H 또는 C1-C6 알킬기(바람직하게는 C1-C3 알킬)임)이고, 이들 기 각각은 연결기를 통해 PTM 기(ULM'기를 포함함)에 선택적으로 연결된다.
ULM-g 내지 ULM-i의 R2'에 대한 바람직한 헤테로고리기는, 테트라하이드로푸란, 테트라하이드로티엔, 테트라하이드로퀴놀린, 피페리딘, 피페라진, 피롤리딘, 모르폴린, 옥산 또는 티안(이들 기 각각은 선택적으로 치환될 수 있음), 또는 다음의 화학 구조식에 따른 기를 포함하고:
또는 바람직하게는, 또는 기,
여기서,
ULM-g 내지 ULM-i의 RPRO는 H, 선택적으로 치환된 C1-C6 알킬 또는 선택적으로 치환된 아릴, 헤테로아릴 또는 헤테로고리기이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 RPRO1 및 RPRO2는 각각 독립적으로 H, 선택적으로 치환된 C1-C3 알킬기, 또는 함께 케토기를 형성하고,
ULM-g 내지 ULM-i의 각각의 n은 독립적으로 0, 1, 2, 3, 4, 5 또는 6(종종 0 또는 1)이고, 이들 각각의 기는 연결기를 통해 PTM기(ULM'기를 포함함)에 선택적으로 연결될 수 있다.
ULM-g 내지 ULM-i의 바람직한 R2' 치환기는 또한 구체적으로, (본 명세서 및 본원에 첨부된 도면에 개시된 특정 화합물들을 포함하는) 본원에 기술된 식별된 화합물들에서 발견되는 R2' 치환기들을 (기술된 특정 화합물에 대한 제한 없이) 포함한다. 이들 각각의 R2' 치환기는 본원에 개시된 임의의 수의 R3' 치환기와 함께 사용될 수 있다.
ULM-g 내지 ULM-i의 R3'는, 바람직하게는 선택적으로 치환된 -T-아릴, 선택적으로 치환된 -T-헤테로아릴, 선택적으로 치환된 -T-헤테로고리, 선택적으로 치환된 -NR1-T-아릴, 선택적으로 치환된 -NR1-T-헤테로아릴 또는 선택적으로 치환된 -NR1-T-헤테로고리이다. 바람직한 구현예에서, R1은 H 또는 C1-C3 알킬기, 바람직하게는 H 또는 CH3이고, T는 선택적으로 치환된 -(CH2)n- 기이되, 각각의 메틸렌기는, 바람직하게는 할로겐, (선형, 분지형, 선택적으로 치환된) C1-C6 알킬기 또는 본원에서 달리 기술된 바와 같은 아미노산 측쇄, 바람직하게는 선택적으로 치환될 수 있는 메틸기로부터 선택되는 1개 또는 2개의 치환기로 선택적으로 치환될 수 있으며; n은 0 내지 6, 예를 들어, 0, 1, 2 또는 3(예컨대, 0 또는 1)이다. 대안적으로, T는 또한 -(CH2O)n- 기, -(OCH2)n- 기, -(CH2CH2O)n- 기, -(OCH2CH2)n- 기일 수 있으며, 이들 각각의 기는 선택적으로 치환된다.
ULM-g 내지 ULM-i의 R3'에 대한 바람직한 아릴기는, 선택적으로 치환된 페닐 또는 나프틸기, 바람직하게는 페닐기 (여기서 페닐 또는 나프틸기는 연결기를 통해 PTM기(ULM'를 포함함)에 부착됨) 및/또는 할로겐(바람직하게는 F 또는 Cl), 아민, 모노알킬- 또는 디알킬 아민(바람직하게는, 디메틸아민), 아미도기(바람직하게는, -(CH2)m-NR1C(O)R2 기(여기서, m, R1 및 R2은 전술한 바와 같음)), 할로(종종 F 또는 Cl), OH, CH3, CF3, OMe, OCF3, NO2, ,CN 또는 S(O)2RS 기(RS는 C1-C6 알킬기, 선택적으로 치환된 아릴, 헤테로아릴 또는 헤테로고리기 또는 -(CH2)mNR1R2 기임) (이들 각각은 페닐 고리의 오르쏘-, 메타- 및/또는 파라 위치, 바람직하게는 파라 위치에서 치환될 수 있음), 또는 아릴(바람직하게는 페닐), 헤테로아릴 또는 헤테로고리를 포함한다. 전술한 치환기 페닐기는, 바람직하게는 선택적으로 치환된 페닐기(즉, 치환기 페닐기 자체는, 바람직하게는 F, Cl, OH, SH, COOH, CH3, CF3, OMe, OCF3, NO2, CN 또는 PTM기(ULM'기를 포함함)에 부착된 연결기 중 적어도 하나로 치환되되, 치환은 페닐 고리의 오르쏘-, 메타- 및/또는 파라 위치, 바람직하게는 파라 위치에서 일어남), 전술한 바와 같이 선택적으로 치환될 수 있는 나프틸기, 선택적으로 치환된 헤테로아릴, 바람직하게는, 메틸 치환된 이속사졸을 포함하는 선택적으로 치환된 이속사졸, 메틸 치환된 옥사졸을 포함하는 선택적으로 치환된 옥사졸, 메틸 치환된 티아졸을 포함하는 선택적으로 치환된 티아졸, 메틸치환된 피롤을 포함하는 선택적으로 치환된 피롤, 메틸이미다졸, 벤질이미다졸 또는 메톡시벤질이미다졸을 포함하는 선택적으로 치환된 이미다졸, 메틸디아졸기를 포함하는 선택적으로 치환된 디아졸기, 메틸 치환된 트리아졸기를 포함하는 선택적으로 치환된 트리아졸기, 할로-(바람직하게는, F) 또는 메틸 치환된 피리딘기 또는 옥사피리딘기(여기서, 피리딘기는 산소에 의해 페닐기에 연결됨)를 포함하는 피리딘기, 또는 선택적으로 치환된 헤테로고리(테트라하이드로푸란, 테트라하이드로티오펜, 피롤리딘, 피페리딘, 모르폴린, 피페라진, 테트라하이드로퀴놀린, 옥산 또는 티안)이다. 각각의 아릴, 헤테로아릴 또는 헤테로고리기는 연결기를 통해 PTM 기(ULM' 기를 포함함)에 선택적으로 연결될 수 있다.
ULM-g 내지 ULM-i의 R3'에 대한 바람직한 헤테로아릴기는, 선택적으로 치환된 퀴놀린(약물중합체에 부착되거나 퀴놀린 고리 내의 임의의 탄소 원자 상에 치환될 수 있음), 선택적으로 치환된 인돌(디하이드로인돌을 포함함), 선택적으로 치환된 인돌리진, 선택적으로 치환된 아자인돌리진(2, 3 또는 4-아자인돌리진), 선택적으로 치환된 벤즈이미다졸, 벤조디아졸, 벤즈옥소푸란, 선택적으로 치환된 이미다졸, 선택적으로 치환된 이속사졸, 선택적으로 치환된 옥사졸(바람직하게는 메틸 치환됨), 선택적으로 치환된 디아졸, 선택적으로 치환된 트리아졸, 테트라졸, 선택적으로 치환된 벤조푸란, 선택적으로 치환된 티오펜, 선택적으로 치환된 티아졸(바람직하게는 메틸 및/또는 티올 치환됨), 선택적으로 치환된 이소티아졸, 선택적으로 치환된 트리아졸(바람직하게는 메틸기로 치환된 1,2,3-트리아졸, 트리이소프로필실릴기, 선택적으로 치환된 -(CH2)m-O-C1-C6 알킬기 또는 선택적으로 치환된 -(CH2)m-C(O)-O-C1-C6 알킬기), 선택적으로 치환된 피리딘(2-, 3- 또는 4-피리딘) 또는 다음의 화학 구조식에 따른 기를 포함한다:
여기서,
ULM-g 내지 ULM-i의 Sc는 CHRSS, NRURE, 또는 O이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 RHET는, H, CN, NO2, 할로(바람직하게는 Cl 또는 F), 선택적으로 치환된 C1-C6 알킬(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기(예를 들어, CF3)로 치환됨), 선택적으로 치환된 O(C1-C6 알킬)(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기로 치환됨) 또는 선택적으로 치환된 아세틸렌기 -C≡C-Ra(여기서 Ra는 H 또는 C1-C6 알킬기(바람직하게는 C1-C3 알킬)임)이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 RSS는, H, CN, NO2, 할로(바람직하게는 F 또는 Cl), 선택적으로 치환된 C1-C6 알킬(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기로 치환됨), 선택적으로 치환된 O-(C1-C6 알킬(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기로 치환됨) 또는 선택적으로 치환된 -C(O)(C1-C6 알킬)(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기로 치환됨)이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 RURE는, H, C1-C6 알킬(바람직하게는 H 또는 C1-C3 알킬) 또는 -C(O)(C1-C6 알킬)(이들 기 각각은 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로겐, 바람직하게는 불소기로 선택적으로 치환됨), 또는 선택적으로 치환된 헤테로고리, 예를 들어, 각각 선택적으로 치환된, 피페리딘, 모르폴린, 피롤리딘, 테트라하이드로푸란, 테트라하이드로티오펜, 피페리딘, 피페라진이고, 및
ULM-g 내지 ULM-i의 YC는, N 또는 C-RYC이고, 여기서 RYC는 H, OH, CN, NO2, 할로(바람직하게는 Cl 또는 F), 선택적으로 치환된 C1-C6 알킬(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기(예를 들어, CF3)로 치환됨), 선택적으로 치환된 O(C1-C6 알킬) (바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기로 치환됨) 또는 선택적으로 치환된 아세틸렌기 -C≡C-Ra (Ra는 H 또는 C1-C6 알킬기(바람직하게는 C1-C3 알킬)임)이다. 각각의 전술한 헤테로아릴기는 연결기를 통해 PTM 기(ULM' 기를 포함함)에 선택적으로 연결될 수 있다.
ULM-g 내지 ULM-i의 R3'에 대한 바람직한 헤테로고리기는, 테트라하이드로퀴놀린, 피페리딘, 피페라진, 피롤리딘, 모르폴린, 테트라하이드로푸란, 테트라하이드로티오펜, 옥산 및 티안(이들 기 각각은 선택적으로 치환될 수 있음), 또는 다음의 화학 구조식에 따른 기를 포함하고:
또는 , 바람직하게는, 또는 기,
여기서,
ULM-g 내지 ULM-i의 RPRO는 H, 선택적으로 치환된 C1-C6 알킬 또는 선택적으로 치환된 아릴(페닐 또는 나프틸), 옥사졸, 이속사졸, 티아졸, 이소티아졸, 이미다졸, 디아졸, 옥시이미다졸, 피롤, 피롤리딘, 푸란, 디하이드로푸란, 테트라하이드로푸란, 티엔, 디하이드로티엔, 테트라하이드로티엔, 피리딘, 피페리딘, 피페라진, 모르폴린, 퀴놀린 (각각 바람직하게는 C1-C3 알킬기, 바람직하게는 메틸 또는 할로기, 바람직하게는 F 또는 Cl로 치환됨), 벤조푸란, 인돌, 인돌리진, 아자인돌리진으로 이루어진 군으로부터 선택되는 헤테로아릴 또는 헤테로고리기이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 RPRO1 및 RPRO2는 각각 독립적으로 H, 선택적으로 치환된 C1-C3 알킬기, 또는 함께 케토기를 형성하고, 그리고
ULM-g 내지 ULM-i의 각각의 n은 0, 1, 2, 3, 4, 5 또는 6(바람직하게는 0 또는 1)이되, 각각의 전술한 헤테로고리기는 연결기를 통해 PTM 기(ULM'기를 포함함)에 선택적으로 연결될 수 있다.
ULM-g 내지 ULM-i의 바람직한 R3' 치환기는 또한 구체적으로, (본 명세서 및 본원에 첨부된 도면에 개시된 특정 화합물들을 포함하는) 본원에 기술된 식별된 화합물들에서 발견되는 R3' 치환기들을 (기술된 특정 화합물에 대한 제한 없이) 포함한다. 이들 각각의 R3' 치환기는 본원에 개시된 임의의 수의 R2' 치환기와 함께 사용될 수 있다.
소정의 대안적인 바람직한 구현예에서, ULM-g 내지 ULM-i의 R2'는 선택적으로 치환된 -NR1-XR2'-알킬기, -NR1-XR2'-아릴기; 선택적으로 치환된 -NR1- XR2'-HET, 선택적으로 치환된 -NR1-XR2'-아릴-HET 또는 선택적으로 치환된 -NR1- XR2'-HET-아릴이고,
여기서,
ULM-g 내지 ULM-i의 R1은 H 또는 C1-C3 알킬기(바람직하게는 H)이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 XR2'는 선택적으로 치환된 -CH2)n- , -CH2)n-CH(Xv)=CH(Xv)- (시스 또는 트랜스), -(CH2)n-CH≡CH-, -(CH2CH2O)n- 또는 C3-C6 시클로알킬기이고; 및
ULM-g 내지 ULM-i의 Xv는 H, 할로 또는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로겐기로 선택적으로 치환되는 C1-C3 알킬기이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 알킬은 선택적으로 치환된 C1-C10 알킬기(바람직하게는 C1-C6 알킬기) (바람직한 특정 구현예에서, 알킬기는 할로기, 종종 Cl 또는 Br로 말단-캡핑됨)이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 아릴은 선택적으로 치환된 페닐 또는 나프틸기(바람직하게는, 페닐기)이고; 및
ULM-g 내지 ULM-i의 HET는 선택적으로 치환된 옥사졸, 이속사졸, 티아졸, 이소티아졸, 이미다졸, 디아졸, 옥시미다졸, 피롤, 피롤리딘, 푸란, 디하이드로푸란, 테트라하이드로푸란, 티엔, 디하이드로티엔, 테트라하이드로티엔, 피리딘, 피페리딘, 피페라진, 모르폴린, 벤조푸란, 인돌, 인돌리진, 아자인돌리진, 퀴놀린(치환될 경우, 각각은 바람직하게는 C1-C3 알킬기, 바람직하게는 메틸 또는 할로기, 바람직하게는 F 또는 Cl로 치환됨) 또는 다음의 화학 구조식에 따른 기이다:
ULM-g 내지 ULM-i의 Sc는 CHRSS, NRURE, 또는 O이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 RHET는, H, CN, NO2, 할로(바람직하게는 Cl 또는 F), 선택적으로 치환된 C1-C6 알킬(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기(예를 들어, CF3)로 치환됨), 선택적으로 치환된 O(C1-C6 알킬)(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기로 치환됨) 또는 선택적으로 치환된 아세틸렌기 -C≡C-Ra(여기서 Ra는 H 또는 C1-C6 알킬기(바람직하게는 C1-C3 알킬)임)이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 RSS는, H, CN, NO2, 할로(바람직하게는 F 또는 Cl), 선택적으로 치환된 C1-C6 알킬(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기로 치환됨), 선택적으로 치환된 O-(C1-C6 알킬(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기로 치환됨) 또는 선택적으로 치환된 -C(O)(C1-C6 알킬)(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기로 치환됨)이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 RURE는, H, C1-C6 알킬(바람직하게는 H 또는 C1-C3 알킬) 또는 -C(O)(C1-C6 알킬)(이들 기 각각은 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로겐, 바람직하게는 불소기로 선택적으로 치환됨), 또는 선택적으로 치환된 헤테로고리, 예를 들어, 각각 선택적으로 치환된, 피페리딘, 모르폴린, 피롤리딘, 테트라하이드로푸란, 테트라하이드로티오펜, 피페리딘, 피페라진이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 YC는 N 또는 C-RYC이고, 여기서 RYC는 H, CN, NO2, 할로(바람직하게는 Cl 또는 F), 선택적으로 치환된 C1-C6 알킬(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기(예를 들어, CF3)로 치환됨), 선택적으로 치환된 O(C1-C6 알킬)(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기로 치환됨) 또는 선택적으로 치환된 아세틸렌기 -C≡C-Ra(Ra는 H 또는 C1-C6 알킬기(바람직하게는 C1-C3 알킬)임)이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 RPRO는 H, 선택적으로 치환된 C1-C6 알킬 또는 선택적으로 치환된 아릴(페닐 또는 나프틸), 옥사졸, 이속사졸, 티아졸, 이소티아졸, 이미다졸, 디아졸, 옥시이미다졸, 피롤, 피롤리딘, 푸란, 디하이드로푸란, 테트라하이드로푸란, 티엔, 디하이드로티엔, 테트라하이드로티엔, 피리딘, 피페리딘, 피페라진, 모르폴린, 퀴놀린 (각각 바람직하게는 C1-C3 알킬기, 바람직하게는 메틸 또는 할로기, 바람직하게는 F 또는 Cl로 치환됨), 벤조푸란, 인돌, 인돌리진, 아자인돌리진으로 이루어진 군으로부터 선택되는 헤테로아릴 또는 헤테로고리기이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 RPRO1 및 RPRO2는 각각 독립적으로 H, 선택적으로 치환된 C1-C3 알킬기, 또는 함께 케토기를 형성하고, 그리고
ULM-g 내지 ULM-i의 각각의 n은 독립적으로 0, 1, 2, 3, 4, 5, 또는 6(바람직하게는 0 또는 1)이다.
각각의 전술한 기는 연결기를 통해 PTM 기(ULM' 기를 포함함)에 선택적으로 연결될 수 있다.
본 개시의 특정 대안적인 구현예에서, ULM-g 내지 ULM-i의 R3'는 선택적으로 치환된 -(CH2)n-(V)n'-(CH2)n-(V)n'-RS3'기, 선택적으로 치환된-(CH2)n-N(R1')(C=O)m'-(V)n'-RS3' 기, 선택적으로 치환된 -XR3'-알킬기, 선택적으로 치환된 -XR3'-아릴기; 선택적으로 치환된 -XR3'-HET 기, 선택적으로 치환된 -XR3'-아릴-HET 기 또는 선택적으로 치환된 -XR3'-HET-아릴기이고,
여기서,
RS3'은 선택적으로 치환된 알킬기(C1-C10, 바람직하게는 C1-C6 알킬), 선택적으로 치환된 아릴기 또는 HET 기이고;
R1'은 H 또는 C1-C3 알킬기(바람직하게는 H)이고;
V는 O, S 또는 NR1'이고;
XR3'은 -(CH2)n- , -(CH2CH2O)n-, -CH2)n-CH(Xv)=CH(Xv)- (시스 또는 트랜스), -CH2)n-CH≡CH-, 또는 C3-C6 시클로알킬기이고(이들 기 모두는 선택적으로 치환됨);
Xv는 H, 할로 또는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로겐기로 선택적으로 치환되는 C1-C3 알킬기이고;
알킬은 선택적으로 치환된 C1-C10알킬기(바람직하게는 C1-C6 알킬기) (바람직한 특정 구현예에서, 알킬기는 할로기, 종종 Cl 또는 Br로 말단-캡핑됨)이고;
아릴은 선택적으로 치환된 페닐 또는 나프틸기(바람직하게는, 페닐기)이고; 및
HET는 선택적으로 치환된 옥사졸, 이속사졸, 티아졸, 이소티아졸, 이미다졸, 디아졸, 옥시미다졸, 피롤, 피롤리딘, 푸란, 디하이드로푸란, 테트라하이드로푸란, 티엔, 디하이드로티엔, 테트라하이드로티엔, 피리딘, 피페리딘, 피페라진, 모르폴린, 벤조푸란, 인돌, 인돌리진, 아자인돌리진, 퀴놀린(치환될 경우, 각각은 바람직하게는 C1-C3 알킬기, 바람직하게는 메틸 또는 할로기, 바람직하게는 F 또는 Cl로 치환됨) 또는 다음의 화학 구조식에 따른 기이다:
ULM-g 내지 ULM-i의 Sc는 CHRSS, NRURE, 또는 O이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 RHET는, H, CN, NO2, 할로(바람직하게는 Cl 또는 F), 선택적으로 치환된 C1-C6 알킬(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기(예를 들어, CF3)로 치환됨), 선택적으로 치환된 O(C1-C6 알킬)(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기로 치환됨) 또는 선택적으로 치환된 아세틸렌기 -C≡C-Ra(여기서 Ra는 H 또는 C1-C6 알킬기(바람직하게는 C1-C3 알킬)임)이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 RSS는, H, CN, NO2, 할로(바람직하게는 F 또는 Cl), 선택적으로 치환된 C1-C6 알킬(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기로 치환됨), 선택적으로 치환된 O-(C1-C6 알킬(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기로 치환됨) 또는 선택적으로 치환된 -C(O)(C1-C6 알킬)(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기로 치환됨)이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 RURE는, H, C1-C6 알킬(바람직하게는 H 또는 C1-C3 알킬) 또는 -C(O)(C0-C6 알킬)(이들 기 각각은 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로겐, 바람직하게는 불소기로 선택적으로 치환됨), 또는 선택적으로 치환된 헤테로고리, 예를 들어, 각각 선택적으로 치환된, 피페리딘, 모르폴린, 피롤리딘, 테트라하이드로푸란, 테트라하이드로티오펜, 피페리딘, 피페라진이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 YC는 N 또는 C-RYC이고, 여기서 RYC는 H, CN, NO2, 할로(바람직하게는 Cl 또는 F), 선택적으로 치환된 C1-C6 알킬(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기(예를 들어, CF3)로 치환됨), 선택적으로 치환된 O(C1-C6 알킬)(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기로 치환됨) 또는 선택적으로 치환된 아세틸렌기 -C≡C-Ra(Ra는 H 또는 C1-C6 알킬기(바람직하게는 C1-C3 알킬)임)이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 RPRO는 H, 선택적으로 치환된 C1-C6 알킬 또는 선택적으로 치환된 아릴(페닐 또는 나프틸), 옥사졸, 이속사졸, 티아졸, 이소티아졸, 이미다졸, 디아졸, 옥시이미다졸, 피롤, 피롤리딘, 푸란, 디하이드로푸란, 테트라하이드로푸란, 티엔, 디하이드로티엔, 테트라하이드로티엔, 피리딘, 피페리딘, 피페라진, 모르폴린, 퀴놀린 (각각 바람직하게는 C1-C3 알킬기, 바람직하게는 메틸 또는 할로기, 바람직하게는 F 또는 Cl로 치환됨), 벤조푸란, 인돌, 인돌리진, 아자인돌리진으로 이루어진 군으로부터 선택되는 헤테로아릴 또는 헤테로고리기이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 RPRO1 및 RPRO2는 각각 독립적으로 H, 선택적으로 치환된 C1-C3 알킬기, 또는 함께 케토기를 형성하고;
ULM-g 내지 ULM-i의 각각의 n은 독립적으로 0, 1, 2, 3, 4, 5, 또는 6(바람직하게는 0 또는 1)이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 각각의 m'은 0 또는 1이고; 및
ULM-g 내지 ULM-i의 각각의 n'은 0 또는 1이고;
각각의 전술한 화합물, 바람직하게는 알킬, 아릴 또는 Het 기는 연결기를 통해 PTM 기(ULM' 기를 포함함)에 선택적으로 연결될 수 있다.
대안적인 구현예에서, ULM-g 내지 ULM-i의 R3'은 -(CH2)n-아릴, -(CH2CH2O)n-아릴, -(CH2)n-HET 또는 -(CH2CH2O)n-HET이고,
여기서,
ULM-g 내지 ULM-i의 상기 아릴은 1개 또는 2개의 치환기로 선택적으로 치환된 페닐이되, 상기 치환기(들)은 바람직하게는 -(CH2)nOH, C1-C6 알킬로부터 선택되며, 이들 자체는 추가로 CN, 할로(3개까지의 할로기), OH, -(CH2)nO(C1-C6)알킬, 아민, 모노- 또는 디-(C1-C6 알킬)아민으로 선택적으로 치환되며, 아민 상의 알킬기는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로(바람직하게는 F, Cl)기로 선택적으로 치환되거나,
ULM-g 내지 ULM-i의 상기 아릴기는 -(CH2)nOH, -(CH2)n-O-(C1-C6)알킬, (CH2)n-O-(CH2)n-(C1-C6)알킬, -(CH2)n-C(O)(C0-C6) 알킬, -(CH2)n-C(O)O(C0-C6)알킬, -(CH2)n-OC(O)(C0-C6)알킬, 아민, 모노- 또는 디-(C1-C6 알킬)아민으로 치환되며, 아민 상의 알킬기는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기(바람직하게는 F, Cl), CN, NO2, 선택적으로 치환된 -(CH2)n-(V)m'-CH2)n-(V)m'-(C1-C6)알킬기, -(V)m'-(CH2CH2O)n-RPEG 기로 선택적으로 치환되며, 여기서 V는 O, S 또는 NR1'이고, R1'은 H 또는 C1-C3 알킬기(바람직하게는 H)이고, RPEG는 H 또는 선택적으로 치환되는 C1-C6 알킬기(카르복실기로 선택적으로 치환되는 것을 포함함)이거나,
ULM-g 내지 ULM-i의 전술한 아릴은 옥사졸, 이속사졸, 티아졸, 이소티아졸, 이미다졸, 디아졸, 옥시미다졸, 피롤, 피롤리딘, 푸란, 디하이드로푸란, 테트라하이드로푸란, 티엔, 디하이드로티엔, 테트라하이드로티엔, 피리딘, 피페리딘, 피페라진, 모르폴린, 퀴놀린, 벤조푸란, 인돌, 인돌리진, 아자인돌리진 (치환될 경우, 각각은 바람직하게는 C1-C3 알킬기, 바람직하게는 메틸 또는 할로기, 바람직하게는 F 또는 Cl로 치환됨) 또는 다음의 화학 구조식에 따른 기로 이루어진 군으로부터 선택되는 헤테로아릴을 포함하는 헤테로고리로 선택적으로 치환된다:
ULM-g 내지 ULM-i의 Sc는 CHRSS, NRURE, 또는 O이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 RHET는, H, CN, NO2, 할로(바람직하게는 Cl 또는 F), 선택적으로 치환된 C1-C6 알킬(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기(예를 들어, CF3)로 치환됨), 선택적으로 치환된 O(C1-C6 알킬)(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기로 치환됨) 또는 선택적으로 치환된 아세틸렌기 -C≡C-Ra(여기서 Ra는 H 또는 C1-C6 알킬기(바람직하게는 C1-C3 알킬)임)이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 RSS는, H, CN, NO2, 할로(바람직하게는 F 또는 Cl), 선택적으로 치환된 C1-C6 알킬(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기로 치환됨), 선택적으로 치환된 O-(C1-C6 알킬(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기로 치환됨) 또는 선택적으로 치환된 -C(O)(C1-C6 알킬)(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기로 치환됨)이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 RURE는, H, C1-C6 알킬(바람직하게는 H 또는 C1-C3 알킬) 또는 -C(O)(C0-C6 알킬)(이들 기 각각은 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로겐, 바람직하게는 불소기로 선택적으로 치환됨), 또는 선택적으로 치환된 헤테로시클릴, 예를 들어, 각각 선택적으로 치환된, 피페리딘, 모르폴린, 피롤리딘, 테트라하이드로푸란, 테트라하이드로티오펜, 피페리딘, 피페라진이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 YC는 N 또는 C-RYC이고, 여기서 RYC는 H, CN, NO2, 할로(바람직하게는 Cl 또는 F), 선택적으로 치환된 C1-C6 알킬(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기(예를 들어, CF3)로 치환됨), 선택적으로 치환된 O(C1-C6 알킬)(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기로 치환됨) 또는 선택적으로 치환된 아세틸렌기 -C≡C-Ra(Ra는 H 또는 C1-C6 알킬기(바람직하게는 C1-C3 알킬)임)이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 RPRO는 H, 선택적으로 치환된 C1-C6 알킬 또는 선택적으로 치환된 아릴(페닐 또는 나프틸), 옥사졸, 이속사졸, 티아졸, 이소티아졸, 이미다졸, 디아졸, 옥시이미다졸, 피롤, 피롤리딘, 푸란, 디하이드로푸란, 테트라하이드로푸란, 티엔, 디하이드로티엔, 테트라하이드로티엔, 피리딘, 피페리딘, 피페라진, 모르폴린, 퀴놀린 (각각 바람직하게는 C1-C3 알킬기, 바람직하게는 메틸 또는 할로기, 바람직하게는 F 또는 Cl로 치환됨), 벤조푸란, 인돌, 인돌리진, 아자인돌리진으로 이루어진 군으로부터 선택되는 헤테로아릴 또는 헤테로고리기이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 RPRO1 및 RPRO2는 각각 독립적으로 H, 선택적으로 치환된 C1-C3 알킬기, 또는 함께 케토기를 형성하고;
ULM-g 내지 ULM-i의 HET는 바람직하게는 옥사졸, 이속사졸, 티아졸, 이소티아졸, 이미다졸, 디아졸, 옥시미다졸, 피롤, 피롤리딘, 푸란, 디하이드로푸란, 테트라하이드로푸란, 티엔, 디하이드로티엔, 테트라하이드로티엔, 피리딘, 피페리딘, 피페라진, 모르폴린, 퀴놀린 (각각은 바람직하게는 C1-C3 알킬기, 바람직하게는 메틸 또는 할로기, 바람직하게는 F 또는 Cl로 치환됨), 벤조푸란, 인돌, 인돌리진, 아자인돌리진 또는 다음의 화학 구조식에 따른 기이다:
ULM-g 내지 ULM-i의 Sc는 CHRSS, NRURE, 또는 O이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 RHET는, H, CN, NO2, 할로(바람직하게는 Cl 또는 F), 선택적으로 치환된 C1-C6 알킬(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기(예를 들어, CF3)로 치환됨), 선택적으로 치환된 O(C1-C6 알킬)(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기로 치환됨) 또는 선택적으로 치환된 아세틸렌기 -C≡C-Ra(여기서 Ra는 H 또는 C1-C6 알킬기(바람직하게는 C1-C3 알킬)임)이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 RSS는, H, CN, NO2, 할로(바람직하게는 F 또는 Cl), 선택적으로 치환된 C1-C6 알킬(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기로 치환됨), 선택적으로 치환된 O-(C1-C6 알킬(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기로 치환됨) 또는 선택적으로 치환된 -C(O)(C1-C6 알킬)(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기로 치환됨)이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 RURE는, H, C1-C6 알킬(바람직하게는 H 또는 C1-C3 알킬) 또는 -C(O)(C0-C6 알킬)(이들 기 각각은 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로겐, 바람직하게는 불소기로 선택적으로 치환됨), 또는 선택적으로 치환된 헤테로시클릴, 예를 들어, 각각 선택적으로 치환된, 피페리딘, 모르폴린, 피롤리딘, 테트라하이드로푸란, 테트라하이드로티오펜, 피페리딘, 피페라진이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 YC는 N 또는 C-RYC이고, 여기서 RYC는 H, CN, NO2, 할로(바람직하게는 Cl 또는 F), 선택적으로 치환된 C1-C6 알킬(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기(예를 들어, CF3)로 치환됨), 선택적으로 치환된 O(C1-C6 알킬)(바람직하게는 1개 또는 2개의 하이드록실기 또는 3개까지의 할로기로 치환됨) 또는 선택적으로 치환된 아세틸렌기 -C≡C-Ra(Ra는 H 또는 C1-C6 알킬기(바람직하게는 C1-C3 알킬)임)이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 RPRO는 H, 선택적으로 치환된 C1-C6 알킬 또는 선택적으로 치환된 아릴, 헤테로아릴 또는 헤테로고리기이고;
ULM-g 내지 ULM-i의 RPRO1 및 RPRO2는 각각 독립적으로 H, 선택적으로 치환된 C1-C3 알킬기, 또는 함께 케토기를 형성하고;
ULM-g 내지 ULM-i의 각각의 m'은 독립적으로 0 또는 1이고; 및
ULM-g 내지 ULM-i의 각각의 n은 독립적으로 0, 1, 2, 3, 4, 5, 또는 6(바람직하게는 0 또는 1)이고,
각각의 전술한 화합물, 바람직하게는 전술한 아릴 또는 HET 기는 연결기를 통해 PTM 기(ULM' 기를 포함함)에 선택적으로 연결될 수 있다.
또 다른 구현예에서, 바람직한 화합물은 다음의 화학 구조식에 따른 화합물:
여기서,
ULM-i의 R1'은 OH이거나 환자 또는 대상체 내에서 OH로 대사되는 기이고;
ULM-i의 R2'은 -NH-CH2-아릴-HET(바람직하게는, 메틸 치환된 티아졸에 직접적으로 연결된 페닐)이고;
ULM-i의 R3'은 -CHRCR3'-NH-C(O)-R3P1 기 또는 -CHRCR3'-R3P2 기이고;
ULM-i의 RCR3'은 C1-C4 알킬기, 바람직하게는 메틸, 이소프로필 또는 삼차-부틸이고;
ULM-i의 R3P1는 C1-C3 알킬(바람직하게는 메틸), 선택적으로 치환된 옥세탄기(바람직하게는 메틸 치환된, -(CH2)nOCH3 기(n은 1 또는 2(바람직하게는 2)), 또는 기(에틸 에테르기는 바람직하게는 페닐 모이어티상에서 메타-치환됨), 모르폴리노기(2- 또는 3-위치에서 카르보닐에 연결됨)이고;
ULM-i의 R3P2는 기이고;
ULM-i의 아릴은 페닐이고;
ULM-i의 HET는 선택적으로 치환된 티아졸 또는 이소티아졸이고; 및
ULM-i의 RHET는 H 또는 할로기(바람직하게는 H)이며;
또는, 이의 약제학적으로 허용가능한 염, 입체이성질체, 용매화물 또는 다형체를 포함하고, 각각의 전술한 화합물은 연결기를 통하여 PTM 기(ULM' 기를 포함함)에 선택적으로 연결된다.
특정 양태에서, 유비퀴틴 E3 리가아제 결합 모이어티(ULM)를 포함하는 이작용성 화합물에서, ULM은 다음의 화학 구조식에 따른 기:
(여기서,
ULM-j의 각각의 R5 및 R6는 독립적으로 OH, SH, 또는 선택적으로 치환된 알킬이거나, R5, R6 및 이들이 부착된 탄소 원자는 카르보닐을 형성하고;
ULM-j의 R7은 H 또는 선택적으로 치환된 알킬이고;
ULM-j의 E는 결합부, C=O, 또는 C=S이고;
ULM-j의 G는 결합부, 선택적으로 치환된 알킬, -COOH 또는 C=J이고;
ULM-j의 J는 O 또는 N-R8이고;
ULM-j의 R8은 H, CN, 선택적으로 치환된 알킬 또는 선택적으로 치환된 알콕시이고;
ULM-j의 M은 선택적으로 치환된 아릴, 선택적으로 치환된 헤테로아릴, 선택적으로 치환된 헤테로고리 또는 이고;
ULM-j의 각각의 R9 및 R10은 독립적으로 H; 선택적으로 치환된 알킬, 선택적으로 치환된 시클로알킬, 선택적으로 치환된 하이드록시알킬, 선택적으로 치환된 티오알킬, 이황화물 연결된 ULM, 선택적으로 치환된 헤테로아릴, 또는 할로알킬이거나; R9, R10, 및 이들이 부착되는 탄소 원자는 선택적으로 치환된 시클로알킬을 형성하고;
ULM-j의 R11은 선택적으로 치환된 헤테로고리, 선택적으로 치환된 알콕시, 선택적으로 치환된 헤테로아릴, 선택적으로 치환된 아릴, 또는 이고;
ULM-j의 R12는 H 또는 선택적으로 치환된 알킬이고;
ULM-f의 R13은 H, 선택적으로 치환된 알킬, 선택적으로 치환된 알킬카르보닐, 선택적으로 치환된 (시클로알킬)알킬카르보닐, 선택적으로 치환된 아랄킬카르보닐, 선택적으로 치환된 아릴카르보닐, 선택적으로 치환된 (헤테로시클릴)카르보닐, 또는 선택적으로 치환된 아랄킬; 선택적으로 치환된 (옥소알킬)카바메이트이고,
ULM-j의 각각의 R14은 독립적으로 H, 할로알킬, 선택적으로 치환된 시클로알킬, 선택적으로 치환된 알킬 또는 선택적으로 치환된 헤테로시클로알킬이고;
ULM-j의 R15은 H, 선택적으로 치환된 헤테로아릴, 할로알킬, 선택적으로 치환된 아릴, 선택적으로 치환된 알콕시, 또는 선택적으로 치환된 헤테로아릴, 선택적으로 치환된 헤테로시클릴이고;
ULM-j의 각각의 R16은 독립적으로 할로, 선택적으로 치환된 알킬, 선택적으로 치환된 할로알킬, CN, 또는 선택적으로 치환된 할로알콕시이고;
ULM-j의 각각의 R25은 독립적으로 H 또는 선택적으로 치환된 알킬이거나; 두 R25 기 모두가 함께 취해져서 옥소 또는 선택적으로 치환된 시클로알킬기를 형성할 수 있고;
ULM-j의 R23는 H 또는 OH이고;
ULM-j의 Z1, Z2, Z3, 및 Z4는 독립적으로 C 또는 N이고; 및
ULM-j의 o는 0, 1, 2, 3 이거나 4이다), 또는 이의 약제학적으로 허용가능한 염, 입체이성질체, 용매화물 또는 다형체이다.
특정 구현예에서, ULM-j의 G는 C=J, J는 O, R7은 H, 각각의 R14은 H이고, o는 0이다.
특정 구현예에서, ULM-j의 G는 C=J, J는 O, R7은 H, 각각의 R14은 H, R15은 선택적으로 치환된 헤테로아릴이고, o는 0이다. 다른 예에서, E는 C=O이고 M은 이다.
특정 구현예에서, ULM-j의 E는 C=O이고, R11은 선택적으로 치환된 헤테로고리 또는 이고, M은 이다.
특정 구현예에서, ULM-j의 E는 C=O이고, M은 이고, R11은 또는 이고, 각각의 R18은 독립적으로 할로, 선택적으로 치환된 알콕시, 시아노, 선택적으로 치환된 알킬, 할로알킬, 또는 할로알콕시이고; p는 0, 1, 2, 3, 또는 4이다.
특정 구현예에서, ULM 및 ULM'(존재할 경우)은 각각 독립적으로 다음의 화학 구조식에 따른 기이다:
,
ULM-k
여기서,
ULM-k의 G는 C=J이고, J는 O이고;
ULM-k의 R7은 H이고;
ULM-k의 각각의 R14은 H이고;
ULM-k의 o는 0이고;
ULM-k의 R15은 이고; 및
ULM-k의 R17은 H, 할로, 선택적으로 치환된 시클로알킬, 선택적으로 치환된 알킬, 선택적으로 치환된 알케닐 및 할로알킬이다.
다른 예에서, ULM-k의 R17은 알킬(예, 메틸) 또는 시클로알킬(예, 시클로프로필)이다.
다른 구현예에서, ULM 및 ULM'(존재할 경우)은 각각 독립적으로 다음의 화학 구조식에 따른 기이다:
여기서,
ULM-k의 G는 C=J이고, J는 O이고;
ULM-k의 R7은 H이고;
ULM-k의 각각의 R14은 H이고;
ULM-k의 o는 0이고; 및
ULM-k의 R15는,
로 이루어진 군으로부터 선택되고, 여기서 ULM-k의 R30은 H 또는 선택적으로 치환된 알킬이다.
다른 구현예에서, ULM 및 ULM'(존재할 경우)은 각각 독립적으로 다음의 화학 구조식에 따른 기이다:
여기서,
ULM-k의 E는 C=O이고;
ULM-k의 M은 이고; 및
ULM-k의 R11은,
이루어진 군으로부터 선택된다.
또 다른 구현예에서, 다음의 화학 구조식의 화합물로,
여기서 ULM-k의 E는 C=O이고;
ULM-k의 R11은 이고; 및
ULM-k의 M은 이고;
ULM-k의 q는 1 또는 2이고;
ULM-k의 R20은 H, 선택적으로 치환된 알킬, 선택적으로 치환된 시클로알킬, 선택적으로 치환된 아릴, 또는 이고;
ULM-k의 R21은 H 또는 선택적으로 치환된 알킬이고; 및
ULM-k의 R22는 H, 선택적으로 치환된 알킬, 선택적으로 치환된 알콕시, 또는 할로알킬이다.
본원에 기술된 임의의 구현예에서, ULM-j 또는 ULM-k의 R11은 다음으로 이루어진 군으로부터 선택된다:
특정 구현예에서, ULM-j 또는 ULM-k의 R11은 다음으로 이루어진 군으로부터 선택된다:
특정 구현예에서, ULM(또는 존재할 경우 ULM')은 다음의 화학 구조식에 따른 기이다:
여기서,
ULM-l의 X는 O 또는 S이고;
ULM-l의 Y는 H, 메틸 또는 에틸이고;
ULM-l의 R17은 H, 메틸, 에틸, 히독시메틸 또는 시클로프로필이고;
ULM-l의 M은 선택적으로 치환된 아릴, 선택적으로 치환된 헤테로아릴, 또는 이고;
ULM-l의 R9은 H이고;
ULM-l의 R10은 H, 선택적으로 치환된 알킬, 선택적으로 치환된 할로알킬, 선택적으로 치환된 헤테로아릴, 선택적으로 치환된 아릴, 선택적으로 치환된 하이드록시알킬, 선택적으로 치환된 티오알킬 또는 시클로알킬이고;
ULM-l의 R11은 선택적으로 치환된 헤테로방향족, 선택적으로 치환된 헤테로고리, 선택적으로 치환된 아릴 또는 이고;
ULM-l의 R12는 H 또는 선택적으로 치환된 알킬이고; 및
ULM-l의 R13은 H, 선택적으로 치환된 알킬, 선택적으로 치환된 알킬카르보닐, 선택적으로 치환된 (시클로알킬)알킬카르보닐, 선택적으로 치환된 아랄킬카르보닐, 선택적으로 치환된 아릴카르보닐, 선택적으로 치환된 (헤테로시클릴)카르보닐, 또는 선택적으로 치환된 아랄킬; 선택적으로 치환된 (옥소알킬)카바메이트이다.
일부 구현예에서, ULM 및 ULM'(존재할 경우)은 각각 독립적으로 다음의 화학 구조식에 따른 기이다:
여기서,
ULM-m의 Y는 H, 메틸 또는 에틸이고
ULM-m의 R9은 H이고;
R10은 이소프로필, 삼차-부틸, 이차-부틸, 시클로펜틸, 또는 시클로헥실이고;
ULM-m의 R11은 선택적으로 치환된 아미드, 선택적으로 치환된 이소인돌리논, 선택적으로 치환된 이소옥사졸, 선택적으로 치환된 헤테로고리이다.
본 발명의 다른 구현예에서, ULM 및 ULM'(존재할 경우)은 각각 독립적으로 다음의 화학 구조식에 따른 기이다:
여기서,
ULM-n의 R17은 메틸, 에틸, 또는 시클로프로필이고; 및
ULM-n의 R9, R10, 및 R11은 전술한 바와 같다. 다른 예에서, R9는 H이고; 및
ULM-n의 R10은 H, 알킬, 또는 시클로알킬(바람직하게는, 이소프로필, 삼차-부틸, 이차-부틸, 시클로펜틸, 또는 시클로헥실)이다.
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 본원에 기술된 바와 같은 ULM(또는 존재하는 경우, ULM')은 약제학적으로 허용가능한 염, 거울상 이성질체, 부분입체이성질체, 용매 또는 이의 다형체일 수 있다. 또한, 본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 본원에 기술된 바와 같은 ULM(또는 존재하는 경우, ULM')은 결합부를 통하거나 화학적 연결기에 의해 PTM에 직접적으로 결합될 수 있다.
본 발명의 특정 양태에서, ULM 모이어티는 다음으로 이루어진 군으로부터 선택된다:
여기서, VLM은, 예를 들어 아릴, 헤테로아릴, 페닐, 또는 인돌기의 페닐을 포함하는, 본원에 기술된 바와 같은, 연결기를 통해서, 임의의 적절한 위치에서, 선택적으로 아민, 에스테르, 에테르, 알킬 또는 알콕시와 같은 임의의 적절한 작용기를 통해, PTM에 연결될 수 있다.
예시적인 ILM
AVPI 테트라펩티트 단편
본원에 기술된 임의의 화합물 중, ILM은 알라닌-발린-프롤린-이소류신(AVPI) 테트라펩티트 단편 또는 이의 비자연적인 모방체를 포함할 수 있다. 특정 구현예에서, ILM은 식 (I), (II), (III), (IV) 및 (V)로 대표되는 화학 구조로 이루어진 군으로부터 선택된다:
여기서,
식 (I), (II), (III), (IV) 및 (V)에 대한 R1은 H 또는 알킬로부터 선택되고;
식 (I), (II), (III), (IV) 및 (V)에 대한 R2는 H 또는 알킬로부터 선택되고;
식 (I), (II), (III), (IV) 및 (V)에 대한 R3는 H, 알킬, 시클로알킬 및 헤테로시클로알킬로부터 선택되고;
식 (I), (II), (III), (IV) 및 (V)에 대한 R5 및 R6는 H, 알킬, 시클로알킬, 헤테로시클로알킬로부터 독립적으로 선택되거나, 보다 바람직하게는, 식 (I), (II), (III), (IV) 및 (V)에 대해 함께 취해진 R5 및 R6는, 선택적으로 1 또는 2 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴 또는 헤테로아릴 고리에 추가로 융합된 피롤리딘 또는 피페리딘 고리를 형성할 수 있고(이들 각각은 다른 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴 또는 헤테로아릴 고리에 추가로 융합될 수 있음);
식 (I), (II), (III), (IV) 및 (V)에 대해 함께 취해진 R3 및 R5는 선택적으로 1 또는 2 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴 또는 헤테로아릴 고리에 추가로 융합된 5 내지 8-원 고리를 형성할 수 있고;
식 (I), (II), (III), (IV), 및 (V)의 R7은 시클로알킬, 시클로알킬알킬, 헤테로시클로알킬, 헤테로시클로알킬알킬, 아릴, 아릴-C(O)-R4, 아릴알킬, 헤테로아릴, 헤테로아릴-C(O)-R4, 헤테로아릴-R4, 헤테로아릴-나프탈렌, 헤테로아릴알킬, 또는 -C(O)NH-R4로부터 선택되고(각각은 할로겐, 알킬, 할로알킬, 하이드록실, 알콕시, 시아노, (헤테로)시클로알킬, (헤테로)아릴, -C(O)NH-R4,또는 -C(O)-R4로부터 선택된 1-3개의 치환기로 추가로 선택적으로 치환됨); 및
R4는 알킬, 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 시클로알킬알킬, 헤테로시클로알킬알킬, 아릴, 아릴알킬, 헤테로아릴, 헤테로아릴알킬로부터 선택된다(전술한 바와 같이 1 내지 3개의 치환기로 추가로 선택적으로 치환됨).
전술한 바와 같이, 식 (II)의 P1, P2, P3, 및 P4는 각각 AVPI 테트라펩티드 단편 또는 이의 비자연적인 모방체의 A, V, P 및 I와 상관된다. 마찬가지로, 식 (I) 및 (III) 내지 (V)의 각각은 AVPI 테트라펩티드 단편 또는 이의 비자연적인 모방체의 A, V, P, 및 I와 상관된다.
본원에 기술된 임의의 화합물 중, ILM은 WO 공보 제2008/014236호에 기재된 IAP 길항제 또는 그의 비자연적인 모방체의 유도체인 식 (VI)의 구조: 　
(여기서,
식 (VI)의 R1은 H, 미치환되거나 치환된 C1-C4-알킬, C1-C4-알케닐, C1-C4-알키닐 또는 C3-C1O-시클로알킬로부터 독립적으로 선택되고;
식 (VI)의 R2는 H, 미치환되거나 치환된 C1-C4-알킬, C1-C4-알케닐, C1-C4-알키닐 또는 C3-C1O-시클로알킬로부터 독립적으로 선택되고;
식 (IV)의 R3는 H, -CF3, -C2H5, C1-C4-알킬, C1-C4-알케닐, C1-C4-알키닐, CH2-Z로부터 독립적으로 선택되거나 임의의 R2 및 R3는 함께 헤테로시클릭 고리를 형성하고;
식 (VI)의 각각의 Z는 H, -OH, F, Cl, -CH3, -CF3, -CH2Cl, -CH2F 또는 -CH2OH로부터 독립적으로 선택되고;
식 (VI)의 R4는 C1-C 16 직선형 또는 분지형 알킬, C1-C16-알케닐, C1-C16-알키닐, C3-C10-시클로알킬, -(CH2)0-6-Z1, -(CH2)0-6-아릴, 및 -(CH2)0-6-헤트로부터 독립적으로 선택되고(여기서 알킬, 시클로알킬, 및 페닐은 미치환이거나 치환됨);
식 (VI)의 R5는, H, C1-10-알킬, 아릴, 페닐, C3-7-시클로알킬, -(CH2)1-6-C3-7-시클로알킬, -C1-10-알킬-아릴, -(CH2)0-6-C3-7-시클로알킬-(CH2)0-6-페닐, -(CH2)0-4-CH[(CH2)1-4-페닐]2, 인다닐, -C(O)-C1-10-알킬, -C(O)-(CH2)1-6-C3-7-시클로알킬, -C(O)-(CH2)0-6-페닐, -(CH2)0-6-C(O)-페닐, -(CH2)0-6-헤트, -C(O)-(CH2)1-6-헤트로부터 독립적으로 선택되거나, R5는 아미노산의 잔기에서 선택되고(여기서 알킬, 시클로알킬, 페닐 및 아릴 치환기는 미치환이거나 치환됨);
식 (VI)의 Z1은, -N(R10)-C(O)-C1-10-알킬, -N(R1O)-C(O)-(CH2)0-6-C3-7-시클로알킬, -N(R10)-C(O)-(CH2)0-6-페닐, -N(R10)-C(O)(CH2)1-6-헤트, -C(O)-N(R11)(R12), -C(O)-O-C1-10-알킬, -C(O)-O-(CH2)1-6-C3-7-시클로알킬, -C(O)-O-(CH2)0-6-페닐, -C(O)-O- (CH2)1-6-헤트, -O-C(O)-C1-10-알킬, -O-C(O)-(CH2)1-6-C3-7-시클로알킬, -O-C(O)-(CH2)0-6-페닐, O-C(O)-(CH2)1-6-헤트로부터 독립적으로 선택되고(여기서 알킬, 시클로알킬, 및 페닐은 미치환이거나 치환됨);
식 (VI)의 헤트는, N, O, 및 S로부터 선택되는 1 내지 4개의 헤테로원자를 함유하는 5 내지 7원 헤테로시클릭 고리, 또는 N, O 및 S로부터 선택되는 1, 2, 또는 3개의 헤테로원자를 함유하는 적어도 하나의 5 내지 7원 헤테로시클릭 고리를 포함하는 8 내지 12원 융합 고리 시스템이고(헤테로시클릭 고리 또는 융합 고리 시스템은 탄소 또는 질소 원자 상에서 미치환이거나 치환됨);
식 (VI)의 R10은 H, -CH3, -CF3, -CH2OH, 또는 -CH2Cl로부터 선택되고;
식 (VI)의 R11 및 R12는 H, C1-4-알킬, C3-7-시클로알킬, -(CH2)1-6-C3-7-시클로알킬, (CH2)0-6-페닐로부터 독립적으로 선택되거나(여기서 알킬, 시클로알킬, 및 페닐은 미치환되거나 치환됨); 또는 R11 및 R12는 질소와 함께 헤트를 형성하고,
식 (VI)의 U는 독립적으로 식 (VII)에 나타낸 바와 같다:
여기서,
식 (VII)의 각각의 n은 독립적으로 0 내지 5로부터 선택되고;
식 (VII)의 X는 -CH 및 N의 군으로부터 선택되고;
식 (VII)의 Ra 및 Rb는 O, S 또는 N 원자 또는 C0-8-알킬의 군으로부터 독립적으로 선택되고(여기서, 알킬 사슬의 하나 이상의 탄소 원자는 선택적으로 O, S, 또는 N으로부터 선택되는 헤테로원자로 대체되고, 각각의 알킬은 독립적으로 미치환되거나 치환됨);
식 (VII)의 Rd는 Re-Q-(Rf)p(Rg)q, 및 Ar1-D-Ar2의 군으로부터 선택되고;
식 (VII)의 Rc는 H 기로부터 선택되거나, 임의의 Rc 및 Rd는 시클로알킬 또는 het를 함께 형성하고; (여기서 Rc 및 Rd가 시클로알킬 또는 het를 형성하는 경우, R5는 C 또는 N 원자에서 형성된 고리에 부착됨);
식 (VII)의 p 및 q는 0 또는 1로부터 독립적으로 선택되고;
식 (VII)의 Re는 C1-8-알킬 및 알키리덴의 군으로부터 선택되고(각각의 Re는 미치환이거나 치환됨);
Q는 N, O, S, S(O), 및 S(O)2의 군으로부터 선택되고;
식 (VII)의 Ar1 및 Ar2는 치환되거나 미치환된 아릴 및 헤트의 군으로부터 독립적으로 선택되고;
식 (VII)의 Rf 및 Rg는 H, -C1-10-알킬, C1-10-알킬아릴, -OH, -O-C1-10-알킬, (CH2)0-6-C3-7-시클로알킬, -O-(CH2)0-6-아릴, 페닐, 아릴, 페닐-페닐, -(CH2)1-6-헤트, -O-(CH2)1-6-헤트, -OR13, -C(0)-R13, -C(O)-N(R13)(R14), -N(R13)(R14), -S-R13, -S(O)-R13, -S(O)2-R13, -S(O)2- NR13R14, -NR13-S(O)2-R14, -S-Ct-10-알킬, 아릴-C1-4-알킬, 또는 헤트-C1-4-알킬로부터 독립적으로 선택되고, 여기서 알킬, 시클로알킬, 헤트 및 아릴은 미치환이거나 치환되고, -SO2-C1-2-알킬, -SO2-C1-2-알킬페닐, -O-C1-4-알킬, 또는 임의의 Rg 및 Rf는 함께 헤트 또는 아릴로부터 선택되는 고리를 형성하고;
식 (VII)의 D는 -CO-, -C(O)-C1-7-알킬렌 또는 아릴렌, -CF2-, -O-, -S(O)r의 군으로부터 선택되고, 여기서 r은 0-2, 1,3-디옥살란, 또는 C1-7-알킬-OH이고; 여기서 알킬, 알킬렌, 또는 아릴렌은 미치환되거나 1개 이상의 할로겐, OH, -O-C1-6-알킬, -S-C1-6-알킬, 또는 -CF3으로 치환되고; 또는 각각의 D는, N(Rh)로부터 독립적으로 선택되고;
Rh는 H, 치환되거나 미치환된 C1 -7-알킬, 아릴, 치환되거나 미치환된 -O-(C1-7-시클로알킬), -C(O)-C1-10-알킬, -C(O)-C0-10-알킬-아릴, -C-O-C01-10-알킬, -C-O-C0-10-알킬-아릴, -SO2-C1-10-알킬, 또는 -SO2-(C0-10-알킬아릴)의 군으로부터 선택되고;
식 (VII)의 R6, R7, R8, 및 R9는, H, -C1-10-알킬, -C1-10-알콕시, 아릴-C1 -10-알콕시, -OH, -O-C1-10-알킬, -(CH2)0-6-C3-7-시클로알킬, -O-(CH2)0-6-아릴, 페닐, -(CH2)1-6-헤트, -O-(CH2)1-6-헤트, -OR13, -C(O)-R13, -C(O)-N(R13)(R14), -N(R13)(R14), -S-R13, -S(O)-R13, -S(O)2- R13, -S(O)2-NR13R14,, 또는 -NR13-S(O)2-R14의 기로부터 독립적으로 선택되고; 여기서 각각의 알킬, 시클로알킬, 및 아릴은 미치환되거나 치환되고; 및 임의의 R6, R7, R8, 및 R9는 선택적으로 함께 고리 시스템을 형성하고;
식 (VII)의 R13 및 R14는 H, C1-10-알킬, -(CH2)0-6-C3-7-시클로알킬, -(CH2)0-6- (CH)0-1-(아릴)1-2, -C(O)-C1-10-알킬, -C(O)-(CH2)1-6-C3-7-시클로알킬, -C(O)-O-(CH2)0-6-아릴, - C(O)-(CH2)0-6-O-플루오레닐, -C(O)-NH-(CH2)0-6-아릴, -C(O)-(CH2)0-6-아릴, -C(O)-(CH2)0.6-헤트, - C(S)-C1-10-알킬, -C(S)-(CH2)1-6-C3-7-시클로알킬, -C(S)-O-(CH2)0-6-아릴, -C(S)-(CH2)0-6-O-플루오레닐, -C(S)-NH-(CH2)0-6-아릴, -C(S)-(CH2)0-6-아릴, 또는 -C(S)-(CH2)1-6-헤트의 군으로부터 독립적으로 선택되거나(여기서 각각의 알킬, 시클로알킬 및 아릴은 미치환이거나 치환됨): 또는 임의의 R13 및 R14은 질소 원자와 함께 헤트를 형성하고;
여기서 식 (VII)의 R13 및 R14의 알킬 치환기는 미치환이거나 치환되고, 치환될 경우, 이들은 C1-10-알킬, 할로겐, OH, - O-C1-6-알킬, -S-C1-6-알킬, 및 -CF3로부터 선택되는 하나 이상의 치환기로 치환되고; R13 및 R14의 치환된 페닐 또는 아릴은 할로겐, 하이드록실. C1-4-알킬, C1-4-알콕시, 니트로, -CN, -O-C(O)-C1-4-알킬, 및 -C(O)-O-C1-4-아릴로부터 선택된 하나 이상의 치환기로 치환된다;) 또는 이의 약제학적으로 허용가능한 염 또는 수화물을 가질 수 있다.
본원에 기술된 임의의 화합물 중, ILM은, Ndubaku, C. 등, Antagonism of c-IAP and XIAP proteins is required for efficient induction of cell death by small-molecule IAP antagonists, ACS Chem. Biol., 557-566, 4 (7) ( 2009)에서 기술된 IAP 리간드, 또는 그의 인공적인 모방체에 기초하는 식 (VIII)의 구조를 가질 수 있다:
여기서 식 (VIII)의 A1 및 A2 각각은 선택적으로 치환된 모노시클릭, 융합된 고리, 아릴 및 헤테로아릴로부터 독립적으로 선택되고; 및
식 (VIII)의 R은 H 또는 Me로부터 선택된다.
특정 구현예에서, 연결기(L)은 식 (VIII)의 A1에 부착된다. 다른 구현예에서, 연결기(L)은 식 (VIII)의 A2에 부착된다.
특정 구현예에서, ILM은 다음으로 이루어진 군으로부터 선택된다.
본원에 기술된 임의의 화합물 중, ILM은, Mannhold, R. 등, IAP antagonists: promising candidates for cancer therapy, Drug Discov. Today, 15 (5-6), 210-9 ( 2010)에서 상호 참조된 화학 종, 또는 그의 인공적인 모방체로부터 유도된, 식 (IX)의 구조를 가질 수 있고:
여기서 R1은 알킬, 시클로알킬 및 헤테로시클로알킬, 가장 바람직하게는, 이소프로필, 삼차-부틸, 시클로헥실 및 테트라하이드로피라닐로부터 선택되고, 식 (IX)의 R2는 -OPh 또는 H로부터 선택된다.
본원에 기술된 임의의 화합물 중, ILM은, Mannhold, R. 등, IAP antagonists: promising candidates for cancer therapy, Drug Discov. Today, 15 (5-6), 210-9 ( 2010)에서 상호 참조된 화학 종, 또는 그의 인공적인 모방체로부터 유도된, 식 (X)의 구조를 가질 수 있고:
여기서,
식 (X)의 R1은 H, -CH2OH, --CH2CH2OH, --CH2NH2, --CH2CH2NH2로부터 선택되고;
식 (X)의 X는 S 또는 CH2로부터 선택되고;
식 (X)의 R2는 다음으로부터 선택되고:
식 (X)의 R3 및 R4는 H 또는 Me로부터 독립적으로 선택된다
본원에 기술된 임의의 화합물 중, ILM은, Mannhold, R. 등, IAP antagonists: promising candidates for cancer therapy, Drug Discov. Today, 15 (5-6), 210-9 ( 2010)에서 상호 참조된 화학 종, 또는 그의 인공적인 모방체로부터 유도된, 식 (XI)의 구조를 가질 수 있고:
여기서 식 (XI)의 R1은 H 또는 Me로부터 선택되고, 식 (XI)의 R2는 H 또는 로부터 선택된다
본원에 기술된 임의의 화합물 중, ILM은, Mannhold, R. 등, IAP antagonists: promising candidates for cancer therapy, Drug Discov. Today, 15 (5-6), 210-9 ( 2010)에서 상호 참조된 화학 종, 또는 그의 인공적인 모방체로부터 유도된, 식 (XII)의 구조를 가질 수 있고:
여기서,
식 (XII)의 R1은 다음으로부터 선택되고:
; 및
식 (XII)의 R2은 다음으로부터 선택된다:
본원에 기술된 임의의 화합물 중, IAP E3 유비퀴틴 리가아제 결합 모이어티는 다음으로 이루어진 군으로부터 선택된다:
본원에 기술된 임의의 화합물 중, ILM은, Flygare, J.A. 등, Small-molecule pan-IAP antagonists: a patent review, Expert Opin. Ther. Pat., 20 (2), 251-67 ( 2010)에서 요약된 IAP 리간드, 또는 그의 인공적인 모방체에 기초하는, 식 (XIII)의 구조를 가질 수 있고:
여기서,
식 (XIII)의 Z는 부재하거나 O이고;
식 (XIII)의 R1은 다음으로부터 선택되고:
R10의 은 H, 알킬 또는 아릴로부터 선택되고;
X는 CH2 및 O로부터 선택되고; 및
는 질소 함유 헤테로아릴이다.
본원에 기술된 임의의 화합물 중, ILM은, Flygare, J.A. 등, Small-molecule pan-IAP antagonists: a patent review, Expert Opin. Ther. Pat., 20 (2), 251-67 ( 2010)에서 요약된 IAP 리간드, 또는 그의 인공적인 모방체에 기초하는, 식 (XIV)의 구조를 가질 수 있고:
여기서,
식 (XIV)의 Z는 부재하거나 O이고;
식 (XIV)의 R3 및 R4는 H 또는 Me로부터 독립적으로 선택되고;
식 (XIV)의 R1은 다음으로부터 선택되고:
R10의 은 H, 알킬 또는 아릴로부터 선택되고;
의 X는 CH2 및 O로부터 선택되고; 및
또는 의 은 질소 함유 헤테로아릴이다.
본원에 기술된 임의의 화합물 중, ILM은 다음으로 이루어진 군으로부터 선택되고:
이들은 미국 특허 공개 제2008/0269140호 및 미국 특허 제7,244,851호에 개시된 리간드의 유도체이다.
본원에 기술된 임의의 화합물 중, ILM은 WO 공개 제2008/128171호에 기재된 IAP 리간드의 유도체, 또는 그의 인공적인 모방체였던, 식 (XV)의 구조를 가질 수 있고: 　
여기서,
식 (XV)의 Z는 부재하거나 O이고;
식 (XV)의 R1은 다음으로부터 선택되고:
R10의 은 H, 알킬 또는 아릴로부터 선택되고;
의 X는 CH2 및 O로부터 선택되고; 및
또는 의 은 질소 함유 헤테로아릴이고; 및
식 (XV)의 R2는 H, 알킬 또는 아실로부터 선택되고;
특정 구현예에서, ILM은 다음의 구조를 갖는다:
본원에 기술된 임의의 화합물 중, ILM은 WO 공개 제2006/069063호에 기재된 IAP 리간드, 또는 그의 인공적인 모방체에 기초하는, 식 (XVI)의 구조를 가질 수 있고: 　
여기서,
식 (XVI)의 R2는 알킬, 시클로알킬 및 헤테로시클로알킬; 보다 바람직하게는, 이소프로필, 삼차-부틸, 시클로헥실 및 테트라하이드로피라닐, 가장 바람직하게는 시클로헥실로부터 선택되고;
식 (XVI)의 은 5-원 또는 6-원 질소-함유 헤테로아릴; 보다 바람직하게는, 5-원 질소-함유 헤테로아릴, 가장 바람직하게는 티아졸이고; 및
식 (XVI)의 Ar은 아릴 또는 헤테로아릴이다.
본원에 기술된 임의의 화합물 중, ILM은, Cohen, F. 등, Antogonists of inhibitors of apoptosis proteins based on thiazole amide isosteres, Bioorg. Med. Chem. Lett., 20(7), 2229-33 (2010)에 기술된 IAP 리간드, 또는 그의 인공적인 모방체에 기초하는, 식 (XVII)의 구조를 가질 수 있고:
여기서,
식 (XVII)의 R1은 할로겐(예를 들어, 불소), 시아노, 의 군으로부터 선택되고;
식 (XVII)의 X는 O 또는 CH2의 군으로부터 선택된다.
본원에 기술된 임의의 화합물 중, ILM은, Cohen, F. 등, Antogonists of inhibitors of apoptosis proteins based on thiazole amide isosteres, Bioorg. Med. Chem. Lett., 20(7), 2229-33 (2010)에 기술된 IAP 리간드, 또는 그의 인공적인 모방체에 기초하는, 식 (XVIII)의 구조를 가질 수 있고:
여기서 식 (XVIII)의 R은 (가변 치환 위치에서) 알킬, 아릴, 헤테로아릴, 아릴알킬, 헤테로아릴알킬 또는 할로겐으로부터 선택된다.
본원에 기술된 임의의 화합물 중, ILM은, Cohen, F. 등, Antogonists of inhibitors of apoptosis proteins based on thiazole amide isosteres, Bioorg. Med. Chem. Lett., 20(7), 2229-33 (2010)에 기술된 IAP 리간드, 또는 그의 인공적인 모방체에 기초하는, 식 (XIX)의 구조를 가질 수 있고:
여기서 은 6-원 질소 헤테로아릴이다.
특정 구현예에서, 조성물의 ILM은 다음으로 이루어진 군으로부터 선택된다:
특정 구현예에서, 조성물의 ILM은 다음으로 이루어진 군으로부터 선택된다:
본원에 기술된 임의의 화합물 중, ILM은 WO 공개 제2007/101347호에 기재된 IAP 리간드, 또는 그의 인공적인 모방체에 기초하는, 식 (XX)의 구조를 가질 수 있다: 　
식 (XX)의 X는 CH2, O, NH, 또는 S로부터 선택된다.
본원에 기술된 임의의 화합물 중, ILM은 미국 특허 제7,345,081호 및 미국 특허 제7,419,975호에 기재된 IAP 리간드, 또는 그의 인공적인 모방체에 기초하는, 식 (XXI)의 구조를 가질 수 있다: 　 　
여기서,
식 (XXI)의 R2는 다음으로부터 선택되고:
식 (XXI)의 R5는 다음으로부터 선택되고;
식 (XXI)의 W는 CH 또는 N으로부터 선택되고; 및
의 R6는 독립적으로 모노- 또는 이중고리 융합 아릴 또는 헤테로아릴이다.
특정 구현예에서, 화합물의 ILM은 다음으로 이루어진 군으로부터 선택된다:
본원에 기술된 임의의 화합물 중, ILM은 WO 공개 제2015/006524호 및 Perez HL, Discovery of potent heterodimeric antagonists of inhibitor of apoptosis proteins (IAPs) with sustained antitumor activity. J. Med. Chem. 58(3), 1556-62 (2015)에 기술된 IAP 리간드, 또는 이들의 인공적인 모방체로부터 유도된, 식 (XXII) 또는 식 (XXIV)의 구조, 및 다음과 같은 연결기(L)에 대한 화학적 연결기:
(여기서,
식 (XXII), (XXIII) 또는 (XXIV)의 R1은 선택적으로 치환된 알킬, 선택적으로 치환된 시클로알킬, 선택적으로 치환된 시클로알킬알킬, 선택적으로 치환된 헤테로시클릴, 선택적으로 치환된 아릴알킬 또는 선택적으로 치환된 아릴이고;
식 (XXII), (XXIII) 또는 (XXIV)의 R2는 선택적으로 치환된 알킬, 선택적으로 치환된 시클로알킬, 선택적으로 치환된 시클로알킬알킬, 선택적으로 치환된 헤테로시클릴, 선택적으로 치환된 아릴알킬 또는 선택적으로 치환된 아릴이고;
또는 대안적으로,
식 (XXII), (XXIII) 또는 (XXIV)의 R1 및 R2는 선택적으로 치환된 티오알킬로부터 독립적으로 선택되고, 여기서 티오알킬의 S 원자에 부착된 치환기는 선택적으로 치환된 알킬, 선택적으로 치환된 분지형 알킬, 선택적으로 치환된 헤테로시클릴, -(CH2)vCOR20, -CH2CHR21COR22 또는 -CH2R23이고,
여기서,
v는 1 내지 3의 정수이고;
-(CH2)vCOR20 및 -CH2R23 의 R20 및 R22는 OH, NR24R25 또는 OR26로부터 독립적으로 선택되고;
-CH2CHR21COR2 의 R21은 NR24R25로부터 선택되고;
-CH2R23 의 R23는 선택적으로 치환된 아릴 또는 선택적으로 치환된 헤테로시클릴로부터 선택되고, 여기서 선택적인 치환기는 알킬 및 할로겐을 포함하고;
NR24R25 의 R24는 수소 또는 선택적으로 치환된 알킬로부터 선택되고;
NR24R25의 R25는 수소, 선택적으로 치환된 알킬, 선택적으로 치환된 분지형 알킬, 선택적으로 치환된 아릴알킬, 선택적으로 치환된 헤테로시클릴, -CH2(OCH2CH2O)mCH3, 또는 스페르민 또는 스페르미딘과 같은 폴리아미드 사슬로부터 선택되고;
OR26의 R26는 선택적으로 치환된 알킬로부터 선택되고, 여기서 선택적인 치환기는 OH, 할로겐 또는 NH2이고; 및
m은 1 내지 8의 정수이고;
식 (XXII), (XXIII) 또는 (XXIV)의 R3 및 R4는 독립적으로, 선택적으로 치환된 알킬, 선택적으로 치환된 시클로알킬, 선택적으로 치환된 아릴, 선택적으로 치환된 아릴알킬, 선택적으로 치환된 아릴알콕시, 선택적으로 치환된 헤테로아릴, 선택적으로 치환된 헤테로시클릴, 선택적으로 치환된 헤테로아릴알킬 또는 선택적으로 치환된 헤테로시클로알킬이고, 여기서 치환기는 알킬, 할로겐 또는 OH이고;
식 (XXII), (XXIII) 또는 (XXIV)의 R5, R6, R7 및 R8은 수소, 선택적으로 치환된 알킬 또는 선택적으로 치환된 시클로알킬로부터 독립적으로 선택되고;) 및/또는 이의 약제학적으로 허용가능한 염, 호변 이성질체 또는 입체 이성질체를 가질 수 있다.
특정 구현예에서, 식 (XXII) 내지 식 (XXIV)에 따른 ILM에서:
R7 및 R8은 H 또는 Me로부터 선택되고;
R5 및 R6는 다음을 포함하는 군으로부터 선택되고:
R3 및 R4는 다음을 포함하는 군으로부터 선택된다:
본원에 기술된 임의의 화합물 중, ILM은 WO 공개 제2014/055461호 및 Kim, KS, Discovery of tetrahydroisoquinoline-based bivalent heterodimeric IAP antagonists. Bioorg. Med. Chem. Lett. 24(21), 5022-9 (2014)에 기술된 IAP 리간드, 또는 이의 인공적인 모방체로부터 유도된, 식 (XXV), (XXVI), (XXVII), 또는 (XXVIII)의 구조, 및 다음과 같은 연결기(L)에 대한 화학적 연결기를 가질 수 있고:
여기서,
식 (XXV) 내지 식 (XXVIII)의 R2는 H, 선택적으로 치환된 알킬, 선택적으로 치환된 시클로알킬, 선택적으로 치환된 시클로알킬알킬, 선택적으로 치환된 헤테로시클릴, 선택적으로 치환된 아릴알킬 또는 선택적으로 치환된 아릴로부터 선택되고;
또는 대안적으로;
식 (XXV) 및 식 (XXVIII)의 R1 및 R2는 H, 선택적으로 치환된 티오알킬-CR60R61SR70 (여기서 R60 및 R61은 H 또는 메틸로부터 선택되고, R70은 선택적으로 치환된 알킬, 선택적으로 치환된 분지형 알킬, 선택적으로 치환된 헤테로시클릴, -(CH2)vCOR20, -CH2CHR21COR22 또는 -CH2R23임)으로부터 독립적으로 선택되고;
여기서,
v는 1 내지 3의 정수이고;
-(CH2)vCOR20 및 -CH2CHR21COR22 의 R20 및 R22는 OH, NR24R25 또는 OR26로부터 독립적으로 선택되고;
-CH2CHR21COR22 의 R21은 NR24R25로부터 선택되고;
-CH2R23 의 R23는 선택적으로 치환된 아릴 또는 선택적으로 치환된 헤테로시클릴로부터 선택되고(여기서 선택적인 치환기는 알킬 및 할로겐을 포함함);
NR24R25 의 R24는 수소 또는 선택적으로 치환된 알킬로부터 선택되고;
NR24R25의 R25는 수소, 선택적으로 치환된 알킬, 선택적으로 치환된 분지형 알킬, 선택적으로 치환된 아릴알킬, 선택적으로 치환된 헤테로시클릴, -CH2CH2(OCH2CH2)mCH3, 또는 스페르민 또는 스페르미딘과 같은 폴리아민 사슬 로부터 선택되고,
여기서 이고;
OR26의 R26는 선택적으로 치환된 알킬이고(여기서 선택적인 치환기는 OH, 할로겐 또는 NH2임);
m은 1 내지 8의 정수이고;
식 (XXV) 내지 (XXVIII)의 R6 및 R8은 수소, 선택적으로 치환된 알킬 또는 선택적으로 치환된 시클로알킬로부터 독립적으로 선택되고; 및
식 (XXV) 내지 (XXVIII)의 R31은 추가로 선택적으로 치환된 알킬, 아릴, 아릴알킬, 헤테로아릴 또는 헤테로아릴알킬로부터 선택되고, 바람직하게는, 다음으로 이루어진 군으로부터 선택된다:
본원에 기술된 임의의 화합물 중, ILM은, WO 공개 제2013/071039호에 기술된 IAP 리간드, 또는 그의 인공적인 모방체로부터 유도된, 식 (XXIX) 또는 (XXX)의 구조를 가질 수 있고:
여기서,
식 (XXIX) 및 (XXX)의 R43 및 R44는 수소, 알킬, 아릴, 아릴알킬, 헤테로아릴, 헤테로아릴알킬, 시클로알킬, 추가로 선택적으로 치환된 시클로알킬알킬로부터 독립적으로 선택되고,
식 (XXIX) 및 (XXX)의 R6 및 R8은 수소, 선택적으로 치환된 알킬 또는 선택적으로 치환된 시클로알킬로부터 독립적으로 선택된다.
식 (XXIX) 및 (XXX)의 각각의 X는 다음으로부터 독립적으로 선택되고:
식 (XXIX) 및 (XXX)의 각각의 Z는 로부터 선택되고(여기서 각각의 은 화합물에 대한 부착 지점을 나타냄); 및
각각의 Y는 다음으로부터 선택되고:
여기서,
는 화합물의 -C=O 부분에 대한 부착 지점을 나타내고;
는 화합물의 아미노 부분에 대한 부착 지점을 나타내고;
는 Z에 대한 제1 부착 지점을 나타내고;
는 Z에 대한 제2 부착 지점을 나타내고; 및
A는 -C(O)R3 또는 또는 임의의 전술한 것의 호변 이성질체로부터 선택되고, 여기서:
-C(O)R3 의 R3는 OH, NHCN, NHS02R10, NHOR11 또는 N(R12)(R13)로부터 선택되고;
NHS02R10 및 NHOR11의 R10 및 R11은 -C1-C4 알킬, 시클로알킬, 아릴, 헤테로아릴 또는, 헤테로시클로알킬(이들 중 임의의 것은 선택적으로 치환됨), 및 수소로부터 독립적으로 선택되고;
N(R12)(R13)의 각각의 R12 및 R13은 수소, -C1-C4 알킬, -(C1-C4 알킬렌)-NH-(C1-C4 알킬), 벤질, -(C1-C4 알킬렌)-C(O)OH,
-(C1-C4 알킬렌)-C(O)CH3, -CH(벤질)-COOH, -C1-C4 알콕시, 및
-(C1-C4 알킬렌)-O-(C1-C4 하이드록시알킬)로부터 독립적으로 선택되거나; N(R12)(R13)의 R12 및 R13은 이들이 일반적으로 결합되는 질소 원자와 함께 취해져, N, O 및 S로부터 선택되는 하나의 추가적인 헤테로원자를 선택적으로 포함하는 포화 헤테로시클릴(포화 헤테로고리는 메틸로 선택적으로 치환됨)을 형성한다.
본원에 기술된 임의의 화합물 중, ILM은 WO 공개 제2013/071039호에 기술된 IAP 리간드, 또는 그의 인공적인 모방체로부터 유도된, 식 (XXXI)의 구조를 가질 수 있고:
여기서,
식 (XXXI)의 W1은 O, S, N-RA, 또는 C(R8a)(R8b)로부터 선택되고;
식 (XXXI)의 W2는 O, S, N-RA, 또는 C(R8c)(R8d)로부터 선택되고; 단, W1 및 W2 모두가 O이 아니거나, 또는 모두가 S가 아닌 경우;
식 (XXXI)의 R1은 수소, C1-C6알킬, C3-C6시클로알킬, -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 C3-C6시클로알킬), 치환되거나 미치환된 아릴, 치환되거나 미치환된 헤테로아릴, -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 아릴), 또는 -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 헤테로아릴)로부터 선택되고;
X1이 O, N-RA, S, S(O) 또는 S(O)2로부터 선택되는 경우, X2는 C(R2aR2b)이고;
또는:
식 (XXXI)의 X1은 CR2cR2d로부터 선택되고 X2는 CR2aR2b이고, R2c 및 R2a는 함께 결합을 형성하고;
또는:
식 (XXXI)의 X1 및 X2는 C 및 N으로부터 독립적으로 선택되고, 융합 치환되거나 미치환 포화되거나 부분적으로 포화된 3 내지 10원 시클로알킬 고리, 융합 치환되거나 미치환 포화되거나 부분적으로 포화된 3 내지 10원 헤테로시클로알킬 고리, 융합 치환되거나 미치환된 5 내지 10원 아릴 고리, 또는 융합 치환되거나 미치환된 5 내지 10원 헤테로아릴 고리의 구성원이고;
또는:
식 (XXXI)의 X1은 CH2로부터 선택되고, X2는 C=0, C=C(RC)2, 또는 C=NRC이고; 이때 각각의 Rc는 H, -CN, -OH, 알콕시, 치환되거나 미치환된 C1-C6알킬, 치환되거나 미치환된 C3-C6시클로알킬, 치환되거나 미치환된 C2-C5헤테로시클로알킬, 치환되거나 미치환된 아릴, 치환되거나 미치환된 헤테로아릴, -C1-C6알킬- (치환되거나 미치환된 C3-C6시클로알킬), -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 C2-C5헤테로시클로알킬), -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 아릴), 또는 -C1-C6알킬- (치환되거나 미치환된 헤테로아릴)로부터 독립적으로 선택되고;
N-RA의 RA는 H, C1-C6알킬, -C(=O)C1-C2알킬, 치환되거나 미치환된 아릴, 또는 치환되거나 미치환된 헤테로아릴로부터 선택되고;
CR2cR2d 및 CR2aR2b의 R2a, R2b, R2c, R2d는 H, 치환되거나 미치환된 C1-C6알킬, 치환되거나 미치환된 C1-C6헤테로알킬, 치환되거나 미치환된 C3-C6시클로알킬, 치환되거나 미치환된 C2-C5헤테로시클로알킬, 치환되거나 미치환된 아릴, 치환되거나 미치환된 헤테로아릴, -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 C3- C6시클로알킬), -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 C2-C5헤테로시클로알킬), -C1-C6알킬- (치환되거나 미치환된 아릴), -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 헤테로아릴) 및 - C(=O)RB로부터 독립적으로 선택되고;
- C(=O)RB의 RB는 치환되거나 미치환된 C1-C6알킬, 치환되거나 미치환된 C3-C6시클로알킬, 치환되거나 미치환된 C2-C5헤테로시클로알킬, 치환되거나 미치환된 아릴, 치환되거나 미치환된 헤테로아릴, -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 C3- C6시클로알킬), -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 C2-C5헤테로시클로알킬), -C1-C6알킬- (치환되거나 미치환된 아릴), -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 헤테로아릴), 또는 NRDRE로부터 선택되고;
NRDRE의 RD 및 RE는 H, 치환되거나 미치환된 C1-C6알킬, 치환되거나 미치환된 C3-C6시클로알킬, 치환되거나 미치환된 C2-C5헤테로시클로알킬, 치환되거나 미치환된 아릴, 치환되거나 미치환된 헤테로아릴, -C1-C6알킬- (치환되거나 미치환된 C3-C6시클로알킬), -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 C2- C5헤테로시클로알킬), -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 아릴), 또는 -C1-C6알킬- (치환되거나 미치환된 헤테로아릴)로부터 독립적으로 선택되고;
식 (XXXI)의 m은 0, 1 또는 2로부터 선택되고;
식 (XXXI)의 -U-는 -NHC(=O)-, -C(=O)NH-, -NHS(=O)2-, -S(=O)2NH-, -NHC(=O)NH-, -NH(C=O)O-, -O(C=O)NH-, 또는 -NHS(=O)2NH-로부터 선택되고;
식 (XXXI)의 R3는 C1-C3알킬, 또는 C1-C3플루오로알킬로부터 선택되고;
식 (XXXI)의 R4는 -NHR5, -N(R5)2, -N+(R5)3 또는 -OR5로부터 선택되고;
-NHR5, -N(R5)2, -N+(R5)3 및 -OR5 의 각각의 R5는 H, C1-C3알킬, C1-C3할로알킬, C1-C3헤테로알킬 및 -C1-C3알킬-(C3-C5시클로알킬)로부터 독립적으로 선택되고;
또는:
식 (XXXI)의 R3 및 R5는 이들이 부착되는 원자와 함께 치환되거나 미치환된 5 내지 7원 고리를 형성하고;
또는:
식 (XXXI)의 R3는 U의 질소 원자에 결합되어 치환되거나 미치환된 5 내지 7원 고리를 형성하고;
식 (XXXI)의 R6은 -NHC(=O)R7, -C(=O)NHR7, -NHS(=O)2R7, -S(=O)2NHR7; -NHC(=O)NHR7, -NHS(=O)2NHR7, -(C1-C3알킬)-NHC(=O)R7, -(C1-C3알킬)-C(=O)NHR7, -(C1-C3알킬)-NHS(=O)2R7, -(C1-C3알킬)-S(=O)2NHR7; -(C1-C3알킬)-NHC(=O)NHR7, -(C1-C3알킬)-NHS(=O)2NHR7, 치환되거나 미치환된 C2-C10헤테로시클로알킬, 또는 치환되거나 미치환된 헤테로아릴로부터 선택되고;
-NHC(=O)R7, -C(=O)NHR7, -NHS(=O)2R7, -S(=O)2NHR7; -NHC(=O)NHR7, -NHS(=O)2NHR7, -(C1-C3알킬)-NHC(=O)R7, -(C1-C3알킬)-C(=O)NHR7, -(C1-C3알킬)-NHS(=O)2R7, -(C1-C3알킬)-S(=O)2NHR7; -(C1-C3알킬)-NHC(=O)NHR7, -(C1-C3알킬)-NHS(=O)2NHR7 의 각각의 R7은 C1-C6알킬, C1-C6할로알킬, C1-C6헤테로알킬, 치환되거나 미치환된 C3-C10시클로알킬, 치환되거나 미치환된 C2- C10헤테로시클로알킬, 치환되거나 미치환된 아릴, 치환되거나 미치환된 헤테로아릴, -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 C3-C10시클로알킬), -C1-C6알킬- (치환되거나 미치환된 C2-C10헤테로시클로알킬, -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 아릴), -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 헤테로아릴), -(CH2)p-CH(치환되거나 미치환된 아릴)2, -(CH2)p-CH(치환되거나 미치환된 헤테로아릴)2, -(CH2)P-CH(치환되거나 미치환된 아릴)(치환되거나 미치환된 헤테로아릴), -(치환되거나 미치환된 아릴)-(치환되거나 미치환된 아릴), -(치환되거나 미치환된 아릴)-(치환되거나 미치환된 헤테로아릴), -(치환되거나 미치환된 헤테로아릴)-(치환되거나 미치환된 아릴), 또는 -(치환되거나 미치환된 헤테로아릴)-(치환되거나 미치환된 헤테로아릴)로부터 독립적으로 선택되고;
R7의 p는 0, 1, 또는 2로부터 선택되고;
C(R8a)(R8b) 및 C(R8c)(R8d)의 R8a, R8b, R8c, 및 R8d는 H, C1-C6알킬, C1-C6플루오로알킬, C1-C6 알콕시, C1-C6헤테로알킬, 및 치환되거나 미치환된 아릴로부터 독립적으로 선택되고;
또는:
R8a 및 R8d는 전술한 정의된 바와 같고, R8b 및 R8c는 함께 결합을 형성하고;
또는:
R8a 및 R8d는 전술한 정의된 바와 같고, R8b 및 R8c는 이들이 부착되는 원자와 함께, S, O 및 N으로부터 선택되는 1 내지 3개의 헤테로원자를 포함하는 치환되거나 미치환된 융합 5 내지 7원 포화 또는 부분적으로 포화된 카보시클릭 고리 또는 헤테로시클릭 고리, 치환되거나 미치환된 융합 5 내지 10원 아릴 고리, 또는 S, O 및 N으로부터 선택되는 1 내지 3개의 헤테로원자를 포함하는 치환되거나 미치환된 융합 5 내지 10원 헤테로아릴 고리를 형성하고;
또는:
R8c 및 R8d는 전술한 정의한 바와 같고, R8a 및 R8b는 이들이 부착되는 원자와 함께 S, O 및 N으로부터 선택되는 1 내지 3개의 헤테로원자를 포함하는 치환되거나 미치환된 포화 또는 부분적으로 포화된 3 내지 7원 스피로고리 또는 헤테로스피로고리를 형성하고;
또는:
R8a 및 R8b는 전술한 정의한 바와 같고, R8c 및 R8d는 이들이 부착되는 원자와 함께 S, O 및 N으로부터 선택되는 1 내지 3개의 헤테로원자를 포함하는 치환되거나 미치환된 포화 또는 부분적으로 포화된 3 내지 7원 스피로고리 또는 헤테로스피로고리를 형성하고;
여기서 각각의 치환된 알킬, 헤테로알킬, 융합 고리, 스피로고리, 헤테로스피로고리, 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴 또는 헤테로아릴은 1 내지 3개의 R9로 치환되고; 및
R8a, R8b, R8c 및 R8d의 각각의 R9은 -OH, -SH, (C=O), CN, C1-C4알킬, C1-C4플루오로알킬, C1-C4 알콕시, C1-C4 플루오로알콕시, -NH2, -NH(C1- C4알킬), -NH(C1-C4알킬)2, - C(=O)OH, -C(=0)NH2, -C(=O)C1-C3알킬, -S(=O)2CH3, -NH(C1-C4알킬)-OH, -NH(C1-C4알킬)-O-(C-C4알킬), -O(C1-C4알킬)-NH2; -O(C1-C4알킬)-NH-(C1-C4알킬), 및 -O(C1-C4알킬)-N-(C1-C4알킬)2로부터 독립적으로 선택되거나, 또는 이들이 부착되는 원자와 함께 2개의 R9가 할로겐, -OH, 또는 C1-C3알킬로 치환되거나 미치환된 메틸렌 디옥시 또는 에틸렌 디옥시 고리를 형성한다.
본원에 기술된 임의의 화합물 중, ILM은 WO 공개 제2013/071039호에 기술된 IAP 리간드, 또는 그의 인공적인 모방체로부터 유도된, 식 (XXXII)의 구조를 가질 수 있고:
여기서,
식 (XXXII)의 W1은 O, S, N-RA, 또는 C(R8a)(R8b)이고;
식 (XXXII)의 W2는 O, S, N-RA, 또는 C(R8c)(R8d)이고; 단, W1 및 W2 모두가 O이 아니거나, 또는 모두가 S가 아닌 경우;
식 (XXXII)의 R1은 수소, C1-C6알킬, C3-C6시클로알킬, -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 C3-C6시클로알킬), 치환되거나 미치환된 아릴, 치환되거나 미치환된 헤테로아릴, -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 아릴), 또는 -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 헤테로아릴)로부터 선택되고;
식 (XXXII)의 X1이 N-RA인 경우에는, X2는 C=O, 또는 CR2cR2d이고, X3는 CR2aR2b이고;
또는:
식 (XXXII)의 X1이 S, S(O), 또는 S(O)2로부터 선택되는 경우에는, X2는 CR2cR2d이고, X3는 CR2aR2b이고;
또는:
식 (XXXII)의 X1이 O인 경우에는, X2는 CR2cR2d 및 N-RA이고, X3는 CR2aR2b이고;
또는:
식 (XXXII)의 X1이 CH3인 경우에는, X2는 O, N-RA, S, S(O), 또는 S(O)2로부터 선택되고, X3는 CR2aR2b이고;
식 (XXXII)의 X1이 CR2eR2f이고 X2가 CR2cR2d인 경우, R2e 및 R2c는 함께 결합을 형성하고, 식 (XXXII)의 X3은 CR2aR2b이고;
또는:
식 (XXXII)의 X1 및 X3은 둘 다 CH2이고, 식 (XXXII)의 X2는 C=0, C=C(RC)2, 또는 C=NRC이고; 이때 각각의 RC는 H, -CN, -OH, 알콕시, 치환되거나 미치환된 C1-C6알킬, 치환되거나 미치환된 C3-C6시클로알킬, 치환되거나 미치환된 C2-C5헤테로시클로알킬, 치환되거나 미치환된 아릴, 치환되거나 미치환된 헤테로아릴, -C1-C6알킬- (치환되거나 미치환된 C3-C6시클로알킬), -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 C2- C5헤테로시클로알킬), -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 아릴), 또는 -C1-C6알킬- (치환되거나 미치환된 헤테로아릴)로부터 독립적으로 선택되고;
또는:
식 (XXXII)의 X1 및 X2는 C 및 N으로부터 독립적으로 선택되고, 융합 치환되거나 미치환 포화되거나 부분적으로 포화된 3 내지 10원 시클로알킬 고리, 융합 치환되거나 미치환 포화되거나 부분적으로 포화된 3 내지 10원 헤테로시클로알킬 고리, 융합 치환되거나 미치환된 5 내지 10원 아릴 고리, 또는 융합 치환되거나 미치환된 5 내지 10원 헤테로아릴 고리의 구성원이고, X3는 CR2aR2b이고;
또는:
식 (XXXII)의 X2 및 X3는 C 및 N으로부터 독립적으로 선택되고, 융합 치환되거나 미치환 포화되거나 부분적으로 포화된 3 내지 10원 시클로알킬 고리, 융합 치환되거나 미치환 포화되거나 부분적으로 포화된 3 내지 10원 헤테로시클로알킬 고리, 융합 치환되거나 미치환된 5 내지 10원 아릴 고리, 또는 융합 치환되거나 미치환된 5 내지 10원 헤테로아릴 고리의 구성원이고, 식 (XXXII)의 X1은 CR2eR2f이고;
N-RA의 RA는 H, C1-C6알킬, -C(=O)C1-C2알킬, 치환되거나 미치환된 아릴, 또는 치환되거나 미치환된 헤테로아릴로부터 선택되고;
CR2cR2d, CR2aR2b 및 CR2eR2f의 R2a, R2b, R2c, R2d, R2e, 및 R2f는 H, 치환되거나 미치환된 C1-C6알킬, 치환되거나 미치환된 C1-C6헤테로알킬, 치환되거나 미치환된 C3-C6시클로알킬, 치환되거나 미치환된 C2-C5헤테로시클로알킬, 치환되거나 미치환된 아릴, 치환되거나 미치환된 헤테로아릴, -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 C3- C6시클로알킬), -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 C2-C5헤테로시클로알킬), -C1-C6알킬- (치환되거나 미치환된 아릴), -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 헤테로아릴) 및 - C(=O)RB로부터 독립적으로 선택되고;
- C(=O)RB의 RB는 치환되거나 미치환된 C1-C6알킬, 치환되거나 미치환된 C3-C6시클로알킬, 치환되거나 미치환된 C2-C5헤테로시클로알킬, 치환되거나 미치환된 아릴, 치환되거나 미치환된 헤테로아릴, -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 C3- C6시클로알킬), -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 C2-C5헤테로시클로알킬), -C1-C6알킬- (치환되거나 미치환된 아릴), -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 헤테로아릴), 또는 NRDRE로부터 선택되고;
NRDRE의 RD 및 RE는 H, 치환되거나 미치환된 C1-C6알킬, 치환되거나 미치환된 C3-C6시클로알킬, 치환되거나 미치환된 C2-C5헤테로시클로알킬, 치환되거나 미치환된 아릴, 치환되거나 미치환된 헤테로아릴, -C1-C6알킬- (치환되거나 미치환된 C3-C6시클로알킬), -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 C2- C5헤테로시클로알킬), -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 아릴), 또는 -C1-C6알킬- (치환되거나 미치환된 헤테로아릴)로부터 독립적으로 선택되고;
식 (XXXII)의 m은 0, 1 또는 2로부터 선택되고;
식 (XXXII)의 -U-는 -NHC(=O)-, -C(=O)NH-, -NHS(=O)2-, -S(=O)2NH-, -NHC(=O)NH-, -NH(C=O)O-, -O(C=O)NH-, 또는 -NHS(=O)2NH-로부터 선택되고;
식 (XXXII)의 R3는 C1-C3알킬, 또는 C1-C3플루오로알킬로부터 선택되고;
식 (XXXII)의 R4는 -NHR5, -N(R5)2, -N+(R5)3 또는 -OR5로부터 선택되고;
-NHR5, -N(R5)2, -N+(R5)3 및 -OR5 의 각각의 R5는 H, C1-C3알킬, C1-C3할로알킬, C1-C3헤테로알킬 및 -C1-C3알킬-(C3-C5시클로알킬)로부터 독립적으로 선택되고;
또는:
식 (XXXII)의 R3 및 R5는 이들이 부착되는 원자와 함께 치환되거나 미치환된 5 내지 7원 고리를 형성하고;
또는:
식 (XXXII)의 R3는 U의 질소 원자에 결합되어 치환되거나 미치환된 5 내지 7원 고리를 형성하고;
식 (XXXII)의 R6은 -NHC(=O)R7, -C(=O)NHR7, -NHS(=O)2R7, -S(=O)2NHR7; -NHC(=O)NHR7, -NHS(=O)2NHR7, -(C1-C3알킬)-NHC(=O)R7, -(C1-C3알킬)-C(=O)NHR7, -(C1-C3알킬)-NHS(=O)2R7, -(C1-C3알킬)-S(=O)2NHR7; -(C1-C3알킬)-NHC(=O)NHR7, -(C1-C3알킬)-NHS(=O)2NHR7, 치환되거나 미치환된 C2-C10헤테로시클로알킬, 또는 치환되거나 미치환된 헤테로아릴로부터 선택되고;
-NHC(=O)R7, -C(=O)NHR7, -NHS(=O)2R7, -S(=O)2NHR7; -NHC(=O)NHR7, -NHS(=O)2NHR7, -(C1-C3알킬)-NHC(=O)R7, -(C1-C3알킬)-C(=O)NHR7, -(C1-C3알킬)-NHS(=O)2R7, -(C1-C3알킬)-S(=O)2NHR7; -(C1-C3알킬)-NHC(=O)NHR7, -(C1-C3알킬)-NHS(=O)2NHR7 의 각각의 R7은 C1-C6알킬, C1-C6할로알킬, C1-C6헤테로알킬, 치환되거나 미치환된 C3-C10시클로알킬, 치환되거나 미치환된 C2- C10헤테로시클로알킬, 치환되거나 미치환된 아릴, 치환되거나 미치환된 헤테로아릴, -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 C3-C10시클로알킬), -C1-C6알킬- (치환되거나 미치환된 C2-C10헤테로시클로알킬, -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 아릴), -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 헤테로아릴), -(CH2)p-CH(치환되거나 미치환된 아릴)2, -(CH2)p-CH(치환되거나 미치환된 헤테로아릴)2, -(CH2)P-CH(치환되거나 미치환된 아릴)(치환되거나 미치환된 헤테로아릴), -(치환되거나 미치환된 아릴)-(치환되거나 미치환된 아릴), -(치환되거나 미치환된 아릴)-(치환되거나 미치환된 헤테로아릴), -(치환되거나 미치환된 헤테로아릴)-(치환되거나 미치환된 아릴), 또는 -(치환되거나 미치환된 헤테로아릴)-(치환되거나 미치환된 헤테로아릴)로부터 독립적으로 선택되고;
R7의 p는 0, 1, 또는 2로부터 선택되고;
C(R8a)(R8b) 및 C(R8c)(R8d)의 R8a, R8b, R8c, 및 R8d는 H, C1-C6알킬, C1-C6플루오로알킬, C1-C6 알콕시, C1-C6헤테로알킬, 및 치환되거나 미치환된 아릴로부터 독립적으로 선택되고;
또는:
R8a 및 R8d는 전술한 정의된 바와 같고, R8b 및 R8c는 함께 결합을 형성하고;
또는:
R8a 및 R8d는 전술한 정의된 바와 같고, R8b 및 R8c는 이들이 부착되는 원자와 함께, S, O 및 N으로부터 선택되는 1 내지 3개의 헤테로원자를 포함하는 치환되거나 미치환된 융합 5 내지 7원 포화 또는 부분적으로 포화된 카보시클릭 고리 또는 헤테로시클릭 고리, 치환되거나 미치환된 융합 5 내지 10원 아릴 고리, 또는 S, O 및 N으로부터 선택되는 1 내지 3개의 헤테로원자를 포함하는 치환되거나 미치환된 융합 5 내지 10원 헤테로아릴 고리를 형성하고;
또는:
R8c 및 R8d는 전술한 정의한 바와 같고, R8a 및 R8b는 이들이 부착되는 원자와 함께 S, O 및 N으로부터 선택되는 1 내지 3개의 헤테로원자를 포함하는 치환되거나 미치환된 포화 또는 부분적으로 포화된 3 내지 7원 스피로고리 또는 헤테로스피로고리를 형성하고;
또는:
R8a 및 R8b는 전술한 정의한 바와 같고, R8c 및 R8d는 이들이 부착되는 원자와 함께 S, O 및 N으로부터 선택되는 1 내지 3개의 헤테로원자를 포함하는 치환되거나 미치환된 포화 또는 부분적으로 포화된 3 내지 7원 스피로고리 또는 헤테로스피로고리를 형성하고;
여기서 각각의 치환된 알킬, 헤테로알킬, 융합 고리, 스피로고리, 헤테로스피로고리, 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴 또는 헤테로아릴은 1 내지 3개의 R9로 치환되고; 및
R8a, R8b, R8c 및 R8d의 각각의 R9은 -OH, -SH, (C=O), CN, C1-C4알킬, C1-C4플루오로알킬, C1-C4 알콕시, C1-C4 플루오로알콕시, -NH2, -NH(C1- C4알킬), -NH(C1-C4알킬)2, - C(=O)OH, -C(=0)NH2, -C(=O)C1-C3알킬, -S(=O)2CH3, -NH(C1-C4알킬)-OH, -NH(C1-C4알킬)-O-(C-C4알킬), -O(C1-C4알킬)-NH2; -O(C1-C4알킬)-NH-(C1-C4알킬), 및 -O(C1-C4알킬)-N-(C1-C4알킬)2로부터 독립적으로 선택되거나, 또는 이들이 부착되는 원자와 함께 2개의 R9가 할로겐, -OH, 또는 C1-C3알킬로 치환되거나 미치환된 메틸렌 디옥시 또는 에틸렌 디옥시 고리를 형성한다.
본원에 기술된 임의의 화합물 중, ILM은 WO 공개 제2013/071039호에 기술된 IAP 리간드, 또는 그의 인공적인 모방체로부터 유도된, 식 (XXXIII)의 구조를 가질 수 있고:
여기서,
식 (XXXIII)의 W1은 O, S, N-RA, 또는 C(R8a)(R8b)로부터 선택되고;
식 (XXXIII)의 W2는 O, S, N-RA, 또는 C(R8c)(R8d)로부터 선택되고; 단, W1 및 W2 모두가 O이 아니거나, 또는 모두가 S가 아닌 경우;
식 (XXXIII)의 R1은 수소, C1-C6알킬, C3-C6시클로알킬, -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 C3-C6시클로알킬), 치환되거나 미치환된 아릴, 치환되거나 미치환된 헤테로아릴, -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 아릴), 또는 -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 헤테로아릴)로부터 선택되고;
식 (XXXIII)의 X1이 N-RA, S, S(O), 또는 S(O)2로부터 선택되는 경우에는, 식 (XXXIII)의 X2는 CR2cR2d이고, 식 (XXXIII)의 X3 는 CR2aR2b이고;
또는:
식 (XXXIII)의 X1이 O인 경우에는, 식 (XXXIII)의 X2는 O, N-RA, S, S(O), 또는 S(O)2로부터 선택되고, 식 (XXXIII)의 X3 는 CR2aR2b이고;
또는:
식 (XXXIII)의 X1은 CR2cR2d이고 식 (XXXIII)의 X2는 CR2cR2d이고, R2e 및 R2c는 함께 결합을 형성하고, 식 (XXXIII)의 X3는 CR2aR2b이고;
또는:
식 (XXXIII)의 X1 및 X2는 C 및 N으로부터 독립적으로 선택되고, 융합 치환되거나 미치환 포화되거나 부분적으로 포화된 3 내지 10원 시클로알킬 고리, 융합 치환되거나 미치환 포화되거나 부분적으로 포화된 3 내지 10원 헤테로시클로알킬 고리, 융합 치환되거나 미치환된 5 내지 10원 아릴 고리, 또는 융합 치환되거나 미치환된 5 내지 10원 헤테로아릴 고리의 구성원이고, 식 (XXXIII)의 X3는 CR2aR2b이고;
또는:
식 (XXXIII)의 X2 및 X3는 C 및 N으로부터 독립적으로 선택되고, 융합 치환되거나 미치환 포화되거나 부분적으로 포화된 3 내지 10원 시클로알킬 고리, 융합 치환되거나 미치환 포화되거나 부분적으로 포화된 3 내지 10원 헤테로시클로알킬 고리, 융합 치환되거나 미치환된 5 내지 10원 아릴 고리, 또는 융합 치환되거나 미치환된 5 내지 10원 헤테로아릴 고리의 구성원이고, 식 (VLII)의 X1은 CR2eR2f이고;
N-RA의 RA는 H, C1-C6알킬, -C(=O)C1-C2알킬, 치환되거나 미치환된 아릴, 또는 치환되거나 미치환된 헤테로아릴이고;
CR2cR2d, CR2aR2b 및 CR2eR2f의 R2a, R2b, R2c, R2d, R2e, 및 R2f는 H, 치환되거나 미치환된 C1-C6알킬, 치환되거나 미치환된 C1-C6헤테로알킬, 치환되거나 미치환된 C3-C6시클로알킬, 치환되거나 미치환된 C2-C5헤테로시클로알킬, 치환되거나 미치환된 아릴, 치환되거나 미치환된 헤테로아릴, -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 C3- C6시클로알킬), -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 C2-C5헤테로시클로알킬), -C1-C6알킬- (치환되거나 미치환된 아릴), -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 헤테로아릴) 및 - C(=O)RB로부터 독립적으로 선택되고;
- C(=O)RB의 RB는 치환되거나 미치환된 C1-C6알킬, 치환되거나 미치환된 C3-C6시클로알킬, 치환되거나 미치환된 C2-C5헤테로시클로알킬, 치환되거나 미치환된 아릴, 치환되거나 미치환된 헤테로아릴, -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 C3- C6시클로알킬), -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 C2-C5헤테로시클로알킬), -C1-C6알킬- (치환되거나 미치환된 아릴), -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 헤테로아릴), 또는 NRDRE이고;
NRDRE의 RD 및 RE는 H, 치환되거나 미치환된 C1-C6알킬, 치환되거나 미치환된 C3-C6시클로알킬, 치환되거나 미치환된 C2-C5헤테로시클로알킬, 치환되거나 미치환된 아릴, 치환되거나 미치환된 헤테로아릴, -C1-C6알킬- (치환되거나 미치환된 C3-C6시클로알킬), -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 C2- C5헤테로시클로알킬), -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 아릴), 또는 -C1-C6알킬- (치환되거나 미치환된 헤테로아릴)로부터 독립적으로 선택되고;
식 (XXXIII)의 m은 0, 1 또는 2로부터 선택되고;
식 (XXXIII)의 -U-는 -NHC(=O)-, -C(=O)NH-, -NHS(=O)2-, -S(=O)2NH-, -NHC(=O)NH-, -NH(C=O)O-, -O(C=O)NH-, 또는 -NHS(=O)2NH-이고;
식 (XXXIII)의 R3는 C1-C3알킬, 또는 C1-C3플루오로알킬이고;
식 (XXXIII)의 R4는 -NHR5, -N(R5)2, -N+(R5)3 또는 -OR5이고;
-NHR5, -N(R5)2, -N+(R5)3 및 -OR5 의 각각의 R5는 H, C1-C3알킬, C1-C3할로알킬, C1-C3헤테로알킬 및 -C1-C3알킬-(C3-C5시클로알킬)로부터 독립적으로 선택되고;
또는:
식 (XXXIII)의 R3 및 R5는 이들이 부착되는 원자와 함께 치환되거나 미치환된 5 내지 7원 고리를 형성하고;
또는:
식 (XXXIII)의 R3는 U의 질소 원자에 결합되어 치환되거나 미치환된 5 내지 7원 고리를 형성하고;
식 (XXXIII)의 R6은 -NHC(=O)R7, -C(=O)NHR7, -NHS(=O)2R7, -S(=O)2NHR7; -NHC(=O)NHR7, -NHS(=O)2NHR7, -(C1-C3알킬)-NHC(=O)R7, -(C1-C3알킬)-C(=O)NHR7, -(C1-C3알킬)-NHS(=O)2R7, -(C1-C3알킬)-S(=O)2NHR7; -(C1-C3알킬)-NHC(=O)NHR7, -(C1-C3알킬)-NHS(=O)2NHR7, 치환되거나 미치환된 C2-C10헤테로시클로알킬, 또는 치환되거나 미치환된 헤테로아릴로부터 선택되고;
-NHC(=O)R7, -C(=O)NHR7, -NHS(=O)2R7, -S(=O)2NHR7; -NHC(=O)NHR7, -NHS(=O)2NHR7, -(C1-C3알킬)-NHC(=O)R7, -(C1-C3알킬)-C(=O)NHR7, -(C1-C3알킬)-NHS(=O)2R7, -(C1-C3알킬)-S(=O)2NHR7; -(C1-C3알킬)-NHC(=O)NHR7, -(C1-C3알킬)-NHS(=O)2NHR7 의 각각의 R7은 C1-C6알킬, C1-C6할로알킬, C1-C6헤테로알킬, 치환되거나 미치환된 C3-C10시클로알킬, 치환되거나 미치환된 C2- C10헤테로시클로알킬, 치환되거나 미치환된 아릴, 치환되거나 미치환된 헤테로아릴, -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 C3-C10시클로알킬), -C1-C6알킬- (치환되거나 미치환된 C2-C10헤테로시클로알킬, -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 아릴), -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 헤테로아릴), -(CH2)p-CH(치환되거나 미치환된 아릴)2, -(CH2)p-CH(치환되거나 미치환된 헤테로아릴)2, -(CH2)P-CH(치환되거나 미치환된 아릴)(치환되거나 미치환된 헤테로아릴), -(치환되거나 미치환된 아릴)-(치환되거나 미치환된 아릴), -(치환되거나 미치환된 아릴)-(치환되거나 미치환된 헤테로아릴), -(치환되거나 미치환된 헤테로아릴)-(치환되거나 미치환된 아릴), 또는 -(치환되거나 미치환된 헤테로아릴)-(치환되거나 미치환된 헤테로아릴)로부터 독립적으로 선택되고;
R7의 p는 0, 1, 또는 2이고;
C(R8a)(R8b) 및 C(R8c)(R8d)의 R8a, R8b, R8c, 및 R8d는 H, C1-C6알킬, C1-C6플루오로알킬, C1-C6 알콕시, C1-C6헤테로알킬, 및 치환되거나 미치환된 아릴로부터 독립적으로 선택되고;
또는:
R8a 및 R8d는 전술한 정의된 바와 같고, R8b 및 R8c는 함께 결합을 형성하고;
또는:
R8a 및 R8d는 전술한 정의된 바와 같고, R8b 및 R8c는 이들이 부착되는 원자와 함께, S, O 및 N으로부터 선택되는 1 내지 3개의 헤테로원자를 포함하는 치환되거나 미치환된 융합 5 내지 7원 포화 또는 부분적으로 포화된 카보시클릭 고리 또는 헤테로시클릭 고리, 치환되거나 미치환된 융합 5 내지 10원 아릴 고리, 또는 S, O 및 N으로부터 선택되는 1 내지 3개의 헤테로원자를 포함하는 치환되거나 미치환된 융합 5 내지 10원 헤테로아릴 고리를 형성하고;
또는:
R8c 및 R8d는 전술한 정의한 바와 같고, R8a 및 R8b는 이들이 부착되는 원자와 함께 S, O 및 N으로부터 선택되는 1 내지 3개의 헤테로원자를 포함하는 치환되거나 미치환된 포화 또는 부분적으로 포화된 3 내지 7원 스피로고리 또는 헤테로스피로고리를 형성하고;
또는:
R8a 및 R8b는 전술한 정의한 바와 같고, R8c 및 R8d는 이들이 부착되는 원자와 함께 S, O 및 N으로부터 선택되는 1 내지 3개의 헤테로원자를 포함하는 치환되거나 미치환된 포화 또는 부분적으로 포화된 3 내지 7원 스피로고리 또는 헤테로스피로고리를 형성하고;
여기서 각각의 치환된 알킬, 헤테로알킬, 융합 고리, 스피로고리, 헤테로스피로고리, 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴 또는 헤테로아릴은 1 내지 3개의 R9로 치환되고; 및
R8a, R8b, R8c 및 R8d의 각각의 R9은 -OH, -SH, (C=O), CN, C1-C4알킬, C1-C4플루오로알킬, C1-C4 알콕시, C1-C4 플루오로알콕시, -NH2, -NH(C1- C4알킬), -NH(C1-C4알킬)2, - C(=O)OH, -C(=0)NH2, -C(=O)C1-C3알킬, -S(=O)2CH3, -NH(C1-C4알킬)-OH, -NH(C1-C4알킬)-O-(C-C4알킬), -O(C1-C4알킬)-NH2; -O(C1-C4알킬)-NH-(C1-C4알킬), 및 -O(C1-C4알킬)-N-(C1-C4알킬)2로부터 독립적으로 선택되거나, 또는 이들이 부착되는 원자와 함께 2개의 R9가 할로겐, -OH, 또는 C1-C3알킬로 치환되거나 미치환된 메틸렌 디옥시 또는 에틸렌 디옥시 고리를 형성한다.
본원에 기술된 임의의 화합물 중, ILM은 WO 공개 제2013/071039호에 기술된 IAP 리간드, 또는 그의 인공적인 모방체로부터 유도된, 식 (XXXIV)의 구조를 가질 수 있고:
여기서,
식 (XXXIV)의 W1은 O, S, N-RA, 또는 C(R8a)(R8b)로부터 선택되고;
식 (XXXIV)의 W2는 O, S, N-RA, 또는 C(R8c)(R8d)로부터 선택되고; 단, W1 및 W2 모두가 O이 아니거나, 또는 모두가 S가 아닌 경우;
W1, W2, 및 W3를 포함하는 고리가 2개의 인접한 산소 원자 또는 황 원자를 포함하지 않는다면, 식 (XXXIV)의 W3는 O, S, N-RA, 또는 C(R8e)(R8f)로부터 선택되고;
식 (XXXIV)의 R1은 수소, C1-C6알킬, C3-C6시클로알킬, -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 C3-C6시클로알킬), 치환되거나 미치환된 아릴, 치환되거나 미치환된 헤테로아릴, -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 아릴), 또는 -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 헤테로아릴)로부터 선택되고;
식 (XXXIV)의 X1이 O인 경우에는, 식 (XXXIV)의 X2는 CR2cR2d 및 N-RA이고, 식 (XXXIV)의 X3는 CR2aR2b이고;
또는:
식 (XXXIV)의 X1이 CH2인 경우에는, 식 (XXIV)의 X2는 O, N-RA, S, S(O), 또는 S(O)2로부터 선택되고, 식 (XXXIV)의 X3는 CR2aR2b이고;
또는:
식 (XXXIV)의 X1이 CR2eR2f이고 식 (XXXIV)의 X2가 CR2cR2d인 경우, R2e 및 R2c는 함께 결합을 형성하고, 식 (XXXIV)의 X3는 CR2aR2b이고;
또는:
식 (XXXIV)의 X1 및 X3은 둘 다 CH2이고, 식 (XXXIV)의 X2는 C=0, C=C(RC)2, 또는 C=NRC이고; 이때 각각의 RC는 H, -CN, -OH, 알콕시, 치환되거나 미치환된 C1-C6알킬, 치환되거나 미치환된 C3-C6시클로알킬, 치환되거나 미치환된 C2-C5헤테로시클로알킬, 치환되거나 미치환된 아릴, 치환되거나 미치환된 헤테로아릴, -C1-C6알킬- (치환되거나 미치환된 C3-C6시클로알킬), -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 C2- C5헤테로시클로알킬), -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 아릴), 또는 -C1-C6알킬- (치환되거나 미치환된 헤테로아릴)로부터 독립적으로 선택되고;
또는:
식 (XXXIV)의 X1 및 X2는 C 및 N으로부터 독립적으로 선택되고, 융합 치환되거나 미치환 포화되거나 부분적으로 포화된 3 내지 10원 시클로알킬 고리, 융합 치환되거나 미치환 포화되거나 부분적으로 포화된 3 내지 10원 헤테로시클로알킬 고리, 융합 치환되거나 미치환된 5 내지 10원 아릴 고리, 또는 융합 치환되거나 미치환된 5 내지 10원 헤테로아릴 고리의 구성원이고, 식 (XXXIV)의 X3는 CR2aR2b이고;
또는:
식 (XXXIV)의 X2 및 X3는 C 및 N으로부터 독립적으로 선택되고, 융합 치환되거나 미치환 포화되거나 부분적으로 포화된 3 내지 10원 시클로알킬 고리, 융합 치환되거나 미치환 포화되거나 부분적으로 포화된 3 내지 10원 헤테로시클로알킬 고리, 융합 치환되거나 미치환된 5 내지 10원 아릴 고리, 또는 융합 치환되거나 미치환된 5 내지 10원 헤테로아릴 고리의 구성원이고, 식 (VLIV)의 X1은 CR2eR2f이고;
N-RA의 RA는 H, C1-C6알킬, -C(=O)C1-C2알킬, 치환되거나 미치환된 아릴, 또는 치환되거나 미치환된 헤테로아릴로부터　선택되고;
CR2cR2d, CR2aR2b 및 CR2eR2f의 R2a, R2b, R2c, R2d, R2e, 및 R2f는 H, 치환되거나 미치환된 C1-C6알킬, 치환되거나 미치환된 C1-C6헤테로알킬, 치환되거나 미치환된 C3-C6시클로알킬, 치환되거나 미치환된 C2-C5헤테로시클로알킬, 치환되거나 미치환된 아릴, 치환되거나 미치환된 헤테로아릴, -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 C3- C6시클로알킬), -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 C2-C5헤테로시클로알킬), -C1-C6알킬- (치환되거나 미치환된 아릴), -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 헤테로아릴) 및 - C(=O)RB로부터 독립적으로 선택되고;
- C(=O)RB의 RB는 치환되거나 미치환된 C1-C6알킬, 치환되거나 미치환된 C3-C6시클로알킬, 치환되거나 미치환된 C2-C5헤테로시클로알킬, 치환되거나 미치환된 아릴, 치환되거나 미치환된 헤테로아릴, -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 C3- C6시클로알킬), -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 C2-C5헤테로시클로알킬), -C1-C6알킬- (치환되거나 미치환된 아릴), -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 헤테로아릴), 또는 NRDRE로부터 선택되고;
NRDRE의 RD 및 RE는 H, 치환되거나 미치환된 C1-C6알킬, 치환되거나 미치환된 C3-C6시클로알킬, 치환되거나 미치환된 C2-C5헤테로시클로알킬, 치환되거나 미치환된 아릴, 치환되거나 미치환된 헤테로아릴, -C1-C6알킬- (치환되거나 미치환된 C3-C6시클로알킬), -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 C2- C5헤테로시클로알킬), -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 아릴), 또는 -C1-C6알킬- (치환되거나 미치환된 헤테로아릴)로부터 독립적으로 선택되고;
식 (XXXIV)의 m은 0, 1 또는 2로부터 선택되고;
식 (XXXIV)의 -U-는 -NHC(=O)-, -C(=O)NH-, -NHS(=O)2-, -S(=O)2NH-, -NHC(=O)NH-, -NH(C=O)O-, -O(C=O)NH-, 또는 -NHS(=O)2NH-로부터 선택되고;
식 (XXXIV)의 R3는 C1-C3알킬, 또는 C1-C3플루오로알킬로부터 선택되고;
식 (XXXIV)의 R4는 -NHR5, -N(R5)2, -N+(R5)3 또는 -OR5로부터 선택되고;
-NHR5, -N(R5)2, -N+(R5)3 및 -OR5 의 각각의 R5는 H, C1-C3알킬, C1-C3할로알킬, C1-C3헤테로알킬 및 -C1-C3알킬-(C3-C5시클로알킬)로부터 독립적으로 선택되고;
또는:
식 (XXXIV)의 R3 및 R5는 이들이 부착되는 원자와 함께 치환되거나 미치환된 5 내지 7원 고리를 형성하고;
또는:
식 (XXXIV)의 R3는 U의 질소 원자에 결합되어 치환되거나 미치환된 5 내지 7원 고리를 형성하고;
식 (XXXIV)의 R6은 -NHC(=O)R7, -C(=O)NHR7, -NHS(=O)2R7, -S(=O)2NHR7; -NHC(=O)NHR7, -NHS(=O)2NHR7, -(C1-C3알킬)-NHC(=O)R7, -(C1-C3알킬)-C(=O)NHR7, -(C1-C3알킬)-NHS(=O)2R7, -(C1-C3알킬)-S(=O)2NHR7; -(C1-C3알킬)-NHC(=O)NHR7, -(C1-C3알킬)-NHS(=O)2NHR7, 치환되거나 미치환된 C2-C10헤테로시클로알킬, 또는 치환되거나 미치환된 헤테로아릴로부터 선택되고;
-NHC(=O)R7, -C(=O)NHR7, -NHS(=O)2R7, -S(=O)2NHR7; -NHC(=O)NHR7, -NHS(=O)2NHR7, -(C1-C3알킬)-NHC(=O)R7, -(C1-C3알킬)-C(=O)NHR7, -(C1-C3알킬)-NHS(=O)2R7, -(C1-C3알킬)-S(=O)2NHR7; -(C1-C3알킬)-NHC(=O)NHR7, -(C1-C3알킬)-NHS(=O)2NHR7 의 각각의 R7은 C1-C6알킬, C1-C6할로알킬, C1-C6헤테로알킬, 치환되거나 미치환된 C3-C10시클로알킬, 치환되거나 미치환된 C2- C10헤테로시클로알킬, 치환되거나 미치환된 아릴, 치환되거나 미치환된 헤테로아릴, -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 C3-C10시클로알킬), -C1-C6알킬- (치환되거나 미치환된 C2-C10헤테로시클로알킬, -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 아릴), -C1-C6알킬-(치환되거나 미치환된 헤테로아릴), -(CH2)p-CH(치환되거나 미치환된 아릴)2, -(CH2)p-CH(치환되거나 미치환된 헤테로아릴)2, -(CH2)P-CH(치환되거나 미치환된 아릴)(치환되거나 미치환된 헤테로아릴), -(치환되거나 미치환된 아릴)-(치환되거나 미치환된 아릴), -(치환되거나 미치환된 아릴)-(치환되거나 미치환된 헤테로아릴), -(치환되거나 미치환된 헤테로아릴)-(치환되거나 미치환된 아릴), 또는 -(치환되거나 미치환된 헤테로아릴)-(치환되거나 미치환된 헤테로아릴)로부터 독립적으로 선택되고;
R7의 p는 0, 1, 또는 2로부터 선택되고;
C(R8a)(R8b), C(R8c)(R8d) 및 C(R8e)(R8f)의 R8a, R8b, R8c, R8d, R8e, 및 R8f는 H, C1-C6알킬, C1-C6플루오로알킬, C1-C6 알콕시, C1-C6헤테로알킬, 및 치환되거나 미치환된 아릴로부터 독립적으로 선택되고;
또는:
C(R8a)(R8b), C(R8c)(R8d) 및 C(R8e)(R8f)의 R8a, R8d, R8e, 및 R8f는 전술한 정의된 바와 같고, R8b 및 R8c는 함께 결합을 형성하고;
또는:
C(R8a)(R8b), C(R8c)(R8d) 및 C(R8e)(R8f)의 R8a, R8b, R8d, 및 R8f는 전술한 정의된 바와 같고, R8c 및 R8e는 함께 결합을 형성하고;
또는:
C(R8a)(R8b), C(R8c)(R8d) 및 C(R8e)(R8f)의 R8a, R8d, R8e, 및 R8f는 전술한 정의한 바와 같고, R8b 및 R8c는 이들이 부착되는 원자와 함께, S, O 및 N으로부터 선택되는 1 내지 3개의 헤테로원자를 포함하는 치환되거나 미치환된 융합 5 내지 7원 포화 또는 부분적으로 포화된 카보시클릭 고리 또는 헤테로시클릭 고리, 치환되거나 미치환된 융합 5 내지 10원 아릴 고리, 또는 S, O 및 N으로부터 선택되는 1 내지 3개의 헤테로원자를 포함하는 치환되거나 미치환된 융합 5 내지 10원 헤테로아릴 고리를 형성하고;
또는:
C(R8a)(R8b), C(R8c)(R8d) 및 C(R8e)(R8f)의 R8a, R8b, R8d, 및 R8f는 전술한 정의한 바와 같고, R8c 및 R8e는 이들이 부착되는 원자와 함께, S, O 및 N으로부터 선택되는 1 내지 3개의 헤테로원자를 포함하는 치환되거나 미치환된 융합 5 내지 7원 포화 또는 부분적으로 포화된 카보시클릭 고리 또는 헤테로시클릭 고리, 치환되거나 미치환된 융합 5 내지 10원 아릴 고리, 또는 S, O 및 N으로부터 선택되는 1 내지 3개의 헤테로원자를 포함하는 치환되거나 미치환된 융합 5 내지 10원 헤테로아릴 고리를 형성하고;
또는:
C(R8c)(R8d) 및 C(R8e)(R8f)의 R8c, R8d, R8e, 및 R8f는 전술한 정의한 바와 같고, R8a 및 R8b는 이들이 부착되는 원자와 함께 S, O 및 N으로부터 선택되는 1 내지 3개의 헤테로원자를 포함하는 치환되거나 미치환된 포화 또는 부분적으로 포화된 3 내지 7원 스피로고리 또는 헤테로스피로고리를 형성하고;
또는:
C(R8a)(R8b) 및 C(R8e)(R8f)의 R8a, R8b, R8e, 및 R8f는 전술한 정의한 바와 같고, R8c 및 R8d는 이들이 부착되는 원자와 함께 S, O 및 N으로부터 선택되는 1 내지 3개의 헤테로원자를 포함하는 치환되거나 미치환된 포화 또는 부분적으로 포화된 3 내지 7원 스피로고리 또는 헤테로스피로고리를 형성하고;
또는:
C(R8a)(R8b) 및 C(R8c)(R8d)의 R8a, R8b, R8c, 및 R8d는 전술한 정의한 바와 같고, R8e 및 R8f는 이들이 부착되는 원자와 함께 S, O 및 N으로부터 선택되는 1 내지 3개의 헤테로원자를 포함하는 치환되거나 미치환된 포화 또는 부분적으로 포화된 3 내지 7원 스피로고리 또는 헤테로스피로고리를 형성하고;
또는:
여기서 각각의 치환된 알킬, 헤테로알킬, 융합 고리, 스피로고리, 헤테로스피로고리, 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴 또는 헤테로아릴은 1 내지 3개의 R9로 치환되고; 및
R8a, R8b, R8c, R8d , R8e, 및 R8f의 각각의 R9은 -OH, -SH, (C=O), CN, C1-C4알킬, C1-C4플루오로알킬, C1-C4 알콕시, C1-C4 플루오로알콕시, -NH2, -NH(C1- C4알킬), -NH(C1-C4알킬)2, - C(=O)OH, -C(=0)NH2, -C(=O)C1-C3알킬, -S(=O)2CH3, -NH(C1-C4알킬)-OH, -NH(C1-C4알킬)-O-(C-C4알킬), -O(C1-C4알킬)-NH2; -O(C1-C4알킬)-NH-(C1-C4알킬), 및 -O(C1-C4알킬)-N-(C1-C4알킬)2로부터 독립적으로 선택되거나, 또는 이들이 부착되는 원자와 함께 2개의 R9가 할로겐, -OH, 또는 C1-C3알킬로 치환되거나 미치환된 메틸렌 디옥시 또는 에틸렌 디옥시 고리를 형성한다.
본원에 기술된 임의의 화합물 중, ILM은 Vamos, M., 등, Expedient synthesis of highly potent antagonists of inhibitor of apoptosis proteins (IAPs) with unique selectivity for ML-IAP, ACS Chem. Biol., 8(4), 725-32 (2013)에서 기술된 IAP 리간드, 또는 그의 인공적인 모방체로부터 유도된, 식 (XXXV), (XXXVI) 또는 (XXXVII)의 구조를 가질 수 있고:
여기서,
식 (XXXV)의 R2는 H 또는 ME로부터 독립적으로 선택되고;
식 (XXXV)의 R3 및 R4는 H 또는 ME로부터 독립적으로 선택되고;
식 (XXXV) 및 (XXXVII)의 X는 O 또는 S로부터 독립적으로 선택되고; 및
식 (XXXV) 및 (XXXVII)의 R1은 다음으로부터 선택되고:
특정 구현예에서, ILM은 식 (XXXVIII)에 따른 구조를 갖는다:
여기서 식 (XXXVIII)의 R3 및 R4는 H 또는 ME로부터 독립적으로 선택되고;
는 다음으로부터 선택되는 5-원 헤테로고리이고:
특정 구현예에서, 식 (XXXVIII)의 은 이다.
특정 구현예에서, ILM은 다음에서 나타내는 바와 같은 구조를 가지며 연결기(L)에 부착된다:
본원에 기술된 임의의 화합물 중, ILM은, Hennessy, EJ 등, Discovery of aminopiperidine-based Smac mimetics as IAP antagonists, Bioorg. Med. Chem. Lett., 22(4), 1960-4 (2012)에서 기술된 IAP 리간드, 또는 그의 인공적인 모방체에 기초하는, 식 (XXXIX) 또는 (XL)의 구조를 가질 수 있고:
여기서,
식 (XXXIX) 및 (XL)의 R1는 다음으로부터 선택되고:
식 (XXXIX) 및 (XL)의 R2는 H 또는 Me로부터 선택되고;
식 (XXXIX) 및 (XL)의 R3는 다음으로부터 선택되고:
X는 H, 할로겐, 메틸, 메톡시, 하이드록시, 니트로 또는 트리플루오로메틸로부터 선택된다.
본원에 기술된 임의의 화합물 중, ILM은 식 (XLI) 또는 (XLII)에 보이는 바와 같은 연결기, 또는 그의 인공적인 모방체의 구조를 가질 수 있고, 이에 화학적으로 연결될 수 있고:
본원에 기술된 임의의 화합물 중, ILM은 Cohen, F 등, Orally bioavailable antagonists of inhibitor of apoptosis proteins based on an azabi시클로octane scaffold, J. Med. Chem., 52(6), 1723-30 (2009)에서 기술된 IAP 리간드, 또는 그의 인공적인 모방체에 기초하는, 식 (XLIII)의 구조를 가질 수 있고:
여기서,
식 (XLIII)의 R1은 다음으로부터 선택되고:
의 X는 H, 플루오로, 메틸 또는 메톡시로부터 선택된다.
특정 구현예에서, ILM은 다음의 구조로 대표된다:
특정 구현예에서, ILM은 다음으로 이루어진 군으로부터 선택된다(ILM과 연결기(L) 사이의 화학적 연결이 나타나 있음):
; 및
본원에 기술된 임의의 화합물 중, ILM은 Asano, M 등, Design, sterioselective synthesis, and biological evaluation of novel tri-cyclic compounds as inhibitor of apoptosis proteins (IAP) antagonists, Bioorg. Med. Chem., 21(18): 5725-37 (2013)에서 기술된 IAP 리간드, 또는 그의 인공적인 모방체에 기초하는, 하기 구조로 이루어진 군으로부터 선택되고:
특정 구현예에서, ILM은 다음으로 이루어진 군으로부터 선택된다(ILM과 연결기(L) 사이의 화학적 연결이 나타나 있음):
본원에 기술된 임의의 화합물 중, ILM은 Asano, M 등, Design, sterioselective synthesis, and biological evaluation of novel tri-cyclic compounds as inhibitor of apoptosis proteins (IAP) antagonists, Bioorg. Med. Chem., 21(18): 5725-37 (2013)에서 기술된 IAP 리간드, 또는 그의 인공적인 모방체에 기초하는, 식 (XLIV)의 구조를 가질 수 있고:
여기서 식 (XLIV)의 X는 H, 할로겐 또는 시아노로부터 독립적으로 선택되는 1 또는 2개의 치환기이다.
본원에 기술된 임의의 화합물 중, ILM은 다음의 구조, 또는 그의 인공적인 모방체의 구조를 가질 수 있고, 식 (XLV) 또는 (XLVI)에 보이는 바와 같은 연결기(L)에 화학적으로 연결될 수 있고:
여기서 식 (XLV) 및 (XLVI)의 X는 H, 할로겐 또는 시아노로부터 독립적으로 선택되는 1 또는 2개의 치환기이고, 및; 식 (XLV) 및 (XLVI)의 L은 본원에 기재된 바와 같은 연결기이다.
본원에 기술된 임의의 화합물 중, ILM은 Ardecky, RJ 등, Design, sysnthesis and evaluation of inhibitor of apoptosis (IAP) antagonists that are highly selective for the BIR2 domain of XIAP, Bioorg. Med. Chem., 23(14): 4253-7 (2013)에서 기술된 IAP 리간드, 또는 그의 인공적인 모방체에 기초하는, 식 (XLVII)의 구조를 가질 수 있고:
여기서,
식 (XLVII)의 는 천연 또는 인공적인 아미노산이고; 및
식 (XLVII)의 R2은 다음으로부터 선택된다:
본원에 기술된 임의의 화합물 중, ILM은 다음의 구조, 또는 그의 인공적인 모방체의 구조를 가질 수 있고, 식 (XLVIII) 또는 (XLIX)에 보이는 바와 같이 연결기(L)에 화학적으로 연결될 수 있고:
식 (XLVIII) 및 (XLIX)의 는 천연 또는 인공적인 아미노산이고; 및
식 (XLVIII) 및 (XLIX)의 L은 본원에 기재된 바와 같은 연결기이다.
본원에 기술된 임의의 화합물 중, ILM은 Wang, J 등, Discovery of novel second mitochondrial-derived activator of caspase mimetics as selective inhibitor or apoptosis protein inhibitors, J. Pharmacol. Exp. Ther., 349(2): 319-29 (2014)에서 기술된 IAP 리간드, 또는 그의 인공적인 모방체에 기초하는, 다음으로 이루어진 군으로부터 선택되는 구조를 가질 수 있고:
본원에 기술된 임의의 화합물 중, ILM은, Hird, AW 등, Structure-based design and synthesis of tricyclic IAP (Inhibitors of Apoptosis Proteins) inhibitors, Bioorg. Med. Chem. Lett., 24(7): 1820-4 (2014)에서 기술된 IAP 리간드, 또는 그의 인공적인 모방체에 기초하는, 식 (L)의 구조를 가지고:
여기서 식 (L)의 R은 다음으로 이루어진 군으로부터 선택되고:
;
의 R1은 H 또는 Me로부터 선택되고;
의 R2는 알킬 또는 시클로알킬로부터 선택되고;
의 X는 할로겐, 하이드록시, 메톡시, 니트로 및 트리플루오로메틸로부터 독립적으로 선택되는 1 또는 2개의 치환기이고
의 Z는 O 또는 NH이고;
의 HET는 모노- 또는 융합된 이중고리 헤테로아릴이고; 및
식 (L)의 --- 은 선택적인 이중 결합이다.
특정 구현예에서, 화합물의 ILM은 다음으로 이루어진 군으로부터 선택되는 화학적 구조를 갖는다:
예시적인 MLM
소정의 추가적인 구현예에서, 이작용성 화합물의 MLM은 치환된 이미다졸린, 치환된 스피로-인돌리논, 치환된 피롤리딘, 치환된 피페리디논, 치환된 모르폴리논, 치환된 피롤로피리미딘, 치환된 이미다졸로피리딘, 치환된 티아졸로이미다졸린, 치환된 피롤로피롤리디논, 및 치환된 이소퀴놀리논과 같은 화학적 모이어티를 포함한다.
추가적인 구현예에서, MLM은 시스- 또는 트랜스-구성으로서 위치된 인접한 비스-아릴 치환기와 함께 전술한 코어 구조를 포함한다.
다른 추가적인 구현예에서, MLM은, RG7112, RG7388, SAR405838, AMG-232, AM-7209, DS-5272, MK-8242, 및 NVP-CGM-097 내에서와 같은 구조적 특징의 일부, 및 이들의 유사체 또는 유도체를 포함한다.
소정의 바람직한 구현예에서, MLM은 식 (A-1)로 대표되는 치환된 이미다졸린, 또는 식 (A-2)로 대표되는 티아졸로이미다졸린, 또는 식 (A-3)으로 대표되는 스피로 인돌리논, 또는 식 (A-4)로 대표되는 피롤리딘, 또는 식 (A-5)로 대표되는 피롤리딘/모트필리논, 또는 식 (A-6)으로 대표되는 이소퀴놀리논, 또는 식 (A-7)로 대표되는 피롤로피리미딘/이미다졸로피리딘 또는 식 (A-8)로 대표되는 피롤로피롤리디논/이미다졸로피롤리디논의 유도체이다.
여기서 식 (A-1) 내지 식 (A-8)에서:
식 (A-1) 내지 식 (A-8)의 X는 탄소, 산소, 황, 설폭시드, 설폰, 및 N-Ra로 이루어진 군으로부터 선택되고;
Ra는 독립적으로 H 또는 1 내지 6개의 탄소를 갖는 알킬기이고;
식 (A-1) 내지 식 (A-8)의 Y 및 Z는 독립적으로 탄소 또는 질소이고;
식 (A-1) 내지 식 (A-8)의 A, A' 및 A"은 C, N, O 또는 S로부터 독립적으로 선택되고, 또한 융합된 이중고리 고리, 또는 6,5- 및 5,5-융합 방향족 이중고리기를 형성하는 1 또는 2개의 원자일 수 있고;
식 (A-1) 내지 식 (A-8)의 R1, R2는, 아릴 또는 황 또는 질소로부터 독립적으로 선택되는 1 또는 2개의 헤테로원자를 갖는 헤테로아릴기로 이루어진 군으로부터 독립적으로 선택되고(여기서, 아릴 또는 헤테로아릴기는, 단일 고리형이거나 이중 고리형일 수 있고, 미치환이거나
할로겐, -CN, C1 내지 C6 알킬기, C3 내지 C6 시클로알킬, -OH, 1 내지 6개의 탄소를 갖는 알콕시, 1 내지 6개의 탄소를 갖는 불소로 치환된 알콕시, 1 내지 6개의 탄소를 갖는 설폭시드, 1 내지 6개의 탄소를 갖는 설폰, 2 내지 6개의 탄소를 갖는 케톤, 2 내지 6개의 탄소를 갖는 아미드, 및 2 내지 6개의 탄소를 갖는 디알킬 아민으로 이루어진 군으로부터 독립적으로 선택되는 1 내지 3개의 치환기로 치환됨);
식 (A-1) 내지 식 (A-8)의 R3, R4는 H, 메틸 및 C1 내지 C6 알킬로 이루어진 군으로부터 독립적으로 선택되고;
식 (A-1) 내지 식 (A-8)의 R5는 아릴 또는 황 또는 질소로부터 독립적으로 선택되는 1 또는 2개의 헤테로원자를 갖는 헤테로아릴기로 이루어진 군으로부터 선택되고(여기서, 아릴 또는 헤테로아릴기는, 단일 고리형이거나 이중 고리형일 수 있고, 미치환이거나
할로겐, -CN, C1 내지 C6 알킬기, C3 내지 C6 시클로알킬, -OH, 1 내지 6개의 탄소를 갖는 알콕시, 1 내지 6개의 탄소를 갖는 불소로 치환된 알콕시, 1 내지 6개의 탄소를 갖는 설폭시드, 1 내지 6개의 탄소를 갖는 설폰, 2 내지 6개의 탄소를 갖는 케톤, 2 내지 6개의 탄소를 갖는 아미드, 2 내지 6개의 탄소를 갖는 디알킬 아민, 알킬 에테르(C2 내지 C6), 알킬 케톤(C3 내지 C6), 모르폴리닐, 알킬 에스테르(C3 내지 C6), 알킬 시아나이드(C3 내지 C6)로 이루어진 군으로부터 독립적으로 선택되는 1 내지 3개의 치환기로 치환됨);
식 (A-1) 내지 식 (A-8)의 R6는 H 또는 -C(=O)Rb이고(여기서,
식 (A-1) 내지 식 (A-8)의 Rb는 알킬, 시클로알킬, 모노-, 디- 또는 삼중-치환된 아릴 또는 헤테로아릴, 4-모르폴리닐, 1-(3-옥소피페라지닐), 1-피페리디닐, 4-N-Rc-모르폴리닐, 4-Rc-1-피페리디닐 및 3-Rc-1-피페리디닐로 이루어진 군으로부터 선택되고, 여기서
식 (A-1) 내지 식 (A-8)의 Rc는 알킬, 불소 치환된 알킬, 시아노 알킬, 하이드록실-치환된 알킬, 시클로알킬, 알콕시알킬, 아미드 알킬, 알킬 설폰, 알킬 설폭시드, 알킬 아미드, 아릴, 헤테로아릴, 모노-, 비스- 및 삼중-치환된 아릴 또는 헤테로아릴, CH2CH2Rd, 및 CH2CH2CH2Rd로 이루어진 군으로부터 선택되고, 여기에서
식 (A-1) 내지 식 (A-8)의 Rd는 알콕시, 알킬 설폰, 알킬 설폭시드, N-치환된 카르복사미드, -NHC(O)-알킬, -NH-SO2-알킬, 아릴, 치환된 아릴, 헤테로아릴, 치환된 헤테로아릴로 이루어진 군으로부터 선택됨);
식 (A-1) 내지 식 (A-8)의 R7은 H, C1 내지 C6 알킬, 고리형 알킬, 불소 치환된 알킬, 시아노 치환된 알킬, 5- 또는 6-원 헤테로 아릴 또는 아릴, 치환된 5- 또는 6-원 헤테로 아릴 또는 아릴로 이루어진 군으로부터 선택되고;
식 (A-1) 내지 식 (A-8)의 R8은 -Re-C(O)-Rf, -Re-알콕시, -Re-아릴, -Re-헤테로아릴, 및 -Re-C(O)-Rf-C(O)-Rg로 이루어진 군으로부터 선택되되,
식 (A-1) 내지 식 (A-8)의 Re는 1 내지 6개의 탄소를 가진 알킬렌, 또는 결합이고;
식 (A-1) 내지 식 (A-8)의 Rf는 치환된 4- 내지 7-원 헤테로고리이고;
식 (A-1) 내지 식 (A-8)의 Rg는 아릴, 헤테로 아릴, 치환된 아릴 또는 헤테로아릴, 및 4- 내지 7-원 헤테로고리로 이루어진 군으로부터 선택되고;
식 (A-1) 내지 식 (A-8)의 R9은 식 (A-3)의 융합된 이중고리 방향족 고리 상의 모노-, 비스- 또는 삼중-치환기로 이루어진 군으로부터 선택되고(여기서, 미치환이거나 Cl 또는 F로 치환된 치환기는 할로겐, 알켄, 알킨, 알킬로 이루어진 군으로부터 독립적으로 선택됨);
식 (A-1) 내지 식 (A-8)의 R10은 아릴 또는 헤테로아릴기로 이루어진 군으로부터 선택되고(헤테로아릴기는 황 또는 질소로서의 1 또는 2개의 헤테로원자를 함유할 수 있고, 아릴 또는 헤테로아릴기는 모노-고리형 또는 이중-고리형일 수 있고, 아릴 또는 헤테로아릴기는 미치환이거나, 할로겐, F, Cl, -CN, 알켄, 알킨, C1 내지 C6 알킬기, C1 내지 C6 시클로알킬, -OH, 1 내지 6개의 탄소를 갖는 알콕시, 1 내지 6개의 탄소를 갖는 불소 치환된 알콕시, 1 내지 6개의 탄소를 갖는 설폭시드, 1 내지 6개의 탄소를 갖는 설폰, 2 내지 6개의 탄소를 갖는 케톤을 포함한, 1 내지 3개의 치환기로 치환될 수 있음);
식 (A-1) 내지 식 (A-8)의 R11은 -C(O)-N(Rh)(Ri)이고, 여기서 Rh 및 Ri는 다음으로 이루어진 군으로부터 선택된다:
H; 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 C1 내지 C6 알킬; 알콕시 치환된 알킬; 모노- 및 디-하이드록시 치환된 알킬(예를 들어, C3 내지 C6, 설폰 치환된 알킬; 선택적으로 치환된 아릴; 또는 선택적으로 치환된 헤테로아릴; 모노-, 비스- 또는 삼중-치환 아릴 또는 헤테로아릴; 페닐-4-카르복실산; 치환된 페닐-4카르복실산, 알킬 카르복실산; 선택적으로 치환된 헤테로아릴 카르복실산; 알킬 카르복실산; 불소 치환된 알킬 카르복실산; 선택적으로 치환된 시클로알키, 3-하이드록시시클로부탄, 4-하이드록시시클로헤헥산, 아릴 치환된 시클로알킬; 헤테로아릴 치환된 시클로알킬; 또는 Rh와 Ri가 합쳐져 고리를 형성하고;
식 (A-1) 내지 식 (A-8)의 R12 및 R13은 H, 저급 알킬(C1 내지 C6), 저급 알케닐 (C2 내지 C6), 저급 알키닐 (C2 내지 C6), 시클로알킬(4, 5 및 6-원 고리), 치환된 시클로알킬, 시클로알케닐, 치환된 시클로알케닐, 5- 및 6-원 아릴 및 헤테로아릴로부터 독립적으로 선택되고, R12 및 R13은 고리 상의 치환을 갖거나 갖지 않고 5- 및 6-원 고리를 형성하도록 연결될 수 있고;
식 (A-1) 내지 식 (A-8)의 R14는 알킬, 치환된 알킬, 알케닐, 치환된 알케닐, 아릴, 치환된 아릴, 헤테로아릴, 치환된 헤테로아릴, 헤테로고리, 치환된 헤테로고리, 시클로알킬, 치환된 시클로알킬, 시클로알케닐 및 치환된 시클로알케닐로 이루어진 군으로부터 선택되고;
식 (A-1) 내지 식 (A-8)의 R15는 CN이고;
식 (A-1) 내지 식 (A-8)의 R16은, 하나 또는 다수의 수소가 불소로 대체된 C1-6 알킬, C1-6 시클로알킬, C2-6 알케닐, C1-6 알킬 또는 C3-6 시클로알킬, 하나의 CH2가 S(=O), -S, 또는 -S(=O)2로 대체된 알킬 또는 시클로알킬, 말단 CH3가 S(=O)2N(알킬)(알킬), -C(=O)N(알킬)(알킬), -N(알킬)S(=O)2(알킬), -C(=O)2(알킬), -O(알킬)로 대체된 알킬 또는 시클로알킬, 수소가 하이드록실기로 대체된 C1-6 알킬 또는 알킬-시클로알킬, 선택적으로 -(C=O)-기를 함유하는 3 내지 7원 시클로알킬 또는 헤테로시클로알킬, 또는 5 또는 6원 아릴 또는 헤테로아릴기로 이루어진 군(여기서, 헤테로시클로알킬 또는 헤테로아릴기는 O, N, 또는 S로부터 독립적으로 선택되는 1 내지 3개의 헤테로원자를 함유할 수 있고, 시클로알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴 또는 헤테로아릴기는 미치환이거나 할로겐, C1-6 알킬기, 하이드록실화된 C1-6 알킬, 티오에테르, 에스테르, 설폰, 설폭시드, 불소를 함유하고 에스테르 또는 시아노기로 치환된 C1-6알킬로부터 독립적으로 선택되는 1 내지 3개의 치환기로 치환될 수 있음)으로부터 선택되고;
식 (A-1) 내지 식 (A-8)의 R17은 (CH2)nC(O)NRkRl (여기서, Rk 및 Rl은 H, C1-6 알킬, 하이드록실화된 C1-6 알킬, C1-6 알콕시 알킬, 하나 또는 다수의 수소가 불소로 대체된 C1-6 알킬, 하나의 탄소가 S(O), S(O)(O)로 대체된 C1-6 알킬, 하나 또는 다수의 수소가 불소로 대체된 C1-6 알콕시알킬, 수소가 시아노기로 대체된 C1-6 알킬, 5 및 6원 아릴 또는 헤테로아릴, 1 내지 6개의 탄소를 함유하는 알킬기를 갖는 알킬 헤테로아릴, 및 1 내지 6개의 탄소를 함유하는 알킬기를 갖는 알킬 헤테로아릴로 이루어진 군으로부터 선택되고(여기서, 아릴 또는 헤테로아릴기는 추가로 치환될 수 있음);
식 (A-1) 내지 식 (A-8)의 R18은 치환된 아릴, 헤테로아릴, 알킬, 시클로알킬로 이루어진 군으로부터 선택되고(치환기는 바람직하게는 -N(C1-4 알킬)(시클로알킬), -N(C1-4 알킬)알킬-시클로알킬, 및 -N(C1-4 알킬)[(알킬)-(헤테로고리-치환)-시클로알킬]임);
식 (A-1) 내지 식 (A-8)의 R19는 아릴, 헤테로아릴, 이중고리 헤테로아릴로 이루어진 군으로부터 선택되고(이들 아릴 또는 헤로아릴기는 할로겐, C1-6 알킬, C1-6 시클로알킬, CF3, F, CN, 알킨, 알킬 설폰으로 치환될 수 있고, 할로겐 치환은 모노-, 비스- 또는 삼중-치환일 수 있음);
식 (A-1) 내지 식 (A-8)의 R20 및 R21은 C1-6 알킬, C1-6 시클로알킬, C1-6 알콕시, 하이드록실화된 C1-6 알콕시 및 불소로 치환된 C1-6 알콕시로부터 독립적으로 선택되고(여기서, R20 및 R21은 추가로 치환될 수 있는 5, 6 및 7-원 고리형 또는 헤테로고리형 고리를 형성하도록 추가로 연결될 수 있음);
식 (A-1) 내지 식 (A-8)의 R22는 H, C1-6 알킬, C1-6 시클로알킬, 카르복실산, 카르복실산 에스테르, 아미드, 역 아미드, 설폰아미드, 역 설폰아미드, N-아실 우레아, 질소-함유 5-원 헤테로고리(5-원 헤테로고리는 C1-6 알킬, 알콕시, 불소-치환된 알킬, CN, 및 알킬설폰으로 추가로 치환될 수 있음)로 이루어진 군으로부터 선택되고;
식 (A-1) 내지 식 (A-8)의 R23은 아릴, 헤테로아릴, -O-아릴, -O-헤테로아릴, -O-알킬, -O-알킬-시클로알킬, -NH-알킬, -NH-알킬-시클로알킬, -N(H)-아릴, -N(H)-헤테로아릴, -N(알킬)-아릴, -N(알킬)-헤테로아릴로부터(아릴 또는 헤테로아릴기는 할로겐, C1-6 알킬, 히독실화된 C1-6 알킬, 시클로알킬, 불소-치환된 C1-6 알킬, CN, 알콕시, 알킬 설폰, 아미드 및 설폰아미드로 치환될 수 있음) 선택되고;
식 (A-1) 내지 식 (A-8)의 R24는 -CH2-(C1-6 알킬), -CH2-시클로알킬, -CH2-아릴, CH2-헤테로아릴로 이루어진 군(여기서 알킬, 시클로알킬, 아릴 및 헤테로아릴은 할로겐, 알콕시, 히독실화된 알킬, 시아노-치환된 알킬, 시클로알킬 및 치환된 시클로알킬로 치환될 수 있음)으로부터 선택되고;
식 (A-1) 내지 식 (A-8)의 R25는 C1-6 알킬, C1-6 알킬-시클로알킬, 알콕시-치환된 알킬, 하이드록실화된 알킬, 아릴, 헤테로아릴, 치환된 아릴 또는 헤테로아릴, 5,6 및 7-원 질소-함유 포화 헤테로고리로 이루어진 군(5,6-융합 ?? 6,6-융합 질소-함유 포화된 헤테로고리 및 이들 포화 헤테로고리는 C1-6 알킬, 불소-치환된 C1-6 알킬, 알콕시, 아릴 및 헤테로아릴기로 치환될 수 있음)으로부터 선택되고;
식 (A-1) 내지 식 (A-8)의 R26은 C1-6 알킬, C3-6 시클로알킬로 이루어진 군(알킬 또는 시클로알킬은 -OH, 알콕시, 불소-치환된 알콕시, 불소-치환된 알킬, -NH2, -NH-알킬, NH-C(O)알킬, -NH-S(O)2-알킬, 및 -S(O)2-알킬로 치환될 수 있음)으로부터 선택되고;
식 (A-1) 내지 식 (A-8)의 R27은 아릴, 헤테로아릴, 이중고리 헤테로아릴로 이루어진 군(아릴 또는 헤로아릴기는 C1-6 알킬, 알콕시, NH2, NH-알킬, 할로겐, 또는 -CN으로 치환될 수 있고, 치환은 독립적으로 모노-, 비스- 또는 삼중-치환일 수 있음)으로부터 선택되고;
식 (A-1) 내지 식 (A-8)의 R28은 아릴, 5 및 6-원 헤테로아릴, 이중고리 헤테로아릴, 시클로알킬, 포화된 헤테로고리(예를 들어, 피페리딘, 피페리디논, 테트라하이드로피란, 및 N-아실-피페리딘)로 이루어진 군(여기서, 시클로알킬, 포화된 헤테로고리, 아릴 또는 헤테로아릴은 -OH, 알콕시, 할로겐, -CN, 알킬 설폰 및 불소로 치환된 알킬기를 포함하는 모노-, 비스- 또는 삼중-치환으로 추가로 치환될 수 있음)으로부터 선택되고; 및
식 (A-1) 내지 식 (A-8)의 R1''은 알킬, 아릴로 치환된 알킬, 알콕시로 치환된 알킬, 시클로알킬, 아릴-치환된 시클로알킬 및 알콕시로 치환된 시클로알킬로 이루어진 군으로부터 선택된다.
소정의 구현예에서, 식 (A-1) 내지 식 (A-8)의 Rf 및 Rg 내의 헤테로고리는 치환된 피롤리딘, 치환된 피페리딘, 치환된 피페리진이다.
보다 구체적으로, MLM의 비제한적인 예는 다음에 도시된 화합물 뿐만 아니라, 다음의 화합물 내에서 도시된 1개 이상의 상이한 특징부의 조합으로부터 발생하는 '하이브리드' 분자를 포함한다.
식 (A-1) 내지 식 (A-8)의 MLM을 사용하여, 다음의 PROTAC는 분해를 위한 특정 단백질을 표적화하기 위해 제조될 수 있다(여기서, 'L"은 연결부(즉 연결기)이고, "PTM"은 표적 단백질에 결합하는 리간드임).
특정 구현예에서, 설명은 다음으로 이루어진 군으로부터 선택되는 구조를 포함하는 이작용성 분자를 제공한다:
여기서, X, Ra, Y, Z, A, A', A'', R1, R2, R3, R4, R5, R6, Rb, Rc, Rd, R7, Re, Rf, Rg, R9, R10, R11, R12, R13, R14, R15, R16, R17, Rk, Rl, R18, R19, R20, R21, R22, R23,R24, R25, R26, R27, R28, 및 R1'' 은 본원에서 식 (A-1) 내지 식 (A-8)에 대해 정의된 바와 같다.
특정 구현예에서, 본 명세서는 다음 구조를 갖는 이작용성 분자 또는 키메라 분자를 제공한다: PTM-L-MLM - 여기서, PTM은 L에 의해 MLM에 결합된 단백질 표적 결합 모이어티이고, L은 결합(즉, 부재) 또는 화학적 연결기이다. 소정의 구현예에서, MLM은 식 A-1-1, A-1-2, A-1-3, 및 A-1-4로 이루어진 군으로부터 선택되는 구조를 갖는다:
여기서,
식 A-1-1 내지 식 A-1-4(즉, 식 A-1-1, A-1-2, A-1-3, 및 A-1-4)의 R1' 및 R2'은 F, Cl, Br, I, 아세틸렌, CN, CF3 및 NO2로 이루어진 군으로부터 독립적으로 선택되고;
R3'은 -OCH3, -OCH2CH3, -OCH2CH2F, -OCH2CH2OCH3, 및 -OCH(CH3)2로 이루어진 군으로부터 선택되고;
식 A-1-1 내지 식 A-1-4의 R4'은 H, 할로겐, -CH3, -CF3, -OCH3, -C(CH3)3, -CH(CH3)2, -시클로프로필, -CN, -C(CH3)2OH, -C(CH3)2OCH2CH3, -C(CH3)2CH2OH, -C(CH3)2CH2OCH2CH3, -C(CH3)2CH2OCH2CH2OH, -C(CH3)2CH2OCH2CH3, -C(CH3)2CN, -C(CH3)2C(O)CH3, -C(CH3)2C(O)NHCH3, -C(CH3)2C(O)N(CH3)2, -SCH3, -SCH2CH3, -S(O)2CH3, -S(O2)CH2CH3, -NHC(CH3)3, -N(CH3)2, 피롤리디닐, 및 4-모르폴리닐로 이루어진 군으로부터 선택되고;
식 A-1-1 내지 식 A-1-4의 R5'은 할로겐, -시클로프로필, -S(O)2CH3, -S(O)2CH2CH3, 1-피롤리디닐, -NH2, -N(CH3)2, 및 -NHC(CH3)3로 이루어진 군으로부터 선택되고; 및
식 A-1-1 내지 식 A-1-4의 R6'은 연결기 연결 지점이 "*"로 표시되는 아래에 제시된 구조로부터 선택된다.
연결기 부착의 지점으로서의 R6'와 별도로, R4' 또한 연결기 부착 지점으로서 기능할 수 있다. R4'가 연결기 연결 지점인 경우, 연결기는 위에 나타낸 R4' 기의 말단 원자에 연결될 것이다.
소정의 구현예에서, 식 A-1-1 내지 식 A-1-4의 연결기 연결 지점은 적어도 하나의 R4' 또는 R6', 또는 둘 모두이다.
소정의 구현예에서, 식 A-1-1 내지 식 A-1-4의 R6'은, H,
로 이루어진 군으로부터 선택된다(여기서, "*"는 연결기의 부착 지점을 나타냄).
소정의 구현예에서, 식 A-4-1 내지 식 A-4-6의 연결기는 R1', R2', R3', R4', R5', R6', 또는 이들의 조합 중 적어도 하나에 부착된다.
특정 구현예에서, 본 명세서는 다음 구조를 갖는 이작용성 분자 또는 키메라 분자를 제공한다: PTM-L-MLM - 여기서, PTM은 L에 의해 MLM에 결합된 단백질 표적 결합 모이어티이고, L은 결합(즉, 부재) 또는 화학적 연결기이다. 소정의 구현예에서, MLM은 식 A-4-1, A-4-2, A-4-3, A-4-4, A-4-5, 및 A-4-6로 이루어진 군으로부터 선택되는 구조를 갖는다:
여기서,
식 A-4-1 내지 A-4-6(즉, A-4-1, A-4-2, A-4-3, A-4-4, A-4-5, 및 A-4-6)의 R7'은 하나 이상의 (예를 들어, 1, 2, 3, 또는 4개의) 할로겐이고;
식 A-4-1 내지 식 A-4-6의 R8'은 H, -F, -Cl, -Br, -I, -CN, -NO2, 에틸닐, 시클로프로필, 메틸, 에틸, 이소프로필, 비닐, 메톡시, 에톡시, 이소프로폭시, -OH, 다른 C1-6 알킬, 다른 C1-6 알케닐 및 C1-6 알키닐(모노-, 디- 또는 삼중-치환됨)으로 이루어진 군으로부터 선택되고;
식 A-4-1 내지 식 A-4-6의 R9'은 알킬, 치환된 알킬, 알케닐, 치환된 알케닐, 알키닐, 치환된 알키닐, 아릴, 치환된 아릴, 헤테로 아릴, 치환된 헤테로아릴, 시클로알킬, 치환된 시클로알킬, 알케닐 및 치환된 시클로알케닐로 이루어진 군으로부터 선택되고;
식 A-4-1 내지 식 A-4-6의 Z는 H, -OCH3, -OCH2CH3, 및 할로겐으로 이루어진 군으로부터 선택되고;
식 A-4-1 내지 식 A-4-6의 R10' 및 R11은 각각 H, (CH2)n-R', (CH2)n-NR'R'', (CH2)n-NR'COR'', (CH2)n-NR'SO2R'', (CH2)n-COOH, (CH2)n-COOR', (CH)n-CONR'R'', (CH2)n-OR', (CH2)n-SR', (CH2)n-SOR', (CH2)n-CH(OH)-R', (CH2)n-COR', (CH2)n-SO2R', (CH2)n-SONR'R'', (CH2)n-SO2NR'R'', (CH2CH2O)m-(CH2)n-R', (CH2CH2O)m-(CH2)n-OH, (CH2CH2O)m-(CH2)n-OR', (CH2CH2O)m-(CH2)n-NR'R'', (CH2CH2O)m-(CH2)n-NR'COR'', (CH2CH2O)m(CH2)n-NR'SO2R'', (CH2CH2O)m(CH2)n-COOH, (CH2CH2O)m(CH2)n-COOR', (CH2CH2O)m-(CH2)n-CONR'R'', (CH2CH2O)m-(CH2)n-SO2R', (CH2CH2O)m-(CH2)n-COR', (CH2CH2O)m-(CH2)n-SONR'R'', (CH2CH2O)m-(CH2)n-SO2NR'R'', (CH2)p-(CH2CH2O)m-(CH2)nR', (CH2)p-(CH2CH2O)m-(CH2)n-OH, (CH2)p-(CH2CH2O)m-(CH2)n-OR', (CH2)p-(CH2CH2O)m-(CH2)n-NR'R'', (CH2)p-(CH2CH2O)m-(CH2)n-NR'COR'', (CH2)p-(CH2CH2O)m-(CH2)n-NR'SO2R'', (CH2)p-(CH2CH2O)m-(CH2)n-COOH, (CH2)p-(CH2CH2O)m-(CH2)n-COOR', (CH2)p-(CH2CH2O)m-(CH2)n-CONR'R'', (CH2)p-(CH2CH2O)m-(CH2)n-SO2R', (CH2)p-(CH2CH2O)m-(CH2)n-COR', (CH2)p-(CH2CH2O)m-(CH2)n-SONR'R'', (CH2)p-(CH2CH2O)m-(CH2)n-SO2NR'R'', 아릴-(CH2)n-COOH, 및 헤테로아릴-알킬-CO-알킬-NR'R'm로 이루어진 군으로부터 독립적으로 선택되고, 여기서 알킬은 OR', 및 헤테로아릴-(CH2)n-헤테로고리로 치환될 수 있고 여기서 헤테로고리는 알킬, 하이드록실, COOR' 및 COR'로 선택적으로 치환될 수 있고; 여기서 R' 및 R''는 H, 알킬, 할로겐으로 치환된 알킬, 하이드록실, NH2, NH(알킬), N(알킬)2, 옥소, 카르복시, 시클로알킬 및 헤테로아릴로부터 선택되고;
m, n, 및 p는 독립적으로 0 내지 6이고;
식 A-4-1 내지 식 A-4-6의 R12'은 -O-(알킬), -O-(알킬)-알콕시, -C(O)-(알킬), -C(OH)-알킬-알콕시, -C(O)-NH-(알킬), -C(O)-N-(알킬)2, -S(O)-(알킬), S(O)2-(알킬), -C(O)-(고리형 아민), 및 -O-아릴-(알킬), -O-아릴-(알콕시)로 이루어진 군으로부터 선택되고;
식 A-4-1 내지 식 A-4-6의 R1"은 알킬, 아릴로 치환된 알킬, 알콕시로 치환된 알킬, 시클로알킬, 아릴-치환된 시클로알킬 및 알콕시로 치환된 시클로알킬로 이루어진 군으로부터 선택된다.
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 알킬, 알콕시 등은 저급 알킬 또는 저급 알콕시일 수 있다.
소정의 구현예에서, 식 A-4-1 내지 식 A-4-6의 연결기 연결 지점은 Z, R8', R9', R10', R11'', R12", 또는 R1'' 중 적어도 하나이다.
식 A-1-1 내지 A-1-4, A-4-1 내지 A-4-6에서 제시된 바와 같은 키메라 분자를 설계하는 데에 사용되는 방법은 식 A-2, A-3, A-5, A-6, A-7 및 A-8을 이용하여 MLM에 적용할 수 있다(여기서, MLM 내의 용매 노출 영역은 PROTAC를 구축할 수 있도록 표적 단백질 리간드 "PTM"에 부착될 연결기 "L"에 연결될 수 있음).
예시적인 MDM2 결합 모이어티는 다음을 포함하지만 이에 한정되지는 않는다:
1. 아래에 기술된 화합물 누트린(nutlin)-3, 누트린-2 및 누트린-1을 포함하여(또는 추가하여), Vassilev, 등, In vivo activation of the p53 pathway by small-molecule antagonists of MDM2, SCIENCE vol:303, pag:844-848 (2004), 및 Schneekloth, 등, Targeted intracellular protein degradation induced by a small molecule: En route to chemical proteomics,Bioorg. Med. Chem. Lett. 18 (2008) 5904-5908에 확인된 HDM2/MDM2 억제제 및, 이들의 모든 유도체와 유사체:
(연결기(L) 또는 -(L-MLM)기가, 예를 들어, 메톡시기에서 또는 하이드록실기로서 부착된 경우, 유도됨);
(연결기(L) 또는 -(L-MLM)기가, 예를 들어, 메톡시기 또는 하이드록실기에서 부착된 경우, 유도됨);
(연결기(L) 또는 -(L-MLM)기가, 예를 들어, 메톡시기를 통하거나 하이드록실기로서 부착된 경우, 유도됨); 및
2. 트랜스-4-4-요오도-4'-보라닐-칼콘
(연결기(L) 또는 -(L-MLM)기가, 예를 들어, 하이드록실기를 통해 부착된 경우, 유도됨).
예시적인 연결기
특정 구현예에서, 본원에 기술된 화합물은 화학적 연결기(L)를 통해 하나 이상의 ULM(예를 들어, CLM, VLM, MLM, ILM, 또는 이들의 조합 중 적어도 하나)에 화학적으로 연결되거나 결합된 하나 이상의 PTM을 포함한다. 소정의 구현예에서, 연결기(L)은 하나 이상의 공유 결합된 구조 단위(예를 들어, -AL 1...(AL)q- 또는 -(AL)q-)를 포함하는 기이다(여기서 A1은 PTM에 결합되는 기이고, (AL)q는 ULM에 결합되는 기임).
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, ULM(예, VLM, ILM, CLM, 또는 MLM)으로의 연결기(L) 연결 또는 결합은 안정한 L-ULM 연결이다. 예를 들어, 본원에 설명된 임의의 양태 또는 구현예에서, 연결기(L)와 ULM이 헤테로원자를 통해 연결되는 경우, 임의의 후속 헤테로원자가 존재하면 아세탈 또는 아미날 기와 같은 적어도 하나의 단일 탄소 원자(예, -CH2-)에 의해 분리된다. 추가 예시에 의하면, 본원에 설명된 임의의 양태 또는 구현예에서, 연결기(L)와 ULM이 헤테로원자를 통해 연결되는 경우에 헤테로원자는 에스테르의 부분이 아니다.
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 연결기(L)은 식 -(AL)q-로 표시되는 결합 또는 화학적 연결기이고, 여기서 A는 화학적 모이어티이고, q는 1-100의 정수(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 또는 100)이고, 여기서 L은 PTM 및 ULM에 공유 결합되고, 및 단백질 표적에 대한 PTM의 충분한 결합 및 E3 유비퀴틴 리가아제에 대한 ULM의 충분한 결합을 제공하여 표적 단백질 유비퀴틴화를 야기한다.
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 연결기(L)는 -(AL)q-이고, 여기서,
(AL)q는 ULM(예컨대 VLM), PTM 모이어티, 또는 이들의 조합 중 적어도 하나에 연결되는 기이고;
연결기의 q는 1 이상의 정수(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 또는 100)이고;
각각의 AL은, 결합, CRL1RL2, O, S, SO, SO2, NRL3, SO2NRL3, SONRL3, CONRL3, NRL3CONRL4, NRL3SO2NRL4, CO, CRL1=CRL2, C≡C, SiRL1RL2, P(O)RL1, P(O)ORL1, NRL3C(=NCN)NRL4, NRL3C(=NCN), NRL3C(=CNO2)NRL4, 0 내지 6개의 RL1 및/또는 RL2기로 선택적으로 치환된 C3-11시클로알킬, 0 내지 9개의 RL1 및/또는 RL2기로 선택적으로 치환된 C5-13 스피로시클로알킬, 0 내지 6개의 RL1 및/또는 RL2기로 선택적으로 치환된 C3-11헤테로시클릴, 0 내지 8개의 RL1 및/또는 RL2기로 선택적으로 치환된 C5-13 스피로헤테로시클로알킬, 0 내지 6개의 RL1 및/또는 RL2 기로 선택적으로 치환된 아릴, 0 내지 6개의 RL1 및/또는 RL2 기로 선택적으로 치환된 헤테로아릴로 이루어진 군(여기서, RL1 또는 RL2는, 각각 독립적으로 또 다른 기에 선택적으로 연결되어 0 내지 4개의 RL5 기로 선택적으로 치환된 시클로알킬 및/또는 헤테로시클릴 모이어티를 형성함)으로부터 독립적으로 선택되고; 및
RL1, RL2, RL3, RL4 및 RL5는 각각 독립적으로 H, 할로, C1-8알킬, OC1-8알킬, SC1-8알킬, NHC1-8알킬, N(C1-8알킬)2, C3-11시클로알킬, 아릴, 헤테로아릴, C3-11헤테로시클릴, OC3-8시클로알킬, SC3-8시클로알킬, NHC3-8시클로알킬, N(C3-8시클로알킬)2, N(C3-8시클로알킬)(C1-8알킬), OH, NH2, SH, SO2C1-8알킬, P(O)(OC1-8알킬)(C1-8알킬), P(O)(OC1-8알킬)2, CC-C1-8알킬, CCH, CH=CH(C1-8알킬), C(C1-8알킬)=CH(C1-8알킬), C(C1-8알킬)=C(C1-8알킬)2, Si(OH)3, Si(C1-8알킬)3, Si(OH)(C1-8알킬)2, COC1-8알킬, CO2H, 할로겐, CN, CF3, CHF2, CH2F, NO2, SF5, SO2NHC1-8알킬, SO2N(C1-8알킬)2, SONHC1-8알킬, SON(C1-8알킬)2, CONHC1-8알킬, CON(C1-8알킬)2, N(C1-8알킬)CONH(C1-8알킬), N(C1-8알킬)CON(C1-8알킬)2, NHCONH(C1-8알킬), NHCON(C1-8알킬)2, NHCONH2, N(C1-8알킬)SO2NH(C1-8알킬), N(C1-8알킬) SO2N(C1-8알킬)2, NH SO2NH(C1-8알킬), NH SO2N(C1-8알킬)2, NH SO2NH2이다.
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 연결기의 q는 0 이상의 정수이다. 특정 구현예에서, q는 1 이상의 정수이다.
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 예를 들어, 연결기의 q가 2보다 큰 경우, (AL)q는 AL 1 및 (AL)q인 기이고, 여기서 유닛 AL은 PTM을 ULM에 결합시킨다.
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 예를 들어, 연결기의 q가 2인 경우, (AL)q는 AL 1 및 ULM에 연결된 기이다.
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 예를 들어, 연결기의 q가 1인 경우, 연결기(L)의 구조는 -AL 1-이고, AL 1은 ULM 모이어티 및 PTM 모이어티에 연결된 기이다.
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 연결기(L)는 다음으로 이루어진 군으로부터 선택된 일반적인 구조로 나타내어지는 기를 포함한다:
-NR(CH2)n-(저급 알킬)-, -NR(CH2)n-(저급 알콕실)-, -NR(CH2)n-(저급 알콕실)-OCH2-, -NR(CH2)n-(저급 알콕실)-(저급 알킬)-OCH2-, -NR(CH2)n-(시클로알킬)-(저급 알킬)-OCH2-, -NR(CH2)n-(헤테로 시클로알킬)-, -NR(CH2CH2O)n-(저급 알킬)-O-CH2-, -NR(CH2CH2O)n-(헤테로 시클로알킬)-O-CH2-, -NR(CH2CH2O)n-아릴-O-CH2-, -NR(CH2CH2O)n-(헤테로 아릴)-O-CH2-, -NR(CH2CH2O)n-(시클로 알킬)-O-(헤테로 아릴)-O-CH2-, -NR(CH2CH2O)n-(시클로 알킬)-O-아릴-O-CH2-, -NR(CH2CH2O)n-(저급 알킬)-NH-아릴-O-CH2-, -NR(CH2CH2O)n-(저급 알킬)-O-아릴-CH2, -NR(CH2CH2O)n-시클로알킬-O-아릴-, -NR(CH2CH2O)n-시클로알킬-O-(헤테로아릴)l-, -NR(CH2CH2)n-(시클로알킬)-O-(헤테로고리)-CH2, -NR(CH2CH2)n-(헤테로고리)-(헤테로시클릴)-CH2, -N(R1R2)-(헤테로고리)-CH2; 여기서,
연결기의 n은 0 내지 10일 수 있고;
연결기의 R은 H, 저급 알킬일 수 있고;
연결기의 R1 및 R2는 연결 N을 갖는 고리를 형성할 수 있다.
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 연결기(L)는 다음으로 이루어진 군으로부터 선택된 일반적인 구조로 나타내어지는 기를 포함한다:
-N(R)-(CH2)m-O(CH2)n-O(CH2)o-O(CH2)p-O(CH2)q-O(CH2)r-OCH2-,
-O-(CH2)m-O(CH2)n-O(CH2)o-O(CH2)p-O(CH2)q-O(CH2)r-OCH2-,
-O-(CH2)m-O(CH2)n-O(CH2)o-O(CH2)p-O(CH2)q-O(CH2)r-O-;
-N(R)-(CH2)m-O(CH2)n-O(CH2)o-O(CH2)p-O(CH2)q-O(CH2)r-O-;
-(CH2)m-O(CH2)n-O(CH2)o-O(CH2)p-O(CH2)q-O(CH2)r-O-;
-(CH2)m-O(CH2)n-O(CH2)o-O(CH2)p-O(CH2)q-O(CH2)r-OCH2-;
여기서,
연결기의 각각의 m, n, o, p, q, 및 r은 독립적으로 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20이고;
위의 수가 0일 경우, N-O 또는 O-O 결합은 없고;
연결기의 R은 H, 메틸 및 에틸이고;
연결기의 X는 H 및 F이며;
연결기의 m은 2, 3, 4, 5일 수 있고,
여기서, 연결기의 각각의 n 및 m은 독립적으로 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6일 수 있음.
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 연결기(L)는 다음으로 이루어진 군으로부터 선택된다:
(여기서, 각각의 m 및 n은 독립적으로 0, 1, 2, 3, 4, 5 또는 6으로부터 선택됨).
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 연결기(L)는 다음으로 이루어진 군으로부터 선택된다:
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 연결기(L)는 다음으로 이루어진 군으로부터 선택된다:
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 연결기(L)는 다음으로 이루어진 군으로부터 선택된다:
여기서, 각각의 m, n, o, p, q, r, s은 독립적으로 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 또는 20이다.
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 연결기(L)는 다음으로 이루어진 군으로부터 선택된다:
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 연결기(L)는 아래에 도시된 구조로부터 선택되는 구조를 포함하지만 이에 한정되지는 않으며, 점선은 PTM 또는 ULM 모이어티에 대한 부착 지점을 나타낸다.
여기서,
WL1 및 WL2은 각각 독립적으로 부재하거나, 0-4개의 헤테로원자를 갖는 4-8 원 고리, RQ로 선택적으로 치환되고, 각각의 RQ는 독립적으로 H, 할로, OH, CN, CF3, 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 C1-C6 알킬, 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 C1-C6 알콕시, 또는 0-4개의 헤테로원자를 포함하는 4-8 원 고리를 형성하기 위해 이들이 부착하는 원자와 함께 취해진 2개의 RQ기이고;
YL1은 각각 독립적으로 결합, 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 C1-C6 알킬이고, 선택적으로 하나 이상의 C 원자가 O로 대체되고; 또는 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 C1-C6 알콕시이고;
n은 0 내지 10이고; 및
은 PTM 또는 ULM 모이어티에 대한 부착 지점을 나타낸다.
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 연결기(L)는 아래에 도시된 구조로부터 선택되는 구조를 포함하지만 이에 한정되지는 않으며, 점선은 PTM 또는 ULM 모이어티에 대한 부착 지점을 나타낸다.
여기서,
WL1 및 WL2는 각각 독립적으로 부재하거나, 아릴, 헤테로아릴, 고리형, 헤테로고리형, C1-6 알킬이고, 선택적으로 하나 이상의 C 원자는 O 또는 N, C1-6 알케닐로 치환되고, 선택적으로 하나 이상의 C 원자는 O 또는 N, C1-6 알킨으로 치환되고, 선택적으로 하나 이상의 C 원자는 O, 이중고리, 바이아릴, 바이헤테로시클릭으로 치환되고, 각각은 RQ로 선택적으로 치환되고, 각각의 RQ는 독립적으로 H, 할로, OH, CN, CF3, 하이드록실, 니트로, C≡CH, C2-6 알케닐, C2-6 알키닐, (선택적으로 치환된 선형 또는 분지형) C1-C6 알킬, (선택적으로 치환된 선형 또는 분지형) C1-C6 알콕시, (하나 이상의 -F로 선택적으로 치환된) OC1-3알킬, OH, NH2, NRY1RY2, CN이거나 2개의 RQ는 이들이 부착하는 원자와 함께 취해지고 0-4개의 헤테로원자를 포함하는 4-8 원 고리를 형성하고;
YL1은 각각 독립적으로 결합, NRYL1, O, S, NRYL2, CRYL1RYL2, C=O, C=S, SO, SO2, 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 C1-C6 알킬(선택적으로 하나 이상의 C 원자는 O로 치환됨); 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 C1-C6 알콕시이고;
QL은 0 내지 4개의 헤테로원자를 가진 3- 내지 6-원 지환족 또는 방향족 고리로서, 0 내지 6개의 RQ와 선택적으로 연결되거나 선택적으로 치환되며, 각각의 RQ는 독립적으로 H, (1개 이상의 할로 또는 C1-6 알콕실에 의해 선택적으로 치환된) 선형 또는 분지형 C1-6 알킬이거나, 또는 2개의 RQ는 이들이 부착하는 원자와 함께 취해져 0-2개의 헤테로원자를 포함하는 3-8 원 고리를 형성하고;
RYL1, RYL2는 각각 독립적으로 H, OH, (1개 이상의 할로, C1-6 알콕실로 선택적으로 치환된) 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 C1-6 알킬이거나, R1, R2는 이들이 부착되는 원자와 함께 0 내지 2개의 헤테로원자를 포함하는 3 내지 8-원 고리 시스템을 형성하고;
n은 0 내지 10이고; 및
은 PTM 또는 ULM 모이어티에 대한 부착 지점을 나타낸다.
추가적인 구현예에서, 연결기는, 1 내지 약 100개의 에틸렌 글리콜 단위(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 등, 에틸렌 글리콜 단위), 약 1 내지 약 50개의 에틸렌 글리콜 단위, 1 내지 약 25개의 에틸렌 글리콜 단위, 약 1 내지 10개의 에틸렌 글리콜 단위, 1 내지 약 8개의 에틸렌 글리콜 단위, 및 1 내지 6개의 에틸렌 글리콜 단위, 2 내지 4개의 에틸렌 글리콜 단위를 갖는 선택적으로 치환된 (폴리)에틸렌글리콜, 또는, O, N, S, P 또는 Si 원자로 선택적으로 치환된 상호 분산된 선택적으로 치환된 알킬기이다. 소정의 구현예에서, 연결기는 아릴, 페닐, 벤질, 알킬, 알킬렌, 또는 헤테로고리기로 치환된다. 특정 구현예에서, 연결기는 비대칭 또는 대칭일 수 있다.
본원에 기술된 화합물의 임의의 구현예에서, 연결기는 본원에 기술된 바와 같은 임의의 적절한 모이어티일 수 있다. 일 구현예에서, 연결기는, 약 1 내지 약 12개의 에틸렌 글리콜 단위, 1 내지 약 10개의 에틸렌 글리콜 단위, 약 2 내지 약 6개의 에틸렌 글리콜 단위, 약 2 내지 5개의 에틸렌 글리콜 단위, 약 2 내지 4개의 에틸렌 글리콜 단위의 크기 범위의 치환되거나 미치환된 폴리에틸렌 글리콜기이다.
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 연결기(L)는 선택적으로 치환된 C1-C100 알킬 (예를 들어, 예: C1, C2, C3, C4, C5, C6, C7, C8, C9, C10, C11, C12, C13, C14, C15, C16, C17, C18, C19, C20, C21, C22, C23, C24, C25, C26, C27, C28, C29, C30, C31, C32, C33, C34, C35, C36, C37, C38, C39, C40, C41, C42, C43, C44, C45, C46, C47, C48, C49, C50, C51, C52, C53, C54, C55, C56, C57, C58, C59, C60, C61, C62, C63, C64, C65, C66, C67, C68, C69, C70, C71, C72, C73, C74, C75, C76, C77, C78, C79, C80, C81, C82, C83, C84, C85, C86, C87, C88, C89, C90, C91, C92, C93, C94, C95, C96, C97, C98, C99, 또는 C100 알킬)를 포함하고, 여기서 각각의 탄소는 (1) 원자가를 완성하기 위해 적절한 수의 수소, 치환 또는 둘 다를 갖는 N, S, P 또는 Si 원자로부터 선택된 헤테로원자, (2) 선택적으로 치환된 시클로알킬 또는 이환 시클로알킬, (3) 선택적으로 치환된 헤테로실로알킬 또는 이환 헤테로실로알킬, (4) 선택적으로 치환된 아릴 또는 이환 아릴, 또는 (5) 선택적으로 치환된 헤테로아릴 또는 이환 헤테로아릴으로 선택적으로 치환된다. 본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 연결기(L)는 헤테로원자-헤테로원자 결합을 갖지 않는다(예를 들어, 헤테로원자는 공유 연결기거나 인접하게 위치되지 않음).
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 연결기(L)는 선택적으로 치환된 C1-C100 알킬 (예를 들어, C1, C2, C3, C4, C5, C6, C7, C8, C9, C10, C11, C12, C13, C14, C15, C16, C17, C18, C19, C20, C21, C22, C23, C24, C25, C26, C27, C28, C29, C30, C31, C32, C33, C34, C35, C36, C37, C38, C39, C40, C41, C42, C43, C44, C45, C46, C47, C48, C49, C50, C51, C52, C53, C54, C55, C56, C57, C58, C59, C60, C61, C62, C63, C64, C65, C66, C67, C68, C69, C70, C71, C72, C73, C74, C75, C76, C77, C78, C79, C80, C81, C82, C83, C84, C85, C86, C87, C88, C89, C90, C91, C92, C93, C94, C95, C96, C97, C98, C99, 또는 C100 알킬)을 포함하고, 여기서,
각각의 탄소는, CRL1RL2, O, S, SO, SO2, NRL3, SO2NRL3, SONRL3, CONRL3, NRL3CONRL4, NRL3SO2NRL4, CO, CRL1=CRL2, C≡C, SiRL1RL2, P(O)RL1, P(O)ORL1, NRL3C(=NCN)NRL4, NRL3C(=NCN), NRL3C(=CNO2)NRL4, 0 내지 6개의 RL1 및/또는 RL2 기로 선택적으로 치환된 C3-11시클로알킬, 0 내지 9개의 RL1 및/또는 RL2 기로 선택적으로 치환된 C5-13 스피로시클로알킬, 0 내지 6개의 RL1 및/또는 RL2 기로 선택적으로 치환된 C3-11 헤테로시클릴, 0 내지 8개의 RL1 및/또는 RL2 기로 선택적으로 치환된 C5-13 스피로헤테로시클로알킬, 0 내지 6개의 RL1 및/또는 RL2 기로 선택적으로 치환된 아릴, 0 내지 6개의 RL1 및/또는 RL2 기로 선택적으로 치환된 헤테로아릴로 이루어진 군(여기서, RL1 또는 RL2는, 각각 독립적으로 또 다른 기와 선택적으로 연결되어 0 내지 4개의 RL5 기로 선택적으로 치환된 시클로알킬 및/또는 헤테로시클릴 모이어티를 형성함)으로부터 독립적으로 선택되고; 및
RL1, RL2, RL3, RL4 및 RL5는 각각 독립적으로 H, 할로, C1-8알킬, OC1-8알킬, SC1-8알킬, NHC1-8알킬, N(C1-8알킬)2, C3-11시클로알킬, 아릴, 헤테로아릴, C3-11헤테로시클릴, OC3-8시클로알킬, SC3-8시클로알킬, NHC3-8시클로알킬, N(C3-8시클로알킬)2, N(C3-8시클로알킬)(C1-8알킬), OH, NH2, SH, SO2C1-8알킬, P(O)(OC1-8알킬)(C1-8알킬), P(O)(OC1-8알킬)2, CC-C1-8알킬, CCH, CH=CH(C1-8알킬), C(C1-8알킬)=CH(C1-8알킬), C(C1-8알킬)=C(C1-8알킬)2, Si(OH)3, Si(C1-8알킬)3, Si(OH)(C1-8알킬)2, COC1-8알킬, CO2H, 할로겐, CN, CF3, CHF2, CH2F, NO2, SF5, SO2NHC1-8알킬, SO2N(C1-8알킬)2, SONHC1-8알킬, SON(C1-8알킬)2, CONHC1-8알킬, CON(C1-8알킬)2, N(C1-8알킬)CONH(C1-8알킬), N(C1-8알킬)CON(C1-8알킬)2, NHCONH(C1-8알킬), NHCON(C1-8알킬)2, NHCONH2, N(C1-8알킬)SO2NH(C1-8알킬), N(C1-8알킬) SO2N(C1-8알킬)2, NH SO2NH(C1-8알킬), NH SO2N(C1-8알킬)2, NH SO2NH2이다.
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 연결기(L)는 헤테로원자-헤테로원자 결합을 갖지 않는다(예를 들어, 헤테로원자는 공유 연결기거나 인접하게 위치되지 않음).
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 연결기(L)는 약 1 내지 약 50(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 또는 50)개의 선택적으로 치환된 알킬렌 글리콜 단위를 포함하고, 여기서 탄소 또는 산소는 원자가를 완성하기 위해 적절한 수의 수소를 갖는 N, S, P 또는 Si 원자로부터 선택된 헤테로원자로 치환될 수 있다. 예를 들어, 본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 연결기(L)는 다음으로부터 선택되는 화학 구조식을 가진다:
여기서 탄소 또는 산소는 원자가를 완성하기 위해 적절한 수의 수소를 갖는 N, S, P 또는 Si 원자로부터 선택된 헤테로원자로 치환될 수 있고, m, n, o, p, q, r, 및 s는 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 및 20로부터 독립적으로 선택된다.
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 본 발명은 위에 기술된 바와 같은 PTM 기를 포함하는 화합물(유비퀴틴 리가아제에 의해 유비퀴틴화되고 연결기 모이어티(L)를 통하거나 ULM기에 직접적으로 화학적으로 연결되는 표적 단백질 또는 폴리펩티드(예를 들어, RAF)에 결합하거나, PTM은 또한 대안적으로 전술한 바와 같은 ULM기와 동일하거나 상이할 수 있는 유비퀴틴 리가아제 결합 모이어티인 ULM' 기이고, 연결기 모이어티를 통하거나 직접적으로 ULM기에 직접적으로 연결되고; L은 존재할 수도 있고 부재일 수도 있는 전술한 바와 같은 연결기 모이어티로서, PTM에 ULM을 화학적으로 (공유 결합적으로) 연결시킨다), 또는 그의 약제학적으로 허용 가능한 염, 거울상 이성질체, 입체 이성질체, 용매화물 또는 다형체에 관한 것이다.
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 연결기(L)는 다음으로 이루어진 군으로부터 독립적으로 선택되는 하나 이상의 공유 결합된 구조 단위를 포함하는 기이다:
X는 O, N, S, S(O) 및 SO2로 이루어진 군으로부터 선택되고; n은 1-5, 5의 정수이고; RL1은 수소 또는 알킬이고, 은 알킬, 할로겐, 할로알킬, 하이드록시, 알콕시 또는 시아노로부터 선택된 1 내지 3개의 치환기로 선택적으로 치환된 모노- 또는 이환 아릴 또는 헤테로아릴이고; 은 알킬, 할로겐, 할로알킬, 하이드록시, 알콕시 또는 시아노로부터 선택된 1 내지 3개의 치환기로 선택적으로 치환된 모노- 또는 이환 시클로알킬 또는 헤테로시클로알킬이고; 페닐 고리 단편은 알킬, 할로겐, 할로알킬, 하이드록시, 알콕시 및 시아노로 이루어진 군으로부터 선택된 1, 2 또는 3개의 치환기로 선택적으로 치환될 수 있다. 일 구현예에서, 연결기(L)는 전술한 바와 같이, 최대 10개의 공유 결합된 구조 단위를 포함한다.
ULM 기 및 PTM 기는 연결기의 화학식에 적절하고 안정적인 임의의 기를 통해 연결기에 공유 결합될 수 있지만, 본 발명의 바람직한 양태에서는, 연결기는 바람직하게는 아미드, 에스테르, 티오에스테르, 케토기, 카바메이트(우레탄), 탄소 또는 에테르를 통해 (이들 각각의 기는 분해될 표적 단백질 상의 유비퀴틴 리가아제 및 PTM 기 상의 ULM 기의 최대 결합을 제공하기 위해 ULM 기 및 PTM 기 상의 임의의 위치에 삽입될 수 있음) ULM 기 및 PTM 기에 독립적으로 공유 결합된다. (PTM 기가 ULM 기인 특정 양태에서, 분해를 위한 표적 단백질은 유비퀴틴 리가아제 자체일 수 있음에 유의한다.) 소정의 바람직한 양태에서, 연결기는 ULM 및/또는 PTM 기 상의 선택적으로 치환된 알킬, 알킬렌, 알켄 또는 알킨, 아릴기 또는 헤테로고리기에 연결될 수 있다.
예시적인 PTM
본 발명의 바람직한 양태에서, PTM 기는 표적 단백질에 결합하는 기이다. PTM 기의 표적은 종류가 다양하며, 서열의 적어도 일부가 세포에서 발견되고 PTM 기에 결합할 수 있도록 세포 내에서 발현되는 단백질로부터 선택된다. 용어 "단백질"은 본 발명에 따른 PTM 기에 결합할 수 있는 충분한 길이의 올리고펩티드 및 폴리펩티드 서열을 포함한다. 본원에 달리 기술된 바와 같이, 진핵 시스템, 또는 바이러스, 박테리아 또는 곰팡이를 포함하는 미생물 시스템에서 임의의 단백질은 본 발명에 따른 화합물에 의해 매개되는 유비퀴틴화의 표적이다. 바람직하게는, 표적 단백질은 진핵 단백질이다.
본 발명에 따른 PTM 기는, 예를 들어 특이적으로 단백질에 결합하는 (표적 단백질에 결합하는) 임의의 모이어티를 포함하며, 소분자 표적 단백질 모이어티의 다수의 다른 것들 중에서도 다음의 비제한적인 예: RAF 억제제, Hsp90 억제제, 키나아제 억제제, HDM2 & MDM2 억제제, 인간 BET 브로모도메인 함유 단백질을 표적으로 하는 화합물, HDAC 억제제, 인간 리신 메틸트랜스퍼라제 억제제, 혈관형성 억제제, 핵 호르몬 수용체 화합물, 면역 억제성 화합물, 및 아릴 탄화수소 수용체(AHR)를 표적으로 하는 화합물을 포함한다. 아래에 기술된 조성물은 소분자 표적 단백질 결합 모이어티의 구성원의 일부를 예시한다. 이러한 소분자 표적 단백질 결합 모이어티는 약제학적으로 허용가능한 염, 거울상 이성질체, 용매 및 이들 조성물의 다형체뿐만 아니라 관심 단백질을 표적화할 수 있는 다른 소분자를 또한 포함한다. 이들 결합 모이어티는 유비퀴틴화 및 분해를 위한 유비퀴틴 리가아제에 근접하여 (단백질 표적 모이어티가 결합된) 표적 단백질을 제시하기 위해 바람직하게는 연결기를 통해 유비퀴틴 리가아제 결합 모이어티에 연결되어 있다.
단백질 표적 모이어티 또는 PTM 기에 결합할 수 있고 유비퀴틴 리가아제에 의해 작용하거나 분해되는 임의의 단백질(예를 들어, RAF)은 본 발명에 따른 표적 단백질이다. 일반적으로, 표적 단백질은, 예를 들어, 촉매 활성, 아로마타아제 활성, 모터 활성, 헬리케이즈 활성, 신진대사 과정(동화 작용 및 대사), 항산화제 활성, 단백질 분해, 생합성, 키나아제 활성을 갖는 단백질, 산화 환원 효소 활성, 트랜스퍼라아제 활성, 가수 분해 효소 활성, 리아제 활성, 이소메라아제 활성, 리가아제 활성, 효소 조절제 활성, 신호 변환 활성, 구조적 분자 활성, 결합 활성(단백질, 지질 탄수화물), 수용체 활성, 세포 운동성, 막 융합, 셀 통신, 생물학적 과정의 조절, 성장, 세포 분화, 자극에 대한 반응, 행동 단백질, 세포 접착 단백질, 세포 사멸과 관련된 단백질, 수송과 관련된 단백질(단백질 전달체 활성, 핵 운송, 이온 수송체 활성, 채널 수송체 활성, 수송체 활성, 투과 효소 활성, 분비 활성, 전자 수송체 활성, 병인, 샤페론 조절체 활성, 핵산 결합 활성, 전사 조절체 활성, 세포 외 조직 및 생물 발생 활성, 번역 조절체 활성을 포함함)에 관련된 단백질을 포함하는, 세포의 통합된 기능에 관련된 구조 단백질, 수용체, 효소, 세포 표면 단백질을 포함할 수 있다. 관심 단백질은, 약물 요법의 표적으로서 인간을 포함하는 진핵생물(예를 들어, c-RAF, A-RAF 및/또는 B-RAF)과 원핵생물로부터의 단백질을 포함할 수 있으며, 다수의 다른 것들 중에서도, 가축을 포함하는 다른 동물, 항생제 및 다른 항균제 및 식물, 심지어 바이러스에 대한 표적에 대한 결정에 대한 미생물로부터의 단백질(예를 들오, v-RAF 및/또는 v-Mil)을 포함할 수 있다.
본 발명은 단백질이 조절되지 않는 임의의 질환 상태 및/또는 병태를 포함하는 다수의 질환 상태 및/또는 병태를 치료하기 위해 사용될 수 있으며, 이때 환자는 단백질의 분해를 통해 혜택을 받을 것이다.
추가적인 양태에서, 본 명세서는 본원에 기술된 바와 같은 유효량의 화합물 또는 이의 염 형태, 및 약제학적으로 허용가능한 담체, 첨가제 또는 부형제 및 선택적으로 부가적인 생리활성제를 포함하는 치료 조성물을 제공한다. 치료 조성물은 환자 또는 대상물, 예를 들어 인간과 같은 동물의 단백질 분해를 조절하고, 분해된 단백질을 통해 조절되는 질환 상태 또는 병태를 치료 또는 완화시키기 위해 사용될 수 있다. 특정 구현예에서, 본원에 기술된 치료 조성물은 질환, 예를 들어, 암, 심장심부 자극 증후군, 신경 섬유종증 제1형, 코스텔로 증후군, 누난 증후군, 레오파드 증후군의 치료 또는 완화를 위한 목적 단백질의 분해를 유도하는 데 사용될 수 있다. 추가의 특정 구현예에서, 질환은 신장 세포 암종, 췌장암, 결장 직장암, 폐암, 난소암, 갑상선암, 모양세포성 성상세포종, 전립선암, 위암, 간세포암종, 및 흑색종이다.
대안적인 양태에서, 본 발명은 이를 통해 질환 상태 또는 병태가 조절되는 단백질 또는 폴리펩티드를 분해시킴으로써 이를 필요로 하는 대상체의 질환 상태의 치료 또는 병태의 증상 완화를 위한 방법에 관한 것으로서, 방법은 전술한 환자 또는 대상체에게 유효량, 즉 전술한 바와 같은 적어도 하나의 화합물의 약제학적으로 허용가능한 유효량을 선택적으로 약제학적으로 허용가능한 담체, 첨가제 또는 부형제 및 선택적으로 부가적인 생리활성제와 조합하여 투여하는 것을 포함하며, 이 조성물은 대상물의 질환 또는 장애 또는 증상을 치료하거나 완화시키기에 효과적이다. 본 발명에 따른 방법은 본원에 기술된 적어도 하나의 화합물의 유효량의 투여에 의해, 암, 심장심부 자극 증후군, 신경 섬유종증 제1형, 코스텔로 증후군, 누난 증후군, 레오파드 증후군을 포함하는 다수의 질환 상태 또는 병태를 치료하는 데 사용될 수 있다. 질환 상태 또는 병태는 미생물 제제 또는 바이러스(쥐 레트로 바이러스 또는 조류 레트로 바이러스(조류 레트로 바이러스 MH2)), 박테리아, 진균류, 원생 동물 또는 다른 미생물과 같은 다른 외인성 제제에 의해 야기되는 질환이거나, 질환 상태 및/또는 질환으로 이어지는 단백질의 과발현 및/또는 지속적으로 활성화된 단백질의 존재에 의해 야기되는 질환 상태일 수 있다.
다른 양태에서, 본 명세서는 본 발명에 따른 화합물을 사용하는 생물학적 시스템에서 관심 단백질의 분해의 효과를 식별하는 방법을 제공한다.
용어 "표적 단백질"은 본 발명에 따른 화합물과의 결합 및 유비퀴틴 리가아제에 의한 분해에 대한 표적이 되는, 단백질 또는 폴리펩티드를 아래에서 설명하는 데 사용된다. 이러한 소분자 표적 단백질 결합 모이어티는 약제학적으로 허용가능한 염, 거울상 이성질체, 용매 및 이들 조성물의 다형체뿐만 아니라 관심 단백질을 표적화할 수 있는 다른 소분자를 또한 포함한다. 이들 결합 모이어티는 적어도 하나의 연결기(L)을 통해 적어도 하나의 ULM 기(예를 들어, VLM, CLM, ILM 및/또는 MLM)에 연결된다.
단백질 표적 모이어티에 결합될 수 있고 유비퀴틴 리가아제 결합 모이어티가 결합되는 리가아제에 의해 분해될 수 있는 표적 단백질은, 임의의 단백질 또는 펩티드를 포함하고, 이의 단편, 이의 유사체, 및/또는 이의 상동체를 포함한다. 표적 단백질은 구조, 조절, 호르몬, 효소, 유전자, 면역, 수축, 저장, 운송 및 신호 전달을 포함하는 임의의 생물학적 기능 또는 활성을 갖는 단백질 및 펩티드를 포함한다. 보다 구체적으로, 인간 치료제용 다수의 약물 표적은, 단백질 표적 모이어티가 본 발명에 따른 화합물에 결합되어 혼입될 수 있는 단백질 표적을 나타낸다. 이는 다수의 다종성 질환에서 기능을 회복시키는 데 사용될 수 있는 단백질, 예를 들어, B7.1 및 B7, TINFRlm, TNFR2, NADPH 산화 효소, BclIBax 및 세포사멸 경로내의 다른 동반체, C5a 수용체, HMG-CoA 환원 효소, PDE V 포스포디에스테라아제 유형, PDE IV 포스포디에스테라아제 유형 4, PDE I, PDEII, PDEIII, 스쿠알렌 시클라아제 억제제, CXCR1, CXCR2, 산화 질소(NO) 합성 효소, 시클로-옥시제나제 1, 시클로-옥시제나제 2, 5HT 수용체, 도파민 수용체, G 단백질(즉, Gq), 히스타민 수용체, 5-리폭시나제, 트립타아제 세린 프로테아제, 티미딜레이트 합성효소, 퓨린 뉴클레오시드 포스포릴라제, GAPDH 트리파노소말, 글리코겐 포스포릴라제, 탄산 탈수효소, 케모킨 수용체, JAW STAT, RXR 및 유사체, HIV 1 프로테아제, HIV 1 인테그라제, 인플루엔자, 뉴라미미다아제, B형 간염 역전사 효소, 나트륨 채널, 다중 약제 내성(MDR), 단백질 P-당단백질(및 MRP), 티로신 키나아제, CD23, CD124, 티로신 키나아제 p56 lck, CD4, CD5, IL-2 수용체, IL-1 수용체, TNF-알파R, ICAM1, Cat+ 채널, VCAM, VLA-4 인테그린, 셀렉틴, CD40/CD40L, 뉴오키닌 및 수용체, 이노신 모노포스페이트 탈수소 효소, p38 MAP 키나아제, Ras/Raf/MEK-ERK 경로, 인터루킨-1 전환 효소, 카스파아제, HCV, NS3 프로테아제, HCV NS3 RNA 헬리케이스, 글리신아미드 리보뉴클레오티드 포르밀 트랜스퍼라제, 리노바이러스 3C 프로테아제, 단순 포진 바이러스-1(HSV-1), 프로테아제, 시토메갈로바이러스(CMV) 프로테아제, 폴리(ADP-리보스) 폴리머라제, 시클린 의존성 키나아제, 혈관 내피 성장 인자, 옥시토신 수용체, 미세소체 이동 단백질 억제제, 담즙산 전달 억제제, 5 알파 환원 효소 억제제, 안지오텐신 11, 글리신 수용체, 노르아드레날린 재흡수 수용체, 엔도텔린 수용체, 신경펩티드 Y 및 수용체, 에스트로겐 수용체, 안드로겐 수용체, 아데노신 수용체, 아데노신 키나아제 및 AMP 디아미나제, 퓨린 수용체(P2Y1, P2Y2, P2Y4, P2Y6, P2X1-7), 파네실트랜스퍼라제, 게라닐게라닐 트랜스퍼라제, TrkA(NGF 수용체), 베타-아밀로이드, 티로신 키나아제 Flk-IIKDR, 비트로넥틴 수용체, 인테그린 수용체, Her-21 neu, 텔로머라제 억제제, 시토솔릭 포스포리파아제A2 및 EGF 수용체 티로신 키나아제를 포함한다. 추가적인 단백질 표적으로, 예를 들어, 엑디손 20-모노옥시제나제, GABA 게이팅된 염화물 채널의 이온 채널, 아세틸콜린에스테라아제, 전압 감응형 나트륨 채널 단백질, 칼슘 방출 채널, 및 염화물 채널을 포함한다. 또 다른 표적 단백질은 아세틸-CoA 카르복실라제, 아데닐로석신네이트 합성효소, 프로토포르피리노겐 산화 효소 및 에놀피루빌시키메이트-포스페이트 합성효소를 포함한다.
이들 다양한 단백질 표적은 그 단백질에 결합하는 화합물 모이어티를 식별하는 스크리닝에 사용할 수 있고, 본 발명에 따른 화합물 내로의 모이어티의 혼입에 의해, 단백질의 활성 레벨은 치료 최종 결과를 위해 바뀔 수 있다.
용어 "단백질 표적 모이어티" 또는 PTM은, 유비퀴틴 리가아제에 의한 단백질 또는 폴리펩티드의 분해가 일어날 수 있도록 표적 단백질 또는 다른 관심 단백질이나 폴리펩티드에 결합하고 그 단백질 또는 폴리펩티드를 유비퀴틴 리가아제에 근접하게 배치시키거나 존재하게 하는 소분자를 설명하는 데 사용된다. 소분자 표적 단백질 결합 모이어티의 비제한적인 예는, 다수의 다른 것들 중에서, RAF 억제제, Hsp90 억제제, 키나아제 억제제, HDM2 및 MDM2 억제제, 인간 BET 브로모도메인 함유 단백질을 표적으로 하는 화합물, HDAC 억제제, 인간 리신 메틸트랜스퍼라제 억제제, 혈관형성 억제제, 면역 억제성 화합물, 및 아릴 탄화수소 수용체(AHR)를 표적으로 하는 화합물을 포함한다. 아래에 기술된 조성물은 소분자 표적 단백질의 구성원의 일부를 예시한다.
본 발명에 따른 예시적인 단백질 표적 모이어티는, RAF 억제제, 할로알칸 할로게나제 억제제, Hsp90 억제제, 키나아제 억제제, MDM2 억제제, 인간 BET 브로모도메인 함유 단백질을 표적으로 하는 화합물, HDAC 억제제, 인간 리신 메틸트랜스퍼라제 억제제, 혈관형성 억제제, 핵 호르몬 수용체 화합물, 면역 억제성 화합물, 및 아릴 탄화수소 수용체(AHR)를 표적으로 하는 화합물을 포함한다.
아래에 기술된 조성물은 이들 유형의 소분자 표적 단백질 결합 모이어티의 일부 구성원을 예시한다. 이러한 소분자 표적 단백질 결합 모이어티는 약제학적으로 허용가능한 염, 거울상 이성질체, 용매 및 이들 조성물의 다형체뿐만 아니라 관심 단백질을 표적화할 수 있는 다른 소분자를 또한 포함한다. 아래 본원에서 인용된 참조 문헌은 그 전체가 참조로서 본원에 통합된다.
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, PTM은 B-RAF 단백질 표적 모이어티를 포함하는 소분자이다.
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, PTM은 RAF를 표적화하고/하거나 이에 결합한다. 예를 들어, 본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, PTM은 PTM-Ia 또는 PTM-Ib로 이루어진 화학 구조식의 군으로부터 선택되는 화학적 기를 포함할 수 있고:
여기서,
이중 점선 결합은 방향족 결합이고;
VPTM, WPTM, XPTM, YPTM, ZPTM은 하기 조합 중 하나이고: C, CH, N, N, C; C, N, N, CH, C; C, O, C, CH, C; C, S, C, CH, C; C, CH, C, O, C; C, CH, C, S, C; C, CH, N, CH, C; N, CH, C, CH, C; C, CH, C, CH, N; N, N, C, CH, C; N, CH, C, N, C; C, CH, C, N, N; C, N, C, CH, N; C, N, C, N, C; 및 C, N, N, N, C;
XPTM35, XPTM36, XPTM37, 및 XPTM38은 CH 및 N으로부터 독립적으로 선택되고;
RPTM1은 ULM, 화학적 연결기(L), CLM, ILM, VLM, MLM, ULM', CLM', ILM', VLM', MLM', 또는 이들의 조합에 공유 결합되고;
RPTM2은 수소, 할로겐, 아릴, 메틸, 에틸, OCH3, NHCH3 또는 M1-CH2-CH2-M2이고(여기서 M1은 CH2, O 및 NH이고, M2는 수소, 알킬, 고리형 알킬, 아릴 또는 헤테로고리임);
RPTM2a 및 RPTM2b는 수소, OH, 할로겐이고;
RPTM3은 부재하거나, 수소, 아릴, 메틸, 에틸, 또 기타 알킬, 고리형 알킬, OCH3, NHCH3 또는 M1-CH2-CH2-M2이고(여기서 M1은 CH2, O 및 NH이고, M2는 수소, 알킬, 고리형 알킬, 아릴 또는 헤테로고리임);
RPTM4은 수소, 할로겐, 아릴, 메틸, 에틸, OCH3, NHCH3 또는 M1-CH2-CH2-M2이고(여기서 M1은 CH2, O 및 NH이고, M2는 수소, 알킬, 고리형 알킬, 아릴 또는 헤테로고리임); 및
RPTM5는 다음으로 이루어진 군으로부터 선택되고:
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, PTM은 PTM-IIa 또는 PTM-IIb로 이루어진 화학 구조식의 군으로부터 선택되는 화학적 기를 포함할 수 있다:
,
여기서,
XPTM1, XPTM2, XPTM3, XPTM4, XPTM5, 및 XPTM6은 CH 또는 N으로부터 독립적으로 선택되고;
RPTM5a는 결합, 선택적으로 치환된 아민, 선택적으로 치환된 아미드(예를 들어, 알킬, 메틸, 에틸, 프로필, 또는 부틸기로 선택적으로 치환됨), H, , -NHC(O)RPTM5로 이루어진 군으로부터 선택되고;
RPTM5는 다음으로 이루어진 군으로부터 선택되고:
RPTM5b는 수소 또는 선형 또는 분지형 C1-C4 알킬(예를 들어, 메틸 또는 에틸)이고;
RPTM6a 및 RPTM6b는 각각 독립적으로 수소, 할로겐, 또는 선택적으로 치환된 선형, 분지형 C1-C6 알킬로부터 선택되고;
RPTM6는 부재하거나, 수소, 할로겐, 아릴, 메틸, 에틸, OCH3, NHCH3 또는 M1-CH2-CH2-M2이고(여기서 M1은 CH2, O 및 NH이고, M2는 수소, 알킬, 고리형 알킬, 아릴 또는 헤테로고리임);
RPTM6c는 수소 또는 선형 또는 분지형 C1-C4 알킬(예를 들어, 메틸 또는 에틸)이고;
RPTM7은 부재하거나, 수소, 할로겐, 아릴, 메틸, 에틸, OCH3, NHCH3 또는 M1-CH2-CH2-M2이고(여기서 M1은 CH2, O 또는 NH이고, M2는 수소, 알킬, 고리형 알킬, 아릴 또는 헤테로고리임);
RPTM8, RPTM9 또는 RPTM10은 부재하거나, 수소, 할로겐, 아릴, 헤테로아릴, 알킬, 시클로알킬, 헤테로고리, 메틸, 에틸, OCH3, NHCH3 또는 M1-CH2-CH2-M2 (여기서 M1은 CH2, O 및 NH이고, M2는 수소, 알킬, 고리형 알킬, 아릴 또는 헤테로고리임)로 이루어진 군으로부터 독립적으로 선택되고;
RPTM11은 부재하거나, 수소, 할로겐, 메틸, 에틸, OCH3, NH CH3 또는 M1-CH2-CH2-M2이고(여기서 M1은 CH2, O 또는 NH이고, M2는 수소, 알킬, 고리형 알킬, 아릴 또는 헤테로고리임); 및
RPTM8, RPTM9 또는 RPTM10 중 적어도 하나는 ULM, 화학적 연결기(L), CLM, ILM, VLM, MLM, ULM', CLM', ILM', VLM', MLM', 또는 이들의 조합에 공유 결합되도록 변형되거나, RPTM8, RPTM9, 및 RPTM10 중 두 개는 화학적 연결기를 가진 다중고리 (예, 이환) 융합된 고리를 형성하도록 변형된다.
특정 구현예에서, PTM은 다음으로 이루어진 화학 구조식의 군으로부터 선택되는 화학적 기를 포함할 수 있다:
여기서 RPTM5, RPTM6a, RPTM6b, RPTM6, RPTM7, RPTM8, RPTM9, RPTM10, RPTM11은 본원에 기술된 바와 같다.
일부 구현예에서, RPTM9이 공유 결합된 위치일 경우, RPTM7 및 RPTM8은 RPTM7 및 RPTM8이 부착된 고리를 가진 이중고리기를 형성하는 방식으로 공유결합을 통해 함께 연결될 수 있다.
다른 구현예에서, RPTM8이 공유 결합된 위치일 경우, RPTM9 및 RPTM10은 RPTM9 및 RPTM10이 부착된 고리를 가진 이중고리기를 형성하는 방식으로 공유결합을 통해 함께 연결될 수 있다.
또 다른 구현예에서, RPTM10이 공유 결합된 위치일 경우, RPTM8 및 RPTM9은 RPTM8 및 RPTM9이 부착된 고리를 가진 이중고리기를 형성하는 방식으로 공유결합을 통해 함께 연결될 수 있다.
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, PTM은 PTM-III로 이루어진 화학 구조식의 군으로부터 선택되는 화학적 기를 포함할 수 있다:
여기서,
XPTM7, XPTM8, XPTM9, XPTM10, XPTM11, XPTM12, XPTM13, XPTM14, XPTM15, XPTM16, XPTM17, XPTM18, XPTM19, XPTM20은 독립적으로 CH 또는 N이고;
RPTM12, RPTM13, RPTM14, RPTM15, RPTM16, RPTM17, RPTM18, RPTM19는 부재하거나, 수소, 할로겐, 아릴, 헤테로아릴, 시클로알킬, 헤테로고리, 메틸, 에틸, 기타 알킬, OCH3, NHCH3 또는 M1-CH2-CH2-M2 (여기서 M1은 CH2, O 및 NH이고, M2는 수소, 알킬, 고리형 알킬, 아릴 또는 헤테로고리임)로 이루어진 군으로부터 독립적으로 선택되고;
RPTM20은 4개 미만의 비-수소 원자를 함유하는 소형 기이고;
RPTM21은 트리플루오로메틸, 클로로, 브로모, 플루오로, 메틸, 에틸, 프로필, 이소프로필, 삼차-부틸, 부틸, 이소-부틸, 시클로프로필, 시클로부틸, 시클로펜틸, 시클로헥실, OCH3, NHCH3, 디메틸아미노 또는 M1-CH2-CH2-M2 (여기서 M1은 CH2, O 또는 NH이고, M2는 수소, 알킬, 고리형 알킬, 아릴 또는 헤테로고리임)로 이루어진 군으로부터 선택되고; 및
RPTM12, RPTM13 및 RPTM16 중 적어도 하나는 ULM, 화학적 연결기(L), CLM, ILM, VLM, MLM, ULM', CLM', ILM', VLM', MLM', 또는 이들의 조합에 공유 결합되도록 변형된다.
일부 구현예에서, RPTM12이 공유 결합된 위치일 경우, RPTM13 및 RPTM14은 RPTM13 및 RPTM14이 부착된 고리를 가진 이중고리기를 형성하는 방식으로 공유결합을 통해 함께 연결될 수 있고; 그리고/또는 RPTM15 및 RPTM16는 RPTM15 및 RPTM16가 부착된 고리를 가진 이중고리기를 형성하는 방식으로 공유결합을 통해 함께 연결될 수 있다.
다른 구현예에서, RPTM13이 공유 결합된 위치일 경우, RPTM12 및 RPTM16은 RPTM12 및 RPTM16이 부착된 고리를 가진 이중고리기를 형성하는 방식으로 공유결합을 통해 함께 연결될 수 있고; 그리고/또는 RPTM15 및 RPTM16는 RPTM15 및 RPTM16가 부착된 고리를 가진 이중고리기를 형성하는 방식으로 공유결합을 통해 함께 연결될 수 있다.
또 다른 구현예에서, RPTM16이 공유 결합된 위치일 경우, RPTM12 및 RPTM13은 RPTM12 및 RPTM13이 부착된 고리를 가진 이중고리기를 형성하는 방식으로 공유결합을 통해 함께 연결될 수 있고; 그리고/또는 RPTM13 및 RPTM14는 RPTM13 및 RPTM14가 부착된 고리를 가진 이중고리기를 형성하는 방식으로 공유결합을 통해 함께 연결될 수 있다.
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, PTM은 PTM-IVa 또는 PTM-IVb로 이루어진 화학 구조식의 군으로부터 선택되는 화학적 기를 포함할 수 있다:
여기서,
XPTM21, XPTM22, XPTM23, XPTM24, XPTM25, XPTM26, XPTM27, XPTM28, XPTM29, XPTM30, XPTM31, XPTM32, XPTM33, XPTM34는 독립적으로 CH 또는 N이고;
RPTM22는 다음으로 이루어진 군으로부터 선택되고
RPTM25a 및 RPTM25b는 각각 독립적으로 수소, 할로겐, 또는 (선형, 분지형, 선택적으로 치환된) C1-C6 알킬로부터 선택되고;
RPTM23, RPTM24, RPTM28, RPTM29, RPTM30, RPTM31, RPTM32는 부재하거나, 결합, 수소, 할로겐, 아릴(선택적으로 치환됨), 헤테로아릴(선택적으로 치환됨), 시클로알킬(선택적으로 치환됨), 헤테로고리(선택적으로 치환됨), 메틸, 에틸(선택적으로 치환됨), (선형, 분지형, 선택적으로 치환된) 기타 알킬, OCH3, NHCH3 또는 M1-CH2-CH2-M2 (여기서 M1은 CH2, O 및 NH이고, M2는 수소, (선형, 분지형, 선택적으로 치환된) 알킬, 고리형 알킬(선택적으로 치환됨), 아릴(선택적으로 치환됨) 또는 헤테로고리(선택적으로 치환됨)임)로 이루어진 군으로부터 독립적으로 선택되고; 및
RPTM25는 부재하거나, 수소, 할로겐, (선형, 분지형, 선택적으로 치환된) C1-C6 알킬, OCH3, NHCH3 또는 SCH3이고;
RPTM26은 부재하거나, 수소, 할로겐, (선형, 분지형, 선택적으로 치환된) C1-C6 알킬, OCH3, NHCH3 또는 SCH3이고;
RPTM27은 부재하거나, 수소, 할로겐, (선형, 분지형, 선택적으로 치환된) C1-C6 알킬, OCH3, NHCH3 또는 SCH3로 이루어진 군으로부터 선택되고; 및
RPTM24, RPTM29, RPTM32 중 적어도 하나는 ULM, 화학적 연결기(L), CLM, ILM, VLM, MLM, ULM', CLM', ILM', VLM', MLM', 또는 이들의 조합에 공유 결합되도록 변형된다.
일부 구현예에서, RPTM24이 공유 결합된 위치일 경우, RPTM31 및 RPTM32은 RPTM31 및 RPTM32이 부착된 고리를 가진 이중고리기를 형성하는 방식으로 공유결합을 통해 함께 연결될 수 있고; 또는 RPTM29 및 RPTM30는 RPTM29 및 RPTM30가 부착된 고리를 가진 이중고리기를 형성하는 방식으로 공유결합을 통해 함께 연결될 수 있다.
다른 구현예에서, RPTM29이 공유 결합된 위치일 경우, RPTM24 및 RPTM32은 RPTM24 및 RPTM32이 부착된 고리를 가진 이중고리기를 형성하는 방식으로 공유결합을 통해 함께 연결될 수 있고; 그리고/또는 RPTM31 및 RPTM32는 RPTM31 및 RPTM32가 부착된 고리를 가진 이중고리기를 형성하는 방식으로 공유결합을 통해 함께 연결될 수 있다.
또 다른 구현예에서, RPTM32이 공유 결합된 위치일 경우, RPTM24 및 RPTM29은 RPTM24 및 RPTM29이 부착된 고리를 가진 이중고리기를 형성하는 방식으로 공유결합을 통해 함께 연결될 수 있고; 그리고/또는 RPTM29 및 RPTM30는 RPTM29 및 RPTM30가 부착된 고리를 가진 이중고리기를 형성하는 방식으로 공유결합을 통해 함께 연결될 수 있다.
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, PTM은 PTM-Va 또는 PTM-Vb로 이루어진 화학 구조식의 군으로부터 선택되는 화학적 기를 포함할 수 있다:
여기서,
XPTM35, XPTM36, XPTM37, XPTM38, 및 XPTM39은 CH 또는 N으로부터 독립적으로 선택되고;
RPTM33은 할로겐 또는 선형 또는 분지형 C1-C4 할로알킬이고;
RPTM34, RPTM35, RPTM36, RPTM37, 및 RPTM38은 수소, 할로겐, 또는 선형 또는 분지형 C1-C4 알킬(예를 들어, 메틸, 에틸, 프로필, 또는 부틸)로부터 각각 독립적으로 선택되고;
RPTM39는 선택적으로 치환된 C4-C7 헤테로시클로알킬(예를 들어, 선택적으로 치환된 C5 또는 C6 헤테로시클로알킬)이고; 및
은 ULM, 화학적 연결기(L), CLM, ILM, VLM, MLM, ULM', CLM', ILM', VLM', MLM', 또는 이들의 조합과의 부착 지점이다.
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, PTM은 화학 구조식 PTM-1, PTM-2, PTM-3, PTM-4, PTM-5, PTM-6, PTM-7, PTM-8, PTM-9, PTM-10, PTM-11, PTM-12, 및 PTM-13로 이루어진 군으로부터 선택된다:
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, ULM은 다음으로 이루어진 군으로부터 선택된다:
여기서, R14a는 H, 메틸 또는 하이드록시메틸이다.
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, (i) PTM은 본 개시의 화합물 1-873 또는 307-873의 PTM으로부터 선택되고; (ii) 화학적 연결기(L)는 본 개시의 화합물 1-873 또는 307-873의 연결기로부터 선택되고; (iii) ULM은 본 개시의 화합물 1-873 또는 307-873의 ULM으로부터 선택되고; (iv) 화합물은 화합물 796-873의 PTM으로부터 선택된 전구약물 화학적 모이어티, 또는 (v) 이들의 조합을 추가로 포함한다.
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, ULM은 다음으로 이루어진 군으로부터 선택된다:
전구약물 이작용성 화합물
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 본 개시의 이작용성 화합물 또는 이의 전구약물은 복수의 에틸렌 글리콜 단위를 추가로 포함한다. 본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 본 개시의 이작용성 화합물 또는 이의 전구약물은 적어도 하나의 (예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8 또는 그 이상의) 폴리에틸렌 글리콜(PEG) 사슬을 추가로 포함한다. 본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 본 개시의 이작용성 화합물 또는 이의 전구약물은 균일한 사슬 길이 또는 사슬 길이들의 혼합물을 갖는 복수의 (예를 들어, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8개 또는 그 이상의) 폴리에틸렌 글리콜 사슬을 추가로 포함한다. 본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 이작용성 화합물 또는 이의 전구약물은 예시적인 화합물 796-873으로부터 선택된 전구약물 부분을 추가로 포함한다.
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 본 개시의 이작용성 화합물 또는 이의 전구약물은 본원에 기술된 바와 같은 적어도 하나의 (예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8개 또는 그 이상의) 폴리에티엘렌 글리콜 사슬을 더 포함하고, 여기서 각각의 폴리에틸렌 글리콜 사슬은 예시적인 화합물 796-873로부터 선택된 화합물에서 PEG 사슬 부착과 동일한 지점에서 이작용성 화합물에 공유 결합된다. 본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 각각의 PEG 사슬은 변수(예를 들어, 메틸기 또는 O)를 통해 직접 또는 간접적으로 부착되거나, 본원에 기술된 VLM(예를 들어, RP, R14a, R14b, W4, W5, R1', R2', R3'), 본원에 기술된 CLM(예를 들어, G 또는 G'), 또는 본원에 기술된 PTM(예를 들어, RPTM6c)의 변수 대신에 부착된다. 예를 들어, VLM이 있는 본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, RP, R14A, R14b, 또는 이들의 조합은 PEG 사슬을 포함하는 모이어티에 직접 또는 간접적으로 공유 결합되도록 변형되거나(예를 들어, RP 또는 R1'의 하이드록실기, R14a, R14b, 또는 W5의 메틸기는 공유 결합되도록 변형됨) PEG 사슬을 포함하는 모이어티로 치환된다. 또한, CLM이 있는 본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, G, G', 또는 이들의 조합은 PEG 사슬을 포함하는 모이어티에 직접 또는 간접적으로 공유 결합되도록 변형되거나(예를 들어, G 또는 G'의 메틸이 공유 결합되도록 변형됨) PEG 사슬을 포함하는 모이어티로 치환된다.
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 본 개시의 이작용성 화합물 또는 이의 전구약물은 적어도 하나(예를 들어, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8 또는 그 이상)의
을 포함하고, 여기서 r은 8 내지 35의 정수이다(예를 들어, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 또는 35). 예를 들어, VLM이 있는 본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, RP, R14A, R14b, 또는 이들의 조합은 상기 언급된 구조 중 하나에 직접 또는 간접적으로 공유 결합되도록 변형되거나(예를 들어, RP의 하이드록실기, 또는 R14a, R14b, 또는 W5의 메틸기는 공유 결합되도록 변형됨) 상기 언급된 구조 중 하나로 치환된다. 또한, CLM이 있는 본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, G, G', 또는 이들의 조합은 상기 언급된 구조 중 하나에 직접 또는 간접적으로 공유 결합되도록 변형되거나(예를 들어, G 또는 G'의 메틸이 공유 결합되도록 변형됨) 상기 언급된 구조 중 하나로 치환된다. 예를 들어, 본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 각각의 PEG 사슬은 다음으로부터 선택된 화학기를 통해 VLM, CLM 또는 PTM에 부착될 수 있다:
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 이작용성 화합물 또는 이의 전구약물의 폴리에틸렌 글리콜 사슬은 약 8 에틸렌 글리콜 단위 내지 약 35 (예를 들어, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 또는 35), 약 10 에틸렌 글리콜 단위 내지 약 35 에틸렌 글리콜 단위(예를 들어, 약 10 내지 약 35 에틸렌 글리콜 단위, 약 10 내지 약 30 에틸렌 글리콜 단위, 약 10 내지 약 25개의 에틸렌 글리콜 단위, 약 10 내지 약 20개의 에틸렌 글리콜 단위, 약 10 내지 약 15개의 에틸렌 글리콜 단위, 약 15 내지 약 35 에틸렌 글리콜 단위, 약 15 내지 약 30 에틸렌 글리콜 단위, 약 15 내지 약 25개의 에틸렌 글리콜 단위, 약 15 내지 약 20개의 에틸렌 글리콜 단위, 약 20 내지 약 35 에틸렌 글리콜 단위, 약 20 내지 약 30 에틸렌 글리콜 단위, 약 20 내지 약 25개의 에틸렌 글리콜 단위, 약 25 내지 약 35 에틸렌 글리콜 단위, 약 25 내지 약 30 에틸렌 글리콜 단위, 또는 약 30 내지 약 35 에틸렌 글리콜 단위)이거나 이를 포함한다.
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 메톡시 폴리에틸렌 글리콜, 또는 (mPEG-1000과 같은) 평균 분자량이 1000인, 메틸기가 일 말단에 캡핑된 폴리에틸렌-글리콜이 본 개시의 전구약물 이작용성 화합물을 제조하는 데 사용될 수 있다. 예를 들어, 임의의 양태 또는 구현예에서, 메톡시 폴리에틸렌 글리콜, 또는 (mPEG-1000과 같은) 평균 사슬 길이가 22 단위인, 메틸기가 일 말단에 캡핑된 폴리에틸렌-글리콜이 본 개시의 전구약물 이작용성 화합물을 제조하는 데 사용될 수 있다. 본원에 기술된 방법은 균일하거나 다양한 사슬 길이의, 더 길거나 더 짧은 PEG 사슬을 만드는 데 사용될 수 있다.
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 본 개시의 전구약물 이작용성 화합물은 적어도 약 10%의 방출 백분율을 갖는다. 예를 들어, 본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 본 개시의 전구약물 이작용성 화합물은 적어도 약 10%, 적어도 약 15%, 적어도 약 20%, 적어도 약 25%, 적어도 약 30%, 적어도 약 35%, 적어도 약 40%, 적어도 약 45%, 적어도 약 50%, 적어도 약 55%, 적어도 약 60%, 적어도 약 65%, 적어도 약 70%, 적어도 약 75%, 적어도 약 80%, 적어도 약 85%, 적어도 약 90%, 약 10% 내지 약 90%, 약 10% 내지 약 80%, 약 10% 내지 약 70%, 약 10% 내지 약 60%, 약 10% 내지 약 50%, 약 10% 내지 약 40%, 약 10% 내지 약 30%, 약 20% 내지 약 90%, 약 20% 내지 약 80%, 약 20% 내지 약 70%, 약 20% 내지 약 60%, 약 20% 내지 약 50%, 약 20% 내지 약 40%, 약 30% 내지 약 90%, 약 30% 내지 약 80%, 약 30% 내지 약 70%, 약 30% 내지 약 60%, 약 30% 내지 약 50%, 약 40% 내지 약 90%, 약 40% 내지 약 80%, 약 40% 내지 약 70%, 약 40% 내지 약 60%, 약 50% 내지 약 90%, 약 50% 내지 약 80%, 약 50% 내지 약 70%, 약 60% 내지 약 90%, 또는 약 60% 내지 약 80%, 약 70% 내지 약 90%, 약 30분, 약 60분, 약 1.5시간, 약 2시간, 약 2.5시간, 약 3시간, 약 3.5시간, 약 4시간, 약 4.5시간, 약 5시간, 약 4.5시간, 약 6시간, 약 6.5시간, 약 7시간, 약 7.5시간, 약 8시간, 약 8.5시간, 약 9시간, 약 9.5시간, 또는 약 10시간의 방출 백분율을 갖는다.
본원에 기술된 임의의 양태 또는 구현예에서, 본 개시의 전구약물 이작용성 화합물은 적어도 약 60분의 반감기를 갖는다. 예를 들어, 본원에 기술된 구현예의 임의의 양태에서, 본 개시의 전구약물 이작용성 화합물은 혈청(예를 들어, 인간 혈청, 원숭이 혈청, 개 혈청, 고양이 혈청, 돼지 혈청 등)에서 약 1분 이하, 약 5분 이하, 10분 이하, 약 15분 이하, 약 30분 이하, 약 45분 이하, 약 1시간 이하, 1.5시간 이하, 약 2시간 이하, 약 2.5시간 이하, 약 3시간 이하, 약 3.5시간 이하, 약 4시간 이하, 4.5시간 이하, 약 5시간 이하, 약 5.5시간 이하, 약 6시간 이하, 약 6.5시간 이하, 약 7시간 이하, 약 7.5시간 이하, 약 8시간 이하, 8.5시간 이하, 약 9시간 이하, 9.5시간 이하, 약 10시간 이하, 약 11시간 이하, 약 12시간 이하, 약 14시간 이하, 약 16시간 이하, 약 18시간 이하, 약 20시간 이하, 약 22시간 이하, 약 24시간 이하, 약 26시간 이하, 약 28시간 이하, 약 30시간 이하, 약 32시간 이하, 약 34시간 이하, 약 36시간 이하, 약 38시간 이하, 약 40시간 이하, 약 42시간 이하, 약 44시간 이하, 약 46시간 이하, 약 48시간 이하, 약 50시간 이하, 약 15초 내지 약 50시간, 약 15초 내지 약 45시간, 약 15초 내지 약 40시간, 약 15초 내지 약 35시간, 약 15초 내지 약 30시간, 약 15초 내지 약 25시간, 약 15초 내지 약 20시간, 약 15초 내지 약 15시간, 약 15초 내지 약 10시간, 약 15초 내지 약 5시간, 약 30초 내지 약 50시간, 약 30초 내지 약 45시간, 약 30초 내지 약 40시간, 약 30초 내지 약 35시간, 약 30초 내지 약 30시간, 약 30초 내지 약 25시간, 약 30초 내지 약 20시간, 약 30초 내지 약 15시간, 약 30초 내지 약 10시간, 약 30초 내지 약 5시간, 약 1분 내지 약 50시간, 약 1분 내지 약 45시간, 약 1분 내지 약 40시간, 약 1분 내지 약 35시간, 약 1분 내지 약 30시간, 약 1분 내지 약 25시간, 약 1분 내지 약 20시간, 약 1분 내지 약 15시간, 약 1분 내지 약 10시간, 약 1분 내지 약 5시간, 약 1 내지 약 50시간, 약 1 내지 약 45시간, 약 1 내지 약 40시간, 약 1 내지 약 35시간, 약 1 내지 약 30시간, 약 1 내지 약 25시간, 약 1 내지 약 20시간, 약 1 내지 약 15시간, 약 1 내지 약 10시간, 약 1 내지 약 5시간, 약 5 내지 약 50시간, 약 5 내지 약 45시간, 약 5 내지 약 40시간, 약 5 내지 약 35시간, 약 5 내지 약 30시간, 약 5 내지 약 25시간, 약 5 내지 약 20시간, 약 5 내지 약 15시간, 약 5 내지 약 10시간, 약 10 내지 약 50시간, 약 10 내지 약 45시간, 약 10 내지 약 40시간, 약 10 내지 약 35시간, 약 10 내지 약 30시간, 약 10 내지 약 25시간, 약 10 내지 약 20시간, 약 15 내지 약 50시간, 약 15 내지 약 45시간, 약 15 내지 약 40시간, 약 15 내지 약 35시간, 약 15 내지 약 30시간, 약 15 내지 약 25시간, 약 20 내지 약 50시간, 약 20 내지 약 45시간, 약 20 내지 약 40시간, 약 20 내지 약 35시간, 약 20 내지 약 30시간, 약 25 내지 약 50시간, 약 25 내지 약 45시간, 약 25 내지 약 40시간, 약 25 내지 약 35시간, 약 30 내지 약 50시간, 약 30 내지 약 45시간, 약 30 내지 약 40시간, 약 35 내지 약 50시간, 약 35 내지 약 45시간, 약 40 내지 약 50시간의 혈청 또는 혈장(예를 들어, 인간, 시아노 원숭이, 랫트, 마우스, 돼지, 개, 고양이, 등 혈청 또는 혈장)의 반감기를 갖는다.
치료 조성물
본원에서 기술된 바와 같은 적어도 하나의 이작용성 화합물의 유효량 및 본원에서 달리 기술된 하나 이상의 화합물의 조합을 포함하는 (약제학적으로 유효한 양의 담체, 첨가제 또는 부형제와 함께 모두 유효량인) 약제학적 조성물은, 본 발명의 추가적인 양태를 나타낸다.
본 발명은, 적용 가능한 경우, 약제학적으로 허용가능한 염, 특히 본원에서 기술된 바와 같은 화합물의 산 또는 염기 첨가 염을 포함하는 조성물을 포함한다. 본 양태에 따라 유용한 전술한 염기 화합물의 약제학적으로 허용가능한 산 부가염을 제조하기 위해 사용되는 산은, 비-독성 산 부가염, 즉, 약물학적으로 허용 가능한 음이온을 함유하는 염, 예를 들어 다수의 다른 것들 중에서, 염산, 브롬화수소산, 요오드화수소산, 니트레이트, 설페이트, 비설페이트, 포스페이트, 산 포스페이트, 아세테이트, 락테이트, 시트레이트, 산 시트레이트, 타르트레이트, 비타르트레이트, 숙시네이트, 말레에이트, 푸마레이트, 글루코네이트, 사카레이트, 벤조에이트, 메탄설포네이트, 에탄설포네이트, 벤젠설포네이트, p-톨루엔설포네이트 및 파모에이트[즉, 1,1'-메틸렌-비스-(2-하이드록시-3 나프토에이트)]염을 형성하는 것들이다.
약제학적으로 허용가능한 염기 부가염은 또한 본 발명에 따른 화합물 또는 유도체의 약제학적으로 허용가능한 염 형태를 제조하는 데 사용될 수 있다. 본질적으로 산성인 본 화합물의 약제학적으로 허용가능한 염기염을 제조하기 위한 시약으로서 사용될 수 있는 화학적 염기는 이러한 화합물과 비-독성 염기염을 형성하는 것들이다. 이러한 비-독성 염기염은, 다른 것들 중에서, 그러한 약물학적으로 허용 가능한 양이온, 예를 들어, 알칼리 금속 양이온(예를 들어, 칼륨 및 나트륨) 및 알칼리 토금속 양이온(예를 들어, 칼슘, 아연 및 마그네슘)으로부터 유래된 것들, 암모늄 또는 수용성 아민 부가염(예를 들어, N-메틸글루카민-(메글루민)), 및 저급 알칸올암모늄 및 약제학적으로 허용가능한 유기 아민의 다른 염기 염을 포함하지만, 이에 한정되지는 않는다.
본원에서 기술된 화합물은 경구, 본 발명에 따라, 비경구 또는 국소 경로에 의해 단일 또는 분할된 투여량으로 투여될 수 있다. 활성 화합물의 투여는 연속적(정맥내 점적주입) 내지 하루 수 회의 경구 투여(예를 들어, Q.I.D.)의 범위일 수 있고, 다른 투여 경로 중에서, 경구, 국소, 비경구, 근육내, 정맥내, 피하, 경피(이는 침투 증강 작용제를 포함할 수 있음), 구강, 설하 및 좌약 투여를 포함할 수 있다. 장 코팅 경구 정제는 또한 경구 투여 경로로부터 화합물의 생체이용률을 증강시키기 위해 이용될 수 있다. 가장 효과적인 투여 형태는 선택된 특정 제제의 약물동력학 및 환자의 질환의 중증도에 따라 달라질 것이다. 비강내, 기관내 또는 폐 투여를 위해 스프레이, 미스트 또는 에어로졸로서, 본 발명에 따른 화합물의 투여가 또한 사용될 수 있다. 따라서, 본 발명은 또한 약제학적으로 허용가능한 담체, 첨가제 또는 부형제와 선택적으로 조합되어, 본원에 기술된 바와 같은 유효량의 화합물을 포함하는 약제학적 조성물에 관한 것이다. 본 발명에 따른 화합물은 즉시 방출, 중간 방출 또는 서방형 또는 조절 방출 형태로 투여될 수 있다. 서방형 또는 조절 방출 형태는 바람직하게는 경구 투여되지만, 좌제 및 경피 또는 다른 국소 형태로도 투여된다. 리포좀 형태의 근육내 주사는 또한 주사 부위에서 화합물의 방출을 조절하거나 유지하기 위해 사용될 수 있다.
본원에서 기술된 바와 같은 조성물은 하나 이상의 약제학적으로 허용가능한 담체를 사용하여 종래의 방식으로 제제화될 수 있고, 또한 조절-방출 제제로 투여될 수 있다. 이러한 약제학적 조성물에 사용될 수 있는 약제학적으로 허용가능한 담체는, 이온 교환체, 알루미나, 알루미늄 스테아레이트, 레시틴, 혈청 단백질, 예를 들어, 인간 혈청 알부민, 완충액 물질, 예를 들어, 인산염, 글리신, 소르브산, 칼륨 소르베이트, 포화된 식물성 지방산, 물, 염 또는 전해질의 부분적인 글리세리드 혼합물, 예를 들어, 프롤라민 설페이트, 디소디움 수소 인산염, 칼륨 수소 인산염, 염화나트륨, 아연 염, 콜로이드성 실리카, 마그네슘 트리실리케이트, 폴리비닐 피롤리돈, 셀룰로오스-기반 물질, 폴리에틸렌 글리콜, 소디움 카르복시메틸셀룰로오스, 폴리아크릴레이트, 왁스, 폴리에틸렌-폴리옥시프로필렌-블록 중합체, 폴리에틸렌 글리콜 및 양모지를 포함하지만, 이에 한정되지는 않는다.
본원에 기술된 바와 같은 조성물은 경구, 비경구, 흡입 스프레이, 국소, 직장, 비음, 협측, 질, 또는 이식된 저장소를 통해 투여될 수 있다. 본원에서 사용되는 용어 "비경구"는 피하, 정맥내, 근육내, 관절내, 활막내, 흉골내, 척수강내, 간내, 병소내 및 두개내 주사 또는 주입 기술을 포함한다. 바람직하게는, 조성물은 경구, 복강내 또는 정맥내로 투여된다.
본원에 기술된 바와 같은 조성물의 멸균 주사 가능한 형태는 수성 또는 유성 현탁액일 수 있다. 이들 현탁액은 적절한 분산액 또는 습윤제 및 현탁제를 사용하여 당 기술분야에 공지된 기술에 따라 제제화될 수 있다. 멸균 주사 가능한 조제물은 또한 비독성 비경구 수용 가능 희석제 또는 용매, 예를 들어 1,3-부탄디올 중의 용액으로서 멸균 주사 가능한 용액 또는 현탁액일 수 있다. 사용될 수 있는 허용 가능한 운반체 및 용매 중에는, 물, 링거 용액 및 이소톤 염화나트륨 용액이 있다. 또한, 멸균된 고정유가 통상적으로 용매 또는 현탁매질로서 사용된다. 이를 위해, 합성 모노- 또는 디-글리세리드를 포함하는 임의의 무미건조한 고정유가 사용될 수도 있다. 올레산 및 이의 글리세리드 유도체와 같은 지방산이 주사 가능한 물질의 제조에 유용하고, 올리브유 또는 피마자유와 같은 천연 약제학적으로 허용가능한 오일, 특히 그들의 폴리옥시에틸화된 형태에서 주사 가능한 물질의 제조에 또한 유용하다. 이들 오일 용액 또는 현탁액은 또한, 장쇄 알코올 희석제 또는 분산제, 예컨대 Ph. Helv 또는 유사한 알코올을 함유할 수 있다.
본원에 기술된 바와 같은 약제학적 조성물은 캡슐, 정제, 수성 현탁액 또는 용액을 포함하지만 이에 한정되지 않는 임의의 경구로 허용 가능한 투여형태로 경구 투여될 수 있다. 경구 용도를 위한 정제의 경우, 일반적으로 사용되는 담체는 락토오스 및 옥수수 전분을 포함한다. 마그네슘 스테아레이트와 같은 윤활제 또한 일반적으로 첨가된다. 캡슐 형태로의 경구 투여를 위한 유용한 희석제는 락토오스 및 건조된 옥수수 전분을 포함한다. 수성 현탁액이 경구 용도로 요구되는 경우, 활성 성분은 유화제 및 현탁제와 조합된다. 필요한 경우, 특정 감미료, 풍미제 또는 착색제가 또한 첨가될 수 있다.
대안적으로, 본원에 기술된 바와 같은 약제학적 조성물은 직장 투여용 좌제의 형태로 투여될 수 있다. 이들은 제제를 적합한 비-자극 부형제와 혼합함으로써 제조될 수 있으며, 이는 실온에서 고체이지만 직장 온 도에서 액체이고, 이에 따라, 약물을 방출시키기 위해 직장에서 용융될 것이다. 이러한 물질은 코코아 버터, 밀납 및 폴리에틸렌 글리콜을 포함한다.
본원에서 기술된 바와 같은 약제학적 조성물은 또한 국소 투여될 수 있다. 적절한 국소 제제은 이들 부위 또는 장기 각각에 대해 용이하게 제조된다. 하부 장관에 대한 국소 적용은 직장 좌약 제제(상기 참조)에서 또는 적합한 관장 제제에서 달성될 수 있다. 국소적으로 허용 가능한 경피 패치 또한 이용될 수 있다.
국소 적용에 대해, 약제학적 조성물은 하나 또는 그 이상의 담체에서 현탁되거나 또는 용해된 활성 성분을 함유하는 적합한 연고로 제제화될 수 있다. 본 발명의 화합물의 국소 투여를 위한 담체는 무기질 오일, 액체 바셀린, 백색 바셀린, 프로필렌 글리콜, 폴리옥시에틸렌, 폴리옥시프로필렌 화합물, 유화 왁스 및 물을 포함하지만 이에 한정되지는 않는다. 본 발명의 특정 바람직한 양태에서, 화합물은 환자 체내의 스텐트에서 발생하는 폐색의 가능성을 억제하거나 감소시키기 위해, 환자 체내로 외과적으로 이식되는 스텐트 위에 코팅될 수 있다.
대안적으로, 약제학적 조성물은 하나 이상의 약제학적으로 허용가능한 담체에 현탁되거나 용해된 활성 성분을 함유하는 적절한 로션 또는 크림으로 제제화될 수 있다. 적합한 담체는 무기질 오일, 소르비탄 모노스테아레이트, 폴리소르베이트 60, 세틸 에스테르 왁스, 세테아릴 알코올, 2-옥틸도데칸올, 벤질 알코올 및 물을 포함하지만 이에 한정되지는 않는다.
안과 이용을 위해, 약제 조성물은 등장성, pH 조정된 무균 염수에서 미소화된 현탁액으로서, 또는 바람직하게는, 보존제, 예를 들어, 벤질알코늄 염화물을 포함하거나 또는 포함하지 않는 등장성, pH 조정된 무균 염수에서 용액으로서 제제화될 수 있다. 대안적으로, 안과 이용을 위해, 약제학적 조성물은 바셀린과 같은 연고로 제제화될 수 있다.
본원에서 기술된 바와 같은 약제학적 조성물은 또한 비강 에어로졸 또는 흡입에 의해 투여될 수 있다. 이러한 조성물은 약제학적 제제의 분야에서 공지된 기술에 따라 제조되고, 벤질 알코올 또는 다른 적합한 보존제, 생체이용률을 증가시키는 흡수 증진제, 탄화플루오르 및/또는 다른 전통적인 가용화제 또는 분산제를 이용하여, 염수에서 용액으로서 제조될 수 있다.
단일 투여 형태를 제조하기 위해 담체 물질과 조합될 수 있는 본원에서 기술된 바와 같은 약제학적 조성물 내의 화합물의 양은, 치료되는 숙주 및 질환, 특정 투여 방식에 따라 달라질 것이다. 바람직하게는, 조성물은 약 0.05 mg 내지 약 750 mg 이상, 보다 바람직하게는 약 1 mg 내지 약 600 mg, 보다 더 바람직하게는 약 10 mg 내지 약 500 mg의 활성 성분을 함유하도록, 단독으로 또는 본 발명에 따른 적어도 하나의 다른 화합물과 조합하여 제형화되어야 한다.
임의의 특정 환자에 대한 특정 투여량 및 치료 요법은 사용된 특정 화합물의 활성, 연령, 체중, 전반적인 건강, 성별, 식이, 투여 시간, 배출 속도, 약물 조합, 치료하는 의사의 재량, 및 치료되는 특정 질병 또는 질환의 중증도를 포함한 다양한 인자에 좌우된다는 것이 또한 이해되어야 한다.
본원에 기술된 방법에 따른 화합물을 사용하는 치료를 필요로 하는 환자 또는 대상체는, 본원에서 달리 명시되지 않는 한, 단독으로 또는 다른 공지된 적혈구 조혈 자극제와 조합하여, 선택적으로 약제학적으로 허용 가능한 담체 또는 희석제에서 유효량의 본 발명에 따른 화합물(이의 약제학적으로 허용 가능한 염, 용매화물 또는 다형체를 포함함)을 환자(대상체)에게 투여함으로써 치료될 수 있다.
이들 화합물은, 임의의 적절한 경로, 예를 들어, 액체, 크림, 겔, 또는 고체 형태, 또는 에어로졸 형태로 경구, 비경구, 정맥내, 피내, 피하, 경피를 포함한 국소를 통해 투여될 수 있다.
활성 화합물은 치료될 환자에게 심각한 독성 영향을 주지 않으면서 환자에게 목적하는 징후에 대한 치료 유효량을 전달하기에 충분한 양으로 약제학적으로 허용가능한 담체 또는 희석제에 포함된다. 본원에서 언급된 모든 조건에 대한 활성 화합물의 바람직한 투여량은, 약 10 ng/kg 내지 300 mg/kg, 바람직하게는 하루 0.1 내지 100 mg/kg, 보다 일반적으로는 수용자/환자의 체중에 대해 하루 0.5 내지 약 25 mg/kg이다. 통상적인 국소 투여량은 적절한 담체 내에서 0.01 내지 5% wt/wt의 범위일 것이다.
화합물은 단위 투여 형태당 1 mg 미만, 1 mg 내지 3000 mg, 바람직하게는 5 내지 500 mg의 활성 성분을 포함하지만 이에 한정되지는 않는, 임의의 적합한 단위 투여량 형태로 편리하게 투여된다. 약 25 내지 250mg의 경구 투여가 종종 편리하다.
활성 성분은 바람직하게는 활성 화합물의 최대 혈장 농도를 약 0.00001 내지 30 mM, 바람직하게는 약 0.1 내지 30 μM로 달성하도록 투여된다. 이는, 예를 들어, 선택적으로 염수 또는 수성 매질 내의 활성 성분의 용액 또는 제제의 정맥 주사, 또는 활성 성분의 한 회분의 분량 투여에 의해 달성될 수 있다. 경구 투여는 또한 활성제의 유효 혈장 농도를 생성하는 데 적합하다.
약물 조성물 내의 활성 화합물의 농도는 약물의 흡수, 분포, 불활성화, 및 배설률 및 당업자에게 공지된 다른 인자에 따라 달라질 것이다. 투여량은 또한 경감될 증상의 중증도에 따라 달라질 것이라는 점에 유의해야 한다. 임의의 특정 대상체에 대해, 특정 투여 요법은 조성물을 투여하거나 조성물의 투여를 감독하는 개인의 개별적인 요구 및 전문적인 판단에 따라 시간에 걸쳐 조정되어야 하고, 본원에 제시된 농도 범위는 단지 예시적인 것이며 청구된 조성물의 범주 또는 실시를 제한하고자 하는 것이 아니라는 것이 추가적으로 이해되어야 한다. 활성 성분은 한 번에 투여되거나, 다양한 시간 간격으로 투여되는 다수의 더욱 작은 용량으로 나누어질 수 있다.
구강 조성물은 일반적으로 불활성 희석제 또는 식용 담체를 포함할 것이다. 이들은 젤라틴 캡슐에 봉입되거나 정제 내로 압축될 수 있다. 경구로의 치료제 투여를 위해, 활성 화합물 또는 이의 전구약물 유도체는 부형제와 혼입될 수 있고, 정제, 트로키제 또는 캡슐의 형태로 사용될 수 있다. 약제학적으로 상용될 수 있는 결합제 및/또는 보조제 물질은 조성물의 일부로서 포함될 수 있다.
정제, 알약, 캡슐, 트로키제 등은 다음의 성분 중 어느 하나, 또는 유사한 성질의 화합물을 함유할 수 있다: 결합제, 예컨대 미정질 셀룰로오스, 검 트라가칸스 또는 젤라틴; 부형제, 예컨대 전분 또는 락토오스, 분산제, 예컨대 알긴산, 프리모겔, 또는 옥수수 전분; 윤활제, 예컨대 마그네슘 스테아레이트 또는 스테로테스; 활택제, 예컨대 콜로이드성 이산화실리콘; 감미제, 예컨대 수크로오스 또는 사카린; 또는 향미제, 예컨대 페퍼민트, 메틸 살리실레이트, 또는 오렌지향. 투여 유닛 형태가 캡슐일 경우, 이것은 전술한 유형의 물질에 더하여, 액체 담체, 예를 들어, 지방유를 함유할 수 있다. 또한, 투여 유닛 형태는 투여 유닛의 물리적 형태를 변형시키는 다양한 다른 물질, 예를 들어, 당, 셸락, 또는 장 작용제의 코팅을 함유할 수 있다.
활성 화합물 또는 이의 약제학적으로 허용가능한 염은 엘릭시르, 현탁액, 시럽, 웨이퍼, 껌 등의 성분으로서 투여될 수 있다. 시럽은 활성 화합물에 더하여, 감미제로서의 수크로오스, 특정 보존제, 염료 및 착색제와 향미제를 함유할 수 있다.
활성 화합물 또는 이의 약학제적으로 허용 가능한 염은 또한 목적하는 작용을 손상시키지 않는 다른 활성 물질, 또는 다른 것들 중에서도, EPO 및 다바포이에틴 알파를 포함하는 적혈구 조혈 자극제와 같은, 목적하는 작용에 영향을 주는 물질과 혼합될 수 있다. 본 발명의 소정의 바람직한 양태에서, 본 발명에 따른 하나 이상의 화합물은 본원에서 달리 기술되는 바와 같은 항생제를 포함하는 적혈구 조혈 자극제 또는 치유 제제와 같은 다른 생물활성 제제와 함께 투여된다.
비경구, 피내, 피하, 또는 국소 적용을 위해 사용되는 용액 또는 현탁액은 다음의 성분을 포함할 수 있다: 무균 희석제, 예컨대, 주사용수, 염수, 고정유, 폴리에틸렌 글리콜, 글리세린, 프로필렌 글리콜 또는 다른 합성용매; 항균제, 예컨대 벤질 알코올 또는 메틸 파라벤; 항산화제, 예컨대 아스코르브산 또는 아황산수소나트륨; 킬레이트제, 예컨대 에틸렌디아민테트라아세트산; 완충액, 예컨대 아세트산염, 구연산염 또는 인산염, 및 등장성의 조절을 위한 제제, 예컨대 염화나트륨 또는 덱스트로스. 비경구 제조물은 유리 또는 플라스틱으로 만들어진 앰풀, 일회용 주입기 또는 다수의 투여 바이알에서 동봉될 수 있다.
정맥 내 투여되는 경우, 바람직한 담체는 생리염수 또는 인산 완충 염수(PBS)이다.
일 구현예에서, 활성 화합물은, 신체에서의 화합물의 급속한 제거로부터 보호하는 담체, 예를 들어, 이식물 및 미세캡슐화된 전달 시스템을 포함한 제어된 방출 제제로 제조된다. 생물분해성, 생체적합성인 중합체, 예를 들어, 에틸렌 비닐 아세테이트, 폴리무수물, 폴리글리콜산, 콜라겐, 폴리오르쏘에스테르, 및 폴리유산이 이용될 수 있다. 이러한 제제의 제조 방법은 당업자에게 명백할 것이다.
리포솜 현탁액이 또한 약학제적으로 허용 가능한 담체일 수 있다. 이들은, 예를 들어, 미국 특허 제4,522,811(본원에서 전문이 참조로서 포함됨)에서 설명된 바와 같이, 당업자에게 공지된 방법에 따라 제조될 수 있다. 　 예를 들어, 리포솜 제제는 적절한 지질(들)(예를 들어, 스테아로일 포스파티딜 에탄올아민, 스테아로일 포 스파티딜 콜린, 아라차도일 포스파티딜 콜린, 및 콜레스테롤)을, 이후 증발되어 건조된 지질의 박막을 용기의 표면 상에 남기는 무기 용매에 용해함으로써 제조될 수 있다. 이어서, 활성 화합물의 수용액은 용기 내로 도입된다. 그 후, 지질 물질을 용기의 측면으로부터 유리시키고 지질 응집체를 분산시키기 위해, 용기는 손에 의해 빙빙 돌려지고, 이에 의해 리포솜 현탁액이 형성된다.
치료 방법
추가적인 양태에서, 본 명세서는 본원에 기술된 바와 같은 유효량의　화합물 또는 이의 염 형태, 및 약제학적으로 허용가능한 담체를 포함하는 치료 조성물을 제공한다. 치료 조성물은 환자 또는 대상물, 예를 들어 인간과 같은 동물의 단백질 분해를 조절하고, 분해된 단백질을 통해 조절되는 질환 상태 또는 병태를 치료 또는 완화시키기 위해 사용될 수 있다.
본원에서 사용되는 용어 "치료하다", "치료하는", 및 "치료" 등은 본 화합물이 결합하는 단백질을 통해 조절되는 임의의 질환 상태 또는 병태의 치료를 포함하여, 본 화합물이 투여될 수 있는 환자에 대한 이점을 제공하는 임의의 행위을 지칭한다. 본 발명에 따른 화합물을 사용하여 치료될 수 있는, 암, 심장심부 자극 증후군, 신경 섬유종증 제1형, 코스텔로 증후군, 누난 증후군, 레오파드(LEOPARD, 흑자(Lentigo), 심전도 이상(Electrocardiographic abnormalities), 안구 고혈압증(Ocular hypertelorism), 폐 협착증(Pulmonary stenosis), 비정상적 성기(Abnormal genitalia), 지연 성장(Retarded growth), 청각 장애(Deafness)) 증후군을 포함하는 질환 상태 또는 병태가 전술되었다.
본 명세서는 암, 심장심부 자극 증후군, 신경 섬유종증 제1형, 코스텔로 증후군, 누난 증후군, 레오파드(흑자, 심전도 이상, 안구 고혈압증, 폐 협착증, 비정상적 성기, 지연 성장, 청각 장애) 증후군과 같은 질환의 치료 또는 완화를 위해, 관심 단백질의 분해를 수행하기 위한 본원에서 기술된 바와 같은 치료학적 조성물을 제공한다. 추가의 특정 구현예에서, 질환은 다발성 골수종이다. 이와 같이, 또 다른 양태에서, 본 명세서는 세포 내 표적 단백질을 유비퀴틴화/분해하는 방법을 제공한다. 특정 구현예에서, 방법은, 예를 들어, 바람직하게는 연결기 모이어티를 통해 연결된 ULM 및 PTM을 포함하는 본원에 기술된 바와 같은 이작용성 화합물을 투여하는 단계를 포함하고, 본원에서 달리 기술되지 않는 이상, ULM은 PTM에 결합되되, ULM은 유비퀴틴 경로 단백질(예를 들어, 세레블론, VHL, IAP 및/또는 MDM2를 포함하는 E3 유비퀴틴 리가아제와 같은 유비퀴틴 리가아제)을 인식하고, PTM은 표적 단백질을 인식하여, 표적 단백질이 유비퀴틴 리가아제의 인근에 위치할 경우 표적 단백질의 분해가 일어나 표적 단백질의 분해/그 효과의 억제 및 단백질 레벨의 조절이 일어나도록 한다. 본 발명에 의해 제공되는 단백질 레벨의 조절은 세포(예를 들어, 환자의 세포) 내에서의 해당 단백질의 레벨을 낮춤으로써 표적 단백질을 통해 조절되는 질환 상태 또는 병태의 치료를 제공한다. 소정의 구현예에서, 방법은 본원에 기술된 바와 같은 화합물의 유효량을 투여하는 단계를 포함하며, 선택적으로, 약제학적으로 혀용 가능한 부형제, 담체, 보강제, 또 다른 생리활성 제제 또는 이들의 조합을 포함한다.
추가의 구현예에서, 본 명세서는, 본원에서 기술된 바와 같은 화합물 또는 그로부터의 염 및 약제학적으로 허용가능한 부형제, 담체, 보강제, 또 다른 생리활성 제제 또는 이들의 조합의 유효량(예를 들어, 약제학적으로 허용가능한 양)을 포함하는 조성물을 이를 필요로 하는 대상체에게 투여하는 것를 포함하여, 대상체 또는 환자(예를 들어 인간과 같은 동물)의 질환, 장애 또는 증상을 치료하거나 완화하기 위한 방법을 제공하되, 조성물은 대상체의 질환 또는 장애 또는 증상을 치료하거나 완화시키는 데 효과적이다.
다른 양태에서, 본 명세서는 본 발명에 따른 화합물을 사용하는 생물학적 시스템에서 관심 단백질의 분해의 효과를 식별하는 방법을 제공한다.
다른 구현예에서, 본 발명은, 단백질의 분해가 인간 환자의 체내에서 치료 효과를 생성하는, 단백질을 통해 조절되는 질환 상태 또는 병태의 치료를 필요로 하는 환자의 치료 방법에 관한 것으로서, 이 방법은 본 발명에 따른 화합물의 유효량을 선택적으로 다른 생리활성제와 조합하여 이를 필요로 하는 환자에게 투여하는 단계를 포함한다. 질환 상태 또는 병태는 미생물 제제 또는 바이러스, 박테리아, 진균류, 원생 동물 또는 다른 미생물과 같은 다른 외인성 제제에 의해 야기되는 질환이거나, 질환 상태 및/또는 질환으로 이어지는 단백질의 과발현 및/또는 과활성화(예를 들어, 지속적인 활성화)에 의해 야기되는 질환 상태일 수 있다
용어 "질환 상태 또는 병태"는 단백질 변이(즉, 환자 체내에서 발현되는 단백질의 양이 상승함)가 발생하고, 환자 체내에서의 하나 이상의 단백질 분해가 이를 필요로 하는 환자에게 유익한 치료 또는 증상의 완화를 제공할 수 있는 임의의 질환 상태 또는 병태를 설명하는 데 사용된다. 특정 경우, 질환 상태 또는 병태는 완치될 수 있다.
본 발명에 따른 화합물을 사용하여 치료될 수 있는 질환 상태 또는 병태는, 예를 들어 천식, 다발성 경화증과 같은 자가 면역 질환, 각종암, 섬모병증, 구개열, 당뇨병, 심장병, 고혈압, 염증성 장질환, 정신 지체, 감정 조절 장애, 비만, 굴절 이상, 불모, 엔젤만 증후군, 카나반병, 체강 질병, 샤르코-마리-투스병, 낭포성 섬유증, 듀센 근이영양증, 혈색소 침착증, 혈우병, 클라인펠터 증후군, 신경 섬유종증, 페닐케톤뇨증, 다낭성 신장 질환, (PKD1) 또는 4 (PKD2) 프라더 윌리 증후군, 시클-세포병, 테이-삭스병, 터너 증후군을 포함한다.
용어 "종양(neoplasia)" 또는 "암"은, 암 또는 악성 종양, 즉, 종종 정상적인 조직보다 급속히 성장하고 새로운 성장을 시작하게 하는 자극이 중단된 후에도 계속되는 세포 증식에 의한 비정상적인 조직의 형성 및 성장을 초래하는 병리학적 과정을 지칭하기 위해 본 명세서 전반에 걸쳐 사용된다. 악성 종양은 정상 조직과의 구조적 조직 및 기능적 협응이 부분적으로 또는 완전히 결여되어 있고, 대부분 주변 조직을 침범하고, 여러 부위로 전이하며, 적절한 치료를 받지 않으면 제거를 시도한 후 재발하고 환자의 사망을 유발할 수도 있다. 본원에서 사용되는 바와 같은 용어, 종양은 모든 암성 질환을 기술하기 위해 사용되고 악성 백혈병, 복수 종양 및 고형 종양과 관련된 병리적 과정을 포함하거나 포괄한다. 본 화합물들에 의해 단독으로 또는 적어도 하나의 추가적인 항암제와 병행하여 치료될 수 있는 예시적인 암은, 편평-세포 암종, 기저세포 암종, 선암종, 간세포 암종, 및 신장세포 암종, 방광, 장, 유방, 경부, 대장, 식도, 뇌, 신장, 간, 폐, 인후, 난소, 췌장, 전립선, 위장의 암; 백혈병; 양성 및 악성 림프종, 특히 버킷 림프종 및 비-호지킨 림프종; 양성 및 악성 흑색종; 골수 증식성 질환; 유잉 육종, 혈관 육종, 카포시 육종, 지방 육종, 근육 육종, 말초 신경 상피종, 활액 육종, 신경아교종, 성상 세포종, 희소 돌기 교종, 상직근종, 신경 교종, 신경 아세포종, 신경절 교종, 신경아교종, 수질모세포종, 송과선 종양, 수막종, 수막 육종, 신경 섬유종, 및 신경초종을 포함하는 육종; 장암, 유방암, 전립선암, 자궁 경부암, 자궁암, 폐암, 난소암, 고환암, 갑상선암, 성상 세포종, 식도암, 췌장암, 위암, 간암, 대장암, 흑색종; 암육종, 호지킨병, 윌름 종양 및 기형 종양을 포함한다. 본 발명에 따른 화합물을 사용하여 치료할 수 있는 추가적인 암은, 예를 들어, T-계통 급성 림프구성 백혈병(T-ALL), T-계통 림프구성 림프종(T-LL), 말초 T-세포 림프종, 성인 T-세포 백혈병, Pre-B ALL, Pre-B 림프종, 대형 B-세포 림프종, 버킷 림프종, B-세포 ALL, 필라델피아 염색체 양성 ALL, 필라델피아 염색체 양성 CML을 포함한다.
용어 "생리활성제"는, 본 발명에 따른 화합물 이외의, 본 화합물이 사용되는 의도된 치료 및/또는 방지/예방을 수행하는 데 도움이 되는 생물학적 활성을 가진 제제로서 본 발명의 화합물과 조합되어 사용되는 제제를 설명하는 데 사용된다. 본원에서 사용하기에 바람직한 생리활성제는 본 화합물이 사용되거나 투여되는 것과 유사한 약리학적 활성을 갖는 약제들, 예를 들어 항암제, 항바이러스제, 특히 항-HIV 제제, 항-레트로바이러스 및 항-HCV 제제, 항균제, 항진균제 등을 포함한다.
용어 "추가적인 항암제"는 암을 치료하기 위해 본 발명에 따른 화합물과 조합될 수 있는, 항암제를 설명하는 데에 사용된다. 이들 제제는 다음을 포함한다: 예를 들어, 에베롤리무스, 트라벡테딘, 아브락산, TLK 286, AV-299, DN-101, 파조파닙, GSK690693, RTA 744, ON 0910.Na, AZD 6244 (ARRY-142886), AMN-107, TKI-258, GSK461364, AZD 1152, 엔자스타우린, 반데타닙, ARQ-197, MK-0457, MLN8054, PHA-739358, R-763, AT-9263, FLT-3 억제제, VEGFR 억제제, EGFR TK 억제제, 오로라 키나아제 억제제, PIK-1 조절제, Bcl-2 억제제, HDAC 인바이터, c-MET 억제제, PARP 억제제, Cdk 억제제, EGFR TK 억제제, IGPR-TK 억제제, 항-HGF 항체, PI3 키나아제 억제제, AKT 억제제, mTORC1/2 억제제, JAK/STAT 억제제, 체크포인트-1 또는 2 억제제, 초점 접착 키나아제 억제제, Map 키나아제 키나아제(mek) 억제제, VEGF 트랩 항체, 페메트렉시드, 엘로티닙, 다사타닙, 닐로티닙, 데카타닙, 파니투무맙, 암루비신, 오레고보맙, Lep-etu, 노라트렉시드, azd2171, 바타불린, 오파투무맙, 자놀리무맙, 에도테카린, 테트라드린, 루비테칸, 테스미리펜, 오블리머센, 티실리무맙, 이필리무맙, 고시폴, Bio 111, 131-I-TM-601, ALT-110, BIO 140, CC 8490, 시렌기티드, 기마테칸, IL13-PE38QQR, INO 1001, IPdR1 KRX-0402, 루칸톤, LY317615, 뉴라디압, 비테스판, Rta 744, Sdx 102, 타람파넬, 아트라센탄, Xr 311, 로미뎁신, ADS-100380, 수니티닙, 5-플루오로우라실, 보리노스타트, 에토포시드, 젬시타빈, 독소루비신, 리포솜 독소루비신, 5'-데옥시-5-플루오로우리딘, 빈크리스틴, 테모졸로마이드, ZK-304709, 셀리시클립; PD0325901, AZD-6244, 카페시타빈, L-글루탐산, N-[4-[2-(2-아미노-4,7-디하이드로-4-옥소-1H-피롤로[2,3-d]피리미딘-5-일)에틸]벤조일]-, 이나트륨 염, 헵타수화물, 캄프토테신, PEG-표지된 이리노테칸, 타목시펜, 토레미펜 시트레이트, 아나스트라졸, 익세메스탄, 레트로졸, DES(디에틸스틸베스트롤), 에스트라디올, 에스트로겐, 접합된 에스트로겐, 베바시주맙, IMC-1C11아스트라졸 CHIR-258); 3-[5-(메틸설포닐피라딘메틸)-인돌릴-퀴놀론, 바탈라닙, AG-013736, AVE-0005, 고세렐린 아세테이트, 루프롤리드 아세테이트, 트립토렐린 파모에이트, 메드록시프로게스테론 아세테이트, 하이드록시프로게스테론 카프로에이트, 메게스트롤 아세테이트, 랄록시펜, 비칼루타미드, 플루타미드, 닐루타미드, 메게스트롤 아세테이트, CP-724714; TAK-165, HKI-272, 엘로티닙, 라파타닙, 카네르티닙, ABX-EGF 항체, 에르비툭스, EKB-569, PKI-166, GW-572016, 이오나파닙, BMS-214662, 티피파닙; 아미포스틴, NVP-LAQ824, 수베로일 아날라이드 히드록삼산, 발프로산, 트리코스타틴 A, FK-228, SU11248, 소라페닙, KRN951, 아미노글루테티미드, 아른사크린, 아나그렐리드, L-아스파라기나제, 칼메트-게랭 간균(BCG) 백신, 아드리아마이신, 블레오마이신, 부세렐린, 부설판, 카보플라틴, 카르무스틴, 클로람부실, 시스플라틴, 클라드리빈, 클로드로네이트, 시프로테론, 시타라빈, 다카르바진, 닥티노마이신, 다우노루비신, 디에틸스틸베스트롤, 에피루비신, 플루다라빈, 플루드로코르티손, 플루옥시메스테론, 플루타미드, 글리벡, 젬시타빈, 하이드록시우레아, 이다루비신, 이포스파미드, 이마티닙, 루프롤리드, 레바미솔, 로무스틴, 메클로레타민, 멜팔란, 6-메르캅토퓨린, 메스나, 메토트렉세이트, 미토마이신, 미토탄, 미톡산트론, 닐루타미드, 옥트레오티드, 옥살리플라틴, 파미드로네이트, 펜토스타틴, 플리카마이신, 포르피머, 프로카르바진, 랄티트렉시드, 리툭시맙, 스트렙토조신, 테니포시드, 테스토스테론, 탈리도마이드, 티오구아닌, 티오테파, 트레티노인, 빈데신, 13-시스-레티노산, 페닐알라닌 머스타드, 우라실 머스타드, 에스트라무스틴, 알트레타민, 플록스우리딘, 5-데옥시우리딘, 시토신 아라비노시드, 6-메르캅토퓨린, 데옥시코포마이신, 칼시트리올, 발루비신, 미트라마이신, 빈블라스틴, 비노렐빈, 토포테칸, 라족신, 마리마스타트, COL-3, 네오바스타트, BMS-275291 , 스쿠알아민, 엔도스타틴, SU5416, SU6668, EMD121974, 인터루킨-12, IM862, 안지오스타틴, 비탁신, 드롤옥시펜, 이독시펜, 스피로놀락톤, 피나스테라이드, 시미티딘, 트라스투주맙, 데닐루킨 디프티톡스, 게피티닙, 보르테지밉, 파클리탁셀, 크레모포르-프리 파클리탁셀, 도세탁셀, 에피틸론 B, BMS- 247550, BMS-310705, 드롤옥시펜, 4-하이드록시타목시펜, 피펜독시펜, ERA-923, 아르조시펜, 풀베스트란트, 아콜비펜, 라소폭시펜, 이독시펜, TSE-424, HMR- 3339, ZK186619, 토포테칸, PTK787/ZK 222584, VX-745, PD 184352, 라파마이신, 40-O-(2-하이드록시에틸)-라파마이신, 템시로리무스, AP-23573, RAD001, ABT-578, BC-210, LY294002, LY292223, LY292696, LY293684, LY293646, 워트마닌, ZM336372, L-779,450, PEG-필그라스팀, 다베포에틴, 에리트로포이에틴, 과립구 콜로니-자극 인자, 졸렌드로네이트, 프레드니손, 세툭시맙, 과립구 대식세포 콜로니-자극 인자, 히스트렐린, 페길화된 인터페론 알파-2a, 인터페론 알파-2a, 페길화된 인터페론 알파-2b, 인터페론 알파-2b, 아자시티딘, PEG-L-아스파라기나제, 레날리도마이드, 겜투주맙, 하이드로코르티손, 인터루킨-11, 덱스라족산, 알렘투주맙, 올-트랜스레티노산, 케토코나졸, 인터루킨-2, 메게스트롤, 면역 글로불린, 질소 머스타드, 메틸프레드니솔론, 이브리투모맙 튜세탄, 안드로겐, 데시타빈, 헥사메틸멜라민, 벡사로텐, 토시투모맙, 비소 트리옥사이드, 코르티손, 에디트로네이트, 미토탄, 시클로스포린, 리포솜 다우노루비신, 에드위나-아스파라기나제, 스트론튬 89, 카소피탄트, 네투피탄트, NK-1 수용체 길항제, 팔로노세트론, 아프레피탄트, 디펜히드라민, 하이드록시진, 메토클로프라미드, 로라제팜, 알프라졸람, 할로페리돌, 드로페리돌, 드로나비놀, 덱사메타손, 메틸프레드니솔론, 프로클로르페라진, 그라니세트론, 온단세트론, 돌라세트론, 트로피세트론, 페그필그라스팀, 에리트로포이에틴, 에포에틴 알파, 다베포에틴 알파 및 이들의 혼합물.
용어 "항 HIV 제제", "항 레트로바이러스" 또는 "부가적인 항-HIV 제제"는, 예를 들어, 다른 것들 중에서도 뉴클레오시드 역전사 효소 억제제(NRTI), 다른 비뉴클레오티드 역전사 효소 억제제(즉, 본 발명의 대표물이 아닌 것들), 프로테아제 억제제, 융합 억제제를 포함하고, 이들의 예시적인 화합물은, 예를 들어, 3TC(라미부딘), AZT(지도부딘), (-)-FTC, ddI(디다노신), ddC(잘시타빈), 아바카비르(ABC), 테노포비르(PMPA), D-D4FC(리베르세트), D4T(스타부딘), 라시비르, L-FddC, L-FD4C, NVP(네비라핀), DLV(델라비르딘), EFV(에파비렌즈), SQVM(사퀴나비르 메실레이트), RTV(리토나비르), IDV(인디나비르), SQV(사퀴나비르), NFV(넬피나비르), APV(암프레나비르), LPV(로피나비르), 융합 억제제, 예컨대 T20, 퓨세온 및 이들의 혼합물을 포함하고, 현재 임상 시험 또는 개발 중에 있는 항-HIV 화합물을 포함한다.
본 발명에 따른 화합물과 함께 병행 투여에 사용될 수 있는 다른 항-HIV/항-레트로바이러스 제제는, 예를 들어, 다른 것들 중에서, 네비라핀(BI-R6-587), 델라비르딘(U-90152S/T), 에파비렌즈(DMP-266), UC-781 (N-[4-클로로-3-(3-메틸-2-부테닐옥시)페닐]-2메틸3-푸란카보티아미드), 에트라비린(TMC125), 트로비르딘(Ly300046.HCl), MKC-442(에미비린, 코액티논), HI-236, HI-240, HI-280, HI-281, 릴피비린(TMC-278), MSC-127, HBY 097, DMP266, 바이칼린(TJN-151) ADAM-II(메틸 3',3'-디클로로-4',4"-디메톡시-5',5"-비스(메톡시카르보닐)-6,6-디페닐헥세노에이트), 메틸 3-브로모-5-(1-5-브로모-4-메톡시-3-(메톡시카르보닐)페닐)헵트-1-에닐)-2-메톡시벤조에이트(알케닐디아릴메탄 유사체, 아담 유사체), (5-클로로-3-(페닐술피닐)-2'-인돌카르복사미드), AAP-BHAP(U-104489 또는 PNU-104489), 카프라비린(AG-1549, S-1153), 아테비르딘(U-87201E), 아우린 트리카르복실산(SD-095345), 1-[(6-시아노-2-인돌릴)카르보닐]-4-[3-(이소프로필아미노)-2-피리디닐]피페라진, 1-[5-[[N-(메틸)메틸설포닐아미노]-2-인돌릴카르보닐-4-[3-(이소프로필아미노)-2-피리디닐]피페라진, 1-[3-(에틸아미노)-2-[피리디닐]-4-[(5-하이드록시-2-인돌릴)카르보닐]피페라진, 1-[(6-포르밀-2-인돌릴)카르보닐]-4-[3-(이소프로필아미노)-2-피리디닐]피페라진, 1-[[5-(메틸설포닐옥시)-2-인돌릴)카르보닐]-4-[3-(이소프로필아미노)-2-피리디닐]피페라진, U88204E, 비스(2-니트로페닐)설폰(NSC 633001), 칼라노리드 A(NSC675451), 칼라노리드 B, 6-벤질-5-메틸-2-(시클로헥실옥시)피리미딘-4-온(DABO-546), DPC 961, E-EBU, E-EBU-dm, E-EPSeU, E-EPU, 포스카르넷(포스카비르), HEPT(1-[(2-하이드록시에톡시)메틸]-6-(페닐티오)티민), HEPT-M(1-[(2-하이드록시에톡시)메틸]-6-(3-메틸페닐)티오)티민), HEPT-S(1-[(2-하이드록시에톡시)메틸]-6-(페닐티오)-2-티오티민), 이노필룸 P, L-737,126, 미쉘라민 A(NSC650898), 미쉘라민 B(NSC649324), 미쉘라민 F, 6-(3,5-디메틸벤질)-1-[(2-하이드록시에톡시)메틸]-5-이소프로필우라실, 6-(3,5-디메틸벤질)-1-(에톡시메틸)-5-이소프로필우라실, NPPS, E-BPTU(NSC 648400), 올티프라즈(4-메틸-5-(피라지닐)-3H-1,2-디티올-3-티온), N-{2-(2-클로로-6-플루오로페네틸]-N'-(2-티아졸릴)티오우레아(PETT Cl, F 유도체), N-{2-(2,6-디플루오로페네틸]-N'-[2-(5-브로모피리딜)]티오우레아{PETT 유도체), N-{2-(2,6-디플루오로페네틸]-N'-[2-(5-메틸피리딜)]티오우레아{PETT 피리딜 유도체), N-[2-(3-플루오로푸라닐)에틸]-N'-[2-(5-클로로피리딜)]티오우레아, N-[2-(2-플루오로-6-에톡시페네틸)]-N'-[2-(5-브로모피리딜)]티오우레아, N-(2-페네틸)-N'-(2-티아졸릴)티오우레아(LY-73497), L-697,639, L-697,593, L-697,661, 3-[2-(4,7-디플루오로벤즈옥사졸-2-일)에틸}-5-에틸-6-메틸(피페리딘-2(1H)-티온(2-피리디논 유도체), 3-[[(2-메톡시-5,6-디메틸-3-피리딜)메틸]아민]-5-에틸-6-메틸(피페리딘-2(1H)-티온, R82150, R82913, R87232, R88703, R89439(로비리드), R90385, S-2720, 수라민 나트륨, TBZ (티아졸로벤즈이미다졸, NSC 625487), 티아졸로이소인돌-5-온, (+)(R)-9b-(3,5-디메틸페닐-2,3-디하이드로티아졸로[2,3-a]이소인돌-5(9bH)-온, 티비라핀(R86183), UC-38 및 UC-84로 이루어진 군으로부터 선택될 수 있는 다른 (즉, 본 발명에 따른 NNRTI와 다른) NNRTI를 포함한다.
용어 "약제학적으로 허용가능한 염"은 본 명세서 전반에 걸쳐, 적용 가능한 경우, 화합물의 용해 및 생체이용률을 증진시키는 목적으로, 환자의 위장관의 위장액 내에서의 화합물의 용해도를 증가시키기 위해 존재하는 하나 이상의 화합물의 염 형태를 설명하는 데 사용된다. 약제학적으로 허용가능한 염은, 적용 가능한 경우, 약제학적으로 허용가능한 무기 또는 유기 염기 및 산으로부터 유래된 것을 포함한다. 적합한 염은 칼륨 및 나트륨과 같은 알칼리 금속, 칼슘 및 마그네슘과 같은 알칼리 토금속 및 암모늄염으로부터 유래된 것 및 약학 분야에 공지된 다수의 다른 산 및 염기를 포함한다. 나트륨 및 칼륨 염은 본 발명에 따른 인산염의 중화염으로서 특히 바람직하다.
용어 "약제학적으로 허용가능한 유도체"는 본 명세서 전반에 걸쳐, 환자에게 투여시 본 화합물 또는 본 화합물의 활성 대사물질을 직접적으로 또는 간접적으로 제공하는 임의의 약제학적으로 허용가능한 전구약물 형태(예를 들어, 에스테르, 아미드 및 다른 전구약물군)를 설명하는 데 사용된다.
일반 합성 접근법
본원에 기술된 바와 같은 이작용성 분자의 합성 실행 및 최적화는 단계적 또는 모듈식으로 접근될 수 있다. 예를 들어, 표적 분자에 결합하는 화합물의 식별은 적절한 리간드가 즉시 이용 가능하지 않은 경우, 높은 또는 중간 처리량 스크리닝 캠페인을 포함할 수 있다. 초기 리간드가 적절한 시험관 내 및 약리학적 및/또는 ADMET 분석법으로부터의 데이터에 의해 식별된 바와 같은 차선의 양태를 개선하기 위한 반복 설계 및 최적화 주기를 필요로 하는 것은 드문 일이 아니다. 최적화/SAR 캠페인의 일부는 치환 내성이 있는 리간드의 위치를 탐색하는 것이며, 이는 본원에서 전술한 연결기 화학 물질을 부착하는 적절한 위치일 수 있다. 결정 구조 또는 NMR 구조 데이터가 이용 가능한 경우, 이는 이러한 합성 노력을 집중하는데 사용될 수 있다.
매우 유사한 방식으로, E3 리가아제(즉, ULM/ILM/VLM/CLM/ILM)에 대한 리간드를 식별하고 최적화할 수 있다.
당면한 PTM 및 ULM(예를 들어, ILM, VLM, CLM 및/또는 ILM)을 사용하여, 당업자는 연결기 모이어티의 유무에 따라 이들의 조합에 대해 공지된 합성 방법을 사용할 수 있다. 연결기 모이어티는, 다양한 조성, 길이 및 유연성으로 합성될 수 있고, PTM 및 ULM 기가 연결기의 원위 단부에 순차적으로 부착될 수 있도록 기능화될 수 있다. 따라서, 시험관 내 및 생체 내 약리학 및 ADMET/PK 연구에서 이작용성 분자의 라이브러리를 구현하고 프로파일링할 수 있다. PTM 및 ULM 기와 같이, 최종 이작용성 분자는 원하는 특성을 갖는 분자를 식별하기 위해 반복 설계 및 최적화 주기를 거칠 수 있다.
일부 예에서, 목적하는 물질의 제조를 용이하게 하기 위해 보호기 적용 및/또는 작용기 상호 전환(FGI)이 필요할 수 있다. 이러한 화학 공정은 합성 유기 화학자에 주지되어 있고, 이들 중 많은 것들은 "Greene's Protective Groups in Organic Synthesis" Peter G. M. Wuts and Theodora W. Greene (Wiley), 및 "Organic Synthesis: The Disconnection Approach" Stuart Warren and Paul Wyatt (Wiley)와 같은 교재에서 찾아볼 수 있다.
약어 목록
AcOH, 아세트산
aq., 수성
BINAP, 2,2'-비스(디페닐포스피노)-1,1'-비나프탈렌
Boc, 삼차-부톡시카르보닐
Boc2O, 디-삼차-부틸 디카보네이트
BOP, (벤조트리아졸-1-일옥시)트리스(디메틸아미노)포스포늄 헥사플루오로포스페이트
CDCl3, 중수소클로로포름
CD3OD, 중수소메탄올
CH3CN, 아세토니트릴
CH3OH, 메탄올
CsF, 불화 세슘
Cs2CO3, 탄산 세슘
Cu(OAc)2, 구리 (II) 아세테이트
Cy2NMe, 디시클로헥실메틸아민
DCM, 디클로로메탄
DIAD, 디이소프로필 아조디카르복실레이트
DIEA 또는 DIPEA, 디이소프로필에틸아민
DMAP, N,N-디메틸아미노피리딘
DMF, N,N-디메틸포름아미드
DMSO, 디메틸설폭시드
DMSO-d6, 헥사중수소디메틸 설폭시드
Et2NH, 디에틸아민
EtOAc 또는 EA, 에틸 아세테이트
HCl, 염산
H2O, 물
HPLC, 고성능 액상 크로마토그래피
IBX, 2-요오독시벤조산
KOAc, 아세트산 칼륨
LCMS, 액상 크로마토그래피/질량 분석기
LiOH, 수산화 리튬
MeOH, 메탄올
MsCl, 메탄설포닐 염화물
N2, 질소
NaH, 수소화 나트륨
NaBH3CN, 나트륨 시아노보로히드라이드
NaBH(OAc)3, 나트륨 트리아세톡시보로히드라이드
NaCl, 염화나트륨
NaHCO3, 중탄산 나트륨
NaI, 요오드화 나트륨
Na2SO4, 황산 나트륨
n-BuLi, n-부틸리튬
NH3, 암모니아
NH4Cl, 염화 암모늄
NH2OH.HCl, 하이드록실아민 염화수소
NMP, N-메틸피롤리돈
NMR, 핵 자기 공명
O2, 산소
Pd(aMPhos)Cl2, 비스(디-삼차-부틸(4-디메틸아미노페닐)포스핀)디클로로팔라듐(II)
Pd2(dba)3, 트리스(디벤질리덴아세톤)디팔라듐(0)
Pd(dppf)Cl2, [1,1'-비스(디페닐포스피노)페로센]디클로로팔라듐(II)
Pd(OH)2, 수산화 팔라듐
Pd(PPh3)4, 테트라키스(트리페닐포스핀)팔라듐(0)
PE, 석유 에테르
Ph3P, 트리페닐포스핀
Py, 피리딘
PyBOP, (벤조트리아졸-1-일옥시)트리피롤리디노포스피늄 헥사플루오로포스페이트
rt, 실온
TBAF, 테트라-n-부틸암모늄 불화물
TBDPSCl, 삼차-부틸디페닐실릴 염화물
TBS, 삼차-부틸디메틸실릴
tBuOK, 삼차-부톡시드 칼륨
[tBu3PH]BF4, 트리-삼차-부틸 포스포늄 테트라플루오로보레이트
TEA, 트리에틸아민
THF, 테트라하이드로푸란
TLC, 박층 크로마토그래피
TMSOTf, 트리메틸실릴 트리플루오로메탄설포네이트
TsCl, p-톨루엔설포닐 염화물
TsOH, p-톨루엔설폰산
반응식 1A.
식 I의 화합물은, 예를 들어, 비스(디-삼차-부틸(4-디메틸아미노페닐)포스핀)디클로로팔라듐(II)과 같은 적절한 팔라듐 촉매, 불화 세슘과 같은 적절한 염기, 1,4-디옥산 및 물의 혼합물과 같은 적절한 용매, 100℃와 같은 적절한 온도 하의 팔라듐 촉매화 교차 결합 조건 하에서 시약 II(구입할 수 있거나, 당업자에게 공지된 표준 반응기술을 사용하여 용이하게 제조될 수 있음)와 반응하여 마이크로웨이브 조사에 상관 없이 식 III의 화합물을 생성할 수 있다. M 또는 M' 중 하나는 팔라듐-촉매된 트랜스메탈화를 겪을 수 있는 작용기, 예를 들어, 보론산, 보론 에스테르, 또는 트리알킬스탄난을 나타내고; M 또는 M' 중 다른 하나는 팔라듐-촉매 산화 부가를 겪을 수 있는 작용기, 예를 들어 요오드화물, 브롬화물, 염화물, 또는 트리플루오로메탄설포네이트를 나타내고; Ar은 방향족 또는 헤테로방향족 고리 시스템을 나타내고; L은 선택적인 연결기 또는 연결기의 부분을 나타내고, 는 선택적으로 4 내지 8-원 헤테로고리의 고리로 고리화된 일차 또는 이차 아민을 나타내되, PG는 t-부톡시카르보닐 또는 벤질을 포함하지만 이에 한정되지 않는 적절한 보호기를 대표한다. 식 III의 화합물은 PG 제거에 적합한 시약, 예를 들어 PG가 t-부톡시카르보닐인 경우 1,4-디옥산 중 염화수소로 처리함으로써 식 IV의 화합물로 전환될 수 있다. 이어서, 화합물 IV는 화합물 V와 반응하여 화합물 VI를 생성할 수 있다(여기서 L'은 선택적인 연결기 또는 연결기의 부분을 대표하고, Y는 CH2 또는 C=O이고, X는 적절한 이탈기(예를 들어, OMs, OTs, Cl 등) 또는 알데히드(CHO)임). X가 이탈기일 경우, n은 0이고, 적절한 반응 조건은 알킬화 반응(예를 들어 디이소프로필에틸아민, 요오드화 칼륨, DMSO 또는 아세토니트릴, 80℃)에 대한 것이다. X가 알데히드인 경우, n은 1이고, 적절한 반응 조건은 환원성 아미노화 반응(예를 들어 나트륨 시아노보로히드라이드, 메탄올, 디클로로메탄, 아세트산, 실온)에 대한 것이다.
반응식 1B.
식 I의 화합물은, 예를 들어, 비스(디-삼차-부틸(4-디메틸아미노페닐)포스핀)디클로로팔라듐(II)과 같은 적절한 팔라듐 촉매, 불화 세슘과 같은 적절한 염기, 1,4-디옥산 및 물의 혼합물과 같은 적절한 용매, 100℃와 같은 적절한 온도 하의 팔라듐 촉매화 교차 결합 조건 하에서 시약 II(구입할 수 있거나, 당업자에게 공지된 표준 반응기술을 사용하여 용이하게 제조될 수 있음)와 반응하여 마이크로웨이브 조사에 상관 없이 식 III의 화합물을 생성할 수 있다. M 또는 M' 중 하나는 팔라듐-촉매된 트랜스메탈화를 겪을 수 있는 작용기, 예를 들어, 보론산, 보론 에스테르, 또는 트리알킬스탄난을 나타내고; M 또는 M' 중 다른 하나는 팔라듐-촉매 산화 부가를 겪을 수 있는 작용기, 예를 들어 요오드화물, 브롬화물, 염화물, 또는 트리플루오로메탄설포네이트를 나타내고; Z 및 Z'는 각각 독립적으로 H 또는 t-부톡시카르보닐과 같은 적절한 보호기이고; Ar은 방향족 또는 헤테로방향족 고리 시스템을 나타내고; L은 선택적인 연결기를 대표하고, 는 선택적으로 4 내지 8-원 헤테로고리의 고리로 고리화된 일차 또는 이차 아민을 나타내되, PG는 t-부톡시카르보닐 또는 벤질을 포함하지만 이에 한정되지 않는 적절한 보호기를 대표한다. 식 III의 화합물은 PG 제거에 적합한 시약, 예를 들어 PG가 t-부톡시카르보닐인 경우 1,4-디옥산 중 염화수소로 처리함으로써 식 IV의 화합물로 전환될 수 있다. 이어서, 화합물 IV는 화합물 V와 반응하여 화합물 VI를 생성할 수 있다(여기서 L'은 선택적인 연결기 또는 연결기의 부분을 대표하고, Y는 CH2 또는 C=O이고, X는 적절한 이탈기(예를 들어, OMs, OTs, Cl 등) 또는 알데히드(CHO)이고, R은 선택적인 치환기(예를 들어, F 또는 OCH3)이고, W는 다음과 같다:
X가 이탈기일 경우, n은 0이고, 적절한 반응 조건은 알킬화 반응(예를 들어 디이소프로필에틸아민, 요오드화 칼륨, DMSO 또는 아세토니트릴, 80℃)에 대한 것이다. X가 알데히드인 경우, n은 1이고, 적절한 반응 조건은 환원성 아미노화 반응(예를 들어 나트륨 시아노보로히드라이드, 메탄올, 디클로로메탄, 아세트산, 실온)에 대한 것이다. 필요에 따라, 임의의 화합물 IV, V, 또는 VI의 거울상 이성질체 또는 부분 입체 이성질체의 혼합물을, 분취 고성능 액체 크로마토그래피 또는 분취 초임계 유체 크로마토그래피를 포함하지만 이에 한정되지 않는, 당업자에게 공지된 기술을 사용하여 이들을 구성하는 거울상 이성질체 또는 부분 입체 이성질체로 분해할 수 있다.
W가 인 경우, 화합물 VI를 이미드 고리화에 적합한 조건, 예를 들어, 100℃에서 아세토니트릴 또는 N-메틸피롤리돈 중 벤젠설폰산으로 처리하여 식 VI의 상이한 화합물을 수득할 수 있으며, 여기서 W는 이다.
Z 또는 Z' 중 하나 또는 둘 모두가 보호기인 경우, 예를 들어, Z 및/또는 Z'가 t-부톡시카르보닐인 경우, 트리플루오로아세트산으로 처리하여, 이러한 보호기를 화합물 VI로부터 제거해서, 식 VI의 상이한 화합물을 수득할 수 있으며, 여기서 Z 및 Z'는 H이다.
V에서의 X 및 II에서의 의 위치가 합성 시퀀스 전체에 걸쳐 거꾸로 되어서, 화합물 VI에서의 및 의 위치가 거꾸로 될 수 있음이 당업자에게 더욱 명백해질 것이다. 이러한 경우, X는 CH2OH 또는 알데히드 보호될 수도 있고, 예를 들어, 아세탈로서 보호될 수도 있고, 이때 예를 들어 데스-마틴 페리오디난으로 알코올 산화시키거나, 예를 들어, V와의 반응 전에 아세톤 중 앰버리스트 15 및 환류 시 물로, 아세탈 탈보호에 의해, X가 CHO인 화합물로 변환시킬 수도 있다.
반응식 2.
식 IV의 화합물은 또한 식 VII의 화합물과 반응하여 식 VIII의 화합물을 제공할 수 있다(여기서 X는 불소 또는 염소와 같은 적절한 이탈기이고, Y는 C=O이고, R은 하나 이상의 선택적 치환기를 나타내고, W는 H 또는 CH3이고, 반응 조건은 친핵성 방향족 치환(예를 들어 트리에틸아민, DMSO, 70℃)에 대한 것이다.
반응식 3A.
식 I의 화합물은, 예를 들어, 반응식 1A 또는 1B에 보이는 바와 같이, 팔라듐 촉매된 교차 결합 조건 하에서 시약 IX(구입할 수 있거나, 당업자에게 공지된 표준 반응기술을 사용하여 용이하게 제조될 수 있음)와 반응하여 식 X의 화합물을 생성할 수 있다. M 또는 M' 중 하나는 팔라듐-촉매된 트랜스메탈화를 겪을 수 있는 작용기, 예를 들어, 보론산, 보론 에스테르, 또는 트리알킬스탄난을 나타내고; M 또는 M' 중 다른 하나는 팔라듐-촉매 산화 부가를 겪을 수 있는 작용기, 예를 들어 요오드화물, 브롬화물, 염화물, 또는 트리플루오로메탄설포네이트를 나타내고; Ar은 방향족 또는 헤테로방향족 고리 시스템을 나타내고; L은 선택적인 연결기 또는 연결기의 부분을 나타내고, PG는 적절한 에스테르 보호기, 예를 들어 메틸, 에틸, 또는 t-부틸을 나타낸다. 식 X의 화합물은 PG 제거에 적합한 시약, 예를 들어 PG가 t-부틸인 경우 1,4-디옥산 중 염화수소로 처리함으로써 식 XI의 화합물로 전환될 수 있다. 이어서, 이어서, 화합물 XI는 화합물 XII(여기서, Z는 H, 메틸, 또는 하이드록시메틸과 같은 선택적인 치환기임)와 아미드 생성 조건(예를 들어, (벤조트리아졸-1-일옥시)트리피롤리디노포스포늄 헥사플루오로포스페이트, 디이소프로필에틸아민, DMF, 실온) 하에서 반응하여 식 XIII의 화합물을 생성할 수 있다.
반응식 3B.
식 I'의 화합물은, 예를 들어, 반응식 1A 또는 1B에 보이는 바와 같이, 팔라듐 촉매된 교차 결합 조건 하에서 시약 IX(구입할 수 있거나, 당업자에게 공지된 표준 반응기술을 사용하여 용이하게 제조될 수 있음)와 반응하여 식 X의 화합물을 생성할 수 있다. M 또는 M' 중 하나는 팔라듐-촉매된 트랜스메탈화를 겪을 수 있는 작용기, 예를 들어, 보론산, 보론 에스테르, 또는 트리알킬스탄난을 나타내고; M 또는 M' 중 다른 하나는 팔라듐-촉매 산화 부가를 겪을 수 있는 작용기, 예를 들어 요오드화물, 브롬화물, 염화물, 또는 트리플루오로메탄설포네이트를 나타내고; Ar은 방향족 또는 헤테로방향족 고리 시스템을 나타내고; L은 선택적인 연결기 또는 연결기의 부분을 대표하고; PG는 적절한 에스테르 보호기, 예를 들어 메틸, 에틸, 또는 t-부틸을 나타내고; W는 선택적인 보호기, 예를 들어 2-(트리메틸실릴)에톡시메틸을 나타낸다. 필요한 경우, 예를 들어, L이 일차 또는 이차 아민 또는 알코올을 함유하는 경우, 이러한 작용기는 적절한 보호기, 예를 들어, 작용기가 아민인 경우에는 t-부톡시카르보닐로 또는 작용기가 알코올인 경우에는 t-부틸디메틸실릴로, 선택적으로 보호될 수 있다. 식 X의 화합물은 선택적 W의 제거에 적합한 시약, 예를 들어 W가 2-(트리메틸실릴)에톡시메틸인 경우 1,4-디옥산 및 메탄올 또는 에틸렌디아민 중 염화수소로 처리함으로써; 이어서 PG 제거에 적합한 시약, 예를 들어 PG가 t-부틸인 경우 1,4-디옥산 중 염화수소로 처리함으로써, 식 XI의 화합물로 전환될 수 있다. 그런 다음, 화합물 XI를 화합물 XII와 반응시켜서 (여기서 Z는 선택적으로 치환된 탄소, 예를 들어 CH2, CD2, CH(Me), CH(CH2OH), C(CH3)2, R은 선택적 치환기, 예를 들어 F 또는 CH2OH이고, Y는 선택적 치환기, 예를 들어 할로겐, CN, 또는 선택적으로 치환된 아릴 또는 헤테로시클릴임), 아미드 형성 조건 하에서, 예를 들어 (벤조트리아졸-1-일옥시)트리피롤리디노포스포늄 헥사플루오로포스페이트, 디이소프로필에틸아민, DMF, 실온에서 식 XIII의 화합물을 생성할 수 있다. L이 보호된 아민 또는 알코올을 함유하는 경우, 이러한 보호기는 화합물 X, XI 또는 XIII의 단계에서 필요에 따라, 예를 들어, 상기 보호기가 t-부톡시카르보닐인 경우에는 트리플루오로아세트산으로, 상기 보호기가 t-부틸디메틸실릴인 경우에는 메탄올 중 염산으로 처리하여 제거될 수 있다는 것이 당업자에게 명백할 것이다.
반응식 4A.
대안적으로, 식 IX의 화합물은 반응식 3A 또는 3B의 X로부터 XI로의 전환에 대한 것과 유사한 조건을 사용하여 식 XIV의 화합물로 전환될 수 있다. 식 XIV의 화합물은 반응식 3A 또는 3B의 XI로부터 XIII로의 전환에 대한 것과 유사한 조건을 사용하여 식 XV의 화합물로 전환될 수 있다. 이어서, 식 XV의 화합물은 반응식 3A 또는 3B의 I 및 IX로부터 X로의 전환에 대한 것과 유사한 조건을 사용하여 식 I의 화합물과 반응하여 식 XIII의 화합물로 전환될 수 있다.
반응식 4B.
대안적으로, 식 IX의 화합물은 반응식 3A 또는 3B의 X로부터 XI로의 전환에 대한 것과 유사한 조건을 사용하여 식 XIV의 화합물로 전환될 수 있다. 식 XIV의 화합물은 반응식 3A 또는 3B의 XI로부터 XIII로의 전환에 대한 것과 유사한 조건을 사용하여 식 XV의 화합물로 전환될 수 있다. 이어서, 식 XV의 화합물은 반응식 3B의 I' 및 IX로부터 X로의 전환 후 W의 선택적 탈보호에 대한 것과 유사한 조건을 사용하여 식 I'의 화합물과 반응하여 식 XIII의 화합물로 전환될 수 있다.
반응식 5.
식 XVI의 화합물은 Chan-Lam 교차 결합 조건(예를 들어, 구리(II) 아세테이트, 피리딘 또는 디에틸아민 또는 트리에틸아민, 100℃) 하에서 시약 II'(구입할 수 있거나, 당업자에게 공지된 표준 반응기술을 사용하여 용이하게 제조될 수 있음)와 반응하여 식 XVII의 화합물을 생성할 수 있다. M'는 보론산 또는 보론 에스테르를 나타내고; Ar은 방향족 또는 헤테로방향족 고리 시스템을 나타내고; L은 선택적인 연결기를 대표하고, 는 선택적으로 4 내지 8-원 헤테로시클릭 고리로 고리화된 일차 또는 이차 아민을 나타내며, 여기서 PG는 t-부톡시카르보닐 또는 벤질을 포함하지만 이에 한정되지 않는 적절한 보호기를 대표한다. 식 XVI의 화합물은 팔라듐 촉매화 교차 결합 조건(예를 들어, [1,1'-비스(디페닐포스피노)페로센]디클로로팔라듐, 트리-삼차-부틸포스핀 테트라플루오로보레이트, 불화 세슘, 1,4-디옥산, 90℃) 하에서 시약 XVIII과 반응하여 식 XIX의 화합물을 생성할 수 있다. M은 팔라듐 촉매화 금속교환반응을 수행할 수 있는 작용기(예를 들어, 보론산, 보론 에스테르, 또는 트리알킬스탄난)를 대표하고, Ar'은 선택적인 치환기를 갖는 방향족 또는 헤테로방향족 고리 시스템을 대표한다. 이어서, 식 XIX의 화합물은 PG 제거에 적합한 시약, 예를 들어 PG가 t-부틸인 경우 1,4-디옥산 또는 메탄올 중 염화수소로 처리함으로써 식 XX의 화합물로 전환될 수 있다. 식 XX의 화합물은 또한 식 VII의 화합물과 반응하여 식 XXI의 화합물을 생성할 수 있다(여기서, X는 불소 또는 염소와 같은 적절한 이탈기이고, Y는 C=O이고, 식 VII의 방향족 고리는 선택적인 치환기를 추가로 가질 수 있고, 반응 조건은 친핵성 방향족 치환(예를 들어 트리에틸아민, DMSO, 80℃)에 대한 것이다. Ar'기가 선택적인 치환기(예를 들어, 케톤)을 함유할 경우, 이는, 예를 들어, 실온에서의 하이드록실아민 염화수소 및 피리딘을 사용하는 처리에 의해 추가적인 기능화를 거쳐 식 XXI의 추가 화합물을 생성한다.
반응식 6.
대안적으로, 식 XVII의 화합물은 반응식 5의 XIX로부터 XX로의 전환에 대한 것과 유사한 조건을 사용하여 식 XXII의 화합물로 전환될 수 있다. 이어서, 식 XXII의 화합물은 반응식 5에서 정의된 바와 같은 식 VII의 화합물로 처리되어 식 XXIII의 화합물을 생성할 수 있다. 이어서, 식 XXIII의 화합물은 반응식 5에서 정의된 바와 같은 시약 XVIII로 처리되어 식 XXI의 화합물을 생성할 수 있다. Ar' 기가 선택적인 치환기(예를 들어, 케톤)을 함유할 경우, 이는, 예를 들어, 실온에서의 하이드록실아민 염화수소 및 피리딘을 사용하는 처리에 의해 추가적인 기능화를 거쳐 식 XXI의 추가 화합물을 생성한다.
반응식 7.
식 XXIV의 화합물(필요한 경우 당업자에게 공지된 추가적인 작용기 전환을 사용하여, 반응식 5의 XVI 및 II'로부터의 XVII의 제조와 유사한 방법으로 제조될 수 있음)은 환원성 아민화 반응(예를 들어, 나트륨 시아노보로히드라이드, 아세트산, 메탄올, 실온) 하에서 식 XXV의 화합물과 반응하여 식 XXVI의 화합물을 생성할 수 있다. 본원에서 Ar은 방향족 또는 헤테로방향족 고리 시스템을 나타내고; L 및 L'은 선택적인 연결기 또는 연결기의 부분을 나타내고, 는 선택적으로 4 내지 8-원 헤테로시클릭 고리로 고리화된 일차 또는 이차 아민을 나타내고, Y는 CH2 또는 C=O이다. 이어서, 식 XXVI의 화합물을 반응식 5에서 정의된 바와 같이 시약 XVIII로 처리되어 식 XXVII의 화합물을 생성한다. Ar'기가 선택적인 치환기(예를 들어, 케톤)을 함유할 경우, 이는, 예를 들어, 실온에서의 하이드록실아민 염화수소 및 피리딘을 사용하는 처리에 의해 추가적인 기능화를 거쳐 식 XVII의 추가 화합물을 생성한다.
반응식 8.
대안적으로, 식 XXII의 화합물은 예를 들어 반응식 7에서와 같은 환원성 아민화 조건 하에서 식 XXVIII의 화합물로 처리되어 식 XXVI'의 화합물을 생성할 수 있다. 여기서, Ar, L, L', , 및 Y는 반응식 7에서와 같이 정의된다. 이어서, 식 XXVI'의 화합물은 반응식 5에서 정의된 바와 같은 시약 XVIII로 처리되어 식 XXVII'의 화합물을 생성할 수 있다. Ar'기가 선택적인 치환기(예를 들어, 케톤)을 함유할 경우, 이는, 예를 들어, 실온에서의 하이드록실아민 염화수소 및 피리딘을 사용하는 처리에 의해 추가적인 기능화를 거쳐 식 XVII'의 추가 화합물을 생성한다.
반응식 9.
식 XIX의 화합물은 식 VII의 화합물과 반응하여 식 XXX의 화합물을 생성할 수 있다(여기서 X는 불소 또는 염소와 같은 적절한 이탈기이고, Y는 C=O이고, VII의 방향족 고리는 선택적인 치환기를 추가로 가질 수 있고, 반응 조건은 친핵성 방향족 치환(예를 들어, 디이소프로필에틸아민, NMP, 130℃, 마이크로웨이브 조사에 관계 없음)에 대한 것이다.
반응식 10.
대안적으로, 식 XIX의 화합물은 환원성 아민화 조건(예를 들어, 나트륨 트리아세톡시보로하드라이드, 에탄올, 디클로로메탄, 실온) 하에서 식 XXVIII의 화합물로 처리되어, 식 XXXI의 화합물을 생성할 수 있다.
반응식 11.
대안적으로, 식 XXXII의 화합물(알킬화 또는 환원성 아민화와 같은 당업자에게 공지된 단순한 변환을 통해 식 XIX의 화합물로부터 제조됨)은 아미드 형성 조건(예를 들어, (벤조트라이졸-1-일옥시)트리필롤리디노포스포늄 헥사플루오로포스페이트, 디이소프로필에틸아민, DMF, 실온) 하에서 식 XII의 화합물과 반응하여 식 XXXIII의 화합물을 생성할 수 있다.
반응식 12A.
식 XXXIV의 화합물은 친핵성 치환 조건(예를 들어 탄산 칼륨, 요오드화 칼륨, DMSO, 60℃) 하에서 시약 XXXV(구입할 수 있거나, 당업자에게 공지된 표준 반응기술을 사용하여 용이하게 제조될 수 있음)와 반응하여 식 XXXVI의 화합물을 생성할 수 있다. 대안적으로, 반응 조건은 미츠노부(Mitsunobu) 반응(예를 들어 트리페닐포스핀, 디에틸아조티카르복실레이트, THF)에 대한 것일 수 있다. 본원에서 Y는 CH2 또는 C=O이고; M 또는 M' 중 하나는 팔라듐-촉매된 트랜스메탈화를 겪을 수 있는 작용기, 예를 들어, 보론산, 보론 에스테르, 또는 트리알킬스탄난을 나타내고; M 또는 M' 중 다른 하나는 팔라듐-촉매 산화 부가를 겪을 수 있는 작용기, 예를 들어 요오드화물, 브롬화물, 염화물, 또는 트리플루오로메탄설포네이트를 나타내고; Ar은 방향족 또는 헤테로방향족 고리 시스템을 나타내고; L은 연결기를 나타낸다. 반응이 친핵성 치환 반응인 경우, X는 적합한 이탈기(예를 들어 p-톨루엔설포네이트, 메탄설포네이트, 요오드화물, 브롬화물 또는 염화물)을 대표하고; 상기 반응이 미츠노부 반응인 경우, X는 OH이다. 이어서, 식 XXXVI의 화합물은, 예를 들어, 비스(디-삼차-부틸(4-디메틸아미노페닐)포스핀)디클로로팔라듐(II)과 같은 적절한 팔라듐 촉매, 불화 세슘과 같은 적절한 염기, 1,4-디옥산 및 물의 혼합물과 같은 적절한 용매, 100℃와 같은 적절한 온도 하의 팔라듐 촉매화 교차 결합 조건 하에서 화합물 I과 반응으로 추가로 변환되어 마이크로웨이브 조사에 상관 없이 식 XXXVII의 화합물을 생성할 수 있다.
반응식 12B.
식 XXXIV의 화합물은 시약 XXXV(구입할 수 있거나, 당업자에게 공지된 표준 반응기술을 사용하여 용이하게 제조될 수 있음)와 반응하여 식 XXXVI의 화합물을 생성할 수 있다. 모든 경우에, M은 팔라듐-촉매된 트랜스메탈화를 겪을 수 있는 작용기, 예를 들어, 보론산, 보론 에스테르, 또는 트리알킬스탄난을 나타내고; 또는 대안적으로, M은 팔라듐-촉매 산화 부가를 겪을 수 있는 작용기, 예를 들어 요오드화물, 브롬화물, 염화물, 또는 트리플루오로메탄설포네이트를 나타내고; Ar은 방향족 또는 헤테로방향족 고리 시스템을 나타내고; L은 연결기를 나타내고; R은 하나 이상의 선택적 치환기를 나타내고; R' 및 R''는 둘 다 카르복시 에스테르, 예를 들어, CO2CH2CH3이고, R은 카르복실 에스테르, 예를 들어, CO2CH3이고, R'는 CN이고, R 및 R'는 함께 다음 중 하나를 형성한다:
, 여기서 Y는 CH2 또는 C=O이다.
일부 경우에, X는 4 내지 8원의 헤테로시클릭 고리로 선택적으로 고리화되는 일차 또는 이차 아민이고, Y는 불소 또는 염소와 같은 적절한 이탈기이며, 반응 조건은 친핵성 방향족 치환을 위한 것, 예를 들어 트리에틸아민, DMSO, 70℃이다. 이들 경우에, Z는 X로부터 유래된 상응하는 이차 또는 삼차 아민으로 된다.
다른 경우에, X는 적절한 이탈기, 예를 들어, p-톨루엔설포네이트, 메탄설포네이트, 요오드화물, 브롬화물, 또는 염화물이고, Y는 OH이며, 반응 조건은 친핵성 치환을 위한 것, 예를 들어, 탄산칼륨, 요오드화칼륨, DMSO, 60℃이다. 이러한 경우에, Z는 O이다.
대안적으로, 반응 조건은 미츠노부(Mitsunobu) 반응을 위한 것, 예를 들어 트리페닐포스핀, 디에틸아조티카르복실레이트, THF일 수 있다. 이러한 경우에, Z는 O이다.
식 XXXVI의 화합물은 식 XXXVI의 상이한 화합물로 추가로 전환될 수 있다. R'가 카르복실 에스테르이고 R''가 CN인 경우, CHO으로의 R''의 환원은 예를 들어, 피리딘, 아세트산, 및 물의 혼합물 중의 차아인산나트륨 및 라니(Raney) 니켈로 처리함으로써, 달성될 수 있다. R'와 R''가 함께 를 형성할 때, 예를 들어 알코올성 용매 및 테트라하이드로푸란 중 수산화나트륨과의 용매 용해로 화합물을 수득할 수 있으며, 여기서 R'는 카르복실 에스테르이고 R''는 CH2OH이다. 이 화합물은 예를 들어, 이산화망간으로 추가로 산화되어, 균등 화합물 XXXVI를 수득할 수 있으며, 여기서 R'는 카르복실 에스테르이고 R''는 CHO이다. 그런 다음, R'가 카르복실 에스테르이고 R''가 CHO인 이러한 화합물은, 예를 들어, 메탄올 및 디클로로메탄 중 나트륨 트리아세톡시보로하이드라이드, 디이소프로필에틸아민, 및 아세트산의 존재 시에 3-아미노글루타르이미드와 반응하여 식 XXXVI의 새로운 화합물을 수득할 수 있으며, 여기서 R' 및 R'는 함께 이고, Y는 CH2이다.
이어서, 식 XXXVI의 화합물은, 예를 들어, 비스(디-삼차-부틸(4-디메틸아미노페닐)포스핀)디클로로팔라듐(II)과 같은 적절한 팔라듐 촉매, 불화 세슘과 같은 적절한 염기, 1,4-디옥산 및 물의 혼합물과 같은 적절한 용매, 100℃와 같은 적절한 온도 하의 팔라듐 촉매화 교차 결합 조건 하에서 화합물 I과 반응으로 추가로 변환되어 마이크로웨이브 조사에 상관 없이 식 XXXVII의 화합물을 생성할 수 있다. 본원에서 M', Z, 및 Z'는 반응식 1B에 정의된 바와 같다.
Z 또는 Z' 중 하나 또는 둘 모두가 보호기인 경우, 이러한 보호기는 화합물 XXXVII로부터 제거될 수 있는데, 예를 들어, Z 및/또는 Z'가 t-부톡시카르보닐일 때 트리플루오로아세트산으로 처리하여, 식 XXXVII의 상이한 화합물을 수득할 수 있고, 여기서 Z 및 Z'는 H이다.
R' 및 R''가 둘 다 화합물 XXXVII 중 카르복실 에스테르인 경우, 예를 들어 메탄올 및 물 중 수산화나트륨으로 가수분해하여 상이한 화합물 XXXVII를 수득할 수 있고, 여기서 R' 및 R''는 CO2H이다. 그런 다음, 이러한 화합물을 예를 들어, N,N-디메틸포름아미드 중 3-아미노글루타르이미드, (벤조트리아졸-1-일옥시)트리스(디메틸아미노)포스포늄 헥사플루오로포스페이트, 및 디이소프로필아민과 반응시켜, 식 XXXVII의 새로운 화합물을 수득할 수 있으며, 여기서 R' 및 R'는 함께 이고, 여기서 Y는 C=O이다.
반응식 13A.
식 I의 화합물은 예를 들어, 1,4-디옥산/물 혼합물과 같은 적절한 용매 중 [1,1'-비스(디페닐포스피노)페로센]디클로로팔라듐(II), 탄산나트륨, 100℃와 같은 적절한 온도 하의 팔라듐 촉매화 교차 결합 조건 하에서 시약 XXXVIII(구입할 수 있거나, 당업자에게 공지된 표준 반응기술을 사용하여 용이하게 제조될 수 있음)과 반응하여 마이크로웨이브 조사에 상관 없이 식 XXXIX의 화합물을 생성할 수 있다. M 또는 M' 중 하나는 팔라듐-촉매된 트랜스메탈화를 겪을 수 있는 작용기, 예를 들어, 보론산, 보론 에스테르, 또는 트리알킬스탄난을 나타내고; M 또는 M' 중 다른 하나는 팔라듐-촉매 산화 부가를 겪을 수 있는 작용기, 예를 들어 요오드화물, 브롬화물, 염화물, 또는 트리플루오로메탄설포네이트를 나타내고; Ar은 방향족 또는 헤테로방향족 고리 시스템을 나타내고; L은 선택적인 연결기 또는 연결기의 부분을 나타내고, PG는 적절한 에스테르 보호기, 예를 들어 메틸, 에틸, 또는 t-부틸을 나타낸다. 식 XXXIX의 화합물은 PG 제거에 적합한 시약, 예를 들어 PG가 메틸 또는 에틸인 경우 40℃의 메탄올 및 물 중 염화수소로 처리함으로써 식 XL의 화합물로 전환될 수 있다. 이어서, 이어서, 화합물 XL은 화합물 XLI(여기서, Z는 H, 메틸, 또는 하이드록시메틸과 같은 선택적인 치환기임)와 아미드 생성 조건(예를 들어, N-[(디메틸아미노)-1H-1,2,3-트리아졸로-[4,5-b]피리딘-1-일메틸렌]-N-메틸메탄아미늄 헥사플루오로포스페이트 N-산화물, 디이소프로필에틸아민, DMF, 실온) 하에서 반응하여 식 XLII의 화합물을 생성할 수 있다.
반응식 13B.
식 I의 화합물은 예를 들어, 1,4-디옥산/물 혼합물과 같은 적절한 용매 중 [1,1'-비스(디페닐포스피노)페로센]디클로로팔라듐(II), 탄산나트륨, 100℃와 같은 적절한 온도 하의 팔라듐 촉매화 교차 결합 조건 하에서 시약 XXXVIII(구입할 수 있거나, 당업자에게 공지된 표준 반응기술을 사용하여 용이하게 제조될 수 있음)과 반응하여 마이크로웨이브 가열에 상관 없이 식 XXXIX의 화합물을 생성할 수 있다. M 또는 M' 중 하나는 팔라듐-촉매된 트랜스메탈화를 겪을 수 있는 작용기, 예를 들어, 보론산, 보론 에스테르, 또는 트리알킬스탄난을 나타내고; M 또는 M' 중 다른 하나는 팔라듐-촉매 산화 부가를 겪을 수 있는 작용기, 예를 들어 요오드화물, 브롬화물, 염화물, 또는 트리플루오로메탄설포네이트를 나타내고; Ar은 방향족 또는 헤테로방향족 고리 시스템을 나타내고; L은 선택적인 연결기 또는 연결기의 부분을 대표하고; PG는 적절한 에스테르 보호기, 예를 들어 메틸, 에틸, 또는 t-부틸을 나타내고; W는 선택적인 보호기, 예를 들어 2-(트리메틸실릴)에톡시메틸을 나타내고; 및 화합물 XXXVIII의 이소옥사졸 및 다음의 구조는 선택적 치환기를 가질 수 있다. 식 XXXIX의 화합물은 선택적 W의 제거에 적합한 시약, 예를 들어 W가 2-(트리메틸실릴)에톡시메틸인 경우 1,4-디옥산 및 메탄올 또는 에틸렌디아민 및 테트라-n-부틸암모늄 불화물 중 염화수소로 처리함으로써; 이어서 PG 제거에 적합한 시약, 예를 들어 PG가 메틸 또는 에틸인 경우 40 ℃에서 메탄올 및 물 중 수산화나트륨으로 처리함으로써, 식 XL의 화합물로 전환될 수 있다. 이어서, 이어서, 화합물 XL은 화합물 XLI(여기서, Z는 H, 메틸, 또는 하이드록시메틸과 같은 선택적인 치환기임)와 아미드 생성 조건(예를 들어, N-[(디메틸아미노)-1H-1,2,3-트리아졸로-[4,5-b]피리딘-1-일메틸렌]-N-메틸메탄아미늄 헥사플루오로포스페이트 N-산화물, 디이소프로필에틸아민, DMF, 실온) 하에서 반응하여 식 XLII의 화합물을 생성할 수 있다. 선택적으로, 당업자에게 명백한 바와 같이, 아미드 결합 및 팔라듐-촉매된 교차 결합 단계의 순서는 M, M' 및 PG의 적절한 조작을 통해 반응 시퀀스에서 거꾸로 될 수 있다.
반응식 14.
식 XLIII의 화합물은 친핵성 치환 조건(예를 들어 탄산 세슘, DMF, 75℃) 하에서 시약 XLIV(구입할 수 있거나, 당업자에게 공지된 표준 반응기술을 사용하여 용이하게 제조될 수 있음)와 반응하여 식 XLV의 화합물을 생성할 수 있다. Ar은 방향족 또는 헤테로방향족 고리 시스템을 나타내고; X는 적절한 이탈기, 예를 들어 p-톨루엔설포네이트, 메탄설포네이트, 요오드화물, 브롬화물 또는 염화물을 나타내고; L은 선택적인 연결기를 나타내고; PG는 적절한 에스테르 보호기, 예를 들어 메틸, 에틸, 또는 t-부틸을 나타낸다. 식 XLV의 화합물은 PG 제거에 적합한 시약, 예를 들어 PG가 t-부틸인 경우 실온에서의 1,4-디옥산 중 3 N 염산으로 처리함으로써 식 XLVI의 화합물로 전환될 수 있다. 이어서, 화합물 XLVI는 아미드 형성 조건(예를 들어, (벤조트리아졸-1-일옥시)트리피롤로디노포스포늄 헥사플루오로포스페이트, 디이소프로필에틸아민, DMF, 실온) 하에서 반응식 3A 또는 3B에 정의된 화합물 XII와 반응하여 식 XLVII의 화합물을 생성할 수 있다. 이어서, 식 XLVII의 화합물은 반응식 5에서 정의된 바와 같은 시약 XVIII로 처리되어 식 XLVIII의 화합물을 생성할 수 있다. Ar'기가 선택적인 치환기(예를 들어, 케톤)을 함유할 경우, 이는, 예를 들어, 실온에서의 하이드록실아민 염화수소 및 피리딘을 사용하는 처리에 의해 추가적인 기능화를 거쳐 식 XLVIII의 추가 화합물을 생성한다.
중간체 1: (3R)-N-[3-([5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일]카르보닐)-2,4-디플루오로페닐]-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드
단계 A:
2,6-디플루오로-3-니트로벤조일 염화물.
150 mL 둥근바닥 플라스크에 2,6-디플루오로-3-니트로벤조산(15.0 g, 73.8 mmol, 1.0당량), 톨루엔 (80 mL), 염화 티오닐(80 mL)을 넣었다. 생성된 혼합물을 80℃에서 밤새 교반하고 감압 하에서 농축시켰다. 이를 통해 14.1 g(86%)의 2,6-디플루오로-3-니트로벤조일 염화물을 갈색 오일로서 수득하였다.
단계 B: 5-브로모-3-[(2,6-디플루오로-3-니트로페닐)카르보닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘.
5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘(11.0 g, 55.8 mmol, 1.1당량)을 200 mL의 클로로메탄과 혼합하고 알루미늄 트리클로라이드(42.0 g, 318.2 mmol, 6.4당량)를 나누어서 첨가하였다. 반응물을 실온에서 1시간 동안 교반하고, 2,6-디플루오로-3-니트로벤조일 염화물(11.0 g, 49.6 mmol, 1.0당량)을 첨가하였다. 반응물을 50℃에서 밤새 가열한 후, 반응 혼합물을 실온으로 냉각시키고 얼음물(500 mL)에 붓고, 에틸 아세테이트(500 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(500 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시켰다. 용매를 농축시켜 (5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)(2,6-디플루오로-3-니트로페닐) 메타논(12.2g)을 황색 고체로서 수득하였고, 이는 추가 정제 없이 다음 단계에 직접 사용되었다. LCMS (ES+): m/z 381.30 [M+H] +.
단계 C: 3-([5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일]카르보닐)-2,4-디플루오로아닐린.
에탄올(40 mL) 및 테트라하이드로푸란(40 mL) 중 (5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)(2,6-디플루오로-3-니트로페닐)메타논(7.8 g, 20.4 mmol, 1.0당량), 철(5.6 g, 100.2 mmol, 4.9당량), 염화 암모늄(3.6 g, 68 mmol), 염산(25.0 mL)의 혼합물을 밤새 환류시켰다. 실온으로 냉각시킨 후, 혼합물을 셀라이트 패드를 통해 여과하였다. 여과물을 진공 중에서 농축시키고, 잔류물을 실리카 겔 상 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르/틸 아세테이트 = 1/2)로 정제하여 (3-아미노-2,6-디플루오로페닐)(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)메타논(4.3 g, 60% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 351.80 [M+H] +.
단계 D: (R)-3-플루오로피롤리딘-1-설포닐 염화물.
오븐 건조된 플라스크를 (R)-3-플루오로피롤리딘 염화수소(3.0 g, 24 mmol) 트리에틸아민(7.2 g, 72 mmol) 및 디클로로메탄(150 mL)으로 채웠다. 혼합물을 실온에서 15분 동안 교반한 후, 약 -30 ℃에서 드라이아이스/아세토니트릴 조에서 10분 동안 냉각시켰다. 술푸릴 염화물(6.0 g, 48 mmol)를 10분에 걸쳐 적가하였다. 반응 혼합물을 약 -30℃에서 1시간 동안 교반하고, 이어서 실온에서 5시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 수용성 HCl(1 N, 70 mL)로 희석시켰다. 층을 분리시키고 수성층을 디클로로메탄(50 mL x 3)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 수용성 HCl(1 N, 50 mL) 및 염수(50 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시켰다. 용매를 농축시켜 (R)-3-플루오로피롤리딘-1-설포닐 염화물(4.5g)을 백색 고체로서 수득하였고, 이는 추가 정제 없이 다음 단계에 직접 사용되었다.
단계 E: (3R)-N-[3-([5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일]카르보닐)-2,4-디플루오로페닐]-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드.
피리딘(25.0 g) 중 (3-아미노-2,6-디플루오로페닐)(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)메타논(8.0 g, 22.79 mmol, 1.0당량) 용액에 (R)-3-플루오로피롤리딘-1-설포닐 염화물(4.6 g, 24.60 mmol, 1.08 eq ) 및 4-디메틸아미노피리딘(560.0 mg, 4.59 mmol, 0.2당량)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 40℃에서 12시간 동안 교반하였다. 용매를 제거하고 물(20 mL)을 첨가한 후, 수용성 중탄산 나트륨으로 pH를 7 내지 8로 조절하고, 에틸 아세테이트(100 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(50 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시켰다. 용매를 진공 중에서 제거하고 잔류물을 실리카 겔 상 컬럼 크로마토그래피(에틸 아세테이트/석유 에테르(3:1))로 정제하여 (R)-N-(3-(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드(6.4 g)를 황색 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 505.05 [M+H]+.
중간체 2: (R)-N-(2,4-디플루오로-3-(5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드
단계 A: (R)-N-(2,4-디플루오로-3-(5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드
1,4-디옥산 중 (R)-N-(3-(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드(1.0 g, 2.0 mmol) 용액에 KOAc(392.0 mg, 4.0 mmol), Pd(dppf)Cl2(163.0 mg, 0.2 mmol)를 첨가하고, 이어서 4,4,4',4',5,5,5',5'-옥타메틸-2,2'-비(1,3,2-디옥사보로란)(1.02 g, 4.0 mmol)를 첨가하였다. 생성된 용액을 N2 하에서 90℃로 밤새 가열하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 용매를 감압 하에서 제거하였다. 잔류물을 실리카 겔 상 컬럼 크로마토그래피(에틸 아세테이트:석유 에테르(1:1)로 용리됨)로 정제하였다. 이를 통해 551.0 mg(50%)의 (R)-N-(2,4-디플루오로-3-(5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드를 연갈색 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 551.15 [M+H]+.
중간체 3: N-(3-[5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로페닐)-2-(디메틸아미노)에탄-1-설폰아미드
단계 A: N-(3-[5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로페닐)에텐-1-설폰아미드
100 mL 둥근바닥 플라스크에 3-[5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로아닐린(500 mg, 1.42 mmol, 1당량), 피리딘(20 mL, 248.47 mmol, 174.99당량), DMAP(35 mg, 0.29 mmol, 0.20당량), 염화 에텐설포닐(360 mg, 2.84 mmol, 2.00당량), 디클로로메탄(20 mL)을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 0.5시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:1)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 300 mg(48%)의 N-(3-[5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로페닐)에텐-1-설폰아미드를 백색 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 443.80[M+H]+.
단계 B: N-(3-[5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로페닐)-2-(디메틸아미노)에탄-1-설폰아미드
100 mL 둥근바닥 플라스크에 N-(3-[5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로페닐)에텐-1-설폰아미드(300 mg, 0.68 mmol, 1당량), 디클로로메탄(20 mL), 디메틸아민(2.0 mL)을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 이를 통해 360 mg(미정제)의 N-(3-[5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로페닐)-2-(디메틸아미노)에탄-1-설폰아미드를 백색 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 488.85 [M+H]+.
중간체 4: N-(3-[5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로페닐)-2,3-디하이드록시프로판-1-설폰아미드
단계 A: N-(3-[5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로페닐)프롭-2-엔-1-설폰아미드
25 mL 둥근바닥 플라스크에 3-[5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로아닐린(500 mg, 1.42 mmol, 1당량), 피리딘(2 mL, 15당량), 프롭-2-에네-1-설포닐 염화물(399.2 mg, 2,84 mmol, 2당량), DMAP(52.0 mg, 0.43 mmol, 0.3당량)를 넣었다. 생성된 용액을 오일조에서 45℃에서 밤새 동안 교반하였다. 생성된 혼합물을 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1/1)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 480 mg(74%)의 N-(3-[5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로페닐)프롭-2-에네-1-설폰아미드를 황색 고체로서 수득하였다.
단계 B: N-(3-[5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로페닐)-2,3-디하이드록시프로판-1-설폰아미드
50 mL 둥근바닥 플라스크에 N-(3-[5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로페닐)프롭-2-에네-1-설폰아미드(430 mg, 0.94 mmol, 1당량), 아세톤(20 mL), N-메틸모르폴린 N-산화물(226 mg), 물(5 mL), 테트라옥소오스뮴(4 mL)을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 밤새 교반하였다. 이어서 반응물을 물(20 mL)의 첨가로 급냉시켰다. 생성된 용액을 에틸 아세테이트(30 mL x 3)로 추출하였다. 생성된 혼합물을 염수(20 mL x 1)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 감압 하에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1/1)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 377 mg(82%)의 N-(3-[5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로페닐)-2,3-디하이드록시프로판-1-설폰아미드를 백색 고체로서 수득하였다.
중간체 5: (R)-N-(3-(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-카르복사미드
디클로로메탄(80 mL) 중 (3-아미노-2,6-디플루오로페닐)(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)메타논(2.0 g, 5.70 mmol, 1.00당량), 트리에틸아민(8.6 g, 85.5 mmol, 15.00당량) 용액에 디클로로메탄(40 mL) 중 비스(트리클로로메틸) 카보네이트(2.5 g, 8.55 mmol, 1.50당량) 용액을 서서히 첨가하고, 이어서 디클로로메탄(40 mL) 중 (R)-3-플루오로피롤리딘(761.0 mg, 8.55 mmol, 1.50당량) 용액을 0 ℃에서 적가하였다. 생성된 용액을 0℃의 물/얼음에서 30분 동안 교반하였다. 생성된 용액을 염화 암모늄(40 mL)의 수용액으로 급냉시키고, 디클로로메탄(40 mL x 2)으로 추출하였다. 이어서 유기층을 합치고 농축시켰다. 잔류물을 클로로포름/메탄올(10:1)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 541.0 mg(20%)의 (R)-N-(3-(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-카르복사미드를 황갈색 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 467.10 [M+H]+.
반응식 15.
식 XLIX의 화합물(당업자에게 공지된 표준 반응 기술을 사용하여 쉽게 제조됨)을 식의 화합물과 반응시킬 수 있다.
식 XLIX의 화합물을 친핵성 치환 조건, 예를 들어, 디이소프로필에틸아민, 요오드화칼륨, 아세토니트릴, 100℃ 하에서 시약 XLIV와 반응시켜, 식 L의 화합물을 생산할 수 있다. L'는 선택적인 연결기 또는 연결기의 부분을 나타내고; Nu-H는 알코올 또는 이차 아민과 같은 적절한 친핵체를 나타내고; X는 적절한 이탈기, 예를 들어 p-톨루엔설포네이트, 메탄설포네이트, 요오드화물, 브롬화물 또는 염화물을 나타내고; L은 선택적인 연결기를 나타내고; PG는 적절한 에스테르 보호기, 예를 들어 메틸, 에틸, 또는 t-부틸을 나타낸다. 식 L의 화합물은 PG 제거에 적합한 시약, 예를 들어 PG가 t-부틸인 경우 트리플루오로아세트산, 디클로로메탄, 30 ℃으로 처리함으로써 식 LI의 화합물로 전환될 수 있다. 그런 다음, 화합물 LI를 반응식 3A 또는 3B에 정의된 화합물 XII와 반응시켜 아미드 형성 조건, 예를 들어 1-에틸-3-(3-디메틸아미노프로필)카르보디이미드, 1-하이드록시벤조트리아졸, 트리에틸아민, DMF, 30℃에서 식 LII의 화합물을 생산할 수 있다.
반응식 16.
이어서, 반응식 15에 정의된 식 XLIX의 화합물을 화합물 V와 반응시켜 화합물 LIII를 생성할 수 있고, 여기서 L은 선택적인 연결기 또는 연결기의 부분을 나타내고, Y는 CH2 또는 C=O이고, X는 적절한 이탈기(예를 들어, OMs, OTs, Cl 등) 또는 알데히드(CHO)이고; R은 선택적 치환기(예를 들어, F 또는 OCH3)이고; W는:
Y가 C=O인 경우, ; 또는
Y가 CH2인 경우, 이다.
X가 이탈기일 경우, n은 0이고, Nu-H는 일차 또는 이차 아민 또는 알코올이고, 적절한 반응 조건은 알킬화 반응을 위한 것, 예를 들어 탄산칼륨, DMF, 70℃이다. X가 알데히드인 경우, n은 1이고, Nu-H는 일차 또는 이차 아민이고, 적절한 반응 조건은 환원성 아미노화 반응을 위한 것, 예를 들어 나트륨 시아노보로히드라이드, 메탄올, 디클로로메탄, 아세트산, 실온이다. Nu 및 (CH2)n의 위치가 화합물 LIII에서 거꾸로 되도록, XLIX에서의 Nu-H의 위치와 V'에서의 X의 위치가 또한 거꾸로 될 수 있음이 당업자에게 명백할 것이다. W가 개방 사슬 형태인 식 LIII의 화합물은 적정 조건, 예를 들어, 벤젠설폰산, 아세토니트릴, 100℃ 하에서 고리화에 의해 W가 글루타르이미드인 식 LIII의 또 다른 화합물로 추가로 전환될 수 있다.
반응식 17.
식 LIV의 화합물(반응식 1A 또는 1B에서 화합물 III의 합성과 유사하게, 당업자에게 공지된 표준 조건을 사용하여 제조됨)을 환원성 아미노화 조건, 예를 들어, 나트륨 트리아세톡시보로하이드라이드, 트리에틸아민, 디클로로에탄, 30 ℃ 하에 식 LV의 화합물(반응식 2에서 화합물 XV의 합성과 유사하게, 당업자에게 공지된 표준 조건을 사용하여 제조됨)과 반응시켜, LVI의 화합물을 생산할 수 있다. 여기에서, Ar은 방향족 또는 헤테로방향족 고리 시스템이고; L 및 L'는 선택적인 연결기 또는 연결기의 부분이고; X는 H 또는 선택적 치환기이며, 이는 선택적으로 L로 고리화되어 고리를 형성할 수 있고; 은 선택적으로 4 내지 8원 헤테로시클릭 고리로 고리화되는, 일차 또는 이차 아민을 나타내고; 및 R, Z, 및 Y는 반응식 3B에서 화합물 XII에 대해 정의된 바와 같다. CHX 및 의 위치가 화합물 LVI에서 거꾸로 되도록 LIV에서 C(O)X 및 LV에서 의 위치가 거꾸로 될 수 있고, X가 선택적으로 L'로 고리화되어 고리를 형성할 수 있음이 당업자에게 명백할 것이다.
반응식 18.
식 LIV의 화합물(반응식 1A 또는 1B에서 화합물 III의 합성과 유사하게, 당업자에게 공지된 표준 조건을 사용하여 제조됨)을 환원성 아미노화 조건, 예를 들어, 나트륨 트리아세톡시보로하이드라이드, 아세트산, 디클로로메탄, 메탄올, 30℃ 하에 식 LVII의 화합물(당업자에게 공지된 표준 조건을 사용하여 제조됨)과 반응시켜, LVIII의 화합물을 생산할 수 있다. 여기에서, Ar은 방향족 또는 헤테로방향족 고리 시스템이고; L 및 L'는 선택적인 연결기 또는 연결기의 부분이고; X는 H 또는 선택적 치환기이며, 이는 선택적으로 L로 고리화되어 고리를 형성할 수 있고; 은 선택적으로 4 내지 8원 헤테로시클릭 고리로 고리화되는, 일차 또는 이차 아민을 나타내고; R, Z, 및 Y는 반응식 3B에서 화합물 XII에 대해 정의된 바와 같고; 화합물 LVII의 이속사졸 및 다음의 구조는 선택적 치환기를 가질 수 있다. CHX 및 의 위치가 화합물 LVIII에서 거꾸로 되도록 LIV에서 C(O)X 및 LVII에서 의 위치가 거꾸로 될 수 있고, X가 선택적으로 L'로 고리화되어 고리를 형성할 수 있음이 당업자에게 명백할 것이다.
화합물 86의 예시적인 합성
단계 A: (R)-삼차-부틸 4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-카르복실레이트.
1,4-디옥산/H2O (20 mL/2 mL) 중 (R)-N-(3-(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드(0.50 g, 1.0 mmol) 용액에 삼차-부틸 4-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)피페라진-1-카르복실레이트(0.43 g, 1.2 mmol), 불화 세슘(0.23 g, 1.5 mmol) 및 Pd(aMPhos)Cl2(0.11 g, 0.15 mmol)를 아르곤 분위기 하에서 첨가하였다. 혼합물을 100℃에서 3시간 동안 교반하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 물을 첨가하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(20 mL x 3)으로 추출하고, 합쳐진 유기상을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 진공 중에서 농축시켰다. 미정제 생성물을 실리카 겔(디클로로메탄/메탄올 = 12:1)로 정제하여 화합물 (R)-삼차-부틸 4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-카르복실레이트(0.39 g, 57%)를 황색 고체로서 수득하였다. LCMS: m/z 685.2 [M+H]+; 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 1.43 (9H, s), 2.06-2.12 (1H, m), 3.18-3.20 (4H, m), 3.26-3.30 (1H, m), 3.37-3.53 (8H, m), 5.30 (1H, d, J = 52.0 Hz), 7.10 (2H, d, J = 8.8 Hz), 7.28 (1H, t, J = 8.4 Hz), 7.60-7.64 (3H, m)， 8.09 (1H, d, J ＝2.8 Hz), 8.55 (1H, brs.), 8.66 (1H, d, J = 2.4 Hz), 9.87 (1H, s), 12.93 (1H, s).
단계 B: (R)-N-(2,4-디플루오로-3-(5-(4-(피페라진-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드.
염산/1,4-디옥산(5 mL, 4.0 N) 중 (R)-삼차-부틸 4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-카르복실레이트(0.39 g, 0.57 mmol) 용액을 실온에서 3시간 동안 교반하였다. 이어서, 용매를 직접 제거하고, 물(10 mL)을 첨가하고, 포화 중탄산 나트륨으로 혼합물의 pH를 8 내지 9로 조정하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(10 mL x 3)로 추출하고, 합쳐진 유기상을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 진공 중에서 농축시켜 (R)-N-(2,4-디플루오로-3-(5-(4-(피페라진-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드(0.30 g, 91%)를 황색 고체로서 수득하였다.
단계 C: 2-(2-클로로에톡시)에틸 4-메틸벤젠설포네이트.
디클로로메탄(10 mL) 중 2-(2-클로로에톡시)에탄올(0.5 g, 4.0 mmol), 염화 토실(0.8 g, 4.0 mmol) 및 트리에틸아민(810 mg, 8.1 mmol)의 혼합물을 실온에서 밤새 교반하였다. 반응물을 포화 중탄산 나트륨 용액(20 mL)에 붓고 디클로로메탄(20 mL Х 3)으로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 진공 중에 농축시키고, 잔류물을 실리카 겔 상 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르/에틸 아세테이트 = 10/1)로 정제하여 2-(2-클로로에톡시)에틸 4-메틸벤젠설포네이트(0.9 g, 80% 수율)을 무색 오일로서 수득하였다. LCMS: m/z 279.1 [M+H]+.
단계 D: 5-(2-(2-클로로에톡시)에톡시)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)이소인돌린-1,3-디온.
디메틸 설폭시드(5 mL) 중 2-(2-클로로에톡시)에틸 4-메틸벤젠설포네이트(100 mg, 0.36 mmol), 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-하이드록시이소인돌린-1,3-디온(98 mg, 0.36 mmol), 에틸디이소프로필아민(93 mg, 0.72 mmol), 및 요오드화 칼륨(59 mg, 0.36 mmol)의 혼합물을 45℃에서 2시간 동안 가열한 후 실온으로 냉각시켰다. 반응 혼합물을 물(10 mL)에 붓고 디클로로메탄(15 mL x 3)으로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 진공 중에서 농축시키고, 잔류물을 실리카 겔 상 컬럼 크로마토그래피(디클로로메탄/메탄올 = 20/1)로 정제하여 5-(2-(2-클로로에톡시)에톡시)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)이소인돌린-1,3-디온(48 mg, 35% 수율)을 백색 고체로서 수득하였다. LCMS: m/z 381.2 [M+H]+.
단계 E: (3R)-N-(3-(5-(4-(4-(2-(2-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1,3-디옥소이소인돌린-5-일옥시)에톡시)에틸)피페라진-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드.
디메틸 설폭시드(5 mL) 중 5-(2-(2-클로로에톡시)에톡시)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)이소인돌린-1,3-디온(40 mg, 0.11 mmol), (R)-N-(2,4-디플루오로-3-(5-(4-(피페라진-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드(61 mg, 0.11 mmol), 에틸디이소프로핀아민(28 mg, 0.22 mmol) 및 요오드화 칼륨(18 mg, 0.11 mmol)의 혼합물을 80℃에서 밤새 가열하였다. 혼합물을 물(10 mL)에 붓고 디클로로메탄(10 mL x 3)으로 추출하였다. 유기상을 진공 중에서 농축시키고 잔류물을 분취-HPLC로 정제하여 (3R)-N-(3-(5-(4-(4-(2-(2-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1,3-디옥소이소인돌린-5-일옥시)에톡시)에틸)피페라진-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드(31 mg, 30% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다. LCMS: m/z 929.3 [M+H]+; 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 1.95-2.10 (3H, m), 2.53-2.59 (8H, m), 3.18-3.23 (4H, m), 3.24-3.31 (2H, m), 3.36-3.39 (2H, m), 3.47 (1H, s), 3.64 (2H, t, J = 6.0 Hz)， 3.80 (2H, t, J ＝4.0 Hz), 4.35 (2H, t, J = 4.0 Hz), 5.12 (1H, dd, J = 5.6, 9.6 Hz), 5.29 (1H, d, J = 12.8 Hz), 7.05 (2H, d, J = 8.8 Hz), 7.26 (1H, d, J = 8.8 Hz), 7.39 (1H, dd, J = 2.0, 8.4 Hz), 7.48 (1H, d, J = 2.4 Hz), 7.58-7.65 (3H, m), 7.85 (1H, d, J = 8.4 Hz), 8.07 (1H, s), 8.53 (1H, d, J = 2.4 Hz), 8.65 (1H, d, J = 2.4 Hz), 9.85 (1H, brs), 11.1 (1H, s), 12.9 (1H, s).
화합물 87 내지 화합물 90은 유사한 방식으로 제조될 수 있다.
화합물 91의 예시적인 합성
단계 A: 2-(2-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페녹시)에톡시)에탄올.
N,N-디메틸포름아미드(15.0 mL) 중 2-(2-클로로에톡시)에탄올(2.0 g, 16.1 mmol) 용액에 4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페놀(3.54 g, 16.1 mmol), 탄산 세슘(10.5 g, 32.2 mmol) 및 요오드화 칼륨(267 mg, 1.61 mmol)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 60℃에서 밤새 교반하였다. 이어서 물(50 mL)을 첨가하고 에틸 아세테이트(50 mL x 3)로 추출하고, 염수(5 mL x 4)로 세척하였다. 합쳐진 유기상을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔(석유 에테르/에틸 아세테이트 = 2:1)로 2-(2-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페녹시)에톡시에탄올(2.1 g, 42%)을 황색 오일로서 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 1.28 (12H, s), 3.49-3.52 (4H, m), 3.74 (2H, t, J = 4.8 Hz), 4.10-4.12 (2H, m), 4.62-4.64 (1H, m), 6.93 (2H, d, J = 9.2 Hz), 7.60 (2H, d, J = 8.4 Hz).
단계 B: 2-(2-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페녹시)에톡시)에틸 메탄설포네이트.
디클로로메탄(15.0 mL) 중 2-(2-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페녹시)에톡시)에탄올(350 mg, 1.14 mmol) 용액에 트리에틸아민(231 mg, 2.28 mmol) 및 염화 메탄설포닐(157 mg, 1.37 mmol)을 질소 하에서 첨가하였다. 생성된 반응 혼합물을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 이어서, 수성 중탄산 나트륨(20.0 mL)을 첨가하고 디클로로메탄(20 mL x 3)으로 추출하고, 염수로 세척하고, 건조시키고 진공 중에서 농축시켜 미정제 2-(2-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페녹시)에톡시)에틸 메탄설포네이트를 황색 오일로서 수득하였고, 이는 추가 정제 없이 다음 단계에서 사용되었다. LCMS: m/z 404.2 [M+18]+.
단계 C: 삼차-부틸 4-(2-(2-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페녹시)에톡시)에틸)피페라진-1-카르복실레이트.
아세토니트릴(20 mL) 중 2-(2-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페녹시)에톡시)에틸 메탄설포네이트(1.14 mmol) 용액에, 탄산 칼륨(315 mg, 2.28 mmol) 및 삼차-부틸 피페라진-1-카르복실레이트(234 mg, 1.25 mmol)를 첨가하였다. 생성된 반응 혼합물을 80℃에서 밤새 교반하였다. 용매를 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트(20 mL x 3) 및 물(20 mL)로 추출하였다. 유기상을 건조시키고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 분취 TLC(석유 에테르/에틸 아세테이트 = 1:2)로 정제하여 삼차-부틸 4-(2-(2-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페녹시)에톡시)에틸)피페라진-1-카르복실레이트(280 mg, 2단계에 대해 52%)를 담황색 고체로서 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 1.27 (12H, s), 1.38 (9H, s), 2.35 (4H, t, J = 5.2 Hz), 2.47-2.50 (2H, m), 3.25-3.26 (4H, m), 3.57 (2H, t, J = 6.0 Hz), 3.70-3.73 (2H, m), 4.10-4.12 (2H, m), 6.92 (2H, d, J = 8.8 Hz), 7.59 (2H, d, J = 8.4 Hz).
단계 D: (R)-삼차-부틸 4-(2-(2-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)에톡시)에틸)피페라진-1-카르복실레이트.
1,4-디옥산/물(10 mL/1 mL) 중 삼차-부틸 4-(2-(2-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페녹시)에톡시)에틸)피페라진-1-카르복실레이트(114 mg, 0.238 mmol) 용액에 (R)-N-(3-(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드(120 mg, 0.238 mmol), 불화 세슘(72.4 mg, 0.476 mmol) 및 Pd(aMPhos)Cl2(16.9 mg, 0.0238 mmol)을 첨가하였다. 생성된 반응 혼합물을 95℃에서 16시간 동안 교반하였다. 냉각시킨 후, 물(20 mL)을 첨가하고 에틸 아세테이트 (15 mL x 3)로 추출하였다. 유기상을 건조시키고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 분취 TLC(디클로로메탄/메탄올=20:1)로 정제하여 (R)-삼차-부틸 4-(2-(2-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)에톡시)에틸)피페라진-1-카르복실레이트(60 mg, 33%)를 담황색 고체로서 수득하였다. LCMS: m/z 773.3 [M+H]+.
단계 E: (R)-N-(2,4-디플루오로-3-(5-(4-(2-(2-(피페라진-1-일)에톡시)에톡시)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 염화수소
염산/1,4-디옥산(5 mL, 4 M) 중 (R)-삼차-부틸 4-(2-(2-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)에톡시)에틸)피페라진-1-카르복실레이트(60 mg, 0.0517 mmol) 용액을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 용매를 진공 중에서 농축시켜 (R)-N-(2,4-디플루오로-3-(5-(4-(2-(2-(피페라진-1-일)에톡시)에톡시)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 염화수소를 담황색 고체로서 수득하였고, 이는 추가 정제 없이 다음 단계에서 사용되었다. LCMS: m/z 673.2 [M+H]+.
단계 F: (3R)-N-(3-(5-(4-(2-(2-(4-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1,3-디옥소이소인돌린-5-일)피페라진-1-일)에톡시)에톡시)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드
디메틸 설폭시드(3 mL) 중 (R)-N-(2,4-디플루오로-3-(5-(4-(2-(2-(피페라진-1-일)에톡시)에톡시)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 염화수소(0.0517 mmol) 용액에 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-플루오로이소인돌린-1,3-디온(14.3 mg, 0.0517 mmol) 및 트리에틸아민(10.5 mg, 0.104 mmol)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 70℃에서 24간 동안 교반하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 물(10 mL)을 첨가하고 에틸 아세테이트 (10.0 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수로 세척하고(2.0 mL Х 4), 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 분취 TLC(디클로로메탄/메탄올=20:1)로 2회 정제하여 (3R)-N-(3-(5-(4-(2-(2-(4-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1,3-디옥소이소인돌린-5-일)피페라진-1-일)에톡시)에톡시)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드(6.7 mg, 14%)를 황색 고체로서 수득하였다. LCMS: m/z 929.3 [M+H]+. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 1.96-2.13 (3H, m), 2.58 (7H, s), 2.83-2.92 (1H, m), 3.26-3.30 (2H, m), 3.40-3.43 (6H, m), 3.48 (1H, s), 3.63-3.67 (2H, m), 3.76-3.80 (2H, m), 4.17-4.19 (2H, m), 5.05-5.09 (1H, m), 5.23-5.36 (1H, m), 7.11 (2H, d, J = 8.4 Hz), 7.24-7.29 (2H, m), 7.34 (1H, s), 7.60-7.69 (4H, m), 8.10 (1H, s), 8.57 (1H, brs), 8.66 (1H, d, J = 2.4 Hz), 9.88 (1H, s), 11.09 (1H, s), 12.95 (1H, s).
화합물 92 내지 화합물 97은 유사한 방식으로 제조될 수 있다.
화합물 99의 예시적인 합성
단계 A: 삼차-부틸 4-(4-브로모페닐)피페라진-1-카르복실레이트
톨루엔(100 mL) 중 1,4-디브로모벤젠(5.0 g, 21.2 mmol) 용액에 삼차-부틸 피페라진-1-카르복실레이트(3.04 g, 16.3 mmol), Pd2 (dba)3(485 mg, 0.53 mmol), t-BuOK(5.95 g, 53 mmol) 및 BINAP(485 mg, 0.53 mmol)을 첨가하였다. 생성된 용액을 N2 하 90℃에서 3시간 동안 교반하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 반응물을 H2O(50 mL)로 급냉시키고, 혼합물을 EA로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔로 정제하여 목적하는 생성물(1.2 g, 17% 수율)을 백색 고체로서 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 7.35 (d, J = 8.8 Hz, 2H), 6.78 (d, J = 9.2 Hz, 2H), 3.57 (t, J = 4.8 Hz, 4H), 3.09 (t, J = 4.8 Hz, 4H), 1.48 (s, 9H).
단계 B: 삼차-부틸 4-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)피페라진-1-카르복실레이트
1,4-디옥산(24 mL) 중 삼차-부틸 4-(4-브로모페닐)피페라진-1-카르복실레이트(1.2 g, 3.53 mmol) 용액에 4,4,4',4',5,5,5',5'-옥타메틸-2,2'-비(1,3,2-디옥사보로란)(1.8 g, 7.06 mmol), Pd(dppf)Cl2(258 mg, 0.35 mmol) 및 KOAc(1.04 g, 10.59 mmol)를 첨가하였다. 생성된 용액을 N2분위기 하 90℃에서 밤새 교반하였다. TLC가 반응이 완료되었음을 나타내었다. 실온으로 냉각시킨 후, 반응물을 EA(50 mL)로 희석하고, 혼합물을 물 및 염수로 세척하였다. 유기상을 무수 황산나트륨 상에서 건조시켰다. 잔류물을 크로마토그래피 컬럼으로 정제하여 목적하는 생성물(1.0 g, 73% 수율)을 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 482.0.
단계 C: 삼차-부틸 2-(2-(4-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)피페라진-1-일)에톡시)아세테이트
DCM(5 mL) 중 삼차-부틸 4-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)피페라진-1-카르복실레이트(550 mg, 1.42 mmol) 용액에 TFA(1.5 mL, 20.2 mmol)를 첨가하였다. 생성된 용액을 5℃에서 2시간 동안 교반하였다. 용매를 진공 중에서 제거하여 잔류물(547 mg, 계산치)을 수득하였고, 이는 다음 단계에서 직접 사용되었다. 건식 DMF(5 mL) 중 전술한 잔류물(547 mg, 1.42 mmol) 용액에 K2CO3(977 mg, 7.08 mmol), KI(470 mg, 2.83 mmol) 및 삼차-부틸 2-(2-클로로에톡시)아세테이트(550 mg, 2.83 mmol)를 첨가하였다. 생성된 용액을 90℃에서 3시간 동안 교반하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 반응물을 20 mL의 포화 NaCl 용액으로 급냉시키고, 혼합물을 EA로 2회 추출하였다. 합쳐진 유기층을 진공 중에서 농축시키고, 잔류물을 실리카 겔로 정제하여 목적하는 생성물(300 mg, 2단계에서 47% 수율)을 오일로서 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 7.70 (d, J = 8.4 Hz, 2H), 6.88 (d, J = 8.8 Hz, 2H), 4.01 (m, 3H), 3.69 (m, 4H), 3.30 (m, 4H), 2.68 (m, 6H), 1.48 (s, 9H), 1.32 (s, 12H).
단계 D: (R)-삼차-부틸 2-(2-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)에톡시)아세테이트
1,4-디옥산/H2O(10 ml/1 mL) 중 삼차-부틸 2-(2-(4-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)피페라진-1-일)에톡시)아세테이트(100 mg, 0.20 mmol) 용액에 (3R)-N-[3-([5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일]카르보닐)-2,4-디플루오로페닐]-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드(134 mg, 0.36 mmol), Pd(aMphos)Cl2(15 mg, 0.02 mmol) 및 CsF(121 mg, 0.80 mmol)를 첨가하였다. 생성된 용액을 N2 분위기 하 95℃에서 3시간 동안 교반하였다. TLC가 반응이 완료되었음을 나타내었다. 실온으로 냉각시킨 후, 반응물을 EA(50 mL)로 희석하고, 혼합물을 물 및 염수로 세척하였다. 유기상을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 크로마토그래피 컬럼으로 정제하여 목적하는 생성물(100 mg, 66% 수율)을 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 743.2 [M+H-16]+.
단계 E: (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(2-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-((R)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)에톡시)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드
1,4-디옥산(2 mL) 중 (R)-삼차-부틸 2-(2-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)에톡시)아세테이트 화합물과 메탄올(100 mg, 0.13 mmol)의 용액에 HCl(g), 1,4-디옥산(1 mL, 8 M)을 첨가하였다. 생성된 용액을 50℃에서 3시간 동안 교반하였다. TLC가 반응이 완료되었음을 나타내었다. 실온으로 냉각시킨 후, 반응 혼합물을 농축시켜 미정제 생성물(93 mg, 100% 수율, 계산치)을 수득하였고, 이는 다음 단계에서 사용되었다. 건조 NMP(5 mL) 중 전술한 미정제 생성물(93 mg, 0.13 mmol) 용액에 (2S,4R)-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)-1-((S)-2-아미노-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복사미드 염화수소(91 mg, 0.19 mmol), DIEA(167 mg, 1.30 mmol) 및 PyBOP(203 mg, 0.39 mmol)를 순차적으로 첨가하였다. 생성된 용액을 10℃에서 1시간 동안 교반하였다. 반응물을 염수(20 mL)로 급냉시킨 후, 혼합물을 EA로 2회 추출하였다. 유기층을 농축시키고, 잔류물을 실리카 겔 및 분취 HPLC로 정제하여 목적하는 생성물(39 mg, 2단계에서 27% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, CD3OD): δ 8.80 (s, 1H), 8.65 (s, 1H), 8.56 (s, 1H), 7.89 (s, 1H), 7.73 (m, 1H), 7.54 (d, J = 8.8 Hz, 2H), 7.44 (d, J = 7.6 Hz, 2H), 7.36 (d, J = 8.0 Hz, 2H), 7.07-7.14 (m, 3H), 5.13 - 5.30 (m, 1H), 4.71 (s, 1H), 4.50 - 4.65 (m, 4H), 4.34 (d, J = 15.6 Hz, 1H), 4.12 (m, 2H), 3.78-3.95 (m, 4H), 3.40-3.65 (m, 9H), 3.10 (m, 6H), 2.42 (s, 3H), 2.00-2.30 (m, 4H), 1.04 (s, 9H); LCMS (ES+): m/z 550.3 [M/2+H]+.
화합물 98, 100-101, 102, 103-106 및 223-252는 유사한 방식으로 제조될 수 있다.
화합물 114의 예시적인 합성
단계 A: 1-(아제티딘-3-일)-4-(4-브로모페닐)피페라진 염화수소
CH3OH/DCM(v/v=1/1, 30 mL) 중 1-(4-브로모페닐)피페라진 염화수소(2.0 g, 7.21 mmol) 용액에 KOAc(1.4 g, 14.4 mmol) 및 촉매 AcOH(0.1 mL)를 실온에서 첨가하였다. 　 30분 동안 교반한 후, NaBH(OAc)3(7.6 g, 36.1 mmol). 혼합물을 30℃에서 밤새 교반하였다. 반응물을 수성 NaHCO3(50 mL)로 급냉시킨 후, 혼합물을 DCM(100 mL x 2)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(50 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 중에서 농축시켜 미정제의 목적하는 생성물(2.5 g)을 연갈색 고체로서 수득하였고, 이는 추가 정제 없이 다음 단계에서 사용되었다. 메탄올(20 mL) 중 전술한 중간체의 용액에 HCl (g)/CH3OH(10 mL)를 첨가하였다. 생성된 용액을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 용매를 진공 하에서 제거하였다. 잔류물을 DCM으로 연화시키고 여과하여 목적하는 생성물 1-(아제티딘-3-일)-4-(4-브로모페닐)피페라진 염화수소(2.0 g)를 갈색 고체로서 수득하였다.
단계 B: 에틸 2-(3-(4-(4-브로모페닐)피페라진-1-일)아제티딘-1-일)아세테이트
CH3OH/DCM(v/v=1/1, 10 mL) 중 1-(아제티딘-3-일)-4-(4-브로모페닐)피페라진 염화수소(2.0 g, 6.01 mmol) 용액에 KOAc(1.2 g, 12.1 mmol) 및 촉매 AcOH(0.1 mL)를 실온에서 첨가하였다. 　 30분 동안 교반한 후, NaBH(OAc)3(6.3 g, 30.1 mmol). 혼합물을 30℃에서 밤새 교반하였다. 반응물을 수성 NaHCO3(30 mL)로 급냉시킨 후, 혼합물을 DCM(50 mL x 3)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(50 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 중에서 농축시켜 목적하는 생성물 에틸 2-(3-(4-(4-브로모페닐)피페라진-1-일)아제티딘-1-일)아세테이트(1.0 g, 미정제)를 연갈색 고체로서 수득하였고, 이는 추가 정제 없이 다음 단계에서 사용되었다. LCMS (ES+): m/z 384.1; 382.1 [M+H] +.
단계 C: 메틸 2-(3-(4-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)피페라진-1-일)아제티딘-1-일)아세테이트
메탄올(20 mL) 중 에틸 2-(3-(4-(4-브로모페닐)피페라진-1-일)아제티딘-1-일) 아세테이트(1.0 g, 미정제) 용액에 HCl (g)/CH3OH(10 mL)를 첨가하였다. 생성된 용액을 60oC에서 2시간 동안 교반하였다. 용매를 진공 하에서 제거하였다. 잔류물을 DCM(100 mL)로 취하고, 혼합물을 NaHCO3(30 mL x 3)로 세척하였다. 유기상을 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물(500 mg)은 추가 정제 없이 다음 반응에서 사용되었다. 1,4-디옥산(20 mL) 중 전술한 중간체(500 mg, 1.4 mmol) 용액에 KOAc(267 mg, 2.8 mmol), Pd(dppf)Cl2(190 mg, 0.14 mmol), 4,4,5,5-테트라메틸-2-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-1,3,2-디옥사보로란(700 mg, 2.8 mmol)을 첨가하였다. 생성된 용액을 실온에서 N2로 10분동안 퍼지하여 과잉 O2를 제거하였다. 혼합물을 100oC에서 밤새 교반하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 반응물을 EtOAc로 취하였다. 유기상을 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 PE/EA(10 내지 1/1)의 실리카 겔로 정제하여 목적하는 생성물 메틸 2-(3-(4-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)피페라진-1-일)아제티딘-1-일)아세테이트(300 mg)을 갈색 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 416.3 [M+H] +.
단계 D: (2S,4R)-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)-1-((S)-3,3-디메틸-2-(2-(3-(4-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)피페라진-1-일)아제티딘-1-일)아세트아미도)부타노일)-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복사미드
H2O/THF(v/v=1/5, 5 mL) 중 메틸 2-(3-(4-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)피페라진-1-일)아제티딘-1-일)아세테이트(300 mg, 0.72mmol) 용액에 LiOH(34 mg, 1.5 mmol)를 첨가하였다. 생성된 용액을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 이어서, 용매를 진공 하에서 제거하였다. 잔류물은 추가 정제 없이 다음 반응에서 사용되었다. DMF(5.0 mL) 중 전술한 중간체의 용액에 DIEA (300 mg, 2.2 mmol), (2S,4R)-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)-1-((S)-2-아미노-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복사미드 염화수소(338 mg, 0.72 mmol) 및 PyBOP(564 mg, 1.1 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 생성된 용액을 20oC에서 2시간 동안 교반하였다. 반응물을 H2O(10 mL)로 급냉시키고, 혼합물을 EtOAc(20 mL Х 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 DCM/CH3OH(20/1)의 분취 TLC로 정제하여 목적하는 생성물 (2S,4R)-1-((S)-3,3-디메틸-2-(2-(3-(4-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)피페라진-1-일)아제티딘-1-일)아세트아미도) 부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드(80 mg)를 연갈색 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 814.4 [M+H] +.
단계 E: (2S,4R)-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)-1-((S)-2-(2-(3-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-((R)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)아제티딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복사미드
H2O/1,4-디옥산(v/v=1/5, 5.0 mL) 중 (2S,4R)-1-((S)-3,3-디메틸-2-(2-(3-(4-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)피페라진-1-일)아제티딘-1-일)아세트아미도) 부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드(80 mg, 0.098 mmol) 용액에 CsF(45 mg, 0.29mmol), Pd(amphos)Cl2(8 mg, 0.01mmol), (R)-N-(3-(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드(70 mg, 0.14 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 용액을 실온에서 N2로 10분동안 퍼지하여 과잉 O2를 제거하였다. 생성된 용액을 80oC에서 밤새 교반하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 반응물을 EtOAc로 취하였다. 합쳐진 유기층을 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 DCM/CH3OH(20/1)의 분취 TLC로 정제하여 목적하는 생성물 (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(3-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로-피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)아제티딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드(35 mg)를 연황색 고체로서 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): δ 9.02 (s, 1H), 8.71-8.75 (m, 2H), 8.68 (br, 1H), 8.12 (s, 1H), 7.61-7.66 (m, 4H), 7.42-7.46 (m, 5H), 7.19-7.21 (m, 2H), 7.06 (d, J = 8.0 Hz, 2H), 5.33-5.35 (m, 0.5H), 5.22-5.23 (m, 0.5 H), 5.16 (d, J = 7.2 Hz, 1H), 4.53 (d, J = 9.6 Hz, 1H), 4.34-4.47 (m, 5H), 4.24-4.29 (m, 1H), 4.04 (s, 1H), 3.65-3.66 (m, 3H), 3.51-.3.61 (m, 5H), 3.22-3.34 (m, 6H), 3.08 (br, 3H), 2.41-2.47 (m, 3H), 1.93-2.07 (m, 5H), 0.94 (s, 9H); LCMS (ES+): m/z 1111.3 [M+H]+, 1108.3 [M-H]+.
화합물 107-113, 115, 116, 및 253-269는 유사한 방식으로 제조될 수 있다.
화합물 117의 예시적인 합성
단계 A: 삼차-부틸 4-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페닐)피페라진-1-카르복실레이트
피리딘(30 mL) 중 4-(4-브로모-1H-피라졸-3-일)피리딘(5.0 g, 22.3 mmol)(Bioorg. Med. Chem. Lett. 2008, 18, 4692-4695에 기재됨), 삼차-부틸 4-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)피페라진-1-카르복실레이트(8.7 g, 22.3 mmol) 및 아세트산 제이구리(4.0 g, 22.3 mmol)의 혼합물을 100℃에서 밤새 교반하였다. 혼합물을 진공 중에서 농축시키고 잔류물을 실리카 겔 상의 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르/에틸 아세테이트 = 5/1)로 정제하여 삼차-부틸 4-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페닐)피페라진-1-카르복실레이트(10.8 g, 70% 수율)를 갈색 고체로서 수득하였다.
단계 B: 삼차-부틸 4-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페닐)피페라진-1-카르복실레이트
삼차-부틸 4-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페닐)피페라진-1-카르복실레이트 (2.4 g, 5.0 mmol), 5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온 (1.3 g, 5.0 mmol), [1,1'-비스(디페닐포스피노)페로센]디클로로팔라듐 (366 mg, 0.5 mmol). 1,4-디옥산/물(20 mL, 10/1) 중 트리-삼차-부틸포스핀 테트라플루오로보레이트(145 mg, 0.5 mmol) 및 불화 세슘(2.3 g, 15.0 mmol)을 90℃에서 밤새 교반하였다. 혼합물을 물(30 mL)에 붓고 디클로로메탄(30 mL x 3)으로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 진공 중에서 농축시키고 잔류물을 실리카 겔 상 컬럼 크로마토그래피(디클로로메탄/메탄올 = 20/1)로 정제하여 삼차-부틸 4-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페닐)피페라진-1-카르복실레이트(1.6 g, 60% 수율)를 황색 고체로서 수득하였다. LCMS: m/z 536.3 [M+H]+.
단계 C: 5-(1-(4-(피페라진-1-일)페닐)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-4-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온 염화수소
건조 염산/메탄올(30 mL, 1,0 M.) 중 삼차-부틸 4-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페닐)피페라진-1-카르복실레이트(1.6 g, 3.0 mmol) 용액을 실온에서 밤새 교반하였다. 반응 혼합물을 진공 중에서 농축시켜 5-(1-(4-(피페라진-1-일)페닐)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-4-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온 염화수소(1.0 g, 80% 수율)를 백색 고체로서 수득하였고, 이는 추가 정제 없이 다음 단계에 직접 사용되었다.
단계 D: 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(4-(4-(4-(1-옥소-2,3- 디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페닐)피페라진-1-일)이소인돌린-1,3-디온
디메틸 설폭시드(10 mL) 중 5-(1-(4-(피페라진-1-일)페닐)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-4-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온 염화수소(1.0 g, 2.3 mmol), 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-플루오로이소인돌린-1,3-디온(635 mg, 2.3 mmol) 및 트리에틸아민(697 mg, 6.9 mmol)의 혼합물을 80℃에서 밤새 교반하였다. 혼합물을 물(20 mL)에 붓고 에틸 아세테이트(20 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 진공 중에서 농축시키고 잔류물을 실리카 겔 상 컬럼 크로마토그래피(디클로로메탄/메탄올 = 20/1)로 정제하여 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(4-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페닐)피페라진-1-일)이소인돌린-1,3-디온(1.1 g, 70% 수율)를 황색 고체로서 수득하였다. LCMS: m/z 692.3 [M+H]+.
단계 E: (E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(4-(4-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페닐)피페라진-1-일)이소인돌린-1,3-디온
피리딘(10 mL) 중 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(4-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페닐)피페라진-1-일)이소인돌린-1,3-디온(300 mg, 0.43 mmol) 및 하이드록실아민 염화수소(300 mg, 4.3 mmol)의 혼합물을 실온에서 밤새 교반하였다. 반응 혼합물을 진궁 중에서 농축시켰다. 잔류물을 분취 HPLC로 정제하여 (E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(4-(4-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페닐)피페라진-1-일)이소인돌린-1,3-디온(182 mg, 60% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다. LCMS: m/z 707.3 [M+H]+; 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 2.01-2.07 (1H, m), 2.54-2.61 (2H, m), 2.80-2.89 (3H, m), 2.98-3.02 (2H, m), 3.39 (4H, brs), 3.66 (4H, brs), 5.06-5.11 (1H, m), 7.16 (2H, d, J = 8.8 Hz), 7.21 (1H, d, J = 7.6 Hz), 7.33-7.35 (1H, m), 7.42 (2H, d, J = 8.0 Hz), 7.47 (2H, dd, J = 5.6, 1.6 Hz), 7.55 (1H, J = 7.6 Hz), 7.72 (1H, d, J = 8.4 Hz), 7.83 (2H, d, J = 8.8 Hz), 8.57 (2H, dd, J = 4.4, 1.2 Hz), 8.73 (1H, s), 10.9 (1H, s), 11.0-11.1 (1H. m).
화합물 118 내지 132 및 화합물 271은 유사한 방식으로 제조될 수 있다.
화합물 137의 예시적인 합성
단계 A: 삼차-부틸 (2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에틸)(메틸)카바메이트
DCM(20 mL) 중 삼차-부틸 메틸(2-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페녹시)에틸)카바메이트(3.57 g, 9.47 mmol) 및 4-(4-브로모-1H-피라졸-3-일)피리딘(2.12 g, 9.47 mmol) 용액에 Et2NH(6.91 g, 94.72 mmol), Cu(OAc)2 (1.72 g, 9.47 mmol)을 첨가하였다. 생성된 혼합물을 O2 분위기 하 30oC에서 16시간 동안 교반하였다. 혼합물을 DCM(30 mL)으로 희석하고, 이어서 혼합물을 NH3·H2O로 3회 세척하였다. 유기상을 감압 하에서 증발시키고, 잔류물을 실리카 겔 상 컬럼 크로마토그래피(DCM/MeOH=80/1)로 정제하여 삼차-부틸 (2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에틸)(메틸)카바메이트(3.0 g, 66.9% 수율)를 갈색 오일로서 수득하였다.
단계 B: 2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)-N-메틸에탄-1-아민
MeOH(6 mL) 중 삼차-부틸 (2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에틸)(메틸)카바메이트(1.56 g, 3.31 mmol) 용액에 HCl/디옥산(6 N, 10 mL)을 실온에서 천천히 첨가하였다. 혼합물을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 혼합물을 감압 하에서 증발시켜 2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)-N-메틸에탄-1-아민(1.23 g, 100% 수율)을 무색 고체로서 수득하였다.
단계 C: 5-((2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에틸)(메틸)아미노)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)이소인돌린-1,3-디온
NMP(2 mL) 중 2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)-N-메틸에탄-1-아민(400 mg, 1.07 mmol) 및 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-플루오로이소인돌린-1,3-디온(591.9 mg, 2.14 mmol) 용액에 DIPEA(1.38 g, 10.7 mmol)를 첨가하였다. 생성된 혼합물을 N2 분위기 하 130oC에서 12시간 동안 교반하였다. 혼합물을 EA(30 mL)로 희석하고, 혼합물을 염수로 2회 세척하였다. 유기상을 감압 하에 증발시켰다. 잔류물을 실리카 겔 상 컬럼 크로마토그래피(PE/EtOAc= 1/3)로 정제하여 5-((2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에틸)(메틸)아미노)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)이소인돌린-1,3-디온(500 mg, 74.1% 수율)를 수득하였다.
단계 D: 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(메틸(2-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에틸)아미노)이소인돌린-1,3-디온
1,4-디옥산/H2O(9 mL, 8:1) 중 5-((2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에틸)(메틸)아미노)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)이소인돌린-1,3-디온(500 mg, 0.79 mmol) 및 5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온(307.6 mg, 1.19 mmol) 용액에 t-Bu3PHBF4 (92.2 mg, 0.32 mmol), CsF(483.3 mg, 3.18 mmol),Cy2NMe(5 방울) 및 Pd2 (dba)3 (145.6 mg, 0.16 mmol)을 첨가하였다. 생성된 혼합물을 N2 분위기 하 100oC에서 2시간 동안 교반하였다. 용매를 감압 하에 증발시켰다. 잔류물을 EA(30 mL)로 희석하고, 혼합물을 염수로 2회 세척하였다. 유기상을 감압 하에 증발시켰다. 잔류물을 실리카 겔 상 컬럼 크로마토그래피(PE/DCM/MeOH=800/200/25)로 정제하여 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(메틸(2-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에틸)아미노)이소인돌린-1,3-디온(500 mg, 92.4% 수율)를 수득하였다.
단계 E: (E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-((2-(4-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에틸)(메틸)아미노)이소인돌린-1,3-디온
CH3CN/Py(3 mL/3 mL) 중 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(메틸(2-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에틸)아미노)이소인돌린-1,3-디온(200 mg, 0.294 mmol) 용액에 NH2OH·HCl(200 mg, 2.877 mmol)을 첨가하고, 혼합물을 40oC에서 0.5시간 동안 교반하였다. 혼합물을 DCM(30 mL)로 희석하고, 염수로 2회 세척하였다. 유기층을 감압 하에서 증발시켰다. 잔류물을 TLC(DCM/EA/MeOH=50/100/15)로 정제하여 (E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-((2-(4-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에틸)(메틸)아미노)이소인돌린-1,3-디온(103 mg, 49.9% 수율)을 황녹색 고체로서 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 8.56 (d, J = 4.0 Hz, 2H), 8.16 (s, 1H), 7.94 (s, 1H), 7.66 - 7.72 (m, 4H), 7.50 (d, J = 4.8 Hz, 2H), 7.43 (s, 1H), 7.29 (s, 1H), 7.19 - 7.26 (m, 2H), 6.93 - 6.98 (m, 3H), 4.92 - 4.96 (m, 1H), 4.24 (t, J = 4.8 Hz, 2H), 3.94 (t, J =10 Hz, 2H), 3.23 (s, 3H), 3.00 - 3.04 (m, 4H), 2.77 - 2.92 (m, 4H), 2.12 - 2.15 (d, J =8.4 Hz, 1H); LCMS (ES+): m/z 696.2 [M+H] +.
화합물 133-136, 138-149, 및 273-281은 유사한 방식으로 제조될 수 있다.
화합물 150의 예시적인 합성
단계 A: 4-(4-브로모-1-(4-(2-(3-((삼차-부틸디메틸실릴)옥시)프로폭시)에톡시)페닐)-1H-피라졸-3-일)피리딘
건조 DMF (10 mL) 중 2-(3-((삼차-부틸디메틸실릴)옥시)프로폭시)에틸4-메틸벤젠-설포네이트(420 mg, 1.08 mmol) 용액에 K2CO3 (299 mg, 2.16 mmol) 및 4-(4-브로모-1H-피라졸-3-일)피리딘(342 mg, 1.08 mmol)을 순차적으로 첨가하였다. 생성된 용액을 80oC에서 3시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 EA(30 mL)로 희석하고 염수로 세척하였다. 유기상을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 정제하여(DCM:MeOH = 20:1) 목적하는 생성물 4-(4-브로모-1-(4-(2-(3-((삼차-부틸디메틸실릴)옥시)프로폭시)에톡시)페닐)-1H-피라졸-3-일)피리딘(430 mg)을 무색 고체로서 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 8.66 (br, 2H), 7.89-7.93 (m, 3H), 7.55 (d, J = 8.8 Hz, 2H), 6.96-6.98 (m, 2H), 4.04-4.14 (m, 2H), 3.76 (d, J = 4.8 Hz, 2H), 3.67 (d, J = 6 Hz, 3H), 3.58 (d, J = 6.4 Hz, 2H), 1.71-1.79 (m, 2H), 0.84 (s, 9H), 0.0 (s, 6H).
단계 B: 3-(2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)프로판-1-올
1,4-디옥산(2 mL) 중 4-(4-브로모-1-(4-(2-(3-((삼차-부틸디메틸실릴)옥시)프로폭시)에톡시)페닐)-1H-피라졸-3-일)피리딘(430 mg, 0.808 mmol) 용액에 1,4-디옥산(4 mL) 중 6 M HCl을 첨가하였다. 생성된 용액을 25oC에서 1시간 동안 교반하였다. 용매를 감압 하에서 제거하여 미정제의 목적하는 생성물 3-(2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)프로판-1-올(270 mg 미정제)을 수득하였고, 이는 추가 정제 없이 다음 단계에서 사용되었다. LCMS (ES+): m/z 420.0 [M+H] +.
단계 C: 3-(2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)프로파날
CH3CN (4 mL) 중 3-(2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)프로판-1-올(135 mg, 0.32 mmol)용액에 IBX(136 mg, 0.48 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 혼합물을 80oC에서 2시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후, 혼합물을 여과하였다. 여과물을 진공 중에서 농축시켜 미정제의 목적하는 생성물 3-(2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)프로파날(140 mg 미정제)을 수득하였고, 이는 추가 정제 없이 다음 단계에서 사용되었다. LCMS (ES+): m/z 416.0 [M+H] +.
단계 D: 삼차-부틸 4-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1,3-디옥소이소인돌린-4-일)피페라진-1-카르복실레이트
NMP(10 mL) 중 삼차-부틸 피페라진-1-카르복실레이트(1.35 g, 7.25 mmol) 용액에 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-플루오로이소인돌린-1,3-디온(1 g, 3.62 mmol) 및 DIEA(1.87 g, 14.5 mmol)를 첨가하였다. 생성된 용액을 N2 분위기 하 90oC에서 4시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 EA(30 mL)로 희석하고 염수로 세척하였다. 유기상을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 정제하여(DCM:EA = 1:1) 목적하는 생성물 삼차-부틸 4-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1,3-디옥소이소인돌린-4-일)피페라진-1-카르복실레이트(1.4 g)를 황색 고체로서 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): δ 7.73 (d, J = 7.2 Hz, 1H), 7.35－7.41 (m, 2H), 5.09－5.13 (m, 1H), 3.52 (s, 4H), 3.26 (s, 4H), 2.84－2.89 (m, 1H), 2.56－2.63 (m, 2H), 2.00－2.05 (m, 2H), 1.45 (s, 9H).
단계 E: 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-(피페라진-1-일)이소인돌린-1,3-디온 염화수소
1,4-디옥산(4 mL) 중 삼차-부틸 4-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1,3-디옥소이소인돌린-4-일)피페라진-1-카르복실레이트(1.4 g, 3.16 mmol) 용액에 1,4-디옥산(6 mL) 중 6 N HCl을 첨가하였다. 생성된 용액을 25oC에서 1시간 동안 교반하였다. 용액을 감압 하에 농축시켰다. 잔류물로부터 목적하는 생성물 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-(피페라진-1-일)이소인돌린-1,3-디온 염화수소(1.4 g 미정제)를 수득하였고, 이는 추가 정제 없이 다음 단계에서 사용되었다. LCMS (ES+): m/z 343.1 [M+H] +.
단계 F: 4-(4-(3-(2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)프로필)피페라진-1-일)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)이소인돌린-1,3-디온
3-(2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)프로파날(140 mg 미정제, 0.32 mmol), 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-(피페라진-1-일) 이소인돌린-1,3-디온(123 mg, 0.32 mmol) 용액에 MeOH 중 NaBH3CN (41 mg, 0.64 mmol), 아세트산(3.8 mg, 0.062 mmol)을 첨가하였다. 생성된 용액을 실온에서 밤새 교반하였다. 혼합물을 EA로 희석하고, 물 및 염수로 세척하였다. 유기상을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 정제하여(DCM:MeOH = 15:1) 목적하는 생성물 4-(4-(3-(2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)프로필)피페라진-1-일)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)이소인돌린-1,3-디온(70 mg)을 황색 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 742.1 [M+H] +.
단계 G: 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-(4-(3-(2-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)프로필)피페라진-1-일)이소인돌린-1,3-디온
1,4-디옥산/H2O(6 mL, 10/1) 중 4-(4-(3-(2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)프로필)피페라진-1-일)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)이소인돌린-1,3-디온(70 mg, 0.094 mmol), 5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥소보로란-2-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온(191 mg, 0.74 mmol), Pd2 (dba)3 (181 mg, 0.198 mmol), CsF (300 mg, 1.97 mmol). 트리-삼차-부틸포스핀 테트라플루오로보레이트(115 mg, 0.39 mmol), N,N-디시클로헥실메틸아민(9 mg, 0.047 mmol). 생성된 용액을 N2 분위기 하 100oC에서 마이크로웨이브로 2시간 동안 조사하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 혼합물을 EA로 희석하고, 물 및 염수로 세척하였다. 유기상을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 정제하여(DCM:MeOH = 20:1) 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-(4-(3-(2-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)프로필)피페라진-1-일)이소인돌린-1,3-디온(33 mg)을 황색 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 795.3 [M+H] +.
단계 H: (E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-(4-(3-(2-(4-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)프로필)피페라진-1-일)이소인돌린-1,3-디온
아세토니트릴(2 mL) 및 피리딘(1.5 mL) 중 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-(4-(3-(2-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)프로필)피페라진-1-일)이소인돌린-1,3-디온(33 mg, 0.042 mmol) 용액에 하이드록실아민 염화수소(27 mg, 0.42 mmol)를 첨가하였다. 혼합물을 40oC에서 20분 동안 교반하고, DCM 20 mL로 희석하고, 염수(10 mL)로 세척하였다. 유기층을 농축시키고 분취 TLC로 정제하여 (E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-(4-(3-(2-(4-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)프로필)피페라진-1-일)이소인돌린-1,3-디온(22 mg, 66.6% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다.1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 8.56 (d, J = 5.6 Hz, 2H), 8.37 (s, 1H), 7.94 (s, 1H), 7.68 (d, J = 9.2 Hz, 3H), 7.55－7.57 (m, 1H), 7.51 (d, J = 5.6 Hz, 2H), 7.38－7.40 (m, 1H), 7.21－7.28 (m, 2H), 7.15 (d, J = 8.4 Hz, 1H), 7.04 (d, J = 8.8 Hz, 2H), 4.91－4.98 (m, 1H), 4.18 (d, J = 4.8 Hz, 2H), 3.82－3.84 (m, 2H), 3.63 (d, J = 6.4 Hz, 2H), 3.49 (s, 2H), 3.36－3.38 (m, 4H), 3.02 (d, J = 10.8 Hz, 4H), 2.69－2.87 (m, 8H), 2.52－2.56 (m, 2H), 1.85－1.88 (m, 1H); LCMS (ES+): m/z 810.2 [M+H] +.
화합물 151-172 및 화합물 282-284는 유사한 방식으로 제조될 수 있다.
화합물 174의 예시적인 합성
단계 A: 4-(벤질옥시)부틸 4-메틸벤젠설포네이트
DCM(50 mL) 중 4-(벤질옥시)부틸 4-메틸벤젠설포네이트(5 g, 27.76 mmol), DMAP(0.34 g, 2.78 mmol) 및 TEA(8.4 g, 83.28 mmol) 용액에 TsCl(7.94 g, 41.64 mmol) 분량을 첨가하였다. 생성된 용액을 15oC에서 2시간 동안 교반하였다. 포화 NH4Cl(50 mL)를 첨가하여 용액을 급냉시켰다. 혼합물을 DCM(50 mL x 2)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔로 정제하여 목적하는 생성물 4-(벤질옥시)부틸 4-메틸벤젠설포네이트(5.6 g, 60% 수율)를 연황색 오일로서 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 7.77 (d, J = 8.4 Hz, 2H), 7.26-7.33 (m, 7H), 4.45 (s, 2H), 4.05 (t, J = 6.4 Hz, 2H), 3.42 (t, J = 6.4 Hz, 2H), 2.44 (s, 3H), 1.59-1.78 (m, 4H).
단계 B: (S)-삼차-부틸 5-아미노-4-(4-(4-(벤질옥시)부톡시)-1,3-디옥소이소인돌린-2-일)-5-옥소펜타노에이트
건조 DMF(8.0 mL) 중 4-(벤질옥시)부틸 4-메틸벤젠설포네이트(0.63 g, 1.87 mmol) 용액에 K2CO3 (0.4 g, 2.88 mmol), 삼차-부틸 (S)-5-아미노-4-(4-하이드록시-1,3-디옥소이소인돌린-2-일)-5-옥소펜타노에이트(0.5 g, 1.44 mmol)를 순차적으로 첨가하였다. 생성된 용액을 70℃에서 2시간 동안 교반하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 반응물을 물(30 mL)로 급냉시키고, 혼합물을 EA(40 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼으로 정제하여 (S)-삼차-부틸 5-아미노-4-(4-(4-(벤질옥시)부톡시)-1,3-디옥소이소인돌린-2-일)-5-옥소펜타노에이트(0.4 g, 55% 수율)를 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 7.63 (t, J = 8.4 Hz, 1H), 7.43 (m, 1H), 7.25-7.40 (m, 5H), 7.18 (s, 1H), 6.41 (br, 1H), 5.66 (br, 1H), 4.79 (m, 1H), 4.52 (s, 2H), 4.19 (t, J = 6.4 Hz, 2H), 3.58 (t, J = 6.4 Hz, 2H), 3.47 (m, 2H), 2.50 (m, 2H), 2.25 (m, 2H), 2.00 (m, 2H), 1.85 (m, 1H), 1.43 (s, 9H).
단계 C: (S)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-(4-하이드록시부톡시)이소인돌린-1,3-디온
아세토니트릴(5 mL) 중 (S)-삼차-부틸 5-아미노-4-(4-(4-(벤질옥시)부톡시)-1,3-디옥소이소인돌린-2-일)-5-옥소펜타노에이트(400 mg, 0.784 mmol) 용액에 TsOH.H2O(1.48g, 7.84mmol)를 첨가하였다. 생성된 용액을 80℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응물을 포화 NaHCO3로 급냉시키고 EA로 추출하였다. 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 농축시키고 컬럼으로 정제하여 (S)-4-(4-(벤질옥시)부톡시)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)이소인돌린-1,3-디온(370 mg)을 수득하였다. THF/MeOH(4 mL/1 mL) 중 (S)-4-(4-(벤질옥시)부톡시)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)이소인돌린-1,3-디온(370 mg, 0.85 mmol) 용액에 Pd(OH)2(185 mg) 및 농축 HCl 2 방울을 첨가하였다. 생성된 혼합물을 H2 1기압 하 20 oC에서 1시간 동안 교반하였다. 생성된 용액을 여과하고 증발시켰다. 잔류물을 분취 TLC로 정제하여 목적하는 생성물 (S)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-(4-하이드록시부톡시)이소인돌린-1,3-디온(250 mg, 2 단계에서 92% 수율)을 수득하였다. LCMS (ES+, Neg): m/z 345.0 [M-H] +.
단계 D: (S)-4-((2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1,3-디옥소이소인돌린-4-일)옥시)부타날
CH3CN (5 mL) 중 (S)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-(4-하이드록시부톡시)이소인돌린-1,3-디온(0.25 g, 0.72 mmol) 용액에 IBX(607 mg, 2.16 mmol)를 첨가하였다. 생성된 용액을 75oC에서 1시간 동안 교반하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 반응 혼합물을 여과하고 진공 중에서 농축시켜 미정제의 목적하는 생성물(240 mg 미정제, 계산치, 100% 수율)을 수득하였고, 이는 다음 단계에서 직접 사용되었다.
단계 E: (S)-4-(4-(4-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페닐)피페라진-1-일)부톡시)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)이소인돌린-1,3-디온
MeOH(6 mL) 중 (S)-4-((2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1,3-디옥소이소인돌린-4-일)옥시)부타날(240 mg 미정제, 0.72 mmol) 용액에 1-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페닐)피페라진(276 mg, 0.72 mmol) 및 AcOH 2 방울을 첨가하였다. 이어서 NaBH3CN(134 mg, 2.16 mmol)을 첨가하였다. 생성된 용액을 18oC에서 2시간 동안 교반하였다. 물(30 mL)로 급냉시킨 후, 혼합물을 EA(40 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 상에 적용하여 목적하는 생성물 (S)-4-(4-(4-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페닐)피페라진-1-일)부톡시)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)이소인돌린-1,3-디온(350 mg, 2 단계에서 68% 수율)를 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 713.1 [M+H] +.
단계 F: (S)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-(4-(4-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페닐)피페라진-1-일)부톡시)이소인돌린-1,3-디온
1,4-디옥산(15 mL)/ H2O (1.5 mL) 중 (S)-4-(4-(4-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페닐)피페라진-1-일)부톡시)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)이소인돌린-1,3-디온(0.35 g, 0.52 mmol), 5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥소보로란-2-일)-2,3-디히드로-1H-인덴-1-온(147 mg, 0.57 mmol) 용액에 CsF (316 mg, 2.08 mmol), Pd2 (dba)3 (190 mg, 0.21 mmol). 트리-삼차-부틸포스핀 테트라플루오로보레이트(121 mg, 0.42 mmol) 및 N-시클로헥실-N-메틸클로로헥산아민 2 방울을 순차적으로 첨가하였다. 반응물을 N2 분위기 하 100oC에서 2시간 동안 가열하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 반응물을 물(20 mL)로 급냉시키고 혼합물을 에틸 아세테이트(30 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 상에 적용하여 목적하는 생성물 (S)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-(4-(4-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페닐)피페라진-1-일)부톡시)이소인돌린-1,3-디온(0.3 g, 80% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 382.8 [(M+H)/2]+.
단계 G: (S,E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-(4-(4-(4-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페닐)피페라진-1-일)부톡시)이소인돌린-1,3-디온
아세토니트릴/피리딘(6 mL/3 mL) 중 (S)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-(4-(4-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페닐)피페라진-1-일)부톡시)이소인돌린-1,3-디온(165 mg, 0.22 mmol) 용액에 하이드록실아민 염화수소(150 mg, 2.16 mmol)를 첨가하였다. 혼합물을 45oC에서 1시간 동안 교반하였다. 용매를 진공 중에서 제거하고, 잔류물을 DCM/MeOH(20/1)의 분취 TLC로 정제하여 목적하는 생성물 (S,E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-(4-(4-(4-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페닐)피페라진-1-일)부톡시)이소인돌린-1,3-디온(60 mg, 38% 수율)을 백색 고체로서 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): δ 11.11 (s, 1H), 10.88 (d, J = 3.6 Hz, 1H), 8.69 (s, 1H), 8.56 (m, 2H), 7.81 (m, 3H), 7.35-7.62 (m, 6H), 7.20 (s, 1H), 7.09 (m, 2H), 5.10 (m, 1H), 4.25 (t, J = 6.4 Hz, 2H), 3.32 (m, 4H), 3.19 (m, 4H), 2.75-3.05 (m, 5H), 2.40 (m, 2H), 1.60-2.10 (m, 8H); LCMS (ES+): m/z 779.3 [M+H]+.
화합물 173 및 화합물 175 내지 181은 유사한 방식으로 제조될 수 있다.
화합물 182의 예시적인 합성
단계 A: N-(3-(5-((1-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1,3-디옥소이소인돌린-4-일)피페리딘-4-일)(메틸)아미노)-3-(피리미딘-5-일)-1H-피롤로[3,2-b]피리딘-1-일)-2,4-디플루오로페닐)프로판-1-설폰아미드
무수 NMP(2.0 mL) 중 N-(2,4-디플루오로-3-(5-(메틸(피페리딘-4-일)아미노)-3-(피리미딘-5-일)-1H-피롤로[3,2-b]피리딘-1-일)페닐)프로판-1-설폰아미드(100.0 mg, 0.18 mmol)(전술한 WO2012/104388에 기재됨), 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-플루오로이소인돌린-1,3-디온(102 mg, 0.36 mmol), DIEA(239 mg, 1.80 mmol)의 혼합물을 마이크로웨이브로 130 oC에서 1시간 동안 조사하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 반응물을 물로 급냉시키고, 혼합물을 EA(10 mL x 3)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 물(10 mL x 3), 염수(20 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 분취 TLC로 정제하여 목적하는 생성물 N-(3-(5-((1-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1,3-디옥소이소인돌린-4-일)피페리딘-4-일)(메틸)아미노)-3-(피리미딘-5-일)-1H-피롤로[3,2-b]피리딘-1-일)-2,4-디플루오로페닐)프로판-1-설폰아미드(DCM : MeOH = 10:1)(45 mg, 수율 = 30.6%)를 백색 고체로서 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 9.58 (s, 1H), 9.10 (s, 1H), 8.03 (s, 1H), 7.67-7.59 (m, 2H), 7.42 (d, J =7.2 Hz, 1H), 7.34 (d, J =8 Hz, 1H), 7.23-7.18 (m, 1H), 6.66 (d, J =12 Hz, 1H), 5.02-4.81 (m, 1H), 3.90-3.89 (m, 1H), 3.18-3.14 (m, 3H), 3.05 (s, 2H), 2.96-2.87 (m, 3H), 2.13 (dd, J =2.8 Hz,4 Hz, 2 H), 2.00-1.90 (m, 3H), 1.30 (s, 8H), 1.09 (t, J =12.0 Hz, 3H), 0.84-.088 (m, 4H); LCMS (ES+): m/z 798.2 [M+H]+.
화합물 183은 유사한 방식으로 제조될 수 있다.
화합물 184의 예시적인 합성
단계 A: 삼차-부틸 (S)-5-아미노-4-(4-(2-(벤질옥시)에톡시)-1,3-디옥소이소인돌린-2- 일)-5-옥소펜타노에이트
DMF(10 mL) 중 삼차-부틸 (S)-5-아미노-4-(4-하이드록시-1,3-디옥소이소인돌린-2-일)-5-옥소펜타노에이트(1.22 g, 3.51mmol), 2-(벤질옥시)에틸 메탄설포네이트(900 mg, 3.91 mmol), K2CO3(1.08 g, 7.83 mmol)의 혼합물을 70 oC에서 6시간 동안 교반하였다. 물로 급냉시킨 후, 혼합물을 EA로 추출하였다. 유기상을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 정제하여(PE:EtOAc = 1:5) 목적하는 생성물 삼차-부틸 (S)-5-아미노-4-(4-(2-(벤질옥시)에톡시)-1,3-디옥소이소인돌린-2- 일)-5-옥소펜타노에이트(907 mg)를 수득하였다.
단계 B: (S)-4-(2-(벤질옥시)에톡시)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)이소인돌린-1,3-디온
MeCN(10 mL) 중 삼차-부틸 (S)-5-아미노-4-(4-(2-(벤질옥시)에톡시)-1,3-디옥소이소인돌린-2-일)-5-옥소펜타노에이트(907 mg, 1.88 mmol), p-TsOH (1.5 g, 7.89 mmol) 용액을 80 oC에서 8시간 동안 교반하였다. 물로 급냉시킨 후, 혼합물을 EA로 희석하고, 물 및 염수로 세척하였다. 유기상을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 정제하여(PE:EtOAc = 1:1) 목적하는 생성물 (S)-4-(2-(벤질옥시)에톡시)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)이소인돌린-1,3-디온(1.23 g, 미정제)을 수득하였다.
단계 C: (S)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-(2-하이드록시에톡시)이소인돌린-1,3-디온
MeOH/EtOAc(1:1, 40 mL) 중 (S)-4-(2-(벤질옥시)에톡시)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일) 이소인돌린-1,3-디온 (1.23 g, 3.01 mmol), Pd(OH)2/C(0.7 g), HCl/디옥산(6N, 6 방울) 용액을 H2 1 기압 하 실온에서 12시간 동안 교반하였다. 혼합물을 셀라이트를 통해 여과하고 여과물을 진공 중에서 농축시켜 목적하는 생성물 (S)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-(2-하이드록시에톡시)이소인돌린-1,3-디온(700 mg, 미정제)을 수득하였다.
단계 D: (S)-2-((2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1,3-디옥소이소인돌린-4-일)옥시)아세트알데히드
CH3CN (10 mL) 중 (S)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-(2-하이드록시에톡시)이소인돌린-1,3-디온(200 mg, 0.63 mmol) 용액에 IBX(352 mg, 1.26 mmol)를 첨가하였다. 생성된 용액을 80oC에서 2시간 동안 교반하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 혼합물을 여과하고, 여과물을 진공 중에서 농축시켜 미정제의 목적하는 생성물, (S)-2-((2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1,3-디옥소이소인돌린-4-일)옥시)아세트알데히드(200 mg 미정제)를 황색 고체로서 수득하였고, 이는 추가 정제없이 다음 단계에서 사용되었다.
단계 E: N-(3-(5-((1-(2-((2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1,3-디옥소이소인돌린-4-일)옥시)에틸)피페리딘-4-일)(메틸)아미노)-3-(피리미딘-5-일)-1H-피롤로[3,2-b]피리딘-1-일)-2,4-디플루오로페닐)프로판-1-설폰아미드
EtOH/DCM(v/v =1/1, 20 mL) 중 (S)-2-((2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1,3-디옥소이소인돌린-4-일)옥시)아세트알데히드(200 mg crude, 0.631 mmol), N-(2,4-디플루오로-3-(5-(메틸(피페리딘-4-일)아미노)-3-(피리미딘-5-일)-1H-피롤로[3,2-b]피리딘-1-일)페닐)프로판-1-설폰아미드 염화수소(80 mg, 0.148 mmol), CH3COOH (3.8 mg, 0.062 mmol) 용액에 NaBH(OAc)3(400 mg, 1.88 mmol)를 첨가하였다. 생성된 용액을 실온에서 밤새 교반하였다. 물로 급냉시킨 후, 혼합물을 EtOAc로 추출하였다. 유기상을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 분취 TLC(DCM/EtOAc/MeOH=10/1/1)로 정제하여 목적하는 생성물 (S)-N-(3-(5- ((1-(2-((2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1,3-디옥소이소인돌린-4-일)옥시)에틸)피페리딘-4-일)(메틸)아미노)-3-(피리미딘-5-일)-1H-피롤로[3,2-b]피리딘-1-일)-2,4-디플루오로페닐)프로판-1-설폰아미드(20.1 mg)를 백색 고체로서 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 11.07 (s, 1H), 9.80 - 10.02 (m, 1H), 9.66 (s, 1H), 9.01 (s, 1H), 8.40 (s, 1H), 7.80 - 7.89 (m, 1H), 7.61-7.63 (m, 2H), 7.44-7.48 (m, 2H), 6.76 (d, J = 9.3 Hz, 1H), 5.08 (dd, J = 12.9, 5.2 Hz, 1H), 4.33 - 4.49 (m, 3H), 3.45 (s, 6H), 3.06 - 3.25 (m, 3H), 2.94 (s, 2H), 2.83 (s, 2H), 2.55 - 2.73 (m, 4H), 2.29 (d, J = 10.3 Hz, 2H), 1.77 (m, 2H), 1.68 (d, J = 10.1 Hz, 2H), 0.99 (t, J = 7.4 Hz, 3H); LC-MS: (ES+): m/z 842.3 [M+H] +.
화합물 185 내지 189는 유사한 방식으로 제조될 수 있다.
화합물 191의 예시적인 합성
단계 A: 삼차-부틸 2-(2-(2-옥소에톡시)에톡시)아세테이트
CH3CN(15 mL) 중 삼차-부틸 2-(2-(2-하이드록시에톡시)에톡시)아세테이트(1 g, 4.55 mmol) 용액에 IBX(3.8 g, 13.64 mmol)를 첨가하였다. 생성된 용액을 75oC에서 1시간 동안 교반하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 혼합물을 여과하고 여과물을 진공 하에서 미정제의 목적하는 생성물 삼차-부틸 2-(2-(2-옥소에톡시)에톡시)아세테이트(1 g 미정제, 100% 수율)를 수득하였고, 이는 다음 단계에서 직접 사용되었다. 1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 9.75 (s, 1H), 4.18 (s, 2H), 4.03 (s, 2H), 3.77 (s, 4H), 1.48 (s, 9H).
단계 B: 단계 B: 삼차-부틸-2-(2-(2-(4-((1-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)페닐)-3-(피리미딘-5-일)-1H-피롤로[3,2-b]피리딘-5-일)(메틸)아미노)피페리딘-1-일)에톡시)에톡시)아세테이트
EtOH/DCM(1/1) 중 삼차-부틸 2-(2-(2-옥소에톡시)에톡시)아세테이트(181 mg 미정제, 0.83 mmol) 용액에 N-(2,4-디플루오로-3-(5-(메틸(피페리딘 -4-일)아미노)-3-(피리미딘-5-일)-1H-피롤로[3,2-b]피리딘-1-일)페닐)프로판-1-설폰아미드 염화수소(150 mg, 0.28 mmol) 및 촉매 AcOH를 첨가하였다. 　 pH가 5 내지 6 미만인 경우 KOAc를 첨가하였다. 30분 동안 교반한 후, NaBH(OAc)3(235 mg, 1.11 mmol)를 첨가하였다. 생성된 용액을 30oC에서 1시간 동안 교반하였다. 물(20 mL)로 급냉시킨 후, 혼합물을 DCM(2 x 30 mL)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 상에 적용하여 목적하는 생성물 2-(2-(2-(4-((1-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)페닐)-3-(피리미딘-5-일)-1H-피롤로[3,2-b]피리딘-5-일)(메틸)아미노)피페리딘-1-일)에톡시)에톡시)아세테이트(120 mg, 58% 수율)을 수득하였다. LCMS: (ES+): m/z 744.3 [M+H] +.
단계 C: 2-(2-(2-(4-((1-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)페닐)-3-(피리미딘-5-일)-1H-피롤로[3,2-b]피리딘-5-일)(메틸)아미노)피페리딘-1-일)에톡시)에톡시)아세트산
DCM(3 mL) 중 삼차-부틸 2-(2-(2-(4-((1-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)페닐)-3-(피리미딘-5-일)-1H-피롤로[3,2-b]피리딘-5-일)(메틸)아미노)피페리딘-1-일)에톡시)에톡시)아세테이트(0.12 g, 0.16 mmol) 용액에 TFA(1 mL)를 첨가하였다. 생성된 용액을 30oC에서 1시간 동안 교반하였다. 용매를 진공 중에서 제거하여 목적하는 생성물 2-(2-(2-(4-((1-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)페닐)-3-(피리미딘-5-일)-1H-피롤로[3,2-b]피리딘-5-일)(메틸)아미노)피페리딘-1-일)에톡시)에톡시)아세트산(111 mg 미정제, 계산치)를 수득하였고, 이는 추가 정제 없이 다음 반응에서 사용되었다. LCMS: (ES+): m/z 688.2 [M+H] +.
단계 D: (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(2-(2-(4-((1-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)페닐)-3-(피리미딘-5-일)-1H-피롤로[3,2-b]피리딘-5-일)(메틸)아미노)피페리딘-1-일)에톡시)에톡시)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드
DCM(10 mL) 중 2-(2-(2-(4-((1-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)페닐)-3-(피리미딘-5-일)-1H-피롤로[3,2-b]피리딘-5-일)(메틸)아미노)피페리딘-1-일)에톡시)에톡시)아세트산(111 mg 미정제, 0.16 mmol) 용액에 (2S,4R)-1-((S)-2-아미노-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드 염화수소(150 mg, 0.32 mmol), DIPEA(209 mg, 1.62 mmol) 및 PyBOP(250 mg, 0.48 mmol)을 순차적으로 첨가하였다. 30oC에서 1시간 동안 교반한 후, 반응 혼합물을 DCM(30 mL)으로 희석하고, 물(10 mL x 2), 염수(10 mL)로 세척하였다. 유기상을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 일차적으로 컬럼(DCM/MeOH 19/1)으로 정제하고, 추가로 분취-HPLC로 정제하여 목적하는 생성물 (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(2-(2-(4-((1-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)페닐)-3-(피리미딘-5-일)-1H-피롤로[3,2-b]피리딘-5-일)(메틸)아미노)피페리딘-1-일)에톡시)에톡시)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드(55 mg, 2 단계에서 31% 수율)를 백색 고체로서 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): δ 9.65 (s, 2H), 9.02 (s, 1H), 8.94 (s, 1H), 8.57 (t, J = 4.8 Hz, 1H), 8.40 (m, 1H), 7.55-7.65 (m, 1H), 7.35-7.50 (m, 7H), 6.74 (d, J = 9.2 Hz, 1H), 4.57 (d, J = 9.6 Hz, 1H), 4.20-4.50 (m, 5H), 4.00 (s, 2H), 3.50-3.70 (m, 2H), 3.00-3.20 (m, 7H), 2.93 (s, 3H), 2.50-2.70 (m, 4H), 2.43 (s, 3H), 1.60-2.25 (m, 13H), 0.90-1.05 (m, 12H); LCMS: (ES+): m/z 1101.4 [M+H] +.
화합물 190 및 192는 유사한 방식으로 제조될 수 있다.
화합물 195 [(3R)-N-(3-(5-(4-(2-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1,3-디옥소이소인돌린-5-일옥시)에톡시)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드]의 예시적인 합성
단계 A: 에틸 2-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페녹시)아세테이트
N,N-디메틸포름아미드(50 mL) 중 4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페놀(5 g, 22.7 mmol) 용액에 에틸 2-브로모아세테이트(4.52 g, 27.2 mmol) 및 탄산칼륨(6.27 g, 45.4 mmol)을 첨가하였다. 혼합물을 질소 가스 하에서 밤새 교반하였다. 반응 혼합물에 물(200 mL)을 첨가하고 에틸 아세테이트(150 mL x 3)로 추출하였다. 유기층을 염수(100 mL x 3)로 세척하였다. 합쳐진 유기상을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 진공 중에서 농축시켜 에틸 2-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페녹시)아세테이트(5.2 g, 75%)를 무색 오일로서 수득하였다.
단계 B: 메틸 2-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페녹시)에탄올
테트라하이드로푸란/에탄올(10 mL/10 mL) 중 에틸 2-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페녹시)아세테이트(1 g, 3.27 mmol) 용액에 수소화 붕소 나트륨(124 mg, 3.27 mmol)을 얼음 조에서 첨가하였다. 혼합물을 실온까지 가온하고 2시간 동안 교반하였다. 혼합물을 에틸 아세테이트(100 mL) 및 물(50 mL) 사이에서 분리시켰다. 유기층을 분리하고, 염수(20 mL x 3)로 세적하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 진공 중에서 농축시켜 메틸 2-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페녹시)에탄올(0.8 g, 93%)를 무색 오일로서 수득하였다.
단계 C: 2-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페녹시)에틸 메탄설포네이트
디클로로메탄(10.0 mL) 중 2-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페녹시)에탄올(200 mg, 0.76 mmol) 및 에틸디이소프로필아민(293 mg, 2.27 mol) 용액에 메탄설포닐 염화물(105 mg, 0.91 mmol)을 냉각 하에서 첨가하고, 혼합물을 0 oC에서 30분 동안 교반하였다. 혼합물을 냉수(10.0 mL)로 급냉시키고, 유기층을 중탄산 나트륨 용액(10.0 mL x 3) 및 염수(10.0 mL x 3)로 세척하고, 무수 포화 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켜 2-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페녹시)에틸 메탄설포네이트를 수득하였고, 이는 다음 단계에 직접 사용되었다.
단계 D: 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(2-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥소보로란-2-일)페녹시)에톡시)이소인돌린-1,3-디온
디메틸 설폭시드(10 mL) 중 (2-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페녹시)에틸 메탄설포네이트(260 mg, 0.76 mmol), 탄산칼륨(210 mg, 1.52 mmol), 요오드화 칼륨(126 mg, 0.76 mmol) 및 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-하이드록시이소인돌린-1,3-디온(208 mg, 0.76 mmol)의 혼합물을 60oC에서 밤새 교반하였다. 생성된 반응 혼합물을 실온으로 냉각시켰다. 물(20 mL) 및 에틸 아세테이트(20 mL)를 첨가하였다. 유기층을 분리하고, 염수(10 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 진공 중에서 농축시키고, 분취-TLC(디클로로메탄/메탄올=20:1)로 정제하여 미정제 생성물 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(2-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥소보로란-2-일)페녹시)에톡시)이소인돌린-1,3-디온(140 mg, 2 단계에서 36%)을 백색 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 521.2 [M+H]+, 538.2 [M+18]+.
단계 E: (3R)-N-(3-(5-(4-(2-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1,3-디옥소이소인돌린-5-일옥시)에톡시)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드
1,4-디옥산(10 mL) 및 물(2 mL) 중 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(2-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페녹시)에톡시)이소인돌린-1,3-디온(136 mg, 0.26 mmol), (R)-N-(3-(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드(120 mg, 0.24 mmol) 및 CsF(0.18 mg , 0.012 mmol) 용액에 Pd(aMPhos)Cl2 (17 mg, 0.024 mmol)를 아르곤 분위기 하에서 첨가하고, 혼합물을 100℃에서 6시간 동안 교반하였다. 실온으로 냉각되었을 때, 물(20 mL)을 첨가하고 생성된 혼합물을 EA(20 mL x 3)로 추출하고, 염수(10 mL x 3)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 농축시켰다. 잔류물을 분취-HPLC로 정제하여 (3R)-N-(3-(5-(4-(2-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1,3-디옥소이소인돌린-5-일옥시)에톡시)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드(8.1 mg, 4% 수율)를 백색 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 817.2 [M+H]+; 1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6 ) δ 2.06-2.09 (3H, m), 2.55-2.62 (2H, m), 2.85-2.93 (1H, m), 3.24-3.27 (1H, m), 3.38-3.50 (3H, m), 4.42-4.46 (2H, m), 4.58-4.62 (2H, m), 5.12-5.16 (1H, m), 5.23-5.36 (1H, m), 7.15 (2H, d, J = 8.8 Hz), 7.25 (1H, t, J = 8.8 Hz), 7.45 (1H, dd, J = 2.4, 8.4 Hz), 7.55 (1H, d, J = 2.0 Hz), 7.59-7.63 (1H, m), 7.70 (2H, d, J = 8.4 Hz), 7.87 (1H, d, J = 8.4 Hz), 8.10 (1H, s), 8.58 (1H, s), 8.68 (1H, d, J = 2.4 Hz), 9.89 (1H, brs.), 11.14 (1H, s), 12.96 (1H, brs.).
화합물 194 및 195는 유사한 방식으로 제조될 수 있다.
화합물 285 [(2S,4R)-1-((S)-2-(3-(2-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)에톡시)이속사졸-5-일)-3-메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드] 및 화합물 286 [(2S,4R)-1-((R)-2-(3-(2-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)에톡시)이속사졸-5-일)-3-메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드]의 예시적인 합성
및
단계 A: 2-(3-하이드록시-1,2-옥사졸-5-일)-3-메틸부탄산
100 mL 둥근바닥 플라스크에 아세트산(20 mL) 중 2-(3-메톡시-1,2-옥사졸-5-일)-3-메틸부탄산(1.0 g, 5.02 mmol, 1.0당량) 및 브롬화수소산(11.9 g, 147.07 mmol, 29.30당량) 용액을 넣었다. 생성된 용액을 오일조에서 60℃에서 밤새 교반하였다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 이를 통해 650.0 mg(미정제)의 2-(3-하이드록시-1,2-옥시-5-일)-3-메틸부탄산을 백색 고체로서 수득하였다.
LCMS (ES+): m/z 186.05 [M+H]+.
단계 B: 에틸 2-(3-하이드록시-1,2-옥사졸-5-일)-3-메틸부타노에이트
질소 불활성 분위기로 퍼지되고 유지된 50 mL 둥근바닥 플라스크에 에탄올(30 mL) 및 황산(1 mL) 중 2-(3-하이드록시-1,2-옥사졸-5-일)-3-메틸부탄산(650.0 mg, 3.51 mmol, 1.00당량)을 넣었다. 생성된 용액을 70℃에서 밤새 교반하였다. 이어서, 반응 혼합물에 20 mL의 물의 첨가로 급냉시키고 에틸 아세테이트(20 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시켰다. 이를 여과하고 여과물을 감압 하에 농축시켰다. 이를 통해 720.0 mg(96%)의 에틸 2-(3-하이드록시-1,2-옥사졸-5-일)-3-메틸부타노에이트를 연황색 오일로서 수득하였다.
단계 C: 에틸 2-[3-(2-브로모에톡시)-1,2-옥사졸-5-일]-3-메틸부타노에이트
질소 불활성 분위기로 퍼지되고 유지된 50 mL 둥근 바닥 플라스크에 아세톤(15 mL), 1,2-디브로모에탄(994.8 mg, 5.30 mmol, 3.00당량), Cs2CO3 (1.17 g, 3.59 mmol, 2.00당량) 중 2-(3-하이드록시-1,2-옥사졸-5-일)-3-메틸부타노에이트(380.0 mg, 1.78 mmol, 1.00당량)를 넣었다. 생성된 혼합물을 실온에서 밤새 교반하였다. 이어서, 반응 혼합물을 물(15 mL)로 급냉시키고 에틸 아세테이트(20 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:5)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 450.0 mg(79%)의 에틸 2-[3-(2-브로모에톡시)-1,2-옥사졸-5-일]-3-메틸부타노에이트를 무색 고체로서 수득하였다.
단계 D: 1-[4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐]피페라진
질소 불활성 분위기로 퍼지되고 유지된 100 mL 둥근바닥 플라스크에 디클로로메탄(40 mL) 중 삼차-부틸 4-[4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐]피페라진-1-카르복실레이트(1.6 g, 4.12 mmol, 1.00당량) 용액을 넣고, 이어서 TMSOTf(1.5 g, 6.75 mmol, 1.60당량)를 0℃에서 교반하며 적가하였다. 이 용액에 6-디메틸피리딘(132.5 mg, 1.00 mmol, 0.30당량)을 첨가하였다. 생성된 용액을 실온에서 3시간 동안 교반하였다. 이어서, 50 mL의 포화 중탄산 나트륨 수용액을 첨가하여 반응물을 급냉시켰다. 생성된 용액을 에틸 아세테이트(30 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(10:1)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 854.0 mg(72%)의 1-[4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐]피페라진을 회백색 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 289.15 [M+H]+.
단계 E: 에틸 3-메틸-2-[3-(2-[4-[4-(테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐]피페라진-1-일]에톡시)-1,2-옥사졸-5-일]부타노에이트
질소 불활성 대기로 퍼지되고 유지된 30 mL의 밀봉된 튜브에 N,N-디메틸포름아미드(6 mL), 1-[4-(테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐]피페라진(624.0 mg, 2.17 mmol, 1.20당량), DIEA(17 mL), NaI(20 mg) 중 에틸 2-[3-(2-브로모에톡시)-1,2-옥사졸-5-일]-3-메틸부타노에이트(576.0 mg, 1.80 mmol, 1.00당량) 용액을 넣었다. 생성된 용액을 130℃에서 16시간 동안 교반하였다. 이어서 반응 혼합물에 30 mL의 물의 첨가하여 급냉시켰다. 생성된 용액을 에틸 아세테이트(30 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(30 mL x 3)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 감압 하에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:2)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 720.0 mg(76%)의 에틸 3-메틸-2-[3-(2-[4-[4-(테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐]피페라진-1-일]에톡시)-1,2-옥사졸-5-일]부타노에이트를 황색 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 528.25 [M+H]+.
단계 F: 에틸 2-(3-[2-[4-(4-[3-[(2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘설포닐]아미노]페닐)카르보닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]에톡시]-1,2-옥사졸-5-일)-3-메틸부타노에이트
질소 불활성 분위기로 퍼지되고 유지된 30 mL의 밀봉된 튜브에 20 mL의 1,4-디옥산/물(4:1), (3R)-N-[3-(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일카르보닐)-2,4-디플루오로페닐]-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드(503.0 mg, 1.00 mmol, 1.00당량), 탄산나트륨(318.0 mg, 3.00 mmol, 3.00당량), Pd(dppf)Cl2(82.0 mg, 0.10 mmol, 0.10당량) 중 3-메틸-2-[3-(2-[4-[4-(테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐]피페라진-1-일]에톡시)-1,2-옥사졸-5-일]부타노에이트(527.0 mg, 1.00 mmol, 1.00당량) 용액을 넣었다. 반응 혼합물을 마이크로웨이브 조사 하 100℃에서 2시간 동안 반응시켰다. 이어서, 반응 혼합물에 20 mL의 물의 첨가로 급냉시켰다. 생성된 용액을 에틸 아세테이트(30 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(10:1)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 460.0 mg(56%)의 에틸 2-(3-[2-[4-(4-[3-[(2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-설포닐]아미노]페닐)카르보닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]에톡시]-1,2-옥사졸-5-일)-3-메틸부타노에이트를 연황색 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 824.15 [M+H]+.
단계 G: 2-(3-[2-[4-(4-[3-[(2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-설포닐]아미노]페닐)카르보닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]에톡시]-1,2-옥사졸-5-일)-3-메틸부탄산
질소 불활성 분위기로 퍼지되고 유지된 50 mL 둥근바닥 플라스크에 메탄올 10 mL 중 에틸 2-(3-[2-[4-(4-[3-[(2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-설포닐]아미노]페닐)카르보닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]에톡시]-1,2-옥사졸-5-일)-3-메틸부타노에이트(420.0 mg, 0.51 mmol, 1.00당량) 용액을 넣고, 이어서 물(2 mL) 중 수산화 나트륨(102.0 mg, 2.55 mmol, 5.00당량) 용액을 첨가하였다. 생성된 용액을 40℃에서 5시간 동안 교반하였다. 염화수소(1 mol/L)로 용액의 pH 값을 6으로 조정하였다. 고체를 여과하여 수집하였다. 고체를 감압 하 오븐에서 건조시켰다. 이를 통해 366.0 mg(90%)의 2-(3-[2-[4-(4-[3-[(2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-설포닐]아미노]페닐)카르보닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]에톡시]-1,2-옥사졸-5-일)-3-메틸부탄산을 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 796.10 [M+H]+.
단계 H: (2S,4R)-1-[2-(3-[2-[4-(4-[3-[(2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-설포닐]아미노]페닐)카르보닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]에톡시]-1,2-옥사졸-5-일)-3-메틸부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐-메틸]피롤리딘-2-카르복사미드
N,N-디메틸포름아미드(10 mL) 중 2-(3-[2-[4-(4-[3-[(2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-설포닐]아미노]페닐)카르보닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]에톡시]-1,2-옥사졸-5-일)-3-메틸부탄산(300.0 mg, 0.38 mmol, 1.00당량) 및 (2S,4R)-4-하이드록시-N-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸피롤리딘-2-카르복사미드 염화수소(199.9 mg, 0.56 mmol, 1.50당량) 용액에 DIEA(3.0 mL) 및 BOP(200.3 mg, 0.45 mmol, 1.20당량)을 첨가하였다. 생성된 혼합물을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 이어서 20 mL의 물을 첨가하여 반응물을 급냉시켰다. 생성된 용액을 에틸 아세테이트(30 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(30 mL x 3)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 감압 하에서 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(10:1)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 265.0 mg(64%)의 (2S,4R)-1-[2-(3-[2-[4-(4-[3-[(2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-설포닐]아미노]페닐)카르보닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]에톡시]-1,2-옥사졸-5-일)-3-메틸부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드를 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 1095.30 [M+H]+.
단계 I: (2S,4R)-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]-1-(2-[3-[2-(메틸아미노)에톡시]-1,2-옥사졸-5-일]부타노일)피롤리딘-2-카르복사미드
및
(2S,4R)-1-[2-(3-[2-[4-(4-[3-[(2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-설포닐]아미노]페닐)카르보닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]에톡시]-1,2-옥사졸-5-일)-3-메틸부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드를 키랄 HPLC로 분리하여 다음을 수득하였다:
25.7 mg(10%)의 (2S,4R)-1-((S)-2-(3-(2-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)에톡시)이속사졸-5-일)-3-메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드. 1H NMR (300 MHz, DMSO-d 6): δ9.10-8.97 (m, 1H), 8.65 (d, J = 2.0 Hz, 1H), 8.60-8.53 (m, 2H), 8.10-8.07 (m, 1H), 7.70-7.56 (m, 3H), 7.51-7.21 (m, 5H), 7.18-7.07 (m, 2H), 6.18-6.12 (m, 1H), 5.38-5.21 (m, 1H), 4.44-4.31 (m, 6H), 3.78 (d, J = 8.6 Hz, 1H), 3.62-3.45 (m, 4H), 3.32-3.01 (m, 8H), 2.98-2.60 (m, 4H), 2.55-2.43 (m, 3H), 2.34-1.82 (m, 6H), 0.97-0.62 (m, 6H). LCMS (ES+): m/z 1095.60 [M+H]+.
57.5 mg(22%)의 (2S,4R)-1-((R)-2-(3-(2-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)에톡시)이속사졸-5-일)-3-메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드. 1H NMR (300 MHz, DMSO-d 6): δ12.90 (brs, 1H), 9.84 (brs, 1H), 8.99-8.95 (m, 1H), 8.69-8.66 (m, 1H), 8.60-8.53 (m, 2H), 8.07 (s, 1H), 7.70-7.61 (m, 3H), 7.54-7.39 (m, 4H), 7.387.30 (m, 1H), 7.21-7.08 (m, 2H), 6.18-5.80 (m, 1H), 5.40-5.15 (m, 1H), 4.74-4.28 (m, 6H), 3.90-3.62 (m ,6H),3.41-3.22 (m, 7H), 3.21-2.81 (m, 5H) 2.45-2.42 (m, 3H), 2.32-2.20 (m, 1H), 2.17-1.80 (m, 4H), 0.95 (d, J = 6.5 Hz, 3H), 0.81 (d, J = 6.7 Hz, 3H). LCMS (ES+): m/z 1095.60 [M+H]+.
화합물 287 및 화합물 288은 유사한 방식으로 제조될 수 있다.
화합물 291 [(2S,4R)-4-하이드록시-1-((S)-2-(2-(2-(4-(4-((E)-1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드]의 예시적인 합성
단계 A: 삼차 -부틸 2-(2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)아세테이트에톡시)아세테이트
DMF(15 mL) 중 삼차-부틸 2-(2-클로로에톡시)아세테이트(400 mg, 2.06 mmol) 및 Cs2CO3 용액에 삼차-부틸 4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페놀(525 mg，1.66 mmol)을 첨가하였다. 혼합물을 75oC에서 3시간 동안 교반하였다. 이어서, 용액을 EA(100 mL)로 희석시켰다. 혼합물을 물 및 염수로 세척하였다. 유기상을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 감압 하에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피로 정제하여 2-(2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)아세테이트에톡시)아세테이트(290 mg, 0,62 mmol)를 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 475.21 [M+H]+, 476.1 [M+2H]+.
단계 B: (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드
1,4-디옥산(5 mL) 중 2-(2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)아세테이트에톡시)아세테이트(290 mg, 0.61 mmol) 용액에 1,4-디옥산(3 M, 5 mL) 중 HCl(g)을 첨가하였다. 반응물을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 용매를 감압 하에서 제거하였다. 잔류물을 DCM(20 mL)에 용해시켰다. (2S,4R)-1-((S)-2-아미노-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4- 메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드 염화수소(394 mg, 0.92 mmol), DIPEA(394 mg, 3.05 mmol) 및 PyBOP(954 g, 1.83 mmol)를 용액에 순차적으로 첨가하였다. 30분 동안 교반한 후, DCM(50 mL)로 희석시켰다. 혼합물을 물 및 염수로 세척하였다. 유기상을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 감압 하에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피로 정제하여 (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드(390 mg, 0.46 mmol)를 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 830.2 [M+H]+.
단계 C: (2S,4R)-1-((S)-3,3-디메틸-2-(2-(2-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)아세트아미도)부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드
1,4-디옥산/물(20 mL/1 mL) 중 (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드(390 mg,0.46 mmol) 및 5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온(248 mg, 0.92 mmol) 용액에 Pd(aMPhos)Cl2 (36 mg, 0.046 mmol), CsF(360 mg, 2.30 mmol)를 순차적으로 첨가하였다. 반응 혼합물을 질소 분위기 하 90oC에서 밤새 교반하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 이를 에틸 아세테이트(100 mL)로 희석시켰다. 혼합물을 염수로 세척하였다(50 mL x 2). 유기상을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피(DCM/MeOH)로 정체하여 (2S,4R)-1-((S)-3,3-디메틸-2-(2-(2-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)아세트아미도)부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드(230 mg, 0.26 mmol)를 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 882.3 [M+H] +.
단계 D: (2S,4R)-4-하이드록시-1-((S)-2-(2-(2-(4-(4-((E)-1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드
CH3CN 및 피리딘(v/v = 1/1, 5 mL) 중 (2S,4R)-1-((S)-3,3-디메틸-2-(2-(2-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)아세트아미도)부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드(230 mg, 0,26 mmol) 용액에 NH2OH·HCl(179 mg, 2.6 mmol)을 첨가하였다. 용액을 20oC에서 3시간 동안 교반하였다. 혼합물을 셀라이트를 통해 여과하였다. 여과물을 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피(DCM/MeOH)로 정제하여 (2S,4R)-4-하이드록시-1-((S)-2-(2-(2-(4-(4-((E)-1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드(21 mg, 0.023 mmol)를 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d 6 ): δ 10.89 (s, 1H), 8.97 (s, 1H), 8.72 (s, 1H),8.56- 8.58 (m, 3H), 7.86 (d, J = 8.4 Hz, 2H), 7.49-7.57 (m, 3H), 7.39 (m, 6H), 7.22 (s, 1H), 7.09-7.12 (m, 2H), 5.17 (m, 1H), 4.52-4.65 (m, 1H), 4.32-4.50 (m, 3H), 4.08-4.29 (s, 4H), 3.95-4.05 (m, 2H), 3.73- 3.82 (m, 2H), 3.56-3.70 (m, 2H), 2.95-3.08 (m, 2H), 2.76-2.85 (s, 2H), 2.40-2.51 (m, 3H), 1.87-2.16 (s, 1H), 0.91-1.07 (s, 9H). LCMS (ES+): m/z 898.4 [M+H]+.
화합물 289, 290, 292, 및 293은 유사한 방식으로 제조될 수 있다.
실시예 15-합성 반응식 A: 화합물 305, 298, 299, 300, 301, 302, 514, 및 303
삼차-부틸 4-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페녹시)부타노에이트(1). N,N-디메틸포름아미드(2 mL) 중 4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페놀(209.12 mg, 0.95 mmol) 및 삼차-부틸 4-브로모부타노에이트(212 mg, 0.95 mmol)의 혼합물에 Cs2CO3(402.47 mg, 1.24 mmol)를 첨가하였다. 반응 혼합물을 65oC에서 12시간 동안(밤새) 가열하였다. 소량의 출발물질(Hex:AcOEt, 7:3)의 TCL에 의해, 미정제 생성물을 플래시 CC(SiO2-25g, Hex:AcOEt, 구배 9:1 내지 4:6)로 정제하여, 198 mg(57% 수율)의 생성물을 오일로서 수득하였다: 1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ 7.59 (d, J = 8.2 Hz, 2H), 6.91 (d, J = 7.9 Hz, 2H), 3.99 (t, J = 6.3 Hz, 2H), 2.35 (t, J = 7.3 Hz, 2H), 1.92 (p, J = 6.7 Hz, 2H), 1.39 (s, 9H), 1.27 (s, 12H).　13C NMR (101 MHz, dmso) δ 172.25, 161.56, 136.66, 114.37, 83.77, 80.12, 66.81, 31.72, 28.20, 25.12, 24.71. LC-MS (ESI); m/z [M+Na]+: Calcd. for C20H31BO5Na, 385.2162. Found 385.2194.
삼차-부틸 4-(4-(3-벤조일-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)부타노에이트(2). 디옥산(6 mL) 중 삼차-부틸 4-[4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페녹시]-부타노에이트(72 mg, 0.2 mmol) 및 (5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-페닐-메타논(59.85 mg, 0.2 mmol) 용액을 진공 하에서 탈기하고 아르곤으로 퍼지하였다. 트리시클로헥실포스핀(5.57 mg, 0.02 mmol) 및 Pd(dba)2(5.71 mg, 0.01 mmol)을 반응 혼합물에 첨가하고 반응 혼합물을 진공 하에서 탈기하고 아르곤으로 퍼지하였다. 이어서 K2CO3(82.4 mg, 0.6 mmol)을 첨가한 후, 물(2 mL)를 첨가하고, 반응 혼합물을 진공 하에서 탈기하고, 아르곤으로 퍼지하였다. 반응 혼합물을 90℃에서 2시간 동안 가열하였다. 일부 SM(Hex:AcOEt, 3:7)의 TLC으로, 추가 양의 트리시클로헥실포스핀(5.57 mg, 0.02 mmol) 및 Pd(dba)2(5.71 mg, 0.01 mmol)을 2회 첨가하고 반응 혼합물을 추가로 2시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 AcOEt(20 mL)로 희석하고, 건조시키고(Na2SO4), 진공 중의 셀라이트 패드 상에서 여과하고, 여과물을 건조시키고(Na2SO4), 진공 중에서 농축시켰다. 미정제 물질을 DCM 중에서 희석하고 플래쉬 크로마토그래피(SiO2-40g, 구배 Hex:AcOEt, 구배 9:1 내지 100% AcOEt)로 정제하여 69 mg(68%)의 생성물을 회백색 고체로서 수득하였다. 1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ 12.68 (s, 1H), 8.65 (s, 1H), 8.60 (s, 1H), 8.10 (s, 1H), 7.82 (d, J = 7.5 Hz, 2H), 7.58 (dt, J = 36.0, 7.9 Hz, 5H), 7.04 (d, J = 8.1 Hz, 2H), 4.16 - 3.83 (m, 2H), 2.37 (t, J = 6.5 Hz, 2H), 1.95 (dd, J = 11.4, 5.5 Hz, 2H), 1.39 (s, 9H).　13C NMR (126 MHz, dmso) δ 189.81, 171.86, 158.13, 148.26, 143.24, 139.62, 136.43, 131.45, 130.82, 130.66, 128.52, 128.48, 128.16, 127.01, 118.77, 115.13, 113.73, 79.68, 66.63, 31.36, 27.77, 24.37.　LC-MS (ESI); m/z: [M+H]+ Calcd. for C28H29N2O4, 457.2127. Found 457.2156.
4-(4-(3-벤조일-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)부탄산(3). TFA(1 ml, 13.46 mmol) 및 디클로로메탄(3 ml)의 혼합물 중 삼차-부틸 4-(4-(3-(2,6-디플루오로벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)-페녹시)부타노에이트(30 mg, 0.06 mmol) 용액을 1시간 동안 교반하였다. 이어서, 용매를 진공 중에서 제거하고 미정제 생성물을 고진공 중에서 2시간 동안 건조시켰다. 미정제 생성물(26.5 mg, 정량적 수율)을 추가 정제 없이 다음 단계에서 사용하였다. LC-MS (ESI); m/z: [M+H]+ Calcd. for　C24H21N2O4, 401.1501. Found 401.1420.
(2S,4R)-1-((S)-2-(4-(4-(3-벤조일-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)부탄아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드(화합물 305). DMF(2 ml) 중 4-[4-(3-벤조일-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)-페녹시]부탄산(26.5 mg, 0.07 mmol) 및 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸- 부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드; 염화수소(30.91 mg, 0.07 mmol) 용액에 TEA (0.2 ml, 1.43 mmol) 및 PyBOP(37.88 mg, 0.07 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 동일한 온도에서 12시간 동안(밤새) 교반하였다. TLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)는 출발 물질이 없음을 나타낸다. DMF를 고진공 중에서 제거하였다. 용리액으로 DCM:MeOH(9:1)를 사용하는 실리카-카보네이트 카트리지(1 g) 상에서 미정제 생성물을 여과하였다. 여과물을 진공 중에서 증발시키고 미정제 생성물을 PTLC(MeOH:DCM, 9:1)로 정제하여 31 mg의 생성물을 수득하였다(58% 수율). 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 12.70 (s, 1H), 8.97 (s, 1H), 8.68 (d, J = 2.2 Hz, 1H), 8.62 (d, J = 2.3 Hz, 1H), 8.60 - 8.51 (m, 1H), 8.12 (s, 1H), 8.00 (d, J = 9.3 Hz, 1H), 7.90 - 7.77 (m, 1H), 7.72 - 7.51 (m, 5H), 7.48 - 7.29 (m, 4H), 7.07 (d, J = 8.7 Hz, 2H), 5.15 (d, J = 3.5 Hz, 1H), 4.59 (d, J = 9.3 Hz, 1H), 4.50 - 4.32 (m, 3H), 4.22 (dd, J = 15.9, 5.4 Hz, 1H), 4.03 (td, J = 6.5, 2.6 Hz, 2H), 3.80 - 3.60 (m, 2H), 2.44 (s, 3H), 2.48 - 2.28 (m, 5H), 2.13 - 1.84 (m, 4H), 0.96 (s, 9H).　13C NMR (101 MHz, dmso) δ 189.87, 172.00, 171.63, 169.69, 158.23, 151.48, 148.29, 147.73, 143.29, 139.64, 139.53, 136.54, 131.52, 131.19, 130.74, 129.65, 128.66, 128.58, 128.55, 128.21, 127.44, 127.05, 118.81, 115.19, 113.74, 68.93, 67.13, 58.75, 56.47, 48.64, 41.68, 38.01, 35.29, 31.33, 26.43, 25.08, 15.99. 　LC-MS (ESI); m/z [M+H]+: Calcd. for C46H49N6O6S, 813.3434. Found 813.3478.
(2S,4R)-1-((S)-2-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]-피리딘-5-일)페녹시]부탄아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)-벤질)피롤리딘-2-카르복사미드 (화합물 514).
DMF(1.5 ml) 중 4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]부탄산(4.08 mg, 0.00732 mmol) 및 (2S,4S)-1-((S)-2-아미노-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)-피롤리딘-2-카르복사미드(3.76 mg, 0.00873 mmol) 용액에 TEA(0.200 mL, 1.43 mmol) 및 PyBOP(4.19 mg, 0.00805 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 동일한 온도에서 4시간 동안 교반하였다. TLC(DCM:MB, 1:1)는 출발 물질이 없음을 나타낸다. DMF를 고진공 중에서 제거하였다(생성물은 부분적으로 수용성임). 용리액으로 DCM:MeOH(9:1)를 사용하는 실리카-카보네이트 카트리지 상에서 미정제 생성물을 여과하였다. 여과물을 진공 중에서 증발시키고 미정제 생성물을 PTLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)로 정제하여 3.1 mg의 생성물을 수득하였다(43% 수율). 1H　(500 MHz, DMSO-d6) δ 12.83 (bs, 1H), 9.64 (bs, 1H), 8.96 (s, 1H), 8.77 - 8.41 (m, 3H), 8.18 (s, 1H), 7.97 (d, J = 8.6 Hz, 1H), 7.65 (d, J = 8.5 Hz, 2H), 7.61 - 7.48 (m, 1H), 7.38 (q, J = 8.2 Hz, 4H), 7.26 (t, J = 8.7 Hz, 1H), 7.04 (d, J = 8.7 Hz, 2H), 5.43 (d, J = 7.2 Hz, 1H), 4.54 - 4.31 (m, 3H), 4.30 - 4.15 (m, 2H), 4.08 - 3.88 (m, 3H), 3.50 - 3.40 (m, 1H), 3.16 - 3.02 (m, 2H), 2.44 - 2.26 (m, 3H), 2.42 (s, 3H), 2.04 - 1.88 (m, 2H), 1.79 - 1.63 (m, 3H), 0.95 (s, 9H), 0.94 (t, 3H). 13C　NMR (151 MHz, DMSO-d6) δ 181.03 , 172.89 , 172.34 , 170.35 , 158.75 , 156.44 (dd, J = 246.1, 6.7 Hz), 152.78 (dd, J = 249.5, 8.6 Hz), 151.89 , 148.94 , 148.15 , 144.15 , 139.63 , 139.07 , 131.74 , 131.55 , 130.82 , 130.14 , 129.36 - 129.11 (m), 129.08 , 128.68 , 127.86 , 126.85 , 122.35 (dd, J = 13.6, 3.4 Hz), 117.94 , 116.03 , 115.59 , 69.53 , 67.52 , 58.95 , 57.24 , 56.04 , 53.86 , 42.21 , 37.36 , 35.11 , 31.62 , 26.82 , 25.42 , 17.26 , 16.37 , 13.04. LC-MS (ESI); m/z [M+H]+: Calcd. for C49H54F2N7O8S2, 970.3443. Found　970.3422
실시예 16-합성 반응식 B: 217, 220, 510, 및 221
삼차-부틸(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)카바메이트(5a). 디옥산(3 ml) 중 삼차-부틸 (4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)-카바메이트(50.99 mg, 0.16 mmol) 용액에 N-[3-(5-브로모-1-H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로-페닐]프로판-1-설폰아미드(0.06 ml, 0.13 mmol), K2CO3(55.19 mg, 0.4 mmol), 트리시클로헥실포스핀(3.73 mg, 0.01 mmol) 및 물(1 mL)을 첨가하였다. 이어서, 반응 혼합물을 진공 중에서 탈기하고 아르곤으로 퍼지한 후, Pd(dba)2(3.83 mg, 0.01 mmol)를 첨가하고 반응 혼합물을 80℃에서 3시간 동안 가열하였다. 소량의 SM(Hex:AcOEt, 3:7)의 TLC에 의해, 반응 혼합물을 진공 중의 셀라이트 패드 상에서 여과하고, 여과물을 NaCl(20 mL)의 포화 수용액에 붓고, 생성물을 EtOAc(2 x 20 mL)로 추출하였다. EtOAc 층을 합치고, 건조시키고(Na2SO4), 진공 중에서 농축시켰다. 미정제 물질을 DCM 중에서 희석하고, 플래쉬 크로마토그래피(SiO2-12 g, 헥산:AcOEt, 구배 8:2 내지 100% AcOEt)로 정제하여 47 mg(56%)의 생성물을 회백색 고체로서 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 12.96 (bs, 1H), 9.77 (bs, 1H), 9.49 (s, 1H), 8.68 (d, J = 2.1 Hz, 1H), 8.57 (bs, 1H), 8.21 (s, 1H), 7.79 - 7.46 (m, 5H), 7.28 (td, J = 8.7, 1.5 Hz, 1H), 3.19 - 3.07 (m, 2H), 1.74 (dq, J = 14.9, 7.4 Hz, 2H), 1.50 (s, 9H), 0.96 (t, J = 7.4 Hz, 3H). 13C NMR (151 MHz, dmso) δ 180.61, 156.03 (dd, J = 246.5, 7.1 Hz), 152.77, 152.34 (dd, J = 249.5, 8.5 Hz),　　 148.60, 143.76, 139.22, 138.64, 131.66, 131.31, 128.79 (d, J = 9.7 Hz), 127.35, 126.38, 121.94 (dd, J = 13.7, 3.6 Hz), 118.66, 118.24 (t, J = 23.5 Hz), 117.53, 115.63, 112.35 (dd, J = 22.6, 3.9 Hz), 79.19, 53.46, 28.15, 16.85, 12.62. LC-MS (ESI); m/z: [M+H]+ Calcd. for C28H29F2N4O5S, 571.1826. Found 571.1917.
N-(3-(5-(4-아미노페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)프로판-1-설폰아미드(6). TFE(2 mL) 중 삼차-부틸 (4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로-[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)카바메이트(30 mg, 0.05 mmol) 용액을 마이크로웨이브 보조 조건 하 140oC에서 3시간 동안 가열하였다. 반응 혼합물을 진공 중에서 건조시켜, 정량적 수율 23 mg의 생성물을 수득하였다. 미정제 생성물은 추가적인 정제 없이 다음 단계에 사용되었다. 　LC-MS (ESI); m/z: [M+H]+ Calcd. for C23H21F2N4O3S, 471.1302. Found 471.1351.　
삼차-부틸-5-((4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)아미노]-5-옥소펜타노에이트(7). THF(2 mL) 중 삼차-부틸 5-클로로-5-옥소펜타노에이트(21.96 mg, 0.11 mmol) 용액에 N-(3-(5-(4-아미노페닐)-1H-피롤로[2,3-b]-피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)프로판-1-설폰아미드(10 mg, 0.02 mmol)를 첨가하였다. 생성된 현탁액을 가열하고 12시간 동안(밤새) 환류시켰다. 반응 혼합물을 진공 중에서 증발시키고 미정제 생성물을 PTLC(MB:DCM, 4:6)로 정제하여 백색 분말 10.7 mg(79% 수율)을 수득하였다. 1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ 12.96 (bs, 1H), 10.04 (s, 1H), 9.76 (bs, 1H), 8.69 (d, J = 2.2 Hz, 1H), 8.59 (s, 1H), 8.21 (s, 1H), 7.75 (d, J = 8.7 Hz, 2H), 7.69 (d, J = 8.6 Hz, 2H), 7.59 (td, J = 9.0, 5.8 Hz, 1H), 7.28 (t, J = 9.2 Hz, 1H), 3.13 (dd, J = 8.7, 6.7 Hz, 2H), 2.39 (t, J = 7.4 Hz, 2H), 2.28 (t, J = 7.4 Hz, 2H), 1.83 (p, J = 7.4 Hz, 2H), 1.75 (h, J = 7.5 Hz, 2H), 1.41 (s, 9H), 0.96 (t, J = 7.4 Hz, 3H).　13C NMR (101 MHz, dmso) δ 181.01, 172.37, 171.16, 156.02 (dd, J = 246.3, 7.0 Hz), 152.34 (dd, J = 249.5, 8.5 Hz), 149.05, 144.18, 139.30, 139.05, 133.00, 131.62, 128.77 (d, J = 9.5 Hz), 127.75, 126.88, 121.96 (dd, J = 13.7, 3.5 Hz), 120.04, 118.74 - 117.84 (m), 117.94, 116.05, 112.34 (dd, J = 22.8, 3.0 Hz). 79.98, 53.89, 35.72, 34.53, 28.20, 20.93, 17.25, 13.02.　LC-MS (ESI); m/z: [M+H]+ Calcd. for C32H35F2N4O6S, 641.2245. Found 641.2473.　
5-((4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)아미노)-5-옥소펜탄산(8). TFA(1 ml, 13.46 mmol) 및 디클로로메탄(2 ml)의 혼합물 중 삼차-부틸 5-((4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)아미노)-5-옥소펜타노에이트(10.7 mg, 0.02 mmol) 용액을 2시간 동안 교반하였다. 이어서, 용매를 진공 중에서 제거하고 미정제 생성물을 고진공 중에서 2시간 동안 건조시켰다. 미정제 생성물(9.7 mg, 정량적 수율)을 추가 정제 없이 다음 단계에서 사용하였다. LC-MS (ESI); m/z: [M+H]+ Calcd. for　C28H27F2N4O6S, 585.1619. Found 585.1636.
N1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)-N5-((S)-1-((2S,4R)-4-하이드록시-2-((4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)카바모일)피롤리딘-1-일)-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일)글루타르아미드(화합물 217). DMF(1 ml) 중 5-((4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)-벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)아미노)-5-옥소펜탄산(9.7 mg, 0.02 mmol) 및 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸- 부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드; 염화수소(8.52 mg, 0.02 mmol) 용액에 TEA (0.1 ml, 0.72 mmol) 및 PyBOP(9.5 mg, 0.02 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 동일한 온도에서 4시간 동안 교반하였다. TLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)는 출발 물질이 없음을 나타낸다. 반응 혼합물을 EtOAc(10 mL)로 희석하고 염수(5 mL, 4회)로 세척하고, 유기상을 건조시키고(Na2SO4), 진공 중에서 증발시켰다. 미정제 생성물을 PTLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)로 정제하여 4.8 mg(29% 수율)의 생성물을 수득하였다. 1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ 10.02 (s, 1H), 8.97 (s, 1H), 8.68 (d, 1H), 8.64 - 8.52 (m, 2H), 8.21 (s, 1H), 7.95 (d, J = 9.2 Hz, 1H), 7.72 (dd, J = 36.7, 8.5 Hz, 4H), 7.62 - 7.54 (m, 1H), 7.40 (dd, 4H), 7.28 (t, J = 8.7 Hz, 1H), 5.16 (d, 2H), 4.56 (d, J = 9.3 Hz, 1H), 4.50 - 4.40 (m, 2H), 4.40 - 4.33 (m, 1H), 4.22 (dd, J = 15.8, 5.3 Hz, 1H), 3.76 - 3.62 (m, 2H), 3.16 - 3.05 (m, 2H), 2.44 (s, 3H), 2.41 - 2.17 (m, 4H), 2.09 - 2.01 (m, 1H), 1.98 - 1.80 (m, 3H), 1.74 (dq, J = 14.9, 7.4 Hz, 2H), 0.96 (s, 9H), 0.95 (t, 3H).　13C NMR (151 MHz, dmso) δ 181.06, 172.39, 172.17, 171.46, 170.15, 156.37 (dd, J = 246.6, 6.3 Hz), 152.73 (dd, J = 249.4, 8.1 Hz), 151.86, 149.05, 148.13, 144.19, 139.91, 139.37, 139.13, 132.97, 131.64, 131.59, 130.05, 129.22 (d, J = 14.7 Hz), 129.06, 127.84, 127.74, 126.89, 122.47 (d, J = 14.1 Hz), 120.07, 119.02 - 118.20 (m), 117.95, 116.06, 112.75 (dd, J = 23.4, 2.8 Hz), 69.34, 59.15, 56.90, 56.81, 53.87, 42.08, 38.38, 36.36, 35.63, 34.63, 26.85, 21.91, 17.27, 16.37, 13.04. LC-MS (ESI); m/z [M+H]+: Calcd. for C50H55F2N8O8S2, 997.3552. Found 997.3524.
N1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)-N4-((S)-1-((2S,4R)-4-하이드록시-2-((4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)카바모일)피롤리딘-1-일)-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일)-N1-메틸석신아미드(화합물 510).
DMF(2 ml) 중 4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-(프로필설포닐아미노)-벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]-N-메틸-아닐리노]-4-옥소-부탄산(33.7 mg, 0.06 mmol) 및 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드;염화수소(4) (32.31 mg, 0.07 mmol) 용액에 TEA(0.2 ml, 1.43 mmol) 및 PyBOP(36 mg, 0.07 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 동일한 온도에서 4시간 동안 교반하였다. TLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)는 일부 출발 물질(산)을 나타내었다. 반응 혼합물을 고진공 하에서 건조될 때까지 증발시켰다. 미정제 생성물을 PTLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)로 정제하여 4.6 mg의 생성물(8% 수율)을 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 13.01 (bs, 1H), 9.70 (bs, 1H), 8.95 (s, 1H), 8.73 (d, J = 2.3 Hz, 1H), 8.66 (bs, 1H), 8.54 (t, J = 5.9 Hz, 1H), 8.22 (s, 1H), 7.84 (dd, J = 19.4, 8.6 Hz, 2H), 7.57 (td, J = 9.0, 6.1 Hz, 1H), 7.52 - 7.30 (m, 6H), 7.26 (t, J = 8.5 Hz, 1H), 5.08 (d, J = 3.2 Hz, 1H), 4.47 (d, J = 9.2 Hz, 1H), 4.44 - 4.25 (m, 3H), 4.19 (dd, J = 16.0, 5.4 Hz, 1H), 3.66 - 3.54 (m, 2H), 3.19 (s, 3H), 3.16 - 3.00 (m, 2H), 2.75 - 2.16 (m, 4H), 2.42 (s, 3H), 2.06 - 1.96 (m, 1H), 1.93 - 1.80 (m, 1H), 1.79 - 1.64 (m, 2H), 0.94 (t, 3H), 0.90 (s, 9H). 13C NMR (151 MHz, DMSO-d6) δ 181.08 , 172.37 , 171.90 , 171.57 , 170.00 , 156.45 (dd, J = 246.4, 7.0 Hz), 152.76 (dd, J = 249.3, 8.9 Hz), 151.88 , 149.37 , 148.13 , 144.49 , 143.73 , 139.91 , 139.34 , 137.64 , 131.59 , 131.11 , 130.04 , 129.53 - 129.16 (m), 129.06 , 127.84 , 127.55 , 122.35 (d, J = 15.0 Hz), 119.06 - 118.23 (m), 117.93 , 116.13 , 112.77 (d, J = 22.0 Hz), 69.31 , 59.13 , 56.87 , 56.75 , 53.86 , 42.07 , 38.32 , 35.76 , 30.61 , 29.66 , 26.77 , 22.93 , 17.26 , 16.37 , 13.04. LC-MS (ESI); m/z [M+H]+: Calcd. for C50H55F2N8O8S2, 997.3552. Found 997.3572.
실시예 17-합성 반응식 C: 화합물 218, 219, 및 222
삼차-부틸 4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)피페라진-1-카르복실레이트(9a). THF(3 mL) 중 N-[3-(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로-페닐]프로판-1-설폰아미드(61 mg, 0.13 mmol) 및 삼차-부틸 피페라진-1-카르복실레이트(37.19 mg, 0.2 mmol) 용액을 아르곤으로 퍼지하였다(5회). RuPhos(18.63 mg, 0.04 mmol) 및 Pd(OAc)2(2.99 mg, 0.01 mmol)을 첨가한 후 THF(0.53 ml) 중 1 M LHMDS를 첨가하였다. 반응 혼합물을 60℃로 가열하고 6시간 동안 교반하였다. 반응물을 냉각시키고 옥살산(5%, 2 ml) 수용액에 붓고, 이어서 NaHCO3(5 ml) 포화 수용액을 첨가하고, 생성물을 DCM(3 x 10 ml)으로 추출하였다. 유기 추출물을 합치고, 건조시키고(Na2SO4) 진공 중에서 증발시켰다. 미정제 생성물을 PTLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)로 정제하여 생성물(20 mg, 26%)을 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 12.61 (bs, 1H), 9.73 (bs, 1H), 8.27 (d, J = 2.6 Hz, 1H), 8.03 (s, 1H), 7.94 (bs, 1H), 7.57 (td, J = 9.0, 5.9 Hz, 1H), 7.26 (td, J = 8.7, 1.5 Hz, 1H), 3.63 - 3.46 (m, 4H), 3.42 - 3.24 (m, 4H), 3.20 - 3.06 (m, 2H), 1.74 (dq, J = 15.0, 7.4 Hz, 2H), 1.43 (s, 9H), 0.96 (t, J = 7.4 Hz, 3H). 13C NMR (101 MHz, dmso) δ 180.37, 155.96 (dd, J = 246.2, 7.2 Hz), 153.87, 152.31 (dd, J = 249.1, 8.6 Hz), 144.72, 144.31, 138.06, 137.78, 128.59 (d, J = 7.8 Hz), 121.94 (dd, J = 13.6, 3.7 Hz), 119.35 - 117.93 (m), 117.56, 115.58, 115.17, 112.25 (dd, J = 22.7, 3.8 Hz), 79.01, 53.49, 50.03, 43.56, 28.07, 16.84, 12.61. LC-MS (ESI); m/z: [M+H]+ Calcd. for C26H32F2N5O5S, 564.2092. Found 564.2
N-(2,4-디플루오로-3-(5-(피페라진-1-일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)페닐)프로판-1-설폰아미드(9b). DCM:TFA(3 mL:1 mL)의 혼합물 중 삼차-부틸 4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로-[2,3-b]피리딘-5-일)피페라진-1-카르복실레이트(20 mg, 0.04 mmol) 용액을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. TLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)은 출발 물질이 완전히 소모되었음을 나타내었다. 16.4 mg(정량적 수율)의 미정제 생성물은 추가 정제 없이 다음 단계에서 사용되었다. LC-MS (ESI); m/z [M+H]+: Calcd. for C21H24F2N5O3S, 464.1567. Found 464.1712.
삼차-부틸 5-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)피페라진-1-일)-5-옥소펜타노에이트(10). DMF(2 ml) 중 N-(2,4-디플루오로-3-(5-(피페라진-1-일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-페닐)프로판-1-설폰아미드(16.4 mg, 0.04 mmol) 및 5-(삼차-부톡시)-5-옥소펜탄산(7.99 mg, 0.04 mmol) 용액에 TEA(0.1 ml, 0.72 mmol) 및 PyBOP(20.25 mg, 0.04 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 동일한 온도에서 3시간 동안 교반하였다. TLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)는 출발 물질이 없음을 나타낸다. 반응 혼합물을 EtOAc(10 mL)에 용해시키고 염수/물(3 x 5 mL)로 세척하였다. 유기 추출물을 진공 중에서 농축시키고 미정제 생성물을 PTLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)로 정제하여 15.4 mg의 생성물(69% 수율)을 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 12.67 (bs, 1H), 9.71 (bs, 1H), 8.29 (s, 1H), 8.03 (s, 1H), 7.95 (s, 1H), 7.56 (q, J = 8.8 Hz, 1H), 7.26 (t, J = 8.7 Hz, 1H), 3.71 - 3.57 (m, 4H), 3.24 - 3.06 (m, 6H), 2.39 (t, J = 7.3 Hz, 2H), 2.26 (t, J = 7.3 Hz, 2H), 1.84 - 1.66 (m, 4H), 1.40 (s, 9H), 0.96 (t, J = 7.4 Hz, 3H).　13C NMR (101 MHz, dmso) δ 180.79, 172.52, 170.57, 156.37 (dd, J = 246.4, 7.1 Hz), 152.72 (dd, J = 249.2, 8.7 Hz), 145.03, 144.70, 138.44, 138.20, 129.01 (d, J = 10.4 Hz), 122.34 (dd, J = 13.7, 3.7 Hz), 119.28 - 118.29 (m), 117.97, 115.84, 115.58, 112.66 (dd, J = 22.8, 3.3 Hz), 79.92, 53.89, 50.66, 45.18, 41.39, 34.57, 31.72, 28.21, 20.83, 17.25, 13.02. 　LC-MS (ESI); m/z [M+H]+: Calcd. for C30H38F2N5O6S, 634.2510. Found 634.2621.　
5-((4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)아미노)-5-옥소펜탄산(11). TFA(1 ml, 13.46 mmol) 및 디클로로메탄(2 ml)의 혼합물 중 삼차-부틸 5-((4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)아미노)-5-옥소펜타노에이트(10.7 mg, 0.02 mmol) 용액을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 이어서, 용매를 진공 중에서 제거하고 미정제 생성물을 고진공 중에서 2시간 동안 건조시켰다. 미정제 생성물(9.7 mg, 정량적 수율)을 추가 정제 없이 다음 단계에서 사용하였다. LC-MS (ESI); m/z: [M+H]+ Calcd. for　C28H27F2N4O6S, 585.1619. Found 585.1636.
(2S,4R)-1-((S)-2-(5-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)피페라진-1-일)-5-옥소펜탄아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드(화합물 218). DMF(1 ml) 중 5-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)-벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)피페라진-1-일)-5-옥소펜탄산(9.3 mg, 0.02 mmol) 및 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸- 부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드; 염화수소(8.27 mg, 0.018 mmol) 용액에 TEA (0.1 ml, 0.72 mmol) 및 PyBOP(9.22 mg, 0.018 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 동일한 온도에서 4시간 동안 교반하였다. TLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)는 출발 물질이 없음을 나타낸다. 반응 혼합물을 EtOAc(10 mL)로 희석하고 염수(5 mL, 4회)로 세척하고, 유기상을 건조시키고(Na2SO4), 진공 중에서 증발시켰다. TLC는 미정제 혼합물 중 생성물을 나타내지 않았고, 단지 일부 VHL 출발 물질(4)(생성물은 수용성임)을 나타내었다. 물 추출물을 밤새 동결건조시키고, 고체 잔류물을 DCM:MeOH:NH4OH (90:9:1, 30 mL)의 혼합물을 사용하여 여과하였다. 여과물을 건조될 때까지 증발시키고 미정제 생성물을 PTLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)로 정제하여 13 mg의 생성물을 수득하였다(81% 수율). 1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ 12.64 (bs, 1H), 9.74 (bs, 1H), 8.97 (s, 1H), 8.62 - 8.52 (m, 3H), 8.28 (d, J = 2.0 Hz, 1H), 8.00 (s, 1H), 7.95 (bs, 1H), 7.90 (d, J = 9.2 Hz, 1H), 7.59 - 7.49 (m, 1H), 7.47 - 7.27 (m, 4H), 7.20 (t, J = 8.7 Hz, 1H), 5.13 (bs, 1H), 4.56 (d, J = 9.3 Hz, 1H), 4.48 - 4.32 (m, 3H), 4.22 (dd, J = 15.8, 5.3 Hz, 1H), 3.75 - 3.57 (m, 5H), 3.23 - 3.02 (m, 7H), 2.44 (s, 3H), 2.41 - 2.17 (m, 4H), 2.07 - 2.01 (m, 1H), 1.96 - 1.87 (m, 1H), 1.81 - 1.66 (m, 4H), 0.95 (s, 9H), 0.94 (t, 3H).　 13C NMR (151 MHz, dmso) δ 180.70, 171.99, 171.92, 170.44, 169.75, 155.24 (dd, J = 248.1, 5.5 Hz), 152.12 (dd, J = 248.8, 8.5 Hz), 151.47, 147.73, 144.63, 144.31, 139.52, 138.02, 137.75, 131.19, 129.65, 128.65, 127.98 - 127.64 (m), 127.44, 123.91 - 123.09 (m), 118.86 - 117.72 (m), 117.60, 115.50, 115.23, 112.02 (dd, J = 22.6, 3.2 Hz), 68.92, 58.74, 56.47, 56.43, 53.44, 50.31, 50.18, 48.63, 44.86, 41.68, 41.00, 37.99, 34.28, 31.80, 26.43, 21.36, 16.99, 15.97, 12.72. 　LC-MS (ESI); m/z [M+H]+: Calcd. for C48H58F2N9O8S2, 990.3817. Found 990.3889.
실시예 18-합성 반응식 C: 화합물 304, 및 306
삼차-부틸 4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-(프로필설포닐아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]피페라진-1-일]부타노에이트(12). DMF(1 ml) 중 메틸 N-[2,4-디플루오로-3-(5-피페라진-1-일-1H-피롤로[2,3-b]-피리딘-3-카르보닐)페닐]프로판-1-설폰아미드); 2,2,2-트리플루오로아세트산(17.4 mg, 0.03 mmol) 및 삼차-부틸 4-요오도부타노에이트(8.95 mg, 0.03 mmol) 용액에 TEA(0.03 ml, 0.15 mmol)를 첨가하고, 생성된 용액을 50℃에서 16시간 동안(밤새) 교반하였다. 용매를 고진공 중에서 증발시키고 잔류물을 용리액으로 DCM:MeOH(9:1)를 사용하는 실리카-카보네이트 카트리지(1 g) 상에서 여과하였다. 여과물을 진공 중에서 증발시키고 미정제 생성물을 PTLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)로 정제하여 8.8 mg의 생성물을 수득하였다(48% 수율). 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 12.63 (bs, 1H), 9.73 (bs, 1H), 8.25 (d, J = 2.7 Hz, 1H), 8.00 (s, 1H), 7.89 (bs, 1H), 7.56 (td, J = 9.0, 6.0 Hz, 2H), 7.34 - 7.16 (m, 1H), 3.25 - 3.04 (m, 6H), 2.68 - 2.52 (m, 4H), 2.34 (t, J = 7.1 Hz, 2H), 2.24 (t, J = 7.2 Hz, 2H), 1.85 - 1.61 (m, 4H), 1.40 (s, 9H), 0.96 (t, J = 7.4 Hz, 3H). 13C NMR (151 MHz, DMSO-d6) δ 180.34 , 172.23 , 155.99 (dd, J = 246.1, 7.0 Hz), 152.31 (dd, J = 249.3, 8.6 Hz), 144.80 , 143.96 , 137.64 , 137.36 , 128.60 (d, J = 9.9 Hz), 121.91 (dd, J = 13.6, 3.7 Hz), 118.41 (t, J = 23.8 Hz), 117.63 , 115.12 , 114.54 , 112.26 (dd, J = 22.8, 3.7 Hz), 56.95 , 53.47 , 52.70 , 49.72 , 32.69 , 27.83 , 21.79 , 16.86 , 12.63. LC-MS (ESI); m/z: [M+H]+ Calcd. for C29H38F2N5O5S, 606.2561. Found 606.2504.
4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-(프로필설포닐아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]피페라진-1-일]부탄산(13). TFA(1 ml, 13.46 mmol) 및 디클로로메탄(3 ml)의 혼합물 중 삼차-부틸 4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-(프로필설포닐아미노)벤조일] -1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]피페라진-1-일]부타노에이트(8.8 mg, 0.01 mmol) 용액을 1시간 동안 교반하였다. 이어서, 용매를 진공 중에서 제거하고 미정제 생성물을 고진공 중에서 2시간 동안 건조시켰다. 미정제 생성물(7.9 mg, 정량적 수율)을 추가 정제 없이 다음 단계에서 사용하였다. LC-MS (ESI); m/z: [M+H]+ Calcd. for　　C25H30F2N5O5S, 550.1936. Found 550.1865.
(2S,4R)-1-((S)-2-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)피페라진-1-일)부탄아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드(화합물 304). DMF(1 ml) 중 4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-(프로필설포닐-아미노)-벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]피페라진-1-일]부탄산(7.9 mg, 0.01 mmol) 및 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸- 부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드; 염화수소(7.38 mg, 0.02 mmol) 용액에 TEA (0.1 ml, 0.72 mmol) 및 PyBOP(8.23 mg, 0.02 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 동일한 온도에서 12시간 동안(밤새) 교반하였다. TLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)는 출발 물질이 없음을 나타낸다. 반응 혼합물을 건조될 때까지 증발시켰다. 용리액으로 DCM:MeOH(9:1)를 사용하는 실리카-카보네이트 카트리지(1 g) 상에서 미정제 생성물을 여과하였다(수회 세척하였고, 생성물은 정지상에 대해 높은 친화성을 가짐). 여과물을 진공 중에서 증발시키고 미정제 생성물을 PTLC(DCM:MeOH, 9:1)로 정제하여 7.2 mg의 생성물을 수득하였다(52% 수율). 1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ 12.66 (bs, 1H), 9.73 (bs, 1H), 8.96 (s, 1H), 8.61 - 8.50 (m, 1H), 8.25 (s, 1H), 8.00 (s, 1H), 7.93 (bs, 1H), 7.88 (d, J = 9.1 Hz, 1H), 7.63 - 7.49 (m, 1H), 7.40 (dd, 4H), 7.25 (t, J = 8.7 Hz, 1H), 5.14 (s, 1H), 4.56 (d, J = 9.1 Hz, 1H), 4.46 - 4.34 (m, 3H), 4.22 (dd, J = 15.8, 4.7 Hz, 1H), 3.75 - 3.60 (m, 2H), 3.23 - 3.14 (m, 4H), 3.13 - 3.08 (m, 2H), 2.65 - 2.53 (m, 4H), 2.43 (s, 3H), 2.38 - 2.31 (m, 2H), 2.31 - 2.25 (m, 1H), 2.24 - 2.16 (m, 1H), 2.07 - 1.99 (m, 1H), 1.95 - 1.87 (m, 1H), 1.72 (dq, J = 16.3, 10.5, 8.9 Hz, 4H), 0.95 (t, J = 5.3 Hz, 3H), 0.95 (s, 9H).　13C NMR (151 MHz, DMSO-d6) δ 180.77 , 172.43 , 172.39 , 170.12 , 156.38 (dd, J = 246.2, 7.1 Hz), 152.75 (dd, J = 249.8, 9.0 Hz), 151.87 , 148.13 , 145.23 , 144.35 , 139.92 , 138.09 , 137.78 , 131.59 , 130.05 ,　　129.21 - 128.76 (m),　　127.84 , 122.32 (d, J = 13.1 Hz), 119.83 - 118.25 (m), 118.03 , 115.53 , 114.96 , 112.68 (d, J = 22.7 Hz), 69.30 , 59.13 , 57.62 , 56.79 , 55.33 , 53.88 , 53.06 , 50.11 , 42.07 , 38.38 , 35.68 , 33.27 , 26.83 , 23.09 , 17.26 , 16.37 , 13.04.　 LC-MS (ESI); m/z [M+H]+: Calcd. for C47H58F2N9O7S2, 962.3868. Found 962.3986.
실시예 19-합성 반응식 E: 화합물 511, 및 513
삼차-부틸 3-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일) 벤즈아미도)프로파노에이트 (14).
N,N-디메틸포름아미드(10 ml) 중 4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2일)벤조산(538 mg, 2.17 mmol) 및 삼차-부틸 3-아미노프로파노에이트 (315 mg, 2.17 mmol)의 용액에 N,N-디이소프로필에틸아민(1.13 mL, 6.51 mmol) 및 O-(7-아자벤조트리아졸-1-일)-N,N,N',N'-테트라메틸우로늄 헥사플루오로포스페이트(825 mg, 2.17 mmol)을 실온에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 동일한 온도에서 4시간 동안 교반하였다. TLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)는 출발 물질이 없음을 나타낸다. 반응 혼합물을 EtOAc (50 mL)로 희석하고, 물/염수(4x30 mL)로 세척하고, 건조시키고(Na2SO4) 진공 중에서 증발시켰다. 미정제 생성물을 플래쉬 크로마토그래피(SiO2-25g, 구배 Hex:EtOAc, 1:9 내지 100% EtOAc, 15분)로 정제하여, 471 mg의 생성물을 수득하였다(NMR에 의해 ~90% 순수, 52% 수율). 이 생성물은 추가적인 정제 없이 다음 단계에 사용되었다. 1H NMR (500 MHz, Chloroform-d) δ 7.86 (d, J = 7.9 Hz, 2H), 7.74 (d, J = 7.9 Hz, 2H), 6.87 (t, 1H)z 3.69 (q, J = 5.9 Hz, 2H), 2.56 (t, J = 5.8 Hz, 2H), 1.45 (s, 9H), 1.35 (s, 12H). LC-MS (ESI); m/z [M+H]+: Calcd. for C20H31BNO5, 376.2295. Found 376.2259.　
삼차-부틸 3-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)벤즈아미도)-프로파노에이트(15).
디옥산(6 ml) 중 N-[3-(5-브로모-1-H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로-페닐]프로판-1-설폰아미드(5) (87.3 mg, 0.191 mmol) 용액에, 삼차-부틸 2-[2-[2-[2-[4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페녹시]에톡시]에톡시]에톡시]아세테이트(14) (65.0 mg, 0.173 mmol), K2CO3 (71.8 mg, 0.520 mmol), 트리시클로헥실 포스핀(4.86 mg,　0.017 mmol) 및 물(2 mL)을 첨가하였다. 이어서 반응 혼합물을 진공 하에서 탈기하고 아르곤(5x)으로 퍼지하고, Pd(dba)2 (4.98 mg, 0.080 mmol)을 내부에 첨가하고 반응 혼합물을 90℃에서 3시간 동안 가열하였다. TLC 소량의 SM(Hex:EtOAc, 3:7)에 의해, 반응 혼합물을 셀라이트 패드 상에서 진공 중에 여과하고, 여과물을 NaCl(20 mL)의 포화 수용액에 붓고, 생성물을 EtOAc(2x20 mL)로 추출하였다. EtOAc 층을 합치고, 건조시키고(Na2SO4) 진공 중에서 농축시켰다. 미정제 물질을 CH2Cl2에서 희석하고 플래쉬 크로마토그래피(SiO2-12g, 헥산:EtOAc, 9:1 내지 100% EtOAc, 15분)로 정제하여 75 mg(71%)의 생성물을 수득하였다. 13C　NMR (101 MHz, DMSO-d6) δ 181.08 , 171.05 , 166.24 , 156.44 (dd, J = 246.3, 6.9 Hz), 152.76 (dd, J = 249.7, 8.2 Hz), 149.55 , 144.57 , 141.15 , 139.40 , 133.71 , 130.98 , 129.65 - 128.79 (m), 128.43 , 127.64 , 127.55 - 126.10 (m), 122.66 - 122.12 (m), 119.00 - 118.20 (m), 117.93 , 116.15 , 112.78 (dd, J = 22.9, 3.5 Hz), 80.28 , 53.88 , 36.10 , 35.45 , 28.17 , 17.25 , 13.03 . 1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ 13.03 (bs, 1H), 9.76 (bs, 1H), 8.78 (s, 1H), 8.69 (s, 1H), 8.61 (t, J = 4.6 Hz, 1H), 8.26 (s, 1H), 7.98 (d, J = 7.1 Hz, 2H), 7.87 (d, J = 7.2 Hz, 2H), 7.59 (q, J = 7.6 Hz, 1H), 7.29 (t, J = 8.7 Hz, 1H), 3.50 (q, J = 5.7 Hz, 2H), 3.13 (t, 2H), 2.64 - 2.44 (m, 2H), 1.74 (dq, J = 13.9, 7.3 Hz, 2H), 1.40 (s, 9H), 0.96 (t, J = 7.4 Hz, 3H). LC-MS (ESI); m/z [M+H]+: Calcd. for　C31H33F2N4O6S, 627.2088. Found　627.2485.　
(2S,4R)-1-((S)-2-(3-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)-벤즈아미도]프로판아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드(화합물 511).
TFA(1 ml, 13.46 mmol) 및 디클로로메탄(3 ml)의 혼합물 중 삼차-부틸 4-[4-(3-벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시]부타노에이트(15) (26.0 mg, 0.0415 mmol) 용액을 1.5시간 동안 교반하였다. 이어서, 용매를 진공 중에서 제거하고 미정제 생성물을 고진공 중에서 2시간 동안 건조시켰다. 미정제 생성물을 추가 정제 없이 다음 단계에서 사용하였다(23.5 mg, 정량적 수율). LS-MS (ESI); m/z: [M+H]+ Calcd. for　　C27H25F2N4O6S,　571.1462. Found　571.1812. 상기 미정제 생성물의 용액; DMF(1 ml) 중 4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-(프로필설포닐아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]-N-메틸-아닐리노]-4-옥소-부탄산(23.5 mg, 0.0402 mmol) 및 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드;염화수소(4) (21.0 mg, 0.0450 mmol)에 TEA (0.139 mL, 1.00 mmol) 및 PyBOP(23.4 mg, 0.0450 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 동일한 온도에서 4시간 동안 교반하였다. TLC(DCM:MB, 1:1)는 출발 물질(산)을 나타내지 않는다. 반응 혼합물을 고진공 하에서 건조될 때까지 증발시켰다(생성물은 수용성임). 용리액으로 DCM:MeOH(9:1)를 사용하는 실리카-카보네이트 카트리지(100 mg) 상에서 미정제 생성물을 여과하였다. 여과물을 진공 중에서 증발시키고 미정제 생성물을 PTLC(MBLDCM, 1:1)로 정제하였다. PTLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)에 의해 제2 정제를 수행하여, 27 mg의 생성물을 수득하였다(73% 수율). 1H　NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ 13.03 (bs, 1H), 9.77 (bs, 1H), 8.96 (s, 1H), 8.77 (s, 1H), 8.69 (s, 1H), 8.57 (t, J = 5.7 Hz, 1H), 8.53 (t, J = 4.9 Hz, 1H), 8.26 (s, 1H), 8.03 (d, J = 9.1 Hz, 1H), 7.98 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 7.86 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 7.59 (q, J = 8.8 Hz, 1H), 7.40 (dd, 4H), 7.28 (t, J = 8.6 Hz, 1H), 5.16 (d, J = 2.8 Hz, 1H), 4.58 (d, J = 9.1 Hz, 1H), 4.50 - 4.34 (m, 3H), 4.22 (dd, J = 15.8, 5.1 Hz, 1H), 3.80 - 3.61 (m, 2H), 3.58 - 3.40 (m, 2H), 3.15 - 3.06 (m, 2H), 2.69 - 2.49 (m, 2H), 2.43 (s, 3H), 2.11 - 1.99 (m, 1H), 1.96 - 1.86 (m, 1H), 1.83 - 1.66 (m, 2H), 0.95 (t, 3H), 0.94 (s, 9H). 13C　NMR (151 MHz, DMSO-d6) δ 180.69 , 171.95 , 170.40 , 169.62 , 165.76 , 156.00 (dd, J = 246.6, 6.9 Hz), 152.34 (dd, J = 249.4, 8.3 Hz), 151.42 , 149.13 , 147.71 , 144.14 , 140.67 , 139.50 , 138.99 , 133.39 , 131.16 , 130.58 , 129.64 , 128.81 (d, J = 9.8 Hz), 128.64 , 128.03 , 127.42 , 127.23 , 126.91 , 122.26 - 121.63 (m), 118.52 - 117.80 (m), 117.52 , 115.75 , 112.77 - 111.89 (m), 68.92 , 58.75 , 56.53 , 56.40 , 53.47 , 41.67 , 37.97 , 36.32 , 35.26 , 34.89 , 26.40 , 16.85 , 15.95 , 12.63. LC-MS (ESI); m/z [M+H]+: Calcd. for　C49H53F2N8O8S2,　983.3395. Found　983.3963.
실시예 20-합성 반응식 F: 화합물 512, 513, 및 516
삼차-부틸 4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)-피페라진-1-카르복실레이트(16).
디옥산(6 ml) 중 N-[3-(5-브로모-1-H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로-페닐]프로판-1-설폰아미드(5) (70.8 mg, 0.155 mmol) 용액에, 삼차-부틸 4-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)피페라진-1-카르복실레이트(60.0 mg, 0.155 mmol), K2CO3　(64.2 mg, 0.465 mmol), 트리시클로헥실 포스핀(4.33 mg, 0.0155 mmol) 및 물(2 mL)을 첨가하였다. 이어서 반응 혼합물을 진공 하에서 탈기하고 아르곤(5x)으로 퍼지하고, Pd(dba)2　(4.44 mg, 0.00773 mmol)을 내부에 첨가하고 반응 혼합물을 90℃에서 3시간 동안 가열하였다. TLC 소량의 SM(Hex:AcOEt, 3:7)에 의해, 반응 혼합물을 셀라이트 패드 상에서 진공 중에 여과하고, 여과물을 NaCl(20 mL)의 포화 수용액에 붓고, 생성물을 EtOAc(2x20 mL)로 추출하였다. EtOAc 층을 합치고, 건조시키고(Na2SO4) 진공 중에서 농축시켰다. 미정제 물질을 CH2Cl2에서 희석하고 플래쉬 크로마토그래피(SiO2-12g, 헥산:EtOAc, 9:1 내지 100% EtOAc, 15분)로 정제하여 82 mg(83%)의 생성물을 수득하였다. 13C　NMR (151 MHz, DMSO-d6) δ 180.61 , 156.04 (dd, J = 246.5, 6.9 Hz), 153.88 , 152.34 (dd, J = 249.4, 8.6 Hz), 150.35 , 148.44 , 143.61 , 138.60 , 131.47 , 128.92 - 128.75 (m), 128.19 (d, J = 161.3 Hz), 126.05 , 121.94 (dd, J = 13.6, 3.6 Hz), 118.96 - 117.87 (m), 117.60 , 116.33 , 115.61 , 112.36 (dd, J = 22.6, 3.2 Hz), 79.03 , 53.42 , 48.08 , 43.72 , 42.58 , 28.09 , 16.87 , 12.64 . 1H　NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ 12.92 (bs, 1H), 9.76 (bs, 1H), 8.66 (d, J = 2.2 Hz, 1H), 8.55 (s, 1H), 8.19 (s, 1H), 7.75 - 7.46 (m, 3H), 7.28 (t, J = 8.7 Hz, 1H), 7.10 (d, J = 8.7 Hz, 2H), 3.49 (t, 4H), 3.19 (t, J = 5.2 Hz, 4H), 3.16 - 3.05 (m, 2H), 1.74 (h, J = 7.5 Hz, 2H), 1.43 (s, 9H), 0.96 (t, J = 7.4 Hz, 3H). LC-MS (ESI); m/z [M+H]+: Calcd. for　C32H36F2N5O5S,　640.2405. Found　640.2541.　
N-(2,4-디플루오로-3-(5-(4-(피페라진-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)페닐)프로판-1-설폰아미드(17).
DCM/TFA (3:1, 4 mL)의 혼합물 중 삼차-부틸 4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-카르복실레이트(16) (28.0 mg, 0.0438 mmol) 용액을 실온에서 1시간 동안 교반하였다(TLC에 의해 SM "A" 없음). 용매를 진공 하에 제거하고 잔류물을 고진공 하에 2시간 동안 건조시켰다 (23 mg의 생성물, 정량적 수율). 미정제 생성물은 추가적인 정제 없이 다음 단계에 사용되었다. LC-MS (ESI); m/z [M+H]+: Calcd. for　C27H28F2N5O3S,　540.1880. Found　540.1949.
삼차-부틸 2-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)-페닐)피페라진-1-일)아세테이트 (18).
DMF(1 ml) 중 메틸 N-[2,4-디플루오로-3-[5-(4-피페라진-1-일페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-페닐]프로판-1-설폰아미드 (17) (23.0 mg, 0.0426 mmol)　및 TEA (0.0594 mL, 0.426 mmol) 용액에 삼차-부틸 2-브로모아세테이트 (9.15 mg, 0.0469 mmol)를 첨가하고, 생성된 용액을 3시간 동안실온에서 교반하였다. 반응 혼합물을 진공 하에서 증발시켰다. 미정제 생성물을 PTLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1, 2x)로 정제하여 19 mg의 순수한 생성물(69% 수율)을 수득하였다. 1H　NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ 12.92 (bs, 1H), 9.76 (bs, 1H), 8.65 (t, J = 2.6 Hz, 1H), 8.55 (s, 1H), 8.18 (s, 1H), 7.76 - 7.42 (m, 3H), 7.28 (t, J = 8.3 Hz, 1H), 7.07 (d, J = 6.5 Hz, 2H), 3.33 (s, 2H), 3.30 - 3.16 (m, 4H), 3.16 - 3.04 (m, 2H), 2.81 - 2.55 (m, 4H), 1.84 - 1.67 (m, 2H), 1.43 (s, 9H), 0.96 (t, J = 7.2 Hz, 3H). 13C　NMR (151 MHz, DMSO-d6) δ 180.57 , 169.22 , 156.02 (dd, J = 246.3, 7.0 Hz), 152.33 (dd, J = 249.4, 8.6 Hz), 150.42 , 148.37 , 143.55 , 138.50 , 131.53 , 128.75 (d, J = 9.6 Hz), 128.17 , 127.58 , 125.93 , 121.92 (dd, J = 13.6, 3.6 Hz), 118.25 (t, J = 23.6 Hz), 117.58 , 115.80 , 115.58 , 112.33 (dd, J = 21.9, 3.0 Hz), 80.23 , 59.21 , 53.44 , 51.81 , 47.93 , 27.82 , 16.84 , 12.62. 　LC-MS (ESI); m/z [M+H]+: Calcd. for　C33H38F2N5O5S,　654.2561. Found　654.2675.
(2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드 (화합물 512).
TFA(2 ml, 13.46 mmol) 및 디클로로메탄(2 ml)의 혼합물 중 삼차-부틸 2-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)아세테이트(18) (20.0 mg, 0.0306 mmol) 용액을 5시간 동안 교반하였다. 이어서, 용매를 진공 중에서 제거하고 미정제 생성물을 고진공 중에서 1시간 동안 건조시켰다. 미정제 생성물을 추가 정제 없이 다음 단계에서 사용하였다(18.3　mg, 정량적 수율). LC-MS (ESI); m/z: [M+H]+ Calcd. for　　C29H30F2N5O5S,　598.1935. Found　598.1953. 상기 미정제 생성물의 용액; DMF(1 ml) 중 2-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)-피페라진-1-일)아세트산(18.3 mg, 0.0306 mmol) 및 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드;염화수소(4) (17.2 mg, 0.0367 mmol)에 TEA(0.106 mL, 0.762 mmol) 및 PyBOP(19.1 mg, 0.0367 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 동일한 온도에서 4시간 동안 교반하였다. TLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)는 출발 물질(산)을 나타내지 않는다. 반응 혼합물을 고진공 하에 증발 건조시켰다. 미정제 생성물을 EtOAc(10 mL)로 희석하고, NaHCO3　(2x5 mL)의 포화 수용액으로 세척하고, 유기 추출물을 건조시키고( Na2SO4), 진공 하에 증발시켰다. 미정제 생성물을 PTLC DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1, 2x)로 정제하여 20 mg의 생성물(65% 수율)을 수득하였다. 1H　NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ 12.92 (bs, 1H), 9.76 (bs, 1H), 8.91 (s, 1H), 8.66 (s, 1H), 8.65 - 8.45 (m, 2H), 7.85 (d, J = 9.1 Hz, 1H), 7.74 - 7.52 (m, 3H), 7.49 - 7.32 (m, 4H), 7.28 (t, J = 8.6 Hz, 1H), 7.09 (d, J = 8.5 Hz, 2H), 5.16 (d, J = 3.0 Hz, 1H), 4.54 (d, J = 9.6 Hz, 1H), 4.52 - 4.32 (m, 3H), 4.26 (dd, J = 15.7, 5.4 Hz, 1H), 3.76 - 3.58 (m, 2H), 3.27 (s, 4H), 3.21 - 2.95 (m, 4H), 2.68 (s, 4H), 2.40 (s, 3H), 2.07 (dd, J = 12.9, 7.7 Hz, 1H), 1.92 (ddd, J = 13.1, 9.0, 4.6 Hz, 1H), 1.75 (h, J = 7.5 Hz, 2H), 0.97 (s, 9H), 0.96 (t, J = 7.4 Hz, 3H). 13C　NMR (126 MHz, DMSO-d6) δ 180.56 , 171.77 , 169.28 , 168.48 , 156.02 (dd, J = 246.6, 7.0 Hz), 152.37 (dd, J = 240.8, 8.8 Hz), 151.30 , 150.27 , 148.38 , 147.68 , 143.55 , 139.42 , 138.47 , 131.48 , 131.12 , 129.68 , 129.10 - 128.66 (m), 128.63 , 128.33 , 127.57 , 127.51 , 125.96 , 121.92 (dd, J = 13.7, 3.6 Hz), 118.60 - 117.95 (m), 117.57 , 115.84 , 115.59 , 112.32 (dd, J = 23.0, 2.7 Hz), 68.91 , 60.59 , 58.81 , 56.56 , 55.86 , 48.16 , 41.67 , 37.87 , 35.80 , 26.26 , 16.83 , 15.90 , 12.61. LC-MS (ESI); m/z [M+H]+: Calcd. for　C51H58F2N9O7S2,　1010.3868. Found　1010.4036
(2S,4R)-1-((S)-2-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]-피리딘-5-일)벤즈아미도)부탄아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드 (화합물 513).
SJF-0633으로부터의 미정제 생성물의 용액; DMF(2 ml) 중 4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)벤즈아미도)부탄산(29.0 mg, 0.0496 mmol) 및 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드;염화수소(27.8 mg, 0.0595 mmol)에 TEA(0.172 mL, 1.23 mmol) 및 PyBOP(31.0 mg, 0.0595 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 동일한 온도에서 4시간 동안 교반하였다. TLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)는 출발 물질(산)을 나타내지 않는다. 반응 혼합물을 고진공 하에서 건조될 때까지 증발시켰다. 용리액으로 DCM:MeOH(9:1)를 사용하는 실리카-카보네이트 카트리지(1g) 상에서 미정제 생성물을 여과하였다. 여과물을 진공 중에서 증발시키고 미정제 생성물을 PTLC(DCM:MeOH:NH4OH, 85:14:1)로 정제하여 35 mg의 생성물을 수득하였다(71% 수율). 1H　NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 12.96 (bs, 1H), 9.70 (bs, 1H), 8.97 (s, 1H), 8.77 (d, J = 2.0 Hz, 1H), 8.69 (bs, 1H), 8.56 (t, J = 5.6 Hz, 2H), 8.26 (s, 1H), 8.08 - 7.92 (m, 3H), 7.86 (d, J = 8.2 Hz, 2H), 7.65 - 7.53 (m, 1H), 7.40 (dd, J = 8.2 Hz, 4H), 7.29 (t, J = 8.7 Hz, 1H), 5.14 (d, J = 3.5 Hz, 1H), 4.57 (d, J = 9.3 Hz, 1H), 4.51 - 4.31 (m, 3H), 4.22 (dd, J = 15.9, 5.4 Hz, 1H), 3.77 - 3.59 (m, 2H), 3.32 - 3.21 (m, 2H), 3.17 - 3.05 (m, 2H), 2.44 (s, 3H), 2.42 - 2.14 (m, 2H), 2.08 - 1.98 (m, 1H), 1.97 - 1.84 (m, 1H), 1.88 - 1.61 (m, 4H), 0.96 (s, 9H), 0.95 (t, 3H). 13C NMR (151 MHz, DMSO-d6) δ 181.11 , 172.38 , 172.30 , 170.10 , 166.19 , 156.45 (dd, J = 246.3, 7.1 Hz), 152.78 (dd, J = 249.6, 8.2 Hz), 151.86 , 149.54 , 148.13 , 144.57 , 141.04 , 139.92 , 139.43 , 133.94 , 131.59 , 131.04 , 130.05 , 129.46 - 129.15 (m), 129.06 , 128.49 , 127.84 , 127.63 , 127.32 , 122.35 (dd, J = 13.4, 3.8 Hz), 118.94 - 118.30 (m), 117.94 , 116.15 , 112.79 (d, J = 22.6 Hz), 69.32 , 59.14 , 56.87 , 56.82 , 53.87 , 42.08 , 40.46 , 38.39 , 35.69 , 33.08 , 26.84 , 26.10 , 17.26 , 16.38 , 13.04. LC-MS (ESI); m/z [M+H]+: Calcd. for　C50H55F2N8O8S2,　997.3552. Found　997.2761.
(2S,4S)-1-((S)-2-(2-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드 (화합물 516).
SJF-0660로부터의 미정제 생성물의 용액; DMF(1 ml) 중 2-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)-피페라진-1-일)아세트산(5.70 mg, 0.00954 mmol) 및 (2S,4S)-1-((S)-2-아미노-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드(5.35 mg, 0.0124 mmol)에 TEA(0.1 mL, 0.762 mmol) 및 PyBOP(5.96 mg, 0.0114 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 동일한 온도에서 4시간 동안 교반하였다. TLC(DCM:MeOH:NH4OH, 85:14:1)는 출발 물질(산)을 나타내지 않는다. 반응 혼합물을 고진공 하에서 건조될 때까지 증발시켰다(생성물은 수용성일 수 있음). 용리액으로 DCM:MeOH(9:1)를 사용하는 실리카-카보네이트 카트리지(100 mg) 상에서 미정제 생성물을 여과하고 진공 하에 증발시켰다. 미정제 생성물을 PTLC(DCM:MeOH:NH4OH, 85:14:1)로 정제하여 6.1 mg의 생성물(63% 수율)을 수득하였다. 1H　NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ 12.93 (bs, 1H), 9.76 (bs, 1H), 8.93 (s, 1H), 8.69 (t, J = 5.8 Hz, 1H), 8.66 (s, 1H), 8.56 (bs, 1H), 8.18 (s, 1H), 7.81 (d, J = 8.6 Hz, 1H), 7.65 - 7.50 (m, 3H), 7.51 - 7.32 (m, 4H), 7.28 (t, J = 8.7 Hz, 1H), 7.09 (d, J = 8.2 Hz, 2H), 5.48 (d, J = 7.2 Hz, 1H), 4.49 (d, J = 9.2 Hz, 1H), 4.46 - 4.33 (m, 2H), 4.32 - 4.18 (m, 2H), 3.96 - 3.88 (m, 1H), 3.54 - 3.42 (m, 1H), 3.30 - 3.19 (m, 4H), 3.17 - 3.00 (m, 4H), 2.78 - 2.56 (m, 4H), 2.41 (s, 3H), 2.39 - 2.30 (m, 1H), 1.82 - 1.68 (m, 3H), 0.98 (s, 9H), 0.95 (t, 3H). 13C　NMR (151 MHz, DMSO-d6) δ 180.60 , 172.29 , 169.55 , 168.84 , 156.04 (dd, J = 246.5, 6.9 Hz), 152.38 (dd, J = 249.4, 8.3 Hz), 151.40 , 150.29 , 148.40 , 147.75 , 143.57 , 139.16 , 138.53 , 131.50 , 131.12 , 129.79 , 128.78 (d, J = 7.4 Hz), 128.70 , 128.36 , 127.54 , 125.99 , 121.93 (dd, J = 13.4, 3.6 Hz), 118.52 - 117.94 (m), 117.59 , 115.87 , 115.60 , 112.35 (dd, J = 23.0, 3.9 Hz), 69.09 , 60.50 , 58.62 , 56.01 , 55.63 , 53.46 , 52.70 , 48.17 , 41.83 , 36.90 , 35.21 , 26.25 , 16.85 , 15.93 , 12.63. LC-MS (ESI); m/z [M+H]+: Calcd. for　C51H58F2N9O7S2,　1010.3868. Found　1010.3542.
실시예 21-합성 반응식 G: 화합물 515
삼차-부틸 5-(4-브로모페닐)-5-옥소펜타노에이트 (19).
자기 교반 막대가 구비된 플라스크에서, 5-(4-브로모페닐)-5-옥소펜탄산(0.460 g, 1.70 mmol), 및 무수 Boc(0.481 g, 2.21 mmol)를 t-부탄올(1.00 mL, 10.5 mmol)에 용해시킨 다음 염화마그네슘(0.0162 g, 0.170 mmol)을 첨가하였다. 혼합물을 40 oC에서 16시간 동안(밤새) 교반하였다. 미정제 반응 혼합물을 EtOAc(100 mL)로 희석하고, 물(2x100 mL), 수성 NaHCO3 (2x100 mL)으로 세척하고, 건조시키고(Na2SO4), 회전 증발에 의해 증발시켰다. 미정제 생성물을 플래쉬 크로마토그래피(SiO2-25g, 구배 Hex 100% 대비 Hex:EtOAc, 1:1, 15분)으로 정제하여 198 mg의 생성물(35% 수율)을 수득하였다.　1H NMR (500 MHz, Chloroform-d) δ 7.82 (d, J = 8.3 Hz, 2H), 7.60 (d, J = 8.4 Hz, 2H), 2.99 (t, J = 7.2 Hz, 2H), 2.33 (t, J = 7.1 Hz, 2H), 2.01 (p, J = 7.2 Hz, 2H), 1.44 (s, 9H).　13C NMR (101 MHz, cdcl3) δ 198.68, 172.67, 135.69, 132.04, 129.72, 128.33, 80.54, 37.64, 34.68, 28.27, 19.68. LC-MS (ESI); m/z [M+Na]+: Calcd. for C15H19BrO3Na, 349.0415. Found 349.0676, and 351.0609.
삼차 -부틸 5-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)-5-옥소펜타노에이트(20).
디옥산(5 mL) 중 삼차-부틸 5-(4-브로모페닐)-5-옥소-펜타노에이트 (19) (74.0 mg, 0.226 mmol)의 용액에 4,4,5,5-테트라메틸-2-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-1,3,2-디옥사보로란 (63.2 mg, 0.249 mmol),　CH3CO2K (66.6 mg, 0.678 mmol)을 첨가하고, 반응 혼합물을 아르곤 하에서 탈기시켰다. X-PHOS (16.2 mg, 0.0339 mmol) 및 팔라듐(II) 아세테이트 (2.54 mg, 0.0113 mmol)를 첨가하고 반응 혼합물을 100 ℃(외부 온도)에서 아르곤 대기 하에 1시간 동안 교반했다. 　 1시간 후, 가열 수조의 온도를 90℃로 낮추고, 플라스크를 가열 수조로부터 들어 올렸지만, 계속 교반하였다. N-[3-(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로-페닐]프로판-1-설폰아미드 (5) (104 mg, 0.226 mmol) 및 탄산칼륨(93.8 mg, 0.678 mmol)을 첨가하고, 이어서 물(2.00 ml)을 첨가하였다. 트리시클로헥실 포스핀 (6.34 mg, 0.0226 mmol, 2x) 및 Pd(dba)2 (6.50 mg, 0.0113 mmol)을 첨가하고, 반응 혼합물을 90℃에서 격렬하게 교반하면서 가열하고 3시간 동안 교반한 다음, 반응 혼합물을 주변 온도로 냉각시켰다. 반응 혼합물을 EtOAc(30 mL)로 희석하고 염수(20 mL)에 붓고, 유기 추출물을 건조시키고(Na2SO4), 진공 하에 증발시켰다. 미정제 생성물을 플래쉬 크로마토그래피(SiO2-40g, 구배 Hex:EtOAc, 1:9 대비 100% EtOAc, 20분)로 정제하였다. 생성물은 약 85% 순도였으며, 이를 PTLC (DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)로 다시 정제하여 45 mg의 생성물을 수득하였다(32% 수율). 1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ 12.98 (bs, 1H), 9.68 (bs, 1H), 8.78 (s, 1H), 8.69 (s, 1H), 8.26 (s, 1H), 8.07 (d, J = 8.3 Hz, 2H), 7.92 (d, J = 8.3 Hz, 2H), 7.65 - 7.49 (m, 1H), 7.27 (t, J = 8.7 Hz, 1H), 3.10 (q, J = 7.8, 7.3 Hz, 4H), 2.29 (t, J = 7.4 Hz, 2H), 1.85 (p, J = 7.3, 6.8 Hz, 2H), 1.79 - 1.62 (m, 2H), 1.39 (s, 9H), 0.95 (t, J = 7.4 Hz, 3H). 13C NMR (151 MHz, DMSO-d6) δ 199.09 , 180.72 , 172.08 , 156.04 (dd, J = 246.5, 6.9 Hz), 152.37 (dd, J = 249.6, 8.5 Hz), 149.29 , 144.21 , 142.60 , 139.11 , 135.42 , 130.30 , 128.97 - 128.74 (m), 128.78 , 127.40 , 127.35 , 122.00 (dd, J = 13.6, 3.7 Hz), 118.66 - 117.86 (m), 117.55 , 115.79 , 112.38 (dd, J = 22.7, 3.8 Hz), 79.61 , 53.48 , 37.08 , 34.03 , 27.80 , 19.46 , 16.86 , 12.64. 　 LC-MS (ESI); m/z: [M+H]+ Calcd. for　　C32H34F2N3O6S,　626.2136. Found　626.2191.
(2S,4R)-1-((S)-2-(5-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)-페닐)-5-옥소펜탄아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)-피롤리딘-2-카르복사미드(화합물 515).
TFA(1.50 mL, 20.2 mmol) 및 디클로로메탄(3 ml)의 혼합물 중 삼차-부틸 5-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)-5-옥소펜타노에이트(20) (22.0 mg, 0.0352 mmol) 용액을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 이어서, 용매를 진공 하에 제거하고 미정제 생성물을 고진공 하에 2시간 동안 건조시켰다. 미정제 생성물을 추가 정제 없이 다음 단계에서 사용하였다(19.9 mg, 정량적 수율). LC-MS (ESI); m/z: [M+H]+ Calcd. for　　C28H26F2N3O6S,　570.1510. Found　570.1553. 상기 미정제 생성물의 용액; DMF(2 ml) 중 5-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)-5-옥소펜탄산(22.0 mg, 0.0386 mmol) 및 (2S,4R)-1-((S)-2-아미노-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드 염화수소 (4)(19.8 mg, 0.0425 mmol)에 TEA(0.200 mL, 1.43 mmol) 및 PyBOP(22.1 mg, 0.0425 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 동일한 온도에서 4시간 동안 교반하였다. TLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)는 출발 물질이 없음을 나타낸다. DMF를 고진공 중에서 제거하였다. 용리액으로 DCM:MeOH(9:1)를 사용하는 실리카-카보네이트 카트리지 상에서 미정제 생성물을 여과하였다. 여과물을 진공 중에서 증발시키고 미정제 생성물을 PTLC(DCM:MeOH:NH4OH, 85:14:1)로 정제하여 25 mg의 생성물을 수득하였다(64% 수율. ~97% 순도, NMR). 1H NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ 13.03 (bs, 1H), 9.73 (bs, 1H), 8.94 (s, 1H), 8.76 (d, J = 2.1 Hz, 1H), 8.69 (bs, 1H), 8.55 (t, J = 6.0 Hz, 1H), 8.25 (s, 1H), 8.06 (d, J = 8.3 Hz, 2H), 7.93 (d, J = 9.3 Hz, 1H), 7.90 (d, J = 8.2 Hz, 2H), 7.63 - 7.50 (m, 1H), 7.37 (dd, 4H), 7.26 (t, J = 8.6 Hz, 1H), 5.11 (d, J = 3.5 Hz, 1H), 4.54 (d, J = 9.3 Hz, 1H), 4.46 - 4.36 (m, 2H), 4.36 - 4.30 (m, 1H), 4.19 (dd, J = 15.8, 5.5 Hz, 1H), 3.78 - 3.55 (m, 2H), 3.13 - 3.07 (m, 2H), 3.04 (t, J = 7.4 Hz, 2H), 2.40 (s, 3H), 2.37 - 2.21 (m, 2H), 2.08 - 1.95 (m, 1H), 1.96 - 1.79 (m, 3H), 1.71 (h, J = 7.5 Hz, 2H),　　0.93 (s, 9H),　0.92 (t, 3H). 13C　(151 MHz, DMSO-d6) δ 199.32 , 180.72 , 171.98 , 171.86 , 169.74 , 156.03 (dd, J = 246.6, 6.9 Hz), 152.36 (dd, J = 249.4, 8.4 Hz), 151.43 , 149.28 , 147.71 , 144.21 , 142.52 , 139.52 , 139.12 , 135.48 , 131.17 , 130.32 , 129.63 , 129.00 - 128.81 (m), 128.79 , 128.64 , 127.43 , 127.36 , 127.36 , 121.98 (dd, J = 13.6, 3.6 Hz), 118.75 - 117.76 (m), 117.54 , 115.78 , 112.37 (dd, J = 22.4, 3.6 Hz), 68.92 , 58.74 , 53.46 , 41.67 , 37.99 , 37.47 , 35.20 , 34.11 , 26.43 , 20.38 , 16.86 , 15.95 , 12.63. LC-MS (ESI); m/z [M+H]+: Calcd. for　C50H54F2N7O8S2,　982.3443. Found　982.3535.
화합물 196의 예시적인 합성: (Z)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(3-(4-(4-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)부톡시)페닐)이소인돌린-1,3-디온
단계 A: 5-(1-(4-(4-하이드록시부톡시)페닐)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-4-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온
1,4-디옥산/H2O(10 mL, v/v=10/1) 중 4-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)부탄-1-올(150 mg, 0.39 mmol) 및 5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-2,3-디하이드로인덴-1-온(120 mg, 0.46 mmol) 용액에 t-Bu3PHBF4 (44.8 mg, 0.15 mmol), CsF (234.9 mg, 1.54 mmol), Cy2NCH3 (5 방울) 및 Pd2 (dba)3 (70.7 mg, 0.077 mmol)을 첨가하였다. 생성된 용액을 N2 분위기 하 100oC에서 2시간 동안 교반하였다. 용매를 감압 하에 증발시켰다. 잔류물을 EA(30 mL)로 희석하고, 혼합물을 염수로 세척하였다. 유기상을 감압 하에서 증발시키고, 잔류물을 실리카 겔 상의 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피(DCM/MeOH=80/1)로 정제하여 목적하는 생성물(140 mg, 수율 82.4%)을 무색 오일로서 수득하였다.
단계 B: 삼차-부틸 5-(3-(피리딘-4-일)-1-(4-(4-(3-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페녹시)부톡시)페닐)-1H-피라졸-4-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온
DCM(10 mL) 중 5-(1-(4-(4-하이드록시부톡시)페닐)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-4-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온(140 mg, 0.32 mmol) 및 트리에틸아민(96.8 mg, 0.96 mmol) 용액에 MsCl(43.8 mg, 0.38 mmol)을 0oC에서 첨가하였다. 30oC에서 1시간 동안 교반한 후, 진공 중에서 용매를 제거하였다. 잔류물을 EA(30 mL)로 희석하고, 혼합물을 염수로 세척하였다. 유기상을 농축시켜 중간 생성물 메실레이트(180 mg, 0.34 mmol, 109%)를 수득하였다. 건조 DMF(10 mL) 중 메실레이트(90 mg, 0.17 mmol) 용액에 3-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페놀(449.7 mg, 0.22 mmol) 및 K2CO3(47.9 mg, 0.34 mmol)를 첨가하였다. 생성된 혼합물을 68oC에서 4시간 동안 교반하였다. 혼합물을 EtOAc(40 mL)로 희석하고, 혼합물을 염수로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시켰다. 유기상을 감압 하에서 농축시켰다. 잔류물을 분취 TLC(PE/EtOAc=1/3)로 정제하여 목적하는 생성물(80 mg, 71.7%)을 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 8.65 - 8.55 (m, 2H), 8.00 (s, 1H), 7.76 (d, J = 7.7 Hz, 1H), 7.68 (d, J = 9.1 Hz, 2H), 7.51 (s, 2H), 7.44 (s, 1H), 7.29 - 7.41 (m, 4H), 7.02 (d, J = 7.0 Hz, 3H), 4.12 (dd, J = 14.0, 6.9 Hz, 4H), 3.60 - 3.67 (m, 1H), 3.13 (s, 2H), 2.74 (s, 2H), 2.01 (s, 2H), 1.34 (s, 12H).
단계 C: 삼차-부틸 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(3-(4-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)부톡시)페닐)이소인돌린-1,3-디온
1,4-디옥산/H2O (9 mL, 8:1) 중 삼차-부틸 5-(3-(피리딘-4-일)-1-(4-(4-(3-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페녹시)부톡시)페닐)-1H-피라졸-4-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온(80 mg, 0.12 mmol) 및 5-(3-브로모페닐)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)이소인돌린-1,3-디온(46.3 mg, 0.14 mmol) 용액에 t-Bu3PHBF4 (14.5 mg, 0.050 mmol), CsF (75.8 mg, 0.50 mmol), Cy2NMe (1 방울) 및 Pd2 (dba)3 (22.8 mg, 0.025mmol)를 첨가하였다. 생성된 혼합물을 N2 분위기 하 100oC에서 2시간 동안 교반하였다. 용매를 감압 하에 증발시켰다. 잔류물을 EA(30 mL)로 희석하고, 혼합물을 염수로 세척하였다. 유기상을 감압 하에 증발시켰다. 잔류물을 TLC(PE/EtOAc=1/8)로 정제하여 목적하는 생성물(40 mg, 41.5%)을 수득하였다.
단계 D: (Z)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(3-(4-(4-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)부톡시)페닐)이소인돌린-1,3-디온
CH3CN/Py (5 mL/2 mL) 중 삼차-부틸 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(3-(4-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)부톡시)페닐)이소인돌린-1,3-디온(40 mg, 0052 mmol) 용액에 NH2OH·HCl (40 mg, 0.57 mmol)을 첨가하였다. 반응물을 40oC에서 0.5시간 동안 교반하였다. 혼합물을 EtOAc(30 mL)로 희석하고, 염수로 2회 세척하였다. 유기층을 감압 하에서 증발시켰다. 잔류물을 분취 HPLC로 정제하여 목적하는 생성물(13.5 mg, 8.6% 수율)을 백색 고체로서 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 8.47 - 8.86 (m, 3H), 8.27 (s, 1H), 8.09 (s, 1H), 7.94 (d, J = 4.9 Hz, 3H), 7.68 (d, J = 8.7 Hz, 3H), 7.52 (s, 2H), 7.36 - 7.47 (m, 2H), 7.29 (s, 1H), 7.21 (s, 1H), 7.15 (s, 1H), 7.02 (d, J = 8.4 Hz, 3H), 4.97 - 5.04 (m, 1H), 4.13 (s, 4H), 2.74 - 3.12 (m, 8H), 2.21 (d, J = 7.7 Hz, 2H), 2.01 - 2.09 (m, 3H). LCMS (ES+): m/z 787.2 [M+H] +.
화합물 197의 예시적인 합성: (E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(4-(2-(2-(4-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)에틸)피페라진-1-일)이소인돌린-1,3-디온
단계 A: 2-(2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)에탄올
건조 DMF(5 mL) 중 4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페놀(500 mg, 1.58 mmol)의 용액에 Cs2CO3 (1.55 g, 4.75 mmol) 및 2-(2-하이드록시에톡시)에틸 4-메틸벤젠설포네이트(1.23 g, 4.75 mmol)를 순차적으로 첨가하였다. 생성된 용액을 70℃에서 3시간 동안 교반하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 반응물을 물(20 mL)로 급냉시키고 혼합물을 EtOAc(20 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼으로 정제하여 목적하는 생성물(500 mg, 78% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 8.69 (s, 2H), 7.91-7.96 (m, 3H), 7.62 (d, J = 8.8 Hz, 2H), 7.05 (d, J = 8.4 Hz, 2H), 4.19 (t, J = 4.4 Hz, 2H), 3.90 (t, J = 4.0 Hz, 2H), 3.78 (t, J = 4.8 Hz, 2H), 3.70 (t, J = 4.4 Hz, 2H).
단계 B: 2-(2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)에틸 메탄설포네이트
DCM(5 mL) 중 2-(2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)에탄올(500 mg, 1.24 mmol) 및 TEA(249 mg, 2.47 mmol) 용액에 MsCl(169 mg, 1.48 mmol)을 0 oC에서 적가하였다. 생성된 용액을 5oC에서 0.5시간 동안 교반하였다. 포화 NaHCO3(20 mL)로 급냉시킨 후, 혼합물을 DCM(20 mL x 2)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 농축시켜 목적하는 생성물(550 mg 미정체, 계산치)을 오일로서 수득하였고, 이는 다음 단계에서 직접 사용되었다. LCMS (ES+): m/z 482.0 [M+H]+.
단계 C: 삼차-부틸 4-(2-(2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)에틸)피페라진-1-카르복실레이트
DMF(5 mL) 중 2-(2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)에틸 메탄설포네이트(0.5 g, 1.04 mmol) 및 삼차-부틸 피페라진-1-카르복실레이트(385 mg, 2.08 mmol) 용액에 K2CO3 (715 mg, 5.20 mmol) 및 KI(860 mg, 5.20 mmol) 순차적으로 첨가하였다. 생성된 용액을 75oC에서 3시간 동안 교반하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 반응물을 물(20 mL)로 급냉시키고 혼합물을 에틸 아세테이트(30 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 상에 적용하여 목적하는 생성물(0.4 g, 2 단계에서 56% 수율)을 갈색 오일로서 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 8.69 (d, J = 4.8 Hz, 2H), 7.97 (m, 3H), 7.61 (d, J = 9.2 Hz, 2H), 7.01 (d, J = 8.8 Hz, 2H), 4.05-4.20 (m, 3H), 3.84 (t, J = 4.8 Hz, 2H), 3.71 (t, J = 5.6 Hz, 2H), 3.44 (m, 4H), 2.63 (t, J = 5.6 Hz, 2H), 2.45 (m, 4H), 1.46 (s, 9H).
단계 D: 삼차-부틸4-(2-(2-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)에틸)피페라진-1-카르복실레이트
1,4-디옥산(15 mL)/ H2O (1.5 mL) 중 삼차-부틸 4-(2-(2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)에틸)피페라진-1-카르복실레이트(0.4 g, 0.70 mmol) 및 5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온(271 mg, 1.05 mmol) 용액에 CsF(425 mg, 2.80 mmol), Pd2 (dba)3 (256 mg, 0.28 mmol), 트리-삼차-부틸포스핀 테트라플루오로보레이트(162 mg, 0.56 mmol) 및 촉매 N-시클로헥실-N-메틸시클로헥산아민을 순차적으로 첨가하였다. 반응물을 N2 분위기 하 100oC에서 2시간 동안 가열하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 반응물을 물(20 mL)로 급냉시키고 혼합물을 에틸 아세테이트(30 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 상에 적용하여 목적하는 생성물(0.4 g 미정제)을 갈색 오일로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 624.7 [M+H]+.
단계 E: 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(4-(2-(2-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)에틸)피페라진-1-일)이소인돌린-1,3-디온
MeOH(5 mL) 중 삼차-부틸 4-(2-(2-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)에틸)피페라진-1-카르복실레이트(400 mg, 0.64 mmol) 용액에 1,4-디옥산 중 HCl(5 mL, 8 mol/L)을 첨가하였다. 생성된 용액을 10℃에서 1시간 동안 교반하였다. 용매를 진공 하에서 제거하여 목적하는 생성물(359 mg, 계산치)을 수득하였고, 이는 다음 단계에서 직접 사용되었다. NMP(5 mL) 중 미정제 생성물(359 mg, 0.64 mmol) 용액에 DIEA(825 mg, 6.40 mmol) 및 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-플루오로이소인돌린-1,3-디온(530 mg, 1.92 mmol)을 순차적으로 첨가하였다. 반응물을 마이크로웨이브로 150oC에서 60분 동안 조사하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 반응물을 물(20 mL)로 급냉시키고 혼합물을 에틸 아세테이트(30 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 상에 적용하여 목적하는 생성물(3 g 미정제, NMP 포함)을 갈색 오일로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 780.8 [M+H]+.
단계 F: (E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(4-(2-(2-(4-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)에틸)피페라진-1-일)이소인돌린-1,3-디온
MeOH/ DCM(4 mL/ 1 mL) 중 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(4-(2-(2-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)에틸)피페라진-1-일)이소인돌린-1,3-디온(625 mg, 0.64 mmol, 계산치) 및 하이드록시아민 염화수소(667 mg, 9.60 mmol) 용액에 NaHCO3 (1.21 g, 14.4 mmol)을 50 oC에서 첨가하였다. 혼합물을 50oC에서 10분 동안 교반하였다. 잔류물을 DCM/MeOH=20/1의 분취 TLC로 정제한 후, 이를 분취 HPLC로 추가로 정제하여 목적하는 생성물(34 mg)을 황색 고체로서 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): δ 11.09 (s, 1H), 10.93 (s, 1H), 9.93 (br, 1H), 8.79 (s, 1H), 8.68 (s, 2H), 7.91 (d, J = 8.4 Hz, 2H), 7.65-7.80 (m, 3H), 7.58 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 7.49 (s, 1H), 7.44 (s, 1H), 7.34 (d, J = 8.4 Hz, 1H), 7.25 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 7.16 (d, J = 8.8 Hz, 2H), 5.09 (m, 1H), 4.25 (m, 4H), 3.88 (m, 4H), 3.01 (m, 2H), 2.86 (m, 3H), 2.50 (m, 3H), 2.03 (m, 1H); LCMS (ES+): m/z 796.3 [M+H]+.
화합물 198의 예시적인 합성: (E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(2-(2-(4-(4-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페닐)피페라진-1-일)에톡시)에톡시)이소인돌린-1,3-디온
단계 A: 5-(1-(4-(4-(2-(2-하이드록시에톡시)에틸)피페라진-1-일)페닐)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-4-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1온
MeOH(3 mL) 중 삼차-부틸 4-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페닐)피페라진-1-카르복실레이트(200 mg, 0.37 mmol) 용액에 1,4-디옥산(1 mL) 중 6 M HCl(g)을 첨가하였다. 생성된 용액을 25oC에서 1시간 동안 교반하였다. 용매를 진공 하에서 제거하였다. 잔류물을 20 mL DCM으로 희석하고, NaHCO3수용액을 조금씩 첨가하여 pH를 약 9로 조정하였다. 혼합물을 DCM으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 Na2SO4 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켜 목적하는 생성물을 수득하였고, 이는 다음 단계에서 직접 사용되었다. DMF(3 mL) 중 위의 중간체(180 mg 미정제, 0.37 mmol) 용액에 2-(2-하이드록시에톡시)에틸 4-메틸벤젠설포네이트(194 mg, 0.75 mmol) 및 K2CO3(153.2 mg, 1.11 mmol)를 첨가하였다. 생성된 용액을 70oC에서 2시간 동안 교반하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 반응물을 DCM(20 mL)으로 희석하고, 혼합물을 염수로 세척하였다. 유기상을 Na2SO4 상에서 건조시키고, 여과하고, 감압 하에서 농축시켰다. 잔류물을 분취 TLC로 정제하여 목적하는 생성물(53 mg, 27.2% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 524.2 [M+H] +.
단계 B: 삼차 부틸 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(2-(2-(4-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페닐)피페라진-1-일)에톡시)에톡시)이소인돌린-1,3-디온
건조 THF(3.0 mL) 중 5-(1-(4-(4-(2-(2-하이드록시에톡시)에틸)피페라진-1-일)페닐)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-4-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온(53 mg, 0.10 mmol), Ph3P (78.7 mg, 0.3 mmol) 및 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-플루오로이소인돌린-1,3-디온(41.1 mg, 0.15 mmol) 용액에 DIAD(60.7 mg,0.3 mmol)을 N2 하에서 적가하였다. 혼합물을 20oC에서 1.5시간 동안 교반하였다. 이를 H2O(20 mL)로 급냉시킨 후, 혼합물을 DCM(20 mL x 3)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수로 세척하고, Na2SO4 상에서 건조시키고, 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 분취 TLC로 정제하여 목적하는 생성물(미정제, 45 mg, 34.7% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 780.3 [M+H]+.
단계 C: (E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(2-(2-(4-(4-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페닐)피페라진-1-일)에톡시)에톡시)이소인돌린-1,3-디온
CH3CN/피리딘(3.0 mL, v/v = 2/1) 중 삼차-부틸 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(2-(2-(4-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페닐)피페라진-1-일)에톡시)에톡시)이소인돌린-1,3-디온(45 mg, 0.058 mmol) 용액에 하이드록실아민 염화수소(40.1 mg, 0.58 mmol)를 첨가하였다. 혼합물을 40oC에서 20분 동안 교반하였다. 이어서 반응물을 DCM(20 mL)으로 희석하고, 혼합물을 염수(10 mL x 3)로 세척하였다. 합쳐진 유기층을 진공 중에서 제거하고, 잔류물을 분취 TLC 및 분취 HPLC로 정제하여 목적하는 생성물(5.5 mg, 12% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 8.55 (s, 2H), 8.04 (s, 1H), 7.94 (s, 1H), 7.79 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 7.65 (d, J = 8.8 Hz, 3H), 7.39 (s, 2H), 7.30 (s, 1H), 7.23 (s, 1H), 7.01 (d, J = 8.8 Hz, 2H), 4.98-4.93 (m, 1H), 4.27 (s, 2H), 3.90 (s, 2H), 3.77 (s, 2H), 3.28 (s, 4H), 3.06-3.01 (m, 4H), 2.93-2.81 (m, 2H), 2.74 (s, 7H), 2.17-2.13 (br, 1H). LCMS (ES+): m/z 795.3 [M+H] +.
화합물 199의 예시적인 합성: (E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-(3-(4-(4-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페닐)피페라진-1-일)프로폭시)이소인돌린-1,3-디온
단계 A: 5-(1-(4-(4-(3-하이드록시프로필)피페라진-1-일)페닐)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-4-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온
MeOH(5 mL) 중 삼차-부틸 4-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페닐)피페라진-1-카르복실레이트(270 mg, 0.50 mmol) 용액에 1,4-디옥산(1 mL) 중 6 M HCl을 첨가하였다. 생성된 용액을 25oC에서 1시간 동안 교반하였다. 용매를 진공 중에서 제거하였다. 잔류물을 20 mL DCM으로 희석하고, NaHCO3수용액을 첨가하여 pH를 약 9로 조정하였다. 혼합물을 DCM으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 Na2SO4 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 잔류물(240 mg 미정제)은 추가적인 정제 없이 다음 단계에 직접 사용되었다.
DMF(5 mL) 중 위의 중간체(240 mg 미정제, 0.50 mmol) 용액에 3-하이드록시프로필 4-메틸벤젠설포네이트(230 mg, 1 mmol) 및 K2CO3 (207 mg, 1.5 mmol)를 첨가하였다. 생성된 용액을 70oC에서 2시간 동안 교반하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 반응물을 DCM(20 mL)으로 희석하였다. 혼합물을 염수로 세척하고 Na2SO4 상에서 건조시켰다. 용액을 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 분취 TLC로 정제하여 목적하는 생성물(100 mg, 30.5% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 494.3 [M+H] +.
단계 B: 삼차 부틸 5-아미노-4-(1,3-디옥소-4-(3-(4-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페닐)피페라진-1-일)프로폭시)이소인돌린-2-일)-5-옥소펜타노에이트
건조 THF(5.0 mL) 중 5-(1-(4-(4-(3-하이드록시프로필)피페라진-1-일)페닐)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-4-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온(100 mg, 0.20 mmol), 트리페닐포스핀(157.2 mg, 0.60 mmol), 및 삼차-부틸 5-아미노-4-(4-하이드록시-1,3-디옥소이소인돌린-2-일)-5-옥소펜타노에이트(104.4 mg, 0.30 mmol)용액에 DIAD(121.2 mg,0.60 mmol)를 N2 하에서 적가하였다. 혼합물을 20oC에서 1.5시간 동안 교반하였다. 반응물을 DCM(20 mL)으로 급냉시키고, 혼합물을 염수(10 mL x 3)로 세척하였다. 유기상을 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 분취 TLC로 정제하여 목적하는 생성물(120 mg, 43.1% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 824.3 [M+H]+.
단계 C: 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-(3-(4-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페닐)피페라진-1-일)프로폭시)이소인돌린-1,3-디온
아세토니트릴(5mL) 중 삼차-부틸 5-아미노-4-(1,3-디옥소-4-(3-(4-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페닐)피페라진-1-일)프로폭시)이소인돌린-2-일)-5-옥소펜타노에이트(미정제 120 mg, 0.087 mmol) 용액에 p-톨루엔설폰산(45.2 mg, 0.26 mmol)을 첨가하였다. 혼합물을 80oC에서 3시간 동안 교반하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 반응물을 DCM(30 mL)으로 희석하고, 혼합물을 염수(10 mL x 2)로 세척하였다. 유기상을 Na2SO4 상에서 건조시키고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 분취 TLC로 정제하여 목적하는 생성물(40 mg, 61.1% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 750.3 [M+H] +.
단계 D: (E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-(3-(4-(4-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페닐)피페라진-1-일)프로폭시)이소인돌린-1,3-디온
아세토니트릴/피리딘(v/v=3/1, 4 mL) 중 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-(3-(4-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페닐)피페라진-1-일)프로폭시)이소인돌린-1,3-디온(40 mg, 0.053 mmol) 용액에 하이드록실아민 염화수소(36.8 mg, 0.53 mmol)를 첨가하였다. 혼합물을 40oC에서 20분 동안 교반한 후, 이를 DCM(20 mL)으로 희석하였다. 혼합물을 염수로 세척하였다(10 mL x 2). 유기상을 Na2SO4 상에서 건조시키고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 분취 TLC 및 분취 HPLC로 정제하여 목적하는 생성물(7.5 mg, 18.4% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): δ 11.11 (s, 1H), 10.90 (s, 1H), 8.70 (s, 1H), 8.57-8.56 (m, 2H), 7.85-7.77 (m, 3H), 7.56 (d, J = 8.0 Hz, 2H), 7.49-7.45 (m, 3H), 7.41 (s, 1H), 7.22 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 7.10-7.08 (m, 2H), 5.12-5.08 (m, 1H), 4.32-4.28 (m, 2H), 3.22 (s, 5H), 3.03-2.97 (m, 2H), 2.89-2.80 (m, 3H), 2.62-2.57 (m, 7H), 2.06-1.99 (m, 3H). LCMS (ES+): m/z 765.2 [M+H] +.
화합물 200의 예시적인 합성: (E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-(3-(3-(4-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)프로폭시)페닐)이소인돌린-1,3-디온
단계 A: 3-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)프로판-1-올
건조 DMF(10.0 mL) 중 4-(4-브로모-1H-피라졸-3-일) 피리딘(500 mg, 1.58 mmol) 용액에 K2CO3 (434 mg, 3.16 mmol) 및 3-하이드록시프로필 4-메틸벤젠설포네이트(400 mg, 1.74mmol)를 순차적으로 첨가하였다. 생성된 용액을 80oC에서 3시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 EA(30 mL)로 희석하고 염수로 세척하였다. 유기상을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 정제하여(PE:EA = 1:1) 목적하는 생성물 3-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)프로판-1-올(400 mg, 67% 수율)을 연황색 오일로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 376.0 [M+H] +.
단계 B: 3-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)프로판-1-올
1,4-디옥산(10 mL) 중 10%의 물의 혼합물 중 3-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)프로판-1-올(400 mg, 1.07 mmol), 5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온(414 mg, 1.6 mmol), Pd2 (dba)3 (392 mg, 0.427 mmol), CsF (650 mg, 4.28 mmol), 트리-삼차-부틸포스핀 테트라플루오로보레이트(248 mg, 0.855 mmol), N,N-디시클로헥실메틸아민(9.0 mg, 0.047 mmol)의 용액에 N2 하에 마이크로웨이브로 100 oC에서 2시간 동안 조사하였다. 혼합물을 실온으로 냉각시키고 물로 급냉시켰다. 혼합물을 EA로 희석하고, 물 및 염수로 세척하였다. 유기상을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 정제하여(DCM: MeOH = 50:1) 목적하는 생성물 3-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)프로판-1-올(450 mg, 87% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 426.1 [M+H]+.
단계 C: 5-(3-(피리딘-4-일)-1-(4-(3-(3-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페녹시)프로폭시)페닐)-1H-피라졸-4-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온
DCM(10.0 mL) 중 3-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)프로판-1-올(450 mg, 1.06 mmol) 및 TEA(214 mg, 2.12 mmol) 용액에 MsCl(145 mg, 1.27 mmol)을 0 oC에서 적가하였다. 생성된 용액을 25oC에서 1시간 동안 교반하였다. 용매를 증발시키고 잔류물을 EA(50 mL)로 희석시켰다. 용액을 포화 NaHCO3 및 염수로 세척하였다. 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시켰다. 용매를 진공 중에서 제거하여 목적하는 생성물(520 mg 미정제)을 수득하였고, 이는 다음 단계에서 직접 사용되었다. 건조 DMF(10 mL) 중 위의 목적하는 생성물(520 mg, 1.03 mmol) 용액에 K2CO3(285 mg, 2.07 mmol) 및 3-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페놀(341 mg, 1.55 mmol)을 첨가하였다. 생성된 용액을 70℃에서 밤새 교반하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 반응물을 EA(50 mL)로 희석하고, 혼합물을 물, 염수로 세척하였다. 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시켰다. 잔류물을 크로마토그래피 컬럼으로 정제하여 5-(3-(피리딘-4-일)-1-(4-(3-(3-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페녹시)프로폭시)페닐)-1H-피라졸-4-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온(200 g, 2 단계에서 32% 수율)을 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 8.62 (d, J = 6 Hz, 2H), 8.00 (s, 1H), 7.76 (d, J = 7.6 Hz, 1H), 7.68 (d, J = 7.6 Hz, 2H), 7.51 (d, J = 4.4 Hz, 2H), 7.27－7.44 (m, 4H), 7.02－7.04 (m, 3H), 4.15－4.22 (m, 3H), 4.11－4.13 (m, 4H), 3.12－3.14 (m, 2H), 2.72－2.75 (m, 2H), 2.10 (s, 1H), 1.34 (s, 11H), 2.83 (s, 1H).
단계 D: 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-(3-(3-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)프로폭시)페닐)이소인돌린-1,3-디온
디옥산(5 mL)/ H2O (0.5 mL) 중 4-클로로-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)이소인돌린-1,3-디온(47 mg, 0.159 mmol) 및 5-(3-(피리딘-4-일)-1-(4-(3-(3-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥소보로란-2-일)페녹시)프로폭시)페닐)-1H-피라졸-4-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온(47 mg, 0.159 mmol) 용액에 CsF (97 mg, 0.64 mmol), Pd(aMphos)Cl2 (12 mg, 0.016 mmol)를 첨가하였다. 질소 분위가 하 100oC에서 2시간 동안 교반한 후, 반응 혼합물을 30 mL의 에틸 아세테이트로 희석하고, 용액을 염수(10 mL x 3)로 세척하였다. 유기상을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 분취 TLC(DCM/MeOH = 20/1)로 정제하여 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-(3-(3-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)프로폭시)페닐)이소인돌린-1,3-디온(50 mg, 40% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 758.2 [M+H] +.
단계 E: (E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-(3-(3-(4-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)프로폭시)페닐)이소인돌린-1,3-디온
아세토니트릴(2 mL) 및 피리딘(1 mL) 중 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-(3-(3-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)프로폭시)페닐)이소인돌린-1,3-디온(50 mg, 0.053 mmol) 용액에 하이드록실아민 염화수소(34 mg, 0.53 mmol)를 첨가하였다. 40oC에서 20분 동안 교반한 후, 반응물을 DCM(20 mL)으로 희석하고, 혼합물을 염수(10 mL x 2)로 세척하였다. 유기상을 Na2SO4 상에서 건조시키고, 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 분취 TLC로 정제하여 (E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-(3-(3-(4-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)프로폭시)페닐)이소인돌린-1,3-디온(26 mg, 51% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다.1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): δ 11.09 (s, 1H), 10.89 (s, 1H), 8.73 (s, 1H), 8.57 (d, J = 5.2 Hz, 2H), 7.82－7.92 (m, 5H), 7.56 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 7.48 (d, J = 4.8 Hz, 2), 7.37－7.41 (m, 2), 7.09－7.23 (m, 6H), 5.05－5.10 (m, 1H), 4.22－4.29 (m, 4H), 4.10 (s, 1H), 3.17 (d, J = 4.8 Hz, 1H), 2.99－3.01 (m, 2H), 2.81－2.84 (m, 3H), 2.22－2.54 (m, 1H), 2.02－2.08 (m, 1H); LCMS (ES+): m/z 773.2 [M+H] +.
화합물 201의 예시적인 합성:
단계 A: 5-플루오로-2-(1-메틸-2,6-디옥소피페리딘-3-일)이소인돌린-1,3-디온
건조 DMF (10.0 mL) 중 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-플루오로이소인돌린-1,3-디온(500 mg, 1.81 mmol) 용액에 NaH(145 mg, 3.62 mmol)를 0 oC에서 첨가하였다. 0.5시간 동안 교반한 후, CH3I(513.7 mg, 3.62 mmol)를 0oC에서 첨가하였다. 생성된 용액을 2시간 동안 교반하였다. NH4Cl 수용액으로 급냉시킨 후, 혼합물을 30 mL의 EA로 희석시키고, 염수(20 mL x 3)로 세척하였다. 유기상을 Na2SO4 상에서 건조시키고, 농축시켜 5-플루오로-2-(1-메틸-2,6-디옥소피페리딘-3-일)이소인돌린-1,3-디온(500 mg, 95.2% 수율)을 갈색 고체로서 수득하였고, 이는 다음 단계에서 직접 사용되었다. LCMS (ES+): m/z 291.1 [M+H]+.
단계 B: 2-(1-메틸-2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(4-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페닐)피페라진-1-일)이소인돌린-1,3-디온
MeOH(3 mL) 중 삼차-부틸 4-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페닐)피페라진-1-카르복실레이트(100 mg, 0.19 mmol) 용액에 1,4-디옥산(1 mL) 중 6 M HCl을 첨가하였다. 생성된 용액을 25oC에서 1시간 동안 교반하였다. 용액을 농축시키고 20 mL의 DCM으로 희석하고, NaHCO3 수용액을 pH > 7까지 첨가하였다. 혼합물을 DCM으로 추출하였다. 유기층을 Na2SO4 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시키고, 이는 다음 단계에서 직접 사용되었다. NMP(5 mL) 중 위의 중간체(90 mg 미정제, 0.19 mmol) 용액에 5-플루오로-2-(1-메틸-2,6-디옥소피페리딘-3-일)이소인돌린-1,3-디온(100 mg, 0.29 mmol) 및 DIEA(245.1 mg, 1.9 mmol)를 첨가하였다. 생성된 용액을 150oC에서 마이크로웨이브로 2시간 동안 조사하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 이를 DCM(20 mL)으로 희석하고, 혼합물을 염수로 세척하였다. 유기상을 Na2SO4 상에서 건조시키고, 여과하고, 감압 하에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼으로 정제하여 2-(1-메틸-2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(4-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페닐)피페라진-1-일)이소인돌린-1,3-디온(43 mg, 26.5% 수율)을 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 706.3 [M+H] +.
단계 C: (E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(4-(4-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페닐)피페라진-1-일)이소인돌린-1,3-디온
아세토니트릴/피리딘(3 mL, v/v = 2/1) 중 2-(1-메틸-2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(4-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페닐)피페라진-1-일)이소인돌린-1,3-디온(43 mg, 0.061 mmol) 용액에 하이드록실아민 염화수소(42.4 mg, 0.61 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 혼합물을 40oC로 40분 동안 가열하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 이를 DCM(20 mL)으로 희석하고, 염수(10 mL)로 세척하였다. 유기상을 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 분취 TLC로 정제하여 (E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(4-(4-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페닐)피페라진-1-일)이소인돌린-1,3-디온(23 mg, 52.3% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): δ 10.90 (s, 1H), 8.73 (s, 1H), 8.58-8.56 (d, J = 8.0 Hz, 2H), 7.84-7.82 (d, J = 8.8 Hz, 2H), 7.74-7.72 (d, J = 8.4 Hz, 1H), 7.56-7.55 (d, J = 8.4 Hz, 1H), 7.49-7.48 (m, 2H), 7.43-7.41 (m, 2H), 7.36-7.34 (m, 1H), 7.22-7.21 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 7.17-7.15 (d, J = 10 Hz, 2H), 5.18-5.14 (m, 1H), 3.66 (s, 4H), 3.42 (s, 4H), 3.02-2.91 (m, 6H), 2.85-2.74 (m, 3H), 2.60-2.53 (m, 1H), 2.09-2.00 (br, 1H). LCMS (ES+): m/z 721.3 [M+H] +.
화합물 202의 예시적인 합성: (3R)-N-(3-(5-(4-(4-(2-(4-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1,3-디옥소이소인돌린-5-일)피페라진-1-일)에틸)피페라진-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드
단계 A: 1-(4-브로모페닐)-4-(2,2-디에톡시에틸)피페라진
건조 DMF(50 mL) 중 1-(4-브로모페닐)피페라진(5 g, 20.8 mmol) 용액에 2-브로모-1,1-디에톡시에탄(4.1 g, 20.8 mmol) 및 K2CO3 (8.6 g, 62.4 mmol)를 첨가하였다. 생성된 용액을 90oC에서 16시간 동안 교반하였다. 반응물을 EA(50 mL)으로 희석하고, 혼합물을 염수(20 mL x 2)로 세척하였다. 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 상에 적용하여 목적하는 생성물(6 g, 81% 수율)을 오일로서 수득하였다.
1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 7.32 (d, J = 9.2 Hz, 2H), 6.77 (d, J = 8.8 Hz, 2H), 4.67 (t, J = 5.2 Hz, 1H), 3.69-3.72 (m, 2H), 3.54-3.58 (m, 2H), 3.15 (m, 4H), 2.68-2.71 (m, 4H), 2.60 (d, J = 5.2 Hz, 2H), 1.22 (t, J = 7.2 Hz, 6H).
단계 B: 1-(2,2-디에톡시에틸)-4-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)피페라진
1,4-디옥산(70 mL) 중 1-(4-브로모페닐)-4-(2,2-디에톡시에틸)피페라진(7.8 g 미정제, 21.9 mmol) 용액에 4,4,4',4',5,5,5',5'-옥타메틸-2,2'-비(1,3,2-디옥사보로란)(8.3 g, 32.8 mmol), Pd(dppf)Cl2 (1.6 g, 2.2 mmol) 및 KOAc(6.4 g, 65.6 mmol)를 첨가하였다. 생성된 용액을 N2분위기 하 90℃에서 밤새 교반하였다. TLC가 반응이 완료되었음을 나타내었다. 실온으로 냉각시킨 후, 반응 혼합물을 농축시키고 크로마토그래피 컬럼으로 정제하여 1-(2,2-디에톡시에틸)-4-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)피페라진(5 g, 74% 수율)을 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 7.69 (d, J = 8.4 Hz, 2H), 6.87 (d, J = 8.4 Hz, 2H), 4.70 (m, 1H), 3.50-3.72 (m, 4H), 3.26 (m, 4H), 2.72 (m, 4H), 2.60 (d, J = 5.2 Hz, 2H), 1.32 (s, 12H), 1.22 (t, J = 7.2 Hz, 6H).
단계 C: (R)-N-(3-(5-(4-(4-(2,2-디에톡시에틸)피페라진-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드
1,4-디옥산/H2O (10 ml/2 mL) 중 (R)-N-(3-(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드(300 mg, 0.60 mmol) 용액에 1-(2,2-디에톡시에틸)-4-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)피페라진(726 mg, 1.80 mmol), Pd(aMphos)Cl2 (42 mg, 0.06 mmol) 및 CsF(363 mg, 3.20 mmol)를 첨가하였다. 생성된 용액을 N2 분위기 하 95℃에서 3시간 동안 교반하였다. TLC가 반응이 완료되었음을 나타내었다. 실온으로 냉각시킨 후, 반응 혼합물을 EA(50 mL)로 희석하고, 혼합물을 물 및 염수로 세척하였다. 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시켰다. 잔류물을 크로마토그래피 컬럼으로 정제하여 (R)-N-(3-(5-(4-(4-(2,2-디에톡시에틸)피페라진-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드(350 mg, 70% 수율)을 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 701.3 [M+H] +.
단계 D: (R)-N-(2,4-디플루오로-3-(5-(4-(4-(2-옥소에틸)피페라진-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드
CH3CN (10 mL) 중 (R)-N-(3-(5-(4-(4-(2,2-디에톡시에틸)피페라진-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드(350 mg, 0.50 mmol) 용액에 농축 HCl(3 mL, 9 mL H2O로 희석됨)을 첨가하였다. 생성된 용액을 55℃에서 16시간 동안 교반하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 반응 혼합물에 포화 NaHCO3를 첨가하여 pH를 7 내지 8로 조정하였다. 많은 고체가 관찰되었다. 현탁액을 DCM으로 추출하였다. 유기상을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 농축시켜 (R)-N-(2,4-디플루오로-3-(5-(4-(4-(2-옥소에틸)피페라진-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드(490 mg, 미정제)를 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 645.2 [M+H+18] +.
단계 E: (3R)-N-(3-(5-(4-(4-(2-(4-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1,3-디옥소이소인돌린-5-일)피페라진-1-일)에틸)피페라진-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드
THF/MeOH/DMSO(15 mL, 1/1/1) 중 (R)-N-(2,4-디플루오로-3-(5-(4-(4-(2-옥소에틸)피페라진-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드(490 mg 미정제, 0.80 mmol) 용액에 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(피페라진-1-일)이소인돌린-1,3-디온 염화수소(364 mg, 0.96 mmol) 및 2 방울의 AcOH를 첨가하였다. 이어서 NaBH3CN(248 mg, 4.00 mmol)을 첨가하였다. 생성된 용액을 20oC에서 2시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 20 mL의 포화 NaCl 용액으로 희석하고 DCM으로 추출하였다. 유기상을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 농축시켰다. 미정제 생성물을 우선 실리카 겔 컬럼 상에 적용시키고 이어서 분취 HPLC로 정제하여 목적하는 생성물 (3R)-N-(3-(5-(4-(4-(2-(4-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1,3-디옥소이소인돌린-5-일)피페라진-1-일)에틸)피페라진-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드(75 mg, 2단계에서 16% 수율)를 황색 고체로서 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): δ 12.92 (s, 1H), 11.08 (s, 1H), 9.80 (br, 1H), 8.54-8.66 (m, 2H), 8.07 (s, 1H), 7.59-7.69 (m, 4H), 7.25-7.35 (m, 3H), 7.07 (d, J = 8.4 Hz, 2H), 5.05-5.36 (m, 2H), 3.22-3.48 (m, 14H), 2.55-3.00 (m, 14H), 1.90-2.20 (m, 4H); LCMS (ES+): m/z 954.3 [M+H] +.
화합물 203의 예시적인 합성: (E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(2-(3-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)이소인돌린-1,3-디온
단계 A: 4-(1-(3-(2-(벤질옥시)에톡시)페닐)-4-브로모-1H-피라졸-3-일)피리딘
DCM(50 mL) 중 2-(3-(2-(벤질옥시)에톡시)페닐)-4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-
디옥사보로란(1.2 g, 3.39 mmol) 용액에 4-(4-브로모-1H-피라졸-3-일)피리딘(831.53 mg, 3.73 mmol), Cu(OAc)2 (615.6 mg, 3.39 mmol), Et2NH(2.47 g, 33.9 mmol)를 순차적으로 첨가하였다. 생성된 용액을 30oC에서 밤새 교반하였다. 혼합물을 수산화 암모늄(30 mL x 3)으로 세척하였다. 유기상을 건조시키고 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 PE/EA의 실리카 겔 컬럼으로 정제하여 목적하는 생성물 4-(1-(3-(2-(벤질옥시)에톡시)페닐)-4-브로모-1H-피라졸-3-일)피리딘(900 mg, 59% 수율)을 자색 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 450.1 [M+H] +.
단계 B: 5-(1-(3-(2-(벤질옥시)에톡시)페닐)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-4-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온
1,4-디옥산/H2O (20 mL, v/v=10/1) 중 4-(1-(3-(2-(벤질옥시)에톡시)페닐)-4-브로모-1H-피라졸-3-일)피리딘(900 mg, 2.0 mmol) 용액에 5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)- 2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온(774 mg, 3.0 mmol), Pd2 (dba)3 (183.14 mg, 0.2 mmol), CsF(3.14 g, 20.64 mmol) [(t-Bu)3PH]BF4 (609 mg, 2.1 mmol), N,N-디시클로헥실메틸아민(503 mg, 2.58 mmol)을 순차적으로 첨가하였다. 생성된 용액을 N2 하 100℃에서 2시간 동안 교반하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 반응물을 EA(50 mL)로 희석하고, 물 및 염수로 세척하였다. 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼으로 정제하여 5-(1-(3-(2-(벤질옥시)에톡시)페닐)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-4-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온(750 mg, 74.9% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 502.2 [M+H] +.
단계 C: 5-(1-(3-(2-하이드록시에톡시)페닐)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-4-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온
DCM(10 mL) 중 5-(1-(3-(2-(벤질옥시)에톡시)페닐)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-4-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온(750 mg, 1.50 mmol) 용액에 DCM(5 mL) 중 BBr3 (1.13 g, 4.50 mmol)를 N2 하 -60℃에서 적가하였다. 1시간 동안 교반한 후, 혼합물을 DCM(20 mL)으로 희석하고, 염수(10 mL x 2)로 세척하였다. 유기상을 농축시키고 실리카 겔 컬럼으로 정제하여 5-(1-(3-(2-하이드록시에톡시)페닐)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-4-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온(150 mg, 24.4% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 412.1 [M+H] +.
단계 D: 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(2-(3-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)이소인돌린-1,3-디온
DCM(10 mL) 및 TEA(109.08 mg, 1.08 mmol) 중 5-(1-(3-(2-하이드록시에톡시)페닐)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-4-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온(150 mg, 0.36 mmol) 용액에 MsCl(61.56 mg, 0.54 mmol)을 0 oC에서 적가하였다. 생성된 용액을 25oC에서 0.5시간 동안 교반하였다. 이어서 물을 첨가하고 DCM으로 추출하였다. 유기층을 물 및 염수로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 농축시켜 목적하는 생성물(170 mg 미정체, 95.5%)을 황색 오일로서 수득하였고, 이는 다음 단계에서 직접 사용되었다. DMF(10 ml) 중 위의 목적하는 생성물(170 mg, 0.35 mmol) 용액에 K2CO3(144.9 mg, 1.05 mmol), 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5- 하이드록시이소인돌린-1,3-디온(191.8 mg, 0.70 mmol)을 첨가하였다. 생성된 용액을 70℃에서 2시간 동안 교반하였다. 물로 급냉시킨 후, 혼합물을 EA(30 mL)로 추출하고, 물 및 염수로 세척하였다. 유기상을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 농축시킨 후 실리카 겔 컬럼으로 정제하여 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(2-(3-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)이소인돌린-1,3-디온(60 mg, 25.9% 수율)을 백색 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 668.2 [M+H] +.
단계 E: (E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(2-(3-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)에톡시)이소인돌린-1,3-디온
아세토니트릴/피리딘(3.0 mL, v/v = 2/1) 중 S2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(2-(3-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)이소인돌린-1,3-디온(60 mg, 0.090 mmol) 용액에 하이드록실아민 염화수소(58.41 mg, 0.90 mmol)를 첨가하였다. 혼합물을 40oC에서 20분 동안 교반하였다. 이어서, 이를 DCM(20 mL)으로 희석하고, 염수(10 mL)로 세척하였다. 유기층을 농축시키고 분취 HPLC로 정제하여 (E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(2-(3-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)이소인돌린-1,3-디온(8 mg, 65.6% 수율)을 백색 고체로서 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 8.58 (s, 2H), 8.04 (s, 2H), 7.83-7.81 (d, J = 8.4 Hz, 1H), 7.68-7.66 (d, J = 7.6 Hz, 1H), 7.52 (m, 2H), 7.48 (m, 1H),7.44-7.43 (m, 2H), 7.41-7.36 (m, 2H), 7.30 (s, 2H), 7.23 (s, 2H), 4.99-4.94 (m, 1H), 4.49 (s , 4H), 3.05-2.94 (m, 4H), 2.90-2.73 (m, 3H), 2.04-2.00 (m, 1H); LCMS:(ES+):m/z 683.2 [M+H]+.
화합물 204 및 205는 화합물 203과 유사한 방식으로 제조될 수 있다.
화합물 206의 예시적인 합성: (E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(2-(4-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)피페리딘-1-일)에톡시)이소인돌린-1,3-디온
단계 A: 단계 A: 삼차-부틸 4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)피페리딘-1-카르복실레이트
DMF(50 mL) 중 4-(4-브로모-1H-피라졸-3-일)피리딘(5.0 g, 22.4 mmol), 삼차-부틸 4-브로모피페리딘-1-카르복실레이트(7.1 g, 26.9 mmol) 및 Cs2CO3 (11.0 g, 33.6 mmol) 용액을 55℃에서 밤새 교반하였다. 실온으로 냉각되었을 때, 물(50 mL)을 첨가하였다. 생성된 혼합물을 에틸 아세테이트(20 mL x 3)로 추출하고, 합쳐진 유기층을 염수(20 mL x 3)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과한 후 농축시켰다. 잔류물을 실리카 상의 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르/에틸 아세테이트 = 1/1)로 정제하여 삼차-부틸 4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)피페리딘-1-카르복실레이트(3.7 g, 41% 수율)를 갈색 오일로서 수득하였다. LCMS: m/z 407.1 [M+H]+.
단계 B: 삼차-부틸 4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)피페리딘-1-카르복실레이트
1,4-디옥산(40 mL) 및 물(8 mL) 중 삼차-부틸 4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)피페리딘-1-카르복실레이트(2.0 g, 4.9 mmol), 5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온(1.4 g, 5.4 mmol) 및 K2CO3 (1.4 g, 9.8 mmol) 용액에 Pd(PPh3)4 (200 mg)를 Ar 분위기 하에서 첨가하고, 혼합물을 80 oC에서 2시간 동안 교반하였다. 실온으로 냉각되었을 때, 혼합물을 에틸 아세테이트(20 mL x 3)로 추출하고, 합쳐진 유기층을 염수(20 mL x 3)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과한 후 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 플래쉬 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르/에틸 아세테이트 = 1/10)로 정제하여 삼차-부틸 4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)피페리딘-1-카르복실레이트(1.9 g, 84% 수율)를 황색 오일로서 수득하였다. LCMS: m/z 459.3 [M+H]+.
단계 C: 5-(1-(피페리딘-4-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-4-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온
HCl/1,4-디옥산(20 mL) 중 삼차-부틸 4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)피페리딘-1-카르복실레이트(1.9 g, 4.1 mmol)의 혼합물을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 이어서, 용매를 진공 중에서 직접 제거하고, 미정제 생성물(1.6 g, 100% 수율)을 염화수소염으로서 수득하였고, 이는 추가 정제 없이 다음 단계에 직접 사용되었다.
단계 D: 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(2-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)피페리딘-1-일)에톡시)이소인돌린-1,3-디온
DMSO(8 mL) 중 5-(1-(피페리딘-4-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-4-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온(440 mg, 1.2 mmol), 5-(2-클로로에톡시)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)이소인돌린-1,3-디온(410 mg, 1.2 mmol), KI(304 mg, 1.8 mmol) 및 DIPEA(476 mg, 3.6 mmol) 용액을 100℃에서 밤새 교반하였다. 실온으로 냉각되었을 때, 물(10 mL)를 첨가하고, 혼합물을 에틸 아세테이트(5 mL x 3)로 추출하고, 합쳐진 유기층을 염수(5 mL x 3)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과한 후 농축시켰다. 잔류물을 분취 TLC(DCM/MeOH = 10/1)로 정제하여 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(2-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)피페리딘-1-일)에톡시)이소인돌린-1,3-디온(180 mg, 22% 수율)을 백색 고체로서 수득하였다. LCMS: m/z 659.3 [M+H]+.
단계 E: (E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(2-(4-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)피페리딘-1-일)에톡시)이소인돌린-1,3-디온
피리딘(2 mL) 중 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(2-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)피페리딘-1-일)에톡시)이소인돌린-1,3-디온(120 mg, 0.2 mmol) 용액에 하이드록실아민 염화수소(126 mg, 1.8 mmol)를 첨가하고, 혼합물을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 이어서, 용매를 진공 중에서 제거하고, 잔류물을 분취 HPLC로 정제하여 (E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(2-(4-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)피페리딘-1-일)에톡시)이소인돌린-1,3-디온(52 mg, 42% 수율)을 수득하였다. LCMS: m/z 674.2 [M+H]+; 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 2.03-2.11 (5H, m), 2.25-2.30 (2H, m), 2.50-2.62 (2H, m), 2.78-2.86 (5H, m), 2.88-2.99 (2H, m), 3.08-3.11 (2H, m), 4.22-4.28 (1H, m), 4.33 (2H, t, J = 5.2 Hz), 5.12 (1H, dd, J = 12.8, 5.2 Hz), 7.12 (1H, d, J = 8.0 Hz), 7.30 (1H, s), 7.38-7.40 (3H, m), 7.49-7.52 (2H, m), 7.84 (1H, d, J = 8.4 Hz), 8.14 (1H, s), 8.50 (2H, dd, J = 4.4, 1.6 Hz), 10.86 (1H, s), 11.10 (1H, s).
화합물 207의 예시적인 합성: (E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(4-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)-1,4'-비피페리딘-1'-일)이소인돌린-1,3-디온
단계 A: 삼차-부틸 4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)-1,4'-비피페리딘-1'-카르복실레이트
DMF(20 mL) 중 5-(1-(피페리딘-4-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-4-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온(2.5 g, 7.0 mmol), 삼차-부틸 4-브로모피페리딘-1-카르복실레이트(2.0 g, 7.7 mmol), KI(1.2 g, 7.0 mmol) 및 K2CO3 (2.9 g, 20.9 mmol) 용액을 110℃에서 밤새 교반하였다. 실온으로 냉각되었을 때, 물(30 mL)을 첨가하였다. 생성된 혼합물을 에틸 아세테이트(20 mL x 3)로 추출하고, 합쳐진 유기층을 염수(20 mL x 3)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과한 후 농축시켰다. 잔류물을 실리카 상의 컬럼 크로마토그래피(DCM/MeOH = 20/1)로 정제하여 삼차-부틸 4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)-1,4'-비피페리딘-1'-카르복실레이트(360 mg, 10% 수율)를 갈색 오일로서 수득하였다. LCMS: m/z 542.3 [M+H]+.
단계 B: 5-(1-(1,4'-비피페리딘-4-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-4-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온
HCl/1,4-디옥산(10 mL) 중 삼차-부틸 4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)-1,4'-비피페리딘-1'-카르복실레이트(360 mg, 0.7 mmol)의 혼합물을 실온에서 30분 동안 교반하였다. 이어서, 용매를 진공 중에서 직접 제거하고, 미정제 생성물(300 mg, 100% 수율)을 염화수소염으로서 수득하였고, 이는 추가 정제 없이 다음 단계에 직접 사용되었다.
단계 C: 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)-1,4'-비피페리딘-1'-일)이소인돌린-1,3-디온
DMSO(5 mL) 중 5-(1-(1,4'-비피페리딘-4-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-4-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온(290 mg, 0.7 mmol), 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-플루오로이소인돌린-1,3-디온(183 mg, 0.7 mmol), 및 Et3N (336 mg, 3.3 mmol) 용액을 80℃에서 밤새 교반하였다. 실온으로 냉각되었을 때, 물(10 mL)를 첨가하고, 혼합물을 에틸 아세테이트(5 mL x 3)로 추출하고, 합쳐진 유기층을 염수(5 mL x 3)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과한 후 농축시켰다. 잔류물을 분취 TLC(DCM/MeOH = 20/1)로 정제하여 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)-1,4'-비피페리딘-1'-일)이소인돌린-1,3-디온(195 mg, 42% 수율)을 백색 고체로서 수득하였다. LCMS: m/z 698.3 [M+H]+.
단계 D: (E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(4-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)-1,4'-비피페리딘-1'-일)이소인돌린-1,3-디온
피리딘(2 mL) 중 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)-1,4'-비피페리딘-1'-일)이소인돌린-1,3-디온(95 mg, 0.1 mmol) 용액에 하이드록실아민 염화수소(94 mg, 1.3 mmol)를 첨가하고, 혼합물을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 이어서, 용매를 진공 중에서 제거하고, 잔류물을 분취 HPLC로 정제하여 (E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(4-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)-1,4'-비피페리딘-1'-일)이소인돌린-1,3-디온(53 mg, 55% 수율)을 수득하였다. LCMS: m/z 713.4 [M+H]+; 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 1.51-1.53 (2H, m), 1.84-1.87 (2H, m), 1.97-2.03 (3H, m), 2.09-2.11 (2H, m), 2.32-2.37 (2H, m), 2.57-2.67 (2H, m), 2.78-2.89 (3H, m), 2.90-2.99 (6H, m), 4.11 (2H, d, J = 12.8 Hz), 4.20-4.22 (1H, m), 5.06 (1H, dd, J = 12.8, 5.6 Hz), 7.12 (1H, d, J = 8.8 Hz), 7.25 (1H, d, J = 6.0 Hz), 7.27 (1H, s), 7.30 (1H, s), 7.38 (2H, dd, J = 4.8, 1.2 Hz), 7.50 (1H, d, J = 8.0 Hz), 7.56 (1H, d, J = 8.8 Hz), 8.13 (1H, s), 8.24 (1H, s), 8.50 (2H, dd, J = 4.8, 1.6, Hz), 10.86 (1H, s), 11.08 (1H, s).
화합물 208의 예시적인 합성: (3R)-N-(3-(5-(4-(2-(2-(2-(2-(4-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1,3-디옥소이소인돌린-5-일)피페라진-1-일)에톡시)에톡시)에톡시)에톡시)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드
단계 A: 2-(2-(2-(2-(4-브로모페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)아세트알데히드
아세토니트릴(30 mL) 중 2-(2-(2-(2-(4-브로모페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)에탄-1-올(3.1 g, 8.90 mmol) 용액에 IBX(3.7 g, 13.40 mmol)를 첨가하였다. 혼합물을 80oC에서 1시간 동안 가열하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 혼합물을 셀라이트를 통해 여과하고, 농축시켜 미정제의 목적하는 생성물 2-(2-(2-(2-(4-브로모페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)아세트알데히드(3.2 g, 미정제)를 오일로서 수득하였다.
단계 B: 5-(4-(2-(2-(2-(2-(4-브로모페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)에틸)피페라진-1-일)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)이소인돌린-1,3-디온
2 방울의 AcOH을 함유하는 메탄올(100 mL) 중 2-(2-(2-(2-(4-브로모페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)아세트알데히드(3.2 g, 9.20 mmol) 및 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(피페라진-1-일)이소인돌린-1,3-디온 염화수소(3.1 g, 9.20 mmol)의 용액에 NaBH3CN (0.58 g, 9.20 mmol)을 첨가하였다. 혼합물을 실온에서 밤새 교반하였다. 물(50 mL)로 급냉시킨 후, 혼합물을 DCM(100 mL x 2)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(200 mL)로 세척하고, Na2SO4 상에서 건조시키고 여과하였다. 용매를 감압 하에 증발시켰다. 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(DCM:MeOH=20:1)로 정제하여 목적하는 화합물 5-(4-(2-(2-(2-(2-(4-브로모페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)에틸)피페라진-1-일)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)이소인돌린-1,3-디온(1.1 g, 18%)을 황색 고체로서 수득하였다. LC-MS: (ES+): m/z 675.1 [M+H]+.
단계 C: 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(4-(2-(2-(2-(2-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)에틸)피페라진-1-일)이소인돌린-1,3-디온
디옥산(10 mL) 중 5-(4-(2-(2-(2-(2-(4-브로모페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)에틸)피페라진-1-일)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)이소인돌린-1,3-디온(400 mg, 0.60 mmol), 4,4,4',4',5,5,5',5'-옥타메틸-2,2'-비(1,3,2-디옥사보로란)(227 mg, 0.89 mmol) , Pd(dppf)Cl2 (88 mg, 0.12 mmol) 및 KOAc(118 mg, 1.20 mmol) 용액을 N2 분위기 하에 90oC로 밤새 가열하였다. 반응 후 물(15 mL)로 급냉시키고, 혼합물을 DCM(50 mL x 2)으로 추출하였다. 합쳐진 층을 물 및 염수로 세척하였다. 합쳐진 유기층을 건조시키고(Na2SO4), 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피로 정제하여 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(4-(2-(2-(2-(2-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)에틸)피페라진-1-일)이소인돌린-1,3-디온(200 mg, 47%)을 황색 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 721.3 [M+H]+.
단계 D: (3R)-N-(3-(5-(4-(2-(2-(2-(2-(4-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1,3-디옥소이소인돌린-5-일)피페라진-1-일)에톡시)에톡시)에톡시)에톡시)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드
디옥산/H2O (5 mL/1 mL) 중 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(4-(2-(2-(2-(2-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)에틸)피페라진-1-일)이소인돌린-1,3-디온(200 mg, 0.28 mmol), (R)-N-(3-(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드(116 mg, 0.23 mmol), Pd(aMPhos)Cl2 (66 mg, 0.09 mmol) 및 CsF (141 mg, 0.93 mmol) 용액을 N2 분위기 하에 100oC로 4시간 동안 가열하였다. 반응 후 물(15 mL)로 급냉시키고, 혼합물을 DCM(50 mL x 2)으로 추출하였다. 합쳐진 층을 물 및 염수로 세척하였다. 합쳐진 유기층을 건조시키고(Na2SO4), 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피로 정제하여 (3R)-N-(3-(5-(4-(2-(2-(2-(2-(4-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1,3-디옥소이소인돌린-5-일)피페라진-1-일)에톡시)에톡시)에톡시)에톡시)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드(40 mg, 17%)를 황색 고체로서 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 11.23 (bs, 1H), 10.56 (s, 1H), 8.73 (s, 1H), 8.54 (s, 1H), 7.68-7.62 (m, 3H), 7.44 (s, 1H), 7.28 (s, 1H), 7.09 (d, J = 8.8 Hz, 2H), 7.01 (t, J = 8.8 Hz, 1H), 6.84 (s, 1H), 6.54 (d, J = 7.6 Hz, 1H), 5.17 (s, 1H), 5.11-4.95 (m, 1H), 4.23 (s, 2H), 3.92 (s, 2H), 3.77-3.76 (m, 2H), 3.69-3.67 (m, 4H), 3.64-3.57 (m, 4H), 3.54-3.51 (m, 2H), 3.42-3.39 (m, 2H), 3.13 (s, 4H), 2.93 (s, 3H), 2.50-2.35 (m, 6H), 2.10 (s, 2H); LCMS (ES+): m/z 1018.3 [M+H]+.
화합물 209의 예시적인 합성:
단계 A: 3-(삼차-부틸디메틸실릴옥시)시클로헥사놀
디클로로메탄(150 mL) 및 테트라하이드로푸란(150 mL)의 혼합물 중 1,3-시클로헥산디올(시스 및 트랜스 혼합물, 25 g, 0.216 mmol) 및 이미다졸(8.8 g, 0.129 mmol) 용액에 디클로로메탄(40 mL) 및 테트라하이드로푸란(40 mL)의 혼합물 중 삼차-부틸디메틸실릴 염화물(16.2 g, 0.107 mmol)을 0℃에서 적가하였다. 반응 혼합물을 실온으로 가온하고 밤새 교반하였다. 불용성 물질을 여과로 제거하고 모액을 감압 하에서 농축시켜 잔류물을 수득하고, 이를 에틸 아세테이트(300 mL)에 용해시킨 후, 1 N 수성 염산(100 mL), 염수(100 mL), 포화 수산화 나트륨 수용액(100 mL), 포화 염화 나트륨(100 mL)으로 차례로 세척하고, 무수 황산 나트륨 상에서 건조시켰다. 용매를 증발시켜 잔류물을 수득하였고, 이를 실리카 겔 상 크로마토그래피(에틸 아세테이트/n-헥산=1:5)로 정제하여 3-(삼차-부틸디메틸실릴옥시)시클로헥사놀(시스 및 트랜스 혼합물)(12.5 g, 51% 수율)을 무색 오일로서 수득하였다.
단계 B: 3-(피리딘-4-일옥시)시클로헥사놀
THF(40 mL, 건조) 중 3-(삼차-부틸디메틸실릴옥시)시클로헥사놀(10 g, 43.4 mmol), 피리딘-4-올(3.9 g, 41.2 mmol), 트리페닐포스핀(14.8 g, 56.42 mmol)의 혼합물을 질소 대기 하에 실온에서 0.5 시간의 기간 동안 디이소프로필 아조디카르복실레이트(10.5 g, 52.1 mmol)를 적가하였다. 혼합물을 질소 분위기 하 실온에서 3시간 동안 교반하였다. HCl 수용액(70 mL, 1 N)을 첨가하고 0.5시간 동안 교반하였다. 혼합물을 DCM(60 mL x 3)으로 추출하였다. 액상층을 KOH로 염기화하고 에틸 아세테이트(60 mL x 4)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켜 3-(피리딘-4-일옥시)시클로헥사놀(3.3 g, 40% 수율)을 황색 오일로서 수득하였다. LCMS: m/z 194.1 [M+H]+.
단계 C: 3-(피페리딘-4-일옥시)시클로헥사놀
에탄올(30 mL) 중 3-(피리딘-4-일옥시)시클로헥사놀(3.3 g, 17 mmol) 용액 혼합물에 이산화백금(660 mg, 2.9 mmol), 황산(2.5 g, 26 mmol)을 첨가한 후, 반응 혼합물을 수소 2.0 MPa 하 50℃에서 2일 동안 교반하였다. 혼합물을 여과하고 농축시키고, 염수(30 mL x 3)를 첨가하고 DCM/MeOH(10/1, 30 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 상 컬럼 크로마토그래피(디클로로메탄/메탄올 = 10/1)로 정제하여 3-(피페리딘-4-일옥시)시클로헥사놀(330 mg, 10% 수율)을 담황색 오일로서 수득하였다.
단계 C: 삼차-부틸 4-(3-하이드록시시클로헥실옥시)피페리딘-1-카르복실레이트
디클로로메탄(15 mL) 중 3-(피페리딘-4-일옥시)시클로헥사놀(330 mg, 1.66 mmol) 및 DIEA(642 mg, 4.9 mmol) 용액에 Boc2O (436 mg, 2.0 mmol)를 첨가한 후, 이를 실온에서 밤새 교반하였다. 용매를 진공 중 실온에서 제거하고 잔류물을 실리카 겔 상 컬럼 크로마토그래피(에틸 아세테이트/석유 에테르 = 1/1)로 정제하여 삼차-부틸 4-(3-하이드록시시클로헥실옥시)피페리딘-1-카르복실레이트(352 mg, 71% 수율)를 황색 오일로서 수득하였다.
단계 D: 삼차-부틸 4-(3-(메틸설포닐옥시)시클로헥실옥시)피페리딘-1-카르복실레이트
디클로로메탄(15 mL) 중 삼차-부틸 4-(3-하이드록시시클로헥실옥시)피페리딘-1-카르복실레이트(352 mg, 1.18 mmol) 및 DIEA(457 mg, 3.5 mmol) 용액에 MsCl(162 mg, 1.4 mmol)을 첨가하고, 혼합물을 0℃에서 1시간 동안 교반하였다. 이를 수성 NaHCO3(15 mL x 2), 염수(10 mL x 2)로 연속적으로 세척하였다. 유기상을 무수 Na2SO4 상에서 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켜, 미정제 삼차-부틸 4-(3-(메틸설포닐옥시)시클로헥실옥시)피페리딘-1-카르복실레이트(351 mg, 79% 수율)를 담황색 오일로서 수득하였다.
단계 E: 시스-삼차-부틸-3-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)시클로헥실옥시)피페리딘-1-카르복실레이트 및 트랜스-삼차-부틸-3-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)시클로헥실옥시)피페리딘-1-카르복실레이트
N,N-디메틸포름아미드(5 mL) 중 삼차-부틸 4-(3-(메틸설포닐옥시)시클로헥실옥시)피페리딘-1-카르복실레이트(450 mg, 1.19 mmol), 4-(4-브로모-1H-피라졸-3-일)피리딘(252 mg, 1.13 mmol), Cs2CO3 (1.16 g, 3.57 mmol)의 혼합물을 80℃에서 2일 동안 교반하였다. 이를 염수(15 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(15 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(15 mL x 3)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 상 컬럼 크로마토그래피(에틸 아세테이트/석유 에테르 = 1/1)로 정제하여 시스-삼차-부틸-3-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)시클로헥실옥시)피페리딘-1-카르복실레이트(140 mg) 및 트랜스-삼차-부틸-3-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)시클로헥실옥시)피페리딘-1-카르복실레이트(130 mg)를 담황색 고체로서 수득하였다. 시스-삼차-부틸-3-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)시클로헥실옥시)피페리딘-1-카르복실레이트: LCMS: m/z 505.3 [M+H]+; 1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 1.38 (9H, s), 1.53-1.72 (6H, m), 1.89-2.11 (6H, m), 2.97-3.04 (2H, m), 3.41-3.47 (1H, m), 3.53-3.55 (1H, m), 3.69 (2H, brs), 4.09-4.15 (1H, m), 7.52 (1H, s), 7.84 (2H, d, J = 6.0 Hz), 8.59 (2H, s). 트랜스-삼차-부틸-3-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)시클로헥실옥시)피페리딘-1-카르복실레이트: LCMS: m/z 505.3 [M+H]+; 1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 1.39 (9H, s), 1.42-1.92 (9H, m), 2.05-2.18 (3H, m), 3.04-3.11 (2H, m), 3.46-3.50 (1H, m), 3.66 (2H, brs), 3.90 (1H, s), 4.42-4.46 (1H, m), 7.47 (1H, s), 7.85 (2H, d, J = 5.6 Hz), 8.58 (2H, s).
단계 F: 삼차-부틸 4-((1S,3R)-3-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)시클로헥실옥시)피페리딘-1-카르복실레이트
1,4-디옥산/물(6 mL, 5/1) 중 삼차-부틸 4-((1S,3R)-3-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)시클로헥실옥시)피페리딘-1-카르복실레이트(40 mg, 0.08 mmol), 5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥소보로란-2-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온(26 mg, 0.1 mmol), K2CO3 (33 mg, 0.24 mmol), 테트라키스(트리페닐포스핀)팔라듐(10 mg, 10M%)의 혼합물을 질소 분위기 하 80 oC에서 2시간 동안 교반하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 이를 물(10 mL)로 희석시키고, 에틸 아세테이트(15 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(20 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르/에틸 아세테이트 = 45/55)로 정제하여 삼차-부틸 4-((1S,3R)-3-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)시클로헥실옥시)피페리딘-1-카르복실레이트(20 mg, 44% 수율)를 황색 고체로서 수득하였다. LCMS: m/z 557.3 [M+H]+.
단계 G: 5-(1-((1R,3S)-3-(피페리딘-4-일옥시)시클로헥실)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-4-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온
1,4-디옥산(3 mL) 중 4 N HCl의 용액 중 삼차-부틸 4-((1S,3R)-3-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)시클로헥실옥시)피페리딘-1-카르복실레이트(40 mg, 0.08 mmol)의 용액을 0 oC에서 5시간 동안 교반하였다. 이어서 용매를 직접적으로 제거하여 5-(1-((1R,3S)-3-(피페리딘-4-일옥시)시클로헥실)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-4-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온(38 mg, 미정제, 100% 수율)을 수득하였고, 이는 추가 정제 없이 다음 단계에 직접 사용되었다.
단계 H: 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(4-((1S,3R)-3-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)시클로헥실옥시)피페리딘-1-일)이소인돌린-1,3-디온
DMSO(3 mL) 중 5-(1-((1R,3S)-3-(피페리딘-4-일옥시)시클로헥실)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-4-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온(20 mg, 0.044 mmol), 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-플루오로이소인돌린-1,3-디온(18 mg, 0.066 mmol), DIEA(17 mg, 0.13 mmol)의 혼합물을 80℃에서 밤새 교반하였다. 이를 염수(15 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(15 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(15 mL x 3)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 분취 TLC(DCM/MeOH = 20/1)로 정제하여 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(4-((1S,3R)-3-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)시클로헥실옥시)피페리딘-1-일)이소인돌린-1,3-디온(15 mg, 50% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다. LCMS: m/z 713.3 [M+H]+.
단계 I: 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(4-((1S,3R)-3-(4-((E)-1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)시클로헥실옥시)피페리딘-1-일)이소인돌린-1,3-디온
피리딘(3 mL) 중 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(4-((1S,3R)-3-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)시클로헥실옥시)피페리딘-1-일)이소인돌린-1,3-디온(15 mg, 0.021 mmol), 하이드록실아민 염화수소(15 mg, 0.21 mmol)의 혼합물을 실온에서 밤새 교반하였다. 용매를 진공 중 실온에서 직접 제거하고, 잔류물을 분취 HPLC로 정제하여 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(4-((1S,3R)-3-(4-((E)-1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)시클로헥실옥시)피페리딘-1-일)이소인돌린-1,3-디온(2.8 mg, 18% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다. LCMS: m/z 728.3 [M+H]+; 1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 1.73-2.08 (12H, m), 2.17-2.19 (1H, m), 2.51-2.53 (1H, m), 2.66-2.96 (7H, m), 3.17-3.23 (2H, m), 3.48-354 (1H, m), 3.61-3.73 (3H, m), 4.16-4.22 (1H, m), 4.84-4.89 (1H, m), 6.98 (1H, dd, J = 8.4, 2.0 Hz), 7.09 (1H, d, J = 8.0 Hz), 7.15 (1H, s), 7.21 (1H, d, J = 2.4 Hz), 7.45-7.51 (3H, m), 7.59 (2H, t, J = 8.8 Hz), 8.14 (1H, d, J = 12.8 Hz), 8.46 (1H, d, J = 4.8 Hz).
화합물 210은 화합물 209와 유사한 방식으로 제조될 수 있다.
화합물 211의 예시적인 합성: (E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(3-(1-(2-(4-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에틸)피페리딘-4-일)아제티딘-1-일)이소인돌린-1,3-디온
단계 A: 삼차-부틸 -3-(1-(2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에틸)피페리딘-4-일)아제티딘-1-카르복실레이트
EtOH/DCM(6 mL/6 mL 중 2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)아세트알데히드(0.34 g, 0.95 mmol) 용액에 삼차-부틸-3-(피페리딘-4-일)아제티딘-1-카르복실레이트(272 mg, 1.14 mmol) 및 촉매 AcOH를 첨가하였다. 　 pH가 5 내지 6 미만인 경우 AcOK를 첨가하였다. 이어서 NaBH(OAc)3(810 mg, 3.80 mmol)를 첨가하였다. 생성된 용액을 30oC에서 1시간 동안 교반하였다. 반응물을 수성 NaHCO3(20 mL)로 급냉시킨 후, 혼합물을 DCM(30 mL x 2)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 상에 적용하여 목적하는 생성물 삼차-부틸-3-(1-(2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에틸)피페리딘-4-일)아제티딘-1-카르복실레이트(270 mg)를 수득하였다. LCMS: (ES+): m/z 583.3 [M+H] +.
단계 B: 4-(1-(4-(2-(4-(아제티딘-3-일)피페리딘-1-일)에톡시)페닐)-4-브로모-1H-피라졸-3-일)피리딘
DCM(6 mL) 중 삼차-부틸 3-(1-(2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)-페녹시)에틸)피페리딘-4-일)아제티딘-1-카르복실레이트 (0.27 g, 0.46 mmol) 용액에 TFA(2 mL)를 첨가하였다. 생성된 혼합물을 30oC에서 1시간 동안 교반하였다. 용매를 진공 하에서 제거하고, 잔류물을 DCM과 함께 2회 공동 증발시켜 목적하는 생성물 4-(1-(4-(2-(4-(아제티딘-3-일)피페리딘-1-일)에톡시)페닐)-4-브로모-1H-피라졸-3-일)피리딘(224 mg 미정제, 계산치, 0.46 mmol)을 수득하였고, 이는 추가 정제 없이 다음 반응에서 사용되었다. LCMS: (ES+): m/z 482.0 [M+H] +.
단계 C: 5-(3-(1-(2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에틸)피페리딘-4-일)아제티딘-1-일)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)이소인돌린-1,3-디온
NMP(5 mL) 중 4-(1-(4-(2-(4-(아제티딘-3-일)피페리딘-1-일)에톡시)페닐)-4-브로모-1H-피라졸-3-일)피리딘(224 mg 미정제, 0.46 mmol) 용액에 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-플루오로이소인돌린-1,3-디온(254 mg, 0.92 mmol) 및 DIEA(0.6 g, 4.6 mmol)를 첨가하였다. 생성된 용액을 150oC에서 마이크로웨이브로 2시간 동안 조사하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 혼합물을 EA(50 mL)로 희석하였다. 혼합물을 염수로 세척하였다(10 mL x 3). 유기상을 Na2SO4 상에서 건조시키고, 여과하고, 감압 하에서 농축시켰다. 잔류물을 분취-TLC로 정제하여 5-(3-(1-(2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에틸)피페리딘-4-일)아제티딘-1-일)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)이소인돌린-1,3-디온(60 mg)을 수득하였다. LCMS: (ES+): m/z 739.3 [M+H] +.
단계 D: 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(3-(1-(2-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에틸)피페리딘-4-일)아제티딘-1-일)이소인돌린-1,3-디온
디옥산(15 mL)/ H2O (3 mL) 중 5-(3-(1-(2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에틸)피페리딘-4-일)아제티딘-1-일)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)이소인돌린-1,3-디온(60 mg, 0.081 mmol) 및 5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온(84 mg, 0.325 mmol) 용액에 CsF(49 mg, 0.325 mmol), Pd2(dba)3 (30 mg, 0.033 mmol), 트리-삼차-부틸포스핀 테트라플루오로보레이트(20 mg, 0.066 mmol) 및 2 방울의 Cy2NCH3 를 순차적으로 첨가하였다. 생성된 용액을 N2 하 100oC에서 16시간 동안 가열하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 반응물을 물(20 mL)로 급냉시키고 혼합물을 에틸 아세테이트(30 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 분취 TLC로 정제하여 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(3-(1-(2-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에틸)피페리딘-4-일)아제티딘-1-일)이소인돌린-1,3-디온(30 mg, 47% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다. LCMS: (ES+): m/z 790.3 [M+H]+.
단계 E: (E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(3-(1-(2-(4-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에틸)피페리딘-4-일)아제티딘-1-일)이소인돌린-1,3-디온
CH3CN / 피리딘(6 mL/3 mL) 중 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(3-(1-(2-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에틸)피페리딘-4-일)아제티딘-1-일)이소인돌린-1,3-디온 (30 mg, 0.038 mmol) 용액에 하이드록실아민 염화수소(26 mg, 0.38 mmol)를 첨가하였다. 혼합물을 50oC에서 1시간 동안 교반하였다. 용매를 진공 하에서 제거하고, 잔류물을 DCM/MeOH(15/1)의 분취 TLC로 정제하여 목적하는 생성물 (E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(3-(1-(2-(4-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에틸)피페리딘-4-일)아제티딘-1-일)이소인돌린-1,3-디온 (15 mg, 50% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): δ 11.07 (s, 1H), 10.91 (s, 1H), 8.75 (s, 1H), 8.57 (d, J = 5.6 Hz, 2H), 7.87 (d, J = 8.8 Hz, 2H), 7.65 (d, J = 4.8 Hz, 1H), 7.55 (d, J = 4.8 Hz, 1H), 7.49 (d, J = 5.6 Hz, 2H), 7.41 (s, 1H), 7.21 (d, J = 4.8 Hz, 1H), 7.12 (d, J = 9.2 Hz, 2H), 6.77 (s, 1H), 6.63 (d, J = 4.4 Hz, 1H), 5.00-5.10 (m, 1H), 4.05-4.20 (m, 4H), 3.70-3.80 (m, 2H), 2.70-3.10 (m, 7H), 2.55-2.65 (m, 4H), 1.70-2.05 (m, 10H); LCMS: (ES+): m/z 806.3 [M+H]+.
화합물 213의 예시적인 합성: (E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-(3-(2-(2-((4-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)메틸)페녹시)에톡시)프로폭시)이소인돌린-1,3-디온
단계 A: (2-(2-(3-((삼차-부틸디메틸실릴)옥시)프로폭시)에톡시)페닐)메탄올
DMF(10 mL) 중 2-(3-((삼차-부틸디메틸실릴)옥시)프로폭시)에틸 4-메틸벤젠설포네이트(1 g, 2.58 mmol) 용액에 2-(하이드록시메틸)페놀(0.38 g, 3.09 mol) 및 K2CO3 (1.07g, 2.74mmol)를 첨가하였다. 생성된 용액을 70oC에서 3시간 동안 교반하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 반응물을 NH4Cl 수용액으로 급냉시키고, 혼합물을 EtOAc로 추출하였다. 유기상을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 크로마토그래피 컬럼으로 정제하여 (2-(2-(3-((삼차-부틸디메틸실릴)옥시)-프로폭시)에톡시)페닐)메탄올(400 mg, 45.6% 수율)을 무색 오일로서 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 7.36-7.34 (d, J = 7.2 Hz, 1H), 7.18-7.14 (t, J = 7.2 Hz, 1H), 6.93-6.90 (m, 2H), 4.90-4.87 (t, J = 5.6 Hz, 1H), 4.49-4.47 (m, 2H), 4.07-4.05 (m, 2H), 3.68-3.61 (m, 4H), 3.52-2.90 (t, J = 6.4 Hz, 2H), 1.70-1.64 (m, 2H), 0.83 (s, 9H), 0.00 (s, 6H).
단계 B: 4-(4-브로모-1-(4-((2-(2-(3-((삼차-부틸디메틸실릴)옥시)프로폭시)에톡시)벤질)옥시)페닐)-1H-피라졸-3-일)피리딘
DCM(20 mL) 및 DIPEA(457 mg, 3.54 mmol) 중 (2-(2-(3-((삼차-부틸디메틸실릴)옥시)프로폭시)에톡시)페닐)-메탄올(400 mg, 1.18 mmol) 용액에 MsCl(268 mg, 2.36 mmol)을 0oC에서 첨가하였다. 생성된 용액을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 반응물을 DCM(100 mL)으로 희석하고, 물 및 염수로 세척하였다. 유기상을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켜 미정제의 목적하는 생성물(320 mg, 수율 100%)을 수득하였고, 이는 추가적인 정제 없이 다음 단계에서 직접 사용되었다. 건조 DMF(20 ml) 중 위의 목적하는 생성물(320 mg, 0.89 mmol) 용액에 K2CO3(368.5 mg, 2.67 mmol) 및 4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페놀(309.7 mg, 0.98 mmol)을 첨가하였다. 생성된 용액을 70℃에서 2시간 동안 교반하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 반응 혼합물을 EtOAc(100 mL)로 희석하고, 물 및 염수로 세척하였다. 유기상을 무수 황산나트륨 상에서 건조시켰다. 잔류물을 크로마토그래피 컬럼으로 정제하여 4-(4-브로모-1-(4-((2-(2-(3-((삼차-부틸디메틸실릴)옥시)프로폭시)에톡시)벤질)옥시)페닐)-1H-피라졸-3-일)피리딘(300 mg, 2 단계에서 40.1% 수율)을 적색 오일로서 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 8.73-8.67 (m, 2H), 8.00-7.90 (m, 3H), 7.63-7.59 (d, J = 9.2 Hz, 1H), 7.50-7.42 (m, 1H), 7.33-7.27 (m, 2H), 7.12-7.08 (m, 2H), 7.02-6.91 (m, 2H), 5.20 (s, 2H), 4.22-4.17 (t, J = 4.8 Hz, 2H), 3.84-3.76 (t, J = 5.2 Hz, 2H), 3.70-3.67 (t, J = 6.4 Hz, 2H), 3.62-3.59 (t, J = 6.4 Hz, 2H), 1.82-1.75 (m, 2H), 0.87 (s, 9H), 0.02 (s, 6H).
단계 C: 3-(2-(2-((4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)메틸)페녹시)에톡시)프로판-1-올
MeOH(10 mL) 중 4-(4-브로모-1-(4-((2-(2-(3-((삼차-부틸디메틸실릴)옥시)프로폭시)에톡시)벤질)옥시)페닐)-1H-피라졸-3-일)피리딘(300 mg, 0.47 mmol) 용액에 1,4-디옥산 중 HCl(1 mL, 6 M/L, 6 mmol)을 실온에서 첨가하였다. 생성된 용액을 실온에서 0.5시간 동안 교반하였다. 용액을 농축시키고 100 ml의 DCM으로 희석하고, NaHCO3(50 mL x 3)로 세척하였다. 유기상을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 분취 TLC로 정제하여 목적하는 생성물 3-(2-(2-((4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)메틸)페녹시)에톡시)프로판-1-올(160 mg, 65% 수율)을 백색 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 524.1 [M+H] +.
단계 D: 삼차-부틸 5-아미노-4-(4-(3-(2-(2-((4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)메틸)프로폭시)에톡시)프로폭시)-1,3-디옥소이소인돌린-2-일)-5-옥소펜타노에이트
건조 THF(10 mL) 중 3-(2-(2-((4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)메틸)페녹시)에톡시)프로판-1-올(160 mg, 0.31 mmol), PPh3 (244 mg, 0.93 mmol) 및 삼차-부틸 5-아미노-4-(4-하이드록시-1,3-디옥소이소인돌린-2-일)-5-옥소펜타노에이트(159.4 mg, 0.46 mmol) 용액에 DIAD(188 mg, 0.93 mmol)를 N2 하에서 첨가하였다. 생성된 용액을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 물로 급냉시킨 후, 혼합물을 DCM으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 물 및 염수로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 농축시켰다. 잔류물을 분취 TLC로 정제하여 목적하는 생성물 삼차-부틸 5-아미노-4-(4-(3-(2-(2-((4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)메틸)프로폭시)에톡시)프로폭시)-1,3-디옥소이소인돌린-2-일)-5-옥소펜타노에이트(110 mg, 42.2% 수율)을 백색 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 854.2 [M+H] +.
단계 D: 4-(3-(2-(2-((4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)메틸)페녹시)에톡시)프로폭시)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)이소인돌린-1,3-디온
아세토니트릴(15 mL) 중 삼차-부틸 5-아미노-4-(4-(3-(2-(2-((4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)메틸)프로폭시)에톡시)프로폭시)-1,3-디옥소이소인돌린-2-일)-5-옥소펜타노에이트(80 mg, 0.094 mmol) 용액에 4-메틸벤젠설폰산(32.3 mg, 0.28 mmol)을 첨가하였다. 생성된 용액을 60oC에서 48시간 동안 교반하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 반응물을 NaHCO3 수용액으로 급냉시키고(pH > 7 까지), 혼합물을 DCM(20 mL x 3)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 Na2SO4 상에서 건조시키고 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 분취-TLC로 정제하여 목적하는 생성물 4-(3-(2-(2-((4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)메틸)페녹시)에톡시)프로폭시)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)이소인돌린-1,3-디온(40 mg, 54.8% 수율)을 백색 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 781.1 [M+H] +.
단계 E: 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-(3-(2-(2-((4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)메틸)페녹시)에톡시)프로폭시)이소인돌린-1,3-디온
1,4-디옥산/ H2O (5 mL, v/v = 10/1) 중 4-(3-(2-(2-((4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)메틸)페녹시)에톡시)프로폭시)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)이소인돌린-1,3-디온(40 mg, 0.051 mmol) 용액에 5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온(19.87 mg, 0.077 mmol), Pd2 (dba)3 (4.67 mg, 0.0051 mmol), CsF(31.0 mg, 0.20 mmol) [(t-Bu)3PH]BF4 (0.59 mg, 0.0020 mmol), N,N-디시클로헥실메틸아민(0.50 mg, 0.0026 mmol)을 첨가하였다. 생성된 용액을 N2 하 100℃에서 2시간 동안 교반하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 반응물을 DCM(50 mL)으로 희석하고, 혼합물을 물 및 염수로 세척하였다. 유기상을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 분취-TLC로 정제하여 목적하는 생성물 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-(3-(2-(2-((4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)메틸)페녹시)에톡시)프로폭시)이소인돌린-1,3-디온(30 mg, 70.3% 수율)을 백색 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 832.3 [M+H] +.
단계 F: (E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-(3-(2-(2-((4-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)메틸)페녹시)에톡시)프로폭시)이소인돌린-1,3-디온
아세토니트릴/피리딘(3 mL, v/v = 2/1) 중 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-(3-(2-(2-((4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)메틸)페녹시)에톡시)-프로폭시)이소인돌린-1,3-디온(30 mg, 0.036 mmol) 용액에 하이드록실아민 염화수소(25.1 mg, 0.36 mmol)를 첨가하였다. 혼합물을 40oC에서 20분 동안 교반하고, DCM(20 mL)으로 희석하고, 염수(10 mL)로 세척하였다. 유기상을 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 분취-TLC로 정제하여 목적하는 생성물 (E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-(3-(2-(2-((4-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)메틸)페녹시)에톡시)프로폭시)이소인돌린-1,3-디온(6.2 mg, 20.3% 수율)을 백색 고체로서 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 8.57-8.56 (m, 2H), 8.32 (s, 1H), 7.93 (s, 1H), 7.69-7.63 (m, 3H), 7.57-7.51 (m, 3H), 7.43-7.41 (m, 1H),7.38-7.36 (d, J = 7.2Hz, 1H), 7.28 (s, 2H), 7.23 (s, 2H), 7.15-7.13 (d, J = 7.6Hz, 1H), 7.08-7.06 (m, 2H), 7.00-6.97 (m, 1H), 6.91-6.89 (d, J = 7.6Hz, 1H), 5.15 (s , 2H), 4.92-4.88 (m, 1H),4.26-4.23 (t, J = 6.4 Hz, 2H), 4.20-4.17 (t, J = 4.4Hz, 2H), 3.86-3.84 (t, J = 4.8Hz, 2H), 3.79-3.76 (t, J = 6.0Hz, 2H), 3.08-2.96 (m, 4H), 2.90-2.82 (m, 1H), 2.81-2.66 (m, 2H), 2.16-2.05 (m, 3H); LCMS (ES+): m/z 847.3 [M+H] +.
화합물 212는 화합물 213과 유사한 방식으로 제조될 수 있다.
화합물 215의 예시적인 합성: (E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-(3-(3-((4'-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)-[1,1'-비페닐]-4-일)옥시)프로폭시)프로폭시)이소인돌린-1,3-디온
단계 A: 4-브로모-4'-메톡시-1,1'-비페닐
톨루엔/MeOH(200 mL/100 mL) 중 (4-메톡시페닐)보론산(5 g, 32.9 mmol) 용액에 1,4-디브로모벤젠(11.6 g, 49.4 mmol), Pd(PPh3)4 (1.9 g, 1.65 mmol) 및 Cs2CO3 (21.4 g, 65.8 mmol)를 첨가하였다. 생성된 용액을 N2 분위기 하 100℃에서 16시간 동안 교반하였다. TLC가 반응이 완료되었음을 나타내었다. 실온으로 냉각시킨 후, 반응 혼합물을 50 mL의 EA로 희석하고, 물 및 염수로 세척하였다. 유기상을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 크로마토그래피 컬럼으로 정제하여 4-브로모-4'-메톡시-1,1'-비페닐(7.0 g, 80% 수율)을 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 263.1 [M+H]+.
단계 B: (4'-메톡시-[1,1'-비페닐]-4-일)보론산
건조 THF(30 mL) 중 4-브로모-4'-메톡시-1,1'-비페닐(2 g, 7.63 mmol) 용액에 n-BuLi(9.2 ml, 22.9 mmol, 헥산 중 2.5 M)를 N2 분위기 하 -78 oC에서 적가하였다. 1시간 후, (CH3O)3B(2.38 g, 22.9 mmol)를 -78oC에서 적가하였다. 생성된 용액을 -78oC에서 1시간, 5℃에서 밤새 교반하였다. 이를 포화 NH4Cl 용액으로 급냉시킨 후, 혼합물을 EA(30 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시켰다. 잔류물을 크로마토그래피 컬럼으로 정제하여 (4'-메톡시-[1,1'-비페닐]-4-일)보론산(1.0 g, 58% 수율)을 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): δ 8.06 (s, 2H), 7.84 (d, J = 7.6 Hz, 2H), 7.63 (d, J = 7.6 Hz, 2H), 7.58 (d, J = 7.6 Hz, 2H), 7.02 (d, J = 7.6 Hz, 2H), 3.80 (s, 3H).
단계 C: 4-(4-브로모-1-(4'-메톡시-[1,1'-비페닐]-4-일)-1H-피라졸-3-일)피리딘
DCM/피리딘(40 ml/4 ml) 중 (4'-메톡시-[1,1'-비페닐]-4-일)보론산(1 g, 4.39 mmol) 용액에 Cu(OAc)2 (0.8 g, 4.39 mmol) 및 4-(4-브로모-1H-피라졸-3-일)피리딘(1.5 g, 6.58 mmol)을 첨가하였다. 생성된 용액을 O2 분위기 하 5oC에서 16시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 암모니아(20 mL x 2)로 세척하였다. 유기상을 Na2SO4 상에서 건조시키고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 상에 적용하여 목적하는 생성물 4-(4-브로모-1-(4'-메톡시-[1,1'-비페닐]-4-일)-1H-피라졸-3-일)피리딘(1 g 미정제, 56% 수율)을 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 407.4 [M+H]+.
단계 D: 4-(1-(4'-(3-(3-(벤질옥시)프로폭시)프로폭시)-[1,1'-비페닐]-4-일)-4-브로모-1H-피라졸-3-일)피리딘
DCM(40 mL) 중 4-(4-브로모-1-(4'-메톡시-[1,1'-비페닐]-4-일)-1H-피라졸-3-일)피리딘(1 g, 2.46 mmol) 용액에 BBr3 (1.85 g, 7.38 mmol)을 적가하였다. 생성된 용액을 10oC에서 2시간 동안 교반하였다. MeOH로 급냉시키고 농축시킨 후, 미정제 생성물을 실리카 겔 컬럼 상에 적용하여 목적하는 생성물 4'-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)-[1,1'-비페닐]-4-올(0.6 g, 62% 수율)을 수득하였다. 건조 DMF(5 mL) 중 4'-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)-[1,1'-비페닐]-4-올(375 mg, 0.96 mmol)의 용액에 Cs2CO3(1.56 g, 4.80 mmol) 및 3-(3-(벤질옥시)프로폭시)프로필 메탄설포네이트(0.58 g, 1.92 mmol)를 첨가하였다. 생성된 용액을 75oC에서 2시간 동안 교반하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 반응 혼합물을 EA(50 mL)로 희석하고, 혼합물을 물 및 염수로 세척하였다. 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시켰다. 잔류물을 크로마토그래피 컬럼으로 정제하여 4-(1-(4'-(3-(3-(벤질옥시)프로폭시)프로폭시)-[1,1'-비페닐]-4-일)-4-브로모-1H-피라졸-3-일)피리딘(400 mg, 70% 수율)을 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): δ 9.02 (s, 1H), 8.73 (br, 2H), 8.00 (m, 2H), 7.80 (d, J = 8.0 Hz, 2H), 7.67 (d, J = 8.4 Hz, 2H), 7.30 (m, 5H), 7.03 (d, J = 8.4 Hz, 2H), 4.45 (m, 2H), 4.06 (t, J = 5.6 Hz, 2H), 3.53 (m, 7H), 1.97 (m, 2H), 1.77 (m, 2H).
단계 E: 5-(1-(4'-(3-(3-하이드록시프로폭시)프로폭시)-[1,1'-비페닐]-4-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-4-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온
1,4-디옥산(15 mL)/ H2O (1.5 mL) 중 4-(1-(4'-(3-(3-(벤질옥시)프로폭시)프로폭시)-[1,1'-비페닐]-4-일)-4-브로모-1H-피라졸-3-일)피리딘(0.4 g, 0.67 mmol), 5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥소보로란-2-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온(260 mg, 1.01 mmol) 용액에 CsF(328 mg, 2.16 mmol), Pd2 (dba)3 (196 mg, 0.216 mmol), 트리-삼차-부틸포스핀 테트라플루오로보레이트(124 mg, 0.43 mmol) 및 N-시클로헥실-N-메틸클로로헥산아민 2 방울을 순차적으로 첨가하였다. 반응물을 N2 분위기 하 100oC에서 2시간 동안 가열하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 반응물을 물(20 mL)로 급냉시키고 혼합물을 에틸 아세테이트(30 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 상에 적용하여 목적하는 생성물 5-(1-(4'-(3-(3-벤질옥시)프로폭시)프로폭시)-[1,1'-비페닐]-4-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-4-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온(0.4 g, 92% 수율)을 갈색 오일로서 수득하였다. 2 방울의 농축 HCl을 함유하는 THF/MeOH(10 mL/1 mL) 중 5-(1-(4'-(3-(3-(벤질옥시)프로폭시)프로폭시)-[1,1'-비페닐]-4-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-4-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온(400 mg, 0.16 mmol) 용액에 탄소 상 Pd(OH)2(200 mg)를 첨가하였다. 혼합물을 H2 1 기압 하 5 oC에서 1시간 동안 교반하였다. 혼합물을 여과하고 고체를 THF로 세척하였다. 유기층을 농축시키고 컬럼으로 정제하여 5-(1-(4'-(3-(3-하이드록시프로폭시)프로폭시)-[1,1'-비페닐]-4-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-4-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온(250 mg, 72% 수율)을 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 8.73 (d, J = 5.6 Hz, 2H), 8.64 (s, 3H), 8.10 (m, 2H), 7.85 (m, 3H), 7.68 (d, J = 6.0 Hz, 2H), 7.55 (m, 4H), 7.28-7.50 (m, 6H), 7.00 (d, J = 8.4 Hz, 2H), 5.68 (m, 1H), 4.49 (s, 2H), 4.15 (m, 3H), 3.45-3.70 (m, 6H), 3.18 (m, 2H), 2.78 (m, 2H)
단계 F: 삼차 부틸 5-아미노-4-(1,3-디옥소-4-(3-(3-((4'-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)-[1,1'-비페닐]-4-일)옥시)프로폭시)프로폭시)이소인돌린-2-일)-5-옥소펜타노에이트
건조 THF(20 mL) 중 5-(1-(4'-(3-(3-하이드록시프로폭시)프로폭시)-[1,1'-비페닐]-4-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-4-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온(250 mg, 0.45 mmol), Ph3P (351 mg, 1.35 mmol) 및 삼차-부틸 5-아미노-4-(4-하이드록시-1,3-디옥소이소인돌린-2-일)-5-옥소펜타노에이트(233 mg, 0.67 mmol) 용액에 THF(3 mL) 중 DIAD(266 mg, 1.35 mmol)를 0 oC에서 적가하였다. 생성된 용액을 0 내지 10℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응물을 EA(50 mL)로 희석하고, 물 및 염수로 세척하였다. 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 농축시키고 실리카 겔 컬럼에 적용하여 삼차 부틸 5-아미노-4-(1,3-디옥소-4-(3-(3-((4'-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)-[1,1'-비페닐]-4-일)옥시)프로폭시)프로폭시)이소인돌린-2-일)-5-옥소펜타노에이트(150 mg, 38% 수율)를 오일로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 890.4 [M+H]+.
단계 G: 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-(3-(3-((4'-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)-[1,1'-비페닐]-4-일)옥시)프로폭시)프로폭시)이소인돌린-1,3-디온
CH3CN (5 mL) 중 삼차-부틸 5-아미노-4-(1,3-디옥소-4-(3-(3-((4'-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)-[1,1'-비페닐]-4-일)옥시)프로폭시)프로폭시)이소인돌린-2-일)-5-옥소펜타노에이트(150 mg, 0.168 mmol) 용액에 TsOH(289 mg, 1.68 mmol)을 첨가하였다. 생성된 용액을 80℃에서 3시간 동안 교반하였다. 반응물을 포화 NaHCO3로 급냉시키고 EA로 추출하였다. 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 농축시키고, 분취 TLC로 정제하여 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-(3-(3-((4'-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)-[1,1'-비페닐]-4-일)옥시)프로폭시)프로폭시)이소인돌린-1,3-디온(100 mg, 73% 수율)을 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 816.3 [M+H]+.
단계 H: (E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-(3-(3-((4'-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)-[1,1'-비페닐]-4-일)옥시)프로폭시)프로폭시)이소인돌린-1,3-디온
MeOH/ DCM(4 mL/1 mL) 중 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-(3-(3-((4'-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)-[1,1'-비페닐]-4-일)옥시)프로폭시)프로폭시)이소인돌린-1,3-디온(100 mg, 0.123 mmol) 및 하이드록시아민 염화수소(256 mg, 3.681 mmol) 용액에 NaHCO3 (464 mg, 5.521 mmol)을 50 oC에서 첨가하였다. 혼합물을 50oC에서 1시간 동안 교반하였다. 잔류물을 DCM/MeOH(20:1)의 분취 TLC로 정제하여 목적하는 생성물 (E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-4-(3-(3-((4'-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)-[1,1'-비페닐]-4-일)옥시)프로폭시)프로폭시)이소인돌린-1,3-디온(24 mg, 24% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): δ 11.09 (s, 1H), 10.90 (s, 1H), 8.90 (s, 1H), 8.59 (d, J = 5.6 Hz, 2H), 8.02 (d, J = 8.4 Hz, 2H), 7.79 (m, 3H), 7.38 - 7.70 (m, 8H), 7.25 (d, J = 6.0 Hz, 1H), 6.98 (d, J = 8.8 Hz, 2H), 5.09 (m, 1H), 4.26 (m, 2H), 4.05 (m, 2H), 3.60 (m, 4H), 3.05 (m, 2H), 2.86 (m, 3H), 2.50 (m, 3H), 2.03 (m, 5H); LCMS (ES+): m/z 831.3 [M+H]+.
화합물 214는 화합물 215와 유사한 방식으로 제조될 수 있다.
화합물 100의 예시적인 합성: (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(3-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-((R)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)프로폭시)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드
단계 A: 삼차-부틸 2-(3-클로로프로폭시)아세테이트
건조 DMF(15 mL) 중 삼차-부틸 2-브로모아세테이트(5.0 g, 26 mmol) 및 3-클로로프로판-1-올(2.9 g, 31 mmol) 용액에 NaOH(1.2 g, 31 mmol)를 0 oC에서 첨가하였다. 0oC에서 2시간 동안 교반한 후, 이를 밤새 실온으로 가온하였다. H2O(20 mL)로 반응 혼합물을 0oC로 급냉시키고, 혼합물을 PE(20 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 물 및 염수로 세척하였다. 유기상을 진공 중에서 농축시켜 목적하는 생성물 삼차-부틸 2-(3-클로로프로폭시)-아세테이트(2.8 g, 52% 수율)를 오일로서 수득하였고, 이는 다음 단계에서 직접 사용되었다. 1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 3.97 (s, 2H), 3.65-3.70 (m, 4H), 2.05-2.08 (m, 2H), 1.49 (s, 9H).
단계 B: 삼차-부틸 2-(3-(4-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)피페라진-1-일)프로폭시)아세테이트
건조 DMF(5 mL) 중 1-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)피페라진 2,2,2-트리플루오로아세테이트(530 mg, 1.32 mmol) 용액에 K2CO3 (911 mg, 6.60 mmol), KI(438 mg, 2.64 mmol) 및 삼차-부틸 2-(3-클로로프로폭시)아세테이트(550 mg, 2.64 mmol)를 순차적으로 첨가하였다. 생성된 용액을 90oC에서 3시간 동안 교반하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 혼합물을 EA(50 mL)로 희석하고, 혼합물을 물 및 염수로 세척하였다. 유기상을 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 분취-TLC로 정제하여 목적하는 삼차-부틸 2-(3-(4-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐) 피페라진-1-일)프로폭시)아세테이트(300 mg, 미정제)를 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 7.70 (d, J = 8.0 Hz, 2H), 6.89 (d, J = 8.0 Hz, 2H), 3.96 (br, 2H), 3.27 (br, 4H), 3.21(br, 2H), 2.60 (br, 4H), 2.51-2.53(m, 2H), 1.82-1.85 (m, 2H), 1.42 (s, 9H), 1.24 (s, 12H).
단계 C: (R)-삼차-부틸 2-(3-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)프로폭시)아세테이트
디옥산/ H2O (10 ml/1 mL) 중 (R)-N-(3-(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드(100 mg, 0.20 mmol) 용액에 삼차-부틸 2-(3-(4-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)피페라진-1-일)프로폭시)아세테이트(200 mg, 0.43 mmol), Pd(aMphos)Cl2 (15 mg, 0.02 mmol) 및 CsF(121 mg, 0.80 mmol)를 첨가하였다. 생성된 용액을 N2 분위기 하 95℃에서 16시간 동안 교반하였다. TLC가 반응이 완료되었음을 나타내었다. 실온으로 냉각시킨 후, 반응 혼합물을 50 mL의 EA로 희석하고, 물 및 염수로 세척하였다. 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시켰다. 잔류물을 분취-TLC로 정제하여 목적하는 생성물 (R)-삼차-부틸 2-(3-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)프로폭시)아세테이트(80 mg, 53% 수율)를 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 12.00 (br, 1H), 8.87 (s, 1H), 8.60 (s, 1H), 7.75 (s, 2H), 7.54 (d, J = 8.0 Hz, 2H), 6.98-7.05 (m, 3H), 5.15 - 5.30 (m, 1H), 3.97 (s, 2H), 3.71-3.75 (m, 2H), 3.49-3.65 (m, 6H), 3.28 (s, 4H), 2.58-2.67 (m, 6H), 1.80-2.30 (m, 3H), 1.49 (s, 9H).
단계 D: (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(3-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-((R)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)프로폭시)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드
디옥산(2 mL) 중 (R)-삼차-부틸 2-(3-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)프로폭시)아세테이트(80 mg, 0.13 mmol) 용액에 디옥산 중 HCl(2 mL, 8 M)을 첨가하였다. 생성된 용액을 50℃에서 5시간 동안 교반하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 용매를 진공 중에서 제거하여 (R)-2-(3-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)프로폭시)아세트산(74 mg, 100% 수율, 계산치)을 수득하였다. 건조 NMP(5.0 mL) 중 (R)-2-(3-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)프로폭시)아세트산(74 mg, 0.11 mmol), (2S,4R)-1-((S)-2-아미노-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드 염화수소(91 mg, 0.19 mmol) 및 DIEA(142 mg, 1.10 mmol) 용액에 PyBOP(172 mg, 0.33 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 10oC에서 1시간 동안 교반한 후, 반응물을 염수(20 mL)로 급냉시키고, 혼합물을 EA로 취하였다. 유기상을 진공 중에서 농축시키고, 잔류물을 분취-TLC 및 분취-HPLC로 정제하여 목적하는 생성물 (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(3-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-((R)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)프로폭시)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드(20 mg, 2 단계에서 17%)를 백색 고체로서 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, CD3OD): δ 8.82 (s, 1H), 8.65 (s, 1H), 8.59 (s, 1H), 7.89 (s, 1H), 7.74 (m, 1H), 7.59 (d, J = 8.8 Hz, 2H), 7.30-7.50 (m, 4H), 7.07-7.20 (m, 3H), 5.15 - 5.30 (m, 1H), 4.62 (s, 1H), 4.50 - 4.60 (m, 3H), 4.30 (d, J = 7.8 Hz, 1H), 4.12 (m, 2H), 3.78-3.95 (m, 2H), 3.40-3.80 (m, 14H), 3.10 (m, 5H), 2.42 (s, 3H), 1.98-2.30 (m, 8H), 1.03 (s, 9H); LCMS (ES+): m/z 1113.3 [M+H]+.
화합물 152의 예시적인 합성: (E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(4-(2-(4-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에틸)피페라진-1-일)이소인돌린-1,3-디온
단계 A: 2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)아세트알데히드
CH3CN (10 mL) 중 4-(4-브로모-1-(4-(2,2-디에톡시에톡시)페닐)-1H-피라졸-3-일)피리딘(1 g, 2.32 mmol) 용액에 농축 HCl(2 mL, 6 mL H2O 내 희석됨)을 첨가하였다. 생성된 용액을 55oC에서 1시간 동안 교반하였다. 0oC로 냉각시킨 후, 포화 NaHCO3 수용액을 조금씩 첨가하여 pH를 약 9로 조정하였다. 고체를 여과하고 CH3CN와 함께 증발시켜 2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)아세트알데히드(0.3 g, 66,9% 수율)를 백색 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 358.0, 376.0/378.0 [M+H]+, [M+18]+.
단계 B: 5-(4-(2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에틸)피페라진-1-일)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)이소인돌린-1,3-디온
MeOH(10 mL) 중 2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)아세트알데히드 (0.1 g, 0.28 mmol) 용액에 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(피페라진-1-일)이소인돌린-1,3-디온 염화수소(127 mg, 0.34 mmol) 및 촉매 HOAc를 첨가하였다. 　 pH가 5 내지 6 미만인 경우 AcOK를 첨가하였다. 이어서 NaBH3CN(87 mg, 1.40 mmol)을 첨가하였다. 생성된 용액을 20oC에서 1시간 동안 교반하였다. 포화 NH4Cl(20 mL)로 급냉시킨 후, 혼합물을 DCM(30 mL x 2)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 분취-TLC로 정제하여 목적하는 생성물 5-(4-(2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에틸)피페라진-1-일)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)이소인돌린-1,3-디온(90 mg, 35% 수율)을 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 684.1/686.1 [M+H]+.
단계 C: 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(4-(2-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에틸)피페라진-1-일)이소인돌린-1,3-디온
디옥산/ H2O(10 mL / 1 mL) 중 5-(4-(2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에틸)피페라진-1-일)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)이소인돌린-1,3-디온 (90 mg, 0.13 mmol) 및 5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥소보로란-2-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온(37 mg, 0.15 mmol) 용액에 t-Bu3PHBF4 (31 mg, 0.11 mmol), CsF (80 mg, 0.53 mmol), Cy2NMe (5 방울) 및 Pd2(dba)3 (48 mg, 0.05 mmol)를 순차적으로 첨가하였다. 생성된 혼합물을 N2 분위기 하 90oC에서 2시간 동안 교반하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 용매를 감압 하에서 제거하였다. 잔류물을 EA(30 mL)로 희석하고 나서, 혼합물을 염수로 세척하였다. 유기상을 진공 하에서 증발시켰다. 잔류물을 분취 TLC 및 분취 HPLC로 정제하여 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(4-(2-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에틸)피페라진-1-일)이소인돌린-1,3-디온(60 mg, 69% 수율)을 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 736.3 [M+H]+.
단계 D: (E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(4-(2-(4-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에틸)피페라진-1-일)이소인돌린-1,3-디온
CH3CN /피리딘(6 mL/3 mL) 중 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(4-(2-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에틸)피페라진-1-일)이소인돌린-1,3-디온(60 mg, 0.08 mmol) 용액에 NH2OH·HCl (57 mg, 0.82 mmol)을 첨가하였다. 혼합물을 45oC에서 0.5시간 동안 교반하였다. 혼합물을 DCM(30 mL)로 희석하고, 염수로 세척하였다. 유기상을 감압 하에서 농축시켰다. 잔류물을 분취 TLC(DCM/MeOH 15/1)로 정제하여 목적하는 생성물 (E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(4-(2-(4-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에틸)피페라진-1-일)이소인돌린-1,3-디온(45 mg, 73% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): δ 11.07 (s, 1H), 10.89 (s, 1H), 8.75 (s, 1H), 8.58 (d, J = 5.6 Hz, 2H), 7.87 (d, J = 8.8 Hz, 2H), 7.68 (d, J = 8.4 Hz, 1H), 7.55 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 7.48 (d, J = 4.4 Hz, 2H), 7.20-7.41 (m, 4H), 7.14 (d, J = 9.2 Hz, 2H), 5.08 (m, 1H), 4.21 (t, J = 5.6 Hz, 2H), 3.47 (m, 4H), 2.99-3.02(m, 2H), 2.67-2.89 (m, 10H), 2.05 (m, 1H); LCMS (ES+): m/z 751.3 [M+H]+.
화합물 216의 예시적인 합성:(2S,4R)-1-((S)-2-(3-(2-(3-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)에톡시)프로판아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드.
DMF(2 ml) 중 3-[2-[3-[3-[2,6-디플루오로-3-(프로필설포닐-아미노)-벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]에톡시]-프로판산(22.8 mg, 0.04 mmol) 및 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸- 부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드; 염화수소(19.93 mg, 0.043 mmol) 용액에 TEA(0.1 ml, 0.72 mmol) 및 PyBOP(22.21 mg, 0.043 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 동일한 온도에서 12시간 동안(밤새) 교반하였다. TLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)는 출발 물질이 없음을 나타낸다. DMF를 고진공 중에서 제거하였다. 용리액으로 DCM:MeOH(9:1)를 사용하는 실리카-카보네이트 카트리지 상에서 미정제 생성물을 여과하였다. 여과물을 진공 하에서 증발시키고 미정제 생성물을 PTLC(MeOH:DCM, 1:9, 2회)로 정제하여 20 mg의 생성물을 수득하였다(52% 수율). 1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ 13.00 (bs, 1H), 9.78 (bs, 1H), 8.96 (s, 1H), 8.71 (s, 1H), 8.62 (s, 1H), 8.55 (t, J = 5.5 Hz, 1H), 8.23 (s, 1H), 7.96 (d, J = 9.2 Hz, 1H), 7.59 (q, J = 8.3 Hz, 1H), 7.52 - 7.18 (m, 8H), 6.99 (d, J = 8.2 Hz, 1H), 5.13 (d, J = 3.8 Hz, 1H), 4.57 (d, J = 9.4 Hz, 1H), 4.48 - 4.32 (m, 3H), 4.23 (d, J = 5.5 Hz, 1H), 4.19 (t, J = 5.1 Hz, 2H), 3.86 - 3.57 (m, 6H), 3.19 - 3.06 (m, 2H), 2.61 (m, 1H), 2.43 (s, 3H), 2.43 - 2.37 (m, 1H), 2.08 - 2.00 (m, 1H), 1.95 - 1.87 (m, 1H), 1.80 - 1.69 (m, 2H), 0.94 (s, 9H), 0.95 (t, 3H). 13C NMR (151 MHz, dmso) δ 180.64, 171.95, 169.97, 169.57, 159.10, 156.03 (dd, J = 246.6, 6.9 Hz), 152.34 (dd, J = 249.6, 8.4 Hz), 151.42, 148.97, 147.72, 144.17, 139.67, 139.50, 138.81, 131.46, 131.17, 130.28, 129.64, 128.94 - 128.71 (m), 128.64, 127.42, 127.17, 121.98 (dd, J = 13.6, 3.4 Hz), 119.57, 118.54 - 117.84 (m), 117.47, 115.72, 113.74, 113.11, 112.53 - 112.23 (m), 68.91, 68.69, 67.21, 67.13, 58.74, 56.37, 53.46, 41.68, 37.97, 35.70, 35.37, 26.36, 16.86, 15.95, 12.63.　LC-MS (ESI); m/z [M+H]+: Calcd. for C50H56F2N7O9S2, 1000.3548. Found 1000.3536.
화합물 217의 예시적인 합성: N1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)-N5-((S)-1-((2S,4R)-4-하이드록시-2-((4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)카바모일)피롤리딘-1-일)-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일)글루타르아미드.
DMF(1 ml) 중 5-((4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)-벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)아미노)-5-옥소펜탄산(9.7 mg, 0.02 mmol) 및 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸- 부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드; 염화수소(8.52 mg, 0.02 mmol) 용액에 TEA (0.1 ml, 0.72 mmol) 및 PyBOP(9.5 mg, 0.02 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 동일한 온도에서 4시간 동안 교반하였다. TLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)는 출발 물질이 없음을 나타낸다. 반응 혼합물을 EtOAc(10 mL)로 희석하고 염수(5 mL, 4회)로 세척하고, 유기상을 건조시키고(Na2SO4), 진공 하에서 증발시켰다. 미정제 생성물을 PTLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1, 2회)로 정제하여 4.8 mg(29% 수율)의 생성물을 수득하였다. 1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ 10.02 (s, 1H), 8.97 (s, 1H), 8.68 (d, 1H), 8.64 - 8.52 (m, 2H), 8.21 (s, 1H), 7.95 (d, J = 9.2 Hz, 1H), 7.72 (dd, J = 36.7, 8.5 Hz, 4H), 7.62 - 7.54 (m, 1H), 7.40 (dd, 4H), 7.28 (t, J = 8.7 Hz, 1H), 5.16 (d, 2H), 4.56 (d, J = 9.3 Hz, 1H), 4.50 - 4.40 (m, 2H), 4.40 - 4.33 (m, 1H), 4.22 (dd, J = 15.8, 5.3 Hz, 1H), 3.76 - 3.62 (m, 2H), 3.16 - 3.05 (m, 2H), 2.44 (s, 3H), 2.41 - 2.17 (m, 4H), 2.09 - 2.01 (m, 1H), 1.98 - 1.80 (m, 3H), 1.74 (dq, J = 14.9, 7.4 Hz, 2H), 0.96 (s, 9H), 0.95 (t, 3H).　13C NMR (151 MHz, dmso) δ 181.06, 172.39, 172.17, 171.46, 170.15, 156.37 (dd, J = 246.6, 6.3 Hz), 152.73 (dd, J = 249.4, 8.1 Hz), 151.86, 149.05, 148.13, 144.19, 139.91, 139.37, 139.13, 132.97, 131.64, 131.59, 130.05, 129.22 (d, J = 14.7 Hz), 129.06, 127.84, 127.74, 126.89, 122.47 (d, J = 14.1 Hz), 120.07, 119.02 - 118.20 (m), 117.95, 116.06, 112.75 (dd, J = 23.4, 2.8 Hz), 69.34, 59.15, 56.90, 56.81, 53.87, 42.08, 38.38, 36.36, 35.63, 34.63, 26.85, 21.91, 17.27, 16.37, 13.04. LC-MS (ESI); m/z [M+H]+: Calcd. for C50H55F2N8O8S2, 997.3552. Found 997.3524.
화합물 218의 예시적인 합성: (2S,4R)-1-((S)-2-(5-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)피페라진-1-일)-5-옥소펜탄아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드.
DMF(1 ml) 중 5-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)-벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)피페라진-1-일)-5-옥소펜탄산(9.3 mg, 0.02 mmol) 및 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸- 부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드; 염화수소(8.27 mg, 0.018 mmol) 용액에 TEA (0.1 ml, 0.72 mmol) 및 PyBOP(9.22 mg, 0.018 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 동일한 온도에서 4시간 동안 교반하였다. TLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)는 출발 물질이 없음을 나타낸다. 반응 혼합물을 EtOAc(10 mL)로 희석하고 염수(5 mL, 4회)로 세척하고, 유기상을 건조시키고(Na2SO4), 진공 중에서 증발시켰다. TLC는 미정제 혼합물 중 생성물을 나타내지 않았고, 단지 일부 출발 물질(생성물은 수용성임)을 나타내었다. 물 추출물을 밤새 동결건조시키고, 고체 잔류물을 DCM:MeOH:NH4OH(90:9:1, 30 mL)를 사용하여 여과하였다. 여과물을 건조될 때까지 증발시키고 미정제 생성물을 PTLC (DCM:MEOH:NH4OH, 90:9:1, 2x)로 정제하여 13 mg의 생성물을 수득하였다(81% 수율). 1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ 12.64 (bs, 1H), 9.74 (bs, 1H), 8.97 (s, 1H), 8.62 - 8.52 (m, 3H), 8.28 (d, J = 2.0 Hz, 1H), 8.00 (s, 1H), 7.95 (bs, 1H), 7.90 (d, J = 9.2 Hz, 1H), 7.59 - 7.49 (m, 1H), 7.47 - 7.27 (m, 4H), 7.20 (t, J = 8.7 Hz, 1H), 5.13 (bs, 1H), 4.56 (d, J = 9.3 Hz, 1H), 4.48 - 4.32 (m, 3H), 4.22 (dd, J = 15.8, 5.3 Hz, 1H), 3.75 - 3.57 (m, 5H), 3.23 - 3.02 (m, 7H), 2.44 (s, 3H), 2.41 - 2.17 (m, 4H), 2.07 - 2.01 (m, 1H), 1.96 - 1.87 (m, 1H), 1.81 - 1.66 (m, 4H), 0.95 (s, 9H), 0.94 (t, 3H).　13C NMR (151 MHz, dmso) δ 180.70, 171.99, 171.92, 170.44, 169.75, 155.24 (dd, J = 248.1, 5.5 Hz), 152.12 (dd, J = 248.8, 8.5 Hz), 151.47, 147.73, 144.63, 144.31, 139.52, 138.02, 137.75, 131.19, 129.65, 128.65, 127.98 - 127.64 (m), 127.44, 123.91 - 123.09 (m), 118.86 - 117.72 (m), 117.60, 115.50, 115.23, 112.02 (dd, J = 22.6, 3.2 Hz), 68.92, 58.74, 56.47, 56.43, 53.44, 50.31, 50.18, 48.63, 44.86, 41.68, 41.00, 37.99, 34.28, 31.80, 26.43, 21.36, 16.99, 15.97, 12.72. LC-MS (ESI); m/z [M+H]+: Calcd. for C48H58F2N9O8S2, 990.3817. Found 990.3889.
화합물 219의 예시적인 합성: (2S,4R)-1-((S)-2-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)피페라진-1-일)-4-옥소부탄아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드.
DMF(1 ml) 중 4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)-벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)피페라진-1-일)-4-옥소부탄산(9 mg, 0.016 mmol) 및 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸- 부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드; 염화수소(8.2 mg, 0.018 mmol) 용액에 TEA(0.1 ml, 0.72 mmol) 및 PyBOP(9.14 mg, 0.018 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 동일한 온도에서 12시간 동안(밤새) 교반하였다. TLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)는 출발 물질이 없음을 나타낸다. 반응 혼합물을 건조될 때까지 증발시켰다. 용리액으로 DCM:MeOH(9:1)를 사용하는 실리카-카보네이트 카트리지(100 mg) 상에서 미정제 생성물을 여과하였다. 여과물을 진공 중에서 증발시키고 미정제 생성물을 PTLC(DCM:MEOH:NH4OH, 90:9:1, 2x)로 정제하여 11 mg의 생성물을 수득하였다(75% 수율).1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ 12.66 (bs, 1H), 9.45 (bs, 1H), 8.98 (s, 1H), 8.60 (bs, 1H), 8.29 (s, 1H), 8.04 (s, 1H), 8.01 - 7.88 (m, 2H), 7.62 - 7.49 (m, 1H), 7.40 (q, J = 8.0 Hz, 4H), 7.26 (t, J = 8.8 Hz, 1H), 5.15 (d, J = 3.5 Hz, 1H), 4.54 (d, J = 9.3 Hz, 1H), 4.49 - 4.31 (m, 3H), 4.22 (dd, J = 16.1, 5.6 Hz, 1H), 3.81 - 3.53 (m, 6H), 3.26 - 3.03 (m, 6H), 2.73 - 2.52 (m, 3H), 2.44 (s, 3H), 2.42 - 2.33 (m, 1H), 2.09 - 1.98 (m, 1H), 1.95 - 1.84 (m, 1H), 1.74 (q, J = 7.5 Hz, 2H), 0.96 (t, 3H), 0.94 (s, 9H). 13C NMR (126 MHz, dmso) δ 180.45, 172.02, 171.35, 170.07, 169.64, 156.00 (dd, J = 245.9, 6.5 Hz), 152.34 (dd, J = 249.7, 8.3 Hz), 151.52, 147.75, 144.70, 144.30, 139.55, 138.08, 137.91, 131.22, 129.66, 128.69, 128.53 (d, J = 2.4 Hz), 127.46, 121.96 (d, J = 14.1 Hz), 118.61 - 117.82 (m), 117.60, 115.44, 115.20, 112.32 (dd, J = 23.0, 3.3 Hz), 68.95, 58.78, 56.50, 56.39, 53.46, 50.25, 50.13, 44.76, 41.69, 41.17, 37.99, 35.43, 30.18, 28.05, 26.44, 16.89, 16.00, 12.67.　LC-MS (ESI); m/z [M+H]+: Calcd. for C47H56F2N9O8S2, 976.3661. Found 976.3712.
화합물 220의 예시적인 합성:N1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)-N4-((S)-1-((2S,4R)-4-하이드록시-2-((4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)카바모일)피롤리딘-1-일)-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일)석신아미드. DMF(1 ml) 중 4-((4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)-벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)아미노-4-옥소부탄산(15 mg, 0.03 mmol) 및 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸- 부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드; 염화수소(13.51 mg, 0.03 mmol) 용액에 TEA(0.1 ml, 0.72 mmol) 및 PyBOP(15.05 mg, 0.03 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 동일한 온도에서 4시간 동안 교반하였다. TLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)는 출발 물질이 없음을 나타낸다. 반응 혼합물을 고진공 하에서 건조될 때까지 증발시켰다. 용리액으로 DCM:MeOH(9:1)를 사용하는 실리카-카보네이트 카트리지(100 mg) 상에서 미정제 생성물을 여과하였다. 여과물을 진공 중에서 증발시키고 미정제 생성물을 PTLC(DCM:MEOH:NH4OH, 90:9:1, 2회)로 정제하여 12 mg의 생성물을 수득하였다(약 85% 순도). 이 생성물을 PTLC(DCM:MeOH, 9:1)로 다시 정제하여 8 mg의 생성물(31% 수율)을 수득하였다. 1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ 12.97 (bs, 1H), 10.11 (s, 1H), 9.79 (bs, 1H), 8.98 (d, J = 2.3 Hz, 0H), 8.69 (s, 1H), 8.66 - 8.49 (m, 2H), 8.23 (s, 1H), 8.02 (d, J = 9.0 Hz, 1H), 7.84 - 7.64 (m, 4H), 7.63 - 7.53 (m, 1H), 7.51 - 7.33 (m, 4H), 7.29 (t, J = 8.4 Hz, 1H), 5.17 (s, 1H), 4.56 (d, J = 7.8 Hz, 1H), 4.50 - 4.39 (m, 2H), 4.40 - 4.31 (m, 1H), 4.26 - 4.16 (m, 1H), 3.66 (q, J = 10.1 Hz, 2H), 3.19 - 3.06 (m, 2H), 2.72 - 2.52 (m, 4H), 2.44 (s, 3H), 2.12 - 1.97 (m, 1H), 1.96 - 1.84 (m, 1H), 1.74 (dq, J = 13.2, 8.3, 7.3 Hz, 2H), 0.96 (t, 3H), 0.95 (s, 9H). 13C NMR (126 MHz, dmso) δ 180.66, 172.02, 171.24, 170.67, 169.64, 156.05 (dd, J = 246.9, 7.0 Hz), 152.37 (dd, J = 249.3, 8.1 Hz), 151.49, 148.66, 147.75, 143.82, 139.53, 139.00, 138.70, 132.54, 131.27, 131.22, 129.68, 129.22 - 128.38 (m), 128.69, 127.47, 127.39, 126.53, 121.99 (dd, J = 12.9, 4.5 Hz), 119.59, 118.72 - 117.87 (m), 117.57, 115.68, 112.90 - 112.05 (m), 68.95, 58.79, 56.56, 56.41, 53.51, 41.71, 37.98, 35.45, 31.98, 30.14, 26.43, 16.88, 15.99, 12.65. LC-MS (ESI); m/z [M+H]+: Calcd. for C49H53F2N8O8S2, 983.3395. Found 983.3569.
화합물 221의 예시적인 합성:N1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)-N3-((S)-1-((2S,4R)-4-하이드록시-2-((4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)카바모일)피롤리딘-1-일)-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일)마론아미드. DMF(1 ml) 중 3-((4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)-벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)아미노-3-옥소프로판산(16.8 mg, 0.03 mmol) 및 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸- 부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드; 염화수소(15.5 mg, 0.033 mmol) 용액에 TEA(0.1 ml, 0.72 mmol) 및 PyBOP(17.28 mg, 0.033 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 동일한 온도에서 12시간 동안(밤새) 교반하였다. TLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)는 출발 물질이 없음을 나타낸다. 반응 혼합물을 고진공 하에서 건조될 때까지 증발시켰다. 용리액으로 DCM:MeOH(9:1)를 사용하는 실리카-카보네이트 카트리지(100 mg) 상에서 미정제 생성물을 여과하였다. 여과물을 진공 중에서 증발시키고 미정제 생성물을 PTLC(DCM:MEOH:NH4OH, 90:9:1, 2x)로 정제하고, PTLC(DCM:MeOH, 9:1)로 다시 정제하여 19.5 mg의 생성물(67% 수율)을 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 12.96 (bs, 1H), 10.23 (s, 1H), 9.75 (bs, 1H), 8.97 (s, 1H), 8.69 (s, 1H), 8.66 - 8.51 (m, 2H), 8.26 (d, J = 9.1 Hz, 1H), 8.22 (s, 1H), 7.73 (dd, J = 8.5 Hz, 4H), 7.59 (q, J = 8.6 Hz, 1H), 7.41 (dd, J = 8.0 Hz, 4H), 7.28 (t, J = 8.7 Hz, 1H), 5.16 (d, 1H), 4.59 (d, J = 9.2 Hz, 1H), 4.52 - 4.33 (m, 3H), 4.24 (dd, J = 15.7, 5.0 Hz, 1H), 3.68 (q, J = 10.6 Hz, 2H), 3.44 (q, 2H), 3.20 - 3.05 (m, 2H), 2.45 (s, 3H), 2.10 - 2.01 (m, 1H), 1.96 - 1.89 (m, 1H), 1.74 (dq, J = 14.8, 7.3 Hz, 2H), 0.98 (s, 9H), 0.97 (t, J = 8.3 Hz, 3H).　13C　　NMR (101 MHz, dmso) δ 180.62, 171.91, 169.34, 166.16, 166.03, 156.02 (dd, J = 246.8, 7.1 Hz), 152.34 (dd, J = 249.4, 8.1 Hz), 151.43, 148.69, 147.73, 143.79, 139.50, 138.69, 138.54, 132.98, 131.17, 131.13, 129.68, 129.11 - 128.65 (m), 128.67, 128.01, 127.45, 126.53, 122.21 - 121.73 (m), 119.70, 118.63 - 117.89 (m), 117.54, 115.66, 112.35 (dd, J = 23.5, 3.0 Hz), 68.93, 58.79, 56.66, 56.52, 53.49, 44.32, 41.70, 37.97, 35.60, 26.33, 16.85, 15.96, 12.62. LC-MS (ESI); m/z [M+H]+: Calcd. for C48H51F2N8O8S2, 969.3239. Found 969.3272.
화합물 222의 예시적인 합성:(2S,4R)-1-((S)-2-(3-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)피페라진-1-일)-3-옥소프로판아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드. DMF(1 ml) 중 3-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)-벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)피페라진-1-일)-3-옥소프로판산(12.5 mg, 0.02 mmol) 및 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸- 부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드; 염화수소(11.69 mg, 0.03 mmol) 용액에 TEA(0.1 ml, 0.72 mmol) 및 PyBOP(13.02 mg, 0.03 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 동일한 온도에서 12시간 동안(밤새) 교반하였다. TLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)는 출발 물질이 없음을 나타낸다. 반응 혼합물을 건조될 때까지 증발시켰다. 용리액으로 DCM:MeOH(9:1)를 사용하는 실리카-카보네이트 카트리지(100 mg) 상에서 미정제 생성물을 여과하였다. 여과물을 진공 중에서 증발시키고 미정제 생성물을 PTLC(MeOH:DCM, 1:9, 2회)로 정제하여 14.1 mg의 생성물을 수득하였다(64% 수율). 1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ 12.71 (bs, 1H), 9.74 (bs, 1H), 8.98 (s, 1H), 8.59 (t, J = 5.7 Hz, 1H), 8.29 (s, 1H), 8.26 (d, J = 9.1 Hz, 1H), 8.03 (s, 1H), 7.96 (bs, 1H), 7.57 (q, J = 7.4, 6.3 Hz, 1H), 7.41 (dd, J = 8.0 Hz, 4H), 7.26 (t, J = 8.7 Hz, 1H), 5.22 - 5.05 (m, 1H), 4.58 (d, J = 9.3 Hz, 1H), 4.51 - 4.32 (m, 3H), 4.23 (dd, J = 15.8, 5.3 Hz, 1H), 3.67 (q, J = 12.3, 10.6 Hz, 8H), 3.52 (dd, J = 53.7, 15.5 Hz, 2H), 3.27 - 3.05 (m, 6H), 2.45 (s, 3H), 2.09 - 2.00 (m, 1H), 1.96 - 1.86 (m, 1H), 1.74 (h, J = 7.3 Hz, 2H), 0.97 (s, 9H)., 0.96 (t, 3H). 13C NMR (101 MHz, dmso) δ 180.41, 171.91, 169.38, 166.32, 166.06, 156.01 (dd, J = 246.5, 6.7 Hz), 152.34 (dd, J = 249.2, 8.3 Hz), 151.44, 147.73, 144.60, 144.28, 139.50, 138.06, 137.84, 131.17, 129.66, 128.75 (d, J = 8.0 Hz), 128.65, 127.43, 121.86 (dd, J = 13.5, 3.5 Hz), 118.34 (m), 117.58, 115.42, 115.18, 112.28 (dd, J = 23.1, 3.5 Hz), 68.89, 58.75, 56.54, 56.43, 53.49, 50.10, 45.56, 41.68, 41.19, 40.95, 37.95, 35.52, 26.36, 16.85, 15.96, 12.62. LC-MS (ESI); m/z [M+H]+: Calcd. for C46H54F2N9O8S2, 962.3504. Found 962.3694.
화합물 294의 예시적인 합성: (E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(3-(4-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)-[1,3'-비아제티딘]-1'-일)이소인돌린-1,3-디온
단계 A: 삼차-부틸-3-(4-(4, 4, 5, 5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페녹시)아제티딘-1-카르복실레이트
건조 DMF(20 mL) 중 삼차-부틸-3-요오도아제티딘-1-카르복실레이트(2.8 g, 12.6 mmol), 4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일) 페놀(3.9 g, 13.8 mmol) 및 K2CO3 (3.5 g, 25.2 mmol)의 혼합물을 80 oC에서 밤새 교반하였다. 실온으로 냉각시킨 후, DCM(50 mL) 및 물(25 mL)을 첨가하였다. 층을 분리하고, 유기상을 물 및 염수로 세척하였다. 유기상을 건조시키고(Na2SO4) 건조시키고, 여과하고, 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 상 플래쉬 컬럼(PE:EA=9:1)을 통해 정제하여 목적하는 생성물(2.4 g, 65% 수율)을 수득하였다.
단계 B: 삼차-부틸 3-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)아제티딘-1-카르복실레이트
DCM(20 mL) 중 삼차-부틸 3-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페녹시)아제티딘-1-카르복실레이트(2.4 g, 6.4 mmol) 및 4-(4-브로모-1H-피라졸-3-일)피리딘(1.71 g, 7.68 mmol) 용액에 Et2NH (4.7 g, 64 mmol), Cu(OAc)2 (1.75 g, 9.6 mmol)를 첨가하였다. 생성된 혼합물을 O2 분위기 하 30oC에서 16시간 동안 교반하였다. 혼합물을 DCM(30 mL)으로 희석하고, 혼합물을 수성 암모니아(10 mL x 3)로 세척하였다. 유기상을 감압 하에서 증발시키고, 잔류물을 실리카 겔 상 컬럼 크로마토그래피(DCM/MeOH=20/1)로 정제하여 삼차-부틸 3-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)아제티딘-1-카르복실레이트(1.5 g, 50% 수율)를 갈색 오일로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 471 [M+H] +.
단계 C: 4-(1-(4-(아제티딘-3-일옥시)페닐)-4-브로모-1H-피라졸-3-일)피리딘
DCM(3 mL) 중 삼차-부틸 3-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)-페녹시)아제티딘-1-카르복실레이트(700 mg) 용액에 1,4-디옥산(3 mL) 중 3 M HCl을 첨가하였다. 생성된 용액을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 용매를 감압 하에 제거하여 미정제의 목적하는 생성물(600 mg, 미정제)을 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 371 [M+H] +.
단계 D: 삼차-부틸 3-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)-[1,3'-비아제티딘]-1'-카르복실레이트
DCE(1.0 mL) 중 4-(1-(4-(아제티딘-3-일옥시)페닐)-4-브로모-1H-피라졸-3-일) 피리딘(50 mg, 0.14 mmol) 및 삼차-부틸 3-옥소아제티딘-1-카르복실레이트(48 mg, 0.28 mmol) 용액에 AcOH(1 방울), NaBH(OAc)3 (74 mg, 0.35 mmol)를 첨가하였다. 생성된 용액을 30oC에서 밤새 교반하였다. 혼합물을 EA(5 mL)로 희석하고, 혼합물을 수성 NaHCO3로 3회 세척하였다. 유기상을 감압 하에서 증발시키고, 잔류물을 실리카 겔 상 컬럼 크로마토그래피(PE/EA= 1/1)로 정제하여 삼차-부틸 3-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)-[1,3'-비아제티딘]-1'-카르복실레이트(30 mg, 42% 수율)를 갈색 오일로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 526 [M+H] +.
단계 E: 5-(3-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)-[1, 3'-비아제티딘]-1'-일)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일) 이소인돌린-1, 3-디온
DCM(2 mL) 중 삼차-부틸 3-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)-[1,3'-비아제티딘]-1'-카르복실레이트(160 mg) 용액에 1,4-디옥산(1 mL) 중 3 M HCl을 첨가하였다. 생성된 용액을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 용매를 감압 하에 제거하여 목적하는 생성물(150 mg, 미정제)을 수득하였다. NMP(1.0 mL) 중 3-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)-1.3'-비아제티딘(7.0 mg, 0.0165 mmol) 및 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-플루오로이소인돌린-1,3-디온(9.0 mg, 0.033 mmol) 용액에 DIPEA(1 방울)를 첨가하였다. 생성된 용액을 N2 분위기 하 130oC에서 1시간 동안 교반하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 혼합물을 EA(3 mL)로 희석하고, 혼합물을 염수로 2회 세척하였다. 유기상을 감압 하에 증발시켰다. 잔류물을 실리카 겔 상 컬럼 크로마토그래피(DCM/MeOH=15/1)로 정제하여 5-(3-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)-[1,3'-비아제티딘]-1'-일)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)이소인돌린-1,3-디온(4 mg, 36% 수율)을 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 682 [M+H] +.
단계 F: 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(3-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)-[1,3'-비아제티딘]-1'-일)이소인돌린-1,3-디온
1,4-디옥산/H2O ( v / v = 10/1, 5 mL) 중 5-(3-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)-[1,3'-비아제티딘]-1'-일)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)이소인돌린-1,3-디온(200 mg, 0.29 mmol) 용액에 5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-2,3-디하이드로-1H-인덴-1-온(83 mg, 0.32 mmol), Pd2 (dba)3 (110 mg, 0.12 mmol), CsF (176 mg, 1.20 mmol), [(t-Bu)3PH]BF4 (68 mg, 0.12 mmol), 및 N,N-디시클로헥실메틸아민(2.9 mg, 0.015 mmol)을 순차적으로 첨가하였다. 생성된 용액을 N2 분위기 하 100℃에서 2시간 동안 가열하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 혼합물을 EA(10 mL)로 희석하고, 혼합물을 물 및 염수로 세척하였다. 유기상을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 분취-HPLC로 정제하여 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(3-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)-[1,3'-비아제티딘]-1'-일)이소인돌린-1,3-디온(90 mg, 41.9% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 733 [M+H] +.
단계 G: (E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(3-(4-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)-[1,3'-비아제티딘]-1'-일)이소인돌린-1,3-디온
아세토니트릴/피리딘(v/v= 1/1, 6.0 mL) 중 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(3-(4-(4-(1-옥소-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)-[1,3'-비아제티딘]-1'-일)이소인돌린-1,3-디온(90 mg, 0.12 mmol) 용액에 하이드록실아민 염화수소(83.4 mg, 1.2 mmol)를 첨가하였다. 혼합물을 40oC에서 20분 동안 교반하였다. DCM(20 mL)로 급냉시킨 후, 혼합물을 염수(10 mL x 2)로 세척하였다. 유기상을 진공 중에서 농축시키고, 잔류물을 분취-HPLC로 정제하여 (E)-2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(3-(4-(4-(1-(하이드록시이미노)-2,3-디하이드로-1H-인덴-5-일)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)-[1,3'-비아제티딘]-1'-일)이소인돌린-1,3-디온(25 mg, 27% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다.
1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ11.06 (s, 1H), 10.89 (s, 1H), 8.73 (s, 1H), 8.57 (d, J = 4.8Hz, 2H), 7.87 (d, J = 8.8 Hz, 2H), 7.65 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 7.56 (d, J = 8.0Hz, 1H), 7.48 (d, J = 4.8Hz, 2H), 7.40 (s, 1H), 7.22 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 7.03 (d, J = 8.8Hz, 2H), 6.80 (s, 1H), 6.68 (d, J = 8.4Hz, 1H), 5.02-5.07 (m, 1H), 4.96 (t, J = 2.4Hz, 1H), 4.09 (t, J = 8.4Hz, 2H), 3.80-3.87 (m, 4H), 3.73 (s, 1H), 3.22 (s, 4H), 3.01 (d, J = 5.2Hz, 2H), 2.84 (d, J = 5.6Hz, 2H), 2.01 (d, J = 9.2Hz, 2H); LCMS (ES+): m/z 748.79 [M+H]+.
화합물 226의 예시적인 합성: (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-((R)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드
단계 A: 삼차-부틸 2-(4-포르밀피페리딘-1-일)아세테이트
CH3CN (10 mL) 중 삼차-부틸 2-(4-(하이드록시메틸)피페리딘-1-일)아세테이트(1.5 g, 6.55 mmol) 용액에 IBX(2.7 g, 9.85 mmol)를 첨가하였다. 생성된 용액을 80℃에서 5시간 동안 교반하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 반응물을 EA(30 mL)로 희석하고, 용액을 아황산나트륨 및 중탄산나트륨으로 세척하였다. 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시켰다. 유기상을 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피(PE:EA=5:1)로 정제하여 목적하는 생성물 삼차-부틸 2-(4-포르밀피페리딘-1-일)아세테이트 (350 mg, 25% 수율)을 황색 오일로서 수득하였다.1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 9.64 (s, 1H), 3.12 (s, 2H), 2.85-2.89 (m, 2H), 2.31-2.37 (m, 2H), 2.20-2.26 (m, 1H), 1.89-1.93 (m, 2H), 1.74-1.77 (m, 2H), 1.47 (s, 9H).
단계 B: 삼차-부틸-2-(4-((4-(4-브로모페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세테이트
CH3OH/DCM (v/v =1/1, 10 mL) 중 삼차-부틸 2-(4-포르밀피페리딘-1-일)아세테이트 (370 mg, 1.54 mmol) 및 1-(4-브로모페닐)피페라진(350 mg, 1.54 mmol) 용액에 촉매 AcOH(0.1 mL)를 실온에서 첨가하였다. 30분 동안 교반한 후, NaBH(OAc)3(1.3 g, 6.17 mmol)를 첨가하였다. 혼합물을 30oC에서 1시간 동안 교반하였다. 수성 NaHCO3(20 mL)로 급냉시킨 후, 혼합물을 DCM(10 mL x 3)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(20 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔(DCM:MeOH=50:1)로 정제하여, 삼차-부틸 2-(4-((4-(4-브로모페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세테이트(330 mg, 47% 수율)을 황색 오일로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 454.2 [M+H] +.
단계 C: 삼차-부틸 2-(4-((4-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세테이트
1,4-디옥산(5 mL) 중 4,4,4',4',5,5,5',5'-옥타메틸-2,2'-비(1,3,2-디옥사보로란)(242 mg, 0.951 mmol) 및 삼차-부틸 2-(4-((4-(4-브로모페닐)피페라진-1-일)메틸)-피페리딘-1-일)아세테이트 (330 mg, 0.732 mmol) 용액에 KOAc(145 mg, 1.46 mmol) 및 Pd(dppf)Cl2 (54 mg, 0.0732 mmol)을 첨가하였다. 질소 분위가 하 90oC에서 밤새 교반한 후, 반응 혼합물을 30 mL의 에틸 아세테이트로 희석하고, 용액을 염수(10 mL x 3)로 세척하였다. 유기상을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔(DCM:MeOH=100:3)로 정제하여 목적하는 생성물 삼차-부틸 2-(4-((4-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세테이트(100 mg, 27% 수율)를 황색 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 499.4 [M+H] +.
단계 D: (R)-삼차-부틸 -2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세테이트
H2O/디옥산(v/v=1/5, 5.0 mL) 중 삼차-부틸 2-(4-((4-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세테이트 (100 mg, 0.199 mmol) 용액에 CsF(121 mg, 0.796 mmol), Pd(aMPhos)Cl2 (14 mg, 0.0199 mmol) 및 (R)-N-(3-(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드(100 mg, 0.199 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 용액을 실온에서 N2로 10분동안 퍼지하여 과잉 O2를 제거하였다. 생성된 용액을 100oC에서 4시간 동안 교반하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 반응물을 EtOAc로 취하였다. 합쳐진 유기층을 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 분취-TLC(DCM:CH3OH=20:1)로 정제하여 목적하는 생성물 (R)-삼차-부틸 -2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세테이트(50 mg, 32% 수율)를 연황색 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 797.6 [M+H]+.
단계 E: (R)-2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트산
DCM(1 mL) 중 (R)-삼차-부틸 2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세테이트 (50 mg, 0.0629 mmol) 용액에 TFA(0.5 mL)를 첨가하였다. 생성된 용액을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 용매를 진공 하에서 제거하였다. 잔류물을 통해 목적하는 생성물(R)-2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트산(80 mg, 미정제)을 황색 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 740.2 [M+H] +.
단계 G: (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-((R)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드
DCM (5.0 mL) 중 (R)-2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트산 (47 mg, 0.0629 mmol) 용액에 DIEA(25 mg, 0.189 mmol), (2S,4R)-1-((S)-2-((l3-클로라닐)디아제닐)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드(30 mg, 0.0691 mmol) 및 PyBOP(40 mg, 0.0755 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 생성된 용액을 20oC에서 1시간 동안 교반하였다. 반응물을 H2O(10 mL)로 급냉시키고, 혼합물을 DCM(20 mL Х 3)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 분취-TLC(DCM:CH3OH=10:1)로 정제하여 (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-((R)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드(33 mg)를 백색 고체로서 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, CD3OD): δ 8.77 (s, 1H), 8.59 (s, 1H), 8.49 (s, 1H), 7.79 (s, 1H), 7.61-7.69 (m, 1H), 7.49 (d, J = 8.8 Hz, 2H), 7.31-7.39 (m, 4H), 6.98-7.04 (m, 3H), 5.18 (s, 0.5H), 5.02 (s, 0.5H), 4.56 (s, 1H), 4.41-4.53 (m, 2H), 4.22-4.29 (m, 1H), 3.76-3.81 (m, 1H), 3.68-3.73 (m, 1H), 3.23-3.52 (m, 4H), 3.16 (s, 4H), 2.94 (s, 2H), 2.90 (s, 1H), 2.72－2.81 (m, 2H), 2.50 (br, 4H), 2.38 (s, 3H), 1.92-2.20 (m, 10H), 1.66-1.79 (m, 2H), 0.95 (s, 9H); LCMS (ES+): m/z 1154.3 [M+H] +.
화합물 227의 예시적인 합성: (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-((R)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드
단계 A: 1-(4-브로모페닐)피페리딘-4-카브알데히드
MeCN(10 mL) 중 1-(4-브로모페닐)-4-(디메톡시메틸)피페리딘(1 g, 3.18 mmol) 용액에 염산(3 N)을 첨가하였다. 생성된 용액을 50℃에서 4시간 동안 교반하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 혼합물에 수성NaHCO3를 첨가하여 pH를 8 내지 9로 조정하였다. 반응물을 30 mL의 EA로 희석하고, 혼합물을 아황산나트륨 및 중탄산나트륨으로 세척하였다. 유기상을 무수 황산나트륨 상에서 건조시켰다. 유기상을 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 통해 목적하는 생성물 1-(4-브로모페닐)피페리딘-4-카브알데히드(1 g 미정제)를 황색 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 268.0 [M+H] +.
단계 B: 삼차-부틸 4-((1-(4-브로모페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-카르복실레이트
CH3OH/DCM (v/v =1/1, 10 mL) 중 1-(4-브로모페닐)피페리딘-4-카브알데히드 (1 g, 미정제) 및 삼차-부틸 피페라진-1-카르복실레이트(590 mg, 3.18 mmol) 용액에 촉매 AcOH (0.1 mL)를 실온에서 첨가하였다. 　 30분 동안 교반한 후, NaBH(OAc)3(2.7 g, 12.7 mmol)를 첨가하였다. 생성된 용액을 30oC에서 밤새 교반하였다. 수성NaHCO3(20 mL)로 급냉시킨 후, 혼합물을 DCM(10 mL x 3)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(20 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 PE/EA(8/1)의 실리카 겔로 정제하여, 삼차-부틸 4-((1-(4-브로모페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-카르복실레이트(800 mg)을 황색 오일로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 440.2 [M+H] +.
단계 C: 삼차-부틸 2-(4-((1-(4-브로모페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)아세테이트
DCM(4 mL) 중 삼차-부틸 4-((1-(4-브로모페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-카르복실레이트 (800 mg, 1.83 mmol) 용액에 TFA(2 mL)를 첨가하였다. 생성된 용액을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 용매를 진공 중에서 제거하여 미정제의 목적하는 생성물(1 g 미정제)을 수득하였고, 이는 다음 단계에서 직접 사용되었다. 건조 DMF(5 mL) 중 위의 미정제 생성물(500 g, 미정제) 및 삼차-부틸 2-브로모아세테이트(176 mg, 0.913 mmol) 용액에 K2CO3(190 mg, 1.37 mmol)를 첨가하였다. 생성된 용액을 실온에서 밤새 교반하였다. 반응물을 40 mL의 EA로 희석하고, 혼합물을 물 및 염수로 세척하였다. 유기상을 무수 황산나트륨 상에서 건조시켰다. 잔류물을 통해 목적하는 생성물 삼차-부틸-2-(4-((1-(4-브로모페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)아세테이트 (410 mg, 미정제)를 황색 오일로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 453.2 [M+H] +.
단계 D: 삼차-부틸 2-(4-((1-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)아세테이트
1,4-디옥산(5 mL) 중 4,4,4',4',5,5,5',5'-옥타메틸-2,2'-비(1,3,2-디옥사보로란)(300 mg, 1.18 mmol) 및 삼차-부틸 2-(4-((1-(4-브로모페닐)피페리딘-4-일)메틸)-피페라진-1-일)아세테이트(410 mg, 0.913 mmol) 용액에 KOAc(178 mg, 1.82 mmol) 및 Pd(dppf)Cl2(67 mg, 0.0913 mmol)을 첨가하였다. 질소 분위가 하 90oC에서 밤새 교반한 후, 반응 혼합물을 30 mL의 에틸 아세테이트로 희석하고, 용액을 염수(10 mL x 3)로 세척하였다. 유기상을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 DCM/MeOH(100/3)의 실리카 겔로 정제하여 목적하는 생성물 삼차-부틸 2-(4-((1-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)아세테이트(200 mg, 미정제)를 황색 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 500.4 [M+H] +.
단계 E: (R)-삼차-부틸 2-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)아세테이트
H2O/디옥산(v/v=1/5, 5.0 mL) 중 삼차-부틸 2-(4-((1-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)아세테이트 (200 mg, 미정제) 용액에 CsF(121 mg, 0.796 mmol), Pd(aMPhos)Cl2 (14 mg, 0.0199 mmol) 및 (R)-N-(3-(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드(100 mg, 0.199 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 용액을 실온에서 N2로 10분동안 퍼지하여 과잉 O2를 제거하였다. 생성된 용액을 100oC에서 4시간 동안 교반하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 반응물을 EtOAc로 취하였다. 합쳐진 유기층을 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 DCM/CH3OH(20/1)의 분취-TLC로 정제하여 목적하는 생성물 (R)-삼차-부틸 2-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)아세테이트(110 mg, 69% 수율)를 연황색 고체로서 수득하였다. LCMS (ES+): m/z 796.3 [M+H] +.
단계 F: (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-((R)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드
DCM(3 mL) 중 (R)-삼차-부틸 2-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)아세테이트 (110 mg, 0.139 mmol) 용액에 TFA(1.5 mL)를 첨가하였다. 생성된 용액을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 용매를 진공 중에서 제거하여 목적하는 생성물(180 mg 미정제)을 수득하였고, 이는 다음 단계에서 직접 사용되었다. DMF(5.0 mL) 중 위의 산(180 mg, 미정제) 용액에 DIEA(54 mg, 0.418 mmol), (2S,4R)-1-((S)-2-((l3-클로라닐)디아제닐)-3,3-디메틸-부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드(66 mg, 0.153 mmol) 및 PyBOP(87 mg, 0.167 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 생성된 용액을 20oC에서 1시간 동안 교반하였다. H2O(10 mL)로 급냉시킨 후, 혼합물을 EA(20 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 분취 HPLC로 정제하여 목적하는 생성물(42 mg)을 황색 고체로서 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, MeOD-d 4 ): δ 8.89 (s, 1H), 8.70 (s, 1H), 8.61 (s, 1H), 7.91 (s, 1H), 7.71－7.80 (m, 1H), 7.60 (d, J = 8.4 Hz, 2H), 7.43－7.50 (m, 4H), 7.12－7.16 (m, 3H), 5.23 (s, 0.5H), 5.18 (s, 0.5H), 4.95 (m, 4H), 4.56 (s, 1H), 4.53－4.66 (m, 4H), 4.35－4.41 (m, 1H), 3.79－3.90 (m, 4H), 3.44－3.60 (m, 6H), 3.08－3.19 (m, 2H), 2.72－2.81 (m, 10H), 2.50 (s, 3H), 2.03－2.25 (m, 5H), 1.87－1.92 (m, 3H), 1.52-1.63 (m, 2H), 1.04 (s, 9H); LCMS (ES+): m/z 1101.3 [M+H] +.
화합물 295의 예시적인 합성: (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((3S,4S)-3-플루오로-4-하이드록시피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드
단계 A: (3S,4S)-3-[(삼차-부틸디페닐실릴)옥시]-4-플루오로피롤리딘
50 mL 둥근바닥 플라스크에 (3S,4S)-4-플루오로피롤리딘-3-올(500 mg, 4.76 mmol, 1당량), 디클로로메틴(10 mL), 이미다졸(323.8 mg, 4.76 mmol, 1당량), TBDPSCl(1307.5 mg, 4.76 mmol, 1당량)을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 밤새 교반하였다. 생성된 혼합물을 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(10/1)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 470mg(29%)의 (3S,4S)-3-[(삼차-부틸디페닐실릴)옥시]-4-플루오로피롤리딘을 황색 오일로서 수득하였다.
단계 B: (3S,4S)-3-[(삼차-부틸디페닐실릴)옥시]-4-플루오로피롤리딘-1-설포닐 염화물
50 mL 둥근 바닥 플라스크에 (3S,4S)-3-[(삼차-부틸디페닐실릴)옥시]-4-플루오로피롤리딘(370 mg, 1당량), 디클로로메탄(5 mL), 디이소프로필에틸아민(279 mg, 2당량), 디클로로설폭시드(290 mg, 2당량)를 넣었다. 생성된 용액을 -30oC에서 4시간 동안 교반하였다. 이어서 반응물을 물(20 mL)의 첨가로 급냉시켰다. 생성된 용액을 디클로로메탄(20 mL x 3)으로 추출하였다. 생성된 혼합물을 염수(20 mL x 1)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 농축시켰다. 이를 통해 450mg의 (3S,4S)-3-[(삼차-부틸디페닐실릴)옥시]-4-플루오로피롤리딘-1-설포닐 염화물을 황색 오일로서 수득하였다.
단계 C: (3S,4S)-N-(3-[5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로페닐)-3-[(삼차-부틸디페닐실릴)옥시]-4-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드
25 mL 둥근 바닥 플라스크에 (3S,4S)-3-[(삼차-부틸디페닐실릴)옥시]-4-플루오로피롤리딘-1-설포닐 염화물(449.4 mg, 1.02 mmol, 2.00당량), 피리딘 (0.7 mL), 3-[5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로아닐린(179 mg, 0.51 mmol, 1당량), 디메틸아미노피리딘(18.6 mg, 0.15 mmol, 0.30당량)을 넣었다. 생성된 용액을 오일조에서 45℃에서 3시간 동안 교반하였다. 생성된 혼합물을 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1/1)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 120 mg(31%)의 (3S,4S)-N-(3-[5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로페닐)-3-[(삼차-부틸디페닐실릴)옥시]-4-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드를 황색 오일로서 수득하였다.
단계 D: 삼차-부틸 2-(4-[[4-(4-[3-[3-([[(3S,4S)-3-[(삼차-부틸디페닐실릴)옥시]-4-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)-2,6-디플루오로벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]메틸]피페리딘의 합성
50 mL 둥근바닥 플라스크에 (3S,4S)-N-(3-[5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로페닐)-3-[(삼차-부틸디페닐실릴)옥시]-4-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드(120 mg, 0.16 mmol, 1당량), 1,4-디옥산(5 mL, 0.06 mmol), 물(0.0 mL, 0.06 mmol), 삼차-부틸 2-[4-([4-[4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐]피페라진-1-일]메틸)피페리딘-1-일]아세테이트(79.1 mg, 0.16 mmol, 1당량), Na2CO3 (50.4 mg, 0.48 mmol, 3당량), Pd(dppf)Cl2 (39 mg)을 넣었다. 생성된 용액을 오일조에서 110oC에서 2시간 동안 교반하였다. 생성된 혼합물을 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(10/1)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 90 mg(54%)의 삼차-부틸 2-(4-[[4-(4-[3-[3-([[(3S,4S)-3-[(삼차-부틸디페닐실릴)옥시]-4-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)-2,6-디플루오로벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]메틸]피페리딘을 황색 오일로서 수득하였다.
단계 E: 2-(4-[[4-(4-[3-[3-([[(3S,4S)-3-[(삼차-부틸디페닐실릴)옥시]-4-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)-2,6-디플루오로벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]메틸]피페리딘-1-일)아세트산의 합성
25 mL 둥근바닥 플라스크에 삼차-부틸 2-(4-[[4-(4-[3-[3-([[(3S,4S)-3-[(삼차-부틸디페닐실릴)옥시]-4-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)-2,6-디플루오로벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]메틸]피페리딘(90 mg, 0.09 mmol, 1당량), 디클로로메탄(5 mL), 트리플루오로아세트산(2 mL, 0.02 mmol)을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 밤새 교반하였다. 생성된 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 이를 통해 60 mg(70.43%)의 삼차-부틸 2-(4-[[4-(4-[3-[3-([[(3S,4S)-3-[(삼차-부틸디페닐실릴)옥시]-4-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)-2,6-디플루오로벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]메틸]피페리딘-1-일)아세트산을 황색 고체로서 수득하였다.
단계 F: 2-(4-[[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3S,4S)-3-플루오로-4-하이드록시피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]메틸]피페리딘-1-일)아세트산의 합성
25 mL 둥근바닥 플라스크에 2-(4-[[4-(4-[3-[3-([[(3S,4S)-3-[(삼차-부틸디페닐실릴)옥시]-4-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)-2,6-디플루오로벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]메틸]피페리딘-1-일)아세트산(60 mg, 0.06 mmol, 1당량), 테트라하이드로푸란(3 mL), TBAF(1 mL, 0.06당량)을 넣었다. 생성된 용액을 40oC에서 2시간 동안 교반하였다. 생성된 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(10/1)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 50 mg(109.62%)의 2-(4-[[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3S,4S)-3-플루오로-4-하이드록시피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]메틸]피페리딘-1-일)아세트산을 황색 오일로서 수득하였다.
단계 G: (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((3S,4S)-3-플루오로-4-하이드록시피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드
25 mL 둥근바닥 플라스크에 2-(4-[[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3S,4S)-3-플루오로-4-하이드록시피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]메틸]피페리딘-1-일)아세트산(50 mg, 0.066 mmol, 1당량), DMF(5 mL), (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드(30.8 mg, 0.066 mmol, 1당량), 디이소프로필에틸아민(34.1 mg, 0.264 mmol, 4.00당량), BOP (35 mg, 0.079 mmol, 1.2당량)를 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 3시간 동안 교반하였다. 이어서, 반응물을 물(30 mL)로 급냉시키고, 디클로로메탄(30 mL x 3)으로 추출하고, 물(30 mL)로 세척하고 감압 하에 농축시켰다. 미정제 생성물을 분취-HPLC로 정제하였다. 이를 통해 32.6 mg(42%)의 (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((3S,4S)-3-플루오로-4-하이드록시피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드를 황색 고체로서 수득하였다. 1H NMR (400 MHz, CD3OD): δ 8.87 (s, 1H), 8.69 (s, 1H), 8.58 (s, 1H), 7.89 (s, 1H), 7.73-7.72 (m, 1H), 7.58 (d, J = 8.8 Hz, 2H), 7.48-7.40 (m, 4H), 7.10-7.05 (m, 3H), 4.93 (s, 1H), 4.63 (s, 1H), 4.57 (d, J = 6 Hz, 1H), 4.52-4.50 (m, 1H), 4.38-4.34 (m, 2H), 3.87-3.86 (m, 1H), 3.82-3.81 (m, 1H), 3.57-3.50 (m, 3H), 3.36-3.33 (m, 1H), 3.31-3.20 (m, 5H), 3.02 (s, 2H), 3.01-2.90 (m, 2H), 2.56 (s, 3H), 2.74 (s, 3H), 2.26-2.20 (m, 4H), 2.10-2.01 (m, 1H), 1.82-1.71 (m, 2H), 1.67-1.61 (m, 3H), 1.44-1.28 (m, 2H), 1.05-1.02 (m, 9H); LCMS (ES+): m/z 1168.30 [M+H]+.
화합물 298의 예시적인 합성: (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설포닐아미노)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)-피롤리딘-2-카르복사미드.
DMF(1 ml) 중 2-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-(프로필설포닐아미노)-벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]아세트산(10.8 mg, 0.02 mmol) 및 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸- 부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸티아졸-5-일)-페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드; 염화수소(9.5 mg, 0.02 mmol) 용액에 TEA(0.1 ml, 0.717 mmol) 및 PyBOP(11 mg, 0.021 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 동일한 온도에서 4시간 동안 교반하였다. TLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)는 출발 물질이 없음을 나타낸다. DCM을 고진공 중에서 제거하였다. 용리액으로 DCM:MeOH(90:10)의 혼합물을 사용하는 실리카-카보네이트 카트리지(100 mg) 상에서 미정제 생성물을 여과하였다. 여과물을 진공 중에서 증발시키고 미정제 생성물을 PTLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)로 정제하여 8.5 mg의 생성물을 수득하였다(44% 수율). 1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ 12.88 (s, 1H), 9.67 (s, 1H), 8.98 (s, 1H), 8.76 - 8.50 (m, 3H), 8.23 (s, 1H), 7.98 (d, J = 9.4 Hz, 1H), 7.69 (d, J = 8.6 Hz, 2H), 7.59 (td, J = 9.0, 5.8 Hz, 1H), 7.49 - 7.34 (m, 4H), 7.33 - 7.20 (m, 1H), 7.10 (d, J = 8.7 Hz, 2H), 5.20 (d, J = 3.3 Hz, 1H), 4.72 (s, 2H), 4.62 (d, J = 9.4 Hz, 1H), 4.54 - 4.34 (m, 3H), 4.25 (dd, J = 15.9, 5.5 Hz, 1H), 3.74 - 3.59 (m, 2H), 3.19 - 3.07 (m, 2H), 2.44 (s, 3H), 2.07 (dd, J = 12.9, 7.7 Hz, 1H), 1.91 (ddd, J = 12.8, 8.8, 4.5 Hz, 1H), 1.80 - 1.65 (m, 2H), 0.96 (s, 9H), 0.94 (t, 3H). 13C NMR (151 MHz, dmso) δ 180.62, 171.82, 169.13, 167.11, 157.51, 156.02 (dd, J = 246.1, 7.0 Hz), 152.34 (dd, J = 249.6, 8.5 Hz), 151.45, 148.60, 147.74, 143.80, 139.47, 138.70, 131.16, 129.70, 129.00 - 128.42 (m), 128.81, 128.69, 128.31, 128.00, 127.48, 126.53, 121.96 (dd, J = 13.6, 3.5 Hz), 118.61 - 117.85 (m), 117.53, 115.63, 115.34, 112.34 (dd, J = 22.4, 3.4 Hz), 68.91, 66.58, 58.80, 56.58, 56.17, 53.45, 41.69, 37.95, 35.79, 26.28, 16.85, 15.96, 12.63. LC-MS (ESI); m/z [M+H]+: Calcd. for C47H50F2N7O8S2, 942.3130. Found 942.3134.
화합물 299의 예시적인 합성: (2S,4R)-1-((S)-2-(4-(3-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)부탄아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드.
DMF(2 ml) 중 4-[3-[3-[2,6-디플루오로-3-(프로필설포닐아미노)-벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]부탄산(18 mg, 0.03 mmol) 및 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸- 부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드; 염화수소(16.8 mg, 0.036 mmol) 용액에 TEA(0.1 ml, 0.72 mmol) 및 PyBOP(18.48 mg, 0.04 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 동일한 온도에서 4시간 동안 교반하였다. TLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)는 출발 물질이 없음을 나타낸다. DMF를 고진공 중에서 제거하였다(생성물은 부분적으로 수용성일 수 있음). 용리액으로 DCM:MeOH(9:1)를 사용하는 실리카-카보네이트 카트리지 상에서 미정제 생성물을 여과하였다. 여과물을 진공 중에서 증발시키고 미정제 생성물을 PTLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)로 정제하고, PTLC(DCM:MeOH, 9:1)로 이차 정제하여 8 mg의 생성물을 수득하였다(25% 수율). 1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ 12.97 (bs, 1H), 9.72 (bs, 1H), 8.97 (s, 1H), 8.71 (d, J = 2.1 Hz, 1H), 8.61 (s, 2H), 8.56 (t, J = 6.0 Hz, 2H), 8.23 (s, 1H), 7.99 (d, J = 9.3 Hz, 1H), 7.59 (td, J = 9.0, 5.9 Hz, 1H), 7.50 - 7.16 (m, 8H), 6.98 (d, J = 8.2 Hz, 1H), 5.13 (d, J = 3.4 Hz, 1H), 4.58 (d, J = 9.3 Hz, 1H), 4.48 - 4.40 (m, 2H), 4.35 (s, 1H), 4.22 (dd, J = 15.9, 5.5 Hz, 1H), 4.08 (ddt, J = 9.6, 7.1, 3.2 Hz, 2H), 3.74 - 3.62 (m, 2H), 3.15 - 3.06 (m, 2H), 2.50 - 2.45 (m, 1H), 2.44 (s, 3H), 2.41 - 2.33 (m, 1H), 2.09 - 1.86 (m, 4H), 1.79 - 1.67 (m, 2H), 0.97 (t, 3H),　　0.94 (s, 9H). 13C NMR (151 MHz, dmso) δ 181.05, 172.38, 172.05, 170.09, 159.63, 156.44 (dd, J = 246.5, 6.8 Hz), 152.74 (dd, J = 249.6, 8.6 Hz), 151.86, 149.36, 148.13, 140.05, 139.92, 139.24, 131.87, 131.59, 130.71, 130.05, 129.20 (t, J = 5.0 Hz), 129.06, 127.84, 127.52, 122.37 (dd, J = 13.5, 3.5 Hz), 119.87, 118.95 - 118.24 (m), 117.88, 116.11, 114.12, 113.60, 112.91 - 112.65 (m), 69.32, 67.53, 59.14, 56.88, 56.83, 53.86, 42.08, 38.38, 35.67, 31.76, 26.80, 25.52, 17.26, 16.37, 13.04. LC-MS (ESI); m/z [M+H]+: Calcd. for C49H54F2N7O8S2, 970.3443. Found 970.3787.
화합물 300의 예시적인 합성: (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(2-(3-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설포닐아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)에톡시)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드.
DMF(2 ml) 중 2-[2-[3-[3-[2,6-디플루오로-3-(프로필설포닐아미노벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]에톡시]아세트산(19.1 mg, 0.03 mmol) 및 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸- 부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드; 염화수소(17.11 mg, 0.04 mmol) 용액에 TEA(0.1 ml, 0.72 mmol) 및 PyBOP(19.06 mg, 0.04 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 동일한 온도에서 2시간 동안 교반하였다. TLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)는 출발 물질이 없음을 나타낸다. DMF를 고진공 중에서 제거하였다(생성물은 부분적으로 수용성일 수 있음). 용리액으로 DCM:MeOH(9:1)를 사용하는 실리카-카보네이트 카트리지 상에서 미정제 생성물을 여과하였다. 여과물을 진공 중에서 증발시키고 미정제 생성물을 PTLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)로 정제하여 13 mg의 생성물을 수득하였다(40% 수율). 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 12.95 (bs, 1H), 9.74 (bs, 1H), 8.91 (s, 1H), 8.67 (d, J = 2.0 Hz, 1H), 8.55 (dd, J = 12.8, 6.8 Hz, 2H), 8.19 (s, 1H), 7.56 (td, J = 9.0, 6.0 Hz, 1H), 7.49 (d, J = 9.5 Hz, 1H), 7.42 - 7.20 (m, 8H), 7.07 - 7.00 (m, 1H), 5.13 (d, J = 3.5 Hz, 1H), 4.58 (d, J = 9.6 Hz, 1H), 4.44 (t, J = 8.1 Hz, 1H), 4.36 (dd, J = 15.8, 6.2 Hz, 2H), 4.30 - 4.16 (m, 3H), 4.06 (s, 2H), 3.86 (t, J = 4.3 Hz, 2H), 3.13 - 3.04 (m, 2H), 2.37 (s, 3H), 2.07 - 1.99 (m, 1H), 1.94 - 1.83 (m, 1H), 1.78 - 1.64 (m, 2H), 0.94 (t, 3H), 0.93 (s, 9H). 13C NMR (126 MHz, dmso) δ 181.03, 172.20, 169.60, 168.98, 159.52, 156.46 (dd, J = 246.7, 7.1 Hz), 152.75 (dd), 151.81, 149.36, 148.14, 144.59, 140.08, 139.80, 139.21, 131.85, 131.56, 130.66, 130.08, 129.62 - 128.89 (m), 129.08, 127.82, 122.38 (dd, J = 13.5, 3.6 Hz),, 120.09, 118.98 - 118.30 (m), 117.89, 116.15, 114.40, 113.50, 112.78 (dd, J = 22.9, 3.8 Hz), 70.05, 70.00, 69.34, 67.49, 59.18, 57.04, 56.16, 53.89, 42.12, 38.34, 36.22, 26.65, 17.28, 16.32, 13.05. LC-MS (ESI); m/z [M+H]+: Calcd. for C49H54F2N7O9S2, 986.3392. Found 986.3679.
화합물 217의 예시적인 합성: N1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)-N5-((S)-1-((2S,4R)-4-하이드록시-2-((4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)카바모일)피롤리딘-1-일)-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일)글루타르아미드.
DMF(1 ml) 중 5-((4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)-벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)아미노)-5-옥소펜탄산(9.7 mg, 0.02 mmol) 및 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸- 부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드; 염화수소(8.52 mg, 0.02 mmol) 용액에 TEA (0.1 ml, 0.72 mmol) 및 PyBOP(9.5 mg, 0.02 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 동일한 온도에서 4시간 동안 교반하였다. TLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)는 출발 물질이 없음을 나타낸다. 반응 혼합물을 EtOAc(10 mL)로 희석하고 염수(5 mL, 4회)로 세척하고, 유기상을 건조시키고(Na2SO4), 진공 중에서 증발시켰다. 미정제 생성물을 PTLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)로 정제하여 4.8 mg(29% 수율)의 생성물을 수득하였다. 1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ 10.02 (s, 1H), 8.97 (s, 1H), 8.68 (d, 1H), 8.64 - 8.52 (m, 2H), 8.21 (s, 1H), 7.95 (d, J = 9.2 Hz, 1H), 7.72 (dd, J = 36.7, 8.5 Hz, 4H), 7.62 - 7.54 (m, 1H), 7.40 (dd, 4H), 7.28 (t, J = 8.7 Hz, 1H), 5.16 (d, 2H), 4.56 (d, J = 9.3 Hz, 1H), 4.50 - 4.40 (m, 2H), 4.40 - 4.33 (m, 1H), 4.22 (dd, J = 15.8, 5.3 Hz, 1H), 3.76 - 3.62 (m, 2H), 3.16 - 3.05 (m, 2H), 2.44 (s, 3H), 2.41 - 2.17 (m, 4H), 2.09 - 2.01 (m, 1H), 1.98 - 1.80 (m, 3H), 1.74 (dq, J = 14.9, 7.4 Hz, 2H), 0.96 (s, 9H), 0.95 (t, 3H).　13C NMR (151 MHz, dmso) δ 181.06, 172.39, 172.17, 171.46, 170.15, 156.37 (dd, J = 246.6, 6.3 Hz), 152.73 (dd, J = 249.4, 8.1 Hz), 151.86, 149.05, 148.13, 144.19, 139.91, 139.37, 139.13, 132.97, 131.64, 131.59, 130.05, 129.22 (d, J = 14.7 Hz), 129.06, 127.84, 127.74, 126.89, 122.47 (d, J = 14.1 Hz), 120.07, 119.02 - 118.20 (m), 117.95, 116.06, 112.75 (dd, J = 23.4, 2.8 Hz), 69.34, 59.15, 56.90, 56.81, 53.87, 42.08, 38.38, 36.36, 35.63, 34.63, 26.85, 21.91, 17.27, 16.37, 13.04. LC-MS (ESI); m/z [M+H]+: Calcd. for C50H55F2N8O8S2, 997.3552. Found 997.3524.
화합물 218의 예시적인 합성: (2S,4R)-1-((S)-2-(5-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)피페라진-1-일)-5-옥소펜탄아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드.
DMF(1 ml) 중 5-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)-벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)피페라진-1-일)-5-옥소펜탄산(9.3 mg, 0.02 mmol) 및 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸- 부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드; 염화수소(8.27 mg, 0.018 mmol) 용액에 TEA (0.1 ml, 0.72 mmol) 및 PyBOP(9.22 mg, 0.018 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 동일한 온도에서 4시간 동안 교반하였다. TLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)는 출발 물질이 없음을 나타낸다. 반응 혼합물을 EtOAc(10 mL)로 희석하고 염수(5 mL, 4회)로 세척하고, 유기상을 건조시키고(Na2SO4), 진공 중에서 증발시켰다. TLC는 미정제 혼합물 중 생성물을 나타내지 않았고, 단지 일부 VHL 출발 물질(4)(생성물은 수용성임)을 나타내었다. 물 추출물을 밤새 동결건조시키고, 고체 잔류물을 DCM:MeOH:NH4OH (90:9:1, 30 mL)의 혼합물을 사용하여 여과하였다. 여과물을 건조될 때까지 증발시키고 미정제 생성물을 PTLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)로 정제하여 13 mg의 생성물을 수득하였다(81% 수율). 1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ 12.64 (bs, 1H), 9.74 (bs, 1H), 8.97 (s, 1H), 8.62 - 8.52 (m, 3H), 8.28 (d, J = 2.0 Hz, 1H), 8.00 (s, 1H), 7.95 (bs, 1H), 7.90 (d, J = 9.2 Hz, 1H), 7.59 - 7.49 (m, 1H), 7.47 - 7.27 (m, 4H), 7.20 (t, J = 8.7 Hz, 1H), 5.13 (bs, 1H), 4.56 (d, J = 9.3 Hz, 1H), 4.48 - 4.32 (m, 3H), 4.22 (dd, J = 15.8, 5.3 Hz, 1H), 3.75 - 3.57 (m, 5H), 3.23 - 3.02 (m, 7H), 2.44 (s, 3H), 2.41 - 2.17 (m, 4H), 2.07 - 2.01 (m, 1H), 1.96 - 1.87 (m, 1H), 1.81 - 1.66 (m, 4H), 0.95 (s, 9H), 0.94 (t, 3H).　 13C NMR (151 MHz, dmso) δ 180.70, 171.99, 171.92, 170.44, 169.75, 155.24 (dd, J = 248.1, 5.5 Hz), 152.12 (dd, J = 248.8, 8.5 Hz), 151.47, 147.73, 144.63, 144.31, 139.52, 138.02, 137.75, 131.19, 129.65, 128.65, 127.98 - 127.64 (m), 127.44, 123.91 - 123.09 (m), 118.86 - 117.72 (m), 117.60, 115.50, 115.23, 112.02 (dd, J = 22.6, 3.2 Hz), 68.92, 58.74, 56.47, 56.43, 53.44, 50.31, 50.18, 48.63, 44.86, 41.68, 41.00, 37.99, 34.28, 31.80, 26.43, 21.36, 16.99, 15.97, 12.72.　LC-MS (ESI); m/z [M+H]+: Calcd. for C48H58F2N9O8S2, 990.3817. Found 990.3889.
화합물 219의 예시적인 합성: (2S,4R)-1-((S)-2-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)피페라진-1-일)-4-옥소부탄아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드.
DMF(1 ml) 중 4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)-벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)피페라진-1-일)-4-옥소부탄산(9 mg, 0.016 mmol) 및 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸- 부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드; 염화수소(8.2 mg, 0.018 mmol)에 TEA(0.1 ml, 0.72 mmol) 및 PyBOP(9.14 mg, 0.018 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 동일한 온도에서 12시간 동안(밤새) 교반하였다. TLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)는 출발 물질이 없음을 나타낸다. 반응 혼합물을 건조될 때까지 증발시켰다. 용리액으로 DCM:MeOH(9:1)를 사용하는 실리카-카보네이트 카트리지(100 mg) 상에서 미정제 생성물을 여과하였다. 여과물을 진공 중에서 증발시키고 미정제 생성물을 PTLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)로 정제하여 11 mg의 생성물을 수득하였다(75% 수율). 1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ 12.66 (bs, 1H), 9.45 (bs, 1H), 8.98 (s, 1H), 8.60 (bs, 1H), 8.29 (s, 1H), 8.04 (s, 1H), 8.01 - 7.88 (m, 2H), 7.62 - 7.49 (m, 1H), 7.40 (q, J = 8.0 Hz, 4H), 7.26 (t, J = 8.8 Hz, 1H), 5.15 (d, J = 3.5 Hz, 1H), 4.54 (d, J = 9.3 Hz, 1H), 4.49 - 4.31 (m, 3H), 4.22 (dd, J = 16.1, 5.6 Hz, 1H), 3.81 - 3.53 (m, 6H), 3.26 - 3.03 (m, 6H), 2.73 - 2.52 (m, 3H), 2.44 (s, 3H), 2.42 - 2.33 (m, 1H), 2.09 - 1.98 (m, 1H), 1.95 - 1.84 (m, 1H), 1.74 (q, J = 7.5 Hz, 2H), 0.96 (t, 3H), 0.94 (s, 9H). 13C NMR (126 MHz, dmso) δ 180.45, 172.02, 171.35, 170.07, 169.64, 156.00 (dd, J = 245.9, 6.5 Hz), 152.34 (dd, J = 249.7, 8.3 Hz), 151.52, 147.75, 144.70, 144.30, 139.55, 138.08, 137.91, 131.22, 129.66, 128.69, 128.53 (d, J = 2.4 Hz), 127.46, 121.96 (d, J = 14.1 Hz), 118.61 - 117.82 (m), 117.60, 115.44, 115.20, 112.32 (dd, J = 23.0, 3.3 Hz), 68.95, 58.78, 56.50, 56.39, 53.46, 50.25, 50.13, 44.76, 41.69, 41.17, 37.99, 35.43, 30.18, 28.05, 26.44, 16.89, 16.00, 12.67. 　 LC-MS (ESI); m/z [M+H]+: Calcd. for C47H56F2N9O8S2, 976.3661. Found 976.3712.
화합물 220의 예시적인 합성: N 1 -(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)-N 4 -((S)-1-((2S,4R)-4-하이드록시-2-((4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)카바모일)피롤리딘-1-일)-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일)석신아미드.
화합물 218 합성으로부터의 생성물의 용액 [(2S,4R)-1-((S)-2-(5-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)피페라진-1-일)-5-옥소펜탄아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드]; DMF(1 ml) 중 4-((4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)-벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)아미노)-4-옥소부탄산(15 mg, 0.03 mmol) 및 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸- 부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드;염화수소(13.51 mg, 0.03 mmol)에 TEA(0.1 ml, 0.72 mmol) 및 PyBOP(15.05 mg, 0.03 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 동일한 온도에서 4시간 동안 교반하였다. TLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)는 출발 물질이 없음을 나타낸다. 반응 혼합물을 고진공 하에서 건조될 때까지 증발시켰다. 용리액으로 DCM:MeOH(9:1)를 사용하는 실리카-카보네이트 카트리지(100 mg) 상에서 미정제 생성물을 여과하였다. 여과물을 진공 중에서 증발시키고 미정제 생성물을 PTLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)로 정제하여 8 mg의 생성물을 수득하였다(31% 수율). 1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ 12.97 (bs, 1H), 10.11 (s, 1H), 9.79 (bs, 1H), 8.98 (d, J = 2.3 Hz, 0H), 8.69 (s, 1H), 8.66 - 8.49 (m, 2H), 8.23 (s, 1H), 8.02 (d, J = 9.0 Hz, 1H), 7.84 - 7.64 (m, 4H), 7.63 - 7.53 (m, 1H), 7.51 - 7.33 (m, 4H), 7.29 (t, J = 8.4 Hz, 1H), 5.17 (s, 1H), 4.56 (d, J = 7.8 Hz, 1H), 4.50 - 4.39 (m, 2H), 4.40 - 4.31 (m, 1H), 4.26 - 4.16 (m, 1H), 3.66 (q, J = 10.1 Hz, 2H), 3.19 - 3.06 (m, 2H), 2.72 - 2.52 (m, 4H), 2.44 (s, 3H), 2.12 - 1.97 (m, 1H), 1.96 - 1.84 (m, 1H), 1.74 (dq, J = 13.2, 8.3, 7.3 Hz, 2H), 0.96 (t, 3H), 0.95 (s, 9H).　13C NMR (126 MHz, dmso) δ 180.66, 172.02, 171.24, 170.67, 169.64, 156.05 (dd, J = 246.9, 7.0 Hz), 152.37 (dd, J = 249.3, 8.1 Hz), 151.49, 148.66, 147.75, 143.82, 139.53, 139.00, 138.70, 132.54, 131.27,　　131.22, 129.68, 129.22 - 128.38 (m),　　128.69, 127.47, 127.39, 126.53, 121.99 (dd, J = 12.9, 4.5 Hz), 119.59, 118.72 - 117.87 (m), 117.57, 115.68, 112.90 - 112.05 (m), 68.95, 58.79, 56.56, 56.41, 53.51, 41.71, 37.98, 35.45, 31.98, 30.14, 26.43, 16.88, 15.99, 12.65. LC-MS (ESI); m/z [M+H]+: Calcd. for C49H53F2N8O8S2, 983.3395. Found 983.3569.
화합물 221의 예시적인 합성: N1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)-N3-((S)-1-((2S,4R)-4-하이드록시-2-((4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)카바모일)피롤리딘-1-일)-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일)마론아미드.
DMF(1 ml) 중 3-((4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)-벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)아미노-3-옥소프로판산(16.8 mg, 0.03 mmol) 및 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸- 부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드; 염화수소(15.5 mg, 0.033 mmol) 용액에 TEA(0.1 ml, 0.72 mmol) 및 PyBOP(17.28 mg, 0.033 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 동일한 온도에서 12시간 동안(밤새) 교반하였다. TLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)는 출발 물질이 없음을 나타낸다. 반응 혼합물을 고진공 하에서 건조될 때까지 증발시켰다. 용리액으로 DCM:MeOH(9:1)를 사용하는 실리카-카보네이트 카트리지(100 mg) 상에서 미정제 생성물을 여과하였다. 여과물을 진공 중에서 증발시키고 미정제 생성물을 PTLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)로 정제하여 19.5 mg의 생성물을 수득하였다(67% 수율). 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 12.96 (bs, 1H), 10.23 (s, 1H), 9.75 (bs, 1H), 8.97 (s, 1H), 8.69 (s, 1H), 8.66 - 8.51 (m, 2H), 8.26 (d, J = 9.1 Hz, 1H), 8.22 (s, 1H), 7.73 (dd, J = 8.5 Hz, 4H), 7.59 (q, J = 8.6 Hz, 1H), 7.41 (dd, J = 8.0 Hz, 4H), 7.28 (t, J = 8.7 Hz, 1H), 5.16 (d, 1H), 4.59 (d, J = 9.2 Hz, 1H), 4.52 - 4.33 (m, 3H), 4.24 (dd, J = 15.7, 5.0 Hz, 1H), 3.68 (q, J = 10.6 Hz, 2H), 3.44 (q, 2H), 3.20 - 3.05 (m, 2H), 2.45 (s, 3H), 2.10 - 2.01 (m, 1H), 1.96 - 1.89 (m, 1H), 1.74 (dq, J = 14.8, 7.3 Hz, 2H), 0.98 (s, 9H), 0.97 (t, J = 8.3 Hz, 3H).　 13C　　NMR (101 MHz, dmso) δ 180.62, 171.91, 169.34, 166.16, 166.03, 156.02 (dd, J = 246.8, 7.1 Hz), 152.34 (dd, J = 249.4, 8.1 Hz), 151.43, 148.69, 147.73, 143.79, 139.50, 138.69, 138.54, 132.98, 131.17, 131.13, 129.68, 129.11 - 128.65 (m), 128.67, 128.01, 127.45, 126.53, 122.21 - 121.73 (m), 119.70, 118.63 - 117.89 (m), 117.54, 115.66, 112.35 (dd, J = 23.5, 3.0 Hz), 68.93, 58.79, 56.66, 56.52, 53.49, 44.32, 41.70, 37.97, 35.60, 26.33, 16.85, 15.96, 12.62. LC-MS (ESI); m/z [M+H]+: Calcd. for C48H51F2N8O8S2, 969.3239. Found 969.3272.
화합물 222의 예시적인 합성: (2S,4R)-1-((S)-2-(3-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)피페라진-1-일)-3-옥소프로판아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드.
DMF(1 ml) 중 3-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)-벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)피페라진-1-일)-3-옥소프로판산(12.5 mg, 0.02 mmol) 및 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸- 부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드; 염화수소(11.69 mg, 0.03 mmol) 용액에 TEA(0.1 ml, 0.72 mmol) 및 PyBOP(13.02 mg, 0.03 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 동일한 온도에서 12시간 동안(밤새) 교반하였다. TLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)는 출발 물질이 없음을 나타낸다. 반응 혼합물을 건조될 때까지 증발시켰다. 용리액으로 DCM:MeOH(9:1)를 사용하는 실리카-카보네이트 카트리지(100 mg) 상에서 미정제 생성물을 여과하였다. 여과물을 진공 중에서 증발시키고 미정제 생성물을 PTLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)로 정제하여 14.1 mg의 생성물을 수득하였다(64% 수율). 1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ 12.71 (bs, 1H), 9.74 (bs, 1H), 8.98 (s, 1H), 8.59 (t, J = 5.7 Hz, 1H), 8.29 (s, 1H), 8.26 (d, J = 9.1 Hz, 1H), 8.03 (s, 1H), 7.96 (bs, 1H), 7.57 (q, J = 7.4, 6.3 Hz, 1H), 7.41 (dd, J = 8.0 Hz, 4H), 7.26 (t, J = 8.7 Hz, 1H), 5.22 - 5.05 (m, 1H), 4.58 (d, J = 9.3 Hz, 1H), 4.51 - 4.32 (m, 3H), 4.23 (dd, J = 15.8, 5.3 Hz, 1H), 3.67 (q, J = 12.3, 10.6 Hz, 8H), 3.52 (dd, J = 53.7, 15.5 Hz, 2H), 3.27 - 3.05 (m, 6H), 2.45 (s, 3H), 2.09 - 2.00 (m, 1H), 1.96 - 1.86 (m, 1H), 1.74 (h, J = 7.3 Hz, 2H), 0.97 (s, 9H)., 0.96 (t, 3H). 13C NMR (101 MHz, dmso) δ 180.41, 171.91, 169.38, 166.32, 166.06, 156.01 (dd, J = 246.5, 6.7 Hz), 152.34 (dd, J = 249.2, 8.3 Hz), 151.44, 147.73, 144.60, 144.28, 139.50, 138.06, 137.84, 131.17, 129.66, 128.75 (d, J = 8.0 Hz), 128.65, 127.43, 121.86 (dd, J = 13.5, 3.5 Hz), 118.34 (m), 117.58, 115.42, 115.18, 112.28 (dd, J = 23.1, 3.5 Hz), 68.89, 58.75, 56.54, 56.43, 53.49, 50.10, 45.56, 41.68, 41.19, 40.95, 37.95, 35.52, 26.36, 16.85, 15.96, 12.62. LC-MS (ESI); m/z [M+H]+: Calcd. for C46H54F2N9O8S2, 962.3504. Found 962.3694.
화합물 301의 예시적인 합성: (2S,4R)-1-((S)-2-(4-(4-(3-(3-부틸아미도-2,6-디플루오로벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)부탄아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드.
DMF(2 ml) 중 4-(4-(3-(3-부틸아미도-2,6-디플루오로벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)-페녹시)부탄산(27 mg, 0.05 mmol) 및 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸- 부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드; 염화수소(26.6 mg, 0.06 mmol) 용액에 TEA(0.1 ml, 0.72 mmol) 및 PyBOP(29.64 mg, 0.06 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 동일한 온도에서 4시간 동안 교반하였다. TLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)는 출발 물질이 없음을 나타낸다. DMF를 고진공 중에서 제거하였다. 용리액으로 DCM:MeOH(9:1)를 사용하는 실리카-카보네이트 카트리지 상에서 미정제 생성물을 여과하였다. 여과물을 진공 중에서 증발시키고 미정제 생성물을 PTLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)로 정제하여 37 mg의 생성물을 수득하였다(76% 수율). 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 12.91 (bs, 1H), 9.79 (s, 1H), 8.97 (s, 1H), 8.65 (d, J = 2.2 Hz, 1H), 8.62 - 8.47 (m, 2H), 8.15 (s, 1H), 8.06 - 7.89 (m, 2H), 7.67 (d, J = 8.7 Hz, 2H), 7.40 (dd, J = 8.3 Hz, 4H), 7.23 (t, J = 8.8 Hz, 1H), 7.07 (d, J = 8.8 Hz, 2H), 5.14 (d, J = 3.5 Hz, 1H), 4.58 (d, J = 9.3 Hz, 1H), 4.49 - 4.40 (m, 2H), 4.37 (bs, 1H), 4.22 (dd, J = 15.9, 5.4 Hz, 1H), 4.03 (t, J = 7.2 Hz, 2H), 3.77 - 3.62 (m, 2H), 2.44 (s, 3H), 2.43 - 2.30 (m, 4H), 2.09 - 1.87 (m, 4H), 1.61 (h, J = 7.4 Hz, 2H), 0.96 (s, 9H), 0.92 (t, J = 7.4 Hz, 3H).　13C NMR (151 MHz, dmso) δ 180.92, 171.97, 171.67, 171.61, 169.68, 158.33, 154.61 (dd, J = 244.6, 7.1 Hz), 151.44, 150.34 (dd, J = 248.8, 8.2 Hz), 148.52, 147.72, 143.71, 139.52, 138.48, 131.32, 131.17, 130.42, 129.64, 128.65, 128.28, 127.43, 126.50, 126.06 (d, J = 10.1 Hz), 123.23 (dd, J = 12.4, 3.6 Hz), 118.47 - 117.44 (m), 117.55, 115.65, 115.18, 111.60 (d, J = 25.0 Hz), 68.92, 67.13, 58.74, 56.48, 56.42, 41.67, 37.99, 37.57, 35.26, 31.32, 26.41, 25.07, 18.56, 15.96, 13.57. LC-MS (ESI); m/z [M+H]+: Calcd. for C50H54F2N7O7S, 934.3773. Found 934.2690.
화합물 302의 예시적인 합성: (2S,4R)-1-((S)-2-(4-(4-(3-(3-아미노-2,6-디플루오로벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)부탄아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4- 하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드.
DMF(2 ml) 중 4-(4-(3-(3-아미노-2,6-디플루오로벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)-페녹시)부탄산(11.5 mg, 0.03 mmol) 및 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸- 부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드; 염화수소(23.79 mg, 0.05 mmol) 용액에 TEA(0.1 ml, 0.72 mmol) 및 PyBOP(14.58 mg, 0.03 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 동일한 온도에서 4시간 동안 교반하였다. TLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)는 출발 물질이 없음을 나타낸다. DMF를 고진공 중에서 제거하였다. 용리액으로 DCM:MeOH(9:1)를 사용하는 실리카-카보네이트 카트리지(1 g) 상에서 미정제 생성물을 여과하였다. 여과물을 진공 중에서 증발시키고 미정제 생성물을 PTLC(MeOH:DCM, 9:1)로 정제하여 17.5 mg의 생성물을 수득하였다(80% 수율). 1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ 12.68 (bs, 1H), 8.97 (s, 1H), 8.64 (d, J = 2.2 Hz, 1H), 8.61 - 8.47 (m, 2H), 8.06 (s, 1H), 8.00 (d, J = 9.3 Hz, 1H), 7.65 (d, J = 8.6 Hz, 2H), 7.40 (dd, 4H), 7.07 (d, J = 8.7 Hz, 2H), 6.99 - 6.82 (m, 2H), 5.21 (s, 2H), 5.15 (d, J = 3.6 Hz, 1H), 4.58 (d, J = 9.3 Hz, 1H), 4.50 - 4.40 (m, 2H), 4.37 (bs, 1H), 4.23 (dd, J = 15.8, 5.3 Hz, 1H), 4.10 - 3.93 (m, 2H), 3.78 - 3.54 (m, 2H), 2.58 - 2.26 (m, 2H), 2.44 (s, 3H),　　2.11 - 1.82 (m, 4H), 0.94 (s, 9H). 13C NMR (126 MHz, dmso) δ 182.20, 171.97, 171.63, 169.69, 158.31, 151.43,149.20 (dd, J = 234.8, 6.5 Hz), 148.45, 147.72, 146.01 (dd, J = 241.2, 7.9 Hz), 143.55, 139.51, 137.92, 133.42 (dd, J = 12.9, 2.4 Hz), 131.18, 130.49, 129.65, 128.65, 128.24, 127.44, 126.47, 118.32 - 117.22 (m), 117.57, 116.91 - 116.23 (m), 115.84, 115.19, 111.36 (dd, J = 22.3, 2.9 Hz), 68.92, 67.14, 58.74, 56.50, 56.41, 41.68, 37.97, 35.25, 31.33, 26.41, 25.07, 15.95. LC-MS (ESI); m/z [M+H]+: Calcd. for C46H48F2N7O6S, 864.3354. Found 864.3437.
화합물 303의 예시적인 합성: (2S,4R)-1-((S)-2-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)부탄아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드.
DMF(2 ml) 중 4-(4-(3-(2,6-디플루오로벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)-페녹시)부탄산(19.4 mg, 0.04 mmol) 및 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸- 부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드; 염화수소(20.76 mg, 0.04 mmol) 용액에 TEA(0.1 ml, 0.72 mmol) 및 PyBOP(25.45 mg, 0.05 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 동일한 온도에서 4시간 동안 교반하였다. TLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)는 출발 물질이 없음을 나타낸다. DMF를 고진공 중에서 제거하였다. 용리액으로 DCM:MeOH(9:1)를 사용하는 실리카-카보네이트 카트리지(1 g) 상에서 미정제 생성물을 여과하였다. 여과물을 진공 중에서 증발시키고 미정제 생성물을 PTLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)로 정제하여 29 mg의 생성물을 수득하였다(77% 수율). 1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ 12.89 (bs, 1H), 8.97 (s, 1H), 8.65 (d, J = 1.9 Hz, 1H), 8.62 - 8.54 (m, 2H), 8.13 (s, 1H), 8.00 (d, J = 9.3 Hz, 1H), 7.75 - 7.55 (m, 3H), 7.43 (d, J = 8.1 Hz, 3H), 7.38 (d, J = 8.1 Hz, 2H), 7.28 (t, J = 7.9 Hz, 2H), 7.07 (d, J = 8.6 Hz, 2H), 5.15 (d, J = 3.3 Hz, 1H), 4.59 (d, J = 9.3 Hz, 1H), 4.49 - 4.40 (m, 2H), 4.39 - 4.33 (m, 1H), 4.23 (dd, J = 15.9, 5.4 Hz, 1H), 4.09 - 3.97 (m, 2H), 3.77 - 3.61 (m, 2H), 1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ 2.48 - 2.31 (m, 2H),　　2.44 (s, 3H), 2.11 - 1.86 (m, 4H), 0.96 (s, 9H).　 13C NMR (151 MHz, dmso) δ 181.30, 171.97, 171.61, 169.68, 158.80 (dd, J = 247.2, 7.9 Hz), 158.33, 151.44, 148.52, 147.72, 143.70, 139.51, 138.38, 132.14 (t, J = 9.9 Hz), 131.30, 131.17, 130.44, 129.64, 128.64, 128.27, 127.43, 126.48, 117.76 (t, J = 23.3 Hz), 117.54, 115.78, 115.18, 112.29 (dd, J = 21.0, 4.2 Hz), 68.92, 67.13, 58.74, 56.48, 56.42, 41.67, 37.98, 35.26, 31.32, 26.41, 25.06, 15.96. LC-MS (ESI); m/z [M+H]+: Calcd. for C46H47F2N6O6S, 849.3245. Found 849.3378.
화합물 304의 예시적인 합성: (2S,4R)-1-((S)-2-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)피페라진-1-일)부탄아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드.
DMF(1 ml) 중 4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-(프로필설포닐-아미노)-벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]피페라진-1-일]부탄산(7.9 mg, 0.01 mmol) 및 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸- 부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드; 염화수소(7.38 mg, 0.02 mmol) 용액에 TEA (0.1 ml, 0.72 mmol) 및 PyBOP(8.23 mg, 0.02 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 동일한 온도에서 12시간 동안(밤새) 교반하였다. TLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)는 출발 물질이 없음을 나타낸다. 반응 혼합물을 건조될 때까지 증발시켰다. 용리액으로 DCM:MeOH(9:1)를 사용하는 실리카-카보네이트 카트리지(1 g) 상에서 미정제 생성물을 여과하였다(수회 세척하였고, 생성물은 정지상에 대해 높은 친화성을 가짐). 여과물을 진공 중에서 증발시키고 미정제 생성물을 PTLC(DCM:MeOH, 9:1)로 정제하여 7.2 mg의 생성물을 수득하였다(52% 수율). 1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ 12.66 (bs, 1H), 9.73 (bs, 1H), 8.96 (s, 1H), 8.61 - 8.50 (m, 1H), 8.25 (s, 1H), 8.00 (s, 1H), 7.93 (bs, 1H), 7.88 (d, J = 9.1 Hz, 1H), 7.63 - 7.49 (m, 1H), 7.40 (dd, 4H), 7.25 (t, J = 8.7 Hz, 1H), 5.14 (s, 1H), 4.56 (d, J = 9.1 Hz, 1H), 4.46 - 4.34 (m, 3H), 4.22 (dd, J = 15.8, 4.7 Hz, 1H), 3.75 - 3.60 (m, 2H), 3.23 - 3.14 (m, 4H), 3.13 - 3.08 (m, 2H), 2.65 - 2.53 (m, 4H), 2.43 (s, 3H), 2.38 - 2.31 (m, 2H), 2.31 - 2.25 (m, 1H), 2.24 - 2.16 (m, 1H), 2.07 - 1.99 (m, 1H), 1.95 - 1.87 (m, 1H), 1.72 (dq, J = 16.3, 10.5, 8.9 Hz, 4H), 0.95 (t, J = 5.3 Hz, 3H), 0.95 (s, 9H).　13C NMR (151 MHz, DMSO-d6) δ 180.77 , 172.43 , 172.39 , 170.12 , 156.38 (dd, J = 246.2, 7.1 Hz), 152.75 (dd, J = 249.8, 9.0 Hz), 151.87 , 148.13 , 145.23 , 144.35 , 139.92 , 138.09 , 137.78 , 131.59 , 130.05 ,　　129.21 - 128.76 (m),　　127.84 , 122.32 (d, J = 13.1 Hz), 119.83 - 118.25 (m), 118.03 , 115.53 , 114.96 , 112.68 (d, J = 22.7 Hz), 69.30 , 59.13 , 57.62 , 56.79 , 55.33 , 53.88 , 53.06 , 50.11 , 42.07 , 38.38 , 35.68 , 33.27 , 26.83 , 23.09 , 17.26 , 16.37 , 13.04. 　 LC-MS (ESI); m/z [M+H]+: Calcd. for C47H58F2N9O7S2, 962.3868. Found 962.3986.
화합물 305의 예시적인 합성: (2S,4R)-1-((S)-2-(4-(4-(3-벤조일-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)-페녹시)부탄아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드.
DMF(2 ml) 중 4-[4-(3-벤조일-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)-페녹시]부탄산(26.5 mg, 0.07 mmol) 및 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸- 부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드; 염화수소(30.91 mg, 0.07 mmol) 용액에 TEA (0.2 ml, 1.43 mmol) 및 PyBOP(37.88 mg, 0.07 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 동일한 온도에서 12시간 동안(밤새) 교반하였다. TLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)는 출발 물질이 없음을 나타낸다. DMF를 고진공 중에서 제거하였다. 용리액으로 DCM:MeOH(9:1)를 사용하는 실리카-카보네이트 카트리지(1 g) 상에서 미정제 생성물을 여과하였다. 여과물을 진공 중에서 증발시키고 미정제 생성물을 PTLC(MeOH:DCM, 9:1)로 정제하여 31 mg의 생성물을 수득하였다(58% 수율). 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 12.70 (s, 1H), 8.97 (s, 1H), 8.68 (d, J = 2.2 Hz, 1H), 8.62 (d, J = 2.3 Hz, 1H), 8.60 - 8.51 (m, 1H), 8.12 (s, 1H), 8.00 (d, J = 9.3 Hz, 1H), 7.90 - 7.77 (m, 1H), 7.72 - 7.51 (m, 5H), 7.48 - 7.29 (m, 4H), 7.07 (d, J = 8.7 Hz, 2H), 5.15 (d, J = 3.5 Hz, 1H), 4.59 (d, J = 9.3 Hz, 1H), 4.50 - 4.32 (m, 3H), 4.22 (dd, J = 15.9, 5.4 Hz, 1H), 4.03 (td, J = 6.5, 2.6 Hz, 2H), 3.80 - 3.60 (m, 2H), 2.44 (s, 3H), 2.48 - 2.28 (m, 5H), 2.13 - 1.84 (m, 4H), 0.96 (s, 9H).　13C NMR (101 MHz, dmso) δ 189.87, 172.00, 171.63, 169.69, 158.23, 151.48, 148.29, 147.73, 143.29, 139.64, 139.53, 136.54, 131.52, 131.19, 130.74, 129.65, 128.66, 128.58, 128.55, 128.21, 127.44, 127.05, 118.81, 115.19, 113.74, 68.93, 67.13, 58.75, 56.47, 48.64, 41.68, 38.01, 35.29, 31.33, 26.43, 25.08, 15.99.　LC-MS (ESI); m/z [M+H]+: Calcd. for C46H49N6O6S, 813.3434. Found 813.3478.
화합물 306의 예시적인 합성: (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(2-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(프로필설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)피페라진-1-일)에톡시)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드.
DMF(1 ml) 중 2-[2-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-(프로필-설포닐아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]피페라진-1-일]에톡시]아세트산(7.9 mg, 0.01 mmol) 및 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸- 부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드; 염화수소(7.18 mg, 0.02 mmol) 용액에 TEA(0.1 ml, 0.72 mmol) 및 PyBOP(8 mg, 0.02 mmol)를 실온에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 동일한 온도에서 12시간 동안(밤새) 교반하였다. TLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)는 출발 물질이 없음을 나타낸다. 반응 혼합물을 고진공 하에서 건조될 때까지 증발시켰다. 미정제 생성물을 진공 중에서 증발시키고 미정제 생성물을 PTLC(DCM:MeOH:NH4OH, 90:9:1)로 정제하여 8.1 mg의 생성물을 수득하였다(59% 수율). 1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ 12.66 (bs, 1H), 9.72 (bs, 1H), 8.93 (s, 1H), 8.59 (bs, 1H), 8.22 (s, 1H), 7.99 (s, 1H), 7.89 (bs, 1H), 7.56 (dh, J = 9.1, 3.4, 2.9 Hz, 1H), 7.51 - 7.31 (m, 5H), 7.25 (t, J = 8.6 Hz, 1H), 5.17 (s, 1H), 4.57 (dd, J = 9.7, 2.4 Hz, 1H), 4.50 - 4.33 (m, 3H), 4.28 - 4.19 (m, 1H), 4.07 - 3.92 (m, 2H), 3.65 (d, J = 15.4 Hz, 4H), 3.22 - 3.05 (m, 6H), 2.64 (d, J = 21.6 Hz, 6H), 2.42 (s, 3H), 2.11 - 2.03 (m, 1H), 1.91 (dd, J = 13.3, 5.8 Hz, 1H), 1.80 - 1.67 (m, 2H), 0.96 (s/t 중첩, 12H).　13C NMR (151 MHz, DMSO-d6) δ 180.38 , 171.80 , 169.18 , 168.58 , 156.01 (dd, J = 246.2, 6.8 Hz), 152.34 (dd, J = 249.1, 8.7 Hz), 151.39 , 147.73 , 144.79 , 143.97 , 139.43 , 137.73 , 137.38 , 131.16 , 129.70 , 128.68 , 128.60 (d), 127.47 , 121.93 (dd, J = 13.8, 3.7 Hz), 118.89 - 118.05 (m), 117.64 , 115.15 , 114.62 , 112.29 (dd, J = 22.2, 3.2 Hz), 69.65 , 68.94 , 68.76 , 58.81 , 57.13 , 56.64 , 55.73 , 53.49 , 53.09 , 49.72 , 41.71 , 37.93 , 35.87 , 26.24 , 16.88 , 15.95 , 12.65.　 LC-MS (ESI); m/z [M+H]+: Calcd. for C47H58F2N9O8S2, 978.3817. Found 978.3933.
(R)-N-(2,4-디플루오로-3-(5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-1-((2-(트리메틸실릴)에톡시)메틸)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)페닐)-3-플루오로-N-((2-(트리메틸실릴)에톡시)메틸)피롤리딘-1-설폰아미드 (중간체 6)의 예시적인 합성
단계 1: 2,6-디플루오로-3-니트로벤조일 클로라이드의 제조
500 mL 둥근바닥 플라스크에 2,6-디플루오로-3-니트로벤조산(30.0 g, 147.6 mmol, 1.0당량), 톨루엔 (160 mL), 염화 티오닐(160 mL)을 넣었다. 생성된 혼합물을 80℃에서 밤새 교반하고 감압 하에서 농축시켰다. 이를 통해 28.2 g(86%)의 2,6-디플루오로-3-니트로벤조일 염화물을 갈색 오일로서 수득하였다.
단계 2: 5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3일)(2,6-디플루오로-3-니트로페닐)메타논의 제조
300 mL의 클로로메탄 중 5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘(22.0 g, 111.6 mmol, 1.1당량)의 혼합물을 알루미늄 트리클로라이드(84.0 g, 0.64 mol, 6.4당량)으로 충진하였다. 반응물을 실온에서 1시간 동안 교반하고, 2,6-디플루오로-3-니트로벤조일 염화물(22.0 g, 100.0 mmol, 1.0당량)을 첨가하였다. 반응물을 50℃에서 밤새 가열한 후, 반응 혼합물을 실온으로 냉각시키고 얼음물(500 mL)에 붓고, 에틸 아세테이트(500 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(500 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시켰다. 용매를 농축시켜 (5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)(2,6-디플루오로-3-니트로페닐) 메타논(24.4 g)을 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 381.30 [M+1] +.
단계 3: (3-아미노-2,6-디플루오로페닐)(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)메타논의 제조
에탄올(80 mL) 및 테트라하이드로푸란(80 mL) 중 (5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)(2,6-디플루오로-3-니트로페닐)메타논（15.8 g, 40.8 mmol, 1.0당량), 철(12.0 g, 200.2 mmol, 4.9당량), 염화 암모늄(7.2 g , 140.0 mmol), 염산(50.0 mL)의 혼합물을 밤새 환류시켰다. 실온으로 냉각시킨 후, 혼합물을 셀라이트 패드를 통해 여과하였다. 여과물을 진공 중에서 농축시키고, 잔류물을 실리카 겔 상 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르/에틸 아세테이트 = 1/2)로 정제하여 (3-아미노-2,6-디플루오로페닐)(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)메타논(8.6 g, 60% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 351.80 [M+1] +.
단계 4: (R)-3-플루오로피롤리딘-1-설포닐 염화물의 제조
오븐 건조된 플라스크를 (R)-3-플루오로피롤리딘 염화수소(3.0 g, 24 mmol). 트리에틸아민(7.2 g, 72 mmol) 및 디클로로메탄(150 mL)으로 채웠다. 혼합물을 실온에서 15분 동안 교반한 다음, 드라이아이스/아세토니트릴 수조에서 10분 동안 약 -30℃까지 냉각시켰다. 설퍼릴 클로라이드(6.0 g, 48 mmol)를 10분에 걸쳐 적가하였다. 반응 혼합물을 약 -30℃에서 1시간 동안 교반한 다음, 실온에서 5시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 수용성 HCl(1 N, 70 mL)로 희석시켰다. 층을 분리시키고 수성층을 디클로로메탄(50 mL x 3)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 수용성 HCl(1 N, 50 mL) 및 염수(50 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시켰다. 용매를 농축시켜 (R)-3-플루오로피롤리딘-1-설포닐 염화물(4.5g)을 백색 고체로서 수득하였다.
단계 5: (R)-N-(3-(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드의 제조
피리딘(25.0 g) 중 (3-아미노-2,6-디플루오로페닐)(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)메타논(8.0 g, 22.79 mmol, 1.0당량) 용액에 (R)-3-플루오로피롤리딘-1-설포닐 염화물(4.6 g, 24.60 mmol, 1.08당량) 및 4-디메틸아미노피리딘(560.0 mg, 4.59 mmol, 0.2당량)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 40℃에서 12시간 동안 교반하였다. 용매를 제거하고 물(20 mL)을 첨가하였다. 수성 중탄산 나트륨을 첨가하여 pH=7~8로 조정하고, 에틸 아세테이트(100 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(50 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시켰다. 용매를 진공 중에서제거하고 잔류물을 실리카 겔 상 컬럼 크로마토그래피(에틸 아세테이트/석유 에테르(3:1))로 정제하여 (R)-N-(3-(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드(6.4 g)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 505.05 [M+1] +.
단계 6: (R)-N-(3-(5-브로모-1-((2-(트리메틸실릴)에톡시)메틸)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로-N-((2-(트리메틸실릴)에톡시)메틸)피롤리딘-1-설폰아미드의 제조
디메틸포름아미드(70 mL) 중 (3R)-N-[3-(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로-페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드(5.82 g, 11.56 mmol, 1당량)의 혼합물에 수소화 나트륨(925 mg, 23.13 mmol, 미네랄 오일 중 순도 60%, 2당량)을 0℃에서 나누어서 첨가하였다. 그런 다음, 혼합물을 0~20℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 이어서, 2-(트리메틸실릴)에톡시메틸 클로라이드(4.24 g, 25.44 mmol, 4.5 mL, 2.2당량)을 20℃에서 혼합물에 적가하였다. 혼합물을 50℃에서 1.5시간 동안 교반하였다. 물(150 mL)을 혼합물에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(100 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수로 세척하고(100 mL x 2), 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르/ 에틸 아세테이트=100/1, 10/1)로 정제하였다. 생성물 (3R)-N-[3-[5-브로모-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로-페닐]-3-플루오로-N-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤리딘-1-설폰아미드(5.01 g, 6.51 mmol, 56% 수율, 99% 순도)를 연황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 765.0 [M+1] +.
단계 7: (R)-N-(2,4-디플루오로-3-(5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-1-((2-(트리메틸실릴)에톡시)메틸)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)페닐)-3-플루오로-N-((2-(트리메틸실릴)에톡시)메틸)피롤리딘-1-설폰아미드의 제조
디옥산(7 mL) 중 4,4,5,5-테트라메틸-2-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-1,3,2-디옥사보로란 (349 mg, 1.37 mmol, 1.05당량) 및 (3R)-N-[3-[5-브로모-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로-페닐]-3-플루오로-N-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤리딘-1-설폰아미드(1 g, 1.31 mmol, 1당량)의 혼합물에 아세트산칼륨(256.97 mg, 2.62 mmol, 2당량) 및 [1,1'-비스(디페닐포스피노)] 페로센 디클로로팔라듐(II) (96 mg, 0.13 mmol, 0.1당량)을 질소 대기 하에 15℃에서 일회분으로 첨가하였다. 혼합물을 85℃에서 12시간 동안 교반하였다. 물(50 mL)을 혼합물에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(50 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수로 세척하고(50 mL x 2), 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르/ 에틸 아세테이트=20/1, 3/1)로 정제하였다. 생성물 (3R)-N-[2,4-디플루오로-3-[5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸) 피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]페닐]-3-플루오로-N-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤리딘-1-설폰아미드(1.02 g, 1.22 mmol, 93% 수율, 96% 순도)를 무색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 811.1 [M+1] +.
(2S,4R)-1-((S)-2-아미노-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 클로라이드(중간체 7)의 예시적인 합성
단계 1: 삼차-부틸 (S)-(1-(4-브로모페닐)에틸)카바메이트 제조
250-mL 둥근 바닥 플라스크에, 디클로로메탄(100 mL), 트리에틸아민(10.0 g, 99.01 mmol, 2.00당량), 디-삼차-부틸 디카르보네이트(13.0 g, 59.63 mmol, 1.20당량) 중 (1S)-1-(4-브로모페닐)에탄-1-아민(10.0 g, 49.98 mmol, 1.00당량)을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 생성된 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:10)로 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 15.0 g의 삼차-부틸 N-[(1S)-1-(4-브로모페닐)에틸]카바메이트를 백색 고체로서 수득하였다.
단계 2: 삼차-부틸 (S)-(1-(4-(4-메틸티아졸-5일)페닐)에틸)카바메이트 제조
질소 불활성 분위기로 퍼지되고 유지된 250 mL 둥근 바닥 플라스크에, N,N-디메틸아세트아미드 (100 mL), 4-메틸-1,3-티아졸 (9.9g, 99.84mmol, 2.00당량), 아세트산 칼륨 (9.8g, 99.86mmol, 2.00당량), 팔라듐(II) 아세테이트 (112.5mg, 0.50mmol, 0.01당량) 중에 삼차-부틸 N-[(1S)-1-(4-브로모페닐)에틸]카바메이트(15.0 g, 49.97 mmol, 1.00당량)를 넣었다. 생성된 용액을 120℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물에 물(500 mL)의 첨가로 급냉시켰다. 생성된 용액을 에틸 아세테이트(200 mL x 3)으로 추출하고, 유기층을 조합하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:5)로 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 7.5 g(47%)의 삼차-부틸 N-[(1S)-1-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5일)페닐]에틸]카바메이트를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 319.13 [M+Na] +.
단계 3: (S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에탄-1- 아민 염화수소의 제조
100 mL 둥근 바닥 플라스크에, 메탄올(20 mL) 중 삼차-부틸 N-[(1S)-1-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5일)페닐]에틸]카바메이트(7.5 g, 23.55 mmol, 1.00당량)의 용액을 넣고, 염화수소(기체)를 실온에서 버블링하였다. 생성된 용액을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 생성된 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 이를 통해 4.4 g (86%)의 (1S)-1-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에탄-1-아민을 백색 고체로서 수득하였다.
단계 4: 삼차-부틸 (2S,4R)-4-하이드록시-2-(((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)카바모일)피롤리딘-1-카르복실레이트 제조
100 mL의 둥근 바닥 플라스크에, N,N-디메틸포름아미드(20 mL), N-에틸-N-이소프로필프로판-2-아민 (7.8 g, 60.35 mmol, 3.00당량), o-(7-아자벤조트리아졸-1-일)-N,N,N',N'-테트라메틸우로늄 헥사플루오로포스페이트(11.5g, 30.26mmol, 1.50당량), (1S)-1-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에탄-1-아민(4.4 g, 20.15 mmol, 1.00당량) 중에 (2S,4R)-1-[(삼차-부톡시카르보닐]-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복실산(4.7 g, 20.32 mmol, 1.00당량)을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물에 20 mL의 물의 첨가로 급냉시켰다. 생성된 용액을 에틸 아세테이트(100 mL x 3)로 추출하고, 유기층을 합치고 감압 하에 오븐에서 건조시키고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:1)로 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 5.0 g (57%)의 삼차-부틸 (2S,4R)-4-하이드록시-2-[[(1S)-1-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에틸]카바모일]피롤리딘-1-카르복실레이트를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 432.15 [M+1] +.
단계 5: (2S,4R)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 염화수소 제조
500-mL 둥근 바닥 플라스크에, 메탄올(200 mL) 중 삼차-부틸 (2S,4R)-4-하이드록시-2-[[(1S)-1-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에틸]카바모일]피롤리딘-1-카르복실레이트(5.0 g, 11.59 mmol, 1.00당량)의 용액을 넣고, 이어서 염화수소(기체)를 실온에서 2시간 동안 반응 혼합물 내로 버블링하였다. 생성된 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 이를 통해 3.2 g (83%)의 (2S,4R)-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드를 적색 고체로서 수득하였다.
단계 6: 삼차-부틸 ((S)-1-((2S,4R)-4-하이드록시-2-(((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)카바모일)피롤리딘-1-일)-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일)카바메이트 제조
25mL mL 둥근 바닥 플라스크에, N,N-디메틸포름아미드(30 mL), N-에틸-N-이소프로필프로판-2-아민(3.4 g, 3.00당량), o-(7-아자벤조트리아졸-1-일)-N,N,N',N'-테트라메틸우로늄 헥사플루오로포스페이트(5.0 g, 1.50당량), (2S,4R)-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카보아미드 염화수소(3.2 g, 8.70 mmol, 1.00당량) 중에 (2S)-2-[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노-3,3-디메틸부탄산(2.0 g, 8.65 mmol, 0.99당량)을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 12시간 동안 교반하였다. 생성된 용액을 에틸 아세테이트로 추출하고(60 mL x 3) 물로 세척하였다(100 mL x 2). 유기층을 합치고 건조시키고 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:3)로 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 4.0 g (84%)의 삼차-부틸 N-[(2S)-1-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-[[(1S)-1-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에틸]카바모일]피롤리딘-1-일]-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일]카바메이트를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 545.30 [M+1] +.
단계 7: (2S,4R)-1-((S)-2-아미노-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 염화수소의 제조
100mL 둥근 바닥 플라스크에, 메탄올(30 mL) 중 삼차-부틸 N-[(2S)-1-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-[[(1S)-1-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에틸]카바모일]피롤리딘-1-일]-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일]카바메이트(4.0 g, 7.34 mmol, 1.00 equiv)의 용액을 넣고, 이어서 염화수소(기체)를 실온에서 2시간 동안 반응 혼합물 내로 버블링하였다. 생성된 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 이를 통해 3.5 g의 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 염화수소를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 445.05 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 8.99 (s, 1 H), 8.57-8.55 (d, J = 7.8 Hz, 1 H), 8.01 (b, 3 H), 7.46-7.43 (d, J = 8.4 Hz, 2 H), 7.39-7.37 (d, J = 8.4 Hz, 2 H), 4.98-4.90 (m, 1 H), 4.57-4.51 (m, 1 H), 4.34 (b, 1 H), 3.94-3.92 (m, 1 H), 3.69-3.66 (m, 1 H), 3.53-3.49 (m, 1 H), 2.52 (s, 3 H), 2.10-2.07 (m, 1 H), 1.83-1.81 (m, 1 H), 1.40-1.30 (m, 3 H), 1.03 (s, 9 H).
N-(2-메틸-5'-모르폴리노-6'-(피페리딘-4-일옥시)-[3,3'-비피리딘]-5-일)-3-(트리플루오로메틸)벤즈아미드 염화수소(중간체 8)의 예시적인 합성
단계 1: 4-(5-브로모-2-플루오로피리딘-3일)모르폴린의 제조
디메틸 포름아미드(40 mL) 중 5-브로모-2-플루오로-피리딘-3-아민(4 g, 20.94 mmol, 1당량)의 혼합물에 수소화 나트륨(2.51 g, 62.83 mmol, 미네랄 오일 중 60%, 3당량)을 0℃에서 첨가하였다. 혼합물을 25℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 그런 다음 1-브로모-2-(2-브로모에톡시) 에탄(7.29 g, 31.41 mmol, 3.94 mL, 1.5당량)을 혼합물에 첨가하였다. 혼합물을 80℃에서 1.5시간 동안 교반하였다. 혼합물을 물(200 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(70 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 물(100 mL x 2), 염수(100 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨 위에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르: 에틸 아세테이트 = 15:1 내지 8:1)로 정제하였다. 화합물 4-(5-브로모-2-플루오로-3-피리딜)모르폴린(3.4 g, 13.02 mmol, 62% 수율)을 연녹색 고체로서 수득하였다. 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ7.80-7.79 (m, 1H), 7.33-7.30 (m, 1H), 3.87-3.82 (m, 4H), 3.13-3.08 (m, 4H).
단계 2: 4-(2-플루오로-5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)피리딘-3-일)모르폴린의 제조
디옥산(25 mL) 중 4-(5-브로모-2-플루오로-3-피리딜)모르폴린(2.0 g, 7.66 mmol, 1당량) 및 4,4,5,5-테트라메틸-2-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-1,3,2-디옥사보로란(2.92 g, 11.49 mmol, 1.5당량)의 혼합물에 아세트산 칼륨(2.26 g, 22.98 mmol, 3당량)과 1,1'-비스(디페닐포스피노)페로센-팔라듐(ii)디클로라이드 디클로로메탄 착물(625 mg, 0.76 mmol, 0.1당량)을 첨가하였다. 혼합물을 탈기하고 질소로 3회 재충진하고 질소 대기 하에 100℃에서 2시간 동안 교반하였다. 혼합물을 여과하고 감압 하에 농축시켜 미정제 생성물을 수득하였다. 미정제 생성물은 추가 정제 없이 다음 단계에 사용되었다. 미정제 생성물 4-[2-플루오로-5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-3-피리딜]모르폴린(5.0 g, 미정제)을 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 309.1 [M+1] +.
단계 3: N-(6'-플루오로-2-메틸-5'-모르폴리노-[3,3'-비피리딘]-5-일)-3-(트리플루오로메틸)벤즈아미드 제조
디옥산(15 mL) 중의 N-(5-브로모-6-메틸-3-피리딜)-3-(트리플루오로메틸)벤즈아미드)(1.5 g, 4.18 mmol, 1당량) 및 4-[2-플루오로-5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-3-피리딜]모르폴린(2.70 g, 8.77 mmol, 2.1당량)의 혼합물에 탄산 칼륨(1.73 g, 12.53 mmol, 3당량), (1,1'-비스(디페닐포스피노)페로센-팔라듐(ii)디클로라이드 디클로로메탄 착물(341 mg, 0.41 mmol, 0.1당량) 및 물(3 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 탈기하고 질소로 3회 재충진하였다. 그런 다음 질소 분위기 하 100℃에서 4시간 동안 교반하였다. 혼합물을 감압 하에 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르: 에틸 아세테이트 = 3:2 내지 1:4)로 정제하였다. 화합물 N-[5-(6-플루오로-5-모르폴리노-3-피리딜)-6-메틸-3-피리딜]-3-(트리플루오로메틸)벤즈아미드(1.3 g, 2.82 mmol, 67% 수율)를 황색 고체로서 수득하였다. 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ8.63 (d, J=2.4 Hz, 1H), 8.32 (s, 1H), 8.20 (d, J=3.2 Hz, 1H), 8.15 (s, 1H), 7.85-7.83 (m, 1H), 7.76-7.74 (m, 1H), 7.66 (t, J=8.0 Hz, 1H), 7.24-7.20 (m, 1H), 3.91-3.89 (m, 4H), 3.18-3.16 (m, 4H), 2.49 (s, 3H).
단계 4: 삼차-부틸 4-((2'-메틸-5-모르폴리노-5'-(3-(트리플루오로메틸)벤즈아미도)-[3,3'-비피리딘]-6-일)옥시피페리딘-1-카르복실레이트 제조
디메틸포름아미드(100 mL) 중 삼차-부틸 4-하이드록시피페리딘-1-카르복실레이트(2.62 g, 13.03 mmol, 1.5당량)의 혼합물에 수소화 나트륨(764 mg, 19.11 mmol, 60% 순도, 2.2당량)을 15℃에서 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 0.5시간 동안 교반하고, N-[5-(6-플루오로-5-모르폴리노-3-피리딜)-6-메틸-3-피리딜]-3-(트리플루오로메틸)벤즈아미드(4 g, 8.69 mmol, 1당량)를 반응 혼합물에 첨가하고, 80℃에서 2시간 동안 교반하였다. 혼합물을 물(200 mL)의 첨가로 급냉시키고, 에틸 아세테이트(20 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(40 mL x 4)로 추출하고, 합쳐진 유기상을 염수(50 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에서 농축시켰다. 잔류물을 석유 에테르/에틸 아세테이트(V/V=5:1, 30 mL)로 연화시키고 여과로 수집하였다. 화합물 삼차-부틸 4-[[5-[2-메틸-5-[[3-(트리플루오로메틸)벤조일]아미노]-3-피리딜]-3-모르폴리노-2-피리딜]옥시]피페리딘-1-카르복실레이트(4.5 g, 7.01 mmol, 80% 수율)를 갈색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 642.2 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 8.64 (d, J=2.4 Hz, 1H), 8.23 - 8.09 (m, 4H), 7.86 (d, J=7.6 Hz, 1H), 7.78 (d, J=1.8 Hz, 1H), 7.72 - 7.63 (m, 1H), 7.07 (d, J=1.7 Hz, 1H), 5.48 - 5.34 (m, 1H), 3.96 - 3.86 (m, 4H), 3.78 - 3.66 (m, 2H), 3.52 - 3.39 (m, 2H), 3.16 (s, 4H), 2.54 (s, 3H), 2.12 - 2.03 (m, 2H), 1.86 (m, 2H), 1.51 (s, 9H).
단계 5: N-(2-메틸-5'-모르폴리노-6'-(피페리딘-4일옥시)-[3,3'-비피리딘]-5-일)-3-(트리플루오로메틸)벤즈아미드 염화수소 제조
디클로로메탄(100 mL) 중 삼차-부틸 4-[[5-[2-메틸-5-[[3-(트리플루오로메틸)벤조일]아미노]-3-피리딜]-3-모르폴리노-2-피리딜]옥시]피페리딘-1-카르복실레이트(4.5 g, 7.01 mmol, 1당량)의 혼합물에 염화수소/디옥산(4 M, 17 mL, 10당량)을 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 1시간 동안 교반하였다. 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 화합물 N-[6-메틸-5-[5-모르폴리노-6-(4-피페리딜옥시)-3-피리딜]-3-피리딜]-3-(트리플루오로메틸)벤즈아미드(4.5 g, 미정제, 염산)를 갈색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 542.2 [M+1] +.
(2S,4R)-1-((S)-2-아미노-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5일)벤질) 피롤리딘-2-카르복사미드 염화수소(중간체 9)의 예시적인 합성
단계 1: 4-(4-메틸티아졸-5일)벤조니트릴 제조
질소 불활성 분위기로 퍼지되고 유지된 1 L 둥근바닥 플라스크에, DMA (250 mL), 4-메틸-1,3-티아졸 (21.88 g, 220.67 mmol, 2.00당량), Pd(OAc)2 (743 mg, 3.31 mmol, 0.03당량) 및 KOAc (21.66 g, 220.71 mmol, 2.00당량) 중의 4-브로모벤조니트릴(20 g, 109.88 mmol, 1.00당량) 용액을 넣었다. 생성된 용액을 150℃에서 5시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물/얼음조로 냉각시키고 1 L의 물로 희석하였다. 생성된 용액을 3x300 mL의 에틸 아세테이트로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 3x300 mL의 물과 1x300 mL의 염수로 세척하고 나서, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 아세트산에틸/석유 에테르(1:100-1:5)로 콤비-플래시 상에서 정제하였다. 이를 통해 20 g (91%)의 4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일) 벤조니트릴을 베이지색 고체로서 수득하였다.
단계 2: (4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)메탄아민 제조
질소 불활성 분위기로 퍼지되고 유지된 3-L 3-목 둥근 바닥 플라스크에, 테트라하이드로푸란(1000 mL) 중 4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)벤조니트릴(35 g, 174.77 mmol, 1.00당량)을 넣었다. 이어서, LiAlH4 (20 g, 526.32 mmol, 3.00당량)를 0℃에서 10분 동안 나누어서 첨가하였다. 생성된 용액을 오일 조 내에서 60℃에서 3시간 동안 교반하였다. 반응물을 물/얼음 조로 0℃까지 냉각시킨 다음, 20 mL의 물, 20mL의 NaOH(15%) 및 60 mL의 물의 첨가로 급냉시켰다. 생성된 용액을 200 mL의 에틸 아세테이트로 희석하였다. 고체를 걸러냈다. 여과물을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(10:1)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 20 g(56%)의 [4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메탄아민을 황색 오일로서 수득하였다.
단계 3: 삼차-부틸 (2S,4R)-4-하이드록시-2-((4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)카바모일)피롤리딘-1-카르복실레이트 제조
50 mL 둥근바닥 플라스크에, N,N-디메틸포름아미드(30 mL), DIEA (2.52 g, 19.50 mmol, 1.20당량), HATU (4.47 g, 11.76 mmol, 1.20당량), [4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메탄아민(2 g, 9.79 mmol, 1.00당량) 중 (2S,4R)-1-[(삼차-부톡시)카르보닐]-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복실산(2.7 g, 11.68 mmol, 1.20당량)을 넣었다. 생성된 용액을 25℃에서 밤새 교반하였다. 이어서, 반응물을 20 mL의 물의 첨가로 급냉시키고 3x20 mL의 에틸 아세테이트로 추출하였다. 유기층을 합치고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(20:1)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이로 인해 1 g (24%)의 삼차-부틸 (2S,4R)-4-하이드록시-2-([[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]카바모일)피롤리딘-1-카르복실레이트를 황색 고체로서 수득하였다.
단계 4: (2S,4R)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드 염화수소 제조
1000mL의 둥근 바닥 플라스크에, 삼차-부틸 (2S,4R)-4-하이드록시-2-([[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]카바모일)피롤리딘-1-카르복실레이트(45 g, 107.78 mmol, 1.00당량), 디옥산(300 mL) 중 염화수소(13.44 L)를 첨가하였다. 생성된 용액을 20℃에서 2시간 동안 교반하였다. 고체를 여과하여 수집하였다. 이를 통해 37.3 g (98%)의 (2S,4R)-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사아미드 염화수소를 황색 고체로서 수득하였다.
단계 5: 삼차-부틸 ((S)-1-((2S,4R)-4-하이드록시-2-((4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)카바모일)피롤리딘-1-일)-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일)카바메이트 제조
1000 mL 둥근바닥 플라스크에, N,N-디메틸포름아미드(500 mL), DIEA (29.2 g, 225.94 mmol, 4.00당량), HATU (25.9 g, 68.12 mmol, 1.20당량) 및 (2S,4R)-2-아미노-5-클로로-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]펜탄아미드(20 g, 56.52 mmol, 1.00당량) 중 (2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노-3,3-디메틸부탄산(15.73 g, 68.01 mmol, 1.20당량)을 넣었다. 생성된 용액을 20℃에서 16시간 동안 교반하였다. 이어서, 반응물을 200 mL의 물의 첨가로 급냉시키고, 3x100 mL의 에틸 아세테이트로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(2:1)로 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 15.2 g (51%)의 삼차-부틸 N-[(2S)-1-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-([[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]카바모일)피롤리딘-1-일]-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일]카바메이트를 황색 고체로서 수득하였다.
단계 6: (2S,4R)-1-((S)-2-아미노-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드 염화수소 제조
500 mL 둥근바닥 플라스크에, 디옥산(20 mL) 중 삼차-부틸 N-[(2S)-1-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-([[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]카바모일)피롤리딘-1-일]-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일]카바메이트(12 g, 22.61 mmol, 1.00당량) 및 디옥산(80 mL) 중 염화수소 용액(3.584 L)의 용액을 넣었다. 생성된 용액을 25℃에서 2시간 동안 교반하였다. 고체를 여과하여 수집하였다. 이를 통해 5.1 g(48%)의 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사아미드 염화수소를 황색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 431 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, CD3OD) δ 9.84-9.82 (s, 1H), 7.58-7.54 (m, 4H), 4.71-4.41 (m, 4H), 4.13-4.08 (m, 1H), 3.86-3.71 (m, 2H), 3.36 (s, 1H), 2.60-2.58 (s, 3H), 2.35-2.07 (m, 2H), 1.19-1.12 (m, 9H).
삼차 -부틸 2-(4-((4-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세테이트(중간체 10)의 예시적인 합성
단계 1: 삼차-부틸 4-((4-(4-브로모페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-카르복실레이트의 제조
100mL 둥근 바닥 플라스크에, 디클로로메탄(20 mL) 중 1-(4-브로모페닐)피페라진 염화수소(900.0 mg, 3.26 mmol, 1.00당량)의 용액을 넣었다. DIEA(841.0 mg, 6.52 mmol, 2.00당량) 및 삼차-부틸 4-포르밀피페리딘-1-카르복실레이트(694.4 mg, 3.26 mmol, 1.00당량)를 첨가하였다. 몇 분 후, 나트륨 트리아세톡시보로하이드라이드(2.1 g, 9.78 mmol, 3.00당량)를 첨가하였다. 생성된 용액을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 그런 다음 물(30 mL)로 반응물을 급냉시키고, 디클로로메탄(30 mL x 2)으로 추출하였다. 유기상을 감압 하에 증발시켜 농축시키고, 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:4)로 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 1.3 g(91%)의 삼차-부틸 4-((4-(4-브로모페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-카르복실레이트를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 438.30 [M+1] +.
단계 2: 1-(4-브로모페닐)-4-(피페리딘-4-일메틸)피페라진의 제조
100mL 둥근 바닥 플라스크에, 디클로로메탄(10 mL) 중 삼차-부틸 4-((4-(4-브로모페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-카르복실레이트(1.3 g, 0.64 mmol, 1.00당량)，2,2,2-트리플루오로아세트알데히드(5ml)의 용액을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 생성된 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 이를 통해 1.3 g(97%)의 1-(4-브로모페닐)-4-(피페리딘-4-일메틸)피페라진 화합물과 2,2,2-트리플루오로아세트산(1:1)을 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 338.05 [M+1] +.
단계 3: 삼차-부틸 2-(4-((4-(4-브로모페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세테이트 제조
100mL 둥근 바닥 플라스크에, THF(20 mL) 중 1-(4-브로모페닐)-4-(피페리딘-4-일메틸)피페라진 화합물과 2,2,2-트리플루오로아세트산(1:1) (1.3 g, 2.88 mmol, 1.00당량) 용액을 넣었다. 수산화나트륨(1M, 10 mL), 삼차-부틸 2-브로모아세테이트(782.2 mg, 4.03 mmol, 1.40당량)를 첨가하였다. 생성된 용액을 0℃의 얼음 욕에서 30분 동안 교반하였다. 생성된 용액을 물(40 mL)로 희석하고 에틸 아세테이트(40 mL x 2)로 추출하였다. 유기상을 감압 하에 증발시켜 농축시키고, 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(2:3)로 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 983.4 mg(76%)의 삼차-부틸 2-(4-((4-(4-브로모페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세테이트를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 452.15 [M+1] +.
단계 4: 삼차-부틸 2-(4-((4-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세테이트 제조
100mL 둥근 바닥 플라스크에, 1,4-디옥산(30 mL) 중 삼차-부틸 2-(4-((4-(4-브로모페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세테이트(983.4 mg, 2.18 mmol, 1.00당량), 4,4,4',4',5,5,5',5'-옥타메틸-2,2'-비(1,3,2-디옥사보로란) (1.1 g, 4.36 mmol, 2.00당량), Pd(dppf)Cl2 (358.1 mg, 0.44 mmol, 0.20당량), 아세트산 칼륨(641.0 g, 6.54 mmol, 3.00당량)을 넣었다. 질소 하에 생성된 용액을 오일조에서 85℃에서 밤새 교반하였다. 고체를 걸러냈다. 여과물을 감압 하에 증발시키고 농축시키고, 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:1)로 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이로 인해 783.4 mg (72%)의 삼차-부틸 2-(4-((4-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세테이트를 황색 고체로서 생성하였다. LC/MS (ESI) m/z: 500.30 [M+1] +.
(2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드(실시예 320)의 예시적인 합성
단계 1: 삼차-부틸 4-(4-(4-브로모페닐)피페라진-1-일)피페리딘-1-카르복실레이트 제조
250 mL 둥근 바닥 플라스크에, 디클로로메탄(10 mL), 삼차-부틸 4-옥소피페리딘-1-카르복실레이트(4.9 g, 24.9 mmol, 1.4당량), 아세틸 에탄페록소에이트; 소디오보라닐 아세테이트(13.2 g, 62.3 mmol, 3.5당량) 중 1-(4-브로모페닐)피페라진 염화수소(5.0 g, 18.0 mmol, 1.0당량)의 용액을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 밤새 교반하였다. 이어서 반응물을 1 mL의 물/얼음의 첨가로 급냉시켰다. 생성된 용액을 디클로로메탄(20 mL x 2)으로 추출하고, 유기층을 합치고 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:0)로 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 4.2 g(54%)의 삼차-부틸 4-[4-(4-브로모페닐)피페라진-1-일]피페리딘-1-카르복실레이트를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 426.10 [M+1] +.
단계 2: 1-(4-브로모페닐)-4-(피페리딘-4-일)피페라진 염화수소의 제조
100 mL 둥근 바닥 플라스크에, 디클로로메탄(10 mL), 염화수소(5 mL) 중 삼차-부틸 4-[4-(4-브로모페닐)피페라진-1-일]피페리딘-1-카르복실레이트(4.2 g, 9.8 mmol, 1.0당량)의 용액을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 생성된 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 이를 통해 3.0 g(85%)의 1-(4-브로모페닐)-4-(피페리딘-4-일)피페라진 염화수소를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 325.95 [M+1] +.
단계 3: 삼차-부틸 2-(4-(4-(4-브로모페닐)피페라진-1-일)피페리딘-1-일)아세테이트 제조
100 mL 둥근 바닥 플라스크에, 디클로로메탄(10 mL), 트리에틸아민(2.0 g, 19.8 mmol, 2.4당량), 삼차-부틸 2-브로모아세테이트 (2.3 g, 11.8 mmol, 1.4당량) 중 1-(4-브로모페닐)-4-(피페리딘-4-일)피페라진 염화수소 (3.0 g, 8.3 mmol, 1.0당량)의 용액을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 밤새 교반하였다. 이어서 반응물을 1 mL의 물/얼음의 첨가로 급냉시켰다. 생성된 용액을 디클로로메탄(20 mL x2)으로 추출하고, 유기층을 합치고 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:0)로 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 2.0 g(53%)의 삼차-부틸 2-[4-[4-(4-브로모페닐) 피페라진-1-일] 피페리딘-1일] 아세테이트를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 440.30 [M+1] +.
단계 4: 삼차-부틸 2-(4-(4-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)피페라진-1-일)피페리딘-1-일)아세테이트 제조
20-30 mL 밀봉 튜브에, 디옥산(10 mL), 4,4,5,5-테트라메틸-2-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-1,3,2-디옥사보로란(2.3 g, 9.1 mmol, 2.0당량), KOAc (874.6 mg, 8.9 mmol, 2.0당량), Pd(dppf)Cl2 (700.6 mg, 0.9 mmol, 0.2당량) 중 삼차-부틸 2-[4-[4-(4-브로모페닐)피페라진-1-일]피페리딘 -1-일]아세테이트(2.0 g, 4.5 mmol, 1.0당량)의 용액을 넣었다. 생성된 용액을 오일조에서 85℃에서 밤새 교반하였다. 이어서 반응물을 1 mL의 물/얼음의 첨가로 급냉시켰다. 생성된 용액을 에틸 아세테이트(20 ml x 2)로 추출하고, 유기층을 합치고 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:0)로 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 630.0 mg(29%)의 삼차-부틸 2-(4-[4-[4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐]피페라진-1-일]피페리딘-1-일]아세테이트를 흑색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 486.25 [M+1] +.
단계 5: 삼차--부틸 (R)-2-(4-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-((3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)피페리딘-1-일)아세테이트 제조
20-30 mL의 밀봉된 튜브에, 디옥산/H2O (4:1 mL), (3R)-N-(3-5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드(300.0 mg, 0.6 mmol, 0.5당량), Pd(dppf)Cl2 (46.9 mg), 탄산나트륨(99.2 mg, 0.9 mmol, 0.7당량) 중 삼차-부틸 2-(4-[4-[4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐]피페라진-1-일]피페리딘 -1-일)아세테이트(630.0 mg, 1.3 mmol, 1.0당량) 용액을 넣었다. 생성된 용액을 105℃에서 2시간 동안 교반하였다. 이어서 1 mL의 물/얼음을 첨가하여 반응물을 급냉시켰다. 생성된 용액을 에틸 아세테이트(20 mL x 2)로 추출하고, 유기층을 합치고 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(10:1)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 256.0 mg (25%)의 삼차-부틸 2-[4-[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]피페리딘-1-일]아세테이트를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 782.05 [M+1] +.
단계 6: (R)-2-(4-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-((3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)피페리딘-1-일)아세트산 제조
100 mL 둥근바닥 플라스크에, 디클로로메탄(10 mL), 트리플루오로아세트산(2 mL) 중 삼차-부틸 2-[4-[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]피페리딘-1-일]아세테이트(256.0 mg, 0.3 mmol, 1.0당량)을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 밤새 교반하였다. 생성된 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 이를 통해 120.0 mg(50%)의 2-[4-[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]피페리딘-1-일]아세트산을 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 726.15 [M+1] +.
단계 7: (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
100 mL 둥근바닥 플라스크에, N,N-디메틸포름아미드(5 mL), (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드(88.2 mg, 0.4 mmol, 1.2당량), N,N-디이소프로필에틸아민(64.1 mg, 1.0 mmol, 3.0당량), (벤조티아졸-1-일옥시)트리스(디메틸아미노) 포스포늄 헥사플루오로포스페이트(87.8 mg) 중 2-[4-[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]피페리딘-1-일]아세트산(120.0 mg, 0.3 mmol, 1.0당량) 용액을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 이어서 1 mL의 물/얼음을 첨가하여 반응물을 급냉시켰다. 생성된 용액을 에틸 아세테이트(20 mL x 2)로 추출하고, 유기층을 합치고 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 하에서 농축시켰다. 미정제 생성물을 분취-HPLC에 의해 정제하여 42.9 mg(23%)의 (2S,4R)-1-[(2S)-2-(2-[4-[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]피페리딘-1-일]아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드를 회백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 1152.20 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.87 (brs, 1H), 9.96 (brs, 1H), 8.96 (d, J = 2.1 Hz, 1H), 8.63 (d, J = 2.3 Hz, 1H), 8.51 (s, 1H), 8.40 (d, J = 7.6 Hz, 1H), 8.04 (s, 1H), 7.74 (d, J = 9.6 Hz, 1H), 7.70-7.60 (m, 3H), 7.47-7.42 (m, 2H), 7.40-7.31 (m, 2H), 7.23 (t, J = 8.9 Hz, 1H), 7.05 (d, J = 8.5 Hz, 2H), 5.36-5.15 (m, 1H), 5.19 (s, 1H), 4.88 (t, J = 7.1 Hz, 1H), 4.54-4.38 (m, 2H), 4.27-4.21 (m, 1H), 3.60-3.52 (m, 2H), 3.47-3.41 (m, 1H), 3.37-3.31 (m, 2H), 3.30-3.24 (m, 5H),3.03 (d, J = 16.1 Hz, 1H), 2.89-2.80 (m, 3H), 2.70-2.55 (m, 5H), 2.34-2.03 (m, 7H), 1.87-1.72 (m,3H), 1.47-1.37 (m, 6H), 0.93 (s, 9H).
(2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-(((3R,5S)-4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)-3,5-디메틸피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드(실시예 360)의 예시적인 합성
단계 1: 삼차-부틸 비스(2-하이드록시프로필)카바메이트의 제조
테트라하이드로푸란(200 mL) 중 1-(2-하이드록시프로필아미노)프로판-2-올(10 g, 75.08 mmol, 10 mL, 1 당량)의 용액에 Boc-무수물(17.2 g, 78.84 mmol, 18 mL, 1.05 당량) 및 트리에틸아민(22.8 g, 225.25 mmol, 31.3 mL, 3 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 12시간 동안 교반하였다. 물(400 mL)을 혼합물에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(200 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수로 세척하고(100 mL x 2), 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트 =10:1 내지 2:1)로 정제하여 삼차-부틸 N,N-비스(2-하이드록시프로필)카바메이트(14.7 g, 63.01 mmol, 83% 수율)를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 256.1 [M+23] +.
단계 2: 삼차-부틸 비스(2-옥소프로필)카바메이트의 제조
디클로로메탄(100 mL) 중 옥살릴 염화물(16.3 g, 128.5 mmol, 3 당량)의 용액에 디클로로메탄(100 mL) 중 디메틸설폭시드(13.4 g, 171.45 mmol, 4 당량)의 용액을 -70℃에서 적가하였다. 혼합물을 -70℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 디클로로메탄(100 mL) 중 삼차-부틸 N,N-비스(2-하이드록시프로필)카바메이트 (10 g, 42.86 mmol, 1 당량)의 용액을 혼합물에 적가하고, 혼합물을 -70℃에서 0.5시간 동안 추가로 교반하였다. 이어서, 트리에틸아민(21.7 g, 214.31 mmol, 5 당량)을 -70℃에서 반응 혼합물에 첨가하였다. 혼합물을 15℃로 데우고 15℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물(500 mL)로 희석시키고 디클로로메탄(300 mL x 2)으로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 포화 염수(300 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트=10:1 내지 2:1)로 정제하여 삼차-부틸 N,N-디아세토닐카바메이트(6.4 g, 27.91 mmol, 65% 수율)를 무색 오일로서 수득하였다.
단계 3: 삼차-부틸 4-(4-브로모페닐)-3,5-디메틸피페라진-1-카르복실레이트 제조
메탄올(70 mL) 중 삼차-부틸 N,N-디아세토닐카바메이트(6.4 g, 27.91 mmol, 1.2 당량) 및 4-브로모아닐린 (4 g, 23.26 mmol, 1 당량)의 용액에 아세트산(7 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 보란;2-메틸피리딘(4.98 g, 46.52 mmol, 2 당량)을 첨가하고, 이어서 혼합물을 15℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물(120 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(80 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 포화 염수(100 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트 = 20:1 내지 5:1)로 정제하여, 삼차-부틸 4-(4-브로모페닐)-3,5-디메틸-피페라진-1-카르복실레이트(8 g, 21.66 mmol, 93% 수율)를 무색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 369.0 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 7.44 - 7.40 (m, 2H), 7.00 - 6.94 (m, 2H), 3.88 (s, 1H), 3.49 (s, 1H), 3.11 - 2.97 (m, 2H), 2.93 - 2.77 (m, 2H), 1.50 (s, 9H), 0.79 (d, J=6.0 Hz, 6H).
단계 4: 1-(4-브로모페닐)-2,6-디메틸피페라진 제조
디클로로메탄 (100 mL) 중 삼차-부틸 4-(4-브로모페닐)-3,5-디메틸-피페라진-1-카르복실레이트(8 g, 21.66 mmol, 1 당량) 용액에 디옥산(90 mL) 중 4 M 염산을 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축시켜 미정제 생성물 1-(4-브로모페닐)-2,6-디메틸-피페라진(6.6 g, 21.59 mmol, 99% 수율, 염화수소)을 백색 고체로서 수득하고, 추가 정제 없이 다음 단계에 사용하였다.
단계 5: 삼차-부틸 4-((4-(4-브로모페닐)-3,5-디메틸피페라진-1일)메틸)피페리딘-1-카르복실레이트 제조
메탄올(100 mL) 중 1-(4-브로모페닐)-2,6-디메틸-피페라진(6.6 g, 21.59 mmol, 1 당량, 염화수소)의 용액에 아세트산 나트륨(5.31 g, 64.78 mmol, 3 당량)을첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 10분 동안 교반하였다. 삼차-부틸 4-포르밀피페리딘-1-카르복실레이트(5.99 g, 28.07 mmol, 1.3 당량)를 첨가하고, 혼합물을 15℃에서 20분 동안 교반하였다. 나트륨 시아노보로하이드라이드(2.71 g, 43.19 mmol, 2당량)를 첨가한 다음, 혼합물을 15℃에서 12시간 동안 추가로 교반하였다. 반응 혼합물을 물(500 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(300 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 포화 염수(300 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고, 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트= 10:1 내지 3:1)로 정제하여, 삼차-부틸 4-[[4-(4-브로모페닐)-3,5-디메틸-피페라진-1일]메틸]피페리딘-1-카르복실레이트(6.6 g, 14.01 mmol, 64% 수율, 99% 순도)를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 466.1 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 7.38 (d, J=8.0 Hz, 2H), 6.89 (d, J=8.0 Hz, 2H), 4.32 (d, J=6.0 Hz, 1H), 4.21 (s, 1H), 3.58 - 3.45 (m, 2H), 2.72 (s, 3H), 2.63 (d, J=8.8 Hz, 2H), 2.29 (dd, J=6.4, 10.4 Hz, 2H), 1.95 - 1.82 (m, 2H), 1.80 - 1.71 (m, 2H), 1.70 - 1.57 (m, 1H), 1.47 (s, 9H), 1.17 - 1.02 (m, 2H), 0.94 (d, J=6.0 Hz, 6H).
단계 6: 1-(4-브로모페닐)-2,6-디메틸-4-(피페리딘-4-일메틸)피페라진 제조
디클로로메탄(50 mL) 중 삼차-부틸 4-[[4-(4-브로모페닐)-3,5-디메틸-피페라진-1일]메틸]피페리딘-1-카르복실레이트(6.6 g, 14.15 mmol, 1 당량) 용액에 디옥산(50 mL, 14.13 당량) 중 4 M 염산을 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 미정제 생성물을 에틸 아세테이트 (100 mL)로 연화시켜 1-(4-브로모페닐)-2,6-디메틸-4-(4-피페리딜메틸)피페라진(6 g, 미정제, 염화수소)을 백색 고체로서 수득하였다.
단계 7: 삼차-부틸 2-(4-(((3R,5S)-4-(4-브로모페닐)-3,5-디메틸피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세테이트 제조
아세토니트릴(100 mL) 중 1-(4-브로모페닐)-2,6-디메틸-4-(4-피페리딜메틸)피페라진(6 g, 14.90 mmol, 1 당량, 염화수소)의 용액에 디이소프로필에틸아민(9.63 g, 74.48 mmol, 12.9 mL, 5 당량) 및 삼차-부틸 2-브로모아세테이트(2.91 g, 14.9 mmol, 2.2 mL, 1 당량)를 첨가하였다. 혼합물을 80℃에서 1.5시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물(200 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(100 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 포화 염수(100 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고, 감압 하에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트 = 10:1 내지 2:1)로 정제하여 삼차-부틸 2-[4-[[(3S,5S)-4-(4-브로모페닐)-3,5-디메틸-피페라진-1-일]메틸]-1-피페리딜]아세테이트(580 mg, 1.21 mmol, 16% 수율)를 백색 고체로서 그리고 2-[4-[[(3R,5S)-4-(4-브로모페닐)-3,5-디메틸-피페라진-1-일]메틸]-1-피페리딜]아세테이트(2.7 g, 5.62 mmol, 75% 수율)를 백색 고체로서 수득하였다. 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 7.39 (d, J=8.4 Hz, 2H), 6.96 (d, J=8.4 Hz, 2H), 3.22 (s, 2H), 3.12 (s, 2H), 2.95 (d, J=11.2 Hz, 2H), 2.67 (d, J=10.4 Hz, 2H), 2.25 - 2.14 (m, 4H), 2.09 (t, J=9.6 Hz, 2H), 1.77 (d, J=12.0 Hz, 2H), 1.55 - 1.44 (m, 10H), 1.40 - 1.27 (m, 2H), 0.84 (d, J=6.0 Hz, 6H).
단계 8:삼차-부틸 2-(4-(((3R,5S)-4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로-N-((2-(트리메틸실릴)에톡시)메틸)피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1-((2-(트리메틸실릴)에톡시)메틸)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)-3,5-디메틸피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세테이트 제조
디옥산(4 mL) 및 물(0.4 mL) 중 삼차-부틸 2-[4-[[(3R,5S)-4-(4-브로모페닐)-3,5-디메틸-피페라진-1-1]메틸]-1-피페리딜]아세테이트(150 mg, 0.31 mmol 당량), (3R)-N-[2,4-디플루오로-3- [5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘 -3-카르보닐]페닐]-3-플루오로-N-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤리딘-1-설폰아미드(253 mg, 0.31 mmol, 1 당량), 불화 세슘(190 mg, 1.25 mmol, 4 당량) 및 4-디삼차-부틸포스파닐-N,N-디메틸-아닐린;디클로로팔라듐(22 mg, 0.03 mmol, 0.1 당량)을 탈기하고 질소(3x)로 퍼지하고, 그런 다음 혼합물을 질소 대기 하에 95℃에서 3시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물(15 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(10 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 포화 염수(10 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고, 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피(디클로로메탄:메탄올 = 100:1 내지 50:1)로 정제하여 삼차-부틸 2-[4-[[(3S,5S)-4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)아미노]벤조일]-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-3,5-디메틸-피페라진-1-일]메틸]-1-피페리딜]아세테이트(170 mg, 0.15 mmol, 50% 수율)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 543.0 [M/2+1] +.
단계 9: 메틸 2-(4-(((3R,5S)-4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)-3,5-디메틸피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세테이트의 제조
메탄올(4 mL) 중 삼차-부틸 2-[4-[[(3R,5S)-4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)아미노]벤조일]-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-3,5-디메틸-피페라진-1-일]메틸]-1-피페리딜]아세테이트(170 mg, 0.15 mmol, 1 당량) 용액에 디옥산(8 mL) 중 4 M 염산을 첨가하였다. 혼합물을 40℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축시켜 디옥산, 메탄올 및 염산을 제거하여 미정제 생성물 메틸 2-[4-[[(3R,5S)-4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-3,5-디메틸-피페라진-1-일]메틸]-1-피페리딜]아세테이트(120 mg, 0.15 mmol, 97% 수율)를 황색 고체로서 수득하고 추가로 정제하지 않고 다음 단계에서 사용하였다. LC/MS (ESI) m/z: 782.5 [M+1] +.
단계 10: 2-(4-(((3R,5S)-4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)-3,5-디메틸피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트산 제조
메탄올(3 mL)과 물(1 mL) 중 메틸 2-[4-[[(3R,5S)-4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-3,5-디메틸-피페라진-1-일]메틸]-1-피페리딜]아세테이트120 mg, 0.15 mmol, 1 당량)의 용액에 수산화 리튬 일수화물(32 mg, 0.76 mmol, 5 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 40℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축시켜 메탄올을 제거하였다. 혼합물을 염산(2 M)으로 pH 4~5로 조정하고 감압 하에 농축시켜 물을 제거하였다. 잔류물을 반-분취 역상 HPLC로 정제하여 2-[4-[[(3R,5S)-4-[4-[3-[2,6-디플루오로- 3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-3,5-디메틸-피페라진-1-일]메틸]-1-피페리딜]아세트산 (90 mg, 0.11 mmol, 76% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 768.4 [M+1] +.
단계 11: (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-(((3R,5S)-4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)-3,5-디메틸피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
디메틸포름아미드(2 mL) 중 2-[4-[[(3R,5S)-4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-3,5-디메틸-피페라진-1-일]메틸]-1-피페리딜]아세트산(90 mg, 0.11 mmol, 1 당량), (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드(56 mg, 0.11 mmol, 1 당량, 염화수소), 트리에틸아민 (23 mg, 0.23 mmol, 2 당량) 및 하이드록시벤조트리아졸 (19 mg, 0.14 mmol, 1.2 당량)을 40℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 1-(3-디메틸아미노프로필)-3-에틸카르보디이미드 염화수소(33 mg, 0.17 mmol, 1.5 당량)를 첨가한 다음, 혼합물을 40℃에서 2.5시간 동안 교반하였다. 용액을 반-분취 역상 HPLC로 정제하여, (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[2-[4-[[(3R,5S)- 4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-3,5-디메틸-피페라진-1-일]메틸]-1-피페리딜]아세틸]아미노]-3,3-디메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드(66.1 mg, 0.05 mmol, 44% 수율, 97% 순도, 포름산염)를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 597.8 [M/2+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.92 (s, 1H), 8.99 (s, 1H), 8.68 (d, J=2.0 Hz, 1H), 8.57 (s, 1H), 8.44 (d, J=7.6 Hz, 1H), 8.19 (s, 1H), 8.07 (s, 1H), 7.78 (d, J=10.0 Hz, 1H), 7.67 - 7.59 (m, 3H), 7.49 - 7.42 (m, 2H), 7.40 - 7.35 (m, 2H), 7.26 (t, J=8.0 Hz, 1H), 7.08 (d, J=8.4 Hz, 2H), 5.39 - 5.21 (m, 1H), 4.91 (q, J=7.2 Hz, 1H), 4.52 (d, J=10.0 Hz, 1H), 4.46 (t, J=8.4 Hz, 1H), 4.30 (s, 1H), 3.69 - 3.56 (m, 3H), 3.33 - 3.25 (m, 6H), 3.08 - 3.00 (m, 2H), 2.94 - 2.79 (m, 3H), 2.46 (s, 3H), 2.44 - 2.37 (m, 2H), 2.21 (d, J=6.4 Hz, 3H), 2.17 - 1.94 (m, 6H), 1.88 - 1.72 (m, 3H), 1.68 - 1.51 (m, 1H), 1.40 (d, J=7.2 Hz, 3H), 1.31 - 1.16 (m, 2H), 1.03 (br d, J=6.0 Hz, 6H), 0.96 (s, 10H).
(2S,4R)-4-하이드록시-1-((2-(2-(2-(2-(4-((2'-메틸-5-모르폴리노-5'-(3-(트리플루오로메틸)벤즈아미도)-[3,3'-비피리딘]-6-일)옥시)피페리딘-1-일)에톡시)에톡시)에톡시)아세틸)-L-발릴)-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드(실시예 346)의 예시적인 합성
단계 1: 삼차-부틸 2-(2-(2-(2-하이드록시에톡시)에톡시)에톡시)아세테이트의 제조
테트라하이드로푸란(200 mL) 중 2-[2-(2-하이드록시에톡시)에톡시]에탄올(38 g, 256.34 mmol, 34 mL, 5당량)의 용액에 수소화 나트륨(2.46 g, 61.52 mmol, 60% 순도, 1.2당량)을 0℃에서 질소 하에 1시간의 기간에 걸쳐 첨가하였다. 반응 혼합물을 1시간 동안 교반하였다. 그런 다음, 테트라하이드로푸란(100 mL) 중 삼차-부틸 2-브로모아세테이트(10 g, 51.27 mmol, 7.58 mL, 1당량)의 용액을 0℃에서 용액에 적가하고, 반응 혼합물을 20℃에서 12시간 동안 추가로 교반하였다. 혼합물을 물(50 mL)로 급냉시키고 에틸 아세테이트(50 mL x 3)로 추출하였다. 유기층을 황산나트륨 상에서 건조시키고, 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트 = 10:1 내지 1:1)로 정제하였다. 삼차-부틸 2-[2-[2-(2-하이드록시에톡시)에톡시]에톡시]아세테이트 (3 g, 11.35 mmol, 22% 수율)를 황색 오일로서 수득하였다.1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 4.02 (s, 2H), 3.81 - 3.57 (m, 12H), 2.61 (br s, 1H), 1.47 (s, 9H).
단계 2: 삼차-부틸 2-(2-(2-(2-(토실옥시)에톡시)에톡시)에톡시)아세테이트 제조
디클로로메탄(20 mL) 중 삼차-부틸 2-[2-[2-(2-하이드록시에톡시)에톡시]에톡시]아세테이트(1 g, 3.78 mmol, 1당량)의 용액에 파라톨루엔설포닐 클로라이드(2.1 g, 11.35 mmol, 3당량) 및 트리에틸아민(1.9 g, 18.92 mmol, 5당량) 4-디메틸아미노피리딘(462 mg, 3.78 mmol, 1당량)을 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 12시간 동안 교반하였다. 물(30 mL)로 혼합물을 급냉시키고 디클로로메탄(30 mL*3)으로 추출하였다. 유기층을 황산나트륨 상에서 건조시키고, 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트 = 10:1 내지 1:1)로 정제하였다. 삼차-부틸 2-[2-[2-[2-(p-톨릴설포닐옥시)에톡시]에톡시]에톡시]아세테이트(500 mg, 1.19 mmol, 31% 수율)를 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 441.1 [M+23] +.
단계 3: 삼차-부틸 2-(2-(2-(2-(4-((2'-메틸-5-모르폴리노-5'-(3-(트리플루오로메틸)벤즈아미도)-[3,3'-비피리딘]-6-일)옥시)피페리딘-1일)에톡시)에톡시)에톡시)아세테이트 제조
아세토니트릴(5 mL) 중 삼차-부틸 2-[2-[2-[2-(p-톨릴설포닐옥시)에톡시]에톡시]에톡시]아세테이트(200 mg, 0.477 mmol, 1당량)의 용액에 N,N-디이소프로필에틸아민(370 mg, 2.87 mmol, 6당량) N-[6-메틸-5-[5-모르폴리노-6-(4-피페리딜옥시)-3-피리딜]-3-피리딜]-3-(트리플루오로메틸)벤즈아미드;염화수소 및 요오드화칼륨(79 mg, 0.477 mmol, 1당량)을 첨가하였다. 혼합물을 100℃에서 12시간 동안 교반하였다. 혼합물을 물(30 mL)로 급냉시키고 에틸 아세테이트(30 mL*3)로 추출하였다. 유기층을 황산나트륨 상에서 건조시키고, 농축시켰다. 잔류물을 분취-TLC(디클로로메탄:메탄올 = 10:1)로 정제하였다. 삼차-부틸 2-[2-[2-[2-[4-[[5-[2- 메틸-5-[[3-(트리플루오로메틸)벤조일]아미노]-3-피리딜]-3-모르폴리노-2-피리딜]옥시]-1-피페리딜]에톡시]에톡시]에톡시]아세테이트(200 mg, 0.253 mmol, 53% 수율)를 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 788.2 [M+1] +.
단계 4: 2-(2-(2-(2-(4-((2'-메틸-5-모르폴리노-5'-(3-(트리플루오로메틸)벤즈아미도)-[3,3'-비피리딘]-6-일)옥시)피페리딘-1-일)에톡시)에톡시)에톡시)아세트산 제조
디클로로메탄(2 mL) 중 삼차-부틸 2-[2-[2-[2-[4-[[5-[2-메틸-5-[[3-(트리플루오로메틸)벤조일]아미노]-3-피리딜]-3-모르폴리노-2-피리딜]옥시]-1-피페리딜]에톡시]에톡시]에톡시]아세테이트(200 mg, 0.253 mmol, 1당량)의 용액에 트리플루오로아세트산(578 mg, 5.08 mmol, 20당량)을 첨가하였다. 혼합물을 20℃에서 12시간 동안 교반하였다. 혼합물을 농축시켰다. 잔류물은 추가적인 정제 없이 다음 단계에 사용되었다. 2-[2-[2-[2-[4-[[5-[2-메틸-5-[[3-(트리플루오로메틸)벤조일]아미노]-3-피리딜]-3-모르폴리노-2-피리딜]옥시]-1-피페리딜]에톡시]에톡시]에톡시]아세트산(200 mg, 미정제, 트리플루오로아세트산)을 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 732.2 [M+1] +.
단계 5: (2S,4R)-4-하이드록시-1-((2-(2-(2-(2-(4-((2'-메틸-5-모르폴리노-5'-(3-(트리플루오로메틸)벤즈아미도)-[3,3'-비피리딘]-6-일)옥시)피페리딘-1-일)에톡시)에톡시)에톡시)아세틸)-L-발릴)-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
N, N-디메틸포름아미드(2 mL) 중 2-[2-[2-[2-[4-[[5-[2-메틸-5-[[3-(트리플루오로메틸)벤조일]아미노]-3-피리딜]-3-모르폴리노-2-피리딜]옥시]-1-피페리딜]에톡시]에톡시]에톡시]아세트산(200 mg, 0.236 mmol, 1당량, 트리플루오로아세트산) 및 (2S, 4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸-부타노일]-4-하이드록시- N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드(170 mg, 0.354 mmol, 1.5당량, 염화수소)를 하이드록시벤조트리아졸(38 mg, 0.283 mmol, 1.2당량) 트리에틸아민(119 mg, 1.18 mmol, 5당량) 및 1-(3-디메틸아미노프로필)-3-에틸카르보디이미드 염화수소(68 mg, 0.354 mmol, 1.5당량)을 첨가하였다. 혼합물을 20℃에서 12시간 동안 교반하였다. 물(30 mL*3)로 혼합물을 급냉시키고 디클로로메탄/메탄올 (10:1,30 mL*3)로 추출하였다. 유기층을 황산나트륨 상에서 건조시키고, 농축시켰다. 잔류물을 분취-HPLC로 정제하였다. (2S,4R)-1-[(2S)-3,3-디메틸-2-[[2-[2-[2-[2-[4-[[5-[2-메틸-5-[[3- (트리플루오로메틸)벤조일]아미노]-3-피리딜]-3-모르폴리노-2-피리딜]옥시]-1-피페리딜]에톡시]에톡시]에톡시]아세틸]아미노]부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사아미드(136.7 mg, 0.107 mmol, 45% 수율, 98% 순도, 2 포름산)을 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 1144.5 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 10.66 (s, 1H), 8.97 (s, 1H), 8.84 (d, J = 2.4 Hz, 1H), 8.43 (d, J = 7.6 Hz, 1H), 8.32 (s, 1H), 8.28 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 8.16 (s, 2H), 8.03 (d, J = 2.4 Hz, 1H), 7.99 (d, J = 7.6 Hz, 1H), 7.84 - 7.74 (m, 2H), 7.46 - 7.32 (m, 5H), 7.20 (d, J = 2.0 Hz, 1H), 5.19 (br s, 1H), 4.95 - 4.85 (m, 1H), 4.55 (d, J = 9.6 Hz, 1H), 4.44 (t, J = 8.0 Hz, 1H), 4.28 (br s, 1H), 3.96 (s, 2H), 3.75 (br s, 4H), 3.67 - 3.49 (m, 12H), 3.09 (br s, 4H), 2.75 - 2.64 (m, 2H), 2.55 (br t, J = 5.6 Hz, 1H), 2.44 (d, J = 4.4 Hz, 9H), 2.09 - 1.94 (m, 3H), 1.82 - 1.70 (m, 3H), 1.37 (d, J = 7.2 Hz, 3H), 0.94 (s, 9H).
N-(6'-((1-(2-(2-(2-((2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소이소인돌린-5-일)옥시)에톡시)에톡시)에틸피페리딘-4-일)옥시)-2-메틸-5'-모르폴리노-[3,3'-비피리딘]-5-일)-3-(트리플루오로메틸)벤즈아미드(실시예 356)의 예시적인 합성
단계 1: 2-(2-(2-하이드록시에톡시)에톡시)에틸 4-메틸벤젠설포네이트 제조
디클로로메탄(50 mL) 중 2-[2-(2-하이드록시에톡시)에톡시]에탄올(5.00 g, 33.29 mmol, 1.00당량) 및 4-메틸벤젠설포닐 클로라이드(1.59 g, 8.32 mmol, 0.25당량)의 혼합물에 트리에틸아민(1.68 g, 16.65 mmol, 2.3 mL, 0.5당량)을 질소 하에 25℃에서 일회분으로 첨가하였다. 혼합물을 25℃에서 12시간 동안 교반하였다. 혼합물을 염수(30 mL Х 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르/에틸 아세테이트 = 1/1 내지 0:1)로 정제하여 2-[2-(2-하이드록시에톡시)에톡시]에틸 4-메틸벤젠설포네이트(1.72 g, 5.65 mmol, 17% 수율)를 무색 오일로서 수득하였다. 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 7.81 (d, J = 8.3 Hz, 2H), 7.35 (d, J = 8.0 Hz, 2H), 4.22 - 4.15 (m, 2H), 3.79 - 3.67 (m, 4H), 3.67 - 3.56 (m, 6H), 2.46 (s, 3H).
단계 2:삼차-부틸 5-아미노-4-(((벤질옥시)카르보닐)아미노)-5-옥소펜타노에이트 제조
디옥산(400 mL) 중 2-(벤질옥시카르보닐아미노)-5-삼차-부톡시-5-옥소-펜타논산(40 g, 118.56 mmol, 1당량), 피리딘(18.76 g, 237.13 mmol, 2당량) 및 디-삼차-부틸 디카르보네이트(41.40 g, 189.70 mmol, 1.6당량)의 혼합물을 0℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 그런 다음, 암모늄 중탄산염(28.12 g, 355.69 mmol, 3당량)을 0℃에서 반응 혼합물에 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 12시간 동안 교반하였다. 혼합물을 물(1000 mL)의 첨가로 급냉시키고, 에틸 아세테이트(200 mL * 4)로 추출하고, 합쳐진 유기상을 염수(200 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에서 농축시켰다. 잔류물을 석유 에테르/에틸 아세테이트(V/V=3:1, 100 mL)로 연화시키고 여과로 수집하였다. 화합물 삼차-부틸 5-아미노-4-(벤질옥시카르보닐아미노)-5-옥소-펜타노에이트(35 g, 104.05 mmol, 87% 수율)를 백색 고체로서 수득하였다. 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 7.44 - 7.31 (m, 5H), 6.34 (d, J=2.8 Hz, 1H), 5.83 - 5.63 (m, 1H), 5.45 (s, 1H), 5.13 (s, 2H), 4.50 - 4.17 (m, 1H), 2.57 - 2.45 (m, 1H), 2.41 - 2.31 (m, 1H), 2.19 - 2.06 (m, 1H), 1.96 (d, J=7.2, 14.4 Hz, 1H), 1.49 - 1.43 (m, 9H).
단계 3:삼차-부틸 4,5-디아미노-5-옥소펜타노에이트의 제조
메탄올(300 mL) 중 삼차-부틸 5-아미노-4-(벤질옥시카르보닐아미노)-5-옥소-펜타노에이트(30 g, 89.18 mmol, 1당량) 용액에 탄소 상 팔라듐(8 g, 10% 순도)을 질소 분위기 하에 첨가하였다. 현탁액을 진공 중에서 탈기하고 수소로 수차례 퍼지하였다. 혼합물을 수소 하(45 PSI) 40℃에서 12시간 동안 교반하였다. 혼합물을 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 잔류물은 추가적인 정제 없이 다음 단계에 사용되었다. 화합물 삼차-부틸 4,5-디아미노-5-옥소-펜타노에이트 (17 g, 84.05 mmol, 94% 수율)를 회색 고체로서 수득하였다. 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 7.32 (s, 1H), 6.98 (s, 1H), 3.10 (m, 1H), 3.04 - 2.58 (m, 2H), 2.24 (m, 2H), 1.84 - 1.70 (m, 1H), 1.65 - 1.50 (m, 1H), 1.40 (s, 9H).
단계 4: 메틸 4-((삼차-부틸디메틸실릴)옥시)-2-메틸벤조에이트 제조
디메틸포름아미드(100 mL) 중 메틸 4-하이드록시-2-메틸-벤조에이트(5.00 g, 30.09 mmol, 1.00당량)의 용액에 이미다졸(6.15 g, 90.27 mmol, 3.00당량)을 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 0.5시간 동안 교반한 다음, 클로로트리메틸실란(6.80 g, 45.14 mmol, 5.5 mL, 1.50당량)을 첨가하였다. 생성된 혼합물을 15℃에서 또 다른 14.5시간 동안 교반하였다. 혼합물을 포화 염수(300 mL)에 붓고 나서, 에틸 아세테이트(300 mL *2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 1 M 염산(300 mL * 2), 염수(300 mL * 3)로 세척하고, 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켜 메틸 4-[삼차-부틸(디메틸)실릴] 옥시-2-메틸-벤조에이트(8.00 g, 28.53 mmol, 95% 수율)를 무색 오일로서 수득하였고, 이는 추가 정제 없이 다음 단계에 사용되었다. LC/MS (ESI) m/z: 281.2 [M+1] +.
단계 5: 메틸 2-(브로모메틸)-4-((삼차-부틸디메틸실릴)옥시)벤조에이트 제조
사염화탄소(40 mL) 중 메틸 4-[삼차-부틸(디메틸)실릴]옥시-2-메틸-벤조에이트(3.00 g, 10.70 mmol, 1.00당량)의 용액에 N-브로모석신이미드(2.29 g, 12.84 mmol, 1.20당량) 및 2,2-아조비스이소부티로니트릴(88 mg, 0.54 mmol, 0.05당량)을 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 0.5시간 동안 교반한 다음, 80℃로 가열하고, 80℃에서 2.5시간 동안 추가로 교반하였다. 혼합물을 물(300 mL)에 붓고, 유기층을 분리하였다. 수성 층을 디클로로메탄(200 mL * 2)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 포화 염수(300 mL * 3)로 세척하고, 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켜 메틸 2-(브로모메틸)-4-[삼차-부틸(디메틸)실릴]옥시-벤조에이트(4.00 g, 8.39 mmol, 78% 수율, 75% 순도)를 연황색 오일로서 수득하였고, 이는 추가 정제 없이 다음 단계에서 직접 사용되었다. LC/MS (ESI) m/z: 359.0/361.0 [M+1] +.
단계 6: 삼차-부틸 5-아미노-4-(5-하이드록시-1-옥소이소인돌린-2-일)-5-옥소펜타노에이트 제조
아세토니트릴(150 mL) 중 메틸 2-(브로모메틸)-4-[삼차-부틸(디메틸)실릴]옥시-벤조에이트(10 g, 27.83 mmol, 1당량) 및 삼차-부틸 4,5-디아미노-5-옥소-펜타노에이트(5.63 g, 27.83 mmol, 1당량)의 혼합물에 디이소프로필에틸아민(14.39 g, 111.32 mmol, 4당량)을 첨가하였다. 혼합물을 80℃에서 12시간 동안 교반하였다. 혼합물을 물(200 mL)의 첨가로 급냉시키고, 에틸 아세테이트(40 mL * 6)로 추출하고, 합쳐진 유기상을 염수(50 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에서 농축시켰다. 잔류물을 분취-HPLC로 정제하여 삼차-부틸 5-아미노-4-[5-[삼차-부틸(디메틸)실릴]옥시-1-옥소-이소인돌린-2-일]-5-옥소-펜타노에이트(3 g, 6.69 mmol, 24% 수율)를 황색 오일로서 수득하고, 삼차-부틸 5-아미노-4-(5-하이드록시-1-옥소-이소인돌린-2-일)-5-옥소-펜타노에이트(4 g, 11.96 mmol, 42% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다.
단계 7: 삼차-부틸 5-아미노-4-(5-(2-(2-(2-하이드록시에톡시)에톡시)에톡시)-1-옥소이소인돌린-2-일)-5-옥소펜타노에이트 제조
N,N-디메틸 포름아미드(4 mL) 중 2-[2-(2-하이드록시에톡시)에톡시]에틸 4-메틸벤젠설포네이트(251 mg, 0.82 mmol, 1.2당량)의 용액에 탄산칼륨(285 mg, 2.06 mmol, 3당량), 요오드화칼륨(114 mg, 0.68 mmol, 1당량) 및 삼차-부틸 5-아미노-4-(5-하이드록시-1-옥소이소인돌린-2-일)-5-옥소-펜타노에이트(230 mg, 0.68 mmol, 1당량)을 첨가하였다. 혼합물을 80℃에서 1시간 동안 교반하였다. 용액을 물(20 mL)로 급냉시키고 디클로로메탄/메탄올=10:1(20 mL x 8)로 추출하였다. 유기층을 포화 염수(20 mL x 1)로 세척하고, 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 잔류물을 분취-박층 크로마토그래피(디클로로메탄:메탄올 = 10:1)로 정제하여 삼차-부틸 5-아미노-4-[5-[2-[2-(2-하이드록시에톡시)에톡시]에톡시]-1-옥소-이소인돌린-2-일]-5-옥소-펜타노에이트(275 mg, 0.58 mmol, 85% 수율)를 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 467.4 [M+1] +.
단계 8: 삼차-부틸 5-아미노-5-옥소-4-(1-옥소-5-(2-(2-(2-(토실옥시)에톡시)에톡시)에톡시)이소인돌린-2-일)펜타노에이트 제조
N,N-디메틸 포름아미드(4 mL) 중 메탄설포닐 염화물(224 mg, 1.18 mmol, 2당량)의 용액에 트리에틸아민(178 mg, 1.77 mmol, 3당량) 및 디메틸아미노피리딘(14 mg, 0.11 mmol, 0.2당량) 및 삼차-부틸 5-아미노-4-[5-[2-[2- (2-하이드록시에톡시)에톡시]에톡시]-1-옥소-이소인돌린-2-일]-5-옥소-펜타노에이트(275 mg, 0.58 mmol, 1당량)을 첨가하였다. 혼합물을 20℃에서 1시간 동안 교반하였다. 용액을 물(10 mL)로 급냉시키고 디클로로메탄:메탄올=10:1(10 mL x 4)로 추출하였다. 유기층을 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 감압 하에 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 잔류물을 분취-박층 크로마토그래피(디클로로메탄:메탄올 = 10:1)로 정제하여 삼차-부틸 5-아미노-5-옥소-4-[1-옥소-5-[2-[2-[2-(p-톨릴설포닐옥시)에톡시]에톡시]에톡시]이소인돌린-2-일]펜타노에이트(220 mg, 0.35 mmol, 60% 수율)를 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 621.4 [M+1] +.
단계 9:삼차-부틸 5-아미노-4-(5-(2-(2-(2-(4-((2'-메틸-5-모르폴리노-5'-(3-(트리플루오로메틸)벤즈아미도)-[3,3'-비피리딘]-6-일)옥시)피페리딘-1-일)에톡시)에톡시)에톡시)-1-옥소이소인돌린-2-일)-5-옥소펜타노에이트 제조
아세토니트릴(5 mL) 중 N-[6-메틸-5-[5-모르폴리노-6-(4-피페리딜옥시)-3-피리딜]-3-피리딜]-3-(트리플루오로메틸)벤즈아미드(204 mg, 0.35 mmol, 1당량, 염화수소)의 용액에 N,N-디이소프로필에틸아민(137 mg, 1.06 mmol, 3당량) 및 요오드화칼륨(58 mg, 0.35 mmol, 1당량) 및 5-아미노-5-옥소-4-[1-옥소-5-[2-[2-[2-(p-톨릴설포닐옥시)에톡시]에톡시]에톡시]이소인돌린-2-일]펜타노에이트(220 mg, 0.35 mmol, 1당량)을 첨가하였다. 혼합물을 100℃에서 1시간 동안 교반하였다. 용액을 물(10 ml)로 급냉시키고 디클로로메탄:메탄올=10:1(10 mL x 3)로 추출하였다. 유기층을 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 감압 하에 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 잔류물을 분취-박층 크로마토그래피(디클로로메탄:메탄올 = 10:1)로 정제하여 삼차-부틸 5-아미노-4-[5-[2-[2-[2-[4-[[5-[2-메틸-5-[[3-(트리플루오로메틸)벤조일]아미노]-3-피리딜]-3-모르폴리노-2-피리딜]옥시]-1-피페리딜]에톡시]에톡시]에톡시]-1-옥소-이소인돌린-2-일]-5-옥소-펜타노에이트(141 mg, 0.13 mmol, 37% yield, 93% 순도)를 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 991.5 [M+1] +.
단계 10: N-(6'-((1-(2-(2-(2-((2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소이소인돌린-5-일)옥시)에톡시)에톡시)에틸)피페리딘-4-일)옥시)-2-메틸-5'-모르폴리노-[3,3'-비피리딘]-5-일)-3-(트리플루오로메틸)벤즈아미드 제조
아세토니트릴(1 mL) 중 삼차-부틸 5-아미노-4-[5-[2-[2-[2-[4-[[5-[2-메틸-5-[[3-(트리플루오로메틸)벤조일]아미노]-3-피리딜]-3-모르폴리노-2-피리딜]옥시]-1-피페리딜]에톡시]에톡시]에톡시]-1-옥소-이소인돌린-2-일]-5-옥소-펜타노에이트(141 mg, 0.14 mg, 1당량)의 용액에 벤젠설폰산(80 mg, 0.42 mmol, 3당량)을 첨가하였다. 혼합물을 100℃에서 1시간 동안 교반하였다. 용액을 물(10 ml)로 급냉시키고 디클로로메탄:메탄올=10:1(10 mL x 3)로 추출하였다. 유기층을 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 감압 하에 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 잔류물을 분취-박층 크로마토그래피(디클로로메탄:메탄올 = 10:1)로 정제하여 N-[5-[6-[[1-[2-[2-[2-[2-(2,6-디옥소-3-피페리딜) 1-옥소-이소인돌린-5-일]옥시에톡시]에톡시]에틸]-4-피페리딜]옥시]-5-모르폴리노-3-피리딜]-6-메틸-3-피리딜]-3-(트리플루오로메틸)벤즈아미드(54.1 mg, 0.057 mmol, 40% 수율, 97% 순도)를 갈색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 916.3 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 10.94 (s, 1H), 10.65 (s, 1H), 8.84 (s, 1H), 8.36 - 8.23 (m, 2H), 8.08 - 7.94 (m, 2H), 7.87 - 7.74 (m, 2H), 7.61 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.24 - 7.14 (m, 2H), 7.06 (d, J=8.4 Hz, 1H), 5.20 (s, 1H), 5.06 (dd, J=5.2, 13.2 Hz, 1H), 4.39 - 4.17 (m, 4H), 3.84 - 3.73 (m, 6H), 3.66 - 3.50 (m, 6H), 3.09 (s, 5H), 2.59 (s, 4H), 2.45 - 2.36 (m, 7H), 1.99 (s, 3H), 1.75 (s, 2H), 1.82 - 1.68 (m, 1H)
N-(6'-(4-(2-(2-(2-((2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1,3-디옥소이소인돌린-5-일)옥시)에톡시)에톡시)에톡시)페녹시)-2-메틸-5'-모르폴리노-[3,3'-비피리딘]-5-일)-3-(트리플루오로메틸)벤즈아미드(실시예 468)의 예시적인 합성
단계 1: N-(2-메틸-5'-모르폴리노-6'-(4-((테트라하이드로-2H-피란-2-일)옥시)페녹시)-[3,3'-비피리딘]-5-일)-3-(트리플루오로메틸)벤즈아미드 제조
1-메틸-2-피롤리디논(15 mL) 중 4-테트라하이드로피란-2일옥시페놀(949 mg, 4.89 mmol, 1.5당량)의 혼합물에 칼륨 삼차-부톡시드(731 mg, 6.52 mmol, 2당량) 및 N-[5-(6-플루오로-5-모르폴리노-3-피리딜)-6-메틸-3-피리딜]-3-(트리플루오로메틸) 벤즈아미드(1.5 g, 3.26 mmol, 1당량)를 15℃에서 일회분으로 첨가하였다. 혼합물을 마이크로웨이브 하에 140℃에서 2시간 동안 교반하였다. 혼합물을 물(50 mL)로 세척하였다. 수성층을 에틸 아세테이트(30 mL x 7)로 추출하였다. 모든 합쳐진 유기층을 염수로 세척하고, 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 농축시켰다. 잔류물을 분취-고성능 액체 크로마토그래피로 정제하여 갈색 고체를 수득하였다. N-[6-메틸-5-[5-모르폴리노-6-(4-테트라하이드로피란-2-일옥시페녹시)-3-피리딜]-3-피리딜]-3-(트리플루오로메틸)벤즈아미드(600 mg, 0.94 mmol, 29% 수율)를 갈색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 635.1 [M+1] +.
단계 2: N-(6'-(4-하이드록시페녹시)-2-메틸-5'-모르폴리노-[3,3'-비피리딘]-5-일)-3-(트리플루오로메틸)벤즈아미드 제조
디클로로메탄(5 mL) 중 N-[6-메틸-5-[5-모르폴리노-6-(4-테트라하이드로피란-2-일옥시페녹시)-3-피리딜]-3-피리딜]-3-(트리플루오로메틸)벤즈아미드(200 mg, 0.31 mmol, 1당량)의 혼합물에 염산/디옥산(4 M, 2 mL, 20당량)을 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 30분 동안 교반하였다. 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 잔류물은 추가적인 정제 없이 다음 단계에 사용되었다. 화합물 N-[5-[6-(4-하이드록시페녹시)-5-모르폴리노-3-피리딜]-6-메틸-3-피리딜]-3-(트리플루오로메틸)벤즈아미드(200 mg, 미정제, 염화수소)를 갈색 고체로서 수득하였다.
단계 3: N-(6'-(4-(2-(2-(2-브로모에톡시에톡시)에톡시)페녹시)-2-메틸-5'-모르폴리노-[3,3'-비피리딘]-5-일)-3-(트리플루오로메틸)벤즈아미드 제조
아세토니트릴(5 mL) 중 N-[5-[6-(4-하이드록시페녹시)-5-모르폴리노-3-피리딜]-6-메틸-3-피리딜]-3-(트리플루오로메틸)벤즈아미드(200 mg, 0.36 mmol, 1당량)의 용액에 탄산칼륨(151 mg, 1.09 mmol, 3당량) 및 1,2-비스(2-브로모에톡시)에탄(250.64 mg, 908.22 umol, 2.5당량)을 첨가하였다. 혼합물을 60℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 여과하고, 여과물을 농축시켰다. 잔류물을 분취-TLC(디클로로메탄:메탄올 = 10:1)로 정제하였다. 화합물 N-[5-[6-[4-[2-[2-(2-브로모에톡시)에톡시]에톡시]페녹시]-5-모르폴리노-3-피리딜]-6-메틸-3-피리딜]-3-(트리플루오로메틸)벤즈아미드(160 mg, 0.21 mmol, 59% 수율)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 747.0 [M+1] +.
단계 4: 2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-하이드록시이소인돌린-1,3-디온 제조
아세트산(45 mL) 중 3-아미노피페리딘-2,6-디온(4.1 g, 24.7 mmol, 1.50당량, HCl 염)의 용액에 아세트산 나트륨(4.1 g, 49.4 mmol, 3.00당량)을 첨가한 다음, 혼합물을 25℃에서 1시간 동안 교반하였다. 이어서, 4-하이드록시프탈산(3.0g, 16.5 mmol, 1.00당량)을 혼합물에 첨가하고 120℃로 가열하고, 추가로 11시간 동안 교반하였다. 혼합물을 농축시킨 다음, 물(20 mL)에 붓고, 여과하였다. 미정제 생성물을 컬럼 크로마토그래피(디클로로메탄:메탄올=50: 1 내지 10: 1)로 정제하여 2-(2,6-디옥소-3-피페리딜)-5-하이드록시-이소인돌린-1,3-디온(3.9 g, 14.3 mmol, 86% 수율)을 무색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 275 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ11.19 - 10.94 (m, 2H), 7.75 (d, J=8.0 Hz, 1H), 7.20 - 7.08 (m, 2H), 5.08 (dd, J=5.2, 12.8 Hz, 1H), 3.34 (br s, 1H), 2.95 - 2.81 (m, 1H), 2.64 - 2.55 (m, 1H), 2.08 - 1.98 (m, 1H).
단계 5: N-(6'-(4-(2-(2-(2-((2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1,3-디옥소이소인돌린-5-일)옥시)에톡시)에톡시)에톡시)페녹시)-2-메틸-5'-모르폴리노-[3,3'-비피리딘]-5-일)-3-(트리플루오로메틸)벤즈아미드 제조
디메틸 포름아미드(2 mL) 중 N-[5-[6-[4-[2-[2-(2-브로모에톡시)에톡시]에톡시]페녹시]-5-모르폴리노-3-피리딜]-6-메틸-3-피리딜]-3-(트리플루오로메틸)벤즈아미드(80 mg, 0.11 mmol, 1당량)의 용액에 탄산칼륨(44 mg, 0.32 mmol, 3당량) 및 2-(2,6-디옥소-3-피페리딜)-5-하이드록시-이소인돌린-1,3-디온(44 mg, 0.16 mmol, 1.5당량)을 첨가하였다. 혼합물을 60℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 여과하고, 여과물을 농축시켰다. 잔류물을 분취-HPLC로 정제하였다. 화합물 N-[5-[6-[4-[2-[2-[2-[2-(2,6- 디옥소-3-피페리딜)-1,3-디옥소-이소인돌린-5-일]옥시에톡시]에톡시]에톡시]페녹시]-5-모르폴리노-3-피리딜]-6-메틸-3-피리딜]-3-(트리플루오로메틸)벤즈아미드(25.8 mg, 0.02 mmol, 25% 수율, 97% 순도)를 회색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 939.2 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 11.10 (d, J=1.0 Hz, 1H), 10.73 - 10.60 (m, 1H), 8.85 (d, J=2.4 Hz, 1H), 8.32 (s, 1H), 8.28 (d, J=7.7 Hz, 1H), 8.05 (d, J=2.3 Hz, 1H), 7.99 (d, J=8.0 Hz, 1H), 7.86 - 7.77 (m, 2H), 7.71 (d, J=2.1 Hz, 1H), 7.46 (d, J=2.2 Hz, 1H), 7.41 - 7.33 (m, 2H), 7.13 - 7.05 (m, 2H), 7.00 - 6.93 (m, 2H), 5.11 (dd, J=5.6, 12.9 Hz, 1H), 4.32 (dd, J=3.6, 5.2 Hz, 2H), 4.16 - 4.02 (m, 2H), 3.84 - 3.79 (m, 2H), 3.78 - 3.73 (m, 6H), 3.64 (s, 4H), 3.56 (d, J=8.8 Hz, 1H), 3.48 - 3.37 (m, 1H), 3.21 - 3.17 (m, 3H), 2.94 - 2.81 (m, 1H), 2.60 (d, J=2.4 Hz, 1H), 2.44 (s, 3H), 2.08 - 1.98 (m, 1H)
(2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-(하이드록시메틸)티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드(실시예 498)의 예시적인 합성
단계 1: (1-(4-브로모페닐)피페리딘-4-일)메탄올 제조
디메틸설폭시드(1.8 L) 중 4-피페리딜메탄올(100 g, 868 mmol, 1당량), 1-브로모-4-요오드-벤젠(245 g, 868 mmol, 1당량), L-PROLINE(40 g, 347 mmol, 0.4당량)의 용액에 요오드화구리(I)(33 g, 173 mmol, 0.2당량) 및 탄산칼륨(240 g, 1.74몰, 2당량)을 첨가하였다. 혼합물을 진공 중에서 탈기하고 질소로 3 회 퍼지하였다. 그런 다음 혼합물을 질소 하에서 90℃로 12시간 동안 가열하였다. 반응 혼합물을 1.0 L 물에 붓고 1시간 동안 교반하였다. 그런 다음 혼합물을 에틸 아세테이트(1000 mL * 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(1 L * 3)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트=10:1 내지 3:1)로 정제하였다. [1-(4-브로모페닐)-4-피페리딜]메탄올(120 g, 444 mmol, 51% 수율)을 백색 고체로서 수득하였다. 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 7.46 - 7.28 (m, 2H), 6.88 - 6.75 (m, 2H), 4.49 (t, J=5.2 Hz, 1H), 3.69 - 3.66 (m, 2H), 3.28 (t, J=6.0 Hz, 2H), 2.66 - 2.60 (m, 2H), 1.75 - 1.70 (m, 2H), 1.52 - 1.51 (m, 1H), 1.24 - 1.18 (m, 2H).
단계 2: 1-(4-브로모페닐)피페리딘-4-카브알데히드 제조
디클로로메탄(550 mL) 중 옥살릴 염화물(140.94 g, 1.11 mol, 3당량)의 용액에 디클로로메탄(550 mL) 중 디메틸설폭시드(115.68 g, 1.48 mol, 4당량)의 용액을 질소 하에 0.5시간의 기간에 걸쳐 -68℃에서 적가하였다. 혼합물을 -68℃에서 30분 동안 교반한 다음, 디클로로메탄(1000 mL) 중 [1-(4-브로모페닐)-4-피페리딜]메탄올(100 g, 370.14 mmol, 1당량)의 용액을 -68℃에서 적가하였다. 혼합물을 -68℃에서 0.5시간 동안 추가로 교반하였다. 트리에틸아민(299.64 g, 2.96 mol, 8당량)을 -68℃에서 반응 혼합물에 적가하였다. 생성된 혼합물을 -68℃에서 2시간 동안 교반하였다. 염화 암모늄(500 mL)으로 25℃에서 반응 혼합물을 급냉시키고, 에틸 아세테이트(600 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(400 mL x 3)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 석유 에테르로(300 mL) 연화시켰다. 1-(4-브로모페닐)피페리딘-4-카브알데히드(93 g, 346.82 mmol, 93% 수율)를 황색 고체로서 수득하였다. 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 9.72 (s, 1H), 7.54 - 7.34 (m, 2.0 H), 6.85 - 6.74 (m, 2.0 H), 3.61 - 3.56 (m, 2H), 2.91 - 2.86 (m, 2H), 2.48 - 2.33 (m, 1H), 2.07 - 2.04 (m, 2H), 1.82 - 1.80 (m, 2H).
단계 3: 1-(4-브로모페닐)-4-(디메톡시메틸)피페리딘 제조
메틸 알코올(1200 mL) 중 1-(4-브로모페닐)피페리딘-4-카브알데히드(370 g, 1.38 mol, 1당량) 용액에 트리메톡시메탄(732.14 g, 6.90 mol, 5당량) 및 4-메틸벤젠설폰산;수화물(52.49 g, 275.97 mmol, 0.2당량)을 첨가하였다. 혼합물을 25℃에서 12시간 동안 교반하였다. 25℃에서 중탄산 나트륨 500 mL을 첨가하여 반응 혼합물을 급냉시키고 디클로로메탄(500 mL x 3)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(300 mL x 3)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 석유 에테르 및 에틸 아세테이트(1.5 L 석유 에테르: 에틸 아세테이트=20:1)로 연화시켰다. 1-(4-브로모페닐)-4-(디메톡시메틸)피페리딘(366 g, 1.16 mol, 84% 수율)을 적색 고체로서 수득하였다. 모액(45 g)을 플래쉬 크로마토그래피로 추가로 정제하였다. 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 7.52 - 7.33 (m, 2 H), 6.83 - 6.70 (m, 2 H), 4.10 (dd, J=2.4 Hz, J=7.2 Hz, 1H), 3.69 - 3.66 (m, 2H), 3.40 (s, 6H), 2.71 - 2.65 (m, 2H), 1.88 - 1.87 (m, 2H), 1.85 - 1.84 (m, 1H),1.48 - 1.44 (m, 2H).
단계 4: 4-(디메톡시메틸)-1-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보란-2-일)페닐)피페리딘 제조
디옥산(10 mL) 중 1-(4-브로모페닐)-4-(디메톡시메틸)피페리딘(1 g, 3.18 mmol, 1당량), 4,4,5,5-테트라메틸-2-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-1,3,2-디옥사보로란(969 mg, 3.82 mmol, 1.2당량), 디삼차-부틸(시클로펜틸)포스판;디클로로팔라듐;철(207 mg, 0.31 mmol, 0.1당량) 및 아세트산 칼륨(624 mg, 6.37 mmol, 2당량)을 탈기시키고 나서 질소 하에서 100℃로 12시간 동안 가열하였다. 반응 혼합물을 에틸 아세테이트(50 mL)로 희석하고, 여과하고, 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르/에틸 아세테이트=50:1 내지 10:1)로 정제하였다. 4-(디메톡시메틸)-1-[4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐]피페리딘(500 mg, 1.38 mmol, 43% 수율)을 백색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 362.2 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 7.71 (d, J=8.8 Hz, 2H), 6.92 (d, J=8.8 Hz, 2H), 4.08 (d, J=6.9 Hz, 1H), 3.85 (d, J=12.5 Hz, 2H), 3.39 (s, 6H), 2.75 (dt, J=2.2, 12.5 Hz, 2H), 1.91 - 1.75 (m, 3H), 1.49 - 1.38 (m, 2H), 1.35 (s, 12H).
단계 5: (R)-N-(3-(5-(4-(4-(디메톡시메틸)피페리딘-1-일)페닐)-1-((2-(트리메틸실릴)에톡시)메틸)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로-N-((2-(트리메틸실릴)에톡시)메틸)피롤리딘-1-설폰아미드 제조
디옥산(15 mL) 및 물(1.5 mL) 중 4-(디메톡시메틸)-1-[4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐]피페리딘(800 mg, 2.21 mmol, 1당량), (3R)-N-[3-[5-브로모-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로-페닐]-3-플루오로-N-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤리딘-1-설폰아미드(1.69 g, 2.21 mmol, 1당량), 불화세슘(1.35 g, 8.86 mmol, 4당량) 및 4-디삼차-부틸포스파닐-N,N-디메틸-아닐린;디클로로팔라듐(156 mg, 0.22 mmol, 0.1당량)을 탈기시키고 나서 질소 하에서 85℃로 12시간 동안 가열하였다. 반응 혼합물을 물(50 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(50 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(50 mL x 3)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르/에틸 아세테이트=50/1 내지 5/1)로 정제하였다. (3R)-N-[3-[5-[4-[4-(디메톡시메틸)-1-피페리딜]페닐]-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로-페닐]-3-플루오로-N-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤리딘-1-설폰아미드(1.5 g, 1.63 mmol, 73% 수율)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 918.1 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 8.72 (d, J=2.0 Hz, 1H), 8.55 (s, 1H), 8.34 (s, 1H), 7.77 (dt, J=6.0, 8.8 Hz, 1H), 7.59 (d, J=8.8 Hz, 2H), 7.43 - 7.36 (m, 1H), 7.06 (d, J=8.8 Hz, 2H), 5.68 (s, 2H), 5.43 - 5.21 (m, 1H), 5.01 - 4.89 (m, 2H), 4.12 - 4.07 (m, 1H), 3.81 (d, J=12.4 Hz, 2H), 3.68 - 3.61 (m, 2H), 3.57 (t, J=8.0 Hz, 2H), 3.50 (s, 1H), 3.45 - 3.38 (m, 2H), 3.30 - 3.25 (m, 7H), 2.20 - 2.00 (m, 2H), 1.78 - 1.66 (m, 3H), 1.42 - 1.27 (m, 2H), 1.21 - 1.13 (m, 1H), 0.91 - 0.77 (m, 4H), -0.02 (s, 9H), -0.09 - -0.14 (m, 9H).
단계 6: (R)-N-(3-(5-(4-(4-(디메톡시메틸)피페리딘-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 제조
메탄올(10 mL) 중 (3S)-N-[3-[5-[4-[4-(디메톡시메틸)-1-피페리딜]페닐]-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로-페닐]-3-플루오로-N-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤리딘-1-설폰아미드(1.4 g, 1.52 mmol, 1당량)의 용액에 염산(디옥산 중 4 M, 20 mL)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 50℃에서 24시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. (3R)-N-[3-[5-[4-[4- (디메톡시메틸)-1-피페리딜]페닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로-페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드(900 mg, 1.37 mmol, 89% 수율)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 658.1 [M+1] +.
단계 7: (R)-N-(2,4-디플루오로-3-(5-(4-(4-포르밀피페리딘-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 제조
테트라하이드로푸란(18 mL) 중 (3R)-N-[3-[5-[4-[4-(디메톡시메틸)-1-피페리딜]페닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로-페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드(900 mg, 1.37 mmol, 1당량)의 용액에 황산(3 M, 18 mL, 40당량)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 50℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 수산화나트륨(물 중 1 M)으로 pH를 8까지 조정하고, 에틸 아세테이트(50 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(100 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트(15 mL)로 연화시켰다. (3R)-N-[2,4-디플루오로-3-[5-[4-(4-포르밀-1-피페리딜)페닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드(710 mg, 1.16 mmol, 84% 수율)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 630.1 [M+19] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.91 (s, 1H), 9.87 (s, 1H), 9.65 (s, 1H), 8.76 - 8.46 (m, 2H), 8.23 - 8.01 (m, 1H), 7.72 - 7.51 (m, 3H), 7.35 - 7.22 (m, 1H), 7.15 - 6.97 (m, 2H), 5.48 - 5.13 (m, 1H), 3.70 (d, J=12.8 Hz, 2H), 3.60 (t, J=6.0 Hz, 1H), 3.48 (s, 1H), 3.36 - 3.24 (m, 2H), 2.98 - 2.83 (m, 2H), 2.09 (dd, J=7.6, 12.8 Hz, 1H), 1.99 - 1.87 (m, 3H), 1.75 (t, J=6.4 Hz, 1H), 1.67 - 1.51 (m, 2H), 0.91 - 0.75 (m, 2H).
단계 8: 삼차-부틸 (S)-(1-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)에틸)카바메이트 제조
디옥산 (100 mL) 중 삼차-부틸 N-[(1S)-1-(4-브로모페닐)에틸]카바메이트(5 g, 16.66 mmol, 1당량)와 4,4,5,5-테트라메틸-2-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-1,3,2-디옥사보로란(5.08 g, 19.99 mmol, 1.2당량)의 용액에 [1,1'-비스(디페닐포스피노)페로센]디클로로팔라듐(II)(974.98 mg, 1.33 mmol, 0.08당량) 및 아세트산 칼륨(3.27 g, 33.31 mmol, 2당량)을 첨가하였다. 혼합물을 90℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 농축시켜 미정제 생성물을 수득하였다. 미정제 생성물을 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트=1:0 내지 10:1)로 정제하였다. 화합물 삼차-부틸 N-[(1S)-1-[4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐]에틸]카바메이트(8.2 g, 16.44 mmol, 98.7% 수율, 69.6% 순도)를 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 370.26 [M+23] +.
단계 9: 에틸 (S)-5-(4-(1-((삼차-부톡시카르보닐)아미노)에틸)페닐)티아졸-4-카르복실레이트 제조
디옥산(130 mL)과 물(22 mL)의 혼합물 중 에틸 5-브로모티아졸-4-카르복실레이트(3.49 g, 14.77 mmol, 0.9당량), 삼차-부틸 N-[(1S)-1-[4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐]에틸]카바메이트(5.70 g, 16.41 mmol, 1당량), [1,1'-비스(디페닐포스피노)페로센]디클로로팔라듐(II)(120 mg, 0.16 mmol, 0.01당량), 탄산 칼륨(4.54 g, 32.83 mmol, 2당량)의 혼합물을 탈기하고 질소로 3회 퍼지한 다음, 혼합물을 질소 분위기 하에 80℃에서 10시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 농축시키고 물(50 mL)고 급냉시킨 다음, 에틸 아세테이트(60 mL)로 2회 추출하였다. 합쳐진 유기층을 포화 염화 나트륨 용액(50 mL)으로 2회 세척하고, 무수 황산 나트륨으로 건조시키고, 농축시켜 미정제 생성물을 수득하였다. 미정제 생성물을 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트 = 1:0 내지 1:1)로 정제하였다. 화합물 에틸 5-[4-[(1S)-1-(삼차-부톡시카르보닐아미노)에틸]페닐]티아졸-4-카르복실레이트(5.07 g, 13.48 mmol, 82.1% 수율)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 377.1 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 8.76 (s, 1H), 7.49 (d, J = 8.0 Hz, 2H), 7.37 (d, J = 8.0 Hz, 2H), 4.85 (s, 2H), 4.35 - 4.29 (m, 2H), 1.44 (s, 9H), 1.28 (t, J = 7.2 Hz, 3H), 1.24 (s, 3H).
단계 10: 삼차-부틸 (S)-(1-(4-(4-(하이드록시메틸)티아졸-5-일)페닐)에틸)카바메이트 제조
물(40 mL)과 테트라하이드로푸란(20 mL) 중 에틸 5-[4-[(1S)-1-(삼차-부톡시카르보닐아미노)에틸]페닐]티아졸-4-카르복실레이트(900 mg, 2.39 mmol, 1당량)와 염화 칼슘(796 mg, 7.17 mmol, 3당량)의 혼합물에 수소화 붕소 나트륨(181 mg, 4.78 mmol, 2당량)을 질소 하에 0℃에서 첨가하였다. 혼합물을 5℃로 가온하고 2시간 동안 교반하였다. 그런 다음 염산(5 M, 4.50 mL)과 아세톤(4.95 mL)을 0℃에서 첨가하고, 반응 혼합물을 5℃에서 0.5시간 동안 추가로 교반하였다. 5 M 수산화 나트륨으로 pH를 5로 조정하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(20 mL Х 4)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수(20 mL Х 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 반-분취 역상 HPLC로 정제하였다. 화합물 삼차-부틸 N-[(1S)-1-[4-[4-(하이드록시메틸)티아졸-5-일]페닐]에틸]카바메이트(400 mg, 1.20 mmol, 50.0% 수율)를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 335.2 [M+1] +.
단계 11: (S)-(5-(4-(1-아미노에틸)페닐)티아졸-4-일)메탄올 제조
디클로로메탄(1.5 mL) 중 삼차-부틸 N-[(1S)-1-[4-[4-(하이드록시메틸)티아졸-5-일]페닐]에틸]카바메이트(0.4 g, 1.20 mmol, 1당량)의 혼합물을 15℃에서 염산/디옥산(4 M, 10 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 2시간 동안 교반하였다. 혼합물을 45℃에서 감압 하에 농축시켰다. 화합물 [5-[4-[(1S)-1-아미노에틸]페닐]티아졸-4-일]메탄올(380 mg, 미정제, 염화수소)을 백색 고체로서 수득하였다.
단계 12: 삼차-부틸 (2S,4R)-4-하이드록시-2-(((S)-1-(4-(4-(하이드록시메틸)티아졸-5-일)페닐)에틸)카바모일)피롤리딘-1-카르복실레이트 제조
N,N-디메틸포름아미드(15 mL) 중 [5-[4-[(1S)-1-아미노에틸]페닐]티아졸-4-일]메탄올(328 mg, 1.21 mmol, 1.00당량, 염화수소) 및 (2S,4R)-1-삼차-부톡시카르보닐-4-하이드록시-피롤리딘-2-카르복실산(280 mg, 1.21 mmol, 1당량)의 혼합물에 1-(3-디메틸아미노프로필)-3-에틸카보디이미드 염화수소(348 mg, 1.82 mmol, 1.5당량), 1-하이드록시벤조트리아졸(245 mg, 1.82 mmol, 1.5당량), 및 N,N-디이소프로필에틸아민(782 mg, 6.05 mmol, 1.05 mL, 5당량)을 15℃에서 일회분으로 질소 하에 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 16시간 동안 교반하였다. 혼합물을 45℃에서 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 반-분취 역상 HPLC로 정제하였다. 화합물 삼차-부틸 (2S,4R)-4-하이드록시-2-[[(1S)-1-[4-[4-(하이드록시메틸)티아졸-5-일]페닐]에틸]카바모일]피롤리딘-1-카르복실레이트(370 mg, 0.83 mmol, 68% 수율)를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 448.2 [M+1] +.
단계 13: (2S,4R)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-(하이드록시메틸)티아졸-5-일)페닐)메틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
디클로로메탄(1 mL) 중 삼차-부틸 (2S,4R)-4-하이드록시-2-[[(1S)-1-[4-[4-(하이드록시메틸)티아졸-5-일)페닐]에틸]카바모일]피롤리딘-1-카르복실레이트(0.39 g, 0.87 mmol, 1당량)의 용액에 염산/디옥산(4 M, 10 mL)을 첨가하고 15℃에서 1시간 동안 교반하였다. 혼합물을 감압 하에 45℃에서 농축시켰다. (2S,4R)-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-[4-(하이드록시메틸)티아졸-5-일]페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드(360 mg, 미정제, 염화수소)를 백색 고체로서 수득하였다.
단계 14: 삼차-부틸 ((S)-1-((2S,4R)-4-하이드록시-2-(((S)-1-(4-(4-(하이드록시메틸)티아졸-5-일)페닐)에틸)카바모일)피롤리딘-1-일)-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일)카바메이트 제조
N, N-디메틸 포름아미드(40 mL) 중 (2S,4R)-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-[4-(하이드록시메틸)티아졸-5-일]페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드(706 mg, 1.84 mmol, 1당량, 염화수소), (2S)-2-(삼차-부톡시카르보닐아미노)-3,3-디메틸-부탄산(425 mg, 1.84 mmol, 1당량), 하이드록시벤조트리아졸(298 mg, 2.21 mmol, 1.2당량), 디이소프로필에틸아민(1.43 g, 11.04 mmol, 6당량) 카보디이미드 염화수소(705 mg, 3.68 mmol, 2당량)의 용액을 20℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 용액을 물(100 mL)로 세척하였다. 수성층을 에틸 아세테이트(40 mL x 8)로 추출하였다. 모든 합쳐진 유기층을 염수로 세척하고, 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에서 농축시켰다. 잔류물(디클로로메탄:메탄올 = 10:1)을 실리카 겔(에틸 아세테이트:메탄올 = 1:0)을 이용해 컬럼 크로마토그래피로 정제하여 백색 고체를 수득하였다. 삼차-부틸 N-[(1S)-1-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-[[(1S)-1-[4-[4-(하이드록시메틸)티아졸-5-일]페닐]에틸]카바모일]피롤리딘-1-카르보닐]-2,2-디메틸-프로필]카바메이트(400 mg, 0.71 mmol, 38% 수율, 99% 순도)를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 561.3 [M+1] +.
단계 15: (2S,4R)-1-((S)-2-아미노-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-(하이드록시메틸)티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
디클로로메탄 (20 mL) 중 삼차-부틸 N-[(1S)-1-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-[[(1S)-1-[4-[4-(하이드록시메틸)티아졸-5-일]페닐]에틸]카바모일]피롤리딘-1-카르보닐]-2,2-디메틸-프로필]카바메이트(400 mg, 0.71 mmol, 1당량)의 용액에 염산/디옥산(4 M, 20 mL, 113.10당량)을 첨가하였다. 혼합물을 20℃에서 20분 동안 교반하였다. 혼합물을 농축시켜 백색 고체를 수득하였다. 백색 고체를 추가적인 정제 없이 다음 단계에 사용하였다. (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-[4-(하이드록시메틸)티아졸-5-일]페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드(351 mg, 미정제, 염화수소)를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 461.2 [M+1] +.
단계 16: 삼차-부틸 4-(2-(((S)-1-((2S,4R)-4-하이드록시-2-(((S)-1-(4-(4-(하이드록시메틸)티아졸-5-일)페닐)에틸)카바모일)피롤리딘-1-일)-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일)아미노)-2-옥소에틸)피페라진-1-카르복실레이트 제조
N,N-디메틸포름아미드(20 mL) 중 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-[4-(하이드록시메틸)티아졸-5-일]페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드(351 mg, 0.70 mmol, 1당량, 염화수소), 2-(4-삼차-부톡시카르보닐피페라진-1-일)아세트산(172 mg, 0.70 mmol, 1당량), 하이드록시벤조트리아졸(114 mg, 0.85 mmol, 1.2당량), 디이소프로필에틸아민(548 mg, 4.24 mmol, 6당량), 카보디이미드 염화수소(271 mg, 1.41 mmol, 2당량)의 용액을 20℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 용액을 물(100 mL)로 세척하였다. 수성층을 에틸 아세테이트(40 mL x 8)로 추출하였다. 모든 합쳐진 유기층을 염수로 세척하고, 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에서 농축시켰다. 잔류물(디클로로메탄:메탄올 = 10:1)을 실리카 겔(에틸 아세테이트:메탄올 = 1:0)을 이용해 컬럼 크로마토그래피로 정제하여 삼차-부틸 4-[2-[[(1S)-1-[(2S,4R)-4-하이드록시-2- [[(1S)-1-[4-[4-(하이드록시메틸)티아졸-5-일]페닐]에틸]카바모일]피롤리딘-1-카르보닐]-2,2-디메틸-프로필]아미노]-2-옥소-에틸]피페라진-1-카르복실레이트(340 mg, 0.48 mmol, 68% 수율, 97% 순도)를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 687.4 [M+1] +.
단계 17: (2S,4R)-1-((S)-3,3-디메틸-2-(2-(피페라진-1-일)아세트아미도)부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-(하이드록시메틸)티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
디클로로메탄 (10 mL) 중 삼차-부틸 4-[2-[[(1S)-1-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-[[(1S)-1-[4-[4-(하이드록시메틸)티아졸-5-일]페닐]에틸]카바모일]피롤리딘-1-카르보닐]-2,2-디메틸-프로필]아미노]-2-옥소-에틸]피페라진-1-카르복실레이트(340 mg, 0.48 mmol, 1당량)의 용액에 염산/디옥산(4 M, 20 mL, 165.66당량)을 첨가하였다. 혼합물을 20℃에서 20분 동안 교반하였다. 혼합물을 농축시켜 백색 고체를 수득하였다. 백색 고체를 추가적인 정제 없이 다음 단계에 사용하였다. (2S,4R)-1-[(2S)-3,3-디메틸-2-[(2-피페라진-1-일아세틸)아미노]부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-[4-(하이드록시메틸)티아졸-5-일]페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드(300 mg, 미정제, 염화수소)를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 587.4 [M+1] +.
단계 18: (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-(하이드록시메틸)티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
디클로로에탄(8 mL) 중 (2S,4R)-1-[(2S)-3,3-디메틸-2-[(2-피페라진-1-일아세틸)아미노]부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-[4-(하이드록시메틸)티아졸-5-일]페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드(200 mg, 0.32 mmol, 1당량, 염화수소)의 용액을 트리에틸아민(195 mg, 1.93 mmol, 6당량)을 첨가하였다. 혼합물을 20℃에서 20분 동안 교반하였다. 그런 다음, (3R)-N-[2,4-디플루오로-3-[5-[4-(4-포르밀-1-피페리딜)페닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드(196 mg, 0.32 mmol, 1당량)를 혼합물에 첨가하였다. 혼합물을 20℃에서 20분 동안 교반하였다. 트리아세톡시보로히드라이드 나트륨(204 mg, 0.96 mmol, 3당량)을 혼합물에 첨가하였다. 혼합물을 20℃에서 3시간 동안 교반하였다. 반응 용액을 물(20 mL)로 세척하였다. 수성층을 에틸 아세테이트(20 mL x 6)로 추출하였다. 모든 합쳐진 유기층을 염수로 세척하고, 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에서 농축시켰다. 잔류물을 분취-고성능 액체 크로마토그래피로 정제하여 황색 고체를 수득하였다. (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[2-[4-[[1-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-4-피페리딜]메틸]피페라진-1-일]아세틸]아미노]-3,3-디메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-[4-(하이드록시메틸)티아졸-5-일]페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드(148 mg, 0.12 mmol, 37% 수율, 95% 순도)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 1182.4 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.94 (s, 1H), 9.85 (s, 1H), 9.03 (d, J=2.8 Hz, 1H), 8.66 (d, J=2.0 Hz, 1H), 8.56 (s, 1H), 8.41 (d, J=8.0 Hz, 1H), 8.09 (s, 1H), 7.70 - 7.58 (m, 3H), 7.58 - 7.51 (m, 2H), 7.43 - 7.32 (m, 2H), 7.27 (m, 1H), 7.16 (d, J=8.0 Hz, 2H), 5.43 - 5.19 (m, 2H), 5.01 - 4.83 (m, 1H), 4.61 - 4.48 (m, 10H), 4.47 - 4.40 (m, 4H), 4.33 - 4.02 (m, 1H), 3.82 (br d, J=11.6 Hz, 2H), 3.69 - 3.46 (m, 5H), 3.06 - 2.79 (m, 6H), 2.24 - 1.58 (m, 8H), 1.52 - 1.29 (m, 5H), 1.04 - 0.88 (m, 9H).
(2S,4R)-1-((R)-2-(3-(4-((1-(5-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)피리미딘-2-일)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)이속사졸-5-일)-3-메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드(실시예 403)의 예시적인 합성
단계 1: 벤질 4-(디메톡시메틸)피페리딘-1-카르복실레이트 제조
메탄올(230 mL) 중 벤질 4-포르밀피페리딘-1-카르복실레이트(25 g, 101.10 mmol, 1당량) 용액에 파라-톨루엔설폰산(961 mg, 5.05 mmol, 0.05당량)과 트리메톡시메탄(53.64 g, 505.48 mmol, 55 mL, 5당량)을 첨가하였다. 혼합물을 25℃에서 12시간 동안 교반하였다. 포화 수성 중탄산 나트륨(50 mL)을 혼합물에 부어 pH=8이 되게 하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(100 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수로 세척하고(100 mL x 2), 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트 = 30:1 내지 10:1)로 정제하였다. 화합물 벤질 4-(디메톡시메틸)피페리딘-1-카르복실레이트(29 g, 98.86 mmol, 97% 수율)를 무색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 316 [M+23] +.
단계 2: 4-(디메톡시메틸)피페리딘 제조
메탄올(200 mL) 중 벤질 4-(디메톡시메틸)피페리딘-1-카르복실레이트(29 g, 98.86 mmol, 1당량) 용액에 탄소 상의 팔라듐(2 g, 10% 순도)을 질소 분위기 하에서 첨가하였다. 현탁액을 탈기하고 수소로 3회 퍼지하였다. 혼합물을 수소 분위기 하(50 Psi) 25℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 여과하고, 필터를 농축시켰다. 미정제 생성물은 추가 정제 없이 다음 단계에 사용되었다. 화합물 4-(디메톡시메틸)피페리딘(14.9 g, 93.58 mmol, 94% 수율)을 연황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 160.2 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 4.03 (d, J=7.2 Hz, 1H), 3.34 (s, 6H), 3.28 (s, 1H), 3.17 - 3.10 (m, 2H), 2.60 (dt, J=2.4, 12.4 Hz, 2H), 1.79 - 1.67 (m, 3H), 1.33 - 1.20 (m, 2H).
단계 3: 5-브로모-2-(4-(디메톡시메틸)피페리딘-1-일)피리미딘 제조
아세토니트릴(20 mL) 중 5-브로모-2-클로로-피리미딘(1.21 g, 6.28 mmol, 1당량) 및 4-(디메톡시메틸)피페리딘(1.0 g, 6.28 mmol, 1당량)의 용액에 탄산칼륨(1.74 g, 12.56 mmol, 2당량)을 첨가하였다. 혼합물을 70℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 에틸 아세테이트(40 mL x 2)로 추출하고 포화 수성 염수(25 mL x 2)로 세척하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르/에틸 아세테이트=10:1 내지 2:1)로 정제하였다. 화합물 5-브로모-2-[4-(디메톡시메틸)-1-피페리딜]피리미딘(1.46 g, 4.62 mmol, 73% 수율)을 백색 고체로서 수득하였다. 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 8.27 (s, 2H), 4.77 - 4.67 (m, 2H), 4.05 (d, J=7.2 Hz, 1H), 3.37 (s, 6H), 2.83 (dt, J=2.8, 13.2 Hz, 2H), 1.95 - 1.79 (m, 3H), 1.33 - 1.22 (m, 2H).
단계 4: (R)-N-(3-(5-(2-(4-(디메톡시메틸)피페리딘-1-일) 피리미딘-5-일)-1-((2-(트리메틸실릴)에톡시)메틸)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로-N-((2-(트리메틸실릴)에톡시)메틸)피롤리딘-1-설폰아미드 제조
디옥산(5 mL) 및 물(1 mL) 중 5-브로모-2-[4-(디메톡시메틸)-1-피페리딜]피리미딘(327 mg, 1.04 mmol, 1.2당량), (3R)-N-[2,4-디플루오로-3-[5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸) 피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]페닐]-3-플루오로-N-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤리딘-1-설폰아미드(700 mg, 0.86 mmol, 1당량), 불화세슘(524 mg, 3.45 mmol, 0.1 mL, 4당량) 및 4-디삼차-부틸포스파닐-N,N-디메틸-아닐린; 디클로로팔라듐(61 mg, 0.09 mmol, 0.1당량)의 혼합물을 탈기하고 질소로 3회 퍼지한 다음 질소 대기 하에 90℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 에틸 아세테이트(30 mL x 2)로 추출하고 포화 수성 염수(30 mL x 2)로 세척하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 분취 역상 HPLC로 정제하였다. 화합물 (3R)-N-[3-[5-[2-[4-(디메톡시메틸)-1-피페리딜]피리미딘-5-일]-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로-페닐]-3-플루오로-N-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤리딘-1-설폰아미드(445 mg, 0.45 mmol, 52% 수율, 97% 순도, 포름산염)를 갈색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 920.5 [M+1] +.
단계 5: (R)-N-(3-(5-(2-(4-(디메톡시메틸)피페리딘-1-일)피리미딘-5-일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 제조
메탄올(3 mL) 중 (3R)-N-[3-[5-[2-[4-(디메톡시메틸)-1-피페리딜]피리미딘-5-일]-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로-페닐]-3-플루오로-N-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤리딘-1-설폰아미드(680 mg, 0.70 mmol, 1당량, 포름산염)의 용액에 염산(디옥산 중 4 M, 8 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 50℃에서 24시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 화합물 (3R)-N-[3-[5-[2-[4-(디메톡시메틸)-1-피페리딜]피리미딘-5-일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로-페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드(560 mg, 미정제)를 황색 고체로서 수득하였으며, 이를 추가 정제 없이 다음 단계에 직접 사용하였다. LC/MS (ESI) m/z: 684.4 [M+23] +.
단계 6: (R)-N-(2,4-디플루오로-3-(5-(2-(4-포르밀피페리딘-1-일)피리미딘-5-일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 제조
테트라하이드로푸란(10 mL) 중 (3R)-N-[3-[5-[2-[4-(디메톡시메틸)-1-피페리딜]피리미딘-5-일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로-페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드(560 mg, 0.85 mmol, 1당량)의 용액에 황산(2 M, 15 mL, 35.34당량)을 첨가하였다. 혼합물을 70℃에서 4시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 포화 중탄산 나트륨으로 pH=7~8로 염기성화하였다. 반응 혼합물을 에틸 아세테이트(30 mL x 2)로 추출하고 포화 염수(25 mL x 2)로 세척하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 반-분취 역상 HPLC로 정제하였다. 화합물 (3R)-N-[2,4-디플루오로-3-[5-[2-(4-포르밀-1-피페리딜)피리미딘-5-일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드(340 mg, 0.55 mmol, 65% 수율)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 614.3 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.95 (s, 1H), 9.65 (s, 1H), 8.75 (s, 2H), 8.65 (s, 1H), 8.54 (s, 1H), 8.09 (s, 1H), 7.67 - 7.53 (m, 1H), 7.23 (t, J=8.8 Hz, 1H), 5.40 - 5.18 (m, 1H), 4.52 (d, J=13.2 Hz, 2H), 3.46 (s, 1H), 3.38 (s, 3H), 3.27 - 3.20 (m, 3H), 2.75 - 2.60 (m, 1H), 2.08 (d, J=13.2 Hz, 2H), 2.00 - 1.88 (m, 2H), 1.58 - 1.41 (m, 2H).
단계 7: 메틸 3-(벤질옥시) 이속사졸-5-카르복실레이트 제조
아세톤(150 mL) 중 메틸 3-하이드록시이속사졸-5-카르복실레이트(7.20 g, 50.31 mmol, 1.00당량) 용액에 탄산 칼륨(13.91 g, 100.62 mmol, 2.00당량)을 첨가하였다. 혼합물을 80℃로 1시간 동안 가열한 후, (브로모메틸)벤젠(10.33 g, 60.37 mmol, 1.20당량)을 첨가하였다. 생성된 혼합물을 80℃에서 또 다른 3시간 동안 교반하였다. 고체를 여과해 버리고 여과물을 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트 = 15:1 내지 10:1)로 추가로 정제하여 3-벤질옥시이속사졸-5-카르복실레이트(9.50 g, 40.73 mmol, 81% 수율)를 무색 오일로서 수득하였다. 오일을 15℃에서 15시간 동안 놔두어 고형화시켰다. LC/MS (ESI) m/z: 256.0 [M+23] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 7.49 - 7.41 (m, 5H), 6.60 (s, 1H), 5.34 (s, 2H), 3.97 (s, 3H).
단계 8: (3-(벤질옥시)이속사졸-5-일)메탄올 제조
메탄올(50 mL) 중 메틸 3-벤질옥시이속사졸-5-카르복실레이트(2.33 g, 9.99 mmol, 1.00당량) 용액에 수소화붕소 나트륨(756 mg, 19.98 mmol, 2.00당량)을 나누어서 첨가하였다. 생성된 혼합물을 15℃에서 3시간 동안 교반하였다. 혼합물을 염산(0.2 M, 200 mL)에 붓고 나서, 에틸 아세테이트(150 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 포화 염수(200 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 진공 중에 농축시켜 (3-벤틸옥시이속사졸-5-일)메탄올(1.85 g, 9.02 mmol, 90% 수율)을 무색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 206.1 [M+1] +.
단계 9: 2-(3-(벤질옥시)이속사졸-5-일)아세토니트릴 제조
디클로로메탄(10 mL) 중 시아노화 브로마이드(334 mg, 3.15 mmol, 1.05당량) 및 트리페닐포스핀(787 mg, 3.00 mmol, 1.00당량) 용액에 디클로로메탄(10 mL) 중 (3-벤질옥시이속사졸-5-일)메탄올(616 mg, 3.00 mmol, 1.00당량) 용액을 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 1시간 동안 교반한 후, 2,3,4,6,7,8,9,10-옥타하이드로피리미도[1,2-a]아제핀(480 mg, 3.15 mmol, 1.05당량)을 0℃에서 첨가하였다. 생성된 혼합물을 0~15 ℃에서 또 다른 14시간 동안 교반하였다. 용매를 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트 = 5:1 내지 4:1)로 추가로 정제하여 2-(3-벤질옥시이속사졸-5-일)아세토니트릴(320 mg, 1.49 mmol, 50% 수율)를 무색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 215.0 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 7.48 - 7.41 (m, 5H), 6.06 (s, 1H), 5.30 (s, 2H), 3.82 (s, 2H).
단계 10: 2-(3-(벤질옥시)이속사졸-5-일)-3-메틸부탄 니트릴 제조
N,N-디메틸포름아미드(3 mL) 중 2-(3-벤질옥시이속사졸-5-일)아세토니트릴(214 mg, 1.00 mmol, 1.00당량) 용액에 탄산 칼륨(138 mg, 1.00 mmol, 1.00당량)을 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 30분 동안 교반한 후, 2-요오도프로판(170 mg, 1.00 mmol, 1.00당량)을 첨가하였다. 생성된 혼합물을 15℃에서 또 다른 2.5시간 동안 교반하였다. 이어서, 칼륨;2-메틸프로판-2-올레이트(90 mg, 0.8 mmol, 0.80당량)를 혼합물에 첨가하고, 혼합물을 15℃에서 또 다른 12시간 동안 교반하였다. 혼합물을 염산(0.2 M, 30 mL)에 붓고, 에틸 아세테이트(30 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트 = 10:1 내지 8:1)로 정제하여 2-(3-벤질옥시이속사졸-5-일)-3-메틸-부탄니트릴(150 mg, 0.56 mmol, 59% 수율)를 무색 오일로서 수득하였다. 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 7. 48 - 7.41 (m, 5H), 6.04 (s, 1H), 5.28 (s, 2H), 3.85 (d, J=5.6 Hz, 1H), 2.42 - 2.37 (m, 1H), 1.18 (d, J=6.8 Hz, 3H), 1.10 (d, J=6.8 Hz, 3H).
단계 11: 2-(3-하이드록시이속사졸-5-일)-3-메틸부탄산 제조
디옥산(30 mL) 중 2-(3-벤질옥시이속사졸-5-일)-3-메틸-부탄니트릴(3.40 g, 13.27 mmol, 1.00당량) 용액에 염산(11.8 M, 120 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 100℃로 가열하고 100℃에서 15시간 동안 교반하였다. 혼합물을 15℃로 냉각시키고, 에틸 아세테이트(150 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 진공 중에서 농축시켰다. 미정제 생성물을 분취-HPLC로 추가로 정제하여 2-(3-하이드록시이속사졸-5-일)-3-메틸-부탄산(230 mg, 1.19 mmol, 9% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 186.1 [M+1] +.
단계 12: 메틸 2-(3-하이드록시이속사졸-5-일)-3-메틸부타노에이트 제조
메탄올 (10 mL) 중 2-(3-하이드록시이속사졸-5-일)-3-메틸-부탄산(1 g, 5.40 mmol, 1당량)의 용액에 염화 티오닐(2.57 g, 21 mmol, 1.57 mL, 4당량)을 0℃에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 70℃에서 3시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 물(50 mL)로 희석하고 에틸 아세테이트(30 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(80 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 메틸 2-(3-하이드록시이속사졸-5-일)-3-메틸-부타노에이트(1 g, 5.02 mmol, 92% 수율)를 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 200.1 [M+1] +.
단계 13: 메틸 3-메틸-2-(3-(((퍼플루오로부틸)설포닐)옥시이속사졸-5-일)부타노에이트 제조
아세토니트릴 (5 mL) 중 메틸 2-(3-하이드록시이속사졸-5-일)-3-메틸-부타노에이트(800 mg, 4.02 mmol, 1당량)의 용액에 탄산 칼륨(1.11 g, 8.03 mmol, 2당량)과 퍼플루오로부틸 설포닐 플루오르화물(1.46 g, 4.82 mmol, 1.2당량)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 25℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물(50 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(30 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(80 mL x 3)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르/에틸 아세테이트=100/1 내지 20/1)로 정제하였다. 메틸 3-메틸-2-[3-(1,1,2,2,3,3,4,4,4-노나플루오로부틸설포닐옥시)이속사졸-5-일]부타노에이트(530 mg, 1.10 mmol, 27 % 수율)를 무색 오일로서 수득하였다. 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 6.44 (s, 1H), 3.79 (s, 3H), 3.68 (d, J=8.0 Hz, 1H), 2.49 - 2.33 (m, 1H), 1.04 (d, J=6.8 Hz, 3H), 0.96 (d, J=6.8 Hz, 3H).
단계 14: 삼차-부틸 4-(5-(1-메톡시-3-메틸-1-옥소부탄-2-일)이속사졸-3-일)피페라진-1-카르복실레이트 제조
디메틸 포름아미드(5 mL) 중 메틸 3-메틸-2-[3-(1,1,2,2,3,3,4,4,4-노나플루오로부틸설포닐옥시) 이속사졸-5-일]부타노에이트(400 mg, 0.83 mmol, 1당량)과 삼차-부틸 피페라진-1-카르복실레이트(154 mg, 0.83 mmol, 1당량)의 용액을 130℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물(30 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(30 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(30 mL x 3)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 분취-TLC(석유 에테르:에틸 아세테이트 = 3:1)로 정제하였다. 삼차-부틸 4-[5-(1-메톡시카르보닐-2-메틸-프로필)이속사졸-3-일]피페라진-1-카르복실레이트(130 mg, 0.35 mmol, 42% 수율)를 무색 오일로서 수득하였다. 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 5.93 (s, 1H), 3.73 (s, 3H), 3.58 - 3.47 (m, 5H), 3.29 - 3.19 (m, 4H), 2.43 - 2.17 (m, 1H), 1.48 (s, 9H), 1.00 (d, J=6.8 Hz, 3H), 0.93 (d, J=6.8 Hz, 3H).
단계 15: 2-(3-(4-(삼차-부톡시카르보닐)피페라진-1-일)이속사졸-5-일)-3-메틸부탄산 제조
메탄올(2 mL), 테트라하이드로푸란(2 mL)과 물(2 mL) 중의 삼차-부틸 4-[5-(1-메톡시카르보닐-2-메틸-프로필)이속사졸-3-일]피페라진-1-카르복실레이트(130 mg, 0.35 mmol, 1당량)용액에 수산화 리튬(44 mg, 1.06 mmol, 3당량)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 15℃에서 1시간 동안 교반하였다. 물(3 mL)을 첨가하였다. 염산(물 중 1 M)으로 pH를 6까지 조정하고, 에틸 아세테이트(10 mL x 5)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(50 mL x 1)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 2-[3-(4-삼차-부톡시카르보닐피페라진-1-일)이속사졸-5-일]-3-메틸부탄산(100 mg, 0.28 mmol, 79% 수율)을 백색 고체로서 수득하였다. 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.83 (s, 1H), 6.23 (s, 1H), 3.45 - 3.36 (m, 5H), 3.20 - 3.09 (m, 4H), 2.30 - 2.16 (m, 1H), 1.41 (s, 9H), 0.95 (d, J=6.8 Hz, 3H), 0.82 (d, J=6.8 Hz, 3H).
단계 16: 삼차-부틸 (S)-(1-(4-브로모페닐)에틸)카바메이트 제조
테트라하이드로푸란 (350 mL) 중 (1S)-1-(4-브로모페닐)에탄아민(24.9 g, 124.45 mmol, 1당량)의 용액에 트리에틸아민(37.78 g, 373.36 mmol, 3당량)을 첨가하였다. 이어서, 디-삼차-부틸설디카보네이트(28.52 g, 130.68 mmol, 30 mL, 1.05당량)를 질소 하에 0℃에서 적가하였다. 그 후, 혼합물을 25℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축시켜 테트라하이드로푸란을 제거하였다. 물(400 mL)을 혼합물에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(200 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수로 세척하고(200 mL x 2), 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 미정제 생성물을 석유 에테르(250 mL)로 연화시켰다. 삼차-부틸 N-[(1S)-1-(4-브로모페닐)에틸]카바메이트(34.5 g, 114.93 mmol, 92 % 수율)를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 246.0 [M+1-56] +.
단계 17: 삼차-부틸 (S)-(1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)카바메이트 제조
디메틸아세트아미드 (15 mL) 중 삼차-부틸 N-[(1S)-1-(4-브로모페닐)에틸)카바메이트(14.5 g, 48.30 mmol, 1당량) 및 4-메틸티아졸(7.18 g, 72.45 mmol, 1.5당량)의 용액에 팔라듐(II) 아세테이트(542 mg, 2.42 mmol, 0.05당량) 및 아세트산 칼륨(9.48 g, 96.61 mmol, 2당량)를 첨가하였다. 혼합물을 90℃에서 12시간 동안 교반하였다. 물(300 mL)을 혼합물에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(100 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수로 세척하고(100 mL x 2), 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 플래쉬 C18 컬럼 크로마토그래피 [ACN/H2O (0.5% FA) =5%~50%]로 정제하였다. 화합물 삼차-부틸 N-[(1S)-1-[4- (4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]카바메이트(9.8 g, 29.85 mmol, 61% 수율, 97% 순도)를 회색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 319.0 [M+1] +.
단계 18: (S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에탄-1-아민 제조
디클로로메탄(20 mL) 중 삼차-부틸 N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]카바메이트(1.5 g, 4.71 mmol, 1당량)의 용액에 염화수소/디옥산 (4 M, 20 mL, 16.98당량)을 첨가하였다. 혼합물을 12시간 교반하였다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축시켜 디클로로메탄을 제거하였다. 미정제 생성물을 석유 에테르(100 mL)로 연화시켰다. 화합물 (1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐] 에탄아민(1.1 g, 미정제, HCl)을 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 219.1 [M+1] +.
단계 19: 삼차-부틸 (2S,4R)-4-하이드록시-2-(((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)카바모일)피롤리딘-1-카르복실레이트 제조
디메틸 포름아미드 (10 mL) 중 (2S,4R)-1-삼차-부톡시카르보닐-4-하이드록시-피롤리딘-2-카르복실산(998 mg, 4.32 mmol, 1.1당량) 및 o-(7-아자벤조트리아졸-1-일)-n,n,n',n'-테트라메틸우로늄 헥사플루오로포스페이트(1.79 g, 4.71 mmol, 1.2당량)의 용액에 (1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에탄아민(1 g, 3.92 mmol, 1당량, 염화수소) 및 디이소프로필 에틸 아민(1.52 g, 11.77 mmol, 2.05 mL, 3당량)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 15℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물(20 mL)에 붓고 에틸 아세테이트(30 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(50 mL x 3)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르/에틸 아세테이트 =100/1 내지 30/1)로 정제하였다. 삼차-부틸 (2S,4R)-4-하이드록시-2-[[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]카바모일]피롤리딘-1-카르복실레이트(1.2 g, 2.78 mmol, 70% 수율)를 백색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 432.3 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 8.98 (s, 1H), 8.52 - 8.28 (m, 1H), 7.46 - 7.36 (m, 4H), 5.03 - 4.93 (m, 2H), 4.27 - 4.13 (m, 2H), 3.45 - 3.22 (m, 5H), 2.88 (s, 1H), 2.75 - 2.67 (m, 1H), 2.44 (s, 3H), 2.04 (q, J=10.8 Hz, 1H), 1.80 - 1.69 (m, 1H), 1.42 - 1.37 (m, 5H), 1.31 (s, 7H).
단계 20: (2S,4R)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
디클로로메탄(10 mL) 중 삼차-부틸 (2S,4R)-4-하이드록시-2-[[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]카바모일]피롤리딘-1-카르복실레이트(1 g, 2.32 mmol, 1당량)의 용액에 염산(디옥산 중 2.5 M, 5 mL, 5.39당량)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 15℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 삼차-부틸 (2S,4R)-4-하이드록시-N-[(1S)-1- [4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드(800 mg, 2.17 mmol, 93% 수율, 염화수소)를 무색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 332.1 [M+1] +.
단계 21: 삼차-부틸 4-(5-(1-((2S,4R)-4-하이드록시-2-(((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)카바모일)피롤리딘-1-일)-3-메틸-1-옥소부탄-2-일)이속사졸-3-일)피페라진-1-카르복실레이트 제조
디메틸 포름아미드 (5 mL) 중 2-[3-(4-삼차-부톡시카르보닐피페라진-1-일)이속사졸-5-일]-3-메틸-부탄산(100 mg, 0.28 mmol, 1당량)과 o-(7-아자벤조트리아졸-1-일)-n,n,n',n'-테트라메틸우로늄 헥사플루오로포스페이트(129 mg, 0.33 mmol, 1.2당량)의 용액에 (2S,4R)-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드(104 mg, 0.28 mmol, 1당량, 염화수소)와 디이소프로필 에틸 아민(109 mg, 0.84 mmol, 3당량)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 15℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물(20 mL)에 붓고 에틸 아세테이트(30 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(50 mL x 3)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 분취-TLC(디클로로메탄:메탄올 = 10:1)로 정제하였다. 삼차-부틸 4-[5-[1-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-[[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]카바모일]피롤리딘-1-카르보닐]-2-메틸-프로필]이속사졸-3-일]피페라진-1-카르복실레이트(180 mg, 0.26 mmol, 92% 수율, 97% 순도)를 무색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 667.4 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 8.70 (d, J=1.2 Hz, 1H), 8.03 (s, 1H), 7.45 - 7.39 (m, 3H), 7.38 - 7.31 (m, 2H), 5.94 (d, J=10.0 Hz, 1H), 5.13 - 4.95 (m, 1H), 4.79 (dd, J=4.4, 8.4 Hz, 1H), 4.70 - 4.59 (m, 2H), 3.84 - 3.71 (m, 1H), 3.67 - 3.55 (m, 4H), 3.54 - 3.47 (m, 5H), 3.21 (td, J=5.2, 13.2 Hz, 4H), 2.98 (s, 4H), 2.90 (s, 4H), 2.82 (s, 6H), 2.55 (d, J=1.6 Hz, 4H), 2.45 (ddd, J=6.4, 9.6, 16.0 Hz, 1H), 2.08 - 1.92 (m, 1H), 1.53 - 1.37 (m, 13H), 1.06 (dd, J=2.4, 6.4 Hz, 3H), 0.94 (d, J=6.8 Hz, 3H).
단계 22: 삼차-부틸 4-(5-((R)-1-((2S,4R)-4-하이드록시-2-(((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)카바모일)피롤리딘-1-일)-3-메틸-1-옥소부탄-2-일)이속사졸-3-일)피페라진-1-카르복실레이트 제조
삼차-부틸 4-[5-[1-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-[[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]카바모일]피롤리딘-1-카르보닐]-2-메틸-프로필]이속사졸-3-일]피페라진-1-카르복실레이트(200 mg, 0.29 mmol, 1당량)를 키랄 초임계 유체 크로마토그래피(supercritical fluid chromatography)에 의해 분리하였다. 삼차-부틸 4-[5-[(1S)-1-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-[[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]카바모일]피롤리딘-1-카르보닐]-2-메틸-프로필]이속사졸-3-일]피페라진-1-카르복실레이트(80 mg, 0.11 mmol, 76% 수율, 95% 순도)를 백색 고체로서 수득하였다. 삼차-부틸 4-[5-[(1R)-1-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-[[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]카바모일]피롤리딘-1-카르보닐]-2-메틸-프로필]이속사졸-3-일]피페라진-1-카르복실레이트(70 mg, 0.1 mmol, 68% 수율, 98% 순도)를 백색 고체로서 수득하였다.
단계 23: (2S,4R)-4-하이드록시-1-((R)-3-메틸-2-(3-(피페라진-1-일)이속사졸-5-일)부타노일)-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
디클로로메탄 (2 mL) 중 삼차-부틸 4-[5-[(1R)-1-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-[[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]카바모일]피롤리딘-1-카르보닐]-2-메틸-프로필]이속사졸-3-일]피페라진-1-카르복실레이트(70 mg, 0.1 mmol, 1당량)의 용액에 염산(디옥산 중 4 M, 3 mL)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 15℃에서 1시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. (2S,4R)-4-하이드록시-1-[(2R)-3-메틸-2-(3-피페라진-1-일이속사졸-5-일)부타노일]-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드(55 mg, 0.09 mmol, 91% 수율, 99% 순도)를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 567.2 [M+1] +.
단계 24: (2S,4R)-1-((R)-2-(3-(4-((1-(5-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)피리미딘-2-일)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)이속사졸-5-일)-3-메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
메탄올(0.5 mL) 및 디클로로메탄(0.5 mL) 중 (2S,4R)-4-하이드록시-1-[(2R)-3-메틸-2-(3-피페라진-1-일이속사졸-5-일)부타노일]-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드(68.81 mg, 0.11 mmol, 1당량, 염화수소)의 용액에 아세트산 나트륨(19 mg, 0.22 mmol, 2당량)을 첨가하여 pH ~8.0로 조정하였다. 그런 다음, (3R)-N-[2,4-디플루오로-3-[5-[2-(4-포르밀-1-피페리딜)피리미딘-5-일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드(70 mg, 0.11 mmol, 1당량)를 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 15분 동안 교반한 다음, 아세트산(14 mg, 0.22 mmol, 2당량)을 첨가하여 pH ~5.0으로 조정하였다. 혼합물을 15℃에서 15분 동안 교반하였다. 이어서 나트륨 시아노보로히드라이드(14 mg, 0.22 mmol, 2당량)를 나누어서 첨가하였다. 반응 혼합물을 30℃에서 2.5시간 동안 교반하였다. 디클로로메탄(30 mL x 2), 메탄올(5 mL) 및 물(25 mL x 2)을 첨가하고, 유기층을 분리하였다. 합쳐진 유기상을 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 반-분취 역상 HPLC로 정제하였다. 화합물 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[4-[[1-[5-[3-[2,6-디플루오로-3- [(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]피리미딘-2-일]-4-피페리딜]메틸]피페라진-1-일]이속사졸-5-일]-3-메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드(56.9 mg, 0.04 mmol, 37% 수율, 95% 순도, 트리플루오로아세트산)를 회백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 582.8 [M/2+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.99 (s, 1H), 9.82 (s, 1H), 8.98 (s, 1H), 8.76 (s, 2H), 8.66 (s, 1H), 8.56 (s, 1H), 8.37 (d, J=6.8 Hz, 1H), 8.11 (s, 1H), 7.69 - 7.56 (m, 1H), 7.51 - 7.41 (m, 2H), 7.40 - 7.33 (m, 2H), 7.27 (t, J=8.8 Hz, 1H), 6.34 - 6.16 (m, 1H), 5.43 - 5.21 (m, 1H), 5.11 (s, 1H), 4.99 - 4.84 (m, 1H), 4.75 (d, J=12.0 Hz, 2H), 4.52 - 4.20 (m, 2H), 3.80 (s, 2H), 3.73 (d, J=6.4 Hz, 1H), 3.63 (d, J=9.2 Hz, 3H), 3.47 (d, J=13.6 Hz, 3H), 3.41 (s, 3H), 3.24 (s, 2H), 3.13 (s, 3H), 3.07 - 2.96 (m, 2H), 2.49 - 2.44 (m, 1H), 2.46 (s, 3H), 2.30 - 2.10 (m, 4H), 2.08 - 1.97 (m, 2H), 1.92 - 1.76 (m, 2H), 1.52 - 1.34 (m, 3H), 1.24 (s, 3H), 0.98 (d, J=6.0 Hz, 2H), 0.90 - 0.77 (m, 3H).
(2S,4R)-1-(2-(3-(3-(4-(5-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)피리미딘-2-일)피페라진-1-일)아제티딘-1-일)이속사졸-5-일)-3-메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드(실시예 322)의 예시적인 합성
단계 1: 삼차-부틸 4-(1-((벤질옥시)카르보닐)아제티딘-3-일)피페라진-1-카르복실레이트 제조
250 mL 둥근바닥 플라스크에, 디클로로메탄(150 mL) 중의 삼차-부틸 피페라진-1-카르복실레이트(10.0 g, 53.69 mmol, 1당량) 및 벤질 3-옥시아제티딘-1-카르복실레이트(11.0 g, 53.60 mmol, 1.00 equiv)을 넣었으며, 여기에 NaBH(OAc)3 (34.1 g, 161.07 mmol, 3당량)을 첨가했다. 생성된 혼합물을 실온에서 3시간 동안 교반하였다. 물(100 mL)로 반응물을 급냉시키고, 디클로로메탄(100 mL x 3)으로 추출하고, 물(100 mL) 및 염수(100 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 감압 하에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(v:v = 2:1)로 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 10.0 g(49.61%)의 삼차-부틸 4-[1-[(벤질옥시)카르보닐]아제티딘-3-일]피페라진-1-카르복실레이트를 연갈색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 376.35 [M+1] +.
단계 2: 삼차-부틸 4-(아제티딘-3-일)피페라진-1-카르복실레이트 제조
30 mL MeOH 중 삼차-부틸 4-[1-[(벤질옥시)카르보닐]아제티딘-3-일]피페라진-1-카르복실레이트(10.0 g, 26.63 mmol, 1당량) 용액에 Pd/C(10%, 2.0 g)를 250 mL 둥근 바닥 플라스크 내 질소 분위기 하에 첨가하였다. 이어서 플라스크를 진공화하고 수소로 플러싱하였다. 반응 혼합물을 수소 분위기 하에 실온에서 2시간 동안 수소 풍선을 사용해 수소화시킨 후, 셀라이트 패드를 통해 여과하고 여액을 감압 하에 농축시켰다. 이를 통해 5.9 g (91.79%)의 삼차-부틸 4-(아제티딘-3-일)피페라진-1-카르복실레이트를 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 242.20 [M+1] +.
단계 3: 삼차-부틸 2-이소프로필부트-3-에노에이트 제조
질소 불활성 분위기로 퍼지되고 유지된 1000 ml 둥근바닥 플라스크에, 테트라하이드로푸란(400 mL) 중의 삼차-부틸 부트-3-에노에이트(20.0 g, 140.6 mmol, 1.0당량)의 용액을 넣었다. 리튬 디이소프로필아미드(30.0 g, 280.1 mmol, 2.0당량)를 상기 혼합물에 -78℃에서 첨가하였다. -78℃에서 30분 동안 교반한 후, 반응 혼합물을 -78℃에서 2-아이오도프로판(36.0 g, 211.8 mmol, 1.5당량)으로 나누어서 채웠다. 생성된 혼합물을 실온까지 가온하고 실온에서 밤새 교반하였다. 이어서 300 mL 포화 NH4Cl 용액을 첨가하여 반응물을 급냉시켰다. 생성된 용액을 에틸 아세테이트(300 mL x 3)로 추출하고, 유기층을 합치고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(20:1)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 18.0 g(69.0%)의 삼차-부틸 2-(프로판-2-일)부트-3-에노에이트를 연황색 액체로서 수득하였다.
단계 4: 삼차-부틸 2-(3-브로모-4,5-디하이드로이속사졸-5-일)-3-메틸부타노에이트 제조
질소 불활성 분위기로 퍼지되고 유지된 1000 mL 둥근바닥 플라스크에, DMF/H20 (200/200 mL) 중 삼차-부틸 2-(프로판-2-일)부트-3-에노에이트(18.0 g, 97.7 mmol, 1.0당량), 칼륨 메탄퍼옥소에이트(29.0 g, 289.7 mmol, 3.0당량)을 -10℃에서 넣었다. 그런 다음 1-브로모-N-하이드록시메탄카르보이미도일 브로마이드(35.0 g, 172.6 mmol, 1.8당량)를 상기 혼합물에 -10℃에서 첨가하였다. 생성된 혼합물을 실온에서 밤새 교반하였다. 이어서 300 mL 물/얼음을 첨가하여 반응물을 급냉시켰다. 생성된 혼합물을 에틸 아세테이트(300 mL x 3)로 추출하고, 유기층을 합치고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(10:1)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 8.6 g(29.0%)의 삼차-부틸 2-(3-브로모-4,5-디하이드로-1,2-이속사졸-5-일)-3-메틸부타노에이트를 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 306.40 [M+1] +.
단계 5: 삼차-부틸 4-(1-(5-(1-(삼차-부톡시)-3-메틸-1-옥소부탄-2-일)-4,5-디하이드로이속사졸-3-일)아제티딘-3-일)피페라진-1-카르복실레이트 제조
질소의 불활성 대기로 퍼지되고 유지된 60mL 밀봉된 튜브에, n-BuOH (20.0 mL) 중 삼차-부틸 4-(아제티딘-3-일)피페라진-1-카르복실레이트(4.0 g, 16.57 mmol, 1당량), 삼차-부틸 2-(3-브로모-4,5-디하이드로-1,2-옥사졸-5-일)-3-메틸부타노에이트(10.2 g, 33.15 mmol, 2당량), DIEA(6.4 g, 49.72 mmol, 3당량)를 넣었다. 생성된 혼합물을 오일조에서 110℃에서 2시간 동안 교반하였다. 그런 다음 반응물을 물(50 mL)로 급냉시키고, 에틸 아세테이트(50 mL x 3)로 추출하고, 물(50 mL) 및 염수(50 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(v:v = 1:4)로 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 2.2 g(28.45%)의 삼차-부틸 4-(1-[5-[1-(삼차-부톡시)-3-메틸-1-옥소부탄-2-일]-4,5-디하이드로-1,2-옥사졸-3-일]아제티딘-3-일)피페라진-1-카르복실레이트를 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 467.45 [M+1] +.
단계 6: 삼차-부틸 4-(1-(5-(1-(삼차-부톡시)-3-메틸-1-옥소부탄-2-일)이속사졸-3-일)아제티딘-3-일)피페라진-1-카르복실레이트 제조
질소의 불활성 대기로 퍼지되고 유지된 30mL 바이알에, 톨루엔(20 mL) 중 삼차-부틸 4-(1-[5-[1-(삼차-부톡시)-3-메틸-1-옥소부탄-2-일]-4,5-디하이드로-1,2-옥사졸-3-일]아제티딘-3-일)피페라진-1-카르복실레이트(2.2 g, 4.71 mmol, 1당량), 피리딘(1.9 g, 23.57 mmol, 5당량), I2 (2.4 g, 9.46 mmol, 2.01당량)를 넣었다. 생성된 용액을 오일조에서 110℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응물을 포화 Na2S2O3 (50 mL)로 급냉시키고, 에틸 아세테이트(50 mL x 3)로 추출하고, 포화 NaHCO3 (50 mL) 및 염수(50 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(v:v = 1:1)로 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 1.0 g(45.65%)의 삼차-부틸 4-(1-[5-[1-(삼차-부톡시)-3-메틸-1-옥소부탄-2-일]-1,2-옥사졸-3-일]아제티딘-3-일)피페라진-1-카르복실레이트를 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 465.1 [M+1] +.
단계 7: 3-메틸-2-(3-(3-(피페라진-1-일)아제티딘-1-일)이속사졸 -5-일)부탄산 제조
100mL의 둥근 바닥 플라스크에, DCM(20 mL) 중 삼차-부틸 4-(1-[5-[1-(삼차-부톡시)-3-메틸-1-옥소부탄-2-일]-1,2-옥사졸-3-일]아제티딘-3-일)피페라진-1-카르복실레이트(500.0 mg, 1.08 mmol, 1당량)를 넣고, 여기에 2,2,2-트리플루오로아세트산(8mL)을 첨가하였다. 생성된 혼합물을 실온에서 5시간 동안 교반하고 감압 하에 농축시켰다. 이를 통해 270.0 mg의 3-메틸-2-[3-[3-(피페라진-1-일)아제티딘-1-일]-1,2-옥사졸-5-일]부탄산을 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 309.30 [M+1] +.
단계 8: (R)-N-(3-(5-(2-클로로피리미딘-5-일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 제조
30mL 밀봉 튜브에, 질소 분위기 하에 디옥산(5 mL) 및 H2O (1 mL) 중 (3R)-N-(3-[5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로페닐]-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드(450.0 mg, 0.89 mmol, 1당량), 2-클로로-5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)피리미딘(645.0 mg, 2.68 mmol, 3.00당량), Na2CO3 (284.0 mg, 2.68 mmol, 3.00당량) 및 Pd(dppf)Cl2 .CH2Cl2 (15.0 mg, 0.02 mmol, 0.02당량)을 넣었다. 생성된 혼합물을 오일조에서 질소 분위기 하에 105℃에서 3시간 동안 교반하였다. 생성된 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:2)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 70.0 mg(14.58%)의 (3R)-N-[3-[5-(2-클로로피리미딘-5-일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로페닐]-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드를 연황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 537.05 [M+1] +.
단계 9: 2-(3-(3-(4-(5-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)피리미딘-2-일)피페라진-1-일)아제티딘-1-일)이속사졸-5-일)-3-메틸부탄산 제조
50mL 둥근 바닥 플라스크에, DCM (2 mL) 중 3-메틸-2-[3-[3-(피페라진-1-일)아제티딘-1-일]-1,2-옥사졸-5-일]부탄산(40 mg, 0.13 mmol, 1당량), (3R)-N-[3-[5-(2-클로로피리미딘-5-일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로페닐]-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드(69.6 mg, 0.13 mmol, 1당량), Et3N (50.3 mg, 0.39 mmol, 3당량)을 넣었다. 생성된 혼합물을 실온에서 48시간 동안 교반하였다. 생성된 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(v:v = 4:1)로 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 53.0 mg (50.52%)의 2-(3-[3-[4-(5-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]피리미딘-2-일)피페라진-1-일]아제티딘-1-일]-1,2-옥사졸-5-일)-3-메틸부탄산을 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 809.05 [M+1] +.
단계 10: (2S,4R)-1-(2-(3-(3-(4-(5-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)피리미딘-2-일)피페라진-1-일)아제티딘-1-일)이속사졸-5-일)-3-메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
50 mL 둥근바닥 플라스크에, DMF(5 mL) 중 2-(3-[3-[4-(5-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]피리미딘-2-일]피페라진-1-일]아제티딘-1-일]-1,2-옥사졸-5-일)-3-메틸부탄산(53 mg, 0.07 mmol, 1당량), (2S,4R)-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드(20.8 mg, 0.07 mmol, 1당량), DIEA (25.4 mg, 0.20 mmol, 3당량), BOP (43.5 mg, 0.10 mmol, 1.5당량)를 넣었다. 생성된 혼합물을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 그런 다음, 20 mL의 물을 첨가하여 반응물을 급냉시키고, 디클로로메탄(20 mL x 2)으로 추출하고, 20 mL의 물과 20 mL의 염수로 세척하였다. 합쳐진 유기상을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 HPLC로 정제하였다. 이를 통해 31.0 mg(42.69%)의 (2S,4R)-1-[2-(3-[3-[4-(5-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]피리미딘-2-일)피페라진-1-일]아제티딘-1-일]-1,2-옥사졸-5-일)-3-메틸부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드를 황색 오일로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 1108.10 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 13.00 (s, 1H), 11.30( brs,1H), 9.80 (s, 1H), 8.97 (s, 1H), 8.85 (s, 2H), 8.67 (d, J = 2.2 Hz, 1H), 8.58 (s, 1H), 8.50-8.46 (m, 1H), 8.14- 8.06 (m, 1H), 7.69-7.55 (m, 1H), 7.46-6.91 (m, 5H), 5.97 (d, J = 2.7 Hz, 1H), 5.38 (s, 1H), 5.20 (s, 1H), 4.85-4.60(m, 2H), 4.43-4.26 (m, 4H), 4.25-4.15 (m, 4H), 3.83-3.74 (m, 2H), 3.69-3.28 (m, 10H), 3.12-2.98 (m, 1H), 2.43-2.40 (m, 3H), 2.27-1.83(m, 5H), 1.23 (d, J = 10.7 Hz, 1H), 0.95-0.90 (m, 2H), 0.85-0.71 (m, 2H), 0.63-0.52 (m, 1H).
(2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-((3-하이드록시프로필)설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드(실시예 321)의 예시적인 합성
단계 1: 나트륨 3-아세톡시프로판-1-설포네이트 제조
질소 불활성 분위기로 퍼지되고 유지된 100 mL 둥근 바닥 플라스크에, 무수 아세트산(40 mL) 중 나트륨 3-아세톡시프로판-1-설포네이트(5 g, 30.84 mmol, 1당량)을 넣었다. 생성된 용액을 오일조에서 120 ℃에서 7시간 동안 교반하였다. 실온으로 냉각시킨 후, 침전된 고체를 여과에 의해 수집하고 진공 하에 건조시켰다. 이를 통해 6.2 g(98.47%)의 나트륨 3-아세톡시프로판-1-설포네이트를 백색 고체로서 수득하였다.
단계 2: 3-(클로로설포닐)프로필 아세테이트 제조
50 mL 둥근 바닥 플라스크에, 옥살릴 이염화물(20 mL) 중 나트륨 3-아세톡시프로판-1-설포네이트(3 g, 14.69 mmol, 1당량)를 넣었다. 촉매량의 DMF(0.1 mL)를 상기 혼합물에 첨가하였다. 생성된 혼합물을 오일조에서 68℃에서 5시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 EtOAc (100 mL)에 재용해시켰다. 불용성 고체를 걸러 내고, 여과물을 진공 중에서 농축시켰다. 이를 통해 2.3 g(78.02%)의 3-(클로로설포닐)프로필 아세테이트를 황색 오일로서 수득하였다.
단계 3: 3-(N-(3-(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)설파모일)프로필 아세테이트 제조
50 mL 둥근바닥 플라스크에, 피리딘(10 mL) 중 3-(클로로설포닐)프로필 아세테이트(200 mg, 1.00 mmol, 1당량), 3-[5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로아닐린(351.0 mg, 1.00 mmol, 1당량), DMAP (12.2 mg, 0.10 mmol, 0.1당량)를 넣었다. 생성된 용액을 오일조에서 40 ℃에서 밤새 교반하였다. 혼합물을 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(20:1)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 293 mg (56.93%)의 3-(N-(3-(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)설파모일)프로필 아세테이트를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 515.90/517.90.20 [M+1] +.
단계 4: 삼차-부틸 2-(4-((4-(4-(3-(3-((3-아세톡시프로필)설폰아미도)-2,6-디플루오로벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세테이트 제조
질소의 불활성 대기로 퍼지되고 유지되는 10mL 바이알로, 질소 대기 하에 디옥산 (5 mL) 및 H2O (1 mL) 중 3-[(3-[5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로페닐)설파모일]프로필 아세테이트(293 mg, 0.57 mmol, 1당량), 삼차-부틸 2-[4-([4-[4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐]피페라진-1-일]메틸)피페리딘-1-일]아세테이트(340.2 mg, 0.68 mmol, 1.2당량), Na2CO3 (180.4 mg, 1.70 mmol, 3당량), Pd(dppf)Cl2 (41.5 mg, 0.06 mmol, 0.1당량)을 넣었다. 생성된 혼합물을 오일조에서 105℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응물을 실온으로 냉각시킨 후, 물(20 mL)로 희석하였다. 생성된 혼합물을 에틸 아세테이트(40 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(20 mL x 1)로 세척하고, 무수 나트륨 상에서 건조시키고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(10:1)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 287 mg (62.52%)의 삼차-부틸 2-(4-((4-(4-(3-(3-(3-아세톡시프로필설폰아미도)-2,6-디플루오로벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세테이트를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 809.55 [M+1] +.
단계 5: 2-(4-((4-(4-(3-(3-((3-아세톡시프로필)설폰아미도)-2,6-디플루오로벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트산 제조
50mL 둥근 바닥 플라스크에, 디클로로메탄(20 mL) 중 3-[[3-(5-[4-[4-([1-[2-(삼차-부톡시)-2-옥소에틸]피페리딘-4-일]메틸)피페라진-1-일]페닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐]설파모일]프로필 아세테이트(287 mg, 0.35 mmol, 1당량)를 넣었다. 그런 다음, 실온에서 TFA(5 mL)를 첨가하였다. 생성된 용액을 실온에서 밤새 교반하였다. 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 이를 통해 267 mg(99.97%)의 2-(4-((4-(4-(3-(3-(3-아세톡시프로필설폰아미도)-2,6-디플루오로벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트산 HCl 염을 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 753.10 [M+1] +.
단계 6: 3-(N-(2,4-디플루오로-3-(5-(4-(4-((1-(2-(((S)-1-((2S,4R)-4-하이드록시-2-((4-(4-메틸티아졸-5일)벤질)카바모일)피롤리딘)피롤리딘-1-일)-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일)아미노)-2-옥소에틸)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)페닐)설파모일)프로필 아세테이트 제조
50mL 둥근 바닥 플라스크에, DMF(20 mL) 중 2-(4-((4-(4-(3-(3-(3-아세톡시프로필설폰아미도)-2,6-디플루오로벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트산 (267 mg, 0.35 mmol, 1당량)을 넣었다. 그런 다음, BOP(188.2 mg, 0.43 mmol, 1.2당량) 및 DIEA(137.5 mg, 1.06 mmol, 3당량)를 상기 용액에 연속적으로 첨가하였다. 실온에서 5분 동안 교반한 후, 반응 혼합물을 DMF(5 mL) 중 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드 HCl 염(152.7 mg, 0.35 mmol, 1당량)의 용액으로 채웠다. 반응 혼합물을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 이어서 반응물을 물(20 mL)의 첨가로 급냉시켰다. 생성된 용액을 디클로로메탄/메탄올(v:v = 10:1, 40 mL x 3)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(10 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(10:1)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 283 mg (68.47%)의 3-(N-(2,4-디플루오로-3-(5-(4-(4-((1-(2-((S)-1-((2S,4R)-4-하이드록시-2-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질카바모일)피롤리딘-1-일)-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일아미노)-2-옥소에틸)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)페닐)설파모일)프로필 아세테이트를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 1187.05 [M+23] +.
단계 7: (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-((3-하이드록시프로필)설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
50mL 둥근바닥 플라스크에, 3-[(2,4-디플루오로-3-[5-[4-(4-[[1-([[(2S)-1-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-([[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]카바모일)피롤리딘-1-일]-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일]카바모일]메틸)피페리딘-4-일]메트 (273 mg, 0.23 mmol, 1당량), MeOH (20 mL, 493.98 mmol, 2108.71당량), H2O (1 mL, 55.51 mmol, 236.96당량), LiOH (16.8 mg, 0.70 mmol, 3당량)을 넣었다. 생성된 용액을 오일조에서 40℃에서 2시간 동안 교반하였다. 미정제 생성물(263 mg)을 분취-HPLC로 정제하였다. 이를 통해 31.6 mg(11.93%)의 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[2-(4-[[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-(3-하이드록시프로판설폰아미도)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]메틸]피페리딘-1-일)아세트아미도]-3,3-디메틸부타노일]-4-hyd를 연황색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 1123.20 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, CD3OD) δ 8.90 (s, 1H), 8.73 (s, 1H), 8.62 (d, J = 2.1 Hz, 1H), 7.98 (s, 1H), 7.72 - 7.54 (m, 3H), 7.48 - 7.34 (m, 4H), 7.25 - 7.07 (m, 3H), 4.65 (d, J = 10.9 Hz, 1H), 4.62 - 4.51 (m, 3H), 4.39 (d, J = 15.5 Hz, 1H), 3.98 - 3.79 (m, 2H), 3.66 (t, J = 6.0 Hz, 2H), 3.34 - 3.12 (m, 8H), 3.06- 2.90 (m, 2H), 2.86 - 2.69 (m, 4H), 2.54 - 2.45 (m, 3H), 2.44 - 2.18 (m, 5H), 2.17 - 1.97 (m, 3H), 1.94 - 1.62 (m, 3H), 1.49 - 1.22 (m, 2H), 1.06 (d, J = 8.1 Hz, 9H).
(2S,4R)-1-((2S)-2-(2-(4-((4-(4-(3-(3-((1-시클로펜틸-2,2,2-트리플루오로에틸)아미노)-2,6-디플루오로벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드 (실시예 365)의 예시적인 합성
단계 1: (E)-N-벤질-1-시클로펜틸메탄이민 제조
디클로로메탄(350 mL) 중 시클로펜탄카르브알데히드(11.2 g, 114.1 mmol, 1당량), 1-페닐메탄아민 (12.8 g, 119.7 mmol, 1.05당량) 및 MgSO4 (69.9 g, 580.7 mmol, 5.09당량)의 현탁액을 21시간 동안 실온에서 교반하였다. 고체를 걸러냈다. 여과물을 증발 건조시키고 진공 하에 건조시켰다. 이를 통해 21.5 g(100%)의 (E)-벤질(시클로펜틸메틸리덴)아민을 연황색 액체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 188.4 [M+1] +.
단계 2: N-벤질-1-시클로펜틸-2,2,2-트리플루오로에탄-1-아민 제조
MeCN(220 mL) 중 (E)-벤질(시클로펜틸메틸리덴)아민(21.8 g, 116.2 mmol, 1당량)의 용액에 TFA(11.2 mL, 150.8 mmol, 1.30당량), KHF2 (7.35 g, 94.1 mmol, 0.81당량) 및 DMF(33 mL)를 0℃에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 0 ℃에서 5분 동안 교반하였다. 그런 다음, Me3SiCF3 (24.9 g, 175.2 mmol, 1.51당량)을 상기 혼합물에 첨가하고, 생성된 혼합물을 교반하면서, 실온에서 17시간 동안 추가로 반응시켰다. 이어서 43 mL의 포화 Na2CO3을 첨가하여 반응물을 급냉시켰다. 혼합물을 5분 동안 교반한 후, 이를 물(300 mL)로 희석하였다. 생성된 혼합물을 에틸 아세테이트(200 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 물(100 mL x 2) 및 염수(100 mL x 1)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시켰다. 미정제물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:20)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 7.34 g(24.6%)의 벤질1-시클로펜틸-2,2,2-트리플루오로에틸)아민을 연황색 액체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 258.10 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 1.44-1.87 (m, 9H), 2.09-2.23 (m, 1H), 2.97-3.06 (m, 1H), 3.86 (d, J = 12.9 Hz, 1H), 4.11 (d, J = 13.2 Hz, 1H), 7.29-7.41 (m, 5H); 9F-NMR (300 MHz, CDCl3) δ 71.5, 72.1, 72.2.
단계 3: 1-시클로펜틸-2,2,2-트리플루오로에탄-1-아민 염화수소 제조
500mL 압력 탱크 반응기 중에 MeOH(80 mL) 중 벤질 (1-시클로펜틸-2,2,2-트리플루오로에틸)아민(6.31 g, 24.52 mmol, 1당량)의 용액에 Pd/C(2.17 g)를 첨가하였다. 혼합물을 50기압 H2로 채우고 50℃에서 19시간 동안 교반하였다. 혼합물을 여과하고 여과물에 메탄올(30 mL) 중 HCl을 첨가하였다. 합쳐진 여과물을 농축시키고 진공 하에 건조시켰다. 이를 통해 4.81 g(96.3%)의 1-시클로펜틸-2,2,2-트리플루오로에탄-1-아민 염화수소를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 168.10 [M+1] +.
단계 4: 메틸 3-브로모-2,6-디플루오로벤조에이트 제조
메탄올(100 mL) 중 3-브로모-2, 6-디플루오로벤조산 (10 g, 42.2 mmol, 1당량)의 용액에 황산(4 mL)을 첨가하였다. 생성된 용액을 환류하며 17시간 동안 가열하였다. 반응 혼합물을 수조를 이용하여 실온으로 냉각시켰다. 생성된 혼합물을 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트(100 mL x 3)로 추출하고, 유기층을 합쳤다. 생성된 혼합물을 염수(100 mL x 2)로 세척하였다. 혼합물을 무수 황산나트륨 상에서 건조시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:20)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 9.04 g(85.4%)의 메틸 3-브로모-2,6-디플루오로벤조에이트를 백색 고체로서 수득하였다. 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ3.98 (d, J = 8.7 Hz, 3H), 6.90-6.96 (m, 1H), 7.62-7.70 (m, 1H); 9F-NMR (300 MHz, CDCl3) δ 102.0, 110.9.
단계 5: 메틸 3-((1-시클로펜틸-2,2,2-트리플루오로에틸)아미노)-2,6-디플루오로벤조에이트 제조
톨루엔(15 mL) 중 메틸 3-브로모-2, 6-디플루오로벤조에이트 1.86 g, 7.41 mmol, 1.49당량), 1-시클로펜틸-2, 2, 2-트리플루오로에탄-1-아민 염화수소 (1.01 g, 4.96 mmol, 1당량) 및 Cs2CO3 (4.83 g, 14.8 mmol, 2.99당량)의 혼합물을 N2로 퍼지하였다. 그런 다음, 여기에 RuPhos-PdCl-2nd G (386.9 mg, 0.50 mmol, 0.10당량)를 첨가하고 밀봉 튜브를 닫고 생성된 혼합물을 100℃에서 3시간 동안 교반하였다. 미정제물을 플래쉬 크로마토그래피(실리카 겔, PE: EtOAc=15:1)로 사전 정제한 다음, 분취-TLC(PE:EtOAc=15:1)로 추가로 정제하였다. 이를 통해 319.6 mg(19.1%)의 메틸 3-[(1-시클로펜틸-2,2,2-트리플루오로에틸)아미노]-2,6-디플루오로벤조에이트를 무색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 338.05 [M+1] +.
단계 6: 3-((1-시클로펜틸-2,2,2-트리플루오로에틸)아미노)-2,6-디플루오로벤조산 제조
THF(10 mL), 메탄올(5 mL) 및 H2O (5 mL) 중 메틸 3-[(1-시클로펜틸-2, 2, 2-트리플루오로에틸) 아미노]-2, 6-디플루오로벤조에이트 (298.4 mg, 0.88 mmol, 1당량)의 교반 용액에 LiOH.H2O (374.1 mg, 8.91 mmol, 10.1당량)를 첨가하였다. 생성된 용액을 실온에서 19시간 동안 교반하였다. 혼합물을 건조될 때까지 증발시켰다. 잔류물에 20 mL H2O을 첨가하였다. 1 M HCl을 첨가하여 pH를 6으로 조정하였다. 혼합물을 에틸 아세테이트(40 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 물, 염수로 세척하고, Na2SO4 상에서 건조시켰다. 유기상을 농축시키고 진공 중에서 건조시켰다. 이를 통해 287 mg(100%)의 3-[(1-시클로펜틸-2,2,2-트리플루오로에틸)아미노]-2,6-디플루오로벤조산을 무색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 324.05 [M+1] +.
단계 7: 3-((1-시클로펜틸-2,2,2-트리플루오로에틸)아미노)-2,6-디플루오로벤조일 클로라이드 제조
톨루엔(10 mL) 중 3-[(1-시클로펜틸-2,2,2-트리플루오로에틸)아미노]-2,6-디플루오로벤조산 (306.3 mg, 0.95 mmol, 1당량)의 용액에 설푸로일 이염화물(2.8 mL, 38.6 mmol, 40.7당량) 및 DMF(0.06 mL, 0.78 mmol, 0.82당량)를 첨가하였다. 생성된 용액을 환류하며 3시간 동안 가열하였다. 용액을 증발 건조시키고 진공 하에 건조시켰다. 이를 통해 323.8 mg(100%)의 3-[(1-시클로펜틸-2,2,2-트리플루오로에틸)아미노]-2,6-디플루오로벤조일 클로라이드를 연갈색 오일로서 수득하였다.
단계 8: (5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)(3-((1-시클로펜틸-2,2,2-트리플루오로에틸)아미노)-2,6-디플루오로페닐)메타논 제조
디클로로메탄(7 mL) 중 AlCl3 (1.03 g, 7.73 mmol, 8.16당량)의 혼합물에 0℃에서 5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (187.2 mg, 0.95 mmol, 1.00당량)을 첨가하였다. 혼합물을 0℃에서 1시간 동안 교반하였다. 그런 다음, 디클로로메탄(7 mL) 중 3-[(1-시클로펜틸-2,2,2-트리플루오로에틸)아미노]-2,6-디플루오로벤조일 클로라이드 (323.8 mg, 0.95 mmol, 1당량)를 0℃에서 첨가하였다. 혼합물을 0℃에서 1시간 동안 교반한 다음, 추가로 15시간 동안 실온까지 가온시켰다. 이어서 15 mL의 물과 포화 NaHCO3 수용액(15 mL)을 첨가하여 반응물을 급냉시켰다. 혼합물을 에틸 아세테이트(30 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(10 mL x 1)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시켰다. 미정제물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(2:5)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 395.3 mg(83.1%)의 3-[5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-N-(1-시클로펜틸-2,2,2-트리플루오로에틸)-2,4-디플루오로아닐린을 연황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 501.95 [M+1] +.
단계 9: 삼차-부틸 2-(4-((4-(4-(3-(3-((1-시클로펜틸-2,2,2-트리플루오로에틸)아미노)-2,6-디플루오로벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세테이트 제조
디옥산 (10 mL) 및 H2O (2.5 mL) 중 3-[5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-N-(1-시클로펜틸-2,2,2-트리플루오로에틸)-2,4-디플루오로아닐린 (200.7 mg, 0.40 mmol, 1당량), 삼차-부틸 2-[4-([4-[4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐]피페라진-1-일]메틸)피페리딘-1-일]아세테이트(358 mg, 0.72 mmol, 1.79당량) 및 Na2CO3 (127.9 mg, 1.21 mmol, 3.02당량)의 혼합물을 N2로 퍼지시켰다. 그런 다음, 여기에 Pd(dppf)Cl2 .CH2Cl2 (51.4 mg, 0.06 mmol, 0.16당량)를 첨가하였다. 밀봉 튜브를 닫고, 반응 혼합물을 105℃에서 4시간 동안 교반하였다. 이어서 반응물을 물(50 mL)의 첨가로 급냉시켰다. 혼합물을 에틸 아세테이트(40 mL x 3)으로 추출하고 합쳐진 유기층을 염수(30 mL x 1)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시켰다. 미정제물을 디클로로메탄/메탄올(15:1)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 240.2 mg(75.6%)의 삼차-부틸 2-[4-([4-[4-(3-[3-[(1-시클로펜틸-2,2,2-트리플루오로에틸)아미노]-2,6-디플루오로벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐]피페라진-1-일]메틸)피페리딘-1-일]아세테이트를 연갈색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 795.30 [M+1] +.
단계 10: 2-(4-((4-(4-(3-(3-((1-시클로펜틸-2,2,2-트리플루오로에틸)아미노)-2,6-디플루오로벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트산 제조
디클로로메탄(15 mL) 중 삼차-부틸 2-[4-([4-[4-(3-[3-[(1-시클로펜틸-2,2,2-트리플루오로에틸)아미노]-2,6-디플루오로벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐]피페라진-1-일]메틸)피페리딘-1-일]아세테이트(185 mg, 0.23 mmol, 1당량)의 용액에 TFA(4.0 mL)를 첨가하였다. 반응 용액을 실온에서 15시간 동안 교반하였다. 생성된 용액을 증발 건조시키고 진공 하에 건조시켰다. 이를 통해 171.9 mg (100%)의 2-[4-([4-[4-(3-[3-[(1-시클로펜틸-2,2,2-트리플루오로에틸)아미노]-2,6-디플루오로벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐]피페라진-1-일]메틸)피페리딘-1-일]아세트산을 연황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 739.25 [M+1] +.
단계 11: (2S,4R)-1-((2S)-2-(2-(4-((4-(4-(3-(3-((1-시클로펜틸-2,2,2-트리플루오로에틸)아미노)-2,6-디플루오로벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
DMF (6 mL) 중 2-[4-([4-[4-(3-[3-[(1-시클로펜틸-2,2,2-트리플루오로에틸)아미노]-2,6-디플루오로벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐]피페라진-1-일]메틸)피페리딘-1-일]아세트산 (171.9 mg, 0.23 mmol, 1당량) 및 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드 염화수소 (175.4 mg, 0.38 mmol, 1.61당량) 용액에 DIEA (0.4 mL, 2.42 mmol, 10.40당량) 및 BOP (200.3 mg, 0.45 mmol, 1.95당량)을 첨가하였다. 반응 용액을 실온에서 3시간 동안 교반하였다. 이어서 30 mL의 물을 첨가하여 반응물을 급냉시켰다. 생성된 혼합물을 에틸 아세테이트(50 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 물(40 mL x 1), 염수(40 mL x 1)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 농축시켰다. 미정제 생성물을 분취-HPLC로 정제하였다. 이를 통해 109.3 mg(40.8%)의 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[2-[4-([4-[4-(3-[3-[(1-시클로펜틸-2,2,2-트리플루오로에틸)아미노]-2,6-디플루오로벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐]피페라진-1-일]메틸)피페리딘-1-일]아세트아미도]-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드를 연황색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 1152.20 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 0.96 (s, 9H), 1.10-1.27 (m, 2H), 1.28-1.62 (m, 6H), 1.63-1.98 (m, 6H), 1.99-2.38 (m, 6H), 2.47 (s, 6H), 2.75-3.09 (m, 4H), 3.11-3.26 (m, 4H), 3.56-3.78 (m, 3H), 4.13-4.57 (m, 6H), 5.17 (s, 1H), 5.73 (d, J = 7.5Hz, 1H), 6.96-7.27 (m, 4H), 7.43 (s, 4H), 7.59 (d, J = 7.5Hz, 2H), 7.83 (d, J = 9.6Hz, 1H), 8.10 (s, 1H), 8.48 (s, 1H), 8.65 (s, 2H), 9.01 (s, 1H), 12.8 (br., 1H).
(2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)페녹시)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드 (실시예 371)의 예시적인 합성
단계 1: 5-브로모-1-토실-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 제조
질소의 불활성 대기로 퍼지되고 유지된 250-mL 3-목 둥근 바닥 플라스크에, THF(120 mL) 중 5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (5.91 g, 29.99 mmol, 1당량)을 넣고, 여기에 0℃에서 물/얼굴 조 내에 NaH(1.80 g, 45.00 mmol, 1.50당량, 60%)를 나누어서 첨가하였다. 생성된 혼합물을 0 ℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 그런 다음, TsCl(6.29 g, 32.99 mmol, 1.10당량)을 첨가하고, 생성된 혼합물을 실온에서 2시간 동안 추가로 교반하였다. 이어서, 반응 혼합물을 물(200 mL)이 첨가로 급냉시키고 에틸 아세테이트(200 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:2)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 10.48 g(99.48%)의 5-브로모-1-(4-메틸벤젠설포닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘을 연황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 350.75 [M+1] +.
단계 2: (2S,3R)-5-브로모-N,N,N-트리에틸-2-하이드록시-1-토실-2,3-디하이드로-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-아미늄 브로마이드 제조
250-mL 둥근 바닥 플라스크에, 아세톤(130 mL) 중 5-브로모-1-(4-메틸벤젠설포닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (7.02 g, 19.99 mmol, 1당량) 및 H2O (3.60 mL, 199.83 mmol, 10.00당량)를 넣고, 여기에 NBS(3.91 g, 21.97 mmol, 1.10당량)를 첨가하였다. 생성된 용액을 실온에서 4.5시간 동안 교반한 다음, TEA(3.0 mL, 21.58 mmol, 1.08당량)로 첨가하였다. 반응 혼합물을 실온에서 추가로 1시간 동안 교반되게 한 다음, 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:1)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 13.70 g(124.78%)의 (2S,3R)-5-브로모-N,N,N-트리에틸-2-하이드록시-1-(4-메틸벤젠설포닐)-1H,2H,3H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-아미늄 브로마이드를 갈색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 467.90 [M+1] +.
단계 3: 2-(디플루오로메톡시)-1,3-디플루오로벤젠 제조
질소의 불활성 대기로 퍼지되고 유지된 500-mL 둥근 바닥 플라스크에, DMF(200 mL) 및 H2O (20 mL) 중 2,6-디플루오로페놀 (20.00 g, 153.73 mmol, 1당량), 나트륨 2-클로로-2,2-디플루오로아세테이트 (46.89 g, 307.56 mmol, 2.00당량), K2CO3 (25.49 g, 184.44 mmol, 1.20당량)을 넣었다. 생성된 혼합물을 오일조에서 100℃에서 3시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 실온으로 냉각시키고 HCl 용액(13 mol/L, 30 mL)으로 급냉시켰다. 혼합물을 물(300 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(300 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(300 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 중에서 농축시켰다. 이를 통해 17.17 g(62.01%)의 2-(디플루오로메톡시)-1,3-디플루오로벤젠을 황색 액체로서 수득하였다. 1H-NMR (300MHz, CDCl3) δ 7.24-7.09 (m, 1H), 7.03-6.93 (m, 2H), 6.69 (t, J=73.4 Hz, 1H).
단계 4: 2-(디플루오로메톡시)-1,3-디플루오로-4-니트로벤젠 제조
100-mL의 3-목 둥근 바닥 플라스크에, H2SO4 (35 mL)를 넣고, 여기에 HNO3 (35 mL, 65%을 -10℃에서 액체 질소/EtOH 조 중에 첨가하였다. 그런 다음, -10℃에서 2-(디플루오로메톡시)-1,3-디플루오로벤젠 (7.00 g, 38.87 mmol, 1당량)을 서서히 첨가하였다. 생성된 혼합물을 -10 ℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 냉수(800 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(300 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 NaHCO3 (200 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:50)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 4.68 g(53.49%)의 2-(디플루오로메톡시)-1,3-디플루오로-4-니트로벤젠을 황색 오일로서 수득하였다. 1H-NMR (300MHz, CDCl3) δ8.15-8.07 (m, 1H), 7.29-7.17 (m, 1H), 6.69 (t, J=72.0 Hz, 1H).
단계 5: 2,6-디플루오로-3-니트로페놀 제조
250-mL 둥근 바닥 플라스크에, 아세트산(6 mL) 중 2-(디플루오로메톡시)-1,3-디플루오로-4-니트로벤젠(6.68 g, 29.68 mmol, 1당량)을 넣고, 여기에 브롬화수소 용액(40%, 90 mL)을 실온에서 첨가하였다. 생성된 용액을 오일조에서 130 ℃에서 40시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 실온으로 냉각시킨 후, 물(500 mL)로 희석하였다. 생성된 혼합물을 에틸 아세테이트(400 mL x 2)로 추출하고, 합쳐진 유기층을 염수(400 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:4)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 3.50 g(67.36%)의 2,6-디플루오로-3-니트로페놀을 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 173.65 [M-1] -.
단계 6: 5-브로모-3-(2,6-디플루오로-3-니트로페녹시)-1-토실-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 제조
250-mL 둥근 바닥 플라스크에, 에틸 아세테이트 (70 mL) 중 2,6-디플루오로-3-니트로페놀 (1.05 g, 6.00 mmol, 1당량), (2S,3R)-5-브로모-N,N,N-트리에틸-2-하이드록시-1-(4-메틸벤젠설포닐)-1H,2H,3H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-아미늄 브로마이드 (3.95 g, 7.19 mmol, 1.20당량), TEA (1.21 g, 11.96 mmol, 1.99당량)를 넣고, 여기에 건식 4A MS (5 g)를 첨가하였다. 생성된 혼합물을 오일조에서 80℃에서 4시간 동안 교반한 다음, 실온으로 냉각시키고, 에톡시에탄 트리플루오로보란(4.26 g, 30.01 mmol, 5.01당량)으로 첨가하였다. 생성된 혼합물을 오일조에서 50℃에서 2시간 동안 추가 교반하였다. 반응 혼합물을 실온으로 냉각시키고 고체를 걸러냈다. 여과물을 에틸 아세테이트(250 mL)로 희석하고, 포화 Na2CO3 용액(100 mL) 및 염수(100 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:7)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 1.13 g(35.94%)의 5-브로모-3-(2,6-디플루오로-3-니트로페녹시)-1-(4-메틸벤젠설포닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘을 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 523.75 [M+1] +.
단계 7: 3-((5-브로모-1-토실-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)옥시)-2,4-디플루오로아닐린 제조
50-mL 둥근 바닥 플라스크에, 아세트산(10 mL) 중 5-브로모-3-(2,6-디플루오로-3-니트로페녹시)-1-(4-메틸벤젠설포닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (1.13 g, 2.16 mmol, 1당량)을 넣었다. 이어서, 실온에서 철 분말(965.6 mg, 17.29 mmol, 8.02당량)을 첨가하였다. 생성된 혼합물을 오일조에서 50℃에서 3시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 실온으로 냉각시키고, 포화 Na2CO3 용액으로 혼합물의 pH 값을 8로 조정하였다. 혼합물을 에틸 아세테이트(250 mL x 3)로 추출하고, 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1/5)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 510 mg(47.87%)의 3-[[5-브로모-1-(4-메틸벤젠설포닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일]옥시]-2,4-디플루오로아닐린을 분홍색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 493.75 [M+1] +.
단계 8: 3-((5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)옥시)-2,4-디플루오로아닐린 제조
50 mL 둥근바닥 플라스크에, THF (7 mL) 중 3-[[5-브로모-1-(4-메틸벤젠설포닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일]옥시]-2,4-디플루오로아닐린 (510 mg, 1.03 mmol, 1당량), TBAF (3.5 mL)을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 24시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물(100 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(120 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(2/3)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 290 mg(82.64%)의 3-([5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3일]옥시)-2,4-디플루오로아닐린을 연갈색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 339.80 [M+1] +.
단계 9: (R)-N-(3-((5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)옥시)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 제조
8-mL 밀봉 튜브에, 피리딘(660 mL) 중 3-([5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일]옥시)-2,4-디플루오로아닐린 (200 mg, 0.59 mmol, 1당량), DMAP (14.4 mg, 0.12 mmol, 0.20당량)를 넣고, 여기에 실온에서 (3R)-3-플루오로피롤리딘-1-설포닐클로라이드 (220.6 mg, 1.18 mmol, 2.00당량)를 서서히 첨가하였다. 생성된 용액을 오일조에서 45 ℃에서 24시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 실온으로 냉각시킨 후, 물(50 mL)로 희석하였다. 혼합물을 에틸 아세테이트(50 mL x 2)로 추출하고, 유기층을 합치고 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1/1)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 216 mg (74.77%)의 (3R)-N-[3-([5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일]옥시)-2,4-디플루오로페닐]-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드를 연갈색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 490.75 [M+1] +.
단계 10: 삼차-부틸 (R)-2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-((3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)페녹시)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세테이트 제조
질소 불활성 분위기로 퍼지되고 유지된 30 mL의 밀봉된 튜브에, 디옥산 (12 mL) 및 H2O (2 mL) 중 (3R)-N-[3-([5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일]옥시)-2,4-디플루오로페닐]-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 (300 mg, 0.61 mmol, 1당량), 삼차-부틸 2-[4-([4-[4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐]피페라진-1-일]메틸)피페리딘-1-일]아세테이트 (366 mg, 0.73 mmol, 1.20당량), Na2CO3 (194.2 mg, 1.83 mmol, 3.00당량), Pd(dppf)Cl2-CH2Cl2 (49.9 mg, 0.06 mmol, 0.10당량)을 넣었다. 생성된 혼합물을 오일조에서 105℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 실온으로 냉각시킨 후, 물(80 mL)로 희석하였다. 생성된 혼합물을 에틸 아세테이트(80 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(15/1)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 454 mg (94.84%)의 삼차-부틸 2-(4-[[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)페녹시]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]메틸]피페리딘-1-일)아세테이트를 갈색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 784.05 [M+1] +.
단계 11: (R)-2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-((3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)페녹시)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트산 제조
50 mL 둥근바닥 플라스크에, 디클로로메탄 (6 mL) 중 삼차-부틸 2-(4-[[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)페녹시]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]메틸]피페리딘-1-일)아세테이트 (398 mg, 0.51 mmol, 1당량)을 넣고, 여기에 TFA (3 mL)를 실온에서 첨가하였다. 생성된 용액을 오일조에서 35℃에서 3시간 동안 교반한 후, 진공 중에서 농축시켰다. 이를 통해 369 mg (99.86%)의 2-(4-[[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)페녹시]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]메틸]피페리딘-1-일)아세트산을 갈색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 728.05 [M+1] +.
단계 12: (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)페녹시)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
8 mL 둥근바닥 플라스크에, DMF (5 mL) 중 2-(4-[[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)페녹시]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]메틸]피페리딘-1-일)아세트산 (218.3 mg, 0.30 mmol, 1당량), (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (168.1 mg, 0.39 mmol, 1.30당량), DIEA (155 mg, 1.20 mmol, 4.00당량), BOP (159.1 mg, 0.36 mmol, 1.20당량)를 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물(50 mL)로 희석시키고 디클로로메탄/메탄올 (10/1, 50 mL x 2)의 혼합물로 추출하였다. 유기층을 염수(50 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(13/1)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 수득된 생성물을 분취-HPLC로 추가로 정제하였다. 이를 통해 64.2 mg (18.77%)의 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[2-(4-[[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)페녹시]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]메틸]피페리딘-1-일)아세트아미도]-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드를 백색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 1140.2 [M+1] +; 1H-NMR (300MHz, CD3OD) δ 8.87 (s, 1H), 8.43 (s, 1H), 7.99 (s, 1H), 7.51-7.40 (m, 7H), 7.09-7.03 (m, 4H), 5.08 (d, J=53.0 Hz, 1H), 4.63-4.48 (m, 4H), 4.38-4.33 (m, 1H), 3.91-3.76 (m, 2H), 3.63-3.34 (m, 4H), 3.22-3.19 (m, 4H), 3.02 (s, 2H), 2.91-2.84 (m, 2H), 2.57-2.54 (m, 4H), 2.47 (s, 3H), 2.25-2.16 (m, 5H), 2.12-1.97 (m, 2H), 1.87-1.76 (m, 3H), 1.60 (s, 1H), 1.36-1.27 (m, 2H), 1.04 (s, 9H).
(2S,4R)-1-((S)-2-(2-(3-(2-(3-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)아제티딘-1-일)에틸)아제티딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드 (실시예 441)의 예시적인 합성
단계 1: 삼차-부틸 3-(4-(벤질옥시)페닐)아제티딘-1-카르복실레이트 제조
질소의 불활성 대기로 퍼지되고 유지된 1000-mL 3-목 둥근 바닥 플라스크에, DMF(400 mL) 중 아연(11 g, 168.25 mmol, 2.95당량)을 넣고, 여기에 I2 (2.23 g, 8.79 mmol, 0.15당량)를 실온에서 첨가하였다. 생성된 혼합물을 실온에서 약 5분 동안 교반한 다음, 삼차-부틸 3-아이오도아제티딘-1-카르복실레이트 (16.2 g, 57.22 mmol, 1.00당량)로 나누어서 채웠다. 반응 혼합물을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 그런 다음, 상기 혼합물에 1-(벤질옥시)-4-브로모벤젠 (15 g, 57.01 mmol, 1.00당량), SPhos (2.4 g, 5.85 mmol, 0.10당량), Pd2(dba)3 (3.6 g, 3.93 mmol, 0.07당량)을 첨가하였다. 생성된 혼합물을 질소 분위기 하에 50℃에서 3시간 동안 추가 교반하였다. 이어서, 물(2000 mL)을 첨가하여 반응물을 급냉시키고, 혼합물을 에틸 아세테이트(3 x 700 mL)로 추출하였다. 유기층을 합치고 염수(3 x 700 ml)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(0% 내지 33% 구배)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 13 g(67.25%)의 삼차-부틸 3-[4-(벤질옥시)페닐]아제티딘-1-카르복실레이트를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 340.10 [M+1] +.
단계 2: 삼차-부틸 3-(4-하이드록시페닐)아제티딘-1-카르복실레이트 제조
100-mL 둥근 바닥 플라스크에, 질소 대기 하에 MeOH(30 mL) 중 삼차-부틸 3-[4-(벤질옥시)페닐]아제티딘-1-카르복실레이트 (3 g, 8.84 mmol, 1.00당량) 및 Pd/C (10%, 3 g, 28.18 mmol, 3.19당량))를 넣었다. 이어서 플라스크를 진공화하고 수소로 플러싱하였다. 반응 혼합물을 수소 분위기 하에 실온에서 3시간 동안 수소 풍선을 사용해 수소화시켰다. 이어서 반응 혼합물을 셀라이트 패드를 통해 여과하고, 여액을 감압 하에 농축시켰다. 이를 통해 1.5 g(68.18%)의 삼차-부틸 3-(4-하이드록시페닐)아제티딘-1-카르복실레이트를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 250.10 [M+1] +.
단계 3: 삼차-부틸 3-(4-(((트리플루오로메틸)설포닐)옥시)페닐)아제티딘-1-카르복실레이트 제조
100-mL 둥근 바닥 플라스크에, DCM(30 mL) 중 삼차-부틸 3-(4-하이드록시페닐)아제티딘-1-카르복실레이트 (1.5 g, 0.006 mmol, 1.00당량), 페닐(트리플루오로메탄설포닐옥시)아미노 트리플루오로메탄설포네이트 (4.6 g, 11.82 mmol, 1.96당량), DIEA (2.30 g, 17.80 mmol, 2.96당량)를 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 12시간 동안 교반하였다. 혼합물을 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:100 내지 3:100 구배)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 1.5 g(65.36%)의 삼차-부틸 3-[4-(트리플루오로메탄설포닐옥시)페닐]아제티딘-1-카르복실레이트를 회백색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 382.10 [M+1] +.
단계 4: 삼차-부틸 3-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)아제티딘-1-카르복실레이트 제조
100-mL 둥근 바닥 플라스크에, 질소 분위기 하에 디옥산 (10 ml) 중 삼차-부틸 3-[4-(트리플루오로메탄설포닐옥시)페닐]아제티딘-1-카르복실레이트 (1.5 g, 3.93 mmol, 1.00당량), 4,4,5,5-테트라메틸-2-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-1,3,2-디옥사보로란 (1.5 g, 5.90 mmol, 1.50당량), KOAc (1.2 g, 12.23 mmol, 3.11당량 ), Pd(dppf)Cl2 (140 mg, 0.19 mmol, 0.05당량)을 넣었다. 생성된 용액을 질소 분위기 하 100℃에서 1시간 동안 교반하였다. 혼합물을 농축시키고, 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:100 내지 1:10 구배)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 500 mg (35.38%)의 삼차-부틸 3-[4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐]아제티딘-1-카르복실레이트를 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 360.23 [M+1] +.
단계 5: 3-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)아제티딘 제조
100-mL 둥근 바닥 플라스크에, DCM(10 mL) 중 삼차-부틸 3-[4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐]아제티딘-1-카르복실레이트 (500 mg, 1.39 mmmo, 1.00당량)를 넣고, 여기에 TFA(3 mL)를 첨가하였다. 생성된 용액을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 이를 통해 350 mg(미정제)의 3-[4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐]아제티딘을 황색 오일로서 수득하였다.
단계 6: 삼차-부틸 3-(2-하이드록시에틸)아제티딘-1-카르복실레이트 제조
250-mL의 3-목 둥근 바닥 플라스크에, THF(100 mL) 중 2-[1-[(삼차-부톡시)카르보닐]아제티딘-3-일]아세트산 (10 g, 46.46 mmol, 1.00당량)을 넣고, 여기에 BH3 .THF (70 mL)를 0℃에서 적가하였다. 생성된 용액을 실온에서 12시간 동안 교반하였다. 이어서 NaOH 용액(2M, 100 mL)을 첨가하여 반응물을 급냉시켰다. 생성된 혼합물을 에틸 아세테이트(3 x 100 mL)로 추출하고, 합쳐진 유기층을 염수로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 농축시켰다. 이를 통해 8.5 g(90.91%)의 삼차-부틸 3-(2-하이드록시에틸)아제티딘-1-카르복실레이트를 연황색 오일로서 수득하였다.
단계 7: 삼차-부틸 3-(2-(토실옥시)에틸)아제티딘-1-카르복실레이트 제조
500 mL 3-목 둥근바닥 플라스크에, DCM (100 mL) 중 삼차-부틸 3-(2-하이드록시에틸)아제티딘-1-카르복실레이트 (8.5 g, 42.23 mmol, 1.00당량), TEA (12.8 g, 0.13 mmol, 3.00당량)를 넣고, 여기에 TsCl (10.5 g, 55.08 mmol, 1.30당량)을 천천히 첨가하였다. 생성된 용액을 실온에서 12시간 동안 교반하였다. 이어서 100 mL의 물을 첨가하여 반응물을 급냉시켰다. 생성된 혼합물을 디클로로메탄(2 x 50 mL)으로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:100 내지 40:100 구배)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 8 g(53.33%)의 삼차-부틸 3-(2-(토실옥시)에틸)아제티딘-1-카르복실레이트를 황색 오일로서 수득하였다.
단계 8: 삼차-부틸 3-(2-(3-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)아제티딘-1-일)에틸)아제티딘-1-카르복실레이트 제조
100-mL 둥근 바닥 플라스크에, MeCN (50 mL) 중 3-[4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐]아제티딘 (350 mg, 1.35 mmol, 1.00당량), 삼차-부틸 3-[2-[(4-메틸벤젠설포닐)옥시]에틸]아제티딘-1-카르복실레이트 (480 mg, 1.35 mmol, 1.00당량), K2CO3 (932 mg, 6.74 mmol, 4.99당량), NaI (20 mg, 0.133 mmol, 0.10당량)을 넣었다. 생성된 용액을 오일조에서 70℃에서 12시간 동안 교반하였다. 불용성 고체를 걸러 내고, 여액을 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(100:1 내지 100:7 구배)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 180 mg (30.13%)의 삼차-부틸 3-(2-[3-[4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐]아제티딘-1-일]에틸)아제티딘-1-카르복실레이트를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 443.25 [M+1] +.
단계 9: 삼차-부틸 (R)-3-(2-(3-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-((3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)아제티딘-1-일)에틸)아제티딘-1-카르복실레이트 제조
100-mL 둥근 바닥 플라스크에, 질소 분위기 하에 디옥산 (17 mL) 및 물 (3 mL) 중 삼차-부틸 3-(2-[3-[4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐]아제티딘-1-일]에틸)아제티딘-1-카르복실레이트 (180 mg, 0.41 mmol, 1.00당량), (3R)-N-(3-[5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 (204 mg, 0.41 mmol, 1.00당량), Na2CO3 (130 mg, 1.227 mmol, 3.01당량), Pd(dppf)Cl2 (60 mg, 0.082 mmol, 0.20당량)을 넣었다. 생성된 혼합물을 오일조에서 85℃에서 2시간 동안 교반하였다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(100:1 내지 100:8 구배)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 100 mg (33.27%)의 삼차-부틸 3-[2-[3-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)아제티딘-1-일]에틸]아제티딘-1-카르복실레이트를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 739.25 [M+1] +.
단계 10: (R)-N-(3-(5-(4-(1-(2-(아제티딘-3-일)에틸)아제티딘-3-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 제조
50-mL 둥근 바닥 플라스크에, DCM (3 mL) 중 삼차-부틸 3-[2-[3-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)아제티딘-1-일]에틸]아제티딘-1-카르복실레이트 (20 mg, 0.027 mmol, 1당량)를 첨가하고, 여기에 실온에서 TFA (0.2 mL)를 첨가하였다. 생성된 용액을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 혼합물을 진공 하에서 농축시켰다. 이를 통해 15 mg (미정제)의 (3R)-N-[3-[5-(4-[1-[2-(아제티딘-3-일)에틸]아제티딘-3-일]페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로페닐]-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드를 황색 고체로서 수득하였다.
단계 11: (R)-2-(3-(2-(3-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-((3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)아제티딘-1-일)에틸)아제티딘-1-일)아세트산 제조
50-mL 둥근 바닥 플라스크에, DCE (10 mL) 중 (3R)-N-[3-[5-(4-[1-[2-(아제티딘-3-일)에틸]아제티딘-3-일]페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로페닐]-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 (100 mg, 0.157 mmol, 1당량), 2-옥소아세트산 (13 mg, 0.176 mmol, 1.12당량)을 넣었다. 생성된 혼합물을 실온에서 10분 동안 교반한 다음, NaBH(OAc)3 (100 mg, 0.472 mmol, 3.01당량)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 이어서 1 mL의 물을 첨가하여 반응물을 급냉시켰다. 생성된 혼합물을 디클로로메탄(2 x 10 mL)으로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 농축시켰다. 미정제 생성물을 분취-HPLC로 정제하였다. 이를 통해 20 mg(2단계 동안 18.33%)의 2-(3-[2-[3-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)아제티딘-1-일]에틸]아제티딘-1-일)아세트산을 무색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 696.95 [M+1] +.
단계 12: (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(3-(2-(3-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)아제티딘-1-일)에틸)아제티딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
100 mL 둥근바닥 플라스크에, DMF (5 mL) 중 (3R)-N-[3-[5-(4-[1-[2-(아제티딘-3-일)에틸]아제티딘-3-일]페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로페닐]-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 (120 mg, 0.172 mmol, 1.00당량), (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (74 mg, 0.172 mmol, 1.00당량), DIEA (111 mg, 0.859 mmol, 4.99당량), BOP (114 mg, 0.26 mmol, 1.50당량)를 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 혼합물을 농축시켰다. 미정제 생성물을 분취-HPLC로 정제하였다. 이를 통해 46.2 mg (18.33%)의 (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(3-(2-(3-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)아제티딘-1-일)에틸)아제티딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 1109.35 [M+1] +; 1H-NMR (300MHz, DMSO-d 6 ) δ 8.96 (m, 1H), 8.67 (s, 1H), 8.56-8.54 (m, 2H), 8.01 (s, 1H), 7.95-7.89 (d, 1H), 7.78-7.75 (m, 2H), 7.54-7.45 (m, 4H), 7.39-7.37 (m, 4H), 6.86 (m, 1H), 5.32 (m, 1H), 5.18 (m, 2H), 4.66-4.39 (m, 10H), 4.30-4.28 (m, 1H), 3.69-3.62 (m, 6H), 3.20-3.07 (m, 6H), 2.60 (m, 2H), 2.43-2.41 (m, 2H), 2.12-1.65 (m, 7H), 0.97 (s, 9H).
2-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)-N-((S)-1-((2S,4R)-4-하이드록시-2-(5-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)-1H-이미다졸-2-일)피롤리딘-1-일)-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일)아세트아미드 (실시예 386)의 예시적인 합성
단계 1: 벤질 (2S,4R)-1-((S)-2-((삼차-부톡시카르보닐)아미노)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복실레이트 제조
질소의 불활성 대기로 퍼지되고 유지된 1000-mL 3-목 둥근 바닥 플라스크에, N,N-디메틸포름아미드(200 mL), (2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]-3,3-디메틸부탄산 (48.98 g, 211.77 mmol, 1.00당량)을 넣고, 이어서 20분 교반 후에, HATU (96.69 g, 254.29 mmol, 1.20당량) 및 DIEA (109.4 g, 846.49 mmol, 4.00당량)를 0°에서 첨가하였다. 여기에 벤질 (2S,4R)-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복실레이트 (100.0 g, 254.45 mmol, 1.20당량)를 0℃에서 여러 배치로 첨가하였다. 생성된 용액을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 생성된 용액을 에틸 아세테이트(300 mL x 3)로 추출하고, 유기층을 합쳤다. 생성된 혼합물을 염수(100 mL x 2)로 세척하였다. 혼합물을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(7/3)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 80 g(87%)의 벤질 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복실레이트를 연황색 고체로서 수득하였다.
단계 2: (2S,4R)-1-((S)-2-((삼차-부톡시카르보닐)아미노)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복실산 제조
100 mL 둥근 바닥 플라스크에, 질소 대기 하에 실온에서 벤질 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복실레이트(3 g, 6.90 mmol, 1당량) 및 멘톨(50 mL, 1.56 mmol, 0.23당량)을 첨가하였다. 교반 용액에 Pd/C (200 mg, 1.88 mmol, 0.27당량)를 질소 분위기 하에 실온에서 나누어서 첨가하였다. 이어서 플라스크를 진공화하고 수소로 플러싱하였다. 반응 혼합물을 수소 분위기 하에 실온에서 16시간 동안 수소 풍선을 사용해 수소화시킨 후, 셀라이트 패드를 통해 여과하고, 필터 케이크를 멘톨(120 mL)로 세척하고 감압 하에 농축시켰다. 이를 통해 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복실산 (1.67 g, 70.23%)을 백색 고체로서 수득하였다.
단계 3: 2-(4-브로모페닐)-2-옥소에틸 (2S,4R)-1-((S)-2-((삼차-부톡시카르보닐)아미노)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복실레이트 제조
50 mL의 둥근 바닥 플라스크에 아세토니트릴 (40 mL) 중 2-브로모-1-(4-브로모페닐)에탄-1-온 (1.04 g, 3.74 mmol, 1당량), N,N-디이소프로필에틸아민(1.5 g, 11.61 mmol, 3.10당량) 및 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복실산 (1.3 g, 3.77 mmol, 1.01당량)을 실온에서 첨가하였다. 생성된 혼합물을 실온에서 3시간 동안 교반한 다음, 진공 하에 농축시켰다. 잔류물을 석유 에테르/에틸 아세테이트(1:1)로 용리시켜 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피로 정제하여 2-(4-브로모페닐)-2-옥소에틸 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복실레이트 (2.16 g, 74.63%)를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 541.00 [M+1] +.
단계 4: 삼차-부틸 ((S)-1-((2S,4R)-2-(5-(4-브로모페닐)-1H-이미다졸-2-일)-4-하이드록시피롤리딘-1-일)-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일)카바메이트 제조
100 mL 둥근 바닥 플라스크에, 크실렌(40 mL) 중 2-(4-브로모페닐)-2-옥소에틸 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복실레이트 (2.06 g, 3.80 mmol, 1당량) 및 아세트산암모늄(2.3 g, 29.84 mmol, 7.84당량)을 실온에서 첨가하였다. 생성된 혼합물을 140℃에서 3시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 실온으로 냉각시킨 후, 물(100 mL)로 희석하였다. 혼합물을 에틸 아세테이트(50 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(50 mL)로 세척하고, 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트(100%)로 용리시키는 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피로 정제하여 삼차-부틸 N-[(2S)-1-[(2S,4R)-2-[5-(4-브로모페닐)-1H-이미다졸-2-일]-4-하이드록시피롤리딘-1-일]-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일]카바메이트 (1.5 g, 75.61%)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 522.95 [M+1] +.
단계 5: 삼차-부틸 ((S)-1-((2S,4R)-4-하이드록시-2-(5-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)-1H-이미다졸-2-일)피롤리딘-1-일)-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일)카바메이트 제조
10 mL 밀봉 튜브에 질소 분위기 하 실온에서 디옥산 (50 mL) 및 물(10 mL) 중 삼차-부틸 N-[(2S)-1-[(2S,4R)-2-[5-(4-브로모페닐)-1H-이미다졸-2-일]-4-하이드록시피롤리딘-1-일]-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일]카바메이트 (1.4 g, 2.68 mmol, 1당량), 탄산칼륨(1.1 g, 7.96 mmol, 2.96당량), Pd(dppf)Cl2 CH2Cl2 (219.3 mg, 0.27 mmol, 0.1당량) 및 4-메틸-5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-1,3-티아졸 (785.7 mg, 3.49 mmol, 1.3당량)을 첨가하였다. 생성된 혼합물을 질소 분위기 하 90℃에서 3시간 동안 교반하였다. 혼합물을 방치하여 실온까지 냉각시켰다. 수성층을 에틸 아세테이트(100 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(50 mL x 2)로 세척하고, 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메틸 알코올(10:1)로 용리시킨 실리카 겔 컬럼에서 정제하여 삼차-부틸 N-[(2S)-1-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-[5-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]-1H-이미다졸-2-일]피롤리딘-1-일]-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일]카바메이트 (1.3 g, 89.72%)를 황색 고체로 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 540.10 [M+1] +.
단계 6: (S)-2-아미노-1-((2S,4R)-4-하이드록시-2-(5-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)-1H-이미다졸-2-일)피롤리딘-1-일)-3,3-디메틸부탄-1-온 염화수소 제조
50 mL의 둥근 바닥 플라스크에 실온에서 디옥산 (20 mL, 4mol/L) 중 삼차-부틸 N-[(2S)-1-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-[5-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]-1H-이미다졸-2-일]피롤리딘-1-일]-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일]카바메이트 (1.3 g, 2.41 mmol, 1당량) 및 염산을 첨가하였다. 생성된 혼합물을 실온에서 2시간 동안 교반한 다음, 감압 하에 농축시켰다. 이를 통해 (2S)-2-아미노-1-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-[5-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]-1H-이미다졸-2-일]피롤리딘-1-일]-3,3-디메틸부탄-1-온 염화수소 (1.25g, 미정제)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 440.30 [M+1] +.
단계 7: 삼차-부틸 4-((1-((벤질옥시)카르보닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-카르복실레이트 제조
500 mL 둥근바닥 플라스크에, 벤질 4-포르밀피페리딘-1-카르복실레이트 (5 g, 20.22 mmol, 1.00당량), 삼차-부틸 피페라진-1-카르복실레이트 (3.8 g, 20.40 mmol, 1.01당량), 디클로로메탄 (200 mL)을 넣었다. 이어서, 25℃에서 10분 동안 나트륨 트리아세톡시보로하이드라이드(5.15 g)를 나누어서 첨가하였다. 생성된 용액을 25℃에서 3시간 동안 교반하였다. 물(50 mL)을 첨가하여 반응물을 급냉시키고 디클로로메탄(50 mL x 3)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(150 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(3:7-9:1)로 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 7.62 g(90%)의 삼차-부틸 4-([1-[(벤질옥시)카르보닐]피페리딘-4-일]메틸)피페라진-1-카르복실레이트를 연황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 418.20 [M+1] +.
단계 8: 삼차-부틸 4-(피페리딘-4-일메틸)피페라진-1-카르복실레이트 제조
질소의 불활성 대기로 퍼지되고 유지된 500-mL 둥근 바닥 플라스크에, 삼차-부틸 4-([1-[(벤질옥시)카르보닐]피페리딘-4-일]메틸)피페라진-1-카르복실레이트 (7.62 g, 18.25 mmol, 1.00당량), 에탄올(200 mL), 팔라듐 탄소(500 mg)를 넣었다. 이어서 플라스크를 진공화하고 수소 풍선을 사용해서 수소로 플러싱하였다. 반응 혼합물을 실온에서 16시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 셀라이트 패드를 통해 여과하고, 여액을 감압 하에 농축시켰다. 이를 통해 4.66 g(미정제)의 삼차-부틸 4-(피페리딘-4-일메틸)피페라진-1-카르복실레이트를 무색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 284.10 [M+1] +.
단계 9: 삼차-부틸 4-((1-(4-브로모페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-카르복실레이트 제조
250-mL 3-목 둥근 바닥 플라스크에, 삼차-부틸 4-[(피페리딘-4-일)메틸]피페라진-1-카르복실레이트 (4.27 g, 15.07 mmol, 1당량), (4-브로모페닐)보론산(3.63 g, 18.07 mmol, 1.20당량), 디클로로메탄(100 mL), 4A MS(5 g), (아세틸옥시)큐프리오 아세테이트(4.10 g, 22.57 mmol, 1.50당량), TEA (8.4 mL, 60.43 mmol, 4.01당량)를 넣었다. 생성된 혼합물을 공기로 퍼지하고 실온에서 20시간 동안 교반하였다. 고체를 걸러내고, 여액을 진공 하에 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:2)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 3.87 g(58.59%)의 삼차-부틸 4-[[1-(4-브로모페닐)피페리딘-4-일]메틸]피페라진-1-카르복실레이트를 연갈색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 438.00 [M+1] +.
단계 10: 1-((1-(4-브로모페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진 제조
100 mL 둥근바닥 플라스크에, 삼차-부틸 4-[[1-(4-브로모페닐)피페리딘-4-일]메틸]피페라진-1-카르복실레이트 (3.87 g, 8.83 mmol, 1당량), 디클로로메탄 (20 mL), 트리플루오로아세트산 (10 mL)을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 생성된 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 이를 통해 7.56 g(189.34%)의 1-[[1-(4-브로모페닐)피페리딘-4-일]메틸]피페라진; 트리플루오로아세트산을 갈색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 337.95 [M+1] +.
단계 11: 삼차-부틸 2-(4-((1-(4-브로모페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)아세테이트 제조
500-mL 둥근 바닥 플라스크에, 1-[[1-(4-브로모페닐)피페리딘-4-일]메틸]피페라진; 트리플루오로아세트산(7.56 g, 16.71 mmol, 1당량), TEA(23 mL, 165.47 mmol, 9.90당량), 디클로로메탄(130 mL)을 넣었다. 이어서 교반하며 삼차-부틸 2-브로모아세테이트(3.59 g, 18.40 mmol, 1.10당량)를 적가 첨가하였다. 생성된 용액을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 생성된 용액을 디클로로메탄(200 mL)으로 희석하고 물(100 mL)로 세척하였다. 유기물을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:1)로 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 3.43 g(45.36%)의 삼차-부틸 2-(4-[[1-(4-브로모페닐)피페리딘-4-일]메틸]피페라진-1-일)아세테이트를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 451.95 [M+1] +.
단계 12: 삼차-부틸 2-(4-((1-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)아세테이트 제조
질소의 불활성 분위기로 퍼지하고 유지된 250 mL 둥근바닥 플라스크에, 삼차-부틸 2-(4-[[1-(4-브로모페닐)피페리딘-4-일]메틸]피페라진-1-일)아세테이트 (3.90 g, 8.62 mmol, 1당량), 4,4,5,5-테트라메틸-2-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-1,3,2-디옥사보로란 (4.38 g, 17.25 mmol, 2.00당량), KOAc (2.53 g, 25.78 mmol, 2.99당량), Pd(dppf)Cl2 .CH2Cl2 (704 mg, 0.86 mmol, 0.10당량), DMSO (70 mL)를 넣었다. 생성된 혼합물을 오일조에서 90℃에서 16시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 실온으로 냉각시킨 후, 에틸 아세테이트 (500 mL)로 희석하였다. 혼합물을 물(200 mL) 및 염수(100 mL x 1)로 세척하였다. 유기물을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(2:1)로 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 2.57 g (59.69%)의 삼차-부틸 2-[4-([1-[4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐]피페리딘-4-일]메틸)피페라진-1-일]아세테이트를 연갈색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 500.15 [M+1] +.
단계 13: 삼차-부틸 (R)-2-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-((3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)아세테이트 제조
질소 불활성 분위기로 퍼지되고 유지된 30 mL의 밀봉된 튜브에, 삼차-부틸 2-[4-([1-[4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐]피페리딘-4-일]메틸)피페라진-1-일]아세테이트 (1.09 g, 2.18 mmol, 1.10당량), (3R)-N-(3-[5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 (1.00 g, 1.99 mmol, 1당량), 디옥산 (20 mL), H2O (4 mL), Na2CO3 (632 mg, 5.96 mmol, 3.00당량), Pd(dppf)Cl2 .CH2Cl2 (162 mg, 0.20 mmol, 0.10당량)을 넣었다. 생성된 혼합물을 오일조에서 105℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 실온으로 냉각시킨 후, 에틸 아세테이트 (150 mL)로 희석하였다. 혼합물을 물(50 mL)로 세척하였다. 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(28:1)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 1.15 g (72.72%)의 삼차-부틸 2-(4-[[1-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페리딘-4-일]메틸]피페라진-1-일)아세테이트를 갈색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 796.00 [M+1] +.
단계 14: (R)-2-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-((3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)아세트산 제조
100 mL 둥근바닥 플라스크에, 삼차-부틸 2-(4-[[1-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페리딘-4-일]메틸]피페라진-1-일)아세테이트 (1.11 g, 1.39 mmol, 1당량), 디클로로메탄 (10 mL), 트리플루오로아세트산 (5 mL)을 넣었다. 생성된 용액을 오일조에서 35℃에서 3시간 동안 교반하였다. 생성된 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 이를 통해 1.12 g (108.55%)의 2-(4-[[1-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페리딘-4-일]메틸]피페라진-1-일)아세트산을 갈색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 740.40 [M+1] +.
단계 15: 2-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)-N-((S)-1-((2S,4R)-4-하이드록시-2-(5-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)-1H-이미다졸-2-일)피롤리딘-1-일)-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일)아세트아미드 제조
100 mL 둥근 바닥 플라스크에 질소 대기 하에 실온에서 N,N-디메틸포름아미드(20 mL) 중 (2S)-2-아미노-1-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-[5-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]-1H-이미다졸-2-일]피롤리딘-1-일]-3,3-디메틸부탄-1-온 염화수소 (100 mg, 1당량), 2-(4-[[1-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페리딘-4-일]메틸]피페라진-1-일)아세트산(336 mg, 2.0당량, 60%), N,N-디이소프로필에틸아민(1 mL, 3.0당량) 및 (벤조트리아졸-1일옥시)트리스(디메틸아미노)포스포늄 헥사플루오로포스페이트(201 mg, 2.0당량)을 첨가하였다. 생성된 혼합물을 질소 분위기 하에 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물로 희석시키고 에틸 아세테이트(50 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(20 mL x 2)로 세척하고, 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 중에서 농축시켰다. 미정제 생성물을 분취-HPLC에 의해 정제하여 2-(4-[[1-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페리딘-4-일]메틸]피페라진-1-일)-N-[(2S)-1-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-[5-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]-1H-이미다졸-2-일]피롤리딘-1-일]-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일]아세트아미드 (53.8 mg, 22.05%)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 1161.20 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, CD3OD) δ 8.88 (s, 1H), 8.69 (s, 1H), 8.61 (s, 1H), 7.90 (s, 1H), 7.82 - 7.71 (m, 3H), 7.63 -7.58 (m, 2H), 7.51 - 7.46 (m, 2H), 7.41 - 7.37 (m, 1H), 7.15 - 7.08 (m, 3H), 5.33 - 5.24 (m, 2H), 4.65 - 4.48 (m, 2H), 3.99 (s, 2H), 3.80 - 3.75 (m, 2H), 3.61 - 3.39 (m, 5H), 3.09 (s, 1H), 2.84 - 2.72 (m, 2H), 2.63 (s, 3H), 2.55 - 2.38 (m, 8H), 2.36 - 2.02 (m, 5H), 1.93 - 1.86(m, 2H), 1.81 - 1.69 (m, 1H),1.40 - 1.26(m,3H), 1.05 (s, 2H), 0.98 (s, 7H).
N-((S)-1-((2S,4R)-2-(5-벤질-1H-이미다졸-2-일)-4-하이드록시피롤리딘-1-일)-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일)-2-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)아세트아미드 (실시예 459)의 예시적인 합성
단계 1: 1-브로모-3-페닐프로판-2-온 제조
아세토니트릴(50 mL) 중 2-페닐아세틸 클로라이드(6 g, 38.812 mmol, 1당량)의 교반 용액에 TMSCHN2 (13.30 g, 116.441 mmol, 3.00당량)를 질소 대기 하에 실온에서 적가하였다. 생성된 혼합물을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 혼합물을 0℃까지 냉각시키고 AcOH 중 HBr의 용액(40%, 12.56 g, 155.249 mmol, 4.0당량)에 의해 적가하였다. 반응 혼합물을 질소 분위기 하 실온에서 15시간 동안 추가 교반하였다. 그런 다음, 혼합물을 감압 하에 농축시키고, 잔류물을 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피로 정제하고, DCM/PE(1:1)로 용리하여 1-브로모-3-페닐프로판-2-온(4.5 g, 54.41%)을 연황색 오일로서 수득하였다.
단계 2: 2-옥소-3-페닐프로필 (2S,4R)-1-((S)-2-((삼차-부톡시카르보닐)아미노)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복실레이트 제조
아세토니트릴(50 mL) 중 1-브로모-3-페닐프로판-2-온 (2.72 g, 12.766 mmol, 1당량) 및 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복실산 (5.28 g, 15.319 mmol, 1.20당량)의 교반 용액에 질소 분위기 하 실온에서 DIEA (7 mL, 40.188 mmol, 3.15당량)를 적가하였다. 생성된 혼합물을 질소 분위기 하에 실온에서 3시간 동안 교반하였다. 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피로 정제하고, 석유 에테르/에틸 아세테이트(1:2)로 용리하여 2-옥소-3-페닐프로필(2S,4R)-1-[(2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복실레이트 (4.3 g, 70.68%)를 회백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 477.25 [M+1] +.
단계 3: 삼차-부틸 ((S)-1-((2S,4R)-2-(5-벤질-1H-이미다졸-2-일)-4-하이드록시피롤리딘-1-일)-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일)카바메이트 제조
100-mL 마이크로파 바이알에, 질소 분위기 하에 크실렌(50 mL) 중 2-옥소-3-페닐프로필 (2S,4R) -1-[(2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복실레이트 (952 mg, 1.998 mmol, 1당량) 및 NH4OAc (1.23 g, 16.0 mmol, 8.0당량)의 용액을 넣었다. 생성된 혼합물을 140℃에서 마이크로파 하에 1시간 동안 조사하였다. 반응 혼합물을 물(30 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(30 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(50 mL)로 세척하고, 무수 Na2SO4으로 건조시키고, 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피로 정제하고, 디클로로메탄/메틸 알코올(10:1)로 용리하여 삼차-부틸N-[(2S)-1-[(2S,4R)-2-(5-벤질-1H-이미다졸-2-일)-4-하이드록시피롤리딘-1-일]-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일]카바메이트 (260.0 mg, 15.08%)를 회백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 457.30 [M+1] +.
단계 4: (S)-2-아미노-1-((2S,4R)-2-(5-벤질-1H-이미다졸-2-일)-4-하이드록시피롤리딘-1-일)-3,3-디메틸부탄-1-온 염화수소 제조
1,4-디옥산(5 mL) 중 삼차-부틸 N-[(2S)-1-[(2S,4R)-2-(5-벤질-1H-이미다졸-2-일)-4-하이드록시피롤리딘-1-일]-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일]카바메이트 (260.0 mg, 0.569 mmol, 1당량)의 용액에 1,4-디옥산 용액(4.0 M, 5 mL) 중 염화수소를 서서히 첨가하였다. 생성된 혼합물을 실온에서 1시간 동안 교반한 다음, 감압 하에 농축시켰다. 이를 통해 200.0mg (2S)-2-아미노-1-[(2S,4R)-2-(5-벤질-1H-이미다졸-2-일)-4-하이드록시피롤리딘-1-일]-3,3-디메틸부탄-1-온-염화수소를 회백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 357.15 [M+1] +.
단계 5: N-((S)-1-((2S,4R)-2-(5-벤질-1H-이미다졸-2-일)-4-하이드록시피롤리딘-1-일)-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일)-2-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)아세트아미드 제조
DMF (5 mL) 중 (2S)-2-아미노-1-[(2S,4R)-2-(5-벤질-1H-이미다졸-2-일)-4-하이드록시피롤리딘-1-일]-3,3-디메틸부탄-1-온 염화수소(110 mg, 0.280 mmol, 1당량) 및 2-(4-[[1-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페리딘-4-일]메틸]피페라진-1-일)아세트산 (207.11 mg, 0.280 mmol, 1.00당량)의 교반 용액에 질소 대기 하에 실온에서 DIEA (1 mL, 5.741 mmol, 20.51당량) 및 BOP (148.58 mg, 0.336 mmol, 1.2당량)를 첨가하였다. 생성된 혼합물을 질소 분위기 하에 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 이어서, 반응물을 물(50 mL)로 급냉시키고 에틸 아세테이트(30 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(30 mL x 2)로 세척하고, 무수 Na2SO4 상에서 건조시키고, 감압 하에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피로 정제하고, 디클로로메탄/메틸 알코올(10:1)로 용리시켜 미정제 생성물을 수득하고, 이를 분취-HPLC로 추가로 정제하였다. 이를 통해 N-[(2S)-1-[(2S,4R)-2-(5-벤질-1H-이미다졸-2-일)-4-하이드록시피롤리딘-1-일]-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일]-2-(4-[[1-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일] 페닐)피페리딘-4-일]메틸]피페라진-1-일)아세트아미드 (50.6 mg, 16.76%)를 연황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 1078.35 [M+1] +; 1H-NMR (300MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.92 (s, 1H), δ 11.50 (brs, 1H), 9.88 (brs, 1H), 8.65 (d, J = 2.2 Hz, 1H), 8.53 (s, 1H), 8.08 (s, 1H), 7.80-7.64 (m, 1H), 7.68-7.54 (m, 3H), 7.30-7.20 (m, 4H), 7.20-7.10 (m,3H), 7.07 (d, J = 8.5 Hz, 2H), 6.64 (s, 1H), 5.39-5.01 (m, 3H), 4.46 (d, J = 9.1 Hz, 2H), 3.98-3.78 (m, 5H), 3.65-3.55 (m, 3H), 3.53-3.40 (m, 2H), 3.06-2.96 (m, 3H), 2.73 (t, J = 11.9 Hz, 3H), 2.60 (s,1H), 2.40-2.20 (m,4H), 2.19-2.03 (m, 4H), 1.90-1.71 (m, 3H), 1.31-1.12 (m, 3H), 0.92-0.89 (m, 1H), 0.79 (s, 9H).
2-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)-N-((S)-1-((2S,4R)-4-하이드록시-2-(5-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)-1H-이미다졸-2-일)피롤리딘-1-일)-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일)아세트아미드 (실시예 444)의 예시적인 합성
단계 1: 1-브로모-3-(4-브로모페닐)프로판-2-온 제조
질소의 불활성 대기로 퍼지되고 유지된 250-mL의 3-목 둥근 바닥 플라스크에, 디클로로메탄(150 mL) 중 2-(4-브로모페닐)아세트산 (2.50 g, 11.63 mmol, 1.0당량)의 용액을 넣고, 여기에 옥살릴 클로라이드(1.77 g, 13.95 mmol, 1.20당량) 및 N,N-디메틸포름아미드(170 mg, 2.33 mmol, 0.20당량)를 첨가하였다. 생성된 혼합물을 실온에서 4시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축시키고, 잔류물을 아세토니트릴(150 mL)에 용해시켰다. 상기 용액에 헥산(17.4 mL) 중 (트리메틸실릴)디아조메탄(3.98 g, 34.85 mmol, 3.00당량)의 용액을 실온에서 첨가하였다. 생성된 용액을 실온에서 2시간 동안 추가 교반하고 나서, 물/얼음조 내에서 0℃로 냉각시켰다. 냉각된 혼합물에 아세트산 중 브롬화수소 용액(40%, 8.48 g, 41.85 mmol, 3.60당량)을 서서히 첨가하였다. 반응 혼합물을 실온에서 추가로 2시간 동안 반응시켰다. 물(100 mL)을 첨가하여 반응물을 급냉시켰다. 생성된 혼합물을 에틸 아세테이트(250 mL x 3)로 추출하고, 합쳐진 유기층을 염수(150 ml)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/석유 에테르(1:10)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 1.80 g(53.03%)의 1-브로모-3-(4-브로모페닐)프로판-2-온을 연황색 오일로서 수득하였다.
단계 2: 3-(4-브로모페닐)-2-옥소프로필 (2S,4R)-1-((S)-2-((삼차-부톡시카르보닐)아미노)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복실레이트 제조
100-mL 둥근바닥 플라스크에, 아세토니트릴 (30 mL) 중 1-브로모-3-(4-브로모페닐)프로판-2-온 (1.80 g, 6.155 mmol, 1.06당량), (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복실산 (2.00 g, 5.807 mmol, 1당량) 및 N-디이소프로필에틸아민(10 mL)을 넣었다. 생성된 혼합물을 실온에서 밤새 교반하였다. 이어서 100 mL의 물을 첨가하여 반응물을 급냉시켰다. 생성된 혼합물을 에틸 아세테이트(250 mL x3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수로 세척하고(150 ml), 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(9:1)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 1.57 g(48.67%)의 3-(4-브로모페닐)-2-옥소프로필 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]-3,3-디메틸부타노일] -4-하이드록시피롤리딘-2-카르복실레이트를 연황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 555.20 [M+1] +.
단계 3: 삼차-부틸 ((S)-1-((2S,4R)-2-(5-(4-브로모벤질)-1H-이미다졸-2-일)-4-하이드록시피롤리딘-1-일)-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일)카바메이트 제조
질소의 불활성 대기로 퍼지되고 유지된 30-mL 밀봉 튜브에, p-크실렌 (20 mL) 중 3-(4-브로모페닐)-2-옥소프로필 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복실레이트 (1.37 g, 2.466 mmol, 1당량), 아세트산암모늄(2.85 g, 36.971 mmol, 14.99당량)을 넣었다. 생성된 혼합물을 오일조에서 140℃에서 24시간 동안 교반하였다. 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(95:5)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 160.0 mg (12.11%)의 삼차-부틸 N-[(2S)-1-[(2S,4R)-2-[5-[(4-브로모페닐)메틸]-1H-이미다졸-2-일]-4-하이드록시피롤리딘-1-일]-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일]카바메이트를 연갈색 반고체로서 수득하였다.
단계 4: 삼차-부틸 ((S)-1-((2S,4R)-4-하이드록시-2-(5-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)-1H-이미다졸-2-일)피롤리딘-1-일)-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일)카바메이트 제조
질소의 불활성 대기로 퍼지되고 유지되는 10-mL 밀봉 튜브에, 질소 대기 하에 디옥산 (3 mL) 및 물(0.5 mL) 중 삼차-부틸 N-[(2S)-1-[(2S,4R)-2-[5-[(4-브로모페닐)메틸]-1H-이미다졸-2-일]-4-하이드록시피롤리딘-1-일]-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일]카바메이트 (180.0 mg, 0.34 mmol, 1.0당량), 4-메틸-5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-1,3-티아졸 (151.0 mg, 0.67 mmol, 2.0당량), 탄산칼륨(141.0 mg, 1.020 mmol, 3.04당량) 및 Pd(dppf)Cl2 .CH2Cl2 (28.0 mg, 0.034 mmol, 0.10당량)를 두었다. 생성된 혼합물을 오일조에서 질소 분위기 하에 95℃에서 3시간 동안 교반하였다. 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(95:5)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 108.0 mg(58.02%)의 삼차-부틸 N-[(2S)-1-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-(5-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]-1H-이미다졸-2-일)피롤리딘-1-일]-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일]카바메이트를 적색 반고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 554.30 [M+1] +.
단계 5: (S)-2-아미노-1-((2S,4R)-4-하이드록시-2-(5-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)-1H-이미다졸-2-일)피롤리딘-1-일)-3,3-디메틸부탄-1-온 염화수소 제조
100-mL 둥근 바닥 플라스크에, 디옥산(5 mL) 중 삼차-부틸 N-[(2S)-1-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-(5-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]-1H-이미다졸-2-일)피롤리딘-1-일]-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일]카바메이트 (108.0 mg, 0.195 mmol, 1당량)의 용액을 넣고, 여기에 1,4-디옥산 용액(4.0 M, 5 mL) 중 염화수소를 첨가하였다. 생성된 혼합물을 실온에서 1.5시간 동안 교반하였다. 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 이를 통해 95.0 mg(99.39%)의 (2S)-2-아미노-1-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-(5-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]-1H-이미다졸-2-일)피롤리딘-1-일]-3,3-디메틸부탄-1-온 염화수소를 연갈색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 454.25 [M+1] +.
단계 6: 2-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)-N-((S)-1-((2S,4R)-4-하이드록시-2-(5-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)-1H-이미다졸-2-일)피롤리딘-1-일)-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일)아세트아미드 제조
100 mL 둥근바닥 플라스크에, N,N-디메틸포름아미드 (10 mL) 중 (2S)-2-아미노-1-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-(5-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]-1H-이미다졸-2-일)피롤리딘-1-일]-3,3-디메틸부탄-1-온 염화수소 (93.0 mg, 0.190 mmol, 1당량), 2-(4-[[1-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페리딘-4-일]메틸]피페라진-1-일)아세트산 (159.0 mg, 0.190 mmol, 1.00당량), N,N-디이소프로필에틸아민 (74.0 mg, 0.573 mmol, 3.02당량), BOP (126.0 mg, 0.285 mmol, 1.50당량)를 넣었다. 생성된 혼합물을 실온에서 1.5시간 동안 교반하였다. 이어서, 반응 혼합물을 물(100 mL)로 급냉시키고 에틸 아세테이트(250 mL x3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(9:1)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 수득된 생성물을 디클로로메탄/메탄올(4:1, 50 mL)에 용해시키고 0.22 um 주사기 필터를 통해 여과하였다. 여액을 감압하에 농축시켰다. 이를 통해 54.2 mg(24.30%)의 2-(4-[[1-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페리딘-4-일]메틸]피페라진-1-일)-N-[(2S)-1-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-(5-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]-1H-이미다졸-2-일)피롤리딘-1-일]-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일]아세트아미드를 연갈색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 1175.50 [M+1] +; 1H-NMR (300MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.89 (s, 1H), 9.90 (brs, 1H), 8.95 (s, 1H), 8.62 (s, 1H), 8.50 (s, 1H), 8.05 (s, 1H), 7.80-7.52 (m, 4H), 7.50-7.29 (m, 5H), 7.12-7.03 (m, 2H), 6.73 (s, 1H), 5.43-4.90 (m, 3H), 4.50-4.42 (m, 2H), 3.91-3.75 (m, 5H), 3.59-3.40 (m, 5H), 3.20-2.80 (m, 2H), 2.81-2.67 (m, 3H), 2.45-2.41 (m, 4H), 2.40-1.96(m, 7H), 1.94-1.71 (m, 3H), 1.42-1.10 (m, 7H), 0.97-0.90 (m, 1H), 0.73 (s, 9H).
2-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)-N-((S)-1-((2S,4R)-4-하이드록시-2-(5-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)티아졸-2-일)피롤리딘-1-일)-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일)아세트아미드 (실시예 473)의 예시적인 합성
단계 1: 삼차-부틸 (2S,4R)-4-((삼차-부틸디페닐실릴)옥시)-2-카바모일피롤리딘-1-카르복실레이트 제조
100-mL 둥근 바닥 플라스크에, N,N-디메틸포름아미드(20 mL) 중 삼차-부틸 (2S,4R)-2-카바모일-4-하이드록시피롤리딘-1-카르복실레이트 (1.00 g, 4.343 mmol, 1당량), 이미다졸e (739.0 mg, 10.855 mmol, 2.50당량) 및 TBDPSCl(1.43 g, 5.203 mmol, 1.20당량)을 넣었다. 생성된 혼합물을 실온에서 밤새 교반하였다. 이어서, 물(150 mL)을 첨가하여 반응 혼합물을 급냉시키고, 생성된 혼합물을 에틸 아세테이트(250 mL x 3)로 추출하였다. 유기층을 합치고, 염수로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(98:2)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 1.55 g(76.15%)의 삼차-부틸 (2S,4R)-4-[(삼차-부틸디페닐실릴)옥시]-2-카바모일피롤리딘-1-카르복실레이트를 무색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 469.25 [M+1] +.
단계 2: 삼차-부틸 (2S,4R)-4-((삼차-부틸디페닐실릴)옥시)-2-카바모티오일피롤리딘-1-카르복실레이트 제조
질소의 불활성 대기로 퍼지되고 유지된 250-mL 3-목 둥근 바닥 플라스크에, THF(60 mL) 중 삼차-부틸 (2S,4R)-4-[(삼차-부틸디페닐실릴)옥시]-2-카바모일피롤리딘-1-카르복실레이트 (1.80 g, 3.841 mmol, 1당량) 및 Lawesson 시약(1.71 g, 4.228 mmol, 1.10당량)를 넣었다. 생성된 혼합물을 오일조에서 70℃에서 12시간 동안 교반하였다. 이어서 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:4)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 1.1 g(59.09%)의 삼차-부틸 (2S,4R)-4-[(삼차-부틸디페닐실릴)옥시]-2-카바모티오일피롤리딘-1-카르복실레이트를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 485.30 [M+1] +.
단계 3: 삼차-부틸 (2S,4R)-2-(5-(4-브로모벤질)티아졸-2-일)-4-((삼차-부틸디페닐실릴)옥시)피롤리딘-1카르복실레이트 제조
100-mL 둥근 바닥 플라스크에, 에탄올(50 mL) 중 삼차-부틸 (2S,4R)-4-[(삼차-부틸디페닐실릴)옥시]-2- 카바모티오일피롤리딘-1-카르복실레이트 (1.0 g, 2.1 mmol, 1당량), 피리딘(244 mg, 3.085 mmol, 1.50당량) 및 1-브로모-3-(4-브로모페닐)프로판-2-온 (904.0 mg, 3.1 mmol, 1.50당량)을 넣었다. 생성된 용액을 오일조에서 80℃에서 1시간 동안 교반하였다. 이어서 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:9)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 960.0 mg(68.66%)의 삼차-부틸 (2S,4R)-2-[5-[(4-브로모페닐)메틸]-1,3-티아졸-2-일]-4-[(삼차-부틸디페닐실릴)옥시]피롤리딘-1-카르복실레이트를 연황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 677.20 [M+1] +.
단계 4: 삼차-부틸 (2S,4R)-4-((삼차-부틸디페닐실릴)옥시)-2-(5-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)티아졸-2-일)피롤리딘-1-카르복실레이트 제조
질소의 불활성 분위기로 퍼지하고 유지된 30 mL 밀봉 튜브에, 디옥산(15 mL) 및 물(3 mL) 중 삼차-부틸 (2S,4R)-2-[5-[(4-브로모페닐)메틸]-1,3-티아졸-2-일]-4-[(삼차-부틸디페닐실릴)옥시]피롤리딘-1-카르복실레이트 (800.0 mg, 1.180 mmol, 1당량), 4-메틸-5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-1,3-티아졸 (398.0 mg, 1.768 mmol, 1.50당량), 탄산 칼륨 (489.0 mg, 3.538 mmol, 3.00당량) 및 Pd(dppf)Cl2 (86.0 mg, 0.118 mmol, 0.10당량)를 넣었다. 생성된 혼합물을 오일조에서 95℃에서 3시간 동안 교반하였다. 이어서 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:4)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 590.0 mg (71.82%)의 삼차-부틸 (2S,4R)-4-[(삼차-부틸디페닐실릴)옥시]-2-(5-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]-1,3-티아졸-2-일)피롤리딘-1-카르복실레이트를 연황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 696.20 [M+1] +.
단계 5: 2-((2S,4R)-4-((삼차-부틸디페닐실릴)옥시)피롤리딘-2-일)-5-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)티아졸 염화수소 제조
100-mL 둥근 바닥 플라스크에, 디옥산 (10 mL) 중 삼차-부틸 (2S,4R)-4-[(삼차-부틸디페닐실릴)옥시]-2-(5-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]-1,3-티아졸-2-일)피롤리딘-1-카르복실레이트 (600.0 mg, 0.862 mmol, 1당량)을 넣고, 여기에 1,4-디옥산 용액(4.0 M, 10 mL) 중 염산을 첨가하였다. 생성된 혼합물을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 이어서 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 이를 통해 540.0 mg (99.06%)의 2-[(2S,4R)-4-[(삼차-부틸디페닐실릴)옥시]피롤리딘-2-일]-5-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일) 페닐]메틸]-1,3-티아졸 염화수소를 연황색 반고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 596.30 [M+1] +.
단계 6: 삼차-부틸 ((S)-1-((2S,4R)-4-((삼차-부틸디페닐실릴)옥시)-2-(5-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)티아졸-2-일)피롤리딘-1-일)-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일)카바메이트 제조
100-mL 둥근 바닥 플라스크에, N,N-디메틸포름아미드 (35 mL) 중 2-[(2S,4R)-4-[(삼차-부틸디페닐실릴)옥시]피롤리딘-2-일]-5-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]-1,3-티아졸 염화수소 (530.0 mg, 0.838 mmol, 1당량), (2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐일]아미노]-3,3-디메틸부탄산 (582.0 mg, 2.516 mmol, 3.00당량), N,N-디이소프로필에틸아민 (650.0 mg, 5.029 mmol, 6.00당량) 및　BOP (1.11 g, 2.510 mmol, 2.99당량)을 넣었다. 생성된 혼합물을 실온에서 12시간 동안 교반하였다. 이어서 100 mL의 물을 첨가하여 반응물을 급냉시켰다. 생성된 혼합물을 에틸 아세테이트(250 mL x 3)로 추출하였다. 유기층을 합치고, 염수로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:3)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 340.0 mg(50.13%)의 삼차-부틸 N-[(2S)-1-[(2S,4R)-4-[(삼차-부틸디페닐실릴)옥시]-2-(5-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]-1,3-티아졸-2-일)피롤리딘-1-일]-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일]카바메이트를 연황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 809.30 [M+1] +.
단계 7: 삼차-부틸 ((S)-1-((2S,4R)-4-하이드록시-2-(5-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)티아졸-2-일)피롤리딘-1-일)-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일)카바메이트 제조
100-mL의 둥근 바닥 플라스크에, 테트라하이드로푸란(20 mL) 중 삼차-부틸 N-[(2S)-1-[(2S,4R)-4-[(삼차-부틸디페닐실릴)옥시]-2-(5-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]-1,3-티아졸-2-일)피롤리딘-1-일]-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일]카바메이트 (390.0 mg, 0.482 mmol, 1당량)를 넣고, 여기에 Bu4N.F (THF 중 1.0 M, 1.45 mL) 용액을 첨가하였다. 생성된 혼합물을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 이어서 100 mL의 물을 첨가하여 반응물을 급냉시켰다. 생성된 혼합물을 에틸 아세테이트(250 mL x 3)로 추출하였다. 유기층을 합치고, 염수로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(3:1)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 250 mg(90.88%)의 삼차-부틸 N-[(2S)-1-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-(5-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸] -1,3-티아졸-2-일)피롤리딘-1-일]-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일]카바메이트를 연황색 반고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 571.25 [M+1] +.
단계 8: (S)-2-아미노-1-((2S,4R)-4-하이드록시-2-(5-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)티아졸-2-일)피롤리딘-1-일)-3,3-디메틸부탄-1-온 염화수소 제조
100-mL 둥근 바닥 플라스크에, 디옥산 (20 mL) 중 삼차-부틸 N-[(2S)-1-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-(5-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]-1,3-티아졸-2-일)피롤리딘-1-일]-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일]카바메이트 (250 mg, 0.438 mmol, 1당량)를 넣고, 여기에 1,4-디옥산 용액(4.0 M, 15 mL) 중 염산을 첨가하였다. 생성된 혼합물을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 이를 통해 220.0 mg(99.05%)의 (2S)-2-아미노-1-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-(5-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일) 페닐]메틸]-1,3-티아졸-2-일)피롤리딘-1-일]-3,3-디메틸부탄-1-온 염화수소를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 471.15 [M+1] +.
단계 9: 2-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)-N-((S)-1-((2S,4R)-4-하이드록시-2-(5-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)티아졸-2-일)피롤리딘-1-일)-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일)아세트아미드 제조
100 mL 둥근바닥 플라스크에, N,N-디메틸포름아미드 (30 mL) 중 2-(4-[[1-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페리딘-4-일]메틸]피페라진-1-일)아세트산 (459.55 mg, 0.621 mmol, 1.50당량), (2S)-2-아미노-1-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-(5-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]-1,3-티아졸-2-일)피롤리딘-1-일]-3,3-디메틸부탄-1-온 염화수소 (210 mg, 0.414 mmol, 1당량), N,N-디이소프로필에틸아민 (161 mg, 1.246 mmol, 3.01당량) 및 BOP (275 mg, 0.622 mmol, 1.50당량)를 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 이어서 100 mL의 물을 첨가하여 반응물을 급냉시켰다. 생성된 혼합물을 에틸 아세테이트(250 mL x3)로 추출하였다. 유기층을 합치고, 염수로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(8:1)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 수득된 생성물을 50 mL 디클로로메탄에 용해시키고, 용액을 0.22 um 주사기 필터를 통해 여과하였다. 여액을 감압하에 농축시켰다. 이를 통해 57.1 mg(11.56%)의 2-(4-[[1-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페리딘-4-일]메틸]피페라진-1-일)-N-[(2S)-1-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-(5-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]-1,3-티아졸-2-일)피롤리딘-1-일]-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일]아세트아미드를 황색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 1192.60 [M+1] +; 1H-NMR (300MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.88 (s, 1H), 9.83 (s, 1H), 8.96 (s, 1H), 8.63 (s, 1H), 8.51 (s, 1H), 8.05 (s, 1H), 7.80-7.70 (m, 1H), 7.69-7.56 (m, 3H), 7.39 (d, J = 8.0 Hz, 2H), 7.35-7.18 (m, 4H), 7.04 (d, J = 8.4 Hz, 2H), 5.74 (s, 1H), 5.44-5.06 (m, 3H), 4.51 (d, J = 9.3 Hz, 1H), 4.49-4.38 (m, 1H), 4.03 (s, 2H), 3.85-3.72 (m, 3H), 3.70-3.62 (m, 1H), 3.48-3.39 (m, 3H), 3.16-2.82 (m, 2H), 2.69 (t, J = 11.8 Hz, 2H), 2.45-2.35 (m, 6H), 2.25-2.05 (m, 7H), 1.80-1.60 (m, 3H), 1.23-1.19 (m, 6H), 0.83 (s, 9H).
2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)-N-((S)-1-((2S,4R)-4-하이드록시-2-(5-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)-1H-이미다졸-2-일)피롤리딘-1-일)-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일)아세트아미드 (실시예 445)의 예시적인 합성
단계 1: 2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)-N-((S)-1-((2S,4R)-4-하이드록시-2-(5-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)-1H-이미다졸-2-일)피롤리딘-1-일)-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일)아세트아미드 제조
100 mL 둥근바닥 플라스크에, DMF (5 mL) 중 2-(4-[[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]메틸]피페리딘-1-일)아세트산 (252.45 mg, 0.341 mmol, 1.00당량), (2S)-2-아미노-1-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-[5-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]-1H-이미다졸-2-일]피롤리딘-1-일]-3,3-디메틸부탄-1-온 (150 mg, 0.341 mmol, 1당량), DIEA (88.20 mg, 0.682 mmol, 2당량), BOP (226.38 mg, 0.512 mmol, 1.5당량)를 넣었다. 생성된 혼합물을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 이어서, 물(20 mL)을 첨가하여 반응물을 급냉시키고, 혼합물을 에틸 아세테이트(20 mLx2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/헥산(5:1)으로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 72.0 mg(18.17%)의 2-(4-[[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]메틸]피페리딘-1-일)-N-[(2S)-1-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-[5-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]-1H-이미다졸-2-일]피롤리딘-1-일]-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일]아세트아미드를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 1161.35 [M+1] +; 1H-NMR (300MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.89 (br s, 1H), 11.95 (s, 1H), 9.83 (br s, 1H), 8.95 (s, 1H), 8.62 (d, J = 2.2 Hz, 1H), 8.51 (s, 1H), 8.05 (s, 1H), 7.78-7.70 (m, 3H), 7.57-7.50 (m, 4H), 7.42 (d, J = 8.0 Hz, 2H), 7.24-7.20 (m, 1H), 7.10-7.01 (m, 2H), 5.49-5.27 (m, 2H), 5.11-5.03 (m, 1H), 4.61-4.50 (m, 2H), 3.95-3.84 (m, 1H), 3.71-3.61 (m, 1H), 3.47-3.42 (m, 1H), 3.41-3.37 (m, 2H), 3.30- 3.20 (m, 1H), 3.19-3.10 (m, 4H), 2.93-2.72 (m, 4H), 2.46 (s, 3H), 2.41-1.89 (m, 9H), 1.89-1.70 (m, 2H), 1.68-1.52 (m, 1H), 1.28-1.22 (m, 1H), 1.21-1.11 (m, 3H), 0.95-0.91 (m, 1H), 0.85-0.72 (m, 9H).
(2S,4R)-1-((S)-5-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)펜타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 (실시예 475) 및 (2S,4R)-1-((R)-5-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)펜타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 (실시예 476)의 예시적인 합성
단계 1: 3-(4-브로모페녹시)프로판-1-올 제조
N,N-디메틸포름아미드(100 mL) 중 4-브로모페놀 (3 g, 17.34 mmol, 1당량)의 용액에 3-브로모프로판-1-올 (2.89 g, 20.81 mmol, 1.2당량) 및 탄산칼륨(7.19 g, 52.02 mmol, 3당량)을 첨가하고, 혼합물을 70℃에서 2시간 동안 교반하였다. 혼합물을 물(100 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(100 mL x 3)로 추출하고 염수(300 mL)로 세척하였다. 유기상을 무수 황산나트륨으로 건조시켜 여과하고, 여액을 농축시켜 미정제 생성물을 수득하였다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피(순수 석유 에테르)로 정제하였다. 생성물 3-(4-브로모페녹시)프로판-1-올 (3.10 g, 13.41 mmol, 77% 수율)을 무색 오일로서 수득하였다. 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ7.41 - 7.30 (m, 2H), 6.84 - 6.69 (m, 2H), 4.16 - 3.95 (m, 2H), 3.83 (t, J=6.0 Hz, 2H), 2.23 - 1.90 (m, 4H).
단계 2: 1-브로모-4-(3-브로모프로폭시)벤젠 제조
테트라하이드로푸란(150 mL) 중 3-(4-브로모페녹시)프로판-1-올 (3.1 g, 13.41 mmol, 1당량) 용액에 카본 테트라브로마이드(6.67 g, 20.12 mmol, 1.5당량) 및 트리페닐포스핀(5.28 g, 20.12 mmol, 1.5당량)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 20℃에서 1시간 동안 교반하였다. 혼합물을 물(70 mL)의 첨가로 급냉시킨 후, 에틸 아세테이트 (40 mL x 3)로 추출하고 염수(60 mL x 2)로 세척하였다. 유기상을 무수 황산나트륨으로 건조시켜 여과하고, 여액을 농축시켜 미정제 생성물을 수득하였다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피(순수 석유 에테르)로 정제하였다. 생성물 1-브로모-4-(3-브로모프로폭시)벤젠 (3 g, 10.20 mmol, 76% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다. 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ7.43 - 7.35 (m, 2H), 6.83 - 6.75 (m, 2H), 4.18 - 4.01 (m, 2H), 3.60 (t, J=6.4 Hz, 2H), 2.32 (quin, J=6.0 Hz, 2H).
단계 3: 2-(3-메틸이속사졸-5-일)아세트산 제조
테트라하이드로푸란(80 mL) 중 3,5-디메틸이속사졸(4.85 g, 49.94 mmol, 4.93 mL, 1당량)의 용액에 n-부틸리튬(2.5 M, 19.98 mL, 1당량)을 -70℃에서 적가하였다. 첨가가 완료되었을 때, 혼합물을 -70℃에서 30분 동안 교반하였다. 그런 다음, 이산화탄소(2.20 g, 49.94 mmol, 1당량) 가스를 -70℃에서 30분 동안 혼합물 내로 버블링하였다. 생성된 혼합물을 -70~0℃에서 또 다른 3시간 동안 교반하였다. 혼합물을 100 mL의 얼음물에 붓고, 1.0 M 염산으로 pH를 3.0으로 조정하였다. 혼합물을 에틸 아세테이트(100 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(200 mL)로 세척하고, 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물은 추가적인 정제 없이 다음 단계에 직접 사용되었다. 2-(3-메틸이속사졸-5-일)아세트산(4.5 g, 미정제)을 회백색 고체로서 수득하였다.
단계 4: 메틸 2-(3-메틸이속사졸-5-일)아세테이트 제조
메탄올(50 mL) 중 2-(3-메틸이속사졸-5-일)아세트산 (4.2 g, 29.76 mmol, 1당량)의 용액에 티오닐 클로라이드(7.08 g, 59.52 mmol, 4.32 mL, 2당량)를 0℃에서 적가하였다. 첨가가 완료되면, 혼합물을 80℃까지 가열하고 80℃에서 2시간 동안 교반하였다. 용매를 진공 중에서 농축시키고, 잔류물을 에틸 아세테이트 (100 mL)로 희석시켰다. 혼합물을 포화 수성 중탄산 나트륨(100 Ml), 염수(100 mL)로 세척하고, 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트=10:1 ~ 5:1)로 정제하여 메틸 2-(3-메틸이속사졸-5-일)아세테이트 (3.6 g, 23.20 mmol, 77% 수율)를 무색 오일로서 수득하였다.1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 6.11 (s, 1H), 3.80 (s, 2H), 3.77 (s, 3H), 2.30 (s, 3H).
단계 5: 메틸 5-(4-브로모페녹시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)펜타노에이트 제조
테트라하이드로푸란(20 mL) 중 메틸 2-(3-메틸이속사졸-5-일)아세테이트 (0.95 g, 6.12 mmol, 1당량)의 용액에 칼륨 삼차-부톡시드(825 mg, 7.35 mmol, 1.2당량)를 첨가하고, 15℃에서 30분 동안 교반한 다음, 1-브로모-4-(4-브로모부톡시)벤젠(1.98 g, 6.74 mmol, 1.1당량)을 N2 보호하에 20℃에서 2시간 동안 혼합물로 첨가하였다. 혼합물을 물(50 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(50 mL x 3)로 추출하고, 염수(100 mL)로 세척하였다. 유기상을 무수 황산나트륨으로 건조시켜 여과하고, 여액을 농축시켜 미정제 생성물을 수득하였다. 잔류물을 이산화 규소 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트=1/0 내지 60/1)로 정제하였다. 생성물 메틸 5-(4-브로모페녹시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)펜타노에이트(370 mg, 1.00 mmol, 17% 수율)를 무색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 368.1 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ7.39 - 7.31 (m, 2H), 6.80 - 6.69 (m, 2H), 6.11 - 6.02 (m, 1H), 4.16 - 3.82 (m, 3H), 3.81 - 3.74 (m, 1H), 3.73 (s, 2H), 2.27 - 2.27 (m, 1H), 2.30 - 2.26 (m, 2H), 2.26 - 2.02 (m, 1H), 1.86 - 1.73 (m, 1H), 1.73 - 1.71 (m, 1H), 1.88 - 1.69 (m, 1H).
단계 6: 메틸 5-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로-N-((2-(트리메틸실릴)에톡시)메틸)피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1-((2-(트리메틸실릴)에톡시)메틸)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)펜타노에이트 제조
플라스크에 메틸 5-(4-브로모페녹시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)펜타노에이트(100 mg, 0.27 mmol, 1당량), 불화 세슘(165 mg, 1.09 mmol, 4당량), 4-디삼차-부틸포스파닐-N,N-디메틸-아닐린; 디클로로팔라듐 (19 mg, 0.03 mmol, 0.1당량), (3R)-N-[2,4-디플루오로-3-[5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]페닐]-3-플루오로-N-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤리딘-1-설폰아미드 (220 mg, 0.27 mmol, 1당량), 디옥산 (10 mL) 및 물(2 mL)로 채웠다. 혼합물을 질소 분위기 하 120℃에서 1시간 동안 교반하였다. 물(30 mL)을 첨가하여 반응 혼합물을 급냉시키고 에틸 아세테이트(20 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(20 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 잔류물을 분취-TLC(석유 에테르:에틸 아세테이트 = 1:1)로 정제하였다. 원하는 생성물 메틸 5-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)아미노]벤조일]-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)펜타노에이트 (50 mg, 0.05 mmol, 19 % 수율)을 황색 오일로 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 972.4 [M+1] +.
단계 7: 메틸 5-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)펜타노에이트 제조
메탄올 (5 mL) 중 메틸 메틸 5-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘 -1-일]설포닐-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)아미노]벤조일]-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)펜타노에이트 (200 mg, 0.20 mmol, 1당량)의 용액에 염화수소/디옥산 (4 M, 10 mL, 464.12당량)를 첨가하였다. 용액을 40℃에서 20시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물은 정제 없이 다음 반응에서 사용되었다. 생성물 메틸 5-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H- 피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)펜타노에이트 (150 mg, 미정제, HCl)를 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 712.2 [M+1] +.
단계 8: 5-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)펜타논산 제조
메탄올(2 mL) 및 물(2 mL) 중 메틸 5-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)펜타노에이트 (150 mg, 0.20 mmol, 1당량, HCl)의 용액에, 수산화리튬(42 mg, 1.00 mmol, 5당량)을 첨가하고, 혼합물을 15 ℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 염화수소(1M)로 서서히 충진하여 pH를 4-5로 조정하고, 혼합물을 물(20 mL)로 세척한 다음, 에틸 아세테이트(15 mL x 3)로 추출하고, 염수(15 mL)로 세척한 다음, 유기상을 진공 중에서 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 생성물 5-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일] 설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)펜타논산(130 mg, 미정제)을 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 698.2 [M+1] +.
단계 9: (2S,4R)-1-((S)-5-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)펜타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 및 (2S,4R)-1-((R)-5-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)펜타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
N,N-디메틸포름아미드 (5 mL) 중 5-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노] 벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)펜타논산(130 mg, 0.19 mmol, 1당량) 및 (2S,4R)-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸] 피롤리딘-2-카르복사미드 (69 mg, 0.19 mmol, 1당량, HCl)의 용액에 1-하이드록시벤조트리아졸 (31 mg, 0.23 mmol, 1.2당량) 및 N,N-디이소프로필에틸아민(73 mg, 0.56 mmol, 3당량)을 첨가하고, 혼합물을 15℃에서 30분 동안 교반하고, 및 N-(3-디메틸아미노프로필)-N-에틸카르보디이미드 염화수소 (43 mg, 0.23 mmol, 1.2당량)을 혼합물에 첨가하고, 그런 다음 40℃에서 2시간 동안 교반하였다. 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 분취-HPLC로 정제하였다. 제1 생성물, (2S,4R)-1-[(2S)-5-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일] 설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)펜타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (23.7 mg, 0.02 mmol, 12 % 수율, 99 % 순도)를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 1011.3 [M+1] +; 1H-NMR (300MHz, DMSO-d 6 ) δ 9.04 - 8.91 (m, 1H), 8.65 (s, 1H), 8.56 (s, 1H), 8.41 (d, J=7.5 Hz, 1H), 8.07 (s, 1H), 7.72 - 7.55 (m, 3H), 7.49 - 7.31 (m, 5H), 7.21 (s, 1H), 7.13 - 7.00 (m, 2H), 6.36 - 6.03 (m, 1H), 5.40 - 5.19 (m, 1H), 5.13 (s, 1H), 5.00 - 4.84 (m, 1H), 4.48 - 4.37 (m, 1H), 4.31 (s, 1H), 4.18 (t, J=7.1 Hz, 1H), 4.11 - 3.95 (m, 2H), 3.78 (dd, J=4.5, 10.5 Hz, 1H), 3.58 (d, J=11.4 Hz, 1H), 3.45 (s, 1H), 2.47 - 2.39 (m, 4H), 2.27 - 2.16 (m, 4H), 2.15 - 2.00 (m, 4H), 2.00 - 1.88 (m, 2H), 1.88 - 1.65 (m, 3H), 1.25 - 0.98 (m, 1H), 1.38 (d, J=6.8 Hz, 3H). 제2 생성물, (2S,4R)-1-[(2R)-5-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일] 설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)펜타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (15.7 mg, 0.02 mmol, 8 % 수율, 98 % 순도)를 백색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 1011.3 [M+1] +; 1H-NMR (300MHz, DMSO-d 6 ) δ 9.04 - 8.94 (m, 1H), 8.65 (d, J=2.1 Hz, 1H), 8.56 (s, 1H), 8.40 (d, J=7.7 Hz, 1H), 8.05 (s, 1H), 7.67 (d, J=8.7 Hz, 2H), 7.62 - 7.53 (m, 1H), 7.48 - 7.41 (m, 2H), 7.40 - 7.30 (m, 3H), 7.21 - 7.01 (m, 1H), 7.11 - 7.01 (m, 2H), 6.28 - 6.22 (m, 1H), 6.33 (s, 1H), 5.43 - 5.19 (m, 1H), 5.17 (s, 1H), 5.03 (s, 1H), 4.92 (t, J=7.3 Hz, 1H), 4.65 - 4.56 (m, 1H), 4.54 - 4.37 (m, 1H), 4.29 (s, 1H), 4.21 (t, J=7.2 Hz, 1H), 4.06 (t, J=6.1 Hz, 2H), 4.02 - 3.90 (m, 1H), 3.73 (t, J=7.7 Hz, 1H), 3.60 (d, J=10.0 Hz, 1H), 2.47 - 2.43 (m, 4H), 2.33 (d, J=1.8 Hz, 1H), 2.25 - 2.16 (m, 4H), 2.13 - 1.91 (m, 5H), 1.78 (dd, J=7.5, 12.5 Hz, 3H), 1.26 - 1.13 (m, 1H), 1.44 - 1.10 (m, 5H).
(2S,4R)-1-((S)-6-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)헥사노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 (실시예 452) 및 (2S,4R)-1-((R)-6-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)헥사노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 (실시예 453)의 예시적인 합성
단계 1: 1-브로모-4-(4-브로모부톡시)벤젠 제조
N,N-디메틸포름아미드(100 mL) 중 4-브로모페놀 (3 g, 17.34 mmol, 1당량)의 용액에 1,4-디브로모부탄 (18.72 g, 86.70 mmol, 5당량) 및 탄산칼륨(7.19 g, 52.02 mmol, 3당량)을 첨가하고, 혼합물을 70℃에서 2시간 동안 교반하였다. 혼합물을 물(100 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(100 mL x 3)로 추출하고, 염수(300 mL)로 세척하였다. 유기상을 무수 황산나트륨으로 건조시켜 여과하고, 여액을 농축시켜 미정제 생성물을 수득하였다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피(순수 석유 에테르)로 정제하였다. 생성물 1-브로모-4-(4-브로모부톡시)벤젠 (4.1 g, 13.31 mmol, 77 % 수율)을 무색 오일로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 308.1 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 7.44 - 7.31 (m, 2H), 6.87 - 6.71 (m, 2H), 4.03 - 3.88 (m, 2H), 3.55 - 3.37 (m, 2H), 2.12 - 1.87 (m, 4H).
단계 2: 메틸 6-(4-브로모페녹시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)헥사노에이트 제조
테트라하이드로푸란(20 mL) 중 메틸 2-(3-메틸이속사졸-5-일)아세테이트 (420 mg, 2.71 mmol, 1당량)의 용액에 칼륨 삼차-부톡시드(456 mg, 4.06 mmol, 1.5당량)를 첨가하고, 15℃에서 30분 동안 교반한 다음, 1-브로모-4-(4-브로모부톡시)벤젠 (1 g, 3.25 mmol, 1.2당량)을 20℃에서 2시간 동안 N2 보호하면서 혼합물에 첨가하였다. 혼합물을 물(50 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(50 mL x 3)로 추출하고, 염수(100 mL)로 세척하였다. 유기상을 무수 황산나트륨으로 건조시켜 여과하고, 여액을 농축시켜 미정제 생성물을 수득하였다. 잔류물을 분취-HPLC로 정제하였다. 생성물 메틸 6-(4-브로모페녹시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)헥사노에이트 (150 mg, 0.39 mmol, 15% 수율)를 백색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 382.0 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 7.41 - 7.31 (m, 2H), 6.81 - 6.71 (m, 2H), 6.08 (s, 1H), 3.96 - 3.82 (m, 3H), 3.74 (s, 3H), 2.34 (s, 3H), 2.20 - 2.07 (m, 1H), 2.06 - 1.90 (m, 1H), 1.89 - 1.69 (m, 2H), 1.58 - 1.41 (m, 2H).
단계 3: 메틸 6-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로-N-((2-(트리메틸실릴)에톡시)메틸)피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1-((2-(트리메틸실릴)에톡시)메틸)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)헥사노에이트 제조
플라스크에 메틸 6-(4-브로모페녹시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)헥사노에이트 (150 mg, 0.39 mmol, 1당량), 불화 세슘(239 mg, 1.57 mmol, 4당량), 4-디삼차-부틸포스파닐-N,N-디메틸-아닐린; 디클로로팔라듐(28 mg, 0.04 mmol, 0.1당량), (3R)-N-[2,4-디플루오로-3-[5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]페닐]-3-플루오로-N-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤리딘-1-설폰아미드 (318 mg, 0.39 mmol, 1당량), 디옥산 (10 mL) 및 물 (2 mL)로 채웠다. 혼합물을 질소 분위기 하 120℃에서 1시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물(10 mL)의 첨가로 급냉시킨 후, 물(20 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(40 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(30 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 잔류물을 분취-TLC(석유 에테르:에틸 아세테이트 = 1:1)로 정제하였다. 생성물 메틸 6-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3- 플루오로피롤리딘-1-일]설포닐-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)아미노]벤조일]-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)헥사노에이트 (170 mg, 0.17 mmol, 44% 수율)를 황색 오일로서 수득하였다.
단계 4: 메틸 6-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)헥사노에이트 제조
메탄올(5 mL) 중 메틸 6-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐- (2-트리메틸실릴에톡시메틸)아미노]벤조일]-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)헥사노에이트 (170 mg, 0.17 mmol, 1당량)의 용액에 염화수소/ 디옥산 (4 M, 20 mL, 464.12당량)을 첨가하였다. 용액을 40℃에서 68시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물은 추가 정제 없이 다음 반응에서 사용되었다. 원하는 생성물 메틸 6-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)헥사노에이트 (120 mg, 0.16 mmol, 91% 수율, HCl)를 무색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 726.1 [M+1] +.
단계 5: 6-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)헥사논산 제조
메탄올(2 mL) 및 물(2 mL) 중 메틸 6-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일] 설포닐아미노] 벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)헥사노에이트 (120 mg, 0.16 mmol, 1당량, HCl)의 용액에 수산화리튬(33 mg, 0.79 mmol, 5당량)을 첨가하고, 혼합물을 15 ℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 염화수소(1M)를 서서히 첨가하여 pH를 4-5로 조정하고, 혼합물을 물(20 mL)로 세척한 다음, 에틸 아세테이트(15 mL x 3)로 추출하고, 염수(15 mL)로 세척한 다음, 유기상을 진공 중에서 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 생성물 6-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노] 벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)헥사논산(110 mg, 미정제)을 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 712.1 [M+1] +.
단계 6: (2S,4R)-1-((S)-6-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)헥사노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 및 (2S,4R)-1-((R)-6-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)헥사노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
N,N-디메틸포름아미드 (5 mL) 중 6-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일] -1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)헥사논산(110 mg, 0.16 mmol, 1당량) 및 (2S,4R)-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸] 피롤리딘-2-카르복사미드 (57 mg, 0.16 mmol, 1당량, HCl) 용액에, 1-하이드록시벤조트리아졸 (25 mg, 0.19 mmol, 1.2당량) 및 N,N-디이소프로필에틸아민 (60 mg, 0.47 mmol, 3당량)을 첨가하고, 혼합물을 15℃에서 30분 동안 교반하고, 및 N-(3-디메틸아미노프로필)-N-에틸카르보디이미드 염화수소 (36 mg, 0.19 mmol, 1.2당량)을 혼합물에 첨가하고, 그런 다음 40℃에서 2시간 동안 교반하였다. 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 분취-HPLC로 정제하였다. 생성물 1 (2S,4R)-1-[(2S)-6-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일] 설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)헥사노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (45.2 mg, 0.04 mmol, 28% 수율, 98% 순도)를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 1025.3 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 9.04 - 8.92 (m, 1H), 8.64 (d, J=2.0 Hz, 1H), 8.55 (s, 1H), 8.38 (d, J=8.0 Hz, 1H) , 8.06 (s, 1H), 7.75 - 7.54 (m, 3H), 7.52 - 7.27 (m, 4H), 7.19 (t, J=8.8 Hz, 1H), 7.11 - 6.99 (m, 2H), 6.34 - 6.02 (m, 1H), 5.38 - 5.04 (m, 2H), 5.01 - 4.80 (m, 1H), 4.76 - 4.58 (m, 1H), 4.51 - 4.35 (m, 1H), 4.30 (s, 1H), 4.10 (t, J=7.6 Hz, 1H), 4.05 - 3.86 (m, 3H), 3.76 (dd, J=4.4, 10.0 Hz, 1H), 3.56 - 3.49 (m, 2H), 3.51 - 3.43 (m, 1H), 2.47 - 2.35 (m, 5H), 2.26 - 2.14 (m, 3H), 2.13 - 1.89 (m, 4H), 1.88 - 1.64 (m, 4H), 1.59 - 1.09 (m, 5H). 생성물 2 (2S,4R)-1-[(2R)-6-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일] 설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)헥사노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (18.6 mg, 0.02 mmol, 11% 수율, 97% 순도)를 백색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 1026.2 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 9.02 - 8.94 (m, 1H), 8.65 (d, J=1.6 Hz, 1H), 8.56 (s, 1H), 8.38 (d, J=7.6 Hz, 1H), 8.20 (s, 1H), 8.07 (s, 1H), 7.72 - 7.56 (m, 3H), 7.48 - 7.37 (m, 3H), 7.36 - 7.27 (m, 2H), 7.22 (t, J=8.8 Hz, 1H), 7.07 (d, J=8.8 Hz, 2H), 6.34 - 6.17 (m, 1H), 5.35 (s, 1H), 5.22 (s, 1H), 5.13 (s, 1H), 5.04 - 4.86 (m, 1H), 4.51 - 4.38 (m, 1H), 4.28 (s, 1H), 4.16 - 3.90 (m, 2H), 3.73 (d, J=7.6 Hz, 1H), 3.62 - 3.51 (m, 1H), 3.46 (s, 2H), 2.42 (d, J=8.8 Hz, 5H), 2.27 - 2.14 (m, 3H), 2.07 (d, J=15.2 Hz, 2H), 2.12 - 2.01 (m, 1H), 1.99 - 1.88 (m, 2H), 1.87 - 1.69 (m, 3H), 1.52 - 1.35 (m, 5H).
(2S,4R)-1-(4-(2-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)에톡시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 (실시예 460)의 예시적인 합성
단계 1: 1-브로모-4-(2-(2-브로모에톡시)에톡시)벤젠 제조
N,N-디메틸포름아미드(10 mL) 중 4-브로모페놀 (3 g, 17.34 mmol, 1당량) 및 1-브로모-2-(2-브로모에톡시)에탄 (4.02 g, 17.34 mmol, 1당량) 용액에 탄산 칼륨(4.79 g, 34.68 mmol, 2당량)를 첨가하였다. 반응 혼합물을 60℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물(10 mL)의 첨가로 급냉시킨 후, 물(20 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(40 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(30 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트=1: 0 내지 50:1)로 정제하여 1-브로모-4- [2-(2-브로모에톡시)에톡시]벤젠(2.8 g, 8.64 mmol, 49% 수율)을 무색 오일로서 수득하였다.1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 7.43 - 7.34 (m, 2H), 6.86 - 6.77 (m, 2H), 4.17 - 4.08 (m, 2H), 3.94 - 3.87 (m, 4H), 3.50 (t, J=6.2 Hz, 2H).
단계 2: 메틸 4-(2-(4-브로모페녹시)에톡시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노에이트 제조
N,N-디메틸포름아미드(5 mL) 중 메틸 2-(3-메틸이속사졸-5-일)아세테이트 (239 mg, 1.54 mmol, 1당량)의 용액에 칼륨 삼차-부톡시드 (190 mg, 1.70 mmol, 1.1당량) 및 요오드화칼륨(25 mg, 0.15 mmol, 0.1당량)을 첨가하였다. 그런 다음 1-브로모-4-[2-(2-브로모에톡시)에톡시]벤젠(500 mg, 1.54 mmol, 1당량)을 첨가하였다. 혼합물을 40℃에서 2시간 동안 교반하였다. 혼합물을 포화 암모니아 염화수소 (20 mL)로 희석하고, 에틸 아세테이트(20 mL x 3)로 추출하였다, 합쳐진 유기상을 포화 염수(30 mL)로 세척하고, 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과한 다음 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트=1: 0 내지 15:1)로 정제하여 메틸 4-[2-(4-브로모페녹시)에톡시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노에이트 (125 mg, 미정제)를 무색 오일로서 수득하였다. 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 7.42 - 7.32 (m, 2H), 6.84 - 6.76 (m, 2H), 6.01 (s, 1H), 4.10 - 4.03 (m, 3H), 3.79 - 3.69 (m, 5H), 3.63 - 3.56 (m, 1H), 3.52 - 3.44 (m, 1H), 2.46 - 2.32 (m, 1H), 2.27 (s, 3H), 2.21 - 2.11 (m, 1H).
단계 3: 메틸 4-(2-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로-N-((2-(트리메틸실릴)에톡시)메틸)피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1-((2-(트리메틸실릴)에톡시)메틸)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)에톡시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노에이트 제조
디옥산 (10 mL) 및 물(2 mL) 중 메틸 4-[2-(4-브로모페녹시)에톡시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노에이트 (125 mg, 0.31 mmol, 1당량), (3R)-N-[2,4-디플루오로-3-[5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란- 2-일)-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]페닐]-3-플루오로-N-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤리딘-1-설폰아미드 (305 mg, 0.37 mmol, 1.2당량), CsF (190 mg, 1.26 mmol, 0.05 uL, 4당량), 4-디삼차-부틸포스파닐-N,N-디메틸-아닐린;디클로로-팔라듐 (22 mg, 0.03 mmol, 0.02 mL, 0.1당량) 혼합물을 탈기시키고 질소로 퍼지하였다(3회), 그런 다음, 혼합물을 질소 대기 하에 120℃에서 1시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물(20 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(40 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(30 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 잔류물을 분취-TLC(석유 에테르:에틸 아세테이트 =1:1)로 정제하여 메틸 4-[2-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)아미노]벤조일]-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]에톡시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노에이트 (130 mg, 0.12 mmol, 40% 수율, 98% 순도)를 무색 오일로서 수득하였다.1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 8.84 (d, J=1.6 Hz, 1H), 8.65 (d, J=2.2 Hz, 1H), 7.79 - 7.68 (m, 2H), 7.62 (d, J=8.8 Hz, 2H), 7.12 - 6.91 (m, 3H), 6.04 (s, 1H), 5.33 - 5.28 (m, 1H), 4.22 - 4.06 (m, 4H), 3.84 - 3.40 (m, 16H), 2.27 (s, 3H), 2.24 - 2.12 (m, 2H), 1.65 (s, 3H), 1.53 (s, 1H), 1.00 - 0.89 (m, 4H), 0.03 (s, 9H), -0.05 (s, 9H).
단계 4: 메틸 4-(2-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)에톡시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노에이트 제조
메탄올 (1 mL) 중 메틸 4-[2-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐- (2-트리메틸실릴에톡시메틸)아미노]벤조일]-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]에톡시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노에이트 (120 mg, 0.12 mmol, 1당량)의 용액에 염화수소 /디옥산 (4 M, 4 mL, 133.63당량)을 첨가하였다. 혼합물을 40℃에서 24시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축시켜 메틸 4-[2-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]에톡시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노에이트 (130 mg, 미정제, 염화수소)를 무색 액체로서 수득하였고, 이를 추가 정제 없이 다음 단계에서 사용하였다.
단계 5: 4-(2-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)에톡시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부탄산 제조
물(2 mL) 및 메탄올(2 mL) 중 메틸 4-[2-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]에톡시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노에이트 (130 mg, 0.17 mmol, 1당량)의 용액에 수산화리튬(80 mg, 1.91 mmol, 10.88당량)을 첨가하였다. 혼합물을 20℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 혼합물 용액을 염화수소(1M)로 PH(5)로 조정하고, 에틸 아세테이트(10 mL x 2)로 추출하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 감압 하에 농축시켜 4-[2-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]에톡시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부탄산(50 mg, 미정제)을 무색 오일로서 수득하였고, 이를 추가 정제 없이 다음 단계에서 사용하였다.
단계 6: (2S,4R)-1-(4-(2-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)에톡시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
N,N-디메틸포름아미드 (1 mL) 중 (2S,4R)-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (25 mg, 0.07 mmol, 1당량, 염화수소)의 용액에 N,N-디이소프로필에틸아민 (26 mg, 0.21 mmol, 3당량)을 첨가하였다. 혼합물을 20℃에서 10분 동안 교반하였다. 그런 다음, 4-[2-[4-[3-[2,6-디플루오로- 3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]에톡시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부탄산 (50 mg, 0.07 mmol, 1당량) 및 1-하이드록시벤조트리아졸 (11 mg, 0.08 mmol, 1.2당량)을 첨가하고, 혼합물을 20 ℃에서 10분간 교반하였다. 그런 다음, N-(3-디메틸아미노- 프로필)-N-에틸카르보디이미드 염화수소(16 mg, 0.08 mmol, 1.2당량)를 첨가하였다. 혼합물을 20℃에서 2시간 40분 동안 교반하였다. 혼합물을 물(5 mL)로 급냉시키고, (디클로로메탄: 메탄올=10: 1)(10 mL x 2)로 추출하고, 염수(20 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과한 다음 농축시켰다. 잔류물을 분취-HPLC로 정제하여 (2S,4R)-1-[4-[2-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]에톡시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (11.9 mg, 0.01 umol, 16% 수율, 100% 순도)를 회백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 521.3 [M/2+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 9.01 - 8.91 (m, 1H), 8.64 (dd, J=2.2, 13.6 Hz, 1H), 8.55 (s, 1H), 8.47 - 8.35 (m, 1H), 8.06 (s, 1H), 7.67 (d, J=8.6 Hz, 1H), 7.64 - 7.55 (m, 2H), 7.46 - 7.32 (m, 5H), 7.19 (t, J=8.4 Hz, 1H), 7.08 (dd, J=8.8, 18.2 Hz, 2H), 6.32 - 6.21 (m, 1H), 5.41 - 5.06 (m, 2H), 4.99 - 4.85 (m, 1H), 4.50 - 4.35 (m, 1H), 4.32 - 4.14 (m, 4H), 3.76 (d, J=4.6 Hz, 3H), 3.57 - 3.41 (m, 5H), 2.47 - 2.39 (m, 4H), 2.18 (d, J=6.4 Hz, 4H), 2.12 - 1.94 (m, 5H), 1.84 - 1.64 (m, 1H), 1.42 - 1.32 (m, 4H), 1.23 (s, 1H).
(2S,4R)-1-((S)-4-(2-(2-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)에톡시)에톡시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 (실시예 461) 및 (2S,4R)-1-((R)-4-(2-(2-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)에톡시)에톡시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 (실시예 462)의 예시적인 합성
단계 1: 2-(2-(2-하이드록시에톡시)에톡시)에틸 4-메틸벤젠설포네이트 제조
디클로로메탄(50 mL) 중 2-[2-(2-하이드록시에톡시)에톡시]에탄올 (5.00 g, 33.29 mmol, 1.00당량) 및 4-메틸벤젠설포닐 클로라이드 (1.59 g, 8.32 mmol, 0.25당량)의 혼합물에 트리에틸아민(1.68 g, 16.65 mmol, 2.3 mL, 0.5당량)을 질소 하에 25℃에서 일회분으로 첨가하였다. 혼합물을 25℃에서 12시간 동안 교반하였다. 혼합물을 염수(30 mL Х 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르/에틸 아세테이트 = 1/1 내지 0:1)로 정제하여 2-[2-(2-하이드록시에톡시)에톡시]에틸 4-메틸벤젠설포네이트 (1.72 g, 5.65 mmol, 17% 수율)를 무색 오일로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 327.0 [M+23] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 7.81 (d, J = 8.3 Hz, 2H), 7.35 (d, J = 8.0 Hz, 2H), 4.22 - 4.15 (m, 2H), 3.79 - 3.67 (m, 4H), 3.67 - 3.56 (m, 6H), 2.46 (s, 3H).
단계 2: 2-(2-(2-(4-브로모페녹시)에톡시)에톡시)에탄-1-올 제조
N,N-디메틸포름아미드(10 mL) 중 2-[2-(2-하이드록시에톡시)에톡시]에틸 4-메틸벤젠설포네이트 (2 g, 6.57 mmol, 1당량) 및 4-브로모페놀 (1.36 g, 7.89 mmol, 1.2당량) 용액에 탄산칼륨(1.82 g, 13.14 mmol, 2당량)를 첨가하였다. 반응 혼합물을 60℃에서 12시간 동안 교반하였다. 물(20 mL)을 첨가하여 반응 혼합물을 급냉시킨 다음, 물(30 mL)로 희석하여 여과하고, 에틸 아세테이트(40 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(80 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트 = 20:1 내지 3:1)로 정제하였다. 원하는 화합물 2-[2-[2-(4-브로모페녹시)에톡시]에톡시]에탄올(1.09 g, 3.57 mmol, 54% 수율)을 무색 오일로서 수득하였다.1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 7.44 - 7.33 (m, 2H), 6.81 (d, J=8.8 Hz, 2H), 4.18 - 4.06 (m, 2H), 3.92 - 3.83 (m, 2H), 3.79 - 3.67 (m, 6H), 3.65 - 3.60 (m, 2H).
단계 3: 1-브로모-4-(2-(2-(2-브로모에톡시)에톡시)에톡시)벤젠 제조
테트라하이드로푸란(10 mL) 중 2-[2-[2-(4-브로모페녹시)에톡시]에톡시]에탄올 (1.09 g, 3.57 mmol, 1당량) 및 트리페닐포스핀(1.41 g, 5.36 mmol, 1.5당량) 용액에 퍼브로모메탄(1.78 g, 5.36 mmol, 1.5당량)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 20℃에서 1시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트 = 50:1 내지 10:1)로 정제하였다. 원하는 화합물 1-브로모-4-[2-[2-(2-브로모에톡시)에톡시]에톡시]벤젠 (1.2 g, 3.26 mmol, 91% 수율)을 연황색 오일로서 수득하였다.1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 7.43 - 7.31 (m, 2H), 6.86 - 6.70 (m, 2H), 4.16 - 4.06 (m, 2H), 3.92 - 3.79 (m, 4H), 3.76 - 3.66 (m, 4H), 3.48 (t, J=6.4 Hz, 2H).
단계 4: 메틸 4-(2-(2-(4-브로모페녹시)에톡시)에톡시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노에이트 제조
N,N-디메틸포름아미드(5 mL) 중 메틸 2-(3-메틸이속사졸-5-일)아세테이트 (211 mg, 1.36 mmol, 1당량) 및 요오드화칼륨(23 mg, 0.14 mmol, 0.1당량)의 용액에 칼륨 삼차-부톡시드(183 mg, 1.63 mmol, 1.2당량) 및 1-브로모-4-[2-[2-(2-브로모에톡시)에톡시]에톡시]벤젠 (500 mg, 1.36 mmol, 1당량)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 40℃에서 2시간 동안 교반하였다. 물(10 mL)을 첨가하여 반응 혼합물을 급냉시킨 다음, 물(20 mL)로 희석하여 여과하고, 에틸 아세테이트(30 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(50 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트 = 20:1 내지 3:1)로 정제하였다. 원하는 화합물 메틸 4-[2-[2-(4-브로모페녹시)에톡시]에톡시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노에이트 (250 mg, 0.57 mmol, 41% 수율)를 무색 오일로서 수득하였다.1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 7.44 - 7.32 (m, 2H), 6.87 - 6.77 (m, 2H), 6.03 (s, 1H), 4.16 - 4.08 (m, 3H), 3.87 - 3.82 (m, 2H), 3.72 (s, 3H), 3.70 - 3.67 (m, 2H), 3.64 - 3.50 (m, 3H), 3.48 - 3.38 (m, 1H), 2.42 - 2.31 (m, 1H), 2.28 (s, 3H), 2.20 - 2.09 (m, 1H).
단계 5: 메틸 4-(2-(2-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로-N-((2-(트리메틸실릴)에톡시)메틸)피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1-((2-(트리메틸실릴)에톡시)메틸)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)에톡시)에톡시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노에이트 제조
디옥산 (10 mL) 및 물(2 mL) 중 메틸 4-[2-[2-(4-브로모페녹시)에톡시]에톡시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노에이트 (180 mg, 0.41 mmol, 1당량) 및 (3R)-N-[2,4-디플루오로-3-[5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]페닐]-3-플루오로-N-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤리딘-1-설폰아미드 (330 mg, 0.41 mmol, 1당량)의 용액에 4-디삼차-부틸포스포닐-N,N-디메틸-아닐린;디클로로팔라듐(29 mg, 0.04 mmol, 0.1당량) 및 불화세슘(247 mg, 1.63 mmol, 4당량)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 120℃에서 1시간 동안 교반하였다. 물(10 mL)을 첨가하여 반응 혼합물을 급냉시킨 다음, 물(20 mL)로 희석하여 여과하고, 에틸 아세테이트(30 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(50 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 잔류물을 분취-TLC(석유 에테르:에틸 아세테이트 = 1:1)로 정제하였다. 원하는 화합물 메틸 4-[2-[2-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)아미노]벤조일]-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]에톡시]에톡시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노에이트 (160 mg, 0.14 mmol, 35% 수율, 92% 순도)를 연황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 1046.0 [M+1] +.
단계 6: 메틸 4-(2-(2-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)에톡시)에톡시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노에이트 제조
메탄올 (1 mL) 중 메틸 4-[2-[2-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)아미노]벤조일]-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]에톡시]에톡시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노에이트 (160 mg, 0.15 mmol, 1당량)의 용액에 염화수소 /디옥산 (4 M, 2 mL, 52.32당량)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 40℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 생성물은 추가 정제 없이 다음 단계에 사용되었다. 원하는 화합물 메틸 4-[2-[2-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]에톡시]에톡시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노에이트 (120 mg, 미정제)를 연황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 786.3 [M+1] +.
단계 7: 4-(2-(2-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)에톡시)에톡시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부탄산 제조
메탄올(4 mL) 및 물(1 mL) 중 메틸 4-[2-[2-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]에톡시]에톡시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노에이트 (120 mg, 0.15 mmol, 1당량)의 용액에 수산화리튬(26 mg, 0.61 mmol, 4당량)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 20℃에서 1시간 동안 교반하였다. 잔류물을 1 M 염화수소로 pH=4 내지 5로 조정하고 에틸 아세테이트(30 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 감압 하에서 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 생성물은 추가 정제 없이 다음 단계에 사용되었다. 원하는 화합물 4-[2-[2-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]에톡시]에톡시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부탄산 (110 mg, 미정제)을 연황색 오일로서 수득하였다.
단계 8: (2S,4R)-1-((S)-4-(2-(2-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)에톡시)에톡시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 및 (2S,4R)-1-((R)-4-(2-(2-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)에톡시)에톡시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
N,N-디메틸포름아미드 (1 mL) 중 4-[2-[2-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]에톡시]에톡시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부탄산 (110 mg, 0.14 mmol, 1당량) 및 (2S,4R)-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (52 mg, 0.14 mmol, 1당량, HCl)의 용액에 N,N-디이소프로필에틸아민 (55 mg, 0.43 mmol, 3당량) 및 하이드록시벤조트리아졸 (23 mg, 0.17 mmol, 1.2당량)을 첨가하였다. 혼합물을 20℃에서 0.15시간 동안 교반한 다음, 1-(3-디메틸아미노프로필)-3-에틸카르보디이미드 염화수소 (33 mg, 0.17 mmol, 1.2당량)를 혼합물에 첨가하였다. 반응 혼합물을 20℃에서 1시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물(10 mL)의 첨가로 급냉시킨 후, 물(20 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(20 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 감압 하에서 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 잔류물을 분취-TLC(디클로로메탄:메탄올 = 10:1)로 정제하였다. 원하는 화합물을 백색 고체로서 수득하였다. 생성물 1, (2S,4R)-1-[(2S)-4-[2-[2-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]에톡시]에톡시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (22.7 mg, 0.021 mmol, 29% 수율, 100% 순도). LC/MS (ESI) m/z: 543.2 [M/2+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.93 (s, 1H), 9.84 (s, 1H), 8.96 (s, 1H), 8.72 - 8.52 (m, 2H), 8.41 (d, J=7.6 Hz, 1H), 8.08 (s, 1H), 7.71 - 7.54 (m, 3H), 7.48 - 7.31 (m, 4H), 7.26 (t, J=8.8 Hz, 1H), 7.07 (d, J=8.8 Hz, 2H), 6.26 - 6.01 (m, 1H), 5.41 - 5.20 (m, 1H), 5.15 - 5.02 (m, 1H), 5.00 - 4.86 (m, 1H), 4.40 (t, J=7.6 Hz, 1H), 4.33 - 4.08 (m, 4H), 3.84 - 3.34 (m, 13H), 2.45 - 2.40 (m, 3H), 2.23 - 1.93 (m, 6H), 1.88 - 1.71 (m, 1H), 1.38 (d, J=6.8 Hz, 3H). 생성물 2, (2S,4R)-1-[(2R)-4-[2-[2-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]에톡시]에톡시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (14.7 mg, 0.013 mmol, 18% 수율, 99 % 순도).LC/MS (ESI) m/z: 543.2 [M/2+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.92 (s, 1H), 9.84 (s, 1H), 9.03 - 8.92 (m, 1H), 8.69 - 8.49 (m, 2H), 8.35 (d, J=7.6 Hz, 1H), 8.08 (s, 1H), 7.77 - 7.53 (m, 3H), 7.47 - 7.20 (m, 5H), 7.09 (d, J=8.4 Hz, 2H), 6.37 - 6.19 (m, 1H), 5.43 - 5.20 (m, 1H), 5.12 (d, J=3.2 Hz, 1H), 5.04 - 4.85 (m, 1H), 4.65 - 4.38 (m, 1H), 4.34 - 4.09 (m, 4H), 3.79 (s, 2H), 3.66 - 3.36 (m, 11H), 2.47 - 2.38 (m, 3H), 2.24 - 1.97 (m, 6H), 1.83 - 1.70 (m, 1H), 1.47 - 1.29 (m, 3H).
(2S,4R)-1-((S)-4-(2-(2-(2-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 (실시예 463) 및 (2S,4R)-1-((R)-4-(2-(2-(2-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 (실시예 464)의 예시적인 합성
단계 1: 2-(2-(2-(2-하이드록시에톡시)에톡시)에톡시)에틸 4-메틸벤젠설포네이트 제조
디클로로메탄(50 mL) 중 2-[2-[2-(2-하이드록시에톡시)에톡시]에톡시]에탄올 (5 g, 25.74 mmol, 4.4 mL, 1당량) 및 4-메틸벤젠설포닐 클로라이드 (1.23 g, 6.44 mmol, 0.25당량)의 혼합물에 트리에틸아민(1.30 g, 12.87 mmol, 1.8 mL, 0.5당량)을 질소 하에 25℃에서 일회분으로 첨가하였다. 혼합물을 25℃에서 12시간 동안 교반하였다. 혼합물을 염수(30 mL Х 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르/에틸 아세테이트 = 1/1 내지 0/1)로 정제하여 2-[2-[2-(2-하이드록시에톡시)에톡시]에톡시]에틸 4-메틸벤젠설포네이트(1.98 g, 5.68 mmol, 22% 수율)를 무색 오일로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 371.0 [M+23] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 7.82 (d, J = 8.3 Hz, 2H), 7.36 (d, J = 8.2 Hz, 2H), 4.21 - 4.11 (m, 2H), 3.75 - 3.61 (m, 14H), 2.47 (s, 3H).
단계 2: 2-(2-(2-(2-(4-브로모페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)에탄-1-올 제조
N,N-디메틸포름아미드(10 mL) 중 2-[2-[2-(2-하이드록시에톡시)에톡시]에톡시]에틸 4-메틸벤젠설포네이트 (2 g, 5.74 mmol, 1당량) 및 4-브로모페놀 (1.09 g, 6.31 mmol, 1.1당량)의 용액에 탄산칼륨(1.59 g, 11.48 mmol, 2당량)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 60℃에서 12시간 동안 교반하였다. 물(20 mL)을 첨가하여 반응 혼합물을 급냉시킨 다음, 물(30 mL)로 희석하여 여과하고, 에틸 아세테이트(40 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(80 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트 = 20:1 내지 3:1)로 정제하였다. 원하는 화합물 2-[2-[2-[2-(4-브로모페녹시)에톡시]에톡시]에톡시]에탄올 (1.34 g, 3.84 mmol, 66% 수율)을 무색 오일로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 351.1 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 7.44 - 7.33 (m, 2H), 6.87 - 6.75 (m, 2H), 4.17 - 4.07 (m, 2H), 3.91 - 3.81 (m, 2H), 3.79 - 3.57 (m, 12H).
단계 3: 1-브로모-4-(2-(2-(2-(2-브로모에톡시)에톡시)에톡시)에톡시)벤젠 제조
테트라하이드로푸란(10 mL) 중 2-[2-[2-[2-(4-브로모페녹시)에톡시]에톡시]에톡시]에탄올 (1.34 g, 3.84 mmol, 1당량)의 용액에 퍼브로모메탄(1.91 g, 5.76 mmol, 1.5당량) 및 트리페닐포스핀(1.51 g, 5.76 mmol, 1.5당량)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 20℃에서 1시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물(10 mL)의 첨가로 급냉시킨 후, 물(20 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(40 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(30 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트 = 50:1 내지 10:1)로 정제하였다. 원하는 화합물 1-브로모-4-[2-[2-[2-(2-브로모에톡시)에톡시]에톡시]에톡시]벤젠 (1.1 g, 2.67 mmol, 69% 수율)을 무색 오일로서 수득하였다. 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 7.42 - 7.33 (m, 2H), 6.87 - 6.73 (m, 2H), 4.14 - 4.07 (m, 2H), 3.91 - 3.77 (m, 4H), 3.76 - 3.66 (m, 8H), 3.47 (t, J=6.4 Hz, 2H).
단계 4: 메틸 4-(2-(2-(2-(4-브로모페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노에이트 제조
N,N-디메틸포름아미드(6 mL) 중 메틸 2-(3-메틸이속사졸-5-일)아세테이트 (188 mg, 1.21 mmol, 1당량)의 용액에 칼륨 삼차-부톡시드(150 mg, 1.33 mmol, 1.1당량) 및 요오드화칼륨 (20 mg, 0.12 mmol, 0.1당량)를 첨가한 다음, 1-브로모-4-[2-[2-[2-(2-브로모에톡시)에톡시]에톡시]에톡시]벤젠 (500 mg, 1.21 mmol, 1당량)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 40℃에서 2시간 동안 교반하였다. 물(10 mL)을 첨가하여 반응 혼합물을 급냉시킨 다음, 물(20 mL)로 희석하여 여과하고, 에틸 아세테이트(30 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(50 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트 = 20:1 내지 3:1)로 정제하였다. 원하는 화합물 메틸 4-[2-[2-[2-(4-브로모페녹시)에톡시]에톡시]에톡시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노에이트 (220 mg, 0.45 mmol, 37% 수율)를 무색 오일로서 수득하였다.1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 7.37 (d, J=8.4 Hz, 2H), 6.80 (d, J=8.8 Hz, 2H), 6.03 (s, 1H), 4.16 - 4.07 (m, 3H), 3.90 - 3.81 (m, 2H), 3.76 - 3.71 (m, 5H), 3.70 - 3.65 (m, 2H), 3.65 - 3.60 (m, 2H), 3.58 - 3.49 (m, 3H), 3.46 - 3.36 (m, 1H), 2.41 - 2.31 (m, 1H), 2.30 - 2.27 (m, 3H), 2.20 - 2.07 (m, 1H).
단계 5: 메틸 4-(2-(2-(2-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로-N-((2-(트리메틸실릴)에톡시)메틸)피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1-((2-(트리메틸실릴)에톡시)메틸)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노에이트 제조
디옥산(10 mL) 및 물(2 mL) 중 메틸 4-[2-[2-[2-(4-브로모페녹시)에톡시]에톡시]에톡시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노에이트 (220 mg, 0.45 mmol, 1당량) 및 (3R)-N-[2,4-디플루오로-3-[5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]페닐]-3-플루오로-N-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤리딘-1-설폰아미드 (367 mg, 0.45 mmol, 1당량)의 용액에 불화세슘(275 mg, 1.81 mmol, 4당량) 및 4-디삼차-부틸포스포닐-N,N-디메틸-아닐린;디클로로팔라듐(32 mg, 0.04 umol, 0.1당량)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 100℃에서 12시간 동안 교반하였다. 물(10 mL)을 첨가하여 반응 혼합물을 급냉시킨 다음, 물(20 mL)로 희석하여 여과하고, 에틸 아세테이트(30 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(50 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 잔류물을 분취-TLC(석유 에테르:에틸 아세테이트 = 1:1)로 정제하였다. 원하는 화합물 메틸 4-[2-[2-[2-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)아미노]벤조일]-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]에톡시]에톡시]에톡시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노에이트 (270 mg, 0.23 mmol, 51% 수율, 94 % 순도)을 연황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 546.2 [M/2+1] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 8.84 (d, J=1.6 Hz, 1H), 8.65 (d, J=2.0 Hz, 1H), 7.83 - 7.68 (m, 2H), 7.61 (d, J=8.8 Hz, 2H), 7.16 - 7.01 (m, 3H), 6.04 (s, 1H), 5.70 (s, 2H), 5.33 - 5.13 (m, 1H), 5.07 - 4.93 (m, 2H), 4.26 - 4.18 (m, 2H), 3.98 - 3.88 (m, 2H), 3.81 - 3.37 (m, 22H), 2.46 - 2.32 (m, 1H), 2.31 - 2.09 (m, 6H), 1.31 - 1.19 (m, 4H), 0.03 (s, 9H), -0.05 (s, 9H).
단계 6: 메틸 4-(2-(2-(2-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노에이트 제조
메탄올 (2 mL) 중 메틸 4-[2-[2-[2-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)아미노]벤조일]-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]에톡시]에톡시]에톡시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노에이트 (270 mg, 0.25 mmol, 1당량)의 용액에 염화수소 /디옥산 (4 M, 2 mL, 32.31당량)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 40℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 생성물은 추가 정제 없이 다음 단계에 사용되었다. 원하는 화합물 메틸 4-[2-[2-[2-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]에톡시]에톡시]에톡시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노에이트 (250 mg, 미정제)를 연황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 830.1 [M+1] +.
단계 7: 4-(2-(2-(2-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부탄산 제조
테트라하이드로푸란(10 mL) 및 물(2 mL) 중 메틸 4-[2-[2-[2-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]에톡시]에톡시]에톡시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노에이트 (250 mg, 0.3 mmol, 1당량)의 용액에 수산화리튬(51 mg, 1.21 mmol, 4당량)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 20℃에서 1시간 동안 교반하였다. 잔류물을 1M 염화수소로 pH=4 내지 5로 조정하고 에틸 아세테이트(30 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 감압 하에서 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 생성물은 추가 정제 없이 다음 단계에 사용되었다. 원하는 화합물 4-[2-[2-[2-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]에톡시]에톡시]에톡시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부탄산 (200 mg, 미정제)을 연황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 816.0 [M+1] +.
단계 8: (2S,4R)-1-((S)-4-(2-(2-(2-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 및 (2S,4R)-1-((R)-4-(2-(2-(2-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
N,N-디메틸포름아미드 (2 mL) 중 4-[2-[2-[2-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]에톡시]에톡시]에톡시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부탄산 (100 mg, 0.12 mmol, 1당량) 및 (2S,4R)-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (45 mg, 0.12 mmol, 1당량, HCl)의 용액에 N,N-디이소프로필에틸아민 (48 mg, 0.37 mmol, 3당량) 및 하이드록시벤조트리아졸 (20 mg, 0.15 mmol, 1.2당량)을 첨가하였다. 혼합물을 20℃에서 0.25시간 동안 교반하고, 1-(3-디메틸아미노프로필)-3-에틸카르보디이미드 염화수소 (28 mg, 0.15 mmol, 1.2당량)를 혼합물에 첨가하였다. 반응 혼합물을 20℃에서 1.25시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물(10 mL)의 첨가로 급냉시킨 후, 물(20 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(20 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 감압 하에서 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 잔류물을 분취-HPLC로 정제하였다(염기성 조건). 그런 다음 잔류물을 분취-TLC(디클로로메탄:메탄올 = 10:1)로 정제하였다. 원하는 화합물을 백색 고체로서 수득하였다. 생성물 1, (2S,4R)-1-[(2S)-4-[2-[2-[2-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일] 설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]에톡시]에톡시]에톡시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (16.97 mg, 0.014 mmol, 24 % 수율, 99% 순도). LC/MS (ESI) m/z: 562.4 [M/2+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 8.96 (s, 1H), 8.71 - 8.52 (m, 2H), 8.43 (s, 1H), 8.08 (s, 1H), 7.64 (s, 3H), 7.49 - 7.19 (m, 6H), 7.08 (s, 2H), 6.34 - 6.04 (m, 1H), 5.41 - 4.81 (m, 3H), 4.45 - 4.07 (m, 4H), 3.77 (s, 2H), 3.62 - 3.50 (m, 12H), 2.43 (s, 3H), 2.28 - 1.91 (m, 10H), 1.81 (s, 1H), 1.37 (s, 4H). 생성물 2, (2S,4R)-1-[(2R)-4-[2-[2-[2-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페녹시]에톡시]에톡시]에톡시]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (15.25 mg, 0.013 mmol, 22% 수율, 100% 순도).LC/MS (ESI) m/z: 562.4 [M/2+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.93 (s, 1H), 9.86 (s, 1H), 9.08 - 8.91 (m, 1H), 8.73 - 8.53 (m, 2H), 8.36 (d, J=8.0 Hz, 1H), 8.08 (s, 1H), 7.73 - 7.55 (m, 3H), 7.50 - 7.22 (m, 5H), 7.15 - 7.03 (m, 2H), 6.36 - 6.20 (m, 1H), 5.41 - 5.18 (m, 2H), 5.12 (d, J=3.6 Hz, 1H), 5.05 - 4.84 (m, 1H), 4.69 - 4.38 (m, 3H), 4.32 - 4.12 (m, 4H), 3.79 (d, J=4.8 Hz, 2H), 3.68 - 3.37 (m, 9H), 2.44 (s, 3H), 2.36 - 1.85 (m, 8H), 1.84 - 1.68 (m, 1H), 1.48 - 1.17 (m, 4H).
(2S,4R)-1-(4-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)-3,3-디메틸-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 (실시예 477)의 예시적인 합성
단계 1: 1-(삼차-부틸) 4-메틸 2,2-디메틸-3-(3-메틸이속사졸-5-일)석신네이트 제조
N,N-디메틸포름아미드 (30 mL) 중 메틸 2-(3-메틸이속사졸-5-일)아세테이트 (4 g, 25.78 mmol, 1당량) 및 삼차-부틸 2-브로모-2-메틸-프로파노에이트 (11.50 g, 51.56 mmol, 2당량)의 용액에 칼륨 삼차-부톡시드(4.34 g, 38.67 mmol, 1.5당량)을 첨가하고, 혼합물을 50℃에서 2시간 동안 교반하였다. 혼합물을 물(100 mL)로 희석하고, 에틸 아세테이트(100 mL, 2회)로 추출하고, 유기상을 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과물을 농축시켜 미정제 생성물을 수득하였다. 이러한 미정제 물질을 분취-HPLC로 정제하고, 혼합물을 pH=8이 될 때까지 중탄산나트륨으로 조정하고, 혼합물을 에틸 아세테이트 (500 mL, 2회)로 추출하고, 유기상을 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고, 여과물을 농축시켜 생성물을 수득하였다. 화합물 1-삼차-부틸 4-메틸 2,2-디메틸-3-(3-메틸이속사졸-5-일)석신에이트(5 g, 16.82 mmol, 65% 수율)을 갈색 오일로서 수득하였다.1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 6.08 (s, 1H), 4.36 (s, 1H), 3.73 - 3.67 (m, 3H), 2.30 (s, 3H), 1.45 (s, 9H), 1.28 (s, 3H), 1.16 (s, 3H).
단계 2: 4-메톡시-2,2-디메틸-3-(3-메틸이속사졸-5-일)-4-옥소부탄산 제조
디클로로메탄 (5 mL) 중 1-삼차-부틸 4-메틸 2,2-디메틸-3-(3-메틸이속사졸-5-일)석신에이트 (4.9 g, 16.48 mmol, 1당량) 용액에 염산/디옥산(4 M, 10 mL, 2.43당량)을 첨가한 후, 20℃에서 11시간 동안 교반하였다. 혼합물을 농축시켜 생성물을 수득하였다. 화합물 4-메톡시-2,2-디메틸-3-(3-메틸이속사졸-5-일)-4-옥소-부탄산 (4.0 g, 미정제)을 담황색 오일로서 수득하였다.1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.65 (br s, 1H), 6.35 (s, 1H), 4.40 (s, 1H), 3.62 (s, 3H), 2.23 (s, 3H), 1.21 (s, 3H), 1.08 (s, 3H).
단계 3: 삼차-부틸 4-(4-메톡시-2,2-디메틸-3-(3-메틸이속사졸-5-일)-4-옥소부타노일)피페라진-1-카르복실레이트 제조
N,N-디메틸포름아미드(30 mL) 중 4-메톡시-2,2-디메틸-3-(3-메틸이속사졸-5-일)-4-옥소-부탄산 (3.4 g, 14.09 mmol, 1당량) 및 삼차-부틸 피페라진-1-카르복실레이트 (3.41 g, 18.32 mmol, 1.3당량)의 용액에, 디이소프로필에틸아민 (3.64 g, 28.19 mmol, 2당량)을 첨가하고 나서, O-(7-아자벤조트리아졸-1-일)-N,N,N,N-테트라메틸우로늄 헥사플루오로포스페이트 (5.89 g, 15.50 mmol, 1.1당량)을 첨가하고, 혼합물을 20℃에서 1시간 동안 교반하였다. 혼합물을 물(100 mL)로 희석하고 디클로로메탄(100 mL, 2회)으로 추출하고, 유기상을 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고, 여과물을 농축시켜 미정제 생성물을 수득하였다. 미정제 생성물을 실리카 겔 크로마토그래피(에틸 아세테이트: 석유 에테르 = 0:1 내지 1:20)로 정제하여 생성물을 수득하였다. 삼차-부틸 4-[4-메톡시-2,2-디메틸-3-(3-메틸이속사졸-5-일)-4-옥소-부타노일]피페라진 -1-카르복실레이트 (5.3 g, 12.94 mmol, 91% 수율)을 담황색 오일로서 수득하였다.1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 6.16 - 6.01 (m, 1H), 4.39 (s, 1H), 3.70 (s, 3H), 3.67 - 3.56 (m, 4H), 3.50 - 3.41 (m, 4H), 2.36 - 2.24 (m, 3H), 1.53 (s, 3H), 1.47 (s, 9H), 1.31 (s, 3H).
단계 4: 삼차-부틸 4-(4-메톡시-2,2-디메틸-3-(3-메틸이속사졸-5-일)-4-옥소부틸)피페라진-1-카르복실레이트 제조
0℃에서 테트라하이드로푸란(60 mL) 중 삼차-부틸 4-[4-메톡시-2,2-디메틸-3-(3-메틸이속사졸-5-일)-4-옥소 -부타노일]피페라진-1-카르복실레이트 (4.3 g, 10.50 mmol, 1당량)의 용액에 디메틸설파이드 보란(10 M, 10.5 mL, 10당량)을 첨가하고, 혼합물을 40℃에서 1시간 동안 교반하였다. 혼합물을 메탄올(20 mL)로 급냉시키고, 잔류물을 농축시켜 미정제 생성물을 수득하였다. 미정제 물질을 분취-HPLC로 정제하고, 혼합물을 포화 중탄산 나트륨 수용액으로 pH=8까지 조정하고, 혼합물을 에틸 아세테이트 (200 mL, 2회)로 추출하고, 유기상을 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고, 여과물을 농축시켜 생성물을 수득하였다. 화합물 삼차-부틸 4-[4-메톡시-2,2-디메틸-3-(3-메틸이속사졸-5-일)-4-옥소-부틸]피페라진-1-카르복실레이트 (2.7 g, 6.83 mmol, 65% 수율)를 무색 오일로서 수득하였다.1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 6.16 (s, 1H), 4.24 - 4.06 (m, 1H), 3.70 (s, 3H), 3.40 (br s, 4H), 2.51 (s, 4H), 2.31 - 2.15 (m, 5H), 1.46 (s, 9H), 1.05 (s, 3H), 0.92 (s, 3H).
단계 5: 4-(4-(삼차-부톡시카르보닐)피페라진-1-일)-3,3-디메틸-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부탄산 제조
메탄올 (10 mL) 및 테트라하이드로푸란(10 mL) 중 삼차-부틸 4-[4-메톡시-2,2-디메틸-3-(3-메틸이속사졸-5-일)-4-옥소-부틸] 피페라진-1-카르복실레이트 (2.7 g, 6.83 mmol, 1당량) 용액에 물(10 mL) 중 수산화 리튬 일수화물(2.86 g, 68.27 mmol, 10당량)을 첨가하고, 혼합물을 20℃에서 10시간 동안 교반하였다. 혼합물을 염산(1 M) 수용액으로 pH=5까지 조정하고, 혼합물을 디클로로메탄(100 mL, 3회)으로 추출하고, 유기상을 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고, 여과물을 농축시켜 생성물을 수득하였다. 이 생성물을 분취-HPLC로 정제하고, 아세토니트릴 분획을 제거하고, 잔류물을 동결 건조시켜 생성물을 수득하였다. 화합물 4-(4-삼차-부톡시카르보닐피페라진-1-일)-3,3-디메틸-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부탄산 (1.2 g, 3.15 mmol)을 백색 고체로서 수득하였다.1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 6.25 (s, 1H), 3.87 (s, 1H), 3.27 - 3.21 (m, 4H), 2.53 (s, 4H), 2.29 (d, J=8.9 Hz, 2H), 2.20 (s, 3H), 1.38 (s, 9H), 0.99 (s, 3H), 0.92 (s, 3H).
단계 6: 삼차-부틸 4-(4-((2S,4R)-4-하이드록시-2-(((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)카바모일)피롤리딘-1-일)-2,2-디메틸-3-(3-메틸이속사졸-5-일)-4-옥소부틸)피페라진-1-카르복실레이트 제조
1,2-디클로로에탄 (15 mL) 중 4-(4-삼차-부톡시카르보닐피페라진-1-일)-3,3-디메틸-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부탄산 (1.2 g, 3.15 mmol, 1당량) 및 (2S,4R)-4-하이드록시 -N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (1.5 g, 4.08 mmol, 1.30당량, 염화수소) 용액에 디이소프로필에틸아민 (1.22 g, 9.44 mmol, 1.64 mL, 3당량)을 첨가한 다음, 1-하이드록시벤조트리아졸 (510 mg, 3.77 mmol, 1.2당량) 및 N-(3-디메틸아미노프로필)-N-에틸카르보디이미드 염화수소 (724 mg, 3.77 mmol, 1.2당량)을 첨가하고, 혼합물을 80℃에서 5시간 동안 교반하였다. 혼합물을 디클로로메탄(100 mL)로 희석하고 물(100 mL)로 세척하고, 유기상을 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고, 여과물을 농축시켜 미정제 생성물을 수득하였다. 잔류물을 실리카겔 크로마토그래피(디클로로메탄:메탄올=50:1 내지 10:1)로 정제하여 생성물을 수득하였다. 생성물을 분취-HPLC에 의해 추가로 정제하고, 아세토니트릴 분획을 제거하고, 잔류물을 동결 건조시켜 생성물을 수득하였다. 생성물을 분취-HPLC에 의해 훨씬 더 정제하고, 아세토니트릴 분획을 제거하고, 잔류물을 동결 건조시켜 최종 생성물을 수득하였다. 화합물 삼차-부틸 4-[4-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-[[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]카바모일]피롤리딘-1-일]-2,2-디메틸-3-(3-메틸이속사졸-5-일)-4-옥소-부틸]피페라진-1-카르복실레이트 (490 mg, 0.71 mmol, 22.4% 수율)를 백색 고체로서 수득하였다.1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 8.68 (s, 1H), 7.50 - 7.34 (m, 5H), 6.27 - 6.08 (m, 1H), 5.13 - 4.97 (m, 1H), 4.71 - 4.55 (m, 2H), 4.47 - 4.32 (m, 1H), 3.90 (dd, J=5.4, 10.5 Hz, 1H), 3.53 (dd, J=4.2, 10.4 Hz, 1H), 3.41 (s, 4H), 2.67 - 2.43 (m, 8H), 2.31 - 2.25 (m, 3H), 2.22 (d, J=3.3 Hz, 2H), 1.97 - 1.85 (m, 1H), 1.52 (d, J=6.8 Hz, 2H), 1.48 - 1.40 (m, 10H), 1.11 (s, 3H), 1.04 - 0.96 (m, 3H).
단계 7: (2S,4R)-1-(3,3-디메틸-2-(3-메틸이속사졸-5-일)-4-(피페라진-1-일)부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
디클로로메탄 (3 mL) 중 삼차-부틸 4-[4-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-[[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]카바모일]피롤리딘-1-일]-2,2-디메틸-3-(3-메틸이속사졸-5-일)-4-옥소-부틸]피페라진-1-카르복실레이트 (200 mg, 0.29 mmol, 1당량)의 용액에 염산/디옥산 (4 M, 3 mL, 41.69당량)을 첨가하고, 혼합물을 20℃에서 1시간 동안 교반하였다. 혼합물을 농축시켜 (2S,4R)-1-[3,3-디메틸-2-(3-메틸이속사졸-5-일)-4-피페라진-1-일-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (230 mg, 미정제, 염화수소)를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 595.2 [M+1] +.
단계 8: (2S,4R)-1-(4-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)-3,3-디메틸-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
메탄올(2 mL) 중 (2S,4R)-1-[3,3-디메틸-2-(3-메틸이속사졸-5-일)-4-피페라진-1-일-부타노일] -4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (50 mg, 0.08 mmol, 1당량, 염화수소)의 혼합물에 아세트산나트륨(13 mg, 0.16 mmol, 2당량)을 일회분으로 15℃에서 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 1분 동안 교반한 다음, 디클로로메탄(0.5 mL) 중 (3R)-N-[2,4-디플루오로-3-[5-[4-(4-포르밀-1-피페리딜)페닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (44 mg, 0.071 mmol, 0.9당량)를 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 30분 동안 추가로 교반하고, 아세트산(0.87 mmol, 0.05 mL, 11.04당량)을 첨가하여 pH = 4~5를 조정하였다. 이어서 나트륨 시아노보로히드라이드(10 mg, 0.16 mmol, 2당량)를 첨가하고, 30℃에서 1시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물(10 mL)로 희석시키고 디클로로메탄(5 mL x 3)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(10 mL x 3)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 반-분취 역상 HPLC로 정제하였다. 화합물 (2S,4R)-1-[4-[4-[[1-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로 피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-4-피페리딜]메틸]피페라진-1-일]-3,3-디메틸-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (22 mg, 0.01 mmol, 21% 수율, 96% 순도, 포름산염)을 연황색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 1190.4 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.94 (s, 1 H), 8.97 - 9.03 (m, 1 H), 8.65 (d, J=2.0 Hz, 1 H), 8.53 ( s, 1 H), 8.41 (d, J=8.0 Hz, 1 H), 8.18 (s, 1 H), 8.06 (s, 1 H), 7.56 - 7.66 (m, 3 H), 7.34 - 7.48 (m, 4 H), 7.25 (t, J=8.8 Hz, 1 H), 7.06 (d, J=8.8 Hz, 2 H), 6.11 - 6.28 (m, 1 H), 5.20 - 5.40 (m, 1 H), 4.87 - 4.99 (m, 1 H), 4.21 - 4.43 (m, 3 H), 4.10 (s, 1 H), 3.77 (d, J = 10.4 Hz, 4 H), 3.47 (s, 8 H), 3.17 (s, 5 H), 2.71 - 2.75 (m, 1 H), 2.47 (s, 6 H), 2.05 - 2.27 (m, 8 H), 1.75 - 1.86 (m, 3 H), 1.70 (s, 1 H), 1.36 - 1.47 (m, 3 H), 1.21 (d, J = 8.8 Hz, 2 H), 0.98 - 1.07 (m, 3 H), 0.88 (s, 3 H).
(2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로-N-메틸피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드 (실시예 330)의 예시적인 합성
단계 1: (5-브로모-1-((2-(트리메틸실릴)에톡시)메틸)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)(2,6-디플루오로-3-니트로페닐)메타논 제조
디메틸포름아미드(25 mL) 중 (5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-(2,6-디플루오로-3-니트로-페닐) 메타논 (2 g, 5.23 mmol, 1당량)의 용액에 2-(클로로메톡시)에틸-트리메틸-실란(1.05 g, 6.28 mmol, 1 mL, 1.2당량) 및 디이소프로필에틸아민(1.01 g, 7.85 mmol, 1 mL, 1.5당량)을 첨가하였다. 혼합물을 80℃에서 1.5시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 포화 염수(30 mL x 2)로 세척하고 에틸 아세테이트(50 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트=12/1 내지 10:1)로 정제하였다. 화합물 [5-브로모-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-3-일]-(2,6-디플루오로-3-니트로-페닐)메타논 (1.74 g, 3.40 mmol, 64 % 수율)을 황색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 513.9 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 8.87 (d, J=2.0 Hz, 1H), 8.52 (d, J=2.0 Hz, 1H), 8.28 (ddd, J=5.6, 8.4, 9.2 Hz, 1H), 7.70 (s, 1H), 7.20 (ddd, J=1.6, 7.2, 9.2 Hz, 1H), 5.68 (s, 2H), 3.63 - 3.55 (m, 2H), 0.96 - 0.87 (m, 2H), -0.04 - -0.06 (m, 9H).
단계 2: (3-아미노-2,6-디플루오로페닐)(5-브로모-1-((2-(트리메틸실릴)에톡시)메틸)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)메타논 제조
에틸 알코올(5 mL) 및 테트라하이드로푸란(5 mL) 및 물(5 mL) 중 [5-브로모-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b] 피리딘-3-일]-(2,6-디플루오로-3-니트로-페닐)메타논 (1.72 g, 3.36 mmol, 1당량)의 용액에 철(1.87 g, 33.57 mmol, 10당량) 및 염화암모늄(898 mg, 16.78 mmol, 0.6 mL, 5당량)을 첨가하였다. 혼합물을 80℃에서 5시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 여과하고, 염수(30 mL x 2)로 세척하고, 에틸 아세테이트(50 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르/에틸 아세테이트 =10/1 내지 4:1)로 정제하였다. 화합물 (3-아미노-2,6-디플루오로-페닐)-[5-브로모-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-3-일]메타논 (1.33 g, 2.56 mmol, 76% 수율, 93% 순도)을 황색 오일로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 484.1 [M+2] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 8.86 (d, J=2.0 Hz, 1H), 8.48 (d, J=2.4 Hz, 1H), 7.74 (s, 1H), 6.90 - 6.80 (m, 2H), 5.66 (s, 2H), 3.60 - 3.54 (m, 2H), 0.94 - 0.88 (m, 2H), -0.04 - -0.07 (m, 9H).
단계 3: (R)-N-(3-(5-브로모-1-((2-(트리메틸실릴)에톡시)메틸)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 제조
피리딘(15 mL) 중 (3-아미노-2,6-디플루오로-페닐)-[5-브로모-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸) 피롤로[2,3-b]피리딘-3-일]메타논 (985 mg, 1.90 mmol, 1당량) 용액에 디메틸아미노피리딘(464 mg, 3.80 mmol, 2당량) 및 (3R)-3-플루오로피롤리딘-1-설포닐클로라이드 (712 mg, 3.80 mmol, 2당량)을 첨가하였다. 혼합물을 50℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 포화 염수(30 mL x 2)로 세척하고 에틸 아세테이트(40 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 반-분취 역상 HPLC로 정제하였다. 포화 수성 중탄산 나트륨 용액을 첨가하여 pH를 9로 조정하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(50 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수(30 mL x 3)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 화합물 (3R)-N-[3-[5-브로모-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로-페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (210 mg, 0.33 mmol, 17 % 수율)를 무색 오일로서 수득하였다.1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 8.85 (d, J=2.0 Hz, 1H), 8.49 (d, J=2.4 Hz, 1H), 7.78 - 7.68 (m, 2H), 7.10 - 6.99 (m, 1H), 6.54 (s, 1H), 5.65 (s, 2H), 5.31 (s, 1H), 3.66 - 3.60 (m, 2H), 3.57 (d, J=8.4 Hz, 2H), 3.55 - 3.43 (m, 2H), 2.38 - 2.23 (m, 1H), 2.16 - 1.96 (m, 1H), 0.94 - 0.88 (m, 2H), -0.05 (s, 9H).
단계 4: (R)-N-(3-(5-브로모-1-((2-(트리메틸실릴)에톡시)메틸)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로-N-메틸피롤리딘-1-설폰아미드 제조
디메틸포름아미드(2 mL) 중 (3R)-N-[3-[5-브로모-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸) 피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로-페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (210 mg, 0.33 mmol, 1당량)의 용액에 디이소프로필에틸아민(64 mg, 0.50 mmol, 1.5당량) 및 요오드메탄(70 mg, 0.50 mmol, 1.5당량)을 첨가하였다. 혼합물을 50℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 포화 수성 염수(30 mL x 2)로 세척하고 에틸 아세테이트 (30 mL x 2)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 분취 - 박층 크로마토그래피(석유 에테르/에틸 아세테이트= 1:1, Rf=0.6)로 정제하였다. 화합물 (3R)-N-[3-[5-브로모-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로 [2,3-b]피리딘-3-카르보닐] -2,4-디플루오로-페닐]-3-플루오로-N-메틸-피롤리딘-1-설폰아미드 (165 mg, 0.25 mmol, 76% 수율)를 무색 오일로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 649.2 [M+2] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 8.85 (d, J=2.0 Hz, 1H), 8.49 (d, J=2.4 Hz, 1H), 7.74 (s, 1H), 7.66 (dt, J=6.0, 8.8 Hz, 1H), 7.08 - 7.01 (m, 1H), 5.65 (s, 2H), 5.34 - 5.14 (m, 1H), 3.71 - 3.64 (m, 1H), 3.64 - 3.59 (m, 2H), 3.59 - 3.53 (m, 2H), 3.53 - 3.47 (m, 1H), 3.25 (s, 3H), 2.39 - 2.06 (m, 2H), 0.95 - 0.88 (m, 2H), -0.06 (s, 9H).
단계 5: 삼차-부틸 (R)-2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-((3-플루오로-N-메틸피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1-((2-(트리메틸실릴)에톡시)메틸)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세테이트 제조
디옥산 (2 mL) 및 물(0.5 mL) 중 (3R)-N-[3-[5-브로모-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로 [2,3-b] 피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로-페닐]-3-플루오로-N-메틸-피롤리딘-1-설폰아미드 (165 mg, 0.25 mmol, 1당량), 삼차-부틸 2-[4-[[4-[4-(4,4,5,5-테트라메틸 -1,3,2-디옥사보로란 -2-일)페닐]피페라진-1-일] 메틸]-1-피페리딜]아세테이트 (152 mg, 0.30 mmol, 1.2당량), 불화 세슘(154 mg, 1.02 mmol, 4당량) 및 4-디삼차-부틸포스파닐 -N,N-디메틸-아닐린;디클로로팔라듐 (18 mg, 0.02 mmol, 0.1당량)의 혼합물을 탈기하고 질소로 3회 퍼지하고, 그런 다음, 혼합물을 질소 대기 하에 100℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 포화 수성 염수(15 mL x 2)로 세척하고 에틸 아세테이트 (30 mL x 2)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 준비된 분취 - 박층 크로마토그래피(디클로로메탄:메탄올 = 10:1, Rf=0.5)로 정제하였다. 화합물 삼차-부틸 2-[4-[[4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일] 설포닐-메틸-아미노]벤조일]-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]메틸]-1-피페리딜]아세테이트 (93 mg, 0.09 mmol, 38 % 수율)를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 940.5 [M] +.
단계 6: 메틸 (R)-2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-((3-플루오로-N-메틸피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세테이트 제조
메탄올 (2 mL) 중 삼차-부틸 2-[4-[[4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3- [[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일] 설포닐-메틸-아미노]벤조일]-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]메틸]-1-피페리딜]아세테이트 (93 mg, 0.10 mmol, 1당량)의 용액에 염산/디옥산 (4 M, 4 mL, 161.75당량)을 첨가하였다. 혼합물을 40℃에서 14시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 진공 중에서 농축하여 잔류물을 수득하였다. 화합물 메틸 2-[4-[[4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3- [[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐-메틸-아미노] 벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]메틸]-1-피페리딜]아세테이트 (120 mg, 미정제, 염화수소)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 768.1 [M+1] +.
단계 7: (R)-2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-((3-플루오로-N-메틸피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트산 제조
메탄올 (1 mL) 물(0.5 mL) 및 테트라하이드로푸란(1 mL) 중 메틸 2-[4-[[4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐 -메틸-아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]메틸]-1-피페리딜]아세테이트 (120 mg, 0.15 mmol, 1당량, 염화수소)의 용액에, 리튬 수화물(11 mg, 0.45 mmol, 3당량)을 첨가하였다. 혼합물을 20℃에서 1시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 진공 중에서 농축하여 잔류물을 수득하였다. 잔류물을 물 20 mL로 희석한 다음, 염산(1 M)으로 pH=5~6까지 산성화시켰다. 현탁액을 진공 중에서 농축하여 잔류물을 수득하였다. 화합물 2-[4-[[4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘- 1-일]설포닐-메틸-아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]메틸]-1-피페리딜]아세트산 (0.1 g, 미정제, 염화수소)을 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 754.3 [M+1] +.
단계 8: (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로-N-메틸피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
디메틸포름아미드 (2 mL) 중 2-[4-[[4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3- [[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐-메틸 -아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]메틸]-1-피페리딜]아세트산 (0.1 g, 0.13 mmol, 1당량, 염화수소)의 용액에 하이드록시벤조트리아졸(20 mg, 0.15 mmol, 1.2당량), 디이소프로필에틸아민 (49 mg, 0.38 mmol, 3당량) 및 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4- 메틸티아졸-5-일) 페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (59 mg, 0.13 mmol, 1당량, 염화수소)를 20℃에서 15분 넘게 첨가하였다. 첨가 후, 탄소 디메틸아민 염화수소(36 mg, 0.19 mmol, 1.5당량)를 첨가하였다. 생성된 혼합물을 35 ℃에서 1.75시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 포화 염수(25 mL x 2)로 세척하고 디클로로메탄(30mL x 2)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 반-분취 역상 HPLC로 정제하였다. 화합물 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[2-[4-[[4-[4-[3- [2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3- 플루오로피롤리딘-1-일] 설포닐-메틸-아미노]벤조일]-1H-피롤로 [2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]메틸]-1-피페리딜]아세틸]아미노]-3,3-디메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (19.1 mg, 0.01 mmol, 11% 수율, 100% 순도, 트리플루오로아세트산)을 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 583.8 [M/2+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.98 (s, 1H), 10.12 - 9.59 (m, 2H), 9.03 - 8.97 (m, 1H), 8.78 (d, J=8.4 Hz, 1H), 8.61 (d, J=6.0 Hz, 2H), 8.12 (s, 1H), 7.76 (dt, J=6.0, 8.8 Hz, 1H), 7.68 (d, J=8.8 Hz, 2H), 7.41 (q, J=8.4 Hz, 4H), 7.33 (t, J=8.8 Hz, 1H), 7.17 (d, J=8.8 Hz, 2H), 5.41 (s, 1H), 5.28 (s, 1H), 4.60 (d, J=9.2 Hz, 2H), 4.52 - 4.34 (m, 5H), 4.22 (dd, J=5.2, 15.6 Hz, 1H), 4.15 - 3.84 (m, 5H), 3.71 (d, J=7.2 Hz, 1H), 3.68 - 3.55 (m, 4H), 3.54 - 3.44 (m, 4H), 3.43 - 3.34 (m, 1H), 3.14 (s, 3H), 3.06 (s, 1H), 2.20 (d, J=6.4 Hz, 2H), 2.13 (d, J=7.6 Hz, 2H), 2.10 - 2.02 (m, 3H), 2.01 - 1.84 (m, 5H), 1.56 (s, 3H), 0.99 - 0.93 (m, 9H).
(2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((4-(4-(3-(2-플루오로-5-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드 (실시예 312)의 예시적인 합성
단계 1: 2-플루오로-5-니트로벤조일 클로라이드 제조
톨루엔(30 mL) 및 디메틸포름아미드(1.5 mL) 중 2-플루오로-5-니트로-벤조산 (5 g, 27 mmol, 1당량) 및 티오닐 클로라이드 (49 g, 413 mmol, 30 mL, 15당량)의 용액. 혼합물을 80℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 메탄올의 첨가로 급냉시켰다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축시켜 용매를 제거하였다. 화합물 2-플루오로-5-니트로-벤조일 클로라이드 (5.8 g, 미정제)를 황색 오일로서 수득하였다.
단계 2: (5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)(2-플루오로-5-니트로페닐)메타논 제조
1,2-디클로로에탄 (100 mL) 중 5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (5.86 g, 29.72 mmol, 1.1당량)의 용액에 알루미늄 트리클로라이드(23 g, 172.93 mmol, 9 mL, 6.4당량)를 나누어서 첨가하였다. 반응물을 20 ℃에서 1시간 동안 교반하고, 2-플루오로-5-니트로-벤조일 클로라이드 (5.5 g, 27.02 mmol, 1당량)을 첨가하였다. 혼합물을 50℃에서 추가 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 포화 수성 염수(35 mL x 2)로 세척하고 에틸 아세테이트 (50 mL x 3)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 감압 하에서 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 잔류물을 아세트산에틸(15 mL) 및 메탄올(15 mL)로 연화하여 정제하였다. 화합물 (5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-(2-플루오로-5-니트로-페닐)메타논 (2.11 g, 5.79 mmol, 21% 수율)을 갈색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 365.8 [M+1] +.
단계 3: (5-아미노-2-플루오로페닐)(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)메타논 제조
테트라하이드로푸란(10 mL) 및 에탄올(10 mL) 중 (5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-(2-플루오로-5-니트로-페닐)메타논 (2.11 g, 5.79 mmol, 1당량), 염산(12 M, 14.5 mL, 30당량), 철 분말(1.62 g, 28.97 mmol, 5당량), 염화 암모늄(930 mg, 17.38 mmol, 3당량)의 혼합물을 80℃에서 16시간 동안 교반하였다. 수성 수산화나트륨(1 M)을 첨가하여 pH=8~9를 조정하였다. (50 mL) 에틸 아세테이트를 첨가하고, 혼합물을 5분 동안 교반하였다. 혼합물을 여과하고 여과물을 에틸 아세테이트(50 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수로 세척하고(50 mL x 3), 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 석유 에테르 및 에틸 아세테이트 (30 mL, v: v=1:1)의 용액에 의해 슬러리화하였다. 생성물 (5-아미노-2-플루오로-페닐)-(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)메타논 (730 mg, 2.06 mmol, 35% 수율, 94% 순도)을 갈색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 333.9 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.93 (br s, 1H), 8.57 (d, J=2.4 Hz, 1H), 8.46 (d, J=2.4 Hz, 1H), 8.07 (d, J=1.6 Hz, 1H), 7.08 - 6.95 (m, 1H), 6.79 - 6.66 (m, 2H), 5.20 (s, 2H).
단계 4: (R)-N-(3-(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-4-플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 제조
피리딘(15 mL) 중 (5-아미노-2-플루오로-페닐)-(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일) 메타논 (680 mg, 2.04 mmol, 1당량) 및 (3R)-3-플루오로피롤리딘-1-설포닐클로라이드 (572 mg, 3.05 mmol, 1.5당량) 용액에 4-디메틸아미노피리딘 (49 mg, 0.4 mmol, 0.2당량)을 첨가하였다. 혼합물을 40℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 포화 수성 중탄산 나트륨으로 pH 8로 조정하였다. 물(100 mL)을 혼합물에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(100 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수로 세척하고(100 mL x 2), 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(디클로로메탄:메탄올 = 400:1 내지 10:1)로 정제하였다. 화합물 (3R)-N-[3- (5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-4-플루오로-페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (780 mg, 1.61 mmol, 78% 수율)를 갈색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 486.9 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 8.89 (s, 1H), 8.47 (s, 1H), 7.77 (s, 1H), 7.46 - 7.36 (m, 2H), 7.18 (t, J=9.2 Hz, 1H), 6.69 (s, 1H), 5.42 - 5.14 (m, 1H), 3.78 - 3.59 (m, 4H), 3.54 - 3.43 (m, 2H), 2.97 - 2.88 (m, 1H).
단계 5: 삼차-부틸 (R)-2-(4-((4-(4-(3-(2-플루오로-5-((3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세테이트 제조
물(1 mL) 및 디옥산 (10 mL) 중 (3R)-N-[3-(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-4-플루오로-페닐] -3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (430 mg, 0.88 mmol, 1당량) 및 삼차-부틸 2-[4-[[4-[4- (4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐]피페라진-1-일]메틸]-1-피페리딜]아세테이트 (442 mg, 0.88 mmol, 1당량) 용액에 4-디삼차-부틸포스파닐-N,N-디메틸-아닐린;디클로로팔라듐 (62 mg, 0.08 mmol, 0.1당량) 및 불화 세슘(538 mg, 3.54 mmol, 4당량)을 첨가하였다. 혼합물을 100℃에서 5시간 동안 교반하였다. 물(100 mL)을 혼합물에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(40 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수로 세척하고(100 mL x 2), 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 분취-박층 크로마토그래피(디클로로메탄:메탄올 = 10:1)로 정제하였다. 화합물 삼차-부틸 2-[4-[[4-[4-[3-[2-플루오로-5-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]메틸]-1-피페리딜]아세테이트 (260 mg, 0.30 mmol, 34% 수율, 92% 순도)를 갈색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 778.1 [M+1] +.
단계 6: (R)-2-(4-((4-(4-(3-(2-플루오로-5-((3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트산 제조
디옥산(10 mL) 중 삼차-부틸 2-[4-[[4-[4-[3-[2-플루오로-5-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일] 설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]메틸]-1-피페리딜]아세테이트 (200 mg, 0.25 mmol, 1당량)의 용액에 디옥산 중 4 M 염산(6.67 mL, 103.72당량)를 첨가하였다. 혼합물을 50℃에서 3시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축시켜 염산, 디옥산 및 디옥산을 제거하였다. 미정제 생성물은 추가 정제 없이 다음 단계에 사용되었다. 화합물 2-[4-[[4-[4-[3-[2-플루오로-5-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]메틸]-1-피페리딜]아세트산 (194 mg, 0.25 mmol, 99% 수율, 염화수소)을 황색 고체로서 수득하였다.
단계 7: (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((4-(4-(3-(2-플루오로-5-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
N,N-디메틸포름아미드 (3 mL) 중 2-[4-[[4-[4-[3-[2-플루오로-5-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일] 설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]메틸]-1-피페리딜]아세트산 (194 mg, 0.25 mmol, 1당량, 염화수소)의 용액에 트리에틸아민 (39 mg, 0.38 mmol, 1.5당량), 하이드록시벤조트리아졸 (41 mg, 0.30 mmol, 1.2당량), 1-(3-디메틸아미노프로필)-3-에틸카르보디이미드 염화수소 (74 mg, 0.38 mmol, 1.5당량) 및 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[[4- (4-메틸티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (119 mg, 0.25 mmol, 1당량, 염산)를 첨가하였다. 혼합물을 20℃에서 3시간 동안 교반하였다. 물(10 mL)을 혼합물에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 디클로로메탄(10 mL x 3)으로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수(10 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 반-분취 역상 HPLC로 정제하였다. 화합물 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[2-[4-[[4-[4-[3-[2-플루오로-5-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]메틸]-1-피페리딜]아세틸]아미노]-3,3-디메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (119 mg, 0.09 mmol, 38% 수율, 96% 순도, 포름산염)을 황색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 567.7 [M/2] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.91 (s, 1H), 9.00 (s, 1H), 8.65 - 8.55 (m, 3H), 8.19 (s, 1H), 7.97 (s, 1H), 7.81 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.59 (d, J=8.8 Hz, 2H), 7.45 - 7.40 (m, 4H), 7.40 - 7.31 (m, 3H), 7.06 (d, J=8.8 Hz, 2H), 5.34 (s, 1H), 5.21 (s, 1H), 4.50 (d, J=9.6 Hz, 1H), 4.47 - 4.41 (m, 1H), 4.41 - 4.32 (m, 2H), 4.30 - 4.24 (m, 1H), 3.71 - 3.54 (m, 2H), 3.47 (d, J=3.2 Hz, 2H), 3.18 (s, 5H), 3.05 - 2.87 (m, 3H), 2.83 (s, 2H), 2.52 (d, J=2.0 Hz, 3H), 2.45 (s, 3H), 2.25 - 1.85 (m, 10H), 1.81 - 1.69 (m, 2H), 1.55 (s, 1H), 1.23 - 1.09 (m, 2H), 0.99 - 0.91 (m, 9H).
(2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((4-(4-(3-(2-플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드 (실시예 313,)의 예시적인 합성
단계 1: (5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)(2-플루오로-3-니트로페닐)메타논 제조
디클로로메탄(100 mL) 중 2-플루오로-3-니트로-벤조산 (10 g, 54 mmol, 1당량)의 용액에 티오닐 클로라이드(14 g, 118.85 mmol, 8.6 mL, 2.2당량) 및 N,N-디메틸포름아미드(1 mL)를 첨가하였다. 혼합물을 60℃에서 12시간 동안 교반하였다. 혼합물을 농축시켰다. 2-플루오로-3-니트로-벤조일 클로라이드 (11 g, 미정제)를 황색 오일로서 수득하였다. 디클로로메탄(100 mL) 중 5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (11.7 g, 59.44 mmol, 1.1당량)의 용액에 알루미늄 트리클로라이드(46.1 g, 345.85 mmol, 6.4당량)를 첨가하였다. 그런 다음, 디클로로메탄(50 mL) 중 2-플루오로-3-니트로-벤조일 클로라이드 (11 g, 54.04 mmol, 1당량)의 용액을 혼합물에 첨가하였다. 혼합물을 60℃에서 12시간 동안 교반하였다. 혼합물에 물(300 mL)을 첨가하고 에틸 아세테이트(300 mL x 3)로 추출하였다. 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트 (30 mL)을 첨가하고 여과하여 원하는 생성물을 수득하였다. (5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-(2-플루오로-3-니트로-페닐) 메타논 (12 g, 32.96 mmol, 60% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 363.8 [M+1] +.
단계 2: (3-아미노-2-플루오로페닐)(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)메타논 제조
에탄올(50 mL) 및 테트라하이드로푸란(50 mL) 중 (5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-(2-플루오로-3-니트로-페닐)메타논 (6 g, 16.48 mmol, 1당량) 염화 암모늄(3 g, 57.67 mmol, 3.5당량), 철 (4.5 g, 80.74 mmol, 4.9당량) 염화수소 (12 M, 20 mL, 14.57당량)의 혼합물을 78 ℃에서 2시간 동안 교반하였다. 혼합물을 수산화나트륨(1M)을 pH=8까지 첨가하였다. 혼합물을 에틸 아세테이트(200 mL x 3)로 추출하였다. 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트(30 mL)로 연화하여 원하는 생성물을 수득하였다. (3-아미노-2-플루오로-페닐)-(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)메타논 (2.7 g, 8.08 mmol, 49% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 335.9 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 8.89 (d, J = 2.0 Hz, 1H), 8.47 (d, J = 2.0 Hz, 1H), 7.77 (d, J = 3.2 Hz, 1H), 7.08 - 7.02 (m, 1H), 6.99 - 6.86 (m, 2H), 3.89 (br s, 2H).
단계 3: (R)-N-(3-(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2-플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 제조
피리딘(7 mL) 중 (3-아미노-2-플루오로-페닐)-(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일) 메타논 (700 mg, 2.09 mmol, 1당량) 용액에 (3R)-3-플루오로피롤리딘-1-설포닐클로라이드 (589 mg, 3.14 mmol, 1.5당량) 및 4-디메틸아미노피리딘 (51 mg, 0.418 mmol, 0.2당량)을 첨가하였다. 혼합물을 40℃에서 12시간 동안 교반하였다. 혼합물에 포화 중탄산 나트륨(50 mL)을 첨가하고, 에틸 아세테이트(50 mL x 3)로 추출하였다. 유기층을 황산나트륨 상에서 건조시키고, 농축시켰다. 잔류물을 분취-TLC(디클로로메탄:메탄올 = 20:1)로 정제하였다. (3R)-N-[3-(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2-플루오로-페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (400 mg, 0.824 mmol, 39% 수율)를 황색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 486.9 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 11.12 (br s, 1H), 8.91 (d, J = 2.0 Hz, 1H), 8.52 - 8.44 (m, 1H), 7.86 - 7.72 (m, 2H), 7.38 - 7.31 (m, 1H), 7.13 - 6.94 (m, 1H), 5.36 - 5.14 (m, 1H), 3.68 - 3.58 (m, 2H), 3.57 - 3.46 (m, 2H), 2.36 - 2.22 (m, 1H), 2.18 - 1.97 (m, 1H).
단계 4: 삼차-부틸 (R)-2-(4-((4-(4-(3-(2-플루오로-3-((3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세테이트 제조
디옥산 (2 mL) 및 물(0.2 mL) 중 (3R)-N-[3-(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2-플루오로- 페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (100 mg, 0.20 mmol, 1당량) 및 삼차-부틸 2-[4-[[4-[4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐]피페라진-1-일]메틸]-1-피페리딜]아세테이트 (102 mg, 0.20 mmol, 1당량) 용액에 4-디삼차-부틸포스파닐-N,N-디메틸-아닐린;디클로로팔라듐 (29 mg, 0.041 mmol, 0.2당량) 및 불화 세슘(125 mg, 0.82 mmol, 4당량)을 첨가하였다. 혼합물을 110℃에서 6시간 동안 교반하였다. 혼합물에 물(30 mL x 3)을 첨가하고 에틸 아세테이트(30 mL x 3)로 추출하였다. 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 농축시켰다. 잔류물을 분취-TLC(디클로로메탄:메탄올 = 20:1)로 정제하였다. 삼차-부틸 2-[4-[[4-[4-[3-[2-플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일] 설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]메틸]-1-피페리딜]아세테이트 (40 mg, 0.038 mmol, 18% 수율, 74% 순도)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 778.5 [M+1] +.
단계 5: (R)-2-(4-((4-(4-(3-(2-플루오로-3-((3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트산 제조
디클로로메탄(5 mL) 중 삼차-부틸 2-[4-[[4-[4-[3-[2-플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일] 설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]메틸]-1-피페리딜]아세테이트 (100 mg, 0.128 mmol, 1당량) 용액에 염화수소/디옥산 (4 M, 7.50 mL)를 첨가하였다. 혼합물을 20℃에서 12시간 동안 교반하였다. 혼합물을 농축시켰다. 잔류물은 추가적인 정제 없이 다음 단계에 사용되었다. 2-[4-[[4-[4-[3-[2-플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일] -1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]메틸]-1-피페리딜]아세트산 (100 mg, 미정제, 염화수소)을 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 722.4 [M+1] +.
단계 6: (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((4-(4-(3-(2-플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
N,N-디메틸포름아미드 (2 mL) 중 2-[4-[[4-[4-[3-[2-플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노] 벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]메틸]-1-피페리딜]아세트산 (100 mg, 0.138 mmol, 1당량) 및 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸-부타노일]-4- 하이드록시-N-[[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (59 mg, 0.138 mmol, 1당량) 용액에 하이드록시벤조트리아졸 (22 mg, 0.166 mmol, 1.2당량) 트리에틸아민 (21mg, 0.207 mmol, 1.5당량) 및 1-(3-디메틸아미노프로필)-3-에틸카르보디이미드 염화수소 (39 mg, 0.207 mmol, 1.5당량)를 첨가하였다. 혼합물을 20℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 물(30 mL x 3)로 혼합물을 급냉시키고 디클로로메탄/메탄올 (10:1, 30 mL x 3)으로 추출하였다. 유기층을 황산나트륨 상에서 건조시키고, 농축시켰다. 잔류물을 분취-HPLC로 정제하였다. (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[2-[4-[[4-[4-[3-[2-플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]메틸]-1-피페리딜]아세틸]아미노]-3,3-디메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (5.9 mg, .0.04 mmol, 3.47% 수율, 100% 순도, 2 포름산)을 황색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 1134.4 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 9.00 (s, 1H), 8.63 (s, 2H), 8.56 (s, 1H), 8.25 (s, 2H), 7.92 (s, 1H), 7.82 (br d, J = 9.6 Hz, 1H), 7.67 - 7.56 (m, 3H), 7.48 - 7.38 (m, 4H), 7.35 - 7.23 (m, 2H), 7.06 (br d, J = 8.8 Hz, 2H), 5.37 - 5.20 (m, 1H), 4.54 - 4.21 (m, 7H), 3.63 (br d, J = 14.2 Hz, 1H), 3.18 (br s, 3H), 3.04 - 2.76 (m, 4H), 2.45 (br s, 7H), 2.23 - 1.85 (m, 12H), 1.82 - 1.69 (m, 2H), 1.56 (br s, 1H), 1.25 - 1.07 (m, 3H), 0.94 (s, 10H).
(2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((4-(4-(3-(2-클로로-6-플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드 (실시예 352)의 예시적인 합성
단계 1: 2-클로로-6-플루오로-3-니트로벤조산 제조
황산(100 mL) 중 2-클로로-6-플루오로-벤조산 (10 g, 57.29 mmol, 1당량)의 용액에 질산(7.22 g, 114.58 mmol, 5.16 mL, 2당량)을 0℃에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 20℃까지 가온시키고 1시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 얼음-물(1000 mL)에 붓고 10분 동안 교반한 다음 에틸 아세테이트(200 mL x 3)로 추출하였다. 유기층을 합치고 물(200 mL x 2) 및 염수(100 mL)로 세척하였다. 유기층을 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 2-클로로-6-플루오로-3-니트로-벤조산 (11.7 g, 53.29 mmol, 93% 수율)을 백색 고체로서 수득하였다.
단계 2: (5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)(2-클로로-6-플루오로-3-니트로페닐)메타논 제조
톨루엔(100 mL) 중 2-클로로-6-플루오로-3-니트로-벤조산 (11.3 g, 51.47 mmol, 1당량)의 용액에 설폭시드 클로라이드(30.62 g, 257.34 mmol, 5당량) 및 N,N-디메틸포름아미드(1 mL)를 첨가하였다. 혼합물을 110℃로 2시간 동안 가열하였다. 용매를 진공 중에서 제거하였다. 잔류물을 디클로로메탄(200 mL) 및 5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (11.15 g, 56.61 mmol, 1.1당량)에 용해시키고, 알루미늄 트리클로라이드(20.59 g, 154.40 mmol, 3당량)을 혼합물에 첨가하였다. 혼합물을 40℃로 3시간 동안 가열하였다. 용매를 진공 중에서 제거하고 잔류물을 얼음-물(500 mL)에 붓고 30분 동안 교반하였다. 혼합물을 테트라하이드로푸란(300 mL x 3)으로 추출하였다. 유기층을 염수(300 mL x 2)로 세척하고, 황산나트륨 상에서 건조시켰다. 혼합물을 여과하고, 여과물을 진공 중에서 농축시켰다. 미정제 생성물을 메탄올(50 mL)로 연화하여 (5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-(2-클로로-6-플루오로-3-니트로-페닐) 메타논 (9.3 g, 22.40 mmol, 43% 수율, 96% 순도)을 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 399.8 [M+1] +.
단계 3: (3-아미노-2-클로로-6-플루오로페닐)(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)메타논 제조
테트라하이드로푸란(60 mL) 및 에틸 알코올(60 mL) 중 (5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)-(2-클로로-6-플루오로-3-니트로-페닐) 메타논 (9.3 g, 23.33 mmol, 1당량)의 용액에 염산(12 M, 3.89 mL, 2당량), 염화 암모늄(3.74 g, 70.00 mmol, 3당량) 및 철 분말(6.52 g, 116.67 mmol, 5당량)을 첨가하였다. 혼합물을 80℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 포화 중탄산 나트륨 수용액으로 pH 8로 조정하였다. 반응 혼합물을 여과하고, 여과물을 농축시켰다. 물(100 mL)을 혼합물에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 테트라하이드로푸란(100 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수로 세척하고(100 mL x 2), 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 미정제 생성물을 석유 에테르:에틸 아세테이트 = 1:1(30 mL)로 연화하여 (3-아미노-2-클로로-6-플루오로-페닐)-(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일)메타논 (8.03 g, 21.13 mmol, 90% 수율, 97% 순도)을 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 369.8 [M+1] +.
단계 4: (R)-N-(3-(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2-클로로-4-플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 제조
피리딘(10 mL) 중 (3-아미노-2-클로로-6-플루오로-페닐)-(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일) 메타논 (1 g, 2.71 mmol, 1당량) 및 (3R)-3-플루오로피롤리딘-1-설포닐클로라이드 (610 mg, 3.26 mmol, 1.2당량)의 용액에 4-디메틸아미노피리딘 (66 mg, 0.54 mmol, 0.2당량)을 첨가하였다. 혼합물을 40℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 포화 수성 중탄산 나트륨으로 pH 8로 조정하였다. 물(100 mL)을 혼합물에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(100 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수로 세척하고(100 mL x 2), 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 분취 역상 HPLC로 정제하였다. 화합물 (3R)-N-[3-(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2-클로로-4-플루오로-페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (270 mg, 0.51 mmol, 19% 수율)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 521.1 [M+1] +.
단계 5: (R)-N-(3-(5-브로모-1-((2-(트리메틸실릴)에톡시)메틸)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2-클로로-4-플루오로페닐)-3-플루오로-N-((2-(트리메틸실릴)에톡시)메틸)피롤리딘-1-설폰아미드 제조
N,N-디메틸포름아미드(4.5 mL) 중 (3R)-N-[3-(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2-클로로- 4-플루오로-페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (410 mg, 0.78 mmol, 1당량)의 용액에 수소화 나트륨(78 mg, 1.97 mmol, 미네랄 오일 중 60%, 2.5당량)을 0℃에서 첨가하였다. 그런 다음 (2-(클로로메톡시)에틸)트리메틸실란(328 mg, 1.97 mmol, 2.5당량)을 15℃에서 혼합물에 첨가하였다. 혼합물을 0-15℃에서 12시간 동안 교반하였다. 이 혼합물에 포화 수성 염화 암모늄(10 mL)을 첨가하였다. 물(10 mL)을 혼합물에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(15 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수로 세척하고(15 mL x 2), 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 분취 역상 박층 크로마토그래피(석유 에테르/에틸 아세테이트=3/1)로 정제하였다. (3R)-N-[3-[5-브로모-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2-클로로-4-플루오로-페닐]-3-플루오로-N-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤리딘-1-설폰아미드 (330 mg, 0.42 mmol, 53% 수율)를 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 781.0 [M+1] +.
단계 6: 삼차-부틸 (R)-2-(4-((4-(4-(3-(2-클로로-6-플루오로-3-((3-플루오로-N-((2-(트리메틸실릴)에톡시)메틸)피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1-((2-(트리메틸실릴)에톡시)메틸)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세테이트 제조
디옥산 (5 mL) 및 물(0.5 mL) 중 (3R)-N-[3-[5-브로모-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘 -3-카르보닐]-2-클로로-4-플루오로-페닐]-3-플루오로-N-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤리딘-1-설폰아미드 (330 mg, 0.42 mmol, 1당량) 및 삼차-부틸 2-[4-[[4-[4-(4,4,5,5-테트라메틸- 1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐]피페라진-1-일]메틸]-1-피페리딜]아세테이트 (211 mg, 0.42 mmol, 1당량)의 용액에 4-디삼차-부틸포스파닐 -N,N-디메틸-아닐린;디클로로팔라듐 (29 mg, 0.04 mmol, 0.1당량) 및 불화 세슘(256 mg, 1.69 mmol, 4당량)을 첨가하였다. 혼합물을 90℃에서 3시간 동안 교반하였다. 물(100 mL)을 혼합물에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(50 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수로 세척하고(100 mL x 2), 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 분취-TLC(디클로로메탄:메탄올 = 10:1)로 정제하였다. 화합물 삼차-부틸 2-[4-[[4-[4-[3-[2-클로로-6-플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)아미노]벤조일]-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]메틸]-1-피페리딜]아세테이트 (340 mg, 0.28 mmol, 68% 수율, 91% 순도)를 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 537.8 [M/2+1] +.
단계 7: 메틸 (R)-2-(4-((4-(4-(3-(2-클로로-6-플루오로-3-((3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세테이트 제조
메탄올 (7 mL) 중 삼차-부틸 2-[4-[[4-[4-[3-[2-클로로-6-플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일] 설포닐-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)아미노]벤조일]-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]메틸]-1-피페리딜]아세테이트 (340 mg, 0.31 mmol, 1당량)의 용액에 염산/디옥산 (4 M, 14 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 40℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 미정제 생성물은 추가 정제 없이 다음 단계에 사용되었다. 메틸 2-[4-[[4-[4-[3-[2-클로로-6-플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]메틸]-1-피페리딜]아세테이트 (250 mg, 0.30 mmol, 97% 수율, 염화수소)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 770.1 [M+1] +.
단계 8: (R)-2-(4-((4-(4-(3-(2-클로로-6-플루오로-3-((3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트산 제조
물(3 mL), 테트라하이드로푸란 (8 mL) 및 메탄올 (8 mL) 중 메틸 2-[4-[[4-[4-[3-[2-클로로-6-플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일] 설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]메틸]-1-피페리딜]아세테이트 (250 mg, 0.30 mmol, 1당량, 염화수소)의 용액에, 수산화 리튬 일수화물 (78 mg, 1.86 mmol, 6당량)을 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 2시간 동안 교반하였다. 수산화 나트륨(24 mg, 0.61 mmol, 2당량)을 혼합물에 첨가하고, 혼합물을 40℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 여과하고 감압 하에 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 그런 다음 반응 혼합물을 염산(1M)으로 pH를 7로 조정하였다. 잔류물을 분취 역상 HPLC로 정제하였다. 화합물 2-[4-[[4-[4-[3-[2-클로로-6-플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]메틸]-1-피페리딜]아세트산 (100 mg, 0.12 mmol, 80% 수율, 포름산염)을 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 756.1 [M+1] +.
단계 9: (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((4-(4-(3-(2-클로로-6-플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
N,N-디메틸포름아미드 (3 mL) 중 2-[4-[[4-[4-[3-[2-클로로-6-플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일] 설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]메틸]-1-피페리딜]아세트산 (100 mg, 0.12 mmol, 1당량, 포름산염) 및 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3- 디메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (58 mg, 0.12 mmol, 1당량, 염화수소)의 용액에 하이드록시벤조트리아졸 (20 mg, 0.14 mmol, 1.2당량) 및 트리에틸아민 (18 mg, 0.18 mmol, 1.5당량)을 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 1-(3-디메틸아미노프로필)-3- 에틸카르보디이미드 염화수소 (28 mg, 0.14 mmol, 1.2당량)를 혼합물에 첨가하고, 혼합물을 15℃에서 11.5h 동안 교반하였다. 물(30 mL)을 혼합물에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 디클로로메탄(10 mL x 3)으로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 분취 역상 HPLC로 정제하였다. 화합물 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[2-[4-[[4-[4- [3-[2-클로로-6-플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]메틸]-1-피페리딜]아세틸]아미노]-3,3-디메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (72.1 mg, 0.05 mmol, 45% 수율, 100% 순도, 2 포름산염)을 황색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 1168.4 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 13.04 - 12.70 (m, 1H), 9.00 (s, 1H), 8.66 - 8.61 (m, 2H), 8.17 (s, 1H), 8.19 - 8.15 (m, 1H), 7.98 (s, 1H), 7.83 (d, J=9.6 Hz, 1H), 7.66 (dd, J=6.0, 8.8 Hz, 1H), 7.58 (d, J=7.6 Hz, 2H), 7.48 - 7.30 (m, 6H), 7.06 (d, J=8.0 Hz, 2H), 5.37 - 5.21 (m, 1H), 4.50 (d, J=9.2 Hz, 1H), 4.48 - 4.40 (m, 2H), 4.37 (d, J=6.4 Hz, 2H), 4.32 - 4.23 (m, 2H), 3.70 - 3.57 (m, 1H), 3.46 (s, 4H), 3.19 (s, 2H), 3.02 (d, J=16.0 Hz, 3H), 2.94 - 2.79 (m, 3H), 2.21 - 2.02 (m, 13H), 1.90 (s, 2H), 1.73 (d, J=14.8 Hz, 2H), 1.55 (s, 1H), 1.22 - 1.10 (m, 2H), 0.95 (s, 9H).
(2S,4R)-1-((S)-2-(3-(3-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)프로필)우레이도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 (실시예 366)의 예시적인 합성
단계 1: 벤질 (3,3-디메톡시프로필)카바메이트 제조
메탄올 (10 mL) 중 벤질 N-(3-옥소프로필)카바메이트 (1 g, 4.83 mmol, 1당량) 용액에 p-메틸벤젠 설폰산 (166 mg, 0.96 mmol, 0.2당량) 및 트리메톡시메탄(2.56 g, 24.1 mmol, 2.6 mL, 5당량)을 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물(15 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(10 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 포화 염수(10 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르: 에틸 아세테이트 = 20:1 내지 5:1)로 정제하여 벤질 N-(3,3-디메톡시프로필)카바메이트 (1.1 g, 4.34 mmol, 89% 수율)를 황색 오일로서 수득하였다.
단계 2: 3,3-디메톡시프로판-1-아민 제조
테트라하이드로푸란(15 mL) 중 벤질 N-(3,3-디메톡시프로필)카바메이트 (1 g, 3.95 mmol, 1당량)의 용액에, 질소 대기 하에, 활성 탄소 상 팔라듐 촉매(300 mg, 10%, 1.00당량)을 첨가하였다. 현탁액을 탈기하고 수소로 3회 퍼지하였다. 혼합물을 수소 하(15 Psi) 15℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 여과하고 필터를 농축시켜 3,3-디메톡시프로판-1-아민(340 mg, 2.85 mmol, 72% 수율)을 무색 오일로서 수득하였다.1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 4.48 (t, J=5.6 Hz, 1H), 3.34 (s, 6H), 2.79 (t, J=6.4 Hz, 2H), 1.77 (q, J=6.4 Hz, 2H), 1.21 ( s, 2H).
단계 3: (2S,4R)-1-((S)-2-(3-(3,3-디메톡시프로필)우레이도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
테트라하이드로푸란(4 mL) 중 3,3-디메톡시프로판-1-아민 (240 mg, 2.01 mmol, 1당량)의 용액에 N,N-카르보닐디이미다졸 (490 mg, 3.02 mmol, 1.5당량) 및 트리에틸아민(407 mg, 4.03 mmol, 0.56 mL, 2당량)을 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 4시간 동안 교반하였다. 테트라하이드로푸란(4 mL) 중 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4- 메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (484 mg, 1.01 mmol, 0.5당량, 염화수소)의 용액을 혼합물에 적가하고, 혼합물을 40℃에서 12시간 동안 추가로 교반하였다. 반응 혼합물을 물(20 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(10 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 포화 염수(10 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피(디클로로메탄:메탄올 = 100:1 내지 30:1)로 정제하여 (2S,4R)-1-[(2S)-2-(3,3- 디메톡시프로필카바모일아미노)-3,3-디메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (380 mg, 0.65 mmol, 31% 수율)를 백색 고체로서 수득하였다.
단계 4: (2S,4R)-1-((S)-3,3-디메틸-2-(3-(3-옥소프로필)우레이도)부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
테트라하이드로푸란(30 mL) 중 (2S,4R)-1-[(2S)-2-(3,3-디메톡시프로필카바모일아미노)-3,3-디메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사아미드(200 mg, 0.33 mmol, 1당량) 용액에 황산(2 M, 6.8 mL, 40당량)을 첨가하였다. 혼합물을 60℃에서 10분 동안 교반하였다. 포화 중탄산나트륨 및 물(15 mL)로 반응 혼합물을 pH 8~9로 조정한 다음, 혼합물을 에틸 아세테이트(10 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 포화 염수(10 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켜 미정제 생성물 (2S,4R)-1-[(2S)-3,3-디메틸-2-(3- 옥소프로필카바모일아미노)부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (180 mg, 미정제)를 백색 고체로 수득하였으며 추가 정제 없이 다음 단계에 사용되었다.
단계 5: 삼차-부틸 4-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)피페라진-1-카르복실레이트 제조
디옥산 (15 mL) 중 4,4,5,5-테트라메틸-2-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일) -1,3,2-디옥사보로란 (893 mg, 3.52 mmol, 1.2당량), 삼차-부틸 4-(4-브로모페닐)피페라진- 1-카르복실레이트 (1 g, 2.93 mmol, 1당량), 아세트산칼륨(575 mg, 5.86 mmol, 2당량) 및 [1,1'-비스(디페닐포스피노)페로센]디클로로팔라듐(ii) (214 mg, 0.29 mmol, 0.1당량)의 혼합물을 탈기하고 질소로 3회 퍼지한 다음, 혼합물을 질소 분위기 하에 90℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 여과시키고, 포화 수성 염수(30 mL x 3)로 세척하고 에틸 아세테이트 (50 mL x 3)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르/에틸 아세테이트=15/1 내지 5:1)로 정제하였다. 화합물 삼차-부틸 4-[4-(4,4,5, 5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐]피페라진-1-카르복실레이트 (1.07 g, 2.59 mmol, 88% 수율, 94% 순도)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 389.3 [M+1] +.
단계 6: 삼차-부틸 (R)-4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-((3-플루오로-N-((2-(트리메틸실릴)에톡시)메틸)피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1-((2-(트리메틸실릴)에톡시)메틸)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-카르복실레이트 제조
디옥산 (10 mL) 및 물(2 mL) 중 삼차-부틸 4-[4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐]피페라진 -1-카르복실레이트 (1.07 g, 2.59 mmol, 1당량), (3R)-N-[3-[5-브로모-1-(2- 트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로-페닐]-3-플루오로-N-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤리딘-1-설폰아미드 (2.2 g, 2.88 mmol, 1.11당량) , 4-디삼차-부틸포스파닐-N,N-디메틸-아닐린;디클로로팔라듐 (183 mg, 0.26 mmol, 0.2 mL, 0.1당량) 및 불화 세슘(1.57 g, 10.35 mmol, 0.4 mL, 4당량)의 혼합물을 탈기하고 질소로 3회 퍼지하고, 그런 다음 혼합물을 질소 대기 하에 100℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물(30 mL)에 붓고 에틸 아세테이트(50 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르/에틸 아세테이트=15:1 내지 2:1)로 정제하였다. 화합물 삼차-부틸 4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일] 설포닐-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)아미노]벤조일]-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-카르복실레이트 (1.54 g, 1.59 mmol, 62% 수율, 97% 순도)를 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 945.2 [M] +.
단계 7: (R)-N-(2,4-디플루오로-3-(5-(4-(피페라진-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 제조
디클로로메탄(5 mL) 중 삼차-부틸 4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일] 설포닐-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)아미노]벤조일]-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-카르복실레이트 (1.54 g, 1.59 mmol, 1당량)의 용액에 염산/디옥산 (4 M, 15 mL, 37.85당량을 첨가하였다. 혼합물을 40℃에서 4시간 동안 교반하였다. 그런 다음, 메틸 알코올(5 mL)을 첨가하고, 혼합물을 40℃에서 12시간 동안 추가로 교반하였다. 반응 혼합물을 진공 중에서 농축하여 잔류물을 수득하였다. 화합물 (3R)-N-[2,4-디플루오로-3-[5-(4-피페라진-1-일페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (1.22 g, 미정제, 2 염화수소)를 황색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 585.1 [M] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.98 (s, 1H), 9.87 (s, 1H), 9.18 (s, 2H), 8.67 (d, J=2.4 Hz, 1H), 8.57 (s, 1H), 8.08 (s, 1H), 7.66 (d, J=8.8 Hz, 2H), 7.27 (t, J=8.8 Hz, 1H), 7.14 (d, J=8.8 Hz, 2H), 5.39 - 5.21 (m, 1H), 3.64 (s, 1H), 3.61 - 3.55 (m, 1H), 3.49 - 3.43 (m, 6H), 3.40 (s, 3H), 3.24 (s, 5H).
단계 8: (2S,4R)-1-((S)-2-(3-(3-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)프로필)우레이도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
1,2-디클로로에탄 (5 mL) 중 (2S,4R)-1-[(2S)-3,3-디메틸-2-(3-옥소프로필카바모일아미노)부타노일]- 4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (140 mg, 0.25 mmol, 1당량)의 용액에 트리에틸아민 (78 mg,0.77 mmol, 3당량) 및 (3R)-N-[2,4-디플루오로-3-[5-(4-피페라진-1-일페닐)-1H-피롤로[2,3-b] 피리딘-3-카르보닐]페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (160 mg, 0.25 mmol, 1당량, 염화수소)를 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 이어서, 나트륨 트리아세톡시보로히드라이드(109 mg, 0.51 mmol, 2당량)을 혼합물에 첨가하고 15℃에서 3시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물(10 mL)로 희석시키고 디클로로메탄(10 mL x 2)으로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 포화 염수(5 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 반-분취 역상 HPLC로 정제하여 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[3-[4-[4-[3-[2,6- 디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]프로필카바모일아미노]-3,3-디메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (89.5 mg, 0.07 mmol, 30% 수율, 100% 순도, 포름산염)를 백색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 1112.3 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.90 (s, 1H), 8.97 (s, 1H), 8.65 (d, J=2.0 Hz, 1H), 8.53 (s, 1H), 8.36 (d, J=7.6 Hz, 1H), 8.19 (s, 1H), 8.05 (s, 1H), 7.66 - 7.56 (m, 3H), 7.46 - 7.41 (m, 2H), 7.40 - 7.35 (m, 2H), 7.25 (t, J=8.0 Hz, 1H), 7.12 - 7.01 (m, 2H), 6.15 (t, J=5.6 Hz, 1H), 6.08 (d, J=9.6 Hz, 1H), 5.38 - 5.19 (m, 1H), 4.91 (q, J=7.2 Hz, 1H), 4.44 (t, J=8.0 Hz, 1H), 4.35 - 4.26 (m, 2H), 3.66 - 3.57 (m, 2H), 3.48 (s, 1H), 3.43 - 3.36 (m, 2H), 3.33 - 3.27 (m, 1H), 3.26 - 3.12 (m, 5H), 3.11 - 2.97 (m, 2H), 2.55 - 2.53 (m, 2H), 2.45 (s, 3H), 2.35 (br t, J=7.2 Hz, 2H), 2.15 - 1.94 (m, 3H), 1.80 (ddd, J=4.8, 8.4, 12.8 Hz, 1H), 1.62 - 1.53 (m, 2H), 1.38 (d, J=7.2 Hz, 3H), 1.00 (s, 2H), 0.93 (s, 9H).
(2S,4R)-1-(4-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 (실시예 440)의 예시적인 합성
단계 1: 메틸 4,4-디메톡시-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노에이트 제조
디메틸 포름아미드(10 mL) 중 메틸 2-(3-메틸이속사졸-5-일)아세테이트 (1 g, 6.45 mmol, 1당량)의 용액에 칼륨 삼차-부톡시드(867 mg, 7.73 mmol, 1.2당량)를 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 30분 동안 교반한 후, 2-브로모-1,1-디메톡시-에탄(1.31 g, 7.73 mmol, 1.2당량)을 첨가하였다. 생성된 혼합물을 15℃에서 또 다른 1.5시간 동안 교반하였다. 혼합물을 50℃로 가열하고 50℃에서 또다른 1시간 동안 교반하였다. 혼합물을 100 mL 염수에 붓고 2.0 M 염산으로 pH를 5.0으로 조정하였다. 혼합물을 에틸 아세테이트(50 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(50 mL x 2)로 세척하고, 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트= 10:1 내지 5:1)로 추가로 정제하여, 메틸 4,4-디메톡시-2- (3-메틸이속사졸-5-일)부타노에이트 (620 mg, 1.53 mmol, 23% 수율, 60% 순도)를 무색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 244.1 [M+1] +.
단계 2: 2-(3-메틸이속사졸-5-일)-4-옥소부탄산 제조
디옥산(2 mL) 중 메틸 4,4-디메톡시-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노에이트 (0.4 g, 1.64 mmol, 1당량)의 용액에 황산(2 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 50℃로 가열하고 50℃에서 2시간 동안 교반하였다. 혼합물을 20 mL 염수에 붓고, 2.0 M 염산으로 pH를 4.0으로 조정하였다. 혼합물을 에틸 아세테이트(30 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물은 추가적인 정제 없이 다음 단계에 직접 사용되었다. 2-(3-메틸이속사졸-5-일)-4-옥소- 부탄산 (340 mg, 미정제)을 무색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 184.1 [M+1] +.
단계 3: 4-(4-(삼차-부톡시카르보닐)피페라진-1-일)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부탄산 제조
메탄올(3 mL)과 디클로로메탄(1 mL)의 혼합물 중 2-(3-메틸이속사졸-5-일)-4-옥소-부탄산 (330 mg, 1.80 mmol, 1당량) 및 삼차-부틸 피페라진-1-카르복실레이트 (335 mg, 1.80 mmol, 1당량)의 용액에 아세트산(10 mg, 0.18 mmol, 0.1당량)을 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 30분 동안 교반하고 나서, 나트륨 시아노보로히드라이드(169 mg, 2.70 mmol, 1.5당량)를 혼합물에 첨가하였다. 생성된 혼합물을 15℃에서 또 다른 30분 동안 교반하였다. 혼합물을 물(20 mL)에 붓고, 포화 중탄산 나트륨 용액으로 pH를 8.0로 조정하였다. 그런 다음 혼합물을 에틸 아세테이트(20 mL)로 추출하고, 유기층을 폐기했다. 수성층을 2.0 M 황산으로 pH~4.0까지 조정하고, 에틸 아세테이트(30 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물은 추가적인 정제 없이 다음 단계에 직접 사용되었다. 4-(4-삼차-부톡시카르보닐피페라진-1-일)-2-(3-메틸이속사졸-5-일) 부탄산 (320 mg, 미정제)을 무색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 354.1 [M+1] +.
단계 4: 삼차-부틸 4-(4-((2S,4R)-4-하이드록시-2-(((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)카바모일)피롤리딘-1-일)-3-(3-메틸이속사졸-5-일)-4-옥소부틸)피페라진-1-카르복실레이트 제조
디메틸 포름아미드 (4 mL) 중 4-(4-삼차-부톡시카르보닐피페라진-1-일)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부탄산 (300 mg, 0.84 mmol, 1당량), 하이드록시벤조트리아졸 (137 mg, 1.02 mmol, 1.2당량) 및 탄소 디일아민 염화수소. (244 mg, 1.27 mmol, 1.5당량) 용액에 (2S,4R)-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘- 2-카르복사미드 (312 mg, 0.84 mmol, 1당량, 염화수소) 및 디이소프로필에틸아민 (219 mg, 1.70 mmol, 2당량)을 첨가하였다. 혼합물을 20℃에서 2시간 동안 교반하였다. 혼합물을 30 ml 포화 염수에 붓고, 에틸 아세테이트(30 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(30 mL x 3)로 세척하고, 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 분취-HPLC로 추가로 정제하고, 분획을 중탄산나트륨 용액으로 중화하고, 에틸 아세테이트(50 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 포화 염수(30 mL x 3)로 세척하고, 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 삼차-부틸 4-[4-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-[[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸- 5-일)페닐]에틸]카바모일]피롤리딘-1-일]-3-(3-메틸이속사졸-5-일)-4-옥소-부틸]피페라진-1-카르복실레이트 (180 mg, 0.27 mmol, 31% 수율)를 회백색 고체로서 수득하였다.1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 8.99 (s, 1H), 8.46 - 8.35 (m, 1H), 7.47 - 7.28 (m, 4H), 6.28 - 6.21 (s, 1H), 5.14 (d, J=3.6 Hz, 1H), 5.02 - 4.84 (m, 1H), 4.44 (t, J=7.6 Hz, 1H), 4.32 - 4.09 (m, 2H), 3.63 - 3.57 (m, 1H), 3.55 - 3.35 (m, 2H), 3.30 (s, 3H), 2.52 (s, 2H), 2.47 - 2.45 (m, 3H), 2.31 - 2.25 (m, 4H), 2.21 - 2.16 (m, 3H), 2.12 - 2.00 (m, 2H), 1.95 - 1.86 (m, 1H), 1.84 - 1.74 (m, 1H), 1.45 - 1.30 (m, 12H).
단계 5: (2S,4R)-4-하이드록시-1-(2-(3-메틸이속사졸-5-일)-4-(피페라진-1-일)부타노일)-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
디클로로메탄 (2 mL) 중 삼차-부틸 4-[4-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-[[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일) 페닐]에틸]카바모일]피롤리딘-1-일]-3-(3-메틸이속사졸-5-일)-4-옥소-부틸]피페라진-1-카르복실레이트 (80 mg, 0.12 mmol, 1당량)의 용액에 염화수소/메탄올 (4 M, 5 mL, 166.71당량)을 첨가하였고, 혼합물을 15℃에서 1시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 진공 중에서 농축하여 잔류물을 수득하였다. 미정제 생성물은 추가 정제 없이 다음 단계에 사용되었다. 생성물 (2S,4R)-4-하이드록시-1-[2-(3-메틸이속사졸-5-일)-4-피페라진-1-일-부타노일]-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (70 mg, 0.12 mmol, 97% 수율, HCl)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 567.2 [M+1] +.
단계 6: (2S,4R)-1-(4-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
디클로로메탄(2 mL) 및 메탄올 (3 mL) 중 (2S,4R)-4-하이드록시-1-[2-(3-메틸이속사졸-5-일)-4-피페라진-1-일- 부타노일]-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (98 mg, 0.16 umol, 1당량, 염화수소) 및 아세트산 나트륨(40 mg, 0.49 mmol, 3당량)의 용액을 25℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 그런 다음, (3R)-N-[2,4-디플루오로-3-[5-[4-(4-포르밀-1-피페리딜)페닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (100 mg, 0.16 mmol, 1당량) 및 아세트산 (9 mg, 0.16 mmol, 1당량)을 첨가하고 0.5시간 동안 교반하였다. 이어서, 나트륨 시아노보로히드라이드(30 mg, 0.49 mmol, 3당량)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 25℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 분취-HPLC로 정제하였다. 잔류물을 분취-TLC(디클로로메탄:메탄올 = 10:1)로 정제하였다. (2S,4R)-1-[4-[4-[[1-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-4-피페리딜]메틸]피페라진-1-일]-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (59 mg, 51.02 umol, 31% 수율, 99% 순도)를 황색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 1165.3 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.89 (s, 1H), 9.03 - 8.94 (m, 1H), 8.64 (s, 1H), 8.53 (s, 1H), 8.44 - 8.28 (m, 1H), 8.06 (s, 1H), 7.68 - 7.53 (m, 3H), 7.50 - 7.22 (m, 6H), 7.06 (d, J=8.8 Hz, 2H), 6.30 - 6.18 (m, 1H), 5.43 - 5.10 (m, 2H), 4.98 - 4.87 (m, 1H), 4.52 - 4.37 (m, 1H), 4.30 (d, J=4.0 Hz, 1H), 4.24 - 4.12 (m, 1H), 3.95 - 3.72 (m, 3H), 3.63 - 3.51 (m, 2H), 3.44 (s, 6H), 2.72 (t, J=11.6 Hz, 2H), 2.46 (d, J=1.6 Hz, 4H), 2.45 - 2.25 (m, 10H), 2.22 - 2.19 (m, 2H), 2.18 - 1.95 (m, 9H), 1.88 - 1.62 (m, 5H), 1.39 - 1.33 (m, 5H), 1.24 - 1.19 (m, 2H).
(2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-(4-(4-(3-(3-((N-에틸-N-메틸설파모일)아미노)-2,6-디플루오로벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 (실시예 480)의 예시적인 합성
단계 1: 에틸(메틸)설파모일 클로라이드 제조
디클로로메탄(8 mL) 중 N-메틸에탄아민(500 mg, 8.46 mmol, 1당량) 및 트리에틸아민(856 mg, 8.46 mmol, 1.18 mL, 1당량)의 용액에. 그 후 디클로로메탄 (3 mL) 중 설퍼릴 클로라이드 (1.14 g, 8.46 mmol, 1당량)을 0℃에서 혼합물에 첨가하였다. 혼합물을 0℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응물을 얼음 염산(1N, 30 mL)에 부었다. 합쳐진 유기상을 염수(50 mL x 1) 및 염산(1N, 20 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 미정제 생성물은 추가 정제 없이 다음 단계에 사용되었다. 화합물 N-에틸-N-메틸-설파모일 클로라이드 (1 g, 미정제)를 무색 오일로서 수득하였다.
단계 2: [(3-{5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로페닐]설파모일](에틸)메틸아민 제조
피리딘(5 mL) 중 (3-아미노-2,6-디플루오로-페닐)-(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일) 메타논 (1.19 g, 3.38 mmol, 1당량) 용액에 4- 디메틸아미노피리딘 (82 mg, 0.67 mmol, 0.2당량) 및 N-에틸-N-메틸-설파모일 클로라이드 (800 mg, 5.08 mmol, 1.5당량)을 첨가하였다. 혼합물을 40℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 포화 수성 중탄산 나트륨으로 pH 8로 조정하였다. 물(100 mL)을 혼합물에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(100 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수로 세척하고(100 mL x 2), 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 분취-HPLC로 정제하였다. 화합물 5-브로모-3-[3-[[에틸(메틸)설파모일]아미노]-2,6-디플루오로-벤조일] -1H-피롤로[2,3-b]피리딘 (550 mg, 1.16 mmol, 34% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 474.9 [M+1] +.
단계 3: {[3-(5-브로모-1-{[2-(트리메틸실릴)에톡시]메틸}-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐]({[2-(트리메틸실릴)에톡시]메틸})설파모일}(에틸)메틸아민 제조
N,N-디메틸포름아미드(6 mL) 중 5-브로모-3-[3-[[에틸(메틸)설파모일]아미노]-2,6-디플루오로-벤조일]-1H -피롤로[2,3-b]피리딘 (550 mg, 1.16 mmol, 1당량)의 용액에 수소화 나트륨(139 mg, 3.49 mmol, 60% 순도, 3당량) 및 (2-(클로로메톡시)에틸)트리메틸실란 (484 mg, 2.91 mmol, 2.5당량)을 첨가하였다. 혼합물을 40℃에서 12시간 동안 교반하였다. 물(100 mL)을 혼합물에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(70 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수로 세척하고(100 mL x 2), 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트=1:0 내지 20:1)로 정제하였다. 화합물 [5-브로모-1-(2- 트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b] 피리딘-3-일]-[3-[[에틸(메틸)설파모일]-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)아미노]-2,6-디플루오로-페닐]메타논 (550 mg, 0.74 mmol, 64% 수율)을 연황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 734.8 [M+1] +.
단계 4: 삼차-부틸 2-(4-(4-(4-(3-(3-((N-에틸-N-메틸설파모일)((2-(트리메틸실릴)에톡시)메틸)아미노)-2,6-디플루오로벤조일)-1-((2-(트리메틸실릴)에톡시)메틸)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)피페리딘-1-일)아세테이트 제조
디옥산 (3 mL) 및 물(0.3 mL) 중 [5-브로모-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-3-일]- [3-[[에틸(메틸)설파모일]-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)아미노]-2,6-디플루오로-페닐]메타논 (350 mg, 0.47 mmol, 1당량) 및 삼차-부틸 2-[4-[4-[4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2- 디옥사보로란-2-일)페닐]피페라진-1-일]-1-피페리딜]아세테이트 (231 mg, 0.47 mmol, 1당량)의 용액에 불화 세슘(289 mg, 1.91 mmol, 4당량) 및 4-디삼차-부틸포스파닐-N,N-디메틸-아닐린;디클로로팔라듐 (33 mg, 0.04 mmol, 0.1당량)을 첨가하였다. 혼합물을 90℃에서 3시간 동안 교반하였다. 물(80 mL)을 혼합물에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(40 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수로 세척하고(100 mL x 2), 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트=1:0 내지 5:1) 화합물 삼차-부틸 2-[4-[4-[4-[3-[3- [[에틸(메틸)설파모일]-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)아미노]-2,6-디플루오로-벤조일]-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]-1-피페리딜]아세테이트 (250 mg, 0.24 mmol, 51% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 506.3 [M/2] +.
단계 5: 메틸 2-(4-(4-(4-(3-(3-((N-에틸-N-메틸설파모일)아미노)-2,6-디플루오로벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)피페리딘-1-일)아세테이트 제조
메탄올(2 mL) 중 삼차-부틸 2-[4-[4-[4-[3-[3-[[에틸(메틸)설파모일]-(2- 트리메틸실릴에톡시메틸)아미노]-2,6-디플루오로-벤조일]-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]-1-피페리딜]아세테이트 (250 mg, 0.24 mmol, 1당량)의 용액에 염산/디옥산 (4 M, 10 mL, 161.98당량)을 첨가하였다. 혼합물을 40℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 미정제 생성물은 추가 정제 없이 다음 단계에 사용되었다. 화합물 메틸 2-[4-[4-[4-[3-[3-[[에틸(메틸)설파모일]아미노]-2,6-디플루오로-벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]-1-피페리딜]아세테이트 (175 mg, 미정제)를 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 701.1 [M/2+1] +.
단계 6: 2-(4-(4-(4-(3-(3-((N-에틸-N-메틸설파모일)아미노)-2,6-디플루오로벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)피페리딘-1-일)아세트산 제조
테트라하이드로푸란(2 mL), 메탄올(2 mL) 및 물(1 mL) 중 메틸 2-[4-[4-[4-[3-[3-[[에틸(메틸)설파모일]아미노]-2,6-디플루오로- 벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]-1-피페리딜]아세테이트 (175 mg, 0.24 mmol, 1당량)의 용액에, 수산화 리튬 일수화물 (41 mg, 0.98 mmol, 4당량)을 첨가하였다. 혼합물을 40℃에서 1시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 반응 혼합물을 염산(1M)으로 pH 7로 조정하였다. 여과에 의해 침전물을 수집하였다. 미정제 생성물은 추가 정제 없이 다음 단계에 사용되었다. 화합물 2-[4-[4-[4- [3-[3-[[에틸(메틸)설파모일]아미노]-2,6-디플루오로-벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]-1-피페리딜]아세트산 (100 mg, 0.14 mmol, 58% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 696.1 [M+1] +.
단계 7: (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-(4-(4-(3-(3-((N-에틸-N-메틸설파모일)아미노)-2,6-디플루오로벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
N,N-디메틸포름아미드 (2 mL) 중 2-[4-[4-[4-[3-[3-[[에틸(메틸)설파모일]아미노]-2,6-디플루오로-벤조일]-1H- 피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]-1-피페리딜]아세트산 (100 mg, 0.14 mmol, 1당량) 및 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4- 메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (69 mg, 0.14 mmol, 1.00당량, 염화수소) 용액에 하이드록시벤조트리아졸 (23 mg, 0.17 mmol, 1.2당량), 트리에틸아민 (22 mg, 0.21 mmol, 1.5당량) 및 1-(3-디메틸아미노프로필)-3-에틸카르보디이미드 염화수소(33 mg, 0.17 mmol, 1.2당량)를 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 12시간 동안 교반하였다. 물(50 mL)을 혼합물에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 디클로로메탄(20 mL x 3)으로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수(20 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 분취-HPLC로 정제하였다. 화합물 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[2-[4-[4-[4-[3-[3-[[에틸(메틸)설파모일]아미노]-2,6-디플루오로-벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]-1-피페리딜]아세틸]아미노]-3,3-디메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (105.2 mg, 0.093 mmol, 65% 수율, 100% 순도)을 황색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 562.0 [M/2+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 13.15 - 12.64 (m, 1H), 8.98 (s, 1H), 8.65 (d, J=2.0 Hz, 1H), 8.57 - 8.43 (m, 2H), 8.18 (s, 1H), 8.09 (s, 1H), 7.77 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.64 - 7.55 (m, 3H), 7.47 - 7.41 (m, 2H), 7.40 - 7.33 (m, 2H), 7.27 (t, J=8.4 Hz, 1H), 7.07 (d, J=8.8 Hz, 2H), 4.94 - 4.85 (m, 1H), 4.53 - 4.41 (m, 2H), 4.28 (s, 1H), 3.14 - 3.06 (m, 4H), 3.03 (s, 1H), 2.90 (d, J=16.0 Hz, 3H), 2.72 (s, 3H), 2.67 (s, 4H), 2.45 (s, 4H), 2.30 - 2.18 (m, 2H), 2.17 (s, 1H), 2.14 - 2.02 (m, 2H), 2.14 - 2.02 (m, 1H), 1.86 (s, 2H), 1.79 - 1.72 (m, 1H), 1.57 - 1.42 (m, 3H), 1.38 (d, J=7.2 Hz, 3H), 1.01 (t, J=7.2 Hz, 3H), 0.95 (s, 9H).
(2S,4R)-1-((S)-2-(2-((2S,6R)-4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)-2,6-디메틸피페라진-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 (실시예 351)의 예시적인 합성
단계 1: 삼차-부틸 (3S,5R)-4-(2-에톡시-2-옥소에틸)-3,5-디메틸피페라진-1-카르복실레이트 제조
아세토니트릴 (10 mL) 중 삼차-부틸 (3S, 5R)-3,5-디메틸피페라진-1-카르복실레이트 (1 g, 4.67 mmol, 1당량) 및 에틸 2-브로모아세테이트(701 mg, 4.20 mmol, 0.9당량)의 용액에 디이소프로필 에틸아민(1.81 g, 14.00 mmol, 3당량)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 80℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물(50 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(50 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(80 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르/에틸 아세테이트=30/1 내지 1/1)로 정제하였다. 삼차-부틸 (3S,5R)-4-(2-에톡시-2-옥소-에틸)-3,5-디메틸-피페라진-1-카르복실레이트 (1.09 g, 3.63 mmol, 77% 수율)를 백색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 301.1 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 4.16 (q, J=7.2 Hz, 2H), 4.02 - 3.72 (m, 2H), 3.56 (s, 2H), 2.96 - 2.82 (m, 2H), 2.53 (s, 2H), 1.46 (s, 9H), 1.27 (t, J=7.2 Hz, 3H), 1.08 (d, J=6.4 Hz, 6H).
단계 2: 에틸 2-((2S,6R)-2,6-디메틸피페라진-1-일)아세테이트 제조
디클로로메탄(10 mL) 중 삼차-부틸 (3S, 5R)-4-(2-에톡시-2-옥소-에틸)-3,5-디메틸-피페라진- 1-카르복실레이트 (200 mg, 0.66 mmol, 1당량) 용액에 염산(디옥산 중 4 M, 2 mL, 10당량)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 15℃에서 1시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 에틸 2-[(2S,6R)-2,6-디메틸피페라진-1-일]아세테이트 (140 mg, 0.59 mmol, 88% 수율, 염화수소)를 백색 고체로서 수득하였다.
단계 3: 에틸 2-((2S,6R)-4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)-2,6-디메틸피페라진-1-일)아세테이트 제조
메탄올(2 mL) 및 디클로로메탄(2 mL) 중 에틸 2-[(2S,6R)-2,6-디메틸피페라진-1-일]아세테이트 (69 mg, 0.29 mmol, 1.2당량, 염화수소) 및 트리에틸아민 (74 mg, 0.73 mmol, 3당량) 용액에 (3R)-N-[2,4-디플루오로-3-[5-[4-(4-포르밀-1- 피페리딜)페닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (150 mg, 0.24 mmol, 1당량)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 15℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 트리아세트옥시보로히드라이드 나트륨(155 mg, 0.73 mmol, 3당량)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 15℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물(50 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(50 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(50 mL x 3)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르/에틸 아세테이트=100/1 내지 30/1)로 정제하였다. 에틸 2-[(2S,6R)-4-[[1-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-4-피페리딜]메틸]-2,6-디메틸-피페라진-1-일]아세테이트 (180 mg, 0.22 mmol, 92% 수율)를 황색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 796.1 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.91 (s, 1H), 9.87 (s, 1H), 8.64 (d, J=2.0 Hz, 1H), 8.53 (s, 1H), 8.07 (s, 1H), 7.67 - 7.52 (m, 3H), 7.27 (t, J=8.4 Hz, 1H), 7.05 (d, J=8.8 Hz, 2H), 5.46 - 5.12 (m, 1H), 4.16 - 4.00 (m, 3H), 3.77 (d, J=12.0 Hz, 2H), 3.50 - 3.43 (m, 3H), 3.39 (s, 2H), 3.32 - 3.24 (m, 2H), 3.16 (d, J=5.2 Hz, 1H), 2.85 (s, 2H), 2.76 - 2.62 (m, 4H), 2.09 (d, J=7.2 Hz, 4H), 1.84 - 1.59 (m, 5H), 1.25 - 1.13 (m, 5H), 0.96 (d, J=6.0 Hz, 6H).
단계 4: 2-((2S,6R)-4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)-2,6-디메틸피페라진-1-일)아세트산 제조
메탄올 (4 mL), 물(4 mL) 및 테트라하이드로푸란 (4 mL) 중 에틸 2-[(2S,6R)-4-[[1-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일] 설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-4-피페리딜]메틸]-2,6-디메틸-피페라진-1-일]아세테이트 (150 mg, 0.18 mmol, 1당량)의 용액에 수산화 리튬 일수화물 (31 mg, 0.75 mmol, 4당량)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 15℃에서 2시간 동안 교반하였다. 1 M 염산을 사용해 pH를 6으로 조정하고, 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 분취-HPLC로 정제하였다. 2-[(2S,6R)-4-[[1-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-4-피페리딜]메틸]-2,6-디메틸-피페라진-1-일] 아세트산 (110 mg, 0.13 mmol, 71% 수율, 포름산염)을 황색 고체로서 수득하였다.
단계 5: (2S,4R)-1-((S)-2-(2-((2S,6R)-4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)-2,6-디메틸피페라진-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
디메틸포름아미드 (5 mL) 중 2-[(2S,6R)-4-[[1-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일] 설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-4-피페리딜]메틸]-2,6-디메틸-피페라진-1-일]아세트산 (70 mg, 0.09 mmol, 1당량), 하이드록시벤조트리아졸 (24 mg, 0.18 mmol, 2당량), 1-(3-디메틸아미노프로필)-3-에틸카르보디이미드 염화수소 (34 mg, 0.18 mmol, 2당량)의 용액에 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3- 디메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (65 mg, 0.13 mmol, 1.5당량, 염화수소) 및 트리에틸아민 (46 mg, 0.45 mmol, 5당량)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 40℃에서 12시간 동안 교반하였다. 1M 염산으로 pH를 6까지 조정하였다. 잔류물을 분취-HPLC로 정제하였다. (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[2-[(2S,6R)-4- [[1-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-4-피페리딜]메틸]-2,6-디메틸-피페라진-1-일]아세틸]아미노]-3,3-디메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (41 mg, 0.032 mmol, 35% 수율, 97% 순도, 포름산염)을 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 848.2 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 8.98 (s, 1H), 8.64 (d, J=2.0 Hz, 1H), 8.49 (d, J=7.5 Hz, 1H), 8.21 (s, 1H), 8.07 (s, 1H), 8.02 - 7.94 (m, 1H), 7.67 - 7.53 (m, 3H), 7.47 - 7.41 (m, 2H), 7.39 - 7.32 (m, 2H), 7.25 (t, J=8.4 Hz, 1H), 7.06 (d, J=8.8 Hz, 2H), 5.39 - 5.19 (m, 1H), 4.93 - 4.86 (m, 1H), 4.51 - 4.42 (m, 2H), 4.27 (s, 1H), 3.79 (s, 1H), 3.32 - 3.24 (m, 4H), 3.14 (d, J=18.0 Hz, 3H), 2.96 (d, J=18.0 Hz, 2H), 2.82 - 2.67 (m, 4H), 2.57 (s, 2H), 2.45 (s, 4H), 2.17 - 1.92 (m, 6H), 1.90 - 1.61 (m, 7H), 1.41 - 1.35 (m, 3H), 1.21 (d, J=11.6 Hz, 2H), 0.98 (d, J=6.0 Hz, 3H), 0.94 (s, 10H), 0.86 (d, J=6.0 Hz, 3H), 0.89 - 0.83 (m, 1H).
(2S,4R)-1-((S)-2-(1-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)시클로프로판-1-카르복사미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 (실시예 361)의 예시적인 합성
단계 1: 벤질 3,4-디하이드록시피롤리딘-1-카르복실레이트 제조
삼차 부탄올(120 mL) 및 물(100 mL) 중 벤질 2,5-디하이드로피롤-1-카르복실레이트 (10 g, 49.20 mmol, 1당량)의 용액에, 칼륨 페리시아니드(40.50 g, 123.01 mmol, 2.5당량), 탄산칼륨(17.00 g, 123.01 mmol, 2.5당량), 메탄설폰아미드(4.68 g, 49.20 mmol, 1당량) 및 칼륨 오스뮴산염(vi) 디하이드레이트(1.81 g, 4.92 mmol, 0.1당량)를 첨가하였다. 혼합물을 0-5 ℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 포화 아황산나트륨(50 mL)으로 급냉시켰다. 반응 혼합물을 물(500 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(200 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 포화 염수(200 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피(디클로로메탄:메탄올 = 100:1 내지 30:1)로 정제하였다. 벤질 3,4-디하이드록시피롤리딘-1-카르복실레이트 (14 g, 미정제)를 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 260.0 [M+23] +.
단계 2: 벤질 비스(2-옥소에틸)카바메이트 제조
테트라하이드로푸란(20 mL) 및 물(10 mL) 중 벤질 3,4-디하이드록시피롤리딘-1-카르복실레이트 (1 g, 4.21 mmol, 1당량)의 용액에 과요오드산나트륨(1.35 g, 6.32 mmol, 1.5당량)을 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 2시간 동안 교반하였다. 물(100 mL)을 혼합물에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(100 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수로 세척하고(100 mL x 2), 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 미정제 생성물은 추가 정제 없이 다음 단계에 사용되었다. 벤질 N,N-비스(2-옥소에틸)카바메이트 (900 mg, 3.83 mmol, 90% 수율)를 황색 오일로서 수득하였다.
단계 3: 벤질 4-(1-(메톡시카르보닐)시클로프로필)피페라진-1-카르복실레이트 제조
메탄올(30 mL) 중 벤질 N,N-비스(2-옥소에틸)카바메이트 (3.29 g, 13.99 mmol, 2당량)의 용액에 메틸 1-아미노시클로프로판카르복실레이트 (805 mg, 6.99 mmol, 1당량) 및 아세트산(2 mL)을 첨가하였다. 15℃에서 30분 동안 교반되는 혼합물을 보란;2-메틸피리딘(1.50 g, 13.99 mmol, 2당량)을 첨가하고 나서, 혼합물을 15 ℃에서 추가 11.5시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 플래시 C18 컬럼 크로마토그래피(아세토니트릴/물(0.5%TFA)=5%~90%)로 정제하였다. 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 포화 중탄산 나트륨 용액(30 mL)을 첨가하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(50 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수로 세척하고(50 mL x 2), 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 화합물 벤질 4-(1-메톡시카르보닐시클로프로필)피페라진-1-카르복실레이트 (2.20 g, 6.91 mmol, 98% 수율)를 무색 오일로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 319.1 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 7.39 - 7.35 (m, 4H), 7.35 - 7.30 (m, 1H), 5.15 (s, 2H), 3.66 (s, 3H), 3.62 - 3.04 (m, 4H), 2.92 (s, 4H), 1.33 - 1.28 (m, 2H), 0.96 (q, J=3.6 Hz, 2H).
단계 4: 메틸 1-(피페라진-1-일)시클로프로판-1-카르복실레이트 제조
테트라하이드로푸란 (30 mL) 중 벤질 4-(1-메톡시카르보닐시클로프로필)피페라진-1-카르복실레이트 (2.2 g, 6.91 mmol, 1당량) 용액에 탄소 상의 팔라듐(30 mg, 10%)을 질소 분위기 하에서 첨가하였다. 현탁액을 진공 중에서 탈기하고 수소로 수차례 퍼지하였다. 혼합물을 수소 하에(15 psi) 30℃에서 12시간 동안 교반하였다. 그런 다음 혼합물을 수소 하에(50 psi) 30℃에서 16시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 여과하고, 여과물을 농축시켰다. 메틸 1-피페라진-1-일시클로프로판카르복실레이트(1.05 g, 미정제)를 무색 오일로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 185.1 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 3.74 - 3.59 (m, 3H), 3.02 - 2.81 (m, 4H), 2.79 - 2.73 (m, 3H), 2.43 - 2.22 (m, 1H), 1.73 - 1.49 (m, 1H), 1.30 - 1.22 (m, 2H), 0.98 - 0.87 (m, 2H).
단계 5: 메틸 (R)-1-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-((3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)시클로프로판-1-카르복실레이트 제조
1,2-디클로로에탄 (2 mL) 중 메틸 1-피페라진-1-일시클로프로판카르복실레이트 (72 mg, 0.39 mmol, 1.2당량) 및 (3R)-N-[2,4-디플루오로-3-[5-[4-(4-포르밀-1-피페리딜)페닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (200 mg, 0.32 mmol, 1당량) 용액에 트리아세트옥시보로히드라이드 나트륨(207 mg, 0.98 mmol, 3당량)을 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 1시간 동안 교반하였다. 물(50 mL)을 혼합물에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 디클로로메탄(30 mL x 3)으로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수로 세척하고(30 mL x 2), 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피(디클로로메탄:메탄올 = 200:1 내지 50:1)로 정제하였다. 화합물 메틸 1-[4-[[1-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-4-피페리딜]메틸]피페라진-1-일]시클로프로판카르복실레이트 (210 mg, 0.26 mmol, 82% 수율)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 780.1 [M+1] +.
단계 6: (R)-1-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-((3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)시클로프로판-1-카르복실산 제조
메탄올 (2 mL), 테트라하이드로푸란 (2 mL) 및 물(2 mL) 중 메틸 1-[4-[[1-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일] 설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-4-피페리딜]메틸]피페라진-1-일]시클로프로판카르복실레이트 (210 mg, 0.26 mmol, 1당량)의 용액에, 수산화 리튬 일수화물 (45 mg, 1.08 mmol, 4당량)을 첨가하였다. 혼합물을 40℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 염산(1 M)으로 pH=5로 조정하고 감압 하에 농축시켰다. 미정제 생성물은 추가 정제 없이 다음 단계에 사용되었다. 화합물 1-[4-[[1-[4- [3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-4-피페리딜]메틸]피페라진-1-일]시클로프로판카르복실산 (200 mg, 무기 염 함유)을 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 766.4 [M+1] +.
단계 7: (2S,4R)-1-((S)-2-(1-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)시클로프로판-1-카르복사미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
N,N-디메틸포름아미드 (5 mL) 중 1-[4-[[1-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노] 벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-4-피페리딜]메틸]피페라진-1-일]시클로프로판카르복실산 (200 mg, 0.26mmol, 1당량) 및 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸 -부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (125 mg, 0.26 mmol, 1당량, 염화수소)의 용액에, 하이드록시벤조트리아졸 (42 mg, 0.31 mmol, 1.2당량), 트리에틸아민 (39 mg, 0.39 mmol, 1.5당량) 및 1-(3-디메틸아미노프로필)-3-에틸카르보디이미드 염화수소 (60 mg, 0.31 mmol, 1.2당량)을 첨가하였다. 혼합물을 40℃에서 12시간 동안 교반하였다. 물(50 mL)을 혼합물에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 디클로로메탄(10 mL x 3)으로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수(10 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 분취-HPLC로 정제하였다. 화합물 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[1-[4-[[1-[4- [3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-4-피페리딜]메틸]피페라진-1-일]시클로프로판카르보닐]아미노]-3,3-디메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (27.3 mg, 0.022 mmol, 2 단계 동안 8% 수율, 99% 순도, 포름산염)을 황색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 596.9 [M/2+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 13.16 - 12.44 (m, 1H), 8.98 (s, 1H), 8.64 (d, J=2.0 Hz, 1H), 8.51 (s, 1H), 8.45 (d, J=7.6 Hz, 1H), 8.36 (d, J=10.0 Hz, 1H), 8.23 (s, 1H), 8.04 (s, 1H), 7.65 - 7.55 (m, 3H), 7.46 - 7.41 (m, 2H), 7.40 - 7.32 (m, 2H), 7.21 (t, J=8.8 Hz, 1H), 7.06 (d, J=8.8 Hz, 2H), 5.39 - 5.18 (m, 1H), 4.95 - 4.83 (m, 1H), 4.53 - 4.40 (m, 2H), 4.28 (s, 1H), 3.77 (d, J=12.8 Hz, 2H), 3.58 (d, J=7.6 Hz, 1H), 3.45 (s, 1H), 3.27 (d, J=6.8 Hz, 3H), 2.72 (t, J=11.2 Hz, 2H), 2.46 (s, 3H), 2.40 (s, 6H), 2.21 (d, J=6.8 Hz, 3H), 2.13 - 2.00 (m, 4H), 1.85 - 1.65 (m, 5H), 1.40 (d, J=7.2 Hz, 3H), 1.30 - 1.15 (m, 2H), 1.08 (d, J=7.0 Hz, 1H), 1.04 - 0.89 (m, 13H).
(2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)-1,4-디아제판-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 (실시예 412)의 예시적인 합성
단계 1: 벤질 4-(2-(삼차-부톡시)-2-옥소에틸)-1,4-디아제판-1-카르복실레이트 제조
아세토니트릴 (10 mL) 중 벤질 1,4-디아제판-1-카르복실레이트 (0.85 g, 3.63 mmol, 1당량)의 용액에 N,N-디이소프로필에틸아민 (938 mg, 7.26 mmol, 2당량), 삼차-부틸 2-브로모아세테이트(707 mg, 3.63 mmol, 0.5 mL, 1당량)을 첨가하였다. 혼합물을 70℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 에틸 아세테이트(40 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 포화 수성 염수(30 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르/에틸 아세테이트=10:1 내지 2:1)로 정제하였다. 화합물 벤질 4-(2-삼차-부톡시-2-옥소-에틸)-1,4-디아제판-1-카르복실레이트 (1.08 g, 2.82 mmol, 77% 수율, 91% 순도)를 무색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 349.1 [M+1] +.
단계 2: 삼차-부틸 2-(1,4-디아제판-1-일)아세테이트 제조
테트라하이드로푸란 (10 mL) 중 벤질 4-(2-삼차-부톡시-2-옥소-에틸)-1,4-디아제판-1-카르복실레이트 (1.31 g, 3.42 mmol, 1당량) 용액에 활성탄 상 팔라듐 촉매(0.2 g, 10% 순도)를 질소 분위기 하에 첨가하였다. 현탁액을 진공 중에서 탈기하고 수소로 수차례 퍼지하였다. 혼합물을 수소 분위기 하(15 psi) 40℃에서 24시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 여과하고, 여과물을 농축시켰다. 화합물 삼차-부틸 2-(1,4-디아제판-1-일)아세테이트 (750 mg, 2.06 mmol, 60% 수율, 59% 순도)를 황색 오일로서 수득하였고, 이는 추가 정제 없이 다음 단계에 직접 사용되었다. LC/MS (ESI) m/z: 215.2 [M+1] +.
단계 3: 삼차-부틸 (R)-2-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-((3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)-1,4-디아제판-1-일)아세테이트 제조
1,2-디클로로메탄 (2 mL) 및 메탄올(1 mL) 중 삼차-부틸 2-(1,4-디아제판-1-일)아세테이트 (131 mg, 0.36 mmol, 1.1당량)의 혼합물에 트리에틸아민 (33 mg, 0.32 mmol, 1당량) 및 (3R)-N-[2,4-디플루오로-3-[5-[4-(4-포르밀-1-피페리딜)페닐]-1H-피롤로 [2,3-b]피리딘-3-카르보닐]페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (0.2 g, 0.32 mmol, 1당량)을 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 10분 동안 교반한 후, 보로히드라이드 아세테이트 나트륨(139 mg, 0.65 mmol, 2당량)을 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 110분 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 에틸 아세테이트(30 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(20 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 미정제 생성물을 분취 박층 크로마토그래피(디클로로메탄: 메탄올=10:1, Rf=0.4)로 정제하였다. 화합물 삼차-부틸 2-[4-[[1-[4-[3-[2,6-디플루오로- 3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-4-피페리딜]메틸]-1,4-디아제판-1-일]아세테이트 (192 mg, 0.22 mmol, 68% 수율, 94% 순도)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 810.4 [M+1] +.
단계 4: (R)-2-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-((3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)-1,4-디아제판-1-일)아세트산 제조
디클로로메탄(5 mL) 중 삼차-부틸 2-[4-[[1-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일] 설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-4-피페리딜]메틸]-1,4-디아제판-1-일]아세테이트 (240 mg, 0.27 mmol, 1당량) 용액에 트리플루오로아세트산 (1 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 16시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 화합물 2-[4-[[1-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-4-피페리딜]메틸]-1,4-디아제판-1-일]아세트산 (240 mg, 미정제, 트리플루오로아세트산)을 황색 고체로서 수득하고, 이를 추가로 정제하지 않고 사용하였다. LC/MS (ESI) m/z: 754.2 [M+1] +.
단계 5: (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)-1,4-디아제판-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
N,N-디메틸포름아미드 (2 mL) 중 2-[4-[[1-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일] 설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-4-피페리딜]메틸]-1,4-디아제판-1-일]아세트산 (240 mg, 0.27 mmol, 1당량, 트리플루오로아세트산)의 용액에, 하이드록시벤조트리아졸 (45 mg, 0.33 mmol, 1.2당량) N,N-디이소프로필에틸아민 (72 mg, 0.55 mmol, 2당량) 및 1-(3-디메틸아미노프로필) -3-에틸카르보디이미드 염화수소 (79 mg, 0.41 mmol, 1.5당량)을 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 10분 동안 교반한 후, (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S) -1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (159 mg, 0.33 mmol, 1.20당량, 염화수소)를 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 110분 동안 추가로 교반하였다. 반응 혼합물을 에틸 아세테이트(30 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(15 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 반-분취 역상 HPLC로 정제하였다. 화합물 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[2-[4-[[1-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로 피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-4-피페리딜] 메틸]-1,4-디아제판-1-일]아세틸]아미노]-3,3-디메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (89.4 mg, 0.07 mmol, 25% 수율, 97% 순도, 포름산염)을 분홍색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 591.0 [M/2+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 8.97 (s, 1H), 8.64 (d, J=2.0 Hz, 1H), 8.52 (s, 1H), 8.42 (d, J=8.4 Hz, 1H), 8.20 (s, 1H), 8.03 (s, 1H), 7.81 (d, J=10.0 Hz, 1H), 7.64 - 7.54 (m, 3H), 7.45 - 7.41 (m, 2H), 7.39 - 7.34 (m, 2H), 7.24 - 7.17 (m, 1H), 7.06 (d, J=8.8 Hz, 2H), 5.41 - 5.17 (m, 1H), 5.02 - 4.83 (m, 1H), 4.61 - 4.39 (m, 2H), 4.29 (s, 1H), 3.78 (d, J=12.4 Hz, 3H), 3.64 - 3.52 (m, 2H), 3.13 - 3.10 (m, 2H), 2.73 - 2.65 (m, 10H), 2.45 (s, 4H), 2.40 - 2.25 (m, 5H), 2.17 - 1.96 (m, 4H), 1.91 - 1.68 (m, 6H), 1.64 (s, 1H), 1.43 - 1.34 (m, 3H), 1.29 - 1.15 (m, 2H), 0.95 (s, 9H).
(2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-(1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)-1,4-디아제판-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 (실시예 437)의 예시적인 합성
단계 1: 8-(4-브로모페닐)-1,4-디옥사-8-아자스피로[4.5]데칸 제조
디메틸설폭시드(40 mL) 중 1-브로모-4-아이오도-벤젠 (5 g, 17.67 mmol, 1당량) 및 1,4-디옥사-8-아자스피로[4.5]데칸 (2.53 g, 17.67 mmol, 2.26 mL, 1당량)의 용액에 L-PROLINE (813 mg, 7.07 mmol, 0.4당량), 요오드화 구리 (673 mg, 3.53 mmol, 0.2당량) 탄산칼륨(4.89 g, 35.35 mmol, 2당량)을 첨가하였다. 혼합물을 80℃에서 12시간 동안 교반하였다. 물(300 mL)을 혼합물에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(100 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수로 세척하고(100 mL x 2), 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트=1:0 내지 10:1)로 정제하였다. 화합물 8-(4-브로모페닐) -1,4-디옥사-8-아자스피로[4.5]데칸 (3.2 g, 10.73 mmol, 60% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 297.9 [M+1] +.
단계 2: 8-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)-1,4-디옥사-8-아자스피로[4.5]데칸 제조
디옥산 (90 mL) 중 8-(4-브로모페닐)-1,4-디옥사-8-아자스피로[4.5]데칸 (3.2 g, 10.73 mmol, 1당량)과 4,4,5,5-테트라메틸-2-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-1,3,2- 디옥사보로란 (2.73 g, 10.73 mmol, 1당량)의 용액에 아세트산 칼륨(2.11 g, 21.46 mmol, 2당량) 및 디삼차-부틸(시클로펜틸)포스판;디클로로팔라듐;철 (699.45 mg, 1.07 mmol, 0.1당량)을 첨가하였다. 혼합물을 80℃에서 12시간 동안 교반하였다. 물(100 mL)을 혼합물에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(100 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수로 세척하고(100 mL x 2), 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트=1:0 내지 30:1)로 정제하였다. 화합물 8-[4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2- 일)페닐]-1,4-디옥사-8-아자스피로[4.5]데칸 (2.2 g, 6.37 mmol, 59% 수율)을 갈색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 346.1 [M+1] +.
단계 3: (R)-N-(3-(5-(4-(1,4-디옥사-8-아자스피로[4.5]데칸-8-일)페닐)-1-((2-(트리메틸실릴)에톡시)메틸)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로-N-((2-(트리메틸실릴)에톡시)메틸)피롤리딘-1-설폰아미드 제조
디옥산 (10 mL) 및 물(1 mL) 중 8-[4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐]-1,4-디옥사-8- 아자스피로[4.5]데칸 (1.4 g, 4.06 mmol, 1당량) 및 (3R)-N-[3-[5-브로모-1-(2- 트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로-페닐]-3-플루오로-N-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤리딘-1-설폰아미드 (3.10 g, 4.06 mmol, 1당량)의 용액에 4-디삼차-부틸포스파닐-N,N- 디메틸-아닐린;디클로로팔라듐 (287 mg, 0.40 mmol, 0.1당량), 및 불화 세슘(2.46 g, 16.22 mmol, 4당량)을 첨가하였다. 혼합물을 90℃에서 12시간 동안 교반하였다. 물(100 mL)을 혼합물에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(100 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수로 세척하고(100 mL x 2), 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트=1:0 내지 20:1)로 정제하였다. 화합물 (3R)-N-[3-[5-[4- (1,4-디옥사-8-아자스피로[4.5]데칸-8-일)페닐]-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로-페닐]-3-플루오로-N-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤리딘-1-설폰아미드 (2.2 g, 2.44 mmol, 60% 수율)를 갈색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 902.4 [M+1] +.
단계 4: (R)-N-(3-(5-(4-(1,4-디옥사-8-아자스피로[4.5]데칸-8-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 제조
메탄올(30 mL) 중 (3R)-N-[3-[5-[4-(1,4-디옥사-8-아자스피로[4.5]데칸-8-일)페닐]-1-(2- 트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로-페닐]-3-플루오로-N-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤리딘-1-설폰아미드 (2.2 g, 2.44 mmol, 1당량)의 용액에, 디옥산 중 4 M 염화수소를 첨가하였다(55 mL, 90.22당량). 혼합물을 50℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 미정제 생성물은 추가 정제 없이 다음 단계에 사용되었다. 화합물 (3R)-N-[3-[5-[4-(1,4-디옥사-8-아자스피로[4.5]데칸-8-일)페닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로-페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (1.5 g, 미정제)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 642.1 [M+1] +.
단계 5: (R)-N-(2,4-디플루오로-3-(5-(4-(4-옥소피페리딘-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 제조
테트라하이드로푸란(20 mL) 중 (3R)-N-[3-[5-[4-(1,4-디옥사-8-아자스피로[4.5]데칸-8-일)페닐]-1H- 피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로-페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (1.5 g, 2.34 mmol, 1당량) 용액에 염화수소 (3 M, 34.09 mL, 43.75당량)을 첨가하였다. 혼합물을 50℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 잔류물을 분취 역상 HPLC로 정제하였다. 화합물 (3R)-N-[2,4-디플루오로 -3-[5-[4-(4-옥소-1-피페리딜)페닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (450 mg, 0.75 mmol, 64 % 수율)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 598.1 [M+1] +.
단계 6: 삼차-부틸 (R)-2-(4-(1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-((3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)-1,4-디아제판-1-일)아세테이트 제조
N,N-디메틸포름아미드 (6 mL) 및 아세트산 (0.6 mL) 중 삼차-부틸 2-(1,4-디아제판-1-일)아세테이트 (149 mg, 0.41 mmol, 1당량) 및 (3R)-N-[2,4-디플루오로-3-[5-[4-(4-옥소-1-피페리딜)페닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (300 mg, 0.41 mmol, 1당량)의 용액에, 나트륨 시아노보로히드라이드(77 mg, 1.23 mmol, 3당량)을 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 12시간 동안 교반하였다. 물(50 mL)을 혼합물에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(20 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수로 세척하고(40 mL x 2), 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 분취 박층 크로마토그래피(디클로로메탄:메탄올=10:1)로 정제하였다. 화합물 삼차-부틸 2-[4-[1-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일] 설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-4-피페리딜]-1,4-디아제판-1-일]아세테이트 (140 mg, 0.17 mmol, 42% 수율)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 796.2 [M+1] +.
단계 7: (R)-2-(4-(1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-((3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)-1,4-디아제판-1-일)아세트산 제조
디클로로메탄(3 mL) 중 삼차-부틸 2-[4-[1-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일] 설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-4-피페리딜]-1,4-디아제판-1-일]아세테이트 (200 mg, 0.25 mmol, 1당량)의 용액에 디옥산 중 4 M 염산(4.4 mL, 70.75당량)을 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 1시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 미정제 생성물은 추가 정제 없이 다음 단계에 사용되었다. 화합물 2-[4-[1-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일] 설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-4-피페리딜]-1,4-디아제판-1-일]아세트산 (200 mg, 미정제, 염화수소)을 황색 고체로서 수득하였다.
단계 8: (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-(1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)-1,4-디아제판-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
N,N-디메틸포름아미드 (3 mL) 중 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4- 메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (123 mg, 0.25 mmol, 1.00당량, 염화수소) 및 2-[4-[1-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일] 설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-4-피페리딜]-1,4-디아제판-1-일]아세트산 (200 mg, 0.25 mmol, 1당량, 염화수소) 용액에 트리에틸아민 (130 mg, 1.29 mmol, 5당량), 1-(3-디메틸아미노프로필)-3- 에틸카르보디이미드 염화수소 (59 mg, 0.30 mmol, 1.2당량) 및 하이드록시벤조트리아졸 (41 mg, 0.30 mmol, 1.2당량)을 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 12시간 동안 교반하였다. 물(50 mL)을 혼합물에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(20 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수(20 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 분취-HPLC로 정제하였다. 화합물 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[2-[4-[1-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3- 플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-4-피페리딜]-1,4-디아제판-1-일]아세틸]아미노]-3,3-디메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (57.8 mg, 0.04 mmol, 17% 수율, 97% 순도, 포름산염)을 황색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 583.9 [M/2] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.94 (s, 1H), 8.98 (s, 1H), 8.64 (d, J=2.0 Hz, 1H), 8.53 (s, 1H), 8.45 (d, J=7.6 Hz, 1H), 8.17 (s, 2H), 8.06 (s, 1H), 7.82 (d, J=9.6 Hz, 1H), 7.66 - 7.54 (m, 3H), 7.46 - 7.40 (m, 2H), 7.40 - 7.33 (m, 2H), 7.25 (t, J=8.4 Hz, 1H), 7.07 (d, J=8.8 Hz, 2H), 5.39 - 5.20 (m, 1H), 4.98 - 4.84 (m, 1H), 4.50 (d, J=9.6 Hz, 1H), 4.44 (t, J=8.4 Hz, 1H), 4.28 (s, 1H), 3.84 (d, J=11.2 Hz, 2H), 3.63 - 3.53 (m, 2H), 3.47 (s, 3H), 3.11 (d, J=8.8 Hz, 2H), 2.79 (d, J=15.2 Hz, 4H), 2.75 - 2.68 (m, 6H), 2.45 (s, 4H), 2.14 - 2.01 (m, 3H), 1.85 - 1.69 (m, 6H), 1.63 - 1.44 (m, 3H), 1.38 (d, J=6.8 Hz, 3H), 0.95 (s, 9H).
(2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)페닐)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 (실시예 377)의 예시적인 합성
단계 1: 메틸 (R)-2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-((3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)페닐)아세테이트 제조
메틸 알코올(2 mL) 및 디클로로메탄(1 mL) 중 (3R)-N-[2,4-디플루오로-3-[5-(4-피페라진-1-일페닐)-1H-피롤로 [2,3-b]피리딘-3-카르보닐]페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (200 mg, 0.30 mmol, 1당량, 2 염화수소) 용액에 아세트산나트륨(50 mg, 0.61 mmol, 2당량)을 첨가하여 pH~8.0을 조정하였다. 그런 다음, 메틸 2-(4-포름일페닐)아세테이트 (108 mg, 0.61 mmol, 2당량)를 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 15분 동안 교반한 다음, 아세트산(36 mg, 0.61 mmol, 2당량)을 첨가하여 pH ~5.0으로 조정하였다. 혼합물을 15℃에서 15분 동안 교반하였다. 이어서 나트륨 시아노보로히드라이드(38 mg, 0.61 mmol, 2당량)를 나누어서 첨가하였다. 반응 혼합물을 30℃에서 1.5시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물(30 mL)에 붓고 에틸 아세테이트(30 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고, 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 분취-박층 크로마토그래피(디클로로메탄: 메탄올= 10:1, Rf=0.4)로 정제하였다. 화합물 메틸 2-[4-[[4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일] 설포닐아미노] 벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일] 메틸]페닐]아세테이트 (140 mg, 0.18 mmol, 60% 수율, 98% 순도)를 무색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 747.2 [M+1] +.
단계 2: (R)-2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-((3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)페닐)아세트산 제조
테트라하이드로푸란(2 mL) 및 물(0.5 mL) 중 메틸 2-[4-[[4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일] 설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]메틸]페닐]아세테이트 (140 mg, 0.19 mmol, 1당량)의 용액에 리튬수화물(14 mg, 0.56 mmol, 3당량)을 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 물 5 mL로 희석한 다음, 염산(1 M)으로 pH=5~6까지 산성화시켰다. 현탁액을 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 반-분취 역상 HPLC로 정제하였다. 화합물 2-[4-[[4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일] 설포닐아미노]벤조일]-1H -피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]메틸]페닐]아세트산 (65 mg, 0.1 mmol, 44% 수율, 94% 순도)을 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 733.1 [M+1] +.
단계 3: (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)페닐)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
N,N-디메틸포름아미드 (1 mL) 중 2-[4-[[4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일] 설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]메틸]페닐]아세트산 (115 mg, 0.15 mmol, 1당량) 및 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸-부타노일] -4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (71 mg, 0.15 mmol, 1.00당량, 염화수소)의 용액에 하이드록시벤조트리아졸 (24 mg, 0.18 mmol, 1.2당량), N,N-디이소프로필에틸아민 (57 mg, 0.44 mmol, 3당량) 및 1-(3-디메틸아미노프로필)-3-에틸카르보디이미드 염화수소 (42.42 mg, 0.22 mmol, 1.5당량)을 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물(30 mL)에 붓고 에틸 아세테이트(40 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 반-분취 역상 HPLC로 정제하였다. 화합물 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[2-[4-[[4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]메틸]페닐]아세틸]아미노]-3,3-디메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (93.8 mg, 0.07 mmol, 51% 수율, 97% 순도, 포름산)을 황색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 580.3 [M/2+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.90 (s, 1H), 9.01 - 8.95 (m, 1H), 8.64 (d, J=2.4 Hz, 1H), 8.53 (s, 1H), 8.44 - 8.36 (m, 1H), 8.15 (s, 1H), 8.06 (s, 1H), 7.99 (d, J=9.2 Hz, 1H), 7.69 - 7.53 (m, 3H), 7.47 - 7.41 (m, 2H), 7.41 - 7.35 (m, 2H), 7.30 - 7.21 (m, 5H), 7.06 (d, J=8.8 Hz, 2H), 5.41 - 5.19 (m, 1H), 5.10 (s, 1H), 5.00 - 4.84 (m, 1H), 4.50 (d, J=9.2 Hz, 1H), 4.43 (t, J=8.0 Hz, 1H), 4.27 (s, 1H), 3.66 - 3.55 (m, 3H), 3.49 (d, J=14.4 Hz, 4H), 3.39 (s, 3H), 3.21 (s, 3H), 2.56 - 2.53 (m, 2H), 2.52 (s, 3H), 2.45 (s, 3H), 2.25 - 1.87 (m, 4H), 1.84 - 1.67 (m, 1H), 1.38 (d, J=7.2 Hz, 3H), 1.00 - 0.80 (m, 9H).
(2S,4R)-1-((S)-2-(3-(4-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)부톡시)이속사졸-5-일)-3-메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 (실시예 383) 및 (2S,4R)-1-((R)-2-(3-(4-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)부톡시)이속사졸-5-일)-3-메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 (실시예 384)의 예시적인 합성
단계 1: 메틸 2-(3-(4,4-디메톡시부톡시)이속사졸-5-일)-3-메틸부타노에이트 제조
N,N-디메틸포름아미드(10 mL) 중 4-클로로-1,1-디메톡시-부탄 (383 mg, 2.51 mmol, 1당량) 및 메틸 2-(3-하이드록시이속사졸-5-일)-3-메틸-부타노에이트 (500 mg, 2.51 mmol, 1당량) 용액에 탄산 세슘(1.64 g, 5.02 mmol, 2당량)를 첨가하였다. 혼합물을 80℃에서 2시간 동안 교반하였다. 물(100 mL)을 혼합물에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(100 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수로 세척하고(100 mL x 2), 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트=1:0 내지 30:1)로 정제하였다. 메틸 2-[3-(4,4-디메톡시부톡시) 이속사졸-5-일]-3-메틸-부타노에이트 (500 mg, 1.36 mmol, 54% 수율, 86% 순도)를 무색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 338.4 [M+23] +.
단계 2: 메틸 3-메틸-2-(3-(4-옥소부톡시)이속사졸-5-일)부타노에이트 제조
테트라하이드로푸란(20 mL) 중 메틸 2-[3-(4,4-디메톡시부톡시)이속사졸-5-일]-3-메틸-부타노에이트 (500 mg, 1.36 mmol, 1당량)의 용액에 황산(2 M, 27 mL, 40당량)을 첨가하였다. 혼합물을 70℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 포화 수성 중탄산 나트륨으로 pH 8로 조정하였다. 물(50 mL)을 혼합물에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(30 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수로 세척하고(30 mL x 2), 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 미정제 생성물은 추가 정제 없이 다음 단계에 사용되었다. 메틸 3-메틸-2-[3-(4-옥소부톡시)이속사졸-5-일]부타노에이트 (270 mg, 1.00 mmol, 73% 수율)를 무색 오일로서 수득하였다.
단계 3: 메틸 2-(3-(4-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)부톡시)이속사졸-5-일)-3-메틸부타노에이트 제조
1,2-디클로로에탄 (5 mL) 중 메틸 3-메틸-2-[3-(4-옥소부톡시)이속사졸-5-일]부타노에이트 (150 mg, 0.55 mmol, 1당량) 및 (3R)-N-[2,4-디플루오로-3-[5-(4-피페라진-1-일페닐)-1H-피롤로[2,3-b] 피리딘-3-카르보닐]페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (345 mg, 0.55 mmol, 1당량, 염화수소) 용액에 트리에틸아민 (112 mg, 1.11 mmol, 2당량) 및 트리아세트옥시보로히드라이드 나트륨(354 mg, 1.67 mmol, 3당량)을 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 2시간 동안 교반하였다. 물(100 mL)을 혼합물에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(30 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수로 세척하고(30 mL x 2), 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 분취-TLC(디클로로메탄:메탄올 = 10:1)로 정제하였다. 화합물 메틸 2-[3-[4-[4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]부톡시]이속사졸-5-일]-3-메틸-부타노에이트 (300 mg, 0.35 mmol, 64% 수율)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 838.1 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.89 (s, 1H), 9.82 (s, 1H), 8.65 (d, J=2.4 Hz, 1H), 8.53 (s, 1H), 8.06 (s, 1H), 7.66 - 7.56 (m, 3H), 7.26 (t, J=8.8 Hz, 1H), 7.07 (d, J=8.8 Hz, 2H), 6.20 (s, 1H), 5.23 (s, 1H), 4.20 (t, J=6.4 Hz, 2H), 3.67 - 3.65 (m, 3H), 3.48 (s, 1H), 3.43 - 3.36 (m, 2H), 3.21 (s, 4H), 2.89 (s, 1H), 2.60 - 2.51 (m, 6H), 2.40 (t, J=6.8 Hz, 2H), 2.33 - 2.25 (m, 1H), 2.14 - 2.06 (m, 1H), 1.81 - 1.72 (m, 2H), 1.59 (quin, J=7.2 Hz, 2H), 0.93 (d, J=6.8 Hz, 3H), 0.85 (d, J=6.8 Hz, 3H).
단계 4: 2-(3-(4-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)부톡시)이속사졸-5-일)-3-메틸부탄산 제조
테트라하이드로푸란 (5 mL), 메탄올 (5 mL) 및 물(3 mL) 중 메틸 2-[3-[4-[4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일] 설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]부톡시]이속사졸-5-일]-3-메틸-부타노에이트 (300 mg, 0.35 mmol, 1당량)의 용액에 수산화 리튬 일수화물 (30 mg, 0.71 mmol, 2당량)을 첨가하였다. 혼합물을 40℃에서 1시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 반응 혼합물을 염산(1 M)으로 pH 5로 조정하였다. 잔류물을 분취-HPLC로 정제하였다. 화합물 2-[3-[4-[4-[4-[3-[2,6-디플루오로 -3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]부톡시]이속사졸-5-일]-3-메틸-부탄산 (200 mg, 0.24 mmol, 67% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 824.4 [M+1] +.
단계 5: (2S,4R)-1-(2-(3-(4-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)부톡시)이속사졸-5-일)-3-메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
N,N-디메틸포름아미드 (5 mL) 중 2-[3-[4-[4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노] 벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]부톡시]이속사졸-5-일]-3-메틸-부탄산 (200 mg, 0.24 mmol, 1당량) 및 (2S,4R)-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4- 메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (89. mg, 0.24 mmol, 1.00당량, HCl)의 용액에 트리에틸아민 (36 mg, 0.36 mmol, 1.5당량), 1-(3-디메틸아미노프로필)-3-에틸카르보디이미드 염화수소 (55 mg, 0.29 mmol, 1.2당량) 및 하이드록시벤조트리아졸 (39 mg, 0.29 mmol, 1.2당량)을 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 12시간 동안 교반하였다. 물(50 mL)을 혼합물에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 디클로로메탄(20 mL x 3)으로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수(20 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 분취-HPLC로 정제하였다. 화합물 (2S,4R)-1-[2-[3-[4-[4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]부톡시]이속사졸-5-일]-3-메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (130 mg, 0.10 mmol, 43% 수율, 96% 순도, 포름산염)를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 569.4 [M/2+1] +.
단계 6: (2S,4R)-1-((S)-2-(3-(4-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)부톡시)이속사졸-5-일)-3-메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 및 (2S,4R)-1-((R)-2-(3-(4-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)부톡시)이속사졸-5-일)-3-메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
(2S,4R)-1-[2-[3-[4-[4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]부톡시]이속사졸-5-일]-3-메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (130 mg, 0.10 mmol, 1당량, 포름산염)를 키랄 초임계 유체 크로마토그래피(supercritical fluid chromatography)에 의해 분리하였다. 화합물 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[3-[4-[4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3- [[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]부톡시]이속사졸-5-일]-3-메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (22.68 mg, 0.01 mmol, 32% 수율, 91% 순도, 포름산염)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 569.3 [M/2+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.86 (s, 1H), 9.01 - 8.96 (m, 1H), 8.95 - 8.82 (m, 1H), 8.63 (d, J=2.1 Hz, 1H), 8.52 (s, 1H), 8.30 (d, J=7.6 Hz, 1H), 8.03 (s, 1H), 7.63 - 7.46 (m, 4H), 7.45 - 7.38 (m, 2H), 7.35 - 7.30 (m, 2H), 7.13 (s, 1H), 7.05 (d, J=8.8 Hz, 2H), 6.16 - 6.07 (m, 1H), 5.37 - 5.17 (m, 1H), 5.11 (d, J=3.2 Hz, 1H), 5.05 - 4.96 (m, 1H), 4.90 (t, J=7.2 Hz, 1H), 4.42 (t, J=7.6 Hz, 1H), 4.26 (s, 1H), 4.22 - 4.11 (m, 2H), 3.75 (d, J=8.8 Hz, 1H), 3.59 - 3.36 (m, 4H), 3.29 - 3.12 (m, 6H), 2.45 (s, 3H), 2.41 - 2.31 (m, 3H), 2.30 - 2.22 (m, 1H), 2.11 - 2.02 (m, 3H), 1.82 - 1.68 (m, 3H), 1.56 (dd, J=7.6, 14.5 Hz, 2H), 1.48 - 1.41 (m, 1H), 1.35 (d, J=7.2 Hz, 3H), 0.96 (d, J=6.4 Hz, 3H), 0.83 (d, J=6.8 Hz, 3H). 화합물 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[4-[4-[4 -[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]부톡시]이속사졸-5-일]-3-메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (52.44 mg, 0.04 mmol, 76% 수율, 95% 순도, 포름산염)를 황색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 569.3 [M/2+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.95 (s, 1H), 9.90 (s, 1H), 8.99 (s, 1H), 8.92 (s, 1H), 8.67 (d, J=2.0 Hz, 1H), 8.56 (s, 1H), 8.44 (d, J=7.6 Hz, 1H), 8.17 - 8.06 (m, 1H), 7.69 - 7.58 (m, 3H), 7.50 - 7.42 (m, 2H), 7.41 - 7.34 (m, 2H), 7.28 (t, J=8.0 Hz, 1H), 7.12 (d, J=8.4 Hz, 2H), 6.14 - 5.93 (m, 1H), 5.39 - 5.22 (m, 1H), 5.39 - 5.22 (m, 1H), 5.15 - 5.01 (m, 1H), 4.99 - 4.84 (m, 1H), 4.37 (t, J=8.0 Hz, 1H), 4.29 (s, 1H), 4.20 (s, 2H), 3.75 - 3.62 (m, 2H), 3.53 - 3.36 (m, 6H), 2.54 - 2.52 (m, 3H), 2.46 (s, 3H), 2.35 (td, J=2.0, 8.4 Hz, 2H), 2.30 - 2.17 (m, 2H), 2.10 - 2.01 (m, 2H), 1.84 - 1.72 (m, 5H), 1.49 - 1.42 (m, 1H), 1.41 - 1.34 (m, 3H), 1.24 (s, 1H), 1.00 - 0.94 (m, 3H), 0.87 - 0.78 (m, 4H).
(2S,4R)-1-((S)-2-(3-(3-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)프로폭시)이속사졸-5-일)-3-메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((R)-2-하이드록시-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 (실시예 493) 및 (2S,4R)-1-((R)-2-(3-(3-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)프로폭시)이속사졸-5-일)-3-메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((R)-2-하이드록시-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 (실시예 479)의 예시적인 합성
단계 1: 삼차-부틸 (R)-(1-(4-브로모페닐)-2-하이드록시에틸)카바메이트제조
테트라하이드로푸란(25 mL) 중 (2R)-2-아미노-2-(4-브로모페닐)에탄올(1.74 g, 6.89 mmol, 1당량, 염화수소)의 용액에 트리에틸아민(2.79 g, 27.56 mmol, 3.84 mL, 4당량)과 삼차-부톡시카르보닐 삼차-부틸 카보네이트(1.80 g, 8.27 mmol, 1.90 mL, 1.2당량)을 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축시켜 테트라하이드로푸란을 제거하였다. 잔류물을 에틸 아세테이트(50 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(40 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 미정제 생성물을 석유 에테르/에틸 아세테이트(22 mL, v:v=10:1)로 연화시켰다. 화합물 삼차-부틸 N-[(1R)-1-(4-브로모페닐)-2-하이드록시-에틸]카바메이트 (2 g, 6.33 mmol, 91% 수율)를 백색 고체로서 수득하였다.1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 7.51 - 7.46 (m, 2H), 7.20 (d, J=8.4 Hz, 2H), 5.27 (s, 1H), 4.73 (s, 1H), 3.92 - 3.75 (m, 2H), 2.12 (s, 1H), 1.51 - 1.32 (m, 9H).
단계 2: 삼차-부틸 (R)-(2-하이드록시-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)카바메이트 제조
디메틸아세트아미드(40 mL) 중 삼차-부틸 N-[(1R)-1-(4-브로모페닐)-2-하이드록시-에틸]카바메이트 (2.0 g, 6.33 mmol, 1당량), 4-메틸티아졸(1.25 g, 12.65 mmol, 1.15 mL, 2당량), 아세트산 칼륨(1.24 g, 12.65 mmol, 2당량) 및 아세트산 팔라듐(142 mg, 0.63 mmol, 0.1당량)의 혼합물을 탈기하고 질소로 3회 퍼지한 다음, 혼합물을 질소 분위기 하에 100℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축시켜 디메틸아세트아미드를 제거하였다. 잔류물을 에틸 아세테이트(40 mL x 2)로 추출하고 포화 염수(40 mL x 2)로 세척하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르/에틸 아세테이트=5/1 내지 1/2)로 정제하였다. 화합물 삼차-부틸 N-[(1R)-2-하이드록시-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일) 페닐] 에틸] 카바메이트(1.45 g, 3.98 mmol, 63% 수율, 91% 순도)를 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 335.1 [M+1] +.
단계 3: (R)-2-아미노-2-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에탄-1-올 제조
디클로로메탄(5 mL) 중 삼차-부틸 N-[(1R)-2-하이드록시-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐] 에틸]카바메이트 (1.45 g, 3.98 mmol, 1당량)의 용액에 염산(디옥산 중 4 M, 18 mL, 18.33당량)을 첨가하였다. 혼합물을 20℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 미정제 생성물을 15℃에서 10분 동안 에틸 아세테이트 (10 mL)로 연화시켰다. 화합물 (2R)-2-아미노-2-[4-(4-메틸티아졸- 5-일)페닐]에탄올 (1.08 g, 3.99 mmol, 100% 수율, 염화수소)을 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 235.0 [M+1] +.
단계 4: 삼차-부틸 (2S,4R)-4-하이드록시-2-(((R)-2-하이드록시-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)카바모일)피롤리딘-1-카르복실레이트 제조
N,N-디메틸포름아미드(15 mL) 중 (2R)-2-아미노-2-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에탄올 (1.08 g, 3.99 mmol, 1당량, 염화수소) 및 (2S,4R)-1-삼차-부톡시카르보닐-4-하이드록시-피롤리딘-2-카르복실산 (922 mg, 3.99 mmol, 1당량)의 용액에 하이드록시벤조트리아졸 (647 mg, 4.79 mmol, 1.2당량), N,N-디이소프로필에틸아민 (1.55 g, 11.97 mmol, 2 mL, 3당량) 및 1-(3-디메틸아미노프로필)-3-에틸카르보디이미드 염화수소 (1.15 g, 5.98 mmol, 1.5당량)을 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 디클로로메탄(30 mL x 3)으로 추출하고 포화 염수(25 mL x 3)로 세척하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피(에틸 아세테이트/메탄올=50/1 내지 20:1)로 정제하였다. 화합물 삼차-부틸 (2S, 4R)-4-하이드록시-2-[[(1R)-2-하이드록시-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]카바모일] 피롤리딘-1-카르복실레이트 (1.67 g, 2.90 mmol, 72% 수율, 77% 순도)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 448.1 [M+1] +.
단계 5: (2S,4R)-4-하이드록시-N-((R)-2-하이드록시-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
디클로로메탄(8 mL) 중 삼차-부틸 (2S,4R)-4-하이드록시-2-[[(1R)-2-하이드록시-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]카바모일]피롤리딘-1-카르복실레이트 (1.67 g, 2.90 mmol, 1당량)의 용액에 염산/디옥산(4 M, 20 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 반-분취 역상 HPLC로 정제하였다. 화합물 (2S,4R)-4-하이드록시-N-[(1R)-2- hydroxy-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일) 페닐]에틸]피롤리딘 -2-카르복사미드 (930 mg, 2.42 mmol, 83% 수율, 염화수소)를 백색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 348.0 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 9.84 (s, 1H), 9.17 (s, 1H), 9.00 (s, 1H), 8.61 (s, 1H), 7.51 - 7.35 (m, 4H), 4.96 - 4.88 (m, 1H), 4.48 - 4.37 (m, 3H), 3.69 - 3.55 (m, 2H), 3.29 (d, J=6.4 Hz, 1H), 3.09 (s, 1H), 2.46 (s, 3H), 2.41 (dd, J=7.6, 13.1 Hz, 1H), 1.89 - 1.74 (m, 1H).
단계 6: 메틸 2-(3-(3,3-디메톡시프로폭시)이속사졸-5-일)-3-메틸부타노에이트 제조
N,N-디메틸포름아미드(40 mL) 중 메틸 2-(3-하이드록시이속사졸-5-일)-3-메틸-부타노에이트 (2 g, 10.04 mmol, 1당량) 용액에 탄산 칼륨(2.08 g, 15.06 mmol, 1.5당량) 및 3-브로모-1,1-디메톡시-프로판(2.02 g, 11.04 mmol, 1.5 mL, 1.1당량)을 첨가하였다. 혼합물을 70℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 에틸 아세테이트(50 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(40 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르/에틸 아세테이트=50:1 내지 20:1)로 정제하였다. 화합물 메틸 2-[3-(3,3-디메톡시프로폭시)이속사졸-5-일]-3-메틸-부타노에이트 (1.97 g, 6.54 mmol, 65% 수율)를 무색 오일로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 324.1 [M+23] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 6.19 (s, 1H), 4.53 (t, J=5.6 Hz, 1H), 4.17 (t, J=6.4 Hz, 2H), 3.76 - 3.61 (m, 4H), 3.24 (s, 6H), 2.34 - 2.22 (m, 1H), 1.99 (q, J=6.4 Hz, 2H), 0.93 (d, J=6.8 Hz, 3H), 0.85 (d, J=6.7 Hz, 3H).
단계 7: 메틸 3-메틸-2-(3-(3-옥소프로폭시)이속사졸-5-일)부타노에이트 제조
테트라하이드로푸란(100 mL) 중 메틸 2-[3-(3,3-디메톡시프로폭시)이속사졸-5-일]-3-메틸-부타노에이트 (1.97 g, 6.54 mmol, 1당량)의 혼합물에 황산(1 M, 100 mL, 15.30당량)을 20℃에서 일회분으로 첨가하였다. 혼합물을 70℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 포화 중탄산 나트륨으로 pH=7~8로 염기성화하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(50 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수(30 mL Х 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 화합물 메틸 3-메틸-2-[3-(3-옥소프로폭시) 이속사졸-5-일]부타노에이트 (1.47 g, 5.76 mmol, 88% 수율)를 무색 오일로서 수득하였는데, 이는 추가 정제 없이 다음 단계에 직접 사용되었다.
단계 8: 메틸 2-(3-(3-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)프로폭시)이속사졸-5-일)-3-메틸부타노에이트 제조
메탄올 (8 mL) 중 (3R)-N-[2,4-디플루오로-3-[5-(4-피페라진-1-일페닐)-1H-피롤로[2,3-b] 피리딘-3-카르보닐]페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (1.45 g, 2.33 mmol, 0.7당량, 염화수소) 혼합물에 나트륨 아세테이트(547 mg, 6.67 mmol, 2당량)을 15℃에서 일회분으로 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 15분 동안 교반한 다음, 디클로로메탄 (5 mL) 중 메틸 3-메틸-2-[3-(3-옥소프로폭시)이속사졸-5-일]부타노에이트 (852 mg, 3.34 mmol, 1당량)를 추가하였다. 혼합물을 15℃에서 15분 동안 추가로 교반하고, 아세트산(0.5 mL)을 첨가하여 pH=4~5를 조정하였다. 그런 다음 나트륨 시아노보로히드라이드(419 mg, 6.67 mmol, 2당량)를 첨가하고 15℃에서 11.5시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 디클로로메탄(40 mL x 2)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(25 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 반-분취 역상 HPLC로 정제하였다. 화합물 메틸 2-[3-[3-[4-[4-[3-[2,6- 디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]프로폭시]이속사졸-5-일]-3-메틸-부타노에이트 (0.7 g, 0.84 mmol, 25% 수율, 99% 순도)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 824.3 [M+1] +.
단계 9: 2-(3-(3-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)프로폭시)이속사졸-5-일)-3-메틸부탄산 제조
테트라하이드로푸란 (1 mL) 물(0.5 mL) 및 메탄올 (2 mL) 중 메틸 2-[3-[3-[4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘 -1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]프로폭시]이속사졸-5-일]-3-메틸-부타노에이트 (320 mg, 0.40 mmol, 1당량)의 용액에 리튬 수화물(28 mg, 1.17 mmol, 3당량)를 첨가하였다. 혼합물을 40℃에서 2시간 동안 교반하였다. 혼합물을 염산(2 M)으로 pH 5~6로 조정하였다. 이어서 반응 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 반-분취 역상 HPLC로 정제하였다. 화합물 2-[3-[3-[4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐 아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]프로폭시]이속사졸-5-일]-3-메틸-부탄산 (195 mg, 0.23mmol, 60% 수율, 97% 순도)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 810.4 [M+1] +.
단계 10: (2S,4R)-1-((S)-2-(3-(3-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)프로폭시)이속사졸-5-일)-3-메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((R)-2-하이드록시-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 및 (2S,4R)-1-((R)-2-(3-(3-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)프로폭시)이속사졸-5-일)-3-메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((R)-2-하이드록시-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
N,N-디메틸포름아미드 (2 mL) 중 2-[3-[3-[4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일] 설포닐아미노] 벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]프로폭시]이속사졸-5-일]-3-메틸-부탄산 (340 mg, 0.42 mmol, 1당량), (2S,4R)-4-하이드록시-N-[(1R)-2-하이드록시-1-[4-(4- 메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (161 mg, 0.42 mmol, 1.00당량, 염화수소), 하이드록시벤조트리아졸 (68 mg, 0.50 mmol, 1.2당량), N,N- 디이소프로필에틸아민 (109 mg, 0.84 mmol, 0.2 mL, 2당량) 및 1-(3-디메틸아미노프로필) -3-에틸카르보디이미드 염화수소 (121 mg, 0.63 mmol, 1.5당량)의 혼합물에 이어서 혼합물을 15℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 디클로로메탄(30 mL x 3)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(20 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 반-분취 역상 HPLC로 정제하였다. 화합물 ((2S,4R)-1-[(2S)-2-[3-[3-[4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일] 설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]프로폭시]이속사졸-5-일]-3-메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1R)-2-하이드록시-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (44.9 mg, 0.04 mmol, 10% 수율, 95% 순도)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 570.3 [M/2+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.87 (s, 1H), 9.83 (s, 1H), 9.03 - 8.94 (m, 1H), 8.67 - 8.61 (m, 1H), 8.53 (s, 1H), 8.29 (d, J=8.0 Hz, 1H), 8.05 (s, 1H), 7.66 - 7.54 (m, 3H), 7.50 - 7.33 (m, 4H), 7.24 (t, J=8.8 Hz, 1H), 7.09 - 7.02 (m, 2H), 5.95 - 5.72 (m, 1H), 5.41 - 5.18 (m, 1H), 5.14 (d, J=3.6 Hz, 1H), 5.10 - 4.91 (m, 1H), 4.89 - 4.80 (m, 1H), 4.61 - 4.43 (m, 1H), 4.34 - 4.19 (m, 1H), 3.92 - 3.77 (m, 2H), 3.71 - 3.64 (m, 1H), 3.62 - 3.49 (m, 4H), 3.47 (s, 3H), 3.31 - 3.24 (m, 3H), 3.23 - 3.15 (m, 4H), 2.56 - 2.52 (m, 2H), 2.47 - 2.43 (m, 3H), 2.39 - 2.26 (m, 3H), 2.13 - 2.04 (m, 2H), 2.02 - 1.88 (m, 1H), 1.86 - 1.67 (m, 3H), 0.99 (d, J=6.4 Hz, 2H), 0.91 (d, J=6.8 Hz, 2H), 0.89 - 0.77 (m, 2H). 화합물 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[3-[4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3- 플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]프로폭시]이속사졸-5-일]-3-메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1R)-2-하이드록시-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (97.1 mg, 0.09 mmol, 22% 수율, 100% 순도)를 황색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 570.3 [M/2+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.91 (s, 1H), 9.86 (s, 1H), 9.04 - 8.91 (m, 1H), 8.65 (d, J=2.4 Hz, 1H), 8.54 (s, 1H), 8.42 (d, J=8.0 Hz, 1H), 8.07 (s, 1H), 7.66 - 7.57 (m, 3H), 7.48 - 7.36 (m, 4H), 7.26 (t, J=8.8 Hz, 1H), 7.15 - 7.00 (m, 2H), 5.77 (s, 1H), 5.41 - 5.19 (m, 1H), 5.13 (d, J=3.6 Hz, 1H), 4.84 (t, J=5.6 Hz, 2H), 4.46 (t, J=8.0 Hz, 1H), 4.34 - 4.21 (m, 1H), 3.90 - 3.80 (m, 2H), 3.75 - 3.52 (m, 4H), 3.48 (s, 2H), 3.43 - 3.35 (m, 3H), 3.32 - 3.25 (m, 3H), 3.24 - 3.15 (m, 4H), 2.47 - 2.42 (m, 4H), 2.40 - 2.34 (m, 2H), 2.26 (d, J=16.0 Hz, 2H), 2.14 - 1.98 (m, 3H), 1.85 - 1.73 (m, 3H), 1.00 - 0.94 (m, 3H), 0.93 - 0.86 (m, 3H).
(2S,4R)-1-((S)-2-(3-(3-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)아제티딘-1-일)이속사졸-5-일)-3-메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((R)-2-하이드록시-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 (실시예 507) 및 (2S,4R)-1-((R)-2-(3-(3-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)아제티딘-1-일)이속사졸-5-일)-3-메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((R)-2-하이드록시-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 (실시예 508)의 예시적인 합성
단계 1: 삼차-부틸 3-(4-(4-브로모페닐)피페라진-1-일)아제티딘-1-카르복실레이트 제조
메탄올 (130 mL) 및 아세트산 (13 mL) 중 1-(4-브로모페닐)피페라진 (8 g, 28.82 mmol, 1당량, 염화수소) 및 삼차-부틸 3-옥소아제티딘-1-카르복실레이트 (5.92 g, 34.58 mmol, 1.2당량)의 용액에 보란;2-메틸피리딘 (6.17 g, 57.64 mmol, 2당량)을 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 디클로로메탄(80 mL x 3)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(50 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르/에틸 아세테이트=15/1 내지 1:1)로 정제하였다. 화합물 삼차-부틸 3-[4-(4-브로모페닐) 피페라진-1-일] 아제티딘-1-카르복실레이트 (11.29 g, 26.49 mmol, 91% 수율, 93% 순도)를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 341.9 [M-56+1] +.
단계 2: 1-(아제티딘-3-일)-4-(4-브로모페닐)피페라진 제조
디클로로메탄(100 mL) 중 삼차-부틸 3-[4-(4-브로모페닐)피페라진-1-일]아제티딘-1-카르복실레이트 (11.29 g, 26.49 mmol, 1당량)의 용액에 트리플루오로아세트산(22 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 잔류물을 포화 중탄산 나트륨(100 mL)으로 pH 8로 조정하였다. 이 동안, 백색 침전물이 형성되었다. 여과에 의해 이를 수집하고 농축시켰다. 화합물 1-(아제티딘- 3-일)-4-(4-브로모페닐) 피페라진 (8.6 g, 미정제)을 백색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 298.0 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 8.74 (s, 1H), 7.34 (d, J=8.8 Hz, 2H), 6.91 (d, J=8.8 Hz, 2H), 4.04 - 3.95 (m, 2H), 3.87 (dd, J=6.4, 10.8 Hz, 2H), 3.31 - 3.27 (m, 1H), 3.19 - 3.10 (m, 4H), 2.47 - 2.42 (m, 4H).
단계 3: 메틸 2-(3-(3-(4-(4-브로모페닐)피페라진-1-일)아제티딘-1-일)이속사졸-5-일)-3-메틸부타노에이트 제조
N-메틸 피롤리돈(80 mL) 중 1-(아제티딘-3-일)-4-(4-브로모페닐)피페라진 (5 g, 16.88 mmol, 1당량)의 용액에 N,N-디이소프로필에틸아민 (6.54 g, 50.64 mmol, 8.82 mL, 3당량) 및 메틸 3-메틸-2-[3-(1,1,2,2,3,3,4,4,4-노나플루오로부틸설포닐옥시) 이속사졸-5-일]부타노에이트 (8.12 g, 16.88 mmol, 1당량)을 첨가하였다. 혼합물을 110℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 에틸 아세테이트(40 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(30 mL x 3)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 분취 역상 HPLC로 정제하였다. 포화 중탄산 나트륨으로 혼합물을 pH=7~8로 염기성화시켰다. 그런 다음 반응 혼합물을 에틸 아세테이트(60 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 포화 수성 염수(30 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 화합물 2-[3-[3-[4-(4- 브로모페닐)피페라진-1-일]아제티딘-1-일]이속사졸-5-일]-3-메틸-부타노에이트 (1.43 g, 2.78 mmol, 16% 수율, 92% 순도)를 황색 고체로서 수득하였다. 메틸 2-(3-하이드록시이속사졸-5-일)-3-메틸-부타노에이트 (2 g, 10.04 mmol, 59% 수율)를 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 478.9 [M+1] +.
단계 4: 메틸 2-(3-(3-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로-N-((2-(트리메틸실릴)에톡시)메틸)피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1-((2-(트리메틸실릴)에톡시)메틸)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)아제티딘-1-일)이속사졸-5-일)-3-메틸부타노에이트 제조
디옥산 (10 mL) 및 물(2 mL) 중 메틸 2-[3-[3-[4-(4-브로모페닐)피페라진-1-일]아제티딘-1-일]이속사졸 -5-일]-3-메틸-부타노에이트 (1.43 g, 3.00 mmol, 1당량), (3R)-N-[2,4-디플루오로-3-[5-(4,4,5,5- 테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]페닐]-3-플루오로-N-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤리딘-1-설폰아미드 (2.43 g, 3.00 mmol, 1당량), 4-디삼차-부틸포스파닐-N,N-디메틸-아닐린;디클로로팔라듐 (212 mg, 0.30 mmol, 0.1당량), 불화 세슘(1.82 g, 11.98 mmol, 4당량) 혼합물을 탈기하고 질소로 3회 퍼지하고, 그런 다음, 혼합물을 질소 대기 하에 100℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 에틸 아세테이트(40 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(25 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르/에틸 아세테이트=10:1 내지 1:1)로 정제하였다. 화합물 메틸 2-[3-[3-[4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)아미노]벤조일]-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-5- 일]페닐]피페라진-1-일]아제티딘-1-일]이속사졸-5-일]-3-메틸-부타노에이트 (1.95 g, 1.78 mmol, 59% 수율, 98% 순도)를 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 541.3 [M/2+1] +.
단계 5: 메틸 2-(3-(3-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)아제티딘-1-일)이속사졸-5-일)-3-메틸부타노에이트 제조
1,2-디클로로메탄 (6 mL) 중 메틸 2-[3-[3-[4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일] 설포닐-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)아미노]벤조일]-1-(2-트리메틸실릴에톡시메틸)피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]아제티딘-1-일]이속사졸-5-일]-3-메틸-부타노에이트 (1.95 g, 1.78 mmol, 1당량)의 용액에 트리플루오로아세트산 (3.05 g, 26.74 mmol, 2 mL, 15당량)을 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 16시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 화합물 메틸 2-[3-[3-[4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐 아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]아제티딘-1-일]이속사졸-5-일]-3-메틸-부타노에이트 (1.67 g, 미정제, 트리플루오로아세트산)를 황색 오일로서 수득하였는데, 이는 추가 정제 없이 다음 단계에 직접 사용되었다. LC/MS (ESI) m/z: 411.4 [M/2+1] +.
단계 6: 2-(3-(3-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)아제티딘-1-일)이속사졸-5-일)-3-메틸부탄산 제조
테트라하이드로푸란 (8 mL) 및 물(2 mL) 중 메틸 2-[3-[3-[4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1- 일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]아제티딘-1-일]이속사졸-5-일]-3-메틸-부타노에이트 (1.67 g, 1.79 mmol, 1당량, 트리플루오로아세테이트)의 용액에 수산화나트륨(285 mg, 7.15 mmol, 4당량)을 첨가하였다. 혼합물을 40℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 황산(1 M)으로 pH=5~6까지 산성화시켰다. 이어서 반응 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 반-분취 역상 HPLC로 정제하였다. 화합물 2-[3-[3-[4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노] 벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]아제티딘-1-일]이속사졸-5-일]-3-메틸-부탄산 (520 mg, 0.64 mmol, 36% 수율, 99% 순도)을 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 807.3 [M+1] +.
단계 7: (2S,4R)-1-(2-(3-(3-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)아제티딘-1-일)이속사졸-5-일)-3-메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((R)-2-하이드록시-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
N,N-디메틸포름아미드 (1 mL) 중 2-[3-[3-[4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일] 설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]아제티딘-1-일]이속사졸-5-일]-3-메틸-부탄산 (170 mg, 0.21 mmol, 1당량) 및 (2S,4R)-4-하이드록시- N-[(1R)-2-하이드록시-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (89 mg, 0.23 mmol, 1.1당량, 염화수소)의 용액에 하이드록시벤조트리아졸 (34 mg, 0.25 mmol, 1.2당량) N,N-디이소프로필에틸아민 (82 mg, 0.63 mmol, 0.1 mL, 3당량) 및 1-(3-디메틸아미노프로필)-3-에틸카르보디이미드 염화수소 (61 mg, 0.32 mmol, 1.5당량)을 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 디클로로메탄(30 mL x 2)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(20 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 분취-HPLC로 정제하였다. 화합물 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[3-[4- [4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]아제티딘-1-일]이속사졸-5-일]-3-메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1R)-2-하이드록시-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (160 mg, 0.14 mmol, 65% 수율, 97% 순도)을 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 568.9 [M/2+1] +.
단계 8: (2S,4R)-1-((S)-2-(3-(3-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)아제티딘-1-일)이속사졸-5-일)-3-메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((R)-2-하이드록시-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 및 (2S,4R)-1-((R)-2-(3-(3-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)아제티딘-1-일)이속사졸-5-일)-3-메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((R)-2-하이드록시-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
(2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[3-[4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일] 설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]아제티딘-1-일]이속사졸-5-일]-3-메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1R)-2-하이드록시-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (160 mg, 0.15 mmol, 1당량)를 SFC로 분리시켰다. 분획을 진공 중에서 농축시키고, 잔류물을 분취-HPLC로 정제하였다. 화합물 (2S, 4R)-1-[(2S)-2-[3-[3-[4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3- 플루오로피롤리딘-1-일] 설포닐아미노] 벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐] 피페라진-1-일]아제티딘-1-일]이속사졸-5-일]-3-메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1R)-2-하이드록시-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (38 mg, 0.03 mmol, 43% 수율, 98% 순도)을 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 568.8 [M/2+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.73 (s, 1H), 8.99 (s, 1H), 8.88 (d, J=8.4 Hz, 1H), 8.63 (d, J=2.0 Hz, 1H), 8.49 (s, 1H), 8.11 (d, J=8.4 Hz, 1H), 7.96 (s, 1H), 7.60 (d, J=8.4 Hz, 2H), 7.56 - 7.46 (m, 2H), 7.43 (d, J=8.0 Hz, 2H), 7.38 - 7.33 (m, 1H), 7.07 (d, J=8.8 Hz, 2H), 6.96 (s, 1H), 5.96 - 5.88 (m, 1H), 5.36 - 5.16 (m, 1H), 5.14 (d, J=3.6 Hz, 1H), 5.08 - 4.91 (m, 1H), 4.89 - 4.79 (m, 1H), 4.65 - 4.44 (m, 1H), 4.34 - 4.19 (m, 1H), 4.03 - 3.87 (m, 2H), 3.81 - 3.64 (m, 4H), 3.58 (dd, J=6.0, 12.0 Hz, 4H), 3.30 - 3.04 (m, 3H), 2.47 (d, J=2.4 Hz, 9H), 2.31 - 2.22 (m, 1H), 2.11 (s, 1H), 2.09 - 2.00 (m, 2H), 2.00 - 1.89 (m, 2H), 1.88 - 1.80 (m, 1H), 1.06 - 0.79 (m, 6H), 0.76 (d, J=6.8 Hz, 1H). 화합물 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[3-[4-[4 -[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3- 플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b] 피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]아제티딘-1-일]이속사졸-5-일]-3-메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1R)-2-하이드록시-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (61.1 mg, 0.05 mmol, 71% 수율, 98% 순도)을 황색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 568.7 [M/2+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.88 (s, 1H), 8.98 (s, 1H), 8.93 - 8.68 (m, 1H), 8.65 (d, J=2.0 Hz, 1H), 8.52 (s, 1H), 8.38 (d, J=8.0 Hz, 1H), 8.03 (s, 1H), 7.69 - 7.55 (m, 3H), 7.50 - 7.34 (m, 4H), 7.17 (t, J=8.8 Hz, 1H), 7.09 (d, J=8.8 Hz, 2H), 5.94 - 5.82 (m, 1H), 5.41 - 5.18 (m, 1H), 5.13 (d, J=3.6 Hz, 1H), 5.03 - 4.73 (m, 2H), 4.43 (t, J=8.0 Hz, 1H), 4.29 (s, 1H), 3.97 (br t, J=6.8 Hz, 2H), 3.83 - 3.67 (m, 4H), 3.67 - 3.54 (m, 4H), 3.29 - 3.20 (m, 6H), 3.17 (d, J=5.2 Hz, 1H), 2.57 - 2.52 (m, 3H), 2.46 (s, 4H), 2.28 - 2.17 (m, 1H), 2.11 (s, 1H), 2.09 - 1.91 (m, 3H), 1.87 - 1.76 (m, 1H), 1.04 - 0.74 (m, 6H).
3-(1-옥소-5-(피페라진-1-일)이소인돌린-2-일)피페리딘-2,6-디온(중간체 X)의 예시적인 합성
단계 1: 메틸 2-브로모-4-플루오로벤조에이트의 제조
메탄올(800 mL) 중 2-브로모-4-플루오로-벤조산 (100 g, 456.60 mmol, 1 당량)의 용액에 황산 이염화물(108.64 g, 913.21 mmol, 2당량)을 0℃에서 첨가하였다. 혼합물을 80℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 물(500 mL)로 희석하고 에틸 아세테이트(200 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 포화 중탄산 나트륨(200 mL) 및 포화 염수(200 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켜 메틸 2-브로모-4-플루오로-벤조에이트(102 g, 437.70 mmol, 95% 수율)를 갈색 오일로서 수득하였다.
단계 2: 삼차-부틸 4-(3-브로모-4-(메톡시카르보닐)페닐)피페라진-1-카르복실레이트 제조
디메틸설폭시드(500 mL) 중 메틸 2-브로모-4-플루오로-벤조에이트(90 g, 386.21 mmol, 1당량)의 용액에 삼차-부틸 피페라진-1-카르복실레이트(111.82 g, 502.07 mmol, 1.3 당량, 염산염) 및 N,N-디이소프로필에틸아민(199.66 g, 1.54 mol, 269 mL, 4당량)을 첨가하였다. 혼합물을 130℃로 가열하고 130℃에서 36시간 동안 교반하였다. 혼합물을 1.0 L 물에 붓고 에틸 아세테이트(500 mL x 2)로 추출하였다. 유기층을 물(1000 mL), 0.5 M 염산(500 mL), 포화 염수(500 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 (석유 에테르:에틸 아세테이트=5:1, 300 mL)로 연화시키고, 고형분을 여과하고 진공 중에서 건조시켰다. 삼차-부틸 4-(3-브로모-4-메톡시카르보닐-페닐)피페라진-1-카르복실레이트 (93 g, 232.92 mmol, 60% 수율)를 회백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 422.1 [M+23] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 7.73 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.18 (d, J=2.4 Hz, 1H), 6.98 (dd, J=8.8, 2.4 Hz, 1H), 3.77 (s, 3H), 3.45-3.42 (m, 4H), 3.34-3.31 (m, 4H), 1.42 (s, 9H).
단계 3: 2-브로모-4-(4-(삼차-부톡시카르보닐)피페라진-1-일)벤조산 제조
테트라하이드로푸란 (400 mL), 물(200 mL) 및 메탄올 (200 mL)의 혼합물 중 삼차-부틸 4-(3-브로모-4-메톡시카르보닐-페닐)피페라진-1-카르복실레이트 (92 g, 230.42 mmol, 1 당량)의 용액에 수산화나트륨(27.65 g, 691.25 mmol, 3 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 60℃에서 2시간 동안 교반하였다. 혼합물을 1.0 L 물에 붓고, 11.8 M 염산으로 pH를 5.0로 조정하고 나서, 에틸 아세테이트(800 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 진공 중에서 농축시켰다. 2-브로모-4-(4-삼차-부톡시카르보닐피페라진-1-일) 벤조산 (85 g, 220.63 mmol, 95% 수율)을 회백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 406.9 [M+23] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 7.75 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.15 (d, J=2.0 Hz, 1H), 6.96 (dd, J=8.8, 2.0 Hz, 1H), 3.44 - 3.42 (m, 4H), 3.34 - 3.31 (m, 4H), 1.42 (s, 9H).
단계 4: 4-(4-(삼차-부톡시카르보닐)피페라진-1-일)-2-포르밀벤조산 제조
테트라하이드로푸란(600 mL) 중 2-브로모-4-(4-삼차-부톡시카르보닐피페라진-1-일)벤조산 (54 g, 140.17 mmol, 1 당량)의 용액에 메틸 리튬(1.6 M, 88 mL, 1.0 당량)을 -70℃에서 첨가하였다. 혼합물을 -70℃에서 30분 동안 교반하고, n-부틸 리튬(2.5 M, 67 mL, 1.2 당량)을 -70℃에서 첨가하였다. 혼합물을 -70℃에서 30분 동안 교반한 다음, 디메틸포름아미드(30.74 g, 420.50 mmol, 32 mL, 3 당량)를 첨가하였다. 생성된 혼합물을 - 70 ~ - 50℃에서 또 다른 1시간 동안 교반하였다. 혼합물을 1.0 L 물에 붓고, 2.0 M 염산으로 pH를 5.0로 조정하고 나서, 에틸 아세테이트(800 mL x 3)로 추출하였다. 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 석유 에테르: 에틸 아세테이트(V/V=1:3, 500 mL)로 연화시켰다. 4-(4-삼차-부톡시카르보닐피페라진-1-일)-2-포르밀-벤조산 (36 g, 107.67 mmol, 77% 수율)을 갈색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 357.1 [M+23] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 7.98 (d, J=8.4 Hz, 1H), 7.58 (d, J=8.4 Hz, 1H), 7.12 (dd, J=8.4, 2.0 Hz, 1H), 6.48 (d, J=6.4 Hz, 1H), 3.60 - 3.39 (m, 8H), 1.43 (s, 9H).
단계 5: 4-(4-(삼차-부톡시카르보닐)피페라진-1-일)-2-(((2,6-디옥소피페리딘-3-일)아미노)메틸)벤조산 제조
메탄올(250 mL) 중 3-아미노피페리딘-2,6-디온 (11.81 g, 71.78 mmol, 1.2 당량, 염산염) 및 아세트산나트륨(9.81 g, 119.63 mmol, 2 당량)의 용액을 15℃에서 30분 동안 교반한 다음, 4-(4-삼차-부톡시카르보닐피페라진-1-일)-2-포르밀-벤조산 (20 g, 59.81 mmol, 1 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 추가 30분 동안 교반하고, 나트륨 시아노보로히드라이드(7.52 g, 119.63 mmol, 2 당량)를 첨가하였다. 생성된 혼합물을 15℃에서 또 다른 2시간 동안 교반하였다. 혼합물을 800 mL 물에 붓고, 2.0 M 염산으로 pH를 5.0로 조정하고 나서, 에틸 아세테이트(400 mL x 3)로 추출하였다. 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 석유 에테르: 에틸 아세테이트(V/V= 3:1, 200 mL)로 연화시켰다. 4-(4-삼차-부톡시카르보닐피페라진-1-일)-2-[[(2,6-디옥소-3-피페리딜)아미노]메틸]벤조산 (26 g, 49.38 mmol, 82% 수율, 84% 순도)을 회색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 447.1 [M+1] +.
단계 6: 삼차-부틸 4-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소이소인돌린-5-일)피페라진-1-카르복실레이트 제조
디메틸포름아미드(250 mL) 중 4-(4-삼차-부톡시카르보닐피페라진-1-일)-2-[[(2,6-디옥소-3-피페리딜)아미노] 메틸]벤조산 (27 g, 51.10 mmol, 1 당량) 및 O-벤조트리아졸-1-일-테트라메틸우로늄 헥사플루오로포스페이트 (23.31 g, 61.32 mmol, 1.2 당량)의 용액에 디이소프로필에틸아민 (19.81 g, 153.29 mmol, 3 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 1시간 동안 교반하였다. 혼합물을 800 mL의 물에 붓고, 혼합물을 15℃에서 30분 동안 교반하였다. 형성된 고체를 여과하고, 에틸 아세테이트 100 mL로 세척한 다음, 진공 중에서 건조시켰다. 삼차-부틸 4-[2-(2,6-디옥소-3-피페리딜)-1-옥소-이소인돌린-5-일]피페라진-1-카르복실레이트 (14.5 g, 33.84 mmol, 66% 수율)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 429.2 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 10.97 (s, 1H), 7.54 (d, J=8.4 Hz, 1H), 7.08 -7.06 (m, 2H), 5.03 (dd, J=13.2, 5.2 Hz, 1H), 4.36 - 4.19 (m, 2H), 3.48-3.45 (m, 4H), 3.27 - 3.26 (m, 4H), 2.89 - 2.87 (m, 1H), 2.60 - 2.56 (m, 1H), 2.38 - 2.34 (m, 1H), 1.98 - 1.96 (m, 1H), 1.43 (s, 9H).
단계 7: 3-(1-옥소-5-(피페라진-1-일)이소인돌린-2-일)피페리딘-2,6-디온 제조
염화수소/디옥산 (4.0 M, 250 mL) 중 삼차-부틸 4-[2-(2,6-디옥소-3-피페리딜)-1-옥소-이소인돌린-5-일]피페라진-1-카르복실레이트 (14.5 g, 33.84 mmol, 1 당량)의 현탁액을 15℃에서 3시간 동안 교반하였다. 용매를 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트 (50 mL)로 연화시켰다. 3-(1-옥소-5-피페라진-1-일-이소인돌린-2-일) 피페리딘-2,6-디온 (12 g, 32.89 mmol, 97% 수율, 염산염)을 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 329.1 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 10.98 (s, 1H), 9.43 (s, 2H), 7.58 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.16 - 7.11 (m, 2H), 5.07 (dd, J=13.2, 5.2 Hz, 1H), 4.38 - 4.21 (m, 2H), 3.55 - 3.53 (m, 4H), 3.20 - 3.19 (m, 4H), 2.90 - 2.86 (m, 1H), 2.60 - 2.56 (m, 1H), 2.38 - 2.34 (m, 1H), 1.98 - 1.96 (m, 1H).
(3R)-N-(3-(5-(4-(4-((1-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소이소인돌린-5-일)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 (예시적 화합물 522)의 예시적인 합성
단계 1: 5-(4-(디메톡시메틸)피페리딘-1-일)이소벤조푸란-1(3H)-온 제조
디메틸 설폭시드(20 mL) 중 5-플루오로-3H-이소벤조푸란-1-온 (1.6 g, 10.52 mmol, 1당량)의 용액에 4-(디메톡시메틸)피페리딘 (1.67 g, 10.52 mmol, 1당량) 및 N,N-디이소프로필에틸아민 (2.72 g, 21.04 mmol, 2당량)을 첨가하고, 반응물을 120℃에서 2시간 동안 교반하였다. 잔류물을 물(30 mL)로 세척하고 에틸 아세테이트(30 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(30 mL x 3)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트=20:1 내지 순수 에틸 아세테이트)로 정제하였다. 생성물 5-[4-(디메톡시메틸)-1-피페리딜]-3H-이소벤조푸란-1-온 (1.9 g, 6.52 mmol, 62% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 292.2 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 7.70 - 7.48 (m, 1H), 7.15 - 6.91 (m, 2H), 5.23 (s, 2H), 4.06 (d, J=6.8 Hz, 1H), 3.96 (d, J=13.2 Hz, 2H), 3.26 (s, 5H), 3.14 - 3.13 (m, 1H), 3.11 - 2.97 (m, 1H), 2.95 - 2.76 (m, 2H), 2.00 - 1.78 (m, 1H), 1.70 (d, J=12.8 Hz, 2H), 1.39 - 1.16 (m, 2H).
단계 2: 4-(4-(디메톡시메틸)피페리딘-1-일)-2-(하이드록시메틸)벤조산 제조
메탄올(10 mL) 중 5-[4-(디메톡시메틸)-1-피페리딜]-3H-이소벤조푸란-1-온 (1.9 g, 6.52 mmol, 1당량)의 용액에 수산화나트륨(1.30 g, 32.61 mmol, 5당량), 물(10 mL)을 첨가하고, 혼합물을 20℃에서 1시간 동안 교반하였다. 잔류물을 물(30 mL)로 세척하고 에틸 아세테이트(30 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(30 mL x 3)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 유기상을 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고, 여과물을 농축시켜 생성물 4-[4-(디메톡시메틸)-1-피페리딜]-2-(하이드록시메틸)벤조산 (1.64 g)을 무색 오일로서 수득하였다.
단계 3: 메틸 4-(4-(디메톡시메틸)피페리딘-1-일)-2-(하이드록시메틸)벤조에이트 제조
메탄올(10 mL) 및 에틸 아세테이트 (10 mL) 중 4-[4-(디메톡시메틸)-1-피페리딜]-2-(하이드록시메틸)벤조산 (1.64 g, 5.30 mmol, 1당량)의 용액에 (디아조메틸)트리메틸실란(2 M, 7.95 mL, 3당량)을 -10℃에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 -10℃에서 0.25시간 동안 교반하였다. 용액을 물(20 mL)로 급냉시키고 에틸 아세테이트(30 mL x 3)로 추출하였다. 유기층을 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하였다. 여과물을 농축시켜 생성물, 메틸 4-[4-(디메톡시메틸)-1-피페리딜]-2-(하이드록시메틸)벤조에이트(1.7 g, 5.26 mmol, 99% 수율)를 무색 오일로서 수득하였다.
단계 4: 메틸 2-(브로모메틸)-4-(4-(디메톡시메틸)피페리딘-1-일)벤조에이트 제조
테트라하이드로푸란(20 mL) 중 메틸 4-[4-(디메톡시메틸)-1-피페리딜]-2-(하이드록시메틸)벤조에이트(1.7 g, 5.26 mmol, 1당량) 용액에 퍼브로모메탄(2.62 g, 7.89 mmol, 1.5당량) 및 트리페닐포스핀(2.07 g, 7.89 mmol, 1.5당량)을 첨가하였다. 반응물을 20℃에서 1시간 동안 교반하였다. 용액을 물(20 mL)로 급냉시키고 에틸 아세테이트(30 mL x 3)로 추출하였다. 유기층을 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하였다. 여액을 농축시켜 미정제 생성물을 수득하였다. 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(이산화규소, 석유 에테르: 에틸 아세테이트= 40:1 내지 20:1)로 정제하였다. 생성물 메틸 2-(브로모메틸)-4-[4-(디메톡시메틸)-1-피페리딜]벤조에이트(1.2 g, 3.11 mmol, 59% 수율)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 388.1 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 7.96 - 7.87 (m, 1H), 6.95 - 6.74 (m, 2H), 4.97 (s, 2H), 4.07 (d, J=6.8 Hz, 1H), 3.94 - 3.83 (m, 5H), 3.38 (s, 6H), 2.84 (dt, J=2.0, 12.8 Hz, 2H), 1.94 - 1.76 (m, 3H), 1.61 - 1.33 (m, 3H).
단계 5: 3-(5-(4-(디메톡시메틸)피페리딘-1-일)-1-옥소이소인돌린-2-일)피페리딘-2,6-디온 제조
아세토니트릴(20 mL) 중 메틸 2-(브로모메틸)-4-([4-(디메톡시메틸)-1-피페리딜]벤조에이트(300 mg, 0.78 mmol, 1당량) 및 3-아미노피페리딘-2,6-디온(192 mg, 1.16 mmol, 1.5당량, HCl)의 용액에 N,N-디이소프로필에틸아민(301 mg, 2.33 mmol, 3당량)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 100℃에서 15시간 동안 교반하였다. 물(20 mL)을 용액에 첨가하고 디클로로메탄(30 mL x 3)으로 추출하였다. 유기층을 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하였다. 여액을 농축시켜 미정제 생성물을 수득하였다. 미정제 생성물을 25 oC에서 10분 동안 에틸 아세테이트(50 mL)로 연화시켰다. 생성물 3-[5-[4- (디메톡시메틸)-1-피페리딜]-1-옥소-이소인돌린-2-일]피페리딘-2,6-디온 (200 mg, 0.50 mmol, 64 % 수율)을 회색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 402.1 [M+1] +.
단계 6: 1-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소이소인돌린-5-일)피페리딘-4-카르브알데히드 제조
테트라하이드로푸란(1 mL) 및 물(0.2 mL) 중 3-[5-[4-(디메톡시메틸)-1-피페리딜]-1-옥소-이소인돌린-2-일]피페리딘 -2,6-디온 (50 mg, 0.13 mmol, 1당량)의 용액에 피리디늄 p-톨루엔설포네이트(63 mg, 0.25 umol, 2당량)를 첨가하고, 혼합물을 70℃에서 8시간 동안 교반하였다. 혼합물을 진공 중에서 농축시켜 생성물 1-[2-(2,6-디옥소-3-피페리딜)-1-옥소-이소인돌린 -5-일]피페리딘-4-카르브알데히드 (40 mg)를 무색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 356.2 [M+1] +.
단계 7: (3R)-N-(3-(5-(4-(4-((1-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소이소인돌린-5-일)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 제조
N,N-디메틸포름아미드 (2 mL) 중 1-[2-(2,6-디옥소-3-피페리딜)-1-옥소-이소인돌린-5-일]피페리딘-4-카르브알데히드 (50 mg, 0.14 mmol, 1당량) 및 (3R)-N-[2,4-디플루오로-3-[5-(4-피페라진-1-일페닐)-1H-피롤로 [2,3-b]피리딘-3-카르보닐]페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (83 mg, 0.14 mmol, 1당량)의 용액에 아세트산 (0.85 mg, 0.02 mmol, 0.1당량)을 첨가하여 25℃에서 pH를 5로 조정하고 20분 동안 교반하고, 그런 다음, 혼합물을 나트륨 시아노보로하이드라이드(18 mg, 0.28 mmol, 2당량)을 첨가하고, 혼합물을 25℃에서 1시간 동안 교반하였다. 잔류물을 여과하여 미정제 생성물을 수득하였다. 잔류물을 분취-HPLC로 정제하였다. 생성물 ((3R)-N-[3-[5-[4-[4-[[1-[2-(2,6-디옥소-3-피페리딜)-1- oxo-이소인돌린-5-일]-4-피페리딜]메틸]피페라진-1-일]페닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로-페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (37.7 mg, 0.04 mmol, 28% 수율, 98% 순도)을 녹색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 924.5 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 10.93 (s, 1H), 8.65 (d, J=2.0 Hz, 1H), 8.53 (s, 1H), 8.20 (s, 1H), 8.05 (s, 1H), 7.67 - 7.55 (m, 3H), 7.50 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.24 (t, J=8.3 Hz, 1H), 7.13 - 6.99 (m, 4H), 5.43 - 5.19 (m, 1H), 5.03 (dd, J=5.2, 13.2 Hz, 1H), 4.37 - 4.12 (m, 1H), 4.16 - 4.12 (m, 1H), 3.88 (d, J=12.4 Hz, 2H), 3.35 - 3.29 (m, 15H), 3.00 - 2.72 (m, 3H), 2.22 (d, J=6.4 Hz, 2H), 2.10 - 1.95 (m, 1H), 1.96 (dd, J=4.9, 10.0 Hz, 2H), 1.87 - 1.72 (m, 3H), 1.26 - 1.11 (m, 2H).
(3-(5-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)-1-옥소이소인돌린-2-일)-2,6-디옥소피페리딘-1-일)메틸 (2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사헵타헥사콘탄-67-일) 카보네이트 (예시적 화합물 862)의 예시적인 합성
단계 1: 클로로메틸 (2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사헵타헥사콘탄-67-일) 카보네이트 제조
테트라하이드로푸란 (200 mL) 중 2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-메톡시 에톡시)에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에탄올 (20 g, 19.98 mmol, 1당량) 및 피리딘 (6.32 g, 79.90 mmol, 6.5 mL, 4당량) 혼합물에 클로로메틸 카보노클로리데이트 (5.15 g, 39.95 mmol, 3.5 mL, 2당량)를 질소 분위기 하에 0℃에서 적가하였다. 혼합물을 30℃에서 12시간 동안 교반하였다. 물(300 mL)을 혼합물에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 디클로로메탄(200 mL x 3)으로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수로 세척하고(200 mL x 2), 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카겔 크로마토그래피(1000 메쉬 실리카 겔, 디클로로메탄/ 메탄올=100/1, 20/1)로 정제하였다. 생성물 클로로메틸 2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2- [2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-메톡시에톡시)에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에틸 카보네이트(18 g, 16.46 mmol, 82% 수율)를 연황색 고체로서 수득하였다.1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 5.73 (s, 2H), 4.43 - 4.29 (m, 2H), 3.85 - 3.44 (m, 86H), 3.38 (s, 3H).
단계 2: (3-(5-(4-(디메톡시메틸)피페리딘-1-일)-1-옥소이소인돌린-2-일)-2,6-디옥소피페리딘-1-일)메틸 (2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사헵타헥사콘탄-67-일) 카보네이트 제조
건조 디메틸포름아미드 (10 mL) 중 3-[5-[4-(디메톡시메틸)-1-피페리딜]-1-옥소-이소인돌린-2-일]피페리딘-2,6- 디온 (1 g, 2.49 mmol, 1당량) 및 클로로메틸 2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2- [2-[2-[2-[2-[2-(2-메톡시에톡시)에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에틸 카보네이트(3.23 g, 2.95 mmol, 1.19당량) 혼합물에 탄산세슘 분말(1.62 g, 4.98 mmol, 2당량)을 15℃에서 일회분으로 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 12시간 동안 교반하였다. 혼합물을 여과하였다. 여과물을 분취 역상 HPLC로 정제하였다. 생성물 [3-[5-[4-(디메톡시메틸)-1-피페리딜]-1-옥소-이소인돌린-2-일]-2,6-디옥소-1- 피페리딜]메틸 2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-메톡시 에톡시)에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에틸 카보네이트(1.4 g, 0.96 mmol, 38% 수율, 100% 순도)를 동결건조에 의해 회백색 오일로서 수득하였다.1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 9.72 (s, 1H), 7.80 - 7.66 (m, 1H), 7.06 - 6.95 (m, 1H), 6.93 - 6.82 (m, 1H), 5.98 - 5.76 (m, 2H), 5.31 (s, 2H), 5.22 (dd, J = 5.2, 13.6 Hz, 1H), 4.49 - 4.20 (m, 4H), 4.08 (d, J = 6.8 Hz, 1H), 3.95 - 3.44 (m, 87H), 3.38 (s, 8H), 3.11 - 2.76 (m, 4H), 2.33 (dq, J = 4.4, 13.2 Hz, 1H), 2.24 - 2.12 (m, 1H), 1.93 - 1.83 (m, 2H), 1.54 - 1.34 (m, 2H).
단계 3: (3-(5-(4-포르밀피페리딘-1-일)-1-옥소이소인돌린-2-일)-2,6-디옥소피페리딘-1-일)메틸 (2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사헵타헥사콘탄-67-일) 카보네이트 제조
디클로로메탄 (20 mL) 중 [3-[5-[4-(디메톡시메틸)-1-피페리딜]-1-옥소-이소인돌린-2-일]-2,6-디옥소-1- 피페리딜]메틸 2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-메톡시 에톡시)에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에틸 카보네이트(1.4 g, 0.96 mmol, 1당량)의 혼합물에 트리플루오로아세트산 (5.47 g, 47.99 mmol, 3.5 mL, 50당량)을 15℃에서 일회분으로 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 12시간 동안 교반하였다. 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 생성물 [3-[5-(4-포르밀-1-피페리딜)-1-옥소- 이소인돌린-2-일]-2,6-디옥소-1-피페리딜]메틸 2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2- [2-[2-[2-[2-[2-(2-메톡시에톡시)에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에틸 카보네이트(1.4 g, 미정제)를 갈색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 707.3 [M/2+1] +.
단계 4: (3-(5-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)-1-옥소이소인돌린-2-일)-2,6-디옥소피페리딘-1-일)메틸 (2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사헵타헥사콘탄-67-일) 카보네이트 제조
디메틸포름아미드 (2 mL) 중 [3-[5-(4-포르밀-1-피페리딜)-1-옥소-이소인돌린-2-일]-2,6-디옥소-1-피페리딜] 메틸 2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-메톡시에톡시)에톡시] 에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에틸 카보네이트(200 mg, 0.14 mmol, 1당량) 및 (3R)-N-[2,4-디플루오로-3-[5-(4-피페라진-1-일페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3- 카르보닐]페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (83 mg, 0.14 mmol, 1당량)의 혼합물에 아세트산 나트륨(12 mg, 0.14 mmol, 1당량)을 첨가하여 pH=8로 조정하였다. 그 후, 아세트산(42 mg, 0.71 mmol, 5당량)을 일회분으로 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 10분 동안 교반하였다. 이어서 나트륨 시아노보로히드라이드(18 mg, 0.28 mmol, 2당량)를 일회분으로 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 1시간 동안 교반하였다. 혼합물을 여과하여 여과물을 수득하였다. 황색 여과물을 반-분취 역상 HPLC로 정제하였다. 생성물 [3-[5-[4-[[4-[4-[3-[2,6- 디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]메틸]-1-피페리딜]-1-옥소-이소인돌린-2-일]-2,6-디옥소-1-피페리딜]메틸 2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-메톡시에톡시)에톡시] 에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에틸 카보네이트(203.4 mg, 0.10 mmol, 46% 수율, 99% 순도, 포름산염)을 황색 수지로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 991.7 [M/2+1] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 8.87 (s, 1H), 8.62 (d, J = 2.0 Hz, 1H), 8.26 (s, 1H), 7.80 - 7.67 (m, 3H), 7.60 (d, J = 8.8 Hz, 2H), 7.09 - 6.96 (m, 4H), 6.89 (s, 1H), 5.97 - 5.75 (m, 2H), 5.31 (s, 1H), 5.30 - 5.13 (m, 2H), 4.49 - 4.17 (m, 4H), 3.86 (d, J = 12.4 Hz, 2H), 3.74 - 3.53 (m, 90H), 3.38 (s, 3H), 3.31 (s, 4H), 3.07 - 3.00 (m, 1H), 2.93 - 2.84 (m, 3H), 2.69 - 2.62 (m, 4H), 2.38 - 1.84 (m, 10H), 1.42 - 1.32 (m, 2H).
(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-5-(4-(4-((1-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소이소인돌린-5-일)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-1-일)메틸 69-메틸-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헵타콘탄-70-오에이트(예시적 화합물 866)의 예시적인 합성
단계 1: 클로로메틸 69-메틸-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헵타콘탄-70-오에이트 제조
2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-메톡시에톡시)에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]프로판산 (0.90 g, 0.84 mmol, 1당량)을 디클로로메탄 (10 mL) 및 물(10 mL) 중 황산수소;테트라부틸암모늄(28 mg, 0.08 mmol, 0.1당량) 및 탄산칼륨 (579 mg, 4.19 mmol, 5당량)의 혼합물에 첨가하였다. 그런 다음, 디클로로메탄(5 mL) 중 클로로(클로로설포닐옥시)메탄(415 mg, 2.52 mmol, 3당량)의 혼합물을 상기 혼합물에 적가하였다. 혼합물을 질소 하 20℃에서 10시간 동안 교반하였다. 디클로로메탄(20 mL) 및 물(10 mL)로 혼합물을 희석시키고, 층을 분리하였다. 수용액 층을 디클로로메탄(50 mL x 3)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 감압 하에서 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피(디클로로메탄:메탄올 = 1:0 내지 15:1)로 정제하여 클로로메틸 2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2 -[2-[2-[2-[2-[2-(2-메톡시에톡시)에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]프로파노에이트 (0.50 g, 0.45 mmol, 53% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다.1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 5.82 - 5.72 (m, 2H), 4.15 (q, J=6.8 Hz, 1H), 3.71 - 3.63 (m, 114H), 3.58 - 3.54 (m, 2H), 3.39 (s, 3H), 1.45 (d, J=6.8 Hz, 3H).
단계 2: (3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-5-(4-(4-((1-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소이소인돌린-5-일)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-1-일)메틸 69-메틸-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헵타콘탄-70-오에이트 제조
N,N-디메틸포름아미드 (3 mL) 중 (3R)-N-[3-[5-[4-[4-[[1-[2-(2,6-디옥소-3-피페리딜)-1-옥소-이소인돌린-5-일] -4-피페리딜]메틸]피페라진-1-일]페닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로-페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (0.23 g, 0.25 mmol, 1당량) 및 클로로메틸 2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-메톡시에톡시)에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]프로파노에이트 (418 mg, 0.37 mmol, 1.5당량)의 혼합물에 탄산칼륨(103 mg, 0.75 mmol, 3당량)을 첨가하였다. 혼합물을 40℃에서 5시간 동안 교반하였다. 혼합물을 여과하여 잔류물을 수득하였다. 잔류물을 반-분취 역상 HPLC로 정제하고, 그런 다음, 분취 박층 크로마토그래피(디클로로메탄: 메탄올 = 15: 1)로 추가 정제하여 [3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-5-[4-[4-[[1-[2-(2,6-디옥소-3-피페리딜)-1-옥소-이소인돌린-5-일]-4-피페리딜]메틸]피페라진-1-일]페닐]피롤로[2,3-b]피리딘-1-일]메틸2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-메톡시에톡시)에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]프로파노에이트 (36.3 mg, 0.02 mmol, 6% 수율, 95% 순도, 포름산)을 황색 수지로서 수득하였다. 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 8.84 (d, J=2.0 Hz, 1H), 8.68 (d, J=2.0 Hz, 1H), 8.11 (s, 1H), 7.86 (s, 1H), 7.80 - 7.70 (m, 2H), 7.60 (d, J=8.8 Hz, 2H), 7.08 - 6.97 (m, 4H), 6.89 (s, 1H), 6.38 - 6.26 (m, 2H), 5.36 - 5.16 (m, 2H), 4.46 - 4.36 (m, 1H), 4.29 - 4.23 (m, 1H), 4.07 (q, J=6.8 Hz, 1H), 3.90 - 3.78 (m, 4H), 3.73 - 3.44 (m, 112H), 3.38 (s, 3H), 3.36 - 3.22 (m, 2H), 2.98 - 2.50 (m, 7H), 2.44 - 2.14 (m, 6H), 2.09 - 1.91 (m, 6H), 1.38 - 1.32 (m, 5H).
(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-5-(4-(4-((1-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소이소인돌린-5-일)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-1-일)메틸 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헵타콘탄-70-오에이트 (예시적 화합물 860)의 예시적인 합성
단계 1: 삼차-부틸 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헵타콘탄-70-오에이트 제조
톨루엔 (500 mL) 중 2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2- 메톡시에톡시)에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에탄올 (50.00 g, 49.94 mmol, 1당량) 및 나트륨; 2-메틸프로판-2-올레이트 (24.00 g, 249.70 mmol, 5.0당량)의 혼합물을 125℃에서 2시간 동안 교반하고, 그런 다음, 반응 혼합물을 80℃로 냉각시키고, 삼차-부틸 2-브로모아세테이트(97.41 g, 499.40 mmol, 73.80 mL, 10.0당량)을 혼합물에 첨가하였다. 혼합물을 125℃에서 28시간 동안 교반하였다. 혼합물을 셀라이트 패드를 통해 여과하였다. 뜨거운 톨루엔(~ 70℃, 100 mL x 3)으로 패드를 헹구고, 합쳐진 여과물을 진공 중에서 농축시켰다. 생성된 오일을 에틸 아세테이트 (100 mL)에 취하고, 격렬하게 교반하면서 석유 에테르(600 mL)에 첨가하였다. 15분 동안 방치한 후, 침전물을 수집하고, 석유 에테르로 함께 세척하고, 진공 중에서 건조시켜 삼차-부틸 2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-메톡시에톡시) 에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]아세테이트 (40.00 g, 35.86 mmol, 71% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다. 생성물을 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트:디클로로메탄:메탄올 = 5:1:0:0 내지 0:0:20:1)로 정제하여 삼차-부틸 2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2- [2-[2-(2-메톡시에톡시)에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]아세테이트 (92% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다.1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 4.02 (s, 2H), 3.67 - 3.62 (m, 90H), 3.57 - 3.52 (m, 2H), 3.38 (s, 3H), 1.47 (s, 9H).
단계 2: 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헵타콘탄-70-오익산 제조
디클로로메탄 (100 mL) 중 삼차-부틸 2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2- [2-(2-메톡시에톡시)에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]아세테이트 (12.00 g, 10.76 mmol, 1당량)의 혼합물에 트리플루오로아세트산 (405.18 mmol, 30 mL, 37.66당량)을 첨가하였다. 혼합물을 20℃에서 6시간 동안 교반하였다. 혼합물을 감압 하에 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 잔류물을 메틸 삼차-부틸 에테르(100 mL)로 채우고 20℃에서 2시간 동안 교반하였다. 혼합물을 여과하고, 케이크를 메틸 삼차-부틸 에테르(50 mL x 3)로 세척한 다음, 감압 하에 농축시켜 2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2- (2-메톡시에톡시)에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]아세트산 (11.00 g, 10.38 mmol, 96% 수율)을 황색 고무질로서 수득하였다.1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 4.19 (s, 2H), 3.81 - 3.75 (m, 2H), 3.67 (s, 100H), 3.61 - 3.57 (m, 2H), 3.41 (s, 3H).
단계 3: 클로로메틸 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헵타콘탄-70-오에이트 제조
2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-메톡시에톡시)에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]아세트산 (5.00 g, 4.72 mmol, 1당량)을 디클로로메탄 (20 mL) 및 물(20 mL) 중 황산수소;테트라부틸암모늄(160 mg, 0.47 mmol, 0.1당량) 및 탄산칼륨(2.61 g, 18.88 mmol, 4당량)의 혼합물에 첨가하였다. 그런 다음, 디클로로메탄(5 mL) 중 클로로(클로로설포닐옥시)메탄(1.17 g, 7.08 mmol, 1.5당량)의 용액을 혼합물에 적가하였다. 혼합물을 질소 하 20℃에서 10시간 동안 교반하였다. 물(20 mL) 및 디클로로메탄(30 mL)으로 혼합물을 희석시키고, 층을 분리하였다. 수용액 층을 디클로로메탄(50 mL x 3)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 감압 하에서 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피(디클로로메탄:메탄올 = 1:0 내지 10:1)로 정제하여 클로로메틸 2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2- [2-[2-(2-메톡시에톡시)에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]아세테이트 (3.00 g, 2.71 mmol, 57% 수율)을 황색 고무질로서 수득하였다.1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 5.72 - 5.68 (m, 2H), 4.26 - 4.15 (m, 2H), 3.72 - 3.67 (m, 2H), 3.58 (d, J=4.6 Hz, 86H), 3.51 - 3.45 (m, 2H), 3.34 - 3.29 (m, 3H).
단계 4: (3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-5-(4-(4-((1-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소이소인돌린-5-일)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-1-일)메틸 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헵타콘탄-70-오에이트 제조
DMF (1 mL) 중 (3R)-N-[3-[5-[4-[4-[[1-[2-(2,6-디옥소-3-피페리딜)-1-옥소-이소인돌린 -5-일]-4-피페리딜]메틸]피페라진-1-일]페닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로-페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (120 mg, 0.13 mmol, 1당량) 및 클로로메틸 2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-메톡시 에톡시)에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]아세테이트 (172 mg, 0.16 mmol, 1.2당량)의 혼합물에 탄산칼륨(54 mg, 0.39 mmol, 3당량)을 첨가하였다. 혼합물을 40℃에서 5시간 동안 교반하였다. 혼합물을 여과하여 잔류물을 수득하였다. 잔류물을 반-분취 역상 HPLC로 정제하였다. 화합물을 분취-TLC(디클로로메탄:메탄올 = 15:1)로 정제하였다. 화합물을 반-분취 역상 HPLC로 추가로 정제하여 [3-[2,6-디플루오로 -3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-5-[4-[4-[[1-[2-(2,6-디옥소-3-피페리딜)-1-옥소-이소인돌린-5-일]-4-피페리딜]메틸]피페라진-1-일]페닐]피롤로[2,3-b]피리딘-1-일]메틸 2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-메톡시에톡시) 에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]아세테이트 (36.53 mg, 0.02 mmol, 13% 수율, 96% 순도, 포름산)을 황색 수지로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 1020.2 [M/2+1] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 8.84 (d, J=2.0 Hz, 1H), 8.69 (d, J=2.0 Hz, 1H), 8.50 - 8.16 (m, 1H), 7.86 (s, 1H), 7.80 - 7.68 (m, 2H), 7.60 (d, J=8.4 Hz, 2H), 7.10 - 6.97 (m, 4H), 6.90 (s, 1H), 6.37 - 6.29 (m, 2H), 5.37 - 5.13 (m, 2H), 4.46 - 4.35 (m, 1H), 4.31 - 4.16 (m, 3H), 3.91 - 3.79 (m, 2H), 3.73 - 3.54 (m, 100H), 3.52 - 3.43 (m, 2H), 3.39 (s, 3H), 3.34 - 3.24 (m, 4H), 2.95 - 2.81 (m, 4H), 2.67 - 2.59 (m, 4H), 2.36 - 1.76 (m, 10H), 1.42 - 1.29 (m, 2H).
(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-5-(4-(4-((1-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소이소인돌린-5-일)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-1-일)메틸 (2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사헵타헥사콘탄-67-일) 카보네이트 (예시적 화합물 857)의 예시적인 합성
단계 1: (3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-5-(4-(4-((1-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소이소인돌린-5-일)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-1-일)메틸 (2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사헵타헥사콘탄-67-일) 카보네이트 제조
N,N-디메틸포름아미드 (3 mL) 중 클로로메틸 2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2- [2-(2-메톡시에톡시)에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에틸 카보네이트 (189 mg, 0.17 mmol, 1.00당량), (3R)-N-[3-[5-[4-[4-[[1-[2-(2,6-디옥소3-피페리딜) -1-옥소-이소인돌린-5-일]-4-피페리딜]메틸]피페라진-1-일]페닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로-페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (160 mg, 0.17 mmol, 1.00당량) 및 탄산칼륨(71 mg, 0.52 mmol, 3.00당량)의 혼합물을 40℃에서 5시간 동안 교반하였다. 혼합물을 여과하고 감압 하에 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 잔류물을 반-분취 역상 HPLC로 먼저 정제하고, 이어서, 분취 TLC(디클로로메탄: 메탄올 = 15:1, Rf=0.2)로 정제하여 [3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-5-[4-[4- [[1-[2-(2,6-디옥소-3-피페리딜)-1-옥소-이소인돌린-5-일]-4-피페리딜]메틸]피페라진-1-일]페닐]피롤로[2,3-b]피리딘-1-일]메틸 -2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-메톡시에톡시)에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에틸 카보네이트 (49.4 mg, 0.02 mmol, 14% 수율, 95% 순도)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 881.0 [M/2+1] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 8.82 (d, J=2.0 Hz, 1H), 8.68 (d, J=2.0 Hz, 1H), 8.21 (br s, 1H), 7.86 (s, 1H), 7.78 - 7.69 (m, 2H), 7.59 (d, J=8.8 Hz, 2H), 7.09 - 6.97 (m, 5H), 6.89 (s, 1H), 6.28 (s, 2H), 5.33 - 5.16 (m, 2H), 4.44 - 4.36 (m, 1H), 4.31 - 4.22 (m, 3H), 3.86 (d, J=12.8 Hz, 3H), 3.73 - 3.42 (m, 76H), 3.38 (s, 3H), 3.32 - 3.25 (m, 4H), 2.95 - 2.59 (m, 9H), 2.40 - 1.73 (m, 15H), 1.42 - 1.23 (m, 3H).
(3R)-N-(3-(5-(4-(6-((1-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소이소인돌린-5-일)피페리딘-4-일)메틸)-2,6-di아자스피로[3.3]헵탄-2-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 (예시적 화합물 536)의 예시적인 합성
단계 1: 삼차-부틸 6-(4-브로모페닐)-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트 제조
250-mL의 3-목 둥근 바닥 플라스크에, 옥살산; 삼차-부틸 2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트 (1.45 g, 5.029 mmol, 1당량), (4-브로모페닐)보론산(1.20 g, 5.975 mmol, 1.19당량), TEA (2.53 g, 25.002 mmol, 4.97당량), Cu(OAc)2 (1.36 g, 7.488 mmol, 1.49당량), DCM (150 mL), 4A MS (5 g)을 넣었다. 혼합물을 공기로 퍼지하고 실온에서 12시간 동안 교반하였다. 고체를 걸러냈다. 여액을 물(100 mL)로 세척하고, 무수 황산 나트륨으로 건조시키고, 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1/5)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 1.02 g (57%)의 삼차-부틸 6-(4-브로모페닐)-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 352.90/354.90 [M+1] +.
단계 2: 삼차-부틸 6-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트 제조
질소의 불활성 대기로 퍼지되고 유지된 30-mL 밀봉된 튜브에, 삼차-부틸 6-(4-브로모페닐)-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트 (706.40 mg, 2.000 mmol, 1.00당량), 4,4,5,5-테트라메틸-2-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-1,3,2-디옥사보로란 (761.70 mg, 3.000 mmol, 1.50당량), KOAc (588.00 mg, 5.991 mmol, 3.00당량), Pd(dppf)Cl2 .CH2Cl2 (163.30 mg, 0.200 mmol, 0.10당량), DMSO (12.00 mL)을 넣었다. 생성된 혼합물을 오일조에서 90℃에서 5시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 실온으로 냉각시킨 후, 물(100 mL)로 희석하였다. 생성된 혼합물을 에틸 아세테이트(100 mL x 2)로 추출하고, 유기층을 합쳤다. 유기물을 염수(100 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1/5)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 743 mg (93%)의 삼차-부틸 6-[4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐]-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 401.05 [M+1] +.
단계 3: 삼차-부틸 (R)-6-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-((3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트 제조
질소의 불활성 대기로 퍼지되고 유지되는 30-mL 밀봉 튜브에, 삼차-부틸 6-[4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐]-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트 (288.20 mg, 0.720 mmol, 1.20당량), (3R)-N-(3-[5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 (302.00 mg, 0.600 mmol, 1.00당량), K2CO3 (248.80 mg, 1.800 mmol, 3.00당량), Pd(dppf)Cl2 .CH2Cl2 (49.00 mg, 0.060 mmol, 0.10당량), 디옥산 (12.00 mL), H2O (2.00 mL)를 넣었다. 생성된 혼합물을 오일조에서 95℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 실온으로 냉각시킨 후, 물(50 mL)로 희석하였다. 생성된 혼합물을 에틸 아세테이트(80 mL x 2)로 추출하고, 유기층을 합치고 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 플래쉬 크로마토그래피(CH2Cl2 / MeOH 30:1)로 정제한 다음, 분취-TLC (CH2Cl2 / MeOH 10:1)로 정제하였다. 이를 통해 203 mg (49%)의 삼차-부틸 6-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 697.10 [M+1] +.
단계 4: (R)-N-(3-(5-(4-(2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 제조
100-mL 둥근 바닥 플라스크에, 삼차-부틸 6-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트 (203.00 mg, 0.291 mmol, 1.00당량), DCM (6.00 mL), TFA (1.50 mL)을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. DIEA를 사용하여 산을 중화시켰다. 이를 통해 DCM 중 173.8 mg (99.98%)의 (3R)-N-[3-[5-(4-[2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-일]페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로페닐]-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드를 연갈색 용액으로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 597.10 [M+1] +.
단계 5: 메틸 2-시아노-4-(4-(하이드록시메틸)피페리딘-1-일)벤조에이트 제조
100-mL 둥근 바닥 플라스크에, 메틸 2-시아노-4-플루오로벤조에이트(3.58 g, 19.983 mmol, 1당량), (피페리딘-4-일)메탄올(3.45 g, 29.954 mmol, 1.50당량), DIEA(9.9 mL, 56.837 mmol, 2.84당량), DMSO(40 mL)를 넣었다. 생성된 혼합물을 오일조에서 110℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 실온으로 냉각시킨 후, 물(200 mL)로 희석하였다. 생성된 혼합물을 에틸 아세테이트(200 mL x 2)로 추출하고, 유기층을 합쳤다. 합쳐진 유기층을 염수(200 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1/1)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 5.21 g(95%)의 메틸 2-시아노-4-[4-(하이드록시메틸)피페리딘-1-일]벤조에이트를 황색 녹색 반고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 274.95 [M+1] +.
단계 6: 메틸 2-포르밀-4-(4-(하이드록시메틸)피페리딘-1-일)벤조에이트 제조
질소의 불활성 대기로 퍼지되고 유지된 100-mL 둥근 바닥 플라스크에, H2O (10 mL), AcOH (10 mL), 피리딘 (20 mL), 메틸 2-시아노-4-[4-(하이드록시메틸)피페리딘-1-일]벤조에이트 (2.3 g, 8.384 mmol, 1당량), 차아인산나트륨 일수화물(8.89 g, 83.873 mmol, 10.00당량), Raney-Ni(1 g, 11.672 mmol, 1.39당량)를 넣었다. 생성된 혼합물을 오일조에서 70℃에서 16시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 실온으로 냉각시키고 고체를 걸러냈다. 여액을 물(100 mL)로 희석하고 에틸 아세테이트(100 mL x 2)로 추출하였다. 유기층을 합치고 염수(100 mL x 2)로 세척하였다. 유기물을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1/1)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 553 mg(24%)의 메틸 2-포르밀-4-[4-(하이드록시메틸)피페리딘-1-일]벤조에이트를 황녹색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 277.95 [M+1] +.
단계 7: 3-(5-(4-(하이드록시메틸)피페리딘-1-일)-1-옥소이소인돌린-2-일)피페리딘-2,6-디온 제조
100-mL 둥근 바닥 플라스크에, 메틸 2-포르밀-4-[4-(하이드록시메틸)피페리딘-1-일]벤조에이트 (500 mg, 1.803 mmol, 1당량), 3-아미노피페리딘-2,6-디온 염화수소 (356.1 mg, 2.164 mmol, 1.20당량), DIEA (0.6 mL), DCM (30 mL), AcOH (1 mL)를 넣었다. 생성된 혼합물을 오일조에서 35℃에서 4시간 동안 교반하였다. 그런 다음, NaBH(OAc)3 (1.15 g, 5.426 mmol, 3.01당량)을 첨가하고, 생성된 혼합물을 실온에서 16시간 동안, 교반하면서, 추가로 반응시켰다. 그런 다음, 물(50 mL)을 첨가하여 반응물을 급냉시키고 포화 NaHCO3을 사용하여 pH를 8로 조정하였다. 생성된 혼합물을 DCM/MeOH (10/1, 100 mL x 6)로 추출하고, 유기층을 합쳤다. 유기물을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(20/1)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 504 mg(78%)의 3-[5-[4-(하이드록시메틸)피페리딘-1-일]-1-옥소-2,3-디하이드로-1H-isoindol-2-일]피페리딘-2,6-디온을 연녹색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 358.00 [M+1] +.
단계 8: 1-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소이소인돌린-5-일)피페리딘-4-카르브알데히드 제조
250-mL 둥근 바닥 플라스크에, 3-[5-[4-(하이드록시메틸)피페리딘-1-일]-1-옥소-2,3-디하이드로-1H-이소인돌-2-일]피페리딘-2,6-디온 (150.00 mg, 0.420 mmol, 1.00당량), DCM (40.00 mL), DMP (356.00 mg, 0.839 mmol, 2.00당량)를 넣었다. 생성된 혼합물을 오일조에서 35℃에서 1시간 동안 교반하였다. 고체를 걸러내고, 여액을 진공 하에 농축시켰다. 잔류물을 분취 TLC(CH2Cl2 / MeOH 8:1)로 정제하였다. 이를 통해 115 mg(77%)의 1-[2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소-2,3-디하이드로-1H-이소인돌-5-일]피페리딘-4-카르브알데히드를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 355.95 [M+1] +.
단계 9: (3R)-N-(3-(5-(4-(6-((1-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소이소인돌린-5-일)피페리딘-4-일)메틸)-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 제조
100-mL 둥근 바닥 플라스크에, (3R)-N-[3-[5-(4-[2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-일]페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로페닐]-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 (173.80 mg, 0.291 mmol, 1.00당량), 1-[2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소-2,3-디하이드로-1H-이소인돌-5-일]피페리딘-4-카르브알데히드 (113.90 mg, 0.320 mmol, 1.10당량), DCM (40.00 mL)을 넣었다. 생성된 용액을 오일조에서 35℃에서 2시간 동안 교반하였다. 그런 다음, NaBH3CN (54.80 mg, 0.872 mmol, 2.99당량)을 첨가하고, 생성된 혼합물을, 실온에서 추가로 0.5시간 동안, 교반하면서, 반응시켰다. 이어서, 반응물을 물(50 mL)의 첨가로 급냉시키고 DCM/MeOH (10/1, 60 mL x 2)으로 추출하였다. 유기층을 합치고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 분취 TLC(CH2Cl2 / MeOH 8:1)로 정제하였다. 이를 통해 69.0 mg(25%)의 (3R)-N-[3-(5-[4-[6-([1-[2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소-2,3-디하이드로-1H-이소인돌-5-일]피페리딘-4-일]메틸)-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-일]페닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐]-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드를 황녹색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 936.25 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.90 (s, 1H), 10.96 (s, 1H), 8.62 (s, 1H), 8.50 (s, 1H), 8.07 (s, 1H), 7.66-7.49 (m, 4H), 7.29-7.23 (m, 1H), 7.05-7.02 (m, 2H), 6.58-6.55 (m, 2H), 5.30 (d, J=52.8 Hz, 1H), 5.08-5.02 (m, 1H), 4.35-4.16 (m, 2H), 3.94-3.84 (m, 6H), 3.51-3.49 (m, 1H), 3.39-3.38 (m, 5H), 3.30-3.23 (m, 1H), 2.91-2.76 (m, 3H), 2.61-2.55 (m, 1H), 2.39-2.35 (m, 3H), 2.18-1.93 (m, 3H), 1.77-1.73 (m, 2H), 1.52 (s, 1H), 1.23-1.18 (m, 4H).
(3R)-N-(3-(5-(4-(4-((6-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소이소인돌린-5-일)-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-일)메틸)피페리딘-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 (예시적 화합물 537)의 예시적인 합성
단계 1: 삼차-부틸 6-(3-시아노-4-(메톡시카르보닐)페닐)-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트 제조
30-mL 밀봉 튜브에, 메틸 2-시아노-4-플루오로벤조에이트(896.00 mg, 5.001 mmol, 1.00당량), 옥살산; 삼차-부틸 2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트 (1.59 g, 5.515 mmol, 1.10당량), DIEA (4.20 mL, 24.113 mmol, 4.82당량), DMSO (12.00 mL)을 넣었다. 생성된 혼합물을 오일조에서 110℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 실온으로 냉각시킨 후, 물(100 mL)로 희석하였다. 생성된 혼합물을 에틸 아세테이트(100 mL x 2)로 추출하고, 유기층을 합쳤다. 유기물을 염수(100 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1/1)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 1.75 g(98%)의 삼차-부틸 6-[3-시아노-4-(메톡시카르보닐)페닐]-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트를 황녹색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 358.00 [M+1] +.
단계 2: 삼차-부틸 6-(3-포르밀-4-(메톡시카르보닐)페닐)-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트 제조
질소의 불활성 대기로 퍼지되고 유지된 250-mL 둥근 바닥 플라스크에, H2O (15.00 mL), AcOH (15.00 mL), 피리딘 (30.00 mL), 삼차-부틸 6-[3-시아노-4-(메톡시카르보닐)페닐]-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트 (1.66 g, 4.645 mmol, 1.00당량), 차아인산나트륨 일수화물(4.89 g, 46.135 mmol, 9.93당량), Raney-Ni (1.00 g, 11.672 mmol, 2.51당량)을 넣었다. 생성된 혼합물을 오일조에서 70℃에서 4시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 실온으로 냉각시킨 후, 물(150 mL)로 희석하였다. 고체를 걸러내고 여과물에 포화 NaHCO3을 첨가하여 pH를 8로 조정하였다. 생성된 혼합물을 에틸 아세테이트(200 mL x 2)로 추출하고, 유기층을 합쳤다. 유기물을 염수(200 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1/1)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 500 mg(45%)의 삼차-부틸 6-[3-포르밀-4-(메톡시카르보닐)페닐]-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트를 황녹색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 361.00 [M+1] +.
단계 3: 삼차-부틸 6-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소이소인돌린-5-일)-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트 제조
100-mL 둥근 바닥 플라스크에, 삼차-부틸 6-[3-포르밀-4-(메톡시카르보닐)페닐]-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트 (684.80 mg, 1.900 mmol, 1.00당량), 3-아미노피페리딘-2,6-디온 염화수소 (375.30 mg, 2.280 mmol, 1.20당량), DCM (30.00 mL), DIEA (0.80 mL, 4.593 mmol, 2.42당량), AcOH (1.50 mL, 26.177 mmol, 13.78당량)을 넣었다. 생성된 혼합물을 오일조에서 35℃에서 4시간 동안 교반하였다. 이어서, NaBH(OAc)3 (1.21 g, 5.709 mmol, 3.00당량)을 첨가하고, 생성된 혼합물을 추가로 3시간 동안, 교반하면서, 반응시키면서 온도를 오일조에서 35℃로 유지시켰다. 이어서, 물(50 mL)을 첨가하여 반응물을 급냉시키고, 포화 NaHCO3로 용액의 pH 값을 8로 조정하였다. 생성된 혼합물을 DCM/MeOH (10/1, 100 mL x 2)으로 추출하고 유기층을 합치고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(25/1)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 620 mg(74%)의 삼차-부틸 6-[2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소-2,3-디하이드로-1H-이소인돌-5-일]-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트를 연녹색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 441.00 [M+1] +.
단계 4: 3-(1-옥소-5-(2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-일)이소인돌린-2-일)피페리딘-2,6-디온 제조
50-mL 둥근 바닥 플라스크에, 삼차-부틸 6-[2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소-2,3-디하이드로-1H-이소인돌-5-일]-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트 (110.10 mg, 0.250 mmol, 1.00당량), DCM (8.00 mL), TFA (1.50 mL)를 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 산을 DIEA로 중화시켰다. 이를 통해 85.1 mg의 DCM 중 3-(5-[2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-일]-1-옥소-2,3-디하이드로-1H-이소인돌-2-일)피페리딘-2,6-디온을 연갈색 용액으로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 341.00 [M+1] +.
단계 5: (3R)-N-(3-(5-(4-(4-((6-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소이소인돌린-5-일)-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-일)메틸)피페리딘-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 제조
50-mL 둥근 바닥 플라스크에, (3R)-N-(2,4-디플루오로-3-[5-[4-(4-포르밀피페리딘-1-일)페닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 (113.00 mg, 0.185 mmol, 1.00당량), 3-(5-[2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-일]-1-옥소-2,3-디하이드로-1H-이소인돌-2-일)피페리딘-2,6-디온 (75.50 mg, 0.222 mmol, 1.20당량), DCM (45.00 mL)을 넣었다. 생성된 용액을 오일조에서 35℃에서 2시간 동안 교반하였다. 그런 다음, NaBH3CN (34.80 mg, 0.554 mmol, 3.00당량)을 첨가하고, 생성된 혼합물을 실온에서 추가로 0.5시간 동안, 교반하면서, 반응시켰다. 이어서, 반응물을 물(50 mL)의 첨가로 급냉시키고 DCM/MeOH (10/1, 60 mL x 2)으로 추출하였다. 유기층을 합치고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 분취 TLC(CH2Cl2/MeOH = 7:1)로 정제하였다. 미정제 생성물을 분취-HPLC로 정제하였다. 이를 통해 27 mg(16%)의 (3R)-N-[3-(5-[4-[4-([6-[2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소-2,3-디하이드로-1H-이소인돌-5-일]-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-일]메틸)피페리딘-1-일]페닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐]-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드를 황녹색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 936.30 [M+1] +; 1H-NMR (300MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.91 (s, 1H), 10.95 (s, 1H), 8.65 (s, 1H), 8.53 (s, 1H), 8.16 (s, 1H), 8.07 (s, 1H), 7.66-7.57 (m, 3H), 7.51-7.48 (m, 1H), 7.30-7.24 (m, 1H), 7.08-7.05 (m, 2H), 6.53-6.48 (m, 2H), 5.30 (d, J = 53.1 Hz, 1H), 5.06-5.00 (m, 1H), 4.34-4.15 (m, 3H), 4.00 (s, 5H), 3.79-3.75 (m, 3H), 2.96-2.81 (m, 2H), 2.74-2.66 (m, 3H), 2.61-2.56 (m, 1H), 2.44-2.28 (m, 4H), 2.14-1.94 (m, 4H), 1.79-1.75 (m, 2H), 1.49 (s, 1H), 1.30-1.19 (m, 3H).
(3R)-N-(3-(5-(4-(4-((4-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소이소인돌린-5-일)피페리딘-1-일)메틸)피페리딘-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 (예시적 화합물 579)의 예시적인 합성
단계 1: 3-(5-브로모-1-옥소이소인돌린-2-일)피페리딘-2,6-디온 제조
질소 불황성 분위기로 퍼지하고 유지된 100-mL 둥근 바닥 플라스크에, N,N-디메틸포름아미드(30 mL), 3-아미노피페리딘-2,6-디온 (4.2 g, 32.78 mmol, 1.00당량), 트리에틸아민 (8.2 g, 81.04 mmol, 2.50당량) 중 4-브로모-2-(브로모메틸)벤조에이트 (10.0 g, 32.47 mmol, 1.00당량) 용액을 넣었다. 생성된 용액을 80℃에서 12시간 동안 교반하였다. 이어서 물을 첨가하여 반응물을 급냉시켰다. 고체를 수집하고, 생성된 용액을 에틸 아세테이트로 추출하고 유기층을 합쳤다. 생성된 혼합물을 염수로 세척하였다. 혼합물을 무수 황산나트륨 상에서 건조시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:5)로 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 수집된 분획을 합치고 진공 중에서 농축시켰다. 이를 통해 5.6 g(53%)의 3-(5-브로모-1-옥소-2,3-디하이드로-1H-이소인돌-2-일)피페리딘-2,6-디온을 자주색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 323.00/325.00 [M+1] +.
단계 2: 삼차-부틸 4-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소이소인돌린-5-일)-3,6-디하이드로피리딘-1(2H)-카르복실레이트 제조
질소의 불활성 대기로 퍼지되고 유지된 250-mL 3-목 둥근 바닥 플라스크에, 디옥산(60 mL), 탄산칼륨(1.3 g, 9.41 mmol, 3.00당량), 3-(5-브로모-1-옥소-2,3-디하이드로-1H-이소인돌-2-일)피페리딘-2,6-디온 (1.0 g, 3.09 mmol, 1.00당량), 테트라키스(트리페닐포스핀)팔라듐(358.0 mg, 0.31 mmol, 0.10당량) 중의 삼차-부틸 4-(테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-1,2,3,6-tetrahydro피리딘-1-카르복실레이트 (2.9 g, 9.38 mmol, 3.00당량)의 용액을 넣었다. 생성된 용액을 오일조에서 질소 분위기 하에 90℃에서 밤새 교반하였다. 여과물을 여과에 의해 수집하였다. 생성된 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1/1)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 수집된 분획을 합치고 진공 중에서 농축시켰다. 이를 통해 260.0 mg (20%)의 삼차-부틸 4-[2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소-2,3-디하이드로-1H-이소인돌-5-일]-1,2,3,6-테트라하이드로피리딘-1-카르복실레이트를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 426.15 [M+1] +.
단계 3: 삼차-부틸 4-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소이소인돌린-5-일)피페리딘-1-카르복실레이트 제조
50-mL 둥근 바닥 플라스크에, 질소 대기 하에 테트라하이드로푸란( mL), 팔라듐 탄소(300.0 mg, 1.69 mmol, 8.00당량) 중 삼차-부틸 4-[2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소-2,3-디하이드로-1H-이소인돌-5-일]-1,2,3,6-테트라하이드로피리딘-1-카르복실레이트 (200.0 mg, 0.47 mmol, 1.00당량)의 용액을 넣었다. 이어서 플라스크를 진공화하고 수소로 플러싱하였다. 반응 혼합물을 수소 분위기 하에 실온에서 4시간 동안 수소 풍선을 사용해 수소화시킨 후, 셀라이트 패드를 통해 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 이를 통해 190.0 mg (95%)의 삼차-부틸 4-[2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소-2,3-디하이드로-1H-이소인돌-5-일]피페리딘-1-카르복실레이트를 황색 고체로서 수득하였다.
단계 4: 3-(1-옥소-5-(피페리딘-4-일)이소인돌린-2-일)피페리딘-2,6-디온 제조
50-mL 둥근 바닥 플라스크에, 디클로로메탄(4 mL), 트리플루오로아세트산(2.0 mL) 중 삼차-부틸 4-[2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소-2,3-디하이드로-1H-이소인돌-5-일]피페리딘-1-카르복실레이트 (90.0 mg, 0.21 mmol, 1.00당량)의 용액을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 생성된 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 이를 통해 80.0 mg(86%)의 3-(1-옥소-5-(피페리딘-4-일)이소인돌린-2-일)피페리딘-2,6-디온 (TFA 염)을 황색 오일로서 수득하였다.
단계 5: (3R)-N-(3-(5-(4-(4-((4-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소이소인돌린-5-일)피페리딘-1-일)메틸)피페리딘-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 제조
50-mL 둥근 바닥 플라스크에, 3-[1-옥소-5-(피페리딘-4-일)-3H-이소인돌-2-일]피페리딘-2,6-디온; 트리플루오로아세트산 (91.00 mg, 0.206 mmol, 1.00당량), 디클로로메탄 (15.00 mL), (3R)-N-(2,4-디플루오로-3-[5-[4-(4-포르밀피페리딘-1-일)페닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 (126.10 mg, 0.206 mmol, 1.00당량)을 넣었다. 혼합물을 실온에서 2시간 동안 교반하고, 여기에 NaBH3CN (64.78 mg, 1.031 mmol, 5.00당량)을 첨가하였다. 생성된 용액을 실온에서 밤새 교반하였다. 이어서 반응물을 물(20 mL)의 첨가로 급냉시켰다. 생성된 용액을 디클로로메탄(2x20 mL)으로 추출하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(10/1)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 미정제 생성물을 분취-HPLC로 정제하였다. 수집된 분획을 합치고 진공 중에서 농축시켰다. 이를 통해 56.1 mg(29.48%)의 (3R)-N-[3-(5-[4-[4-([4-[2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소-3H-이소인돌-5-일]피페리딘-1-일]메틸)피페리딘-1-일]페닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐]-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 923.30 [M+1] +; 1H-NMR (300MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.91 (s, 1H), 10.99 (s, 1H), 9.85 (s, 1H), 8.67 (s, 1H), 8.66 (s, 1H), 8.08 (s, 1H), 7.68-7.52 (m, 5H), 7.44-7.41 (d, J=7.8Hz, 1H), 7.30-7.25 (m, 1H), 7.10-7.07 (d, J=8.4Hz, 2H), 5.40-5.09 (m, 2H), 4.47-4.28 (m, 2H), 3.83-3.79 (m, 2H), 3.51-3.29 (m, 4H), 3.04-3.00 (d, J=10.5Hz, 2H), 2.93-2.52 (m, 5H), 2.27-2.25 (d, J=6.3Hz, 2H), 2.15-1.99 (m, 5H), 1.87-1.73 (m, 7H), 1.28-1.25 (d, J=9.6Hz, 2H).
(3R)-N-(3-(5-(4-(2-(4-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소이소인돌린-5-일)피페라진-1-일)에틸)페닐)-1H-인돌-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 (예시적 화합물 596)의 예시적인 합성
단계 1: 1-브로모-4-(2,2-디메톡시에틸)벤젠 제조
메탄올(30 mL) 중 2-(4-브로모페닐) 아세트알데히드(2 g, 10.05 mmol, 1당량) 및 트리메톡시메탄(5.33 g, 50.24 mmol, 5.51 mL, 5당량)의 혼합물에 p-톨루엔설폰산 아쿠아-착물(96 mg, 0.50 mmol, 0.05당량)을 질소 하에 15℃에서 일회분으로 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 16시간 동안 교반하였다. 포화 수성 중탄산 나트륨 용액을 첨가하여 pH를 8~9로 조정하였다. 혼합물을 물(20 mL)에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(60 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수(30 mL * 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르/에틸 아세테이트=15/1 내지 5:1)로 정제하였다. 화합물 1-브로모-4-(2,2-디메톡시에틸) 벤젠 (1.97 g, 8.04 mmol, 80% 수율)을 무색 오일로서 수득하였다. 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 7.47 - 7.34 (m, 2H), 7.16 - 7.05 (m, 2H), 4.55 - 4.44 (m, 1H), 3.39 - 3.30 (m, 6H), 2.92 - 2.79 (m, 2H).
단계 2: 2-(4-(2,2-디메톡시에틸)페닐)-4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란 제조
디옥산 (25 mL) 중 1-브로모-4-(2,2-디메톡시에틸)벤젠 (1.63 g, 6.65 mmol, 1당량), 4,4,5,5-테트라메틸-2-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-1,3,2-디옥사보로란 (2.20 g, 8.65 mmol, 1.3당량), 아세트산칼륨 (1.31 g, 13.30 mmol, 2당량) 및 디삼차-부틸(시클로펜틸)포스판;디클로로팔라듐;철 (433 mg, 0.66 mmol, 0.1당량)의 혼합물을 탈기하고 질소로 3회 퍼지하고, 그런 다음, 혼합물을 질소 대기 하에 95℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르/에틸 아세테이트=50/1 내지 20:1)로 정제하였다. 화합물 2-[4-(2,2-디메톡시에틸)페닐]-4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란 (1.9 g, 6.50 mmol, 98% 수율)을 갈색 오일로서 수득하였다. 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 7.71 - 7.64 (m, 2H), 7.19 (s, 2H), 4.51 - 4.42 (m, 1H), 3.29 - 3.19 (m, 6H), 2.89 - 2.80 (m, 2H), 1.28 - 1.25 (m, 12H).
단계 3: (R)-N-(3-(5-(4-(2,2-디메톡시에틸)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 제조
디옥산 (20 mL) 및 물(4 mL) 중 (3R)-N-[3-(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로-페닐] -3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (1.95 g, 3.87 mmol, 1당량), 2-[4-(2,2-디메톡시에틸) 페닐]-4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란 (1.25 g, 4.26 mmol, 1.1당량), 4-디삼차- 부틸포스파닐-N,N-디메틸-아닐린;디클로로팔라듐 (274 mg, 0.39 mmol, 0.3 mL, 0.1당량), 불화 세슘(2.35 g, 15.50 mmol, 0.6 mL, 4당량)의 혼합물을 탈기하고 질소로 3회 퍼지하고, 그런 다음, 혼합물을 질소 대기 하에 90℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물(30 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(50 mL * 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(40 mL * 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에서 농축시켰다. 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(디클로로메탄:메탄올=1/0 내지 10:1)로 정제하였다. 미정제 생성물을 분취-HPLC로 추가로 정제하였다. 화합물 (3R)-N-[3-[5-[4-(2,2-디메톡시에틸) 페닐]-1H-인돌-3-카르보닐]-2,4-디플루오로 -페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (1.31 g, 2.23 mmol, 57% 수율)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 589.2 [M+1] +.
단계 4: (R)-N-(2,4-디플루오로-3-(5-(4-(2-옥소에틸)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 제조
테트라하이드로푸란(15 mL) 중 (3R)-N-[3-[5-[4-(2,2-디메톡시에틸)페닐]-1H-인돌-3-카르보닐]-2,4 -디플루오로-페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (1.31 g, 2.23 mmol, 1당량)의 용액에 황산(2 M, 15 mL, 13.46당량)을 첨가하였다. 혼합물을 70℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 포화 수성 중탄산 나트륨으로 pH=8까지 염기성화하였다. 이어서 반응 혼합물을 물(40 mL)로 희석시키고, 테트라하이드로푸란 (30 mL) 및 에틸 아세테이트(30 mL * 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(30 mL * 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에서 농축시켰다. 화합물 (3R)-N-[2, 4-디플루오로-3-[5-[4-(2-옥소에틸) 페닐]-1H-인돌-3-카르보닐] 페닐] - 3-플루오로- 피롤리딘-1-설폰아미드 (1.26 g)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 543.2 [M+1] +.
단계 5: (3R)-N-(3-(5-(4-(2-(4-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소이소인돌린-5-일)피페라진-1-일)에틸)페닐)-1H-인돌-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 제조
메탄올 (2 mL) 및 디클로로메탄(1 mL) 중 3-(1-옥소-5-피페라진-1-일-이소인돌린-2-일)피페리딘-2,6-디온 (70 mg, 0.19 mmol, 1당량, 염화수소) 용액에 아세트산 나트륨(31 mg, 0.38 mmol, 2당량)을 첨가하여 PH~8로 조정하였다. 혼합물을 30℃에서 5분 동안 교반한 다음, (3R)-N-[2,4-디플루오로-3-[5-[4-(2-옥소에틸)페닐]-1H- 피롤로 [2,3-b] 피리딘-3- 카르보닐]페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (104 mg, 0.19 mmol, 1당량)를 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 5분 동안 교반한 다음 아세트산(23.04 mg, 0.38 mmol, 2당량)을 첨가하여 pH ~5.0로 조정하였다. 혼합물을 15℃에서 20분 동안 교반하였다. 이어서, 나트륨 시아노보로히드라이드(24 mg, 0.38 mmol, 2당량)을 나누어서 첨가하였다. 반응 혼합물을 30℃에서 1.5시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물(30 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(25 mL * 2) 및 테트라하이드로푸란 (20 mL)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 포화 염수(20 mL * 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에서 농축시켰다. 잔류물을 분취-HPLC로 정제하였다. 화합물 3R)-N-[3-[5-[4-[2-[4-[2-(2,6-디옥소-3- 피페리딜)-1-옥소-이소인돌린-5-일] 피페라진-1-일]에틸]페닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로-페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (104.5 mg, 0.10 mmol, 55% 수율, 98% 순도, 트리플루오로아세테이트)를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 855.3 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 13.05 - 12.95 (m, 1H), 10.96 (s, 1H), 9.85 (s, 1H), 8.72 (d, J = 2.4Hz, 1H), 8.64 (d, J = 0.8 Hz, 1H), 8.13 (d, J = 2.8 Hz, 1H), 7.81 - 7.73 (m, 2H), 7.67 - 7.56 (m, 2H), 7.47 (d, J = 8.0 Hz, 2H), 7.28 (t, J = 8.4 Hz, 1H), 7.24 - 7.15 (m, 2H), 5.41 - 5.18 (m, 1H), 5.07 (dd, J = 5.2, 13.2 Hz, 1H), 4.42 - 4.33 (m, 1H), 4.29 - 4.22 (m, 1H), 4.14 - 4.02 (m, 3H), 3.72 (d, J = 11.2 Hz, 3H), 3.42 - 3.38 (m, 2H), 3.37 - 3.21 (m, 4H), 3.20 - 3.09 (m, 4H), 2.99 - 2.85 (m, 1H), 2.64 - 2.54 (m, 2H), 2.39 (dd, J = 4.8, 13.2 Hz, 1H), 2.13 - 2.07 (m, 1H), 2.01 - 1.95 (m, 1H).
(3R)-N-(3-(5-(4-(((1R,3S)-3-((1-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소이소인돌린-5-일)피페리딘-4-일)옥시)시클로헥실)옥시)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 (예시적 화합물 709)의 예시적인 합성
단계 1: 삼차-부틸 (R)-5-브로모-3-(2,6-디플루오로-3-((3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-1-카르복실레이트 제조
250-mL 둥근 바닥 플라스크에, (3R)-N-(3-[5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로- 페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 (10.0 g, 19.9 mmol, 1.0당량), DCM (120 mL), TEA (6.0 g, 59.3 mmol,　3.0당량) 및　(Boc)2O (6.0 g, 29.7 mmol, 1.5당량)를 넣었다. 생성된 혼합물을 실온에서 6시간 동안 교반하였다. 생성된 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:3)로 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 9.0 g(75.1%)의 삼차-부틸 5-브로모-3-(2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일설포닐]아미노]벤조일)피롤로[2,3-b]피리딘-1-카르복실레이트를 회백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 605.10 [M+1] +.
단계 2: 삼차-부틸 (R)-3-(2,6-디플루오로-3-((3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-1-카르복실레이트 제조
질소의 불활성 대기로 퍼지되고 유지된 250-mL 둥근 바닥 플라스크에, 삼차-부틸 5-브로모-3-(2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일설포닐]아미노]벤조일)피롤로[2,3-b]피리딘-1-카르복실레이트 (9.0 g, 14.9 mmol, 1.0당량), 비스(피나콜라토)디보론(7.6 g, 29.9 mmol, 2.0당량), Pd(dppf)Cl2 (1.6 g, 2.2 mmol, 0.15당량), KOAc (4.4 g, 44.8 mmol, 3.0당량) 및 디옥산 (150 mL)을 넣었다. 생성된 현탁액을 오일조에서 90℃에서 5시간 동안 교반하였다. 고체를 걸러낸 다음, DCM (3x100 mL)으로 세척하였다. 합쳐진 여과물을 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:1)로 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 5.5 g (57%)의 삼차-부틸 3-(2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3- 플루오로피롤리딘-1-일설포닐]아미노]벤조일)-5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)피롤로[2,3-b]피리딘-1-카르복실레이트를 연황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 651.20 [M+1] +.
단계 3: 3-(4-아이오도페녹시)시클로헥산-1-올 제조
질소의 불활성 대기로 퍼지되고 유지된 1-L 3-목 둥근 바닥 플라스크에, PPh3 (17.9 g, 68.2 mmol, 1.5당량), THF (500 mL) 및 DIAD (13.8 g, 68.2 mmol, 1.5당량)를 0℃에서 물/얼음조에 넣었다. 반응 혼합물을 0℃에서 30분 동안 교반한 후, 시클로헥산-1,3-디올 (7.9 g, 68.0 mmol, 1.5당량) 및 4-아이오도페놀 (10.0 g, 45.4 mmol, 1.0당량)을 플라스크에 첨가하였다. 생성된 혼합물을 0℃에서 30분 동안 교반한 다음, 냉각조를 제거하였다. 생성된 혼합물을 실온에서 밤새 교반하면서, 반응시켰다. 생성된 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 이어서 잔류물을 200 mL 물의 첨가로 급냉시켰다. 생성된 혼합물을 에틸 아세테이트(3x250 mL)로 추출하였다. 유기상을 합치고, 3 x150 ml 염수로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:4)로 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 5.5 g(38.0%)의 3-(4-아이오도페녹시)시클로헥산-1-올을 백색 고체로서 수득하였다.
단계 4: ((3-(4-아이오도페녹시)시클로헥실)옥시)트리메틸실란 제조
250-mL 둥근 바닥 플라스크에, 3-(4-아이오도페녹시)시클로헥산-1-올 (5.5 g, 17.3 mmol, 1.0당량), DCM (100 mL), TEA (5.5 g, 54.4 mmol, 3.1당량) 및 TMSCl (2.8 g, 25.8 mmol, 1.5당량)을 넣었다. 생성된 혼합물을 실온에서 5시간 동안 교반하였다. 이어서 150 mL의 NaHCO3 (수성)을 첨가하여 반응물을 급냉시켰다. 생성된 혼합물을 디클로로메탄(2x100 mL)으로 추출하였다. 유기상을 합치고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 이를 통해 6.5 g(96.3%)의((3-(4-아이오도페녹시)시클로헥실)옥시)트리메틸실란을 백색 반고체로서 수득하였다.
단계 5: (((1S,3R)-3-(4-아이오도페녹시)시클로헥실)옥시)트리메틸실란의 제조
[[3-(4-아이오도페녹시)시클로헥실]옥시]트리메틸실란 (6.5 g, 16.65 mmol, 1.0당량)을 플래쉬-분취-HPLC로 정제하였다. 이를 통해 2.0 g(30.8%)의 [[(1S,3R)-3-(4-아이오도페녹시)시클로헥실]옥시]트리메틸실란을 백색 고체로서 수득하였다.
단계 6: 4-(((1S,3R)-3-(4-아이오도페녹시)시클로헥실)옥시)피페리딘 제조
질소의 불활성 대기로 퍼지되고 유지되는 100-mL 3-목 둥근 바닥 플라스크에, [[(1S,3R)-3-(4-아이오도페녹시)시클로헥실]옥시]트리메틸실란 (1.9 g, 4.8 mmol, 1.0당량) 및 DCM(50 mL)을 넣었다. EtOH/N2 (액체) 조를 사용해 용액을 -70℃까지 냉각시켰다. 그런 다음, 온도를 -60℃ 미만으로 유지하면서, 삼차-부틸 4-옥소피페리딘-1-카르복실레이트 (0.97 g, 4.8 mmol, 1.0당량), Et3SiH (0.62 g, 5.4 mmol, 1.1당량) 및 TMSOTf (0.54 g, 2.4 mmol, 0.5당량)를 플라스크에 연속적으로 첨가하였다. 생성된 혼합물을 2시간 넘게 실온까지 가온하고 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 이어서 150 mL의 NaHCO3(수성)을 첨가하여 반응물을 급냉시켰다. 생성된 혼합물을 디클로로메탄(3x150 mL)으로 추출하였다. 유기상을 합치고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올/Et3N (80:15:5)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 580 mg(29.7%)의 4-[[(1S,3R)-3-(4-아이오도페녹시)시클로헥실]옥시]피페리딘을 연갈색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 402.10 [M+1] +.
단계 7: 메틸 4-플루오로-2-포르밀벤조에이트 제조
250-mL 둥근 바닥 플라스크에, 메틸 2-시아노-4-플루오로벤조에이트(5.38 g, 30.031 mmol, 1.00당량), 포름산(50.00 mL, 88%), H2O (5.00 mL), PtO2 (1.36 g, 5.989 mmol, 0.20당량)를 넣었다. 생성된 혼합물을 오일조에서 80℃에서 2시간 동안 교반하였다. 나머지 PtO2 (0.10당량)를 첨가하고, 생성된 혼합물을 추가로 2시간 동안, 교반하면서, 반응시키면서, 온도를 오일 조에서 80℃로 유지시켰다. 반응 혼합물을 실온으로 냉각시켰다. 생성된 혼합물을 물(100 mL)과 에틸 아세테이트(200 mL)로 희석시켰다. 고체를 걸러냈다. 수성층을 에틸 아세테이트(100 mL)로 재차 추출하였다. 유기층을 합치고 염수(150 mL x 2)로 세척하였다. 유기물을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1/25)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 2.17 g(40%)의 메틸 4-플루오로-2-포르밀벤조에이트를 백색 결정으로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 182.95 [M+1] +; 1H-NMR (300MHz, CDCl3) δ 10.68-10.65 (m, 1H), 8.10-8.03 (m, 1H), 7.64-7.60 (m, 1H), 7.36-7.28 (m, 1H), 3.99 (s, 3H).
단계 8: 메틸 2-포르밀-4-(4-(((1S,3R)-3-(4-아이오도페녹시)시클로헥실)옥시)피페리딘-1-일)벤조에이트 제조
30-mL 밀봉 튜브에, 4-[[(1S,3R)-3-(4-아이오도페녹시)- 시클로헥실]옥시]피페리딘 (550 mg, 1.4 mmol, 1.0당량), 메틸 4-플루오로-2-포르밀벤조에이트 (380 mg, 2.1 mmol, 1.5당량), DMSO (10 mL) 및 DIEA(2 mL, 11.5 mmol, 8.4당량)를 넣었다. 질소의 불활성 대기로 튜브를 퍼지하고 유지하였다. 생성된 혼합물을 오일조에서 110℃에서 밤새 교반하였다. 이어서 150 mL의 물을 첨가하여 반응물을 급냉시켰다. 생성된 혼합물을 에틸 아세테이트(3x150 mL)로 추출하였다. 유기상을 합치고, 3 x100 ml의 염수로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:4)로 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 95 mg(12.3%)의 메틸 2-포르밀-4-(4-[[(1S,3R)-3-(4-아이오도페녹시)시클로헥실]옥시]피페리딘-1-일)벤조에이트를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 564.05 [M+1] +.
단계 9: 3-(5-(4-(((1S,3R)-3-(4-아이오도페녹시)시클로헥실)옥시)피페리딘-1-일)-1-옥소이소인돌린-2-일)피페리딘-2,6-디온 제조
100-mL 둥근 바닥 플라스크에, 3-아미노피페리딘-2,6-디온 염화수소 (33 mg, 0.20 mmol, 1.2당량), MeOH (1.5 mL), DIEA (44 mg, 0.34 mmol, 2.0당량), DCM (25 mL),　메틸 2-포르밀-4-(4-[[(1S,3R)-3-(4-아이오도페녹시)시클로헥실]- 옥시]피페리딘-1-일)벤조에이트 (95 mg, 0.17 mmol, 1.0당량) 및 HOAc (81 mg, 1.35 mmol, 8.0당량)을 넣었다. 생성된 혼합물을 오일조에서 35℃에서 4시간 동안 교반한 후, NaBH3CN (32 mg, 0.51 mmol, 3.0당량)을 플라스크에 첨가하였다. 생성된 혼합물을 오일조에서 35℃로 온도를 유지하면서 밤새 교반하였다. 이어서 50 mL의 NaHCO3 (수성)을 첨가하여 반응물을 급냉시켰다. 생성된 혼합물을 디클로로메탄(3x150 mL)으로 추출하였다. 유기상을 합치고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 미정제 생성물을 플래쉬-분취-HPLC로 정제하였다. 이를 통해 65 mg(59.9%)의 3-[5-(4-[[(1S,3R)-3-(4-아이오도페녹시)시클로헥실]옥시]피페리딘-1-일)-1-옥소- 3H-이소인돌-2-일]피페리딘-2,6-디온을 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 644.15 [M+1] +.
단계 10: 삼차-부틸 3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-5-(4-(((1R,3S)-3-((1-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소이소인돌린-5-일)피페리딘-4-일)옥시)시클로헥실)옥시)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-1-카르복실레이트 제조
8-mL 밀봉 튜브에, 3-[5-(4-[[(1S,3R)-3-(4-아이오도페녹시)시클로헥실]옥시]피페리딘-1-일)-1-옥소-3H-이소인돌-2-일]- 피페리딘-2,6-디온 (60 mg, 0.09 mmol, 1.0당량), 삼차-부틸 3-(2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1- 일설포닐]아미노]벤조일)-5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)피롤로[2,3-b]피리딘-1-카르복실레이트 (91 mg, 0.14 mmol, 1.5당량), K2CO3 (39 mg, 0.28 mmol, 3.0당량), Pd(dtbpf)Cl2 (6 mg, 0.009 mmol, 0.1당량), 디옥산 (2.1 mL), 및 H2O (0.3 mL)을 넣었다. 질소의 불활성 대기로 튜브를 퍼지하고 유지하였다. 생성된 혼합물을 오일조에서 90℃에서 1.5시간 동안 교반하였다. 미정제 생성물을 플래쉬-분취-HPLC로 정제하였다. 이를 통해 75 mg(77.3%)의 삼차-부틸 3-(2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로- 피롤리딘-1-일설포닐]아미노]벤조일)-5-(4-[[(1R,3S)-3-([1-[2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소-3H-이소인돌-5-일]피페리딘-4-일]옥시)시클로헥실]옥시]페닐)피롤로[2,3-b]피리딘-1-카르복실레이트를 회백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 1040.35 [M+1] +.
단계 11: (3R)-N-(3-(5-(4-(((1R,3S)-3-((1-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소이소인돌린-5-일)피페리딘-4-일)옥시)시클로헥실)옥시)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 제조
100-mL 둥근 바닥 플라스크에, 삼차-부틸 3-(2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일설포닐]아미노]벤조일)-5- (4-[[(1R,3S)-3-([1-[2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소-3H-이소인돌-5-일]피페리딘-4-일]옥시)시클로헥실]옥시]페닐)피롤로[2,3-b]피리딘-1-카르복실레이트 (75 mg, 0.07 mmol, 1.0당량), DCM (10 mL) 및 TFA (2 mL)을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 1시간 동안 교반한 다음, 진공 하에 농축시켰다. 미정제 생성물을 플래쉬-분취-HPLC로 정제하였다. 이를 통해 25.0 mg(36.9%)의 (3R)-N-[3-[5-(4-[[(1R,3S)-3-([1-[2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)- 1-옥소-3H-이소인돌-5-일]피페리딘-4-일]옥시)시클로헥실]옥시]페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로페닐]-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 940.25 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.94 (brs, 1H), 10.95 (s, 1H), 9.87 (brs, 1H), 8.68 (s, 1H), 8.57 (brs, 1H), 8.11 (s, 1H), 7.72-7.60 (m, 3H), 7.51 (d, J = 8.4 Hz, 1H), 7.29 (t, J = 8.8 Hz, 1H), 7.17-7.03 (m, 4H), 5.31 (d, J = 53.4 Hz, 1H), 5.05 (d, J = 12.6 Hz, 1H), 4.41 (s, 1H), 4.33 (d, J = 16.7 Hz, 1H), 4.21 (d, J = 16.4 Hz, 1H), 3.79-3.55 (m, 4H), 3.50-3.39 (m, 3H), 3.13-3.03 (m, 2H), 2.98-2.84 (m, 1H), 2.45-2.32 (s, 2H), 2.20-1.85 (m, 8H), 1.84-1.72 (m, 1H), 1.58-1.45 (m, 2H), 1.43-1.05 (m, 5H).
(3R)-N-(3-(5-(4-(4-(3-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소이소인돌린-5-일)-3-하이드록시프로필)피페라진-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 (예시적 화합물 766)의 예시적인 합성
단계 1: 3-(5-(3,3-디에톡시프로프-1-인-1-일)-1-옥소이소인돌린-2-일)피페리딘-2,6-디온 제조
30-mL 밀봉 튜브에, 3-(5-브로모-1-옥소-3H-이소인돌-2-일)피페리딘-2,6-디온 (2.00 g, 6.189 mmol, 1.00당량), 디메틸 포름아미드 (15.00 mL), CuI (0.12 g, 0.619 mmol, 0.10당량), 디이소프로필에틸아민 (2.40 g, 18.567 mmol, 3.00당량), Pd(PPh3)2Cl2 (0.43 g, 0.619 mmol, 0.10당량), 3,3-디에톡시-프로핀(1.19 g, 9.284 mmol, 1.50당량)을 넣었다. 생성된 용액을 오일조에서 65 ℃에서 3시간 동안 교반하였다. 이어서 반응물을 물(20 mL)의 첨가로 급냉시켰다. 생성된 용액을 에틸 아세테이트(2x20 mL)로 추출하였다. 생성된 혼합물을 염수(2 x10 mL)로 세척하였다. 혼합물을 무수 황산나트륨 상에서 건조시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(10/1)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 수집된 분획을 합치고 진공 중에서 농축시켰다. 이를 통해 1.2 g(52.34%)의 3-[5-(3,3-디에톡시프로프-1-인-1-일)-1-옥소-3H-이소인돌-2-일]피페리딘-2,6-디온을 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 371.05 [M+1] +.
단계 2: 3-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소이소인돌린-5-일)프로피올알데히드 제조
50-mL 둥근 바닥 플라스크에, 3-[5-(3,3-디에톡시프로프-1-인-1-일)-1-옥소-3H-이소인돌-2-일]피페리딘-2,6-디온 (200.00 mg, 0.540 mmol, 1.00당량), 테트라하이드로푸란 (5.00 mL), H2SO4 (5.00 mL, 93.803 mmol, 173.73당량)을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 이어서 반응물을 물(10 mL)의 첨가로 급냉시켰다. Na2CO3 (1 mol/L)으로 용액의 pH 값을 8로 조정하였다. 생성된 용액을 디클로로메탄(2x20 mL)으로 추출하였다. 수집된 분획을 합치고 진공 중에서 농축시켰다. 이를 통해 120 mg(75.01%)의 3-[2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소-3H-이소인돌-5-일]프로프-2-인알을 황색 고체로서 수득하였다.
단계 3: (3R)-N-(3-(5-(4-(4-(3-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소이소인돌린-5-일)-3-하이드록시프로필)피페라진-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 제조
50-mL 둥근 바닥 플라스크에, (3R)-N-(2,4-디플루오로-3-[5-[4-(피페라진-1-일)페닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드; 트리플루오로아세트산 (254.67 mg, 0.365 mmol, 1.20당량), 디클로로메탄 (15.00 mL), 디이소프로필에틸아민 (117.78 mg, 0.911 mmol, 3.00당량), 3-[2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소-3H-이소인돌-5-일]프로프-2-인알 (90.00 mg, 0.304 mmol, 1.00당량), HOAc (36.48 mg, 0.608 mmol, 2.00당량), NaBH3CN (57.27 mg, 0.911 mmol, 3.00당량)을 넣었다. 생성된 용액을 오일조에서 35 ℃에서 밤새 교반하였다. 이어서 반응물을 물(20 mL)의 첨가로 급냉시켰다. 생성된 용액을 디클로로메탄(2x20 mL)으로 추출하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(10/1)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 미정제 생성물을 분취-HPLC로 정제하였다. 수집된 분획을 합치고 진공 중에서 농축시켰다. 이를 통해 29.5 mg(10.97%)의 (3R)-N-(3-[5-[4-(4-[3-[2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소-3H-이소인돌-5-일]-3-하이드록시프로필]피페라진-1-일)페닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 885.20 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.91 (s, 1H), 10.99 (s, 1H), 9.81 (s, 1H), 8.66 (s, 1H), 8.54 (s, 1H), 8.07 (s, 1H), 7.70-7.50 (m, 6H), 7.29-7.24 (m, 1H), 7.09-7.07 (d, J=8.8Hz, 2H), 5.62 (s, 1H), 5.37-5.10 (m, 2H), 4.83-4.79 (m, 1H), 4.49-4.31 (m, 2H), 3.48-3.32 (m, 3H), 3.29-3.23 (m, 5H), 2.92-2.86 (m, 1H), 2.63-2.38 (m, 8H), 2.12-2.00 (m, 3H), 1.88-1.83 (m, 2H).
(2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-(((S)-4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)-2-(하이드록시메틸)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 (예시적 화합물 773)의 예시적인 합성
단계 1: 삼차-부틸 (S)-2-(하이드록시메틸)-4-(4-아이오도페닐)피페라진-1-카르복실레이트 제조
질소의 불활성 대기로 퍼지되고 유지된 250-mL 둥근 바닥 플라스크에, DMSO(60 mL), 1,4-디아이오도벤젠 (19.1 g, 59.9 mmol, 1.1당량), CuI (0.9 g, 5.2 mmol, 0.1당량), K2CO3 (14.5 g, 105.4mmol, 2.0당량), L-프롤린(1.2 g, 10.4 mmol, 0.2당량) 중 삼차-부틸 (2S)-2-(하이드록시메틸)피페라진-1-카르복실레이트 (11.4 g, 52.7 mmol, 1.0당량)의 용액을 넣었다. 생성된 혼합물을 오일조에서 90℃에서 12시간 동안 교반하였다. 이어서 200 mL의 물/얼음을 첨가하여 반응물을 급냉시켰다. 생성된 용액을 에틸 아세테이트(200 mL x 2)로 추출하였다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:1)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 4.2 g(18.8%)의 삼차-부틸 (2S)-2-(하이드록시메틸)-4-(4-아이오도페닐) 피페라진-1-카르복실레이트를 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 419.05 [M+1] +.
단계 2: (S)-(4-(4-아이오도페닐)피페라진-2-일)메탄올 제조
50-mL 둥근 바닥 플라스크에, DCM(20 mL) 및 TFA(2 mL) 중 삼차-부틸 (2S)-2-(하이드록시메틸)-4-(4-아이오도페닐)피페라진-1-카르복실레이트 (4.2 g, 9.9 mmol, 1당량)를 넣었다. 생성된 혼합물을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 생성된 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 이를 통해 3.2 g의 [(2S)-4-(4-아이오도페닐) 피페라진-2-일] 메탄올을 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 318.95 [M+1] +.
단계 3: 삼차-부틸 (S)-4-((2-(하이드록시메틸)-4-(4-아이오도페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-카르복실레이트 제조
100-mL 둥근 바닥 플라스크에, DCM(30 mL) 중 [(2S)-4-(4-아이오도페닐)피페라진-2-일]메탄올 (3.2 g, 9.9 mmol, 1.0당량), 삼차-부틸 4-포르밀피페리딘-1-카르복실레이트 (2.5 g, 12.1 mmol, 1.2당량), 트리메틸 오르토포르메이트(1.1 g, 9.9 mmol, 1.0당량)의 용액을 넣었다. 생성된 혼합물을 실온에서 16시간 동안 교반하고, NaBH(OAc)3 (3.2 g, 15.2 mmol, 1.5당량)을 첨가하고, 반응물을 실온에서 3시간 동안 교반하였다. 이어서 100 mL의 물/얼음을 첨가하여 반응물을 급냉시켰다. 생성된 용액을 디클로로메탄(50 mL x 3)으로 추출하였다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:1)로 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 3.6 g(67.1%)의 삼차-부틸 4-[[(2S)-2-(하이드록시메틸)-4-(4-아이오도페닐) 피페라진-1-일] 메틸] 피페리딘-1-카르복실레이트를 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 516.15 [M+1] +.
단계 4: (S)-(4-(4-아이오도페닐)-1-(피페리딘-4-일메틸)피페라진-2-일)메탄올 제조
100-mL 둥근 바닥 플라스크에, DCM(30 mL) 및 TFA(3 mL) 중 삼차-부틸 4-[[(2S)-2-(하이드록시메틸)-4-(4-아이오도페닐)피페라진-1-일]메틸]피페리딘-1-카르복실레이트 (3.6 g, 6.2 mmol, 1.0당량)를 넣었다. 생성된 혼합물을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 생성된 혼합물을 농축시켰다. 이를 통해 2.5 g(85.6%)의 [(2S)-4-(4-아이오도페닐)-1-[(피페리딘-4-일) 메틸] 피페라진-2-일] 메탄올을 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 416.10 [M+1] +.
단계 5: 삼차-부틸 (S)-2-(4-((2-(하이드록시메틸)-4-(4-아이오도페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세테이트 제조
100-mL 둥근 바닥 플라스크에, DCM(30 mL) 중 [(2S)-4-(4-아이오도페닐)-1-[(피페리딘-4-일)메틸]피페라진-2-일]메탄올 (2.5 g, 5.7 mmol, 1.0당량), 삼차-부틸 2-브로모아세테이트 (1.1g, 5.7 mmol, 1.0당량), N,N-디이소프로필에틸아민 (1.4 g, 11.5 mmol, 2.0당량)을 넣었다. 생성된 혼합물을 실온에서 16시간 동안 교반하였다. 이어서 100 mL의 물을 첨가하여 반응물을 급냉시켰다. 생성된 용액을 디클로로메탄(50 mL x 3)으로 추출하였다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:1)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 1.2 g(44.2%)의 삼차-부틸 2-(4-[[(2S)-2-(하이드록시메틸)-4-(4-아이오도페닐) 피페라진-1-일] 메틸] 피페리딘-1-일) 아세테이트를 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 530.25 [M+1] +.
단계 6: 삼차-부틸 (S)-2-(4-((2-(((삼차-부틸디페닐실릴)옥시)메틸)-4-(4-아이오도페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세테이트 제조
100-mL 둥근 바닥 플라스크에, DCM (30 mL) 중 삼차-부틸 2-(4-[[(2S)-2-(하이드록시메틸)-4-(4-아이오도페닐)피페라진-1-일]메틸]피페리딘-1-일)아세테이트 (1.2 g, 2.4 mmol, 1.0당량), 삼차-부틸(클로로)디페닐실란(754.6 mg, 2.5 mmol, 1.1당량), 이미다졸e (339.6 mg, 4.9 mmol, 2.0당량)의 용액을 넣었다. 생성된 혼합물을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 이어서 반응물을 50 mL 물의 첨가로 급냉시켰다. 생성된 혼합물을 디클로로메탄(50 mL x 3)으로 추출하였다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:1)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 920.0 mg(61.1%)의 삼차-부틸 2-(4-[[(2S)-2-[[(삼차-부틸디페닐실릴)옥시] 메틸]-4-(4-아이오도페닐) 피페라진-1-일] 메틸] 피페리딘-1-일) 아세테이트를 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 768.35 [M+1] +.
단계 7: (R)-N-(2,4-디플루오로-3-(5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 제조
질소의 불활성 대기로 퍼지되고 유지된 250-mL 둥근 바닥 플라스크에, (3R)-N-(3-[5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 (5 g, 9.93 mmol, 1.0당량), 비스(피나콜라토)디보론(13 g, 51.19 mmol, 5.15당량), KOAc (5 g, 50.94 mmol, 5.13당량), Pd(dppf)Cl2 (1.7 g, 2.32 mmol, 0.23당량), 디옥산 (100 mL)을 넣었다. 생성된 용액을 오일조에서 질소 분위기 하에 100oC에서 16시간 동안 교반하였다. 생성된 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/에틸 아세테이트 (1:1)로 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 4.05 g (74%)의 (3R)-N-[2,4-디플루오로-3-[5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]페닐]-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드를 연갈색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 551.10 [M+1] +.
단계 8: 삼차-부틸 2-(4-(((S)-2-(((삼차-부틸디페닐실릴)옥시)메틸)-4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세테이트 제조
질소 불활성 분위기로 퍼지되고 유지된 30 mL의 밀봉된 튜브에, 디옥산/H2O (4/1=10 mL), (3R)-N-[2,4-디플루오로-3-[5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]페닐]-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 (1.0 mg, 1.9 mmol, 1.5당량), 제삼인산칼륨(796.2 mg, 3.4 mmol, 3.0당량), Pd(DtBPF)Cl2 (162.9 mg, 0.3 mmol, 0.2당량) 중 삼차-부틸 2-(4-[[(2S)-2-[[(삼차-부틸디페닐실릴)옥시]메틸]-4-(4-아이오도페닐)피페라진-1-일]메틸]피페리딘-1-일)아세테이트 (920.0 mg, 1.1 mmol, 1.0당량) 용액을 넣었다. 최종 반응 혼합물은 마이크로파로 N2 하에 95 ℃에서 1시간 동안 조사되었다. 생성된 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(15:1)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 465.0 mg의 삼차-부틸 2-(4-[[(2S)-2-[[(삼차-부틸디페닐실릴)옥시]메틸]-4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐] 아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]메틸]피페리딘-1-일)아세테이트를 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 1064.40 [M+1] +.
단계 9: 2-(4-(((S)-2-(((삼차-부틸디페닐실릴)옥시)메틸)-4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트산 제조
50-mL 둥근 바닥 플라스크에, DCM (10 mL) 및 TFA (2.0 mL) 중 삼차-부틸 2-(4-[[(2S)-2-[[(삼차-부틸디페닐실릴)옥시]메틸]-4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일] 메틸] 피페리딘-1-일)아세테이트 (465.0 mg, 0.5 mmol, 1.0당량) 용액을 넣었다. 생성된 혼합물을 실온에서 4시간 동안 교반하였다. 생성된 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 이를 통해 415.0 mg (98.0%)의 2-(4-[[(2S)-2-[[(삼차-부틸디페닐실릴) oxy]메틸]-4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]메틸]피페리딘-1-일)아세트산을 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 1008.45 [M+1] +.
단계 10: (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-(((S)-2-(((삼차-부틸디페닐실릴)옥시)메틸)-4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
50-mL 둥근 바닥 플라스크에, DMF (10 mL) 중 2-(4-[[(2S)-2-[[(삼차-부틸디페닐실릴)옥시]메틸]-4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]메틸]피페리딘-1-일)아세트산 (415.0 mg, 0.5 mmol, 1.0당량), (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일) 페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (225.2 mg, 0.5 mmol, 1.1당량), N,N-디이소프로필에틸아민 (120.9 mg, 0.8 mmol, 2.0당량), BOP (249.4 mg, 0.6 mmol, 1.3당량) 용액을 넣었다. 생성된 혼합물을 실온에서 30분 동안 교반하였다. 이어서 반응물을 50 mL 물의 첨가로 급냉시켰다. 생성된 용액을 에틸 아세테이트(50 mL x 3)로 추출하였다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(10:1)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 365.0 mg (63.3%)의 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[2-(4-[[(2S)-2-[[(삼차-부틸 디페닐실릴) 옥시]메틸]-4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐] 아미노) 벤조일]-1H-피롤로 [2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]메틸]피페리딘-1-일)아세트아미도]-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드를 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 1435.75 [M+1] +.
단계 11: (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-(((S)-4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)-2-(하이드록시메틸)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
50-mL의 둥근 바닥 플라스크에, DMSO (10 mL) 중 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[2-(4-[[(2S)-2-[[(삼차-부틸디페닐실릴)옥시]메틸]-4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]메틸]피페리딘-1-일)아세트아미도]-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (365.0 mg, 0.2 mmol, 1.0당량) 및 CsF (88.2 mg, 0.4 mmol, 2.0당량) 용액을 넣었다. 생성된 혼합물을 오일조에서 40℃에서 48시간 동안 교반하였다. 이어서 반응물을 50 mL 물의 첨가로 급냉시켰다. 생성된 용액을 농축된 에틸 아세테이트(50 mL x 3)로 추출하였다. 미정제 생성물을 분취-HPLC로 정제하였다. 이를 통해 69.8 mg (23.9%)의 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[2-(4-[[(2S)-4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)-2-(하이드록시메틸) 피페라진-1-일]메틸]피페리딘-1-일)아세트아미도]-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드를 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 1196.55 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.90 (s, 1H), 8.98 (s, 1H), 8.72 (s, 1H), 8.60-8.53 (m, 1H), 8.10 (s, 1H), 7.78-7.72 (m, 1H), 7.62-7.55 (m, 3H), 7.47 (d, J = 8.0 Hz, 2H), 7.35 (d, J = 9.5 Hz, 2H), 7.25-7.16 (m, 1H), 7.10-7.08 (m, 2H),5.35-5.20 (m, 1H), 5.12 (s, 1H), 4.93-4.80 (m, 1H), 4.65-4.60 (m, 1H), 4.51-4.45 (m, 1H), 4.30-4.20 (m, 1H), 3.75-3.70 (m, 1H), 3.65-3.57 (m, 2H),3.55-3.52 (m, 3H), 3.45-3.33 (m, 3H), 3.32-3.16 (m, 1H), 3.11-3.02 (m, 2H), 3.00-2.56 (m, 7H), 2.50-2.46 (m, 4H), 2.33 (s, 1H), 2.29-2.07 (m, 6H), 1.90-1.70 (m, 3H), 1.51(m, 1H), 1.38 (s, 3H), 1.25-1.06 (s, 3H), 0.94 (s, 9H).
(2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(피리딘-4-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 (예시적 화합물 776)의 예시적인 합성
단계 1: 메틸 (2S,4R)-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복실레이트 제조
디클로로메탄(10 mL) 중 1-삼차-부틸 2-메틸 (2S,4R)-4-하이드록시피롤리딘-1,2-디카르복실레이트 (10 g, 40.77 mmol, 1 당량)의 혼합물에 염화수소/디옥산(4 M, 10 당량)을 20℃에서 첨가하였다. 혼합물을 20℃에서 1시간 동안 교반하였다. 혼합물을 감압 하에 농축시켜 메틸 (2S,4R)-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복실레이트 (7.4 g, 염화수소)를 황색 오일로서 수득하였다.
단계 2: 메틸 (2S,4R)-1-((S)-2-((삼차-부톡시카르보닐)아미노)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복실레이트 제조
디메틸포름아미드(200 mL) 중 메틸 (2S,4R)-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복실레이트 (7.4 g, 40.75 mmol, 1 당량, 염화수소),(2S)-2-(삼차-부톡시카르보닐아미노)-3,3-디메틸-부탄산 (9.42 g, 40.75 mmol, 1 당량)의 혼합물에 카르보디이미드 염화수소 (15.62 g, 81.49 mmol, 2 당량), 하이드록시벤조트리아졸 (6.61 g, 48.89 mmol, 1.2 당량) 및 디이소프로필에틸아민 (31.60 g, 244.47 mmol, 6 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 20℃에서 12시간 동안 교반하였다. 혼합물을 물(1000 mL)의 첨가로 급냉시키고, 에틸 아세테이트(200 mL * 4)로 추출하고, 합쳐진 유기상을 염수(100 mL * 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트=5:1~1:1)로 정제하였다. 화합물 메틸 (2S,4R)-1-[(2S)-2-(삼차-부톡시카르보닐아미노)-3,3-디메틸-부타노일]-4-하이드록시-피롤리딘-2-카르복실레이트 (13.5 g, 37.66 mmol, 92% 수율)를 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 381.2 [M+23] +.
단계 3: 메틸 (2S,4R)-1-((S)-2-아미노-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복실레이트 제조
디클로로메탄(5 mL) 중 메틸 (2S,4R)-1-[(2S)-2-(삼차-부톡시카르보닐아미노)-3,3-디메틸-부타노일]-4-하이드록시-피롤리딘-2-카르복실레이트 (13 g, 36.27 mmol, 1 당량)의 혼합물에 염화수소/디옥산 (4 M, 10 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 20℃에서 20분 동안 교반하였다. 혼합물을 감압 하에 농축시켜 메틸 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸-부타노일]-4-하이드록시-피롤리딘-2-카르복실레이트 (11 g, 염화수소)를 무색 오일로서 수득하였다.
단계 4: 삼차-부틸 4-(2-(((S)-1-((2S,4R)-4-하이드록시-2-(메톡시카르보닐)피롤리딘-1-일)-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일)아미노)-2-옥소에틸)피페라진-1-카르복실레이트 제조
디메틸포름아미드(400 mL) 중 메틸 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸-부타노일]-4-하이드록시-피롤리딘-2-카르복실레이트 (11 g, 37.32 mmol, 1 당량, 염화수소), 2-(4-삼차-부톡시카르보닐피페라진-1-일)아세트산 (10.03 g, 41.05 mmol, 1.1 당량)의 혼합물에 카본이미드 염화수소 (14.31 g, 74.63 mmol, 2 당량), 하이드록시벤조트리아졸 (6.05 g, 44.78 mmol, 1.2 당량) 및 디이소프로필에틸아민 (28.94 g, 223.90 mmol, 6 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 20℃에서 12시간 동안 교반하였다. 혼합물을 물(1000 mL)의 첨가로 급냉시키고, 에틸 아세테이트(100 mL * 6)로 추출하고, 합쳐진 유기상을 염수(100 mL * 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트=3:1~0:1)로 정제하였다. 화합물 삼차-부틸 4-[2-[[(1S)-1-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-메톡시카르보닐-피롤리딘-1-카르보닐]-2,2-디메틸-프로필]아미노]-2-옥소-에틸]피페라진-1-카르복실레이트 (5 g, 10.32 mmol, 27% 수율)를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 485.3 [M+1] +.
단계 5: 메틸 (2S,4R)-1-((S)-3,3-디메틸-2-(2-(피페라진-1-일)아세트아미도)부타노일)-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복실레이트 제조
디클로로메탄(50 mL) 중 삼차-부틸 4-[2-[[(1S)-1-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-메톡시카르보닐-피롤리딘-1-카르보닐]-2,2-디메틸-프로필]아미노]-2-옥소-에틸]피페라진-1-카르복실레이트 (600 mg, 1.24 mmol, 1 당량)의 혼합물에 염화수소/디옥산(4 M, 10 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 25℃에서 30분 동안 교반하였다. 혼합물을 감압 하에 농축시켜 메틸 (2S,4R)-1-[(2S)-3,3-디메틸-2-[(2-피페라진-1-일아세틸)아미노]부타노일]-4-하이드록시-피롤리딘-2-카르복실레이트 (520 mg, 염화수소)를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 385.1 [M+1] +.
단계 6: (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복실레이트 제조
디클로로에탄(20 mL) 중 메틸 (2S,4R)-1-[(2S)-3,3-디메틸-2-[(2-피페라진-1-일아세틸)아미노]부타노일]-4-하이드록시-피롤리딘-2-카르복실레이트 (520 mg, 1.24 mmol, 1.2 당량, 염화수소)의 혼합물에 트리에틸아민(625 mg, 6.18 mmol, 6 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 25℃에서 15분 동안 교반하였다. 그런 다음, (3R)-N-[2,4-디플루오로-3-[5-[4-(4-포르밀-1-피페리딜)페닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (629 mg, 1.03 mmol, 1 당량)를 반응물에 첨가하고, 혼합물을 25℃에서 15분 동안 교반하였다. 그런 다음, 수소화 붕소 나트륨 아세테이트(436 mg, 2.06 mmol, 2 당량)를 반응 혼합물에 첨가하고, 혼합물을 25℃에서 12시간 동안 교반하였다. 혼합물을 물(150 mL)의 첨가로 급냉시키고, 에틸 아세테이트 (30 mL * 5)로 추출하고, 합쳐진 유기상을 염수(30 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트=5:1~0:1)로 정제하였다. 화합물 메틸 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[2-[4-[[1-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-4-피페리딜]메틸]피페라진-1-일]아세틸]아미노]-3,3-디메틸-부타노일]-4-하이드록시-피롤리딘-2-카르복실레이트 (500 mg, 0.51 mmol, 49% 수율)을 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 980.5 [M] +.
단계 7: (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복실산 제조
메탄올 (10 mL) 중 메틸 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[2-[4-[[1-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-4-피페리딜]메틸]피페라진-1-일]아세틸]아미노]-3,3-디메틸-부타노일]-4-하이드록시-피롤리딘-2-카르복실레이트 (500 mg, 0.51 mmol, 1 당량)의 혼합물에 수산화나트륨(4 M, 4 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 40℃에서 1시간 동안 교반하였다. 혼합물을 감압 하에 농축시켜 메탄올을 제거하고, 잔류물을 pH=3~4로 조정하였다. 용액을 분취-HPLC로 정제하였다. 화합물 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[2-[4-[[1-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-4-피페리딜]메틸]피페라진-1-일]아세틸]아미노]-3,3-디메틸-부타노일]-4-하이드록시-피롤리딘-2-카르복실산 (400 mg, 0.41 mmol, 81% 수율)을 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 966.1 [M] +.
단계 8: 삼차-부틸 (S)-(1-(4-(피리딘-4-일)페닐)에틸)카바메이트 제조
디옥산 (50 mL) 및 물(5 mL) 중 삼차-부틸 N-[(1S)-1-(4-브로모페닐)에틸]카바메이트 (500 mg, 1.67 mmol, 1 당량), 4-피리딜보론산 (245 mg, 2.00 mmol, 1.2 당량), [1,1-비스(디페닐포스피노)페로센] 디클로로팔라듐(II) (121 mg, 0.16 mmol, 0.1 당량) 및 인산칼륨(707 mg, 3.33 mmol, 2 당량)의 혼합물을 탈기시키고 나서 질소 하에서 80℃로 12시간 동안 가열하였다. 혼합물을 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트=15:1~5:1)로 정제하였다. 화합물 삼차-부틸 N-[(1S)-1-[4-(4-피리딜)페닐]에틸] 카바메이트 (400 mg, 1.34 mmol, 80% 수율)를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 299.2 [M+1] +.
단계 9: (S)-1-(4-(피리딘-4-일)페닐)에탄-1-아민 제조
디클로로메탄 (10 mL) 중 삼차-부틸 N-[(1S)-1-[4-(4-피리딜)페닐]에틸]카바메이트 (400 mg, 1.34 mmol, 1 당량)의 혼합물에 염화수소/디옥산 (4 M, 3.35 mL, 10 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 25℃에서 30분 동안 교반하였다. 혼합물을 감압 하에 농축시켜 (1S)-1-[4-(4-피리딜)페닐]에탄아민(380 mg, 염화수소)을 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 199.1 [M+1] +.
단계 10: (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(피리딘-4-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
디메틸포름아미드 (10 mL) 중 (1S)-1-[4-(4-피리딜)페닐]에탄아민 (54 mg, 0.23 mmol, 1.5 당량, 염화수소), (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[2-[4-[[1-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-4-피페리딜]메틸]피페라진-1-일]아세틸]아미노]-3,3-디메틸-부타노일]-4-하이드록시-피롤리딘-2-카르복실산 (150 mg, 0.15 mmol, 1 당량)의 혼합물에 하이드록시벤조트리아졸 (25 mg, 0.18 mmol, 1.2 당량), 디이소프로필에틸아민 (120 mg, 0.93 mmol, 6 당량) 및 카르보디이미드 염화수소 (59 mg, 0.31 mmol, 2 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 25℃에서 12시간 동안 교반하였다. 혼합물을 물(100 mL)의 첨가로 급냉시키고, 에틸 아세테이트(30 mL * 3)로 추출하고, 합쳐진 유기상을 염수(30 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에서 농축시켰다. 잔류물을 분취-HPLC로 정제하였다. 화합물 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[2-[4-[[1-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-4-피페리딜]메틸]피페라진-1-일]아세틸]아미노]-3,3-디메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-피리딜)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (61 mg, 0.04 mmol, 31% 수율, 99% 순도, 2포름산염)을 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 573.8 [M/2+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 13.14 - 12.31 (m, 1H), 8.68 - 8.59 (m, 3H), 8.56 - 8.43 (m, 2H), 8.22 - 8.13 (m, 2H), 8.06 (s, 1H), 7.81 - 7.67 (m, 5H), 7.64 - 7.54 (m, 3H), 7.47 - 7.37 (m, 2H), 7.25 (t, J=9.2 Hz, 1H), 7.07 (d, J=8.8 Hz, 2H), 5.41 - 5.19 (m, 1H), 5.18 - 4.87 (m, 2H), 4.55 - 4.37 (m, 2H), 4.31 - 4.23 (m, 1H), 3.83 - 3.75 (m, 2H), 3.63 - 3.53 (m, 6H), 3.01 - 2.94 (m, 2H), 2.78 - 2.68 (m, 3H), 2.44 (s, 3H), 2.21 (d, J=6.8 Hz, 3H), 2.14 - 1.99 (m, 4H), 1.86 - 1.66 (m, 5H), 1.48 - 1.37 (m, 3H), 1.30 - 1.13 (m, 3H), 0.95 (s, 9H).
(2S,4R)-1-(2-(5-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)피리딘-3-일)-3-메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 (예시적 화합물 752)의 예시적인 합성
단계 1: 에틸 2-(5-브로모피리딘-3-일)아세테이트 제조
에탄올(13 mL) 중 2-(5-브로모피리딘-3-일)아세토니트릴 (510 mg, 2.6 mmol)의 용액에 con.H2SO4 (4.0 mL)를 첨가하였다. 반응물을 90oC에서 16시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후, 포화 NaHCO3으로 혼합물의 pH를 10으로 조정한 다음, 에틸 아세테이트(10 X 3 mL)로 추출하고, 염수(5 mL)로 세척하였다. 유기상을 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 컬럼 크로마토그래피로(PE:EA=2:1~1:5) 정제하여 에틸 2-(5-브로모피리딘-3-일)아세테이트 (550 mg)을 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 244.1 [M+1] +.
단계 2: 에틸 2-(5-브로모피리딘-3-일)-3-메틸부타노에이트 제조
무수 THF 1mL 중 에틸 2-(5-브로모피리딘-3-일)아세테이트 (100 mg, 0.41 mmol)의 용액을 -78oC까지 냉각시키고, LiHMDS (0.45 mL, 0.45 mmol)를 적가하였다. 30분 후, 2-아이오도프로판(76.5 mg, 0.45 mmol)을 첨가하였다. 혼합물을 -78oC에서 1시간 동안 교반한 다음, 실온에서 12시간 동안 두었다. 반응이 완료된 후, 이를 0oC에서 물로 급냉시켰다. 혼합물을 EA (5 mL*3)로 추출하고, 염수(2 mL)로 세척하였다. 유기상을 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(PE:EA=1:5~1:1)로 정제하여 2-(5-브로모피리딘-3-일)-3-메틸부타노에이트 (320 mg)를 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 287.0 [M+1] +.
단계 3: 삼차-부틸 4-(5-(1-에톡시-3-메틸-1-옥소부탄-2-일)피리딘-3-일)피페라진-1-카르복실레이트 제조
톨루엔(4 mL) 중 2-(5-브로모피리딘-3-일)-3-메틸부타노에이트 (220 mg, 0.77mmol), 삼차-부틸 피페라진-1-카르복실레이트 (216 mg, 1.16 mmol), Ru(phos) (145 mg, 0.31 mmol), Cs2CO3 (378 mg, 1.16 mmol) 및 Pd(OAc)2 (34 mg, 0.15 mmol)의 혼합물을 N2 하에 100oC에서 4시간 동안 교반하였다. 혼합물을 농축시키고 PE:EA=1:10~1:1에 의해 크로마토그래피 컬럼으로 정제하여 삼차-부틸 4-(5-(1-에톡시-3-메틸-1-옥소부탄-2-일)피리딘-3-일)피페라진-1-카르복실레이트 (280 mg)를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 392.2 [M+1] +.
단계 4: 에틸 3-메틸-2-(5-(피페라진-1-일)피리딘-3-일)부타노에이트 제조
50-mL 둥근 바닥 플라스크에, 디옥산 (15 mL) 중 삼차-부틸 4-[5-(1-에톡시-3-메틸-1-옥소부탄-2-일)피리딘-3-일]피페라진-1-카르복실레이트 (450 mg, 1.149 mmol, 1당량)의 용액을 넣고, 여기에 1,4-디옥산 ((4M, 15 mL) 중 HCl을 첨가하였다. 생성된 용액을 실온에서 7시간 동안 교반하였다. 생성된 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 이를 통해 460 mg의 에틸 3-메틸-2-[5-(피페라진-1-일)피리딘-3-일]부타노에이트 염화수소를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 292.20 [M+1] +.
단계 5: 에틸 2-(5-(4-((1-(4-브로모페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)피리딘-3-일)-3-메틸부타노에이트 제조
100-mL 둥근 바닥 플라스크에, DCM (50 mL) 중 에틸 3-메틸-2-[5-(피페라진-1-일)피리딘-3-일]부타노에이트 (146.70 mg, 0.503 mmol, 1당량), DIEA (195.20 mg, 1.510 mmol, 3당량), 1-(4-브로모페닐)피페리딘-4-카르브알데히드 (135 mg, 0.503 mmol, 1당량), 아세틸 에탄페록소에이트 소디오보라닐 아세테이트(320.10 mg, 1.510 mmol, 3당량) 용액을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 8시간 동안 교반하였다. 이어서 20 mL의 물/얼음을 첨가하여 반응물을 급냉시켰다. 생성된 용액을 에틸 아세테이트(40mL x 3)로 추출하고 유기층을 합쳤다. 생성된 혼합물을 염수(20mL x 1)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 감압 하에서 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(20/1)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 수집된 분획을 합치고 진공 중에서 농축시켰다. 이를 통해 105 mg(38.37%)의 에틸 2-[5-(4-[[1-(4-브로모페닐)피페리딘-4-일]메틸]피페라진-1-일)피리딘-3-일]-3-메틸부타노에이트를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 545.30 [M+1] +.
단계 6: 에틸 2-(5-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)피리딘-3-일)-3-메틸부타노에이트 제조
질소 불활성 분위기로 퍼지되고 유지된 20-mL 밀봉된 튜브에, H2O (2 ml) 중 에틸 2-[5-(4-[[1-(4-브로모페닐)피페리딘-4-일]메틸]피페라진-1-일)피리딘-3-일]-3-메틸부타노에이트 (105 mg, 0.193 mmol, 1당량), (3R)-N-[2,4-디플루오로-3-[5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]페닐]-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 (159.47 mg, 0.290 mmol, 1.50당량), K3PO4 (123.01 mg, 0.580 mmol, 3.00당량), 디옥산 (8 ml) 중 Pd(DtBPF)Cl2 (62.95 mg, 0.097 mmol, 0.5당량)을 넣었다. 최종 반응 혼합물은 마이크로파로 85 oC에서 1시간 동안 조사되었다. 이어서 10 mL의 물/얼음을 첨가하여 반응물을 급냉시켰다. 생성된 용액을 에틸 아세테이트(40 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(20 mL x 1)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(10/1)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 31 mg의 에틸 2-[5-(4-[[1-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페리딘-4-일]메틸]피페라진-1-일)피리딘-3-일]-3-메틸부타노에이트를 갈색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 887.20 [M+1] +.
단계 7: 2-(5-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)피리딘-3-일)-3-메틸부탄산 제조
50-mL 둥근 바닥 플라스크에, MeOH (5 mL) 중 에틸 2-[5-(4-[[1-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페리딘-4-일]메틸]피페라진-1-일)피리딘-3-일]-3-메틸부타노에이트 (31 mg, 0.035 mmol, 1당량)의 용액을 넣고, 여기에 H2O (2 mL) 중 LiOH.H2O (14.67 mg, 0.349 mmol, 10당량)을 첨가하였다. 생성된 용액을 오일조에서 40 oC에서 8시간 동안 교반하였다. HCl (2 mol/L)로 용액의 pH 값을 5로 조정하였다. 생성된 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 이를 통해 79 mg의 2-[5-(4-[[1-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페리딘-4-일]메틸]피페라진-1-일)피리딘-3-일]-3-메틸부탄산; 리튬올을 갈색 고체로서 수득하였다.
단계 8: (2S,4R)-1-(2-(5-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)피리딘-3-일)-3-메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
25-mL 둥근 바닥 플라스크에, DMF (10 mL) 중 2-[5-(4-[[1-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페리딘-4-일]메틸]피페라진-1-일)피리딘-3-일]-3-메틸부탄산 (79 mg, 0.092 mmol, 1당량), DIEA (35.66 mg, 0.276 mmol, 3당량), (2S,4R)-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (60.96 mg, 0.184 mmol, 2.00당량), BOP (81.35 mg, 0.184 mmol, 2당량)를 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 이어서 10 mL의 물/얼음을 첨가하여 반응물을 급냉시켰다. 생성된 용액을 에틸 아세테이트(40 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(20 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 농축시켰다. 미정제 생성물을 분취-HPLC로 정제하였다. 이를 통해 10.2 mg(9.46%)의 (2S,4R)-1-[2-[5-(4-[[1-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페리딘-4-일]메틸]피페라진-1-일)피리딘-3-일]-3-메틸부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 1172.65 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, CD3OD) δ 8.77 (s, 1H), 8.76 (s, 1H), 8.50 (s, 1H), 8.02 (s, 1H), 7.79-7.48 (m, 1H), 7.47 (s, 1H), 7.39 (s, 2H), 7.36-7.32 (m, 5H), 7.12-7.00 (m, 3H), 5.21-5.11 (m, 2H), 4.62-4.55 (m, 5H), 4.51-4.31 (m, 2H), 3.67-3.63 (m, 3H), 3.47-3.39 (m, 4H), 2.64-2.56 (m, 2H), 2.55-2.51 (m, 4H), 2.47 (s, 3H), 2.39-2.37 (m, 3H), 2.14-2.10 (m, 3H), 1.86-1.82 (m, 4H), 1.76-1.72 (m, 1H), 1.43-1.45 (t, J = 8 Hz, 2H), 1.35-1.18 (m, 5H), 1.18 (s, 3H), 0.65-0.61 (m, 3H).
(2S,4R)-1-((S)-2-(5-(2-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)에톡시)-1-메틸-1H-피라졸-3-일)-3-메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 (예시적 화합물 753)의 예시적인 합성
단계 1: 메틸 2-(5-하이드록시-1-메틸-1H-피라졸-3-일)아세테이트 제조
톨루엔(200 mL) 중 메틸히드라진(21.83 g, 189.49 mmol, 25 mL, 1.1당량)의 혼합물에 디메틸 3-옥소펜탄디오에이트(30 g, 172.26 mmol, 24.79 mL, 1당량) 및 디이소프로필에틸아민(26.72 g, 206.72 mmol, 36 mL, 1.2당량)을 첨가하였다. 혼합물을 140℃에서 2시간 동안 교반하고 물을 증류시켰다. 그런 다음, 혼합물을 140℃에서 12시간 동안 교반하였다. 물(400 mL)을 첨가하여 혼합물을 급냉시키고 에틸 아세테이트(100 mL x 3)로 추출하였다. 1 M 염산으로 PH=3~4로 조정하고 나서, 에틸 아세테이트(100 mL x 10)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수(100 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 감압 하에 농축시켰다. 화합물 메틸 2-(5-하이드록시-1-메틸-피라졸-3-일)아세테이트 (8.5 g, 49.95 mmol, 1.00당량)를 분취 역상 HPLC로 정제하였다. 생성물 메틸 2-(5-하이드록시-1-메틸-피라졸-3-일)아세테이트 (5.38 g, 31.62 mmol, 63% 수율)를 회백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 171.2 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 10.81 (br s, 1H), 5.42 - 5.11 (m, 1H), 3.59 (s, 3H), 3.43 (s, 3H), 3.40 (s, 2H).
단계 2: 메틸 2-(5-(2,2-디메톡시에톡시)-1-메틸-1H-피라졸-3-일)아세테이트 제조
디메틸포름아미드 (30 mL) 중 메틸 2-(5-하이드록시-1-메틸-피라졸-3-일)아세테이트 (1.38 g, 8.11 mmol, 1당량) 용액에 탄산칼륨(2.24 g, 16.22 mmol, 2당량) 및 2-브로모-1,1-디메톡시-에탄(1.44 g, 8.52 mmol, 1 mL, 1.05당량)을 첨가하였다. 혼합물을 70℃에서 12시간 동안 교반하였다. 물(50 mL)을 혼합물에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(50 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수로 세척하고(50 mL x 3), 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르/에틸 아세테이트 =20/1, 2/1)로 정제하였다. 생성물 메틸 2-[5-(2,2-디메톡시에톡시)-1-메틸-피라졸 -3-일]아세테이트 (744 mg, 2.74 mmol, 33% 수율, 95% 순도)를 무색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 259.2 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 5.52 (s, 1H), 4.68 (t, J=5.2 Hz, 1H), 4.03 (d, J=5.2 Hz, 2H), 3.71 (s, 3H), 3.61 (s, 3H), 3.57 (s, 2H), 3.44 (s, 6H).
단계 3: 메틸 2-(5-(2,2-디메톡시에톡시)-1-메틸-1H-피라졸-3-일)-3-메틸부타노에이트 제조
테트라하이드로푸란(12 mL) 중 메틸 2-[5-(2,2-디메톡시에톡시)-1-메틸-피라졸-3-일]아세테이트 (744 mg, 2.88 mmol, 1당량)의 용액에 리튬 디이소프로필아미드(2 M, 2.88 mL, 2당량)를 -70℃에서 첨가하였다. 혼합물을 -70℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 이어서 2-아이오도프로판 (734 mg, 4.32 mmol, 0.45 mL, 1.5당량)을 -70℃에서 적가하였다. 혼합물을 25℃에서 3시간 동안 교반하였다. 혼합물을 물(50 mL)에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(30 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수로 세척하고(30 mL x 2), 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르/에틸 아세테이트 =20/1, 4/1)로 정제하였다. 생성물 메틸 2-[5-(2,2-디메톡시에톡시)-1-메틸-피라졸-3-일] -3-메틸-부타노에이트 (300 mg, 0.86 mmol, 29% 수율, 85% 순도)를 연황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 301.1 [M+1] +.
단계 4: 2-(5-(2,2-디메톡시에톡시)-1-메틸-1H-피라졸-3-일)-3-메틸부탄산 제조
테트라하이드로푸란(5 mL), 메탄올(2 mL)과 물(1 mL) 중의 메틸 2-[5-(2,2-디메톡시에톡시)-1-메틸-피라졸-3-일]-3-메틸- 부타노에이트 (300 mg, 0.99 mmol, 1당량) 용액에 수산화 리튬(167 mg, 4.00 mmol, 4당량)을 첨가하였다. 혼합물을 40℃에서 12시간 동안 교반하였다. 염산(1 M, 5 mL)을 반응 혼합물에 첨가하여 pH를 약 4~5로 조정한 다음, 혼합물을 에틸 아세테이트 (30 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(50 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 화합물 2-[5-(2,2-디메톡시에톡시)-1-메틸-피라졸-3-일]-3-메틸-부탄산 (260 mg, 0.90 mmol, 90% 수율)을 갈색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 287.2 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 5.61 (s, 1H), 4.66 (t, J = 5.2 Hz, 1H), 4.06 - 3.98 (m, 2H), 3.52 - 3.47 (m, 3H), 3.34 (d, J = 0.8 Hz, 6H), 2.99 (d, J = 10.0 Hz, 1H), 2.12 (qd, J = 6.4, 16.4 Hz, 1H), 0.94 (d, J = 6.4 Hz, 3H), 0.75 (d, J = 6.8 Hz, 3H).
단계 5: (2S,4R)-1-(2-(5-(2,2-디메톡시에톡시)-1-메틸-1H-피라졸-3-일)-3-메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
디메틸포름아미드 (5 mL) 중 (2S,4R)-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸] 피롤리딘-2-카르복사미드 (334 mg, 0.90 mmol, 1당량, 염화수소) 2-[5-(2,2- 디메톡시에톡시)-1-메틸-피라졸-3-일]-3-메틸-부탄산 (260 mg, 0.90 mmol, 1당량)의 용액에 O-(7-아자벤조트리아졸-1-일)-N,N,N',N'-테트라메틸우로늄 헥사플루오로포스페이트 (517 mg, 1.36 mmol, 1.5당량)와 N,N-디이소프로필에틸아민 (352 mg, 2.72 mmol, 3당량)을 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 1시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물(30 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(50 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(50 mL x 3)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 플래쉬 실리카 겔 크로마토그래피(0~10% 디클로로메탄/메탄올의 용리액)로 정제하였다. 화합물 (2S,4R)-1-[2-[5-(2,2-디메톡시에톡시) -1-메틸-피라졸-3-일]-3-메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (300 mg, 0.47 mmol, 52.33% 수율, 95% 순도)를 백색 고무질로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 600.3 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 8.68 (s, 1H), 7.44 - 7.30 (m, 5H), 5.57 - 5.53 (m, 1H), 4.82 - 4.95 (m, 1H), 4.74 - 4.53 (m, 3H), 4.11 - 3.95 (m, 2H), 3.93 - 3.82 (m, 1H), 3.58 (d, J = 3.2 Hz, 4H), 3.45 - 3.42 (m, 3H), 3.41 (s, 2H), 3.38 (s, 2H), 2.53 (d, J = 1.6 Hz, 3H), 2.39 (s, 1H), 1.48 (d, J = 7.2 Hz, 1H), 1.32 (d, J = 7.2 Hz, 3H), 1.03 (d, J = 6.6 Hz, 3H), 0.94 - 0.86 (m, 2H), 0.86 - 0.77 (m, 3H).
단계 6: (2S,4R)-1-((S)-2-(5-(2,2-디메톡시에톡시)-1-메틸-1H-피라졸-3-일)-3-메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
(2S,4R)-1-[2-[5-(2,2-디메톡시에톡시)-1-메틸-피라졸-3-일]-3-메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (300 mg, 0.50 mmol, 1당량)를 키랄 SFC로 정제하였다. 생성물 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[5-(2,2-디메톡시에톡시)-1-메틸-피라졸-3-일]-3-메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (85 mg, 0.14 mmol, 84% 수율, 98.1% 순도)를 백색 고체로서 수득하였다.
단계 7: (2S,4R)-4-하이드록시-1-((S)-3-메틸-2-(1-메틸-5-(2-옥소에톡시)-1H-피라졸-3-일)부타노일)-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
테트라하이드로푸란 (5 mL) 중 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[5-(2,2-디메톡시에톡시)-1-메틸-피라졸-3-일] -3-메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (80 mg, 0.13 mmol, 1당량)의 용액에 황산(2 M, 2 mL, 30당량)을 첨가하였다. 혼합물을 70℃에서 2시간 동안 교반하였다. 물(10 mL)을 혼합물에 첨가하고 포화 중탄산나트륨 용액을 첨가하여 pH를 약 8로 조정하였다. 그런 다음 혼합물을 에틸 아세테이트 40 mL (20 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 감압 하에 농축시켰다. 화합물 (2S,4R)-4-하이드록시-1-[(2S)-3-메틸-2-[1-메틸-5-(2-옥소에톡시)피라졸-3-일] 부타노일]-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (55 mg, 0.10 mmol, 74% 수율)를 무색 고무질로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 277.6 [M/2+1] +.
단계 8: (2S,4R)-1-((S)-2-(5-(2-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)에톡시)-1-메틸-1H-피라졸-3-일)-3-메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
디메틸포름아미드(1.5 mL) 중 (3R)-N-[2,4-디플루오로-3-[5-(4-피페라진-1-일페닐)-1H-피롤로[2,3-b] 피리딘-3-카르보닐]페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (58 mg, 0.099 mmol, 1.00당량)의 용액에 (2S,4R)-4-하이드록시-1-[(2S)-3-메틸-2-[1-메틸-5-(2-옥소에톡시)피라졸-3-일]부타노일]-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (55 mg, 0.099 mmol, 1당량)을 첨가하였다. 이어서, 나트륨 시아노보로히드라이드(13 mg, 0.20 mmol, 2당량)을 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물(10 mL)로 희석시키고 디클로로메탄/메탄올 (10 mL x 3)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 반-분취 역상 HPLC로 정제하였다. 화합물 (2S,4R)-1-[(2S)- 2-[5-[2-[4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]에톡시]-1-메틸-피라졸-3-일]-3-메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (40.2 mg, 0.03 mmol, 32% 수율, 95% 순도, 포름산염)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 1122.4 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.88 (s, 1H), 8.98 (s, 1H), 8.65 (s, 1H), 8.53 (s, 1H), 8.32 (d, J = 7.5 Hz, 1H), 8.05 (s, 1H), 7.60 (d, J = 8.8 Hz, 3H), 7.45 - 7.41 (m, 2H), 7.38 (s, 2H), 7.23 (d, J = 8.8 Hz, 1H), 7.08 (d, J = 9.2 Hz, 2H), 5.56 (s, 1H), 5.39 - 5.19 (m, 1H), 5.03 (d, J = 4.0 Hz, 1H), 4.95 - 4.87 (m, 1H), 4.34 - 4.24 (m, 2H), 4.18 (d, J = 5.2 Hz, 2H), 3.70 (s, 1H), 3.50 (s, 4H), 3.47 (s, 3H), 3.25 - 3.20 (m, 7H), 2.67 (s, 5H), 2.45 (s, 4H), 2.08 (d, J =10.4 Hz, 3H), 1.96 (s, 2H), 1.80 (s, 1H), 1.39 (d, J = 7.2 Hz, 3H), 0.92 (d, J = 6.4 Hz, 3H), 0.71 (d, J = 6.8 Hz, 3H).
(2S,4R)-1-((R)-2-(5-(2-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)에톡시)-1-메틸-1H-피라졸-3-일)-3-메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 (예시적 화합물 757)의 예시적인 합성
단계 1: (2S,4R)-1-((R)-2-(5-(2,2-디메톡시에톡시)-1-메틸-1H-피라졸-3-일)-3-메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
(2S,4R)-1-[2-[5-(2,2-디메톡시에톡시)-1-메틸-피라졸-3-일]-3-메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (300 mg, 0.50 mmol, 1당량)를 키랄 SFC로 정제하였다. 생성물 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[5-(2,2-디메톡시에톡시)-1-메틸-피라졸-3-일]-3-메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (150 mg, 0.24 mmol, 74% 수율, 97.8% 순도)를 무색 고무질로서 수득하였다.
단계 2: (2S,4R)-4-하이드록시-1-((R)-3-메틸-2-(1-메틸-5-(2-옥소에톡시)-1H-피라졸-3-일)부타노일)-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
테트라하이드로푸란(2 mL) 중 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[5-(2,2-디메톡시에톡시)-1-메틸-피라졸-3-일]-3-메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (150 mg, 0.25 mmol, 1당량) 용액에 황산(2 M, 1 mL, 8.00당량)을 첨가하였다. 혼합물을 70℃에서 2시간 동안 교반하였다. 물(10 mL)을 혼합물에 첨가하고 포화 중탄산나트륨 용액을 첨가하여 pH를 약 8로 조정하였다. 그런 다음 혼합물을 에틸 아세테이트 40 mL (20 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 감압 하에 농축시켰다. 화합물 (2S,4R)-4-하이드록시-1-[(2R)-3-메틸-2-[1-메틸-5-(2-옥소에톡시)피라졸-3-일]부타노일]-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (130 mg, 0.23 mmol, 93% 수율)를 무색 고무질로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 554.3 [M+1] +.
단계 3: (2S,4R)-1-((R)-2-(5-(2-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)에톡시)-1-메틸-1H-피라졸-3-일)-3-메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
디메틸포름아미드(1.5 mL) 중 (3R)-N-[2,4-디플루오로-3-[5-(4-피페라진-1-일페닐)-1H-피롤로[2,3-b] 피리딘-3-카르보닐]페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (137 mg, 0.23 mmol, 1.00당량) 용액에 (2S,4R)-4-하이드록시-1-[(2R)-3-메틸-2-[1- 메틸-5-(2-옥소에톡시)피라졸-3-일]부타노일]-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (130 mg, 0.23mmol, 1당량)을 첨가하였다. 이어서, 나트륨 시아노보로히드라이드(29 mg, 0.46 mmol, 2당량)을 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물(10 mL)로 희석시키고 디클로로메탄/메탄올 (10 mL x 3)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 반-분취 역상 HPLC로 정제하였다. 화합물 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[5 -[2-[4-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페라진-1-일]에톡시]-1-메틸-피라졸-3-일]-3-메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (53.9 mg, 0.04 mmol, 19% 수율, 100% 순도, 포름산염)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 561.8 [M/2+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.88 (s, 1H), 8.99 - 8.96 (m, 1H), 8.64 (d, J = 2.2 Hz, 1H), 8.53 (s, 1H), 8.06 (s, 1H), 7.86 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 7.65 - 7.56 (m, 3H), 7.44 (d, J = 4.4 Hz, 1H), 7.40 (d, J = 8.4 Hz, 2H), 7.35 - 7.25 (m, 2H), 7.11 - 6.99 (m, 2H), 5.62 - 5.52 (m, 1H), 5.41 - 5.17 (m, 1H), 5.05 (d, J = 3.6 Hz, 1H), 4.93 - 4.81 (m, 1H), 4.48 - 4.37 (m, 1H), 4.28 - 4.02 (m, 3H), 3.57 - 3.50 (m, 2H), 3.50 - 3.42 (m, 5H), 3.39 (s, 2H), 3.34 (s, 2H), 3.22 (s, 1H), 3.17 (s, 3H), 2.73 - 2.62 (m, 3H), 2.59 (s, 3H), 2.48 - 2.41 (m, 4H), 2.20 (s, 1H), 2.09 (d, J = 15.6 Hz, 2H), 1.99 (s, 1H), 1.85 (br d, J = 5.6 Hz, 1H), 1.45 (d, J = 6.4 Hz, 1H), 1.31 (d, J = 7.2 Hz, 2H), 0.94 (d, J = 6.4 Hz, 2H), 0.77 (d, J = 6.4 Hz, 3H), 0.68 (d, J = 6.4 Hz, 1H).
(2S,4R)-1-((S)-4-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)-3,3-디메틸-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 (예시적 화합물 754)의 예시적인 합성
단계 1: 삼차-부틸 4-((S)-4-((2S,4R)-4-하이드록시-2-(((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)카바모일)피롤리딘-1-일)-2,2-디메틸-3-(3-메틸이속사졸-5-일)-4-옥소부틸)피페라진-1-카르복실레이트 제조
삼차-부틸 4-[4-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-[[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸] 카바모일]피롤리딘-1-일]-2,2-디메틸-3-(3-메틸이속사졸-5-일)-4-옥소-부틸]피페라진-1-카르복실레이트 (80 mg, 0.12 mmol, 1 당량)를 SFC로 정제하여 생성물 삼차-부틸 4-[(3S)-4-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-[[(1S)-1-[4-(4- 메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]카바모일]피롤리딘-1-일]-2,2-디메틸-3-(3-메틸이속사졸-5-일)-4-옥소-부틸]피페라진-1-카르복실레이트를 백색 고체로서 수득하였다. 생성물을 분취-HPLC에 의해 추가로 정제하고, 아세토니트릴의 분획을 제거하고, 잔류물을 동결 건조시켜 삼차-부틸 4-[(3S)-4-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-[[(1S)-1-[4-(4- 메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]카바모일]피롤리딘-1-일]-2,2-디메틸-3-(3-메틸이속사졸-5-일)-4-옥소-부틸]피페라진-1-카르복실레이트 (19.7 mg, 0.023 mmol, 20% 수율, 97% 순도, TFA)를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 695.3 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 8.96 (s, 1H), 7.52 - 7.37 (m, 4H), 6.47 (s, 1H), 5.04 (q, J=7.1 Hz, 1H), 4.65 - 4.55 (m, 1H), 4.48 - 4.39 (m, 2H), 4.32 - 4.14 (m, 2H), 3.89 (dd, J=3.9, 11.3 Hz, 1H), 3.70 (d, J=12.1 Hz, 1H), 3.56 (d, J=11.2 Hz, 2H), 3.44 - 3.30 (m, 2H), 3.23 - 3.02 (m, 3H), 2.97 - 2.87 (m, 1H), 2.49 (s, 3H), 2.32 (s, 3H), 2.30 - 2.23 (m, 1H), 1.97 (ddd, J=4.3, 9.5, 13.4 Hz, 1H), 1.53 (d, J=7.1 Hz, 3H), 1.50 (s, 9H), 1.48 (s, 3H), 1.11 (s, 3H).
단계 2: (2S,4R)-1-((S)-3,3-디메틸-2-(3-메틸이속사졸-5-일)-4-(피페라진-1-일)부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
디클로로메탄 (4 mL) 중 삼차-부틸 4-[(3S)-4-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-[[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]카바모일]피롤리딘-1-일]-2,2-디메틸-3-(3-메틸이속사졸-5-일)-4-옥소-부틸]피페라진-1-카르복실레이트 (330 mg, 0.47 mmol, 1 당량)의 용액에 염산/디옥산 (4 M, 4 mL, 33.69 당량)을 첨가하고, 혼합물을 20 ℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 혼합물을 농축시켜 (2S,4R)-1-[(2S)-3,3-디메틸-2-(3-메틸이속사졸-5-일)-4-피페라진-1-일-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (310 mg, HCl)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 595.2 [M+1] +.
단계 3: (2S,4R)-1-((S)-4-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)-3,3-디메틸-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
메탄올 (2 mL) 및 디클로로메탄 (2 mL) 중 (2S,4R)-1-[(2S)-3,3-디메틸-2-(3-메틸이속사졸-5-일)-4-피페라진-1-일-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (120 mg, 0.19 mmol, 1 당량, HCl)의 용액에 아세트산나트륨(31 mg, 0.38 mmol, 2 당량)을 첨가하고, 이어서 (3R)-N-[2,4-디플루오로-3-[5-[4-(4-포르밀-1-피페리딜)페닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (116 mg, 0.19 mmol, 1 당량)를 추가하였고, pH=6이 될 때까지 아세트산 (53 mg, 0.87 mmol, 4.60 당량)을 첨가하고, 혼합물을 20℃에서 10분 동안 교반하고, 그런 다음 나트륨 시아노보로하이드라이드(48 mg, 0.76 mmol, 4 당량)를 추가하였고, 혼합물을 20℃에서 1시간 동안 교반하였다. 혼합물을 농축시켜 미정제 생성물을 수득하고, 이를 분취-HPLC로 정제하였다. 아세토니트릴의 분획을 제거하고, 잔류물을 동결 건조시켜 생성물을 수득하였다. 화합물 (2S,4R)-1-[(2S)-4-[4-[[1-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-4-피페리딜]메틸]피페라진-1-일]-3,3-디메틸-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (83.7 mg, 66.41 umol, 34.9% 수율, 98.1% 순도, FA)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 1190.5 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.91 (br s, 1H), 9.01 - 8.95 (m, 1H), 8.64 (d, J=2.2 Hz, 1H), 8.52 (br s, 1H), 8.41 (d, J=8.1 Hz, 1H), 8.18 (s, 1H), 8.07 (s, 1H), 7.65 - 7.52 (m, 3H), 7.48 - 7.32 (m, 4H), 7.25 (t, J=8.3 Hz, 1H), 7.05 (br d, J=8.8 Hz, 2H), 6.28 - 6.11 (m, 1H), 5.42 - 5.17 (m, 1H), 5.14 - 4.87 (m, 1H), 4.99 - 4.65 (m, 1H), 4.40 - 4.18 (m, 3H), 3.94 (s, 1H), 3.76 (br d, J=10.5 Hz, 2H), 3.47 (br s, 2H), 3.32 - 3.23 (m, 6H), 2.77 - 2.68 (m, 2H), 2.46 - 2.45 (m, 1H), 2.46 (s, 3H), 2.47 - 2.35 (m, 1H), 2.39 (br s, 2H), 2.24 - 1.95 (m, 11H), 1.85 - 1.62 (m, 4H), 1.46 - 1.35 (m, 3H), 1.20 (br d, J=10.1 Hz, 2H), 1.07 - 0.95 (m, 3H), 0.90 - 0.81 (m, 3H).
(2S,4R)-1-((R)-4-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)-3,3-디메틸-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 (예시적 화합물 755)의 예시적인 합성
단계 1: 삼차-부틸 4-((R)-4-((2S,4R)-4-하이드록시-2-(((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)카바모일)피롤리딘-1-일)-2,2-디메틸-3-(3-메틸이속사졸-5-일)-4-옥소부틸)피페라진-1-카르복실레이트 제조
삼차-부틸 4-[4-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-[[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸] 카바모일]피롤리딘-1-일]-2,2-디메틸-3-(3-메틸이속사졸-5-일)-4-옥소-부틸]피페라진-1-카르복실레이트 (80 mg, 0.12 mmol, 1 당량)을 SFC로 정제하여 생성물 삼차-부틸 4-[(3R)-4-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-[[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일) 페닐]에틸]카바모일]피롤리딘-1-일]-2,2-디메틸-3-(3-메틸이속사졸-5-일)-4-옥소-부틸]피페라진-1-카르복실레이트 (24.3 mg, 34.03 umol, 29.6% 수율, 97.3% 순도)를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 695.4 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 8.87 (s, 1H), 7.48 - 7.36 (m, 4H), 6.24 (s, 1H), 5.06 - 4.98 (m, 1H), 4.61 - 4.50 (m, 1H), 4.41 (s, 2H), 3.78 (d, J=10.9 Hz, 1H), 3.56 (dd, J=4.2, 10.7 Hz, 1H), 3.43 (s, 4H), 2.66 - 2.56 (m, 2H), 2.54 - 2.41 (m, 6H), 2.29 (d, J=13.0 Hz, 1H), 2.24 (s, 3H), 2.22 - 2.14 (m, 1H), 1.92 (ddd, J=4.7, 8.3, 13.2 Hz, 1H), 1.52 (d, J=7.0 Hz, 3H), 1.45 (s, 9H), 1.10 (s, 3H), 0.98 (s, 3H).
단계 2: (2S,4R)-1-((R)-3,3-디메틸-2-(3-메틸이속사졸-5-일)-4-(피페라진-1-일)부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
디클로로메탄 (2 mL) 중 삼차-부틸 4-[(3R)-4-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-[[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]카바모일]피롤리딘-1-일]-2,2-디메틸-3-(3-메틸이속사졸-5-일)-4-옥소-부틸]피페라진-1-카르복실레이트 (120 mg, 0.17 mmol, 1 당량) 용액에, 염산 /디옥산 (2 M, 2.9 mL, 33.69 당량)을 첨가하고, 혼합물을 20℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 혼합물을 농축시켜 생성물 (2S,4R)-1-[(2R)-3,3-디메틸-2-(3-메틸이속사졸-5-일)-4-피페라진-1-일-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (125 mg, HCl)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 595.2 [M+1] +.
단계 3: (2S,4R)-1-((R)-4-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)-3,3-디메틸-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
메탄올 (2 mL) 및 디클로로메탄 (2 mL) 중 (2S,4R)-1-[(2R)-3,3-디메틸-2-(3-메틸이속사졸-5-일)-4-피페라진-1-일-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (100 mg, 0.17 mmol, 1 당량, HCl)의 용액에 아세트산나트륨(28 mg, 0.34 mmol, 2 당량)을 첨가하고, 이어서 (3R)-N-[2,4-디플루오로-3-[5-[4-(4-포르밀-1-피페리딜)페닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (103 mg, 0.17 mmol, 1 당량)를 추가하였고, pH=6이 될 때까지 아세트산 (46 mg, 0.77 mmol, 4.60 당량)을 첨가하고, 혼합물을 20℃에서 10분 동안 교반하고, 그런 다음 나트륨 시아노보로하이드라이드(42 mg, 0.67 mmol, 4 당량)를 추가하였고, 혼합물을 20℃에서 1시간 동안 교반하였다. 혼합물을 농축시켜 미정제 생성물을 수득하고, 이를 분취-HPLC로 정제하였다. 아세토니트릴의 분획을 제거하고, 잔류물을 동결 건조시켜 생성물을 수득하였다. 화합물 (2S,4R)-1-[(2R)-4-[4-[[1-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-4-피페리딜]메틸]피페라진-1-일]-3,3-디메틸-2-(3-메틸이속사졸-5-일)부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (90.4 mg, 73.11 umol, 43.5% 수율, 100% 순도, FA)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 1190.5 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.91 (br s, 1H), 9.01 - 8.96 (m, 1H), 8.64 (d, J=2.2 Hz, 1H), 8.53 (br s, 1H), 8.31 (d, J=7.8 Hz, 1H), 8.18 (s, 1H), 8.07 (s, 1H), 7.66 - 7.54 (m, 3H), 7.48 - 7.31 (m, 4H), 7.25 (t, J=8.7 Hz, 1H), 7.06 (br d, J=8.8 Hz, 2H), 6.19 (s, 1H), 5.40 - 5.20 (m, 1H), 4.90 (quin, J=7.1 Hz, 1H), 4.41 (t, J=7.3 Hz, 1H), 4.27 (br s, 1H), 4.22 (s, 1H), 3.77 (br d, J=11.9 Hz, 2H), 3.59 (br d, J=9.0 Hz, 1H), 3.47 (br s, 2H), 3.33 - 3.28 (m, 4H), 2.76 - 2.68 (m, 2H), 2.46 - 2.28 (m, 10H), 2.20 - 1.94 (m, 10H), 1.83 - 1.63 (m, 4H), 1.37 (d, J=7.0 Hz, 2H), 1.48 (br d, J=7.2 Hz, 1H), 1.28 - 1.11 (m, 2H), 1.04 - 0.94 (m, 3H), 0.87 (s, 3H).
(2S,4R)-1-((S)-3,3-디메틸-2-(2-(2-(((1R,3R)-3-((2'-메틸-5-모르폴리노-5'-(3-(트리플루오로메틸)벤즈아미도)-[3,3'-비피리딘]-6-일)옥시)시클로헥실)옥시)에톡시)아세트아미도)부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 (예시적 화합물 756)의 예시적인 합성
단계 1: N-(5-브로모-6-메틸피리딘-3-일)-3-(트리플루오로메틸)벤즈아미드 제조
디메틸 포름아미드(100 mL) 중 3-(트리플루오로메틸)벤조산 (10.16 g, 53.47 mmol, 1당량) 및 5-브로모-6-메틸-피리딘-3-아민 (10 g, 53.47 mmol, 1당량)의 혼합물에 [디메틸아미노(트리아졸로[4,5-b]피리딘-3-일옥시)메틸렌]-디메틸 -암모늄; 헥사플루오로포스페이트 (30.49 g, 80.20 mmol, 1.5당량) 및 트리에틸아민 (10.82 g, 106.93 mmol, 2당량)을 첨가하였다. 혼합물을 20℃에서 12시간 동안 교반하였다. 혼합물을 물(300 mL)로 급냉시켰다. 수성층을 에틸 아세테이트(200 mLХ3)로 추출하였다. 모든 합쳐진 유기층을 염수(300 mL)로 세척하고, 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 농축시켰다. 잔류물을 석유 에테르/에틸 아세테이트=50:1(100 mL)의 용액에서 연화시켜N-(5-브로모-6-메틸-3-피리딜)-3-(트리플루오로메틸)벤즈아미드 (17 g, 46.01 mmol, 86% 수율, 97% 순도)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 360.9 [M+1] +.
단계 2: (2-메틸-5-(3-(트리플루오로메틸)벤즈아미도)피리딘-3-일)보론산 제조
디옥산 (100 mL) 중 4,4,5,5-테트라메틸-2-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-1,3,2- 디옥사보로란 (7.07 g, 27.84 mmol, 2당량), N-(5-브로모-6-메틸-3-피리딜)- 3-(트리플루오로메틸)벤즈아미드 (5 g, 13.92 mmol, 1당량), [1,1'-비스(디페닐포스피노)페로센]디클로로팔라듐(II) (1.14 g, 1.39 mmol, 0.1당량), 아세트산칼륨 (4.10 g, 41.76 mmol, 3당량)의 혼합물을 탈기하고 질소로 3회 퍼지하고, 그런 다음, 혼합물을 질소 대기 하에 100℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 여과하고, 여액을 농축시켰다. 화합물 [2-메틸-5-[[3-(트리플루오로메틸)벤조일]아미노]-3-피리딜]보론산 (5.5 g)을 흑갈색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 325.1 [M+1] +.
단계 3: (1S,3R)-3-(벤질옥시)시클로헥산-1-올 제조
디메틸 포름아미드(250 mL) 중 시클로헥산-1,3-디올 (18 g, 154.96 mmol, 1당량)의 용액에 나트륨-수소 (6.20 g, 154.96 mmol, 60% 순도, 1당량) 및 붕소 삼브롬화물(26.50 g, 154.96 mmol, 18.41 mL, 1당량)를 첨가하였다. 혼합물을 0~60℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 0℃에서 물 1500 mL로 급냉시킨 다음, 에틸 아세테이트(500 mL X 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(500 mL X 3)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 컬럼 크로마토그래피로 정제하였다. 화합물 (1S,3R)-3-벤질옥시시클로헥산올 (10 g, 48.48 mmol, 62% 수율)를 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 259.0 [M-56] +.
단계 4: 2-(((1R,3R)-3-(벤질옥시)시클로헥실)옥시)-5-브로모-3-니트로피리딘 제조
테트라하이드로푸란(150 mL) 중 5-브로모-3-니트로-피리딘-2-올 (8.76 g, 39.99 mmol, 1.1당량) 및 (1S,3R)-3-벤질옥시시클로헥산올 (7.5 g, 36.36 mmol, 1당량)의 용액에 트리페닐포스핀(14.30 g, 54.54 mmol, 1.5당량) 및 이소프로필 (NE)-N-이소프로폭시카르보닐이미노카바메이트(11.03 g, 54.54 mmol, 10.60 mL, 1.5당량)를 첨가하였다. 혼합물을 0~25 ℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 20℃에서 물 300 mL로 급냉시킨 다음, 에틸 아세테이트(100 mL X 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(100 mL X 3)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트=1:0 내지 50:1)로 정제하였다. 화합물 2-[(1R,3R)-3-벤질옥시시클로헥속시]- 5-브로모-3-니트로-피리딘 (7.5 g, 18.42 mmol, 50% 수율)을 황색 오일로서 수득하였다.
단계 5: 2-(((1R,3R)-3-(벤질옥시)시클로헥실)옥시)-5-브로모피리딘-3-아민 제조
에틸 알코올(250 mL) 및 물(50 mL) 중 2-[(1R,3R)-3-벤질옥시시클로헥속시]-5-브로모-3-니트로-피리딘 (13.1 g, 32.17 mmol, 1당량), 철(8.98 g, 160.83 mmol, 5당량), 염화 암모늄(8.60 g, 160.83 mmol, 5당량)의 혼합물을 탈기하고, 질소로 3회 퍼지하고, 혼합물을 질소 대기 하에 80℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 여과하고, 여과물을 농축시켰다. 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르/에틸 아세테이트=50/1 내지 10:1)로 정제하였다. 화합물 2-[(1R,3R)-3-벤질옥시시클로헥속시]-5-브로모-피리딘-3-아민 (11.5 g, 30.48 mmol, 94% 수율)을 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 377.1 [M+1] +.
단계 6: 4-(2-(((1R,3R)-3-(벤질옥시)시클로헥실)옥시)-5-브로모피리딘-3-일)모르폴린 제조
디메틸 포름아미드(200 mL) 중 2-[(1R,3R)-3-벤질옥시시클로헥속시]-5-브로모-피리딘-3-아민 (14.7 g, 38.96 mmol, 1당량)의 혼합물에 수소화 나트륨(7.79 g, 194.82 mmol, 60% 순도, 5당량)을 25℃에서 첨가하였다. 혼합물을 25℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 그런 다음 1-브로모-2-(2-브로모에톡시)에탄(27.11 g, 116.89 mmol, 14.65 mL, 3당량)을 혼합물에 첨가하였다. 혼합물을 80℃에서 11.5시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 0℃에서 물 1000 mL로 급냉시킨 다음, 에틸 아세테이트(200 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(200 mL X 3)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르/에틸 아세테이트=30:1 내지 10:1)로 정제하였다. 화합물 4-[2-[(1R,3R)-3-벤질옥시시클로헥속시] -5-브로모-3-피리딜]모르폴린 (17 g, 38.00 mmol, 97% 수율)을 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 447.1 [M+1] +.
단계 7: N-(6'-(((1R,3R)-3-(벤질옥시)시클로헥실)옥시)-2-메틸-5'-모르폴리노-[3,3'-비피리딘]-5-일)-3-(트리플루오로메틸)벤즈아미드 제조
디옥산 (200 mL) 중 [2-메틸-5-[[3-(트리플루오로메틸)벤조일]아미노]-3-피리딜]보론산 (4.78 g, 14.75 mmol, 1.1당량), 4-[2-[(1R,3R)-3-벤질옥시시클로헥속시]-5-브로모-3-피리딜]모르폴린 (6 g, 13.41 mmol, 1당량), 시클로펜틸(디페닐)포스판;디클로로메탄; 디클로로팔라듐;철(1.10 g, 1.34 mmol, 0.1당량), 탄산칼륨(5.56 g, 40.24 mmol, 3당량) 및 물(2 mL)의 혼합물을 탈기하고 질소로 3회 퍼지한 다음, 혼합물을 질소 대기 하에 100℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 25℃에서 물 500 mL로 급냉시킨 다음, 에틸 아세테이트 (200 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(100 mL X 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르/에틸 아세테이트=20:1 내지 8:1)로 정제하였다. 화합물 N-[5-[6-[(1R,3R)-3-벤질옥시시클로헥속시]-5-모르폴리노-3-피리딜]-6-메틸-3-피리딜]-3-(트리플루오로메틸)벤즈아미드 (5.5 g, 8.50 mmol, 63% 수율)를 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 647.1 [M+1] +.
단계 8: N-(6'-(((1R,3R)-3-하이드록시시클로헥실)옥시)-2-메틸-5'-모르폴리노-[3,3'-비피리딘]-5-일)-3-(트리플루오로메틸)벤즈아미드 제조
디클로로메탄(100 mL) 중 N-[5-[6-[(1R,3R)-3-벤질옥시시클로헥속시]-5-모르폴리노-3-피리딜] -6-메틸-3-피리딜]-3-(트리플루오로메틸)벤즈아미드 (5.5 g, 8.50 mmol, 1당량)의 용액에 붕소 삼브롬화물(6.39 g, 25.51 mmol, 2.46 mL, 3당량)를 첨가하였다. 혼합물을 -68℃에서 1시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 25℃에서 중탄산나트륨 100 mL의 첨가로 급냉시킨 후, 물 150 mL로 희석시키고 에틸 아세테이트(80 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수 150 mL로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에서 농축시켰다. 잔류물을 분취-HPLC로 정제하였다. 화합물 N-[5-[6-[(1R,3R)-3- 하이드록시시클로헥속시]-5-모르폴리노-3-피리딜]-6-메틸-3-피리딜]-3-(트리플루오로메틸)벤즈아미드 (4.2 g, 7.55 mmol, 88% 수율)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 557.2 [M+1] +.
단계 9: 에틸 2-(((1R,3R)-3-((2'-메틸-5-모르폴리노-5'-(3-(트리플루오로메틸)벤즈아미도)-[3,3'-비피리딘]-6-일)옥시)시클로헥실)옥시)아세테이트 제조
디클로로메탄(10 mL) 중 N-[5-[6-[(1R,3R)-3-하이드록시시클로헥속시]-5-모르폴리노-3-피리딜] -6-메틸-3-피리딜]-3-(트리플루오로메틸)벤즈아미드 (1 g, 1.80 mmol, 1당량)의 용액에 디아세톡시로듐(39 mg, 0.18 mmol, 0.1당량) 및 에틸 2-디아조아세테이트(615 mg, 5.39 mmol, 3당량)를 첨가하였다. 혼합물을 25℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 여과하고, 여과물을 농축시켰다. 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트=3:1 내지 1:3)로 정제하였다. 화합물 에틸 2-[(1R,3R)-3-[[5-[2-메틸-5-[[3- (트리플루오로메틸)벤조일]아미노]-3-피리딜]-3-모르폴리노-2-피리딜]옥시]시클로헥속시]아세테이트 (500 mg, 0.18 mmol, 43% 수율)를 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 643.1 [M+1] +.
단계 10: N-(6'-(((1R,3R)-3-(2-하이드록시에톡시)시클로헥실)옥시)-2-메틸-5'-모르폴리노-[3,3'-비피리딘]-5-일)-3-(트리플루오로메틸)벤즈아미드 제조
테트라하이드로푸란(10 mL) 중 에틸 2-[(1R,3R)-3-[[5-[2-메틸-5-[[3-(트리플루오로메틸)벤조일] 아미노]-3-피리딜]-3-모르폴리노-2-피리딜]옥시]시클로헥속시]아세테이트 (700 mg, 1.09 mmol, 1당량)의 용액에 리튬 알루미늄 수소화물(41 mg, 1.09 mmol, 1당량)을 첨가하였다. 혼합물을 0~25 ℃에서 1시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 0℃에서 물 2 mL로 급냉시킨 다음, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 분취-TLC(디클로로메탄:메틸 알코올 = 10:1)로 정제하였다. 화합물 N-[5-[6-[(1R,3R)-3-(2- 하이드록시에톡시)시클로헥속시]-5-모르폴리노-3-피리딜]-6-메틸-3-피리딜]-3-(트리플루오로메틸)벤즈아미드 (400 mg, 0.67 mmol, 61% 수율)를 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 601.1 [M+1] +.
단계 11: 에틸 2-(2-(((1R,3R)-3-((2'-메틸-5-모르폴리노-5'-(3-(트리플루오로메틸)벤즈아미도)-[3,3'-비피리딘]-6-일)옥시)시클로헥실)옥시)에톡시)아세테이트 제조
디클로로메탄(1 mL) 중 N-[5-[6-[(1R,3R)-3-(2-하이드록시에톡시)시클로헥속시]-5-모르폴리노 -3-피리딜]-6-메틸-3-피리딜]-3-(트리플루오로메틸)벤즈아미드 (100 mg, 0.16 mmol, 1당량)의 용액에 디아세톡시로듐(7 mg, 0.03 mmol, 0.2당량) 및 에틸 2-디아조아세테이트(189mg, 1.66 mmol, 10당량)를 첨가하였다. 혼합물을 25℃에서 1시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 여과하고, 필터를 농축시켰다. 잔류물을 분취-TLC(디클로로메탄:메틸 알코올 = 10:1)로 정제하였다. 화합물 에틸 2-[2-[(1R,3R)-3-[[5-[2-메틸-5-[[3-(트리플루오로메틸)벤조일]아미노]-3-피리딜]-3- 모르폴리노-2-피리딜]옥시]시클로헥속시]에톡시]아세테이트 (81 mg, 0.11 mmol, 70% 수율)를 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 687.2 [M+1] +.
단계 12: 2-(2-(((1R,3R)-3-((2'-메틸-5-모르폴리노-5'-(3-(트리플루오로메틸)벤즈아미도)-[3,3'-비피리딘]-6-일)옥시)시클로헥실)옥시)에톡시)아세트산 제조
테트라하이드로푸란(2 mL) 및 물(0.2 mL) 중 에틸 2-[2-[(1R,3R)-3-[[5-[2-메틸-5-[[3-(트리플루오로메틸)벤조일] 아미노]-3-피리딜]-3-모르폴리노-2-피리딜]옥시]시클로헥속시]에톡시]아세테이트 (105 mg, 0.15 mmol, 1당량)의 용액에 수산화리튬(19 mg, 0.46 mmol, 3당량)을 첨가하였다. 혼합물을 40℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축시켜 테트라하이드로푸란을 제거하였다. 잔류물을 물 2 ml로 희석하고, 혼합물을 염산(1M) 2mL로 pH=5로 조정하였다. 잔류물을 분취-HPLC로 정제하였다. 화합물 2-[2-[(1R,3R)-3-[[5-[2-메틸-5-[[3-(트리플루오로메틸)벤조일] 아미노]-3-피리딜]-3-모르폴리노-2-피리딜]옥시]시클로헥속시]에톡시]아세트산 (60 mg, 0.09 mmol, 59% 수율)을 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 659.2 [M+1] +.
단계 13: (2S,4R)-1-((S)-3,3-디메틸-2-(2-(2-(((1R,3R)-3-((2'-메틸-5-모르폴리노-5'-(3-(트리플루오로메틸)벤즈아미도)-[3,3'-비피리딘]-6-일)옥시)시클로헥실)옥시)에톡시)아세트아미도)부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
디메틸 포름아미드 (3 mL) 중 2-[2-[(1R,3R)-3-[[5-[2-메틸-5-[[3-(트리플루오로메틸)벤조일]아미노]-3- 피리딜]-3-모르폴리노-2-피리딜]옥시]시클로헥속시]에톡시]아세트산 (60 mg, 0.09 mmol, 1당량), (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4- 메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (48 mg, 0.1 mmol, 1.1당량, 염화수소), 하이드록시벤조트리아졸 (14 mg, 0.10 mmol, 1.2당량), 1-(3-디메틸아미노프로필)-3-에틸카르보디이미드 (21 mg, 0.1 mmol, 1.2당량) 및 트리에틸아민 (27 mg, 0.27 mmol, 3당량)을 탈기하고 질소로 3회 퍼지하고, 그런 다음, 혼합물을 질소 대기 하에 40℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 25℃에서 물 50 mL로 급냉시킨 다음, 에틸 아세테이트(20 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(15 mL X 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 분취-TLC(디클로로메탄: 메틸 알코올 = 10:1)로 정제하였다. 화합물 (2S,4R)-1-[(2S)-3,3-디메틸-2-[[2-[2-[(1R,3R)-3-[[5-[2-메틸-5-[[3-(트리플루오로메틸)벤조일]아미노]-3-피리딜]-3-모르폴리노-2-피리딜]옥시]시클로헥속시]에톡시]아세틸]아미노]부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (34.4 mg, 0.03 mmol, 34% 수율, 98% 순도)을 백색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 1086.2 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 10.65 (s, 1H), 8.96 (s, 1H), 8.84 (d, J=2.4 Hz, 1H), 8.41 (d, J=7.2 Hz, 1H), 8.31 (s, 1H), 8.27 (d, J=7.3Hz, 1H), 8.03 (d, J=2.4 Hz, 1H), 7.99 (d, J=7.6 Hz, 1H), 7.83 - 7.75 (m, 2H), 7.46 - 7.39 (m, 2H), 7.38 - 7.30 (m, 3H), 7.19 (d, J=1.6 Hz, 1H), 5.46 (s, 1H), 5.13 (d, J=3.2 Hz, 1H), 4.95 - 4.82 (m, 1H), 4.53 (d, J=10.0 Hz, 1H), 4.43 (t, J=8.4 Hz, 1H), 4.28 (s, 1H), 4.01 - 3.93 (m, 2H), 3.79 - 3.65 (m, 6H), 3.61 (dd, J=3.6, 8.4 Hz, 5H), 3.08 (s, 4H), 2.44 (s, 6H), 2.11 - 1.97 (m, 2H), 1.92 - 1.63 (m, 6H), 1.60 - 1.43 (m, 2H), 1.35 (dd, J=3.6, 6.8 Hz, 3H), 0.92 (d, J=3.2 Hz, 9H).
4-((R)-2-((2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복사미도)-2-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에톡시)-4-옥소부탄산 (예시적 화합물 758)의 예시적인 합성
단계 1: 벤질 (2S,4R)-1-((S)-2-((삼차-부톡시카르보닐)아미노)-3,3-디메틸부타노일)-4-((삼차-부틸디메틸실릴)옥시)피롤리딘-2-카르복실레이트 제조
150-mL 둥근 바닥 플라스크에, 0 ℃에서 디클로로메탄(80mL) 중 벤질 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복실레이트 (7 g, 16.11 mmol, 1.00당량), 이미다졸e (1.6 g, 23.51 mmol, 1.46당량)을 넣었다. 이어서 TBDMSCl (3.6 g, 23.89 mmol, 1.48당량)을 0 ℃에서 나누어서 첨가하였다. 생성된 용액을 실온에서 6시간 동안 교반하였다. 이어서 반응물을 물(60 mL)의 첨가로 급냉시켰다. 생성된 혼합물을 디클로로메탄(50 mL x 3)으로 추출하여 유기층을 합치고, 염수(100 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:9)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 5.8 g(66%)의 벤질 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]-3,3-디메틸부타노일]-4-[(삼차-부틸디메틸실릴)옥시]피롤리딘-2-카르복실레이트를 연황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 549.20 [M+1] +.
단계 2: (2S,4R)-1-((S)-2-((삼차-부톡시카르보닐)아미노)-3,3-디메틸부타노일)-4-((삼차-부틸디메틸실릴)옥시)피롤리딘-2-카르복실산 제조
메탄올(15 mL) 중 벤질 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]-3,3-디메틸부타노일]-4-[(삼차-부틸디메틸실릴)옥시]피롤리딘-2-카르복실레이트 (500 mg, 0.91 mmol, 1.00당량)의 용액을 질소 대기 하에 Pd/C (10%, 100 mg)로 채웠다. 이어서 플라스크를 진공화하고 수소로 플러싱하였다. 반응 혼합물을 수소 분위기 하에 실온에서 16시간 동안 수소 풍선을 사용해 수소화시킨 후, 셀라이트 패드를 통해 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 이를 통해 273 mg(65%)의 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]-3,3-디메틸부타노일]-4-[(삼차-부틸디메틸실릴)옥시]피롤리딘-2-카르복실산을 무색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 459.30 [M+1] +.
단계 3: 삼차-부틸 ((S)-1-((2S,4R)-4-((삼차-부틸디메틸실릴)옥시)-2-(((R)-2-하이드록시-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)카바모일)피롤리딘-1-일)-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일)카바메이트 제조
25-mL 둥근 바닥 플라스크에, DMF (5 mL) 중 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]-3,3-디메틸부타노일]-4-[(삼차-부틸디메틸실릴)옥시]피롤리딘-2-카르복실산 (930 mg, 1당량), (2R)-2-아미노-2-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에탄-1-올 염화수소 (550 mg), HATU (930 mg), DIEA (1 g)을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물(80 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(50 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:0)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 460 mg의 삼차-부틸 N-[(2S)-1-[(2S,4R)-4-[(삼차-부틸디메틸실릴)옥시]-2-[[(1R)-2-하이드록시-1-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에틸]카바모일]피롤리딘-1-일]-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일]카바메이트를 연황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 675.20 [M+1] +.
단계 4: (2S,4R)-1-((S)-2-아미노-3,3-디메틸부타노일)-4-((삼차-부틸디메틸실릴)옥시)-N-((R)-2-하이드록시-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
25 mL의 둥근 바닥 플라스크에 디클로로메탄 (10 mL) 중 삼차-부틸 N-[(2S)-1-[(2S,4R)-4-[(삼차-부틸디메틸실릴)옥시] -2-[[(1R)-2-하이드록시-1-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에틸]카바모일]피롤리딘-1-일]-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일]카바메이트 (660 mg, 980 mmol, 1당량)를 첨가하였다. 상기 혼합물에 TFA(3 mL)를 0℃에서 적가하였다. 생성된 혼합물을 0 ℃에서 0.5시간 동안 교반한 다음, 포화 중탄산나트륨 용액(100 mL)을 실온에서 첨가하여 급냉시켰다. 생성된 혼합물을 DCM(10 mL x 2)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 황산나트륨 상에서 건조시키고, 감압 하에 농축시켰다. 이를 통해 (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸부타노일]-4-[(삼차-부틸디메틸실릴)옥시]-N-[(1R)-2-하이드록시-1-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드, 트리플루오로아세트산 염(760 mg)을 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 575.20 [M+1] +.
단계 5: 삼차-부틸 (R)-2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-((3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세테이트 제조
100 mL 둥근바닥 플라스크에, 1,4-디옥산 (15 mL) 및 물(3 mL) 중 삼차-부틸 2-(4-((4-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세테이트 (783.4 mg, 1.57 mmol, 1.50당량), (R)-N-(3-(5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 (525.0 mg, 1.05 mmol, 1.00당량), 탄산나트륨(222.6 mg, 2.10 mmol, 2.00당량), Pd(dppf)Cl2 (85.5 mg, 0.10 mmol, 0.10당량)의 용액을 넣었다. 질소 하에 생성된 용액을 오일조에서 100oC에서 밤새 교반하였다. 잔류물을 감압 하에 증발시켜 농축시키고 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:0)로 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 621.5 mg (75%)의 (R)-삼차-부틸 2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세테이트를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 796.20 [M+1] +.
단계 6: (R)-2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-((3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트산 제조
50 mL 둥근 바닥 플라스크에, 디클로로메탄 (8 mL) 중 (R)-삼차-부틸 2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세테이트 (621.5 mg, 0.78 mmol, 1.00당량), 2,2,2-트리플루오로아세트알데히드 (8 mL) 용액을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 5시간 동안 교반하였다. 잔류물을 감압 하에 증발시켜 농축시키고 메탄올/ 클로로포름(1:2)로 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 500.0 mg (87%)의 (R)-2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트산을 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 740.15 [M+1] +.
단계 7: (2S,4R)-4-((삼차-부틸디메틸실릴)옥시)-1-((S)-2-(2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-N-((R)-2-하이드록시-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
50 mL 둥근 바닥 플라스크에 DMF (5 mL) 중 2-(4-[[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]메틸]피페리딘-1-일)아세트산 (700 mg, 950 mmol, 1당량), (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸부타노일]-4-[(삼차-부틸디메틸실릴)옥시]-N-[(1R)-2-하이드록시-1-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드, 트리플루오로아세트산 염 (736.5 mg in 10 mL DMF, 1.07 mol, 1.13당량), DIEA (50 mg, 0.39 mmol, 3.25당량)을 실온에서 첨가하였다. 생성된 혼합물을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 혼합물을 물(22 mL)로 희석시키고 EtOAc (30 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(10 mL)로 세척하고, 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/MeOH(9:1)로 용리시켜 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피로 정제하여 (2R)-2-[[(2S,4R)-1-[(2S)-2-[2-(4-[[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]메틸]피페리딘-1-일)아세트아미도]-(760 mg, 65.60%)를 황색 오일로서 수득하였다.
단계 8: 4-((R)-2-((2S,4R)-4-((삼차-부틸디메틸실릴)옥시)-1-((S)-2-(2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)피롤리딘-2-카르복사미도)-2-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에톡시)-4-옥소부탄산 제조
질소 불활성 분위기로 퍼지되고 유지된 50 mL 플라스크에, DCM (20 mL) 중 (2S,4R)-4-[(삼차-부틸디메틸실릴)옥시]-1-[(2S)-2-[2-(4-[[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]메틸]피페리딘-1-일)아세트아미도]-3,3-디메틸부타노일]-N-[(1R)-2-하이드록시-1-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (100.00 mg, 0.077 mmol, 1.00당량), DMAP (37.69 mg, 0.308 mmol, 4당량), TEA (15.61 mg, 0.154 mmol, 2당량), 옥소란-2,5-디온 (30.87 mg, 0.308 mmol, 4.00당량) 용액을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 16시간 동안 교반하였다. 생성된 용액을 디클로로메탄 (50 mLx3)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 감압 하에 농축시켰다. 이를 통해 126 mg의 4-[(2R)-2-[[(2S,4R)-4-[(삼차-부틸디메틸실릴)옥시]-1-[(2S)-2-[2-(4-[[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]메틸]피페리딘-1-일)아세트아미도]-3,3-디메틸부타노일]피롤리딘-2-일]포름아미도]-2-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에톡시]-4-옥소부탄산을 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 1396 [M+1] +.
단계 9: 4-((R)-2-((2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복사미도)-2-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에톡시)-4-옥소부탄산 제조
100-mL 둥근 바닥 플라스크에, 디옥산(8.00 mL) 중 4-[(2R)-2-[[(2S,4R)-4-[(삼차-부틸디메틸실릴)옥시]-1-[(2S)-2-[2-(4-[[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]메틸]피페리딘-1-일)아세트아미도]-3,3-디메틸부타노일]피롤리딘-2-일]포름아미도]-2-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에톡시]-4-옥소부탄산 (110.00 mg, 0.308 mmol, 1당량)을 넣고, 여기에 농축된 염화수소(1.00 mL)를 첨가하였다. 생성된 용액을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 생성된 용액을 디클로로메탄(50 mL x 3)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 분취-HPLC로 정제하였다. 이를 통해 50 mg의 4-[(2R)-2-[[(2S,4R)-1-[(2S)-2-[2-(4-[[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]메틸]피페리딘-1-일)아세트아미도]-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시피롤리딘-2-일]포름아미도]-2-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에톡시]-4-옥소부탄산을 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 1282 [M+1] +; 1H-NMR (300MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.91(s, 1H), 9.83 (s, 1H), 8.99 (s, 1H), 8.65 (s, 1H), 8.60 -8.55 (m, 2H), 8.07 (s, 1H), 7.62 (s, 3H), 7.60 -7.37 (m, 4H), 7.30-7.24 (m, 1H), 7.09-7.07 (m, 2H), 5.21-5.13 (m, 2H), 4.54-4.44 (m, 2H), 4.29 -4.23 (m, 3H), 3.62-3.31 (m, 13H), 2.91-2.73 (m, 4H), 2.56-2.54 (m, 3H), 2.50-2.47 (m, 7H), 2.28-1.96 (m, 8H), 1.81-1.77 (m, 4H), 1.31-1.11(m, 2H), 0.95-0.86 (s, 9H).
2-(2-((R)-2-((2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복사미도)-2-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에톡시)-2-옥소에톡시)아세트산 (예시적 화합물 759)의 예시적인 합성
단계 1: 2-(2-((R)-2-((2S,4R)-4-((삼차-부틸디메틸실릴)옥시)-1-((S)-2-(2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)피롤리딘-2-카르복사미도)-2-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에톡시)-2-옥소에톡시)아세트산 제조
질소의 불활성 대기로 퍼지하고 유지한 25-mL 플라스크에, DCM (5.00 mL) 중 (2S,4R)-4-[(삼차-부틸디메틸실릴)옥시]-1-[(2S)-2-[2-(4-[[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]메틸]피페리딘-1-일)아세트아미도]-3,3-디메틸부타노일]-N-[(1R)-2-하이드록시-1-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (100.00 mg, 0.077 mmol, 1.00당량), DMAP (28.27 mg, 0.231 mmol, 3.00당량), TEA (15.61 mg, 0.154 mmol, 2당량), 1,4-디옥산-2,6-디온 (35.81 mg, 0.308 mmol, 4.00당량) 용액을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 16시간 동안 교반하였다. 생성된 용액을 (50 mL x 3)의 디클로로메탄으로 추출하고, 유기층을 합치고 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 중에서 농축시켰다. 이를 통해 137.7 mg의 2-[2-[(2R)-2-[[(2S,4R)-4-[(삼차-부틸디메틸실릴)옥시]-1-[(2S)-2-[2-(4-[[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]메틸]피페리딘-1-일)아세트아미도]-3,3-디메틸부타노일]피롤리딘-2-일]포름아미도]-2-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에톡시]-2-옥소에톡시]아세트산을 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 1142 [M+1] +.
단계 2: 2-(2-((R)-2-((2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복사미도)-2-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에톡시)-2-옥소에톡시)아세트산 제조
디옥산 (8.00 mL) 중 2-[2-[(2R)-2-[[(2S,4R)-4-[(삼차-부틸디메틸실릴)옥시]-1-[(2S)-2-[2-(4-[[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]메틸]피페리딘-1-일)아세트아미도]-3,3-디메틸부타노일]피롤리딘-2-일]포름아미도]-2-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에톡시]-2-옥소에톡시]아세트산 (137.70 mg) 용액을 농축된 염화수소 (1.00 mL)로 채웠다. 생성된 용액을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 생성된 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 분취-HPLC로 정제하였다. 이를 통해 50 mg의 2-[2-[(2R)-2-[[(2S,4R)-1-[(2S)-2-[2-(4-[[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]메틸]피페리딘-1-일)아세트아미도]-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시피롤리딘-2-일]포름아미도]-2-(4-메틸페닐)에톡시]-2-옥소에톡시]아세트산을 연황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 1298.45 [M+1] +; 1H-NMR (300MHz, DMSO-d 6 ) δ 8.99 (s, 1H), 8.64-8.61 (m, 2H), 8.53 (s, 1H), 8.06 (s, 1H), 7.89-7.86 (m, 1H), 7.61 (s, 3H), 7.58-7.46 (m, 4H), 7.28-7.22 (m, 1H), 7.08-7.05 (d, J = 8.1Hz, 2H), 5.31-5.19 (m, J = 2H), 4.53-4.43 (m, 2H), 4.38-4.16 (m, 6H), 4.06-3.95 (m, 3H), 3.49-3.38 (m, 3H), 3.29-3.13 (m, 6H), 3.23-2.87 (m, 6H), 2.68-2.56 (m, 3H), 2.50-2.46 (m, 3H), 2.26-2.18 (m, 8H), 1.87-1.71 (m, 3H), 1.70-1.53 (m, 1H), 1.31-1.12 (m, 3H), 1.01-0.87 (s, 9H).
(3R)-N-(3-(5-(4-(4-((((1r,3r)-3-((2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1,3-디옥소이소인돌린-5-일)옥시)시클로부틸)(이소프로필)아미노)메틸)피페리딘-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 (예시적 화합물 760)의 예시적인 합성
단계 1: 삼차-부틸 ((1s,3s)-3-하이드록시시클로부틸)카바메이트 제조
테트라하이드로푸란 (150 mL) 중 삼차-부틸 N-(3-옥소시클로부틸)카바메이트 (15.00 g, 80.98 mmol, 1.00당량)의 용액에 테트라하이드로푸란(100 mL) 및 물(100 mL) 중 수소화 붕소 나트륨(1.53 g, 40.49 mmol, 0.50당량)을 -70℃에서 2시간 동안 적가하였다. 혼합물을 -70℃에서 2시간 동안 교반하였다. 그런 다음 혼합물에 물(100 mL)을 첨가하고, 20 ℃로 가온하였다. 혼합물을 에틸 아세테이트(2 x 200 mL)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(2 x 400 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켜 백색 고체를 수득하였다. 고체를 석유 에테르:에틸 아세테이트(50 mL, v:v=20:1)의 용액으로 용해시켰다. 현탁 용액을 0.5시간 동안 교반한 다음 여과하여 삼차-부틸 N-(3-하이드록시시클로부틸)카바메이트 (13.80 g, 73.70 mmol, 91% 수율)를 수득하였다. 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 7.00 (d, J=7.2 Hz, 1H), 4.96 (d, J=5.6 Hz, 1H), 3.62 - 3.82 (m, 1H), 3.33 - 3.47 (m, 1H), 2.35 - 2.47 (m, 2H), 1.63 - 1.76 (m, 2H), 1.36 (s, 9H).
단계 2: 디메틸 4-((1r,3r)-3-((삼차-부톡시카르보닐)아미노)시클로부톡시)프탈레이트 제조
0 ℃에서 테트라하이드로푸란(150 mL) 중 디메틸 4-하이드록시벤젠-1,2-디카르복실레이트 (17.04 g, 81.07 mmol, 1.10당량), 삼차-부틸 N-(3-하이드록시시클로부틸)카바메이트 (13.80 g, 73.70 mmol, 1.00당량) 및 트리페닐포스핀(25.13 g, 95.82 mmol, 1.30당량)의 용액에 디이소프로필 아조디카르복실레이트(19.37 g, 95.82 mmol, 1.30당량)를 적가하였다. 혼합물을 15℃로 가온시켰다. 혼합물을 15℃에서 15시간 동안 교반하였다. 혼합물을 물(150 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(2 x 100 mL)로 추출하였다. 유기층을 염수(2 x 100 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트 = 10:1 내지 3:1)로 정제하여 디메틸 4-[3-(삼차-부톡시카르보닐아미노)시클로부톡시]벤젠-1,2-디카르복실레이트(25.50 g, 67.21 mmol, 91% 수율)를 적색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 402.1 [M+23] +.
단계 3: 디메틸 4-((1r,3r)-3-아미노시클로부톡시)프탈레이트 제조
디클로로메탄(30 mL) 중 디메틸 4-[3-(삼차-부톡시카르보닐아미노)시클로부톡시]벤젠-1,2- 디카르복실레이트 (25.50 g, 67.21 mmol, 1.00당량)의 용액에 염산/에틸 아세테이트(4 M, 30 mL, 1.79당량)를 20℃에서 첨가하였다. 혼합물을 20℃에서 1시간 동안 교반하였다. 혼합물을 감압 하에 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 잔류물을 물(60 mL)로 희석하고 에틸 아세테이트(4 x 50 mL)로 추출하였다. 수상을 수산화암모늄에 의해 pH=8로 조정하고 감압 하에 농축시켜 디메틸 4-(3-아미노시클로부톡시)벤젠-1,2-디카르복실레이트 (19.00 g)를 연적색 고체로서 수득하였다. 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 7.92 - 8.60 (m, 2H), 7.75 - 7.80 (m, 1H), 7.02 - 7.06 (m, 1H), 6.98 - 7.01 (m, 1H), 5.09 - 5.18 (m, 1H), 3.80 - 3.84 (m, 1H), 3.80 (s, 3H), 3.77 (s, 3H), 2.58 - 2.69 (m, 2H), 2.37 - 2.46 (m, 2H).
단계 4: 디메틸 4-((1r,3r)-3-(((1-(삼차-부톡시카르보닐)피페리딘-4-일)메틸)아미노)시클로부톡시)프탈레이트 제조
100-mL 둥근 바닥 플라스크에, 삼차-부틸 4-포르밀피페리딘-1-카르복실레이트 (680 mg, 3.18 mmol, 1.00당량), 1,2-디메틸 4-[(1r,3r)-3-아미노시클로부톡시]벤젠-1,2-디카르복실레이트 염화수소 (1 g, 3.16 mmol, 0.99당량), 디클로로메탄 (40 mL)을 넣었다. 이어서, DIEA(약 0.2 mL, PH=8~9로 조정함)를 실온에서 1시간 동안 교반하면서 적가하였다. 여기에 NaBH(OAc)3 (1.4 g, 6.60 mmol, 2.1당량)을 실온에서 5분 동안 나누어서 첨가하였다. HOAc(약 0.4 mL, PH= 5~6로 조정함) 생성된 용액을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 이어서 30 mL의 물을 첨가하여 반응물을 급냉시켰다. 생성된 용액을 3x30 mL의 디클로로메탄으로 추출하고 유기층을 합쳤다. 생성된 혼합물을 1x30 mL의 포화 염화 나트륨 수용액으로 세척하였다. 혼합물을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(9:1)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 원하는 생성물을 진공 하에 농축시켜 수득하였다. 이를 통해 1.23 g(81%)의 1,2-디메틸 4-[(1r,3r)-3-[([1-[(삼차-부톡시)카르보닐]피페리딘-4-일]메틸)아미노]시클로부톡시]벤젠-1,2-디카르복실레이트를 연황색 오일로서 수득하였다.
단계 5: 디메틸 4-((1r,3r)-3-(((1-(삼차-부톡시카르보닐)피페리딘-4-일)메틸)(이소프로필)아미노)시클로부톡시)프탈레이트 제조
질소의 불활성 대기로 퍼지되고 유지된 100-mL 둥근 바닥 플라스크에, iPrOH/아세톤(20/20 mL) 중 1,2-디메틸 4-[(1r,3r)-3-[([1-[(삼차-부톡시)카르보닐]피페리딘-4-일]메틸)아미노]시클로부톡시]벤젠-1,2-디카르복실레이트 (1.23 g, 2.44 mmol, 1.00당량)의 용액을 넣었다. Ti(iPrO)4 (693mg, 2.44 mmol, 1.00당량) 및 4A MS 10 g을 첨가하였다. 1시간 동안 실온에서 교반한 후, NaBH3CN (461 mg, 7.32 mmol, 3.00당량)을 첨가하였다. 생성된 용액을 60oC에서 20시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 냉각시켰다. 고체를 걸러냈다. 생성된 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(10/1)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 원하는 생성물을 진공 하에 농축시켜 수득하였다. 이를 통해 841 mg(67%)의 1,2-디메틸 4-[(1r,3r)-3-[([1-[(삼차-부톡시)카르보닐]피페리딘-4-일]메틸)(프로판-2-일)아미노]시클로부톡시]벤젠-1,2-디카르복실레이트를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 518.30 [M+1] +.
단계 6: 디메틸 4-((1r,3r)-3-(이소프로필(피페리딘-4-일메틸)아미노)시클로부톡시)프탈레이트 제조
100-mL 둥근 바닥 플라스크에, 1,4-디옥산 (20 mL, 4mol/L) 중 1,2-디메틸 4-[(1r,3r)-3-[([1-[(삼차-부톡시)카르보닐]피페리딘-4-일]메틸)(프로판-2-일)아미노]시클로부톡시]벤젠-1,2-디카르복실레이트 (841mg, 1.62 mmol, 1.00당량), HCl (기체)을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 원하는 생성물을 진공 하에 농축시켜 수득하였다. 이를 통해 863 mg의 1,2-디메틸 4-[(1r,3r)-3-[[(피페리딘-4-일)메틸](프로판-2-일)아미노]시클로부톡시]벤젠-1,2-디카르복실레이트 염화수소를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 418.25 [M+1] +.
단계 7: 디메틸 4-((1r,3r)-3-(((1-(4-브로모페닐)피페리딘-4-일)메틸)(이소프로필)아미노)시클로부톡시)프탈레이트 제조
250-mL 둥근 바닥 플라스크에, 1,2-디메틸 4-[(1r,3r)-3-[[(피페리딘-4-일)메틸](프로판-2-일)아미노]시클로부톡시]벤젠-1,2-디카르복실레이트 (2.40 g, 5.734 mmol, 1.00당량), (4-브로모페닐)보론산 (2.30 g, 11.469 mmol, 2.00당량), 디클로로메탄 (100 mL), TEA (2.32 g, 22.937 mmol, 4.00당량), Cu(OAc)2 (2.08 g, 11.469 mmol, 2.00당량)을 넣었다. 생성된 용액을 대기 중에 실온에서 72시간 동안 교반하였다. 여과 후, 물(100 mL)로 희석하였다. 생성된 혼합물을 디클로로메탄(200 mL x 3)으로 추출하고, 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 중에서 농축시켰다. 그런 다음, 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:3)로 용리시킨다. 이를 통해 880 mg(27%)의 1,2-디메틸 4-[(1r,3r)-3-([[1-(4-브로모페닐)피페리딘-4-일]메틸](프로판-2-일)아미노)시클로부톡시]벤젠-1,2-디카르복실레이트를 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 572.19 [M+1] +.
단계 8: 디메틸 4-((1r,3r)-3-(이소프로필((1-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)아미노)시클로부톡시)프탈레이트 제조
질소의 불활성 대기로 퍼지되고 유지되는 25-mL 둥근 바닥 플라스크에, 1,2-디메틸 4-[(1r,3r)-3-([[1-(4-브로모페닐)피페리딘-4-일]메틸](프로판-2-일)아미노)시클로부톡시]벤젠-1,2-디카르복실레이트 (740.00 mg, 1.290 mmol, 1.00당량), 4,4,5,5-테트라메틸-2-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-1,3,2-디옥사보로란 (655.30 mg, 2.581 mmol, 2.00당량), 디옥산 (5.00 mL, 59.020 mmol, 45.74당량), KOAc (253.26 mg, 2.581 mmol, 2.00당량), Pd(dppf)Cl2 (94.41 mg, 0.129 mmol, 0.10당량)을 넣었다. 생성된 용액을 오일조에서 90℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응물을 실온으로 냉각시키고 무수 나트륨으로 건조시키고, 진공 중에서 농축시켰다. 그런 다음, 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:1)로 용리시킨다. 이를 통해 590 mg(73%)의 1,2-디메틸 4-[(1r,3r)-3-[(프로판-2-일)([1-[4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐]피페리딘-4-일]메틸)아미노]시클로부톡시]벤젠-1,2-디카르복실레이트를 갈색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 620.36 [M+1] +.
단계 9: 디메틸 4-((1r,3r)-3-(((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)(이소프로필)아미노)시클로부톡시)프탈레이트 제조
질소의 불활성 대기로 퍼지되고 유지된 25-mL 밀봉된 튜브에, 1,2-디메틸 4-[(1r,3r)-3-[이소프로필([1-[4-(4,4,5-트리메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐]피페리딘-4-일]메틸)아미노]시클로부톡시]프탈레이트 (570.00 mg, 1.1당량), (3R)-N-(3-[5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 (420 mg, 1.00당량), 디옥산 (5 mL), H2O (1 mL), Na2CO3 (177 mg, 2.0당량), Pd(dppf)Cl2 (68 mg, 0.1당량)을 넣었다. 최종 반응 혼합물은 마이크로파로 100 ℃에서 2시간 동안 조사되었다. 반응물을 실온으로 냉각시키고 무수 나트륨으로 건조시키고, 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트(100%)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 220 mg(29%)의 1,2-디메틸 4-[(1r,3r)-3-[[(1-[4-[3-(2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일설포닐]아미노]벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페리딘-4-일)메틸](이소프로필)아미노]시클로부톡시]프탈레이트를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 916.34 [M+1] +.
단계 10: 4-((1r,3r)-3-(((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)(이소프로필)아미노)시클로부톡시)프탈산 제조
25-mL 둥근 바닥 플라스크에, 1,2-디메틸 4-[(1r,3r)-3-[[(1-[4-[3-(2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일설포닐]아미노]벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페리딘-4-일)메틸](이소프로필)아미노]시클로부톡시]프탈레이트 (200.00 mg, 0.218 mmol, 1.00당량), MeOH (10.00 mL), H2O (4.00 mL)을 넣었다. 이어서 NaOH (174.47 mg, 4.362 mmol, 20.00당량)을 10 oC에서 첨가하였다. 생성된 용액을 오일조에서 50℃에서 20시간 동안 교반하였다. 반응물을 실온으로 냉각시키고 무수 나트륨으로 건조시키고, 진공 중에서 농축시켰다. 이를 통해 210 mg의 4-[(1r,3r)-3-[[(1-[4-[3-(2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일설포닐]아미노]벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페리딘-4-일)메틸](이소프로필)아미노]시클로부톡시]벤젠-1,2-디카르복실산을 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 888.31 [M+1] +.
단계 11: (3R)-N-(3-(5-(4-(4-((((1r,3r)-3-((2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1,3-디옥소이소인돌린-5-일)옥시)시클로부틸)(이소프로필)아미노)메틸)피페리딘-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 제조
25-mL 둥근 바닥 플라스크에, 4-[(1r,3r)-3-[[(1-[4-[3-(2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일설포닐]아미노]벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]피페리딘-4-일)메틸](이소프로필)아미노]시클로부톡시]벤젠-1,2-디카르복실산 (190.00 mg, 0.214 mmol, 1.00당량), 3-아미노피페리딘-2,6-디온 (27.39 mg, 0.214 mmol, 1.00당량), HOAc (10.00 mL), NaOAc (175.33 mg, 2.137 mmol, 10.00당량)을 넣었다. 생성된 용액을 오일조에서 120 ℃에서 1시간 동안 교반하였다. 반응물을 실온으로 냉각시키고 무수 나트륨으로 건조시키고, 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(15:1)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 생성물을 분취-HPLC로 추가로 정제하였다. 이를 통해 23 mg (11%)의 (3R)-N-[2,4-디플루오로-3-(5-[4-[4-([이소프로필[(1r,3r)-3-[[2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1,3-디옥소이소인돌-5-일]옥시]시클로부틸]아미노]메틸)피페리딘-1-일]페닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)페닐]-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드를 연황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 981.20 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.89 (s, 1H), 11.10 (s, 1H), 8.65 (s, 1H), 8.52 (s, 1H), 8.15 (s, 1H), 8.06 (s, 1H), 7.83 (d, J = 8.4 Hz, 1H), 7.67-7.55 (m, 3H), 7.31- 7.21 (m, 3H), 7.10-7.03 (m, 2H), 5.36 (d, J = 32.6 Hz, 1H), 5.22-5.20 (m, 1H), 4.92 (t, J = 6.6 Hz, 1H), 3.86-3.74 (m, 4H), 3.69 (t, J = 8.1 Hz, 2H), 2.89-2.86 (m, 2H), 2.72-2.70 (m, 3H), 2.59-2.56 (m, 2H), 2.29-2.28 (m, 3H), 2.20-2.17 (m, 2H), 2.13-2.00 (m, 3H), 1.86 (d, J = 12.4 Hz, 2H), 1.54 (b, 1H), 1.26 - 1.13 (m, 3H), 0.94 (d, J = 6.6 Hz, 6H).
(3R)-N-(3-(5-(4-(4-((4-(4-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 (예시적 화합물 761)의 예시적인 합성
단계 1: 삼차-부틸 4-(4-(2-메톡시-2-옥소에틸)페닐)피페라진-1-카르복실레이트 제조
질소 불활성 분위기로 퍼지되고 유지된 500 mL 둥근바닥 플라스크에, PhMe (200 mL) 중 메틸 2-(4-브로모페닐)아세테이트 (10.0 g, 43.6 mmol, 1.0당량), 삼차-부틸 피페라진-1-카르복실레이트 (8.1 g, 43.6 mmol, 1.0당량), Cs2CO3 (28.5 g, 87.3 mmol, 2.0당량), RuPhos-PdCl-2nd G (3.4 g, 4.3 mmol, 0.1당량)을 넣었다. 생성된 용액을 오일조에서 110℃에서 16시간 동안 교반하였다. 생성된 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:1)로 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 6.5 g의 삼차-부틸 4-[4-(2-메톡시-2-옥소에틸) 페닐] 피페라진-1-카르복실레이트를 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 335.00 [M+1] +.
단계 2: 삼차-부틸 4-(4-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)페닐)피페라진-1-카르복실레이트 제조
질소의 불활성 대기로 퍼지되고 유지된 250-mL 둥근 바닥 플라스크에, THF(60.0 mL) 중 삼차-부틸 4-[4-(2-메톡시-2-옥소에틸)페닐]피페라진-1-카르복실레이트 (6.5 g, 19.4 mmol, 1.0당량) 및 t-BuOK (2.4 g, 21.3 mmol, 1.1당량)을 넣었다. 그런 다음, 폴리아크릴아미드(1.2 g, 17.4 mmol, 0.9당량)를 첨가하였다. 생성된 혼합물을 50℃에서 오일조에서 밤새 교반하였다. 이어서 100 mL의 물을 첨가하여 반응물을 급냉시켰다. 생성된 용액을 에틸 아세테이트(100 x 3 mL)로 추출하고, 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(2:1)로 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 2.1 g(30.0%)의 삼차-부틸 4-[4-(2, 6-디옥소피페리딘-3-일) 페닐] 피페라진-1-카르복실레이트를 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 374.05 [M+1] +.
단계 3: 3-(4-(피페라진-1-일)페닐)피페리딘-2,6-디온 제조
50 mL 둥근바닥 플라스크에, DCM (20.0 mL) 중 삼차-부틸 4-[4-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)페닐]피페라진-1-카르복실레이트 (2.1 g, 1.0당량)를 넣고, 여기에 1,4-디옥산 용액(4.0 M, 20 mL) 중 염화수소를 첨가하였다. 생성된 혼합물을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 생성된 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 이를 통해 1.1 g의 3-[4-(피페라진-1-일) 페닐] 피페리딘-2, 6-디온을 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 274.00 [M+1] +.
단계 4: (3R)-N-(3-(5-(4-(4-((4-(4-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 제조
100-mL 둥근 바닥 플라스크에, DCM (15.0 mL) 중 (3R)-N-(2,4-디플루오로-3-[5-[4-(4-포르밀피페리딘-1-일)페닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 (150.0 mg, 0.25 mmol, 1.0당량) 및 3-[4-(피페라진-1-일)페닐]피페리딘-2,6-디온 (67.0 mg, 0.25 mmol, 1.0당량)을 넣었다. 생성된 혼합물을 1시간 동안 교반한 다음, NaBH(OAc)3(62.3 mg, 0.29 mmol, 1.2당량)을 첨가하였다. 생성된 혼합물을 실온에서 12시간 동안 교반하였다. 이어서 반응물을 50 mL 물의 첨가로 급냉시켰다. 생성된 용액을 디클로로메탄(50 mL x3)으로 추출하였다. 유기층을 합치고 감압 하에 농축시켰다. 미정제 생성물을 분취-HPLC로 정제하였다. 이를 통해 15.6 mg(7.3%)의 (3R)-N-[3-(5-[4-[4-([4-[4-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)페닐]피페라진-1-일]메틸)피페리딘-1-일]페닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐]-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드를 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 869.15 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.94 (s, 1H), 10.80 (s, 1H), 9.86 (s, 1H), 9.51 (s, 1H), 8.66 (d, J = 2.2 Hz, 1H), 8.55 (s, 1H), 8.07 (d, J = 3.0 Hz, 1H), 7.68-7.57 (m, 3H), 7.26-7.20 (m, 1H), 7.17 -7.08 (m, 4H), 6.99-6.90 (m, 2H), 5.40-5.20 (m, 1H), 3.85-3.72 (m, 5H), 3.68-3.61 (m, 2H), 3.51-3.40 (m, 2H), 3.29-3.16 (m, 5H), 2.92-2.71 (m, 2H), 2.72-2.59 (m, 1H), 2.22-2.09 (m, 3H), 2.12-1.95 (m, 2H), 1.93-1.84 (m, 2H), 1.50-1.37 (m, 2H), 1.25-1.21 (s, 2H).
(2S,4R)-1-((S)-2-(5-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)-1-메틸-1H-피라졸-3-일)-3-메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 (예시적 화합물 762)의 예시적인 합성
단계 1: 에틸 5-아미노-1-메틸-1H-피라졸-3-카르복실레이트 제조
메탄올(150 mL) 중 메틸히드라진(13.47 g, 116.92 mmol, 15.4 mL, 1.1당량)의 혼합물에 황산(10.42 g, 106.29 mmol, 5.6 mL, 1당량)을 0℃에서 적가하였다. 혼합물을 25℃에서 0.5시간 동안 교반한 다음, 에틸 3-시아노-2-옥소-프로파노에이트 (15 g, 106.29 mmol, 1당량)를 25℃에서 첨가하고, 혼합물을 25℃에서 20.5시간 동안 교반하였다. 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트=20:1~1:2)로 정제하였다. 생성물 에틸 5-아미노-1-메틸-피라졸-3-카르복실레이트 (11.9 g, 70.34 mmol, 66% 수율)를 갈색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 170.2 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 6.16 - 6.05 (m, 1H), 4.47 - 4.32 (m, 2H), 3.83 - 3.68 (m, 3H), 3.28 - 3.14 (m, 2H), 1.44 - 1.35 (m, 3H).
단계 2: 벤질 4-(3-(에톡시카르보닐)-1-메틸-1H-피라졸-5-일)피페라진-1-카르복실레이트 제조
아세트산(20 mL) 및 메탄올(280 mL) 중 벤질 N,N-비스(2-옥소에틸)카바메이트 (14.8 g, 62.92 mmol, 1.1당량) 및 에틸 5-아미노-1-메틸-피라졸-3-카르복실레이트 (9.68 g, 57.20 mmol, 1당량)의 용액에 보란;2-메틸피리딘(12.24 g, 114.39 mmol, 2당량)을 첨가하였다. 혼합물을 25℃에서 1시간 동안 교반하였다. 그런 다음 혼합물을 25 ℃에서 11시간 동안 교반하였다. 포화 수성 중탄산 나트륨 용액(~180 mL)을 첨가하여 pH=8로 조정하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(300 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수로 세척하고(500 mL x 2), 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르/에틸 아세테이트=30/1, 1/1)로 정제하였다. 이 오일을 분취 역상 HPLC로 추가로 정제하였다. 용액을 진공 중에서 농축시켰다. 수성상을 에틸 아세테이트(200 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수로 세척하고(200 mL x 2), 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 생성물 벤질 4-(5-에톡시카르보닐-2-메틸-피라졸-3-일)피페라진-1-카르복실레이트 (11.55 g, 31.01 mmol, 54% 수율)를 무색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 373.3 [M+1] +.
단계 3: 5-(4-((벤질옥시)카르보닐)피페라진-1-일)-1-메틸-1H-피라졸-3-카르복실산 제조
물(20 mL) 및 테트라하이드로푸란(200 mL) 중 벤질 4-(5-에톡시카르보닐-2-메틸-피라졸-3-일)피페라진-1-카르복실레이트 (16.18 g, 43.45 mmol, 1당량)의 혼합물에 수산화나트륨(4.34 g, 108.61 mmol, 2.5당량)을 25℃에서 일회분으로 첨가하였다. 혼합물을 25℃에서 12시간 동안 교반하였다. 혼합물에 물(100 mL)을 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(100 mL)로 추출하였다. 수성상에 염산(2 M)을 첨가하여 pH=3~4를 조정하였다. 그런 다음 수성상을 에틸 아세테이트(150 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수(200 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 생성물 5-(4-벤질옥시카르보닐피페라진-1-일)-1-메틸-피라졸-3-카르복실산 (13.12 g, 38.10 mmol, 87% 수율)을 적색 고무질로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 345.0 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 8.69 (s, 1H), 7.67 - 7.59 (m, 2H), 7.39 (d, J=8.4 Hz, 2H), 4.85 (s, 1H), 3.50 (s, 1H), 1.48 (d, J=6.4 Hz, 3H), 1.44 (s, 9H).
단계 4: 벤질 4-(3-(하이드록시메틸)-1-메틸-1H-피라졸-5-일)피페라진-1-카르복실레이트 제조
테트라하이드로푸란(20 mL) 중 5-(4-벤질옥시카르보닐피페라진-1-일)-1-메틸-피라졸-3-카르복실산 (5 g, 14.52 mmol, 1당량)의 고체에 보란 디메틸 설파이드 복합체(10 M, 7.3 mL, 5당량)를 0℃에서 첨가하였다. 혼합물을 25℃에서 1시간 동안 교반하였다. 혼합물을 0℃에서 메탄올(200 mL)에 적가하고 1분 동안 교반하였다. 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트=5:1~1:2)로 정제하였다. 오일을 100 mL의 아세토니트릴에 용해시키고, 2 mL의 트리플루오로아세트산을 첨가하고, 혼합물을 25℃에서 2시간 동안 교반하였다. 그런 다음, 컬럼을 구배(디클로로메탄:메탄올=50:1~25:1)로 플러싱하여 또 다른 배치의 생성물을 수득하였다. 생성물 벤질 4-[5-(하이드록시메틸)-2-메틸 -피라졸-3-일]피페라진-1-카르복실레이트 (3.8 g, 11.50 mmol, 79% 수율)를 무색 고무질로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 331.5 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 7.44 - 7.30 (m, 5H), 5.83 (s, 1H), 5.17 (s, 2H), 4.60 (s, 2H), 3.71 (s, 3H), 3.68 - 3.61 (m, 4H), 2.87 (s, 4H), 2.05 - 2.03 (m, 1H).
단계 5: 벤질 4-(1-메틸-3-(((메틸설포닐)옥시)메틸)-1H-피라졸-5-일)피페라진-1-카르복실레이트 제조
디클로로메탄(35 mL) 중 벤질 4-[5-(하이드록시메틸)-2-메틸-피라졸-3-일]피페라진-1-카르복실레이트 (2.5 g, 7.57 mmol, 1당량) 및 트리에틸아민 (1.53 g, 15.13 mmol, 2.1 mL, 2당량)의 혼합물에 메탄설포닐클로라이드 (1.30 g, 11.35 mmol, 1.5당량)를 0℃에서 적가하였다. 혼합물을 0℃에서 2시간 동안 교반하였다. 혼합물에 물(30 mL)을 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 디클로로메탄 (30 mL x 2)으로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수로 세척하고(30 mL x 2), 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 생성물 벤질 4-[2-메틸-5-(메틸설포닐옥시메틸)피라졸-3-일]피페라진-1-카르복실레이트 (3 g)를 연황색 오일로서 수득하였다.
단계 6: 벤질 4-(3-(시아노메틸)-1-메틸-1H-피라졸-5-일)피페라진-1-카르복실레이트 제조
디메틸포름아미드(30 mL) 중 벤질 4-[2-메틸-5-(메틸설포닐옥시메틸)피라졸-3-일]피페라진-1- 카르복실레이트 (3 g, 7.34 mmol, 1당량)의 혼합물에 시안화 나트륨(720 mg, 14.69 mmol, 2당량)을 25℃에서 일회분으로 첨가하였다. 혼합물을 50℃에서 16시간 동안 교반하였다. 물(150 mL)을 혼합물에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(100 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수로 세척하고(100 mL x 2), 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 수성상을 수성 차아염소산나트륨(1500 mL)에 부었다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르/에틸 아세테이트=3/1, 1/1)로 정제하였다. 생성물 벤질 4-[5-(시아노메틸)-2-메틸-피라졸-3-일] 피페라진-1-카르복실레이트 (820 mg, 2.42 mmol, 32.90% 수율)를 연황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 340.5 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 7.43 - 7.30 (m, 5H), 5.85 (s, 1H), 5.17 (s, 2H), 3.70 (s, 3H), 3.68 - 3.62 (m, 6H), 2.88 (d, J = 7.7 Hz, 4H).
단계 7: 벤질 4-(3-(1-시아노-2-메틸프로필)-1-메틸-1H-피라졸-5-일)피페라진-1-카르복실레이트 제조
디메틸포름아미드 (15 mL) 중 벤질 4-[5-(시아노메틸)-2-메틸-피라졸-3-일]피페라진-1-카르복실레이트 (820 mg, 2.42 mmol, 1당량)의 용액에 칼륨 삼차-부톡시드 (298 mg, 2.66 mmol, 1.1당량)을 0℃에서 첨가하였다. 혼합물을 25℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 그런 다음 2-아이오도프로판(411 mg, 2.42 mmol, 1당량)을 혼합물에 첨가하였다. 혼합물을 25℃에서 2시간 동안 교반하였다. 물(50 mL)을 혼합물에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(20 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수(20 mL x 3)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르/에틸 아세테이트=4/1, 1/1)로 정제하였다. 생성물 벤질 4-[5-(1-시아노-2-메틸-프로필)-2-메틸-피라졸-3-일]피페라진-1- 카르복실레이트 (360 mg, 0.94 mmol, 39% 수율)를 무색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 382.2 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 7.43 - 7.31 (m, 5H), 5.89 - 5.79 (m, 1H), 5.22 - 5.12 (m, 2H), 3.72 - 3.69 (m, 3H), 3.69 - 3.68 (m, 1H), 3.68 - 3.60 (m, 4H), 2.90 - 2.84 (m, 4H), 2.29 - 2.12 (m, 1H), 1.14 - 1.03 (m, 6H).
단계 8: 3-메틸-2-(1-메틸-5-(피페라진-1-일)-1H-피라졸-3-일)부탄산 제조
디옥산(4 mL) 중 벤질 4-[5-(1-시아노-2-메틸-프로필)-2-메틸-피라졸-3-일]피페라진-1- 카르복실레이트 (360 mg, 0.94 mmol, 1당량)의 혼합물에 염산(12 M, 4 mL, 50당량)을 25℃에서 일회분으로 첨가하였다. 혼합물을 100℃에서 12시간 동안 교반하였다. 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 생성물 3-메틸-2-(1-메틸-5-피페라진-1-일-피라졸-3-일)부탄산 (250 mg)을 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 267.2 [M+1] +.
단계 9: 2-(5-(4-(삼차-부톡시카르보닐)피페라진-1-일)-1-메틸-1H-피라졸-3-일)-3-메틸부탄산 제조
물(2 mL) 및 테트라하이드로푸란(3 mL) 중 3-메틸-2-(1-메틸-5-피페라진-1-일-피라졸-3-일)부탄산 (250 mg, 0.94 mmol, 1당량)의 혼합물에 탄산나트륨(497 mg, 4.69 mmol, 5당량), 디-삼차-부틸 디카르보네이트(410 mg, 1.88 mmol, 2당량)를 25℃에서 일회분으로 첨가하였다. 혼합물을 25℃에서 2시간 동안 교반하였다. 물(20 mL)을 혼합물에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(20 mL x 2)로 추출하였다. 수성상에 염산(2 M)을 첨가하여 pH=3~4를 조정하였다. 그런 다음 수성상을 에틸 아세테이트(20 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수(20 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 생성물 2-[5-(4-삼차-부톡시카르보닐피페라진-1-일)-1-메틸 -피라졸-3-일]-3-메틸-부탄산 (330 mg, 0.79 mmol, 84% 수율, 87% 순도)을 무색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 367.2 [M+1] +.
단계 10: 삼차-부틸 4-(3-(1-((2S,4R)-4-하이드록시-2-(((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)카바모일)피롤리딘-1-일)-3-메틸-1-옥소부탄-2-일)-1-메틸-1H-피라졸-5-일)피페라진-1-카르복실레이트 제조
디메틸포름아미드 (5 mL) 중 2-[5-(4-삼차-부톡시카르보닐피페라진-1-일)-1-메틸-피라졸-3-일]-3-메틸- 부탄산 (330 mg, 0.79 mmol, 1당량)의 혼합물에 디이소프로필에틸아민 (306 mg, 2.37 mmol, 3당량) , 1-하이드록시벤조트리아졸 (128 mg, 0.95 mmol, 1.2당량) 및 1-(3-디메틸아미노프로필)-3-에틸카르보디이미드 (227 mg, 1.19 mmol, 1.5당량)을 25℃에서 일회분으로 첨가하였다. 혼합물을 25℃에서 10분 동안 교반하고 나서, (2S,4R)-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (291 mg, 0.79 mmol, 1당량, 염화수소)를 첨가하고, 혼합물을 25℃에서 11시간 50분 동안 교반하였다. 혼합물에 물(40 mL)을 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(20 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수(20 mL x 3)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피(디클로로메탄/메탄올=200/1, 40/1)로 정제하였다. 생성물 삼차-부틸 4-[5-[1-[(2S,4R)-4- 하이드록시-2-[[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]카바모일]피롤리딘-1-카르보닐]-2-메틸-프로필]-2-메틸-피라졸-3-일]피페라진-1-카르복실레이트 (360 mg, 0.44 mmol, 56% 수율, 84% 순도)를 무색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 680.3 [M+1] +.
단계 11: 삼차-부틸 4-(3-((S)-1-((2S,4R)-4-하이드록시-2-(((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)카바모일)피롤리딘-1-일)-3-메틸-1-옥소부탄-2-일)-1-메틸-1H-피라졸-5-일)피페라진-1-카르복실레이트 제조
삼차-부틸 4-[5-[1-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-[[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸] 카바모일]피롤리딘-1-카르보닐]-2-메틸-프로필]-2-메틸-피라졸-3-일]피페라진-1-카르복실레이트 (360 mg, 0.44 mmol, 1당량)를 키랄 SFC에 의해 정제하였다. 생성물 삼차-부틸 4-[5-[(1S)-1-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-[[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]카바모일]피롤리딘-1-카르보닐]-2-메틸-프로필]-2-메틸-피라졸-3-일]피페라진-1-카르복실레이트 (150 mg, 0.20 mmol, 88% 수율, 89% 순도)를 백색 고체로서 수득하였다.
단계 12: (2S,4R)-4-하이드록시-1-((S)-3-메틸-2-(1-메틸-5-(피페라진-1-일)-1H-피라졸-3-일)부타노일)-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
디클로로메탄 (5 mL) 중 삼차-부틸 4-[5-[(1S)-1-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-[[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5- 일)페닐]에틸]카바모일]피롤리딘-1-카르보닐]-2-메틸-프로필]-2-메틸-피라졸-3-일]피페라진-1-카르복실레이트 (150 mg, 0.20 mmol, 1당량)의 혼합물에 염산(디옥산 중 4 M, 5 mL, 100당량)을 25℃에서 일회분으로 첨가하였다. 혼합물을 25℃에서 2시간 동안 교반하였다. 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 생성물 (2S,4R)-4-하이드록시-1-[(2S)-3-메틸-2-(1-메틸-5-피페라진-1-일-피라졸-3-일)부타노일]-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (150 mg, 염화수소)를 회백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 580.2 [M+1] +.
단계 13: (2S,4R)-1-((S)-2-(5-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)-1-메틸-1H-피라졸-3-일)-3-메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
메탄올(5 mL) 중 (2S,4R)-4-하이드록시-1-[(2S)-3-메틸-2-(1-메틸-5-피페라진-1-일-피라졸 -3-일)부타노일]-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (140 mg, 0.23 mmol, 1당량, 염화수소)의 혼합물에 30℃에서 일회분으로 아세트산나트륨(74 mg, 0.91 mmol, 4당량)을 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 1분 동안 교반한 다음, 디클로로메탄(2 mL) 중 (3R)-N-[2,4-디플루오로-3-[5-[4-(4-포르밀-1-피페리딜)페닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (104 mg, 0.17 mmol, 0.75당량)를 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 1분 동안 추가로 교반하고, 아세트산(0.02 mL)을 첨가하여 pH=4~5를 조정하였다. 그런　다음　나트륨 시아노보로히드라이드(28 mg, 0.45 mmol, 2당량)를 30℃에서 58분 동안 첨가하고 교반하였다. 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 4 mL의 디메틸포름아미드를 첨가하였다. 혼합물을 여과하여 여과물을 수득하였다. 황색 여과물을 반-분취 역상 HPLC로 정제하였다. 생성물 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[5-[4-[[1-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-4-피페리딜]메틸]피페라진-1-일]-1-메틸-피라졸-3-일]-3-메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (103.38 mg, 0.09 mmol, 38% 수율, 99% 순도, 트리플루오로아세테이트)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 588.3 [M/2+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.95 - 12.88 (m, 1H), 9.84 (s, 1H), 9.43 - 9.20 (m, 1H), 9.06 - 8.95 (m, 1H), 8.66 (d, J = 2.0 Hz, 1H), 8.55 (s, 1H), 8.30 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 8.13 - 8.01 (m, 1H), 7.74 - 7.56 (m, 3H), 7.48 - 7.34 (m, 4H), 7.27 (t, J = 8.8 Hz, 1H), 7.13 (d, J = 8.8 Hz, 2H), 5.83 (s, 1H), 5.40 - 5.19 (m, 1H), 4.99 - 4.84 (m, 1H), 4.38 - 4.23 (m, 2H), 3.85 (d, J = 11.6 Hz, 2H), 3.75 - 3.69 (m, 2H), 3.61 (s, 4H), 3.41 (s, 2H), 3.32 - 3.23 (m, 6H), 3.19 - 3.14 (m, 2H), 3.06 - 2.91 (m, 2H), 2.83 (t, J = 11.7 Hz, 2H), 2.46 (s, 4H), 2.18 - 1.75 (m, 9H), 1.50 - 1.30 (m, 5H), 0.94 (d, J = 6.4 Hz, 3H), 0.69 (d, J = 6.4 Hz, 3H).
(2S,4R)-1-((R)-2-(5-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)-1-메틸-1H-피라졸-3-일)-3-메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 (예시적 화합물 763)의 예시적인 합성
단계 1: 삼차-부틸 4-(3-((R)-1-((2S,4R)-4-하이드록시-2-(((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)카바모일)피롤리딘-1-일)-3-메틸-1-옥소부탄-2-일)-1-메틸-1H-피라졸-5-일)피페라진-1-카르복실레이트 제조
삼차-부틸 4-[5-[1-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-[[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸] 카바모일]피롤리딘-1-카르보닐]-2-메틸-프로필]-2-메틸-피라졸-3-일]피페라진-1-카르복실레이트 (360 mg, 0.44 mmol, 1당량)를 키랄 SFC에 의해 정제하였다. 생성물 삼차-부틸 4-[5-[(1R)-1-[(2S,4R)-4- 하이드록시-2-[[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]카바모일]피롤리딘-1-카르보닐]-2-메틸-프로필]-2-메틸-피라졸-3-일]피페라진-1-카르복실레이트 (150 mg, 0.21 mmol, 93% 수율, 94% 순도)를 백색 고체로서 수득하였다.
단계 2: (2S,4R)-4-하이드록시-1-((R)-3-메틸-2-(1-메틸-5-(피페라진-1-일)-1H-피라졸-3-일)부타노일)-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
디클로로메탄 (5 mL) 중 삼차-부틸 4-[5-[(1R)-1-[(2S,4R)-4-하이드록시-2-[[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸 -5-일)페닐]에틸]카바모일]피롤리딘-1-카르보닐]-2-메틸-프로필]-2-메틸-피라졸-3-일]피페라진-1-카르복실레이트 (150 mg, 0.21 mmol, 1당량)의 혼합물에 염산(디옥산 중 4 M, 5 mL, 100당량)을 25℃에서 일회분으로 첨가하였다. 혼합물을 25℃에서 2시간 동안 교반하였다. 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 생성물 (2S,4R)-4-하이드록시-1-[(2R)-3-메틸-2-(1-메틸-5-피페라진-1-일-피라졸-3-일)부타노일]-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (150 mg, 염화수소)를 회백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 580.2 [M+1] +.
단계 3: (2S,4R)-1-((R)-2-(5-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)-1-메틸-1H-피라졸-3-일)-3-메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
메탄올(5 mL) 중 (2S,4R)-4-하이드록시-1-[(2R)-3-메틸-2-(1-메틸-5-피페라진-1-일-피라졸 -3-일)부타노일]-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (140 mg, 0.23 mmol, 1당량, 염화수소)의 혼합물에 아세트산나트륨(74 mg, 0.91 mmol, 4당량)을 일회분으로 30℃에서 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 1분 동안 교반한 다음, 디클로로메탄(2 mL) 중 (3R)-N-[2,4-디플루오로-3-[5-[4-(4-포르밀-1-피페리딜)페닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (104 mg, 0.17 mmol, 0.75당량)를 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 1분 동안 추가로 교반하고, 아세트산(0.02 mL)을 첨가하여 pH=4~5를 조정하였다. 그런 다음 나트륨 시아노보로히드라이드(28 mg, 0.45 mmol, 2당량)를 30℃에서 58분 동안 첨가하고 교반하였다. 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 4 mL의 디메틸포름아미드를 첨가하였다. 혼합물을 여과하여 여과물을 수득하였다. 황색 여과물을 반-분취 역상 HPLC로 정제하였다. 생성물 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[5-[4-[[1-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일] 설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-4-피페리딜]메틸]피페라진-1-일]-1-메틸-피라졸-3-일]-3-메틸-부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (135.5 mg, 0.11 mmol, 50% 수율, 91% 순도, 트리플루오로아세테이트). LC/MS (ESI) m/z: 1175.4 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 13.03 - 12.84 (m, 1H), 9.84 (s, 1H), 9.50 - 9.19 (m, 1H), 8.99 (s, 1H), 8.78 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 8.66 (d, J = 2.0 Hz, 1H), 8.61 - 8.47 (m, 1H), 8.25 - 8.13 (m, 1H), 8.07 (d, J = 2.4 Hz, 1H), 7.70 - 7.57 (m, 3H), 7.51 - 7.39 (m, 3H), 7.38 - 7.31 (m, 1H), 7.27 (t, J = 9.2 Hz, 1H), 7.19 - 7.06 (m, 2H), 5.92 - 5.75 (m, 1H), 5.41 - 5.17 (m, 1H), 5.07 - 4.97 (m, 1H), 4.92 - 4.77 (m, 1H), 4.69 - 4.60 (m, 1H), 4.50 - 4.38 (m, 1H), 4.29 - 4.17 (m, 1H), 3.85 - 3.80 (m, 3H), 3.49 (s, 3H), 3.41 - 3.36 (m, 3H), 3.32 - 3.15 (m, 8H), 2.89 - 2.77 (m, 2H), 2.47 - 2.44 (m, 4H), 2.20 - 1.78 (m, 9H), 1.47 - 1.32 (m, 5H), 0.95 (d, J = 6.8 Hz, 2H), 0.84 - 0.71 (m, 3H), 0.70 - 0.64 (m, 1H).
3-(5-(2-(2-(2-(2-(4-(4-(4-클로로-3-하이드록시페닐)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)에톡시)-1-옥소이소인돌린-2-일)피페리딘-2,6-디온 (예시적 화합물 764)의 예시적인 합성
단계 1: 4-(4-브로모-1-(4-((테트라하이드로-2H-피란-2-일)옥시)페닐)-1H-피라졸-3-일)피리딘 제조
디클로로메탄 (80 mL) 중 4-(4-브로모-1H-피라졸-3-일)피리딘 (4 g, 17.85 mmol, 1당량), (4-테트라하이드로피란 -2-일옥시페닐)보론산 (3.96 g, 17.85 mmol, 1당량), (4-테트라하이드로피란-2-일옥시페닐) 보론산 (3.96 g, 17.85 mmol, 1당량) 및 아세트산구리(4.86 g, 26.78 mmol, 1.5당량)의 혼합물을 탈기하고 산소로 3회 퍼지하고, 그런 다음, 혼합물을 산소 대기 하에 15℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 디클로로메탄(50 mL)으로 희석하고, 수산화암모늄(100 mL x 3)으로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 플래쉬 실리카 겔 크로마토그래피로 정제하였다. 화합물 4-[4-브로모-1-(4-테트라하이드로피란-2-일옥시페닐)피라졸-3-일] 피리딘 (3.6 g, 8.63 mmol, 48% 수율, 96% 순도)을 연황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 401.9 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 8.75 - 8.65 (m, 2H), 8.01 - 7.92 (m, 3H), 7.67 - 7.56 (m, 2H), 7.22 - 7.10 (m, 2H), 5.46 (t, J = 3.2 Hz, 1H), 3.91 (ddd, J = 3.2, 10.0, 11.2 Hz, 1H), 3.64 (dtd, J = 1.2, 4.0, 11.2 Hz, 1H), 2.05 - 1.97 (m, 1H), 1.90 (td, J = 3.8, 7.6 Hz, 2H), 1.75 - 1.63 (m, 3H).
단계 2: 4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페놀 제조
디클로로메탄(20 mL) 중 4-[4-브로모-1-(4-테트라하이드로피란-2-일옥시페닐)피라졸-3-일]피리딘 (3.6 g, 8.45 mmol, 1당량)의 용액에 염화수소/디옥산 (4 M, 10.57 mL, 5당량)을 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축시켜 용매를 제거하였다. 화합물 4-[4-브로모-3-(4-피리딜)피라졸-1-일]페놀 (3.4 g, 염화수소)을 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 316.1 [M+1] +.
단계 3: 2-(2-(2-(2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)에탄-1-올 제조
N,N-디메틸포름아미드(20 mL) 중 4-[4-브로모-3-(4-피리딜)피라졸-1-일]페놀 (880 mg, 2.27 mmol, 1당량, 염화수소)의 용액에 탄산 세슘(1.48 g, 4.54 mmol, 2당량) 및 2-[2-[2-(2-하이드록시에톡시)에톡시]에톡시]에틸 4-메틸벤젠설포네이트 (790 mg, 2.27 mmol, 1당량)를 첨가하였다. 혼합물을 80℃에서 3시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물(30 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(50 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(50 mL x 3)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피(석유 에테르/에틸 아세테이트 = 1:1 내지 0:1 디클로로메탄/메탄올 = 10:1)로 정제하였다. 화합물 2-[2-[2-[2-[4-[4-브로모-3-(4-피리딜)피라졸 -1-일]페녹시]에톡시]에톡시]에톡시]에탄올 (0.85 g, 1.73 mmol, 76% 수율)을 갈색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 494.0 [M+1] +.
단계 4: 삼차-부틸 5-아미노-4-(5-(2-(2-(2-(2-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)에톡시)-1-옥소이소인돌린-2-일)-5-옥소펜타노에이트 제조
테트라하이드로푸란(15 mL) 중 2-[4-[4-브로모-3-(4-피리딜)피라졸-1-일]페녹시]에탄올 (880 mg, 1.62 mmol, 1당량)의 용액에 삼차-부틸 5-아미노-4-(5-하이드록시-1-옥소- 이소인돌린-2-일)-5-옥소-펜타노에이트 (527 mg, 1.40 mmol, 1당량) 트리페닐포스핀(554 mg, 2.11 mmol, 1.3당량) 및 디이소프로필 아조포르메이트(427 mg, 2.11 mmol, 1.3당량)을 0℃에서 첨가하였다. 혼합물을 60℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물(20 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(30 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(50 mL x 3)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 플래쉬 실리카 겔 크로마토그래피로 정제하였다. 생성물을 반-분취 역상 HPLC로 추가로 정제하였다. 화합물 삼차-부틸 5-아미노-4-[5-[2-[2-[2-[2-[4-[4-브로모-3-(4-피리딜)피라졸-1-일]페녹시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]-1-옥소-이소인돌린-2-일]-5-옥소-펜타노에이트 (850 mg, 1.05 mmol, 64% 수율)를 황색 고무질로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 810.0 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 8.75 - 8.61 (m, 2H), 8.06 - 7.90 (m, 3H), 7.73 (d, J = 8.4 Hz, 1H), 7.61 (d, J = 9.2 Hz, 2H), 7.08 - 6.97 (m, 3H), 6.95 (s, 1H), 6.36 (s, 1H), 5.38 (s, 1H), 4.86 (dd, J = 6.4, 8.8 Hz, 1H), 4.52 - 4.32 (m, 2H), 4.18 (q, J = 4.8 Hz, 4H), 3.95 - 3.83 (m, 4H), 3.79 - 3.64 (m, 8H), 2.43 - 2.07 (m, 4H), 1.42 (s, 9H).
단계 5: 삼차-부틸 5-아미노-4-(5-(2-(2-(2-(2-(4-(4-(4-클로로-3-하이드록시페닐)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)에톡시)-1-옥소이소인돌린-2-일)-5-옥소펜타노에이트 제조
디옥산 (1.5 mL) 및 물(0.3 mL) 중 삼차-부틸 5-아미노-4-[5-[2-[2-[2-[2-[4-[4-브로모-3-(4-피리딜)피라졸-1-일] 페녹시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]-1-옥소-이소인돌린-2-일]-5-옥소-펜타노에이트 (400 mg, 0.49 mmol, 1당량), (4-클로로-3-하이드록시-페닐)보론산 (85 mg, 0.49 mmol, 1당량), 디삼차-부틸(시클로펜틸)포스파인;디클로로팔라듐;철 (32 mg, 0.049 mmol, 0.1당량) 및 불화 세슘(300 mg, 1.98 mmol, 4당량)의 혼합물을 탈기하고 질소로 3회 퍼지하고, 그런 다음, 혼합물을 질소 대기 하에 90℃에서 3시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물(10 mL)로 희석시키고 디클로로메탄(20 mL x 3)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 여과하고, 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 플래쉬 실리카 겔 크로마토그래피로 정제하였다. 화합물 삼차-부틸 5-아미노-4-[5-[2-[2-[2-[2-[4-[4-(4-클로로-3-하이드록시-페닐)-3-(4-피리딜)피라졸-1-일]페녹시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]-1-옥소-이소인돌린-2-일]-5-옥소-펜타노에이트 (230 mg, 0.25 mmol, 51% 수율, 95% 순도)를 갈색 고무질로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 856.1 [M+1] +.
단계 6: 3-(5-(2-(2-(2-(2-(4-(4-(4-클로로-3-하이드록시페닐)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)에톡시)-1-옥소이소인돌린-2-일)피페리딘-2,6-디온 제조
아세토니트릴(10 mL) 중 삼차-부틸 5-아미노-4-[5-[2-[2-[2-[2-[4-[4-(4-클로로-3-하이드록시-페닐)-3- (4-피리딜)피라졸-1-일]페녹시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]-1-옥소-이소인돌린-2-일]-5-옥소-펜타노에이트 (230 mg, 0.25 mmol, 1당량)의 용액에 벤젠설폰산(80 mg, 0.51 mmol, 2당량)을 첨가하였다. 혼합물을 80℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 반-분취 역상 HPLC로 정제하였다. 화합물 3-[5-[2-[2-[2-[2-[4-[4-(4-클로로-3-하이드록시-페닐)-3-(4-피리딜) 피라졸-1-일]페녹시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]-1-옥소-이소인돌린-2-일]피페리딘-2,6-디온 (118.4 mg, 0.12 mmol, 49% 수율, 96% 순도, 트리플루오로아세테이트)을 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 782.2 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 10.95 (s, 1H), 10.43 - 10.21 (m, 1H), 8.96 - 8.60 (m, 3H), 7.92 - 7.84 (m, 2H), 7.81 (d, J = 5.6 Hz, 2H), 7.60 (d, J = 8.4 Hz, 1H), 7.40 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 7.18 - 7.09 (m, 3H), 7.04 (dd, J = 2.0, 8.4 Hz, 1H), 6.96 (d, J = 2.0 Hz, 1H), 6.86 (dd, J = 2.0, 8.0 Hz, 1H), 5.05 (dd, J = 5.2, 13.3 Hz, 1H), 4.41 - 4.32 (m, 1H), 4.29 - 4.21 (m, 1H), 4.20 - 4.11 (m, 4H), 3.82 - 3.74 (m, 6H), 3.60 (d, J = 2.8 Hz, 6H), 2.96 - 2.80 (m, 1H), 2.59 (d, J = 2.2 Hz, 1H), 2.42 - 2.35 (m, 1H), 2.03 - 1.90 (m, 1H).
3-(5-((14-(4-(4-(4-클로로-3-하이드록시페닐)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)-3,6,9,12-테트라옥사테트라데실)옥시)-1-옥소이소인돌린-2-일)피페리딘-2,6-디온 (예시적 화합물 765)의 예시적인 합성
단계 1: 14-하이드록시-3,6,9,12-테트라옥사테트라데실 4-메틸벤젠설포네이트 제조
DCM(양Х10 mL) 중 펜타에틸렌 글리콜(1당량)의 차갑고 교반된 용액에 Ag2O (1.5당량), TsCl (1.1당량) 및 KI(0.2당량)를 첨가하였다. 30 내지 60분 동안 교반한 후, 침전된 은 염을 셀라이트 패드를 통해 여과하여 제거하고, EtOAc로 철저히 세척하였다. 합쳐진 여과물을 진공 하에 농축시키고, 잔여물을 실리카 겔 크로마토그래피로 정제하여 무색 오일, 77%를 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 393.2 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 2.45 (s, 3H), 3.59-3.73 (m, 18H), 4.16 (t, J = 4.8 Hz, 2H), 7.34 (d, J = 8.0 Hz, 2H), 7.80 (d, J = 8.0 Hz, 2H).
단계 2: 14-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)-3,6,9,12-테트라옥사테트라데칸-1-올 제조
N,N-디메틸포름아미드 (10 mL) 중 4-[4-브로모-3-(4-피리딜)피라졸-1-일]페놀 (500 mg, 1.42 mmol, 1 당량, 염화수소)의 용액에 2-[2-[2-[2-(2-하이드록시에톡시) 에톡시]에톡시]에톡시]에틸 4-메틸벤젠설포네이트 (556 mg, 1.42 mmol, 1 당량) 및 탄산세슘 (924 mg, 2.84 mmol, 2 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 80℃에서 2시간 동안 교반하였다. 혼합물을 물(30 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(30 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(50 mL x 3)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 미정제 생성물을 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트=3:1 내지 디클로로메탄:메탄올=20:1)로 정제하여 2-[2-[2-[2-[2-[4-[4-브로모-3-(4-피리딜)피라졸-1 -일]페녹시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에탄올 (500 mg, 0.93 mmol, 65% 수율)을 연황색 오일로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 538.2 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 8.86 (s, 1H), 8.75 - 8.65 (m, 2H), 7.96 - 7.88 (m, 2H), 7.82 (d, J = 9.2 Hz, 2H), 7.11 (d, J = 9.2 Hz, 2H), 4.56 (t, J = 5.6 Hz, 1H), 4.19 - 4.11 (m, 2H), 3.81 - 3.73 (m, 2H), 3.63 - 3.58 (m, 2H), 3.57 - 3.54 (m, 2H), 3.53 - 3.49 (m, 8H), 3.49 - 3.45 (m, 2H), 3.43 - 3.38 (m, 2H).
단계 3: 삼차-부틸 5-아미노-4-(5-((14-(4-(4-브로모-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)-3,6,9,12-테트라옥사테트라데실)옥시)-1-옥소이소인돌린-2-일)-5-옥소펜타노에이트 제조
테트라하이드로푸란 (12 mL) 중 2-[2-[2-[2-[2-[4-[4-브로모-3-(4-피리딜)피라졸-1-일]페녹시]에톡시]에톡시] 에톡시]에톡시]에탄올 (600 mg, 1.12 mmol, 1 당량) 및 삼차-부틸 5-아미노-4-(5-하이드록시- 1-옥소-이소인돌린-2-일)-5-옥소-펜타노에이트 (374 mg, 1.12 mmol, 1 당량)의 용액에 질소 대기 하에 0℃에서 트리페닐 포스핀 (352 mg, 1.34 mmol, 1.2 당량)　및 디이소프로필 아조디카르복실레이트 (271 mg, 1.34 mmol, 1.2 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 60℃에서 12시간 동안 교반하였다. 혼합물을 물(50 mL)로 희석하고, 에틸 아세테이트(30 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(50 mL x 3)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 미정제 생성물을 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트=1:1 내지 디클로로메탄:메탄올=10:1)로 정제하였다. 생성물을 분취 역상 TLC(디클로로메탄:메탄올=15:1)에 의해 추가로 정제하여 삼차-부틸 5-아미노-4-[5-[2- [2-[2-[2-[2-[4-[4-브로모-3-(4-피리딜)피라졸-1-일]페녹시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]-1-옥소-이소인돌린-2-일]-5-옥소-펜타노에이트 (300 mg, 0.35 mmol, 31% 수율)를 연황색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 853.7 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 8.86 (s, 1H), 8.74 - 8.65 (m, 2H), 7.96 - 7.89 (m, 2H), 7.85 - 7.79 (m, 2H), 7.57 (d, J = 8.4 Hz, 1H), 7.54 (s, 1H), 7.15 (s, 2H), 7.13 - 7.08 (m, 2H), 7.01 (dd, J = 2.0, 8.4 Hz, 1H), 4.75 - 4.64 (m, 1H), 4.54 (d, J = 17.6 Hz, 1H), 4.43 - 4.30 (m, 1H), 4.15 (td, J = 2.8, 5.6 Hz, 4H), 3.79 - 3.71 (m, 4H), 3.61 - 3.56 (m, 4H), 3.56 - 3.53 (m, 4H), 3.52 (s, 4H), 3.17 (d, J = 5.2 Hz, 2H), 2.12 - 2.06 (m, 1H), 2.02 - 1.89 (m, 1H), 1.32 (s, 9H).
단계 4: 삼차-부틸 5-아미노-4-(5-((14-(4-(4-(4-클로로-3-하이드록시페닐)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)-3,6,9,12-테트라옥사테트라데실)옥시)-1-옥소이소인돌린-2-일)-5-옥소펜타노에이트 제조
디옥산 (6 mL) 및 물(1 mL) 중 삼차-부틸 5-아미노-4-[5-[2-[2-[2-[2-[2-[4-[4-브로모-3-(4-피리딜)피라졸-1-일] 페녹시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]-1-옥소-이소인돌린-2-일]-5-옥소-펜타노에이트 (300 mg, 0.35 mmol, 1 당량) 및 (4-클로로-3-하이드록시-페닐)보론산 (60 mg, 0.35 mmol, 1 당량)의 용액에 불화 세슘(106 mg, 0.70 mmol, 2 당량) 및 디삼차-부틸(시클로펜틸)포스파인;디클로로팔라듐;철 (23 mg, 0.035 mmol, 0.1 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 90℃에서 2시간 동안 교반하였다. 혼합물을 물(20 mL)로 희석하고, 에틸 아세테이트(15 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(30 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고, 진공 중에서 농축시켰다. 미정제 생성물을 분취 역상 TLC(디클로로메탄: 메탄올=10:1)로 정제하여 삼차-부틸 5-아미노-4-[5-[2-[2-[2-[2-[2-[4-[4-(4-클로로-3-하이드록시-페닐)-3-(4-피리딜)피라졸-1-일]페녹시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]-1-옥소-이소인돌린-2-일]-5-옥소-펜타노에이트 (170 mg, 0.18 mmol, 53% 수율)를 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 900.2 [M+1] +.
단계 5: 3-(5-((14-(4-(4-(4-클로로-3-하이드록시페닐)-3-(피리딘-4-일)-1H-피라졸-1-일)페녹시)-3,6,9,12-테트라옥사테트라데실)옥시)-1-옥소이소인돌린-2-일)피페리딘-2,6-디온 제조
아세토니트릴(5 mL) 중 삼차-부틸 5-아미노-4-[5-[2-[2-[2-[2-[2-[4-[4-(4-클로로-3-하이드록시-페닐)-3- (4-피리딜)피라졸-1-일]페녹시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]-1-옥소-이소인돌린-2-일]-5-옥소-펜타노에이트 (170 mg, 0.18 mmol, 1 당량)의 용액에 벤젠설폰산(60 mg, 0.37 mmol, 2 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 80℃에서 12시간 동안 교반하였다. 혼합물을 진공 하에 농축시켰다. 미정제 생성물을 분취 역상-HPLC에 의해 정제하여 3-[5-[2-[2-[2-[2-[2-[4-[4-(4-클로로-3-하이드록시-페닐)-3-(4-피리딜)피라졸-1-일]페녹시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]에톡시]-1-옥소-이소인돌린-2-일]피페리딘-2,6-디온 (111.8 mg, 0.12 mmol, 66% 수율, 97% 순도, 포름산염)를 황색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 826.3 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 11.07 - 10.85 (m, 1H), 8.66 (s, 1H), 8.61 - 8.54 (m, 2H), 8.40 (s, 1H), 7.87 - 7.82 (m, 2H), 7.61 (d, J = 8.4 Hz, 1H), 7.51 - 7.45 (m, 2H), 7.35 (d, J = 8.4 Hz, 1H), 7.15 (d, J = 2.0 Hz, 1H), 7.12 - 7.08 (m, 2H), 7.04 (dd, J = 2.0, 8.4 Hz, 1H), 6.95 (d, J = 2.0 Hz, 1H), 6.80 (dd, J = 2.0, 8.4 Hz, 1H), 5.06 (dd, J = 5.1, 13.3 Hz, 1H), 4.41 - 4.32 (m, 1H), 4.29 - 4.21 (m, 1H), 4.20 - 4.13 (m, 4H), 3.78 - 3.74 (m, 4H), 3.60 - 3.57 (m, 4H), 3.56 - 3.54 (m, 4H), 3.52 (s, 4H), 2.93 - 2.83 (m, 1H), 2.62 - 2.57 (m, 2H), 2.41 - 2.33 (m, 1H), 2.02 - 1.92 (m, 1H).
(3R)-N-(3-(5-(4-(3-((4-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소이소인돌린-5-일)피페라진-1-일)메틸)아제티딘-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 (예시적 화합물 767)의 예시적인 합성
단계 1: 아제티딘-3-일메탄올 제조
디클로로메탄(60 mL) 중 삼차-부틸 3-(하이드록시메틸)아제티딘-1-카르복실레이트 (5 g, 26.70 mmol, 1 당량)의 용액에 트리플루오로아세트산(15 mL, 7.59 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 농축시켜 아제티딘-3-일메탄올(4.3 g, 트리플루오로아세테이트)을 연황색 오일로서 수득하였다.
단계 2: (1-(4-아이오도페닐)아제티딘-3-일)메탄올 제조
디메틸설폭시드(100 mL) 중 아제티딘-3-일메탄올 (4.3 g, 21.38 mmol, 1 당량, 트리플루오로아세테이트)의 용액에 탄산칼륨(14.77 g, 106.89 mmol, 5당량)을 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 1,4-디아이오도벤젠 (7.76 g, 23.52 mmol, 1.1 당량), L-프롤린(984 mg, 8.55 mmol, 0.4 당량) 및 요오드화구리(814 mg, 4.28 mmol, 0.2 당량)를 첨가한 다음, 혼합물을 90℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물(300 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(150 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 포화 염수(200 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 농축시켰다. 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트=20:1 내지 3:1)로 정제하여 [1-(4-아이오도페닐)아제티딘-3-일]메탄올 (3.5 g, 12.11 mmol, 56% 수율)을 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 290.4 [M+1] +.
단계 3: 1-(4-아이오도페닐)아제티딘-3-카르브알데히드 제조
디클로로메탄 (40 mL) 중 옥살릴 클로라이드 (3.03 g, 23.87 mmol, 2.1 mL, 2.3 당량)의 용액에 디클로로메탄 (20 mL) 중 디메틸설폭시드 (3.73 g, 47.73 mmol, 3.73 mL, 4.6 당량)의 용액을 -70℃에서 적가하였다. 혼합물을 -70℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 디클로로메탄 (30 mL) 중 [1-(4-아이오도페닐)아제티딘-3-일]메탄올 (3 g, 10.38 mmol, 1 당량)의 용액을 혼합물에 적가하고, 혼합물을 -70℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 트리에틸아민(5.46 g, 53.96 mmol, 7.5 mL, 5.2 당량)을 -70℃에서 첨가하고 15°까지 가온시켰다. 혼합물을 15℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물(200 mL)로 희석시키고 디클로로메탄 (150 mL x 2)으로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 포화 염수(150 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 농축시켰다. 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르: 에틸 아세테이트=20:1 내지 5:1)로 정제하여 1-(4-아이오도페닐)아제티딘-3-카르브알데히드 (870 mg, 3.03 mmol, 29% 수율)를 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 320.4 [M+32+1] +.
단계 4: 3-(5-(4-((1-(4-아이오도페닐)아제티딘-3-일)메틸)피페라진-1-일)-1-옥소이소인돌린-2-일)피페리딘-2,6-디온 제조
메탄올 (20 mL) 및 디메틸포름아미드 (5 mL) 중 3-(1-옥소-5-피페라진-1-일-이소인돌린-2-일)피페리딘-2,6-디온 (1.11 g, 3.03 mmol, 1 당량, 염화수소) 용액에 아세트산 나트륨(745 mg, 9.09 mmol, 3 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 30℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 1-(4-아이오도페닐)아제티딘-3-카르브알데히드 (870 mg, 3.03 mmol, 1 당량)를 첨가한 다음, 혼합물을 30℃에서 12시간 동안 교반하였다. 나트륨 시아노보로히드라이드 (380 mg, 6.06 mmol, 2 당량)를 첨가하고, 혼합물을 30℃에서 추가 0.5시간 동안 교반하였다. 혼합물 반응물을 물(50 mL)에 붓고 10분 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 여과하고, 필터 케이크를 수집하였다. 미정제 생성물을 메탄올(30 mL x 3)로 연화시켜 3-[5-[4-[[1-(4-아이오도페닐)아제티딘-3-일]메틸]피페라진-1-일]-1-옥소-이소인돌린 -2-일]피페리딘-2,6-디온 (680 mg, 1.13 mmol, 37% 수율)을 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 600.1 [M+1] +.
단계 5: 삼차-부틸 3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-5-(4-(3-((4-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소이소인돌린-5-일)피페라진-1-일)메틸)아제티딘-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-1-카르복실레이트 제조
디메틸포름아미드 (20 mL) 중 3-[5-[4-[[1-(4-아이오도페닐)아제티딘-3-일]메틸]피페라진-1-일]-1-옥소- 이소인돌린-2-일]피페리딘-2,6-디온 (500 mg, 0.83 mmol, 1 당량), 삼차-부틸 3-[2,6-디플루오로-3- [[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)피롤로[2,3-b]피리딘-1-카르복실레이트 (651 mg, 1.00 mmol, 1.2 당량), 디삼차-부틸(시클로펜틸)포스파인;디클로로팔라듐;철(54 mg, 0.083 mmol, 0.1 당량), 탄산칼륨 (172 mg, 1.25 mmol, 1.5 당량) 및 물(2 mL)의 혼합물을 탈기하고 질소로 3회 퍼지하고, 그런 다음, 혼합물을 질소 대기 하에 90℃에서 1.5시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물(50 mL)로 희석시키고 테트라하이드로푸란/에틸 아세테이트 (V/V=2:1, 50 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 포화 염수(50 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 농축시켰다. 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(디클로로메탄:메탄올=100:1 내지 10:1)로 정제하여 삼차-부틸 3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-5-[4-[3-[[4-[2-(2,6-디옥소-3-피페리딜)-1-옥소-이소인돌린-5-일]피페라진-1-일]메틸]아제티딘-1-일]페닐]피롤로[2,3-b]피리딘-1-카르복실레이트 (210 mg, 0.17 mmol, 20% 수율, 82% 순도)을 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 896.2 [M-99] +.
단계 6: (3R)-N-(3-(5-(4-(3-((4-(2-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-1-옥소이소인돌린-5-일)피페라진-1-일)메틸)아제티딘-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 제조
디클로로메탄 (10 mL) 중 삼차-부틸 3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-5-[4-[3-[[4-[2-(2,6-디옥소-3-피페리딜)-1-옥소-이소인돌린-5-일]피페라진-1-일]메틸]아제티딘-1-일]페닐]피롤로[2,3-b]피리딘-1-카르복실레이트 (210 mg, 0.17 mmol, 1 당량)의 용액에 트리플루오로아세트산 (2.46 mL, 192.18 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 농축시켰다. 잔류물을 분취-HPLC에 의해 정제하여 (3R)-N-[3-[5-[4-[3-[[4-[2-(2,6-디옥소- 3-피페리딜)-1-옥소-이소인돌린-5-일]피페라진-1-일]메틸]아제티딘-1-일]페닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로-페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (99 mg, 0.10 mmol, 60% 수율, 99% 순도, 포름산염)을 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 896.3 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.90 (s, 1H), 10.96 (s, 1H), 8.62 (d, J=2.0 Hz, 1H), 8.50 (s, 1H), 8.15 (s, 1H), 8.06 (s, 1H), 7.62 (dt, J=6.0, 8.8 Hz, 1H), 7.54 (dd, J=8.8, 12.0 Hz, 3H), 7.26 (t, J=8.8 Hz, 1H), 7.12 - 7.03 (m, 2H), 6.57 (d, J=8.8 Hz, 2H), 5.39 - 5.19 (m, 1H), 5.05 (dd, J=5.2, 13.2 Hz, 1H), 4.38 - 4.29 (m, 1H), 4.25 - 4.17 (m, 1H), 4.01 (t, J=7.4 Hz, 2H), 3.58 - 3.52 (m, 2H), 3.49 - 3.45 (M, 2H), 3.41 - 3.38 (m, 4H), 3.05 - 2.84 (m, 3H), 2.62 - 2.58 (m, 1H), 2.58 - 2.52 (m, 8H), 2.43 - 2.34 (m, 1H), 2.13 - 2.04 (m, 1H), 1.99 - 1.93 (m, 1H).
(3R)-N-(3-(5-(4-(4-((4-(3-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 (예시적 화합물 768)의 예시적인 합성
단계 1: 삼차-부틸 4-(3-(2-메톡시-2-옥소에틸)페닐)피페라진-1-카르복실레이트 제조
질소 불활성 분위기로 퍼지되고 유지된 250 mL 둥근바닥 플라스크에, 메틸 2-(3-브로모페닐)아세테이트 (10.0 g, 43.65 mmol, 1.0당량), 삼차-부틸 피페라진-1-카르복실레이트 (8.1 g, 43.65 mmol, 1당량), Cs2CO3 (28.5 g, 87.31 mmol, 2당량), RuPhos-PdCl-2nd G (3.4 g, 4.37 mmol, 0.1당량), 톨루엔 (150 mL)을 넣었다. 생성된 용액을 80℃에서 밤새 교반하였다. 생성된 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:19)로 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 10.1 g (69.2%)의 삼차-부틸 4-[3-(2-메톡시-2-옥소에틸)페닐]피페라진-1-카르복실레이트를 황색 액체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 335.19 [M+1] +.
단계 2: 5-에틸 1-메틸 2-(3-(4-(삼차-부톡시카르보닐)피페라진-1-일)페닐)펜탄디오에이트 제조
질소의 불활성 대기로 퍼지되고 유지된 100-mL 3-목 둥근 바닥 플라스크에, 삼차-부틸 4-[3-(2-메톡시-2-옥소에틸)페닐]피페라진-1-카르복실레이트 (3.0 g, 8.97 mmol, 1.0당량), 테트라하이드로푸란 (30 mL)을 0℃에서 물/얼음조 내에 넣었다. 생성된 혼합물을 0℃에서 30분 동안 교반한 다음, 삼차-부톡시나트륨(1.7 g, 17.94 mmol, 2.0당량) 및 에틸 아크릴레이트(1.1 g, 10.76 mmol, 1.2당량)를 플라스크에 첨가하였다. 생성된 용액을 실온에서 밤새 교반하였다. 생성된 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:1)로 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 1.3 g(33.4%)의 5-에틸 1-메틸 2-[3-[4-(삼차-부톡시카르보닐)피페라진-1-일]페닐]펜탄디오에이트를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 435.25 [M+1] +.
단계 3: 삼차-부틸 4-(3-(5-아미노-1-메톡시-1,5-디옥소펜탄-2-일)페닐)피페라진-1-카르복실레이트 제조
질소의 불활성 대기로 퍼지되고 유지된 20-mL 밀봉 튜브에, 5-에틸 1-메틸 2-[3-[4-(삼차-부톡시카르보닐)피페라진-1-일]페닐]펜탄디오에이트 (590.0 mg)를 넣었다. MeOH(13.00 mL) 중의 상기 NH3 (g)에 용액 내로 첨가하였다. 생성된 용액을 35℃에서 20시간 동안 교반하였다. 생성된 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(100%)로 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 220 mg(37.3%)의 5-아미노 1-메틸 2-[3-[4-(삼차-부톡시카르보닐)피페라진-1-일]페닐]펜탄디오에이트를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 406.15 [M+1] +.
단계 4: 삼차-부틸 4-(3-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)페닐)피페라진-1-카르복실레이트 제조
질소의 불활성 대기로 퍼지되고 유지된 8-mL 밀봉 튜브에, 삼차-부틸 4-[3-(4-카바모일-1-메톡시-1-옥소부탄-2-일)페닐]피페라진-1-카르복실레이트 (200.0 mg, 0.49 mmol, 1.0당량), Cs2CO3 (322.4 mg, 0.99 mmol, 2당량), 아세토니트릴 (5 mL)을 넣었다. 생성된 용액을 85℃에서 8시간 동안 교반하였다. 생성된 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(19:1)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 58 mg (31.5%)의 삼차-부틸 4-[3-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)페닐]피페라진-1-카르복실레이트를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 374.25 [M+1] +.
단계 5: 3-(3-(피페라진-1-일)페닐)피페리딘-2,6-디온 제조
25-mL 둥근 바닥 플라스크에, 삼차-부틸 4-[3-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)페닐]피페라진-1-카르복실레이트 (58.00 mg, 0.155 mmol, 1.00당량), DCM (3.00 mL, 0.035 mmol, 0.23당량), 트리플루오로아세트알데히드 (0.50 mL, 0.005 mmol, 0.03당량)를 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 생성된 혼합물을 농축시켰다. 이를 통해 50 mg(117.78%)의 3-[3-(피페라진-1-일)페닐]피페리딘-2,6-디온을 연황색 오일로서 수득하였다.
단계 6: (3R)-N-(3-(5-(4-(4-((4-(3-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 제조
100-mL 둥근 바닥 플라스크에, 3-[3-(피페라진-1-일)페닐]피페리딘-2,6-디온 (40.22 mg, 0.147 mmol, 1.00당량), DCE (15.00 mL), DIEA (0.50 mL, 0.004 mmol, 0.03당량), (3R)-N-(2,4-디플루오로-3-[5-[4-(4-포르밀피페리딘-1-일)페닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 (90.00 mg, 0.147 mmol, 1.00당량), HOAc (0.50 mL, 0.008 mmol, 0.06당량)을 넣고, 35℃에서 3시간 동안 교반한 후, NaBH3CN (27.74 mg, 0.441 mmol, 3.0당량)을 용액에 첨가하였다. 생성된 용액을 오일조에서 35℃에서 16시간 동안 교반하였다. 생성된 용액을 디클로로메탄(100mL)으로 추출하였다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(10/1)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 미정제 생성물을 플래쉬-분취-HPLC로 정제하였다. 이를 통해 22.7 mg(17.75%)의 (3R)-N-[3-(5-[4-[4-([4-[3-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)페닐]피페라진-1-일]메틸)피페리딘-1-일]페닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐)-2,4-디플루오로페닐]-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드를 연황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 869.35 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.90 (s, 1H), 10.80 (s, 1H), 9.86(s, 1H), 8.66 (s, 1H), 8.54 (s, 1H), 8.07 (s, 1H), 7.66-7.58 (m, 3H), 7.30-7.25 (m, 1H), 7.19-7.15 (m, 1H), 7.09-7.07 (d, J=8.0Hz, 2H), 6.85-6.82(m, 1H),6.64-6.62(d, J=8.0Hz,1H), 5.37-5.24 (m, 1H), 3.82-3.75 (m, 3H), 3.52-3.39 (m, 5H), 3.15 (m, 4H), 2.79-2.73 (m, 4H), 2.65-2.51 (m, 3H), 2.26-2.03 (m, 3H), 1.87-1.83 (m, 3H), 1.27-1.25 (m, 2H).
5-(6-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-일)-N-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-3,4-디하이드로-1,8-나프티리딘-1(2H)-카르복사미드 (예시적 화합물 789)의 예시적인 합성
단계 1: 3-(3-클로로프로필)-2-플루오로-4-아이오도피리딘 제조
테트라하이드로푸란(80 mL) 중 2-플루오로-4-아이오도-피리딘 (7.70 g, 34.53 mmol, 1.00 당량) 용액에 리튬 디이소프로필아미드(2 M, 20.72 mL, 1.20 당량)를 -78℃에서 1.5시간 동안 첨가하였다. 그런 다음, 혼합물을 테트라하이드로푸란(10 mL) 중 1-클로로-3-아이오도-프로판(14.12 g, 69.06 mmol, 7.43 mL, 2.00 당량)의 용액을 -78℃에서 첨가하고 0.5시간 동안 교반하였다. 이어서 혼합물을 15℃로 가온하고 1시간 동안 교반하였다. 혼합물을 포화 염화 암모늄 용액(80 mL)으로 급냉시키고, 에틸 아세테이트 (2 x 40 mL)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(50 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고여과하고 농축시켜 잔류물을 수득하였다. 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(petroleum ether: 에틸 아세테이트 = 1:0 내지 10:1)로 정제하여 3-(3-클로로프로필)-2-플루오로-4-아이오도-피리딘 (9.00 g, 30.05 mmol, 87% 수율)을 연황색 오일로서 수득하였다.1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 7.69 (d, J=5.6 Hz, 1H), 7.61 (d, J=5.2 Hz, 1H), 3.61 (t, J=6.4 Hz, 2H), 2.90 - 2.97 (m, 2H), 2.04 - 2.08 (m, 1H), 1.99 - 2.03 (m, 1H).
단계 2: 1-(2,4-디메톡시벤질)-5-아이오도-1,2,3,4-테트라하이드로-1,8-나프티리딘 제조
N,N-디메틸포름아미드 (30 mL)　중 3-(3-클로로프로필)-2-플루오로-4-아이오도-피리딘 (3 g, 10.02 mmol, 1 당량) 및 (2,4-디메톡시페닐)메탄아민 (2.01 g, 12.02 mmol, 1.2 당량)의 용액에 요오드화 칼륨 (2.00 g, 12.02 mmol, 1.2 당량), 피리딘 (475 mg, 6.01 mmol, 0.6 당량) 및 탄산칼륨 (2.49 g, 18.03 mmol, 1.8 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 70℃에서 12시간 동안 교반하였다. 혼합물을 물(50 mL)로 희석하고 15℃에서 15분 동안 교반하였다. 혼합물을 여과하고, 여과물을 아세트산에틸(50 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(100 mL x 3)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 미정제 생성물을 석유 에테르 및 에틸 아세테이트(V: V=10:1)로 연화시켜 1-[(2,4-디메톡시페닐)메틸]-5-아이오도-3,4- 디하이드로-2H-1,8-나프티리딘 (3 g, 7.31 mmol, 73.01% 수율)을 갈색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 398.1 [M-12] +.
단계 3: 삼차-부틸 6-(8-(2,4-디메톡시벤질)-5,6,7,8-테트라하이드로-1,8-나프티리딘-4-일)-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트 제조
2-메틸부탄-2-올 (8.89 g, 100.78 mmol, 37.60 당량) 중 1-[(2,4-디메톡시페닐)메틸]-5-아이오도-3,4-디하이드로-2H-1,8-나프티리딘 (1.1 g, 2.68 mmol, 1 당량)의 용액에 삼차-부틸 2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트;옥살산 (912 mg, 1.88 mmol, 0.7 당량), 나트륨 삼차-부톡시드 (2 M, 4.02 mL, 3 당량)　및 메탄설포네이트(2-디시클로헥실포스피노- 2',6'-디-아이-프로폭시-1,1'-비페닐)(2'-아미노-1,1'-비페닐-2-일)팔라듐(II) (224 mg, 0.26 mmol, 0.1 당량)을 질소 대기 하에 첨가하였다. 혼합물을 90℃에서 12시간 동안 교반하였다. 혼합물을 물(50 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(30 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(50 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 미정제 생성물을 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르:에틸 아세테이트=10:1 내지 5:1)로 정제하여 삼차-부틸 6-[8-[(2,4-디메톡시페닐)메틸]-6,7-디하이드로-5H-1,8- 나프티리딘-4-일]-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트 (1 g, 2.08 mmol, 77% 수율)을 연황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 481.3 [M+1] +.
단계 4: 5-(2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-일)-1,2,3,4-테트라하이드로-1,8-나프티리딘 제조
톨루엔(10 mL) 중 삼차-부틸 6-[8-[(2,4-디메톡시페닐)메틸]-6,7-디하이드로-5H-1,8- 나프티리딘-4-일]-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트 (1 g, 2.08 mmol, 1 당량)의 용액에 트리플루오로아세트산 (7.70 g, 67.53 mmol, 32.45 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 65℃에서 1시간 동안 교반하였다. 혼합물을 여과하고, 여과물을 진공 중에서 농축시켰다. 화합물 5-(2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-일)-1,2,3,4-테트라하이드로- 1,8-나프티리딘 (500 mg, 1.45 mmol, 69% 수율, 트리플루오로아세테이트)을 갈색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 231.2 [M+1] +.
단계 5: 삼차-부틸 6-(5,6,7,8-테트라하이드로-1,8-나프티리딘-4-일)-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트 제조
디클로로메탄(10 mL) 중 5-(2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-일)-1,2,3,4-테트라하이드로-1,8-나프티리딘 (500 mg, 1.45 mmol, 1 당량, 트리플루오로아세테이트)의 용액에 디-삼차-부틸 디카르보네이트(380 mg, 1.74 mmol, 1.2 당량), 트리에틸아민 (734 mg, 7.26 mmol, 5 당량) 및 4-디메틸아미노피리딘 (17 mg, 0.14 mmol, 0.1 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 1시간 동안 교반하였다. 혼합물을 물(20 mL)로 희석하고, 에틸 아세테이트(15 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(30 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고, 진공 중에서 농축시켰다. 미정제 생성물을 분취 역상 TLC(디클로로메탄: 메탄올=8:1)로 정제하여 삼차-부틸 6-(5,6,7,8-테트라하이드로-1,8- 나프티리딘-4-일)-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트 (380 mg, 1.15 mmol, 79% 수율 의 황색 고체로 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 331.5 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 7.48 (d, J = 5.6 Hz, 1H), 6.06 (s, 1H), 5.66 (d, J = 5.9 Hz, 1H), 4.07 (s, 4H), 3.99 (s, 4H), 3.16 (s, 2H), 2.47 (s, 2H), 1.74 - 1.65 (m, 2H), 1.37 (s, 9H).
단계 6: 삼차-부틸 6-(8-((2,6-디옥소피페리딘-3-일)카바모일)-5,6,7,8-테트라하이드로-1,8-나프티리딘-4-일)-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트 제조
테트라하이드로푸란(10 mL) 중 삼차-부틸 6-(5,6,7,8-테트라하이드로-1,8-나프티리딘-4-일)-2,6-디아자스피로[3.3] 헵탄-2-카르복실레이트 (380 mg, 1.15 mmol, 1 당량)의 용액에 트리에틸아민 (698 mg, 6.90 mmol, 6 당량)　및 비스(트리클로로메틸) 카보네이트(341 mg, 1.15 mmol, 1 당량)를 0°에서 첨가하였다. 혼합물을 25℃에서 3시간 동안 교반하였다. 그 후, 3-아미노피페리딘-2,6-디온(227.14 mg, 1.38 mmol, 1.2 당량, 염화수소)을 혼합물에 첨가하였다. 혼합물을 50℃에서 36시간 동안 교반하였다. 혼합물을 물(30 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(20 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(40 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고, 진공 중에서 농축시켰다. 미정제 생성물을 분취 역상 TLC(디클로로메탄: 메탄올=15:1)로 정제하여 삼차-부틸 6-[8-[(2,6-디옥소-3-피페리딜)카바모일]-6,7-디하이드로- 5H-1,8-나프티리딘-4-일]-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트 (220 mg, 0.45 mmol, 39% 수율)를 백색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 485.2 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 11.19 (d, J = 6.4 Hz, 1H), 10.79 (s, 1H), 7.80 (d, J = 5.6 Hz, 1H), 6.12 (d, J = 5.6 Hz, 1H), 4.58 - 4.46 (m, 1H), 4.17 (s, 4H), 4.05 - 3.97 (m, 4H), 3.84 - 3.72 (m, 2H), 2.80 - 2.67 (m, 1H), 2.57 (t, J = 6.0 Hz, 2H), 2.20 - 2.09 (m, 1H), 2.07 - 1.89 (m, 2H), 1.81 - 1.66 (m, 2H), 1.38 (s, 9H).
단계 7: N-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-5-(2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-일)-3,4-디하이드로-1,8-나프티리딘-1(2H)-카르복사미드 제조
디클로로메탄(5 mL) 중 삼차-부틸 6-[8-[(2,6-디옥소-3-피페리딜)카바모일]-6,7-디하이드로-5H-1,8- 나프티리딘-4-일]-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트 (220 mg, 0.45 mmol, 1 당량)의 용액에 트리에틸아민 (3.85 g, 33.77 mmol, 74.37 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 1시간 동안 교반하였다. 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 화합물 5-(2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-일)-N-(2,6-디옥소-3-피페리딜)- 3,4-디하이드로-2H-1,8-나프티리딘-1-카르복사미드 (220 mg, 0.44 mmol, 97.21% 수율, 트리플루오로아세테이트)를 연황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 385.3 [M+1] +.
단계 8: 5-(6-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-일)-N-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-3,4-디하이드로-1,8-나프티리딘-1(2H)-카르복사미드 제조
N,N-디메틸포름아미드 (5 mL)　중 5-(2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-일)-N-(2,6-디옥소-3-피페리딜)-3,4-디하이드로- 2H-1,8-나프티리딘-1-카르복사미드 (110 mg, 0.22 mmol, 1 당량, 트리플루오로아세테이트)의 용액에 아세트산나트륨(90 mg, 1.10 mmol, 5 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 그런 다음, (3R)-N-[2,4-디플루오로-3-[5-[4-(4-포르밀-1- 피페리딜)페닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (134 mg, 0.22 mmol, 1 당량)　및 아세트산 (26 mg,0.44 mmol, 2 당량)을 혼합물에 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 이어서, 나트륨 시아노보로히드라이드(27 mg, 0.44 mmol, 2 당량)을 혼합물에 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 2시간 동안 교반하였다. 혼합물을 여과하고, 여과물을 분취-HPLC로 정제하여 5-[6-[[1-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일] 설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-4-피페리딜]메틸]-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-일]-N-(2,6-디옥소-3-피페리딜)-3,4-디하이드로-2H-1,8-나프티리딘-1-카르복사미드 (44.5 mg, 0.04 mmol, 19% 수율, 98% 순도, 포름산염)를 황색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 981.3 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 11.20 (d, J = 6.8 Hz, 1H), 10.79 (s, 1H), 8.64 (s, 1H), 8.52 (d, J = 2.8 Hz, 1H), 8.17 (s, 1H), 8.05 (s, 1H), 7.79 (d, J = 5.2 Hz, 1H), 7.66 - 7.60 (m, 1H), 7.53 (d, J = 2.8 Hz, 2H), 7.24 (t, J = 8.4 Hz, 1H), 7.05 (d, J = 8.0 Hz, 2H), 6.13 (d, J = 5.6 Hz, 1H), 5.40 - 5.15 (m, 1H), 4.58 - 4.45 (m, 1H), 4.12 (s, 4H), 3.82 - 3.74 (m, 4H), 3.47 (s, 4H), 3.27 - 3.26 (m, 4H), 2.75 - 2.64 (m, 4H), 2.54 - 2.52 (m, 3H), 2.34 - 2.31 (m, 2H), 2.18 - 2.04 (m, 3H), 2.04 - 1.91 (m, 2H), 1.83 - 1.71 (m, 4H), 1.51 - 1.39 (m, 1H), 1.30 - 1.18 (m, 2H).
4-(6-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-일)-N-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-2-메톡시벤즈아미드 (예시적 화합물 790)의 예시적인 합성
단계 1: 삼차-부틸 6-(3-메톡시-4-(메톡시카르보닐)페닐)-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트 제조
디메틸설폭시드(10 mL) 중 메틸 4-플루오로-2-메톡시-벤조에이트 (500 mg, 2.71 mmol, 1 당량)　및 삼차-부틸 2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트;옥살산(660 mg, 1.36 mmol, 0.5 당량)의 용액에 디이소프로필에틸아민(701 mg, 5.43 mmol, 945.80 uL, 2 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 120℃에서 2시간 동안 교반하였다. 물(50 mL)을 혼합물에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(20 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수(20 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르/에틸 아세테이트=10/1 내지 1/1)로 정제하였다. 화합물 삼차-부틸 6-(3- 메톡시-4-메톡시카르보닐-페닐)-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트 (250 mg, 0.68 mmol, 25% 수율)를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 363.2 [M+1] +.
단계 2: 4-(6-(삼차-부톡시카르보닐)-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-일)-2-메톡시벤조산 제조
테트라하이드로푸란(5 mL), 메탄올 (5 mL)　　및 물(5 mL) 중의 삼차-부틸 6-(3-메톡시-4-메톡시카르보닐-페닐)-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트 (250 mg, 0.68 mmol, 1 당량) 용액에 수산화 리튬 일수화물 (115. mg, 2.76 mmol, 4 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 20℃에서 12시간 동안 교반하였다. 물(50 mL)을 혼합물에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(20 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수(20 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(디클로로메탄: 메탄올 = 1:0 내지 20:1)로 정제하였다. 화합물 4-(2-삼차-부톡시카르보닐-2,6- 디아자스피로[3.3]헵탄-6-일)-2-메톡시-벤조산 (230 mg, 0.66 mmol, 95% 수율)을 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 349.3 [M+1] +.
단계 3: 삼차-부틸 6-(4-((2,6-디옥소피페리딘-3-일)카바모일)-3-메톡시페닐)-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트 제조
N,N-디메틸포름아미드(5 mL) 중 4-(2-삼차-부톡시카르보닐-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-6-일)-2-메톡시-벤조산 (230 mg, 0.66 mmol, 1 당량)의 용액에 o-(7- 아자벤조트리아졸-1-일)-n,n,n',n'-테트라메틸우로늄 헥사플루오로포스페이트(376 mg, 0.99 mmol, 1.5 당량) 및 3-아미노피페리딘-2,6-디온 (108 mg, 0.66 mmol, 1 당량, 염화수소)을 첨가하였다. 혼합물을 15℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 디이소프로필에틸아민(170 mg, 1.32 mmol, 229.98 uL, 2 당량)을 첨가하고, 혼합물을 15℃에서 11.5시간 동안 교반하였다. 물(40 mL)을 혼합물에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(10 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수(10 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 분취-TLC(디클로로메탄: 메탄올 = 10:1)로 정제하였다. 화합물 삼차-부틸 6-[4-[(2,6-디옥소-3-피페리딜) 카바모일]-3-메톡시-페닐]-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트 (120 mg, 0.26 mmol, 39% 수율)를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 459.2 [M+1] +.
단계 4: N-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-2-메톡시-4-(2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-일)벤즈아미드 제조
디클로로메탄(2 mL) 중 삼차-부틸 6-[4-[(2,6-디옥소-3-피페리딜)카바모일]-3-메톡시-페닐]-2,6- 디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트 (120 mg, 0.26 mmol, 1 당량)의 용액에 트리플루오로아세트산 (770 mg, 6.75 mmol, 0.5 mL, 25.80 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 20℃에서 12시간 동안 교반하였다. 화합물 4-(2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-일)-N-(2,6-디옥소-3-피페리딜)-2-메톡시-벤즈아미드 (120 mg, 트리플루오로아세테이트)를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 359.2 [M+1] +.
단계 5: 4-(6-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-일)-N-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-2-메톡시벤즈아미드 제조
1,2-디클로로에탄 (4 mL)　중 4-(2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-일)-N-(2,6-디옥소-3-피페리딜)-2-메톡시- 벤즈아미드 (120 mg, 0.25 mmol, 1 당량, 트리플루오로아세테이트) 및 (3R)-N-[2,4-디플루오로-3-[5-[4-(4- 포르밀-1-피페리딜)페닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (155 mg, 0.25 mmol, 1 당량)의 용액에 트리에틸아민 (51 mg, 0.50 mmol, 70.71 uL, 2 당량)을 첨가하였다 혼합물을 30℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 트리아세트옥시보로히드라이드 나트륨(161 mg, 0.76 mmol, 3 당량)을 혼합물에 첨가하고 30℃에서 1.5시간 동안 교반하였다. 잔류물을 분취-HPLC로 정제하였다. 반응 혼합물을 포화 수성 중탄산 나트륨으로 pH 8로 조정하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(20 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수(20 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 화합물 4-[6-[[1-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘 -1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-4-피페리딜]메틸]-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-일]-N-(2,6-디옥소-3-피페리딜)-2-메톡시-벤즈아미드 (71.8 mg, 0.074 mmol, 29 % 수율, 98% 순도)를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 954.3 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 1.20 - 1.30 (m, 2 H) 1.47 (s, 1 H) 1.77 (d, J=10.8 Hz, 2 H) 2.02 - 2.17 (m, 3 H) 2.52 (s, 4 H) 2.69 - 2.83 (m, 2 H) 3.24 - 3.30 (m, 4 H) 3.34 - 3.42 (m, 6 H) 3.47 (s, 1 H) 3.76 (d, J=12.0 Hz, 2 H) 3.90 (s, 3 H) 3.99 (s, 3 H) 4.69 (dt, J=12.4, 6.0 Hz, 1 H) 5.20 - 5.41 (m, 1 H) 6.01 (d, J=1.6 Hz, 1 H) 6.07 (dd, J=8.8, 1.6 Hz, 1 H) 7.05 (d, J=8.8 Hz, 2 H) 7.25 (t, J=8.4 Hz, 1 H) 7.54 - 7.66 (m, 3 H) 7.76 (d, J=8.4 Hz, 1 H) 8.06 (s, 1 H) 8.39 (d, J=6.8 Hz, 1 H) 8.53 (s, 1 H) 8.64 (d, J=2.0 Hz, 1 H) 10.85 (s, 1 H) 12.89 (s, 1 H).
4-(6-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-일)-N-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-2-플루오로벤즈아미드 (예시적 화합물 792)의 예시적인 합성
단계 1: 삼차-부틸 6-(3-플루오로-4-(메톡시카르보닐)페닐)-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트 제조
디메틸설폭시드(10 mL) 중 메틸 2,4-디플루오로벤조에이트 (500 mg, 2.90 mmol, 1 당량)　및 삼차-부틸 2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트;옥살산(706 mg, 1.45 mmol, 0.5 당량)의 용액에 디이소프로필에틸아민(750 mg, 5.81 mmol, 1.01 mL, 2 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 120℃에서 2시간 동안 교반하였다. 물(50 mL)을 혼합물에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(20 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수로 세척하고(30 mL x 2), 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(석유 에테르/에틸 아세테이트=20/1 내지 3/1)로 정제하였다. 화합물 삼차-부틸 6-(3-플루오로-4-메톡시카르보닐-페닐)-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트 (350 mg, 0.99 mmol, 34% 수율)를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 351.5 [M+1] +.
단계 2: 4-(6-(삼차-부톡시카르보닐)-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-일)-2-플루오로벤조산 제조
테트라하이드로푸란 (6 mL), 메탄올 (6 mL)　및 물(6 mL) 중의 6-(3-플루오로-4-메톡시카르보닐-페닐)-2,6-디아자스피로[3.3] 헵탄-2-카르복실레이트 (350 mg, 0.99 mmol, 1 당량)용액에 수산화 나트륨(159 mg, 4.00 mmol, 4 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 40℃에서 3시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 황산(2M)으로 pH 6로 조정하였다. 물(30 mL)을 혼합물에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 디클로로메탄(10 mL x 3)으로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수(10 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 화합물 4-(2-삼차-부톡시카르보닐-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-6-일)-2-플루오로-벤조산 (300 mg, 0.89 mmol, 89% 수율)을 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 337.4 [M+1] +.
단계 3: 삼차-부틸 6-(4-((2,6-디옥소피페리딘-3-일)카바모일)-3-플루오로페닐)-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트 제조
N,N-디메틸포름아미드(5 mL) 중 4-(2-삼차-부톡시카르보닐-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-6-일)-2-플루오로-벤조산 (300 mg, 0.89 mmol, 1 당량)의 용액에 o-(7- 아자벤조트리아졸-1-일)-n,n,n',n'-테트라메틸우로늄 헥사플루오로포스페이트(508 mg, 1.34 mmol, 1.5 당량)를 첨가하고, 혼합물을 20℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 그런 다음, 디이소프로필에틸아민(230 mg, 1.78 mmol, 310.71 uL, 2 당량) 및 3-아미노피페리딘-2,6-디온 (146 mg, 0.89 mmol, 1 당량, 염화수소)을 혼합물에 첨가하고, 혼합물을 20℃에서 12시간 동안 교반하였다. 물(50 mL)을 혼합물에 붓고 1분 동안 교반하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(20 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수(20 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 컬럼 크로마토그래피(디클로로메탄:메탄올 = 200:1 내지 20:1)로 정제하였다. 화합물 삼차-부틸 6-[4-[(2,6-디옥소-3-피페리딜)카바모일]-3-플루오로-페닐]-2,6- 디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트 (250 mg, 0.55 mmol, 62% 수율)를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 447.2 [M+1] +.
단계 4: N-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-2-플루오로-4-(2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-일)벤즈아미드 제조
디클로로메탄(5 mL) 중 삼차-부틸 6-[4-[(2,6-디옥소-3-피페리딜)카바모일]-3-플루오로-페닐]-2,6- 디아자스피로[3.3]헵탄-2-카르복실레이트 (250 mg, 0.55 mmol, 1 당량)의 용액에 트리플루오로아세트산(1.54 g, 13.51 mmol, 1 mL, 24.12 당량)을 첨가하였다. 혼합물을 20℃에서 12시간 동안 교반하였다. 　 반응 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 화합물 4-(2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-일)-N-(2,6-디옥소-3-피페리딜)-2-플루오로-벤즈아미드 (250 mg, 트리플루오로아세테이트)를 갈색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 347.2 [M+1] +.
단계 5: 4-(6-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-일)-N-(2,6-디옥소피페리딘-3-일)-2-플루오로벤즈아미드 제조
1,2-디클로로에탄 (3 mL)　중 4-(2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-일)-N-(2,6-디옥소-3-피페리딜)-2-플루오로- 벤즈아미드 (90 mg, 0.19 mmol, 1 당량, 트리플루오로아세테이트) 및 (3R)-N-[2,4-디플루오로-3-[5-[4-(4- 포르밀-1-피페리딜)페닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]페닐]-3-플루오로-피롤리딘-1-설폰아미드 (120 mg, 0.19 mmol, 1 당량)의 용액에 트리에틸아민 (39 mg, 0.39 mmol, 2 당량)을 첨가하고,　혼합물을 30℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 트리아세트옥시보로히드라이드 나트륨(124 mg, 0.58 mmol, 3 당량)을 혼합물에 첨가하고 30℃에서 1.5시간 동안 교반하였다. 잔류물을 분취-HPLC로 정제하였다. 반응 혼합물을 포화 수성 중탄산 나트륨으로 pH 8로 조정하였다. 수성상을 에틸 아세테이트(20 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수(20 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨으로 건조시키고, 여과하고 진공 중에서 농축시켰다. 화합물 4-[6-[[1-[4-[3-[2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐아미노]벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐]-4-피페리딜]메틸]-2,6-디아자스피로[3.3]헵탄-2-일]-N-(2,6-디옥소-3-피페리딜)-2-플루오로-벤즈아미드 (37.7 mg, 0.038 mmol, 19% 수율, 95% 순도)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 942.3 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 1.20 - 1.30 (m, 2 H) 1.46 (s, 1 H) 1.76 (d, J=11.2 Hz, 2 H) 2.02 - 2.17 (m, 3 H) 2.52 (s, 1 H) 2.64 - 2.82 (m, 3 H) 3.26 - 3.33 (m, 9 H) 3.39 (d, J=3.2 Hz, 2 H) 3.47 (s, 1 H) 3.76 (d, J=12.0 Hz, 2 H) 3.93 - 4.06 (m, 4 H) 4.72 (dt, J=12.8, 6.28 Hz, 1 H) 5.17 - 5.41 (m, 1 H) 6.20 - 6.31 (m, 2 H) 7.05 (d, J=8.8 Hz, 2 H) 7.25 (t, J=8.4 Hz, 1 H) 7.54 - 7.66 (m, 4 H) 7.97 (t, J=7.2 Hz, 1 H) 8.05 (s, 1 H) 8.53 (s, 1 H) 8.64 (d, J=2.0 Hz, 1 H) 10.82 (s, 1 H) 12.88 (s, 1 H).
PEG 전구약물에 대한 일반 합성 반응식
반응식 전구약물 1. VHL 리간드의 하이드록시프롤린 상에서 알콕시-아세테이트 에스테르를 통해 연결된 PEG 전구약물에 대한 일반적인 합성 반응식
반응식 전구약물 2. VHL 리간드의 하이드록시프롤린 상에서 석신에이트 비스-에스테르를 통해 연결된 PEG 전구약물에 대한 일반적인 합성 계획
반응식 전구약물 3. VHL 리간드의 하이드록시프롤린 상에서 3-알콕시-프로피오네이트 에스테르를 통해 연결된 PEG 전구약물에 대한 일반적인 합성 반응식
반응식 전구약물 4. VHL 리간드의 하이드록시프롤린 상에서 3-알콕시-부티레이트 에스테르를 통해 연결된 PEG 전구약물에 대한 일반적인 합성 반응식
반응식 전구약물 5. VHL 리간드의 하이드록시프롤린 상에서 2-알콕시-프로피오네이트 에스테르를 통해 연결된 PEG 전구약물에 대한 일반적인 합성 반응식
반응식 전구약물 6. VHL 리간드의 하이드록시프롤린 상에서 4-알콕시-부티레이트 에스테르를 통해 연결된 PEG 전구약물에 대한 일반적인 합성 반응식
반응식 전구약물 7. VHL 리간드의 하이드록시프롤린 상에서 석신에이트 모노-에스테르 모노-(2차)-아미드를 통해 연결된 PEG 프로드러그에 대한 일반적인 합성 반응식
반응식 전구약물 8. VHL 리간드의 하이드록시프롤린 상에서 석신에이트 모노-에스테르 모노-(3차)-아미드를 통해 연결된 PEG 전구약물에 대한 일반적인 합성 반응식
반응식 전구약물 9. VHL 리간드의 벤질 메틸기 상에서 석신에이트 모노-에스테르 모노-아미드를 통해 연결된 PEG 전구약물에 대한 일반적인 합성 반응식
반응식 전구약물 10. VHL 리간드의 하이드록시프롤린 상에서 2,2'-옥시디아세트산의 비스-에스테르를 통해 연결된 PEG 전구약물에 대한 일반적인 합성 반응식
반응식 전구약물 11. VHL 리간드의 하이드록시프롤린 상에서 클릭 화학을 통해 연결된 PEG 전구약물에 대한 일반 합성 계획
반응식 전구약물 12. 세레블론 리간드의 이미드 N 상에서 메틸렌 카보네이트를 통해 연결된 PEG 전구약물에 대한 일반적인 합성 반응식
반응식 전구약물 13. 모체 약물의 인돌로부터 메틸렌 2-프로피오네이트를 통해 연결된 PEG 전구약물에 대한 일반적인 합성 반응식
반응식 전구약물 14. 모체 약물의 인돌로부터 메틸렌 아세에이트를 통해 연결된 PEG 전구약물에 대한 일반적인 합성 반응식
반응식 전구약물 15. 모체 약물의 인돌로부터 메틸렌 카보네이트를 통해 연결된 PEG 전구약물에 대한 일반적인 합성 반응식
(3R,5S)-1-((S)-2-(2-(3-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)아제티딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-5-((4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)카바모일)피롤리딘-3-일 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50-헵타데카옥사도펜타콘탄-52-오에이트 (예시적 화합물 797)의 예시적인 합성
단계 1: 삼차-부틸 3-(4-(4-브로모페닐)피페라진-1-일)아제티딘-1-카르복실레이트 제조
500-mL 둥근 바닥 플라스크에, 1-(4-브로모페닐)피페라진 (10.0 g , 36.2 mmol 1.0당량), 삼차-부틸 3-옥소아제티딘-1-카르복실레이트 (7.0 g, 36.2 mmol, 1.0당량), 디클로로메탄(300.0 mL), N,N-디이소프로필에틸아민 (4.67 g, 36.2 mmol , 1.0당량), 트리아세톡시보로하이드라이드 나트륨(35.0 g, 0.16 mol, 4당량)을 넣었다. 생성된 혼합물을 실온에서 24시간 동안 교반하고 디클로로메탄(500.0 ml x2으로 추출하였다. 유기상을 농축시키고, 이를 통해 12.0 g의 삼차-부틸 3-(4-(4-브로모페닐)피페라진-1-일)아제티딘-1-카르복실레이트를 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 396.25 [M+1] +.
단계 2: 1-(아제티딘-3-일)-4-(4-브로모페닐)피페라진 제조
1-L 둥근 바닥 플라스크에, 100 mL 디클로로메탄 중 삼차-부틸 3-[4-(4-브로모페닐)피페라진-1-일]아제티딘-1-카르복실레이트 (15.0 g, 1당량)를 넣은 다음, 1,4-디옥산 용액(4.0 M, 100 mL) 중 염화수소를 첨가하였다. 생성된 혼합물을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 고체를 여과에 의해 수집하고, 이를 통해 10.0 g의 1-(아제티딘-3-일)-4-(4-브로모페닐)피페라진을 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 296.20 [M+1] +.
단계 3: 삼차-부틸 2-(3-(4-(4-브로모페닐)피페라진-1-일)아제티딘-1-일)아세테이트 제조
질소의 불활성 대기로 퍼지되고 유지된 1-L 둥근 바닥 플라스크에, 1-(아제티딘-3-일)-4-(4-브로모페닐)피페라진 (15.0 g, 50.68mmol, 1.0당량), 옥소란(200.0 mL), 수산화나트륨 수용액(2.0 M, 100.0 mL), 삼차-부틸 2-브로모아세테이트(10.0 g, 51.3mmol 1.1당량)를 넣었다. 생성된 혼합물을 얼음/염 조에서 0℃에서 2시간 동안 교반하였다. 생성된 용액을 에틸 아세테이트(500.0 ml x2)로 추출하고, 유기층을 합치고 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 농축시켰다. 이를 통해 10.0 g의 삼차-부틸 2-[3-[4-(4-브로모페닐)피페라진-1-일]아제티딘-1-일]아세테이트를 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 410.30 [M+1] +.
단계 4: 삼차-부틸 2-(3-(4-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)피페라진-1-일)아제티딘-1-일)아세테이트 제조
질소로 퍼지하고 질소의 불활성 분위기 하에 유지된 250 mL 둥근바닥 플라스크에, 삼차-부틸 2-[3-[4-(4-브로모페닐)피페라진-1-일]아제티딘-1-일]아세테이트 (10.4 g, 25.24 mmol 1.0당량), 4,4,5,5-테트라메틸-2-(테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-1,3,2-디옥사보로란 (12.8 g, 50.48 mmol 2.0당량), 아세트산 칼륨(4.9 g 50.48 mmol 2.0당량), Pd(dppf)Cl2 (2.0 g 2.52 mmol 0.1당량) 및 디옥산 (200.0 mL)을 넣었다. 생성된 용액을 오일조에서 80℃에서 밤새 교반하였다. 생성된 혼합물을 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(10:1)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 10.0 g의 삼차-부틸 2-(3-[4-[4-(테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐]피페라진-1-일]아제티딘-1-일)아세테이트를 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 458.35 [M+1] +.
단계 5: 삼차-부틸 (R)-2-(3-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-((3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)아제티딘-1-일)아세테이트 제조
질소의 불활성 대기로 퍼지되고 유지된 30-mL 밀봉된 튜브에, (3R)-N-[3-([5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-일]카르보닐)-2,4-디플루오로페닐]-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 (1.0g, 2.0 mmol 1.0당량), 삼차-부틸 2-(3-[4-[4-(테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐]피페라진-1-일]아제티딘-1-일)아세테이트 (1.9 g 4.15mmol 2.1당량), Na2CO3 (0.43 g, 4.0mmol, 2.0당량), Pd(dppf)Cl2 (163.0 mg, 0.2mmol, 0.1당량), 디옥산 (10 mL) 및 H2O (2 mL)을 넣었다. 생성된 혼합물을 마이크로파 조건 하에 105℃에서 3시간 동안 교반하였다. 생성된 혼합물을 농축시키고, 잔류물을 디클로로메탄/메탄올 (10:1)으로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 0.94 g (62.76%)의 삼차-부틸 2-[3-[4-(4-[3-[(2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-설포닐]아미노]페닐)카르보닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]아제티딘-1-일]아세테이트를 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 754.45 [M+1] +.
단계 6: (R)-2-(3-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-((3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)아제티딘-1-일)아세트산 제조
100-mL 둥근바닥 플라스크에, 삼차-부틸 2-[3-[4-(4-[3-[(2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-설포닐]아미노]페닐)카르보닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]아제티딘-1-일]아세테이트 (1.0 g), 디클로로메탄 (20 mL) 및 트리플루오로아세트산 (10 mL)을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 12시간 동안 교반하였다. 생성된 혼합물을 농축시켰다. 이를 통해 820.0 mg의 2-[3-[4-(4-[3-[(2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-설포닐]아미노]페닐)카르보닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]아제티딘-1-일]아세트산을 갈색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 698.05 [M+1] +.
단계 7: (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(3-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)아제티딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
100-mL 둥근바닥 플라스크에, 2-[3-[4-(4-[3-[(2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-설포닐]아미노]페닐)카르보닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]아제티딘-1-일]아세트산 (1.0 g), N,N-디메틸포름아미드 (10 mL), (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (0.61 g), N,N-디이소프로필에틸아민 (0.55 g), 프로판포스폰산 고리형 무수물(1.3 g)을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 이어서 60 mL의 물을 첨가하여 반응물을 급냉시켰다. 생성된 용액을 에틸 아세테이트(50 mL x 2)로 추출하고, 유기상을 농축시켰다. 미정제 생성물을 분취-HPLC로 정제하였다. 이를 통해 251.7 mg의 (2S,4R)-1-[(2S)-2-(2-[3-[4-(4-[3-[(2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-설포닐]아미노]페닐)카르보닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]아제티딘-1-일]아세트아미도)-3,3-디메틸을 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 1110.15 [M+1] +; 1H-NMR (300MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.89 (s, 1H), 8.94 (s, 1H), 8.70-8.36 (m, 3H), 8.13 (s, 1H), 8.04 (s, 1H), 7.57 (dd, J = 9.0, 5.1 Hz, 4H), 7.38 (s, 4H), 7.22 (td, J = 8.8, 1.6 Hz, 1H), 7.03 (d, J = 8.7 Hz, 2H), 5.26 (d, J = 53.1 Hz, 2H), 4.54-4.16 (m, 5H), 3.68-3.50 (m, 3H), 3.42 (d, J = 19.4 Hz, 2H), 3.30 (dt, J = 25.7, 4.6 Hz, 2H), 3.15 (d, J = 18.7 Hz, 7H), 3.01 (s, 3H), 2.40 (d, J = 8.0 Hz, 7H), 2.16-1.78 (m, 4H), 1.37 (s, 1H), 0.91 (s, 9H).
단계 8: 삼차-부틸 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50-헵타데카옥사도펜타콘탄-52-오에이트 제조
질소의 불활성 대기로 퍼지되고 유지된 1-L 둥근 바닥 플라스크에, THF(400 mL) 중 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47-헥사데카옥사노네이트트라콘탄-49-올 (40.00 g, 54.28mmol, 1당량)을 넣었다. 용액을 물/얼음조에서 0℃로 냉각시키고, NaH(3.20 g, 80.01 mmol, 1.47당량)를 나누어서 첨가하였다. 생성된 혼합물을 0℃에서 0.5시간 동안 교반하였다. 그런 다음, 삼차-부틸 2-브로모아세테이트 (15.60 g, 79.98 mmol, 1.47당량)를 교반하면서 적가하였다. 반응 혼합물을 실온에서 추가로 14시간 동안, 교반하면서, 반응시켰다. 이어서 반응물을 물(300 mL)의 첨가로 급냉시켰다. 생성된 용액을 에틸 아세테이트(130 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(20:1)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 20 g(43.29%)의 삼차-부틸 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50-헵타데카옥사도펜타콘탄-52-오에이트를 무색 오일로서 수득하였다.1H-NMR (300MHz, CDCl3) δ 4.02 (s, 2H), 3.71-3.56 (m, 75H), 3.38 (s, 3H), 1.48 (s, 9H).
단계 9: 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50-헵타데카옥사도펜타콘탄-52-오익산 제조
50-mL 둥근 바닥 플라스크에, 삼차-부틸 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50-헵타데카옥사도펜타콘탄-52-오에이트 (500 mg), DCE (5.0 mL), TFA (1.5 mL)를 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 4시간 동안 교반하였다. 생성된 혼합물을 진공 하에서 농축시켰다. 미정제 생성물을 분취-HPLC로 정제하였다. 이를 통해 126.1mg (27.00%)의 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50-헵타데카옥사도펜타콘탄-52-오익산을 연황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 398.35 [M/2+1] +; 1H-NMR (300MHz, D2O) δ 4.8-4.15 (m, 2H), 3.70-3.55 (m, 77H), 3.30 (s, 3H).
단계 10: (3R,5S)-1-((S)-2-(2-(3-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)아제티딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-5-((4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)카바모일)피롤리딘-3-일 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50-헵타데카옥사도펜타콘탄-52-오에이트 제조
100-mL 둥근 바닥 플라스크에, (2S,4R)-1-[(2S)-2-(2-[3-[4-(4-[3-[(2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-설포닐]아미노]페닐)카르보닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]아제티딘-1-일]아세트아미도)-3,3-디메틸 (300.0mg,270.51mmol, 1.0당량), 2-(2-메톡시에톡시)아세트산 (1.074g,1.35mmol 5.0당량), 디클로로메탄(20.0 mL), 　4-디메틸아미노피리딘 (1.5g,2.7mol 10당량), 　N-(3-디메틸아미노프로필)-N'-에틸카르보디이미드 염화수소 (5.71g,2.7mol 10.0당량)을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 24시간 동안 교반하였다. 생성된 혼합물을 300 x ml의 NH4Cl로 세척하였다. 생성된 용액을 2 x 200 mL의 디클로로메탄으로 추출하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 농축시켰다. 생성된 혼합물을 농축시켰다. 미정제 생성물을 분취-HPLC로 정제하였다. 이를 통해 31.6 mg의 (3R,5S)-1-((S)-2-(2-(3-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)아제티딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-5-((4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)카바모일)피롤리딘-3-일 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50-헵타데카옥사도펜타콘탄-52-오에이트를 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 1887.26 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 8.99 (s, 1H), 8.89 - 8.44 (m, 2H), 8.17 (s, 3H), 7.62 (dd, J = 9.0, 6.8 Hz, 1H), 7.42 (s, 3H), 7.28 (t, J = 8.9 Hz, 4H), 7.08 (d, J = 8.4 Hz, 2H), 5.31 (d, J = 52.8 Hz, 2H), 4.58 - 4.23 (m, 5H), 4.29 - 3.68 (m, 6H), 3.78 - 3.51 (m, 12H), 3.47 - 2.77 (m, 66H), 2.47 (s, 7H), 2.42 - 1.88 (m, 5H), 0.97 (s, 9H).
(3R,5S)-1-((S)-2-(2-(3-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)아제티딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-5-((4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)카바모일)피롤리딘-3-일 (65-하이드록시-3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,39,42,45,48,51,54,57,60,63-헤니코사옥사펜타헥사콘틸) 석신에이트(예시적 화합물 799)의 예시적인 합성
단계 1: 4-(((3R,5S)-1-((S)-2-(2-(3-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)아제티딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-5-((4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)카바모일)피롤리딘-3-일)옥시)-4-옥소부탄산 제조
100-mL 둥근바닥 플라스크에, 10분 교반한 후에, (2S,4R)-1-[(2S)-2-(2-[3-[4-(4-[3-[(2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-설포닐]아미노]페닐)카르보닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]아제티딘-1-일]아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (250.0 mg, 0.23 mmol, 1.00당량), 디클로로메탄 (10 mL), 4-디메틸아미노피리딘 (82.50 mg, 0.68 mmol, 3.00당량), 트리에틸아민 (45.53 mg, 0.45 mmol, 2.00당량), 옥소란-2,5-디온 (45.08 mg, 0.45 mmol, 2.00당량)을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 밤새 교반하였다. 생성된 용액을 디클로로메탄(100 mL)으로 추출하고 유기층을 합쳤다. 생성된 혼합물을 NH4Cl (수용액)(50 mL)로 세척하였다. 혼합물을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 중에서 농축시켰다. 미정제 생성물을 분취-HPLC로 정제하였다. 이를 통해 38 mg (14%)의 4-[[(3R,5S)-1-[(2S)-2-(2-[3-[4-(4-[3-[(2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-설포닐]아미노]페닐)카르보닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]아제티딘-1-일]아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일]-5-([[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]카바모일)피롤리딘-3-일]옥시]-4-옥소부탄산을 연황색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 1210.10 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, CD3OD) δ 8.85 (s, 1H), 8.67 (s, 1H), 8.58 (d, J = 2.0Hz, 1H), 7.88 (s, 1H), 7.75-7.74 (m, 1H), 7.58 (d, J = 8.8Hz, 2H), 7.47-7.40 (m, 4H), 7.16-7.07 (m, 3H), 5.35-5.15 (m, 2H), 4.57-4.53 (m, 3H), 4.38-4.34 (m, 1H), 4.16-4.13 (m,1H), 4.00-3.87 (m, 3H) , 3.59-3.39 (m, 7H), 3.30-3.24 (m, 6H), 2.55-2.44 (m, 12H), 2.20-2.00 (m, 3H), 1.04 (s, 9H).
단계 2: (3R,5S)-1-((S)-2-(2-(3-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)아제티딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-5-((4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)카바모일)피롤리딘-3-일 (2,5-디옥소피롤리딘-1-일) 석신에이트 제조
50-mL 둥근바닥 플라스크에, 4-[[(3R,5S)-1-[(2S)-2-(2-[3-[4-(4-[3-[(2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-설포닐]아미노]페닐)카르보닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]아제티딘-1-일]아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일]-5-([[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]카바모일)피롤리딘-3-일]옥시]-4-옥소부탄산 (250.0 mg, 0.21 mmol, 1.00당량), 디클로로메탄 (10 mL), 1-하이드록시피롤리딘-2,5-디온 (47.55 mg, 0.41 mmol, 2.00당량), DCC (85.19 mg, 0.41 mmol, 2.00당량)를 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 밤새 교반하였다. 고체를 걸러냈다. 이를 통해 270.0 mg (100%)의 (3R,5S)-1-[(2S)-2-(2-[3-[4-(4-[3-[(2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-설포닐]아미노]페닐)카르보닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]아제티딘-1-일]아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일]-5-([[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]카바모일)피롤리딘-3-일 2,5-디옥소피롤리딘-1-일 부탄디오에이트를 연황색 고체로서 수득하였다.
단계 3: (3R,5S)-1-((S)-2-(2-(3-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)아제티딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-5-((4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)카바모일)피롤리딘-3-일 (65-하이드록시-3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,39,42,45,48,51,54,57,60,63-헤니코사옥사펜타헥사콘틸) 석신에이트 제조
질소의 불활성 대기로 퍼지하고 유지한 50-mL 둥근 바닥 플라스크에, (3R,5S)-1-[(2S)-2-(2-[3-[4-(4-[3-[(2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-설포닐]아미노]페닐)카르보닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]아제티딘-1-일]아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일]-5-([[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]카바모일)피롤리딘-3-일 2,5-디옥소피롤리딘-1-일 부탄디오에이트 (290.0 mg, 0.22 mmol, 1.00당량), 디클로로메탄 (5.0 mL), PEG 1000 (666.0 mg, 3.00당량), 트리에틸아민 (67.28 mg, 0.66 mmol, 3.00당량)를 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 밤새 교반하였다. 생성된 용액을 디클로로메탄(50 mL x 2)으로 추출하고 유기층을 합쳤다. 생성된 혼합물을 NH4Cl (수용액)(50 mL x 2)로 세척하였다. 혼합물을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 중에서 농축시켰다. 미정제 생성물을 분취-HPLC로 정제하였다. 이를 통해, 59.6 mg(21%)의 (3R,5S)-1-((S)-2-(2-(3-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)아제티딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-5-((4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)카바모일)피롤리딘-3-일 (65-하이드록시-3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,39,42,45,48,51,54,57,60,63-헤니코사옥사펜타헥사콘틸) 석신에이트를 연황색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 2179.44 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, CD3OD) δ 8.86 (s, 1H), 8.67(s, 1H), 8.59-8.58 (d, J = 2.0Hz, 1H), 7.89 (s, 1H), 7.75- 7.74 (m, 1H), 7.60-7.58 (d, J = 8.8Hz, 2H), 7.48-7.41 (m, 4H), 7.10-7.08 (m, 3H), 5.35-5.15 (m, 2H), 4.54-4.53 (m, 3H), 4.38-4.34 (m, 1H), 4.23-4.13 (m,3H), 3.90-3.80 (m, 2H) , 3.70-3.53 (m, 99H), 3.47-3.31 (m, 3H), 3.29-3.26 (m, 4H), 3.17-3.10 (m, 3H), 2.64 (s, 4H), 2.56 (s, 4H), 2.48 (s, 4H), 2.47-2.35 (m, 1H), 2.25-2.10 (m, 3H), 1.05 (s, 9H)
(3R,5S)-1-((S)-2-(2-(2-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)에톡시)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-5-((4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)카바모일)피롤리딘-3-일 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헨헵타콘탄-71-오에이트 (예시적 화합물 800)의 예시적인 합성
단계 1: 삼차-부틸 2-(2-(벤질옥시)에톡시)아세테이트 제조
1000 mL 둥근바닥 플라스크에, 디클로로메탄(150 mL) 중 2-(벤질옥시)에탄-1-올 (10.0 g, 65.71 mmol, 1.00당량), 삼차-부틸 2-브로모아세테이트(19.2 g, 98.43 mmol, 1.50당량), 37% 수산화나트륨(150 mL), 및 염화 테트라부틸암모늄(18.3 g, 65.83 mmol, 1.00당량)을 넣었다. 생성된 용액을 물/얼음조 내 실온에서 4시간 동안 교반하였다. 생성된 용액을 디클로로메탄(100 mL x 3)으로 추출하고, 유기층을 합치고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1/15)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 15.0g (86%)의 삼차-부틸 2-[2-(벤질옥시)에톡시]아세테이트를 황색 오일로서 수득하였다.
단계 2: 삼차-부틸 2-(2-하이드록시에톡시)아세테이트 제조
500 mL 둥근바닥 플라스크에, 질소 대기 하에 실온에서 팔라듐 탄소(15.0 g, 92.02 mmol, 10.00당량)을 메탄올(250 mL) 중 삼차-부틸 2-[2-(벤질옥시)에톡시]아세테이트 (20.9 g, 78.47 mmol, 1.00당량) 용액에 첨가하였다. 반응 플라스크를 진공에 두고 수소 풍선으로 충진하였다. 생성된 용액을 실온에서 16시간 동안 교반하였다. 팔라듐 탄소를 제거하였다. 생성된 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 이를 통해 9.9 g(72%)의 삼차-부틸 2-(2-하이드록시에톡시)아세테이트를 연황색 고체로 수득하였다.
단계 3: 삼차-부틸 2-(2-(토실옥시)에톡시)아세테이트 제조
250 mL 둥근바닥 플라스크에, 디클로로메탄(50 mL) 중 삼차-부틸 2-(2-하이드록시에톡시)아세테이트 (4.5 g, 25.54 mmol, 1.00당량) 트리에틸아민 (5.2 g, 51.39 mmol, 2.01당량), 4-메틸벤젠-1-설포닐클로라이드 (5.8 g, 30.42 mmol, 1.20당량)의 용액을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 8시간 동안 교반하였다. 이어서 반응물을 물(100 mL)의 첨가로 급냉시켰다. 생성된 용액을 디클로로메탄(30 mL x 3)으로 추출하고, 유기층을 합쳤다. 생성된 혼합물을 염수(20 mL x 1)로 세척하였다. 혼합물을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:3)로 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 6.1 g(72%)의 삼차-부틸 2-(2-[[(4-메틸벤젠)설포닐]옥시]에톡시)아세테이트를 무색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 275.06 [M-55] +.
단계 4: 삼차-부틸 2-(2-(4-(4-브로모페닐)피페라진-1-일)에톡시)아세테이트 제조
500 mL 둥근바닥 플라스크에, 1-(4-브로모페닐)피페라진 염화수소 (10.0 g, 36.02 mmol, 1.00당량), 삼차-부틸 2-2-[(4-메틸벤젠설포닐)옥시]에톡시아세테이트 (14.2 g, 42.98 mmol, 1.20당량), 아세토니트릴 (200 mL), 요오드화 칼륨 (6.0 g, 1.00당량) 및 탄산 칼륨(14.9 g, 107.81 mmol, 3.00당량)을 넣었다. 생성된 용액을 오일조에서 70 ℃에서 10시간 동안 교반하였다. 고체를 걸러냈다. 여액을 감압하에 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(v:v = 1:1)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 9.6 g(67%)의 삼차-부틸 2-[2-[4-(4-브로모페닐)피페라진-1-일]에톡시]아세테이트를 연갈색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 399.10 [M+1] +.
단계 5: 삼차-부틸 2-(2-(4-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)피페라진-1-일)에톡시)아세테이트 제조
질소로 퍼지하고 질소의 불활성 분위기로 유지된 500 mL 둥근바닥 플라스크에, 삼차-부틸 2-[2-[4-(4-브로모페닐)피페라진-1-일]에톡시]아세테이트 (9.6 g, 24.04 mmol, 1당량), 4,4,5,5-테트라메틸-2-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-1,3,2-디옥사보로란 (12.2 g, 48.08 mmol, 2당량), 아세트산 칼륨(7.1 g, 72.12 mmol, 3당량), Pd(dppf)Cl2 .CH2Cl2 (3.9 g, 4.81 mmol, 0.2당량) 및 100 mL 디옥산을 넣었다. 생성된 용액을 오일조에서 질소 분위기 하에 85℃에서 5시간 동안 교반하였다. 물(100 mL)로 반응 혼합물을 급냉시키고 디클로로메탄(100 mL x 3)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(100 mL)과 물(100 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(v:v = 1:1)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 8.2 g (76.41%)의 삼차-부틸 2-(2-[4-[4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐]피페라진-1-일]에톡시)아세테이트를 연갈색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 447.30 [M+1] +.
단계 6: 삼차-부틸 (R)-2-(2-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-((3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)에톡시)아세테이트 제조
질소의 불활성 대기로 퍼지되고 유지된 100-mL 둥근 바닥 플라스크에, (3R)-N-(3-[5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐]-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드 (5.8 g, 11.52 mmol, 1당량), 삼차-부틸 2-(2-[4-[4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐]피페라진-1-일]에톡시)아세테이트 (6.2 g, 13.83 mmol, 1.2당량), 탄산나트륨(3.7 g, 34.57 mmol, 3당량), Pd(dppf)Cl2 .CH2Cl2 (1.9 g, 2.30 mmol, 0.2당량), 디옥산 (50 mL) 및 물(5 mL)을 넣었다. 생성된 용액을 오일조에서 105 ℃에서 2시간 동안 교반하였다. 생성된 용액을 디클로로메탄(100 mL)으로 희석하고 디클로로메탄(100 mL x 3)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(100 mL) 및 물(100 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(10:1)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 4.8 g (56.07%)의 삼차-부틸 2-[2-[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]에톡시]아세테이트를 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 743.15 [M+1] +.
단계 7: (R)-2-(2-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-((3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)에톡시)아세트산 제조
250 mL 둥근바닥 플라스크에, 삼차-부틸 2-[2-[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]에톡시]아세테이트 (4.8 g, 6.46 mmol, 1당량), 디클로로메탄 (50 mL, 786.50 mmol, 121.71당량) 및 TFA (10 mL)을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 3시간 동안 교반하였다. 생성된 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 이를 통해 3.8 g (85.64%)의 2-[2-[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]에톡시]아세트산을 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 687.35 [M+1] +.
단계 8: (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(2-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)에톡시)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
100 mL의 둥근 바닥 플라스크에, 2-[2-[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐) 피페라진-1-일]에톡시]아세트산 (1.1 g, 1.60 mmol, 1당량), N,N-디메틸포름아미드 (20 mL), (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐] 메틸]피롤리딘-2-카르복사미드 염화수소 (748.1 mg, 1.60 mmol, 1당량), N,N-디이소프로필에틸아민 (621.1 mg, 4.81 mmol, 3당량) 및 T3P (에틸 아세테이트 중 1.526 g, 50% 용액, 2.40 mmol, 1.5당량)을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 물(50 mL)로 반응 혼합물을 급냉시키고 디클로로메탄(50 mL x 3)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(50 mL) 및 물(50 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(v:v = 10:1)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 256.3 mg(14.56%)의 (2S,4R)-1-[(2S)-2-(2-[2-[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]에톡시]아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 1099.60 [M+1] +; 1H-NMR (300MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.94 (s, 1H), 9.81 (s, 1H), 8.96 (s, 1H), 8.74-8.60 (m, 2H), 8.60-8.49 (m, 1H), 8.08 (s, 1H), 7.72-7.53 (m, 3H), 7.51-7.33 (m, 5H), 7.32-7.22 (m, 1H), 7.04 (d, J = 8.5 Hz, 2H), 5.48-5.11 (m, 2H), 4.71-4.08 (m, 6H), 4.08-3.89 (m, 2H), 3.77-3.48 (m, 4H), 3.30-3.11 (m, 6H), 2.72-2.58 (m, 6H), 2.42 (s, 3H), 2.26-1.84 (m, 5H), 0.97 (s, 9H).
단계 9: 삼차-부틸 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헨헵타콘탄-71-오에이트 제조
THF(10 mL) 중 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사헵타헥사콘탄-67-올 (1.00 g, 1.00 mmol, 1당량)의 용액에 Na (5.8 mg, 0.25 mmol, 0.253당량) 및 삼차-부틸 프로프-2-에노에이트(640.9 mg, 5.00 mmol, 5.006당량)를 첨가하였다. 반응 혼합물을 실온에서 26시간 동안 교반하였다. 이어서 반응물을 물(30 mL)의 첨가로 급냉시켰다. 진공 하에 THF를 제거하였다. 잔류물을 에틸 아세테이트(80 mL x 4)로 추출하였다. 합쳐진 유기상을 염수(30 mL x 1)로 세척하였다. 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(15:1)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 453.3 mg(40.19%)의 삼차-부틸 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헨헵타콘탄-71-오에이트를 연갈색 반고체로서 수득하였다.
단계 10: 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헨헵타콘탄-71-오익산 제조
1,2-디클로로에탄 (4 mL) 중 삼차-부틸 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헨헵타콘탄-71-오에이트 (400 mg, 0.35 mmol, 1당량)의 용액에 트리플루오로아세트산(1.2 mL)을 첨가하였다. 반응 용액을 실온에서 4시간 동안 교반하였다. 생성된 용액을 증발 건조시킨 다음, 1,2-디클로로에탄을 첨가하고 여러 번 증발 건조시켜 트리플루오로아세트산을 제거하였다. 이를 통해 380 mg(99.97%)의 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헨헵타콘탄-71-오익산을 연황색 오일로서 수득하였다.
단계 11: (3R,5S)-1-((S)-2-(2-(2-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)에톡시)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-5-((4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)카바모일)피롤리딘-3-일 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헨헵타콘탄-71-오에이트 제조
100-mL 둥근 바닥 플라스크에, (2S,4R)-1-[(2S)-2-(2-[2-[4-(4-[3-[(2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-설포닐]아미노]페닐)카르보닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]에톡시]아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (330 mg, 0.30 mmol, 1당량), DCM (25 mL)을 넣었다. 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헨헵타콘탄-71-오익산 (2.42 g, 2.25 mmol, 7.511당량), DMAP (550 mg, 4.50 mmol, 14.996당량) 및 EDCI (863 mg, 4.50 mmol, 14.996당량)을 5회분으로 3시간 만에 첨가하였다. 생성된 용액을 실온에서 48시간 동안 교반하였다. 생성된 용액을 농축시키고, 잔류물을 포화 NH4Cl (200 mL)로 희석시켰다. 생성된 혼합물을 에틸 아세테이트(180 mL x 2)로 추출하고, 유기층을 합쳤다. 합쳐진 유기층을 포화 NH4Cl (200 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 중에서 농축시켰다. 미정제 생성물을 분취-HPLC로 정제하였다. 이를 통해 162.0 mg(25.05%)의 (3R,5S)-1-((S)-2-(2-(2-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)에톡시)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-5-((4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)카바모일)피롤리딘-3-일 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헨헵타콘탄-71-오에이트를 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 2154.45 [M+1] +; 1H-NMR (300MHz, CDCl3) δ 11.70 (s, 1H), 8.83 (s, 1H), 8.66 (s, 1H), 8.57 (s, 1H), 7.76-7.68 (m, 2H), 7.53 (d, J = 8.4 Hz, 2H), 7.41-7.32 (m, 5H), 7.23-7.20 (m, 1H), 7.06-6.96 (m, 3H), 5.42 (s , 1H), 5.23 (d, J=51.0 Hz, 1H), 4.74-4.69 (m, 1H), 4.58-4.51 (m, 2H), 4.37-4.31 (m, 1H), 4.08-3.94 (m, 3H), 3.87-3.73 (m, 2H), 3.70-3.61 (m, 93H), 3.57-3.48 (m, 2H), 3.37 (s, 3H), 3.29 (m, 4H), 2.73-2.53 (m, 9H), 2.49 (s, 3H), 2.27-2.11 (m, 4H), 0.95 (s, 9H).
(3R,5S)-1-((S)-2-(2-(2-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)에톡시)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-5-((4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)카바모일)피롤리딘-3-일 69-메틸-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헨헵타콘탄-71-오에이트 (예시적 화합물 801)의 예시적인 합성
단계 1: 삼차-부틸 69-메틸-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헨헵타콘탄-71-오에이트 제조
THF(200 mL) 중 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사헵타헥사콘탄-67-올 (20 g, 19.98 mmol, 1당량)의 용액에 Na (236.6 mg, 10.29 mmol, 0.515당량)을 첨가하였다. 그런 다음, 삼차-부틸 부트-3-에노에이트(65 mL, 400.89 mmol, 20.069당량)를 첨가하였다. 생성된 용액을 실온에서 14시간 동안 교반하였다. 이어서 반응물을 물(20 mL)의 첨가로 급냉시켰다. 진공 하에 THF를 제거하였다. 잔류물을 에틸 아세테이트(80 mL x 4)로 추출하였다. 유기층을 염수(20 mL x 4)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시켰다. 미정제물을 디클로로메탄/메탄올(15:1)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 14.64 g(64.10%)의 삼차-부틸 69-메틸-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헨헵타콘탄-71-오에이트를 백색 반고체로서 수득하였다. 1H-NMR (300MHz, CDCl3) δ 3.90-3.84 (m, 1H), 3.80-3.53 (m, 90H), 3.38 (m, 3H), 2.56-2.48 (m, 1H), 2.33-2.24 (m, 2H), 1.45 (s, 9H), 1.21-1.19 (m, 3H).
단계 2: 69-메틸-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헨헵타콘탄-71-오익산 제조
DCE(100 mL) 중 삼차-부틸 69-메틸-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헨헵타콘탄-71-오에이트 (10 g, 8.75 mmol, 1당량)의 용액에 TFA(30 mL, 403.89 mmol, 46.181당량)를 첨가하였다. 생성된 용액을 실온에서 5시간 동안 교반하였다. 그런 다음, 생성된 혼합물을 증발 건조시켰다. DCE를 첨가하고 용액을 증발 건조시켰다. 이 과정을 3회 반복한 다음 진공 하에 건조시켜 연갈색 오일을 수득하였다. 이를 통해 9.6 g (100%)의 69-메틸-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헨헵타콘탄-71-오익산을 연갈색 오일로서 수득하였다.
단계 3: (3R,5S)-1-((S)-2-(2-(2-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)에톡시)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-5-((4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)카바모일)피롤리딘-3-일 69-메틸-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헨헵타콘탄-71-오에이트 제조
100-mL 둥근 바닥 플라스크에, (2S,4R)-1-[(2S)-2-(2-[2-[4-(4-[3-[(2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-설포닐]아미노]페닐)카르보닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]에톡시]아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (330 mg, 0.30 mmol, 1당량), 디클로로메탄 (25 mL)을 넣었다. 69-메틸-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헨헵타콘탄-71-오익산 (2.45 g, 2.25 mmol, 7.506당량), DMAP (550 mg, 4.50 mmol, 14.996당량) 및 EDCI (863 mg, 4.50 mmol, 14.996당량)을 5회분으로 3시간 만에 첨가하였다. 생성된 용액을 실온에서 48시간 동안 교반하였다. 생성된 용액을 농축시키고, 잔류물을 포화 NH4Cl (200 mL)로 희석시켰다. 생성된 혼합물을 에틸 아세테이트(200 mL x 2)로 추출하고, 유기층을 합쳤다. 유기물을 포화 NH4Cl (200 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 중에서 농축시켰다. 미정제 생성물을 분취-HPLC로 정제하였다. 이를 통해 189.9 mg (29.17%)의 (3R,5S)-1-((S)-2-(2-(2-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)에톡시)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-5-((4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)카바모일)피롤리딘-3-일 69-메틸-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헨헵타콘탄-71-오에이트를 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 2168.46 [M+1] +; 1H-NMR (300MHz, CDCl3) δ 11.67 (s, 1H), 8.82 (s, 1H), 8.66 (s, 1H), 8.58 (s, 1H), 7.75-7.67 (m, 2H), 7.54 (d, J = 8.7 Hz, 2H), 7.40-7.29 (m, 5H), 7.25-7.23 (m, 1H), 7.05-6.96 (m, 3H), 5.40 (s , 1H), 5.21 (d, J = 52.2 Hz, 1H), 4.70 (m, 1H), 4.59-4.50 (m, 2H), 4.37-4.30 (m, 1H), 4.07-3.98 (m, 3H), 3.93-3.81 (m, 3H), 3.70-3.42 (m, 92H), 3.37 (s, 3H), 3.27 (m, 4H), 2.73 (m, 6H), 2.62-2.50 (m, 2H), 2.48 (s, 3H), 2.42-2.35 (m, 1H), 2.26-2.09 (m, 4H), 1.98-1.93 (m, 1H), 1.19 (d, J = 6.3 Hz, 3H), 0.96 (s, 9H).
(3R,5S)-1-((S)-2-(2-(3-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)아제티딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-5-((4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)카바모일)피롤리딘-3-일 69-메틸-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헵타콘탄-70-오에이트 (예시적 화합물 802)의 예시적인 합성
단계 1: 삼차-부틸 69-메틸-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헵타콘탄-70-오에이트 제조
질소 불활성 분위기로 퍼지되고 유지된 100 mL 둥근 바닥 플라스크에, PEG1000 (10 g, 10.00 mmol, 1.00당량), 테트라하이드로푸란 (100 mL)을 넣었다. 이어서 1시간 교반 후에, 수소화나트륨(1.6 g, 66.67 mmol, 4.00당량)을 여러 회분으로 나누어서 0℃에서 첨가했으며, 여기에 2-브로모프로파노에이트 (4.16 g, 19.90 mmol, 2.00당량)을 교반하면서 첨가했다. 생성된 용액을 실온에서 밤새 교반하였다. 이어서 반응물을 물/얼음(100 mL)의 첨가로 급냉시켰다. 생성된 용액을 에틸 아세테이트(200 mL x 2)로 추출하고, 유기층을 합쳤다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(10/1)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 4.63 g의 삼차-부틸 69-메틸-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헵타콘탄-70-오에이트를 무색 오일로서 수득하였다
단계 2: 69-메틸-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헵타콘탄-70-오익산 제조
250-mL 둥근바닥 플라스크에, 삼차-부틸 2-(2-메톡시에톡시)프로파노에이트 (4.63 g, 4.10 mmol, 1.00당량), 디옥산 (50 mL), 염화수소 (4M) (20 mL)를 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 16시간 동안 교반하였다. 생성된 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 이를 통해 4.0 g (91%)의 69-메틸-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헵타콘탄-70-오익산을 연황색 오일로서 수득하였다.
단계 3: (3R,5S)-1-((S)-2-(2-(3-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)아제티딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-5-((4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)카바모일)피롤리딘-3-일 69-메틸-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헵타콘탄-70-오에이트 제조
100-mL 둥근바닥 플라스크에, (2S,4R)-1-[(2S)-2-(2-[3-[4-(4-[3-[(2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-설포닐]아미노]페닐)카르보닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]아제티딘-1-일]아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (300.0 mg, 0.27 mmol, 1.00당량), 디클로로메탄 (10 mL), 4-디메틸아미노피리딘 (165 mg, 1.35 mmol, 5.00당량), 2-(2-메톡시에톡시)프로판오익산 (581.0 mg, 0.54 mmol, 2.00당량)을 넣고, 10분 교반 후에, EDCI (259.0 mg, 1.35 mmol, 5.00당량)를 첨가하였다. 생성된 용액을 실온에서 16시간 동안 교반하였다. 그런 다음, DMAP를 16시간 동안 추가로 교반하였다. 생성된 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 생성된 용액을 에틸 아세테이트(150 mL x 2)로 추출하고 유기층을 합쳤다. 생성된 혼합물을 염수(50 mL x 2)로 세척하였다. 미정제 생성물을 분취-HPLC로 정제하였다. 이를 통해, 122.8 mg(37%)의 (3R,5S)-1-((S)-2-(2-(3-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)아제티딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-5-((4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)카바모일)피롤리딘-3-일 69-메틸-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헵타콘탄-70-오에이트를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 2165.45 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, CD3OD) δ 8.86 (s, 1H), 8.67 (s, 1H), 8.59 (d, J = 2.0Hz, 1H), 7.89 (s, 1H), 7.75-7.74 (m, 1H), 7.59 (d, J = 8.8Hz, 2H), 7.46-7.43 (m, 4H), 7.10-7.08 (m, 3H), 5.35-5.15 (m, 2H), 4.56-4.54 (m, 3H), 4.38-4.34 (m, 1H), 4.23-4.13 (m, 2H), 3.90-3.80 (m, 2H) , 3.63-3.44 (m, 89H), 3.34-3.31 (m, 6H), 3.29-3.16 (m, 11H), 2.56 (s, 4H), 2.48 (s, 3H), 2.30-2.25 (m, 1H), 2.20-2.10 (m, 2H), 1.36-1.34 (m, 3H), 1.05 (s, 9H).
(3R,5S)-1-((S)-2-(2-(2-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)에톡시)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-5-((4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)카바모일)피롤리딘-3-일 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사도헵타콘탄-72-오에이트 (예시적 화합물 803)의 예시적인 합성
단계 1: 4-브로모부타노일 클로라이드 제조
250 mL 둥근바닥 플라스크에, 4-브로모부탄산 (10.0 g, 59.88 mmol, 1.00당량), 디클로로메탄 (100 mL), N,N-디메틸포름아미드 (0.15 mL)를 넣었다. 이어서, 이를 0 ℃에서 교반하며 티오닐 클로라이드 (8.5 mL)를 적가하였다. 생성된 용액을 실온에서 4시간 동안 교반하였다. 생성된 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 이를 통해 11.08 g (100%)의 4-브로모부타노일 클로라이드를 연황색 오일로서 수득하였다.
단계 2: (3-메틸옥세탄-3-일)메틸 4-브로모부타노에이트 제조
250-mL 둥근바닥 플라스크에, (3-메틸옥세탄-3-일)메탄올 (6.14 g, 60.12 mmol, 1.00당량), 디클로로메탄 (100 mL), 피리딘 (5.70 g, 72.06 mmol, 1.20당량)을 넣었다. 그 다음 디클로로메탄(100 mL) 중의 4-브로모부타노일 클로라이드 (11.08 g, 59.75 mmol, 0.99당량)의 용액을 0℃에서 교반하면서 적가하였다. 생성된 용액을 실온에서 16시간 동안 교반하였다. 생성된 용액을 디클로로메탄(50 mL x 2)으로 추출하고 유기층을 합쳤다. 생성된 혼합물을 염수(10 mL x 2)로 세척하였다. 혼합물을 무수 황산나트륨 상에서 건조시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1/3)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 11.4 g (72%)의 에틸 5-브로모-1-[(3-메틸옥세탄-3-일)메톡시]펜탄-2-온을 연황색 오일로서 수득하였다.
단계 3: 1-(3-브로모프로필)-4-메틸-2,6,7-트리옥사비시클로[2.2.2]옥탄 제조
디클로로메탄 (40 mL) 중 5-브로모-1-[(3-메틸옥세탄-3-일)메톡시]펜탄-2-온 (9.46 g, 35.68 mmol, 1당량)의 용액에 BF3 .Et2O (1.2 mL, 9.47 mmol, 0.265당량)를 0 ℃에서 첨가하였다. 이어서, 반응 혼합물을 0℃에서 4시간 동안 교반하였다. 이어서 5.7 mL의 Et3N을 첨가하여 반응물을 급냉시켰다. 생성된 혼합물을 실온에서 15분 동안 교반한 다음, 농축시켰다. 잔류물을 Et2O(100 mL)에 용해시키고, 여과하고 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/석유 에테르(1:2)로 염기성 Al2O3 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 4.68 g(52.2%)의 1-(3-브로모프로필)-4-메틸-2,6,7-트리옥사비시클로[2.2.2]옥탄을 무색 오일로서 수득하였다.1H-NMR (300MHz, CDCl3) δ 3.89 (s, 6H), 3.48-3.42 (m, 2H), 2.06-1.99 (m, 2H), 1.83-1.80 (m, 2H), 0.80 (s, 3H).
단계 4: 1-(2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헨헵타콘탄-71-일)-4-메틸-2,6,7-트리옥사비시클로[2.2.2]옥탄 제조
30-mL 밀봉 튜브에, 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사헵타헥사콘탄-67-올 (1.1967 g, 1.20 mmol, 1.500당량), 톨루엔 (2 mL), t-BuOH (1.3 mL), t-BuOK (143.6 mg, 1.28 mmol, 1.606당량), 1-(3-브로모프로필)-4-메틸-2,6,7-트리옥사비시클로[2.2.2]옥탄 (200.1 mg, 0.80 mmol, 1당량)을 넣었다. 생성된 혼합물을 N2 분위기 하에 두고 70℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 실온으로 냉각시켰다. 혼합물을 여과하고, 감압 하에 용매를 증류시켰다. 생성된 용액을 에틸 아세테이트(10 mL x 4)로 추출하고, 유기층을 합쳤다. 합쳐진 유기층을 염수(10 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시켰다. 생성된 혼합물을 농축 건조시키고 진공 하에서 건조시켰다. 이를 통해 657.5 mg(70.4%)의 4-메틸-1-(2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헨헵타콘탄-71-일)-2,6,7-트리옥사비시클로[2.2.2]옥탄을 연황색 반고체로서 수득하였다.
단계 5: 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사도헵타콘탄-72-오익산 제조
물(2 mL) 중 4-메틸-1-(2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헨헵타콘탄-71-일)-2,6,7-트리옥사비시클로[2.2.2]옥탄 (657.5 mg, 0.56 mmol, 1당량)의 용액에 pH = 1 될때까지 H3PO4 를 첨가하였다. 반응 용액을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 그런 다음, KOH를 첨가하여 pH = 12를 조정하였다. 생성된 용액을 실온에서 17시간 동안 교반하고, H3PO4를 다시 첨가하여 pH = 3을 조정하였다. 생성된 혼합물을 디클로로메탄(20 mL x 4)으로 추출하고, 유기층을 합치고 무수 황산나트륨 상에서 건조시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(10:1)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 555.4 mg(91.0%)의 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사도헵타콘탄-72-오익산을 연황색 반고체로서 수득하였다.
단계 6: (3R,5S)-1-((S)-2-(2-(2-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)에톡시)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-5-((4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)카바모일)피롤리딘-3-일 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사도헵타콘탄-72-오에이트 제조
디클로로메탄 (4 mL) 중 (2S,4R)-1-[(2S)-2-(2-[2-[4-(4-[3-[(2,6-디플루오로-3-[[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-설포닐]아미노]페닐)카르보닐]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]에톡시]아세트아미도)-3,3-디메틸부타노이 (50.3 mg, 0.05 mmol, 1당량)의 용액에 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사도헵타콘탄-72-오익산 (74.6 mg, 0.07 mmol, 1.4당량) 및 DMAP (17.0 mg, 0.14 mmol, 2.80당량)를 첨가하였다. 혼합물을 실온에서 10분 동안 교반하였다. 그런 다음, 여기에 EDCI(28.8 mg, 0.15 mmol, 3.0당량)를 첨가하였다. 반응 용액을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 추가로 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사도헵타콘탄-72-오익산 (225 mg, 0.21 mmol, 4.1당량), DMAP (55.1 mg, 0.45 mmol, 9.0당량) 및 EDCI (87 mg, 0.45 mmol, 9.1당량)를 3회분으로 나누고 상기 과정을 또다른 3회 반복하였다. 그런 다음, 여기에 DMAP(58.6 mg, 0.48 mmol, 9.6당량)를 첨가하였다. 반응 용액을 또다른 2시간 동안 교반하였다. 진공 하에 디클로로메탄을 제거하였다. 잔류물을 에틸 아세테이트(30 mL x 3)로 추출하였다. 생성된 혼합물을 포화 NH4Cl (10 mL x 2)로 세척하였다. 혼합물을 무수 황산나트륨 상에서 건조시켰다. 미정제 생성물을 분취-HPLC로 정제하였다. 이를 통해 16.6 mg(16.7%)의 (3R,5S)-1-((S)-2-(2-(2-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)에톡시)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-5-((4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)카바모일)피롤리딘-3-일 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사도헵타콘탄-72-오에이트를 연황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 2168.45 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 0.95 (s, 9H), 1.85-1.89 (m, 2H), 1.92-2.01 (m, 1H), 2.03-2.28 (m, 3H), 2.36-2.38 (m, 2H), 2.48 (s, 4H), 2.66-2.71 (m, 8H), 3.21-3.28 (m, 4H), 3.37 (s, 3H), 3.44-3.49 (m, 4H), 3.53-3.72 (m, 91H), 3.81-3.88 (m, 1H), 3.94-4.12 (m, 3H), 4.25-4.38 (m, 1H), 4.47-4.58 (m, 2H), 4.65-4.73 (m, 1H), 5.08-5.35 (m, 1H), 5.39 (s, 1H), 6.96-7.06 (m, 3H), 7.19-7.24 (m, 1H), 7.32-7.39 (m, 5H), 7.52-7.55 (m, 2H), 7.65-7.79 (m, 2H), 8.57-8.58 (m, 1H), 8.66 (s, 1H), 8.81 (s, 1H).
(3R,5S)-1-((S)-2-(2-(4-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-5-(((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)카바모일)피롤리딘-3-일 69-옥소-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사-68-아자도헵타콘탄-72-오에이트 (예시적 화합물 828)의 예시적인 합성
단계 1: 삼차-부틸 4-(4-(4-브로모페닐)피페라진-1-일)피페리딘-1-카르복실레이트 제조
250 mL 둥근 바닥 플라스크에, 디클로로메탄 (10 mL), 삼차-부틸 4-옥소피페리딘-1-카르복실레이트 (4.9 g, 24.9 mmol, 1.4당량), 아세틸 에탄페록소에이트; 소디오보라닐 아세테이트(13.2 g, 62.3 mmol, 3.5당량) 중 1-(4-브로모페닐)피페라진 염화수소 (5.0 g, 18.0 mmol, 1.0당량)의 용액을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 밤새 교반하였다. 이어서 1 mL의 물/얼음을 첨가하여 반응물을 급냉시켰다. 생성된 용액을 디클로로메탄(20 mL x 2)으로 추출하고, 유기층을 합치고 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:0)로 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 4.2 g(54%)의 삼차-부틸 4-[4-(4-브로모페닐) 피페라진-1-일] 피페리딘-1-카르복실레이트를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 426.10 [M+1] +.
단계 2: 1-(4-브로모페닐)-4-(피페리딘-4-일)피페라진 염화수소 제조
100 mL 둥근 바닥 플라스크에, 디클로로메탄(10 mL), 염화수소(5 mL) 중 삼차-부틸 4-[4-(4-브로모페닐)피페라진-1-일]피페리딘-1-카르복실레이트 (4.2 g, 9.8 mmol, 1.0당량)의 용액을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 생성된 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 이를 통해 3.0 g(85%)의 1-(4-브로모페닐)-4-(피페리딘-4-일)피페라진 염화수소를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 325.95 [M+1] +.
단계 3: 삼차-부틸 2-(4-(4-(4-브로모페닐)피페라진-1-일)피페리딘-1-일)아세테이트 제조
100 mL 둥근 바닥 플라스크에, 디클로로메탄(10 mL), 트리에틸아민(2.0 g, 19.8 mmol, 2.4당량), 삼차-부틸 2-브로모아세테이트(2.3 g, 11.8 mmol, 1.4당량) 중 1-(4-브로모페닐)-4-(피페리딘-4-일)피페라진 염화수소 (3.0 g, 8.3 mmol, 1.0당량)의 용액을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 밤새 교반하였다. 이어서 1 mL의 물/얼음을 첨가하여 반응물을 급냉시켰다. 생성된 용액을 디클로로메탄(20 mL x2)으로 추출하고, 유기층을 합치고 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:0)로 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 2.0 g(53%)의 삼차-부틸 2-[4-[4-(4-브로모페닐) 피페라진-1-일] 피페리딘-1-일] 아세테이트를 백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 440.30 [M+1] +.
단계 4: 삼차-부틸 2-(4-(4-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐)피페라진-1-일)피페리딘-1-일)아세테이트 제조
20-30 mL 밀봉 튜브에, 디옥산 (10 mL), 4,4,5,5-테트라메틸-2-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)-1,3,2-디옥사보로란 (2.3 g, 9.1 mmol, 2.0당량), KOAc (874.6 mg, 8.9 mmol, 2.0당량), Pd(dppf)Cl2 (700.6 mg, 0.9 mmol, 0.2당량) 중 삼차-부틸 2-[4-[4-(4-브로모페닐)피페라진-1-일]피페리딘-1-일]아세테이트 (2.0 g, 4.5 mmol, 1.0당량)의 용액을 넣었다. 생성된 용액을 오일조에서 85℃에서 밤새 교반하였다. 이어서 1 mL의 물/얼음을 첨가하여 반응물을 급냉시켰다. 생성된 용액을 에틸 아세테이트(20 mL x 2)로 추출하고, 유기층을 합치고 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:0)로 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 630.0 mg(29%)의 삼차-부틸 2-(4-[4-[4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일) 페닐] 피페라진-1-일] 피페리딘-1-일) 아세테이트를 흑색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 486.25 [M+1] +.
단계 5: 삼차-부틸 (R)-2-(4-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-((3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)피페리딘-1-일)아세테이트 제조
20-30 mL의 밀봉된 튜브에, 디옥산/H2O (4:1 mL), (3R)-N-(3-5-브로모-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카르보닐-2,4-디플루오로페닐)-3-플루오로피롤리딘-1-설폰아미드(300.0 mg, 0.6 mmol, 0.5당량), Pd(dppf)Cl2 (46.9 mg), 탄산나트륨(99.2 mg, 0.9 mmol, 0.7당량) 중 삼차-부틸 2-(4-[4-[4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보로란-2-일)페닐]피페라진-1-일]피페리딘-1-일)아세테이트(630.0 mg, 1.3 mmol, 1.0당량) 용액을 넣었다. 생성된 용액을 105℃에서 2시간 동안 교반하였다. 이어서 1 mL의 물/얼음을 첨가하여 반응물을 급냉시켰다. 생성된 용액을 에틸 아세테이트(20 mL x 2)로 추출하고, 유기층을 합치고 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(10:1)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 256.0 mg (25%)의 삼차-부틸 2-[4-[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]피페리딘-1-일]아세테이트를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 782.05 [M+1] +.
단계 6: (R)-2-(4-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-((3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)피페리딘-1-일)아세트산 제조
100 mL 둥근바닥 플라스크에, 디클로로메탄 (10 mL), 트리플루오로아세트산 (2 mL) 중 삼차-부틸 2-[4-[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]피페리딘-1-일]아세테이트 (256.0 mg, 0.3 mmol, 1.0당량)을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 밤새 교반하였다. 생성된 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 이를 통해 120.0 mg(50%)의 2-[4-[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]피페리딘-1-일]아세트산을 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 726.15 [M+1] +.
단계 7: (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
100 mL 둥근바닥 플라스크에, N,N-디메틸포름아미드 (5 mL), (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (88.2 mg, 0.4 mmol, 1.2당량), N,N-디이소프로필에틸아민 (64.1 mg, 1.0 mmol, 3.0당량), (벤조트리아졸-1-일옥시) 트리스(디메틸아미노) 포스포늄 헥사플루오로포스페이트(87.8 mg) 중 2-[4-[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]피페리딘-1-일]아세트산 (120.0 mg, 0.3 mmol, 1.0당량) 용액을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 이어서 1 mL의 물/얼음을 첨가하여 반응물을 급냉시켰다. 생성된 용액을 에틸 아세테이트(20 mL x 2)로 추출하고, 유기층을 합치고 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 중에서 농축시켰다. 미정제 생성물을 분취-HPLC에 의해 정제하여 42.9 mg(23%)의 (2S,4R)-1-[(2S)-2-(2-[4-[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]피페리딘-1-일]아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드를 회백색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 1152.20 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.87 (brs, 1H), 9.96 (brs, 1H), 8.96 (d, J = 2.1 Hz, 1H), 8.63 (d, J = 2.3 Hz, 1H), 8.51 (s, 1H), 8.40 (d, J = 7.6 Hz, 1H), 8.04 (s, 1H), 7.74 (d, J = 9.6 Hz, 1H), 7.70-7.60 (m, 3H), 7.47-7.42 (m, 2H), 7.40-7.31 (m, 2H), 7.23 (t, J = 8.9 Hz, 1H), 7.05 (d, J = 8.5 Hz, 2H), 5.36-5.15 (m, 1H), 5.19 (s, 1H), 4.88 (t, J = 7.1 Hz, 1H), 4.54-4.38 (m, 2H), 4.27-4.21 (m, 1H), 3.60-3.52 (m, 2H), 3.47-3.41 (m, 1H), 3.37-3.31 (m, 2H), 3.30-3.24 (m, 5H),3.03 (d, J = 16.1 Hz, 1H), 2.89-2.80 (m, 3H), 2.70-2.55 (m, 5H), 2.34-2.03 (m, 7H), 1.87-1.72 (m,3H), 1.47-1.37 (m, 6H), 0.93 (s, 9H).
단계 8: 4-(((3R,5S)-1-((S)-2-(2-(4-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-5-(((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)카바모일)피롤리딘-3-일)옥시)-4-옥소부탄산 제조
질소 불활성 분위기로 퍼지되고 유지된 50-mL 둥근바닥 플라스크에, 디클로로메탄 (20 mL) 중 (2S,4R)-1-[(2S)-2-(2-[4-[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]피페리딘-1-일]아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시-N-[(1S)-1-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (467 mg, 0.405 mmol, 1당량), Et3N (123.02 mg, 1.216 mmol, 3당량), DMAP (148.53 mg, 1.216 mmol, 3당량), 옥소란-2,5-디온 (202.77 mg, 2.026 mmol, 5당량)를 넣었다. 생성된 용액을 오일조에서 25 ℃에서 16시간 동안 교반하였다. 이어서 반응물을 물/얼음(10 mL)을 첨가하여 급냉시켰다. 생성된 혼합물을 디클로로메탄(40 mL x 3)으로 추출하고, 유기층을 합치고, 포화 NH4Cl 용액(40 mL)으로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 중에서 농축시켰다. 이를 통해 353 mg(69.55%)의 4-[[(3R,5S)-1-[(2S)-2-(2-[4-[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]피페리딘-1-일]아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일]-5-[[(1S)-1-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에틸]카바모일]피롤리딘-3-일]옥시]-4-옥소부탄산을 황색 고체로서 수득하였다.
단계 9: 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사헵타헥사콘탄-67-일 4-메틸벤젠설포네이트 제조
250-mL 둥근바닥 플라스크에, PEG1000-OMe (5.0 g, 5.00 mmol, 1.00당량), TsCl (1.9 g, 9.97 mmol, 2.00당량), 트리에틸아민 (1.01 g, 9.98 mmol, 2.00당량), 4-디메틸아미노피리딘 (61.0 mg, 0.50 mmol, 0.10당량)을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 5시간 동안 교반하였다. 생성된 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(15/1)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 7.47 g의 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사헵타헥사콘탄-67-일 4-메틸벤젠설포네이트를 연황색 고체로서 수득하였다.
단계 10: 삼차-부틸 (삼차-부톡시카르보닐)(2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사헵타헥사콘탄-67-일)카바메이트 제조
250-mL 둥근 바닥 플라스크에, 2-메톡시에틸 4-메틸벤젠-1-설포네이트 (7.47 g, 6.47 mmol, 1.00당량), 아세토니트릴 (150 mL), 삼차-부틸 N-[(삼차-부톡시)카르보닐]카바메이트 (1.40 g, 6.44 mmol, 1.00당량), Cs2CO3 (4.20 g, 12.89 mmol, 2.00당량)을 넣었다. 생성된 용액을 오일조에서 50℃에서 밤새 교반하였다. 고체를 걸러냈다. 생성된 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(10/1)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 6.6 g(371%)의 삼차-부틸 (삼차-부톡시카르보닐)(2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사헵타헥사콘탄-67-일)카바메이트를 연황색 고체로서 수득하였다
단계 11: 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사헵타헥사콘탄-67-아민 제조
250-mL 둥근 바닥 플라스크에, 삼차-부틸 N-[(삼차-부톡시)카르보닐]-N-(2-메톡시에틸)카바메이트 (6.6 g, 5.50 mmol, 1.00당량), 디옥산 (60.0 mL), 염화수소 (4M) (60 mL)를 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 16시간 동안 교반하였다. 생성된 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 이를 통해 5.5 g의 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사헵타헥사콘탄-67-아민 염화수소를 연황색 고체로서 수득하였다
단계 12: (3R,5S)-1-((S)-2-(2-(4-(4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-5-(((S)-1-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸)카바모일)피롤리딘-3-일 69-옥소-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사-68-아자도헵타콘탄-72-오에이트 제조
50-mL 둥근 바닥 플라스크에, DMF (25 mL) 중 4-[[(3R,5S)-1-[(2S)-2-(2-[4-[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]피페리딘-1-일]아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일]-5-[[(1S)-1-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에틸]카바모일]피롤리딘-3-일]옥시]-4-옥소부탄산 (333 mg, 0.266 mmol, 1당량)을 넣고, 여기에 DIPEA (137.45 mg, 1.064 mmol, 4당량), 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사헵타헥사콘탄-67-아민 (531.88 mg, 0.532 mmol, 2.00당량), BOP (176.39 mg, 0.399 mmol, 1.5당량)를 첨가하였다. 생성된 용액을 오일조에서 25 ℃에서 3시간 동안 교반하였다. 이어서 반응물을 물/얼음(30 mL)을 첨가하여 급냉시켰다. 생성된 혼합물을 에틸 아세테이트(40 mL x 3)로 추출하고, 유기층을 합치고, 염수(40 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 농축시켰다. 미정제 생성물을 분취-HPLC로 정제하였다. 이를 통해, 207 mg(34.84%)의 (3R,5S)-1-[(2S)-2-(2-[4-[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]피페리딘-1-일]아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일]-5-[[(1S)-1-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에틸]카바모일]피롤리딘-3-일 3-[(2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사헵타헥사콘탄-67-일)카바모일]프로파노에이트를 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 2234.68 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 9.01 (s, 1H), 8.75 (s, 1H), 8.65 (s, 1H), 7.95 (s, 1H), 7.78-7.70 (m, 3H), 7.50-7.44 (m, 4H), 7.24-7.17 (m, 3H), 5.32 (s, 2H), 5.19 (s, 1H), 5.06-5.04 (m, 1H), 4.89 (s, 1H), 4.60-4.58 (m, 1H), 4.41-4.32 (m, 2H), 4.30 (s, 5H), 4.14-4.10 (m, 91H), 3.83-3.81 (m, 7H), 3.64-3.63 (m, 5H), 3.56-3.33 (m, 4H), 2.76 (s, 1H), 2.67-2.42 (m, 4H), 2.37-2.34 (m, 4H), 2.21 (m, 3H), 2.16-2.13 (m, 3H), 1.55-1.53(m, 3H), 1.11-1.08 (m, 9H).
(3R,5S)-1-((S)-2-(2-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-5-((4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)카바모일)피롤리딘-3-일 68-메틸-69-옥소-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사-68-아자도헵타콘탄-72-오에이트 (예시적 화합물 816)의 예시적인 합성
단계 1: (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드 제조
100-mL 둥근바닥 플라스크에, DMF (15 mL) 중 2-(4-[[1-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페리딘-4-일]메틸]피페라진-1-일)아세트산 (500.0 mg, 0.67 mmol, 1당량), (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (290.0 mg, 0.67 mmol, 1.00당량), DIEA (345.0 mg, 2.68 mmol, 4.0당량), BOP (450.0 mg, 1.01 mmol, 1.51당량)를 넣었다. 반응물을 실온에서 3시간 동안 교반한 다음 물(50 mL)의 첨가로 급냉시켰다. 생성된 혼합물을 에틸 아세테이트(50 mL x 2)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 감압 하에 농축시켰다. 미정제 생성물을 분취-HPLC로 정제하였다. 이를 통해 193 mg의 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[2-(4-[[1-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페리딘-4-일]메틸]피페라진-1-일)아세트아미도]-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드를 회백색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 1152.45 [M+1] +; 1H-NMR (300MHz, CD3OD) δ 12.90 (brs, 1H), 9.85 (brs, 1H), 8.98 (s, 1H), 8.67-8.60 (m, 2H), 8.60-8.48 (m, 1H), 8.07 (s, 1H), 7.85-7.76 (m, 1H), 7.68-7.56 (m, 3H), 7.50-7.38 (m, 4H), 7.30-7.22 (m, 1H), 7.12-7.00 (m, 2H), 5.40-5.20 (m, 1H), 5.14 (s, 1H), 4.57-4.47 (m, 1H), 4.47-4.32 (m, 3H), 4.31-4.22 (m, 1H), 3.83-3.70 (m, 2H), 3.70-3.57 (m, 2H), 3.52-3.45 (m, 1H), 3.44-3.35 (m, 2H), 3.31-3.23 (m, 1H), 3.14-2.87 (m, 2H), 2.87-2.67 (m, 2H), 2.63-2.52 (m, 4H), 2.49-2.38 (m, 7H), 2.23-2.14 (m, 2H), 2.14-1.89 (m, 4H), 1.83-1.62 (m, 3H), 1.87-1.12 (m, 2H), 1.00-0.92 (m, 9H).
단계 2: 4-(((3R,5S)-1-((S)-2-(2-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-5-((4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)카바모일)피롤리딘-3-일)옥시)-4-옥소부탄산 제조
30-mL 밀봉된 튜브에, (2S,4R)-1-[(2S)-2-[2-(4-[[1-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페리딘-4-일]메틸]피페라진-1-일)아세트아미도]-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (576.2 mg, 0.50 mmol, 1당량), Et3N (0.14 mL, 1.01 mmol, 2.01당량), DMAP (183.3 mg, 1.50 mmol, 3.00당량), 디클로로메탄 (16 mL), 테트라하이드로푸란 (4 mL)를 넣었다. 혼합물을 실온에서 10분 동안 교반하고 이어서 옥소란-2,5-디온 (250.3 mg, 2.50 mmol, 5.00당량)을 첨가하였다. 생성된 혼합물을 오일조에서 35℃에서 추가로 16시간 동안, 교반하면서, 반응시켰다. 생성된 혼합물을 디클로로메탄(300 mL)으로 희석하고 NH4Cl 포화 수용액 (200 ml x 2)로 세척하였다. 유기물을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 생성된 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 이를 통해 620 mg (99.00%)의 4-[[(3R,5S)-1-[(2S)-2-[2-(4-[[1-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페리딘-4-일]메틸]피페라진-1-일)아세트아미도]-3,3-디메틸부타노일]-5-([[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]카바모일)피롤리딘-3-일]옥시]-4-옥소부탄산을 진황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 1252.20 [M+1] +.
단계 3: 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사헵타헥사콘탄-67-일 4-메틸벤젠설포네이트 제조
250-mL 둥근 바닥 플라스크에, 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사헵타헥사콘탄-67-올 (5 g, 4.99 mmol, 1당량), Et3N (1.39 mL, 10.00 mmol, 2.00당량), DMAP (61 mg, 0.50 mmol, 0.10당량), DCM (50 mL), TsCl (1.91 g, 10.02 mmol, 2.01당량)을 넣었다. 생성된 용액을 오일조에서 35℃에서 4시간 동안 교반하였다. 생성된 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(23:2)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 5.73 g(99.31%)의 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사헵타헥사콘탄-67-일 4-메틸벤젠-1-설포네이트를 백색 반고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 578.30 [M/2+1] +.
단계 4: N-메틸-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사헵타헥사콘탄-67-아민 제조
질소의 불활성 대기로 퍼지되고 유지된 30-mL 밀봉된 튜브에, 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사헵타헥사콘탄-67-일 4-메틸벤젠-1-설포네이트 (1.155 g, 1.00 mmol, 1당량), 메탄아민 염화수소 (337.5 mg, 5.00 mmol, 5.00당량), K2CO3 (552.8 mg, 4.00 mmol, 4.00당량), 디옥산 (20 mL)을 넣었다. 생성된 혼합물을 오일조에서 70℃에서 16시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 실온으로 냉각시키고 합쳤다. 혼합물을 물(200 mL)로 희석시켰다. 생성된 용액을 디클로로메탄(200 mL x 2)으로 추출하고, 유기층을 합치고 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 중에서 농축시켰다. 이를 통해 2.02 g(99.61%)의 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사-68-아자노나헥사콘탄을 연황색 반고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 507.70 [M/2+1] +.
단계 5: (3R,5S)-1-((S)-2-(2-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-5-((4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)카바모일)피롤리딘-3-일 68-메틸-69-옥소-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사-68-아자도헵타콘탄-72-오에이트 제조
100-mL 둥근 바닥 플라스크에, 4-[[(3R,5S)-1-[(2S)-2-[2-(4-[[1-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페리딘-4-일]메틸]피페라진-1-일)아세트아미도]-3,3-디메틸부타노일]-5-([[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]카바모일)피롤리딘-3-일]옥시]-4-옥소부탄산 (300 mg, 0.24 mmol, 1당량), 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사-68-아자노나헥사콘탄 (971.8 mg, 0.96 mmol, 4.00당량), DIEA (123.8 mg, 0.96 mmol, 4.00당량), BOP (211.8 mg, 0.48 mmol, 2.00당량), DMF (8 mL)을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 생성된 용액을 물(400 mL)로 희석시키고 EtOAc/THF (10/1, 400 mL x 3)로 추출하고, 유기층을 합쳤다. 유기물을 염수(400 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 중에서 농축시켰다. 미정제 생성물을 분취-HPLC로 정제하였다. 이를 통해, 87.7 mg (16.28%)의 (3R,5S)-1-[(2S)-2-[2-(4-[[1-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페리딘-4-일]메틸]피페라진-1-일)아세트아미도]-3,3-디메틸부타노일]-5-([[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]카바모일)피롤리딘-3-일 3-[(2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사헵타헥사콘탄-67-일)(메틸)카바모일]프로파노에이트를 황색 반고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 2248.5 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, D2O) δ 9.69 (s, 1H), 8.44-8.36 (m, 2H), 7.79 (s, 1H), 7.59-7.55 (m, 5H), 7.42-7.37 (m, 4H), 7.05-7.00 (m, 1H), 5.34 (s , 1H), 5.20 (d, J=52.4 Hz, 1H), 4.55-4.51 (m, 1H), 4.41-4.38 (m, 3H), 4.11-4.03 (m, 3H), 3.90-3.88 (m, 1H), 3.37-3.46 (m, 102H), 3.40-3.27 (m, 6H), 3.01-2.99 (m, 2H), 2.84-2.57 (m, 6H), 2.47-2.41 (m, 6H), 2.22-2.06 (m, 5H), 1.98-1.83 (m, 3H), 0.92 (s, 9H).
(R)-2-((2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복사미도)-2-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸 69-옥소-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사-68-아자도헵타콘탄-72-오에이트 (예시적 화합물 827)의 예시적인 합성
단계 1: 벤질 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복실레이트 제조
250-mL 둥근 바닥 플라스크에, N,N-디메틸포름아미드(100 mL) 중 (2S)-2-{[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노}-3,3-디메틸부탄산 (8.5 g, 36.75 mmol, 1.00당량)의 용액을 넣었다. 이어서 HATU (15.5 g, 40.76 mmol, 1.10당량)을 0 ℃에서 수회분으로 첨가하였다. 그런 다음, DIEA(14.24 g, 110.40 mmol, 3.00당량)를 첨가하였다. 생성된 혼합물을 0℃에서 20분 동안 교반한 다음, 0℃에서 N,N-디메틸포름아미드(20 mL) 중 벤질 (2S,4R)-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복실레이트 염화수소 (9.5 g, 36.86 mmol, 1.00당량)의 용액에 의해 적가하였다. 반응 혼합물을 실온에서 1시간 동안 교반한 다음, 물(500 mL)의 첨가로 급냉시켰다. 생성된 혼합물을 에틸 아세테이트(100 mL x 3)로 추출하였다. 유기층을 합치고, 물(100 mL x 2) 및 염수(100 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨을 용해 건조시키고 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:2)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 11.6 g(72%)의 벤질 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복실레이트를 연황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 435.15 [M+1] +.
단계 2: 벤질 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]-3,3-디메틸부타노일]-4-[(삼차-부틸디메틸실릴)옥시]피롤리딘-2-카르복실레이트 제조
150-mL 둥근 바닥 플라스크에, 0 ℃에서 디클로로메탄(80 mL) 중 벤질 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복실레이트 (7 g, 16.11 mmol, 1.00당량), 이미다졸e (1.6 g, 23.51 mmol, 1.46당량)을 넣었다. 이어서 TBDMSCl (3.6 g, 23.89 mmol, 1.48당량)을 0 ℃에서 나누어서 첨가하였다. 생성된 용액을 실온에서 6시간 동안 교반하였다. 이어서 반응물을 물(60 mL)의 첨가로 급냉시켰다. 생성된 혼합물을 디클로로메탄(50 mL x 3)으로 추출하여 유기층을 합치고, 염수(100 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:9)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 5.8 g(66%)의 벤질 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]-3,3-디메틸부타노일]-4-[(삼차-부틸디메틸실릴)옥시]피롤리딘-2-카르복실레이트를 연황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 549.20 [M+1] +.
단계 3: (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]-3,3-디메틸부타노일]-4-[(삼차-부틸디메틸실릴)옥시]피롤리딘-2-카르복실산 제조
50 ml의 둥근 바닥 플라스크에서, 질소 대기 하에 메탄올(15 mL) 중 벤질 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]-3,3-디메틸부타노일]-4-[(삼차-부틸디메틸실릴)옥시]피롤리딘-2-카르복실레이트 (500 mg, 0.91 mmol, 1.00당량)의 용액에 Pd/C(10%, 100 mg)를 첨가하였다. 이어서 플라스크를 진공화하고 수소로 플러싱하였다. 반응 혼합물을 수소 분위기 하에 실온에서 16시간 동안 수소 풍선을 사용해 수소화시킨 후, 셀라이트 패드를 통해 여과하고 감압 하에 농축시켰다. 이를 통해 273 mg(65%)의 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]-3,3-디메틸부타노일]-4-[(삼차-부틸디메틸실릴)옥시]피롤리딘-2-카르복실산을 무색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 459.30 [M+1] +.
단계 4: 삼차-부틸 N-[(2S)-1-[(2S,4R)-4-[(삼차-부틸디메틸실릴)옥시]-2-[[(1R)-2-하이드록시-1-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에틸]카바모일]피롤리딘-1-일]-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일]카바메이트 제조
25-mL 둥근 바닥 플라스크에, DMF (5 mL) 중 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]-3,3-디메틸부타노일]-4-[(삼차-부틸디메틸실릴)옥시]피롤리딘-2-카르복실산 (930 mg, 1당량), (2R)-2-아미노-2-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에탄-1-올 염화수소 (550 mg), HATU (930 mg), DIEA (1 g)을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물(80 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(50 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:0)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 460 mg의 삼차-부틸 N-[(2S)-1-[(2S,4R)-4-[(삼차-부틸디메틸실릴)옥시]-2-[[(1R)-2-하이드록시-1-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에틸]카바모일]피롤리딘-1-일]-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일]카바메이트를 연황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 675.20 [M+1] +.
단계 5: 4-[(2R)-2-[[(2S,4R)-1-[(2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]-3,3-디메틸부타노일]-4-[(삼차-부틸디메틸실릴)옥시]피롤리딘-2-일]포름아미도]-2-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에톡시]-4-옥소부탄산 제조
50-mL 둥근 바닥 플라스크에, 디클로로메탄 (20 mL) 중 삼차-부틸 N-[(2S)-1-[(2S,4R)-4-[(삼차-부틸디메틸실릴)옥시]-2-[[(1R)-2-하이드록시-1-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에틸]카바모일]피롤리딘-1-일]-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일]카바메이트 (840 mg, 1.24 mmol, 1당량), 옥소란-2,5-디온 (623 mg, 6.23 mmol, 5.00당량), 　트리에틸아민 (380 mg, 3.76 mmol, 3.02당량)을 넣었다. 이어서 DMAP (460 mg, 3.77 mmol, 3.03당량)을 실온에서 나누어서 첨가하였다. 생성된 용액을 실온에서 16시간 동안 교반하였다. 혼합물을 물(30 mL)로 희석시키고 디클로로메탄(25 mL x 3)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(40 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(10:1)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 800 mg(82.94%)의 4-[(2R)-2-[[(2S,4R)-1-[(2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]-3,3-디메틸부타노일]-4-[(삼차-부틸디메틸실릴)옥시]피롤리딘-2-일]포름아미도]-2-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에톡시]-4-옥소부탄산을 연황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 775.25 [M+1] +.
단계 6: (2R)-2-[[(2S,4R)-1-[(2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]-3,3-디메틸부타노일]-4-[(삼차-부틸디메틸실릴)옥시]피롤리딘-2-일]포름아미도]-2-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에틸 3-[(2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사헵타헥사콘탄-67-일)카바모일]프로파노에이트 제조
50-mL의 둥근 바닥 플라스크에, DMF (10 mL) 중 4-[(2R)-2-[[(2S,4R)-1-[(2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]-3,3-디메틸부타노일]-4-[(삼차-부틸디메틸실릴)옥시]피롤리딘-2-일]포름아미도]-2-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에톡시]-4-옥소부탄산 (800 mg, 1.03 mmol, 1당량), 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사헵타헥사콘탄-67-아민 염화수소 (2.1 g, 2.03 mmol, 1.96당량), DIEA (540 mg, 4.18 mmol, 4.05당량)을 넣었다. 이어서, BOP (900 mg, 2.03 mmol, 1.97당량)를 실온에서 첨가하였다. 생성된 용액을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 혼합물을 물(30 mL)로 희석시키고 에틸 아세테이트(30 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(50 mL)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(10:1)의 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 1.8 g(99.24%)의 (2R)-2-[[(2S,4R)-1-[(2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]-3,3-디메틸부타노일]-4-[(삼차-부틸디메틸실릴)옥시]피롤리딘-2-일]포름아미도]-2-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에틸 3-[(2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사헵타헥사콘탄-67-일)카바모일]프로파노에이트를 황색 오일로서 수득하였다.
단계 7: (2R)-2-[[(2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시피롤리딘-2-일]포름아미도]-2-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에틸 3-[(2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사헵타헥사콘탄-67-일)카바모일]프로파노에이트 염화수소 제조
100-mL의 둥근 바닥 플라스크에, 디옥산 (20 mL) 중 (2R)-2-[[(2S,4R)-1-[(2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]-3,3-디메틸부타노일]-4-[(삼차-부틸디메틸실릴)옥시]피롤리딘-2-일]포름아미도]-2-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에틸 3-[(2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사헵타헥사콘탄-67-일)카바모일]프로파노에이트 (1.8 g, 1.02 mmol, 1당량)을 넣었다. 상기에 HCl/디옥산(20 mL, 4mol을 첨가하였다. 생성된 용액을 염산 가스 분위기 하 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 혼합물을 농축시켰다. 이를 통해 1.6 g(98.90%)의 (2R)-2-[[(2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시피롤리딘-2-일]포름아미도]-2-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에틸 3-[(2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사헵타헥사콘탄-67-일)카바모일]프로파노에이트 염화수소를 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 772.30 [M/2+1] +.
단계 8: (R)-2-((2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복사미도)-2-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸 69-옥소-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사-68-아자도헵타콘탄-72-오에이트 제조
25 mL 둥근바닥 플라스크에, DMF (6 mL) 중 2-(4-[[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]메틸]피페리딘-1-일)아세트산 (280 mg, 0.378 mmol, 1당량), (2R)-2-[[(2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시피롤리딘-2-일]포름아미도]-2-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에틸 3-[(2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사헵타헥사콘탄-67-일)카바모일]프로파노에이트 염화수소 (600 mg, 0.380 mmol, 1.00당량), DIEA (200 mg, 1.547 mmol, 4.09당량)를 넣었다. 이어서, BOP(330 mg, 0.746 mmol, 1.97당량)를 실온에서 첨가하였다. 생성된 혼합물을 실온에서 2시간 동안 교반한 다음, 농축시켰다. 미정제 생성물을 분취-HPLC로 정제하여, 114.6 mg (13.37%)의 (R)-2-((2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복사미도)-2-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸 69-옥소-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사-68-아자도헵타콘탄-72-오에이트를 황색 오일로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 2264.7 [M+1] +; 1H-NMR (300MHz, CD3OD) δ 8.89 (s, 1H), 8.69 (s, 1H), 8.60 (s, 1H), 7.89 (s, 1H), 7.76-7.74 (m, 1H), 7.62 (d, J = 9Hz, 2H), 7.48-7.45 (m, 4H), 7.14-7.11 (m, 3H), 5.32-5.14 (m, 2H), 4.64-4.63 (m, 2H), 4.46-4.44 (m, 2H), 4.37-4.32 (m, 1H), 3.88-3.84 (m, 3H), 3.68-3.51 (m, 109H), 3.47-3.36 (m, 5H), 3.14 (s, 2H), 3.01-2.97 (m, 2H), 2.75-2.66 (m, 7H), 2.54-2.42 (m, 7H), 2.37-2.10 (m, 5H), 1.96-1.85 (m, 4H), 1.75-1.70 (m, 1H), 1.46-1.33 (m, 2H), 1.06-1.04 (m, 9H).
(R)-2-((2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복사미도)-2-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸 68-메틸-69-옥소-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사-68-아자도헵타콘탄-72-오에이트 (예시적 화합물 842)의 예시적인 합성
단계 1: (2R)-2-[[(2S,4R)-1-[(2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]-3,3-디메틸부타노일]-4-[(삼차-부틸디메틸실릴)옥시]피롤리딘-2-일]포름아미도]-2-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에틸 3-[(2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59, 62,65-도코사옥사헵타헥사콘탄-67-일)(메틸)카바모일]프로파노에이트 제조
100-mL 둥근 바닥 플라스크에, DMF (50 mL) 중 4-[(2R)-2-[[(2S,4R)-1-[(2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]-3,3-디메틸부타노일]-4-[(삼차-부틸디메틸실릴)옥시]피롤리딘-2-일]포름아미도]-2-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에톡시]-4-옥소부탄산 (1.11 g, 1.432 mmol, 1.00당량), 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사-68-아자노나헥사콘탄 (1.45 g, 1.430 mmol, 1당량), DIEA (0.37 g, 2.863 mmol, 2.00당량), BOP (0.76 g, 1.718 mmol, 1.20당량)의 용액을 수득하였다. 생성된 혼합물을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 그런 다음 혼합물을 물(50 mL)로 희석시키고 디클로로메탄(100 mL x 2)으로 추출하였다. 유기층을 합치고 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 디클로로메탄/메탄올(10:1)로 용리하는 실리카 겔 컬럼 상에 적용하였다. 이를 통해 1.56 g(61.60%)의 (2R)-2-[[(2S,4R)-1-[(2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]-3,3-디메틸부타노일]-4-[(삼차-부틸디메틸실릴)옥시]피롤리딘-2-일]포름아미도]-2-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에틸 3-[(2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59, 62,65-도코사옥사헵타헥사콘탄-67-일)(메틸)카바모일]프로파노에이트를 백색 고체로서 수득하였다.
단계 2: (2R)-2-[[(2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시피롤리딘-2-일]포름아미도]-2-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에틸 3-[(2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사헵타헥사콘탄-67-일)(메틸)카바모일]프로파노에이트 염화수소 제조
100-mL의 둥근 바닥 플라스크에, 50 mL 디옥산 중 (2R)-2-[[(2S,4R)-1-[(2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]-3,3-디메틸부타노일]-4-[(삼차-부틸디메틸실릴)옥시]피롤리딘-2-일]포름아미도]-2-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에틸 3-[(2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사헵타헥사콘탄-67-일)(메틸)카바모일]프로파노에이트 (1.0 g, 0.565 mmol, 1당량)의 용액을 넣었다. 이어서, 1,4-디옥산 중 염화수소 용액(4.0 M, 10 mL)을 첨가하였다. 생성된 혼합물을 실온에서 1시간 동안 교반한 다음, 감압 하에 농축시켰다. 이를 통해 850.0 mg(94.49%)의 (2R)-2-[[(2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시피롤리딘-2-일]포름아미도]-2-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에틸 3-[(2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사헵타헥사콘탄-67-일)(메틸)카바모일]프로파노에이트 염화수소를 무색 오일로서 수득하였다.
단계 3: (R)-2-((2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복사미도)-2-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸 68-메틸-69-옥소-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사-68-아자도헵타콘탄-72-오에이트 제조
100-mL 둥근바닥 플라스크에, DMF (30 mL) 중 2-(4-[[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]메틸]피페리딘-1-일)아세트산 (417.9 mg, 0.565 mmol, 1.00당량), (2R)-2-[[(2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시피롤리딘-2-일]포름아미도]-2-[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]에틸 3-[(2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사헵타헥사콘탄-67-일)(메틸)카바모일]프로파노에이트 염화수소 (900.0 mg, 0.565 mmol, 1당량), DIEA (146.0 mg, 1.130 mmol, 2.00당량), BOP (299.8 mg, 0.678 mmol, 1.20당량)의 용액을 넣었다. 생성된 혼합물을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 그런 다음 혼합물을 물(50 mL)로 희석시키고 디클로로메탄(100 mL x 2)으로 추출하였다. 유기층을 합치고 감압 하에 농축시켰다. 미정제 생성물을 다음 조건의 분취-HPLC로 정제하였다: 컬럼: X는 CSH OBD Column 30*150mm 5um n 선택; 이동상 A:물(0.1%FA), 이동상 B: ACN; 유속: 60 mL/분; 구배: 11분 내에 15% B 내지 38% B; 254/220 nm; 실온: 10.27 분.이를 통해 200.3 mg(7.23%)의 (R)-2-((2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복사미도)-2-(4-(4-메틸티아졸-5-일)페닐)에틸 68-메틸-69-옥소-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사-68-아자도헵타콘탄-72-오에이트를 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 2278.71 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, DMSO-d 6 ) δ 12.91 (s, 1H), 9.85 (brs, 1H), 8.99 (s, 1H), 8.65 (d, J = 2.2 Hz, 1H), 6.60-8.53 (m, 2H), 8.07 (s, 1H), 7.88-7.80 (m, 1H), 7.69-7.54 (m, 3H), 7.52-7.45 (m, 4H), 7.31-7.25 (m, 1H), 7.07 (d, J = 8.4 Hz, 2H), 5.36-5.23 (m, 1H), 5.21-5.13 (m, 2H), 4.55-4.43 (m, 2H), 4.29-4.22 (m, 3H), 3.72-3.38(m, 105H), 3.26-3.15 (m, 7H) , 3.02-2.95 (m, 2H), 2.85-2.76 (m, 2H), 2.48-2.39 (m, 4H),2.34-1.91 (m, 6H), 1.77-1.60 (m, 4H), 1.31-1.19 (m, 2H), 0.95 (s, 9H).
(3R,5S)-1-((S)-2-(2-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-5-((4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)카바모일)피롤리딘-3-일 2-((69-옥소-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헵타콘탄-70-일)옥시)아세테이트 (예시적 화합물 815)의 예시적인 합성
단계 1: (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드 (예시적 화합물 227) 제조
8-mL 튜브에, 2-(4-[[1-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페리딘-4-일]메틸]피페라진-1-일)아세트산 (111 mg, 0.15 mmol, 1당량), (2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드 염화수소 (84 mg, 0.18 mmol, 1.20당량), DIEA (77.5 mg, 0.60 mmol, 4.00당량), DMF (2 mL), BOP (79.6 mg, 0.18 mmol, 1.20당량)를 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 생성된 용액을 물(30 mL)로 희석시키고 디클로로메탄/메탄올 (10/1, 50 mL x 2)로 추출하고, 유기층을 합쳤다. 유기물을 염수(50 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 중에서 농축시켰다. 미정제 생성물을 분취-HPLC로 정제하여, 81.9 mg (47.37%)의 (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드를 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 1152.20 [M+1] +; 1H-NMR (300MHz, CD3OD) δ 8.87 (s, 1H), 8.67 (s, 1H), 8.58 (s, 1H), 7.88 (s, 1H), 7.78-7.70 (m, 1H), 7.56 (d, J=8.7 Hz, 2H), 7.48-7.38 (m, 4H), 7.16-7.06 (m, 3H), 5.21 (d, J=53.7 Hz, 1H), 4.63-4.50 (m, 4H), 4.37-4.32 (m, 1H), 3.91-3.70 (m, 4H), 4.63-3.35 (m, 4H), 3.05 (s, 2H), 2.72-2.46 (m, 13H), 2.27-1.95 (m, 6H), 1.84-1.80 (m, 2H), 1.65 (m, 1H), 1.35-1.24 (m, 2H), 1.04 (m, 9H).
단계 2: 69-옥소-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68,71-테트라코사옥사트리헵타콘탄-73-오익산 제조
1-L 둥근 바닥 플라스크에, 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사헵타헥사콘탄-67-올 (8 g, 7.99 mmol, 1당량), TEA (2.22 mL, 15.97 mmol, 2.00당량), DMAP (2.93 g, 23.98 mmol, 3.00당량), 디클로로메탄 (250 mL), 테트라하이드로푸란 (30 mL)을 넣고 혼합물을 10분 동안 교반하였다. 이어서 교반하면서 1,4-디옥산-2,6-디온 (4.64 g, 39.98 mmol, 5.00당량)을 첨가하였다. 생성된 용액을 오일조에서 35℃에서 16시간 동안 교반하였다. 생성된 용액을 디클로로메탄(800 mL)으로 희석하고 NH4Cl (800 mL x 2)로 세척하였다. 유기물을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 이를 통해 8.90 g(99.69%)의 69-옥소-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68,71-테트라코사옥사트리헵타콘탄-73-오익산을 황색 반고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 559.30 [M/2+1] +.
단계 3: (3R,5S)-1-((S)-2-(2-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-5-((4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)카바모일)피롤리딘-3-일 2-((69-옥소-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헵타콘탄-70-일)옥시)아세테이트 제조
100-mL 둥근 바닥 플라스크에, (2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시-N-(4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)피롤리딘-2-카르복사미드 (300 mg, 0.26 mmol, 1당량), 디클로로메탄 (20 mL)을 넣었다. 혼합물에 69-옥소-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68,71-테트라코사옥사트리헵타콘탄-73-오익산 (1.31 g, 1.17 mmol, 4.50당량), DMAP (285.9 mg, 2.34 mmol, 9.00당량) 및 EDCI (449 mg, 2.34 mmol, 9.00당량)을 3회분으로 3시간 안에 첨가하였다. 생성된 용액을 실온에서 16시간 동안 교반하였다. 이어서 DMAP (636.6 mg, 5.21 mmol, 20.01당량)의 나머지를 4회분으로 4시간 안에 첨가하였다. 생성된 용액을 실온에서 추가 2시간 동안, 교반하면서, 반응시켰다. 생성된 용액을 농축시키고, 잔류물을 NH4Cl (300 mL)로 희석하였다. 혼합물을 EtOAc/THF (10/1, 300 mL x 2)로 추출하고, 유기층을 합쳤다. 유기물을 NH4Cl (300 mL x 2)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고 진공 중에서 농축시켰다. 미정제 생성물을 분취-HPLC로 정제하여, 125.8 mg (21.46%)의 (3R,5S)-1-((S)-2-(2-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-5-((4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)카바모일)피롤리딘-3-일 2-((69-옥소-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헵타콘탄-70-일)옥시)아세테이트를 진황색 반고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 2251.46 [M+1] +; 1H-NMR (300MHz, CDCl3) δ 11.49 (s, 1H), 8.84 (s, 1H), 8.69 (s, 1H), 8.60 (s, 1H), 7.74-7.66 (m, 3H), 7.56 (d, J=8.4 Hz, 2H), 7.45-7.41 (m, 1H), 7.37-7.30 (m, 4H), 7.04-6.99 (m, 3H), 5.43 (s , 1H), 5.21 (d, J=52.5 Hz, 1H), 4.76-4.71 (m, 1H), 4.59-4.52 (m, 1H), 4.35-4.18 (m, 9H), 3.86-3.68 (m, 7H), 3.64-3.62 (m, 78H), 3.55-3.44 (m, 7H), 3.37 (s, 3H), 2.96 (s, 2H), 2.81-2.68 (m, 4H), 2.51-2.43 (m, 11H), 2.26-2.19 (m, 5H), 2.02-1.95 (m, 1H), 1.86-1.82 (m, 2H), 1.61 (m, 1H), 1.35-1.30 (m, 2H), 0.93 (s, 9H).
(3R,5S)-1-((S)-2-(2-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-5-((4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)카바모일)피롤리딘-3-일 69-옥소-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,71-트리코사옥사-68-아자트리헵타콘탄-73-오에이트 (예시적 화합물 814)의 예시적인 합성
단계 1: 2-(2-[[(3R,5S)-1-[(2S)-2-[2-(4-[[1-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페리딘-4-일]메틸]피페라진-1-일)아세트아미도]-3,3-디메틸부타노일]-5-([[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]카바모일)피롤리딘-3-일]옥시]-2-옥소에톡시)아세트산 제조
30-mL 밀봉 튜브에, (2S,4R)-1-[(2S)-2-[2-(4-[[1-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페리딘-4-일]메틸]피페라진-1-일)아세트아미도]-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시-N-[[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]피롤리딘-2-카르복사미드 (230 mg, 0.20 mmol, 1당량), Et3N (40.4 mg, 0.40 mmol, 2.00당량), DMAP (73 mg, 0.60 mmol, 2.99당량), 디클로로메탄 (8 mL), 테트라하이드로푸란 (2 mL)을 넣고 혼합물을 10분 동안 교반하였다. 그런 다음, 1,4-디옥산-2,6-디온 (116.1 mg, 1.00 mmol, 5.01당량)을 교반하면서 첨가하였다. 생성된 용액을 오일조에서 35℃에서 16시간 동안 교반하였다. 생성된 용액을 디클로로메탄/메탄올(10/1, 200 mL)로 희석하고 NH4Cl 포화 수용액(100 mL x 2)으로 세척하였다. 유기물을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 생성된 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 미정제 생성물을 분취-HPLC에 의해 정제하여 79.6 mg(31.44%)의 2-(2-[[(3R,5S)-1-[(2S)-2-[2-(4-[[1-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페리딘-4-일]메틸]피페라진-1-일)아세트아미도]-3,3-디메틸부타노일]-5-([[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]카바모일)피롤리딘-3-일]옥시]-2-옥소에톡시)아세트산을 연황색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 1268.20 [M+1] +; 1H-NMR (300MHz, CD3OD) δ 8.90 (s, 1H), 8.69 (s, 1H), 8.62 (m, 1H), 7.94 (s, 1H), 7.82-7.74 (m, 1H), 7.63-7.60 (m, 2H), 7.49-7.42 (m, 4H), 7.22-7.14 (m, 3H), 5.50 (s , 1H), 5.26 (m, 1H), 4.66-4.56 (m, 7H), 4.42-4.29 (m, 4H), 4.13-4.00 (m, 2H), 3.92-3.79 (m, 3H), 3.61-3.44 (m, 6H), 3.17 (m, 3H), 3.03 (s, 3H), 2.90-2.79 (m, 4H), 2.50 (s, 3H), 2.28-2.22 (m, 2H), 2.07-1.96 (m, 3H), 1.49-1.45 (m, 2H), 1.07 (s, 9H).
단계 2: (3R,5S)-1-((S)-2-(2-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-5-((4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)카바모일)피롤리딘-3-일 69-옥소-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,71-트리코사옥사-68-아자트리헵타콘탄-73-오에이트 제조
50 mL 둥근바닥 플라스크에, 2-(2-[[(3R,5S)-1-[(2S)-2-[2-(4-[[1-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페리딘-4-일]메틸]피페라진-1-일)아세트아미도]-3,3-디메틸부타노일]-5-([[4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]카바모일)피롤리딘-3-일]옥시]-2-옥소에톡시)아세트산 (761 mg, 0.60 mmol, 1당량), 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65-도코사옥사헵타헥사콘탄-67-아민 염화수소 (1.244 g, 1.20 mmol, 2.00당량), DIEA (310 mg, 2.40 mmol, 4.00당량), DMF (15 mL), BOP (398 mg, 0.90 mmol, 1.50당량)를 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 생성된 용액을 물(200 mL)로 희석시키고, 에틸 아세테이트/THF (10/1, 300 mL x 2)로 추출하고, 유기층을 합쳤다. 유기물을 NH4Cl (300 mL x 2)로 세척하였다. 유기물을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 미정제 생성물을 분취-HPLC에 의해 정제하여 238.0 mg (17.63%)의 3R,5S)-1-((S)-2-(2-(4-((1-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페리딘-4-일)메틸)피페라진-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-5-((4-(4-메틸티아졸-5-일)벤질)카바모일)피롤리딘-3-일 69-옥소-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,71-트리코사옥사-68-아자트리헵타콘탄-73-오에이트를 황색 고체로서 수득하였다.LC/MS (ESI) m/z: 2250.47 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 11.22 (s, 1H), 8.86 (s, 1H), 8.70 (s, 1H), 8.64 (s, 1H), 7.75-7.71 (m, 3H), 7.57 (d, J=8.0 Hz, 2H), 7.47 (m, 1H),7.338-7.33 (m, 4H), 7.13 (m, 1H), 7.06-7.02 (m, 3H), 5.44 (s , 1H), 5.23 (d, J=54.2 Hz, 1H), 4.9-4.75 (m, 1H), 4.60-4.55 (m, 1H), 4.37-4.27 (m, 4H), 4.19-4.07 (m, 3H), 3.82-3.48 (m, 91H), 3.39 (s, 3H), 2.98 (m, 2H), 2.77-2.71 (m, 4H), 2.55-2.46 (m, 11H), 2.27-2.22 (m, 4H), 2.12-2.00 (m, 2H), 1.88-1.85 (m, 3H), 1.64 (m, 1H), 1.36-1.27 (m, 4H), 0.94 (s, 9H).
2-(((2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복사미도)메틸)-5-(4-메틸티아졸-5-일)벤질 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헵타콘탄-70-오에이트 (예시적 화합물 813)의 예시적인 합성
단계 1: 메틸 2-([비스[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]메틸)-5-브로모벤조에이트 제조
250 mL 둥근 바닥 플라스크에, 메틸 5-브로모-2-(브로모메틸)벤조에이트(3.5 g, 11.36 mmol, 1당량), 삼차-부틸 N-[(삼차-부톡시)카르보닐]카바메이트 (2.65 g, 12.20 mmol, 1.07당량) 및 메틸 에틸 케톤(120 mL)을 실온에서 첨가하였다. 교반된 혼합물에 탄산세슘(3.7 g, 11.36 mmol, 1.00당량)을 실온에서 나누어서 첨가하였다. 생성된 혼합물을 70℃에서 16시간 동안 교반하였다. 생성된 혼합물을 여과하였다. 여액을 감압하에 농축시켰다. 생성된 혼합물을 물(200 mL)로 희석시켰다. 수성층을 에틸 아세테이트(60 mL x 3)로 추출하였다. 생성된 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:10)로 용리시킨, 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피로 정제하여 메틸 2-([비스[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]메틸)-5-브로모벤조에이트(4.25 g, 84.16%를 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 465.90 [M+23] +.
단계 2: 메틸 2-([비스[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]메틸)-5-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)벤조에이트 제조
250 mL 둥근 바닥 플라스크에 메틸 2-([비스[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]메틸)-5-브로모벤조에이트(25 g, 56.27 mol, 1당량), 4-메틸-1,3-티아졸(12 g, 120 mmol), DMF (50 mL) 및 아세트산칼륨(25 g, 254.73 mmol, 4.53당량)을 실온에서 첨가하였다. 혼합물에 Pd(OAc)2(2.5 g, 0.01 mmol)를 질소 대기 하에 실온에서 첨가하였다. 생성된 혼합물을 질소 분위기 하 100℃에서 2시간 동안 교반하였다. 생성된 혼합물을 물(50 mL)로 희석시켰다. 수성층을 에틸 아세테이트(60 mL x 4)로 추출하였다. 생성된 고체를 건조시켰다. 생성된 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(3:1)로 용리시킨, 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피로 정제하여 메틸 2-([비스[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]메틸)-5-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)벤조에이트(15g,57.63%)를 황색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 463.10 [M+1] +.
단계 3: 삼차-부틸 N-[(삼차-부톡시)카르보닐]-N-[[2-(하이드록시메틸)-4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]카바메이트 제조
250 mL 둥근 바닥 플라스크에, 실온에서 메틸 2-([비스[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]메틸)-5-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)벤조에이트(360 mg, 0.78 mmol, 1당량) 및 디클로로메탄 (20 mL, 314.60 mol, 404.23당량)을 첨가하였다. 상기 혼합물에 DIBAl-H (3.3 mL, 19.68 mmol, 25.28당량)를 -70℃에서 10분에 걸쳐 나누어서 첨가하였다. 생성된 혼합물을 -70℃에서 추가로 1시간 동안 교반하였다. 반응물을 염화암모늄 수용액으로 실온에서 급냉시켰다. 생성된 혼합물을 디클로로메탄(20 mL x 3)으로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(20 mL x 1)로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시켰다. 여과 후에 여과물을 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(2:1)로 용리시킨, 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피로 정제하여 삼차-부틸 N-[(삼차-부톡시)카르보닐]-N-[[2-(하이드록시메틸)-4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]카바메이트(120mg,35.48%)를 황색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 335.00 [M-100] +.
단계 4: [2-(아미노메틸)-5-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메탄올 염화수소 제조
250 mL 둥근 바닥 플라스크에, 실온에서 삼차-부틸 N-[(삼차-부톡시)카르보닐]-N-[[2-(하이드록시메틸)-4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]카바메이트(150 mg, 0.35 mmol, 1당량) 및 디옥산 중 HCl (4M) (10.0 mL, 329.12 mmol, 953.46당량)을 첨가하였다. 생성된 혼합물을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 생성된 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 이를 통해 [2-(아미노 메틸)-5-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메탄올 염화수소(132 mg, 미정제)를 갈색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 234.95 [M+1] +.
단계 5: 삼차-부틸 N-[(2S)-1-[(2S,4R)-4-[(삼차-부틸디메틸실릴)옥시]-2-([[2-(하이드록시메틸)-4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]카바모일)피롤리딘-1-일]-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일]카바메이트 제조
50mL의 둥근 바닥 플라스크에, 실온에서 (2S,4R)-1-[(2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]-3,3-디메틸부타노일]-4-[(삼차-부틸디메틸실릴)옥시]피롤리딘-2-카르복실산 (750 mg, 1.64 mmol, 1당량), DMF (10 mL, 0.14 mmol, 0.08당량), HATU (750 mg, 1.97 mmol, 1.21당량), DIEA (840 mg, 6.50 mmol, 3.97당량) 및 [2-(아미노메틸)-5-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메탄올 염화수소 (440 mg, 1.62 mmol, 0.99당량)을 첨가하였다. 생성된 혼합물을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 생성된 혼합물을 물(60 mL)로 희석시켰다. 생성된 혼합물을 에틸 아세테이트(25 mL x 3)로 추출하였다. 합쳐진 유기층을 염수(15 mL)로 세척하고, 무수 Na2SO4으로 건조시켰다. 여과 후에 여과물을 감압 하에 농축시켰다. 잔류물을 에틸 아세테이트/석유 에테르(1:0)로 용리시킨, 실리카 겔 컬럼 크로마토그래피로 정제하여 1.34 g (121.41%)의 삼차-부틸 N-[(2S)-1-[(2S,4R)-4-[(삼차-부틸디메틸실릴)옥시]-2-([[2-(하이드록시메틸)-4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]카바모일)피롤리딘-1-일]-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일]카바메이트를 오렌지색 오일로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 675.15 [M+1] +.
단계 6: [2-([[(2S,4R)-1-[(2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]-3,3-디메틸부타노일]-4-[(삼차-부틸디메틸실릴)옥시]피롤리딘-2-일]포름아미도]메틸)-5-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헵타콘탄-70-오에이트 제조
50-mL 둥근 바닥 플라스크에, 삼차-부틸 N-[(2S)-1-[(2S,4R)-4-[(삼차-부틸디메틸실릴)옥시]-2-([[2-(하이드록시메틸)-4-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸]카바모일)피롤리딘-1-일]-3,3-디메틸-1-옥소부탄-2-일]카바메이트 (570 mg, 0.84 mmol, 1당량), 디클로로메탄 (20 mL)을 넣었다. 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헵타콘탄-70-오익산 (1.34 g, 1.27 mmol, 1.50당량), DMAP (309.6 mg, 2.53 mmol, 3.00당량) 및 EDCI (485.6 mg, 2.53 mmol, 3.00당량)를 첨가하였다. 생성된 용액을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 생성된 용액을 농축시키고, 잔류물을 NH4Cl (400 mL)로 희석하였다. 혼합물을 에틸 아세테이트/THF (10/1, 300 mL x 2)로 추출하고, 유기층을 합쳤다. 유기물을 NH4Cl 포화 수용액(300 mL x 2)으로 세척하고, 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 중에서 농축시켰다. 이를 통해 910 mg(62.79%)의 [2-([[(2S,4R)-1-[(2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]-3,3-디메틸부타노일]-4-[(삼차-부틸디메틸실릴)옥시]피롤리딘-2-일]포름아미도]메틸)-5-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헵타콘탄-70-오에이트를 황색 오일로서 수득하였다.
단계 7: [2-([[(2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시피롤리딘-2-일]포름아미도]메틸)-5-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헵타콘탄-70-오에이트 염화수소 제조
100-mL의 둥근 바닥 플라스크에, [2-([[(2S,4R)-1-[(2S)-2-[[(삼차-부톡시)카르보닐]아미노]-3,3-디메틸부타노일]-4-[(삼차-부틸디메틸실릴)옥시]피롤리딘-2-일]포름아미도]메틸)-5-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헵타콘탄-70-오에이트 (950 mg, 0.55 mmol, 1당량), 디옥산/HCl (10 mL), (디옥산 중 4M)을 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 생성된 혼합물을 진공 중에서 농축시켰다. 이를 통해 850 mg (99.82%)의 [2-([[(2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시피롤리딘-2-일]포름아미도]메틸)-5-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헵타콘탄-70-오에이트 염화수소를 황색 오일로서 수득하였다.
단계 8: 2-(((2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복사미도)메틸)-5-(4-메틸티아졸-5-일)벤질 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헵타콘탄-70-오에이트 제조
100-mL 둥근바닥 플라스크에, 2-(4-[[4-(4-[3-[2,6-디플루오로-3-([[(3R)-3-플루오로피롤리딘-1-일]설포닐]아미노)벤조일]-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일]페닐)피페라진-1-일]메틸]피페리딘-1-일)아세트산 (408.8 mg, 0.55 mmol, 1당량), [2-([[(2S,4R)-1-[(2S)-2-아미노-3,3-디메틸부타노일]-4-하이드록시피롤리딘-2-일]포름아미도]메틸)-5-(4-메틸-1,3-티아졸-5-일)페닐]메틸 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헵타콘탄-70-오에이트 염화수소 (850 mg, 0.55 mmol, 1.00당량), DIEA (283.4 mg, 2.19 mmol, 3.97당량), BOP (293 mg, 0.66 mmol, 1.20당량), DMF (15 mL)를 넣었다. 생성된 용액을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 생성된 용액을 에틸 아세테이트/THF(10/1, 500 mL)로 희석하고, 물(200 mL) 및 NH4Cl (포화 수용액, 200 mL)로 세척하였다. 유기물을 무수 황산나트륨 상에서 건조시키고, 진공 하에서 농축시켰다. 미정제 생성물을 분취-HPLC에 의해 정제하여 280.0 mg (22.79%)의 2-(((2S,4R)-1-((S)-2-(2-(4-((4-(4-(3-(2,6-디플루오로-3-(((R)-3-플루오로피롤리딘)-1-설폰아미도)벤조일)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-5-일)페닐)피페라진-1-일)메틸)피페리딘-1-일)아세트아미도)-3,3-디메틸부타노일)-4-하이드록시피롤리딘-2-카르복사미도)메틸)-5-(4-메틸티아졸-5-일)벤질 2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68-트리코사옥사헵타콘탄-70-오에이트를 연갈색 고체로서 수득하였다. LC/MS (ESI) m/z: 2223.44 [M+1] +; 1H-NMR (400MHz, CDCl3) δ 11.61 (s, 1H), 8.84 (s, 1H), 8.70 (s, 1H), 8.59 (s, 1H), 7.90 (m, 1H), 7.76 (s, 1H), 7.73-7.68 (m, 1H), 7.57-7.55 (m, 2H), 7.44-7.33 (m, 4H), 7.04-6.97 (m, 3H), 5.27-5.15 (m, 3H), 4.74 (m, 1H), 4.61-4.44 (m, 4H), 4.20-4.13 (m, 4H), 3.81-3.66 (m, 4H), 3.64-3.62 (m, 81H), 3.58-3.54 (m, 4H), 3.50-3.46 (m, 2H), 3.38 (s, 3H), 3.24 (m, 3H), 2.95-2.77 (m, 4H), 2.55-2.46 (m, 8H), 2.28-1.98 (m, 8H), 1.80-1.72 (m, 2H), 1.52 (m, 1H), 1.27 (s, 1H), 1.17 (m, 2H), 0.97 (s, 9H), 0.88-0.82 (m, 1H).
단백질 수준 대조군
본 명세서는 또한 세포에서 단백질 수준을 제어하는 방법을 제공한다. 이는, 바람직하게는 특정 치료 효과를 위해, 생체 내에서의 표적 단백질의 분해를 위해 특정 표적 단백질과 상호작용하여 생물학적 시스템에서의 단백질 양의 제어를 초래할 수 있는 것으로 알려져 있는, 본원에 기술된 화합물을 사용하는 것에 기초한다.
다음의 실시예는 본 발명을 설명하는 데 도움이 되지만, 어떠한 방식으로도 본 발명을 제한하는 것으로 이해되어서는 안된다.
다음의 실시예는 본 발명의 설명을 돕기 위한 것이며, 어떠한 방식으로도 본 발명을 제한하는 것으로 이해되어서는 안된다.
실시예
검정 및 분해 데이터
표적 단백질 분해(A375 세포)의 세포 분석을 위한 프로토콜. A375 세포를 12 웰 플레이트의 ATCC DMEM+10%FBS에서 배양하고, 표 1 내지 표 41로부터의 표시된 화합물 또는 0.1% DMSO 운반체 대조군을 16시간 동안 처리하였다. 세포를 Roche 프로테아제 억제제 정제(Cat# 11873580001)를 첨가하여 세포 신호전달 용해 완충액(Cat# 9803)에서 수확하고, 용해물을 마이크로원심분리로 정제하였다. 단백질을 SDS-PAGE로 분리하고, Invitrogen iBlot 시스템을 사용하여 니트로셀룰로오스 막으로 옮겼다. 면역블로팅은 BRAF(Santa Cruz Cat# 9002), CRAF(BD Cat#610151) 및 pErk(Cell Signaling Cat#9106)로 수행되었다. GAPDH(Cat#)를 로딩 대조군으로서 사용하였다. 정량화는 BioRad Image Lab 5 소프트웨어를 사용하여 수행되었다.
표적 단백질 분해(A375 세포)의 세포 내 웨스턴 세포 분석을 위한 프로토콜. A375 세포를 96 웰 플레이트의 ATCC DMEM+10%FBS에서 배양하고, 표 43으로부터의 표시된 화합물 또는 0.1% DMSO 운반체 대조군을 72시간 동안 처리하였다. 세포를 PBS 1x로 세척하고, 인산염 완충 염수 중의 4% PFA를 사용하여 15분 동안 플레이트에 부착하고; PBS 중에서 0.1% Triton-X-100을 사용하여 5분 동안 1X를 세척하고 투과시키고; LICOR 차단제(Cat.# 927-50000)로 1X로 세척하고 1시간 동안 차단하였다. 이어서, 세포를 LICOR 차단제 중 B-Raf 항체(Santa Cruz Cat# 9002) 및 튜불린 항체(Sigma #T6074)로 18시간 동안 배양하였다. 세포를 2차 항체(LICOR cat #926-32210 및 926-68071)를 첨가하기 전에 3회 세척하고 1시간 동안 배양하였다. 세포를 3회 세척하고 LICOR Odyssey 소프트웨어를 사용하여 이미지화하였다.
표 1A, 1B, 1C 및 1D의 이작용성 화합물은(각각 도 2A, 2B, 2C 및 2D) 본 출원의 청구범위에 기술된 이작용성 화합물의 예이다. 이들 중 일부는 세포 내에서 BRAF 단백질의 분해 활성을 나타낼 것인지를 확인하기 위해 테스트되었으며, 그 결과는 표 2A, 2B 및 2D (도 3A, 3B 및 3D) 내의 DC50 및 D최대의 열에 나타내었다. 여기서, DC50은 화합물로 세포를 배양하는 배지에 첨가된 화합물 농도의 함수로서 세포에서 BRAF 단백질 농도를 측정하는 용량-반응 곡선에서의 BRAF 농도 레벨이 최대 레벨과 최소 레벨 사이의 중점에 도달하는 화합물 농도이고, D최대는 화합물 농도를 변화시킴으로써 얻을 수 있는 최대 단백질 분해 레벨이다. 이들 표의 많은 화합물에 대한 DC50 및 D최대의 값 및 범위는 나타내지 않았으며, 이는 이들이 테스트 또는 합성되지 않았거나 예상 사례이기 때문이다.
전구약물의 반감기 및 방출율에 대한 프로토콜. 사슬 길이 이성질체는 크로마토그래피 분리 동안 머무름 시간에 있어서 약간 상이하며, 이는 원하는 PEG 사슬 길이에 대해 농축된 혼합물을 제공한다. 따라서, 크로마토그래피 분리는 균질한 사슬 길이 산물의 단리를 제공하지 않는다. 또한, LCMS에 의한 페길화된 샘플의 분석은, MS 신호가 보고되는 HPLC 피크 내의 시점, 또는 질량 신호가 평균화되는 간격에 따라 약간 다른 사슬 길이의 혼합물을 나타낼 것이다
사슬 길이 이성질체의 혼합물인 페길화된 화합물의 경우, 표 2C의 MS 데이터는 특정 화합물의 사슬 길이에 대해 계산된 질량과 밀접하게 일치하는 신호를 보고한다(예, n = 22).
탄소 13 및 중수소(각각 ~ 1% 순)의 자연적인 풍부함으로 인해, 전구약물(MW~2000) 크기의 유기 분자는 탄소-13 원자 또는 중수소 원자를 함유할 가능성이 있다. 따라서, 이들 분자에 대한 가장 강한 질량 분광 신호는 탄소 12 및 H-1을 가정하는 [M+H]+ 이온에 대해 계산된 질량보다 1 단위 더 무겁다. 가장 경량의 동위원소 피크(모든 탄소 12 및 H-1)는 모든 시료에서 관찰가능하고, 데이터 표에 보고된다.
본 개시의 전구약물과 같은, 큰 분자는, 통상적으로, 그리고 당업자에 의해 예상되는, 모노-, 이중- 및 삼중-양성자 이온에 대한 m/z 신호를 나타낸다. [M+H]+, [M+2H]2+ 및 [M+3H]3+. 종종, 모노-하전된 [M+H]+ 이온에 대한 MS 신호는 이중- 및 삼중-하전된 이온보다 약하다.
표 1C의 페길화된 전구약물에 대한 명칭은 Chemdraw Pro(버전 18.0)에 의해 생성되었으며, n = 22 사슬 길이 형태이고, 사슬 길이의 혼합물을 나타내지 않으며, 표 2C에서 발견된다.
본 개시의 PEG-전구약물을 다수의 종의 헤파린-안정화 혈장으로 처리하여 모 약물의 방출 속도를 연구하였다.
본 발명의 PEG 전구약물로부터 모 약물의 방출 속도를 결정하기 위한 프로토콜: 시험 화합물의 스톡 용액을 DMSO에서 제조하고 1 mM의 최종 농도로 희석하였다. 　 DMSO 및 아세토니트릴에서 각각 1 mM 로바스타틴 및 프로판텔린 작업 용액을 제조하였다. 프로판텔린 및 로바스타틴을 양성 대조군으로서 사용하였다. 2.5 μL의 이 1 mM 스톡 용액을 497.5 μL의 혈장에 첨가하여 5 μM의 최종 농도에 도달하였다. 유기 용매의 최종 농도는 0.5%였다. 검정을 중복하여 수행하였다. 반응 시료를 수조에서 대략 60 rpm으로 37℃에서 인큐베이션하였다. 전구약물 시료의 경우, 0, 2, 5, 15, 30, 120, 300 및 1440분에 반응 시료로부터 50 μL의 분취량을 취하였다. 중간체 또는 모체 표준의 경우, 0분에 반응 시료로부터 50 μL의 분취량을 취하였다. 인큐베이션 전과 후에 pH 값을 측정하였다.
내부 표준(IS, 200 ng/mL)을 함유하는 7 부피의 차가운 아세토니트릴을 첨가하여 반응을 중단시켰다. 대안적으로, 0.1% 포름산을 갖는 메탄올을 아세토니트릴로부터 침전시킨 화합물에 사용하였다.
모든 시료를 2분 동안 와류시킨 다음, 3220 g에서 30분 동안 원심분리하여 단백질을 침전시켰다. 100 μL의 상청액을 새로운 평판으로 옮겼다. 상청액을 LC-MS 신호 반응 및 피크 형상에 따라 초순수로 희석하였다. 시료를 LC-MS/MS로 분석하였다.
LC 시스템: ESI 인터페이스가 있는 AB Inc(캐나다)의 Shimadzu Triple Quad 6500+ Low Mass, 컬럼 온도: 40℃, 주입 부피: 10 μL, 컬럼: XSelect Hss T3 2.5μ (2.1Х30 mm) 컬럼 XP와 프리가드 컬럼 결합, 이동상: 아세토니트릴(B) 중 0.1% 포름산 및 물(A) 중 0.1% 포름산.
모든 계산은 마이크로소프트 엑셀을 사용하여 수행하였다. 각 시점에서의 전구약물의 나머지 백분율은 추출된 이온 크로마토그램으로부터의 피크 면적 비율에 의해 결정하였다. 중간체 또는 모체 약물(μM)의 성상은 전구약물 시료의 중간체 또는 모체 약물 및 중간체 또는 모 약물 표준의 피크 면적 비율에 의해 각각 계산하였다.
도 4, 도 5, 도 6a, 도 6b, 도 6c, 도 7, 도 8a, 도 8b, 도 9a, 도 9b 및 도 10의 요약. 화합물 512와 같은, PTM-IIa 및 PTM-IIb를 포함하는 이작용성 화합물은, 베무라페닙에 민감한(분류 1) 및 민감하지 않은(분류 2 및 분류 3) BRAF 돌연변이체의 표적화된 분해를 유도한다. 돌연변이체 BRAF의 분해는 MAPK를 억제하고 암 세포 성장을 정지시킬 수 있다. 야생형 BRAF는 본 개시의 이작용성 화합물을 결합시키고 삼원 복합체를 형성하는 능력에도 불구하고 분해로부터 보존되고; Cullin 2의 비효율적인 모집은 관찰된 결과를 설명할 수 있다. 유도된 분해는 베무라게닙 내성을 극복하기 위한 전략일 수 있다.
표 1A. 본 발명의 예시적인 단백질 표적화 모이어티 및 화합물(도 2a 참조).
표 1B. 본 발명의 예시적인 단백질 표적화 모이어티 및 화합물(도 2b 참조).
표 1C. 본 발명의 예시적인 단백질 표적화 모이어티 및 화합물(도 2c 참조).
표 1D. 본 발명의 예시적인 단백질 표적화 모이어티 및 화합물(도 2d 참조).
표 2A. 표 1A의 예시적인 화합물들의 분해 데이터(도 3a 참조).
표 2B. 표 1B의 예시적인 화합물의 분해 데이터(도 3b 참조).
표 2C. 표 1C의 예시적인 화합물의 분해 데이터(도 3c 참조).
표 2D. 표 1D의 예시적인 화합물의 분해 데이터(도 3d 참조).
본 발명의 특정 구현예
본 발명은 다음의 구체적인 구현예를 포함한다. 다음의 구현예는, 특정된 바와 같은 구현예에서 기술되는 모든 특징을 포함할 수 있다. 적용 가능한 경우, 다음의 구현예는 또한 임의의 진행형 구현예에 기술된 특징을 포괄적으로 또는 대안적으로 포함할 수 있다.
임의의 양태 또는 구현예에서, 본 설명은 이의 염, 전구약물, 다형체, 유사체, 유도체, 및 중수소화된 형태를 포함하는, 다음의 예시적인 RAF 이작용성 분자(표 1A, 1B, 1C의 화합물, 즉, 표 1A, 1B, 1C의 화합물 중 임의의 하나 또는 이의 조합)를 제공한다.
이와 같이, 본 설명은 표 1A-1C의 화합물 중 임의의 하나의 구조를 포함하는 화합물(즉, 표 1A, 1B, 1C의 화합물 중 임의의 하나 또는 이의 조합), 동일한 것을 포함하는 치료 조성물, 및 본원에서 기술된 바와 같은 사용 방법을 제공한다.

Claims (42)

  1. 하기 화학 구조식을 갖는 이작용성 화합물:
    ULM-L-PTM,
    또는 이의 약제학적으로 허용가능한 염, 거울상 이성질체, 입체 이성질체, 용매화물, 다형체 또는 전구약물로서,
    여기서,
    상기 ULM은 E3 유비퀴틴 리가아제에 결합하는 소분자 E3 유비퀴틴 리가아제 결합 모이어티고;
    상기 PTM은 급속 진행성 섬유육종(RAF) 단백질 표적화 모이어티를 포함하는 소분자이고; 및
    상기 L은 상기 ULM 및 상기 PTM을 연결하는 결합 또는 화학적 연결기 모이어티인, 이작용성 화합물.
  2. 제1항에 있어서, 상기 E3 유비퀴틴 리가아제 결합 모이어티는 폰 히펠 린다우(VLM), 세레블론(CLM), 마우스 이중-분 상동체2(MLM) 및 IAP(ILM)으로 이루어진 군으로부터 선택되는 E3 유비퀴틴 리가아제를 표적화하는, 이작용성 화합물.
  3. 제1항 또는 제2항에 있어서, 상기 PTM은 하기 화학 구조식 PTM-Ia 또는 PTM-Ib로 대표되는, 이작용성 화합물:


    여기서,
    이중 점선 결합은 방향족 결합이고;
    VPTM, WPTM, XPTM, YPTM, ZPTM은 하기 조합 중 하나이고: C, CH, N, N, C; C, N, N, CH, C; C, O, C, CH, C; C, S, C, CH, C; C, CH, C, O, C; C, CH, C, S, C; C, CH, N, CH, C; N, CH, C, CH, C; C, CH, C, CH, N; N, N, C, CH, C; N, CH, C, N, C; C, CH, C, N, N; C, N, C, CH, N; C, N, C, N, C; 및 C, N, N, N, C;
    XPTM35, XPTM36, XPTM37, 및 XPTM38은 CH 및 N으로부터 독립적으로 선택되고;
    RPTM1은 ULM, 화학적 연결기(L), CLM, ILM, VLM, MLM, ULM', CLM', ILM', VLM', MLM', 또는 이들의 조합에 공유 결합되고;
    RPTM2은 수소, 할로겐, 아릴, 메틸, 에틸, OCH3, NHCH3 또는 M1-CH2-CH2-M2이고, 여기서 M1은 CH2, O 및 NH이고, M2는 수소, 알킬, 고리형 알킬, 아릴 또는 헤테로고리이고;
    RPTM2a 및 RPTM2b는 수소, OH, 할로겐이고;
    RPTM3은 부재하거나, 수소, 아릴, 메틸, 에틸, 기타 알킬, 고리형 알킬, OCH3, NHCH3 또는 M1-CH2-CH2-M2이고, 여기서 M1은 CH2, O 및 NH이고, M2는 수소, 알킬, 고리형 알킬, 아릴 또는 헤테로고리이고;
    RPTM4은 수소, 할로겐, 아릴, 메틸, 에틸, OCH3, NHCH3 또는 M1-CH2-CH2-M2이고, 여기서 M1은 CH2, O 및 NH이고, M2는 수소, 알킬, 고리형 알킬, 아릴 또는 헤테로고리이고; 및
    RPTM5는 다음으로 이루어진 군으로부터 선택됨
  4. 제1항 또는 제2항에 있어서, 상기 PTM은 하기 화학 구조식 PTM-IIa 또는 PTM-IIb로 대표되는, 이작용성 화합물:

    여기서,
    XPTM1, XPTM2, XPTM3, XPTM4, XPTM5, 및 XPTM6은 CH 또는 N으로부터 독립적으로 선택되고;
    RPTM5a는 H, 선택적으로 치환된 아미드 (예를 들어, 알킬, 메틸, 에틸, 프로필, 또는 부틸기로 선택적으로 치환됨), 선택적으로 치환된 아민, -NHC(O)RPTM5로 이루어진 군으로부터 선택되고;
    RPTM5는 다음으로 이루어진 군으로부터 선택되고:

    RPTM5b는 수소 또는 선형 또는 분지형 C1-C4 알킬(예를 들어, 메틸 또는 에틸)이고;
    RPTM6a 및 RPTM6b는 각각 독립적으로 수소, 할로겐, 또는 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 C1-C6 알킬로부터 선택되고;
    RPTM6는 다음의 군 중 하나이고: 부재하거나, 수소, 할로겐, 아릴, 메틸, 에틸, OCH3, NHCH3 또는 M1-CH2-CH2-M2, 여기서 M1은 CH2, O 및 NH이고, M2는 수소, 알킬, 고리형 알킬, 아릴 또는 헤테로고리임;
    RPTM6c는 수소 또는 선형 또는 분지형 C1-C4 알킬(예를 들어, 메틸 또는 에틸)이고;
    RPTM7는 부재하거나, 수소, 할로겐, 아릴, 메틸, 에틸, OCH3, NHCH3 또는 M1-CH2-CH2-M2이고, 여기서 M1은 CH2, O 및 NH이고, M2는 수소, 알킬, 고리형 알킬, 아릴 또는 헤테로고리이고;
    RPTM8, RPTM9 또는 RPTM10은 부재하거나, 수소, 할로겐, 아릴, 헤테로아릴, 알킬, 시클로알킬, 헤테로고리, 메틸, 에틸, OCH3, NHCH3 또는 M1-CH2-CH2-M2 (여기서 M1은 CH2, O 및 NH이고, M2는 수소, 알킬, 고리형 알킬, 아릴 또는 헤테로고리임)로 이루어진 군으로부터 독립적으로 선택되고; 및
    RPTM11은 부재하거나, 수소, 할로겐, 메틸, 에틸, OCH3, NHCH3 또는 M1-CH2-CH2-M2이고(여기서 M1은 CH2, O 및 NH이고, M2는 수소, 알킬, 고리형 알킬, 아릴 또는 헤테로고리임),
    RPTM8, RPTM9, 또는 RPTM10 중 적어도 하나는 ULM, 화학적 연결기(L), CLM, ILM, VLM, MLM, ULM', CLM', ILM', VLM', MLM', 또는 이들의 조합에 공유 결합되도록 변형되거나, RPTM8, RPTM9, 및 RPTM10 중의 2개는 화학적 연결기로 다중고리(예를 들어, 이중고리) 융합된 고리를 형성하도록 변형됨.
  5. 제4항에 있어서,
    RPTM9이 공유 결합된 위치일 경우, RPTM7 및 RPTM8은 RPTM7 및 RPTM8이 부착된 고리를 가진 이중고리기를 형성하는 방식으로 공유결합을 통해 함께 연결되거나; 또는
    RPTM8이 공유 결합된 위치일 경우, RPTM9 및 RPTM10은 RPTM9 및 RPTM10이 부착된 고리를 가진 이중고리기를 형성하는 방식으로 공유결합을 통해 함께 연결되거나; 또는
    RPTM10이 공유 결합된 위치일 경우, RPTM8 및 RPTM9는 RPTM8 및 RPTM9가 부착된 고리를 가진 이중고리기를 형성하는 방식으로 공유결합을 통해 함께 연결되는, 이작용성 화합물.
  6. 제1항 또는 제2항에 있어서, 상기 PTM은 하기 화학 구조식 PTM-III으로 대표되는, 이작용성 화합물:

    여기서,
    XPTM7, XPTM8, XPTM9, XPTM10, XPTM11, XPTM12, XPTM13, XPTM14, XPTM15, XPTM16, XPTM17, XPTM18, XPTM19, XPTM20은 독립적으로 CH 또는 N이고;
    RPTM12, RPTM13, RPTM14, RPTM15, RPTM16, RPTM17, RPTM18, RPTM19는 부재하거나, 수소, 할로겐, 아릴, 헤테로아릴, 시클로알킬, 헤테로고리, 메틸, 에틸, 기타 알킬, OCH3, NHCH3 또는 M1-CH2-CH2-M2로 이루어진 군으로부터 독립적으로 선택되고, 여기서 M1은 CH2, O 및 NH이고, M2는 수소, 알킬, 고리형 알킬, 아릴 또는 헤테로고리이고;
    RPTM20은 4개 미만의 비-수소 원자를 함유하는 소형 기이고;
    RPTM21은 트리플루오로메틸, 클로로, 브로모, 플루오로, 메틸, 에틸, 프로필, 이소프로필, 삼차-부틸, 부틸, 이소-부틸, 시클로프로필, 시클로부틸, 시클로펜틸, 시클로헥실, OCH3, NHCH3, 디메틸아미노 또는 M1-CH2-CH2-M2로 이루어진 군으로부터 선택되고, 여기서 M1은 CH2, O 또는 NH이고, M2는 수소, 알킬, 고리형 알킬, 아릴 또는 헤테로고리이고; 및
    RPTM12, RPTM13 및 RPTM16 중 적어도 하나는 ULM, 화학적 연결기(L), CLM, ILM, VLM, MLM, ULM', CLM', ILM', VLM', MLM', 또는 이들의 조합에 공유 결합됨.
  7. 제6항에 있어서,
    RPTM12가 공유 결합된 위치일 경우, RPTM13 및 RPTM14는 RPTM13 및 RPTM14가 부착되는 고리를 가진 이중고리기를 형성하는 방식으로 공유결합을 통해 함께 연결되고/되거나, RPTM15 및 RPTM16은 RPTM15 및 RPTM16이 부착되는 고리를 가진 이중고리기를 형성하는 방식으로 공유결합을 통해 함께 연결되고;
    RPTM13이 공유 결합된 위치일 경우, RPTM12 및 RPTM16은 RPTM12 및 RPTM16이 부착되는 고리를 가진 이중고리기를 형성하는 방식으로 공유결합을 통해 함께 연결되고/되거나, RPTM15 및 RPTM16은 RPTM15 및 RPTM16이 부착되는 고리를 가진 이중고리기를 형성하는 방식으로 공유결합을 통해 함께 연결되고; 또는
    RPTM16이 공유 결합된 위치일 경우, RPTM12 및 RPTM13은 RPTM12 및 RPTM13이 부착되는 고리를 가진 이중고리기를 형성하는 방식으로 공유결합을 통해 함께 연결되고/되거나, RPTM13 및 RPTM14는 RPTM13 및 RPTM14가 부착되는 고리를 가진 이중고리기를 형성하는 방식으로 공유결합을 통해 함께 연결되는, 이작용성 화합물.
  8. 제1항 또는 제2항에 있어서, 상기 PTM은 하기 화학 구조식 PTM-IVa 또는 PTM-IVb로 대표되는, 이작용성 화합물:


    여기서,
    XPTM21, XPTM22, XPTM23, XPTM24, XPTM25, XPTM26, XPTM27, XPTM28, XPTM29, XPTM30, XPTM31, XPTM32, XPTM33, XPTM34는 독립적으로 CH 또는 N이고;
    RPTM22는 다음으로 이루어진 군으로부터 선택되고

    RPTM25a 및 RPTM25b는 각각 독립적으로 수소, 할로겐, 또는 (선형, 분지형, 선택적으로 치환된) C1-C6 알킬로부터 선택되고;
    RPTM23, RPTM24, RPTM28, RPTM29, RPTM30, RPTM31, RPTM32는 부재하거나, 결합, 수소, 할로겐, 아릴(선택적으로 치환됨), 헤테로아릴(선택적으로 치환됨), 시클로알킬(선택적으로 치환됨), 헤테로고리(선택적으로 치환됨), 메틸, 에틸(선택적으로 치환됨), (선형, 분지형, 선택적으로 치환된) 기타 알킬, OCH3, NHCH3 또는 M1-CH2-CH2-M2 (여기서 M1은 CH2, O 및 NH이고, M2는 수소, (선형, 분지형, 선택적으로 치환된) 알킬, 고리형 알킬(선택적으로 치환됨), 아릴(선택적으로 치환됨) 또는 헤테로고리(선택적으로 치환됨)임)로 이루어진 군으로부터 독립적으로 선택되고; 및
    RPTM25는 부재하거나, 수소, 할로겐, (선형, 분지형, 선택적으로 치환된) C1-C6 알킬, OCH3, NHCH3 또는 SCH3로부터 선택되고;
    RPTM26은 부재하거나, 수소, 할로겐, (선형, 분지형, 선택적으로 치환된) C1-C6 알킬, OCH3, NHCH3 또는 SCH3로부터 선택되고;
    RPTM27은 부재하거나, 수소, 할로겐, (선형, 분지형, 선택적으로 치환된) C1-C6 알킬, OCH3, NHCH3 또는 SCH3로 이루어진 군으로부터 선택되고; 및
    RPTM24, RPTM29, RPTM32 중 적어도 하나는 ULM, 화학적 연결기(L), CLM, ILM, VLM, MLM, ULM', CLM', ILM', VLM', MLM', 또는 이들의 조합에 공유 결합됨.
  9. 제8항에 있어서,
    RPTM24가 공유 결합된 위치일 경우, RPTM31 및 RPTM32는 RPTM31 및 RPTM32가 부착되는 고리를 가진 이중고리기를 형성하는 방식으로 공유결합을 통해 함께 연결되거나, RPTM29 및 RPTM30은 RPTM29 및 RPTM30이 부착되는 고리를 가진 이중고리기를 형성하는 방식으로 공유결합을 통해 함께 연결되거나; 또는
    RPTM29가 공유 결합된 위치일 경우, RPTM24 및 RPTM32는 RPTM24 및 RPTM32가 부착되는 고리를 가진 이중고리기를 형성하는 방식으로 공유결합을 통해 함께 연결되고/되거나, RPTM31 및 RPTM32는 RPTM31 및 RPTM32가 부착되는 고리를 가진 이중고리기를 형성하는 방식으로 공유결합을 통해 함께 연결되거나; 또는
    RPTM32가 공유 결합된 위치일 경우, RPTM24 및 RPTM29는 RPTM24 및 RPTM29가 부착되는 고리를 가진 이중고리기를 형성하는 방식으로 공유결합을 통해 함께 연결되고/되거나, RPTM29 및 RPTM30은 RPTM29 및 RPTM30이 부착되는 고리를 가진 이중고리기를 형성하는 방식으로 공유결합을 통해 함께 연결되는, 이작용성 화합물.
  10. 제1항 또는 제2항에 있어서, 상기 PTM은 하기 화학 구조식 PTM-Va로 대표되는, 이작용성 화합물:

    여기서,
    XPTM35, XPTM36, XPTM37, XPTM38, 및 XPTM39은 독립적으로 CH 또는 N이고;
    RPTM33은 할로겐 또는 선형 또는 분지형 C1-C4 할로알킬이고;
    RPTM34, RPTM35, RPTM36, RPTM37, 및 RPTM38은 수소, 할로겐, 또는 선형 또는 분지형 C1-C4 알킬(예를 들어, 메틸, 에틸, 프로필, 또는 부틸)로부터 각각 독립적으로 선택되고;
    RPTM39는 선택적으로 치환된 C4-C7 헤테로시클로알킬(예를 들어, 선택적으로 치환된 C5 또는 C6 헤테로시클로알킬)이고; 및
    은 ULM, 화학적 연결기(L), CLM, ILM, VLM, MLM, ULM', CLM', ILM', VLM', MLM', 또는 이들의 조합과의 부착 지점임.
  11. 제1항 내지 제10항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 PTM은 PTM-1, PTM-2, PTM-3, PTM-4, PTM-5, PTM-6, PTM-7, PTM-8, PTM-9, PTM-10, PTM-11, PTM-12, 및 PTM-13로 이루어진 군으로부터 선택되는, 이작용성 화합물:

  12. 제1항 내지 제11항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 ULM은 다음으로 이루어진 군으로부터 선택되는, 이작용성 화합물:


    여기서 R14a는 메틸 또는 하이드록시메틸임.
  13. 제1항 내지 제11항 중 어느 한 항에 있어서, ULM은 하기로 대표되는 화학적 구조를 갖는 폰 히펠-린다우(VHL) 리가아제-결합 모이어티(VLM)인, 이작용성 화합물:

    여기서,
    X1, X2는, 결합부, O, NRY3, CRY3RY4, C=O, C=S, SO, 및 SO2의 군으로부터 각각 독립적으로 선택되고;
    RY3, RY4는 각각 독립적으로 H, (1개 이상의 할로로 선택적으로 치환된) 선형 또는 분지형 C1-6 알킬, 선택적으로 치환된 C1-6 알콕실(예를 들어, 0 내지 3개의 RP 기로 선택적으로 치환됨)의 군으로부터 선택되고;
    RP 는 H, 할로, -OH, C1-3 알킬, C=O로부터 각각 독립적으로 선택되는 0, 1, 2 또는 3개의 기이고;
    W3는, 선택적으로 치환된 T, 선택적으로 치환된 -T-N(R1aR1b)X3, 선택적으로 치환된 -T-N(R1aR1b), 선택적으로 치환된 -T-아릴, 선택적으로 치환된 -T-헤테로아릴, 선택적으로 치환된 -T-비헤테로아릴, 선택적으로 치환된 -T-헤테로고리, 선택적으로 치환된 -T-비헤테로고리, 선택적으로 치환된 -NR1-T-아릴, 선택적으로 치환된 -NR1-T-헤테로아릴, 또는 선택적으로 치환된 -NR1-T-헤테로고리의 군으로부터 선택되고;
    식 ULM-a의 X3는 C=O, R1, R1a, R1b이고;
    R1, R1a, R1b는 H, 1개 이상의 할로 또는 -OH기로 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 C1-C6 알킬기, RY3C=O, RY3C=S, RY3SO, RY3SO2, N(RY3RY4)C=O, N(RY3RY4)C=S, N(RY3RY4)SO 및 N(RY3RY4)SO2로 이루어진 군으로부터 각각 독립적으로 선택되고;
    T는 선택적으로 치환된 알킬, -(CH2)n-의 군으로부터 선택되며, 여기서 각각의 메틸렌 기는 할로겐, 메틸, 선택적으로 치환된 알콕시, 1개 이상의 할로겐에 의해 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 C1-C6 알킬기, C(O) NR1R1a, 또는 NR1R1a의 군으로부터 선택되는 1개 또는 2개의 치환기로 선택적으로 치환되고, 또는 R1 및 R1a은 선택적으로 치환된 헤테로고리, 또는 -OH 기 또는 선택적으로 치환된 아미노산 측쇄를 형성하기 위해 결합되고; 및
    n은 0 내지 6이고,
    W4는 또는 이고;
    R14a, R14b,는 H, 할로알킬, 선택적으로 치환된 알콕시, 선택적으로 치환된 하이드록실 알킬, -(CH2)m'C(=O)(CH2)m'C(=O)(OH), (CH2)m'OCOCH2(CH2)m'OCH2(CH2)m'CO(CH2)m'OH, (CH2)m'OCOCH2(CH2)m'CO(CH2)m'OH, 또는 선택적으로 산소로 대체된 하나 이상의 탄소를 갖는 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 알킬로 이루어진 군으로부터 각각 독립적으로 선택되고;
    R1은 H, 1개 이상의 할로 또는 -OH 기로 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 C1-C6 알킬기이고;
    각각의 m'은 개별적으로 1 내지 4의 정수(예를 들어, 1, 2, 3 또는 4)이고;
    W5은 선택적으로 치환된 페닐, 선택적으로 치환된 5 내지 10-원 헤테로아릴로 이루어진 군으로부터 선택되고,
    W6은 선택적으로 치환된 8 내지 14-원 이중고리 헤테로고리이고;
    R15는 H, 할로겐, CN, OH, NO2, N R14aR14b, OR14a, CONR14aR14b, NR14aCOR14b, SO2NR14aR14b, NR14a SO2R14b, 선택적으로 치환된 알킬, 선택적으로 치환된 할로알킬, 선택적으로 치환된 할로알콕시 선택적으로 치환된 아릴, 선택적으로 치환된 헤테로아릴, 선택적으로 치환된 시클로알킬, 또는 선택적으로 치환된 시클로헤테로알킬로 이루어진 군으로부터 선택되고; 및
    점선은 적어도 하나의 PTM, 또 다른 ULM(ULM'), 또는 적어도 하나의 PTM 또는 ULM' 또는 둘 모두를 ULM에 결합시키는 화학적 연결기 모이어티의 부착 지점을 나타냄.
  14. 제1항 내지 제11항 중 어느 한 항에 있어서, ULM은 하기로 대표되는 화학적 구조를 갖는 폰 히펠-린다우(VHL) 리가아제-결합 모이어티(VLM)인, 이작용성 화합물:

    여기서,
    W3은 선택적으로 치환된 아릴, 선택적으로 치환된 헤테로아릴, 또는 로 이루어진 군으로부터 선택되고;
    R9 및 R10은 독립적으로 수소, 선택적으로 치환된 알킬, 선택적으로 치환된 시클로알킬, 선택적으로 치환된 하이드록시알킬, 선택적으로 치환된 헤테로아릴 또는 할로알킬이거나, R9, R10 및 이들이 부착되는 탄소 원자는 선택적으로 치환된 시클로알킬을 형성하고;
    R11은 선택적으로 치환된 헤테로고리, 선택적으로 치환된 알콕시, 선택적으로 치환된 헤테로아릴, 선택적으로 치환된 아릴, , 또는 로 이루어진 군으로부터 선택되고;
    R12는 H 또는 선택적으로 치환된 알킬의 군으로부터 선택되고;
    R13은 H, 선택적으로 치환된 알킬, 선택적으로 치환된 알킬카르보닐, 선택적으로 치환된 (시클로알킬)알킬카르보닐, 선택적으로 치환된 아랄킬카르보닐, 선택적으로 치환된 아릴카르보닐, 선택적으로 치환된 (헤테로시클릴)카르보닐, 또는 선택적으로 치환된 아랄킬의 군으로부터 선택되고;
    R1은 H, 1개 이상의 할로 또는 -OH 기로 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 C1-C6 알킬기이고;
    R14a, R14b,는 H, 할로알킬, 선택적으로 치환된 알콕시, (CH2)m'OCOCH2(CH2)m'OCH2(CH2)m'CO(CH2)m'OH, (CH2)m'OCOCH2(CH2)m'CO(CH2)m'OH, 선택적으로 치환된 하이드록실 알킬, -(CH2)m'C(=O)(CH2)m'C(=O)(OH), 또는 선택적으로 산소로 대체된 하나 이상의 탄소를 갖는 선택적으로 치환된 알킬로 이루어진 군으로부터 각각 독립적으로 선택되고;
    각각의 m'은 개별적으로 1 내지 4의 정수(예를 들어, 1, 2, 3 또는 4)이고;
    W5은 선택적으로 치환된 페닐 또는 선택적으로 치환된 5 내지 10-원 헤테로아릴로 이루어진 군으로부터 선택되고,
    R15는 H, 할로겐, CN, OH, NO2, NR14aR14b, OR14a, CONR14aR14b, NR14aCOR14b, SO2NR14aR14b, NR14a SO2R14b, 선택적으로 치환된 알킬, 선택적으로 치환된 할로알킬, 선택적으로 치환된 할로알콕시, 선택적으로 치환된 아릴, 선택적으로 치환된 헤테로아릴, 선택적으로 치환된 시클로알킬, 또는 선택적으로 치환된 시클로헤테로알킬로 이루어진 군으로부터 선택되고;
    각각의 R16은 H, CN, 할로, 선택적으로 산소 원자로 대체된 하나 이상의 탄소 원자를 갖는 선택적으로 치환된 알킬, 선택적으로 치환된 할로알킬, 하이드록시, 또는 선택적으로 치환된 할로알콕시의 군으로부터 독립적으로 선택되고;
    o는 0, 1, 2, 3, 또는 4이고;
    R18은 H, 할로, 선택적으로 치환된 알콕시, 시아노, 선택적으로 치환된 알킬, 할로알킬, 할로알콕시 또는 연결기의 군으로부터 독립적으로 선택되고; 및
    p는 0, 1, 2, 3 또는 4이고, 점선은 적어도 하나의 PTM, 또 다른 ULM(ULM'), 또는 적어도 하나의 PTM 또는 ULM' 또는 둘 모두를 ULM에 결합시키는 화학적 연결기 모이어티의 부착 부위를 나타냄.
  15. 제1항 내지 제11항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 ULM은 다음의 군으로부터 선택되는 화학적 구조를 갖는, 이작용성 화합물:

    여기서,
    R1은 H, 에틸, 이소프로필, 삼차-부틸, 2차-부틸, 시클로프로필, 시클로부틸, 시클로펜틸, 또는 시클로헥실; 선택적으로 치환된 알킬, 선택적으로 치환된 하이드록시알킬, 선택적으로 치환된 헤테로아릴, 또는 할로알킬이고;
    R14a는 H, 할로알킬, 선택적으로 치환된 알킬, 메틸, 플루오로메틸, 하이드록시메틸, 에틸, 이소프로필, (CH2)m'OCOCH2(CH2)m'OCH2(CH2)m'CO(CH2)m'OH, (CH2)m'OCOCH2(CH2)m'CO(CH2)m'OH, 또는 시클로프로필이고;
    각각의 m'은 개별적으로 1 내지 4의 정수(예를 들어, 1, 2, 3 또는 4)이고;
    R15는 H, 할로겐, CN, OH, NO2, 선택적으로 치환된 헤테로아릴, 선택적으로 치환된 아릴; 선택적으로 치환된 알킬, 선택적으로 치환된 할로알킬, 선택적으로 치환된 할로알콕시, 선택적으로 치환된 시클로알킬, 또는 선택적으로 치환된 시클로헤테로알킬로 이루어진 군으로부터 선택되고;
    X는 C, CH2, 또는 C=O이고;
    R3는 결합부 또는 선택적으로 치환된 5- 또는 6-원 헤테로아릴이고; 및
    점선은 적어도 하나의 PTM, 또 다른 ULM(ULM'), 또는 적어도 하나의 PTM 또는 ULM' 또는 둘 모두를 상기 ULM에 결합시키는 화학적 연결기 모이어티의 부착 지점을 나타냄.
  16. 제1항 내지 제11항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 ULM은 하기 화학 구조식에 따른 기를 포함하는, 이작용성 화합물:

    여기서,
    R14a는 H, 할로알킬, 선택적으로 치환된 알킬, 메틸, 플루오로메틸, 하이드록시메틸, 에틸, 이소프로필, (CH2)m'OCOCH2(CH2)m'OCH2(CH2)m'CO(CH2)m'OH, (CH2)m'OCOCH2(CH2)m'CO(CH2)m'OH, 또는 시클로프로필이고;
    각각의 m'은 개별적으로 1 내지 4의 정수(예를 들어, 1, 2, 3 또는 4)이고;
    R9는 H이고;
    R10은 H, 에틸, 이소프로필, 삼차-부틸, 2차-부틸, 시클로프로필, 시클로부틸, 시클로펜틸, 또는 시클로헥실이고;
    R11는 ; 선택적으로 치환된 헤테로아릴, 또는 이고;
    p는 0, 1, 2, 3, 또는 4이고; 및
    각각의 R18은 독립적으로 할로, 선택적으로 치환된 알콕시, 시아노, 선택적으로 치환된 알킬, 할로알킬, 할로알콕시 또는 연결기이고;
    R12는 H, C=O이고;
    R13은 H, 선택적으로 치환된 알킬, 선택적으로 치환된 알킬카르보닐, 선택적으로 치환된 (시클로알킬)알킬카르보닐, 선택적으로 치환된 아랄킬카르보닐, 선택적으로 치환된 아릴카르보닐, 선택적으로 치환된 (헤테로시클릴)카르보닐, 또는 선택적으로 치환된 아랄킬이고,
    R15는 H, 할로겐, Cl, CN, OH, NO2, 선택적으로 치환된 헤테로아릴, 선택적으로 치환된 아릴, 선택적으로 치환된 시클로헤테로아릴, 로 이루어진 군으로부터 선택되고; 및
    점선은 적어도 하나의 PTM, 또 다른 ULM (ULM'), 또는 적어도 하나의 PTM 또는 ULM' 또는 둘 모두를 ULM에 결합시키는 화학적 연결기 모이어티의 부착 부위를 나타냄.
  17. 제1항 내지 제11항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 ULM은 탈리도미드, 레날리도미드, 포말리도미드, 이의 유사체, 이의 동배체, 또는 이의 유도체로 이루어진 군으로부터 선택되는 세레블론 E3 리가아제-결합 모이어티(CLM)인, 이작용성 화합물.
  18. 제1항 내지 제11항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 ULM은 하기로 대표되는 화학 구조식을 갖는 CLM인, 이작용성 화합물:



    여기서,
    W는 CH2, O, CHR, C=O, SO2, NH, 선택적으로 치환된 시클로알킬, 선택적으로 치환된 헤테로시클로알킬, 및 N-알킬로 이루어진 군으로부터 선택되고;
    W3은 C 또는 N으로부터 선택되고;
    각각의 X는 O, S, 및 CH2로 이루어진 군으로부터 독립적으로 선택되고;
    Y는 CH2, -C=CR', NH, N-알킬, N-아릴, N-헤트아릴, N-시클로알킬, N-헤테로시클릴, O, 및 S로 이루어진 군으로부터 선택되고;
    Z는 O, S, 및 CH2로 이루어진 군으로부터 선택되고;
    G 및 G'는 H, 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 알킬, OH, -(CH2)n'-O-P(=O)(O-C1-6알킬)(OH), -(CH2)n'-O-P(=O)(O-C1-6알킬)2,-(CH2)n'-O-P(=O)(OH)2, -CH2OCOO(CH2CH2O)n"CH3,R'OCOOR, R'OCONRR", R'로 선택적으로 치환된 CH2-헤테로시클릴, 및 R'로 선택적으로 치환된 벤질로 이루어진 군으로부터 독립적으로 선택되고;
    n"은 8 내지 35의 정수이고(예를 들어, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17. 18. 19. 20. 21. 22. 23 24. 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 또는 35);
    Q1, Q2, Q3, 및 Q4는 각각 독립적으로, H, R, N 또는 N-산화물로부터 독립적으로 선택되는 기로 치환된 탄소 C를 나타내고;
    A는 H, 선택적으로 치환된 선형, 분지형 알킬, 시클로알킬, Cl 및 F 군으로부터 독립적으로 선택되고;
    R은 할로겐, -CONR'R", -OR', -NR'R", -SR', -SO2R', -SO2NR'R", -CR'R"-, -CR'NR'R"-, (-CR'O)n'R", 선택적으로 치환된-아릴(예를 들어, 선택적으로 치환된 C5-C7 아릴), 선택적으로 치환된 알킬-아릴(예를 들어, 선택적으로 치환된 C1-C6 알킬, 선택적으로 치환된 C5-C7 아릴, 또는 이들의 조합 중 적어도 하나를 포함하는 알킬-아릴), 선택적으로 치환된-헤테로아릴(예를 들어, 선택적으로 치환된 C5-C7 헤테로아릴), 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형-알킬(예를 들어, 1개 이상의 할로겐으로 선택적으로 치환된 C1-C6 선형 또는 분지형 알킬, 시클로알킬(예를 들어, C3-C6 시클로알킬), 또는 아릴(예를 들어, C5-C7 아릴)), 선택적으로 치환된 알콕실기(예를 들어, 메톡시, 에톡시, 부톡시, 프로폭시, 펜톡시, 또는 헥옥시; 여기서 상기 알콕실은 1개 이상의 할로겐, 알킬, 할로알킬, 플루오로알킬, 시클로알킬(예를 들어, C3-C6 시클로알킬), 또는 아릴(예를 들어, C5-C7 아릴)으로 치환될 수 있다), 선택적으로 치환된 (예를 들어, 1개 이상의 할로겐, 알킬, 할로알킬, 플루오로알킬, 시클로알킬(예: C3-C6 시클로알킬), 또는 아릴(예를 들어, C5-C7 아릴)으로 선택적으로 치환됨), 선택적으로 치환된 (예를 들어, 1개 이상의 할로겐, 알킬, 할로알킬, 플루오로알킬, 시클로알킬(예를 들어, C3-C6 시클로알킬), 또는 아릴(예를 들어, C5-C7 아릴)으로 선택적으로 치환됨), 선택적으로 치환된 시클로알킬(예를 들어, 선택적으로 치환된 C3-C7 시클로알킬), 선택적으로 치환된-헤테로시클릴(예를 들어, 선택적으로 치환된 C3-C7 헤테로시클릴), -P(O)(OR')R", -P(O)R'R", -OP(O)(OR')R", -OP(O)R'R", -Cl, -F, -Br, -I, -CF3, -CN, -NR'SO2NR'R", -NR'CONR'R", -CONR'COR", -NR'C(=N-CN)NR'R", -C(=N-CN)NR'R", -NR'C(=N-CN)R", -NR'C(=C-NO2)NR'R", -SO2NR'COR", -NO2, -CO2R', -C(C=N-OR')R", -CR'=CR'R", -CCR', -S(C=O)(C=N-R')R", -SF5 및 -OCF3, (여기서 적어도 하나의 R는 PTM, 화학적 연결기(L), ULM, CLM'(예를 들어, CLM'은 제1 CLM과 동일하거나 상이한 구조를 갖는 추가 CLM임), 또는 이들의 조합에 공유 결합되도록 변형된다)을 포함하고;
    x, y, 및 z의 각각은 독립적으로 0, 1, 2, 3, 4, 5, 또는 6이고;
    식 (a) 내지 식 (f)의 n' 및 n은 각각 독립적으로 1 내지 10의 정수(예를 들어, 1 내지 4, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 또는 10)이고;
    R' 및 R"은, H, 선택적으로 치환된 선형, 분지형 알킬, 선택적으로 치환된 시클로알킬, 선택적으로 치환된 아릴, 선택적으로 치환된 헤테로아릴, 선택적으로 치환된 헤테로고리, -C(=O)R, 선택적으로 치환된 헤테로시클릴로 이루어진 군으로부터 독립적으로 선택되고;
    은 단일 결합 또는 이중 결합을 나타내고; 및
    은 입체특이적((R) 또는 (S)) 또는 비-입체특이적일 수 있는 결합부를 나타냄.
  19. 제1항 내지 제11항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 ULM은 하기로 대표되는 화학 구조식을 갖는 CLM인, 이작용성 화합물:

    여기서,
    W는 CH2, C=O, NH, 및 N-알킬로 이루어진 군으로부터 독립적으로 선택되고;
    A는 H, 메틸, 선택적으로 치환된 알킬(예를 들어, (선형, 분지형, 선택적으로 치환된) C1-C6 알킬)로부터 독립적으로 선택되고;
    식 (g)의 R은 H, O, OH, N, NH, NH2, 할로겐, 메틸, 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 알킬(예를 들어, 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 C1-C6 알킬), 선택적으로 치환된 C1-C6 알콕시, 선택적으로 치환된-시클로알킬(예를 들어, 선택적으로 치환된 C3-C7 시클로알킬), 선택적으로 치환된-헤테로시클릴(예: 선택적으로 치환된 C3-C7 헤테로시클릴), 선택적으로 치환된-알킬-아릴(예를 들어, C1-C6 알킬, C4-C7 아릴, 또는 이들의 조합 중 적어도 하나를 포함하는 -알킬-아릴), 선택적으로 치환된 아릴(예를 들어, C5-C7 아릴), 아민, 아미드, 또는 카르복시)로부터 독립적으로 선택되고;
    식 (g)의 n은 1 내지 4의 정수(예를 들어, 1, 2, 3 또는 4)를 나타내며, 여기서 적어도 하나의 R(예를 들어, O, OH, N, NH, NH2, C1-C6 알킬, C1-C6 알콕시, -알킬-아릴(예를 들어, C1-C6 알킬, C4-C7 아릴, 또는 이들의 조합 중 적어도 하나를 포함하는 -알킬-아릴), 아릴(예를 들어, C5-C7 아릴), 아민, 아미드, 또는 카르복시 중 적어도 하나)는 PTM, 화학적 연결기(L), ULM, CLM (또는 CLM'), 또는 이들의 조합에 공유 결합되도록 변형되고; 그리고 은 입체특이적((R) 또는 (S)) 또는 비-입체특이적일 수 있는 결합부를 나타냄.
  20. 제1항 내지 제11항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 ULM은 하기로 대표되는 화학 구조식을 갖는 CLM인, 이작용성 화합물:




    여기서,
    W는 CH2, O, CHR, C=O, SO2, NH, 선택적으로 치환된 시클로알킬, 선택적으로 치환된 헤테로시클알킬, 및 N-알킬로부터 독립적으로 선택되고;
    Q1, Q2, Q3, Q4, Q5는 각각 독립적으로 H, R', N 또는 N-산화물로부터 독립적으로 선택된 기로 치환된 탄소 C 또는 N를 나타내고;
    R1은 부재하거나, H, OH, CN, C1-C3 알킬, C=O로부터 선택되고;
    R2는 부재하거나, H, OH, CN, C1-C3 알킬, CHF2, CF3, CHO, C(=O)NH2 군으로부터 선택되고;
    R3는 H, 알킬(예를 들어, C1-C6 또는 C1-C3 알킬), 치환된 알킬(예를 들어, 치환된 C1-C6 또는 C1-C3 알킬), 알콕시(예를 들어, C1-C6 또는 C1-C3 알콕실), 치환된 알콕시(예를 들어, 치환된 C1-C6 또는 C1-C3 알콕실)로부터 선택되고;
    R4는 H, 알킬, 치환된 알킬로부터 선택되고;
    R5 및 R6는 각각 독립적으로 H, 할로겐, C(=O)R', CN, OH, CF3이고;
    X는 C, CH, C=O, 또는 N이고;
    X1은 C=O, N, CH 또는 CH2이고;
    R'은 H, OH, 할로겐, 아민, 시아노, 알킬(예를 들어, C1-C3 알킬), 치환된 알킬(예를 들어, 치환된 C1-C3 알킬), 알콕시(예를 들어, C1-C3 알콕실), 치환된 알콕시(예를 들어, 치환된 C1-C3 알콕실), NR2R3, C(=O)OR2, 선택적으로 치환된 페닐로부터 선택되고;
    n은 0 내지 4이고;
    는 단일 또는 이중 결합이고; 및
    상기 CLM은 PTM, 화학적 연결기(L), ULM, CLM(또는 CLM') 또는 이들의 조합에 공유 결합됨.
  21. 제1항 내지 제11항 중 어느 한 항에 있어서,
    상기 ULM은 치환된 이미다졸린, 치환된 스피로-인돌리논, 치환된 피롤리딘, 치환된 피페리디논, 치환된 모르폴리논, 치환된 피롤로피리미딘, 치환된 이미다졸로피리딘, 치환된 티아졸로이미다졸린, 치환된 피롤로피롤리디논, 및 치환된 이소퀴놀리논으로 이루어진 군으로부터 선택되는 화학적 모이어티를 갖는 (MDM2) 결합 모이어티(MLM)이고; 또는
    상기 ULM은 아미노산 알라닌(A), 발린(V), 프롤린(P), 및 이소류신(I) 또는 그들의 인공적인 모방체를 포함하는 IAP E3 유비퀴틴 리가아제 결합 모이어티(ILM)인, 이작용성 화합물.
  22. 제1항 내지 제11항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 ULM은 AVPI 테트라펩티트 단편 또는 이의 유도체를 포함하는 IAP E3 유비퀴틴 리가아제 결합 모이어티(ILM)인, 이작용성 화합물.
  23. 제1항에 있어서, (i) 화학적 연결기(L)는 화합물 307-873의 연결기로부터 선택되고, (ii) ULM은 화합물 307-873의 ULM으로부터 선택되고, (iii) PTM은 화합물 307-873의 PTM으로부터 선택되고, (iv) 화합물은 화합물 796-873의 PTM으로부터 선택된 전구약물 화학적 모이어티를 추가로 포함하고, 또는 (v) 이들의 조합 중 적어도 하나인, 이작용성 화합물.
  24. 제1항 내지 제23항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 연결기(L)는 하기 식으로 대표되는 화학적 구조 단위를 포함하는, 이작용성 화합물:
    -(AL)q-,
    여기서,
    (AL)q는 상기 ULM, 상기 PTM 또는 이들의 조합 중 적어도 하나에 연결된 기이고;
    q는 1 이상의 정수이고;
    각각의 AL은, 결합, CRL1RL2, O, S, SO, SO2, NRL3, SO2NRL3, SONRL3, CONRL3, NRL3CONRL4, NRL3SO2NRL4, CO, CRL1=CRL2, C≡C, SiRL1RL2, P(O)RL1, P(O)ORL1, NRL3C(=NCN)NRL4, NRL3C(=NCN), NRL3C(=CNO2)NRL4, 0 내지 6개의 RL1 및/또는 RL2 기로 선택적으로 치환된 C3-11시클로알킬, 0 내지 6개의 RL1 및/또는 RL2 기로 선택적으로 치환된 C3-11헤테로시클릴, 0 내지 6개의 RL1 및/또는 RL2 기로 선택적으로 치환된 아릴, 0 내지 6개의 RL1 및/또는 RL2 기로 선택적으로 치환된 헤테로아릴로 이루어진 군으로부터 독립적으로 선택되고, 여기서, RL1 또는 RL2는, 각각 독립적으로 또 다른 기에 선택적으로 연결되어 0 내지 4개의 RL5 기로 선택적으로 치환된 시클로알킬 및/또는 헤테로시클릴 모이어티를 형성하고; 및
    RL1, RL2, RL3, RL4 및 RL5는 각각 독립적으로 H, 할로, C1-8알킬, OC1-8알킬, SC1-8알킬, NHC1-8알킬, N(C1-8알킬)2, C3-11시클로알킬, 아릴, 헤테로아릴, C3-11헤테로시클릴, OC3-8시클로알킬, SC3-8시클로알킬, NHC3-8시클로알킬, N(C3-8시클로알킬)2, N(C3-8시클로알킬)(C1-8알킬), OH, NH2, SH, SO2C1-8알킬, P(O)(OC1-8알킬)(C1-8알킬), P(O)(OC1-8알킬)2, CC-C1-8알킬, CCH, CH=CH(C1-8알킬), C(C1-8알킬)=CH(C1-8알킬), C(C1-8알킬)=C(C1-8알킬)2, Si(OH)3, Si(C1-8알킬)3, Si(OH)(C1-8알킬)2, COC1-8알킬, CO2H, 할로겐, CN, CF3, CHF2, CH2F, NO2, SF5, SO2NHC1-8알킬, SO2N(C1-8알킬)2, SONHC1-8알킬, SON(C1-8알킬)2, CONHC1-8알킬, CON(C1-8알킬)2, N(C1-8알킬)CONH(C1-8알킬), N(C1-8알킬)CON(C1-8알킬)2, NHCONH(C1-8알킬), NHCON(C1-8알킬)2, NHCONH2, N(C1-8알킬)SO2NH(C1-8알킬), N(C1-8알킬) SO2N(C1-8알킬)2, NH SO2NH(C1-8알킬), NH SO2N(C1-8알킬)2, NH SO2NH2임.
  25. 제1항 내지 제24항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 연결기(L)는 하기로 이루어지는 군으로부터 선택되는 일반적인 구조로 대표되는 기를 포함하는, 이작용성 화합물:
    -N(R)-(CH2)m-O(CH2)n-O(CH2)o-O(CH2)p-O(CH2)q-O(CH2)r-OCH2-,
    -O-(CH2)m-O(CH2)n-O(CH2)o-O(CH2)p-O(CH2)q-O(CH2)r-OCH2-,
    -O-(CH2)m-O(CH2)n-O(CH2)o-O(CH2)p-O(CH2)q-O(CH2)r-O-;
    -N(R)-(CH2)m-O(CH2)n-O(CH2)o-O(CH2)p-O(CH2)q-O(CH2)r-O-;
    -(CH2)m-O(CH2)n-O(CH2)o-O(CH2)p-O(CH2)q-O(CH2)r-O-;
    -(CH2)m-O(CH2)n-O(CH2)o-O(CH2)p-O(CH2)q-O(CH2)r-OCH2-;




    여기서, 각각의 m, n, o, p, q, 및 r은 독립적으로 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6이고, 0일 경우, N-O 또는 O-O 결합은 없고, R은 H, 메틸 또는 에틸의 군으로부터 선택되고, X는 H 또는 F의 군으로부터 선택됨;








  26. 제1항 내지 제24항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 연결기(L)는 하기로 이루어지는 군으로부터 선택되는, 이작용성 화합물:


























    여기서 m, n, o, p, q, r, 또는 s은 독립적으로 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 또는 20임.
  27. 제1항 내지 제24항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 연결기(L)는 하기로 이루어지는 군으로부터 선택되는, 이작용성 화합물:














    ; 및 ,
    여기서, 각각의 m 및 n은 독립적으로 0, 1, 2, 3, 4, 5 또는 6임.
  28. 제1항 내지 제24항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 연결기(L)는 하기로 이루어지는 군으로부터 선택되는, 이작용성 화합물:



  29. 제1항 내지 제23항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 연결기(L)는 하기 화학 구조를 포함하는, 이작용성 화합물:
    또는 ,
    여기서,
    WL1 및 WL2은 각각 독립적으로 부재하거나, RQ로 선택적으로 치환된, 0-4개의 헤테로원자를 갖는 4-8 원 고리이고, 각각의 RQ는 독립적으로 H, 할로, OH, CN, CF3, 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 C1-C6 알킬, 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 C1-C6 알콕시, 또는 0-4개의 헤테로원자를 포함하는 4-8 원 고리 시스템을 형성하기 위해 이들이 부착하는 원자와 함께 취해진 2개의 RQ기이고;
    YL1은 각각 독립적으로 결합, 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 C1-C6 알킬이고, 선택적으로 하나 이상의 C 원자가 O로 대체되고; 또는 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 C1-C6 알콕시이고;
    n은 0 내지 10이고; 및
    은 PTM 또는 ULM 모이어티에 대한 부착 지점을 나타냄.
  30. 제1항 내지 제23항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 연결기(L)는 하기 화학 구조를 포함하는, 이작용성 화합물:
    , ,
    , 또는
    ,,
    여기서,
    WL1 및 WL2는 각각 독립적으로 부재하거나, 아릴, 헤테로아릴, 고리형, 헤테로고리형, C1-6 알킬 및 선택적으로 하나 이상의 C 원자는 O로 대체되고, C1-6 알켄 및 선택적으로 하나 이상의 C 원자는 O로 대체되고, C1-6 알킨 및 선택적으로 하나 이상의 C 원자는 O로 대체되고, 이중고리, 바이아릴, 바이헤테로고리이며, 각각은 RQ로 선택적으로 치환되고, 각각의 RQ는 독립적으로 H, 할로, OH, CN, CF3, 하이드록실, 니트로, C≡CH, C2-6 알케닐, C2-6 알키닐, 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 C1-C6 알킬, 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 C1-C6 알콕시, (1개 이상의 -F로 선택적으로 치환된) OC1-3알킬, OH, NH2, NRY1RY2, CN이거나 2개의 RQ는 이들이 부착하는 원자와 함께 취해지고 0-4개의 헤테로원자를 포함하는 4-8 원 고리를 형성하고;
    YL1은 각각 독립적으로 결합, NRYL1, O, S, NRYL2, CRYL1RYL2, C=O, C=S, SO, SO2, 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 C1-C6 알킬(선택적으로 하나 이상의 C 원자는 O로 대체됨); 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 C1-C6 알콕시이고;
    QL은 0 내지 4개의 헤테로원자를 가진 3- 내지 6-원 지환족 또는 방향족 고리로서, 0 내지 6개의 RQ와 선택적으로 연결되거나 선택적으로 치환되며, 각각의 RQ는 독립적으로 H, (1개 이상의 할로 또는 C1-6 알콕실에 의해 선택적으로 치환된) 선형 또는 분지형 C1-6 알킬이거나, 또는 2개의 RQ는 이들이 부착하는 원자와 함께 취해져 0-2개의 헤테로원자를 포함하는 3-8 원 고리를 형성하고;
    RYL1, RYL2는 각각 독립적으로 H, OH, (1개 이상의 할로, C1-6 알콕실로 선택적으로 치환된) 선택적으로 치환된 선형 또는 분지형 C1-6 알킬이거나, R1, R2는 이들이 부착되는 원자와 함께 0 내지 2개의 헤테로원자를 포함하는 3 내지 8-원 고리 시스템을 형성하고;
    n은 0 내지 10이고; 및
    은 PTM 또는 ULM 모이어티에 대한 부착 지점을 나타냄.
  31. 제29항 또는 제30항에 있어서, 상기 연결기(L)는 다음으로 이루어진 군으로부터 선택되는, 이작용성 화합물:


  32. 제1항 내지 제23항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 연결기(L)는 선택적으로 치환된 C1-C100 알킬을 포함하고, 여기서:
    각각의 탄소는, CRL1RL2, O, S, SO, SO2, NRL3, SO2NRL3, SONRL3, CONRL3, NRL3CONRL4, NRL3SO2NRL4, CO, CRL1=CRL2, C≡C, SiRL1RL2, P(O)RL1, P(O)ORL1, NRL3C(=NCN)NRL4, NRL3C(=NCN), NRL3C(=CNO2)NRL4, 0 내지 6개의 RL1 및/또는 RL2 기로 선택적으로 치환된 C3-11시클로알킬, 0 내지 9개의 RL1 및/또는 RL2 기로 선택적으로 치환된 C5-13 스피로시클로알킬, 0 내지 6개의 RL1 및/또는 RL2 기로 선택적으로 치환된 C3-11 헤테로시클릴, 0 내지 8개의 RL1 및/또는 RL2 기로 선택적으로 치환된 C5-13 스피로헤테로시클로알킬, 0 내지 6개의 RL1 및/또는 RL2 기로 선택적으로 치환된 아릴, 0 내지 6개의 RL1 및/또는 RL2 기로 선택적으로 치환된 헤테로아릴로 선택적으로 치환되고, 이때 RL1 또는 RL2는, 각각 독립적으로 또 다른 기와 선택적으로 연결되어 0 내지 4개의 RL5 기로 선택적으로 치환된 시클로알킬 및/또는 헤테로시클릴 모이어티를 형성하고; 및
    RL1, RL2, RL3, RL4 및 RL5는 각각 독립적으로 H, 할로, C1-8알킬, OC1-8알킬, SC1-8알킬, NHC1-8알킬, N(C1-8알킬)2, C3-11시클로알킬, 아릴, 헤테로아릴, C3-11헤테로시클릴, OC3-8시클로알킬, SC3-8시클로알킬, NHC3-8시클로알킬, N(C3-8시클로알킬)2, N(C3-8시클로알킬)(C1-8알킬), OH, NH2, SH, SO2C1-8알킬, P(O)(OC1-8알킬)(C1-8알킬), P(O)(OC1-8알킬)2, CC-C1-8알킬, CCH, CH=CH(C1-8알킬), C(C1-8알킬)=CH(C1-8알킬), C(C1-8알킬)=C(C1-8알킬)2, Si(OH)3, Si(C1-8알킬)3, Si(OH)(C1-8알킬)2, COC1-8알킬, CO2H, 할로겐, CN, CF3, CHF2, CH2F, NO2, SF5, SO2NHC1-8알킬, SO2N(C1-8알킬)2, SONHC1-8알킬, SON(C1-8알킬)2, CONHC1-8알킬, CON(C1-8알킬)2, N(C1-8알킬)CONH(C1-8알킬), N(C1-8알킬)CON(C1-8알킬)2, NHCONH(C1-8알킬), NHCON(C1-8알킬)2, NHCONH2, N(C1-8알킬)SO2NH(C1-8알킬), N(C1-8알킬) SO2N(C1-8알킬)2, NH SO2NH(C1-8알킬), NH SO2N(C1-8알킬)2, NH SO2NH2인, 이작용성 화합물.
  33. 제1항 내지 제24항 및 제32항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 연결기는 다음으로 이루어진 군으로부터 선택되는, 이작용성 화합물:











  34. 제1항에 있어서, 상기 화합물은 표 1A 내지 표 1C로부터 선택되는, 이작용성 화합물.
  35. 제1항 내지 제34항 중 어느 한 항에 있어서, 적어도 하나의 폴리에틸렌 글리콜 사슬을 더 포함하는, 이작용성 화합물.
  36. 제1항 내지 제35항 중 어느 한 항에 따른 이작용성 화합물의 유효량 및 약제학적으로 허용 가능한 담체를 포함하는 조성물.
  37. 제35항에 있어서, 부가적인 생리활성제 또는 제1항 내지 제34항 중 어느 한 항의 또 다른 이작용성 화합물 중 적어도 하나를 추가로 포함하는, 조성물.
  38. 제36항에 있어서, 상기 부가적인 생리활성제는 항암제인 조성물.
  39. 대상체 내에서 질환 또는 장애를 치료하기 위한 약제학적으로 허용 가능한 담체 및 제1항 내지 제35항 중 어느 한 항에 따른 적어도 하나의 화합물의 유효량을 포함하는 조성물로서, 방법은 상기 조성물을 이를 필요로 하는 대상체에게 투여하는 단계를 포함하되, 상기 화합물은 질환 또는 장애의 적어도 하나의 증상을 치료하거나 완화시키는 데 효과적인, 조성물.
  40. 제38항에 있어서, 상기 질환 또는 장애는 BRaf 축적 및 응집과 연관된 조성물.
  41. 제38항 또는 제39항에 있어서, 상기 질환 또는 장애는 암; 심장심부 자극 증후군; 신경 섬유종증 제1형; 코스텔로 증후군; 누난 증후군; 또는 렌티고, 심전도 이상, 안구 비대증, 폐동맥 협착증, 생식기 이상, 지연 성장, RAF축적 및 응집과 연관된 난청(LEOPARD) 증후군인, 조성물.
  42. 제39항에 있어서, 상기 암은 신장 세포 암종; 췌장암, 결장 직장암; 폐암; 난소암; 갑상선암; 과립구 성상세포종; 전립선암; 위암; 간세포 암종; 또는 흑색종인, 조성물.
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