KR20190065500A - 갑상선 여포암 특이적 단백질분해조절 효소 유전자를 포함하는 갑상선 여포암 바이오마커 및 이를 이용한 갑상선 여포암 진단정보제공방법 - Google Patents
갑상선 여포암 특이적 단백질분해조절 효소 유전자를 포함하는 갑상선 여포암 바이오마커 및 이를 이용한 갑상선 여포암 진단정보제공방법 Download PDFInfo
- Publication number
- KR20190065500A KR20190065500A KR1020170164314A KR20170164314A KR20190065500A KR 20190065500 A KR20190065500 A KR 20190065500A KR 1020170164314 A KR1020170164314 A KR 1020170164314A KR 20170164314 A KR20170164314 A KR 20170164314A KR 20190065500 A KR20190065500 A KR 20190065500A
- Authority
- KR
- South Korea
- Prior art keywords
- seq
- gene
- thyroid follicular
- follicular cancer
- measuring
- Prior art date
Links
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
- C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
- C12N15/115—Aptamers, i.e. nucleic acids binding a target molecule specifically and with high affinity without hybridising therewith ; Nucleic acids binding to non-nucleic acids, e.g. aptamers
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
- G01N33/57407—Specifically defined cancers
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/10—Type of nucleic acid
- C12N2310/16—Aptamers
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2525/00—Reactions involving modified oligonucleotides, nucleic acids, or nucleotides
- C12Q2525/10—Modifications characterised by
- C12Q2525/205—Aptamer
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/118—Prognosis of disease development
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
- G01N2800/52—Predicting or monitoring the response to treatment, e.g. for selection of therapy based on assay results in personalised medicine; Prognosis
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Pathology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Oncology (AREA)
- Hospice & Palliative Care (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Hematology (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
본 발명의 갑상선 여포암 진단 또는 예후 예측용 조성물은 갑상선 여포암 의심환자 또는 갑상선 여포암 환자의 암 발생 영역의 조직에서 특이적으로 발현 수준이 변화되는 유전자의 수준을 측정함으로써, 갑상선 여포암의 진단 또는 예후 예측을 위해 사용될 수 있다.
Description
본 발명은 갑상선 여포암(FTC; Follicular Thyroid Cancer) 특이적 단백질분해조절 효소 유전자를 포함하는 갑상선 여포암 바이오마커 및 이를 이용한 갑상선 여포암 진단을 위한 정보제공방법 또는 갑상선 여포암 치료방법에 대한 것이다.
임상적으로 분화갑상선암(well differentiated thyroid carcinoma)은 갑상선여포암(follicular thyroid carcinoma, FTC)과 유두암(papillary thyroid carcinoma, PTC)으로 분류되며 되며 치료나 예후 등에서도 같은 선상에서 논해진다. 그러나 FTC는 PTC와는 분자유전학적인 발병 기전과 임상적인 특성에서 차이를 보인다. 특히, FTC는 PTC에 비해 요오드 결핍 지역과 고령에서 더 흔하게 발생하는 것으로 보고되며, PTC와는 달리 가족력이 드문 것으로 보고된다. 또한 FTC는 주로 국소전이보다 원격 전이가 흔하게 일어나며 예후 측면에서도 PTC보다 좋지 않은 것으로 보고되지만 그 원인은 아직 명확하지 않다고 한다. FTC는 고형 형태로써 침습적인 성장을 하게 되는데 PTC와는 달리 괴사가 흔치 않고 대부분 단일 병소이며 피막으로 둘러싸여 있는 특징을 보이는데 피막 침습이 심하거나 혈관을 침범하는 경우에는 전이의 위험성이 높아지며 아주 크게 성장하게 되면 반대편 엽 부위와 주위 경부 조직도 침범하는 경우도 발생한다.
갑상선여포암(follicular thyroid carcinoma, FTC)의 감별법은 병리학적 육안 검사, 세침흡인세포검사, 수술 시 동결 조직검사 등으로는 여포선종(follicular adenoma, FA)이나 여포 변종 유두암과 감별할 수 없어 최종적인 병리학적 현미경 검사를 통해서만 가능하다는 문제가 존재한다.
통상적으로 여포성 종양(follicular neoplasm, FN)은 갑상선 여포선종(FA)과 여포암(FTC)을 통칭하고 있으나 이는 수술 전 진단의 모호성 때문으로 보고된다. 따라서 여포성 종양의 진단과 치료 과정과 갑상선 결절 진단 등에 있어서의 많은 문제점을 해결하는 것이 중요하다고 사료된다.
다시 말해 FTC의 경우 세포 검사로써는 갑상선 결절 진단에 문제가 있어 흔히 여포성 종양(FN)으로 진단되거나 선종성 과다 형성(adenomatous hyperplasia)과 같이 양성으로 진단되는 경우가 많다. 따라서 세침흡인세포검사(FNAC) 상 FN으로 진단된 경우 수술을 통해 종괴를 제거하고 병리학적 검사를 진행해야만 확진이 가능한 문제가 있고 확진에서 악성일 확률에 대해서는 전향적인 연구가 없는 상태이다.
갑상선 종양 중에서 여포암(FTC; Follicular Thyroid Cancer)의 경우, 수술을 해야지만 암인지를 알 수 있어 반드시 수술을 요구하는 암으로써, 여포암 중 약 15-20% 정도가 암이며, 80-85%는 양성 종양으로 유두암 또는 유두암의 여포성 변종이 차지한다. 또한 암이라 할지라도 90%의 암은 수술로 간단히 치료가 되며 발견되는 암의 10% 또는 양성 판정 후에도 종양과 동일한 형태를 보이는 경우 정기적인 추적 관찰이 반드시 필요하다.
이와 같이 FN으로 진단되는 경우, 70-80%의 환자가 불필요한 수술을 받는 것이며 수술 전에는 FA와 FTC를 감별할 방법이 없는 상태이다.
한편, 세포의 항상성에 가장 큰 영향을 끼치는 현상 중 하나인 단백질의 발현과 분해와 관련하여, 단백질 소단위체인 유비퀴틴 (ubiquitin)에 의해 단백질이 전사 후에 변형되는 유비퀴틴화 (ubiquitination)는 세포의 항상성 유지에 매우 결정적인 역할을 한다는 것이 1980년도에 Aaron Ciechanover, Avram Hershko, Irwin Rose 등 3인에 의하여 처음 밝혀졌다. 유비퀴틴이 표적단백질과 결합하는 현상인 유비퀴틴화 (ubiquitination)의 가장 큰 역할은 단백질의 분해를 유도하는 기전으로 목표 단백질의 유비퀴틴화가 일어날 경우 단백질은 세포질 내의 프로테아좀 (proteasome)에 의해 분해된다. 이러한 현상을 유비퀴틴-프로테아좀 경로 (ubiquitin-proteasome pathway)라 일컫는다. 세포 내 발현하는 대부분의 단백질들은 유비퀴틴화를 거치며, 이 과정은 유비퀴틴이 E1 (ubiquitin-activating), E2 (ubiquitin-conjugating), E3 (ubiquitin-ligase) 효소에 의해 순차적으로 촉진된다. 유비퀴틴은 76개의 아미노산으로 구성되어 있으며, 목표 단백질의 아미노산중 라이신 (lysine, K) 부분에 다중유비퀴틴 결합고리 (poly-ubiquitin chain)를 형성하여 부착되거나, 단일유비퀴틴 분자가 (mono-ubiquitination) 부착되기도 하는데, 다중유비퀴틴 결합고리는 유비퀴틴 분자상의 각각 6, 11, 27, 29, 33, 48, 63번째 라이신 고리마다 형성할 수 있으며, 현재까지 밝혀진 바에 따르면 11, 29, 48번째 라이신 부위를 통한 다중유비퀴틴 결합고리가 표적단백질의 분해를 조절하며, 63번째 고리 및 단일유비퀴틴은 단백질의 기능을 조절하는 것으로 나타났다. 유비퀴틴-프로테아좀 경로에 의한 기질 단백질의 분해과정은 단백질분해조절 효소 (탈유비퀴틴화 효소, deubiquitinating enzymes, DUBs)에 의해 가역적으로 조절된다.
다양한 질병의 발병원인을 규명하는 연구에서 유비퀴틴-프로테아좀 시스템 기능 억제에 대한 연구가 현재 국내외로 점점 각광을 받고 있으며, 다발성 골수종 (multiple-myeloma)이나 외투세포림프종 (mantle cell lymphoma)에서 프로테아좀 억제제 (proteasome inhibitor)로 알려진 Velcade (Bortezomib)의 항암 치료에 대한 효과가 최근 FDA 승인을 거쳐 암 치료에 있어서 매우 효과적인 항암치료제로 임상적으로 사용되고 있으나, 광범위한 단백질의 분해 억제를 유발하기 때문에 부작용뿐 아니라, 다른 항암제와 마찬가지로 항암제에 대한 내성이 생기는 현상이 보고되고 있다.
단백질의 유비퀴틴화 과정은 단백질분해조절 효소에 의해 가역적으로 일어날 수 있으며, 단백질분해조절 효소는 기본적으로 단백질에 결합한 유비퀴틴을 제거하여 특정 단백질이 분해되는 것을 막는 역할을 수행한다. 현재까지 단백질 유비퀴틴화 효소 (E1, E2, E3)는 약 500여 가지가 있는 것으로 추정되며, 단백질분해조절 효소는 100여 가지가 있는 것으로 밝혀졌다. 유비퀴틴화 효소는 많이 밝혀진 만큼 그 기능 또한 활발히 연구가 진행되어 유비퀴틴화 효소를 조절하는 억제제를 인위적으로 합성해 항암치료를 위한 임상치료제로 사용되고 있는 반면, 단백질분해조절 효소에 대한 세포 내 기능 연구는 매년 논문이 꾸준히 발표되고 있지만 유비퀴틴화 효소 연구에 비해 아직 미개척 분야로 평가받고 있다.
본 발명은 특정 질병을 진단하기 위해 단백질 분해를 막는 탈유비퀴틴화 경로에 관련된 효소계를 연구하던 중 단백질분해조절 효소와 갑상선 여포암과 밀접한 관련성이 있음을 발견하고, 본 발명을 완성하게 되었다.
본 발명의 목적은 USP9Y (Ubiquitin specific peptidase 9Y), USP14 (Ubiquitin specific peptidase 14), USP21 (Ubiquitin specific peptidase 21), USP24 (Ubiquitin specific peptidase 24), USP34 (Ubiquitin specific peptidase 34), USP45 (Ubiquitin specific peptidase 45), USP47 (Ubiquitin specific peptidase 47), USP52 (Ubiquitin specific peptidase 52), OTUD1 (OTU Deubiquitinase 1), OTUD3 (OTU Deubiquitinase 3), OTUD4 (OTU Deubiquitinase 4), OTUD6B (OTU Deubiquitinase 6B), COPS5 (COP9 signalosome subunit 5), MPND (MPN domain-containing protein), PSMD14 (Proteasome 26S subunit, non-ATPase, 14) 및 YOD1 (OUT deubiquitinating enzyme 1 homolog)로 구성된 군으로부터 선택된 어느 하나 이상의 갑상선 여포암 진단용 유전자의 발현 수준을 측정하는 제제를 포함하는 갑상선 여포암 진단용 조성물을 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 목적은 상기 조성물을 갑상선 여포암 발병여부를 진단하고자 하는 개체에서 분리된 생체 시료에 처리하여, 갑상선 여포암 진단용 유전자의 mRNA 또는 상기 유전자로부터 발현되는 단백질의 발현 수준을 측정하는 단계를 포함하는, 갑상선 여포암을 진단하기 위한 정보를 제공하는 방법을 제공하는 것이다.
상기 목적을 달성하기 위한 하나의 실시양태로서, 본 발명은 USP9Y (Ubiquitin specific peptidase 9Y), USP14 (Ubiquitin specific peptidase 14), USP21 (Ubiquitin specific peptidase 21), USP24 (Ubiquitin specific peptidase 24), USP34 (Ubiquitin specific peptidase 34), USP45 (Ubiquitin specific peptidase 45), USP47 (Ubiquitin specific peptidase 47), USP52 (Ubiquitin specific peptidase 52), OTUD1 (OTU Deubiquitinase 1), OTUD3 (OTU Deubiquitinase 3), OTUD4 (OTU Deubiquitinase 4), OTUD6B (OTU Deubiquitinase 6B), COPS5 (COP9 signalosome subunit 5), MPND (MPN domain-containing protein), PSMD14 (Proteasome 26S subunit, non-ATPase, 14) 및 YOD1 (OUT deubiquitinating enzyme 1 homolog)로 구성된 군으로부터 선택된 어느 하나 이상의 갑상선 여포암 진단용 유전자의 발현 수준을 측정하는 하나 이상의 제제를 포함하는 갑상선 여포암 진단용 조성물을 제공한다.
갑상선 여포암 진단용 유전자라 함은, 갑상선 여포암 발병 여부를 확인하려는 개체로부터 유래된 생체 시료에서의 발현 수준이 정상인의 생체 시료 또는 갑상선 여포선종(대조군)의 발현 수준보다 유의미하게 증가하거나 감소하는 유전자를 의미한다.
갑상선 여포암 진단용 유전자는 USP9Y (Ubiquitin specific peptidase 9Y), USP14 (Ubiquitin specific peptidase 14), USP21 (Ubiquitin specific peptidase 21), USP24 (Ubiquitin specific peptidase 24), USP34 (Ubiquitin specific peptidase 34), USP45 (Ubiquitin specific peptidase 45), USP47 (Ubiquitin specific peptidase 47), USP52 (Ubiquitin specific peptidase 52), OTUD1 (OTU Deubiquitinase 1), OTUD3 (OTU Deubiquitinase 3), OTUD4 (OTU Deubiquitinase 4), OTUD6B (OTU Deubiquitinase 6B), COPS5 (COP5 signalosome complex subunit 5), MPND (MPN domain-containing protein), PSMD14 (Proteasome 26S subunit, non-ATPase, 14) 또는 YOD1 (OUT deubiquitinating enzyme 1 homolog) 일 수 있다.
보다 바람직하게는 USP24 (Ubiquitin specific peptidase 24), USP34 (Ubiquitin specific peptidase 34), COPS5 (COP9 signalosome subunit 5), OTUD3 (OTU Deubiquitinase 3) 및 MPND (MPN domain-containing protein)의 조합일 수 있으며, 더욱 바람직하게는 USP24 (Ubiquitin specific peptidase 24), USP34 (Ubiquitin specific peptidase 34), COPS5 (COP9 signalosome subunit 5), OTUD3 (OTU Deubiquitinase 3), USP52 (Ubiquitin specific peptidase 52) 및 MPND (MPN domain-containing protein)의 조합 일 수 있다.
상기 USP9Y (Ubiquitin specific peptidase 9Y)는 서열번호 1로 구성되고, USP14 (Ubiquitin specific peptidase 14)는 서열번호 2로 구성되고, USP21 (Ubiquitin specific peptidase 21)는 서열번호 3으로 구성되고, USP24 (Ubiquitin specific peptidase 24)는 서열번호 4로 구성되고, USP34 (Ubiquitin specific peptidase 34)는 서열번호 5로 구성되고, USP45 (Ubiquitin specific peptidase 45)는 서열번호 6으로 구성되고, USP47 (Ubiquitin specific peptidase 47)는 서열번호 7으로 구성되고, USP52 (Ubiquitin specific peptidase 52)는 서열번호 8로 구성되고, OTUD1 (OTU Deubiquitinase 1)는 서열번호 9로 구성되고, OTUD3 (OTU Deubiquitinase 3)은 서열번호 10으로 구성되고, OTUD4 (OTU Deubiquitinase 4)는 서열번호 11로 구성되고, OTUD6B (OTU Deubiquitinase 6B)는 서열번호 12로 구성되고, COPS5 (COP9 signalosome subunit 5), 는 서열번호 13으로 구성되고, MPND (MPN domain-containing protein)은 서열번호 14로 구성되고, PSMD14 (Proteasome 26S subunit, non-ATPase, 14)는 서열번호 15로 구성되고, YOD1 (OUT deubiquitinating enzyme 1 homolog)는 서열번호 16으로 구성될 수 있다.
상기 유전자는 갑상선 여포암을 진단하거나 갑상선 여포함 예후 예측을 위해 단독으로 사용될 수 있고, 또는 유전자가 복합적으로 사용될 수 있으며, 복합적으로 사용되는 경우 진단 또는 예후 예측의 성공율을 향상시킬 수 있다.
상기 진단은 감별 진단일 수 있으며, 상기 감별 진단은 갑상선 여포선종(FA)로부터 갑상선 여포암(FTC)을 감별하기 위한 것일 수 있다.
상기 생체 시료는 갑상선 여포암 발병 여부를 확인하려는 개체로부터 분리된 조직, 체액(혈액, 오줌 등), 그의 추출물 및 채취한 조직의 배양물 등이 될 수 있으며, 갑상선 여포암 발병 유무를 확인하기 위한 세포를 포함하는 것이라면 특별히 한정되지 않는다.
상기 조직, 세포 또는 체액은 갑상선에서 유래된 것일 수 있다.
본 발명의 "유전자 및/또는 이로부터 발현되는 단백질"이란, 상기 유전자로부터 발현되고, 생체 시료에서 발현 수준이 유의미하게 변화하며, 갑상선 여포암의 진단 또는 갑상선 여포선종으로부터 갑상선 여포암의 감별진단에 사용될 수 있는 유전자를 의미한다.
상기 유전자 또는 단백질은 갑상선 여포암의 진단 뿐만 아니라, 갑상선 여포암의 예후 예측에도 활용될 수 있다.
상기 유전자 또는 단백질의 발현은 갑상선 여포암이 악화되고 있는 조직 또는 세포에서 변화하기 때문에 갑상선 여포암의 예후를 예측하는 마커로서 활용될 수 있다. 상기 마커의 발현 수준이 정상인의 발현 수준에 유의미하게 차이나는 경우 예후가 나쁘다고 예측할 수 있으며, 상기 마커의 발현수준이 정상인의 발현 수준에 유의미하게 차이나지 않는 경우 예후가 좋다고 예측할 수 있다. 여기서 예후란 질환 특히 갑상선 여포암의 경과를 예측하는 행위로 해석될 수 있다.
유전자의 발현 수준은 상기 유전자의 mRNA 수준 또는 상기 유전자에 의해 발현된 단백질의 수준을 통해 측정할 수 있다.
상기 "유전자의 mRNA 수준을 측정하는 제제"는 상기 유전자로부터 전사된 mRNA의 수준을 측정하는 방법에 사용되는 제제를 의미하며, 특별히 이에 한정되지 않으나, 일 예로서 RT-PCR, 정량적 실시간 PCR(quantified real time PCR), 경쟁적 RT-PCR(Competitive RT-PCR), 실시간 RT-PCR(real time quantitative RT-PCR), RNase 보호 분석법(RPA; RNase protection assay), 노던 블럿팅(Northern blotting), DNA 칩 분석법 등의 방법에 사용되는 표적 유전자에 특이적으로 결합할 수 있는 프라이머 세트 또는 프로브 등이 될 수 있다.
상기 프라이머 세트는 상기 유전자의 mRNA로부터 얻어진 cDNA를 PCR 증폭하기 위한 프라이머 세트일 수 있다.
상기 프라이머 세트는 갑상선 여포암을 진단하거나 예후 예측을 위해 단독으로 사용될 수 있고, 프라이머 세트가 복합적으로 사용될 수 있으며, 복합적으로 사용되는 경우 진단 또는 예후 예측의 성공율을 향상시킬 수 있다.
상기 프라이머 세트는 일 예로,
USP9Y (Ubiquitin specific peptidase 9Y) 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 17 및 서열번호 18의 프라이머 세트일 수 있고, USP14 (Ubiquitin specific peptidase 14) 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 19 및 서열번호 20의 프라이머 세트일 수 있고, USP21 (Ubiquitin specific peptidase 21) 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 21 및 서열번호 22의 프라이머 세트일 수 있고, USP24 (Ubiquitin specific peptidase 24) 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 23 및 서열번호 24의 프라이머 세트일 수 있고, USP34 (Ubiquitin specific peptidase 34) 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 25 및 서열번호 26의 프라이머 세트일 수 있고, USP45 (Ubiquitin specific peptidase 45) 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 27 및 서열번호 28의 프라이머 세트일 수 있고, USP47 (Ubiquitin specific peptidase 47) 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 29 및 서열번호 30의 프라이머 세트일 수 있고, USP52 (Ubiquitin specific peptidase 52) 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 31 및 서열번호 32의 프라이머 세트일 수 있고, OTUD1 (OTU Deubiquitinase 1) 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 33 및 서열번호 34의 프라이머 세트일 수 있고, OTUD3 (OTU Deubiquitinase 3) 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 35 및 서열번호 36의 프라이머 세트일 수 있고, OTUD4 (OTU Deubiquitinase 4) 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 37 및 서열번호 38의 프라이머 세트일 수 있고, OTUD6B (OTU Deubiquitinase 6B) 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 39 및 서열번호 40의 프라이머 세트일 수 있고, COPS5 (COP9 signalosome subunit 5) 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 41 및 서열번호 42의 프라이머 세트일 수 있고, MPND (MPN domain-containing protein) 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 43 및 서열번호 44의 프라이머 세트일 수 있고, PSMD14 (Proteasome 26S subunit, non-ATPase, 14) 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 45 및 서열번호 46의 프라이머 세트일 수 있고 또는 YOD1 (OUT deubiquitinating enzyme 1 homolog) 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 47 및 서열번호 48의 프라이머 세트일 수 있다.
본 발명의 용어 "프로브"란, mRNA와 특이적 결합을 이룰 수 있는 짧게는 수 염기 내지 길게는 수백 염기에 해당하는 RNA 또는 DNA 등의 핵산 단편을 의미한다. 상기 프로브는 표지용 물질로 표지하여 특정 mRNA를 검출할 수 있도록 제작될 수 있는데, 올리고뉴클레오티드(oligonucleotide) 프로브, 단쇄 DNA(single stranded DNA) 프로브, 이중쇄 DNA(double stranded DNA) 프로브, RNA 프로브 등의 형태로 제작될 수 있다.
본 발명의 목적상 상기 프로브는 상기 유전자의 mRNA와 상보적으로 혼성화 되는지의 여부를 확인함으로써, 갑상선 여포암의 진단 또는 예후 예측을 할 수 있다.
본 발명의 용어 "단백질 발현 수준 측정"이란, 목적하는 개체에서 갑상선 여포암의 진단 또는 예후 예측을 하기 위하여 상기 개체로부터 수득한 생체 시료에서 상기 유전자가 발현된 단백질의 존재 여부와 발현 정도를 확인하는 과정을 의미한다. 통상적으로는 상기 단백질에 대하여 특이적으로 결합하는 항체 또는 앱타머를 이용하여 단백질의 양을 확인함으로써 수행될 수 있다.
이를 위하여 웨스턴 블럿(western blotting), ELISA(enzyme linked immunosorbent assay), 방사선면역분석(RIA: Radioimmunoassay), 방사 면역 확산법(radioimmunodiffusion), 오우크테로니(Ouchterlony) 면역 확산법, 로케트(rocket) 면역전기영동, 조직면역 염색, 면역침전 분석법(Immunoprecipitation Assay), 보체 고정 분석법(Complement Fixation Assay), FACS 및 단백질 칩(protein chip) 분석법 등이 사용될 수 있으나, 특별히 이에 제한되지는 않는다.
본 발명은 다른 양태로서, 상기 갑상선 여포암 진단 또는 예후 예측용 조성물을 포함하는 갑상선 여포암 진단 또는 예후 예측용 키트를 제공한다.
본 발명의 키트는 갑상선 여포암 특이적 유전자의 mRNA 또는 이로부터 발현되는 단백질의 검출 여부를 확인함으로써 갑상선 여포암의 진단 또는 예후 예측을 할 수 있다. 본 발명의 갑상선 여포암의 진단 또는 예후 예측용 키트에는 갑상선 여포암 특이적 유전자의 발현 수준을 검출하기 위한 프라이머, 프로브 또는 단백질을 특이적으로 검출할 수 있는 항체 뿐만 아니라 분석 방법에 적합한 한 종류 또는 그 이상의 다른 구성 성분 조성물, 용액 또는 장치가 포함될 수 있다.
구체적인 일 예로서, 본 발명의 키트는 RT-PCR을 수행하기 위해 필요한 필수 요소를 포함하는 키트일 수 있다. RT-PCR 키트는, 마커로 사용된 유전자에 대한 특이적인 각각의 프라이머 쌍 외에도 테스트 튜브 또는 다른 적절한 컨테이너, 반응 완충액(pH 및 마그네슘 농도는 다양), 데옥시뉴클레오타이드(dNTPs), Taq-폴리머라아제 및 역전사효소와 같은 효소, DNase, RNAse 억제제, DEPC-수(DEPC-water), 멸균수 등을 포함할 수 있다. 또한, 정량 대조구로 사용되는 유전자에 특이적인 프라이머 쌍을 포함할 수 있다.
다른 예로서, 본 발명의 키트는 DNA 칩을 수행하기 위해 필요한 필수 요소를 포함하는 키트일 수 있다. DNA 칩 키트는, 유전자 또는 그의 단편에 해당하는 cDNA가 프로브로 부착되어 있는 기판, 및 형광표식 프로브를 제작하기 위한 시약, 제제, 효소 등을 포함할 수 있다. 또한, 기판은 정량 대조군 유전자 또는 그의 단편에 해당하는 cDNA를 포함할 수 있다.
또 다른 예로서, 본 발명의 키트는 항체의 면역학적 검출을 위하여 기질, 적당한 완충 용액, 발색 효소 또는 형광물질로 표지된 2차 항체, 발색 기질 등을 포함할 수 있다. 상기에서 기질은 니트로셀룰로오스 막, 폴리비닐 수지로 합성된 96 웰 플레이트, 폴리스티렌 수지로 합성된 96 웰 플레이트 및 유리로 된 슬라이드글라스 등이 이용될 수 있고, 발색 효소는 퍼옥시다아제(peroxidase), 알칼라인 포스파타아제(Alkaline Phosphatase)가 사용될 수 있고, 형광물질은 FITC, RITC 등이 사용될 수 있고, 발색 기질액은 ABTS(2,2'-아지노-비스(3-에틸벤조티아졸린-6-설폰산)) 또는 OPD(o-페닐렌디아민), TMB(테트라메틸 벤지딘)가 사용될 수 있다.
본 발명은 또 다른 양태로서, 상기 갑상선 여포암의 진단 또는 예후 예측용 조성물을 갑상선 여포암의 진단 또는 예후 예측을 하고자 하는 개체의 여포선종 조직 시료 및 갑상선 여포암 조직 시료에 처리하여, 상기 각 시료로부터 갑상선 여포암 진단 또는 예후 예측용 유전자의 mRNA 또는 상기 유전자로부터 발현되는 단백질의 발현 수준을 측정하는 단계를 포함하는 갑상선의 예후를 예측하기 위한 정보를 제공하는 방법을 제공한다.
본 발명의 용어 "개체"란, 갑상선 여포암의 예후을 예측하고자 하는 대상을 의미하는데, 대체로 갑상선 여포암 발병 후, 갑상선 여포암 치료 시술을 받은 개체를 의미한다. 이때, 상기 개체는 사람(보다 바람직하게는 여성)을 비롯하여, 개, 말, 소, 쥐, 염소, 토끼, 닭, 오리, 거위 등의 갑상선암이 발병될 수 있는 동물이라면 제한없이 포함할 수 있다.
상기 방법을 통하여, 갑상선 여포암의 진단 또는 예후를 예측하고자 하는 개체의 갑상선 여포암 조직 시료에서 유전자의 mRNA 또는 이로부터 발현되는 단백질의 발현 수준을 측정하고, 여포선종 조직의 발현 수준과 비교함으로써, 상기 환자의 갑상선 여포암의 예후가 좋은지 아니면 나쁜지를 예측하기 위한 정보를 제공할 수 있다. 즉, 갑상선 여포암 조직에서 측정된 상기 유전자의 mRNA 또는 이로부터 발현되는 단백질의 발현 수준이 여포선종 갑상선 조직에서의 발현 수준에 비하여, 증가 하거나 또는 감소할 경우, 상기 개체의 예후가 나쁘다고 판정할 수 있고, 이에 반하여, 갑상선 조직에서 측정된 상기 유전자의 mRNA 또는 이로부터 발현되는 단백질의 발현 수준이 여포선종 갑상선 조직에서의 발현 수준에 비하여 큰 차이를 나타내지 않는 경우, 상기 개체의 예후가 좋다고 판정할 수 있다.
일 예로서, 갑상선 여포암 조직 시료로부터 측정된 갑상선 여포암 예후 예측용 유전자인 USP9Y, USP14, USP21, USP24, USP34, USP45, USP47, USP52, OTUD1, OTUD3, OTUD4, OTUD6B, COPS5, MPND, PSMD14 또는 YOD1 유전자의 mRNA 또는 상기 유전자로부터 발현되는 단백질의 발현 수준이 여포선종 갑상선 조직 시료로부터 측정된 발현 수준에 비하여 1.5배 이상 증가되거나 (USP52 단독의 경우) 및 1.2배 이하로 감소하는 경우 (USP9Y, USP14, USP21, USP24, USP34, USP45, USP47, OTUD1, OTUD3, OTUD4, OTUD6B, COPS5, MPND, PSMD14 또는 YOD1의 경우)를 갑상선 여포암의 예후가 나쁘다고 판정할 수 있다.
다른 예로서, 갑상선 여포암 조직 시료로부터 측정된 갑상선 여포암 예후 예측용 유전자인 USP9Y, USP14, USP21, USP24, USP34, USP45, USP47, USP52, OTUD1, OTUD3, OTUD4, OTUD6B, COPS5, MPND, PSMD14 또는 YOD1 유전자의 mRNA 또는 상기 유전자로부터 발현되는 단백질의 발현 수준이 여포선종 갑상선 조직 시료로부터 측정된 발현 수준에 비하여 1.2배 미만의 수준으로 정상과 유사해지고, USP52 유전자의 mRNA 또는 상기 유전자로부터 발현되는 단백질의 발현 수준이 1.5배 미만의 수준으로 정상과 유사해지는 경우, 갑상선 여포암의 예후가 좋다고 판정할 수 있다.
또한, 본 발명의 또 다른 목적을 달성하기 위해, 갑상선 여포암의 발병 여부를 진단하고자 하는 개체로부터 생체 시료를 분리하는 단계; 상기 생체시료에서 USP9Y, USP14, USP21, USP24, USP34, USP45, USP47, USP52, OTUD1, OTUD3, OTUD4, OTUD6B, COPS5, MPND, PSMD14 또는 YOD1 유전자의 발현량을 측정하는 단계; 상기 USP9Y, USP14, USP21, USP24, USP34, USP45, USP47, OTUD1, OTUD3, OTUD4, OTUD6B, COPS5, MPND, PSMD14 또는 YOD1 유전자의 발현량이 정상인의 세포보다 적게 발현되었는지 또는 USP52 유전자의 발현량이 정상인의 세포보다 많이 발현되었는지를 확인하여 갑상선 여포암 발병 여부를 확인하는 단계; 및 갑상선 여포암 치료제에 의한 갑상선 여포암 치료 예후 예측 방법을 제공한다.
상기 유전자는 갑상선 여포함 예후 예측을 위해 단독으로 사용될 수 있고, 또는 유전자가 복합적으로 사용될 수 있으며, 복합적으로 사용되는 경우 진단 또는 예후 예측의 성공율을 향상시킬 수 있다.
상기 치료방법에서 유전자의 발현량을 측정하기 위해,
USP9Y (Ubiquitin specific peptidase 9Y) 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 17 및 서열번호 18의 프라이머 세트, USP14 (Ubiquitin specific peptidase 14) 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 19 및 서열번호 20의 프라이머 세트, USP21 (Ubiquitin specific peptidase 21) 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 21 및 서열번호 22의 프라이머 세트, USP24 (Ubiquitin specific peptidase 24) 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 23 및 서열번호 24의 프라이머 세트, USP34 (Ubiquitin specific peptidase 34) 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 25 및 서열번호 26의 프라이머 세트, USP45 (Ubiquitin specific peptidase 45) 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 27 및 서열번호 28의 프라이머 세트, USP47 (Ubiquitin specific peptidase 47) 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 29 및 서열번호 30의 프라이머 세트, USP52 (Ubiquitin specific peptidase 52) 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 31 및 서열번호 32의 프라이머 세트, OTUD1 (OTU Deubiquitinase 1) 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 33 및 서열번호 34의 프라이머 세트, OTUD3 (OTU Deubiquitinase 3) 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 35 및 서열번호 36의 프라이머 세트, OTUD4 (OTU Deubiquitinase 4) 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 37 및 서열번호 38의 프라이머 세트, OTUD6B (OTU Deubiquitinase 6B) 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 39 및 서열번호 40의 프라이머 세트, COPS5 (COP9 signalosome subunit 5) 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 41 및 서열번호 42의 프라이머 세트, MPND (MPN domain-containing protein) 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 43 및 서열번호 44의 프라이머 세트, PSMD14 (Proteasome 26S subunit, non-ATPase, 14) 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 45 및 서열번호 46의 프라이머 세트 또는 YOD1 (OUT deubiquitinating enzyme 1 homolog) 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 47 및 서열번호 48의 프라이머 세트를 이용할 수 있다.
보다 바람직하게는 USP24 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 23 및 서열번호 24의 프라이머 세트, USP34 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 25 및 서열번호 26의 프라이머 세트, COPS5 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 41 및 서열번호 42의 프라이머 세트, OTUD3 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 35 및 서열번호 36의 프라이머 세트, USP52 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 31 및 서열번호 32의 프라이머 세트 또는 MPND 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 43 및 서열번호 44의 프라이머 세트를 이용할 수 있다.
본 발명은 갑상선 여포암의 진단용 조성물을 갑상선 여포암을 진단하고자 하는 개체의 조직 시료에 처리하여, 상기 각 시료로부터 갑상선 여포암 진단용 유전자의 mRNA 또는 상기 유전자로부터 발현되는 단백질의 발현 수준을 측정하는 단계; 상기 갑상선 여포암 진단용 유전자의 발현수준을 기준값과 비교하는 단계; 갑상선 여포암의 가능성 또는 갑상선 여포선종 가능성을 판별하는 단계;를 포함하는 갑상선 여포암의 감별진단을 위한 정보를 제공하는 방법을 제공한다.
상기 갑상선 여포암의 진단용 조성물은 USP9Y (Ubiquitin specific peptidase 9Y), USP14 (Ubiquitin specific peptidase 14), USP21 (Ubiquitin specific peptidase 21), USP24 (Ubiquitin specific peptidase 24), USP34 (Ubiquitin specific peptidase 34), USP45 (Ubiquitin specific peptidase 45), USP47 (Ubiquitin specific peptidase 47), USP52 (Ubiquitin specific peptidase 52), OTUD1 (OTU Deubiquitinase 1), OTUD3 (OTU Deubiquitinase 3), OTUD4 (OTU Deubiquitinase 4), OTUD6B (OTU Deubiquitinase 6B), COPS5 (COP9 signalosome subunit 5), MPND (MPN domain-containing protein), PSMD14 (Proteasome 26S subunit, non-ATPase, 14) 및 YOD1 (OUT deubiquitinating enzyme 1 homolog)로 구성된 군으로부터 선택된 어느 하나 이상의 갑상선 여포암 진단용 유전자의 발현 수준을 측정하는 하나 이상의 제제를 포함하는 갑상선 여포암 진단용 조성물을 의미한다.
보다 구체적으로, 갑상선 여포암 진단용 유전자의 발현수준을 기준값과 비교하는 단계에서 USP52 유전자의 발현수준이 여포선종 갑상선 조직 시료로부터 측정된 발현수준보다 1.5배 이상 증가하거나, USP9Y, USP14, USP21, USP24, USP34, USP45, USP47, OTUD1, OTUD3, OTUD4, OTUD6B, COPS5, MPND, PSMD14 또는 YOD1 유전자 발현수준이 여포선종 갑상선 조직시료로부터 측정된 발현수준보다 1.2배 이하로 감소할 수 있다.
본 발명의 갑상선여포암 진단 또는 예후 예측용 조성물은 갑상선여포암 의심환자 또는 갑상선여포암 환자의 암 발생 영역의 조직에서 특이적으로 발현 수준이 변화되는 유전자의 수준을 측정함으로써, 갑상선여포암의 진단 또는 예후 예측을 위해 사용될 수 있다.
도 1은 갑상선 여포암 환자 6명과 대조군 갑상선 여포선종 환자 11명의 조직을 이용한 단백질분해조절 효소 유전자의 발현량을 비교한 결과이다.
도 2. 갑상선 여포암 환자 조직에서 낮게 발현되는 단백질분해조절 효소계 (DUB) 유전자의 t-test의 결과 및 이에 따른 p-values 값이다.
도 3. 갑상선 여포암 환자 조직에서 낮게 발현되는 단백질분해조절 효소계 (DUB) 유전자인 USP34, USP24, COPS5, OTUD3 또는 MPND에 대한 ROC Curve (AUC) 결과이다.
도 4. USP34, USP24, COPS5, OTUD3 및 MPND의 조합에 대한 ROC Curve (AUC) 결과이다.
도 5. USP34, USP24, USP52, COPS5, OTUD3 및 MPND의 조합에 대한 ROC Curve (AUC) 결과이다
도 2. 갑상선 여포암 환자 조직에서 낮게 발현되는 단백질분해조절 효소계 (DUB) 유전자의 t-test의 결과 및 이에 따른 p-values 값이다.
도 3. 갑상선 여포암 환자 조직에서 낮게 발현되는 단백질분해조절 효소계 (DUB) 유전자인 USP34, USP24, COPS5, OTUD3 또는 MPND에 대한 ROC Curve (AUC) 결과이다.
도 4. USP34, USP24, COPS5, OTUD3 및 MPND의 조합에 대한 ROC Curve (AUC) 결과이다.
도 5. USP34, USP24, USP52, COPS5, OTUD3 및 MPND의 조합에 대한 ROC Curve (AUC) 결과이다
1. 조직 준비
2000년부터 2011년까지 서울아산병원에서 갑상선 여포암 및 갑상선 여포선종으로 진단되어 갑상선 검사를 위하여 조직 적출술을 시행 받은 환자 예를 대상으로 하였다.
2. Multiplex PCR
PCR primer sets는 6 아형의 그룹으로 나뉘어져 있는 단백질분해조절 효소를 총 12그룹으로 다시 나눈 후, 각 그룹별로 발현하는 패턴을 알아보기 쉽게 PCR 결과물의 크기가 다르게끔 디자인하였다. 이후, 환자 조직에서 뽑은 cDNA를 대상으로 하여 총 40 cycles의 PCR를 진행하여 2% agarose gel을 이용하여 gel electrophoresis을 진행하여 발현량을 비교 분석하였다. PCR 조건과 관련하여 모든 primer sets에 대한 유전자에서 denaturation 조건인 95℃에서 20초, annealing 조건인 60℃에서 40초, extension 조건인 72℃에서 1분간 반응하였다. 이 PCR 반응을 위한 primer sets는 표 2과 같다.
그룹 1 | 그룹 2 | 그룹 3 | 그룹 4 | 그룹 5 | 그룹 6 | 그룹 7 | 그룹 8 | 그룹 9 | 그룹 10 | 그룹 11 | 그룹 12 |
USP4 | USP1 | USP3 | Ataxin3 | COPS5 | OTUB1 | OTUB6B | USP17 | USP2 | USP6 | USP38 | USP36 |
USP5 | USP11 | USP10 | BRCC3 | COPS6 | OTUB2 | OTUD3 | USP26 | USP7 | USP29 | USP31 | USP24 |
USP8 | USP12 | USP16 | EIF3S | EIF3S3 | OTUD1 | OTUD4 | USP35 | USP9Y | USP41 | USP28 | MPND |
USP9X | USP13 | USP18 | JOSD1 | PSMD7 | OTUD5 | OTUD7B | USP50 | USP49 | OTUD6A | BAP1 | USP32 |
USP27 | USP14 | USP19 | JOSD2 | PSMD14 | TNFAIP3 | PARP11 | OTUD7A | ATXIN3L | CYLD | USP39 | |
USP42 | USP15 | USP21 | STAMBP | PRPF8 | VCPIP1 | YOD1 | USP43 | USP37 | |||
USP47 | USP46 | USP33 | STAMBPL1 | ZRANB1 | USP20 | USPL1 | |||||
USP51 | USP48 | USP34 | USP22 | ||||||||
USP52 | USP53 | ||||||||||
USP54 |
3. 갑상선 여포암 환자 조직에서 높거나 낮게 발현하는 단백질분해조절 효소계 (DUB) 유전자
갑상선 여포암 환자 조직과 이에 대한 대조군으로서의 여포선종 암 환자 조직에서 Multiplex PCR primer set를 이용하여 PCR을 진행한 후, 갑상선 여포암 환자 조직에서 높거나 낮게 발현하는 단백질분해조절 효소계 (DUB) 유전자를 발굴하였다 (도 1). 이 중에서, t-test 통계를 이용하여 p-values 값이 유의하게 나타나는 6종을 최종 panel로 확정하였다 (도 2).
단백질분해조절 효소계(DUB) 유전자 | 서열번호 | 프라이머 서열 | 크기 (base pair) | 프라이머 농도 (pmol) |
|
USP9Y | 17 | Forward | 5'-TTGAGGACTCCTGGCAGACT-3' | 413 | 3 |
18 | Reverse | 5'-ATCCTGGTCATCTGGCTCCT-3' | |||
USP14 | 19 | Forward | 5'-TCA GTG TAT TCG TTC TGT GCC TGA-3' | 268 | 4 |
20 | Reverse | 5'-CTC GCT CAT TTG TAT CCA ACA TTCA-3' | |||
USP21 | 21 | Forward | 5'-TGA CAA AGC CGG AAG TCC TGT A-3' | 250 | 2 |
22 | Reverse | 5'-AAA GGG CTT CAC AGG TGC CAG A-3' | |||
USP24 | 23 | Forward | 5'-CCGACAGTTGTCCGTGTCTG-3' | 380 | 5 |
24 | Reverse | 5'-TCCGAAGCTGTAGGCACGTA-3' | |||
USP34 | 25 | Forward | 5'-CAG CCA TAG TGC TGA AGT TCA AGT-3' | 410 | 3 |
26 | Reverse | 5'-GAC TGA CAT CAC CAG ATT GTG CT-3' | |||
USP45 | 27 | Forward | 5'-TGGGCTGTTCAGATCCAGTAGT-3' | 100 | 15 |
28 | Reverse | 5'-ACTGTCAGTCTCCTTGGTGTACAG-3' | |||
USP47 | 29 | Forward | 5'-CGA TGA TCA ACA TGT CAG CAG GA-3' | 150 | 10 |
30 | Reverse | 5'-TTT CTG GCT GGA TCC TTC AGT CT-3' | |||
USP52 | 31 | Forward | 5'-TCT GGC AAG GTT TCC CTG AGA GA-3' | 100 | 15 |
32 | Reverse | 5'-GGT TGC CAT GCA CAT CAA AGT CT-3' | |||
OTUD1 | 33 | Forward | 5'-ATG GGG CAG ATG CTG AAT GTG A-3' | 199 | 5 |
34 | Reverse | 5'-TGC ACC AGT TGT CGT ACT CTG-3' | |||
OTUD3 | 35 | Forward | 5'-GAA GAC GAC CTG AGA GAT GA-3' | 188 | 5 |
36 | Reverse | 5'-CTG GGC TCA AGA TTC TCT TC-3' | |||
OTUD4 | 37 | Forward | 5'-GCT CTG CTA TGT GTC AGT CTC T-3' | 155 | 3 |
38 | Reverse | 5'-TTA CTT GCA ACT GTC ATC CTC TG-3' | |||
OTUD6B | 39 | Forward | 5'-AAG AAT GCT GTT CCC AAG AA-3' | 301 | 15 |
40 | Reverse | 5'-CCA TAT GTC TGG CTC CTG TT-3' | |||
COPS5 | 41 | Forward | 5'-GCA GTG GTG ATT GAT CCA ACA A-3' | 301 | 10 |
42 | Reverse | 5'-AGA CCT GAC CAG TGG TAT AGT C-3' | |||
MPND | 43 | Forward | 5'-CGGGCAGACCTTCAACTCAC-3' | 285 | 20 |
44 | Reverse | 5'-CCCAGTGGTCTCCGACTCTT-3' | |||
PSMD14 | 45 | Forward | 5'-GGT TTG ACA CTT CAG GAC TAC A-3' | 200 | 5 |
46 | Reverse | 5'-GAG GTC ATA AGT ACA TCC ACAT G-3' | |||
YOD1 | 47 | Forward | 5'-ACT TGC CCA TCC AAT CTG GTG A-3' | 100 | 10 |
48 | Reverse | 5'-ACG TAA CTA GAA GCA CCA CGT T-3' |
4. Logistic regression model 과정
USP24 (Ubiquitin specific peptidase 24), USP34 (Ubiquitin specific peptidase 34), COPS5 (COP9 signalosome subunit 5), OTUD3 (OTU Deubiquitinase 3) 및 MPND (MPN domain-containing protein)로 구성된 5종의 DUB panel의 확인을 위하여 Logistic regression model 을 적용하였고 그 결과 이 panel에 의해 갑상선 여포암에서 확실하게 낮게 발현되어 갑상선 여포선종과 구별되는 것을 확인하였다 (도 3 및 4).
또한, USP24 (Ubiquitin specific peptidase 24), USP34 (Ubiquitin specific peptidase 34), USP52 (Ubiquitin specific peptidase 52), COPS5 (COP9 signalosome subunit 5), OTUD3 (OTU Deubiquitinase 3) 및 MPND (MPN domain-containing protein)로 구성된 6종의 DUB panel의 확인을 위하여 Logistic regression model 을 적용하였고 그 결과 이 panel에 의해 갑상선 여포암에서 확실하게 높게 발현되거나 (USP52 ), 낮게 발현(USP24, USP34, COPS5, OTUD3, MPND) 되어 갑상선 여포선종과 구별되는 것을 확인하였다 (도5).
<110> 32323
<120> 323232
<130> 33
<160> 48
<170> KoPatentIn 3.0
<210> 1
<211> 7668
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 1
atgacagcca tcactcatgg ctctccagta ggagggaacg acagccaggg ccaggttctt 60
gatggccagt ctcagcatct cttccaacag aaccagactt catcacctga ttcttccaat 120
gagaattccg tagcaactcc tcctccagag gaacaagggc aaggtgatgc cccaccacag 180
catgaagatg aagagcctgc atttccacat actgagctgg caaacctgga tgacatgatc 240
aacaggcctc gatgggtggt tcctgttttg ccaaaagggg aattagaagt gcttttagaa 300
gctgctattg atcttagtgt aaaaggcctt gatgttaaaa gtgaagcatg ccaacgtttt 360
tttcgagatg gactaacaat atctttcact aaaattctta tggatgaggc tgtgagtggc 420
tggaagtttg aaattcatag atgtattatt aacaatactc atcgcctagt ggagctttgt 480
gtggccaagt tgtcccaaga ttggtttcca cttctagaac ttctcgccat ggccttaaat 540
cctcactgca agtttcatat ctacaatggt acacgtccgt gtgaattaat ttcctcaaat 600
gctcagttgc ctgaagatga attatttgct cgttcttcag atcctcgatc accaaaaggt 660
tggctagtgg atctcatcaa taaatttggc acattaaatg ggttccagat tttgcatgat 720
cgttttttta atggatcagc attaaatatt caaataattg cagctcttat taaaccattt 780
ggacaatgct atgagtttct cagtcaacat acactgaaaa agtacttcat tccagttata 840
gaaatggttc cacatttatt ggaaaactta actgatgaag aactgaaaaa ggaggcaaag 900
aatgaagcca aaaatgatgc cctttcaatg attattaaat ctttgaagaa cttagcttca 960
agaatttcag gacaagatga gactataaaa aatttggaaa tttttaggtt aaagatgata 1020
ctcagattgt tgcaaatttc ctcttttaat ggaaagatga atgcactgaa tgaaataaat 1080
aaggttatat ctagtgtatc atattatact catcggcata gtaatcctga ggaggaagaa 1140
tggctgacag ctgagcgaat ggcagaatgg atacagcaaa ataatatctt atccatagtc 1200
ttgcaagaca gtcttcatca accacaatat gtagaaaagc tagagaaaat tcttcgtttt 1260
gtgattaaag aaaaggctct tacattacag gaccttgata atatctgggc agcacaggca 1320
ggaaaacatg aagccattgt gaagaatgta catgatctgc tagcaaagtt ggcttgggat 1380
ttttctcctg gacaacttga tcatcttttt gattgcttta aggcaagttg gacaaatgca 1440
agtaaaaagc aacgtgaaaa gctccttgag ttgatacgcc gtcttgcaga agatgataaa 1500
gatggtgtga tggcacacaa agtgttgaac cttctttgga acctggctca gagtgatgat 1560
gtgcctgtat acatcatgga ccttgctctt agtgcccaca taaaaatact agattatagt 1620
tgtgcccagg atcgagatgc acagaagatc cagtggatag atcactttat agaagaactt 1680
cgcacaaatg acaagtgggt aattcctgct ctgaaacaaa taagagaaat ttgtagtttg 1740
tttggtgaag catctcaaaa tttgagtcaa actcagcgaa gtccccacat attttatcgc 1800
catgatttaa tcaaccagct tcaacaaaat catgctttag ttactttggt agcagaaaac 1860
cttgcaacct acatgaatag catcagattg tatgctggag atcatgaaga ctatgatcca 1920
caaacagtga ggcttggaag tcgatacagt catgttcaag aagttcaaga acgactaaac 1980
ttccttagat ttttagtgaa ggatggccaa ctgtggctct gtgctcctca ggcaaaacaa 2040
atatggaagt gcttagcaga aaatgcagtt tatctttgtg atcgtgaagc ctgttttaag 2100
tggtattcca agttaatggg ggatgaacca gacttggatc ctgatattaa taaggacttc 2160
tttgaaagta atgtacttca gcttgatcct tcccttttaa ctgaaaatgg aatgaaatgc 2220
tttgaaagat ttttcaaagc tgtcaattgt cgagaaagga aactaatagc aaaaagaaga 2280
tcctatatga tggatgattt ggaattaatt ggactagact acctttggag ggttgtgatt 2340
cagagtagtg acgagattgc taacagagct atagatcttc ttaaagagat atacacaaac 2400
cttggcccaa gattaaaagc caatcaggtg gttatccatg aagacttcat tcagtcttgc 2460
tttgatcgtt taaaagcatc atatgataca ctgtgtgttt ttgatggtga caaaaacagc 2520
attaattgtg caagacaaga agccattcga atggttagag tattaactgt tataaaagag 2580
tacattaatg aatgtgacag tgattatcac aaggaaagaa tgattctacc tatgtcgaga 2640
gcatttcgtg gcaaacacct ctctcttata gttcggtttc caaaccaggg cagacaggtt 2700
gatgagttgg atatatggtc tcatacgaat gacacaattg gttcagtacg gcgatgtatt 2760
gttaatcgta ttaaagccaa tgtagcccac aaaaaaattg aactttttgt gggtggtgag 2820
ctgatagatt ctgaagatga cagaaagcta attggacaat taaacttaaa agataaatct 2880
ctaattacag ccaaacttac acaaataaat ttcaatatgc catcaagtcc tgatagctct 2940
tccgattcct caactgcatc tcctggaaac caccgtaatc attacaatga tggtcccaat 3000
ctagaggtgg aaagttgttt gcctggggtg ataatgtcag tgcatcccag atacatctct 3060
ttcctttggc aagttgcaga cttaggtagc aacctgaata tgccacctct tagagatgga 3120
gcaagagtac ttatgaaact tatgccacca gatagaacag ctgtagaaaa attacgagct 3180
gtttgtttgg accatgcaaa acttggagaa ggcaaactta gtccacccct tgactctctt 3240
ttctttggtc cttctgcctc ccaagttcta tacctaacag aggtagttta tgccttgtta 3300
atgcctgctg gtgtgcctct aactgatggg tcctctgact ttcaagttca cttcttgaaa 3360
agtggtggct tacctcttgt actgagtatg ctaataagaa ataacttctt gccaaataca 3420
gatatggaaa ctcgaagggg tgcttattta aatgctctta aaatagccaa actgttgtta 3480
actgcgattg gctatggcca tgttcgagct gtagcagaag cttgtcagcc agttgtagat 3540
ggtacagacc ccataacaca gattaaccaa gttactcatg atcaagcagt ggtgctacaa 3600
agtgcccttc agagcattcc taatccctca tccgagtgcg tacttagaaa tgagtccata 3660
cttcttgctc aggaaatatc taatgaggct tcaagatata tgcctgatat ttgtgtaatt 3720
agggctatac agaaaattat ctgggcatca gcatgtgggg cattaggact agtttttagc 3780
ccaaatgaag aaataactaa aatttatcag atgaccacca atggaagcaa taagctggag 3840
gtggaagatg aacaagtttg ctgtgaagca ctggaagtga tgaccttatg ttttgcttta 3900
cttccaacag cgttggatgc acttagtaaa gaaaaagcct ggcagacctt catcattgac 3960
ttattattgc actgtccaag caaaactgtt cgtcagttgg cacaggagca gttcttttta 4020
atgtgcacca gatgttgcat gggacacagg cctctgcttt tcttcattac tttactcttt 4080
accatactgg ggagcacagc aagagagaag ggtaaatatt caggtgatta tttcacactt 4140
ttacggcacc ttctcaatta tgcttacaat ggcaatatta acatacccaa tgctgaagtt 4200
cttcttgtca gtgaaattga ttggctcaaa aggattaggg ataatgttaa aaacacaggt 4260
gaaacaggtg tcgaagagcc aatactggaa ggccaccttg gggtaacaaa agagttattg 4320
gcctttcaaa cttctgagaa aaagtatcac tttggttgtg aaaaaggagg tgctaatctc 4380
attaaagaat taattgatga tttcatcttt cccgcatcca aagtttacct gcagtattta 4440
agaagtggag aactaccagc tgagcaggct attccagtct gtagttcacc cgttaccatc 4500
aatgccggtt ttgagctact tgtagcatta gctattggct gtgtgaggaa tctcaaacag 4560
atagtagact gtttgactga aatgtattac atgggcacag caattactac ttgtgaagca 4620
cttactgagt gggaatatct gccccctgtt ggaccccgcc caccaaaagg atttgtggga 4680
ctcaaaaatg ctggtgctac gtgttacatg aactctgtga tccagcagct atacatgatt 4740
ccttctatca ggaacagtat tcttgcaatt gaaggcacag gtagtgattt acacgatgat 4800
atgttcgggg atgagaagca ggacagtgag agtaatgttg atccccgaga tgatgtattt 4860
ggatatcctc atcaatttga agacaagcca gcattaagta agacagaaga taggaaagag 4920
tataatattg gtgtcctaag acaccttcag gtcatctttg gtcatttagc tgcttcccaa 4980
ctacaatact atgtacccag aggattttgg aaacagttca ggctttgggg tgaacctgtt 5040
aatctccgtg aacaacatga tgccttagag ttttttaatt ctttggtgga tagtttagat 5100
gaagctttaa aagctttagg acacccggct atactaagta aagtcctagg aggctccttt 5160
gctgatcaga agatctgcca aggctgccca cataggtatg aatgtgaaga atcttttaca 5220
actttgaatg tggatattag aaatcatcaa aatcttcttg actctttgga acagtatatc 5280
aaaggagatt tattggaagg tgcaaatgca tatcattgtg aaaaatgtga taaaaaggtt 5340
gacacagtaa agcgcctgct aattaaaaaa ttgcctcggg ttcttgctat ccaactcaaa 5400
cgatttgact atgactggga aagagaatgt gcaattaaat tcaatgatta ttttgaattt 5460
cctcgagagc tggatatggg accttacaca gtagcaggtg ttgcaaacct ggaaagggat 5520
aatgtaaact cagaaaatga gttgattgaa cagaaagagc agtctgacaa tgaaactgca 5580
ggaggcacaa agtacagact tgtaggagtg cttgtacaca gtggtcaagc aagcggtggg 5640
cattattatt cttacatcat tcaaaggaat ggtaaagatg atcagacaga tcactggtat 5700
aaatttgatg atggagatgt aacagaatgc aaaatggatg atgatgaaga aatgaaaaat 5760
cagtgttttg gtggagagta catgggagaa gtatttgatc acatgatgaa gcgcatgtca 5820
tataggcgac agaagaggtg gtggaatgct tacatacttt tttatgaaca aatggatatg 5880
atagatgaag atgatgagat gataagatac atatcagagc taactattgc aagaccccat 5940
cagatcatta tgtcaccagc cattgagaga agtgtacgga aacaaaatgt gaaatttatg 6000
cataaccgat tgcaatatag tttagagtat tttcagtttg tgaaaaaact gcttacatgt 6060
aatggtgttt atttaaaccc tgctccaggg caggattatt tgttgcctga agcagaagaa 6120
attactatga ttagtattca gcttgctgct agattcctct ttaccactgg atttcacacc 6180
aagaaaatag ttcgtggtcc tgccagtgac tggtatgatg cactgtgcgt tcttctccgt 6240
cacagcaaaa atgtaggttt ttggtttact cataatgtcc tttttaatgt atcaaatcgc 6300
ttctctgaat accttctgga gtgccctagt gcagaagtga ggggtgcatt tgcaaaactt 6360
atagtgttta ttgcacactt ttccttgcaa gatgggtctt gtccttctcc ttttgcatct 6420
ccaggacctt ctagtcaggc atgtgataac ttgagcttga gtgaccactt actaagagcc 6480
acactaaatc tcttgagaag ggaagtttca gagcatggac atcatttaca gcaatatttt 6540
aatttgtttg taatgtatgc caatttaggt gtggcagaaa aaacacagct tctgaaattg 6600
aatgtacctg ctacctttat gcttgtgtct ttagacgaag gaccaggtcc tccaatcaaa 6660
tatcagtatg ctgaattagg caagttatat tcagtagtgt ctcagctgat tcgttgttgc 6720
aatgtgtcat caacaatgca gtcttcaatc aatggtaatc cccctctccc caatcctttc 6780
ggtgacctta atttatcaca gcctataatg ccaattcagc agaatgtgtt agacatttta 6840
tttgtgagaa caagttatgt gaagaaaatt attgaagact gcagtaactc agaggatacc 6900
atcaaattac ttcgcttttg ctcttgggag aatcctcagt tctcatctac tgtcctcagc 6960
gaacttctct ggcaggttgc atattcatat acctatgaac ttcggccata tttagatcta 7020
cttttccaaa ttttactgat tgaggactcc tggcagactc acagaattca taatgcactt 7080
aaaggaattc cagatgacag agatgggctg ttcgatacaa tacagcgctc gaagaatcac 7140
tatcaaaaac gagcatatca gtgcataaaa tgtatggtag ctctatttag cagttgtcct 7200
gttgcttacc agatcttaca gggtaacgga gatcttaaaa gaaaatggac ctgggcagtg 7260
gaatggctag gagatgaact tgaaagaaga ccatatactg gcaatcctca gtatagttac 7320
aacaattggt ctcctccagt acaaagcaat gaaacagcaa atggttattt cttagaaaga 7380
tcacatagtg ctaggatgac acttgcaaaa gcttgtgaac tctgtccaga agaggagcca 7440
gatgaccagg atgccccaga tgagcatgag ccctctccat cagaagatgc cccattatat 7500
cctcattcac ctgcctctca gtatcaacag aataatcatg tacatggaca gccatataca 7560
ggaccagcag cacatcactt gaacaaccct cagaaaacag gccaacgaac acaagaaaat 7620
tatgaaggca atgaagaagt atcctcacct cagatgaagg atcagtga 7668
<210> 2
<211> 1485
<212> DNA
<213> Homo Sapiens
<400> 2
atgccgctct actccgttac tgtaaaatgg ggaaaggaga aatttgaagg tgtagaattg 60
aatacagatg aacctccaat ggtattcaag gctcagctgt ttgcgttgac tggagtccag 120
cctgccagac agaaagttat ggtgaaagga ggaacgctaa aggatgatga ttggggaaac 180
atcaaaataa aaaatggaat gactctacta atgatggggt cagcagatgc tcttccagaa 240
gaaccctcag ccaaaactgt cttcgtagaa gacatgacag aagaacagtt agcatctgct 300
atggagttac catgtggatt gacaaacctt ggtaacactt gttacatgaa tgccacagtt 360
cagtgtattc gttctgtgcc tgaactcaaa gatgccctta aaaggtatgc aggtgccttg 420
agagcttcag gggaaatggc ttcagcgcag tatattactg cagcccttag agatttgttt 480
gattccatgg ataaaacttc ttccagtatt ccacctatta ttctactgca gtttttgcac 540
atggctttcc cacagtttgc cgagaaaggt gaacaaggac agtatcttca acaggatgct 600
aatgaatgtt ggatacaaat gatgcgagta ttgcaacaga aattggaagc aatagaggat 660
gattctgtta aagagacaga ctcctcatct gcatcggcag cgacaccttc taaaaagaaa 720
agtttaatcg atcagttctt cggtgttgag tttgaaacta ccatgaaatg tacagaatct 780
gaagaagaag aagtcaccaa aggaaaggaa aatcaacttc agcttagctg ttttatcaat 840
caggaagtca agtatctttt tacaggactt aaattgcgac ttcaggaaga aatcaccaaa 900
cagtctccaa cgttgcaaag aaatgccttg tatatcaaat cttccaagat cagccggctg 960
cctgcttact tgaccattca gatggttcga tttttttata aagagaagga atctgtgaat 1020
gccaaagttc ttaaggatgt taaatttcct cttatgttgg atatgtatga actgtgtaca 1080
ccagaacttc aagagaaaat ggtgtctttt cgatccaaat tcaaggatct agaagataaa 1140
aaagtgaatc agcagccaaa tacaagtgac aaaaagagta gtccccagaa agaagttaag 1200
tatgaaccct tttcttttgc tgatgatatt ggctccaata attgtggata ctatgactta 1260
caagcagtac taacacacca gggaaggtct agttcttcag gtcattatgt atcatgggtg 1320
aaaaggaaac aagatgaatg gattaagttt gatgatgaca aagtcagcat cgtaacacca 1380
gaagatatct tacggctttc tggtggtgga gactggcata tcgcttacgt tctactctat 1440
gggcctcgca gagttgaaat aatggaagag gaaagtgaac agtaa 1485
<210> 3
<211> 1698
<212> DNA
<213> Homo Sapiens
<400> 3
atgccccagg cctctgagca ccgcctgggc cgtacccgag agccacctgt taatatccag 60
ccccgagtgg gatccaagct accatttgcc cccagggccc gcagcaagga gcgcagaaac 120
ccagcctctg ggccaaaccc catgttacga cctctgcctc cccggccagg tctgcctgat 180
gaacggctca agaaactgga gctgggacgg ggacggacct caggccctcg tcccagaggc 240
ccccttcgag cagatcatgg ggttcccctg cctggctcac cacccccaac agtggctttg 300
cctctcccat ctcggaccaa cttagcccgt tccaagtctg tgagcagtgg ggacttgcgt 360
ccaatgggga ttgccttggg agggcaccgt ggcaccggag agcttggggc tgcactgagc 420
cgcttggccc tccggcctga gccacccact ttgagacgta gcacttctct ccgccgccta 480
gggggctttc ctggaccccc taccctgttc agcatacgga cagagccccc tgcttcccat 540
ggctccttcc acatgatatc cgcccggtcc tctgagcctt tctactctga tgacaagatg 600
gctcatcaca cactccttct gggctctggt catgttggcc ttcgaaacct gggaaacacg 660
tgcttcctga atgctgtgct gcagtgtctg agcagcactc gacctcttcg ggacttctgt 720
ctgagaaggg acttccggca agaggtgcct ggaggaggcc gagcccaaga gctcactgaa 780
gcctttgcag atgtgattgg tgccctctgg caccctgact cctgcgaagc tgtgaatcct 840
actcgattcc gagctgtctt ccagaaatat gttccctcct tctctggata cagccagcag 900
gatgcccaag agttcctgaa gctcctcatg gagcggctac accttgaaat caaccgccga 960
ggccgccggg ctccaccgat acttgccaat ggtccagttc cctctccacc ccgccgagga 1020
ggggctctgc tagaagaacc tgagttaagt gatgatgacc gagccaacct aatgtggaaa 1080
cgttacctgg agcgagagga cagcaagatt gtggacctgt ttgtgggcca gttgaaaagt 1140
tgtctcaagt gccaggcctg tgggtatcgc tccacgacct tcgaggtttt ttgtgacctg 1200
tccctgccca tccccaagaa aggatttgct gggggcaagg tgtctctgcg ggattgtttc 1260
aaccttttca ctaaggaaga agagctagag tcggagaatg ccccagtgtg tgaccgatgt 1320
cggcagaaaa ctcgaagtac caaaaagttg acagtacaaa gattccctcg aatcctcgtg 1380
ctccatctga atcgattttc tgcctcccga ggctccatca aaaaaagttc agtaggtgta 1440
gactttccac tgcagcgact gagcctaggg gactttgcca gtgacaaagc cggaagtcct 1500
gtataccagc tgtatgccct ttgcaaccac tcaggcagcg tccactatgg ccactacaca 1560
gccctgtgcc ggtgccagac tggttggcat gtctacaatg actctcgtgt ctcccctgtc 1620
agtgaaaacc aggtggcatc cagcgagggc tacgtgctgt tctaccaact gatgcaggag 1680
ccaccccggt gcctgtga 1698
<210> 4
<211> 7863
<212> DNA
<213> Homo Sapiens
<400> 4
atggaatcgg aggaggagca gcacatgacc acgctgctgt gcatgggctt ctcagacccc 60
gccaccatcc gcaaggccct gcgcctggcc aagaacgaca ttaacgaggc cgtggcactg 120
ctcaccaacg agcggccggg cctcgactac ggcggctacg agcccatgga cagcggcggt 180
ggccccagcc ccgggcccgg cgggggcccg cggggcgacg gcggaggtga cggcggcggc 240
ggcggcccct cccgcggcgg gagcaccgga ggcgggggcg gcttcgaccc cccgcccgcc 300
taccacgagg tggtggacgc ggagaagaat gatgagaatg gaaactgctc aggggaagga 360
attgaattcc ctacaacaaa tttatatgaa ctggaaagcc gtgttttgac tgatcattgg 420
tccatccctt acaagcgaga agaatcacta ggcaaatgcc tgttggcatc tacctaccta 480
gcaagacttg gtctttccga gtctgatgag aattgtagaa ggtttatgga caggtgtatg 540
cctgaagcat ttaaaaagct cctgacatca agtgctgttc acaagtgggg tactgaaatt 600
catgaaggaa tttacaacat gttgatgcta ttaatagaac tggtcgcaga gagaataaaa 660
caagatccaa ttcccactgg tctcctgggt gtgcttacaa tggctttcaa tcctgataat 720
gaataccatt ttaaaaacag aatgaaagtg tctcaaagga attgggcaga agtgtttgga 780
gagggaaata tgtttgctgt ttcacctgta tcgactttcc aaaaggagcc tcatggatgg 840
gttgtggatt tggtaaataa gtttggagaa ttaggtggat ttgcagcaat ccaagccaag 900
ctccattcag aagatataga acttggggct gtctcagcac tgattcagcc cttaggagtg 960
tgtgcagagt acctcaattc ctccgtggta cagcccatgc tagacccagt cattcttact 1020
acaatccagg atgtacggag tgtagaagag aaagacctca aagacaagag attggttagc 1080
atccctgagc tcttgtctgc cgttaagtta ctttgcatgc gcttccaacc ggatctggtg 1140
acaattgtgg atgaccttcg actagatatt ctattgcgca tgctgaaatc accacatttc 1200
agtgctaaga tgaattctct caaagaagta accaaactaa tagaagatag cactttatcc 1260
aaatctgtga agaatgctat agatacagac agattattag attggctagt tgaaaactca 1320
gttctgtcga ttgcactgga aggcaacata gaccaagcac aatactgtga ccgtataaag 1380
ggaattattg aactcttggg tagtaaattg tcgttagatg aactcactaa aatttggaag 1440
atacagtcag gacaatcatc tactgtgatt gagaacattc atactattat tgctgcagcg 1500
gctgtgaaat ttaattcaga tcagcttaat catttgtttg ttctcattca gaagagctgg 1560
gagactgaga gtgatagagt aagacagaag cttttgagcc tgattggacg aataggccgg 1620
gaagctcgct ttgagaccac ttctggaaag gttttagacg tactctggga actggctcac 1680
cttccaaccc tgcccagtag ccttattcag caggccttgg aggagcacct gacaatcctt 1740
agtgatgcat atgcagtgaa agaagcaatc aagaggagct acatcatcaa gtgcatagaa 1800
gatattaaga ggcctggaga atggtcaggt ttggaaaaaa acaagaagga tggattcaag 1860
tcatctcagc ttaataatcc ccagtttgta tgggtggtac cagctttgcg tcagctccat 1920
gaaattactc gctcattcat aaaacaaacc tatcaaaagc aagacaagag cattattcaa 1980
gacttgaaga agaattttga aatagtgaaa ttggtaacgg gaagtttgat cgcttgtcat 2040
cggcttgcag ctgctgtggc cgggcctgga ggcttaagtg gctcgacact agtggatggc 2100
cggtacactt accgggagta tttagaggca catctaaaat ttctagcgtt tttcttgcaa 2160
gaagctactc tgtatctggg ctggaatcgt gccaaggaga tctgggagtg tcttgtaact 2220
ggccaggatg tttgtgaatt agatagagag atgtgttttg aatggtttac aaaaggacag 2280
catgatcttg agagtgatgt tcagcagcag ctcttcaagg agaaaattct taaattggag 2340
tcatatgaaa tcactatgaa tggttttaac ttatttaaaa ctttttttga aaatgtgaat 2400
ctttgtgatc atcgattgaa aagacaagga gctcagttgt atgtagaaaa gctggaattg 2460
ataggaatgg atttcatttg gaaaatagcc atggaatcac ctgatgaaga aattgctaat 2520
gaagctattc agctaatcat aaactatagt tacattaatc taaatcctag attaaagaag 2580
gattcagtat ctttacataa gaaattcatt gctgattgct acacaagatt agaagcagcc 2640
agttcagcac ttggtggccc cactctaaca catgctgtga ccagagcaac aaaaatgctt 2700
acagcaactg ccatgccaac tgtagcaacc tcagttcagt ctccttatag atctactaaa 2760
cttgtaataa ttgagagatt gctgcttctg gcagagcgct atgtgatcac tatagaggat 2820
ttttactctg ttccacgaac tattctacct catggtgcct catttcatgg acatctttta 2880
acccttaatg ttacctatga gtctaccaaa gataccttca ctgtcgaggc tcacagtaat 2940
gaaaccatag ggagtgtccg gtggaaaata gccaagcagt tgtgctctcc tgtggataat 3000
atacagatat ttacaaatga tagcctgctg acagtgaata aagatcaaaa gctactccac 3060
caactgggct tttctgatga acaaatcctt acagtgaaga cttctggcag tgggacccca 3120
tctgggagtt cagcagattc ttcaaccagc tccagcagca gcagcagtgg ggtttttagt 3180
tcttcatatg ccatggagca ggagaaatcc ctccctggtg tagtgatggc tctcgtatgt 3240
aacgtatttg acatgcttta tcagctcgcc aatctggaag agccaaggat aactctacga 3300
gtacggaagc ttctgctctt gatacccact gatccagcca ttcaggaagc ccttgatcaa 3360
cttgattctt taggaagaaa gaaaacattg ctgtctgaat caagttctca gtcctcaaaa 3420
tctccatccc tgtcatcaaa gcaacagcac cagccaagtg ccagttcaat tttagaaagt 3480
ctgtttcgat cttttgcccc gggaatgtct accttcagag tgctctacaa cttagaagtt 3540
ctaagctcca aactcatgcc aacagctgat gatgacatgg ccagaagctg tgccaaatcc 3600
ttctgtgaaa acttcctcaa agctggcggt ttgagtttgg ttgtaaatgt catgcagaga 3660
gactccatcc catcagaagt agactatgaa acaaggcagg gtgtttattc catctgtcta 3720
cagcttgcaa gatttttact tgtcggacaa acaatgccca cgttattaga tgaagacctc 3780
accaaagatg gtatagaagc actttcttcc cgcccattcc gaaatgtcag ccggcagaca 3840
agcagacaga tgtccttatg tggtacccca gaaaagtcat cctaccgaca gttgtccgtg 3900
tctgataggt cttctattag ggttgaggaa atcatccctg ctgctcgagt tgcaatacaa 3960
acaatggaag taagtgattt cacttctact gtggcttgct tcatgagatt gtcatgggct 4020
gcggctgcag gacggcttga tcttgttggg agtagccagc caattaaaga aagtaattcc 4080
ctgtgtcctg ctggaattcg aaacagactc agcagttcag gaagcaattg cagctctgga 4140
agtgaaggag aaccagtagc cctgcatgcg ggaatctgtg ttcgacaaca gtctgtatcc 4200
accaaagact cgctgattgc gggagaggct ttgtctcttc ttgttacgtg cctacagctt 4260
cggagccagc aactggcatc tttctataac ttgccctgtg ttgctgattt catcattgat 4320
attctgctcg gatcaccaag tgctgagatt cgccgggttg cctgtgatca gctgtacact 4380
cttagtcaga cagacacatc agcgcatcca gatgtgcaga agccaaatca gtttcttcta 4440
ggcgtaatcc tcacggctca gctgcctctc tggtctccaa ctagtattat gagaggagtc 4500
aatcagagac tgttatctca gtgtatggag tattttgatt tgagatgcca gttattagat 4560
gatctgacaa cttcagaaat ggagcagtta aggatcagcc cagctacgat gcttgaagat 4620
gagattactt ggctggataa ctttgaacct aatcgtacag ctgaatgtga gaccagtgaa 4680
gcggacaaca tcttactggc agggcactta cgcctcatca agacccttct ttcactctgt 4740
ggggcagaaa aggaaatgct tggttcatca ctcattaaac cattgttaga tgacttcctt 4800
ttccgagctt ctagaattat tttaaatagt cattctccag ctggcagtgc cgccatcagt 4860
caacaggact ttcatccaaa gtgtagtaca gcgaatagcc gattggcagc ctatgaagtc 4920
cttgtgatgt tggctgatag ttcaccttca aatcttcaaa ttattataaa agaactgctt 4980
tctatgcatc accagcctga ccctgctctt accaaggagt ttgattacct tcccccagtg 5040
gatagcaggt ccagttcagg gtttgtgggg ctgagaaatg gtggtgcaac ttgttatatg 5100
aatgcagtct tccagcagct gtatatgcaa cctgggctcc ctgagtcatt actttcagtg 5160
gatgatgaca cagacaatcc agatgatagc gtgttttacc aagtgcagtc tctctttgga 5220
catttaatgg aaagcaagct gcagtactat gtacctgaga atttttggaa gattttcaag 5280
atgtggaata aagaacttta tgtgagagaa cagcaggatg catatgaatt ctttactagt 5340
ctcattgatc agatggatga atacctcaag aaaatgggga gagaccaaat ttttaagaat 5400
acatttcagg gcatctactc tgatcagaag atctgtaaag actgtcctca cagatatgag 5460
cgtgaagaag ctttcatggc tctcaatcta ggagtgactt cttgtcagag tttggaaatt 5520
tctttggacc aatttgttag aggagaagtt ctagaaggaa gtaatgcgta ctactgtgaa 5580
aagtgtaaag aaaagagaat aacagtgaaa aggacctgta ttaaatcttt acctagcgtc 5640
ttggtaattc acctaatgag atttgggttt gactgggaaa gcggacgctc cattaaatat 5700
gatgaacaaa taaggtttcc ctggatgcta aacatggagc cttacacagt ttcaggaatg 5760
gctcgccaag attcttcttc tgaagttggg gaaaatgggc gaagtgtgga tcagggcggt 5820
ggaggatccc cacgaaaaaa ggttgccctc acagaaaact atgaacttgt cggtgtcatc 5880
gtacacagtg ggcaggcaca cgcaggccac tactattcct tcattaagga caggcgaggg 5940
tgtggaaaag gaaagtggta taaatttaat gacacagtta tagaagaatt tgacctaaat 6000
gacgagaccc tggagtatga atgctttgga ggagaatata gaccaaaagt ttatgatcaa 6060
acaaacccat acactgatgt gcgccgaaga tactggaatg cctatatgct tttctaccaa 6120
agggtgtctg atcagaactc cccagtatta ccaaagaaaa gtcgagtcag cgttgtacgg 6180
caggaagctg aggatctctc tctgtcagct ccatcttcac cagaaatttc acctcagtca 6240
tcccctcggc cccataggcc gaacaatgac cggctgtcta ttcttaccaa gctggttaaa 6300
aaaggcgaga agaaaggact gtttgtggag aaaatgcctg ctcgaatata ccagatggtg 6360
agagatgaga acctcaagtt tatgaagaat agagatgtat acagtagtga ttatttcagt 6420
tttgttttgt ctttagcttc attgaatgct actaaattaa agcatccata ttatccttgc 6480
atggcaaagg tgagcttaca gcttgctatt caattccttt ttcaaactta tctacggaca 6540
aagaagaaac tcagggttga tactgaagaa tggattgcta ccattgaagc attgctttca 6600
aaaagttttg atgcttgtca gtggttagtt gaatatttta ttagttctga aggacgagaa 6660
ttgataaaga ttttcttact ggagtgcaat gtgagagaag tacgagttgc tgtggccacc 6720
attctggaga aaaccctaga cagtgccttg ttttatcagg ataagttaaa aagccttcat 6780
cagttactgg aggtactact tgctctgttg gacaaagacg tcccagaaaa ttgtaaaaac 6840
tgtgctcagt actttttcct gttcaacact tttgtacaaa agcaaggaat tagggctgga 6900
gatcttcttc tgaggcattc agctctgcgg cacatgatca gcttcctcct aggggccagt 6960
cggcaaaaca atcagatacg tcgatggagt tcagcacaag cacgagaatt tgggaatctt 7020
cacaatacag tggcgttact tgttttgcat tcagatgtct catcccaaag gaatgttgct 7080
cctggcatat ttaagcaacg accacccatt agcattgctc cctcaagccc tctgttgccc 7140
ctccatgagg aggtagaagc cttgttgttc atgtctgaag ggaaacctta cctgttagag 7200
gtaatgtttg ctttgcggga gctgacaggc tcgctcttgg cactcattga gatggtagtg 7260
tactgctgtt tctgtaatga gcatttttcc ttcacaatgc tgcatttcat taagaaccaa 7320
ctagaaacgg ctccacctca tgagttaaag aatacgttcc aactacttca tgaaatattg 7380
gttattgaag atcctataca agtagagcga gtcaaatttg tgtttgagac agaaaatgga 7440
ttactagctt tgatgcacca cagtaatcat gtggacagta gtcgctgcta ccagtgtgtc 7500
aaatttcttg tcactcttgc tcaaaagtgt cctgcagcta aggagtactt caaggagaat 7560
tcccaccact ggagctgggc tgtgcagtgg ctacagaaga agatgtcaga acattactgg 7620
acaccacaga gtaatgtctc taatgaaaca tcaactggaa aaacctttca gcgaaccatt 7680
tcagctcagg acacgttagc gtatgccaca gctttgttga atgaaaaaga gcaatcagga 7740
agcagtaatg ggtcggagag tagtcctgcc aatgagaacg gagacaggca tctacagcag 7800
ggttcagaat ctcccatgat gattggtgag ttgagaagtg accttgatga tgttgatccc 7860
tag 7863
<210> 5
<211> 10188
<212> DNA
<213> homo sapiens
<400> 5
atgagaagga aaaactctta ctatgtgtgg caaaaaattt ttcaaattca gtttccctta 60
tatactgctt acaagcataa tactcaccct actattgagg atatatcaac tcaagaaagt 120
aacatattag gggcattctg tgatatgaat gatgtagaag taccattgca tttgcttcgt 180
tatgtatgtt tgttttgtgg gaaaaatggc ctttctctca tgaaggattg ctttgaatat 240
ggaactcctg aaactttgcc atttcttata gcacatgcgt ttattacagt tgtgtctaat 300
attagaatat ggctacatat tcccgctgtc atgcagcaca ttataccttt taggacctat 360
gttattaggt atttatgcaa gctctcggat caggagttac gacagagtgc agctcgtaac 420
atggctgact taatgtggag cacagtcaaa gaaccattgg atacaacatt atgctttgat 480
aaagaaagcc tagatcttgc atttaagtac tttatgtcac ctactttgac tatgaggttg 540
gctggattga gtcagataac aaatcaactc cataccttca atgatgtgtg caataatgaa 600
tcattagtat cggacacaga aacgtccatt gcaaaagaac ttgcagactg gcttattagc 660
aacaatgtgg tggagcatat atttggacca aatttacata ttgagattat caaacagtgc 720
caagtgattt tgaatttttt ggcagcagaa gggcgactga gtactcaaca tattgactgt 780
atttgggctg cagcacagtt gaaacattgt agtcggtata tacatgactt atttccttca 840
ctcatcaaga atttggatcc cgtaccactt agacatctac ttaatctggt ctcagctctt 900
gagccaagtg ttcatactga acagacactg tacttggcat ccatgttaat taaagcactg 960
tggaataacg cactagcagc taaggctcag ttatctaaac agagttcttt tgcatcttta 1020
ttaaatacta atattcccat tggaaataag aaagaggaag aagagcttag aagaacagct 1080
ccatcacctt ggtcacctgc agctagtcct caaagcagtg ataatagcga tacacatcaa 1140
agtggaggta gtgacattga aatggatgag caacttatta atagaaccaa acatgtgcaa 1200
caacgacttt cagacacaga ggaatccatg cagggaagtt ctgacgaaac tgccaacagt 1260
ggtgaagatg gaagcagtgg tcctggtagc agtagtgggc atagtgatgg atctagcaat 1320
gaggttaatt ctagccacgc aagccagtca gctgggagcc ctggcagtga ggtacagtca 1380
gaagacattg cagatattga agccctcaaa gaggaagatg aagacgatga tcatggtcat 1440
aatcctccca aaagcagttg tggtacagat cttcggaata gaaagttaga gagtcaagca 1500
ggcatttgcc tgggggactc ccaaggcacg tcagaaagaa atgggacaag cagcggaaca 1560
ggaaaggacc tggtttttaa cactgaatca ttgccatcag tagataatcg aatgcgaatg 1620
ctggatgctt gttcacactc tgaagaccca gaacatgata tttcagggga aatgaatgct 1680
actcatatag cacaagggtc tcaggagtct tgtatcacac gaactgggga cttccttggg 1740
gagactattg ggaatgaatt atttaattgt cgacaattta ttggtccaca gcatcaccac 1800
caccaccacc accatcacca ccaccacgat gggcatatgg ttgatgatat gctaagtgca 1860
gatgatgtca gttgtagtag ctcccaggtt agtgcaaaat cagaaaaaaa tatggctgat 1920
tttgatggtg aagaatctgg atgtgaagag gagctagttc agattaattc acatgcggaa 1980
ctgacatctc acctccaaca acatcttccc aatttagctt ccatttacca tgaacatctt 2040
agtcaaggac ctgtagttca taaacatcaa ttcaacagta atgctgttac agacattaat 2100
ttggataatg tttgcaagaa aggaaatact ttgttgtggg atatagtcca agatgaagat 2160
gcagttaatc tttctgaagg attaataaat gaagcagaga aacttctttg ttcgttagta 2220
tgttggttta cagatagaca aattcgaatg agattcattg aaggttgcct tgaaaacttg 2280
ggaaacaaca gatcagtagt aatttcactt cgtcttcttc caaaactatt tggtactttt 2340
cagcagtttg ggagcagtta cgatacacac tggataacaa tgtgggcaga aaaagaactg 2400
aacatgatga agcttttctt tgataatttg gtatactaca ttcaaactgt gagagaagga 2460
agacaaaaac atgcactgta cagccatagt gctgaagttc aagttcgtct tcaattcttg 2520
acttgtgtat tttcaactct gggatcacct gatcatttca ggttaagttt agagcaagtt 2580
gacatcttat ggcattgttt agtagaagat tctgaatgtt atgatgatgc actccattgg 2640
tttttaaatc aagttcgaag taaagatcaa catgctatgg gtatggaaac ctacaaacat 2700
cttttcctgg agaagatgcc ccagctaaaa cctgaaacaa ttagcatgac tggcttaaac 2760
ctgtttcagc atctctgtaa cttggctcga ttggctacca gtgcctatga tggttgttca 2820
aattctgagc tgtgtggtat ggaccaattt tggggcattg ctttaagagc acaatctggt 2880
gatgtcagtc gagcagctat ccagtatatt aactcctatt atattaatgg taaaacaggt 2940
ttggagaagg agcaagaatt tattagtaag tgcatggaga gtcttatgat agcttctagc 3000
agtcttgaac aggaatcaca ctcaagtctc atggttatag aaagaggact ccttatgctg 3060
aagacacatc tggaagcgtt taggagaagg tttgcatatc atctgagaca gtggcaaatt 3120
gaaggcactg gtattagtag tcatttgaaa gcactgagtg acaaacagtc tctgccgcta 3180
agggttgtat gccagccagc tggacttcct gacaagatga ctattgaaat gtatcctagt 3240
gaccaggtag cagatcttag ggctgaagta actcattggt atgaaaattt acagaaagaa 3300
caaataaatc aacaagctca gcttcaggag tttggtcaaa gcaaccgaaa aggagagttt 3360
cctggaggcc tcatgggacc tgtcaggatg atttcatctg gacacgagtt aacaacagat 3420
tatgatgaaa aagcacttca tgagcttggt tttaaggata tgcagatggt atttgtatct 3480
ttgggtgcac caaggagaga gcggaaaggg gaaggtgttc agctgccagc atcttgcctc 3540
ccaccccctc agaaggacaa cattccaatg cttttgcttt tacaagagcc tcatttaact 3600
actctttttg atttattaga gatgcttgca tcatttaaac caccctcagg aaaagtggca 3660
gtggatgata gtgagagctt acgatgtgaa gaacttcatc ttcatgcaga aaatctgtct 3720
aggcgggtct gggagctact gatgcttctt cctacatgtc ctaatatgtt gatggcattc 3780
cagaatatct cagatgagca gagtaatgat ggatttaatt ggaaagaact tctcaaaatt 3840
aagagcgccc acaagctatt gtatgctctg gaaattattg aagcactggg aaaacctaat 3900
agaagaataa ggagggagtc tacgggaagt tacagtgatc tttatccaga ttcagatgat 3960
tcaagtgagg atcaagtgga aaatagtaaa aattcctgga gttgcaagtt tgttgctgct 4020
ggagggcttc aacagttatt agaaattttt aattctggaa ttctagagcc taaagagcag 4080
gaatcatgga ctgtgtggca gctagactgt cttgcttgct tgctgaagtt aatatgccag 4140
tttgcagtag atccatccga tttggattta gcttatcatg atgtctttgc ctggtctggt 4200
atagcggaaa gccataggaa aagaacctgg cctggcaaat caaggaaggc tgctggtgat 4260
catgctaagg gtcttcatat accacgatta acagaggtat ttcttgttct tgtccaagga 4320
accagtttga ttcagcgact tatgtctgtt gcttatacgt atgataatct ggctcctaga 4380
gttttaaaag ctcagtctga tcacaggtct agacatgaag tttcacatta ttcaatgtgg 4440
ctcttggtga gttgggctca ttgctgttct ttagtgaaat ctagccttgc tgatagcgat 4500
catttacaag attggctaaa gaaattgact ctccttattc ctgagactgc agttcgtcat 4560
gaatcatgca gtggtctcta taagttatcc ctgtcagggc tggatggagg agactcaatc 4620
aatcgttctt ttctgctatt ggctgcctca acattattga aatttcttcc tgatgctcaa 4680
gcactcaaac ctattaggat agatgattat gaggaagaac caatattaaa accaggatgt 4740
aaagagtatt tttggttgtt atgcaaatta gttgacaaca tacatataaa ggacgctagt 4800
cagacaacgc tcctcgactt agatgccttg gcaagacatt tggctgactg tattcgaagt 4860
agggagatcc ttgatcatca ggatggtaat gtagaagatg atgggcttac aggactccta 4920
aggcttgcaa caagtgttgt taaacacaaa ccacccttta aattttcaag ggaaggacag 4980
gaatttttga gagatatctt caatctcctg tttttgttgc caagtctaaa ggaccgacaa 5040
cagccaaagt gcaaatcaca ttcttcaaga gctgccgctt acgatttgtt agtagagatg 5100
gtaaaggggt ctgttgagaa ctacaggcta atacacaact gggttatggc acaacacatg 5160
cagtcccatg caccttataa atgggattac tggcctcatg aagatgtccg tgctgaatgt 5220
agatttgttg gccttactaa ccttggagct acttgttact tagcttctac tattcagcaa 5280
ctttatatga tacctgaggc aagacaggct gtcttcactg ccaagtattc agaggatatg 5340
aagcacaaga ccactcttct ggagcttcag aaaatgttta catatttaat ggagagtgaa 5400
tgcaaagcat ataatcctag acctttctgt aaaacataca ccatggataa gcagcctctg 5460
aatactgggg aacagaaaga tatgacagag ttttttactg atctaattac caaaatcgaa 5520
gaaatgtctc ccgaactgaa aaataccgtc aaaagtttat ttggaggtgt aattacaaac 5580
aatgttgtat ccttggattg tgaacatgtt agtcaaactg ctgaagagtt ttatactgtg 5640
aggtgccaag tggctgatat gaagaacatt tatgaatctc ttgatgaagt tactataaaa 5700
gacactttgg aaggtgataa catgtatact tgttctcatt gtgggaagaa agtacgagct 5760
gaaaaaaggg catgttttaa gaaattgcct cgcattttga gtttcaatac tatgagatac 5820
acatttaata tggtcacgat gatgaaagag aaagtgaata cacacttttc cttcccatta 5880
cgtttggaca tgacgcccta tacagaagat tttcttatgg gaaagagtga gaggaaagaa 5940
ggttttaaag aagtcagtga tcattcaaaa gactcagaga gctatgaata tgacttgata 6000
ggagtgactg ttcacacagg aacggcagat ggtggacact attatagctt tatcagagat 6060
atagtaaatc cccatgctta taaaaacaat aaatggtatc tttttaatga tgctgaggta 6120
aaaccttttg attctgctca acttgcatct gaatgttttg gtggagagat gacgaccaag 6180
acctatgatt ctgttacaga taaatttatg gacttctctt ttgaaaagac acacagtgca 6240
tatatgctgt tttacaaacg catggaacca gaggaagaaa atggcagaga atacaaattt 6300
gatgtttcgt cagagttact agagtggatt tggcatgata acatgcagtt tcttcaagac 6360
aaaaacattt ttgaacatac atattttgga tttatgtggc aattgtgtag ttgtattccc 6420
agtacattac cagatcctaa agctgtgtcc ttaatgacag caaagttaag cacttccttt 6480
gtcctagaga catttattca ttctaaagaa aagcccacga tgcttcagtg gattgaactg 6540
ttgacgaaac agtttaataa tagtcaggca gcttgtgagt ggtttttaga tcgtatggct 6600
gatgacgact ggtggccaat gcagatacta attaagtgcc ctaatcaaat tgtgagacag 6660
atgtttcagc gtttgtgtat ccatgtgatt cagaggctga gacctgtgca tgctcatctc 6720
tatttgcagc caggaatgga agatgggtca gatgatatgg atacctcagt agaagatatt 6780
ggtggtcgtt catgtgtcac tcgctttgtg agaaccctgt tattaattat ggaacatggt 6840
gtaaaacctc acagtaaaca tcttacagag tattttgcct tcctttacga atttgcaaaa 6900
atgggtgaag aagagagcca atttttgctt tcattgcaag ctatatctac aatggtacat 6960
ttttacatgg gaacaaaagg acctgaaaat cctcaagttg aagtgttatc agaggaagaa 7020
ggggaagaag aagaggagga agaagatatc ctctctctgg cagaagaaaa atacaggcca 7080
gctgcccttg aaaagatgat agctttagtt gctcttttgg ttgaacagtc tcgatcagaa 7140
aggcatttga cattatcaca gactgacatg gcagcattaa caggaggaaa gggatttccc 7200
ttcttgtttc aacatattcg tgatggcatc aatataagac aaacttgtaa tctgattttc 7260
agcctgtgtc gatacaataa tcgacttgca gaacatattg tatctatgct tttcacatca 7320
atagcaaagt tgactcctga ggcagccaat cctttcttta agttgttgac tatgctaatg 7380
gagtttgctg gtggacctcc aggaatgcct ccctttgcat cttatattct gcagaggata 7440
tgggaggtga ttgaatacaa tccttctcag tgtctagatt ggttggcagt gcagacaccc 7500
cgaaataaac tggcacacag ctgggtctta cagaatatgg aaaactgggt cgagcggttt 7560
cttttggctc acaattatcc tagagtgagg acttctgcag cttatcttct ggtgtccctt 7620
ataccaagca attcattccg tcagatgttc cggtcaacaa ggtctttgca catcccaacc 7680
cgtgaccttc cactcagtcc agacacaaca gtagtcctac atcaggtcta caacgtgctc 7740
cttggtttgc tctcaagagc caaactttat gttgatgctg ctgttcatgg cactacaaag 7800
ctagtgccct attttagctt tatgacttac tgtttaattt ccaaaactga gaagctgatg 7860
ttttccacat atttcatgga tttgtggaac cttttccagc ctaaactttc tgagccagca 7920
atagctacaa atcacaataa acaggctttg ctttcatttt ggtacaatgt ctgtgctgac 7980
tgtccagaga atatccgcct tattgttcag aacccagtgg taaccaagaa cattgccttc 8040
aattacatcc ttgctgacca tgatgatcag gatgtggtgc tttttaaccg tgggatgctg 8100
ccagcgtact atggcattct gaggctctgc tgtgagcagt ctcctgcatt cacacgacaa 8160
ctggcttctc accagaacat ccagtgggcc tttaagaatc ttacaccaca tgccagccaa 8220
taccctggag cagtagaaga actgtttaac ctgatgcagc tgtttatagc tcagaggcca 8280
gatatgagag aagaagaatt agaagatatt aaacagttca agaaaacaac cataagttgt 8340
tacttacgtt gcttagatgg ccgctcctgc tggactactt taataagtgc cttcagaata 8400
ctattagaat ctgatgaaga cagacttctt gttgtattta atcgaggatt gattctaatg 8460
acagagtctt tcaacacttt gcacatgatg tatcacgaag ctacagcttg ccatgtgact 8520
ggagatttag tagaacttct gtcaatattt ctttcggttt tgaagtctac acgcccttat 8580
cttcagagaa aagatgtgaa acaagcatta atccagtggc aggagcgaat tgaatttgcc 8640
cataaactgt taactcttct taattcctat agtcctccag aacttagaaa tgcctgtata 8700
gatgtcctca aggaacttgt acttttgagt ccccatgatt ttcttcatac tctggttccc 8760
tttctacaac acaaccattg tacttaccat cacagtaata taccaatgtc tcttggacct 8820
tatttccctt gtcgagaaaa tatcaagcta ataggaggga aaagcaatat tcggcctccg 8880
cgccctgaac tcaatatgtg cctcttgccc acaatggtgg aaaccagtaa gggcaaagat 8940
gacgtttatg atcgtatgct gctagactac ttcttttctt atcatcagtt catccatcta 9000
ttatgccgag ttgcaatcaa ctgtgaaaaa tttactgaaa cattagttaa gctgagtgtc 9060
ctagttgcct atgaaggttt gccacttcat cttgcactgt tccccaaact ttggactgag 9120
ctatgccaga ctcagtctgc tatgtcaaaa aactgcatca agcttttgtg tgaagatcct 9180
gttttcgcag aatatattaa atgtatccta atggatgaaa gaactttttt aaacaacaac 9240
attgtctaca cgttcatgac acatttcctt ctaaaggttc aaagtcaagt gttttctgaa 9300
gcaaactgtg ccaatttgat cagcactctt attacaaact tgataagcca gtatcagaac 9360
ctacagtctg atttctccaa ccgagttgaa atttccaaag caagtgcttc tttaaatggg 9420
gacctgaggg cactcgcttt gctcctgtca gtacacactc ccaaacagtt aaacccagct 9480
ctaattccaa ctctgcaaga gcttttaagc aaatgcagga cttgtctgca acagagaaac 9540
tcactccaag agcaagaagc caaagaaaga aaaactaaag atgatgaagg agcaactccc 9600
attaaaaggc ggcgtgttag cagtgatgag gagcacactg tagacagctg catcagtgac 9660
atgaaaacag aaaccaggga ggtcctgacc ccaacgagca cttctgacaa tgagaccaga 9720
gactcctcaa ttattgatcc aggaactgag caagatcttc cttcccctga aaatagttct 9780
gttaaagaat accgaatgga agttccatct tcgttttcag aagacatgtc aaatatcagg 9840
tcacagcatg cagaagaaca gtccaacaat ggtagatatg acgattgtaa agaatttaaa 9900
gacctccact gttccaagga ttctacccta gctgaggaag aatctgagtt cccttctact 9960
tctatctctg cagttctgtc tgacttagct gacttgagaa gctgtgatgg ccaagctttg 10020
ccctcccagg accctgaggt tgctttatct ctcagttgtg gccattccag aggactcttt 10080
agtcatatgc agcaacatga cattttagat accctgtgta ggaccattga atctacaatc 10140
catgtcgtca caaggatatc tggcaaagga aaccaagctg cttcttga 10188
<210> 6
<211> 2445
<212> DNA
<213> homo sapiens
<400> 6
atgcgggtga aagatccaac taaagcttta cctgagaaag ccaaaagaag taaaaggcct 60
actgtacctc atgatgaaga ctcttcagat gatattgctg taggtttaac ttgccaacat 120
gtaagtcatg ctatcagcgt gaatcatgta aagagagcaa tagctgagaa tctgtggtca 180
gtttgctcag aatgtttaaa agaaagaaga ttctatgatg ggcagctagt acttacttct 240
gatatttggt tgtgcctcaa gtgtggcttc cagggatgtg gtaaaaactc agaaagccaa 300
cattcattga agcactttaa gagttccaga acagagcccc attgtattat aattaatctg 360
agcacatgga ttatatggtg ttatgaatgt gatgaaaaat tatcaacgca ttgtaataag 420
aaggttttgg ctcagatagt tgattttctc cagaaacatg cttctaaaac acaaacaagt 480
gcattttcta gaatcatgaa actttgtgaa gaaaaatgtg aaacagatga aatacagaag 540
ggaggaaaat gcagaaattt atctgtaaga ggaattacaa atttaggaaa tacttgcttt 600
tttaatgcag tcatgcagaa cttggcacag acttatactc ttactgatct gatgaatgag 660
atcaaagaaa gtagtacaaa actcaagatt tttccttcct cagactctca gctggaccca 720
ttggtggtgg aactttcaag gcctggacca ctgacctcag ccttgttcct gtttcttcac 780
agcatgaagg agactgaaaa aggaccactt tctcctaaag ttctttttaa tcagctttgt 840
cagaaggcac ctcgatttaa agatttccag caacaggaca gtcaggagct tcttcattat 900
cttctggatg cagtgaggac agaagaaaca aagcgaatac aagctagcat tctaaaagca 960
tttaacaacc caactactaa aactgctgat gatgaaacta gaaaaaaagt caaagcatat 1020
ggaaaagaag gtgtgaaaat gaacttcata gatcggatct ttattggtga attaactagc 1080
acggtcatgt gtgaagaatg tgcaaatatc tccacggtga aagatccatt cattgatatt 1140
tcacttccta taatagaaga aagggtttca aaacctttac tttggggaag aatgaataaa 1200
tatagaagtt tacgggagac agatcatgat cgatacagtg gcaatgttac tatagaaaat 1260
attcatcaac ctagagctgc caagaagcat tcttcatcta aagataagag tcaactaatt 1320
catgaccgaa aatgtattag aaaattgtca tctggagaaa ctgtcacata ccagaaaaat 1380
gaaaaccttg aaatgaatgg ggattcttta atgtttgcca gcctcatgaa ttctgagtca 1440
cgtctgaatg aaagccctac tgatgacagt gaaaaagaag ccagccattc tgaaagcaat 1500
gttgatgctg acagtgagcc ttcagaatct gaaagtgctt caaagcagac tgggctgttc 1560
agatccagta gtggatccgg tgtgcagcca gatggacccc tttaccctct gtcagcaggt 1620
aaactgctgt acaccaagga gactgacagt ggtgataagg aaatggcaga agctatttct 1680
gaacttcgtt tgagcagcac tgtaactgga gatcaagatt ttgacagaga aaatcagcca 1740
ctaaatattt caaataattt atgtttttta gaggggaagc atttgaggtc ttatagtccc 1800
caaaatgctt ttcagaccct ttctcagagc tatataacta cttctaaaga atgttcaatt 1860
cagtcctgtc tctaccagtt tacatctatg gaattactaa tggggaataa taagcttcta 1920
tgtgagaatt gtactaaaaa caaacagaag taccaagaag aaaccagttt tgcagaaaag 1980
aaagtagaag gagtttatac taatgccagg aagcaattgc tcatttctgc tgttccagct 2040
gtcctaattc tccacctgaa aagatttcat caggctggct tgagtcttcg taaagtaaac 2100
agacatgtag attttccact tatgctcgat ttagcaccat tctgctctgc tacttgtaag 2160
aatgcaagtg tgggagataa agttctctac ggtctctatg gcatagtgga acatagtggc 2220
tcgatgagag aaggccacta cactgcttat gtgaaagtga gaacaccctc caggaaatta 2280
tcggaacata acactaaaaa gaaaaatgtg cctggtttga aagcggctga taatgaatca 2340
gcaggccagt gggtccatgt tagtgacact tacttacagg tggttccaga atcaagagca 2400
cttagtgcac aagcctacct tcttttctat gaaagagtat tataa 2445
<210> 7
<211> 4068
<212> DNA
<213> homo sapiens
<400> 7
atggtgcccg gcgaggagaa ccaactggtc ccgaaagaga tagaaaatgc tgctgaagaa 60
cctagagtct tatgtattat acaagatact actaattcaa agacagtgaa tgaacggatc 120
actttaaatt taccagcatc tactccagtc agaaagctct ttgaagatgt ggccaacaaa 180
gtaggctaca taaatggaac ctttgacttg gtgtggggaa atggaatcaa tactgctgat 240
atggcaccac tggatcatac cagtgacaag tcacttctcg acgctaattt tgagccagga 300
aagaagaact ttctgcattt gacagataaa gatggtgaac aacctcaaat actgctggag 360
gattccagtg ctggggaaga cagtgttcat gacaggttta taggtccgct tccaagagaa 420
ggttctgggg gttctaccag tgattatgtc agccaaagct actcctactc atctattttg 480
aataaatcag aaactggata tgtgggacta gtaaaccaag caatgacttg ctatttgaat 540
agccttttgc aaacactttt tatgactcct gaatttagga atgcattata taagtgggaa 600
tttgaagaat ctgaagaaga tccagtgaca agtattccat accaacttca aaggcttttt 660
gttttgttac aaaccagcaa aaagagagca attgaaacca cagatgttac aaggagcttt 720
ggatgggata gtagtgaggc ttggcagcag catgatgtac aagaactatg cagagtcatg 780
tttgatgctt tggaacagaa atggaagcaa acagaacagg ctgatcttat aaatgagcta 840
tatcaaggca agctgaagga ctacgtgaga tgtctggaat gtggttatga gggctggcga 900
atcgacacat atcttgatat tccattggtc atccgacctt atgggtccag ccaagcattt 960
gctagtgtgg aagaagcatt gcatgcattt attcagccag agattctgga tggcccaaat 1020
cagtattttt gtgaacgttg taagaagaag tgtgatgcac ggaagggcct tcggtttttg 1080
cattttcctt atctgctgac cttacagctg aaaagattcg attttgatta tacaaccatg 1140
cataggatta aactgaatga tcgaatgaca tttcccgagg aactagatat gagtactttt 1200
attgatgttg aagatgagaa atctcctcag actgaaagtt gcactgacag tggagcagaa 1260
aatgaaggta gttgtcacag tgatcagatg agcaacgatt tctccaatga tgatggtgtt 1320
gatgaaggaa tctgtcttga aaccaatagt ggaactgaaa agatctcaaa atctggactt 1380
gaaaagaatt ccttgatcta tgaacttttc tctgttatgg ttcattctgg gagcgctgct 1440
ggtggtcatt attatgcatg tataaagtca ttcagtgatg agcagtggta cagcttcaat 1500
gatcaacatg tcagcaggat aacacaagag gacattaaga aaacacatgg tggatcttca 1560
ggaagcagag gatattattc tagtgctttc gcaagttcca caaatgcata tatgctgatc 1620
tatagactga aggatccagc cagaaatgca aaatttctag aagtggatga atacccagaa 1680
catattaaaa acttggtgca gaaagagaga gagttggaag aacaagaaaa gagacaacga 1740
gaaattgagc gcaatacatg caagataaaa ttattctgtt tgcatcctac aaaacaagta 1800
atgatggaaa ataaattgga ggttcataag gataagacat taaaggaagc agtagaaatg 1860
gcttataaga tgatggattt agaagaggta atacccctgg attgctgtcg ccttgttaaa 1920
tatgatgagt ttcatgatta tctagaacgg tcatatgaag gagaagaaga tacaccaatg 1980
gggcttctac taggtggcgt caagtcaaca tatatgtttg atctgctgtt ggagacgaga 2040
aagcctgatc aggttttcca atcttataaa cctggagaag tgatggtgaa agttcatgtt 2100
gttgatctaa aggcagaatc tgtagctgct cctataactg ttcgtgctta cttaaatcag 2160
acagttacag aattcaaaca actgatttca aaggccatcc atttacctgc tgaaacaatg 2220
agaatagtgc tggaacgctg ctacaatgat ttgcgtcttc tcagtgtctc cagtaaaacc 2280
ctgaaagctg aaggattttt tagaagtaac aaggtgtttg ttgaaagctc cgagactttg 2340
gattaccaga tggcctttgc agactctcat ttatggaaac tcctggatcg gcatgcaaat 2400
acaatcagat tatttgtttt gctacctgaa caatccccag tatcttattc caaaaggaca 2460
gcataccaga aagctggagg cgattctggt aatgtggatg atgactgtga aagagtcaaa 2520
ggacctgtag gaagcctaaa gtctgtggaa gctattctag aagaaagcac tgaaaaactc 2580
aaaagcttgt cactgcagca acagcaggat ggagataatg gggacagcag caaaagtact 2640
gagacaagtg actttgaaaa catcgaatca cctctcaatg agagggactc ttcagcatca 2700
gtggataata gagaacttga acagcatatt cagacttctg atccagaaaa ttttcagtct 2760
gaagaacgat cagactcaga tgtgaataat gacaggagta caagttcagt ggacagtgat 2820
attcttagct ccagtcatag cagtgatact ttgtgcaatg cagacaatgc tcagatccct 2880
ttggctaatg gacttgactc tcacagtatc acaagtagta gaagaacgaa agcaaatgaa 2940
gggaaaaaag aaacatggga tacagcagaa gaagactctg gaactgatag tgaatatgat 3000
gagagtggca agagtagggg agaaatgcag tacatgtatt tcaaagctga accttatgct 3060
gcagatgaag gttctgggga aggacataaa tggttgatgg tgcatgttga taaaagaatt 3120
actctggcag ctttcaaaca acatttagag ccctttgttg gagttttgtc ctctcacttc 3180
aaggtctttc gagtgtatgc cagcaatcaa gagtttgaga gcgtccggct gaatgagaca 3240
ctttcatcat tttctgatga caataagatt acaattagac tggggagagc acttaaaaaa 3300
ggagaataca gagttaaagt ataccagctt ttggtcaatg aacaagagcc atgcaagttt 3360
ctgctagatg ctgtgtttgc taaaggaatg actgtacggc aatcaaaaga ggaattaatt 3420
cctcagctca gggagcaatg tggtttagag ctcagtattg acaggtttcg tctaaggaaa 3480
aaaacatgga agaatcctgg cactgtcttt ttggattatc atatttatga agaagatatt 3540
aatatttcca gcaactggga ggttttcctt gaagttcttg atggggtaga gaagatgaag 3600
tccatgtcac agcttgcagt tttgtcaaga cggtggaagc cttcagagat gaagttggat 3660
cccttccagg aggttgtatt ggaaagcagt agtgtggacg aattgcgaga gaagcttagt 3720
gaaatcagtg ggattccttt ggatgatatt gaatttgcta agggtagagg aacatttccc 3780
tgtgatattt ctgtccttga tattcatcag gatttagact ggaatcctaa agtttctacc 3840
ctgaatgtct ggcctcttta tatctgtgat gatggtgcgg tcatatttta tagggataaa 3900
acagaagaat taatggaatt gacagatgag caaagaaatg aactgatgaa aaaagaaagc 3960
agtcgactcc agaagactgg acatcgtgta acatactcac ctcgtaaaga gaaagcacta 4020
aaaatatatc tggatggagc accaaataaa gatctgactc aagactga 4068
<210> 8
<211> 3609
<212> DNA
<213> homo sapiens
<400> 8
atgaactttg agggtctgga ccctggactg gcagaatatg ccccagccat gcattctgcc 60
ctggaccctg tcttggatgc ccacctgaac ccaagtctgc tacagaatgt ggagctggac 120
ccagagggag tggccttgga ggctcttccc gtccaggaat cagtgcacat aatggaaggt 180
gtctactctg aattgcacag cgtggtggct gaagtgggtg tacctgtttc cgtctcccac 240
tttgacttgc acgaggagat gctgtgggtg gggagccacg ggggccatgc cacttcattt 300
tttggcccag ccttggagcg ctactcatcc tttcaagtca atggcagtga tgatattcgg 360
cagatccaga gcctggagaa tggtatcctt tttctcacca agaacaacct caagtatatg 420
gcccgtgggg gcctcattat atttgattac ctgctggatg agaatgagga tatgcacagt 480
ctcctactga ctgacagcag cactctactc gttggtgggc tgcagaatca catactagag 540
attgatctta acactgtcca ggagactcag aagtatgcag tagagacgcc tggagtcacc 600
atcatgagac agacaaatcg cttcttcttc tgcggccaca cgtctggcaa ggtttccctg 660
agagacctcc gtacttttaa ggtggaacat gagtttgatg ccttctcagg aagtctgtca 720
gactttgatg tgcatggcaa cctgctagct gcctgtggct tctccagccg cctcactggc 780
ctggcctgcg accgtttcct caaggtgtat gatttgcgca tgatgcgtgc catcacacca 840
cttcaagtac atgtggatcc tgccttcttg cgcttcattc ctacatatac ttctcgtctt 900
gctatcatct ctcagtcagg gcagtgccaa ttctgtgaac ccacaggcct ggccaaccca 960
gccgatatct ttcatgtgaa tcctgtgggg cctctgctaa tgacatttga tgtgtcagcc 1020
agcaagcagg ctctggcctt tggggattct gagggctgtg tgcacctctg gactgattcc 1080
ccggagcctt ccttcaaccc ctactcccgt gagactgagt ttgctttgcc gtgtctcgtg 1140
gactcactgc ctcctctgga ctggagccag gacctgctgc ctctttccct catccctgtc 1200
ccactcacca ctgacacact tctctctgat tggcctgctg ccaactctgc tccagctccc 1260
aggcgagcac cacccgtgga tgcagagatt ctgcgcacca tgaagaaggt gggcttcatt 1320
ggctatgcgc ccaatccccg caccaggctg cgcaatcaga taccctacag actcaaggag 1380
tcagacagtg aatttgacag cttcagccag gtcactgagt caccagtagg acgagaagag 1440
gaaccacatc tccacatggt ttctaagaaa taccgcaagg tgaccatcaa atattccaag 1500
ctagggctgg aggactttga cttcaaacac tacaataaga ccttgtttgc tggattagag 1560
ccccacattc ccaacgccta ctgtaactgc atgatccagg tgctctattt cctggagcct 1620
gtacgctgtc taattcaaaa ccacctttgc cagaaggagt tctgtctggc atgtgagctg 1680
ggcttcctgt ttcacatgtt ggacctctct cgtggtgacc cttgccaggg caataatttt 1740
cttcgggcat tccgtactat tcctgaggcc tcagccctcg gtctaatcct ggctgactca 1800
gatgaggcct caggcaaggg caatctggcc aggctcattc agaggtggaa tcgcttcatt 1860
ctcactcaac tgcatcaaga tatgcaggag ctggaaatac cacaggctta tcgaggtgct 1920
ggaggcagca gcttttgctc atcgggggac tctgttattg ggcagctctt cagctgtgag 1980
atggagaact gcagcctctg ccgctgtggc agtgagaccg tgcgagcctc atccactctg 2040
cttttcacac tctcctaccc tgatggtagc aaaagtgata aaactgggaa gaactatgac 2100
tttgctcagg tgctgaagcg aagcatctgc ctggaccaga atacacaggc ctggtgtgac 2160
acctgtgaaa agtaccagcc cacgattcag acccgcaaca tccgccatct gccagatatt 2220
cttgtcatca attgtgaggt gaacagctca aaagaggctg atttctggag aatgcaggct 2280
gaggttgcct tcaagatggc agtaaagaaa cacggtgggg aaatctccaa gaacaaggaa 2340
tttgctttgg ctgattggaa ggaactaggg agtccagagg gtgtgctggt gtgtccctcc 2400
attgaggagt tgaagaacgt ctggcttcct ttctccattc gcatgaagat gaccaaaaac 2460
aaagggctgg atgtttgcaa ttggactgat ggggatgaga tgcagtgggg cccagccagg 2520
gcagaggagg agcatggtgt ctatgtgtat gacctgatgg ctactgtggt acacatcctg 2580
gactcacgca cagggggcag cctggtggct cacatcaaag ttggagagac ctaccaccag 2640
cgcaaggagg gcgttactca ccagcagtgg tatctgttca atgactttct tattgaacct 2700
attgataagc atgaagctgt gcagtttgac atgaattgga aagtacctgc aatcctttat 2760
tatgtcaaac ggaatctcaa ttccagatac aacctgaaca tcaagaaccc tattgaggca 2820
agtgtcttgc tggctgaagc ctcgctggca cggaagcagc ggaaaacaca tactaccttt 2880
attccactga tgctgaatga gatgccacag attggggacc tggtgggtct ggatgctgag 2940
tttgtcaccc ttaatgagga ggaagcagag ttacgcagtg atggtaccaa gtctaccatt 3000
aaaccaagcc agatgtcagt agccaggatt acctgtgttc ggggccaggg acccaatgag 3060
ggtatcccct tcattgatga ctacatctct acccaggagc aggtggtgga ttacttgact 3120
caatactcgg gtataaagcc tggtgacctc gatgccaaaa tttcctccaa gcacctaaca 3180
actctcaagt ctacctactt aaagcttcgt tttctcattg acattggagt caagtttgtg 3240
ggtcatggcc tgcagaagga cttccgggtc atcaacctga tggtgcccaa ggaccaagtc 3300
cttgacactg tctacctgtt ccatatgccc cgaaaacgaa tgatttccct gcgattcctt 3360
gcttggtact ttctggacct gaagattcaa ggggaaaccc atgacagtat tgaggatgcc 3420
cgcacagccc ttcagctgta ccgaaagtat ctggagctaa gcaaaaatgg cactgagcct 3480
gagtctttcc acaaggtgct caagggtctt tatgagaagg gcagaaagat ggactggaag 3540
gtgcctgagc ctgagggcca aacaagtccc aagaatgcag ctgtcttctc ctcagtgctg 3600
gcgctctga 3609
<210> 9
<211> 1446
<212> DNA
<213> homo sapiens
<400> 9
atgcagctct acagcagcgt ctgcacccac taccccgccg gggccccggg tcccacggcc 60
gccgcccccg cgccacccgc cgccgctacc cccttcaagg tctcgctgca gcccccggga 120
gccgccggcg ccgcgcccga gcccgagacc ggtgagtgcc agcccgccgc ggccgccgag 180
caccgggaag ccgccgctgt ccccgccgcc aagatgcccg ccttctcctc ctgcttcgag 240
gtggtgtccg gggccgccgc gcccgcctcc gccgccgccg gcccgcccgg cgcgtcctgc 300
aagccgccgc tgccgccgca ctacacgtcc accgcacaga tcaccgtgcg ggccctgggc 360
gccgacaggc tcctgctgca cgggcccgat cccgttcccg gcgccgcggg ctccgccgct 420
gccccgcgcg gccgctgcct cctgctcgcc ccggcgcccg cagccccggt cccgccgcgg 480
cggggctcct cggcctggct cctggaggag ctgctgcggc ccgactgccc cgagcccgcg 540
ggcttggacg cgacacggga ggggcccgat cggaacttcc gactgagcga gcaccgccag 600
gccctggccg ccgccaagca ccgaggcccc gcggcgaccc cggggagccc cgatcccggc 660
cccggtccgt ggggcgaaga gcacttggcg gagaggggcc ccaggggctg ggagaggggc 720
ggcgatcgct gcgacgcgcc cggtggggac gcggcgcgga ggcccgaccc agaggccgag 780
gcaccccccg ccgggagcat cgaggccgcc ccgagtagtg cggcggagcc ggtgatcgtc 840
tccaggtcgg atcccagaga cgagaagctg gccctatacc tggccgaggt ggagaagcag 900
gacaagtatc tgcggcagag gaataagtac cgattccaca tcattccaga cggcaactgc 960
ctctaccgag ctgtcagcaa gacggtgtat ggggaccaga gcctgcaccg ggagttgagg 1020
gagcagacgg tgcactacat cgccgaccat ctcgaccact tcagccccct gattgagggc 1080
gacgtggggg agtttatcat cgctgctgcc caagacgggg catgggccgg gtacccggag 1140
ttgctggcca tggggcagat gctgaatgtg aatatccatt taactactgg agggaggctg 1200
gagagtccca cggtgtctac catgattcat tatttgggcc cagaggattc cctgaggcct 1260
agtatttggc tcagttggct cagtaacgga cactatgatg ctgtatttga tcactcctat 1320
cctaacccag agtacgacaa ctggtgcaaa caaactcaag tgcaaaggaa acgcgacgaa 1380
gaacttgcca aatctatggc catatccttg tctaaaatgt atattgaaca aaatgcatgc 1440
tcttga 1446
<210> 10
<211> 1197
<212> DNA
<213> homo sapiens
<400> 10
atgtcccgaa agcaggcggc gaagagccgg ccgggcagcg gcagccggaa agccgaggcc 60
gagcgcaagc gggacgagcg ggcggcgcgc cgggccctgg ccaaggagcg gcggaatcgg 120
ccggagtctg gcggcggcgg cggctgcgag gaggagttcg tcagcttcgc caaccagctg 180
caggccctgg ggctgaagct gcgggaggtg ccgggggacg gcaattgctt gttcagagct 240
cttggtgatc aattggaggg acactcacga aatcatctca agcacagaca ggagacagtg 300
gactacatga taaagcagcg ggaagatttt gaaccctttg tagaagatga cattcctttt 360
gagaagcatg tggccagttt ggcaaagcct ggtacttttg ctggcaatga tgcaattgta 420
gcctttgcaa gaaatcatca gttgaatgta gtgattcatc aacttaatgc ccctttgtgg 480
cagattcgtg gtacagagaa aagcagcgtg agggagttac acatcgcata tcggtatgga 540
gagcactacg acagtgttcg gaggatcaat gacaactcag aggcacctgc acatctccag 600
acggattttc agatgcttca tcaagatgaa tcaaataaaa gagaaaagat caagacaaag 660
ggaatggact ctgaagacga cctgagagat gaagtagagg atgctgtcca gaaagtttgt 720
aatgcaactg gatgttcaga ttttaattta atagtccaga acctggaagc tgaaaattat 780
aatattgaat ctgcaataat tgccgtgctt cggatgaacc aagggaagag aaataatgca 840
gaagagaatc ttgagcccag tggtcgagtg ctgaagcagt gtggcccttt gtgggaggag 900
ggtggcagtg gtgccagaat ctttggaaat cagggcttaa atgaaggcag gaccgaaaac 960
aataaggcac aggccagccc tagtgaagaa aacaaagcaa ataaaaacca gctcgcaaag 1020
gtcacaaaca aacagaggcg agaacagcag tggatggaga agaagaagcg gcaggaggag 1080
aggcaccgcc acaaagccct ggagagcaga ggtagccaca gggacaataa cagaagcgaa 1140
gcagaggcga acacgcaggt caccttggtg aagaccttcg ccgctctcaa catctga 1197
<210> 11
<211> 3150
<212> DNA
<213> homo sapiens
<400> 11
atggcctgta ttcactatct tcgagagaac agagagaaat ttgaagcgtt tatagaagga 60
tcatttgaag aatatttaaa gcgtttggaa aatccacagg aatgggtagg acaagtggaa 120
ataagtgccc tttctcttat gtacaggaaa gattttataa tttatcggga accaaatgtt 180
tctccttcac aagtaacaga aaataatttt cctgaaaagg tgttactgtg tttttcaaat 240
ggaaatcatt atgatattgt gtatcccata aagtataaag aaagctctgc tatgtgtcag 300
tctctccttt atgaattgct gtatgagaag gtatttaaaa ctgatgttag taaaattgtg 360
atggaactag acacgttgga agtagctgat gaagataaca gtgaaatatc agattcagag 420
gatgacagtt gcaagagtaa gactgctgct gctgctgctg atgtgaatgg atttaaacct 480
ttgtcaggca atgagcagct gaagaacaat gggaactcta ctagcctgcc tttgtctaga 540
aaggttctta agtcactcaa tcctgcagtc tatagaaatg tggaatatga aatttggctg 600
aagtctaaac aagctcagca aaaacgtgat tattccattg ctgctggctt acaatatgaa 660
gttggagaca aatgtcaagt taggttggat cacaatggaa aatttttgaa tgcagatgtt 720
caaggaattc attctgagaa tggaccagtt ttggttgaag aactgggaaa gaagcacaca 780
tcaaagaacc tcaaggcacc tcccccagaa agctggaaca cagtgtcagg gaagaagatg 840
aaaaaacctt ccacttctgg acaaaatttc cattctgatg tggattacag agggccaaag 900
aatccaagca agccaataaa agccccatca gcactacctc ctcgactgca gcatccttca 960
ggagtaagac aacatgcgtt ctctagtcat tcttcagggt cacagtctca gaaattctcc 1020
agtgagcaca aaaatcttag ccggacacct tcacagatca taagaaaacc tgatcgtgaa 1080
agagttgagg attttgatca cacaagtcga gaatctaact atttcggcct ttccccagaa 1140
gagcgcagag agaagcaagc tatagaagaa tcccgtttac tctatgagat tcagaacaga 1200
gatgaacagg ctttcccagc cctttccagc tcatcagtca atcagtcagc ttctcagagt 1260
agcaatccat gtgtccagag aaaatcatca catgtaggtg atagaaaagg aagcaggcgg 1320
agaatggata cagaagaacg aaaagacaaa gactctattc atggacatag tcagttggat 1380
aaaagacccg aaccaagcac attggagaat attactgatg ataaatatgc aacagtttca 1440
tcaccatcaa agtcaaagaa gttagagtgc ccttctcctg cggaacaaaa gccagcagaa 1500
catgtgtctt tgtcaaatcc agctcccctt ctagtttctc cagaggtaca tctaactcct 1560
gcggtgcctt ctttaccagc cactgtgcca gcctggccaa gtgaacctac aacttttgga 1620
ccaacaggtg tccctgctcc aattcccgtt ttgtcagtga cacagacttt gaccactgga 1680
cctgattcag ctgtatccca agctcattta acaccctctc cagttcctgt gtcaatacag 1740
gcagttaacc agcccttgat gcctttgcct cagacattga gcctttatca agacccactc 1800
tatcctgggt ttccttgtaa tgaaaaggga gatcgagcca ttgtaccacc ttattcactg 1860
tgtcagactg gggaggacct acctaaagat aagaatattc ttcgattctt cttcaatctt 1920
ggtgtgaagg catacagttg tcctatgtgg gccccacatt cttacctgta ccctctgcac 1980
caggcctacc tggcagcctg caggatgtac ccaaaggtcc ctgtccctgt ttatcctcat 2040
aatccctggt tccaagaggc tcctgctgct cagaatgaaa gtgattgtac ctgtactgat 2100
gcccactttc ctatgcagac tgaggccagt gttaatggtc aaatgccaca gccagagatt 2160
ggaccgccga cattttcttc acctctggtt atccctccat ctcaggtgtc tgaaagtcat 2220
ggacaattgt cttaccaggc tgatcttgaa tctgagaccc ctgggcagct tctgcatgct 2280
gattatgaag agtcactaag tggcaagaat atgttccccc agccatcttt tggacccaat 2340
ccattcttag gcccagttcc tattgcacct cctttctttc ctcatgtttg gtatgggtac 2400
ccttttcagg gattcataga aaatccagta atgaggcaga atattgtcct gccctctgat 2460
gaaaaaggag aattggatct gtctctggaa aatctggatc tgtctaaaga ttgtggttca 2520
gtttcaacag tagatgagtt tccagaagcc aggggtgaac atgtacattc tctccctgaa 2580
gcaagtgtga gcagtaagcc ggacgaaggc cggacagagc aatcttccca gacacgaaag 2640
gcagatacgg cattggcttc catccctcct gtagcagagg gaaaggctca tcctcccact 2700
cagattctaa acagagagag agaaactgtg cctgttgaac ttgaacctaa aaggaccatt 2760
caaagcctga aagaaaaaac agaaaaagta aaagatccta agactgctgc tgatgtggtc 2820
agccctgggg ccaactctgt tgatagcaga gtgcaaagac caaaagaaga gagttcagaa 2880
gatgaaaatg aagtgtctaa tattttgaga agtggtagat ccaagcagtt ctataatcaa 2940
acttatggaa gcaggaagta caaaagtgat tggggctatt ctggtagggg tggatatcaa 3000
catgtgagaa gtgaggagtc ctggaaagga cagccaagca gaagtcggga tgaaggttat 3060
cagtaccatc gaaatgtcag agggcgacca tttaggggag ataggaggag atcagggatg 3120
ggagatggcc ataggggaca gcacacttga 3150
<210> 12
<211> 972
<212> DNA
<213> homo sapiens
<400> 12
atggagcccc gggtgagggt tgaggggtgg aaggtgccta ctagccggtg caggtttctt 60
ctagcgcgtg tgctggggta cctggtcgtc atggaggcgg tattgaccga agagcttgat 120
gaggaagagc agctgctgag aaggcatcgc aaagagaaga aggagttgca agccaaaatt 180
cagggcatga agaatgctgt tcccaagaat gacaagaaga ggaggaagca actcaccgaa 240
gatgtggcca agttggaaaa agaaatggaa cagaaacata gagaggaact ggagcaattg 300
aagctgacta ctaaggagaa taagatagat tctgttgctg ttaacatttc aaacttggtg 360
cttgagaatc agccacctcg gatatcaaaa gcacaaaaga gacgggaaaa gaaagctgca 420
ttggaaaagg agcgagaaga acggatagct gaagctgaaa ttgaaaactt aacaggagcc 480
agacatatgg aaagtgagaa acttgctcaa atattggcag ctagacagtt agaaattaaa 540
cagattccat ctgatggcca ctgtatgtat aaagccattg aagatcaact gaaagaaaag 600
gattgtgctc tgactgtggt tgccttgaga agtcagaccg ctgagtatat gcaaagccat 660
gtggaagact ttctgccatt tttaacaaac cctaatacag gagatatgta tactccagaa 720
gaatttcaga agtactgtga agatattgta aacacagctg catggggagg tcagcttgag 780
ctaagagctc tgtctcacat tttacaaaca ccaatagaga taatacaggc agattctcct 840
cccattatag ttggtgaaga atattcaaaa aaaccactaa tacttgtata tatgagacat 900
gcatatggct taggagaaca ttataattcg gttacacggt tggtaaacat agttactgaa 960
aattgcagct aa 972
<210> 13
<211> 1005
<212> DNA
<213> homo sapiens
<400> 13
atggcggcgt ccgggagcgg tatggcccag aaaacctggg aactggccaa caacatgcag 60
gaagctcaga gtatcgatga aatctacaaa tacgacaaga aacagcagca agaaatcctg 120
gcggcgaagc cctggactaa ggatcaccat tactttaagt actgcaaaat ctcagcattg 180
gctctgctga agatggtgat gcatgccaga tcgggaggca acttggaagt gatgggtctg 240
atgctaggaa aggtggatgg tgaaaccatg atcattatgg acagttttgc tttgcctgtg 300
gagggcactg aaacccgagt aaatgctcag gctgctgcat atgaatacat ggctgcatac 360
atagaaaatg caaaacaggt tggccgcctt gaaaatgcaa tcgggtggta tcatagccac 420
cctggctatg gctgctggct ttctgggatt gatgttagta ctcagatgct caatcagcag 480
ttccaggaac catttgtagc agtggtgatt gatccaacaa gaacaatatc cgcagggaaa 540
gtgaatcttg gcgcctttag gacataccca aagggctaca aacctcctga tgaaggacct 600
tctgagtacc agactattcc acttaataaa atagaagatt ttggtgtaca ctgcaaacaa 660
tattatgcct tagaagtctc atatttcaaa tcctctttgg atcgcaaatt gcttgagctg 720
ttgtggaata aatactgggt gaatacgttg agttcttcta gcttgcttac taatgcagac 780
tataccactg gtcaggtctt tgatttgtct gaaaagttag agcagtcaga agcccagctg 840
ggacgaggga gtttcatgtt gggtttagaa acgcatgacc gaaaatcaga agacaaactt 900
gccaaagcta caagagacag ctgtaaaact accatagaag ctatccatgg attgatgtct 960
caggttatta aggataaact gtttaatcaa attaacatct cttaa 1005
<210> 14
<211> 1416
<212> DNA
<213> homo sapiens
<400> 14
atggcagctc cggagccgct gtccccggcg ggcggtgcgg gcgaggaggc gccggaggag 60
gacgaggacg aagcggaggc cgaggaccct gagcggccga atgcgggagc gggcggtgga 120
cgcagtggcg gcggcggcag tagcgtcagc ggaggaggcg gcggcggcgg ggccggggcg 180
gggggctgcg gcgggcccgg gggcgcgctc accaggcgcg cggtcacact gcgggtgctc 240
ctcaaagacg cgctgctgga gcctggcgcc ggggtgctgt ccatctacta cctggggaag 300
aagttcctgg gcgacctgca gccagacgga aggatcatgt ggcaggagac cgggcagacc 360
ttcaactcac ccagcgcctg ggccacccac tgcaagaagc tggtgaaccc tgccaagaag 420
tcgggctgtg gctgggcctc tgtcaagtac aaaggccaga aactggacaa gtacaaggcc 480
acctggctcc ggctgcacca gctgcacacg cctgccacgg ctgctgatga gagcccagcc 540
agtgaagggg aggaggagga gttgctgatg gaagaggagg aggaggacgt tctggcaggg 600
gtctcagcag aggacaagag tcggagacca ctggggaaga gcccttcaga gcctgcccac 660
ccggaggcca caaccccagg gaagcgggtg gacagcaaga tccgggttcc ggtccgctac 720
tgcatgctgg gcagccgcga cttggccagg aacccccaca ccctggtgga agtaacatcc 780
tttgcagcca tcaacaagtt ccagccgttc aacgtggctg tttctagcaa cgtgctgttc 840
ctgctggact tccacagtca cctgacacgg agtgaggtcg tgggttacct ggggggccgc 900
tgggacgtca acagccagat gctgacggtg ctcagagcct tcccttgtcg gagccggctc 960
ggggacgcag agactgcagc tgccatcgaa gaggagatct accagagcct gttcctgcgg 1020
ggcctgtccc tggtgggctg gtaccacagc cacccacaca gcccggcgct gccatctctg 1080
caggacatcg acgcacagat ggactaccag ctgcggctgc agggctccag caatggcttc 1140
cagccctgcc tcgccctgct ctgctcccct tactattctg gcaacccagg ccccgagtcc 1200
aagatctcgc ctttctgggt gatgcctcct cccgagatgc tgctggtgga gttctacaag 1260
ggttcccctg acctcgtgag gctccaggaa ccctggagcc aggagcacac ctacctcgac 1320
aagcttaaga tctccttggc cagcaggacg cccaaggacc agagcctgtg tcacgtcctg 1380
gaacaggtgt gcggcgtcct caagcagggg agctga 1416
<210> 15
<211> 933
<212> DNA
<213> homo sapiens
<400> 15
atggacagac ttcttagact tggaggaggt atgcctggac tgggccaggg gccacctaca 60
gatgctcctg cagtggacac agcagaacaa gtctatatct cttccctggc actgttaaaa 120
atgttaaaac atggccgtgc tggagttcca atggaagtta tgggtttgat gcttggagaa 180
tttgttgatg attataccgt cagagtgatt gatgtgtttg ctatgccaca gtcaggaaca 240
ggtgtcagtg tggaggcagt tgatccagtg ttccaagcta aaatgttgga tatgttgaag 300
cagacaggaa ggccggagat ggttgttggt tggtatcaca gtcaccctgg ctttggttgt 360
tggctttctg gtgtggatat caacactcag cagagctttg aagccttgtc ggagagagct 420
gtggcagtgg ttgtggatcc cattcagagt gtaaaaggaa aggttgttat tgatgccttc 480
agattgatca atgctaatat gatggtctta ggacatgaac caagacaaac aacttcgaat 540
ctgggtcact taaacaagcc atctatccag gcattaattc atggactaaa cagacattat 600
tactccatta ctattaacta tcggaaaaat gaactggaac agaagatgtt gctaaatttg 660
cataagaaga gttggatgga aggtttgaca cttcaggact acagtgaaca ttgtaaacac 720
aatgaatcag tggtaaaaga gatgttggaa ttagccaaga attacaataa ggctgtagaa 780
gaagaagata agatgacacc tgaacagctg gcaataaaga atgttggcaa gcaggacccc 840
aaacgtcatt tggaggaaca tgtggatgta cttatgacct caaatattgt ccagtgttta 900
gcagctatgt tggatactgt cgtatttaaa taa 933
<210> 16
<211> 1047
<212> DNA
<213> homo sapiens
<400> 16
atgtttggcc ccgctaaagg tcgccatttt ggagtccacc cggcgcctgg tttccccggc 60
ggcgtctccc aacaggctgc cgggaccaaa gctggccccg cgggtgcctg gcctgtgggc 120
agccggaccg acacgatgtg gcggctccgc tgcaaggcca aggacggcac ccatgttttg 180
caggggctgt ccagccggac ccgggtgcgg gaactccagg gccaaattgc cgccatcacc 240
gggatcgccc ccggcggtca gcgaatcctc gtcggatacc ctcccgagtg cctggatctc 300
agcaatgggg ataccattct ggaagacttg cccatccaat ctggtgacat gctgatcatt 360
gaagaagacc aaaccaggcc cagaagttca cctgcattta ctaaacgtgg tgcttctagt 420
tacgtcaggg aaactttgcc tgtgcttacc agaaccgtgg tcccagcaga caactcttgc 480
ctctttacta gtgtgtacta tgtcgtcgaa ggaggagtct tgaatccagc ttgtgcccct 540
gagatgagac gcctcatagc acaaattgta gcaagcgatc cagacttcta tagtgaggca 600
atactgggaa aaacaaatca agagtactgt gactggatca aaagggatga cacttgggga 660
ggagcaatag agatatcgat tttgtccaag ttttaccaat gtgaaatatg tgtagtggat 720
acacagacag taagaattga tcgttttggg gaagatgcag gatataccaa aagggttctg 780
cttatttatg atggcatcca ctatgatcca cttcagcgta acttccctga tccagataca 840
cctcctctga ccattttctc ctctaatgat gatattgttc ttgtacaagc actggaatta 900
gcagatgaag ctagaagaag gagacagttt actgatgtca accgcttcac cctgagatgc 960
atggtatgtc agaaaggatt aactggacaa gcagaagcaa gggaacatgc caaggagaca 1020
ggccatacca actttggaga agtgtga 1047
<210> 17
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> USP9Y Forward primer
<400> 17
ttgaggactc ctggcagact 20
<210> 18
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> USP9Y reverse primer
<400> 18
atcctggtca tctggctcct 20
<210> 19
<211> 24
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> USP14 Forward primer
<400> 19
tcagtgtatt cgttctgtgc ctga 24
<210> 20
<211> 25
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> USP14 Reverse primer
<400> 20
ctcgctcatt tgtatccaac attca 25
<210> 21
<211> 22
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> USP21 forward primer
<400> 21
tgacaaagcc ggaagtcctg ta 22
<210> 22
<211> 22
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> USP21 Reverse primer
<400> 22
aaagggcttc acaggtgcca ga 22
<210> 23
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> USP24 Forward primer
<400> 23
ccgacagttg tccgtgtctg 20
<210> 24
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> USP24 Reverse primer
<400> 24
tccgaagctg taggcacgta 20
<210> 25
<211> 24
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> USP34 Forward primer
<400> 25
cagccatagt gctgaagttc aagt 24
<210> 26
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> USP34 Reverse primer
<400> 26
gactgacatc accagattgt gct 23
<210> 27
<211> 22
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> USP52 Forward primer
<400> 27
tgggctgttc agatccagta gt 22
<210> 28
<211> 24
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> USP45 Reverse primer
<400> 28
actgtcagtc tccttggtgt acag 24
<210> 29
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> USP47 Forward primer
<400> 29
cgatgatcaa catgtcagca gga 23
<210> 30
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> USP47 Reverse primer
<400> 30
tttctggctg gatccttcag tct 23
<210> 31
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> USP52 Forward primer
<400> 31
tctggcaagg tttccctgag aga 23
<210> 32
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> USP52 Reverse primer
<400> 32
ggttgccatg cacatcaaag tct 23
<210> 33
<211> 22
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> OTUD1 Forward primer
<400> 33
atggggcaga tgctgaatgt ga 22
<210> 34
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> OTUD1 Reverse primer
<400> 34
tgcaccagtt gtcgtactct g 21
<210> 35
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> OTUD3 Forward primer
<400> 35
gaagacgacc tgagagatga 20
<210> 36
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> OTUD3 Reverse primer
<400> 36
ctgggctcaa gattctcttc 20
<210> 37
<211> 22
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> OTUD4 Forward primer
<400> 37
gctctgctat gtgtcagtct ct 22
<210> 38
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> OTUD4 Reverse primer
<400> 38
ttacttgcaa ctgtcatcct ctg 23
<210> 39
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> OTUD6B Forward primer
<400> 39
aagaatgctg ttcccaagaa 20
<210> 40
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> OTUD6B Reverse primer
<400> 40
ccatatgtct ggctcctgtt 20
<210> 41
<211> 22
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> COPS5 Forward primer
<400> 41
gcagtggtga ttgatccaac aa 22
<210> 42
<211> 22
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> COPS5 Reverse primer
<400> 42
agacctgacc agtggtatag tc 22
<210> 43
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> MPND Forward primer
<400> 43
cgggcagacc ttcaactcac 20
<210> 44
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> MPND Reverse primer
<400> 44
cccagtggtc tccgactctt 20
<210> 45
<211> 22
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> PSMD14 Forward primer
<400> 45
ggtttgacac ttcaggacta ca 22
<210> 46
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> PSMD14 Reverse primer
<400> 46
gaggtcataa gtacatccac atg 23
<210> 47
<211> 22
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> YOD1 Forward primer
<400> 47
acttgcccat ccaatctggt ga 22
<210> 48
<211> 22
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> YOD1 Reverse primer
<400> 48
acgtaactag aagcaccacg tt 22
Claims (9)
- USP9Y (Ubiquitin specific peptidase 9Y), USP14 (Ubiquitin specific peptidase 14), USP21 (Ubiquitin specific peptidase 21), USP24 (Ubiquitin specific peptidase 24), USP34 (Ubiquitin specific peptidase 34), USP45 (Ubiquitin specific peptidase 45), USP47 (Ubiquitin specific peptidase 47), USP52 (Ubiquitin specific peptidase 52), OTUD1 (OTU Deubiquitinase 1), OTUD3 (OTU Deubiquitinase 3), OTUD4 (OTU Deubiquitinase 4), OTUD6B (OTU Deubiquitinase 6B), COPS5 (COP9 signalosome subunit 5), MPND (MPN domain-containing protein), PSMD14 (Proteasome 26S subunit, non-ATPase, 14) 및 YOD1 (OUT deubiquitinating enzyme 1 homolog)로 구성된 군으로부터 선택된 어느 하나 이상의 갑상선 여포암 진단용 유전자의 발현 수준을 측정하는 제제를 포함하는 갑상선 여포암 진단용 조성물.
- 제1항에 있어서, 상기 USP9Y (Ubiquitin specific peptidase 9Y)는 서열번호 1로 구성되고, USP14 (Ubiquitin specific peptidase 14)는 서열번호 2로 구성되고, USP21 (Ubiquitin specific peptidase 21)는 서열번호 3으로 구성되고, USP24 (Ubiquitin specific peptidase 24)는 서열번호 4로 구성되고, USP34 (Ubiquitin specific peptidase 34)는 서열번호 5로 구성되고, USP45 (Ubiquitin specific peptidase 45)는 서열번호 6으로 구성되고, USP47 (Ubiquitin specific peptidase 47)는 서열번호 7으로 구성되고, USP52 (Ubiquitin specific peptidase 52)는 서열번호 8로 구성되고, OTUD1 (OTU Deubiquitinase 1)는 서열번호 9로 구성되고, OTUD3 (OTU Deubiquitinase 3)은 서열번호 10으로 구성되고, OTUD4 (OTU Deubiquitinase 4)는 서열번호 11로 구성되고, OTUD6B (OTU Deubiquitinase 6B)는 서열번호 12로 구성되고, COPS5 (COP9 signalosome subunit 5)는 서열번호 13으로 구성되고, MPND (MPN domain-containing protein)은 서열번호 14로 구성되고, PSMD14 (Proteasome 26S subunit, non-ATPase, 14)는 서열번호 15로 구성되고, YOD1 (OUT deubiquitinating enzyme 1 homolog)는 서열번호 16으로 구성되는 것을 특징으로 하는 갑상선 여포암 진단용 조성물.
- 제1항에 있어서, 상기 갑상선 여포암 진단용 유전자의 발현 수준을 측정하는 제제는 상기 갑상선 여포암 진단용 유전자에 특이적인 프라이머 세트 또는 프로브인 것을 특징으로 하는 갑상선 여포암 진단용 조성물.
- 제1항에 있어서, 상기 갑상선 여포암 진단용 유전자의 발현 수준을 측정하는 제제는 상기 갑상선 여포암 진단용 유전자 단백질에 특이적인 항체 또는 앱타머인 것을 특징으로 하는 갑상선 여포암 진단용 조성물.
- 제3항에 있어서, 상기 프라이머 세트는 USP9Y 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 17 및 서열번호 18의 프라이머 세트; USP14 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 19 및 서열번호 20의 프라이머 세트; USP21 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 21 및 서열번호 22의 프라이머 세트; USP24 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 23 및 서열번호 24의 프라이머 세트; USP34 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 25 및 서열번호 26의 프라이머 세트; USP45 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 27 및 서열번호 28의 프라이머 세트 ; USP47 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 29 및 서열번호 30의 프라이머 세트; USP52 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 31 및 서열번호 32의 프라이머 세트; OTUD1 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 33 및 서열번호 34의 프라이머 세트; OTUD3 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 35 및 서열번호 36의 프라이머 세트; OTUD4 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 37 및 서열번호 38의 프라이머 세트; OTUD6B 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 39 및 서열번호 40의 프라이머 세트;
COPS5 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 41 및 서열번호 42의 프라이머 세트; MPND 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 43 및 서열번호 44의 프라이머 세트; PSMD14 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 45 및 서열번호 46의 프라이머 세트 및 YOD1 유전자 발현량을 측정하기 위한 서열번호 47 및 서열번호 48의 프라이머 세트로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상을 포함하는, 갑상선 여포암 진단용 조성물. - 제1항에 있어서, 상기 갑상선 여포암 진단은 갑상선 여포선종으로부터 갑상선 여포암을 감별하기 위한 감별진단인 것을 특징으로 하는 갑상선 여포암 진단용 조성물.
- 제1항의 갑상선 여포암 진단용 조성물을 갑상선 여포암 의 발병 여부를 진단하고자 하는 개체에서 분리된 생체 시료에 처리하여, 상기 갑상선 여포암 진단용 유전자의 mRNA 또는 상기 유전자로부터 발현되는 단백질의 발현 수준을 측정하는 단계를 포함하는, 갑상선 여포암의 진단 또는 예후 예측을 위한 정보제공방법.
- 제1항의 갑상선 여포암의 진단용 조성물을 갑상선 여포암을 진단하고자 하는 개체의 조직 시료에 처리하여, 상기 각 시료로부터 갑상선 여포암 진단용 유전자의 mRNA 또는 상기 유전자로부터 발현되는 단백질의 발현 수준을 측정하는 단계; 상기 갑상선 여포암 진단용 유전자의 발현수준을 기준값과 비교하는 단계; 갑상선 여포암의 가능성 또는 갑상선 여포선종 가능성을 판별하는 단계;를 포함하는 갑상선 여포암의 감별진단을 위한 정보를 제공하는 방법.
- 제8항에 있어서, 갑상선 여포암 진단용 유전자의 발현수준을 기준값과 비교하는 단계는 USP52 유전자의 발현수준이 여포선종 갑상선 조직 시료로부터 측정된 발현수준보다 1.5배 이상 증가하거나, USP9Y, USP14, USP21, USP24, USP34, USP45, USP47, OTUD1, OTUD3, OTUD4, OTUD6B, COPS5, MPND, PSMD14 또는 YOD1 유전자 발현수준이 여포선종 갑상선 조직시료로부터 측정된 발현수준보다 1.2배 이하로 감소하는 것을 특징으로 하는 갑상선 여포암의 감별진단을 위한 정보를 제공하는 방법.
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
KR1020170164314A KR102043802B1 (ko) | 2017-12-01 | 2017-12-01 | 갑상선 여포암 특이적 단백질분해조절 효소 유전자를 포함하는 갑상선 여포암 바이오마커 및 이를 이용한 갑상선 여포암 진단정보제공방법 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
KR1020170164314A KR102043802B1 (ko) | 2017-12-01 | 2017-12-01 | 갑상선 여포암 특이적 단백질분해조절 효소 유전자를 포함하는 갑상선 여포암 바이오마커 및 이를 이용한 갑상선 여포암 진단정보제공방법 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
KR20190065500A true KR20190065500A (ko) | 2019-06-12 |
KR102043802B1 KR102043802B1 (ko) | 2019-11-13 |
Family
ID=66845856
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
KR1020170164314A KR102043802B1 (ko) | 2017-12-01 | 2017-12-01 | 갑상선 여포암 특이적 단백질분해조절 효소 유전자를 포함하는 갑상선 여포암 바이오마커 및 이를 이용한 갑상선 여포암 진단정보제공방법 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
KR (1) | KR102043802B1 (ko) |
Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
KR20100112192A (ko) * | 2008-02-04 | 2010-10-18 | 바이파 사이언스 인코포레이티드 | Parp-매개된 질병을 진단 및 치료하는 방법 |
WO2011079846A2 (en) * | 2009-12-30 | 2011-07-07 | Rigshospitalet | Mrna classification of thyroid follicular neoplasia |
WO2016097059A1 (en) * | 2014-12-17 | 2016-06-23 | Diaxonhit | Compositions and methods for diagnosing thyroid cancer |
-
2017
- 2017-12-01 KR KR1020170164314A patent/KR102043802B1/ko active IP Right Grant
Patent Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
KR20100112192A (ko) * | 2008-02-04 | 2010-10-18 | 바이파 사이언스 인코포레이티드 | Parp-매개된 질병을 진단 및 치료하는 방법 |
WO2011079846A2 (en) * | 2009-12-30 | 2011-07-07 | Rigshospitalet | Mrna classification of thyroid follicular neoplasia |
WO2016097059A1 (en) * | 2014-12-17 | 2016-06-23 | Diaxonhit | Compositions and methods for diagnosing thyroid cancer |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
BMC Med Genomics, 2013, 6: 38 (2013.10.07.)* * |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
KR102043802B1 (ko) | 2019-11-13 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
DK2681333T3 (en) | EVALUATION OF RESPONSE TO GASTROENTEROPANCREATIC NEUROENDOCRINE NEOPLASIS (GEP-NENE) THERAPY | |
RU2721916C2 (ru) | Способы прогнозирования рака предстательной железы | |
DK2456889T3 (en) | Markers of endometrial cancer | |
AU2012340393B2 (en) | Methods and compositions for the treatment and diagnosis of bladder cancer | |
AU2012345789B2 (en) | Methods of treating breast cancer with taxane therapy | |
US20030068636A1 (en) | Compositions, kits and methods for identification, assessment, prevention, and therapy of breast and ovarian cancer | |
US20220389519A1 (en) | Biomarkers predictive of anti-immune checkpoint response | |
KR20110084995A (ko) | 전립선암에서의 반복적 유전자 융합체 | |
CA2430981A1 (en) | Gene expression profiling of primary breast carcinomas using arrays of candidate genes | |
CN101573453A (zh) | 使用生物学途径基因表达分析来预测淋巴结阴性原发性乳腺癌的远处转移的方法 | |
KR102672646B1 (ko) | 암세포의 부착 의존성 변환을 통한 암 전이 억제 방법 | |
KR101883936B1 (ko) | 림프절 전이 예측용 마커 및 이를 이용한 림프절 전이 예측 방법 | |
KR102043802B1 (ko) | 갑상선 여포암 특이적 단백질분해조절 효소 유전자를 포함하는 갑상선 여포암 바이오마커 및 이를 이용한 갑상선 여포암 진단정보제공방법 | |
KR101683961B1 (ko) | 방광암 재발 진단 마커 | |
IL270787B2 (en) | Melanoma detection methods | |
KR20180137049A (ko) | 삼중음성 유방암 특이적 단백질분해조절 효소 유전자를 포함하는 삼중음성 유방암 바이오마커 및 이를 이용한 삼중음성 유방암 진단을 위한 정보제공방법 | |
KR102631854B1 (ko) | Bub1의 비근침윤성 방광암의 예후 예측용 바이오마커로의 용도 | |
AU2013276992C1 (en) | IVIG Modulations of Chemokines for Treatment of Multiple Sclerosis, Alzheimer's Disease, and Parkinson's Disease | |
KR102632423B1 (ko) | 비근침윤성 방광암의 예후 예측을 위한 바이오마커 및 이의 용도 | |
WO2015129655A1 (ja) | Dnajb1-prkaca遺伝子の検出方法 | |
KR101093508B1 (ko) | 대장암 진단용 조성물 및 그 용도 | |
JP2014054185A (ja) | 新規braf融合体の検出法 | |
KR20110036557A (ko) | 대장암 진단용 조성물 및 그 용도 | |
KR20110036558A (ko) | 대장암 진단용 조성물 및 그 용도 | |
KR20110036556A (ko) | 대장암 진단용 조성물 및 그 용도 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A201 | Request for examination | ||
E902 | Notification of reason for refusal | ||
E701 | Decision to grant or registration of patent right | ||
GRNT | Written decision to grant |