KR20190017702A - 암 치료를 위한 t 세포의 활성화 방법 - Google Patents

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Abstract

서열번호 1 내지 184 중 어느 하나로 표시되는 암 특이적 네오-에피토프(neo-epitope), 상기 네오-에피토프가 로딩된 항원 제시 세포, 및 상기 항원 제시 세포에 의해 암 치료를 위한 T 세포를 활성화하는 방법에 관한 것이다.
본 발명에서 제공하는 암 특이적 에피토프가 로딩된 항원 제시 세포, 즉 수지상 세포를 통해 암 항원 특이적인 T 세포, 바람직하게는 메모리 T 세포의 분화 및 증식을 빠르고 효과적으로 유도할 수 있고, 이렇게 활성화된 메모리 T 세포는 암 세포의 방어 기작을 피해 암 또는 종양성 상태를 치료하거나 암의 재발, 진행 또는 전이를 예방할 수 있다.

Description

암 치료를 위한 T 세포의 활성화 방법{Method for activating T cells to treat cancer}
본 발명은 암 특이적 네오-에피토프(neo-epitope), 상기 네오-에피토프가 로딩된 항원 제시 세포, 및 상기 항원 제시 세포에 의해 암 치료를 위한 T 세포를 활성화하는 방법에 관한 것이다.
위암의 발병은 전세계적으로, 특히 아시아에서 높은 발병률을 나타내는 악성 종양으로 알려져 있다. 위암의 발병 원인으로는 여러 가지가 알려져 왔지만 대표적으로 엡스타인-바 바이러스(epstein barr virus; EBV)의 감염으로 인해 나타나는 EBV-연관성 위암과 위장 세포의 유전자 변이의 축적에 의해 발생하는 위암 세포 항원-연관성 위암으로 분류할 수 있다. 현재 위암에 대한 치료책은 오랜 시간 동안 암 조직의 절개 수술이 가장 효과적으로 알려져 왔으며, 화학적 요법 및 방사선 치료 또한 행해지고 있지만 위암을 초기에 발견하지 못하였을 때는 완치가 힘든 질병으로 나타나고 있다. 또한 여러 가지 생물학적 제재 (항체, small molecule)를 통해 임상 시험을 진행해오고 있지만, 아직 좋은 임상적 효과를 보이는 치료제는 나타나지 않고 있다.
최근 환자 유래 자가 T 세포를 이용한 암 세포 특이적 타겟 치료 방법이 여러 기관에서 연구가 되어왔고, 키메라 항원 수용체(chimeric antigen receptor; CAR) T 세포를 이용한 림프종에 대해 여러 기관에서 임상 시험을 진행한 결과 좋은 임상적 효과와 낮은 부작용으로 항암 치료에 새로운 분야로써 각광을 받아 왔다.
환자 유래 T 세포를 이용하게 되면 세포 치료제의 가장 큰 부작용인 면역 반응의 유도가 적으며, 공여자의 HLA 타입에 대한 제한이 사라지므로, 효과적이고 부작용이 없는 치료제로 알려져 왔다. 현재까지 항암 치료 분야에서 가장 많이 사용되고 있는 세포 치료제의 종류로는 CD8+ T 세포, CD4+ T 세포, NK 세포, 수지상 세포, CAR T 세포로 알려져 있다. NK 세포의 경우 세포 사멸 효능을 가지고 있지만 항원 특이성이 없기 때문에 여러 가지 부작용을 지니며, 수지상 세포의 경우에는 직접적으로 세포를 사멸하는 기능이 없는 반면 환자 체내의 T 세포에 항원 특이성을 전달하여 높은 효율로 T 세포의 암세포 특이성을 부여할 수 있는 백신 개념의 치료제이다. 또한 CD4+ T 세포는 항원 특이성을 통해 다른 세포에 대해 도움을 주는 역할을 가지고 있으며, CD8+ T 세포의 경우 항원 특이성 및 세포 사멸 효과가 가장 좋은 세포로 알려져 있다.
하지만 현재까지 사용되거나 개발되고 있는 세포 치료제는 대부분 한계점을 지니고 있어 임상적인 효과가 나타나지 않고 있는 실정이다. 그 한계점을 살펴본다면, 암 세포는 인체 내 면역반응을 억제하는 물질을 스스로 분비하거나 암 세포에 대한 항체 생성에 필수적인 항원을 제시하지 못하기 때문에 적절한 면역반응을 일으키지 못하게 만든다.
한편, 수지상 세포는 인체의 외부로부터 들어오거나 내부에서 발생하는 항원들을 감지하는 감시자의 역할을 수행할 뿐 아니라, 이렇게 인지하고 흡수한 항원을 가지고 면역 기관 (secondary lymphoid organ)으로 신속히 이동하여 항원과 반응하는 T 세포를 포함한 면역 세포들에게 항원을 제시하는 전문적인 항원제시 세포의 역할을 수행한다. 수지상 세포를 이용한 항암 면역 치료 백신의 경우 여러 가지 방법을 통해 개발되어 왔으며, 크게 생체 외에서 발생한(ex vivo generated) 수지상 세포 백신과 생체 내 (in vivo) 수지상 세포 백신으로 나눌 수 있다. 생체 내 수지상 세포 백신의 경우 체내에 존재하는 수지상 세포에 항원을 직접적으로 전달하는 방식이다. 또한 생체 외에서 발생한 수지상 세포 백신 방법의 경우 환자의 PBMC로부터 수지상 세포를 분리하여 분리된 수지상 세포에 제시할 항원을 전달하고, 이를 통해 수지상 세포가 활성화된 뒤 다시 환자에게 주입하여 주입된 수지상 세포로부터 T 세포로의 항원이 전달되게 하는 방법이다. 이 방식의 경우에는 생체 외에서 수지상 세포 배양 방법 및 항원 전달 방식이 중요하며, 현재 사용되는 항원 제시 방법으로는 제시할 항원의 DNA를 바이러스나 뉴클레오펙션(nucleofection)을 이용하여 형질 전환(transfection) 시켜주거나 수지상 세포를 타겟하는 항체에 항원을 결합시켜 수지상 세포를 타겟으로 하는 항원 전달이 사용되고 있다.
현재 수지상 세포 백신의 가장 큰 문제점으로는 체내의 극심한 만성 염증 현상, 바르부르크 효과(Warburg effect), 면역억제 사이토카인, 면역억제 T 세포 및 수지상 세포 등이 존재하는 암 미세환경 속에서 효과적인 항암 면역세포의 활성화가 매우 어렵게 여겨지고 있다는 점이다.
본 발명의 일 목적은 엡스타인-바 바이러스(epstein barr virus; EBV) 양성 암 특이적 네오-에피토프(neoepitope)와 이를 포함하는 T 세포 활성화용 조성물을 제공하고자 한다.
본 발명의 다른 목적은 본 발명의 네오-에피토프 에피토프가 로딩된 것으로, 암 치료를 위한 T 세포를 활성화시킬 수 있는 항원 제시 세포를 제공하고자 한다.
본 발명의 또 다른 목적은 본 발명의 네오-에피토프 에피토프가 로딩된 항원 제시 세포에 의해 활성화된 T 세포를 제공하고자 한다.
본 발명의 또 다른 목적은 암 치료를 위하여 T 세포를 활성화하는 방법을 제공하고자 한다.
그러나 본 발명이 이루고자 하는 기술적 과제는 이상에서 언급한 과제에 제한되지 않으며, 언급되지 않은 또 다른 과제들은 아래의 기재로부터 당 업계에서 통상의 지식을 가진 자에게 명확하게 이해될 수 있을 것이다.
본 발명의 일 구현 예에 따르면, 암 특이적 에피토프(tumor antigen epitope)에 관한 것이다.
본 발명에서 상기 "암 특이적 에피토프"는 암 세포에만 존재하고 정상 세포에는 존재하지 않는 단백질 항원으로부터 유래된 것이다. 본 발명에서 상기 암 특이적 에피토프는 T 세포 수용체에 의해 인식되는 적어도 하나의 에피토프를 포함하는 것으로, 바람직하게는 엡스타인-바 바이러스(epstein barr virus; EBV) 양성 암 세포에 존재하는 에피토프로 상기 EBV 바이러스 에피토프 또는 암 세포의 에피토프를 포함할 수 있으며, 보다 바람직하게는 엡스타인-바 바이러스(EBV) 양성 암 세포의 항원인 엡스타인-바 바이러스 잠복성 막 단백질 2(Epstein-Barr virus latent membrane protein 2, LMP2a), 엡스타인-바 핵 항원 1(Epstein-Barr nuclear antigen 1, EBNA-1) 또는 이들의 네오-에피토프(neoepitope)일 수 있다.
본 발명에서 상기 "엡스타인-바 바이러스 잠복성 막 단백질 2(Epstein-Barr virus latent membrane protein 2, LMP2a)"는 모든 Ⅱ형 및 Ⅲ형 질환/악성 종양에서 발현되는 몇 개의 EBV 유전자 중 하나로, LMP2a는 B 세포-수용체 신호전달의 음성 조정자로서 작용하고, 티로신 키나제의 격리(sequestering)를 통한 세포 생존을 촉진시키는 막관통 단백질에 해당한다. HLA-A2 제한 펩티드는 생체 외 개인의 60~75%에서 검출 가능한 에피토프 특이적 세포독성 T 림프구로, 잠복성 질환에서 가장 면역우성인 LMP 에피토프이다. CLGGLLTMV 펩티드는, 에피토프가 NPC 및 HL 환자로부터 검사한 생검에서 보존되고, 기타 EBV 잠재 에피토프와 함께, 면역학적으로 취약하므로, NPC 및 HL 치료에 대한 잠재적 표적인 것으로 오랫동안 나타났다.
본 발명에서 상기 "엡스타인-바 핵 항원 1(Epstein-Barr nuclear antigen 1, EBNA-1)"은 엡스타인-바 바이러스와 관련된 다기능성, 이합체 바이러스 단백질에 해당한다. 이는 모든 EBV-관련 악성 종양에서만 발견되는 EBV 단백질에 해당한다. 이는 세포가 EBV에 감염되었을 때 수반되는 상태 변형을 유지하는데 중요한 역할을 한다. 한편, EBNA-1은 단백질을 아미노- 및 카복시-터미널 도메인으로 분리하는 글라이신-알라닌 반복 서열에 해당한다. 이러한 서열은 단백질을 안정화하고, 프로테아좀 관련 분해(proteasomal breakdown)를 방지하며, 항원 프로세싱과 MHC 클래스 I-제한 항원 발현을 손상시키는 역할을 한다. 따라서, 상기 EBNA-1은 바이러스 감염된 세포에 대한 CD8-제한적 세포 독성 T 세포의 반응을 억제한다. 상기 EBNA-1은 모든 잠복성 프로그램(latency programs)에서 Qp 프로모터에 의해 발현되며, 잠복성 프로그램 I에서 유일하게 발현되는 바이러스 단백질에 해당한다.
본 발명에서 상기 "네오-에피토프(neo-epitope)"는 정상적인 비암 세포 또는 생식 세포와 같은 레퍼런스에서는 존재하지 않지만 암 세포에서는 발견되는 에피토프를 가리킨다.
본 발명에서 상기 네오-에피토프로는, 인간의 혈액으로부터 추출된 T 세포, 바람직하게는 메모리 T 세포(memory T cells)가 효능을 가질 수 있도록, HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-E, HLA-F, HLA-G, β2-마이크로글로불린, HLA-DPA1, HLA-DPB1, HLA-DQA1, HLA-DQB1, HLA-DRA1, HLA-DRB1, HLA-DRB3, HLA-DRB4, HLA-DRB5, HLA-DM, HLA-DOA 및 HLA-DOB 유전자좌 중 적어도 하나와 결합 친화도(binding affinity)를 나타낼 수 있고, 그 중에서도 한국인이 가장 많이 발현하고 있는 HLA 타입으로, 예를 들면, HLA-A*2402, HLA-A*A0201, HLA-A*3303, HLA-A*1101, HLA-A*0206, HLA-A*3101, HLA-B*5101, HLA-B*4403, HLA-B*5401, HLA-B*5801 및 HLA-B*3501 중 적어도 하나와 높은 결합 친화도를 나타내는 것일 수 있다.
바람직하게는 본 발명에서 상기 네오-에피토프로는, HLA-A*2402에 대하여 높은 결합 친화도를 갖는 것으로, 서열번호 1 내지 151 중 어느 하나로 표시되는 펩티드인 LMP2a 항원의 네오-에피토프일 수 있고; 또는 HLA-A*3101에 대하여 높은 결합 친화도를 갖는 것으로, 서열번호 152 내지 184 중 어느 하나로 표시되는 펩티드인 EBNA-1 항원의 네오-에피토프일 수 있다.
단, 본 발명에서 상기 네오-에피토프-HLA 친화도를 측정하는 방법으로는 네오-에피토프가 특정 HLA 대립 형질에 결합하는지를 예측하기 위해 NetMHC 3.4(URL: www.cbs.dtu.dk/services/NetMHC-3.4/)를 사용할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 "HLA" 또는 "인간 백혈구 항원"은 면역계의 조절의 원인이 되는 세포의 표면 상에서 MHC (주조직 적합성 복합체) 단백질을 암호화하는 인간 유전자를 지칭한다. "HLA-I" 또는 "HLA 클래스 I"은 HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-E, HLA-F, HLA-G 및 β2-마이크로글로불린 유전자좌를 포함하는 인간 MHC 클래스 I 유전자를 지칭한다. "HLA-II" 또는 "HLA 클래스 II"는 HLA-DPA1, HLA-DPB1, HLA-DQA1, HLA-DQB1, HLA-DRA1, HLA-DRB1, HLA-DRB3, HLA-DRB4, HLA-DRB5, HLA-DM, HLA-DOA 및 HLA-DOB 유전자좌를 포함하는 인간 MHC 클래스 II 유전자를 지칭한다.
본 발명에서 상기 암으로는 엡스타인-바 바이러스(epstein barr virus; EBV) 양성 암으로, EBV 양성 위암, EBV 양성 자궁경부암, EBV 양성 버키트 림프종(Burkitt's lymphoma), EBV 양성 T 세포 림프종(T cell lymphomas), EBV 양성 유방암, EBV 양성 평활근육종(leiomyosarcomas), EBV 양성 평활근종양(smooth muscle tumors), EBV 양성 호지킨 림프종(Hodgkin lymphoma), EBV 양성 비인두암 또는 EBV 양성 이식후 림프세포증식 질환(PTLD)일 수 있으나, 바람직하게는 EBV 양성 위암일 수 있다.
본 발명의 다른 구현 예에 따르면, 본 발명에서 제공하는 암 특이적 에피토프(tumor antigen epitope)로, 바람직하게는 엡스타인-바 바이러스(EBV) 양성 암 세포의 항원인 LMP2a 또는 EBNA-1의 네오-에피토프(neoepitope)를 코딩하는 핵산 분자에 관한 것이다.
본 발명의 핵산 분자는 본 발명에서 제공하는 폴리펩티드의 아미노산 서열을 당업자에게 알려진 바와 같이 폴리뉴클레오티드 서열로 번역된 핵산 분자 모두를 포함한다. 그러므로 ORF(open reading frame)에 의한 다양한 폴리뉴클레오티드 서열이 제조될 수 있으며 이 또한 모두 본 발명의 핵산 분자에 포함된다.
본 발명의 또 다른 구현 예에 따르면, 본 발명에서 제공하는 상기 단리된 핵산 분자가 삽입된 발현 벡터를 제공한다.
본 발명에서 상기 "벡터"는 어떤 핵산 분자가 연결된 또 다른 핵산을 수송할 수 있는 상기 핵산 분자이다. 벡터의 한 가지 유형은, 추가적인 DNA 세그멘트가 결찰될 수 있는 원형 이중가닥 DNA를 가리키는 "플라스미드"이다. 또 다른 유형의 벡터는 파지 벡터이다. 또 다른 유형의 벡터는 바이러스성 벡터로, 추가적인 DNA 세그멘트가 바이러스 게놈에 결찰될 수 있다. 어떤 벡터들은 그들이 유입된 숙주세포에서 자율적인 복제를 할 수 있다(예컨대, 박테리아성 벡터는 박테리아성 복제 기원을 갖는 에피솜 포유류 벡터). 기타 벡터(예컨대, 비-에피솜 포유류 벡터)는 숙주세포에 유입되면서 숙주세포의 게놈에 통합될 수 있고, 그럼으로써, 숙주 게놈과 함께 복제된다. 뿐만 아니라, 어떤 벡터는 이들이 작동차원에서 연결된 유전자의 발현을 지시할 수 있다. 이와 같은 벡터는 본원에서 "재조합 발현 벡터" 또는 단순히 "발현 벡터"라 명명된다. 일반적으로 재조합 DNA 기법에서 유용한 발현 벡터는 종종 플라스미드의 형태로 존재한다. 본 명세서에서, "플라스미드"와 "벡터"는, 플라스미드가 벡터 중 가장 통상적으로 사용되는 형태이기 때문에, 상호 교환하여 사용될 수 있다.
본 발명에서 상기 발현 벡터의 구체적인 예시로는 상업적으로 널리 사용되는 pCDNA 벡터, F, R1, RP1, Col, pBR322, ToL, Ti 벡터; 코스미드; 람다, 람도이드(lambdoid), M13, Mu, p1 P22, Qμ, T-even, T2, T3, T7 등의 파아지; 식물 바이러스로 이루어진 군으로부터 선택될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니며, 당업자에게 발현 벡터로 알려진 모든 발현 벡터는 본 발명에 사용 가능하고, 발현 벡터를 선택할 때에는 목적으로 하는 숙주 세포의 성질에 따른다. 숙주세포로의 벡터 도입 시 인산칼슘 트랜스펙션, 바이러스 감염, DEAE-덱스트란 조절 트랜스펙션, 리포펙타민 트랜스펙션 또는 전기천공법에 의해 수행될 수 있으나 이에 한정되는 것은 아니며 당업자는 사용하는 발현 벡터 및 숙주 세포에 알맞은 도입 방법을 선택하여 이용할 수 있다. 바람직하게 벡터는 하나 이상의 선별 마커를 함유하나 이에 한정되지 않으며, 선별 마커를 포함하지 않은 벡터를 이용하여 생산물 생산 여부에 따라 선별이 가능하다. 선별 마커의 선택은 목적하는 숙주 세포에 의해 선별되며, 이는 이미 당업자에게 알려진 방법을 이용하므로 본 발명은 이에 제한을 두지 않는다.
본 발명의 핵산 분자를 정제를 용이하게 하기 위하여 태그 서열을 발현 벡터 상에 삽입하여 융합시킬 수 있다. 상기 태그로는 헥사-히스티딘 태그, 헤마글루티닌 태그, myc 태그 또는 flag 태그를 포함하나 이에 한정되는 것은 아니며 당업자에게 알려진 정제를 용이하게 하는 태그는 모두 본 발명에서 이용 가능하다.
본 발명의 또 다른 구현 예에 다르면, 본 발명에서 제공하는 상기 발현 벡터가 형질 감염된 숙주 세포를 제공한다.
본 발명에서 상기 "숙주 세포"에는 폴리펩티드 삽입물의 편입을 위한 벡터(들)의 수령자(recipient)일 수 있거나 수령자였던 개별적인 세포 또는 세포 배양물이 포함된다. 숙주 세포에는 단일 숙주 세포의 자손이 포함되고, 상기 자손은 자연적인, 우발적인 또는 고의의 돌연변이 때문에 반드시 원래 모세포와 완전히 동일(형태학상 또는 게놈 DNA 보완체에서)하지 않을 수 있다. 숙주 세포에는 본원의 폴리펩티드(들)로 체내에서 형질주입된 세포가 포함된다.
본 발명에 있어서, 상기 숙주 세포로는 포유동물, 식물, 곤충, 균류 또는 세포성 기원의 세포를 포함할 수 있고, 예를 들면 대장균, 스트렙토미세스, 살모넬라 티피뮤리움 등의 박테리아 세포; 효모 세포, 피치아 파스 토리스 등의 균류세포; 드로조필라, 스포도프테라 Sf9 세포 등의 곤충 세포; CHO(중국 햄스터 난소 세포, Chinese hamster ovary cells), SP2/0(생쥐 골수종), 인간 림프아구(Human lymphoblastoid), COS, NSO(생쥐 골 수종), 293T, 보우 멜라노마 세포, HT-1080, BHK(베이비 햄스터 신장세포, Baby Hamster Kidney cells), HEK(인간 배아신장 세포, Human Embryonic Kidney cells) 또는 PERC.6(인간 망막 세포)의 동물 세포; 또는 식물 세포일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니며, 당업자에게 알려진 숙주 세포로 사용 가능한 세포는 모두 이용 가능하다.
본 발명의 또 다른 구현 예에 따르면, 본 발명에서 제공하는 암 특이적 에피토프(tumor antigen epitope), 이를 코딩하는 핵산 분자, 상기 핵산 분자가 삽입된 발현 벡터 또는 상기 발현 벡터가 형질 전환된 숙주 세포를 포함하는 T 세포의 활성화용 조성물에 관한 것이다.
본 명세서에서 사용되는 바와 같이, "T 세포의 활성화"는 적어도 하나의 종양 항원 펩티드를 인식하는 T 세포 수용체를 갖는, 단일클론 (예를 들어, 동일한 TCR을 암호화하는) 또는 다클론 (예를 들어, 상이한 TCR을 암호화하는 클론을 갖는) T 세포 집단을 지칭한다. 활성화된 T 세포는 세포독성 T 세포, 보조 T 세포, 자연 살해 T 세포, γδ T 세포, 조절 T 세포 및 메모리 T 세포로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함하나, 이에 한정되지 않는 T 세포의 하나 이상의 아형을 함유할 수 있으나, 바람직하게는 메모리 T 세포(memory T cells)일 수 있다.
본 발명에서 상기 활성화된 T 세포는 암 세포의 방어 기작을 피해 암 또는 종양성 상태를 치료하거나 암의 재발, 진행 또는 전이를 예방할 수 있다.
본 발명의 또 다른 구현 예에 따르면, 본 발명에서 제공하는 암 특이적 에피토프(tumor antigen epitope)가 로딩(loading)된 항원 제시 세포(antigen presenting cells, APC)일 수 있다.
본 발명에서 상기 항원 제시 세포는 수지상 세포(dendritic cells, DC), B 세포 및 대식 세포 중 1종 이상을 포함할 수 있으나, 바람직하게는 수지상 세포일 수 있다.
본 발명에서 상기 "수지상 세포"는 림프성 또는 비-림프성 조직에서 발견되는 형태학적으로 유사한 세포 유형의 다양한 집단의 구성원이다. 이러한 세포는 이들의 독특한 형태, 및 항원 펩티드를 T 세포에 제시하는 단백질인 표면 클래스 I 및 클래스 Ⅱ MHC 분자의 높은 발현 수준을 특징으로 한다. DC, 다른 APC 및 T 세포는 말초 혈액으로부터의 유래된 말초 혈액 단핵 세포 (PBMC)와 같이 편리하게는 말초 혈액으로부터 그리고 다수의 조직 공급원으로부터 단리되거나 유래 (예컨대 분화)될 수 있다.
본 발명에서 상기 항원 제시 세포는 암 항원 특이적인 T 세포, 바람직하게는 메모리 T 세포의 분화 및 증식을 유도하여 암 세포의 방어 기작을 피해 암 또는 종양성 상태를 치료하거나 암의 재발, 진행 또는 전이를 예방할 수 있다.
본 발명의 또 다른 구현 예에 따르면, 본 발명에서 제공하는 암 특이적 에피토프(tumor antigen epitope); 및 수지상 세포 특이적 항체 또는 그 단편을 포함하는 융합 단백질에 관한 것이다.
본 발명에서 제공하는 융합 단백질은 수지상 세포에 본 발명에서 제공하는 암 특이적 에피토프가 로딩될 수 있도록 한다.
본 발명에서 상기 수지상 세포 특이적 항체로는, 수지상 세포의 DCIR, MHC 클래스 I, MHC 클래스 II, CD1, CD2, CD3, CD4, CD8, CD11b, CD14, CD15, CD16, CD19, CD20, CD29, CD31, CD40, CD43, CD44, CD45, CD54, CD56, CD57, CD58, CD83, CD86, CMRF-44, CMRF-56, DCIR, DC-ASPGR, CLEC-6, CD40, BDCA-2, MARCO, DEC-205, Clec9A, 33D1, 만노스 수용체(mannose receptor), 랑게린(Langerin), DECTIN-1, B7-1, B7-2, IFN-γ 수용체, IL-2 수용체, ICAM-1, Fcγ 수용체, LOX-1, 또는 ASPGR에 특이적인 항체일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명의 융합 단백질에서 상기 암 특이적 에피토프는 상기 수지상 세포 특이적 항체 또는 그 단편에 컨쥬게이트된 것일 수 있다. 여기서 상기 "컨쥬게이트(conjugate)"는 2개 부분을 함께 결합시켜 형성된 임의의 물질을 말한다. 본 발명에 따른 대표적인 접합체는 항원과 항체 및 TLR 효능제를 함께 결합시켜 형성된 것들을 포함한다. 용어 "컨쥬게이션(conjugation) "는 접합체를 형성하는 공정을 말하며 일반적으로 물리적 커플링, 예를 들면, 공유결합, 동시-배위 공유결합, 또는 제2 결합력, 예를 들면, 반 데르 발스 결합력(Van der Waals bonding force)을 말한다. 항원을 항체에 연결시키는 공정은 또한 독커린-코헤신 연합(dockerin-cohesin association)과 같은 비-공유결합성 연합[(Banchereau) 등의 미국 특허 공보 제20100135994호, 본원에 참조로 인용된 부분과 관련됨]을 통해 또는 펩타이드 또는 화학적 결합을 형성함으로써 직접적인 화학적 연결에 의해 수행될 수 있다.
본 발명의 또 다른 구현 예에 따르면, 본 발명에서 제공하는 암 특이적 에피토프(tumor antigen epitope)가 로딩된 항원 제시 세포(Antigen presenting cells)를 제조하는 방법에 관한 것이다.
본 발명에서 상기 항원 제시 세포는 수지상 세포, B 세포 및 대식 세포 중 1종 이상을 포함할 수 있으나, 바람직하게는 수지상 세포일 수 있다.
본 발명에서 상기 수지상 세포 (예컨대 미성숙 수지상 세포)는 자가 공급원, 즉 목적하는 개체 유래를 포함하는 다양한 공급원으로부터 얻을 수 있고, 바람직하게는 말초 혈액 유래의 말초혈액 단핵세포(Peripheral blood mononuclear cell, PBMC)로부터 얻어질 수 있으며, 보다 바람직하게는 개체 유래 PBMC로부터 단핵구를 분리하여 복수의 사이토카인과 접촉시킴으로써 얻어질 수 있다. 여기서, 상기 단핵구의 수지상 세포로의 분화를 유도하는 사이토카인의 종류는 특별히 제한하지 않으나, 예를 들면, GM-CSF 및 IL-4 중 1종 이상을 포함할 수 있다.
본 발명에서 상기 "목적하는 개체"란, 암이 발병하였거나, 발병 가능성이 높은 개체를 의미한다.
본 발명에서 상기와 같이 항원 제시 세포가 준비되면, 상기 항원 제시 세포에 본 발명의 암 특이적 에피토프를 로딩할 수 있다. 일반적으로 미성숙 수지상 세포는 식작용이나 수용체를 통한 세포 내 이입(endocytosis)을 통하여 항원을 포획하여, 세포 내의 일련의 과정을 통하여 항원을 가공 후 MHC에 항원 펩티드를 적재하여 T 림프구에 제시하게 된다. 항원을 가공하는 과정과 함께 수지상 세포는 점점 성숙하게 되어 식작용과 세포 내 이입에 사용되는 수용체를 잃고, MHC class I, II, 보조자극 분자, 세포유착 분자의 발현이 증가 되고, 새로운 케모카인 수용체를 발현하여 주변 림프절의 T림프구가 풍부한 지역으로 이동하여 T 림프구에 항원을 제시함으로써 T 림프구 면역반응을 일으키게 된다.
본 발명의 일 예시로, 상기 암 특이적 에피토프를 상기 항원 제시 세포에 로딩하기 위해서는 상기 항원 제시 세포를 본 발명의 암 특이적 에피토프와 접촉시킬 수 있으며, 바람직하게는 상기 항원 제시 세포로 예를 들면, 미성숙 수지상 세포, 또는 PBMC에 포함되거나 이로부터 유래된 (예컨대 분화된) 항원 제시 세포(예컨대 수지상 세포)로 본 발명의 상기 암 특이적 에피토프를 펄싱(pulsing)하는 단계를 수행할 수 있다. 본 기술 분야에 알려진 바와 같이, 펄싱은 세포, 예컨대 수지상 세포를, 본 발명의 암 특이적 에피토프 펩티드를 함유하는 용액과 혼합하고, 이어서 임의로 혼합물로부터 상기 암 특이적 에피토프를 제거하는 공정을 지칭한다. 본 발명에서는 상기 미성숙 수지상 세포를 암 특이적 에피토프와 접촉시킬 때 톨 유사 수용체(Toll-like receptor) 작용제를 처리하여 미성숙 수지상 세포의 집단의 성숙을 추가로 유도할 수 있다. 이때, 예시적인 TLR 작용제에는 폴리IC, MALP 및 R848이 포함되나, 이에 한정되지 않는다.
본 발명의 다른 예시로, 상기 암 특이적 에피토프를 상기 항원 제시 세포에 로딩하기 위해서는 상기 암 특이적 에피토프를 코딩하는 핵산 분자가 삽입된 발현 벡터, 바람직하게는 플라스미드로 상기 항원 제시 세포를 뉴클레오펙션(nucleofection)시킬 수 있다. 여기서 상기 뉴클레오펙션 시 예를 들면 Amaxa® 뉴클레오펙션 시스템 또는 InVitrogen® 뉴클레오펙션 시스템을 포함한 본 분야에서의 어떤 유용한 수단에 의해 발생될 수 있다.
본 발명의 또 다른 예시로서, 상기 암 특이적 에피토프를 상기 항원 제시 세포에 로딩하기 위해서는, 본 발명에서 제공하는 상기 암 특이적 에피토프; 및 수지상 세포 특이적 항체 또는 그 단편을 포함하는 융합 단백질을 사용하여 수행될 수 있다.
본 발명의 또 다른 구현 예에 따르면, 본 발명에서 제공하는 항원 제시 세포(Antigen presenting cells)에 의해 활성화된 T 세포에 관한 것이다.
본 발명에서 상기 T 세포는 종양 항원 펩티드를 인식하는 T 세포 수용체를 갖는, 단일클론 (예를 들어, 동일한 TCR을 암호화하는) 또는 다클론 (예를 들어, 상이한 TCR을 암호화하는 클론을 갖는) T 세포 집단을 지칭하는 것으로, 세포독성 T 세포, 보조 T 세포, 자연 살해 T 세포, γδ T 세포, 조절 T 세포 및 메모리 T 세포로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함할 수 있으며, 이에 한정되지 않는 T 세포의 하나 이상의 아형을 함유할 수 있으나, 바람직하게는 메모리 T 세포일 수 있다.
본 발명에서 상기 "메모리 T 세포(memory T cells)"는 이들의 특이적 항원과 이전에 조우하여 반응한 T 세포 또는 활성화된 T 세포로부터 분화된 T 세포이다. 종양 특이적 메모리 T 세포는 총 T 세포 양의 작은 부분을 구성하지만, 이들은 개인의 전체 수명 동안 종양 세포의 감시에 중요한 기능을 수행한다. 종양 특이적 메모리 T 세포가 이들의 특정 종양 항원을 발현하는 종양 세포를 조우하면, 메모리 T 세포는 즉시 활성화되어 클론 확장(clonally expanded)된다. 활성화되고 증식된 T 세포는 이펙터 T 세포로 분화되어, 고효율로 종양 세포를 죽인다. 메모리 T 세포는 T 세포의 장기 종양 항원 특이적 반응을 확립하고 유지하는 데 중요하다. 본 발명에서 활성화된 T 세포, 바람직하게는 활성화된 메모리 T 세포는 암 세포의 항원을 특이적으로 인식하여, 암 세포의 방어 기작을 피해 암 또는 종양성 상태를 치료하거나 암의 재발, 진행 또는 전이를 예방할 수 있다.
본 발명의 또 다른 구현 예에 따르면, 본 발명에서 제공하는 항원 제시 세포(Antigen presenting cells, APC)에 의해 T 세포를 활성화하는 방법에 관한 것이다.
본 발명에서는 상기 T 세포의 활성화를 위해서는 상기 T 세포를 본 발명의 암 특이적 에피토프가 로딩된 항원 제시 세포와 공동 배양할 수 있다.
본 발명에서 상기 T 세포는 자가 공급원, 즉 목적하는 개체 유래를 포함하는 다양한 공급원으로부터 얻을 수 있고, 바람직하게는 말초 혈액 유래의 말초혈액 단핵세포(Peripheral blood mononuclear cell, PBMC)로부터 얻어질 수 있으며, 보다 바람직하게는 상기 말초혈액 단핵세포의 비부착성 부분으로부터 얻을 수 있다. 본 발명의 일 예시로, 상기 PBMC의 비부착성 부분을 말초 혈액 샘플의 밀도 구배 원심분리에 의해 얻을 수 있고, 이를 항-CD3 항체 (예컨대 OKT3)가 있거나 없이, 적어도 하나의 사이토카인 (예컨대 IL-2)과 함께 배양하여 얻을 수 있다.
본 발명에서 상기 T 세포는 종양 항원 펩티드를 인식하는 T 세포 수용체를 갖는, 단일클론 (예를 들어, 동일한 TCR을 암호화하는) 또는 다클론 (예를 들어, 상이한 TCR을 암호화하는 클론을 갖는) T 세포 집단을 지칭하는 것으로, 세포독성 T 세포, 보조 T 세포, 자연 살해 T 세포, γδ T 세포, 조절 T 세포 및 메모리 T 세포로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함할 수 있으며, 이에 한정되지 않는 T 세포의 하나 이상의 아형을 함유할 수 있으나, 바람직하게는 메모리 T 세포일 수 있다.
또한, 본 발명에서 상기 T 세포 및 상기 항원 제시 세포는 동일한 개체, 예컨대 암, 바람직하게는 EBV 양성 암을 앓고 있는 개체 (예를 들어 저등급 내지 중간 등급 암)로부터 유래될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 T 세포의 활성화를 위하여, 상기 T 세포는 본 발명의 항원 제시 세포와 1, 2, 3, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28 또는 30일 중 어느 하나 이상 동안 공동 배양될 수 있고, 바람직하게는 1일 내지 21일, 1일 내지 14일, 2일 내지 10일, 2일 내지 5일, 2일 내지 5일, 3일, 5일, 7일, 10일, 14일, 16일, 18일 또는 21일 동안 공동 배양될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 T 세포와 본 발명의 항원 제시 세포의 공동 배양 시 1종 이상의 사이토카인을 첨가하여 T 세포의 활성화, 성숙 및/또는 증식을 촉진하고 이후의 기억 T 세포로의 분화를 위해 T 세포를 프라이밍할 수 있다. 이러한 단계에서 사용할 수 있는 예시적인 사이토카인에는 인터루킨-2(IL-2), 인터루킨-4(IL-4), 인터루킨-7(IL-7), 인터루킨-15(IL-15), 인터루킨-21(IL-21) 또는 이들의 조합 등이 포함되나, 이에 한정되지 않는다.
또한, 본 발명에서는 상기 T 세포와 본 발명의 항원 제시 세포의 공동 배양 시 사이토카인 및 면역글로불린(immunoglobulin) 중쇄 불변부를 포함하는 융합 단백질을 첨가하여 T 세포의 활성화, 성숙 및/또는 증식을 촉진하고 이후의 기억 T 세포로의 분화를 위해 T 세포를 프라이밍할 수 있다. 여기서 상기 사이토카인으로는 인터페론-γ(IFN-γ), 인터루킨-2(IL-2), 인터루킨-4(IL-4), 인터루킨-12(IL-12), IL-18, 종양 괴사 인자(TNF) 또는 과립구 마크로파지 콜로니 자극 인자(GMCSF)일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다. 또한, 상기 면역글로불린 중쇄 불변부는 면역글로불린 힌지부, 및 임의로 CH2 도메인, CH3 도메인 및 CH4 도메인 또는 그의 배합물로 구성된 군으로부터 선택된 면역글로불린 중쇄 불변부 영역일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다. 또한, 상기 면역글로불린 중쇄 불변부는 IgA(Igα), IgD(Igδ), IgE(Igε), IgG(Igγ), 및 IgM(Igμ)로 당업계에서 불리워지는 임의의 5개 면역글로불린 클래스에 속하는 면역글로불린으로부터 유래될 수 있으나, 바람직하게는 IgG 클래스로부터 유래된 면역글로불린 중쇄 불변부일 수 있다.
또한, 본 발명에서는 상기 T 세포와 본 발명의 항원 제시 세포의 공동 배양 시 메모리 T 세포에서 높게 발현하는 세포 표면 단백질과 결합하는 리간드; 및 면역글로불린(immunoglobulin) 중쇄 불변부를 포함하는 융합 단백질을 첨가하여 T 세포의 활성화, 성숙 및/또는 증식을 촉진하고 이후의 기억 T 세포로의 분화를 위해 T 세포를 프라이밍할 수 있다. 여기서 상기 메모리 T 세포에서 높게 발현하는 세포 표면 단백질로는 CD27, CXCR3 또는 CD62L일 수 있다. 상기 CD27에 결합할 수 있는 리간드로는 CD70일 수 있고, CXCR3에 결합할 수 있는 리간드는 CXCR9 또는 CXCR10일 수 있으며, 상기 CD62L에 결합할 수 있는 리간드는 GlyCAM-1, CD34, MadCAM-1 또는 PSGL-1일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다. 또한, 상기 면역글로불린 중쇄 불변부는 IgA(Igα), IgD(Igδ), IgE(Igε), IgG(Igγ), 및 IgM(Igμ)로 당업계에서 불리워지는 임의의 5개 면역글로불린 클래스에 속하는 면역글로불린으로부터 유래될 수 있으나, 바람직하게는 IgG 클래스로부터 유래된 면역글로불린 중쇄 불변부일 수 있다.
본 발명의 또 다른 구현 예에 따르면, 본 발명에서 제공하는 암 특이적 에피토프가 로딩된 항원 제시 세포를 유효 성분으로 포함하는 면역 치료제에 관한 것이다. 본 발명에 따른 면역 치료제는 면역 반응을 증가시키거나, 특정 질병으로 예를 들어 암의 치료 또는 예방에 바람직한 면역 반응의 일부를 선택적으로 상승시킬 수 있다.
본 발명의 또 다른 구현 예에 따르면, 본 발명에서 제공하는 암 특이적 에피토프가 로딩된 항원 제시 세포; 및/또는 활성화된 T 세포를 유효 성분으로 포함하는 항암 백신, 또는 암의 예방 또는 치료용 약학 조성물에 관한 것이다.
본 발명에서 상기 "암"은 포유류에서 전형적으로 조절되지 않는 세포 성장으로 특징 지어진 생리적 상태를 나타내거나 가리킨다. 본 발명에서 예방, 개선 또는 치료의 대상이 되는 암은 엡스타인-바 바이러스(epstein barr virus; EBV) 양성 암으로, EBV 양성 위암, EBV 양성 자궁경부암, EBV 양성 버키트 림프종(Burkitt's lymphoma), EBV 양성 T 세포 림프종(T cell lymphomas), EBV 양성 유방암, EBV 양성 평활근육종(leiomyosarcomas), EBV 양성 평활근종양(smooth muscle tumors), EBV 양성 호지킨 림프종(Hodgkin lymphoma), EBV 양성 비인두암 또는 EBV 양성 이식후 림프세포증식 질환(PTLD)일 수 있으나, 바람직하게는 EBV 양성 위암일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 제공하는 상기 항원 제시 세포는 EBV 양성 암 항원 특이적인 T 세포, 바람직하게는 메모리 T 세포의 분화 및 증식을 유도할 수 있고, 이렇게 활성화된 메모리 T 세포는 암 세포의 방어 기작을 피해 암 또는 종양성 상태를 치료하거나 암의 재발, 진행 또는 전이를 예방할 수 있다.
본 발명에 따른 항암 백신은 일회 투여함으로써 수행되는 면역화 방법과 연속 투여함으로써 수행되는 면역화 방법을 모두 포함할 수 있다.본 발명에서, "예방"은 본 발명의 약학 조성물을 이용하여 암의 증상을 차단하거나, 그 증상을 억제 또는 지연시키는 모든 행위라면 제한없이 포함할 수 있다.
또한, 본 발명에서, "치료"는 본 발명의 약학 조성물을 이용하여 암의 증상이 호전되거나 이롭게 되는 모든 행위라면 제한없이 포함할 수 있다.
본 발명에서 상기 약학 조성물은 캡슐, 정제, 과립, 주사제, 연고제, 분말 또는 음료 형태임을 특징으로 할 수 있으며, 상기 약학 조성물은 인간을 대상으로 하는 것을 특징으로 할 수 있다.
본 발명에서 상기 약학 조성물은 이들로 한정되는 것은 아니지만, 각각 통상의 방법에 따라 산제, 과립제, 캡슐, 정제, 수성 현탁액 등의 경구형 제형, 외용제, 좌제 및 멸균 주사 용액의 형태로 제형화하여 사용될 수 있다. 본 발명의 약학 조성물은 약학적으로 허용 가능한 담체를 포함할 수 있다. 약학적으로 허용되는 담체는 경구 투여 시에는 결합제, 활탁제, 붕해제, 부형제, 가용화제, 분산제, 안정화제, 현탁화제, 색소, 향료 등을 사용할 수 있으며, 주사제의 경우에는 완충제, 보존제, 무통화제, 가용화제, 등장제, 안정화제 등을 혼합하여 사용할 수 있으며, 국소투여용의 경우에는 기제, 부형제, 윤활제, 보존제 등을 사용할 수 있다. 본 발명의 약학 조성물의 제형은 상술한 바와 같은 약제학적으로 허용되는 담체와 혼합하여 다양하게 제조될 수 있다. 예를 들어, 경구 투여시에는 정제, 트로키, 캡슐, 엘릭서(elixir), 서스펜션, 시럽, 웨이퍼 등의 형태로 제조할 수 있으며, 주사제의 경우에는 단위 투약 앰플 또는 다수회 투약 형태로 제조할 수 있다. 기타, 용액, 현탁액, 정제, 캡슐, 서방형 제제 등으로 제형화할 수 있다.
한편, 제제화에 적합한 담체, 부형제 및 희석제의 예로는, 락토즈, 덱스트로즈, 수크로즈, 솔비톨, 만니톨, 자일리톨, 에리스리톨, 말디톨, 전분, 아카시아 고무, 알지네이트, 젤라틴, 칼슘 포스페이트, 칼슘 실리케이트, 셀룰로즈, 메틸 셀룰로즈, 미정질 셀룰로즈, 폴리비닐피롤리돈, 물, 메틸하이드록시벤조에이트, 프로필하이드록시벤조에이트, 탈크, 마그네슘 스테아레이트 또는 광물유 등이 사용될 수 있다. 또한, 충진제, 항 응집제, 윤활제, 습윤제, 향료, 유화제, 방부제 등을 추가로 포함할 수 있다.
본 발명에 상기 약학 조성물의 투여 경로는 이들로 한정되는 것은 아니지만 구강, 정맥내, 근육내, 동맥내, 골수내, 경막내, 심장내, 경피, 피하, 복강내, 비강내, 장관, 국소, 설하 또는 직장이 포함된다. 경구 또는 비경구 투하가 바람직하다.
본 발명에서 상기 "비경구"란, 피하, 피내, 정맥내, 근육내, 관절내, 활액낭내, 흉골내, 경막내, 병소내 및 두개골내 주사 또는 주입기술을 포함한다. 본 발명의 약학 조성물은 또한 직장 투여를 위한 좌제의 형태로 투여될 수 있다.
본 발명의 상기 약학 조성물은 사용된 특정 화합물의 활성, 연령, 체중, 일반적인 건강, 성별, 정식, 투여 시간, 투여 경로, 배출율, 약물 배합 및 예방 또는 치료될 특정 질환의 중증을 포함한 여러 요인에 따라 다양하게 변할 수 있고, 상기 약학 조성물의 투여량은 환자의 상태, 체중, 질병의 정도, 약무 형태, 투여 경로 및 기간에 따라 다르지만 당업자에 의해 적절하게 선택될 수 있고, 1일 0.0001 내지 50mg/kg 또는 0.001 내지 50mg/kg으로 투여할 수 있다. 투여는 하루에 한번 투여할 수도 있고, 수회 나누어 투여할 수도 있다. 상기 투여량은 어떠한 면으로든 본 발명의 범위를 한정하는 것은 아니다. 본 발명에 따른 의약 조성물은 환제, 당의정, 캡슐, 액제, 겔, 시럽, 슬러리, 현탁제로 제형화될 수 있다.
본 발명의 다른 구현 예에 따르면, 암을 예방 또는 치료하기 위하여, 목적하는 개체에 본 발명에서 제공하는 암 특이적 에피토프가 로딩된 항원 제시 세포; 및/또는 활성화된 T 세포를 투여하는 단계를 포함하는, 암의 예방 또는 치료 방법에 관한 것이다.
본 발명에서 상기 암은 엡스타인-바 바이러스(epstein barr virus; EBV) 양성 암으로, EBV 양성 위암, EBV 양성 자궁경부암, EBV 양성 버키트 림프종(Burkitt's lymphoma), EBV 양성 T 세포 림프종(T cell lymphomas), EBV 양성 유방암, EBV 양성 평활근육종(leiomyosarcomas), EBV 양성 평활근종양(smooth muscle tumors), EBV 양성 호지킨 림프종(Hodgkin lymphoma), EBV 양성 비인두암 또는 EBV 양성 이식후 림프세포증식 질환(PTLD)일 수 있으나, 바람직하게는 EBV 양성 위암일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 제공하는 암 특이적 에피토프가 로딩된 항원 제시 세포 또는 활성화된 T 세포의 투여량, 스케줄 및 투여 경로는 개체의 크기 및 조건에 따라, 그리고 표준 약제학적 관행에 따라 결정될 수 있다. 예시적인 투여 경로는 정맥내, 동맥내, 복강내, 폐내, 혈관내, 근육내, 기관내, 피하, 안내, 척수강내 또는 경피를 포함한다.
개체에 투여되는 세포의 용량은, 예를 들어, 투여되는 세포의 특정 유형, 투여 경로 및 치료되는 암의 특정 유형과 병기에 따라 달라질 수 있다. 상기 양은 심한 독성 또는 유해 사례없이, 암에 대한 치료 반응과 같은 원하는 반응을 가져오기 충분해야 한다. 일부 실시 형태에서, 투여될 활성화된 T 세포 또는 항원 제시 세포(예컨대 수지상 세포)의 양은 치료적 유효량이다. 일부 실시 형태에서, 세포 (예컨대 암 특이적 에피토프가 로딩된 수지상 세포 또는 활성화된 T 세포)의 양은 치료 전의 동일한 개체에서의 상응하는 종양 크기, 암 세포의 수 또는 종양 성장 속도와 비교하여, 또는 치료를 받지 않은 다른 개체에서의 상응하는 활성과 비교하여 적어도 약 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95% 또는 100% 중 어느 하나만큼 종양 크기를 감소시키거나, 암 세포의 수를 감소시키거나, 종양의 성장 속도를 감소시키기 충분한 양이다. 정제된 효소를 사용한 시험관내 검정, 세포 기반 검정, 동물 모델 또는 인체 실험과 같은 표준 방법을 사용하여 효과의 규모를 측정할 수 있다.
본 발명의 일 실시 형태에서, 본 발명의 암 특이적 에피토프가 로딩된 항원 제시 세포(예컨대 수지상 세포)는 1Х105~5Х105, 5Х105~1Х106, 1Х106~2×106, 2Х106~3Х106, 3Х106~4Х106, 4Х106~5Х106, 5Х106~6Х106, 6Х106~7Х106, 7Х106~8Х106, 8Х106~1Х108, 1Х106~3Х106, 3Х106~5Х106, 5Х106~7Х106, 2Х106~4Х106, 1Х106~5Х106 또는 5Х106~1Х107개 중 어느 하나의 세포/개체의 투여량으로 투여될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명의 다른 실시 형태에서, 본 발명의 암 특이적 에피토프가 로딩된 항원 제시 세포(예컨대 수지상 세포)는 1Х104~5Х104, 5Х104~1Х105, 1Х105~2Х105, 2Х105~4Х105, 4Х105~6Х105, 6Х105~8Х105, 8Х105~1Х106, 1Х106~2Х106, 2Х106~1Х107, 1Х104~1Х105, 1Х105~1Х106, 1Х106~1Х107, 1Х104~1Х106 또는 1Х105~1Х107개 중 어느 하나의 세포/㎏의 투여량으로 투여될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
또한, 본 발명의 일 실시 형태에서 본 발명의 활성화된 T 세포는 1Х108 내지 5Х108, 5Х108 내지 9Х108, 9Х108 내지 1Х109, 1Х109 내지 2Х109, 2Х109 내지 3Х109, 3Х109 내지 4Х109, 4Х109 내지 5Х109, 5Х109 내지 6Х109, 6Х109 내지 1Х1010, 1Х109 내지 3Х109, 3Х109 내지 5Х109, 5Х109 내지 7Х109, 7Х109 내지 1Х1010, 1Х109 내지 5Х109, 5Х109 내지 1Х1010, 3Х109 내지 7Х109, 1Х1010 내지 1.5Х1010, 1Х1010 내지 2Х1010 또는 1Х109 내지 1Х1010개 중 어느 하나의 세포/개체의 투여량으로 투여될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명의 다른 실시 형태에서, 본 발명의 활성화된 T 세포는 1Х107 내지 1 Х108, 1Х108 내지 2Х108, 2Х108 내지 4Х108, 4Х108 내지 6Х108, 6Х108 내지 8Х108, 8Х108 내지 1Х109, 1Х109 내지 2Х109, 2Х109 내지 4Х109, 4Х109 내지 1Х1010, 2Х108 내지 6Х108, 6Х108 내지 1Х109, 1Х108 내지 2Х108, 2Х108 내지 2Х109, 1Х107 내지 1Х108, 1Х108 내지 1Х109, 1Х109 내지 1Х1010 또는 1Х107 내지 1Х109개 중 어느 하나의 세포/㎏의 투여량으로 투여될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 암 특이적 에피토프가 로딩된 항원 제시 세포(예컨대 수지상 세포) 및/또는 활성화된 T 세포 투여 시 인간 알부민과 같은 안정화제 또는 부형제가 함께 사용될 수 있다.
본 발명에서 상기 암 특이적 에피토프가 로딩된 항원 제시 세포(예컨대 수지상 세포) 및/또는 활성화된 T 세포의 투여량 및 투여 스케줄은 투여하는 의사의 판단에 기초하여 치료 과정에 걸쳐 조정될 수 있다. 일부 실시 형태에서, 활성화된 T 세포는, 상기 암 특이적 에피토프가 로딩된 항원 제시 세포가 투여되고 약 1일, 2일, 3일, 4일, 5일, 6일, 7일, 8일, 9일, 10일, 11일, 12일, 13일, 14일, 15일, 16일, 17일, 18일, 19일, 20일, 21일 또는 1개월 후에 투여되거나, 상기 항원 제시 세포와 동시에 투여될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 암 특이적 에피토프가 로딩된 항원 제시 세포(예컨대 수지상 세포) 및/또는 활성화된 T 세포의 투여 시 단독으로 또는 다른 요법, 예컨대 수술, 방사선 치료, 유전자 치료, 면역치료, 골수 이식, 줄기세포 이식, 호르몬 요법, 표적 치료, 냉동요법, 초음파 치료, 광역동 치료, 화학요법 등과 함께 수행될 수 있다. 추가로, 증식성 질환이 발병할 위험이 더 큰 사람은 질환의 발병을 억제 및/또는 지연하기 위한 치료를 받을 수 있다.
본 발명에서 제공하는 엡스타인-바 바이러스(EBV) 양성 암 특이적 에피토프가 로딩된 항원 제시 세포, 즉 수지상 세포를 통해 상기 암 항원 특이적인 T 세포, 바람직하게는 메모리 T 세포의 분화 및 증식을 빠르고 효과적으로 유도할 수 있고, 이렇게 활성화된 메모리 T 세포는 암 세포의 방어 기작을 피해 엡스타인-바 바이러스(EBV) 양성 암 또는 종양성 상태를 치료하거나 암의 재발, 진행 또는 전이를 예방할 수 있다.
기존에 입양(adoptive) T 세포 치료에서 암환자 치료를 위하여 많은 수의 T 세포를 생산하기 위하여 3~6개월의 장시간이 소요되어 면역 세포 치료에서의 세포 생산공정에서의 큰 문제점이 있었다. 하지만, 본 발명에 의하는 경우 환자 치료에 사용해야 하는 109의 자가 메모리 T 세포를 3주 안에 생산할 수 있고, 비용절감 및 외부 오염원에 대한 감염 위험 요소들을 최소화할 수 있다. 따라서 본 발명에 의하는 경우 보다 많은 고형암 환자들에게 빠른 치료적 접근이 가능하여 말기 암 환자들에게도 적용이 가능한 기술이다.
도 1은 본 발명의 일 실시예에 따라 SNU719 세포주에 있어서 EBNA-1 유래 네오-에피토프의 T 세포 활성화 정도를 확인하기 위하여 각각의 네오-에피토프에 대한 ELISPOT을 실시한 결과를 나타낸 것이다.
도 2는 본 발명의 일 실시예에 따라 EBV가 감염된 MKN74 세포주에 있어서 EBNA-1 유래 네오-에피토프의 T 세포 활성화 정도를 확인하기 위하여 각각의 네오-에피토프에 대한 ELISPOT을 실시한 결과를 나타낸 것이다.
도 3은 본 발명의 일 실시예에 따라 SNU719 세포주에 있어서 LMP-2A 유래 네오-에피토프의 T 세포 활성화 정도를 확인하기 위하여 각각의 네오-에피토프에 대한 ELISPOT을 실시한 결과를 나타낸 것이다.
도 4는 본 발명의 일 실시예에 따라 EBV가 감염된 MKN74 세포주에 있어서 LMP-2A 유래 네오-에피토프의 T 세포 활성화 정도를 확인하기 위하여 각각의 네오-에피토프에 대한 ELISPOT을 실시한 결과를 나타낸 것이다.
도 5는 본 발명의 일 실시예에 따라 제작된 인간 유래 메모리 T 세포의 EBV 양성 위암 세포 항원의 표적 암세포 사멸 활성을 확인하기 위해 HLA 타입에 따른 SNU-719 세포주에서 EBNA-1 유래의 네오-에피토프 중 선정된 3개의 네오-에피토프에 대해 각각 Cr51 방출 분석법(Cr51 release assay)을 수행한 결과를 나타낸 것이다.
도 6은 본 발명의 일 실시예에 따라 제작된 인간 유래 메모리 T 세포의 EBV 양성 위암 세포 항원의 표적 암세포 사멸 활성을 확인하기 위해 HLA 타입에 따른 EBV가 감염된 MKN74 세포주에서 EBNA-1 유래의 네오-에피토프 중 선정된 3개의 네오-에피토프에 대해 각각 Cr51 방출 분석법(Cr51 release assay)을 수행한 결과를 나타낸 것이다.
도 7은 본 발명의 일 실시예에 따라 제작된 인간 유래 메모리 T 세포의 EBV 양성 위암 세포 항원의 표적 암 세포 사멸 활성을 확인하기 위하여 HLA 타입에 따른 SNU-719 세포주에서 LMP-2A 유래의 네오-에피토프 중 선정된 3개의 네오-에피토프에 대해 각각 Cr51 방출 분석법(Cr51 release assay)을 수행한 결과를 나타낸 것이다.
도 8은 본 발명의 일 실시예에 따라 제작된 인간 유래 메모리 T 세포의 EBV 양성 위암 세포 항원의 표적 암세포 사멸 활성을 확인하기 위해 HLA 타입에 따른 EBV가 감염된 MKN74 세포주에서 LMP-2A 유래의 네오-에피토프 중 선정된 3개의 네오-에피토프에 대해 각각 Cr51 방출 분석법(Cr51 release assay)을 수행한 결과를 나타낸 것이다.
도 9는 본 발명의 일 실시예에 따라 제작된 인간 유래 메모리 T 세포의 EBV 양성 위암 세포 항원 중 EBNA-1 유래 네오-에피토프의 암세포 특이성을 확인하기 위하여 EBV 음성 MKN74 세포주에서 선정된 3개의 3개의 네오-에피토프에 대해 각각 Cr51 방출 분석법(Cr51 release assay)을 수행한 결과를 나타낸 것이다.
도 10은 본 발명의 일 실시예에 따라 제작된 인간 유래 메모리 T 세포의 EBV 양성 위암 세포 항원 중 EBNA-1 유래 네오-에피토프의 암세포 특이성을 확인하기 위하여 EBV 음성 MKN74 세포주에서 선정된 3개의 3개의 네오-에피토프에 대해 각각 Cr51 방출 분석법(Cr51 release assay)을 수행한 결과를 나타낸 것이다.
도 11은 본 발명의 일 실시예에 따라 제작된 인간 유래 메모리 T 세포의 EBV 양성 위암 세포 항원 중 LMP-2A 유래 네오-에피토프의 암세포 특이성을 확인하기 위하여 EBV 음성 MKN74 세포주에서 선정된 3개의 3개의 네오-에피토프에 대해 각각 Cr51 방출 분석법(Cr51 release assay)을 수행한 결과를 나타낸 것이다.
도 12는 본 발명의 일 실시예에 따라 제작된 인간 유래 메모리 T 세포의 EBV 양성 위암 세포 항원 중 LMP-2A 유래 네오-에피토프의 암세포 특이성을 확인하기 위하여 EBV 음성 MKN74 세포주에서 선정된 3개의 3개의 네오-에피토프에 대해 각각 Cr51 방출 분석법(Cr51 release assay)을 수행한 결과를 나타낸 것이다.
도 13은 본 발명의 일 실시예에 따라 EBNA-1 유래 네오-에피토프의 생체 내(in vivo) 항암효과를 검증하기 위하여 BALB/c 누드 마우스 이종이식 동물 모델 (SNU-719)에서 네오-에피토프 특이적 세포독성 T 세포의 효과에 대한 실험 결과를 나타낸 것이다.
도 14는 본 발명의 일 실시예에 따라 EBNA-1 유래 네오-에피토프의 생체 내(in vivo) 항암효과를 검증하기 위하여 BALB/c 누드 마우스 이종이식 동물 모델 (EBV 감염 MKN74)에서 네오-에피토프 특이적 세포독성 T 세포의 효과에 대한 실험 결과를 나타낸 것이다.
도 15는 본 발명의 일 실시예에 따라 LMP-2A 유래 네오-에피토프의 생체 내(in vivo) 항암효과를 검증하기 위하여 BALB/c 누드 마우스 이종이식 동물 모델 (SNU-719)에서 네오-에피토프 특이적 세포독성 T 세포의 효과에 대한 실험 결과를 나타낸 것이다.
도 16은 본 발명의 일 실시예에 따라 LMP-2A 유래 네오-에피토프의 생체 내(in vivo) 항암효과를 검증하기 위하여 BALB/c 누드 마우스 이종이식 동물 모델 (EBV 감염 MKN74)에서 네오-에피토프 특이적 세포독성 T 세포의 효과에 대한 실험 결과를 나타낸 것이다.
이하, 실시예를 통하여 본 발명을 더욱 상세히 설명하고자 한다. 이들 실시예는 오로지 본 발명을 보다 구체적으로 설명하기 위한 것으로서, 본 발명의 요지에 따라 본 발명의 범위가 이들 실시예에 의해 제한되지 않는다는 것은 당업계에서 통상의 지식을 가진 자에게 있어서 자명할 것이다.
실시예
[실시예 1] EBV 양성 위암 세포에 특이적인 자가 메모리 T 세포의 제작 방법 및 임상적 적용
1. EBV 양성 위암 세포 항원 네오-에피토프의 선별
위암 세포에서 유전자 변이가 축적된 가장 주요한 시퀀스를 예측하며, 이 시퀀스가 T 세포의 HLA에 결합하는 에피토프를 예측하는 알고리즘은 바이오 인포매틱스 및 프로테오믹스를 이용하여 개발하였다. 네오-에피토프 예측 알고리즘으로는 NetMHC 및 NetCTLpan를 이용하였다. 이때, 한국인이 가장 많이 발현하고 있는 HLA 타입인 HLA-A*2402, HLA-A*A0201 및 HLA-A*3303을 포함한 여러 HLA 타입으로 HLA-A*1101, HLA-A*0206, HLA-A*3101와, HLA-B*5101, HLA-B*4403, HLA-B*5401, HLA-B*5801, HLA-B*3501과 결합 친화도가 높을 것으로 예상되는 펩타이드 시퀀스를 발굴하였다. 이를 위해서, 현재 존재하는 EBV+ 위암 세포주의 HLA 타이핑(typing)을 통해 각 세포주의 HLA 타입을 조사하며, EBV 바이러스에 의해 EBV+ 위암 세포에만 존재하고 악성 종양을 유발하는 대표적 단백질인 LMP-2A와 EBNA-1 단백질에 대하여 NetMHC 프로그램을 통해 각 HLA 타입과 결합 친화도가 높은 네오-에피토프를 예측하여 발굴하였다. 그 결과는 각각 표 1 및 2로 나타내었다.
LMP-2A 단백질에 대한 네오-에피토프
#ID SEQ(9mer) HLA-A*24:02 HLA-A*02:01 HLA-A*33:03 HLA-A*11:01 HLA-A*02:06 HLA-A*31:01 HLA-B*51:01 HLA-B*15:01 HLA-B*44:03 HLA-B*54:01 HLA-B*58:01 HLA-B*35:01
LMP2A_SNU-719_1 MGSLEMVPM
(서열번호 1)		 27371.8 11991.5 19548.9 21044.7 2968.1 20300.8 19068 1393.9 31463.2 20902.1 2627.5 164.2
LMP2A_SNU-719_119 SMNPVCLPV(서열번호 2) 9889.5 9.9 6933.4 4394.9 14.9 1649.6 18869.2 443.8 11789.2 12880.3 9730 9998.1
LMP2A_SNU-719_121 NPVCLPVIV(서열번호 3) 40322.3 27033.9 31415.9 38783.6 19110.2 38909.2 1717.4 34671.7 29524.1 241.1 30432.6 868.3
LMP2A_SNU-719_124 CLPVIVAPY(서열번호 4) 13941.3 10007.3 11545.2 4017.4 5530.2 10510.1 32273.1 161.2 17839.2 29638.7 17168.1 1118.9
LMP2A_SNU-719_125 LPVIVAPYL(서열번호 5) 29593.2 19280.3 23285.5 37445.1 8770.7 30098.9 456.5 22503.1 30741.7 337.4 11162.4 39
LMP2A_SNU-719_127 VIVAPYLFW(서열번호 6) 3787.8 21911.8 24575.2 10829.4 13529.2 16840.6 23369.9 7172.4 14029.8 36881.8 81 14816.8
LMP2A_SNU-719_128 IVAPYLFWL(서열번호 7) 2732.2 10.1 5448.5 8930.6 6.7 2015.8 14093.9 7650 29346.4 18362.2 817.2 9877.3
LMP2A_SNU-719_129 VAPYLFWLA(서열번호 8) 6485.2 2405.6 10912 20624.5 159.1 10250.1 21984.5 20546.3 34583.3 6597 10554.1 13623
LMP2A_SNU-719_130 APYLFWLAA(서열번호 9) 39372.1 14186.6 22554 23424.5 5249.7 20785.8 9931.9 20808.5 14633.9 25.3 33807.9 1458.6
LMP2A_SNU-719_131 PYLFWLAAI(서열번호 10) 45.8 20451.8 20179 37721.6 12845 12993.1 32690.2 33027.6 35911.5 39974.3 31558.3 38018.7
LMP2A_SNU-719_132 YLFWLAAIA(서열번호 11) 36946.9 22.5 13714.8 22720.8 67.5 15292.2 26173.6 3914.4 28938.1 5371.4 30695.2 11886.3
LMP2A_SNU-719_136 LAAIAASCF(서열번호 12) 11127 28133.2 32080.5 26643.1 12921.5 32823.8 7996.6 63.4 14661.8 18015.7 159.8 23.8
LMP2A_SNU-719_138 AIAASCFTA(서열번호 13) 30319.9 200.5 24584.2 6731.1 71.3 12568.3 37957.8 6013.5 31247.4 14492.5 17396.7 21943.8
LMP2A_SNU-719_140 AASCFTASV(서열번호 14) 25117.4 224.6 17740.8 12369.6 32.8 11110 9860.7 3306.5 10812.2 5602.1 3334.9 7527.4
LMP2A_SNU-719_144 FTASVSTVV(서열번호 15) 19464.9 88.6 13762.4 20136.1 14.6 19810.8 5884.4 1074.2 32054.2 1077.5 1464.4 1864.9
LMP2A_SNU-719_146 ASVSTVVTA(서열번호 16) 37052.1 5560.8 32852.6 8850.6 424.7 18831.4 32015 3547.8 26008.7 9458.8 3367.2 18947.7
LMP2A_SNU-719_153 TATGLALSL(서열번호 17) 28638.1 14742.6 31449.6 28040.2 4055.3 34638 12835.5 9454.7 26436.6 21854.8 1695.6 404.4
LMP2A_SNU-719_156 GLALSLLLL(서열번호 18) 18374.7 83 33237 18495.4 254.8 19863.2 38515.9 4023.7 31753.5 41085.5 15854.4 36429.6
LMP2A_SNU-719_157 LALSLLLLA(서열번호 19) 35190.6 817.2 21235.6 14830.1 83.6 15856.8 9880.7 9979.6 25269 909.2 2060 6184.2
LMP2A_SNU-719_158 ALSLLLLAA(서열번호 20) 40341.5 157.1 31542.6 14530.5 190 17991.5 41561.2 6626.9 26400.6 22040.9 30091.4 31931.3
LMP2A_SNU-719_159 LSLLLLAAV(서열번호 21) 25009.2 295.1 14717.7 21696.2 30.5 9125.3 7137.4 4766.5 30342.5 3013.5 2491.7 14007.7
LMP2A_SNU-719_160 SLLLLAAVA(서열번호 22) 38650.3 362.5 30858 23970.9 591.4 22057.6 35597.7 6048.7 26564.8 16328.5 32493.8 27442.7
LMP2A_SNU-719_162 LLLAAVASS(서열번호 23) 39044.6 402.5 31171.1 21818.6 315.9 23555.9 34547.8 3633.5 37258.4 16083.4 27538.7 18507
LMP2A_SNU-719_163 LLAAVASSY(서열번호 24) 26232.6 11237.2 17769.4 1693.5 8474.3 15035 23097.6 9.1 9592.6 23151.9 2410.6 43
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LMP2A_SNU-719_166 AVASSYAAA(서열번호 26) 39351.2 1556.8 21477.3 6403.6 124.8 14250.3 36692.7 1626.1 28170.4 6365.9 23419.2 10828.7
LMP2A_SNU-719_168 ASSYAAAQR(서열번호 27) 40984.7 33783 367.6 173.6 25710.5 76.6 45002.3 24905.2 34733.7 39245.8 16532.8 34429.5
LMP2A_SNU-719_169 SSYAAAQRK(서열번호 28) 36886.5 31558.3 5931.4 14.5 20818 930.3 35890.1 17324.8 25977.8 33151.5 7653 29593.5
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LMP2A_SNU-719_184 VLTAVVTFF(서열번호 34) 1880 1724.7 18858.8 13899.4 1269.2 11444.8 28882.1 119.1 16654.5 35748.6 1881.7 4251.7
LMP2A_SNU-719_185 LTAVVTFFA(서열번호 35) 28599.4 522 4795.8 3078.1 92.6 3678 26352.3 14096.2 34361.4 2279.9 2239.6 11683.7
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LMP2A_SNU-719_219 LQGIYVLVM(서열번호 45) 21973.1 8022.8 37703.6 30905.4 2345.8 29019 28065.4 128 14998.1 33933.9 18243.6 8771
LMP2A_SNU-719_221 GIYVLVMLV(서열번호 46) 36065.3 151.8 21377.9 13972.3 448.8 8123.9 35575.8 16510.1 32974.8 28738.1 24709.3 42830.8
LMP2A_SNU-719_223 YVLVMLVLL(서열번호 47) 17490.5 293.6 15156 27530.7 153.6 11887.4 25310.5 10525.9 35050.4 21845.1 9208.3 13460.3
LMP2A_SNU-719_226 VMLVLLILA(서열번호 48) 35525.8 444.6 24613.5 18421.9 674.5 10636.3 38789 14580.5 34150.1 26232 28571.3 36984.1
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LMP2A_SNU-719_443 MTNTLLSAW(서열번호 138) 7290.9 20237.4 12898.6 10001.4 8034.8 12238.2 12564 770.3 3529.2 16440 4.4 383.6
LMP2A_SNU-719_446 TLLSAWILT(서열번호 139) 30273 396.9 21252 15570.9 352.7 14095.9 41198.1 22402.5 35064.1 28311.3 32570.2 33655.3
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LMP2A_SNU-719_457 FLIFLIGFA(서열번호 145) 42365.3 42.7 13437.3 25165.8 52 16269.2 37931.1 9963.8 38572.6 13793.5 39126.6 29860.5
LMP2A_SNU-719_459 IFLIGFALF(서열번호 146) 43.6 17773.3 13570.3 28036.3 10285.2 10021.4 27325.6 5467.1 19946.5 32621 14748.5 7339.5
LMP2A_SNU-719_460 FLIGFALFG(서열번호 147) 36214.7 277.8 25993.6 27631.3 461.1 25977.5 36790.5 11054.1 32861.9 25757.5 25267.6 26034.4
LMP2A_SNU-719_461 LIGFALFGV(서열번호 148) 24962.4 20.3 11149.9 18296.8 16.6 6672.9 30790.6 17419.9 38901.6 20134.8 18600.8 33095.9
LMP2A_SNU-719_463 GFALFGVIR(서열번호 149) 35328.8 33229.1 582.4 8108.8 32269.6 210 48129.4 37637.2 36865.8 42648.6 44000.4 40388.2
LMP2A_SNU-719_466 LFGVIRCCR(서열번호 150) 28785.7 34993.2 78.8 12351.4 33974.7 38.3 46970.9 39068.3 42482.3 39408.7 43194.2 37968.9
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EBNA-1 단백질에 대한 네오-에피토프
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EBNA-1_SNU-719_277 RGRGGSGGR
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EBNA-1_SNU-719_285 RGRGGSGGR(서열번호 153) 45316.5 39680 4373 18740.2 34826.3 289.3 47765.8 29769.2 45986.8 44280.7 39982.1 43547.6
EBNA-1_SNU-719_293 RGRGGSGGR(서열번호 154) 45316.5 39680 4373 18740.2 34826.3 289.3 47765.8 29769.2 45986.8 44280.7 39982.1 43547.6
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EBNA-1_SNU-719_454 GVFVYGGSK(서열번호 169) 44626.5 27517.3 9143.4 81.9 20473.5 1986.2 41747.3 17980.8 36473 31707.9 30633.8 30968.7
EBNA-1_SNU-719_462 KTSLYNLRR(서열번호 170) 34794.6 26595.5 446.4 53.6 20319.7 18.8 45634.8 29342.9 38073.8 40031.5 13160.8 39576.3
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EBNA-1_SNU-719_514 LQTHIFAEV(서열번호 180) 17941 61.6 16078.5 25417.3 9.8 12729.3 17980.6 1123 14996.1 11684.8 17726.8 17732.5
EBNA-1_SNU-719_526 AIKDLVMTK(서열번호 181) 39676.1 22195.5 2666.4 29.4 14992.6 322.1 44286.5 16408 35567.3 36968.8 30457 32160.8
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EBNA-1_SNU-719_544 TVCSFDDGV(서열번호 183) 40262.6 2096.8 22454.7 24077.5 380.9 24941.6 34793.9 28022.7 35086.1 24905.8 21011.9 27572.1
EBNA-1_SNU-719_558 FPPMVEGAA(서열번호 184) 43694.8 29057.6 36446.2 42153.1 18949.4 43126.1 7576.1 30308.4 45375.9 48.7 39527.1 418.3
상기 표 1 및 2에서 보는 바와 같이, 인 실리코(in silico) 예측을 통해 HLA-A*2402, HLA-A*A0201, HLA-A*3303, HLA-A*1101, HLA-A*0206, HLA-A*3101, HLA-B*5101, HLA-B*4403, HLA-B*5401, HLA-B*5801 또는 HLA-B*3501에 대해 높은 결합 친화도를 갖는 네오-에피토프의 발굴하고, 각 HLA와 결합 친화도를 IC50(nM) 값을 통해 예측하였다. 실제 인간의 위암 세포에 존재하며, 체내에 있는 T 세포에 의해 인지될 수 있는 시퀀스를 상기 HLA와의 결합 친화도에 기반하여 선별하였다. 표 1에서 보는 바와 같이, LMP-2A에 대한 네오-에피토프는 HLA-A*2402에 대한 결합 친화도가 높은 순서대로 TYGPVFMCL (IC50=43.1 nM), LLWTLVVLL (IC50=22368.6 nM), LTEWGSGNR (IC50=45205.3 nM)을 선정하였고, HLA-A*3101에 대한 네오-에피토프는 LAYRRRWRR (IC50=5.2 nM), LTVMTNTLL (IC50=14004.8 nM), YPSASGSYG (IC50=42032 nM)를 선정하였다. 또한, 표 2에서 보는 바와 같이 EBNA-1에 대한 네오-에피토프는 HLA-A*2402에 대한 결합 친화도가 높은 순서대로 MVFLQTHIF (IC50=773.1 nM), AIKDLVMTK (IC50=39676.1 nM), GSRERARGR (IC50=47184.8 nM)을 선정하였고, HLA-A*3101에 대한 네오-에피토프는 KTSLYNLRR (IC50=18.8 nM), RGRGGSGGR (IC50=289.3 nM), FPPMVEGAA (IC50=43126.1 nM)을 선정하였다. 이하의 실험을 위해서 상기와 같이 선별한 네오-에피토프를 펩타이드(eptide)로 합성하였다.
2. 선별된 네오-에피토프가 로딩된 수지상 세포로 활성화된 T 세포의 ELISPOT 결과
건강한 인간의 혈액으로부터 추출한 PBMC를 유세포 분석기를 통해 단핵구(monocyte)와 백혈구(leukocyte)로 분리하여 단핵구는 수지상 세포로 분화시키기 위해 GM-CSF와 IL-4 사이토카인을 배양액에 넣어 2일간 배양하였다. 또한, 백혈구의 경우 항-CD3/CD28 항체와 함께 3일간 배양하며, 이후 IL-2 사이토카인을 함께 넣은 배양액에서 배양하였다. 수지상 세포로 분화된 단핵구에 상기와 같이 선별한 네오-에피토프 펩타이드를 전기충격 유전자 전달법 (electrophoration)을 이용하여 수지상 세포에 전달한다. 이 후 2일간 배양하여 수지상 세포의 표면에서 상기 네오-에피토프가 발현되는 것을 확인한 뒤 항 CD3/CD28 항체가 포함된 배양액에서 배양하고 있는 백혈구와 함께 1:20 (수지상 세포: 백혈구)의 비율로 공동 배양한다. 공동 배양 시 배양액에는 수지상 세포의 항원 제시 기능 효능을 증가시키는 사이토카인인 IL-4와 T 세포의 메모리 세포로의 전환을 도와주는 기능을 하는 사이토카인인 IL-2와 IL-7을 함께 넣은 사이토카인 칵테일을 섞어서 배양하였다. 16시간 후 이렇게 활성화된 T 세포의 IFN-γ의 발현 정도를 ELISPOT으로 측정하여 도 1 내지 4에 나타내었다. 단, 상기 실험에 사용된 음성 대조군 펩타이드는 EBNA-1과 LMP-2A에서 NetMHC를 통해 추출되지 않은 임의의 EBNA-1, LMP-2A 단백질의 아미노산 서열 9mer(서열: GGSRERARG)를 채용하였다.
그 결과, 본 발명의 네오-에피토프 펩타이드가 로딩된 수지상 세포와 함께 배양된 T 세포에서 상기 펩타이드의 HLA에 대한 결합 친화도와 상관없이 대조군에 비하여 월등하게 IFNr를 분비하는 것을 확인할 수 있었다.
이를 통하여 본 발명에서 상기 표 1 및 2에서 각 세포주의 HLA-A 유형에 의해 선정된 네오-에피토프가 로딩된 수지상 세포에 의해 세포 독성 T 림프구(Cytotoxic T lymphocytes, CTLs)를 활성화시킬 수 있고, 이렇게 활성화된 T 세포는 신항원인 네오-에피토프를 인지할 수 있는 항원 특이성을 지님을 알 수 있었다.
3. 선별된 네오-에피토프가 로딩된 수지상 세포로 활성화된 T 세포의 암 세포 용혈 효과
상기 2.에서와 같이 72시간 동안 공동 배양한 뒤 수지상 세포를 통해 항원이 제시된 메모리 T 세포를 골라내기 위해 IFNr 사이토카인을 분비하는 T 세포를 추출할 수 있는 자석을 이용한 세포 추출기 (MACS)를 이용하여 EBV 항원 특이적 메모리 T 세포를 추출하였다. 추출된 메모리 T 세포는 메모리 기능을 유지하고, 세포의 수를 늘리기 위해 IL-2, IL-7, IL-15 사이토카인이 혼합된 배양액에서 배양하여 마우스에 주입 가능한 세포 수에 도달할 때까지 배양하였다.
이처럼 활성화된 T 세포를 EBV 양성 위암 세포인 SNU-719 세포주와, EBV 감염 MKN74 세포주와 공동 배양(co-culture) 시켜 암 세포의 용혈(lysis) 여부를 Cr51 방출 분석법(release assay)으로 확인하여 그 결과를 도 5 내지 8에 나타내고, EBV 음성 위암 세포인 MKN-74 세포주와 공동 배양(co-culture) 시켜 암 세포의 용혈(lysis) 여부를 Cr51 방출 분석법(release assay)으로 확인하여 그 결과를 도 9 내지 12에 나타내었다. 단, 상기 실험에 사용된 음성 대조군 펩타이드는 EBNA-1과 LMP-2A에서 NetMHC를 통해 추출되지 않은 임의의 EBNA-1, LMP-2A 단백질의 아미노산 서열 9mer(서열: GGSRERARG)를 채용하였다.
그 결과, 본 발명에 따른 네오-에피토프로 활성화된 T 세포는 EBV 양성 위암 세포의 용혈능이 우수한 반면, EBV 음성 위암 세포에 대한 용혈능은 미미한 것을 확인할 수 있었다. 즉, 본 발명에 따른 EBV 암 특이적 항원 네오-에피토프가 로딩된 수지상 세포로 활성화된 T 세포는 EBV 양성 암 세포를 특이적으로 용혈시키는 것을 알 수 있다.
또한, 본 발명의 네오-에피토프로 활성화된 T 세포는 특히 EBV 양성 위암 세포와의 공동 배양 시 혼합 농도 의존적으로 상기 용혈능이 증가하는 경향을 보였으며, 각 HLA 타입에 따른 네오-에피토프 중에서도 특히 HLA와의 결합 친화도가 높을수록 EBV 양성 위암 세포주에 대한 용혈능이 증가하는 것을 확인할 수 있었다.
4. 선별된 네오-에피토프가 로딩된 수지상 세포로 활성화된 T 세포의 생체 내(in vivo)에서 항암 효과 확인
BALB/c 누드 마우스의 옆구리에 EBV 양성 위암 세포주인 SNU-719(HLA type: HLA-A*2402) 또는 EBV 감염 MKN74(HLA type: HLA-A*3101)를 1x107 세포의 양으로 매트리젤과 혼합하여 이식하여 이종이식 동물 모델을 제작하고, 4주 경과하여 암 조직이 관찰되면 상기 2.에서 활성화된 T 세포를 1x107 세포의 양으로 1주에 1회씩 종양 내(intratumoral) 주입한 뒤 암 조직의 크기를 측정하여 도 13 내지 16에 나타내었다. 단, 상기 실험에 사용된 음성 대조군 펩타이드는 EBNA-1과 LMP-2A에서 NetMHC를 통해 추출되지 않은 임의의 EBNA-1, LMP-2A 단백질의 아미노산 서열 9mer(서열: GGSRERARG)를 채용하였다.
그 결과, 본 발명에 따른 네오-에피토프로 활성화된 T 세포를 처리한 경우 대조군 대비 EBV 양성 위암의 크기가 현저히 감소한 것을 확인할 수 있었고, 각 HLA 타입에 따른 네오-에피토프 중에서도 특히 HLA와의 결합 친화도가 높을수록 위암의 크기 감소율이 높은 것을 확인할 수 있었다.
상기와 같이 각 세포주의 HLA-A 유형에 의해 선정된 네오-에피토프는 모두 T 세포의 활성 향상 효과가 뛰어나며, 바이오인포매틱스(bioinformatics)에 의한 결합 친화도가 증가할수록(즉, IC50 값이 낮아질수록) 상기 T 세포의 활성 향상 및 표적 암세포 사멸에 대한 활성도가 증가하는 것을 확인할 수 있었다. 이를 통하여 표 1 및 2에 나타낸 네오-에피토프를 수지상 세포를 이용하여 T 세포의 활성을 향상시킬 수 있으며 이를 통해 표적 암의 치료 효과 또한 뛰어날 것임을 용이하게 예측할 수 있다.
이상으로 본 발명의 특정한 부분을 상세히 기술하였는 바, 당업계의 통상의 지식을 가진 자에게 있어서 이러한 구체적인 기술은 단지 바람직한 구현예일 뿐이며, 이에 본 발명의 범위가 제한되는 것이 아닌 점은 명백하다. 따라서, 본 발명의 실질적인 범위는 첨부된 청구항과 그의 등가물에 의하여 정의된다고 할 것이다.
<110> Good T Cells, Inc. <120> Method for activating T cells to treat cancer <130> DPB173500k01 <150> KR 10-2017-0101800 <151> 2017-08-10 <160> 184 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 1 Met Gly Ser Leu Glu Met Val Pro Met 1 5 <210> 2 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 2 Ser Met Asn Pro Val Cys Leu Pro Val 1 5 <210> 3 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 3 Asn Pro Val Cys Leu Pro Val Ile Val 1 5 <210> 4 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 4 Cys Leu Pro Val Ile Val Ala Pro Tyr 1 5 <210> 5 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 5 Leu Pro Val Ile Val Ala Pro Tyr Leu 1 5 <210> 6 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 6 Val Ile Val Ala Pro Tyr Leu Phe Trp 1 5 <210> 7 <211> 9 <212> PRT <213> 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Thr Leu Ala Ala Ala Leu Ala Leu Leu 1 5 <210> 82 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 82 Leu Ala Ala Ala Leu Ala Leu Leu Ala 1 5 <210> 83 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 83 Ala Ala Leu Ala Leu Leu Ala Ser Leu 1 5 <210> 84 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 84 Ala Leu Ala Leu Leu Ala Ser Leu Ile 1 5 <210> 85 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 85 Leu Ala Leu Leu Ala Ser Leu Ile Leu 1 5 <210> 86 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 86 Tyr Pro Ser Ala Ser Gly Ser Tyr Gly 1 5 <210> 87 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 87 Leu Leu Ala Ser Leu Ile Leu Gly Thr 1 5 <210> 88 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 88 Ser Leu Ile Leu Gly Thr Leu Asn Leu 1 5 <210> 89 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 89 Leu Ile Leu Gly Thr Leu Asn Leu Thr 1 5 <210> 90 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 90 Gly Thr Leu Asn Leu Thr Thr Met Phe 1 5 <210> 91 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 91 Thr Leu Asn Leu Thr Thr Met Phe Leu 1 5 <210> 92 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 92 Asn Leu Thr Thr Met Phe Leu Leu Met 1 5 <210> 93 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 93 Thr Thr Met Phe Leu Leu Met Leu Leu 1 5 <210> 94 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 94 Thr Met Phe Leu Leu Met Leu Leu Trp 1 5 <210> 95 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 95 Phe Leu Leu Met Leu Leu Trp Thr Leu 1 5 <210> 96 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 96 Leu Leu Met Leu Leu Trp Thr Leu Val 1 5 <210> 97 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 97 Leu Met Leu Leu Trp Thr Leu Val Val 1 5 <210> 98 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 98 Met Leu Leu Trp Thr Leu Val Val Leu 1 5 <210> 99 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 99 Leu Leu Trp Thr Leu Val Val Leu Leu 1 5 <210> 100 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 100 Cys Pro Leu Thr Lys Ile Leu Leu Ala 1 5 <210> 101 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 101 Ile Leu Leu Ala Arg Leu Phe Leu Tyr 1 5 <210> 102 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 102 Leu Leu Ala Arg Leu Phe Leu Tyr Ala 1 5 <210> 103 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 103 Arg Leu Phe Leu Tyr Ala Leu Ala Leu 1 5 <210> 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<220> <223> Artificial sequence <400> 111 Ala Leu Ile Ala Gly Gly Ser Ile Leu 1 5 <210> 112 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 112 Gly Ser Ile Leu Gln Thr Asn Phe Lys 1 5 <210> 113 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 113 Lys Ser Leu Ser Ser Thr Glu Phe Ile 1 5 <210> 114 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 114 Ser Ser Thr Glu Phe Ile Pro Asn Leu 1 5 <210> 115 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 115 Phe Ile Pro Asn Leu Phe Cys Met Leu 1 5 <210> 116 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 116 Ile Pro Asn Leu Phe Cys Met Leu Leu 1 5 <210> 117 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 117 Asn Leu Phe Cys Met Leu Leu Leu Ile 1 5 <210> 118 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 118 Met Leu Leu Leu Ile Val Ala Gly Ile 1 5 <210> 119 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 119 Leu Leu Ile Val Ala Gly Ile Leu Phe 1 5 <210> 120 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 120 Leu Ile Val Ala Gly Ile Leu Phe Ile 1 5 <210> 121 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 121 Ile Val Ala Gly Ile Leu Phe Ile Leu 1 5 <210> 122 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 122 Phe Ile Leu Ala Ile Leu Thr Glu Trp 1 5 <210> 123 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 123 Leu Thr Glu Trp Gly Ser Gly Asn Arg 1 5 <210> 124 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 124 Arg Thr Tyr Gly Pro Val Phe Met Cys 1 5 <210> 125 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 125 Thr Tyr Gly Pro Val Phe Met Cys Leu 1 5 <210> 126 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<220> <223> Artificial sequence <400> 133 Met Val Ala Gly Ala Val Trp Leu Thr 1 5 <210> 134 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 134 Val Ala Gly Ala Val Trp Leu Thr Val 1 5 <210> 135 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 135 Trp Leu Thr Val Met Thr Asn Thr Leu 1 5 <210> 136 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 136 Leu Thr Val Met Thr Asn Thr Leu Leu 1 5 <210> 137 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 137 Val Met Thr Asn Thr Leu Leu Ser Ala 1 5 <210> 138 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 138 Met Thr Asn Thr Leu Leu Ser Ala Trp 1 5 <210> 139 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 139 Thr Leu Leu Ser Ala Trp Ile Leu Thr 1 5 <210> 140 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 140 Leu Leu Ser Ala Trp Ile Leu Thr Ala 1 5 <210> 141 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 141 Ser Ala Trp Ile Leu Thr Ala Gly Phe 1 5 <210> 142 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 142 Trp Ile Leu Thr Ala Gly Phe Leu Ile 1 5 <210> 143 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 143 Ile Leu Thr Ala Gly Phe Leu Ile Phe 1 5 <210> 144 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 144 Leu Thr Ala Gly Phe Leu Ile Phe Leu 1 5 <210> 145 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 145 Phe Leu Ile Phe Leu Ile Gly Phe Ala 1 5 <210> 146 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 146 Ile Phe Leu Ile Gly Phe Ala Leu Phe 1 5 <210> 147 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 147 Phe Leu Ile Gly Phe Ala Leu Phe Gly 1 5 <210> 148 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 148 Leu Ile Gly Phe Ala Leu Phe Gly Val 1 5 <210> 149 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 149 Gly Phe Ala Leu Phe Gly Val Ile Arg 1 5 <210> 150 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 150 Leu Phe Gly Val Ile Arg Cys Cys Arg 1 5 <210> 151 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 151 Val Pro Met Gly Ala Gly Pro Pro Ser 1 5 <210> 152 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 152 Arg Gly Arg Gly Gly Ser Gly Gly Arg 1 5 <210> 153 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 153 Arg Gly Arg Gly Gly Ser Gly Gly Arg 1 5 <210> 154 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 154 Arg Gly Arg Gly Gly Ser Gly Gly Arg 1 5 <210> 155 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 155 Arg Gly Arg Gly Arg Glu Arg Ala Arg 1 5 <210> 156 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 156 Arg Ala Arg Gly Gly Ser Arg Glu Arg 1 5 <210> 157 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 157 Gly Ser Arg Glu Arg Ala Arg Gly Arg 1 5 <210> 158 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 158 Arg Ala Arg Gly Arg Gly Arg Gly Arg 1 5 <210> 159 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 159 Arg Gly Arg Gly Arg Gly Glu Lys Arg 1 5 <210> 160 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 160 Arg Gly Arg Gly Glu Lys Arg Pro Arg 1 5 <210> 161 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 161 Ser Ser Ser Ser Gly Ser Pro Pro Arg 1 5 <210> 162 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 162 His Pro Val Gly Asp Ala Asp Tyr Phe 1 5 <210> 163 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 163 Lys Gly Gly Trp Phe Gly Lys His Arg 1 5 <210> 164 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 164 Arg Gly Arg Gly Arg Gly Arg Gly Arg 1 5 <210> 165 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 165 Glu Gly Leu Arg Val Leu Leu Ala Arg 1 5 <210> 166 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 166 Arg Val Leu Leu Ala Arg Ser His Val 1 5 <210> 167 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 167 Leu Leu Ala Arg Ser His Val Glu Arg 1 5 <210> 168 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 168 Arg Gly Arg Gly Arg Gly Gly Gly Arg 1 5 <210> 169 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 169 Gly Val Phe Val Tyr Gly Gly Ser Lys 1 5 <210> 170 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 170 Lys Thr Ser Leu Tyr Asn Leu Arg Arg 1 5 <210> 171 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 171 Ile Ala Leu Ala Val Pro Gln Cys Arg 1 5 <210> 172 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 172 Ile Thr Pro Leu Ser Arg Leu Pro Phe 1 5 <210> 173 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 173 Arg Glu Ser Ile Val Cys Tyr Phe Met 1 5 <210> 174 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 174 Glu Ser Ile Val Cys Tyr Phe Met Val 1 5 <210> 175 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 175 Ser Ile Val Cys Tyr Phe Met Val Phe 1 5 <210> 176 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 176 Ile Val Cys Tyr Phe Met Val Phe Leu 1 5 <210> 177 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 177 Phe Met Val Phe Leu Gln Thr His Ile 1 5 <210> 178 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 178 Met Val Phe Leu Gln Thr His Ile Phe 1 5 <210> 179 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 179 Phe Leu Gln Thr His Ile Phe Ala Glu 1 5 <210> 180 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 180 Leu Gln Thr His Ile Phe Ala Glu Val 1 5 <210> 181 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 181 Ala Ile Lys Asp Leu Val Met Thr Lys 1 5 <210> 182 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 182 Asn Ile Lys Val Thr Val Cys Ser Phe 1 5 <210> 183 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 183 Thr Val Cys Ser Phe Asp Asp Gly Val 1 5 <210> 184 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Artificial sequence <400> 184 Phe Pro Pro Met Val Glu Gly Ala Ala 1 5

Claims (36)

  1. 서열번호 1 내지 184 중 어느 하나로 표시되는 암 특이적 네오-에피토프(neo-epitope).
  2. 제1항에 있어서,
    상기 암 특이적 네오-에피토프는 HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-E, HLA-F, HLA-G, β2-마이크로글로불린, HLA-DPA1, HLA-DPB1, HLA-DQA1, HLA-DQB1, HLA-DRA1, HLA-DRB1, HLA-DRB3, HLA-DRB4, HLA-DRB5, HLA-DM, HLA-DOA 및 HLA-DOB 유전자좌 중 적어도 하나와 결합 친화도(binding affinity)를 나타내는 것인, 암 특이적 네오-에피토프(neo-epitope).
  3. 제1항에 있어서,
    상기 암 특이적 네오-에피토프는 HLA-A*2402, HLA-A*A0201, HLA-A*3303, HLA-A*1101, HLA-A*0206, HLA-A*3101, HLA-B*5101, HLA-B*4403, HLA-B*5401, HLA-B*5801 및 HLA-B*3501 중 적어도 하나와 결합 친화도(binding affinity)를 나타내는 것인, 암 특이적 네오-에피토프(neo-epitope).
  4. 제1항에 있어서,
    상기 암은 엡스타인-바 바이러스(epstein barr virus; EBV) 양성 암인, 암 특이적 네오-에피토프(neo-epitope).
  5. 제4항에 있어서,
    상기 암은 EBV 양성 위암, EBV 양성 자궁경부암, EBV 양성 버키트 림프종(Burkitt's lymphoma), EBV 양성 T 세포 림프종(T cell lymphomas), EBV 양성 유방암, EBV 양성 평활근육종(leiomyosarcomas), EBV 양성 평활근종양(smooth muscle tumors), EBV 양성 호지킨 림프종(Hodgkin lymphoma), EBV 양성 비인두암 또는 EBV 양성 이식후 림프세포증식 질환(PTLD)인, 암 특이적 네오-에피토프(neo-epitope).
  6. 제1항 내지 제5항 중 어느 한 항의 암 특이적 네오-에피토프(neo-epitope)를 코딩하는 핵산 분자.
  7. 제6항의 핵산 분자가 삽입된 발현 벡터.
  8. 제7항의 발현 벡터가 형질 감염된 숙주 세포.
  9. 서열번호 1 내지 184 중 어느 하나로 표시되는 암 특이적 네오-에피토프(neo-epitope)를 포함하는, T 세포의 활성화용 조성물.
  10. 제9항에 있어서,
    상기 T 세포는 암의 예방 또는 치료를 위한 것인, T 세포의 활성화용 조성물.
  11. 제9항에 있어서,
    상기 T 세포는 세포독성 T 세포, 보조 T 세포, 자연 살해 T 세포, γδ T 세포, 조절 T 세포 및 메모리 T 세포로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함하는, T 세포의 활성화용 조성물.
  12. 서열번호 1 내지 184 중 어느 하나로 표시되는 암 특이적 네오-에피토프(neo-epitope)가 로딩(loading)된 항원 제시 세포.
  13. 제12항에 있어서,
    상기 항원 제시 세포는 수지상 세포, B 세포 및 대식 세포 중 1종 이상을 포함하는, 항원 제시 세포.
  14. 제13항에 있어서,
    상기 항원 제시 세포는 T 세포의 증식 또는 분화를 촉진하는, 항원 제시 세포.
  15. 서열번호 1 내지 184 중 어느 하나로 표시되는 암 특이적 네오-에피토프(neo-epitope); 및 수지상 세포 특이적 항체 또는 그 단편을 포함하는 융합 단백질.
  16. 제15항에 있어서,
    상기 수지상 세포 특이적 항체는 수지상 세포의 DCIR, MHC 클래스 I, MHC 클래스 II, CD1, CD2, CD3, CD4, CD8, CD11b, CD14, CD15, CD16, CD19, CD20, CD29, CD31, CD40, CD43, CD44, CD45, CD54, CD56, CD57, CD58, CD83, CD86, CMRF-44, CMRF-56, DCIR, DC-ASPGR, CLEC-6, CD40, BDCA-2, MARCO, DEC-205, Clec9A, 33D1, 만노스 수용체(mannose receptor), 랑게린(Langerin), DECTIN-1, B7-1, B7-2, IFN-γ 수용체, IL-2 수용체, ICAM-1, Fcγ 수용체, LOX-1, 또는 ASPGR에 특이적인 항체인, 융합 단백질.
  17. 서열번호 1 내지 184 중 어느 하나로 표시되는 암 특이적 네오-에피토프(neo-epitope)가 로딩된 항원 제시 세포(Antigen presenting cells)를 제조하는 방법.
  18. 제17항에 있어서,
    상기 항원 제시 세포는 수지상 세포, B 세포 및 대식 세포 중 1종 이상을 포함하는, 방법.
  19. 제17항에 있어서,
    상기 항원 제시 세포는 목적하는 개체의 말초 혈액 유래의 말초혈액 단핵세포(Peripheral blood mononuclear cell, PBMC)로부터 얻어진 것인, 방법.
  20. 제17항에 있어서,
    상기 로딩은 상기 항원 제시 세포를 상기 암 특이적 네오-에피토프(neo-epitope)와 접촉시켜 수행되는, 방법.
  21. 제17항에 있어서,
    상기 로딩은 상기 항원 제시 세포로 상기 암 특이적 네오-에피토프(neo-epitope)를 펄싱(pulsing)하여 수행되는, 방법.
  22. 제17항에 있어서,
    상기 로딩은 상기 암 특이적 네오-에피토프(neo-epitope)를 코딩하는 핵산 분자가 삽입된 발현 벡터를 상기 항원 제시 세포에 뉴클레오펙션(nucleofection)시켜 수행되는, 방법.
  23. 제17항에 있어서,
    상기 로딩은 상기 암 특이적 네오-에피토프(neo-epitope); 및 수지상 세포 특이적 항체 또는 그 단편을 포함하는 융합 단백질를 사용하여 수행되는, 방법.
  24. 제12항 내지 제14항 중 어느 한 항의 항원 제시 세포에 의해 활성화된 T 세포.
  25. 제12항 내지 제14항 중 어느 한 항의 항원 제시 세포에 의해 T 세포를 활성화하는 방법.
  26. 제25항에 있어서,
    상기 방법은 상기 T 세포를 상기 항원 제시 세포와 공동 배양(co-culture)하여 수행되는, 방법.
  27. 제25항에 있어서,
    상기 T 세포는 목적하는 개체의 말초혈액 단핵세포(Peripheral blood mononuclear cell, PBMC)로부터 얻어진 것인, 방법.
  28. 제25항에 있어서,
    상기 T 세포는 세포독성 T 세포, 보조 T 세포, 자연 살해 T 세포, γδ T 세포, 조절 T 세포 및 메모리 T 세포로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함하는, 방법.
  29. 제26항에 있어서,
    상기 공동 배양 시 인터루킨-2(IL-2), 인터루킨-4(IL-4), 인터루킨-7(IL-7), 인터루킨-15(IL-15), 인터루킨-21(IL-21) 또는 이들의 조합을 첨가하며 수행되는, 방법.
  30. 제26항에 있어서,
    상기 공동 배양 시 사이토카인 및 면역글로불린(immunoglobulin) 중쇄 불변부를 포함하는 융합 단백질을 첨가하며 수행되는, 방법.
  31. 제30항에 있어서,
    상기 사이토카인은 인터페론-γ(IFN-γ), 인터루킨-2(IL-2), 인터루킨-4(IL-4), 인터루킨-12(IL-12), IL-18, 종양 괴사 인자(TNF) 또는 과립구 마크로파지 콜로니 자극 인자(GMCSF)인, 방법.
  32. 제26항에 있어서,
    상기 공동 배양 시 CD27, CXCR3 또는 CD62L의 리간드; 및 면역글로불린(immunoglobulin) 중쇄 불변부를 포함하는 융합 단백질을 첨가하며 수행되는, 방법.
  33. 제12항 내지 제14항 중 어느 한 항의 항원 제시 세포를 유효 성분으로 포함하는 암의 예방 또는 치료용 약학 조성물.
  34. 제33항에 있어서,
    상기 암은 엡스타인-바 바이러스(epstein barr virus; EBV) 양성 암인, 약학 조성물.
  35. 제24항의 활성화된 T 세포를 유효 성분으로 포함하는 암의 예방 또는 치료용 약학 조성물.
  36. 제35항에 있어서,
    상기 암은 엡스타인-바 바이러스(epstein barr virus; EBV) 양성 암인, 약학 조성물.
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