KR20190011222A

KR20190011222A - 면역 회피성 박테리오파지

Info

Publication number: KR20190011222A
Application number: KR1020180085957A
Authority: KR
Inventors: 남윤성; 유정헌
Original assignee: 한국과학기술원
Priority date: 2017-07-24
Filing date: 2018-07-24
Publication date: 2019-02-01
Also published as: KR102233993B1

Abstract

본 발명은 캡시드에 자가-펩티드(self-peptide)를 포함하는 박테리오파지 및 이의 활용에 관한 발명으로써, 본 발명의 박테리오파지는 면역 체계를 회피할 수 있어 생체 내에서 오랜 시간 순환하여 지속적이고 효과적으로 세균을 제거하고 세균에 의한 감염증을 치료할 수 있다.

Description

면역 회피성 박테리오파지{Immunologically cloaking Bacteriophage}

본 발명은 면역 작용에 의한 제거를 회피할 수 있는 박테리오파지(bacteriophage)에 관한 것으로, 상세하게는 캡시드(capsid)에 자가-펩티드(self-paptide)를 포함하는 박테리오파지 및 이의 용도에 관한 것이다.

세균에 의한 다양한 감염증의 치료를 위해 여러 항생제가 사용되고 있다. 항생제는 특정 미생물이 다른 미생물의 성장을 억제하기 위해 생산하는 물질로써 감염증의 종류마다 그에 맞는 적합한 항생제를 사용하고 있다. 항생제의 적절한 처방은 세균 감염증의 치료에 효과적이나, 항생제의 남용에 의해 항생제에 대한 내성, 구토, 불쾌감 등의 문제가 발생할 수 있다.

최근에는 기존의 사용되고 있는 항생제에 의한 문제를 해결할 수 있는 대안으로, 한국 공개특허 제10-2012-0067096호와 같이 인간이나 동물에 직접적으로 해를 끼치지 않는 바이러스나 세균 등을 활용한 항생제에 대한 연구가 활발하다. 그러나, 생체 내에서 바이러스나 세균 등은 일반적으로 외래 물질로 인식되기 때문에 인간을 포함한 동물, 식물의 면역 작용에 의해 체내에서 빠르게 제거될 수 있다. 예를 들어, 식세포(phagocyte)에 의한 식균작용(phagocytosis)는 미생물에 대한 비특이적 면역 작용이기 때문에 외부 미생물이 생체 내로 들어오게 되면 미생물의 종류에 상관없이 미생물을 섭취해 분해해 버릴 수 있다.

바이러스인 박테리오파지가 면역 제거(immune clearance)되는 것을 지연 시키기 위해 폴리에틸렌 글리콜(polyethylene glycol)을 사용하는 연구가 수행된 바 있다. 그러나, 폴리에틸렌 글리콜은 친수성 및 비활성 특성이 있어 박테리오파지의 표면에 단백질 간의 상호작용을 감소시킬 수 있는 입체 장벽을 형성시킬 수 있다. 폴리에틸렌 글리콜에 의해 형성되는 입체 장벽은 세포 섭취를 제한하고, 엔도좀 탈출(endosomal escape)를 억제하며, 2차 면역 반응을 촉진하는 단점이 있다. 또한, 최초 폴리에틸렌 글리콜로 표지된 박테리오파지가 증식하게 되면, 증식한 박테리오파지에는 폴리에틸렌 글리콜이 표지되지 않기 때문에 폴리에틸렌 글리콜에 의한 효과가 사라지게 된다. 그러므로, 증식한 박테리오파지에 의한 세균 제거 등의 효과는 기대하기 어렵고, 지속적인 화학적 처리가 필요한 단점도 있다.

따라서, 기존에 사용되던 항생 물질외에 바이러스나 세균 등을 응용한 항생제 개발에 있어서 생체 내에 존재하는 면역 작용을 회피하는 방법이 반드시 필요하다.

한국 공개특허 제10-2012-0067096호.

본 발명의 목적은 캡시드(capsid)에 자가-펩티드(self-peptide)를 포함하는 박테리오파지를 제공하고, 이를 활용한 항균 조성물, 세균에 의해 유발되는 감염증의 치료 또는 예방을 위한 건강기능성 식품, 약학 조성물 및 식물병 방제용 조성물을 제공하는 것이다.

본 발명은 캡시드에 하기 식(1)로 표현되는 자가-펩티드(self-peptide)를 포함하는 박테리오파지를 제공한다.

[A₁A₂A₃…A_n] - 식(1)

(n은 서열의 길이(개수)이고, 6≤n≤21이고, A₁ 내지 A_n 각각은 아미노산이고, A₁ 내지 A_n 중 6개의 아미노산은 SIRP-α(signal regulatory protein-α)와 결합할 수 있는 아미노산이고, 나머지 n-6개의 아미노산은 임의의 아미노산이며, n은 자연수이다.)

본 발명의 일 실시예에 따른 박테리오파지는 자가-펩티드가 박테리오파지의 머리를 구성하는 캡시드에 발현된 박테리오파지를 포함한다.

본 발명의 일 실시예에 따른 박테리오파지는 용균성(lytic) 파지를 포함한다.

본 발명의 일 실시예에 따른 박테리오파지에서 상기 자가-펩티드는 CD47 유래인 자가-펩티드를 포함한다.

본 발명의 일 실시예에 따른 박테리오파지는 상기 SIRP-α(signal regulatory protein-α)와 결합할 수 있는 아미노산은 순서대로 E, E, L, T, E, E인 박테리오파지를 포함한다.

본 발명의 일 실시예에 따른 박테리오파지에서 상기 자가-펩티드는 캡시드의 C-말단에 연결되는 자가-펩티드를 포함한다.

본 발명의 일 실시예에 따른 박테리오파지에서 상기 자가-펩티드는 서열번호 1(GNYTCEVTELTREGETIIELK) 또는 서열번호 2(EVTELTREGE)인 자가-펩티드를 포함한다.

본 발명의 일 실시예에 따른 박테리오파지의 종류는 T7, T3 β-phage, Phage C1, H-19B, ΦFC3208, ΦN315, Φ13, ΦMu50A, ΦETA, PVL, PV83, T12, CS112, 315.2, 및 M30 중에서 선택되는 하나 이상을 포함한다.

본 발명은 캡시드에 자가-펩티드가 발현된 박테리오파지를 포함하는 세균 감염증의 치료 또는 예방용 약학 조성물을 제공한다.

본 발명의 일 실시예에 따른 약학 조성물은 경구 투여 또는 주사용 약학 조성물을 포함한다.

본 발명은 캡시드에 자가-펩티드가 발현된 박테리오파지를 포함하는 항균 조성물을 제공한다.

본 발명은 캡시드에 자가-펩티드가 발현된 박테리오파지를 포함하는 세균 감염증 예방용 건강기능성 식품을 제공한다.

본 발명은 캡시드에 자가-펩티드가 발현된 박테리오파지를 포함하는 식물병 방제용 조성물을 제공한다.

본 발명의 일 실시예에 따른 박테리오파지는 감염을 일으키는 세균 또는 항균 대상 세균으로 대장균(E. coli), 시겔라소네이균(Shigella sonnei) 및 쥐티푸스균(Salmonella typhimurium), 코네리박테리움 디프테리아(Corynebacterium diphtheria), 클로스트리듐 보툴리누스(Clostridium botulinum), 황색포도상구균(Staphylococcus aureus), 화농연쇄상구균(Streptococcus pyogenes) 및 콜레라균(Vibrio cholera)에서 선택되는 하나 이상의 세균을 포함한다.

본 발명의 일 실시예에 따른 치료 또는 예방 대상인 세균 감염증은 장염, 세균성 이질, 디프테리아(diphtheria), 급성발열, 성홍열, 콜레라 및 식중독에서 선택되는 하나 이상인 감염증을 포함한다.

본 발명의 캡시드에 자가-펩티드를 포함하는 박테리오파지는 생체 내에서 면역 물질로 인식되지 않아 체내 면역 작용을 회피할 수 있다. 특히, 대식 세포 등에 의한 비특이적 미생물의 제거 기전을 회피할 수 있어 오랜 시간 혈액을 따라 순환할 수 있기 때문에 세균에 의한 감염증의 치료 또는 예방 효과와 항균 효과가 매우 우수하다.

도 1은 a) 마우스 대식세포인 J774A.1 및 b) 인간 대식세포인 THP-1과 T7 박테리오파지(WT-T7: 야생형 박테리오파지, Self-T7: 캡시드에 자가-펩티드가 발현된 박테리오파지)의 수의 비에 따른 식균작용을 보여주는 형광 다이어그램(fluorescence diagram) 결과이다.
도 2는 마우스 대식세포인 J774A.1과 T7 박테리오파지(WT-T7; 야생형 박테리오파지, Self-T7; 캡시드에 자가-펩티드가 발현된 박테리오파지)의 수의 비에 따른 식균작용을 보여주는 공초점 현미경 이미지이다(스케일 바(scale bar): 10㎛).
도 3은 PBS, cy5 표지-WT-T7 및 cy5 표지-Sefl-T7를 각각 주사한 balb/c 마우스에 채취한 혈액의 형광 강도를 측정한 결과이다.
도 4는 WT-T7 및 Sefl-T7을 각각 주사한 balb/c 마우스 및 NOD/SCID 마우스로부터 채취한 혈액 내 생존하고 있는 파지 수를 결정하기 위한 플라크-형성 어세이 결과이다.
도 5는 PBS, cy5 표지-WT-T7 및 cy5 표지-Sefl-T7를 각각 주사한 balb/c 마우스 및 NOD/SCID 마우스 몸 전체의 형광 이미지 측정 결과이다.
도 6은 PBS, cy5 표지-WT-T7 및 cy5 표지-Sefl-T7를 각각 주사한 balb/c 마우스의 간(liver), 비장(spleen), 심장(heart), 신장(kidney) 및 폐(lung)의 형광 이미지 측정 결과이다.
도 7은 cy5 표지-WT-T7 및 cy5 표지-Sefl-T7를 각각 주사한 balb/c 마우스에서 허벅지 대복재정맥(great saphenous vein, GSV)의 동일한 지점에서 측정한 형광 신호 검출 결과이다.
도 8은 cy5 표지-WT-T7 및 cy5 표지-Sefl-T7를 각각 주사한 balb/c 마우스에서 허벅지 대복재정맥(great saphenous vein, GSV)의 동일한 지점에서 측정한 라이브 이미징 결과이다.
도 9는 cy5 표지-WT-T7 및 cy5 표지-Sefl-T7를 각각 주사한 balb/c 마우스의 간에서 파지 축적을 라이브 이미징한 결과이다.
도 10은 서로 다른 농도의 E. coli BL21을 balb/c 마우스에 복강 주사한 후, 주사 후부터 100 시간까지 쥐의 질병 증상(Symptoms of Disease)을 측정한 결과로써 농도 의존적인 증상 변화를 보여준다([정상; 0], [활동감소; 1], [혼수상태, 주름진 모피 및 꼽추; 2], [혼수상태, 주름진 모피, 꼽추 및 눈 주위 삼출물(exudates)로 감겨진 눈; 3], [빈사상태; 4], [죽음; 5]).
도 11은 balb/c 마우스에 E. coli를 감염시키지 않은 경우와 2 × 10⁸cfu 농도의 E. coli BL21를 복강 주사로 감염시켜 감염증(장염)을 유발시킨 balb/c 마우스에 PBS, WT-T7 및 Self-T7를 각각 복강 주사하고 100 시간까지 쥐의 질병 증상(Symptoms of Disease)을 측정한 결과이다([정상; 0], [활동감소; 1], [혼수상태, 주름진 모피 및 꼽추; 2], [혼수상태, 주름진 모피, 꼽추 및 눈 주위 삼출물(exudates)로 감겨진 눈; 3], [빈사상태; 4], [죽음; 5]).
도 12는 balb/c 마우스에 E. coli를 감염시키지 않은 경우와 2 × 10⁸cfu 농도의 E. coli BL21를 복강 주사로 감염시켜 감염증(장염)을 유발시킨 balb/c 마우스에 PBS, WT-T7 및 Self-T7를 각각 복강 주사하고 100시간 때 쥐의 장에서 채취한 조직액을 배양한 결과이다. PBS 및 WT-T7를 주사한 마우스 조직액의 배양 결과 대장균 콜로니 형성을 확인할 수 있었고, Self-T7을 주사한 마우스 조직액의 배양 결과 대장균이 완전히 사라진 것을 확인할 수 있었다.
도 13은 balb/c 마우스에 E. coli를 감염시키지 않은 경우와 2 × 10⁸cfu 농도의 E. coli BL21를 복강 주사로 감염시켜 감염증(장염)을 유발시킨 balb/c 마우스에 PBS, WT-T7, PEG로 표면 개질된 T7(PEG-T7) 및 Self-T7를 각각 정맥 주사하고 100 시간까지 쥐의 질병 증상(Symptoms of Disease)을 측정한 결과이다([정상; 0], [활동감소; 1], [혼수상태, 주름진 모피 및 꼽추; 2], [혼수상태, 주름진 모피, 꼽추 및 눈 주위 삼출물(exudates)로 감겨진 눈; 3], [빈사상태; 4], [죽음; 5]).
도 14는 balb/c 마우스에 E. coli를 감염시키지 않은 경우와 2 × 10⁸cfu 농도의 E. coli BL21를 복강 주사로 감염시켜 감염증(장염)을 유발시킨 balb/c 마우스에 PBS, WT-T7, PEG-T7 및 Self-T7를 각각 정맥 주사하고 100시간 때 쥐의 장에서 채취한 조직액을 배양한 결과이다. PBS, PEG-T7 및 WT-T7를 주사한 마우스 조직액의 배양 결과 대장균 콜로니 형성을 확인할 수 있었고, Self-T7을 주사한 마우스 조직액의 배양 결과 대장균이 완전히 사라진 것을 확인할 수 있었다.
도 15는 2 × 10⁸cfu 농도의 E. coli BL21를 복강 주사로 감염시켜 감염증(장염)을 유발시킨 balb/c 마우스에 WT-T7, PEG-T7 및 Self-T7를 각각 정맥 주사하고 100시간 때 쥐의 장을 적출한 후 장에 존재하는 대장균의 수를 측정한 결과이다. WT-T7를 주사한 경우 2 × 10⁸cfu/㎖가 넘는 대장균이 검출되었고, PEG-T7을 주사한 경우 대장균의 제거 효과가 있었으나 Self-T7과 같이 완전히 대장균을 제거하지는 못하였다.
도 16은 자가-펩티드를 코딩하는 서열이 삽입되는 T7 박테리오파지 10B 캡시드 서열을 나타낸다.
도 17은 자가-펩티드가 T7 박테리오파지 10B 캡시드에 포함된 T7 박테리오파지의 시퀀싱 결과를 나타낸다.
도 18은 37 ℃에서 다양한 모의 체액에서 WT-T7, PEG-T7 및 Self-T7 파지의 생존을 측정한 결과를 나타낸다.
도 19는 WT-T7, PEG-T7 및 Self-T7 (n=3)이 접종된 박테리아 현탁액의 광학 밀도를 측정한 결과를 나타낸다.

이하에서 본 발명에 대하여 구체적으로 설명한다. 본 명세서에서 사용되는 용어는 따로 정의하지 않는 경우 해당 분야에서 통상의 지식을 가진 자가 일반적으로 이해하는 내용으로 해석되어야 할 것이다. 본 명세서의 도면 및 실시예는 통상의 기술자가 본 발명을 쉽게 이해하고 실시하기 위한 것으로 도면 및 실시예에서 발명의 요지를 흐릴 수 있는 내용은 생략될 수 있으며, 본 발명이 도면 및 실시예로 한정되는 것은 아니다.

본 발명은 캡시드(capsid)에 자가-펩티드(self-peptide)를 포함하는 박테리오파지 및 이의 응용에 관한 발명이다.

박테리오파지는 세균(bacteria)를 숙주로 이용해 증식하는 바이러스로써 인간 및 인간 외의 동물에서 다양한 감염증을 일으키는 세균들을 제거하는데 이용할 수 있다. 그러나, 박테리오파지 자체도 생체 내에서 생체 외부 물질로 인식되기 때문에 세망내피계(reticuloendothelial system (RES)) 등 생물의 다양한 면역 체계에 의하여 제거(immune clearance)될 수 있다. 특히, 대식세포(macrophage)의 식균작용(phagocytosis)에 의한 바이러스의 제거는 비특이적으로 미생물을 제거하기 때문에 생체 내로 주입된 박테리오파지는 단기간에 제거될 수 있다.

본 발명은 박테리오파지의 캡시드에 자가-펩티드를 발현시켜 생체 내 면역 체계를 회피할 수 있는 박테리오파지를 제공하고, 이러한 박테리오파지를 활용한 약학 조성물, 건강 기능성 식품, 항균 조성물 및 식물병 방제용 조성물 등을 제공한다.

본 발명에서 “자가-펩티드(self-peptide)”는 생체 내에서 원래부터 존재하거나 내재되어 있던 펩티드, 혹은 생체 내의 면역 작용에 의한 제거(clearance) 신호를 막아 줄 수 있는 펩티드를 의미한다. 예를 들어, CD47(Cluster of Differentiation 47)의 당단백질은 모든 생물체의 세포막에서 발현되는 '자체(self)'마커이고, CD47로부터 유래한 특정 펩타이드는 식세포(phagocyte)의 SIRP-α(signal regulatory protein-α)와 상호작용(결합)하여 복합체를 이루고 식균작용(phagocytosis)를 회피할 수 있는 '나를 먹지 말라(do-not-eat-me)'는 신호를 보낼 수 있다.

본 발명에서 자가-펩티드는 생체 내 면역 체계 중, 특히 비특이적으로 미생물을 제거할 수 있는 식세포에 의한 식균작용을 회피할 수 있도록, 식세포에 면역 작용 억제 신호를 보낼 수 있는 펩티드라면 제한되지 않는다.

본 발명에 따르면, 박테리오파지의 캡시드에서 발현되어 외부로 노출될 수 있는 자가-펩티드를 이용한다면, 본 발명의 목적 및 효과를 달성할 수 있으므로 자가-펩티드를 특정 펩티드로 제한할 필요가 없다.

본 발명의 일 실시예에 따르면, 자가-펩티드는 바람직하게는 CD47 유래 펩티드이나 이에 제한되는 것은 아니다. 자가-펩티드는 특정 단백질로부터 분리하거나, 재조합 미생물로부터 생산, 또는 인위적인 합성 등을 통해서도 얻을 수 있다.

본 발명의 다른 일 실시예에 다르면, 자가-펩티드의 길이는 6mer 이상, 6 내지 21mer, 바람직하게는 6 내지 15mer, 보다 바람직하게는 6 내지 10mer 이나 이에 제한되는 것은 아니다(이하, 서열은 특별한 언급이 없는 이상 5'-말단에서 3'-말단 또는 N-말단에서 C-말단의 순서와 같이 본 발명의 분야에서 일반적으로 사용되는 서열 기록 순서를 따른다). 구체적으로, CD47 유래의 자가-펩티드인 경우 SIRPα와 상호작용(결합)하는데 필요한 아미노산인 E, E, L, T, E, E가 자가-펩티드의 서열 상에 순서대로 삽입되어 있는 자가-펩티드를 포함할 수 있다. CD47 유래의 자가-펩티드의 서열 상에 E, E, L, T, E, E가 순서대로 포함되어 있는 경우, E, E, L, T, E, E외의 임의의 아미노산 서열에 의해 자가-펩티드의 입체 구조가 변할 수 있다. 그리고, 입체 구조의 변화에 따라 식세포의 SIRPα와 같이 자가-펩티드를 인지하는 단백질 등과 상호작용하는 정도가 달라질 수 있다. 그러나, 서열상 E, E, L, T, E, E를 순서대로 포함한 펩티드는 자가-펩티드로써 기능할 수 있어 파지에 면역 회피 성질을 부여할 수 있다. 이러한 자가-펩티드는 하기 식 (1)과 같이 나타낼 수 있다.

[A₁A₂A₃…A_n] - 식(1)

(n은 서열의 길이(개수)이고, A₁ 내지 A_n 각각은 아미노산이고, A₁ 내지 A_n 중 6개의 아미노산은 순서대로 E, E, L, T, E, E이고, 나머지 n-6개의 아미노산은 임의의 아미노산이며, n은 자연수이다.)

상기 식에서 n은 6≤n≤21일 수 있으며, 바람직하게는 6≤n≤15, 보다 바람직하게는 바람직하게는 6≤n≤10일 수 있다. 또는 보다 긴 서열이 필요할 때는 10≤n≤21일 수 있다.

상기 식의 구체적인 예를 들면, n=6일 때 A₁A₂A₃A₄A₅A₆는 EELTEE이고, n=7일 때 A₁A₂A₃A₄A₅A₆A₇는 XEELTEE, EXELTEE, EEXLTEE, EELXTEE, EELTXEE 또는 EELTEXE, EELTEEX(X는 임의의 아미노산을 나타낸다.)이고, n=8일 때 XXEELTEE, XEXELTEE, XEEXLTEE, XEELXTEE, XEELTXEE, XEELTEXE, XEELTEEX, EXXELTEE, EXEXLTEE, EXELXTEE, EXELTXEE, EXELTEXE, EXELTEEX, EEXXLTEE, EEXLXTEE, EEXLTXEE, EEXLTEXE, EEXLTEEX, EELXXTEE, EELXTXEE, EELXTEXE, EELXTEEX, EELTXXEE, EELTXEXE 또는 EELTXEEX일 수 있다. 본 발명의 또 다른 일 실시예에 따른 보다 구체적인 예로, CD47 유래의 GNYTCEVTELTREGETIIELK(서열번호 1) 또는 EVTELTREGE(서열번호 2)로 이루어진 자가-펩티드일 수 있다.

본 발명에서 자가-펩티드는 박테리오파지의 캡시드에서 발현되어 외부로 노출될 수 있다. 캡시드에서 발현되어 외부로 노출된 자가-펩티드는 면역 작용에 필요한 생체 내 신호를 억제하거나, 면역 작용으로부터 회피할 수 있는 상호작용을 수행할 수 있다. 본 발명의 일 실시예에 따르면, 박테리오파지의 캡시드에 발현된 자가-펩티드가 식세포의 다양한 신호조절단백질(signal regulatory protein)과 상호작용하여 식세포의 식균작용에 의한 제거를 회피할 수 있다. 보다 구체적으로, CD47 유래의 GNYTCEVTELTREGETIIELK가 파지 캡시드의 C-말단(C-terminal)에 연결되어 발현되고, 캡시드에서 외부로 노출되어 대식세포의 신호조절단백질인 SIRP-α와 상호작용(self-peptide receptor interaction)하여 대식세포가 식균작용으로 박테리오파지를 제거하지 않도록 할 수 있다.

본 발명에서 자가-펩티드는 박테리오파지의 캡시드(capsid, coat protein)에 포함되고, 캡시드 외부로 노출될 수 있다. 자가-펩티드가 포함된 캡시드는 박테리오파지 캡시드 중 머리(head)를 이루는 캡시드가 바람직하나 이에 제한되는 것은 아니다.

본 발명의 일 실시예에 따르면, T7 박테리오파지의 경우 T7 박테리오파지 서열과 자가-펩티드의 재조합(recombinant)을 통해 자가-펩티드가 외피 단백질(coat protein) 중 10B의 C-말단에 연결되어 발현될 수 있다. 자가-펩티드는 캡시드를 이루는 단백질 중 다수를 차지하는 메이저 캡시드에만 연결되어 발현될 수 있는 것은 아니며, 마이너 캡시드에 발현되도록 T7 박테리오파지를 구축(construction)할 수 있다. 이러한 자가-펩티드를 연결하는 캡시드의 종류 차이는 면역 회피성을 가지도록 구축된 박테리오파지(constructed bacteriophage)의 면역 회피성 정도에 차이가 있을 수 있을 뿐 본 발명에서 목적하는 효과가 달라지는 것은 아니다.

본 발명의 다른 일 실시예에 따르면, T7 박테리오파지의 캡시드인 10B에서 자가-펩티드가 발현되도록 박테리오파지를 구축하면, T7 박테리오파지의 헤드를 형성하는 415개의 10B에 자가-펩티드가 매우 균일하게 발현되어 외부로 노출될 수 있다. 이러한 발현의 균일성은 면역 회피를 위한 신호 전달 및 식세포 표면의 수용체와 일어나는 상호작용을 매우 효율적으로 할 수 있다.

본 발명의 자가-펩티드는 박테리오파지의 종류에 따라 박테리오파지의 서열과 재조합하는 방법이 달라질 수 있다.

본 발명의 일 실시예에 따르면 박테리오파지의 서열과 재조합하려는 자가-펩티드의 핵산 서열을 디자인하고, 이를 포함하는 벡터 및 제한효소를 이용하여 박테리오파지의 핵산에 자가-펩티드를 코딩하는 서열을 재조합 할 수 있다.

보다 구체적으로, CD47로부터 유래한 GNYTCEVTELTREGETIIELK를 T7 박테리오파지 캡시드인 10B의 C-말단에서 발현시키기 위해서 GNYTCEVTELTREGETIIELK를 코딩하는 서열을 T7 박테리오파지의 10B 캡시드를 코딩하는 서열내에 재조합으로 삽입할 수 있다. GNYTCEVTELTREGETIIELK를 코딩하는 서열인 ggt aac tac aca tgc gag gtc aca gag ctc aca cga gaa ggc gag acc ata att gaa ctc aag(서열번호 3) 또는 이와 상보적인 서열을 10B 캡시드를 코딩하는 서열인 atg ctc ggg gat ccg aat tca agc ttg(서열번호 4) 또는 이와 상보적인 서열에 삽입하면, T7의 10B 캡시드를 코딩하는 서열에 atg ctc ggg gat ccg aat tca ggt aac tac aca tgc gag gtc aca gag ctc aca cga gaa ggc gag acc ata att gaa ctc aag agc ttg(서열번호 5) 서열 또는 이와 상보적인 서열이 포함되어 10B 캡시드에서 자가-펩티드가 발현될 수 있다.

본 발명에서 박테리오파지는 인간 또는 인간외 동물에 유해한 박테리오파지가 아니라면 특별히 제한되지 않는다. 바람직하게는 용균성(lytic) 박테리오파지이다. 용균성 박테리오파지는 박테리오파지의 숙주인 세균을 용균시켜 증식하므로 감염증을 유발하는 세균을 사멸시킬 수 있다. 그리고, 숙주인 세균이 존재하는 한, 자가-펩티드가 발현될 수 있는 박테리오파지가 계속 증식할 수 있다.

박테리오파지의 종류로 T7, T3 β-phage, Phage C1, H-19B, ΦFC3208, ΦN315, Φ13, ΦMu50A, ΦETA, PVL, PV83, T12, CS112, 315.2, 및 M30 중에서 선택되는 하나 이상이 바람직하나 이에 제한되는 것은 아니다.

본 발명의 일 실시예에 따르면, 캡시드에 자가-펩티드를 포함한 용균성 박테리오파지를 사용하기 때문에 in vivo 및 in vitro에서 해로운 세균을 숙주로 하여 지속적으로 자가 증식할 수 있고 안전성이 우수하다.

그리고, 자가 증식으로 생성된 후세대 박테리오파지도 본 발명의 박테리오파지와 동일하게 캡시드에 자가-펩티드를 포함하고 있어 본 발명의 목적 및 효과를 그대로 가질 수 있다.

이러한 특징은 자가-펩티드가 수식된 나노입자와 구분되는 중요한 특징으로, 자가-펩티드가 수식된 나노입자는 스스로 증식할 수 없어 시간에 따라 그 수가 감소할 수 밖에 없다.

그리고, 감염증의 정도에 따라 자가-펩티드가 수식된 나노입자를 지속적으로 주입해야 하고, 과량의 나노입자 주입에 의한 생체 내 이상 증상이 나타날 수 있다.

또한, 목적 위치에 박테리오파지를 전달하기 위한 담체(carrier)도 필요하지 않고, 박테리오파지는 치료제로 사용할 수 있을 정도로 안전성도 검증되어 있다.

나아가, 본 발명의 박테리오파지는 자가 펩티드가 수식된 나노입자의 제조와 같이 나노입자 및 펩티드의 합성과 이들의 공유결합 형성에 필요한 복잡한 화학적 반응 유도도 필요하지 않다.

본 발명은 캡시드에 자가-펩티드를 포함하는 박테리오파지를 활용하여 세균에 의한 감염증의 치료 또는 예방용 약학 조성물을 제공할 수 있다.

본 발명의 용어, 예방이란 조성물의 투여로 질병을 억제시키거나 발병을 지연시키는 모든 행위를 의미하며, 본 발명의 용어, 치료란 조성물의 투여로 상기 질병의 증세가 호전되거나 상기 질병의 억제 또는 경감 및 이롭게 변경되는 모든 행위를 의미한다.

본 발명에 따른 약학적 조성물은　제한되지 않으나, 약학적으로 허용 가능한 담체를 추가로 포함할 수 있다. 본 발명에서 용어,　약학적으로 허용 가능한 담체란 생물체를 자극하지 않고 투여되는 박테리오파지의 생물학적 활성 및 특성을 저해하지 않는 담체 또는 희석제를 의미한다. 일 예로, 액상 용액으로 제제화되는 조성물에 있어서 허용되는 약제학적 담체로는, 멸균 및 생체에 적합한 것으로서, 식염수, 멸균수, 링거액, 완충 식염수, 알부민 주사용액, 덱스트로오스 용액, 말토 덱스트린 용액, 글리세롤, 에탄올 및 이들 성분 중 1성분 이상을 혼합하여 사용할 수 있으며, 필요에 따라 항산화제, 완충액, 정균제 등 다른 통상의 첨가제를 첨가할 수 있다. 또한 희석제, 분산제, 계면활성제, 결합제 및 윤활제를 부가적으로 첨가하여 수용액, 현탁액, 유탁액 등과 같은 주사용 제형, 환약, 캡슐, 과립 또는 정제로 제제화할 수 있다.

본 발명에 따른 약학적 조성물은 질환 부위에의 도포 또는 분무하는 방법으로 이용할 수 있으며, 그 밖에 비강 분무, 경구 투여, 주사 또는 비경구 투여를 통해 투여할 수도 있으며, 비경구 투여의 경우 정맥 내 투여, 복강 내 투여, 근육 내 투여, 피하 투여 또는 국부 투여를 이용하여 투여할 수도 있으나, 이는 일 예일 뿐이므로 투여 방법이 이에 한정되는 것은 아니다.

본 발명에 따른 약학적 조성물의 적합한 투여 방법 및 투여량은 제제화 방법, 투여 방식, 대상이 되는 동물 및 환자의 연령, 체중, 성, 질병 증상의 정도, 음식, 투여시간, 투여 경로, 배설 속도 및 반응 감응성과 같은 요인들에 의해 다양하며, 보통으로 숙련된 의사나 수의사는 목적하는 치료에 효과적인 투여량을 용이하게 결정 및 처방할 수 있다.

본 발명에 따른 약학적 조성물을 유효성분으로 포함하는 경구 투여용 제형으로는, 예를 들어 정제, 트로키제, 로렌지, 수용성 또는 유성현탁액, 조제분말 또는 과립, 에멀젼, 하드 또는 소프트 캡슐, 시럽 또는 엘릭시르제로 제제화할 수 있다. 정제 및 캡슐 등의 제형으로 제제화하기 위해, 락토오스, 사카로오스, 솔비톨, 만니톨, 전분, 아밀로펙틴, 셀룰로오스 또는 젤라틴과 같은 결합제, 디칼슘 포스페이트와 같은 부형제, 옥수수 전분 또는 고구마 전분과 같은 붕괴제, 스테아르산 마그네슘, 스테아르산 칼슘, 스테아릴푸마르산 나트륨 또는 폴리에틸렌글리콜 왁스와 같은 윤활유를 포함할 수 있으며, 캡슐 제형의 경우 상기 언급한 물질 외에도 지방유와 같은 액체 담체를 더 함유할 수 있다.

본 발명에 따른 약학적 조성물을 유효성분으로 포함하는 비경구 투여용 제형으로는, 피하주사, 정맥주사 또는 근육 내 주사 등의 주사용 형태, 좌제 주입방식 또는 호흡기를 통하여 흡입이 가능하도록 하는 에어로졸제 등 스프레이용으로 제제화할 수 있다. 주사용 제형으로 제제화하기 위해서는 본 발명의 조성물을 안정제 또는 완충제와 함께 물에서 혼합하여 용액 또는 현탁액으로 제조하고, 이를 앰플 또는 바이알의 단위 투여용으로 제제화할 수 있다. 에어로졸제 등의 스프레이용으로 제형화하는 경우, 수분산된 농축물 또는 습윤 분말이 분산되도록 추진제 등이 첨가제와 함께 배합될 수 있다.

본 발명에 따른 박테리오파지를 포함한 약학 조성물은 치료 또는 예방 대상인 세균 감염증의 종류에 적합하도록 박테리오파지를 선택할 수 있다.

본 발명의 일 양태에서, 상기 세균 감염증의 종류는 특별히 제한되는 것은 아니나, 일예로 장염, 세균성 이질, 디프테리아(diphtheria), 급성발열, 성홍열, 콜레라 및 식중독 등에서 선택되는 하나 이상일 수 있으며, 이에 제한되는 것은 아니다. 치료 또는 예방 대상의 세균 감염증을 유발하는 세균의 종류에 따라 해당 세균을 숙주로 하는 박테리오파지를 달리할 수 있다.

상기 박테리오파지의 종류는 제한되는 것은 아니나, 일예로 T7, T3 β-phage, Phage C1, H-19B, ΦFC3208, ΦN315, Φ13, ΦMu50A, ΦETA, PVL, PV83, T12, CS112, 315.2, 및 M30 중에서 선택되는 하나 이상이 바람직하나 이에 제한되는 것은 아니다.

본 발명의 일 실시예에 따르면, 주사를 통한 혈관 투여 뿐만 아니라, 복강 투여와 같이 상이한 방법으로 박테리오파지를 투여하여도 우수한 면역 회피 작용 효과가 있고, 감염증의 예방 또는 치료가 가능한 효과가 있음을 확인할 수 있었다.

본 발명의 다른 일 실시예에 따르면, 상기 박테리오파지의 투여량은 제한되지 않으나 혈액 내 식세포 수를 측정하여 적합한 투여량을 결정할 수 있다. 바람직하게는 식세포 수 대비 10 내지 100배이나 이에 제한되는 것은 아니다.

본 발명은 캡시드에 자가-펩티드를 포함하는 박테리오파지를 활용하여 항균(anti-bacterial) 조성물을 제공할 수 있다.

본 발명에 따른 항균 조성물은 인간, 인간을 제외한 동물, 생활용품, 화장품, 의류 및 포장재 등에 유용하게 활용될 수 있다.

본 발명의 용어 “항균 조성물”이란 약제 형태로 인간 또는 인간을 제외한 동물에게 제공되어 미생물을 사멸시키거나 또는 발육을 억제하는 물질을 의미할 수 있으며, 이때 방부제, 살균제 및 항생제 등을 통칭하는 의미로 사용될 수 있다. 상기 동물은 제한되지는 않으나 인간을 포함한 포유동물을 포함할 수 있으며, 특정 균에 대한 특이적 활성을 나타내어 익균은 죽이지 않고, 특정 병원균만 사멸시킬 수 있고, 약물 내성 내지 저항성을 유도하지 않아, 기존의 항생물질에 비하여 제품수명(life cycling)이 긴 신규한 제제로 활용할 수 있다. 본 발명에 따른 항균 조성물은 자가-펩티드를 포함하는 박테리오파지를 단독으로 또는 사용 목적에 따라 적절히 선택된 첨가제를 포함할 수 있다. 상기 첨가제의 선택 사용 및 함량에 대해 특별히 제한을 두지 않으며, 당업계에서 통상적으로 사용하는 사용방법 및 제형에 따라 적절히 조절이 가능하다. 이에 따라 첨가제는 통상의 항균 조성물에 포함되는 물질 예를 들면, 부형제 또는 희석제일 수 있으며, 그 예로는 식염수, 완충용액, 덱스트로스, 이소파라핀, 물, 글리세롤, 에탄올이 사용될 수 있으며, 이에 한정되는 것은 아니다.

또한 본 발명의 용어 “항균 조성물”은 생활용품, 화장품, 의류 및 포장재 등의 다양한 물품에 포함되는 물질을 의미할 수 있다. 비한정적이고 구체적인 예로, 섬유유연제, 세제, 세정제, 소독제, 의약외품, 방향제, 화장료 및 포장용 필름 등의 물품에 사용 가능하다. 세정제로 사용하는 경우 분무제, 세척제, 샴푸, 헤어린스, 헤어컨디셔너, 비누 등으로 제조 가능하며, 이때 항균 조성물은 0.01 내지 1 중량%로 포함할 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다. 의약외품으로 사용하는 경우 발모제, 염모제, 제모제, 탈취제, 체취방지제, 치약 등으로 제조 가능하며, 이때 항균 조성물은 0.01 내지 2 중량%로 포함할 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다. 방향제로 사용하는 경우, 휘발성 물질을 더욱 포함할 수 있으며, 항균제 조성물은 0.0001 내지 1 중량%로 사용할 수 있다. 섬유유연제로 사용하는 경우, 항균제 조성물은 0.0001 내지 5 중량%로 사용할 수 있다. 화장료로 사용하는 경우, 항균제 조성물은 0.0001 내지 1 중량%로 포함될 수 있다.

본 발명에 따른 박테리오파지를 포함하는 항균 조성물은 다양한 미생물에 항균 활성을 나타낼 수 있으며, 항균 대상으로는 제한되는 것은 아니나, 인체 병원성 세균, 식물병원성 세균, 진균 등이 예시될 수 있으며, 구체적인 일 예로 대장균(E.coli), 시겔라소네이균(Shigella sonnei), 쥐티푸스균(Salmonella typhimurium), 코네리박테리움 디프테리아(Corynebacterium diphtheria), 클로스트리듐 보툴리누스(Clostridium botulinum), 황색포도상구균(Staphylococcus aureus), 화농연쇄상구균(Streptococcus pyogenes) 및 콜레라균(Vibrio cholera) 등으로 이루어진 군에서 선택되는 하나 이상일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.

본 발명은 캡시드에 자가-펩티드를 포함하는 박테리오파지를 활용하여 세균에 의한 감염증의 예방용 건강기능성 식품을 제공할 수 있다

본 발명에 따른 박테리오파지를 유효성분으로 포함하는 건강기능성　식품으로는 특별히 제한되는 것은 아니나 예를 들어, 각종　식품류, 음료, 껌, 차, 비타민 복합제, 건강보조　식품류 등이 있고, 분말, 과립, 정제, 캡슐 또는 음료인 형태로 사용할 수 있다.

상기 유효성분은 일반적으로 전체　식품　중량의 0.001 내지 15중량%, 구체적으로 0.01 내지 1중량%로 포함될 수 있으며, 건강 음료 조성물은 100ml를 기준으로 0.001 내지 1g, 구체적으로 0.01 내지 0.1g의 비율로 포함될 수 있으나 이는 일 예일 뿐 상기 수치범위에 제한받지 않는다.

본 발명에 따른 건강기능성　식품은 필수 성분으로서 상기 자가-펩티드를 포함하는 박테리오파지를 함유하는 것 외에　식품학적으로 허용 가능한　식품보조 첨가제, 예컨대, 천연 탄수화물 및 다양한 향미제 등을 추가 성분으로서 함유할 수 있다. 상기 천연 탄수화물의 예로는 포도당, 과당 등의 단당류, 말토오스, 수크로오스 등의 이당류 및 덱스트린, 시클로덱스트린 등의 다당류와 같은 통상적인 당 및 자일리톨, 소르비톨, 에리쓰리톨 등의 당알코올이 있다. 상기 향미제로는 타우마틴, 레바우디오시드 A, 글리시르히진, 사카린, 아스파르탐 등을 사용할 수 있다.

상기 외에 본 발명에 따른 건강기능성　식품은 여러 가지 영양제, 비타민, 광물, 합성 풍미제 및 천연 풍미제 등의 풍미제, 착색제 및 중진제, 펙트산 및 그의 염, 알긴산 및 그의 염, 유기산, 보호성 콜로이드 증점제, pH 조절제, 안정화제, 방부제, 글리세린, 알코올, 탄산음료에 사용되는 탄산화제 등을 함유할 수 있다.

그 밖에 본 발명에 따른 건강기능성　식품은 천연 과일 주스 및 과일 주스 음료 및 야채 음료 등의 제조를 위한 과육을 함유할 수도 있다. 이러한 성분은 독립적으로 또는 조합하여 사용할 수 있다. 상기 건강기능성 식품의 제조방법은 특별히 제한되는 것은 아니며, 일반적으로 널리 알려진 식품의 제조방법을 도입하여 활용하여 사용할 수 있으며, 필요에 따라 변형하여 사용할 수도 있다.

본 발명은 식물병을 일으키는 세균의 방제를 위한 조성물을 제공하며, 상기 조성물은 본 발명에 따른 캡시드에 자가-펩티드를 포함하는 박테리오파지을 이용할 수 있다.

본 발명에 따른 식물병 방제용 조성물은 식물의 보호와 생장에 사용되는 약제를 의미하며, 식물의 재배 또는 저장 중 발생하는 병충, 해충, 잡초 등을 방제하는데 사용하는 화학농약 및 생물농약, 농작물의 생리기능을 증진 또는 억제하는데 사용되는 생장조정제, 약효를 증진시키는 보조제 등을 총칭한다.

구체적으로 상기 식물병 방제용 조성물은 수간주사 조성물, 생물제제 조성물, 비료 조성물, 영양 조성물, 식물 강화 조성물, 식물 보호 조성물, 토양 개량 조성물(soil conditioner composition) 또는 생산량 증가 조성물(yield enhancer composition)일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.

상기 식물병 방제용 조성물의 제형으로는 수화제(wettable powder), 입상 수화제(water dispersible granule), 분제(dusting powder), 액상 수화제(suspension concentrate), 유제(emulsifiable concentrate), 정제(tablet), 액제(liquid) 또는 오일 현탁제(oil suspension)로 제제화될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.

상기 식물병 방제용 조성물은 유효량의 물과 함께, 하나 이상의 분산제를 포함할 수 있으며, 상기 분산제는 약 2 내지 약 60%(w/w)의 범위로 포함될 수 있다. 이러한 분산제는 유화제, 현탁제 등 당업계에 공지된 것을 제한없이 사용할 수 있으며, 분산제의 구체적인 예로, 폴리비닐피롤리돈, 폴리비닐알코올, 리그노술포네이트, 페닐 나프탈렌 술포네이트, 에톡시화(ethoxylated) 알킬 페놀, 에톡시화지방산, 알콕시화 선형 알코올, 환방향족(polyaromatic) 술포네이트, 소듐 알킬 아릴 술포네이트, 글리세릴에스테르, 말레산 무수물 공중합체, 포스페이트 에스테르, 아릴 술폰산과 포름알데히드의 축합반응 생성물, 알킬아릴 술폰산과 포름알데히드의 축합반응 생성물, 에틸렌 옥시드와 지방산 에스테르의 첨가 반응 생성물, 에틸렌 옥시드와 지방산 에스테르의 첨가 반응 생성물의 염, 축합된(condensed) 나프탈렌의 술포네이트, 에틸렌 옥시드와 지방산 에스테르의 첨가 반응 생성물, 에틸렌 옥시드와 지방산 에스테르의 첨가 반응 생성물의 염, 리그닌 유도체, 나프탈렌 포름알데히드 축합물, 이소데실술포숙신산 하프 에스테르(half ester)의 소듐 염, 폴리카르복실레이트, 소듐 알킬벤젠술포네이트, 술폰화 나프탈렌의 소듐 염, 술폰화 나프탈렌의 암모늄 염, 폴리아크릴산의 염, 페놀술폰산의 염 또는 나프탈렌 술폰산의 염일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.

또한 상기 식물병 방제용 조성물은 습윤제, 결합제, 충진제(filler) 또는 유기 첨가제를 추가로 포함할 수 있다.

상기 습윤제는 상기 식물병 방제용 조성물에 약 0.1 내지 5중량%, 구체적으로 0.5 내지 2 중량% 범위로 포함될 수 있으며, 구체적인 예로, 알킬 나프탈렌 술포네이트, 소듐 알킬 나프탈렌 술포네이트, 술폰화 알킬카르복실레이트의 소듐 염, 폴리옥시알킬화 에틸 페놀, 폴리옥시에톡시화(polyoxyethoylated) 지방성 알코올, 폴리옥시에톡시화 지방성 아민, 리그닌 유도체, 알칸 술포네이트, 알킬벤젠 술포네이트, 폴리카르복시산의 염, 술포숙신산의 에스테르의 염, 알킬나프탈렌술포네이트, 알킬벤젠술포네이트, 알킬폴리글리콜 에테르 술포네이트, 알킬 에테르 포스페이트, 알킬 에테르 술페이트 또는 알킬 술포숙신산 모노에스테르일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.

상기 결합제는 상기 식물병 방제용 조성물에 약 0.1 내지 7 중량%, 구체적으로 0.5 내지 3중량%의 범위로 포함될 수 있으며, 구체적인 예로, 폴리비닐 알코올, 리그닌 유도체, 폴리비닐 피롤리돈, 폴리알킬피롤리돈, 카르복시메틸셀룰로오스, 크산탄 검, 폴리에톡시화 지방산, 폴리에톡시화 지방성 알코올, 에틸렌 옥시드 공중합체, 프로필렌 옥시드 공중합체, 폴리에틸렌 글리콜 또는 폴리에틸렌 옥시드일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.

상기 충진제는 상기 식물병 방제용 조성물에 약 0.1 내지 10%의 범위로 포함될 수 있으며, 구체적인 예로, 벤토나이트, 서브-벤토나이트(sub-bentonite), 아타풀자이트(attapulgite), 카올리나이트(kaolinite), 몬모릴로나이트, 보크사이트, 수화된 알루미나(hydrated alumina), 하소된(calcined) 알루미나, 규조토(diatomaceous earth), 백악(chalk), 백토(fuller's earth), 돌로마이트, 규조토(kieselguhr), 황토(loess), 프로필리트(prophyllite), 탈크(talc), 버미큘라이트(vermiculite), 석회암(limestone), 천연 및 합성 실리케이트(silicate), 실리카(silica) 또는 고령토(china clay)일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.

상기 유기 첨가제는 상기 식물병 방제용 조성물에 약 0.01 내지 50%의 범위로 포함될 수 있으며, 구체적인 예로, 다량 영양소(macronutrient), 미량 영양소 퇴비 비료(micronutrient compost fertilizer), 천연 원소(natural element), 천연 유기체(natural organism), 트리코데르마(trichoderma), 부식산(humic acid) 추출물, 바실러스 투린지엔시스(Bacillus thuringiensis), 바이러스, 천연 곰팡이, 식물 추출물, 제충국, 생물학적 제어 산물(biological control product), 천연 오일, 천연 추출물, 광물 또는 요소 군일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다. 상기 미량 영양소는 아연, 철, 망간, 구리, 보론, 코발트, 바나듐, 셀레늄, 실리콘 또는 니켈일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다. 상기 다량 영양소는 질소, 인, 칼륨, 칼슘 또는 마그네슘일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.

본 발명의 일 실시예에 따르면, 자가-펩티드 발현된 파지 스톡의 건조 분말을 액상화 시켜 식물병이 발생한 식물에 분무한 결과, 식물병의 진행 억제를 확인할 수 있었고 이는 파지에 의한 식물병 유발 세균의 사멸 효과로 여겨진다.

본 발명에서, 상기 식물병을 일으키는 원인균은 본 발명의 식물병 방제용 조성물에 의해 방제될 수 있는 균이라면 그 종류에 있어 제한되는 것은 아니나, 일예로 클라도스포리움 쿠쿠메리눔(Cladosporium cucumerinum),　푸사리움 솔라니(Fusarium solani), 콜레토트리쿰 코코데스(Colletotrichum coccodes), 펠리쿨라리아 사사키(Pellicularia sasaki), 알터나리아 말리(Alternaria mali) 및 보트리오티니아 퍼켈리아나(Botryotinia fuckeliana) 등에서 선택되는 하나 이상일 수 있으나 이에 제한되는 것은 아니다.

본 발명의 박테리오파지를 포함하는 식물병 방제용 조성물을 처리하여 방제할 수 있는 상기 식물병의 종류는 특별히 한정되는 것은 아니나, 일예로 도열병, 흰가루병, 고추탄저병, 포도탄저병, 사과점무늬낙엽병, 잎집무늬병, 검은별무늬병, 잿빛곰팡이병, 붉은곰팡이병, 흑점병 및 노균병 등에서 선택되는 하나 이상일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.

본 발명에서 상기 항균 또는 식물병 방제는 본 발명의 자가-펩티드 발현 박테리오 파지를 유효성분으로 포함하는 항균 조성물, 식물병 방제용 조성물을 각각 미생물 또는 식물(잎 또는 뿌리)에 처리하는 단계를 포함할 수 있으나 이에 제한되는 것은 아니다.

이하에서 본 발명을 실시하기 위한 실시예에 대하여 설명한다. 실시예는 본 발명을 실시하기 위한 하나의 예시에 해당하는 것으로서 본 발명이 실시예에 의해 한정 해석되어서는 안된다.

[실시예 1] 자가-펩타이드를 나타내는 T7 파지의 구축 및 박테리오파지 스톡(bacteriophage stocks) 준비

T7 파지 캡시드 단백질 10B 분자 상에 자가-펩티드를 발현하기 위해 T7Select415-1 클로닝 벡터(Novagen, Madison, WI)를 사용하였다. T7 파지 캡시드 상에 자가-펩티드를 나타내기 위해, 두 개의 DNA 시퀀스가 디자인되었다. 자가-펩티드의 DNA 시퀀스는 아래와 같이 합성되었다.

정방향은 5'-[phosphate] AATT CA GGT AAC TAC ACA TGC GAG GTC ACA GAG CTC ACA CGA GAA GGC GAG ACC ATA ATT GAA CTC AAG-3´(서열번호 6)이고, 역방향은 5´AGCT CTT GAG TTC AAT TAT GGT CTC GCC TTC TCG TGT GAG CTC TGT GAC CTC GCA TGT GTA GTT ACC TG-3´(서열번호 7)이다.

T7 파지에 자가-펩타이드를 나타내기 위해 두 개의 프라이머를 94℃에서 4분간 어닐링하여 이중가닥 DNA 삽입물을 형성하고, EcoRI 및 HindIII 제한 효소를 사용하여 10B 캡시드 단백질의 C-말단에 라이게이션 하였다. 인비트로 패키징 (in vitro packaging)을 통해 클로닝 벡터가 포함된 파지를 구성하고 제조사에서 권장하는 플라크-형성 어세이(plaque-forming assay)로 파지의 컴플렉시티(complexity)를 측정하였다.

PCR 증폭 후 재조합 T7 파지의 서열을 동정하였다. DNA 시퀀싱으로 PCR 산물을 확인하여 10B 캡시드에 자가-펩티드 서열이 삽입된 5'-ATG CTC GGG GAT CCG AATT CA GGT AAC TAC ACA TGC GAG GTC ACA GAG CTC ACA CGA GAA GGC GAG ACC ATA ATT GAA CTC AAG AGC TT G CGG CCG CAC TCG AGT AAC TAG-3'(서열번호 8) 또는 이와 상보적인 서열을 확인할 수 있었다. 캡시드 상에 펩티드 시퀀스를 발현하지 않는 WT-T7 대조군(control)으로 사용하였다. 자가-펩티드를 나타내는 T7 박테리오파지 및 야생형 타입 모두 준비한 후, 파지 증폭 및 정제를 수행하였다. E. coli BL21의 하루 배양한 배양물을 M9LB 배지 500㎖에 접종하고, 37℃ 진탕 배양기(shaking incubator)에서 최종 OD₆₀₀=0.7~0.8까지 배양하였다. M9LB 배지에서 BL21에 구축한 T7 파지를 감염시키고, 세포의 완전 용해가 관찰될 때까지 배양하였다. 이 후, NaCl 12.5g을 첨가하고 4℃에서 12,000×g로 10분간 원심분리하여 T7 파지에서 박테리아 잔해(debris)를 분리하였다. 다음으로, 상청액(supernatant)에 10%의 폴리에틸렌 글리콜(MW 8kDa)를 첨가하고, 4℃에서 10시간 동안 보관하여 파지를 효율적으로 침전시켰다. 위의 침전액을 4℃에서 12,000×g로 10분간 원심분리하고, 침전된 파지를 10% PEG(10mM Tris-HCl, pH 8.0, 1mM EDTA)로 재현탁(resuspend)하였다. 현탁물(suspension)을 4℃에서 14,000×g로 10분간 원심분리하고, 펠렛을 1 M NaCl (10 mM Tris-HCl, pH 8.0, 1 mM EDTA)으로 재현탁 하였다. 그 다음으로 4℃에서 14,000×g로 30분간 용액을 원심분리하고 조심스럽게 T7 파지를 포함하는 수상(aqueous phase)을 수집하였다. 파지를 TE 버퍼(10 mM Tris, pH7.5, 100 mM NaCl) 중 네 단계 구배의 염화 세슘상에서, 20℃에서3 5,000rpm으로 60분간 초원심분리(Optima XE 90 ultracentrifuge, Beckman Coulter, Pasadena, CA, USA)하여 정제하였다. 2:1 층(CsCl:TE) 위에서 T7 파지의 날카롭고 탁한 밴드가 분리되었다.

최종적으로 수득한 자가-펩티드가 발현된 T7 파지에는 메이저(major) 캡시드인 10B 캡시드에 대식세포(macrophage)의 SIRPα에 결합하는 CD47 유래의 21-mer의 서열인 GNYTCEVTELTREGETIIELK 자가-펩티드 415 카피가 발현되었다(도 16 및 도 17).

[실시예 2] In vitro에서 형광표지세포분류(fluorescence-activated cell sorting, FACS)를 이용한 식균작용(phagocytosis) 시험

1. 마우스 대식세포 J774A .1

6-웰 배양 플레이트에 웰마다 J774A.1(1.0×10⁶ cells per mL DMEM)을 분주하고 CO₂ 배양기에서 37℃ 조건으로 24시간 배양하였다. Cy5-표지된 야생형(이하 'WT-T7'은 동일한 박테리오파지를 의미함) 및 자가-펩티드 발현된 T7 박테리오파지(이하 'Self-T7'은 동일한 박테리오파지를 의미함)를 몰비 1:10 및 1:100 비율로 각각 준비하여 37℃에서 배양하였다. 30분 및 1시간 동안 배양한 후, 과량의 파지를 1㎖의 PBS로 4회 세척하였다. 1㎖의 4% 포름알데히드 첨가 후 15분간 세척하여 펩티드를 고정하고, 0.5㎖의 trypsin EDTA(Gibco, Waltham, MA)를 첨가하여 플레이트에서 세포를 분리하였다.

세포를 PBS에서 1wt% BSA로 세척하였다. 이후, FL-4 검출기(670/40)으로 ~500,000개의 세포를 검출할 수 있는 유세포측정기(Beckman Coulter MoFlo XDP, Pasadena, CA, USA)를 사용하였다.

in vitro에서 마우스 대식세포(magrophage cell)인 J774A.1에 의한 식균 작용(phagocytosis) 분석 결과는 다음과 같다. 대식세포 표면의 SIRPα와 Self-T7의 상호작용에 의해 형광 강도가 더 낮게 나타나 대식세포가 Self-T7을 더 적게 섭취한 것을 확인할 수 있었다. J774A.1과 T7 파지의 수가 1:10(J774A.1:T7 파지)일 때 식균작용이 70% 감소한 반면, 1:100 일 때 식균작용이 약 50% 감소하였다(도 1a). 그리고, 공초점 현미경 이미지는 Self-T7의 더 적은 세포 섭취(celluar uptake)를 보여주었다(도 2).

2. 인간 대식세포 THP -1.

상기 마우스의 자가-펩티드와 85%의 아미노산 서열 상동성(identities) 및 100%의 아미노산 서열 포지티브(positives)를 갖는 인간 대식세포 THP-1을 이용하여, 상기 마우스 대식세포에 대한 실험과 유사한 방법으로 유세포 측정을 수행하였다.

6-웰 배양 플레이트에 웰마다 THP-1(1.0×10⁶ cells/mL RPMI1640)을 분주하고, CO₂ 배양기에서 37℃ 조건으로 24시간 배양하였다. THP-1 세포의 분화는 100 ng/mL의 PMA(phorbol myristate acetate)에서 2일 동안 이루어졌으며, 조직 배양 플라스틱에 이들 세포가 부착됨을 통해 확인하였다.

Cy5-표지된 야생형(이하 'THP1:WT-T7') 및 자가-펩티드 발현된 T7 박테리오파지(이하 'THP-1:Self-T7')를 몰비 1:10 및 1:1000 비율로 각각 준비하여 37℃에서 배양하였다. 30분 및 1시간 동안 배양한 후, 과량의 파지를 1㎖의 PBS로 4회 세척하여 제거하였다. 1㎖의 4% 포름알데히드 첨가 후 15분간 세척하여 펩티드를 고정하고, 0.5㎖의 trypsin EDTA(Gibco, Waltham, MA)를 첨가하여 플레이트에서 세포를 분리하였다.

in vitro에서 인간 대식세포인 THP-1에 의한 식균 작용을 분석한 결과, 인간 대식세포는 THP-1:WT-T7보다 THP-1:Self-T7를 더 적게 섭취한 것을 확인하였다. 또한 THP-1과 T7 파지의 수의 비율이 1:10 일 경우에 비해, 1:1000일 때 자가 펩티드 처리한 경우, 식균작용(대식작용)이 현저하게 저하되는 것을 확인할 수 있었다(도 1b).

[실시예 3] 전혈에서(whole blood)내 자가-펩티드가 발현된 파지 및 야생형 파지 순환의 정량적 비교

OrientBio(Sungnam, Republic of Korea)로부터 6 주령 수컷 balb/c 및 NOD/SCID 마우스들을 받아 준비하였다. Cy5-표지된 야생형 및 자가-펩티드 발현된 T7 박테리오파지 2 × 10⁹ pfu를 정맥 주사하였다. 주사 후 0.25, 0.5, 1, 4, 12 및 24시간 후 각각의 마우스로부터 10% 헤파린을 포함한 튜브에 혈액을 채취하였다. Xenogen IVIS image system (Caliper Life Sciences, Waltham, MA, USA)을 사용하여 각각의 튜브의 형광 강도를 측정하였다(도 3). 추가로, 채취한 혈액을 Luria-Bertani (LB)로 연속적으로 희석하고, 혈액 내에 생존하고 있는 파지 수를 결정하기 위해 플라크-형성 어세이로 검사하였다(도 4).

검사 결과, Self-T7은 더 오랜 시간 동안 혈액에 존재하였고, 주사 후 15 분에서부터 현저한 차이가 나타는데, Self-T7 파지 플라크의 수는 WT-T7 보다 4배 이상 많았고 이러한 차이는 시간이 지나도 지속되었다. 주사 후 1시간이 되었을 때는 Self-T7 플라크가 WT-T7 보다 18.5배나 더 많았다. 파지의 전체적인 수는 NOD 마우스에서 더 높게 나타났다. 특히 Self-T7 30분까지 고농도로 존재하였고 60분 이후 감소하였으나, babl/c에서 약 12배 높은 농도를 나타냈고, WT-T7 보다는 약 4배 더 높았다. 이러한 결과는, 마우스 주(strain) 마다 서로 다른 CD47 및 SIRPα의 상호작용에 의한 것으로써, Self-T7은 혈액 순환에서 면역 작용에 의해 제거되지 않고 오랜 시간 유지될 수 있음을 확인할 수 있었다.

[실시예 4] Cy5-표지된 파지를 이용한 생체 내 분포(biodistribution) 측정

OrientBio (Sungnam, Republic of Korea)로부터 6 주령 수컷 balb/c 및 NOD 마우스들을 받아 준비하였다. Cy5-표지된 야생형 및 자가-펩티드 발현된 T7 박테리오파지 2 × 10¹⁰pfu를 정맥 주사하였다. 주사 후 2, 4, 12 및 24 시간 후 각각의 쥐마다 Xenogen IVIS image system으로 형광을 측정하였다(도 5). 30 시간 후 쥐들을 안락사 시키고 여러 장기(간, 비장, 심장, 신장 및 폐)를 적출하였다. Xenogen IVIS image system으로 각각의 장기의 형광 강도를 측정하였다(도 6).

측정 결과, Self-T7은 장기에서 WT-T7 보다 더 느리게 축적되었다. 이러한 결과로 Self-T7은 장기에서 축적되지 않고 혈액에서 더 오랜 시간 순환 될 수 있음을 알 수 있었다.

[실시예 5] 파지의 in vivo 순환 속 생체 이미지 측정

OrientBio (Sungnam, Republic of Korea)로부터 6 주령 수컷 balb/c 및 NOD 마우스들을 받아 준비하였다. 실험 동안 열 패드를 사용하여 체온을 37℃로 유지시켰다. 각 마우스 허벅지에서 대복재정맥(great saphenous vein, GSV)을 노출시키기 위해 외과적 피부 절개 후 파지 순환의 라이브 영상을 수행하였다. 토우 핀칭으로 실험 동안 마취 수준을 모니터링하였고, Zoletil-xylazine 혼합물을 지속적으로 주사했다. 파지 주사 후, 각각의 마우스의 꼬리 정맥에 FITC-dex(dextran-fluorescein isothiocyanate)를 주사하여 혈관 내강을 표지하였다. Cy5-표지된 야생형 또는 자가-펩티드 발현된 T7 박테리오파지 2 × 10¹⁰pfu를 정맥 주사 후, 2 bandpass filters(FF01-525/45, FF01-697/58, Semrock)로 2색 형광 신호를 동시에 검출하였다(도 7). 간에서 파지 축적의 라이브 이미지의 경우, 마우스의 처리 과정은 앞의 과정과 동일하게 하였다. 파지 주입 전 30분 동안 혈관 및 쿠퍼(Kupffer) 세포를 표지하기 위해 FITC-dex 및 Alexa Fluor 555-결합된 CD31 항체(CD31-A555)를 각각 주사하였다. 흉골 기저부의 ~5mm까지 단일 복부 정중안 절개를 수행하였다. 간에 조심스럽게 커버 글라스를 씌웠다. Cy5-표지된 야생형 또는 자가-펩티드 발현된 T7 박테리오파지 2×10¹⁰pfu를 정맥 주사 후, 3 bandpass filters (FF01-525/45, FF01-697/58, Semrock)를 통한 3PMT로 3색 형광 신호를 동시에 검출하였다(도 9). KAIST GSNT 부서 IVMVL 맞춤 공초점 현미경으로 이미지를 촬영하였다.

그 결과, WT-T7 및 Self-T7 모두 주사 후 즉시 형광 강도가 증가하였고, WT-T7의 형광은 1분 이내에 급격히 감소한 반면, Self-T7은 WT-T7보다 두 배 넘는 신호 강도가 지속되었다(도 7). 현광 현미경 영상을 통해 동일한 지점의 대복재정맥(GSV) 영상을 확인한 결과 WT-T7의 형광 강도는 Self-T7의 형광 강도보다 현저히 낮았다(도 8). 이러한 결과는 식균작용 때문에 시간에 따라 혈액을 순환하는 WT-T7의 양이 급격히 감소한 것을 보여주는 것이었다.

또한, WT-T7은 조직에 축적되었으나, Self-T7은 혈액을 따라 지속적으로 순환하였다. 주사 10분 후, 붉은 색인 WT-T7은 혈관이 아닌 간에서 관찰되었고, Self-T7의 경우 파지의 붉은 색이 간의 쿠퍼(Kupffer) 세포 보다 혈관에서 나타났다(도 9). 이러한 결과를 통해 T7에서 발현된 자가-펩티드가 in- vivo에서도 식균 작용을 억제하는 것을 확인할 수 있었다.

[실시예 6] in vivo 에서 파지를 이용한 치료

각 감염 실험에 대해, E. coli BL21을 광학 밀도(OD₆₀₀)가 1에 도달할 때까지(10⁹ cfu) 37℃의 진탕 배양기에서 150㎖의 LB 배지에서 단일 콜로니로부터 성장시켰다. 이 후, E. coli BL21를 100㎖의 세균 배양 용액에서 15,000×g로 10분간 원심분리하여 수확하였다. 수확한 E. coli BL21 세균을 4℃ PBS에 현탁하고, 2 × 10⁶, 2 × 10⁷, 2 × 10⁸, 2 × 10⁹, 1 × 10¹⁰cfu(per 100㎕)로 연속하여 희석하였다. 다음으로, 3주령 balb/c 수컷 마우스 (KOATECH (Pyeongtaek, Republic of Korea))를 준비하고, 치사량을 측정하기 위해 마우스에 복강 주사로 희석액을 주입한 후 100 시간 동안 관찰하였다(도 10). 구체적으로, 복강 주사로 2 × 10⁸ cfu(per 100㎕)의 E. coli BL21를 3 그룹의 마우스에 감염시켰다. 감염 30분 후, 3 그룹 중 서로 다른 2 그룹에 4 × 10⁹ pfu의 야생형 및 4 × 10⁹ pfu의 자가-펩티드 발현된 T7 마이크로파지는 주사하였다. 나머지 그룹은 컨트롤로 PBS를 주사하였다. 주사 후, 마우스들을 [정상; 0], [활동감소; 1], [혼수상태, 주름진 모피 및 꼽추; 2], [혼수상태, 주름진 모피, 꼽추 및 눈 주위 삼출물(exudates)로 감겨진 눈; 3], [빈사상태; 4], [죽음; 5]의 신체 증상을 구분하여 점수를 매겼다.

마우스들의 증상 확인 결과는 다음과 같다. PBS 처리된 컨트롤 그룹은 별다른 증상이 나타나지 않았으나, E. coli를 주사한 다른 그룹 마우스들은 48시간 이내에 사망하였다. WT-T7을 주사한 마우스는 80시간 이내에 사망하여 T7에 의한 약간의 치료 효과를 확인할 수 있었다. Self-T7을 주사한 마우스에서는 E. coli를 주사 후 20시간 까지는 증상이 나타났으나 50 내지 60시간 후에는 증상이 사라지기 시작했고 Self-T7 주사 후 100시간 후에는 증상이 완전히 사라져 정상 상태로 돌아왔다(도 11). 이러한 결과를 통해 Self-T7이 마우스에서 장기간 생존할 수 있고 박테리아 감염에 의해 야기된 증상들을 완화하기 위한 대장균 용균 활성이 유지될 수 있음을 보여주는 것이었다. 그리고, WT-T7으로 처리한 마우스에서 점성의 황색 액체가 배출되어 장의 황변과 팽창이 나타났고, 각각의 마우스에서 채취한 조직액을 배양한 결과 대장균 콜로니는 WT-T7으로 처리된 마우스 그룹에서만 나타난 것을 확인할 수 있었다(도 12).

또한, PEG로 표면 개질된 T7 박테리오파지를 4 × 10⁹ pfu(per 100㎕)를 정맥 주사하여 대장균에 의한 감염증 치료 효과를 확인할 결과, WT-T7을 정맥 주사한 결과보다는 치료 효과가 우수하였으나, 대장균이 완전히 사멸된 Self-T7와 달리 100시간 후에도 대장균이 일부 생존해 있는 것을 확인할 수 있었다(도 13, 도 14, 도 15).

[실시예 7] 파지를 이용한 경구 투여 치료

상기 실시예에서와 같이 일반적으로 사용되는 주사 투여 방식을 대신하여, 면역학적 제거를 피할 수 있는 구강 및 복강 투여 효과를 측정하였다.

모사(simulated) 실험군으로 절식된 위액(fasted gastric fluid), 급식된 위액(fed gastri fluid) 및 장액(intestinal fluid)를 하기와 같이 제조하여 사용하였다.

1. 절식된 위액(fasted gastric fluid)

0.7 % (v / v) 염산 중 0.2 % (w / v) 염화나트륨, 0.2 mg / mL 펩신, pH 1.5

2. 급식된 위액(fed gastri fluid)

0.7 % (v / v) 염산 중 0.2 % (w / v) 염화나트륨, 1.0 mg / mL 펩신, pH 5

3. 장액(intestinal fluid)

0.062 % (v / v) NaOH 중 0.68 % (w / v) KH₂PO₄, 1 % (w / v) 팬 크레아틴, pH 6.8

상기와 같이 제조된 각 실험군에 대하여, 1 x 10⁶ pfu의 WT-T7, PEG-T7 및 Self-T7 파지를 각각의 모의 유체에 첨가하고 37 ℃에서 1 시간 동안 진탕배양기에서 100 rpm으로 배양 하였다. 배양 후, 절식된 위액의 용액을 1M NaOH로 중화시키고, LB 배지로 연속하여 희석한 후, 플라크 형성 시험(plaque-forming assay)으로 37 ℃에서 E. coli BL21을 접종하여 3시간 배양한 후, 용액 중의 생존 파지의 수를 결정하였다.

각 실험군 별 생존 파지의 비율을 측정하여 도 18에 도시하였다.

상기 결과로부터 매우 낮은 pH를 갖는 절식된 위액에서는 파지의 생존이 거의 불가능하였으나, 음식물의 공급을 통해 펩신의 공급이 증가한 위액에서는 pH가 파지의 생존이 가능한 정도로 변화하여, 80% 이상의 파지가 생존함으로써 플라크(plaque)를 형성할 수 있음을 확인하였다. 이는 복강을 통해 장액에 직접 투여하는 경우에 비해서는 플라크의 생존율이 다소 낮지만, 혈관에의 주사 투여에 따른 파지의 면역학적 제거를 피할 수 있는 대안으로 음식물과 함께 경구를 통해 활용할 수 있는 가능성이 높음을 확인하였다.

[실시예 8] Self-T7 및 PEG화된 파지(PEG-T7)의 식균작용(대식작용) 비교

상기 실시예 1의 결과로부터 본원 발명의 자가-펩티드가 발현된 T7 파지(Self-T7)에는 메이저(major) 캡시드인 10B 캡시드에 대식세포(macrophage)의 SIRPα에 결합하는 CD47 유래의 21-mer의 서열인 GNYTCEVTELTREGETIIELK 자가-펩티드 415 카피가 발현된 것을 확인하였다.

본원 발명의 파지의 식균작용 효과를 비교하기 위해 대조군으로서 종래의 방법을 이용한 PEG화 파지(PEGylated phage; PEG-T7)는 상기 실시예 1의 PEG 처리 과정과 유사하게 아래와 같이 제작하였다.

E. coli BL21의 하루 배양한 배양물을 M9LB 배지 500㎖에 접종하고, 37℃ 진탕 배양기(shaking incubator)에서 최종 OD₆₀₀=0.7~0.8까지 배양하였다. M9LB 배지에서 BL21에 구축한 T7 파지를 감염시키고, 세포의 완전 용해가 관찰될 때까지 배양하였다. 이 후, NaCl 12.5g을 첨가하고 4℃에서 12,000×g로 10분간 원심분리하여 T7 파지에서 박테리아 잔해(debris)를 분리하였다. 다음으로, 상청액(supernatant)에 10%의 폴리에틸렌 글리콜(MW 8kDa)를 첨가하고, 4℃에서 10시간 동안 보관하여 파지를 효율적으로 침전시켰다. 위의 침전액을 4℃에서 12,000×g로 10분간 원심분리하고, 침전된 파지를 10% PEG(10mM Tris-HCl, pH 8.0, 1mM EDTA)로 재현탁(resuspend)하였다. 현탁물(suspension)을 4℃에서 14,000×g로 10분간 원심분리하고, 펠렛을 1 M NaCl (10 mM Tris-HCl, pH 8.0, 1 mM EDTA)으로 재현탁 하였다. 그 다음으로 4℃에서 14,000×g로 30분간 용액을 원심분리하고 조심스럽게 T7 파지를 포함하는 수상(aqueous phase)을 수집하였다. 파지를 TE 버퍼(10 mM Tris, pH7.5, 100 mM NaCl) 중 네 단계 구배의 염화 세슘상에서, 20℃에서 35,000rpm으로 60분간 초원심분리(Optima XE 90 ultracentrifuge, Beckman Coulter, Pasadena, CA, USA)하여 정제하였다.

그 결과, T7 파지에서 약 48%의 노출된 리신(lysine)이 폴리에틸렌글리콜(PEG)에 의해 컨쥬게이션된 것을 확인하였다. PEG-T7은 친수성인 PEG 층으로 둘러싸여, 혈청에 존재하는 옵소닌(opsonin)의 부착을 감소시켰다.

상기와 같이 제조된 본원 발명의 자가-펩티드가 발현된 T7 파지(Self-T7) 및 대조군 PEG-T7, WT-T7 및 PBS를, E. coli 배양 접시에 각각 처리한 후, 시간 경과에 따른 광학 밀도(OD₆₀₀)을 측정하였다(도 19). Self-T7에 발현된 자가-펩티드의 수는 T7에 접합된 PEG 수의 1/5에 불과하였으나, Self-T7은 상기 PEG-T7 대비 현저하게 우수한 대식작용 억제 효과를 나타내었다.

T7 파지에 의한 숙주의 인식에 있어서, T7 꼬리 섬유의 A518, D520, V544를 포함하는 팁 도메인(tip domain)은 숙주의 범위 결정에 중요한 역할을 수행하며, 피라미드 도메인 역시 파지 표면의 리포폴리사카라이드(lipopolysaccharide)와의 상호 작용을 위한 영역으로 활용될 수 있음을 발견하였다.

상기 결과로부터, Self-T7 파지 표면에 결합한 자가-펩티드는 파지의 꼬리에 변형을 일으키지 않아 박테리아 감염 효율에 영향을 미치지 않는 반면, PEG-T7은 파지 꼬리에 대한 스크리닝 효과로 인해 세균 감염 비율이 현저히 지연되는 것을 확인하였다. 파지 꼬리의 팁 도메인 및 피라미드 도메인에는 1차 아민 사이트가 존재하고 있음을 PDB ID code 4A0T 등을 통해 확인할 수 있으며, 이로부터 비특이적인 PEG의 결합이 T7 파지의 세균 표면 인식을 방해하는 것으로 추측할 수 있었다.

[실시예 9] 파지 조성물을 이용한 식물병의 방제 실험

상기 실시예 1로부터 제조한 박테리오파지가 보관된 스탁으로부터 박테리오파지를 꺼내어, 물 1000 mL에 박테리오파지 10 mg을 혼합하여 25 ℃에서 30분간 잘 저어 용해하여 식물병 방제를 위한 액상 조성물을 제조하였다.

이어서 오이에 검은별무늬병을 일으키는 클라도스포리움 쿠쿠메리눔(Cladosporium cucumerinum)에 대한 조성물의 활성 측정을 위해, 검은별 무늬병이 발생한 오이에 상기 제조한 액상 조성물을 오이 잎과 뿌리에 각각 150 mL 씩 10회 분무하여 처리한 후, 오이에서 검은별 무늬의 소멸 여부를 관찰하였다.

그 결과, 24시간 경과 후 점차 오이에서 검은별 무늬의 확산 속도가 느려지기 시작하여 10일 경과 후 더 이상 검은별 무늬가 확산되지 않는 것을 확인하였다. 이로부터 상기 조성물에 포함된 박테리오파지가 병원균인 클라도스포리움 쿠쿠메리눔(Cladosporium cucumerinum)에 대한 용균 활성을 나타내어 식물병의 확산을 억제하는 효과를 나타내는 것을 확인하였다.

[실시예 10] 자가-펩티드의 길이에 따른 발현 시험

T7 파지 캡시드 단백질 10B에 아래와 같이 디자인된 자가-펩티드 DNA를 합성하고 발현하였다. 발현 방법은 실시예 1과 동일하게 수행하였으며, 실시예 2 내지 6과 같은 방법으로 in vitro 및 in vivo 실험을 진행하였다.

6 mer의 자가-펩티드 DNA 서열은 아래와 같이 합성하였다.

정방향은 5'-[phosphate] AATT CA GAG GAG CTC ACA GAA GAG -3´이고, 역방향은 5´AGCT CTC TTC TGT GAG CTC CTC TG-3´이다.

7 mer의 자가-펩티드 DNA 서열은 아래와 같이 합성하였다.

정방향은 5'-[phosphate] AATT CA GAG ACA GAG CTC ACA GAA GAG -3´이고, 역방향은 5´AGCT CTC GCC TTC TGT GAG CTC CTC TG-3´이다.

8 mer의 자가-펩티드 DNA 서열은 아래와 같이 합성하였다.

정방향은 5'-[phosphate] AATT CA GGT GAG GTC GAG CTC ACA GAA GAG -3´이고, 역방향은 5´AGCT CTC TTC TGT GAG CTC GAC CTC ACC TG-3´이다.

9 mer의 자가-펩티드 DNA 서열은 아래와 같이 합성하였다.

정방향은 5'-[phosphate] AATT CA GGT GAG ACA GAG CTC ACA CGA GAA GAG -3´이고, 역방향은 5´AGCT CTC TTC TCG TGT GAG CTC TGT CTC ACC TG-3´이다.

10 mer의 자가-펩티드 DNA 서열은 아래와 같이 합성하였다.

정방향은 5'-[phosphate] AATT CA GGT GAG GTC GAG CTC ACA CGA GAA GAG AAG-3´이고, 역방향은 5´AGCT CTT CTC TTC TCG TGT GAG CTC GAC CTC ACC TG-3´이다.

11 mer의 자가-펩티드 DNA 서열은 아래와 같이 합성하였다.

정방향은 5'-[phosphate] AATT CA GGT GAG ACA GAG CTC ACA CGA GAA GGC GAG AAG-3´이고, 역방향은 5´AGCT CTT CTC GCC TTC TCG TGT GAG CTC TGT CTC ACC TG-3´이다.

12 mer의 자가-펩티드 DNA 서열은 아래와 같이 합성하였다.

정방향은 5'-[phosphate] AATT CA GGT TGC GAG GTC GAG CTC ACA CGA GAA GGC GAG AAG-3´이고, 역방향은 5´AGCT CTT CTC GCC TTC TCG TGT GAG CTC GAC CTC GCA ACC TG-3´이다.

13 mer의 자가-펩티드 DNA 서열은 아래와 같이 합성하였다.

정방향은 5'-[phosphate] AATT CA GGT TGC GAG GTC ACA GAG CTC ACA CGA GAA GGC GAG AAG-3´이고, 역방향은 5´AGCT CTT CTC GCC TTC TCG TGT GAG CTC TGT GAC CTC GCA ACC TG-3´이다.

14 mer의 자가-펩티드 DNA 서열은 아래와 같이 합성하였다.

정방향은 5'-[phosphate] AATT CA GGT TGC GAG GTC ACA GAG CTC ACA CGA GAA GGC GAG ACC AAG-3´이고, 역방향은 5´AGCT CTT GGT CTC GCC TTC TCG TGT GAG CTC TGT GAC CTC GCA ACC TG-3´이다.

15 mer의 자가-펩티드 DNA 서열은 아래와 같이 합성하였다.

정방향은 5'-[phosphate] AATT CA GGT ACA TGC GAG GTC ACA GAG CTC ACA CGA GAA GGC GAG ACC AAG-3´이고, 역방향은 5´AGCT CTT GGT CTC GCC TTC TCG TGT GAG CTC TGT GAC CTC GCA TGT ACC TG-3´이다.

16 mer의 자가-펩티드 DNA 서열은 아래와 같이 합성하였다.

정방향은 5'-[phosphate] AATT CA GGT TAC ACA TGC GAG GTC ACA GAG CTC ACA CGA GAA GGC GAG ACC AAG-3´이고, 역방향은 5´AGCT CTT GGT CTC GCC TTC TCG TGT GAG CTC TGT GAC CTC GCA TGT GTA ACC TG-3´이다.

17 mer의 자가-펩티드 DNA 서열은 아래와 같이 합성하였다.

정방향은 5'-[phosphate] AATT CA GGT TAC ACA TGC GAG GTC ACA GAG CTC ACA CGA GAA GGC GAG ACC CTC AAG-3´이고, 역방향은 5´AGCT CTT GAG GGT CTC GCC TTC TCG TGT GAG CTC TGT GAC CTC GCA TGT GTA ACC TG-3´이다.

18 mer의 자가-펩티드 DNA 서열은 아래와 같이 합성하였다.

정방향은 5'-[phosphate] AATT CA GGT TAC ACA TGC GAG GTC ACA GAG CTC ACA CGA GAA GGC GAG ACC ATA CTC AAG-3´이고, 역방향은 5´AGCT CTT GAG TAT GGT CTC GCC TTC TCG TGT GAG CTC TGT GAC CTC GCA TGT GTA ACC TG-3´이다.

19 mer의 자가-펩티드 DNA 서열은 아래와 같이 합성하였다.

정방향은 5'-[phosphate] AATT CA GGT AAC TAC TGC GAG GTC ACA GAG CTC ACA CGA GAA GGC GAG ACC ATA ATT CTC AAG-3´이고, 역방향은 5´AGCT CTT GAG AAT TAT GGT CTC GCC TTC TCG TGT GAG CTC TGT GAC CTC GCA GTA GTT ACC TG-3´이다.

20 mer의 자가-펩티드 DNA 서열은 아래와 같이 합성하였다.

정방향은 5'-[phosphate] AATT CA GGT AAC TAC ACA TGC GAG GTC ACA GAG CTC ACA CGA GAA GGC GAG ACC ATA ATT GAA AAG-3´이고, 역방향은 5´AGCT CTT TTC AAT TAT GGT CTC GCC TTC TCG TGT GAG CTC TGT GAC CTC GCA TGT GTA GTT ACC TG-3´이다.

위와 같이 합성한 자가-펩티드를 T7 박테리오파지에서 발현시켜 in vitro 및 in vivo에서 식균 작용 및 대장균 사멸 실험 결과, 자가-펩티드의 길이에 따른 효과에 있어, 실험군 사이의 차이는 있었으나 면역회피 및 대장균 사멸 효과를 모두 나타내는 것을 확인하여 본 발명을 완성하였다.

<110> Korea Advanced Institute of Science and Technology <120> Immunologically cloaking Bacteriophage <130> P-15950 <160> 38 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 21 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Self-peptide from Cluster of Differentiation 47 <400> 1 Gly Asn Tyr Thr Cys Glu Val Thr Glu Leu Thr Arg Glu Gly Glu Thr 1 5 10 15 Ile Ile Glu Leu Lys 20 <210> 2 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Self-peptide from Cluster of Differentiation 47 <400> 2 Glu Val Thr Glu Leu Thr Arg Glu Gly Glu 1 5 10 <210> 3 <211> 63 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> coding DNA of Self-peptide from Cluster of Differentiation 47 <400> 3 ggtaactaca catgcgaggt cacagagctc acacgagaag gcgagaccat aattgaactc 60 aag 63 <210> 4 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> T7 bacteriophage 10B capsid <400> 4 atgctcgggg atccgaattc aagcttg 27 <210> 5 <211> 90 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> self-peptide inserted T7 bacteriophage 10B capsid <400> 5 atgctcgggg atccgaattc aggtaactac acatgcgagg tcacagagct cacacgagaa 60 ggcgagacca taattgaact caagagcttg 90 <210> 6 <211> 69 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> embodiment 1 forward primer <400> 6 aattcaggta actacacatg cgaggtcaca gagctcacac gagaaggcga gaccataatt 60 gaactcaag 69 <210> 7 <211> 69 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> embodiment 1 reverse primer <400> 7 agctcttgag ttcaattatg gtctcgcctt ctcgtgtgag ctctgtgacc tcgcatgtgt 60 agttacctg 69 <210> 8 <211> 111 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> self-peptide inserted T7 10B capsid <400> 8 atgctcgggg atccgaattc aggtaactac acatgcgagg tcacagagct cacacgagaa 60 ggcgagacca taattgaact caagagcttg cggccgcact cgagtaacta g 111 <210> 9 <211> 24 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> 6mer self-peptide forward <400> 9 aattcagagg agctcacaga agag 24 <210> 10 <211> 24 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> 6mer self-peptide reverse <400> 10 agctctcttc tgtgagctcc tctg 24 <210> 11 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> 7mer self-peptide forward <400> 11 aattcagaga cagagctcac agaagag 27 <210> 12 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> 7mer self-peptide reverse <400> 12 agctctcgcc ttctgtgagc tcctctg 27 <210> 13 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> 8mer self-peptide forward <400> 13 aattcaggtg aggtcgagct cacagaagag 30 <210> 14 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> 8mer self-peptide reverse <400> 14 agctctcttc tgtgagctcg acctcacctg 30 <210> 15 <211> 33 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> 9mer self-peptide forward <400> 15 aattcaggtg agacagagct cacacgagaa gag 33 <210> 16 <211> 33 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> 9mer self-peptide reverse <400> 16 agctctcttc tcgtgtgagc tctgtctcac ctg 33 <210> 17 <211> 36 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> 10mer self-peptide forward <400> 17 aattcaggtg aggtcgagct cacacgagaa gagaag 36 <210> 18 <211> 36 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> 10mer self-peptide reverse <400> 18 agctcttctc ttctcgtgtg agctcgacct cacctg 36 <210> 19 <211> 39 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> 11mer self-peptide forward <400> 19 aattcaggtg agacagagct cacacgagaa ggcgagaag 39 <210> 20 <211> 39 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> 11mer self-peptide reverse <400> 20 agctcttctc gccttctcgt gtgagctctg tctcacctg 39 <210> 21 <211> 42 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> 12mer self-peptide forward <400> 21 aattcaggtt gcgaggtcga gctcacacga gaaggcgaga ag 42 <210> 22 <211> 42 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> 12mer self-peptide reverse <400> 22 agctcttctc gccttctcgt gtgagctcga cctcgcaacc tg 42 <210> 23 <211> 45 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> 13mer self-peptide forward <400> 23 aattcaggtt gcgaggtcac agagctcaca cgagaaggcg agaag 45 <210> 24 <211> 45 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> 13mer self-peptide reverse <400> 24 agctcttctc gccttctcgt gtgagctctg tgacctcgca acctg 45 <210> 25 <211> 48 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> 14mer self-peptide forward <400> 25 aattcaggtt gcgaggtcac agagctcaca cgagaaggcg agaccaag 48 <210> 26 <211> 48 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> 14mer self-peptide reverse <400> 26 agctcttggt ctcgccttct cgtgtgagct ctgtgacctc gcaacctg 48 <210> 27 <211> 51 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> 15mer self-peptide forward <400> 27 aattcaggta catgcgaggt cacagagctc acacgagaag gcgagaccaa g 51 <210> 28 <211> 51 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> 15mer self-peptide reverse <400> 28 agctcttggt ctcgccttct cgtgtgagct ctgtgacctc gcatgtacct g 51 <210> 29 <211> 54 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> 16mer self-peptide forward <400> 29 aattcaggtt acacatgcga ggtcacagag ctcacacgag aaggcgagac caag 54 <210> 30 <211> 54 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> 16mer self-peptide reverse <400> 30 agctcttggt ctcgccttct cgtgtgagct ctgtgacctc gcatgtgtaa cctg 54 <210> 31 <211> 57 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> 17mer self-peptide forward <400> 31 aattcaggtt acacatgcga ggtcacagag ctcacacgag aaggcgagac cctcaag 57 <210> 32 <211> 57 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> 17mer self-peptide reverse <400> 32 agctcttgag ggtctcgcct tctcgtgtga gctctgtgac ctcgcatgtg taacctg 57 <210> 33 <211> 60 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> 18mer self-peptide forward <400> 33 aattcaggtt acacatgcga ggtcacagag ctcacacgag aaggcgagac catactcaag 60 60 <210> 34 <211> 60 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> 18mer self-peptide reverse <400> 34 agctcttgag tatggtctcg ccttctcgtg tgagctctgt gacctcgcat gtgtaacctg 60 60 <210> 35 <211> 63 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> 19mer self-peptide forward <400> 35 aattcaggta actactgcga ggtcacagag ctcacacgag aaggcgagac cataattctc 60 aag 63 <210> 36 <211> 63 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> 19mer self-peptide reverse <400> 36 agctcttgag aattatggtc tcgccttctc gtgtgagctc tgtgacctcg cagtagttac 60 ctg 63 <210> 37 <211> 66 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> 20mer self-peptide forward <400> 37 aattcaggta actacacatg cgaggtcaca gagctcacac gagaaggcga gaccataatt 60 gaaaag 66 <210> 38 <211> 66 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> 20mer self-peptide reverse <400> 38 agctcttttc aattatggtc tcgccttctc gtgtgagctc tgtgacctcg catgtgtagt 60 tacctg 66

Claims

캡시드(capsid)에 하기 식(1)로 표현되는 자가-펩티드(self-peptide)를 포함하는 박테리오파지.
[A₁A₂A₃…A_n] - 식(1)
(n은 서열의 길이(개수)이고, 6≤n≤21이고, A₁ 내지 A_n 각각은 아미노산이고, A₁ 내지 A_n 중 6개의 아미노산은 SIRP-α(signal regulatory protein-α)와 결합할 수 있는 아미노산이고, 나머지 n-6개의 아미노산은 임의의 아미노산이며, n은 자연수이다.)
제1항에 있어서,
상기 박테리오파지는 용균성(lytic)인 박테리오파지.
제1항에 있어서,
상기 자가-펩티드는 CD47 유래인 박테리오파지.
제1항에 있어서,
상기 SIRP-α(signal regulatory protein-α)와 결합할 수 있는 아미노산은 순서대로 E, E, L, T, E, E인 박테리오파지.
제4항에 있어서,
상기 자가-펩티드는 캡시드의 C-말단에 연결된 박테리오파지.
제5항에 있어서,
상기 자가-펩티드는 서열번호 1(GNYTCEVTELTREGETIIELK) 또는 서열번호 2(EVTELTREGE)인 박테리오파지.
제1항에 있어서,
상기 박테리오파지는 T7, T3 β-phage, Phage C1, H-19B, ΦFC3208, ΦN315, Φ13, ΦMu50A, ΦETA, PVL, PV83, T12, CS112, 315.2, 및 M30로 이루어진 군에서 선택되는 박테리오파지.
제1항의 박테리오파지를 포함하는, 세균에 의해 유발되는 감염증의 치료 또는 예방용 약학 조성물.
제8항에 있어서,
상기 약학 조성물은 경구 투여 또는 주사용인 약학 조성물.
제8항에 있어서,
상기 세균은 대장균(E. coli), 시겔라소네이균(Shigella sonnei) 및 쥐티푸스균(Salmonella typhimurium), 코네리박테리움 디프테리아(Corynebacterium diphtheria), 클로스트리듐 보툴리누스(Clostridium botulinum), 황색포도상구균(Staphylococcus aureus), 화농연쇄상구균(Streptococcus pyogenes) 및 콜레라균(Vibrio cholera)으로 이루어진 군에서 선택되는 세균인 약학 조성물.
제8항에 있어서,
상기 감염증은 장염, 세균성 이질, 디프테리아(diphtheria), 급성발열, 성홍열, 콜레라 및 식중독으로 이루어진 군에서 선택되는 하나 이상의 감염증인 약학 조성물.
제1항의 박테리오파지를 포함하는 항균(anti-bacterial) 조성물.
제12항에 있어서,
상기 항균의 대상인 세균은 대장균(E. coli), 시겔라소네이균(Shigella sonnei) 및 쥐티푸스균(Salmonella typhimurium), 코네리박테리움 디프테리아(Corynebacterium diphtheria), 클로스트리듐 보툴리누스(Clostridium botulinum), 황색포도상구균(Staphylococcus aureus), 화농연쇄상구균(Streptococcus pyogenes) 및 콜레라균(Vibrio cholera)으로 이루어진 군에서 선택되는 세균인 항균 조성물.
제1항의 박테리오파지를 포함하는, 세균에 의해 유발되는 감염증 예방용 건강기능성 식품.
제1항의 박테리오파지를 포함하는 식물병 방제용 조성물.