KR20140068234A - Hgf/hgfr 활성의 모니터링 및 조정 - Google Patents

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Abstract

본 발명은 치료학적 유효량의 간세포 성장인자(HGF) 수용체 작용제를 함유하는, 개체에 있어서 림프관 형성을 증가시키기 위한 조성물이며, 상기 작용제가, 간세포 성장인자 폴리펩티드 또는 그 생물학적으로 활성이 있는 단편, 및 간세포 성장인자 폴리펩티드 또는 그 생물학적으로 활성이 있는 단편을 코딩하는 핵산으로 이루어진 군에서 선택되는 조성물을 제공한다.

Description

HGF/HGFR 활성의 모니터링 및 조정{MONITORING AND MODULATING HGF/HGFR ACTIVITY}
간세포 성장인자(Hepatocyte Growth Factor : HGF)는 인간 혈청에서 발견할 수 있는 성장인자이다.
상기 HGF의 수용체(HGFR)는 c-Met 원발암유전자의 산물로서 동정되었다. 예를 들면, Bottaro et al., Science, 251:802-804(1991); Naldini et al., Oncogene, 6:501-504(1991); WO 92/13097; 및 WO 93/15754를 참조한다.
하나의 면에서, 본 발명은 바람직하지 않은 피부 상태, 예를 들면, 피부구조가 손상된 상태를 가진 개체를 치료하는 방법을 특징으로 한다. 상기 방법은 개체에, HGF/HGFR 조정자(modulator)를 치료학적 유효량으로 투여하는 단계를 포함한다. 하나의 면에서, 본 발명은 약제의 제조에 있어서의 치료학적으로 유효량의 HGF/HGFR 조정자(예, 작용제(agonist) 또는 길항제(antagonist))의 용도를 특징으로 한다.
하나의 태양에서, 상기 조정자는 HGF/HGFR 작용제이다. HGF/HGFR 작용제는 개체에서의 HGF/HGFR의 활성을 직접적으로 또는 간접적으로 증가시키는 약물이다.
상기 작용제는 증가된 림프관 형성을 요구하는 상태를 치료하거나 또는 그 상태 치료용의 약물의 제조에 사용할 수 있다. 이러한 상태로는 림프부종, 예를 들면, 후천성 림프부종을 들 수 있다. 후천성 림프 부종의 예로는 외과수술 또는 방사선 치료 후에 획득된 림프부종, 또는, 예를 들면, 병원체에 의한 감염(예, 사사충증 등의 감염)에 의해 적어도 일부분에서 유발되는 림프부종을 들 수 있다. 림프관 형성 증가가 요구되는 기타 상태로는 노화된 피부 또는 손상된 피부(예, UVB-손상 피부)를 들 수 있다. 또 다른 상태로는 유전 또는 환경 인자(예, 자외선 방사)에 의해 부분적으로 유발되는 것들을 들 수 있다. 예를 들면, 상기 상태는 표피박리증(epidermolysis), 예를 들어, 노화 또는 자외선에의 과도한 노출에 의해 유발되는 표피박리증이다.
다수의 HGF/HGFR 작용제는 HGFR 신호전달 활성을 증가시킨다. HGF/HGFR 작용제의 예로는 간세포 성장인자 폴리펩티드(예, 그의 성숙 이형이량체 형태로 변형됨)를 포함하는 단백질 또는 그들의 생물학적으로 활성이 있는 단편 또는 유사체, 간세포 성장인자 또는 그들의 생물학적으로 활성이 있는 단편 또는 유사체를 코딩하는 핵산을 들 수 있다. 기타 단백질 및 분자(예, 항체 및 소분자)를 사용하여 HGFR 활성을 증가시킬 수도 있다. 예를 들면, HGFR과 결합 및 필요에 따라 가교(예, 이량화)하는 항체를 사용하여 HGFR 활성을 증가시킬 수 있다.
예를 들면, 상기 바람직하지 않은 상태는 염증 또는 자가면역 피부 질환(예, 건선), 또는 주사 피부염(rosacea dermatosis)이다. 치료학적으로 유효량의 HGF/HGFR 작용제를 상기의 염증성 또는 자가면역 피부 질환 또는 주사 피부염 치료용 약제의 제조에 사용할 수 있다.
하나의 태양에서, 상기 조정자는 HGF/HGFR 길항제이다. HGF/HGFR 길항제는 세포 또는 개체에서 HGF/HGFR의 활성을 직접적으로 또는 간접적으로 감소시키는 약물이다. 길항제로는 핵산 및 단백질(예, 항체 또는 가용성 HGF 수용체 단편)을 들 수 있다. 예를 들면, 상기 길항제는 HGF와 상호작용하여, 예를 들어, 세포 표면 HGFR에 대한 HGF의 결합 친화성을 감소시키는 단백질일 수 있다. 예를 들면, 상기 단백질은 (i)HGF 또는 HGFR을 인식하는 항체, 또는 (ii)HGFR의 세포외 부위, 예를 들어, 가용성 HGF 수용체(예, Fc 영역(domain)에 융합된)를 포함하는 단백질일 수 있다. 길항제의 예로는, HGF mRNA에 결합하거나 그렇지 않으면 HFG mRNA(예, mRNA 생성, 프로세싱, 또는 번역)을 저해하는 핵산 분자를 들 수 있다. 또 다른 길항제로는 우성 음성 HGF 단백질 또는 그 단편 및 HGF 핵산 발현을 감소시키는 약물(예, 인공적인 전사 인자 또는 인공적인 전사 인자를 코딩하는 핵산)을 들 수 있다.
몇몇 실시(implementation)에서, 상기 조정자는 HGF 또는 HGFR의 내인성 수준(endogenous level)을 감소시킨다.
하나의 면에서, 본 발명은 종양성 질환(예, 전이성 암), 특히 림프관내에 세포 전이를 포함한 것 또는 림프절에 전이될 잠재성을 가진 암에 걸렸거나 걸릴 위험이 있는 개체를 치료하는 방법을 특징으로 한다. 상기 방법은 개체에, 그 개체에서의 HGF/HGFR 활성을 감소시키는 HGF/HGFR 길항제를 치료학적 유효량으로 투여하는 단계를 포함한다. 치료학적으로 유효량의 HGF/HGFR는 종양성 질환, 예를 들어, 전이성 암에 걸렸거나 걸릴 위험이 있는 개체를 치료하기 위한 약제의 제조에 사용할 수 있다.
길항제로는 핵산 및 단백질(예, 항체 또는 가용성 HGF 수용체 단편)을 들 수 있다. 예를 들면, 상기 길항제는 HGF와 상호작용하여, 예를 들어, 세포 표면 HGFR에 대한 HGF의 결합 친화성을 감소시키는 단백질 또는 다른 약물일 수 있다. 예를 들면, 상기 단백질은 항체 HGF 또는 HGFR의 세포외 부위(예, 가용성 HGF 수용체)일 수 있다. 길항제의 예로는 HGF mRNA에 결합하거나 그렇지 않으면 HGF mRNA(예, mRNA 생성, 프로세싱, 또는 번역)를 저해할 수 있는 핵산 분자를 들 수 있다. 또 다른 길항제로는 우성 음성 HGF 단백질 또는 그 단편 및 HGF 핵산 발현을 감소시키는 약물(예, 인공적인 전사 인자 또는 인공적인 전사 인자를 코딩하는 핵산)을 들 수 있다.
또 다른 면에서, 본 발명은 종양성 질환(예, 전이성 암), 특히 림프관내에서의 세포 전이를 포함하는 암 또는 림프절에 전이될 잠재성이 있는 암에 걸렸거나, 걸릴 위험이 있는 개체를 치료하는 방법을 특징으로 한다. 상기 방법은 개체에, 그 개체에서의 α9 인테그린(integrin) 활성을 감소시키는 α9 인테그린 길항제를 치료학적 유효량으로 투여하는 단계를 포함한다. 예를 들면, 상기 길항제는 α9 인테그린 또는 상대(counterpart) 인테그린 β 서브유닛과 상호작용하여, 예를 들어, 세포에 대한 인테그린의 결합 친화성을 감소시키는 단백질 또는 다른 약물일 수 있다. 예를 들면, 상기 단백질은 α9 인테그린 또는 상대 인테그린 β 서브유닛에 대한 항체 또는 α9 인테그린 수용체의 세포외 부위일 수 있다. 치료학적으로 유효량의 α9 인테그린 길항제는 종양성 질환(예, 전이성 암)에 걸렸거나 또는 걸릴 위험이 있는 개체의 치료를 위한 약제의 제조에 사용될 수 있다.
길항제의 예로는 α9 인테그린 mRNA에 결합할 수 있거나 그렇지 않으면 HFG mRNA(예, mRNA 생성, 프로세싱, 또는 번역)를 저해할 수 있는 핵산 분자를 들 수 있다. 또 다른 길항제로는 우성 음성 α9 인테그린 단백질 또는 그 단편 및 α9 인테그린 핵산 발현을 감소시키는 약물(예, 인공적인 전사 인자 또는 인공적인 전사 인자를 코딩하는 핵산)을 들 수 있다.
또 다른 면에서, 본 발명은 세포 또는 개체를 평가하는 방법(예를 들면, 개체로부터 얻은 세포를 사용하는 방법)을 특징으로 한다. 상기 방법은 세포 또는 개체로부터의 세포에서의 인테그린 α9 와 스탠니오칼신 1(stanniocalcin 1)의 mRNA 또는 단백질의 발현을 평가하는 단계를 포함한다. 상기 방법은 개체의 HGF 활성 평가에 사용할 수 있다. 예를 들면, 상기 세포 또는 개체로부터 얻은 세포로는 내피세포, 예를 들어, 림프 내피세포(Lymph Endothelial Cells : LEC)를 들 수 있다. 상기 세포 또는 개체는 본 명세서에 기재된 약물(예, HGF/HGFR의 작용제 또는 길항제)에 의한 평가 전, 평가 중, 또는 평가 후에 치료할 수 있다. 상기 방법은 본 명세서에 기재된 질환에 걸렸거나 또는 걸릴 위험이 있는 개체 및 본 명세서에 기재된 약물로 치료될 수 있는 개체의 모니터링에 사용할 수 있다.
또 다른 면에서, 본 발명은 림프 내피세포 활성(예, 증식 또는 이동(migration))을 조정하는 화합물을 동정하는 방법을 특징으로 한다. 상기 방법은 HGF/HGFR 활성을 모니터링할 수 있는 세포 또는 유기체를 제공하는 단계; 상기 세포 또는 유기체와 시험 화합물을 접촉시키는 단계; 및 상기 세포 또는 유기체의 HGF/HGFR 활성을 평가하는 단계를 포함한다. 예를 들면, 상기 세포는 HGF/HGFR 활성의 리포터(reporter) 또는 이 세포를 구성하는 유기체를 포함한다. HGF/HGFR 활성은, 예를 들어, 단백질 또는 mRNA 발현 또는 리포터 활성을 측정함에 의해 평가할 수 있다. 리포터 활성 또는 다른 관련 파라미터의 변화는, 예를 들어, HGF/HGFR 활성의 변화를 나타낸다. 상기 방법은 세포 증식 또는 세포 이동(예, 림프 내피세포 증식 또는 이동)에 대한 시험 화합물의 효과를 평가하는 단계를 더 포함할 수 있다.
하나의 태양에서, 상기 리포터는 검출가능한 단백질을 코딩하는 서열, 및 HGF 또는 HGF-R 유전자의 프로모터 부위(예, 전사개시점으로부터 적어도 100, 200, 300, 500, 800, 1000, 2000, 또는 5000 염기 상류 위치까지의 부위, 개시자 MET 코돈으로부터 적어도 100, 200, 300, 500, 800, 1000, 2000, 또는 5000 염기 상류 위치까지의 부위, 또는 TATA 박스로부터 적어도 100, 200, 300, 500, 800, 1000, 2000, 또는 5000 염기 상류 위치까지의 부위)를 포함하는 작동적으로 결합된 프로모터를 포함하는 유전자이다.
상기 세포 또는 유기체는 일반적으로 포유동물, 예를 들어, 사람 또는 사람이 아닌, 예를 들면, 마우스, 래트, 햄스터, 기니픽, 원숭이 등이다.
또 다른 면에서, 본 발명은 내피세포 활성을 조정하는 화합물(예를 들면, 간세포 성장인자 의존적 림프 내피세포 증식 또는 이동을 저해하는 화합물)을 동정하는 방법을 특징으로 한다. 상기 방법은 간세포 성장인자를 발현하는 내피세포(예, 림프 내피세포)를 제공하는 단계; 상기 내피세포와 간세포 성장인자 및 시험 물질을 접촉시키는 단계; 및 상기 세포를, 예를 들어, 증식 또는 이동 등의 HGF/HGFR에 의해 조절되는 특성에 대해 평가하는 단계를 포함한다. 예를 들면, 상기 방법은 시험 화합물의 존재하에 림프 내피세포의 증식 또는 이동이 변경되는지를 결정하는 단계를 포함할 수 있다. 증식 또는 이동의 감소는 시험 화합물이 간세포 증식인자 의존적 림프 내피세포 증식을 저해함을 나타낼 수 있다.
상기 내피세포는 마우스, 래트, 토끼, 햄스터, 또는 인간 등의 포유동물 세포일 수 있다. 상기 세포는 배양 또는 단리될 수 있으며; 예를 들어, 상기 세포는 세포주 또는 1차 세포(primary cell)로부터 유래한다. 하나의 태양에서, 상기 세포는 Prox1 및 히아루로난 수용체 LYVE-1을 발현한다.
상기 방법은 또 다른 HGF/HGFR 경로 조정자의 존재 하(예를 들면, 가용성 HGF를 포함하는 단백질, HGFR의 가용성 세포외 영역을 포함하는 단백질, 또는 HGF 또는 HGFR에 대한 항체의 존재 하)에, 시험 화합물을 평가하는 단계를 포함할 수 있다.
상기 방법은, 예를 들어, 상기 시험 화합물이 질병을 일으키는지를 결정하기 위해서, 간세포 성장인자 수용체의 티로신 인산화를 평가하는 단계를 포함할 수 있다. 하나의 태양에서, 상기 림프 내피세포는 재조합 간세포 성장인자 수용체 또는 그 돌연변이를 발현한다.
상기 방법은 시험 화합물을 유기체(예, 인간 또는 인간이 아닌 포유동물)에 투여하는 단계를 더 포함할 수 있다. 상기 방법은 시험 화합물 또는 그 시험화합물의 생물학적 활성을 유지한 변형된 시험 화합물을, 예를 들어, 약제학적으로 허용가능한 담체와 결합시켜, 약제학적 조성물로서, 제제화하는 단계를 더 포함할 수 있다.
또 다른 면에서, 본 발명은 시험 화합물, 예를 들어, 시험 유기체(예, HGF/HGFR 경로 활성의 리포터를 포함하는 형질전환 유기체)에 국소적으로 적용되는 화합물을 평가하는 방법을 특징으로 한다. 상기 방법은 시험 화합물과 시험 유기체를 접촉시키는 단계와 HGF/HGFR 경로 활성을 평가하는 단계를 포함한다. 예를 들면, 상기 평가 단계는 HGF, HGFR, 또는 HGFR에 의해 조절되는 유전자 또는 유전자 산물(예, α9 인테그린 또는 스탠니노칼신 1)의 단백질 또는 mRNA 발현을 평가하는 단계를 포함할 수 있다. 또한, 상기 방법은 또 다른 HGF/HGFR 경로 조정자의 존재(예를 들면, 가용성 HGF를 포함하는 단백질, HGFR의 가용성 세포외 영역을 포함하는 단백질, 또는 HGF 또는 HGFR의 항체의 존재) 하에 시험 화합물을 평가하는 단계를 포함할 수 있다.
하나의 태양에서, 상기 리포터는 검출가능한 단백질을 코딩하는 서열, 및 HGF, HGFR, α9 인테그린 또는 스탠니오칼신1 유전자의 프로모터 부위(예를 들면, 전사개시점으로부터 적어도 100, 200, 300, 500, 800, 1000, 2000, 또는 5000 염기 상류 위치까지의 부위, 개시자 MET 코돈으로부터 적어도 100, 200, 300, 500, 800, 1000, 2000, 또는 5000 염기 상류 위치까지의 부위, 또는 TATA 박스로부터 적어도 100, 200, 300, 500, 800, 1000, 2000, 또는 5000 염기 상류 위치까지의 부위)를 포함하는 작동적으로 결합된 프로모터를 포함하는 유전자이다. 상기 방법은 2개 이상의 상기 리포터를 평가하는 단계를 포함할 수도 있다.
상기 방법은, 시험 화합물이 HGF/HGFR 경로 활성을 증가 또는 감소시킬 경우, 그 시험 화합물(예, 시험 화합물의 라이브러리로부터)을 선별하는 단계를 포함할 수 있다. 선별된 시험 화합물은, 예를 들어, 국소 투여 또는 다른 투여 경로에 적합한, 약제학적 조성물 등으로 제제화될 수 있다. 상기 방법은 상기 약제학적 조성물을 개체(예, 본 명세서에서 기재한 질환에 걸렸거나 걸릴 위험이 있는 개체)에 투여하는 단계를 더 포함할 수 있다.
본 발명의 하나 이상의 태양에 대한 상세한 내용은 하기 도면 및 상세한 설명에서 기술한다. 본 발명의 다른 특징, 목적, 및 이점은 하기 상세한 설명 및 도면, 및 청구항으로부터 명백해질 것이다. 모든 인용된 특허, 출원, 및 참조문헌은 본 명세서에 참고로서 기입한다.
도 1은 림프세포 계통 마커 mRNA 수준에 대한 정량적 RT-PCR 데이터 및 HGFR mRNA 및 단백질 대한 정량적 RT-PCR 및 면역블롯 분석 데이터를 각각 나타낸다.
도 2는 림프관의, 림프 마커 LYVE-1(녹색) 및 HGFR(적색)에 대한 이중 면역형광 염색을 나타낸다.
도 3은 마우스의 배 발생(embryonic development) 동안 림프낭 내피세포의, 림프 마커 LYVE-1(녹색) 및 HGFR(적색)에 대한 이중 면역형광 염색을 나타낸다.
도 4는 HGF로 처리한 LEC 세포에 대한 림프 내피세포(LEC) 증식 및 이동 분석에 대한 데이터를 나타낸다.
도 5는 HGF에 반응하여 시험관내에서 LEC 관(tube) 형성, 및 생체내에서의 림프관 형성 데이터를 나타낸다.
도 6은 실험에 의한 피부염증 후, LYVE-1(녹색) 및 CD31(적색)에 대한 림프관의 이중 면역형광 염색을 나타낸다.
도 7은 HGF로 처리한 후 LEC에서의 인테그린 α9 및 스탠니오칼신 1 mRNA 수준에 대한 QPCR 데이터를 나타낸다.
도 8은 HGF 형질전환 마우스(도 8b, d, f, h) 및 야생형 마우스(도 8a, c, e, g) 회장(ileum)의 대표적인 조직 영상(H&E 염색 및 포도플라닌(podoplanin) 검출용 면역형광)을 나타낸다. 스케일 바: 100㎛.
도 9는 LYVE-1(녹색) 및 CD31(적색)에 대한 마우스 귀 절편의 이중 면역형광 분석을 나타낸다. LYVE-1 양성 림프관 형성의 유도는 HGF 함유 저속 방출 펠렛을 이식한 후 14일째에 관찰되었으나(도 9b 및 c; 화살촉부분), 대조구 펠렛에서는 관찰되지 않았다. 블로킹 항-VEGFR-3 항체(도 9c)에 의한 전신적 처리는, 대조구 IgG 처리에 비해(도 9b), HGF-유도 림프관 형성을 저해하지 않았다. 새롭게 형성된 혈관이 모든 시료에서 관찰되었다. P: 펠렛, 스케일 바: 100㎛.
본 발명자들은, 무엇보다도, 간세포 성장인자 수용체(HGFR)가 림프계의 림프 내피세포(LEC)에서 고도로 발현됨을 알아내었다. HGF에 의한 LEC 처리는 LEC의 증식, 이동(migration), 및 맥관(vessel)으로의 조직화(organization)를 촉진시킨다. 또한, HGF의 마우스로의 투여는 새로운 림프관 형성을 강력하게 촉진시켰다. 또한, LEC 이동의 유도는 대부분 α9 인테그린을 거쳐서 중재되었다.
따라서, HGF/HGFR 활성을 조정함에 의해 림프계에 의해 영향을 받는 병상을 치료할 수 있다. 또한, HGF/HGFR 활성을 평가하는 파라미터를 평가함에 의해 개체를 진단할 수 있다. HGF/HGFR 활성을 조정하는 약물은, 예를 들면, 본 명세서에서 기재한 분석법 및 스크리닝법을 사용하여 동정할 수 있다.
I. HGF HGFR
인간 혈청으로부터 정제한 주요 형태(major form)에 상응하는, 인간 HGF(hHGF)의 성숙한 형태는 인간의 프로호르몬 아미노산 R494 및 V495 사이의 단백분해 분열(proteolytic cleavage)에 의해 유도된 디설피드 결합 헤테로다이머(disulfide linked heterodimer)이다. 이 분열 과정에 의해, 440개 아미노산의 α 서브유닛(분자량 69 kDa)과 234개 아미노산의 β 서브유닛(분자량 34 kDa)으로 구성된 분자를 생성한다. 상기 α 및 β 쇄는 프리-프로 전구체 단백질에 대해 코딩하는 단일 해독틀(open reading frame)로부터 생성된다. 대표적인 성숙 hHGF의 예상 1차 구조에서, 쇄간 S-S 가교는 α 쇄의 Cys 487과 β 쇄의 Cys 604 사이에 형성된다(예를 들면, Nakamura et al., Nature 342:440-443,(1989) 참조). 상기 α쇄의 N 말단은 메티오닌기에서 시작하여, 54개의 아미노산까지의 위치를 점한다. 이 세그먼트는 31개 잔기의 특징적인 소수성 리더(시그널) 서열 및 그 프로서열(prosequence)을 포함한다. 상기 α 쇄는 아미노산(aa) 55에서 시작하고, 4개의 크링글 영역(kringle domain)을 포함한다. 상기 크링글 1 영역은 α 쇄의 약 aa 128에서 약 aa 206까지 뻗어있고, 크링글 2 영역은 α 쇄의 약 aa 221과 약 aa 288 사이이고, 크링글 3 영역은 α 쇄의 약 aa 303에서 약 aa 383까지의 범위로 규정되고, 크링글 4 영역은 α 쇄의 약 aa 391에서 약 aa 464까지 뻗어있다. 대표적인 HGF는 4개의 잠정적인 글리코실화 부위를 포함하며, 이 부위들은 α쇄의 294와 402 위치, 및 β쇄의 566과 653 위치에 존재한다.
상기 HGF 수용체(HGFR)는 c-Met 원발암유전자의 산물로서 동정되었다(Bottaro et al., Science, 251:802-804(1991); Naldini et al., Oncogene, 6:501-504(1991); 1992년 8월 6일에 공개된 WO 92/13097; 1993년 8월 19일에 공개된 WO 93/15754). 상기 수용체(AKA c-MET)는 통상, 그 원래 형태로, 190-kDa 이형이량(디설피드 결합된 50-kDa α-쇄와 145-kDa β-쇄) 막-횡단(membrane spanning) 티로신 키나제 단백질을 포함한다(Park et al., Proc . Natl . Acad . Sci . USA , 84:6379-6386(1987)).
그 수용체에 대한 HGF의 결합 활성은, 처음 두개의 크링클 영역을 포함한, HGF 분자의 N-말단부에 위치한 기능적 영역에 의해 전달(convey)되는 것으로 여겨진다(Matsumoto et al., Biochem . Biophys . Res . Commun ., 181:691-699(1991); Hartmann et al. Proc . Natl . Acad . Sci., 89:11574-11578(1992); Lokker et al., EMBO J., 11:2503-2510(1992); Lokker and Godowski, J. Biol . Chem, 268:17145-17150(1991)). HGF 결합시, 상기 c-MET 단백질은 145 kDa β 서브유닛의 티로신 잔기에서 인산화된다.
본 명세서에 개시된 방법에 관하여, HGF는 정제된 폴리펩티드로서 생성될 수 있으며, 그 아미노산 서열은 하기에 기재한 HGF의 서열번호 1∼4 중 어느 것 또는 기타 자연적으로 발생하는 HGF의 변이체와 적어도 80% 일치(즉, 85%, 87%, 89%, 90%, 92%, 94%, 96%, 98%, 99%, 또는 100% 일치)할 수 있다. HGF 수용체(HGFR)는 정제된 폴리펩티드로서 생성될 수 있으며, 그 아미노산 서열은 하기에 기재한 HGFR의 서열번호 5∼8 중 어느 것 또는 기타 자연적으로 발생하는 HGFR의 변이체와 적어도 80% 일치(즉, 85%, 87%, 89%, 90%, 92%, 94%, 96%, 98%, 99%, 또는 100% 일치)할 수 있다.
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HGFR의 대표적인 부위로는 하기를 들 수 있다:
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몇몇 태양에서는, HGF 및 그들의 생물학적으로 활성이 있는 단편은 정제된 폴리펩티드로서 제공된다. 정제된 폴리펩티드로는 시험관내(in vitro)에서 생성(예, 시험관내 번역에 의해 또는 자동 폴리페티드 합성기를 사용함에 의해 생성)된 폴리펩티드류 및 처음에 세포(예, 원핵 세포, 진핵 세포, 곤충 세포, 효모 세포, 포유동물 세포, 식물 세포)내에서 발현시킨 다음 정제한 폴리펩티드를 들 수 있다. 정제된 폴리펩티드를 발현하는 세포로는 내인성 유전자를 코딩하는 세포, 폴리펩티드를 코딩하는 발현 벡터로 변환시킨 세포, 및 통상 그 세포에서 발현되지 않는 내인성 유전자의 발현을 유도하도록 실험적으로 조작된 세포(예, 유전자 활성화 기술)를 들 수 있다. 몇몇 태양에서는, 폴리펩티드는 개개의 폴리펩티드로 분열 및 분리시키는 단백질분해효소 분열부위를 포함할 수 있는 융합 단백질(예, HGFR-글루타치온-S-트랜스퍼라제 융합)이다. 몇몇 태양에서는, 폴리펩티드는 그 폴리펩티드의 정제를 촉진하는 아미노산 서열(예, 다중 히스티딘 태그, FLAG 태그 등)을 포함할 수 있다. 세포로부터 단백질을 단리하는 방법 또는 세포에 의해 발현된 폴리펩티드를 단리하는 방법으로는, 친화 정제(affinity purification), 크기 배제 크로마토그래피(size exclusion chromatography), 고성능 액체 크로마토그래피, 및 기타 크로마토그래피 정제법을 들 수 있다. 상기 폴리펩티드는 번역 후 변형(예, 글리코실화)될 수 있다.
정제된 HGF(예, 정제된 인간 HGF)는 본 명세서에 서열번호 2로 기재된 인간 HGF 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA로 안정적으로 트랙스펙션되고, 예를 들어, 미국특허번호 5,686,292, Schwall, 또는 Naka et al., Journal of Biol . Chem ., 267 (28):20114-20119(1992)에 기재된 바와 같은 성숙 HFG를 분비하는 포유동물 세포주로부터 얻을 수 있다. 몇몇 태양에서는, HGF는, Lokker et al., EMBO J., 11(7):2503-2510(1992)에 기재된 바와 같은, 분열유도 활성(mitogenic activity)은 결여되나 고친화성 수용체 결합은 유지하고 있는 단일 쇄 변이체일 수 있다.
II . HGF HGFR ( HGF / HGFR ) 조정자
다양한 약물들이 림프계와 관련된(예, 림프부종, 림프관종, 종양 림프신생, 또는 종양 전이가 유도된) 병상을 치료하기 위한 HGF/HGFR 조정자로서 사용될 수 있다. 상기 약물은 개체에 투여할 수 있는 어떠한 종류의 화합물(예, 항체, 단백질, 펩티드, 당단백질, 글리코펩티드, 당지질, 다당류, 올리고당류, 핵산, 생유기 분자, 펩티도모방제(peptidomimetic), 약리 제제 및 그들의 대사산물, 전사 및 번역 조절 서열 등)일 수 있다. 하나의 태양에서, 상기 HGF/HGFR 조정자는 생물학적인, 예를 들어, 분자량이 5~300 kDa인 단백질이다.
예를 들면, HGF/HGFR 조정자는 HGF의 HGFR에 대한 결합을 저해하거나 또는 HGF 매개 NF-κB 활성화를 방지할 수 있다. 일반적인 HGF/HGFR 조정자는 HGFR, 예를 들어, 분열유도 활성은 결여되나 고친화성 수용체 결합은 유지하고 있는 HGF의 단일 쇄 변이체에 결합할 수 있다(예를 들면, Lokker et al., EMBO J., 11(7):2503-2510,(1992) 참조). HGF에 결합하는 HGF/HGFR 조정자는 HGF의 입체구조(conformation)를 변경하여, HGF의 HGFR에 대한 결합을 방해하거나, 그렇지 않으면 HGF의 HGFR에 대한 친화성을 감소시키거나 HGF와 HGFR간의 상호결합을 막을 수 있다.
HGF/HGFR 조정자(예, 항체)는 HGF 또는 HGFR에 10-6, 10-7, 10-8, 10-9 또는 10-10M 미만의 Kd 로 결합할 수 있다. 하나의 태양에서, HGF/HGFR 조정자는 간세포 성장인자형/대식세포 자극 단백질(HGF1/MSP)에 대한 친화성보다 적어도 5, 10, 20, 50, 100, 200, 500, 또는 1000배 더 나은 친화성으로 HGF에 결합한다. 하나의 태양에서는, 상기 HGF/HGFR 조정자는 대식세포 자극 1 수용체(RON)(예, NP_002438)에 대한 친화성보다 적어도 5, 10, 20, 50, 100, 200, 500, 또는 1000배 더 나은 친화성으로 HGF 또는 HGFR에 결합한다. HGR 또는 HGFR 특이적 항체 등의 바람직한 HGF/HGFR 조정자는 HGF 또는 HGFR에 특이적으로 결합한다.
대표적인 HGF 단백질 분자로는 인간 HGF(예, 서열번호 1로서 나타낸, NP_001010932), 침팬지 HGF(예, 서열번호 2로서 나타낸, XP_519174), 마우스 HGF(예, 서열번호 3으로서 나타낸, CAA51054), 및 래트 HGF(예, 서열번호 4로서 나타낸, 1602237A)를 들 수 있다. 또한, 상술한 HGF 단백질의 성숙 과정을 거친(processed) 부위(예, 서열번호 1의 아미노산 25-1390과 적어도 90, 92, 95, 97, 98, 99% 일치 또는 완전히 일치한 아미노산 서열)와 적어도 90, 92, 95, 97, 98, 99% 일치 또는 완전히 일치한 아미노산 서열을 포함하는 단백질; 및 자연적으로 발생하는 HGF 단백질을 코딩하는 인간, 침팬지, 마우스 또는 래트 유전자와 매우 엄격한 조건 하에서 혼성화하는 핵산에 의해 코딩되는 단백질을 들 수 있다. 바람직하게는, HGF 단백질은, 성숙 과정을 거친 성숙 형태로, 적어도 하나의 HGF 활성, 예를 들면, HGFR에 결합하는 활성을 제공할 수 있다.
두 서열간의 "상동성(homology)" 또는 "서열 동일성(sequence identity)"(본 명세서에서 두 용어는 호환하여 사용함)의 계산은 다음과 같이 수행한다. 상기 서열을 최적의 비교를 위해 정렬시킨다(예, 최적의 정렬을 위해 첫번째 및 두번째 아미노산 또는 핵산 서열 중 하나 또는 둘다에 갭을 도입할 수 있고, 비상동성 서열은 비교를 위해 무시할 수 있다). 상기 최적 정렬은, 갭 감점이 12, 갭 확장 감점이 4 및 프레임시프트 갭 감점이 5인 Blossum 62 득점 매트릭스와 함께 GCG 소프트웨어 패키지의 GAP 프로그램을 사용하여 최고 점수로서 결정된다. 그 다음, 대응 아미노산 위치 또는 뉴클레오티드 위치에서의 그 아미노산 잔기 또는 뉴클레오티드를 비교한다. 첫번째 서열에서의 위치가 두번째 서열에서의 대응 위치와 동일한 아미노산 잔기 또는 뉴클레오티드에 의해 점유된 경우, 그때 그 분자는 그 위치에서 일치한다(여기서 사용된 바와 같이 아미노산 또는 핵산 "동일성"은 아미노산 또는 핵산의 "상동성"과 같은 의미이다). 상기 두 서열간의 퍼센트 동일성(identity)은 서열들간에 공유하는 일치한 위치의 수의 함수이다.
본 명세서에서 기재한 바와 같이, "매우 엄격한 조건 하에서 혼성화(hybridizes under high stringency conditions)"라 함은 혼성화 및 세정용 조건을 말한다. 혼성화 반응을 수행하기 위한 길잡이는 본 명세서에 참고로서 기입된 Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, N.Y.(1989), 6.3.1-6.3.6에서 확인할 수 있다. 상기 참고자료에 수성 및 비수성 방법이 기재되어 있으며 어느 한 방법을 사용할 수 있다. 매우 엄격한 혼성화 조건은 약 45℃에서 6X SSC에서의 혼성화 후, 65℃, 0.2X SCC, 0.1% SDS에서 또는 유사한 조건으로 1회 이상 세정하는 것을 포함한다.
대표적인 HGF/HGFR 조정자로는 HGF 또는 HGFR에 결합하는 항체, 및 HGF에 결합하는 세포 표면 HGFR과 경쟁하는 HGFR의 가용성 형태를 들 수 있다. 상기 HGFR의 가용성 형태의 예로는, HGFR-Fc라고 불리는, HGFR의 세포외 영역의 적어도 일부(예, HGFR의 가용성 HGF-결합 단편)를 포함하는 Fc 융합 단백질이 있다(예를 들면, Mark et al., Journal of Biol . Chem ., 267(36):26166-26171,(1992) 참조). HGFR의 기타 가용성 형태, 예를 들어, Fc 영역을 포함하지 않는 형태도 사용할 수 있다. 항체 HGF/HGFR 조정자는 하기에서 더 논의한다. HGF/HGFR 조정자의 다른 종류(예, 소분자, 핵산 또는 핵산계 앱테이머(aptamer), 및 펩티드)는, 예를 들어, Jhaveri et al. Nat . Biotechnol. 18:1293 및 미국특허번호 5,223,409에 기재된 바와 같이, 스크리닝하여 단리할 수 있다. 약물이 HGF 또는 HGFR에 결합하는 지와 약물이 HGF/HGFR 상호작용을 조정하는지를 결정하기 위한 대표적인 분석법(assay)이, 예를 들어, Schwall et al. 에 의한 미국 특허번호 6,468,529에 기재되어 있다.
상기 HGFR 단백질의 대표적인 가용성 형태는 HGF에 결합하는 HGFR 단백질 부위, 예를 들어, 세포외 영역(예, 세포외 부위에 있는 영역)을 포함한다. 이 부위는, 예를 들어, 그의 N 말단 또는 C 말단에 있는 또 다른 아미노산 서열(예, Fc 영역)에 융합되어, 물리적으로 결합될 수 있다. 상기 HGFR로부터의 부위는 이종 아미노산 서열 유래의 링커(linker)에 의해 구분되어 있다(spaced). Michieli et al.(2005), Cancer Cell, 6:61-73은 대표적인 HGFR 융합 단백질을 기재하고 있다.
A. 항체
대표적인 HGF/HGFR 조정자로는 HGF 및/또는 HGFR에 결합하는 항체를 들 수 있다. 하나의 태양에서는, 상기 항체는 HGF와 HGFR 간의 상호작용을, 예를 들어, 물리적으로 막거나, HGF 및/또는 HGFR의 그 상대에 대한 친화성을 감소시키거나, HGF 복합체를 파괴 또는 불안정화시키거나, HGF 또는 HGFR을 격리(sequester)시키거나, 또는 분해를 위해 HGF 또는 HGFR를 표적으로 함에 의해, 저해한다. 하나의 태양에서는, 상기 항체는 HGF/HGFR 결합 계면(binding interface)에 관여하는 하나 이상의 아미노산 잔기를 포함하는 항원결정기(epitope)에서 HGF 또는 HGFR에 결합할 수 있다. 이러한 아미노산 잔기는, 예를 들어, 알라닌 스캐닝(alanine scanning)에 의해 동정할 수 있다. 또 다른 태양에서는, 상기 항체는 HGF/HGFR 결합에 관여하지 않는 잔기에 결합할 수 있다. 예를 들면, 상기 항체는 HGF/HGFR의 입체구조(conformation)를 변경시킴으로써 결합 친화성을 감소시킬 수 있으며, 또는 상기 항체는 HGFR/HGFR 결합을 공간적으로(sterically) 방해할 수 있다. 상기 항체는 HGF의 α서브유닛 또는 β서브유닛에 결합할 수 있다.
HGF 및/또는 HGFR에 결합하는 항체 외에도, 다른 항체를 사용할 수 있다. 하나의 태양에서는, 상기 항체는 HGF/HGFR 매개 이벤트 또는 활성의 활성화를 방지할 수 있다. 예를 들면, HGF에 의해 상향조절되는, α9 인테그린에 대한 항체를 사용할 수 있다. 예를 들면, α9에 대한 어떠한 항체는 HGF 유도 세포 이동을 저해할 수 있다.
본 명세서에 기재한 바와 같이, "항체"라 함은 적어도 하나의 면역글로불린 가변부위, 예를 들어, 면역글로불린 가변 영역 또는 면역글로불린 가변 영역 서열을 제공하는 아미노산을 포함하는 단백질을 말한다. 예를 들면, 항체는 중(H)쇄 가변부위(이하, VH라고 함), 및 경(L)쇄 가변부위(이하, VL이라고 함)를 포함할 수 있다. 또 다른 예에서, 항체는 2개의 중(H)쇄 가변부위와 2개의 경(L)쇄 가변부위를 포함한다. 상기 "항체"라는 용어는 항체의 항원 결합 단편(예, 단일 쇄 항체, Fab 단편, F(ab')2 단편, Fd 단편, Fv 단편, 및 dAb 단편)뿐만 아니라, 완전한 항체(예, IgA, IgG(예, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4), IgE, IgD, IgM 형(그들의 아형 포함)의 손상없는 및/또는 전장 면역글로불린)를 포함한다. 상기 면역글로불린의 경쇄는 카파(kappa)형 또는 람다(lambda)형일 수 있다. 하나의 태양에서는, 상기 항체는 글리코실화된다. 항체는 항체 의존적 세포독성 및/또는 보체-매개 세포독성에 대해 기능적일 수 있으며, 또는 이들 활성의 하나 또는 둘 다에 대해 비기능적일 수 있다.
상기 VH 및 VL 부위는 "골격부위(framework regions)"(FR)라고 불리는 더 보존된 부위가 산재된, "상보성 결정 부위(complementarity determining region)"("CDR")라고 불리는 초가변 부위(hypervariable region)들로 더 세분할 수 있다. 상기 FR과 CDR의 범위(extent)는 정확하게 규정되어 있다(예를 들면, Kabat, E. A., et al., (1991) Sequences of Proteins of Immunological Interest, Fifth Edition, US Department of Health and Human Services, NIH Publication No.91-3242; 및 Chothia, C. et al.(1987) J. Mol . Biol . 196:901-917 참조). 본 명세서에서는 Kabat 정의가 사용된다. VH 및 VL 각각은 통상 3개의 CDR과 4개의 FR로 구성되며, 아미노 말단으로부터 카르복시 말단까지 다음 순서로 배열된다: FR1, CDR1, FR2, CDR2, FR3, CDR3, FR4.
"면역글로불린 영역(immunoglobulin domain)"은 면역글로불린 분자의 가변 또는 불변 영역 유래의 영역을 말한다. 면역글로불린 영역은 통상 약 7개의 β-가닥으로 형성된 β-시트 2개와, 보존된 이황화 결합을 포함한다(예를 들면, A. F. Williams and A. N. Barclay(1988) Ann . Rev Immunol. 6:381-405 참조). "면역글로불린 가변 영역 서열" 이라 함은 항원 결합에 적합한 입체구조로 CDR 서열을 배치(position)하기에 충분한 구조를 형성할 수 있는 아미노산 서열을 말한다. 예를 들면, 상기 서열은 자연적으로 발생하는 가변 영역의 아미노산 서열의 전부 또는 일부를 포함할 수 있다. 예를 들면, 상기 서열은 1개, 2개, 또는 그 이상의 N-말단 또는 C-말단 아미노산, 내부 아미노산을 생략할 수 있으며, 하나 이상의 삽입 또는 부가적인 말단 아미노산을 포함하거나, 또는 다른 변이를 포함할 수 있다. 하나의 태양에서, 면역글로불린 가변 영역 서열을 포함하는 폴리펩티드는 또 다른 면역글로불린 가변 영역 서열과 결합하여 표적 결합 구조(또는 "항원결합부위"), 예를 들어, HGF 또는 HGFR과 상호작용하는 구조를 형성할 수 있다.
상기 항체의 VH 또는 VL 쇄는 각각, 중쇄 또는 경쇄 불변 부위의 전체 또는 일부를 더 포함함으로써, 면역글로불린 중쇄 또는 경쇄를 형성할 수 있다. 하나의 태양에서는, 상기 항체는 면역글로불린 중쇄 2개와 면역글로불린 경쇄 2개로 된 4량체이다. 상기 면역글로불린 중쇄 및 경쇄는 이황화 결합에 의해 연결될 수 있다. 상기 중쇄 불변부위는 통상 3개의 불변 영역, CH1, CH2, 및 CH3을 포함한다. 상기 경쇄 불변부위는 통상 CL 영역을 포함한다. 상기 중쇄 및 경쇄의 가변부위는 항체와 상호작용하는 결합 영역을 포함한다. 상기 항체의 불변부위는 통상, 면역계의 각종 세포(예, 작용 세포(effector cell)) 및 전형적인 보체계의 제1 성분(Clq)을 포함한, 숙주 조직 또는 인자에 대한 항체의 결합을 매개한다.
항체의 하나의 이상의 부위는 인간이거나, 유효하게 인간이거나, 또는 인간화될 수 있다. 예를 들면, 가변부위 중 하나 이상은 인간이거나 또는 유효하게 인간일 수 있다. 예를 들면, CDR 중 하나 이상, 예를 들면, HC CDR1, HC CDR2, HC CDR3, LC CDR1, LC CDR2, 및 LC CDR3은 인간일 수 있다. 경쇄 CDR 각각은 인간일 수 있다. HC CDR3는 인간일 수 있다. 골격부위 중 하나 이상은 인간(예, HC 또는 LC의 FR1, FR2, FR3, 및 FR4)일 수 있다. 하나의 태양에서는, 모든 골격부위가, 예를 들어, 인간의 체세포(예, 면역글로불린을 생성하는 조혈세포 또는 비조혈 세포) 유래의 인간일 수 있다. 하나의 태양에서, 상기 인간 서열은, 예를 들어, 생식세포 핵산(germline nucleic acid)에 의해 코딩되는 생식세포 서열이다. 상기 불변부위 중 하나 이상은 인간이거나, 유효하게 인간이거나, 또는 인간화될 수 있다. 또 다른 태양에서, 골격부위(예, FR1, FR2 및 FR3, 총괄, 또는 FR1, FR2, FR3, 및 FR4, 총괄) 중 적어도 70, 75, 80, 85, 90, 92, 95, 또는 98% 또는 전체 항체가 인간이거나, 유효하게 인간이거나, 또는 인간화될 수 있다. 예를 들면, FR1, FR2 및 FR3는 총괄하여, 인간 생식세포 세그먼트에 의해 코딩되는 인간 서열에 대하여, 적어도 70, 75, 80, 85, 90, 92, 95, 98, 또는 99% 일치 또는 완전히 일치할 수 있다.
"유효하게 인간(effectively human)" 면역글로불린 가변부위는 그 면역글로불린 가변부위가 정상 인간에서는 면역원성 응답을 유도하지 않는 충분한 수의 인간 골격 아미노산 위치(position)를 포함하는 면역글로불린 가변부위이다. "유효하게 인간" 항체는 그 항체가 정상 인간에서는 면역원성 응답을 유도하지 않는 충분한 수의 인간 아미노산 위치를 포함하는 항체이다.
"인간화(humanized)" 면역글로불린 가변부위는 그 변형 형태가 비변형 형태보다 인간의 면역반응을 더 적게 유도하도록 변형된(예, 면역글로불린 가변부위가 정상 인간에서는 면역 반응을 유도하지 않는 충분한 수의 인간 골격 아미노산 위치를 포함하도록 변형된) 면역글로불린 가변부위이다. "인간화" 면역글로불린에 대한 설명은, 예를 들어, 미국특허번호 6,407,213 및 5,693,762에 기재되어 있다. 어떤 경우에는, 인간화 면역글로불린은 하나 이상의 골격 아미노산 위치에 비인간 아미노산을 포함할 수 있다.
HGF 또는 HGFR에 결합하는 항체는, 예를 들어, 동물을 사용한 면역화, 또는 파지 디스플레이(phage display) 등의 시험관내 방법(in vitro method)을 포함한, 다양한 수단에 의해 생성할 수 있다. HGF 또는 HGFR 전부 또는 일부는 면역원(immunogen)으로서 또는 선별용 표적으로서 사용할 수 있다. 예를 들어, HGF 또는 그 단편 또는 HGFR 또는 그 단편은 면역원으로서 사용할 수 있다. 하나의 태양에서, 상기 면역화 동물은 천연, 인간, 또는 부분적으로 인간인 면역글로불린 유전자좌를 가진 면역글로불린 생산 세포를 함유한다. 하나의 태양에서는, 상기 인간이 아닌 동물은 인간 면역글로불린 유전자의 적어도 일부를 포함한다. 예를 들면, 마우스 항체 생산이 불충분한 마우스 세포주를 인간 Ig 유전자좌의 큰 단편을 사용하여 조작(engineering)할 수 있다. 따라서, 하이브리도마 기술을 사용하여, 적어도 부분적으로 인간인, 원하는 특이성을 가진 항원 특이적 단일클론성 항체를 생성하여 선별할 수 있다. 예를 들면, XENOMOUSETM, Green et al.(1994) Nat . Gen . 7:13-21; US2003-0070185; 미국특허번호 5,789,650; 및 WO 96/34096를 참조한다.
또한, HGF 및 HGFR에 대한 비인간 항체를, 예를 들어, 설치류에서, 생산할 수 있다. 상기 비인간 항체는, 예를 들어, EP 239,400; 미국특허번호 6,602,503; 5,693,761; 및 6,407,213에 기재된 바와 같이, 인간화, 비면역화, 또는 다른 한편으로 유효하게 인간으로 되도록 변형시킬 수 있다.
EP 239 400(Winter et al.)은 하나의 종에 대한 그들의 상보성 결정 부위(CDR)를 다른 하나로부터의 상보성 결정 부위로 치환(정해진 가변부위내에서의 치환)함에 의한 항체의 변경(altering)에 대해 기재하고 있다. 통상, 비인간(예, 마우스) 항체의 CDR은 재조합 핵산 기술을 사용하여 인간 항체 중의 대응 부위내로 치환되어 원하는 치환된 항체를 코딩하는 서열을 생성한다. 상기 원하는 동종형(isotype)의 인간 불변부위 유전자 세그먼트(통상 CH에 대해서는 감마 I이고 CL에 대해서는 카파임)가 추가될 수 있으며 상기 인간화 중쇄 및 경쇄 유전자는 포유동물 세포에서 함께 발현되어 가용성 인간화 항체를 생성할 수 있다. 다른 항체 인간화 방법도 사용할 수 있다. 예를 들면, 다른 방법은 항체의 3차원 구조, 결합 결정기에 3차원적으로 근접해 있는 골격 위치, 및 면역원성 펩티드 서열을 밝힐 수 있다. 예를 들면, WO 90/07861; 미국특허번호 5,693,762; 5,693,761; 5,585,089; 및 5,530,101; Tempest et al.(1991) Biotechnology 9:266-271 및 미국특허번호 6,407,213을 참조할 수 있다.
HGF 및 HGFR에 결합하는 완전한 인간 단일클론성 항체는, Boerner et al.(1991) J. Immunol. 147:86-95에 기재된 바와 같이, 예를 들어, 시험관내 초회감작 인간 비장세포(in vitro-primed human splenocyte)를 사용하여 생산할 수 있다. 그들은, Persson et al.(1991) Proc . Nat . Acad . Sci . USA 88:2432-2436 또는 Huang and Stollar(1991) J. Immunol . Methods 141:227-236; 또한 미국특허번호 5,798,230에 기재된 바와 같은, 레퍼토리 클로닝(repertoire cloning)에 의해 제조할 수 있다. 큰 비면역화 인간 파지 디스플레이 라이브러리를 사용하여, 표준 파지 기술을 사용하여 인간 치료제로서 개발될 수 있는 고친화성 항체를 단리할 수도 있다(참조, 예를 들면, Hoogenboom et al.(1998) Immunotechnology 4:1-20; Hoogenboom et al.(2000) Immunol Today 2:371-378; 및 US 2003-0232333).
본 명세서에 기재한 항체 및 기타 단백질은 원핵 세포 및 진핵 세포에서 생산할 수 있다. 하나의 태양에서는, 상기 항체(예, scFV's)는 피키아(Pichia)(예를 들면, Powers et al.(2001) J. Immunol . Methods 251:123-35 참조), 한세울라(Hanseula), 또는 사카로마이세스(Saccharomyces)와 같은 효모 세포에서 발현된다.
항체, 특히 전장 항체(full length antibody), 예를 들어, IgG는 포유동물 세포에서 생산할 수 있다. 대표적인 재조합 발현용 포유동물 숙주 세포로는 차이니즈 햄스터 난소(CHO 세포)(예를 들어, Kaufman and Sharp(1982) Mol . Biol . 159:601-621에 기재된 바와 같은, DHFR 선택 마커와 함께 사용되는, Urlaub and Chasin(1980) Proc . Natl . Acad . Sci . USA 77:4216-4220에 기재된 디히드로폴레이트 리덕타제-음성 CHO 세포 포함), 림프 세포주, 예를 들면, NS0 골수종 세포 및 SP2 세포, COS 세포, K562, 및 형질전환동물(예, 형질전환 포유동물)로부터의 세포를 들 수 있다. 예를 들면, 상기 세포는 유방 상피세포일 수 있다.
상기 재조합 발현 벡터는, 상기 면역글로불린 영역을 코딩하는 핵산 서열 외에도, 숙주세포에서의 그 벡터의 복제를 조절하는 서열(예, 복제 기점) 등의 부가적인 핵산 서열을 운반할 수 있다. 상기 선택 마커 유전자는 상기 벡터가 도입된 숙주세포의 선별을 촉진한다(참조, 예를 들면, 미국특허번호 4,399,216; 4,634,665; 및 5,179,017). 대표적인 선택 표지 유전자는 디히드로폴레이트 리덕타제(DHFR) 유전자(메토트렉세이트 선별/증폭시 dhfr - 숙주세포에 사용됨) 및 neo 유전자(G418 선별용)를 들 수 있다.
대표적인 항체의 재조합 발현용 시스템(예, 전장 항체 또는 그들의 항원결합 부분)에서, 항체의 중쇄와 경쇄 둘다를 코딩하는 재조합 발현 벡터는 인산칼슘-매개 트랜스펙션에 의해 dhfr - CHO 세포에 도입된다. 상기 재조합 발현 벡터 내에, 상기 항체의 중쇄 및 경쇄 유전자는 유전자의 고수준 전사를 유도하는 인핸서/프로모터 조절 요소(예를 들면, CMV 인핸서/AdMLP 프로모터 조절 요소 또는 SV40 인핸서/AdMLP 프로모터 조절 요소 등의, SV40, CMV, 아데노바이러스 등에서 유래.)에 각각 작동적으로 결합되어 있다. 상기 재조합 발현 벡터는 메토트렉세이트 선별/증폭을 이용하여 벡터로 트랜스펙션된 CHO 세포의 선별이 가능하도록 하는 DHFR 유전자도 운반한다. 상기 선별된 형질전환 숙주 세포는 배양되어 상기 항체 중쇄 및 경쇄의 발현이 가능해지고 무손상 항체(intact antibody)는 배양 배지로부터 회수된다. 표준 분자생물학 기술을 사용하여, 재조합 발현 벡터를 제조하고, 숙주 세포를 트랜스펙션시키고, 형질전환체를 선별하고, 그 숙주세포를 배양하고, 그 배양 배지로부터 항체를 회수한다. 예를 들면, 일부 항체는 단백질 A 또는 단백질 G에 의한 친화성 크로마토그래피에 의해 단리할 수 있다
또한, 항체(및 Fc 융합)는, 예를 들어, Fc 기능을 변경시키는(예, Fc 수용체 또는 C1q, 또는 둘다와의 상호작용을 감소 또는 제거하는) 변형을 포함할 수 있다. 예를 들면, 인간 IgG1 불변부위는 하나 이상(예를 들면, 미국특허번호 5,648,260에서의 넘버링에 따라, 잔기 234 및 237 중의 하나 이상)의 잔기에서 변이될 수 있다. 기타 대표적인 변형으로는 미국특허 5,648,260에 기재된 것들을 들 수 있다.
Fc 영역을 포함하는 일부 단백질에 대하여, 항체/단백질 생산 시스템은 Fc 부위가 글리코실화된 항체 또는 기타 단백질을 합성하도록 설계될 수 있다. 예를 들면, IgG 분자의 Fc 영역은 CH 2 영역의 아스파라긴 297에서 글리코실화된다. 상기 Fc 영역은 다른 진핵의 번역 후 변형을 포함할 수도 있다. 다른 경우에, 상기 단백질은 글리코실화되지 않은 형태로 생산된다.
항체와 기타 단백질은 형질전환동물(transgenic animal)에 의해 생산할 수도 있다. 예를 들면, 미국특허번호 5,849,992는 형질전환포유동물의 유선에서 항체를 발현하는 방법을 기재하고 있다. 형질전환유전자(transgene)는 밀크 특이적 프로모터, 목적으로 하는 항체(예를 들면, 본 명세서에 기재된 항체)를 코딩하는 핵산 서열, 및 분비용 시그널 서열을 포함하도록 구성된다(construct). 이러한 형질전환포유동물의 암컷에 의해 생산된 밀크는, 그 내부에서 분비되는, 목적으로 하는 단백질(예, 항체 또는 Fc 융합 단백질)을 포함한다. 상기 단백질은 상기 밀크로부터 정제하거나, 또는 특정 목적으로, 직접 사용할 수 있다.
항체에 관한 문맥에 기재된 방법은 기타 단백질, 예를 들면, Fc 융합 및 가용성 수용체 단편에 적용할 수 있다.
B. HGF 변이체
몇몇 태양에서, HGF 단백질은 HGF를 그의 2 쇄 형태로 생체내 전환(in vivo conversion)시킬 수 있는 효소에 의한 단백질분해 분열(proteolytic cleavage)에 대해 내성을 나타내는 HGF 변이체일 수 있다. 상기 변이체는 바람직하게는 HGF를 그의 2쇄 형태로 전환시킬 수 있는 효소에 의해 인식되는 부위내에서의 자리지정 돌연변이(site directed mutagenesis)에 의해 단쇄 형태로 안정화된다. 이들 HGF 변이체는 실질적으로, 그 대응하는 야생형 HGF의 완전한 수용체 결합 친화성을 보유하지만, HGFR을 활성화시키지는 않는다. 하나의 태양에서, HGF 변이체는 그 대응하는 야생형 HGF에 비해 증강된 수용체 결합 친화성을 가질 수 있으나 HGFR을 활성화시킬 수 없다. 이러한 화합물은 그 대응하는 야생형 HGF의 경쟁적 길항제이며, 충분한 농도로 존재할 경우, 야생형 HGF의 HGFR에 대한 결합을 저해할 수 있다. 예를 들면, Lokker et al., EMBO J., 11(7):2503-2510,(1992) 및 Godowski et al.에 의한 미국특허번호 5,316,921를 참조한다. 따라서, 그들은 HGF/HGFR 길항제로서 사용할 수 있다.
C. 펩티드
몇몇 태양에서, HGF/HGFR 조정자는 표적 분자(예, HGFR)에 독립적으로 결합하지만 표적 분자를 활성화시키지 않는 32개 아미노산 이하의 펩티드일 수 있다. 이러한 펩티드 중 몇몇은 하나 이상의 이황화 결합을 포함할 수 있다. 다른 펩티드, 소위 "선형 펩티드(linear peptide)" 는 시스테인이 결여되어 있다. 하나의 태양에서, 상기 펩티드는 인공물이며, 즉, 자연에는 존재하지 않거나 또는 목적으로 하는 하나 이상의 게놈(예, 인간 게놈)에 의해 코딩된 단백질에는 존재하지 않는다. 합성 펩티드는 용액 중에서 거의 또는 전혀 구조를 갖지 않거나(예, 구조화되지 않거나(unconstructed)), 불균일한 구조(예, 선택적 입체구조(alternative conformatin) 또는 느슨하게 구성된(loosely structured) 구조)를 갖거나, 또는 특이한 자연 구조(예, 협동적으로 접힘)를 가질 수 있다. 어떠한 합성 펩티드는 표적 분자에 결합할 때 특정한 구조를 취한다. 어떠한 대표적인 합성 펩티드는 적어도 이황화 결합을 갖고, 예를 들어, 약 4∼12개의 비시스테인 잔기의 루프를 갖는 소위 "환상 펩티드"이다. 대표적인 펩티드는 길이가 28, 24, 20, 또는 18개 아미노산 이하이다.
HGFR에 독립적으로 결합하는 펩티드 서열은 다양한 방법에 의해 동정할 수 있다. 예를 들면, 그들은 펩티드의 디스플레이 라이브러리(display library) 또는 어레이(array)로부터 선별할 수 있다. 동정 후, 상기 펩티드는 합성 또는 재조합 수단에 의해 생산할 수 있다. 상기 서열은 더 긴 서열에 도입(예, 삽입하거나, 덧붙이거나, 또는 부착)할 수 있다.
Kay et al., Phage Display of Peptides and Proteins : A Laboratory Manual(Academic Press, Inc., San Diego 1996) 및 미국특허번호 5,223,409에서 검토한 기술은 선별된 모 주형(parental template)에 대응한 잠재적인 바인더의 라이브러리 제조에 유용하다. 이러한 기술에 따라 펩티드 디스플레이 라이브러리를 제조한 다음, HGFR에 결합하여 저해하는 펩티드를 스크리닝할 수 있다.
또한, 파지(phage) 라이브러리 또는 파지 라이브러리로부터 선별된 군집은, 예를 들면, HGF 결합에 기여하는 SEMA(세마포린) 영역 또는 PSI(플렉신/세마포린/인테그린) 영역, 또는 둘다가 결핍된 HGFR 결합 영역에 의한 역선택(counter-selection)에 의해, 역선별할 수 있다. 이러한 과정을 이용하여 HGF 결합부위에 접촉하지 않는 펩티드를 처분(discard)할 수 있다.
또한, 펩티드는, 예를 들어, 증가된 단백질분해효소 내성을 가진 화합물을 생산하기 위해, 대체 골격(alternative backbones)(예, 펩토이드 골격(peptoid backbone))을 사용하여 합성할 수 있다. 특히, 이 방법을 사용하여, HGFR 활성화를 저해하고 혈청 단백질분해효소 등에 의해 분해(cleave)되지 않는 화합물을 제조할 수 있다.
HGFR 활성화를 저해하는 폴리펩티드는 중합체와, 예를 들어, 폴리알킬렌 옥사이드 또는 폴리에틸렌 옥사이드 등의 실질적으로 비항원성 중합체와 결합할 수 있다. 적합한 중합체는 실질적으로 중량에 따라 다양하다. 약 200∼35000(또는 약 1000∼약 15000, 및 2000∼12500) 범위의 수평균 분자량을 가진 중합체를 사용할 수 있다. 복수의 중합체 부분(moiety)이 하나의 폴리펩티드에 부착될 수 있으며, 예를 들어, 수평균 분자량이 약 2000∼7000인 적어도 2개, 3개, 또는 4개의 상기 부분(moiety)이 부착될 수 있다.
예를 들면, 상기 폴리펩티드는 수용성 중합체, 예를 들어, 폴리비닐알콜 및 폴리비닐피롤리돈 등의 친수성 폴리비닐 중합체에 접합될 수 있다. 이러한 중합체로는 폴리에틸렌글리콜(PEG) 또는 폴리프로필렌글리콜 등의 폴리알킬렌 옥사이드 단독 중합체류, 폴리옥시에틸렌화 폴리올류, 그들의 공중합체류, 및 그들의 블록 공중합체류(그 블록 공중합체의 수용성이 유지되는 경우)를 들 수 있으며, 이들에 제한되지 않는다. 부가적인 유용한 중합체로는 폴리옥시에틸렌, 폴리옥시프로필렌, 폴리옥시에틸렌과 폴리옥시프로필렌의 블록 공중합체 등의 폴리옥시알킬렌류(Pluronics); 폴리메타크릴레이트류; 카르보머류; 락토스, 아밀로펙틴, 전분, 히드록시에틸 전분, 아밀로스, 덱스트란 설페이트, 덱스트란, 덱스트린, 글리코겐, 또는 산 점액다당류의 다당류 서브유닛(예, 히아루론산) 등의 동질다당류 및 이질다당류를 포함한, 당 모노머 D-만노스, D- 및 L-갈락토스, 퓨코스, 프락토스, D-자일로스, L-아라비노스, D-글루쿠론산, 시알린산, D-갈락투론산, D-만누론산(예, 폴리만누론산, 또는 알긴산), D-글루코사민, D-갈락토사민, D-글루코스 및 뉴로아민산으로 구성된 분기 또는 미분기 다당류; 폴리소르비톨 및 폴리만니톨 등의 당 알콜의 중합체류; 헤파린 또는 헤파론을 들 수 있다.
기타 화합물, 예를 들면, 세포독소(cytotoxin), 표지, 또는 또 다른 표적 약물 또는 관련없는 약물(unrelated agent)을 부착할 수도 있다. 모노활성화(mono-activated), 알콕시기말단(alkoxy-terminated) 폴리아킬렌옥사이드(PAO's), 예를 들면, 모노메톡시기말단 폴리에틸렌글리콜류(mPEG's); C1 -4 알킬말단 중합체류; 및 비스활성화 폴리에틸렌옥사이드류(글리콜류)를 가교용으로 사용할 수 있다. 예를 들면, U.S. 5,951,974를 참조할 수 있다.
D. 핵산 길항제( Nucleic acid Antagonist )
특정한 실시형태에서는, HGF, HGFR, 인테그린 α9, 또는 스탠니오칼신 1을 코딩하는 내인성 유전자의 발현을 감소시키기 위해, 핵산 길항제를 사용한다. 하나의 태양에서, 상기 핵산 길항제는 HGF 또는 HGFR을 코딩하는 mRNA를 표적으로 하는 siRNA이다. 또한, 다른 타입의 길항적 핵산으로는, 예를 들어, dsRNA, 리보자임, 3중나선 구성체, 또는 안티센스 핵산을 사용할 수 있다. 몇몇 태양에서는, 핵산 길항제는 HGFR 활성화의 하류 작용자(downstream effector) 표적으로 될 수 있다(direct)(예, 유전자은행 번호 NM_002207 하에 열거된 대표적 서열인 인간 α9 인테그린).
siRNA는 필요에 따라 오버행(overhang)을 포함하는 작은 이중 가닥 RNA(dsRNA)이다. 예를 들면, siRNA의 이중 부위는 길이가 약 18∼25의 뉴클레오티드이고, 예를 들면, 길이가 약 19, 20, 21, 22, 23, 또는 24의 뉴클레오티드이다. 통상, 상기 siRNA 서열은 표적 mRNA에 정확히 상보적이다. dsRNA 및 siRNA는 특히 포유동물 세포(예, 인간 세포)에서의 유전자 발현을 침묵시키기 위해 사용할 수 있다. 또한 siRNA는 29염기쌍의 스템과 2-뉴클레오티드 3' 오버행을 가진 짧은 헤어핀 RNA(shRNA)을 포함한다. 예를 들면, Clemens et al.(2000) Proc . Natl . Acad . Sci. USA 97:6499-6503; Billy et al.(2001) Proc . Natl . Sci . USA 98:14428-14433; Elbashir et al.(2001) Nature. 411:494-8; Yang et al.(2002) Proc . Natl . Acad. Sci . USA 99:9942-9947; Siolas et al.(2005), Nat . Biotechnol. 23(2):227-31; 20040086884; U.S.20030166282; 20030143204; 20040038278; 및 20030224432를 참조한다.
안티센스제는, 예를 들어, 약 8∼80 핵산염기(즉, 약 8∼80 뉴클레오티드), 예를 들면, 약 8∼50 핵산염기, 또는 약 12∼30 핵산염기를 포함할 수 있다. 안티센스 화합물로는 표적 핵산과 혼성화하여 그 발현을 조정하는, 리보자임, 외부 유도 서열(EGS) 올리고뉴클레오티드(올리고자임), 및 기타 짧은 촉매 RNA 또는 촉매 올리고뉴클레오티드를 들 수 있다. 안티센스 화합물은 표적 유전자 서열에 상보적인 적어도 8개의 연속적인 핵산염기의 스트레치(stretch)를 포함할 수 있다. 올리고뉴클레오티드가 특이적으로 혼성화할 수 있는 그 표적 핵산 서열에 100% 상보적일 필요는 없다. 올리고뉴클레오티드는 그 올리고뉴클레오티드의 표적에 대한 결합이 표적 분자의 정상적 기능을 방해하여 유용성의 손실을 유발할 때 특이적으로 혼성화될 수 있으며, 특이적 결합이 요구되는 조건 하에서, 즉, 생체내 분석 또는 치료 처리의 경우에, 생리학적 조건 하에서 또는, 시험관내 분석의 경우에, 그 분석이 수행되는 조건 하에서, 올리고뉴클레오티드의 표적이 아닌 서열에 대한 비특이적 결합을 회피할 정도의 충분한 상보성이 있다.
안티센스 올리고뉴클레오티드와 mRNA(예, HGF 또는 HGFR을 코딩하는 mRNA)의 혼성화는 mRNA의 정상적인 기능 중 하나 이상을 방해할 수 있다. 방해되는 mRNA의 기능으로는 예를 들어, RNA의 단백질 번역 부위로의 RNA의 전위, RNA로부터 단백질의 번역, 하나 이상의 mRNA 종을 생성하기 위한 RNA의 스플라이싱, 및 RNA가 관여하는 촉매 활성 등의 모든 주요 기능을 들 수 있다. 또한, RNA에 대한 특이적인 단백질의 결합은 RNA에 대한 안티센스 올리고뉴클레오티드 혼성화에 의해 방해될 수 있다.
대표적인 안티센스 화합물로는 표적 핵산(예, HGF 또는 HGFR을 코딩하는 mRNA)에 특이적으로 혼성화하는 DNA 또는 RNA 서열을 들 수 있다. 그 상보적인 부위는 약 8∼80 핵산염기 사이로 확장할 수 있다. 상기 화합물은 하나 이상의 변형된 핵산염기를 포함할 수 있다. 변형된 핵산염기로는, 예를 들어, 5-요오도우라실, 5-요오도시토신 등의 5-치환 피리미딘류, 및 C5-프로피닐시토신 및 C5-프로피닐우라실 등의 C5-프로피닐 피리미딘류를 들 수 있다. 기타 적합한 변형 핵산염기로는 N4--(C1-C12)알킬아미노시토신류 및 N4,N4--(C1-C12)디알킬아미노시토신류를 들 수 있다. 또한, 변형된 핵산염기로는 7-치환-8-아자-7-데아자퓨린류 및, 7-요오드-7데아자퓨린류, 7-시아노-7-데아자퓨린류, 7-아미노카르보닐-7-데아자퓨린류 등의 7-치환-7-데아자퓨린류를 들 수 있다. 이들의 예로는 6-아미노-7-요오도-7-데아자퓨린류, 6-아미노-7-시아노-7-데아자퓨린류, 6-아미노-7-아미노카르보닐-7-데아자퓨린류, 2-아미노-6-히드록시-7-요오도-7-데아자퓨린류, 2-아미노-6-히드록시-7-시아노-7-데아자퓨린류, 및 2-아미노-6-히드록시-7-아미노카르보닐-7-데아자퓨린류를 들 수 있다. 또한, N6-메틸아미노아데닌 및 N6,N6-디메틸아미노아데닌을 포함한, N6--(C1-C12)알킬아미노퓨린류 및 N6,N6--(C1-C12)디알킬아미노퓨린류도 적합한 변형 핵산염기이다. 마찬가지로, 예를 들어, 6-티오구아닌을 포함한 기타 6-치환 퓨린류는 적합한 변형 핵산염기를 구성할 수 있다. 기타 적합한 핵산염기는 2-티오우라실, 8-브로모아데닌, 8-브로모구아닌, 2-플루오로아데닌, 및 2-플루오로구아닌을 들 수 있다. 상기한 변형 핵산염기 중 어느 것의 유도체류도 적합하다. 상기한 화합물 중 어느 것의 치환체로는 C1-C30 알킬, C2-C30 알케닐, C2-C30 알키닐, 아릴, 아랄킬, 헤테로아릴, 할로, 아미노, 아미도, 니트로, 티오, 설포닐, 카르복실, 알콕시, 알킬카르보닐, 알콕시카르보닐 등을 들 수 있다.
다른 종류의 핵산제에 대한 기재도 이용할 수 있다. 예를 들면, 미국특허번호 4,987,071; 5,116,742; 및 5,093,246; Woolf et al.(1992) Proc Natl Acad Sci USA; Antisense RNA and DNA, D.A. Melton, Ed., Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor N.Y.(1988); 89:7305-9; Haselhoff and Gerlach(1988) Nature 334:585-59; Helene, C.(1991) Anticancer Drug Des. 6:569-84; Helene(1992) Ann . N.Y. Acad . Sci. 660:27-36; 및 Maher(1992) Bioassays 14:807-15를 참조한다.
E. 인공적인 전사 인자
인공적인 전사인자를 사용하여 HGF, HGFR, 인테그린 α9, 또는 스탠니오칼신 1의 발현을 조절할 수도 있다. 상기 인공적인 전사인자는 HGF 또는 HGFR을 코딩하는 내인성 유전자, 예를 들면, 조절부위(예, 프로모터)의 서열에 대한 결합력을 갖도록 설계하거나 또는 라이브러리로부터 선별할 수 있다. 예를 들면, 상기 인공적인 전사 인자는 시험관내(예, 파지디스플레이 사용, 미국특허번호 6,534,261), 또는 생체내 선별에 의해 제조하거나, 또는 인식 코드에 근거하여 설계하여 제조할 수 있다(참조, 예를 들면, WO 00/42219 및 미국특허번호 6,511,808). 예를 들면, Rebar et al.(1996) Methods Enzymol . 269:129; Greisman and Pabo(1997) Science 275:657; Isalan et al.(2001) Nat . Biotechnol 19:656; 및 Wu et al.(1995) Proc . Natl. Acad . Sci . USA 92:344를 참조하며, 이들 중에서도, 다양한 징크 핑거 영역의 라이브러리를 만드는 방법에 대하여 참조한다.
필요에 따라, 인공적인 전사 인자는 전사 조절 영역, 예를 들면, 전사를 활성화시키는 활성화 영역 또는 전사를 억제하는 억제 영역에 융합될 수 있다. 특히, 억제 영역은 HGF 또는 HGFR을 코딩하는 내인성 유전자의 발현 감소에 사용될 수 있다. 상기 인공적인 전사인자 그 자체가 세포에 전달되는 이종 핵산에 의해 코딩되거나 또는 그 단백질 자체가 세포에 전달될 수 있다(참조, 예를 들면, 미국특허번호 6,534,261). 상기 인공적인 전사인자를 코딩하는 서열을 포함하는 이종 핵산은 유도성 프로모터, 예를 들어, 세포 내에서의 그 인공적인 전사인자의 수준을 미세하게 제어할 수 있는 유도성 프로모터에 작동적으로 결합될 수 있다.
F. 약제학적 조성물
HGF/HGFR 조정자(예, 항체 또는 가용성 HGFR 단백질, 예를 들어, Fc에 융합된 HGFR 세포외 부위)는, 예를 들어, 림프계 관련 질병(예, 림프 부종, 림프관성 사상충증, 종양 림프관신생, 또는 종양 전이 등의 본 명세서에서 기재한 질환)에 걸린 개체에 투여하기 위한 약제학적 조성물로서 제형화될 수 있다. 통상, 약제학적 조성물은 약제학적으로 허용가능한 담체를 포함한다. 본 명세서에 사용되는 "약제학적으로 허용가능한 담체"는 생리학적으로 적합한 임의 및 모든 용제, 분산 매체, 코팅제, 항균제 및 항진균제, 등장제 및 흡착 지연제 등을 포함한다. 상기 조성물은 약제학적으로 허용가능한 염, 예를 들어, 산 부가 염 또는 염기 부가 염을 포함할 수 있다(참조, 예를 들면, Berge, S.M., et al.(1977) J. Pharm . Sci . 66:1-19).
상기 HGF/HGFR 조정자는 표준 방법에 따라 제제화할 수 있다. 약물 제형은 잘 확립된 기술이며, 예를 들어, Gennaro(ed.), Remington: The Science and Practice of Pharmacy, 20th ed., Lippincott, Williams & Wilkins(2000) (ISBN:0683306472); Ansel et al., Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems, 7th Ed., Lippincott Williams & Wilkins Publishers (1999)(ISBN:0683305727); 및 Kibbe(ed.), Handbook of Pharmaceutical Excipients American Pharmaceutical Association, 3rd ed.(2000)(ISBN:091733096X)에도 기재되어 있다.
하나의 태양에서, 상기 HGF/HGFR 조정자(예, 항체 또는 HGFR-Fc)는 염화나트륨, 이염기성인산나트륨 칠수화물, 일염기성인산나트륨, 및 안정화제 등의 부형제(excipient material)와 함께 제제화할 수 있다. 예를 들면, 적합한 농도로 완충액 중에 제공할 수 있고 2∼8℃에서 저장할 수 있다.
상기 약제학적 조성물은 다양한 형태일 수 있다. 이들로는, 예를 들어, 액체 용액(예, 주사가능 및 주입가능 용액), 분산액 또는 현탁액, 정제, 환, 분말, 리포좀 및 좌약 등의 액상, 반고형 및 고형 투여형태를 들 수 있다. 그 바람직한 형태는 의도한 투여 방식 및 치료상의 적용방식에 따라 달라질 수 있다. 통상적으로 본 명세서에서 기재한 약물의 조성물은 주사가능한 또는 주입가능한 용액 형태이다.
이러한 조성물은 비경구 방식(예, 정맥내, 피하, 복강내, 또는 근육내 주사)에 의해 투여할 수 있다. 본 명세서에서 사용되는 "비경구 투여" 및 "비경구적으로 투여된"이라는 어구는, 통상 주사에 의한, 장내 및 국소 투여 이외의 투여 방식을 의미하고, 이에 제한은 없으며, 피하, 근육내, 동맥내, 수막강내, 낭내, 안와내, 심장내, 진피내, 복막내, 경기관내, 피하, 표피하, 관절내, 피막하, 거미막하, 척수관내, 경막외, 및 흉골내 주사 및 주입을 포함한다.
상기 조성물은 용액, 마이크로에멀션, 분산액, 리포솜, 또는 고농도에서 안정하게 저장하기에 적합한 기타 정연한 구조로 제제화될 수 있다. 무균 주사용액은 상기에 열거한 성분들 중 하나 또는 조합한 것과 함께 본 명세서에 기재된 필요한 양의 약물을 적합한 용제에 주입한 후, 필요에 따라, 여과에 의해 살균하여 제조할 수 있다. 일반적으로, 분산액은 기본 분산매 및 상기에 열거한 성분들 중 필요한 기타 성분을 함유한 무균 운반체에, 본 명세서에서 기재한 약물을 주입하여 제조한다. 무균 주사가능 용액을 제조하기 위한 무균 분말의 경우, 바람직한 제조 방법은 본 명세서에 기재된 약물에 더하여, 그들의 앞서 살균여과한 용액으로부터 얻은 어떠한 부가적인 원하는 성분의 분말을 생산하는, 진공 건조 및 동결 건조이다. 용액의 적합한 유동성은, 예를 들어, 레시틴 등의 코팅제의 사용, 분산액의 경우에 필요한 입자 크기의 유지 및 계면활성제의 사용에 의해 유지할 수 있다. 주사가능 조성물의 지연된 흡수는 조성물내에 흡수를 지연시키는 약물(예, 모노스테아레이트염 및 젤라틴)을 포함함에 의해 유발할 수 있다.
어떠한 태양에서, 상기 HGF/HGFR 조정자는, 임플란트를 포함한 제어방출 제제, 및 마이크로캡슐화 전달 시스템 등의 상기 화합물의 빠른 방출을 막는 담체를 사용하여 제조할 수 있다. 에틸렌비닐아세테이트, 폴리안하이드라이드, 폴리글리콜산, 콜라겐, 폴리오르토에스테르 및 폴리락트산 등의 생분해성, 생체적합성 중합체를 사용할 수 있다. 이러한 제제의 많은 제조 방법이 특허되어 있거나 또는 일반적으로 알려져 있다. 예를 들면, Sustained and Controlled Release Drug Delivery Systems, J.R. Robinson, ed., Marcel Dekker, Inc., New York, 1978.을 참조한다.
HGF/HGFR 조정자(예, 항체 또는 수용성 HGFR 단백질)는, 예를 들어, 혈액, 혈청, 또는 기타 조직 등에서의 순환시 그 안정화 및/또는 유지를, 예를 들어, 적어도 1.5, 2, 5, 10, 또는 50배까지 향상시키는 부분(moiety)으로 수식(modify)될 수 있다.
예를 들면, 상기 HGF/HGFR 조정자(예, 항체 또는 가용성 HGFR 단백질)는 중합체(예, 폴리알킬렌 옥사이드 또는 폴리에틸렌 옥사이드 등의 실질적으로 비항원성 중합체)와 결합될 수 있다. 적합한 중합체는 실질적으로 중량에 따라 다양할 것이다. 약 200∼35000 Daltons(또는 약 1000∼15000, 및 약 2000∼12500) 범위의 수평균 분자량을 가진 중합체를 사용할 수 있다.
예를 들면, HGF/HGFR 조정자는 친수성 폴리비닐 중합체(예, 폴리비닐알콜 또는 폴리비닐피롤리돈) 등의 수용성 중합체에 접합될 수 있다. 이러한 중합체로는 폴리에틸렌글리콜(PEG) 또는 폴리프로필렌글리콜 등의 폴리알킬렌 옥사이드 단독중합체류, 폴리옥시에틸렌화 폴리올류, 그들의 공중합체류 및 그들의 블록 공중합체류(그 블록 공중합체의 수용성이 유지되는 경우)를 들 수 있으며, 이들에 한정되지 않는다. 부가적으로 유용한 중합체로는 폴리옥시에틸렌, 폴리옥시프로필렌, 및 폴리옥시에틸렌과 폴리옥시프로필렌의 블록 공중합체 등의 폴리옥시알킬렌류(Pluronics); 폴리메타크릴레이트류; 카르보머류; 및 분기 또는 미분기 다당류를 들 수 있다.
상기 HGF/HGFR 조정자를 두번째 약물과 조합하여 사용하는 경우, 그 두 약물은 별도로 또는 함께 제제화할 수 있다. 예를 들면, 각각의 약제학적 조성물을, 예를 들어, 투여하기 직전에 혼합하여, 함께 투여하거나, 또는 예를 들어, 동시 또는 다른 시간에 별도로 투여할 수 있다.
림프계는 조직액 항상성에 결정적인 역할을 하며, 예를 들면, 암세포 전이; 수술, 방사능 치료, 또는 감염에 의해 유도되는 등의 후천성 림프부종; 노화 또는 과도한 자외광 노출에 의해 유발되는 표피 박리증 등의 피부 상태를 포함한 다수의 병상에 영향을 미치거나 영향을 받는다. 또한, 종양 전이는 일차적으로 림프계를 통해서 발생하며, 림프절의 관여 정도는 질병의 중증도(severity)에 대한 중요한 예후 인자이다. 일차 종양에서의 림프관신생 및 종양내 림프관의 양은 동물실험(예를 들면, 유방암)에서 종양 전이와 상호관련있었다(Skobe et al., Nature Medicine 7(2):192-198(2001)). 종양내 림프 맥관계는 유방암, 결장암, 폐암, 갑상선암, 위암, 편평세포암, 중피종, 뼈육종, 및 신경모세포종 등의 많은 종양 종류의 전이에 중요한 역할을 할 수 있다.
G. 투여
상기 HGF/HGFR 조정자(예, 항체 또는 가용성 HGFR 단백질) 또는 기타 약물은 개체(예, 인간 개체)에 다양한 방법으로 투여할 수 있다. 많은 적용에 있어서, 그 투여 경로는 동맥내 주사 또는 주입(IV), 피하 주사(SC), 복강내(IP), 또는 근육내 주사 중의 하나이다. 상기 HGF/HGFR 조정자는 고정된 투여량, 또는 개체의 체중에 따라 조정한 투여량(예, mg/kg 투여량)으로서 투여할 수 있다.
또한, 상기 투여량은 상기 HGF/HGFR 조정자에 대한 항체의 생산을 감소 또는 회피하도록 선택할 수도 있다.
상기 HGF/HGFR의 투여 경로 및/또는 방식은, 예를 들어, 단층촬영, 림프관조영술, 및 특정 질병과 관련된 표준 파라미터(예, 림프 및 림프계 관련 질환을 평가 기준(criteria)) 등을 사용하여 개체를 모니터링함으로써, 개개의 경우에 맞춰질 수 있다.
투여 요법(dosage regimen)은 원하는 반응(예, 치료 반응 또는 복합 치료 효과)을 제공하도록 조정된다. 일반적으로, 개체에 약물을 생체이용가능한 양으로 투여하기 위해서, HGF/HGFR 조정자의 투여량의 어떠한 조합을 사용할 수 있다. 예를 들면, 1∼100 mg/kg, 0.5∼20 mg/kg, 또는 1∼10 mg/kg 범위의 투여량이 투여될 수 있다.
본 명세서에서 사용되는, 투여 단위 형태 또는 "고정된 투여량(fixed dose)"은 치료할 개체에 대한 단위 투여량(unitary dosage)으로서 맞춰진 물리적으로 분리된 단위를 말하며; 각 단위는 원하는 약제학적 담체 및 필요에 따라 다른 약물과 공동으로 원하는 치료 효과를 생성하도록 계산된 소정량의 활성 화합물을 함유한다.
상기 HGF/HGFR 조정자는, 림프 또는 림프계 관련 질환의 증상 또는 악화의 발병 후에, 약 10분에서 48시간 사이, 바람직하게는 약 10분과 24시간 사이, 더욱 바람직하게는 약 3시간내에 적어도 1회 투여될 수 있다. 예를 들면, 상기 약물은 림프부종에 걸렸거나 또는 걸릴 위험이 있는 환자에게 투여될 수 있다. 단일 또는 다중 투여가 행해질 수 있다. 선택적으로, 또는 부가적으로, 상기 HGF/HGFR 조정제는 연속적인 주입을 통해 투여될 수 있다. 상기 치료는, 림프 또는 림프계 관련 질환에서의 림프관신생을 적합하게 조정하기 위해서, 수일, 수주, 수개월 또는 심지어 수년 동안 지속될 수 있다.
상기 HGF/HGFR 조정자는 약 1~10주 동안, 바람직하게는 2~8주 동안, 더욱 바람직하게는 약 3~7주, 및 더욱더 바람직하게는 약 4, 5, 또는 6주 동안 주당 1회 투여할 수 있다. 숙련된 기술자들은, 질병 또는 질환의 중증도, 사전 치료, 개체의 일반 건강 및/또는 나이, 및 기타 질병의 존재를 포함한(이들에 한정되지 않음), 특정 인자들이 개체를 효과적으로 치료하는 데 필요한 투여량과 시기에 영향을 미칠 수 있음을 인식하고 있을 것이다. 더욱이, 치료학적으로 유효한 양의 화합물에 의한 개체의 치료는 단독 치료 또는, 바람직하게는, 일련의 치료를 포함할 수 있다.
개체가 본 명세서에 기재한 질환(예, 사상충증) 또는 다른 림프계 관련 질환이 발병할 위험을 가진 경우, 상기 HGF/HGFR 조정자를 예방적인 조치로서 상기 상태의 발병 전에 투여할 수 있다. 이러한 예방 치료의 지속기간은 HGF/HGFR 조정자의 단독 투여이거나 또는 그 치료를 지속할 수 있으며(예, 다중 투여), 예를 들면, 본 명세서에 기재된 상태를 가질 위험이 있는 개체는, 손상이 발생하는 것을 방지하기 위해서, 수일, 수주, 수개월, 또는 심지어 수년 동안 상기 HGF/HGFR 조정자로 치료할 수 있다.
약제학적 조성물은 본 명세서에 기재된 약물의 "치료학적으로 유효한 양(therapeutically effective amount)"을 포함할 수 있다. 이러한 유효한 양은 투여되는 약물의 효과, 또는 하나 이상의 약물을 사용하는 경우에는 약물의 병합 효과(combinational effect)에 의거하여 결정할 수 있다. 또한, 치료학적으로 유효한 양의 약물은 개체의 질병 상태, 나이, 성별, 체중 및 개체에서 원하는 반응을 유도하는 화합물의 능력(예, 적어도 하나의 질환 파라미터의 경감 또는 질환의 적어도 하나의 증상의 경감) 등의 인자에 따라 다양할 수 있다. 또한, 치료학적으로 유효한 양은 상기 조성물의 치료학적으로 유익한 효과가 어떠한 치명적이거나 해로운 효과를 능가하는 양이다.
HGF/HGFR의 길항제는 암을 치료하기 위해 사용될 수 있다. 암성 질환의 예로는, 제한은 없지만, 고형 종양, 연조직 종양, 및 전이성 병변을 들 수 있다. 고형 종양의 예로는, 폐, 유방, 림프계, 위장관(예, 결장), 비뇨생식관(예, 신장, 요로내피세포), 인두, 전립선, 난소 등의 각종 기관계의 악성종양(예, 육종, 선암종, 및 암종)은 물론, 대부분의 결장암, 직장암, 신장세포 암종, 간암, 폐의 비소세포 암종, 소장암 등의 악성종양을 포함하는 선암종을 들 수 있다. 또한, 상술한 암의 전이성 병변, 및 특히 이들 암의 전이형은 본 명세서에 기재된 방법 및 조성물을 사용하여 치료 또는 예방할 수 있다.
상기 방법은, 폐, 유방, 림프계, 위장관(예, 결장), 비뇨생식관, 전립선, 난소, 인두에 영향을 미치는 것 등의, 각종 조직계의 악성종양 뿐만 아니라, 대부분의 결장암, 신장세포 암종, 전립선암 및/또는 고환암, 폐의 비소세포 암종, 소장암 및 식도암 등의 악성종양을 포함하는 선암종의 치료에 사용할 수 있다. 치료할 수 있는 대표적인 고형 종양으로는 섬유육종, 점액육종, 지방육종, 연골육종, 골원성 육종, 척삭종, 혈관육종, 내피육종, 림프관육종, 림프관내피육종, 윤활막종, 중피종, 유윙스 종양(Ewing's turmor), 평활근육종, 횡문근육종, 결장암종, 췌장암, 유방암, 나소암, 전립선암, 편평세포 암종, 기저세포 암종, 선암종, 한선 암종, 피지선 암종, 유두 암종, 유두 선암종, 낭선암종, 수질성 암종, 기관지원성 암종, 신장세포 암종, 간암, 담관 암종, 융모막암종, 고환종, 배아 암종, 월름스 종양(Wilm's tumor), 자궁경부암, 고환종양, 폐암종, 소세포 폐암종, 비소세포 폐암종, 방광 암종, 상피 암종, 신경아교종, 별아교세포종, 속질모세포종, 두개인두종, 뇌실막세포종, 송과체종, 혈관모세포종, 청신경초종, 희소돌기아교세포종, 수막종, 악성흑색종, 신경모세포종 및 망막모세포종을 들 수 있다.
상기 "암종(carninoma)"은 본 발명의 기술분야에서 숙련된 기술자에 의해 인정된 용어이며, 호흡계 암종, 위장관계 암종, 비뇨생식관계 암종, 고환 암종, 유방 암종, 전립선 암종, 내분비계 암종, 및 흑색종을 포함한 상피 또는 내분비 조직의 악성종양을 말한다. 대표적인 암종으로는 자궁경부, 폐, 전립선, 유방, 두경부, 결장 및 난소 조직으로부터 형성된 것들을 들 수 있다. 또한 상기 용어는, 예를 들어, 암종성 및 육종성 조직으로 이루어진 악성 종양을 포함하는, 암육종 (carcinosarcoma)을 포함한다. "선암종(adenocarcinoa)"이라 함은 과립 조직으로부터 유래하는 또는 종양 세포가 인식가능한 과립 구조를 형성하는 암종을 말한다. "육종(sarcoma)"이라 함은 본 발명의 기술분야에서 숙련된 기술자에 의해 인정된 용어이며 중간엽 유래의 악성 종양을 말한다.
H. 장치 및 키트
HGF/HGFR 조정자(예, 항체 또는 가용성 HGFR)를 포함하는 약제학적 조성물은 의료 장치(medical device)를 사용하여 투여할 수 있다. 상기 장치는 휴대성(portability), 실온 저장 및, 예를 들어, 숙련되지 않은 개체 또는 해당분야의 긴급대원들에 의해 긴급한 상황에서 사용할 수 있도록 한 사용 용이성 등의 특징을 갖도록 설계될 수 있으며, 의료설비 및 기타 의료 기구로 옮겨진다. 상기 장치는, 예를 들면, HGF/HGFR 조정자를 포함하는 제제를 저장하기 위한 하나 이상의 피복물(housing)을 포함할 수 있으며, HGFR 조정자의 하나 이상의 단위 투여량을 전달하도록 형성(configure)될 수 있다.
예를 들면, 상기 약제학적 조성물은, 미국특허번호 5,399,163; 5,383,851; 5,312,335; 5,064,413; 4,941,880; 4,790,824; 또는 4,596,556에 개시된 장치와 같은, 무침 피하주사 장치를 사용하여 투여할 수 있다. 잘 알려진 임플란트(implant) 및 모듈(module)의 예로는 제어된 속도로 약물을 투여하는 이식가능 미세주입 펌프를 개시하고 있는 미국특허번호 4,487,603; 피부를 통해 약제를 투여하는 치료 장치를 개시하고 있는 미국특허번호 4,486,194; 정확한 주입 속도로 약물을 전달하기 위한 의약 주입 펌프를 개시하고 있는 미국특허번호 4,447,233; 연속 약물 전달용으로 가변성 흐름 이식가능 주입 장치를 개시하고 있는 미국특허번호 4,447,224; 다실 칸막이(multi-chamber compartment)을 가진 삼투성 약물전달시스템을 개시하고 있는 미국특허번호 4,439,196; 및 삼투성 약물전달시스템을 개시하고 있는 미국특허번호 4,475,196을 들 수 있다. 또한, 많은 다른 장치, 임플란트, 전달시스템, 및 모듈이 알려져 있다.
HGF/HGFR 조정자(예, 항체 또는 가용성 HGFR 단백질)는 키트에 제공될 수 있다. 하나의 태양에서, 상기 키트는 (a) HGF/HGFR 조정자를 함유하는 조성물을 포함하는 용기(container), 및 필요에 따라서 (b) 정보자료(informational material)를 포함한다. 상기 정보자료는 본 명세서에서 기재한 방법 및/또는 치료에 유익한 약물의 사용에 관한 설명, 지침, 마케팅 또는 기타 자료일 수 있다. 또한, 하나의 태양에서, 상기 키트는 림프 및 림프계 관련 질환을 치료하기 위한 제2 약물을 포함한다. 예를 들면, 상기 키트는 HGF/HGFR 조정자를 포유하는 조성물을 함유하는 제1 용기, 및 제2 약물을 함유하는 제2 용기를 포함한다.
상기 키트의 정보자료는 그 형태에 제한되지 않는다. 하나의 태양에서, 상기 정보자료는 화합물의 생산, 화합물의 분자량, 농도, 유효 기한, 배치 또는 생산부 정보 등에 관한 정보를 포함할 수 있다. 하나의 태양에서는, 상기 정보자료는 림프 또는 림프계 관련 질환에 걸렸거나 걸릴 위험이 있는 개체를 치료하기 위해, 예를 들어, 적합한 투여량, 투여 형태, 또는 투여 방식(예, 본 명세서에 기재된 투여량, 투여형태, 투여방식)으로 HGF/HGFR 조정자를 투여하는 방법에 관한 것이다. 상기 정보는 인쇄된 텍스트, 컴퓨터 판독가능 자료, 비디오 기록, 또는 오디오 기록을 포함한 다양한 포맷으로 제공되거나, 또는 중요한 자료에 대한 링크 또는 어드레스를 제공하는 정보로서 제공될 수 있다.
상기 키트의 조성물은, 상기 HGF/HGFR 조정자 외에, 용제 또는 완충액, 안정화제, 또는 방부제 등의 다른 성분들을 포함할 수 있다. 상기 HGF/HGFR 조정자는 액체, 건조 또는 동결형태, 바람직하게는 실질적으로 순수형 및/또는 살균형태 등의 어떠한 형태로도 제공될 수 있다. 상기 약물이 액체 용액으로 제공되는 경우, 그 액체 용액은 바람직하게는 수성 용액이다. 상기 약물이 건조형태로 제공되는 경우, 통상 적합한 용제를 첨가함에 의해 재구성이 이루어진다. 상기 용제, 예를 들면, 멸균수 또는 완충액은 필요에 따라 키트에 제공될 수 있다.
상기 키트는 상기 약물을 함유하는 조성물 또는 조성물들용의 하나 이상의 용기를 포함할 수 있다. 몇몇 태양에서, 상기 키트는 상기 조성물 및 정보자료용의 개별 용기, 분할기(dividers) 또는 칸막이를 포함한다. 예를 들면, 상기 조성물은 병, 바이알, 또는 주사기에 함유될 수 있으며, 상기 정보자료는 플라스틱 슬리브(sleeve) 또는 패킷(packet)에 포함될 수 있다. 다른 태양에서, 상기 키트의 개별 구성요소는 단일의 분리되지 않은 용기내에 포함된다. 예를 들면, 조성물은 정보자료가 라벨의 형태로 부착되어 있는 병, 바이알 또는 주사기에 함유된다. 몇몇 태양에서, 상기 키트는 복수의 개별 용기를 포함하고, 각 용기는 약물의 하나 이상의 단위 투여 형태(예, 본 명세서에 기재된 투여형태)를 포함한다. 상기 용기는 병합 단위 투여량, 예를 들어, HGF/HGFR 조정자와 제2 약물 둘다를, 예를 들어, 원하는 비율로, 포함하는 단위를 포함할 수 있다. 예를 들면, 상기 키트는 복수의 주사기, 앰플, 포일 패킷(foil packet), 기포 팩(blister pack), 또는 의료 장치(예, 각각은 단일 병합 단위 투여량을 포함함)를 포함한다. 상기 키트의 용기는 기밀, 방수(예, 수분 변화 또는 증발에 비투과성), 및/또는 차광성일 수 있다.
상기 키트는 필요에 따라 상기 조성물을 투여하기에 적합한 장치(예, 주사기) 또는 기타 적합한 전달 장치를 포함한다. 상기 장치는 약물 중 하나 또는 둘다를 미리 로딩하여 제공하거나 또는 로딩하기 적합하게 빈 상태로 제공할 수 있다.
III . HGF / HGFR 경로 활성 조정자의 스크리닝 방법
HGF/HGFR 경로 발현의 추정 조정자(예, HGF, HGFR, 인테그린 α9 및 스탠니오칼신 1)의 스크리닝은 시험관내 또는 생체내 HGF 또는 HGFR 프로모터 활성에 대한 조정자의 효과를 결정함에 의해 수행할 수 있다. 예를 들면, HGFR 프로모터(예, 인간, 원숭이 또는 마우스 HGFR 유전자의 프로모터) 또는 그 조절 부위(예, Gambarotta et al.(1994), J. Biol . Chem ., 269(17):12852-12857), 또는 HGF 프로모터(예, 인간, 원숭이 또는 마우스의 HGF 유전자의 프로모터) 또는 그 조절 부위(예, Bell et al.(1998), J. Biol . Chem ., 273(12):6900-6908)를 포함하는 핵산은 리포터 폴리펩티드를 코딩하는 핵산, 예를 들면, 하기 리포터 폴리펩티드 중의 하나(예, 증강된 녹색 형광 단백질)에 작동적으로 결합될 수 있다. 사용할 수 있는 다른 프로모터로는 HGF/HGFR 경로 활성에 의해 조정되는 다른 유전자(예, 인테그린 α9 및 스탠니오칼신 1)의 프로모터들을 들 수 있다. 상기 리포터 핵산에 작동적으로 결합된 표적 프로모터를 포함한 핵산은 배양 중인 세포에 도입되며 및/또는 형질전환동물의 생성에 사용될 수 있으며, 생체내 프로모터 활성을 평가할 수 있다. 몇몇 태양에서는, 형질전환동물은 HGF/HGFR 조정자의 투여에 의해 영향을 받는 다른 표현형(예, 피부에서의 유전자 발현 유도 또는 억제)에 대해서도 평가될 수 있다.
A. 피부에 대한 추정 HGF / HGFR 조정자의 효과 평가
본 명세서에 개시된 방법에 의해, 실험 개체의 HGF 또는 HGFR 또는 다른 표적 유전자의 발현에 대한 화합물의 효과를 평가할 수 있게 된다. 몇몇 태양에서, 피부에 대한 화합물(예, 피부 상태에 대한 치료 화합물)의 효과는 그 발현이 측정되는 동일한 실험 개체에서 평가할 수 있다. 피부에 대한 효과는 통상 피부 대사 관련 프로모터의 조절 하에 유전자 발현에 대한 효과로서 결정된다. 이러한 프로모터로는 피부 구성성분(예, 진피 또는 표피)인 산물; 피부의 수화 또는 영양에 영향을 미치는 산물; 피부 구성성분의 합성 또는 분해를 촉진하는 산물; 피부의 맥관계에 영향을 미치는 산물; 모공 대사에 영향을 미치는 산물; 피부 분비 구조에 영향을 미치는 산물; 피하 근육계에 영향을 미치는 산물; 지방조직에 영향을 미치는 산물; 또는 피부 신경에 영향을 미치는 산물의 발현 및/또는 합성을 제어하는 프로모터를 들 수 있다.
본 발명의 방법은 피부 외관 또는 건강(예, 피부 탄력성, 피부의 주름 성형), 피부의 유액(예, 물 또는 오일) 유지력, 피부의 손상(예, 광 또는 UV 유도 손상)에 저항 또는 회복시키는 능력, 증식 주기 또는 색소 침착을 포함한 모공의 대사, 또는 피하 근육 톤 및 기능에 관련된 파라미터에 대한 화합물의 효과를 평가하는데 유용하다. 일반적으로, 이들 파라미터에 대한 효과는 간접적으로, 예를 들면, 이들 파라미터 중의 어떤 것에 영향을 미치는 산물을 코딩하는 유전자에 정상적으로 커플링된 프로모터의 조절하에 리포터 유전자의 발현에 대한 효과에 의해 평가될 것이다.
형질전환동물
본 발명의 방법에 사용될 수 있는 형질전환동물로는 돼지(예, 미니돼지); 또는 설치류(예, 마우스, 래트, 또는 기니픽), 예를 들어, 무모 마우스(예를 들어, Begona M. et al.,(1994) Proc . Natl . Acad . Sci. 91:7717-7721에 기재됨), 누드 마우스, 노화 가속화 마우스(예를 들면, Takeda et al.(1991) L. Am . Geriatr . Soc. 39:911-19), 또는 가속화된 노화의 표현형을 나타내는 형질전환 돌연변이 마우스 등의 인간이 아닌 포유동물을 들 수 있다. 상기 동물의 세포 중 하나 이상, 및 바람직하게는 본질적으로 모든 세포는 형질전환유전자를 포함한다. 상기 형질전환동물은 상기 형질전환유전자에 대해 동형접합성 또는 이형접합성이다. 마우스는 바람직한 대상 동물이다.
형질전환동물(예, 마우스)을 만드는 다수의 방법들이 공지되어 있다. 하나의 대표적인 접근법은 하기에 기재한다.
배아 조작(embryo manipulation) 및 미세주입 과정은, 예를 들어, 마우스 배아 조작(Manipulating the Mouse Embryo)에 기재되어 있다(Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY., 1986, 그 내용이 본 명세서에 참고로서 기입되어 있다.). 마우스 접합체(zygote)는, 임신 말 혈청(pregnant mares serum: PMS)으로 처리한 다음 48시간 후 인간 융모성 성선 자극 호르몬으로 처리하여 과배란을 유도한, 6주된 암컷으로부터 수집할 수 있다. 초회감작된 암컷(primed female)을 수컷과 함께 두고 다음날 아침에 질전(vaginal plug)을 체크한다. 가(假)임신 암컷을 발정용으로 선별하여, 완전히 무균상태의 정관절제된 수컷과 같이 두고, 수용자로서 사용하였다. 접합체를 수집하여 난구세포를 제거한다. 나아가, 포배(blastocyst)를 획득할 수 있다. 전핵시기 배아는 수컷과 교미시킨 암컷 마우스로부터 회수한다. 암컷은 임신 말 혈청(PMS)으로 처리하여 난포 성장을 유도하고 인간 융모성 성선자극호르몬(hCG)을 처리하여 배란을 유도한다. 배아를 듈베코의 인산염 생리식염 완충액(Dulbecco's modified phosphate buffered saline(DPBS)) 중에 회수하여, 10%의 소태아혈청이 보충된 듈베코의 변형 필수배지(Dulbecco's modified essential medium(DMEM))에 유지한다.
형질전환구성물(transgenic construct)의 미세주입은 현미경에 부착된 표준 미세조작장치를 사용하여 수행할 수 있다. 예를 들면, 배아는 통상 미세주입하는 동안 오일 하에 DPBS의 100 마이크로리터 방울 내에 함유되어 있다. DNA 용액은 수컷의 전핵으로 미세주입된다. 성공적인 주입은 상기 전핵의 팽창에 의해 모니터링된다. 재조합 ES 세포는, 유사한 기술을 사용하여, 포배에 주입할 수 있다. 주입 후 즉시 배아를 수용체 암컷(예, 정관절제한 수컷 마우스와 교미시킨 성숙한 마우스)에 이입(transfer)시킨다. 일반적인 프로토콜에서, 수용체 마우스를 마취하고, 허리주위 절개를 행하여 난관을 꺼집어내어, 배아를 난관의 평대 부위로 변형시킨다. 그 체벽은 봉합하고 그 피부를 창상 클립(wound clip)으로 덮는다.
표적 구성물의 존재에 대한 스크리닝
형질전환동물은 표준 프로토콜에 의해 탄생 후 동정될 수 있다. 꼬리 조직으로부터의 DNA는 서던 블로팅 및/또는 PCR을 사용하여 표적 구성물의 존재에 대해 스크리닝할 수 있다. 그 다음, 모자이크로 나타나는 자손은, 만약 그들이 동형접합성 형질전환동물을 생산하기 위해 그들의 배자계열(germ line)에 표적 구성체를 담지한다고 믿는 경우에, 서로 교차시킨다. 그 자손이 배자계열 전달을 할지가 불명확한 경우, 그들은 모세포주 또는 기타 세포주, 및 이형접합성으로 스크리닝된 그 자손과 교차시킬 수 있다. 상기 이형접합성은 서던 블로팅 및/또는 DNA의 PCR 증폭에 의해 동정된다.
다음, 상기 이형접합체를 서로 교차시켜 동형접합성 형질전환 자손을 생산할 수 있다. 동형접합체는 이 교차 산물인 마우스는 물론, 공지의 이형접합체 마우스 및 야생형 마우스로부터의 등량의 게놈 DNA를 서든 블로팅함에 의해 동정할 수 있다. 상기 서던 블롯(southern blot)을 스크리닝하는 프로브(probe)는 상기 설명한 바와 같이 설계할 수 있다.
상기 형질전환 자손을 동정 및 특징짓는 다른 수단이 본 발명의 기술분야에 알려져 있다. 예를 들면, 노던 블롯은 리포터 유전자를 코딩하는 전사체의 존재 또는 부재에 대한 mRNA의 프로빙(probing)에 사용할 수 있다. 또한, 웨스턴 블롯은, 그 형질전환유전자에 의해 코딩되는 단백질에 대한 항체 또는, 이 유전자가 발현되는 경우, 마커 유전자 산물에 대한 항체를 사용하여 웨스턴 블롯을 프로빙함에 의해, 이들 자손의 각종 조직에서의 상기 형질전환유전자의 발현 수준을 평가하기 위해 사용할 수 있다. 결국, 상기 자손으로부터 얻은 각종 세포의 제자리 분석(in situ analysis)(세포를 고정하고 항체를 표지함 등) 및/또는 FACS (fluorescence activated cell sorting) 분석은 상기 형질전환유전자의 존재 또는 부재를 찾는 적당한 항체를 사용하여 수행할 수 있다. 예를 들면, 개개의 프로모터-리포터 형질전환유전자에 대한 형질전환마우스를 이종교배시킴에 의해, 검출가능한 전혀 다른 리포터에 작동적으로 결합된 전혀 다른 프로모터를 가진 두개의 별개의 형질전환유전자를 가진 형질전환동물을 생산할 수 있다.
기타 형질전환동물이 본 발명의 방법에 사용될 수 있다. 다양한 동물의 생산 방법은 본 발명의 기술분야에 알려져 있다. 형질전환돼지의 생산 프로토콜은 White and Yannoutsos, Current Topics in Complement Research: 64th Forum in Immunology, pp.88-94; 미국특허번호 5,523,226; 미국특허번호 5,573,933; PCT 출원 WO93/25071; 및 PCT 출원 WO95/04744에서 확인할 수 있다. 형질전환래트의 생산 프로토콜은 Bader and Ganten, Clinical and Experimental Pharmacology and Physiology, Supp. 3:S81-S87, 1996에서 확인할 수 있다. 형질전환 소(cow)의 생산 프로토콜은 Transgenic Animal Technology, A Handbook, 1994, ed., Carl A. Pinkert, Academic Press, Inc.에서 확인할 수 있다. 형질전환 양(sheep)의 생산 프로토콜은 Transgenic Animal Technology, A Handbook, 1994, ed., Carl A. Pinkert, Academic Press, Inc.에서 확인할 수 있다.
리포터 유전자
프로모터 활성은 리포터 유전자를 목적으로 하는 프로모터(예, HGF, HGFR, 인테그린 α9 또는 스탠니오칼신 1 프로모터)에 커플링시켜 분석할 수 있다. 상기 리포터 유전자는 검출가능한 산물을 코딩하는 어떠한 유전자일 수 있으며, 바람직하게는 비교적 쉽게 검출할 수 있는 유전자(예를 들면, 형광성의 유전자 산물), 또는 착색, 형광, 또는 발광 산물의 형성에 의해 측정될 수 있는 반응을 촉매하는 유전자일 수 있다. 예를 들면, 상기 리포터 유전자는 효소(예, 검출가능한 산물(예, 착색, 형광, 발광 산물)을 생성하는 효소)를 코딩할 수 있다. 리포터 유전자는 본 기술분야에 알려져 있으며, β-갈락토시다제 유전자, 루시퍼라제 유전자, 녹색 형광 단백질 유전자, 시안 형광 단백질, 황색 형광 단백질, 적색 형광 단백질, 알칼린 포스파타제 유전자, 양고추냉이(horseradish) 퍼옥시다제 유전자, β-락타마제 유전자, 또는 클로르암페니콜 아세틸 트랜스퍼라제 유전자를 포함한다. 리포터 유전자는, 예를 들어, Sambrook, J., Fritsh, E. F., and Maniatis, T. Molecular Cloning; A Laboratory Manual. 2nd, ed., Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY, 1989.에 기재되어 있다.
IV . 진단 분석( Diagnostic Assay )
A. 핵산 및 단백질 검출
어레이(array)는 시료(예, 개체로부터의 시료)를 특징짓는데 유용한 분자 도구이다. 예를 들면, 어레이는 HGF, HGFR, 인테그린 α9 및 스탠니오칼신 1 핵산에 대한 프로브를 포함한 복수 유전자, 또는 복수 단백질에 대한 캡쳐 프로브(capture probe)를 갖는다. 어레이는 기체(substrate)상에 많은 어드레스(예, 배치부(locatable site))를 가질 수 있다. 상기 특성의 어레이는 다양한 포맷으로 형성될 수 있으며, 하기에 설명한 예에 한정되는 것은 아니다.
상기 기체는 불투명, 반투명, 또는 투명할 수 있다. 상기 어드레스는 기체 상에 일차원으로(예, 선형 어레이); 이차원으로(에, 평판 어레이); 또는 3차원으로(예, 3차원적 어레이) 배치될 수 있다. 상기 고형 기체는 어떠한 편리한 모양 또는 형태(예, 사각형, 직사각형, 타원형, 원형)일 수 있다.
어레이는 다양한 방법, 예를 들면, 사진식각법(photolithographic method)(참조, 예, 미국특허번호 5,143,854; 5,510,270; 및 5,527,681), 기계적 방법(예, 미국특허번호 5,384,261에 기재된 지향성 흐름법(directed-flow method)), 핀계 방법(pin based method)(예, 미국특허번호 5,288,514의 기재), 및 비드계 기술(bead based technique)(예, PCT US/93/04145의 기재)에 의해 제조할 수 있다.
상기 캡쳐 프로브는 단일가닥 핵산, 이중가닥 핵산(예, 혼성화하기 전 또는 혼성화하는 동안 변성됨), 또는 단일가닥 부위와 이중가닥 부위를 가진 핵산일 수 있다. 바람직하게는, 상기 캡쳐 프로브는 단일가닥이다. 상기 캡쳐 프로브는 다양한 기준에 의해 선별될 수 있으며, 바람직하게는 최적화 파라미터를 사용하여 컴퓨터 프로그램에 의해 설계된다. 상기 캡쳐 프로브는 유전자의 서열 리치(예, 단독중합이 아닌) 부위에 혼성화하도록 선별될 수 있다. 상기 캡쳐 프로브의 Tm은 상보성 부위 및 길이의 신중한 선별에 의해 최적화할 수 있다. 이상적으로는, 어레이 상의 모든 캡쳐 프로브의 Tm은, 예를 들면, 또 다른 하나와 20, 10, 5, 3, 또는 2℃내에서 유사하다.
상기 단리된 핵산은 바람직하게는, 예를 들어, 게놈 DNA를 제거하는 DNase 처리 및 올리고-dT가 커플링된 고형 기체에의 혼성화를 포함한, 통상의 방법에 의해 단리할 수 있는 mRNA이다(예, Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, N.Y의 기재 참조). 상기 기체를 세정하여, mRNA를 용출시킨다(elute).
상기 단리된 mRNA는 역전사시킬 수 있으며, 필요에 따라, 예를 들어, 미국특허번호 4,683,202에 기재된 바와 같은, 역전사 중합효소연쇄반응(RT-PCR)에 의해 증폭시킬 수 있다. 상기 핵산은, 예를 들면, PCR(미국특허번호 4,683,196 및 4,683,202); 롤링 서클 증폭(rolling circle amplification:"RCA" 미국특허번호 5,714,320), 등온 RNA 증폭(isothermal RNA amplification) 또는 NASBA(미국특허번호 5,130,238; 5,409,818; 및 5,554,517), 및 가닥 치환 증폭(strand displacement amplification)(미국특허번호 5,455,166)으로부터의 증폭 산물일 수 있다. 상기 핵산은, 예를 들면, 표지된 뉴클레오티드를 도입함에 의해, 증폭하는 동안 표지될 수 있다. 바람직한 표지의 예로는 형광 표지(예, 적색형광염료 Cy5TM(Amersham) 또는 녹색형광염료 Cy3TM(Amersham)), 및 화학발광 표지(예, 미국특허번호 4,277,437의 기재 참조)를 들 수 있다. 필요에 따라, 상기 핵산은 비오틴으로 표지하여, 표지된 스트렙타비딘(예, 스트렙타비딘-피코에리트린(Molecular Probes))과 혼성화한 후 검출할 수 있다.
상기 표지된 핵산은 어레이에 접촉시킬 수 있다. 또한, 대조구 핵산 또는 참조 핵산을 동일한 어레이에 접촉시킬 수 있다. 상기 대조구 핵산 또는 참조 핵산은 시료 핵산 이외의 표지(예, 상이한 발광 최고값을 가진 것)로 표지할 수 있다. 표지된 핵산은 혼성화 조건 하에서 어레이에 접촉시킬 수 있다. 상기 어레이는 세정한 다음, 어레이의 각 어드레스에서의 형광을 검출하기 위해서 영상처리할 수 있다.
HGF 또는 HGFR 단백질의 발현 수준은 그 폴리펩티드에 특이적인 항체를 사용하여 측정할 수 있다(예, 웨스턴 블롯 또는 ELISA 분석법 사용). 또한, HGF 및 HGFR을 포함한 복수의 단백질의 발현 수준은 그 폴리펩티드 각각에 대한 항체 캡쳐 프로브를 가진 폴리펩티드 어레이를 사용하여 동시에 신속하게 결정할 수 있다. 폴리펩티드에 특이적인 항체는 본 명세서에서 기재한 방법에 의해 생산할 수 있다("항체 생산" 참조).
단백질이 니트로셀룰로스 막에 점찍혀있는(spotted) 저밀도 (96 웰 포맷) 단백질 어레이가 개발되어 있다(Ge(2000) Nucleic Acids Res. 28, e3, I-VII). 항체 스크리닝용으로 사용되는 고밀도 단백질 어레이(예, 222×222내에 100,000개의 시료)는 단백질을 폴리비닐리덴 디플루오라이드(PVDF)상에 점찍음(spotting)에 의해 생산할 수 있다(Lueking et al.(1999) Anal . Biochem. 270:103-111). 또한, 예를 들면, Mendoza et al.(1999). Biotechniques 27:778-788; MacBeath and Schreiber(2000) Science 289:1760-1763; 및 De Wildt et al.(2000). Nature Biotech. 18:989-994를 참조한다. 이들 공지의 방법 등은 시료 중의 폴리펩티드의 존재(abundance)를 검출하기 위한 항체 어레이의 생산에 사용할 수 있다. 상기 시료는 형광 표지에 커플링된 스트렙타비딘에 의한 후속 검출용으로, 표지(예, 비오틴화)할 수 있다. 그 다음, 상기 어레이는 각 어드레스에서의 결합을 측정하기 위해 스캐닝할 수 있다.
본 발명의 핵산 및 폴리펩티드 어레이는 널리 다양하게 응용할 수 있다. 예를 들면, 상기 어레이를 사용하여, 환자 시료를 분석할 수 있다. 상기 시료는 앞서 얻은 데이터(예를 들면, 알려진 임상 시험편 또는 다른 환자의 시료)와 비교한다. 또한, 상기 어레이를 사용하여, 파라미터를 변화시킨 후(예를 들어, 세포배양액을 항원, 형질전환유전자, 또는 시험 화합물에 노출시킨 후)의 세포 상태를 결정하는 등의 세포 배양 시료의 특성을 기술할 수 있다.
상기 발현 데이터는 데이터베이스, 예를 들어, SQL 데이터베이스(예, Oracle 또는 Sybase 데이터베이스 환경) 등의 관계형 데이터베이스에 저장할 수 있다. 상기 데이터베이스는 다중 표(multiple table)를 가질 수 있다. 예를 들면, 미가공의 발현 데이터는 하나의 표에 저장될 수 있으며, 그 중 각 행은 평가할 유전자(예, 어드레스 또는 어레이)에 해당하며, 각 열은 시료에 해당한다. 개별적인 표는 식별자와 시료 정보(예, 사용된 어레이의 배치(batch) 번호, 데이터, 및 기타 품질 조절 정보)를 저장할 수 있다.
어레이 상의 유전자 발현 분석으로부터 얻은 발현 프로파일을 사용하여, Golub et al.(1999) Science 286:531에 기재된 바와 같은 다양한 상태의 시료 및/또는 세포를 비교할 수 있다. 하나의 태양에서, HGF를 코딩하는 유전자 및/또는 HGFR를 코딩하는 유전자에 대한 발현(예, mRNA 발현 또는 단백질 발현) 정보는, 예를 들어, 참조값(reference value) 비교에 의해, 예를 들어, 참조값을 평가할 수 있다. 참조값은 대조구, 참조구 개체로부터 얻을 수 있다. 또한, 참조값은, 예를 들어, 나이 및 성별을 매치시킨 개체(예, 정상 개체 또는 림프 또는 림프계 관련 질환에 걸렸거나 걸릴 위험이 있는 개체) 등의 개체의 코호트(cohort)에 대한 참조값을 제공하기 위해, 통계적 분석으로부터 얻어질 수 있다. 특정한 참조구(예, 위험 관련 코호트에 대한 참조구) 또는 정상 코호트에 대한 통계적 유사성을 사용하여, 사전에 림프 질환이 없는 개체, 림프 질환에 걸릴 위험(예, 유전적 소인)이 있는 개체, 또는 림프 질환을 가지고 있는 개체 등의 개체에 대한 평가(예, 림프 질환 위험의 표시)를 제공할 수 있다.
치료에 적합한 개체는 HGF/HGFR 경로 활성의 발현 및/또는 활성(예, HGF 발현, HGFR 발현, 인테그린 a9 발현 및 스탠니오칼신 1 발현) 뿐만 아니라, 변형 상태 또는 이들 인자들과 관련된 다른 파라미터에 대해 평가될 수 있다. 몇몇 태양에서는, HGF 및/또는 HGFR에 대한 발현 및/또는 활성이 참조구(예, 정상과 관련된 참조값 등의 참조값)에 대하여 변화(예, 증강)되는 경우, 개체는 치료에 적합한 것으로 동정될 수 있다.
림프 또는 림프계 관련 질환에 대하여 본 명세서에 기재된 약물을 투여하거나 또는 다른 치료를 하는 개체는 HGF 및/또는 HGFR의 발현 및/또는 활성에 대해 기재한 바와 같이 평가할 수 있다. 상기 개체는 복수의 시간(예, 치료과정(치료 요법) 동안 복수의 시간)에 평가될 수 있다. 개체의 치료는 그 개체가 치료에 어떻게 반응하느냐에 따라서 변형시킬 수 있다. 예를 들면, HGF 및/또는 HGFR 발현 또는 활성의 감소는 투여되는 약물이 길항제인지에 대한 반응성의 표시일 수 있다.
약물에 의해 중재된 특정 효과는 통계학적으로 유의한 차이(예, 미처리 개체, 대조구 개체, 또는 기타 참조구에 대하여)를 나타낼 수 있다(예, P값 < 0.05 또는 0.02). 통계학적 유의성은 어떠한 공지의 방법에 의해 결정될 수 있다. 대표적인 통계학적 검정으로는 스튜던트 T-검정, 만-위트니 비모수적 검정(Mann Whitney U non-parametric test), 및 윌콕슨 비모수적 검정(Wilcoxon non-parametric test)을 들 수 있다. 몇몇 통계학적으로 유의한 관계는 0.05 또는 0.02 미만의 P값을 갖는다.
B. 유전 물질 평가 방법
유전 정보를 제공하기 위한 다수의 유전 물질 평가 방법이 있다. 이 방법들을 사용하여, HGF를 코딩하는 유전자 또는 HGFR을 코딩하는 유전자를 포함하는 유전자좌 뿐만 아니라, 다른 유전자좌를 평가할 수 있다. 상기 방법을 사용하여, 하나 이상의 뉴클레오티드, 예를 들어, 조절 부위(예, 프로모터, 미번역 부위 또는 인트론을 코딩하는 부위 등)내의, 유전자의 코딩 또는 논코딩 부위를 평가할 수 있다.
핵산 시료는 생물물리학적 기술(예, 혼성화, 전기영동 등), 서열분석법, 효소계 기술, 및 그들의 조합을 사용하여 분석할 수 있다. 예를 들어, 시료 핵산과 핵산 마이크로어레이의 혼성화를 사용하여, mRNA 군집에서의 서열을 평가하고 유전적 다형성(genetic polymorphism)을 평가할 수 있다. 기타 혼성화에 의거한 기술로는 서열 특이적 프라이머 결합(예, PCR 또는 LCR); DNA(예, 게놈 DNA)의 서던 분석; RNA(예, mRNA)의 노던 분석; 형광 프로브에 의거한 기술(참조, 예를 들면, Beaudet et al.(2001) Genome Res.11(4):600-8); 및 대립유전자 특이적 증폭을 들 수 있다. 효소 기술로는 제한효소 절단; 서열분석; 및 단일 염기 확장(SBE)을 들 수 있다. 이들 및 기타 기술들은 본 발명이 속하는 기술분야에서 숙련된 기술자에게 잘 알려져 있다.
전기영동 기술은 모세관 전기영동 및 단일가닥 입체구조 다형성(SSCP) 검출(참조, 예를 들면, Myers et al.(1985) Nature 313:495-8 및 Ganguly(2002) Hum Mutat. 19(4):334-42)를 포함한다. 기타 생물물리학적 방법으로는 변성 고압 액체 크로마토그래피(DHPLC)를 들 수 있다.
하나의 태양에서는, 선택적 PCR 증폭에 따른 대립유전자 특이적 증폭 기술을 사용하여, 유전 정보를 얻을 수 있다. 특이적 증폭용 프라이머로서 사용되는 올리고뉴클레오티드는 그 분자의 가운데에(증폭이 특정 혼성화에 의해 좌우되도록)(Gibbs et al.(1989) Nucl. Acids Res. 17:2437-2448) 또는 하나의 프라이머의 맨끝의 3'-말단에, 적당한 조건하에서, 불일치(mismatch)를 방지하거나, 또는 폴리머라제 연장을 감소시킬 수 있는 목적으로 하는 돌연변이를 운반(carry)할 수 있다. 또한, 절단에 의한 검출(cleavage-based detection)을 생성하기 위해, 상기 돌연변이 부위에 제한효소 인식부위를 도입할 수 있다(Gasparini et al.(1992) Mol. Cell Probes 6:1). 또 다른 태양에서, 증폭은 중폭용 Taq 연결효소를 사용하여 수행할 수 있다(Barany(1991) Proc . Natl . Acad . Sci USA 88:189). 이러한 경우, 연결(ligation)은, 증폭의 존재 또는 부재를 조사함에 의해 특이적 부위에서의 알려진 돌연변이의 존재를 검출가능하도록 하는, 5' 서열의 3' 말단에서의 완전한 일치(match)가 있는 경우에만 발생할 것이다.
서열 검출용 효소법은 중합효소연쇄반응(PCR; Saiki, et al.(1985) Science 230:1350-1354) 및 연결효소연쇄반응(Ligase Chain Reaction)(LCR; Wu. et al.(1989) Genomics 4:560-569; Barringer et al.(1990), Gene 1989:117-122; F. Barany(1991) Proc . Natl . Acad . Sci . USA 1988:189-193) 등의 증폭에 의거한 방법; 핵산을 증폭시키기 위해 RNA 중합효소에 의한 합성을 이용하는 전사에 의거한 방법(미국특허번호 6,066,457; 6,132,997; 및 5,716,785; Sarkar et al.,(1989) Science 244:331-34; Stofler et al.,(1988) Science 239:491); NASBA(미국특허번호 5,130,238; 5,409,818; 및 5,554,517); 롤링 서클 증폭(RCA; 미국특허번호 5,854,033 및 6,143,495) 및 가닥 치환 증폭(SDA; 미국특허번호 5,455,166 및 5,624,825)을 들 수 있다. 증폭법은 다른 기술과 조합하여 사용할 수 있다.
기타 효소 기술로는 중합효소(예, DNA 중합효소)를 사용한 서열분석법 및 단일염기 연장 기술 등의 그들의 변형법을 들 수 있다. 예를 들면, 미국특허번호 6,294,336; 6,013,431; 및 5,952,174를 참조한다.
또한, 형광에 의거한 방법을 사용하여, 핵산의 다형성을 검출할 수 있다. 예를 들면, 상이한 종결인자 ddNTP는 다른 형광 염료로 표지할 수 있다. 프라이머는 다형성 근처 또는 바로 인접하여 어닐링할 수 있으며, 다형성 부위의 핵산은 도입된 형광 염료의 종류에 따라 검출될 수 있다.
또한, 마이크로어레이와의 혼성화를 사용하여, SNP를 포함한 다형성을 검출할 수 있다. 예를 들면, 그 올리고뉴클레오티드와 다른 위치에서의 다형성 뉴클레오티드를 포함하는, 상이한 올리고뉴클레오티드 세트를 핵산 어레이 상에 배치할 수 있다. 다른 대립유전자에 특이적인 올리고뉴클레오티드와의 혼성화 및 위치의 함수로서 혼성화 정도(extent)를 사용하여, 특정 다형성이 존재하는지를 결정할 수 있다. 예를 들면, 미국특허번호 6,066,454를 참조한다.
하나의 실시에서, 혼성화 프로브는 두가닥 형성을 불안정화시키고 그 분석을 민감하게 하는 하나 이상의 부가적인 불일치(mismatch)를 포함할 수 있다. 상기 불일치는 그 조회 위치에 바로 인접해있거나, 또는 그 조회 위치의 10, 7, 5, 4, 3, 2개의 뉴클레오티드이내에 있을 수 있다. 또한, 혼성화 프로브는 특정 Tm, 예를 들면, 45∼60℃, 55∼65℃, 또는 60∼75℃를 갖는 것을 선택할 수 있다. 다중 분석에서, Tm은 상호간에 5, 3, 또는 2℃ 내에 있도록 선택할 수 있다.
또한, 특정한 유전자좌에 대하여, 예를 들면, 증폭 및 서열분석, 또는 증폭, 클로닝 및 서열분석에 의해, 핵산을 직접 서열분석할 수 있다. 고처리율 자동화(예, 모세관 또는 마이크로칩계) 서열분석장치를 사용할 수 있다. 또 다른 태양에서, 목적으로 하는 단백질 서열을 분석하여, 그 유전자 서열을 추론한다. 단백질 서열분석 방법으로는 단백질 서열분석법(sequencing), 질량분석법(mass spectroscopy), 서열/항원결정기 특이적 면역글로불린, 및 단백질분해효소 절단을 들 수 있다.
상기 방법들의 어떠한 조합도 사용할 수 있다. 상기 방법들, 예를 들어, 특정한 개체군으로부터 유전 정보를 분석하는 방법 또는, 예를 들어, HGF, HGFR, 인테그린 α9 또는 스탠니오칼신 1을 코딩하는 유전자 중의 림프 또는 림프계 관련 질환과 관련된 다형성을 분석하는 방법을 사용하여, 어떠한 유전자좌를 평가할 수 있다.
C. 생체내 영상( In Vivo Imaging )
HGF/HGFR 결합제(예, 항체)를 사용하여, 생체내의 HGF 및/또는 HGFR의 존재(예, 개체의 생체 영상)를 각각 검출할 수 있다. 상기 방법을 사용하여, 본 명세서에 기재된 상태(예, 림프 질환 또는 그 질환에 걸릴 위험)를 평가(예, 진단(diagnose), 배치(localize), 단계짓기(stage))할 수 있다. 상기 방법은 (i) HGF/HGFR 결합제(예, HGF 또는 HGFR에 결합하는 항체)와 HGF 또는 HGFR의 상호작용이 일어나는 조건 하에서, 개체(및, 필요에 따라, 대조군)에 상기 결합제를 투여하는 단계; 및 (ii) 예를 들어, HGF 또는 HGFR 발현 세포를 배치 또는 그렇지 않으면 동정하기 위해, 상기 결합제를 검출하는 단계를 포함한다. 참조구(예, 대조구 개체 또는 개체의 기준선)에 대한, 개체 중의 통계학적으로 유의한 복합체의 양 증가는 림프 또는 림프계 관련 질환 또는 이 질환에 걸릴 위험의 진단으로 유도할 수 있는 인자일 수 있다.
바람직하게는, 생체내에서 사용되는 HGF/HGFR 결합제는, 결합된 또는 결합되지 않은 결합제의 검출을 촉진하기 위해, 검출가능한 성분으로 직접 또는 간접적으로 표지된다. 적합한 검출가능 성분으로는 각종 효소, 보조 분자족, 형광 물질, 발광 물질 및 방사성 물질을 들 수 있다. 하나의 태양에서, HGF 또는 HGFR 결합 단백질은 방사성 이온, 예를 들면, 인듐(111In), 요오드(131I 또는 125I), 이트륨(90Y), 액티늄(225Ac), 비스머스(212Bi 또는 213Bi), 황(35S), 탄소(14C), 트리튬(3H), 로듐(188Rh), 또는 인(32P)에 커플링된다. 또 다른 태양에서, 상기 HGF/HGFR 결합 단백질은 NMR 조영제로 표지된다.
하나의 면에서, 본 발명은 림프 또는 림프계 관련 질환에 걸릴 위험이 있거나, 또는 그 질환이 진행중인 환자의 맥관계(예, 림프 맥관계)의 이미징(imaging) 방법을 특징으로 한다. 상기 방법은 HGF 또는 HGFR에 결합하는 약물(예, 본 명세서에 기재된 약물)을 제공하는 단계로서, 상기 단백질은 이미징제(imaging agent)와 물리적으로 결합되는 단계; 상기 약물을 환자(예, 림프 또는 림프계 관련 질환에 걸릴 위험이 있는 환자)에 투여하는 단계; 및 예를 들면, HGF 또는 HGFR 발현 세포를 검출하기 위해, 예를 들면, 환자를 이미징함에 의해, 환자내에서의 상기 약물의 위치를 알아내는(locating) 단계를 포함한다.
[실시예]
실시예 1. HGFR 은 혈관 내피세포에서 보다 림프 내피세포에서 더 높은 수준으로 발현되고 기능적임
실시간 정량 RT-PCR(QPCR) 결과, 3개의 독립적으로 확립된 일차 LEC 세포주는, 혈관 내피세포(BVEC)에 대해, 주요 림프 계통 마커 Prox1 및 LYVE-1의 mRNA를 고수준으로 발현하지만, 혈관 계통 마커 Flt-1은 저수준으로 발현함이 확인되었다(도 1a-c). LEC에서의 HGFR mRNA 수준은 QPCR에 의해 측정하였으며, BVEC에서의 수준보다 2배 이상 더 높음이 확인되었다(도 1d). 또한, 면역침전 및 웨스턴 블롯 분석 결과, HGFR 단백질 발현이 BVEC에서 보다 LEC에서 더 높음이 입증되었다(도 1e). LEC에 30ng/ml의 HGF를 처리한 결과, HGFR 인산화의 증가가 일어났으므로(도 1f), HGFR은 LEC에서 기능적이다. 요컨데, HGFR은 BVEC보다 LEC에서 고수준으로 발현되며 LEC를 HGF로 치료하는 경우 활성화된다.
실시예 2. HGFR 발현은 생체내에서의 염증 및 조직회복 동안 림프관에서 발현됨
HGFR에 대한 항체 및 림프 특이적 히알루로난 수용체 LYVE-1에 대한 항체를 사용하여, 정상 마우스 피부의 차별 면역형광(differential immunofluorescence) 분석을 수행하였다. 정상 피부의 정지 림프관(quiescent lymphatic vessel)에서는 HGFR의 발현이 거의 또는 전혀 검출되지 않았다. HGFR이 병리 과정 동안 림프 내피에 의해 상향조절되는지의 여부를 결정하기 위해서, 본 발명자들은 림프관 확장 및 증식을 특징으로 하는 VEGF-A 형질전환(VEGF-TG) 마우스에서 실험적으로 유도된 지연형 과민감성 반응으로부터 얻은 만성 염증이 있는 마우스의 피부 시료를 면역염색하였다(Kunstfeld et al(2004), Blood, 104(4):1048-1057). 피부 염증 유발 후 7일째에, 확장된 LYVE-1-양성 림프관이 VEGF-TG 마우스에서 검출되었으나, 야생형 마우스에서는 검출되지 않았다(도 2a, d). LYVE-1-양성 림프관은 HGFR을 강하게 발현하는 반면, 야생형 마우스의 정상 림프관에서는 HGFR 발현이 거의 또는 전혀 검출되지 않았다(도 2a-f).
마우스에서 실험적으로 유도된 전체 두께의 피부 상처 후 2∼3주째에, 과립 조직내에서 현저한 림프관신생이 확인되었다. 손상 후 21일째에 손상 조직의 이중 면역형광 분석 결과, 수개의 LYVE-1-양성 림프관이 HGFR을 발현한 것으로 드러났다(도 2g-l).
배아 림프관 형성 동안 HGFR의 가능한 역할을 더 특징짓기 위해서, 마우스 배아 조직을, 림프관 전구세포의 활성 출아(budding) 및 증식이 일어나는 때인 배자기(embryonic day)(E) 10.5∼14.5일에 시험하였다. E11.5에는, 전주정맥(anterior cardinal vein)의 내피세포상에서 LYVE-1 발현이 검출되었다. 이 세포들은 HGFR을 거의 또는 전혀 발현하지 않았지만, 앞창자의 인두부위 내 및 중간엽 세포에서는 HGFR 발현이 이미 검출되었다(도 3a-c). 그러나, E12.5에는, LYVE-1 발현이 전주정맥의 LYVE-1-양성 내피세포상에서 명백히 검출할 수 있었으나, 원시 림프낭을 라이닝한 내피세포상에서는 단지 가끔 HGFR 발현이 확인되었으며, LYVE-1 반응성과 중복되었다(도 3d-f). E14.5까지, 대다수의 LYVE-1-양성 림프 내피세포상에서 강한 HGFR 발현이 검출되었다(도 3g-i). 이 단계에서, HGFR은, LYVE-1-음성인, 목정맥 및 동맥을 라이닝하는 내피세포에 의해 여전히 약하게 발현되었다(도 3d-f).
실시예 3. HGF LEC 증식 및 이동을 직접적으로 촉진
HGF는 HGFR의 유일하게 알려진 리간드이며 인간의 맥관내피세포(HVEC)의 증식 및 이동을 유도하는 것으로 밝혀져 있다(예, Bussolino et al.(1992), J. Cell . Biol., 119:629-641). LEC 대 BVEC에 의한 HGFR의 상이한 발현 수준이 HGF 자극에 대한 그들의 상이한 반응을 나타내는지를 조사하기 위해서, 다음으로 시험관내에서의 LEC 대 BVEC 증식에 대한 HGF의 효과를 조사하였다. HGF는, 미처리 대조구 배양에 비해, 1ng/ml(p<0.01)의 최소 유효 농도로 LEC 증식을 강력하게 유도하였다. 또한, HGF는 이 농도로 BVEC 증식을 유도하였으나, 성장 자극의 정도는 BVEC에서 보다 LEC에서 더 높았다(도 4a). 지금까지는, VEGF-C 및 VEGF-D가 VEGF 수용체-3(VEGFR-3)의 활성화를 통해 LEC 증식을 직접 촉진시키는 유일하게 알려진 성장인자이며(예, Jussila and Alitalo(2002), Physiol Rev, 82:673-700), 림프관신생에 대한 FGF-2의 효과는, 그들이 VEGFR-3 경로의 차단에 의해 저해될 수 있기 때문에, VEGFR-3 리간드의 상향조절의 결과인 것으로 제안되었다(예, Chang et al.(2004), PNAS, 101:11658-11663; Kubo et al.(2002), PNAS, 99:8868-8873). HGF가 직접 또는 간접적으로 LEC 증식을 자극하는지를 조사하기 위해서, 다음으로, VEGFR-3 또는 HGFR에 대한 블로킹 항체의 존재 또는 부재 하에, LEC에 HGF를 처리하였다. LEC를 HGFR 블로킹 항체와 함께 배양함은 HGF에 의한 LEC 증식 자극을 강력하게 차단시키는 반면(P < 0.001), VEGFR-3 블로킹 항체(VEGF-C에 의한 성장 자극을 효과적으로 차단한 투여량으로(데이터는 기재하지 않음))와 함께 배양 또는 대조구 IgG와 함께 배양함은 HGF-유도 증식에 영향을 미치지 못하였다(도 4b). 이 결과들은 HGF-유도 LEC 증식이 VEGF-R3 경로의 활성화로부터 독립적으로 일어나고 HGF의 그 수용체에의 유효한 결합에 의존적임을 나타낸다.
또한, HGF 처리는 3ng/ml의 최소 유효 농도로, 투여량-의존적으로 LEC 및 BVEC의 이동을 촉진시켰다(도 4c). HGF 자극이 시험관내에서의 림프관의 형성을 촉진시키는지를 조사하기 위해서, Hirakawa et al.(2003), Am . J. Pathol ., 162:575-586에 앞서 기재한 바와 같이, LEC 융합성 배양물(confluent LED culture)을 타입 I 콜라겐으로 뒤덮었다. HGF는, 미처리 대조군 배양물에 비해, 3ng/ml의 최소 유효 투여량으로(p < 0.001), LEC에 의한 인대(cord) 형성을 강하게 유도하였다(도 5a, b).
실시예 4. HGF 생체내에서의 림프관 형성을 촉진
HGF가 생체내에서도 림프관신생을 유도하는지를 조사하기 위해, Hirakawa et al.(2003), Am , J. Pathol ., 162:575-586에 기재한 바와 같이, HGF를 포함하거나 포함하지 않은 매트리겔(matrigel)을 FVB 마우스에 피하이식하였다. 림프 특이적 글리코겐 포도프라닌에 대한 면역염색 결과(예, Schacht et al.(2003), EMBO J., 22:3546-3556), 이식 후 7일째에 HGF 함유 매트리겔내에서 새로운 림프관이 현저하게 형성됨이 확인된 반면, 대조구 매트리겔내에는 림프관이 관찰되지 않았다(도 5c, d).
실시예 5. HGFR 의 조직적 차단은 실험에 의한 피부염증 동안 림프관 확장을 저해
본 발명자는 마우스의 실험에 의한 피부염증 동안 확장된 림프관에 의해 HGFR이 강하게 발현됨을 확인하였으므로, 다음으로, HGF가 생체내에서의 림프관 확장에 직접적으로 기여하는지를 조사하였다. Kunstfeld et al.(2004), Blood, 104(4):1048-1057에 기재된 바와 같이, 마우스의 귀에 국소 적용함에 의해 지연형 과민성 반응을 유도하였다. 실험에 의한 염증 유도 하루 전에, HGFR에 대한 블로킹 항체 100㎍ 또는 대조구 면역글로불린 G 등량을 복강내 주입하였다. 염증 유도 후 24시간째에 면역형광을 분석한 결과, 대조구 IgG로 처리한 마우스에 비해서, HGF-R 블로킹 항체로 처리한 마우스의 림프관 크기가 상당히 감소함을 확인하였다(도 6a, b). LYVE-1 및 CD31에 대해 염색된 절편의 컴퓨터를 활용하여 형태분석한 결과, 림프관의 평균 크기, 및 림프관으로 덮인 조직 면적의 퍼센트가, 대조구 IgG 처리 마우스에 비해, HGF-R 블로킹 항체 주입 후(P < 0.01)에 유의하게 감소됨이 입증되었다(도 6c, d). 림프관 밀도는 두 처리 군간에 유의한 차이가 없었다(도 6e).
실시예 6. HGF 인테그린 α 9을 통해 LEC 이동을 촉진
LEC에 대한 HGF 효과를 중재하는 가능한 분자 메카니즘을 규정하기 위해, 2개의 독립적인 LEC 세포주를 30ng/ml의 HGF를 첨가하거나 첨가하지 않고 6시간 동안 배양한 다음, Affymetrix HU133v2TM 어레이를 사용하여 마이크로어레이 분석을 행하였다. 본 발명자는 스탠니오칼신 1이 HGF 처리 후 가장 높게 상향조절된 유전자 중의 하나임을 확인하였다. 또한, 인테그린 α9의 발현도, HGF 처리 후 유의하게 상향조절되었다. 이 결과들은 QPCR 분석에 의해 확인되었다(도 7a).
특이적 인테그린 α9 블로킹 항체의 존재 또는 부재 하에 LEC를 HGF와 동시배양(co-incubation)한 결과, 인테그린 α9의 차단은 HGF-유도 이동을 부분적으로 저해한 반면(p=0.0143), HGF-R 블로킹 항체와의 배양은 LEC 이동에 대한 HGF의 효과를 완전히 저해하였다(p=0.0074)(도 7b).
실시예 7. HGF 생체내 림프관 형성을 VEGF 과 독립적으로 촉진
HGF의 생체내 과다발현의 효과를 결정하기 위해서, 앞서 확립한 메탈로티오네인 I 프로모터-유도 HGF 형질전환마우스의 림프 맥관계를 조사하였다(Takayama et al.(1996) Proc . Natl . Acad . Sci. USA, 93:5866-5871). 상기 분석은 유전학적 마우스 모델에서 림프관이 가장 풍부하고 림프계의 이상이 가장 쉽게 검출되는 피부 및 소장에 촛점을 맞추었다. 야생형 마우스에 비해(도 8a), HGF 형질전환마우스의 회장(ileum)의 점막층 및 점막하층에서 맥관계 확장이 검출되었다(도 8b). 림프 특이적 마커 포도플라닌에 대한 면역형광 염색 결과, HGF 형질전환 마우스의 회장의 점막하층에서 현저한 중심림프관 팽창과 림프관 확장이 확인되었다(도 8c, d). 또한, 포도플라닌 염색 결과, HGF 형질전환마우스 피부에서의 림프관 수 증가 및 확장이 확인된 반면(도 8g, h), 주요한 조직학적 이상은 관찰되지 않았다(도 8e, f). HGF 형질전환마우스의 십이지장 및 간에서도 증강된 림프관 형성 및 확장이 관찰되었다.
HGF가 VEGFR-3 경로를 거쳐서 직접적으로 또는 간접적으로 새로운 림프관의 형성을 촉진하는지를 시험하기 위해서, 느린 방출 펠렛(HGF 포함 또는 미포함)을 마우스 귀에 피하이식하고, 마우스 VEGFR-3에 대한 블로킹 항체 또는 대조구 IgG를 전신적으로 처리하였다. 14일 후, CD31 및 LYVE-1에 대한 면역형광 염색 결과, HGF-함유 펠렛 주위에 림프관이 현저하게 형성되었으나, 대조구 펠렛 주변에는 형성되지 않은 것으로 확인되었다(도 9a-c). 그러나, 항 VEGFR-3 블로킹 항체에 의한 처리는 HGF에 의해 유도되는 림프관 형성을 저해하지 못하였다(도 9b, c). HGF-함유 펠렛으로 이식한 마우스는 적당히 증강된 혈관 형성을 나타내었다.
상기 실시예들에 나타낸 결과들은 HGF가 림프관신생 조절용 단백질 표적임을 나타낸다.
기타 태양
본 발명의 다수의 태양을 기재하였다. 그럼에도 불구하고, 본 발명의 기술적 사상이나 범위로부터 벗어남 없이 다양한 변형이 이루어질 수 있음은 이해될 것이다. 예를 들면, HGFR 및 HGFR 활성의 핵산과 항체 조정자의 조합물이 고려된다. 따라서, 기타 태양은 하기 청구항의 범위내에 포함된다.
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Phe Thr Val Lys Val Ala Asp Phe Gly Leu Ala Arg Asp Met Tyr 1235 1240 1245 Asp Lys Glu Tyr Tyr Ser Val His Asn Lys Thr Gly Ala Lys Leu Pro 1250 1255 1260 Val Lys Trp Met Ala Leu Glu Ser Leu Gln Thr Gln Lys Phe Thr Thr 1265 1270 1275 1280 Lys Ser Asp Val Trp Ser Phe Gly Val Leu Leu Trp Glu Leu Met Thr 1285 1290 1295 Arg Gly Ala Pro Pro Tyr Pro Asp Val Asn Thr Phe Asp Ile Thr Val 1300 1305 1310 Tyr Leu Leu Gln Gly Arg Arg Leu Leu Gln Pro Glu Tyr Cys Pro Asp 1315 1320 1325 Pro Leu Tyr Glu Val Met Leu Lys Cys Trp His Pro Lys Ala Glu Met 1330 1335 1340 Arg Pro Ser Phe Ser Glu Leu Val Ser Arg Ile Ser Ala Ile Phe Ser 1345 1350 1355 1360 Thr Phe Ile Gly Glu His Tyr Val His Val Asn Ala Thr Tyr Val Asn 1365 1370 1375 Val Lys Cys Val Ala Pro Tyr Pro Ser Leu Leu Ser Ser Glu Asp Asn 1380 1385 1390 Ala Asp Asp Glu Val Asp Thr Arg Pro Ala Ser Phe Trp Glu Thr Ser 1395 1400 1405 <210> 7 <211> 1379 <212> PRT <213> Mus musculus <400> 7 Met Lys Ala Pro Thr Val Leu Ala Pro Gly Ile Leu Val Leu Leu Leu 1 5 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Val Leu Leu Thr Ser Ile Ser Thr Phe Ile Lys Gly Asp 435 440 445 Leu Thr Ile Ala Asn Leu Gly Thr Ser Glu Gly Arg Phe Met Gln Val 450 455 460 Val Leu Ser Arg Thr Ala His Leu Thr Pro His Val Asn Phe Leu Leu 465 470 475 480 Asp Ser His Pro Val Ser Pro Glu Val Ile Val Glu His Pro Ser Asn 485 490 495 Gln Asn Gly Tyr Thr Leu Val Val Thr Gly Lys Lys Ile Thr Lys Ile 500 505 510 Pro Leu Asn Gly Leu Gly Cys Gly His Phe Gln Ser Cys Ser Gln Cys 515 520 525 Leu Ser Ala Pro Tyr Phe Ile Gln Cys Gly Trp Cys His Asn Gln Cys 530 535 540 Val Arg Phe Asp Glu Cys Pro Ser Gly Thr Trp Thr Gln Glu Ile Cys 545 550 555 560 Leu Pro Ala Val Tyr Lys Val Phe Pro Thr Ser Ala Pro Leu Glu Gly 565 570 575 Gly Thr Val Leu Thr Ile Cys Gly Trp Asp Phe Gly Phe Arg Lys Asn 580 585 590 Asn Lys Phe Asp Leu Arg Lys Thr Lys Val Leu Leu Gly Asn Glu Ser 595 600 605 Cys Thr Leu Thr Leu Ser Glu Ser Thr Thr Asn Thr Leu Lys Cys Thr 610 615 620 Val Gly Pro Ala Met Ser Glu His Phe Asn Val Ser Val Ile Ile Ser 625 630 635 640 Asn Ser Arg Glu Thr Thr Gln Tyr Ser Ala Phe Ser Tyr Val Asp Pro 645 650 655 Val Ile Thr Ser Ile Ser Pro Arg Tyr Gly Pro Gln Ala Gly Gly Thr 660 665 670 Leu Leu Thr Leu Thr Gly Lys Tyr Leu Asn Ser Gly Asn Ser Arg His 675 680 685 Ile Ser Ile Gly Gly Lys Thr Cys Thr Leu Lys Ser Val Ser Asp Ser 690 695 700 Ile Leu Glu Cys Tyr Thr Pro Ala Gln Thr Thr Ser Asp Glu Phe Pro 705 710 715 720 Val Lys Leu Lys Ile Asp Leu Ala Asn Arg Glu Thr Ser Ser Phe Ser 725 730 735 Tyr Arg Glu Asp Pro Val Val Tyr Glu Ile His Pro Thr Lys Ser Phe 740 745 750 Ile Ser Gly Gly Ser Thr Ile Thr Gly Ile Gly Lys Thr Leu Asn Ser 755 760 765 Val Ser Leu Pro Lys Leu Val Ile Asp Val His Glu Val Gly Val Asn 770 775 780 Tyr Thr Val Ala Cys Gln His Arg Ser Asn Ser Glu Ile Ile Cys Cys 785 790 795 800 Thr Thr Pro Ser Leu Lys Gln Leu Gly Leu Gln Leu Pro Leu Lys Thr 805 810 815 Lys Ala Phe Phe Leu Leu Asp Gly Ile Leu Ser Lys His Phe Asp Leu 820 825 830 Thr Tyr Val His Asn Pro Val Phe Glu Pro Phe Glu Lys Pro Val Met 835 840 845 Ile Ser Met Gly Asn Glu Asn Val Val Glu Ile Lys Gly Asn Asn Ile 850 855 860 Asp Pro Glu Ala Val Lys Gly Glu Val Leu Lys Val Gly Asn Gln Ser 865 870 875 880 Cys Glu Ser Leu His Trp His Ser Gly Ala Val Leu Cys Thr Val Pro 885 890 895 Ser Asp Leu Leu Lys Leu Asn Ser Glu Leu Asn Ile Glu Trp Lys Gln 900 905 910 Ala Val Ser Ser Thr Val Leu Gly Lys Val Ile Val Gln Pro Asp Gln 915 920 925 Asn Phe Ala Gly Leu Ile Ile Gly Ala Val Ser Ile Ser Val Val Val 930 935 940 Leu Leu Leu Ser Gly Leu Phe Leu Trp Met Arg Lys Arg Lys His Lys 945 950 955 960 Asp Leu Gly Ser Glu Leu Val Arg Tyr Asp Ala Arg Val His Thr Pro 965 970 975 His Leu Asp Arg Leu Val Ser Ala Arg Ser Val Ser Pro Thr Thr Glu 980 985 990 Met Val Ser Asn Glu Ser Val Asp Tyr Arg Ala Thr Phe Pro Glu Asp 995 1000 1005 Gln Phe Pro Asn Ser Ser Gln Asn Gly Ala Cys Arg Gln Val Gln Tyr 1010 1015 1020 Pro Leu Thr Asp Leu Ser Pro Ile Leu Thr Ser Gly Asp Ser Asp Ile 1025 1030 1035 1040 Ser Ser Pro Leu Leu Gln Asn Thr Val His Ile Asp Leu Ser Ala Leu 1045 1050 1055 Asn 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Thr Lys Ser Asp Val 1250 1255 1260 Trp Ser Phe Gly Val Leu Leu Trp Glu Leu Met Thr Arg Gly Ala Pro 1265 1270 1275 1280 Pro Tyr Pro Asp Val Asn Thr Phe Asp Ile Thr Ile Tyr Leu Leu Gln 1285 1290 1295 Gly Arg Arg Leu Leu Gln Pro Glu Tyr Cys Pro Asp Ala Leu Tyr Glu 1300 1305 1310 Val Met Leu Lys Cys Trp His Pro Lys Ala Glu Met Arg Pro Ser Phe 1315 1320 1325 Ser Glu Leu Val Ser Arg Ile Ser Ser Ile Phe Ser Thr Phe Ile Gly 1330 1335 1340 Glu His Tyr Val His Val Asn Ala Thr Tyr Val Asn Val Lys Cys Val 1345 1350 1355 1360 Ala Pro Tyr Pro Ser Leu Leu Pro Ser Gln Asp Asn Ile Asp Gly Glu 1365 1370 1375 Gly Asn Thr <210> 8 <211> 1382 <212> PRT <213> Rattus norvegicus <400> 8 Met Lys Ala Pro Thr Ala Leu Ala Pro Gly Ile Leu Leu Leu Leu Leu 1 5 10 15 Thr Leu Ala Gln Arg Ser His Gly Glu Cys Lys Glu Ala Leu Val Lys 20 25 30 Ser Glu Met Asn Val Asn Met Lys Tyr Gln Leu Pro Asn Phe Thr Ala 35 40 45 Glu Thr Pro Ile Gln Asn Val Val Leu His Gly His His Ile Tyr Leu 50 55 60 Gly Ala Thr Asn Tyr Ile Tyr Val Leu Asn Asp Lys Asp Leu Gln Lys 65 70 75 80 Val Ser Glu Phe Lys Thr Gly Pro Val Val Glu His Pro Asp Cys Phe 85 90 95 Pro Cys Gln Asp Cys Ser Ser Lys Ala Asn Val Ser Gly Gly Val Trp 100 105 110 Lys Asp Asn Val Asn Met Ala Leu Leu Val Asp Thr Tyr Tyr Asp Asp 115 120 125 Gln Leu Ile Ser Cys Gly Ser Val Asn Arg Gly Thr Cys Gln Arg His 130 135 140 Val Leu Pro Pro Asp Asn Ala Ala Asp Ile Gln Ser Glu Val His Cys 145 150 155 160 Met Phe Ser Pro Leu Ala Glu Glu Glu Ser Gly Gln Cys Pro Asp Cys 165 170 175 Val Val Ser Ala Leu Gly Ala Lys Val Leu Leu Ser Glu Lys Asp Arg 180 185 190 Phe Ile Asn Phe Phe Val Gly Asn Thr Ile Asn Ser Ser Tyr Pro Pro 195 200 205 Asp Tyr Ser Leu His Ser Ile Ser Val Arg Arg Leu Lys Glu Thr Gln 210 215 220 Asp Gly Phe Lys Phe Leu Thr Asp Gln Ser Tyr Ile Asp Val Leu Gly 225 230 235 240 Glu Phe Arg Asp Ser Tyr Pro Ile Lys Tyr Ile His Ala Phe Glu Ser 245 250 255 Asn His Phe Ile Tyr Phe Leu Thr Val Gln Lys Glu Thr Leu Asp Ala 260 265 270 Gln Thr Phe His Thr Arg Ile Ile Arg Phe Cys Ser Val Asp Ser Gly 275 280 285 Leu His Ser Tyr Met Glu Met Pro Leu Glu Cys Ile Leu Thr Glu Lys 290 295 300 Arg Arg Lys Arg Ser Thr Arg Glu Glu Val Phe Asn Ile Leu Gln Ala 305 310 315 320 Ala Tyr Val Ser Lys Pro Gly Ala Asn Leu Ala Lys Gln Ile Gly Ala 325 330 335 Ser Pro Tyr Asp Asp Ile Leu Tyr Gly Val Phe Ala Gln Ser Lys Pro 340 345 350 Asp Ser Ala Glu Pro Met Asn Arg Ser Ala Val Cys Ala Phe Pro Ile 355 360 365 Lys Tyr Val Asn Asp Phe Phe Asn Lys Ile Val Asn Lys Asn Asn Val 370 375 380 Arg Cys Leu Gln His Phe Tyr Gly Pro Asn His Glu His Cys Phe Asn 385 390 395 400 Arg Thr Leu Leu Arg Asn Ser Ser Gly Cys Glu Val Arg Ser Asp Glu 405 410 415 Tyr Arg Thr Glu Phe Thr Thr Ala Leu Gln Ala Val Asp Leu Phe Met 420 425 430 Gly Arg Leu Asn His Val Leu Leu Thr Ser Ile Ser Thr Phe Ile Lys 435 440 445 Gly Asp Leu Thr Ile Ala Asn Leu Gly Thr Ser Glu Gly Arg Phe Met 450 455 460 Gln Val Val Leu Ser Arg Thr Ala His Phe Thr Pro His Val Asn Phe 465 470 475 480 Leu Leu Asp Ser His Pro Val Ser Pro Glu Val Ile Val Glu His Pro 485 490 495 Ser Asn Gln Asn Gly Tyr Thr Leu Val Val Thr Gly Lys Lys Ile Thr 500 505 510 Lys Ile Pro Leu Asn Gly Leu Gly Cys Gly His Phe Gln Ser Cys Ser 515 520 525 Gln Cys Leu Ser Ala Pro Tyr Phe Ile Gln Cys Gly Trp Cys His Asn 530 535 540 Arg Cys Val His Ser Asn Glu Cys Pro Ser Gly Thr Trp Thr Gln Glu 545 550 555 560 Ile Cys Leu Pro Ala Val Tyr Lys Val Phe Pro Thr Ser Ala Pro Leu 565 570 575 Glu Gly Gly Thr Met Leu Thr Ile Cys Gly Trp Asp Phe Gly Phe Lys 580 585 590 Lys Asn Asn Lys Phe Asp Leu Arg Lys Thr Lys Val Leu Leu Gly Asn 595 600 605 Glu Ser Cys Thr Leu Thr Leu Ser Glu Ser Thr Thr Asn Thr Leu Lys 610 615 620 Cys Thr Val Gly Pro Ala Met Ser Glu His Phe Asn Val Ser Val Ile 625 630 635 640 Val Ser Asn Ser Arg Glu Thr Thr Gln Tyr Ser Ala Phe Ser Tyr Val 645 650 655 Asp Pro Val Ile Thr Ser Ile Ser Pro Arg Tyr Gly Pro His Ala Gly 660 665 670 Gly Thr Leu Leu Thr Leu Thr Gly Lys Tyr Leu Asn Ser Gly Asn Ser 675 680 685 Arg His Ile Ser Ile Gly Gly Lys Thr Cys Thr Leu 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1305 1310 Leu Tyr Glu Val Met Leu Lys Cys Trp His Pro Lys Ala Glu Met Arg 1315 1320 1325 Pro Ser Phe Ser Glu Leu Val Ser Arg Ile Ser Ser Ile Phe Ser Thr 1330 1335 1340 Phe Ile Gly Glu His Tyr Val His Val Asn Ala Thr Tyr Val Asn Val 1345 1350 1355 1360 Lys Cys Val Ala Pro Tyr Pro Ser Leu Leu Pro Ser Gln Asp Asn Ile 1365 1370 1375 Asp Gly Glu Ala Asn Thr 1380

Claims (19)

  1. 간세포 성장인자(HGF) 수용체 작용제를 치료학적 유효량 함유하는, 개체에 있어서 림프관 형성을 증가시키기 위한 조성물이며,
    상기 작용제가, 간세포 성장인자 폴리펩티드 또는 그 생물학적으로 활성이 있는 단편, 및 간세포 성장인자 폴리펩티드 또는 그 생물학적으로 활성이 있는 단편을 코딩하는 핵산으로 이루어진 군에서 선택되는, 조성물.
  2. 제1항에 있어서,
    상기 작용제가 HGF 폴리펩티드 또는 그 생물학적으로 활성이 있는 단편인, 조성물.
  3. 제2항에 있어서,
    상기 HGF 폴리펩티드가 인간 HGF 폴리펩티드이거나 상기 HGF 폴리펩티드의 생물학적으로 활성이 있는 단편이 인간 HGF 폴리펩티드의 생물학적으로 활성이 있는 단편인, 조성물.
  4. 제3항에 있어서,
    상기 인간 HGF 폴리펩티드가 프로세싱된, 성숙 인간 HGF 폴리펩티드인, 조성물.
  5. 제4항에 있어서,
    상기 프로세싱된, 성숙 인간 HGF 폴리펩티드가
    서열번호 1의 아미노산 55-494로 구성되는 α 서브유닛; 및
    서열번호 1의 아미노산 495-728로 구성되는 β 서브유닛
    을 포함하는, 조성물
  6. 제1항 내지 제5항 중 어느 한 항에 있어서,
    상기 작용제가 간세포 성장인자 폴리펩티드 또는 그 생물학적으로 활성이 있는 단편을 코딩하는 핵산인, 조성물.
  7. 제6항에 있어서,
    상기 작용제가 인간 간세포 성장인자 또는 그 생물학적으로 활성이 있는 단편을 코딩하는 핵산인, 조성물.
  8. 제7항에 있어서,
    상기 핵산이 서열번호 1에 적어도 90%, 적어도 92%, 적어도 94%, 적어도 96%, 적어도 98%, 적어도 99%, 또는 100% 일치하는 폴리펩티드를 코딩하는, 조성물.
  9. 제1항 내지 제5항 중 어느 한 항에 있어서,
    상기 작용제가 정맥내, 피하, 근육내, 또는 복막내 주사제로 제형화된, 조성물.
  10. 제1항 내지 제5항 중 어느 한 항에 있어서,
    상기 작용제가 약제학적으로 허용 가능한 담체를 포함하는 약제학적 조성물로 제형화된, 조성물.
  11. 제1항 내지 제5항 중 어느 한 항에 있어서,
    상기 개체가 인간인, 조성물.
  12. 간세포 성장인자 활성 길항제(antagonist)를 치료학적 유효량 포함하는, 종양질환에 걸렸거나 걸릴 위험이 있는 개체의 치료를 위한 약제학적 조성물.
  13. 제12항에 있어서,
    상기 종양질환이 암인, 약제학적 조성물.
  14. 제13항에 있어서,
    상기 암이 전이성 암인, 약제학적 조성물.
  15. 제13항에 있어서,
    상기 암이 림프절로의 전이 위험을 특징으로 하는, 약제학적 조성물.
  16. 제14항에 있어서,
    상기 전이성 암이 림프관내에서의 세포 전이를 포함하는, 약제학적 조성물.
  17. 제12항에 있어서,
    상기 간세포 성장인자 활성 길항제가, 세포성 간세포 성장인자 mRNA와 결합하여 그 단백질의 발현을 저해할 수 있는 핵산 길항제, 간세포 성장인자 단백질과 특이적으로 결합하는 항체 또는 항체 단편, 가용성 간세포 성장인자 수용체, 우성 음성 간세포 성장인자 단백질 또는 그 단편, 및 간세포 성장인자 핵산 발현을 감소시키는 약물로 이루어지는 군에서 선택되는, 약제학적 조성물.
  18. 제12항 내지 제17항 중 어느 한 항에 있어서,
    국소 투여 또는 비경구 투여에 의해 투여되는, 약제학적 조성물.
  19. 제17항에 있어서,
    상기 핵산 길항제가, HGF 또는 HGF 수용체를 코딩하는 mRNA를 표적으로 하는 siRNA, dsRNA, 리보자임, 3중나선 구성체, 및 안티센스 핵산으로 이루어지는 군에서 선택되는, 약제학적 조성물.
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